lowQualScore : 1 11 11111111
lowQualScore : 6 00 5555555555 2222222222222 00 000 1111111 33333 0 1 11111 22 0 000 22222222 111
lowQualScore : . .. .......... ............. .. ... ....... ..... . . ..... .. . ... ........ ...
lowQualScore : 3 66 8888888888 2222222222222 66 777 3333333 88888 4 1 66666 66 9 888 22222222 999
consensus : ATGATGCTGAACA--CACATG----C-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AATG-------A---GTGG-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAAACT
Reference ( gi|47531 ) : ATGATGGTGAACA--CACATG----C-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AATG-------A---GTGG-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAAACT
gi|47573 : ATGATGGTGAACA--CACATG----C-----GAAGTTTC-------------GT--TCATATCC---AATG-------A---GTGG-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAAACT
gi|47625 : ATGATGGTGAATA--CACATG----C-----AAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AATG-------A---GTGG-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAAACT
gi|47585 : ATGATGGTGAACA--CACATG----G-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AATG-------A---GTGG-TTGCA-----T--AGA-C---AT--CT----TACCTGATA--AAAAACT
gi|47558 : ATGATAGTGAACA--CACATG----C-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AATG-------A---GTGG-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACATGATA--AAAAACT
gi|47595 : ATGATGGTGAACA--CACATG----C-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AATG-------A---GTGG-TTGTA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATAATAAAAACT
gi|47570 : ATGATGGTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AATG-------A---GTAG-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TGCCTGATA--AAAAACT
gi|47556 : ATGATGGTGAACA--CACATG----T-----AAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AATG-------A---GTGG-TTGCA-----T--AGA-C---AT--CT----TACCTGATA--AAAAACT
gi|47654 : ATGATGGTGAACA--CACATG----C-----GAAGTTGC-------------AT--TCATATCC---AATG-------A---GTGG-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAA
gi|47541 : ATGATGGTGAACA--CACATG----C-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AATG-------A---GTGG-TTGCA-----C--AGA-T---AT--CT----GATCTGATA--AAAAACTct
gi|47545 : ATGATGGTGAACA--CAGATG----C-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AATG-------A---GTGG-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CG----TACCTGATA--AAAAAC
gi|47599 : ATAATGGTGAACA--CACATA----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AATG-------A---GTGG-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAAATT
gi|47567 : ATGATGTTGAACA--CACATG----C-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AATG-------A---GCGG-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACATGATA--AAAAACT
gi|47519 : ATGATGTTGAACA--CACATG----C-----AAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AATG-------A---GTGG-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATC--AAAAACT
gi|47617 : ATGATGGTGAACA--CACAGG----C-----AAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AATG-------A---GTGG-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATT--AAAAACT
gi|47546 : ATGATGGTGAACA--CACATG----C-----GAAATTTT-------------AT--TCATATCC---AATG-------A---GTGG-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATT--AAAAAC
gi|47527 : ATGATGGTGAACA--CACATG----G-----GAAGTTCC-------------AT--TCATATCC---AATG-------A---GAGG-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAAACT
gi|47980 : ATAATGGTTAACA--CACATG----C-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AATG-------A---GTGG-TTGCA-----A--AGA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAAACT
gi|47598 : tgATGATGGTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---ATTG-------A---GTGG-TTGCA-----T--ATA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAAACT
gi|47672 : ATGATGGTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCACATCC---AGTG-------A---GTGG-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACGTGATA--AAAAACT
gi|47602 : ATGATGGTGAATA--CACATG----C-----AAAGTTTC-------------AT--TCATATCT---AATG-------A---GTGG-TTGCA-----T--AGA-T---AT--GT----TACCTGATA--AAAAACT
gi|47608 : ATGATGGTGAACA--CACATG----C-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCA---AATG-------A---TTGG-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACGTGATA--AAAAACT
gi|47656 : ATGATGGTGAACA--CACATG----C-----GAGGTTTC-------------CT--TCATATCC---AATG-------A---GTGG-TTGGA-----T--AGA-T---AT--TT----TACCTGATA--AAAAACT
gi|47629 : ATGATGGTGAACA--CGCATG----C-----AATGTTTC-------------AT--TCATATCC---AATG-------A---GTGG-TTGCA-----T--AGA-T---AT--GT----TACCTGATA--AAAAACT
gi|47553 : ATGATGATGAACA--CACATG----G-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AATG-------A---GTGG-TTGCA-----T--AGA-A---AT--CT----TACCCGATA--AAAAACT
gi|47544 : ATGATGTTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AATG-------A---GTGG-TTGCA-----T--AGA-T---AT--TT----TACCTGATA--ATAAACT
gi|47589 : ATGATGGTGAACA--CACATG----T-----GAAGGTTC-------------AT--TCATATCC---AATG-------A---GTGG-TTGC---------AGA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAAACT
gi|47540 : ATGATGGTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AATG-------A---GTGG-TTGCATACGGT--AGA-T---AT--CT----GACCTGATA--AAAAACT
gi|47648 : ATGATGGTGAAAA--CTCATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AATG-------A---GTGG-TTGCA-----T--AAA-T---AT--CT----TACCTGATA--GAAAACT
gi|47587 : ATGATGCTGAACA--CACATG----T-----GAAATTTC-------------AT--TCATATCA---AATG-------A---GTGG-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACTTGATA--AAAAACT
gi|47581 : ATAATGGTGAACA--CACATG----C-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AATG-------A---GTGG-TTGTA-----T--AGATT---AT--GT----TACCTGATA--AAAAA
gi|47577 : ATAATGGTGAACA--CACATG----C-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AATG-------A---GTGG-TTGTA-----T--AGATT---AT--GT----TACCTGATA--AAAAA
gi|47542 : ATGATGGTGAACA--CACATG----C-----ACAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AATG-------A---GTGG-TTGCA-----T--AGA-T---AT--AT----GACCTGATA--AAAAATT
gi|47611 : ATGATGCTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AA--TCATATCG---AATG-------A---GTGA-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAAACT
gi|47666 : ATGATGGTAAACA--CACATG----C-----AAAGTCTT-------------AT--TCATATCC---AATG-------A---GTGG-TTGAC-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAAACT
gi|47624 : ATGATGCTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AA--TCATATCA---AATG-------A---GTGG-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAAA
gi|47566 : ATGATACTGAACA--CACATGATTGT-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AATG-------A---GTGG-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TTCCTGATA--AAAAACT
gi|47673 : ATGATGCTGAGCA--CACACG----T-----GACGTTTC-------------AT--TCATATCC---AATG-------A---ATGG-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATA--ACAAACT
gi|47507 : ATGATGCTGAACA--CACATG----T-----GACATTTC-------------AT--TTATATCC---AATG-------A---GTGG-TTGCA-----T--AGA-T---AT--TT----TATCTGATA--AAAAAC
gi|47563 : ATGATGCTGAACA--CATATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATTG---AATG-------A---ATGG-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGTTA--AAAAACT
gi|47622 : ATGATGCTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCA---TATG-------A---GTGG-TTGCA-----T--AGA-T---TT--TT----TACCTGATA--GAAAACT
gi|47591 : ATGACCGTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCT---AATG-------A---GT-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--TT----TACCTGATC--AAAAACT
gi|47593 : ATGATACTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TGATATAC---AATT-------A---GTGG-TTGCA-----T--AAA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAAATT
gi|47509 : ATGATACTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCG---TATG-------A---GTGG-TTGC---------AGA-T---AT--CT----TACCTGACA--AAAAACT
gi|47623 : ATGTTGCTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATC-----ATA-------AA--GTGG-TTGCA-----T--AGA-T---AT--TT----TACCTGATC--AAAAACT
gi|47547 : ATGATAGTGAACA--CACATG----C-----GAAGTTTC-------------AT--TCACATCC---AATG-------A---GTGG-TTGCA-----T--AAA-T---AT--AT----T
