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Reference ( gi|20414 ) : CATATGCACC--GTGT---ACATAGCA-CTTAGTGCCCA-GAACATTTATTTCCACTTTTTTT-----CACG-T----GC-------AC-------ATGCGGTCGACAGGTT--T-TG---CAGTCCACGTCATACGATTCATGCAATA-GAGGCCAATTTG-----------A--T-------T----T-------T--TTTTA--TTTTTTCACATAT-TTCAACATGCAACGGATTTCTG-AAAACGGAC-GCA-A-TAA---AA---T------GATAGTGGGTGG-GGTAACGGCCATAGTG--GTCGCATTCCAGTTATGGTGCTGTCGCAAATAGA--ATG-AGCGACCTGAGGCACGTTTCCGATATACCTGA-ACTGTTTACAGTC-A---CAGCGACCTGGTAAACGGTAAACCTGTAGAGACAAA-GACCGGA----ACCG--A----------ACGT----TG----------------ACGT--GCTTACGTCAATGTCTGTTGCCACGGCTACCTTCGCTGCTTGGCAGCATGGCGTATTAGTACAGAATATTCGTTACCGTTTGCGTCGTAACTCCCAACTAATCAGAGT-GCGA-GGCGCCCATACACTAGAACTGGT-CAAATAATGACCCGACGTTACCTCGCTGCCATGCTTTTATGGGTGCGATGTCATCTGAACTGGAGTTAAATGGCAGCCCATGTTCACCAGGCAATACTTGAACCAGGTCAATGTTTTCACATGGC
gi|20415 : CATATGCACC--GTGT---ACATAGGA-CTTAGTGCCAA-GAACATTCATTTCCACTTTAAC------CACG-T----GC-------AC-------ATGCGGTCGACAGGTT--T-TG---CAGTCCACGTCATACGATTCATGCAATA-GAGGCCAATTTG-----------A--TGGTT---T----T-------T--TTTTA--GTTTTTCACAGTT-TTCAACATGCCACGGATATCTG-AAAACGGAC-GCA-A-TAA---AA---T------GATAGTGGGTTG-GGTAACGGCCATAGTT--GTCGCATTCCAGTTATGGTGCTGTCGCAAATAGA--ATT-AGCGACCTGAGGCACGTTTCCAATATACCTGA-ACTGTTTACAGTC-A---CAGCGACATGGTAAACGGTAAACCTGTAAGGACAAA-GACCGGA----ACCG--A----------ACGT----TG----------------ACGT--GCTTACGTCAGTGTCTGTTGCCACGGCTACCTTCGCTGCTTGGCAGCATGGCGTTTCAGTACAGACTATTCGTTACCGTTTGCGTCGTAACTCCTAACTAATCAGAGT-GCGA-GGCGCCCATACACTAGAACTGGT-CAAATAATGACCTGACGTTACCTCGCTGCCATGCTTTTATGTGTGCGACGTCATCTGAACTGAAGTTAAATGGCAGCCCATGTTCACCAGGCAATAATTGAACCAGGTCAATGTTTTCACATGGC
gi|20416 : CATATGCACC--GTGT---ACATAGCA-CTTAGTGCCCA-GAACATTCATTTCCACTTTTTC------CACG-T----GC-------AC-------ATGCGGTCGACAGGTT--T-TG---CAGTCCACGTCATACGATTCATGCAAGA-GAGGCCGATTTG-----------AATT-------T----T-------T--TTTTA--GTTTTTCACAGTT-TTCAACATGCAACGGATTTCTG-AAAACGGAC-ACA-A-TAA---AA---T------GAAAGTGG-TGG-GGTAACGGCCATAATG--GTCGCATTTCAGTTATGGTGCTGTCGCATATAGA--ATG-AGCGACCTGAGGCACGTTTCTGATATACCTGA-ACTGTTTACAGTC-A---CAGCGACCTGGTAAACGGTAAACCTGTAGAGACAAAAGACCGGA----ACCG--A----------ACAT----TG----------------ACGT--GCCTACGTCAGTGTCTGTTGCCATATCTACCTTCGCTGCTTGGCAGTATGGTGTTTCAGTACAGACTATTCGTTACCGTTTTCGTCGTAACTCCCAACTTATCAGAGT-GCGA-GGCACCCATACACTAGAACTGGT-CAAATAATGACCCGACGTTACCTCGCTGCCATGCTTTTATGTGTGAGACGTCATCTGAACTGGAGCTAAATGGCAGACCATGTTTGTCAGGCAATACTTGAACCAGGTTAATGTTTTCACA
