lowQualScore : 1 66666666666 1 111 11 1 1
lowQualScore : 6 666 3 6 3 33333333333 2 1 22 000 9 333 44 4444 1 9 1 1 22 4444 0 5 333 1 00 1 1 7 55 333 99 8 9 3 22
lowQualScore : . ... . . . ........... . . .. ... . ... .. .... . . . . .. .... . . ... . .. . . . .. ... .. . . . ..
lowQualScore : 0 444 3 2 2 33333333333 7 9 66 222 6 333 22 0000 9 4 8 8 66 0000 8 0 333 9 22 5 8 5 00 333 88 8 1 0 55
consensus : AAAAAAGCGAAATCAGACTCCCGAATCAAGTACTTATTATCTGAAGTCCTTGCCGAAATATACGACTCTTTCAATGTGCATGTTGGCGATATAGTTCGTGAC---CTGGAATTTGATT-T-ACAAGATGGCGTCCTGAAA----AATCTTTTGGTCACGTGACCATAGTTCAGCGCGTCTGTATTCATGCGCT-TTAATTCCTTTGT--GCTGATTAATAGCACTGAATAT---AAACTTGGAATTTATACGATACGCAATTGTTTATAGGTATAAAT----CGTC-GCTGTCTGTTATA-ATATTAATG-TTTTCGTTGAAATAG--GCGAATCTACTGTTTAT----AGTGAGTTCGAGCGCTTATCAGGGG---GTGGAAC-TATTTGATTGGTGGTTGTCAGGTTTGCA-TTAACACGATACACGGTTGT--AGATTT---GCGGTAT-TGAAAATAAAATCATGTTAGCTCTGAGAGCG--GCTGCTAAAGCACCGCCCCCAAAA
Reference ( gi|75570 ) : AAAAAAGCGAAATCAGACTCCCGAATCAAGTACTTATTATCTGAAGTCCTTGCCGAAATATACGACTCTTTCAATGCGCATGTTGGCGATATAGTTCGTGAC---CTGGAATTTGATT-T-ACACGATGGCGT-----------AATATTTTGGTCACGTGACCATAGTTCAGCGCGTCTGTATTCATGCGCT-TTAATTCCTTTGT--GCTGATTAATGCTACAGAATAT---AAACTTGGAATTTATACGATACGTAATTGTTTATAGGTATAAAT----CGTC-GCTGTATGTTATA-ATATTAATG-TTTTCGTTGAAATAG--GCGAATCTACTGTTTAT----AGTGAGTTCGAGCGCTTATCAGGGG---GTGGAAC-TATTTGATAAGTGGTTGTTAGGTTTGCA-TTAACACGAAACACGGTTGT--AGATTT---GCGGTAT-TGAAAATAAAATCATGTTAGCACTTAGAGCG--GCTGCTAAAGCACCGCCCCCAAAA
gi|75574 : AAAAAAGCGAAATCAGACTCCCGAATCAAGTACTTATTATCTGAAGTCCTTGCCGAAATATACGACTCTTTCAATGTGCATGTTGACGATATCGTTCGTGAC---CTGGAATTTGATT-T-ACAAGATGGCGT-----------AATCTTTTGGTCACGTGACCATAGTTCAGCGCGTCTGTATTCATGCGCT-TTAATTCCTTTGT--GCTGATTAATGCTACAGAATAT---AAACTTGAAATTTATATGATACGTAATGGTTTATAGGTATAAAT----CGTC-GCTGTATGTTATA-ATATTATTA-TTTTCATTGAAATAG--GCGAATCTACTGTTTAA----AGTGAGTTCGAGCGCTTATCA-GGG---GTGGAACTTTTTTGATAAGTCGTTGTTAGGTTTGCA-TTAACACGAAACACGGTTGT--AGATTT---GCGGTAT-TGAAAATAAAATCATGTTAGCTCTGAGAGCG--GCTGCTAAAGCACCACCCCCAAAA
gi|75573 : AAAAAAGCGAAATCAGACTCCCGAATCAAGTACTTACTAGCTGAAGTCCTTGCCGAAATATACGACTCTTTCAATGTGCATGTTGGCGATATAGTTCGTGAC---CTGGAATTTGATT-T-ACAAAATGGCGT-----------AAGCTTTTGGTCACATGGCCATAGTTCAGCGCAAATGTATTCATGCGCT-TTAATTCCTTTGT--GCTGATTAATGCTACAGAATAT---AAACTTGGAATTTATACGATACGTAATTGTTAATAGGTATAAAT----CGTC-GCTGTATGTTATT-ATATTAATG-TTTTCGTTGAAATAG--GCGAATCTACTGTTTAT----AGTGAGTTTGAGCGCTTGTCA-GGG---GTGGAAC-TATTTGATAAGTGGTTGTTAGGTTTGCA-TTAACACGAAACACGGTTGT--AGATTT---GCGGTAT-TGAAGATAAAATTATGTTAGCTCTGAGAGCG--GCTGCTAAAGCACCGCCCCCAAAAa
gi|75572 : AAAAAAGCGAAATCAGACTCCCGAATCAAGTACTTATTATCTGAAATCCTTGCAGAAATATACAACTCTTTCAATGTGCATGTTGGCGATATAGTTCGTGAC---CTGGAATTTAATT-T-ACAATATGGCGT-----------GATCTTTTGGTCACGTGACCGTAGTTCAGCGCGTCTGTATTCATGCGCT-TTAATTCCTTTGT--GCTGATTAATGCTACAGAATAT---AAACTTGAAATTTATACAATACGTAATTGTTTATAGGTATAAAT----CGTC-GCTGTTTGTTATA-ATATTAATG-TTTTCGTTGAAATAG--GCGAATCTACTGTTTAA----AGTGAGTTCGAGCGCTTATTAGGGG---ATGGAAC-TATTTGATAAGTGGTTTGTAGGTTTGCA-TTAACACGAAACACAGTTGT--AGATTT---GCGGTAT-TGAAAATAAAATCATGTTAGCTCTGAGAGCG--GCTGCTAAAGCACCGCCCCCCAAAa
gi|75569 : AAAAAAGCGAAATCAGACTCCCGAATCAAGTACTCATTATCTGAAGTCCTTGCCGAAATATAAGACTCTTTCAATGTACATGTTGGCGATATAGTTCGTGAT---CTGGAATTTGATT-T-ACAAGATGGTGT-----------AATCTTTTGGTCACGTGACCATAGTTCAGCGCGTTTGTATTCATGCGCT-TTAATTCCTTTGT--GCTGATTAATAGCACTGAATAT---AAACTTGGAATTTATACGATACACAATTGTTTATAGGTATAAAT----CGTC-GTTGTATGTTATA-ATATTAATG-TTTTCGTTGAAATAG--GCGAATCTACTGTTTAT----AGTGAGTTGGAGCGCTTATCAGGGG---GCGGAAC-TATTTGATTAGTGGTTGTTATGTTTGCA-TTAACACGATACACGGTTGT--AGATTT---GCGGTAT-TGAAAATAAAATCATGTTAGCTCTGAGAGCG--TCTGCTAAAGCACCGCCCCCAAAAa
gi|75575 : AAAAAAGCGAAATCAAACTCCCGAATCAAGTACTTATTATCTGAAGTCCTTGCTGAAATATACGACTCTTTCAATGTGCATGTTGGCGATATAGTTCGTGAC---CTGGAATTTGATT-T-ACAAGATGGCGT-----------AATCTTTTGGT--------------TCAGCGCGTCTGTATTCATGGGCT-TTAATTCCTTTGT--GCTGATTAATGCTACAGAATAT---AAACTTGGAATTTATACGATACGTAATTGTTTATAGGTATAAAT----CGTC-GCTGTATGTTATA-ATATTAATG-TTTTCATTGAAATAG--GCGAATCTACTGTTTAT----AGTGAGTTCGAGCGCTTATCA---G---GTGGAAC-TATTTGATAAGTGGTTGTTAGGTTTGCA-TTAACACGAAACACGTTTGT--AGATTT---GCGGTAT-TGAAAATAAAATCATGTTAGCTCTGAGAGCG--GCTGCTAAAGCACCGCCCCCAAAAa
gi|75576 : AAAAAAGCGAAATCAAACTCCCGAATCAAGTACTTATTATCTGAAGTCCTTGCCGAAATATACGACTCTTTCAATGTGCATGTTGGCGATATAGTTCGTGAC---CTGGAATTTGATT-T-ACAAGATGGCGT-----------AATCTTTTGGT--------------TCAGCGCGTCTGTATTCATGCGCT-TTCATTCTTTTGT--GCTGATTAATGCTACAGAATAT---AAACTTGGAATTTATACGATACGTAATTGTTTATAGGTATAAAT----CGTT-GCTATATGTTTTA-ATATTAATA-TTTTCGTTGAAATAG--GCGAATCTACTGTTTAT----AGTGAGTTCGAGAGCTTATCA---G---GTGGAAC-TATTTGATAAGTGGTTGTTAGGTCTGCA-TTAACACGAAACACGGTTGT--AGATTT---GCGGTAT-TGAAAATAAAATCATGTTAGCTCTGAGAGCG--GCTGCTAAAGCACCGCCCCCAAAAa
gi|75577 : AAAAAAGCGAAATCAAACTCCCGAATCAAGTACTTATTATCTGAAGTCCTTGCCGAAATATACGACTCTTTCAATGTGCATGTTGGCGATATAGTTCGTGAC---CTGGAATATGATT-T-ACAAGATGGCGT-----------AATCTTTTG--------------GTTCAGCGCGTCTGTATTCATGCGCT-TTCATTCCTTTGT--GCTGATTAATGCTACAGAATAT---AAACTTGGAATTTATACGATACGTAATTGTTTATAGGTATAAAT----CGTC-ACTGTATGTTATA-ATATTAATA-TTTTCGTTGAAATAG--GCAAATCTACTGTTTAT----AGTGAGTTCGAGAGCTTATAA---G---GTGGAAC-TATTTGATAAGTGGTTGTTAGGTCTGCA-TTAACACGAAACACGGTTGT--AGATTT---GCAGTAT-TGAAAATAAAATCATGTTAGCTTTGAGAGCG--GCTGCTAAAGCACCGCCCCCAAAAa
gi|75571 : AAAAAAGCGAAATCAGACTCCCGAATCAAGTACTTATTATCTAAAGTCCTTGCCGAAATATACGACTCTTTCAACGTACATGTTAGCGACATACTTCGTGAC---CTGGAATTTGATT-TTACAAGATGGCGT-----------AATCTTTTGGTCACGTGACGATAGTTCACCGCGTCTGTATTCATGCGCT-TTAATTCCTTTGT--GCTGATTAATAGCACTGAATAT---AAACTTGGAATTTATACGATACAGAATTGTTTATAGGTATGAAT----CGTC-GCTGTCTGTTCTA-ATATTAATGTTTTTCGTTGAAATAA--GGTAATCTACTGTTTATAGCGAGCGAGTTCGAACGCTTATCAGATG---GTGGAAC-TATTTGATTAGTGGTTGTTAGGTTTGCA-TTAACACGATACACGGTTGT--AGGTTT---GCGGTAT-TAAAAAAAAAATCATGTTAGCTTTGAGAGCG--GTTGCTAAAGTACCGCCCCCAAAAa
gi|75578 : AATAAAGCAAAATCAGACTCCCGAATCAAGTACTTATTATCTGAAGTCCTa
