lowQualScore : 77 66 1 22 3333 66 0 1 222 9
lowQualScore : .. .. . .. .... .. . . ... .
lowQualScore : 22 77 6 11 3333 33 3 5 777 4
consensus : ATTTTCCN-TT-TGGTGAAATGA-GAA--A----AA--GTTCCCCTTTAACTTCCGGGTAGT-GATTGTT---TGTAANAAAA
Reference ( gi|3207 ) : ATTTTCCA-TT-CGGTGAAATGA-GAA--A----AA--GTTCCCCTTTAACTTCCGGGTAGT-GATTGTT---TGTAATAAAA
gi|3209 : ATTTTCCA-TT-TGGTGAAATGA-GAT--A----AA--GTTCCCCTTTAACTTCCAGGTAGT-GATTGTT---TGTAATAAAA
gi|3210 : ATTTTCCA-TT-TGGTGAATTGA-GAA--A----AA--GTTACTCTTTAACTTCCGGGTAGT-GATTGTT---TGTAAAAGAA
gi|3219 : ATTTTCAA-TT-CGGTGAAATGA-GGA--A----A---GTTTCCCTTTAACTTTCGGGTAGT-TATTGTT---TGTAATAAAA
gi|3205 : ATTTTCTT-TT-TGGTGAAATGA-GAA--A----AA--GTTCCCCTTTAACCTTCGAGTAGT-GATTGTT---TGTAAAAAAA
gi|3214 : ATTTTCCG-TT-TGGTGAAATGA-GAA--A----AA--GCTCCCCTTTAATCATCGGGTAGT-GATTGTT---TGTAAAAAAA
gi|3213 : ATTTTCCT-TT-TTGTGGAATGA-GAA--A----AA--GTTCCCCTTTAACTTTCGGGTAGT-GGTTGTT---TGTAA
gi|3216 : ATTTTCAT-TT-TGGTGAAATGAAGAA--A----AA--GTTCATCTTTAACTTTCGGGTTGT-GATTGTT---TGTAAGAAAAacaa
gi|3211 : ATTTTCTG-TT-TGGTGAAATGA-GAA--AGAAAAA--GTTTCCTTTTAATCTTCGGGTTGT-GATTGTT---TGTAAAAAAA
gi|3215 : ATTTTCCT-TT-TGGTGAATTAA-TAA--A----AA--GTTCCCCTTTAATTTCCGGGTGCT-GATTACTGCATGTAA
gi|3217 : ATTTTCAT-TT-CGGTAAAGTGA-GAA--A----A---GTTCGCCTTTAACTTCGGGGTTAA-GATTGTT---TGTAAa
gi|3206 : ATTTTCCT-TT-TGGTGAATTGA-TAA--A----TT--GTTCCCCTTTAATTTCTGGGTGCT-GATCGCT---TGTAA-AAAAacaa
gi|3212 : ATTTTCCT-TT-TGGTGAAATGA-GAA--A--------------------CTTCCGGTTAGT-GATTATT---TGTAATAAAA
gi|3220 : ATTTTCAA-TT-TGGTGAAATGA-AAA--A----AA----TGCCATTTATCTTCCAGGCAGT-GATAACT---TGT-ATAA
gi|3218 : ATTTTCCT-TT-GGGTCAAATGA--AA--A----AG--GT--CCCTTTAACTCTCCTGTAAC-GATTGTT---TGT-ACAAAAcaaa
gi|3222 : TTTTTCA-TT-TGGTGAAATAA-AAAGAA----AA--GTTCCCCTTTAATTTCCGGGTTGT-GATTGTT---TGTAAAAAAAa
gi|3221 : TTTTCCT-TT-TGTTAATATGA-GAA--A----AA--GCTTCCCTTCAATCTTCGGGTAGT-GATTGTT---TGTAAAAAAA
gi|3223 : TTTTCGT-TT-TGGTGAAATGA-TAA--A----AA--GTTCCCCTTTAATTTCTAAGTAGT-CAATGTT---TGTAA-AAAA
gi|3225 : TTTCCA-TT-TGGCGAAATGA-GAA--A----AA--GTTCCCCTTTAACTTTCGGGTGGC-GATTGTT---TGTAAAAAAA
gi|3224 : TTTCCA-TT-TGGTGAATTGT-GAA--A----AA--GTTCCCCTTTAACTTCCGGGAAGT-GATTGTT---TGT--TAAAA
