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Reference ( family-660 )      :                                                                                                                                                                                         AGANAAAGGATT-TAGA--AAGAAAGAAAAAGGAAA-TTGGAAATAATGGTTGTATGATATAATAATAAGG-----------TAATCTAAATATACCCTATAATTAGAAGAATCGTCATCAG--GCCGACTTT-----TTATGCACATATATTGTTTAGTTAATT------ANTATCAAANCGTTTCGTGTCTTTAAT--A-AATTGTTGTACNTGTG-TGAA---TATA------AATGN--GTTTTCGT--CG-CC-GGTATANGTATCT-TTAC---CGAATAG-AAA-----G-TA----TNA--TG-ACTNAGAGGATGAAANCGGCGTGTGGCNCGAAAAAGNCGGAGTCGTTCAT--TTG-AAAATATAGNACATTGCATAAAATAGT
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gi|143724                     :                                                                                                                                                                                agataggacAGATAAAGGATT-TAGG--AAGAAAGAAAAAAG-------GAAATAATGGTTGTATGATATAATAATAAGGTAATCTAAAGGTAATCTAAACATACCCCATAATTAGAAGAATCGTCATCAG--GCCGACTTT-----TTATGCACATATATT-TTTAGTTAATTAATGTCAATATCAAATCGTTTTGAGTCTTTGCT--A-Aa
gi|143725                     :                                                                                                                                                                                         AGAAAAAGGATT-TAGT--AAGAAAGAAAAAGGAAA-TTGGAAATAATGGTTGTATGATATAATAATAAGA-----------TAATCTAAATATACCCTATAATTAGAAGAATCGTCATCAG--GCCAACTTT-----TTATGCACATATATTCTTTAGTTAATT------
gi|143726                     :                                                                                                                                                                                         AGAAAAAGGATT-TAGA--AAGAAAGAAAAAGGAAA-TTGGAAATAATGGTTGTATGATATAATAATACGG-----------TAATTTAAATATACCCTATAATTAGAAGAATCGTCATCAG--GCC
gi|143727                     :                                                                                                                                                                                                  ATTATAGG--GAGAAAGAAAAAGGAAT-TTGGAAATGAAGGTTGTATAGTCTAATAATAAGA-----------TAATCTAAATATACCCTATAATTAGAGTAATTGTCATTAATCGCCGACTTT-----TAATGCGCATATAATGTACAGTTAATT------AGTATGGAATCGTTTTAAGTATTTGAT--A-AATTGTTGCACAGATG-TGAA---TATA------AATGA--GTTTTCAT--
gi|143728                     :                                                                                                                                                                                                    T-TAGATAAAGAAAAGAAAAGAAAA-TTGGAAATAAAGATTGGATAATGTAATAATAAGA-----------TAATATAAATAT--TCTATTAGTAGAACAACCACCATTAT--GCCGAC-----------GGCA-ATGTA-----CAGTTAATA------AGTATCGAATCGCTTTGTGTCTTTGGT--A-AATTGTTGTACAGACG-TGAA---AAGA------AATGA--GTTTTCGT--CG-TT-AGTATAGGTATCT-TTAT---CCAA-AA-AAA-----A-TAACTGTGA--TG-ACTGAGATGATAAAATCGCCGTGTAGGTCGAAAA-----GAGTTGTTCGT--TTG-ATAATA-AACAAATTGCATGAAATAGT
gi|143729                     :                                                                                                                                                                                                                                                                -----------TAATTTAAATACACCCTATAATTTGAAGAATCGTCATTAG--GCCGACTAT-----TAAT
gi|143730                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TAGTTAATT------AATATCAAGTCGTTTTGAGTCTTTAAT--G-AATTGTTGCACAGATG-TGAA---TATA------AATGA--GTTTTCGT--CG-TT-AGTATAAGTGTCT-TTAC---CGAACAGAAAA-----G-TA----TTA--TG-ACTAAGAGGATGAAATCGACGTGTGGCTCTAAAAAGTCGGATTAGTTCGT--TTA-AGAATATAATACATTTCATAAAATAAT
gi|143731                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AGTCAATT------GTTGGCAAAACGTTTCGTGTCTTTAAT--G-TACTGTTGTACTTGTG-TTAA---TATA------AATAAATGTTTTTGTGTCA-TT-GGTATATGT-TCTCTTAC---CAAATAA-TAA-----C-AC----TCG--TGTACTAAAGGGATGAAAACGGCGCGTGGAACGAAAAAGACGAAGTCGTTCAT--CAG-TATATATAGAACATTGCATAAAGTAGT
gi|143732                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AGTCAATT------GTTGACAAAACGTTTCGTGTCTTTAAT--G-CATTGTTGTACTTGTG-TAAA---TATA------AATAT--ATTTGCTA--CA-CT-TGTATATGTACTT-TTAC---CAAATAA-AAA-----C-AC----TCG--TGTACTTAAGGGATGAAAACGGCGTGTGGAACGAAAAAGACGAAGTCGTTAAT--CAG-TATATATAGAACATTGCATAAAGTAGT
