lowQualScore : 11111 111 11111111 11 111111111 1111111 111 111111111111111 1111 11111111 1111111 11 111 1111111 2222222222222222222222 111 11 1111 1111111111111111 22222222222222 111111111 11111 1 11 1111 1
lowQualScore : 22 1 5 66 66 22222 666 0 4 666 0 3 7777 0 666 55 999 66666666 2 00 3 888888 555 0 33 99 3 1 3 99 44 77 3 44 3 1 3 666666666 3 0 555 11 3333333 55 555 7777 55555 2 2 3 44 666 3 777 111 888888888888888 2 2 2222 555 3 555 888888 2 33333333 1 666 3 6666 2222222 9999 6 44 44 111 1111111 3 66666 2222222222222222222222 77 88888 33 0 444 33 44 4 0 0 2 88888 2 444 00 4444 66666 66 77777 7777777777777777 2 666 99999 11 0 2 0 3 888888 7777 444 3 33 7777 3 00000000000000 222222222 2 55 00000 0 1 0 1 55 44 3 2 11 8 2 2 0 777 4 0 5 5 0 9999 66 8888 4 4 4 2222 55 55 0 4 4 777 1 0
lowQualScore : .. . . .. .. ..... ... . . ... . . .... . ... .. ... ........ . .. . ...... ... . .. .. . . . .. .. .. . .. . . . ......... . . ... .. ....... .. ... .... ..... . . . .. ... . ... ... ............... . . .... ... . ... ...... . ........ . ... . .... ....... .... . .. .. ... ....... . ..... ...................... .. ..... .. . ... .. .. . . . . ..... . ... .. .... ..... .. ..... ................ . ... ..... .. . . . . ...... .... ... . .. .... . .............. ......... . .. ..... . . . . .. .. . . .. . . . . ... . . . . . .... .. .... . . . .... .. .. . . . ... . .
lowQualScore : 00 4 0 11 11 33333 444 5 0 444 4 6 7777 1 444 00 111 88888888 4 11 1 111111 000 1 99 22 8 2 3 22 66 22 3 66 3 0 3 777777777 3 8 888 22 5555555 00 888 4444 88888 1 1 0 22 333 2 111 888 999999999999999 9 9 8888 444 1 444 888888 0 99999999 2 999 4 6666 1111111 2222 2 22 88 555 8888888 6 55555 4444444444444444444444 33 11111 99 1 666 44 99 4 6 3 5 99999 0 444 99 0000 22222 55 00000 3333333333333333 7 777 88888 66 6 0 1 9 888888 7777 888 8 88 7777 6 55555555555555 555555555 6 66 00000 7 6 7 4 55 99 2 3 00 0 3 5 8 888 4 7 5 0 1 4444 44 5555 0 0 0 5555 55 55 9 0 0 888 2 4
consensus : CAAGGTTGCTAAAACTAGCATCCCCTGTTATATCTGAAAGTATTATGTTTATTGTGAATAAAAGTCT-GCGAGATGGAATATT--TCCACATA--TATG----GAAACAGGC---AAAGATAAAACCATT-CTATA---AAAGCGGCCGA-AAGGATGACGTAAATAATTATCGTCC----TATATCTATTTTGCCAACATTATCAAA---ACTTATAG--AAAAA-NTTAT--------TCATATTAATTTGATGAN-ATTTAT-AAATA-----AATAT---AACTTATTGCATAAAACACAA--AGTGGTTTTAGG--GAAGGTCATTCAAC-TG--A--ATCTGCATTAATTC-GT-A--TGA-TTGATAAATGGCTAACG-GCAATTAACGATGG---------CA-AGTT---AGTTGGGGC----TGT--CATGGTC---GATTTTCGGAA-G---GCCTTTGATCTCGTNAGTCAT--A--CTACT-T-TACTAGCAAAA---CTAAAGTG-----------CTATAAAT-G-TAGTGATCG---TTTT---T-T---G------ANGT-------GGAT-G-AAATCTTACCT-TA-CAAAC-------AGAGGT--CA-A--GTTG-TGT-CTATAAA-------TT-CAGNA---ACT---TC-AA----A---A---ANC--AATTG----TAT--AACATCN-G--GG-GTTCCNCAAGGTTCTA-T--T--TTGGGTCCATTGTTAT---TT--TTAC---TTTTT-----ATA--AATGATTT-A-CCA-----T--TG-TNTG-T-AAATAAC-GT-TTCAACAACTGACTTATATGCAGATGAC------AC---AAC--GTTATATGAC-AT----ACAA-A-----C--------AAAT---A----CAGATATTTTAAAAG-GTAAC-----TTGCAAACTTCAATTAAT--CGTCTTAATATGTGGTGCATTCAAAATGGTATG--GTAT-TGAATACTGACAAAACAAAAGT---A-ATGTTAATCACCTCTCGTCAGAAACGACAGCAT-TTAAAT----CAAATCGATTTACAACTTACGTACAA----CAG-TA-CA-GA----A--TTAACT--ACAACAAAAGGC-G-ATAAAATCCTTGGAATATTTATTGACGATTGCATGCT---ATGGAATAAACATTTACAATCTCTCTC
Reference ( gi|148760 ) : CAAGGTTGCTAAAACTAGCATCCCCTGTTATATCTGAAAGTATTATGTTTATTGTGAATAAAAGTCT-GCGAGATGGAATATT--TCCACATA--TATG----GAAACAGGC---AAAGATAAAACCATT-CTATA---AAAGCGGCCGA-AAGGATGACGTAAATAATTATCGTCC----TATATCTATTTTGCCAACATTATCAAA---ACTTATAG--AAAAA-ATTAT--------TCATATTAATTTAATGAA-ATTTAT-AAATA-----AATAT---AACTTATTGCATAAAACACAA--AGTGGTTTTAGG--GAAGGTCATTCAAC-TG--A--ATCTGCATTAATTC-GT-A--TGA-TTGATAAATGGCTAACG-GCAATTAATGATGG---------CA-AGTT---AGTTGGGGC----TGT--CATGGTC---GATTTTCGGAA-G---GCCTTTGATCTCGTAAGTCAT--A--CTACT-T-TACTAGCAAAA---CTAAAGTG-----------CTATAAAT-G-TAGTGATCG---TTTT---T-T---G------ATGT-------TGAT-G-AAATCTTACCT-TA-CAAAC-------AGAGGT--CA-A--GTTG-TGT-CTATAAA-------TT-CAGAA---ACT---TA-AA----A---A---AAC--AATTG----TAT--AACATCA-G--GG-GTTCCACAGGGTTCTA-T--T--TTAGGTCCATTGTTAT---TT--TTAC---TTTTT-----ATA--AATGATTT-A-CCA-----T--TG-TTTA-T-AAATAAC-GT-TTCAACAACTGACTTATATGCAAATGAC------AC---AAC--GTTATATGAC-AT----ACAA-A-----C--------AAAT---A----CAGATATTTTAAAAG-GTAAC-----TTGCAAACTTCCATTAAT--CGTCTTAATATGTGGTGCATTCAAAATGGTATG--GTAT-TGAATACTGACAAAACAAAAGT---A-ATGTTAATCACCTCTCGTCAGAAACGATAGCAT-TTAAAT----CAAATCAATTTACAACTTACGTACAA----CAG-TA-CA-GA----A--TTAACT--ACAACAAAAGGC-G-ATAAAATCCTTGGAATATTTATTGACGATTGCATGCT---ATGGAATCAACATTTACAATCTCTCTC
gi|148762 : CAAGGTTGCTTAAACACGCATCCCCTATTTTATCTGAAAGTATTATGTTTATTGTGAATAAAAATCT-GCGAGATGGAATATT--TCCACATA--TATG----GAAACAGGC---AAAGATAAAACCATT-CTATA---AAAGCGACCGA-AAGGATGACGTAAATAATTATAGTCC----TATTTCTATTTTGCCAACATTATCAAA---ACTTACAG--AAAAA-CTTAT--------TCATATTAATTTAATGAA-ATTAAT-AAATA-----AATAT---AACTTATTGCATAAAACACAA--AGTAGTTTTATG--GAAGTTCATTCAAC-TG--A--ATCTGCATTAATTC-GT-A--TGA-CTGATAAATGGCTAACG-GCAATTAATGATGG---------CA-AGCT---AGTTGGGGC----TGT--CATGGTC---GATTTTCGGAA-G---GCCTTTGATCTCGTAAGTCAT--A--CTATT-T-TACTAGCAAAA---CTAAAGTG-----------CTATAAAT-G-TAGTGATCG---TTTT---T-T---G------ATTT-------GGAT-G-AAATCTGACCT-TA-CAAAC-------AGAGGT--CA-A--GTTG-TGT-CTATAAA-------TT-CAGCA---ACT---TC-AA----A---A---ATC--AATTG----TAT--AACATCC-G--GG-GTTCCACAGGGTTCAA-G--T--TTAGGTCCATTGTTAT---TT--TAAC---TTTTC-----ATA--AATGATTT-A-CCA-----T--TG-TTTA-T-AAATTAC-GT-TACAACAACTGACTTAAATGCAGATGAC------AC---AAC--GTTATATGAC-AT----ACAA-A-----C--------AAAT---A----TAGATATTTTAAAAG-GTAAC-----TTGCAAA-TTCAATTAAT--CGTCTTAATATGTGGTGCATTCAAATTGGTATG--GTAT-TGAATACTGACAAATCAAAAGT---A-ATGTTAATCACCTCTCGTCAGAAACGACAGCAT-TTAAAT----CAAATCAATTTACAACATACGCACAA----CAG-TA-CA-GA----A--TTAACT--ACAACAAAAGGC-G-ATAAAATCCTTGGAATATTTATTGATGATTGCATGCT---ATGGAATAAATATTTACAATCTCTCTC
gi|148761 : CAAGGTTGCTAAAACTAGCATCCCCTGTTATATCTGAAAGTATTATGTTTATTGTGAATAAAAGTTT-GCGAGATGGAATATT--TCCACATA--TATA----AAAGC-GGCCGAAAGGATGAaaa
gi|148763 : CAAGGTTTCTAAAACTAGCATCCCCTGTTATATCTGAAAGTATTATGTTTATTGTGAACAAAATTCT-GCGAGATGGAATATT--TCATCATA--TATG----GAAACAGGC---AACGATAAAAACATT-CTATA---AAAGCGGCCGA-AAGGATGACGTAAATAATTATCGTCC----TATATGTATTTTGCCAACATTATCAAA---ACTTATAG--AATTT-TTTAT--------TCATATTAATTAAATGAA-ATTTAT-AAATA-----AATAG---AACTTATTGCATAAAACACAA--AGTGGTTTTAGA--GAAGGTCGTTCAAT-TG--A--ATCTGCATTAATTG-GT-A--TGG-TTGATAAACGGCTAACG-GCAATTAATGATGG---------CA-AGTT---AGTTGGG-C----TGT--CATGGTC---GATTTTCG-AA-G---GTCTTTGATCTCGTAAGTCAT--A--CTATT-T-TACTAGCAAAA---CTTAAGTG-----------CTATTAAT-G-TATTGATCG---TTGT---T-T---T------ATGT-------GGAT-A-AACTATT--TT-TA-CAAAC-------AGAGTT--CA-A--GTTG-AGT-CTATAAA-------TT-CAGCA---ACT---TC-AA----A---A---AAC--AATTG----TAT--AACATCA-G--GG-GTTCCACAGGGTTCTA-T--T--TTAGGTCCATTGTTAT---TT--TTAC---TTTTC-----ATA--AATAATTT-A-CCA-----T--TG-TTTA-T-GAATAAC-AT-TTCAACAACTGACTTATATGCAGATGAC------AC---AAC--GTTATATGAC-AT----ACAA-A-----C--------GAAT---A----CAGATATTTTAAAAG-GTAAC-----TTGCTAACTTAAATTAAT--CGTCTTAATATGTGGTGCATTCAAAATGGTATG--GTAT-TGAATACTAACAAAACAAAAGT---A-ATATTAACCACCTTTCGTCAGAAACGACAGCAT-TTAAAT----CAAATCATTTTACAAATTACGTACAA----CAG-TA-CA-GA----A--TTAACT--ACAACAAAATGCAA-AAAAAAGTCTTGGAATATTTATTGACGATTGCATGCT---ACGGAATAAAAA--TA-AATCTCcgtaaataattatcgtcctatatctattttgccaacattatcaaaacttatagaaaaatttattcatattaatttaatgaaatttataaataaatataacttattgcatataacacaaagtggttttagggaaggtcattcaactgaatctgcattaattcgtatgattgataaatggctaacggcaattaatgatggcaagttagttggagctgtcatggtcgattttcggaaggcctttgatctcgtaagtcatactactttactagcaaaactaaagtgctataaatgtagtgatcgttttttgatgtggatgaaatcttaccttacaaacagaggtcaagttgtgtctataaattcagcaacttcaaaaaccaattgtataacatcaggggttccacagggttctattttagggtcattgttatttttacttttataaatgatttaccattgtttacaaataacgtttcaacaactgacttatatgcagatgacacaacgttatatgacatacaaacaaatacagatattttaaaaggtaacttgcaaacttcaattaatcgtcttaatatgtggtgcattcaaaatggtatggtattgaatactgacaaaacaaaagtaatgttaaacacctctcgtcagaaacgacagcatttaaatcaaatcaatttacaacttacgtacaacaatacagaattatctacaacaaaaggcgataaaatccttggaatatttattgacgattgcatgctatggaattaacatttacaatctctctcaaa
gi|148764 : CAAGGTTGCTAAAACTAGCATCCCCTGTTATATCTGAA-GTATTATGTTTATTGTGAATAAAAGTCT-GCAAGATGGATTATT--TCCACATA--TATT----GGAACAGGC---AAAGATAAAACCATT-CTATA---AAAGCGGTCGA-ATGTGTGCCGTGAATAATTATCGTCC----TATATCTATTTTGCCAACATTTTCAAA---ACGTTTAG--AAAAA-AATAT--------TCATACTAATTTGATGAC-ATTTAT-GACTA-----A-TAA---AACTTATTGCATAAAACACAA--AGTGACTTTAGG--GAAGGTCATTTAAC-TG--A--ATATGCATTAATTA-GG-T--TGA-TTGATAAATGACTAATG-GCAATTAACGATTG---------CA-AGTT---AGTTGGGAC----TGT--CATTGTC---AATATTCGGAA-G---GCATTTGATCTCTTAAGTCAT--A--CTATT-T-TACTAGCAAAA---CTAAAATG-----------CTATAAAT-G-CAGTGATCG---TTTT---T-T---G------AGGT-------GGAT-G-AAATCTTACCT-TA-CAAAC-------AGAGAT--CA-A--AT
gi|148765 : CAATGTTGCCAAA-CTAGCATCCCCTGTTATATCTGAAAGTATTGTATTTATTGTGAATAAAAGTCT-GCGAGACTGAATATT--ACCACATA--TATG----GAAACAGGC---AAAGATAAAACCATT-CTATA---AAAGCGGCCGA-AATGATGACGTAAATAATTATCGCCC----TATATCTATTTTGCCAACATAATCAAA---ACTTATAG--AAAAA-TGTAT--------TCATATTAATTTGATGGC-ATTTAT-AAATA-----AATAT---AACTTATTGCATAAAACACAA--AGAAGTTTTA
gi|148766 : GTTGC--AAACTAGCATCCCCTGTTATATCTGAAAGTATCATGTTTATTGTGAATTAAAGTCT-GCGATATGGAATATT--TCCACATA--TATG----GAAACAGGC---AAAGATACAACCATT-CTATA---AAAGCGGCCGA-AAGGATGACGTAAATAATTATCGTCC----TATATCTATTTTGCCAACATTATTAA-----CTTATAG--AAAAA-TTTAT--------TTATATTAATTTAATGAA-ATTTAT-AAGTA-----AATAT---AACTTATTGCATAAAACACAA--AGTGGTTT-AGG--GAAGGTCAATCAAC-TG--A--ATCTGCATTAATTC-GT-A--TGA-TTGATAAATGGCTAACT-GCAATTAATGATGG---------CA-AGTT---TGTTGGGGC----TGT--CATGGTC---GATTTTCGGAA-G---GCCTTTGATCTCGTAAGTCAT--A--CTATT-T-TACTAGCAAAA---CTAAAGTG-----------CTATAAAT-G-TAGTGATCG---TTTT---T-T---G------ATGT-------GGAT-G-AAATCTTACCT-TA-CAAAC-------AGAGGT--TA-A--GTTG-TGT-CTATAAA-------TT-CAGCA---ACT---TC-AA----A---A---ACC--AATTG----TAT--AACATCA-G--GG-GTTCCACAGGGTTCTA-T--T--TTAGGTCCATTGTTAT---TT--TTAC---TTATC-----ATA--AATGATTT-A-CCA-----T--TG-TTTA-T-AAATAAC-GT-TTCAACAACAAACTTATATGCAGATGAC------AC---AAC--GTTATATGAC-AT----ACAG-A-----C--------AAAT---A----CAGATATTTTAAAAG-GTAAC-----TTGCAAACTTCAATAAAT--CGTCTTAATATGTGGTGCATTCAAAATGGTATG--GTAT-TGAATACTGACAAAACAAAAGT---A-ATGTTAATCA-CTCTCGTCAGAAACGACAGCGT-TTAAAT----CAAATCAATTTACAACTTACGTACGA----CAG-TA-CA-GA----A--TTAACT--ACAACAAAAGGC-G-ATAAAATCCTTGGAATATTTATTGACGATTGCATGCT---ATTGAATAAACATTTACAATCTCTCTC
gi|148767 : TTGCTTATACTAGTTTCATACGTTTCATCTGAACGTATTATGTTTACTTTAATTAAAAGTCT-GCGAGATGGAATATT--TCCACATGCTTAT------AAACAGGC---AGAGATAAA--CATTTCTATA---AAAGCGATCGA-AGTGATGACATGAAGGCTTATCGTCT----TATATCTAGTTTGCCAACATTATCAAA---ACTTATAG--GAACA-TATAT--------TCATATTAATTTGATGAC-ATTTAT-AACT------TGCGT---AA-TTA-TGCGTAAAACACAA--AGTGATGTTAGG--ACAGGTCATTTAAC-TG--A--ATCTGCATTAATTC-AT-A--GGA-TTCATAAATGATTAACG-GCATTTAACGACGG---------CA-AGAT---Aaaa
gi|148768 : TTATGTATA--ATAAATACAAGTTTAGCCAG-TGGAAGCTT--TCCATCCG--CATG----GAAACA--------------AAC-GTT-TTTTA---AGAGTGGAAGT-AAAGATAAAATAAACAACTGTCACCCCTGCTACCGCTATATTAACAACTTTATCGAA------TGTAGTTGAAGA-AT-ATCTCGGTTCTCATTTGAATTCCTTC----TTCAA-CAATC-----ATTAT---A---TATTACATGAGTCTCAA--AGCGGATTTAGA--GAAGGTCATTCAACATA--ATTATCTGTTTTGTTT---T-A--TTACTTGATTAATGTCTGAGT-GCAATTAATGAGGGA--------CA-ATTTGTAAGATG--------TGT--TATGGTC---TATTTCAAGAA-GAAAAC----GATCAAGTAAATCAT--G--ATA-----TACTAATAAAAAATCTCAAACT-----------TTACAAAT-G-TAGCGAT
gi|148769 : TGTAATATTCCTCAAAATA--TATTTTTTGAAACAGAC---AAATATAAAACCATT-CTATA---AAAGCGATAGA-AAGGATGACGT------------------------CTATTTTGC-GACATTATCAAA---ATTTATAG--AAAAA---TAT--------TCATATTAAATTGATGAC-ATTTAT-GAATA-----AATA--------------ACAAAA----A--AGTGGTTTTATG--AAA--------------------TCTGCATTTATCC-GT-A--TAA-TTGATAAATGGCTAATG-GCAGTTAACGACGG---------C----------------------TGT--CATGGAC---GATTTT-AGAT-G---ACCTTTGATCTCGTTA-CCAT--A--TCATT-T-TACTAGCAAAA---CTAAAATG-----------ATATAAAT-G-CAGTGATCT---TATT---T-T---G------ACGT-------GGTT-G-AAATCTTACCT-CG-CAAAC-------AGAGTA--CA-A--GTTG-TGT-C--TAAT-------TT-CAGCT---ACT---AC-AG----G---A---ACC--AATTG----TAT--AACATGA-A--GT-GTTCCGCAGGGT--TA-T--TAATTAGGTTCATTGTTAG---TT--TTAC---TTTTT-----ATA------ATT----CCA-----T----------T-AAATTAA-AT-T----CAATT---TTATAAGCAAAaaactagcaaagtggtgtcaatcatacattaccaatcgctagcaagttgt
gi|148770 : AAAAATGC---AAAAGTAA---C-TC-CTATACACAAAAAGGGAGATAAATCTGAGGCAACTAATTACAGACC----TATATCAGTACTACCAACATTGTCTAA---GTTAATTG--AAAAA-CATATC-------TCCCAACAACTTTATAAGTATTTGTCAGAT--------TTT---AACCTATTACATCCATCTCAA--TCTGGATTTAGGCCGAA--TCACTC--C-TGTCA--AACAGCACTAATAA-AT-A--TAA-CTGACAAATGGTTACAA-GAAATGAATGATGG---------AA-ACAT---AAATGGAGT----AGT---AT--TCTTGGATTTAAAAAA-A---GCTTTTGATGTTGTTGATCACAAA--CT-CT-TATGCCA--AAAG---CTTAA---------------TATATATGG-TTGTACTCGAACTTCC---C-T---G------AAGT-------TGTT-T-GAATCATATCT-TA-ATAAC-------AGActatcagcaaacatatcaggttgaccatttataacgtt
gi|148771 : AGTC---AAA-ATCACACCAAT-TTTTA---AGAAAGGTTTA-AAACAAGACAAAAATAACTATCGCCC----AATTTCCATTCTTCCTATTCTGTCTAAGATACTTG-AG--AGACATGTTAG--------TAATAGTG-TTCGGTCT---TTTTT-AAATA-----CATAC---AATTTATTGCATGAAAGACAATCAG-GGTTC-AGA--TCTGATCATTCATG-CG--A--AACAGCATTAA--CAGTGA--TGG-TTGATGACTGGATCACA-GCTATTGATCAAAA---------CA-GAAT---ATCTGGAACCATATTT--CTTGACC---TATCT----AA-A---GCATTTGATCTGGTTGATCAT--AGTTTACT----GCTTGAAAAA---C---------------------TAAAT-G-TATT--CCA---TTTC---CATAAAG------ATGTACAAAATTGGT-TTAAATCCTATTTATG-TGAACGTTCACAAAAAGTTTCA-ATAGCTG--GT---ACACT-------TT-CAGAA---AGT------------A---A---ATC--AGT-----------AACATGT-G--GT-GTACCCCAAGGATCTG-T--T--TTAGGCCCACTTCTAT---TTA-TTA----TCTTT-----ATC--AATGATAT-G-CCC-----T--TA-TGCACT-CAGTA------TTCAAAAATGAACATGTTTGCTGATGACTCCTCTAT---CAC--TTTATCTGGTAAT----TCAATAT----C--------AGAC---ATCACCGAATCTCTTAA-----TAA-------TG--AATT---AATAAA--TGTC-CAACA-ATGGTGTAATAATAATTGGATG--ACCA-TAAATACTTCAAAAACCAAAGC---A-ATGTTTATAGCCTCTCATCCAAAGCAAC--CAC-T--ATT----CAGATCAGATTAGCACTTA---AAAA----TAG-GA-GATGAGGCTA--TTGAAT---TTACAAGTAGT-G-AAAAACTTCTGGGAGTAACAATTGACAA---CACACTAACATGGACTCAACAacacagcaggtaaaagtaggaaatgccaagtctaaatctgcccctatttctcatggagttccccaaggttcaatactgggtccattacttttcattttatatattaatgacctcccattacatgtaaaaaacagtgaaactgatatgtatgcagatgactccacattccacacttcaggaaaaactgttggagaaattcagcagagattacaagccgacttaacttctataaataaatggtgttcaagaaatatgatgtatattaatacagaaaaaactaa
gi|148761 : TATA---AAAGCGGCCGA-AAGGATGACGTAAATAATTATCGTCC----TATATCTATTTTGCCAACATTATCAAA---ACTTATAG--AAAAA-TTTAT--------TCATATTAATTTAATGAA-ATTTAT-AAATA-----AATAT---AACTTATTGCATATAACACAA--AGTGGTTTTAGG--GAAGGTCATTCAAC-TG--A--ATCTGCATTAATTC-GT-A--TGA-TTGATAAATGGCTAACG-GCAATTAATGATGG---------CA-AGTT---AGTTGGAGC----TGT--CATGGTC---GATTTTCGGAA-G---GCCTTTGATCTCGTAAGTCAT--A--CTACT-T-TACTAGCAAAA---CTAAAGTG-----------CTATAAAT-G-TAGTGATCG---TTTT---T-T---G------ATGT-------GGAT-G-AAATCTTACCT-TA-CAAAC-------AGAGGT--CA-A--GTTG-TGT-CTATAAA-------TT-CAGCA---ACT---TC-AA----A---A---ACC--AATTG----TAT--AACATCA-G--GG-GTTCCACAGGGTTCTA-T--T--TTAGGGTCATTGTTAT---TT--TTAC----TTTT-----ATA--AATGATTT-A-CCA-----T--TG-TTTA-C-AAATAAC-GT-TTCAACAACTGACTTATATGCAGATGAC------AC---AAC--GTTATATGAC-AT----ACAA-A-----C--------AAAT---A----CAGATATTTTAAAAG-GTAAC-----TTGCAAACTTCAATTAAT--CGTCTTAATATGTGGTGCATTCAAAATGGTATG--GTAT-TGAATACTGACAAAACAAAAGT---A-ATGTTAAACACCTCTCGTCAGAAACGACAGCAT-TTAAAT----CAAATCAATTTACAACTTACGTACAA----CAA-TA-CA-GA----A--TTATCT--ACAACAAAAGGC-G-ATAAAATCCTTGGAATATTTATTGACGATTGCATGCT---ATGGAATTAACATTTACAATCTCTCTCagttgaaaacactctaaaa
gi|148783 : caaggttgctaaaactagcatcccctgttatatctgaaagtattatgtttattgtgaataaaagtttgcgagatggaatatttccacataATGGC-ATTTAT-AAATA-----AATAT---AACTTATTGCATAAAACACAA--AGAAGTTTTAaaa
gi|148772 : gAA-CTTTAT-AAGTATCTGTAAGATTTTAACCTATTACATTTATCTCAA--TCTGCATTTAGGCCGAA--TCACTC--C-TGTCA--AACAGCACTAATAA-AT-A--TAA-TTGACAAATGG-TAACAAGAAATGAATGATGGAAACATAAACAGAGTT---A-CTGTAGT----TATTTCTTGG------ATTTATAAAA-A---GCTTTTGATGTTGTTGATCAC--A--A-ACTCT-TA-TGCCAAAAG--CTTAA---------------TATACAT-GGTTGTGCTCAAACTTCC---C-T---G------AAGT-------TGTT-T-GAATCATATCT-AA-ATAAC-------AGAA----CACA--GTAG--GT---A-AAA-------GT-AGGAA---ATG---CA-AAGTCTA---A---ATC-----TGCCCCTAT--TTC-TCATG--GA-GTTCCCTAAGGTTCCA-T--A--CTGGGTCCATTAC--T---TT--TCAT---TTTAT-----ATATTAATGATCT-C-CCA-----T--TA-CATG-T-AAAAAACAGT----GA-AACTGATATGTATGCAGATGAC------TC---CAC--ATTCCAC-AC--T----TCAG-G-----A--------AAA----A----C---TGTTTGAAAAATTTAGCAGAGATTACAAGCCGACATAACT--TCTATAAATAAATGGTG--TTCAAGA-AATATGATGTATATTAATACAGA-AAAAAATAAGT---GTATGACAATtaaaatccttggaatatttattgacgattgcatgctatggaataaacatttacaatctctctcaaa
