lowQualScore : 111111111 1111111111111111111 11111111111 111111111111 11 111 111 666666666666666666666 1
lowQualScore : 777 777 777777777 2 3333 555 2222222222222222222 22 22 1 88888888888 666 4 5 000000000000 44 55 0 7 6 444 777777777 111 222222222222222222222 3 1 4444 6666 0 1 999 2 9999 444 0 4444 9 2 1 33 77
lowQualScore : ... ... ......... . .... ... ................... .. .. . ........... ... . . ............ .. .. . . . ... ......... ... ..................... . . .... .... . . ... . .... ... . .... . . . .. ..
lowQualScore : 888 888 888888888 2 3333 222 1111111111111111111 66 66 6 11111111111 777 2 9 777777777777 88 11 2 1 2 444 666666666 777 444444444444444444444 6 0 0000 7777 2 9 555 1 1111 999 2 7777 4 5 5 22 88
consensus : TATTA---AAA---TGTATTC---------GTCAGCCTTGCAATAT-T--T-T---ATT---A-------GT------AC--AC--CGCA--T-TNTT---A---AAATNTGACCAGCCACCGT-----------TAATC--T-CCCATGGTGTATCACATAGTGGTACAGAATGGN-CTA---------AAAN--TGTGTTAAA--A---AATTAT-T-----A-TT-AAACTGTG----A----TGTTTGT-AAA--NAAGCAC-CC---GGCAG-A-TTGCTCG----TACCTAAAAAGCGCC-ATAATTAAAAAAT--ATT-TTAAAAAA
Reference ( gi|132164 ) : TATTA---AAA---TGTATTC---------GTCAGCCTTGCAATAT-T--T-T---ATT---A-------GT------AC--AC--CACA--T-TATC---A---AAATGTGACCAACCACCGC-----------TAATC--T-CCCATGGTGTATCACATAGTGGTACACAATGGA-CTA---------AAAA--TGTGTTAAA--G---AATTGT-T-----A-TT-AAATTGTG----A----TGTTTGT-AAA--AAAGCAC-CC---AGCAG-A-TTGCTCG----TACCTAAAAAGCGCC-ATAATTAAAAACT--ATC-TTAAAAAA
gi|132163 : TATTA---AAA---TGTATTT---------GTCAGCCTTGCAATAT-T--T-T---ATT---A-------GT------AC--AC--CACA--T-TATT---A---AAATGTGACCAACCGC-GC-----------TAATC--T-CCCATGGTGTATCACATAGTGGTACACAATGGA-AAA---------AAAA--TGTGTTAAA--A---GATT-T-T-----A-TT-GAATTGTG----A----TGTTTGT-AAA--GAAGCAC-CC---GACAG-A-TTGCTCG----TACCTAAAAAGCGCC-ATAATTAAAAAAT--ATC-TTAAAAAA
gi|132167 : TATTG---AAA---AAAGTTC---------GTCAGCCTTGCAATAT-T--T-T---GCT---A-------GT------AC--AC--CACA--C-TATT---A---AAATGTGACCAACCACCGC-----------TAATC--T-TCCATGATGTATCAGATATTGGTACACAATGGA-CTA---------AAAG--TATGTTAAA------AATTGT-TATTAAA-TT-AAATTGTG----A----TGTTTGT-AAA--GAAGCAC-CC---GGCAG-A-TTGCTCG----TACCTAAAAAGCGCC-ATAATTAAAAAAT--ATC-TTAAAAAA
gi|132165 : TATTA---AAA---TATATTT---------GTCAGCTTTGCAATAT-T--C-T---ATT---A-------TT------AA--AC--CACA--T-TTTT---A---AAATGTGACCAACCACCGC-----------TAATC--T-CCCATGGTGTATCACAAAGTGGTACACAATGGA-CTA---------AAAT--TGTGTTAAA--A---AA-TGT-TTTG--A-TT-AAATTGTG----A----TGTTTGT-AAA--GAAGCAC-CC---GGCAG-A-TTGCTCG----TACCTGAAAAGCGCA-ATAATTAAAAAAT--ATC-TTAAATAA
gi|132168 : TATTA---AGA---TGCGTTC---------GTCAGCCTTGCAATAT-T--T-T---ATA---A-------GT------AC--AC--CGCA--T-TGAT---A---AAATGTGAC-AACCCCCCCCCCCCCCCCCTTAATC--T-CCCATGGTGTATCAAACAGTGGTACAGAATGG--TTT---------AAAA--TGTATTAAA--ATGTAATT-T-A-----A-TT-AAACTCTG----A----AATGTGT--AA--TAAGCAC-CC---GGCAG-A-CTGCTCG----TACCCAAAAAGCGCC-ATAATTAAAAAAT--AT
gi|132166 : TATTA---AAA---TGTATTC---------GTCAGCTTTGCAATAT-T--T-T---ATT---A-------GT------AC--AC-----A--T-TATT---A---AAATGTGACCAATCACCGC-----------TAATC--T-CCCATGGTGTATCACATAGTGGTACACAATGGA-CTA---------AAAT--TGTGTTAAAT-A---AAATGT---------TT-AAA
gi|132169 : TATTA---AAA---AGTGTTC---------ATCAGCCTTGCAATAT-T--T-T---ATT---A-------GT------AC--AA--CACA--T-TATT---A---AAATGTAAcaaacttaatattt
gi|132170 : TATTACTCAAA---TGTATTTATGAACAGTGTCAGC--TG-AATAA-G--T-T---ATT---ATCCATCAGC------AT--AT--CGCA--T-TTTTTTTA---AAAACTGACCAGTCACTGT-----------TAATC--GATCCATTTTGCATCA-ATAATGATACAGAATGGT-TTA---------AGAG--TGTGTTAAAACA---AAACAA-A-----G-TT-GAACTGTG----A----AAAATGT-ATATTAGGGCAC-CC---GGCAG-C-TCGTCCA----TACCTAAAAAGTGAA-A-AAT--AAAACTAAATA-GTAAAAAA
gi|132171 : ATTA---AAA---TGTATTC---------GTCAGCCTTGCACTAT-T--T-T---ATT---A-------GT------AC--AC--CACT--T-TATT---A---AGATGTGACCAACCAC-GC-----------TAATC--T-CCCATGGTGTATCACATAGTGGTACACAATGGA-CTA---------AAAA--TGTGTTAAG--A---GGTT-T-T-----A-TT-AAATTGTG----A----TGTTTGTAAAA--AAAGCAG-CC---AGCAG-A-TTGTTCG----TACCTAAAAAGCGCC-ATAATTAAAATAT--ATA-TTAAAAAA
gi|132172 : TTA---AAAGTTTGTATTT---------GTCAGCCTGGCAATATAT--T-T---ATT---A-------G-----------------------------------------ACCAACCCCCGT-----------TAATC--C-ACCAAAGTCTATCATACAGTGATACAATATGG--TTA---------AATATTTGTATTAAA--A---CATTTT-T-------TT-TGATTTTT----T----TTTTTGT-AA