gi|143733                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AGTCAGTT------GTTGACAAAACATTTCGCGTCTTTAAT--A-TACTGTTTTACCTGTG-TAAA---TATA------AATGT--ATTTGCAT--AA-CT-GGTATATGTACTC-TTAC---CAAATA--AAA-----G-CAC---TCG--TGTACTTAAGGGATGAAAACGGCGTGTAGAACGAAAAAGACCAAGTCGTTCAT--TAG-TATACATAGGACATTGCATAAA
gi|143734                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AATCAATT------GTTGACAAAACGTTTCGTGTCTTTAAT--G-TATTGTTGTACTTGTG-TAAA---TATA------AATGT--ATTTGTGT--CA-CT-GGTATATGTACTC-TTAC---CAAATAA-AAA-----C-AC----TCG--TGTACTTAAGGGATGAAAACGGCACGTGGAACGAAAAAGACG
gi|143735                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AGTCAGTT------GTTGACAAAACGATTCGTGTCTTTAAT--A-TATTGTTGTACTTGTG-TAAA---TATG------AATGT--ATTTGTGT--CA-CT-GGTATATGTACTC-TTAC---CAAGTA--AAA-----G-CAC---TCG--TGTACTAAAGGGATGAAAACGGCGTGTAGAACGAAAAcat
gi|143736                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AGTCAGTT------GTTGGCAAAACGTTTTGTGTTTTTAAT--G-AATTGTTGTACCTGTA-TAAA---TATA------AATAT--ATTTTCGT--CA-CT-GTTATATGTACTC-TTAC---ACAA-AA-AAA-----G-CA----CCCGTTT-ACTTAAAGGATGAAAACTGCGTGTAGAAAAAAAATGACGAAGTCATTAAT--tcgcacatccgttgcatct
gi|143737                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GTCAATT------GTTGACAAAACGTTTCATGTCTTTAAT--G-TATTATTGTACTTGTG-TAAA---TATA------AATGT--ATTTGTGT--CA-CT-GGTATATGTACTC-TTAC---CAAATAA-TAACACTCG-TA----T-------ACTTAAGGGATGAAAACGGCGTGTGGAACGAAAAAGACGAAGTCGTTCAT--CAG-TATATATAGAACATTGCATAAAGTAGTcagtatacatgcat
gi|143738                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TATCAAAACGTTTAGTGTCTTTAAT--A-AAAGTTTGGACAT-TGTTAAA---TATA------ACACT--ATTTTCAT--CGTCT-GAAATAT-CATCT-CTCC---CGTGTAACAGG-----G-TT----TTA--AC-ACTAA-AGGATGAAGGTGACATGTAGCATGAAAGAGACGAAGTCGATTAT--TTA-AAAAAGAAGGACATTGCATGAAATAGT
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Reference ( family-660 )      :                                                                                                                                                                                         AGANAAAGGATT-TAGA--AAGAAAGAAAAAGGAAA-TTGGAAATAATGGTTGTATGATATAATAATAAGG-----------TAATCTAAATATACCCTATAATTAGAAGAATCGTCATCAG--GCCGACTTT-----TTATGCACATATATTGTTTAGTTAATT------ANTATCAAANCGTTTCGTGTCTTTAAT--A-AATTGTTGCACNTGTG-TGAA---TATA------AATGN--GTTTTCGT--CG-CC-GGTATANGTATCT-TTAC---CGAATA-A--AAA-----G-TA----TCA--TG-ACTNAGAGGATGAAANCGACGTGTGGCNCGAAAAAGACGGAGTCGTTCAT--TTG-AAAATATAGNACATTGCATAAAATAGT
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gi|143720                     :                                                                                                                                                                                         AGATAAAGGATT-TAGA--AAGAAAGAAAAAGGAAA-CTGGAAATAATGGTTGTATGATATAATAATAAGG-----------TAATCTAAATATACCCTATGATTAGAAAAATCGTCATCAC--GCCGACATT-----TTATGCACATATATTGTTTAGTTAATT------AAAATCAAATCATTTTGAGTCTTTAAT--G-AATTGCTGCACAGATG-TAAA---TATA------AATGA--GTTTTCAT--CG-TC-AGTATAAGGGTCT-TTAC---CG--------------------------A--TG-ACTGAGAGGATGAAATCGACGCGTGCCTCTAAAAAGTCGGATTCGTTCAT--TTG-AGAATATAATACATTTCATAAAATAAT
gi|143721                     :                                                                                                                                                                                         AGATAAAGGATT-TAGA--AAGAACGAAAAAGGATA-TTGGAAATAATTGTTGTATGATATAAAAATAAGG-----------TAATCTAAATATACCCTATAATTAGAAGGAAGGTCATCAG--GCCGACTTT-----TTATGCACATATATTGTTTAGTTAATT------AATATCAAATCGTTTTGTGTCTTTGAT--A-AATTGTTGCACAGATG-TGAA---TATA------AATGA--GTTTTCAT--CG-TC-AGTATAAGTGTCT-TTAC---CGAAC-------A-----G-TA----TGA--TG-ACTGAGA
gi|143722                     :                                                                                                                                                                                         AGAAAAAGGATT-TAGT--AAGAAAGAAAAAGGAAA-TTGGAAATAATGGTTGTATGATATAATAATAAGG-----------TAATCTAAATATACCCTATAATTAGAAGAATCGTCATCAG--GCCAACTTT-----TTATGCACATATATTCTTTAGTTAATT------AATATCAAATCGTTTTGAGTCTTTGAT--A-AATTGCTG