gi|47459 : ATGATACTGAACA--CACATG----T-----AACGTTTC-------------AT--TCATATCC---ATTG-------A---GTGG-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CTTTAATACCTGATT--TAAAACTgaacttaagcgcaaaa
gi|47640 : ATGATGCTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCACATCC---AATG-------A---GTGG-TTGCA-----T--AGA-T---AT--
gi|47469 : ATGGTGTTGAACA--CACATA----T-----GAAATTTC-------------AT--TCATATCC---AATG-------A---TAGG-TTG-A-----TG-AAA-T---AT---G----TACCTGCTA--AAAAACT
gi|47444 : ATGATACTGAACA--CACATG----T-----GAGGTTTC-------------AT--TCATATCC---AACG-------A---TAGG-TTG-A-----TG-AAA-T---AT---G----TACCTGCTC--AAAAACT
gi|47449 : ATGATAATGAACA--CACATG----A-----GAAGTTTT-------------AT--TCATATCC---AATG-------A---TAGA-TTG-A-----TG-AAA-T---AT---G----TACCTGCTC--AAAAACT
gi|47467 : ATGATGCTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATTA---AATG-------T---TAGG-TTG-A-----TG-AAA-T---AT---G----TACCTGTTC--AAAAACT
gi|47445 : ATGATACTGAACA--CACATG----T-----AAAGTTTC-------------AT--GCATATCC---AATA-------A---TAGG-TTG-A-----TG-AAA-T---AT---G----TACCTGCTC--AAAAACT
gi|47472 : ATGATGTTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATTC---AATG-------A---TAGC-TTG-A-----TG-AAA-T---ATG-C------ACCTGCTC--AAAA
gi|47458 : ATGATACTGAACA--CATATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AATG-------A---TAGG-TTG-A-----TGAAAA-T---AT---G----TACATGCTC--ATAAACT
gi|47451 : ATGATACTGAACA--CACATG----T-----GATGTTTC-------------AT--TCGTATCC---AATG-------ATC-AT-G-TTG-A-----TG-AAA-T---AT---G----TACCTGCTC--AAAAACT
gi|47480 : ACGATACTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AATA-------A---TAGG-TTG-A-----T---GA-T---A---------TA--TGTTA--AAAAATT
gi|47503 : ATGATGCTGAACA--CACATG----T-----GACGTTTC-------------AT--TCATATCC---AATA-------T---GTGA-Tctaacttgcccaaaaact
gi|47470 : ATGATGCTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--GCATATCC---AATGCATATCTA---ATGA-TAGAA-----T---GA-TCAAAT--GTG---TACCTACTT--AAAAACTgaaaaatgtatctgctttaaaact
gi|47497 : ATGATGATGAAGA--CACACG--------------TTTC-------------AT--TCATATCC---AATG-------A---TTGG-TTG-G-----T--GAA-T---AT---G----TACCCGCTC--AAAAGCT
gi|47476 : ATGATGCTGAACAAACATATG----T-----GAAGTTGC-------------AT--TCATGTCC---AATG-------A---TATG-TTG-A-----TG-AAA-T---AT---G----TACCAGCTC--AAAAACT
gi|47478 : ATGATGCTGAACA--CATATG----T-----AAAGTTTC-------------AT--TCATGCCC---ATTG-------A---TAGG-TTG-A-----TG-AAA-T---AT--
gi|47474 : ATGATACTGAATA--CACATG----T-----GAAGTT-------------------TCATATCT---AATG-------A---TAGG-CTG-A-----TG-AAA-T---AT---G----TACCTGCTC--AAAAACTgtaccaacccaaaaac
gi|47495 : ATGATGCTGAGCA--CATATG----A-----GAAGTTGT-------------AT--TCATGTCC---AATG-------A---TAGG-TTG-A-----TG-AAA-T---AT--
gi|47530 : ATGATACTGAACA--CACATA----TTTTATGAAGCTTC-------------AT--TAATATCC---AATG-------A---TTGG-TTatagcaactcaaaaact
gi|47486 : ATGATGCTTAACA--CA--TG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCT---AATG-------T---TAGG-TTG-A-----TG-AAA-T---AT--A-----TACCTACTC--AAAAGCaatgacagttgtaccaactcaaaacct
gi|47490 : ATAATGCTAAGCA--CA--TG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCAAATCC---AATG-------A---TAGG-TTG-A-----TG-AAA-T---AT--A-----TACCTGCTT--AAA
gi|47513 : ATGATGTCAAACA--TGCATG----T-----GAAGTTCC-------------AT--TCACATCC---AATG-------A---
gi|47485 : ACGATGCTGAACA--CACATG----T-----ACAATTCC-------------TT--TCATATTC---AATG-------A---TAGG-TTG-A-----TG-AAA-T---AT---G----TACCTGtaggatgatgaaataagtaccagctcaaaacct
gi|47491 : ATGATGTTGAACA--CAC-------T-----GAAGTTTC-------------AT--CCAAATCA---AATG-------A---CAGG-TTG-A-----T--GAA-T---G---------TAGCTGCTC--AAAAACTctcgaaa
gi|47489 : ATGATGTTGAATA--CACATG----T-----AAAGCTTC-------------AT--TCATATTC---ACTG-------A---TAGC-TTGGT-----G--AAA-T---ATG-C------ACCTGCTC--AAAA
gi|47479 : ATGATATTGAACA--CGGAAT----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AACG-------A----TGGAATG-A-----TG-AAA-T---ATGATG----TACCTGCTC--AAAAACT
gi|47637 : ATGACGTTGAACA--CACAAT----C-----AAAGTTTT-------------AT--TCA-ATCC---AATA-------T---G-GG-CTG-A-----T---GA-A---AT--CTA---TACCTGCTC--AAA
gi|47473 : ATAATGTTGAACA--CAAATG----T-----GAAGTTTCATAAATATATTATAT--TCATATTC---AATG-------A---TAGC-TTG-A-----TA-AAA-T---ATG-CT------CCTGCTA--ATAAACT
gi|47518 : ATGATGTTGAACA--CACATG----T-----GAATTTTT-------------TTTGTCATACCC---ATTG-------A---TAGA-TCG-A-----TG-AAA-T---AT---G----TACATGCTA--AAAAAC
gi|47487 : ATGATGTTGAACA--CAC-TG----T-----GAAATTTC-------------AT--CCAAAAGC---AATG-------ACAGGTAG-ATGAAT----T--ATA-T---AA--TG----TACCTGCTC--AGAAACT
gi|47514 : ATGATGCTTAACA--CACA---------------GTTTC-------------AT--TCATTTTC---AATG-------A---TAGG-TTG-A-----T---GA-A---AT--GTG---TACCAACTC--AAAAACT
gi|47976 : TAATGCTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TTATATCC---AATG-------A---GTGG-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAAACT
gi|47973 : TGATGCTGAACA--CACATG----A-----GAAGTTTC-------------AT--TCATGTTC---AATG-------A---CAGG-TTG
gi|47971 : TGATGCTGAACA--CACATG----A-----GAAGTTTG-------------AT--TTACGTCC---AATG-------A---TAGG-TTGgtaaaatatgtaacaactcaaaa
gi|48006 : GATGGTGAACA--CACATG----C-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AATG-------A---GTGG-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAAAgtgaactatgtaccaactcaaaaact
gi|47999 : GATGTTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATGTCC---AATG-------A---
gi|47995 : GATGCTGAACA--CACATA----T-----GAAGTCTC-------------AT--TCATATCCACTAATA-------A---GTTG-ATG----------AAA-T---AT---G----TACCTGCTC--AAAAACTtaggatgatgaaacaagtacaaaatcaaaaact
gi|47994 : GATGCGGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATGTCC---AATG-------A---TAGG-TTG-A-----TG-AAA-T---A---AG----TACCAACTC--AAAAACT
gi|47998 : GATGCTTAACA--CACATG----T-----AAAGTTTC-------------AT--TCATGTCC---AATG-------A---CGGG-TTG
gi|48001 : GATGTTGAACA--CACATG----A-----GAAGTTTC-------------AT--TCACGTCC---AATG-------A---atgaaataagtattgactcaaaaact
gi|47996 : GGTGCTGAACA--CATATG-----------AAGTTTC-------------AT--TCATATTC---AATG-------A---TAGG-TTG-A-----TG-AAA-T---AT---G----TACCAACTC--AAAAACTtaggatgatgaaataagtac
gi|48000 : GATGTTGAACA--CACAAG----T-----GAGGTTTC-------------AT--TCCTGTCC---AATG-------A---TAGG-ATG-A-----TG-AAA-T---A---GG----TACCAAATC--AAAAACT
gi|48003 : GATGTTGAACA--TACAAG----T-----GAGGTTTC-------------AT--TCCTGTCC---AATG-------A---
gi|48005 : GATGTTGAACG--TACAAG----T-----GAGGTTTT-------------AT--TCCTGTCC---AATG-------A---GAGA-CTG-A-----TG-AAA-T---A---GG----TACCAAATC--AAAAACTtaggatgataaaataggtacc
gi|48004 : GATGTTGAACA--CACCAG----T-----GATGTTCC-------------CT--TCCTGTCC---AATG-------A---TAGG-ATG-A-----TG-AAA-T---A---GG----TACCAAATC--AAAAACT
gi|48010 : ATGCTGAACA--CACATG----T-----CAAGTTTC-------------AT--TCATGTCC---AATG-------A---
gi|48011 : ATGCTGAACA--CACATG----A-----GAAGTTTC-------------AT--TCTTGCTA---AATG-------A---TTGG-TTG-A-----TG-AAA-T---AT--CT----tagtgtgatgaaataagtaccaactcgaaaact
gi|48013 : TGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCA---AATG-------A---GTGG-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAAACTgccaactcaaaaa
gi|47997 : cTGAACA--CATATG----A-----GAAGTTCC-------------AT--TCATGTCC---AATG-------A---TAGG-ATG-A-----TG-AAA-T---A---AG----TACCAAATC--AAAAACT
gi|48035 : gatttA--CACATG----T-----GAAGTTTA-------------AT--TCACGTTC---AATG-------A---TAGG-TTG
gi|47496 : --CACATG----T-----GATGTTTC-------------AT--TCATGTCC---AATG-------A---TAGG-CTG-A-----TA-AAA-T---AT---G----TACCAACTA--AAAAACTgtgaaatgtgtaccaactcaaaa
gi|48036 : atgagtctgattg--CACATG----T-----GAAGTTTT-------------AG--TCATATAC---ATTA-------A---TAGG-TT-TA-----T--GAA-T---AT---G----AACCTGCTT--AAAAACT
gi|48041 : -----GAAGTTTC-------------AT--TCATATAC---AATG-------A---TAAG-TTG-A-----TG-AAA-T---AT---G----TACATACTC--AGAAACT
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|48043 ): TCATGCATATCCAAGGTTGATAGGTTGATGAAATATGTACCTGTTCAAAAAC
Alignments
lowQualScore : 1 11 11111111
lowQualScore : 2 00 5555555555 2222222222222 00 000 000 0 1111111 33333 0 0 1 11111 22 0 000 22222222 0 111
lowQualScore : . .. .......... ............. .. ... ... . ....... ..... . . . ..... .. . ... ........ . ...
