lowQualScore : 11 11111111 111 111 33333333 1111 1
lowQualScore : 2 22 333 00 2 777 55555555 0 6 1 666 000 4444 666 3 8 1 666 0 3333 55 44444 1 66666666 22222222 2 2 0000 7 4 5555 6 0 6
lowQualScore : . .. ... .. . ... ........ . . . ... ... .... ... . . . ... . .... .. ..... . ........ ........ . . .... . . .... . . .
lowQualScore : 1 99 777 00 1 000 88888888 7 4 2 000 000 0000 000 1 0 8 999 7 9999 22 55555 8 99999999 11111111 5 5 6666 5 9 7777 8 7 0
consensus : CTTGTATAAGGCTA-A--A---A--C-AAT---TTAATA------TTATGTCGTATTTTGAGCAA---AT---T----CT---TCAATATTTCAGTNGTTGACCTTTGAC-CCAATGACCTCAATGAA----TAATACATGTT-----AT-T--------ATTTTATAC----GCA-TGC-CATT----GGTA-ATTTAAAATAAAC----CAATAATGATGGTCAAAAC
Reference ( gi|102940 ) : CTTGTATAAAGCTA-A--A---A--C-AAT---TTAATA------TCATGTCGTATTTTGAGCAA---AT---T----CT---TCAATATTTCAGTTGTTGACCTTTGAC-CAAGTGACCTCAATGAA----TAATACATGTT-----AT-T--------ATTTTA-AC----TCA-TGC-CATT----GGTA-ATTTAAGATAAAC----CAAAAGTGATGGTCAAAGC
gi|102941 : CTTGTATAAGGCTA-A--A---A--C-AAT---TTAATA------CTATGTTCTATTTTTAGCTC---AT---T----CT---TCAATATTTCAGTTGTTGACCTTTGAC-CCAATGACACCAATTTT----TAATACATGTT-----AT-T--------ATTTTATAC----TCA-TGC-CATT----GGTA-ATTTAAAATAAAC----CAATAATGATGGTCAGAA
gi|102942 : CTTGTATAAGGCTA-A--A---A--C-AAT---TTAACA------TTATGTCGGATTTTGAGCAA---AT---T----CT---TCATTATTTCAGTTGTTGACCTTTGAC-TCAATGACCTCAATGAA----TAATACATTTA-----AT-T--------ATTATATAC----GCA-TGC-AATT----AA-A-ATTCACAATAAAA----CAATAGTGATGGTCAAAA
gi|102943 : CTTGTATAAGGCTA-A--A---A--C-AAT---TTAATA------TTATGTCACATTTTGTGCAA---AA---T----CT---TCAATATTTCAGTTGTTGACTT--------ATTAACCTCAATGAA----TAATACATGTT-----AT-T--------ATTTTATAC----ACA-TGC-CATT----GGTG-ATTTGAAATAAAC----TAATAATGATTGTCAAA
gi|102944 : CTTGTATAAGGCTA-A--A---A--C-AAT---TTAATA------TTATGCTCTATTTTGAGCAA---AG---T----CT---TCAATATTTCAGTGTTTGACCTTTGAC-ACACTGACCTCAGTGAA----TATTACATGTT-----AT-T--------GTCTTATAA----GCA-TGC-AATT----ATTG-ATTAAAAATAAAC----CAATAGTGATGGTCAAAAa
gi|102945 : CTTGTATAAGGCTA-A--A---A--C-AAT---TTAAT-------------------TTGAGAAA---TT---T----CT---TCAATATTTCAGTAGGTGACGTTTGAC-CCA-TGACCTCAATGAA----TAATACACGTC-----AT-T--------ATTTTATAC----ACA-TGC-CATT----GGTA-ATTTAAAAAAAATACAACAATAATGATAGTCAA
gi|102946 : CTTGTATCAGGCTA-A--A---A--C-AAT---TTA---------TTATATCGTATTTTGAGAAC---AT---T----CC---TCAATATCTCAGTAGTTGA-CTTTGACTCAAATGGCCTCAATTAA-----AATACATGTT-----AT-T--------ATTTTA-gac
gi|102947 : TATATAAGGTTA-A--A---A--C-AAT---TTGATA------TTATGTCCTATTTTTAGCTA---AC---T----CT---TCAATATTTCAATTGTTTACCTTTGAC-CCAATGACCTCAATGAA----TAATATGTAAT-----AT-T--------ATTGTATAC----ACA-TGT-CATT----GGTA-ATTTAAAATGAAC----CAATAACGATGGTCAAAAta
gi|102953 : ATAAAGCTA-A--A---AAAT-AAT---AAAAGA------ATATGAAATATTTTTAAAAATTCGT---T----CC---TCAATATTTTAATAGTTGACCTTTGAC-CCAATGATCTTAATGAA----TAATACA---T-----AT-T--------ATTTTA-A-----TCA-T----ATTTAAAGATATATTTAAATTGAAT----CA
gi|102952 : ATAAAGCTA-A--A---AA-T-AAT-----AAAA------TAATAT---ATTTTGAACAA---TTCCCT----CC---TCAATATATTACTAGTTGACCTTTGAC-CCAATGACCTTAATGAA----TGATGCATATC-----AT-ttgcagttggtaaaa
gi|102951 : ATAAAGCTA-A--A---AGAT-AAT---AAAAGA------ATATAACATTTTTTGAA-AA---AT---TACCTCC---TCAAAATTTTAATAGTTGACCTTTGAC-CCATTGACCTTAATGAA----TGGTACATGTC-----AT-T--------
gi|102955 : ATAAAACTA-A--A---AA-T-AAT---AAAATA------ATATGACATATTTTAAAAAATC-AC---T----CC---TCCATATTTCACTAGTTGACCTTTGAC-CATATGACCT-----------TGATACA---T-----AT-C--------ATTTTA-
gi|102954 : ATAAAGGTA-A--ACAAA--T-AATAAATTAATA------TGATATA--ATTTTAA-CAT---AT---C----CTCC-TCAATATTTCACTAGTCGACCTTTGAC-TCAATTTCCTTAATGAA----TAATACATATA-----AT-CTGAAGCAAATTTAA-A----------GA-CAT----------ATTTAAAATAAAT----CA
gi|102948 : ATTAAGCTA-AGAA---A--T-AATAAATGAATA------TGA---CATATTTTGAA-AA---AT---C----CCGCCTCAGTATTTTACTAGTTTGCCTTTGAC-CCAATGACCTTAATGAATGTTTAA-GCATATTTAAAAATAT--------ATTTAA-ACTGAATCAGTTC-TATT----GGTA-Agttctgttgttaaaa
