lowQualScore : 111 3333333 3333333 222 111 11 11111 1111 2222222 111111 1111111 11111 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 11111111 11111111111 111 11
lowQualScore : 4 6 777 2222222 2222222 6 4 777 5 6 0 555 6 33 0 11111 66 5555 3 1111111 55 555555 777 1 88 55 4444444 999 3 0 444 7777 3 66666 1 888888 666 444444 777 4 999999999 88 2 0 3 1 1 333 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 0 88888888 3 1 66 3 55555555555 333 0 4444 666 333 1 1 55 22 2 000 7 22 6 0 3
lowQualScore : . . ... ....... ....... . . ... . . . ... . .. . ..... .. .... . ....... .. ...... ... . .. .. ....... ... . . ... .... . ..... . ...... ... ...... ... . ......... .. . . . . . ... ......................................................... . ........ . . .. . ........... ... . .... ... ... . . .. .. . ... . .. . . .
lowQualScore : 0 5 555 5555555 5555555 5 0 555 0 5 8 333 7 33 2 88888 99 6666 4 3333333 55 777777 000 6 99 55 8888888 666 1 8 111 6666 1 66666 6 666666 111 888888 333 4 333333333 88 1 6 7 7 1 222 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 6 33333333 8 0 44 8 55555555555 333 9 2222 555 333 5 3 00 55 0 555 4 11 5 2 6
consensus : ATATATNTATATATGCATATATGATAAGAGTCACATT---AACAC-------GTTGTTAGTA-------TAAAGAATGTCAGTCGCTNTTATATGTAGATATTTTAACTGACTGTTGTT--ATATACATTAGTTTGATGATGTATGTTTATAATGATCGGTTAATTAATTG-T-ATCTTTTCTG-CATTGTAN-ATGAATTTTGCTATGTTT-GTTAACA--AA----GNTTT--TA-AGTTT--GT-G----GAT---ATCAGT-GAT--TG----A--AATTTGTTTANNGTT-GGCCAACTACAGTAGTA--TCTTTTAA-AGTANGTATT----C-CTT--A----ANT--NT-CTATA-TG-CG---GGACA-NACCAGAANGAAATGATATT-CGTCTTC---GAT--TC--GG-------T-TC--ATT----T--GG--C--A------T-T-----TCGTACAAA--------TTC-TGTTT--TCT-CTTGG---------TA---TGTTA---T--CGT---ATCTTCCTGTTTCTATCGCT-AAAT-TATG---TGACGATATGCGNAATCTTGAAAGTGCAAATT
Reference ( gi|19498 ) : ATATATATATATATGCATATATGATAAGAGTCACATT---AACAC-------GTTGTTAGTA-------TAAAGAATGTCAGTCGCTTTTATATGTAGATATTTTAACTGACTGTTGT---ATATACATTAGTTTAATGATGTATGTTTATAATGATCGGTTAATTAATTG-T-ATCTTTTCTG-CATTGTAT-ATGAATTTTGCTATGTTT-GTTAACA--AA----GCTTT--TA-AGTTT--GT-G----GAT---ATCAGT-GAT--TG----A--AATTTGTTTATTGTT-GGCCAACTACAGTAGTA--TCTTTTAA-AGTAGGTATT----C-CTC--A----AGT--GT-CTATA-TG-CG---GGACA-CACCAGAAGGAAATGATATT-CATTTTC---GAT--TT--GG-------T-TC--ATT----T--GG--C--A------T-T-----TTGTACAAA--------TTC-TGTTT--TCT-CTTGG---------TA---TGTTA---T--CGT---ATCTTCCTGTTTCTATCGCT-AAAT-TATG---TGACGATATGCGTAATCTTGAAAATGCAAATT
gi|19497 : ATATATATATATATGCATATATGATAAGAGTCACATT---AACAC-------GTTGTTAGTA-------TAAAGAATGTCAGTCGCTTTTATATGTAGATATTTTAACTGACTGTTGT---ATATACATTAGTTTAATGATGTATGTTTATAATGATCGGTTAATTAATTG-T-ATCTTTTCTG-CATTGTAT-ATGAATTTTGCTATGTTT-GTTAACA--AA----GCTTT--TA-AGTTT--GT-G----GAT---ATCAGT-GAT--TG----A--AATTTGTTTATTGTT-GGCCAACTACAGTAGTA--TCTTTTAA-AGTAGGTATT----C-CTC--A----AGT--GT-CTATA-TG-CG---GGACA-CACCAGAAGGAAATGATATT-CATTTTC---GAT--TT--GG-------T-TC--ATT----T--GG--C--A------T-T-----TTGTACAAA--------TTC-TGTTT--TCT-CTTGG---------TA---TGTTA---T--CGT---ATCTTCCTGTTTCTATCGCT-AAAT-TATG---TGACGATATGCGTAATCTTGAAAATGCAAATT
gi|19499 : ATATACACATATATGCATATATGATAAGAGTCATATT---AACAC-------GTTGTTAGTA-------TAAAGAATGTCAGTCGCTTTTATATGTAGATATTTTAACTGACTGTTGT---ATATACATTAGTTTGATGATGTATGTTTATAATGATC-GTTAATTAATTGTT-ATCTTTTCTG-CATTGTAT-ATGAATTTTCCTATGTTT-GTTAACA--AA----GCTTT--TG-AGTCT--GT-G----GTT---ATCAGT-GAT--TG----A--AATTTGTTTATTGTT-GGCCAACTACAGTAGTA--TCTTTTAA-AGTAGGTATT----C-CTC--A----ACT--GT-CTATA-TG-CG---GGACA-CACCAGAAGGAAATGATATT-CATTTTC---GAT--TT--GG-------T-TC--ATT----T--GG--C--A------T-T-----TTGTGCAAA--------TTC-TGTTT--TCT-CTTGA---------TA---TGTTA---T--CGT---ATCTTCCTGTTTCTATCACT-AAAT-TATG---TGACGATATGTGAAATCTTGAAAGTGCAAATT
gi|19500 : ATATATTTATAAATGCATATATGATAAGAGTCACATT---AACAC-------GTTGTTAGTA-------TTAAGAATGTATATTA-TACTATATGTAGATATTTAAACTGACTGTTGTT--ATATACATTAGTTTGATGATGTATGTTTATAATGATCGCTTAATTAATTG-TCATCTTTTCTG-TATTGTAC-ATGAATTTTGCTATGTTT-GTGAACA--AA----GCTTT--TG-AATTT--TA-G----GAT---ATCAGT-GAT--TG----A--AATTTGTTCATCGTT-GGCCAACTACAGTAGTA--TCTTTTAA-AGTAGGTATT----T-CTC--A----AGT--GT-CTGTA-TG-CG---GGACC-CACCATAAGGAAATGATATT-CATTTTC---GAT--TT--GG-------T-TC--ATT----T--AG--C--A------T-T-----TTGTACAAA--------TTC-TGTTT--TCT-CTTGG---------TA---TGTTA---T--CGT---ATCTTCATGTTTCTATCGCT-AAAT-AATG---TGACGATATGCGAAATCTTGAAAGTGCGAATT
gi|19501 : ATTTATTTATATACGCATATATGGCAAGAGTCA-ATTTTTAACATATTCATAGTTGTTAGTACATGTATTATAGAATGTCAATCGTTATAACATGTATATGTTTTAACTGTTTGTTGTTATATACACATTGGTTCTACGCTGTTTGTTTATACTGGACAATTAATTAATCG-TTATCTTTTCTG-CATTGTAA-ATGAAGTTTGCTATGTTT-GTTAATA--AA----GATTT--TG-AGTTT--GT-G----GAT---ATC--T-GGTAGTG----A--AATGTGTTTGTCACT-GGCCAATTACAGTAGTA--
gi|19502 : GTTAA--AATTC-C-ATTTTTATTT-TATT-TATTAGGTATTTTGATATATT------ACA--TAT---GATTT--TT-TGGTT--GT-TTAACGAG---ATAAGT-GTC--TT----G--AGTCTACGCATTGTT-TGCCAGTGACAATAATAAGGCTTGGAA-A--AAGTATT----T-CTT--A----AAT--CT-CAATAATG-TG---G-ACA-TGCCAGAAGGAAATGAAACT-CATTTTC---AAT--TG--TA-------T-TC--AT---------------A------T----------TACAAG--------ATT-TACTA--TGT-CTTTGACTACGCTCTG---TGTTA---T--CGT---ATTTTCCTGTTTC
gi|19503 : -ATCCTTTTTGACA--GTA-----AATT--GCTAGTTTT-ATTAACA--AT----GGTTTCTTA---TTT--GT-------AT----TCAGAAGAT--TG----ATCAATTTAAAAACACTT-GGTTTATTAAAATAGTA--TTTTGGAA-TGAACGCTTT----C-CTT--A----AATTGAT-ATATA-TA--GAAAGGACA-TACCAGAATAAAATGATATT-CATTCTC---
gi|19504 : GTAA-ATAAGTTTTGATAGATTT-A-----A--AATGTCGTTCT--T----TTT--ATTG----GAT---AGCATT--AT--TATATCA--AATTTGTTTA-GGTTAGGCCAGCTACAGAAGTA--TGGTTTCA-AATA--TTTT----C-TACAAA----AAT--CT-CTGTA-TG-TT---GGGCA-TACTAACAGAAAGTGATATT-CATTTTC---GA----C--AA----------C--ATT----T--GA-----A------T-TACAAAATGTGCATA--------GAC-TGTCA--TTT-CTAGG---------TA---TGTTA---T--AGC---GAC--CGCG-TTCTATTTCC-AAAT-TATG---TGGCGATA