gi|75579 : CGAAACAAGTACTTAATATCTGAAGTCCTTGCAGAAATATACGACTCTTTCAATGTACATGTTGGTGATATACTTCGTGAC---CTGGAATTTGATT-TTACAAGATGGCAT-----------AATCTTTTGGTCACGTGACCATAGTTCAGCGCATCTGTATTCATGCGCT-TTAATTCCTTTGT--GTTGATTAATAGCACTGAATTT---AAACTTG-AATTTATACGATACACAATTGTTTATAGGTATAAAT----CGCT-GCTGTCTGTTATA-ATATTAATG-TTTTCGTTGA--TAG--GCGAATCTACTGTTTAT----AGCGAGTTCAAACGCTTATCAGGGG---GTGAAAC-TGTTTGATTGGTGGTTGTCAGGTTGGCA-TTAACACGATACACGGTTGT--AGATTT---TTGGTAT-AGGAAAAAAAATCACGTTAGTTCTGAGAGAG--ACTGCTAAAGCACCGCCCTAAAAA
gi|75580 : TGACTGTCTTGAATT-GTTG-T-CCAAGATGGCGTCCT--------GACCTTTTGGTCACGTGATCATAGTTCAGCGCGTCTGTATTCATGCGCT-TAAATTCCTTTGG--ACTGATTAATAGCACTGAATAG---AAACTTTGAATTTATACGATACACAATTGTTTATAGGAATATAT----CGTC-GCTGTCTGTTATA-ATATTAATG-TTTTCGTTGAAATAG--GCGAATCTACTGTTTAT----AGTGAGTTCGAACGCTTATCAGAGG---GTGAAAA-TATTTGATTGGTGGTTGTCAGGTTTGCA-TTATTACGATACACGGTTGT--AGATTT---GCGGTAT-AGGAAA-AAAAACACGTAAGCTATGAGAGCT--GCTGCTAAAGCACCGCCCCCAGAAa
gi|75581 : ---CTTGAATT--ATTGT-CCAAGATGGCATCCTGAAA----AATCTTTTAGTCACATGACCATAGTTCAGCACGTCTATATTCATGCGCT-TTAATTCCTTTGT--GCTGATTAAAAGGACTGAATATTATAAA-TTGGAATTTATAAGTTACGCAATTGTTTATAGGTATAAAT----CGTT-GCTGT----TATA-ATATAAATG-TTTTTGTTGAAATAG--GCGAATCTTCTGTTTAT----TGTGAGTTCAAACGCTTATTAGGGG---GTGGAAC-TATTTGATTGGTGGTTGTCAGGTTTGCA-TTAACACGATACATGGTTGC--AGATTT---GCGGTAT-AGGAA--AAAATCATG---GC------AGCG--GCTGCCAAAGCACCGCCCCCAAAAa
gi|75583 : TT-T-CCAAGATGGCGTCCTGAAA----AATCTTTTGGTCACGTGACCATAGTTCAGCGCGTCTG
gi|75584 : -ACATGATGACGTCCTGAAA----AATCTTTTGGTCACGTGACCATAGTTCAGCGCGTCTGTATTCATGCGCT-TTAATTCCAGTGT--GCTGATTAATACCACTGATTAT---AAACTTGGAATTTATAAGATACACAATTGTTTATAGGTATAAAT----CGTC-GCTGTCTGTTATA-ATATTAATG-TTTTCGTTGAAATAG--GCGAATCTACTGTTTAT----AGTGAGTT----CGCTTATCAGGGG---GTGGAAC-TATTTGATTGGTGGTTGTCAGGTTTGCA-TTAACACGATACACGGTTGT--AGATTTGCGGCGGTA--TAAGAACATAATCATGTTAGCTCTGAGAGCG--GTTGCTAAAGCACCGCCCCAAAAA
gi|75585 : CAAGATGGCGTCCTGAA-----AAAATTTTGGTCACGTGACCATAGTTCAGAGCGTCTGTATTCATGCGCT-TTCATTCCTTTTTTTGCTGATTAATAGCACTGAATAT---AAACTTGGAATTTATACGGTACACAATTGTTTATAGGTATAAAT----CGTC-GCTGTCTGTTATA-ATATTTTTG-TTTTCGTTGAAATAG--GCGAATCTACTGTTTAT----AGTGAGTTCGAACGCTTATCAGGGG---GTAGAAC-TATTTAATTGGTGGTTGTCAGGTTTGCA-TTAATACGATACACGGTTGT--AGATTT---GCGGTAT-TGGAAA-AAAATCATGTTAGCTCTGAGAGCG--GCTGCTAAAGCACCGCACCCAAAAa
gi|75587 : CACGATGGCGTCCTGCAAA---AATCTTTTAATCACGTGACCATAGTTAAGCGCGTCTGTATTCATGCGTT-TTAATTTCTGTGT--GCTGAATAATAGCACTGAATAT---AAACTTGGAATTTATACGATACACAATTGTTTATAGGTATTAAT----CATC-GCTGTCTGTTATT-ATATTAATA-TTATCGTTGAAATAG--GCGAATCTACTGTTTAT----AGTGAGTTCGAACCCTTATCAGGGG---TTGGAAC-TATTTGATTGGTGGTTGTCAGGTTTGCA-TTAACACGATACACGGTTGT--AGATTT---GCGGTATAGGAAAAT--AATCATGTTTACTCTGAGAGCA--GTTGCTAAAGCACCGCCCCCAAAa
gi|75586 : CAAGATGGCATCCTGAAA----AATCTTTTGACCACATGACCATTATTCAGAGCGTCTGTATTCATGCTCT-TTAATTCCTTTGT--GCTGATTGATAGCACTGAATAT---TAACTTGGAATTTATATGGTACAAAATTGTTAACAGGTATAAAT----CGTTTGCTGTCTGTTATA-ATATTAATG-TTTTCGTTAAAATAG--GCGAATCTACTGTTTAT----AGTGAGTTTGAACGCTTATCAGGGG---GTGGAAC-TATTTGACTGGTGGTTGTCAGGTTTGCA-TTAACAGGATACACATTTGT--AGATTT---GCGGTAT-AGGAAA-AAAATCATGTTAGCTCTGAGAGCG--GCTGCTAAAGCAACGACCCCAAAA
gi|75589 : CAAGATAGCGTCCTGAAA----AATCTTTTGGTCACATGACCATAGTTCAGCGCATCTGTATTCATGCGCT-ATAATTCCTGTGT--GCTGGTTAATAGCACTGAATTT---AAACTTGGAATTTATGCGATACACAATTGTTTATAGGCATAAAT----TGTC-GCTGTCTGTAATA-ATA---ATA-TTTTCGTTGAAATAG--GCGAATTTACTGTTTAT----AGTGAGTTGGAATGCTTATCAGGGG---GTGAAAC-TATTTGATTTGTGGTTGTCAGGTTTGCA-TTAACACAATACACGGTTGT--AGATTT---GCGGTATATGAAAAT--AATCATGTAAGCTCTGAGAGC-------------CACCGCCCCCAAAAa
gi|75590 : CAAGATGGCGTCCTGAAAAA--AATATTTTGGCCACGTGACTATAGTTCAGCGCATCTATATTCATGTGCT-TTAATTCCTTTGT--GCTGATTGATAGCACTGAATAT---AA-------------------------TGTTTATAGGTATAAAT----CGCC-GCTGTCTGTTATA-ATATTATTG-TTTTCGTTGAAATAG--GCGAATCTACTGTTTAA----AGTGAGTTCGAACGTTTATCAAGGG---TCGGAAC-TATTCGCTTGGT-GTTGTCAGGGTTGCA-TTACTACGACACACGGTTGT--AGATTT---GCGGTAT-AGGAAA-AAA--CATGTTAGCTCTTAGAGCG--GCTGCTTAAGCCCCGACCCCa
gi|75591 : CAAGATGGCGTCCTGAAAAAAAAATCTTTCGGTCACGTGAGCATAGTTCAGAGCGTCTGTATGCATACGCT-TTAATTCCATTGT--GCTGATTAATAACACTGACTAT---AAACTTGGAATTTATATGGTACACAATTGTTCATAGGTATAAATTTACTGTC-GCTGTCTTTTATT-ATATTAATG-TTTT-GTTGAAAT
gi|75588 : -----------AATCTTTTGGTAACGTGACCATAGTTCAGCGCGTCTGTATTCATGCGCT-TTAATTTCAGTGT--GCTAATTAATAGCACTGAATAT---AAACTTGGAATTTATACGATACACAATTGTTTATAGGTATAAAC----CTTC-GCAGTCTGTTATT-ATATTAATG--TTACGTTGAAATAG--GCGAATCTTCTGTTTAA----AGTGAGTTCGACCGCTTATCATGGG---GTGGAAC-TATTTGATCGGTGGTTGTCAGGTCTGCA-TTAACACGATACAGGGTTGT--AGATTG---GCGGTATAAGAAAAC--AATCATGTTAGCTCTGAGAGCG--ACTGCTGAAGAACCGACCCC
gi|75582 : caagatggctccctgaaa-----------AATCTTTTGGTCACGTGACCATAGTTCAGCGCGTCTATATACATGCACT-TTAATTCCTTTGT--GCTGATTAATAACACTGAATAT---AATCTTGGAATTTATACGACACACAATTGTTTATAGGTATAAAT----TGTC-GCTGTCTGTTTTA-ATATTAATG-TTTATGTTGAAATAG--GTGAATCTACTGTTTAA----AGCGAGTTCGGACACTTATCAGTAG---GTGGAAC-TTTTTGATTGGTGGTTGTCAGGTTTGCA-TTAATCTGATACACGGTTGT--A
gi|75592 : ttgaattgtccaagaGTCTGTCTTGAATTGTTGTTAATTCCTTTGT--ACTGATTAATAACACTGAATAT---AAACTTGGAATTTATACGATACACAATTGT------GTATAAAT----CGTC-GCTGTCTGTTATA-ATATTAATG-TTTTCATTGAAATAG--GCGAATCTACTGTTTAT----AGTGAGTTTGAACGCTTATTACGGG---GTGGAAC-TATTTGTTTGGTGGTTGTCAGGTTTGCA-TTAACACGATACACGGTTGT--AGATTT---GCGGTATAGGAAAAAAAAAACATGTTAGCTCTGAGAGCG--GCTGCTAAAGCACC-CCCCCAAAA
gi|75594 : ATACATATTTATG-TTATCGTTGAA-T-GTCACGGAACCACTTTTT-----------GTTTGAG--------AGGGGAGTGTGGGGC-T-TTTGA--GGCAATTGCAAGGCTTATAGTTAG---GAAACGTGATTGTCAAAACAT---G----GT-TTAAGACAAA--TGTGTAAGCTCTATGCACG--GTTACTTAAGCACCGCCCCCAAAAa
gi|75593 : GTGGTAATAAGGTTTGCA-GTAAG--GAAACGCGGTTGTTAAAACAT---G--GT-T-T---AAGAAAATCGTGTTAGC--TAAGAACACAACTGCTTAAGCACCGCCACCAAAA
gi|75595 : ctttgaagttgaaacacacttttgattatgtatactaattatctttttacatagtaacgttatcattaaaagccacagagcaactttttgtttgaagtggggagggggttacgacGGTAT-----AAGAAAATAGTGTTAGCTCTTAGCACG--GTTGATAAATCACCGCCCCCa
Alignments
lowQualScore : 33333333
lowQualScore : 555 3 5 11111111 6666 1 22 1 333 0 22 3333 1 0 3 1 3333 44 3333 0 3 333 1 2 1 1 1 44 333 99 8
lowQualScore : ... . . ........ .... . .. . ... . .. .... . . . . .... .. .... . . ... . . . . . .. ... .. .