gi|143722                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             A--TG-ACTTAGAGGATGAAATCGACGTGTGGCTCTAAAAAGTCGGATTCGTTCAT--TTG-AGAATATAATACATTTCATAAAATAATatgacttagaggatgacttagaggatgaaatcgacgtgtggctctaaaaagtcggattcgttcatttgagaatataatacatttcataaaataat
gi|143723                     : agaaaaaggatttagtaagaaagaaaaaggaaattggaaataatggttgtatgatataataataaggtaatctaaatataccctataattagaagaatcgtcatcaggccaactttttatgcacatatattctttagttaattaatatcaaatcgttttgagtctttgataaattgctgatgacttagaggGGATT-CGAA--AAGAAAGAGA--GGAAACTTGGAAATAAAGGTTATATAGTATAATAATAAGC-----------TACTCTATATATACCCTATAATTAGAACAAAAGTCATTAG--TCCGATTTTAATCATTAATAACATGCATTGAACAGTTACTT------AATATCAAATCACTTTGAGTCTTTGAC----AATTGCTCCACCGACA-TGCA---TATA------AATGC--GTTTTCAT--CG-CT-AGCATAAGTTTTG-TTAT---CGGA-A-AGTAAT-----G-TA----TGA--CA-ACTGAGAGGATGAAATCGATATGCGGCTAGAAAAAGTCGGATTATTTCGC--CTG-AAAA-ATA
gi|143724                     :                                                                                                                                                                                agataggacAGATAAAGGATT-TAGG--AAGAAAGAAAAAAG-------GAAATAATGGTTGTATGATATAATAATAAGGTAATCTAAAGGTAATCTAAACATACCCCATAATTAGAAGAATCGTCATCAG--GCCGACTTT-----TTATGCACATATATT-TTTAGTTAATTAATGTCAATATCAAATCGTTTTGAGTCTTTGCT--A-Aa
gi|143725                     :                                                                                                                                                                                         AGAAAAAGGATT-TAGT--AAGAAAGAAAAAGGAAA-TTGGAAATAATGGTTGTATGATATAATAATAAGA-----------TAATCTAAATATACCCTATAATTAGAAGAATCGTCATCAG--GCCAACTTT-----TTATGCACATATATTCTTTAGTTAATT------
gi|143726                     :                                                                                                                                                                                         AGAAAAAGGATT-TAGA--AAGAAAGAAAAAGGAAA-TTGGAAATAATGGTTGTATGATATAATAATACGG-----------TAATTTAAATATACCCTATAATTAGAAGAATCGTCATCAG--GCC
gi|143727                     :                                                                                                                                                                                                  ATTATAGG--GAGAAAGAAAAAGGAAT-TTGGAAATGAAGGTTGTATAGTCTAATAATAAGA-----------TAATCTAAATATACCCTATAATTAGAGTAATTGTCATTAATCGCCGACTTT-----TAATGCGCATATAATGTACAGTTAATT------AGTATGGAATCGTTTTAAGTATTTGAT--A-AATTGTTGCACAGATG-TGAA---TATA------AATGA--GTTTTCAT--
gi|143728                     :                                                                                                                                                                                                    T-TAGATAAAGAAAAGAAAAGAAAA-TTGGAAATAAAGATTGGATAATGTAATAATAAGA-----------TAATATAAATAT--TCTATTAGTAGAACAACCACCATTAT--GCCGAC-----------GGCA-ATGTA-----CAGTTAATA------AGTATCGAATCGCTTTGTGTCTTTGGT--A-AATTGTTGTACAGACG-TGAA---AAGA------AATGA--GTTTTCGT--CG-TT-AGTATAGGTATCT-TTAT---CCAA-A-A--AAA-----A-TAACTGTGA--TG-ACTGAGATGATAAAATCGCCGTGTAGGTCGAAAA-----GAGTTGTTCGT--TTG-ATAATA-AACAAATTGCATGAAATAGT
gi|143729                     :                                                                                                                                                                                                                                                                -----------TAATTTAAATACACCCTATAATTTGAAGAATCGTCATTAG--GCCGACTAT-----TAAT
gi|143730                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TAGTTAATT------AATATCAAGTCGTTTTGAGTCTTTAAT--G-AATTGTTGCACAGATG-TGAA---TATA------AATGA--GTTTTCGT--CG-TT-AGTATAAGTGTCT-TTAC---CGAACAGA--AAA-----G-TA----TTA--TG-ACTAAGAGGATGAAATCGACGTGTGGCTCTAAAAAGTCGGATTAGTTCGT--TTA-AGAATATAATACATTTCATAAAATAAT
gi|143731                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AGTCAATT------GTTGGCAAAACGTTTCGTGTCTTTAAT--G-TACTGTTGTACTTGTG-TTAA---TATA------AATAAATGTTTTTGTGTCA-TT-GGTATATGT-TCTCTTAC---CAAATA-A--TAA-----C-AC----TCG--TGTACTAAAGGGATGAAAACGGCGCGTGGAACGAAAAAGACGAAGTCGTTCAT--CAG-TATATATAGAACATTGCATAAAGTAGT