gi|20417 : CATATGCACC--GTGT---ACATAGCA-CTTAATGCCCA-GAACATTCATTTCCACTTTTTC------CACG-T----GC-------AC-------ATGCAGTCGACAGGTT--T-TT---CAGTCCACGTCATTCGATTAATGCAATA-GAGACCGATTTG-----------A--T-------T----T-------T--TTTTA--GTTTTTCACAGTT-TTCAACATGCAACGGATTTCTG-AAA-CAGAT-GCA-A-TAA---AA---T------GATAGTGGGTGG-GGTAACGGCCATGGTG--GCCGCATTCCAGTTATGGTGCTGTCACAAATATA--ATG-AGCGACTTGAGGCACGTTTCCGAT-------A-A----------------------ACCTCGTAAACGGTAAACCTGGAGAGACAAA-GACTGGA----ACCA--A----------ACGT----TG----------------ACGT--ACTTACGTTAGTGTCTGTTGCCA--GCTACCTTTGCTGCTGGGCAGCATGGCATTTTAGTACAGACTATTCGTTACCATTTGCGTCGTAACTCCCAACTAATCAGAGTAGCGC-GGCGCCCATACACTAGTACTGGT-CAAATAATGACCCGATGTCACATCGCTGCCATGTTTGTATGTGTGTGACGTCATCTGAACTGGAGCTAAATGGCAGCCCATGTTCACCAGGCAATACTTGACCCAGGTCAATGTTTTCACATGG
gi|20418 : CATATGAACC--GTGT---ACATAGCA-CTTAGTGCCCA-GAACATTCATTTCCACTTATTT------CACG-T----GC-------AC-------ATGCGGTCGACAGGTT--T-TT---CAGGTCACGTCATACGATTTATGCAATA-GAGGCCGATTTG-----------A--T-------T----TA------T--TTTTGATTTTTTTCACAGTT-TCCAACATGCTACGGATTTCTG-AAAATGGAC-GCA-A-TAA---TC---T------GATAGTGGGTGG-GGTAACGGCCACGGTG--GTCGCATTCCAGTTCTGGTGCTGTCGCAAATAGA--TTG-AGCGACTAAAGGCACGTTTCCGATATACCTGA-ACTGTTTACAGTCTG---CAGCAAACT-------GGTAAACCTGGACAGACAAA-GACGTTA----AACGTTACATC------ACGT----AT----------------ACAT--ACTTACGTCAGCGTCTGTTCCCA--GCTACATTCGTTGCTGGGCAACATGGCGTCTCAGTACAGACTGTTTGTTACCGCTTGCGACGTAACTCCCAACTAATCAGAGTAGCGT-GGCGCCCATATACTAGTACTGGT-CAAATAATGACCCGACGTCACCTCGCTGTCATGCTTTTATGTGTGCAACGTCATCTGAACTGGAGCTAAATTGCAGCCCAGGTTAACCATATAATACTTGACCCAGGTCAATGTTTTCACATGGC
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Alignments
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lowQualScore : .. ... . . . .... ................ . . ...... . ................................ . . .. . . . . . . .............. ...... . . . . .. .... . . . . . ..... . . . ...... .. .. .. .......... .......... .. ................ . .. .. . ...... .. . .... . . . . . . .
