lowQualScore                  :                 888888888888888888888                            1                                       1                                                11111111111       222222222222222             11111111111111111111   1111111                                          2222222222222          111111111           111111     111            11111                   33333333333333333333333333333333333                                2222222222222222222222                                                         11111111    1111           11111        11       2222222222222222222222                   11111   111111                    22222222222                                       1   2222222222                             444444444                       1111111111                                        1111111111       111111                  111         
lowQualScore                  :      6          777777777777777777777     3     999999  3        4            44       0  88          5  1      77777 2    5555  22  6666 444             88888888888   33  111111111111111             55555555555555555555   1111111      77777   888888     6666 44  555     1111111111111 3 44 33  000000000      3  2 555555     000 333  666   44444  777  444  666666 66666666666666666666666666666666666 33  33 88   55555    6  2 4    5555555555555555555555            3     444    3  66   0    1  7 66   4     1  66666666 5  1111 0    6    44444 1  0   11 0 4   1111111111111111111111 333 555555  1   0 66666   222222  44444    1  3   1 55555555555 1  22  5         66666         1      1   7777777777  44    8         7777   3   999999999 2 2  22 333      33   7777777777   5555  4 2  5 33   2   7    5  777777 3333333333  33   000000   2   3   3 3    888         
lowQualScore                  :      .          .....................     .     ......  .        .            ..       .  ..          .  .      ..... .    ....  ..  .... ...             ...........   ..  ...............             ....................   .......      .....   ......     .... ..  ...     ............. . .. ..  .........      .  . ......     ... ...  ...   .....  ...  ...  ...... ................................... ..  .. ..   .....    .  . .    ......................            .     ...    .  ..   .    .  . ..   .     .  ........ .  .... .    .    ..... .  .   .. . .   ...................... ... ......  .   . .....   ......  .....    .  .   . ........... .  ..  .         .....         .      .   ..........  ..    .         ....   .   ......... . .  .. ...      ..   ..........   ....  . .  . ..   .   .    .  ...... ..........  ..   ......   .   .   . .    ...         
lowQualScore                  :      0          444444444444444444444     3     666666  3        2            22       7  88          7  4      11111 9    9999  99  1111 777             00000000000   77  555555555555555             66666666666666666666   3333333      77777   888888     5555 22  444     2222222222222 1 22 77  777777777      9  2 999999     444 999  111   44444  111  111  888888 66666666666666666666666666666666666 33  11 33   33333    3  1 0    7777777777777777777777            6     666    7  99   3    9  7 22   3     9  22222222 0  0000 2    1    88888 0  8   44 7 0   5555555555555555555555 333 555555  9   1 44444   111111  55555    9  9   9 66666666666 9  66  0         77777         4      0   7777777777  00    7         7777   8   777777777 1 8  99 777      11   4444444444   3333  5 5  0 44   5   7    3  777777 5555555555  77   333333   7   3   6 6    111         
consensus                     :    GTAATTTCGGATAGATATGTCAAAATT-------AGTTT-GTGTT------GC-GAGTTTTCGTTACAATGCTGT--GTAAACAGCACAGGATTAGAGA-GG-CGTGTC----GA-AAGCGT--CGGGAT----G---AAAGGTGTGAATA-------C---GTT--GA--------T-AT---CGCAAATTCACTT------------G------ATTA-----AAATACAA-----ATT------ATAAG----T--AG---ATATA---------T---A-T--C--TA------T--TAGAAAACT-GAA----ATATTG-NT---TT---TAT---ANGC--GTA---TT------T-------T------T-----------A-AT--A--TA-CT--T--CCT-----GAAA-AG-A-GCTG---------ANG-------AAAATACGTCACGCT-GGCGT--AAAATGTGN-CGTCTACT-ATTG-NAATCGACAT-ATN-------CNTC---NAGGAAAACGGTCTANTTCTAGCACCATCT-CAC-----TG--GA-GAANAT--NTA---A------TA-CACAT---C-AGT-----NAA-----CACA-CGACCT-CTG-ATA--A--T-GA--CACGCATATTTT-----ATGTAATGAAACGGATGGAA-N-G--T--NAACGCAGTNACCGTATTTA---AAC-TTAA-T-AATAAA-TCAG--T---ACACTT--AAT------TTCCTAA----TTCA-AG-T--TAA-TTTNTATT-GA------T----A-----AA--TAG------TAA-ATA-AAA-A-CACA--CGAGGTAAAA
Reference ( gi|128435 )       :    GTGATTTCGGATA---AT-------TT-------AGTTT-GTGTT------GC-GAGTTTTCCTTACAATGCTGT--GTAAACAGCACAGGATTAGAGA-GG-CGTGTC----GA-AAGCGT--CGGGAT----G---AAAGGTGTGAATA-------C---GTT--GA--------T-AT---CGCAAATTCACTT------------G------ATTA-----AGATACAA-----ATT------ATAAG----T--AG---ATATA---------T---A-T--C--TA------T--TAGAAAACT-GAA----ATATTG-AT---TT---TAT---AAGC--GTA---TT------T-------T------T-----------A-AT--A--TA-CT--T--CCT-----GAAA-AG-A-GCTG---------ATG-------AATATATGTCACGCT-GGTGT--GAAATATGG-CGTTTACT-ATAG-AAATCGACAT-ATA-------CGTC---AAAGAAAATGGTATAACTCTAGCACCATCT-CAC-----TG--GA-GACTAT--TTA---A------TA-CACAT---C-AGT-----TAA-----CACA-TGGCCT-C-G-ATA--A-AT-GA--CAGGCATATTTT-----ATGTAATGAGACAGATCGAA-G-G--T--AAACGCAGTAACCGTATTTA---AAC-TTAA-T-AATAGA-TTAA--T---ACACTT--AAT------TTCCTAA----TTCA-AG-T--TAA-TTTGTATT-GA------T----A-----AA--TAG------TAA-ATA-AAA-A-CACA--AGAGGTAAAA
gi|128436                     :    GTAATTTCTGATA---GT-------TT-------AGTTT-GTGTT------GC-GAGTTTTCGTTACAATGCTGT--GTAAACAGCACAGGATTAGAGA-GG-CGTGTC----GA-AAGCGT--CGGTAT----G---AAAGGTGTGAATA-------C---GTT--GA--------T-AT---CGCAAATTCACTT------------G------ATTA-----AAAT-CAA-----ATA------ATAAG----T--AG---ATATA---------T---A-T--C--TA------T--TAGAAAACT-GAA----ATATTG-TT---TT---TAT---AAGC--GTA---TT------T-------T------T-----------A-AT--A--TA-CT--T--CCT-----GAAA-AG-A-GCTG---------ATG-------AAAATATGTCACGCT-GGTGT--GAAATATGG-CGTTTACT-ATAG-AAATCGACAT-ATG-------CGTC---AAAGAAAATGGTATAACTCTAGCACCATCT-TAC-----TG--GA-GACTAT--TTA---A------TA-CACAT---C-AGT-----TAA-----CACA-TGGCCT-C-G-ATT--A-AT-GA--CAGGCATATTTT-----ATGTAATGAGACAGATCGAT-G-G--T--TAACGCAGTAGCCCTATTTA---AAC-TTAA-T-AATAAA-TTAA--T---ACACTT--AAT------TTCCTAA----TTCA-AG-T--TAA-TGTGTATT-GA------T----A-----AA--TAG------TAA-ATA-AAA-A-CACA--CGAGGTAAAA
gi|128439                     :    GTAATTTCGAATA---GT-------TT-------AGTTT-GTGTT------GT-GAGTTTTCTTTACAATGCTGT--GTAAACAGCACAGGATTAGAGA-GG-CGTGTC----GA-AAGCAT--CGGGAT----G---AAATTTGTGAATA-------C---GTT--GA--------T-AT---CGCAAATTCACTT------------G------ATTA-----AAATACAA-----ATT------ATAAG----T--AG---ATATA---------T---A-T--T--TA------T--TGGAAAACC-GAA----ATATTG-TG---TT---TAT---A-----------TT------T-------T------T-----------A-AT--A--TA-CT--T--CCT-----GAAA-AA-A-GCTG---------ATG-------AAAATATGTCACGCT-GGTGT--GAAATATGG-CGTTTACT-ATAG-AAATCGACAT-ATG-------TGTC---AAAGAAAATGATTCAACTCTAGCACCATCT-CAC-----TG--GA-GAATAT--TTA---A------AA-CACAT---C-AGT-----TAG-----TACA-TGGCCT-C-G-ATA--A-AT-GA--CAGGCATATTTT-----ATGTAATGAGACAGATCGAA-GTT--T--AAACGCAGTAGCCGTATTTA---AAC-TTAA-T-ACTAAA-TAAA--T---ACACTT--AAT------TTCCTAA----TTCA-AG-T--TAA-TTTGTATT-GA------T----A-----AA--TAG------AAA-ATA-AAA-A-CACA--CGAGGTAAAA
gi|128437                     :    GTAATTTCGGATACATATGTCAAAATT-------AGTTT-GTGTT------GC-GAGTTTTCGTTACAATGCTGT--GTAAACATCACAGGATTAGAGA-GG-CGTGTC----GA-AAGCAT--CGGGAT----G---AAAGGTGTGAATA-------C---GTT--GA--------T-AT---CGCAAATTCATTT------------G------ATTA-----ATATACAA-----ATT------ATAAG----T--AG---ATATA---------T---A-T--C--TA------T--TAGAAAACT-GAA----ATATTG-AT---TT---TAT---AAGC--GTA---TT------T-------T------T-----------A-AT--A--TA-CT--T--CCT-----GAAA-AG-A-GCTG---------ATG-------AAAATATGTCACGCT-GGTGT--GAAATATAG-CGTTTACT-CTAG-AAATCGACAT-ATG-------TGTC---AAAGAAAATGGTTTAACTCTAACACCATCT-CAC-----TG--AA-GAATAT--TTA---A------T------------AG-----------------A-TGGCCT-C-G-ATA--A-AT-GA--CAGGCATATTTT-----ATGTAATGAGACAGATCGAA-G-GT-T--AAACGCAGTAGCCGTATTTA---AAT-TTAA-T-AATAAA-TTAA--T---ACACTT--AAT------TTCCTAA----TTCA-AG-T--TAA-TTTTTATT-AA------T----A-----AA--TAG------TAA-ATA-AAA-A-CACA--CGAGGTAAAA
gi|128438                     :    GTAATTTCGGATAGATATGTCAAAATT-------AGTTT-GTGTT------GC-GAGTTTTCGTTACAATGCTGT--GTAAACATCACAGGATTAGAGA-GG-CGTGTC----GA-AAGCAT--CGGGAT----G---AAAGGTGTGAATA-------C---GTT--GA--------T-AT---CGCAAATTCACTT------------G------ATTA-----AAATACAA-----ATT------ATAAG----T--AG---ATATA---------T---A-T--C--TA------T--TAGAAAACT-GAA----ATATTG-AT---TT---TAT---AAGC--GTA---TT------T-------T------T-----------A-AT--A--TA-CT--T--CCT-----GAAA-AG-A-ACTG---------ATG-------AAAATATGTCACGCT-GGTGA--GATATATGG-CGTTTACT-CTAG-AAAGCGACAT-ATG-------CGTC---AAAGAAAATGGTTTAACTCTAGCACCATCT-CAC-----TG--GA-GAATAT--TTA---A------T-----------------------------ACA-TGGCCT-C-G-ATA--A-AT-GA--CAGGCATATTTT-----ATGTAATGAGACAAATCGAA-G-GT-T--AAACGCAGTAGAAGTATATA---AAT-TTAA---AATAAA-TTAA--T---ACACTT--AAT------TTCCTAA----TTCA-AG-T--TAA-TTTGTATT-GA------T----A-----AA--TAG------TAA-ATA-GAA-A-CACA--CGAGGTGAAA
gi|128441                     :    GTAATTTCGGATAGATAT-------GTCAACATAAGAAT-GTGTT------GC-GAGTTTTCGTTACAATGCTGT--GTAAACAACACAGGCTTAGAG------GTGTC----AA-
gi|128445                     :                               -------AGTTT-GTGTTTAATACGCCGAGTTTTCCTTACAATGCTGT--GTAAACAGCACAGGATTAGAGA-GG-CGTGTC----GA-AAGCGT--CGGGAT----G---AAAGGTGTGAATA-------C---GTT--AA--------T-AT---CGCAAATTCACTT------------G------ATTA-----AAATACAA-----ATT------ATAAG----T--AG---ATATA---------C---A-T--C--TA------T--TAGAAAACT-GAA----ATATTG-GT---TT---TAT---AAGC--GTA---TT------T-------T------T-----------A-AT--A--TA-CT--T--CCT-----GAAA-AG-A-GCTG---------ATG-------AATATATGTCACGCT-GGTGT--GAAATATGG-CGTTTACT-ATAG-AAATCGACAT-ATG-------CGTC---AAAGAAAATGGTATAACTCTAGCACCATCT-CAC-----TG--GA-GACTAT--TTA---A------TA-CACAT-----AGT-----TAA-----CACA-TGGCCT-C-G-ATA--A-AT-GA--CAGGCATATTTT-----ATATAACGAGATAGATCGAA-A-G--T--TAACGCAGTAGCCGTATTTA---AAC-----------------AA--T---ACAATT--AAT------TTCCTAA----TTCA-AG-T--TAA-TTTTTACT-GA------T----A-----AA--TAG------TAA-ATC-AAA-T-CACA--CGAGGTAAAA
gi|128440                     : attccatggatcattttataaaaaatagta-------AGTTT-GTGTT------GC-GAGTTTTCGTTACAATGCTGT--GTAAACAGCACAGGATTATAAA-GG-CGTGTC----AA-AACCAT--CGAGAT----G---AAAGGTTTGAATA-------C---GTT--GAGA------T-AT---CGCAAATTAACTT------------G------ATTA-----AAATACAA-----ATT------ATAAG----T--AG---ATATA---------T---A-TATC--TA------T--TA-AAAACT-GAA----ATATTG-TT---TG---TAT---AAGC--GTA---GT------T-------T------T-----------A-AT--A--TA-CT--T--CCT-----GAAA-AG-T-GCTG---------ATG-------AAAATATGTCACGCT-GGTGT--GAAATATGG-CGTCTACT-CTAG-AAATCGACAT-ATT-------CGTC---AAAGAAAATGGTTTAACTCTAGCACCATCT-CAC-----TG--GA-GAATAT--TTA---A------TA-CACAT---C-AGT-----TAA-----CATA-TAGCCT-C-G-GTA--A-AT-GA--CAGGCATATTTT-----ATGTAATGAGACAGATCGAA-G-GT-T--AAACGCATTAGCCGTATTTA---AAT-TTAA-T-AATAAA-TTAA--T---ACACTT--AAT------TACCAAA----TTAA-AG-T--TAA-TTTGTATT-GA------T----A-----AA--TAG------TGA-ATA-AAA-A-CACA--CCAGCTAAAA
gi|128442                     :             gtaatctcgaatagatatgtcaacataTTT-GTCTT------GC-GACGTTTCATTACAATAC-------AAACATCACATGATAAGAGA-GAACATGCC----CA-AAGCAT--AGTGTT----G---ATACACGTGAATA-------G---GTT--AA--------T-AT---CGTAAATTCACTT------------G------ATTA-----AAACACAA-----AAT------ATTAG-------AA---ATATA---------A---A-T--C--TA------A--TAGAGAGCT-GA------TTTTT-TTCCCTT---TAT---ATGC--ATA---T----------------------------------A-AT-----------------T-----AAAG-AG-A-GCTG---------AGG-------AAAATATGTCACGCC-GAT
gi|128443                     :     gtcattttgggtagatgtgtcaattagccgacagtTTTAGTGTT------AT-GAGTTTTGATCAAACTGTTAT--GAAAACAACA----ATTGGAGA-GGATGTGTC----AC-AAG----------T----T---AAAGTTGTTAATA-------G---ATT--GAGAC-----C-AG---CACAAATTCACTT------------G-------TTAG----AAATA
gi|128444                     :      gtaattgttgggagagatgtcaattagtctgtgcTTG-GTGTT------AC-GAGAGTTGATCAAACTGTTAT--GTAATCAACA----ATTGGAGATGA-CATGTT----GC-AAGT-T-----GAT----G-------GTGTAAATA-------G---GTT--GA--------G-ACAAATGCATATTCACTtttatttctccttgagaaaaagaaataaaaacttaatagtaataggctactctttaattaaatacaagaaatctgcgttgtatttattcgtatgcatattctctcttttaaaattttttacttgaaacaatgctggaaaaatatgtcacgctgtggtaaaatgtgttgtctactattgtaattgacatattcttccaggaaacggtatatttttatataatttttttttatataatcattaaataaaataaacacaagtcaacacatgacctgtgatattaacacgcatattttatgtaatgaaatggattgaatattgatacagttactgtattttaacttaaatcagtacacttaattaaacatttcaaatttaattt
gi|128447                     :        gtaatcatgggtagagatgtcagttatgcaccTTT-GTGTT------AC-AAGTTTTG-TTATAATACTATATGCAAACAGCA-----TTAGAGT-GGATGTGTC-----A-ATGCTTACCGGTATTGTCA---AAAGGCGTGAACA-------G---GTTATGACCACAGGTT-ATGACCACAAATTCACTT------------G------CTAA-----ACATAACA-----TTT------ATAAATTCCT--AG---ATAGA---------A---A-T--A---A------G--TA-AAAAC--GAA----ACAGTA-GT---TT---cattcactcattagaaatatttatttctcatcgacaaaaagaaacaaaaataggctacttttcaattaaataattaatctgtatggtactcattcacacacattttctctttttacaataactaattaagataatgctggaaaaatatgtgatgctgacaaaatgtgtcatctactgatgtaagtgacatattcttctaggaaatagtctattttaagcttttcacagtgatgaaaataaaatacacgtcggtaaacacatgatctctgatactgacacgcatgttttatataatgaaacggatggaatattaatacagttaccatattttaaatgaatcagtacacttaattaaagatttaaagtttactttttcaatagatctaatagcaaattgagcacactaaatagaa
gi|128448                     :                                        TTT-GTGTT------AC-CAGTTTTGATTA-AAT-TTAT--GAAAATAGCA-----TTGGAGA-GAACATGTC----AC-A--CGT--TGA-AT----G---CTTATTGCCAACA-------A---ATT---------------------TAAATTCACTC------------G-------TTA-----AAAAACTA-----ATTCCTCGAAAAAA----T--AG----TATGAGG------T---AAT--C--TAATAAATC--TAGAAATCT-G-------TATCGTAT---TT---CTTCGCAAAC--ATAATCTT------TCC-----T------T-----------T-ATGAA--TC-AT--TAACTT-----GATATAG-T-GCTG---------GAA-------AAAACCCATCAAGCT-GGCGA--AAAATATGT-CGTCTGCT-ATTG-TATTTGACAT-ATT-------TGTTTTTAAA--AAACGGT------------CTATTT-TAC-----TGT-GATGAACAT--GAA---A------TA-CATAC---G-AGT-----AAG-----TACG-CTACCA-C----TA--ATATTGA--CATGCATATAAT-----ATGTAATAAAATAAACAGAA-T-A--T--TAATACAGT---TTTTTTTACTTAAC-TTAA-T-A--------AA--T---GCAC-T--AAT------TTTATTT----TTC--AG-TAATAA---TGAATT-GA------T----A-----AACTTAT------TGG-ATA-A
gi|128446                     :                                                                         TGTTAC--GAAAACAATAT-GGA----AGATGA-CGTGTCATAAGATAAGTG---CGTAAT----GTCAAAAGGTCAGAATAGCGAGGTC---GT---GA--------TCAG---CGTCAATTCCCTC------------G------TTAA-----AAATACTG-----ATT------CTTCG----T--A----ATATA---------ACAAA-C--CAATA------C--TAGAAA--T--------ATATT---T---TT---TATTT-ATGC--ACA---TT------TATTTTCTT------TCAAA-------A-AT-----TA-CT--T--TTT-----TGAA-AA-A-GATG---------GAA-------AA-ATACGTCACGCT-GACGT--AAAATATGT-CGTCTACT-ATTG-CAACTGACAT-ATC-------CTTC----AGGGAAACGGTCTATTTATAGCA
gi|128450                     :                                         cgaatagatatcaataagttggagctttggcgaattatttatgaccttgatttaacTATAGA-GG-CGTGTC----AA-AACCAT--CGTGAT----G---AAAGGTGTGAATA-------C---GTT--GA--------T-AT---CATAAATTCACTG------------G------ATAA-----AAATAAAA-----ATT------ATAAG----T--AG---ATATA---------T---A-T--C--TA------T--TAGAAAACT-AAA----ATATTG-TT---TT---TAT---AAGC--GTA---TT------T-------T------T-------------AT--A--AA-CT--T--CCT-----GAAA-AG-A-GCTG---------ATA-------AAAATATGTCACGCT-GGTGT--GAAATATGG-CGTTTACT-CTAG-AAATCGACAT-ATG-------CGTT---AAAGAAAATGG
gi|128451                     :                                                                                                                                      ----G---AAAGGTGTTATTA-------G---GTC---A--------TGAC---TGCAAATTGACTTTTCCACAAAAGTA------ATTATTTGTAGATAGAA-----GT---------AAA----TGAAA---ACATAATGCTTTTTT---A-T--T--TA------TACTAGAAATTT-GTATCCTATATT-------TT---TGT---ATGCATGTC---TT------T-------T------TTTATTTAAAAAA-AT--ACCTA-CTGGTA-CTT-----GAAAGAG-A-GCCG---------GAA-------AA-ATAAGCAACGCT-GGTGT--TAAAT---G-TGTT------------ATTGACAT-GTT-------CTTC---TAGGAAA-TGGCCTATTTTTAGCACCTTTTACAG-----TG--AT-GAAAAT--GTA---A------TA-CACAC---C-AGT-----TAA-----TAC
gi|128452                     :                                                                                                                                           ---AAACATGTGAATAGTT----CACGGCT--GG--------T-A-----G-AAATTCTCTT------------GAAACAAATTA-------ATACAATATGCATT------GT--G----T--AGTTTAAATA---------T---A----A--TA------C--TAGATATCT-GTATC--ACATTT-AT---TTGCATGC---ATGT--TTG---TT------T-------T------TTAAC-------A-ATC-A--T--CT--T--CTT-----AAAAGAG-A-GCTG---------G-A-------AACATATGTTACACTGGGTATAAAAAATGTGT-CGTCTTCT-ATTG-CAGTTTACAT-AT
gi|128454                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                    --TA------C--TAGAAATCT-G-------TATTG-TG---TT---TAT---TTGCATGCA---TT------T-------T------T-----------A-TT-----T--CT--T--T-T-----AAAA-ATTA-CCTA---------CTT-------GAGAGA-GT---GCTTGATGT--TAAA-ATGT-TGTCTGTT-ATTG-TAATTGGTAT-ACT-------CTTC---TA-GAAAATGGTCTATTTTTAGCACT-TTT-CACAGTGATG--AA-AATGAA--ATACCGG------TA-CACAT---G-AGT-----TAA-----CACA-CGACCT-CTC-AT---A-TT-GA--CACGCATATTTT-----ATGTAATAAAACAGATGGAA-T-C--C--AGATACAGTTACTGTATTT----AAC-TTAAGC-AATGCACTCAA--TCAAAAACTTTAAAT------T--CTAA----TT-A-------TAT-TTTTCAAT-AA------TAGCAA-----AA--TAGATACATTAA-ATAGAAA-A-CAtcttctgggaaccagactatttactattttcagtgcctctcacagtgacgaaaatgtaaaacacatgtatatgcacatataatctgacattgacatacatgacctctgacattgacatattacatggtttatataattcaataaatggaagattacatacagt
gi|128453                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                    --TA------C--TAGAAATCT-GTATC--ATATTT-AT---TC----AC---ATGC--ATA---TT------T-------TCTCCTTT-----------AGAA--A--TAGCT--A--CCT-----GAA--------CTA---------ATGCTTGA--AAAATACGTCATGCT-GACAT--AAAATGTGT-CGTCTTCT-ATTGTAAAT-GACAT-ATT-------CTTC---TAGGAAACTG-------TCTATTACAGT----GA-----TG--AA-AA-------TA---A------AA-AGCATG--CGAGT-----AAA-----CACA-CAACCT-CTG-A-A--A-TT-GATTCAA--ATATTTT-----A-GAAATGAAACAGATGGAA-T-A--T--TAATGCAGTTACCGGATTTT---AAC-ATAA-T-
gi|128443                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AGAAATCT-GCGTT--GTATTT-AT---TCG--TAT-----GC--ATA---TTCTCTCTT-------T------T-----------A-AA--A--TT-TT--TTACTT-----GAAA-CA-ATGCTG---------GAA-------AA-ATATGTCACGCT-GTGGT--AAAATGTGT-TGTCTACT-ATTG-TAATTGACAT-ATT-------CTTC---CAGGAAA-CGGTATATTTTTA-TATAATTT-TTT-----TT--TA-TATAATCATTA---AATAAAATA-AACAC---A-AGT-----CAA-----CACA-TGACCTGT-G-ATA--T--T-AA--CACGCATATTTT-----ATGTAATGAAATGGATTGAA-T-A--T--TGATACAGTTACTGTATTTT---AAC-TTAA--------A-TCAG--T---ACACTT--AAT------TAAACAT----TTCA-AATT--TAA-TTT
gi|128455                     :                                                                                              gtaattgttgggagagatgtcaattagtctgtgctttagtgttatgagttttgatcaaactgttatgaaaacaacaattggagaggatgtgtcacaagttaaagttgttaatagattgagaccagcacaaattcacttgttagaaatatttatttctccttgagaaaaagaaataaaaacttaatagtaataggctactctttaattaaatacaAATACTAGAA----ATCTTG-AT---TG---TAT---------TTA---TT------T-------G------C-----------G-CTC-A--TA-TT--T--CCTCTCTTAAAA-AC-A-GCTGTTTGAAACAATGCTGGAGAAATATACATCACGTT-GACGT--AAAATGGGT-CATCTACT-ATTG-TAATTGACGC-ATT-------C-TC---CTAGAAAATGG----ACTGT-------TTT-TA-----------G-GGCT-T--TCC---A------CA-TACAT---GGAGT-----AAA-----CACA-GGACCT-CTG-ATA--G--T-GA--CACGCATATTTT-----AAGTCATGAAACAGATGGAA-T-A--T--TAA--TAGTTACCATATTTT---AAC----------CAAA-TCAG--T---GCACTA--AAT------
gi|128456                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -GAA----ATAT---GT---AT---CAT---A------TA---TT------T-------T------TTTGTTTAAAA-A-AT-----TA-CC--T--ACT-----TGAA-AG-A-A-TGTT-------ACA-------AGAATATGTCAGGCT-GGTGT--AAAATGTGT-CGTCAGCT-GTTG-TAATTGACAT-ATA-------CTTC---TAGGAAA-TGATCTATTTTGAGCACTTTC--CACAG---TG--AT-GAACGT--GAG---A------TA-CAC-T---CGAGT-----AAA-----CACA-TGTCCT-----ATGCTA-TT-GA--CAGGCATATTTC-----ATGTGATGAAACAGAT-----G-G-----------AGTATTTGTATTTA---AAC-TTA---------A-TCAG--T---ACAC-T--A-------------AA----TTAA-AG----AAA-TATATATT-TT------T----C-----AA--TAA------T-A-ACA-AAATA-CACA--
gi|128457                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -CT--A--CTT-----GAAA-CA-ATGCTG---------GAA-------AA-ATACGTCACGCT-AACGT--AAAAT-TGGTCGACTACT-ATTG-AAATTGACATGATAAATTCTTCTTC---TAGGACA-CAGTCTATTTCTAGCGCT-TTT-CACAT---TGATGA-AGCTAA----A---A------TA-CA-----------------AA-----CAAG-TA--CT-CTG-ATA--T--T-GA--CACGCATATTTT-----ATGTAATGAAA------GAA------T---AATACATTTACTGTATTTA---AAC-TTA---------A-TCAG--T---ACACTA--AATCAAGGATTTCAAA----TTTATAT-T--TAACTTTCAACT-GA------T----CT----AA--TAGC-----TAA-ATcaataaa
gi|128449                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             T-----AAAC-AA-A-GCTG---------AAA-------AAAATACGTCACGCT-GACGT--AGAAT-TGGTCGTTTACT-GTTG-TAATGGACAT-CTA-------GGT----------AACGGTCTATTTTAAGCGCTTTC--CAC------A--GC-GATCAA----A---A------TAACATATACGC-GAG-----AAA-----CACA-CTACCT-CTG-ATA--A--T-GA--CACGCATTGTTT-----ATGTAATCAAACGGTTGGAA-T-A--T--TAAAACAGATACCGTATTTT---AAC-TTA---------A-TCAG--T---GCACTA--AATTAAAGATTTCAAA----TTTA-AATT--TAA-CTT---TC-GATACATCT----A-----AA--TGA------TAA-ATG-AGC-A-CAC
gi|128444                     :                                                                                                                                                                                                        agtgttttgtcaaactgttatgaaaacacaaattggagaggacgtatcacaagttgaagatgtacgtaggtcgagacaaacgcaaattcactcatcagaaatatgtattcttcgtcgacaaacagaaatgaagttataataatccaataggctactttttaatgaaatactttcgagtagtttttttttaaaaagagaataagcgtgcgaataaatacaatgcagatt-GCTG---------GAA-------AA-ATATGTGATGCT-GACA----AAATGTGT-CATCTACTGATGT-AAGT-GACAT-ATT-------CTTC---TAGGAAA-TAGTCTA-TTTTA--AGCTTTT-CACAG---TG--AT-GAAAAT--AAA---A------TA-CACGT---C-GGT-----AAA-----CACA-TGATCT-CTG-AT---A-CT-GA--CACGCATGTTTT-----ATATAATGAAACGGATGGAA-T-A--T--TAATACAGTTACCATATT---------TTA----AATGAA-TCAG--T---ACACTT--AAT----------TAAAGATTTAA-AG-T--TTA-CTTTT-TC-AA------T----AGATCTAA--TAG------CAA-AT