gi|143732                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AGTCAATT------GTTGACAAAACGTTTCGTGTCTTTAAT--G-CATTGTTGTACTTGTG-TAAA---TATA------AATAT--ATTTGCTA--CA-CT-TGTATATGTACTT-TTAC---CAAATA-A--AAA-----C-AC----TCG--TGTACTTAAGGGATGAAAACGGCGTGTGGAACGAAAAAGACGAAGTCGTTAAT--CAG-TATATATAGAACATTGCATAAAGTAGT
gi|143733                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AGTCAGTT------GTTGACAAAACATTTCGCGTCTTTAAT--A-TACTGTTTTACCTGTG-TAAA---TATA------AATGT--ATTTGCAT--AA-CT-GGTATATGTACTC-TTAC---CAAAT--A--AAA-----G-CAC---TCG--TGTACTTAAGGGATGAAAACGGCGTGTAGAACGAAAAAGACCAAGTCGTTCAT--TAG-TATACATAGGACATTGCATAAA
gi|143734                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AATCAATT------GTTGACAAAACGTTTCGTGTCTTTAAT--G-TATTGTTGTACTTGTG-TAAA---TATA------AATGT--ATTTGTGT--CA-CT-GGTATATGTACTC-TTAC---CAAATA-A--AAA-----C-AC----TCG--TGTACTTAAGGGATGAAAACGGCACGTGGAACGAAAAAGACG
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gi|143728                     :                                                                                                                                                                                                     T-TAGATAAAGAAAAGAAAAGAAAA-TTGGAAATAAAGATTGGATAATGTAATAATAAGA-----------TAATATAAATAT--TCTATTAGTAGAACAACCACCATTAT--GCCGAC-----------GGCA-ATGTA-----CAGTTAATA------AGTATCGAATCGCTTTGTGTCTTTGGT--A-AATTGTTGTACAGACG-TGAA---AAGA------AATGA--GTTTTCGT--CG-TT-AGTATAGGTATCT-TTAT---CCAAAA-A--AAAT-AACTGTGATG-AC--TGAGATGATAAAATCGCCGTGTAGGTCGAAAA-----GAGTTGTTCGT--TTG-ATAATA-AACAAATTGCATGAAATAGT
gi|143729                     :                                                                                                                                                                                                                                                                 -----------TAATTTAAATACACCCTATAATTTGAAGAATCGTCATTAG--GCCGACTAT-----TAAT
gi|143730                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TAGTTAATT------AATATCAAGTCGTTTTGAGTCTTTAAT--G-AATTGTTGCACAGATG-TGAA---TATA------AATGA--GTTTTCGT--CG-TT-AGTATAAGTGTCT-TTAC---CGAACAGA--AAAG-TATTA---TG-AC--TAAGAGGATGAAATCGACGTGTGGCTCTAAAAAGTCGGATTAGTTCGT--TTA-AGAATATAATACATTTCATAAAATAAT
gi|143731                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AGTCAATT------GTTGGCAAAACGTTTCGTGTCTTTAAT--G-TACTGTTGTACTTGTG-TTAA---TATA------AATAAATGTTTTTGTGTCA-TT-GGTATATGT-TCTCTTAC---CAAATA-A--TAAC-ACTCG---TGTAC--TAAAGGGATGAAAACGGCGCGTGGAACGAAAAAGACGAAGTCGTTCAT--CAG-TATATATAGAACATTGCATAAAGTAGT
gi|143732                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AGTCAATT------GTTGACAAAACGTTTCGTGTCTTTAAT--G-CATTGTTGTACTTGTG-TAAA---TATA------AATAT--ATTTGCTA--CA-CT-TGTATATGTACTT-TTAC---CAAATA-A--AAAC-ACTCG---TGTAC--TTAAGGGATGAAAACGGCGTGTGGAACGAAAAAGACGAAGTCGTTAAT--CAG-TATATATAGAACATTGCATAAAGTAGT
gi|143733                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AGTCAGTT------GTTGACAAAACATTTCGCGTCTTTAAT--A-TACTGTTTTACCTGTG-TAAA---TATA------AATGT--ATTTGCAT--AA-CT-GGTATATGTACTC-TTAC---CAAATA-A--AAGC-ACTCG---TGTAC--TTAAGGGATGAAAACGGCGTGTAGAACGAAAAAGACCAAGTCGTTCAT--TAG-TATACATAGGACATTGCATAAA
gi|143734                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AATCAATT------GTTGACAAAACGTTTCGTGTCTTTAAT--G-TATTGTTGTACTTGTG-TAAA---TATA------AATGT--ATTTGTGT--CA-CT-GGTATATGTACTC-TTAC---CAAATA-A--AAAC-ACTCG---TGTAC--TTAAGGGATGAAAACGGCACGTGGAACGAAAAAGACG
gi|143735                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AGTCAGTT------GTTGACAAAACGATTCGTGTCTTTAAT--A-TATTGTTGTACTTGTG-TAAA---TATG------AATGT--ATTTGTGT--CA-CT-GGTATATGTACTC-TTAC---CAAGTA-A--AAGC-ACTCG---TGTAC--TAAAGGGATGAAAACGGCGTGTAGAACGAAAAcat
gi|143736                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AGTCAGTT------GTTGGCAAAACGTTTTGTGTTTTTAAT--G-AATTGTTGTACCTGTA-TAAA---TATA------AATAT--ATTTTCGT--CA-CT-GTTATATGTACTC-TTAC---ACAA-A-A--AAAGCACCCGT--TT-AC--TTAAAGGATGAAAACTGCGTGTAGAAAAAAAATGACGAAGTCATTAAT--tcgcacatccgttgcatct