gi|19505 : AATTTCGCTAAGTTAAG--AACAGTAA----GTTTTGCTATAGTTTTCAT-T----AAC---AT------AT--CG----A--A-TTTGTTTAAGTTT-GGCCATCGGCAGTAGTA--AAGTTTAA-AATATTTTTT----T-CTT--A----ATT--CT-TTATA-GA-AG---GGACA-CATAAGTAAGAAGAGATGTT-CATTTTatctaaatct
gi|19506 : TT--TA---TTT--GT-A----GATGAAATTAG---AT--TT----ATAAATTTATTAACTGTT-GG--AA--ATGATA-TA--TTTTTTAG-A-TATTTAGT----T-CTT--A-----TT--ATTCTATA-TT-TT---GGACAACATAAGA-GAAAATGATACT-C-----T---GAT--TC--AA-------CAAC--ATT----TAAGGAAC--A------T-A-----ATTTACAAA--------TTC-GATTT--TCT-CTTTC---------TA---CATTA---T--TAT---ATCTTCCTGATTCTATTTCT-AAAG-TATG---
gi|19507 : TT--TA---TTT--GT-A----GAG---GAAAGTAGAT--TT----ATAAATTTATTAACTGTT-GG--AA--ATGATA-TA--TTTTTTAG-A-TATTTAGT----T-CTT--A-----TT--GTTCTATA-TT-TT---GGACAACATAAGA-GAAAATGATACT-C-----T---GAT--TC--AA-------CAAC--ATT----TAAGGAAC--A------T-A-----ATTTACAAA--------TTC-GATTT--TCT-CTTTC---------TA---CATTA---T--TAT---ATCTGCCTGATTCTATGTCT-AAAG-TATG---
gi|19508 : --AATTTGTTTAAGTTT-GGCCATCAGCAAAAGTA--ATGTTTAA-AATTGTTTTG----C-CTT--A----ATT--CT-TTATA-GG-AG---GGACA-AACAAGTAAGAAGTGATATT-CATTTTC---AAT--AA--AA-------T-CC--GTG----T---------------------------TACAAA--------ATG-ACTTT--TC--CTT------------------TCA---T--C-T---CTTTTAATATTTCTATAGCA-AGAT-TATG---GGAGGATA
gi|19509 : --AATTTGTTTAAGTTT-GGCCATCGGCAGTTGTA--ACGTTTAA-A-TACTGCTT----T-CTT--A----ATT--CT-TTATA-GA-AG---CGACA-AATAGGTAAGAAATGATATTGAATTTTC---AAT--AA--AA-------T-TC--ATG----T--TA--CAAA------A-A-----TGACACACA--------TCC-TTTCA--TTT-CTTTG---------AA---TATTT---T--CGT---ATCTACCACTTTCTATGGCG-AGAT-GATG---GGAGGAT
gi|19510 : GTTTAGTTTT-GGGCAGCTACAGAAGCAA-TACTTTA-------GTTCT----A-CTT--AGATCAAT--GT-ATATA---------GGACA-TTCTAAGAAAAAGTGATTTT-CGTTTTC---GAC-------G-------T--C--ATT----T--GA-----A------T-T---------ACAAAAAAATGCATTC-TTTTA--TTT-CTAGG---------CA---CATCG---T--TGT---AGCGACCGCGTTCTATTTCC-AAAT-TATG---TAACGATA
gi|19511 : GTAGTA--TTTTTTAATATTA--CATTG---C-CTG--A----AAT--CT-TTGTA-CA-AC---AGACA-TTCTAAAATAAAATGAAATT-CATCTTCTAAGAC-------A-------T-TCAAATT----T--GA--C--A------T-T----------------------TTC-TATCT--TCT-GCTGG---------TATTCTGTTAGGTT--TGTGCCACCTTCCAGCTTCAATTTC--AAGTCTATG---TGAGGACA--CTCAATCTAGTCAATGCATATatctaaatctacgtaaagcaattt
gi|19512 : GTATT----T------A----AGT--GT-CTATA-TG-CG---GGACA-TTCCAGAAGGAAATGATATT-CATTTTC---GAT--TT--GG-------C-TC--ATT----T--GG--C--A------T-T-----TTGTACAAA--------TTC-TGTTT--AAT-CTTGG---------TA---TGTTC---T--CGT---TCCTTCCTGATTCTATTGCC-AGAT-TATG---TGACGAAATATGAAATCTTGAAATTGCAAATT
gi|19513 : GTATTGCTGC-CTG--A----AGT--TT-CTATA-TAACG---GG-CA-GATCATAATAAAATGATACT-CGTCTTC---TATAGTT--TG-------T-TC--CTT--------G--C--A------A-A-----ATGGACATA--------TTC-TGTAT--TCA-TATGG---------AA---TATTG---T--TAT---GTCTGCCAGTTTTTATCATC-AAAT-TATGAGCTGA--ATAT-CTAAATCTTGAAAGTG-AAATT
gi|19514 : TGTT----CTCTC--A----AAT--GT-ACATA-GG-CG---AAGCA-TAGTAGTAGAAAATGGTATT-CATCCTC---AAC--CC--CA-------T--C--GTT----A--AA--C--A------C-T-----TT--ACATA--------TTC-TATTT--TCA-TACAA---------TA---AACCA---T--CGT---GTCTTCCTTGTTCTA-CATTCAAAT-TATG---CGACG
gi|19515 : -CTT--A----AGT--TT-CTATA-TAACG---GG-CA-GATCATAATAACATGATACT-CGTCTTC---TATAGTT--TG-------T-TC--CTT--------G--C--A------A-A-----ATGGACATA--------TTC-TGTAT--TCA-TATGG---------AA---TATTG---T--TAT---GTCTGCCAGTTTCTATCATC-AAAT-TATGAGCTGA--ACAT-CTAAATCTTGAAAGTG-AAATT
gi|19516 : -CTT--A----AGT--TG-CTAAA-TAACG---GG-CA-GATCATAATAAAATGATACT-CGTCTTC---TATAGTT--TG-------T-TC--CTT--------G--C--A------A-AA----TCG-ACATA--------TTA-TGTAT--TCA-TATGG---------AA---TATTG---T--TAT---GCCTGCCAGTTTCTATCATC-AAAT-TATGAGCTGA--ACAT-CTAAATCTTGAAAGTG-AAATT
gi|19517 : TATA-TG-CA---GAACA-AATTAGAATAAAATGAAATT-CGTCTTC---TAT--AT--------------C--ACCAGAAT--TA--C--A------TCT-----TTG-ACAAAAACG----TTCATGTCTC-TCTACTCG---------------TGTTC---TTGCGT---ATCTGCCGGTTTCAATCCTT-AAGC-TATG---TGATGGCAACCGTAACCTAGCAAATGCAA
gi|19518 : TATA-TG-CA---GAACA-AATTAGAATAAAACGAAATT-CGTCTTT---TAT--AT--------------C--ACCAGAAT--TA--C--A------TAT-----TTG-ACAAAAACG----TTCATGTCTC-TCTACTCG---------------TGTTC---TTCCGT---ATCTGCCGGTTTCAATCCTT-AAGC-TATG---TGATGACAACCGTAACCTAAAAAATGCAA
gi|19519 : ---GGACA-TAGTAATACAAAATGAAATT-CGTCTTC---AAT--TTCAGGACTGTCAT-AC--ATC----T--GG--C--AAACCCTT-TCATG-TCGTTCAAG--------TC-----TT--TCT-CTTGA--------------------------AT---ACCTTCCTGTTTCAATTCTT-AAAT-TATG---AGAAGATATGCGTAATCTTG-TAATACAACTT
gi|19520 : ---GGGCA-AATAAGTACGAAATGGTATT-CGTCTTC---GAT-------G-------T--C--ATT----TAAGT--C--A------C-A-----ACATAAAAAAGT-----TTC-TTTGG--TCT-CTTGC---------AA---TTTTT---T--GAT---GTCGTCCTGTTTCTATAGCT-AGTT-TATG---TGATGATA
gi|19521 : GGCA-GATTAGTATGAAATGGTATT-CGTCTTC---GAT-------G-------T--C--ATT----TAAGT--C--A------C-A-----ACATAAACA--------TTT-TCTTTGGTCT-CTTGC---------AA---TTTTA---T---AT---GTCGTCCTGTTTCTATAGCT-AGTT-TATG---TGATGATA
Alignments
lowQualScore : 111 2222222 2222222 2 11 111 1111 1111111 111111 1 111111 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 1111 11111111111 111 11
lowQualScore : 1 3 444 6666666 6666666 3 1 0 11 1 3 111 5 66 7777 66 3333 1 6666666 55 333333 666 0 7777 88888888888 444 2 0 22 66 1 2 1 22 3 000000 333 1 1 1 5 3333 1 11 1 1 444 0 333 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 0000 3333 3 0 1 44 3 44444444444 333 0 3333 555 333 1 0 33 1 1 000 6 22 11 2 2
lowQualScore : . . ... ....... ....... . . . .. . . ... . .. .... .. .... . ....... .. ...... ... . .... ........... ... . . .. .. . . . .. . ...... ... . . . . .... . .. . . ... . ... ............................................................. . .... .... . . . .. . ........... ... . .... ... ... . . .. . . ... . .. .. . .