gi|128458                     :                                                                                                                                                                                gtaatcatgggtagagatgtcagttatgcaccttggtgttacgagagttgatcaaactgttatgtaatcaacaattggagatgacatgttgcaagttgatggtgtaaataggttgagacaaatgcatattcactcattcactcattagaaatatttatttctcatcgacaaaaagaaacaaaaataggctacttttcaattaaataattaatctgtatggtactcattcacacacattttctctttttacaataactaattaagataat-------AAAATATGTCACGGT-AGTAC--ACAATGTGC-TGTCAACT-ATTG-TAATTGACAT-ATT-------CTTT---TAAGAACA--GTCTATTTTTATCAC----T-TAC----------------AT--GTA---A------AA-CACG----C-AAT-------A-----TATC-TGATTT-------------T-GA--CAGGTATATTTT-----ATGTAATAAAACGGATGGAATT-G--T---ATTACAGTCACAGTACTTT---AACATTAA------AAA-TCAG--T---GCACTA--AAG------T---CAA-----GGA-AG-T--TAC-TTTTTTTTCAA------T----A-----AA---AG------CAA-A-A-TAA-C-CACA--CTAAATAAAAtgagcacactaaatagaa
gi|128459                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ATGCT-GACGT--AAAATGTGT-TGTCCACT-ATTA-TAATTGACAT-ACT-------CTTC---TAGGAAA-CGGTCTA-TTTTAGTTCT-TTT-GACAG---TG--AT-GAAAAT--GAA---A------TA-TACTT---G-AGTAACCATAGGGGACCACA-GGACCT-CTG-ATA--C--T-GA--AACCCATATTTTG----AT---ATGAAATGGATGGAA-T-A--TTTAAAC--AGTTACCATATTTT---AAC-TTAA-TCAGTGCA-CTAAATT---AAA-----GAT------TTTATAT----TTAA-AT-T--TAA-CTTTTATTGGA------T----CT----GA--TAG------CAA-AT
gi|128460                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AGAAAACGGTCTATATTTAGTGCTTTCCACAT-----TG--AT-GAAAAT--AAA---A------TG-CATGT---G-AGT-----AAA-----CACA-CAACTT-CTG-ATA--T--T-TA--C--GCATATTTT-----ATGTAATGAAACGGAT-GAA-A-A--T--TAATATATT-ACTGTATTTT---AGC-TTGA-
gi|128462                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -CAC-----TG--GT-GAAAAT--TTG---A------TA-CACAT---G-GGT-----TAA-----CAC---GACCT-CTG-ACA--A--T-GA--CTCG-ATACTTT-----ATGTAATGAAACAAATGGAA-G-AA-T--AAATGCAGTAACCATATTTA---AAC-TTA---------A-TCAA--T---GCACTA--AAT------TAAATAT----TTAA-AT-T--TCA-TTTTTATT-GA------T----A-----AA--TAG------TAACACA-AAG-ACCACATGAGACATAAAA
gi|128461                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       A---A------TA-CACAC---G-AGT-----AAT-----CACA-CAACCT-G-GGATA--T--T-AA--CATGAATATTTT-----ATGTAATGAAACTGATGGAA-C-A--T--TAATACAGCTACCATATTTT---AAC-TTA---------A-TCAG--T---GCGCTT--AAT------T
gi|128463                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tttcacagtgataaatataaAA-----CATAATGTCCT-T-T-AGC--A-AT-GA--CACGCATGCTTTTATTAATGTAATGAAGCAGGT-GAG-A-GACT--AAACGCAGTGACCGTATTTA---AACGTTGA-T-AA-ACA-TTAA--C---A





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                        2222     22222222      11111111                                                                      1                                                11111111        222222222222222                                                    1111111111             111111      1111111111111                             11111                               1111111              333333333333333333333333333333333333                       111111    11111                                                                                                        111111111111111111   11111111                     2222222222222222222222222                                  1                                              1111                               3333333333333                  11111111111111                                      1111111111                                           
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                      4        44  3 1  5555   3 11111111      00000000  888888  2    2 2  00    99999999  2      33 0     2  55          5  2      66666 2    7777  33  5555 444             33333333 2  33  222222222222222              8888888  66666 5 444          777777  1111111111   5555   2  222222 444  7777777777777  33333  999999999      6  2 77777    4444 444444  333   7777 3  1111111  555  666666 333333333333333333333333333333333333  4  22 77      22 6   111111    11111   3   1          2   3333       1          0 2   1      66666666 1 1  555   3333  0    333   1  2    1 999999999999999999   55555555   1  77     555555  7777777777777777777777777   2 1   66666666  7777      7  1 0 5     4444         66666            2   44   5555 1 1 3     1         7777   3  9999999999999             22   99999999999999   2 5555  3 2  7 33   4   1    5  33 2222222222  33   999999   2   2   3 3        55      
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                      .        ..  . .  ....   . ........      ........  ......  .    . .  ..    ........  .      .. .     .  ..          .  .      ..... .    ....  ..  .... ...             ........ .  ..  ...............              .......  ..... . ...          ......  ..........   ....   .  ...... ...  .............  .....  .........      .  . .....    .... ......  ...   .... .  .......  ...  ...... ....................................  .  .. ..      .. .   ......    .....   .   .          .   ....       .          . .   .      ........ . .  ...   ....  .    ...   .  .    . ..................   ........   .  ..     ......  .........................   . .   ........  ....      .  . . .     ....         .....            .   ..   .... . . .     .         ....   .  .............             ..   ..............   . ....  . .  . ..   .   .    .  .. ..........  ..   ......   .   .   . .        ..      
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                      0        00  6 4  7777   3 44444444      44444444  222222  9    7 7  88    77777777  7      77 5     6  11          0  5      00000 5    5555  22  3333 111             88888888 4  22  222222222222222              9999999  22222 0 444          777777  7777777777   7777   7  333333 777  4444444444444  99999  777777777      5  0 11111    2222 444444  555   4444 8  1111111  888  111111 999999999999999999999999999999999999  0  88 55      88 0   222222    33333   6   3          5   9999       6          5 8   0      66666666 6 6  333   2222  6    222   0  5    1 333333333333333333   55555555   6  77     000000  6666666666666666666666666   2 7   00000000  9999      0  7 4 0     9999         11111            6   44   2222 0 7 1     6         0000   6  2222222222222             99   55555555555555   4 0000  1 4  1 22   7   0    0  44 1111111111  44   777777   5   9   1 1        00      
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                GTAATT-TCGGATAGATATGTCAA---ATTA-G--------TTTGTG--------TT------GC-GAGT-T-TTCGTTAC--------AA-TGCTGT--GTAAACAGCACAGGATTAGAGA-GG-CGTGTC----GA-AAGCGT--CGGGAT----G---AAAGGTGTGAATA-------CG-TT--GA--------T-AT---CGCAAATTCACTTGA------TT-----A-A---AATACAAATT------AT----------AAG----TAG-AT------A---TA---------T---AT--C--TA------T--TAGAAANCT-GAA---ATAT----TGNT---TT---TAT----ANGC--G----TA---TT------T-------T------T-----------A-AT---A--TA-CT--T--CCTGAA--A-AGA------GCTG--ANGAAA-ATACGTCACGCTGGCGTA----AAATGTGTCGTCTACTATTGNAATCGACATA--------TTCTTCT--AGGA---AAACGGT---CTATTTCTAGCGCC-TCT-------------CAC--TG-GN-GAANATNNAATAC------ACGC---------------------G-AGTNA-ACA--------CA-C--GACCTCTGA-T-ANTGACA---CGCATATTTT-----ATGTAATGAAACGGATG-GAA-NA-TTA-ACGCAGTNACCGTATTTA---AAC-TTAA-TAATA-----AATCAGTACACTT--AAT------T-----TCCTA-A----TTCA-AG-T--TAA-TTTNTATT-GA--T----A-----AA--TAG------TAA-ATA-AAA-A-CACACGAG--GTAAAA
Reference ( family-658 )      :                                                                                                                                                                                                                                                GTAATT-TCGGATAGATATGTCAA--AATTA-G--------TTTGTG--------TT------GC-GAGT-T-TTCGTTAC--------AA-TGCTGT--GTAAACAGCACAGGATTAGAGA-GG-CGTGTC----GA-AAGCGT--CGGGAT----G---AAAGGTGTGAATA-------CG-TT--GA--------T-AT---CGCAAATTCACTTGA------TT-----A-A---AATACAAATT------AT----------AAG----TAG-AT------A---TA---------T---AT--C--TA------T--TAGAAAACT-GAA---ATAT----TGNT---TT---TAT----ANGC--G----TA---TT------T-------T------T-----------A-AT---A--TA-CT--T--CCTGAA--A-AGA------GCTG--ANGAAA-ATACGTCACGCTGGCGTA----AAATGTGNCGTCTACTATTGNAATCGACATA--------TNCNTCN--AGGA---AAACGGT---CTANTTCTAGCACCATCT-------------CAC--TG-GA-GAANATNTAATAC------ACAT---------------------C-AGTNA-ACA--------CA-C--GACCTCTGA-T-AATGACA---CGCATATTTT-----ATGTAATGAAACGGATG-GAA-NG-TNA-ACGCAGTNACCGTATTTA---AAC-TTAA-TAATA-----AATCAGTACACTT--AAT------T-----TCCTA-A----TTCA-AG-T--TAA-TTTNTATT-GA--T----A-----AA--TAG------TAA-ATA-AAA-A-CACACGAG--GTAAAA
gi|128435                     :                                                                                                                                                                                                                                                GTGATT-TCGGATA---AT---------TTA-G--------TTTGTG--------TT------GC-GAGT-T-TTCCTTAC--------AA-TGCTGT--GTAAACAGCACAGGATTAGAGA-GG-CGTGTC----GA-AAGCGT--CGGGAT----G---AAAGGTGTGAATA-------CG-TT--GA--------T-AT---CGCAAATTCACTTGA------TT-----A-A---GATACAAATT------AT----------AAG----TAG-AT------A---TA---------T---AT--C--TA------T--TAGAAAACT-GAA---ATAT----TGAT---TT---TAT----AAGC--G----TA---TT------T-------T------T-----------A-AT---A--TA-CT--T--CCTGAA--A-AGA------GCTG--ATGAAT-ATATGTCACGCTGGTGTG----AAATATGGCGTTTACTATAGAAATCGACATA--------TACGTCA--AAGA---AAATGGT---ATAACTCTAGCACCATCT-------------CAC--TG-GA-GACTATTTAATAC------ACAT---------------------C-AGTTA-ACA--------CA-T--GGCCTC-GA-TAAATGACA---GGCATATTTT-----ATGTAATGAGACAGATC-GAA-GG-TAA-ACGCAGTAACCGTATTTA---AAC-TTAA-TAATA-----GATTAATACACTT--AAT------T-----TCCTA-A----TTCA-AG-T--TAA-TTTGTATT-GA--T----A-----AA--TAG------TAA-ATA-AAA-A-CACAAGAG--GTAAAA
gi|128436                     :                                                                                                                                                                                                                                                GTAATT-TCTGATAG-----T-------TTA-G--------TTTGTG--------TT------GC-GAGT-T-TTCGTTAC--------AA-TGCTGT--GTAAACAGCACAGGATTAGAGA-GG-CGTGTC----GA-AAGCGT--CGGTAT----G---AAAGGTGTGAATA-------CG-TT--GA--------T-AT---CGCAAATTCACTTGA------TT-----A-A---AAT-CAAATA------AT----------AAG----TAG-AT------A---TA---------T---AT--C--TA------T--TAGAAAACT-GAA---ATAT----TGTT---TT---TAT----AAGC--G----TA---TT------T-------T------T-----------A-AT---A--TA-CT--T--CCTGAA--A-AGA------GCTG--ATGAAA-ATATGTCACGCTGGTGTG----AAATATGGCGTTTACTATAGAAATCGACATA--------TGCGTCA--AAGA---AAATGGT---ATAACTCTAGCACCATCT-------------TAC--TG-GA-GACTATTTAATAC------ACAT---------------------C-AGTTA-ACA--------CA-T--GGCCTC-GATT-AATGACA---GGCATATTTT-----ATGTAATGAGACAGATC-GAT-GG-TTA-ACGCAGTAGCCCTATTTA---AAC-TTAA-TAATA-----AATTAATACACTT--AAT------T-----TCCTA-A----TTCA-AG-T--TAA-TGTGTATT-GA--T----A-----AA--TAG------TAA-ATA-AAA-A-CACACGAG--GTAAAA
gi|128437                     :                                                                                                                                                                                                                                                GTAATT-TCGGATACATATGTCAA--AATTA-G--------TTTGTG--------TT------GC-GAGT-T-TTCGTTAC--------AA-TGCTGT--GTAAACATCACAGGATTAGAGA-GG-CGTGTC----GA-AAGCAT--CGGGAT----G---AAAGGTGTGAATA-------CG-TT--GA--------T-AT---CGCAAATTCATTTGA------TT-----A-A---TATACAAATT------AT----------AAG----TAG-AT------A---TA---------T---AT--C--TA------T--TAGAAAACT-GAA---ATAT----TGAT---TT---TAT----AAGC--G----TA---TT------T-------T------T-----------A-AT---A--TA-CT--T--CCTGAA--A-AGA------GCTG--ATGAAA-ATATGTCACGCTGGTGTG----AAATATAGCGTTTACTCTAGAAATCGACATA--------TGTGTCA--AAGA---AAATGGT---TTAACTCTAACACCATCT-------------CAC--TG-AA-GAATATTTAAT-----------------------------------AG----------------A-T--GGCCTC-GA-TAAATGACA---GGCATATTTT-----ATGTAATGAGACAGATC-GAA-GGTTAA-ACGCAGTAGCCGTATTTA---AAT-TTAA-TAATA-----AATTAATACACTT--AAT------T-----TCCTA-A----TTCA-AG-T--TAA-TTTTTATT-AA--T----A-----AA--TAG------TAA-ATA-AAA-A-CACACGAG--GTAAAA
gi|128438                     :                                                                                                                                                                                                                                                GTAATT-TCGGATAGATATGTCAA--AATTA-G--------TTTGTG--------TT------GC-GAGT-T-TTCGTTAC--------AA-TGCTGT--GTAAACATCACAGGATTAGAGA-GG-CGTGTC----GA-AAGCAT--CGGGAT----G---AAAGGTGTGAATA-------CG-TT--GA--------T-AT---CGCAAATTCACTTGA------TT-----A-A---AATACAAATT------AT----------AAG----TAG-AT------A---TA---------T---AT--C--TA------T--TAGAAAACT-GAA---ATAT----TGAT---TT---TAT----AAGC--G----TA---TT------T-------T------T-----------A-AT---A--TA-CT--T--CCTGAA--A-AGA------ACTG--ATGAAA-ATATGTCACGCTGGTGAG----ATATATGGCGTTTACTCTAGAAAGCGACATA--------TGCGTCA--AAGA---AAATGGT---TTAACTCTAGCACCATCT-------------CAC--TG-GA-GAATATTTAAT-------------------------------------------A--------CA-T--GGCCTC-GA-TAAATGACA---GGCATATTTT-----ATGTAATGAGACAAATC-GAA-GGTTAA-ACGCAGTAGAAGTATATA---AAT-TTAA--AATA-----AATTAATACACTT--AAT------T-----TCCTA-A----TTCA-AG-T--TAA-TTTGTATT-GA--T----A-----AA--TAG------TAA-ATA-GAA-A-CACACGAG--GTGAAA
gi|128439                     :                                                                                                                                                                                                                                                GTAATT-TCGAATAG-----T-------TTA-G--------TTTGTG--------TT------GT-GAGT-T-TTCTTTAC--------AA-TGCTGT--GTAAACAGCACAGGATTAGAGA-GG-CGTGTC----GA-AAGCAT--CGGGAT----G---AAATTTGTGAATA-------CG-TT--GA--------T-AT---CGCAAATTCACTTGA------TT-----A-A---AATACAAATT------AT----------AAG----TAG-AT------A---TA---------T---AT--T--TA------T--TGGAAAACC-GAA---ATAT----TGTG---TT---TA----------------TA---TT------T-------T------T-----------A-AT---A--TA-CT--T--CCTGAA--A-AAA------GCTG--ATGAAA-ATATGTCACGCTGGTGTG----AAATATGGCGTTTACTATAGAAATCGACATA--------TGTGTCA--AAGA---AAATGAT---TCAACTCTAGCACCATCT-------------CAC--TG-GA-GAATATTTAAAAC------ACAT---------------------C-AGTTA-GTA--------CA-T--GGCCTC-GA-TAAATGACA---GGCATATTTT-----ATGTAATGAGACAGATC-GAAGTT-TAA-ACGCAGTAGCCGTATTTA---AAC-TTAA-TACTA-----AATAAATACACTT--AAT------T-----TCCTA-A----TTCA-AG-T--TAA-TTTGTATT-GA--T----A-----AA--TAG------AAA-ATA-AAA-A-CACACGAG--GTAAAA
gi|128440                     :                                                                                                                                                                                                                                                GTAATC-TCGAATAGATATGTCAA--CATAA-G--------TTTGTG--------TT------GC-GAGT-T-TTCGTTAC--------AA-TGCTGT--GTAAACAGCACAGGATTATAAA-GG-CGTGTC----AA-AACCAT--CGAGAT----G---AAAGGTTTGAATA-------CG-TT--GAGA------T-AT---CGCAAATTAACTTGA------TT-----A-A---AATACAAATT------AT----------AAG----TAG-AT------A---TA---------T---ATATC--TA------T--TA-AAAACT-GAA---ATAT----TGTT---TG---TAT----AAGC--G----TA---GT------T-------T------T-----------A-AT---A--TA-CT--T--CCTGAA--A-AGT------GCTG--ATGAAA-ATATGTCACGCTGGTGTG----AAATATGGCGTCTACTCTAGAAATCGACATA--------TTCGTCA--AAGA---AAATGGT---TTAACTCTAGCACCATCT-------------CAC--TG-GA-GAATATTTAATAC------ACAT---------------------C-AGTTA-ACA--------TA-T--AGCCTC-GG-TAAATGACA---GGCATATTTT-----ATGTAATGAGACAGATC-GAA-GGTTAA-ACGCATTAGCCGTATTTA---AAT-TTAA-TAATA-----AATTAATACACTT--AAT------T-----ACCAA-A----TTAA-AG-T--TAA-TTTGTATT-GA--T----A-----AA--TAG------TGA-ATA-AAA-A-CACACCAG--CTAAAA
gi|128441                     :                                                                                                                                                                                                                                                GTAATT-TCGGATAGATATGTCAA--CATAA-G--------AATGTG--------TT------GC-GAGT-T-TTCGTTAC--------AA-TGCTGT--GTAAACAACACAGGCTTAGAG------GTGTC----AA-
gi|128442                     :                                                                                                                                                                                                                                                GTCATT-TTGGGTAGATGTGTCAA----TTA-GCCGACAGTTTTGTC--------TT------GC-GACG-T-TTCATTAC--------AA-TAC-------AAACATCACATGATAAGAGA-GAACATGCC----CA-AAGCAT--AGTGTT----G---ATACACGTGAATA-------GG-TT--AA--------T-AT---CGTAAATTCACTTGA------TT-----A-A---AACACAAAAT------AT----------TAG-----AA-AT------A---TA---------A---AT--C--TA------A--TAGAGAGCT-G-----ATTT----TTTTCCCTT---TAT----ATGC--A----TA--------------------------T-----------A-AT------------------TAAA--G-AGA------GCTG--AGGAAA-ATATGTCACGCCG
gi|128443                     :                                                                                                                                                                                                                                                GTAATTGTTGGG-AGAGATGTCAA----TTA-G--------TCTGTGCTTTAGTGTT------AT-GAGT-T-TTGATCAA--------AC-TGTTAT--GAAAACAACA----ATTGGAGA-GGATGTGTC----AC-AAG----------T----T---AAAGTTGTTAATA-------GA-TT--GAGAC-----C-AG---CACAAATTCACTTG-------TT-----AGA---AATAat
gi|128443                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AGAAATCT-G------CGT----TGTA---TT---TATTCGTATGC--A----TA---TTCTCTCTT-------T------T-----------A-AA---A--TT-TT--TTACTTGAA--A-CAAT-----GCTG--GA-AAA-ATATGTCACGCTGTGGTA----AAATGTGTTGTCTACTATTGTAATTGACATA--------TTCTTCC--AGGA---AA-CGGT---ATATTTTTA-TATAATTTTTTTTTATATAATCAT--TA-AA-TAAAAT--AA-AC------ACA------------------------AGTCA-ACA--------CA-T--GACCTGTGA-T-ATTAACA---CGCATATTTT-----ATGTAATGAAATGGATT-GAA-TA-TTG-ATACAGTTACTGTATTTT---AAC-T-------TA-----AATCAGTACACTT--AAT------T-----AAACA-T----TTCA-AATT--TAA-TTTtttatttctccttgagaaaaagaaataaaaacttaatagtaataggctactctttaattaaatacaagaaatctgcgttgtatttattcgtatgcatattctctcttttaaaattttttacttgaaacaatgctggaaaaatatgtcacgctgtggtaaaatgtgttgtctactattgtaattgacatattcttccaggaaacggtatatttttatataatttttttttatataatcattaaataaaataaacacaagtcaacacatgacctgtgatattaacacgcatattttatgtaatgaaatggattgaatattgatacagttactgtattttaacttaaatcagtacacttaattaaacatttcaaatttaattt
gi|128444                     :                          gtaattgttgggagagatgtcaattagtctgtgctttagtgttatgagttttgatcaaactgttatgaaaacaacaattggagaggatgtgtcacaagttaaagttgttaatagattgagaccagcacaaattcacttgttagaaatatttatttctccttgagaaaaagaaataaaaacttaatagtaataggctactctttaattaaatacaGTAATC-ATGGGTAGAGATGTCAG----TTATGCACC----TTGGTG--------TT------AC-GAGA-G-TTGATCAA--------AC-TGTTAT--GTAATCAACA----ATTGGAGATGA-CATGTT----GC-AAGT-T-----GAT----G-------GTGTAAATA-------GG-TT--GA--------G-ACAAATGCATATTCACT
gi|128444                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ------GCTG--GA-AAA-ATATGTGATGCTGAC--A----AAATGTGTCATCTACTGATGTAAGTGACATA--------TTCTTCT--AGGA---AA-TAGT---CTATTTTAAGCT---TTT-------------CACAGTG-AT-GAAAATAAAATAC------ACGT---------------------C-GGTAA-ACA--------CA-T--GATCTCTGA-T-ACTGACA---CGCATGTTTT-----ATATAATGAAACGGATG-GAA-TA-TTA-ATACAGTTACCATATT---------TTA---AATG-----AATCAGTACACTT--AAT---------------TA-AAGATTTAA-AG-T--TTA-CTTTT-TC-AA--T----AGATCTAA--TAG------CAA-AT--TGA-G-CACACTAA--ATAGAAcattcactcattagaaatatttatttctcatcgacaaaaagaaacaaaaataggctacttttcaattaaataattaatctgtatggtactcattcacacacattttctctttttacaataactaattaagataatgctggaaaaatatgtgatgctgacaaaatgtgtcatctactgatgtaagtgacatattcttctaggaaatagtctattttaagcttttcacagtgatgaaaataaaatacacgtcggtaaacacatgatctctgatactgacacgcatgttttatataatgaaacggatggaatattaatacagttaccatattttaaatgaatcagtacacttaattaaagatttaaagtttactttttcaatagatctaatagcaaattgagcacactaaatagaa
gi|128445                     : gtaatcatgggtagagatgtcagttatgcaccttggtgttacgagagttgatcaaactgttatgtaatcaacaattggagatgacatgttgcaagttgatggtgtaaataggttgagacaaatgcatattcactcattcactcattagaaatatttatttctcatcgacaaaaagaaacaaaaataggctacttttcaattaaataattaatctgtatggtactcattcacacacattttctctttttacaataactaattaagataatA-G--------TTTGTG--------TTTAATACGCCGAGT-T-TTCCTTAC--------AA-TGCTGT--GTAAACAGCACAGGATTAGAGA-GG-CGTGTC----GA-AAGCGT--CGGGAT----G---AAAGGTGTGAATA-------CG-TT--AA--------T-AT---CGCAAATTCACTTGA------TT-----A-A---AATACAAATT------AT----------AAG----TAG-AT------A---TA---------C---AT--C--TA------T--TAGAAAACT-GAA---ATAT----TGGT---TT---TAT----AAGC--G----TA---TT------T-------T------T-----------A-AT---A--TA-CT--T--CCTGAA--A-AGA------GCTG--ATGAAT-ATATGTCACGCTGGTGTG----AAATATGGCGTTTACTATAGAAATCGACATA--------TGCGTCA--AAGA---AAATGGT---ATAACTCTAGCACCATCT-------------CAC--TG-GA-GACTATTTAATAC------ACAT-----------------------AGTTA-ACA--------CA-T--GGCCTC-GA-TAAATGACA---GGCATATTTT-----ATATAACGAGATAGATC-GAA-AG-TTA-ACGCAGTAGCCGTATTTA---AA--------------------CAATACAATT--AAT------T-----TCCTA-A----TTCA-AG-T--TAA-TTTTTACT-GA--T----A-----AA--TAG------TAA-ATC-AAA-T-CACACGAG--GTAAAA