gi|143737                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GTCAATT------GTTGACAAAACGTTTCATGTCTTTAAT--G-TATTATTGTACTTGTG-TAAA---TATA------AATGT--ATTTGTGT--CA-CT-GGTATATGTACTC-TTAC---CAAATA-A--TAAC-ACTCG---TATAC--TTAAGGGATGAAAACGGCGTGTGGAACGAAAAAGACGAAGTCGTTCAT--CAG-TATATATAGAACATTGCATAAAGTAGTcagtatacatgcat
gi|143738                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TATCAAAACGTTTAGTGTCTTTAAT--A-AAAGTTTGGACAT-TGTTAAA---TATA------ACACT--ATTTTCAT--CGTCT-GAAATAT-CATCT-CTCC---CGTGTA-A--CAGG-GTTT----TA-ACA-CTAAAGGATGAAGGTGACATGTAGCATGAAAGAGACGAAGTCGATTAT--TTA-AAAAAGAAGGACATTGCATGAAATAGT
gi|143739                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TATCAAAACGTTTAGTGTCTTTAAT--ATAAGT-TTGGACAT-TG-TTAAATTTATACAAC--AATA----TTTTCAT--CG-TTTGAAATAATCATCT-CTCC---CGTGTA-A--CAGG-GTTT----TA-ACACTTAAAGGATGAAGGTGATGTGTAGCATGAAAGAGACGAAGTCGATCGC--TTA-AAAAAGAAGGACATTGCATGAAATAGT
gi|143740                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TATCAAAACGTTTAGTGTCTTTAATGTA-AGTT--TGGACAT-TG-TTAAC--TATATT----AATA----TTTTCAT--TG-TC-TG---AGATATCA-TCACTCCCGTGTA-A--TAAG-GTTT----TA-ACACTTAAAGGAAGACGATGACGTGTAGCATGAAAGAGACGAAGTCGATCAT--TTA-AAAAAGAAGAACATTGCATGAAATAGT
gi|143741                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CAAAACGTTTCGTGTCTTTAAT--G-TATCGTTGTACTTGTG-TAAA---TATA------AATGT--ATTTGTGT--CG-CT-GGTATATGTACAC-TTAC---CAAATA-A--TAAC-ACTCG---TGTAC--TTAAGGGATGGAAACGGCGTGTGGAACGAAAAAGACGAAGTCGTTCATCATT---ATATATAGAACATTGCATAAAGTAGT
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gi|143723                     : agaaaaaggatttagtaagaaagaaaaaggaaattggaaataatggttgtatgatataataataaggtaatctaaatataccctataattagaagaatcgtcatcaggccaactttttatgcacatatattctttagttaattaatatcaaatcgttttgagtctttgataaattgctgatgacttagaggaGGATT-CGAA--AAGAAAGAGA--GGAAACTTGGAAATAAAGGTTATATAGTATAATAATAAGC-----------TACTCTATATATACCCTATAATTAGAACAAAAGTCATTAG--TCCGATTTTAATCATTAATAACATGCATTGAACAGTTACTT------AATATCAAATCACTTTGAGTCTTTGAC----AATTGCTCCACCGACA-TGCA---TATA------AATGC--GTTTTCAT--CG-CT-AGCATAAGTTTTG-TTAT---CGGA-A-AGTAAT-G-TAT-GA-CA-AC--TGAGAGGATGAAATCGATATGCGGCTAGAAAAAGTCGGATTATTTCGC--CTG-AAAA-ATA
gi|143724                     :                                                                                                                                                                                 agataggacAGATAAAGGATT-TAGG--AAGAAAGAAAAAAG-------GAAATAATGGTTGTATGATATAATAATAAGGTAATCTAAAGGTAATCTAAACATACCCCATAATTAGAAGAATCGTCATCAG--GCCGACTTT-----TTATGCACATATATT-TTTAGTTAATTAATGTCAATATCAAATCGTTTTGAGTCTTTGCT--A-Aa
gi|143725                     :                                                                                                                                                                                          AGAAAAAGGATT-TAGT--AAGAAAGAAAAAGGAAA-TTGGAAATAATGGTTGTATGATATAATAATAAGA-----------TAATCTAAATATACCCTATAATTAGAAGAATCGTCATCAG--GCCAACTTT-----TTATGCACATATATTCTTTAGTTAATT------
gi|143726                     :                                                                                                                                                                                          AGAAAAAGGATT-TAGA--AAGAAAGAAAAAGGAAA-TTGGAAATAATGGTTGTATGATATAATAATACGG-----------TAATTTAAATATACCCTATAATTAGAAGAATCGTCATCAG--GCC
gi|143727                     :                                                                                                                                                                                                   ATTATAGG--GAGAAAGAAAAAGGAAT-TTGGAAATGAAGGTTGTATAGTCTAATAATAAGA-----------TAATCTAAATATACCCTATAATTAGAGTAATTGTCATTAATCGCCGACTTT-----TAATGCGCATATAATGTACAGTTAATT------AGTATGGAATCGTTTTAAGTATTTGAT--A-AATTGTTGCACAGATG-TGAA---TATA------AATGA--GTTTTCAT--
gi|143728                     :                                                                                                                                                                                                     T-TAGATAAAGAAAAGAAAAGAAAA-TTGGAAATAAAGATTGGATAATGTAATAATAAGA-----------TAATATAAATAT--TCTATTAGTAGAACAACCACCATTAT--GCCGAC-----------GGCA-ATGTA-----CAGTTAATA------AGTATCGAATCGCTTTGTGTCTTTGGT--A-AATTGTTGTACAGACG-TGAA---AAGA------AATGA--GTTTTCGT--CG-TT-AGTATAGGTATCT-TTAT---CCAAAA-A--AAATA-ACTGTGATG-AC--TGAGATGATAAAATCGCCGTGTAGGTCGAAAA-----GAGTTGTTCGT--TTG-ATAATA-AACAAATTGCATGAAATAGT
