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lowQualScore                  :               .     . .    .............    ...            ..    .     .. . . ..   .  . .  . ..            .   .        ..   .        .. .    .  .......    .      .. ....... .  ....    ......    . . .... .... .. .  .   .   ... .  ..........................    .   .   ....        .    ..            
lowQualScore                  :               8     9 5    0000000000000    666            00    4     99 4 1 00   0  8 4  4 55            9   6        66   7        00 4    7  5555555    4      55 0000000 5  5555    777777    5 2 6666 4444 22 6  8   7   000 3  11111111111111111111111111    4   7   2222        5    55            
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Reference ( gi|7634 )         : CCAAAATGGCCGCCTAATTTTA-CAAA----TT-----T-CACG---TTTGTCCTTATA--TTTA-CAGTA-TT-TTA--TGACATCTTAT-AA-CTCTTTATGACT-AATATTATCAAATTATACTTATATTTAAT-AATTCTA---GTAGTTTT-ATTGCG--A---C---A-AAT---TATT--C---TAAA-AGA-G--A----A--A-AA-ATG-CAA---ACTA-AT---GG--C-TAAGGTCGT--C--AAAATTAG-CAA-AC-ATTTCTATTATTT--AGATATTATTTT
gi|7637                       : CCAAAATGGCCGCCTAATTTTA-CAAA----TT-----T-CACG---TTTGTCCTTATA--TTTA-CAGTA-TT-TTA--TGACATCTTAT-AA-CTCTTTATGACA-AATATTATCAAATTATACTTATATTTAAT-AATTCTA---GTAGTTTT-ATTGCG--A---C---A-AAT---TATT--C---TAAA-AGA-G--A----A--A-AA-ATG-CAA---ACTA-AT---GG--C-TAAGGTCGT--C--AAAATTAG-CAA-AC-ATTTCTATTATTT--AGATATTATTTT
gi|7639                       : CCAAAATGGCAGCCAAATTTTA-CAAA----TT-----T-CAGG---TTTGTCCTTATA--TTTA-CCGTA-TG-TTA--TGACATCTTTC-AC-CTCT----GACT-AATATTACCAAATTATACTTATATTTAAT-AATTATA---ATAGTTTT-ATTGCG--A---C---A-AAT---TATT--C---TTAA-AGA-GAAA----A--A-AA-ATG-CAA---ACTA-AT---GG--A-TAAGATCGT--C--AAAATTAG-CAA-AC-ATTTCTATTATTT--AGATATTATTTT
gi|7641                       : CCAAAATGGCCGCCAAGTTTGA-CAAA----TT-----T-CACG---TTTGTCCTTATA--TTTA-CAATA-TT-TAA--TGACATCTTAT-TA-CTCGTTATGACT-AATGTTATCAAATTATACGTATATTTGAT-AATTACAATCATGGTTTT-ATTGCA--A---C---A-AAT---TATT--C---TAAA-AGA-GA-A----A--A-AA-ATG-AAA---ACTT-AT---GG--C-TAAGATTGT--C--AAAATTAG-CAA-AC-A-TTATATTATTT--AGATATTAGTTT
gi|7644                       : CCAAGATGGCCGCCAAATTTTA-CAAA----TT-----T-CACG---TTTGTCCTTAAA--TTTA-CATT--TT-TTA--TGAAATATTTT-AA-CTCTTTAAGACT-AATGTTATCAAATTATACTTATATTTTAT-AATTTTA---TTGGTTTT-ATTGCG--A---C---A-ACT---TATT--G---CAAG-AGA-T--A----ATTA-AA-A-G-CAA---ACCA-AT---GA--C-TAAGACCAT--C--AAAATTAG-CAA-AC-AT