gi|132173 : TCAGCCTTGCAATAC-T--A-T---ATTT--A-------GT------AC--AC--CGCA--C-GGTT---A---AAATTTGACCAACCCCTGT-----------TAATC--T-CCCAGGGTGTGTCACATGGTGGTACACAATGGT-TTA---------AAAT--TAAATTAAA--A---TATTATAT-----ATTT-AAACTGTG----A----AATTTGT-AAA--TAAGCAC-CC---GGCAG-A-TTGCTCA----TACCTAAAAAGCGCC-ATCTTTAAAAAAT--GTT-TTAAAAGA
gi|132174 : TCAGCCTTGCAATAT-T--G-T---ATTT--A-------GT------AC--AC--CGCA--T-GGTT---A---AGATTTGACCAACCCCTGT-----------TAATC--T-CCCAGGGTGTGTCACATAGTGGTACAAAATGGT-TTA---------AAAT--TAAATTAAA--A---TATTATAT-----ATTT-AGACTGTG----A----AATTTGT-AAA--TAAGCAC-CC---GGCAG-A-TTGCTCA----TACCTAAAAAGCGCC-ATCTTTAAAAAAT--GTT-TTAAAAGA
gi|132175 : TCAGCCTTGCAATAT-T--G-T---ATTT--A-------GT------AC--AC--CGCA--C-GGTT---A---AAATTTGACCAACCCCTGT-----------TAATC--T-CCCAGGGTGTGTCAAATGGTGGTACACAATGGT-TTA---------AAAT--TAAATTAAA--A---TATTATAT-----A-TTTAAACTGCG----A----AATTTGT-AAA--TAAGCAC-CC---GGCAG-A-TTGCTCA----TACCTAAAAAGCGCC-ATCTTTAAAAAAT--GTT-TTAAAAGA
gi|132176 : TCAGCCATGCAATAT-T--G-T---ATTT--A-------GA------AC--AC--GGCA--C-GGTT---A---AGATTTGACCAACCCCTGT-----------TAATC--T-CCCAGGGTGTGTCACATAGTGGTACACAATGGT-TTC---------AAAT--TAAATTAAA--A---TATTATAT-----A-TTTAAACTGTG----A----AATTTGT-AAA--TAAGCAC-CC---GGCAG-A-TTGCTCA----TACCTAAAAAGCGCC-ATCTTTAAAAAAT--GTT-TTAAAAGA
gi|132177 : TACAGTAT-TATT-T---ATT---A-------GC------AT--AT--CGCA--T-ATTT---A---AAAACTGACCAGTCACTGT-----------TAATCAAT-CC-ATTTTGCATCA-GTAATGATACAGAATGGA-TTA---------AGAG--TTTGTTAAA--ACAAAAATAA-A-----G-TT-AAACTGTG----AAAAATGTATAT-CTA--AGGACAC-CC---GACAG-C-TCGCACA----TACCGTAAAAGCGCCAATAG-TAAAAAAT--ATT-TTAAAAA
gi|132178 : GTAACAT-T--T-TTAAATT---T-------GTCAAAACAT--AT--CACA--T-ACTC---ACATAGATATGACCAGCTATAAT-----------TAATCG-T-ACCATAGTGCATCACAACGTGATACAGAAGGTT-CTA---------AAAG--TGTATAAAATGG---AATAA--------A-AT-AAACTGTG----A----TGTCTAT-AAA--
gi|132179 : AATAT-T--C-----GTT---A-------AA------AC--ATATCACA--TACAT--------AAACATGACCAGTTATTGT-----------TAATCG-T-ACCAAAGTGCATCACAACGTGATACAGACGGGT-CTA---------AAAT--TGTATTAAA--G---GA-----------A-T--AAACTGTG----A----TGTTTGT-AAA--CAAGCAC-CTGGGGGCA--A-TTCCACC----CACCTAATAAGCG-C-A-AATAAGAAATT--GT--TTAAAAAAc
gi|132180 : ATAT-T--T-TT--ATTTAAA-------AT------AT--AA--CCCA--T-TCGC---ACATAAATATGACCAGTTATTGT-----------TAATCG-T-ACTATAGTGTATTACGCAGTT-TACAGAA-GGATCTAGGTTTTTATAAAA--AGTAATAGA--A---A---------------T-AAACTGTG----A----TGTTTGT-AAA--CTAGCAT-AC---GGGGGCACTTTCACC----CACCTAATAAGCG
gi|132181 : TAT-T--TAT---ATT---C-------GTTAAA--ACGTAT--CACA--TACATA---A---AAATG--ACCAGTCATTGT-----------TAATCG-T-ACCAAAGTGCATCACAACGTGATACA-GATGGGTCTA---------AAAT--TGTATTAAA--G---GAATAG-G-----A-AT-AAACTGTG----A----TGTTTGT-AAA--CAAGCAC-Caaa
gi|132182 : -T---ATC---A-------GC-------T--AT--CGCA--T-TTTTT--A---AAAACTGACCAGTCACTGT-----------TAATC--GATCCATTTTGCATCA-ATAATGATACAGAATGG--TTA---------AAGGG-TGTATTAAA--ACA-AAATAA-A-----G-TT-AAACTGTG----A----AAAATGT-ATATTAGGGCAC-CT---GGCAG------CTCGAAAATACCTAAAAAGTGCCAATAG-TAAAAAAT--ATT-TTAAAAAAtcaataattcatttaagcgaatataattaagaagcagttatt
gi|132183 : ---ATC---A-------GC------AT--AT--CGCACGT-TATTT--A---AAAACTGACCAGTCACTGT-----------TAATCG-T-ACCATTCTGCATCA-ATAATGGTAGAGAATGGT-TTA---------AGAG--TGTGTTAAA--ATA-AAGTGA-C-----G-TT-AAACTGTG----AAA--TATGTAT-AAT--AGGGCAC-CC---GGCAG-C-TCGCGCA----TACCGTAAAAGCGCCAATAA-TAAAAAAT--ATT-TTAAGAAA
gi|132184 : ---ATC---A-------GC------AT--AT--CGCACTT-TATTT--A---AAAACTGACCAGTCACTGT-----------TAATCG-T-ACCATTCTGCATCA-ATAATGGTAAAGAATGGT-TTA---------AGAG--TGTGTTAAAATA---AAGTGA-C-----G-TT-AAACTGTGAAATA----TGTATGT------AGGGCAC-CC---GGCAG----CGCGCA----TACCTTAAAAGTGCCAATAA-TAAAAAAT--ATT-TTAAGAAA
gi|132185 : GA-ATA---------AAAT--TATGTTAAA--A---A--TGC-TTTA--A-TT-AAATTGTG----A----TGTTTGT-AAA--AAAAAACACC---GGCAG-A-T----CG----TACCTAAAAAGCGCC-ATAATTAAAAAAT--ATCGTTAAAAAA
gi|132186 : -TT-AAATTGTG----A----TATATGT-AAA--AAAGCAC-CT---GACAG-A-TTGCTCG----TACCTAAAAAGCGCC-ATAATTAAAAACT--ATT-GTAAAAAA
Alignments
lowQualScore : 111111111 111 11 33333333333333333 1111
lowQualScore : 777 777 666666666 2 33 2 555 111 6666666 999999 22 22 22 333 777 666 22 8888888888 5 44 44 6 2 22 1 44 44 99999999999999999 1 5 3333 1111 44 1 3 2 2 7777 4444 4 4 333 2
lowQualScore : ... ... ......... . .. . ... ... ....... ...... .. .. .. ... ... ... .. .......... . .. .. . . .. . .. .. ................. . . .... .... .. . . . . .... .... . . ... .
