lowQualScore : 11 11 2222 1111 222222222222 22222222222222222 111111 1111 11 1111111111 3333333333333333333333333333 1 22222 2222222222222 1111111 22222222222222222222 11111111 22222222222 33333333333333 111111 111111111 111 1111111 1 111111111
lowQualScore : 1 9 22 2 77 1111 0000 3 8 0 2 22 1 22 333333333333 5 0 2 0 5 3 4 22222222222222222 3 4 444444 1 44 2222 6 44444 00 4444444444 77 1 1 5555555555555555555555555555 4 0 2 8 1 1 2 6 4 88888 2 0000000000000 88 333 7777777 2 99999999999999999999 333 4444 0 0 55555 4 66666666 3 1 1 6666666 55555555555 7777 2 22222222222222 55555 111111 4444 2 3 555 0 2 2 000000000 99 55 999 55555 4444 2 99 111 2 0000000 2 6 888888 666666 2 333 333333333 2 0 2 2 6 6 1 444 3 3 555
lowQualScore : . . .. . .. .... .... . . . . .. . .. ............ . . . . . . . ................. . . ...... . .. .... . ..... .. .......... .. . . ............................ . . . . . . . . . ..... . ............. .. ... ....... . .................... ... .... . . ..... . ........ . . . ....... ........... .... . .............. ..... ...... .... . . ... . . . ......... .. .. ... ..... .... . .. ... . ....... . . ...... ...... . ... ......... . . . . . . . ... . . ...
lowQualScore : 7 1 99 9 11 8888 2222 9 4 1 6 33 9 88 444444444444 0 6 0 9 3 6 6 44444444444444444 6 7 777777 8 66 5555 5 55555 00 4444444444 88 8 9 8888888888888888888888888888 2 5 1 4 2 5 1 4 2 55555 1 6666666666666 77 777 9999999 1 66666666666666666666 777 5555 4 7 44444 2 22222222 8 3 9 8888888 33333333333 6666 1 77777777777777 66666 555555 9999 2 9 222 1 1 1 999999999 22 88 999 44444 5555 2 22 444 1 4444444 6 3 888888 111111 1 777 333333333 6 8 1 1 7 7 9 111 1 2 888
consensus : GAAAACCAGACAAAATNAAGC--GNAAAACAATTATACAAAA----TATTG--AAAACGGNGGTNTAAAAATGATAGATA-TAG--A-----ACT--T-TTTATAAATT-CAATTAAAGCAAGTTGGGTNAAAAG----A------------TTAA-CAGAT-G-T-AA-AC-AATAAC---GGCGA-----AT--GGAA----G----NATATATAC-AT-GTCT----T-C----ANTGG-A-A-----AAATATGGCGG-AAA-CTTCATCTTTGAGAGT-AACTT-TAATTT-TAAAGAT-AGTTGT-TCT----ATG--TT---CAAC---G--AAAC-G---C---C---------G--TT---TT----TATGTAA--C--ATNAT---NG---AATCATGG-TCAAAAATAAATTTT-------AAC-----T--NTAATA---TTGA-AGATGTTAATCT-AN---TAA-----AAC---AG-TACA-TA-TGGAATAATTCT--TTC-A-T---AA----AAN-AT--AACGGCAG---TTCA----TTATTTTACAAAGCATGGT-T--ACAGC-TAGGAA-T-T-----AAA-ACA-ATAAATG----ATAT------ATAT-G---ATT--------NTAGACACAAGACGTT-TTATA-ATTTT-GA-AAGATTAAA---ACAAT-TNTACAAT---ATAAATAAT
Reference ( gi|21796 ) : GAAAACCAGACAAAATTAAGC--GAAAAACAATTATTCAAAA----TATTG--AAAACGGTGGTATGAAGATGATAGATA-TAG--A-----GCT--T-TTTATACATT-CAATTAAGGCAAGTTGGGTTAAACG----A------------TTAA-CAGAT-G-T-AA-AC-AATAAT---GGCGA-----AT--GGAA----G----TATACATAC-AT-GTCT----T-C----ATTGG-A-A-----AAATATGGCGG-AAA-CTTCATCTTTGAGAGT-AATTT-TAATTT-TAAAGAT-AGTTGT-TCT----ATG--TT---CAAC---G--AAAC-G---C---C---------G--TT---TT----TATGTAA--C--ATTAT---TG---AATCATGG-TCAAAAATAAATTTT-------AAC-----T--GTAATA---TTGA-AGATGTTAATCT-AC---TAA-----AAC---AG-TACA-TA-TGGAATAATTCT--TTC-A-T---AA----AAC-AT--AATGGCAA---TTTA----TTATTTTACAAAGCATGGC-T--ACAGC-TAGGAA-T-T-----AAA-ACA-ATAAATG----ATAT------ATAT-G---ATT--------GTAGACACAAGACATT-TTATA-ATTTT-GA-AAGATTAAA---ACAAT-TGTACAAT---ATAAGTAAT
gi|21797 : GAAAACCAGACAAAATTAAGC--GAAAAACAATTATTCAAAA----TATTG--AAAACGGTGGTATGAAGATGATATATA-TAG--A-----GCT--T-TTTATACATT-CAATTAAGGCAAGTTGGGTTAAACG----A------------TTAA-CAGAT-G-T-AA-AC-AATAAT---GGCGA-----AT--GGAA----G----TATATATAC-AT-GTCT----T-C----ATTGG-A-A-----AAATATGGCGG-AAA-CTTCATCTTTGAGAGT-AATTT-TAATTT-TAAAGAT-AGTTGT-TCT----ATG--TT---CAAC---G--AAAC-G---C---C---------G--TT---TT----TATGTAA--C--ATTAT---TG---AATCATGG-TCAAAAATAAATTTT-------AAC-----T--GTAATA---TTGA-AGATGTTAATCT-AC---TAA-----AAC---AG-TACA-TA-TGGAATAATTCT--TTC-A-T---AA----AAC-AT--AATGGCAA---TTTA----TTATTTTACAAAGCATGGC-T--ACAGC-TAGGAA-T-T-----AAA-ACA-ATAAATG----ATAT------ATAT-G---ATT--------GTAGACACAAGACGTT-TTATA-ATTTT-GA-AAGATTAAA---ACAAT-TGTACAAT---ATAAGTCAT
gi|21799 : GAAAACCAGACAAAATTAAGC--GTAAAACAATTATTCAAAA----TACTG--AAAACGGTGGTATGAAGTTGACAGATA---G--A-----GCT--T-TTTATACATT-CAATCAAGGCAAGTTTGGTTAAGCG----A------------TTAA-CAGAT-G-TAAA-AC-AATAAT---GGCGA-----AT--GGAA----G----TATATATAC-AT-GTTT----T-C----ATT-G-A-A-----AAATATGACGG-AAA-CTTCATCTTTGCGAGT-AATTT-TATTTT-TAAAGAT-AGTTGT-TCT----TTG--TT---TAGC---G--AAAC-G---C---T---------A--TT---TT----TATATGA--C--ATTAT---TG---AATCATGG-TCAAAAACAAATTTT-------AAC-----T--CTAATA---TTGA-AGATGTTAATCT-AT---CAA-----AAC---AG-TACA-TA-TAGAATAATACT--TTC-A-T----A----AAC-AT--AAAGGCAA---TTTA----TTATATTACAAAGCATGGC-T--ACAGC-TAAGAA-T-T-----AAA-ACA-ATAACTG----ATAT------ATAT-G---ATT--------GTAGATACAAGACATT-TTATA-ATTTT-GA-AAGATTAAA---ACAAT-TGTAC
gi|21798 : GAAAACCAGATAAAATAAAGC--GTAAAACTATTATACAAAA----TATTG--AAAACGGTGGATTGAAAATGATAGATA-TAG--A-----ACT--T-TTTATAAATT-CAATAAAAGCAAGTTGGGTTAAACG----A------------CTAA-CAGAT-G-T-AC-AT-AATAAT---GGCGA-----AT--GGAA----G----TATATATAC-AG-GTCT----T-C----ACTTG-A-A-----AAATATGGTGA-AAA-CTTGATCTTTGATAGT-AATTT-TAATTT-CGAAAAT-AGTTGT-TCT----ATG--TT---TAAT---G--AAAC-G---C---C---------G--TT---TT----TATGTAA--C--ATAAT---AT---AATCATGG-TCCAAAATAAATCTT-------ATC-----T--TT-ATA---TTGA-AGATGGTAATCT-AG---TAA-----AAC---CG-TACA-TA-TGGAACAATTCT--TTC-A-T---AA----AAA-AT--AATGGCAG---TTTC----TTATTTTACAAATCATGGT-T--ACAGT-TACGAA-T-T-----AAA-ACA-TTAAATG----ATAT------ATAT-A---ATT--------CTAGACACAACACATT-TTATA-CTTTT-GA-AAGATTAAA---ACAAT-TATACAAT---ATAAATAAT
gi|21800 : GGAAACAAGACAAAGTAAAGC--GTAAACCTATTAT-AAAAA----TATTG--AAAACGATGGTATGAAGATGATAGATA-TAT--A-----ACG--T-TTGATACATT-CAATAAAAACAAGTTGGGTTAAATG----A------------CTAA-CAGAT-G-T-AA-AC-AATAAT---GACGA-----AT--GGAA----G----AATATATAC-AT-GTCT----T-C----AATTG-A-A-----ATTTACGGCGG-AAA-CTTCATCTTTGAG----AATGT-TAATTG-CAAAG-----------------ACG--TT---CAGT---G--AAAC-G---C---C---------A--TT---TT----TATGTAA--C--ATGAC---GG---AATCATGT-TTAAAAACTTATTTT-------AAC-----A--CTAATA---TTGA-AGATGTTAATTT-AG---TAA-----AAC---AA-TATC-TA-ACGAATAATTAT--TTC-ACT---GA----AA--GT--AAAGGCAG---TCAG----TTATGTTACAAATCATGGT-T--ACAGCATA-GAA-T-GAAAAAAAA-ACA-ATAAATG----ATAT------ATAT-A---ATT--------CTAGACACAAGGCGTT-TTATA-CTTCT-GA-ATGATT
gi|21802 : AAAACCTGATAAAATAAAAA--GGACAACACTAACTCAAGAC---TAT-G--AAAATGGAGGTCTAAAAATGATTGATA-TTG--A-----AAT--G-TTCATAAACT-CTCTTAAATCAAGTTGGATAAAAAG----A------------TTAC-TTGAT------A-AC-AGTAATTCCGGTCA-----AT--GGAA----AGTCATATATCTAA-AT-AAAC----T-C----AAT-----------AAGTATGGTGGTAAA-CT-CATTTTTGAAAGT-AACTTGCAAG----AAAAAT-A--TGT-TTTGAAAATG--TA---TAA-------AAAC-G---A---T---------AACTT---TC----TAAAGGA--A--ATCAT---AA---TATCATGGACCAAAATTAAA-----------AAG-----T--TTGATA---G-GA-AAATG--AACAT-AAA--TAA-----AGA---AA-TTTT-TA-TGGAATAA--------C-A-C---AAATATAAC-TTTAAATCTTAA---TACG----TTATGCTACATTGATTGGT-C--AGAAA-AGGGAA-T-C-----AAATATATACAAA------ACAT------ATAT-G---ATT--------TTAGAAAAAAAAGATT-TTATA-ATTTCAGC-GAGCTTAAA---AC
gi|21801 : AAAACCTGATAAAATAAAAA--GGACAACACTAACTCAAGAC---TAT-G--AAAATGGAGGTCTAAAAATGATTGATA-TTG--A-----AAT--G-TTCATAAACT-CTCTTAAATCAAGTTGGATAAAAAG----A------------TTAC-TTGAT------A-AC-AGTAATTCCGGTCA-----AT--GGAA----AGTCATATATCTAA-AT-AAAC----T-C----AAT-----------AAGTATGGTGGTAAA-CT-CATTTTTGAAAGT-AACTTGCAAG----AAAAAT-A--TGT-TTTGAAAATG--TA---TAA-------AAAC-G---A---T---------AACTT---TC----TAAAGGA--A--ATCAT---AA---TATCATGGACCAAAATTAAA-----------AAG-----T--TTGATA---G-GA-AAATG--AACAT-AAA--TAA-----AGA---AA-TTTT-TA-TGGAATAA--------C-A-C---AAATATAAC-TTTAAATCTTAA---TACG----TTATGCTACATTGATTGGT-C--AGAAA-AGGGAA-T-C-----AAATATATACAAA------ACAT------ATAT-G---ATT--------TTAGAAAAAAAAGATT-TTATA-ATTTCAGC-GAGCTTAAA---AC
gi|21803 : AAAGCC-GACAAGATCAAAC--GAAAAATACTAA--CAAAA-----ATTACCAAAACGGTGGTTTAAAAATGATTGATATTAATTA-----ATTCAT-TTTAT-CATT-CAAAT----CAAGCTGGATAACTCG----A------------TTAT-TTGAT-G---AA-TCAAACAAG---GGTTT-----AT--GGAA----A----TAAATTTAT-TT-ATCTAAGAT-C----A-----A-T-----AACTATGGAGGCAAA-C-TAATTTTTGAAAGT-AATTT-
gi|21804 : AAAACCTGATAAAATAAAAA--TGACAACACTAACTCAAGAC---TAT-G--AAAATGGAGGTCCAAAAATGATTGATA-TTG--A-----AAT--G-TTCATAAACT-CTCTTAAATCAAGTTGGATAAAAAG----A------------TTAC-TTGAT------A-AC-AGTAATTCCGGTCA-----AT--GGAAAGTCA----TATATCTAA-AT-AAAC----T-C----A-----A-T-----AAGTATGGTGGTAAA-C-TCATTTTTGAAAGT-AACTT-GCA-----AGAAAA-AGATGT-TTTGAAAATG--TA---TAA-------AAAC-GATAA---C---------T--TT---CT----AAAGGAAATC--ATAATACATG---TATCATGG-ACCAAAATTAA---C-------AAG-----T--TTGATA----GGA-AAATG--AACATAAA---TAA-----AGA---AA-T-TT-TA-TGGAATAA--------C-A-C---AA----ATC--T--AACTTTAAATCTTCATACGTTATGCTACATTGATTGGT-T--AGAAA-AGGGAA-T-C-----AAATATATACAAA------ACAT------ATAT-G---ATT--------TTAGAAAAAAAAGATT-TTATA-ATTTCAGC-GAACTTAAA---AC
gi|21805 : AAAACCCGACAAGATAAAAC--GTAAAATACTTA--CAAAA----GATTACCAAAACGGTGGTTTAAAAATTATTGATA-TTG--ATAAATACA--T-TTTAT-CATTAAAATT-----AAGCTGGATAAAACG----A------------TGAT-TTGAT-G---AA-TC-A--AAC---AG-GATTTTTTT--GGAA----------ACAAATTT-AT--TTT----T-CTAAGATT---A-AT----AACTATGGAGGCAAA-CTT-ATATTTGAAAGT-AA-AT-TAACAG-AAAACAA-AATTGTAAAA----ATG--TT---TAA-------AAAT-G---A---C---------A--CC---TT----CTTCTAA--CAAATCCT---TG---TATCTTGG-TCTAATATAAA
gi|21806 : AAACCAGACAAAGTTAAAT--GTAAAACTATTATACAAAA----TATTG--AAAACGGTGGTATGAAGATGATAGATA-TAG--ATAGA-ACT--T-TTTATAAATT-CAATTAAAGCAAGTTGGGCTAAACG----A------------TTAA-CAGAT-A-T-AA-AC-AATAAA---GGCGC-----AT--GGAA----G----ACTATTTAC-AT-GTCA----T-C----AATTG-A-A-----AAATATGGTGG-AAA-CTTAATCTTTGAGAAT-AACTT-TAATTG-CAAAGAC-GATAAT-TCT----ATG--TT---TAGC---G--AAAT-GC--C---C---------T--TT---TT----TATGTAA--C--ATAAT---AG---AGCCATGG-TCAAAAATTAATTTT-------AAA-----A--CTACTA---TTGA-AGATGTTAATAT-AG---CAA-----AAC---AG-TATA-TA-TGGAATAATTCT--TTC-A-T---TA----AAA-GT--AAAGGCAG---TTTG----TTATTTTAC-AAGCATGGT-T--AGAGC-TAGGAG-T-C-----AAA-ACA-ATAAATGATATATAT------ATAT-G---ATT--------CTAGACACAAGACGTT-TTATA-CTTTT-TA-ACGATTAAA---TCAAT-TATACAAT---ATTAGTAAT
gi|21807 : AAACCAGATCAAATTAAGC--GTAAA-CTATAATACAAAA----TATTT--AAC-CGGTAGTATGAAAAAGATAGGTA-TAG--A-----ACT--T-TT-ATCAATT-CAATAAAAGCAAATTGGGTTAAAAG----A------------TTAA-CAGAT-G-A-AA-AC-AATAAT---GGCGA-----AT--GGAA----T----AATATATAC-AT-GTCT----T-C----AGT----------------TAACGG-AAAACTTCATCTTTGACAGT-AAATT-TAGTTA-CAAAAAT-GGTTAT-TCT----ATG--TT---CAGC---G--AAAC-G---C---C------------------T----GATGTTA--C--ATAAT---AG---AATCATGG-TCAAAAATTAATTGT-------AAC-----T----AATA---TTGA-AGATATTATTTT-GG---TAA-----AAC---AA-TACA-TA-TGGAATAACTAT--TTCAA-T---AA----AA--AT--AAAGACAG---TTTG----CTACTTTATAAATTATTTT-A--ACAGC-TTGAAA-T-T-----AAA-ATA-ATAAATG----GTAT------ATAA-GTATATTTATATATACTAGACACAAGACGTT-TTATA-CTTTT-AA-AATATTAAA---ACAAT-TATACAAT---ATAAGTAAT
gi|21808 : AAATCTGATAAAATTAGTC--GAAAAACAATAATACAGGA----TGATG--AAAACGGGGGCCTAAAAATGATTGATT-TAA--A-----CAT--G-TTTATAAAAG-CAATTAAAGCAGGATGGGTCAAAAG----A------------ATAA-TCGATAA-T-AA-A--AATGAG---GGTGA-----TT--GGAA----A----CATATATACAAT-AGC-----A-C----ATTAG-ATA-----AAATA-GGGGG-ACA-ATTAATATTTGAATGT-AATTC-AAA----TGAAAAT-GA------CT----ATA--TTAAACAAA---A--AAACAA---C---CATTTCCCAAA--TT---TT----TCT-TAG--A--AATAT---TGC--AATCCTGG-TCAAGCATAAACTTTGTAAATAAAC-----C--AGAA-G---CTGA-AGG-ATTAA----AC-----A-----ATC---AGATAT--TA-TGGAACAACTCT--TAT-A-TAAAAA----AACAAT--AA-AACGA-----CA----TTATTTTATAAAGAATGATAT--GCAAA--AGGTA-CAT-----CAA-ACA-A------------AT------ATTT-G---ATA--------GTAGGTAAAAAACATT-TTATACATTT
gi|21809 : AAACCAGACAAAA-TAAGTA-GAAAAACAATTATACAAAA----TAACG--AAAATGGGGGCTTAAAAATGATAGATC-TGA--A-----TAT--G-TTTATTAAGT-CAATTAAAGCAGGTTGGGTGAAAAGAATTA------------TCAACCAGA--G-T-AATAC-A--------GGTGA-----TTCAGGAA----G----CATATATAC-ATGGGCCAA--C-C----A--GA-A-A-----AAATA-GGAGG-ACC-ATTAATATTTTAATGT-AA-TT-TAA----TAAAAAT-GACT-----T----AAA--T-----AAT---G--CAAC-T---C---A---------G--ATAGACT----CA---GA--A--ATTGT---AC---AATCATGG-TCAAGTATCAATTAT-------AAA-----G--AAAATG---TTGA-ATATATAAAT----------A-----AACA--AA-TAC--TA-TGGAATAATTC---AAC-A-T---CA----AAA-AT--AATAATAA---AACA----TTCTTCTATAA
gi|21810 : AAACCGGATAAAATTAATA--GAAAAACAATTATACAAAAC---TA-CG--AAAATGGGGGTTTAAAAATGATAGATC-TGC--A-----ATT--A-TTTATAAATT-CGATTAAAGCCGGGTGGGTCAAACGT---A------------TT-A-TAAAT-GAT-CA-A--AATAAA---GGGGA-----CT--TGAA----A----CACATATAC-
gi|21811 : AAACCAGACAAAA-TAAGTA-GAAAGACAATTATACAAAA----TTACG--AAAATGGGGGCTTAAAAATAATAGATC-TGA--A-----TAT--G-TTTATTAAGT-CAATTAAAGCAGGTTGGGTGAAAAGAATTA------------TCAATCAGA--G-T----AC-TACA-----GGTGA-----TT--GGAA----G----CATATATAC-AA-GGGC----C-A----ACTAGCA-A-----AAATA-GGAGG-ACC-ATTAATATTTCAGTGT-TATAT-TAA----TAAAAATGACTTAA-ATA----ATG-------CAACTTAGATAAAC-T---CAAAC------------TT---TT----TATCAGA--A--ATTGT---AC---AATCATGG-TCAA
gi|21812 : AAACCAGATAAAAT--AGCAAGACACACAATTA---AAAAAGACTAT-A--AAGATGGGGGATTAAAAATGATAGATT-TGA--AT----GCA--TATCTATAC--T-CAATAAAAGCAAGTTGGATCAAAAG----AATTT--------TTAA-C-GAT-G----A-A--AATACC---GG--A-----ATCTGGAA----A----GATAATTAT-AT-G--------------AATGA-A-ATTAACAAATTTGGTGG-GAA-ATT-ATTATTACAATC-AAACA-TAACATATAAAGAT-A--TAA-CCA----ATAAATT---CAA-------AAAT-A---T---T------------TT---CT----TAAGGGA--T--GTT-T---TACAAAGT--TGG-GCAAAGGTAAACTTT-------AAT-----TCGGAAATA---ACAA-ACAT-------C-ACAGATGA-----AAT--------CA-TA-TGGAATAACTCA--TTT-A-T---AC----AAA-AT--AACAATAA---AACA----ATATTTTATAGAGTATGGC-TGGATAA---AGGAA-T-A-----AAATATA-TTAAACA----AC-T------TTAT-G---ATT--------ACAGAAATAAGAACTT-TTATA-ATTTT-AATACGATC-AA---ACAAC-TTTACAAT---CTAGACAAT
gi|21813 : AAACCAGATAAAAT--AGCAAGACACACAATTA---AAAAAGACTAT-A--AAGATGGGGGATTAAAAATGATAGATT-TGA--AT----GCA--TATCTATAC--T-CAATAAAAGCAAGCTGGATCAAAAG----AATTT--------TTAA-C-GAT-G----A-A--AATACC---GG--A-----ATCTGGAA----A----GATAATTAT-AT-G--------------AATGA-A-ATTAACAAATTTGGTGG-GAA-ATT-ATTATT-ACAGTCAAACA-TAACATATAAAGAT-A--TAA-CCA----ATAAATT---CAA-------AAAT-A---T---T---------T--TC---TTAAGGTATGTT-------TTAC---AA---AGT--TGG-GCAAAGGTAAACTTT-------AAT-----TCGGAAATA---ACAA-ACAT-------C-ACAGATGA-----AAT--------CA-TA-TGGAATAACTCA--TTT-A-T---AC----AAA-AT--AACAATAA---AACA----ATATTTTATAGAGTATGGC-TGGATAA---AGGAA-T-A-----AAATATA-TTAAACA----AC-T------TTAT-G---ATT--------ACAAAAATAAGAACTT-TTATA-ATTTT-AATACGATC-AA---ACAAC-TTTACAAT---CTAGACAAT
gi|21814 : AAACCAGATAAAAT--AGCAAGACACACAATTA---AAAAAGACTAT-A--AAGATGGGGGATTAAAAATGATAGATT-TGA--AT----GCA--TATCTATAC--T-CAATAAAAGCAAGTTGGATCAAAAG----AATTT--------TTAA-C-GAT-G----A-A--AATACC---GG--A-----ATCTGGAA----A----GATAATTAT-AT-G--------------AATGA-A-ATTAACAAATTTGGTGG-TAA-ATT-ATTATTACAATC-AAACA-TAACATATAAAGAT-A--TAA-CCA----ATAAATT---CAAA---A--AAAT-T--------------------TT---CT----TAAGGGA--T--GTT-T---TACAAAGT--TGG-GCAAAGGTAAACTTT-------AAT-----TCGGAAATA---ACAA-ACAT-------C-ACAGATGA-----AAT--------CA-TA-TGGAATAACTCA--TTT-A-T---AC----AAA-AT--AACAATAA---AACA----ATATTTTATAGAGTACGGC-TGGATAA---AGGAA-T-A-----AAATATA-TTAAACA----AC-T------TTAT-G---ATT--------ACAGAAATAAGAACTT-TTATA-ATTTT-AATACGATC-AA---ACAAC-TTTACAAT---CTAGACAAT
gi|21815 : AAATAAAGC--GTAAAACTAATATACAAAA----TATTG--AAAATCGTGGTATGAAACTGACAGATA-TAG--A-----ACT--T-TTTATAAATT-CAATAAAAGCAAGTTGGGTTAAAAG----A------------CTAA-CAGAT-G-A-AA-AT-AATAAT---GAAGA-----AT--GGAA----G----TATATAAAC-AG-GTCT----T-C----ATTGG-A-A-----AAATATGGTGG-AAA-CTTCATCTTTGAGGGT-AACTT-TTAGTT-CGAAGAT-AGTTGT-TCT----ATG--TT---TAGT---G--AAAC-G---C---C---------G--TT---TT----TATGTAA--C--ATAAT---AG---AATCATGG-TTCAAAATTAATTTT-------AAT-----T--TTAATA---TTGA-AGATGGTTATCT-AG---TAA-----AAC---AA-TATA-TA-TGGAACAATTTC--TTC-A-T---CA----AAA-AT--AATGGCAG---ATTA----TTATTTTACAAATCATGGT-A--ACAAT-TAGGAA-T-T-----AAA-ACA-TTAAATG----ATAT------ATAT-G---ATT--------CTTGACATATGACATT-TTATA-CTATT-GA-AAGATTAAA---ACAAT-TATACAAT---ATAAATAAT
gi|21816 : -TAG--A-----ACT--T-TCTATAAATT-CAATTAAAGCAAGTTGGGTTAAACA----AACGCACCAAACATCAA-CAGAT-G-T-AA-AC-AATAAA---GGCGA-----AT--GGAA----G----AATATATAC-CT-GTCT----TCC----ATT-G-A-A-----AAATATGACGG-AAA-CATCATCTTTGAGAAT-AACTT-TAATAG-CAAAGAT-GGTTAT-TCT----ATG--TT---CAGC---G--AAAC-G---C---C---------T--TT---TT----TATGCAA--C--ATAAT---AA---AACCATGG-TCAAAAATTAATTTT-------AAC-----A--CTAATA---TTGA-AGAT
gi|21819 : ------------TTAA-CAGAT-G-T-TA-AC-AATAAC---GGCGA-----AT--GGAA----G----TATATATAC-AT-GTCT----T-C----AT
gi|21817 : attgaattttttttaaaaaaagtttaaacgtggatgtgttgct------------TTAA-CAGAT-G-T-TA-AC-AATAAC---GGCGA-----AT--GGAA----G----TATATATAC-AT-GTCT----T-C----ATaatggcagtttattattttacaaagcatggctacagctaggaattaaaacaataaattgtatatatgattgtagatacaagacattttataattttgaaagattaaaacaattgtacaatataagtaat
gi|21818 : AATTT-TAACGAT-AGTTGT-TCT----ATG--TT---CAGC---G--AAAC-G---C---C---------G--TT---TA----TTTGTAA--C--ATAAT---TG---AATCATGG-TAAACAATTAATTTT-------A-------------------TTGA-AGATGTTTATCT-AC---TAA-----AAC---AC-TTCA-TA-TGGAATAATTCT--TTC-A-T---AA----AAC-AT--AATTGCAG---TTTA----TTATTTTACAAAGCATGAC-T--ACAGC-TAGGAA-T-A-----AAT-ACA-ATAAATG----ATAT------ATAT-G---ATT--------GTAG-----AGACATT-TTATA-ATTTT-GA-AAGATTGAT---ACAaatgg
gi|21819 : AT---TG---AATTTTTT-TTAAAAA-AAGTTTA-------AACGTGGAT--GTGTTGCT-TTAACAGATGTTAAC---AA---TAACGGCGAATGGAAG-TATA-TA-T---ACATGTCT--T-----------------C-AT--AATGGCAG---TTTA----TTATTTTACAAAGCATGGC-T--ACAGC-TAGGAA-T-T-----AAA-ACA-ATAAATT----GTAT------ATAT-G---ATT--------GTAGATACAAGACATT-TTATA-ATTTT-GA-AAGATTAAA---ACAAT-TGTACAAT---ATAAGTAAT
gi|21820 : ATGG--CAGAATTAAATA---------AAA-----T---TAATAGACTTAC-AAGTAATAATCG------TAA-----AAT---AA-TAAAATAATAGAATAATTCTCTTTT-A-T---TA----AAA-GT--AA---CAT---TTTA----ATATTTTATTAATCATGGT-T--ACAGC-CAGGAA-T-TA----AAA-ACA-ATAAATGAC--ATAT------ATAT-G---ATC--------CTGGACACAAGACG-T-TTATC-ATT------------------ACAAG-TATGCAATATGATAAGTAA
gi|21821 : GGAATTTTTCT--TTC-A-T---TA----AAA-AT--AAAG--AG---TTTA----TTATTTTATAAATCATGGT-T--GCAGC-AAGGAAAT-T-----GAA-TCA-ATAAATG----ATATATATATATAT-G---ATT--------CTAGACACAA-ACCTTGTTAAA-CTTTT-GA-AAGATTAAATATACAATATG-ACAAT---ATGAATAA
gi|21822 : -TGGGAA-T-T-----AAA-ACA-ATAAATG----ATAT------ATATAA---ATC--------G-AGATACAAGGCGTT-TTATT-CTTTT-GA-TAGATTAAA---ACAAT-TATATAAT---AACAATAAT
Alignments
lowQualScore : 1 111 11111111111111111111111 11111 1111 1111111 3333333333333 1 22222 222222222222222 1111111 22222222222222222222 11111111 11111 1111111111111111 1
lowQualScore : 1 6 88 1 2 4 8888 1 1 55 888888 44444 555 555 55 1 1 1 1 44444444444444444444444 3 4 11111 3333 2222 3 88888888 22 888 77 1 1 1111111 1 0000000000000 3 0 2 2 7 0 1 22 4 4 55555 2 000000000000000 333 6666666 2 44444444444444444444 333 4444 0 44444 55 1 222 333 3 0 1 6666666 00000000 666 2 2 0 11111 55555 7777777777 2 3 444 2 9 77777 22 5555 6666666666666666 2 88 999 2 9999999 2 6 777777 555555 333 888888888 2 3 2 2 6 6 1 333 1
lowQualScore : . . .. . . . .... . . .. ...... ..... ... ... .. . . . . ....................... . . ..... .... .... . ........ .. ... .. . . ....... . ............. . . . . . . . .. . . ..... . ............... ... ....... . .................... ... .... . ..... .. . ... ... . . . ....... ........ ... . . . ..... ..... .......... . . ... . . ..... .. .... ................ . .. ... . ....... . . ...... ...... ... ......... . . . . . . . ... .