lowQualScore : 888 1 7 99999999 4444 8 55 3 222 6 44 7777 7 5 3 7 5555 11 7777 9 7 000 7 7 7 7 8 88 222 00 0
consensus : AAAAAAGCGAAATCAGACTCCCGAATCAAGTACTTATTATCTGAAGTCCTTGCCGAAATATACGACTCTTTCAATGTGCATGTTGGCGATATAGTTCGTGAC---CTGGAATTTGATT-T-ACAAGATGGCGTCCTG-AAAAA----TCTTTTGGTCACGTGACCATAGTTCAGCGCGTCTGTATTCATGCGCT-TTAATTCCTTTGT--GCTGATTAATAGCACTGAATAT---AAACTTGGAATTTATACGATACGCAATTGTTTATAGGTATA--AAT----CGTC-GCTGTCTGTTATA-ATATTAATG-TTTTCGTTGAAA----TAG--GCGAATCTACTGTTTAT----AGTGAGTTCGAGCGCTTATCAGGGG---GTGGAAC-TATTTGATTGGTGG-TTGTCAGGTTTGCA-TTAACACGATACACGGTTGT--AGATTT---GCGGTAT-TGAAAATAAAATCATGTTAGCTCTGAGAGCGGCTGCTAAAGCACCGCCCCCAAAA
Reference ( family-688 ) : AAAAAAGCGAAATCAGACTCCCGAATCAAGTACTTATTATCTGAAGTCCTTGCCGAAATATACGACTCTTTCAATGTGCATGTTGGCGATATAGTTCGTGAC---CTGGAATTTGATT-T-ACAAGATGGCGTCCTG-AAAAA----TCTTTTGGTCACGTGACCATAGTTCAGCGCGTCTGTATTCATGCGCT-TTAATTCCTTTGT--GCTGATTAATAGCACTGAATAT---AAACTTGGAATTTATACGATACGCAATTGTTTATAGGTATA--AAT----CGTC-GCTGTCTGTTATA-ATATTAATG-TTTTCGTTGAAA----TAG--GCGAATCTACTGTTTAT----AGTGAGTTCGAGCGCTTATCAGGGG---GTGGAAC-TATTTGATTGGTGG-TTGTCAGGTTTGCA-TTAACACGATACACGGTTGT--AGATTT---GCGGTAT-TGAAAATAAAATCATGTTAGCTCTGAGAGCGGCTGCTAAAGCACCGCCCCCAAAA
gi|75569 : AAAAAAGCGAAATCAGACTCCCGAATCAAGTACTCATTATCTGAAGTCCTTGCCGAAATATAAGACTCTTTCAATGTACATGTTGGCGATATAGTTCGTGAT---CTGGAATTTGATT-T-ACAAGATGGTGT--------AA----TCTTTTGGTCACGTGACCATAGTTCAGCGCGTTTGTATTCATGCGCT-TTAATTCCTTTGT--GCTGATTAATAGCACTGAATAT---AAACTTGGAATTTATACGATACACAATTGTTTATAGGTATA--AAT----CGTC-GTTGTATGTTATA-ATATTAATG-TTTTCGTTGAAA----TAG--GCGAATCTACTGTTTAT----AGTGAGTTGGAGCGCTTATCAGGGG---GCGGAAC-TATTTGATTAGTGG-TTGTTATGTTTGCA-TTAACACGATACACGGTTGT--AGATTT---GCGGTAT-TGAAAATAAAATCATGTTAGCTCTGAGAGCGTCTGCTAAAGCACCGCCCCCAAAA
gi|75570 : AAAAAAGCGAAATCAGACTCCCGAATCAAGTACTTATTATCTGAAGTCCTTGCCGAAATATACGACTCTTTCAATGCGCATGTTGGCGATATAGTTCGTGAC---CTGGAATTTGATT-T-ACACGATGGCGT--------AA----TATTTTGGTCACGTGACCATAGTTCAGCGCGTCTGTATTCATGCGCT-TTAATTCCTTTGT--GCTGATTAATGCTACAGAATAT---AAACTTGGAATTTATACGATACGTAATTGTTTATAGGTATA--AAT----CGTC-GCTGTATGTTATA-ATATTAATG-TTTTCGTTGAAA----TAG--GCGAATCTACTGTTTAT----AGTGAGTTCGAGCGCTTATCAGGGG---GTGGAAC-TATTTGATAAGTGG-TTGTTAGGTTTGCA-TTAACACGAAACACGGTTGT--AGATTT---GCGGTAT-TGAAAATAAAATCATGTTAGCACTTAGAGCGGCTGCTAAAGCACCGCCCCCAAAAa
gi|75571 : AAAAAAGCGAAATCAGACTCCCGAATCAAGTACTTATTATCTAAAGTCCTTGCCGAAATATACGACTCTTTCAACGTACATGTTAGCGACATACTTCGTGAC---CTGGAATTTGATT-TTACAAGATGGCGT--------AA----TCTTTTGGTCACGTGACGATAGTTCACCGCGTCTGTATTCATGCGCT-TTAATTCCTTTGT--GCTGATTAATAGCACTGAATAT---AAACTTGGAATTTATACGATACAGAATTGTTTATAGGTATG--AAT----CGTC-GCTGTCTGTTCTA-ATATTAATGTTTTTCGTTGAAA----TAA--GGTAATCTACTGTTTATAGCGAGCGAGTTCGAACGCTTATCAGATG---GTGGAAC-TATTTGATTAGTGG-TTGTTAGGTTTGCA-TTAACACGATACACGGTTGT--AGGTTT---GCGGTAT-TAAAAAAAAAATCATGTTAGCTTTGAGAGCGGTTGCTAAAGTACCGCCCCCAAAA
gi|75572 : AAAAAAGCGAAATCAGACTCCCGAATCAAGTACTTATTATCTGAAATCCTTGCAGAAATATACAACTCTTTCAATGTGCATGTTGGCGATATAGTTCGTGAC---CTGGAATTTAATT-T-ACAATATGGCGT--------GA----TCTTTTGGTCACGTGACCGTAGTTCAGCGCGTCTGTATTCATGCGCT-TTAATTCCTTTGT--GCTGATTAATGCTACAGAATAT---AAACTTGAAATTTATACAATACGTAATTGTTTATAGGTATA--AAT----CGTC-GCTGTTTGTTATA-ATATTAATG-TTTTCGTTGAAA----TAG--GCGAATCTACTGTTTAA----AGTGAGTTCGAGCGCTTATTAGGGG---ATGGAAC-TATTTGATAAGTGGTTTGT-AGGTTTGCA-TTAACACGAAACACAGTTGT--AGATTT---GCGGTAT-TGAAAATAAAATCATGTTAGCTCTGAGAGCGGCTGCTAAAGCACCGCCCCCCAAAa
gi|75573 : AAAAAAGCGAAATCAGACTCCCGAATCAAGTACTTACTAGCTGAAGTCCTTGCCGAAATATACGACTCTTTCAATGTGCATGTTGGCGATATAGTTCGTGAC---CTGGAATTTGATT-T-ACAAAATGGCGT--------AA----GCTTTTGGTCACATGGCCATAGTTCAGCGCAAATGTATTCATGCGCT-TTAATTCCTTTGT--GCTGATTAATGCTACAGAATAT---AAACTTGGAATTTATACGATACGTAATTGTTAATAGGTATA--AAT----CGTC-GCTGTATGTTATT-ATATTAATG-TTTTCGTTGAAA----TAG--GCGAATCTACTGTTTAT----AGTGAGTTTGAGCGCTTGTCA-GGG---GTGGAAC-TATTTGATAAGTGG-TTGTTAGGTTTGCA-TTAACACGAAACACGGTTGT--AGATTT---GCGGTAT-TGAAGATAAAATTATGTTAGCTCTGAGAGCGGCTGCTAAAGCACCGCCCCCAAAAa
gi|75574 : AAAAAAGCGAAATCAGACTCCCGAATCAAGTACTTATTATCTGAAGTCCTTGCCGAAATATACGACTCTTTCAATGTGCATGTTGACGATATCGTTCGTGAC---CTGGAATTTGATT-T-ACAAGATGGCGT--------AA----TCTTTTGGTCACGTGACCATAGTTCAGCGCGTCTGTATTCATGCGCT-TTAATTCCTTTGT--GCTGATTAATGCTACAGAATAT---AAACTTGAAATTTATATGATACGTAATGGTTTATAGGTATA--AAT----CGTC-GCTGTATGTTATA-ATATTATTA-TTTTCATTGAAA----TAG--GCGAATCTACTGTTTAA----AGTGAGTTCGAGCGCTTATCA-GGG---GTGGAACTTTTTTGATAAGTCG-TTGTTAGGTTTGCA-TTAACACGAAACACGGTTGT--AGATTT---GCGGTAT-TGAAAATAAAATCATGTTAGCTCTGAGAGCGGCTGCTAAAGCACCACCCCCAAAAa
gi|75575 : AAAAAAGCGAAATCAAACTCCCGAATCAAGTACTTATTATCTGAAGTCCTTGCTGAAATATACGACTCTTTCAATGTGCATGTTGGCGATATAGTTCGTGAC---CTGGAATTTGATT-T-ACAAGATGGCGT--------AA----TCTTTTGGT--------------TCAGCGCGTCTGTATTCATGGGCT-TTAATTCCTTTGT--GCTGATTAATGCTACAGAATAT---AAACTTGGAATTTATACGATACGTAATTGTTTATAGGTATA--AAT----CGTC-GCTGTATGTTATA-ATATTAATG-TTTTCATTGAAA----TAG--GCGAATCTACTGTTTAT----AGTGAGTTCGAGCGCTTATCA---G---GTGGAAC-TATTTGATAAGTGG-TTGTTAGGTTTGCA-TTAACACGAAACACGTTTGT--AGATTT---GCGGTAT-TGAAAATAAAATCATGTTAGCTCTGAGAGCGGCTGCTAAAGCACCGCCCCCAAAAa
gi|75576 : AAAAAAGCGAAATCAAACTCCCGAATCAAGTACTTATTATCTGAAGTCCTTGCCGAAATATACGACTCTTTCAATGTGCATGTTGGCGATATAGTTCGTGAC---CTGGAATTTGATT-T-ACAAGATGGCGT--------AA----TCTTTTGGT--------------TCAGCGCGTCTGTATTCATGCGCT-TTCATTCTTTTGT--GCTGATTAATGCTACAGAATAT---AAACTTGGAATTTATACGATACGTAATTGTTTATAGGTATA--AAT----CGTT-GCTATATGTTTTA-ATATTAATA-TTTTCGTTGAAA----TAG--GCGAATCTACTGTTTAT----AGTGAGTTCGAGAGCTTATCA---G---GTGGAAC-TATTTGATAAGTGG-TTGTTAGGTCTGCA-TTAACACGAAACACGGTTGT--AGATTT---GCGGTAT-TGAAAATAAAATCATGTTAGCTCTGAGAGCGGCTGCTAAAGCACCGCCCCCAAAAa
gi|75577 : AAAAAAGCGAAATCAAACTCCCGAATCAAGTACTTATTATCTGAAGTCCTTGCCGAAATATACGACTCTTTCAATGTGCATGTTGGCGATATAGTTCGTGAC---CTGGAATATGATT-T-ACAAGATGGCGT--------AA----TCTTTTGGT--------------TCAGCGCGTCTGTATTCATGCGCT-TTCATTCCTTTGT--GCTGATTAATGCTACAGAATAT---AAACTTGGAATTTATACGATACGTAATTGTTTATAGGTATA--AAT----CGTC-ACTGTATGTTATA-ATATTAATA-TTTTCGTTGAAA----TAG--GCAAATCTACTGTTTAT----AGTGAGTTCGAGAGCTTATAA---G---GTGGAAC-TATTTGATAAGTGG-TTGTTAGGTCTGCA-TTAACACGAAACACGGTTGT--AGATTT---GCAGTAT-TGAAAATAAAATCATGTTAGCTTTGAGAGCGGCTGCTAAAGCACCGCCCCCAAAAa
gi|75578 : AATAAAGCAAAATCAGACTCCCGAATCAAGTACTTATTATCTGAAGTCCTa