gi|148773 : ATAT---ATCTTA--ACATCAGTCTCAA--CGTGGTTTTAGA--ATAAGTCATTCAAC-GG--A--ATCTTCTTTA--TT-AT-AATTGT-TTGATAAAGAGATAGAG-ACAACAGACGAAGG---------TC-AGTT---TGTAGGATA----TGT--TATGGTC---GATTTCAGAAA-A---GCATTCGAT----TAAGTAA---A--ATGAA-A-TACTATTAAAAGG-TTAAAGCT-----------TTCCAAAT-G-AAGCGAT-G---AATTAAAT-T---GTATCGTATTT-------TGAT-G-CA----TACCT-TACCGAAC--------GCTCT--CA-A--GTTGTTGA-C-ATAAA-------TT----GG---ACTATGTC-AG----A---A---CAA--AAGTC----CAT--CGCGTGT-T--GC-GTTCCACACTGCTCCAGC--C--TTGGGCTTGTT-TTGT---GT--TAAT---CATTT-----ATA--AACAACTTAA-CCA-----TGACGCTTTC-T-AAA-ATT-GT-CTCAGGTACTGATTTATATGCAGATGAT------ACTATAATTGATTATTTTAA-AT----CTGA-A-----A--------AAAA---A----AGGAAATCTTGAACG-A-AAT-----GTTCAGTGTTCACTAAATTATATTTTAA-AT-TGATGTAAATAGAACGAAATG--CTTT-TAAACACTGCCAAAACAAAAGTCTCA-ATGT
gi|148774 : ---GATTTTTAAAACA---GTCTTTGATCTAGTTAGCCAT--G--AAACT-C-TTCCTGCAAAA---CTAAAATGTAACAGTTTTTCGACAAAT-G-TA-----C----TTTT---G-T---A------AAGT-------T--T---AGTTCTTATCT-----AAATG------AAAGAG--CA-A--ATTG--GTACTATAAAAATTATATT-CA--A---ACT---C------------------C--AATCG----AATTGAAAGT---G--GT-GTACCTCAAGGATCTA-TA-C--TTGGG-CCAATGTTAT---TCA-TTA----TGTTT-----GTA--AATGATTT-G-CCA-----C--TT-TATG-T-CAATAAT-GC-T
gi|148775 : AA-A---GCCTTTGATTTAGTTAATCAC--G--ACATT-C-TTCTTGCAAAA---CTAAAATG-----------TTACAATT-T-CAAAAAATG---CACT---T-T---G------AAGT-------GGTT-A-AGTTCTTATCT-----AAAT-------GAAAGTG-CA-A--ATTG--GT--TCTAAG-------TTATATAATATATT---TA-AA----ATCCA---ATCT-AAT------TAG--AA-GT---G--GG-GTACCTCAAGGATCTA-TA-C--ATGGG-CCATTGTTATAAATTCATTA----TATTT-----GTA--AATGATCT-G-TCA-----C--T
gi|148776 : AGTAAAG---C-AAAATG-----------GTATAAAA-G---GTAATC-----TTC---T-T---A------AT---------TGATTG-AA-------------CAAAG-------AGTTTT--TATA--GTTA-TTA-CTTTT---------TT-CAGAA---A-----TACAA----G---A---AAC--AACTG--------------CC-G--GA-GTTCCCCAAGGTTTAA-T--T--CTGGGTCCTTTATTCT---TT--TTAA---TTTAC-----ATA--AATGATAT-AGCTAAAAATT--TG-T----T-AAGTA----T-T---AC-AC--ACATATTTGCAGATGAT------AT---A
gi|148784 : aaagcatttgatcgcatgtagttaaaaggtcttctgttcaaAT-G-AAATCTTACCT-TA-CAAAC-------AGAGAT--CA-A--AT
gi|148777 : T---TC-AA----A---ATCCAACCTAATT-----TAT--AAGAGT--G--GG-GTACCTCAAGGATCTG-TCCT--TTGG--CCATTGTTAT---TTA-TTA----TGTTT-----GTA--AATGATTT-G-CCA-----C--TT-TATG-T-CAATAAC-GC-T--AAC-ACTGATAAATTTGCAGATGacagaatagactactacaacaggcgataaaatccttggaaaatttattgaagattgcatgctatggaataaacatttacaatctctctacaaa
gi|148778 : C--AAATC----TAC--AACAGCT-G--GT-GTTCCACAGGGCTCTG-T--T--CTAGGTC---TGCTAT---TT--TTCCTTGTTTTT-----GTT--AATGAT-------A-----T--TG-T
gi|148779 : --AATATCG-GCTGGTGTTCCTCAAGGCTCAA-T--T--CTTGGTCCATTATTAT---TT--CTTG---TTTAT-----ATC--AATGAT-------A-----T--TG-TTTC-TGAAATA---GG-CTCTGCGATTCGCTTCTTTGCTGACGAC------AC---AAC--CCTTTATG
gi|148770 : TCATG--GA-GTTCCCCAAGGTTCAA-T--A--CTGGGTCCATTAC--T---TT--TCAT---TTTAT-----ATATTAATGACCT-C-CCA-----T--TA-CATG-T-AAAAAACAGT----GA-AACTGATATGTATGCAGATGAC------TC---CAC--ATTCCAC-AC-TTCAGGAAAA-A-----CTGTTGGAGAAATTCAG----CAGAGA--TTACAAG-CCGAC-----TT---AACTTCTA-TA----------AATAAATGGTG--TTCAAGA-AATATGATGTATATTAATACAGAAAAAACTAA
gi|148780 : aaaaatgcaaaagtaactcctatacacaaaaagggagataaatctgaggcaactaattacagacctatatcagtactaccaacattgtctaagttaattgaaaaacatatctcccaacaactttataagtatttgtcagattttaacctattacatccatctcaatctggatttaggccgaatcactcctgtcaaacagcactaataaatataactgacaaatggttacaagaaatgaatgatggaaacataaatggagtagtattcttggatttaaaaaaagcttttgatgttgttgatcacaaactcttatgccaaaagcttaatatatatggttgtactcgaacttccctgaagttgtttgaatcatatcttaataacagaacacagcaggtaaaagtaggaaatgccaagtctaaatctgcccctatttc-G--GT-GTTCAACAAGGTTCTG-T--T--TTAGGTCCTTTATT-T---TT--TTAT---TTTTTTTTACATT--AATGATAT-A-GCA-------------------GAGAAC-GTATTGCACAA--AACTT---TCCGAATGAT------AC--------GTCACATG-C-TT----ATTA-A-----C--------AAAT---T----CAGA
gi|148781 : A--GATGATTT-A-CTA-----T--T----------ACTAAC-GT-TTCAACAACTGA--TATATGCAGACGAC------AC---AAC--GTTATATTAC-AT----ACAA-A-----C--------AATT---A----TAGATTTTTTTAAAA-GTAAC-----ATGCAAACTTCAATTAAT--CGTCTTAATATGTGGTGCATTTAAAATAGTATG--GTAT-TTAATACTGACACAACCAAAGT---A-ATGTCAATCAACTCTCGACAGAAACGAAAGCGT-TGCAAT----TGTATTGATTTACAACTTACGTACAG----CTG-TATTT-TA----A--TTAGCT--GCTACAACATGC-A-ATAAAATCCTTGGAATATTTTATGACAATTGCAATCT---ATGAAATAAACATTTATTATCTCTCTC
gi|148782 : ATGAT------AC---TAC--CTTATCTAAA-AT----AGGA-GAATCTC--------AAA----A----T-GATATTC---AAA-TTAAA-----TTACAAAATTCTCTAAAT--GATCTGCAAACTTGGTGCAAGCATAATGGCATG--CTTA-TAAATTCTGCAAAAACCAAAGT---G-ATGTTAATAACAACTCAT--GAAATGACAGCACATTAAATTTTGCAAATTGATTTTCAGCTAAACTATAA----TGA-TG-CA-AAT---C--TTGCCTTAATATCAAA---T-G-ACAAAATAATTGGGATcaa
gi|148783 : GATGGCAT-TTA-------TAAATAAAT--ATAACTTAT--------------TG-CA-TA----A----AAC---ACAA-AGAAGTT-TTATAAAATCCTTGGAATATTTATTGACGATTGCATGCT---ATGGAATAAACATTTACAATCTCTCTC
gi|148784 : AT----GAAATC---TTAC--CTTACAAACAGAGATCAAATA-CA-GA----A--TAGACT--ACTACAACAGGC-G-ATAAAATCCTTGGAAAATTTATTGAAGATTGCATGCT---ATGGAATAAACATTTACAATCTCTCTaaa
gi|148785 : ACG-ACGG----CAA-GA-TA-AA----AGTTCAATT--ACAATA---GGC-G-ATAAAATCCTTGAAATATTTATTGATGATTGCATACT---ATGAAA-AAACAATAACAATCTCTCTacaaa
Alignments
lowQualScore : 11111 111 111111111 111111 222222222222 111 111 11 1111111 11111 11 11111111111111 11 1111
lowQualScore : 0 0 4 55 55 00000 555 3 555 3 7777 555 555 444 6 3 44 2 77777 444 33 0 88 2 0 3 88 44 55 3 44 3 0 3 1 555555555 3 555 9999999 44 555 55 0 2 555 1 1 1 555 33 33 1 111111 2 555 777 55 555555555555 33 2 2 555 2 000 1 0 7 44 33 2 33 33 222 77777 5 33 555 0000000 5555 2 3 777 6666 6666 1 5 33 33333 1 9999 3 1 2 77 33 1 444 00 8 444 55555 66 4 444 55555 33 33 8888 2 2 5 555 11 2 0 888888 555 44 2 3 7777 3 77777777777777 999999999 1 44 99999 1 1 44 555 444 22 2 1 00 7 1 1 777 4 5 5 9999 4 1 2 8888 4 4 4 2222 55 55 3 3 7777 777
lowQualScore : . . . .. .. ..... ... . ... . .... ... ... ... . . .. . ..... ... .. . .. . . . .. .. .. . .. . . . . ......... . ... ....... .. ... .. . . ... . . . ... .. .. . ...... . ... ... .. ............ .. . . ... . ... . . . .. .. . .. .. ... ..... . .. ... ....... .... . . ... .... .... . . .. ..... . .... . . . .. .. . ... .. . ... ..... .. . ... ..... .. .. .... . . . ... .. . . ...... ... .. . . .... . .............. ......... . .. ..... . . .. ... ... .. . . .. . . . ... . . . .... . . . .... . . . .... .. .. . . .... ...
lowQualScore : 5 1 4 55 55 11111 888 6 888 3 1111 888 888 333 7 3 11 9 11111 777 77 5 55 8 4 1 55 22 88 1 22 1 2 1 1 444444444 1 444 9999999 66 444 11 7 9 000 2 2 0 000 99 99 6 111111 9 000 999 77 111111111111 99 9 9 111 9 000 0 7 2 11 88 9 66 99 777 11111 7 00 000 0000000 5555 1 1 999 1111 1111 0 3 77 33333 1 2222 1 0 4 99 22 4 111 33 5 111 99999 11 0 999 99999 22 33 0000 7 5 3 555 66 0 1 222222 000 22 8 3 1111 3 99999999999999 999999999 7 22 11111 4 4 11 555 222 77 0 3 00 3 2 4 000 0 0 0 4444 4 9 4 5555 0 0 0 5555 55 00 6 6 7777 000
consensus : CAAGGTTGCTAAAACTAGCATCCCCTGTTATATCTGAAAGTATTATGTTTATTGTGAATAAAAGTCT-GCGAGATGGAATATT--TCCACATA--TATG----GAAACAGGC---AAAGATAAAACCATT-CTATA---AAAGCGGCCGA-AAGGATGACGTAAATAATTATCGTCC----TATATCTATTTTGCCAACATTATCAAA---ACTTATAG---AAAAAT-TTAT-TCA-TATTAATTTGATGA-CATTTAT-AAATA-----AATAT---AACTTATTGCATAAAACACAA--AGTGGTTTTAGG--GAAGGTCATTCAAC-TG--A--ATCTGCATTAATTC-GT-A--TGA-TTGATAAATGGCTAACG-GCAATTAACGATGG---------CA-AGTT---AGTTGGGGC----TGT--CATGGTC---GATTTTCGGAA-G---GCCTTTGATCTCGTNA---GTCAT--A--CTACT------T-TA---CTAGCAAAA---CTAAA-GTG-----------CTATAA--AT-G-TAG--TG-ATCG---TTTTTTGANGTGGNTG-AAATCTTACCT-TA-CAAAC-AG--AGGT-C-----A-AGTTG-TGT-CTATAAA-------TT---CAGNA-ACT---TCAA----AA----ACC-AA--TTG----TATAACATC-N-GGNGTTCCNCAGGGTTCTA-T--T--TTGGGTCCATTGTTAT---TT--TTACTT---TTT-----ATA--AATGATTT-A-CCA-----T--TG-TTTG-T-AAATAAC-GT-TTCAACAACTGACTTATATGCAGATGAC------AC---AAC--GTTATATGAC-AT----ACAA-A-----C--------AAAT---A----CAGATATTTTAAAAG-GTAAC-----TTGCAAACTTCAAT-TAAT--CGTCT-T-AATATGTGGTGCATTCAAAATGGTATG--GTAT-TGAATACTGACAAAACAAAAGT---A-ATGTTAATCACCTCTCGTCAGAAACGACAGC-AT-TTAAAT----CAAATCGATTTACAACTTACGTACAA----CAG-TA-CA-GA----A--TTAACT--ACAACA-AAAGGC-G----ATAAAATCCTTGGAATATTTATTGACGATTGCATGCT---ATGGAATAAACATTTACAATCTCTCTC
Reference ( family-701 ) : CAAGGTTGCTAAAACTAGCATCCCCTGTTATATCTGAAAGTATTATGTTTATTGTGAATAAAAGTCT-GCGAGATGGAATATT--TCCACATA--TATG----GAAACAGGC---AAAGATAAAACCATT-CTATA---AAAGCGGCCGA-AAGGATGACGTAAATAATTATCGTCC----TATATCTATTTTGCCAACATTATCAAA---ACTTATAG---AAAAAN-TTAT-TCA-TATTAATTTGATGA-NATTTAT-AAATA-----AATAT---AACTTATTGCATAAAACACAA--AGTGGTTTTAGG--GAAGGTCATTCAAC-TG--A--ATCTGCATTAATTC-GT-A--TGA-TTGATAAATGGCTAACG-GCAATTAACGATGG---------CA-AGTT---AGTTGGGGC----TGT--CATGGTC---GATTTTCGGAA-G---GCCTTTGATCTCGTNA---GTCAT--A--CTACT------T-TA---CTAGCAAAA---CTAAA-GTG-----------CTATAA--AT-G-TAG--TG-ATCG---TTTTTTGANGTGGATG-AAATCTTACCT-TA-CAAAC-AG--AGGT-C-----A-AGTTG-TGT-CTATAAA-------TT---CAGNA-ACT---TCAA----AA----ANC-AA--TTG----TATAACATC-N-GGGGTTCCNCAAGGTTCTA-T--T--TTGGGTCCATTGTTAT---TT--TTACTT---TTT-----ATA--AATGATTT-A-CCA-----T--TG-TNTG-T-AAATAAC-GT-TTCAACAACTGACTTATATGCAGATGAC------AC---AAC--GTTATATGAC-AT----ACAA-A-----C--------AAAT---A----CAGATATTTTAAAAG-GTAAC-----TTGCAAACTTCAAT-TAAT--CGTCT-T-AATATGTGGTGCATTCAAAATGGTATG--GTAT-TGAATACTGACAAAACAAAAGT---A-ATGTTAATCACCTCTCGTCAGAAACGACAGC-AT-TTAAAT----CAAATCGATTTACAACTTACGTACAA----CAG-TA-CA-GA----A--TTAACT--ACAACA-AAAGGC-G----ATAAAATCCTTGGAATATTTATTGACGATTGCATGCT---ATGGAATAAACATTTACAATCTCTCTC
gi|148760 : CAAGGTTGCTAAAACTAGCATCCCCTGTTATATCTGAAAGTATTATGTTTATTGTGAATAAAAGTCT-GCGAGATGGAATATT--TCCACATA--TATG----GAAACAGGC---AAAGATAAAACCATT-CTATA---AAAGCGGCCGA-AAGGATGACGTAAATAATTATCGTCC----TATATCTATTTTGCCAACATTATCAAA---ACTTATAG---AAAAAA-TTAT-TCA-TATTAATTTAATGA-AATTTAT-AAATA-----AATAT---AACTTATTGCATAAAACACAA--AGTGGTTTTAGG--GAAGGTCATTCAAC-TG--A--ATCTGCATTAATTC-GT-A--TGA-TTGATAAATGGCTAACG-GCAATTAATGATGG---------CA-AGTT---AGTTGGGGC----TGT--CATGGTC---GATTTTCGGAA-G---GCCTTTGATCTCGTAA---GTCAT--A--CTACT------T-TA---CTAGCAAAA---CTAAA-GTG-----------CTATAA--AT-G-TAG--TG-ATCG---TTTTTTGATGTTGATG-AAATCTTACCT-TA-CAAAC-AG--AGGT-C-----A-AGTTG-TGT-CTATAAA-------TT---CAGAA-ACT---TAAA----AA----AAC-AA--TTG----TATAACATC-A-GGGGTTCCACAGGGTTCTA-T--T--TTAGGTCCATTGTTAT---TT--TTACTT---TTT-----ATA--AATGATTT-A-CCA-----T--TG-TTTA-T-AAATAAC-GT-TTCAACAACTGACTTATATGCAAATGAC------AC---AAC--GTTATATGAC-AT----ACAA-A-----C--------AAAT---A----CAGATATTTTAAAAG-GTAAC-----TTGCAAACTTCCAT-TAAT--CGTCT-T-AATATGTGGTGCATTCAAAATGGTATG--GTAT-TGAATACTGACAAAACAAAAGT---A-ATGTTAATCACCTCTCGTCAGAAACGATAGC-AT-TTAAAT----CAAATCAATTTACAACTTACGTACAA----CAG-TA-CA-GA----A--TTAACT--ACAACA-AAAGGC-G----ATAAAATCCTTGGAATATTTATTGACGATTGCATGCT---ATGGAATCAACATTTACAATCTCTCTC
gi|148761 : CAAGGTTGCTAAAACTAGCATCCCCTGTTATATCTGAAAGTATTATGTTTATTGTGAATAAAAGTTT-GCGAGATGGAATATT--TCCACATA--TATA----AAAGC-GGCCGAAAGGATGA
gi|148761 : TATA---AAAGCGGCCGA-AAGGATGACGTAAATAATTATCGTCC----TATATCTATTTTGCCAACATTATCAAA---ACTTATAG---AAAAAT-TTAT-TCA-TATTAATTTAATGA-AATTTAT-AAATA-----AATAT---AACTTATTGCATATAACACAA--AGTGGTTTTAGG--GAAGGTCATTCAAC-TG--A--ATCTGCATTAATTC-GT-A--TGA-TTGATAAATGGCTAACG-GCAATTAATGATGG---------CA-AGTT---AGTTGGAGC----TGT--CATGGTC---GATTTTCGGAA-G---GCCTTTGATCTCGTAA---GTCAT--A--CTACT------T-TA---CTAGCAAAA---CTAAA-GTG-----------CTATAA--AT-G-TAG--TG-ATCG---TTTTTTGATGTGGATG-AAATCTTACCT-TA-CAAAC-AG--AGGT-C-----A-AGTTG-TGT-CTATAAA-------TT---CAGCA-ACT---TCAA----AA----ACC-AA--TTG----TATAACATC-A-GGGGTTCCACAGGGTTCTA-T--T--TTAGGGTCATTGTTAT---TT--TTAC-T---TTT-----ATA--AATGATTT-A-CCA-----T--TG-TTTA-C-AAATAAC-GT-TTCAACAACTGACTTATATGCAGATGAC------AC---AAC--GTTATATGAC-AT----ACAA-A-----C--------AAAT---A----CAGATATTTTAAAAG-GTAAC-----TTGCAAACTTCAAT-TAAT--CGTCT-T-AATATGTGGTGCATTCAAAATGGTATG--GTAT-TGAATACTGACAAAACAAAAGT---A-ATGTTAAACACCTCTCGTCAGAAACGACAGC-AT-TTAAAT----CAAATCAATTTACAACTTACGTACAA----CAA-TA-CA-GA----A--TTATCT--ACAACA-AAAGGC-G----ATAAAATCCTTGGAATATTTATTGACGATTGCATGCT---ATGGAATTAACATTTACAATCTCTCTCcgtaaataattatcgtcctatatctattttgccaacattatcaaaacttatagaaaaatttattcatattaatttaatgaaatttataaataaatataacttattgcatataacacaaagtggttttagggaaggtcattcaactgaatctgcattaattcgtatgattgataaatggctaacggcaattaatgatggcaagttagttggagctgtcatggtcgattttcggaaggcctttgatctcgtaagtcatactactttactagcaaaactaaagtgctataaatgtagtgatcgttttttgatgtggatgaaatcttaccttacaaacagaggtcaagttgtgtctataaattcagcaacttcaaaaaccaattgtataacatcaggggttccacagggttctattttagggtcattgttatttttacttttataaatgatttaccattgtttacaaataacgtttcaacaactgacttatatgcagatgacacaacgttatatgacatacaaacaaatacagatattttaaaaggtaacttgcaaacttcaattaatcgtcttaatatgtggtgcattcaaaatggtatggtattgaatactgacaaaacaaaagtaatgttaaacacctctcgtcagaaacgacagcatttaaatcaaatcaatttacaacttacgtacaacaatacagaattatctacaacaaaaggcgataaaatccttggaatatttattgacgattgcatgctatggaattaacatttacaatctctctcaaa
gi|148762 : caaggttgctaaaactagcatcccctgttatatctgaaagtattatgtttattgtgaataaaagtttgcgagatggaatatttccacataCAAGGTTGCTTAAACACGCATCCCCTATTTTATCTGAAAGTATTATGTTTATTGTGAATAAAAATCT-GCGAGATGGAATATT--TCCACATA--TATG----GAAACAGGC---AAAGATAAAACCATT-CTATA---AAAGCGACCGA-AAGGATGACGTAAATAATTATAGTCC----TATTTCTATTTTGCCAACATTATCAAA---ACTTACAG---AAAAAC-TTAT-TCA-TATTAATTTAATGA-AATTAAT-AAATA-----AATAT---AACTTATTGCATAAAACACAA--AGTAGTTTTATG--GAAGTTCATTCAAC-TG--A--ATCTGCATTAATTC-GT-A--TGA-CTGATAAATGGCTAACG-GCAATTAATGATGG---------CA-AGCT---AGTTGGGGC----TGT--CATGGTC---GATTTTCGGAA-G---GCCTTTGATCTCGTAA---GTCAT--A--CTATT------T-TA---CTAGCAAAA---CTAAA-GTG-----------CTATAA--AT-G-TAG--TG-ATCG---TTTTTTGATTTGGATG-AAATCTGACCT-TA-CAAAC-AG--AGGT-C-----A-AGTTG-TGT-CTATAAA-------TT---CAGCA-ACT---TCAA----AA----ATC-AA--TTG----TATAACATC-C-GGGGTTCCACAGGGTTCAA-G--T--TTAGGTCCATTGTTAT---TT--TAACTT---TTC-----ATA--AATGATTT-A-CCA-----T--TG-TTTA-T-AAATTAC-GT-TACAACAACTGACTTAAATGCAGATGAC------AC---AAC--GTTATATGAC-AT----ACAA-A-----C--------AAAT---A----TAGATATTTTAAAAG-GTAAC-----TTGCAAA-TTCAAT-TAAT--CGTCT-T-AATATGTGGTGCATTCAAATTGGTATG--GTAT-TGAATACTGACAAATCAAAAGT---A-ATGTTAATCACCTCTCGTCAGAAACGACAGC-AT-TTAAAT----CAAATCAATTTACAACATACGCACAA----CAG-TA-CA-GA----A--TTAACT--ACAACA-AAAGGC-G----ATAAAATCCTTGGAATATTTATTGATGATTGCATGCT---ATGGAATAAATATTTACAATCTCTCTCaaa
gi|148763 : CAAGGTTTCTAAAACTAGCATCCCCTGTTATATCTGAAAGTATTATGTTTATTGTGAACAAAATTCT-GCGAGATGGAATATT--TCATCATA--TATG----GAAACAGGC---AACGATAAAAACATT-CTATA---AAAGCGGCCGA-AAGGATGACGTAAATAATTATCGTCC----TATATGTATTTTGCCAACATTATCAAA---ACTTATAG---AATTTT-TTAT-TCA-TATTAATTAAATGA-AATTTAT-AAATA-----AATAG---AACTTATTGCATAAAACACAA--AGTGGTTTTAGA--GAAGGTCGTTCAAT-TG--A--ATCTGCATTAATTG-GT-A--TGG-TTGATAAACGGCTAACG-GCAATTAATGATGG---------CA-AGTT---AGTTGGG-C----TGT--CATGGTC---GATTTTCG-AA-G---GTCTTTGATCTCGTAA---GTCAT--A--CTATT------T-TA---CTAGCAAAA---CTTAA-GTG-----------CTATTA--AT-G-TAT--TG-ATCG---TTGTTTTATGTGGATA-AACTATT--TT-TA-CAAAC-AG--AGTT-C-----A-AGTTG-AGT-CTATAAA-------TT---CAGCA-ACT---TCAA----AA----AAC-AA--TTG----TATAACATC-A-GGGGTTCCACAGGGTTCTA-T--T--TTAGGTCCATTGTTAT---TT--TTACTT---TTC-----ATA--AATAATTT-A-CCA-----T--TG-TTTA-T-GAATAAC-AT-TTCAACAACTGACTTATATGCAGATGAC------AC---AAC--GTTATATGAC-AT----ACAA-A-----C--------GAAT---A----CAGATATTTTAAAAG-GTAAC-----TTGCTAACTTAAAT-TAAT--CGTCT-T-AATATGTGGTGCATTCAAAATGGTATG--GTAT-TGAATACTAACAAAACAAAAGT---A-ATATTAACCACCTTTCGTCAGAAACGACAGC-AT-TTAAAT----CAAATCATTTTACAAATTACGTACAA----CAG-TA-CA-GA----A--TTAACT--ACAACA-AAATGCAA----AAAAAAGTCTTGGAATATTTATTGACGATTGCATGCT---ACGGAATAAAAA--TA-AATCTCaaa
gi|148764 : CAAGGTTGCTAAAACTAGCATCCCCTGTTATATCTGAA-GTATTATGTTTATTGTGAATAAAAGTCT-GCAAGATGGATTATT--TCCACATA--TATT----GGAACAGGC---AAAGATAAAACCATT-CTATA---AAAGCGGTCGA-ATGTGTGCCGTGAATAATTATCGTCC----TATATCTATTTTGCCAACATTTTCAAA---ACGTTTAG---AAAAAA-ATAT-TCA-TACTAATTTGATGA-CATTTAT-GACTA-----A-TAA---AACTTATTGCATAAAACACAA--AGTGACTTTAGG--GAAGGTCATTTAAC-TG--A--ATATGCATTAATTA-GG-T--TGA-TTGATAAATGACTAATG-GCAATTAACGATTG---------CA-AGTT---AGTTGGGAC----TGT--CATTGTC---AATATTCGGAA-G---GCATTTGATCTCTTAA---GTCAT--A--CTATT------T-TA---CTAGCAAAA---CTAAA-ATG-----------CTATAA--AT-G-CAG--TG-ATCG---TTTTTTGAGGTGGATG-AAATCTTACCT-TA-CAAAC-AG--AGAT-C-----A-AAT
gi|148765 : CAATGTTGCCAAA-CTAGCATCCCCTGTTATATCTGAAAGTATTGTATTTATTGTGAATAAAAGTCT-GCGAGACTGAATATT--ACCACATA--TATG----GAAACAGGC---AAAGATAAAACCATT-CTATA---AAAGCGGCCGA-AATGATGACGTAAATAATTATCGCCC----TATATCTATTTTGCCAACATAATCAAA---ACTTATAG---AAAAAT-GTAT-TCA-TATTAATTTGATGG-CATTTAT-AAATA-----AATAT---AACTTATTGCATAAAACACAA--AGAAGTTTTA