lowQualScore : 1 8 22 0 1 0 7777 0 0 22 444444 88888 777 444 22 1 1 9 0 99999999999999999999999 6 7 55555 1111 6666 0 99999999 55 555 55 8 9 5555555 0 1111111111111 5 0 0 1 5 6 0 88 4 0 33333 0 222222222222222 555 1111111 0 99999999999999999999 555 2222 2 66666 55 0 222 333 6 8 4 5555555 00000000 222 0 6 1 77777 33333 8888888888 1 3 555 0 6 22222 88 4444 6666666666666666 1 77 888 0 4444444 0 0 555555 888888 555 222222222 0 0 0 0 3 3 3 999 0
consensus : GAAAACCAGACAAAATNAAGC--GNAAAACAATTATACAAAA-TATTG--AAAACGGNGGTNTAAAAATGATAGATA-TNG----A-----AC---T--NTTTATAAATTCAATTAAAG-CAAGTTGGGTNAAA------------AG----A----TTAA-CAGAT-G-T-AA-AC-AATAA---CGGCGA-----A--T--GGAAG--NATATA--TAC-AT-GTCT----TCAAT--GG-A-A-----AAATATGGCGG-AAA-CTTCATCTTTGAGAGT--AACTT-TAAT-TNTAAAGAT-AGTTGT-TC--T----ATGTT---CAAC---G--AAAC-G---C---C---------G--TT---TT----TATGTAA--C--A--TNATAG-A---ATCATGG-TCAAAAATAAATTTT-------AAC-----TCTAATA---TTGA-AGATGTTAATCT-AGTAA-----AAC---AGTACA-TA-TGGAATAATTCT--TTC-ATAAAA----AAT--AACGGCAG---TT----CA----TTATTTTACAAAGCATGGC-T--ACAGC-TAGGAA-T-T-----AAA-ACA-ATAAATG----ATAT------ATATG---ATT--------NTAGACACAAGACGTT-TTATA-ATTTT-GA-AAGATTAAA---ACAATTNTACAATATAAATAAT
Reference ( family-691 ) : GAAAACCAGACAAAATNAAGC--GNAAAACAATTATACAAAA-TATTG--AAAACGGNGGTNTAAAAATGATAGATA-TAG----A-----AC---T--TTTTATAAATTCAATTAAAG-CAAGTTGGGTNAAA------------AG----A----TTAA-CAGAT-G-T-AA-AC-AATAA---CGGCGA-----A--T--GGAAG--NATATA--TAC-AT-GTCT----TCANT--GG-A-A-----AAATATGGCGG-AAA-CTTCATCTTTGAGAGT--AACTT-TAAT-TTTAAAGAT-AGTTGT-TC--T----ATGTT---CAAC---G--AAAC-G---C---C---------G--TT---TT----TATGTAA--C--A--TNATNG-A---ATCATGG-TCAAAAATAAATTTT-------AAC-----TNTAATA---TTGA-AGATGTTAATCT-ANTAA-----AAC---AGTACA-TA-TGGAATAATTCT--TTC-ATAAAA----NAT--AACGGCAG---TT----CA----TTATTTTACAAAGCATGGT-T--ACAGC-TAGGAA-T-T-----AAA-ACA-ATAAATG----ATAT------ATATG---ATT--------NTAGACACAAGACGTT-TTATA-ATTTT-GA-AAGATTAAA---ACAATTNTACAATATAAATAAT
gi|21796 : GAAAACCAGACAAAATTAAGC--GAAAAACAATTATTCAAAA-TATTG--AAAACGGTGGTATGAAGATGATAGATA-TAG----A-----GC---T--TTTTATACATTCAATTAAGG-CAAGTTGGGTTAAA------------CG----A----TTAA-CAGAT-G-T-AA-AC-AATAA---TGGCGA-----A--T--GGAAG--TATACA--TAC-AT-GTCT----TCATT--GG-A-A-----AAATATGGCGG-AAA-CTTCATCTTTGAGAGT--AATTT-TAAT-TTTAAAGAT-AGTTGT-TC--T----ATGTT---CAAC---G--AAAC-G---C---C---------G--TT---TT----TATGTAA--C--A--TTATTG-A---ATCATGG-TCAAAAATAAATTTT-------AAC-----TGTAATA---TTGA-AGATGTTAATCT-ACTAA-----AAC---AGTACA-TA-TGGAATAATTCT--TTC-ATAAAA----CAT--AATGGCAA---TT----TA----TTATTTTACAAAGCATGGC-T--ACAGC-TAGGAA-T-T-----AAA-ACA-ATAAATG----ATAT------ATATG---ATT--------GTAGACACAAGACATT-TTATA-ATTTT-GA-AAGATTAAA---ACAATTGTACAATATAAGTAAT
gi|21797 : GAAAACCAGACAAAATTAAGC--GAAAAACAATTATTCAAAA-TATTG--AAAACGGTGGTATGAAGATGATATATA-TAG----A-----GC---T--TTTTATACATTCAATTAAGG-CAAGTTGGGTTAAA------------CG----A----TTAA-CAGAT-G-T-AA-AC-AATAA---TGGCGA-----A--T--GGAAG--TATATA--TAC-AT-GTCT----TCATT--GG-A-A-----AAATATGGCGG-AAA-CTTCATCTTTGAGAGT--AATTT-TAAT-TTTAAAGAT-AGTTGT-TC--T----ATGTT---CAAC---G--AAAC-G---C---C---------G--TT---TT----TATGTAA--C--A--TTATTG-A---ATCATGG-TCAAAAATAAATTTT-------AAC-----TGTAATA---TTGA-AGATGTTAATCT-ACTAA-----AAC---AGTACA-TA-TGGAATAATTCT--TTC-ATAAAA----CAT--AATGGCAA---TT----TA----TTATTTTACAAAGCATGGC-T--ACAGC-TAGGAA-T-T-----AAA-ACA-ATAAATG----ATAT------ATATG---ATT--------GTAGACACAAGACGTT-TTATA-ATTTT-GA-AAGATTAAA---ACAATTGTACAATATAAGTCAT
gi|21798 : GAAAACCAGATAAAATAAAGC--GTAAAACTATTATACAAAA-TATTG--AAAACGGTGGATTGAAAATGATAGATA-TAG----A-----AC---T--TTTTATAAATTCAATAAAAG-CAAGTTGGGTTAAA------------CG----A----CTAA-CAGAT-G-T-AC-AT-AATAA---TGGCGA-----A--T--GGAAG--TATATA--TAC-AG-GTCT----TCACT--TG-A-A-----AAATATGGTGA-AAA-CTTGATCTTTGATAGT--AATTT-TAAT-TTCGAAAAT-AGTTGT-TC--T----ATGTT---TAAT---G--AAAC-G---C---C---------G--TT---TT----TATGTAA--C--A--TAATAT-A---ATCATGG-TCCAAAATAAATCTT-------ATC-----TTT-ATA---TTGA-AGATGGTAATCT-AGTAA-----AAC---CGTACA-TA-TGGAACAATTCT--TTC-ATAAAA----AAT--AATGGCAG---TT----TC----TTATTTTACAAATCATGGT-T--ACAGT-TACGAA-T-T-----AAA-ACA-TTAAATG----ATAT------ATATA---ATT--------CTAGACACAACACATT-TTATA-CTTTT-GA-AAGATTAAA---ACAATTATACAATATAAATAAT
gi|21799 : GAAAACCAGACAAAATTAAGC--GTAAAACAATTATTCAAAA-TACTG--AAAACGGTGGTATGAAGTTGACAGATA---G----A-----GC---T--TTTTATACATTCAATCAAGG-CAAGTTTGGTTAAG------------CG----A----TTAA-CAGAT-G-TAAA-AC-AATAA---TGGCGA-----A--T--GGAAG--TATATA--TAC-AT-GTTT----TCATT---G-A-A-----AAATATGACGG-AAA-CTTCATCTTTGCGAGT--AATTT-TATT-TTTAAAGAT-AGTTGT-TC--T----TTGTT---TAGC---G--AAAC-G---C---T---------A--TT---TT----TATATGA--C--A--TTATTG-A---ATCATGG-TCAAAAACAAATTTT-------AAC-----TCTAATA---TTGA-AGATGTTAATCT-ATCAA-----AAC---AGTACA-TA-TAGAATAATACT--TTC-AT-AAA----CAT--AAAGGCAA---TT----TA----TTATATTACAAAGCATGGC-T--ACAGC-TAAGAA-T-T-----AAA-ACA-ATAACTG----ATAT------ATATG---ATT--------GTAGATACAAGACATT-TTATA-ATTTT-GA-AAGATTAAA---ACAATTGTAC
gi|21800 : GGAAACAAGACAAAGTAAAGC--GTAAACCTATTATA-AAAA-TATTG--AAAACGATGGTATGAAGATGATAGATA-TAT----A-----AC---G--TTTGATACATTCAATAAAAA-CAAGTTGGGTTAAA------------TG----A----CTAA-CAGAT-G-T-AA-AC-AATAA---TGACGA-----A--T--GGAAG--AATATA--TAC-AT-GTCT----TCAAT--TG-A-A-----ATTTACGGCGG-AAA-CTTCATCTTTGAGAAT--G---T-TAAT-TGCAAAG-------------------ACGTT---CAGT---G--AAAC-G---C---C---------A--TT---TT----TATGTAA--C--A--TGACGG-A---ATCATGT-TTAAAAACTTATTTT-------AAC-----ACTAATA---TTGA-AGATGTTAATTT-AGTAA-----AAC---AATATC-TA-ACGAATAATTAT--TTC-ACTGAA----AGT--AAAGGCAG---TC----AG----TTATGTTACAAATCATGGT-T--ACAGCATA-GAA-T-GAAAAAAAA-ACA-ATAAATG----ATAT------ATATA---ATT--------CTAGACACAAGGCGTT-TTATA-CTTCT-GA-ATGATT
gi|21801 : AAAACCTGATAAAATAAAAA--GGACAACACTAACTCAAGACTAT-G--AAAATGGAGGTCTAAAAATGATTGATA-TTG----A-----AA---T--GTTCATAAACTCTCTTAAAT-CAAGTTGGATAAAA------------AG----A----TTAC-TTGAT------A-AC-AGTAATTCCGGTCA-----A--T--GGAAAGTCATATATCTAA-AT-AAAC----TCAAT-------------AAGTATGGTGGTAAA-C-TCATTTTTGAAAGT--AACTTGCAA----GAAAAAT-A--TGT-TT--TGAAAATGTA---TAA-------AAAC-G---A---T---------AACTT---TC----TAAAGGA--A--A--TCATAA-T---ATCATGGACCAAAATTAAA-----------AAG-----TTTGATA----GGA-AAATG--AACATAAATAA-----AGA---AATTTT-TA-TGGAATAA--------C-AC-AAA----TAT--AACTTTAAATCTTAATACG----TTATGCTACATTGATTGGT-C--AGAAA-AGGGAA-T-C-----AAATATATACAAA------ACAT------ATATG---ATT--------TTAGAAAAAAAAGATT-TTATA-ATTTCAGC-GAGCTTAAA---AC
gi|21802 : AAAACCTGATAAAATAAAAA--GGACAACACTAACTCAAGACTAT-G--AAAATGGAGGTCTAAAAATGATTGATA-TTG----A-----AA---T--GTTCATAAACTCTCTTAAAT-CAAGTTGGATAAAA------------AG----A----TTAC-TTGAT------A-AC-AGTAATTCCGGTCA-----A--T--GGAAAGTCATATATCTAA-AT-AAAC----TCAAT-------------AAGTATGGTGGTAAA-C-TCATTTTTGAAAGT--AACTTGCAA----GAAAAAT-A--TGT-TT--TGAAAATGTA---TAA-------AAAC-G---A---T---------AACTT---TC----TAAAGGA--A--A--TCATAA-T---ATCATGGACCAAAATTAAA-----------AAG-----TTTGATA----GGA-AAATG--AACATAAATAA-----AGA---AATTTT-TA-TGGAATAA--------C-AC-AAA----TAT--AACTTTAAATCTTAATACG----TTATGCTACATTGATTGGT-C--AGAAA-AGGGAA-T-C-----AAATATATACAAA------ACAT------ATATG---ATT--------TTAGAAAAAAAAGATT-TTATA-ATTTCAGC-GAGCTTAAA---AC
gi|21803 : AAAGCC-GACAAGATCAAAC--GAAAAATA-CTA-ACAAAA--ATTACCAAAACGGTGGTTTAAAAATGATTGATATTAATT--A-----AT---TCATTTTA-----TCATTCAAAT-CAAGCTGGATAACT------------CG----A----TTAT-TTGAT-G---AA-TCAAACAA---GGGTTT-----A--T--GGAAA--TAAATT--TAT-TT-ATCTAAGATCAAT-------------AACTATGGAGGCAAA-C-TAATTTTTGAAAGT--AATTT-
gi|21804 : AAAACCTGATAAAATAAAAA--TGACAACACTAACTCAAGACTAT-G--AAAATGGAGGTCCAAAAATGATTGATA-TTG----A-----AA---T--GTTCATAAACTCTCTTAAAT-CAAGTTGGATAAAA------------AG----A----TTAC-TTGAT------A-AC-AGTAATTCCGGTCA-----A--T--GGAAAGTCATATATCTAA-AT-AAAC----TCAAT-------------AAGTATGGTGGTAAA-C-TCATTTTTGAAAGT--AACTT-GCA-----AGAAAA-AGATGT-TT--TGAAAATGTA---TAA-------AAAC-GATAA---C---------T--TT---CT----AAAGGAAATC--A--TAATAC-ATGTATCATGG-ACCAAAATTAA---C-------AAG-----TTTGATA----GGA-AAATG--AACATAAATAA-----AGA---AAT-TT-TA-TGGAATAA--------C-AC-AAA----TCT--AACTTTAAATCTT----CATACGTTATGCTACATTGATTGGT-T--AGAAA-AGGGAA-T-C-----AAATATATACAAA------ACAT------ATATG---ATT--------TTAGAAAAAAAAGATT-TTATA-ATTTCAGC-GAACTTAAA---AC
gi|21805 : AAAACCCGACAAGATAAAAC--GTAAAATACTTA--CAAAA-GATTACCAAAACGGTGGTTTAAAAATTATTGATA-TTG----ATAAATAC---A--TTTTA-----TC-ATTAAAATTAAGCTGGATAAAA------------CG----A----TGAT-TTGAT-G---AA-TC-A--AA---CAG-GATTTTTT--T--GGAAA--CAAATT--TAT-TT-TTCT----AAGAT--TA-A-T-----AACTATGGAGGCAAA-CTT-ATATTTGAAAGT--AAA-T-TAAC-AGAAAACAA-AATTGTAAA--A----ATGTT---TAA-------AAAT-G---A---C---------A--CC---TT----CTTCTAA--CAAA--TCCTTG-T---ATCTTGG-TCTAATATAAA
gi|21806 : AAACCAGACAAAGTTAAAT--GTAAAACTATTATACAAAA-TATTG--AAAACGGTGGTATGAAGATGATAGATA-TAGATAGA-----AC---T--TTTTATAAATTCAATTAAAG-CAAGTTGGGCTAAA------------CG----A----TTAA-CAGAT-A-T-AA-AC-AATAA---AGGCGC-----A--T--GGAAG--ACTATT--TAC-AT-GTCA----TCAAT--TG-A-A-----AAATATGGTGG-AAA-CTTAATCTTTGAGAAT--AACTT-TAAT-TGCAAAGAC-GATAAT-TC--T----ATGTT---TAGC---G--AAAT-GC--C---C---------T--TT---TT----TATGTAA--C--A--TAATAG-A---GCCATGG-TCAAAAATTAATTTT-------AAA-----ACTACTA---TTGA-AGATGTTAATAT-AGCAA-----AAC---AGTATA-TA-TGGAATAATTCT--TTC-ATTAAA----AGT--AAAGGCAG---TT----TG----TTATTTTAC-AAGCATGGT-T--AGAGC-TAGGAG-T-C-----AAA-ACA-ATAAATGATATATAT------ATATG---ATT--------CTAGACACAAGACGTT-TTATA-CTTTT-TA-ACGATTAAA---TCAATTATACAATATTAGTAAT
gi|21807 : AAACCAGATCAAATTAAGC--GTAAA-CTATAATACAAAA-TATTT--AAC-CGGTAGTATGAAAAAGATAGGTA-TAG----A-----AC---T--TTT-ATCAATTCAATAAAAG-CAAATTGGGTTAAA------------AG----A----TTAA-CAGAT-G-A-AA-AC-AATAA---TGGCGA-----A--T--GGAAT--AATATA--TAC-AT-GTCT----TCAGT------------------TAACGG-AAAACTTCATCTTTGACAGT--AAATT-TAGT-TACAAAAAT-GGTTAT-TC--T----ATGTT---CAGC---G--AAAC-G---C---C------------------T----GATGTTA--C--A--TAATAG-A---ATCATGG-TCAAAAATTAATTGT-------AAC-----T--AATA---TTGA-AGATATTATTTT-GGTAA-----AAC---AATACA-TA-TGGAATAACTAT--TTCAATAAAA-----AT--AAAGACAG---TT----TG----CTACTTTATAAATTATTTT-A--ACAGC-TTGAAA-T-T-----AAA-ATA-ATAAATG----GTAT------ATAAGTATATTTATATATACTAGACACAAGACGTT-TTATA-CTTTT-AA-AATATTAAA---ACAATTATACAATATAAGTAAT
gi|21808 : AAATCTGATAAAATTAGTC--GAAAAACAATAATACAGGA-TGATG--AAAACGGGGGCCTAAAAATGATTGATT-TA-----A-----ACA--T--GTTTATAAAAGCAATTAAAG-CAGGATGGGTCAAA------------AG----A----ATAA-TCGATAA-T-AA-A--AATGA---GGGTGA-----T--T--GGAAA--CATATA--TACAAT-AGC-----ACATT--AG-ATA-----AAATA-GGGGG-ACA-ATTAATATTTGAATGT--AATTC-AAA----TGAAAAT-GA------C--T----ATATTAAACAAA---A--AAACAA---C---CATTTCCCAAA--TT---TT----TCT-TAG--A--A--ATATTGCA---ATCCTGG-TCAAGCATAAACTTTGTAAATAAAC-----CAGAA-G---CTGA-AGG-ATTAAAC------A-----ATC---AG-ATATTA-TGGAACAACTCT--TAT-ATAAAAAAACAATAAAACGA------------CA----TTATTTTATAAAGAATGATAT--GCAAA--AGGTA-CAT-----CAA-ACA-A------------AT------ATTTG---ATA--------GTAGGTAAAAAACATT-TTATACATTT
gi|21809 : AAACCAGACAAAATAAGTA--GAAAAACAATTATACAAAA-TAACG--AAAATGGGGGCTTAAAAATGATAGATC-T-G----A-----ATA--T--GTTTATTAAGTCAATTAAAG-CAGGTTGGGTGAAA------------AGAATTA----TCAACCAGA--G-T-AATAC-A--------GGTGA-----T--TCAGGAAG--CATATA--TAC-ATGGGC------CAACCAGA-A-A-----AAATA-GGAGG-ACC-ATTAATATTTTAATGT--AA-TT-TAA----TAAAAAT-GACT-------T----AAAT-----AAT---G--CAAC-T---C---A---------G--ATAGACT----CA---GA--A--A--TTGTAC-A---ATCATGG-TCAAGTATCAATTAT-------AAA-----GAAAATG---TTGA-ATATATAAAT-------A-----AACA--AATAC--TA-TGGAATAATTC---AAC-ATCAAA----AAT--AATAATAA---AA----CA----TTCTTCTATAA
gi|21810 : AAACCGGATAAAATTAATA--GAAAAACAATTATACAAAACTA-CG--AAAATGGGGGTTTAAAAATGATAGATC-TGC----A-----AT---T--ATTTATAAATTCGATTAAAG-CCGGGTGGGTCAAA------------CGT---A----TT-A-TAAAT-GAT-CA-A--AATAA---AGGGGA-----C--T--TGAAA--CACATA--TAC-
gi|21811 : AAACCAGACAAAATAAGTA--GAAAGACAATTATACAAAA-TTACG--AAAATGGGGGCTTAAAAATAATAGATC-T-G----A-----ATA--T--GTTTATTAAGTCAATTAAAG-CAGGTTGGGTGAAA------------AGAATTA----TCAATCAGA--G-T----AC-TACA-----GGTGA-----T--T--GGAAG--CATATA--TAC-AA-GGGC----CAACT--AGCA-A-----AAATA-GGAGG-ACC-ATTAATATTTCAGTGT--TATAT-TAA----TAAAAATGACTTAA-AT--A----ATG-----CAACTTAGATAAAC-T---CAAAC------------TT---TT----TATCAGA--A--A--TTGTAC-A---ATCATGG-TCAA
gi|21812 : AAACCAGATAAAAT--AGCAAGACACACAATTAAAAAAGACTAT-A--AAGATGGGGGATTAAAAATGATAGAT--TTG----A-----ATGCAT--ATCTAT--ACTCAATAAAAG-CAAGTTGGATCAAA------------AG----AATTTTTAA-C-GAT-G---AA----AATAC---CG--GA-----ATCT--GGAAA--GATAAT--TAT-AT-G---------AAT--GA-A-ATTAACAAATTTGGTGG-GAA-ATT-ATTATTACAATC--AAACA-TAACATATAAAGAT-A--TAA-CCAAT----AAATT---CAA-------AAAT-A---T---T------------TT---CT----TAAGGGA--T--GTTTTACAA-A---GT--TGG-GCAAAGGTAAACTTT-------AAT-----TCGGAAA---TAAC-AAACATCA--CA-GATGA-----AAT-------CA-TA-TGGAATAACTCA--TTT-ATACAA----AAT--AACAATAA---AA----CA----ATATTTTATAGAGTATGGC-TGGATAA---AGGAA-T-A-----AAATATA-TTAAACA----AC-T------TTATG---ATT--------ACAGAAATAAGAACTT-TTATA-ATTTT-AATACGATC-AA---ACAACTTTACAATCTAGACAAT
gi|21813 : AAACCAGATAAAAT--AGCAAGACACACAATTAAAAAAGACTAT-A--AAGATGGGGGATTAAAAATGATAGAT--TTG----A-----ATGCAT--ATCTAT--ACTCAATAAAAG-CAAGCTGGATCAAA------------AG----AATTTTTAA-C-GAT-G---AA----AATAC---CG--GA-----ATCT--GGAAA--GATAAT--TAT-AT-G---------AAT--GA-A-ATTAACAAATTTGGTGG-GAA-ATT-ATTATT-ACAGTCAAAC-A-TAACATATAAAGAT-A--TAA-CCAAT----AAATT---CAA-------AAAT-A---T---T---------T--TC---TTAAGGTATGT-------T--TTACAA-A---GT--TGG-GCAAAGGTAAACTTT-------AAT-----TCGGAAA---TAAC-AAACATCA--CA-GATGA-----AAT-------CA-TA-TGGAATAACTCA--TTT-ATACAA----AAT--AACAATAA---AA----CA----ATATTTTATAGAGTATGGC-TGGATAA---AGGAA-T-A-----AAATATA-TTAAACA----AC-T------TTATG---ATT--------ACAAAAATAAGAACTT-TTATA-ATTTT-AATACGATC-AA---ACAACTTTACAATCTAGACAAT
gi|21814 : AAACCAGATAAAAT--AGCAAGACACACAATTAAAAAAGACTAT-A--AAGATGGGGGATTAAAAATGATAGAT--TTG----A-----ATGCAT--ATCTAT--ACTCAATAAAAG-CAAGTTGGATCAAA------------AG----AATTTTTAA-C-GAT-G---AA----AATAC---CG--GA-----ATCT--GGAAA--GATAAT--TAT-AT-G---------AAT--GA-A-ATTAACAAATTTGGTGG-TAA-ATT-ATTATTACAATC--AAACA-TAACATATAAAGAT-A--TAA-CCAAT----AAATT---CAAA---A--AAA----------T---------T--TT---CT----TAAGGGA--T--GTTTTACAA-A---GT--TGG-GCAAAGGTAAACTTT-------AAT-----TCGGAAA---TAAC-AAACATCA--CA-GATGA-----AAT-------CA-TA-TGGAATAACTCA--TTT-ATACAA----AAT--AACAATAA---AA----CA----ATATTTTATAGAGTACGGC-TGGATAA---AGGAA-T-A-----AAATATA-TTAAACA----AC-T------TTATG---ATT--------ACAGAAATAAGAACTT-TTATA-ATTTT-AATACGATC-AA---ACAACTTTACAATCTAGACAAT
gi|21815 : AAATAAAGC--GTAAAACTAATATACAAAA-TATTG--AAAATCGTGGTATGAAACTGACAGATA-TAG----A-----AC---T--TTTTATAAATTCAATAAAAG-CAAGTTGGGTTAAA------------AG----A----CTAA-CAGAT-G-A-AA-AT-AATAA---TGAAGA-----A--T--GGAAG--TATATA--AAC-AG-GTCT----TCATT--GG-A-A-----AAATATGGTGG-AAA-CTTCATCTTTGAGGGT--AACTT-TTAG-TTCGAAGAT-AGTTGT-TC--T----ATGTT---TAGT---G--AAAC-G---C---C---------G--TT---TT----TATGTAA--C--A--TAATAG-A---ATCATGG-TTCAAAATTAATTTT-------AAT-----TTTAATA---TTGA-AGATGGTTATCT-AGTAA-----AAC---AATATA-TA-TGGAACAATTTC--TTC-ATCAAA----AAT--AATGGCAG---AT----TA----TTATTTTACAAATCATGGT-A--ACAAT-TAGGAA-T-T-----AAA-ACA-TTAAATG----ATAT------ATATG---ATT--------CTTGACATATGACATT-TTATA-CTATT-GA-AAGATTAAA---ACAATTATACAATATAAATAAT
gi|21816 : -TAG----A-----AC---T--TTCTATAAATTCAATTAAAG-CAAGTTGGGTTAAACAAACGCACCAAAC----A----TCAA-CAGAT-G-T-AA-AC-AATAA---AGGCGA-----A--T--GGAAG--AATATA--TAC-CT-GTCT----TCCAT--TG-A-A-----AAATATGACGG-AAA-CATCATCTTTGAGAAT--AACTT-TAAT-AGCAAAGAT-GGTTAT-TC--T----ATGTT---CAGC---G--AAAC-G---C---C---------T--TT---TT----TATGCAA--C--A--TAATAA-A---ACCATGG-TCAAAAATTAATTTT-------AAC-----ACTAATA---TTGA-AGAT
gi|21817 : ----TTAA-CAGAT-G-T-TA-AC-AATAA---CGGCGA-----A--T--GGAAG--TATATA--TAC-AT-GTCT----TCA
gi|21818 : AAT-TTTAACGAT-AGTTGT-TC--T----ATGTT---CAGC---G--AAAC-G---C---C---------G--TT---TA----TTTGTAA--C--A--TAATTG-A---ATCATGG-TAAACAATTAATTTT-------A-----------------TTGA-AGATGTTTATCT-ACTAA-----AAC---ACTTCA-TA-TGGAATAATTCT--TTC-ATAAAA----CAT--AATTGCAG---TT----TA----TTATTTTACAAAGCATGAC-T--ACAGC-TAGGAA-T-A-----AAT-ACA-ATAAATG----ATAT------ATATG---ATT--------GTAG-----AGACATT-TTATA-ATTTT-GA-AAGATTGAT---ACAtaatgg
gi|21819 : ATTG-A---ATTTTTT-TTAAAAA-AAGTTTA-------AACGTGGATGTGTTGCT-TTAACAGATGTTAAC---AATAACGGCGAATGGAAGTATA-TA-T---ACATGTCT--T-------------CAT--AATGGCAG---TT----TA----TTATTTTACAAAGCATGGC-T--ACAGC-TAGGAA-T-T-----AAA-ACA-ATAAATT----GTAT------ATATG---ATT--------GTAGATACAAGACATT-TTATA-ATTTT-GA-AAGATTAAA---ACAATTGTACAATATAAGTAAT
gi|21820 : ATGG--CAGAATTAAAT----------AAA-----ATTAATAGACTTAC-AAGTAATAATC---GTAA-----AAT---AATAAAATAATAGAATAATTCTCTTTT-ATTAAA----AGT--AAC---AT---TT----TA----ATATTTTATTAATCATGGT-T--ACAGC-CAGGAA-T-TA----AAA-ACA-ATAAATGAC--ATAT------ATATG---ATC--------CTGGACACAAGACG-T-TTATC-ATT------------------ACAAGTATGCAATAT-GATAA
gi|21821 : GGAATTTTTCT--TTC-ATTAAA----AAT--AAAG--AG---TT----TA----TTATTTTATAAATCATGGT-T--GCAGC-AAGGAAAT-T-----GAA-TCA-ATAAATG----ATATATATATATATG---ATT--------CTAGACACAA-ACCTTGTTAAA-CTTTT-GA-AAGATTAAATATACAATATGACAATATGAATAAgtaa
gi|21822 : -TGGGAA-T-T-----AAA-ACA-ATAAATG----ATAT------ATATA---AAT--------CGAGATACAAGGCGTT-TTATT-CTTTT-GA-TAGATTAAA---ACAATTATATAATAACAATAAT
Alignments
lowQualScore : 1 1111111111 11111111111111111111111 1111 1111 1111111 2222222222222 1 22222 1111111111111 1111111 11111111111 111111111111 11111111 11111111111 1
lowQualScore : 1 6 88 1 2 4 8888 1 1 4 5 333 6666666666 2 6 1 1 1 1 44444444444444444444444 3 4 1 3333 1 44 1111 5 44444 99 888 77 3 1 0000000 55 1 5555555555555 3 0 2 2 7 0 1 22 6 4 11111 2 5555555555555 88 333 6666666 2 88888888888 333 000000000000 4444 2 1 44444 888 1 333 3 1 1 888 333 0 22 4 22222222 33 88888888888 2 2 555 8 888888888 4444 22 444 55555555555 2 88 999 2 9999999 2 6 777777 555555 333 888888888 2 3 2 2 6 6 1 333 1
lowQualScore : . . .. . . . .... . . . . ... .......... . . . . . . ....................... . . . .... . .. .... . ..... .. ... .. . . ....... .. . ............. . . . . . . . .. . . ..... . ............. .. ... ....... . ........... ... ............ .... . . ..... ... . ... . . . ... ... . .. . ........ .. ........... . . ... . ......... .... .. ... ........... . .. ... . ....... . . ...... ...... ... ......... . . . . . . . ... .