lowQualScore : 4 66 7777777777 2222222222222 66 777 777 4 3333333 11111 4 4 2 66666 88 9 888 33333333 1 999
consensus : ATGATGCTGAACA--CACATG----C-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAAACT
Reference ( family-71 ) : ATGATGCTGAACA--CACATG----C-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAAACT
gi|47444 : ATGATACTGAACA--CACATG----T-----GAGGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---C-G-------A---TAG-G-TTG-A-----TG-AAA-T---AT---G----TACCTGCTC--AAAAACT
gi|47445 : ATGATACTGAACA--CACATG----T-----AAAGTTTC-------------AT--GCATATCC---AA---T-A-------A---TAG-G-TTG-A-----TG-AAA-T---AT---G----TACCTGCTC--AAAAACT
gi|47449 : ATGATAATGAACA--CACATG----A-----GAAGTTTT-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---TAG-A-TTG-A-----TG-AAA-T---AT---G----TACCTGCTC--AAAAACT
gi|47451 : ATGATACTGAACA--CACATG----T-----GATGTTTC-------------AT--TCGTATCC---AA---T-G-------A---TCATG-TTG-A-----TG-AAA-T---AT---G----TACCTGCTC--AAAAACT
gi|47458 : ATGATACTGAACA--CATATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---TAG-G-TTG-A-----TGAAAA-T---AT---G----TACATGCTC--ATAAACT
gi|47459 : ATGATACTGAACA--CACATG----T-----AACGTTTC-------------AT--TCATATCC---AT---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CTTTAATACCTGATT--TAAAACT
gi|47467 : ATGATGCTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATTA---AA---T-G-------T---TAG-G-TTG-A-----TG-AAA-T---AT---G----TACCTGTTC--AAAAACT
gi|47469 : ATGGTGTTGAACA--CACATA----T-----GAAATTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---TAG-G-TTG-A-----TG-AAA-T---AT---G----TACCTGCTA--AAAAACT
gi|47470 : ATGATGCTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--GCATATCC---AA---T-GCATATCTA---ATG-A-TAGAA-----T---GA-TCAAAT--GTG---TACCTACTT--AAAAACT
gi|47472 : ATGATGTTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATTC---AA---T-G-------A---TAG-C-TTG-A-----TG-AAA-T---ATG-C------ACCTGCTC--AAAA
gi|47473 : ATAATGTTGAACA--CAAATG----T-----GAAGTTTCATAAATATATTATAT--TCATATTC---AA---T-G-------A---TAG-C-TTG-A-----TA-AAA-T---ATG-CT------CCTGCTA--ATAAACT
gi|47474 : ATGATACTGAATA--CACATG----T-----GAAGTT-------------------TCATATCT---AA---T-G-------A---TAG-G-CTG-A-----TG-AAA-T---AT---G----TACCTGCTC--AAAAACT
gi|47476 : ATGATGCTGAACAAACATATG----T-----GAAGTTGC-------------AT--TCATGTCC---AA---T-G-------A---TAT-G-TTG-A-----TG-AAA-T---AT---G----TACCAGCTC--AAAAACT
gi|47478 : ATGATGCTGAACA--CATATG----T-----AAAGTTTC-------------AT--TCATGCCC---AT---T-G-------A---TAG-G-TTG-A-----TG-AAA-T---AT--
gi|47479 : ATGATATTGAACA--CGGAAT----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---C-G-------A----TG-GAATG-A-----TG-AAA-T---ATGATG----TACCTGCTC--AAAAACTgtaccaacccaaaaac
gi|47480 : ACGATACTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-A-------A---TAG-G-TTG-A-----T---GA-T---A---------TA--TGTTA--AAAAATT
gi|47485 : ACGATGCTGAACA--CACATG----T-----ACAATTCC-------------TT--TCATATTC---AA---T-G-------A---TAG-G-TTG-A-----TG-AAA-T---AT---G----TACCTGctaacttgcccaaaaact
gi|47486 : ATGATGCTTAACA--CA--TG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCT---AA---T-G-------T---TAG-G-TTG-A-----TG-AAA-T---AT--A-----TACCTACTC--AAAAGCctcgaaa
gi|47487 : ATGATGTTGAACA--CAC-TG----T-----GAAATTTC-------------AT--CCAAAAGC---AA---T-G-------ACAGGTA-G-ATGAAT----T--ATA-T---AA--TG----TACCTGCTC--AGAAACT
gi|47489 : ATGATGTTGAATA--CACATG----T-----AAAGCTTC-------------AT--TCATATTC---AC---T-G-------A---TAG-C-TTGGT-----G--AAA-T---ATG-C------ACCTGCTC--AAAA
gi|47490 : ATAATGCTAAGCA--CA--TG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCAAATCC---AA---T-G-------A---TAG-G-TTG-A-----TG-AAA-T---AT--A-----TACCTGCTT--AAA
gi|47491 : ATGATGTTGAACA--CAC-------T-----GAAGTTTC-------------AT--CCAAATCA---AA---T-G-------A---CAG-G-TTG-A-----T--GAA-T---G---------TAGCTGCTC--AAAAACT
gi|47495 : ATGATGCTGAGCA--CATATG----A-----GAAGTTGT-------------AT--TCATGTCC---AA---T-G-------A---TAG-G-TTG-A-----TG-AAA-T---AT--
gi|47496 : ATGAGTCTGATTG--CACATG----T-----GATGTTTC-------------AT--TCATGTCC---AA---T-G-------A---TAG-G-CTG-A-----TA-AAA-T---AT---G----TACCAACTA--AAAAACTatagcaactcaaaaact
gi|47497 : ATGATGATGAAGA--CACACG--------------TTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---TTG-G-TTG-G-----T--GAA-T---AT---G----TACCCGCTC--AAAAGCT
gi|47503 : ATGATGCTGAACA--CACATG----T-----GACGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-A-------T---GTG-A-T
gi|47507 : ATGATGCTGAACA--CACATG----T-----GACATTTC-------------AT--TTATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--TT----TATCTGATA--AAAAACgaaaaatgtatctgctttaaaact
gi|47509 : ATGATACTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCG---TA---T-G-------A---GTG-G-TTGC---------AGA-T---AT--CT----TACCTGACA--AAAAACT
gi|47513 : ATGATGTCAAACA--TGCATG----T-----GAAGTTCC-------------AT--TCACATCC---AA---T-G-------A---
gi|47514 : ATGATGCTTAACA--CACA---------------GTTTC-------------AT--TCATTTTC---AA---T-G-------A---TAG-G-TTG-A-----T---GA-A---AT--GTG---TACCAACTC--AAAAACTtaggatgatgaaataagtaccagctcaaaacct
gi|47518 : ATGATGTTGAACA--CACATG----T-----GAATTTTT-------------TTTGTCATACCC---AT---T-G-------A---TAG-A-TCG-A-----TG-AAA-T---AT---G----TACATGCTA--AAAAAC
gi|47519 : ATGATGTTGAACA--CACATG----C-----AAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATC--AAAAACT
gi|47527 : ATGATGGTGAACA--CACATG----G-----GAAGTTCC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GAG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAAACT
gi|47530 : ATGATACTGAACA--CACATA----TTTTATGAAGCTTC-------------AT--TAATATCC---AA---T-G-------A---TTG-G-TT
gi|47531 : ATGATGGTGAACA--CACATG----C-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAAACTaatgacagttgtaccaactcaaaacct
gi|47540 : ATGATGGTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCATACGGT--AGA-T---AT--CT----GACCTGATA--AAAAACT
gi|47541 : ATGATGGTGAACA--CACATG----C-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----C--AGA-T---AT--CT----GATCTGATA--AAAAACT
gi|47542 : ATGATGGTGAACA--CACATG----C-----ACAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--AT----GACCTGATA--AAAAATT
gi|47544 : ATGATGTTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--TT----TACCTGATA--ATAAACT
gi|47545 : ATGATGGTGAACA--CAGATG----C-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CG----TACCTGATA--AAAAAC
gi|47546 : ATGATGGTGAACA--CACATG----C-----GAAATTTT-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATT--AAAAAC
gi|47547 : ATGATAGTGAACA--CACATG----C-----GAAGTTTC-------------AT--TCACATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AAA-T---AT--AT----T
gi|47553 : ATGATGATGAACA--CACATG----G-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-A---AT--CT----TACCCGATA--AAAAACTgaacttaagcgcaaaa
gi|47556 : ATGATGGTGAACA--CACATG----T-----AAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-C---AT--CT----TACCTGATA--AAAAACT
gi|47558 : ATGATAGTGAACA--CACATG----C-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACATGATA--AAAAACT
gi|47563 : ATGATGCTGAACA--CATATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATTG---AA---T-G-------A---ATG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGTTA--AAAAACT
gi|47566 : ATGATACTGAACA--CACATGATTGT-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TTCCTGATA--AAAAACT
gi|47567 : ATGATGTTGAACA--CACATG----C-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GCG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACATGATA--AAAAACT
gi|47570 : ATGATGGTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTA-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TGCCTGATA--AAAAACT