gi|128446                     :                                                                                                                                                                                                                          attccatggatcattttataaaaaatagtaCGAATAGATAT--CAATAAGTTG-GAGC-----TTTG------------------GC-GAAT-TATTTATGACCTTGATTTAACTGTTAC--GAAAACAATAT-GGA----AGATGA-CGTGTCATAAGATAAGTG---CGTAAT----GTCAAAAGGTCAGAATAGCGAGGTCG-T---GA--------TCAG---CGTCAATTCCCTCGT------TA-----A-A---AATACTGATT------CT----------TCG----TA--AT------A---TA---------ACAAAC--CAATA------C--TAGAAA--T-------ATAT----T--T---TT---TATTT--ATGC--A----CA---TT------TATTTTCTT------TCAAA-------A-AT------TA-CT--T--TTTTGA--A-AAA------GATG--GA-AAA-ATACGTCACGCTGACGTA----AAATATGTCGTCTACTATTGCAACTGACATA--------TCCTTC---AGGG---AAACGGT---CTATTTATAGCA
gi|128447                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                 --------TTTGTG--------TT------AC-AAGT-T-TT-GTTAT--------AA-TACTATATGCAAACAGCA-----TTAGAGT-GGATGTGTC-----A-ATGCTTACCGGTATTGTCA---AAAGGCGTGAACA-------GG-TTATGACCACAGGTT-ATGACCACAAATTCACTTGC------TA-----A-A---CATAACATTT------AT----------AAATTCCTAG-AT------A---GA---------A---AT--A---A------G--TA-AAAAC--GAA---ACAG----TAGT---TT---
gi|128448                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                 --------TTTGTG--------TT------AC-CAGT-T-TTGATTA---------AA-T-TTAT--GAAAATAGCA-----TTGGAGA-GAACATGTC----AC-A--CGT--TGA-AT----G---CTTATTGCCAACA-------AA-TT---------------------TAAATTCACTCG-------TT-----A-A---AAAACTAATTCCTCGAAA----------AAA----TAGTAT------GAGGTA-------------AT--C--TAATAAATC--TAGAAATCT-GTATC-GTAT----T-TC---TT---CGC----AAAC--A----TAATCTT------TCC-----T------T-----------T-ATGA-A--TC-AT--TAACTTGAT--ATAGT------GCTG--GAAAAA-ACCCATCAAGCTGGCGAA----AAATATGTCGTCTGCTATTGTATTTGACATA--------TTTGTTTTTAA-A---AAACGGT---CTATTTT-------------------------AC--TGTGATGAACATGAAATAC------ATAC---------------------G-AGTAA-GTA--------CG-C--TACCACTAA-T-ATTGACA---TGCATATAAT-----ATGTAATAAAATAAACA-GAA-TA-TTA-ATACAGTT---TTTTTTACTTAAC-TTAA-TA------------AATGCAC-T--AAT------T-----TTATT-T----TTC--AG-TAATAA---TGAATT-GA--T----A-----AACTTAT------TGG-ATA-A
gi|128449                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AGTGT-TTTGTCAA--------AC-TGTTAT--GAAAACA---CAA-ATTGGAGA-GGACGTATC----AC-AAGT---------T----G---AA-GATGTACGTA-------GG-TC--GA--------G-ACAAACGCAAATTCACTC-A------TC-----AGA---AATATGTATT------CT----------TCG----TCG-AC------A--------------------------A------A--CAGAAA--T-GAAGTTATAA----TAAT---CC---AAT----AGGC-------TAC--TT------T-------T------T-----------A-ATGAAA--TA-CT--T--TC
gi|128449                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TAAA--C-AAA------GCTG--AAAAAA-ATACGTCACGCTGACGTA----GAATTGGTCGTTTACTGTTGTAATGGACA--------------TCT--AGG----TAACGGT---CTATTTTAAGCGCTTTC--------------CAC--AGCGATCAAAATAACATAT------ACGC---------------------G-AG-AA-ACA--------CA-C--TACCTCTGA-T-AATGACA---CGCATTGTTT-----ATGTAATCAAACGGTTG-GAA-TA-TTA-AAACAGATACCGTATTTT---AAC-TT-------------AATCAGTGCACTA--AATTAAAGAT-----TTCAA-A----TTTA-AATT--TAACTTTCGATA-CATCT----A-----AA--TGA------TAA-ATG-AGC-A-CACgagtagtttttttttaaaaagagaataagcgtgcgaataaatacaatgcagatttaaacaaagctgaaaaaaatacgtcacgctgacgtagaattggtcgtttactgttgtaatggacatctaggtaacggtctattttaagcgctttccacagcgatcaaaataacatatacgcgagaaacacactacctctgataatgacacgcattgtttatgtaatcaaacggttggaatattaaaacagataccgtattttaacttaatcagtgcactaaattaaagatttcaaatttaaatttaactttcgatacatctaaatgataaatgagcacac
gi|128450                     :                                                                                                                                agtgttttgtcaaactgttatgaaaacacaaattggagaggacgtatcacaagttgaagatgtacgtaggtcgagacaaacgcaaattcactcatcagaaatatgtattcttcgtcgacaaacagaaatgaagttataataatccaataggctactttttaatgaaatactttcgagtagtttttttttaaaaagagaataagcgtgcgaataaatacaatgcagattTATAGA-GG-CGTGTC----AA-AACCAT--CGTGAT----G---AAAGGTGTGAATA-------CG-TT--GA--------T-AT---CATAAATTCACTGGA------TA-----A-A---AATAAAAATT------AT----------AAG----TAG-AT------A---TA---------T---AT--C--TA------T--TAGAAAACT-AAA---ATAT----TGTT---TT---TAT----AAGC--G----TA---TT------T-------T------T-------------AT---A--AA-CT--T--CCTGAA--A-AGA------GCTG--ATAAAA-ATATGTCACGCTGGTGTG----AAATATGGCGTTTACTCTAGAAATCGACATA--------TGCGTTA--AAGA---AAATGG
gi|128451                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ----G---AAAGGTGTTATTA-------GG-TC---A--------TGAC---TGCAAATTGACTT--------TTCCACAA-A---AGTA---ATT------ATTTGTAGATAGAAG----TAA-ATGAAAACA---TAATGCTTTTTT---AT--T--TA------TACTAGAAATTT-G------TATCCTATATT---TT---TGT----ATGCATG----TC---TT------T-------T------TTTATTTAAAAAA-AT---ACCTA-CTGGTA-CTTGAA--AGAGA------GCCG--GA-AAA-ATAAGCAACGCTGGTGTT----AAATGTGT-------TATTG------ACATG--------TTCTTCT--AGGA---AA-TGGC---CTATTTTTAGCACCTTTTA------------CAG--TG-AT-GAAAATGTAATAC------ACAC---------------------C-AGTTA-ATA--------C
gi|128452                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ---AAACATGTGAATAGTTCA--CGGCT--GG--------T-A-----G-AAATTCTCTTGAAACAAATT-----A-ATACAATATGCATT------GT------------G----TAG-TTTAA---A---TA---------T---A---A--TA------C--TAGATATCT-GTATC-ACAT----TTAT---TTGCATGC----ATGT--T----TG---TT------T-------T------TTAAC-------A-ATC--A--T--CT--T--CTTAAA--AGAGA------GCTG----GAAACATATGTTACACTGG-GTATAAAAAATGTGTCGTCTTCTATTGCAGTTTACATA--------TTCTTCT--GGGAACCAGACTATTTACTATTTTCAGTGCC-TCT-------------CACAGTG-AC-GAAAATGTAAAAC------ACATGTATATGCACATATAATCTGAC-ATTGACATA--------CA-T--GACCTCTGA-C-ATTGACATATTACATGGTTT-----ATATAATTCAATAAATG-GAA-GA-TTACATACAGT
gi|128453                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      --TA------C--TAGAAATCT-GTATC-ATAT----TTAT---TC----AC----ATGC--A----TA---TT------T-------TCTCCTTT-----------AGAA---A--TAGCT--A--CCTGAACTA-ATG------CTTG--A--AAA-ATACGTCATGCTGACATA----AAATGTGTCGTCTTCTATTGTAAATGACATA--------TTCTTCT--AGG----AAACTGT---CTAT---TA----------------------CAG--TG-AT-GAAAATAAAAAGC------ATGC---------------------G-AGTAA-ACA--------CA-C--AACCTCTGA-A-ATTGATT---CAAATATTTT-----A-GAAATGAAACAGATG-GAA-TA-TTA-ATGCAGTTACCGGATTTT---AAC-ATAA-T
gi|128454                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      --TA------C--TAGAAATCT-G------TAT----TGTG---TT---TAT----TTGCATG----CA---TT------T-------T------T-----------A------------TT--T--CTTTTA--A-AAATTACCTACTT--GAGAGA-GTGCTTGATGTT-----A----AAATGT--TGTCTGTTATTGTAATTGGTATA--------CTCTTCT--AG-A---AAATGGT---CTATTTTTAGCACT-TTT-------------CACAGTG-AT-GAAAATGAAATACCGGTACACAT---------------------G-AGTTA-ACA--------CA-C--GACCTCTCA-T-ATTGACA---CGCATATTTT-----ATGTAATAAAACAGATG-GAA-TC-CAG-ATACAGTTACTGTATTT----AAC-TTAAGCAATGCACTCAATCAA-AAACTTTAAAT------T-------CTA-A----TT-A-------TAT-TTTTCAAT-AA--TAGCAA-----AA--TAGATACATTAA-ATAGAAA-A-CA
gi|128455                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      --TA------C--TAGAAATCTTGA-------T----TGTA---TT---TAT----TTGC--GCTCATA---TT------TCCTCTC-T------T-----------A-AA---AA-CAGCT--G--TTTGAA--A-CAAT-----GCTG--GAGAAATATACATCACGTTGACGTA----AAATGGGTCATCTACTATTGTAATTGACGCA--------TTCTCCT--A-GA---AAATGGA---CTGTTTTTAGGGCTTTC--------------CAC-----------------ATAC------ATG----------------------G-AGTAA-ACA--------CA-G--GACCTCTGA-T-AGTGACA---CGCATATTTT-----AAGTCATGAAACAGATG-GAA-TA-TTA-A--TAGTTACCATATTTT---AAC---------CA-----AATCAGTGCACTA--AAT------
gi|128456                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aa-GAA---ATAT------GT---AT---CAT----A----------TA---TT------T-------T------TTTGTTTAAAA-A-AT------TA-CC--T--ACTTGA--A-AGA------A-TGTTACAAGA-ATATGTCAGGCTGGTGTA----AAATGTGTCGTCAGCTGTTGTAATTGACATA--------TACTTCT--AGGA---AA-TGAT---CTATTTTGAGCACTTTC--------------CACAGTG-AT-GAACGTGAGATAC------AC-T---------------------CGAGTAA-ACA--------CA-T--GTCCTATGC-T-ATTGACA---GGCATATTTC-----ATGTGATGAAACAGATG-GAG-TA-TT------------TGTATTTA---AAC-TT-------------AATCAGTACAC-T--A------------------A-A----TTAA-AG----AAA-TATATATT-TT--T----C-----AA--TAA------T-A-ACA-AAATA-CACACAA----TAAA
gi|128457                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -CT--A--CTTGAA--A-CAAT-----GCTG--GA-AAA-ATACGTCACGCTAACGTA----AAATTGGTCGACTACTATTGAAATTGACATGATAAATTCTTCTTCT--AGG----ACACAGT---CTATTTCTAGCGCT-TTT-------------CACATTG-AT-GAAGCTAAAATAC------AAAC---------------------A-AGTA----------------------CTCTGA-T-ATTGACA---CGCATATTTT-----ATGTAATGAAA-------GAA-----TA-ATACATTTACTGTATTTA---AAC-TT-------------AATCAGTACACTA--AATCAAGGAT-----TTCAA-A----TTTATAT-T--TAACTTTCAACT-GA--T----CT----AA--TAGC-----TAA-AT
gi|128458                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AAA-ATATGTCACGGTAGTACA----CAATGTGCTGTCAACTATTGTAATTGACATA--------TTCTTTT--AAGA---A--CAGT---CTATTTTTA--------T-------------CAC--TT------ACATGTAAAAC------ACG---------------------------CA-ATA--------TA--------TCTGA-T-TTTGACA---GGTATATTTT-----ATGTAATAAAACGGATG-GAA-TT-GTA-TTACAGTCACAGTACTTT---AACATTAA-----A-----AATCAGTGCACTA--AAG------T--------CA-A-----GGA-AG-T--TAC-TTTTTTTTCAA--T----A-----AA---AG------CAA-A-A-TAA-C-CACACTAA--ATAAAA
gi|128459                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATGCTGACGTA----AAATGTGTTGTCCACTATTATAATTGACATA--------CTCTTCT--AGG----AAACGGT---CTATTT-TAGT-TCTTTTGA-----------CAG--TG-AT-GAAAATGAAATAT------ACTT---------------------G-AGTAA-CCATAGGGGACCA-CAGGACCTCTGA-T-ACTGAAA---CCCATATTTTG----AT---ATGAAATGGATG-GAA-TA-TTT-AAACAGTTACCATATTTT---AAC-TT-------------AATCAGTGCACTA--AAT------TAAAGATTTTATA----TTTA-AATT--TAA-CTTTTATTGGA--T----CT----GA--TAG------CAA-AT
gi|128460                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GA---AAACGGT---CTATATTTAGTGCTTTCCA------------CAT--TG-AT-GAAAATAAAATGC------ATGT---------------------G-AGTAA-ACA--------CA-C--AACTTCTGA-T-ATT--TA---CGCATATTTT-----ATGTAATGAAACGGAT--GAA-AA-TTA-ATATA-TTACTGTATTTT---AGC-TTGA-
gi|128461                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aTTT-------------CACAGTG-AT-AAATATAAAATAC------ACAC---------------------G-AGTAA-TCA--------CA-C--AACCTGGGA-T-ATTAACA---TGAATATTTT-----ATGTAATGAAACTGATG-GAA-CA-TTA-ATACAGCTACCATATTTT---AAC-TT-------------AATCAGTGCGCTT--AAT------T-----
gi|128462                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              -------------CAC--TG-GT-GAAAATTTGATAC------ACAT---------------------G-GGTTA-ACA--------C-----GACCTCTGA-C-AATGACT---CG-ATACTTT-----ATGTAATGAAACAAATG-GAA-GAATAA-ATGCAGTAACCATATTTA---AAC-TTAA-T------------CAATGCACTA--AAT------T-----AAATA-T----TTAA-AT-T--TCA-TTTTTATT-GA--T----A-----AA--TAG------TAACACA-AAG-ACCACATGAGACATAAAA
gi|128463                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        A-ACA--------TAAT--GTCCTTTAG-C-AATGACA---CGCATGCTTTTATTAATGTAATGAAGCAGGTGAGAG-AC-TAA-ACGCAGTGACCGTATTTA---AACGTTGA-TAA





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                         222     11111111      11111111  111111                                                              1                                                11111111        222222222222222                                                    1111111111             111111      1111111111111                             11111                               1111111              333333333333333333333333333333333333                       111111    11111                                                                                                     1111111111        22                            2222222222222222222222                                  1                                                                                   3333333333333                  11111111111111                                      1111111111                                           
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                       4        44  3 1  999   3 66666666      00000000  333333  2    2 2  00    99999999  2      33 0     2  55          5  2      66666 2    7777  33  5555 444             33333333 2  33  222222222222222              8888888  66666 5 444          777777  1111111111   5555   2  222222 444  7777777777777  33333  999999999      3  2 77777    4444 444444  333   7777 3  1111111  555  666666 333333333333333333333333333333333333  4  22 77      22 6   111111    11111   3   1          2   3333       1          0 1   1      66666666 1 333  3   5 333      333      5   4444444444 1 22   00  44  555 1  33     555555  3333333333333333333333 1  2    66666666  9999      7  1 0 1     4444         66666            2   2   5555   7 1 777    1         7777   3  9999999999999             22   99999999999999   2 5555  3 2  7 33   4   1    5  33 2222222222  33   999999   2   2   3 3        55      
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                       .        ..  . .  ...   . ........      ........  ......  .    . .  ..    ........  .      .. .     .  ..          .  .      ..... .    ....  ..  .... ...             ........ .  ..  ...............              .......  ..... . ...          ......  ..........   ....   .  ...... ...  .............  .....  .........      .  . .....    .... ......  ...   .... .  .......  ...  ...... ....................................  .  .. ..      .. .   ......    .....   .   .          .   ....       .          . .   .      ........ . ...  .   . ...      ...      .   .......... . ..   ..  ..  ... .  ..     ......  ...................... .  .    ........  ....      .  . . .     ....         .....            .   .   ....   . . ...    .         ....   .  .............             ..   ..............   . ....  . .  . ..   .   .    .  .. ..........  ..   ......   .   .   . .        ..      
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                       0        00  6 4  999   3 44444444      44444444  222222  9    7 7  88    77777777  7      77 5     6  11          0  5      00000 5    5555  22  3333 111             88888888 4  22  222222222222222              9999999  22222 0 444          777777  7777777777   7777   7  333333 777  4444444444444  99999  777777777      1  0 11111    2222 444444  555   4444 8  1111111  888  111111 999999999999999999999999999999999999  0  88 55      88 0   222222    33333   6   3          5   9999       5          5 6   0      66666666 7 333  4   6 000      222      6   9999999999 4 44   99  55  444 6  22     000000  0000000000000000000000 7  8    00000000  6666      0  7 4 0     9999         11111            6   7   7777   0 7 222    6         0000   6  2222222222222             99   55555555555555   4 0000  1 4  1 22   7   0    0  44 1111111111  44   777777   5   9   1 1        00      
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                 GTAATT-TCGGATAGATATGTCAA---TTA-G--------TTTGTG--------TT------GC-GAGT-T-TTCGTTAC--------AA-TGCTGT--GTAAACAGCACAGGATTAGAGA-GG-CGTGTC----GA-AAGCGT--CGGGAT----G---AAAGGTGTGAATA-------CG-TT--GA--------T-AT---CGCAAATTCACTTGA------TT-----A-A---AATACAAATT------AT----------AAG----TAG-AT------A---TA---------T---AT--C--TA------T--TAGAAANCT-GAA---ATAT----TGNT---TT---TAT----ANGC--G----TA---TT------T-------T------T-----------A-AT---A--TA-CT--T--CCTGAA--A-AGA------GCTG--ANGAAA-ATACGTCACGCTGGCGTA----AAATGTGTCGTCTACTATTGNAATCGACATA--------TTC--TTCTAGGAA---AACGGT---CTATTTCTAG-----CGCC-TCT--CACA-TGATGA---ANATNNAATAC------AC--------GC-----------GA-GTNAACA--------CA-C--GACCTCTGA-T-ANTGACA---CGCATATTTT-----ATGTAATGAAACGGATGGAA---NATT-A-A-CGCAGTNACCGTATTTA---AAC-TTAA-TAATA-----AATCAGTACACTT--AAT------T-----TCCTA-A----TTCA-AG-T--TAA-TTTNTATT-GA--T----A-----AA--TAG------TAA-ATA-AAA-A-CACACGAG--GTAAAA
Reference ( family-658 )      :                                                                                                                                                                                                                                                 GTAATT-TCGGATAGATATGTCAA-A-TTA-G--------TTTGTG--------TT------GC-GAGT-T-TTCGTTAC--------AA-TGCTGT--GTAAACAGCACAGGATTAGAGA-GG-CGTGTC----GA-AAGCGT--CGGGAT----G---AAAGGTGTGAATA-------CG-TT--GA--------T-AT---CGCAAATTCACTTGA------TT-----A-A---AATACAAATT------AT----------AAG----TAG-AT------A---TA---------T---AT--C--TA------T--TAGAAANCT-GAA---ATAT----TGNT---TT---TAT----ANGC--G----TA---TT------T-------T------T-----------A-AT---A--TA-CT--T--CCTGAA--A-AGA------GCTG--ANGAAA-ATACGTCACGCTGGCGTA----AAATGTGTCGTCTACTATTGNAATCGACATA--------TTC--TTCTAGGAA---AACGGT---CTATTTCTAG-----CGCC-TCT--CAC--TGGNGA---ANATNNAATAC------AC--------GC-----------GA-GTNAACA--------CA-C--GACCTCTGA-T-ANTGACA---CGCATATTTT-----ATGTAATGAAACGGATGGAA---NATT-A-A-CGCAGTNACCGTATTTA---AAC-TTAA-TAATA-----AATCAGTACACTT--AAT------T-----TCCTA-A----TTCA-AG-T--TAA-TTTNTATT-GA--T----A-----AA--TAG------TAA-ATA-AAA-A-CACACGAG--GTAAAA
gi|128435                     :                                                                                                                                                                                                                                                 GTGATT-TCGGATA---AT--------TTA-G--------TTTGTG--------TT------GC-GAGT-T-TTCCTTAC--------AA-TGCTGT--GTAAACAGCACAGGATTAGAGA-GG-CGTGTC----GA-AAGCGT--CGGGAT----G---AAAGGTGTGAATA-------CG-TT--GA--------T-AT---CGCAAATTCACTTGA------TT-----A-A---GATACAAATT------AT----------AAG----TAG-AT------A---TA---------T---AT--C--TA------T--TAGAAAACT-GAA---ATAT----TGAT---TT---TAT----AAGC--G----TA---TT------T-------T------T-----------A-AT---A--TA-CT--T--CCTGAA--A-AGA------GCTG--ATGAAT-ATATGTCACGCTGGTGTG----AAATATGGCGTTTACTATAGAAATCGACATA--------TAC--GTCAAAGAA---AATGGT---ATAACTCTAG-----CACCATCT--CAC--TGGAGA---CTATTTAATAC------AC--------AT-----------CA-GTTAACA--------CA-T--GGCCTC-GA-TAAATGACA---GGCATATTTT-----ATGTAATGAGACAGATCGAA---GGTA-A-A-CGCAGTAACCGTATTTA---AAC-TTAA-TAATA-----GATTAATACACTT--AAT------T-----TCCTA-A----TTCA-AG-T--TAA-TTTGTATT-GA--T----A-----AA--TAG------TAA-ATA-AAA-A-CACAAGAG--GTAAAA
gi|128436                     :                                                                                                                                                                                                                                                 GTAATT-TCTGATAG-----T------TTA-G--------TTTGTG--------TT------GC-GAGT-T-TTCGTTAC--------AA-TGCTGT--GTAAACAGCACAGGATTAGAGA-GG-CGTGTC----GA-AAGCGT--CGGTAT----G---AAAGGTGTGAATA-------CG-TT--GA--------T-AT---CGCAAATTCACTTGA------TT-----A-A---AAT-CAAATA------AT----------AAG----TAG-AT------A---TA---------T---AT--C--TA------T--TAGAAAACT-GAA---ATAT----TGTT---TT---TAT----AAGC--G----TA---TT------T-------T------T-----------A-AT---A--TA-CT--T--CCTGAA--A-AGA------GCTG--ATGAAA-ATATGTCACGCTGGTGTG----AAATATGGCGTTTACTATAGAAATCGACATA--------TGC--GTCAAAGAA---AATGGT---ATAACTCTAG-----CACCATCT--TAC--TGGAGA---CTATTTAATAC------AC--------AT-----------CA-GTTAACA--------CA-T--GGCCTC-GATT-AATGACA---GGCATATTTT-----ATGTAATGAGACAGATCGAT---GGTT-A-A-CGCAGTAGCCCTATTTA---AAC-TTAA-TAATA-----AATTAATACACTT--AAT------T-----TCCTA-A----TTCA-AG-T--TAA-TGTGTATT-GA--T----A-----AA--TAG------TAA-ATA-AAA-A-CACACGAG--GTAAAA
gi|128437                     :                                                                                                                                                                                                                                                 GTAATT-TCGGATACATATGTCAA-AATTA-G--------TTTGTG--------TT------GC-GAGT-T-TTCGTTAC--------AA-TGCTGT--GTAAACATCACAGGATTAGAGA-GG-CGTGTC----GA-AAGCAT--CGGGAT----G---AAAGGTGTGAATA-------CG-TT--GA--------T-AT---CGCAAATTCATTTGA------TT-----A-A---TATACAAATT------AT----------AAG----TAG-AT------A---TA---------T---AT--C--TA------T--TAGAAAACT-GAA---ATAT----TGAT---TT---TAT----AAGC--G----TA---TT------T-------T------T-----------A-AT---A--TA-CT--T--CCTGAA--A-AGA------GCTG--ATGAAA-ATATGTCACGCTGGTGTG----AAATATAGCGTTTACTCTAGAAATCGACATA--------TGT--GTCAAAGAA---AATGGT---TTAACTCTAA-----CACCATCT--CAC--TGAAGA---ATATTTAATA-----------------G-------------------------------A-T--GGCCTC-GA-TAAATGACA---GGCATATTTT-----ATGTAATGAGACAGATCGAA---GGTTAA-A-CGCAGTAGCCGTATTTA---AAT-TTAA-TAATA-----AATTAATACACTT--AAT------T-----TCCTA-A----TTCA-AG-T--TAA-TTTTTATT-AA--T----A-----AA--TAG------TAA-ATA-AAA-A-CACACGAG--GTAAAA
gi|128438                     :                                                                                                                                                                                                                                                 GTAATT-TCGGATAGATATGTCAA-AATTA-G--------TTTGTG--------TT------GC-GAGT-T-TTCGTTAC--------AA-TGCTGT--GTAAACATCACAGGATTAGAGA-GG-CGTGTC----GA-AAGCAT--CGGGAT----G---AAAGGTGTGAATA-------CG-TT--GA--------T-AT---CGCAAATTCACTTGA------TT-----A-A---AATACAAATT------AT----------AAG----TAG-AT------A---TA---------T---AT--C--TA------T--TAGAAAACT-GAA---ATAT----TGAT---TT---TAT----AAGC--G----TA---TT------T-------T------T-----------A-AT---A--TA-CT--T--CCTGAA--A-AGA------ACTG--ATGAAA-ATATGTCACGCTGGTGAG----ATATATGGCGTTTACTCTAGAAAGCGACATA--------TGC--GTCAAAGAA---AATGGT---TTAACTCTAG-----CACCATCT--CAC--TGGAGA---ATATTTAAT----------------------------------------A--------CA-T--GGCCTC-GA-TAAATGACA---GGCATATTTT-----ATGTAATGAGACAAATCGAA---GGTTAA-A-CGCAGTAGAAGTATATA---AAT-TTAA--AATA-----AATTAATACACTT--AAT------T-----TCCTA-A----TTCA-AG-T--TAA-TTTGTATT-GA--T----A-----AA--TAG------TAA-ATA-GAA-A-CACACGAG--GTGAAA