lowQualScore : 1 8 22 0 1 0 7777 0 0 4 4 333 6666666666 9 0 1 1 9 0 44444444444444444444444 5 1 7 2222 7 00 6666 7 33333 66 222 22 5 8 1111111 00 8 6666666666666 5 0 0 1 5 6 0 88 0 0 66666 0 9999999999999 22 555 1111111 0 66666666666 555 222222222222 2222 4 5 11111 555 0 555 8 3 9 444 777 3 99 1 88888888 11 77777777777 2 7 222 1 444444444 5555 88 888 99999999999 1 77 888 0 4444444 0 0 555555 888888 555 222222222 0 0 0 0 3 3 3 999 0
consensus : GAAAACCAGACAAAATNAAGC--GNAAAACAATTATACAAAA-TATTG--AAAACGGNGGTNTAAAAATGATAGATATNG---A-----AC---TNTTTATAAATTCAATTAAAG-CAAGTTGGGTNAAA------------AG----A----TTAA-CAGAT-G-T-AA-AC-AATAA---CGGCGA-----AT--GGAAG--NATATA--TAC-AT-GTCT----TC--AA-T--GG-A-A-----AAATATGGCGG-AAA-CTTCATCTTTGAGAGT--AACTT-TAAT-TNTAAAGAT-AGTTGT-TCT----ATG--TT---CAAC---G--AAAC-G---C---CG--TT---T------------T----TATGTAA--C--ATN--ATAGA---ATCATGG-TCAAAAATAAATTTTAACTCTAATA---TTGA--AGATGTTAATCT-AG-TA--AAAC-AAT---ACA-TA-TGGAATAATTCT--TTCATNAA---------A----AAT--AACGGCAG---TT----CGTTATTTTACAAAGCATGGC-T--ACAGC-TAGGAA-T-T-----AAA-ACA-ATAAATG----ATAT------ATATG---ATT--------NTAGACACAAGACGTT-TTATA-ATTTT-GA-AAGATTAAA---ACAATTNTACAATATAAATAAT
Reference ( family-691 ) : GAAAACCAGACAAAATNAAGC--GNAAAACAATTATACAAAA-TATTG--AAAACGGNGGTNTAAAAATGATAGATATNG---A-----AC---TNTTTATAAATTCAATTAAAG-CAAGTTGGGTNAAA------------AG----A----TTAA-CAGAT-G-T-AA-AC-AATAA---CGGCGA-----AT--GGAAG--NATATA--TAC-AT-GTCT----TC--AA-T--GG-A-A-----AAATATGGCGG-AAA-CTTCATCTTTGAGAGT--AACTT-TAAT-TNTAAAGAT-AGTTGT-TCT----ATG--TT---CAAC---G--AAAC-G---C---CG--TT---T------------T----TATGTAA--C--ATN--ATAGA---ATCATGG-TCAAAAATAAATTTTAACTCTAATA---TTGA--AGATGTTAATCT-AG-TA--AAAC-AGT---ACA-TA-TGGAATAATTCT--TTCATAAA---------A----AAT--AACGGCAG---TT----CATTATTTTACAAAGCATGGC-T--ACAGC-TAGGAA-T-T-----AAA-ACA-ATAAATG----ATAT------ATATG---ATT--------NTAGACACAAGACGTT-TTATA-ATTTT-GA-AAGATTAAA---ACAATTNTACAATATAAATAAT
gi|21796 : GAAAACCAGACAAAATTAAGC--GAAAAACAATTATTCAAAA-TATTG--AAAACGGTGGTATGAAGATGATAGATATAG---A-----GC---TTTTTATACATTCAATTAAGG-CAAGTTGGGTTAAA------------CG----A----TTAA-CAGAT-G-T-AA-AC-AATAA---TGGCGA-----AT--GGAAG--TATACA--TAC-AT-GTCT----TC--AT-T--GG-A-A-----AAATATGGCGG-AAA-CTTCATCTTTGAGAGT--AATTT-TAAT-TTTAAAGAT-AGTTGT-TCT----ATG--TT---CAAC---G--AAAC-G---C---CG--TT---T------------T----TATGTAA--C--ATT--ATTGA---ATCATGG-TCAAAAATAAATTTTAACTGTAATA---TTGA--AGATGTTAATCT-AC-TA--AAAC-AGT---ACA-TA-TGGAATAATTCT--TTCATAAA---------A----CAT--AATGGCAA---TT----TATTATTTTACAAAGCATGGC-T--ACAGC-TAGGAA-T-T-----AAA-ACA-ATAAATG----ATAT------ATATG---ATT--------GTAGACACAAGACATT-TTATA-ATTTT-GA-AAGATTAAA---ACAATTGTACAATATAAGTAAT
gi|21797 : GAAAACCAGACAAAATTAAGC--GAAAAACAATTATTCAAAA-TATTG--AAAACGGTGGTATGAAGATGATATATATAG---A-----GC---TTTTTATACATTCAATTAAGG-CAAGTTGGGTTAAA------------CG----A----TTAA-CAGAT-G-T-AA-AC-AATAA---TGGCGA-----AT--GGAAG--TATATA--TAC-AT-GTCT----TC--AT-T--GG-A-A-----AAATATGGCGG-AAA-CTTCATCTTTGAGAGT--AATTT-TAAT-TTTAAAGAT-AGTTGT-TCT----ATG--TT---CAAC---G--AAAC-G---C---CG--TT---T------------T----TATGTAA--C--ATT--ATTGA---ATCATGG-TCAAAAATAAATTTTAACTGTAATA---TTGA--AGATGTTAATCT-AC-TA--AAAC-AGT---ACA-TA-TGGAATAATTCT--TTCATAAA---------A----CAT--AATGGCAA---TT----TATTATTTTACAAAGCATGGC-T--ACAGC-TAGGAA-T-T-----AAA-ACA-ATAAATG----ATAT------ATATG---ATT--------GTAGACACAAGACGTT-TTATA-ATTTT-GA-AAGATTAAA---ACAATTGTACAATATAAGTCAT
gi|21798 : GAAAACCAGATAAAATAAAGC--GTAAAACTATTATACAAAA-TATTG--AAAACGGTGGATTGAAAATGATAGATATAG---A-----AC---TTTTTATAAATTCAATAAAAG-CAAGTTGGGTTAAA------------CG----A----CTAA-CAGAT-G-T-AC-AT-AATAA---TGGCGA-----AT--GGAAG--TATATA--TAC-AG-GTCT----TC--AC-T--TG-A-A-----AAATATGGTGA-AAA-CTTGATCTTTGATAGT--AATTT-TAAT-TTCGAAAAT-AGTTGT-TCT----ATG--TT---TAAT---G--AAAC-G---C---CG--TT---T------------T----TATGTAA--C--ATA--ATATA---ATCATGG-TCCAAAATAAATCTTATCTTT-ATA---TTGA--AGATGGTAATCT-AG-TA--AAAC-CGT---ACA-TA-TGGAACAATTCT--TTCATAAA---------A----AAT--AATGGCAG---TT----TCTTATTTTACAAATCATGGT-T--ACAGT-TACGAA-T-T-----AAA-ACA-TTAAATG----ATAT------ATATA---ATT--------CTAGACACAACACATT-TTATA-CTTTT-GA-AAGATTAAA---ACAATTATACAATATAAATAAT
gi|21799 : GAAAACCAGACAAAATTAAGC--GTAAAACAATTATTCAAAA-TACTG--AAAACGGTGGTATGAAGTTGACAGATA--G---A-----GC---TTTTTATACATTCAATCAAGG-CAAGTTTGGTTAAG------------CG----A----TTAA-CAGAT-G-TAAA-AC-AATAA---TGGCGA-----AT--GGAAG--TATATA--TAC-AT-GTTT----TC---A-T--TG-A-A-----AAATATGACGG-AAA-CTTCATCTTTGCGAGT--AATTT-TATT-TTTAAAGAT-AGTTGT-TCT----TTG--TT---TAGC---G--AAAC-G---C---TA--TT---T------------T----TATATGA--C--ATT--ATTGA---ATCATGG-TCAAAAACAAATTTTAACTCTAATA---TTGA--AGATGTTAATCT-AT-CA--AAAC-AGT---ACA-TA-TAGAATAATACT--TTCAT-AA---------A----CAT--AAAGGCAA---TT----TATTATATTACAAAGCATGGC-T--ACAGC-TAAGAA-T-T-----AAA-ACA-ATAACTG----ATAT------ATATG---ATT--------GTAGATACAAGACATT-TTATA-ATTTT-GA-AAGATTAAA---ACAATTGTAC
gi|21800 : GGAAACAAGACAAAGTAAAGC--GTAAACCTATTATA-AAAA-TATTG--AAAACGATGGTATGAAGATGATAGATATAT---A-----AC---GTTTGATACATTCAATAAAAA-CAAGTTGGGTTAAA------------TG----A----CTAA-CAGAT-G-T-AA-AC-AATAA---TGACGA-----AT--GGAAG--AATATA--TAC-AT-GTCT----TC--AA-T--TG-A-A-----ATTTACGGCGG-AAA-CTTCATCTTTGAGAAT--G---T-TAAT-TGCAAAG-----------------ACG--TT---CAGT---G--AAAC-G---C---CA--TT---T------------T----TATGTAA--C--ATG--ACGGA---ATCATGT-TTAAAAACTTATTTTAACACTAATA---TTGA--AGATGTTAATTT-AG-TA--AAAC-AAT---ATC-TA-ACGAATAATTAT--TTCACTGA---------A----AGT--AAAGGCAG---TC----AGTTATGTTACAAATCATGGT-T--ACAGCATA-GAA-T-GAAAAAAAA-ACA-ATAAATG----ATAT------ATATA---ATT--------CTAGACACAAGGCGTT-TTATA-CTTCT-GA-ATGATT
gi|21801 : AAAACCTGATAAAATAAAAA--GGACAACACTAACTCAAGACTAT-G--AAAATGGAGGTCTAAAAATGATTGATATTG---A-----AA---TGTTCATAAACTCTCTTAAAT-CAAGTTGGATAAAA------------AG----A----TTAC-TTGAT------A-AC-AGTAATTCCGGTCA-----AT--GGAAAGTCATATATCTAA-AT-AAAC----TC--AA-T-------------AAGTATGGTGGTAAA-C-TCATTTTTGAAAGT--AACTTGCAA----GAAAAAT-A--TGT-TTTGAAAATG--TA---TAA-------AAAC-G---A---TAACTT---T------------C----TAAAGGA--A--ATC--ATAAT---ATCATGGACCAAAATTAAA----AAGTTTGATA----GGA--AAATG--AACATAAA-TA--AAGA-AAT---TTT-TA-TGGAATAA--------CAC-AA---------A----TAT--AACTTTAAATCTTAATACGTTATGCTACATTGATTGGT-C--AGAAA-AGGGAA-T-C-----AAATATATACAAA------ACAT------ATATG---ATT--------TTAGAAAAAAAAGATT-TTATA-ATTTCAGC-GAGCTTAAA---AC
gi|21802 : AAAACCTGATAAAATAAAAA--GGACAACACTAACTCAAGACTAT-G--AAAATGGAGGTCTAAAAATGATTGATATTG---A-----AA---TGTTCATAAACTCTCTTAAAT-CAAGTTGGATAAAA------------AG----A----TTAC-TTGAT------A-AC-AGTAATTCCGGTCA-----AT--GGAAAGTCATATATCTAA-AT-AAAC----TC--AA-T-------------AAGTATGGTGGTAAA-C-TCATTTTTGAAAGT--AACTTGCAA----GAAAAAT-A--TGT-TTTGAAAATG--TA---TAA-------AAAC-G---A---TAACTT---T------------C----TAAAGGA--A--ATC--ATAAT---ATCATGGACCAAAATTAAA----AAGTTTGATA----GGA--AAATG--AACATAAA-TA--AAGA-AAT---TTT-TA-TGGAATAA--------CAC-AA---------A----TAT--AACTTTAAATCTTAATACGTTATGCTACATTGATTGGT-C--AGAAA-AGGGAA-T-C-----AAATATATACAAA------ACAT------ATATG---ATT--------TTAGAAAAAAAAGATT-TTATA-ATTTCAGC-GAGCTTAAA---AC
gi|21803 : AAAGCC-GACAAGATCAAAC--GAAAAATA-CTA-ACAAAA--ATTACCAAAACGGTGGTTTAAAAATGATTGATATTAATTA-----AT---TCATTTTA---TCATTCAAAT-CAAGCTGGATAACT------------CG----A----TTAT-TTGAT-G---AA-TCAAACAA---GGGTTT-----AT--GGAAA--TAAATT--TAT-TT-ATCTAAGATC--AA-T-------------AACTATGGAGGCAAA-C-TAATTTTTGAAAGT--AATTT-
gi|21804 : AAAACCTGATAAAATAAAAA--TGACAACACTAACTCAAGACTAT-G--AAAATGGAGGTCCAAAAATGATTGATATTG---A-----AA---TGTTCATAAACTCTCTTAAAT-CAAGTTGGATAAAA------------AG----A----TTAC-TTGAT------A-AC-AGTAATTCCGGTCA-----AT--GGAAAGTCATATATCTAA-AT-AAAC----TC--AA-T-------------AAGTATGGTGGTAAA-C-TCATTTTTGAAAGT--AACTT-GCA-----AGAAAA-AGATGT-TTTGAAAATG--TA---TAA-------AAAC-GATAA---CT--TT---C------------T----AAAGGAAATC--ATA--ATACATGTATCATGG-ACCAAAATTAA---CAAGTTTGATA----GGA--AAATG--AACATAAA-TA--AAGA-AAT----TT-TA-TGGAATAA--------CACAAATCTAACTTTA----AAT----CTTCA----TA----CGTTATGCTACATTGATTGGT-T--AGAAA-AGGGAA-T-C-----AAATATATACAAA------ACAT------ATATG---ATT--------TTAGAAAAAAAAGATT-TTATA-ATTTCAGC-GAACTTAAA---AC
gi|21805 : AAAACCCGACAAGATAAAAC--GTAAAATACTTA--CAAAA-GATTACCAAAACGGTGGTTTAAAAATTATTGATATTG---ATAAATAC---ATTTTA-----TC-ATTAAAATTAAGCTGGATAAAA------------CG----A----TGAT-TTGAT-G---AA-TC-A--AA---CAG-GATTTTTTT--GGAAA--CAAATT--TAT-TT-TTCT----AA--GA-T--TA-A-T-----AACTATGGAGGCAAA-CTT-ATATTTGAAAGT--AAA-T-TAAC-AGAAAACAA-AATTGTAAAA----ATG--TT---TAA-------AAAT-G---A---CA--CC---T------------T----CTTCTAA--CAAATC--CTTGT---ATCTTGG-TCTAATATAAA
gi|21806 : AAACCAGACAAAGTTAAAT--GTAAAACTATTATACAAAA-TATTG--AAAACGGTGGTATGAAGATGATAGATATAG---ATAGA-AC---TTTTTATAAATTCAATTAAAG-CAAGTTGGGCTAAA------------CG----A----TTAA-CAGAT-A-T-AA-AC-AATAA---AGGCGC-----AT--GGAAG--ACTATT--TAC-AT-GTCA----TC--AA-T--TG-A-A-----AAATATGGTGG-AAA-CTTAATCTTTGAGAAT--AACTT-TAAT-TGCAAAGAC-GATAAT-TCT----ATG--TT---TAGC---G--AAAT-GC--C---CT--TT---T------------T----TATGTAA--C--ATA--ATAGA---GCCATGG-TCAAAAATTAATTTTAAAACTACTA---TTGA--AGATGTTAATAT-AG-CA--AAAC-AGT---ATA-TA-TGGAATAATTCT--TTCATTAA---------A----AGT--AAAGGCAG---TT----TGTTATTTTAC-AAGCATGGT-T--AGAGC-TAGGAG-T-C-----AAA-ACA-ATAAATGATATATAT------ATATG---ATT--------CTAGACACAAGACGTT-TTATA-CTTTT-TA-ACGATTAAA---TCAATTATACAATATTAGTAAT
gi|21807 : AAACCAGATCAAATTAAGC--GTAAA-CTATAATACAAAA-TATTT--AAC-CGGTAGTATGAAAAAGATAGGTATAG---A-----AC---T-TTTATCAATTCAATAAAAG-CAAATTGGGTTAAA------------AG----A----TTAA-CAGAT-G-A-AA-AC-AATAA---TGGCGA-----AT--GGAAT--AATATA--TAC-AT-GTCT----TC--AG-T------------------TAACGG-AAAACTTCATCTTTGACAGT--AAATT-TAGT-TACAAAAAT-GGTTAT-TCT----ATG--TT---CAGC---G--AAAC-G---C---C---------------------T----GATGTTA--C--ATA--ATAGA---ATCATGG-TCAAAAATTAATTGTAACT--AATA---TTGA--AGATATTATTTT-GG-TA--AAAC-AAT---ACA-TA-TGGAATAACTAT--TTCAATAA---------A----AAT--AAAGACAG---TT----TGCTACTTTATAAATTATTTT-A--ACAGC-TTGAAA-T-T-----AAA-ATA-ATAAATG----GTAT------ATAAGTATATTTATATATACTAGACACAAGACGTT-TTATA-CTTTT-AA-AATATTAAA---ACAATTATACAATATAAGTAAT
gi|21808 : AAATCTGATAAAATTAGTC--GAAAAACAATAATACAGGA-TGATG--AAAACGGGGGCCTAAAAATGATTGAT-TTA---A-----ACA--TGTTTATAAAAGCAATTAAAG-CAGGATGGGTCAAA------------AG----A----ATAA-TCGATAA-T-AA-A--AATGA---GGGTGA-----TT--GGAAA--CATATA--TACAAT-AGC-----AC--AT-T--AG-ATA-----AAATA-GGGGG-ACA-ATTAATATTTGAATGT--AA-TT-CAA---ATGAAAAT-GA------CT----ATA--TTAAACAAA---A--AAACAA---C---CA--TT---TCCCAAATTTTTCT----TA-GAAA--T--AT----TGCA---ATCCTGG-TCAAGCATAAACTTTG----TAA-A---TAAACCAGAAGCTGA----AG-GATTAAAC-AATCAGATATTA-TGGAACAACTCT--TATATAAA---------AAAACAATAAAACGA------------CATTATTTTATAAAGAATGATAT--GCAAA--AGGTA-CAT-----CAA-ACA-A------------AT------ATTTG---ATA--------GTAGGTAAAAAACATT-TTATACATTT
gi|21809 : AAACCAGACAAAATAAGTA--GAAAAACAATTATACAAAA-TAACG--AAAATGGGGGCTTAAAAATGATAGATCT-G---A-----ATA--TGTTTATTAAGTCAATTAAAG-CAGGTTGGGTGAAA------------AGAATTA----TCAACCAGA--G-T-AATAC-A--------GGTGA-----TTCAGGAAG--CATATA--TAC-ATGGGC------C--AA-CCAGA-A-A-----AAATA-GGAGG-ACC-ATTAATATTTTAATGT--AA-TT-TAA----TAAAAAT-GACT-----T----AAA--T-----AAT---G--CAAC-T---C---AG--ATAGAC------------T----CA---GA--A--ATT--GTACA---ATCATGG-TCAAGTATCAATTATAAAGAAAATG---TTGA--ATATATAAAT----------AAACAAAT---AC--TA-TGGAATAATTC---AACATCAA---------A----AAT--AATAATAA---AA----CATTCTTCTATAA
gi|21810 : AAACCGGATAAAATTAATA--GAAAAACAATTATACAAAACTA-CG--AAAATGGGGGTTTAAAAATGATAGATCTGC---A-----AT---TATTTATAAATTCGATTAAAG-CCGGGTGGGTCAAA------------CGT---A----TT-A-TAAAT-GAT-CA-A--AATAA---AGGGGA-----CT--TGAAA--CACATA--TAC-
gi|21811 : AAACCAGACAAAATAAGTA--GAAAGACAATTATACAAAA-TTACG--AAAATGGGGGCTTAAAAATAATAGATCT-G---A-----ATA--TGTTTATTAAGTCAATTAAAG-CAGGTTGGGTGAAA------------AGAATTA----TCAATCAGA--G-T----AC-TACA-----GGTGA-----TT--GGAAG--CATATA--TACAAG-GGC------C--AACT--AGCA-A-----AAATA-GGAGG-ACC-ATTAATATTTCAGTGT--TATAT-TAA----TAAAAATGACTTAA-ATA----ATG-------CAACTTAGATAAAC-T---CAAAC---TT---T------------T----TATCAGA--A--ATT--GTACA---ATCATGG-TCAA
gi|21812 : AAACCAGATAAAAT--AGCAAGACACACAATTAAAAAAGACTAT-A--AAGATGGGGGATTAAAAATGATAGAT-TTG---A-----ATGCATATCTATA--CTCAATAAAAG-CAAGTTGGATCAAA------------AG----AATTTTTAA-C-GAT-G----A-A--AATAC---CGG--A-----ATCTGGAAA--GATAAT--TAT-AT-G-----------AA-T--GA-A-ATTAACAAATTTGGTGG-GAA-ATT-ATTATTACAATC--AAACA-TAACATATAAAGAT-A--TAA-CCA----ATAAATT---CAA-------AAAT-A---T---T---TT---C------------T----TAAGGGA--T--GTTTTACAAA---GT--TGG-GCAAAGGTAAACTTTAATTCGGAAA---TAAC--AAACATCA---C-AGATG--AAAT--------CA-TA-TGGAATAACTCA--TTTATACA---------A----AAT--AACAATAA---AA----CAATATTTTATAGAGTATGGC-TGGATAA---AGGAA-T-A-----AAATATA-TTAAACA----AC-T------TTATG---ATT--------ACAGAAATAAGAACTT-TTATA-ATTTT-AATACGATC-AA---ACAACTTTACAATCTAGACAAT
gi|21813 : AAACCAGATAAAAT--AGCAAGACACACAATTAAAAAAGACTAT-A--AAGATGGGGGATTAAAAATGATAGAT-TTG---A-----ATGCATATCTATA--CTCAATAAAAG-CAAGCTGGATCAAA------------AG----AATTTTTAA-C-GAT-G----A-A--AATAC---CGG--A-----ATCTGGAAA--GATAAT--TAT-AT-G-----------AA-T--GA-A-ATTAACAAATTTGGTGG-GAA-ATT-ATTATT-ACAGTCAAACAT--AACATATAAAGAT-A--TAA-CCA----ATAAATT---CAA-------AAAT-A---T---TT--TC---T------------TAAGGTATGTT-------TT--ACAAA---GT--TGG-GCAAAGGTAAACTTTAATTCGGAAA---TAAC--AAACATCA---C-AGATG--AAAT--------CA-TA-TGGAATAACTCA--TTTATACA---------A----AAT--AACAATAA---AA----CAATATTTTATAGAGTATGGC-TGGATAA---AGGAA-T-A-----AAATATA-TTAAACA----AC-T------TTATG---ATT--------ACAAAAATAAGAACTT-TTATA-ATTTT-AATACGATC-AA---ACAACTTTACAATCTAGACAAT
gi|21814 : AAACCAGATAAAAT--AGCAAGACACACAATTAAAAAAGACTAT-A--AAGATGGGGGATTAAAAATGATAGAT-TTG---A-----ATGCATATCTATA--CTCAATAAAAG-CAAGTTGGATCAAA------------AG----AATTTTTAA-C-GAT-G----A-A--AATAC---CGG--A-----ATCTGGAAA--GATAAT--TAT-AT-G-----------AA-T--GA-A-ATTAACAAATTTGGTGG-TAA-ATT-ATTATTACAATC--AAACA-TAACATATAAAGAT-A--TAA-CCA----ATAAATT---CAAA---A--AAAT-T-----------TT---C------------T----TAAGGGA--T--GTTTTACAAA---GT--TGG-GCAAAGGTAAACTTTAATTCGGAAA---TAAC--AAACATCA---C-AGATG--AAAT--------CA-TA-TGGAATAACTCA--TTTATACA---------A----AAT--AACAATAA---AA----CAATATTTTATAGAGTACGGC-TGGATAA---AGGAA-T-A-----AAATATA-TTAAACA----AC-T------TTATG---ATT--------ACAGAAATAAGAACTT-TTATA-ATTTT-AATACGATC-AA---ACAACTTTACAATCTAGACAAT
gi|21815 : AAATAAAGC--GTAAAACTAATATACAAAA-TATTG--AAAATCGTGGTATGAAACTGACAGATATAG---A-----AC---TTTTTATAAATTCAATAAAAG-CAAGTTGGGTTAAA------------AG----A----CTAA-CAGAT-G-A-AA-AT-AATAA---TGAAGA-----AT--GGAAG--TATATA--AAC-AG-GTCT----TC--AT-T--GG-A-A-----AAATATGGTGG-AAA-CTTCATCTTTGAGGGT--AACTT-TTAG-TTCGAAGAT-AGTTGT-TCT----ATG--TT---TAGT---G--AAAC-G---C---CG--TT---T------------T----TATGTAA--C--ATA--ATAGA---ATCATGG-TTCAAAATTAATTTTAATTTTAATA---TTGA--AGATGGTTATCT-AG-TA--AAAC-AAT---ATA-TA-TGGAACAATTTC--TTCATCAA---------A----AAT--AATGGCAG---AT----TATTATTTTACAAATCATGGT-A--ACAAT-TAGGAA-T-T-----AAA-ACA-TTAAATG----ATAT------ATATG---ATT--------CTTGACATATGACATT-TTATA-CTATT-GA-AAGATTAAA---ACAATTATACAATATAAATAAT
gi|21816 : TAG---A-----AC---TTTCTATAAATTCAATTAAAG-CAAGTTGGGTTAAACAAACGCACCAAAC----A----TCAA-CAGAT-G-T-AA-AC-AATAA---AGGCGA-----AT--GGAAG--AATATA--TAC-CT-GTCT----TC--CA-T--TG-A-A-----AAATATGACGG-AAA-CATCATCTTTGAGAAT--AACTT-TAAT-AGCAAAGAT-GGTTAT-TCT----ATG--TT---CAGC---G--AAAC-G---C---CT--TT---T------------T----TATGCAA--C--ATA--ATAAA---ACCATGG-TCAAAAATTAATTTTAACACTAATA---TTGA--AGAT
gi|21817 : ----TTAA-CAGAT-G-T-TA-AC-AATAA---CGGCGA-----AT--GGAAG--TATATA--TAC-AT-GTCT----TCATAA-T--GG-
gi|21818 : AAT-TTTAACGAT-AGTTGT-TCT----ATG--TT---CAGC---G--AAAC-G---C---CG--TT---T------------A----TTTGTAA--C--ATA--ATTGA---ATCATGG-TAAACAATTAATTTTA------------TTGA--AGATGTTTATCT-AC-TA--AAAC-ACT---TCA-TA-TGGAATAATTCT--TTCATAAA---------A----CAT--AATTGCAG---TT----TATTATTTTACAAAGCATGAC-T--ACAGC-TAGGAA-T-A-----AAT-ACA-ATAAATG----ATAT------ATATG---ATT--------GTAG-----AGACATT-TTATA-ATTTT-GA-AAGATTGAT---ACA