lowQualScore : 000 000 000000000 2 11 1 222 000 2222222 555555 66 66 11 333 111 444 55 3333333333 1 00 44 2 2 22 8 66 33 22222222222222222 7 2 9999 6666 55 9 0 0 0 1111 5555 4 4 999 4
consensus : TATTA---AAA---TGTATTC---------GTCAGCCTTGCAATAT-T--T-T---ATT---A-------GT------AC--ACCGCA--TTNT---T---A---AAATNTGAC----------CAGCCACCGTTAATC--T-CCCATGGTGTATCACATAGTGGTACAGAATGGTCTAAA-A-NTGTGTTAAA--A---A--AT--TAT-T--A-TT-AAACTGTG----A----TGTTTGT--A-AANAAG-CAC-CCGGCAG--A-TTGCTCG----TACCTAAAAAGCGCC-A-TAATTAAA---AAATATT-TTAAAAAA
Reference ( family-737 ) : TATTA---AAA---TGTATTC---------GTCAGCCTTGCAATAT-T--T-T---ATT---A-------GT------AC--ACCGCA--TTNT---T---A---AAATNTGAC----------CAGCCACCGTTAATC--T-CCCATGGTGTATCACATAGTGGTACAGAATGGNCTAAA-A-NTGTGTTAAA--A---A--AT--TAT-T--A-TT-AAACTGTG----A----TGTTTGT--A-AANAAG-CAC-CCGGCAG--A-TTGCTCG----TACCTAAAAAGCGCC-A-TAATTAAA---AAATATT-TTAAAAAA
gi|132163 : TATTA---AAA---TGTATTT---------GTCAGCCTTGCAATAT-T--T-T---ATT---A-------GT------AC--ACCACA--TTAT---T---A---AAATGTGAC----------CAACCGC-GCTAATC--T-CCCATGGTGTATCACATAGTGGTACACAATGGAAAAAA-A-ATGTGTTAAA--A---G--AT--T-T-T--A-TT-GAATTGTG----A----TGTTTGT--A-AAGAAG-CAC-CCGACAG--A-TTGCTCG----TACCTAAAAAGCGCC-A-TAATTAAA---AAATATC-TTAAAAAA
gi|132164 : TATTA---AAA---TGTATTC---------GTCAGCCTTGCAATAT-T--T-T---ATT---A-------GT------AC--ACCACA--TTAT---C---A---AAATGTGAC----------CAACCACCGCTAATC--T-CCCATGGTGTATCACATAGTGGTACACAATGGACTAAA-A-ATGTGTTAAA--G---A--AT--TGT-T--A-TT-AAATTGTG----A----TGTTTGT--A-AAAAAG-CAC-CCAGCAG--A-TTGCTCG----TACCTAAAAAGCGCC-A-TAATTAAA---AACTATC-TTAAAAAA
gi|132165 : TATTA---AAA---TATATTT---------GTCAGCTTTGCAATAT-T--C-T---ATT---A-------TT------AA--ACCACA--TTTT---T---A---AAATGTGAC----------CAACCACCGCTAATC--T-CCCATGGTGTATCACAAAGTGGTACACAATGGACTAAA-A-TTGTGTTAAA--A---A--ATG-TTT-TG-A-TT-AAATTGTG----A----TGTTTGT--A-AAGAAG-CAC-CCGGCAG--A-TTGCTCG----TACCTGAAAAGCGCA-A-TAATTAAA---AAATATC-TTAAATAA
gi|132166 : TATTA---AAA---TGTATTC---------GTCAGCTTTGCAATAT-T--T-T---ATT---A-------GT------AC--AC---A--TTAT---T---A---AAATGTGAC----------CAATCACCGCTAATC--T-CCCATGGTGTATCACATAGTGGTACACAATGGACTAAA-A-TTGTGTTAAAT-A---A--AA--TGT-TTAA-AC-AAACT-TA----A----TATTT
gi|132167 : TATTG---AAA---AAAGTTC---------GTCAGCCTTGCAATAT-T--T-T---GCT---A-------GT------AC--ACCACA--CTAT---T---A---AAATGTGAC----------CAACCACCGCTAATC--T-TCCATGATGTATCAGATATTGGTACACAATGGACTAAA-A-GTATGTTAAA--A---ATTGT--TAT-TAAA-TT-AAATTGTG----A----TGTTTGT--A-AAGAAG-CAC-CCGGCAG--A-TTGCTCG----TACCTAAAAAGCGCC-A-TAATTAAA---AAATATC-TTAAAAAA
gi|132168 : TATTA---AGA---TGCGTTC---------GTCAGCCTTGCAATAT-T--T-T---ATA---A-------GT------AC--ACCGCA--TTGA---T---A---AAATGTGACAACCCCCCCCCCCCCCCCCTTAATC--T-CCCATGGTGTATCAAACAGTGGTACAGAATGGTTTAAA-A--TGTATTAAA--ATGTA--AT--T-T-A--A-TT-AAACTCTG----A----AATGTGT----AATAAG-CAC-CCGGCAG--A-CTGCTCG----TACCCAAAAAGCGCC-A-TAATTAAA---AAATAT
gi|132169 : TATTA---AAA---AGTGTTC---------ATCAGCCTTGCAATAT-T--T-T---ATT---A-------GT------AC--AACACA--TTAT---T---A---AAATGTAA
gi|132170 : TATTACTCAAA---TGTATTTATGAACAGTGTCAGC--TG-AATAA-G--T-T---ATT---ATCCATCAGC------AT--ATCGCA--TTTT---TTTTA---AAAACTGAC----------CAGTCACTGTTAATC--GATCCATTTTGCATCA-ATAATGATACAGAATGGTTTAAG-A-GTGTGTTAAAACA---A--AA--CAA-A--G-TT-GAACTGTGAAAAA----TGTATAT--T-AGG--G-CAC-CCGGCAG--C-TCGTCCA----TACCTAAAAAGTG---A-AAAATAAAACTAAATA---GTAAAAAA
gi|132171 : ATTA---AAA---TGTATTC---------GTCAGCCTTGCACTAT-T--T-T---ATT---A-------GT------AC--ACCACT--TTAT---T---A---AGATGTGAC----------CAACCAC-GCTAATC--T-CCCATGGTGTATCACATAGTGGTACACAATGGACTAAA-A-ATGTGTTAAG--A---G--GT--T-T-T--A-TT-AAATTGTG----A----TGTTTGTA-A-AAAAAG-CAG-CCAGCAG--A-TTGTTCG----TACCTAAAAAGCGCC-A-TAATTAAA---ATATATA-TTAAAAAA
gi|132172 : TTA---AAAGTTTGTATTT---------GTCAGCCTGGCAATATAT--T-T---ATT---A-------G-----------------------------------------AC----------CAACCCCCGTTAATC--C-ACCAAAGTCTATCATACAGTGATACAATATGGT-TAAATATTTGTATTAAA--A---C--AT--TTT-T--T-TT-GA