gi|7646                       : CCAAAATGGCCACCAAATTTTA-CAAA----TA-----G-TACA---TTTGTCCTTATA--TTTA-CAGTA-TT-TTA--TGACATCTTTT-AAACTTTTTATGACT-AATGTTATCATATTAGTCTTAAATATAAT-AATTTTA---ATGGTTTT-ATTGCA--A---C---A-AAA---TATT--C---TAAT-AGA-G--A----A--A-AA-ATG-CAA---ACTA-TT---GG--C-TAA-ATCTT--C--AAAA--A--------------TATTATTT--AGGTATTATTTT
gi|7647                       : CCAAGATGGGCGCCAAATTTTA-CAT-----TT-----T-CACG---TTTGTCCTTATA--TTTA-CAGTA-TT-TT------------------------ATGACT-AATGGTATAAAATTATACTGATATTTAAT-AATTCTA---ATGGTTTT-ATAACT--A---C---A-AAT---TACT--C---TAAA-AGA-G--AAAATA--A-AA-ATG-CAA---ACTT-AT---GA--T-TAAAATTGT--C--AAAATTAG-CAA-AG-ATTTCTATTATTT--AGATAATATTTT
gi|7635                       : CCAAAATGGCCGCC-AATTTTG-AAAA----TT-----T-TATG---TTTGTCCTTATA--TTTA-CAGTA-TT-TTA--TGAAAACGTAT-AA-CTCATTATGACT-AGTGTCTTCAAATTATAGTTATATTTCAT-AATTGAA---ATGGTTTT-ATCGCT--A---C---A-CAC---TATT--C---TAAA-AGA-G--A----A--A-AATATT-TAA---ACTT-TT---GG--C-T-------------AAAATTAG-CAACAA-ATCCCTATTATTT--AGATATTATTTT
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gi|7638                       : CCAAAATGGCCGCCAAATTTGA-CAAA----AT-----C-CATA---TTTGTCTTTATATTTTTA-CAGTA-GT-TAA--TGATATTTAAT-AG-ATCTTTATGACTAAATGTTATCAAA--ACATTTATATTTGTT-GATTTTA---CTTCTTTT-ATTTCGA-A---A---A-AAA---TATT--T---TAAG-ATA-T--A----A--A-AATATG-CAA---AATA-TA---GA--CTTAAAATCTT--A--AATAATAG--AA-ACAATTTCTAAAATTT--GAATATTattc
gi|7651                       : CCAAAATGGCCGCAAAATTTGA-CAAA----TT-----T-CACG---TTTGTCCTTAAA--TTTA-CAGAA-TT-TTA--TGAAAACTTAT-AA-TTTTTTATGACT-AATGATATCAAATCATATTAATATTGAAT-AATTTTA---AT--CTCT-ATT--A--A---T---A-AATCTCTATT--
gi|7652                       : CCGAAATAGCCGCCAAATTTAA-CAAA----AT-----C-CATA---TCTGTCTTTATA--TTTA-CAGTA-GA-TAA--TGATATATGAT-AG-CTCTTTATTACT-AATGTTATCAAAACATATTTATATATGTT-ATTTTCA---ATGCTTTT-ATAGCG--A---A---A-GAA---TATT------TAAA-ATA-T--A----A--A-AATATG-CAA---AATA-TA---GG--CTTAAAATCTT--T--AAAAATAG-CAA-CA-AATAGTATAATTT--CAATATT
gi|7636                       : CCAAAATGGCCGCCAAATTTGA-CAAA----AT-----C-CATA---TTTGTCTTTATA--TTTA-CAGTA-GT-TAA--TGATATTTGAT-AG-ATCTTTATGACTAAATTTTATCAAA--ACATTTATATTTGTT-GATTTTA---CTTCTTTT-ATTTCG--A---A---A-AAA---TATC--T---TTAA-ATA-T--A----A--A-AATATG-CAA---AATG-TA---GA--CTTAAAATTTT--A--AATAATAG--AA-ACAATTTCAAAAATTT--GAATATT