gi|21819 : ----TTAA-CAGAT-G-T-TA-AC-AATAA---CGGCGA-----AT--GGAAG--TATATA--TAC-AT-GTCT----TCATAA-T--GG-
gi|21819 : attgaattttttttaaaaaaagtttaaacgtggatgtgttgctAT--AATGGCAG---TT----TATTATTTTACAAAGCATGGC-T--ACAGC-TAGGAA-T-T-----AAA-ACA-ATAAATT----GTAT------ATATG---ATT--------GTAGATACAAGACATT-TTATA-ATTTT-GA-AAGATTAAA---ACAATTGTACAATATAAGTAATcagtttattattttacaaagcatggctacagctaggaattaaaacaataaattgtatatatgattgtagatacaagacattttataattttgaaagattaaaacaattgtacaatataagtaat
gi|21820 : attgaattttttttaaaaaaagtttaaacgtggatgtgttgctttaacagatgttaacaataacggcgaatggaagtatatatacatgtcttcATGG--CAGAATTAAAT---AAAATTAATAGACTTAC--AAGTAATAATC---G-TA--AAAT-AAT---AAAATAATAGAATAATTCTCTTTTATTAA---------A----AGT--AAC---AT---TT----TAATATTTTATTAATCATGGT-T--ACAGC-CAGGAA-T-TA----AAA-ACA-ATAAATGAC--ATAT------ATATG---ATC--------CTGGACACAAGACG-T-TTATC-ATT------------------ACAAGTATGCAATAT-GATAA
gi|21821 : GGAATTTTTCT--TTCATTAA---------A----AAT--AAAG--AG---TT----TATTATTTTATAAATCATGGT-T--GCAGC-AAGGAAAT-T-----GAA-TCA-ATAAATG----ATATATATATATATG---ATT--------CTAGACACAA-ACCTTGTTAAA-CTTTT-GA-AAGATTAAATATACAATATGACAATATGAATAAgtaa
gi|21822 : -TGGGAA-T-T-----AAA-ACA-ATAAATG----ATAT------ATATA---AAT--------CGAGATACAAGGCGTT-TTATT-CTTTT-GA-TAGATTAAA---ACAATTATATAATAACAATAAT
Alignments
lowQualScore : 1 1111111111 11111111111111111111111 111 1111 1111111 2222222222222 1 22222 222222222222222 1111111 11111111111 111111111111 11111111 111111111111 1
lowQualScore : 1 6 88 1 2 4 8888 1 1 4 5 333 6666666666 2 55 1 1 1 1 44444444444444444444444 3 4 1 000 2222 1111 2 88888888 22 888 77 3 1 0000000 55 1 5555555555555 3 0 2 2 7 0 1 22 6 4 11111 2 000000000000000 333 6666666 2 66666666666 333 000000000000 4444 2 1 44444 55 3 1 333 3 1 1 888 333 0 22 4 22222222 33 333 7777777 2 0 777777 3 4444 22 444 999999999999 2 88 999 2 9999999 2 6 777777 555555 333 888888888 2 3 2 2 6 6 1 333 1
lowQualScore : . . .. . . . .... . . . . ... .......... . .. . . . . ....................... . . . ... .... .... . ........ .. ... .. . . ....... .. . ............. . . . . . . . .. . . ..... . ............... ... ....... . ........... ... ............ .... . . ..... .. . . ... . . . ... ... . .. . ........ .. ... ....... . . ...... . .... .. ... ............ . .. ... . ....... . . ...... ...... ... ......... . . . . . . . ... .
lowQualScore : 1 8 22 0 1 0 7777 0 0 4 4 333 6666666666 9 22 1 1 9 0 44444444444444444444444 5 1 7 555 1111 6666 5 11111111 44 222 22 5 8 1111111 00 8 6666666666666 5 0 0 1 5 6 0 88 0 0 66666 0 222222222222222 555 1111111 0 99999999999 555 222222222222 2222 4 5 11111 55 0 0 555 8 3 9 444 777 3 99 1 88888888 11 222 4444444 2 9 666666 1 5555 88 222 777777777777 1 77 888 0 4444444 0 0 555555 888888 555 222222222 0 0 0 0 3 3 3 999 0
consensus : GAAAACCAGACAAAATNAAGC--GNAAAACAATTATACAAAA-TATTG--AAAACGGNGGTNTAAAAATGATAGATATNG---A-----AC---TNTTTATAAATTCAATTAAAG-CAAGTTGGGTNAAA------------AG----A----TTAA-CAGAT-G-T-AA-AC-AATAA---CGGCGA-----A--T--GGAAG--NATATA--TAC-AT-GTCT----TC--AA-T--GG-A-A-----AAATATGGCGG-AAA-CTTCATCTTTGAGAGT--AACTT-TAAT-TNTAAAGAT-AGTTGT-TC--T----ATGTT---CAAC---G--AAAC-G---C---CG--TT---T------------T----TATGTAA--C--A--TNATAGA---ATCATGG-TCAAAAATAAATTTTAACTCTAATA---TTGA--AGATGTTAATCT-AG-TA--AAAC-AAT---ACA-TA-TGGAATAATTC---T--TTCATNAAA----AAT--AACGGCAG---TT----TATTATTTTACAAAGCATGGC-T--ACAGC-TAGGAA-T-T-----AAA-ACA-ATAAATG----ATAT------ATATG---ATT--------NTAGACACAAGACGTT-TTATA-ATTTT-GA-AAGATTAAA---ACAATTNTACAATATAAATAAT
Reference ( family-691 ) : GAAAACCAGACAAAATNAAGC--GNAAAACAATTATACAAAA-TATTG--AAAACGGNGGTNTAAAAATGATAGATATNG---A-----AC---TNTTTATAAATTCAATTAAAG-CAAGTTGGGTNAAA------------AG----A----TTAA-CAGAT-G-T-AA-AC-AATAA---CGGCGA-----A--T--GGAAG--NATATA--TAC-AT-GTCT----TC--AA-T--GG-A-A-----AAATATGGCGG-AAA-CTTCATCTTTGAGAGT--AACTT-TAAT-TNTAAAGAT-AGTTGT-TC--T----ATGTT---CAAC---G--AAAC-G---C---CG--TT---T------------T----TATGTAA--C--A--TNATAGA---ATCATGG-TCAAAAATAAATTTTAACTCTAATA---TTGA--AGATGTTAATCT-AG-TA--AAAC-AAT---ACA-TA-TGGAATAATTC---T--TTCATNAAA----AAT--AACGGCAG---TT----CGTTATTTTACAAAGCATGGC-T--ACAGC-TAGGAA-T-T-----AAA-ACA-ATAAATG----ATAT------ATATG---ATT--------NTAGACACAAGACGTT-TTATA-ATTTT-GA-AAGATTAAA---ACAATTNTACAATATAAATAAT
gi|21796 : GAAAACCAGACAAAATTAAGC--GAAAAACAATTATTCAAAA-TATTG--AAAACGGTGGTATGAAGATGATAGATATAG---A-----GC---TTTTTATACATTCAATTAAGG-CAAGTTGGGTTAAA------------CG----A----TTAA-CAGAT-G-T-AA-AC-AATAA---TGGCGA-----A--T--GGAAG--TATACA--TAC-AT-GTCT----TC--AT-T--GG-A-A-----AAATATGGCGG-AAA-CTTCATCTTTGAGAGT--AATTT-TAAT-TTTAAAGAT-AGTTGT-TC--T----ATGTT---CAAC---G--AAAC-G---C---CG--TT---T------------T----TATGTAA--C--A--TTATTGA---ATCATGG-TCAAAAATAAATTTTAACTGTAATA---TTGA--AGATGTTAATCT-AC-TA--AAAC-AGT---ACA-TA-TGGAATAATTC---T--TTCATAAAA----CAT--AATGGCAA---TT----TATTATTTTACAAAGCATGGC-T--ACAGC-TAGGAA-T-T-----AAA-ACA-ATAAATG----ATAT------ATATG---ATT--------GTAGACACAAGACATT-TTATA-ATTTT-GA-AAGATTAAA---ACAATTGTACAATATAAGTAAT
gi|21797 : GAAAACCAGACAAAATTAAGC--GAAAAACAATTATTCAAAA-TATTG--AAAACGGTGGTATGAAGATGATATATATAG---A-----GC---TTTTTATACATTCAATTAAGG-CAAGTTGGGTTAAA------------CG----A----TTAA-CAGAT-G-T-AA-AC-AATAA---TGGCGA-----A--T--GGAAG--TATATA--TAC-AT-GTCT----TC--AT-T--GG-A-A-----AAATATGGCGG-AAA-CTTCATCTTTGAGAGT--AATTT-TAAT-TTTAAAGAT-AGTTGT-TC--T----ATGTT---CAAC---G--AAAC-G---C---CG--TT---T------------T----TATGTAA--C--A--TTATTGA---ATCATGG-TCAAAAATAAATTTTAACTGTAATA---TTGA--AGATGTTAATCT-AC-TA--AAAC-AGT---ACA-TA-TGGAATAATTC---T--TTCATAAAA----CAT--AATGGCAA---TT----TATTATTTTACAAAGCATGGC-T--ACAGC-TAGGAA-T-T-----AAA-ACA-ATAAATG----ATAT------ATATG---ATT--------GTAGACACAAGACGTT-TTATA-ATTTT-GA-AAGATTAAA---ACAATTGTACAATATAAGTCAT
gi|21798 : GAAAACCAGATAAAATAAAGC--GTAAAACTATTATACAAAA-TATTG--AAAACGGTGGATTGAAAATGATAGATATAG---A-----AC---TTTTTATAAATTCAATAAAAG-CAAGTTGGGTTAAA------------CG----A----CTAA-CAGAT-G-T-AC-AT-AATAA---TGGCGA-----A--T--GGAAG--TATATA--TAC-AG-GTCT----TC--AC-T--TG-A-A-----AAATATGGTGA-AAA-CTTGATCTTTGATAGT--AATTT-TAAT-TTCGAAAAT-AGTTGT-TC--T----ATGTT---TAAT---G--AAAC-G---C---CG--TT---T------------T----TATGTAA--C--A--TAATATA---ATCATGG-TCCAAAATAAATCTTATCTTT-ATA---TTGA--AGATGGTAATCT-AG-TA--AAAC-CGT---ACA-TA-TGGAACAATTC---T--TTCATAAAA----AAT--AATGGCAG---TT----TCTTATTTTACAAATCATGGT-T--ACAGT-TACGAA-T-T-----AAA-ACA-TTAAATG----ATAT------ATATA---ATT--------CTAGACACAACACATT-TTATA-CTTTT-GA-AAGATTAAA---ACAATTATACAATATAAATAAT
gi|21799 : GAAAACCAGACAAAATTAAGC--GTAAAACAATTATTCAAAA-TACTG--AAAACGGTGGTATGAAGTTGACAGATA--G---A-----GC---TTTTTATACATTCAATCAAGG-CAAGTTTGGTTAAG------------CG----A----TTAA-CAGAT-G-TAAA-AC-AATAA---TGGCGA-----A--T--GGAAG--TATATA--TAC-AT-GTTT----TC---A-T--TG-A-A-----AAATATGACGG-AAA-CTTCATCTTTGCGAGT--AATTT-TATT-TTTAAAGAT-AGTTGT-TC--T----TTGTT---TAGC---G--AAAC-G---C---TA--TT---T------------T----TATATGA--C--A--TTATTGA---ATCATGG-TCAAAAACAAATTTTAACTCTAATA---TTGA--AGATGTTAATCT-AT-CA--AAAC-AGT---ACA-TA-TAGAATAATAC---T--TTCAT-AAA----CAT--AAAGGCAA---TT----TATTATATTACAAAGCATGGC-T--ACAGC-TAAGAA-T-T-----AAA-ACA-ATAACTG----ATAT------ATATG---ATT--------GTAGATACAAGACATT-TTATA-ATTTT-GA-AAGATTAAA---ACAATTGTAC
gi|21800 : GGAAACAAGACAAAGTAAAGC--GTAAACCTATTATA-AAAA-TATTG--AAAACGATGGTATGAAGATGATAGATATAT---A-----AC---GTTTGATACATTCAATAAAAA-CAAGTTGGGTTAAA------------TG----A----CTAA-CAGAT-G-T-AA-AC-AATAA---TGACGA-----A--T--GGAAG--AATATA--TAC-AT-GTCT----TC--AA-T--TG-A-A-----ATTTACGGCGG-AAA-CTTCATCTTTGAGAAT--G---T-TAAT-TGCAAAG-------------------ACGTT---CAGT---G--AAAC-G---C---CA--TT---T------------T----TATGTAA--C--A--TGACGGA---ATCATGT-TTAAAAACTTATTTTAACACTAATA---TTGA--AGATGTTAATTT-AG-TA--AAAC-AAT---ATC-TA-ACGAATAATTA---T--TTCACTGAA----AGT--AAAGGCAG---TC----AGTTATGTTACAAATCATGGT-T--ACAGCATA-GAA-T-GAAAAAAAA-ACA-ATAAATG----ATAT------ATATA---ATT--------CTAGACACAAGGCGTT-TTATA-CTTCT-GA-ATGATT
gi|21801 : AAAACCTGATAAAATAAAAA--GGACAACACTAACTCAAGACTAT-G--AAAATGGAGGTCTAAAAATGATTGATATTG---A-----AA---TGTTCATAAACTCTCTTAAAT-CAAGTTGGATAAAA------------AG----A----TTAC-TTGAT------A-AC-AGTAATTCCGGTCA-----A--T--GGAAAGTCATATATCTAA-AT-AAAC----TC--AA-T-------------AAGTATGGTGGTAAA-C-TCATTTTTGAAAGT--AACTTGCAA----GAAAAAT-A--TGT-TT--TGAAAATGTA---TAA-------AAAC-G---A---TAACTT---T------------C----TAAAGGA--A--A--TCATAAT---ATCATGGACCAAAATTAAA----AAGTTTGATA----GGA--AAATG--AACATAAA-TA--AAGA-AAT---TTT-TA-TGGAATAA-----------CA-CAAA----TAT--AACTTTAAATCTTAATACGTTATGCTACATTGATTGGT-C--AGAAA-AGGGAA-T-C-----AAATATATACAAA------ACAT------ATATG---ATT--------TTAGAAAAAAAAGATT-TTATA-ATTTCAGC-GAGCTTAAA---AC
gi|21802 : AAAACCTGATAAAATAAAAA--GGACAACACTAACTCAAGACTAT-G--AAAATGGAGGTCTAAAAATGATTGATATTG---A-----AA---TGTTCATAAACTCTCTTAAAT-CAAGTTGGATAAAA------------AG----A----TTAC-TTGAT------A-AC-AGTAATTCCGGTCA-----A--T--GGAAAGTCATATATCTAA-AT-AAAC----TC--AA-T-------------AAGTATGGTGGTAAA-C-TCATTTTTGAAAGT--AACTTGCAA----GAAAAAT-A--TGT-TT--TGAAAATGTA---TAA-------AAAC-G---A---TAACTT---T------------C----TAAAGGA--A--A--TCATAAT---ATCATGGACCAAAATTAAA----AAGTTTGATA----GGA--AAATG--AACATAAA-TA--AAGA-AAT---TTT-TA-TGGAATAA-----------CA-CAAA----TAT--AACTTTAAATCTTAATACGTTATGCTACATTGATTGGT-C--AGAAA-AGGGAA-T-C-----AAATATATACAAA------ACAT------ATATG---ATT--------TTAGAAAAAAAAGATT-TTATA-ATTTCAGC-GAGCTTAAA---AC
gi|21803 : AAAGCC-GACAAGATCAAAC--GAAAAATA-CTA-ACAAAA--ATTACCAAAACGGTGGTTTAAAAATGATTGATATTAATTA-----AT---TCATTTTA---TCATTCAAAT-CAAGCTGGATAACT------------CG----A----TTAT-TTGAT-G---AA-TCAAACAA---GGGTTT-----A--T--GGAAA--TAAATT--TAT-TT-ATCTAAGATC--AA-T-------------AACTATGGAGGCAAA-C-TAATTTTTGAAAGT--AATTT-
gi|21804 : AAAACCTGATAAAATAAAAA--TGACAACACTAACTCAAGACTAT-G--AAAATGGAGGTCCAAAAATGATTGATATTG---A-----AA---TGTTCATAAACTCTCTTAAAT-CAAGTTGGATAAAA------------AG----A----TTAC-TTGAT------A-AC-AGTAATTCCGGTCA-----A--T--GGAAAGTCATATATCTAA-AT-AAAC----TC--AA-T-------------AAGTATGGTGGTAAA-C-TCATTTTTGAAAGT--AACTT-GCA-----AGAAAA-AGATGT-TT--TGAAAATGTA---TAA-------AAAC-GATAA---CT--TT---C------------T----AAAGGAAATC--A--TAATACATGTATCATGG-ACCAAAATTAA---CAAGTTTGATA----GGA--AAATG--AACATAAA-TA--AAGA-AAT----TT-TA-TGGAATAACACAAAT--CTAACTTTA----AAT----CTTCA----TA----CGTTATGCTACATTGATTGGT-T--AGAAA-AGGGAA-T-C-----AAATATATACAAA------ACAT------ATATG---ATT--------TTAGAAAAAAAAGATT-TTATA-ATTTCAGC-GAACTTAAA---AC
gi|21805 : AAAACCCGACAAGATAAAAC--GTAAAATACTTA--CAAAA-GATTACCAAAACGGTGGTTTAAAAATTATTGATATTG---ATAAATAC---ATTTTA-----TC-ATTAAAATTAAGCTGGATAAAA------------CG----A----TGAT-TTGAT-G---AA-TC-A--AA---CAG-GATTTTTT--T--GGAAA--CAAATT--TAT-TT-TTCT----AA--GA-T--TA-A-T-----AACTATGGAGGCAAA-CTT-ATATTTGAAAGT--AAA-T-TAAC-AGAAAACAA-AATTGTAAA--A----ATGTT---TAA-------AAAT-G---A---CA--CC---T------------T----CTTCTAA--CAAA--TCCTTGT---ATCTTGG-TCTAATATAAA
gi|21806 : AAACCAGACAAAGTTAAAT--GTAAAACTATTATACAAAA-TATTG--AAAACGGTGGTATGAAGATGATAGATATAG---ATAGA-AC---TTTTTATAAATTCAATTAAAG-CAAGTTGGGCTAAA------------CG----A----TTAA-CAGAT-A-T-AA-AC-AATAA---AGGCGC-----A--T--GGAAG--ACTATT--TAC-AT-GTCA----TC--AA-T--TG-A-A-----AAATATGGTGG-AAA-CTTAATCTTTGAGAAT--AACTT-TAAT-TGCAAAGAC-GATAAT-TC--T----ATGTT---TAGC---G--AAAT-GC--C---CT--TT---T------------T----TATGTAA--C--A--TAATAGA---GCCATGG-TCAAAAATTAATTTTAAAACTACTA---TTGA--AGATGTTAATAT-AG-CA--AAAC-AGT---ATA-TA-TGGAATAATTC---T--TTCATTAAA----AGT--AAAGGCAG---TT----TGTTATTTTAC-AAGCATGGT-T--AGAGC-TAGGAG-T-C-----AAA-ACA-ATAAATGATATATAT------ATATG---ATT--------CTAGACACAAGACGTT-TTATA-CTTTT-TA-ACGATTAAA---TCAATTATACAATATTAGTAAT
gi|21807 : AAACCAGATCAAATTAAGC--GTAAA-CTATAATACAAAA-TATTT--AAC-CGGTAGTATGAAAAAGATAGGTATAG---A-----AC---T-TTTATCAATTCAATAAAAG-CAAATTGGGTTAAA------------AG----A----TTAA-CAGAT-G-A-AA-AC-AATAA---TGGCGA-----A--T--GGAAT--AATATA--TAC-AT-GTCT----TC--AG-T------------------TAACGG-AAAACTTCATCTTTGACAGT--AAATT-TAGT-TACAAAAAT-GGTTAT-TC--T----ATGTT---CAGC---G--AAAC-G---C---C---------------------T----GATGTTA--C--A--TAATAGA---ATCATGG-TCAAAAATTAATTGTAACT--AATA---TTGA--AGATATTATTTT-GG-TA--AAAC-AAT---ACA-TA-TGGAATAACTA---T--TTCAATAAA----AAT--AAAGACAG---TT----TGCTACTTTATAAATTATTTT-A--ACAGC-TTGAAA-T-T-----AAA-ATA-ATAAATG----GTAT------ATAAGTATATTTATATATACTAGACACAAGACGTT-TTATA-CTTTT-AA-AATATTAAA---ACAATTATACAATATAAGTAAT
gi|21808 : AAATCTGATAAAATTAGTC--GAAAAACAATAATACAGGA-TGATG--AAAACGGGGGCCTAAAAATGATTGAT-TTA---A-----ACA--TGTTTATAAAAGCAATTAAAG-CAGGATGGGTCAAA------------AG----A----ATAA-TCGATAA-T-AA-A--AATGA---GGGTGA-----T--T--GGAAA--CATATA--TACAAT-AGC-----AC--AT-T--AG-ATA-----AAATA-GGGGG-ACA-ATTAATATTTGAATGT--AA-TT-CAA---ATGAAAAT-GA------C--T----ATATTAAACAAA---A--AAACAA---C---CA--TT---TCCCAAATTTTTCT----TA-GAAA--T--A--T--TGCA---ATCCTGG-TCAAGCATAAACTTTG----TAA-A---TAAACCAGAAGCTGA----AG-GATTAAAC-AATCAGATATTA-TGGAACAACTC---T--TATATAAAAAAACAATAAAACGACA------------TTATTTTATAAAGAATGATAT--GCAAA--AGGTA-CAT-----CAA-ACA-A------------AT------ATTTG---ATA--------GTAGGTAAAAAACATT-TTATACATTT
gi|21809 : AAACCAGACAAAATAAGTA--GAAAAACAATTATACAAAA-TAACG--AAAATGGGGGCTTAAAAATGATAGATCT-G---A-----ATA--TGTTTATTAAGTCAATTAAAG-CAGGTTGGGTGAAA------------AGAATTA----TCAACCAGA--G-T-AATAC-A--------GGTGA-----T--TCAGGAAG--CATATA--TAC-ATGGGC------C--AA-CCAGA-A-A-----AAATA-GGAGG-ACC-ATTAATATTTTAATGT--AA-TT-TAA----TAAAAAT-GACT-------T----AAAT-----AAT---G--CAAC-T---C---AG--ATAGAC------------T----CA---GA--A--A--TTGTACA---ATCATGG-TCAAGTATCAATTATAAAGAAAATG---TTGA--ATATATAAAT----------AAACAAAT---AC--TA-TGGAATAATTC------AACATCAAA----AAT--AA
gi|21810 : AAACCGGATAAAATTAATA--GAAAAACAATTATACAAAACTA-CG--AAAATGGGGGTTTAAAAATGATAGATCTGC---A-----AT---TATTTATAAATTCGATTAAAG-CCGGGTGGGTCAAA------------CGT---A----TT-A-TAAAT-GAT-CA-A--AATAA---AGGGGA-----C--T--TGAAA--CACATA--TAC-taataaaacattcttctataa
gi|21811 : AAACCAGACAAAATAAGTA--GAAAGACAATTATACAAAA-TTACG--AAAATGGGGGCTTAAAAATAATAGATCT-G---A-----ATA--TGTTTATTAAGTCAATTAAAG-CAGGTTGGGTGAAA------------AGAATTA----TCAATCAGA--G-T----AC-TACA-----GGTGA-----T--T--GGAAG--CATATA--TACAAG-GGC------C--AACT--AGCA-A-----AAATA-GGAGG-ACC-ATTAATATTTCAGTGT--TATAT-TAA----TAAAAATGACTTAA-AT--A----ATG-----CAACTTAGATAAAC-T---CAAAC---TT---T------------T----TATCAGA--A--A--TTGTACA---ATCATGG-TCAA
gi|21812 : AAACCAGATAAAAT--AGCAAGACACACAATTAAAAAAGACTAT-A--AAGATGGGGGATTAAAAATGATAGAT-TTG---A-----ATGCATATCTAT--ACTCAATAAAAG-CAAGTTGGATCAAA------------AG----AATTTTTAA-C-GAT-G---AA----AATAC---CG--GA-----ATCT--GGAAA--GATAAT--TAT-AT-G-----------AA-T--GA-A-ATTAACAAATTTGGTGG-GAA-ATT-ATTATTACAATC--AAACA-TAACATATAAAGAT-A--TAA-CCAAT----AAATT---CAA-------AAAT-A---T---T---TT---C------------T----TAAGGGA--T--GTTTTACAAA---GT--TGG-GCAAAGGTAAACTTTAATTCGGAAA---TAAC--AAACATCA---C-AGATG--AAAT--------CA-TA-TGGAATAACTC---A--TTTATACAA----AAT--AACAATAA---AA----CAATATTTTATAGAGTATGGC-TGGATAA---AGGAA-T-A-----AAATATA-TTAAACA----AC-T------TTATG---ATT--------ACAGAAATAAGAACTT-TTATA-ATTTT-AATACGATC-AA---ACAACTTTACAATCTAGACAAT
gi|21813 : AAACCAGATAAAAT--AGCAAGACACACAATTAAAAAAGACTAT-A--AAGATGGGGGATTAAAAATGATAGAT-TTG---A-----ATGCATATCTAT--ACTCAATAAAAG-CAAGCTGGATCAAA------------AG----AATTTTTAA-C-GAT-G---AA----AATAC---CG--GA-----ATCT--GGAAA--GATAAT--TAT-AT-G-----------AA-T--GA-A-ATTAACAAATTTGGTGG-GAA-ATT-ATTATT-ACAGTCAAAC-A-TAACATATAAAGAT-A--TAA-CCAAT----AAATT---CAA-------AAAT-A---T---TT--TC---T------------TAAGGTATGT-------T--TTACAAA---GT--TGG-GCAAAGGTAAACTTTAATTCGGAAA---TAAC--AAACATCA---C-AGATG--AAAT--------CA-TA-TGGAATAACTC---A--TTTATACAA----AAT--AACAATAA---AA----CAATATTTTATAGAGTATGGC-TGGATAA---AGGAA-T-A-----AAATATA-TTAAACA----AC-T------TTATG---ATT--------ACAAAAATAAGAACTT-TTATA-ATTTT-AATACGATC-AA---ACAACTTTACAATCTAGACAAT
