lowQualScore : 1 1 11 11 1111111111 111 1 11111 1
lowQualScore : 1 3 2 1 8 6 33 444 77 4 2 6 2 2 11 55 22 6666666666 22 22 2 777 555555 55555 2 2 5 2 8888 3 33 8 33333 1 7 6
lowQualScore : . . . . . . .. ... .. . . . . . .. .. .. .......... .. .. . ... ...... ..... . . . . .... . .. . ..... . . .
lowQualScore : 5 5 4 8 1 5 22 111 77 8 2 6 1 1 00 55 88 7777777777 88 88 2 000 888888 00000 0 0 6 0 9999 9 11 4 44444 2 1 0
consensus : ACAAAGTGTGTGAATTTTATTGGAAAAT-ATTATCAATTCCCTGAGAATTAACGTTTCAAACAGCGATACCCT--AAA---TCACCAACTTTGCAATTAG-TAGCGGTTGTAACTAC-CATTTACAGCAATGC-AG-GCA--A--C--A--T---A--CCC--GC--CTCGTTG--AAAGCACAATA------TTTGCA-----AT-ACAGTG-TTGAGAAATGTTGTT-CCACTCCTG-A-CCNA--AGGC-G-TGGGAAAGCTCATTAACGTTTCTCGGTGGTGGCCGA
Reference ( gi|82675 ) : ACAAAGTTTGTGAATTTTATTGGAAAAT-ATTATCAATTCCCTGAGAATTAACGCTTCATACAGTGATACCCT--AAA---TCACCAACTTTGCAATTAG-AAGCGGTTGTAATTAC-CATTTACAGCAACGC-AG-GCA--A--C--A--T---A--GCC--GC--CTCGTTG--TAAGCACAATA------TTTGCA-----AT-ACAGTG-TCGAGAAATGTTGTT-CCACTCCTG-A-TCAA--ATGC-A-TAGGAAAGCTCATTAACGTTTCTCTGTGGTGACTGA
gi|82676 : ACAAAGTGTGTGAATTTTATTGGAAAAT-ATTATCAATTCCCTGAGAATTAACGCTTTAAACAACGACACCCT--AAA---TCATCAACTTTGCAATTAG-TACCGGTTGTAACTAC-CATTTACGGCAATGC-AC-GCA--A--C--A--C---ATTTTC--GC--CTCGTTG--GAAGCACAATA------ATTGCAATATTAT-ACAGTG-TTAAGAAATGTTGTT-CCACTCCTG-A-CCCA--AAGT-G-TGGGAAAGCTCAATAACGTTTCTCGGTGGTAGCCGA
gi|82679 : ACAAAGTGAGTTAATTTTATCGGGAAAT-ATTGTCAATTCCCTGAGAATTAATGCT---------GATACCCT--AAA---TCACCAACTTTGCAATTAG-TAGCGGTTGTAACTAC-CATTTACAGCAATGC-AG-GCA--A--C--ACAT---A--TCC--GC--CTCGTTG--AAACCACAATA------TTTGCC-----AT-ACAGTG-TTGAGAAATGTTGTT-CCACTCCTG-A-CCCA--AGGC-A-TGGGAAAGCTCAGTAACGTTTCTCGGTTGGGGCCGA
gi|82678 : ACAAAGTGTGTGAATTTTGTTGGAAAAT-TTTATTAATTTCCTGAGAATTTCCGTTTCAAACAGAGAAACCCT--AAA---TCACCAACTTTGCAATTAG-TAGCGTTTGTAACCAC-CATTTACAGCAATGC-AG-GCACCC--C--A--T---A--CCC--GC--CTCGTTG--AAAGTACAACA------TTTGCA-----AT-ACAGTG-TTGGGAAATATTGCT-CCACTCCTG-A-CCCA--AGGC-G-TGTGAAGGCTCATTAACGTTTCTCGGTGGTGGCTGA
gi|82680 : ACAAACTAGGTGAATATTATTGGAAAAT-ATTATCAATTAACTGAGAATTAATGTTTGAAACAGCGCTACCCT--AAA---TCACCAACTTTGCAATTAG-TAATGGTTGTAACTAC-CATTTACAGCAATGC-AG-GTA--A--C--A--C---A--TCT--GT--CTTGATA--AAAGCACAATA------TTTGCA-----AT-ACAGTG-TTAAGAAATATTGTT-ACACTTTTG-A-CCAA--ATGC-G-TGGGAAAACTCATTAAAGTTCCTCAGTGGTGGCTGA
gi|82677 : ACAAACTGTGTGCATTTTATTGGAACAT-ATTAACA-TCCCCTGATAATCAACGTTTCAAACAGCGATACCCT--AAA---GCACCAACTTCGCAATTTG-TAGCGGTTGTAATTAC-CATTTACAGGAATGC-AG-GCC--A--C--A--T---ATTTCC--GC--CTCGTTG--AAAGGACACTA-------TTGCA-----AT-ACAGTG-TTGAGAAATGTTGTT-ACACTCCTGAA-TCAA--G-GC-G-TGTGAAAGCTCAGTTTCGTTTCTC-GTGGTGGCTGA
gi|82681 : ACAAACTGTGTGAATTTTATTGGAAAAT-GTTATCAATTCCCCGAGAATTAATGTTTCAAATAGCGATACACT--AAA---TCACCAACTTTGCATTTAG-TAGAGGTTGTATCTAC-CATTTTCCGCAATAC-AG-GCA--A--C--A--TGTAA--G-T--GC--CTCGAAG--AAAGCAGAATA------TTTGCA-----AT-ACAGGG-TTAAGAAA-GATGTT-CCACCTATG-A-CTGA--AGGT-G-TGGGAAAGCTCATTATCGTTTCTCGGTGGTGGCCGA
gi|82683 : ACAAACTGTTTGAATTTTATTGGAAAAT-ATTATCAATTCTCTGAAAATTAACGTTTCGAAAAGCGATACCCT--AAACATTCACCAACTTTACAATGAG-TAGCGGTTGTAACTAC-CATTTACAGCAATGC-AG-GCAACA--C--A--T---A--CCT--GC--CTCGCTG--AAATCACAATA------TTTGCA-----AT-AAAGTG-TCGAGAAATGTTGTTACTACTACT
gi|82682 : ACAAAGTGTGTAAATTTTATCGGAAAAT-ATTACCAATTCCCTGAGAATTAACGTTTCAGACAGCGATA-CCT--AAA---CCATCAACTTTGCAACCAG-TAGCGGTTGTAACTAC-CATCTACAGCAATAA-AATGCAACA--C--A--T---A--CCC--AC--GTCGTCA--AAAGCACAATA------TTCGCA-----TT-ACAGTA-TTGAGAAATGTTATT-CAACTCCTG-A-CCCA--A
gi|82684 : ACAAAGTGTGTGAATTTTATTGGAAAAT-ATTATCAATTCCGCGAGAATTAACGCTTCAAACAGCGATACCCT--AAA---ACACCAACTTTGCAATAAG-TAGCGGTTAAAACTAC-CATTTACAACAACGC-AA-TCA--A--C--A--C---A--TAC--CC--CCCA------AACCACGATG------CTCGAA-----ATCACGATG-ag
gi|82685 : ACAAATTGTGTGAATTTTATTGAGAAAT-AATTTCAATTGTCTGAGAATTCACGTTTTAatgaaa
gi|82686 : AAAGTGTTTGACTTTCATTGGAGAAT-ATTATCAATTTCCTGAGAATTAACGTTTCTAACTGCGAAACTCT--AAA---TCACCAACTTTGCAATTAG-TGGCGTTTGTAACTAC-CATTTACAGCAA-GC-AG-GCA--ACGC--A--T---T--CCC--GC--CTCGTTG--AAAGCACAATA------TTTGCA-----CT-ACAGTG-TTGAGAAATG--------GCTCGTG------------------GGAAGGCTCATTAACGTTTCTCGGTGGTGGCCGA
gi|82687 : AAACTATGTGAATTTTATTGGAAAAT-ATTATC---------AG---------TTC-------GATACCCT--AAA---TCACCAACTTTGCATTAAG-TAGCGGTTGTAACTAC-AATTAATGGCAATGC-AG-GCA--ATTT--A--T---A--CCT--GT--CTTGC----TAA----AA-----------GCA-----A----AGT--------AATGTTGTC-GCACTTCTG-A-CTAA--G-GC-G-TGGGAAAGATCATTAAAGTTTCTCGGTGGTG
gi|82688 : AAGTTTGTGAAGTTAATTGGAAAAT-ATTATCAATTCCTTGAGAATTTACACTTCAAACA------CCATTCAAA---TTACCACTTTTGCAATTAG-TAGCGGTTGTAACTAC-CATTTACAGCAATGC-TG-GCA--A--C--ACAT---A--CCC--GC--CTCGATG--AAAGCACAATA------TTTGCA-----AT-ACAGTG-TTGAGAAATGTTGTG-CCACTCCTACC-TCAA--G-GC-G-TGGTAAAGCTCATCAACGTTTTTCAATGGTGGCCGA