gi|7642                       : CCAAAATGGCCGCCAAATTTGA-CAAA----AT-----C-CATA---TTTGTCTTTATA--CTTA-CAGTA-GT-TAA--AGA-------T-AG-CTTTTCATGACT-AATGTTATCAAAGCATATTTATATTTGTT-GACTGTA---ATACTTTT-ATTGCC--A---C---A-AAT---TAAT--T---TAAA-ATA-T--A----A--A-CA-AT
gi|7643                       : CCAAAATGGCCGCCAAATTTGC-CAAA----AT---------CGCTTTTTGTCTTTATA--TTTAACAGT-----TAA--TGATATGTGTT-AG-CTCTTTATGACT-AATGTAATCAAAACATATTCATATTTGTT-GATTTTT---ATGGTTTC-ATTGCG--A---A---A-GAA---TATT--T---TAAA-ATA-T--A----A--A-AATATA-CAGTATATTA-AC-------T-TAAAATCTT--A--AAAAATAG-CAA-CA-ATGGCTATAATTT--AAATATTt
gi|7645                       : CCAAGATGGCCGCCAAATTTAA-CAAA----AT-----C-CCTA---TGTGTCTTTATA--TTTA-AAGTA-AT-TAA--TGATATTTGAT-AG-CTTTTTATGACT-TATGTTATCAAAACATATTTATATTTGTT-AATT-TA---ATGCTTTT-ATTGCG--AATACGAAA-AAA---GATC--T---TAAA-ATA-T--A----A--A-AATATG-CAA---A----AT---G-----TAGA----------AAAAATAG-CCA-CA-ATTTCTATAATTT--GAATATT
gi|7653                       : CTAAAATGGTCGCCAAATTTGA-TAAA----AT-----C-CATA---TTTGTCGTTATA--ATTA-CAATA-GT-TAA--TGATATTTGAT-AG-CTCTGTATGACT-GCTGTTATCAAA--ACATTTATCTTTGTT-TATTTTA---ATTCTTTT-ATAGCG--AAAGA---A-AAT---TA---------AAT-ATA-T--A----A--A-TA-A-G-CAA---AATATAA---GC--T-TAAAATCTTTAC--AAAA-TAGTCAC-A--ATTCGTATAATTTGAAAATACTGTT
gi|7649                       : CTAAAATGGCCGCCAAATTTTA-CAAA----ATCCATAT-CATT---TTTGTC-TAATA--ATTA-AAGCA-GT-TAA--TGATATTTTAT-AA-CACTTAATGATT-AAAGTTATCAAA--ATA--TAT------T-GATT-TA---TTGGTTAT-ATTGCG--A---A---A-GAA---AATT--T---AAAA-ATA-A--A----A--A-AA-A
gi|7654                       :  CAAGATGGCCACCAAATTTTA-CAA-----TT-----T-CACG---TTTGTCCTTATA--TTTA-CAGTA-TT-TTA--TGACATCTTCT-AA-CTCTTTATGGCT-AATATTATCAAATTATACTTCTGTTTAAT-AATTCTA---ATGGTTTT-ATTGCG--A---C---A-AAT---TATT--C---TAAA-AGA-GA-A----A--A-AA-AAG-CAA---ACTA-AT---GG--C-TAAGATCGT--C--AAAATTGG-CAA-AC-AATTCTATTATTT--AGATGTTATTTT
gi|7655                       :  CAAAATGGCCGCCAAATTTTATCAAA----TT-----T-CACG---TTTGTTCTCATA--TTTA-AAGTA-TT-TTA--TTAAATCTTAT-AA-ATCTTTCTGACT-AATGTTATCAAATAACAC------TTAAT-ACTTTTA---ATGGCTTT-ATTGTG--A---C---A-AAT---TATT--C---TAAA-AGA-G--A----A--A-AA------AA---ACTA-TT---GG--C-TAAGATCGT--C--AAAATTAG-CAA-AT-ATTTCTATTATTT--ACATATTATTTT
gi|7657                       :  CAAAATGACCGCCAAACTTTA-TAAAAACATT----------A---TTTGTCTTTATA--TTTA-CAATA-TT-TAA--TGACAATTGAA-AG-CTCTTTATGACT-TATGTTAGCGGAACATA-TTATTGTTGTT-GATTGTA---ATGCTTTT-ATTGCG--A---A---A-GAA---TATT--T---TAAT-GTA-T--C----A--A-AATATG-CCA---AATATAT---A-----TAAAGTC-T--T--AAAAATAG-CAA-CA-ATTTCTACGATTT--GAATATT