gi|21814 : AAACCAGATAAAAT--AGCAAGACACACAATTAAAAAAGACTAT-A--AAGATGGGGGATTAAAAATGATAGAT-TTG---A-----ATGCATATCTAT--ACTCAATAAAAG-CAAGTTGGATCAAA------------AG----AATTTTTAA-C-GAT-G---AA----AATAC---CG--GA-----ATCT--GGAAA--GATAAT--TAT-AT-G-----------AA-T--GA-A-ATTAACAAATTTGGTGG-TAA-ATT-ATTATTACAATC--AAACA-TAACATATAAAGAT-A--TAA-CCAAT----AAATT---CAAA---A--AAA----------TT--TT---C------------T----TAAGGGA--T--GTTTTACAAA---GT--TGG-GCAAAGGTAAACTTTAATTCGGAAA---TAAC--AAACATCA---C-AGATG--AAAT--------CA-TA-TGGAATAACTC---A--TTTATACAA----AAT--AACAATAA---AA----CAATATTTTATAGAGTACGGC-TGGATAA---AGGAA-T-A-----AAATATA-TTAAACA----AC-T------TTATG---ATT--------ACAGAAATAAGAACTT-TTATA-ATTTT-AATACGATC-AA---ACAACTTTACAATCTAGACAAT
gi|21815 : AAATAAAGC--GTAAAACTAATATACAAAA-TATTG--AAAATCGTGGTATGAAACTGACAGATATAG---A-----AC---TTTTTATAAATTCAATAAAAG-CAAGTTGGGTTAAA------------AG----A----CTAA-CAGAT-G-A-AA-AT-AATAA---TGAAGA-----A--T--GGAAG--TATATA--AAC-AG-GTCT----TC--AT-T--GG-A-A-----AAATATGGTGG-AAA-CTTCATCTTTGAGGGT--AACTT-TTAG-TTCGAAGAT-AGTTGT-TC--T----ATGTT---TAGT---G--AAAC-G---C---CG--TT---T------------T----TATGTAA--C--A--TAATAGA---ATCATGG-TTCAAAATTAATTTTAATTTTAATA---TTGA--AGATGGTTATCT-AG-TA--AAAC-AAT---ATA-TA-TGGAACAATTT---C--TTCATCAAA----AAT--AATGGCAG---AT----TATTATTTTACAAATCATGGT-A--ACAAT-TAGGAA-T-T-----AAA-ACA-TTAAATG----ATAT------ATATG---ATT--------CTTGACATATGACATT-TTATA-CTATT-GA-AAGATTAAA---ACAATTATACAATATAAATAAT
gi|21816 : TAG---A-----AC---TTTCTATAAATTCAATTAAAG-CAAGTTGGGTTAAACAAACGCACCAAAC----A----TCAA-CAGAT-G-T-AA-AC-AATAA---AGGCGA-----A--T--GGAAG--AATATA--TAC-CT-GTCT----TC--CA-T--TG-A-A-----AAATATGACGG-AAA-CATCATCTTTGAGAAT--AACTT-TAAT-AGCAAAGAT-GGTTAT-TC--T----ATGTT---CAGC---G--AAAC-G---C---CT--TT---T------------T----TATGCAA--C--A--TAATAAA---ACCATGG-TCAAAAATTAATTTTAACACTAATA---TTGA--AGAT
gi|21817 : ----TTAA-CAGAT-G-T-TA-AC-AATAA---CGGCGA-----A--T--GGAAG--TATATA--TAC-AT-GTCT----TCATAA-T--GG-
gi|21818 : AAT-TTTAACGAT-AGTTGT-TC--T----ATGTT---CAGC---G--AAAC-G---C---CG--TT---T------------A----TTTGTAA--C--A--TAATTGA---ATCATGG-TAAACAATTAATTTTA------------TTGA--AGATGTTTATCT-AC-TA--AAAC-ACT---TCA-TA-TGGAATAATTC---T--TTCATAAAA----CAT--AATTGCAG---TT----TATTATTTTACAAAGCATGAC-T--ACAGC-TAGGAA-T-A-----AAT-ACA-ATAAATG----ATAT------ATATG---ATT--------GTAG-----AGACATT-TTATA-ATTTT-GA-AAGATTGAT---ACA
gi|21819 : ----TTAA-CAGAT-G-T-TA-AC-AATAA---CGGCGA-----A--T--GGAAG--TATATA--TAC-AT-GTCT----TCATAA-T--GG-
gi|21819 : attgaattttttttaaaaaaagtttaaacgtggatgtgttgctAT--AATGGCAG---TT----TATTATTTTACAAAGCATGGC-T--ACAGC-TAGGAA-T-T-----AAA-ACA-ATAAATT----GTAT------ATATG---ATT--------GTAGATACAAGACATT-TTATA-ATTTT-GA-AAGATTAAA---ACAATTGTACAATATAAGTAATcagtttattattttacaaagcatggctacagctaggaattaaaacaataaattgtatatatgattgtagatacaagacattttataattttgaaagattaaaacaattgtacaatataagtaat
gi|21820 : attgaattttttttaaaaaaagtttaaacgtggatgtgttgctttaacagatgttaacaataacggcgaatggaagtatatatacatgtcttcATGG--CAGAATTAAAT---AAAATTAATAGACTTAC--AAGTAATAATC---G-TA--AAAT-AAT---AAAATAATAGAATAATTC---TCTTTTATTAAA----AGT--AAC---AT---TT----TAATATTTTATTAATCATGGT-T--ACAGC-CAGGAA-T-TA----AAA-ACA-ATAAATGAC--ATAT------ATATG---ATC--------CTGGACACAAGACG-T-TTATC-ATT------------------ACAAGTATGCAATAT-GATAA
gi|21821 : GGAATTTTTC---T--TTCATTAAA----AAT--AAAG--AG---TT----TATTATTTTATAAATCATGGT-T--GCAGC-AAGGAAAT-T-----GAA-TCA-ATAAATG----ATATATATATATATG---ATT--------CTAGACACAA-ACCTTGTTAAA-CTTTT-GA-AAGATTAAATATACAATATGACAATATGAATAAgtaa
gi|21822 : -TGGGAA-T-T-----AAA-ACA-ATAAATG----ATAT------ATATA---AAT--------CGAGATACAAGGCGTT-TTATT-CTTTT-GA-TAGATTAAA---ACAATTATATAATAACAATAAT
Alignments
lowQualScore : 1 1111111111 11111111111111111111111 111 1111 1111111 2222222222222 1 22222 222222222222222 1111111 11111111111 111111111111 11111111 11111 1
lowQualScore : 1 6 88 1 2 4 8888 1 1 4 5 333 6666666666 2 55 1 1 1 1 44444444444444444444444 3 4 1 000 2222 1111 2 88888888 22 888 77 3 1 0000000 55 1 5555555555555 3 0 2 2 7 0 1 22 6 4 11111 2 000000000000000 333 6666666 2 66666666666 333 000000000000 4444 2 1 44444 55 3 1 333 3 1 1 888 333 0 22 4 22222222 33 333 7777777 2 2 555 33 44444 22 444 9999 55555 2 88 999 2 9999999 2 6 777777 555555 333 888888888 2 3 2 2 6 6 1 333 1
lowQualScore : . . .. . . . .... . . . . ... .......... . .. . . . . ....................... . . . ... .... .... . ........ .. ... .. . . ....... .. . ............. . . . . . . . .. . . ..... . ............... ... ....... . ........... ... ............ .... . . ..... .. . . ... . . . ... ... . .. . ........ .. ... ....... . . ... .. ..... .. ... .... ..... . .. ... . ....... . . ...... ...... ... ......... . . . . . . . ... .
lowQualScore : 1 8 22 0 1 0 7777 0 0 4 4 333 6666666666 9 22 1 1 9 0 44444444444444444444444 5 1 7 555 1111 6666 5 11111111 44 222 22 5 8 1111111 00 8 6666666666666 5 0 0 1 5 6 0 88 0 0 66666 0 222222222222222 555 1111111 0 99999999999 555 222222222222 2222 4 5 11111 55 0 0 555 8 3 9 444 777 3 99 1 88888888 11 222 4444444 2 7 222 99 66666 88 222 7777 00000 1 77 888 0 4444444 0 0 555555 888888 555 222222222 0 0 0 0 3 3 3 999 0
consensus : GAAAACCAGACAAAATNAAGC--GNAAAACAATTATACAAAA-TATTG--AAAACGGNGGTNTAAAAATGATAGATATNG---A-----AC---TNTTTATAAATTCAATTAAAG-CAAGTTGGGTNAAA------------AG----A----TTAA-CAGAT-G-T-AA-AC-AATAA---CGGCGA-----A--T--GGAAG--NATATA--TAC-AT-GTCT----TC--AA-T--GG-A-A-----AAATATGGCGG-AAA-CTTCATCTTTGAGAGT--AACTT-TAAT-TNTAAAGAT-AGTTGT-TC--T----ATGTT---CAAC---G--AAAC-G---C---CG--TT---T------------T----TATGTAA--C--A--TNATAGA---ATCATGG-TCAAAAATAAATTTTAACTCTAATA---TTGA--AGATGTTAATCT-AG-TA--AAAC-AAT---ACA-TA-TGGAATAATTCT--TTCATNAAA----AAT--AACGGCAG---TTTA-----TTATTTTACAAAGCATGGC-T--ACAGC-TAGGAA-T-T-----AAA-ACA-ATAAATG----ATAT------ATATG---ATT--------NTAGACACAAGACGTT-TTATA-ATTTT-GA-AAGATTAAA---ACAATTNTACAATATAAATAAT
Reference ( family-691 ) : GAAAACCAGACAAAATNAAGC--GNAAAACAATTATACAAAA-TATTG--AAAACGGNGGTNTAAAAATGATAGATATNG---A-----AC---TNTTTATAAATTCAATTAAAG-CAAGTTGGGTNAAA------------AG----A----TTAA-CAGAT-G-T-AA-AC-AATAA---CGGCGA-----A--T--GGAAG--NATATA--TAC-AT-GTCT----TC--AA-T--GG-A-A-----AAATATGGCGG-AAA-CTTCATCTTTGAGAGT--AACTT-TAAT-TNTAAAGAT-AGTTGT-TC--T----ATGTT---CAAC---G--AAAC-G---C---CG--TT---T------------T----TATGTAA--C--A--TNATAGA---ATCATGG-TCAAAAATAAATTTTAACTCTAATA---TTGA--AGATGTTAATCT-AG-TA--AAAC-AAT---ACA-TA-TGGAATAATTCT--TTCATNAAA----AAT--AACGGCAG---TTTA-----TTATTTTACAAAGCATGGC-T--ACAGC-TAGGAA-T-T-----AAA-ACA-ATAAATG----ATAT------ATATG---ATT--------NTAGACACAAGACGTT-TTATA-ATTTT-GA-AAGATTAAA---ACAATTNTACAATATAAATAAT
gi|21796 : GAAAACCAGACAAAATTAAGC--GAAAAACAATTATTCAAAA-TATTG--AAAACGGTGGTATGAAGATGATAGATATAG---A-----GC---TTTTTATACATTCAATTAAGG-CAAGTTGGGTTAAA------------CG----A----TTAA-CAGAT-G-T-AA-AC-AATAA---TGGCGA-----A--T--GGAAG--TATACA--TAC-AT-GTCT----TC--AT-T--GG-A-A-----AAATATGGCGG-AAA-CTTCATCTTTGAGAGT--AATTT-TAAT-TTTAAAGAT-AGTTGT-TC--T----ATGTT---CAAC---G--AAAC-G---C---CG--TT---T------------T----TATGTAA--C--A--TTATTGA---ATCATGG-TCAAAAATAAATTTTAACTGTAATA---TTGA--AGATGTTAATCT-AC-TA--AAAC-AGT---ACA-TA-TGGAATAATTCT--TTCATAAAA----CAT--AATGGCAA---TTTA-----TTATTTTACAAAGCATGGC-T--ACAGC-TAGGAA-T-T-----AAA-ACA-ATAAATG----ATAT------ATATG---ATT--------GTAGACACAAGACATT-TTATA-ATTTT-GA-AAGATTAAA---ACAATTGTACAATATAAGTAAT
gi|21797 : GAAAACCAGACAAAATTAAGC--GAAAAACAATTATTCAAAA-TATTG--AAAACGGTGGTATGAAGATGATATATATAG---A-----GC---TTTTTATACATTCAATTAAGG-CAAGTTGGGTTAAA------------CG----A----TTAA-CAGAT-G-T-AA-AC-AATAA---TGGCGA-----A--T--GGAAG--TATATA--TAC-AT-GTCT----TC--AT-T--GG-A-A-----AAATATGGCGG-AAA-CTTCATCTTTGAGAGT--AATTT-TAAT-TTTAAAGAT-AGTTGT-TC--T----ATGTT---CAAC---G--AAAC-G---C---CG--TT---T------------T----TATGTAA--C--A--TTATTGA---ATCATGG-TCAAAAATAAATTTTAACTGTAATA---TTGA--AGATGTTAATCT-AC-TA--AAAC-AGT---ACA-TA-TGGAATAATTCT--TTCATAAAA----CAT--AATGGCAA---TTTA-----TTATTTTACAAAGCATGGC-T--ACAGC-TAGGAA-T-T-----AAA-ACA-ATAAATG----ATAT------ATATG---ATT--------GTAGACACAAGACGTT-TTATA-ATTTT-GA-AAGATTAAA---ACAATTGTACAATATAAGTCAT
gi|21798 : GAAAACCAGATAAAATAAAGC--GTAAAACTATTATACAAAA-TATTG--AAAACGGTGGATTGAAAATGATAGATATAG---A-----AC---TTTTTATAAATTCAATAAAAG-CAAGTTGGGTTAAA------------CG----A----CTAA-CAGAT-G-T-AC-AT-AATAA---TGGCGA-----A--T--GGAAG--TATATA--TAC-AG-GTCT----TC--AC-T--TG-A-A-----AAATATGGTGA-AAA-CTTGATCTTTGATAGT--AATTT-TAAT-TTCGAAAAT-AGTTGT-TC--T----ATGTT---TAAT---G--AAAC-G---C---CG--TT---T------------T----TATGTAA--C--A--TAATATA---ATCATGG-TCCAAAATAAATCTTATCTTT-ATA---TTGA--AGATGGTAATCT-AG-TA--AAAC-CGT---ACA-TA-TGGAACAATTCT--TTCATAAAA----AAT--AATGGCAG---TTTC-----TTATTTTACAAATCATGGT-T--ACAGT-TACGAA-T-T-----AAA-ACA-TTAAATG----ATAT------ATATA---ATT--------CTAGACACAACACATT-TTATA-CTTTT-GA-AAGATTAAA---ACAATTATACAATATAAATAAT
gi|21799 : GAAAACCAGACAAAATTAAGC--GTAAAACAATTATTCAAAA-TACTG--AAAACGGTGGTATGAAGTTGACAGATA--G---A-----GC---TTTTTATACATTCAATCAAGG-CAAGTTTGGTTAAG------------CG----A----TTAA-CAGAT-G-TAAA-AC-AATAA---TGGCGA-----A--T--GGAAG--TATATA--TAC-AT-GTTT----TC---A-T--TG-A-A-----AAATATGACGG-AAA-CTTCATCTTTGCGAGT--AATTT-TATT-TTTAAAGAT-AGTTGT-TC--T----TTGTT---TAGC---G--AAAC-G---C---TA--TT---T------------T----TATATGA--C--A--TTATTGA---ATCATGG-TCAAAAACAAATTTTAACTCTAATA---TTGA--AGATGTTAATCT-AT-CA--AAAC-AGT---ACA-TA-TAGAATAATACT--TTCAT-AAA----CAT--AAAGGCAA---TTTA-----TTATATTACAAAGCATGGC-T--ACAGC-TAAGAA-T-T-----AAA-ACA-ATAACTG----ATAT------ATATG---ATT--------GTAGATACAAGACATT-TTATA-ATTTT-GA-AAGATTAAA---ACAATTGTAC
gi|21800 : GGAAACAAGACAAAGTAAAGC--GTAAACCTATTATA-AAAA-TATTG--AAAACGATGGTATGAAGATGATAGATATAT---A-----AC---GTTTGATACATTCAATAAAAA-CAAGTTGGGTTAAA------------TG----A----CTAA-CAGAT-G-T-AA-AC-AATAA---TGACGA-----A--T--GGAAG--AATATA--TAC-AT-GTCT----TC--AA-T--TG-A-A-----ATTTACGGCGG-AAA-CTTCATCTTTGAGAAT--G---T-TAAT-TGCAAAG-------------------ACGTT---CAGT---G--AAAC-G---C---CA--TT---T------------T----TATGTAA--C--A--TGACGGA---ATCATGT-TTAAAAACTTATTTTAACACTAATA---TTGA--AGATGTTAATTT-AG-TA--AAAC-AAT---ATC-TA-ACGAATAATTAT--TTCACTGAA----AGT--AAAGGCAG---TCAG-----TTATGTTACAAATCATGGT-T--ACAGCATA-GAA-T-GAAAAAAAA-ACA-ATAAATG----ATAT------ATATA---ATT--------CTAGACACAAGGCGTT-TTATA-CTTCT-GA-ATGATT
gi|21801 : AAAACCTGATAAAATAAAAA--GGACAACACTAACTCAAGACTAT-G--AAAATGGAGGTCTAAAAATGATTGATATTG---A-----AA---TGTTCATAAACTCTCTTAAAT-CAAGTTGGATAAAA------------AG----A----TTAC-TTGAT------A-AC-AGTAATTCCGGTCA-----A--T--GGAAAGTCATATATCTAA-AT-AAAC----TC--AA-T-------------AAGTATGGTGGTAAA-C-TCATTTTTGAAAGT--AACTTGCAA----GAAAAAT-A--TGT-TT--TGAAAATGTA---TAA-------AAAC-G---A---TAACTT---T------------C----TAAAGGA--A--A--TCATAAT---ATCATGGACCAAAATTAAA----AAGTTTGATA----GGA--AAATG--AACATAAA-TA--AAGA-AAT---TTT-TA-TGGAATAA--------CA-CAAA----TAT--AACTTTAAAT-CTTAATACGTTATGCTACATTGATTGGT-C--AGAAA-AGGGAA-T-C-----AAATATATACAAA------ACAT------ATATG---ATT--------TTAGAAAAAAAAGATT-TTATA-ATTTCAGC-GAGCTTAAA---AC
gi|21802 : AAAACCTGATAAAATAAAAA--GGACAACACTAACTCAAGACTAT-G--AAAATGGAGGTCTAAAAATGATTGATATTG---A-----AA---TGTTCATAAACTCTCTTAAAT-CAAGTTGGATAAAA------------AG----A----TTAC-TTGAT------A-AC-AGTAATTCCGGTCA-----A--T--GGAAAGTCATATATCTAA-AT-AAAC----TC--AA-T-------------AAGTATGGTGGTAAA-C-TCATTTTTGAAAGT--AACTTGCAA----GAAAAAT-A--TGT-TT--TGAAAATGTA---TAA-------AAAC-G---A---TAACTT---T------------C----TAAAGGA--A--A--TCATAAT---ATCATGGACCAAAATTAAA----AAGTTTGATA----GGA--AAATG--AACATAAA-TA--AAGA-AAT---TTT-TA-TGGAATAA--------CA-CAAA----TAT--AACTTTAAAT-CTTAATACGTTATGCTACATTGATTGGT-C--AGAAA-AGGGAA-T-C-----AAATATATACAAA------ACAT------ATATG---ATT--------TTAGAAAAAAAAGATT-TTATA-ATTTCAGC-GAGCTTAAA---AC
gi|21803 : AAAGCC-GACAAGATCAAAC--GAAAAATA-CTA-ACAAAA--ATTACCAAAACGGTGGTTTAAAAATGATTGATATTAATTA-----AT---TCATTTTA---TCATTCAAAT-CAAGCTGGATAACT------------CG----A----TTAT-TTGAT-G---AA-TCAAACAA---GGGTTT-----A--T--GGAAA--TAAATT--TAT-TT-ATCTAAGATC--AA-T-------------AACTATGGAGGCAAA-C-TAATTTTTGAAAGT--AATTT-
gi|21804 : AAAACCTGATAAAATAAAAA--TGACAACACTAACTCAAGACTAT-G--AAAATGGAGGTCCAAAAATGATTGATATTG---A-----AA---TGTTCATAAACTCTCTTAAAT-CAAGTTGGATAAAA------------AG----A----TTAC-TTGAT------A-AC-AGTAATTCCGGTCA-----A--T--GGAAAGTCATATATCTAA-AT-AAAC----TC--AA-T-------------AAGTATGGTGGTAAA-C-TCATTTTTGAAAGT--AACTT-GCA-----AGAAAA-AGATGT-TT--TGAAAATGTA---TAA-------AAAC-GATAA---CT--TT---C------------T----AAAGGAAATC--A--TAATACATGTATCATGG-ACCAAAATTAA---CAAGTTTGATA----GGA--AAATG--AACATAAA-TA--AAGA-AAT----TT-TA-TGGAATAA--------CA-CAAA----TCT--AACTTTAAATCTTCATACG-TTATGCTACATTGATTGGT-T--AGAAA-AGGGAA-T-C-----AAATATATACAAA------ACAT------ATATG---ATT--------TTAGAAAAAAAAGATT-TTATA-ATTTCAGC-GAACTTAAA---AC
gi|21805 : AAAACCCGACAAGATAAAAC--GTAAAATACTTA--CAAAA-GATTACCAAAACGGTGGTTTAAAAATTATTGATATTG---ATAAATAC---ATTTTA-----TC-ATTAAAATTAAGCTGGATAAAA------------CG----A----TGAT-TTGAT-G---AA-TC-A--AA---CAG-GATTTTTT--T--GGAAA--CAAATT--TAT-TT-TTCT----AA--GA-T--TA-A-T-----AACTATGGAGGCAAA-CTT-ATATTTGAAAGT--AAA-T-TAAC-AGAAAACAA-AATTGTAAA--A----ATGTT---TAA-------AAAT-G---A---CA--CC---T------------T----CTTCTAA--CAAA--TCCTTGT---ATCTTGG-TCTAATATAAA
gi|21806 : AAACCAGACAAAGTTAAAT--GTAAAACTATTATACAAAA-TATTG--AAAACGGTGGTATGAAGATGATAGATATAG---ATAGA-AC---TTTTTATAAATTCAATTAAAG-CAAGTTGGGCTAAA------------CG----A----TTAA-CAGAT-A-T-AA-AC-AATAA---AGGCGC-----A--T--GGAAG--ACTATT--TAC-AT-GTCA----TC--AA-T--TG-A-A-----AAATATGGTGG-AAA-CTTAATCTTTGAGAAT--AACTT-TAAT-TGCAAAGAC-GATAAT-TC--T----ATGTT---TAGC---G--AAAT-GC--C---CT--TT---T------------T----TATGTAA--C--A--TAATAGA---GCCATGG-TCAAAAATTAATTTTAAAACTACTA---TTGA--AGATGTTAATAT-AG-CA--AAAC-AGT---ATA-TA-TGGAATAATTCT--TTCATTAAA----AGT--AAAGGCAG---TTTG-----TTATTTTAC-AAGCATGGT-T--AGAGC-TAGGAG-T-C-----AAA-ACA-ATAAATGATATATAT------ATATG---ATT--------CTAGACACAAGACGTT-TTATA-CTTTT-TA-ACGATTAAA---TCAATTATACAATATTAGTAAT
gi|21807 : AAACCAGATCAAATTAAGC--GTAAA-CTATAATACAAAA-TATTT--AAC-CGGTAGTATGAAAAAGATAGGTATAG---A-----AC---T-TTTATCAATTCAATAAAAG-CAAATTGGGTTAAA------------AG----A----TTAA-CAGAT-G-A-AA-AC-AATAA---TGGCGA-----A--T--GGAAT--AATATA--TAC-AT-GTCT----TC--AG-T------------------TAACGG-AAAACTTCATCTTTGACAGT--AAATT-TAGT-TACAAAAAT-GGTTAT-TC--T----ATGTT---CAGC---G--AAAC-G---C---C---------------------T----GATGTTA--C--A--TAATAGA---ATCATGG-TCAAAAATTAATTGTAACT--AATA---TTGA--AGATATTATTTT-GG-TA--AAAC-AAT---ACA-TA-TGGAATAACTAT--TTCAATAAA----AAT--AAAGACAG---TTTG-----CTACTTTATAAATTATTTT-A--ACAGC-TTGAAA-T-T-----AAA-ATA-ATAAATG----GTAT------ATAAGTATATTTATATATACTAGACACAAGACGTT-TTATA-CTTTT-AA-AATATTAAA---ACAATTATACAATATAAGTAAT
gi|21808 : AAATCTGATAAAATTAGTC--GAAAAACAATAATACAGGA-TGATG--AAAACGGGGGCCTAAAAATGATTGAT-TTA---A-----ACA--TGTTTATAAAAGCAATTAAAG-CAGGATGGGTCAAA------------AG----A----ATAA-TCGATAA-T-AA-A--AATGA---GGGTGA-----T--T--GGAAA--CATATA--TACAAT-AGC-----AC--AT-T--AG-ATA-----AAATA-GGGGG-ACA-ATTAATATTTGAATGT--AA-TT-CAA---ATGAAAAT-GA------C--T----ATATTAAACAAA---A--AAACAA---C---CA--TT---TCCCAAATTTTTCT----TA-GAAA--T--A--T--TGCA---ATCCTGG-TCAAGCATAAACTTTG----TAA-A---TAAACCAGAAGCTGA----AG-GATTAAAC-AATCAGATATTA-TGGAACAACTCT--TATATAAAAAAACAATAAAACGAC--------A-----TTATTTTATAAAGAATGATAT--GCAAA--AGGTA-CAT-----CAA-ACA-A------------AT------ATTTG---ATA--------GTAGGTAAAAAACATT-TTATACATTT
gi|21809 : AAACCAGACAAAATAAGTA--GAAAAACAATTATACAAAA-TAACG--AAAATGGGGGCTTAAAAATGATAGATCT-G---A-----ATA--TGTTTATTAAGTCAATTAAAG-CAGGTTGGGTGAAA------------AGAATTA----TCAACCAGA--G-T-AATAC-A--------GGTGA-----T--TCAGGAAG--CATATA--TAC-ATGGGC------C--AA-CCAGA-A-A-----AAATA-GGAGG-ACC-ATTAATATTTTAATGT--AA-TT-TAA----TAAAAAT-GACT-------T----AAAT-----AAT---G--CAAC-T---C---AG--ATAGAC------------T----CA---GA--A--A--TTGTACA---ATCATGG-TCAAGTATCAATTATAAAGAAAATG---TTGA--ATATATAAAT----------AAACAAAT---AC--TA-TGGAATAATTC---AACATCAAA----AAT--AA