gi|82690 : TGTGAGTTTCATTGGAAGCT-ATCAACAATTACCTGAGAATTAACGTTTCAAACAGCGATACACC--GAA---TCATCAAGTTTGCAATTAG-TAACTGTTGTAACTAT-CATTTACAGCAATAT-AG-GTA--A--CATA--T---A--TCC--GC--CTCATTG--AAAGCACAATA------TTTGCA-----AA-ACATTG-TTAGGAAATGTTGTT-CCTCTACTG-A-AACA--ATGC-G-TGGGAAATCTCAGTAACGTTTCTCAGTGGTG
gi|82689 : tgTGTCAATTTCATTTGAAAAT-AATAACAATTCCCGGAGAATTGACGTTTCAAACAGCGACACCTC--AAA---TCGTCAAC-----AATTAGTAAACGGT-------AG-CATT--------------------A--C--A--T---C--TCC--GC--TTCAATG--AAAGCAAAATA------TTTGCA-----AT-ACATTG-TTGGGGTATGTTGTT-CCAATCCTG-A-TCAA--AAGC-A-TTGGAACGCTCAATAACGTTTTACGGTGGTGgtc
gi|82691 : aaatgcAATTATATTTGAAAAT-ATTATCAATTCTCTGAGAATTAACGCTTCAAACAGCGATACCCT--AAA---ACACCAACTTTGCAATTAG-TAACAGTTGTAACTAC-CATTTACAGCAATGC-AG-GTAACA--C--A--T---A--TCC--AA--CTCATTG--AAAGTACAATA------TTTGCA-----AT-AGTGTG-TTTAGGAATGTCGTT-TCACTCCTG-ACCCAAGGAGGC-A----GGAAGCTCAATAATGTTTCTCGGTGGTGGCCGAtcc
gi|82692 : ATTGTACTGGAAAATGATTA-CAACTCCCTGAGAATTACCATTTCA---AATTTCACCTC--AAA---CCACCAACTTTACAACTA-------------ACTAT-CATATGCAGCAGTGC-AG-GCA--A--C--A--C---A--ACTCTGC--CTCATTG--AACATACAATACATGTATTTGCA-----AT-ACTATG-CTAAGGAATGTTGAT-CCACTCTGG-A-ACCA--A-GC-AGTAAGAAAGGTCAGCAACATTTCTTGGTGGTGGTTGA
gi|82693 : ACAATGATACCCT--AAA---TCACCAACTTTGCAATTAG-TAGCGGTTGTAACTAC-GTTTTACAGCAATGC-AG-GCA--A--C--A--C---A--TCT--AC--CTCGATG--AAAGCACAATT------TTTGCA-----AT-ACAGTG-TTGAGAAATGT--TT-TCAATACTG-A-CCTA--AGGT-G-CGGGACAACTCATTAATGTTTCTCGGTGGCGGCTGA
gi|82695 : aaTTACGCATTGAT-GCA-CGCTCG-GCA--A--C------------GAC--TT--CTCACTG--AATGGATAATA------TTTGAA-----AT-CC--TGCTTGAGGTATGTT-TT-CTATTCCTG-A-ACAA--ATGC-T-CAACGAAGTACATGAACGTT
gi|82694 : aatcagtatcttgtattagcctccATGC-GC-GCA--C--G--A--C---A--GCC--ACTTCTCATTGAATAGATAC--TA------TTTGTA-----AT-ACGGGT-TTGTGGTATGTTGTT-TTACTCCTgatttcaatgat
gi|82696 : ccaaattcacaaaatcagtatcatgtatagcctccttgtgcattg--A--C--A--T---A--CCC--GC--CTGGTTG--AAAGCACACTA------TTTGCA-----GT-ACATTG-TTGAGAAATGTTATT-CCACACCTG-A-CCCA--AGGCGG-GGGGGAAGCTCATCAACGTTACTCGGTTGTGGCTGAtaataggcgt
gi|82697 : GGAATGTTGTT-CCACGCCTGAA-TTAA--G-GC-T-TGTGTTAGTTCATTAACGT
Alignments
lowQualScore : 11
lowQualScore : 1 2 2 333 22 2 22 333 55555 2 33 55 22 77 888 22 0 1 555555 44444 1 1 1 4 1 2 0 33
lowQualScore : . . . ... .. . .. ... ..... . .. .. .. .. ... .. . . ...... ..... . . . . . . . ..
lowQualScore : 1 5 2 999 88 0 88 555 00000 0 11 22 66 99 333 66 5 9 555555 88888 9 9 9 1 7 1 7 22
consensus : ACAAAGTG-TGTGAATTTTATTGGAAAAT-ATTATCAATTCCCTGAGAATTAACGTTTCAAACAGCGATACCCTAAA---TCACCAACTTTGCAA--TTAGTAG-CGGTTGTAACTACCAT--TTACAGCA---ATGCA-----G-GCA--A--C--A--TA--CCCGC--CTCGTTGAA-AGCACAATA------TTTGCA-----AT-ACAGTG-TTGAGAAATGTTGTT-CCACTCCTGACCCAAGGC-GTGGGAAAGCTCATTAACGTT--TCTCGGTGGTGGCCGA
Reference ( family-742 ) : ACAAAGTG-TGTGAATTTTATTGGAAAAT-ATTATCAATTCCCTGAGAATTAACGTTTCAAACAGCGATACCCTAAA---TCACCAACTTTGCAA--TTAGTAG-CGGTTGTAACTACCAT--TTACAGCA---ATGCA-----G-GCA--A--C--A--TA--CCCGC--CTCGTTGAA-AGCACAATA------TTTGCA-----AT-ACAGTG-TTGAGAAATGTTGTT-CCACTCCTGACCNAAGGC-GTGGGAAAGCTCATTAACGTT--TCTCGGTGGTGGCCGA
gi|82675 : ACAAAGTT-TGTGAATTTTATTGGAAAAT-ATTATCAATTCCCTGAGAATTAACGCTTCATACAGTGATACCCTAAA---TCACCAACTTTGCAA--TTAGAAG-CGGTTGTAATTACCAT--TTACAGCA---ACGCA-----G-GCA--A--C--A--TA--GCCGC--CTCGTTGTA-AGCACAATA------TTTGCA-----AT-ACAGTG-TCGAGAAATGTTGTT-CCACTCCTGATCAAATGC-ATAGGAAAGCTCATTAACGTT--TCTCTGTGGTGACTGA
gi|82676 : ACAAAGTG-TGTGAATTTTATTGGAAAAT-ATTATCAATTCCCTGAGAATTAACGCTTTAAACAACGACACCCTAAA---TCATCAACTTTGCAA--TTAGTAC-CGGTTGTAACTACCAT--TTACGGCA---ATGCA-----C-GCA--A--C--A--CATTTTCGC--CTCGTTGGA-AGCACAATA------ATTGCAATATTAT-ACAGTG-TTAAGAAATGTTGTT-CCACTCCTGACCCAAAGT-GTGGGAAAGCTCAATAACGTT--TCTCGGTGGTAGCCGA
gi|82677 : ACAAACTG-TGTGCATTTTATTGGAACAT-ATTAACA-TCCCCTGATAATCAACGTTTCAAACAGCGATACCCTAAA---GCACCAACTTCGCAA--TTTGTAG-CGGTTGTAATTACCAT--TTACAGGA---ATGCA-----G-GCC--A--C--A--TATTTCCGC--CTCGTTGAA-AGGACACTA-------TTGCA-----AT-ACAGTG-TTGAGAAATGTTGTT-ACACTCCTGAATCAAGGC-GTGTGAAAGCTCAGTTTCGTT--TCTC-GTGGTGGCTGA
gi|82678 : ACAAAGTG-TGTGAATTTTGTTGGAAAAT-TTTATTAATTTCCTGAGAATTTCCGTTTCAAACAGAGAAACCCTAAA---TCACCAACTTTGCAA--TTAGTAG-CGTTTGTAACCACCAT--TTACAGCA---ATGCA-----G-GCACCC--C--A--TA--CCCGC--CTCGTTGAA-AGTACAACA------TTTGCA-----AT-ACAGTG-TTGGGAAATATTGCT-CCACTCCTGACCCAAGGC-GTGTGAAGGCTCATTAACGTT--TCTCGGTGGTGGCTGA
gi|82679 : ACAAAGTG-AGTTAATTTTATCGGGAAAT-ATTGTCAATTCCCTGAGAATTAATGCT---------GATACCCTAAA---TCACCAACTTTGCAA--TTAGTAG-CGGTTGTAACTACCAT--TTACAGCA---ATGCA-----G-GCA--A--C--ACATA--TCCGC--CTCGTTGAA-ACCACAATA------TTTGCC-----AT-ACAGTG-TTGAGAAATGTTGTT-CCACTCCTGACCCAAGGC-ATGGGAAAGCTCAGTAACGTT--TCTCGGTTGGGGCCGA