gi|132173 : TCAGCCTTGCAATAC-T--A-T---ATTT--A-------GT------AC--ACCGCA--CGGT---T---A---AAATTTGAC----------CAACCCCTGTTAATC--T-CCCAGGGTGTGTCACATGGTGGTACACAATGGTTTAAA-A-TTAAATTAAA--A---T--AT--TATAT--A-TTTAAACTGTG----A----AATTTGT--A-AATAAG-CAC-CCGGCAG--A-TTGCTCA----TACCTAAAAAGCGCC-A-TCTTTAAA---AAATGTT-TTAAAAGAtttttttttttgtaa
gi|132174 : TCAGCCTTGCAATAT-T--G-T---ATTT--A-------GT------AC--ACCGCA--TGGT---T---A---AGATTTGAC----------CAACCCCTGTTAATC--T-CCCAGGGTGTGTCACATAGTGGTACAAAATGGTTTAAA-A-TTAAATTAAA--A---T--AT--TATAT--ATTT-AGACTGTG----A----AATTTGT--A-AATAAG-CAC-CCGGCAG--A-TTGCTCA----TACCTAAAAAGCGCC-A-TCTTTAAA---AAATGTT-TTAAAAGA
gi|132175 : TCAGCCTTGCAATAT-T--G-T---ATTT--A-------GT------AC--ACCGCA--CGGT---T---A---AAATTTGAC----------CAACCCCTGTTAATC--T-CCCAGGGTGTGTCAAATGGTGGTACACAATGGTTTAAA-A-TTAAATTAAA--A---T--AT--TATAT--A-TTTAAACTGCG----A----AATTTGT--A-AATAAG-CAC-CCGGCAG--A-TTGCTCA----TACCTAAAAAGCGCC-A-TCTTTAAA---AAATGTT-TTAAAAGA
gi|132176 : TCAGCCATGCAATAT-T--G-T---ATTT--A-------GA------AC--ACGGCA--CGGT---T---A---AGATTTGAC----------CAACCCCTGTTAATC--T-CCCAGGGTGTGTCACATAGTGGTACACAATGGTTTCAA-A-TTAAATTAAA--A---T--AT--TATAT--A-TTTAAACTGTG----A----AATTTGT--A-AATAAG-CAC-CCGGCAG--A-TTGCTCA----TACCTAAAAAGCGCC-A-TCTTTAAA---AAATGTT-TTAAAAGA
gi|132177 : TACAGTAT-TATT-T---ATT---A-------GC------AT--ATCGCA--TATT---T---A---AAAACTGAC----------CAGTCACTGTTAATCAAT-CC-ATTTTGCATCA-GTAATGATACAGAATGGATTAAG-A-GTTTGTTAAA--ACAAA--AA--TAA-A--G-TT-AAACTGTG----AAAAATGTATATCTA-AGGA---CAC-CCGACAG--C-TCGCACA----TACCGTAAAAGCGCC-AATAGT-AAA---AAATATT-TTAAAAA
gi|132178 : GTAACAT-T--T-TTAAATT---T-------GTCAAAACAT--ATCACA--TACT---C---ACATAGATATGAC----------CAGCTATAATTAATCG-T-ACCATAGTGCATCACAACGTGATACAGAAGGTTCTAAA-A-GTGTAT-AAA--ATGGA--AT--AA-----A-AT-AAACTGTG----A----TGTCTAT--A-AA
gi|132179 : ---AAACATGAC----------CAGTTATTGTTAATCG-T-ACCAAAGTGCATCACAACGTGATACAGACGGGTCTAAA-A-TTGTATTAAA--G---G--A----------A-T--AAACTGTG----A----TGTTTGT--A-AACAAG-CAC-CTGGGGGCAA-TTCCACC----CACCTAATAAGCGC-----AAATAAG---AAATTGT-TTAAAAAAc
gi|132180 : aatattcgttaaaacatatcacatacatATAT-T--T-TT--ATTTAAA-------AT------AT--AACCCA--TTCG---C---ACATAAATATGAC----------CAGTTATTGTTAATCG-T-ACTATAGTGTATTACGCAGTT-TACAGAAGGATCTAGG-T-TTTTAT-AAA--A---A--GTAATAG-A--A-AT-AAACTGTG----A----TGTTTGT--A-AACTAG-CAT-ACGGGGGC-ACTTTCACC----CACCTAATAAGCG
gi|132181 : TAT-T--TAT---ATT---C-------GTTAAA--ACGTATCACA--TACA---T---A---AAA-ATGAC----------CAGTCATTGTTAATCG-T-ACCAAAGTGCATCACAACGTGATACAGATGGGTCTAAA-A-TTGTATTAAA--G---G--AA--TAG-G--A-AT-AAACTGTG----A----TGTTTGT--A-AACAAG-CAC-Caaa
gi|132182 : -T---ATC---A-------GC-------T--ATCGCA--TTTT---TT--A---AAAACTGAC----------CAGTCACTGTTAATC--GATCCATTTTGCATCA-ATAATGATACAGAATGGTTAAAG-G-GTGTATTAAA--ACA-A--AA--TAA-A--G-TT-AAACTGTG----AAAAATGTATAT--T-AGG--G-CAC-CTGGCAG-------CTCGAAAATACCTAAAAAGTGCCAA-TAG-TAAA---AAATATT-TTAAAAAAtcaataattcatttaagcgaatataattaagaagcagttatt
gi|132183 : ---ATC---A-------GC------AT--ATCGCACGTTAT---TT--A---AAAACTGAC----------CAGTCACTGTTAATCG-T-ACCATTCTGCATCA-ATAATGGTAGAGAATGGTTTAAG-A-GTGTGTTAAA--ATA-A--AG--TGA-C--G-TT-AAACTGTG----A----AATATGT--ATAATAGGGCAC-CCGGCAG--C-TCGCGCA----TACCGTAAAAGCGCCAA-TAA-TAAA---AAATATT-TTAAGAAA
gi|132184 : ---ATC---A-------GC------AT--ATCGCA--CTTTATTT---A---AAAACTGAC----------CAGTCACTGTTAATCG-T-ACCATTCTGCATCA-ATAATGGTAAAGAATGGTTTAAG-A-GTGTGTTAAA--ATA-A--AG--TGA-C--G-TT-AAACTGTG----AAATATGTATGT--A-GG---G-CAC-CCGGCAG-----CGCGCA----TACCTTAAAAGTGCC-AATAAT-AAA---AAATATT-TTAAGAAA
gi|132185 : TAAA-A-TTATGTTAAA--A---AT-GC--TTT-A--A-TT-AAATTGTG----A----TGTTTGT--A-AAAAAA-AACACCGGCAG--A-T----CG----TACCTAAAAAGCGCC-A-TAATTAAA---AAATATCGTTAAAAAA
gi|132186 : gaa-TT-AAATTGTG----A----TATATGT--A-AAAAAG-CAC-CTGACAG--A-TTGCTCG----TACCTAAAAAGCGCC-A-TAATTAAA---AACTATT-GTAAAAAA
Alignments
lowQualScore : 111111111 111 11 33333333333333333 1111
lowQualScore : 777 777 666666666 2 33 2 555 111 6666666 999999 22 22 22 333 777 666 22 8888888888 5 44 44 6 2 1 1 44 44 99999999999999999 1 5 3333 1111 44 1 3 2 2 7777 4444 4 4 333 2
lowQualScore : ... ... ......... . .. . ... ... ....... ...... .. .. .. ... ... ... .. .......... . .. .. . . . . .. .. ................. . . .... .... .. . . . . .... .... . . ... .
