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gi|51940                      :                                                                                                                                                                          GGCGTTATGGACAGCAGATCA----GATATTAAAATAATAAAAAAA
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gi|51942                      :                                                                                                                                                                            CGTTATGGACAGCAGATCA----GATATCAAAATGATAAAAAA
gi|51943                      :                                                                                                                                                                             GTTATGGACAGCAGATCA----GATATCAAAATAATAAAAAA
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lowQualScore                  :                                                7777            55   55                    888888        0         7777   7  3 3           3                   6 8888888                       0000      2              
consensus                     : TTTGATAAATTAATGTTTCATTGATTTATTTCAACAGTTTGTTTATG----TTGTCAAGCCGT--ATA--ACAGCGTTAAATGACATACA------CAGCGAAGCGGTGTCGGT----GGA-TT-T-TTTTCCAGTAC-ATAAATTGGTCTAGCGCAA-T-------AAGGCGTTATGGACAGCAGATCA----GATATCAAAATAATAAAAAAA
Reference ( family-725 )      : TTTGATAAATTAATGTTTCATTGATTTATTTCAACAGTTTGTTTATG----TTGTCAAGCCGT--ATA--ACAGCGTTAAATGACATACA------CAGCGAAGCGGTGTCGGT----GGA-TT-T-TTTTCCAGTAC-ATAAATTGGTCTAGCGCAA-T-------AAGGCGTTATGGACAGCAGATCA----GATATCAAAATAATAAAAAAA
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gi|51925                      : TTTAATAAATTAATGTTTCATTTATTTATTTCAACAGTTTGTTTATG----TTGTCAAGCCGT--ATA--ACAGCGTTAAATGACATACA------CAGCGAAGCGGTGTCGGT----GAATTT-T-TTTTCCAGTAC-ATAAATTGGTCTAGCGCAA-T-------AAGGCGTTATGGACAGCAGATCA----AATATCAAAATTATAAAAAAA
gi|51926                      : TTTGATAAATTAATGTTTCATTGATTTATTTCAACAGTTTGTTAATG----TTGTTAAGCCGT--ATA--ACAGCGTTAAATGACGTACA------CAGCGGAGTAGTGTCGGT----GGA-TT-T-TATTCCAGTAC-ATAAATTGGTCTAGCGCAA-T-------AAGGCGTTATGGACAGCAGATCA----GATATCAAAATAATAAAAAAA
gi|51927                      : TTTGATAAATTAATGTTTCATTGATTTATTTCAACAGTT-ATTTATG----TTGTCAAGCCGT--ATA--ACAGCGTTAAATGACATACA------CAGCGAAGCGGTGTGGGT----GGA-TT-T-T-TTCCAGTAC-ATAAATTGGTCTAGCGCAA-T-------AAGGCGTTATGGACAGCAGATCA----GATATCAAAATTATAAAAAAA
gi|51928                      : TTTGATAAATTAATGTTACATTGATTTATTTCAACAGTTTGTTTATG----CTGTCAAGCCGT--ATATAACAGCGTTAAATGACATACA------TAGCGAAGCGGTGTCGGT----GGA-TT-T-TTTTCCAGTAC-ATAAATTGGTCTAGCGCAA-C-------AAGGCGTTAAGGACAGCAGATCA----GATATCCAAATAATAAAAAA
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gi|51930                      : TTTGATAAATTAATGTTTCATTGATTTATTTCAGCAGTTTGTTTATG----TTGTCAAGCCGT--ATA--ACAGTGTTAAATGACATACA------CAGCTAAGAGGTGTTGGT----TGA-TT-T-TTTTCCAGTAC-ATAAATTGGTC
gi|51931                      : TTTGATAAATTAATGTTTCATTGATTTATTTCAACAGTTTGTTTATGTCCATTATCAGGC
gi|51932                      :  TTGATAAATTAATGCTCCATATATTTATTTAAA-A--------ATG----CTGTCAAGTTGTGCATT--GCA----TGAACAACATATAATG---CAGTGAAGAGGTTTCTGT----GGAATT-T-TTTTCAAGTAC-AGAAATTCATCTAGCGCAA-T-------AAAACATAAT------CAGGTCACACGAATATTACAAT
gi|51933                      :    GATAAATTAATGTTTCATTGATTTATTTCAACAGTTTTTTTATG----TTGTCAAGCCGT--ATA--ACAGCATTAAATGACATACA------CAGCGAAGCGGTGTCGGT----GGA-TT-T-TTTCC
gi|51934                      :                  TCATCGACTTATTTCAACAGTGAAATTATG----CTGTTGAGGTGT--GTT--ACAGAGTT-ATTTACATATATCTACTCAGTGAAGTGGTGTC--T----GTA-TT-TATTTTCCAATAC-ATAAATTGGTATGGCGCAG-TTACTTTAAAGTCG-TATCGACAGCTGATCG----AATATCCAAATAATAAAAAA
gi|51935                      :                                                                                      ATATA------CAGCGAAG--GTGTCTGTATGCGGA-TTGT-TTTTCCATTCT-AAAAATTTGTCTAGCGTAG-A-------AAGACAAAGTGGATAGCAGGTCT----TATATCCAAATCATAAAAA
gi|51936                      :                                                                                                                          -TT-C-TTTTTCTGTACGAGAAATTGAT-TAGCACAA-T-------ATGGCATTATGGCCTGCAAGTAA----AACATCAAAATTATAGAA
gi|51937                      :                                                                                                                                        TAC-AAAAACCGGTCTAGCACAAAT-------AAGAAGTGATGGACAGCACATCA----GATATCCAAATATTAAAGAA
gi|51938                      :                                                                                                                                                                         AGTCATTATGGACAGCAGATCA----GATATTCAAGTAATAAAAAA
gi|51939                      :                                                                                                                                                                          GGCTTTATGGACAGCAGATCA----GATATCAAAATTATAAAAAA
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gi|51940                      :                                                                                                                                                                          GGCGTTATGGACAGCAGATCA----GATATTAAAATAATAAAAAAA
gi|51941                      :                                                                                                                                                                            CGTTATGGACAGCAGATCA----GATATCAAAATAATAAAAAA
gi|51942                      :                                                                                                                                                                            CGTTATGGACAGCAGATCA----GATATCAAAATGATAAAAAA
gi|51943                      :                                                                                                                                                                             GTTATGGACAGCAGATCA----GATATCAAAATAATAAAAAA
gi|51944                      :                                                                                                                                                                             GTTATGGACAGCAGATCA----GATATCAAAATAATAAAAA
gi|51945                      :                                                                                                                                                                             GTTAAGGACAGCAGATCA----GATATCCAAATAATAAAAAA
gi|51946                      :                                                                                                                                                                              TTATGGACAGCAGATCA----GATATCAAAATAATAAAAA
gi|51947                      :                                                                                                                                                                                ATGGACAGCAGATCA----GATATCAAAATAATAAAAAA