lowQualScore : 0 2 000 0000000 0000000 2 0 4 00 4 2 666 7 00 0000 11 9999 0 0000000 00 444444 444 5 8888 66666666666 999 9 1 00 33 1 9 3 44 7 555555 777 0 0 9 7 5555 0 00 5 0 555 1 000 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 2 9999 9999 6 5 8 33 6 00000000000 222 4 6666 888 222 0 9 99 9 9 000 5 77 77 9 5
consensus : ATATATATATATATGCATATATGATAAGAGTCACATT---AACAC-------GTTGTTAGTA-------TAAAGAATGTCAGTCGCTTTTATATGTAGATATTTTAACTGACTGTTGTTATATACA--TTAGTTTGATGATGTATGTTTATAATGATCGGTTAATTAATTG-T-ATCTTTTCTG-CATTGTAN-ATGAATTTTGCTATGTTT-GTTAACA--AA----GCTTT--TA-AGTTT--GT-G----GAT---ATCAG--T-GAT--TG----A--AATTTGTTTANNGTT-GGCCAACTACAGTAGTA--TCTTTTAA-AGTANGTATT----C-CT---TAANTNTCTATA-TG-CGG----GACANACCAGAANGAAATGATATTCG--TCTTC---GAT--T------CGGTT---C---A---TTT--GG--C--A------T--T----TC-----GTACAAA----T----TC-TGT-TT--TCT-CTTGG---------TA---TGTTA---T--CGT---ATCTTCCTGTTTCTATCGCT-AAAT-TATG---TGACGATATGCGNAATCTTGAAAGTGCAAATT
Reference ( family-708 ) : ATATATNTATATATGCATATATGATAAGAGTCACATT---AACAC-------GTTGTTAGTA-------TAAAGAATGTCAGTCGCTNTTATATGTAGATATTTTAACTGACTGTTGTTATATACA--TTAGTTTGATGATGTATGTTTATAATGATCGGTTAATTAATTG-T-ATCTTTTCTG-CATTGTAN-ATGAATTTTGCTATGTTT-GTTAACA--AA----GNTTT--TA-AGTTT--GT-G----GAT---ATCAG--T-GAT--TG----A--AATTTGTTTANNGTT-GGCCAACTACAGTAGTA--TCTTTTAA-AGTANGTATT----C-CT---TAANTNTCTATA-TG-CGG----GACANACCAGAANGAAATGATATTCG--TCTTC---GAT--T------CGGTT---C---A---TTT--GG--C--A------T--T----TC-----GTACAAA----T----TC-TGT-TT--TCT-CTTGG---------TA---TGTTA---T--CGT---ATCTTCCTGTTTCTATCGCT-AAAT-TATG---TGACGATATGCGNAATCTTGAAAGTGCAAATT
gi|19497 : ATATATATATATATGCATATATGATAAGAGTCACATT---AACAC-------GTTGTTAGTA-------TAAAGAATGTCAGTCGCTTTTATATGTAGATATTTTAACTGACTGTTGT-ATATACA--TTAGTTTAATGATGTATGTTTATAATGATCGGTTAATTAATTG-T-ATCTTTTCTG-CATTGTAT-ATGAATTTTGCTATGTTT-GTTAACA--AA----GCTTT--TA-AGTTT--GT-G----GAT---ATCAG--T-GAT--TG----A--AATTTGTTTATTGTT-GGCCAACTACAGTAGTA--TCTTTTAA-AGTAGGTATT----C-CT---CAAGTGTCTATA-TG-CGG----GACACACCAGAAGGAAATGATATTCA--TTTTC---GAT--T------TGGTT---C---A---TTT--GG--C--A------T--T----TT-----GTACAAA----T----TC-TGT-TT--TCT-CTTGG---------TA---TGTTA---T--CGT---ATCTTCCTGTTTCTATCGCT-AAAT-TATG---TGACGATATGCGTAATCTTGAAAATGCAAATT
gi|19498 : ATATATATATATATGCATATATGATAAGAGTCACATT---AACAC-------GTTGTTAGTA-------TAAAGAATGTCAGTCGCTTTTATATGTAGATATTTTAACTGACTGTTGT-ATATACA--TTAGTTTAATGATGTATGTTTATAATGATCGGTTAATTAATTG-T-ATCTTTTCTG-CATTGTAT-ATGAATTTTGCTATGTTT-GTTAACA--AA----GCTTT--TA-AGTTT--GT-G----GAT---ATCAG--T-GAT--TG----A--AATTTGTTTATTGTT-GGCCAACTACAGTAGTA--TCTTTTAA-AGTAGGTATT----C-CT---CAAGTGTCTATA-TG-CGG----GACACACCAGAAGGAAATGATATTCA--TTTTC---GAT--T------TGGTT---C---A---TTT--GG--C--A------T--T----TT-----GTACAAA----T----TC-TGT-TT--TCT-CTTGG---------TA---TGTTA---T--CGT---ATCTTCCTGTTTCTATCGCT-AAAT-TATG---TGACGATATGCGTAATCTTGAAAATGCAAATT
gi|19499 : ATATACACATATATGCATATATGATAAGAGTCATATT---AACAC-------GTTGTTAGTA-------TAAAGAATGTCAGTCGCTTTTATATGTAGATATTTTAACTGACTGTTGT-ATATACA--TTAGTTTGATGATGTATGTTTATAATGATC-GTTAATTAATTGTT-ATCTTTTCTG-CATTGTAT-ATGAATTTTCCTATGTTT-GTTAACA--AA----GCTTT--TG-AGTCT--GT-G----GTT---ATCAG--T-GAT--TG----A--AATTTGTTTATTGTT-GGCCAACTACAGTAGTA--TCTTTTAA-AGTAGGTATT----C-CT---CAACTGTCTATA-TG-CGG----GACACACCAGAAGGAAATGATATTCA--TTTTC---GAT--T------TGGTT---C---A---TTT--GG--C--A------T--T----TT-----GTGCAAA----T----TC-TGT-TT--TCT-CTTGA---------TA---TGTTA---T--CGT---ATCTTCCTGTTTCTATCACT-AAAT-TATG---TGACGATATGTGAAATCTTGAAAGTGCAAATT
gi|19500 : ATATATTTATAAATGCATATATGATAAGAGTCACATT---AACAC-------GTTGTTAGTA-------TTAAGAATGTATATTA-TACTATATGTAGATATTTAAACTGACTGTTGTTATATACA--TTAGTTTGATGATGTATGTTTATAATGATCGCTTAATTAATTG-TCATCTTTTCTG-TATTGTAC-ATGAATTTTGCTATGTTT-GTGAACA--AA----GCTTT--TG-AATTT--TA-G----GAT---ATCAG--T-GAT--TG----A--AATTTGTTCATCGTT-GGCCAACTACAGTAGTA--TCTTTTAA-AGTAGGTATT----T-CT---CAAGTGTCTGTA-TG-CGG----GACCCACCATAAGGAAATGATATTCA--TTTTC---GAT--T------TGGTT---C---A---TTT--AG--C--A------T--T----TT-----GTACAAA----T----TC-TGT-TT--TCT-CTTGG---------TA---TGTTA---T--CGT---ATCTTCATGTTTCTATCGCT-AAAT-AATG---TGACGATATGCGAAATCTTGAAAGTGCGAATT
gi|19501 : ATTTATTTATATACGCATATATGGCAAGAGTCA-ATTTTTAACATATTCATAGTTGTTAGTACATGTATTATAGAATGTCAATCGTTATAACATGTATATGTTTTAACTGTTTGTTGTTATATACACATTGGTTCTACGCTGTTTGTTTATACTGGACAATTAATTAATCG-TTATCTTTTCTG-CATTGTAA-ATGAAGTTTGCTATGTTT-GTTAATA--AA----GATTT--TG-AGTTT--GT-G----GAT---ATC----T-GGTAGTG----A--AATGTGTTTGTCACT-GGCCAATTACAGTAGTA--
gi|19502 : GTTAA--AATTC-C-ATTTTTATTT-TATT-TATTAGGTATTTTGATATATT------ACA--TAT---GATTT--TT-TGGTT--GT-TTAACGAG---ATAAG--T-GTC--TT----G--AGTCTACGCATTGTT-TGCCAGTGACAATAATAAGGCTTGGAA-A--AAGTATT----T-CT---TAAATCTCAATAATG-TGG-----ACATGCCAGAAGGAAATGAAACTCA--TTTTC---AAT--T------GTATT---C---A---T-----------A------T---------------TACAAG----A----TT-TAC-TA--TGT-CTTTGACTACGCTCTG---TGTTA---T--CGT---ATTTTCCTGTTTC
gi|19503 : -ATCCTTTTTGACA--GTAA-AT------TGCTAGTTTT-ATTAACA--AT----GGTTTCTTA---TTT--GT-------AT----TCAG--AAGAT--TG----ATCAATTTAAAAACACTT-GGTTTATTAAAATAGTA--TTTTGGAA-TGAACGCTTT----C-CT---TAAATTGATATA-TA-TAGAAAGGACATACCAGAATAAAATGATATTCA--TTCTC---
gi|19504 : GTAA-ATAAGTTTTGATAGATTT-A-----A--AATGTCGTTCT--T----TTT--ATTG----GAT---AGCAT--T--AT--TATATCA--AATTTGTTTA-GGTTAGGCCAGCTACAGAAGTA--TGGTTTCA-AATAT---TT----T-CTACAAAAATCTCTGTA-TG-TTG----GGCATACTAACAGAAAGTGATATTCA--TTTTC---GA----------CAA-----C---A---TTT--GA-----A------T--T----ACAAAATGTGCATA----G----AC-TGT-CA--TTT-CTAGG---------TA---TGTTA---T--AGC---GAC--CGCG-TTCTATTTCC-AAAT-TATG---TGGCGATAATCTAAATCT