gi|21810 : AAACCGGATAAAATTAATA--GAAAAACAATTATACAAAACTA-CG--AAAATGGGGGTTTAAAAATGATAGATCTGC---A-----AT---TATTTATAAATTCGATTAAAG-CCGGGTGGGTCAAA------------CGT---A----TT-A-TAAAT-GAT-CA-A--AATAA---AGGGGA-----C--T--TGAAA--CACATA--TAC-taataaaacattcttctataa
gi|21811 : AAACCAGACAAAATAAGTA--GAAAGACAATTATACAAAA-TTACG--AAAATGGGGGCTTAAAAATAATAGATCT-G---A-----ATA--TGTTTATTAAGTCAATTAAAG-CAGGTTGGGTGAAA------------AGAATTA----TCAATCAGA--G-T----AC-TACA-----GGTGA-----T--T--GGAAG--CATATA--TACAAG-GGC------C--AACT--AGCA-A-----AAATA-GGAGG-ACC-ATTAATATTTCAGTGT--TATAT-TAA----TAAAAATGACTTAA-AT--A----ATG-----CAACTTAGATAAAC-T---CAAAC---TT---T------------T----TATCAGA--A--A--TTGTACA---ATCATGG-TCAA
gi|21812 : AAACCAGATAAAAT--AGCAAGACACACAATTAAAAAAGACTAT-A--AAGATGGGGGATTAAAAATGATAGAT-TTG---A-----ATGCATATCTAT--ACTCAATAAAAG-CAAGTTGGATCAAA------------AG----AATTTTTAA-C-GAT-G---AA----AATAC---CG--GA-----ATCT--GGAAA--GATAAT--TAT-AT-G-----------AA-T--GA-A-ATTAACAAATTTGGTGG-GAA-ATT-ATTATTACAATC--AAACA-TAACATATAAAGAT-A--TAA-CCAAT----AAATT---CAA-------AAAT-A---T---T---TT---C------------T----TAAGGGA--T--GTTTTACAAA---GT--TGG-GCAAAGGTAAACTTTAATTCGGAAA---TAAC--AAACATCA---C-AGATG--AAAT--------CA-TA-TGGAATAACTCA--TTTATACAA----AAT--AACAATAA---AACA-----ATATTTTATAGAGTATGGC-TGGATAA---AGGAA-T-A-----AAATATA-TTAAACA----AC-T------TTATG---ATT--------ACAGAAATAAGAACTT-TTATA-ATTTT-AATACGATC-AA---ACAACTTTACAATCTAGACAAT
gi|21813 : AAACCAGATAAAAT--AGCAAGACACACAATTAAAAAAGACTAT-A--AAGATGGGGGATTAAAAATGATAGAT-TTG---A-----ATGCATATCTAT--ACTCAATAAAAG-CAAGCTGGATCAAA------------AG----AATTTTTAA-C-GAT-G---AA----AATAC---CG--GA-----ATCT--GGAAA--GATAAT--TAT-AT-G-----------AA-T--GA-A-ATTAACAAATTTGGTGG-GAA-ATT-ATTATT-ACAGTCAAAC-A-TAACATATAAAGAT-A--TAA-CCAAT----AAATT---CAA-------AAAT-A---T---TT--TC---T------------TAAGGTATGT-------T--TTACAAA---GT--TGG-GCAAAGGTAAACTTTAATTCGGAAA---TAAC--AAACATCA---C-AGATG--AAAT--------CA-TA-TGGAATAACTCA--TTTATACAA----AAT--AACAATAA---AACA-----ATATTTTATAGAGTATGGC-TGGATAA---AGGAA-T-A-----AAATATA-TTAAACA----AC-T------TTATG---ATT--------ACAAAAATAAGAACTT-TTATA-ATTTT-AATACGATC-AA---ACAACTTTACAATCTAGACAAT
gi|21814 : AAACCAGATAAAAT--AGCAAGACACACAATTAAAAAAGACTAT-A--AAGATGGGGGATTAAAAATGATAGAT-TTG---A-----ATGCATATCTAT--ACTCAATAAAAG-CAAGTTGGATCAAA------------AG----AATTTTTAA-C-GAT-G---AA----AATAC---CG--GA-----ATCT--GGAAA--GATAAT--TAT-AT-G-----------AA-T--GA-A-ATTAACAAATTTGGTGG-TAA-ATT-ATTATTACAATC--AAACA-TAACATATAAAGAT-A--TAA-CCAAT----AAATT---CAAA---A--AAA----------TT--TT---C------------T----TAAGGGA--T--GTTTTACAAA---GT--TGG-GCAAAGGTAAACTTTAATTCGGAAA---TAAC--AAACATCA---C-AGATG--AAAT--------CA-TA-TGGAATAACTCA--TTTATACAA----AAT--AACAATAA---AACA-----ATATTTTATAGAGTACGGC-TGGATAA---AGGAA-T-A-----AAATATA-TTAAACA----AC-T------TTATG---ATT--------ACAGAAATAAGAACTT-TTATA-ATTTT-AATACGATC-AA---ACAACTTTACAATCTAGACAAT
gi|21815 : AAATAAAGC--GTAAAACTAATATACAAAA-TATTG--AAAATCGTGGTATGAAACTGACAGATATAG---A-----AC---TTTTTATAAATTCAATAAAAG-CAAGTTGGGTTAAA------------AG----A----CTAA-CAGAT-G-A-AA-AT-AATAA---TGAAGA-----A--T--GGAAG--TATATA--AAC-AG-GTCT----TC--AT-T--GG-A-A-----AAATATGGTGG-AAA-CTTCATCTTTGAGGGT--AACTT-TTAG-TTCGAAGAT-AGTTGT-TC--T----ATGTT---TAGT---G--AAAC-G---C---CG--TT---T------------T----TATGTAA--C--A--TAATAGA---ATCATGG-TTCAAAATTAATTTTAATTTTAATA---TTGA--AGATGGTTATCT-AG-TA--AAAC-AAT---ATA-TA-TGGAACAATTTC--TTCATCAAA----AAT--AATGGCAG---ATTA-----TTATTTTACAAATCATGGT-A--ACAAT-TAGGAA-T-T-----AAA-ACA-TTAAATG----ATAT------ATATG---ATT--------CTTGACATATGACATT-TTATA-CTATT-GA-AAGATTAAA---ACAATTATACAATATAAATAAT
gi|21816 : TAG---A-----AC---TTTCTATAAATTCAATTAAAG-CAAGTTGGGTTAAACAAACGCACCAAAC----A----TCAA-CAGAT-G-T-AA-AC-AATAA---AGGCGA-----A--T--GGAAG--AATATA--TAC-CT-GTCT----TC--CA-T--TG-A-A-----AAATATGACGG-AAA-CATCATCTTTGAGAAT--AACTT-TAAT-AGCAAAGAT-GGTTAT-TC--T----ATGTT---CAGC---G--AAAC-G---C---CT--TT---T------------T----TATGCAA--C--A--TAATAAA---ACCATGG-TCAAAAATTAATTTTAACACTAATA---TTGA--AGAT
gi|21817 : ----TTAA-CAGAT-G-T-TA-AC-AATAA---CGGCGA-----A--T--GGAAG--TATATA--TAC-AT-GTCT----TCATAA-T--GG-
gi|21818 : AAT-TTTAACGAT-AGTTGT-TC--T----ATGTT---CAGC---G--AAAC-G---C---CG--TT---T------------A----TTTGTAA--C--A--TAATTGA---ATCATGG-TAAACAATTAATTTTA------------TTGA--AGATGTTTATCT-AC-TA--AAAC-ACT---TCA-TA-TGGAATAATTCT--TTCATAAAA----CAT--AATTGCAG---TTTA-----TTATTTTACAAAGCATGAC-T--ACAGC-TAGGAA-T-A-----AAT-ACA-ATAAATG----ATAT------ATATG---ATT--------GTAG-----AGACATT-TTATA-ATTTT-GA-AAGATTGAT---ACA
gi|21819 : ----TTAA-CAGAT-G-T-TA-AC-AATAA---CGGCGA-----A--T--GGAAG--TATATA--TAC-AT-GTCT----TCATAA-T--GG-
gi|21819 : attgaattttttttaaaaaaagtttaaacgtggatgtgttgctAT--AATGGCAG---TTTA-----TTATTTTACAAAGCATGGC-T--ACAGC-TAGGAA-T-T-----AAA-ACA-ATAAATT----GTAT------ATATG---ATT--------GTAGATACAAGACATT-TTATA-ATTTT-GA-AAGATTAAA---ACAATTGTACAATATAAGTAATcagtttattattttacaaagcatggctacagctaggaattaaaacaataaattgtatatatgattgtagatacaagacattttataattttgaaagattaaaacaattgtacaatataagtaat
gi|21820 : attgaattttttttaaaaaaagtttaaacgtggatgtgttgctttaacagatgttaacaataacggcgaatggaagtatatatacatgtcttcATGG--CAGAATTAAAT---AAAATTAATAGACTTAC--AAGTAATAATC---G-TA--AAAT-AAT---AAAATAATAGAATAATTCTCTTTTATTAAA----AGT--AAC---AT---TTTA-----ATATTTTATTAATCATGGT-T--ACAGC-CAGGAA-T-TA----AAA-ACA-ATAAATGAC--ATAT------ATATG---ATC--------CTGGACACAAGACG-T-TTATC-ATT------------------ACAAGTATGCAATAT-GATAA
gi|21821 : GGAATTTTTCT--TTCATTAAA----AAT--AAAG--AG---TTTA-----TTATTTTATAAATCATGGT-T--GCAGC-AAGGAAAT-T-----GAA-TCA-ATAAATG----ATATATATATATATG---ATT--------CTAGACACAA-ACCTTGTTAAA-CTTTT-GA-AAGATTAAATATACAATATGACAATATGAATAAgtaa
gi|21822 : -TGGGAA-T-T-----AAA-ACA-ATAAATG----ATAT------ATATA---AAT--------CGAGATACAAGGCGTT-TTATT-CTTTT-GA-TAGATTAAA---ACAATTATATAATAACAATAAT
Alignments
lowQualScore : 1 1111111111 11111111111111111111111 111 1111 1111111 2222222222222 1 22222 222222222222222 1111111 11111111111 111111111111 11111111 11111 1
lowQualScore : 1 6 88 1 2 4 8888 1 1 4 5 333 6666666666 2 55 1 1 1 1 44444444444444444444444 3 4 1 000 2222 1111 2 88888888 22 888 77 3 1 0000000 55 1 5555555555555 3 0 2 2 7 0 1 22 6 4 11111 2 000000000000000 333 6666666 2 66666666666 333 000000000000 4444 2 1 44444 55 3 1 333 3 1 1 888 333 0 22 4 22222222 33 333 7777777 2 2 555 33 44444 22 444 9999 55555 2 88 999 2 9999999 2 6 777777 555555 333 888888888 2 3 2 2 6 6 1 333 1
lowQualScore : . . .. . . . .... . . . . ... .......... . .. . . . . ....................... . . . ... .... .... . ........ .. ... .. . . ....... .. . ............. . . . . . . . .. . . ..... . ............... ... ....... . ........... ... ............ .... . . ..... .. . . ... . . . ... ... . .. . ........ .. ... ....... . . ... .. ..... .. ... .... ..... . .. ... . ....... . . ...... ...... ... ......... . . . . . . . ... .
lowQualScore : 1 8 22 0 1 0 7777 0 0 4 4 333 6666666666 9 22 1 1 9 0 44444444444444444444444 5 1 7 555 1111 6666 5 11111111 44 222 22 5 8 1111111 00 8 6666666666666 5 0 0 1 5 6 0 88 0 0 66666 0 222222222222222 555 1111111 0 99999999999 555 222222222222 2222 4 5 11111 55 0 0 555 8 3 9 444 777 3 99 1 88888888 11 222 4444444 2 7 222 99 66666 88 222 7777 00000 1 77 888 0 4444444 0 0 555555 888888 555 222222222 0 0 0 0 3 3 3 999 0
consensus : GAAAACCAGACAAAATNAAGC--GNAAAACAATTATACAAAA-TATTG--AAAACGGNGGTNTAAAAATGATAGATATNG---A-----AC---TNTTTATAAATTCAATTAAAG-CAAGTTGGGTNAAA------------AG----A----TTAA-CAGAT-G-T-AA-AC-AATAA---CGGCGA-----A--T--GGAAG--NATATA--TAC-AT-GTCT----TC--AA-T--GG-A-A-----AAATATGGCGG-AAA-CTTCATCTTTGAGAGT--AACTT-TAAT-TNTAAAGAT-AGTTGT-TC--T----ATGTT---CAAC---G--AAAC-G---C---CG--TT---T------------T----TATGTAA--C--A--TNATAGA---ATCATGG-TCAAAAATAAATTTTAACTCTAATA---TTGA--AGATGTTAATCT-AG-TA--AAAC-AAT---ACA-TA-TGGAATAATTCT--TTCATNAAA----AAT--AACGGCAG---TTTA-----TTATTTTACAAAGCATGGC-T--ACAGC-TAGGAA-T-T-----AAA-ACA-ATAAATG----ATAT------ATATG---ATT--------NTAGACACAAGACGTT-TTATA-ATTTT-GA-AAGATTAAA---ACAATTNTACAATATAAATAAT
Reference ( family-691 ) : GAAAACCAGACAAAATNAAGC--GNAAAACAATTATACAAAA-TATTG--AAAACGGNGGTNTAAAAATGATAGATATNG---A-----AC---TNTTTATAAATTCAATTAAAG-CAAGTTGGGTNAAA------------AG----A----TTAA-CAGAT-G-T-AA-AC-AATAA---CGGCGA-----A--T--GGAAG--NATATA--TAC-AT-GTCT----TC--AA-T--GG-A-A-----AAATATGGCGG-AAA-CTTCATCTTTGAGAGT--AACTT-TAAT-TNTAAAGAT-AGTTGT-TC--T----ATGTT---CAAC---G--AAAC-G---C---CG--TT---T------------T----TATGTAA--C--A--TNATAGA---ATCATGG-TCAAAAATAAATTTTAACTCTAATA---TTGA--AGATGTTAATCT-AG-TA--AAAC-AAT---ACA-TA-TGGAATAATTCT--TTCATNAAA----AAT--AACGGCAG---TTTA-----TTATTTTACAAAGCATGGC-T--ACAGC-TAGGAA-T-T-----AAA-ACA-ATAAATG----ATAT------ATATG---ATT--------NTAGACACAAGACGTT-TTATA-ATTTT-GA-AAGATTAAA---ACAATTNTACAATATAAATAAT
gi|21796 : GAAAACCAGACAAAATTAAGC--GAAAAACAATTATTCAAAA-TATTG--AAAACGGTGGTATGAAGATGATAGATATAG---A-----GC---TTTTTATACATTCAATTAAGG-CAAGTTGGGTTAAA------------CG----A----TTAA-CAGAT-G-T-AA-AC-AATAA---TGGCGA-----A--T--GGAAG--TATACA--TAC-AT-GTCT----TC--AT-T--GG-A-A-----AAATATGGCGG-AAA-CTTCATCTTTGAGAGT--AATTT-TAAT-TTTAAAGAT-AGTTGT-TC--T----ATGTT---CAAC---G--AAAC-G---C---CG--TT---T------------T----TATGTAA--C--A--TTATTGA---ATCATGG-TCAAAAATAAATTTTAACTGTAATA---TTGA--AGATGTTAATCT-AC-TA--AAAC-AGT---ACA-TA-TGGAATAATTCT--TTCATAAAA----CAT--AATGGCAA---TTTA-----TTATTTTACAAAGCATGGC-T--ACAGC-TAGGAA-T-T-----AAA-ACA-ATAAATG----ATAT------ATATG---ATT--------GTAGACACAAGACATT-TTATA-ATTTT-GA-AAGATTAAA---ACAATTGTACAATATAAGTAAT
gi|21797 : GAAAACCAGACAAAATTAAGC--GAAAAACAATTATTCAAAA-TATTG--AAAACGGTGGTATGAAGATGATATATATAG---A-----GC---TTTTTATACATTCAATTAAGG-CAAGTTGGGTTAAA------------CG----A----TTAA-CAGAT-G-T-AA-AC-AATAA---TGGCGA-----A--T--GGAAG--TATATA--TAC-AT-GTCT----TC--AT-T--GG-A-A-----AAATATGGCGG-AAA-CTTCATCTTTGAGAGT--AATTT-TAAT-TTTAAAGAT-AGTTGT-TC--T----ATGTT---CAAC---G--AAAC-G---C---CG--TT---T------------T----TATGTAA--C--A--TTATTGA---ATCATGG-TCAAAAATAAATTTTAACTGTAATA---TTGA--AGATGTTAATCT-AC-TA--AAAC-AGT---ACA-TA-TGGAATAATTCT--TTCATAAAA----CAT--AATGGCAA---TTTA-----TTATTTTACAAAGCATGGC-T--ACAGC-TAGGAA-T-T-----AAA-ACA-ATAAATG----ATAT------ATATG---ATT--------GTAGACACAAGACGTT-TTATA-ATTTT-GA-AAGATTAAA---ACAATTGTACAATATAAGTCAT
gi|21798 : GAAAACCAGATAAAATAAAGC--GTAAAACTATTATACAAAA-TATTG--AAAACGGTGGATTGAAAATGATAGATATAG---A-----AC---TTTTTATAAATTCAATAAAAG-CAAGTTGGGTTAAA------------CG----A----CTAA-CAGAT-G-T-AC-AT-AATAA---TGGCGA-----A--T--GGAAG--TATATA--TAC-AG-GTCT----TC--AC-T--TG-A-A-----AAATATGGTGA-AAA-CTTGATCTTTGATAGT--AATTT-TAAT-TTCGAAAAT-AGTTGT-TC--T----ATGTT---TAAT---G--AAAC-G---C---CG--TT---T------------T----TATGTAA--C--A--TAATATA---ATCATGG-TCCAAAATAAATCTTATCTTT-ATA---TTGA--AGATGGTAATCT-AG-TA--AAAC-CGT---ACA-TA-TGGAACAATTCT--TTCATAAAA----AAT--AATGGCAG---TTTC-----TTATTTTACAAATCATGGT-T--ACAGT-TACGAA-T-T-----AAA-ACA-TTAAATG----ATAT------ATATA---ATT--------CTAGACACAACACATT-TTATA-CTTTT-GA-AAGATTAAA---ACAATTATACAATATAAATAAT
gi|21799 : GAAAACCAGACAAAATTAAGC--GTAAAACAATTATTCAAAA-TACTG--AAAACGGTGGTATGAAGTTGACAGATA--G---A-----GC---TTTTTATACATTCAATCAAGG-CAAGTTTGGTTAAG------------CG----A----TTAA-CAGAT-G-TAAA-AC-AATAA---TGGCGA-----A--T--GGAAG--TATATA--TAC-AT-GTTT----TC---A-T--TG-A-A-----AAATATGACGG-AAA-CTTCATCTTTGCGAGT--AATTT-TATT-TTTAAAGAT-AGTTGT-TC--T----TTGTT---TAGC---G--AAAC-G---C---TA--TT---T------------T----TATATGA--C--A--TTATTGA---ATCATGG-TCAAAAACAAATTTTAACTCTAATA---TTGA--AGATGTTAATCT-AT-CA--AAAC-AGT---ACA-TA-TAGAATAATACT--TTCAT-AAA----CAT--AAAGGCAA---TTTA-----TTATATTACAAAGCATGGC-T--ACAGC-TAAGAA-T-T-----AAA-ACA-ATAACTG----ATAT------ATATG---ATT--------GTAGATACAAGACATT-TTATA-ATTTT-GA-AAGATTAAA---ACAATTGTAC
gi|21800 : GGAAACAAGACAAAGTAAAGC--GTAAACCTATTATA-AAAA-TATTG--AAAACGATGGTATGAAGATGATAGATATAT---A-----AC---GTTTGATACATTCAATAAAAA-CAAGTTGGGTTAAA------------TG----A----CTAA-CAGAT-G-T-AA-AC-AATAA---TGACGA-----A--T--GGAAG--AATATA--TAC-AT-GTCT----TC--AA-T--TG-A-A-----ATTTACGGCGG-AAA-CTTCATCTTTGAGAAT--G---T-TAAT-TGCAAAG-------------------ACGTT---CAGT---G--AAAC-G---C---CA--TT---T------------T----TATGTAA--C--A--TGACGGA---ATCATGT-TTAAAAACTTATTTTAACACTAATA---TTGA--AGATGTTAATTT-AG-TA--AAAC-AAT---ATC-TA-ACGAATAATTAT--TTCACTGAA----AGT--AAAGGCAG---TCAG-----TTATGTTACAAATCATGGT-T--ACAGCATA-GAA-T-GAAAAAAAA-ACA-ATAAATG----ATAT------ATATA---ATT--------CTAGACACAAGGCGTT-TTATA-CTTCT-GA-ATGATT
gi|21801 : AAAACCTGATAAAATAAAAA--GGACAACACTAACTCAAGACTAT-G--AAAATGGAGGTCTAAAAATGATTGATATTG---A-----AA---TGTTCATAAACTCTCTTAAAT-CAAGTTGGATAAAA------------AG----A----TTAC-TTGAT------A-AC-AGTAATTCCGGTCA-----A--T--GGAAAGTCATATATCTAA-AT-AAAC----TC--AA-T-------------AAGTATGGTGGTAAA-C-TCATTTTTGAAAGT--AACTTGCAA----GAAAAAT-A--TGT-TT--TGAAAATGTA---TAA-------AAAC-G---A---TAACTT---T------------C----TAAAGGA--A--A--TCATAAT---ATCATGGACCAAAATTAAA----AAGTTTGATA----GGA--AAATG--AACATAAA-TA--AAGA-AAT---TTT-TA-TGGAATAA--------CA-CAAA----TAT--AACTTTAAAT-CTTAATACGTTATGCTACATTGATTGGT-C--AGAAA-AGGGAA-T-C-----AAATATATACAAA------ACAT------ATATG---ATT--------TTAGAAAAAAAAGATT-TTATA-ATTTCAGC-GAGCTTAAA---AC
gi|21802 : AAAACCTGATAAAATAAAAA--GGACAACACTAACTCAAGACTAT-G--AAAATGGAGGTCTAAAAATGATTGATATTG---A-----AA---TGTTCATAAACTCTCTTAAAT-CAAGTTGGATAAAA------------AG----A----TTAC-TTGAT------A-AC-AGTAATTCCGGTCA-----A--T--GGAAAGTCATATATCTAA-AT-AAAC----TC--AA-T-------------AAGTATGGTGGTAAA-C-TCATTTTTGAAAGT--AACTTGCAA----GAAAAAT-A--TGT-TT--TGAAAATGTA---TAA-------AAAC-G---A---TAACTT---T------------C----TAAAGGA--A--A--TCATAAT---ATCATGGACCAAAATTAAA----AAGTTTGATA----GGA--AAATG--AACATAAA-TA--AAGA-AAT---TTT-TA-TGGAATAA--------CA-CAAA----TAT--AACTTTAAAT-CTTAATACGTTATGCTACATTGATTGGT-C--AGAAA-AGGGAA-T-C-----AAATATATACAAA------ACAT------ATATG---ATT--------TTAGAAAAAAAAGATT-TTATA-ATTTCAGC-GAGCTTAAA---AC
gi|21803 : AAAGCC-GACAAGATCAAAC--GAAAAATA-CTA-ACAAAA--ATTACCAAAACGGTGGTTTAAAAATGATTGATATTAATTA-----AT---TCATTTTA---TCATTCAAAT-CAAGCTGGATAACT------------CG----A----TTAT-TTGAT-G---AA-TCAAACAA---GGGTTT-----A--T--GGAAA--TAAATT--TAT-TT-ATCTAAGATC--AA-T-------------AACTATGGAGGCAAA-C-TAATTTTTGAAAGT--AATTT-
gi|21804 : AAAACCTGATAAAATAAAAA--TGACAACACTAACTCAAGACTAT-G--AAAATGGAGGTCCAAAAATGATTGATATTG---A-----AA---TGTTCATAAACTCTCTTAAAT-CAAGTTGGATAAAA------------AG----A----TTAC-TTGAT------A-AC-AGTAATTCCGGTCA-----A--T--GGAAAGTCATATATCTAA-AT-AAAC----TC--AA-T-------------AAGTATGGTGGTAAA-C-TCATTTTTGAAAGT--AACTT-GCA-----AGAAAA-AGATGT-TT--TGAAAATGTA---TAA-------AAAC-GATAA---CT--TT---C------------T----AAAGGAAATC--A--TAATACATGTATCATGG-ACCAAAATTAA---CAAGTTTGATA----GGA--AAATG--AACATAAA-TA--AAGA-AAT----TT-TA-TGGAATAA--------CA-CAAA----TCT--AACTTTAAATCTTCATACG-TTATGCTACATTGATTGGT-T--AGAAA-AGGGAA-T-C-----AAATATATACAAA------ACAT------ATATG---ATT--------TTAGAAAAAAAAGATT-TTATA-ATTTCAGC-GAACTTAAA---AC
gi|21805 : AAAACCCGACAAGATAAAAC--GTAAAATACTTA--CAAAA-GATTACCAAAACGGTGGTTTAAAAATTATTGATATTG---ATAAATAC---ATTTTA-----TC-ATTAAAATTAAGCTGGATAAAA------------CG----A----TGAT-TTGAT-G---AA-TC-A--AA---CAG-GATTTTTT--T--GGAAA--CAAATT--TAT-TT-TTCT----AA--GA-T--TA-A-T-----AACTATGGAGGCAAA-CTT-ATATTTGAAAGT--AAA-T-TAAC-AGAAAACAA-AATTGTAAA--A----ATGTT---TAA-------AAAT-G---A---CA--CC---T------------T----CTTCTAA--CAAA--TCCTTGT---ATCTTGG-TCTAATATAAA
gi|21806 : AAACCAGACAAAGTTAAAT--GTAAAACTATTATACAAAA-TATTG--AAAACGGTGGTATGAAGATGATAGATATAG---ATAGA-AC---TTTTTATAAATTCAATTAAAG-CAAGTTGGGCTAAA------------CG----A----TTAA-CAGAT-A-T-AA-AC-AATAA---AGGCGC-----A--T--GGAAG--ACTATT--TAC-AT-GTCA----TC--AA-T--TG-A-A-----AAATATGGTGG-AAA-CTTAATCTTTGAGAAT--AACTT-TAAT-TGCAAAGAC-GATAAT-TC--T----ATGTT---TAGC---G--AAAT-GC--C---CT--TT---T------------T----TATGTAA--C--A--TAATAGA---GCCATGG-TCAAAAATTAATTTTAAAACTACTA---TTGA--AGATGTTAATAT-AG-CA--AAAC-AGT---ATA-TA-TGGAATAATTCT--TTCATTAAA----AGT--AAAGGCAG---TTTG-----TTATTTTAC-AAGCATGGT-T--AGAGC-TAGGAG-T-C-----AAA-ACA-ATAAATGATATATAT------ATATG---ATT--------CTAGACACAAGACGTT-TTATA-CTTTT-TA-ACGATTAAA---TCAATTATACAATATTAGTAAT