gi|128439                     :                                                                                                                                                                                                                                                 GTAATT-TCGAATAG-----T------TTA-G--------TTTGTG--------TT------GT-GAGT-T-TTCTTTAC--------AA-TGCTGT--GTAAACAGCACAGGATTAGAGA-GG-CGTGTC----GA-AAGCAT--CGGGAT----G---AAATTTGTGAATA-------CG-TT--GA--------T-AT---CGCAAATTCACTTGA------TT-----A-A---AATACAAATT------AT----------AAG----TAG-AT------A---TA---------T---AT--T--TA------T--TGGAAAACC-GAA---ATAT----TGTG---TT---TA----------------TA---TT------T-------T------T-----------A-AT---A--TA-CT--T--CCTGAA--A-AAA------GCTG--ATGAAA-ATATGTCACGCTGGTGTG----AAATATGGCGTTTACTATAGAAATCGACATA--------TGT--GTCAAAGAA---AATGAT---TCAACTCTAG-----CACCATCT--CAC--TGGAGA---ATATTTAAAAC------AC--------AT-----------CA-GTTAGTA--------CA-T--GGCCTC-GA-TAAATGACA---GGCATATTTT-----ATGTAATGAGACAGATCGAA---GTTTAA-A-CGCAGTAGCCGTATTTA---AAC-TTAA-TACTA-----AATAAATACACTT--AAT------T-----TCCTA-A----TTCA-AG-T--TAA-TTTGTATT-GA--T----A-----AA--TAG------AAA-ATA-AAA-A-CACACGAG--GTAAAA
gi|128440                     :                                                                                                                                                                                                                                                 GTAATC-TCGAATAGATATGTCAACA-TAA-G--------TTTGTG--------TT------GC-GAGT-T-TTCGTTAC--------AA-TGCTGT--GTAAACAGCACAGGATTATAAA-GG-CGTGTC----AA-AACCAT--CGAGAT----G---AAAGGTTTGAATA-------CG-TT--GAGA------T-AT---CGCAAATTAACTTGA------TT-----A-A---AATACAAATT------AT----------AAG----TAG-AT------A---TA---------T---ATATC--TA------T--TA-AAAACT-GAA---ATAT----TGTT---TG---TAT----AAGC--G----TA---GT------T-------T------T-----------A-AT---A--TA-CT--T--CCTGAA--A-AGT------GCTG--ATGAAA-ATATGTCACGCTGGTGTG----AAATATGGCGTCTACTCTAGAAATCGACATA--------TTC--GTCAAAGAA---AATGGT---TTAACTCTAG-----CACCATCT--CAC--TGGAGA---ATATTTAATAC------AC--------AT-----------CA-GTTAACA--------TA-T--AGCCTC-GG-TAAATGACA---GGCATATTTT-----ATGTAATGAGACAGATCGAA---GGTTAA-A-CGCATTAGCCGTATTTA---AAT-TTAA-TAATA-----AATTAATACACTT--AAT------T-----ACCAA-A----TTAA-AG-T--TAA-TTTGTATT-GA--T----A-----AA--TAG------TGA-ATA-AAA-A-CACACCAG--CTAAAA
gi|128441                     :                                                                                                                                                                                                                                                 GTAATT-TCGGATAGATATGTCAACA-TAA-G--------AATGTG--------TT------GC-GAGT-T-TTCGTTAC--------AA-TGCTGT--GTAAACAACACAGGCTTAGAG------GTGTC----AA-
gi|128442                     :                                                                                                                                                                                                                                                 GTCATT-TTGGGTAGATGTGTCAA---TTA-GCCGACAGTTTTGTC--------TT------GC-GACG-T-TTCATTAC--------AA-TAC-------AAACATCACATGATAAGAGA-GAACATGCC----CA-AAGCAT--AGTGTT----G---ATACACGTGAATA-------GG-TT--AA--------T-AT---CGTAAATTCACTTGA------TT-----A-A---AACACAAAAT------AT----------TAG-----AA-AT------A---TA---------A---AT--C--TA------A--TAGAGAGCT-G-----ATTT----TTTTCCCTT---TAT----ATGC--A----TA--------------------------T-----------A-AT------------------TAAA--G-AGA------GCTG--AGGAAA-ATATGTCACGCCG
gi|128443                     :                                                                                                                                                                                                                                                 GTAATTGTTGGG-AGAGATGTCAA---TTA-G--------TCTGTGCTTTAGTGTT------AT-GAGT-T-TTGATCAA--------AC-TGTTAT--GAAAACAACA----ATTGGAGA-GGATGTGTC----AC-AAG----------T----T---AAAGTTGTTAATA-------GA-TT--GAGAC-----C-AG---CACAAATTCACTTG-------TT-----AGA---AATAat
gi|128443                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AGAAATCT-G------CGT----TGTA---TT---TATTCGTATGC--A----TA---TTCTCTCTT-------T------T-----------A-AA---A--TT-TT--TTACTTGAA--A-CAAT-----GCTG--GA-AAA-ATATGTCACGCTGTGGTA----AAATGTGTTGTCTACTATTGTAATTGACATA--------TTC--TTCCAGGAA---A-CGGT---ATATTTTTATATAATTTTT-TTT--TATA-TAATCATT-AAATAAAATAA------AC--------AC-----------AA-GTCAACA--------CA-T--GACCTGTGA-T-ATTAACA---CGCATATTTT-----ATGTAATGAAATGGATTGAA---TATT-G-A-TACAGTTACTGTATTTT---AAC-T-------TA-----AATCAGTACACTT--AAT------T-----AAACA-T----TTCA-AATT--TAA-TTTtttatttctccttgagaaaaagaaataaaaacttaatagtaataggctactctttaattaaatacaagaaatctgcgttgtatttattcgtatgcatattctctcttttaaaattttttacttgaaacaatgctggaaaaatatgtcacgctgtggtaaaatgtgttgtctactattgtaattgacatattcttccaggaaacggtatatttttatataatttttttttatataatcattaaataaaataaacacaagtcaacacatgacctgtgatattaacacgcatattttatgtaatgaaatggattgaatattgatacagttactgtattttaacttaaatcagtacacttaattaaacatttcaaatttaattt
gi|128444                     :                           gtaattgttgggagagatgtcaattagtctgtgctttagtgttatgagttttgatcaaactgttatgaaaacaacaattggagaggatgtgtcacaagttaaagttgttaatagattgagaccagcacaaattcacttgttagaaatatttatttctccttgagaaaaagaaataaaaacttaatagtaataggctactctttaattaaatacaGTAATC-ATGGGTAGAGATGTCAG---TTATGCACC----TTGGTG--------TT------AC-GAGA-G-TTGATCAA--------AC-TGTTAT--GTAATCAACA----ATTGGAGATGA-CATGTT----GC-AAGT-T-----GAT----G-------GTGTAAATA-------GG-TT--GA--------G-ACAAATGCATATTCACT
gi|128444                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ------GCTG--GA-AAA-ATATGTGATGCTGAC--A----AAATGTGTCATCTACTGATGTAAGTGACATA--------TTC--TTCTAGGAA---A-TAGT---CTATTT-TAA------GCT-TTT--CACAGTGATGA---AAATAAAATAC------AC--------GT-----------CG-GTAAACA--------CA-T--GATCTCTGA-T-ACTGACA---CGCATGTTTT-----ATATAATGAAACGGATGGAA---TATT-A-A-TACAGTTACCATATT---------TTA---AATG-----AATCAGTACACTT--AAT---------------TA-AAGATTTAA-AG-T--TTA-CTTTT-TC-AA--T----AGATCTAA--TAG------CAA-AT--TGA-G-CACACTAA--ATAGAAcattcactcattagaaatatttatttctcatcgacaaaaagaaacaaaaataggctacttttcaattaaataattaatctgtatggtactcattcacacacattttctctttttacaataactaattaagataatgctggaaaaatatgtgatgctgacaaaatgtgtcatctactgatgtaagtgacatattcttctaggaaatagtctattttaagcttttcacagtgatgaaaataaaatacacgtcggtaaacacatgatctctgatactgacacgcatgttttatataatgaaacggatggaatattaatacagttaccatattttaaatgaatcagtacacttaattaaagatttaaagtttactttttcaatagatctaatagcaaattgagcacactaaatagaa
gi|128445                     : gtaatcatgggtagagatgtcagttatgcaccttggtgttacgagagttgatcaaactgttatgtaatcaacaattggagatgacatgttgcaagttgatggtgtaaataggttgagacaaatgcatattcactcattcactcattagaaatatttatttctcatcgacaaaaagaaacaaaaataggctacttttcaattaaataattaatctgtatggtactcattcacacacattttctctttttacaataactaattaagataatA-G--------TTTGTG--------TTTAATACGCCGAGT-T-TTCCTTAC--------AA-TGCTGT--GTAAACAGCACAGGATTAGAGA-GG-CGTGTC----GA-AAGCGT--CGGGAT----G---AAAGGTGTGAATA-------CG-TT--AA--------T-AT---CGCAAATTCACTTGA------TT-----A-A---AATACAAATT------AT----------AAG----TAG-AT------A---TA---------C---AT--C--TA------T--TAGAAAACT-GAA---ATAT----TGGT---TT---TAT----AAGC--G----TA---TT------T-------T------T-----------A-AT---A--TA-CT--T--CCTGAA--A-AGA------GCTG--ATGAAT-ATATGTCACGCTGGTGTG----AAATATGGCGTTTACTATAGAAATCGACATA--------TGC--GTCAAAGAA---AATGGT---ATAACTCTAG-----CACCATCT--CAC--TGGAGA---CTATTTAATAC------AC--------AT------------A-GTTAACA--------CA-T--GGCCTC-GA-TAAATGACA---GGCATATTTT-----ATATAACGAGATAGATCGAA---AGTT-A-A-CGCAGTAGCCGTATTTA---AA--------------------CAATACAATT--AAT------T-----TCCTA-A----TTCA-AG-T--TAA-TTTTTACT-GA--T----A-----AA--TAG------TAA-ATC-AAA-T-CACACGAG--GTAAAA
gi|128446                     :                                                                                                                                                                                                                           attccatggatcattttataaaaaatagtaCGAATAGATAT--CAA---TAA-G--------TTGGAG--------CTTTG---GC-GAAT-TATTTATGACCTTGATTTAACTGTTAC--GAAAACAATAT-GGA----AGATGA-CGTGTCATAAGATAAGTG---CGTAAT----GTCAAAAGGTCAGAATAGCGAGGTCG-T---GA--------TCAG---CGTCAATTCCCTCGT------TA-----A-A---AATACTGATT------CT----------TCG----TA--AT------A---TA---------ACAAAC--CAATA------C--TAGAAAT---------ATAT----T--T---TT---TATTT--ATGC--A----CA---TT------TATTTTCTT------TCAAA-------A-AT------TA-CT--T--TTTTGA--A-AAA------GATG--GA-AAA-ATACGTCACGCTGACGTA----AAATATGTCGTCTACTATTGCAACTGACATA--------TCC--TTC-AGGGA---AACGGT---CTATTTATAG-----C
gi|128447                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                 --------TTTGTG--------TT------AC-AAGT-T-TT-GTTAT--------AA-TACTATATGCAAACAGCA-----TTAGAGT-GGATGTGTC-----A-ATGCTTACCGGTATTGTCA---AAAGGCGTGAACA-------GG-TTATGACCACAGGTT-ATGACCACAAATTCACTTGC------TA-----A-A---CATAACATTT------AT----------AAATTCCTAG-AT------A---GA---------A---AT--A---A------G--TAAAAAC---GAA---ACAG----TAGT---TT---a
gi|128448                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                 --------TTTGTG--------TT------AC-CAGT-T-TTGATTA---------AA-T-TTAT--GAAAATAGCA-----TTGGAGA-GAACATGTC----AC-A--CGT--TGA-AT----G---CTTATTGCCAACA-------AA-TT---------------------TAAATTCACTCG-------TT-----A-A---AAAACTAATTCCTCGAAA----------AAA----TAGTAT------GAGGTA-------------AT--C--TAATAAATC--TAGAAATCT-GTATC-GTAT----T-TC---TT---CGC----AAAC--A----TAATCTT------TCC-----T------T-----------T-ATGA-A--TC-AT--TAACTTGAT--ATAGT------GCTG--GAAAAA-ACCCATCAAGCTGGCGAA----AAATATGTCGTCTGCTATTGTATTTGACATA--------TTTGTTTTTAA-AA---AACGGT---CTATTT-TAC-----TG-------------TGATGA---ACATGAAATAC------AT--------AC-----------GA-GTAAGTA--------CG-C--TACCACTAA-T-ATTGACA---TGCATATAAT-----ATGTAATAAAATAAACAGAA---TATT-A-A-TACAGTT---TTTTTTACTTAAC-TTAA-TA------------AATGCAC-T--AAT------T-----TTATT-T----TTC--AG-TAATAA---TGAATT-GA--T----A-----AACTTAT------TGG-ATA-A
gi|128449                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AGTGT-TTTGTCAA--------AC-TGTTAT--GAAAACA---CAA-ATTGGAGA-GGACGTATC----AC-AAGT---------T----G---AA-GATGTACGTA-------GG-TC--GA--------G-ACAAACGCAAATTCACTC-A------TC-----AGA---AATATGTATT------CT----------TCG----TCG-AC------A--------------------------A------A--CAGAAA--T-GAAGTTATAA----TAAT---CC---AAT----AGGC-------TAC--TT------T-------T------T-----------A-ATGAAA--TA-CT--T--TC
gi|128449                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TAAA--C-AAA------GCTG--AAAAAA-ATACGTCACGCTGACGTA----GAATTGGTCGTTTACTGTTGTAATGGACAT----------------CTAGGTA---A-CGGT---CTATTTTAAG-----CGCT-TTC--CAC---AGCGATCAAAATAACATAT------AC--------GC-----------GA-G-AAACA--------CA-C--TACCTCTGA-T-AATGACA---CGCATTGTTT-----ATGTAATCAAACGGTTGGAA---TATT-A-A-AACAGATACCGTATTTT---AAC-TT-------------AATCAGTGCACTA--AATTAAAGAT-----TTCAA-A----TTTA-AATT--TAACTTTCGATA-CATCT----A-----AA--TGA------TAA-ATG-AGC-A-CACgagtagtttttttttaaaaagagaataagcgtgcgaataaatacaatgcagatttaaacaaagctgaaaaaaatacgtcacgctgacgtagaattggtcgtttactgttgtaatggacatctaggtaacggtctattttaagcgctttccacagcgatcaaaataacatatacgcgagaaacacactacctctgataatgacacgcattgtttatgtaatcaaacggttggaatattaaaacagataccgtattttaacttaatcagtgcactaaattaaagatttcaaatttaaatttaactttcgatacatctaaatgataaatgagcacac
gi|128450                     :                                                                                                                                agtgttttgtcaaactgttatgaaaacacaaattggagaggacgtatcacaagttgaagatgtacgtaggtcgagacaaacgcaaattcactcatcagaaatatgtattcttcgtcgacaaacagaaatgaagttataataatccaataggctactttttaatgaaatactttcgagtagtttttttttaaaaagagaataagcgtgcgaataaatacaatgcagattTATAGA-GG-CGTGTC----AA-AACCAT--CGTGAT----G---AAAGGTGTGAATA-------CG-TT--GA--------T-AT---CATAAATTCACTGGA------TA-----A-A---AATAAAAATT------AT----------AAG----TAG-AT------A---TA---------T---AT--C--TA------T--TAGAAAACT-AAA---ATAT----TGTT---TT---TAT----AAGC--G----TA---TT------T-------T------T-------------AT---A--AA-CT--T--CCTGAA--A-AGA------GCTG--ATAAAA-ATATGTCACGCTGGTGTG----AAATATGGCGTTTACTCTAGAAATCGACATA--------TGC--GTTAAAGAA---AATGG
gi|128451                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ----G---AAAGGTGTTATTA-------GG-TC---A--------TGAC---TGCAAATTGACTT--------TTCCACAA-A---AGTA---ATT------ATTTGTAGATAGAAG----TAA-ATGAAAACA---TAATGCTTTTTT---AT--T--TA------TACTAGAAATTT-G------TATCCTATATT---TT---TGT----ATGCATG----TC---TT------T-------T------TTTATTTAAAAAA-AT---ACCTA-CTGGTA-CTTGAA--AGAGA------GCCG--GA-AAA-ATAAGCAACGCTGGTGTT----AAATGTGT-------TATT------GACATG--------TTC--TTCTAGG-A---AATGGC---CTATTTTTAG-----CACC-TTT--TACAGTGATGA---AAATGTAATAC------AC--------AC-----------CA-GTTAATA--------C
gi|128452                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ---AAACATGTGAATAGTTCA--CGGCT--GG--------T-A-----G-AAATTCTCTTGAAACAAATT-----A-ATACAATATGCATT------GT------------G----TAG-TTTAA---A---TA---------T---A---A--TA------C--TAGATATCT-GTATC-ACAT----TTAT---TTGCATGC----ATGT--T----TG---TT------T-------T------TTAAC-------A-ATC--A--T--CT--T--CTTAAA--AGAGA------GCTG----GAAACATATGTTACACTGG-GTATAAAAAATGTGTCGTCTTCTATTGCAGTTTACATA--------TTC--TTCTGGGAACCAGACTATTTACTATTTTCAG-----TGCC-TCT--CACAGTGACGA---AAATGTAAAAC------ACATGTATATGCACATATAATCTGACATTGACA--------TA-CATGACCTCTGA-C-ATTGACATATTACATGGTTT-----ATATAATTCAATAAATGGAA---GATT-ACA-TACAGT
gi|128453                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      --TA------C--TAGAAATCT-GTATC-ATAT----TTAT---TC----AC----ATGC--A----TA---TT------T-------TCTCCTTT-----------AGAA---A--TAGCT--A--CCTGAACTA-ATG------CTTG--A--AAA-ATACGTCATGCTGACATA----AAATGTGTCGTCTTCTATTGTAAATGACATA--------TTC--TTCTAGG-A---AACTGT---CTAT---TA----------------CAG--TGATGA---AAATAAAAAGC------AT--------GC-----------GA-GTAAACA--------CA-C--AACCTCTGA-A-ATTGATT---CAAATATTTT-----A-GAAATGAAACAGATGGAA---TATT-A-A-TGCAGTTACCGGATTTT---AAC-ATAA-T
gi|128454                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      --TA------C--TAGAAATCT-G------TAT----TGTG---TT---TAT----TTGCATG----CA---TT------T-------T------T-----------A------------TT--T--CTTTTA--A-AAATTACCTACTT--GAGAGA-GTGCTTGATGTT-----A----AAATGT--TGTCTGTTATTGTAATTGGTATA--------CTC--TTCTAG-AA---AATGGT---CTATTTTTAG-----CACT-TTT--CACAGTGATGA---AAATGAAATACCGGTACAC--------AT-----------GA-GTTAACA--------CA-C--GACCTCTCA-T-ATTGACA---CGCATATTTT-----ATGTAATAAAACAGATGGAA---TCCA-G-A-TACAGTTACTGTATTT----AAC-TTAAGCAATGCACTCAATCAA-AAACTTTAAAT------T-------CTA-A----TT-A-------TAT-TTTTCAAT-AA--TAGCAA-----AA--TAGATACATTAA-ATAGAAA-A-CA
gi|128455                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      --TA------C--TAGAAATCTTGA-------T----TGTA---TT---TAT----TTGC--GCTCATA---TT------TCCTCTC-T------T-----------A-AA---AA-CAGCT--G--TTTGAA--A-CAAT-----GCTG--GAGAAATATACATCACGTTGACGTA----AAATGGGTCATCTACTATTGTAATTGACGCA--------TTC--TCCTAG-AA---AATGGA---CTGTTTTTAG-----GGCT-TTC--CAC------------------ATAC------AT--------G------------GA-GTAAACA--------CA-G--GACCTCTGA-T-AGTGACA---CGCATATTTT-----AAGTCATGAAACAGATGGAA---TATT-A-A---TAGTTACCATATTTT---AAC---------CA-----AATCAGTGCACTA--AAT------
gi|128456                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aa-GAA---ATAT------GT---AT---CAT----A----------TA---TT------T-------T------TTTGTTTAAAA-A-AT------TA-CC--T--ACTTGA--A-AGA------A-TGTTACAAGA-ATATGTCAGGCTGGTGTA----AAATGTGTCGTCAGCTGTTGTAATTGACATA--------TAC--TTCTAGG-A---AATGAT---CTATTTTGAG-----CACT-TTC--CACAGTGATGA---ACGTGAGATAC------AC--------TC-----------GA-GTAAACA--------CA-T--GTCCTATGC-T-ATTGACA---GGCATATTTC-----ATGTGATGAAACAGATGGAG---TATT--------------TGTATTTA---AAC-TT-------------AATCAGTACAC-T--A------------------A-A----TTAA-AG----AAA-TATATATT-TT--T----C-----AA--TAA------T-A-ACA-AAATA-CACACAA----TAAA
gi|128457                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -CT--A--CTTGAA--A-CAAT-----GCTG--GA-AAA-ATACGTCACGCTAACGTA----AAATTGGTCGACTACTATTGAAATTGACATGATAAATTCTTC--TTCTAGG-A---CACAGT---CTATTTCTAG-----CGCT-TTT--CACATTGATGA---AGCTAAAATAC------AA--------AC-----------AA-GTA---------------------CTCTGA-T-ATTGACA---CGCATATTTT-----ATGTAATGAAA------GAA------T-A-A-TACATTTACTGTATTTA---AAC-TT-------------AATCAGTACACTA--AATCAAGGAT-----TTCAA-A----TTTATAT-T--TAACTTTCAACT-GA--T----CT----AA--TAGC-----TAA-AT
gi|128458                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AAA-ATATGTCACGGTAGTACA----CAATGTGCTGTCAACTATTGTAATTGACATA--------TTC--TTTTAAG-----AACAGT---CTATTTTTA-------------T--CAC--TT-------ACATGTAAAAC------AC--------GC-----------------AATA--------TA--------TCTGA-T-TTTGACA---GGTATATTTT-----ATGTAATAAAACGGATGGAATTGTATT-A-----CAGTCACAGTACTTT---AACATTAA-----A-----AATCAGTGCACTA--AAG------T--------CA-A-----GGA-AG-T--TAC-TTTTTTTTCAA--T----A-----AA---AG------CAA-A-A-TAA-C-CACACTAA--ATAAAA
gi|128459                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATGCTGACGTA----AAATGTGTTGTCCACTATTATAATTGACATA--------CTC--TTCTAGG-A---AACGGT---CTATTT-TAG-----TTCT-TTTGACAG--TGATGA---AAATGAAATAT------AC--------TT-----------GA-GTAACCATAGGGGACCA-CAGGACCTCTGA-T-ACTGAAA---CCCATATTTTG----AT---ATGAAATGGATGGAA---TATT-T-A-AACAGTTACCATATTTT---AAC-TT-------------AATCAGTGCACTA--AAT------TAAAGATTTTATA----TTTA-AATT--TAA-CTTTTATTGGA--T----CT----GA--TAG------CAA-AT
gi|128460                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GAA---AACGGT---CTATATTTAG-----TGCT-TTC--CACATTGATGA---AAATAAAATGC------AT--------GT-----------GA-GTAAACA--------CA-C--AACTTCTGA-T-ATT--TA---CGCATATTTT-----ATGTAATGAAACGGAT-GAA---AATT-A-A-TATA-TTACTGTATTTT---AGC-TTGA-
gi|128461                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              a-TTT--CACAGTGATAA---ATATAAAATAC------AC--------AC-----------GA-GTAATCA--------CA-C--AACCTGGGA-T-ATTAACA---TGAATATTTT-----ATGTAATGAAACTGATGGAA---CATT-A-A-TACAGCTACCATATTTT---AAC-TT-------------AATCAGTGCGCTT--AAT------T-----
gi|128462                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   --CAC--TGGTGA---AAATTTGATAC------AC--------AT-----------GG-GTTAACA--------C-----GACCTCTGA-C-AATGACT---CG-ATACTTT-----ATGTAATGAAACAAATGGAA---GAAT-A-AATGCAGTAACCATATTTA---AAC-TTAA-T------------CAATGCACTA--AAT------T-----AAATA-T----TTAA-AT-T--TCA-TTTTTATT-GA--T----A-----AA--TAG------TAACACA-AAG-ACCACATGAGACATAAAA
gi|128463                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AACA--------TAAT--GTCCTTTAG-C-AATGACA---CGCATGCTTTTATTAATGTAATGAAGCAGGTGAGA---GACT-A-AACGCAGTGACCGTATTTA---AACGTTGA-TAA





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                          22     11111111   11111111     111111                                                              1                                                11111111        222222222222222                                                    1111111111             111111      1111111111111                             11111                               1111111              333333333333333333333333333333333333                       111111    11111                                                                                                     1111111111      22                            2222222222222222222222                   1111                                                                                                3333333333333                  11111111111111                                      1111111111                                           
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                        4        44  3 1  00   3 66666666   00000000     333333  2    2 2  00    99999999  2      33 0     2  55          5  2      66666 2    7777  33  5555 444             33333333 2  33  222222222222222              8888888  66666 5 444          777777  1111111111   5555   2  222222 444  7777777777777  33333  999999999      3  2 77777    4444 444444  333   7777 3  1111111  555  666666 333333333333333333333333333333333333  4  22 77      22 6   111111    11111   3   1          2   3333       1          0 1   1      66666666 1 333  3   5 333      333      5   5555555555 0    77 1  1  22 1  33     555555  3333333333333333333333 1  2    66666666  0000      7  1 7 44     4444         66666            2   2   5555   5 1 888    1         7777   3  9999999999999             22   99999999999999   2 5555  3 2  7 33   4   1    5  33 2222222222  33   999999   2   2   3 3        55      
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                        .        ..  . .  ..   . ........   ........     ......  .    . .  ..    ........  .      .. .     .  ..          .  .      ..... .    ....  ..  .... ...             ........ .  ..  ...............              .......  ..... . ...          ......  ..........   ....   .  ...... ...  .............  .....  .........      .  . .....    .... ......  ...   .... .  .......  ...  ...... ....................................  .  .. ..      .. .   ......    .....   .   .          .   ....       .          . .   .      ........ . ...  .   . ...      ...      .   .......... .    .. .  .  .. .  ..     ......  ...................... .  .    ........  ....      .  . . ..     ....         .....            .   .   ....   . . ...    .         ....   .  .............             ..   ..............   . ....  . .  . ..   .   .    .  .. ..........  ..   ......   .   .   . .        ..      