gi|3227 : TTCCAATTGTGATGAAATGA-GAA--G----AA--ATCACCCTTTTACTTCCGAGTAGT-AATTGTT---GATAAaaa
gi|3229 : -TT-TAGTGAAATGA-GAA--A----AACTGTTCCCCTTTAACTTCTGGGTGGT-GATTGTT---TGTAATAAAA
gi|3208 : -TT-TGGTGAAATGA-GAA--T----AACGGTTCCCCTTTATCTTCTAGGTGGT-GATTGTT---TGTAAAAAAAa
gi|3228 : atattact-TT-TGGTGAAATGA-GAA--A----AA--A---------AACTTCCGGGTAGT-AATTGTT---TGTAA
gi|3226 : GTGGAGCGA-GAA--A----AA--GTTCCCCTTTAACTTTCGGGTAGT-GATTGTT---TGTAATAAAAa
gi|3230 : ttcactttttGTGAAATGA-GAA--A----AACAGTTCCCCTTTAACTTCTGGGTGGT-GATTGTT---TGTGACAAAA
gi|3231 : --A----AA--GTTCCCCTTTAACCTTCGGTT-GTGGATTGTT---GGTAAAAAAA
Alignments
lowQualScore : 1 22 1 1 22 3333 66 1 222 33 1
lowQualScore : . .. . . .. .... .. . ... .. .
lowQualScore : 7 66 6 5 00 1111 11 5 666 55 0
consensus : ATTTTC-CN-TT-TGGTGAAATGA-GAA--A----AA--GTTCCCCTTTAACTTCCGGGTAGT-GATTGTT---TG--TAAAAAAA
Reference ( family-692 ) : ATTTTC-CN-TT-TGGTGAAATGA-GAA--A----AA--GTTCCCCTTTAACTTCCGGGTAGT-GATTGTT---TG--TAANAAAA
gi|3205 : ATTTTC-TT-TT-TGGTGAAATGA-GAA--A----AA--GTTCCCCTTTAACCTTCGAGTAGT-GATTGTT---TG--TAAAAAAA
gi|3206 : ATTTTC-CT-TT-TGGTGAATTGA-TAA--A----TT--GTTCCCCTTTAATTTCTGGGTGCT-GATCGCT---TG--TAAAAAA
gi|3207 : ATTTTC-CA-TT-CGGTGAAATGA-GAA--A----AA--GTTCCCCTTTAACTTCCGGGTAGT-GATTGTT---TG--TAATAAAA
gi|3208 : ATATTA-CT-TT-TGGTGAAATGA-GAA--T----AACGGTTCCCCTTTATCTTCTAGGTGGT-GATTGTT---TG--TAAAAAAA
gi|3209 : ATTTTC-CA-TT-TGGTGAAATGA-GAT--A----AA--GTTCCCCTTTAACTTCCAGGTAGT-GATTGTT---TG--TAATAAAA
gi|3210 : ATTTTC-CA-TT-TGGTGAATTGA-GAA--A----AA--GTTACTCTTTAACTTCCGGGTAGT-GATTGTT---TG--TAAAAGAA
gi|3211 : ATTTTC-TG-TT-TGGTGAAATGA-GAA--AGAAAAA--GTTTCCTTTTAATCTTCGGGTTGT-GATTGTT---TG--TAAAAAAA
gi|3212 : ATTTTC-CT-TT-TGGTGAAATGA-GAA--A--------------------CTTCCGGTTAGT-GATTATT---TG--TAATAAAA
gi|3213 : ATTTTC-CT-TT-TTGTGGAATGA-GAA--A----AA--GTTCCCCTTTAACTTTCGGGTAGT-GGTTGTT---TG--TAAACAA
gi|3214 : ATTTTC-CG-TT-TGGTGAAATGA-GAA--A----AA--GCTCCCCTTTAATCATCGGGTAGT-GATTGTT---TG--TAAAAAAA
gi|3215 : ATTTTC-CT-TT-TGGTGAATTAA-TAA--A----AA--GTTCCCCTTTAATTTCCGGGTGCT-GATTACTGCATG--TAA
gi|3216 : ATTTTC-AT-TT-TGGTGAAATGAAGAA--A----AA--GTTCATCTTTAACTTTCGGGTTGT-GATTGTT---TG--TAAGAAAAa
gi|3217 : ATTTTC-AT-TT-CGGTAAAGTGA-GAA--A----A---GTTCGCCTTTAACTTCGGGGTTAA-GATTGTT---TG--TAAACAA