gi|21807 : AAACCAGATCAAATTAAGC--GTAAA-CTATAATACAAAA-TATTT--AAC-CGGTAGTATGAAAAAGATAGGTATAG---A-----AC---T-TTTATCAATTCAATAAAAG-CAAATTGGGTTAAA------------AG----A----TTAA-CAGAT-G-A-AA-AC-AATAA---TGGCGA-----A--T--GGAAT--AATATA--TAC-AT-GTCT----TC--AG-T------------------TAACGG-AAAACTTCATCTTTGACAGT--AAATT-TAGT-TACAAAAAT-GGTTAT-TC--T----ATGTT---CAGC---G--AAAC-G---C---C---------------------T----GATGTTA--C--A--TAATAGA---ATCATGG-TCAAAAATTAATTGTAACT--AATA---TTGA--AGATATTATTTT-GG-TA--AAAC-AAT---ACA-TA-TGGAATAACTAT--TTCAATAAA----AAT--AAAGACAG---TTTG-----CTACTTTATAAATTATTTT-A--ACAGC-TTGAAA-T-T-----AAA-ATA-ATAAATG----GTAT------ATAAGTATATTTATATATACTAGACACAAGACGTT-TTATA-CTTTT-AA-AATATTAAA---ACAATTATACAATATAAGTAAT
gi|21808 : AAATCTGATAAAATTAGTC--GAAAAACAATAATACAGGA-TGATG--AAAACGGGGGCCTAAAAATGATTGAT-TTA---A-----ACA--TGTTTATAAAAGCAATTAAAG-CAGGATGGGTCAAA------------AG----A----ATAA-TCGATAA-T-AA-A--AATGA---GGGTGA-----T--T--GGAAA--CATATA--TACAAT-AGC-----AC--AT-T--AG-ATA-----AAATA-GGGGG-ACA-ATTAATATTTGAATGT--AA-TT-CAA---ATGAAAAT-GA------C--T----ATATTAAACAAA---A--AAACAA---C---CA--TT---TCCCAAATTTTTCT----TA-GAAA--T--A--T--TGCA---ATCCTGG-TCAAGCATAAACTTTG----TAA-A---TAAACCAGAAGCTGA----AG-GATTAAAC-AATCAGATATTA-TGGAACAACTCT--TATATAAAAAAACAATAAAACGAC--------A-----TTATTTTATAAAGAATGATAT--GCAAA--AGGTA-CAT-----CAA-ACA-A------------AT------ATTTG---ATA--------GTAGGTAAAAAACATT-TTATACATTT
gi|21809 : AAACCAGACAAAATAAGTA--GAAAAACAATTATACAAAA-TAACG--AAAATGGGGGCTTAAAAATGATAGATCT-G---A-----ATA--TGTTTATTAAGTCAATTAAAG-CAGGTTGGGTGAAA------------AGAATTA----TCAACCAGA--G-T-AATAC-A--------GGTGA-----T--TCAGGAAG--CATATA--TAC-ATGGGC------C--AA-CCAGA-A-A-----AAATA-GGAGG-ACC-ATTAATATTTTAATGT--AA-TT-TAA----TAAAAAT-GACT-------T----AAAT-----AAT---G--CAAC-T---C---AG--ATAGAC------------T----CA---GA--A--A--TTGTACA---ATCATGG-TCAAGTATCAATTATAAAGAAAATG---TTGA--ATATATAAAT----------AAACAAAT---AC--TA-TGGAATAATTC---AACATCAAA----AAT--AA
gi|21810 : AAACCGGATAAAATTAATA--GAAAAACAATTATACAAAACTA-CG--AAAATGGGGGTTTAAAAATGATAGATCTGC---A-----AT---TATTTATAAATTCGATTAAAG-CCGGGTGGGTCAAA------------CGT---A----TT-A-TAAAT-GAT-CA-A--AATAA---AGGGGA-----C--T--TGAAA--CACATA--TAC-taataaaacattcttctataa
gi|21811 : AAACCAGACAAAATAAGTA--GAAAGACAATTATACAAAA-TTACG--AAAATGGGGGCTTAAAAATAATAGATCT-G---A-----ATA--TGTTTATTAAGTCAATTAAAG-CAGGTTGGGTGAAA------------AGAATTA----TCAATCAGA--G-T----AC-TACA-----GGTGA-----T--T--GGAAG--CATATA--TACAAG-GGC------C--AACT--AGCA-A-----AAATA-GGAGG-ACC-ATTAATATTTCAGTGT--TATAT-TAA----TAAAAATGACTTAA-AT--A----ATG-----CAACTTAGATAAAC-T---CAAAC---TT---T------------T----TATCAGA--A--A--TTGTACA---ATCATGG-TCAA
gi|21812 : AAACCAGATAAAAT--AGCAAGACACACAATTAAAAAAGACTAT-A--AAGATGGGGGATTAAAAATGATAGAT-TTG---A-----ATGCATATCTAT--ACTCAATAAAAG-CAAGTTGGATCAAA------------AG----AATTTTTAA-C-GAT-G---AA----AATAC---CG--GA-----ATCT--GGAAA--GATAAT--TAT-AT-G-----------AA-T--GA-A-ATTAACAAATTTGGTGG-GAA-ATT-ATTATTACAATC--AAACA-TAACATATAAAGAT-A--TAA-CCAAT----AAATT---CAA-------AAAT-A---T---T---TT---C------------T----TAAGGGA--T--GTTTTACAAA---GT--TGG-GCAAAGGTAAACTTTAATTCGGAAA---TAAC--AAACATCA---C-AGATG--AAAT--------CA-TA-TGGAATAACTCA--TTTATACAA----AAT--AACAATAA---AACA-----ATATTTTATAGAGTATGGC-TGGATAA---AGGAA-T-A-----AAATATA-TTAAACA----AC-T------TTATG---ATT--------ACAGAAATAAGAACTT-TTATA-ATTTT-AATACGATC-AA---ACAACTTTACAATCTAGACAAT
gi|21813 : AAACCAGATAAAAT--AGCAAGACACACAATTAAAAAAGACTAT-A--AAGATGGGGGATTAAAAATGATAGAT-TTG---A-----ATGCATATCTAT--ACTCAATAAAAG-CAAGCTGGATCAAA------------AG----AATTTTTAA-C-GAT-G---AA----AATAC---CG--GA-----ATCT--GGAAA--GATAAT--TAT-AT-G-----------AA-T--GA-A-ATTAACAAATTTGGTGG-GAA-ATT-ATTATT-ACAGTCAAAC-A-TAACATATAAAGAT-A--TAA-CCAAT----AAATT---CAA-------AAAT-A---T---TT--TC---T------------TAAGGTATGT-------T--TTACAAA---GT--TGG-GCAAAGGTAAACTTTAATTCGGAAA---TAAC--AAACATCA---C-AGATG--AAAT--------CA-TA-TGGAATAACTCA--TTTATACAA----AAT--AACAATAA---AACA-----ATATTTTATAGAGTATGGC-TGGATAA---AGGAA-T-A-----AAATATA-TTAAACA----AC-T------TTATG---ATT--------ACAAAAATAAGAACTT-TTATA-ATTTT-AATACGATC-AA---ACAACTTTACAATCTAGACAAT
gi|21814 : AAACCAGATAAAAT--AGCAAGACACACAATTAAAAAAGACTAT-A--AAGATGGGGGATTAAAAATGATAGAT-TTG---A-----ATGCATATCTAT--ACTCAATAAAAG-CAAGTTGGATCAAA------------AG----AATTTTTAA-C-GAT-G---AA----AATAC---CG--GA-----ATCT--GGAAA--GATAAT--TAT-AT-G-----------AA-T--GA-A-ATTAACAAATTTGGTGG-TAA-ATT-ATTATTACAATC--AAACA-TAACATATAAAGAT-A--TAA-CCAAT----AAATT---CAAA---A--AAA----------TT--TT---C------------T----TAAGGGA--T--GTTTTACAAA---GT--TGG-GCAAAGGTAAACTTTAATTCGGAAA---TAAC--AAACATCA---C-AGATG--AAAT--------CA-TA-TGGAATAACTCA--TTTATACAA----AAT--AACAATAA---AACA-----ATATTTTATAGAGTACGGC-TGGATAA---AGGAA-T-A-----AAATATA-TTAAACA----AC-T------TTATG---ATT--------ACAGAAATAAGAACTT-TTATA-ATTTT-AATACGATC-AA---ACAACTTTACAATCTAGACAAT
gi|21815 : AAATAAAGC--GTAAAACTAATATACAAAA-TATTG--AAAATCGTGGTATGAAACTGACAGATATAG---A-----AC---TTTTTATAAATTCAATAAAAG-CAAGTTGGGTTAAA------------AG----A----CTAA-CAGAT-G-A-AA-AT-AATAA---TGAAGA-----A--T--GGAAG--TATATA--AAC-AG-GTCT----TC--AT-T--GG-A-A-----AAATATGGTGG-AAA-CTTCATCTTTGAGGGT--AACTT-TTAG-TTCGAAGAT-AGTTGT-TC--T----ATGTT---TAGT---G--AAAC-G---C---CG--TT---T------------T----TATGTAA--C--A--TAATAGA---ATCATGG-TTCAAAATTAATTTTAATTTTAATA---TTGA--AGATGGTTATCT-AG-TA--AAAC-AAT---ATA-TA-TGGAACAATTTC--TTCATCAAA----AAT--AATGGCAG---ATTA-----TTATTTTACAAATCATGGT-A--ACAAT-TAGGAA-T-T-----AAA-ACA-TTAAATG----ATAT------ATATG---ATT--------CTTGACATATGACATT-TTATA-CTATT-GA-AAGATTAAA---ACAATTATACAATATAAATAAT
gi|21816 : TAG---A-----AC---TTTCTATAAATTCAATTAAAG-CAAGTTGGGTTAAACAAACGCACCAAAC----A----TCAA-CAGAT-G-T-AA-AC-AATAA---AGGCGA-----A--T--GGAAG--AATATA--TAC-CT-GTCT----TC--CA-T--TG-A-A-----AAATATGACGG-AAA-CATCATCTTTGAGAAT--AACTT-TAAT-AGCAAAGAT-GGTTAT-TC--T----ATGTT---CAGC---G--AAAC-G---C---CT--TT---T------------T----TATGCAA--C--A--TAATAAA---ACCATGG-TCAAAAATTAATTTTAACACTAATA---TTGA--AGAT
gi|21817 : ----TTAA-CAGAT-G-T-TA-AC-AATAA---CGGCGA-----A--T--GGAAG--TATATA--TAC-AT-GTCT----TCATAA-T--GG-
gi|21818 : AAT-TTTAACGAT-AGTTGT-TC--T----ATGTT---CAGC---G--AAAC-G---C---CG--TT---T------------A----TTTGTAA--C--A--TAATTGA---ATCATGG-TAAACAATTAATTTTA------------TTGA--AGATGTTTATCT-AC-TA--AAAC-ACT---TCA-TA-TGGAATAATTCT--TTCATAAAA----CAT--AATTGCAG---TTTA-----TTATTTTACAAAGCATGAC-T--ACAGC-TAGGAA-T-A-----AAT-ACA-ATAAATG----ATAT------ATATG---ATT--------GTAG-----AGACATT-TTATA-ATTTT-GA-AAGATTGAT---ACA
gi|21819 : ----TTAA-CAGAT-G-T-TA-AC-AATAA---CGGCGA-----A--T--GGAAG--TATATA--TAC-AT-GTCT----TCATAA-T--GG-
gi|21819 : attgaattttttttaaaaaaagtttaaacgtggatgtgttgctAT--AATGGCAG---TTTA-----TTATTTTACAAAGCATGGC-T--ACAGC-TAGGAA-T-T-----AAA-ACA-ATAAATT----GTAT------ATATG---ATT--------GTAGATACAAGACATT-TTATA-ATTTT-GA-AAGATTAAA---ACAATTGTACAATATAAGTAATcagtttattattttacaaagcatggctacagctaggaattaaaacaataaattgtatatatgattgtagatacaagacattttataattttgaaagattaaaacaattgtacaatataagtaat
gi|21820 : attgaattttttttaaaaaaagtttaaacgtggatgtgttgctttaacagatgttaacaataacggcgaatggaagtatatatacatgtcttcATGG--CAGAATTAAAT---AAAATTAATAGACTTAC--AAGTAATAATC---G-TA--AAAT-AAT---AAAATAATAGAATAATTCTCTTTTATTAAA----AGT--AAC---AT---TTTA-----ATATTTTATTAATCATGGT-T--ACAGC-CAGGAA-T-TA----AAA-ACA-ATAAATGAC--ATAT------ATATG---ATC--------CTGGACACAAGACG-T-TTATC-ATT------------------ACAAGTATGCAATAT-GATAA
gi|21821 : GGAATTTTTCT--TTCATTAAA----AAT--AAAG--AG---TTTA-----TTATTTTATAAATCATGGT-T--GCAGC-AAGGAAAT-T-----GAA-TCA-ATAAATG----ATATATATATATATG---ATT--------CTAGACACAA-ACCTTGTTAAA-CTTTT-GA-AAGATTAAATATACAATATGACAATATGAATAAgtaa
gi|21822 : -TGGGAA-T-T-----AAA-ACA-ATAAATG----ATAT------ATATA---AAT--------CGAGATACAAGGCGTT-TTATT-CTTTT-GA-TAGATTAAA---ACAATTATATAATAACAATAAT
blockSeqs : A T AA A T C TACC T A A A ATT TAAATAC T AC T T T T CAAACGCACCAAACA C A A TA TCA TTCC C TTTTTT CA GTC TC A G TCTAAGA AT C GAAATTAAC C T A T C CA T G CATAT G GATGTTTTGAAA AAA CTTAGAT A ATAACT AGA CCCAAATTTTTC AAGG T T ATC TT T G TGT A A T CTG GAC CC T ACATAAA TT AAA CAGATAT A T TCT TA AAACA AA TGG AATC ATACG A GG CAT A GAAAAA T T TGATAT ATATAT TAT TATATATAC C G G C A T A TAT G
blockSeqs : A A AA T T C TACC T T A A . TAGAAC T AA T A . T AGAATTA T A . AT TAC TTCC C ATC . GTC TC A . TCT AT . GAAATTAAC T T . T G . T G CATAT . TGTTTTGAAA . CG . ATAAC . . . T T CAA TT A T . A A T CTT . . G ACATAAA . AG AAAA . T T TA C . TGG AAT ATACG . GG CT . AT T T TGAC . . G C A . . A T A . A
blockSeqs : A T AA T T C TG T A A A . ATGCA T AC T C . T AGAATTA . A . T AC TTCC C ATC . GTC TC . . TCT . . GAAATTAAC C C . T C . T . CATAT . TGTTTTGAAA . TG . ATAAC . . . T T C . T G . . A T CTC . . T ACATAAA . CG ACA . T T CT A . AGG AAT TACG . GG TT . TA T T TG . . C T A . . A T A . G
blockSeqs : A A . T T C TG T A A T . ATGCA T AC T A . T AGAATTT . A . T AT T C ATC . T . . . TTT . . CAGAAA C T . T C . C . TTTT . ATTGTAAAA . CG . CAAAC . . . T T C . G G . . T T CAC . . T ATCTAC . AG ACA . T T TT C . AGG A . . . CT . T T . TG . . G C G . . . . A . A
blockSeqs : T A . G C C TG A C A T . ATGCA G AA C T . A AGAATTT . T . T AC T T A . T . . . TCT . . AGATA T C . T C . C . TTTC . GTTGTTCT . TG . CCCT . . . A G C . C A . . A T GTT . . T ATCTAG . AA ACA . T T AT A . CTT G . . . AA . T T . TG . . C A A . . . . A . A
blockSeqs : T A . G C C TG A C A T . ACA G AA C T . A AGAATTT . T . T AC T T A . T . . . AAC . . AGCAA T . . T C . T . TTTT . GTTGTTCT . CG . CCG . . . A G C . C A . . A T GTT . . T ATCTAT . AA ATC . C T TA T . CTT A . . . AA . T T . TG . . T A A . . . . A . T
blockSeqs : T C . A C C TG T T A T . ATA C AA C C . A CGTA . T . A AC T T A . A . . . AAC . . GGAA A . . T A . C . TTGC . GTTGTTCT . CG . CCG . . . A G A . A C . . T C GTT . . C ATTTAG . AA TTT . C T TC T . CTT G . . . AA . C . . TG . . T A A . . . . A . T
blockSeqs : C A . G T . TT A C A T . ATA G AA T T . A CGA . T . T AC G T A . T . . . AAC . . TGAA T . . T C . A . CAGA . ATAATTCT . AA . CTA . . . T T A . C G . . A T AAC . . T ATATAG . AA TTT . T T TA T . AGG G . . . CT . C . . CA . . T C G . . . . A . T
blockSeqs : A A . T T . TG T T A A . GC T CA T T . A CGA . T . T AC C C A . C . . . TCT . . TGAA A . . T A . C . TTGC . GTTATTCT . TG . CCA . . . T T C . A G . . T C AGA . . T TTTTGG . AG ATA . C A TA A . AGA G . . . CT . C . . CA . . C C G . . . . A . A
blockSeqs : A T . T T . CG T A A A . AC T AA A T . T CGA . A . T TC A C A . A . . . TCA . . TGAA T . . T C . A . TTAC . CTTAAATA . AA . ACA . . . T T C . A G . . T C TTC . . T ATCTAG . AA ACA . C A TA A . CGA A . . . TT . C . . CA . . G T A . . . . G . G
blockSeqs : T T . T T . CG T A A T . GC G TA G A . T TGA . A . A AC T T A . A . . . TCT . . TAAT C . . T A . T . GTTC . TAACCAAT . TG . CCA . . . T A T . T C . . A C TTC . . T ATCTAC . AA ATA . C A TC A . CAA A . . . CT . T . . TG . . A A C . . . . A . A
blockSeqs : A T . A T . CG G C C G . AC G AA T T . C AGA . C . T AC G T A . C . . . TCT . . TGAA G . . T A . A . TAGC . TAACCAAT . CG . CAG . . . A A A . T C . . C T TTC . . G CAGA . AA TCA . T C TA A . CAA A . . . CT . A . . TG . . A A C . . . . A . T
blockSeqs : G A . A T . TG G T C T . AA A TA G T . G AGA . A . T AC A G A . C . . . TCT . . GGAA A . . T A . C . TTTT . TAACCAAT . CG . TTT . . . T G A . T C . . A T TTT . . T CAGA . AC TT . T T TT A . CAA G . . . CC . A . . TT . . A A C . . . . A . A
blockSeqs : A T . A A . G G T C T . AA G AA C T . C CGA . A . T AT C T A . C . . . TCT . . TGAA A . . T C . A . AT . GTTGTTCT . . . CCG . . . A T T . T A . . A T CAC . . A CAGA . AA AC . T T TT A . TGG G . . . CA . A . . TG . . C C A . . . . . .
blockSeqs : A A . A A . G G T A T . AT A AA C T . G AGA . A . . AC C A T . C . . . TCT . . . T . . A C . C . G . GTTATTCT . . . CCT . . . T G T . T A . . A T AAT . . . ATCG . . CA . T . T A . TTG G . . . A . T . . TG . . G T A . . . . . .
blockSeqs : A A . A A . G G T . A . AA A A C A . C CGA . A . . AC C C T . G . . . GC . . . T . . . . . C . G . GTTGTTCT . . . CCG . . . T T C . A A . . T . CT . . . AAG . . CA . . . C C . TGG T . . . . . A . . . . . G C A . . . . . .
blockSeqs : A . . A T . A G T . A . AC A . T A . C CGA . A . . AC T C C . G . . . GC . . . T . . . . . . . T . ACTT . . . CC . . . T C C . A G . . T . . . . . AT . . CA . . . C A . AG G . . . . . T . . . . . C C G . . . . . .
blockSeqs : . . . A . . A G T . . . AT T . T A . C AGA . A . . A A C T . G . . . GC . . . T . . . . . . . T . ACT . . . TT . . . . T C . A A . . T . . . . . . C A . C . . . . . . T . . . . . C T C . . . .
blockSeqs : . . T . . A T A . . . AC T . . A . T AGA . A . . A C . A . T . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . G . . A . . T . . . . . C . G . .
blockSeqs : . . AC . . . T . T AGA . . . . . C . A . A . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . T . .
blockSeqCons :
originalCons : GAAAACCAGACAAAATNAAGC--GNAAAACAATTATACAAAA-TATTG--AAAACGGNGGTNTAAAAATGATAGATATNG---A-----AC---TNTTTATAAATTCAATTAAAG-CAAGTTGGGTNAAA------------AG----A----TTAA-CAGAT-G-T-AA-AC-AATAA---CGGCGA-----A--T--GGAAG--NATATA--TAC-AT-GTCT----TC--AA-T--GG-A-A-----AAATATGGCGG-AAA-CTTCATCTTTGAGAGT--AACTT-TAAT-TNTAAAGAT-AGTTGT-TC--T----ATGTT---CAAC---G--AAAC-G---C---CG--TT---T------------T----TATGTAA--C--A--TNATAGA---ATCATGG-TCAAAAATAAATTTTAACTCTAATA---TTGA--AGATGTTAATCT-AG-TA--AAAC-AAT---ACA-TA-TGGAATAATTCT--TTCATNAAA----AAT--AACGGCAG---TTTA-----TTATTTTACAAAGCATGGC-T--ACAGC-TAGGAA-T-T-----AAA-ACA-ATAAATG----ATAT------ATATG---ATT--------NTAGACACAAGACGTT-TTATA-ATTTT-GA-AAGATTAAA---ACAATTNTACAATATAAATAAT
finalCons : GAAAACCAGACAAAATNAAGC--GNAAAACAATTATACAAAA-TATTG--AAAACGGNGGTNTAAAAATGATAGATATNG---A-----AC---TNTTTATAAATTCAATTAAAG-CAAGTTGGGTNAAA------------AG----A----TTAA-CAGAT-G-T-AA-AC-AATAA---CGGCGA-----A--T--GGAAG--NATATA--TAC-AT-GTCT----TC--AA-T--GG-A-A-----AAATATGGCGG-AAA-CTTCATCTTTGAGAGT--AACTT-TAAT-TNTAAAGAT-AGTTGT-TC--T----ATGTT---CAAC---G--AAAC-G---C---CG--TT---T------------T----TATGTAA--C--A--TNATAGA---ATCATGG-TCAAAAATAAATTTTAACTCTAATA---TTGA--AGATGTTAATCT-AG-TA--AAAC-AAT---ACA-TA-TGGAATAATTCT--TTCATNAAA----AAT--AACGGCAG---TTTA-----TTATTTTACAAAGCATGGC-T--ACAGC-TAGGAA-T-T-----AAA-ACA-ATAAATG----ATAT------ATATG---ATT--------NTAGACACAAGACGTT-TTATA-ATTTT-GA-AAGATTAAA---ACAATTNTACAATATAAATAAT
Alignments
lowQualScore : 1 1111111111 11111111111111111111111 111 1111 1111111 2222222222222 1 22222 222222222222222 1111111 11111111111 111111111111 11111111 11111 1
lowQualScore : 1 6 88 1 2 4 8888 1 1 4 5 333 6666666666 2 55 1 1 1 1 44444444444444444444444 3 4 1 000 2222 1111 2 88888888 22 888 77 3 1 0000000 55 1 5555555555555 3 0 2 2 7 0 1 22 6 4 11111 2 000000000000000 333 6666666 2 66666666666 333 000000000000 4444 2 1 44444 55 3 1 333 3 1 1 888 333 0 22 4 22222222 33 333 7777777 2 2 555 33 44444 22 444 9999 55555 2 88 999 2 9999999 2 6 777777 555555 333 888888888 2 3 2 2 6 6 1 333 1
lowQualScore : . . .. . . . .... . . . . ... .......... . .. . . . . ....................... . . . ... .... .... . ........ .. ... .. . . ....... .. . ............. . . . . . . . .. . . ..... . ............... ... ....... . ........... ... ............ .... . . ..... .. . . ... . . . ... ... . .. . ........ .. ... ....... . . ... .. ..... .. ... .... ..... . .. ... . ....... . . ...... ...... ... ......... . . . . . . . ... .