gi|148766 : GTTGC--AAACTAGCATCCCCTGTTATATCTGAAAGTATCATGTTTATTGTGAATTAAAGTCT-GCGATATGGAATATT--TCCACATA--TATG----GAAACAGGC---AAAGATACAACCATT-CTATA---AAAGCGGCCGA-AAGGATGACGTAAATAATTATCGTCC----TATATCTATTTTGCCAACATTATTAA-----CTTATAG---AAAAAT-TTAT-TTA-TATTAATTTAATGA-AATTTAT-AAGTA-----AATAT---AACTTATTGCATAAAACACAA--AGTGGTTT-AGG--GAAGGTCAATCAAC-TG--A--ATCTGCATTAATTC-GT-A--TGA-TTGATAAATGGCTAACT-GCAATTAATGATGG---------CA-AGTT---TGTTGGGGC----TGT--CATGGTC---GATTTTCGGAA-G---GCCTTTGATCTCGTAA---GTCAT--A--CTATT------T-TA---CTAGCAAAA---CTAAA-GTG-----------CTATAA--AT-G-TAG--TG-ATCG---TTTTTTGATGTGGATG-AAATCTTACCT-TA-CAAAC-AG--AGGT-T-----A-AGTTG-TGT-CTATAAA-------TT---CAGCA-ACT---TCAA----AA----ACC-AA--TTG----TATAACATC-A-GGGGTTCCACAGGGTTCTA-T--T--TTAGGTCCATTGTTAT---TT--TTACTT---ATC-----ATA--AATGATTT-A-CCA-----T--TG-TTTA-T-AAATAAC-GT-TTCAACAACAAACTTATATGCAGATGAC------AC---AAC--GTTATATGAC-AT----ACAG-A-----C--------AAAT---A----CAGATATTTTAAAAG-GTAAC-----TTGCAAACTTCAAT-AAAT--CGTCT-T-AATATGTGGTGCATTCAAAATGGTATG--GTAT-TGAATACTGACAAAACAAAAGT---A-ATGTTAATCA-CTCTCGTCAGAAACGACAGC-GT-TTAAAT----CAAATCAATTTACAACTTACGTACGA----CAG-TA-CA-GA----A--TTAACT--ACAACA-AAAGGC-G----ATAAAATCCTTGGAATATTTATTGACGATTGCATGCT---ATTGAATAAACATTTACAATCTCTCTC
gi|148767 : TTGCTTATACTAGTTTCATACGTTTCATCTGAACGTATTATGTTTACTTTAATTAAAAGTCT-GCGAGATGGAATATT--TCCACATGCTTAT------AAACAGGC---AGAGATAAA--CATTTCTATA---AAAGCGATCGA-AGTGATGACATGAAGGCTTATCGTCT----TATATCTAGTTTGCCAACATTATCAAA---ACTTATAG---GAACAT-ATAT-TCA-TATTAATTTGATGA-CATTTAT-AACT------TGCGT---AA-TTA-TGCGTAAAACACAA--AGTGATGTTAGG--ACAGGTCATTTAAC-TG--A--ATCTGCATTAATTC-AT-A--GGA-TTCATAAATGATTAACG-GCATTTAACGACGG---------CA-AGAT---Aaaa
gi|148768 : TTATGTATA--ATAAATACAAGTTTAGCCAG-TGGAAGCTT--TCCATCCG--CATG----GAAACA--------------AAC-GTT-TTTTA---AGAGTGGAAGT-AAAGATAAAATAAACAACTGTCACCCCTGCTACCGCTATATTAACAACTTTATCGAA------TGTAGTTGAAGAA---TATCTCGGTTCTCATTTGAATT-CCTTCTT-CAACA-----ATCAT---TATATATTACATGAGTCTCAA--AGCGGATTTAGA--GAAGGTCATTCAACATA--ATTATCTGTTTTGTTT---T-A--TTACTTGATTAATGTCTGAGT-GCAATTAATGAGGGA--------CA-ATTTGTAAGATG--------TGT--TATGGTC---TATTTCAAGAA-GAAAAC----GATCAAGTAA---ATCAT--G--ATA----------TA---CTAATAAAAAATCTCAA-ACT-----------TTACAA--AT-G-TAG--CG-ATAA---ACTAGCAAAGTGG-TGTCAATCATACAT-TA-CCAAT-CGCTAG---C-----A-AGTTG-T
gi|148769 : TGTAATATTCCTCAAAATA--TATTTTTTGAAACAGAC---AAATATAAAACCATT-CTATA---AAAGCGATAGA-AAGGATGACGT------------------------CTATTTTGC-GACATTATCAAA---ATTTATAG---AAAAA---TAT-TCA-TATTAAATTGATGA-CATTTAT-GAATA-----AATA--------------ACAAAA----A--AGTGGTTTTATG--AAA--------------------TCTGCATTTATCC-GT-A--TAA-TTGATAAATGGCTAATG-GCAGTTAACGACGG---------C----------------------TGT--CATGGAC---GATTTT-AGAT-G---ACCTTTGATCTCGTTA----CCAT--A--TCATT------T-TA---CTAGCAAAA---CTAAA-ATG-----------ATATAA--AT-G-CAG--TG-ATCT---TATTTTGACGTGGTTG-AAATCTTACCT-CG-CAAAC-AG--AGTA-C-----A-AGTTG-TGT-C--TAAT-------TT---CAGCT-ACT---ACAG----GA----ACC-AA--TTG----TATAACATG-A-AGTGTTCCGCAGGGT--TA-T--TAATTAGGTTCATTGTTAG---TT--TTACTT---TTT-----ATA--A
gi|148770 : AAAAATGC---AAAAGTAA---C-TC-CTATACACAAAAAGGGAGATAAATCTGAGGCAACTAATTACAGACC----TATATCAGTACTACCAACATTGTCTAA---GTTAATTG---AAAAAC-ATATCTCC-CAACAACTTTATAAGTATTTGTCAGAT--------TTT---AACCTATTACATCCATCTCAA--TCTGGATTTAGGCCGAA--TCACTC--C-TGTCA--AACAGCACTAATAA-AT-A--TAA-CTGACAAATGGTTACAA-GAAATGAATGATGG---------AA-ACAT---AAATGGAGT----AGT---AT--TCTTGGATTTAAAAAA-A---GCTTTTGATGTTGTTG---ATCACAAA--CT-CT------TATG---CCA--AAAG---CTTAA----------------TATAT--ATGG-TTG--TA-CTCGAACTTCCCTGAAGTTGTTT-GAATCATATCT-TA-ATAAC-AG--AA---C-----ACAGCAG--G---TA-AAA-------GT---AGGAA-ATG---CCAAGTCTAA----ATC------TGCCCCTATTTC-TCAT-GGAGTTCCCCAAGGTTCAA-T--A--CTGGGTCCATTAC--T---TT--TCATTT---TAT-----ATATTAATGACCT-C-CCA-----T--TA-CATG-T-AAAAAACAGT----GA-AACTGATATGTATGCAGATGAC------TC---CAC--ATTCCAC-AC-TTCAGGAAAA-A-----CTGTTGGAGAAATTCAG----CAGAGA--TTACAAG-CCGAC-----TT---AACTTC----TA--------T-A-AATAAATGGTG--TTCAAGA-AATATGATGTATATTAATACAGAAAAAACTAAttccattaaattaaattcaattttataagcaaactatcagcaaacatatcaggttgaccatttataacgtt
gi|148771 : AGTC---AAA-ATCACACCAAT-TTTTA---AGAAAGGTTTA-AAACAAGACAAAAATAACTATCGCCC----AATTTCCATTCTTCCTATTCTGTCTAAGATACTTG-AG---AGACATGTTAG-TAA-TAGTG-TTCGGT---CTTTTTT-AAATA-----CATAC---AATTTATTGCATGAAAGACAATCAG-GG-TTCAGA--TCTGATCATTCATG-CG--A--AACAGCATTAA--CAGTGA--TGG-TTGATGACTGGATCACA-GCTATTGATCAAAA---------CA-GAAT---ATCTGGAACCATATTT--CTTGACC---TATCT----AA-A---GCATTTGATCTGGTTG---ATCAT--AGTTTAC---------TG---CTTGAAAAA---CTAAATGTATTCCATTT---CCATAAAGAT-G-TA--------CA---------AAATTGGTTT-AAATCCTATTTATG-TGAAC------GTT-CACAAAA-AGTT----T-CAATAGC-------T-----GGTACACTT--TCAG----AA----AGT-AA--ATC----AGTAACATG-T-GGTGTACCCCAAGGATCTG-T--T--TTAGGCCCACTTCTAT---TTA-TTA-TC---TTT-----ATC--AATGATAT-G-CCC-----T--TA-TGCACT-CAGTA------TTCAAAAATGAACATGTTTGCTGATGACTCCTCTAT---CAC--TTTATCTGGTAAT----TCAATAT----C--------AGAC---ATCACCGAATCTCTTAA-----TAA-------TG-AA---TTAAT-AAAT---GTC--C-AACA-ATGGTGTAATAATAATTGGATG--ACCA-TAAATACTTCAAAAACCAAAGC---A-ATGTTTATAGCCTCTCATCCAAAGCAACCACTAT-TCAGAT----CA----GATTAGC-ACTTA---AAAA----TAG-GA-GATGAGGCTA--TTGAAT---TTACA-AGTAGT-G----AAAAACTTCTGGGAGTAACAATTGACAA---CACACTAACATGGACTCAACA
gi|148772 : TTTAT-AAGTATCTGTAAGATTTTAACCTATTACATTTATCTCAA--TCTGCATTTAGGCCGAA--TCACTC--C-TGTCA--AACAGCACTAATAA-AT-A--TAA-TTGACAAATGG-TAACAAGAAATGAATGATGGAAACATAAACAGAGTT---A-CTGTAGT----TATTTCTTGG------ATTTATAAAA-A---GCTTTTGATGTTGTTG---ATCAC--A--A-ACTC-----T-TA----TGCCAAAAG--CTTAA----------------TATAC--AT-GGTTG--TG-CTCAAACTTCCCTGAAGTTGTTT-GAATCATATCT-AA-ATAAC-AG--AA---C-----ACAGTAG-------GTAAA-------AG---TAGGA-AAT---GCAA----AG----TCT-AAATCTGCCCCTATTTC-TC-ATGGAGTTCCCTAAGGTTCCA-T--A--CTGGGTCCATTAC--T---TT--TCATTT---TAT-----ATATTAATGATCT-C-CCA-----T--TA-CATG-T-AAAAAACAGT----GA-AACTGATATGTATGCAGATGAC------TC---CAC--ATTCCAC-AC--T----TCAG-G-----A--------AAA----A----C---TGTTTGAAAAATTTAGCAGAGATTACAAGC--CGACATAA---CTTCTATAAATAAATGGTG--TTCAAGA-AATATGATGTATATTAATACAGA-AAAAAATAAGT---GTATGACAATagttgaaaacactctaaaa
gi|148773 : aacATAT---ATCTTA--ACATCAGTCTCAA--CGTGGTTTTAGA--ATAAGTCATTCAAC-GG--A--ATCTTCTTTA--TT-AT-AATTGT-TTGATAAAGAGATAGAG-ACAACAGACGAAGG---------TC-AGTT---TGTAGGATA----TGT--TATGGTC---GATTTCAGAAA-A---GCATTCGATTAAGTAAAATGAAAT--A--CTATTAAAAGGT-TAAAGCTTTCCAAA----TGAA-GCG-------------ATGA--AT---TAAATTGTATCG---TATTTTGATG-----------CATACCT-TACCGAAC--G--CTCT-C-----A-AGTTGTTGA-C-ATAAA-------TT------GG-ACTATGTCAG----AA----CAA-AA--GTC----CATCGCGTG-T-TGCGTTCCACACTGCTCCAGC--C--TTGGGCTTGTT-TTGT---GT--TAATCA---TTT-----ATA--AACAACTTAA-CCA-----TGACGCTTTC-T-AAA-ATT-GT-CTCAGGTACTGATTTATATGCAGATGAT------ACTATAATTGATTATTTTAA-AT----CTGA-A-----A--------AAAA---A----AGGAAATCTTGAACG-A-AAT-----GTTCAGTGTTCACT-AAATTATATTT-T-AA-AT-TGATGTAAATAGAACGAAATG--CTTT-TAAACACTGCCAAAACAAAAGTCTCA-ATGT
gi|148774 : ---GATTTTTAAAACA---GTCTTTGATCTAGTTA---GCCAT--G--AAACT------C-TT---CCTGCAAAA---CTAAA-ATGTAACAGTTTTTCGACAA--AT-G-TA--------C----TTTTGTAAAGT---TT-AGTTCTTATCT-----AAATGAA--AGAG-C-----A-AATTG--GTACTATAAAAATTATATT---CA--A-ACT---CCAA-----------TCGAA--TTG-------AAAGT----GGTGTACCTCAAGGATCTA-TA-C--TTGGG-CCAATGTTAT---TCA-TTA-TG---TTT-----GTA--AATGATTT-G-CCA-----C--TT-TATG-T-CAATAAT-GC-T
gi|148775 : AA-A---GCCTTTGATTTAGTTA---ATCAC--G--ACATT------C-TT---CTTGCAAAA---CTAAA-ATG-----------TTACAA--TT-T-CAA--AA-AATG---CACTTTGAAGTGGTTA-AGTTCTTATCT-----AAAT-GA--AAGTGC-----A-AATTG--GT--TCTAAG-------TTATATAATA-TAT---TTAA----AA----TCC-AA--TCT----AATTAGAAG-T-GGGGTACCTCAAGGATCTA-TA-C--ATGGG-CCATTGTTATAAATTCATTA-TA---TTT-----GTA--AATGATCT-G-TCA-----C--T
gi|148776 : -------TT---CAGAA-A-T---ACAA----GA----AAC-AA--CTG------------C-C-GGAGTTCCCCAAGGTTTAA-T--T--CTGGGTCCTTTATTCT---TT--TTAATT---TAC-----ATA--AATGATAT-AGCTAAAAATT--TG-T----T-AAGTA----T-T---AC-AC--ACATATTTGCAGATGAT------AT---A
gi|148777 : aaagcatttgatcgcatgtagttaaaaggtcttctgttcaaagtaaagcaaaatggtataaaaggtaatcttcttaattgattgaacaaagagtttttatagttattacttttT---TCAA----AATCCAACCTAA--TT-----TATAAGAG--T-GGGGTACCTCAAGGATCTG-TCCT--TTGG--CCATTGTTAT---TTA-TTA-TG---TTT-----GTA--AATGATTT-G-CCA-----C--TT-TATG-T-CAATAAC-GC-T--AAC-ACTGATAAATTTGCAGATG
gi|148778 : C-AA--ATC----TACAACAGC-T-GGTGTTCCACAGGGCTCTG-T--T--CTAGGTC---TGCTAT---TT--TTCCTTGTTTTT-----GTT--AATGAT-------A-----T--TG-T
gi|148779 : C-T-GGTGTTCCTCAAGGCTCAA-T--T--CTTGGTCCATTATTAT---TT--CTTGTT---TAT-----ATC--AATGAT-------A-----T--TG-TTTC-TGAAATA---GG-CTCTGCGATTCGCTTCTTTGCTGACGAC------AC---AAC--CCTTTATG
gi|148780 : aatatcgg-GGTGTTCAACAAGGTTCTG-T--T--TTAGGTCCTTTATT-T---TT--TTATTT---TTTTTTACATT--AATGATAT-A------------------G-C-AGAGAAC-GTATTGCACAA--AACTT---TCCGAATGAT------------AC--GTCACATG-C-TT----ATTA-A-----C--------AAAT---T----CAGA
gi|148781 : A--GATGATTT-A-CTA-----T--T----------ACTAAC-GT-TTCAACAACTGA--TATATGCAGACGAC------AC---AAC--GTTATATTAC-AT----ACAA-A-----C--------AATT---A----TAGATTTTTTTAAAA-GTAAC-----ATGCAAACTTCAAT-TAAT--CGTCT-T-AATATGTGGTGCATTTAAAATAGTATG--GTAT-TTAATACTGACACAACCAAAGT---A-ATGTCAATCAACTCTCGACAGAAACGAAAGC-GT-TGCAAT----TGTATTGATTTACAACTTACGTACAG----CTG-TATTT-TA----A--TTAGCT--GCTACA-ACATGC-A----ATAAAATCCTTGGAATATTTTATGACAATTGCAATCT---ATGAAATAAACATTTATTATCTCTCTC
gi|148782 : ATGAT------AC---TAC--CTTATCTAAA-AT----AGGA-GAATCTC--------AAA----A----T-GATATTC---AAA-TTAAA-----TTACAAAATTCTCT-AAAT--GATCT-G-CAAACTTGGTGCAAGCATAATGGCATG--CTTA-TAAATTCTGCAAAAACCAAAGT---G-ATGTTAATAACAACTCAT--GAAATGACAGC-ACATTAAATTTTGCAAATTGATTTTCAGCTAAACTATAA----TGA-TG-CA-AAT---C--TTGCCTTAATATCA-AA---T-G----ACAAAATAATTGGGATcaa
gi|148783 : GATGG-CATTTAT-AAATA-----AATAT---AACTTATTGCATAAAACACAA--AGAAGTTTTA
gi|148783 : T--AAAACACAAAGAA-GTTTTATAAAATCCTTGGAATATTTATTGACGATTGCATGCT---ATGGAATAAACATTTACAATCTCTCTCtaaaatccttggaatatttattgacgattgcatgctatggaataaacatttacaatctctctcaaa
gi|148784 : gatggcatttataaataaatataacttattgcaAT----GAAATC---TTAC--CTTACAAACAGAGATCAAATA-CA-GA----A--TAGACT--ACTACA-ACAGGC-G----ATAAAATCCTTGGAAAATTTATTGAAGATTGCATGCT---ATGGAATAAACATTTACAATCTCTCTaaa
gi|148785 : ACG-ACGG----CAA-GA-TA-AA----AGTTCAATT--ACAATA----GGC-G----ATAAAATCCTTGAAATATTTATTGATGATTGCATACT---ATGAAA-AAACAATAACAATCTCTCTacaaa
Alignments
lowQualScore : 11111 111111111 111111 222222222222 1111 111 11111 111111111111 11111111 111 11 11111111111111 11 1111
lowQualScore : 0 0 4 55 55 00000 555 3 555 3 7777 555 555 99 3 33 2 77777 444 33 0 88 2 0 3 88 44 55 3 44 3 0 3 1 555555555 3 555 9999999 44 555 55 0 44444 2 0 33 444 33 9999 0 333333 2 444 777 55 444444444444 33 2 2 444 2 0000 1 2 2 0 0 5555 22 33 222 66666 8 11111 2 555 44 55 1 3 33 555 6666 444444444444 2 33 00000000 444 000 1 1 2 66666 2 1 444 00 8 444 55555 66 4 22 33 33 6666 33 2 444 2 5 555 11 2 0 888888 6666 44 2 3 7777 3 77777777777777 999999999 1 44 99999 1 1 44 555 444 22 2 1 00 7 1 1 777 4 5 5 9999 4 1 2 8888 4 4 4 2222 55 55 3 3 7777 777
lowQualScore : . . . .. .. ..... ... . ... . .... ... ... .. . .. . ..... ... .. . .. . . . .. .. .. . .. . . . . ......... . ... ....... .. ... .. . ..... . . .. ... .. .... . ...... . ... ... .. ............ .. . . ... . .... . . . . . .... .. .. ... ..... . ..... . ... .. .. . . .. ... .... ............ . .. ........ ... ... . . . ..... . . ... .. . ... ..... .. . .. .. .. .... .. . ... . . ... .. . . ...... .... .. . . .... . .............. ......... . .. ..... . . .. ... ... .. . . .. . . . ... . . . .... . . . .... . . . .... .. .. . . .... ...
lowQualScore : 5 1 4 55 55 11111 888 6 888 3 1111 888 888 11 3 99 9 11111 777 77 5 55 8 4 1 55 22 88 1 22 1 2 1 1 444444444 1 444 9999999 66 444 11 7 88888 1 5 77 777 77 3333 8 000000 7 777 333 77 555555555555 77 7 7 111 7 9999 0 9 1 9 5 0000 88 77 333 77777 0 00000 4 444 22 11 0 1 77 000 1111 444444444444 7 77 55555555 666 777 0 0 4 22222 4 4 111 33 5 111 99999 11 0 55 22 22 0000 00 7 777 5 3 555 66 0 1 222222 5555 22 8 3 1111 3 99999999999999 999999999 7 22 11111 4 4 11 555 222 77 0 3 00 3 2 4 000 0 0 0 4444 4 9 4 5555 0 0 0 5555 55 00 6 6 7777 000
consensus : CAAGGTTGCTAAAACTAGCATCCCCTGTTATATCTGAAAGTATTATGTTTATTGTGAATAAAAGTCT-GCGAGATGGAATATT--TCCACATA--TATG----GAAACAGGC---AAAGATAAAACCATT-CTATA---AAAGCGGCCGA-AAGGATGACGTAAATAATTATCGTCC----TATATCTATTTTGCCAACATTATCAAA---ACTTATAG---AAAAAT-NTAT-TCATATTAATTTGATGA-CATTTAT-AAATA-----AATAT---AACTTATTGCATAAAACACAA--AGTGGTTTTAGG--GAAGGTCATTCAAC-TG--A--ATCTGCATTAATTC-GT-A--TGA-TTGATAAATGGCTAACG-GCAATTAACGATGG---------CA-AGTT---AGTTGGGGC----TGT--CATGGTC---GATTTTCGGAA-G---GCCTTTGATCTCGTN-A---GTCAT--A----CTACT------T-TA---CTAGCAAAA---CTAAA-GTG-----------CTATAA--AT-G-TAG--TG-ATCG---TTTTTTGANGTGGNTGAAATCTTACCT-TA-CAAAC-AG--AGNT-C-----A-AGTTG-TGT-CTA---TAAA--TTCAGNA-AC-T---TCAA----AA----A------CC-AA--TTG----T--AT--AACATCN-GGNGTTCCNCAGGGTTCTA-T--T--T-TGGGTCCATTGTTAT---TT--TTACTT---TTT-----ATA--AATGATTT-ACC--AT--TG-TTTG-T-A---AATAAC-GT-TTCAACAACTGACTTATATGCAGATGAC------AC---AAC--GTTATATGAC-AT----ACAA-A-----C--------AAAT---A----CAGATATTTTAAAAG-GTAAC-----TTGCAAACTTCAAT-TAAT--CGTCT-T-AATATGTGGTGCATTCAAAATGGTATG--GTAT-TGAATACTGACAAAACAAAAGT---A-ATGTTAATCACCTCTCGTCAGAAACGACAGC-AT-TTAAAT----CAAATCGATTTACAACTTACGTACAA----CAG-TA-CA-GA----A--TTAACT--ACAACA-AAAGGC-G----ATAAAATCCTTGGAATATTTATTGACGATTGCATGCT---ATGGAATAAACATTTACAATCTCTCTC
Reference ( family-701 ) : CAAGGTTGCTAAAACTAGCATCCCCTGTTATATCTGAAAGTATTATGTTTATTGTGAATAAAAGTCT-GCGAGATGGAATATT--TCCACATA--TATG----GAAACAGGC---AAAGATAAAACCATT-CTATA---AAAGCGGCCGA-AAGGATGACGTAAATAATTATCGTCC----TATATCTATTTTGCCAACATTATCAAA---ACTTATAG---AAAAAT-TTAT-TCATATTAATTTGATGA-CATTTAT-AAATA-----AATAT---AACTTATTGCATAAAACACAA--AGTGGTTTTAGG--GAAGGTCATTCAAC-TG--A--ATCTGCATTAATTC-GT-A--TGA-TTGATAAATGGCTAACG-GCAATTAACGATGG---------CA-AGTT---AGTTGGGGC----TGT--CATGGTC---GATTTTCGGAA-G---GCCTTTGATCTCGTN-A---GTCAT--A----CTACT------T-TA---CTAGCAAAA---CTAAA-GTG-----------CTATAA--AT-G-TAG--TG-ATCG---TTTTTTGANGTGGNTGAAATCTTACCT-TA-CAAAC-AG--AGGT-C-----A-AGTTG-TGT-CTA---TAAA--TTCAGNA-AC-T---TCAA----AA----A------CC-AA--TTG----T--AT--AACATCN-GGNGTTCCNCAGGGTTCTA-T--T--T-TGGGTCCATTGTTAT---TT--TTACTT---TTT-----ATA--AATGATTT-ACC--AT--TG-TTTG-T-A---AATAAC-GT-TTCAACAACTGACTTATATGCAGATGAC------AC---AAC--GTTATATGAC-AT----ACAA-A-----C--------AAAT---A----CAGATATTTTAAAAG-GTAAC-----TTGCAAACTTCAAT-TAAT--CGTCT-T-AATATGTGGTGCATTCAAAATGGTATG--GTAT-TGAATACTGACAAAACAAAAGT---A-ATGTTAATCACCTCTCGTCAGAAACGACAGC-AT-TTAAAT----CAAATCGATTTACAACTTACGTACAA----CAG-TA-CA-GA----A--TTAACT--ACAACA-AAAGGC-G----ATAAAATCCTTGGAATATTTATTGACGATTGCATGCT---ATGGAATAAACATTTACAATCTCTCTC
gi|148760 : CAAGGTTGCTAAAACTAGCATCCCCTGTTATATCTGAAAGTATTATGTTTATTGTGAATAAAAGTCT-GCGAGATGGAATATT--TCCACATA--TATG----GAAACAGGC---AAAGATAAAACCATT-CTATA---AAAGCGGCCGA-AAGGATGACGTAAATAATTATCGTCC----TATATCTATTTTGCCAACATTATCAAA---ACTTATAG---AAAAAA-TTAT-TCATATTAATTTAATGA-AATTTAT-AAATA-----AATAT---AACTTATTGCATAAAACACAA--AGTGGTTTTAGG--GAAGGTCATTCAAC-TG--A--ATCTGCATTAATTC-GT-A--TGA-TTGATAAATGGCTAACG-GCAATTAATGATGG---------CA-AGTT---AGTTGGGGC----TGT--CATGGTC---GATTTTCGGAA-G---GCCTTTGATCTCGTA-A---GTCAT--A----CTACT------T-TA---CTAGCAAAA---CTAAA-GTG-----------CTATAA--AT-G-TAG--TG-ATCG---TTTTTTGATGTTGATGAAATCTTACCT-TA-CAAAC-AG--AGGT-C-----A-AGTTG-TGT-CTA---TAAA--TTCAGAA-AC-T---TAAA----AA----A------AC-AA--TTG----T--AT--AACATCA-GGGGTTCCACAGGGTTCTA-T--T--T-TAGGTCCATTGTTAT---TT--TTACTT---TTT-----ATA--AATGATTT-ACC--AT--TG-TTTA-T-A---AATAAC-GT-TTCAACAACTGACTTATATGCAAATGAC------AC---AAC--GTTATATGAC-AT----ACAA-A-----C--------AAAT---A----CAGATATTTTAAAAG-GTAAC-----TTGCAAACTTCCAT-TAAT--CGTCT-T-AATATGTGGTGCATTCAAAATGGTATG--GTAT-TGAATACTGACAAAACAAAAGT---A-ATGTTAATCACCTCTCGTCAGAAACGATAGC-AT-TTAAAT----CAAATCAATTTACAACTTACGTACAA----CAG-TA-CA-GA----A--TTAACT--ACAACA-AAAGGC-G----ATAAAATCCTTGGAATATTTATTGACGATTGCATGCT---ATGGAATCAACATTTACAATCTCTCTC
gi|148761 : CAAGGTTGCTAAAACTAGCATCCCCTGTTATATCTGAAAGTATTATGTTTATTGTGAATAAAAGTTT-GCGAGATGGAATATT--TCCACATA--TATA----AAAGC-GGCCGAAAGGATGA