gi|75579 : CGAAACAAGTACTTAATATCTGAAGTCCTTGCAGAAATATACGACTCTTTCAATGTACATGTTGGTGATATACTTCGTGAC---CTGGAATTTGATT-TTACAAGATGGCAT--------AA----TCTTTTGGTCACGTGACCATAGTTCAGCGCATCTGTATTCATGCGCT-TTAATTCCTTTGT--GTTGATTAATAGCACTGAATTT---AAACTTG-AATTTATACGATACACAATTGTTTATAGGTATA--AAT----CGCT-GCTGTCTGTTATA-ATATTAATG-TTTTCGTTGA------TAG--GCGAATCTACTGTTTAT----AGCGAGTTCAAACGCTTATCAGGGG---GTGAAAC-TGTTTGATTGGTGG-TTGTCAGGTTGGCA-TTAACACGATACACGGTTGT--AGATTT---TTGGTAT-AGGAAAAAAAATCACGTTAGTTCTGAGAGAGACTGCTAAAGCACCGCCCTAAAAA
gi|75580 : TGACTGTCTTGAATT-GTTG-T-CCAAGATGGCGTCCTG-A--------CCTTTTGGTCACGTGATCATAGTTCAGCGCGTCTGTATTCATGCGCT-TAAATTCCTTTGG--ACTGATTAATAGCACTGAATAG---AAACTTTGAATTTATACGATACACAATTGTTTATAGGAATA--TAT----CGTC-GCTGTCTGTTATA-ATATTAATG-TTTTCGTTGAAA----TAG--GCGAATCTACTGTTTAT----AGTGAGTTCGAACGCTTATCAGAGG---GTGAAAA-TATTTGATTGGTGG-TTGTCAGGTTTGCA-TTATTACGATACACGGTTGT--AGATTT---GCGGTAT-AGGAAA-AAAAACACGTAAGCTATGAGAGCTGCTGCTAAAGCACCGCCCCCAGAAa
gi|75581 : ---CTTGAATT--ATTGT-CCAAGATGGCATCCTG-AAAAA----TCTTTTAGTCACATGACCATAGTTCAGCACGTCTATATTCATGCGCT-TTAATTCCTTTGT--GCTGATTAAAAGGACTGAATATTATAAA-TTGGAATTTATAAGTTACGCAATTGTTTATAGGTATA--AAT----CGTT-GCTGT----TATA-ATATAAATG-TTTTTGTTGAAA----TAG--GCGAATCTTCTGTTTAT----TGTGAGTTCAAACGCTTATTAGGGG---GTGGAAC-TATTTGATTGGTGG-TTGTCAGGTTTGCA-TTAACACGATACATGGTTGC--AGATTT---GCGGTAT-AGGAA--AAAATCATG---GC------AGCGGCTGCCAAAGCACCGCCCCCAAAAa
gi|75582 : GTCC-A-AGAAA----TCTTTTGGTCACGTGACCATAGTTCAGCGCGTCTATATACATGCACT-TTAATTCCTTTGT--GCTGATTAATAACACTGAATAT---AATCTTGGAATTTATACGACACACAATTGTTTATAGGTATA--AAT----TGTC-GCTGTCTGTTTTA-ATATTAATG-TTTATGTTGAAA----TAG--GTGAATCTACTGTTTAA----AGCGAGTTCGGACACTTATCAGTAG---GTGGAAC-TTTTTGATTGGTGG-TTGTCAGGTTTGCA-TTAATCTGATACACGGTTGT--A
gi|75583 : ttgaattTT-T-CCAAGATGGCGTCCTG-AAAAA----TCTTTTGGTCACGTGACCATAGTTCAGCGCGTCTG
gi|75584 : -ACATGATGACGTCCTG-AAAAA----TCTTTTGGTCACGTGACCATAGTTCAGCGCGTCTGTATTCATGCGCT-TTAATTCCAGTGT--GCTGATTAATACCACTGATTAT---AAACTTGGAATTTATAAGATACACAATTGTTTATAGGTATA--AAT----CGTC-GCTGTCTGTTATA-ATATTAATG-TTTTCGTTGAAA----TAG--GCGAATCTACTGTTTAT----AGTGAGTT----CGCTTATCAGGGG---GTGGAAC-TATTTGATTGGTGG-TTGTCAGGTTTGCA-TTAACACGATACACGGTTGT--AGATTTGCGGCGGTA--TAAGAACATAATCATGTTAGCTCTGAGAGCGGTTGCTAAAGCACCGCCCCAAAAA
gi|75585 : CAAGATGGCGTCCTG-AAAAA-----ATTTTGGTCACGTGACCATAGTTCAGAGCGTCTGTATTCATGCGCT-TTCATTCCTTTTTTTGCTGATTAATAGCACTGAATAT---AAACTTGGAATTTATACGGTACACAATTGTTTATAGGTATA--AAT----CGTC-GCTGTCTGTTATA-ATATTTTTG-TTTTCGTTGAAA----TAG--GCGAATCTACTGTTTAT----AGTGAGTTCGAACGCTTATCAGGGG---GTAGAAC-TATTTAATTGGTGG-TTGTCAGGTTTGCA-TTAATACGATACACGGTTGT--AGATTT---GCGGTAT-TGGAAA-AAAATCATGTTAGCTCTGAGAGCGGCTGCTAAAGCACCGCACCCAAAAa
gi|75586 : CAAGATGGCATCCTG-AAAAA----TCTTTTGACCACATGACCATTATTCAGAGCGTCTGTATTCATGCTCT-TTAATTCCTTTGT--GCTGATTGATAGCACTGAATAT---TAACTTGGAATTTATATGGTACAAAATTGTTAACAGGTATA--AAT----CGTTTGCTGTCTGTTATA-ATATTAATG-TTTTCGTTAAAA----TAG--GCGAATCTACTGTTTAT----AGTGAGTTTGAACGCTTATCAGGGG---GTGGAAC-TATTTGACTGGTGG-TTGTCAGGTTTGCA-TTAACAGGATACACATTTGT--AGATTT---GCGGTAT-AGGAAA-AAAATCATGTTAGCTCTGAGAGCGGCTGCTAAAGCAACGACCCCAAAAa
gi|75587 : CACGATGGCGTCCTGCAAAAA----TCTTTTAATCACGTGACCATAGTTAAGCGCGTCTGTATTCATGCGTT-TTAATTTCTGTGT--GCTGAATAATAGCACTGAATAT---AAACTTGGAATTTATACGATACACAATTGTTTATAGGTATT--AAT----CATC-GCTGTCTGTTATT-ATATTAATA-TTATCGTTGAAA----TAG--GCGAATCTACTGTTTAT----AGTGAGTTCGAACCCTTATCAGGGG---TTGGAAC-TATTTGATTGGTGG-TTGTCAGGTTTGCA-TTAACACGATACACGGTTGT--AGATTT---GCGGTATAGGAAAAT--AATCATGTTTACTCTGAGAGCAGTTGCTAAAGCACCGCCCCCAAAa
gi|75588 : CAAGATGGCTCCCTG-AAAAA----TCTTTTGGTAACGTGACCATAGTTCAGCGCGTCTGTATTCATGCGCT-TTAATTTCAGTGT--GCTAATTAATAGCACTGAATAT---AAACTTGGAATTTATACGATACACAATTGTTTATAGGTATA--AAC----CTTC-GCAGTCTGTTATT-ATATTAATG--TTACGTTGAAA----TAG--GCGAATCTTCTGTTTAA----AGTGAGTTCGACCGCTTATCATGGG---GTGGAAC-TATTTGATCGGTGG-TTGTCAGGTCTGCA-TTAACACGATACAGGGTTGT--AGATTG---GCGGTATAAGAAAAC--AATCATGTTAGCTCTGAGAGCGACTGCTGAAGAACCGACCCC
gi|75589 : CAAGATAGCGTCCTG-AAAAA----TCTTTTGGTCACATGACCATAGTTCAGCGCATCTGTATTCATGCGCT-ATAATTCCTGTGT--GCTGGTTAATAGCACTGAATTT---AAACTTGGAATTTATGCGATACACAATTGTTTATAGGCATA--AAT----TGTC-GCTGTCTG---TA-ATAATAATA-TTTTCGTTGAAA----TAG--GCGAATTTACTGTTTAT----AGTGAGTTGGAATGCTTATCAGGGG---GTGAAAC-TATTTGATTTGTGG-TTGTCAGGTTTGCA-TTAACACAATACACGGTTGT--AGATTT---GCGGTATATGAAAAT--AATCATGTAAGCTCTGAGAGC-----------CACCGCCCCCAAAA
gi|75590 : CAAGATGGCGTCCTG-AAAAAAA--TATTTTGGCCACGTGACTATAGTTCAGCGCATCTATATTCATGTGCT-TTAATTCCTTTGT--GCTGATTGATAGCACTGAATAT---AA-------------------------TGTTTATAGGTATA--AAT----CGCC-GCTGTCTGTTATA-ATATTATTG-TTTTCGTTGAAA----TAG--GCGAATCTACTGTTTAA----AGTGAGTTCGAACGTTTATCAAGGG---TCGGAAC-TATTCGCTTGGT-G-TTGTCAGGGTTGCA-TTACTACGACACACGGTTGT--AGATTT---GCGGTAT-AGGAAA-AAA--CATGTTAGCTCTTAGAGCGGCTGCTTAAGCCCCGACCCCa
gi|75591 : CAAGATGGCGTCCTG-AAAAAAAAATCTTTCGGTCACGTGAGCATAGTTCAGAGCGTCTGTATGCATACGCT-TTAATTCCATTGT--GCTGATTAATAACACTGACTAT---AAACTTGGAATTTATATGGTACACAATTGTTCATAGGTATA--AATTTACTGTC-GCTGTCTTTTATT-ATATTAATG-TTTT-GTTGAAA----T
gi|75592 : GTCTGTCTTGAATTGTTGTTAATTCCTTTGT--ACTGATTAATAACACTGAATAT---AAACTTGGAATTTATACGATACACAATTGT------GTATA--AAT----CGTC-GCTGTCTGTTATA-ATATTAATG-TTTTCATTGAAA----TAG--GCGAATCTACTGTTTAT----AGTGAGTTTGAACGCTTATTACGGG---GTGGAAC-TATTTGTTTGGTGG-TTGTCAGGTTTGCA-TTAACACGATACACGGTTGT--AGATTT---GCGGTATAGGAAAAAAAAAACATGTTAGCTCTGAGAGCGGCTGCTAAAGCACC-CCCCCAAAA
gi|75593 : TTGATTAT--GTATACTAAT-----------TATCTTTT-TACATAGTAACG-TTATCATTAAAAGCCACAGA-GCAACTTT-TTGTTTGA----AGTGGG-------G------AGGGG---GT------TAC--GAC--GTGG-TAATAAGGTTTGCA-GTAAG--GAAACGCGGTTGTTAAAACAT---G--GT-T-T---AAGAAAATCGTGTTAGCTAAGAACACAACTGCTTAAGCACCGCCACCAAAAa
gi|75594 : ctttgaagttgaaacacacttATACATATTTATG-TTATCGTTGAA-----T-GTCACGGAACCACTTTTT-----------GTTTGAG--------AGGGGAGTGTGGGGC-T-TTTGA--GGCAA-TTGCAAGGCTTATAGTTAG---GAAACGTGATTGTCAAAACAT---G----GT-TTAAGACAAA--TGTGTAAGCTCTATGCACGGTTACTTAAGCACCGCCCCCAAAAa
gi|75595 : GGTAT-----AAGAAAATAGTGTTAGCTCTTAGCACGGTTGATAAATCACCGCCCCC
Alignments
lowQualScore : 33333333
lowQualScore : 555 3 5 11111111 6666 1 22 1 333 0 22 3333 1 0 3 1 3333 44 3333 0 3 333 1 2 1 1 1 44 333 99 8
lowQualScore : ... . . ........ .... . .. . ... . .. .... . . . . .... .. .... . . ... . . . . . .. ... .. .