gi|47573 : ATGATGGTGAACA--CACATG----C-----GAAGTTTC-------------GT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAAACT
gi|47577 : ATAATGGTGAACA--CACATG----C-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGTA-----T--AGATT---AT--GT----TACCTGATA--AAAAA
gi|47581 : ATAATGGTGAACA--CACATG----C-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGTA-----T--AGATT---AT--GT----TACCTGATA--AAAAA
gi|47585 : ATGATGGTGAACA--CACATG----G-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-C---AT--CT----TACCTGATA--AAAAACT
gi|47587 : ATGATGCTGAACA--CACATG----T-----GAAATTTC-------------AT--TCATATCA---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACTTGATA--AAAAACT
gi|47589 : ATGATGGTGAACA--CACATG----T-----GAAGGTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGC---------AGA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAAACT
gi|47591 : ATGACCGTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCT---AA---T-G-------A---GT--G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--TT----TACCTGATC--AAAAACT
gi|47593 : ATGATACTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TGATATAC---AA---T-T-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AAA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAAATT
gi|47595 : ATGATGGTGAACA--CACATG----C-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGTA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATAATAAAAACT
gi|47598 : ATGATGGTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AT---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--ATA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAAACT
gi|47599 : ATAATGGTGAACA--CACATA----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAAATT
gi|47602 : ATGATGGTGAATA--CACATG----C-----AAAGTTTC-------------AT--TCATATCT---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--GT----TACCTGATA--AAAAACT
gi|47608 : ATGATGGTGAACA--CACATG----C-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCA---AA---T-G-------A---TTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACGTGATA--AAAAACT
gi|47611 : ATGATGCTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AA--TCATATCG---AA---T-G-------A---GTG-A-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAAACT
gi|47617 : ATGATGGTGAACA--CACAGG----C-----AAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATT--AAAAACT
gi|47622 : ATGATGCTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCA---TA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---TT--TT----TACCTGATA--GAAAACT
gi|47623 : ATGTTGCTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATC-----A---TAA-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--TT----TACCTGATC--AAAAACT
gi|47624 : ATGATGCTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AA--TCATATCA---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAAA
gi|47625 : ATGATGGTGAATA--CACATG----C-----AAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAAACT
gi|47629 : ATGATGGTGAACA--CGCATG----C-----AATGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--GT----TACCTGATA--AAAAACT
gi|47637 : ATGACGTTGAACA--CACAAT----C-----AAAGTTTT-------------AT--TCA-ATCC---AA---T-A-------T---G-G-G-CTG-A-----T---GA-A---AT--CTA---TACCTGCTC--AAA
gi|47640 : ATGATGCTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCACATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--
gi|47648 : ATGATGGTGAAAA--CTCATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AAA-T---AT--CT----TACCTGATA--GAAAACT
gi|47654 : ATGATGGTGAACA--CACATG----C-----GAAGTTGC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAA
gi|47656 : ATGATGGTGAACA--CACATG----C-----GAGGTTTC-------------CT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGGA-----T--AGA-T---AT--TT----TACCTGATA--AAAAACTct
gi|47666 : ATGATGGTAAACA--CACATG----C-----AAAGTCTT-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGAC-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAAACT
gi|47672 : ATGATGGTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCACATCC---AG---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACGTGATA--AAAAACT
gi|47673 : ATGATGCTGAGCA--CACACG----T-----GACGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---ATG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATA--ACAAACT
gi|47971 : TGATGCTGAACA--CACATG----A-----GAAGTTTG-------------AT--TTACGTCC---AA---T-G-------A---TAG-G-TTG
gi|47973 : TGATGCTGAACA--CACATG----A-----GAAGTTTC-------------AT--TCATGTTC---AA---T-G-------A---CAG-G-TTGgtgaactatgtaccaactcaaaaact
gi|47976 : TAATGCTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TTATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAAACTgtaaaatatgtaacaactcaaaa
gi|47980 : ATAATGGTTAACA--CACATG----C-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----A--AGA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAAACT
gi|47994 : tgGATGCGGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATGTCC---AA---T-G-------A---TAG-G-TTG-A-----TG-AAA-T---A---AG----TACCAACTC--AAAAACT
gi|47995 : GATGCTGAACA--CACATA----T-----GAAGTCTC-------------AT--TCATATCCACTAA---T-A-------A---GTT-G-ATG----------AAA-T---AT---G----TACCTGCTC--AAAAACT
gi|47996 : GGTGCTGAACA--CATATG-----------AAGTTTC-------------AT--TCATATTC---AA---T-G-------A---TAG-G-TTG-A-----TG-AAA-T---AT---G----TACCAACTC--AAAAACT
gi|47997 : GATTTTGAACA--CATATG----A-----GAAGTTCC-------------AT--TCATGTCC---AA---T-G-------A---TAG-G-ATG-A-----TG-AAA-T---A---AG----TACCAAATC--AAAAACT
gi|47998 : GATGCTTAACA--CACATG----T-----AAAGTTTC-------------AT--TCATGTCC---AA---T-G-------A---CGG-G-TTG
gi|47999 : GATGTTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATGTCC---AA---T-G-------A---atgaaataagtattgactcaaaaact
gi|48000 : GATGTTGAACA--CACAAG----T-----GAGGTTTC-------------AT--TCCTGTCC---AA---T-G-------A---TAG-G-ATG-A-----TG-AAA-T---A---GG----TACCAAATC--AAAAACTtaggatgatgaaacaagtacaaaatcaaaaact
gi|48001 : GATGTTGAACA--CACATG----A-----GAAGTTTC-------------AT--TCACGTCC---AA---T-G-------A---
gi|48003 : GATGTTGAACA--TACAAG----T-----GAGGTTTC-------------AT--TCCTGTCC---AA---T-G-------A---taggatgatgaaataagtac
gi|48004 : GATGTTGAACA--CACCAG----T-----GATGTTCC-------------CT--TCCTGTCC---AA---T-G-------A---TAG-G-ATG-A-----TG-AAA-T---A---GG----TACCAAATC--AAAAACTtaggatgataaaataggtacc
gi|48005 : GATGTTGAACG--TACAAG----T-----GAGGTTTT-------------AT--TCCTGTCC---AA---T-G-------A---GAG-A-CTG-A-----TG-AAA-T---A---GG----TACCAAATC--AAAAACT
gi|48006 : GATGGTGAACA--CACATG----C-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAAA
gi|48010 : ATGCTGAACA--CACATG----T-----CAAGTTTC-------------AT--TCATGTCC---AA---T-G-------A---
gi|48011 : ATGCTGAACA--CACATG----A-----GAAGTTTC-------------AT--TCTTGCTA---AA---T-G-------A---TTG-G-TTG-A-----TG-AAA-T---AT--CT----tagtgtgatgaaataagtaccaactcgaaaact
gi|48013 : CTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCA---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAAACTgccaactcaaaaa
gi|48035 : A--CACATG----T-----GAAGTTTA-------------AT--TCACGTTC---AA---T-G-------A---TAG-G-TTG
gi|48036 : --CACATG----T-----GAAGTTTT-------------AG--TCATATAC---AT---T-A-------A---TAG-G-TT-TA-----T--GAA-T---AT---G----AACCTGCTT--AAAAACTgtgaaatgtgtaccaactcaaaa
gi|48041 : -----GAAGTTTC-------------AT--TCATATAC---AA---T-G-------A---TAA-G-TTG-A-----TG-AAA-T---AT---G----TACATACTC--AGAAACT
gi|48043 : TC-------------AT--GCATATCC---AAGGTT-G-------A---TAG-G-TTG-A-----TG-AAA-T---AT---G----TACCTGTTC--AAAAAC
Alignments
lowQualScore : 1 11 11111111
lowQualScore : 2 00 5555555555 2222222222222 00 000 000 0 1111111 33333 0 0 1 11111 22 0 000 22222222 0 111
lowQualScore : . .. .......... ............. .. ... ... . ....... ..... . . . ..... .. . ... ........ . ...