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                        0        00  6 4  00   3 44444444   44444444     222222  9    7 7  88    77777777  7      77 5     6  11          0  5      00000 5    5555  22  3333 111             88888888 4  22  222222222222222              9999999  22222 0 444          777777  7777777777   7777   7  333333 777  4444444444444  99999  777777777      1  0 11111    2222 444444  555   4444 8  1111111  888  111111 999999999999999999999999999999999999  0  88 55      88 0   222222    33333   6   3          5   9999       5          5 6   0      66666666 7 333  4   6 000      222      6   3333333333 3    22 7  7  44 6  22     000000  0000000000000000000000 7  8    00000000  0000      0  7 0 55     9999         11111            6   7   7777   2 7 999    6         0000   6  2222222222222             99   55555555555555   4 0000  1 4  1 22   7   0    0  44 1111111111  44   777777   5   9   1 1        00      
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                  GTAATT-TCGGATAGATATGTCAA--TTA-G--------TTT--------GTGTT------GC-GAGT-T-TTCGTTAC--------AA-TGCTGT--GTAAACAGCACAGGATTAGAGA-GG-CGTGTC----GA-AAGCGT--CGGGAT----G---AAAGGTGTGAATA-------CG-TT--GA--------T-AT---CGCAAATTCACTTGA------TT-----A-A---AATACAAATT------AT----------AAG----TAG-AT------A---TA---------T---AT--C--TA------T--TAGAAANCT-GAA---ATAT----TGNT---TT---TAT----ANGC--G----TA---TT------T-------T------T-----------A-AT---A--TA-CT--T--CCTGAA--A-AGA------GCTG--ANGAAA-ATACGTCACGCTGGCGTA----AAATGTGTCGTCTACTATTGNAATCGACATA--------TTC--TTCTAGGAA---AACGGT---CTATTTCTAG-----CGCC-TCTCACAGT-GATGA--ANATNNAATAC------AC--------GC-----------GA-GTNAACA--------CA-C--GACCTCTGA-T-AN-TGACA---CGCATATTTT-----ATGTAATGAAACGGATGGAA---NATT-A-A-CGCAGTNACCGTATTTA---AAC-TTAA-TAATA-----AATCAGTACACTT--AAT------T-----TCCTA-A----TTCA-AG-T--TAA-TTTNTATT-GA--T----A-----AA--TAG------TAA-ATA-AAA-A-CACACGAG--GTAAAA
Reference ( family-658 )      :                                                                                                                                                                                                                                                  GTAATT-TCGGATAGATATGTCAA--TTA-G--------TTT--------GTGTT------GC-GAGT-T-TTCGTTAC--------AA-TGCTGT--GTAAACAGCACAGGATTAGAGA-GG-CGTGTC----GA-AAGCGT--CGGGAT----G---AAAGGTGTGAATA-------CG-TT--GA--------T-AT---CGCAAATTCACTTGA------TT-----A-A---AATACAAATT------AT----------AAG----TAG-AT------A---TA---------T---AT--C--TA------T--TAGAAANCT-GAA---ATAT----TGNT---TT---TAT----ANGC--G----TA---TT------T-------T------T-----------A-AT---A--TA-CT--T--CCTGAA--A-AGA------GCTG--ANGAAA-ATACGTCACGCTGGCGTA----AAATGTGTCGTCTACTATTGNAATCGACATA--------TTC--TTCTAGGAA---AACGGT---CTATTTCTAG-----CGCC-TCTCACA-T-GATGA--ANATNNAATAC------AC--------GC-----------GA-GTNAACA--------CA-C--GACCTCTGA-T-AN-TGACA---CGCATATTTT-----ATGTAATGAAACGGATGGAA---NATT-A-A-CGCAGTNACCGTATTTA---AAC-TTAA-TAATA-----AATCAGTACACTT--AAT------T-----TCCTA-A----TTCA-AG-T--TAA-TTTNTATT-GA--T----A-----AA--TAG------TAA-ATA-AAA-A-CACACGAG--GTAAAA
gi|128435                     :                                                                                                                                                                                                                                                  GTGATT-TCGGATA---AT-------TTA-G--------TTT--------GTGTT------GC-GAGT-T-TTCCTTAC--------AA-TGCTGT--GTAAACAGCACAGGATTAGAGA-GG-CGTGTC----GA-AAGCGT--CGGGAT----G---AAAGGTGTGAATA-------CG-TT--GA--------T-AT---CGCAAATTCACTTGA------TT-----A-A---GATACAAATT------AT----------AAG----TAG-AT------A---TA---------T---AT--C--TA------T--TAGAAAACT-GAA---ATAT----TGAT---TT---TAT----AAGC--G----TA---TT------T-------T------T-----------A-AT---A--TA-CT--T--CCTGAA--A-AGA------GCTG--ATGAAT-ATATGTCACGCTGGTGTG----AAATATGGCGTTTACTATAGAAATCGACATA--------TAC--GTCAAAGAA---AATGGT---ATAACTCTAG-----CACCATCTCAC--T-GGAGA--CTATTTAATAC------AC--------AT-----------CA-GTTAACA--------CA-T--GGCCTC-GA-TAAA-TGACA---GGCATATTTT-----ATGTAATGAGACAGATCGAA---GGTA-A-A-CGCAGTAACCGTATTTA---AAC-TTAA-TAATA-----GATTAATACACTT--AAT------T-----TCCTA-A----TTCA-AG-T--TAA-TTTGTATT-GA--T----A-----AA--TAG------TAA-ATA-AAA-A-CACAAGAG--GTAAAA
gi|128436                     :                                                                                                                                                                                                                                                  GTAATT-TCTGATAG-----T-----TTA-G--------TTT--------GTGTT------GC-GAGT-T-TTCGTTAC--------AA-TGCTGT--GTAAACAGCACAGGATTAGAGA-GG-CGTGTC----GA-AAGCGT--CGGTAT----G---AAAGGTGTGAATA-------CG-TT--GA--------T-AT---CGCAAATTCACTTGA------TT-----A-A---AAT-CAAATA------AT----------AAG----TAG-AT------A---TA---------T---AT--C--TA------T--TAGAAAACT-GAA---ATAT----TGTT---TT---TAT----AAGC--G----TA---TT------T-------T------T-----------A-AT---A--TA-CT--T--CCTGAA--A-AGA------GCTG--ATGAAA-ATATGTCACGCTGGTGTG----AAATATGGCGTTTACTATAGAAATCGACATA--------TGC--GTCAAAGAA---AATGGT---ATAACTCTAG-----CACCATCTTAC--T-GGAGA--CTATTTAATAC------AC--------AT-----------CA-GTTAACA--------CA-T--GGCCTC-GATT-AA-TGACA---GGCATATTTT-----ATGTAATGAGACAGATCGAT---GGTT-A-A-CGCAGTAGCCCTATTTA---AAC-TTAA-TAATA-----AATTAATACACTT--AAT------T-----TCCTA-A----TTCA-AG-T--TAA-TGTGTATT-GA--T----A-----AA--TAG------TAA-ATA-AAA-A-CACACGAG--GTAAAA
gi|128437                     :                                                                                                                                                                                                                                                  GTAATT-TCGGATACATATGTCAAAATTA-G--------TTT--------GTGTT------GC-GAGT-T-TTCGTTAC--------AA-TGCTGT--GTAAACATCACAGGATTAGAGA-GG-CGTGTC----GA-AAGCAT--CGGGAT----G---AAAGGTGTGAATA-------CG-TT--GA--------T-AT---CGCAAATTCATTTGA------TT-----A-A---TATACAAATT------AT----------AAG----TAG-AT------A---TA---------T---AT--C--TA------T--TAGAAAACT-GAA---ATAT----TGAT---TT---TAT----AAGC--G----TA---TT------T-------T------T-----------A-AT---A--TA-CT--T--CCTGAA--A-AGA------GCTG--ATGAAA-ATATGTCACGCTGGTGTG----AAATATAGCGTTTACTCTAGAAATCGACATA--------TGT--GTCAAAGAA---AATGGT---TTAACTCTAA-----CACCATCTCAC--T-GAAGA--ATATTTAATA---------------------------------G---------------A-T--GGCCTC-GA-T-AAATGACA---GGCATATTTT-----ATGTAATGAGACAGATCGAA---GGTT-A-AACGCAGTAGCCGTATTTA---AAT-TTAA-TAATA-----AATTAATACACTT--AAT------T-----TCCTA-A----TTCA-AG-T--TAA-TTTTTATT-AA--T----A-----AA--TAG------TAA-ATA-AAA-A-CACACGAG--GTAAAA
gi|128438                     :                                                                                                                                                                                                                                                  GTAATT-TCGGATAGATATGTCAAAATTA-G--------TTT--------GTGTT------GC-GAGT-T-TTCGTTAC--------AA-TGCTGT--GTAAACATCACAGGATTAGAGA-GG-CGTGTC----GA-AAGCAT--CGGGAT----G---AAAGGTGTGAATA-------CG-TT--GA--------T-AT---CGCAAATTCACTTGA------TT-----A-A---AATACAAATT------AT----------AAG----TAG-AT------A---TA---------T---AT--C--TA------T--TAGAAAACT-GAA---ATAT----TGAT---TT---TAT----AAGC--G----TA---TT------T-------T------T-----------A-AT---A--TA-CT--T--CCTGAA--A-AGA------ACTG--ATGAAA-ATATGTCACGCTGGTGAG----ATATATGGCGTTTACTCTAGAAAGCGACATA--------TGC--GTCAAAGAA---AATGGT---TTAACTCTAG-----CACCATCTCAC--T-GGAGA--ATATTTAATAC------AT--------G-------------------------------------GCCTC-GA-T-AAATGACA---GGCATATTTT-----ATGTAATGAGACAAATCGAA---GGTTAA-A-CGCAGTAGAAGTATATA---AAT-TTAA--AATA-----AATTAATACACTT--AAT------T-----TCCTA-A----TTCA-AG-T--TAA-TTTGTATT-GA--T----A-----AA--TAG------TAA-ATA-GAA-A-CACACGAG--GTGAAA
gi|128439                     :                                                                                                                                                                                                                                                  GTAATT-TCGAATAG-----T-----TTA-G--------TTT--------GTGTT------GT-GAGT-T-TTCTTTAC--------AA-TGCTGT--GTAAACAGCACAGGATTAGAGA-GG-CGTGTC----GA-AAGCAT--CGGGAT----G---AAATTTGTGAATA-------CG-TT--GA--------T-AT---CGCAAATTCACTTGA------TT-----A-A---AATACAAATT------AT----------AAG----TAG-AT------A---TA---------T---AT--T--TA------T--TGGAAAACC-GAA---ATAT----TGTG---TT---TA----------------TA---TT------T-------T------T-----------A-AT---A--TA-CT--T--CCTGAA--A-AAA------GCTG--ATGAAA-ATATGTCACGCTGGTGTG----AAATATGGCGTTTACTATAGAAATCGACATA--------TGT--GTCAAAGAA---AATGAT---TCAACTCTAG-----CACCATCTCAC--T-GGAGA--ATATTTAAAAC------AC--------AT-----------CA-GTTAGTA--------CA-T--GGCCTC-GA-TAAA-TGACA---GGCATATTTT-----ATGTAATGAGACAGATCGAA---GTTTAA-A-CGCAGTAGCCGTATTTA---AAC-TTAA-TACTA-----AATAAATACACTT--AAT------T-----TCCTA-A----TTCA-AG-T--TAA-TTTGTATT-GA--T----A-----AA--TAG------AAA-ATA-AAA-A-CACACGAG--GTAAAA
gi|128440                     :                                                                                                                                                                                                                                                  GTAATC-TCGAATAGATATGTCAACATAA-G--------TTT--------GTGTT------GC-GAGT-T-TTCGTTAC--------AA-TGCTGT--GTAAACAGCACAGGATTATAAA-GG-CGTGTC----AA-AACCAT--CGAGAT----G---AAAGGTTTGAATA-------CG-TT--GAGA------T-AT---CGCAAATTAACTTGA------TT-----A-A---AATACAAATT------AT----------AAG----TAG-AT------A---TA---------T---ATATC--TA------T--TA-AAAACT-GAA---ATAT----TGTT---TG---TAT----AAGC--G----TA---GT------T-------T------T-----------A-AT---A--TA-CT--T--CCTGAA--A-AGT------GCTG--ATGAAA-ATATGTCACGCTGGTGTG----AAATATGGCGTCTACTCTAGAAATCGACATA--------TTC--GTCAAAGAA---AATGGT---TTAACTCTAG-----CACCATCTCAC--T-GGAGA--ATATTTAATAC------AC--------AT-----------CA-GTTAACA--------TA-T--AGCCTC-GG-TAAA-TGACA---GGCATATTTT-----ATGTAATGAGACAGATCGAA---GGTTAA-A-CGCATTAGCCGTATTTA---AAT-TTAA-TAATA-----AATTAATACACTT--AAT------T-----ACCAA-A----TTAA-AG-T--TAA-TTTGTATT-GA--T----A-----AA--TAG------TGA-ATA-AAA-A-CACACCAG--CTAAAA
gi|128441                     :                                                                                                                                                                                                                                                  GTAATT-TCGGATAGATATGTCAACATAA-G--------AAT--------GTGTT------GC-GAGT-T-TTCGTTAC--------AA-TGCTGT--GTAAACAACACAGGCTTAGAG------GTGTC----AA-
gi|128442                     :                                                                                                                                                                                                                                                  GTCATT-TTGGGTAGATGTGTCAA--TTA-GCCGACAGTTTT--------GTCTT------GC-GACG-T-TTCATTAC--------AA-TAC-------AAACATCACATGATAAGAGA-GAACATGCC----CA-AAGCAT--AGTGTT----G---ATACACGTGAATA-------GG-TT--AA--------T-AT---CGTAAATTCACTTGA------TT-----A-A---AACACAAAAT------AT----------TAG-----AA-AT------A---TA---------A---AT--C--TA------A--TAGAGAGCT-G-----ATTT----TTTTCCCTT---TAT----ATGC--A----TA--------------------------T-----------A-AT------------------TAAA--G-AGA------GCTG--AGGAAA-ATATGTCACGCCG
gi|128443                     :                                                                                                                                                                                                                                                  GTAATTGTTGGG-AGAGATGTCAA--TTA-G--------TCTGTGCTTTAGTGTT------AT-GAGT-T-TTGATCAA--------AC-TGTTAT--GAAAACAACA----ATTGGAGA-GGATGTGTC----AC-AAG----------T----T---AAAGTTGTTAATA-------GA-TT--GAGAC-----C-AG---CACAAATTCACTTG-------TT-----AGA---AATAat
gi|128443                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AGAAATCT-G------CGT----TGTA---TT---TATTCGTATGC--A----TA---TTCTCTCTT-------T------T-----------A-AA---A--TT-TT--TTACTTGAA--A-CAAT-----GCTG--GA-AAA-ATATGTCACGCTGTGGTA----AAATGTGTTGTCTACTATTGTAATTGACATA--------TTC--TTCCAGGAA---A-CGGT---ATATTTTTATATAATTTTT-TTTTATA-T-AATCATTAAATAAAATAA------AC--------AC-----------AA-GTCAACA--------CA-T--GACCTGTGA-T-AT-TAACA---CGCATATTTT-----ATGTAATGAAATGGATTGAA---TATT-G-A-TACAGTTACTGTATTTT---AAC-T-------TA-----AATCAGTACACTT--AAT------T-----AAACA-T----TTCA-AATT--TAA-TTTtttatttctccttgagaaaaagaaataaaaacttaatagtaataggctactctttaattaaatacaagaaatctgcgttgtatttattcgtatgcatattctctcttttaaaattttttacttgaaacaatgctggaaaaatatgtcacgctgtggtaaaatgtgttgtctactattgtaattgacatattcttccaggaaacggtatatttttatataatttttttttatataatcattaaataaaataaacacaagtcaacacatgacctgtgatattaacacgcatattttatgtaatgaaatggattgaatattgatacagttactgtattttaacttaaatcagtacacttaattaaacatttcaaatttaattt
gi|128444                     :                            gtaattgttgggagagatgtcaattagtctgtgctttagtgttatgagttttgatcaaactgttatgaaaacaacaattggagaggatgtgtcacaagttaaagttgttaatagattgagaccagcacaaattcacttgttagaaatatttatttctccttgagaaaaagaaataaaaacttaatagtaataggctactctttaattaaatacaGTAATC-ATGGGTAGAGATGTCAG--TTATGCACC----TTG--------GTGTT------AC-GAGA-G-TTGATCAA--------AC-TGTTAT--GTAATCAACA----ATTGGAGATGA-CATGTT----GC-AAGT-T-----GAT----G-------GTGTAAATA-------GG-TT--GA--------G-ACAAATGCATATTCACT
gi|128444                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ------GCTG--GA-AAA-ATATGTGATGCTGAC--A----AAATGTGTCATCTACTGATGTAAGTGACATA--------TTC--TTCTAGGAA---A-TAGT---CTATTT-TAA------GCT-TTTCACAGT-GATGA--AAATAAAATAC------AC--------GT-----------CG-GTAAACA--------CA-T--GATCTCTGA-T-AC-TGACA---CGCATGTTTT-----ATATAATGAAACGGATGGAA---TATT-A-A-TACAGTTACCATATT---------TTA---AATG-----AATCAGTACACTT--AAT---------------TA-AAGATTTAA-AG-T--TTA-CTTTT-TC-AA--T----AGATCTAA--TAG------CAA-AT--TGA-G-CACACTAA--ATAGAAcattcactcattagaaatatttatttctcatcgacaaaaagaaacaaaaataggctacttttcaattaaataattaatctgtatggtactcattcacacacattttctctttttacaataactaattaagataatgctggaaaaatatgtgatgctgacaaaatgtgtcatctactgatgtaagtgacatattcttctaggaaatagtctattttaagcttttcacagtgatgaaaataaaatacacgtcggtaaacacatgatctctgatactgacacgcatgttttatataatgaaacggatggaatattaatacagttaccatattttaaatgaatcagtacacttaattaaagatttaaagtttactttttcaatagatctaatagcaaattgagcacactaaatagaa
gi|128445                     : gtaatcatgggtagagatgtcagttatgcaccttggtgttacgagagttgatcaaactgttatgtaatcaacaattggagatgacatgttgcaagttgatggtgtaaataggttgagacaaatgcatattcactcattcactcattagaaatatttatttctcatcgacaaaaagaaacaaaaataggctacttttcaattaaataattaatctgtatggtactcattcacacacattttctctttttacaataactaattaagataatA-G--------TTT--------GTGTTTAATACGCCGAGT-T-TTCCTTAC--------AA-TGCTGT--GTAAACAGCACAGGATTAGAGA-GG-CGTGTC----GA-AAGCGT--CGGGAT----G---AAAGGTGTGAATA-------CG-TT--AA--------T-AT---CGCAAATTCACTTGA------TT-----A-A---AATACAAATT------AT----------AAG----TAG-AT------A---TA---------C---AT--C--TA------T--TAGAAAACT-GAA---ATAT----TGGT---TT---TAT----AAGC--G----TA---TT------T-------T------T-----------A-AT---A--TA-CT--T--CCTGAA--A-AGA------GCTG--ATGAAT-ATATGTCACGCTGGTGTG----AAATATGGCGTTTACTATAGAAATCGACATA--------TGC--GTCAAAGAA---AATGGT---ATAACTCTAG-----CACCATCTCAC--T-GGAGA--CTATTTAATAC------AC--------AT------------A-GTTAACA--------CA-T--GGCCTC-GA-TAAA-TGACA---GGCATATTTT-----ATATAACGAGATAGATCGAA---AGTT-A-A-CGCAGTAGCCGTATTTA---AA--------------------CAATACAATT--AAT------T-----TCCTA-A----TTCA-AG-T--TAA-TTTTTACT-GA--T----A-----AA--TAG------TAA-ATC-AAA-T-CACACGAG--GTAAAA
gi|128446                     :                                                                                                                                                                                                                            attccatggatcattttataaaaaatagtaCGAATAGATAT--CAA--TAA-G--------TTG--------GAGCTTTG---GC-GAAT-TATTTATGACCTTGATTTAACTGTTAC--GAAAACAATAT-GGA----AGATGA-CGTGTCATAAGATAAGTG---CGTAAT----GTCAAAAGGTCAGAATAGCGAGGTCG-T---GA--------TCAG---CGTCAATTCCCTCGT------TA-----A-A---AATACTGATT------CT----------TCG----TA--AT------A---TA---------ACAAAC--CAATA------C--TAGAAAT---------ATAT----T--T---TT---TATTT--ATGC--A----CA---TT------TATTTTCTT------TCAAA-------A-AT------TA-CT--T--TTTTGA--A-AAA------GATG--GA-AAA-ATACGTCACGCTGACGTA----AAATATGTCGTCTACTATTGCAACTGACATA--------TCC--TTC-AGGGA---AACGGT---CTATTTATAG-----C
gi|128447                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                 --------TTT--------GTGTT------AC-AAGT-T-TT-GTTAT--------AA-TACTATATGCAAACAGCA-----TTAGAGT-GGATGTGTC-----A-ATGCTTACCGGTATTGTCA---AAAGGCGTGAACA-------GG-TTATGACCACAGGTT-ATGACCACAAATTCACTTGC------TA-----A-A---CATAACATTT------AT----------AAATTCCTAG-AT------A---GA---------A---AT--A---A------G--TAAAAAC---GAA---ACAG----TAGT---TT---a
gi|128448                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                 --------TTT--------GTGTT------AC-CAGT-T-TTGATTA---------AA-T-TTAT--GAAAATAGCA-----TTGGAGA-GAACATGTC----AC-A--CGT--TGA-AT----G---CTTATTGCCAACA-------AA-TT---------------------TAAATTCACTCG-------TT-----A-A---AAAACTAATTCCTCGAAA----------AAA----TAGTAT------GAGGTA-------------AT--C--TAATAAATC--TAGAAATCT-GTATC-GTAT----T-TC---TT---CGC----AAAC--A----TAATCTT------TCC-----T------T-----------T-ATGA-A--TC-AT--TAACTTGAT--ATAGT------GCTG--GAAAAA-ACCCATCAAGCTGGCGAA----AAATATGTCGTCTGCTATTGTATTTGACATA--------TTTGTTTTTAA-AA---AACGGT---CTATTT-TA------------CT---G-T-GATGA--ACATGAAATAC------AT--------AC-----------GA-GTAAGTA--------CG-C--TACCACTAA-T-AT-TGACA---TGCATATAAT-----ATGTAATAAAATAAACAGAA---TATT-A-A-TACAGTT---TTTTTTACTTAAC-TTAA-TA------------AATGCAC-T--AAT------T-----TTATT-T----TTC--AG-TAATAA---TGAATT-GA--T----A-----AACTTAT------TGG-ATA-A
gi|128449                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AGTGT-TTTGTCAA--------AC-TGTTAT--GAAAACA---CAA-ATTGGAGA-GGACGTATC----AC-AAGT---------T----G---AA-GATGTACGTA-------GG-TC--GA--------G-ACAAACGCAAATTCACTC-A------TC-----AGA---AATATGTATT------CT----------TCG----TCG-AC------A--------------------------A------A--CAGAAA--T-GAAGTTATAA----TAAT---CC---AAT----AGGC-------TAC--TT------T-------T------T-----------A-ATGAAA--TA-CT--T--TC
gi|128449                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TAAA--C-AAA------GCTG--AAAAAA-ATACGTCACGCTGACGTA----GAATTGGTCGTTTACTGTTGTAATGGACAT----------------CTAGGTA---A-CGGT---CTATTTTAAG-----CGCT-TTCCACAGC-GATCA--AAATAACATAT------AC--------GC-----------GA-G-AAACA--------CA-C--TACCTCTGA-T-AA-TGACA---CGCATTGTTT-----ATGTAATCAAACGGTTGGAA---TATT-A-A-AACAGATACCGTATTTT---AAC-TT-------------AATCAGTGCACTA--AATTAAAGAT-----TTCAA-A----TTTA-AATT--TAACTTTCGATA-CATCT----A-----AA--TGA------TAA-ATG-AGC-A-CACgagtagtttttttttaaaaagagaataagcgtgcgaataaatacaatgcagatttaaacaaagctgaaaaaaatacgtcacgctgacgtagaattggtcgtttactgttgtaatggacatctaggtaacggtctattttaagcgctttccacagcgatcaaaataacatatacgcgagaaacacactacctctgataatgacacgcattgtttatgtaatcaaacggttggaatattaaaacagataccgtattttaacttaatcagtgcactaaattaaagatttcaaatttaaatttaactttcgatacatctaaatgataaatgagcacac
gi|128450                     :                                                                                                                                agtgttttgtcaaactgttatgaaaacacaaattggagaggacgtatcacaagttgaagatgtacgtaggtcgagacaaacgcaaattcactcatcagaaatatgtattcttcgtcgacaaacagaaatgaagttataataatccaataggctactttttaatgaaatactttcgagtagtttttttttaaaaagagaataagcgtgcgaataaatacaatgcagattTATAGA-GG-CGTGTC----AA-AACCAT--CGTGAT----G---AAAGGTGTGAATA-------CG-TT--GA--------T-AT---CATAAATTCACTGGA------TA-----A-A---AATAAAAATT------AT----------AAG----TAG-AT------A---TA---------T---AT--C--TA------T--TAGAAAACT-AAA---ATAT----TGTT---TT---TAT----AAGC--G----TA---TT------T-------T------T-------------AT---A--AA-CT--T--CCTGAA--A-AGA------GCTG--ATAAAA-ATATGTCACGCTGGTGTG----AAATATGGCGTTTACTCTAGAAATCGACATA--------TGC--GTTAAAGAA---AATGG
gi|128451                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ----G---AAAGGTGTTATTA-------GG-TC---A--------TGAC---TGCAAATTGACTT--------TTCCACAA-A---AGTA---ATT------ATTTGTAGATAGAAG----TAA-ATGAAAACA---TAATGCTTTTTT---AT--T--TA------TACTAGAAATTT-G------TATCCTATATT---TT---TGT----ATGCATG----TC---TT------T-------T------TTTATTTAAAAAA-AT---ACCTA-CTGGTA-CTTGAA--AGAGA------GCCG--GA-AAA-ATAAGCAACGCTGGTGTT----AAATGTGT-------TATT------GACATG--------TTC--TTCTAGG-A---AATGGC---CTATTTTTAG-----CACC-TTTTACAGT-GATGA--AAATGTAATAC------AC--------AC-----------CA-GTTAATA--------C
gi|128452                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ---AAACATGTGAATAGTTCA--CGGCT--GG--------T-A-----G-AAATTCTCTTGAAACAAATT-----A-ATACAATATGCATT------GT------------G----TAG-TTTAA---A---TA---------T---A---A--TA------C--TAGATATCT-GTATC-ACAT----TTAT---TTGCATGC----ATGT--T----TG---TT------T-------T------TTAAC-------A-ATC--A--T--CT--T--CTTAAA--AGAGA------GCTG----GAAACATATGTTACACTGG-GTATAAAAAATGTGTCGTCTTCTATTGCAGTTTACATA--------TTC--TTCTGGGAACCAGACTATTTACTATTTTCAG-----TGCC-TCTCACAGT-GACGA--AAATGTAAAAC------ACATGTATATGCACATATAATCTGACATTGACA--------TA-CATGACCTCTGA-C-AT-TGACATATTACATGGTTT-----ATATAATTCAATAAATGGAA---GATT-ACA-TACAGT