lowQualScore : 888 1 7 99999999 4444 8 55 3 222 6 44 7777 7 5 3 7 5555 11 7777 9 7 000 7 7 7 7 8 88 222 00 0
consensus : AAAAAAGCGAAATCAGACTCCCGAATCAAGTACTTATTATCTGAAGTCCTTGCCGAAATATACGACTCTTTCAATGTGCATGTTGGCGATATAGTTCGTGAC---CTGGAATTTGATT-T-ACAAGATGGCGTCCTG-AAAAA----TCTTTTGGTCACGTGACCATAGTTCAGCGCGTCTGTATTCATGCGCT-TTAATTCCTTTGT--GCTGATTAATAGCACTGAATAT---AAACTTGGAATTTATACGATACGCAATTGTTTATAGGTATA--AAT----CGTC-GCTGTCTGTTATA-ATATTAATG-TTTTCGTTGAAA----TAG--GCGAATCTACTGTTTAT----AGTGAGTTCGAGCGCTTATCAGGGG---GTGGAAC-TATTTGATTGGTGG-TTGTCAGGTTTGCA-TTAACACGATACACGGTTGT--AGATTT---GCGGTAT-TGAAAATAAAATCATGTTAGCTCTGAGAGCGGCTGCTAAAGCACCGCCCCCAAAA
Reference ( family-688 ) : AAAAAAGCGAAATCAGACTCCCGAATCAAGTACTTATTATCTGAAGTCCTTGCCGAAATATACGACTCTTTCAATGTGCATGTTGGCGATATAGTTCGTGAC---CTGGAATTTGATT-T-ACAAGATGGCGTCCTG-AAAAA----TCTTTTGGTCACGTGACCATAGTTCAGCGCGTCTGTATTCATGCGCT-TTAATTCCTTTGT--GCTGATTAATAGCACTGAATAT---AAACTTGGAATTTATACGATACGCAATTGTTTATAGGTATA--AAT----CGTC-GCTGTCTGTTATA-ATATTAATG-TTTTCGTTGAAA----TAG--GCGAATCTACTGTTTAT----AGTGAGTTCGAGCGCTTATCAGGGG---GTGGAAC-TATTTGATTGGTGG-TTGTCAGGTTTGCA-TTAACACGATACACGGTTGT--AGATTT---GCGGTAT-TGAAAATAAAATCATGTTAGCTCTGAGAGCGGCTGCTAAAGCACCGCCCCCAAAA
gi|75569 : AAAAAAGCGAAATCAGACTCCCGAATCAAGTACTCATTATCTGAAGTCCTTGCCGAAATATAAGACTCTTTCAATGTACATGTTGGCGATATAGTTCGTGAT---CTGGAATTTGATT-T-ACAAGATGGTGT--------AA----TCTTTTGGTCACGTGACCATAGTTCAGCGCGTTTGTATTCATGCGCT-TTAATTCCTTTGT--GCTGATTAATAGCACTGAATAT---AAACTTGGAATTTATACGATACACAATTGTTTATAGGTATA--AAT----CGTC-GTTGTATGTTATA-ATATTAATG-TTTTCGTTGAAA----TAG--GCGAATCTACTGTTTAT----AGTGAGTTGGAGCGCTTATCAGGGG---GCGGAAC-TATTTGATTAGTGG-TTGTTATGTTTGCA-TTAACACGATACACGGTTGT--AGATTT---GCGGTAT-TGAAAATAAAATCATGTTAGCTCTGAGAGCGTCTGCTAAAGCACCGCCCCCAAAA
gi|75570 : AAAAAAGCGAAATCAGACTCCCGAATCAAGTACTTATTATCTGAAGTCCTTGCCGAAATATACGACTCTTTCAATGCGCATGTTGGCGATATAGTTCGTGAC---CTGGAATTTGATT-T-ACACGATGGCGT--------AA----TATTTTGGTCACGTGACCATAGTTCAGCGCGTCTGTATTCATGCGCT-TTAATTCCTTTGT--GCTGATTAATGCTACAGAATAT---AAACTTGGAATTTATACGATACGTAATTGTTTATAGGTATA--AAT----CGTC-GCTGTATGTTATA-ATATTAATG-TTTTCGTTGAAA----TAG--GCGAATCTACTGTTTAT----AGTGAGTTCGAGCGCTTATCAGGGG---GTGGAAC-TATTTGATAAGTGG-TTGTTAGGTTTGCA-TTAACACGAAACACGGTTGT--AGATTT---GCGGTAT-TGAAAATAAAATCATGTTAGCACTTAGAGCGGCTGCTAAAGCACCGCCCCCAAAAa
gi|75571 : AAAAAAGCGAAATCAGACTCCCGAATCAAGTACTTATTATCTAAAGTCCTTGCCGAAATATACGACTCTTTCAACGTACATGTTAGCGACATACTTCGTGAC---CTGGAATTTGATT-TTACAAGATGGCGT--------AA----TCTTTTGGTCACGTGACGATAGTTCACCGCGTCTGTATTCATGCGCT-TTAATTCCTTTGT--GCTGATTAATAGCACTGAATAT---AAACTTGGAATTTATACGATACAGAATTGTTTATAGGTATG--AAT----CGTC-GCTGTCTGTTCTA-ATATTAATGTTTTTCGTTGAAA----TAA--GGTAATCTACTGTTTATAGCGAGCGAGTTCGAACGCTTATCAGATG---GTGGAAC-TATTTGATTAGTGG-TTGTTAGGTTTGCA-TTAACACGATACACGGTTGT--AGGTTT---GCGGTAT-TAAAAAAAAAATCATGTTAGCTTTGAGAGCGGTTGCTAAAGTACCGCCCCCAAAA
gi|75572 : AAAAAAGCGAAATCAGACTCCCGAATCAAGTACTTATTATCTGAAATCCTTGCAGAAATATACAACTCTTTCAATGTGCATGTTGGCGATATAGTTCGTGAC---CTGGAATTTAATT-T-ACAATATGGCGT--------GA----TCTTTTGGTCACGTGACCGTAGTTCAGCGCGTCTGTATTCATGCGCT-TTAATTCCTTTGT--GCTGATTAATGCTACAGAATAT---AAACTTGAAATTTATACAATACGTAATTGTTTATAGGTATA--AAT----CGTC-GCTGTTTGTTATA-ATATTAATG-TTTTCGTTGAAA----TAG--GCGAATCTACTGTTTAA----AGTGAGTTCGAGCGCTTATTAGGGG---ATGGAAC-TATTTGATAAGTGGTTTGT-AGGTTTGCA-TTAACACGAAACACAGTTGT--AGATTT---GCGGTAT-TGAAAATAAAATCATGTTAGCTCTGAGAGCGGCTGCTAAAGCACCGCCCCCCAAAa
gi|75573 : AAAAAAGCGAAATCAGACTCCCGAATCAAGTACTTACTAGCTGAAGTCCTTGCCGAAATATACGACTCTTTCAATGTGCATGTTGGCGATATAGTTCGTGAC---CTGGAATTTGATT-T-ACAAAATGGCGT--------AA----GCTTTTGGTCACATGGCCATAGTTCAGCGCAAATGTATTCATGCGCT-TTAATTCCTTTGT--GCTGATTAATGCTACAGAATAT---AAACTTGGAATTTATACGATACGTAATTGTTAATAGGTATA--AAT----CGTC-GCTGTATGTTATT-ATATTAATG-TTTTCGTTGAAA----TAG--GCGAATCTACTGTTTAT----AGTGAGTTTGAGCGCTTGTCA-GGG---GTGGAAC-TATTTGATAAGTGG-TTGTTAGGTTTGCA-TTAACACGAAACACGGTTGT--AGATTT---GCGGTAT-TGAAGATAAAATTATGTTAGCTCTGAGAGCGGCTGCTAAAGCACCGCCCCCAAAAa
gi|75574 : AAAAAAGCGAAATCAGACTCCCGAATCAAGTACTTATTATCTGAAGTCCTTGCCGAAATATACGACTCTTTCAATGTGCATGTTGACGATATCGTTCGTGAC---CTGGAATTTGATT-T-ACAAGATGGCGT--------AA----TCTTTTGGTCACGTGACCATAGTTCAGCGCGTCTGTATTCATGCGCT-TTAATTCCTTTGT--GCTGATTAATGCTACAGAATAT---AAACTTGAAATTTATATGATACGTAATGGTTTATAGGTATA--AAT----CGTC-GCTGTATGTTATA-ATATTATTA-TTTTCATTGAAA----TAG--GCGAATCTACTGTTTAA----AGTGAGTTCGAGCGCTTATCA-GGG---GTGGAACTTTTTTGATAAGTCG-TTGTTAGGTTTGCA-TTAACACGAAACACGGTTGT--AGATTT---GCGGTAT-TGAAAATAAAATCATGTTAGCTCTGAGAGCGGCTGCTAAAGCACCACCCCCAAAAa
gi|75575 : AAAAAAGCGAAATCAAACTCCCGAATCAAGTACTTATTATCTGAAGTCCTTGCTGAAATATACGACTCTTTCAATGTGCATGTTGGCGATATAGTTCGTGAC---CTGGAATTTGATT-T-ACAAGATGGCGT--------AA----TCTTTTGGT--------------TCAGCGCGTCTGTATTCATGGGCT-TTAATTCCTTTGT--GCTGATTAATGCTACAGAATAT---AAACTTGGAATTTATACGATACGTAATTGTTTATAGGTATA--AAT----CGTC-GCTGTATGTTATA-ATATTAATG-TTTTCATTGAAA----TAG--GCGAATCTACTGTTTAT----AGTGAGTTCGAGCGCTTATCA---G---GTGGAAC-TATTTGATAAGTGG-TTGTTAGGTTTGCA-TTAACACGAAACACGTTTGT--AGATTT---GCGGTAT-TGAAAATAAAATCATGTTAGCTCTGAGAGCGGCTGCTAAAGCACCGCCCCCAAAAa
gi|75576 : AAAAAAGCGAAATCAAACTCCCGAATCAAGTACTTATTATCTGAAGTCCTTGCCGAAATATACGACTCTTTCAATGTGCATGTTGGCGATATAGTTCGTGAC---CTGGAATTTGATT-T-ACAAGATGGCGT--------AA----TCTTTTGGT--------------TCAGCGCGTCTGTATTCATGCGCT-TTCATTCTTTTGT--GCTGATTAATGCTACAGAATAT---AAACTTGGAATTTATACGATACGTAATTGTTTATAGGTATA--AAT----CGTT-GCTATATGTTTTA-ATATTAATA-TTTTCGTTGAAA----TAG--GCGAATCTACTGTTTAT----AGTGAGTTCGAGAGCTTATCA---G---GTGGAAC-TATTTGATAAGTGG-TTGTTAGGTCTGCA-TTAACACGAAACACGGTTGT--AGATTT---GCGGTAT-TGAAAATAAAATCATGTTAGCTCTGAGAGCGGCTGCTAAAGCACCGCCCCCAAAAa
gi|75577 : AAAAAAGCGAAATCAAACTCCCGAATCAAGTACTTATTATCTGAAGTCCTTGCCGAAATATACGACTCTTTCAATGTGCATGTTGGCGATATAGTTCGTGAC---CTGGAATATGATT-T-ACAAGATGGCGT--------AA----TCTTTTGGT--------------TCAGCGCGTCTGTATTCATGCGCT-TTCATTCCTTTGT--GCTGATTAATGCTACAGAATAT---AAACTTGGAATTTATACGATACGTAATTGTTTATAGGTATA--AAT----CGTC-ACTGTATGTTATA-ATATTAATA-TTTTCGTTGAAA----TAG--GCAAATCTACTGTTTAT----AGTGAGTTCGAGAGCTTATAA---G---GTGGAAC-TATTTGATAAGTGG-TTGTTAGGTCTGCA-TTAACACGAAACACGGTTGT--AGATTT---GCAGTAT-TGAAAATAAAATCATGTTAGCTTTGAGAGCGGCTGCTAAAGCACCGCCCCCAAAAa
gi|75578 : AATAAAGCAAAATCAGACTCCCGAATCAAGTACTTATTATCTGAAGTCCTa
gi|75579 : CGAAACAAGTACTTAATATCTGAAGTCCTTGCAGAAATATACGACTCTTTCAATGTACATGTTGGTGATATACTTCGTGAC---CTGGAATTTGATT-TTACAAGATGGCAT--------AA----TCTTTTGGTCACGTGACCATAGTTCAGCGCATCTGTATTCATGCGCT-TTAATTCCTTTGT--GTTGATTAATAGCACTGAATTT---AAACTTG-AATTTATACGATACACAATTGTTTATAGGTATA--AAT----CGCT-GCTGTCTGTTATA-ATATTAATG-TTTTCGTTGA------TAG--GCGAATCTACTGTTTAT----AGCGAGTTCAAACGCTTATCAGGGG---GTGAAAC-TGTTTGATTGGTGG-TTGTCAGGTTGGCA-TTAACACGATACACGGTTGT--AGATTT---TTGGTAT-AGGAAAAAAAATCACGTTAGTTCTGAGAGAGACTGCTAAAGCACCGCCCTAAAAA
gi|75580 : TGACTGTCTTGAATT-GTTG-T-CCAAGATGGCGTCCTG-A--------CCTTTTGGTCACGTGATCATAGTTCAGCGCGTCTGTATTCATGCGCT-TAAATTCCTTTGG--ACTGATTAATAGCACTGAATAG---AAACTTTGAATTTATACGATACACAATTGTTTATAGGAATA--TAT----CGTC-GCTGTCTGTTATA-ATATTAATG-TTTTCGTTGAAA----TAG--GCGAATCTACTGTTTAT----AGTGAGTTCGAACGCTTATCAGAGG---GTGAAAA-TATTTGATTGGTGG-TTGTCAGGTTTGCA-TTATTACGATACACGGTTGT--AGATTT---GCGGTAT-AGGAAA-AAAAACACGTAAGCTATGAGAGCTGCTGCTAAAGCACCGCCCCCAGAAa
gi|75581 : ---CTTGAATT--ATTGT-CCAAGATGGCATCCTG-AAAAA----TCTTTTAGTCACATGACCATAGTTCAGCACGTCTATATTCATGCGCT-TTAATTCCTTTGT--GCTGATTAAAAGGACTGAATATTATAAA-TTGGAATTTATAAGTTACGCAATTGTTTATAGGTATA--AAT----CGTT-GCTGT----TATA-ATATAAATG-TTTTTGTTGAAA----TAG--GCGAATCTTCTGTTTAT----TGTGAGTTCAAACGCTTATTAGGGG---GTGGAAC-TATTTGATTGGTGG-TTGTCAGGTTTGCA-TTAACACGATACATGGTTGC--AGATTT---GCGGTAT-AGGAA--AAAATCATG---GC------AGCGGCTGCCAAAGCACCGCCCCCAAAAa