gi|143729                     :                                                                                                                                                                                                                                                                 -----------TAATTTAAATACACCCTATAATTTGAAGAATCGTCATTAG--GCCGACTAT-----TAAT
gi|143730                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TAGTTAATT------AATATCAAGTCGTTTTGAGTCTTTAAT--G-AATTGTTGCACAGATG-TGAA---TATA------AATGA--GTTTTCGT--CG-TT-AGTATAAGTGTCT-TTAC---CGAACAGA--AAA-G-TAT-TA-TG-AC--TAAGAGGATGAAATCGACGTGTGGCTCTAAAAAGTCGGATTAGTTCGT--TTA-AGAATATAATACATTTCATAAAATAAT
gi|143731                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AGTCAATT------GTTGGCAAAACGTTTCGTGTCTTTAAT--G-TACTGTTGTACTTGTG-TTAA---TATA------AATAAATGTTTTTGTGTCA-TT-GGTATATGT-TCTCTTAC---CAAATA-A--TAA-C-ACT-CG-TGTAC--TAAAGGGATGAAAACGGCGCGTGGAACGAAAAAGACGAAGTCGTTCAT--CAG-TATATATAGAACATTGCATAAAGTAGT
gi|143732                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AGTCAATT------GTTGACAAAACGTTTCGTGTCTTTAAT--G-CATTGTTGTACTTGTG-TAAA---TATA------AATAT--ATTTGCTA--CA-CT-TGTATATGTACTT-TTAC---CAAATA-A--AAA-C-ACT-CG-TGTAC--TTAAGGGATGAAAACGGCGTGTGGAACGAAAAAGACGAAGTCGTTAAT--CAG-TATATATAGAACATTGCATAAAGTAGT
gi|143733                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AGTCAGTT------GTTGACAAAACATTTCGCGTCTTTAAT--A-TACTGTTTTACCTGTG-TAAA---TATA------AATGT--ATTTGCAT--AA-CT-GGTATATGTACTC-TTAC---CAAATA-A--AAG-C-ACT-CG-TGTAC--TTAAGGGATGAAAACGGCGTGTAGAACGAAAAAGACCAAGTCGTTCAT--TAG-TATACATAGGACATTGCATAAA
gi|143734                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AATCAATT------GTTGACAAAACGTTTCGTGTCTTTAAT--G-TATTGTTGTACTTGTG-TAAA---TATA------AATGT--ATTTGTGT--CA-CT-GGTATATGTACTC-TTAC---CAAATA-A--AAA-C-ACT-CG-TGTAC--TTAAGGGATGAAAACGGCACGTGGAACGAAAAAGACG
gi|143735                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AGTCAGTT------GTTGACAAAACGATTCGTGTCTTTAAT--A-TATTGTTGTACTTGTG-TAAA---TATG------AATGT--ATTTGTGT--CA-CT-GGTATATGTACTC-TTAC---CAAGTA-A--AAG-C-ACT-CG-TGTAC--TAAAGGGATGAAAACGGCGTGTAGAACGAAAAcat
gi|143736                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AGTCAGTT------GTTGGCAAAACGTTTTGTGTTTTTAAT--G-AATTGTTGTACCTGTA-TAAA---TATA------AATAT--ATTTTCGT--CA-CT-GTTATATGTACTC-TTAC---ACAA-A-A--AAA-GCACC-CGTTT-AC--TTAAAGGATGAAAACTGCGTGTAGAAAAAAAATGACGAAGTCATTAAT--tcgcacatccgttgcatct
gi|143737                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GTCAATT------GTTGACAAAACGTTTCATGTCTTTAAT--G-TATTATTGTACTTGTG-TAAA---TATA------AATGT--ATTTGTGT--CA-CT-GGTATATGTACTC-TTAC---CAAATA-A--TAA-C-ACT-CG-TATAC--TTAAGGGATGAAAACGGCGTGTGGAACGAAAAAGACGAAGTCGTTCAT--CAG-TATATATAGAACATTGCATAAAGTAGTcagtatacatgcat
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Reference ( family-660 )      :                                                                                                                                                                                          AGANAAAGGATT-TAGA--AAGAAAGAAAAAGGAAA-TTGGAAATAATGGTTGTATGATATAATAATAAGG-----------TAATCTAAATATACCCTATAATTAGAAGAATCGTCATCAG--GCCGACTTT-----TTATGCACATATATTGTTTAGTTAATT------ANTATCAAANCGTTTCGTGTCTTTAAT--A-AATTGTTGCACNTGTG-TGAA---TATA------AATGN--GTTTTCGT--CG-CC-GGTATANGTATCT-TTAC---CGAATA-A--AAA-G-NCT-CG-TG-AC--TTAGAGGATGAAANCGACGTGTGGCNCGAAAAAGACGGAGTCGTTCAT--TTG-AAAATATAGNACATTGCATAAAATAGT
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gi|143723                     : agaaaaaggatttagtaagaaagaaaaaggaaattggaaataatggttgtatgatataataataaggtaatctaaatataccctataattagaagaatcgtcatcaggccaactttttatgcacatatattctttagttaattaatatcaaatcgttttgagtctttgataaattgctgatgacttagaggaGGATT-CGAA--AAGAAAGAGA--GGAAACTTGGAAATAAAGGTTATATAGTATAATAATAAGC-----------TACTCTATATATACCCTATAATTAGAACAAAAGTCATTAG--TCCGATTTTAATCATTAATAACATGCATTGAACAGTTACTT------AATATCAAATCACTTTGAGTCTTTGAC----AATTGCTCCACCGACA-TGCA---TATA------AATGC--GTTTTCAT--CG-CT-AGCATAAGTTTTG-TTAT---CGGA-A-AGTAAT-G-TAT-GA-CA-AC--TGAGAGGATGAAATCGATATGCGGCTAGAAAAAGTCGGATTATTTCGC--CTG-AAAA-ATA