gi|128453                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      --TA------C--TAGAAATCT-GTATC-ATAT----TTAT---TC----AC----ATGC--A----TA---TT------T-------TCTCCTTT-----------AGAA---A--TAGCT--A--CCTGAACTA-ATG------CTTG--A--AAA-ATACGTCATGCTGACATA----AAATGTGTCGTCTTCTATTGTAAATGACATA--------TTC--TTCTAGG-A---AACTGT---CTATT-------------------ACAGT-GATGA--AAATAAAAAGC------AT--------GC-----------GA-GTAAACA--------CA-C--AACCTCTGA-A-AT-TGATT---CAAATATTTT-----A-GAAATGAAACAGATGGAA---TATT-A-A-TGCAGTTACCGGATTTT---AAC-ATAA-T
gi|128454                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      --TA------C--TAGAAATCT-G------TAT----TGTG---TT---TAT----TTGCATG----CA---TT------T-------T------T-----------A------------TT--T--CTTTTA--A-AAATTACCTACTT--GAGAGA-GTGCTTGATGTT-----A----AAATGT--TGTCTGTTATTGTAATTGGTATA--------CTC--TTCTAG-AA---AATGGT---CTATTTTTAG-----CACT-TTTCACAGT-GATGA--AAATGAAATACCGGTACAC--------AT-----------GA-GTTAACA--------CA-C--GACCTCTCA-T-AT-TGACA---CGCATATTTT-----ATGTAATAAAACAGATGGAA---TCCA-G-A-TACAGTTACTGTATTT----AAC-TTAAGCAATGCACTCAATCAA-AAACTTTAAAT------T-------CTA-A----TT-A-------TAT-TTTTCAAT-AA--TAGCAA-----AA--TAGATACATTAA-ATAGAAA-A-CA
gi|128455                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      --TA------C--TAGAAATCTTGA-------T----TGTA---TT---TAT----TTGC--GCTCATA---TT------TCCTCTC-T------T-----------A-AA---AA-CAGCT--G--TTTGAA--A-CAAT-----GCTG--GAGAAATATACATCACGTTGACGTA----AAATGGGTCATCTACTATTGTAATTGACGCA--------TTC--TCCTAG-AA---AATGGA---CTGTTTTTAG-----GGCT-TTCCACA-T-----------------AC------AT--------G------------GA-GTAAACA--------CA-G--GACCTCTGA-T-AG-TGACA---CGCATATTTT-----AAGTCATGAAACAGATGGAA---TATT-A-A---TAGTTACCATATTTT---AAC---------CA-----AATCAGTGCACTA--AAT------
gi|128456                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aa-GAA---ATAT------GT---AT---CAT----A----------TA---TT------T-------T------TTTGTTTAAAA-A-AT------TA-CC--T--ACTTGA--A-AGA------A-TGTTACAAGA-ATATGTCAGGCTGGTGTA----AAATGTGTCGTCAGCTGTTGTAATTGACATA--------TAC--TTCTAGG-A---AATGAT---CTATTTTGAG-----CACT-TTCCACAGT-GATGA--ACGTGAGATAC------AC--------TC-----------GA-GTAAACA--------CA-T--GTCCTATGC-T-AT-TGACA---GGCATATTTC-----ATGTGATGAAACAGATGGAG---TATT--------------TGTATTTA---AAC-TT-------------AATCAGTACAC-T--A------------------A-A----TTAA-AG----AAA-TATATATT-TT--T----C-----AA--TAA------T-A-ACA-AAATA-CACACAA----TAAA
gi|128457                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -CT--A--CTTGAA--A-CAAT-----GCTG--GA-AAA-ATACGTCACGCTAACGTA----AAATTGGTCGACTACTATTGAAATTGACATGATAAATTCTTC--TTCTAGG-A---CACAGT---CTATTTCTAG-----CGCT-TTTCACATT-GATGA--AGCTAAAATAC------AA--------AC-----------AA-GTA---------------------CTCTGA-T-AT-TGACA---CGCATATTTT-----ATGTAATGAAA------GAA------T-A-A-TACATTTACTGTATTTA---AAC-TT-------------AATCAGTACACTA--AATCAAGGAT-----TTCAA-A----TTTATAT-T--TAACTTTCAACT-GA--T----CT----AA--TAGC-----TAA-AT
gi|128458                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AAA-ATATGTCACGGTAGTACA----CAATGTGCTGTCAACTATTGTAATTGACATA--------TTC--TTTTAAG-----AACAGT---CTATTTTTA-------------TCACT-T--------ACATGTAAAAC------AC--------GC-----------------AATA--------TA--------TCTGA-T-TT-TGACA---GGTATATTTT-----ATGTAATAAAACGGATGGAATTGTATT-A-----CAGTCACAGTACTTT---AACATTAA-----A-----AATCAGTGCACTA--AAG------T--------CA-A-----GGA-AG-T--TAC-TTTTTTTTCAA--T----A-----AA---AG------CAA-A-A-TAA-C-CACACTAA--ATAAAA
gi|128459                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATGCTGACGTA----AAATGTGTTGTCCACTATTATAATTGACATA--------CTC--TTCTAGG-A---AACGGT---CTATTT-TAG-----TTCT-TTTGACAGT-GATGA--AAATGAAATAT------AC--------TT-----------GA-GTAACCATAGGGGACCA-CAGGACCTCTGA-T-AC-TGAAA---CCCATATTTTG----AT---ATGAAATGGATGGAA---TATT-T-A-AACAGTTACCATATTTT---AAC-TT-------------AATCAGTGCACTA--AAT------TAAAGATTTTATA----TTTA-AATT--TAA-CTTTTATTGGA--T----CT----GA--TAG------CAA-AT
gi|128460                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GAA---AACGGT---CTATATTTAG-----TGCT-TTCCACA-TTGATGA--AAATAAAATGC------AT--------GT-----------GA-GTAAACA--------CA-C--AACTTCTGA-T-AT-T--TA---CGCATATTTT-----ATGTAATGAAACGGAT-GAA---AATT-A-A-TATA-TTACTGTATTTT---AGC-TTGA-
gi|128461                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              a-TTTCACAGT-GATAA--ATATAAAATAC------AC--------AC-----------GA-GTAATCA--------CA-C--AACCTGGGA-T-AT-TAACA---TGAATATTTT-----ATGTAATGAAACTGATGGAA---CATT-A-A-TACAGCTACCATATTTT---AAC-TT-------------AATCAGTGCGCTT--AAT------T-----
gi|128462                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CAC--T-GGTGA--AAATTTGATAC------AC--------AT-----------GG-GTTAACA--------C-----GACCTCTGA-C-AA-TGACT---CG-ATACTTT-----ATGTAATGAAACAAATGGAA---GAAT-A-AATGCAGTAACCATATTTA---AAC-TTAA-T------------CAATGCACTA--AAT------T-----AAATA-T----TTAA-AT-T--TCA-TTTTTATT-GA--T----A-----AA--TAG------TAACACA-AAG-ACCACATGAGACATAAAA
gi|128463                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AACA--------TAAT--GTCCTTTAG-C-AA-TGACA---CGCATGCTTTTATTAATGTAATGAAGCAGGTGAGA---GACT-A-AACGCAGTGACCGTATTTA---AACGTTGA-TAA





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                          22     11111111   11111111     111111                                                              1                                                11111111        222222222222222                                                    1111111111             111111      1111111111111                             11111                               1111111              333333333333333333333333333333333333                       111111    11111                                                                                                              1      11                           2222222222222222222222                                 1                                                                                   3333333333333                  11111111111111                                      1111111111                                           
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                        4        44  3 1  00   3 66666666   00000000     333333  2    2 2  00    99999999  2      33 0     2  55          5  2      66666 2    7777  33  5555 444             33333333 2  33  222222222222222              8888888  66666 5 444          777777  1111111111   5555   2  222222 444  7777777777777  33333  999999999      3  2 77777    4444 444444  333   7777 3  1111111  555  666666 333333333333333333333333333333333333  4  22 77      22 6   111111    11111   3   1          2   3333       1          0 2   1      66666666 1 333  3     333 3    333      5   6666666  2 1    44   1  22 1  33     555555  3333333333333333333333 1  2    66666666  9999      7   2 1     4444         66666            2   2   5555   7 1 777    1         7777   3  9999999999999             22   99999999999999   2 5555  3 2  7 33   4   1    5  33 2222222222  33   999999   2   2   3 3        55      
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                        .        ..  . .  ..   . ........   ........     ......  .    . .  ..    ........  .      .. .     .  ..          .  .      ..... .    ....  ..  .... ...             ........ .  ..  ...............              .......  ..... . ...          ......  ..........   ....   .  ...... ...  .............  .....  .........      .  . .....    .... ......  ...   .... .  .......  ...  ...... ....................................  .  .. ..      .. .   ......    .....   .   .          .   ....       .          . .   .      ........ . ...  .     ... .    ...      .   .......  . .    ..   .  .. .  ..     ......  ...................... .  .    ........  ....      .   . .     ....         .....            .   .   ....   . . ...    .         ....   .  .............             ..   ..............   . ....  . .  . ..   .   .    .  .. ..........  ..   ......   .   .   . .        ..      
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                        0        00  6 4  00   3 44444444   44444444     222222  9    7 7  88    77777777  7      77 5     6  11          0  5      00000 5    5555  22  3333 111             88888888 4  22  222222222222222              9999999  22222 0 444          777777  7777777777   7777   7  333333 777  4444444444444  99999  777777777      1  0 11111    2222 444444  555   4444 8  1111111  888  111111 999999999999999999999999999999999999  0  88 55      88 0   222222    33333   6   3          5   9999       5          5 8   0      66666666 7 333  4     000 8    222      6   3333333  7 4    33   7  44 6  22     000000  0000000000000000000000 7  8    00000000  6666      0   2 0     9999         11111            6   7   7777   0 7 222    6         0000   6  2222222222222             99   55555555555555   4 0000  1 4  1 22   7   0    0  44 1111111111  44   777777   5   9   1 1        00      
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                  GTAATT-TCGGATAGATATGTCAA--TTA-G--------TTT--------GTGTT------GC-GAGT-T-TTCGTTAC--------AA-TGCTGT--GTAAACAGCACAGGATTAGAGA-GG-CGTGTC----GA-AAGCGT--CGGGAT----G---AAAGGTGTGAATA-------CG-TT--GA--------T-AT---CGCAAATTCACTTGA------TT-----A-A---AATACAAATT------AT----------AAG----TAG-AT------A---TA---------T---AT--C--TA------T--TAGAAANCT-GAA---ATAT----TGNT---TT---TAT----ANGC--G----TA---TT------T-------T------T-----------A-AT---A--TA-CT--T--CCTGAA--A-AGA------GCTG--ANGAAA-ATACGTCACGCTGGCGTA----AAATGTGTCGTCTACTATTGNAATCGACATA--------TTC--TTCTAGGAA---AACGGT---CTATTTCTAG-----CGCC-TCTCACAGTGATGA--ANATNNAATAC------AC--------GC-----------GA-GTNAACA--------CA-C--GACCTCTGAT-ANTGACA---CGCATATTTT-----ATGTAATGAAACGGATGGAA---NATT-A-A-CGCAGTNACCGTATTTA---AAC-TTAA-TAATA-----AATCAGTACACTT--AAT------T-----TCCTA-A----TTCA-AG-T--TAA-TTTNTATT-GA--T----A-----AA--TAG------TAA-ATA-AAA-A-CACACGAG--GTAAAA
Reference ( family-658 )      :                                                                                                                                                                                                                                                  GTAATT-TCGGATAGATATGTCAA--TTA-G--------TTT--------GTGTT------GC-GAGT-T-TTCGTTAC--------AA-TGCTGT--GTAAACAGCACAGGATTAGAGA-GG-CGTGTC----GA-AAGCGT--CGGGAT----G---AAAGGTGTGAATA-------CG-TT--GA--------T-AT---CGCAAATTCACTTGA------TT-----A-A---AATACAAATT------AT----------AAG----TAG-AT------A---TA---------T---AT--C--TA------T--TAGAAANCT-GAA---ATAT----TGNT---TT---TAT----ANGC--G----TA---TT------T-------T------T-----------A-AT---A--TA-CT--T--CCTGAA--A-AGA------GCTG--ANGAAA-ATACGTCACGCTGGCGTA----AAATGTGTCGTCTACTATTGNAATCGACATA--------TTC--TTCTAGGAA---AACGGT---CTATTTCTAG-----CGCC-TCTCACAGTGATGA--ANATNNAATAC------AC--------GC-----------GA-GTNAACA--------CA-C--GACCTCTGAT-ANTGACA---CGCATATTTT-----ATGTAATGAAACGGATGGAA---NATT-A-A-CGCAGTNACCGTATTTA---AAC-TTAA-TAATA-----AATCAGTACACTT--AAT------T-----TCCTA-A----TTCA-AG-T--TAA-TTTNTATT-GA--T----A-----AA--TAG------TAA-ATA-AAA-A-CACACGAG--GTAAAA
gi|128435                     :                                                                                                                                                                                                                                                  GTGATT-TCGGATA---AT-------TTA-G--------TTT--------GTGTT------GC-GAGT-T-TTCCTTAC--------AA-TGCTGT--GTAAACAGCACAGGATTAGAGA-GG-CGTGTC----GA-AAGCGT--CGGGAT----G---AAAGGTGTGAATA-------CG-TT--GA--------T-AT---CGCAAATTCACTTGA------TT-----A-A---GATACAAATT------AT----------AAG----TAG-AT------A---TA---------T---AT--C--TA------T--TAGAAAACT-GAA---ATAT----TGAT---TT---TAT----AAGC--G----TA---TT------T-------T------T-----------A-AT---A--TA-CT--T--CCTGAA--A-AGA------GCTG--ATGAAT-ATATGTCACGCTGGTGTG----AAATATGGCGTTTACTATAGAAATCGACATA--------TAC--GTCAAAGAA---AATGGT---ATAACTCTAG-----CACCATCTCAC--TGGAGA--CTATTTAATAC------AC--------AT-----------CA-GTTAACA--------CA-T--GGCCTC-GATAAATGACA---GGCATATTTT-----ATGTAATGAGACAGATCGAA---GGTA-A-A-CGCAGTAACCGTATTTA---AAC-TTAA-TAATA-----GATTAATACACTT--AAT------T-----TCCTA-A----TTCA-AG-T--TAA-TTTGTATT-GA--T----A-----AA--TAG------TAA-ATA-AAA-A-CACAAGAG--GTAAAA
gi|128436                     :                                                                                                                                                                                                                                                  GTAATT-TCTGATAG-----T-----TTA-G--------TTT--------GTGTT------GC-GAGT-T-TTCGTTAC--------AA-TGCTGT--GTAAACAGCACAGGATTAGAGA-GG-CGTGTC----GA-AAGCGT--CGGTAT----G---AAAGGTGTGAATA-------CG-TT--GA--------T-AT---CGCAAATTCACTTGA------TT-----A-A---AAT-CAAATA------AT----------AAG----TAG-AT------A---TA---------T---AT--C--TA------T--TAGAAAACT-GAA---ATAT----TGTT---TT---TAT----AAGC--G----TA---TT------T-------T------T-----------A-AT---A--TA-CT--T--CCTGAA--A-AGA------GCTG--ATGAAA-ATATGTCACGCTGGTGTG----AAATATGGCGTTTACTATAGAAATCGACATA--------TGC--GTCAAAGAA---AATGGT---ATAACTCTAG-----CACCATCTTAC--TGGAGA--CTATTTAATAC------AC--------AT-----------CA-GTTAACA--------CA-T--GGCCTC-GATTAATGACA---GGCATATTTT-----ATGTAATGAGACAGATCGAT---GGTT-A-A-CGCAGTAGCCCTATTTA---AAC-TTAA-TAATA-----AATTAATACACTT--AAT------T-----TCCTA-A----TTCA-AG-T--TAA-TGTGTATT-GA--T----A-----AA--TAG------TAA-ATA-AAA-A-CACACGAG--GTAAAA
gi|128437                     :                                                                                                                                                                                                                                                  GTAATT-TCGGATACATATGTCAAAATTA-G--------TTT--------GTGTT------GC-GAGT-T-TTCGTTAC--------AA-TGCTGT--GTAAACATCACAGGATTAGAGA-GG-CGTGTC----GA-AAGCAT--CGGGAT----G---AAAGGTGTGAATA-------CG-TT--GA--------T-AT---CGCAAATTCATTTGA------TT-----A-A---TATACAAATT------AT----------AAG----TAG-AT------A---TA---------T---AT--C--TA------T--TAGAAAACT-GAA---ATAT----TGAT---TT---TAT----AAGC--G----TA---TT------T-------T------T-----------A-AT---A--TA-CT--T--CCTGAA--A-AGA------GCTG--ATGAAA-ATATGTCACGCTGGTGTG----AAATATAGCGTTTACTCTAGAAATCGACATA--------TGT--GTCAAAGAA---AATGGT---TTAACTCTAA-----CACCATCTCAC--TGAAGA--ATATTTAATA-----------------G-------------------------------A-T--GGCCTC-GATAAATGACA---GGCATATTTT-----ATGTAATGAGACAGATCGAA---GGTTAA-A-CGCAGTAGCCGTATTTA---AAT-TTAA-TAATA-----AATTAATACACTT--AAT------T-----TCCTA-A----TTCA-AG-T--TAA-TTTTTATT-AA--T----A-----AA--TAG------TAA-ATA-AAA-A-CACACGAG--GTAAAA
gi|128438                     :                                                                                                                                                                                                                                                  GTAATT-TCGGATAGATATGTCAAAATTA-G--------TTT--------GTGTT------GC-GAGT-T-TTCGTTAC--------AA-TGCTGT--GTAAACATCACAGGATTAGAGA-GG-CGTGTC----GA-AAGCAT--CGGGAT----G---AAAGGTGTGAATA-------CG-TT--GA--------T-AT---CGCAAATTCACTTGA------TT-----A-A---AATACAAATT------AT----------AAG----TAG-AT------A---TA---------T---AT--C--TA------T--TAGAAAACT-GAA---ATAT----TGAT---TT---TAT----AAGC--G----TA---TT------T-------T------T-----------A-AT---A--TA-CT--T--CCTGAA--A-AGA------ACTG--ATGAAA-ATATGTCACGCTGGTGAG----ATATATGGCGTTTACTCTAGAAAGCGACATA--------TGC--GTCAAAGAA---AATGGT---TTAACTCTAG-----CACCATCTCAC--TGGAGA--ATATTTAAT----------------------------------------A--------CA-T--GGCCTC-GATAAATGACA---GGCATATTTT-----ATGTAATGAGACAAATCGAA---GGTTAA-A-CGCAGTAGAAGTATATA---AAT-TTAA--AATA-----AATTAATACACTT--AAT------T-----TCCTA-A----TTCA-AG-T--TAA-TTTGTATT-GA--T----A-----AA--TAG------TAA-ATA-GAA-A-CACACGAG--GTGAAA
gi|128439                     :                                                                                                                                                                                                                                                  GTAATT-TCGAATAG-----T-----TTA-G--------TTT--------GTGTT------GT-GAGT-T-TTCTTTAC--------AA-TGCTGT--GTAAACAGCACAGGATTAGAGA-GG-CGTGTC----GA-AAGCAT--CGGGAT----G---AAATTTGTGAATA-------CG-TT--GA--------T-AT---CGCAAATTCACTTGA------TT-----A-A---AATACAAATT------AT----------AAG----TAG-AT------A---TA---------T---AT--T--TA------T--TGGAAAACC-GAA---ATAT----TGTG---TT---TA----------------TA---TT------T-------T------T-----------A-AT---A--TA-CT--T--CCTGAA--A-AAA------GCTG--ATGAAA-ATATGTCACGCTGGTGTG----AAATATGGCGTTTACTATAGAAATCGACATA--------TGT--GTCAAAGAA---AATGAT---TCAACTCTAG-----CACCATCTCAC--TGGAGA--ATATTTAAAAC------AC--------AT-----------CA-GTTAGTA--------CA-T--GGCCTC-GATAAATGACA---GGCATATTTT-----ATGTAATGAGACAGATCGAA---GTTTAA-A-CGCAGTAGCCGTATTTA---AAC-TTAA-TACTA-----AATAAATACACTT--AAT------T-----TCCTA-A----TTCA-AG-T--TAA-TTTGTATT-GA--T----A-----AA--TAG------AAA-ATA-AAA-A-CACACGAG--GTAAAA
gi|128440                     :                                                                                                                                                                                                                                                  GTAATC-TCGAATAGATATGTCAACATAA-G--------TTT--------GTGTT------GC-GAGT-T-TTCGTTAC--------AA-TGCTGT--GTAAACAGCACAGGATTATAAA-GG-CGTGTC----AA-AACCAT--CGAGAT----G---AAAGGTTTGAATA-------CG-TT--GAGA------T-AT---CGCAAATTAACTTGA------TT-----A-A---AATACAAATT------AT----------AAG----TAG-AT------A---TA---------T---ATATC--TA------T--TA-AAAACT-GAA---ATAT----TGTT---TG---TAT----AAGC--G----TA---GT------T-------T------T-----------A-AT---A--TA-CT--T--CCTGAA--A-AGT------GCTG--ATGAAA-ATATGTCACGCTGGTGTG----AAATATGGCGTCTACTCTAGAAATCGACATA--------TTC--GTCAAAGAA---AATGGT---TTAACTCTAG-----CACCATCTCAC--TGGAGA--ATATTTAATAC------AC--------AT-----------CA-GTTAACA--------TA-T--AGCCTC-GGTAAATGACA---GGCATATTTT-----ATGTAATGAGACAGATCGAA---GGTTAA-A-CGCATTAGCCGTATTTA---AAT-TTAA-TAATA-----AATTAATACACTT--AAT------T-----ACCAA-A----TTAA-AG-T--TAA-TTTGTATT-GA--T----A-----AA--TAG------TGA-ATA-AAA-A-CACACCAG--CTAAAA
gi|128441                     :                                                                                                                                                                                                                                                  GTAATT-TCGGATAGATATGTCAACATAA-G--------AAT--------GTGTT------GC-GAGT-T-TTCGTTAC--------AA-TGCTGT--GTAAACAACACAGGCTTAGAG------GTGTC----AA-
gi|128442                     :                                                                                                                                                                                                                                                  GTCATT-TTGGGTAGATGTGTCAA--TTA-GCCGACAGTTTT--------GTCTT------GC-GACG-T-TTCATTAC--------AA-TAC-------AAACATCACATGATAAGAGA-GAACATGCC----CA-AAGCAT--AGTGTT----G---ATACACGTGAATA-------GG-TT--AA--------T-AT---CGTAAATTCACTTGA------TT-----A-A---AACACAAAAT------AT----------TAG-----AA-AT------A---TA---------A---AT--C--TA------A--TAGAGAGCT-G-----ATTT----TTTTCCCTT---TAT----ATGC--A----TA--------------------------T-----------A-AT------------------TAAA--G-AGA------GCTG--AGGAAA-ATATGTCACGCCG
gi|128443                     :                                                                                                                                                                                                                                                  GTAATTGTTGGG-AGAGATGTCAA--TTA-G--------TCTGTGCTTTAGTGTT------AT-GAGT-T-TTGATCAA--------AC-TGTTAT--GAAAACAACA----ATTGGAGA-GGATGTGTC----AC-AAG----------T----T---AAAGTTGTTAATA-------GA-TT--GAGAC-----C-AG---CACAAATTCACTTG-------TT-----AGA---AATAat
gi|128443                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AGAAATCT-G------CGT----TGTA---TT---TATTCGTATGC--A----TA---TTCTCTCTT-------T------T-----------A-AA---A--TT-TT--TTACTTGAA--A-CAAT-----GCTG--GA-AAA-ATATGTCACGCTGTGGTA----AAATGTGTTGTCTACTATTGTAATTGACATA--------TTC--TTCCAGGAA---A-CGGT---ATATTTTTATATAATTTTT-TTTTATA-TAATCATTAAATAAAATAA------AC--------AC-----------AA-GTCAACA--------CA-T--GACCTGTGAT-ATTAACA---CGCATATTTT-----ATGTAATGAAATGGATTGAA---TATT-G-A-TACAGTTACTGTATTTT---AAC-T-------TA-----AATCAGTACACTT--AAT------T-----AAACA-T----TTCA-AATT--TAA-TTTtttatttctccttgagaaaaagaaataaaaacttaatagtaataggctactctttaattaaatacaagaaatctgcgttgtatttattcgtatgcatattctctcttttaaaattttttacttgaaacaatgctggaaaaatatgtcacgctgtggtaaaatgtgttgtctactattgtaattgacatattcttccaggaaacggtatatttttatataatttttttttatataatcattaaataaaataaacacaagtcaacacatgacctgtgatattaacacgcatattttatgtaatgaaatggattgaatattgatacagttactgtattttaacttaaatcagtacacttaattaaacatttcaaatttaattt
gi|128444                     :                            gtaattgttgggagagatgtcaattagtctgtgctttagtgttatgagttttgatcaaactgttatgaaaacaacaattggagaggatgtgtcacaagttaaagttgttaatagattgagaccagcacaaattcacttgttagaaatatttatttctccttgagaaaaagaaataaaaacttaatagtaataggctactctttaattaaatacaGTAATC-ATGGGTAGAGATGTCAG--TTATGCACC----TTG--------GTGTT------AC-GAGA-G-TTGATCAA--------AC-TGTTAT--GTAATCAACA----ATTGGAGATGA-CATGTT----GC-AAGT-T-----GAT----G-------GTGTAAATA-------GG-TT--GA--------G-ACAAATGCATATTCACT