gi|19505 : AATTTCGCTAAGTTAAG--AACAGTAA----GTTTTGCTATAGTTTTCAT-T----AAC---AT--------AT--CG----A--A-TTTGTTTAAGTTT-GGCCATCGGCAGTAGTA--AAGTTTAA-AATATTTTTT----T-CT---TAATTCTTTATA-GA-AGG----GACACATAAGTAAGAAGAGATGTTCA--TTTT
gi|19506 : TT--TA---TTT--GT-A----GATGAAATTAGATT-TAT--------A--AATTTATTAACTGTT-GG--AA--ATGATA-TA--TTTTTTAG-A-TATTTAGT----T-CT---TATTATTCTATA-TT-TTG----GACAACATAAGAGAAAATGATACTC-------T---GAT--T------CAACAA--C---A---TTTAAGGAAC--A------TAAT----T-------TACAAA----T----TC-GAT-TT--TCT-CTTTC---------TA---CATTA---T--TAT---ATCTTCCTGATTCTATTTCT-AAAG-TATG---
gi|19507 : TT--TA---TTT--GT-A----GAG---GAAAG--TAGAT--TT----ATAAATTTATTAACTGTT-GG--AA--ATGATA-TA--TTTTTTAG-A-TATTTAGT----T-CT---TATTGTTCTATA-TT-TTG----GACAACATAAGAGAAAATGATACTC-------T---GAT--T------CAACAA--C---A---TTTAAGGAAC--A------TAAT----T-------TACAAA----T----TC-GAT-TT--TCT-CTTTC---------TA---CATTA---T--TAT---ATCTGCCTGATTCTATGTCT-AAAG-TATG---
gi|19508 : --AATTTGTTTAAGTTT-GGCCATCAGCAAAAGTA--ATGTTTAA-AAT-TGTTTTG---C-CT---TAATTCTTTATA-GG-AGG----GACAAACAAGTAAGAAGTGATATTCA--TTTTC---AAT--A------AAATC---C---G---TGT--------------------------------TACAAA----A----TG-ACT-TT--TC--CTT------------------TCA---T--C-T---CTTTTAATATTTCTATAGCA-AGAT-TATG---GGAGGATA
gi|19509 : --AATTTGTTTAAGTTT-GGCCATCGGCAGTTGTA--ACGTTTAA-A-TACTGCTT----T-CT---TAATTCTTTATA-GA-AGC----GACAAATAGGTAAGAAATGATATT-GAATTTTC---AAT--A------AAATT---C---A---TGT--TA--CAAA------A--A----TG-----ACACACA----T----CC-TTT-CA--TTT-CTTTG---------AA---TATTT---T--CGT---ATCTACCACTTTCTATGGCG-AGAT-GATG---GGAGGAT
gi|19510 : GTTTAGTTTT-GGGCAGCTACAGAAGCAA-TACTTTA-------GTTCT----A-CT---TAGATCAATGTA-TA-TAG----GACATTCTAAGAAAAAGTGATTTTCG--TTTTC---GA----------CG--T---C---A---TTT--GA-----A------T--T----AC-----AAAAAAA----TGCATTC-TTT-TA--TTT-CTAGG---------CA---CATCG---T--TGT---AGCGACCGCGTTCTATTTCC-AAAT-TATG---TAACGATAATCTAAATCT
gi|19511 : GTAGTA--TTTTTTAATATTACAT-TG----C-CT---GAAATCTTTGTA-CA-ACA----GACATTCTAAAATAAAATGAAATTCA--TCTTCTAAGAC-----------ATT---CAA-A---TTT--GA--C--A------T--T----------------------T----TC-TAT-CT--TCT-GCTGG---------TATTCTGTTAGGTT--TGTGCCACCTTCCAGCTTCAATTTC--AAGTCTATG---TGAGGACA--CTCAATCTAGTCAATGCATATacgtaaagcaattt
gi|19512 : GTATT-----------TAAGTGTCTATA-TG-CGG----GACATTCCAGAAGGAAATGATATTCA--TTTTC---GAT--T------TGGCT---C---A---TTT--GG--C--A------T--T----TT-----GTACAAA----T----TC-TGT-TT--AAT-CTTGG---------TA---TGTTC---T--CGT---TCCTTCCTGATTCTATTGCC-AGAT-TATG---TGACGAAATATGAAATCTTGAAATTGCAAATT
gi|19513 : GTATTGCTGC-CT---GAAGTTTCTATA-TAACGG----G-CAGATCATAATAAAATGATACTCG--TCTTC---TATAGT------TTGTT---C---C---TT----G--C--A------A--A----AT-----GGACATA----T----TC-TGT-AT--TCA-TATGG---------AA---TATTG---T--TAT---GTCTGCCAGTTTTTATCATC-AAAT-TATGAGCTGA--ATAT-CTAAATCTTGAAAGTG-AAATT
gi|19514 : TGTT----CTCT---CAAATGTACATA-GG-CGA----AGCATAGTAGTAGAAAATGGTATTCA--TCCTC---AAC--C------CCAT----C---G---TTA--AA--C--A------C--T----T-------TACATA----T----TC-TAT-TT--TCA-TACAA---------TA---AACCA---T--CGT---GTCTTCCTTGTTCTA-CATTCAAAT-TATG---CGACG
gi|19515 : -CT---TAAGTTTCTATA-TAACGG----G-CAGATCATAATAACATGATACTCG--TCTTC---TATAGT------TTGTT---C---C---TT----G--C--A------A--A----AT-----GGACATA----T----TC-TGT-AT--TCA-TATGG---------AA---TATTG---T--TAT---GTCTGCCAGTTTCTATCATC-AAAT-TATGAGCTGA--ACAT-CTAAATCTTGAAAGTG-AAATT
gi|19516 : -CT---TAAGTTGCTAAA-TAACGG----G-CAGATCATAATAAAATGATACTCG--TCTTC---TATAGT------TTGTT---C---C---TT----G--C--A------A--AA---TC-----G-ACATA----T----TA-TGT-AT--TCA-TATGG---------AA---TATTG---T--TAT---GCCTGCCAGTTTCTATCATC-AAAT-TATGAGCTGA--ACAT-CTAAATCTTGAAAGTG-AAATT
gi|19517 : TATA-TG-CAG----AACAAATTAGAATAAAATGAAATTCG--TCTTC---TATA-T------CA--C---CAGAA---TT----A--C--A------TC-T----TT-----G-ACAAAAACGT----TCATGTCTC--TCTACTCG---------------TGTTC---TTGCGT---ATCTGCCGGTTTCAATCCTT-AAGC-TATG---TGATGGCAACCGTAACCTAGCAAATGCAA
gi|19518 : TATA-TG-CAG----AACAAATTAGAATAAAACGAAATTCG--TCTTT---TATA-T------CA--C---C---AGAATT----A--C--A------TA-T----TT-----G-ACAAAAACGT----TCATGT-CTC-TCTACTCG---------------TGTTC---TTCCGT---ATCTGCCGGTTTCAATCCTT-AAGC-TATG---TGATGACAACCGTAACCTAAAAAATGCAA
gi|19519 : G----GACATAGTAATACAAAATGAAATTCG--TCTTC---AAT--TTCAGGACTGTCATAC---A---TCT--GG--C--AAACCCTT--TCATGTC-----GTTCAAG----T----C------TT--TCT-CTTGA--------------------------AT---ACCTTCCTGTTTCAATTCTT-AAAT-TATG---AGAAGATATGCGTAATCTTGTAA-TACAACTT
gi|19520 : G----GGCAAATAAGTACGAAATGGTATTCG--TCTTC---GAT-----------GT----C---A---TTTAAGT--C--A------C--A----AC-----ATAAAAAAGT-T----TC-TTT-GG--TCT-CTTGC---------AA---TTTTT---T--GAT---GTCGTCCTGTTTCTATAGCT-AGTT-TATG---TGATGATA
gi|19521 : ----GGCAGATTAGTATGAAATGGTATTCG--TCTTC---GAT-----------GT----C---A---TTTAAGT--C--A------C--A----AC-----ATAAACA----T----TT-TCT-TTGGTCT-CTTGC---------AA---TTTTA---T---AT---GTCGTCCTGTTTCTATAGCT-AGTT-TATG---TGATGATA
Alignments
lowQualScore : 111 2222222 2222222 2 11 111 1111 1111111 111111 1 111111 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 1111 11111111111 111 11
lowQualScore : 1 3 444 6666666 6666666 3 1 0 11 1 3 111 5 66 7777 66 3333 1 6666666 55 333333 666 0 7777 88888888888 444 2 0 22 66 1 2 1 22 3 000000 333 1 1 1 5 3333 1 11 1 1 444 0 333 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 0000 3333 3 0 1 44 3 44444444444 333 0 3333 555 333 1 0 33 1 1 000 6 22 11 2 2
lowQualScore : . . ... ....... ....... . . . .. . . ... . .. .... .. .... . ....... .. ...... ... . .... ........... ... . . .. .. . . . .. . ...... ... . . . . .... . .. . . ... . ... ............................................................. . .... .... . . . .. . ........... ... . .... ... ... . . .. . . ... . .. .. . .