gi|143724                     :                                                                                                                                                                                 agataggacAGATAAAGGATT-TAGG--AAGAAAGAAAAAAG-------GAAATAATGGTTGTATGATATAATAATAAGGTAATCTAAAGGTAATCTAAACATACCCCATAATTAGAAGAATCGTCATCAG--GCCGACTTT-----TTATGCACATATATT-TTTAGTTAATTAATGTCAATATCAAATCGTTTTGAGTCTTTGCT--A-Aa
gi|143725                     :                                                                                                                                                                                          AGAAAAAGGATT-TAGT--AAGAAAGAAAAAGGAAA-TTGGAAATAATGGTTGTATGATATAATAATAAGA-----------TAATCTAAATATACCCTATAATTAGAAGAATCGTCATCAG--GCCAACTTT-----TTATGCACATATATTCTTTAGTTAATT------
gi|143726                     :                                                                                                                                                                                          AGAAAAAGGATT-TAGA--AAGAAAGAAAAAGGAAA-TTGGAAATAATGGTTGTATGATATAATAATACGG-----------TAATTTAAATATACCCTATAATTAGAAGAATCGTCATCAG--GCC
gi|143727                     :                                                                                                                                                                                                   ATTATAGG--GAGAAAGAAAAAGGAAT-TTGGAAATGAAGGTTGTATAGTCTAATAATAAGA-----------TAATCTAAATATACCCTATAATTAGAGTAATTGTCATTAATCGCCGACTTT-----TAATGCGCATATAATGTACAGTTAATT------AGTATGGAATCGTTTTAAGTATTTGAT--A-AATTGTTGCACAGATG-TGAA---TATA------AATGA--GTTTTCAT--
gi|143728                     :                                                                                                                                                                                                     T-TAGATAAAGAAAAGAAAAGAAAA-TTGGAAATAAAGATTGGATAATGTAATAATAAGA-----------TAATATAAATAT--TCTATTAGTAGAACAACCACCATTAT--GCCGAC-----------GGCA-ATGTA-----CAGTTAATA------AGTATCGAATCGCTTTGTGTCTTTGGT--A-AATTGTTGTACAGACG-TGAA---AAGA------AATGA--GTTTTCGT--CG-TT-AGTATAGGTATCT-TTAT---CCAAAA-A--AAATA-ACTGTGATG-AC--TGAGATGATAAAATCGCCGTGTAGGTCGAAAA-----GAGTTGTTCGT--TTG-ATAATA-AACAAATTGCATGAAATAGT
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gi|143731                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AGTCAATT------GTTGGCAAAACGTTTCGTGTCTTTAAT--G-TACTGTTGTACTTGTG-TTAA---TATA------AATAAATGTTTTTGTGTCA-TT-GGTATATGT-TCTCTTAC---CAAATA-A--TAA-C-ACT-CG-TGTAC--TAAAGGGATGAAAACGGCGCGTGGAACGAAAAAGACGAAGTCGTTCAT--CAG-TATATATAGAACATTGCATAAAGTAGT
gi|143732                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AGTCAATT------GTTGACAAAACGTTTCGTGTCTTTAAT--G-CATTGTTGTACTTGTG-TAAA---TATA------AATAT--ATTTGCTA--CA-CT-TGTATATGTACTT-TTAC---CAAATA-A--AAA-C-ACT-CG-TGTAC--TTAAGGGATGAAAACGGCGTGTGGAACGAAAAAGACGAAGTCGTTAAT--CAG-TATATATAGAACATTGCATAAAGTAGT
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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                             A        .    .                  .                                  .                                                  .          .                   C           .      A       T     T A         G           C  CGA  . G  .      .         A          .   . C       A      .    .      C . A    CACTCGTGT      .  T           T          CT        T             .    .  A      C
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                             T        .    .                  .                                  .                                                  .          .                   G           .      A       T     T A         A           C  AGA  . G  .      .         C          .   . T       G      .    .      T . T    CACTCGTGT      .  G           T          GT        T             .    .  A      T