gi|3218 : ATTTTC-CT-TT-GGGTCAAATGA--AA--A----AG--GT--CCCTTTAACTCTCCTGTAAC-GATTGTT---TG--TACAAAAA
gi|3219 : ATTTTC-AA-TT-CGGTGAAATGA-GGA--A----A---GTTTCCCTTTAACTTTCGGGTAGT-TATTGTT---TG--TAATAAAA
gi|3220 : ATTTTC-AA-TT-TGGTGAAATGA-AAA--A----AA----TGCCATTTATCTTCCAGGCAGT-GATAACT---TGTATAACAAA
gi|3221 : TTTTC-CT-TT-TGTTAATATGA-GAA--A----AA--GCTTCCCTTCAATCTTCGGGTAGT-GATTGTT---TG--TAAAAAAA
gi|3222 : TTTTT-CA-TT-TGGTGAAATAA-AAAGAA----AA--GTTCCCCTTTAATTTCCGGGTTGT-GATTGTT---TG--TAAAAAAA
gi|3223 : TTTTC-GT-TT-TGGTGAAATGA-TAA--A----AA--GTTCCCCTTTAATTTCTAAGTAGT-CAATGTT---TG--TAAAAAA
gi|3224 : TTTC-CA-TT-TGGTGAATTGT-GAA--A----AA--GTTCCCCTTTAACTTCCGGGAAGT-GATTGTT---TGT-TAAAAAAA
gi|3225 : TTTC-CA-TT-TGGCGAAATGA-GAA--A----AA--GTTCCCCTTTAACTTTCGGGTGGC-GATTGTT---TG--TAAAAAAA
gi|3226 : TTCACT-TT-TTGTGGAGCGA-GAA--A----AA--GTTCCCCTTTAACTTTCGGGTAGT-GATTGTT---TG--TAATAAAA
gi|3227 : TTC-CAATTGTGATGAAATGA-GAA--G----AA--ATCACCCTTTTACTTCCGAGTAGT-AATTGTT---GA--TAA
gi|3228 : -TT-TGGTGAAATGA-GAA--A----AA--A---------AACTTCCGGGTAGT-AATTGTT---TG--TAA
gi|3229 : -TT-TAGTGAAATGA-GAA--A----AACTGTTCCCCTTTAACTTCTGGGTGGT-GATTGTT---TG--TAATAAAAa
gi|3230 : GTGAAATGA-GAA--A----AACAGTTCCCCTTTAACTTCTGGGTGGT-GATTGTT---TG--TGACAAAAa
gi|3231 : --A----AA--GTTCCCCTTTAACCTTCGGTT-GTGGATTGTT---GG--TAAAAAAA
Alignments
lowQualScore : 1 22 1 1 22 3333 66 1 222 1 1 1
lowQualScore : . .. . . .. .... .. . ... . . .
lowQualScore : 7 66 6 5 00 1111 11 5 666 5 5 5
consensus : ATTTTC-CN-TT-TGGTGAAATGA-GAA--A----AA--GTTCCCCTTTAACTTCCGGGTAGT-GATTGTT---TG-TA-A-AAAAA
Reference ( family-692 ) : ATTTTC-CN-TT-TGGTGAAATGA-GAA--A----AA--GTTCCCCTTTAACTTCCGGGTAGT-GATTGTT---TG-TA-A-AAAAA
gi|3205 : ATTTTC-TT-TT-TGGTGAAATGA-GAA--A----AA--GTTCCCCTTTAACCTTCGAGTAGT-GATTGTT---TG-TA-A-AAAAA
gi|3206 : ATTTTC-CT-TT-TGGTGAATTGA-TAA--A----TT--GTTCCCCTTTAATTTCTGGGTGCT-GATCGCT---TG-TA-A-AAAA
gi|3207 : ATTTTC-CA-TT-CGGTGAAATGA-GAA--A----AA--GTTCCCCTTTAACTTCCGGGTAGT-GATTGTT---TG-TA-A-TAAAA
gi|3208 : ATATTA-CT-TT-TGGTGAAATGA-GAA--T----AACGGTTCCCCTTTATCTTCTAGGTGGT-GATTGTT---TG-TA-A-AAAAA
gi|3209 : ATTTTC-CA-TT-TGGTGAAATGA-GAT--A----AA--GTTCCCCTTTAACTTCCAGGTAGT-GATTGTT---TG-TA-A-TAAAA