lowQualScore : 000 000 000000000 2 11 1 222 000 2222222 555555 66 66 11 333 111 444 55 3333333333 1 00 44 2 2 2 8 66 33 22222222222222222 7 2 9999 6666 55 9 0 0 0 1111 5555 4 4 999 4
consensus : TATTA---AAA---TGTATTC---------GTCAGCCTTGCAATAT-T--T-T---ATT---A-------GT------AC--ACCGCA--TTNT---T---A---AAATNTGAC----------CAGCCACCGTTAATC--T-CCCATGGTGTATCACATAGTGGTACAGAATGGTCTAAA-A-NTGTGTTAAA--A---A--AT--TAT-T--A-TT-AAACTGTG----A----TGTTTGT--A-AANAAG-CAC-CCGGCAG--A-TTGCTCG----TACCTAAAAAGCGCC-A-TAATTAAA---AAATATT-TTAAAAAA
Reference ( family-737 ) : TATTA---AAA---TGTATTC---------GTCAGCCTTGCAATAT-T--T-T---ATT---A-------GT------AC--ACCGCA--TTNT---T---A---AAATNTGAC----------CAGCCACCGTTAATC--T-CCCATGGTGTATCACATAGTGGTACAGAATGGTCTAAA-A-NTGTGTTAAA--A---A--AT--TAT-T--A-TT-AAACTGTG----A----TGTTTGT--A-AANAAG-CAC-CCGGCAG--A-TTGCTCG----TACCTAAAAAGCGCC-A-TAATTAAA---AAATATT-TTAAAAAA
gi|132163 : TATTA---AAA---TGTATTT---------GTCAGCCTTGCAATAT-T--T-T---ATT---A-------GT------AC--ACCACA--TTAT---T---A---AAATGTGAC----------CAACCGC-GCTAATC--T-CCCATGGTGTATCACATAGTGGTACACAATGGAAAAAA-A-ATGTGTTAAA--A---G--AT--T-T-T--A-TT-GAATTGTG----A----TGTTTGT--A-AAGAAG-CAC-CCGACAG--A-TTGCTCG----TACCTAAAAAGCGCC-A-TAATTAAA---AAATATC-TTAAAAAA
gi|132164 : TATTA---AAA---TGTATTC---------GTCAGCCTTGCAATAT-T--T-T---ATT---A-------GT------AC--ACCACA--TTAT---C---A---AAATGTGAC----------CAACCACCGCTAATC--T-CCCATGGTGTATCACATAGTGGTACACAATGGACTAAA-A-ATGTGTTAAA--G---A--AT--TGT-T--A-TT-AAATTGTG----A----TGTTTGT--A-AAAAAG-CAC-CCAGCAG--A-TTGCTCG----TACCTAAAAAGCGCC-A-TAATTAAA---AACTATC-TTAAAAAA
gi|132165 : TATTA---AAA---TATATTT---------GTCAGCTTTGCAATAT-T--C-T---ATT---A-------TT------AA--ACCACA--TTTT---T---A---AAATGTGAC----------CAACCACCGCTAATC--T-CCCATGGTGTATCACAAAGTGGTACACAATGGACTAAA-A-TTGTGTTAAA--A---A--ATG-TTT-TG-A-TT-AAATTGTG----A----TGTTTGT--A-AAGAAG-CAC-CCGGCAG--A-TTGCTCG----TACCTGAAAAGCGCA-A-TAATTAAA---AAATATC-TTAAATAA
gi|132166 : TATTA---AAA---TGTATTC---------GTCAGCTTTGCAATAT-T--T-T---ATT---A-------GT------AC--AC---A--TTAT---T---A---AAATGTGAC----------CAATCACCGCTAATC--T-CCCATGGTGTATCACATAGTGGTACACAATGGACTAAA-A-TTGTGTTAAAT-A---A--AA--TGT-TTAA-AC-AAACT-TA----A----TATTT
gi|132167 : TATTG---AAA---AAAGTTC---------GTCAGCCTTGCAATAT-T--T-T---GCT---A-------GT------AC--ACCACA--CTAT---T---A---AAATGTGAC----------CAACCACCGCTAATC--T-TCCATGATGTATCAGATATTGGTACACAATGGACTAAA-A-GTATGTTAAA--A---ATTGT--TAT-TAAA-TT-AAATTGTG----A----TGTTTGT--A-AAGAAG-CAC-CCGGCAG--A-TTGCTCG----TACCTAAAAAGCGCC-A-TAATTAAA---AAATATC-TTAAAAAA
gi|132168 : TATTA---AGA---TGCGTTC---------GTCAGCCTTGCAATAT-T--T-T---ATA---A-------GT------AC--ACCGCA--TTGA---T---A---AAATGTGACAACCCCCCCCCCCCCCCCCTTAATC--T-CCCATGGTGTATCAAACAGTGGTACAGAATGGTTTAAA-A--TGTATTAAA--ATGTA--AT--T-T-A--A-TT-AAACTCTG----A----AATGTGT----AATAAG-CAC-CCGGCAG--A-CTGCTCG----TACCCAAAAAGCGCC-A-TAATTAAA---AAATAT
gi|132169 : TATTA---AAA---AGTGTTC---------ATCAGCCTTGCAATAT-T--T-T---ATT---A-------GT------AC--AACACA--TTAT---T---A---AAATGTAA
gi|132170 : TATTACTCAAA---TGTATTTATGAACAGTGTCAGC--TG-AATAA-G--T-T---ATT---ATCCATCAGC------AT--ATCGCA--TTTT---TTTTA---AAAACTGAC----------CAGTCACTGTTAATC--GATCCATTTTGCATCA-ATAATGATACAGAATGGTTTAAG-A-GTGTGTTAAAACA---A--AA--CAA-A--G-TT-GAACTGTGAAAAA----TGTATAT--T-AGG--G-CAC-CCGGCAG--C-TCGTCCA----TACCTAAAAAGTG---A-AAAATAAAACTAAATA---GTAAAAAA
gi|132171 : ATTA---AAA---TGTATTC---------GTCAGCCTTGCACTAT-T--T-T---ATT---A-------GT------AC--ACCACT--TTAT---T---A---AGATGTGAC----------CAACCAC-GCTAATC--T-CCCATGGTGTATCACATAGTGGTACACAATGGACTAAA-A-ATGTGTTAAG--A---G--GT--T-T-T--A-TT-AAATTGTG----A----TGTTTGTA-A-AAAAAG-CAG-CCAGCAG--A-TTGTTCG----TACCTAAAAAGCGCC-A-TAATTAAA---ATATATA-TTAAAAAA
gi|132172 : TTA---AAAGTTTGTATTT---------GTCAGCCTGGCAATATAT--T-T---ATT---A-------G-----------------------------------------AC----------CAACCCCCGTTAATC--C-ACCAAAGTCTATCATACAGTGATACAATATGGT-TAAATATTTGTATTAAA--A---C--AT--TTT-T--T-TT-GA
gi|132173 : TCAGCCTTGCAATAC-T--A-T---ATTT--A-------GT------AC--ACCGCA--CGGT---T---A---AAATTTGAC----------CAACCCCTGTTAATC--T-CCCAGGGTGTGTCACATGGTGGTACACAATGGTTTAAA-A-TTAAATTAAA--A---T--AT--TATAT--A-TTTAAACTGTG----A----AATTTGT--A-AATAAG-CAC-CCGGCAG--A-TTGCTCA----TACCTAAAAAGCGCC-A-TCTTTAAA---AAATGTT-TTAAAAGAtttttttttttgtaa
gi|132174 : TCAGCCTTGCAATAT-T--G-T---ATTT--A-------GT------AC--ACCGCA--TGGT---T---A---AGATTTGAC----------CAACCCCTGTTAATC--T-CCCAGGGTGTGTCACATAGTGGTACAAAATGGTTTAAA-A-TTAAATTAAA--A---T--AT--TATAT--ATTT-AGACTGTG----A----AATTTGT--A-AATAAG-CAC-CCGGCAG--A-TTGCTCA----TACCTAAAAAGCGCC-A-TCTTTAAA---AAATGTT-TTAAAAGA
gi|132175 : TCAGCCTTGCAATAT-T--G-T---ATTT--A-------GT------AC--ACCGCA--CGGT---T---A---AAATTTGAC----------CAACCCCTGTTAATC--T-CCCAGGGTGTGTCAAATGGTGGTACACAATGGTTTAAA-A-TTAAATTAAA--A---T--AT--TATAT--A-TTTAAACTGCG----A----AATTTGT--A-AATAAG-CAC-CCGGCAG--A-TTGCTCA----TACCTAAAAAGCGCC-A-TCTTTAAA---AAATGTT-TTAAAAGA
gi|132176 : TCAGCCATGCAATAT-T--G-T---ATTT--A-------GA------AC--ACGGCA--CGGT---T---A---AGATTTGAC----------CAACCCCTGTTAATC--T-CCCAGGGTGTGTCACATAGTGGTACACAATGGTTTCAA-A-TTAAATTAAA--A---T--AT--TATAT--A-TTTAAACTGTG----A----AATTTGT--A-AATAAG-CAC-CCGGCAG--A-TTGCTCA----TACCTAAAAAGCGCC-A-TCTTTAAA---AAATGTT-TTAAAAGA