gi|102949 : ATAAAGATACA--A---A--CTAAT---AAAAGA------ATACGACATATTTTGAACAT---TTTCCT----CC---TCAATACTTTACTAGTTGACTTTTAAT-CCAATGATCTTAATGAA----AGATACACATC-----AT-C--------A
gi|102950 : ATAAAGCTA-A--A---A--T---T---CTAATAAAAGAAT-ACGACATATTTTGAACAA---TTCCCT----CT---TCAATA---------------TCTGAC-TCAATGACCTTAATGGA----TGATACA---C-----AT-C--------ATGTCATAC----ACA--GT-CAAA----GACATATTTAAAATGAAT----CAagttcatac
gi|102956 : AAGGCTA-A--A---A--C-AAC---TTAATA------TTTTGTCGTAATTTGAGCAA---AT---T----CT---TCAATATTTCA---GTTAACCTTTGAC-CCAATGACCACAATGAA----TAATCAATGTT-----TT-T--------ATTTTATAC----GCA-TGT-CATT----GGTA-ATTTAAAATGAAC----CAATAATGATGGTCAAAAgttctattggtaaaa
gi|102957 : CTA-A--A---A--C-AAT---TTAATA------GTATGTCGTATTTTGAGGAA---AT---T----CT---TCAATATTTCAGTTGTTGACATTTGAC-CCA-TGACCTTAATGAA----TGATATATGTT------T-T--------TTTGTATAC----ACA-TGC-CATT----GGTA-ATTTAAAATAAAC----CAATAATGATGGTCAA
gi|102958 : TA-A--A---A--C-AAT---TTAATA------GTATGTCATATTTTGAGCAA---AT---T----CT---TCAATATTTCAGTTGTTGACCTTTGAC-CCAATGCCCTCATTGAA----TAATTCTTGTT-----AT-T--------ATTTTATAC----TCT-TGT-CATT----GGTA-ATTTAAGATAAAC----CAGTAGCGATGGTCAAAAga
gi|102959 : TA-A--A---A--C-AAT---TTAATA------TTATTTCCTATTTTGAGCAA---AT---T----CT---TCAATATTTCAGACGTTGACCTCT----------------ATGAA----T--TATGT-TT-----AT-T---------TTTCATAC----GCA-TGC-CATT----GGTA-ATTTAAAATAAAC----CAGTAGTGATGATCAAAA
gi|102960 : T---TTAATA------TTATGTCGTATTTTGATCAA---AT---T----CT---TCAATATTTCAGTTGTTGACCTTTGAC-CTAATGACCTCGATGAA----TAATAAAAGTT-----AT-T--------ATTTTATAC----GCA-TGC-CATT----GGTT-ATTTAAAAAAAAC--------AATGATGGTCAAAA
gi|102961 : ---AT---T----AC---TCATTATTTTACTAGTTGACCTTTGAC-CCAATGACATTAATGAA----TGATAT---TC-----AT-C--------ATTTTA-A
gi|102962 : ATATATTAATAGTTGACCTTTGAC-CCAATGACCTTAATGAA----AGCTACAT-T-------T-C--------ATTTTA-A----------GCACATTTAAAGATATATTTAAAATGAAT----CAATTATGTTGGTAAAAagatatatttaacatgaatcagttatattggtaaaa
Alignments
lowQualScore : 2 333 99 2 666 1 888888 1 5 0 555 333 3333 555 333 2 1 0 44 8888888 0 5 0 9999 9 5555
lowQualScore : . ... .. . ... . ...... . . . ... ... .... ... ... . . . .. ....... . . . .... . ....
lowQualScore : 0 555 55 0 000 9 666666 4 6 7 777 222 9999 777 222 7 7 2 55 1111111 3 4 3 1111 4 0000
consensus : CTTGTATAAGGCTA-AA---A--C-AAT---TTAAT-AN-----TATGTCGTATTTTGAGCAA---AT---T----CT---TC---AATATTTCAGTNGTTGACCTTTGACCC-AATGACCTCAATGAATAATACATGTTATT-------ATTTTATACGCATGCCATT----GGTA-ATTTAAAATAAAC----CAATAATGATGGTCAAAAC
Reference ( family-749 ) : CTTGTATAAGGCTA-AA---A--C-AAT---TTAAT-AT-----TATGTCGTATTTTGAGCAA---AT---T----CT---TC---AATATTTCAGTNGTTGACCTTTGACCC-AATGACCTCAATGAATAATACATGTTATT-------ATTTTATACGCATGCCATT----GGTA-ATTTAAAATAAAC----CAATAATGATGGTCAAAAC
gi|102940 : CTTGTATAAAGCTA-AA---A--C-AAT---TTAAT-AT-----CATGTCGTATTTTGAGCAA---AT---T----CT---TC---AATATTTCAGTTGTTGACCTTTGACCA-AGTGACCTCAATGAATAATACATGTTATT-------ATTTTA-ACTCATGCCATT----GGTA-ATTTAAGATAAAC----CAAAAGTGATGGTCAAAGC
gi|102941 : CTTGTATAAGGCTA-AA---A--C-AAT---TTAAT-AC-----TATGTTCTATTTTTAGCTC---AT---T----CT---TC---AATATTTCAGTTGTTGACCTTTGACCC-AATGACACCAATTTTTAATACATGTTATT-------ATTTTATACTCATGCCATT----GGTA-ATTTAAAATAAAC----CAATAATGATGGTCAGAAC
gi|102942 : CTTGTATAAGGCTA-AA---A--C-AAT---TTAAC-AT-----TATGTCGGATTTTGAGCAA---AT---T----CT---TC---ATTATTTCAGTTGTTGACCTTTGACTC-AATGACCTCAATGAATAATACATTTAATT-------ATTATATACGCATGCAATT----AA-A-ATTCACAATAAAA----CAATAGTGATGGTCAAAAC
gi|102943 : CTTGTATAAGGCTA-AA---A--C-AAT---TTAAT-AT-----TATGTCACATTTTGTGCAA---AA---T----CT---TC---AATATTTCAGTTGTTGACTTAT--------TAACCTCAATGAATAATACATGTTATT-------ATTTTATACACATGCCATT----GGTG-ATTTGAAATAAAC----TAATAATGATTGTCAAAA
gi|102944 : CTTGTATAAGGCTA-AA---A--C-AAT---TTAAT-AT-----TATGCTCTATTTTGAGCAA---AG---T----CT---TC---AATATTTCAGTGTTTGACCTTTGACAC-ACTGACCTCAGTGAATATTACATGTTATT-------GTCTTATAAGCATGCAATT----ATTG-ATTAAAAATAAAC----CAATAGTGATGGTCAAAAC