lowQualScore : 1 8 22 0 1 0 7777 0 0 4 4 333 6666666666 9 22 1 1 9 0 44444444444444444444444 5 1 7 555 1111 6666 5 11111111 44 222 22 5 8 1111111 00 8 6666666666666 5 0 0 1 5 6 0 88 0 0 66666 0 222222222222222 555 1111111 0 99999999999 555 222222222222 2222 4 5 11111 55 0 0 555 8 3 9 444 777 3 99 1 88888888 11 222 4444444 2 7 222 99 66666 88 222 7777 00000 1 77 888 0 4444444 0 0 555555 888888 555 222222222 0 0 0 0 3 3 3 999 0
consensus : GAAAACCAGACAAAATNAAGC--GNAAAACAATTATACAAAA-TATTG--AAAACGGNGGTNTAAAAATGATAGATATNG---A-----AC---TNTTTATAAATTCAATTAAAG-CAAGTTGGGTNAAA------------AG----A----TTAA-CAGAT-G-T-AA-AC-AATAA---CGGCGA-----A--T--GGAAG--NATATA--TAC-AT-GTCT----TC--AA-T--GG-A-A-----AAATATGGCGG-AAA-CTTCATCTTTGAGAGT--AACTT-TAAT-TNTAAAGAT-AGTTGT-TC--T----ATGTT---CAAC---G--AAAC-G---C---CG--TT---T------------T----TATGTAA--C--A--TNATAGA---ATCATGG-TCAAAAATAAATTTTAACTCTAATA---TTGA--AGATGTTAATCT-AG-TA--AAAC-AAT---ACA-TA-TGGAATAATTCT--TTCATNAAA----AAT--AACGGCAG---TTTA-----TTATTTTACAAAGCATGGC-T--ACAGC-TAGGAA-T-T-----AAA-ACA-ATAAATG----ATAT------ATATG---ATT--------NTAGACACAAGACGTT-TTATA-ATTTT-GA-AAGATTAAA---ACAATTNTACAATATAAATAAT
Reference ( family-691 ) : GAAAACCAGACAAAATNAAGC--GNAAAACAATTATACAAAA-TATTG--AAAACGGNGGTNTAAAAATGATAGATATNG---A-----AC---TNTTTATAAATTCAATTAAAG-CAAGTTGGGTNAAA------------AG----A----TTAA-CAGAT-G-T-AA-AC-AATAA---CGGCGA-----A--T--GGAAG--NATATA--TAC-AT-GTCT----TC--AA-T--GG-A-A-----AAATATGGCGG-AAA-CTTCATCTTTGAGAGT--AACTT-TAAT-TNTAAAGAT-AGTTGT-TC--T----ATGTT---CAAC---G--AAAC-G---C---CG--TT---T------------T----TATGTAA--C--A--TNATAGA---ATCATGG-TCAAAAATAAATTTTAACTCTAATA---TTGA--AGATGTTAATCT-AG-TA--AAAC-AAT---ACA-TA-TGGAATAATTCT--TTCATNAAA----AAT--AACGGCAG---TTTA-----TTATTTTACAAAGCATGGC-T--ACAGC-TAGGAA-T-T-----AAA-ACA-ATAAATG----ATAT------ATATG---ATT--------NTAGACACAAGACGTT-TTATA-ATTTT-GA-AAGATTAAA---ACAATTNTACAATATAAATAAT
gi|21796 : GAAAACCAGACAAAATTAAGC--GAAAAACAATTATTCAAAA-TATTG--AAAACGGTGGTATGAAGATGATAGATATAG---A-----GC---TTTTTATACATTCAATTAAGG-CAAGTTGGGTTAAA------------CG----A----TTAA-CAGAT-G-T-AA-AC-AATAA---TGGCGA-----A--T--GGAAG--TATACA--TAC-AT-GTCT----TC--AT-T--GG-A-A-----AAATATGGCGG-AAA-CTTCATCTTTGAGAGT--AATTT-TAAT-TTTAAAGAT-AGTTGT-TC--T----ATGTT---CAAC---G--AAAC-G---C---CG--TT---T------------T----TATGTAA--C--A--TTATTGA---ATCATGG-TCAAAAATAAATTTTAACTGTAATA---TTGA--AGATGTTAATCT-AC-TA--AAAC-AGT---ACA-TA-TGGAATAATTCT--TTCATAAAA----CAT--AATGGCAA---TTTA-----TTATTTTACAAAGCATGGC-T--ACAGC-TAGGAA-T-T-----AAA-ACA-ATAAATG----ATAT------ATATG---ATT--------GTAGACACAAGACATT-TTATA-ATTTT-GA-AAGATTAAA---ACAATTGTACAATATAAGTAAT
gi|21797 : GAAAACCAGACAAAATTAAGC--GAAAAACAATTATTCAAAA-TATTG--AAAACGGTGGTATGAAGATGATATATATAG---A-----GC---TTTTTATACATTCAATTAAGG-CAAGTTGGGTTAAA------------CG----A----TTAA-CAGAT-G-T-AA-AC-AATAA---TGGCGA-----A--T--GGAAG--TATATA--TAC-AT-GTCT----TC--AT-T--GG-A-A-----AAATATGGCGG-AAA-CTTCATCTTTGAGAGT--AATTT-TAAT-TTTAAAGAT-AGTTGT-TC--T----ATGTT---CAAC---G--AAAC-G---C---CG--TT---T------------T----TATGTAA--C--A--TTATTGA---ATCATGG-TCAAAAATAAATTTTAACTGTAATA---TTGA--AGATGTTAATCT-AC-TA--AAAC-AGT---ACA-TA-TGGAATAATTCT--TTCATAAAA----CAT--AATGGCAA---TTTA-----TTATTTTACAAAGCATGGC-T--ACAGC-TAGGAA-T-T-----AAA-ACA-ATAAATG----ATAT------ATATG---ATT--------GTAGACACAAGACGTT-TTATA-ATTTT-GA-AAGATTAAA---ACAATTGTACAATATAAGTCAT
gi|21798 : GAAAACCAGATAAAATAAAGC--GTAAAACTATTATACAAAA-TATTG--AAAACGGTGGATTGAAAATGATAGATATAG---A-----AC---TTTTTATAAATTCAATAAAAG-CAAGTTGGGTTAAA------------CG----A----CTAA-CAGAT-G-T-AC-AT-AATAA---TGGCGA-----A--T--GGAAG--TATATA--TAC-AG-GTCT----TC--AC-T--TG-A-A-----AAATATGGTGA-AAA-CTTGATCTTTGATAGT--AATTT-TAAT-TTCGAAAAT-AGTTGT-TC--T----ATGTT---TAAT---G--AAAC-G---C---CG--TT---T------------T----TATGTAA--C--A--TAATATA---ATCATGG-TCCAAAATAAATCTTATCTTT-ATA---TTGA--AGATGGTAATCT-AG-TA--AAAC-CGT---ACA-TA-TGGAACAATTCT--TTCATAAAA----AAT--AATGGCAG---TTTC-----TTATTTTACAAATCATGGT-T--ACAGT-TACGAA-T-T-----AAA-ACA-TTAAATG----ATAT------ATATA---ATT--------CTAGACACAACACATT-TTATA-CTTTT-GA-AAGATTAAA---ACAATTATACAATATAAATAAT
gi|21799 : GAAAACCAGACAAAATTAAGC--GTAAAACAATTATTCAAAA-TACTG--AAAACGGTGGTATGAAGTTGACAGATA--G---A-----GC---TTTTTATACATTCAATCAAGG-CAAGTTTGGTTAAG------------CG----A----TTAA-CAGAT-G-TAAA-AC-AATAA---TGGCGA-----A--T--GGAAG--TATATA--TAC-AT-GTTT----TC---A-T--TG-A-A-----AAATATGACGG-AAA-CTTCATCTTTGCGAGT--AATTT-TATT-TTTAAAGAT-AGTTGT-TC--T----TTGTT---TAGC---G--AAAC-G---C---TA--TT---T------------T----TATATGA--C--A--TTATTGA---ATCATGG-TCAAAAACAAATTTTAACTCTAATA---TTGA--AGATGTTAATCT-AT-CA--AAAC-AGT---ACA-TA-TAGAATAATACT--TTCAT-AAA----CAT--AAAGGCAA---TTTA-----TTATATTACAAAGCATGGC-T--ACAGC-TAAGAA-T-T-----AAA-ACA-ATAACTG----ATAT------ATATG---ATT--------GTAGATACAAGACATT-TTATA-ATTTT-GA-AAGATTAAA---ACAATTGTAC
gi|21800 : GGAAACAAGACAAAGTAAAGC--GTAAACCTATTATA-AAAA-TATTG--AAAACGATGGTATGAAGATGATAGATATAT---A-----AC---GTTTGATACATTCAATAAAAA-CAAGTTGGGTTAAA------------TG----A----CTAA-CAGAT-G-T-AA-AC-AATAA---TGACGA-----A--T--GGAAG--AATATA--TAC-AT-GTCT----TC--AA-T--TG-A-A-----ATTTACGGCGG-AAA-CTTCATCTTTGAGAAT--G---T-TAAT-TGCAAAG-------------------ACGTT---CAGT---G--AAAC-G---C---CA--TT---T------------T----TATGTAA--C--A--TGACGGA---ATCATGT-TTAAAAACTTATTTTAACACTAATA---TTGA--AGATGTTAATTT-AG-TA--AAAC-AAT---ATC-TA-ACGAATAATTAT--TTCACTGAA----AGT--AAAGGCAG---TCAG-----TTATGTTACAAATCATGGT-T--ACAGCATA-GAA-T-GAAAAAAAA-ACA-ATAAATG----ATAT------ATATA---ATT--------CTAGACACAAGGCGTT-TTATA-CTTCT-GA-ATGATT
gi|21801 : AAAACCTGATAAAATAAAAA--GGACAACACTAACTCAAGACTAT-G--AAAATGGAGGTCTAAAAATGATTGATATTG---A-----AA---TGTTCATAAACTCTCTTAAAT-CAAGTTGGATAAAA------------AG----A----TTAC-TTGAT------A-AC-AGTAATTCCGGTCA-----A--T--GGAAAGTCATATATCTAA-AT-AAAC----TC--AA-T-------------AAGTATGGTGGTAAA-C-TCATTTTTGAAAGT--AACTTGCAA----GAAAAAT-A--TGT-TT--TGAAAATGTA---TAA-------AAAC-G---A---TAACTT---T------------C----TAAAGGA--A--A--TCATAAT---ATCATGGACCAAAATTAAA----AAGTTTGATA----GGA--AAATG--AACATAAA-TA--AAGA-AAT---TTT-TA-TGGAATAA--------CA-CAAA----TAT--AACTTTAAAT-CTTAATACGTTATGCTACATTGATTGGT-C--AGAAA-AGGGAA-T-C-----AAATATATACAAA------ACAT------ATATG---ATT--------TTAGAAAAAAAAGATT-TTATA-ATTTCAGC-GAGCTTAAA---AC
gi|21802 : AAAACCTGATAAAATAAAAA--GGACAACACTAACTCAAGACTAT-G--AAAATGGAGGTCTAAAAATGATTGATATTG---A-----AA---TGTTCATAAACTCTCTTAAAT-CAAGTTGGATAAAA------------AG----A----TTAC-TTGAT------A-AC-AGTAATTCCGGTCA-----A--T--GGAAAGTCATATATCTAA-AT-AAAC----TC--AA-T-------------AAGTATGGTGGTAAA-C-TCATTTTTGAAAGT--AACTTGCAA----GAAAAAT-A--TGT-TT--TGAAAATGTA---TAA-------AAAC-G---A---TAACTT---T------------C----TAAAGGA--A--A--TCATAAT---ATCATGGACCAAAATTAAA----AAGTTTGATA----GGA--AAATG--AACATAAA-TA--AAGA-AAT---TTT-TA-TGGAATAA--------CA-CAAA----TAT--AACTTTAAAT-CTTAATACGTTATGCTACATTGATTGGT-C--AGAAA-AGGGAA-T-C-----AAATATATACAAA------ACAT------ATATG---ATT--------TTAGAAAAAAAAGATT-TTATA-ATTTCAGC-GAGCTTAAA---AC
gi|21803 : AAAGCC-GACAAGATCAAAC--GAAAAATA-CTA-ACAAAA--ATTACCAAAACGGTGGTTTAAAAATGATTGATATTAATTA-----AT---TCATTTTA---TCATTCAAAT-CAAGCTGGATAACT------------CG----A----TTAT-TTGAT-G---AA-TCAAACAA---GGGTTT-----A--T--GGAAA--TAAATT--TAT-TT-ATCTAAGATC--AA-T-------------AACTATGGAGGCAAA-C-TAATTTTTGAAAGT--AATTT-
gi|21804 : AAAACCTGATAAAATAAAAA--TGACAACACTAACTCAAGACTAT-G--AAAATGGAGGTCCAAAAATGATTGATATTG---A-----AA---TGTTCATAAACTCTCTTAAAT-CAAGTTGGATAAAA------------AG----A----TTAC-TTGAT------A-AC-AGTAATTCCGGTCA-----A--T--GGAAAGTCATATATCTAA-AT-AAAC----TC--AA-T-------------AAGTATGGTGGTAAA-C-TCATTTTTGAAAGT--AACTT-GCA-----AGAAAA-AGATGT-TT--TGAAAATGTA---TAA-------AAAC-GATAA---CT--TT---C------------T----AAAGGAAATC--A--TAATACATGTATCATGG-ACCAAAATTAA---CAAGTTTGATA----GGA--AAATG--AACATAAA-TA--AAGA-AAT----TT-TA-TGGAATAA--------CA-CAAA----TCT--AACTTTAAATCTTCATACG-TTATGCTACATTGATTGGT-T--AGAAA-AGGGAA-T-C-----AAATATATACAAA------ACAT------ATATG---ATT--------TTAGAAAAAAAAGATT-TTATA-ATTTCAGC-GAACTTAAA---AC
gi|21805 : AAAACCCGACAAGATAAAAC--GTAAAATACTTA--CAAAA-GATTACCAAAACGGTGGTTTAAAAATTATTGATATTG---ATAAATAC---ATTTTA-----TC-ATTAAAATTAAGCTGGATAAAA------------CG----A----TGAT-TTGAT-G---AA-TC-A--AA---CAG-GATTTTTT--T--GGAAA--CAAATT--TAT-TT-TTCT----AA--GA-T--TA-A-T-----AACTATGGAGGCAAA-CTT-ATATTTGAAAGT--AAA-T-TAAC-AGAAAACAA-AATTGTAAA--A----ATGTT---TAA-------AAAT-G---A---CA--CC---T------------T----CTTCTAA--CAAA--TCCTTGT---ATCTTGG-TCTAATATAAA
gi|21806 : AAACCAGACAAAGTTAAAT--GTAAAACTATTATACAAAA-TATTG--AAAACGGTGGTATGAAGATGATAGATATAG---ATAGA-AC---TTTTTATAAATTCAATTAAAG-CAAGTTGGGCTAAA------------CG----A----TTAA-CAGAT-A-T-AA-AC-AATAA---AGGCGC-----A--T--GGAAG--ACTATT--TAC-AT-GTCA----TC--AA-T--TG-A-A-----AAATATGGTGG-AAA-CTTAATCTTTGAGAAT--AACTT-TAAT-TGCAAAGAC-GATAAT-TC--T----ATGTT---TAGC---G--AAAT-GC--C---CT--TT---T------------T----TATGTAA--C--A--TAATAGA---GCCATGG-TCAAAAATTAATTTTAAAACTACTA---TTGA--AGATGTTAATAT-AG-CA--AAAC-AGT---ATA-TA-TGGAATAATTCT--TTCATTAAA----AGT--AAAGGCAG---TTTG-----TTATTTTAC-AAGCATGGT-T--AGAGC-TAGGAG-T-C-----AAA-ACA-ATAAATGATATATAT------ATATG---ATT--------CTAGACACAAGACGTT-TTATA-CTTTT-TA-ACGATTAAA---TCAATTATACAATATTAGTAAT
gi|21807 : AAACCAGATCAAATTAAGC--GTAAA-CTATAATACAAAA-TATTT--AAC-CGGTAGTATGAAAAAGATAGGTATAG---A-----AC---T-TTTATCAATTCAATAAAAG-CAAATTGGGTTAAA------------AG----A----TTAA-CAGAT-G-A-AA-AC-AATAA---TGGCGA-----A--T--GGAAT--AATATA--TAC-AT-GTCT----TC--AG-T------------------TAACGG-AAAACTTCATCTTTGACAGT--AAATT-TAGT-TACAAAAAT-GGTTAT-TC--T----ATGTT---CAGC---G--AAAC-G---C---C---------------------T----GATGTTA--C--A--TAATAGA---ATCATGG-TCAAAAATTAATTGTAACT--AATA---TTGA--AGATATTATTTT-GG-TA--AAAC-AAT---ACA-TA-TGGAATAACTAT--TTCAATAAA----AAT--AAAGACAG---TTTG-----CTACTTTATAAATTATTTT-A--ACAGC-TTGAAA-T-T-----AAA-ATA-ATAAATG----GTAT------ATAAGTATATTTATATATACTAGACACAAGACGTT-TTATA-CTTTT-AA-AATATTAAA---ACAATTATACAATATAAGTAAT
gi|21808 : AAATCTGATAAAATTAGTC--GAAAAACAATAATACAGGA-TGATG--AAAACGGGGGCCTAAAAATGATTGAT-TTA---A-----ACA--TGTTTATAAAAGCAATTAAAG-CAGGATGGGTCAAA------------AG----A----ATAA-TCGATAA-T-AA-A--AATGA---GGGTGA-----T--T--GGAAA--CATATA--TACAAT-AGC-----AC--AT-T--AG-ATA-----AAATA-GGGGG-ACA-ATTAATATTTGAATGT--AA-TT-CAA---ATGAAAAT-GA------C--T----ATATTAAACAAA---A--AAACAA---C---CA--TT---TCCCAAATTTTTCT----TA-GAAA--T--A--T--TGCA---ATCCTGG-TCAAGCATAAACTTTG----TAA-A---TAAACCAGAAGCTGA----AG-GATTAAAC-AATCAGATATTA-TGGAACAACTCT--TATATAAAAAAACAATAAAACGAC--------A-----TTATTTTATAAAGAATGATAT--GCAAA--AGGTA-CAT-----CAA-ACA-A------------AT------ATTTG---ATA--------GTAGGTAAAAAACATT-TTATACATTT
gi|21809 : AAACCAGACAAAATAAGTA--GAAAAACAATTATACAAAA-TAACG--AAAATGGGGGCTTAAAAATGATAGATCT-G---A-----ATA--TGTTTATTAAGTCAATTAAAG-CAGGTTGGGTGAAA------------AGAATTA----TCAACCAGA--G-T-AATAC-A--------GGTGA-----T--TCAGGAAG--CATATA--TAC-ATGGGC------C--AA-CCAGA-A-A-----AAATA-GGAGG-ACC-ATTAATATTTTAATGT--AA-TT-TAA----TAAAAAT-GACT-------T----AAAT-----AAT---G--CAAC-T---C---AG--ATAGAC------------T----CA---GA--A--A--TTGTACA---ATCATGG-TCAAGTATCAATTATAAAGAAAATG---TTGA--ATATATAAAT----------AAACAAAT---AC--TA-TGGAATAATTC---AACATCAAA----AAT--AA
gi|21810 : AAACCGGATAAAATTAATA--GAAAAACAATTATACAAAACTA-CG--AAAATGGGGGTTTAAAAATGATAGATCTGC---A-----AT---TATTTATAAATTCGATTAAAG-CCGGGTGGGTCAAA------------CGT---A----TT-A-TAAAT-GAT-CA-A--AATAA---AGGGGA-----C--T--TGAAA--CACATA--TAC-taataaaacattcttctataa
gi|21811 : AAACCAGACAAAATAAGTA--GAAAGACAATTATACAAAA-TTACG--AAAATGGGGGCTTAAAAATAATAGATCT-G---A-----ATA--TGTTTATTAAGTCAATTAAAG-CAGGTTGGGTGAAA------------AGAATTA----TCAATCAGA--G-T----AC-TACA-----GGTGA-----T--T--GGAAG--CATATA--TACAAG-GGC------C--AACT--AGCA-A-----AAATA-GGAGG-ACC-ATTAATATTTCAGTGT--TATAT-TAA----TAAAAATGACTTAA-AT--A----ATG-----CAACTTAGATAAAC-T---CAAAC---TT---T------------T----TATCAGA--A--A--TTGTACA---ATCATGG-TCAA
gi|21812 : AAACCAGATAAAAT--AGCAAGACACACAATTAAAAAAGACTAT-A--AAGATGGGGGATTAAAAATGATAGAT-TTG---A-----ATGCATATCTAT--ACTCAATAAAAG-CAAGTTGGATCAAA------------AG----AATTTTTAA-C-GAT-G---AA----AATAC---CG--GA-----ATCT--GGAAA--GATAAT--TAT-AT-G-----------AA-T--GA-A-ATTAACAAATTTGGTGG-GAA-ATT-ATTATTACAATC--AAACA-TAACATATAAAGAT-A--TAA-CCAAT----AAATT---CAA-------AAAT-A---T---T---TT---C------------T----TAAGGGA--T--GTTTTACAAA---GT--TGG-GCAAAGGTAAACTTTAATTCGGAAA---TAAC--AAACATCA---C-AGATG--AAAT--------CA-TA-TGGAATAACTCA--TTTATACAA----AAT--AACAATAA---AACA-----ATATTTTATAGAGTATGGC-TGGATAA---AGGAA-T-A-----AAATATA-TTAAACA----AC-T------TTATG---ATT--------ACAGAAATAAGAACTT-TTATA-ATTTT-AATACGATC-AA---ACAACTTTACAATCTAGACAAT
gi|21813 : AAACCAGATAAAAT--AGCAAGACACACAATTAAAAAAGACTAT-A--AAGATGGGGGATTAAAAATGATAGAT-TTG---A-----ATGCATATCTAT--ACTCAATAAAAG-CAAGCTGGATCAAA------------AG----AATTTTTAA-C-GAT-G---AA----AATAC---CG--GA-----ATCT--GGAAA--GATAAT--TAT-AT-G-----------AA-T--GA-A-ATTAACAAATTTGGTGG-GAA-ATT-ATTATT-ACAGTCAAAC-A-TAACATATAAAGAT-A--TAA-CCAAT----AAATT---CAA-------AAAT-A---T---TT--TC---T------------TAAGGTATGT-------T--TTACAAA---GT--TGG-GCAAAGGTAAACTTTAATTCGGAAA---TAAC--AAACATCA---C-AGATG--AAAT--------CA-TA-TGGAATAACTCA--TTTATACAA----AAT--AACAATAA---AACA-----ATATTTTATAGAGTATGGC-TGGATAA---AGGAA-T-A-----AAATATA-TTAAACA----AC-T------TTATG---ATT--------ACAAAAATAAGAACTT-TTATA-ATTTT-AATACGATC-AA---ACAACTTTACAATCTAGACAAT
gi|21814 : AAACCAGATAAAAT--AGCAAGACACACAATTAAAAAAGACTAT-A--AAGATGGGGGATTAAAAATGATAGAT-TTG---A-----ATGCATATCTAT--ACTCAATAAAAG-CAAGTTGGATCAAA------------AG----AATTTTTAA-C-GAT-G---AA----AATAC---CG--GA-----ATCT--GGAAA--GATAAT--TAT-AT-G-----------AA-T--GA-A-ATTAACAAATTTGGTGG-TAA-ATT-ATTATTACAATC--AAACA-TAACATATAAAGAT-A--TAA-CCAAT----AAATT---CAAA---A--AAA----------TT--TT---C------------T----TAAGGGA--T--GTTTTACAAA---GT--TGG-GCAAAGGTAAACTTTAATTCGGAAA---TAAC--AAACATCA---C-AGATG--AAAT--------CA-TA-TGGAATAACTCA--TTTATACAA----AAT--AACAATAA---AACA-----ATATTTTATAGAGTACGGC-TGGATAA---AGGAA-T-A-----AAATATA-TTAAACA----AC-T------TTATG---ATT--------ACAGAAATAAGAACTT-TTATA-ATTTT-AATACGATC-AA---ACAACTTTACAATCTAGACAAT
gi|21815 : AAATAAAGC--GTAAAACTAATATACAAAA-TATTG--AAAATCGTGGTATGAAACTGACAGATATAG---A-----AC---TTTTTATAAATTCAATAAAAG-CAAGTTGGGTTAAA------------AG----A----CTAA-CAGAT-G-A-AA-AT-AATAA---TGAAGA-----A--T--GGAAG--TATATA--AAC-AG-GTCT----TC--AT-T--GG-A-A-----AAATATGGTGG-AAA-CTTCATCTTTGAGGGT--AACTT-TTAG-TTCGAAGAT-AGTTGT-TC--T----ATGTT---TAGT---G--AAAC-G---C---CG--TT---T------------T----TATGTAA--C--A--TAATAGA---ATCATGG-TTCAAAATTAATTTTAATTTTAATA---TTGA--AGATGGTTATCT-AG-TA--AAAC-AAT---ATA-TA-TGGAACAATTTC--TTCATCAAA----AAT--AATGGCAG---ATTA-----TTATTTTACAAATCATGGT-A--ACAAT-TAGGAA-T-T-----AAA-ACA-TTAAATG----ATAT------ATATG---ATT--------CTTGACATATGACATT-TTATA-CTATT-GA-AAGATTAAA---ACAATTATACAATATAAATAAT
gi|21816 : TAG---A-----AC---TTTCTATAAATTCAATTAAAG-CAAGTTGGGTTAAACAAACGCACCAAAC----A----TCAA-CAGAT-G-T-AA-AC-AATAA---AGGCGA-----A--T--GGAAG--AATATA--TAC-CT-GTCT----TC--CA-T--TG-A-A-----AAATATGACGG-AAA-CATCATCTTTGAGAAT--AACTT-TAAT-AGCAAAGAT-GGTTAT-TC--T----ATGTT---CAGC---G--AAAC-G---C---CT--TT---T------------T----TATGCAA--C--A--TAATAAA---ACCATGG-TCAAAAATTAATTTTAACACTAATA---TTGA--AGAT
gi|21817 : ----TTAA-CAGAT-G-T-TA-AC-AATAA---CGGCGA-----A--T--GGAAG--TATATA--TAC-AT-GTCT----TCATAA-T--GG-
gi|21818 : AAT-TTTAACGAT-AGTTGT-TC--T----ATGTT---CAGC---G--AAAC-G---C---CG--TT---T------------A----TTTGTAA--C--A--TAATTGA---ATCATGG-TAAACAATTAATTTTA------------TTGA--AGATGTTTATCT-AC-TA--AAAC-ACT---TCA-TA-TGGAATAATTCT--TTCATAAAA----CAT--AATTGCAG---TTTA-----TTATTTTACAAAGCATGAC-T--ACAGC-TAGGAA-T-A-----AAT-ACA-ATAAATG----ATAT------ATATG---ATT--------GTAG-----AGACATT-TTATA-ATTTT-GA-AAGATTGAT---ACA
gi|21819 : ----TTAA-CAGAT-G-T-TA-AC-AATAA---CGGCGA-----A--T--GGAAG--TATATA--TAC-AT-GTCT----TCATAA-T--GG-
gi|21819 : attgaattttttttaaaaaaagtttaaacgtggatgtgttgctAT--AATGGCAG---TTTA-----TTATTTTACAAAGCATGGC-T--ACAGC-TAGGAA-T-T-----AAA-ACA-ATAAATT----GTAT------ATATG---ATT--------GTAGATACAAGACATT-TTATA-ATTTT-GA-AAGATTAAA---ACAATTGTACAATATAAGTAATcagtttattattttacaaagcatggctacagctaggaattaaaacaataaattgtatatatgattgtagatacaagacattttataattttgaaagattaaaacaattgtacaatataagtaat
gi|21820 : attgaattttttttaaaaaaagtttaaacgtggatgtgttgctttaacagatgttaacaataacggcgaatggaagtatatatacatgtcttcATGG--CAGAATTAAAT---AAAATTAATAGACTTAC--AAGTAATAATC---G-TA--AAAT-AAT---AAAATAATAGAATAATTCTCTTTTATTAAA----AGT--AAC---AT---TTTA-----ATATTTTATTAATCATGGT-T--ACAGC-CAGGAA-T-TA----AAA-ACA-ATAAATGAC--ATAT------ATATG---ATC--------CTGGACACAAGACG-T-TTATC-ATT------------------ACAAGTATGCAATAT-GATAA
gi|21821 : GGAATTTTTCT--TTCATTAAA----AAT--AAAG--AG---TTTA-----TTATTTTATAAATCATGGT-T--GCAGC-AAGGAAAT-T-----GAA-TCA-ATAAATG----ATATATATATATATG---ATT--------CTAGACACAA-ACCTTGTTAAA-CTTTT-GA-AAGATTAAATATACAATATGACAATATGAATAAgtaa
gi|21822 : -TGGGAA-T-T-----AAA-ACA-ATAAATG----ATAT------ATATA---AAT--------CGAGATACAAGGCGTT-TTATT-CTTTT-GA-TAGATTAAA---ACAATTATATAATAACAATAAT