gi|75582 : GTCC-A-AGAAA----TCTTTTGGTCACGTGACCATAGTTCAGCGCGTCTATATACATGCACT-TTAATTCCTTTGT--GCTGATTAATAACACTGAATAT---AATCTTGGAATTTATACGACACACAATTGTTTATAGGTATA--AAT----TGTC-GCTGTCTGTTTTA-ATATTAATG-TTTATGTTGAAA----TAG--GTGAATCTACTGTTTAA----AGCGAGTTCGGACACTTATCAGTAG---GTGGAAC-TTTTTGATTGGTGG-TTGTCAGGTTTGCA-TTAATCTGATACACGGTTGT--A
gi|75583 : ttgaattTT-T-CCAAGATGGCGTCCTG-AAAAA----TCTTTTGGTCACGTGACCATAGTTCAGCGCGTCTG
gi|75584 : -ACATGATGACGTCCTG-AAAAA----TCTTTTGGTCACGTGACCATAGTTCAGCGCGTCTGTATTCATGCGCT-TTAATTCCAGTGT--GCTGATTAATACCACTGATTAT---AAACTTGGAATTTATAAGATACACAATTGTTTATAGGTATA--AAT----CGTC-GCTGTCTGTTATA-ATATTAATG-TTTTCGTTGAAA----TAG--GCGAATCTACTGTTTAT----AGTGAGTT----CGCTTATCAGGGG---GTGGAAC-TATTTGATTGGTGG-TTGTCAGGTTTGCA-TTAACACGATACACGGTTGT--AGATTTGCGGCGGTA--TAAGAACATAATCATGTTAGCTCTGAGAGCGGTTGCTAAAGCACCGCCCCAAAAA
gi|75585 : CAAGATGGCGTCCTG-AAAAA-----ATTTTGGTCACGTGACCATAGTTCAGAGCGTCTGTATTCATGCGCT-TTCATTCCTTTTTTTGCTGATTAATAGCACTGAATAT---AAACTTGGAATTTATACGGTACACAATTGTTTATAGGTATA--AAT----CGTC-GCTGTCTGTTATA-ATATTTTTG-TTTTCGTTGAAA----TAG--GCGAATCTACTGTTTAT----AGTGAGTTCGAACGCTTATCAGGGG---GTAGAAC-TATTTAATTGGTGG-TTGTCAGGTTTGCA-TTAATACGATACACGGTTGT--AGATTT---GCGGTAT-TGGAAA-AAAATCATGTTAGCTCTGAGAGCGGCTGCTAAAGCACCGCACCCAAAAa
gi|75586 : CAAGATGGCATCCTG-AAAAA----TCTTTTGACCACATGACCATTATTCAGAGCGTCTGTATTCATGCTCT-TTAATTCCTTTGT--GCTGATTGATAGCACTGAATAT---TAACTTGGAATTTATATGGTACAAAATTGTTAACAGGTATA--AAT----CGTTTGCTGTCTGTTATA-ATATTAATG-TTTTCGTTAAAA----TAG--GCGAATCTACTGTTTAT----AGTGAGTTTGAACGCTTATCAGGGG---GTGGAAC-TATTTGACTGGTGG-TTGTCAGGTTTGCA-TTAACAGGATACACATTTGT--AGATTT---GCGGTAT-AGGAAA-AAAATCATGTTAGCTCTGAGAGCGGCTGCTAAAGCAACGACCCCAAAAa
gi|75587 : CACGATGGCGTCCTGCAAAAA----TCTTTTAATCACGTGACCATAGTTAAGCGCGTCTGTATTCATGCGTT-TTAATTTCTGTGT--GCTGAATAATAGCACTGAATAT---AAACTTGGAATTTATACGATACACAATTGTTTATAGGTATT--AAT----CATC-GCTGTCTGTTATT-ATATTAATA-TTATCGTTGAAA----TAG--GCGAATCTACTGTTTAT----AGTGAGTTCGAACCCTTATCAGGGG---TTGGAAC-TATTTGATTGGTGG-TTGTCAGGTTTGCA-TTAACACGATACACGGTTGT--AGATTT---GCGGTATAGGAAAAT--AATCATGTTTACTCTGAGAGCAGTTGCTAAAGCACCGCCCCCAAAa
gi|75588 : CAAGATGGCTCCCTG-AAAAA----TCTTTTGGTAACGTGACCATAGTTCAGCGCGTCTGTATTCATGCGCT-TTAATTTCAGTGT--GCTAATTAATAGCACTGAATAT---AAACTTGGAATTTATACGATACACAATTGTTTATAGGTATA--AAC----CTTC-GCAGTCTGTTATT-ATATTAATG--TTACGTTGAAA----TAG--GCGAATCTTCTGTTTAA----AGTGAGTTCGACCGCTTATCATGGG---GTGGAAC-TATTTGATCGGTGG-TTGTCAGGTCTGCA-TTAACACGATACAGGGTTGT--AGATTG---GCGGTATAAGAAAAC--AATCATGTTAGCTCTGAGAGCGACTGCTGAAGAACCGACCCC
gi|75589 : CAAGATAGCGTCCTG-AAAAA----TCTTTTGGTCACATGACCATAGTTCAGCGCATCTGTATTCATGCGCT-ATAATTCCTGTGT--GCTGGTTAATAGCACTGAATTT---AAACTTGGAATTTATGCGATACACAATTGTTTATAGGCATA--AAT----TGTC-GCTGTCTG---TA-ATAATAATA-TTTTCGTTGAAA----TAG--GCGAATTTACTGTTTAT----AGTGAGTTGGAATGCTTATCAGGGG---GTGAAAC-TATTTGATTTGTGG-TTGTCAGGTTTGCA-TTAACACAATACACGGTTGT--AGATTT---GCGGTATATGAAAAT--AATCATGTAAGCTCTGAGAGC-----------CACCGCCCCCAAAA
gi|75590 : CAAGATGGCGTCCTG-AAAAAAA--TATTTTGGCCACGTGACTATAGTTCAGCGCATCTATATTCATGTGCT-TTAATTCCTTTGT--GCTGATTGATAGCACTGAATAT---AA-------------------------TGTTTATAGGTATA--AAT----CGCC-GCTGTCTGTTATA-ATATTATTG-TTTTCGTTGAAA----TAG--GCGAATCTACTGTTTAA----AGTGAGTTCGAACGTTTATCAAGGG---TCGGAAC-TATTCGCTTGGT-G-TTGTCAGGGTTGCA-TTACTACGACACACGGTTGT--AGATTT---GCGGTAT-AGGAAA-AAA--CATGTTAGCTCTTAGAGCGGCTGCTTAAGCCCCGACCCCa
gi|75591 : CAAGATGGCGTCCTG-AAAAAAAAATCTTTCGGTCACGTGAGCATAGTTCAGAGCGTCTGTATGCATACGCT-TTAATTCCATTGT--GCTGATTAATAACACTGACTAT---AAACTTGGAATTTATATGGTACACAATTGTTCATAGGTATA--AATTTACTGTC-GCTGTCTTTTATT-ATATTAATG-TTTT-GTTGAAA----T
gi|75592 : GTCTGTCTTGAATTGTTGTTAATTCCTTTGT--ACTGATTAATAACACTGAATAT---AAACTTGGAATTTATACGATACACAATTGT------GTATA--AAT----CGTC-GCTGTCTGTTATA-ATATTAATG-TTTTCATTGAAA----TAG--GCGAATCTACTGTTTAT----AGTGAGTTTGAACGCTTATTACGGG---GTGGAAC-TATTTGTTTGGTGG-TTGTCAGGTTTGCA-TTAACACGATACACGGTTGT--AGATTT---GCGGTATAGGAAAAAAAAAACATGTTAGCTCTGAGAGCGGCTGCTAAAGCACC-CCCCCAAAA
gi|75593 : TTGATTAT--GTATACTAAT-----------TATCTTTT-TACATAGTAACG-TTATCATTAAAAGCCACAGA-GCAACTTT-TTGTTTGA----AGTGGG-------G------AGGGG---GT------TAC--GAC--GTGG-TAATAAGGTTTGCA-GTAAG--GAAACGCGGTTGTTAAAACAT---G--GT-T-T---AAGAAAATCGTGTTAGCTAAGAACACAACTGCTTAAGCACCGCCACCAAAAa
gi|75594 : ctttgaagttgaaacacacttATACATATTTATG-TTATCGTTGAA-----T-GTCACGGAACCACTTTTT-----------GTTTGAG--------AGGGGAGTGTGGGGC-T-TTTGA--GGCAA-TTGCAAGGCTTATAGTTAG---GAAACGTGATTGTCAAAACAT---G----GT-TTAAGACAAA--TGTGTAAGCTCTATGCACGGTTACTTAAGCACCGCCCCCAAAAa
gi|75595 : GGTAT-----AAGAAAATAGTGTTAGCTCTTAGCACGGTTGATAAATCACCGCCCCC
blockSeqs : TGT G T CCTGCAAA AAAA G TT C TAT CT TTAC T C T GCCA TC AGCG G AGT T A T G A TA GCG AG T
blockSeqs : . . T CCTGAAA AA . . G . . . . C . . A . G . . T . . T CA . AA A
blockSeqs : . . . CCTGAAA . . . C . . . . . . . . . G . . A . . A . . AT T
blockSeqs : . . . CCTGAAA . . . C . . . . . . . . . G . . A . . A . . AG T
blockSeqs : . . . CCTGAAA . . . C . . . . . . . . . G . . A . . A . . T T
blockSeqs : . . . CCTGAAA . . . C . . . . . . . . . G . . A . . A . . T T
blockSeqs : . . . CCTGAAA . . . C . . . . . . . . . G . . A . . A . . T T
blockSeqs : . . . CCTGAAA . . . C . . . . . . . . . G . . A . . A . . T T
blockSeqs : . . . CCTGAAA . . . G . . . . . . . . . G . . T . . T . . T A
blockSeqs : . . . CCTGAAA . . . G . . . . . . . . . G . . T . . T . . T C
blockSeqs : . . . CCAAGA . . . G . . . . . . . . . G . . T . . T . . T T
blockSeqs : . . CCTGA . . . A . . . . . . . . . T . . T . . T . . T C
blockSeqs : . . . . . C . . . . . . . . . G . . T . . T . . A T
blockSeqs : . . . . G . . . . . . . . . A . . T . . T . . A A
blockSeqs : . . . . G . . . . . . . . . C . . T . . T . . A G
blockSeqs : . . . . G . . . . . . . . . G . . T . . T . . T C
blockSeqs : . . . . G . . . . . . . . . G . . C . . T . . T G
blockSeqs : . . . . G . . . . . . . . . . . . T . . T . . A .
blockSeqs : . . . . G . . . . . . . . . . . . T . . C . . A .
blockSeqs : . . . . A . . . . . . . . . . . . T . . T . . T .
blockSeqs : . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . A . . T .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqCons : CCTGAAA*
originalCons : AAAAAAGCGAAATCAGACTCCCGAATCAAGTACTTATTATCTGAAGTCCTTGCCGAAATATACGACTCTTTCAATGTGCATGTTGGCGATATAGTTCGTGAC---CTGGAATTTGATT-T-ACAAGATGGCGTCCTG-AAAAA----TCTTTTGGTCACGTGACCATAGTTCAGCGCGTCTGTATTCATGCGCT-TTAATTCCTTTGT--GCTGATTAATAGCACTGAATAT---AAACTTGGAATTTATACGATACGCAATTGTTTATAGGTATA--AAT----CGTC-GCTGTCTGTTATA-ATATTAATG-TTTTCGTTGAAA----TAG--GCGAATCTACTGTTTAT----AGTGAGTTCGAGCGCTTATCAGGGG---GTGGAAC-TATTTGATTGGTGG-TTGTCAGGTTTGCA-TTAACACGATACACGGTTGT--AGATTT---GCGGTAT-TGAAAATAAAATCATGTTAGCTCTGAGAGCGGCTGCTAAAGCACCGCCCCCAAAA
finalCons : AAAAAAGCGAAATCAGACTCCCGAATCAAGTACTTATTATCTGAAGTCCTTGCCGAAATATACGACTCTTTCAATGTGCATGTTGGCGATATAGTTCGTGAC---CTGGAATTTGATT-T-ACAAGATGGCGTCCTGAAA-AA----TCTTTTGGTCACGTGACCATAGTTCAGCGCGTCTGTATTCATGCGCT-TTAATTCCTTTGT--GCTGATTAATAGCACTGAATAT---AAACTTGGAATTTATACGATACGCAATTGTTTATAGGTATA--AAT----CGTC-GCTGTCTGTTATA-ATATTAATG-TTTTCGTTGAAA----TAG--GCGAATCTACTGTTTAT----AGTGAGTTCGAGCGCTTATCAGGGG---GTGGAAC-TATTTGATTGGTGG-TTGTCAGGTTTGCA-TTAACACGATACACGGTTGT--AGATTT---GCGGTAT-TGAAAATAAAATCATGTTAGCTCTGAGAGCGGCTGCTAAAGCACCGCCCCCAAAA
Alignments
lowQualScore : 33333333
lowQualScore : 555 3 5 11111111 6666 1 22 1 333 0 22 3333 1 0 3 1 3333 44 3333 0 3 333 1 2 1 1 1 44 333 99 8
lowQualScore : ... . . ........ .... . .. . ... . .. .... . . . . .... .. .... . . ... . . . . . .. ... .. .