gi|102945 : CTTGTATAAGGCTA-AA---A--C-AAT---TTAAT-------------------TTGAGAAA---TT---T----CT---TC---AATATTTCAGTAGGTGACGTTTGACCC-A-TGACCTCAATGAATAATACACGTCATT-------ATTTTATACACATGCCATT----GGTA-ATTTAAAAAAAATACAACAATAATGATAGTCAAGAC
gi|102946 : CTTGTATCAGGCTA-AA---A--C-AAT---TTA----T-----TATATCGTATTTTGAGAAC---AT---T----CC---TC---AATATCTCAGTAGTTGA-CTTTGACTCAAATGGCCTCAATTAA-AATACATGTTATT-------ATTTTATA
gi|102947 : TATATAAGGTTA-AA---A--C-AAT---TTGAT-AT-----TATGTCCTATTTTTAGCTA---AC---T----CT---TC---AATATTTCAATTGTTTACCTTTGACCC-AATGACCTCAATGAATAATATGTAATATT-------ATTGTATACACATGTCATT----GGTA-ATTTAAAATGAAC----CAATAACGATGGTCAAAAC
gi|102948 : ATTAAGCTA-AG---A----AATAA-TAAATGAA-----TATGACATATTTTGAA-AA---AT---C----CCGCCTC---AGTATTTTACTAGTTTGCCTTTGACCC-AATGACCTTAATGAAT
gi|102949 : ATAAAGATACAA---A--CTAAT---AAAAG-AA-----TACGACATATTTTGAACAT---TT---T----CC---TCCTCAATACTTTACTAGTTGACTTTTAATCC-AATGATCTTAATGAAAGATACACATCATCA------AGTTCATACgtttaagcatatttaaaaatatatttaaactgaatcagttctattggtaa
gi|102950 : ATAAAGCTA-AA---A--T---T---CTAAT-AAAAGAATACGACATATTTTGAACAA---TT---C----CC---TC--------TTCAATA-------TCTGACTC-AATGACCTTAATGGATGATACA---CATC-------ATGTCATACACA-GTCAAA----GACATATTTAAAATGAAT----CAGTTCTATTGGTAAAA
gi|102951 : ATAAAGCTA-AA---AGAT-AAT---AAAAG-AA-----TATAACATTTTTTGAA-AA---AT---TACCTCC---TC---AAAATTTTAATAGTTGACCTTTGACCC-ATTGACCTTAATGAATGGTACATGTCATT-------
gi|102952 : ATAAAGCTA-AA---AA-T-AAT---AAAAT-AA-----TAT-----ATTTTGAACAA---TTCCCT----CC---TC---AATATATTACTAGTTGACCTTTGACCC-AATGACCTTAATGAATGATGCATATCAT
gi|102953 : ATAAAGCTA-AA---AAAT-AAT---AAAAG-AA-----TATGAAATATTTTTAAAAATTCGT---T----CC---TC---AATATTTTAATAGTTGACCTTTGACCC-AATGATCTTAATGAATAATACA---TATT-------ATTTTA-AT-CAT---ATTTAAAGATATATTTAAATTGAAT----CA
gi|102954 : ATAAAGGTA-AACAAA--T-AATAAATTAAT-AT-----GATATA--ATTTTAA-CAT---AT---C----CTCC-TC---AATATTTCACTAGTCGACCTTTGACTC-AATTTCCTTAATGAATAATACATATAATCTGAAGCAAATTTAAAGACAT---------------ATTTAAAATAAAT----CAGTTCTG-TTGTTAAAAttgcagttggtaaaa
gi|102955 : ATAAAACTA-AA---AA-T-AAT---AAAAT-AA-----TATGACATATTTTAAAAAATC-AC---T----CC---TC---CATATTTCACTAGTTGACCTTTGACCA-TATGACCT-------TGATACA---TATC-------ATTTTA
gi|102956 : AAGGCTA-AA---A--C-AAC---TTAAT-AT-----TTTGTCGTAATTTGAGCAA---AT---T----CT---TC---AATATTTCAGT---TAACCTTTGACCC-AATGACCACAATGAATAATCAATGTTTTT-------ATTTTATACGCATGTCATT----GGTA-ATTTAAAATGAAC----CAATAATGATGGTCAAAAC
gi|102957 : CTA-AA---A--C-AAT---TTAAT-AG-----TATGTCGTATTTTGAGGAA---AT---T----CT---TC---AATATTTCAGTTGTTGACATTTGACCC--ATGACCTTAATGAATGATATATGTT-TT-------TTTGTATACACATGCCATT----GGTA-ATTTAAAATAAAC----CAATAATGATGGTCAAGA
gi|102958 : TA-AA---A--C-AAT---TTAAT-AG-----TATGTCATATTTTGAGCAA---AT---T----CT---TC---AATATTTCAGTTGTTGACCTTTGACCC-AATGCCCTCATTGAATAATTCTTGTTATT-------ATTTTATACTCTTGTCATT----GGTA-ATTTAAGATAAAC----CAGTAGCGATGGTCAAAAC
gi|102959 : TA-AA---A--C-AAT---TTAAT-AT-----TATTTCCTATTTTGAGCAA---AT---T----CT---TC---AATATTTCAGACGTTGACCTCT----------------ATGAAT--TATGT-TTATT--------TTTCATACGCATGCCATT----GGTA-ATTTAAAATAAAC----CAGTAGTGATGATCAAAAC
gi|102960 : T---TTAAT-AT-----TATGTCGTATTTTGATCAA---AT---T----CT---TC---AATATTTCAGTTGTTGACCTTTGACCT-AATGACCTCGATGAATAATAAAAGTTATT-------ATTTTATACGCATGCCATT----GGTT-ATTTAAAAAAAAC--------AATGATGGTCAAAAC
gi|102961 : ---AT---T----AC---TC---ATTATTTTACTAGTTGACCTTTGACCC-AATGACATTAATGAATGATAT---TCATC-------ATTTTAAA---------------GATATATTTAACATGAAT----CAGTTATATTGGTAAAA
gi|102962 : ATATATTAATAGTTGACCTTTGACCC-AATGACCTTAATGAAAGCTACAT-T--TC-------ATTTTAAGCACAT----TTAAA-GATATATTTAAAATGAAT----CAATTATGTTGGTAAAAA
Alignments
lowQualScore : 2 99 2 33333 22 1 666666 2 4 0 555 333 3333 555 333 2 1 0 44 8888888 0 5 0 9999 9 5555
lowQualScore : . .. . ..... .. . ...... . . . ... ... .... ... ... . . . .. ....... . . . .... . ....