gi|82680 : ACAAACTA-GGTGAATATTATTGGAAAAT-ATTATCAATTAACTGAGAATTAATGTTTGAAACAGCGCTACCCTAAA---TCACCAACTTTGCAA--TTAGTAA-TGGTTGTAACTACCAT--TTACAGCA---ATGCA-----G-GTA--A--C--A--CA--TCTGT--CTTGATAAA-AGCACAATA------TTTGCA-----AT-ACAGTG-TTAAGAAATATTGTT-ACACTTTTGACCAAATGC-GTGGGAAAACTCATTAAAGTT--CCTCAGTGGTGGCTGA
gi|82681 : ACAAACTG-TGTGAATTTTATTGGAAAAT-GTTATCAATTCCCCGAGAATTAATGTTTCAAATAGCGATACACTAAA---TCACCAACTTTGCAT--TTAGTAG-AGGTTGTATCTACCAT--TTTCCGCA---ATACA-----G-GCA--A--C--ATGTA--AGTGC--CTCGAAGAA-AGCAGAATA------TTTGCA-----AT-ACAGGG-TTAAGAAA-GATGTT-CCACCTATGACTGAAGGT-GTGGGAAAGCTCATTATCGTT--TCTCGGTGGTGGCCGA
gi|82682 : ACAAAGTG-TGTAAATTTTATCGGAAAAT-ATTACCAATTCCCTGAGAATTAACGTTTCAGACAGCGATA-CCTAAA---CCATCAACTTTGCAA--CCAGTAG-CGGTTGTAACTACCAT--CTACAGCA---ATAAA-----ATGCAACA--C--A--TA--CCCAC--GTCGTCAAA-AGCACAATA------TTCGCA-----TT-ACAGTA-TTGAGAAATGTTATT-CAACTCCTGACCCAAAG
gi|82683 : ACAAACTG-TTTGAATTTTATTGGAAAAT-ATTATCAATTCTCTGAAAATTAACGTTTCGAAAAGCGATACCCTAAACATTCACCAACTTTACAA--TGAGTAG-CGGTTGTAACTACCAT--TTACAGCA---ATGCA-----G-GCAACA--C--A--TA--CCTGC--CTCGCTGAA-ATCACAATA------TTTGCA-----AT-AAAGTG-TCGAGAAATGTTGTTACTACTACT
gi|82684 : ACAAAGTG-TGTGAATTTTATTGGAAAAT-ATTATCAATTCCGCGAGAATTAACGCTTCAAACAGCGATACCCTAAA---ACACCAACTTTGCAA--TAAGTAG-CGGTTAAAACTACCAT--TTACAACA---ACGCA-----A-TCAACA--C--A--TA--CCCCC--C------AA-ACCACGATG------CTCGAA-----ATCACGATG-ATGAAA
gi|82685 : ACAAATTG-TGTGAATTTTATTGAGAAAT-AATTTCAATTGTCTGAGAATTCACGTTTTA
gi|82686 : AAAGTG-TTTGACTTTCATTGGAGAAT-ATTATCAATTTCCTGAGAATTAACGTTTCTAACTGCGAAACTCTAAA---TCACCAACTTTGCAA--TTAGTGG-CGTTTGTAACTACCAT--TTACAGCA---A-GCA-----G-GCA--ACGC--A--TT--CCCGC--CTCGTTGAA-AGCACAATA------TTTGCA-----CT-ACAGTG-TTGAGAAATG--GCT------------------C-GTGGGAAGGCTCATTAACGTT--TCTCGGTGGTGGCCGA
gi|82687 : AAACTA-TGTGAATTTTATTGGAAAAT-ATTATCAGTTC-------------------------GATACCCTAAA---TCACCAACTTTGCAT--TAAGTAG-CGGTTGTAACTACAAT--TAATGGCA---ATGCA-----G-GCA--ATTT--A--TA--CCTGT--CTTGCTAAA-AGCAAAGT----------------------------------AATGTTGTC-GCACTTCTGA-CTAAGGC-GTGGGAAAGATCATTAAAGTT--TCTCGGTGGTG
gi|82688 : AAGTT-TGTGAAGTTAATTGGAAAAT-ATTATCAATTCCTTGAGAATTTACACTTCAAACACC-ATTC---AAA---TTACCACTTTTGCAA--TTAGTAG-CGGTTGTAACTACCAT--TTACAGCA---ATGCT-----G-GCA--A--C--ACATA--CCCGC--CTCGATGAA-AGCACAATA------TTTGCA-----AT-ACAGTG-TTGAGAAATGTTGTG-CCACTCCTACCTCAAGGC-GTGGTAAAGCTCATCAACGTT--TTTCAATGGTGGCCGA
gi|82689 : AAATGCTGTCAATTTCATTTGAAAAT-AATAACAATTCCCGGAGAATTGACGTTTCAAACAGCGACACCTCAAA---TCGTCAAC-----AA--TTAGTAAACGGT-------AGCAT--T---------------------------A--C--A--TC--TCCGC--TTCAATGAA-AGCAAAATA------TTTGCA-----AT-ACATTG-TTGGGGTATGTTGTT-CCAATCCTGATCAAAAGC-ATTGGAACGCTCAATAACGTT--TTACGGTGGTGTCC
gi|82690 : TG-TGTGAGTTTCATTGGAAGCT-ATCAACAATTACCTGAGAATTAACGTTTCAAACAGCGATACACCGAA---TCATCAAGTTTGCAA--TTAGTAA-CTGTTGTAACTATCAT--TTACAGCA---ATATA-----G-GTA--A--CATA--TA--TCCGC--CTCATTGAA-AGCACAATA------TTTGCA-----AA-ACATTG-TTAGGAAATGTTGTT-CCTCTACTGAAACAATGC-GTGGGAAATCTCAGTAACGTT--TCTCAGTGGTGGTC
gi|82691 : AATTATATTTGAAAAT-ATTATCAATTCTCTGAGAATTAACGCTTCAAACAGCGATACCCTAAA---ACACCAACTTTGCAA--TTAGTAA-CAGTTGTAACTACCAT--TTACAGCA---ATGCA-----G-GTAACA--C--A--TA--TCCAA--CTCATTGAA-AGTACAATA------TTTGCA-----AT-AGTGTG-TTTAGGAATGTCGTT-TCACTCCTGACCCAAGGA-GGCAGGAAGCTCAATAATGTT--TCTCGGTGGTGGCCGA
gi|82692 : ATTGTACTGGAAAATGATTA-CAACTCCCTGAGAATTACCATTTCAAATTTC---ACCTCAAA---CCACCAACTTTACAA--CTA-------------ACTATCAT--ATGCAGCA---GTGCA-----G-GCA--A--C--A--CAACTCTGC--CTCATTGAA-CATACAATACATGTATTTGCA-----AT-ACTATG-CTAAGGAATGTTGAT-CCACTCTGGAACCAAGCA-GTAAGAAAGGTCAGCAACATT--TCTTGGTGGTGGTTGA
gi|82693 : AAACAATGATACCCTAAA---TCACCAACTTTGCAA--TTAGTAG-CGGTTGTAACTACGTT--TTACAGCA---ATGCA-----G-GCA--A--C--A--CA--TCTAC--CTCGATGAA-AGCACAATT------TTTGCA-----AT-ACAGTG-TTGAGAAATGT--TT-TCAATACTGACCTAAGGT-GCGGGACAACTCATTAATGTT--TCTCGGTGGCGGCTGA
gi|82694 : CCAAATTCACAAAATCAGTAT-CATGTATAGCCTCCTT--GTGCATTG---ATGCG-----C-GCA--C--G--A--CA--GCCACTTCTCATTGAATAG-ATACTA------TTTGTA-----AT-ACGGGT-TTGTGGTATGTTGTT-TTACTCCTTA--ATAGGC-GT
gi|82695 : AA--TCAGTAT-C--TTGTA-TTAGCCTCCTTAC-GCATTGATGCACGCTCG-GCA--A--C--G---A--CTT----CTCACTGAA-TGGATAATA------TTTGAA-----AT-CC--TGCTTGAGGTATGTT-TT-CTATTCCTGAACAAATGC-TCAACGAAGTACATGAACGTTGATTTCAATGAT
gi|82696 : --A--C--A--TA--CCCGC--CTGGTTGAA-AGCACACTA------TTTGCA-----GT-ACATTG-TTGAGAAATGTTATT-CCACACCTGACCCAAGGCGGGGGGGAAGCTCATCAACGTT--ACTCGGTTGTGGCTGA
gi|82697 : TGTGGAATGTTGTT-CCACGCCTGAATTAAGGC-TTGTGTTAGTTCATTAACGT
Alignments
lowQualScore : 11
lowQualScore : 1 2 2 333 22 2 22 333 55555 2 33 55 22 77 888 22 0 1 555555 44444 1 1 1 4 1 2 2 0 33
lowQualScore : . . . ... .. . .. ... ..... . .. .. .. .. ... .. . . ...... ..... . . . . . . . . ..