lowQualScore : 4 66 7777777777 2222222222222 66 777 777 4 3333333 11111 4 4 2 66666 88 9 888 33333333 1 999
consensus : ATGATGCTGAACA--CACATG----C-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAAACT
Reference ( family-71 ) : ATGATGCTGAACA--CACATG----C-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAAACT
gi|47444 : ATGATACTGAACA--CACATG----T-----GAGGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---C-G-------A---TAG-G-TTG-A-----TG-AAA-T---AT---G----TACCTGCTC--AAAAACT
gi|47445 : ATGATACTGAACA--CACATG----T-----AAAGTTTC-------------AT--GCATATCC---AA---T-A-------A---TAG-G-TTG-A-----TG-AAA-T---AT---G----TACCTGCTC--AAAAACT
gi|47449 : ATGATAATGAACA--CACATG----A-----GAAGTTTT-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---TAG-A-TTG-A-----TG-AAA-T---AT---G----TACCTGCTC--AAAAACT
gi|47451 : ATGATACTGAACA--CACATG----T-----GATGTTTC-------------AT--TCGTATCC---AA---T-G-------A---TCATG-TTG-A-----TG-AAA-T---AT---G----TACCTGCTC--AAAAACT
gi|47458 : ATGATACTGAACA--CATATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---TAG-G-TTG-A-----TGAAAA-T---AT---G----TACATGCTC--ATAAACT
gi|47459 : ATGATACTGAACA--CACATG----T-----AACGTTTC-------------AT--TCATATCC---AT---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CTTTAATACCTGATT--TAAAACT
gi|47467 : ATGATGCTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATTA---AA---T-G-------T---TAG-G-TTG-A-----TG-AAA-T---AT---G----TACCTGTTC--AAAAACT
gi|47469 : ATGGTGTTGAACA--CACATA----T-----GAAATTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---TAG-G-TTG-A-----TG-AAA-T---AT---G----TACCTGCTA--AAAAACT
gi|47470 : ATGATGCTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--GCATATCC---AA---T-GCATATCTA---ATG-A-TAGAA-----T---GA-TCAAAT--GTG---TACCTACTT--AAAAACT
gi|47472 : ATGATGTTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATTC---AA---T-G-------A---TAG-C-TTG-A-----TG-AAA-T---ATG-C------ACCTGCTC--AAAA
gi|47473 : ATAATGTTGAACA--CAAATG----T-----GAAGTTTCATAAATATATTATAT--TCATATTC---AA---T-G-------A---TAG-C-TTG-A-----TA-AAA-T---ATG-CT------CCTGCTA--ATAAACT
gi|47474 : ATGATACTGAATA--CACATG----T-----GAAGTT-------------------TCATATCT---AA---T-G-------A---TAG-G-CTG-A-----TG-AAA-T---AT---G----TACCTGCTC--AAAAACT
gi|47476 : ATGATGCTGAACAAACATATG----T-----GAAGTTGC-------------AT--TCATGTCC---AA---T-G-------A---TAT-G-TTG-A-----TG-AAA-T---AT---G----TACCAGCTC--AAAAACT
gi|47478 : ATGATGCTGAACA--CATATG----T-----AAAGTTTC-------------AT--TCATGCCC---AT---T-G-------A---TAG-G-TTG-A-----TG-AAA-T---AT--
gi|47479 : ATGATATTGAACA--CGGAAT----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---C-G-------A----TG-GAATG-A-----TG-AAA-T---ATGATG----TACCTGCTC--AAAAACTgtaccaacccaaaaac
gi|47480 : ACGATACTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-A-------A---TAG-G-TTG-A-----T---GA-T---A---------TA--TGTTA--AAAAATT
gi|47485 : ACGATGCTGAACA--CACATG----T-----ACAATTCC-------------TT--TCATATTC---AA---T-G-------A---TAG-G-TTG-A-----TG-AAA-T---AT---G----TACCTGctaacttgcccaaaaact
gi|47486 : ATGATGCTTAACA--CA--TG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCT---AA---T-G-------T---TAG-G-TTG-A-----TG-AAA-T---AT--A-----TACCTACTC--AAAAGCctcgaaa
gi|47487 : ATGATGTTGAACA--CAC-TG----T-----GAAATTTC-------------AT--CCAAAAGC---AA---T-G-------ACAGGTA-G-ATGAAT----T--ATA-T---AA--TG----TACCTGCTC--AGAAACT
gi|47489 : ATGATGTTGAATA--CACATG----T-----AAAGCTTC-------------AT--TCATATTC---AC---T-G-------A---TAG-C-TTGGT-----G--AAA-T---ATG-C------ACCTGCTC--AAAA
gi|47490 : ATAATGCTAAGCA--CA--TG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCAAATCC---AA---T-G-------A---TAG-G-TTG-A-----TG-AAA-T---AT--A-----TACCTGCTT--AAA
gi|47491 : ATGATGTTGAACA--CAC-------T-----GAAGTTTC-------------AT--CCAAATCA---AA---T-G-------A---CAG-G-TTG-A-----T--GAA-T---G---------TAGCTGCTC--AAAAACT
gi|47495 : ATGATGCTGAGCA--CATATG----A-----GAAGTTGT-------------AT--TCATGTCC---AA---T-G-------A---TAG-G-TTG-A-----TG-AAA-T---AT--
gi|47496 : ATGAGTCTGATTG--CACATG----T-----GATGTTTC-------------AT--TCATGTCC---AA---T-G-------A---TAG-G-CTG-A-----TA-AAA-T---AT---G----TACCAACTA--AAAAACTatagcaactcaaaaact
gi|47497 : ATGATGATGAAGA--CACACG--------------TTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---TTG-G-TTG-G-----T--GAA-T---AT---G----TACCCGCTC--AAAAGCT
gi|47503 : ATGATGCTGAACA--CACATG----T-----GACGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-A-------T---GTG-A-T
gi|47507 : ATGATGCTGAACA--CACATG----T-----GACATTTC-------------AT--TTATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--TT----TATCTGATA--AAAAACgaaaaatgtatctgctttaaaact
gi|47509 : ATGATACTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCG---TA---T-G-------A---GTG-G-TTGC---------AGA-T---AT--CT----TACCTGACA--AAAAACT
gi|47513 : ATGATGTCAAACA--TGCATG----T-----GAAGTTCC-------------AT--TCACATCC---AA---T-G-------A---
gi|47514 : ATGATGCTTAACA--CACA---------------GTTTC-------------AT--TCATTTTC---AA---T-G-------A---TAG-G-TTG-A-----T---GA-A---AT--GTG---TACCAACTC--AAAAACTtaggatgatgaaataagtaccagctcaaaacct
gi|47518 : ATGATGTTGAACA--CACATG----T-----GAATTTTT-------------TTTGTCATACCC---AT---T-G-------A---TAG-A-TCG-A-----TG-AAA-T---AT---G----TACATGCTA--AAAAAC
gi|47519 : ATGATGTTGAACA--CACATG----C-----AAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATC--AAAAACT
gi|47527 : ATGATGGTGAACA--CACATG----G-----GAAGTTCC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GAG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAAACT
gi|47530 : ATGATACTGAACA--CACATA----TTTTATGAAGCTTC-------------AT--TAATATCC---AA---T-G-------A---TTG-G-TT
gi|47531 : ATGATGGTGAACA--CACATG----C-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAAACTaatgacagttgtaccaactcaaaacct
gi|47540 : ATGATGGTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCATACGGT--AGA-T---AT--CT----GACCTGATA--AAAAACT
gi|47541 : ATGATGGTGAACA--CACATG----C-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----C--AGA-T---AT--CT----GATCTGATA--AAAAACT
gi|47542 : ATGATGGTGAACA--CACATG----C-----ACAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--AT----GACCTGATA--AAAAATT
gi|47544 : ATGATGTTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--TT----TACCTGATA--ATAAACT
gi|47545 : ATGATGGTGAACA--CAGATG----C-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CG----TACCTGATA--AAAAAC
gi|47546 : ATGATGGTGAACA--CACATG----C-----GAAATTTT-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATT--AAAAAC
gi|47547 : ATGATAGTGAACA--CACATG----C-----GAAGTTTC-------------AT--TCACATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AAA-T---AT--AT----T
gi|47553 : ATGATGATGAACA--CACATG----G-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-A---AT--CT----TACCCGATA--AAAAACTgaacttaagcgcaaaa
gi|47556 : ATGATGGTGAACA--CACATG----T-----AAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-C---AT--CT----TACCTGATA--AAAAACT
gi|47558 : ATGATAGTGAACA--CACATG----C-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACATGATA--AAAAACT
gi|47563 : ATGATGCTGAACA--CATATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATTG---AA---T-G-------A---ATG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGTTA--AAAAACT
gi|47566 : ATGATACTGAACA--CACATGATTGT-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TTCCTGATA--AAAAACT
gi|47567 : ATGATGTTGAACA--CACATG----C-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GCG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACATGATA--AAAAACT
gi|47570 : ATGATGGTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTA-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TGCCTGATA--AAAAACT
gi|47573 : ATGATGGTGAACA--CACATG----C-----GAAGTTTC-------------GT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAAACT
gi|47577 : ATAATGGTGAACA--CACATG----C-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGTA-----T--AGATT---AT--GT----TACCTGATA--AAAAA
gi|47581 : ATAATGGTGAACA--CACATG----C-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGTA-----T--AGATT---AT--GT----TACCTGATA--AAAAA
gi|47585 : ATGATGGTGAACA--CACATG----G-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-C---AT--CT----TACCTGATA--AAAAACT
gi|47587 : ATGATGCTGAACA--CACATG----T-----GAAATTTC-------------AT--TCATATCA---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACTTGATA--AAAAACT
gi|47589 : ATGATGGTGAACA--CACATG----T-----GAAGGTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGC---------AGA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAAACT
gi|47591 : ATGACCGTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCT---AA---T-G-------A---GT--G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--TT----TACCTGATC--AAAAACT
gi|47593 : ATGATACTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TGATATAC---AA---T-T-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AAA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAAATT
gi|47595 : ATGATGGTGAACA--CACATG----C-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGTA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATAATAAAAACT
gi|47598 : ATGATGGTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AT---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--ATA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAAACT
gi|47599 : ATAATGGTGAACA--CACATA----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAAATT
gi|47602 : ATGATGGTGAATA--CACATG----C-----AAAGTTTC-------------AT--TCATATCT---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--GT----TACCTGATA--AAAAACT
gi|47608 : ATGATGGTGAACA--CACATG----C-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCA---AA---T-G-------A---TTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACGTGATA--AAAAACT
gi|47611 : ATGATGCTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AA--TCATATCG---AA---T-G-------A---GTG-A-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAAACT
gi|47617 : ATGATGGTGAACA--CACAGG----C-----AAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATT--AAAAACT
gi|47622 : ATGATGCTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCA---TA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---TT--TT----TACCTGATA--GAAAACT
gi|47623 : ATGTTGCTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATC-----A---TAA-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--TT----TACCTGATC--AAAAACT
gi|47624 : ATGATGCTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AA--TCATATCA---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAAA
gi|47625 : ATGATGGTGAATA--CACATG----C-----AAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAAACT
gi|47629 : ATGATGGTGAACA--CGCATG----C-----AATGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--GT----TACCTGATA--AAAAACT
gi|47637 : ATGACGTTGAACA--CACAAT----C-----AAAGTTTT-------------AT--TCA-ATCC---AA---T-A-------T---G-G-G-CTG-A-----T---GA-A---AT--CTA---TACCTGCTC--AAA
gi|47640 : ATGATGCTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCACATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--
gi|47648 : ATGATGGTGAAAA--CTCATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AAA-T---AT--CT----TACCTGATA--GAAAACT
gi|47654 : ATGATGGTGAACA--CACATG----C-----GAAGTTGC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAA
gi|47656 : ATGATGGTGAACA--CACATG----C-----GAGGTTTC-------------CT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGGA-----T--AGA-T---AT--TT----TACCTGATA--AAAAACTct
gi|47666 : ATGATGGTAAACA--CACATG----C-----AAAGTCTT-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGAC-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAAACT
gi|47672 : ATGATGGTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCACATCC---AG---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACGTGATA--AAAAACT
gi|47673 : ATGATGCTGAGCA--CACACG----T-----GACGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---ATG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATA--ACAAACT
gi|47971 : TGATGCTGAACA--CACATG----A-----GAAGTTTG-------------AT--TTACGTCC---AA---T-G-------A---TAG-G-TTG
gi|47973 : TGATGCTGAACA--CACATG----A-----GAAGTTTC-------------AT--TCATGTTC---AA---T-G-------A---CAG-G-TTGgtgaactatgtaccaactcaaaaact
gi|47976 : TAATGCTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TTATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAAACTgtaaaatatgtaacaactcaaaa
gi|47980 : ATAATGGTTAACA--CACATG----C-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----A--AGA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAAACT
gi|47994 : tgGATGCGGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATGTCC---AA---T-G-------A---TAG-G-TTG-A-----TG-AAA-T---A---AG----TACCAACTC--AAAAACT
gi|47995 : GATGCTGAACA--CACATA----T-----GAAGTCTC-------------AT--TCATATCCACTAA---T-A-------A---GTT-G-ATG----------AAA-T---AT---G----TACCTGCTC--AAAAACT
gi|47996 : GGTGCTGAACA--CATATG-----------AAGTTTC-------------AT--TCATATTC---AA---T-G-------A---TAG-G-TTG-A-----TG-AAA-T---AT---G----TACCAACTC--AAAAACT
gi|47997 : GATTTTGAACA--CATATG----A-----GAAGTTCC-------------AT--TCATGTCC---AA---T-G-------A---TAG-G-ATG-A-----TG-AAA-T---A---AG----TACCAAATC--AAAAACT
gi|47998 : GATGCTTAACA--CACATG----T-----AAAGTTTC-------------AT--TCATGTCC---AA---T-G-------A---CGG-G-TTG
gi|47999 : GATGTTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATGTCC---AA---T-G-------A---atgaaataagtattgactcaaaaact
gi|48000 : GATGTTGAACA--CACAAG----T-----GAGGTTTC-------------AT--TCCTGTCC---AA---T-G-------A---TAG-G-ATG-A-----TG-AAA-T---A---GG----TACCAAATC--AAAAACTtaggatgatgaaacaagtacaaaatcaaaaact
gi|48001 : GATGTTGAACA--CACATG----A-----GAAGTTTC-------------AT--TCACGTCC---AA---T-G-------A---
gi|48003 : GATGTTGAACA--TACAAG----T-----GAGGTTTC-------------AT--TCCTGTCC---AA---T-G-------A---taggatgatgaaataagtac
gi|48004 : GATGTTGAACA--CACCAG----T-----GATGTTCC-------------CT--TCCTGTCC---AA---T-G-------A---TAG-G-ATG-A-----TG-AAA-T---A---GG----TACCAAATC--AAAAACTtaggatgataaaataggtacc
gi|48005 : GATGTTGAACG--TACAAG----T-----GAGGTTTT-------------AT--TCCTGTCC---AA---T-G-------A---GAG-A-CTG-A-----TG-AAA-T---A---GG----TACCAAATC--AAAAACT
gi|48006 : GATGGTGAACA--CACATG----C-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAAA
gi|48010 : ATGCTGAACA--CACATG----T-----CAAGTTTC-------------AT--TCATGTCC---AA---T-G-------A---
gi|48011 : ATGCTGAACA--CACATG----A-----GAAGTTTC-------------AT--TCTTGCTA---AA---T-G-------A---TTG-G-TTG-A-----TG-AAA-T---AT--CT----tagtgtgatgaaataagtaccaactcgaaaact
gi|48013 : CTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCA---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAAACTgccaactcaaaaa
gi|48035 : A--CACATG----T-----GAAGTTTA-------------AT--TCACGTTC---AA---T-G-------A---TAG-G-TTG
gi|48036 : --CACATG----T-----GAAGTTTT-------------AG--TCATATAC---AT---T-A-------A---TAG-G-TT-TA-----T--GAA-T---AT---G----AACCTGCTT--AAAAACTgtgaaatgtgtaccaactcaaaa
gi|48041 : -----GAAGTTTC-------------AT--TCATATAC---AA---T-G-------A---TAA-G-TTG-A-----TG-AAA-T---AT---G----TACATACTC--AGAAACT
gi|48043 : TC-------------AT--GCATATCC---AAGGTT-G-------A---TAG-G-TTG-A-----TG-AAA-T---AT---G----TACCTGTTC--AAAAAC
blockSeqs : C TTTTAT ATAAATATATTAT CATATCT CAGGT C TACGG GA CTTTAA AAT
blockSeqs : A ATTGT . . TA A T G GATG C
blockSeqs : C T . . TA A . G GTG C
blockSeqs : C A . . TC G . G GCT C
blockSeqs : C T . . TA C . G GTG C
blockSeqs : C T . . GT C . G CTA T
blockSeqs : T T . . TA C . G GC C
blockSeqs : C T . . TA C . A TG A
blockSeqs : T T . . AT C . G GC T
blockSeqs : T T . . TA C . G TT C
blockSeqs : C T . . TA C . G CT A
blockSeqs : C T . . TA C . G CT C
blockSeqs : C T . . TA C . G CT C
blockSeqs : T T . . TA C . G CT C
blockSeqs : C T . . TA C . G CT A
blockSeqs : C T . . TA C . G CT C
blockSeqs : C T . . TA C . A AT C
blockSeqs : T T . . TA C . G TT C
blockSeqs : T T . . TA C . G CG T
blockSeqs : C T . . CA C . G CT C
blockSeqs : T T . . TA C . G AT A
blockSeqs : C T . . TA C . G CT C
blockSeqs : C T . . TT C . G CT A
blockSeqs : A A . . GT C . G CT A
blockSeqs : C T . . GT T . G CT C
blockSeqs : C T . . GT T . G CT A
blockSeqs : C T . . TA C . G CT C
blockSeqs : T T . . TA C . . CT A
blockSeqs : C T . . GT C . . CT A
blockSeqs : T T . . GA C . . GT A
blockSeqs : T C . . TT C . . GT A
blockSeqs : G G . . GT T . . CT A
blockSeqs : C C . . GT C . . CT A
blockSeqs : G T . . GT C . . CT A
blockSeqs : G C . . GT C . . TT T
blockSeqs : G C . . GT C . . CT A
blockSeqs : G T . . GT C . . CT A
blockSeqs : T C . . GT C . . CT A
blockSeqs : G C . . GT C . . CT A
blockSeqs : G C . . GT C . . GT A
blockSeqs : G G . . GT C . . CT A
blockSeqs : A T . . GT C . . CT A
blockSeqs : G C . . AT C . . CT A
blockSeqs : G T . . GT C . . TT A
blockSeqs : C C . . GC C . . TT A
blockSeqs : C T . . GT C . . CT A
blockSeqs : T C . . GT G . . CT A
blockSeqs : G C . . GT A . . GT A
blockSeqs : G C . . GT C . . CT C
blockSeqs : G G . . GT C . . CT A
blockSeqs : G T . . GT C . . TT A
blockSeqs : G T . . GT C . . CT A
blockSeqs : C T . . GT C . . CT A
blockSeqs : G T . . GT C . . CT A
blockSeqs : G C . . GT T . . CT A
blockSeqs : C T . . GT . . . CT T
blockSeqs : G T . . GT . . . AG A
blockSeqs : G C . . GT . . . AG C
blockSeqs : G C . . TT . . . GG A
blockSeqs : G T . . GT . . . GG A
blockSeqs : G C . . GT . . . GG A
blockSeqs : C T . . GT . . . CT C
blockSeqs : G T . . GT . . . CT A
blockSeqs : C T . . GT . . . CT A
blockSeqs : C C . . GT . . . G A
blockSeqs : C C . . GT . . . G A
blockSeqs : G C . . GT . . . G A
blockSeqs : G T . . GT . . . G A
blockSeqs : T T . . GT . . . G A
blockSeqs : C C . . GT . . . G A
blockSeqs : G C . . GT . . . G C
blockSeqs : G C . . GT . . . G C
blockSeqs : G T . . AT . . . G C
blockSeqs : G T . . TA . . . A C
blockSeqs : G A . . CA . . . A C
blockSeqs : C A . . GT . . . G C
blockSeqs : C T . . GT . . . G C
blockSeqs : C C . . TA . . . G A
blockSeqs : C T . . GT . . . G A
blockSeqs : G T . . TA . . . G T
blockSeqs : C A . . TA . . . G C
blockSeqs : C T . . CG . . . G C
blockSeqs : C T . . TA . . . G
blockSeqs : T T . . TA . . . .