gi|128444                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ------GCTG--GA-AAA-ATATGTGATGCTGAC--A----AAATGTGTCATCTACTGATGTAAGTGACATA--------TTC--TTCTAGGAA---A-TAGT---CTATTT-TAA------GCT-TTTCACAGTGATGA--AAATAAAATAC------AC--------GT-----------CG-GTAAACA--------CA-T--GATCTCTGAT-ACTGACA---CGCATGTTTT-----ATATAATGAAACGGATGGAA---TATT-A-A-TACAGTTACCATATT---------TTA---AATG-----AATCAGTACACTT--AAT---------------TA-AAGATTTAA-AG-T--TTA-CTTTT-TC-AA--T----AGATCTAA--TAG------CAA-AT--TGA-G-CACACTAA--ATAGAAcattcactcattagaaatatttatttctcatcgacaaaaagaaacaaaaataggctacttttcaattaaataattaatctgtatggtactcattcacacacattttctctttttacaataactaattaagataatgctggaaaaatatgtgatgctgacaaaatgtgtcatctactgatgtaagtgacatattcttctaggaaatagtctattttaagcttttcacagtgatgaaaataaaatacacgtcggtaaacacatgatctctgatactgacacgcatgttttatataatgaaacggatggaatattaatacagttaccatattttaaatgaatcagtacacttaattaaagatttaaagtttactttttcaatagatctaatagcaaattgagcacactaaatagaa
gi|128445                     : gtaatcatgggtagagatgtcagttatgcaccttggtgttacgagagttgatcaaactgttatgtaatcaacaattggagatgacatgttgcaagttgatggtgtaaataggttgagacaaatgcatattcactcattcactcattagaaatatttatttctcatcgacaaaaagaaacaaaaataggctacttttcaattaaataattaatctgtatggtactcattcacacacattttctctttttacaataactaattaagataatA-G--------TTT--------GTGTTTAATACGCCGAGT-T-TTCCTTAC--------AA-TGCTGT--GTAAACAGCACAGGATTAGAGA-GG-CGTGTC----GA-AAGCGT--CGGGAT----G---AAAGGTGTGAATA-------CG-TT--AA--------T-AT---CGCAAATTCACTTGA------TT-----A-A---AATACAAATT------AT----------AAG----TAG-AT------A---TA---------C---AT--C--TA------T--TAGAAAACT-GAA---ATAT----TGGT---TT---TAT----AAGC--G----TA---TT------T-------T------T-----------A-AT---A--TA-CT--T--CCTGAA--A-AGA------GCTG--ATGAAT-ATATGTCACGCTGGTGTG----AAATATGGCGTTTACTATAGAAATCGACATA--------TGC--GTCAAAGAA---AATGGT---ATAACTCTAG-----CACCATCTCAC--TGGAGA--CTATTTAATAC------AC--------AT------------A-GTTAACA--------CA-T--GGCCTC-GATAAATGACA---GGCATATTTT-----ATATAACGAGATAGATCGAA---AGTT-A-A-CGCAGTAGCCGTATTTA---AA--------------------CAATACAATT--AAT------T-----TCCTA-A----TTCA-AG-T--TAA-TTTTTACT-GA--T----A-----AA--TAG------TAA-ATC-AAA-T-CACACGAG--GTAAAA
gi|128446                     :                                                                                                                                                                                                                            attccatggatcattttataaaaaatagtaCGAATAGATAT--CAA--TAA-G--------TTG--------GAGCTTTG---GC-GAAT-TATTTATGACCTTGATTTAACTGTTAC--GAAAACAATAT-GGA----AGATGA-CGTGTCATAAGATAAGTG---CGTAAT----GTCAAAAGGTCAGAATAGCGAGGTCG-T---GA--------TCAG---CGTCAATTCCCTCGT------TA-----A-A---AATACTGATT------CT----------TCG----TA--AT------A---TA---------ACAAAC--CAATA------C--TAGAAAT---------ATAT----T--T---TT---TATTT--ATGC--A----CA---TT------TATTTTCTT------TCAAA-------A-AT------TA-CT--T--TTTTGA--A-AAA------GATG--GA-AAA-ATACGTCACGCTGACGTA----AAATATGTCGTCTACTATTGCAACTGACATA--------TCC--TTC-AGGGA---AACGGT---CTATTTATAG-----C
gi|128447                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                 --------TTT--------GTGTT------AC-AAGT-T-TT-GTTAT--------AA-TACTATATGCAAACAGCA-----TTAGAGT-GGATGTGTC-----A-ATGCTTACCGGTATTGTCA---AAAGGCGTGAACA-------GG-TTATGACCACAGGTT-ATGACCACAAATTCACTTGC------TA-----A-A---CATAACATTT------AT----------AAATTCCTAG-AT------A---GA---------A---AT--A---A------G--TAAAAAC---GAA---ACAG----TAGT---TT---a
gi|128448                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                 --------TTT--------GTGTT------AC-CAGT-T-TTGATTA---------AA-T-TTAT--GAAAATAGCA-----TTGGAGA-GAACATGTC----AC-A--CGT--TGA-AT----G---CTTATTGCCAACA-------AA-TT---------------------TAAATTCACTCG-------TT-----A-A---AAAACTAATTCCTCGAAA----------AAA----TAGTAT------GAGGTA-------------AT--C--TAATAAATC--TAGAAATCT-GTATC-GTAT----T-TC---TT---CGC----AAAC--A----TAATCTT------TCC-----T------T-----------T-ATGA-A--TC-AT--TAACTTGAT--ATAGT------GCTG--GAAAAA-ACCCATCAAGCTGGCGAA----AAATATGTCGTCTGCTATTGTATTTGACATA--------TTTGTTTTTAA-AA---AACGGT---CTATTT-TA------------CT----GTGATGA--ACATGAAATAC------AT--------AC-----------GA-GTAAGTA--------CG-C--TACCACTAAT-ATTGACA---TGCATATAAT-----ATGTAATAAAATAAACAGAA---TATT-A-A-TACAGTT---TTTTTTACTTAAC-TTAA-TA------------AATGCAC-T--AAT------T-----TTATT-T----TTC--AG-TAATAA---TGAATT-GA--T----A-----AACTTAT------TGG-ATA-A
gi|128449                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AGTGT-TTTGTCAA--------AC-TGTTAT--GAAAACA---CAA-ATTGGAGA-GGACGTATC----AC-AAGT---------T----G---AA-GATGTACGTA-------GG-TC--GA--------G-ACAAACGCAAATTCACTC-A------TC-----AGA---AATATGTATT------CT----------TCG----TCG-AC------A--------------------------A------A--CAGAAA--T-GAAGTTATAA----TAAT---CC---AAT----AGGC-------TAC--TT------T-------T------T-----------A-ATGAAA--TA-CT--T--TC
gi|128449                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TAAA--C-AAA------GCTG--AAAAAA-ATACGTCACGCTGACGTA----GAATTGGTCGTTTACTGTTGTAATGGACAT----------------CTAGGTA---A-CGGT---CTATTTTAAG-----CGCT-TTCCACAGCGATCA--AAATAACATAT------AC--------GC-----------GA-G-AAACA--------CA-C--TACCTCTGAT-AATGACA---CGCATTGTTT-----ATGTAATCAAACGGTTGGAA---TATT-A-A-AACAGATACCGTATTTT---AAC-TT-------------AATCAGTGCACTA--AATTAAAGAT-----TTCAA-A----TTTA-AATT--TAACTTTCGATA-CATCT----A-----AA--TGA------TAA-ATG-AGC-A-CACgagtagtttttttttaaaaagagaataagcgtgcgaataaatacaatgcagatttaaacaaagctgaaaaaaatacgtcacgctgacgtagaattggtcgtttactgttgtaatggacatctaggtaacggtctattttaagcgctttccacagcgatcaaaataacatatacgcgagaaacacactacctctgataatgacacgcattgtttatgtaatcaaacggttggaatattaaaacagataccgtattttaacttaatcagtgcactaaattaaagatttcaaatttaaatttaactttcgatacatctaaatgataaatgagcacac
gi|128450                     :                                                                                                                                agtgttttgtcaaactgttatgaaaacacaaattggagaggacgtatcacaagttgaagatgtacgtaggtcgagacaaacgcaaattcactcatcagaaatatgtattcttcgtcgacaaacagaaatgaagttataataatccaataggctactttttaatgaaatactttcgagtagtttttttttaaaaagagaataagcgtgcgaataaatacaatgcagattTATAGA-GG-CGTGTC----AA-AACCAT--CGTGAT----G---AAAGGTGTGAATA-------CG-TT--GA--------T-AT---CATAAATTCACTGGA------TA-----A-A---AATAAAAATT------AT----------AAG----TAG-AT------A---TA---------T---AT--C--TA------T--TAGAAAACT-AAA---ATAT----TGTT---TT---TAT----AAGC--G----TA---TT------T-------T------T-------------AT---A--AA-CT--T--CCTGAA--A-AGA------GCTG--ATAAAA-ATATGTCACGCTGGTGTG----AAATATGGCGTTTACTCTAGAAATCGACATA--------TGC--GTTAAAGAA---AATGG
gi|128451                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ----G---AAAGGTGTTATTA-------GG-TC---A--------TGAC---TGCAAATTGACTT--------TTCCACAA-A---AGTA---ATT------ATTTGTAGATAGAAG----TAA-ATGAAAACA---TAATGCTTTTTT---AT--T--TA------TACTAGAAATTT-G------TATCCTATATT---TT---TGT----ATGCATG----TC---TT------T-------T------TTTATTTAAAAAA-AT---ACCTA-CTGGTA-CTTGAA--AGAGA------GCCG--GA-AAA-ATAAGCAACGCTGGTGTT----AAATGTGT-------TATTG------ACATG--------TTC--TTCTAGGAA---A-TGGC---CTATTTTTAG-----CACC-TTTTACAGTGATGA--AAATGTAATAC------AC--------AC-----------CA-GTTAATA--------C
gi|128452                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ---AAACATGTGAATAGTTCA--CGGCT--GG--------T-A-----G-AAATTCTCTTGAAACAAATT-----A-ATACAATATGCATT------GT------------G----TAG-TTTAA---A---TA---------T---A---A--TA------C--TAGATATCT-GTATC-ACAT----TTAT---TTGCATGC----ATGT--T----TG---TT------T-------T------TTAAC-------A-ATC--A--T--CT--T--CTTAAA--AGAGA------GCTG----GAAACATATGTTACACTGG-GTATAAAAAATGTGTCGTCTTCTATTGCAGTTTACATA--------TTC--TTCTGGGAACCAGACTATTTACTATTTTCAG-----TGCC-TCTCACAGTGACGA--AAATGTAAAAC------ACATGTATATGCACATATAATCTGACATTGACA--------TA-CATGACCTCTGAC-ATTGACATATTACATGGTTT-----ATATAATTCAATAAATGGAA---GATT-ACA-TACAGT
gi|128453                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      --TA------C--TAGAAATCT-GTATC-ATAT----TTAT---TC----AC----ATGC--A----TA---TT------T-------TCTCCTTT-----------AGAA---A--TAGCT--A--CCTGAACTA-ATG------CTTG--A--AAA-ATACGTCATGCTGACATA----AAATGTGTCGTCTTCTATTGTAAATGACATA--------TTC--TTCTAGGAA---A-CTGT---CTATT-------------------ACAGTGATGA--AAATAAAAAGC------AT--------GC-----------GA-GTAAACA--------CA-C--AACCTCTGAA-ATTGATT---CAAATATTTT-----A-GAAATGAAACAGATGGAA---TATT-A-A-TGCAGTTACCGGATTTT---AAC-ATAA-T
gi|128454                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      --TA------C--TAGAAATCT-G------TAT----TGTG---TT---TAT----TTGCATG----CA---TT------T-------T------T-----------A------------TT--T--CTTTTA--A-AAATTACCTACTT--GAGAGA-GTGCTTGATGTT-----A----AAATGT--TGTCTGTTATTGTAATTGGTATA--------CTC--TTCTAG-AA---AATGGT---CTATTTTTAG-----CACT-TTTCACAGTGATGA--AAATGAAATACCGGTACAC--------AT-----------GA-GTTAACA--------CA-C--GACCTCTCAT-ATTGACA---CGCATATTTT-----ATGTAATAAAACAGATGGAA---TCCA-G-A-TACAGTTACTGTATTT----AAC-TTAAGCAATGCACTCAATCAA-AAACTTTAAAT------T-------CTA-A----TT-A-------TAT-TTTTCAAT-AA--TAGCAA-----AA--TAGATACATTAA-ATAGAAA-A-CA
gi|128455                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      --TA------C--TAGAAATCTTGA-------T----TGTA---TT---TAT----TTGC--GCTCATA---TT------TCCTCTC-T------T-----------A-AA---AA-CAGCT--G--TTTGAA--A-CAAT-----GCTG--GAGAAATATACATCACGTTGACGTA----AAATGGGTCATCTACTATTGTAATTGACGCA--------TTC--TCCTAG-AA---AATGGA---CTGTTTTTAG-----GGCT-TTCCACA-----------------TAC------AT--------G------------GA-GTAAACA--------CA-G--GACCTCTGAT-AGTGACA---CGCATATTTT-----AAGTCATGAAACAGATGGAA---TATT-A-A---TAGTTACCATATTTT---AAC---------CA-----AATCAGTGCACTA--AAT------
gi|128456                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aa-GAA---ATAT------GT---AT---CAT----A----------TA---TT------T-------T------TTTGTTTAAAA-A-AT------TA-CC--T--ACTTGA--A-AGA------A-TGTTACAAGA-ATATGTCAGGCTGGTGTA----AAATGTGTCGTCAGCTGTTGTAATTGACATA--------TAC--TTCTAGGAA---A-TGAT---CTATTTTGAG-----CACT-TTCCACAGTGATGA--ACGTGAGATAC------AC--------TC-----------GA-GTAAACA--------CA-T--GTCCTATGCT-ATTGACA---GGCATATTTC-----ATGTGATGAAACAGATGGAG---TATT--------------TGTATTTA---AAC-TT-------------AATCAGTACAC-T--A------------------A-A----TTAA-AG----AAA-TATATATT-TT--T----C-----AA--TAA------T-A-ACA-AAATA-CACACAA----TAAA
gi|128457                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -CT--A--CTTGAA--A-CAAT-----GCTG--GA-AAA-ATACGTCACGCTAACGTA----AAATTGGTCGACTACTATTGAAATTGACATGATAAATTCTTC--TTCTAGG-A---CACAGT---CTATTTCTAG-----CGCT-TTTCACATTGATGA--AGCTAAAATAC------AA--------AC-----------AA-GTA---------------------CTCTGAT-ATTGACA---CGCATATTTT-----ATGTAATGAAA------GAA------T-A-A-TACATTTACTGTATTTA---AAC-TT-------------AATCAGTACACTA--AATCAAGGAT-----TTCAA-A----TTTATAT-T--TAACTTTCAACT-GA--T----CT----AA--TAGC-----TAA-AT
gi|128458                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AAA-ATATGTCACGGTAGTACA----CAATGTGCTGTCAACTATTGTAATTGACATA--------TTC--TTTTAAG-----AACAGT---CTATTTTTAT-----CACT-T---------------ACATGTAAAAC------AC--------GC-----------------AATA--------TA--------TCTGAT-TTTGACA---GGTATATTTT-----ATGTAATAAAACGGATGGAATTGTATT-A-----CAGTCACAGTACTTT---AACATTAA-----A-----AATCAGTGCACTA--AAG------T--------CA-A-----GGA-AG-T--TAC-TTTTTTTTCAA--T----A-----AA---AG------CAA-A-A-TAA-C-CACACTAA--ATAAAA
gi|128459                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATGCTGACGTA----AAATGTGTTGTCCACTATTATAATTGACATA--------CTC--TTCTAGG-A---AACGGT---CTATTT-TAG-----TTCT-TTTGACAGTGATGA--AAATGAAATAT------AC--------TT-----------GA-GTAACCATAGGGGACCA-CAGGACCTCTGAT-ACTGAAA---CCCATATTTTG----AT---ATGAAATGGATGGAA---TATT-T-A-AACAGTTACCATATTTT---AAC-TT-------------AATCAGTGCACTA--AAT------TAAAGATTTTATA----TTTA-AATT--TAA-CTTTTATTGGA--T----CT----GA--TAG------CAA-AT
gi|128460                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GAA---AACGGT---CTATATTTAG-----TGCT-TTCCACATTGATGA--AAATAAAATGC------AT--------GT-----------GA-GTAAACA--------CA-C--AACTTCTGAT-ATT--TA---CGCATATTTT-----ATGTAATGAAACGGAT-GAA---AATT-A-A-TATA-TTACTGTATTTT---AGC-TTGA-
gi|128461                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              a-TTTCACAGTGATAA--ATATAAAATAC------AC--------AC-----------GA-GTAATCA--------CA-C--AACCTGGGAT-ATTAACA---TGAATATTTT-----ATGTAATGAAACTGATGGAA---CATT-A-A-TACAGCTACCATATTTT---AAC-TT-------------AATCAGTGCGCTT--AAT------T-----
gi|128462                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CACTGGTGA--AAATTTGATAC------AC--------AT-----------GG-GTTAACA--------C-----GACCTCTGAC-AATGACT---CG-ATACTTT-----ATGTAATGAAACAAATGGAA---GAAT-A-AATGCAGTAACCATATTTA---AAC-TTAA-T------------CAATGCACTA--AAT------T-----AAATA-T----TTAA-AT-T--TCA-TTTTTATT-GA--T----A-----AA--TAG------TAACACA-AAG-ACCACATGAGACATAAAA
gi|128463                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AACA--------TAAT--GTCCTTTAGC-AATGACA---CGCATGCTTTTATTAATGTAATGAAGCAGGTGAGA---GACT-A-AACGCAGTGACCGTATTTA---AACGTTGA-TAA





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                          22     11111111   11111111     111111                                                              1                                                11111111        222222222222222                                                    1111111111             111111      1111111111111                             11111                               1111111              333333333333333333333333333333333333                       111111    11111                                                                                                              1      11                           2222222222222222222222                                 1                                                                                   3333333333333                  11111111111111                                      1111111111                                           
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                        4        44  3 1  00   3 66666666   00000000     333333  2    2 2  00    99999999  2      33 0     2  55          5  2      66666 2    7777  33  5555 444             33333333 2  33  222222222222222              8888888  66666 5 444          777777  1111111111   5555   2  222222 444  7777777777777  33333  999999999      3  2 77777    4444 444444  333   7777 3  1111111  555  666666 333333333333333333333333333333333333  4  22 77      22 6   111111    11111   3   1          2   3333       1          0 2   1      66666666 1 333  3     333 3    333      5   6666666  2 1    44   1  22 1  33     555555  3333333333333333333333 1  2    66666666  9999      7   2 1     4444         66666            2   2   5555   7 1 777    1         7777   3  9999999999999             22   99999999999999   2 5555  3 2  7 33   4   1    5  33 2222222222  33   999999   2   2   3 3        55      
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                        .        ..  . .  ..   . ........   ........     ......  .    . .  ..    ........  .      .. .     .  ..          .  .      ..... .    ....  ..  .... ...             ........ .  ..  ...............              .......  ..... . ...          ......  ..........   ....   .  ...... ...  .............  .....  .........      .  . .....    .... ......  ...   .... .  .......  ...  ...... ....................................  .  .. ..      .. .   ......    .....   .   .          .   ....       .          . .   .      ........ . ...  .     ... .    ...      .   .......  . .    ..   .  .. .  ..     ......  ...................... .  .    ........  ....      .   . .     ....         .....            .   .   ....   . . ...    .         ....   .  .............             ..   ..............   . ....  . .  . ..   .   .    .  .. ..........  ..   ......   .   .   . .        ..      
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                        0        00  6 4  00   3 44444444   44444444     222222  9    7 7  88    77777777  7      77 5     6  11          0  5      00000 5    5555  22  3333 111             88888888 4  22  222222222222222              9999999  22222 0 444          777777  7777777777   7777   7  333333 777  4444444444444  99999  777777777      1  0 11111    2222 444444  555   4444 8  1111111  888  111111 999999999999999999999999999999999999  0  88 55      88 0   222222    33333   6   3          5   9999       5          5 8   0      66666666 7 333  4     000 8    222      6   3333333  7 4    33   7  44 6  22     000000  0000000000000000000000 7  8    00000000  6666      0   2 0     9999         11111            6   7   7777   0 7 222    6         0000   6  2222222222222             99   55555555555555   4 0000  1 4  1 22   7   0    0  44 1111111111  44   777777   5   9   1 1        00      
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                  GTAATT-TCGGATAGATATGTCAA--TTA-G--------TTT--------GTGTT------GC-GAGT-T-TTCGTTAC--------AA-TGCTGT--GTAAACAGCACAGGATTAGAGA-GG-CGTGTC----GA-AAGCGT--CGGGAT----G---AAAGGTGTGAATA-------CG-TT--GA--------T-AT---CGCAAATTCACTTGA------TT-----A-A---AATACAAATT------AT----------AAG----TAG-AT------A---TA---------T---AT--C--TA------T--TAGAAANCT-GAA---ATAT----TGNT---TT---TAT----ANGC--G----TA---TT------T-------T------T-----------A-AT---A--TA-CT--T--CCTGAA--A-AGA------GCTG--ANGAAA-ATACGTCACGCTGGCGTA----AAATGTGTCGTCTACTATTGNAATCGACATA--------TTC--TTCTAGGAA---AACGGT---CTATTTCTAG-----CGCC-TCTCACAGTGATGA--ANATNNAATAC------AC--------GC-----------GA-GTNAACA--------CA-C--GACCTCTGAT-ANTGACA---CGCATATTTT-----ATGTAATGAAACGGATGGAA---NATT-A-A-CGCAGTNACCGTATTTA---AAC-TTAA-TAATA-----AATCAGTACACTT--AAT------T-----TCCTA-A----TTCA-AG-T--TAA-TTTNTATT-GA--T----A-----AA--TAG------TAA-ATA-AAA-A-CACACGAG--GTAAAA
Reference ( family-658 )      :                                                                                                                                                                                                                                                  GTAATT-TCGGATAGATATGTCAA--TTA-G--------TTT--------GTGTT------GC-GAGT-T-TTCGTTAC--------AA-TGCTGT--GTAAACAGCACAGGATTAGAGA-GG-CGTGTC----GA-AAGCGT--CGGGAT----G---AAAGGTGTGAATA-------CG-TT--GA--------T-AT---CGCAAATTCACTTGA------TT-----A-A---AATACAAATT------AT----------AAG----TAG-AT------A---TA---------T---AT--C--TA------T--TAGAAANCT-GAA---ATAT----TGNT---TT---TAT----ANGC--G----TA---TT------T-------T------T-----------A-AT---A--TA-CT--T--CCTGAA--A-AGA------GCTG--ANGAAA-ATACGTCACGCTGGCGTA----AAATGTGTCGTCTACTATTGNAATCGACATA--------TTC--TTCTAGGAA---AACGGT---CTATTTCTAG-----CGCC-TCTCACAGTGATGA--ANATNNAATAC------AC--------GC-----------GA-GTNAACA--------CA-C--GACCTCTGAT-ANTGACA---CGCATATTTT-----ATGTAATGAAACGGATGGAA---NATT-A-A-CGCAGTNACCGTATTTA---AAC-TTAA-TAATA-----AATCAGTACACTT--AAT------T-----TCCTA-A----TTCA-AG-T--TAA-TTTNTATT-GA--T----A-----AA--TAG------TAA-ATA-AAA-A-CACACGAG--GTAAAA
gi|128435                     :                                                                                                                                                                                                                                                  GTGATT-TCGGATA---AT-------TTA-G--------TTT--------GTGTT------GC-GAGT-T-TTCCTTAC--------AA-TGCTGT--GTAAACAGCACAGGATTAGAGA-GG-CGTGTC----GA-AAGCGT--CGGGAT----G---AAAGGTGTGAATA-------CG-TT--GA--------T-AT---CGCAAATTCACTTGA------TT-----A-A---GATACAAATT------AT----------AAG----TAG-AT------A---TA---------T---AT--C--TA------T--TAGAAAACT-GAA---ATAT----TGAT---TT---TAT----AAGC--G----TA---TT------T-------T------T-----------A-AT---A--TA-CT--T--CCTGAA--A-AGA------GCTG--ATGAAT-ATATGTCACGCTGGTGTG----AAATATGGCGTTTACTATAGAAATCGACATA--------TAC--GTCAAAGAA---AATGGT---ATAACTCTAG-----CACCATCTCAC--TGGAGA--CTATTTAATAC------AC--------AT-----------CA-GTTAACA--------CA-T--GGCCTC-GATAAATGACA---GGCATATTTT-----ATGTAATGAGACAGATCGAA---GGTA-A-A-CGCAGTAACCGTATTTA---AAC-TTAA-TAATA-----GATTAATACACTT--AAT------T-----TCCTA-A----TTCA-AG-T--TAA-TTTGTATT-GA--T----A-----AA--TAG------TAA-ATA-AAA-A-CACAAGAG--GTAAAA
gi|128436                     :                                                                                                                                                                                                                                                  GTAATT-TCTGATAG-----T-----TTA-G--------TTT--------GTGTT------GC-GAGT-T-TTCGTTAC--------AA-TGCTGT--GTAAACAGCACAGGATTAGAGA-GG-CGTGTC----GA-AAGCGT--CGGTAT----G---AAAGGTGTGAATA-------CG-TT--GA--------T-AT---CGCAAATTCACTTGA------TT-----A-A---AAT-CAAATA------AT----------AAG----TAG-AT------A---TA---------T---AT--C--TA------T--TAGAAAACT-GAA---ATAT----TGTT---TT---TAT----AAGC--G----TA---TT------T-------T------T-----------A-AT---A--TA-CT--T--CCTGAA--A-AGA------GCTG--ATGAAA-ATATGTCACGCTGGTGTG----AAATATGGCGTTTACTATAGAAATCGACATA--------TGC--GTCAAAGAA---AATGGT---ATAACTCTAG-----CACCATCTTAC--TGGAGA--CTATTTAATAC------AC--------AT-----------CA-GTTAACA--------CA-T--GGCCTC-GATTAATGACA---GGCATATTTT-----ATGTAATGAGACAGATCGAT---GGTT-A-A-CGCAGTAGCCCTATTTA---AAC-TTAA-TAATA-----AATTAATACACTT--AAT------T-----TCCTA-A----TTCA-AG-T--TAA-TGTGTATT-GA--T----A-----AA--TAG------TAA-ATA-AAA-A-CACACGAG--GTAAAA