gi|7658                       :  CAAAATGGCCACCAAATTTGA-CAAA----AT-----C-AATA---TTTGTCTTCATT--TATA-CAGTA-GT-TAA--TTCCATTTGAC-AG-CTTTTGATGAGT-AATGTTATCAAAACACATTTATATTTAAT-GATTTTA---ATGCTTTT-TTT
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gi|7659                       :   AAGACGGTCGCCAAATTTTA-CAAA----------------G---TTT-TCCTTATA--TTGG-CAGTA-GT-TTG--TGACATCTTAT-AA-CTCTATACGACT-AACGT---CAAATTATAATTATATTTAAT-AATTTTA---AATGTTTT-ATTGCG--A---A---A-AAG---TATT--A---TAAAGAGA-G-------A--A-AA-ATA-CAA---AATA-TT---G-----------------------TTA--CAA-AA-ATCTCTATTATTT--ACATATAATTTT
gi|7661                       :    AAATGGCCGCCAAAGTTTA-CAAG----TT-----T-CACG---TTTGTCATTATA--ATTA-CAGTG-TT-TTA--TGACATCTTAT-AA-CTC-AAATGACT-AATGTTATCAAATTACATTTGTATTTCAT-AATTCAA---AAGGTTTT-ATGGCG--A---A---AGAAA---TATT--C---TAAA-AGA-G--A----A--A-AT-ATG-TAA---ACTT-TT---GC--C-TAAAATCTT--C--AAAGTTAG-CAA-AA-ACTTCTATTATTT--AGATATTATTTT
gi|7660                       :                AACTTT--CAAA----TT-----T-CACG---TTTGTCCTTATA--TTTA-CAGTA-TT-GTT--TGACATCTTAT-AA-CTCTTTATGACT-AATGTTATCAATTTAAACTTGTATCTAAT-AATTTTG---AT-GTTTTAATTGCG--A---C---A-AAA---CATT--C---TAAA-AGA-G--A----T--A-AA-ATT-CAA---GCTG-AT---GG--A-TAAA---AT--T--AAAATTAG-CAA-AC-ATTTCTATTATTT--AGATATTATGTT
gi|7662                       :                                           aaagaccgaTCTTTATA--GTTA-CAGTAGTTATTAAATGATAT-TTATTAG-CTTTTTGTGACT-AATGGTATCAAA--AAAATTACATTTGTT-GATTTTA---ATGCTTTT-ATTGCG--A---A---A-GAA---TATT--T---TAAA-ATA-T--A----A--A-AATATGATAA---AT---AT---AGACT-TAAAATCTT--TAAAAAAATAG-CAA-CA-ATTTCCATAATTT--GAATATT





Alignments
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lowQualScore                  :                     0 1    555555555    222  222          11    1     1  55555    1  0 1  1 11            2            5    3      1  22 222    0  222   0          666 5555 1  1    555555    1 0 6666 4444 22 1  2   1   222 1  333333333333       3 666 1   1      555        1    22            
lowQualScore                  :                     . .    .........    ...  ...          ..    .     .  .....    .  . .  . ..            .            .    .      .  .. ...    .  ...   .          ... .... .  .    ......    . . .... .... .. .  .   .   ... .  ............       . ... .   .      ...        .    ..            