blockSeqs : C A . . GA . . . .
blockSeqs : T T . . GT . . .
blockSeqs : T T . . TT . . .
blockSeqs : T T . . GT . . .
blockSeqs : T C . . TA
blockSeqs : T T . . TA
blockSeqs : T A . . TA
blockSeqs : G T . . TA
blockSeqs : C T . . T
blockSeqs : C T . . G
blockSeqs : C . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqCons : ** CT******
originalCons : ATGATGCTGAACA--CACATG----C-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAAACT
finalCons : ATGATGCTGAACA--CACATG----C-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---ATCT------TACCTGATA--AAAAACT
Alignments
lowQualScore : 1 11 11111111
lowQualScore : 2 00 5555555555 2222222222222 00 000 000 0 1111111 33333 0 0 1 11111 22 0 000 22222222 0 111
lowQualScore : . .. .......... ............. .. ... ... . ....... ..... . . . ..... .. . ... ........ . ...
lowQualScore : 4 66 7777777777 2222222222222 66 777 777 4 3333333 11111 4 4 2 66666 88 9 888 33333333 1 999
consensus : ATGATGCTGAACA--CACATG----C-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAAACT
Reference ( family-71 ) : ATGATGCTGAACA--CACATG----C-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAAACT
gi|47444 : ATGATACTGAACA--CACATG----T-----GAGGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---C-G-------A---TAG-G-TTG-A-----TG-AAA-T---AT---G----TACCTGCTC--AAAAACT
gi|47445 : ATGATACTGAACA--CACATG----T-----AAAGTTTC-------------AT--GCATATCC---AA---T-A-------A---TAG-G-TTG-A-----TG-AAA-T---AT---G----TACCTGCTC--AAAAACT
gi|47449 : ATGATAATGAACA--CACATG----A-----GAAGTTTT-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---TAG-A-TTG-A-----TG-AAA-T---AT---G----TACCTGCTC--AAAAACT
gi|47451 : ATGATACTGAACA--CACATG----T-----GATGTTTC-------------AT--TCGTATCC---AA---T-G-------A---TCATG-TTG-A-----TG-AAA-T---AT---G----TACCTGCTC--AAAAACT
gi|47458 : ATGATACTGAACA--CATATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---TAG-G-TTG-A-----TGAAAA-T---AT---G----TACATGCTC--ATAAACT
gi|47459 : ATGATACTGAACA--CACATG----T-----AACGTTTC-------------AT--TCATATCC---AT---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CTTTAATACCTGATT--TAAAACT
gi|47467 : ATGATGCTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATTA---AA---T-G-------T---TAG-G-TTG-A-----TG-AAA-T---AT---G----TACCTGTTC--AAAAACT
gi|47469 : ATGGTGTTGAACA--CACATA----T-----GAAATTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---TAG-G-TTG-A-----TG-AAA-T---AT---G----TACCTGCTA--AAAAACT
gi|47470 : ATGATGCTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--GCATATCC---AA---T-GCATATCTA---ATG-A-TAGAA-----T---GA-TCAAAT--GTG---TACCTACTT--AAAAACT
gi|47472 : ATGATGTTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATTC---AA---T-G-------A---TAG-C-TTG-A-----TG-AAA-T---ATG-C------ACCTGCTC--AAAA
gi|47473 : ATAATGTTGAACA--CAAATG----T-----GAAGTTTCATAAATATATTATAT--TCATATTC---AA---T-G-------A---TAG-C-TTG-A-----TA-AAA-T---ATG-CT------CCTGCTA--ATAAACT
gi|47474 : ATGATACTGAATA--CACATG----T-----GAAGTT-------------------TCATATCT---AA---T-G-------A---TAG-G-CTG-A-----TG-AAA-T---AT---G----TACCTGCTC--AAAAACT
gi|47476 : ATGATGCTGAACAAACATATG----T-----GAAGTTGC-------------AT--TCATGTCC---AA---T-G-------A---TAT-G-TTG-A-----TG-AAA-T---AT---G----TACCAGCTC--AAAAACT
gi|47478 : ATGATGCTGAACA--CATATG----T-----AAAGTTTC-------------AT--TCATGCCC---AT---T-G-------A---TAG-G-TTG-A-----TG-AAA-T---AT--
gi|47479 : ATGATATTGAACA--CGGAAT----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---C-G-------A----TG-GAATG-A-----TG-AAA-T---ATGATG----TACCTGCTC--AAAAACTgtaccaacccaaaaac
gi|47480 : ACGATACTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-A-------A---TAG-G-TTG-A-----T---GA-T---A---------TA--TGTTA--AAAAATT
gi|47485 : ACGATGCTGAACA--CACATG----T-----ACAATTCC-------------TT--TCATATTC---AA---T-G-------A---TAG-G-TTG-A-----TG-AAA-T---AT---G----TACCTGctaacttgcccaaaaact
gi|47486 : ATGATGCTTAACA--CA--TG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCT---AA---T-G-------T---TAG-G-TTG-A-----TG-AAA-T---AT--A-----TACCTACTC--AAAAGCctcgaaa
gi|47487 : ATGATGTTGAACA--CAC-TG----T-----GAAATTTC-------------AT--CCAAAAGC---AA---T-G-------ACAGGTA-G-ATGAAT----T--ATA-T---AA--TG----TACCTGCTC--AGAAACT
gi|47489 : ATGATGTTGAATA--CACATG----T-----AAAGCTTC-------------AT--TCATATTC---AC---T-G-------A---TAG-C-TTGGT-----G--AAA-T---ATG-C------ACCTGCTC--AAAA
gi|47490 : ATAATGCTAAGCA--CA--TG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCAAATCC---AA---T-G-------A---TAG-G-TTG-A-----TG-AAA-T---AT--A-----TACCTGCTT--AAA
gi|47491 : ATGATGTTGAACA--CAC-------T-----GAAGTTTC-------------AT--CCAAATCA---AA---T-G-------A---CAG-G-TTG-A-----T--GAA-T---G---------TAGCTGCTC--AAAAACT
gi|47495 : ATGATGCTGAGCA--CATATG----A-----GAAGTTGT-------------AT--TCATGTCC---AA---T-G-------A---TAG-G-TTG-A-----TG-AAA-T---AT--
gi|47496 : ATGAGTCTGATTG--CACATG----T-----GATGTTTC-------------AT--TCATGTCC---AA---T-G-------A---TAG-G-CTG-A-----TA-AAA-T---AT---G----TACCAACTA--AAAAACTatagcaactcaaaaact
gi|47497 : ATGATGATGAAGA--CACACG--------------TTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---TTG-G-TTG-G-----T--GAA-T---AT---G----TACCCGCTC--AAAAGCT
gi|47503 : ATGATGCTGAACA--CACATG----T-----GACGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-A-------T---GTG-A-T
gi|47507 : ATGATGCTGAACA--CACATG----T-----GACATTTC-------------AT--TTATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--TT----TATCTGATA--AAAAACgaaaaatgtatctgctttaaaact
gi|47509 : ATGATACTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCG---TA---T-G-------A---GTG-G-TTGC---------AGA-T---AT--CT----TACCTGACA--AAAAACT
gi|47513 : ATGATGTCAAACA--TGCATG----T-----GAAGTTCC-------------AT--TCACATCC---AA---T-G-------A---
gi|47514 : ATGATGCTTAACA--CACA---------------GTTTC-------------AT--TCATTTTC---AA---T-G-------A---TAG-G-TTG-A-----T---GA-A---AT--GTG---TACCAACTC--AAAAACTtaggatgatgaaataagtaccagctcaaaacct
gi|47518 : ATGATGTTGAACA--CACATG----T-----GAATTTTT-------------TTTGTCATACCC---AT---T-G-------A---TAG-A-TCG-A-----TG-AAA-T---AT---G----TACATGCTA--AAAAAC
gi|47519 : ATGATGTTGAACA--CACATG----C-----AAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATC--AAAAACT
gi|47527 : ATGATGGTGAACA--CACATG----G-----GAAGTTCC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GAG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAAACT
gi|47530 : ATGATACTGAACA--CACATA----TTTTATGAAGCTTC-------------AT--TAATATCC---AA---T-G-------A---TTG-G-TT
gi|47531 : ATGATGGTGAACA--CACATG----C-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAAACTaatgacagttgtaccaactcaaaacct
gi|47540 : ATGATGGTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCATACGGT--AGA-T---AT--CT----GACCTGATA--AAAAACT
gi|47541 : ATGATGGTGAACA--CACATG----C-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----C--AGA-T---AT--CT----GATCTGATA--AAAAACT
gi|47542 : ATGATGGTGAACA--CACATG----C-----ACAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--AT----GACCTGATA--AAAAATT
gi|47544 : ATGATGTTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--TT----TACCTGATA--ATAAACT
gi|47545 : ATGATGGTGAACA--CAGATG----C-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CG----TACCTGATA--AAAAAC
gi|47546 : ATGATGGTGAACA--CACATG----C-----GAAATTTT-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATT--AAAAAC
gi|47547 : ATGATAGTGAACA--CACATG----C-----GAAGTTTC-------------AT--TCACATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AAA-T---AT--AT----T
gi|47553 : ATGATGATGAACA--CACATG----G-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-A---AT--CT----TACCCGATA--AAAAACTgaacttaagcgcaaaa
gi|47556 : ATGATGGTGAACA--CACATG----T-----AAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-C---AT--CT----TACCTGATA--AAAAACT
gi|47558 : ATGATAGTGAACA--CACATG----C-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACATGATA--AAAAACT
gi|47563 : ATGATGCTGAACA--CATATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATTG---AA---T-G-------A---ATG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGTTA--AAAAACT