gi|3210 : ATTTTC-CA-TT-TGGTGAATTGA-GAA--A----AA--GTTACTCTTTAACTTCCGGGTAGT-GATTGTT---TG-TA-A-AAGAA
gi|3211 : ATTTTC-TG-TT-TGGTGAAATGA-GAA--AGAAAAA--GTTTCCTTTTAATCTTCGGGTTGT-GATTGTT---TG-TA-A-AAAAA
gi|3212 : ATTTTC-CT-TT-TGGTGAAATGA-GAA--A--------------------CTTCCGGTTAGT-GATTATT---TG-TA-A-TAAAA
gi|3213 : ATTTTC-CT-TT-TTGTGGAATGA-GAA--A----AA--GTTCCCCTTTAACTTTCGGGTAGT-GGTTGTT---TG-TA-A-ACAA
gi|3214 : ATTTTC-CG-TT-TGGTGAAATGA-GAA--A----AA--GCTCCCCTTTAATCATCGGGTAGT-GATTGTT---TG-TA-A-AAAAA
gi|3215 : ATTTTC-CT-TT-TGGTGAATTAA-TAA--A----AA--GTTCCCCTTTAATTTCCGGGTGCT-GATTACTGCATG-TA-A-
gi|3216 : ATTTTC-AT-TT-TGGTGAAATGAAGAA--A----AA--GTTCATCTTTAACTTTCGGGTTGT-GATTGTT---TG-TA-A-GAAAA
gi|3217 : ATTTTC-AT-TT-CGGTAAAGTGA-GAA--A----A---GTTCGCCTTTAACTTCGGGGTTAA-GATTGTT---TG-TA-A-ACAA
gi|3218 : ATTTTC-CT-TT-GGGTCAAATGA--AA--A----AG--GT--CCCTTTAACTCTCCTGTAAC-GATTGTT---TG-TA-C-AAAAA
gi|3219 : ATTTTC-AA-TT-CGGTGAAATGA-GGA--A----A---GTTTCCCTTTAACTTTCGGGTAGT-TATTGTT---TG-TA-A-TAAAA
gi|3220 : ATTTTC-AA-TT-TGGTGAAATGA-AAA--A----AA----TGCCATTTATCTTCCAGGCAGT-GATAACT---TG-TATA-ACAAA
gi|3221 : TTTTC-CT-TT-TGTTAATATGA-GAA--A----AA--GCTTCCCTTCAATCTTCGGGTAGT-GATTGTT---TG-TA-A-AAAAA
gi|3222 : TTTTT-CA-TT-TGGTGAAATAA-AAAGAA----AA--GTTCCCCTTTAATTTCCGGGTTGT-GATTGTT---TG-TA-A-AAAAA
gi|3223 : TTTTC-GT-TT-TGGTGAAATGA-TAA--A----AA--GTTCCCCTTTAATTTCTAAGTAGT-CAATGTT---TG-TA-A-AAAA
gi|3224 : TTTC-CA-TT-TGGTGAATTGT-GAA--A----AA--GTTCCCCTTTAACTTCCGGGAAGT-GATTGTT---TGTTA-A-AAAAA
gi|3225 : TTTC-CA-TT-TGGCGAAATGA-GAA--A----AA--GTTCCCCTTTAACTTTCGGGTGGC-GATTGTT---TG-TA-A-AAAAA
gi|3226 : TTCACT-TT-TTGTGGAGCGA-GAA--A----AA--GTTCCCCTTTAACTTTCGGGTAGT-GATTGTT---TG-TA-A-TAAAA
gi|3227 : TTC-CAATTGTGATGAAATGA-GAA--G----AA--ATCACCCTTTTACTTCCGAGTAGT-AATTGTT---GA-TA-A-
gi|3228 : -TT-TGGTGAAATGA-GAA--A----AA--A---------AACTTCCGGGTAGT-AATTGTT---TG-TA-A-
gi|3229 : -TT-TAGTGAAATGA-GAA--A----AACTGTTCCCCTTTAACTTCTGGGTGGT-GATTGTT---TG-TA-ATAAAAA
gi|3230 : GTGAAATGA-GAA--A----AACAGTTCCCCTTTAACTTCTGGGTGGT-GATTGTT---TG-TG-A-CAAAA
gi|3231 : --A----AA--GTTCCCCTTTAACCTTCGGTT-GTGGATTGTT---GG-TA-A-AAAAA
Alignments
lowQualScore : 1 22 1 1 22 3333 66 1 222 1 1 1
lowQualScore : . .. . . .. .... .. . ... . . .