lowQualScore                  :                     6 4    666666666    555  555          99    4     0  33333    6  4 0  4 77            8            1    3      4  33 444    4  444   3          111 2222 5  0    222222    5 8 9999 8888 11 5  3   7   999 8  888888888888       3 444 7   6      333        1    44            
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Reference ( family-662 )      : CCAAAATGGCCGCCAAATTTTA-CAAANT-----T-CACG---TT---TGTCCTTATA--TTTA-CAGTATTTN----ATGACATCTTAT-AG-CTCTTTATGACT-AATGTTATCAAATCATACTTATAT-TTGAT---AATTTTA---ATGGTTTTATTGCG---AC---A-AANTATT--C---TAAA-AGA-G--A----A--A-AA-ATG-CAA---ACTA-AT---GG--C-TAAAATCNTC--A-AAANTAGCAA-ANATTTCTATTATTT--AGATATTATTTT
gi|7634                       : CCAAAATGGCCGCCTAATTTTA-CAAATT-----T-CACG---TT---TGTCCTTATA--TTTA-CAGTATTTT----ATGACATCTTAT-AA-CTCTTTATGACT-AATATTATCAAATTATACTTATAT-TTAAT---AATTCTA---GTAGTTTTATTGCG---AC---A-AATTATT--C---TAAA-AGA-G--A----A--A-AA-ATG-CAA---ACTA-AT---GG--C-TAAGGTCGTC--A-AAATTAGCAA-ACATTTCTATTATTT--AGATATTATTTT
gi|7635                       : CCAAAATGGCCGCCAA-TTTTG-AAAATT-----T-TATG---TT---TGTCCTTATA--TTTA-CAGTATTTT----ATGAAAACGTAT-AA-CTCATTATGACT-AGTGTCTTCAAATTATAGTTATAT-TTCAT---AATTGAA---ATGGTTTTATCGCT---AC---A-CACTATT--C---TAAA-AGA-G--A----A--A-AATATT-TAA---ACTT-TT---GG--C-TAAAAT------------TAGCAACAAATCCCTATTATTT--AGATATTATTTT
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gi|7638                       : CCAAAATGGCCGCCAAATTTGA-CAAAAT-----C-CATA---TT---TGTCTTTATATTTTTA-CAGTAGTTA----ATGATATTTAAT-AG-ATCTTTATGACTAAATGTTATCAAAACAT--TTATAT-TTGTT---GATTTTA---CTTCTTTTATTTCGA--AA---A-AAATATT--T---TAAG-ATA-T--A----A--A-AATATG-CAA---AATA-TA---GA--CTTAAAATCTTA--A-ATAATAGAAA-CAATTTCTAAAATTT--GAATATT
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gi|7642                       : CCAAAATGGCCGCCAAATTTGA-CAAAAT-----C-CATA---TT---TGTCTTTATA--CTTA-CAGTAGTTA----AAGA-------T-AG-CTTTTCATGACT-AATGTTATCAAAGCATATTTATAT-TTGTT---GACTGTA---ATACTTTTATTGCC---AC---A-AATTAAT--T---TAAA-ATA-T--A----A--A-CA-AT
gi|7643                       : CCAAAATGGCCGCCAAATTTGC-CAAAAT---------CGCTTTT---TGTCTTTATA--TTTAACAGT---TA----ATGATATGTGTT-AG-CTCTTTATGACT-AATGTAATCAAAACATATTCATAT-TTGTT---GATTTTT---ATGGTTTCATTGCG---AA---A-GAATATT--T---TAAA-ATA-T--A----A--A-AATATA-CAGTATATTA-AC-------T-TAAAATCTTA--A-AAAATAGCAA-CAATGGCTATAATTT--AAATATTt
gi|7644                       : CCAAGATGGCCGCCAAATTTTA-CAAATT-----T-CACG---TT---TGTCCTTAAA--TTTA-CATT-TTTT----ATGAAATATTTT-AA-CTCTTTAAGACT-AATGTTATCAAATTATACTTATAT-TTTAT---AATTTTA---TTGGTTTTATTGCG---AC---A-ACTTATT--G---CAAG-AGA-T--A----ATTA-AA-A-G-CAA---ACCA-AT---GA--C-TAAGACCATC--A-AAATTAGCAA-ACAT
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gi|7648                       : CCAAAATTGCCGCCAAATTTTA-CAAATT-----T-CACG---TT---TGTCCTTATA--TTTA-CAATATTTC----ATGACGTCTTAT-AT-CTCTTTATGACT-AATTTTATCGATTTACATTCATAT-GTCATCAAAA---TA---ATGGT--------------------AACATT--C---TTAA-AGA-G--A----A--ATGT-TTG-CAA---ACT---------------AAATCTTA--A-CAATTAGCAA-ATATTTCTATTATTT--AGATA