gi|47566 : ATGATACTGAACA--CACATGATTGT-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TTCCTGATA--AAAAACT
gi|47567 : ATGATGTTGAACA--CACATG----C-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GCG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACATGATA--AAAAACT
gi|47570 : ATGATGGTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTA-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TGCCTGATA--AAAAACT
gi|47573 : ATGATGGTGAACA--CACATG----C-----GAAGTTTC-------------GT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAAACT
gi|47577 : ATAATGGTGAACA--CACATG----C-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGTA-----T--AGATT---AT--GT----TACCTGATA--AAAAA
gi|47581 : ATAATGGTGAACA--CACATG----C-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGTA-----T--AGATT---AT--GT----TACCTGATA--AAAAA
gi|47585 : ATGATGGTGAACA--CACATG----G-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-C---AT--CT----TACCTGATA--AAAAACT
gi|47587 : ATGATGCTGAACA--CACATG----T-----GAAATTTC-------------AT--TCATATCA---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACTTGATA--AAAAACT
gi|47589 : ATGATGGTGAACA--CACATG----T-----GAAGGTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGC---------AGA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAAACT
gi|47591 : ATGACCGTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCT---AA---T-G-------A---GT--G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--TT----TACCTGATC--AAAAACT
gi|47593 : ATGATACTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TGATATAC---AA---T-T-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AAA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAAATT
gi|47595 : ATGATGGTGAACA--CACATG----C-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGTA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATAATAAAAACT
gi|47598 : ATGATGGTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AT---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--ATA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAAACT
gi|47599 : ATAATGGTGAACA--CACATA----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAAATT
gi|47602 : ATGATGGTGAATA--CACATG----C-----AAAGTTTC-------------AT--TCATATCT---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--GT----TACCTGATA--AAAAACT
gi|47608 : ATGATGGTGAACA--CACATG----C-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCA---AA---T-G-------A---TTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACGTGATA--AAAAACT
gi|47611 : ATGATGCTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AA--TCATATCG---AA---T-G-------A---GTG-A-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAAACT
gi|47617 : ATGATGGTGAACA--CACAGG----C-----AAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATT--AAAAACT
gi|47622 : ATGATGCTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCA---TA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---TT--TT----TACCTGATA--GAAAACT
gi|47623 : ATGTTGCTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATC-----A---TAA-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--TT----TACCTGATC--AAAAACT
gi|47624 : ATGATGCTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AA--TCATATCA---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAAA
gi|47625 : ATGATGGTGAATA--CACATG----C-----AAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAAACT
gi|47629 : ATGATGGTGAACA--CGCATG----C-----AATGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--GT----TACCTGATA--AAAAACT
gi|47637 : ATGACGTTGAACA--CACAAT----C-----AAAGTTTT-------------AT--TCA-ATCC---AA---T-A-------T---G-G-G-CTG-A-----T---GA-A---AT--CTA---TACCTGCTC--AAA
gi|47640 : ATGATGCTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCACATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--
gi|47648 : ATGATGGTGAAAA--CTCATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AAA-T---AT--CT----TACCTGATA--GAAAACT
gi|47654 : ATGATGGTGAACA--CACATG----C-----GAAGTTGC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAA
gi|47656 : ATGATGGTGAACA--CACATG----C-----GAGGTTTC-------------CT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGGA-----T--AGA-T---AT--TT----TACCTGATA--AAAAACTct
gi|47666 : ATGATGGTAAACA--CACATG----C-----AAAGTCTT-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGAC-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAAACT
gi|47672 : ATGATGGTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCACATCC---AG---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACGTGATA--AAAAACT
gi|47673 : ATGATGCTGAGCA--CACACG----T-----GACGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---ATG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATA--ACAAACT
gi|47971 : TGATGCTGAACA--CACATG----A-----GAAGTTTG-------------AT--TTACGTCC---AA---T-G-------A---TAG-G-TTG
gi|47973 : TGATGCTGAACA--CACATG----A-----GAAGTTTC-------------AT--TCATGTTC---AA---T-G-------A---CAG-G-TTGgtgaactatgtaccaactcaaaaact
gi|47976 : TAATGCTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TTATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAAACTgtaaaatatgtaacaactcaaaa
gi|47980 : ATAATGGTTAACA--CACATG----C-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----A--AGA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAAACT
gi|47994 : tgGATGCGGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATGTCC---AA---T-G-------A---TAG-G-TTG-A-----TG-AAA-T---A---AG----TACCAACTC--AAAAACT
gi|47995 : GATGCTGAACA--CACATA----T-----GAAGTCTC-------------AT--TCATATCCACTAA---T-A-------A---GTT-G-ATG----------AAA-T---AT---G----TACCTGCTC--AAAAACT
gi|47996 : GGTGCTGAACA--CATATG-----------AAGTTTC-------------AT--TCATATTC---AA---T-G-------A---TAG-G-TTG-A-----TG-AAA-T---AT---G----TACCAACTC--AAAAACT
gi|47997 : GATTTTGAACA--CATATG----A-----GAAGTTCC-------------AT--TCATGTCC---AA---T-G-------A---TAG-G-ATG-A-----TG-AAA-T---A---AG----TACCAAATC--AAAAACT
gi|47998 : GATGCTTAACA--CACATG----T-----AAAGTTTC-------------AT--TCATGTCC---AA---T-G-------A---CGG-G-TTG
gi|47999 : GATGTTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATGTCC---AA---T-G-------A---atgaaataagtattgactcaaaaact
gi|48000 : GATGTTGAACA--CACAAG----T-----GAGGTTTC-------------AT--TCCTGTCC---AA---T-G-------A---TAG-G-ATG-A-----TG-AAA-T---A---GG----TACCAAATC--AAAAACTtaggatgatgaaacaagtacaaaatcaaaaact
gi|48001 : GATGTTGAACA--CACATG----A-----GAAGTTTC-------------AT--TCACGTCC---AA---T-G-------A---
gi|48003 : GATGTTGAACA--TACAAG----T-----GAGGTTTC-------------AT--TCCTGTCC---AA---T-G-------A---taggatgatgaaataagtac
gi|48004 : GATGTTGAACA--CACCAG----T-----GATGTTCC-------------CT--TCCTGTCC---AA---T-G-------A---TAG-G-ATG-A-----TG-AAA-T---A---GG----TACCAAATC--AAAAACTtaggatgataaaataggtacc
gi|48005 : GATGTTGAACG--TACAAG----T-----GAGGTTTT-------------AT--TCCTGTCC---AA---T-G-------A---GAG-A-CTG-A-----TG-AAA-T---A---GG----TACCAAATC--AAAAACT
gi|48006 : GATGGTGAACA--CACATG----C-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCC---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAAA
gi|48010 : ATGCTGAACA--CACATG----T-----CAAGTTTC-------------AT--TCATGTCC---AA---T-G-------A---
gi|48011 : ATGCTGAACA--CACATG----A-----GAAGTTTC-------------AT--TCTTGCTA---AA---T-G-------A---TTG-G-TTG-A-----TG-AAA-T---AT--CT----tagtgtgatgaaataagtaccaactcgaaaact
gi|48013 : CTGAACA--CACATG----T-----GAAGTTTC-------------AT--TCATATCA---AA---T-G-------A---GTG-G-TTGCA-----T--AGA-T---AT--CT----TACCTGATA--AAAAACTgccaactcaaaaa
gi|48035 : A--CACATG----T-----GAAGTTTA-------------AT--TCACGTTC---AA---T-G-------A---TAG-G-TTG
gi|48036 : --CACATG----T-----GAAGTTTT-------------AG--TCATATAC---AT---T-A-------A---TAG-G-TT-TA-----T--GAA-T---AT---G----AACCTGCTT--AAAAACTgtgaaatgtgtaccaactcaaaa
gi|48041 : -----GAAGTTTC-------------AT--TCATATAC---AA---T-G-------A---TAA-G-TTG-A-----TG-AAA-T---AT---G----TACATACTC--AGAAACT
gi|48043 : TC-------------AT--GCATATCC---AAGGTT-G-------A---TAG-G-TTG-A-----TG-AAA-T---AT---G----TACCTGTTC--AAAAAC