lowQualScore : 1 5 2 999 88 0 88 555 00000 0 11 22 66 99 333 66 5 9 555555 88888 9 9 9 1 2 0 1 7 22
consensus : ACAAAGTG-TGTGAATTTTATTGGAAAAT-ATTATCAATTCCCTGAGAATTAACGTTTCAAACAGCGATACCCTAAA---TCACCAACTTTGCAA--TTAGTAG-CGGTTGTAACTACCAT--TTACAGCA---ATGCA-----G-GCA--A--C--A--TA--CCCGC--CTCGTTGAA-AGCACAATA------TTTGCA-----AT-ACAGTG-TTGAGAAATGTTGTT-CCACTCCTGACCCA-AGGC-GTGGGAAAGCTCATTAACGTT--TCTCGGTGGTGGCCGA
Reference ( family-742 ) : ACAAAGTG-TGTGAATTTTATTGGAAAAT-ATTATCAATTCCCTGAGAATTAACGTTTCAAACAGCGATACCCTAAA---TCACCAACTTTGCAA--TTAGTAG-CGGTTGTAACTACCAT--TTACAGCA---ATGCA-----G-GCA--A--C--A--TA--CCCGC--CTCGTTGAA-AGCACAATA------TTTGCA-----AT-ACAGTG-TTGAGAAATGTTGTT-CCACTCCTGACCCA-AGGC-GTGGGAAAGCTCATTAACGTT--TCTCGGTGGTGGCCGA
gi|82675 : ACAAAGTT-TGTGAATTTTATTGGAAAAT-ATTATCAATTCCCTGAGAATTAACGCTTCATACAGTGATACCCTAAA---TCACCAACTTTGCAA--TTAGAAG-CGGTTGTAATTACCAT--TTACAGCA---ACGCA-----G-GCA--A--C--A--TA--GCCGC--CTCGTTGTA-AGCACAATA------TTTGCA-----AT-ACAGTG-TCGAGAAATGTTGTT-CCACTCCTGATCAA-ATGC-ATAGGAAAGCTCATTAACGTT--TCTCTGTGGTGACTGA
gi|82676 : ACAAAGTG-TGTGAATTTTATTGGAAAAT-ATTATCAATTCCCTGAGAATTAACGCTTTAAACAACGACACCCTAAA---TCATCAACTTTGCAA--TTAGTAC-CGGTTGTAACTACCAT--TTACGGCA---ATGCA-----C-GCA--A--C--A--CATTTTCGC--CTCGTTGGA-AGCACAATA------ATTGCAATATTAT-ACAGTG-TTAAGAAATGTTGTT-CCACTCCTGACCCA-AAGT-GTGGGAAAGCTCAATAACGTT--TCTCGGTGGTAGCCGA
gi|82677 : ACAAACTG-TGTGCATTTTATTGGAACAT-ATTAACA-TCCCCTGATAATCAACGTTTCAAACAGCGATACCCTAAA---GCACCAACTTCGCAA--TTTGTAG-CGGTTGTAATTACCAT--TTACAGGA---ATGCA-----G-GCC--A--C--A--TATTTCCGC--CTCGTTGAA-AGGACACTA-------TTGCA-----AT-ACAGTG-TTGAGAAATGTTGTT-ACACTCCTGAATCA-AGGC-GTGTGAAAGCTCAGTTTCGTT--TCTC-GTGGTGGCTGA
gi|82678 : ACAAAGTG-TGTGAATTTTGTTGGAAAAT-TTTATTAATTTCCTGAGAATTTCCGTTTCAAACAGAGAAACCCTAAA---TCACCAACTTTGCAA--TTAGTAG-CGTTTGTAACCACCAT--TTACAGCA---ATGCA-----G-GCACCC--C--A--TA--CCCGC--CTCGTTGAA-AGTACAACA------TTTGCA-----AT-ACAGTG-TTGGGAAATATTGCT-CCACTCCTGACCCA-AGGC-GTGTGAAGGCTCATTAACGTT--TCTCGGTGGTGGCTGA
gi|82679 : ACAAAGTG-AGTTAATTTTATCGGGAAAT-ATTGTCAATTCCCTGAGAATTAATGCT---------GATACCCTAAA---TCACCAACTTTGCAA--TTAGTAG-CGGTTGTAACTACCAT--TTACAGCA---ATGCA-----G-GCA--A--C--ACATA--TCCGC--CTCGTTGAA-ACCACAATA------TTTGCC-----AT-ACAGTG-TTGAGAAATGTTGTT-CCACTCCTGACCCA-AGGC-ATGGGAAAGCTCAGTAACGTT--TCTCGGTTGGGGCCGA
gi|82680 : ACAAACTA-GGTGAATATTATTGGAAAAT-ATTATCAATTAACTGAGAATTAATGTTTGAAACAGCGCTACCCTAAA---TCACCAACTTTGCAA--TTAGTAA-TGGTTGTAACTACCAT--TTACAGCA---ATGCA-----G-GTA--A--C--A--CA--TCTGT--CTTGATAAA-AGCACAATA------TTTGCA-----AT-ACAGTG-TTAAGAAATATTGTT-ACACTTTTGACCAA-ATGC-GTGGGAAAACTCATTAAAGTT--CCTCAGTGGTGGCTGA
gi|82681 : ACAAACTG-TGTGAATTTTATTGGAAAAT-GTTATCAATTCCCCGAGAATTAATGTTTCAAATAGCGATACACTAAA---TCACCAACTTTGCAT--TTAGTAG-AGGTTGTATCTACCAT--TTTCCGCA---ATACA-----G-GCA--A--C--ATGTA--AGTGC--CTCGAAGAA-AGCAGAATA------TTTGCA-----AT-ACAGGG-TTAAGAAA-GATGTT-CCACCTATGACTGA-AGGT-GTGGGAAAGCTCATTATCGTT--TCTCGGTGGTGGCCGA
gi|82682 : ACAAAGTG-TGTAAATTTTATCGGAAAAT-ATTACCAATTCCCTGAGAATTAACGTTTCAGACAGCGATA-CCTAAA---CCATCAACTTTGCAA--CCAGTAG-CGGTTGTAACTACCAT--CTACAGCA---ATAAA-----ATGCAACA--C--A--TA--CCCAC--GTCGTCAAA-AGCACAATA------TTCGCA-----TT-ACAGTA-TTGAGAAATGTTATT-CAACTCCTGACCCA-AAG
gi|82683 : ACAAACTG-TTTGAATTTTATTGGAAAAT-ATTATCAATTCTCTGAAAATTAACGTTTCGAAAAGCGATACCCTAAACATTCACCAACTTTACAA--TGAGTAG-CGGTTGTAACTACCAT--TTACAGCA---ATGCA-----G-GCAACA--C--A--TA--CCTGC--CTCGCTGAA-ATCACAATA------TTTGCA-----AT-AAAGTG-TCGAGAAATGTTGTTACTACTACT
gi|82684 : ACAAAGTG-TGTGAATTTTATTGGAAAAT-ATTATCAATTCCGCGAGAATTAACGCTTCAAACAGCGATACCCTAAA---ACACCAACTTTGCAA--TAAGTAG-CGGTTAAAACTACCAT--TTACAACA---ACGCA-----A-TCAACA--C--A--TA--CCCCC--C------AA-ACCACGATG------CTCGAA-----ATCACGATG-ATGAAA
gi|82685 : ACAAATTG-TGTGAATTTTATTGAGAAAT-AATTTCAATTGTCTGAGAATTCACGTTTTA
gi|82686 : AAAGTG-TTTGACTTTCATTGGAGAAT-ATTATCAATTTCCTGAGAATTAACGTTTCTAACTGCGAAACTCTAAA---TCACCAACTTTGCAA--TTAGTGG-CGTTTGTAACTACCAT--TTACAGCA---A-GCA-----G-GCA--ACGC--A--TT--CCCGC--CTCGTTGAA-AGCACAATA------TTTGCA-----CT-ACAGTG-TTGAGAAATG--GCT-------------------C-GTGGGAAGGCTCATTAACGTT--TCTCGGTGGTGGCCGA
gi|82687 : AAACTA-TGTGAATTTTATTGGAAAAT-ATTATCAGTTC-------------------------GATACCCTAAA---TCACCAACTTTGCAT--TAAGTAG-CGGTTGTAACTACAAT--TAATGGCA---ATGCA-----G-GCA--ATTT--A--TA--CCTGT--CTTGCTAAA-AGCAAAGT----------------------------------AATGTTGTC-GCACTTCTGA-CTA-AGGC-GTGGGAAAGATCATTAAAGTT--TCTCGGTGGTG
gi|82688 : AAGTT-TGTGAAGTTAATTGGAAAAT-ATTATCAATTCCTTGAGAATTTACACTTCAAACACC-ATTC---AAA---TTACCACTTTTGCAA--TTAGTAG-CGGTTGTAACTACCAT--TTACAGCA---ATGCT-----G-GCA--A--C--ACATA--CCCGC--CTCGATGAA-AGCACAATA------TTTGCA-----AT-ACAGTG-TTGAGAAATGTTGTG-CCACTCCTACCTCA-AGGC-GTGGTAAAGCTCATCAACGTT--TTTCAATGGTGGCCGA