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gi|7650                       : CCAAAATGACCACCAAATTTTA-CAAAAA-----TACACG---TT---TGTCCTTATA--CTTA-GAATATATC----ATGACATCTTAT-AA-CCCTTTATGACT-AACGTCATCAAAACATATTTATAT-TTCAT---GATTATA---ATGG-TTTATGACGAA-AT---A-AACTATTAGC---TAAA-AAA-
gi|7651                       : CCAAAATGGCCGCAAAATTTGA-CAAATT-----T-CACG---TT---TGTCCTTAAA--TTTA-CAGAATTTT----ATGAAAACTTAT-AA-TTTTTTATGACT-AATGATATCAAATCATATTAATAT-TGAAT---AATTTTA---AT--CTCTATTattc
gi|7652                       : CCGAAATAGCCGCCAAATTTAA-CAAAAT-----C-CATA---TC---TGTCTTTATA--TTTA-CAGTAGATA----ATGATATATGAT-AG-CTCTTTATTACT-AATGTTATCAAAACATATTTATAT-ATGTT---ATTTTCA---ATGCTTTTATAGCG---AA---A-GAATATT------TAAA-ATA-T--A----A--A-AATATG-CAA---AATA-TA---GG--CTTAAAATCTTT--A-AAAATAGCAA-CAAATAGTATAATTT--CAATATTaataaatctctatt
gi|7653                       : CTAAAATGGTCGCCAAATTTGA-TAAAAT-----C-CATA---TT---TGTCGTTATA--ATTA-CAATAGTTA----ATGATATTTGAT-AG-CTCTGTATGACT-GCTGTTATCAAAACAT--TTATCT-TTGTT---TATTTTA---ATTCTTTTATAGCG---AA---A-GAAAAT-------TAAATATA-T--A----A--A-TA-A-G-CAA---AATATAA---GC--T-TAAAATCTTT--ACAAAATAGTCA-CAATTCGTATAATTTGAAAATACTGTT
gi|7654                       :  CAAGATGGCCACCAAATTTTA-CAA-TT-----T-CACG---TT---TGTCCTTATA--TTTA-CAGTATTTT----ATGACATCTTCT-AA-CTCTTTATGGCT-AATATTATCAAATTATACTTCTGT-TTAAT---AATTCTA---ATGGTTTTATTGCG---AC---A-AATTATT--C---TAAA-AGA-GA-A----A--A-AA-AAG-CAA---ACTA-AT---GG--C-TAAGATCGTC--A-AAATTGGCAA-ACAATTCTATTATTT--AGATGTTATTTT
gi|7655                       :  CAAAATGGCCGCCAAATTTTATCAAATT-----T-CACG---TT---TGTTCTCATA--TTTA-AAGTATTTT----ATTAAATCTTAT-AA-ATCTTTCTGACT-AATGTTATCAAATAACACTTA-------AT---ACTTTTA---ATGGCTTTATTGTG---AC---A-AATTATT--C---TAAA-AGA-G--A----A--A-AA------AA---ACTA-TT---GG--C-TAAGATCGTC--A-AAATTAGCAA-ATATTTCTATTATTT--ACATATTATTTT
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gi|7660                       :    AAA-GACCG--AAACTTT--CAAATT-----T-CACG---TT---TGTCCTTATA--TTTA-CAGTATTGT----TTGACATCTTAT-AA-CTCTTTATGACT-AATGTTATCAATTTAAACTTGTATCTAAT---AATTTTG---ATGTTTTAATTG------CG--ACA-AAACATT--C---TAAA-AGA-G--A----T--A-AA-ATT-CAA---GCTG-AT---GG--A-TAAAA---TT--A-AAATTAGCAA-ACATTTCTATTATTT--AGATATTATGTT
gi|7661                       :    AAATGGCCGCCAAAGTTTA-CAAGTT-----T-CACG---TT---TGTCATTATA--ATTA-CAGTGTTTT----ATGACATCTTAT-AA-CTCAA-ATGACT-AATGTTATCAAATTACATTTGTATTTCAT---AATTCAA---AAGGTTTTATGG------CG--AAAGAAATATT--C---TAAA-AGA-G--A----A--A-AT-ATG-TAA---ACTT-TT---GC--C-TAAAATCTTC--A-AAGTTAGCAA-AAACTTCTATTATTT--AGATATTATTTT
gi|7662                       :                                                   TCTTTATA--GTTA-CAGTAGTTATTAAATGATAT-TTATTAG-CTTTTTGTGACT-AATGGTATCAAA--AAAATTACATTTGTT---GATTTTA---ATGCTTTTATTG------CG--AAA-GAATATT--T---TAAA-ATA-T--A----A--A-AATATGATAA---AT---AT---AGACT-TAAAATCTTTAAA-AAAATAGCAA-CAATTTCCATAATTT--GAATATT