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                             A        .    .                  .                                  .                                                  .          .                   C           .      A       T     T A         A           T  AGA  . G  .      .         A          .   . T       A      .    .      T . A    CACTCGTGT      .  G           T          CT        A             .    .  A      A
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                             A        .    .                  .                                  .                                                  .          .                   G           .      G       T     T A         A           C  AGA  . G  .      .         A          .   . T       T      .    .      T . A    CACTCGTAT      .  A           A          AA        A             .    .  T      A
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                      .    .                  .                                  .                                                  .          .                   .           .      G       T     T T         A           T  TTG  . T  .      .         A          .   . T       T      .    .      T . A    CACTCGTGT      .  A           A          AA        A             .    .  T      G
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                      .    .                  .                                  .                                                  .          .                   .           .      A       T     T A         A           T  TTG  . A  .      .         T          .   . T       T      .    .      T . A    CGCTCATGT      .  T           A          AA        A             .    .  T      A
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                      .    .                  .                                  .                                                  .          .                               .      T       A     C T         G           T  CTG  . A  .      .         T          .   . T       T      .    .      T . A    GTATGATG       .  T           A          AA        A             .    .  T      G
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                 .                                                  .                                          .      T       A     C T         G           T  TTG  . A  .      .         T          .   . T       T      .    .      T . T    GTATGATG       .  T           A          AA        A             .    .  A      G
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               .      T       A     C C         G           T  TTG  . A  .      .         T          .   . T       T      .    .      T . C    GTATGATG       .  A           A          AA        A             .    .  A      A
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               .      T       A     C T         A           T  CTG  . A  .      .         T          .   . T       T      .    .      T . C    GTATGACA       .  T           A          AA        A             .    .  A      A
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               .      T       A     C T         G           T  TTG  . A  .      .         T          .   . T       T      .    .      T . T    GTATTATG       .  T           G          CA        A             .    .  T      G
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Reference ( family-660 )      :                                                                                                                                                                                            AGANAAAGGATT-TAGA--AAGAAAGAAAAAGGAAA-TTGGAAATAATGGTTGTATGATATAATAATAAGG-----------TAATCTAAATATACCCTATAATTAGAAGAATCGTCATCAG--GCCGACTTT-----TTATGCACATATATTGTTTAGTTAATT------ANTATCAAANCGTTTCGTGTCTTTAA--TA-AATTGTTGCACNT-GTGTGAA---TATA------AATGN--GTTTTCGT--CGCC-GGTATANGTATCT-TTA---C-CGAATAA-AAACGCTCGT-AT----ACTTAGAGGATGAAANCGACGTGTGGCNCGAAAAAGACGGAGTCGTTCAT--TTG-AAAATATAGNACATTGCATAAAATAGT
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