lowQualScore : 0 55 0 11111 66 9 444444 7 0 7 777 222 9999 777 222 7 7 2 55 1111111 3 4 3 1111 4 0000
consensus : CTTGTATAAGGCTA-AAA--C-AAT--T--TAA--T-AN-----TATGTCGTATTTTGAGCAA---AT---T----CT---TC---AATATTTCAGTNGTTGACCTTTGACCC-AATGACCTCAATGAATAATACATGTTATT-------ATTTTATACGCATGCCATT----GGTA-ATTTAAAATAAAC----CAATAATGATGGTCAAAAC
Reference ( family-749 ) : CTTGTATAAGGCTA-AAA--C-AAT--T--TAA--T-AN-----TATGTCGTATTTTGAGCAA---AT---T----CT---TC---AATATTTCAGTNGTTGACCTTTGACCC-AATGACCTCAATGAATAATACATGTTATT-------ATTTTATACGCATGCCATT----GGTA-ATTTAAAATAAAC----CAATAATGATGGTCAAAAC
gi|102940 : CTTGTATAAAGCTA-AAA--C-AAT--T--TAA--T-AT-----CATGTCGTATTTTGAGCAA---AT---T----CT---TC---AATATTTCAGTTGTTGACCTTTGACCA-AGTGACCTCAATGAATAATACATGTTATT-------ATTTTA-ACTCATGCCATT----GGTA-ATTTAAGATAAAC----CAAAAGTGATGGTCAAAGC
gi|102941 : CTTGTATAAGGCTA-AAA--C-AAT--T--TAA--T-AC-----TATGTTCTATTTTTAGCTC---AT---T----CT---TC---AATATTTCAGTTGTTGACCTTTGACCC-AATGACACCAATTTTTAATACATGTTATT-------ATTTTATACTCATGCCATT----GGTA-ATTTAAAATAAAC----CAATAATGATGGTCAGAAC
gi|102942 : CTTGTATAAGGCTA-AAA--C-AAT--T--TAA--C-AT-----TATGTCGGATTTTGAGCAA---AT---T----CT---TC---ATTATTTCAGTTGTTGACCTTTGACTC-AATGACCTCAATGAATAATACATTTAATT-------ATTATATACGCATGCAATT----AA-A-ATTCACAATAAAA----CAATAGTGATGGTCAAAAC
gi|102943 : CTTGTATAAGGCTA-AAA--C-AAT--T--TAA--T-AT-----TATGTCACATTTTGTGCAA---AA---T----CT---TC---AATATTTCAGTTGTTGACTTAT--------TAACCTCAATGAATAATACATGTTATT-------ATTTTATACACATGCCATT----GGTG-ATTTGAAATAAAC----TAATAATGATTGTCAAAA
gi|102944 : CTTGTATAAGGCTA-AAA--C-AAT--T--TAA--T-AT-----TATGCTCTATTTTGAGCAA---AG---T----CT---TC---AATATTTCAGTGTTTGACCTTTGACAC-ACTGACCTCAGTGAATATTACATGTTATT-------GTCTTATAAGCATGCAATT----ATTG-ATTAAAAATAAAC----CAATAGTGATGGTCAAAAC
gi|102945 : CTTGTATAAGGCTA-AAA--C-AAT--T--TAA--T-------------------TTGAGAAA---TT---T----CT---TC---AATATTTCAGTAGGTGACGTTTGACCC-A-TGACCTCAATGAATAATACACGTCATT-------ATTTTATACACATGCCATT----GGTA-ATTTAAAAAAAATACAACAATAATGATAGTCAAGAC
gi|102946 : CTTGTATCAGGCTA-AAA--C-AAT--T--TA------T-----TATATCGTATTTTGAGAAC---AT---T----CC---TC---AATATCTCAGTAGTTGA-CTTTGACTCAAATGGCCTCAATTAA-AATACATGTTATT-------ATTTTATA
gi|102947 : TATATAAGGTTA-AAA--C-AAT--T--TGA--T-AT-----TATGTCCTATTTTTAGCTA---AC---T----CT---TC---AATATTTCAATTGTTTACCTTTGACCC-AATGACCTCAATGAATAATATGTAATATT-------ATTGTATACACATGTCATT----GGTA-ATTTAAAATGAAC----CAATAACGATGGTCAAAAC
gi|102948 : ATTAAGCTA-AGA----AATAAT--AAA--TGAA-----TATGACATATTTTGAA-AA---AT---C----CCGCCTC---AGTATTTTACTAGTTTGCCTTTGACCC-AATGACCTTAATGAAT
gi|102949 : ATAAAGATACAAA--CTAAT--A--AAA--G-AA-----TACGACATATTTTGAACAT---TT---T----CC---TCCTCAATACTTTACTAGTTGACTTTTAATCC-AATGATCTTAATGAAAGATACACATCATCA------AGTTCATACgtttaagcatatttaaaaatatatttaaactgaatcagttctattggtaa
gi|102950 : ATAAAGCTA-AAA--T---T--C--TAA--T-AAAAGAATACGACATATTTTGAACAA---TT---C----CC---TC--------TTCAATA-------TCTGACTC-AATGACCTTAATGGATGATACA---CATC-------ATGTCATACACA-GTCAAA----GACATATTTAAAATGAAT----CAGTTCTATTGGTAAAA
gi|102951 : ATAAAGCTA-AAAGAT-AAT--A--AAA--G-AA-----TATAACATTTTTTGAA-AA---AT---TACCTCC---TC---AAAATTTTAATAGTTGACCTTTGACCC-ATTGACCTTAATGAATGGTACATGTCATT-------
gi|102952 : ATAAAGCTA-AAAA-T-AAT--A--AAA--T-AA-----TAT-----ATTTTGAACAA---TTCCCT----CC---TC---AATATATTACTAGTTGACCTTTGACCC-AATGACCTTAATGAATGATGCATATCAT
gi|102953 : ATAAAGCTA-AAAAAT-AAT--A--AAA--G-AA-----TATGAAATATTTTTAAAAATTCGT---T----CC---TC---AATATTTTAATAGTTGACCTTTGACCC-AATGATCTTAATGAATAATACA---TATT-------ATTTTA-AT-CAT---ATTTAAAGATATATTTAAATTGAAT----CA
gi|102954 : ATAAAGGTA-AA---C-AAA--TAATAAATT-AA-----TATGATATAATTTTAACAT---AT---C----CTCC-TC---AATATTTCACTAGTCGACCTTTGACTC-AATTTCCTTAATGAATAATACATATAATCTGAAGCAAATTTAAAGACAT---------------ATTTAAAATAAAT----CAGTTCTG-TTGTTAAAAttgcagttggtaaaa