gi|148761 : TATA---AAAGCGGCCGA-AAGGATGACGTAAATAATTATCGTCC----TATATCTATTTTGCCAACATTATCAAA---ACTTATAG---AAAAAT-TTAT-TCATATTAATTTAATGA-AATTTAT-AAATA-----AATAT---AACTTATTGCATATAACACAA--AGTGGTTTTAGG--GAAGGTCATTCAAC-TG--A--ATCTGCATTAATTC-GT-A--TGA-TTGATAAATGGCTAACG-GCAATTAATGATGG---------CA-AGTT---AGTTGGAGC----TGT--CATGGTC---GATTTTCGGAA-G---GCCTTTGATCTCGTA-A---GTCAT--A----CTACT------T-TA---CTAGCAAAA---CTAAA-GTG-----------CTATAA--AT-G-TAG--TG-ATCG---TTTTTTGATGTGGATGAAATCTTACCT-TA-CAAAC-AG--AGGT-C-----A-AGTTG-TGT-CTA---TAAA--TTCAGCA-AC-T---TCAA----AA----A------CC-AA--TTG----T--AT--AACATCA-GGGGTTCCACAGGGTTCTA-T--T--T-TAGGGTCATTGTTAT---TT--TTAC-T---TTT-----ATA--AATGATTT-ACC--AT--TG-TTTA-C-A---AATAAC-GT-TTCAACAACTGACTTATATGCAGATGAC------AC---AAC--GTTATATGAC-AT----ACAA-A-----C--------AAAT---A----CAGATATTTTAAAAG-GTAAC-----TTGCAAACTTCAAT-TAAT--CGTCT-T-AATATGTGGTGCATTCAAAATGGTATG--GTAT-TGAATACTGACAAAACAAAAGT---A-ATGTTAAACACCTCTCGTCAGAAACGACAGC-AT-TTAAAT----CAAATCAATTTACAACTTACGTACAA----CAA-TA-CA-GA----A--TTATCT--ACAACA-AAAGGC-G----ATAAAATCCTTGGAATATTTATTGACGATTGCATGCT---ATGGAATTAACATTTACAATCTCTCTCcgtaaataattatcgtcctatatctattttgccaacattatcaaaacttatagaaaaatttattcatattaatttaatgaaatttataaataaatataacttattgcatataacacaaagtggttttagggaaggtcattcaactgaatctgcattaattcgtatgattgataaatggctaacggcaattaatgatggcaagttagttggagctgtcatggtcgattttcggaaggcctttgatctcgtaagtcatactactttactagcaaaactaaagtgctataaatgtagtgatcgttttttgatgtggatgaaatcttaccttacaaacagaggtcaagttgtgtctataaattcagcaacttcaaaaaccaattgtataacatcaggggttccacagggttctattttagggtcattgttatttttacttttataaatgatttaccattgtttacaaataacgtttcaacaactgacttatatgcagatgacacaacgttatatgacatacaaacaaatacagatattttaaaaggtaacttgcaaacttcaattaatcgtcttaatatgtggtgcattcaaaatggtatggtattgaatactgacaaaacaaaagtaatgttaaacacctctcgtcagaaacgacagcatttaaatcaaatcaatttacaacttacgtacaacaatacagaattatctacaacaaaaggcgataaaatccttggaatatttattgacgattgcatgctatggaattaacatttacaatctctctcaaa
gi|148762 : caaggttgctaaaactagcatcccctgttatatctgaaagtattatgtttattgtgaataaaagtttgcgagatggaatatttccacataCAAGGTTGCTTAAACACGCATCCCCTATTTTATCTGAAAGTATTATGTTTATTGTGAATAAAAATCT-GCGAGATGGAATATT--TCCACATA--TATG----GAAACAGGC---AAAGATAAAACCATT-CTATA---AAAGCGACCGA-AAGGATGACGTAAATAATTATAGTCC----TATTTCTATTTTGCCAACATTATCAAA---ACTTACAG---AAAAAC-TTAT-TCATATTAATTTAATGA-AATTAAT-AAATA-----AATAT---AACTTATTGCATAAAACACAA--AGTAGTTTTATG--GAAGTTCATTCAAC-TG--A--ATCTGCATTAATTC-GT-A--TGA-CTGATAAATGGCTAACG-GCAATTAATGATGG---------CA-AGCT---AGTTGGGGC----TGT--CATGGTC---GATTTTCGGAA-G---GCCTTTGATCTCGTA-A---GTCAT--A----CTATT------T-TA---CTAGCAAAA---CTAAA-GTG-----------CTATAA--AT-G-TAG--TG-ATCG---TTTTTTGATTTGGATGAAATCTGACCT-TA-CAAAC-AG--AGGT-C-----A-AGTTG-TGT-CTA---TAAA--TTCAGCA-AC-T---TCAA----AA----A------TC-AA--TTG----T--AT--AACATCC-GGGGTTCCACAGGGTTCAA-G--T--T-TAGGTCCATTGTTAT---TT--TAACTT---TTC-----ATA--AATGATTT-ACC--AT--TG-TTTA-T-A---AATTAC-GT-TACAACAACTGACTTAAATGCAGATGAC------AC---AAC--GTTATATGAC-AT----ACAA-A-----C--------AAAT---A----TAGATATTTTAAAAG-GTAAC-----TTGCAAA-TTCAAT-TAAT--CGTCT-T-AATATGTGGTGCATTCAAATTGGTATG--GTAT-TGAATACTGACAAATCAAAAGT---A-ATGTTAATCACCTCTCGTCAGAAACGACAGC-AT-TTAAAT----CAAATCAATTTACAACATACGCACAA----CAG-TA-CA-GA----A--TTAACT--ACAACA-AAAGGC-G----ATAAAATCCTTGGAATATTTATTGATGATTGCATGCT---ATGGAATAAATATTTACAATCTCTCTCaaa
gi|148763 : CAAGGTTTCTAAAACTAGCATCCCCTGTTATATCTGAAAGTATTATGTTTATTGTGAACAAAATTCT-GCGAGATGGAATATT--TCATCATA--TATG----GAAACAGGC---AACGATAAAAACATT-CTATA---AAAGCGGCCGA-AAGGATGACGTAAATAATTATCGTCC----TATATGTATTTTGCCAACATTATCAAA---ACTTATAG---AATTTT-TTAT-TCATATTAATTAAATGA-AATTTAT-AAATA-----AATAG---AACTTATTGCATAAAACACAA--AGTGGTTTTAGA--GAAGGTCGTTCAAT-TG--A--ATCTGCATTAATTG-GT-A--TGG-TTGATAAACGGCTAACG-GCAATTAATGATGG---------CA-AGTT---AGTTGGG-C----TGT--CATGGTC---GATTTTCG-AA-G---GTCTTTGATCTCGTA-A---GTCAT--A----CTATT------T-TA---CTAGCAAAA---CTTAA-GTG-----------CTATTA--AT-G-TAT--TG-ATCG---TTGTTTTATGTGGATAAACTATT--TT-TA-CAAAC-AG--AGTT-C-----A-AGTTG-AGT-CTA---TAAA--TTCAGCA-AC-T---TCAA----AA----A------AC-AA--TTG----T--AT--AACATCA-GGGGTTCCACAGGGTTCTA-T--T--T-TAGGTCCATTGTTAT---TT--TTACTT---TTC-----ATA--AATAATTT-ACC--AT--TG-TTTA-T-G---AATAAC-AT-TTCAACAACTGACTTATATGCAGATGAC------AC---AAC--GTTATATGAC-AT----ACAA-A-----C--------GAAT---A----CAGATATTTTAAAAG-GTAAC-----TTGCTAACTTAAAT-TAAT--CGTCT-T-AATATGTGGTGCATTCAAAATGGTATG--GTAT-TGAATACTAACAAAACAAAAGT---A-ATATTAACCACCTTTCGTCAGAAACGACAGC-AT-TTAAAT----CAAATCATTTTACAAATTACGTACAA----CAG-TA-CA-GA----A--TTAACT--ACAACA-AAATGCAA----AAAAAAGTCTTGGAATATTTATTGACGATTGCATGCT---ACGGAATAAAAA--TA-AATCTCaaa
gi|148764 : CAAGGTTGCTAAAACTAGCATCCCCTGTTATATCTGAA-GTATTATGTTTATTGTGAATAAAAGTCT-GCAAGATGGATTATT--TCCACATA--TATT----GGAACAGGC---AAAGATAAAACCATT-CTATA---AAAGCGGTCGA-ATGTGTGCCGTGAATAATTATCGTCC----TATATCTATTTTGCCAACATTTTCAAA---ACGTTTAG---AAAAAA-ATAT-TCATACTAATTTGATGA-CATTTAT-GACTA-----A-TAA---AACTTATTGCATAAAACACAA--AGTGACTTTAGG--GAAGGTCATTTAAC-TG--A--ATATGCATTAATTA-GG-T--TGA-TTGATAAATGACTAATG-GCAATTAACGATTG---------CA-AGTT---AGTTGGGAC----TGT--CATTGTC---AATATTCGGAA-G---GCATTTGATCTCTTA-A---GTCAT--A----CTATT------T-TA---CTAGCAAAA---CTAAA-ATG-----------CTATAA--AT-G-CAG--TG-ATCG---TTTTTTGAGGTGGATGAAATCTTACCT-TA-CAAAC-AG--AGAT-C-----A-AAT
gi|148765 : CAATGTTGCCAAA-CTAGCATCCCCTGTTATATCTGAAAGTATTGTATTTATTGTGAATAAAAGTCT-GCGAGACTGAATATT--ACCACATA--TATG----GAAACAGGC---AAAGATAAAACCATT-CTATA---AAAGCGGCCGA-AATGATGACGTAAATAATTATCGCCC----TATATCTATTTTGCCAACATAATCAAA---ACTTATAG---AAAAAT-GTAT-TCATATTAATTTGATGG-CATTTAT-AAATA-----AATAT---AACTTATTGCATAAAACACAA--AGAAGTTTTA
gi|148766 : GTTGC--AAACTAGCATCCCCTGTTATATCTGAAAGTATCATGTTTATTGTGAATTAAAGTCT-GCGATATGGAATATT--TCCACATA--TATG----GAAACAGGC---AAAGATACAACCATT-CTATA---AAAGCGGCCGA-AAGGATGACGTAAATAATTATCGTCC----TATATCTATTTTGCCAACATTATTAA-----CTTATAG---AAAAAT-TTAT-TTATATTAATTTAATGA-AATTTAT-AAGTA-----AATAT---AACTTATTGCATAAAACACAA--AGTGGTTT-AGG--GAAGGTCAATCAAC-TG--A--ATCTGCATTAATTC-GT-A--TGA-TTGATAAATGGCTAACT-GCAATTAATGATGG---------CA-AGTT---TGTTGGGGC----TGT--CATGGTC---GATTTTCGGAA-G---GCCTTTGATCTCGTA-A---GTCAT--A----CTATT------T-TA---CTAGCAAAA---CTAAA-GTG-----------CTATAA--AT-G-TAG--TG-ATCG---TTTTTTGATGTGGATGAAATCTTACCT-TA-CAAAC-AG--AGGT-T-----A-AGTTG-TGT-CTA---TAAA--TTCAGCA-AC-T---TCAA----AA----A------CC-AA--TTG----T--AT--AACATCA-GGGGTTCCACAGGGTTCTA-T--T--T-TAGGTCCATTGTTAT---TT--TTACTT---ATC-----ATA--AATGATTT-ACC--AT--TG-TTTA-T-A---AATAAC-GT-TTCAACAACAAACTTATATGCAGATGAC------AC---AAC--GTTATATGAC-AT----ACAG-A-----C--------AAAT---A----CAGATATTTTAAAAG-GTAAC-----TTGCAAACTTCAAT-AAAT--CGTCT-T-AATATGTGGTGCATTCAAAATGGTATG--GTAT-TGAATACTGACAAAACAAAAGT---A-ATGTTAATCA-CTCTCGTCAGAAACGACAGC-GT-TTAAAT----CAAATCAATTTACAACTTACGTACGA----CAG-TA-CA-GA----A--TTAACT--ACAACA-AAAGGC-G----ATAAAATCCTTGGAATATTTATTGACGATTGCATGCT---ATTGAATAAACATTTACAATCTCTCTC
gi|148767 : TTGCTTATACTAGTTTCATACGTTTCATCTGAACGTATTATGTTTACTTTAATTAAAAGTCT-GCGAGATGGAATATT--TCCACATGCTTAT------AAACAGGC---AGAGATAAA--CATTTCTATA---AAAGCGATCGA-AGTGATGACATGAAGGCTTATCGTCT----TATATCTAGTTTGCCAACATTATCAAA---ACTTATAG---GAACAT-ATAT-TCATATTAATTTGATGA-CATTTAT-AACT------TGCGT---AA-TTA-TGCGTAAAACACAA--AGTGATGTTAGG--ACAGGTCATTTAAC-TG--A--ATCTGCATTAATTC-AT-A--GGA-TTCATAAATGATTAACG-GCATTTAACGACGG---------CA-AGAT---Aaaa
gi|148768 : TTATGTATA--ATAAATACAAGTTTAGCCAG-TGGAAGCTT--TCCATCCG--CATG----GAAACA--------------AAC-GTT-TTTTA---AGAGTGGAAGT-AAAGATAAAATAAACAACTGTCACCCCTGCTACCGCTATATTAACAACTTTATCGAA------TGTAGTTGAAGAAT-ATCT-CGGTTCTCATTTGAATT-CCTTCTT-CAACA-----ATCAT---TATATATTACATGAGTCTCAA--AGCGGATTTAGA--GAAGGTCATTCAACATA--ATTATCTGTTTTGTTT---T-A--TTACTTGATTAATGTCTGAGT-GCAATTAATGAGGGA--------CA-ATTTGTAAGATG--------TGT--TATGGTC---TATTTCAAGAA-GAAAAC----GATCAAGTA-A---ATCAT--G----ATA----------TA---CTAATAAAAAATCTCAA-ACT-----------TTACAA--AT-G-TAG--CG-ATAA---ACTAGCAAAGTGGTGTCAATCATACAT-TA-CCAAT-CGCTAG---C-----A-AGTTG-T
gi|148769 : TGTAATATTCCTCAAAATA--TATTTTTTGAAACAGAC---AAATATAAAACCATT-CTATA---AAAGCGATAGA-AAGGATGACGT------------------------CTATTTTGC-GACATTATCAAA---ATTTATAG---AAAAAT---AT-TCATATTAAATTGATGA-CATTTAT-GAATA-----AATA--------------ACAAAA----A--AGTGGTTTTATG--AAA--------------------TCTGCATTTATCC-GT-A--TAA-TTGATAAATGGCTAATG-GCAGTTAACGACGG---------C----------------------TGT--CATGGAC---GATTTT-AGAT-G---ACCTTTGATCTCGTT-A----CCAT--A----TCATT------T-TA---CTAGCAAAA---CTAAA-ATG-----------ATATAA--AT-G-CAG--TG-ATCT---TATTTTGACGTGGTTGAAATCTTACCT-CG-CAAAC-AG--AGTA-C-----A-AGTTG-TGT-C-----TAAT--TTCAGCT-AC-T---ACAG----GA----A------CC-AA--TTG----T--AT--AACATGA-AGTGTTCCGCAGGGT--TA-T--TAAT-TAGGTTCATTGTTAG---TT--TTACTT---TTT-----ATA--A
gi|148770 : AAAAATGC---AAAAGTAA---C-TC-CTATACACAAAAAGGGAGATAAATCTGAGGCAACTAATTACAGACC----TATATCAGTACTACCAACATTGTCTAA---GTTAATTG---AAAAAC-ATATCTCCCAACAACTTTATAAGTATTTGTCAGAT--------TTT---AACCTATTACATCCATCTCAA--TCTGGATTTAGGCCGAA--TCACTC--C-TGTCA--AACAGCACTAATAA-AT-A--TAA-CTGACAAATGGTTACAA-GAAATGAATGATGG---------AA-ACAT---AAATGGAGT----AGT---AT--TCTTGGATTTAAAAAA-A---GCTTTTGATGTTGTT-G---ATCACAAA----CT-CT------TATG---CCA--AAAG---CTTAA----------------TATAT--ATGG-TTG--TA-CTCGAACTTCCCTGAAGTTGTTTGAATCATATCT-TA-ATAAC-AG--AA---C-----ACAGCAG--G---TA----AAA--GTAGGAA-AT-G---CCAAGTCTAA----ATCTGCCCC-TA--TT-----T--CT----CAT---GGAGTTCCCCAAGGTTCAA-T--A--C-TGGGTCCATTAC--T---TT--TCATTT---TAT-----ATATTAATGACCT-CCC--AT--TA-CATG-T-A---AAAAACAGT----GA-AACTGATATGTATGCAGATGAC------TC---CAC--ATTCCAC-AC-TTCAGGAAAA-A-----CTGTTGGAGAAATTCAG----CAGAGA--TTACAAG-CCGAC-----TT---AACTTC----TA--------T-A-AATAAATGGTG--TTCAAGA-AATATGATGTATATTAATACAGAAAAAACTAAttccattaaattaaattcaattttataagcaaactatcagcaaacatatcaggttgaccatttataacgtt
gi|148771 : AGTC---AAA-ATCACACCAAT-TTTTA---AGAAAGGTTTA-AAACAAGACAAAAATAACTATCGCCC----AATTTCCATTCTTCCTATTCTGTCTAAGATACTTG-AG---AGACATGTTAG-TAATAGTG-TTCGGT---CTTTTTT-AAATA-----CATAC---AATTTATTGCATGAAAGACAATCAG-GG-TTCAGA--TCTGATCATTCATG-CG--A--AACAGCATTAA--CAGTGA--TGG-TTGATGACTGGATCACA-GCTATTGATCAAAA---------CA-GAAT---ATCTGGAACCATATTT--CTTGACC---TATCT----AA-A---GCATTTGATCTGGTT-G---ATCAT--AGT--TTAC---------TG---CTTGAAAAA---CTAAATGTATTCCATTT---CCATAAAGAT-G-TA--------CA---------AAATTGGTTTAAATCCTATTTATG-TGAAC------GTT-CACAAAA-AGTT----T-CAA---TAGC--T--GGTACACTT---TCAG----AA----A------GT-AA--ATC----A--GT--AACATGT-GGTGTACCCCAAGGATCTG-T--T--T-TAGGCCCACTTCTAT---TTA-TTA-TC---TTT-----ATC--AATGATAT-GCC--CT--TA---TG-C-ACTCAGTA------TTCAAAAATGAACATGTTTGCTGATGACTCCTCTAT---CAC--TTTATCTGGTAAT----TCAATAT----C--------AGAC---ATCACCGAATCTCTTAA-----TAA-------TG-AA---TTAAT-AAAT---GTC--C-AACA-ATGGTGTAATAATAATTGGATG--ACCA-TAAATACTTCAAAAACCAAAGC---A-ATGTTTATAGCCTCTCATCCAAAGCAACCACTAT-TCAGAT----CA----GATTAGC-ACTTA---AAAA----TAG-GA-GATGAGGCTA--TTGAAT---TTACA-AGTAGT-G----AAAAACTTCTGGGAGTAACAATTGACAA---CACACTAACATGGACTCAACA
gi|148772 : TTTAT-AAGTATCTGTAAGATTTTAACCTATTACATTTATCTCAA--TCTGCATTTAGGCCGAA--TCACTC--C-TGTCA--AACAGCACTAATAA-AT-A--TAA-TTGACAAATGG-TAACAAGAAATGAATGATGGAAACATAAACAGAGTT---A-CTGTAGT----TATTTCTTGG------ATTTATAAAA-A---GCTTTTGATGTTGTT-G---ATCAC--A----A-ACTC-----T-TA----TGCCAAAAG--CTTAA----------------TATAC--AT-GGTTG--TG-CTCAAACTTCCCTGAAGTTGTTTGAATCATATCT-AA-ATAAC-AG--AA---C-----ACAGTAG-------G---TAAA--AGTAGGA-AA-T---GCAA----AG----T------CT-AAATCTGCCCCT--AT--TTC-TCATGGAGTTCCCTAAGGTTCCA-T--A--C-TGGGTCCATTAC--T---TT--TCATTT---TAT-----ATATTAATGATCT-CCC--AT--TA-CATG-T-A---AAAAACAGT----GA-AACTGATATGTATGCAGATGAC------TC---CAC--ATTCCAC-AC--T----TCAG-G-----A--------AAA----A----C---TGTTTGAAAAATTTAGCAGAGATTACAAGC--CGACATAA---CTTCTATAAATAAATGGTG--TTCAAGA-AATATGATGTATATTAATACAGA-AAAAAATAAGT---GTATGACAATagttgaaaacactctaaaa
gi|148773 : aacATAT---ATCTTA--ACATCAGTCTCAA--CGTGGTTTTAGA--ATAAGTCATTCAAC-GG--A--ATCTTCTTTA--TT-AT-AATTGT-TTGATAAAGAGATAGAG-ACAACAGACGAAGG---------TC-AGTT---TGTAGGATA----TGT--TATGGTC---GATTTCAGAAA-A---GCATTCGATTAAGTA-AAATGAAAT--A----CTATTAAAAGGT-TAAAGCTTTCCAAA----TGAA-GCG-------------ATGA--AT---TAAATTGTATCG---TATTTTGATG----------CATACCT-TACCGAAC--G--CTCT-C-----A-AGTTGTTGA-C-A---TAAA--TT---GG-AC-TATGTCAG----AA------------C-AA--AAG----TCCAT--CGCGTGT-TGCGTTCCACACTGCTCCAGC--C--T-TGGGCTTGTT-TTGT---GT--TAATCA---TTT-----ATA--AACAACTTAACC--ATGACGCTTTC-T-A---AA-ATT-GT-CTCAGGTACTGATTTATATGCAGATGAT------ACTATAATTGATTATTTTAA-AT----CTGA-A-----A--------AAAA---A----AGGAAATCTTGAACG-A-AAT-----GTTCAGTGTTCACT-AAATTATATTT-T-AA-AT-TGATGTAAATAGAACGAAATG--CTTT-TAAACACTGCCAAAACAAAAGTCTCA-ATGT
gi|148774 : ---GATTTTTAAAACA---GTCTTTGATCTAGTT-A---GCCAT--G----AAACT------C-TT---CCTGCAAAA---CTAAA-ATGTAACAGTTTTTCGACAA--AT-G-TA--------C----TTTTGTAAAGT---TTAGTTCTTATCT-----AAATGAA--AGAG-C-----A-AATTG--GTACTA---TAAAAATT--ATA----T---TCAA----AC----T------CC-AA--TCG----A--ATTGAAAGT---GGTGTACCTCAAGGATCTA-TA-C--T-TGGG-CCAATGTTAT---TCA-TTA-TG---TTT-----GTA--AATGATTT-GCC--AC--TT-TATG-T-C---AATAAT-GC-T
gi|148775 : AA-A---GCCTTTGATTTAGTT-A---ATCAC--G----ACATT------C-TT---CTTGCAAAA---CTAAA-ATG-----------TTACAA--TT-T-CAA--AA-AATG---CACTTTGAAGTGGTTAAGTTCTTATCT-----AAAT-GA--AAGTGC-----A-AATTG-GTT-CTAAGTTATA--T--AATA-TA-T---TTAA----AA----T------CC-AA--TCT----A--AT--TAGAAGT-GGGGTACCTCAAGGATCTA-T--A--CATGGG-CCATTGTTATAAATTCATTA-TA---TTT-----GTA--AATGATCT-GTC--AC--T
gi|148776 : AA-A---GCATTTGATCGCATGTA---GTTAA--AAGGTCTTCTG-----T-TC---AAAGTAAAG---C-AAA-ATG-----------GTATAA--AA-G---G--TA-ATC-----TTCTTAAT-TGATTGAA-------------CAAAG-AG--TTTT-T-----ATAGTTA-TTA-CTT---TT----TTCAGAA-A--T---ACAA----GA----A------AC-AA--CTG----------------CC-GGAGTTCCCCAAGGTTTAA-T--T--C-TGGGTCCTTTATTCT---TT--TTAATT---TAC-----ATA--AATGATAT-AGCTAAA--AA-TTTGTT-A---AGTA----T-T---AC-AC--ACATATTTGCAGATGAT------AT---A
gi|148777 : -T---TCAA----AATCCAA------CCTAA--TT-----T--AT--AAGAG-T-GGGGTACCTCAAGGATCTG-TCCT--T-TGG--CCATTGTTAT---TTA-TTA-TG---TTT-----GTA--AATGATTT-GCC--AC--TT-TATG-T-C---AATAAC-GC-T--AAC-ACTGATAAATTTGCAGATG
gi|148778 : C-AA--ATC----T--AC--AACAGCT-GGTGTTCCACAGGGCTCTG-T--T--C-TAGGTC---TGCTAT---TT--TTCCTTGTTTTT-----GTT--AATGAT--------AT--TG-T
gi|148779 : CT-GGTGTTCCTCAAGGCTCAA-T--T--C-TTGGTCCATTATTAT---TT--CTTGTT---TAT-----ATC--AATGAT--------AT--TG-TTTC-TGA---AATA---GG-CTCTGCGATTCGCTTCTTTGCTGACGAC------AC---AAC--CCTTTATG
gi|148780 : aatatcgg-GGTGTTCAACAAGGTTCTG-T--T--T-TAGGTCCTTTATT-T---TT--TTATTT---TTTTTTACATT--AATGATAT-A--------------G-C-A---GAGAAC-GTATTGCACAA--AACTT---TCCGAATGAT------AC--------GTCACATG-C-TT----ATTA-A-----C--------AAAT---T----CAGA
gi|148781 : A--GATGATTT-ACT--AT--T-------------ACTAAC-GT-TTCAACAACTGA--TATATGCAGACGAC------AC---AAC--GTTATATTAC-AT----ACAA-A-----C--------AATT---A----TAGATTTTTTTAAAA-GTAAC-----ATGCAAACTTCAAT-TAAT--CGTCT-T-AATATGTGGTGCATTTAAAATAGTATG--GTAT-TTAATACTGACACAACCAAAGT---A-ATGTCAATCAACTCTCGACAGAAACGAAAGC-GT-TGCAAT----TGTATTGATTTACAACTTACGTACAG----CTG-TATTT-TA----A--TTAGCT--GCTACA-ACATGC-A----ATAAAATCCTTGGAATATTTTATGACAATTGCAATCT---ATGAAATAAACATTTATTATCTCTCTC
gi|148782 : ATGAT------AC---TAC--CTTATCTAAA-AT----AGGA-GAATCTC--------AAA----A----T-GATATTC---AAA-TTAAA-----TTACAAAATTCTCT-AAAT--GATCT-G-CAAACTTGGTGCAAGCATAATGGCATG--CTTA-TAAATTCTGCAAAAACCAAAGT---G-ATGTTAATAACAACTCAT--GAAATGACAGC-ACATTAAATTTTGCAAATTGATTTTCAGCTAAACTATAA----TGA-TG-CA-AAT---C--TTGCCTTAATATCA-AA---T-G----ACAAAATAATTGGGATcaa
gi|148783 : GATGG-CATTTAT-AAATA-----AATAT---AACTTATTGCATAAAACACAA--AGAAGTTTTA
gi|148783 : T--AAAACACAAAGAA-GTTTTATAAAATCCTTGGAATATTTATTGACGATTGCATGCT---ATGGAATAAACATTTACAATCTCTCTCtaaaatccttggaatatttattgacgattgcatgctatggaataaacatttacaatctctctcaaa
gi|148784 : gatggcatttataaataaatataacttattgcaAT----GAAATC---TTAC--CTTACAAACAGAGATCAAATA-CA-GA----A--TAGACT--ACTACA-ACAGGC-G----ATAAAATCCTTGGAAAATTTATTGAAGATTGCATGCT---ATGGAATAAACATTTACAATCTCTCTaaa
gi|148785 : ACG-ACGG----CAA-GA-TA-AA----AGTTCAATT--ACAATA----GGC-G----ATAAAATCCTTGAAATATTTATTGATGATTGCATACT---ATGAAA-AAACAATAACAATCTCTCTacaaa
Alignments
lowQualScore : 11111 111111111 111111 222222222222 1111 111111111111 11111111 111 11 1111 11111111111111 11 1111
lowQualScore : 0 0 4 55 55 00000 555 3 555 3 7777 555 555 4 3 44 33 2 77777 444 33 0 88 2 0 3 88 44 55 3 44 3 0 3 1 555555555 3 555 9999999 44 555 55 0 44444 2 0 33 444 33 9999 0 333333 2 444 777 55 444444444444 33 2 2 444 2 0000 1 2 2 0 0 5555 5 33 44 66666 66 44444 2 555 44 77 1 3 33 555 6666 444444444444 2 33 00000000 444 000 1 1 2 66666 2 1 444 00 2222 55555 66 4 22 33 33 6666 33 2 444 2 5 555 11 2 0 888888 6666 44 2 3 7777 3 77777777777777 999999999 1 44 99999 1 1 44 555 444 22 2 1 00 7 1 1 777 4 5 5 9999 4 1 2 8888 4 4 4 2222 55 55 3 3 7777 777
lowQualScore : . . . .. .. ..... ... . ... . .... ... ... . . .. .. . ..... ... .. . .. . . . .. .. .. . .. . . . . ......... . ... ....... .. ... .. . ..... . . .. ... .. .... . ...... . ... ... .. ............ .. . . ... . .... . . . . . .... . .. .. ..... .. ..... . ... .. .. . . .. ... .... ............ . .. ........ ... ... . . . ..... . . ... .. .... ..... .. . .. .. .. .... .. . ... . . ... .. . . ...... .... .. . . .... . .............. ......... . .. ..... . . .. ... ... .. . . .. . . . ... . . . .... . . . .... . . . .... .. .. . . .... ...