lowQualScore : 7 66 6 5 00 1111 11 5 666 5 5 5
consensus : ATTTTC-CN-TT-TGGTGAAATGA-GAA--A----AA--GTTCCCCTTTAACTTCCGGGTAGT-GATTGTT---TG-TA-A-AAAAA
Reference ( family-692 ) : ATTTTC-CN-TT-TGGTGAAATGA-GAA--A----AA--GTTCCCCTTTAACTTCCGGGTAGT-GATTGTT---TG-TA-A-AAAAA
gi|3205 : ATTTTC-TT-TT-TGGTGAAATGA-GAA--A----AA--GTTCCCCTTTAACCTTCGAGTAGT-GATTGTT---TG-TA-A-AAAAA
gi|3206 : ATTTTC-CT-TT-TGGTGAATTGA-TAA--A----TT--GTTCCCCTTTAATTTCTGGGTGCT-GATCGCT---TG-TA-A-AAAA
gi|3207 : ATTTTC-CA-TT-CGGTGAAATGA-GAA--A----AA--GTTCCCCTTTAACTTCCGGGTAGT-GATTGTT---TG-TA-A-TAAAA
gi|3208 : ATATTA-CT-TT-TGGTGAAATGA-GAA--T----AACGGTTCCCCTTTATCTTCTAGGTGGT-GATTGTT---TG-TA-A-AAAAA
gi|3209 : ATTTTC-CA-TT-TGGTGAAATGA-GAT--A----AA--GTTCCCCTTTAACTTCCAGGTAGT-GATTGTT---TG-TA-A-TAAAA
gi|3210 : ATTTTC-CA-TT-TGGTGAATTGA-GAA--A----AA--GTTACTCTTTAACTTCCGGGTAGT-GATTGTT---TG-TA-A-AAGAA
gi|3211 : ATTTTC-TG-TT-TGGTGAAATGA-GAA--AGAAAAA--GTTTCCTTTTAATCTTCGGGTTGT-GATTGTT---TG-TA-A-AAAAA
gi|3212 : ATTTTC-CT-TT-TGGTGAAATGA-GAA--A--------------------CTTCCGGTTAGT-GATTATT---TG-TA-A-TAAAA
gi|3213 : ATTTTC-CT-TT-TTGTGGAATGA-GAA--A----AA--GTTCCCCTTTAACTTTCGGGTAGT-GGTTGTT---TG-TA-A-ACAA
gi|3214 : ATTTTC-CG-TT-TGGTGAAATGA-GAA--A----AA--GCTCCCCTTTAATCATCGGGTAGT-GATTGTT---TG-TA-A-AAAAA
gi|3215 : ATTTTC-CT-TT-TGGTGAATTAA-TAA--A----AA--GTTCCCCTTTAATTTCCGGGTGCT-GATTACTGCATG-TA-A-
gi|3216 : ATTTTC-AT-TT-TGGTGAAATGAAGAA--A----AA--GTTCATCTTTAACTTTCGGGTTGT-GATTGTT---TG-TA-A-GAAAA
gi|3217 : ATTTTC-AT-TT-CGGTAAAGTGA-GAA--A----A---GTTCGCCTTTAACTTCGGGGTTAA-GATTGTT---TG-TA-A-ACAA
gi|3218 : ATTTTC-CT-TT-GGGTCAAATGA--AA--A----AG--GT--CCCTTTAACTCTCCTGTAAC-GATTGTT---TG-TA-C-AAAAA
gi|3219 : ATTTTC-AA-TT-CGGTGAAATGA-GGA--A----A---GTTTCCCTTTAACTTTCGGGTAGT-TATTGTT---TG-TA-A-TAAAA
gi|3220 : ATTTTC-AA-TT-TGGTGAAATGA-AAA--A----AA----TGCCATTTATCTTCCAGGCAGT-GATAACT---TG-TATA-ACAAA
gi|3221 : TTTTC-CT-TT-TGTTAATATGA-GAA--A----AA--GCTTCCCTTCAATCTTCGGGTAGT-GATTGTT---TG-TA-A-AAAAA
gi|3222 : TTTTT-CA-TT-TGGTGAAATAA-AAAGAA----AA--GTTCCCCTTTAATTTCCGGGTTGT-GATTGTT---TG-TA-A-AAAAA