gi|102955 : ATAAAACTA-AAAA-T-AAT--A--AAA--T-AA-----TATGACATATTTTAAAAAATC-AC---T----CC---TC---CATATTTCACTAGTTGACCTTTGACCA-TATGACCT-------TGATACA---TATC-------ATTTTA
gi|102956 : AAGGCTA-AAA--C-AAC--T--TAA--T-AT-----TTTGTCGTAATTTGAGCAA---AT---T----CT---TC---AATATTTCAGT---TAACCTTTGACCC-AATGACCACAATGAATAATCAATGTTTTT-------ATTTTATACGCATGTCATT----GGTA-ATTTAAAATGAAC----CAATAATGATGGTCAAAAC
gi|102957 : CTA-AAA--C-AAT--T--TAA--T-AG-----TATGTCGTATTTTGAGGAA---AT---T----CT---TC---AATATTTCAGTTGTTGACATTTGACCC--ATGACCTTAATGAATGATATATGTT-TT-------TTTGTATACACATGCCATT----GGTA-ATTTAAAATAAAC----CAATAATGATGGTCAAGA
gi|102958 : TA-AAA--C-AAT--T--TAA--T-AG-----TATGTCATATTTTGAGCAA---AT---T----CT---TC---AATATTTCAGTTGTTGACCTTTGACCC-AATGCCCTCATTGAATAATTCTTGTTATT-------ATTTTATACTCTTGTCATT----GGTA-ATTTAAGATAAAC----CAGTAGCGATGGTCAAAAC
gi|102959 : TA-AAA--C-AAT--T--TAA--T-AT-----TATTTCCTATTTTGAGCAA---AT---T----CT---TC---AATATTTCAGACGTTGACCTCT----------------ATGAAT--TATGT-TTATT--------TTTCATACGCATGCCATT----GGTA-ATTTAAAATAAAC----CAGTAGTGATGATCAAAAC
gi|102960 : T--T--TAA--T-AT-----TATGTCGTATTTTGATCAA---AT---T----CT---TC---AATATTTCAGTTGTTGACCTTTGACCT-AATGACCTCGATGAATAATAAAAGTTATT-------ATTTTATACGCATGCCATT----GGTT-ATTTAAAAAAAAC--------AATGATGGTCAAAAC
gi|102961 : ---AT---T----AC---TC---ATTATTTTACTAGTTGACCTTTGACCC-AATGACATTAATGAATGATAT---TCATC-------ATTTTAAA---------------GATATATTTAACATGAAT----CAGTTATATTGGTAAAA
gi|102962 : ATATATTAATAGTTGACCTTTGACCC-AATGACCTTAATGAAAGCTACAT-T--TC-------ATTTTAAGCACAT----TTAAA-GATATATTTAAAATGAAT----CAATTATGTTGGTAAAAA
Alignments
lowQualScore : 2 99 2 33333 22 1 666666 2 4 0 555 333 3333 555 333 2 1 0 44 8888888 0 5 0 9999 9 5555
lowQualScore : . .. . ..... .. . ...... . . . ... ... .... ... ... . . . .. ....... . . . .... . ....
lowQualScore : 0 55 0 11111 66 9 444444 7 0 7 777 222 9999 777 222 7 7 2 55 1111111 3 4 3 1111 4 0000
consensus : CTTGTATAAGGCTA-AAA--C-AAT--T--TAA--T-AN-----TATGTCGTATTTTGAGCAA---AT---T----CT---TC---AATATTTCAGTNGTTGACCTTTGACCC-AATGACCTCAATGAATAATACATGTTATT-------ATTTTATACGCATGCCATT----GGTA-ATTTAAAATAAAC----CAATAATGATGGTCAAAAC
Reference ( family-749 ) : CTTGTATAAGGCTA-AAA--C-AAT--T--TAA--T-AN-----TATGTCGTATTTTGAGCAA---AT---T----CT---TC---AATATTTCAGTNGTTGACCTTTGACCC-AATGACCTCAATGAATAATACATGTTATT-------ATTTTATACGCATGCCATT----GGTA-ATTTAAAATAAAC----CAATAATGATGGTCAAAAC
gi|102940 : CTTGTATAAAGCTA-AAA--C-AAT--T--TAA--T-AT-----CATGTCGTATTTTGAGCAA---AT---T----CT---TC---AATATTTCAGTTGTTGACCTTTGACCA-AGTGACCTCAATGAATAATACATGTTATT-------ATTTTA-ACTCATGCCATT----GGTA-ATTTAAGATAAAC----CAAAAGTGATGGTCAAAGC
gi|102941 : CTTGTATAAGGCTA-AAA--C-AAT--T--TAA--T-AC-----TATGTTCTATTTTTAGCTC---AT---T----CT---TC---AATATTTCAGTTGTTGACCTTTGACCC-AATGACACCAATTTTTAATACATGTTATT-------ATTTTATACTCATGCCATT----GGTA-ATTTAAAATAAAC----CAATAATGATGGTCAGAAC
gi|102942 : CTTGTATAAGGCTA-AAA--C-AAT--T--TAA--C-AT-----TATGTCGGATTTTGAGCAA---AT---T----CT---TC---ATTATTTCAGTTGTTGACCTTTGACTC-AATGACCTCAATGAATAATACATTTAATT-------ATTATATACGCATGCAATT----AA-A-ATTCACAATAAAA----CAATAGTGATGGTCAAAAC
gi|102943 : CTTGTATAAGGCTA-AAA--C-AAT--T--TAA--T-AT-----TATGTCACATTTTGTGCAA---AA---T----CT---TC---AATATTTCAGTTGTTGACTTAT--------TAACCTCAATGAATAATACATGTTATT-------ATTTTATACACATGCCATT----GGTG-ATTTGAAATAAAC----TAATAATGATTGTCAAAA
gi|102944 : CTTGTATAAGGCTA-AAA--C-AAT--T--TAA--T-AT-----TATGCTCTATTTTGAGCAA---AG---T----CT---TC---AATATTTCAGTGTTTGACCTTTGACAC-ACTGACCTCAGTGAATATTACATGTTATT-------GTCTTATAAGCATGCAATT----ATTG-ATTAAAAATAAAC----CAATAGTGATGGTCAAAAC