gi|132177 : TACAGTAT-TATT-T---ATT---A-------GC------AT--ATCGCA--TATT---T---A---AAAACTGAC----------CAGTCACTGTTAATCAAT-CC-ATTTTGCATCA-GTAATGATACAGAATGGATTAAG-A-GTTTGTTAAA--ACAAA--AA--TAA-A--G-TT-AAACTGTG----AAAAATGTATATCTA-AGGA---CAC-CCGACAG--C-TCGCACA----TACCGTAAAAGCGCC-AATAGT-AAA---AAATATT-TTAAAAA
gi|132178 : GTAACAT-T--T-TTAAATT---T-------GTCAAAACAT--ATCACA--TACT---C---ACATAGATATGAC----------CAGCTATAATTAATCG-T-ACCATAGTGCATCACAACGTGATACAGAAGGTTCTAAA-A-GTGTAT-AAA--ATGGA--AT--AA-----A-AT-AAACTGTG----A----TGTCTAT--A-AA
gi|132179 : ---AAACATGAC----------CAGTTATTGTTAATCG-T-ACCAAAGTGCATCACAACGTGATACAGACGGGTCTAAA-A-TTGTATTAAA--G---G--A----------A-T--AAACTGTG----A----TGTTTGT--A-AACAAG-CAC-CTGGGGGCAA-TTCCACC----CACCTAATAAGCGC-----AAATAAG---AAATTGT-TTAAAAAAc
gi|132180 : aatattcgttaaaacatatcacatacatATAT-T--T-TT--ATTTAAA-------AT------AT--AACCCA--TTCG---C---ACATAAATATGAC----------CAGTTATTGTTAATCG-T-ACTATAGTGTATTACGCAGTT-TACAGAAGGATCTAGG-T-TTTTAT-AAA--A---A--GTAATAG-A--A-AT-AAACTGTG----A----TGTTTGT--A-AACTAG-CAT-ACGGGGGC-ACTTTCACC----CACCTAATAAGCG
gi|132181 : TAT-T--TAT---ATT---C-------GTTAAA--ACGTATCACA--TACA---T---A---AAA-ATGAC----------CAGTCATTGTTAATCG-T-ACCAAAGTGCATCACAACGTGATACAGATGGGTCTAAA-A-TTGTATTAAA--G---G--AA--TAG-G--A-AT-AAACTGTG----A----TGTTTGT--A-AACAAG-CAC-Caaa
gi|132182 : -T---ATC---A-------GC-------T--ATCGCA--TTTT---TT--A---AAAACTGAC----------CAGTCACTGTTAATC--GATCCATTTTGCATCA-ATAATGATACAGAATGGTTAAAG-G-GTGTATTAAA--ACA-A--AA--TAA-A--G-TT-AAACTGTG----AAAAATGTATAT--T-AGG--G-CAC-CTGGCAG-------CTCGAAAATACCTAAAAAGTGCCAA-TAG-TAAA---AAATATT-TTAAAAAAtcaataattcatttaagcgaatataattaagaagcagttatt
gi|132183 : ---ATC---A-------GC------AT--ATCGCACGTTAT---TT--A---AAAACTGAC----------CAGTCACTGTTAATCG-T-ACCATTCTGCATCA-ATAATGGTAGAGAATGGTTTAAG-A-GTGTGTTAAA--ATA-A--AG--TGA-C--G-TT-AAACTGTG----A----AATATGT--ATAATAGGGCAC-CCGGCAG--C-TCGCGCA----TACCGTAAAAGCGCCAA-TAA-TAAA---AAATATT-TTAAGAAA
gi|132184 : ---ATC---A-------GC------AT--ATCGCA--CTTTATTT---A---AAAACTGAC----------CAGTCACTGTTAATCG-T-ACCATTCTGCATCA-ATAATGGTAAAGAATGGTTTAAG-A-GTGTGTTAAA--ATA-A--AG--TGA-C--G-TT-AAACTGTG----AAATATGTATGT--A-GG---G-CAC-CCGGCAG-----CGCGCA----TACCTTAAAAGTGCC-AATAAT-AAA---AAATATT-TTAAGAAA
gi|132185 : TAAA-A-TTATGTTAAA--A---AT-GC--TTT-A--A-TT-AAATTGTG----A----TGTTTGT--A-AAAAAA-AACACCGGCAG--A-T----CG----TACCTAAAAAGCGCC-A-TAATTAAA---AAATATCGTTAAAAAA
gi|132186 : gaa-TT-AAATTGTG----A----TATATGT--A-AAAAAG-CAC-CTGACAG--A-TTGCTCG----TACCTAAAAAGCGCC-A-TAATTAAA---AACTATT-GTAAAAAA
blockSeqs : CTC GTT ATGAACAGT A AT A TAA TAA TCCATCA CAAAAC GT CG TA ATT TTT CAT TG AACCCCCCCC C AA AT C C C T TT AC ATTGTTATTAA T T AAAA AAAA CT T A G A CAA AAAA A A ACT G
blockSeqs : . . . . . . T T . TAAA . . TT . T CAT TG . C G AT C C C . A T CAAAAATAAA . T . AAAA A . G . . CAC . A A . .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . . TA . T . TG . C G C C C C . T . AATGTTTTG . T . AATA . . G . . A . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . . TA . . . TG . C G C G C C . T . AAATGTTTA . . . . . . T . . A . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . . TG . . . TG . C G C A G T . G . TGTAATTTA . . . . . . G . . A . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . TA . . . TG . T G T C G T . G . AGTAATAGA . . . . . . A . . A . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . TT . . . AC . C G C T C C . A . CAAAATAAA . . . . . . T . . C . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . TA . . . TG . T . C C A T . T . TAAAGTGAC . . . . . . T . . A . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . GG . . . TT . T . A C C T . T . TAAAGTGAC . . . . . . T . . A . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . GG . . . TT . T . C A A T . T . TATTATAT . . . . . . T . . A . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . GG . . . TT . T . C C C T . T . TATTATAT . . . . . . G . . A . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . GG . . . TT . T . C C C T . G . TATTATAT . . . . . . C . . A . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . AT . . . AC . A . C C G C . G . TATTATAT . . . . . . C . . C . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . AC . . . TA . T . C C G C . T . TGGAATAA . . . . . . C . . C . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . TC . . . CA . T . A C G C . T . ATGCTTTA . . . . . . G . . A . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . AC . . . TA . T . A . G C . T . AATTGTT . . . . . . T . . A . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . TT . . . AC . T . A . G T . G . AAACAAA . . . . . . A . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . TA . . . AC . T . A . G T . G . CATTTTT . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . TT . . . AC . T . A . G T . G . GAATAGG . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . A . . . A . G . . T . GGTTTT . . . . . .
blockSeqs : . . . . . GA . . . .
blockSeqs : . .