gi|3223 : TTTTC-GT-TT-TGGTGAAATGA-TAA--A----AA--GTTCCCCTTTAATTTCTAAGTAGT-CAATGTT---TG-TA-A-AAAA
gi|3224 : TTTC-CA-TT-TGGTGAATTGT-GAA--A----AA--GTTCCCCTTTAACTTCCGGGAAGT-GATTGTT---TGTTA-A-AAAAA
gi|3225 : TTTC-CA-TT-TGGCGAAATGA-GAA--A----AA--GTTCCCCTTTAACTTTCGGGTGGC-GATTGTT---TG-TA-A-AAAAA
gi|3226 : TTCACT-TT-TTGTGGAGCGA-GAA--A----AA--GTTCCCCTTTAACTTTCGGGTAGT-GATTGTT---TG-TA-A-TAAAA
gi|3227 : TTC-CAATTGTGATGAAATGA-GAA--G----AA--ATCACCCTTTTACTTCCGAGTAGT-AATTGTT---GA-TA-A-
gi|3228 : -TT-TGGTGAAATGA-GAA--A----AA--A---------AACTTCCGGGTAGT-AATTGTT---TG-TA-A-
gi|3229 : -TT-TAGTGAAATGA-GAA--A----AACTGTTCCCCTTTAACTTCTGGGTGGT-GATTGTT---TG-TA-ATAAAAA
gi|3230 : GTGAAATGA-GAA--A----AACAGTTCCCCTTTAACTTCTGGGTGGT-GATTGTT---TG-TG-A-CAAAA
gi|3231 : --A----AA--GTTCCCCTTTAACCTTCGGTT-GTGGATTGTT---GG-TA-A-AAAAA
blockSeqs : A AA G A GA GAAA CG G GCA T T T
blockSeqs : . T . . . . CT . . . . .
blockSeqs : . A . . . . CA . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : ATTTTC-CN-TT-TGGTGAAATGA-GAA--A----AA--GTTCCCCTTTAACTTCCGGGTAGT-GATTGTT---TG-TA-A-AAAAA
finalCons : ATTTTC-CN-TT-TGGTGAAATGA-GAA--A----AA--GTTCCCCTTTAACTTCCGGGTAGT-GATTGTT---TG-TA-A-AAAAA
Alignments
lowQualScore : 1 22 1 1 22 3333 66 1 222 1 1 1
lowQualScore : . .. . . .. .... .. . ... . . .
lowQualScore : 7 66 6 5 00 1111 11 5 666 5 5 5
consensus : ATTTTC-CN-TT-TGGTGAAATGA-GAA--A----AA--GTTCCCCTTTAACTTCCGGGTAGT-GATTGTT---TG-TA-A-AAAAA
Reference ( family-692 ) : ATTTTC-CN-TT-TGGTGAAATGA-GAA--A----AA--GTTCCCCTTTAACTTCCGGGTAGT-GATTGTT---TG-TA-A-AAAAA
gi|3205 : ATTTTC-TT-TT-TGGTGAAATGA-GAA--A----AA--GTTCCCCTTTAACCTTCGAGTAGT-GATTGTT---TG-TA-A-AAAAA
gi|3206 : ATTTTC-CT-TT-TGGTGAATTGA-TAA--A----TT--GTTCCCCTTTAATTTCTGGGTGCT-GATCGCT---TG-TA-A-AAAA
gi|3207 : ATTTTC-CA-TT-CGGTGAAATGA-GAA--A----AA--GTTCCCCTTTAACTTCCGGGTAGT-GATTGTT---TG-TA-A-TAAAA
gi|3208 : ATATTA-CT-TT-TGGTGAAATGA-GAA--T----AACGGTTCCCCTTTATCTTCTAGGTGGT-GATTGTT---TG-TA-A-AAAAA
gi|3209 : ATTTTC-CA-TT-TGGTGAAATGA-GAT--A----AA--GTTCCCCTTTAACTTCCAGGTAGT-GATTGTT---TG-TA-A-TAAAA