lowQualScore : 4 2 000 0000000 0000000 2 4 4 00 4 2 666 7 00 0000 11 9999 9 0000000 00 444444 444 5 8888 66666666666 999 9 1 00 33 1 9 3 44 7 555555 777 0 0 9 7 5555 0 00 5 0 555 1 000 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 2 9999 9999 6 5 8 33 6 00000000000 222 4 6666 888 222 0 9 99 9 9 000 5 77 77 9 5
consensus : ATATATATATATATGCATATATGATAAGAGTCACATT---AACAC-------GTTGTTAGTA-------TAAAGAATGTCAGTCGCTTTTATATGTAGATATTTTAACTGACTGTTGTTATATACA--TTAGTTTGATGATGTATGTTTATAATGATCGGTTAATTAATTG-T-ATCTTTTCTG-CATTGTAN-ATGAATTTTGCTATGTTT-GTTAACA--AA----GCTTT--TA-AGTTT--GT-G----GAT---ATCAG--T-GAT--TG----A--AATTTGTTTANNGTT-GGCCAACTACAGTAGTA--TCTTTTAA-AGTANGTATT----C-CT---TAANTNTCTATA-TG-CGG----GACANACCAGAANGAAATGATATTCG--TCTTC---GAT--T------CGGTT---C---A---TTT--GG--C--A------T--T----TC-----GTACAAA----T----TC-TGT-TT--TCT-CTTGG---------TA---TGTTA---T--CGT---ATCTTCCTGTTTCTATCGCT-AAAT-TATG---TGACGATATGCGNAATCTTGAAAGTGCAAATT
Reference ( family-708 ) : ATATATATATATATGCATATATGATAAGAGTCACATT---AACAC-------GTTGTTAGTA-------TAAAGAATGTCAGTCGCTTTTATATGTAGATATTTTAACTGACTGTTGTTATATACA--TTAGTTTGATGATGTATGTTTATAATGATCGGTTAATTAATTG-T-ATCTTTTCTG-CATTGTAN-ATGAATTTTGCTATGTTT-GTTAACA--AA----GCTTT--TA-AGTTT--GT-G----GAT---ATCAG--T-GAT--TG----A--AATTTGTTTANNGTT-GGCCAACTACAGTAGTA--TCTTTTAA-AGTANGTATT----C-CT---TAANTNTCTATA-TG-CGG----GACANACCAGAANGAAATGATATTCG--TCTTC---GAT--T------CGGTT---C---A---TTT--GG--C--A------T--T----TC-----GTACAAA----T----TC-TGT-TT--TCT-CTTGG---------TA---TGTTA---T--CGT---ATCTTCCTGTTTCTATCGCT-AAAT-TATG---TGACGATATGCGNAATCTTGAAAGTGCAAATT
gi|19497 : ATATATATATATATGCATATATGATAAGAGTCACATT---AACAC-------GTTGTTAGTA-------TAAAGAATGTCAGTCGCTTTTATATGTAGATATTTTAACTGACTGTTGT-ATATACA--TTAGTTTAATGATGTATGTTTATAATGATCGGTTAATTAATTG-T-ATCTTTTCTG-CATTGTAT-ATGAATTTTGCTATGTTT-GTTAACA--AA----GCTTT--TA-AGTTT--GT-G----GAT---ATCAG--T-GAT--TG----A--AATTTGTTTATTGTT-GGCCAACTACAGTAGTA--TCTTTTAA-AGTAGGTATT----C-CT---CAAGTGTCTATA-TG-CGG----GACACACCAGAAGGAAATGATATTCA--TTTTC---GAT--T------TGGTT---C---A---TTT--GG--C--A------T--T----TT-----GTACAAA----T----TC-TGT-TT--TCT-CTTGG---------TA---TGTTA---T--CGT---ATCTTCCTGTTTCTATCGCT-AAAT-TATG---TGACGATATGCGTAATCTTGAAAATGCAAATT
gi|19498 : ATATATATATATATGCATATATGATAAGAGTCACATT---AACAC-------GTTGTTAGTA-------TAAAGAATGTCAGTCGCTTTTATATGTAGATATTTTAACTGACTGTTGT-ATATACA--TTAGTTTAATGATGTATGTTTATAATGATCGGTTAATTAATTG-T-ATCTTTTCTG-CATTGTAT-ATGAATTTTGCTATGTTT-GTTAACA--AA----GCTTT--TA-AGTTT--GT-G----GAT---ATCAG--T-GAT--TG----A--AATTTGTTTATTGTT-GGCCAACTACAGTAGTA--TCTTTTAA-AGTAGGTATT----C-CT---CAAGTGTCTATA-TG-CGG----GACACACCAGAAGGAAATGATATTCA--TTTTC---GAT--T------TGGTT---C---A---TTT--GG--C--A------T--T----TT-----GTACAAA----T----TC-TGT-TT--TCT-CTTGG---------TA---TGTTA---T--CGT---ATCTTCCTGTTTCTATCGCT-AAAT-TATG---TGACGATATGCGTAATCTTGAAAATGCAAATT
gi|19499 : ATATACACATATATGCATATATGATAAGAGTCATATT---AACAC-------GTTGTTAGTA-------TAAAGAATGTCAGTCGCTTTTATATGTAGATATTTTAACTGACTGTTGT-ATATACA--TTAGTTTGATGATGTATGTTTATAATGATC-GTTAATTAATTGTT-ATCTTTTCTG-CATTGTAT-ATGAATTTTCCTATGTTT-GTTAACA--AA----GCTTT--TG-AGTCT--GT-G----GTT---ATCAG--T-GAT--TG----A--AATTTGTTTATTGTT-GGCCAACTACAGTAGTA--TCTTTTAA-AGTAGGTATT----C-CT---CAACTGTCTATA-TG-CGG----GACACACCAGAAGGAAATGATATTCA--TTTTC---GAT--T------TGGTT---C---A---TTT--GG--C--A------T--T----TT-----GTGCAAA----T----TC-TGT-TT--TCT-CTTGA---------TA---TGTTA---T--CGT---ATCTTCCTGTTTCTATCACT-AAAT-TATG---TGACGATATGTGAAATCTTGAAAGTGCAAATT
gi|19500 : ATATATTTATAAATGCATATATGATAAGAGTCACATT---AACAC-------GTTGTTAGTA-------TTAAGAATGTATATTA-TACTATATGTAGATATTTAAACTGACTGTTGTTATATACA--TTAGTTTGATGATGTATGTTTATAATGATCGCTTAATTAATTG-TCATCTTTTCTG-TATTGTAC-ATGAATTTTGCTATGTTT-GTGAACA--AA----GCTTT--TG-AATTT--TA-G----GAT---ATCAG--T-GAT--TG----A--AATTTGTTCATCGTT-GGCCAACTACAGTAGTA--TCTTTTAA-AGTAGGTATT----T-CT---CAAGTGTCTGTA-TG-CGG----GACCCACCATAAGGAAATGATATTCA--TTTTC---GAT--T------TGGTT---C---A---TTT--AG--C--A------T--T----TT-----GTACAAA----T----TC-TGT-TT--TCT-CTTGG---------TA---TGTTA---T--CGT---ATCTTCATGTTTCTATCGCT-AAAT-AATG---TGACGATATGCGAAATCTTGAAAGTGCGAATT
gi|19501 : ATTTATTTATATACGCATATATGGCAAGAGTCA-ATTTTTAACATATTCATAGTTGTTAGTACATGTATTATAGAATGTCAATCGTTATAACATGTATATGTTTTAACTGTTTGTTGTTATATACACATTGGTTCTACGCTGTTTGTTTATACTGGACAATTAATTAATCG-TTATCTTTTCTG-CATTGTAA-ATGAAGTTTGCTATGTTT-GTTAATA--AA----GATTT--TG-AGTTT--GT-G----GAT---ATC----T-GGTAGTG----A--AATGTGTTTGTCACT-GGCCAATTACAGTAGTA--
gi|19502 : GTTAA--AATTC-C-ATTTTTATTT-TATT-TATTAGGTATTTTGATATATT------ACA--TAT---GATTT--TT-TGGTT--GT-TTAACGAG---ATAAG--T-GTC--TT----G--AGTCTACGCATTGTT-TGCCAGTGACAATAATAAGGCTTGGAA-A--AAGTATT----T-CT---TAAATCTCAATAATG-TGG-----ACATGCCAGAAGGAAATGAAACTCA--TTTTC---AAT--T------GTATT---C---A---T-----------A------T---------------TACAAG----A----TT-TAC-TA--TGT-CTTTGACTACGCTCTG---TGTTA---T--CGT---ATTTTCCTGTTTC
gi|19503 : -ATCCTTTTTGACA--GTAA-AT------TGCTAGTTTT-ATTAACA--AT----GGTTTCTTA---TTT--GT-------AT----TCAG--AAGAT--TG----ATCAATTTAAAAACACTT-GGTTTATTAAAATAGTA--TTTTGGAA-TGAACGCTTT----C-CT---TAAATTGATATA-TA-TAGAAAGGACATACCAGAATAAAATGATATTCA--TTCTC---
gi|19504 : GTAA-ATAAGTTTTGATAGATTT-A-----A--AATGTCGTTCT--T----TTT--ATTG----GAT---AGCAT--T--AT--TATATCA--AATTTGTTTA-GGTTAGGCCAGCTACAGAAGTA--TGGTTTCA-AATAT---TT----T-CTACAAAAATCTCTGTA-TG-TTG----GGCATACTAACAGAAAGTGATATTCA--TTTTC---GA----------CAA-----C---A---TTT--GA-----A------T--T----ACAAAATGTGCATA----G----AC-TGT-CA--TTT-CTAGG---------TA---TGTTA---T--AGC---GAC--CGCG-TTCTATTTCC-AAAT-TATG---TGGCGATAATCTAAATCT
gi|19505 : AATTTCGCTAAGTTAAG--AACAGTAA----GTTTTGCTATAGTTTTCAT-T----AAC---AT--------AT--CG----A--A-TTTGTTTAAGTTT-GGCCATCGGCAGTAGTA--AAGTTTAA-AATATTTTTT----T-CT---TAATTCTTTATA-GA-AGG----GACACATAAGTAAGAAGAGATGTTCA--TTTT
gi|19506 : TT--TA---TTT--GT-A----GATGAAATTAGATT-TAT--------A--AATTTATTAACTGTT-GG--AA--ATGATA-TA--TTTTTTAG-A-TATTTAGT----T-CT---TATTATTCTATA-TT-TTG----GACAACATAAGAGAAAATGATACTC-------T---GAT--T------CAACAA--C---A---TTTAAGGAAC--A------TAAT----T-------TACAAA----T----TC-GAT-TT--TCT-CTTTC---------TA---CATTA---T--TAT---ATCTTCCTGATTCTATTTCT-AAAG-TATG---
gi|19507 : TT--TA---TTT--GT-A----GAG---GAAAG--TAGAT--TT----ATAAATTTATTAACTGTT-GG--AA--ATGATA-TA--TTTTTTAG-A-TATTTAGT----T-CT---TATTGTTCTATA-TT-TTG----GACAACATAAGAGAAAATGATACTC-------T---GAT--T------CAACAA--C---A---TTTAAGGAAC--A------TAAT----T-------TACAAA----T----TC-GAT-TT--TCT-CTTTC---------TA---CATTA---T--TAT---ATCTGCCTGATTCTATGTCT-AAAG-TATG---
gi|19508 : --AATTTGTTTAAGTTT-GGCCATCAGCAAAAGTA--ATGTTTAA-AAT-TGTTTTG---C-CT---TAATTCTTTATA-GG-AGG----GACAAACAAGTAAGAAGTGATATTCA--TTTTC---AAT--A------AAATC---C---G---TGT--------------------------------TACAAA----A----TG-ACT-TT--TC--CTT------------------TCA---T--C-T---CTTTTAATATTTCTATAGCA-AGAT-TATG---GGAGGATA