blockSeqCons : TATTATAN*********
originalCons : TATTA---AAA---TGTATTC---------GTCAGCCTTGCAATAT-T--T-T---ATT---A-------GT------AC--ACCGCA--TTNT---T---A---AAATNTGAC----------CAGCCACCGTTAATC--T-CCCATGGTGTATCACATAGTGGTACAGAATGGTCTAAA-A-NTGTGTTAAA--A---A--AT--TAT-T--A-TT-AAACTGTG----A----TGTTTGT--A-AANAAG-CAC-CCGGCAG--A-TTGCTCG----TACCTAAAAAGCGCC-A-TAATTAAA---AAATATT-TTAAAAAA
finalCons : TATTA---AAA---TGTATTC---------GTCAGCCTTGCAATAT-T--T-T---ATT---A-------GT------AC--ACCGCA--TTNT---T---A---AAATNTGAC----------CAGCCACCGTTAATC--T-CCCATGGTGTATCACATAGTGGTACAGAATGGTCTAAA-A-NTGTGTTAAA--ATATTATAN---------A-TT-AAACTGTG----A----TGTTTGT--A-AANAAG-CAC-CCGGCAG--A-TTGCTCG----TACCTAAAAAGCGCC-A-TAATTAAA---AAATATT-TTAAAAAA
Alignments
lowQualScore : 111111111 111 11 222222222222222 1111
lowQualScore : 777 777 666666666 2 33 2 555 111 6666666 999999 22 22 22 333 777 666 22 8888888888 2 44 44 6 2 1 1 44 3333 444444444444444 1 3333 1111 44 1 3 2 2 7777 4444 4 4 333 2
lowQualScore : ... ... ......... . .. . ... ... ....... ...... .. .. .. ... ... ... .. .......... . .. .. . . . . .. .... ............... . .... .... .. . . . . .... .... . . ... .
lowQualScore : 000 000 000000000 2 11 1 222 000 2222222 555555 66 66 11 333 111 444 55 3333333333 7 00 44 2 2 2 8 66 9999 222222222222222 8 9999 6666 55 9 0 0 0 1111 5555 4 4 999 4
consensus : TATTA---AAA---TGTATTC---------GTCAGCCTTGCAATAT-T--T-T---ATT---A-------GT------AC--ACCGCA--TTNT---T---A---AAATNTGAC----------CAGCCACCGTTAATC--T-CCCATGGTGTATCACATAGTGGTACAGAATGGTCTAAA-A-NTGTGT----TAAAA--TAT-TA-T-ANA-TT-AAACTGTG----A----TGTTTGT--A-AANAAG-CAC-CCGGCAG--A-TTGCTCG----TACCTAAAAAGCGCC-A-TAATTAAA---AAATATT-TTAAAAAA
Reference ( family-737 ) : TATTA---AAA---TGTATTC---------GTCAGCCTTGCAATAT-T--T-T---ATT---A-------GT------AC--ACCGCA--TTNT---T---A---AAATNTGAC----------CAGCCACCGTTAATC--T-CCCATGGTGTATCACATAGTGGTACAGAATGGTCTAAA-A-NTGTGT----TAAAA--TAT-TA-T-ANA-TT-AAACTGTG----A----TGTTTGT--A-AANAAG-CAC-CCGGCAG--A-TTGCTCG----TACCTAAAAAGCGCC-A-TAATTAAA---AAATATT-TTAAAAAA
gi|132163 : TATTA---AAA---TGTATTT---------GTCAGCCTTGCAATAT-T--T-T---ATT---A-------GT------AC--ACCACA--TTAT---T---A---AAATGTGAC----------CAACCGC-GCTAATC--T-CCCATGGTGTATCACATAGTGGTACACAATGGAAAAAA-A-ATGTGT----TAAAA--GAT-TT-T-A---TT-GAATTGTG----A----TGTTTGT--A-AAGAAG-CAC-CCGACAG--A-TTGCTCG----TACCTAAAAAGCGCC-A-TAATTAAA---AAATATC-TTAAAAAA
gi|132164 : TATTA---AAA---TGTATTC---------GTCAGCCTTGCAATAT-T--T-T---ATT---A-------GT------AC--ACCACA--TTAT---C---A---AAATGTGAC----------CAACCACCGCTAATC--T-CCCATGGTGTATCACATAGTGGTACACAATGGACTAAA-A-ATGTGT----TAAAG--AAT-TG-T--TA-TT-AAATTGTG----A----TGTTTGT--A-AAAAAG-CAC-CCAGCAG--A-TTGCTCG----TACCTAAAAAGCGCC-A-TAATTAAA---AACTATC-TTAAAAAA
gi|132165 : TATTA---AAA---TATATTT---------GTCAGCTTTGCAATAT-T--C-T---ATT---A-------TT------AA--ACCACA--TTTT---T---A---AAATGTGAC----------CAACCACCGCTAATC--T-CCCATGGTGTATCACAAAGTGGTACACAATGGACTAAA-A-TTGTGT----TAAAA--AATGTT-T-TGA-TT-AAATTGTG----A----TGTTTGT--A-AAGAAG-CAC-CCGGCAG--A-TTGCTCG----TACCTGAAAAGCGCA-A-TAATTAAA---AAATATC-TTAAATAA
gi|132166 : TATTA---AAA---TGTATTC---------GTCAGCTTTGCAATAT-T--T-T---ATT---A-------GT------AC--AC---A--TTAT---T---A---AAATGTGAC----------CAATCACCGCTAATC--T-CCCATGGTGTATCACATAGTGGTACACAATGGACTAAA-A-TTGTGTTAAATAAAA--TGT-T--T-AAA--C-AAACT-TA----A----TATTT
gi|132167 : TATTG---AAA---AAAGTTC---------GTCAGCCTTGCAATAT-T--T-T---GCT---A-------GT------AC--ACCACA--CTAT---T---A---AAATGTGAC----------CAACCACCGCTAATC--T-TCCATGATGTATCAGATATTGGTACACAATGGACTAAA-A-GTATGT----TAAAAATTGT-TATT-AAA-TT-AAATTGTG----A----TGTTTGT--A-AAGAAG-CAC-CCGGCAG--A-TTGCTCG----TACCTAAAAAGCGCC-A-TAATTAAA---AAATATC-TTAAAAAA
gi|132168 : TATTA---AGA---TGCGTTC---------GTCAGCCTTGCAATAT-T--T-T---ATA---A-------GT------AC--ACCGCA--TTGA---T---A---AAATGTGACAACCCCCCCCCCCCCCCCCTTAATC--T-CCCATGGTGTATCAAACAGTGGTACAGAATGGTTTAAA-A--TGTAT----TAAAA--TGT-AA-T-TTAATT-AAACTCTG----A----AATGTGT--A-A-TAAG-CAC-CCGGCAG--A-CTGCTCG----TACCCAAAAAGCGCC-A-TAATTAAA---AAATAT
gi|132169 : TATTA---AAA---AGTGTTC---------ATCAGCCTTGCAATAT-T--T-T---ATT---A-------GT------AC--AACACA--TTAT---T---A---AAATGTAA
gi|132170 : TATTACTCAAA---TGTATTTATGAACAGTGTCAGC--TG-AATAA-G--T-T---ATT---ATCCATCAGC------AT--ATCGCA--TTTT---TTTTA---AAAACTGAC----------CAGTCACTGTTAATC--GATCCATTTTGCATCA-ATAATGATACAGAATGGTTTAAG-A-GTGTGT----TAAAA--CAA-AA-C-AAAGTT-GAACTGTGAAAAA----TGTATAT--T-AGG--G-CAC-CCGGCAG--C-TCGTCCA----TACCTAAAAAGTG---A-AAAATAAAACTAAATA---GTAAAAAA