gi|102945 : CTTGTATAAGGCTA-AAA--C-AAT--T--TAA--T-------------------TTGAGAAA---TT---T----CT---TC---AATATTTCAGTAGGTGACGTTTGACCC-A-TGACCTCAATGAATAATACACGTCATT-------ATTTTATACACATGCCATT----GGTA-ATTTAAAAAAAATACAACAATAATGATAGTCAAGAC
gi|102946 : CTTGTATCAGGCTA-AAA--C-AAT--T--TA------T-----TATATCGTATTTTGAGAAC---AT---T----CC---TC---AATATCTCAGTAGTTGA-CTTTGACTCAAATGGCCTCAATTAA-AATACATGTTATT-------ATTTTATA
gi|102947 : TATATAAGGTTA-AAA--C-AAT--T--TGA--T-AT-----TATGTCCTATTTTTAGCTA---AC---T----CT---TC---AATATTTCAATTGTTTACCTTTGACCC-AATGACCTCAATGAATAATATGTAATATT-------ATTGTATACACATGTCATT----GGTA-ATTTAAAATGAAC----CAATAACGATGGTCAAAAC
gi|102948 : ATTAAGCTA-AGA----AATAAT--AAA--TGAA-----TATGACATATTTTGAA-AA---AT---C----CCGCCTC---AGTATTTTACTAGTTTGCCTTTGACCC-AATGACCTTAATGAAT
gi|102949 : ATAAAGATACAAA--CTAAT--A--AAA--G-AA-----TACGACATATTTTGAACAT---TT---T----CC---TCCTCAATACTTTACTAGTTGACTTTTAATCC-AATGATCTTAATGAAAGATACACATCATCA------AGTTCATACgtttaagcatatttaaaaatatatttaaactgaatcagttctattggtaa
gi|102950 : ATAAAGCTA-AAA--T---T--C--TAA--T-AAAAGAATACGACATATTTTGAACAA---TT---C----CC---TC--------TTCAATA-------TCTGACTC-AATGACCTTAATGGATGATACA---CATC-------ATGTCATACACA-GTCAAA----GACATATTTAAAATGAAT----CAGTTCTATTGGTAAAA
gi|102951 : ATAAAGCTA-AAAGAT-AAT--A--AAA--G-AA-----TATAACATTTTTTGAA-AA---AT---TACCTCC---TC---AAAATTTTAATAGTTGACCTTTGACCC-ATTGACCTTAATGAATGGTACATGTCATT-------
gi|102952 : ATAAAGCTA-AAAA-T-AAT--A--AAA--T-AA-----TAT-----ATTTTGAACAA---TTCCCT----CC---TC---AATATATTACTAGTTGACCTTTGACCC-AATGACCTTAATGAATGATGCATATCAT
gi|102953 : ATAAAGCTA-AAAAAT-AAT--A--AAA--G-AA-----TATGAAATATTTTTAAAAATTCGT---T----CC---TC---AATATTTTAATAGTTGACCTTTGACCC-AATGATCTTAATGAATAATACA---TATT-------ATTTTA-AT-CAT---ATTTAAAGATATATTTAAATTGAAT----CA
gi|102954 : ATAAAGGTA-AA---C-AAA--TAATAAATT-AA-----TATGATATAATTTTAACAT---AT---C----CTCC-TC---AATATTTCACTAGTCGACCTTTGACTC-AATTTCCTTAATGAATAATACATATAATCTGAAGCAAATTTAAAGACAT---------------ATTTAAAATAAAT----CAGTTCTG-TTGTTAAAAttgcagttggtaaaa
gi|102955 : ATAAAACTA-AAAA-T-AAT--A--AAA--T-AA-----TATGACATATTTTAAAAAATC-AC---T----CC---TC---CATATTTCACTAGTTGACCTTTGACCA-TATGACCT-------TGATACA---TATC-------ATTTTA
gi|102956 : AAGGCTA-AAA--C-AAC--T--TAA--T-AT-----TTTGTCGTAATTTGAGCAA---AT---T----CT---TC---AATATTTCAGT---TAACCTTTGACCC-AATGACCACAATGAATAATCAATGTTTTT-------ATTTTATACGCATGTCATT----GGTA-ATTTAAAATGAAC----CAATAATGATGGTCAAAAC
gi|102957 : CTA-AAA--C-AAT--T--TAA--T-AG-----TATGTCGTATTTTGAGGAA---AT---T----CT---TC---AATATTTCAGTTGTTGACATTTGACCC--ATGACCTTAATGAATGATATATGTT-TT-------TTTGTATACACATGCCATT----GGTA-ATTTAAAATAAAC----CAATAATGATGGTCAAGA
gi|102958 : TA-AAA--C-AAT--T--TAA--T-AG-----TATGTCATATTTTGAGCAA---AT---T----CT---TC---AATATTTCAGTTGTTGACCTTTGACCC-AATGCCCTCATTGAATAATTCTTGTTATT-------ATTTTATACTCTTGTCATT----GGTA-ATTTAAGATAAAC----CAGTAGCGATGGTCAAAAC
gi|102959 : TA-AAA--C-AAT--T--TAA--T-AT-----TATTTCCTATTTTGAGCAA---AT---T----CT---TC---AATATTTCAGACGTTGACCTCT----------------ATGAAT--TATGT-TTATT--------TTTCATACGCATGCCATT----GGTA-ATTTAAAATAAAC----CAGTAGTGATGATCAAAAC
gi|102960 : T--T--TAA--T-AT-----TATGTCGTATTTTGATCAA---AT---T----CT---TC---AATATTTCAGTTGTTGACCTTTGACCT-AATGACCTCGATGAATAATAAAAGTTATT-------ATTTTATACGCATGCCATT----GGTT-ATTTAAAAAAAAC--------AATGATGGTCAAAAC
gi|102961 : ---AT---T----AC---TC---ATTATTTTACTAGTTGACCTTTGACCC-AATGACATTAATGAATGATAT---TCATC-------ATTTTAAA---------------GATATATTTAACATGAAT----CAGTTATATTGGTAAAA
gi|102962 : ATATATTAATAGTTGACCTTTGACCC-AATGACCTTAATGAAAGCTACAT-T--TC-------ATTTTAAGCACAT----TTAAA-GATATATTTAAAATGAAT----CAATTATGTTGGTAAAAA
blockSeqs : C GA T AAT AT G AAAGAA T C TTC CCC ACCT GCC CTC T A TG TGAAGCA T TAAA T ACAA
blockSeqs : . AA . TAA . . C T G TC . . CC . T . TT A G AAA T .