gi|82689 : AAATGCTGTCAATTTCATTTGAAAAT-AATAACAATTCCCGGAGAATTGACGTTTCAAACAGCGACACCTCAAA---TCGTCAAC-----AA--TTAGTAAACGGT-------AGCAT--T---------------------------A--C--A--TC--TCCGC--TTCAATGAA-AGCAAAATA------TTTGCA-----AT-ACATTG-TTGGGGTATGTTGTT-CCAATCCTGATCAA-AAGC-ATTGGAACGCTCAATAACGTT--TTACGGTGGTGTCC
gi|82690 : TG-TGTGAGTTTCATTGGAAGCT-ATCAACAATTACCTGAGAATTAACGTTTCAAACAGCGATACACCGAA---TCATCAAGTTTGCAA--TTAGTAA-CTGTTGTAACTATCAT--TTACAGCA---ATATA-----G-GTA--A--CATA--TA--TCCGC--CTCATTGAA-AGCACAATA------TTTGCA-----AA-ACATTG-TTAGGAAATGTTGTT-CCTCTACTGAAACA-ATGC-GTGGGAAATCTCAGTAACGTT--TCTCAGTGGTGGTC
gi|82691 : AATTATATTTGAAAAT-ATTATCAATTCTCTGAGAATTAACGCTTCAAACAGCGATACCCTAAA---ACACCAACTTTGCAA--TTAGTAA-CAGTTGTAACTACCAT--TTACAGCA---ATGCA-----G-GTAACA--C--A--TA--TCCAA--CTCATTGAA-AGTACAATA------TTTGCA-----AT-AGTGTG-TTTAGGAATGTCGTT-TCACTCCTGACCCA-AGGA-GGCAGGAAGCTCAATAATGTT--TCTCGGTGGTGGCCGA
gi|82692 : ATTGTACTGGAAAATGATTA-CAACTCCCTGAGAATTACCATTTCAAATTTC---ACCTCAAA---CCACCAACTTTACAA--CTA-------------ACTATCAT--ATGCAGCA---GTGCA-----G-GCA--A--C--A--CAACTCTGC--CTCATTGAA-CATACAATACATGTATTTGCA-----AT-ACTATG-CTAAGGAATGTTGAT-CCACTCTGGAACCA-AGCA-GTAAGAAAGGTCAGCAACATT--TCTTGGTGGTGGTTGA
gi|82693 : AAACAATGATACCCTAAA---TCACCAACTTTGCAA--TTAGTAG-CGGTTGTAACTACGTT--TTACAGCA---ATGCA-----G-GCA--A--C--A--CA--TCTAC--CTCGATGAA-AGCACAATT------TTTGCA-----AT-ACAGTG-TTGAGAAATGT--TT-TCAATACTGACCTA-AGGT-GCGGGACAACTCATTAATGTT--TCTCGGTGGCGGCTGA
gi|82694 : CCAAATTCACAAAATCAGTAT-CATGTATAGCCTCCTT--GTGCATTG---ATGCG-----C-GCA--C--G--A--CA--GCCACTTCTCATTGAATAG-ATACTA------TTTGTA-----AT-ACGGGT-TTGTGGTATGTTGTT-TTACTCCTTA---ATAGGC-GT
gi|82695 : AA--TCAGTAT-C--TTGTA-TTAGCCTCCTTAC-GCATTGATGCACGCTCG-GCA--A--C--G---A--CTT----CTCACTGAA-TGGATAATA------TTTGAA-----AT-CC--TGCTTGAGGTATGTT-TT-CTATTCCTGAACAA-ATGC-TCAACGAAGTACATGAACGTTGATTTCAATGAT
gi|82696 : --A--C--A--TA--CCCGC--CTGGTTGAA-AGCACACTA------TTTGCA-----GT-ACATTG-TTGAGAAATGTTATT-CCACACCTGACCCA-AGGCGGGGGGGAAGCTCATCAACGTT--ACTCGGTTGTGGCTGA
gi|82697 : TGTGGAATGTTGTT-CCACGCCTGAATTA-AGGC-TTGTGTTAGTTCATTAACGT
Alignments
lowQualScore : 11
lowQualScore : 1 2 2 333 22 2 22 333 55555 2 33 55 22 77 888 22 0 1 555555 44444 1 1 1 4 1 2 2 0 33
lowQualScore : . . . ... .. . .. ... ..... . .. .. .. .. ... .. . . ...... ..... . . . . . . . . ..
lowQualScore : 1 5 2 999 88 0 88 555 00000 0 11 22 66 99 333 66 5 9 555555 88888 9 9 9 1 2 0 1 7 22
consensus : ACAAAGTG-TGTGAATTTTATTGGAAAAT-ATTATCAATTCCCTGAGAATTAACGTTTCAAACAGCGATACCCTAAA---TCACCAACTTTGCAA--TTAGTAG-CGGTTGTAACTACCAT--TTACAGCA---ATGCA-----G-GCA--A--C--A--TA--CCCGC--CTCGTTGAA-AGCACAATA------TTTGCA-----AT-ACAGTG-TTGAGAAATGTTGTT-CCACTCCTGACCCA-AGGC-GTGGGAAAGCTCATTAACGTT--TCTCGGTGGTGGCCGA
Reference ( family-742 ) : ACAAAGTG-TGTGAATTTTATTGGAAAAT-ATTATCAATTCCCTGAGAATTAACGTTTCAAACAGCGATACCCTAAA---TCACCAACTTTGCAA--TTAGTAG-CGGTTGTAACTACCAT--TTACAGCA---ATGCA-----G-GCA--A--C--A--TA--CCCGC--CTCGTTGAA-AGCACAATA------TTTGCA-----AT-ACAGTG-TTGAGAAATGTTGTT-CCACTCCTGACCCA-AGGC-GTGGGAAAGCTCATTAACGTT--TCTCGGTGGTGGCCGA
gi|82675 : ACAAAGTT-TGTGAATTTTATTGGAAAAT-ATTATCAATTCCCTGAGAATTAACGCTTCATACAGTGATACCCTAAA---TCACCAACTTTGCAA--TTAGAAG-CGGTTGTAATTACCAT--TTACAGCA---ACGCA-----G-GCA--A--C--A--TA--GCCGC--CTCGTTGTA-AGCACAATA------TTTGCA-----AT-ACAGTG-TCGAGAAATGTTGTT-CCACTCCTGATCAA-ATGC-ATAGGAAAGCTCATTAACGTT--TCTCTGTGGTGACTGA
gi|82676 : ACAAAGTG-TGTGAATTTTATTGGAAAAT-ATTATCAATTCCCTGAGAATTAACGCTTTAAACAACGACACCCTAAA---TCATCAACTTTGCAA--TTAGTAC-CGGTTGTAACTACCAT--TTACGGCA---ATGCA-----C-GCA--A--C--A--CATTTTCGC--CTCGTTGGA-AGCACAATA------ATTGCAATATTAT-ACAGTG-TTAAGAAATGTTGTT-CCACTCCTGACCCA-AAGT-GTGGGAAAGCTCAATAACGTT--TCTCGGTGGTAGCCGA
gi|82677 : ACAAACTG-TGTGCATTTTATTGGAACAT-ATTAACA-TCCCCTGATAATCAACGTTTCAAACAGCGATACCCTAAA---GCACCAACTTCGCAA--TTTGTAG-CGGTTGTAATTACCAT--TTACAGGA---ATGCA-----G-GCC--A--C--A--TATTTCCGC--CTCGTTGAA-AGGACACTA-------TTGCA-----AT-ACAGTG-TTGAGAAATGTTGTT-ACACTCCTGAATCA-AGGC-GTGTGAAAGCTCAGTTTCGTT--TCTC-GTGGTGGCTGA
gi|82678 : ACAAAGTG-TGTGAATTTTGTTGGAAAAT-TTTATTAATTTCCTGAGAATTTCCGTTTCAAACAGAGAAACCCTAAA---TCACCAACTTTGCAA--TTAGTAG-CGTTTGTAACCACCAT--TTACAGCA---ATGCA-----G-GCACCC--C--A--TA--CCCGC--CTCGTTGAA-AGTACAACA------TTTGCA-----AT-ACAGTG-TTGGGAAATATTGCT-CCACTCCTGACCCA-AGGC-GTGTGAAGGCTCATTAACGTT--TCTCGGTGGTGGCTGA
gi|82679 : ACAAAGTG-AGTTAATTTTATCGGGAAAT-ATTGTCAATTCCCTGAGAATTAATGCT---------GATACCCTAAA---TCACCAACTTTGCAA--TTAGTAG-CGGTTGTAACTACCAT--TTACAGCA---ATGCA-----G-GCA--A--C--ACATA--TCCGC--CTCGTTGAA-ACCACAATA------TTTGCC-----AT-ACAGTG-TTGAGAAATGTTGTT-CCACTCCTGACCCA-AGGC-ATGGGAAAGCTCAGTAACGTT--TCTCGGTTGGGGCCGA
