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blockSeqs                     :                                    A                                                   . 
blockSeqs                     :                                    A                                                   . 
blockSeqs                     :                                    A                                                   . 
blockSeqs                     :                                    A                                                     
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blockSeqs                     :                                    A                                                     
blockSeqs                     :                                    G                                                     
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blockSeqs                     :                                    G                                                     
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blockSeqs                     :                                    G                                                     
blockSeqs                     :                                    A                                                     
blockSeqs                     :                                    G                                                     
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blockSeqs                     :                                    .                                                     


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : TTAATTGTGTCATCAAATTGTTATGATACAAACACG---AGCGAGACACACGCTAATTAGACAAACAACGCCGCTGCTTGTTTGGGT--TAAAGCGATAACACGGAAAATTGAGTGAACGAAATCAAACACTAATTGACATTTAG
finalCons                     : TTAATTGTGTCATCAAATTGTTATGATACAAACACG---AGCGAGACACACGCTAATTAGACAAACAACGCCGCTGCTTGTTTGGGT--TAAAGCGATAACACGGAAAATTGAGTGAACGAAATCAAACACTAATTGACATTTAG





Alignments
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lowQualScore                  :                                    ....     .                                          ..    .                                                   
lowQualScore                  :                                    6666     8                                          99    2                                                   
consensus                     : TTAATTGTGTCATCAAATTGTTATGATACAAACACG---AGCGAGACACACGCTAATTAGACAAACAACGCCGCTGCTTGTTTGGGT--TAAAGCGATAACACGGAAAATTGAGTGAACGAAATCAAACACTAATTGACATTTAG
Reference ( family-683 )      : TTAATTGTGTCATCAAATTGTTATGATACAAACACG---AGCGAGACACACGCTAATTAGACAAACAACGCCGCTGCTTGTTTGGGT--TAAAGCGATAACACGGAAAATTGAGTGAACGAAATCAAACACTAATTGACATTTAG
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gi|17810                      :   AATTGTGTCATAAAATTGTTATGATACAAACACA---AGCAAGACACACGCT