lowQualScore : 5 1 4 55 55 11111 888 6 888 3 1111 888 888 2 3 66 99 9 11111 777 77 5 55 8 4 1 55 22 88 1 22 1 2 1 1 444444444 1 444 9999999 66 444 11 7 88888 1 5 77 777 77 3333 8 000000 7 777 333 77 555555555555 77 7 7 111 7 9999 0 9 1 9 5 0000 3 77 66 77777 33 66666 4 444 22 77 0 1 77 000 1111 444444444444 7 77 55555555 666 777 0 0 4 22222 4 4 111 33 6666 99999 11 0 55 22 22 0000 00 7 777 5 3 555 66 0 1 222222 5555 22 8 3 1111 3 99999999999999 999999999 7 22 11111 4 4 11 555 222 77 0 3 00 3 2 4 000 0 0 0 4444 4 9 4 5555 0 0 0 5555 55 00 6 6 7777 000
consensus : CAAGGTTGCTAAAACTAGCATCCCCTGTTATATCTGAAAGTATTATGTTTATTGTGAATAAAAGTCT-GCGAGATGGAATATT--TCCACATA--TATG----GAAACAGGC---AAAGATAAAACCATT-CTATA---AAAGCGGCCGA-AAGGATGACGTAAATAATTATCGTCC----TATATCTATTTTGCCAACATTATCAAA---ACTTATAG---AAAAATNTAT-TCATATTAAT--TTGATGA-CATTTAT-AAATA-----AATAT---AACTTATTGCATAAAACACAA--AGTGGTTTTAGG--GAAGGTCATTCAAC-TG--A--ATCTGCATTAATTC-GT-A--TGA-TTGATAAATGGCTAACG-GCAATTAACGATGG---------CA-AGTT---AGTTGGGGC----TGT--CATGGTC---GATTTTCGGAA-G---GCCTTTGATCTCGTN-A---GTCAT--A----CTACT------T-TA---CTAGCAAAA---CTAAA-GTG-----------CTATAA--AT-G-TAG--TG-ATCG---TTTTTTGANGTGGNTGAAATCTTACCT-TA-CAAAC-AG--AGNTC-----A--AGTTG-TGT-CTA---TAAA--TTCAGNA-AC-T---TCAA----AA----A------CC-AA--TTG----T--AT--AACATCN-GGNGTTCCNCAGGGTTCTA-T--T--T-TGGGTCCATTGTTAT---TT--TTAC---TTTTT-----ATA--AATGATTT-ACC--AT--TG-TTTG-T-A---AATAAC-GT-TTCAACAACTGACTTATATGCAGATGAC------AC---AAC--GTTATATGAC-AT----ACAA-A-----C--------AAAT---A----CAGATATTTTAAAAG-GTAAC-----TTGCAAACTTCAAT-TAAT--CGTCT-T-AATATGTGGTGCATTCAAAATGGTATG--GTAT-TGAATACTGACAAAACAAAAGT---A-ATGTTAATCACCTCTCGTCAGAAACGACAGC-AT-TTAAAT----CAAATCGATTTACAACTTACGTACAA----CAG-TA-CA-GA----A--TTAACT--ACAACA-AAAGGC-G----ATAAAATCCTTGGAATATTTATTGACGATTGCATGCT---ATGGAATAAACATTTACAATCTCTCTC
Reference ( family-701 ) : CAAGGTTGCTAAAACTAGCATCCCCTGTTATATCTGAAAGTATTATGTTTATTGTGAATAAAAGTCT-GCGAGATGGAATATT--TCCACATA--TATG----GAAACAGGC---AAAGATAAAACCATT-CTATA---AAAGCGGCCGA-AAGGATGACGTAAATAATTATCGTCC----TATATCTATTTTGCCAACATTATCAAA---ACTTATAG---AAAAATNTAT-TCATATTAAT--TTGATGA-CATTTAT-AAATA-----AATAT---AACTTATTGCATAAAACACAA--AGTGGTTTTAGG--GAAGGTCATTCAAC-TG--A--ATCTGCATTAATTC-GT-A--TGA-TTGATAAATGGCTAACG-GCAATTAACGATGG---------CA-AGTT---AGTTGGGGC----TGT--CATGGTC---GATTTTCGGAA-G---GCCTTTGATCTCGTN-A---GTCAT--A----CTACT------T-TA---CTAGCAAAA---CTAAA-GTG-----------CTATAA--AT-G-TAG--TG-ATCG---TTTTTTGANGTGGNTGAAATCTTACCT-TA-CAAAC-AG--AGNTC-----A--AGTTG-TGT-CTA---TAAA--TTCAGNA-AC-T---TCAA----AA----A------CC-AA--TTG----T--AT--AACATCN-GGNGTTCCNCAGGGTTCTA-T--T--T-TGGGTCCATTGTTAT---TT--TTAC---TTTTT-----ATA--AATGATTT-ACC--AT--TG-TTTG-T-A---AATAAC-GT-TTCAACAACTGACTTATATGCAGATGAC------AC---AAC--GTTATATGAC-AT----ACAA-A-----C--------AAAT---A----CAGATATTTTAAAAG-GTAAC-----TTGCAAACTTCAAT-TAAT--CGTCT-T-AATATGTGGTGCATTCAAAATGGTATG--GTAT-TGAATACTGACAAAACAAAAGT---A-ATGTTAATCACCTCTCGTCAGAAACGACAGC-AT-TTAAAT----CAAATCGATTTACAACTTACGTACAA----CAG-TA-CA-GA----A--TTAACT--ACAACA-AAAGGC-G----ATAAAATCCTTGGAATATTTATTGACGATTGCATGCT---ATGGAATAAACATTTACAATCTCTCTC
gi|148760 : CAAGGTTGCTAAAACTAGCATCCCCTGTTATATCTGAAAGTATTATGTTTATTGTGAATAAAAGTCT-GCGAGATGGAATATT--TCCACATA--TATG----GAAACAGGC---AAAGATAAAACCATT-CTATA---AAAGCGGCCGA-AAGGATGACGTAAATAATTATCGTCC----TATATCTATTTTGCCAACATTATCAAA---ACTTATAG---AAAAAATTAT-TCATATTAAT--TTAATGA-AATTTAT-AAATA-----AATAT---AACTTATTGCATAAAACACAA--AGTGGTTTTAGG--GAAGGTCATTCAAC-TG--A--ATCTGCATTAATTC-GT-A--TGA-TTGATAAATGGCTAACG-GCAATTAATGATGG---------CA-AGTT---AGTTGGGGC----TGT--CATGGTC---GATTTTCGGAA-G---GCCTTTGATCTCGTA-A---GTCAT--A----CTACT------T-TA---CTAGCAAAA---CTAAA-GTG-----------CTATAA--AT-G-TAG--TG-ATCG---TTTTTTGATGTTGATGAAATCTTACCT-TA-CAAAC-AG--AGGTC-----A--AGTTG-TGT-CTA---TAAA--TTCAGAA-AC-T---TAAA----AA----A------AC-AA--TTG----T--AT--AACATCA-GGGGTTCCACAGGGTTCTA-T--T--T-TAGGTCCATTGTTAT---TT--TTAC---TTTTT-----ATA--AATGATTT-ACC--AT--TG-TTTA-T-A---AATAAC-GT-TTCAACAACTGACTTATATGCAAATGAC------AC---AAC--GTTATATGAC-AT----ACAA-A-----C--------AAAT---A----CAGATATTTTAAAAG-GTAAC-----TTGCAAACTTCCAT-TAAT--CGTCT-T-AATATGTGGTGCATTCAAAATGGTATG--GTAT-TGAATACTGACAAAACAAAAGT---A-ATGTTAATCACCTCTCGTCAGAAACGATAGC-AT-TTAAAT----CAAATCAATTTACAACTTACGTACAA----CAG-TA-CA-GA----A--TTAACT--ACAACA-AAAGGC-G----ATAAAATCCTTGGAATATTTATTGACGATTGCATGCT---ATGGAATCAACATTTACAATCTCTCTC
gi|148761 : CAAGGTTGCTAAAACTAGCATCCCCTGTTATATCTGAAAGTATTATGTTTATTGTGAATAAAAGTTT-GCGAGATGGAATATT--TCCACATA--TATA----AAAGC-GGCCGAAAGGATGA
gi|148761 : TATA---AAAGCGGCCGA-AAGGATGACGTAAATAATTATCGTCC----TATATCTATTTTGCCAACATTATCAAA---ACTTATAG---AAAAATTTAT-TCATATTAAT--TTAATGA-AATTTAT-AAATA-----AATAT---AACTTATTGCATATAACACAA--AGTGGTTTTAGG--GAAGGTCATTCAAC-TG--A--ATCTGCATTAATTC-GT-A--TGA-TTGATAAATGGCTAACG-GCAATTAATGATGG---------CA-AGTT---AGTTGGAGC----TGT--CATGGTC---GATTTTCGGAA-G---GCCTTTGATCTCGTA-A---GTCAT--A----CTACT------T-TA---CTAGCAAAA---CTAAA-GTG-----------CTATAA--AT-G-TAG--TG-ATCG---TTTTTTGATGTGGATGAAATCTTACCT-TA-CAAAC-AG--AGGTC-----A--AGTTG-TGT-CTA---TAAA--TTCAGCA-AC-T---TCAA----AA----A------CC-AA--TTG----T--AT--AACATCA-GGGGTTCCACAGGGTTCTA-T--T--T-TAGGGTCATTGTTAT---TT--TTAC----TTTT-----ATA--AATGATTT-ACC--AT--TG-TTTA-C-A---AATAAC-GT-TTCAACAACTGACTTATATGCAGATGAC------AC---AAC--GTTATATGAC-AT----ACAA-A-----C--------AAAT---A----CAGATATTTTAAAAG-GTAAC-----TTGCAAACTTCAAT-TAAT--CGTCT-T-AATATGTGGTGCATTCAAAATGGTATG--GTAT-TGAATACTGACAAAACAAAAGT---A-ATGTTAAACACCTCTCGTCAGAAACGACAGC-AT-TTAAAT----CAAATCAATTTACAACTTACGTACAA----CAA-TA-CA-GA----A--TTATCT--ACAACA-AAAGGC-G----ATAAAATCCTTGGAATATTTATTGACGATTGCATGCT---ATGGAATTAACATTTACAATCTCTCTCcgtaaataattatcgtcctatatctattttgccaacattatcaaaacttatagaaaaatttattcatattaatttaatgaaatttataaataaatataacttattgcatataacacaaagtggttttagggaaggtcattcaactgaatctgcattaattcgtatgattgataaatggctaacggcaattaatgatggcaagttagttggagctgtcatggtcgattttcggaaggcctttgatctcgtaagtcatactactttactagcaaaactaaagtgctataaatgtagtgatcgttttttgatgtggatgaaatcttaccttacaaacagaggtcaagttgtgtctataaattcagcaacttcaaaaaccaattgtataacatcaggggttccacagggttctattttagggtcattgttatttttacttttataaatgatttaccattgtttacaaataacgtttcaacaactgacttatatgcagatgacacaacgttatatgacatacaaacaaatacagatattttaaaaggtaacttgcaaacttcaattaatcgtcttaatatgtggtgcattcaaaatggtatggtattgaatactgacaaaacaaaagtaatgttaaacacctctcgtcagaaacgacagcatttaaatcaaatcaatttacaacttacgtacaacaatacagaattatctacaacaaaaggcgataaaatccttggaatatttattgacgattgcatgctatggaattaacatttacaatctctctcaaa
gi|148762 : caaggttgctaaaactagcatcccctgttatatctgaaagtattatgtttattgtgaataaaagtttgcgagatggaatatttccacataCAAGGTTGCTTAAACACGCATCCCCTATTTTATCTGAAAGTATTATGTTTATTGTGAATAAAAATCT-GCGAGATGGAATATT--TCCACATA--TATG----GAAACAGGC---AAAGATAAAACCATT-CTATA---AAAGCGACCGA-AAGGATGACGTAAATAATTATAGTCC----TATTTCTATTTTGCCAACATTATCAAA---ACTTACAG---AAAAACTTAT-TCATATTAAT--TTAATGA-AATTAAT-AAATA-----AATAT---AACTTATTGCATAAAACACAA--AGTAGTTTTATG--GAAGTTCATTCAAC-TG--A--ATCTGCATTAATTC-GT-A--TGA-CTGATAAATGGCTAACG-GCAATTAATGATGG---------CA-AGCT---AGTTGGGGC----TGT--CATGGTC---GATTTTCGGAA-G---GCCTTTGATCTCGTA-A---GTCAT--A----CTATT------T-TA---CTAGCAAAA---CTAAA-GTG-----------CTATAA--AT-G-TAG--TG-ATCG---TTTTTTGATTTGGATGAAATCTGACCT-TA-CAAAC-AG--AGGTC-----A--AGTTG-TGT-CTA---TAAA--TTCAGCA-AC-T---TCAA----AA----A------TC-AA--TTG----T--AT--AACATCC-GGGGTTCCACAGGGTTCAA-G--T--T-TAGGTCCATTGTTAT---TT--TAAC---TTTTC-----ATA--AATGATTT-ACC--AT--TG-TTTA-T-A---AATTAC-GT-TACAACAACTGACTTAAATGCAGATGAC------AC---AAC--GTTATATGAC-AT----ACAA-A-----C--------AAAT---A----TAGATATTTTAAAAG-GTAAC-----TTGCAAA-TTCAAT-TAAT--CGTCT-T-AATATGTGGTGCATTCAAATTGGTATG--GTAT-TGAATACTGACAAATCAAAAGT---A-ATGTTAATCACCTCTCGTCAGAAACGACAGC-AT-TTAAAT----CAAATCAATTTACAACATACGCACAA----CAG-TA-CA-GA----A--TTAACT--ACAACA-AAAGGC-G----ATAAAATCCTTGGAATATTTATTGATGATTGCATGCT---ATGGAATAAATATTTACAATCTCTCTCaaa
gi|148763 : CAAGGTTTCTAAAACTAGCATCCCCTGTTATATCTGAAAGTATTATGTTTATTGTGAACAAAATTCT-GCGAGATGGAATATT--TCATCATA--TATG----GAAACAGGC---AACGATAAAAACATT-CTATA---AAAGCGGCCGA-AAGGATGACGTAAATAATTATCGTCC----TATATGTATTTTGCCAACATTATCAAA---ACTTATAG---AATTTTTTAT-TCATATTAAT--TAAATGA-AATTTAT-AAATA-----AATAG---AACTTATTGCATAAAACACAA--AGTGGTTTTAGA--GAAGGTCGTTCAAT-TG--A--ATCTGCATTAATTG-GT-A--TGG-TTGATAAACGGCTAACG-GCAATTAATGATGG---------CA-AGTT---AGTTGGG-C----TGT--CATGGTC---GATTTTCG-AA-G---GTCTTTGATCTCGTA-A---GTCAT--A----CTATT------T-TA---CTAGCAAAA---CTTAA-GTG-----------CTATTA--AT-G-TAT--TG-ATCG---TTGTTTTATGTGGATAAACTATT--TT-TA-CAAAC-AG--AGTTC-----A--AGTTG-AGT-CTA---TAAA--TTCAGCA-AC-T---TCAA----AA----A------AC-AA--TTG----T--AT--AACATCA-GGGGTTCCACAGGGTTCTA-T--T--T-TAGGTCCATTGTTAT---TT--TTAC---TTTTC-----ATA--AATAATTT-ACC--AT--TG-TTTA-T-G---AATAAC-AT-TTCAACAACTGACTTATATGCAGATGAC------AC---AAC--GTTATATGAC-AT----ACAA-A-----C--------GAAT---A----CAGATATTTTAAAAG-GTAAC-----TTGCTAACTTAAAT-TAAT--CGTCT-T-AATATGTGGTGCATTCAAAATGGTATG--GTAT-TGAATACTAACAAAACAAAAGT---A-ATATTAACCACCTTTCGTCAGAAACGACAGC-AT-TTAAAT----CAAATCATTTTACAAATTACGTACAA----CAG-TA-CA-GA----A--TTAACT--ACAACA-AAATGCAA----AAAAAAGTCTTGGAATATTTATTGACGATTGCATGCT---ACGGAATAAAAA--TA-AATCTCaaa
gi|148764 : CAAGGTTGCTAAAACTAGCATCCCCTGTTATATCTGAA-GTATTATGTTTATTGTGAATAAAAGTCT-GCAAGATGGATTATT--TCCACATA--TATT----GGAACAGGC---AAAGATAAAACCATT-CTATA---AAAGCGGTCGA-ATGTGTGCCGTGAATAATTATCGTCC----TATATCTATTTTGCCAACATTTTCAAA---ACGTTTAG---AAAAAAATAT-TCATACTAAT--TTGATGA-CATTTAT-GACTA-----A-TAA---AACTTATTGCATAAAACACAA--AGTGACTTTAGG--GAAGGTCATTTAAC-TG--A--ATATGCATTAATTA-GG-T--TGA-TTGATAAATGACTAATG-GCAATTAACGATTG---------CA-AGTT---AGTTGGGAC----TGT--CATTGTC---AATATTCGGAA-G---GCATTTGATCTCTTA-A---GTCAT--A----CTATT------T-TA---CTAGCAAAA---CTAAA-ATG-----------CTATAA--AT-G-CAG--TG-ATCG---TTTTTTGAGGTGGATGAAATCTTACCT-TA-CAAAC-AG--AGATC-----A--AAT
gi|148765 : CAATGTTGCCAAA-CTAGCATCCCCTGTTATATCTGAAAGTATTGTATTTATTGTGAATAAAAGTCT-GCGAGACTGAATATT--ACCACATA--TATG----GAAACAGGC---AAAGATAAAACCATT-CTATA---AAAGCGGCCGA-AATGATGACGTAAATAATTATCGCCC----TATATCTATTTTGCCAACATAATCAAA---ACTTATAG---AAAAATGTAT-TCATATTAAT--TTGATGG-CATTTAT-AAATA-----AATAT---AACTTATTGCATAAAACACAA--AGAAGTTTTA
gi|148766 : GTTGC--AAACTAGCATCCCCTGTTATATCTGAAAGTATCATGTTTATTGTGAATTAAAGTCT-GCGATATGGAATATT--TCCACATA--TATG----GAAACAGGC---AAAGATACAACCATT-CTATA---AAAGCGGCCGA-AAGGATGACGTAAATAATTATCGTCC----TATATCTATTTTGCCAACATTATTAA-----CTTATAG---AAAAATTTAT-TTATATTAAT--TTAATGA-AATTTAT-AAGTA-----AATAT---AACTTATTGCATAAAACACAA--AGTGGTTT-AGG--GAAGGTCAATCAAC-TG--A--ATCTGCATTAATTC-GT-A--TGA-TTGATAAATGGCTAACT-GCAATTAATGATGG---------CA-AGTT---TGTTGGGGC----TGT--CATGGTC---GATTTTCGGAA-G---GCCTTTGATCTCGTA-A---GTCAT--A----CTATT------T-TA---CTAGCAAAA---CTAAA-GTG-----------CTATAA--AT-G-TAG--TG-ATCG---TTTTTTGATGTGGATGAAATCTTACCT-TA-CAAAC-AG--AGGTT-----A--AGTTG-TGT-CTA---TAAA--TTCAGCA-AC-T---TCAA----AA----A------CC-AA--TTG----T--AT--AACATCA-GGGGTTCCACAGGGTTCTA-T--T--T-TAGGTCCATTGTTAT---TT--TTAC---TTATC-----ATA--AATGATTT-ACC--AT--TG-TTTA-T-A---AATAAC-GT-TTCAACAACAAACTTATATGCAGATGAC------AC---AAC--GTTATATGAC-AT----ACAG-A-----C--------AAAT---A----CAGATATTTTAAAAG-GTAAC-----TTGCAAACTTCAAT-AAAT--CGTCT-T-AATATGTGGTGCATTCAAAATGGTATG--GTAT-TGAATACTGACAAAACAAAAGT---A-ATGTTAATCA-CTCTCGTCAGAAACGACAGC-GT-TTAAAT----CAAATCAATTTACAACTTACGTACGA----CAG-TA-CA-GA----A--TTAACT--ACAACA-AAAGGC-G----ATAAAATCCTTGGAATATTTATTGACGATTGCATGCT---ATTGAATAAACATTTACAATCTCTCTC
gi|148767 : TTGCTTATACTAGTTTCATACGTTTCATCTGAACGTATTATGTTTACTTTAATTAAAAGTCT-GCGAGATGGAATATT--TCCACATGCTTAT------AAACAGGC---AGAGATAAA--CATTTCTATA---AAAGCGATCGA-AGTGATGACATGAAGGCTTATCGTCT----TATATCTAGTTTGCCAACATTATCAAA---ACTTATAG---GAACATATAT-TCATATTAAT--TTGATGA-CATTTAT-AACT------TGCGT---AA-TTA-TGCGTAAAACACAA--AGTGATGTTAGG--ACAGGTCATTTAAC-TG--A--ATCTGCATTAATTC-AT-A--GGA-TTCATAAATGATTAACG-GCATTTAACGACGG---------CA-AGAT---Aaaa
gi|148768 : TTATGTATA--ATAAATACAAGTTTAGCCAG-TGGAAGCTT--TCCATCCG--CATG----GAAACA--------------AAC-GTT-TTTTA---AGAGTGGAAGT-AAAGATAAAATAAACAACTGTCACCCCTGCTACCGCTATATTAACAACTTTATCGAA------TGTAGTTGAAGAATATCT-CGGTTCTCAT--TTGAATT-CCTTCTT-CAACA-----ATCAT---TATATATTACATGAGTCTCAA--AGCGGATTTAGA--GAAGGTCATTCAACATA--ATTATCTGTTTTGTTT---T-A--TTACTTGATTAATGTCTGAGT-GCAATTAATGAGGGA--------CA-ATTTGTAAGATG--------TGT--TATGGTC---TATTTCAAGAA-GAAAAC----GATCAAGTA-A---ATCAT--G----ATA----------TA---CTAATAAAAAATCTCAA-ACT-----------TTACAA--AT-G-TAG--CG-ATAA---ACTAGCAAAGTGGTGTCAATCATACAT-TA-CCAAT-CGCTAG--C-----A--AGTTG-T
gi|148769 : TGTAATATTCCTCAAAATA--TATTTTTTGAAACAGAC---AAATATAAAACCATT-CTATA---AAAGCGATAGA-AAGGATGACGT------------------------CTATTTTGC-GACATTATCAAA---ATTTATAG---AAAAAT--AT-TCATATTAAA--TTGATGA-CATTTAT-GAATA-----AATA--------------ACAAAA----A--AGTGGTTTTATG--AAA--------------------TCTGCATTTATCC-GT-A--TAA-TTGATAAATGGCTAATG-GCAGTTAACGACGG---------C----------------------TGT--CATGGAC---GATTTT-AGAT-G---ACCTTTGATCTCGTT-A----CCAT--A----TCATT------T-TA---CTAGCAAAA---CTAAA-ATG-----------ATATAA--AT-G-CAG--TG-ATCT---TATTTTGACGTGGTTGAAATCTTACCT-CG-CAAAC-AG--AGTAC-----A--AGTTG-TGT-C-----TAAT--TTCAGCT-AC-T---ACAG----GA----A------CC-AA--TTG----T--AT--AACATGA-AGTGTTCCGCAGGGT--TA-T--TAAT-TAGGTTCATTGTTAG---TT--TTAC---TTTTT-----ATA--A
gi|148770 : AAAAATGC---AAAAGTAA---C-TC-CTATACACAAAAAGGGAGATAAATCTGAGGCAACTAATTACAGACC----TATATCAGTACTACCAACATTGTCTAA---GTTAATTG---AAAAACATATCTCCCAACAAC--TTTATAAGTATTTGTCAGAT--------TTT---AACCTATTACATCCATCTCAA--TCTGGATTTAGGCCGAA--TCACTC--C-TGTCA--AACAGCACTAATAA-AT-A--TAA-CTGACAAATGGTTACAA-GAAATGAATGATGG---------AA-ACAT---AAATGGAGT----AGT---AT--TCTTGGATTTAAAAAA-A---GCTTTTGATGTTGTT-G---ATCACAAA----CT-CT------TATG---CCA--AAAG---CTTAA----------------TATAT--ATGG-TTG--TA-CTCGAACTTCCCTGAAGTTGTTTGAATCATATCT-TA-ATAAC-AG--AACAC-----AGCAG--G-TA---------AAA--GTAGGAA-AT-G---CCAAGTCTAA----ATCTGCCCC-TA--TT-----T--CT----CAT---GGAGTTCCCCAAGGTTCAA-T--A--C-TGGGTCCATTAC--T---TT--TCAT---TTTAT-----ATATTAATGACCT-CCC--AT--TA-CATG-T-A---AAAAACAGT----GA-AACTGATATGTATGCAGATGAC------TC---CAC--ATTCCAC-AC-TTCAGGAAAA-A-----CTGTTGGAGAAATTCAG----CAGAGA--TTACAAG-CCGAC-----TT---AACTTC----TA--------T-A-AATAAATGGTG--TTCAAGA-AATATGATGTATATTAATACAGAAAAAACTAAttccattaaattaaattcaattttataagcaaactatcagcaaacatatcaggttgaccatttataacgtt
gi|148771 : AGTC---AAA-ATCACACCAAT-TTTTA---AGAAAGGTTTA-AAACAAGACAAAAATAACTATCGCCC----AATTTCCATTCTTCCTATTCTGTCTAAGATACTT---G---AGAGACATGT-TAGTAATAGTGTTCGGT---CTTTTTT-AAATA-----CATAC---AATTTATTGCATGAAAGACAATCAG-GG-TTCAGA--TCTGATCATTCATG-CG--A--AACAGCATTAA--CAGTGA--TGG-TTGATGACTGGATCACA-GCTATTGATCAAAA---------CA-GAAT---ATCTGGAACCATATTT--CTTGACC---TATCT----AA-A---GCATTTGATCTGGTT-G---ATCAT--AGT--TTAC---------TG---CTTGAAAAA---CTAAATGTATTCCATTT---CCATAAAGAT-G-TA--------CA---------AAATTGGTTTAAATCCTATTTATG-TGAAC------GTTCACAAAA--AGTT----T-CAA---TAGC--T--GGTACACTT---TCAG----AA----A------GT-AA--ATC----A--GT--AACATGT-GGTGTACCCCAAGGATCTG-T--T--T-TAGGCCCACTTCTAT---TTA-TTA----TCTTT-----ATC--AATGATAT-GCC--CT--TA---TG-C-ACTCAGTA------TTCAAAAATGAACATGTTTGCTGATGACTCCTCTAT---CAC--TTTATCTGGTAAT----TCAATAT----C--------AGAC---ATCACCGAATCTCTTAA-----TAA-------TG-AA---TTAAT-AAAT---GTC--C-AACA-ATGGTGTAATAATAATTGGATG--ACCA-TAAATACTTCAAAAACCAAAGC---A-ATGTTTATAGCCTCTCATCCAAAGCAACCACTAT-TCAGAT----CA----GATTAGC-ACTTA---AAAA----TAG-GA-GATGAGGCTA--TTGAAT---TTACA-AGTAGT-G----AAAAACTTCTGGGAGTAACAATTGACAA---CACACTAACATGGACTCAACA
gi|148772 : TTTAT-AAGTATCTGTAAGATTTTAACCTATTACATTTATCTCAA--TCTGCATTTAGGCCGAA--TCACTC--C-TGTCA--AACAGCACTAATAA-AT-A--TAA-TTGACAAATGG-TAACAAGAAATGAATGATGGAAACATAAACAGAGTT---A-CTGTAGT----TATTTCTTGG------ATTTATAAAA-A---GCTTTTGATGTTGTT-G---ATCAC--A----A-ACTC-----T-TA----TGCCAAAAG--CTTAA----------------TATAC--AT-GGTTG--TG-CTCAAACTTCCCTGAAGTTGTTTGAATCATATCT-AA-ATAAC-AG--AACAC-----A------G-TAG-GTA---AAAG--T--AGGA-AA-T---GCAA----AG----T------CT-AAATCTGCCCCT--AT--TTC-TCATGGAGTTCCCTAAGGTTCCA-T--A--C-TGGGTCCATTAC--T---TT--TCAT---TTTAT-----ATATTAATGATCT-CCC--AT--TA-CATG-T-A---AAAAACAGT----GA-AACTGATATGTATGCAGATGAC------TC---CAC--ATTCCAC-AC--T----TCAG-G-----A--------AAA----A----C---TGTTTGAAAAATTTAGCAGAGATTACAAGC--CGACATAA---CTTCTATAAATAAATGGTG--TTCAAGA-AATATGATGTATATTAATACAGA-AAAAAATAAGT---GTATGACAATagttgaaaacactctaaaa
gi|148773 : aacATAT---ATCTTA--ACATCAGTCTCAA--CGTGGTTTTAGA--ATAAGTCATTCAAC-GG--A--ATCTTCTTTA--TT-AT-AATTGT-TTGATAAAGAGATAGAG-ACAACAGACGAAGG---------TC-AGTT---TGTAGGATA----TGT--TATGGTC---GATTTCAGAAA-A---GCATTCGATTAAGTA-AAATGAAAT--A----CTATTAAAAGGT-TAAAGCTTTCCAAA----TGAA-GCG-------------ATGA--AT---TAAATTGTATCG---TATTTTGATG----------CATACCT-TACCGAAC--G--CTCTC-----A--AGTTGTTGA-C-A---TAAA--TT---GG-AC-TATGTCAG----AA------------C-AA--AAG----TCCAT--CGCGTGT-TGCGTTCCACACTGCTCCAGC--C--T-TGGGCTTGTT-TTGT---GT--TAAT---CATTT-----ATA--AACAACTTAACC--ATGACGCTTTC-T-A---AA-ATT-GT-CTCAGGTACTGATTTATATGCAGATGAT------ACTATAATTGATTATTTTAA-AT----CTGA-A-----A--------AAAA---A----AGGAAATCTTGAACG-A-AAT-----GTTCAGTGTTCACT-AAATTATATTT-T-AA-AT-TGATGTAAATAGAACGAAATG--CTTT-TAAACACTGCCAAAACAAAAGTCTCA-ATGT
gi|148774 : ---GATTTTTAAAACA---GTCTTTGATCTAGTT-A---GCCAT--G----AAACT------C-TT---CCTGCAAAA---CTAAA-ATGTAACAGTTTTTCGACAA--AT-G-TA--------C----TTTTGTAAAGT---TTAGTTCTTATCT-----AAATGAA--AGAGC-----A--AATTG--GTACTA---TAAAAATT--ATA----T---TCAA----AC----T------CC-AA--TCG----A--ATTGAAAGT---GGTGTACCTCAAGGATCTA-TA-C--T-TGGG-CCAATGTTAT---TCA-TTA----TGTTT-----GTA--AATGATTT-GCC--AC--TT-TATG-T-C---AATAAT-GC-T
gi|148775 : AA-A---GCCTTTGATTTAGTT-A---ATCAC--G----ACATT------C-TT---CTTGCAAAA---CTAAA-ATG-----------TTACAA--TT-T-CAA--AA-AATG---CACTTTGAAGTGGTTAAGTTCTTATCT-----AAATGAA--AGTGC-----A--AATTG-GTT-CTAAGTTATA--T--AATA-TA-T---TTAA----AA----T------CC-AA--TCT----A--AT--TAGAAGT-GGGGTACCTCAAGGATCTA-T--A--CATGGG-CCATTGTTATAAATTCATTA----TATTT-----GTA--AATGATCT-GTC--AC--T
gi|148776 : AA-A---GCATTTGATCGCATGTA---GTTAA--AAGGTCTTCTG-----T-TC---AAAGTAAAG---C-AAA-ATG-----------GTATAA--AA-G---G--TA-ATC-----TTCTTAAT-TGATTGAA-------------CAAAG-AG--TTTTT-----AT-AGTTA-TTA-CTT---TT----TTCAGAA-A--T---ACAA----GA----A------AC-AA--CTG----------------CC-GGAGTTCCCCAAGGTTTAA-T--T--C-TGGGTCCTTTATTCT---TT--TTAA---TTTAC-----ATA--AATGATAT-AGCTAAA--AA-TTTGTT-A---AGTA----T-T---AC-AC--ACATATTTGCAGATGAT------AT---A
gi|148777 : -T---TCAA----AATCCAA------CCTAA--TT-----T--AT--AAGAG-T-GGGGTACCTCAAGGATCTG-TCCT--T-TGG--CCATTGTTAT---TTA-TTA----TGTTT-----GTA--AATGATTT-GCC--AC--TT-TATG-T-C---AATAAC-GC-T--AAC-ACTGATAAATTTGCAGATG
gi|148778 : C-AA--ATC----T--AC--AACAGCT-GGTGTTCCACAGGGCTCTG-T--T--C-TAGGTC---TGCTAT---TT--TTCCTTGTTTTT-----GTT--AATGAT--------AT--TG-T
gi|148779 : CT-GGTGTTCCTCAAGGCTCAA-T--T--C-TTGGTCCATTATTAT---TT--CTTG---TTTAT-----ATC--AATGAT--------AT--TG-TTTC-TGA---AATA---GG-CTCTGCGATTCGCTTCTTTGCTGACGAC------AC---AAC--CCTTTATG
gi|148780 : aatatcgg-GGTGTTCAACAAGGTTCTG-T--T--T-TAGGTCCTTTATT-T---TT--TTAT---TTTTTTTTACATT--AATGATAT-A--------------G-C-A---GAGAAC-GTATTGCACAA--AACTT---TCCGAATGAT------AC--------GTCACATG-C-TT----ATTA-A-----C--------AAAT---T----CAGA
gi|148781 : A--GATGATTT-ACT--AT--T-------------ACTAAC-GT-TTCAACAACTGA--TATATGCAGACGAC------AC---AAC--GTTATATTAC-AT----ACAA-A-----C--------AATT---A----TAGATTTTTTTAAAA-GTAAC-----ATGCAAACTTCAAT-TAAT--CGTCT-T-AATATGTGGTGCATTTAAAATAGTATG--GTAT-TTAATACTGACACAACCAAAGT---A-ATGTCAATCAACTCTCGACAGAAACGAAAGC-GT-TGCAAT----TGTATTGATTTACAACTTACGTACAG----CTG-TATTT-TA----A--TTAGCT--GCTACA-ACATGC-A----ATAAAATCCTTGGAATATTTTATGACAATTGCAATCT---ATGAAATAAACATTTATTATCTCTCTC
gi|148782 : ATGAT------AC---TAC--CTTATCTAAA-AT----AGGA-GAATCTC--------AAA----A----T-GATATTC---AAA-TTAAA-----TTACAAAATTCTCT-AAAT--GATCT-G-CAAACTTGGTGCAAGCATAATGGCATG--CTTA-TAAATTCTGCAAAAACCAAAGT---G-ATGTTAATAACAACTCAT--GAAATGACAGC-ACATTAAATTTTGCAAATTGATTTTCAGCTAAACTATAA----TGA-TG-CA-AAT---C--TTGCCTTAATATCA-AA---T-G----ACAAAATAATTGGGATcaa
gi|148783 : GATGG-CATTTAT-AAATA-----AATAT---AACTTATTGCATAAAACACAA--AGAAGTTTTA
gi|148783 : T--AAAACACAAAGAA-GTTTTATAAAATCCTTGGAATATTTATTGACGATTGCATGCT---ATGGAATAAACATTTACAATCTCTCTCtaaaatccttggaatatttattgacgattgcatgctatggaataaacatttacaatctctctcaaa
gi|148784 : gatggcatttataaataaatataacttattgcaAT----GAAATC---TTAC--CTTACAAACAGAGATCAAATA-CA-GA----A--TAGACT--ACTACA-ACAGGC-G----ATAAAATCCTTGGAAAATTTATTGAAGATTGCATGCT---ATGGAATAAACATTTACAATCTCTCTaaa
gi|148785 : ACG-ACGG----CAA-GA-TA-AA----AGTTCAATT--ACAATA----GGC-G----ATAAAATCCTTGAAATATTTATTGATGATTGCATACT---ATGAAA-AAACAATAACAATCTCTCTacaaa
Alignments
lowQualScore : 11111 111111111 111111 222222222222 1111 111111111111 11111111 111 11 1111 11111111111111 11 1111
lowQualScore : 0 0 4 55 55 00000 555 3 555 3 7777 555 555 4 3 44 33 2 77777 444 33 0 88 2 0 3 88 44 55 3 44 3 0 3 1 555555555 3 555 9999999 44 555 55 0 44444 2 0 33 444 33 9999 0 333333 2 444 777 55 444444444444 33 2 2 444 2 0000 1 2 2 0 0 5555 5 33 44 66666 66 44444 2 555 44 77 1 3 33 555 6666 444444444444 2 33 00000000 444 000 1 1 2 66666 2 1 444 00 2222 55555 66 4 22 33 33 6666 33 2 444 2 5 555 11 2 0 888888 6666 44 2 3 7777 3 77777777777777 999999999 1 44 99999 1 1 44 555 444 22 2 1 00 7 1 1 777 4 5 5 9999 4 1 2 8888 4 4 4 2222 55 55 3 3 7777 777
lowQualScore : . . . .. .. ..... ... . ... . .... ... ... . . .. .. . ..... ... .. . .. . . . .. .. .. . .. . . . . ......... . ... ....... .. ... .. . ..... . . .. ... .. .... . ...... . ... ... .. ............ .. . . ... . .... . . . . . .... . .. .. ..... .. ..... . ... .. .. . . .. ... .... ............ . .. ........ ... ... . . . ..... . . ... .. .... ..... .. . .. .. .. .... .. . ... . . ... .. . . ...... .... .. . . .... . .............. ......... . .. ..... . . .. ... ... .. . . .. . . . ... . . . .... . . . .... . . . .... .. .. . . .... ...