lowQualScore : 888 1 7 99999999 4444 8 55 3 222 6 44 7777 7 5 3 7 5555 11 7777 9 7 000 7 7 7 7 8 88 222 00 0
consensus : AAAAAAGCGAAATCAGACTCCCGAATCAAGTACTTATTATCTGAAGTCCTTGCCGAAATATACGACTCTTTCAATGTGCATGTTGGCGATATAGTTCGTGAC---CTGGAATTTGATT-T-ACAAGATGGCGTCCTG-AAAAA----TCTTTTGGTCACGTGACCATAGTTCAGCGCGTCTGTATTCATGCGCT-TTAATTCCTTTGT--GCTGATTAATAGCACTGAATAT---AAACTTGGAATTTATACGATACGCAATTGTTTATAGGTATA--AAT----CGTC-GCTGTCTGTTATA-ATATTAATG-TTTTCGTTGAAA----TAG--GCGAATCTACTGTTTAT----AGTGAGTTCGAGCGCTTATCAGGGG---GTGGAAC-TATTTGATTGGTGG-TTGTCAGGTTTGCA-TTAACACGATACACGGTTGT--AGATTT---GCGGTAT-TGAAAATAAAATCATGTTAGCTCTGAGAGCGGCTGCTAAAGCACCGCCCCCAAAA
Reference ( family-688 ) : AAAAAAGCGAAATCAGACTCCCGAATCAAGTACTTATTATCTGAAGTCCTTGCCGAAATATACGACTCTTTCAATGTGCATGTTGGCGATATAGTTCGTGAC---CTGGAATTTGATT-T-ACAAGATGGCGTCCTG-AAAAA----TCTTTTGGTCACGTGACCATAGTTCAGCGCGTCTGTATTCATGCGCT-TTAATTCCTTTGT--GCTGATTAATAGCACTGAATAT---AAACTTGGAATTTATACGATACGCAATTGTTTATAGGTATA--AAT----CGTC-GCTGTCTGTTATA-ATATTAATG-TTTTCGTTGAAA----TAG--GCGAATCTACTGTTTAT----AGTGAGTTCGAGCGCTTATCAGGGG---GTGGAAC-TATTTGATTGGTGG-TTGTCAGGTTTGCA-TTAACACGATACACGGTTGT--AGATTT---GCGGTAT-TGAAAATAAAATCATGTTAGCTCTGAGAGCGGCTGCTAAAGCACCGCCCCCAAAA
gi|75569 : AAAAAAGCGAAATCAGACTCCCGAATCAAGTACTCATTATCTGAAGTCCTTGCCGAAATATAAGACTCTTTCAATGTACATGTTGGCGATATAGTTCGTGAT---CTGGAATTTGATT-T-ACAAGATGGTGT--------AA----TCTTTTGGTCACGTGACCATAGTTCAGCGCGTTTGTATTCATGCGCT-TTAATTCCTTTGT--GCTGATTAATAGCACTGAATAT---AAACTTGGAATTTATACGATACACAATTGTTTATAGGTATA--AAT----CGTC-GTTGTATGTTATA-ATATTAATG-TTTTCGTTGAAA----TAG--GCGAATCTACTGTTTAT----AGTGAGTTGGAGCGCTTATCAGGGG---GCGGAAC-TATTTGATTAGTGG-TTGTTATGTTTGCA-TTAACACGATACACGGTTGT--AGATTT---GCGGTAT-TGAAAATAAAATCATGTTAGCTCTGAGAGCGTCTGCTAAAGCACCGCCCCCAAAA
gi|75570 : AAAAAAGCGAAATCAGACTCCCGAATCAAGTACTTATTATCTGAAGTCCTTGCCGAAATATACGACTCTTTCAATGCGCATGTTGGCGATATAGTTCGTGAC---CTGGAATTTGATT-T-ACACGATGGCGT--------AA----TATTTTGGTCACGTGACCATAGTTCAGCGCGTCTGTATTCATGCGCT-TTAATTCCTTTGT--GCTGATTAATGCTACAGAATAT---AAACTTGGAATTTATACGATACGTAATTGTTTATAGGTATA--AAT----CGTC-GCTGTATGTTATA-ATATTAATG-TTTTCGTTGAAA----TAG--GCGAATCTACTGTTTAT----AGTGAGTTCGAGCGCTTATCAGGGG---GTGGAAC-TATTTGATAAGTGG-TTGTTAGGTTTGCA-TTAACACGAAACACGGTTGT--AGATTT---GCGGTAT-TGAAAATAAAATCATGTTAGCACTTAGAGCGGCTGCTAAAGCACCGCCCCCAAAAa
gi|75571 : AAAAAAGCGAAATCAGACTCCCGAATCAAGTACTTATTATCTAAAGTCCTTGCCGAAATATACGACTCTTTCAACGTACATGTTAGCGACATACTTCGTGAC---CTGGAATTTGATT-TTACAAGATGGCGT--------AA----TCTTTTGGTCACGTGACGATAGTTCACCGCGTCTGTATTCATGCGCT-TTAATTCCTTTGT--GCTGATTAATAGCACTGAATAT---AAACTTGGAATTTATACGATACAGAATTGTTTATAGGTATG--AAT----CGTC-GCTGTCTGTTCTA-ATATTAATGTTTTTCGTTGAAA----TAA--GGTAATCTACTGTTTATAGCGAGCGAGTTCGAACGCTTATCAGATG---GTGGAAC-TATTTGATTAGTGG-TTGTTAGGTTTGCA-TTAACACGATACACGGTTGT--AGGTTT---GCGGTAT-TAAAAAAAAAATCATGTTAGCTTTGAGAGCGGTTGCTAAAGTACCGCCCCCAAAA
gi|75572 : AAAAAAGCGAAATCAGACTCCCGAATCAAGTACTTATTATCTGAAATCCTTGCAGAAATATACAACTCTTTCAATGTGCATGTTGGCGATATAGTTCGTGAC---CTGGAATTTAATT-T-ACAATATGGCGT--------GA----TCTTTTGGTCACGTGACCGTAGTTCAGCGCGTCTGTATTCATGCGCT-TTAATTCCTTTGT--GCTGATTAATGCTACAGAATAT---AAACTTGAAATTTATACAATACGTAATTGTTTATAGGTATA--AAT----CGTC-GCTGTTTGTTATA-ATATTAATG-TTTTCGTTGAAA----TAG--GCGAATCTACTGTTTAA----AGTGAGTTCGAGCGCTTATTAGGGG---ATGGAAC-TATTTGATAAGTGGTTTGT-AGGTTTGCA-TTAACACGAAACACAGTTGT--AGATTT---GCGGTAT-TGAAAATAAAATCATGTTAGCTCTGAGAGCGGCTGCTAAAGCACCGCCCCCCAAAa
gi|75573 : AAAAAAGCGAAATCAGACTCCCGAATCAAGTACTTACTAGCTGAAGTCCTTGCCGAAATATACGACTCTTTCAATGTGCATGTTGGCGATATAGTTCGTGAC---CTGGAATTTGATT-T-ACAAAATGGCGT--------AA----GCTTTTGGTCACATGGCCATAGTTCAGCGCAAATGTATTCATGCGCT-TTAATTCCTTTGT--GCTGATTAATGCTACAGAATAT---AAACTTGGAATTTATACGATACGTAATTGTTAATAGGTATA--AAT----CGTC-GCTGTATGTTATT-ATATTAATG-TTTTCGTTGAAA----TAG--GCGAATCTACTGTTTAT----AGTGAGTTTGAGCGCTTGTCA-GGG---GTGGAAC-TATTTGATAAGTGG-TTGTTAGGTTTGCA-TTAACACGAAACACGGTTGT--AGATTT---GCGGTAT-TGAAGATAAAATTATGTTAGCTCTGAGAGCGGCTGCTAAAGCACCGCCCCCAAAAa
gi|75574 : AAAAAAGCGAAATCAGACTCCCGAATCAAGTACTTATTATCTGAAGTCCTTGCCGAAATATACGACTCTTTCAATGTGCATGTTGACGATATCGTTCGTGAC---CTGGAATTTGATT-T-ACAAGATGGCGT--------AA----TCTTTTGGTCACGTGACCATAGTTCAGCGCGTCTGTATTCATGCGCT-TTAATTCCTTTGT--GCTGATTAATGCTACAGAATAT---AAACTTGAAATTTATATGATACGTAATGGTTTATAGGTATA--AAT----CGTC-GCTGTATGTTATA-ATATTATTA-TTTTCATTGAAA----TAG--GCGAATCTACTGTTTAA----AGTGAGTTCGAGCGCTTATCA-GGG---GTGGAACTTTTTTGATAAGTCG-TTGTTAGGTTTGCA-TTAACACGAAACACGGTTGT--AGATTT---GCGGTAT-TGAAAATAAAATCATGTTAGCTCTGAGAGCGGCTGCTAAAGCACCACCCCCAAAAa
gi|75575 : AAAAAAGCGAAATCAAACTCCCGAATCAAGTACTTATTATCTGAAGTCCTTGCTGAAATATACGACTCTTTCAATGTGCATGTTGGCGATATAGTTCGTGAC---CTGGAATTTGATT-T-ACAAGATGGCGT--------AA----TCTTTTGGT--------------TCAGCGCGTCTGTATTCATGGGCT-TTAATTCCTTTGT--GCTGATTAATGCTACAGAATAT---AAACTTGGAATTTATACGATACGTAATTGTTTATAGGTATA--AAT----CGTC-GCTGTATGTTATA-ATATTAATG-TTTTCATTGAAA----TAG--GCGAATCTACTGTTTAT----AGTGAGTTCGAGCGCTTATCA---G---GTGGAAC-TATTTGATAAGTGG-TTGTTAGGTTTGCA-TTAACACGAAACACGTTTGT--AGATTT---GCGGTAT-TGAAAATAAAATCATGTTAGCTCTGAGAGCGGCTGCTAAAGCACCGCCCCCAAAAa
gi|75576 : AAAAAAGCGAAATCAAACTCCCGAATCAAGTACTTATTATCTGAAGTCCTTGCCGAAATATACGACTCTTTCAATGTGCATGTTGGCGATATAGTTCGTGAC---CTGGAATTTGATT-T-ACAAGATGGCGT--------AA----TCTTTTGGT--------------TCAGCGCGTCTGTATTCATGCGCT-TTCATTCTTTTGT--GCTGATTAATGCTACAGAATAT---AAACTTGGAATTTATACGATACGTAATTGTTTATAGGTATA--AAT----CGTT-GCTATATGTTTTA-ATATTAATA-TTTTCGTTGAAA----TAG--GCGAATCTACTGTTTAT----AGTGAGTTCGAGAGCTTATCA---G---GTGGAAC-TATTTGATAAGTGG-TTGTTAGGTCTGCA-TTAACACGAAACACGGTTGT--AGATTT---GCGGTAT-TGAAAATAAAATCATGTTAGCTCTGAGAGCGGCTGCTAAAGCACCGCCCCCAAAAa
gi|75577 : AAAAAAGCGAAATCAAACTCCCGAATCAAGTACTTATTATCTGAAGTCCTTGCCGAAATATACGACTCTTTCAATGTGCATGTTGGCGATATAGTTCGTGAC---CTGGAATATGATT-T-ACAAGATGGCGT--------AA----TCTTTTGGT--------------TCAGCGCGTCTGTATTCATGCGCT-TTCATTCCTTTGT--GCTGATTAATGCTACAGAATAT---AAACTTGGAATTTATACGATACGTAATTGTTTATAGGTATA--AAT----CGTC-ACTGTATGTTATA-ATATTAATA-TTTTCGTTGAAA----TAG--GCAAATCTACTGTTTAT----AGTGAGTTCGAGAGCTTATAA---G---GTGGAAC-TATTTGATAAGTGG-TTGTTAGGTCTGCA-TTAACACGAAACACGGTTGT--AGATTT---GCAGTAT-TGAAAATAAAATCATGTTAGCTTTGAGAGCGGCTGCTAAAGCACCGCCCCCAAAAa