gi|19509 : --AATTTGTTTAAGTTT-GGCCATCGGCAGTTGTA--ACGTTTAA-A-TACTGCTT----T-CT---TAATTCTTTATA-GA-AGC----GACAAATAGGTAAGAAATGATATT-GAATTTTC---AAT--A------AAATT---C---A---TGT--TA--CAAA------A--A----TG-----ACACACA----T----CC-TTT-CA--TTT-CTTTG---------AA---TATTT---T--CGT---ATCTACCACTTTCTATGGCG-AGAT-GATG---GGAGGAT
gi|19510 : GTTTAGTTTT-GGGCAGCTACAGAAGCAA-TACTTTA-------GTTCT----A-CT---TAGATCAATGTA-TA-TAG----GACATTCTAAGAAAAAGTGATTTTCG--TTTTC---GA----------CG--T---C---A---TTT--GA-----A------T--T----AC-----AAAAAAA----TGCATTC-TTT-TA--TTT-CTAGG---------CA---CATCG---T--TGT---AGCGACCGCGTTCTATTTCC-AAAT-TATG---TAACGATAATCTAAATCT
gi|19511 : GTAGTA--TTTTTTAATATTACAT-TG----C-CT---GAAATCTTTGTA-CA-ACA----GACATTCTAAAATAAAATGAAATTCA--TCTTCTAAGAC-----------ATT---CAA-A---TTT--GA--C--A------T--T----------------------T----TC-TAT-CT--TCT-GCTGG---------TATTCTGTTAGGTT--TGTGCCACCTTCCAGCTTCAATTTC--AAGTCTATG---TGAGGACA--CTCAATCTAGTCAATGCATATacgtaaagcaattt
gi|19512 : GTATT-----------TAAGTGTCTATA-TG-CGG----GACATTCCAGAAGGAAATGATATTCA--TTTTC---GAT--T------TGGCT---C---A---TTT--GG--C--A------T--T----TT-----GTACAAA----T----TC-TGT-TT--AAT-CTTGG---------TA---TGTTC---T--CGT---TCCTTCCTGATTCTATTGCC-AGAT-TATG---TGACGAAATATGAAATCTTGAAATTGCAAATT
gi|19513 : GTATTGCTGC-CT---GAAGTTTCTATA-TAACGG----G-CAGATCATAATAAAATGATACTCG--TCTTC---TATAGT------TTGTT---C---C---TT----G--C--A------A--A----AT-----GGACATA----T----TC-TGT-AT--TCA-TATGG---------AA---TATTG---T--TAT---GTCTGCCAGTTTTTATCATC-AAAT-TATGAGCTGA--ATAT-CTAAATCTTGAAAGTG-AAATT
gi|19514 : TGTT----CTCT---CAAATGTACATA-GG-CGA----AGCATAGTAGTAGAAAATGGTATTCA--TCCTC---AAC--C------CCAT----C---G---TTA--AA--C--A------C--T----T-------TACATA----T----TC-TAT-TT--TCA-TACAA---------TA---AACCA---T--CGT---GTCTTCCTTGTTCTA-CATTCAAAT-TATG---CGACG
gi|19515 : -CT---TAAGTTTCTATA-TAACGG----G-CAGATCATAATAACATGATACTCG--TCTTC---TATAGT------TTGTT---C---C---TT----G--C--A------A--A----AT-----GGACATA----T----TC-TGT-AT--TCA-TATGG---------AA---TATTG---T--TAT---GTCTGCCAGTTTCTATCATC-AAAT-TATGAGCTGA--ACAT-CTAAATCTTGAAAGTG-AAATT
gi|19516 : -CT---TAAGTTGCTAAA-TAACGG----G-CAGATCATAATAAAATGATACTCG--TCTTC---TATAGT------TTGTT---C---C---TT----G--C--A------A--AA---TC-----G-ACATA----T----TA-TGT-AT--TCA-TATGG---------AA---TATTG---T--TAT---GCCTGCCAGTTTCTATCATC-AAAT-TATGAGCTGA--ACAT-CTAAATCTTGAAAGTG-AAATT
gi|19517 : TATA-TG-CAG----AACAAATTAGAATAAAATGAAATTCG--TCTTC---TATA-T------CA--C---CAGAA---TT----A--C--A------TC-T----TT-----G-ACAAAAACGT----TCATGTCTC--TCTACTCG---------------TGTTC---TTGCGT---ATCTGCCGGTTTCAATCCTT-AAGC-TATG---TGATGGCAACCGTAACCTAGCAAATGCAA
gi|19518 : TATA-TG-CAG----AACAAATTAGAATAAAACGAAATTCG--TCTTT---TATA-T------CA--C---C---AGAATT----A--C--A------TA-T----TT-----G-ACAAAAACGT----TCATGT-CTC-TCTACTCG---------------TGTTC---TTCCGT---ATCTGCCGGTTTCAATCCTT-AAGC-TATG---TGATGACAACCGTAACCTAAAAAATGCAA
gi|19519 : G----GACATAGTAATACAAAATGAAATTCG--TCTTC---AAT--TTCAGGACTGTCATAC---A---TCT--GG--C--AAACCCTT--TCATGTC-----GTTCAAG----T----C------TT--TCT-CTTGA--------------------------AT---ACCTTCCTGTTTCAATTCTT-AAAT-TATG---AGAAGATATGCGTAATCTTGTAA-TACAACTT
gi|19520 : G----GGCAAATAAGTACGAAATGGTATTCG--TCTTC---GAT-----------GT----C---A---TTTAAGT--C--A------C--A----AC-----ATAAAAAAGT-T----TC-TTT-GG--TCT-CTTGC---------AA---TTTTT---T--GAT---GTCGTCCTGTTTCTATAGCT-AGTT-TATG---TGATGATA
gi|19521 : ----GGCAGATTAGTATGAAATGGTATTCG--TCTTC---GAT-----------GT----C---A---TTTAAGT--C--A------C--A----AC-----ATAAACA----T----TT-TCT-TTGGTCT-CTTGC---------AA---TTTTA---T---AT---GTCGTCCTGTTTCTATAGCT-AGTT-TATG---TGATGATA
blockSeqs : A C TTT ATTCATA CATGTAT C T T CA A G TT A TT GTT GT TGTC C GCTATAG TC TTAAC GAA ATT TATATCA TTG A CT AG C T G GG A GCTGC ACA G G A A AAAG C CC A G GAA TAA TTCAGGACTGTCATACATCTGGCAAACCCTTTCATGTCGT AACG GCAT A C GG A GACTACGCTCT TTC AGGT TGC GCC T CG C C AGC C TG GT A C
blockSeqs : A T . . . C T T . G G TC . T GTT . T C TAAG . TG . AA AGTGA TTG . CT A C . G GG A GC . C G . A . C CC A G A . TCAACAACATTTAAGGAACATAATTT AACG . A . C A GT . A TCC . T CA . . AGC C TG GA G C
blockSeqs : T C . . . T A . . G A TT . T GTG . . C TGAG . G . TA TGATC TCG . CT . C . G GG A CT . G G . A . C CC A G A . TCAACAACATTTAAGGAACATAATTT AGT . . . . . AT . A C . T CG . . AGC C TG GA G C
blockSeqs : T . . . . . A . . T . T . C GTT . . A TGAA . G . T TTATA TCA . TT . C . G AG A C . A C . . . T CC A G A . AAAATTCATGTTACAAAAATGAC . . . . . . GT . A C . T TT . . . C AT TA A C
blockSeqs : C . A ATT . . A TGAG . G . T TGA TTG . TG . T . A CG T C . A T . . . T CC A T A . CAACATTTGAATTACAAAATGT . . . . . . GT . A C . T TT . . . G AT TA T C
blockSeqs : . A AG . . G TTTG . G . T TGA CAC . TT . G . A TT T T . A C . . . T CT C G A . TTGGTTCATTTGGCATTTTGT . . . . . . CT . A C . G GT . . . G TA TC G C
blockSeqs : A A . . T CTTA . T . T TGA AGT . CT . A . A TT A T . T C . . . C TA T A A . TTGGTTCATTTGGCATTTTGT . . . . . . CT . A A . T AG . . . C AC GA G C
blockSeqs : . . . T TA . A . T TTG CTG . CG . T . T TT A C . T T . . . A AT G G A . TTGGTTCATTTAGCATTTTGT . . . . . . GA . A T . A GG . . . G AC TA G C
blockSeqs : TA . A . T CGA CTG . CA . T . . TG T T . T T . . . A AT G G A . TTGGCTCATTTGGCATTTTGT . . . . . . GC . A T . A TT . . . C TG TA A .
blockSeqs : T . . . . A AGT . CG . T . . CT C T . T C . . . A CA T A G . AGTTTGTTCCTTGCAAAATGG . . . . . . GT . T C . T TT . . . C T TA A .
blockSeqs : AGT . CT . C . . CA T T . T C . . . A TA T A A . AGTTTGTTCCTTGCAAAATGG . . . . . . GT . G C . T TG . . . T T GT . .
blockSeqs : GTT . . . A . . T A T . A C . . . T CT G A A . AGTTTGTTCCTTGCAAAATCG . . . . . . GA . C T . G CA . . . T T GT
blockSeqs : GG . . . T . . G A T . A C . . . T CT A T G . ATCACCAGAATTACATCTTTG . . . . . . AT . G T . T CA . . . A . GT
blockSeqs : . G A . G G . . . T CC A G A . ATCACCAGAATTACATATTTG . . . . . . GA . A C . G CA . . . T
blockSeqs : . C . G T . . . G TC A T G . GTCATTTAAGTCACAACAT . . . . . . GA . G T . G CA . . . T
blockSeqs : . . . A G . . . T GT T G G . GTCATTTAAGTCACAACAT . . . . . . CA . G C . G CC . . . .
blockSeqs : . G T . . . G TC A T G . CCCATCGTTAAACACTTT . . . . . . CA . C T . G CC . . . .
blockSeqs : . G T . . . G TC A T G . CGTCATTTGAATTACAA . . . . . . A . C T . T TC . . . .
blockSeqs : . . . A TT A T G . ATTCAAATTTGACATT . . . . . . . . T G . T AG . . .
blockSeqs : . . . A TT A T G . TGTATTCATATT . . . . . . . . A . . T AG . . .
blockSeqs : . T GT T C G . AAAATCCGTGTT . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A TA T C . .
blockSeqs : . G TT T T .