lowQualScore : 5 1 4 55 55 11111 888 6 888 3 1111 888 888 2 3 66 99 9 11111 777 77 5 55 8 4 1 55 22 88 1 22 1 2 1 1 444444444 1 444 9999999 66 444 11 7 88888 1 5 77 777 77 3333 8 000000 7 777 333 77 555555555555 77 7 7 111 7 9999 0 9 1 9 5 0000 3 77 66 77777 33 66666 4 444 22 77 0 1 77 000 1111 444444444444 7 77 55555555 666 777 0 0 4 22222 4 4 111 33 6666 99999 11 0 55 22 22 0000 00 7 777 5 3 555 66 0 1 222222 5555 22 8 3 1111 3 99999999999999 999999999 7 22 11111 4 4 11 555 222 77 0 3 00 3 2 4 000 0 0 0 4444 4 9 4 5555 0 0 0 5555 55 00 6 6 7777 000
consensus : CAAGGTTGCTAAAACTAGCATCCCCTGTTATATCTGAAAGTATTATGTTTATTGTGAATAAAAGTCT-GCGAGATGGAATATT--TCCACATA--TATG----GAAACAGGC---AAAGATAAAACCATT-CTATA---AAAGCGGCCGA-AAGGATGACGTAAATAATTATCGTCC----TATATCTATTTTGCCAACATTATCAAA---ACTTATAG---AAAAATNTAT-TCATATTAAT--TTGATGA-CATTTAT-AAATA-----AATAT---AACTTATTGCATAAAACACAA--AGTGGTTTTAGG--GAAGGTCATTCAAC-TG--A--ATCTGCATTAATTC-GT-A--TGA-TTGATAAATGGCTAACG-GCAATTAACGATGG---------CA-AGTT---AGTTGGGGC----TGT--CATGGTC---GATTTTCGGAA-G---GCCTTTGATCTCGTN-A---GTCAT--A----CTACT------T-TA---CTAGCAAAA---CTAAA-GTG-----------CTATAA--AT-G-TAG--TG-ATCG---TTTTTTGANGTGGNTGAAATCTTACCT-TA-CAAAC-AG--AGNTC-----A--AGTTG-TGT-CTA---TAAA--TTCAGNA-AC-T---TCAA----AA----A------CC-AA--TTG----T--AT--AACATCN-GGNGTTCCNCAGGGTTCTA-T--T--T-TGGGTCCATTGTTAT---TT--TTAC---TTTTT-----ATA--AATGATTT-ACC--AT--TG-TTTG-T-A---AATAAC-GT-TTCAACAACTGACTTATATGCAGATGAC------AC---AAC--GTTATATGAC-AT----ACAA-A-----C--------AAAT---A----CAGATATTTTAAAAG-GTAAC-----TTGCAAACTTCAAT-TAAT--CGTCT-T-AATATGTGGTGCATTCAAAATGGTATG--GTAT-TGAATACTGACAAAACAAAAGT---A-ATGTTAATCACCTCTCGTCAGAAACGACAGC-AT-TTAAAT----CAAATCGATTTACAACTTACGTACAA----CAG-TA-CA-GA----A--TTAACT--ACAACA-AAAGGC-G----ATAAAATCCTTGGAATATTTATTGACGATTGCATGCT---ATGGAATAAACATTTACAATCTCTCTC
Reference ( family-701 ) : CAAGGTTGCTAAAACTAGCATCCCCTGTTATATCTGAAAGTATTATGTTTATTGTGAATAAAAGTCT-GCGAGATGGAATATT--TCCACATA--TATG----GAAACAGGC---AAAGATAAAACCATT-CTATA---AAAGCGGCCGA-AAGGATGACGTAAATAATTATCGTCC----TATATCTATTTTGCCAACATTATCAAA---ACTTATAG---AAAAATNTAT-TCATATTAAT--TTGATGA-CATTTAT-AAATA-----AATAT---AACTTATTGCATAAAACACAA--AGTGGTTTTAGG--GAAGGTCATTCAAC-TG--A--ATCTGCATTAATTC-GT-A--TGA-TTGATAAATGGCTAACG-GCAATTAACGATGG---------CA-AGTT---AGTTGGGGC----TGT--CATGGTC---GATTTTCGGAA-G---GCCTTTGATCTCGTN-A---GTCAT--A----CTACT------T-TA---CTAGCAAAA---CTAAA-GTG-----------CTATAA--AT-G-TAG--TG-ATCG---TTTTTTGANGTGGNTGAAATCTTACCT-TA-CAAAC-AG--AGNTC-----A--AGTTG-TGT-CTA---TAAA--TTCAGNA-AC-T---TCAA----AA----A------CC-AA--TTG----T--AT--AACATCN-GGNGTTCCNCAGGGTTCTA-T--T--T-TGGGTCCATTGTTAT---TT--TTAC---TTTTT-----ATA--AATGATTT-ACC--AT--TG-TTTG-T-A---AATAAC-GT-TTCAACAACTGACTTATATGCAGATGAC------AC---AAC--GTTATATGAC-AT----ACAA-A-----C--------AAAT---A----CAGATATTTTAAAAG-GTAAC-----TTGCAAACTTCAAT-TAAT--CGTCT-T-AATATGTGGTGCATTCAAAATGGTATG--GTAT-TGAATACTGACAAAACAAAAGT---A-ATGTTAATCACCTCTCGTCAGAAACGACAGC-AT-TTAAAT----CAAATCGATTTACAACTTACGTACAA----CAG-TA-CA-GA----A--TTAACT--ACAACA-AAAGGC-G----ATAAAATCCTTGGAATATTTATTGACGATTGCATGCT---ATGGAATAAACATTTACAATCTCTCTC
gi|148760 : CAAGGTTGCTAAAACTAGCATCCCCTGTTATATCTGAAAGTATTATGTTTATTGTGAATAAAAGTCT-GCGAGATGGAATATT--TCCACATA--TATG----GAAACAGGC---AAAGATAAAACCATT-CTATA---AAAGCGGCCGA-AAGGATGACGTAAATAATTATCGTCC----TATATCTATTTTGCCAACATTATCAAA---ACTTATAG---AAAAAATTAT-TCATATTAAT--TTAATGA-AATTTAT-AAATA-----AATAT---AACTTATTGCATAAAACACAA--AGTGGTTTTAGG--GAAGGTCATTCAAC-TG--A--ATCTGCATTAATTC-GT-A--TGA-TTGATAAATGGCTAACG-GCAATTAATGATGG---------CA-AGTT---AGTTGGGGC----TGT--CATGGTC---GATTTTCGGAA-G---GCCTTTGATCTCGTA-A---GTCAT--A----CTACT------T-TA---CTAGCAAAA---CTAAA-GTG-----------CTATAA--AT-G-TAG--TG-ATCG---TTTTTTGATGTTGATGAAATCTTACCT-TA-CAAAC-AG--AGGTC-----A--AGTTG-TGT-CTA---TAAA--TTCAGAA-AC-T---TAAA----AA----A------AC-AA--TTG----T--AT--AACATCA-GGGGTTCCACAGGGTTCTA-T--T--T-TAGGTCCATTGTTAT---TT--TTAC---TTTTT-----ATA--AATGATTT-ACC--AT--TG-TTTA-T-A---AATAAC-GT-TTCAACAACTGACTTATATGCAAATGAC------AC---AAC--GTTATATGAC-AT----ACAA-A-----C--------AAAT---A----CAGATATTTTAAAAG-GTAAC-----TTGCAAACTTCCAT-TAAT--CGTCT-T-AATATGTGGTGCATTCAAAATGGTATG--GTAT-TGAATACTGACAAAACAAAAGT---A-ATGTTAATCACCTCTCGTCAGAAACGATAGC-AT-TTAAAT----CAAATCAATTTACAACTTACGTACAA----CAG-TA-CA-GA----A--TTAACT--ACAACA-AAAGGC-G----ATAAAATCCTTGGAATATTTATTGACGATTGCATGCT---ATGGAATCAACATTTACAATCTCTCTC
gi|148761 : CAAGGTTGCTAAAACTAGCATCCCCTGTTATATCTGAAAGTATTATGTTTATTGTGAATAAAAGTTT-GCGAGATGGAATATT--TCCACATA--TATA----AAAGC-GGCCGAAAGGATGA
gi|148761 : TATA---AAAGCGGCCGA-AAGGATGACGTAAATAATTATCGTCC----TATATCTATTTTGCCAACATTATCAAA---ACTTATAG---AAAAATTTAT-TCATATTAAT--TTAATGA-AATTTAT-AAATA-----AATAT---AACTTATTGCATATAACACAA--AGTGGTTTTAGG--GAAGGTCATTCAAC-TG--A--ATCTGCATTAATTC-GT-A--TGA-TTGATAAATGGCTAACG-GCAATTAATGATGG---------CA-AGTT---AGTTGGAGC----TGT--CATGGTC---GATTTTCGGAA-G---GCCTTTGATCTCGTA-A---GTCAT--A----CTACT------T-TA---CTAGCAAAA---CTAAA-GTG-----------CTATAA--AT-G-TAG--TG-ATCG---TTTTTTGATGTGGATGAAATCTTACCT-TA-CAAAC-AG--AGGTC-----A--AGTTG-TGT-CTA---TAAA--TTCAGCA-AC-T---TCAA----AA----A------CC-AA--TTG----T--AT--AACATCA-GGGGTTCCACAGGGTTCTA-T--T--T-TAGGGTCATTGTTAT---TT--TTAC----TTTT-----ATA--AATGATTT-ACC--AT--TG-TTTA-C-A---AATAAC-GT-TTCAACAACTGACTTATATGCAGATGAC------AC---AAC--GTTATATGAC-AT----ACAA-A-----C--------AAAT---A----CAGATATTTTAAAAG-GTAAC-----TTGCAAACTTCAAT-TAAT--CGTCT-T-AATATGTGGTGCATTCAAAATGGTATG--GTAT-TGAATACTGACAAAACAAAAGT---A-ATGTTAAACACCTCTCGTCAGAAACGACAGC-AT-TTAAAT----CAAATCAATTTACAACTTACGTACAA----CAA-TA-CA-GA----A--TTATCT--ACAACA-AAAGGC-G----ATAAAATCCTTGGAATATTTATTGACGATTGCATGCT---ATGGAATTAACATTTACAATCTCTCTCcgtaaataattatcgtcctatatctattttgccaacattatcaaaacttatagaaaaatttattcatattaatttaatgaaatttataaataaatataacttattgcatataacacaaagtggttttagggaaggtcattcaactgaatctgcattaattcgtatgattgataaatggctaacggcaattaatgatggcaagttagttggagctgtcatggtcgattttcggaaggcctttgatctcgtaagtcatactactttactagcaaaactaaagtgctataaatgtagtgatcgttttttgatgtggatgaaatcttaccttacaaacagaggtcaagttgtgtctataaattcagcaacttcaaaaaccaattgtataacatcaggggttccacagggttctattttagggtcattgttatttttacttttataaatgatttaccattgtttacaaataacgtttcaacaactgacttatatgcagatgacacaacgttatatgacatacaaacaaatacagatattttaaaaggtaacttgcaaacttcaattaatcgtcttaatatgtggtgcattcaaaatggtatggtattgaatactgacaaaacaaaagtaatgttaaacacctctcgtcagaaacgacagcatttaaatcaaatcaatttacaacttacgtacaacaatacagaattatctacaacaaaaggcgataaaatccttggaatatttattgacgattgcatgctatggaattaacatttacaatctctctcaaa
gi|148762 : caaggttgctaaaactagcatcccctgttatatctgaaagtattatgtttattgtgaataaaagtttgcgagatggaatatttccacataCAAGGTTGCTTAAACACGCATCCCCTATTTTATCTGAAAGTATTATGTTTATTGTGAATAAAAATCT-GCGAGATGGAATATT--TCCACATA--TATG----GAAACAGGC---AAAGATAAAACCATT-CTATA---AAAGCGACCGA-AAGGATGACGTAAATAATTATAGTCC----TATTTCTATTTTGCCAACATTATCAAA---ACTTACAG---AAAAACTTAT-TCATATTAAT--TTAATGA-AATTAAT-AAATA-----AATAT---AACTTATTGCATAAAACACAA--AGTAGTTTTATG--GAAGTTCATTCAAC-TG--A--ATCTGCATTAATTC-GT-A--TGA-CTGATAAATGGCTAACG-GCAATTAATGATGG---------CA-AGCT---AGTTGGGGC----TGT--CATGGTC---GATTTTCGGAA-G---GCCTTTGATCTCGTA-A---GTCAT--A----CTATT------T-TA---CTAGCAAAA---CTAAA-GTG-----------CTATAA--AT-G-TAG--TG-ATCG---TTTTTTGATTTGGATGAAATCTGACCT-TA-CAAAC-AG--AGGTC-----A--AGTTG-TGT-CTA---TAAA--TTCAGCA-AC-T---TCAA----AA----A------TC-AA--TTG----T--AT--AACATCC-GGGGTTCCACAGGGTTCAA-G--T--T-TAGGTCCATTGTTAT---TT--TAAC---TTTTC-----ATA--AATGATTT-ACC--AT--TG-TTTA-T-A---AATTAC-GT-TACAACAACTGACTTAAATGCAGATGAC------AC---AAC--GTTATATGAC-AT----ACAA-A-----C--------AAAT---A----TAGATATTTTAAAAG-GTAAC-----TTGCAAA-TTCAAT-TAAT--CGTCT-T-AATATGTGGTGCATTCAAATTGGTATG--GTAT-TGAATACTGACAAATCAAAAGT---A-ATGTTAATCACCTCTCGTCAGAAACGACAGC-AT-TTAAAT----CAAATCAATTTACAACATACGCACAA----CAG-TA-CA-GA----A--TTAACT--ACAACA-AAAGGC-G----ATAAAATCCTTGGAATATTTATTGATGATTGCATGCT---ATGGAATAAATATTTACAATCTCTCTCaaa
gi|148763 : CAAGGTTTCTAAAACTAGCATCCCCTGTTATATCTGAAAGTATTATGTTTATTGTGAACAAAATTCT-GCGAGATGGAATATT--TCATCATA--TATG----GAAACAGGC---AACGATAAAAACATT-CTATA---AAAGCGGCCGA-AAGGATGACGTAAATAATTATCGTCC----TATATGTATTTTGCCAACATTATCAAA---ACTTATAG---AATTTTTTAT-TCATATTAAT--TAAATGA-AATTTAT-AAATA-----AATAG---AACTTATTGCATAAAACACAA--AGTGGTTTTAGA--GAAGGTCGTTCAAT-TG--A--ATCTGCATTAATTG-GT-A--TGG-TTGATAAACGGCTAACG-GCAATTAATGATGG---------CA-AGTT---AGTTGGG-C----TGT--CATGGTC---GATTTTCG-AA-G---GTCTTTGATCTCGTA-A---GTCAT--A----CTATT------T-TA---CTAGCAAAA---CTTAA-GTG-----------CTATTA--AT-G-TAT--TG-ATCG---TTGTTTTATGTGGATAAACTATT--TT-TA-CAAAC-AG--AGTTC-----A--AGTTG-AGT-CTA---TAAA--TTCAGCA-AC-T---TCAA----AA----A------AC-AA--TTG----T--AT--AACATCA-GGGGTTCCACAGGGTTCTA-T--T--T-TAGGTCCATTGTTAT---TT--TTAC---TTTTC-----ATA--AATAATTT-ACC--AT--TG-TTTA-T-G---AATAAC-AT-TTCAACAACTGACTTATATGCAGATGAC------AC---AAC--GTTATATGAC-AT----ACAA-A-----C--------GAAT---A----CAGATATTTTAAAAG-GTAAC-----TTGCTAACTTAAAT-TAAT--CGTCT-T-AATATGTGGTGCATTCAAAATGGTATG--GTAT-TGAATACTAACAAAACAAAAGT---A-ATATTAACCACCTTTCGTCAGAAACGACAGC-AT-TTAAAT----CAAATCATTTTACAAATTACGTACAA----CAG-TA-CA-GA----A--TTAACT--ACAACA-AAATGCAA----AAAAAAGTCTTGGAATATTTATTGACGATTGCATGCT---ACGGAATAAAAA--TA-AATCTCaaa
gi|148764 : CAAGGTTGCTAAAACTAGCATCCCCTGTTATATCTGAA-GTATTATGTTTATTGTGAATAAAAGTCT-GCAAGATGGATTATT--TCCACATA--TATT----GGAACAGGC---AAAGATAAAACCATT-CTATA---AAAGCGGTCGA-ATGTGTGCCGTGAATAATTATCGTCC----TATATCTATTTTGCCAACATTTTCAAA---ACGTTTAG---AAAAAAATAT-TCATACTAAT--TTGATGA-CATTTAT-GACTA-----A-TAA---AACTTATTGCATAAAACACAA--AGTGACTTTAGG--GAAGGTCATTTAAC-TG--A--ATATGCATTAATTA-GG-T--TGA-TTGATAAATGACTAATG-GCAATTAACGATTG---------CA-AGTT---AGTTGGGAC----TGT--CATTGTC---AATATTCGGAA-G---GCATTTGATCTCTTA-A---GTCAT--A----CTATT------T-TA---CTAGCAAAA---CTAAA-ATG-----------CTATAA--AT-G-CAG--TG-ATCG---TTTTTTGAGGTGGATGAAATCTTACCT-TA-CAAAC-AG--AGATC-----A--AAT
gi|148765 : CAATGTTGCCAAA-CTAGCATCCCCTGTTATATCTGAAAGTATTGTATTTATTGTGAATAAAAGTCT-GCGAGACTGAATATT--ACCACATA--TATG----GAAACAGGC---AAAGATAAAACCATT-CTATA---AAAGCGGCCGA-AATGATGACGTAAATAATTATCGCCC----TATATCTATTTTGCCAACATAATCAAA---ACTTATAG---AAAAATGTAT-TCATATTAAT--TTGATGG-CATTTAT-AAATA-----AATAT---AACTTATTGCATAAAACACAA--AGAAGTTTTA
gi|148766 : GTTGC--AAACTAGCATCCCCTGTTATATCTGAAAGTATCATGTTTATTGTGAATTAAAGTCT-GCGATATGGAATATT--TCCACATA--TATG----GAAACAGGC---AAAGATACAACCATT-CTATA---AAAGCGGCCGA-AAGGATGACGTAAATAATTATCGTCC----TATATCTATTTTGCCAACATTATTAA-----CTTATAG---AAAAATTTAT-TTATATTAAT--TTAATGA-AATTTAT-AAGTA-----AATAT---AACTTATTGCATAAAACACAA--AGTGGTTT-AGG--GAAGGTCAATCAAC-TG--A--ATCTGCATTAATTC-GT-A--TGA-TTGATAAATGGCTAACT-GCAATTAATGATGG---------CA-AGTT---TGTTGGGGC----TGT--CATGGTC---GATTTTCGGAA-G---GCCTTTGATCTCGTA-A---GTCAT--A----CTATT------T-TA---CTAGCAAAA---CTAAA-GTG-----------CTATAA--AT-G-TAG--TG-ATCG---TTTTTTGATGTGGATGAAATCTTACCT-TA-CAAAC-AG--AGGTT-----A--AGTTG-TGT-CTA---TAAA--TTCAGCA-AC-T---TCAA----AA----A------CC-AA--TTG----T--AT--AACATCA-GGGGTTCCACAGGGTTCTA-T--T--T-TAGGTCCATTGTTAT---TT--TTAC---TTATC-----ATA--AATGATTT-ACC--AT--TG-TTTA-T-A---AATAAC-GT-TTCAACAACAAACTTATATGCAGATGAC------AC---AAC--GTTATATGAC-AT----ACAG-A-----C--------AAAT---A----CAGATATTTTAAAAG-GTAAC-----TTGCAAACTTCAAT-AAAT--CGTCT-T-AATATGTGGTGCATTCAAAATGGTATG--GTAT-TGAATACTGACAAAACAAAAGT---A-ATGTTAATCA-CTCTCGTCAGAAACGACAGC-GT-TTAAAT----CAAATCAATTTACAACTTACGTACGA----CAG-TA-CA-GA----A--TTAACT--ACAACA-AAAGGC-G----ATAAAATCCTTGGAATATTTATTGACGATTGCATGCT---ATTGAATAAACATTTACAATCTCTCTC
gi|148767 : TTGCTTATACTAGTTTCATACGTTTCATCTGAACGTATTATGTTTACTTTAATTAAAAGTCT-GCGAGATGGAATATT--TCCACATGCTTAT------AAACAGGC---AGAGATAAA--CATTTCTATA---AAAGCGATCGA-AGTGATGACATGAAGGCTTATCGTCT----TATATCTAGTTTGCCAACATTATCAAA---ACTTATAG---GAACATATAT-TCATATTAAT--TTGATGA-CATTTAT-AACT------TGCGT---AA-TTA-TGCGTAAAACACAA--AGTGATGTTAGG--ACAGGTCATTTAAC-TG--A--ATCTGCATTAATTC-AT-A--GGA-TTCATAAATGATTAACG-GCATTTAACGACGG---------CA-AGAT---Aaaa
gi|148768 : TTATGTATA--ATAAATACAAGTTTAGCCAG-TGGAAGCTT--TCCATCCG--CATG----GAAACA--------------AAC-GTT-TTTTA---AGAGTGGAAGT-AAAGATAAAATAAACAACTGTCACCCCTGCTACCGCTATATTAACAACTTTATCGAA------TGTAGTTGAAGAATATCT-CGGTTCTCAT--TTGAATT-CCTTCTT-CAACA-----ATCAT---TATATATTACATGAGTCTCAA--AGCGGATTTAGA--GAAGGTCATTCAACATA--ATTATCTGTTTTGTTT---T-A--TTACTTGATTAATGTCTGAGT-GCAATTAATGAGGGA--------CA-ATTTGTAAGATG--------TGT--TATGGTC---TATTTCAAGAA-GAAAAC----GATCAAGTA-A---ATCAT--G----ATA----------TA---CTAATAAAAAATCTCAA-ACT-----------TTACAA--AT-G-TAG--CG-ATAA---ACTAGCAAAGTGGTGTCAATCATACAT-TA-CCAAT-CGCTAG--C-----A--AGTTG-T
gi|148769 : TGTAATATTCCTCAAAATA--TATTTTTTGAAACAGAC---AAATATAAAACCATT-CTATA---AAAGCGATAGA-AAGGATGACGT------------------------CTATTTTGC-GACATTATCAAA---ATTTATAG---AAAAAT--AT-TCATATTAAA--TTGATGA-CATTTAT-GAATA-----AATA--------------ACAAAA----A--AGTGGTTTTATG--AAA--------------------TCTGCATTTATCC-GT-A--TAA-TTGATAAATGGCTAATG-GCAGTTAACGACGG---------C----------------------TGT--CATGGAC---GATTTT-AGAT-G---ACCTTTGATCTCGTT-A----CCAT--A----TCATT------T-TA---CTAGCAAAA---CTAAA-ATG-----------ATATAA--AT-G-CAG--TG-ATCT---TATTTTGACGTGGTTGAAATCTTACCT-CG-CAAAC-AG--AGTAC-----A--AGTTG-TGT-C-----TAAT--TTCAGCT-AC-T---ACAG----GA----A------CC-AA--TTG----T--AT--AACATGA-AGTGTTCCGCAGGGT--TA-T--TAAT-TAGGTTCATTGTTAG---TT--TTAC---TTTTT-----ATA--A
gi|148770 : AAAAATGC---AAAAGTAA---C-TC-CTATACACAAAAAGGGAGATAAATCTGAGGCAACTAATTACAGACC----TATATCAGTACTACCAACATTGTCTAA---GTTAATTG---AAAAACATATCTCCCAACAAC--TTTATAAGTATTTGTCAGAT--------TTT---AACCTATTACATCCATCTCAA--TCTGGATTTAGGCCGAA--TCACTC--C-TGTCA--AACAGCACTAATAA-AT-A--TAA-CTGACAAATGGTTACAA-GAAATGAATGATGG---------AA-ACAT---AAATGGAGT----AGT---AT--TCTTGGATTTAAAAAA-A---GCTTTTGATGTTGTT-G---ATCACAAA----CT-CT------TATG---CCA--AAAG---CTTAA----------------TATAT--ATGG-TTG--TA-CTCGAACTTCCCTGAAGTTGTTTGAATCATATCT-TA-ATAAC-AG--AACAC-----AGCAG--G-TA---------AAA--GTAGGAA-AT-G---CCAAGTCTAA----ATCTGCCCC-TA--TT-----T--CT----CAT---GGAGTTCCCCAAGGTTCAA-T--A--C-TGGGTCCATTAC--T---TT--TCAT---TTTAT-----ATATTAATGACCT-CCC--AT--TA-CATG-T-A---AAAAACAGT----GA-AACTGATATGTATGCAGATGAC------TC---CAC--ATTCCAC-AC-TTCAGGAAAA-A-----CTGTTGGAGAAATTCAG----CAGAGA--TTACAAG-CCGAC-----TT---AACTTC----TA--------T-A-AATAAATGGTG--TTCAAGA-AATATGATGTATATTAATACAGAAAAAACTAAttccattaaattaaattcaattttataagcaaactatcagcaaacatatcaggttgaccatttataacgtt
