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lowQualScore                  :     7       999        888   6    888    4444                   1111     999999999 6666666  666    5 5        0              1111 00 333333        333333 666     11   5      3 22      
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Reference ( family-667 )      : TTTT-TATTTCA---CTTGTCCA---GTC-GGAC---AAGT----ATTTCTAAAATCTGCTTGT----CCTGA---------C--C----AA---AAAC-A-ACTTGTCCTTACTTTAATCTAGA----A--T------TATGGTAC------T---AGTCC--TAT-GGATATAA--AATTAA
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gi|132145                     :                  TGTCCA---GCC-GGAC---AAGT----ATTTCTAAATTCTGCTTGT----CCTGA---------C-------AA---ATAC-A-ACTTGTCCTTACTTTAATCTAGA----A--T------TATGGTAC------A---GGTCC--TAT-GGATAT-A--AATTAA
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gi|132147                     :                                                 TCTTAAA-CTGCTTGT----CCTGA---------C--A----TA---AAAC-A-ACTTGTCCT-ACTTTAGTCTAGA----A--T------TATGATAC------T---AATCT--TAT-GGATAT-A--AATTAA
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