blockSeqCons : TT*
originalCons : ATATATATATATATGCATATATGATAAGAGTCACATT---AACAC-------GTTGTTAGTA-------TAAAGAATGTCAGTCGCTTTTATATGTAGATATTTTAACTGACTGTTGTTATATACA--TTAGTTTGATGATGTATGTTTATAATGATCGGTTAATTAATTG-T-ATCTTTTCTG-CATTGTAN-ATGAATTTTGCTATGTTT-GTTAACA--AA----GCTTT--TA-AGTTT--GT-G----GAT---ATCAG--T-GAT--TG----A--AATTTGTTTANNGTT-GGCCAACTACAGTAGTA--TCTTTTAA-AGTANGTATT----C-CT---TAANTNTCTATA-TG-CGG----GACANACCAGAANGAAATGATATTCG--TCTTC---GAT--T------CGGTT---C---A---TTT--GG--C--A------T--T----TC-----GTACAAA----T----TC-TGT-TT--TCT-CTTGG---------TA---TGTTA---T--CGT---ATCTTCCTGTTTCTATCGCT-AAAT-TATG---TGACGATATGCGNAATCTTGAAAGTGCAAATT
finalCons : ATATATATATATATGCATATATGATAAGAGTCACATT---AACAC-------GTTGTTAGTA-------TAAAGAATGTCAGTCGCTTTTATATGTAGATATTTTAACTGACTGTTGTTATATACA--TTAGTTTGATGATGTATGTTTATAATGATCGGTTAATTAATTGTT-ATCTTTTCTG-CATTGTAN-ATGAATTTTGCTATGTTT-GTTAACA--AA----GCTTT--TA-AGTTT--GT-G----GAT---ATCAG--T-GAT--TG----A--AATTTGTTTANNGTT-GGCCAACTACAGTAGTA--TCTTTTAA-AGTANGTATT----C-CT---TAANTNTCTATA-TG-CGG----GACANACCAGAANGAAATGATATTCG--TCTTC---GAT--T------CGGTT---C---A---TTT--GG--C--A------T--T----TC-----GTACAAA----T----TC-TGT-TT--TCT-CTTGG---------TA---TGTTA---T--CGT---ATCTTCCTGTTTCTATCGCT-AAAT-TATG---TGACGATATGCGNAATCTTGAAAGTGCAAATT
Alignments
lowQualScore : 111 2222222 2222222 2 11 1 1111 1111111 1 111111 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 1111 11111111111 111 11
lowQualScore : 1 3 444 6666666 6666666 3 1 0 11 1 8 3 6 1 0 5 3 66 0000 0 6666666 55 44 777 9999 55 8888 99 444 2 0 22 66 1 2 1 22 3 000000 333 1 1 1 5 3333 1 11 1 1 444 0 333 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 0000 3333 3 0 1 44 3 44444444444 333 0 3333 555 333 1 0 33 1 1 000 6 22 11 2 2
lowQualScore : . . ... ....... ....... . . . .. . . . . . . . . .. .... . ....... .. .. ... .... .. .... .. ... . . .. .. . . . .. . ...... ... . . . . .... . .. . . ... . ... ............................................................. . .... .... . . . .. . ........... ... . .... ... ... . . .. . . ... . .. .. . .
lowQualScore : 4 2 000 0000000 0000000 2 4 4 00 4 2 6 7 0 2 0 2 99 6666 2 1111111 55 77 000 5555 55 5555 22 999 9 1 00 33 1 9 3 44 7 555555 777 0 0 9 7 5555 0 00 5 0 555 1 000 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 2 9999 9999 6 5 8 33 6 00000000000 222 4 6666 888 222 0 9 99 9 9 000 5 77 77 9 5
consensus : ATATATATATATATGCATATATGATAAGAGTCACATT---AACAC-------GTTGTTAGTA-------TAAAGAATGTCAGTCGCTTTTATATGTAGATATTTTAACTGACTGTTGTTATATACA--TTAGTTTGATGATGTATGTTTATAATGATCGGTTAATTAATTGTTATCTTTTCTG-CATTGTANATGAATTTTGCTATGTTT-GTTAACA--AA----GCTTT--TA-AGTTT--GT-GGAT---ATCAG--T-GAT--TG----A--AATTTGTTTANNGTT-GGCCAACTACAGTAGTA--TCTTTTAA-AGTANGTATT----C-CT---TAANTNTCTATA-TG-CGG----GACANACCAGAANGAAATGATATTCG--TCTTC---GAT--T------CGGTT---C---A---TTT--GG--C--A------T--T----TC-----GTACAAA----T----TC-TGT-TT--TCT-CTTGG---------TA---TGTTA---T--CGT---ATCTTCCTGTTTCTATCGCT-AAAT-TATG---TGACGATATGCGNAATCTTGAAAGTGCAAATT
Reference ( family-708 ) : ATATATATATATATGCATATATGATAAGAGTCACATT---AACAC-------GTTGTTAGTA-------TAAAGAATGTCAGTCGCTTTTATATGTAGATATTTTAACTGACTGTTGTTATATACA--TTAGTTTGATGATGTATGTTTATAATGATCGGTTAATTAATTGTTATCTTTTCTG-CATTGTANATGAATTTTGCTATGTTT-GTTAACA--AA----GCTTT--TA-AGTTT--GT-GGAT---ATCAG--T-GAT--TG----A--AATTTGTTTANNGTT-GGCCAACTACAGTAGTA--TCTTTTAA-AGTANGTATT----C-CT---TAANTNTCTATA-TG-CGG----GACANACCAGAANGAAATGATATTCG--TCTTC---GAT--T------CGGTT---C---A---TTT--GG--C--A------T--T----TC-----GTACAAA----T----TC-TGT-TT--TCT-CTTGG---------TA---TGTTA---T--CGT---ATCTTCCTGTTTCTATCGCT-AAAT-TATG---TGACGATATGCGNAATCTTGAAAGTGCAAATT
gi|19497 : ATATATATATATATGCATATATGATAAGAGTCACATT---AACAC-------GTTGTTAGTA-------TAAAGAATGTCAGTCGCTTTTATATGTAGATATTTTAACTGACTGTTGT-ATATACA--TTAGTTTAATGATGTATGTTTATAATGATCGGTTAATTAATTGT-ATCTTTTCTG-CATTGTATATGAATTTTGCTATGTTT-GTTAACA--AA----GCTTT--TA-AGTTT--GT-GGAT---ATCAG--T-GAT--TG----A--AATTTGTTTATTGTT-GGCCAACTACAGTAGTA--TCTTTTAA-AGTAGGTATT----C-CT---CAAGTGTCTATA-TG-CGG----GACACACCAGAAGGAAATGATATTCA--TTTTC---GAT--T------TGGTT---C---A---TTT--GG--C--A------T--T----TT-----GTACAAA----T----TC-TGT-TT--TCT-CTTGG---------TA---TGTTA---T--CGT---ATCTTCCTGTTTCTATCGCT-AAAT-TATG---TGACGATATGCGTAATCTTGAAAATGCAAATT
gi|19498 : ATATATATATATATGCATATATGATAAGAGTCACATT---AACAC-------GTTGTTAGTA-------TAAAGAATGTCAGTCGCTTTTATATGTAGATATTTTAACTGACTGTTGT-ATATACA--TTAGTTTAATGATGTATGTTTATAATGATCGGTTAATTAATTGT-ATCTTTTCTG-CATTGTATATGAATTTTGCTATGTTT-GTTAACA--AA----GCTTT--TA-AGTTT--GT-GGAT---ATCAG--T-GAT--TG----A--AATTTGTTTATTGTT-GGCCAACTACAGTAGTA--TCTTTTAA-AGTAGGTATT----C-CT---CAAGTGTCTATA-TG-CGG----GACACACCAGAAGGAAATGATATTCA--TTTTC---GAT--T------TGGTT---C---A---TTT--GG--C--A------T--T----TT-----GTACAAA----T----TC-TGT-TT--TCT-CTTGG---------TA---TGTTA---T--CGT---ATCTTCCTGTTTCTATCGCT-AAAT-TATG---TGACGATATGCGTAATCTTGAAAATGCAAATT
gi|19499 : ATATACACATATATGCATATATGATAAGAGTCATATT---AACAC-------GTTGTTAGTA-------TAAAGAATGTCAGTCGCTTTTATATGTAGATATTTTAACTGACTGTTGT-ATATACA--TTAGTTTGATGATGTATGTTTATAATGATCG-TTAATTAATTGTTATCTTTTCTG-CATTGTATATGAATTTTCCTATGTTT-GTTAACA--AA----GCTTT--TG-AGTCT--GT-GGTT---ATCAG--T-GAT--TG----A--AATTTGTTTATTGTT-GGCCAACTACAGTAGTA--TCTTTTAA-AGTAGGTATT----C-CT---CAACTGTCTATA-TG-CGG----GACACACCAGAAGGAAATGATATTCA--TTTTC---GAT--T------TGGTT---C---A---TTT--GG--C--A------T--T----TT-----GTGCAAA----T----TC-TGT-TT--TCT-CTTGA---------TA---TGTTA---T--CGT---ATCTTCCTGTTTCTATCACT-AAAT-TATG---TGACGATATGTGAAATCTTGAAAGTGCAAATT
gi|19500 : ATATATTTATAAATGCATATATGATAAGAGTCACATT---AACAC-------GTTGTTAGTA-------TTAAGAATGTATATTA-TACTATATGTAGATATTTAAACTGACTGTTGTTATATACA--TTAGTTTGATGATGTATGTTTATAATGATCGCTTAATTAATTGTCATCTTTTCTG-TATTGTACATGAATTTTGCTATGTTT-GTGAACA--AA----GCTTT--TG-AATTT--TA-GGAT---ATCAG--T-GAT--TG----A--AATTTGTTCATCGTT-GGCCAACTACAGTAGTA--TCTTTTAA-AGTAGGTATT----T-CT---CAAGTGTCTGTA-TG-CGG----GACCCACCATAAGGAAATGATATTCA--TTTTC---GAT--T------TGGTT---C---A---TTT--AG--C--A------T--T----TT-----GTACAAA----T----TC-TGT-TT--TCT-CTTGG---------TA---TGTTA---T--CGT---ATCTTCATGTTTCTATCGCT-AAAT-AATG---TGACGATATGCGAAATCTTGAAAGTGCGAATT