gi|75578 : AATAAAGCAAAATCAGACTCCCGAATCAAGTACTTATTATCTGAAGTCCTa
gi|75579 : CGAAACAAGTACTTAATATCTGAAGTCCTTGCAGAAATATACGACTCTTTCAATGTACATGTTGGTGATATACTTCGTGAC---CTGGAATTTGATT-TTACAAGATGGCAT--------AA----TCTTTTGGTCACGTGACCATAGTTCAGCGCATCTGTATTCATGCGCT-TTAATTCCTTTGT--GTTGATTAATAGCACTGAATTT---AAACTTG-AATTTATACGATACACAATTGTTTATAGGTATA--AAT----CGCT-GCTGTCTGTTATA-ATATTAATG-TTTTCGTTGA------TAG--GCGAATCTACTGTTTAT----AGCGAGTTCAAACGCTTATCAGGGG---GTGAAAC-TGTTTGATTGGTGG-TTGTCAGGTTGGCA-TTAACACGATACACGGTTGT--AGATTT---TTGGTAT-AGGAAAAAAAATCACGTTAGTTCTGAGAGAGACTGCTAAAGCACCGCCCTAAAAA
gi|75580 : TGACTGTCTTGAATT-GTTG-T-CCAAGATGGCGTCCTG-A--------CCTTTTGGTCACGTGATCATAGTTCAGCGCGTCTGTATTCATGCGCT-TAAATTCCTTTGG--ACTGATTAATAGCACTGAATAG---AAACTTTGAATTTATACGATACACAATTGTTTATAGGAATA--TAT----CGTC-GCTGTCTGTTATA-ATATTAATG-TTTTCGTTGAAA----TAG--GCGAATCTACTGTTTAT----AGTGAGTTCGAACGCTTATCAGAGG---GTGAAAA-TATTTGATTGGTGG-TTGTCAGGTTTGCA-TTATTACGATACACGGTTGT--AGATTT---GCGGTAT-AGGAAA-AAAAACACGTAAGCTATGAGAGCTGCTGCTAAAGCACCGCCCCCAGAAa
gi|75581 : ---CTTGAATT--ATTGT-CCAAGATGGCATCCTG-AAAAA----TCTTTTAGTCACATGACCATAGTTCAGCACGTCTATATTCATGCGCT-TTAATTCCTTTGT--GCTGATTAAAAGGACTGAATATTATAAA-TTGGAATTTATAAGTTACGCAATTGTTTATAGGTATA--AAT----CGTT-GCTGT----TATA-ATATAAATG-TTTTTGTTGAAA----TAG--GCGAATCTTCTGTTTAT----TGTGAGTTCAAACGCTTATTAGGGG---GTGGAAC-TATTTGATTGGTGG-TTGTCAGGTTTGCA-TTAACACGATACATGGTTGC--AGATTT---GCGGTAT-AGGAA--AAAATCATG---GC------AGCGGCTGCCAAAGCACCGCCCCCAAAAa
gi|75582 : GTCC-A-AGAAA----TCTTTTGGTCACGTGACCATAGTTCAGCGCGTCTATATACATGCACT-TTAATTCCTTTGT--GCTGATTAATAACACTGAATAT---AATCTTGGAATTTATACGACACACAATTGTTTATAGGTATA--AAT----TGTC-GCTGTCTGTTTTA-ATATTAATG-TTTATGTTGAAA----TAG--GTGAATCTACTGTTTAA----AGCGAGTTCGGACACTTATCAGTAG---GTGGAAC-TTTTTGATTGGTGG-TTGTCAGGTTTGCA-TTAATCTGATACACGGTTGT--A
gi|75583 : ttgaattTT-T-CCAAGATGGCGTCCTG-AAAAA----TCTTTTGGTCACGTGACCATAGTTCAGCGCGTCTG
gi|75584 : -ACATGATGACGTCCTG-AAAAA----TCTTTTGGTCACGTGACCATAGTTCAGCGCGTCTGTATTCATGCGCT-TTAATTCCAGTGT--GCTGATTAATACCACTGATTAT---AAACTTGGAATTTATAAGATACACAATTGTTTATAGGTATA--AAT----CGTC-GCTGTCTGTTATA-ATATTAATG-TTTTCGTTGAAA----TAG--GCGAATCTACTGTTTAT----AGTGAGTT----CGCTTATCAGGGG---GTGGAAC-TATTTGATTGGTGG-TTGTCAGGTTTGCA-TTAACACGATACACGGTTGT--AGATTTGCGGCGGTA--TAAGAACATAATCATGTTAGCTCTGAGAGCGGTTGCTAAAGCACCGCCCCAAAAA
gi|75585 : CAAGATGGCGTCCTG-AAAAA-----ATTTTGGTCACGTGACCATAGTTCAGAGCGTCTGTATTCATGCGCT-TTCATTCCTTTTTTTGCTGATTAATAGCACTGAATAT---AAACTTGGAATTTATACGGTACACAATTGTTTATAGGTATA--AAT----CGTC-GCTGTCTGTTATA-ATATTTTTG-TTTTCGTTGAAA----TAG--GCGAATCTACTGTTTAT----AGTGAGTTCGAACGCTTATCAGGGG---GTAGAAC-TATTTAATTGGTGG-TTGTCAGGTTTGCA-TTAATACGATACACGGTTGT--AGATTT---GCGGTAT-TGGAAA-AAAATCATGTTAGCTCTGAGAGCGGCTGCTAAAGCACCGCACCCAAAAa
gi|75586 : CAAGATGGCATCCTG-AAAAA----TCTTTTGACCACATGACCATTATTCAGAGCGTCTGTATTCATGCTCT-TTAATTCCTTTGT--GCTGATTGATAGCACTGAATAT---TAACTTGGAATTTATATGGTACAAAATTGTTAACAGGTATA--AAT----CGTTTGCTGTCTGTTATA-ATATTAATG-TTTTCGTTAAAA----TAG--GCGAATCTACTGTTTAT----AGTGAGTTTGAACGCTTATCAGGGG---GTGGAAC-TATTTGACTGGTGG-TTGTCAGGTTTGCA-TTAACAGGATACACATTTGT--AGATTT---GCGGTAT-AGGAAA-AAAATCATGTTAGCTCTGAGAGCGGCTGCTAAAGCAACGACCCCAAAAa
gi|75587 : CACGATGGCGTCCTGCAAAAA----TCTTTTAATCACGTGACCATAGTTAAGCGCGTCTGTATTCATGCGTT-TTAATTTCTGTGT--GCTGAATAATAGCACTGAATAT---AAACTTGGAATTTATACGATACACAATTGTTTATAGGTATT--AAT----CATC-GCTGTCTGTTATT-ATATTAATA-TTATCGTTGAAA----TAG--GCGAATCTACTGTTTAT----AGTGAGTTCGAACCCTTATCAGGGG---TTGGAAC-TATTTGATTGGTGG-TTGTCAGGTTTGCA-TTAACACGATACACGGTTGT--AGATTT---GCGGTATAGGAAAAT--AATCATGTTTACTCTGAGAGCAGTTGCTAAAGCACCGCCCCCAAAa
gi|75588 : CAAGATGGCTCCCTG-AAAAA----TCTTTTGGTAACGTGACCATAGTTCAGCGCGTCTGTATTCATGCGCT-TTAATTTCAGTGT--GCTAATTAATAGCACTGAATAT---AAACTTGGAATTTATACGATACACAATTGTTTATAGGTATA--AAC----CTTC-GCAGTCTGTTATT-ATATTAATG--TTACGTTGAAA----TAG--GCGAATCTTCTGTTTAA----AGTGAGTTCGACCGCTTATCATGGG---GTGGAAC-TATTTGATCGGTGG-TTGTCAGGTCTGCA-TTAACACGATACAGGGTTGT--AGATTG---GCGGTATAAGAAAAC--AATCATGTTAGCTCTGAGAGCGACTGCTGAAGAACCGACCCC
gi|75589 : CAAGATAGCGTCCTG-AAAAA----TCTTTTGGTCACATGACCATAGTTCAGCGCATCTGTATTCATGCGCT-ATAATTCCTGTGT--GCTGGTTAATAGCACTGAATTT---AAACTTGGAATTTATGCGATACACAATTGTTTATAGGCATA--AAT----TGTC-GCTGTCTG---TA-ATAATAATA-TTTTCGTTGAAA----TAG--GCGAATTTACTGTTTAT----AGTGAGTTGGAATGCTTATCAGGGG---GTGAAAC-TATTTGATTTGTGG-TTGTCAGGTTTGCA-TTAACACAATACACGGTTGT--AGATTT---GCGGTATATGAAAAT--AATCATGTAAGCTCTGAGAGC-----------CACCGCCCCCAAAA
gi|75590 : CAAGATGGCGTCCTG-AAAAAAA--TATTTTGGCCACGTGACTATAGTTCAGCGCATCTATATTCATGTGCT-TTAATTCCTTTGT--GCTGATTGATAGCACTGAATAT---AA-------------------------TGTTTATAGGTATA--AAT----CGCC-GCTGTCTGTTATA-ATATTATTG-TTTTCGTTGAAA----TAG--GCGAATCTACTGTTTAA----AGTGAGTTCGAACGTTTATCAAGGG---TCGGAAC-TATTCGCTTGGT-G-TTGTCAGGGTTGCA-TTACTACGACACACGGTTGT--AGATTT---GCGGTAT-AGGAAA-AAA--CATGTTAGCTCTTAGAGCGGCTGCTTAAGCCCCGACCCCa
gi|75591 : CAAGATGGCGTCCTG-AAAAAAAAATCTTTCGGTCACGTGAGCATAGTTCAGAGCGTCTGTATGCATACGCT-TTAATTCCATTGT--GCTGATTAATAACACTGACTAT---AAACTTGGAATTTATATGGTACACAATTGTTCATAGGTATA--AATTTACTGTC-GCTGTCTTTTATT-ATATTAATG-TTTT-GTTGAAA----T
gi|75592 : GTCTGTCTTGAATTGTTGTTAATTCCTTTGT--ACTGATTAATAACACTGAATAT---AAACTTGGAATTTATACGATACACAATTGT------GTATA--AAT----CGTC-GCTGTCTGTTATA-ATATTAATG-TTTTCATTGAAA----TAG--GCGAATCTACTGTTTAT----AGTGAGTTTGAACGCTTATTACGGG---GTGGAAC-TATTTGTTTGGTGG-TTGTCAGGTTTGCA-TTAACACGATACACGGTTGT--AGATTT---GCGGTATAGGAAAAAAAAAACATGTTAGCTCTGAGAGCGGCTGCTAAAGCACC-CCCCCAAAA
gi|75593 : TTGATTAT--GTATACTAAT-----------TATCTTTT-TACATAGTAACG-TTATCATTAAAAGCCACAGA-GCAACTTT-TTGTTTGA----AGTGGG-------G------AGGGG---GT------TAC--GAC--GTGG-TAATAAGGTTTGCA-GTAAG--GAAACGCGGTTGTTAAAACAT---G--GT-T-T---AAGAAAATCGTGTTAGCTAAGAACACAACTGCTTAAGCACCGCCACCAAAAa
gi|75594 : ctttgaagttgaaacacacttATACATATTTATG-TTATCGTTGAA-----T-GTCACGGAACCACTTTTT-----------GTTTGAG--------AGGGGAGTGTGGGGC-T-TTTGA--GGCAA-TTGCAAGGCTTATAGTTAG---GAAACGTGATTGTCAAAACAT---G----GT-TTAAGACAAA--TGTGTAAGCTCTATGCACGGTTACTTAAGCACCGCCCCCAAAAa
gi|75595 : GGTAT-----AAGAAAATAGTGTTAGCTCTTAGCACGGTTGATAAATCACCGCCCCC