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Reference ( family-724 ) : CATATGCACC--GTGT---ACATAGCGCTTAGTGCCCA-GAACATTCATTTCCAC-TTTTT-CCACGT----GC-------AC-------ATGCGGTCGA-CAGGTTT-T--T---CAGTCCACGTCATACGATTCATGCAATA-GAGGCCAATTTG------AA--------T-T---TT--------T-TTTAGTTTT--TCACAGTTTTCAACATGCCA-CGGATTTCTG-AAAACGGAC-GCA-A-T-GAG---A------TGAT------AGTGGGTGG-GGTAACGGCCATGGCGGTCGCGCGTCAGTTCGGGTGCTGTCGCAA----ATAGATTGAGCGACTTGAGGCACGTTTCCGATATACCTGA-ACTGTTTACGGTC-G---CAGCGACCTGGTAAAC-GGTAAACCTGGAGAGAC-GAAGACCGGAACCG--A----------ACGT----------TGACGT--ACTTAC----------------GTCAGCGTCNGTTGCC--A--GCTACCTTCGCTGCTGGGCGGCATGGCGTCTCAGTACAGACTATTCGTTACCGTTTGCGTCGTAACTCCCAACCAATCAGAGC-GCG-G--GCGCCCATACACTAG-ACTGGT-CAAATAATGACCCGACGTCACCTCGCTGCCATGCTTTTATGTGTGCGACGTCATCTGAACTGGAGCTAAATGGCAGCCCANGTTCACCAGGCAATACTTGACCCAGGTCAATGTTTTCACATGGC
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gi|20423 : CATATACACC--ATGT---ACATAGCGCTTGGTGCCCA-GAGTATTCATTTCCACTT
gi|20424 : ATGTACATC--ATGT---ACATAGCGCTTAGTGCTCA-GAACATTCATTTCCACCTTTT-C-CACGT----GCACGCAATAC-------ATGCAGTCGA-CAGGTTT-T--T---CAGTCCACGT-----GATTCATGCAA-----------TT-G-AA-A--C--A--TT-----T--TT-TTT--AGTTTT--TCACAGTTTTCAACATGCCA-CTCATTTCTA-AATACGGAC-GCATT-T-GGG---A------T------GATAGTTGGTGG-GGTTACGGCCATGGCGTTTGCGTGTCAGTTCGGGTGCTATCGCA
gi|20425 : TGTACCTCATAT---ACATAGCGCTTA-CGCCTG-CACCTTTCATTTTCACTTTTTTC-CACAT----GC-------ACGCTATACATGTGTTCGA-GAGGTTT-TATT---CAATACACGTCGTGCTATCCATGCATTACAGGCCAATTT-G-GACA-TC--AATTT-----TGGTT-TTT--AATTTT---CGAAGTTTTCGACATGCCA-CGGCTGTCTACAAAACG-ACAGAA-A-T-CAG---GCAATTGT------GATATTTGGCGG-GAAGACGGCTAGGGCCGTTGCGCGTCAGTTCGGGTGCTGTCGCTT----ATAGA
gi|20426 : CACC--CGGT---GCATAACCCTCACCAACCG-GAACGTTGATTTTCACGTTTT-G-CACGT----GCGCGCTATAC-------ATGTGCTCGATCAATTAA-T--T---CAGTCAACGTCGTACGATACTTGCGACACAGGCTAATCC-G-AA-A-----A--TTAAACAAA-GT-TTT--ACTTTT--TCACTCTGTTCATCATGTCA-CGCTTGTCTG-AAATTGAAA-GAA-A-T-CAGGCAA------T------GGGAAT-GCTGGAGGTG--GGCCAGTGCCGTCGCCCGCAGGCTAGGCTGCTGTCGGAAGACCATACA--GA--GGCTTGCGACCCGGTTTCAACAGA-CTGAGACTGTTTGCGATC-GTTCC--CGTCCTGGTCACC-------CCCGT---CAC-CACCACCAGAACTA--ACCACTACATCACGT----------TAACGC--ACTTGT----------------GTCAGCGTCGTTTGCC--A--GCCGCAGTAACGTCTAGGAGATACGGTGTGTCAGCGCAGACCATCCGTAATCGCTTGCGATGCAAAACTCAGCCAATCAGAGCA---CG-AG-GCCCATAT------ATCGGT-CAAACAATGATGCGACGTCACCATG-TACCAT
gi|20427 : GTACCCA-GAACATTCATTTCCACTTTTT-C-CACGT----GC-------AC-------