gi|82680 : ACAAACTA-GGTGAATATTATTGGAAAAT-ATTATCAATTAACTGAGAATTAATGTTTGAAACAGCGCTACCCTAAA---TCACCAACTTTGCAA--TTAGTAA-TGGTTGTAACTACCAT--TTACAGCA---ATGCA-----G-GTA--A--C--A--CA--TCTGT--CTTGATAAA-AGCACAATA------TTTGCA-----AT-ACAGTG-TTAAGAAATATTGTT-ACACTTTTGACCAA-ATGC-GTGGGAAAACTCATTAAAGTT--CCTCAGTGGTGGCTGA
gi|82681 : ACAAACTG-TGTGAATTTTATTGGAAAAT-GTTATCAATTCCCCGAGAATTAATGTTTCAAATAGCGATACACTAAA---TCACCAACTTTGCAT--TTAGTAG-AGGTTGTATCTACCAT--TTTCCGCA---ATACA-----G-GCA--A--C--ATGTA--AGTGC--CTCGAAGAA-AGCAGAATA------TTTGCA-----AT-ACAGGG-TTAAGAAA-GATGTT-CCACCTATGACTGA-AGGT-GTGGGAAAGCTCATTATCGTT--TCTCGGTGGTGGCCGA
gi|82682 : ACAAAGTG-TGTAAATTTTATCGGAAAAT-ATTACCAATTCCCTGAGAATTAACGTTTCAGACAGCGATA-CCTAAA---CCATCAACTTTGCAA--CCAGTAG-CGGTTGTAACTACCAT--CTACAGCA---ATAAA-----ATGCAACA--C--A--TA--CCCAC--GTCGTCAAA-AGCACAATA------TTCGCA-----TT-ACAGTA-TTGAGAAATGTTATT-CAACTCCTGACCCA-AAG
gi|82683 : ACAAACTG-TTTGAATTTTATTGGAAAAT-ATTATCAATTCTCTGAAAATTAACGTTTCGAAAAGCGATACCCTAAACATTCACCAACTTTACAA--TGAGTAG-CGGTTGTAACTACCAT--TTACAGCA---ATGCA-----G-GCAACA--C--A--TA--CCTGC--CTCGCTGAA-ATCACAATA------TTTGCA-----AT-AAAGTG-TCGAGAAATGTTGTTACTACTACT
gi|82684 : ACAAAGTG-TGTGAATTTTATTGGAAAAT-ATTATCAATTCCGCGAGAATTAACGCTTCAAACAGCGATACCCTAAA---ACACCAACTTTGCAA--TAAGTAG-CGGTTAAAACTACCAT--TTACAACA---ACGCA-----A-TCAACA--C--A--TA--CCCCC--C------AA-ACCACGATG------CTCGAA-----ATCACGATG-ATGAAA
gi|82685 : ACAAATTG-TGTGAATTTTATTGAGAAAT-AATTTCAATTGTCTGAGAATTCACGTTTTA
gi|82686 : AAAGTG-TTTGACTTTCATTGGAGAAT-ATTATCAATTTCCTGAGAATTAACGTTTCTAACTGCGAAACTCTAAA---TCACCAACTTTGCAA--TTAGTGG-CGTTTGTAACTACCAT--TTACAGCA---A-GCA-----G-GCA--ACGC--A--TT--CCCGC--CTCGTTGAA-AGCACAATA------TTTGCA-----CT-ACAGTG-TTGAGAAATG--GCT-------------------C-GTGGGAAGGCTCATTAACGTT--TCTCGGTGGTGGCCGA
gi|82687 : AAACTA-TGTGAATTTTATTGGAAAAT-ATTATCAGTTC-------------------------GATACCCTAAA---TCACCAACTTTGCAT--TAAGTAG-CGGTTGTAACTACAAT--TAATGGCA---ATGCA-----G-GCA--ATTT--A--TA--CCTGT--CTTGCTAAA-AGCAAAGT----------------------------------AATGTTGTC-GCACTTCTGA-CTA-AGGC-GTGGGAAAGATCATTAAAGTT--TCTCGGTGGTG
gi|82688 : AAGTT-TGTGAAGTTAATTGGAAAAT-ATTATCAATTCCTTGAGAATTTACACTTCAAACACC-ATTC---AAA---TTACCACTTTTGCAA--TTAGTAG-CGGTTGTAACTACCAT--TTACAGCA---ATGCT-----G-GCA--A--C--ACATA--CCCGC--CTCGATGAA-AGCACAATA------TTTGCA-----AT-ACAGTG-TTGAGAAATGTTGTG-CCACTCCTACCTCA-AGGC-GTGGTAAAGCTCATCAACGTT--TTTCAATGGTGGCCGA
gi|82689 : AAATGCTGTCAATTTCATTTGAAAAT-AATAACAATTCCCGGAGAATTGACGTTTCAAACAGCGACACCTCAAA---TCGTCAAC-----AA--TTAGTAAACGGT-------AGCAT--T---------------------------A--C--A--TC--TCCGC--TTCAATGAA-AGCAAAATA------TTTGCA-----AT-ACATTG-TTGGGGTATGTTGTT-CCAATCCTGATCAA-AAGC-ATTGGAACGCTCAATAACGTT--TTACGGTGGTGTCC
gi|82690 : TG-TGTGAGTTTCATTGGAAGCT-ATCAACAATTACCTGAGAATTAACGTTTCAAACAGCGATACACCGAA---TCATCAAGTTTGCAA--TTAGTAA-CTGTTGTAACTATCAT--TTACAGCA---ATATA-----G-GTA--A--CATA--TA--TCCGC--CTCATTGAA-AGCACAATA------TTTGCA-----AA-ACATTG-TTAGGAAATGTTGTT-CCTCTACTGAAACA-ATGC-GTGGGAAATCTCAGTAACGTT--TCTCAGTGGTGGTC
gi|82691 : AATTATATTTGAAAAT-ATTATCAATTCTCTGAGAATTAACGCTTCAAACAGCGATACCCTAAA---ACACCAACTTTGCAA--TTAGTAA-CAGTTGTAACTACCAT--TTACAGCA---ATGCA-----G-GTAACA--C--A--TA--TCCAA--CTCATTGAA-AGTACAATA------TTTGCA-----AT-AGTGTG-TTTAGGAATGTCGTT-TCACTCCTGACCCA-AGGA-GGCAGGAAGCTCAATAATGTT--TCTCGGTGGTGGCCGA
gi|82692 : ATTGTACTGGAAAATGATTA-CAACTCCCTGAGAATTACCATTTCAAATTTC---ACCTCAAA---CCACCAACTTTACAA--CTA-------------ACTATCAT--ATGCAGCA---GTGCA-----G-GCA--A--C--A--CAACTCTGC--CTCATTGAA-CATACAATACATGTATTTGCA-----AT-ACTATG-CTAAGGAATGTTGAT-CCACTCTGGAACCA-AGCA-GTAAGAAAGGTCAGCAACATT--TCTTGGTGGTGGTTGA
gi|82693 : AAACAATGATACCCTAAA---TCACCAACTTTGCAA--TTAGTAG-CGGTTGTAACTACGTT--TTACAGCA---ATGCA-----G-GCA--A--C--A--CA--TCTAC--CTCGATGAA-AGCACAATT------TTTGCA-----AT-ACAGTG-TTGAGAAATGT--TT-TCAATACTGACCTA-AGGT-GCGGGACAACTCATTAATGTT--TCTCGGTGGCGGCTGA
gi|82694 : CCAAATTCACAAAATCAGTAT-CATGTATAGCCTCCTT--GTGCATTG---ATGCG-----C-GCA--C--G--A--CA--GCCACTTCTCATTGAATAG-ATACTA------TTTGTA-----AT-ACGGGT-TTGTGGTATGTTGTT-TTACTCCTTA---ATAGGC-GT
gi|82695 : AA--TCAGTAT-C--TTGTA-TTAGCCTCCTTAC-GCATTGATGCACGCTCG-GCA--A--C--G---A--CTT----CTCACTGAA-TGGATAATA------TTTGAA-----AT-CC--TGCTTGAGGTATGTT-TT-CTATTCCTGAACAA-ATGC-TCAACGAAGTACATGAACGTTGATTTCAATGAT
gi|82696 : --A--C--A--TA--CCCGC--CTGGTTGAA-AGCACACTA------TTTGCA-----GT-ACATTG-TTGAGAAATGTTATT-CCACACCTGACCCA-AGGCGGGGGGGAAGCTCATCAACGTT--ACTCGGTTGTGGCTGA
gi|82697 : TGTGGAATGTTGTT-CCACGCCTGAATTA-AGGC-TTGTGTTAGTTCATTAACGT
blockSeqs : G C G CAT AA A CC TTG CGCTC T CC CG AT CA TTT TT T CATGTA ATATT C C A C C T G GA
blockSeqs : C . . . . . . . . . AC TT . TG TTT . . . . . . . A C . . .