blockSeqs                     :                       T    ATCCATAT     CTT  ATT          TT    A     T  ATTAA    A    T  T AA            A            T    G        CA CAA       ATC            CGAATA  AA C G  C    TATG      T   GAA  AAAT TT T  T   A   TAT C  ATATAGGCT          T TAA C   A      CAA        T    GA
blockSeqs                     :                       .    AATA         .    .            .     .     G  T        T    G  . A             A            A    C        GT .         .              .       A  A .  A    AGC       G   TG   .    .  .  T   .   .   A  ATAGACT            G A   .   T      CA         A    . 
blockSeqs                     :                       .    TTT          .    .            .     .     T  A        C    T  . G             .            T    C        AA .         .              .       .  C .  T    C         .   GA   .    .  .  T   .   .   C  TAGACT             T C   .   A      AC         T    . 
blockSeqs                     :                       .    ATC          .    .            .     .     G  T        T    A  . A             .            A    T        GT .         .              .       .  A .  A    T         .   GA   .    .  .  T   .   .   A  TAGACT             G A   .   T      CA         A    . 
blockSeqs                     :                       .    TTT          .    .            .     .     T  A        C    T  . G             .            T    C        AA .         .              .       .  C .  T    C         .   G    .    .  .  T   .   .   C  TAGACT             T C   .   A      AC         T    . 
blockSeqs                     :                       .    ATC          .    .            .     .     G  T        T    G  . C             .            A    T        GT .         .              .       .  A .  A    T         .   T    .    .  .  T   .   .   A  TAGGCT             G A   .   T      CA         A    . 
blockSeqs                     :                       .    TTT          .    .            .     .     T  A        C    T  . G             .            T    T        GA .         .              .       .  C .  T    C         .   G    .    .  .  T   .   .   C  TAAGCT             T C   .   A      AC         T    . 
blockSeqs                     :                       .    ATC          .    .            .     .     G  A        T    G  . A             .            G    C        GT .         .              .       .  C .  T    T         .   T    .    .  .  T   .   .   T  TTGGC              A A   .   T      CA         A    . 
blockSeqs                     :                       .    TTT          .    .            .     .     T  A        A    T  . G             .            A    T        GT .         .              .       .  A .  A    C         .   T    .    .  .  .   .   .   C  ATGGC              T C   .   A      AC         A    . 
blockSeqs                     :                       .    ATC          .    .            .     .     A  A        T    G  . G             .            T    C        TA .         .              .       .  C .  T    T         .   T    .    .  .  .   .   .   C  ATGGA              G C   .   A      CA         T    . 