gi|3210 : ATTTTC-CA-TT-TGGTGAATTGA-GAA--A----AA--GTTACTCTTTAACTTCCGGGTAGT-GATTGTT---TG-TA-A-AAGAA
gi|3211 : ATTTTC-TG-TT-TGGTGAAATGA-GAA--AGAAAAA--GTTTCCTTTTAATCTTCGGGTTGT-GATTGTT---TG-TA-A-AAAAA
gi|3212 : ATTTTC-CT-TT-TGGTGAAATGA-GAA--A--------------------CTTCCGGTTAGT-GATTATT---TG-TA-A-TAAAA
gi|3213 : ATTTTC-CT-TT-TTGTGGAATGA-GAA--A----AA--GTTCCCCTTTAACTTTCGGGTAGT-GGTTGTT---TG-TA-A-ACAA
gi|3214 : ATTTTC-CG-TT-TGGTGAAATGA-GAA--A----AA--GCTCCCCTTTAATCATCGGGTAGT-GATTGTT---TG-TA-A-AAAAA
gi|3215 : ATTTTC-CT-TT-TGGTGAATTAA-TAA--A----AA--GTTCCCCTTTAATTTCCGGGTGCT-GATTACTGCATG-TA-A-
gi|3216 : ATTTTC-AT-TT-TGGTGAAATGAAGAA--A----AA--GTTCATCTTTAACTTTCGGGTTGT-GATTGTT---TG-TA-A-GAAAA
gi|3217 : ATTTTC-AT-TT-CGGTAAAGTGA-GAA--A----A---GTTCGCCTTTAACTTCGGGGTTAA-GATTGTT---TG-TA-A-ACAA
gi|3218 : ATTTTC-CT-TT-GGGTCAAATGA--AA--A----AG--GT--CCCTTTAACTCTCCTGTAAC-GATTGTT---TG-TA-C-AAAAA
gi|3219 : ATTTTC-AA-TT-CGGTGAAATGA-GGA--A----A---GTTTCCCTTTAACTTTCGGGTAGT-TATTGTT---TG-TA-A-TAAAA
gi|3220 : ATTTTC-AA-TT-TGGTGAAATGA-AAA--A----AA----TGCCATTTATCTTCCAGGCAGT-GATAACT---TG-TATA-ACAAA
gi|3221 : TTTTC-CT-TT-TGTTAATATGA-GAA--A----AA--GCTTCCCTTCAATCTTCGGGTAGT-GATTGTT---TG-TA-A-AAAAA
gi|3222 : TTTTT-CA-TT-TGGTGAAATAA-AAAGAA----AA--GTTCCCCTTTAATTTCCGGGTTGT-GATTGTT---TG-TA-A-AAAAA
gi|3223 : TTTTC-GT-TT-TGGTGAAATGA-TAA--A----AA--GTTCCCCTTTAATTTCTAAGTAGT-CAATGTT---TG-TA-A-AAAA
gi|3224 : TTTC-CA-TT-TGGTGAATTGT-GAA--A----AA--GTTCCCCTTTAACTTCCGGGAAGT-GATTGTT---TGTTA-A-AAAAA
gi|3225 : TTTC-CA-TT-TGGCGAAATGA-GAA--A----AA--GTTCCCCTTTAACTTTCGGGTGGC-GATTGTT---TG-TA-A-AAAAA
gi|3226 : TTCACT-TT-TTGTGGAGCGA-GAA--A----AA--GTTCCCCTTTAACTTTCGGGTAGT-GATTGTT---TG-TA-A-TAAAA
gi|3227 : TTC-CAATTGTGATGAAATGA-GAA--G----AA--ATCACCCTTTTACTTCCGAGTAGT-AATTGTT---GA-TA-A-
gi|3228 : -TT-TGGTGAAATGA-GAA--A----AA--A---------AACTTCCGGGTAGT-AATTGTT---TG-TA-A-
gi|3229 : -TT-TAGTGAAATGA-GAA--A----AACTGTTCCCCTTTAACTTCTGGGTGGT-GATTGTT---TG-TA-ATAAAAA
gi|3230 : GTGAAATGA-GAA--A----AACAGTTCCCCTTTAACTTCTGGGTGGT-GATTGTT---TG-TG-A-CAAAA
gi|3231 : --A----AA--GTTCCCCTTTAACCTTCGGTT-GTGGATTGTT---GG-TA-A-AAAAA