blockSeqs : G . . . . . . . . . AC . . CA ACT . . . . . . . C C . . .
blockSeqs : G . . . . . . . . . AC . . . C . . . . . . . C C . . .
blockSeqs : C . . . . . . . . . AC . . . T . . . . . . . C A . . .
blockSeqs : C . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . C G . . .
blockSeqs : G . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . C C . . .
blockSeqs : C . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . C T . . .
blockSeqs : G . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . T C . . .
blockSeqs : T . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . A A . . .
blockSeqs : G . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . C C . . .
blockSeqs : C . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . A C . . .
blockSeqs : G . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . C C . . .
blockSeqs : A . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . A T . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . C A . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . A C . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . T . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . C . . . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : ACAAAGTG-TGTGAATTTTATTGGAAAAT-ATTATCAATTCCCTGAGAATTAACGTTTCAAACAGCGATACCCTAAA---TCACCAACTTTGCAA--TTAGTAG-CGGTTGTAACTACCAT--TTACAGCA---ATGCA-----G-GCA--A--C--A--TA--CCCGC--CTCGTTGAA-AGCACAATA------TTTGCA-----AT-ACAGTG-TTGAGAAATGTTGTT-CCACTCCTGACCCA-AGGC-GTGGGAAAGCTCATTAACGTT--TCTCGGTGGTGGCCGA
finalCons : ACAAAGTG-TGTGAATTTTATTGGAAAAT-ATTATCAATTCCCTGAGAATTAACGTTTCAAACAGCGATACCCTAAA---TCACCAACTTTGCAA--TTAGTAG-CGGTTGTAACTACCAT--TTACAGCA---ATGCA-----G-GCA--A--C--A--TA--CCCGC--CTCGTTGAA-AGCACAATA------TTTGCA-----AT-ACAGTG-TTGAGAAATGTTGTT-CCACTCCTGACCCA-AGGC-GTGGGAAAGCTCATTAACGTT--TCTCGGTGGTGGCCGA
Alignments
lowQualScore : 11
lowQualScore : 1 2 2 333 22 2 22 333 55555 2 33 55 22 77 888 22 0 1 555555 44444 1 1 1 4 1 2 2 0 33
lowQualScore : . . . ... .. . .. ... ..... . .. .. .. .. ... .. . . ...... ..... . . . . . . . . ..
lowQualScore : 1 5 2 999 88 0 88 555 00000 0 11 22 66 99 333 66 5 9 555555 88888 9 9 9 1 2 0 1 7 22
consensus : ACAAAGTG-TGTGAATTTTATTGGAAAAT-ATTATCAATTCCCTGAGAATTAACGTTTCAAACAGCGATACCCTAAA---TCACCAACTTTGCAA--TTAGTAG-CGGTTGTAACTACCAT--TTACAGCA---ATGCA-----G-GCA--A--C--A--TA--CCCGC--CTCGTTGAA-AGCACAATA------TTTGCA-----AT-ACAGTG-TTGAGAAATGTTGTT-CCACTCCTGACCCA-AGGC-GTGGGAAAGCTCATTAACGTT--TCTCGGTGGTGGCCGA
Reference ( family-742 ) : ACAAAGTG-TGTGAATTTTATTGGAAAAT-ATTATCAATTCCCTGAGAATTAACGTTTCAAACAGCGATACCCTAAA---TCACCAACTTTGCAA--TTAGTAG-CGGTTGTAACTACCAT--TTACAGCA---ATGCA-----G-GCA--A--C--A--TA--CCCGC--CTCGTTGAA-AGCACAATA------TTTGCA-----AT-ACAGTG-TTGAGAAATGTTGTT-CCACTCCTGACCCA-AGGC-GTGGGAAAGCTCATTAACGTT--TCTCGGTGGTGGCCGA
gi|82675 : ACAAAGTT-TGTGAATTTTATTGGAAAAT-ATTATCAATTCCCTGAGAATTAACGCTTCATACAGTGATACCCTAAA---TCACCAACTTTGCAA--TTAGAAG-CGGTTGTAATTACCAT--TTACAGCA---ACGCA-----G-GCA--A--C--A--TA--GCCGC--CTCGTTGTA-AGCACAATA------TTTGCA-----AT-ACAGTG-TCGAGAAATGTTGTT-CCACTCCTGATCAA-ATGC-ATAGGAAAGCTCATTAACGTT--TCTCTGTGGTGACTGA
gi|82676 : ACAAAGTG-TGTGAATTTTATTGGAAAAT-ATTATCAATTCCCTGAGAATTAACGCTTTAAACAACGACACCCTAAA---TCATCAACTTTGCAA--TTAGTAC-CGGTTGTAACTACCAT--TTACGGCA---ATGCA-----C-GCA--A--C--A--CATTTTCGC--CTCGTTGGA-AGCACAATA------ATTGCAATATTAT-ACAGTG-TTAAGAAATGTTGTT-CCACTCCTGACCCA-AAGT-GTGGGAAAGCTCAATAACGTT--TCTCGGTGGTAGCCGA
gi|82677 : ACAAACTG-TGTGCATTTTATTGGAACAT-ATTAACA-TCCCCTGATAATCAACGTTTCAAACAGCGATACCCTAAA---GCACCAACTTCGCAA--TTTGTAG-CGGTTGTAATTACCAT--TTACAGGA---ATGCA-----G-GCC--A--C--A--TATTTCCGC--CTCGTTGAA-AGGACACTA-------TTGCA-----AT-ACAGTG-TTGAGAAATGTTGTT-ACACTCCTGAATCA-AGGC-GTGTGAAAGCTCAGTTTCGTT--TCTC-GTGGTGGCTGA
gi|82678 : ACAAAGTG-TGTGAATTTTGTTGGAAAAT-TTTATTAATTTCCTGAGAATTTCCGTTTCAAACAGAGAAACCCTAAA---TCACCAACTTTGCAA--TTAGTAG-CGTTTGTAACCACCAT--TTACAGCA---ATGCA-----G-GCACCC--C--A--TA--CCCGC--CTCGTTGAA-AGTACAACA------TTTGCA-----AT-ACAGTG-TTGGGAAATATTGCT-CCACTCCTGACCCA-AGGC-GTGTGAAGGCTCATTAACGTT--TCTCGGTGGTGGCTGA
gi|82679 : ACAAAGTG-AGTTAATTTTATCGGGAAAT-ATTGTCAATTCCCTGAGAATTAATGCT---------GATACCCTAAA---TCACCAACTTTGCAA--TTAGTAG-CGGTTGTAACTACCAT--TTACAGCA---ATGCA-----G-GCA--A--C--ACATA--TCCGC--CTCGTTGAA-ACCACAATA------TTTGCC-----AT-ACAGTG-TTGAGAAATGTTGTT-CCACTCCTGACCCA-AGGC-ATGGGAAAGCTCAGTAACGTT--TCTCGGTTGGGGCCGA