blockSeqs                     :                       .    TTT          .    .            .     .     T  T        C    T  . A             .            A    C        GT .         .              .       .  A .  A    T         .   T    .    .  .  .   .   .   C  ATGGC              T C   .   T      AG         T    . 
blockSeqs                     :                       .    ATC          .    .            .     .     T  A        C    T  . G             .            T    T        AA .         .              .       .  C .  A    G         .   T    .    .  .  .   .   .   C  ATGAC              T A   .   T      AT         T    . 
blockSeqs                     :                       .    TAG          .    .            .     .     T  T        T    T  . T             .            T    T        AA .         .              .       .  C .  T    T         .   G    .    .  .  .   .   .   A  TTGGC              T T   .   A      CA         A    . 
blockSeqs                     :                       .    TTT          .    .            .     .     G  C        C    T  . A             .            T    T        CA .         .              .       .  A .  A    C         .   G    .    .  .  .   .   .   A  ATGAT              G T   .   A      CA         A    . 
blockSeqs                     :                       .    TTT          .    .            .     .     T  A        A    T  . A             .            A    T        GA .         .              .       .  T .  A    C         .   G    .    .  .  .   .   .   C  ATGGC              G C   .   T      AC         T    . 
blockSeqs                     :                       .    TTT          .    .            .     .     T  C        T    G  . A             .            A    C        CA .         .              .       .  A .  C    C         .   A    .    .  .  .   .   .   C  TTGGC              T C   .   T      AT         T    . 
blockSeqs                     :                       .    ATC          .    .            .     .     G  T        T    G  . G             .            T    C        AA .         .              .       .  A .  A    T         .   T    .    .  .  .   .   .   A  ATGGA              T A   .   A      TC         T    . 
blockSeqs                     :                       .    ATC          .    .            .     .     G  A        C    T  . G             .            A    C        GT .         .              .       .  C .  A    C         .   T    .    .  .  .   .   .   A  TTGCC              T T   .   A      CA         G    . 
blockSeqs                     :                       .    TTT          .    .            .     .     T  A        A    T  . A             .            A    T        GT .         .              .       .  C .  T    C         .   G    .    .  .  .   .   .   C  TATA               T C   .   T      AA         T    . 
blockSeqs                     :                       .    TTT          .    .            .     .     T  T        T    G  . A             .            T    A        AA .         .              .       .  A .  T    T         .   G    .    .  .  .   .   .   C  ACT                . .   .   T      AC         T    . 
blockSeqs                     :                       .    ATC          .    .            .     .     T  T        C    G  . G             .            T    C        GT .         .              .       .  A .  A    A         .   T    .    .  .  .   .   .   T  ATG                . .   .   T      AA         T    . 
blockSeqs                     :                       .    TTT          .    .            .     .     T  A        C    G  . G             .            A    T        AA .         .              .       .  A .  A    C         .   G    .    .  .  .   .   .   .  TTG                . .   .   A      CA         A    . 
blockSeqs                     :                       .    TTT          .    .            .     .     G  A        C    T  . G             .            A    A        AA .         .              .       .  C .  G    C         .   G    .    .  .  .   .   .   .  .                  . .   .   .      .                 
blockSeqs                     :                       .    AT           .    .            .     .     G  A        C    T  . A             .            A    .        AA .         .              .       .  A .  A    T         .   G    .    .  .  .                                                                    
blockSeqs                     :                       .    A            .    .            .     .     T  T        C    T  . A             .            T    .        CA .         .              .       .  A .  A    .         .   T    .    .  .  .                                                                    
blockSeqs                     :                       .    .            .    .            .     .     T  T        T    T  . A             .            T    .        GT .         .              .       .  . .  A    .         .                                                                                        
blockSeqs                     :                       .    .            .    .            .     .     G  T        .    .  . G             .            T    .        A  .         .                                                                                                                                      
blockSeqs                     :                                                           .     .     .  .        .    .  . .             .            .    .        .  .         .                                                                                                                                      


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