gi|148771 : AGTC---AAA-ATCACACCAAT-TTTTA---AGAAAGGTTTA-AAACAAGACAAAAATAACTATCGCCC----AATTTCCATTCTTCCTATTCTGTCTAAGATACTT---G---AGAGACATGT-TAGTAATAGTGTTCGGT---CTTTTTT-AAATA-----CATAC---AATTTATTGCATGAAAGACAATCAG-GG-TTCAGA--TCTGATCATTCATG-CG--A--AACAGCATTAA--CAGTGA--TGG-TTGATGACTGGATCACA-GCTATTGATCAAAA---------CA-GAAT---ATCTGGAACCATATTT--CTTGACC---TATCT----AA-A---GCATTTGATCTGGTT-G---ATCAT--AGT--TTAC---------TG---CTTGAAAAA---CTAAATGTATTCCATTT---CCATAAAGAT-G-TA--------CA---------AAATTGGTTTAAATCCTATTTATG-TGAAC------GTTCACAAAA--AGTT----T-CAA---TAGC--T--GGTACACTT---TCAG----AA----A------GT-AA--ATC----A--GT--AACATGT-GGTGTACCCCAAGGATCTG-T--T--T-TAGGCCCACTTCTAT---TTA-TTA----TCTTT-----ATC--AATGATAT-GCC--CT--TA---TG-C-ACTCAGTA------TTCAAAAATGAACATGTTTGCTGATGACTCCTCTAT---CAC--TTTATCTGGTAAT----TCAATAT----C--------AGAC---ATCACCGAATCTCTTAA-----TAA-------TG-AA---TTAAT-AAAT---GTC--C-AACA-ATGGTGTAATAATAATTGGATG--ACCA-TAAATACTTCAAAAACCAAAGC---A-ATGTTTATAGCCTCTCATCCAAAGCAACCACTAT-TCAGAT----CA----GATTAGC-ACTTA---AAAA----TAG-GA-GATGAGGCTA--TTGAAT---TTACA-AGTAGT-G----AAAAACTTCTGGGAGTAACAATTGACAA---CACACTAACATGGACTCAACA
gi|148772 : TTTAT-AAGTATCTGTAAGATTTTAACCTATTACATTTATCTCAA--TCTGCATTTAGGCCGAA--TCACTC--C-TGTCA--AACAGCACTAATAA-AT-A--TAA-TTGACAAATGG-TAACAAGAAATGAATGATGGAAACATAAACAGAGTT---A-CTGTAGT----TATTTCTTGG------ATTTATAAAA-A---GCTTTTGATGTTGTT-G---ATCAC--A----A-ACTC-----T-TA----TGCCAAAAG--CTTAA----------------TATAC--AT-GGTTG--TG-CTCAAACTTCCCTGAAGTTGTTTGAATCATATCT-AA-ATAAC-AG--AACAC-----A------G-TAG-GTA---AAAG--T--AGGA-AA-T---GCAA----AG----T------CT-AAATCTGCCCCT--AT--TTC-TCATGGAGTTCCCTAAGGTTCCA-T--A--C-TGGGTCCATTAC--T---TT--TCAT---TTTAT-----ATATTAATGATCT-CCC--AT--TA-CATG-T-A---AAAAACAGT----GA-AACTGATATGTATGCAGATGAC------TC---CAC--ATTCCAC-AC--T----TCAG-G-----A--------AAA----A----C---TGTTTGAAAAATTTAGCAGAGATTACAAGC--CGACATAA---CTTCTATAAATAAATGGTG--TTCAAGA-AATATGATGTATATTAATACAGA-AAAAAATAAGT---GTATGACAATagttgaaaacactctaaaa
gi|148773 : aacATAT---ATCTTA--ACATCAGTCTCAA--CGTGGTTTTAGA--ATAAGTCATTCAAC-GG--A--ATCTTCTTTA--TT-AT-AATTGT-TTGATAAAGAGATAGAG-ACAACAGACGAAGG---------TC-AGTT---TGTAGGATA----TGT--TATGGTC---GATTTCAGAAA-A---GCATTCGATTAAGTA-AAATGAAAT--A----CTATTAAAAGGT-TAAAGCTTTCCAAA----TGAA-GCG-------------ATGA--AT---TAAATTGTATCG---TATTTTGATG----------CATACCT-TACCGAAC--G--CTCTC-----A--AGTTGTTGA-C-A---TAAA--TT---GG-AC-TATGTCAG----AA------------C-AA--AAG----TCCAT--CGCGTGT-TGCGTTCCACACTGCTCCAGC--C--T-TGGGCTTGTT-TTGT---GT--TAAT---CATTT-----ATA--AACAACTTAACC--ATGACGCTTTC-T-A---AA-ATT-GT-CTCAGGTACTGATTTATATGCAGATGAT------ACTATAATTGATTATTTTAA-AT----CTGA-A-----A--------AAAA---A----AGGAAATCTTGAACG-A-AAT-----GTTCAGTGTTCACT-AAATTATATTT-T-AA-AT-TGATGTAAATAGAACGAAATG--CTTT-TAAACACTGCCAAAACAAAAGTCTCA-ATGT
gi|148774 : ---GATTTTTAAAACA---GTCTTTGATCTAGTT-A---GCCAT--G----AAACT------C-TT---CCTGCAAAA---CTAAA-ATGTAACAGTTTTTCGACAA--AT-G-TA--------C----TTTTGTAAAGT---TTAGTTCTTATCT-----AAATGAA--AGAGC-----A--AATTG--GTACTA---TAAAAATT--ATA----T---TCAA----AC----T------CC-AA--TCG----A--ATTGAAAGT---GGTGTACCTCAAGGATCTA-TA-C--T-TGGG-CCAATGTTAT---TCA-TTA----TGTTT-----GTA--AATGATTT-GCC--AC--TT-TATG-T-C---AATAAT-GC-T
gi|148775 : AA-A---GCCTTTGATTTAGTT-A---ATCAC--G----ACATT------C-TT---CTTGCAAAA---CTAAA-ATG-----------TTACAA--TT-T-CAA--AA-AATG---CACTTTGAAGTGGTTAAGTTCTTATCT-----AAATGAA--AGTGC-----A--AATTG-GTT-CTAAGTTATA--T--AATA-TA-T---TTAA----AA----T------CC-AA--TCT----A--AT--TAGAAGT-GGGGTACCTCAAGGATCTA-T--A--CATGGG-CCATTGTTATAAATTCATTA----TATTT-----GTA--AATGATCT-GTC--AC--T
gi|148776 : AA-A---GCATTTGATCGCATGTA---GTTAA--AAGGTCTTCTG-----T-TC---AAAGTAAAG---C-AAA-ATG-----------GTATAA--AA-G---G--TA-ATC-----TTCTTAAT-TGATTGAA-------------CAAAG-AG--TTTTT-----AT-AGTTA-TTA-CTT---TT----TTCAGAA-A--T---ACAA----GA----A------AC-AA--CTG----------------CC-GGAGTTCCCCAAGGTTTAA-T--T--C-TGGGTCCTTTATTCT---TT--TTAA---TTTAC-----ATA--AATGATAT-AGCTAAA--AA-TTTGTT-A---AGTA----T-T---AC-AC--ACATATTTGCAGATGAT------AT---A
gi|148777 : -T---TCAA----AATCCAA------CCTAA--TT-----T--AT--AAGAG-T-GGGGTACCTCAAGGATCTG-TCCT--T-TGG--CCATTGTTAT---TTA-TTA----TGTTT-----GTA--AATGATTT-GCC--AC--TT-TATG-T-C---AATAAC-GC-T--AAC-ACTGATAAATTTGCAGATG
gi|148778 : C-AA--ATC----T--AC--AACAGCT-GGTGTTCCACAGGGCTCTG-T--T--C-TAGGTC---TGCTAT---TT--TTCCTTGTTTTT-----GTT--AATGAT--------AT--TG-T
gi|148779 : CT-GGTGTTCCTCAAGGCTCAA-T--T--C-TTGGTCCATTATTAT---TT--CTTG---TTTAT-----ATC--AATGAT--------AT--TG-TTTC-TGA---AATA---GG-CTCTGCGATTCGCTTCTTTGCTGACGAC------AC---AAC--CCTTTATG
gi|148780 : aatatcgg-GGTGTTCAACAAGGTTCTG-T--T--T-TAGGTCCTTTATT-T---TT--TTAT---TTTTTTTTACATT--AATGATAT-A--------------G-C-A---GAGAAC-GTATTGCACAA--AACTT---TCCGAATGAT------AC--------GTCACATG-C-TT----ATTA-A-----C--------AAAT---T----CAGA
gi|148781 : A--GATGATTT-ACT--AT--T-------------ACTAAC-GT-TTCAACAACTGA--TATATGCAGACGAC------AC---AAC--GTTATATTAC-AT----ACAA-A-----C--------AATT---A----TAGATTTTTTTAAAA-GTAAC-----ATGCAAACTTCAAT-TAAT--CGTCT-T-AATATGTGGTGCATTTAAAATAGTATG--GTAT-TTAATACTGACACAACCAAAGT---A-ATGTCAATCAACTCTCGACAGAAACGAAAGC-GT-TGCAAT----TGTATTGATTTACAACTTACGTACAG----CTG-TATTT-TA----A--TTAGCT--GCTACA-ACATGC-A----ATAAAATCCTTGGAATATTTTATGACAATTGCAATCT---ATGAAATAAACATTTATTATCTCTCTC
gi|148782 : ATGAT------AC---TAC--CTTATCTAAA-AT----AGGA-GAATCTC--------AAA----A----T-GATATTC---AAA-TTAAA-----TTACAAAATTCTCT-AAAT--GATCT-G-CAAACTTGGTGCAAGCATAATGGCATG--CTTA-TAAATTCTGCAAAAACCAAAGT---G-ATGTTAATAACAACTCAT--GAAATGACAGC-ACATTAAATTTTGCAAATTGATTTTCAGCTAAACTATAA----TGA-TG-CA-AAT---C--TTGCCTTAATATCA-AA---T-G----ACAAAATAATTGGGATcaa
gi|148783 : GATGG-CATTTAT-AAATA-----AATAT---AACTTATTGCATAAAACACAA--AGAAGTTTTA
gi|148783 : T--AAAACACAAAGAA-GTTTTATAAAATCCTTGGAATATTTATTGACGATTGCATGCT---ATGGAATAAACATTTACAATCTCTCTCtaaaatccttggaatatttattgacgattgcatgctatggaataaacatttacaatctctctcaaa
gi|148784 : gatggcatttataaataaatataacttattgcaAT----GAAATC---TTAC--CTTACAAACAGAGATCAAATA-CA-GA----A--TAGACT--ACTACA-ACAGGC-G----ATAAAATCCTTGGAAAATTTATTGAAGATTGCATGCT---ATGGAATAAACATTTACAATCTCTCTaaa
gi|148785 : ACG-ACGG----CAA-GA-TA-AA----AGTTCAATT--ACAATA----GGC-G----ATAAAATCCTTGAAATATTTATTGATGATTGCATACT---ATGAAA-AAACAATAACAATCTCTCTacaaa
blockSeqs : A CC CT TTTTT CGA T CAC T CTGC GAT TTG T C GT GT C TCTGT TTT TC CC G A TC TT CA G AT C A T AAACATAAA G GTA AACCATA TT TTG TC GAAA C GT AAT AA AGGT AAAAGG A AAG AAT TG TAACAGTTTTTC AG G G AAT T GAAC T A G ATG G CT GT ACAAA GC TTGA T AGT AA TC C C CT ATG GTCT ATCTGCCC T AT GCCCCT TGA CAT G A G TAA A G AAA CA CTTG TTTAC TT T AA TA GA GCTT GT G CTC A A ATT CA T TCCTCT TATA TG G A CAGG T CTGTTGGAG CATCAC A TT AGAGA C A AT TAT ATA TG C T AT A G C CTC T T A TTTG A A T AGAT A T T GGCT GT TA C A TTTT AAC
blockSeqs : . . . A . . . . . . . T . . A . . . . CC G . TC . C . . . . T A . . AGC . . TC CA C A . . GT C . . G G TTCCATTTC . . . G . AAAC T A G TAC G . GT . T TGT T . . TC C . C . . TCCAAC . . GTCC A CA G A . CCT . T . A C . TT T A . . GTT A . . A A TT CA T . A . G . . . AATCTC TTCAG A G . C A T C T TG C T AT A G C . . . . . A A C . . . . T . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . . . . . . T . . A . . . . . G . . . C . . . . T . . . GGC . . TC G C A . . . G . . . G C . . . G . G T A A TA . . TT . . TGT T . . TC C . C . . AC . . GT A CC G A . AC . T . A C . . T A . . GTT A . . A . TA CA T . A . G . . . TC TA A G . C A T C T TG C T . . G C . . . . . A A T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . . . . . . A . . A . . . . . G . . . G . . . . C . . . GAC . . TC G A A . . . . . . . G C . . . T . G G A G TA . . AT . . AGT T . . TC C . C . . AT . . GT A CA G A . T . T . A C . . T A . . GTT A . . A . TT CA T . A . G . . . C TA A G . C A T C T TG C T . . G C . . . . . A A T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . T . . . . . . . G . . C . . . . . G . . . A . . . . T . . . GGC . . TC G C A . . . . . . . A C . . . G . G T A G TA . . GT . . TGT A . . TC C . C . . AA . . GT A CA T G . T . T . . C . . C A . . GTT A . . A . TT AA A . A . G . . . C TA A G . C A A C T AA T T . . T A . . . . . G A T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . . . . . . T . . C . . . . . G . . . C . . . . C . . . AGT . . CA G C A . . . . . . . G C . . . G . G A T T TA . . TA . . TGT T . . TA A . C . . AC . . GT A GA A C . T . T . . C . . A C . . ACA G . . A . TT GT A . C . T . . . C TA G C . G G T C A AA T C . . A A . . . . . G A T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . . . . . . A . . A . . . . . G . . . C . . . . T . . . AGT . . AA G T A . . . . . . . A C . . . G . G C T G TA . . CA . . TAG T . . TC T . T . . AC . . GT A GT T C . T . C . . T . . C G . . ACA G . . T . CT CG A . C . G . . . C AA G A . C A A C C TG C T . . T C . . . . . G . A . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . . . . . . A . . C . . . . . G . . . C . . . . C . . . ATA . . AT G A T . . . . . . . A T . . . G . A A T T TA . . TT . . GTA T . . T G . A . . AG . . CA T GT A C . A . T . . T . . T C . . TTA G . . A . CT CA T . C . G . . . A TT A G . A A A G T CT C T . . A C . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . A . . C . . . . . A . . . A . . . . T . . . GC . . CA A T T . . . . . . . G A . . . G . T A T T CG . . CA . . GTT T . . T G . C . . TC . . GA C GT C A . T . C . . T . . T G . . ATT C . . A . TT CA A . A . T . . . A TA A T . . T T . T A . . . . T A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . C . . . . . . . . . A . . . . T . . . . . . TT A A T . . . . . . . A T . . . G . A A T T TA . . CT . . TTA . . . . T . A . . TC . . TA T CC T T . A . T . . A . . C G . . TTA G . . A . T A A . A . A . . . C A . . . . . A . G T . . . . A . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . C . . . . . . . . . T . . . . T . . . . . . T A C T . . . . . . . A G . . . A . G T T T AA . . AG . . TA . . . . T . . . . TC . . CT A CT G T . C . T . . G . . A A . . GTT G . . A . T A T . A . . . . . C A .
blockSeqs : C . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . A C A . . . . . . . A . . . . G . G A T A . . . TG . . T . . . . A . . . . AA . . T A CT A C . A . T . . T . . T G . . A C . . . . . C T . T . .
blockSeqs : . . . . A A T . . . . . . . . . . . . . . . A . G . . . TT . . . . . . . G . T G T . T . T . . . . . A A . . . G . . . . . C . . .
blockSeqs : . . A . T . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . T . . T A . T . . . . . . . T A . . . . . . . .
blockSeqs : . T T . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T A . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : .
blockSeqCons :
originalCons : CAAGGTTGCTAAAACTAGCATCCCCTGTTATATCTGAAAGTATTATGTTTATTGTGAATAAAAGTCT-GCGAGATGGAATATT--TCCACATA--TATG----GAAACAGGC---AAAGATAAAACCATT-CTATA---AAAGCGGCCGA-AAGGATGACGTAAATAATTATCGTCC----TATATCTATTTTGCCAACATTATCAAA---ACTTATAG---AAAAATNTAT-TCATATTAAT--TTGATGA-CATTTAT-AAATA-----AATAT---AACTTATTGCATAAAACACAA--AGTGGTTTTAGG--GAAGGTCATTCAAC-TG--A--ATCTGCATTAATTC-GT-A--TGA-TTGATAAATGGCTAACG-GCAATTAACGATGG---------CA-AGTT---AGTTGGGGC----TGT--CATGGTC---GATTTTCGGAA-G---GCCTTTGATCTCGTN-A---GTCAT--A----CTACT------T-TA---CTAGCAAAA---CTAAA-GTG-----------CTATAA--AT-G-TAG--TG-ATCG---TTTTTTGANGTGGNTGAAATCTTACCT-TA-CAAAC-AG--AGNTC-----A--AGTTG-TGT-CTA---TAAA--TTCAGNA-AC-T---TCAA----AA----A------CC-AA--TTG----T--AT--AACATCN-GGNGTTCCNCAGGGTTCTA-T--T--T-TGGGTCCATTGTTAT---TT--TTAC---TTTTT-----ATA--AATGATTT-ACC--AT--TG-TTTG-T-A---AATAAC-GT-TTCAACAACTGACTTATATGCAGATGAC------AC---AAC--GTTATATGAC-AT----ACAA-A-----C--------AAAT---A----CAGATATTTTAAAAG-GTAAC-----TTGCAAACTTCAAT-TAAT--CGTCT-T-AATATGTGGTGCATTCAAAATGGTATG--GTAT-TGAATACTGACAAAACAAAAGT---A-ATGTTAATCACCTCTCGTCAGAAACGACAGC-AT-TTAAAT----CAAATCGATTTACAACTTACGTACAA----CAG-TA-CA-GA----A--TTAACT--ACAACA-AAAGGC-G----ATAAAATCCTTGGAATATTTATTGACGATTGCATGCT---ATGGAATAAACATTTACAATCTCTCTC
finalCons : CAAGGTTGCTAAAACTAGCATCCCCTGTTATATCTGAAAGTATTATGTTTATTGTGAATAAAAGTCT-GCGAGATGGAATATT--TCCACATA--TATG----GAAACAGGC---AAAGATAAAACCATT-CTATA---AAAGCGGCCGA-AAGGATGACGTAAATAATTATCGTCC----TATATCTATTTTGCCAACATTATCAAA---ACTTATAG---AAAAATNTAT-TCATATTAAT--TTGATGA-CATTTAT-AAATA-----AATAT---AACTTATTGCATAAAACACAA--AGTGGTTTTAGG--GAAGGTCATTCAAC-TG--A--ATCTGCATTAATTC-GT-A--TGA-TTGATAAATGGCTAACG-GCAATTAACGATGG---------CA-AGTT---AGTTGGGGC----TGT--CATGGTC---GATTTTCGGAA-G---GCCTTTGATCTCGTN-A---GTCAT--A----CTACT------T-TA---CTAGCAAAA---CTAAA-GTG-----------CTATAA--AT-G-TAG--TG-ATCG---TTTTTTGANGTGGNTGAAATCTTACCT-TA-CAAAC-AG--AGNTC-----A--AGTTG-TGT-CTA---TAAA--TTCAGNA-AC-T---TCAA----AA----A------CC-AA--TTG----T--AT--AACATCN-GGNGTTCCNCAGGGTTCTA-T--T--T-TGGGTCCATTGTTAT---TT--TTAC---TTTTT-----ATA--AATGATTT-ACC--AT--TG-TTTG-T-A---AATAAC-GT-TTCAACAACTGACTTATATGCAGATGAC------AC---AAC--GTTATATGAC-AT----ACAA-A-----C--------AAAT---A----CAGATATTTTAAAAG-GTAAC-----TTGCAAACTTCAAT-TAAT--CGTCT-T-AATATGTGGTGCATTCAAAATGGTATG--GTAT-TGAATACTGACAAAACAAAAGT---A-ATGTTAATCACCTCTCGTCAGAAACGACAGC-AT-TTAAAT----CAAATCGATTTACAACTTACGTACAA----CAG-TA-CA-GA----A--TTAACT--ACAACA-AAAGGC-G----ATAAAATCCTTGGAATATTTATTGACGATTGCATGCT---ATGGAATAAACATTTACAATCTCTCTC
Alignments
lowQualScore : 11111 111111111 111111 222222222222 1111 111111111111 11111111 111 11 1111 11111111111111 11 1111
lowQualScore : 0 0 4 55 55 00000 555 3 555 3 7777 555 555 4 3 44 33 2 77777 444 33 0 88 2 0 3 88 44 55 3 44 3 0 3 1 555555555 3 555 9999999 44 555 55 0 44444 2 0 33 444 33 9999 0 333333 2 444 777 55 444444444444 33 2 2 444 2 0000 1 2 2 0 0 5555 5 33 44 66666 66 44444 2 555 44 77 1 3 33 555 6666 444444444444 2 33 00000000 444 000 1 1 2 66666 2 1 444 00 2222 55555 66 4 22 33 33 6666 33 2 444 2 5 555 11 2 0 888888 6666 44 2 3 7777 3 77777777777777 999999999 1 44 99999 1 1 44 555 444 22 2 1 00 7 1 1 777 4 5 5 9999 4 1 2 8888 4 4 4 2222 55 55 3 3 7777 777
lowQualScore : . . . .. .. ..... ... . ... . .... ... ... . . .. .. . ..... ... .. . .. . . . .. .. .. . .. . . . . ......... . ... ....... .. ... .. . ..... . . .. ... .. .... . ...... . ... ... .. ............ .. . . ... . .... . . . . . .... . .. .. ..... .. ..... . ... .. .. . . .. ... .... ............ . .. ........ ... ... . . . ..... . . ... .. .... ..... .. . .. .. .. .... .. . ... . . ... .. . . ...... .... .. . . .... . .............. ......... . .. ..... . . .. ... ... .. . . .. . . . ... . . . .... . . . .... . . . .... .. .. . . .... ...