gi|82680 : ACAAACTA-GGTGAATATTATTGGAAAAT-ATTATCAATTAACTGAGAATTAATGTTTGAAACAGCGCTACCCTAAA---TCACCAACTTTGCAA--TTAGTAA-TGGTTGTAACTACCAT--TTACAGCA---ATGCA-----G-GTA--A--C--A--CA--TCTGT--CTTGATAAA-AGCACAATA------TTTGCA-----AT-ACAGTG-TTAAGAAATATTGTT-ACACTTTTGACCAA-ATGC-GTGGGAAAACTCATTAAAGTT--CCTCAGTGGTGGCTGA
gi|82681 : ACAAACTG-TGTGAATTTTATTGGAAAAT-GTTATCAATTCCCCGAGAATTAATGTTTCAAATAGCGATACACTAAA---TCACCAACTTTGCAT--TTAGTAG-AGGTTGTATCTACCAT--TTTCCGCA---ATACA-----G-GCA--A--C--ATGTA--AGTGC--CTCGAAGAA-AGCAGAATA------TTTGCA-----AT-ACAGGG-TTAAGAAA-GATGTT-CCACCTATGACTGA-AGGT-GTGGGAAAGCTCATTATCGTT--TCTCGGTGGTGGCCGA
gi|82682 : ACAAAGTG-TGTAAATTTTATCGGAAAAT-ATTACCAATTCCCTGAGAATTAACGTTTCAGACAGCGATA-CCTAAA---CCATCAACTTTGCAA--CCAGTAG-CGGTTGTAACTACCAT--CTACAGCA---ATAAA-----ATGCAACA--C--A--TA--CCCAC--GTCGTCAAA-AGCACAATA------TTCGCA-----TT-ACAGTA-TTGAGAAATGTTATT-CAACTCCTGACCCA-AAG
gi|82683 : ACAAACTG-TTTGAATTTTATTGGAAAAT-ATTATCAATTCTCTGAAAATTAACGTTTCGAAAAGCGATACCCTAAACATTCACCAACTTTACAA--TGAGTAG-CGGTTGTAACTACCAT--TTACAGCA---ATGCA-----G-GCAACA--C--A--TA--CCTGC--CTCGCTGAA-ATCACAATA------TTTGCA-----AT-AAAGTG-TCGAGAAATGTTGTTACTACTACT
gi|82684 : ACAAAGTG-TGTGAATTTTATTGGAAAAT-ATTATCAATTCCGCGAGAATTAACGCTTCAAACAGCGATACCCTAAA---ACACCAACTTTGCAA--TAAGTAG-CGGTTAAAACTACCAT--TTACAACA---ACGCA-----A-TCAACA--C--A--TA--CCCCC--C------AA-ACCACGATG------CTCGAA-----ATCACGATG-ATGAAA
gi|82685 : ACAAATTG-TGTGAATTTTATTGAGAAAT-AATTTCAATTGTCTGAGAATTCACGTTTTA
gi|82686 : AAAGTG-TTTGACTTTCATTGGAGAAT-ATTATCAATTTCCTGAGAATTAACGTTTCTAACTGCGAAACTCTAAA---TCACCAACTTTGCAA--TTAGTGG-CGTTTGTAACTACCAT--TTACAGCA---A-GCA-----G-GCA--ACGC--A--TT--CCCGC--CTCGTTGAA-AGCACAATA------TTTGCA-----CT-ACAGTG-TTGAGAAATG--GCT-------------------C-GTGGGAAGGCTCATTAACGTT--TCTCGGTGGTGGCCGA
gi|82687 : AAACTA-TGTGAATTTTATTGGAAAAT-ATTATCAGTTC-------------------------GATACCCTAAA---TCACCAACTTTGCAT--TAAGTAG-CGGTTGTAACTACAAT--TAATGGCA---ATGCA-----G-GCA--ATTT--A--TA--CCTGT--CTTGCTAAA-AGCAAAGT----------------------------------AATGTTGTC-GCACTTCTGA-CTA-AGGC-GTGGGAAAGATCATTAAAGTT--TCTCGGTGGTG
gi|82688 : AAGTT-TGTGAAGTTAATTGGAAAAT-ATTATCAATTCCTTGAGAATTTACACTTCAAACACC-ATTC---AAA---TTACCACTTTTGCAA--TTAGTAG-CGGTTGTAACTACCAT--TTACAGCA---ATGCT-----G-GCA--A--C--ACATA--CCCGC--CTCGATGAA-AGCACAATA------TTTGCA-----AT-ACAGTG-TTGAGAAATGTTGTG-CCACTCCTACCTCA-AGGC-GTGGTAAAGCTCATCAACGTT--TTTCAATGGTGGCCGA
gi|82689 : AAATGCTGTCAATTTCATTTGAAAAT-AATAACAATTCCCGGAGAATTGACGTTTCAAACAGCGACACCTCAAA---TCGTCAAC-----AA--TTAGTAAACGGT-------AGCAT--T---------------------------A--C--A--TC--TCCGC--TTCAATGAA-AGCAAAATA------TTTGCA-----AT-ACATTG-TTGGGGTATGTTGTT-CCAATCCTGATCAA-AAGC-ATTGGAACGCTCAATAACGTT--TTACGGTGGTGTCC
gi|82690 : TG-TGTGAGTTTCATTGGAAGCT-ATCAACAATTACCTGAGAATTAACGTTTCAAACAGCGATACACCGAA---TCATCAAGTTTGCAA--TTAGTAA-CTGTTGTAACTATCAT--TTACAGCA---ATATA-----G-GTA--A--CATA--TA--TCCGC--CTCATTGAA-AGCACAATA------TTTGCA-----AA-ACATTG-TTAGGAAATGTTGTT-CCTCTACTGAAACA-ATGC-GTGGGAAATCTCAGTAACGTT--TCTCAGTGGTGGTC
gi|82691 : AATTATATTTGAAAAT-ATTATCAATTCTCTGAGAATTAACGCTTCAAACAGCGATACCCTAAA---ACACCAACTTTGCAA--TTAGTAA-CAGTTGTAACTACCAT--TTACAGCA---ATGCA-----G-GTAACA--C--A--TA--TCCAA--CTCATTGAA-AGTACAATA------TTTGCA-----AT-AGTGTG-TTTAGGAATGTCGTT-TCACTCCTGACCCA-AGGA-GGCAGGAAGCTCAATAATGTT--TCTCGGTGGTGGCCGA
gi|82692 : ATTGTACTGGAAAATGATTA-CAACTCCCTGAGAATTACCATTTCAAATTTC---ACCTCAAA---CCACCAACTTTACAA--CTA-------------ACTATCAT--ATGCAGCA---GTGCA-----G-GCA--A--C--A--CAACTCTGC--CTCATTGAA-CATACAATACATGTATTTGCA-----AT-ACTATG-CTAAGGAATGTTGAT-CCACTCTGGAACCA-AGCA-GTAAGAAAGGTCAGCAACATT--TCTTGGTGGTGGTTGA
gi|82693 : AAACAATGATACCCTAAA---TCACCAACTTTGCAA--TTAGTAG-CGGTTGTAACTACGTT--TTACAGCA---ATGCA-----G-GCA--A--C--A--CA--TCTAC--CTCGATGAA-AGCACAATT------TTTGCA-----AT-ACAGTG-TTGAGAAATGT--TT-TCAATACTGACCTA-AGGT-GCGGGACAACTCATTAATGTT--TCTCGGTGGCGGCTGA
gi|82694 : CCAAATTCACAAAATCAGTAT-CATGTATAGCCTCCTT--GTGCATTG---ATGCG-----C-GCA--C--G--A--CA--GCCACTTCTCATTGAATAG-ATACTA------TTTGTA-----AT-ACGGGT-TTGTGGTATGTTGTT-TTACTCCTTA---ATAGGC-GT
gi|82695 : AA--TCAGTAT-C--TTGTA-TTAGCCTCCTTAC-GCATTGATGCACGCTCG-GCA--A--C--G---A--CTT----CTCACTGAA-TGGATAATA------TTTGAA-----AT-CC--TGCTTGAGGTATGTT-TT-CTATTCCTGAACAA-ATGC-TCAACGAAGTACATGAACGTTGATTTCAATGAT
gi|82696 : --A--C--A--TA--CCCGC--CTGGTTGAA-AGCACACTA------TTTGCA-----GT-ACATTG-TTGAGAAATGTTATT-CCACACCTGACCCA-AGGCGGGGGGGAAGCTCATCAACGTT--ACTCGGTTGTGGCTGA
gi|82697 : TGTGGAATGTTGTT-CCACGCCTGAATTA-AGGC-TTGTGTTAGTTCATTAACGT