blockSeqs : . A . T . . T T A . . . . . T . TG . A . T .
blockSeqs : . A . T . . T C C . . . . . G . TG . G . T .
blockSeqs : . . . T . . T T G . . . . . A . CG . A . . .
blockSeqs : . . . T . . T T C . . . . . A . TG . A . . .
blockSeqs : . . . T . . T A A . . . . . T . TA . A . . .
blockSeqs : . . . T . . A A A . . . . . A . CA . A . . .
blockSeqs : . . . T . . A A A . . . . . A . TG . G . . .
blockSeqs : . . . A . . A A A . . . . . A . TA . A . . .
blockSeqs : . . . C . . A A A . . . . . A . TA . T . . .
blockSeqs : . . . A . . A A A . . . . . A . TG . G . . .
blockSeqs : . . . A . . A A A . . . . . A . TG . G . . .
blockSeqs : . . . A . . A T G . . . . . A . TG . A . . .
blockSeqs : . . . A . . T T G . . . . . A . AG . . . . .
blockSeqs : . . . T . . G T A . . . . . T . T . . . . .
blockSeqs : . . . T . . G T C . . . . . T . T .
blockSeqs : . . . T . . T T G . . . . . C . . .
blockSeqs : . . . T . . T . . . . . . . T . . .
blockSeqs : T . . . . . . . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . A . .
blockSeqs : . .
blockSeqCons :
originalCons : CTTGTATAAGGCTA-AAA--C-AAT--T--TAA--T-AN-----TATGTCGTATTTTGAGCAA---AT---T----CT---TC---AATATTTCAGTNGTTGACCTTTGACCC-AATGACCTCAATGAATAATACATGTTATT-------ATTTTATACGCATGCCATT----GGTA-ATTTAAAATAAAC----CAATAATGATGGTCAAAAC
finalCons : CTTGTATAAGGCTA-AAA--C-AAT--T--TAA--T-AN-----TATGTCGTATTTTGAGCAA---AT---T----CT---TC---AATATTTCAGTNGTTGACCTTTGACCC-AATGACCTCAATGAATAATACATGTTATT-------ATTTTATACGCATGCCATT----GGTA-ATTTAAAATAAAC----CAATAATGATGGTCAAAAC
Alignments
lowQualScore : 2 99 2 33333 22 1 666666 2 4 0 555 333 3333 555 333 2 1 0 44 8888888 0 5 0 9999 9 5555
lowQualScore : . .. . ..... .. . ...... . . . ... ... .... ... ... . . . .. ....... . . . .... . ....
lowQualScore : 0 55 0 11111 66 9 444444 7 0 7 777 222 9999 777 222 7 7 2 55 1111111 3 4 3 1111 4 0000
consensus : CTTGTATAAGGCTA-AAA--C-AAT--T--TAA--T-AN-----TATGTCGTATTTTGAGCAA---AT---T----CT---TC---AATATTTCAGTNGTTGACCTTTGACCC-AATGACCTCAATGAATAATACATGTTATT-------ATTTTATACGCATGCCATT----GGTA-ATTTAAAATAAAC----CAATAATGATGGTCAAAAC
Reference ( family-749 ) : CTTGTATAAGGCTA-AAA--C-AAT--T--TAA--T-AN-----TATGTCGTATTTTGAGCAA---AT---T----CT---TC---AATATTTCAGTNGTTGACCTTTGACCC-AATGACCTCAATGAATAATACATGTTATT-------ATTTTATACGCATGCCATT----GGTA-ATTTAAAATAAAC----CAATAATGATGGTCAAAAC
gi|102940 : CTTGTATAAAGCTA-AAA--C-AAT--T--TAA--T-AT-----CATGTCGTATTTTGAGCAA---AT---T----CT---TC---AATATTTCAGTTGTTGACCTTTGACCA-AGTGACCTCAATGAATAATACATGTTATT-------ATTTTA-ACTCATGCCATT----GGTA-ATTTAAGATAAAC----CAAAAGTGATGGTCAAAGC
gi|102941 : CTTGTATAAGGCTA-AAA--C-AAT--T--TAA--T-AC-----TATGTTCTATTTTTAGCTC---AT---T----CT---TC---AATATTTCAGTTGTTGACCTTTGACCC-AATGACACCAATTTTTAATACATGTTATT-------ATTTTATACTCATGCCATT----GGTA-ATTTAAAATAAAC----CAATAATGATGGTCAGAAC
gi|102942 : CTTGTATAAGGCTA-AAA--C-AAT--T--TAA--C-AT-----TATGTCGGATTTTGAGCAA---AT---T----CT---TC---ATTATTTCAGTTGTTGACCTTTGACTC-AATGACCTCAATGAATAATACATTTAATT-------ATTATATACGCATGCAATT----AA-A-ATTCACAATAAAA----CAATAGTGATGGTCAAAAC
gi|102943 : CTTGTATAAGGCTA-AAA--C-AAT--T--TAA--T-AT-----TATGTCACATTTTGTGCAA---AA---T----CT---TC---AATATTTCAGTTGTTGACTTAT--------TAACCTCAATGAATAATACATGTTATT-------ATTTTATACACATGCCATT----GGTG-ATTTGAAATAAAC----TAATAATGATTGTCAAAA
gi|102944 : CTTGTATAAGGCTA-AAA--C-AAT--T--TAA--T-AT-----TATGCTCTATTTTGAGCAA---AG---T----CT---TC---AATATTTCAGTGTTTGACCTTTGACAC-ACTGACCTCAGTGAATATTACATGTTATT-------GTCTTATAAGCATGCAATT----ATTG-ATTAAAAATAAAC----CAATAGTGATGGTCAAAAC