gi|132171 : ATTA---AAA---TGTATTC---------GTCAGCCTTGCACTAT-T--T-T---ATT---A-------GT------AC--ACCACT--TTAT---T---A---AGATGTGAC----------CAACCA-CGCTAATC--T-CCCATGGTGTATCACATAGTGGTACACAATGGACTAAA-A-ATGTGT----TAAGA--GGT-TT-T---A-TT-AAATTGTG----A----TGTTTGTA-A-AAAAAG-CAG-CCAGCAG--A-TTGTTCG----TACCTAAAAAGCGCC-A-TAATTAAA---ATATATA-TTAAAAAA
gi|132172 : TTA---AAAGTTTGTATTT---------GTCAGCCTGGCAATATAT--T-T---ATT---A-------G-----------------------------------------AC----------CAACCCCCGTTAATC--C-ACCAAAGTCTATCATACAGTGATACAATATGGT-TAAATATTTGTAT----TAAAA--CAT-T
gi|132173 : TCAGCCTTGCAATAC-T--A-T---ATTT--A-------GT------AC--ACCGCA--CGGT---T---A---AAATTTGAC----------CAACCCCTGTTAATC--T-CCCAGGGTGTGTCACATGGTGGTACACAATGGTTTAAA-A-TTAAAT----TAAAA--TAT-TA-T-ATATTT-AAACTGTG----A----AATTTGT--A-AATAAG-CAC-CCGGCAG--A-TTGCTCA----TACCTAAAAAGCGCC-A-TCTTTAAA---AAATGTT-TTAAAAGAttttttgatttttttttttgtaa
gi|132174 : TCAGCCTTGCAATAT-T--G-T---ATTT--A-------GT------AC--ACCGCA--TGGT---T---A---AGATTTGAC----------CAACCCCTGTTAATC--T-CCCAGGGTGTGTCACATAGTGGTACAAAATGGTTTAAA-A-TTAAAT----TAAAA--TAT-TA-T-ATATTT-AGACTGTG----A----AATTTGT--A-AATAAG-CAC-CCGGCAG--A-TTGCTCA----TACCTAAAAAGCGCC-A-TCTTTAAA---AAATGTT-TTAAAAGA
gi|132175 : TCAGCCTTGCAATAT-T--G-T---ATTT--A-------GT------AC--ACCGCA--CGGT---T---A---AAATTTGAC----------CAACCCCTGTTAATC--T-CCCAGGGTGTGTCAAATGGTGGTACACAATGGTTTAAA-A-TTAAAT----TAAAA--TAT-TA-T-ATATTT-AAACTGCG----A----AATTTGT--A-AATAAG-CAC-CCGGCAG--A-TTGCTCA----TACCTAAAAAGCGCC-A-TCTTTAAA---AAATGTT-TTAAAAGA
gi|132176 : TCAGCCATGCAATAT-T--G-T---ATTT--A-------GA------AC--ACGGCA--CGGT---T---A---AGATTTGAC----------CAACCCCTGTTAATC--T-CCCAGGGTGTGTCACATAGTGGTACACAATGGTTTCAA-A-TTAAAT----TAAAA--TAT-TA-T-ATA-TTTAAACTGTG----A----AATTTGT--A-AATAAG-CAC-CCGGCAG--A-TTGCTCA----TACCTAAAAAGCGCC-A-TCTTTAAA---AAATGTT-TTAAAAGA
gi|132177 : TACAGTAT-TATT-T---ATT---A-------GC------AT--ATCGCA--TATT---T---A---AAAACTGAC----------CAGTCACTGTTAATCAAT-CC-ATTTTGCATCA-GTAATGATACAGAATGGATTAAG-A-GTTTGT----TAAAA--CAA-AAAT-AAAGTT-AAACTGTG----AAAAATGTATATCTA-AGGA---CAC-CCGACAG--C-TCGCACA----TACCGTAAAAGCGCC-AATAGT-AAA---AAATATT-TTAAAAA
gi|132178 : GTAACAT-T--T-TTAAATT---T-------GTCAAAACAT--ATCACA--TACT---C---ACATAGATATGAC----------CAGCTATAATTAATCG-T-ACCATAGTGCATCACAACGTGATACAGAAGGTTCTAAA-A-GTGTA-----TAAAA--TGG-AA-T-AAA-AT-AAACTGTG----A----TGTCTAT--A-AA
gi|132179 : ---AAACATGAC----------CAGTTATTGTTAATCG-T-ACCAAAGTGCATCACAACGTGATACAGACGGGTCTAAA-A-TTGTAT----TAAAG------------GA-AT-AAACTGTG----A----TGTTTGT--A-AACAAG-CAC-CTGGGGGCAA-TTCCACC----CACCTAATAAGCGC-----AAATAAG---AAATTGT-TTAAAAAAc
gi|132180 : aatattcgttaaaacatatcacatacatATAT-T--T-TT--ATTTAAA-------AT------AT--AACCCA--TTCG---C---ACATAAATATGAC----------CAGTTATTGTTAATCG-T-ACTATAGTGTATTACGCAGTT-TACAGAAGGATCTAGG-T-TTTTAT----AAAAAG-TAA-TA-G-AAA-T--AAACTGTG----A----TGTTTGT--A-AACTAG-CAT-ACGGGGGC-ACTTTCACC----CACCTAATAAGCG
gi|132181 : TAT-T--TAT---ATT---C-------GTTAAA--ACGTATCACA--TACA---T---A---AAA-ATGAC----------CAGTCATTGTTAATCG-T-ACCAAAGTGCATCACAACGTGATACAGATGGGTCTAAA-A-TTGTAT----TAAAG--GAA-TA-G-GAA-T--AAACTGTG----A----TGTTTGT--A-AACAAG-CAC-Caaa
gi|132182 : -T---ATC---A-------GC-------T--ATCGCA--TTTT---TT--A---AAAACTGAC----------CAGTCACTGTTAATC--GATCCATTTTGCATCA-ATAATGATACAGAATGGTTAAAG-G-GTGTAT----TAAAA--CAA-AA-T-AAAGTT-AAACTGTG----AAAAATGTATAT--T-AGG--G-CAC-CTGGCAG-------CTCGAAAATACCTAAAAAGTGCCAA-TAG-TAAA---AAATATT-TTAAAAAAtcaataattcatttaagcgaatataattaagaagcagttatt
gi|132183 : ---ATC---A-------GC------AT--ATCGCACGTTAT---TT--A---AAAACTGAC----------CAGTCACTGTTAATCG-T-ACCATTCTGCATCA-ATAATGGTAGAGAATGGTTTAAG-A-GTGTGT----TAAAA--TAA-AG-TGACG-TT-AAACTGTG----A----AATATGT--ATAATAGGGCAC-CCGGCAG--C-TCGCGCA----TACCGTAAAAGCGCCAA-TAA-TAAA---AAATATT-TTAAGAAA
gi|132184 : ---ATC---A-------GC------AT--ATCGCA--CTTTATTT---A---AAAACTGAC----------CAGTCACTGTTAATCG-T-ACCATTCTGCATCA-ATAATGGTAAAGAATGGTTTAAG-A-GTGTGT----TAAAA--TAA-AG-TGACG-TT-AAACTGTG----AAATATGTATGT--A-GG---G-CAC-CCGGCAG-----CGCGCA----TACCTTAAAAGTGCC-AATAAT-AAA---AAATATT-TTAAGAAA
gi|132185 : TAAA-A-TTATGT----TAAAAA-TGC-TT-T-A-A-TT-AAATTGTG----A----TGTTTGT--A-AAAAAA-AACACCGGCAG--A-T----CG----TACCTAAAAAGCGCC-A-TAATTAAA---AAATATCGTTAAAAAA
gi|132186 : gaa-TT-AAATTGTG----A----TATATGT--A-AAAAAG-CAC-CTGACAG--A-TTGCTCG----TACCTAAAAAGCGCC-A-TAATTAAA---AACTATT-GTAAAAAA