gi|20428 : -------AC-------ATGCGGTCAA-CAGGTTT-A--T---CGGTATACGTTATAT-ATTAATGCACT-GAGGACAATTTAG-AA-A-TT--AA-TT-----CA-TT-TTTTTAATTT-----ACAGTTTTCAACATTCCA-CGAATTTCTG-AAAACGGAT-GAA-ACT-GGG---A------T------GATCGT------------------TGGTGGTCGTGCGTCAGTTTGGACA-----GCAA----AACGATTGAGTGACTTGAGGCACGTTACCGACA--------------TATGGTCTG---CAGCAACCTGATAAAC-------CCC-GAGAGAC-GAAGACCGGAACCG--ACCATTACATCACAT----------TGAGGC--ACTTACGTCAACACGCCCTTACGTCAACGTTGGTTGCC--T--GCCACCTTCGCTGCTGGGGGCCATGG
gi|20429 : CACGTGCACGATATACCTGA-ACTGTTTACAGTC-C---CAACGACCTCGTAAAC-GGTAAACCTGAAGAGAC-AAAGACCCGAACCG--A----------ACGT----------TGACGT--ACTTAC----------------GTCAGTGTCTGTTGCC--A--GTTAACTTCGCTGCTGGACAGCATGACGTTTCAGTACAGACTATTCGTTACCGT
gi|20430 : ---CAGTGGCCTGATAAA-------GCCTA-AGTGAC-GAAGACCGGAACCG--ACCATTACATTACGT----------GGGCGC--ACCAAC----------------GTTAGCGTCGGCTGCC--A--GCCACCTTCACTGCTGGGCGGCATGGTGTCTCGTCACAGACTA-GCGTTA
gi|20431 : TAAACCGGGAGAGAC-AAAGACCGGAACTG--A----------ACGT----------TGACGT--ACTTAC----------------GTCAGTGTCTGTTGCC--A--GCTACCTTCGCTGCTGGGCAGCATTGCGTTTCAGTAAAGACTATTCGTTACTGTTTGCGTCGTAA-----AACTAATCAGAGTA--GTGTGGCGCCCATACACTAGAACTAGT-TCAATAATGA-CCGGCGTCACCTCGCTGCCATGCTTTTATGTGTGCAATGTCATCTGAACTGGGGCTAAATGGCAGCCCATGTTCACTAGGCAATACTTGACCCAGGTCACTGTTTTCACATGGC
gi|20432 : TAAACCTGGAGAGAC-AAAGACCGGAACCG--A----------ACGT----------TGACAT--ACTTAC----------------CTCAGTGTCTGTTGAC--A--GCTACCTTCGCTGCTGGGCAGTATGGCATTTCAGTATAGACTATTCGTTA
gi|20433 : AC----------------GTAAGCGTCGGTTGCC--A--TCTACCTTCGCTGCTGGGCGGCATAGTATCTCAGCACAGACTATTTGTTATCGTTTGCGTCGAAACTCCCAACCATTCAGAGTACGGCG-G-CGCCCATACACT------GGT-CAAATATTGACCCGACGTCACCGCGTTGCCACGCATTTATAGGTGCAACGTCATCTGAACTGGAGCTGAATGGCAGTCCTGGTTCACCAGACAATACTTGGCACAAATCAATGTTTTGACATTGC
gi|20434 : gactgttaACAGAATATTCGTAATCGTTTACGTCGCAACTACCAGCCAATTAGAGCA---CG-G-TGCCTATA---------------------TGACCCGACGTCACCGCGCTGCCA--------------------CA---GAACTGGAG---AATGGAAGACCAGGTTCACTGGGCAATACTTGGCACAGATCAATGTTTTCACATGG
gi|20435 : GTCGTACCGATCAACCAATCAGAG----ACG-G-CGCCAATACACT------GGT-CAAATAATA--------TCACCGCTCTGTCAGGCTTTTATGGACACGACGTCATTTGCACTGGA---AAATGGCAGAACATGTTAACCACGCAGTACTTGGCATAAATCAACGTCCTCACTTG
gi|20436 : -CACATAATGACCAGACGTCACCTCCCTGCCATGCTTTTATGTGTTCGATGTCATCTGAACTGGATTTAAATGGCAGCCCGGGTTCACCAGGCAATACTTGACCCGGGTCAATGTTTTCACATGGC
gi|20437 : TAATGACCCGACGTCACATCGCTGTCATGTTTTTATGTGTGCGACGTCATCTGAACTGGAGCTAAATGGCAGCCCATGTTCACCAGGCAATACTTGACCCAGGTCAATGTTCTCACATGGC