gi|19501 : ATTTATTTATATACGCATATATGGCAAGAGTCA-ATTTTTAACATATTCATAGTTGTTAGTACATGTATTATAGAATGTCAATCGTTATAACATGTATATGTTTTAACTGTTTGTTGTTATATACACATTGGTTCTACGCTGTTTGTTTATACTGGACAATTAATTAATCGTTATCTTTTCTG-CATTGTAAATGAAGTTTGCTATGTTT-GTTAATA--AA----GATTT--TG-AGTTT--GT-GGAT---ATC----T-GGTAGTG----A--AATGTGTTTGTCACT-GGCCAATTACAGTAGTA--
gi|19502 : ATTGTT-TGCCAGTGACAATAATAAGGCTTGGAA-A--AAGTATT----T-CT---TAAATCTCAATAATG-TGG-----ACATGCCAGAAGGAAATGAAACTCA--TTTTC---AAT--T------GTATT---C---A---T-----------A------T---------------TACAAG----A----TT-TAC-TA--TGT-CTTTGACTACGCTCTG---TGTTA---T--CGT---ATTTTCCTGTTTC
gi|19503 : gttaaaattccatttttattttatttattaggtattttgatatattacatatgattttttggttgtttaacgagataagtgtcttgagtctacgcATCCTTTTTGACA--GTAAAT------TGCTAGTTTT-ATTAACA--AT----GGTTTCTTA---TTT--GT---AT----TCAG--AAGAT--TG----ATCAATTTAAAAACACTT-GGTTTATTAAAATAGTA--TTTTGGAA-TGAACGCTTT----C-CT---TAAATTGATATA-TA-TAGAAAGGACATACCAGAATAAAATGATATTCA--TTCTC---
gi|19504 : GTAAATAAGTTTTGATAGATTT-A-----A--AATGTCGTTCT--T----TTT--ATTGGAT---AGCAT--T--AT--TATATCA--AATTTGTTTA-GGTTAGGCCAGCTACAGAAGTA--TGGTTTCA-AATAT---TT----T-CTACAAAAATCTCTGTA-TG-TTG----GGCATACTAACAGAAAGTGATATTCA--TTTTC---GA----------CAA-----C---A---TTT--GA-----A------T--T----ACAAAATGTGCATA----G----AC-TGT-CA--TTT-CTAGG---------TA---TGTTA---T--AGC---GAC--CGCG-TTCTATTTCC-AAAT-TATG---TGGCGATAATCTAAATCT
gi|19505 : AATTTCGCTAAGTTAAG--AACAGTAA----GTTTTGCTATAGTTTTCAT-TAAC---AT--------AT--CG----A--A-TTTGTTTAAGTTT-GGCCATCGGCAGTAGTA--AAGTTTAA-AATATTTTTT----T-CT---TAATTCTTTATA-GA-AGG----GACACATAAGTAAGAAGAGATGTTCA--TTTT
gi|19506 : TT--TA---TTT--GT-AGATGAAATTAGATT-TAT--------A--AATTTATTAACTGTT-GG--AA--ATGATA-TA--TTTTTTAG-A-TATTTAGT----T-CT---TATTATTCTATA-TT-TTG----GACAACATAAGAGAAAATGATACTC-------T---GAT--T------CAACAA--C---A---TTTAAGGAAC--A------TAAT----T-------TACAAA----T----TC-GAT-TT--TCT-CTTTC---------TA---CATTA---T--TAT---ATCTTCCTGATTCTATTTCT-AAAG-TATG---
gi|19507 : TT--TA---TTT--GT-AGAG---GAAAG--TAGAT--TT----ATAAATTTATTAACTGTT-GG--AA--ATGATA-TA--TTTTTTAG-A-TATTTAGT----T-CT---TATTGTTCTATA-TT-TTG----GACAACATAAGAGAAAATGATACTC-------T---GAT--T------CAACAA--C---A---TTTAAGGAAC--A------TAAT----T-------TACAAA----T----TC-GAT-TT--TCT-CTTTC---------TA---CATTA---T--TAT---ATCTGCCTGATTCTATGTCT-AAAG-TATG---
gi|19508 : --AATTTGTTTAAGTTT-GGCCATCAGCAAAAGTA--ATGTTTAA-AAT-TGTTTTG---C-CT---TAATTCTTTATA-GG-AGG----GACAAACAAGTAAGAAGTGATATTCA--TTTTC---AAT--A------AAATC---C---G---TGT--------------------------------TACAAA----A----TG-ACT-TT--TC--CTT------------------TCA---T--C-T---CTTTTAATATTTCTATAGCA-AGAT-TATG---GGAGGATA
gi|19509 : --AATTTGTTTAAGTTT-GGCCATCGGCAGTTGTA--ACGTTTAA-A-TACTGCTT----T-CT---TAATTCTTTATA-GA-AGC----GACAAATAGGTAAGAAATGATATT-GAATTTTC---AAT--A------AAATT---C---A---TGT--TA--CAAA------A--A----TG-----ACACACA----T----CC-TTT-CA--TTT-CTTTG---------AA---TATTT---T--CGT---ATCTACCACTTTCTATGGCG-AGAT-GATG---GGAGGAT
gi|19510 : GTTTAGTTTT-GGGCAGCTACAGAAGCAA-TACTTTA-------GTTCT----A-CT---TAGATCAATGTA-TA-TAG----GACATTCTAAGAAAAAGTGATTTTCG--TTTTC---GA----------CG--T---C---A---TTT--GA-----A------T--T----AC-----AAAAAAA----TGCATTC-TTT-TA--TTT-CTAGG---------CA---CATCG---T--TGT---AGCGACCGCGTTCTATTTCC-AAAT-TATG---TAACGATAATCTAAATCT
gi|19511 : GTAGTA--TTTTTTAATATTACAT-TG----C-CT---GAAATCTTTGTA-CA-ACA----GACATTCTAAAATAAAATGAAATTCA--TCTTCTAAGAC-----------ATT---CAA-A---TTT--GA--C--A------T--T----------------------T----TC-TAT-CT--TCT-GCTGG---------TATTCTGTTAGGTT--TGTGCCACCTTCCAGCTTCAATTTC--AAGTCTATG---TGAGGACA--CTCAATCTAGTCAATGCATATacgtaaagcaattt
gi|19512 : GTATT-----------TAAGTGTCTATA-TG-CGG----GACATTCCAGAAGGAAATGATATTCA--TTTTC---GAT--T------TGGCT---C---A---TTT--GG--C--A------T--T----TT-----GTACAAA----T----TC-TGT-TT--AAT-CTTGG---------TA---TGTTC---T--CGT---TCCTTCCTGATTCTATTGCC-AGAT-TATG---TGACGAAATATGAAATCTTGAAATTGCAAATT
gi|19513 : GTATTGCTGC-CT---GAAGTTTCTATA-TAACGG----G-CAGATCATAATAAAATGATACTCG--TCTTC---TATAGT------TTGTT---C---C---TT----G--C--A------A--A----AT-----GGACATA----T----TC-TGT-AT--TCA-TATGG---------AA---TATTG---T--TAT---GTCTGCCAGTTTTTATCATC-AAAT-TATGAGCTGA--ATAT-CTAAATCTTGAAAGTG-AAATT
gi|19514 : TGTT----CTCT---CAAATGTACATA-GG-CGA----AGCATAGTAGTAGAAAATGGTATTCA--TCCTC---AAC--C------CCAT----C---G---TTA--AA--C--A------C--T----T-------TACATA----T----TC-TAT-TT--TCA-TACAA---------TA---AACCA---T--CGT---GTCTTCCTTGTTCTA-CATTCAAAT-TATG---CGACG
gi|19515 : -CT---TAAGTTTCTATA-TAACGG----G-CAGATCATAATAACATGATACTCG--TCTTC---TATAGT------TTGTT---C---C---TT----G--C--A------A--A----AT-----GGACATA----T----TC-TGT-AT--TCA-TATGG---------AA---TATTG---T--TAT---GTCTGCCAGTTTCTATCATC-AAAT-TATGAGCTGA--ACAT-CTAAATCTTGAAAGTG-AAATT
gi|19516 : -CT---TAAGTTGCTAAA-TAACGG----G-CAGATCATAATAAAATGATACTCG--TCTTC---TATAGT------TTGTT---C---C---TT----G--C--A------A--AA---TC-----G-ACATA----T----TA-TGT-AT--TCA-TATGG---------AA---TATTG---T--TAT---GCCTGCCAGTTTCTATCATC-AAAT-TATGAGCTGA--ACAT-CTAAATCTTGAAAGTG-AAATT
gi|19517 : TATA-TG-CAG----AACAAATTAGAATAAAATGAAATTCG--TCTTC---TATA-T------CA--C---CAGAA---TT----A--C--A------TC-T----TT-----G-ACAAAAACGT----TCATGTCTC--TCTACTCG---------------TGTTC---TTGCGT---ATCTGCCGGTTTCAATCCTT-AAGC-TATG---TGATGGCAACCGTAACCTAGCAAATGCAA
gi|19518 : TATA-TG-CAG----AACAAATTAGAATAAAACGAAATTCG--TCTTT---TATA-T------CA--C---C---AGAATT----A--C--A------TA-T----TT-----G-ACAAAAACGT----TCATGT-CTC-TCTACTCG---------------TGTTC---TTCCGT---ATCTGCCGGTTTCAATCCTT-AAGC-TATG---TGATGACAACCGTAACCTAAAAAATGCAA
gi|19519 : G----GACATAGTAATACAAAATGAAATTCG--TCTTC---AAT--TTCAGGACTGTCATAC---A---TCT--GG--C--AAACCCTT--TCATGTC-----GTTCAAG----T----C------TT--TCT-CTTGA--------------------------AT---ACCTTCCTGTTTCAATTCTT-AAAT-TATG---AGAAGATATGCGTAATCTTGTAA-TACAACTT
gi|19520 : G----GGCAAATAAGTACGAAATGGTATTCG--TCTTC---GAT-----------GT----C---A---TTTAAGT--C--A------C--A----AC-----ATAAAAAAGT-T----TC-TTT-GG--TCT-CTTGC---------AA---TTTTT---T--GAT---GTCGTCCTGTTTCTATAGCT-AGTT-TATG---TGATGATA
gi|19521 : ----GGCAGATTAGTATGAAATGGTATTCG--TCTTC---GAT-----------GT----C---A---TTTAAGT--C--A------C--A----AC-----ATAAACA----T----TT-TCT-TTGGTCT-CTTGC---------AA---TTTTA---T---AT---GTCGTCCTGTTTCTATAGCT-AGTT-TATG---TGATGATA