lowQualScore : 5 1 4 55 55 11111 888 6 888 3 1111 888 888 2 3 66 99 9 11111 777 77 5 55 8 4 1 55 22 88 1 22 1 2 1 1 444444444 1 444 9999999 66 444 11 7 88888 1 5 77 777 77 3333 8 000000 7 777 333 77 555555555555 77 7 7 111 7 9999 0 9 1 9 5 0000 3 77 66 77777 33 66666 4 444 22 77 0 1 77 000 1111 444444444444 7 77 55555555 666 777 0 0 4 22222 4 4 111 33 6666 99999 11 0 55 22 22 0000 00 7 777 5 3 555 66 0 1 222222 5555 22 8 3 1111 3 99999999999999 999999999 7 22 11111 4 4 11 555 222 77 0 3 00 3 2 4 000 0 0 0 4444 4 9 4 5555 0 0 0 5555 55 00 6 6 7777 000
consensus : CAAGGTTGCTAAAACTAGCATCCCCTGTTATATCTGAAAGTATTATGTTTATTGTGAATAAAAGTCT-GCGAGATGGAATATT--TCCACATA--TATG----GAAACAGGC---AAAGATAAAACCATT-CTATA---AAAGCGGCCGA-AAGGATGACGTAAATAATTATCGTCC----TATATCTATTTTGCCAACATTATCAAA---ACTTATAG---AAAAATNTAT-TCATATTAAT--TTGATGA-CATTTAT-AAATA-----AATAT---AACTTATTGCATAAAACACAA--AGTGGTTTTAGG--GAAGGTCATTCAAC-TG--A--ATCTGCATTAATTC-GT-A--TGA-TTGATAAATGGCTAACG-GCAATTAACGATGG---------CA-AGTT---AGTTGGGGC----TGT--CATGGTC---GATTTTCGGAA-G---GCCTTTGATCTCGTN-A---GTCAT--A----CTACT------T-TA---CTAGCAAAA---CTAAA-GTG-----------CTATAA--AT-G-TAG--TG-ATCG---TTTTTTGANGTGGNTGAAATCTTACCT-TA-CAAAC-AG--AGNTC-----A--AGTTG-TGT-CTA---TAAA--TTCAGNA-AC-T---TCAA----AA----A------CC-AA--TTG----T--AT--AACATCN-GGNGTTCCNCAGGGTTCTA-T--T--T-TGGGTCCATTGTTAT---TT--TTAC---TTTTT-----ATA--AATGATTT-ACC--AT--TG-TTTG-T-A---AATAAC-GT-TTCAACAACTGACTTATATGCAGATGAC------AC---AAC--GTTATATGAC-AT----ACAA-A-----C--------AAAT---A----CAGATATTTTAAAAG-GTAAC-----TTGCAAACTTCAAT-TAAT--CGTCT-T-AATATGTGGTGCATTCAAAATGGTATG--GTAT-TGAATACTGACAAAACAAAAGT---A-ATGTTAATCACCTCTCGTCAGAAACGACAGC-AT-TTAAAT----CAAATCGATTTACAACTTACGTACAA----CAG-TA-CA-GA----A--TTAACT--ACAACA-AAAGGC-G----ATAAAATCCTTGGAATATTTATTGACGATTGCATGCT---ATGGAATAAACATTTACAATCTCTCTC
Reference ( family-701 ) : CAAGGTTGCTAAAACTAGCATCCCCTGTTATATCTGAAAGTATTATGTTTATTGTGAATAAAAGTCT-GCGAGATGGAATATT--TCCACATA--TATG----GAAACAGGC---AAAGATAAAACCATT-CTATA---AAAGCGGCCGA-AAGGATGACGTAAATAATTATCGTCC----TATATCTATTTTGCCAACATTATCAAA---ACTTATAG---AAAAATNTAT-TCATATTAAT--TTGATGA-CATTTAT-AAATA-----AATAT---AACTTATTGCATAAAACACAA--AGTGGTTTTAGG--GAAGGTCATTCAAC-TG--A--ATCTGCATTAATTC-GT-A--TGA-TTGATAAATGGCTAACG-GCAATTAACGATGG---------CA-AGTT---AGTTGGGGC----TGT--CATGGTC---GATTTTCGGAA-G---GCCTTTGATCTCGTN-A---GTCAT--A----CTACT------T-TA---CTAGCAAAA---CTAAA-GTG-----------CTATAA--AT-G-TAG--TG-ATCG---TTTTTTGANGTGGNTGAAATCTTACCT-TA-CAAAC-AG--AGNTC-----A--AGTTG-TGT-CTA---TAAA--TTCAGNA-AC-T---TCAA----AA----A------CC-AA--TTG----T--AT--AACATCN-GGNGTTCCNCAGGGTTCTA-T--T--T-TGGGTCCATTGTTAT---TT--TTAC---TTTTT-----ATA--AATGATTT-ACC--AT--TG-TTTG-T-A---AATAAC-GT-TTCAACAACTGACTTATATGCAGATGAC------AC---AAC--GTTATATGAC-AT----ACAA-A-----C--------AAAT---A----CAGATATTTTAAAAG-GTAAC-----TTGCAAACTTCAAT-TAAT--CGTCT-T-AATATGTGGTGCATTCAAAATGGTATG--GTAT-TGAATACTGACAAAACAAAAGT---A-ATGTTAATCACCTCTCGTCAGAAACGACAGC-AT-TTAAAT----CAAATCGATTTACAACTTACGTACAA----CAG-TA-CA-GA----A--TTAACT--ACAACA-AAAGGC-G----ATAAAATCCTTGGAATATTTATTGACGATTGCATGCT---ATGGAATAAACATTTACAATCTCTCTC
gi|148760 : CAAGGTTGCTAAAACTAGCATCCCCTGTTATATCTGAAAGTATTATGTTTATTGTGAATAAAAGTCT-GCGAGATGGAATATT--TCCACATA--TATG----GAAACAGGC---AAAGATAAAACCATT-CTATA---AAAGCGGCCGA-AAGGATGACGTAAATAATTATCGTCC----TATATCTATTTTGCCAACATTATCAAA---ACTTATAG---AAAAAATTAT-TCATATTAAT--TTAATGA-AATTTAT-AAATA-----AATAT---AACTTATTGCATAAAACACAA--AGTGGTTTTAGG--GAAGGTCATTCAAC-TG--A--ATCTGCATTAATTC-GT-A--TGA-TTGATAAATGGCTAACG-GCAATTAATGATGG---------CA-AGTT---AGTTGGGGC----TGT--CATGGTC---GATTTTCGGAA-G---GCCTTTGATCTCGTA-A---GTCAT--A----CTACT------T-TA---CTAGCAAAA---CTAAA-GTG-----------CTATAA--AT-G-TAG--TG-ATCG---TTTTTTGATGTTGATGAAATCTTACCT-TA-CAAAC-AG--AGGTC-----A--AGTTG-TGT-CTA---TAAA--TTCAGAA-AC-T---TAAA----AA----A------AC-AA--TTG----T--AT--AACATCA-GGGGTTCCACAGGGTTCTA-T--T--T-TAGGTCCATTGTTAT---TT--TTAC---TTTTT-----ATA--AATGATTT-ACC--AT--TG-TTTA-T-A---AATAAC-GT-TTCAACAACTGACTTATATGCAAATGAC------AC---AAC--GTTATATGAC-AT----ACAA-A-----C--------AAAT---A----CAGATATTTTAAAAG-GTAAC-----TTGCAAACTTCCAT-TAAT--CGTCT-T-AATATGTGGTGCATTCAAAATGGTATG--GTAT-TGAATACTGACAAAACAAAAGT---A-ATGTTAATCACCTCTCGTCAGAAACGATAGC-AT-TTAAAT----CAAATCAATTTACAACTTACGTACAA----CAG-TA-CA-GA----A--TTAACT--ACAACA-AAAGGC-G----ATAAAATCCTTGGAATATTTATTGACGATTGCATGCT---ATGGAATCAACATTTACAATCTCTCTC
gi|148761 : CAAGGTTGCTAAAACTAGCATCCCCTGTTATATCTGAAAGTATTATGTTTATTGTGAATAAAAGTTT-GCGAGATGGAATATT--TCCACATA--TATA----AAAGC-GGCCGAAAGGATGA
gi|148761 : TATA---AAAGCGGCCGA-AAGGATGACGTAAATAATTATCGTCC----TATATCTATTTTGCCAACATTATCAAA---ACTTATAG---AAAAATTTAT-TCATATTAAT--TTAATGA-AATTTAT-AAATA-----AATAT---AACTTATTGCATATAACACAA--AGTGGTTTTAGG--GAAGGTCATTCAAC-TG--A--ATCTGCATTAATTC-GT-A--TGA-TTGATAAATGGCTAACG-GCAATTAATGATGG---------CA-AGTT---AGTTGGAGC----TGT--CATGGTC---GATTTTCGGAA-G---GCCTTTGATCTCGTA-A---GTCAT--A----CTACT------T-TA---CTAGCAAAA---CTAAA-GTG-----------CTATAA--AT-G-TAG--TG-ATCG---TTTTTTGATGTGGATGAAATCTTACCT-TA-CAAAC-AG--AGGTC-----A--AGTTG-TGT-CTA---TAAA--TTCAGCA-AC-T---TCAA----AA----A------CC-AA--TTG----T--AT--AACATCA-GGGGTTCCACAGGGTTCTA-T--T--T-TAGGGTCATTGTTAT---TT--TTAC----TTTT-----ATA--AATGATTT-ACC--AT--TG-TTTA-C-A---AATAAC-GT-TTCAACAACTGACTTATATGCAGATGAC------AC---AAC--GTTATATGAC-AT----ACAA-A-----C--------AAAT---A----CAGATATTTTAAAAG-GTAAC-----TTGCAAACTTCAAT-TAAT--CGTCT-T-AATATGTGGTGCATTCAAAATGGTATG--GTAT-TGAATACTGACAAAACAAAAGT---A-ATGTTAAACACCTCTCGTCAGAAACGACAGC-AT-TTAAAT----CAAATCAATTTACAACTTACGTACAA----CAA-TA-CA-GA----A--TTATCT--ACAACA-AAAGGC-G----ATAAAATCCTTGGAATATTTATTGACGATTGCATGCT---ATGGAATTAACATTTACAATCTCTCTCcgtaaataattatcgtcctatatctattttgccaacattatcaaaacttatagaaaaatttattcatattaatttaatgaaatttataaataaatataacttattgcatataacacaaagtggttttagggaaggtcattcaactgaatctgcattaattcgtatgattgataaatggctaacggcaattaatgatggcaagttagttggagctgtcatggtcgattttcggaaggcctttgatctcgtaagtcatactactttactagcaaaactaaagtgctataaatgtagtgatcgttttttgatgtggatgaaatcttaccttacaaacagaggtcaagttgtgtctataaattcagcaacttcaaaaaccaattgtataacatcaggggttccacagggttctattttagggtcattgttatttttacttttataaatgatttaccattgtttacaaataacgtttcaacaactgacttatatgcagatgacacaacgttatatgacatacaaacaaatacagatattttaaaaggtaacttgcaaacttcaattaatcgtcttaatatgtggtgcattcaaaatggtatggtattgaatactgacaaaacaaaagtaatgttaaacacctctcgtcagaaacgacagcatttaaatcaaatcaatttacaacttacgtacaacaatacagaattatctacaacaaaaggcgataaaatccttggaatatttattgacgattgcatgctatggaattaacatttacaatctctctcaaa
gi|148762 : caaggttgctaaaactagcatcccctgttatatctgaaagtattatgtttattgtgaataaaagtttgcgagatggaatatttccacataCAAGGTTGCTTAAACACGCATCCCCTATTTTATCTGAAAGTATTATGTTTATTGTGAATAAAAATCT-GCGAGATGGAATATT--TCCACATA--TATG----GAAACAGGC---AAAGATAAAACCATT-CTATA---AAAGCGACCGA-AAGGATGACGTAAATAATTATAGTCC----TATTTCTATTTTGCCAACATTATCAAA---ACTTACAG---AAAAACTTAT-TCATATTAAT--TTAATGA-AATTAAT-AAATA-----AATAT---AACTTATTGCATAAAACACAA--AGTAGTTTTATG--GAAGTTCATTCAAC-TG--A--ATCTGCATTAATTC-GT-A--TGA-CTGATAAATGGCTAACG-GCAATTAATGATGG---------CA-AGCT---AGTTGGGGC----TGT--CATGGTC---GATTTTCGGAA-G---GCCTTTGATCTCGTA-A---GTCAT--A----CTATT------T-TA---CTAGCAAAA---CTAAA-GTG-----------CTATAA--AT-G-TAG--TG-ATCG---TTTTTTGATTTGGATGAAATCTGACCT-TA-CAAAC-AG--AGGTC-----A--AGTTG-TGT-CTA---TAAA--TTCAGCA-AC-T---TCAA----AA----A------TC-AA--TTG----T--AT--AACATCC-GGGGTTCCACAGGGTTCAA-G--T--T-TAGGTCCATTGTTAT---TT--TAAC---TTTTC-----ATA--AATGATTT-ACC--AT--TG-TTTA-T-A---AATTAC-GT-TACAACAACTGACTTAAATGCAGATGAC------AC---AAC--GTTATATGAC-AT----ACAA-A-----C--------AAAT---A----TAGATATTTTAAAAG-GTAAC-----TTGCAAA-TTCAAT-TAAT--CGTCT-T-AATATGTGGTGCATTCAAATTGGTATG--GTAT-TGAATACTGACAAATCAAAAGT---A-ATGTTAATCACCTCTCGTCAGAAACGACAGC-AT-TTAAAT----CAAATCAATTTACAACATACGCACAA----CAG-TA-CA-GA----A--TTAACT--ACAACA-AAAGGC-G----ATAAAATCCTTGGAATATTTATTGATGATTGCATGCT---ATGGAATAAATATTTACAATCTCTCTCaaa
gi|148763 : CAAGGTTTCTAAAACTAGCATCCCCTGTTATATCTGAAAGTATTATGTTTATTGTGAACAAAATTCT-GCGAGATGGAATATT--TCATCATA--TATG----GAAACAGGC---AACGATAAAAACATT-CTATA---AAAGCGGCCGA-AAGGATGACGTAAATAATTATCGTCC----TATATGTATTTTGCCAACATTATCAAA---ACTTATAG---AATTTTTTAT-TCATATTAAT--TAAATGA-AATTTAT-AAATA-----AATAG---AACTTATTGCATAAAACACAA--AGTGGTTTTAGA--GAAGGTCGTTCAAT-TG--A--ATCTGCATTAATTG-GT-A--TGG-TTGATAAACGGCTAACG-GCAATTAATGATGG---------CA-AGTT---AGTTGGG-C----TGT--CATGGTC---GATTTTCG-AA-G---GTCTTTGATCTCGTA-A---GTCAT--A----CTATT------T-TA---CTAGCAAAA---CTTAA-GTG-----------CTATTA--AT-G-TAT--TG-ATCG---TTGTTTTATGTGGATAAACTATT--TT-TA-CAAAC-AG--AGTTC-----A--AGTTG-AGT-CTA---TAAA--TTCAGCA-AC-T---TCAA----AA----A------AC-AA--TTG----T--AT--AACATCA-GGGGTTCCACAGGGTTCTA-T--T--T-TAGGTCCATTGTTAT---TT--TTAC---TTTTC-----ATA--AATAATTT-ACC--AT--TG-TTTA-T-G---AATAAC-AT-TTCAACAACTGACTTATATGCAGATGAC------AC---AAC--GTTATATGAC-AT----ACAA-A-----C--------GAAT---A----CAGATATTTTAAAAG-GTAAC-----TTGCTAACTTAAAT-TAAT--CGTCT-T-AATATGTGGTGCATTCAAAATGGTATG--GTAT-TGAATACTAACAAAACAAAAGT---A-ATATTAACCACCTTTCGTCAGAAACGACAGC-AT-TTAAAT----CAAATCATTTTACAAATTACGTACAA----CAG-TA-CA-GA----A--TTAACT--ACAACA-AAATGCAA----AAAAAAGTCTTGGAATATTTATTGACGATTGCATGCT---ACGGAATAAAAA--TA-AATCTCaaa
gi|148764 : CAAGGTTGCTAAAACTAGCATCCCCTGTTATATCTGAA-GTATTATGTTTATTGTGAATAAAAGTCT-GCAAGATGGATTATT--TCCACATA--TATT----GGAACAGGC---AAAGATAAAACCATT-CTATA---AAAGCGGTCGA-ATGTGTGCCGTGAATAATTATCGTCC----TATATCTATTTTGCCAACATTTTCAAA---ACGTTTAG---AAAAAAATAT-TCATACTAAT--TTGATGA-CATTTAT-GACTA-----A-TAA---AACTTATTGCATAAAACACAA--AGTGACTTTAGG--GAAGGTCATTTAAC-TG--A--ATATGCATTAATTA-GG-T--TGA-TTGATAAATGACTAATG-GCAATTAACGATTG---------CA-AGTT---AGTTGGGAC----TGT--CATTGTC---AATATTCGGAA-G---GCATTTGATCTCTTA-A---GTCAT--A----CTATT------T-TA---CTAGCAAAA---CTAAA-ATG-----------CTATAA--AT-G-CAG--TG-ATCG---TTTTTTGAGGTGGATGAAATCTTACCT-TA-CAAAC-AG--AGATC-----A--AAT
gi|148765 : CAATGTTGCCAAA-CTAGCATCCCCTGTTATATCTGAAAGTATTGTATTTATTGTGAATAAAAGTCT-GCGAGACTGAATATT--ACCACATA--TATG----GAAACAGGC---AAAGATAAAACCATT-CTATA---AAAGCGGCCGA-AATGATGACGTAAATAATTATCGCCC----TATATCTATTTTGCCAACATAATCAAA---ACTTATAG---AAAAATGTAT-TCATATTAAT--TTGATGG-CATTTAT-AAATA-----AATAT---AACTTATTGCATAAAACACAA--AGAAGTTTTA
gi|148766 : GTTGC--AAACTAGCATCCCCTGTTATATCTGAAAGTATCATGTTTATTGTGAATTAAAGTCT-GCGATATGGAATATT--TCCACATA--TATG----GAAACAGGC---AAAGATACAACCATT-CTATA---AAAGCGGCCGA-AAGGATGACGTAAATAATTATCGTCC----TATATCTATTTTGCCAACATTATTAA-----CTTATAG---AAAAATTTAT-TTATATTAAT--TTAATGA-AATTTAT-AAGTA-----AATAT---AACTTATTGCATAAAACACAA--AGTGGTTT-AGG--GAAGGTCAATCAAC-TG--A--ATCTGCATTAATTC-GT-A--TGA-TTGATAAATGGCTAACT-GCAATTAATGATGG---------CA-AGTT---TGTTGGGGC----TGT--CATGGTC---GATTTTCGGAA-G---GCCTTTGATCTCGTA-A---GTCAT--A----CTATT------T-TA---CTAGCAAAA---CTAAA-GTG-----------CTATAA--AT-G-TAG--TG-ATCG---TTTTTTGATGTGGATGAAATCTTACCT-TA-CAAAC-AG--AGGTT-----A--AGTTG-TGT-CTA---TAAA--TTCAGCA-AC-T---TCAA----AA----A------CC-AA--TTG----T--AT--AACATCA-GGGGTTCCACAGGGTTCTA-T--T--T-TAGGTCCATTGTTAT---TT--TTAC---TTATC-----ATA--AATGATTT-ACC--AT--TG-TTTA-T-A---AATAAC-GT-TTCAACAACAAACTTATATGCAGATGAC------AC---AAC--GTTATATGAC-AT----ACAG-A-----C--------AAAT---A----CAGATATTTTAAAAG-GTAAC-----TTGCAAACTTCAAT-AAAT--CGTCT-T-AATATGTGGTGCATTCAAAATGGTATG--GTAT-TGAATACTGACAAAACAAAAGT---A-ATGTTAATCA-CTCTCGTCAGAAACGACAGC-GT-TTAAAT----CAAATCAATTTACAACTTACGTACGA----CAG-TA-CA-GA----A--TTAACT--ACAACA-AAAGGC-G----ATAAAATCCTTGGAATATTTATTGACGATTGCATGCT---ATTGAATAAACATTTACAATCTCTCTC
gi|148767 : TTGCTTATACTAGTTTCATACGTTTCATCTGAACGTATTATGTTTACTTTAATTAAAAGTCT-GCGAGATGGAATATT--TCCACATGCTTAT------AAACAGGC---AGAGATAAA--CATTTCTATA---AAAGCGATCGA-AGTGATGACATGAAGGCTTATCGTCT----TATATCTAGTTTGCCAACATTATCAAA---ACTTATAG---GAACATATAT-TCATATTAAT--TTGATGA-CATTTAT-AACT------TGCGT---AA-TTA-TGCGTAAAACACAA--AGTGATGTTAGG--ACAGGTCATTTAAC-TG--A--ATCTGCATTAATTC-AT-A--GGA-TTCATAAATGATTAACG-GCATTTAACGACGG---------CA-AGAT---Aaaa
gi|148768 : TTATGTATA--ATAAATACAAGTTTAGCCAG-TGGAAGCTT--TCCATCCG--CATG----GAAACA--------------AAC-GTT-TTTTA---AGAGTGGAAGT-AAAGATAAAATAAACAACTGTCACCCCTGCTACCGCTATATTAACAACTTTATCGAA------TGTAGTTGAAGAATATCT-CGGTTCTCAT--TTGAATT-CCTTCTT-CAACA-----ATCAT---TATATATTACATGAGTCTCAA--AGCGGATTTAGA--GAAGGTCATTCAACATA--ATTATCTGTTTTGTTT---T-A--TTACTTGATTAATGTCTGAGT-GCAATTAATGAGGGA--------CA-ATTTGTAAGATG--------TGT--TATGGTC---TATTTCAAGAA-GAAAAC----GATCAAGTA-A---ATCAT--G----ATA----------TA---CTAATAAAAAATCTCAA-ACT-----------TTACAA--AT-G-TAG--CG-ATAA---ACTAGCAAAGTGGTGTCAATCATACAT-TA-CCAAT-CGCTAG--C-----A--AGTTG-T
gi|148769 : TGTAATATTCCTCAAAATA--TATTTTTTGAAACAGAC---AAATATAAAACCATT-CTATA---AAAGCGATAGA-AAGGATGACGT------------------------CTATTTTGC-GACATTATCAAA---ATTTATAG---AAAAAT--AT-TCATATTAAA--TTGATGA-CATTTAT-GAATA-----AATA--------------ACAAAA----A--AGTGGTTTTATG--AAA--------------------TCTGCATTTATCC-GT-A--TAA-TTGATAAATGGCTAATG-GCAGTTAACGACGG---------C----------------------TGT--CATGGAC---GATTTT-AGAT-G---ACCTTTGATCTCGTT-A----CCAT--A----TCATT------T-TA---CTAGCAAAA---CTAAA-ATG-----------ATATAA--AT-G-CAG--TG-ATCT---TATTTTGACGTGGTTGAAATCTTACCT-CG-CAAAC-AG--AGTAC-----A--AGTTG-TGT-C-----TAAT--TTCAGCT-AC-T---ACAG----GA----A------CC-AA--TTG----T--AT--AACATGA-AGTGTTCCGCAGGGT--TA-T--TAAT-TAGGTTCATTGTTAG---TT--TTAC---TTTTT-----ATA--A
gi|148770 : AAAAATGC---AAAAGTAA---C-TC-CTATACACAAAAAGGGAGATAAATCTGAGGCAACTAATTACAGACC----TATATCAGTACTACCAACATTGTCTAA---GTTAATTG---AAAAACATATCTCCCAACAAC--TTTATAAGTATTTGTCAGAT--------TTT---AACCTATTACATCCATCTCAA--TCTGGATTTAGGCCGAA--TCACTC--C-TGTCA--AACAGCACTAATAA-AT-A--TAA-CTGACAAATGGTTACAA-GAAATGAATGATGG---------AA-ACAT---AAATGGAGT----AGT---AT--TCTTGGATTTAAAAAA-A---GCTTTTGATGTTGTT-G---ATCACAAA----CT-CT------TATG---CCA--AAAG---CTTAA----------------TATAT--ATGG-TTG--TA-CTCGAACTTCCCTGAAGTTGTTTGAATCATATCT-TA-ATAAC-AG--AACAC-----AGCAG--G-TA---------AAA--GTAGGAA-AT-G---CCAAGTCTAA----ATCTGCCCC-TA--TT-----T--CT----CAT---GGAGTTCCCCAAGGTTCAA-T--A--C-TGGGTCCATTAC--T---TT--TCAT---TTTAT-----ATATTAATGACCT-CCC--AT--TA-CATG-T-A---AAAAACAGT----GA-AACTGATATGTATGCAGATGAC------TC---CAC--ATTCCAC-AC-TTCAGGAAAA-A-----CTGTTGGAGAAATTCAG----CAGAGA--TTACAAG-CCGAC-----TT---AACTTC----TA--------T-A-AATAAATGGTG--TTCAAGA-AATATGATGTATATTAATACAGAAAAAACTAAttccattaaattaaattcaattttataagcaaactatcagcaaacatatcaggttgaccatttataacgtt
gi|148771 : AGTC---AAA-ATCACACCAAT-TTTTA---AGAAAGGTTTA-AAACAAGACAAAAATAACTATCGCCC----AATTTCCATTCTTCCTATTCTGTCTAAGATACTT---G---AGAGACATGT-TAGTAATAGTGTTCGGT---CTTTTTT-AAATA-----CATAC---AATTTATTGCATGAAAGACAATCAG-GG-TTCAGA--TCTGATCATTCATG-CG--A--AACAGCATTAA--CAGTGA--TGG-TTGATGACTGGATCACA-GCTATTGATCAAAA---------CA-GAAT---ATCTGGAACCATATTT--CTTGACC---TATCT----AA-A---GCATTTGATCTGGTT-G---ATCAT--AGT--TTAC---------TG---CTTGAAAAA---CTAAATGTATTCCATTT---CCATAAAGAT-G-TA--------CA---------AAATTGGTTTAAATCCTATTTATG-TGAAC------GTTCACAAAA--AGTT----T-CAA---TAGC--T--GGTACACTT---TCAG----AA----A------GT-AA--ATC----A--GT--AACATGT-GGTGTACCCCAAGGATCTG-T--T--T-TAGGCCCACTTCTAT---TTA-TTA----TCTTT-----ATC--AATGATAT-GCC--CT--TA---TG-C-ACTCAGTA------TTCAAAAATGAACATGTTTGCTGATGACTCCTCTAT---CAC--TTTATCTGGTAAT----TCAATAT----C--------AGAC---ATCACCGAATCTCTTAA-----TAA-------TG-AA---TTAAT-AAAT---GTC--C-AACA-ATGGTGTAATAATAATTGGATG--ACCA-TAAATACTTCAAAAACCAAAGC---A-ATGTTTATAGCCTCTCATCCAAAGCAACCACTAT-TCAGAT----CA----GATTAGC-ACTTA---AAAA----TAG-GA-GATGAGGCTA--TTGAAT---TTACA-AGTAGT-G----AAAAACTTCTGGGAGTAACAATTGACAA---CACACTAACATGGACTCAACA
gi|148772 : TTTAT-AAGTATCTGTAAGATTTTAACCTATTACATTTATCTCAA--TCTGCATTTAGGCCGAA--TCACTC--C-TGTCA--AACAGCACTAATAA-AT-A--TAA-TTGACAAATGG-TAACAAGAAATGAATGATGGAAACATAAACAGAGTT---A-CTGTAGT----TATTTCTTGG------ATTTATAAAA-A---GCTTTTGATGTTGTT-G---ATCAC--A----A-ACTC-----T-TA----TGCCAAAAG--CTTAA----------------TATAC--AT-GGTTG--TG-CTCAAACTTCCCTGAAGTTGTTTGAATCATATCT-AA-ATAAC-AG--AACAC-----A------G-TAG-GTA---AAAG--T--AGGA-AA-T---GCAA----AG----T------CT-AAATCTGCCCCT--AT--TTC-TCATGGAGTTCCCTAAGGTTCCA-T--A--C-TGGGTCCATTAC--T---TT--TCAT---TTTAT-----ATATTAATGATCT-CCC--AT--TA-CATG-T-A---AAAAACAGT----GA-AACTGATATGTATGCAGATGAC------TC---CAC--ATTCCAC-AC--T----TCAG-G-----A--------AAA----A----C---TGTTTGAAAAATTTAGCAGAGATTACAAGC--CGACATAA---CTTCTATAAATAAATGGTG--TTCAAGA-AATATGATGTATATTAATACAGA-AAAAAATAAGT---GTATGACAATagttgaaaacactctaaaa
gi|148773 : aacATAT---ATCTTA--ACATCAGTCTCAA--CGTGGTTTTAGA--ATAAGTCATTCAAC-GG--A--ATCTTCTTTA--TT-AT-AATTGT-TTGATAAAGAGATAGAG-ACAACAGACGAAGG---------TC-AGTT---TGTAGGATA----TGT--TATGGTC---GATTTCAGAAA-A---GCATTCGATTAAGTA-AAATGAAAT--A----CTATTAAAAGGT-TAAAGCTTTCCAAA----TGAA-GCG-------------ATGA--AT---TAAATTGTATCG---TATTTTGATG----------CATACCT-TACCGAAC--G--CTCTC-----A--AGTTGTTGA-C-A---TAAA--TT---GG-AC-TATGTCAG----AA------------C-AA--AAG----TCCAT--CGCGTGT-TGCGTTCCACACTGCTCCAGC--C--T-TGGGCTTGTT-TTGT---GT--TAAT---CATTT-----ATA--AACAACTTAACC--ATGACGCTTTC-T-A---AA-ATT-GT-CTCAGGTACTGATTTATATGCAGATGAT------ACTATAATTGATTATTTTAA-AT----CTGA-A-----A--------AAAA---A----AGGAAATCTTGAACG-A-AAT-----GTTCAGTGTTCACT-AAATTATATTT-T-AA-AT-TGATGTAAATAGAACGAAATG--CTTT-TAAACACTGCCAAAACAAAAGTCTCA-ATGT
gi|148774 : ---GATTTTTAAAACA---GTCTTTGATCTAGTT-A---GCCAT--G----AAACT------C-TT---CCTGCAAAA---CTAAA-ATGTAACAGTTTTTCGACAA--AT-G-TA--------C----TTTTGTAAAGT---TTAGTTCTTATCT-----AAATGAA--AGAGC-----A--AATTG--GTACTA---TAAAAATT--ATA----T---TCAA----AC----T------CC-AA--TCG----A--ATTGAAAGT---GGTGTACCTCAAGGATCTA-TA-C--T-TGGG-CCAATGTTAT---TCA-TTA----TGTTT-----GTA--AATGATTT-GCC--AC--TT-TATG-T-C---AATAAT-GC-T
gi|148775 : AA-A---GCCTTTGATTTAGTT-A---ATCAC--G----ACATT------C-TT---CTTGCAAAA---CTAAA-ATG-----------TTACAA--TT-T-CAA--AA-AATG---CACTTTGAAGTGGTTAAGTTCTTATCT-----AAATGAA--AGTGC-----A--AATTG-GTT-CTAAGTTATA--T--AATA-TA-T---TTAA----AA----T------CC-AA--TCT----A--AT--TAGAAGT-GGGGTACCTCAAGGATCTA-T--A--CATGGG-CCATTGTTATAAATTCATTA----TATTT-----GTA--AATGATCT-GTC--AC--T
gi|148776 : AA-A---GCATTTGATCGCATGTA---GTTAA--AAGGTCTTCTG-----T-TC---AAAGTAAAG---C-AAA-ATG-----------GTATAA--AA-G---G--TA-ATC-----TTCTTAAT-TGATTGAA-------------CAAAG-AG--TTTTT-----AT-AGTTA-TTA-CTT---TT----TTCAGAA-A--T---ACAA----GA----A------AC-AA--CTG----------------CC-GGAGTTCCCCAAGGTTTAA-T--T--C-TGGGTCCTTTATTCT---TT--TTAA---TTTAC-----ATA--AATGATAT-AGCTAAA--AA-TTTGTT-A---AGTA----T-T---AC-AC--ACATATTTGCAGATGAT------AT---A
gi|148777 : -T---TCAA----AATCCAA------CCTAA--TT-----T--AT--AAGAG-T-GGGGTACCTCAAGGATCTG-TCCT--T-TGG--CCATTGTTAT---TTA-TTA----TGTTT-----GTA--AATGATTT-GCC--AC--TT-TATG-T-C---AATAAC-GC-T--AAC-ACTGATAAATTTGCAGATG
gi|148778 : C-AA--ATC----T--AC--AACAGCT-GGTGTTCCACAGGGCTCTG-T--T--C-TAGGTC---TGCTAT---TT--TTCCTTGTTTTT-----GTT--AATGAT--------AT--TG-T
gi|148779 : CT-GGTGTTCCTCAAGGCTCAA-T--T--C-TTGGTCCATTATTAT---TT--CTTG---TTTAT-----ATC--AATGAT--------AT--TG-TTTC-TGA---AATA---GG-CTCTGCGATTCGCTTCTTTGCTGACGAC------AC---AAC--CCTTTATG
gi|148780 : aatatcgg-GGTGTTCAACAAGGTTCTG-T--T--T-TAGGTCCTTTATT-T---TT--TTAT---TTTTTTTTACATT--AATGATAT-A--------------G-C-A---GAGAAC-GTATTGCACAA--AACTT---TCCGAATGAT------AC--------GTCACATG-C-TT----ATTA-A-----C--------AAAT---T----CAGA
gi|148781 : A--GATGATTT-ACT--AT--T-------------ACTAAC-GT-TTCAACAACTGA--TATATGCAGACGAC------AC---AAC--GTTATATTAC-AT----ACAA-A-----C--------AATT---A----TAGATTTTTTTAAAA-GTAAC-----ATGCAAACTTCAAT-TAAT--CGTCT-T-AATATGTGGTGCATTTAAAATAGTATG--GTAT-TTAATACTGACACAACCAAAGT---A-ATGTCAATCAACTCTCGACAGAAACGAAAGC-GT-TGCAAT----TGTATTGATTTACAACTTACGTACAG----CTG-TATTT-TA----A--TTAGCT--GCTACA-ACATGC-A----ATAAAATCCTTGGAATATTTTATGACAATTGCAATCT---ATGAAATAAACATTTATTATCTCTCTC
gi|148782 : ATGAT------AC---TAC--CTTATCTAAA-AT----AGGA-GAATCTC--------AAA----A----T-GATATTC---AAA-TTAAA-----TTACAAAATTCTCT-AAAT--GATCT-G-CAAACTTGGTGCAAGCATAATGGCATG--CTTA-TAAATTCTGCAAAAACCAAAGT---G-ATGTTAATAACAACTCAT--GAAATGACAGC-ACATTAAATTTTGCAAATTGATTTTCAGCTAAACTATAA----TGA-TG-CA-AAT---C--TTGCCTTAATATCA-AA---T-G----ACAAAATAATTGGGATcaa
gi|148783 : GATGG-CATTTAT-AAATA-----AATAT---AACTTATTGCATAAAACACAA--AGAAGTTTTA
gi|148783 : T--AAAACACAAAGAA-GTTTTATAAAATCCTTGGAATATTTATTGACGATTGCATGCT---ATGGAATAAACATTTACAATCTCTCTCtaaaatccttggaatatttattgacgattgcatgctatggaataaacatttacaatctctctcaaa
gi|148784 : gatggcatttataaataaatataacttattgcaAT----GAAATC---TTAC--CTTACAAACAGAGATCAAATA-CA-GA----A--TAGACT--ACTACA-ACAGGC-G----ATAAAATCCTTGGAAAATTTATTGAAGATTGCATGCT---ATGGAATAAACATTTACAATCTCTCTaaa
gi|148785 : ACG-ACGG----CAA-GA-TA-AA----AGTTCAATT--ACAATA----GGC-G----ATAAAATCCTTGAAATATTTATTGATGATTGCATACT---ATGAAA-AAACAATAACAATCTCTCTacaaa