gi|102945 : CTTGTATAAGGCTA-AAA--C-AAT--T--TAA--T-------------------TTGAGAAA---TT---T----CT---TC---AATATTTCAGTAGGTGACGTTTGACCC-A-TGACCTCAATGAATAATACACGTCATT-------ATTTTATACACATGCCATT----GGTA-ATTTAAAAAAAATACAACAATAATGATAGTCAAGAC
gi|102946 : CTTGTATCAGGCTA-AAA--C-AAT--T--TA------T-----TATATCGTATTTTGAGAAC---AT---T----CC---TC---AATATCTCAGTAGTTGA-CTTTGACTCAAATGGCCTCAATTAA-AATACATGTTATT-------ATTTTATA
gi|102947 : TATATAAGGTTA-AAA--C-AAT--T--TGA--T-AT-----TATGTCCTATTTTTAGCTA---AC---T----CT---TC---AATATTTCAATTGTTTACCTTTGACCC-AATGACCTCAATGAATAATATGTAATATT-------ATTGTATACACATGTCATT----GGTA-ATTTAAAATGAAC----CAATAACGATGGTCAAAAC
gi|102948 : ATTAAGCTA-AGA----AATAAT--AAA--TGAA-----TATGACATATTTTGAA-AA---AT---C----CCGCCTC---AGTATTTTACTAGTTTGCCTTTGACCC-AATGACCTTAATGAAT
gi|102949 : ATAAAGATACAAA--CTAAT--A--AAA--G-AA-----TACGACATATTTTGAACAT---TT---T----CC---TCCTCAATACTTTACTAGTTGACTTTTAATCC-AATGATCTTAATGAAAGATACACATCATCA------AGTTCATACgtttaagcatatttaaaaatatatttaaactgaatcagttctattggtaa
gi|102950 : ATAAAGCTA-AAA--T---T--C--TAA--T-AAAAGAATACGACATATTTTGAACAA---TT---C----CC---TC--------TTCAATA-------TCTGACTC-AATGACCTTAATGGATGATACA---CATC-------ATGTCATACACA-GTCAAA----GACATATTTAAAATGAAT----CAGTTCTATTGGTAAAA
gi|102951 : ATAAAGCTA-AAAGAT-AAT--A--AAA--G-AA-----TATAACATTTTTTGAA-AA---AT---TACCTCC---TC---AAAATTTTAATAGTTGACCTTTGACCC-ATTGACCTTAATGAATGGTACATGTCATT-------
gi|102952 : ATAAAGCTA-AAAA-T-AAT--A--AAA--T-AA-----TAT-----ATTTTGAACAA---TTCCCT----CC---TC---AATATATTACTAGTTGACCTTTGACCC-AATGACCTTAATGAATGATGCATATCAT
gi|102953 : ATAAAGCTA-AAAAAT-AAT--A--AAA--G-AA-----TATGAAATATTTTTAAAAATTCGT---T----CC---TC---AATATTTTAATAGTTGACCTTTGACCC-AATGATCTTAATGAATAATACA---TATT-------ATTTTA-AT-CAT---ATTTAAAGATATATTTAAATTGAAT----CA
gi|102954 : ATAAAGGTA-AA---C-AAA--TAATAAATT-AA-----TATGATATAATTTTAACAT---AT---C----CTCC-TC---AATATTTCACTAGTCGACCTTTGACTC-AATTTCCTTAATGAATAATACATATAATCTGAAGCAAATTTAAAGACAT---------------ATTTAAAATAAAT----CAGTTCTG-TTGTTAAAAttgcagttggtaaaa
gi|102955 : ATAAAACTA-AAAA-T-AAT--A--AAA--T-AA-----TATGACATATTTTAAAAAATC-AC---T----CC---TC---CATATTTCACTAGTTGACCTTTGACCA-TATGACCT-------TGATACA---TATC-------ATTTTA
gi|102956 : AAGGCTA-AAA--C-AAC--T--TAA--T-AT-----TTTGTCGTAATTTGAGCAA---AT---T----CT---TC---AATATTTCAGT---TAACCTTTGACCC-AATGACCACAATGAATAATCAATGTTTTT-------ATTTTATACGCATGTCATT----GGTA-ATTTAAAATGAAC----CAATAATGATGGTCAAAAC
gi|102957 : CTA-AAA--C-AAT--T--TAA--T-AG-----TATGTCGTATTTTGAGGAA---AT---T----CT---TC---AATATTTCAGTTGTTGACATTTGACCC--ATGACCTTAATGAATGATATATGTT-TT-------TTTGTATACACATGCCATT----GGTA-ATTTAAAATAAAC----CAATAATGATGGTCAAGA
gi|102958 : TA-AAA--C-AAT--T--TAA--T-AG-----TATGTCATATTTTGAGCAA---AT---T----CT---TC---AATATTTCAGTTGTTGACCTTTGACCC-AATGCCCTCATTGAATAATTCTTGTTATT-------ATTTTATACTCTTGTCATT----GGTA-ATTTAAGATAAAC----CAGTAGCGATGGTCAAAAC
gi|102959 : TA-AAA--C-AAT--T--TAA--T-AT-----TATTTCCTATTTTGAGCAA---AT---T----CT---TC---AATATTTCAGACGTTGACCTCT----------------ATGAAT--TATGT-TTATT--------TTTCATACGCATGCCATT----GGTA-ATTTAAAATAAAC----CAGTAGTGATGATCAAAAC
gi|102960 : T--T--TAA--T-AT-----TATGTCGTATTTTGATCAA---AT---T----CT---TC---AATATTTCAGTTGTTGACCTTTGACCT-AATGACCTCGATGAATAATAAAAGTTATT-------ATTTTATACGCATGCCATT----GGTT-ATTTAAAAAAAAC--------AATGATGGTCAAAAC
gi|102961 : ---AT---T----AC---TC---ATTATTTTACTAGTTGACCTTTGACCC-AATGACATTAATGAATGATAT---TCATC-------ATTTTAAA---------------GATATATTTAACATGAAT----CAGTTATATTGGTAAAA
gi|102962 : ATATATTAATAGTTGACCTTTGACCC-AATGACCTTAATGAAAGCTACAT-T--TC-------ATTTTAAGCACAT----TTAAA-GATATATTTAAAATGAAT----CAATTATGTTGGTAAAAA