gi|128437                     :                                                                                                                                                                                                                                                  GTAATT-TCGGATACATATGTCAAAATTA-G--------TTT--------GTGTT------GC-GAGT-T-TTCGTTAC--------AA-TGCTGT--GTAAACATCACAGGATTAGAGA-GG-CGTGTC----GA-AAGCAT--CGGGAT----G---AAAGGTGTGAATA-------CG-TT--GA--------T-AT---CGCAAATTCATTTGA------TT-----A-A---TATACAAATT------AT----------AAG----TAG-AT------A---TA---------T---AT--C--TA------T--TAGAAAACT-GAA---ATAT----TGAT---TT---TAT----AAGC--G----TA---TT------T-------T------T-----------A-AT---A--TA-CT--T--CCTGAA--A-AGA------GCTG--ATGAAA-ATATGTCACGCTGGTGTG----AAATATAGCGTTTACTCTAGAAATCGACATA--------TGT--GTCAAAGAA---AATGGT---TTAACTCTAA-----CACCATCTCAC--TGAAGA--ATATTTAATA-----------------G-------------------------------A-T--GGCCTC-GATAAATGACA---GGCATATTTT-----ATGTAATGAGACAGATCGAA---GGTTAA-A-CGCAGTAGCCGTATTTA---AAT-TTAA-TAATA-----AATTAATACACTT--AAT------T-----TCCTA-A----TTCA-AG-T--TAA-TTTTTATT-AA--T----A-----AA--TAG------TAA-ATA-AAA-A-CACACGAG--GTAAAA
gi|128438                     :                                                                                                                                                                                                                                                  GTAATT-TCGGATAGATATGTCAAAATTA-G--------TTT--------GTGTT------GC-GAGT-T-TTCGTTAC--------AA-TGCTGT--GTAAACATCACAGGATTAGAGA-GG-CGTGTC----GA-AAGCAT--CGGGAT----G---AAAGGTGTGAATA-------CG-TT--GA--------T-AT---CGCAAATTCACTTGA------TT-----A-A---AATACAAATT------AT----------AAG----TAG-AT------A---TA---------T---AT--C--TA------T--TAGAAAACT-GAA---ATAT----TGAT---TT---TAT----AAGC--G----TA---TT------T-------T------T-----------A-AT---A--TA-CT--T--CCTGAA--A-AGA------ACTG--ATGAAA-ATATGTCACGCTGGTGAG----ATATATGGCGTTTACTCTAGAAAGCGACATA--------TGC--GTCAAAGAA---AATGGT---TTAACTCTAG-----CACCATCTCAC--TGGAGA--ATATTTAAT----------------------------------------A--------CA-T--GGCCTC-GATAAATGACA---GGCATATTTT-----ATGTAATGAGACAAATCGAA---GGTTAA-A-CGCAGTAGAAGTATATA---AAT-TTAA--AATA-----AATTAATACACTT--AAT------T-----TCCTA-A----TTCA-AG-T--TAA-TTTGTATT-GA--T----A-----AA--TAG------TAA-ATA-GAA-A-CACACGAG--GTGAAA
gi|128439                     :                                                                                                                                                                                                                                                  GTAATT-TCGAATAG-----T-----TTA-G--------TTT--------GTGTT------GT-GAGT-T-TTCTTTAC--------AA-TGCTGT--GTAAACAGCACAGGATTAGAGA-GG-CGTGTC----GA-AAGCAT--CGGGAT----G---AAATTTGTGAATA-------CG-TT--GA--------T-AT---CGCAAATTCACTTGA------TT-----A-A---AATACAAATT------AT----------AAG----TAG-AT------A---TA---------T---AT--T--TA------T--TGGAAAACC-GAA---ATAT----TGTG---TT---TA----------------TA---TT------T-------T------T-----------A-AT---A--TA-CT--T--CCTGAA--A-AAA------GCTG--ATGAAA-ATATGTCACGCTGGTGTG----AAATATGGCGTTTACTATAGAAATCGACATA--------TGT--GTCAAAGAA---AATGAT---TCAACTCTAG-----CACCATCTCAC--TGGAGA--ATATTTAAAAC------AC--------AT-----------CA-GTTAGTA--------CA-T--GGCCTC-GATAAATGACA---GGCATATTTT-----ATGTAATGAGACAGATCGAA---GTTTAA-A-CGCAGTAGCCGTATTTA---AAC-TTAA-TACTA-----AATAAATACACTT--AAT------T-----TCCTA-A----TTCA-AG-T--TAA-TTTGTATT-GA--T----A-----AA--TAG------AAA-ATA-AAA-A-CACACGAG--GTAAAA
gi|128440                     :                                                                                                                                                                                                                                                  GTAATC-TCGAATAGATATGTCAACATAA-G--------TTT--------GTGTT------GC-GAGT-T-TTCGTTAC--------AA-TGCTGT--GTAAACAGCACAGGATTATAAA-GG-CGTGTC----AA-AACCAT--CGAGAT----G---AAAGGTTTGAATA-------CG-TT--GAGA------T-AT---CGCAAATTAACTTGA------TT-----A-A---AATACAAATT------AT----------AAG----TAG-AT------A---TA---------T---ATATC--TA------T--TA-AAAACT-GAA---ATAT----TGTT---TG---TAT----AAGC--G----TA---GT------T-------T------T-----------A-AT---A--TA-CT--T--CCTGAA--A-AGT------GCTG--ATGAAA-ATATGTCACGCTGGTGTG----AAATATGGCGTCTACTCTAGAAATCGACATA--------TTC--GTCAAAGAA---AATGGT---TTAACTCTAG-----CACCATCTCAC--TGGAGA--ATATTTAATAC------AC--------AT-----------CA-GTTAACA--------TA-T--AGCCTC-GGTAAATGACA---GGCATATTTT-----ATGTAATGAGACAGATCGAA---GGTTAA-A-CGCATTAGCCGTATTTA---AAT-TTAA-TAATA-----AATTAATACACTT--AAT------T-----ACCAA-A----TTAA-AG-T--TAA-TTTGTATT-GA--T----A-----AA--TAG------TGA-ATA-AAA-A-CACACCAG--CTAAAA
gi|128441                     :                                                                                                                                                                                                                                                  GTAATT-TCGGATAGATATGTCAACATAA-G--------AAT--------GTGTT------GC-GAGT-T-TTCGTTAC--------AA-TGCTGT--GTAAACAACACAGGCTTAGAG------GTGTC----AA-
gi|128442                     :                                                                                                                                                                                                                                                  GTCATT-TTGGGTAGATGTGTCAA--TTA-GCCGACAGTTTT--------GTCTT------GC-GACG-T-TTCATTAC--------AA-TAC-------AAACATCACATGATAAGAGA-GAACATGCC----CA-AAGCAT--AGTGTT----G---ATACACGTGAATA-------GG-TT--AA--------T-AT---CGTAAATTCACTTGA------TT-----A-A---AACACAAAAT------AT----------TAG-----AA-AT------A---TA---------A---AT--C--TA------A--TAGAGAGCT-G-----ATTT----TTTTCCCTT---TAT----ATGC--A----TA--------------------------T-----------A-AT------------------TAAA--G-AGA------GCTG--AGGAAA-ATATGTCACGCCG
gi|128443                     :                                                                                                                                                                                                                                                  GTAATTGTTGGG-AGAGATGTCAA--TTA-G--------TCTGTGCTTTAGTGTT------AT-GAGT-T-TTGATCAA--------AC-TGTTAT--GAAAACAACA----ATTGGAGA-GGATGTGTC----AC-AAG----------T----T---AAAGTTGTTAATA-------GA-TT--GAGAC-----C-AG---CACAAATTCACTTG-------TT-----AGA---AATAat
gi|128443                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AGAAATCT-G------CGT----TGTA---TT---TATTCGTATGC--A----TA---TTCTCTCTT-------T------T-----------A-AA---A--TT-TT--TTACTTGAA--A-CAAT-----GCTG--GA-AAA-ATATGTCACGCTGTGGTA----AAATGTGTTGTCTACTATTGTAATTGACATA--------TTC--TTCCAGGAA---A-CGGT---ATATTTTTATATAATTTTT-TTTTATA-TAATCATTAAATAAAATAA------AC--------AC-----------AA-GTCAACA--------CA-T--GACCTGTGAT-ATTAACA---CGCATATTTT-----ATGTAATGAAATGGATTGAA---TATT-G-A-TACAGTTACTGTATTTT---AAC-T-------TA-----AATCAGTACACTT--AAT------T-----AAACA-T----TTCA-AATT--TAA-TTTtttatttctccttgagaaaaagaaataaaaacttaatagtaataggctactctttaattaaatacaagaaatctgcgttgtatttattcgtatgcatattctctcttttaaaattttttacttgaaacaatgctggaaaaatatgtcacgctgtggtaaaatgtgttgtctactattgtaattgacatattcttccaggaaacggtatatttttatataatttttttttatataatcattaaataaaataaacacaagtcaacacatgacctgtgatattaacacgcatattttatgtaatgaaatggattgaatattgatacagttactgtattttaacttaaatcagtacacttaattaaacatttcaaatttaattt
gi|128444                     :                            gtaattgttgggagagatgtcaattagtctgtgctttagtgttatgagttttgatcaaactgttatgaaaacaacaattggagaggatgtgtcacaagttaaagttgttaatagattgagaccagcacaaattcacttgttagaaatatttatttctccttgagaaaaagaaataaaaacttaatagtaataggctactctttaattaaatacaGTAATC-ATGGGTAGAGATGTCAG--TTATGCACC----TTG--------GTGTT------AC-GAGA-G-TTGATCAA--------AC-TGTTAT--GTAATCAACA----ATTGGAGATGA-CATGTT----GC-AAGT-T-----GAT----G-------GTGTAAATA-------GG-TT--GA--------G-ACAAATGCATATTCACT
gi|128444                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ------GCTG--GA-AAA-ATATGTGATGCTGAC--A----AAATGTGTCATCTACTGATGTAAGTGACATA--------TTC--TTCTAGGAA---A-TAGT---CTATTT-TAA------GCT-TTTCACAGTGATGA--AAATAAAATAC------AC--------GT-----------CG-GTAAACA--------CA-T--GATCTCTGAT-ACTGACA---CGCATGTTTT-----ATATAATGAAACGGATGGAA---TATT-A-A-TACAGTTACCATATT---------TTA---AATG-----AATCAGTACACTT--AAT---------------TA-AAGATTTAA-AG-T--TTA-CTTTT-TC-AA--T----AGATCTAA--TAG------CAA-AT--TGA-G-CACACTAA--ATAGAAcattcactcattagaaatatttatttctcatcgacaaaaagaaacaaaaataggctacttttcaattaaataattaatctgtatggtactcattcacacacattttctctttttacaataactaattaagataatgctggaaaaatatgtgatgctgacaaaatgtgtcatctactgatgtaagtgacatattcttctaggaaatagtctattttaagcttttcacagtgatgaaaataaaatacacgtcggtaaacacatgatctctgatactgacacgcatgttttatataatgaaacggatggaatattaatacagttaccatattttaaatgaatcagtacacttaattaaagatttaaagtttactttttcaatagatctaatagcaaattgagcacactaaatagaa
gi|128445                     : gtaatcatgggtagagatgtcagttatgcaccttggtgttacgagagttgatcaaactgttatgtaatcaacaattggagatgacatgttgcaagttgatggtgtaaataggttgagacaaatgcatattcactcattcactcattagaaatatttatttctcatcgacaaaaagaaacaaaaataggctacttttcaattaaataattaatctgtatggtactcattcacacacattttctctttttacaataactaattaagataatA-G--------TTT--------GTGTTTAATACGCCGAGT-T-TTCCTTAC--------AA-TGCTGT--GTAAACAGCACAGGATTAGAGA-GG-CGTGTC----GA-AAGCGT--CGGGAT----G---AAAGGTGTGAATA-------CG-TT--AA--------T-AT---CGCAAATTCACTTGA------TT-----A-A---AATACAAATT------AT----------AAG----TAG-AT------A---TA---------C---AT--C--TA------T--TAGAAAACT-GAA---ATAT----TGGT---TT---TAT----AAGC--G----TA---TT------T-------T------T-----------A-AT---A--TA-CT--T--CCTGAA--A-AGA------GCTG--ATGAAT-ATATGTCACGCTGGTGTG----AAATATGGCGTTTACTATAGAAATCGACATA--------TGC--GTCAAAGAA---AATGGT---ATAACTCTAG-----CACCATCTCAC--TGGAGA--CTATTTAATAC------AC--------AT------------A-GTTAACA--------CA-T--GGCCTC-GATAAATGACA---GGCATATTTT-----ATATAACGAGATAGATCGAA---AGTT-A-A-CGCAGTAGCCGTATTTA---AA--------------------CAATACAATT--AAT------T-----TCCTA-A----TTCA-AG-T--TAA-TTTTTACT-GA--T----A-----AA--TAG------TAA-ATC-AAA-T-CACACGAG--GTAAAA
gi|128446                     :                                                                                                                                                                                                                            attccatggatcattttataaaaaatagtaCGAATAGATAT--CAA--TAA-G--------TTG--------GAGCTTTG---GC-GAAT-TATTTATGACCTTGATTTAACTGTTAC--GAAAACAATAT-GGA----AGATGA-CGTGTCATAAGATAAGTG---CGTAAT----GTCAAAAGGTCAGAATAGCGAGGTCG-T---GA--------TCAG---CGTCAATTCCCTCGT------TA-----A-A---AATACTGATT------CT----------TCG----TA--AT------A---TA---------ACAAAC--CAATA------C--TAGAAAT---------ATAT----T--T---TT---TATTT--ATGC--A----CA---TT------TATTTTCTT------TCAAA-------A-AT------TA-CT--T--TTTTGA--A-AAA------GATG--GA-AAA-ATACGTCACGCTGACGTA----AAATATGTCGTCTACTATTGCAACTGACATA--------TCC--TTC-AGGGA---AACGGT---CTATTTATAG-----C
gi|128447                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                 --------TTT--------GTGTT------AC-AAGT-T-TT-GTTAT--------AA-TACTATATGCAAACAGCA-----TTAGAGT-GGATGTGTC-----A-ATGCTTACCGGTATTGTCA---AAAGGCGTGAACA-------GG-TTATGACCACAGGTT-ATGACCACAAATTCACTTGC------TA-----A-A---CATAACATTT------AT----------AAATTCCTAG-AT------A---GA---------A---AT--A---A------G--TAAAAAC---GAA---ACAG----TAGT---TT---a
gi|128448                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                 --------TTT--------GTGTT------AC-CAGT-T-TTGATTA---------AA-T-TTAT--GAAAATAGCA-----TTGGAGA-GAACATGTC----AC-A--CGT--TGA-AT----G---CTTATTGCCAACA-------AA-TT---------------------TAAATTCACTCG-------TT-----A-A---AAAACTAATTCCTCGAAA----------AAA----TAGTAT------GAGGTA-------------AT--C--TAATAAATC--TAGAAATCT-GTATC-GTAT----T-TC---TT---CGC----AAAC--A----TAATCTT------TCC-----T------T-----------T-ATGA-A--TC-AT--TAACTTGAT--ATAGT------GCTG--GAAAAA-ACCCATCAAGCTGGCGAA----AAATATGTCGTCTGCTATTGTATTTGACATA--------TTTGTTTTTAA-AA---AACGGT---CTATTT-TA------------CT----GTGATGA--ACATGAAATAC------AT--------AC-----------GA-GTAAGTA--------CG-C--TACCACTAAT-ATTGACA---TGCATATAAT-----ATGTAATAAAATAAACAGAA---TATT-A-A-TACAGTT---TTTTTTACTTAAC-TTAA-TA------------AATGCAC-T--AAT------T-----TTATT-T----TTC--AG-TAATAA---TGAATT-GA--T----A-----AACTTAT------TGG-ATA-A
gi|128449                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AGTGT-TTTGTCAA--------AC-TGTTAT--GAAAACA---CAA-ATTGGAGA-GGACGTATC----AC-AAGT---------T----G---AA-GATGTACGTA-------GG-TC--GA--------G-ACAAACGCAAATTCACTC-A------TC-----AGA---AATATGTATT------CT----------TCG----TCG-AC------A--------------------------A------A--CAGAAA--T-GAAGTTATAA----TAAT---CC---AAT----AGGC-------TAC--TT------T-------T------T-----------A-ATGAAA--TA-CT--T--TC
gi|128449                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TAAA--C-AAA------GCTG--AAAAAA-ATACGTCACGCTGACGTA----GAATTGGTCGTTTACTGTTGTAATGGACAT----------------CTAGGTA---A-CGGT---CTATTTTAAG-----CGCT-TTCCACAGCGATCA--AAATAACATAT------AC--------GC-----------GA-G-AAACA--------CA-C--TACCTCTGAT-AATGACA---CGCATTGTTT-----ATGTAATCAAACGGTTGGAA---TATT-A-A-AACAGATACCGTATTTT---AAC-TT-------------AATCAGTGCACTA--AATTAAAGAT-----TTCAA-A----TTTA-AATT--TAACTTTCGATA-CATCT----A-----AA--TGA------TAA-ATG-AGC-A-CACgagtagtttttttttaaaaagagaataagcgtgcgaataaatacaatgcagatttaaacaaagctgaaaaaaatacgtcacgctgacgtagaattggtcgtttactgttgtaatggacatctaggtaacggtctattttaagcgctttccacagcgatcaaaataacatatacgcgagaaacacactacctctgataatgacacgcattgtttatgtaatcaaacggttggaatattaaaacagataccgtattttaacttaatcagtgcactaaattaaagatttcaaatttaaatttaactttcgatacatctaaatgataaatgagcacac
gi|128450                     :                                                                                                                                agtgttttgtcaaactgttatgaaaacacaaattggagaggacgtatcacaagttgaagatgtacgtaggtcgagacaaacgcaaattcactcatcagaaatatgtattcttcgtcgacaaacagaaatgaagttataataatccaataggctactttttaatgaaatactttcgagtagtttttttttaaaaagagaataagcgtgcgaataaatacaatgcagattTATAGA-GG-CGTGTC----AA-AACCAT--CGTGAT----G---AAAGGTGTGAATA-------CG-TT--GA--------T-AT---CATAAATTCACTGGA------TA-----A-A---AATAAAAATT------AT----------AAG----TAG-AT------A---TA---------T---AT--C--TA------T--TAGAAAACT-AAA---ATAT----TGTT---TT---TAT----AAGC--G----TA---TT------T-------T------T-------------AT---A--AA-CT--T--CCTGAA--A-AGA------GCTG--ATAAAA-ATATGTCACGCTGGTGTG----AAATATGGCGTTTACTCTAGAAATCGACATA--------TGC--GTTAAAGAA---AATGG
gi|128451                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ----G---AAAGGTGTTATTA-------GG-TC---A--------TGAC---TGCAAATTGACTT--------TTCCACAA-A---AGTA---ATT------ATTTGTAGATAGAAG----TAA-ATGAAAACA---TAATGCTTTTTT---AT--T--TA------TACTAGAAATTT-G------TATCCTATATT---TT---TGT----ATGCATG----TC---TT------T-------T------TTTATTTAAAAAA-AT---ACCTA-CTGGTA-CTTGAA--AGAGA------GCCG--GA-AAA-ATAAGCAACGCTGGTGTT----AAATGTGT-------TATTG------ACATG--------TTC--TTCTAGGAA---A-TGGC---CTATTTTTAG-----CACC-TTTTACAGTGATGA--AAATGTAATAC------AC--------AC-----------CA-GTTAATA--------C
gi|128452                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ---AAACATGTGAATAGTTCA--CGGCT--GG--------T-A-----G-AAATTCTCTTGAAACAAATT-----A-ATACAATATGCATT------GT------------G----TAG-TTTAA---A---TA---------T---A---A--TA------C--TAGATATCT-GTATC-ACAT----TTAT---TTGCATGC----ATGT--T----TG---TT------T-------T------TTAAC-------A-ATC--A--T--CT--T--CTTAAA--AGAGA------GCTG----GAAACATATGTTACACTGG-GTATAAAAAATGTGTCGTCTTCTATTGCAGTTTACATA--------TTC--TTCTGGGAACCAGACTATTTACTATTTTCAG-----TGCC-TCTCACAGTGACGA--AAATGTAAAAC------ACATGTATATGCACATATAATCTGACATTGACA--------TA-CATGACCTCTGAC-ATTGACATATTACATGGTTT-----ATATAATTCAATAAATGGAA---GATT-ACA-TACAGT
gi|128453                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      --TA------C--TAGAAATCT-GTATC-ATAT----TTAT---TC----AC----ATGC--A----TA---TT------T-------TCTCCTTT-----------AGAA---A--TAGCT--A--CCTGAACTA-ATG------CTTG--A--AAA-ATACGTCATGCTGACATA----AAATGTGTCGTCTTCTATTGTAAATGACATA--------TTC--TTCTAGGAA---A-CTGT---CTATT-------------------ACAGTGATGA--AAATAAAAAGC------AT--------GC-----------GA-GTAAACA--------CA-C--AACCTCTGAA-ATTGATT---CAAATATTTT-----A-GAAATGAAACAGATGGAA---TATT-A-A-TGCAGTTACCGGATTTT---AAC-ATAA-T
gi|128454                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      --TA------C--TAGAAATCT-G------TAT----TGTG---TT---TAT----TTGCATG----CA---TT------T-------T------T-----------A------------TT--T--CTTTTA--A-AAATTACCTACTT--GAGAGA-GTGCTTGATGTT-----A----AAATGT--TGTCTGTTATTGTAATTGGTATA--------CTC--TTCTAG-AA---AATGGT---CTATTTTTAG-----CACT-TTTCACAGTGATGA--AAATGAAATACCGGTACAC--------AT-----------GA-GTTAACA--------CA-C--GACCTCTCAT-ATTGACA---CGCATATTTT-----ATGTAATAAAACAGATGGAA---TCCA-G-A-TACAGTTACTGTATTT----AAC-TTAAGCAATGCACTCAATCAA-AAACTTTAAAT------T-------CTA-A----TT-A-------TAT-TTTTCAAT-AA--TAGCAA-----AA--TAGATACATTAA-ATAGAAA-A-CA
gi|128455                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      --TA------C--TAGAAATCTTGA-------T----TGTA---TT---TAT----TTGC--GCTCATA---TT------TCCTCTC-T------T-----------A-AA---AA-CAGCT--G--TTTGAA--A-CAAT-----GCTG--GAGAAATATACATCACGTTGACGTA----AAATGGGTCATCTACTATTGTAATTGACGCA--------TTC--TCCTAG-AA---AATGGA---CTGTTTTTAG-----GGCT-TTCCACA-----------------TAC------AT--------G------------GA-GTAAACA--------CA-G--GACCTCTGAT-AGTGACA---CGCATATTTT-----AAGTCATGAAACAGATGGAA---TATT-A-A---TAGTTACCATATTTT---AAC---------CA-----AATCAGTGCACTA--AAT------
gi|128456                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aa-GAA---ATAT------GT---AT---CAT----A----------TA---TT------T-------T------TTTGTTTAAAA-A-AT------TA-CC--T--ACTTGA--A-AGA------A-TGTTACAAGA-ATATGTCAGGCTGGTGTA----AAATGTGTCGTCAGCTGTTGTAATTGACATA--------TAC--TTCTAGGAA---A-TGAT---CTATTTTGAG-----CACT-TTCCACAGTGATGA--ACGTGAGATAC------AC--------TC-----------GA-GTAAACA--------CA-T--GTCCTATGCT-ATTGACA---GGCATATTTC-----ATGTGATGAAACAGATGGAG---TATT--------------TGTATTTA---AAC-TT-------------AATCAGTACAC-T--A------------------A-A----TTAA-AG----AAA-TATATATT-TT--T----C-----AA--TAA------T-A-ACA-AAATA-CACACAA----TAAA
gi|128457                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -CT--A--CTTGAA--A-CAAT-----GCTG--GA-AAA-ATACGTCACGCTAACGTA----AAATTGGTCGACTACTATTGAAATTGACATGATAAATTCTTC--TTCTAGG-A---CACAGT---CTATTTCTAG-----CGCT-TTTCACATTGATGA--AGCTAAAATAC------AA--------AC-----------AA-GTA---------------------CTCTGAT-ATTGACA---CGCATATTTT-----ATGTAATGAAA------GAA------T-A-A-TACATTTACTGTATTTA---AAC-TT-------------AATCAGTACACTA--AATCAAGGAT-----TTCAA-A----TTTATAT-T--TAACTTTCAACT-GA--T----CT----AA--TAGC-----TAA-AT
gi|128458                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AAA-ATATGTCACGGTAGTACA----CAATGTGCTGTCAACTATTGTAATTGACATA--------TTC--TTTTAAG-----AACAGT---CTATTTTTAT-----CACT-T---------------ACATGTAAAAC------AC--------GC-----------------AATA--------TA--------TCTGAT-TTTGACA---GGTATATTTT-----ATGTAATAAAACGGATGGAATTGTATT-A-----CAGTCACAGTACTTT---AACATTAA-----A-----AATCAGTGCACTA--AAG------T--------CA-A-----GGA-AG-T--TAC-TTTTTTTTCAA--T----A-----AA---AG------CAA-A-A-TAA-C-CACACTAA--ATAAAA
gi|128459                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATGCTGACGTA----AAATGTGTTGTCCACTATTATAATTGACATA--------CTC--TTCTAGG-A---AACGGT---CTATTT-TAG-----TTCT-TTTGACAGTGATGA--AAATGAAATAT------AC--------TT-----------GA-GTAACCATAGGGGACCA-CAGGACCTCTGAT-ACTGAAA---CCCATATTTTG----AT---ATGAAATGGATGGAA---TATT-T-A-AACAGTTACCATATTTT---AAC-TT-------------AATCAGTGCACTA--AAT------TAAAGATTTTATA----TTTA-AATT--TAA-CTTTTATTGGA--T----CT----GA--TAG------CAA-AT
gi|128460                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GAA---AACGGT---CTATATTTAG-----TGCT-TTCCACATTGATGA--AAATAAAATGC------AT--------GT-----------GA-GTAAACA--------CA-C--AACTTCTGAT-ATT--TA---CGCATATTTT-----ATGTAATGAAACGGAT-GAA---AATT-A-A-TATA-TTACTGTATTTT---AGC-TTGA-
gi|128461                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              a-TTTCACAGTGATAA--ATATAAAATAC------AC--------AC-----------GA-GTAATCA--------CA-C--AACCTGGGAT-ATTAACA---TGAATATTTT-----ATGTAATGAAACTGATGGAA---CATT-A-A-TACAGCTACCATATTTT---AAC-TT-------------AATCAGTGCGCTT--AAT------T-----
gi|128462                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CACTGGTGA--AAATTTGATAC------AC--------AT-----------GG-GTTAACA--------C-----GACCTCTGAC-AATGACT---CG-ATACTTT-----ATGTAATGAAACAAATGGAA---GAAT-A-AATGCAGTAACCATATTTA---AAC-TTAA-T------------CAATGCACTA--AAT------T-----AAATA-T----TTAA-AT-T--TCA-TTTTTATT-GA--T----A-----AA--TAG------TAACACA-AAG-ACCACATGAGACATAAAA
gi|128463                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AACA--------TAAT--GTCCTTTAGC-AATGACA---CGCATGCTTTTATTAATGTAATGAAGCAGGTGAGA---GACT-A-AACGCAGTGACCGTATTTA---AACGTTGA-TAA


blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                        G        AT  G C  AA   T CCGACAGT   GTGCTTTA     TAATAC  C    G A        CTTGATTT  C      AT       G  CA          T  A      ATAAG T    TTAC  GT  TGTC TCA             GCGAGGTC G  AT  CCACAGGTTATGAC               AAACAAA  CCACA G TAC          CCTCGA  TTGTAGATAG   TTCC   T  GAAAAC AGG  ATGCTTTTTT     ATC    ATAAATC        A  T AAGTT    CCTA TTTCCC  GCA   TCGT A  GCTCA    ATC  CTCTCT TTTTATTTAAAAAAATACC                   G  GG TA      CT T   TTACCT    TTACA   C   T          T   TAAA       G            A   C      ATAAATTC G GTT  A     CCA A    TTA      C   ATAATTT  A C    AG   A  TT T  TT     CGGTAC  ATGTATATGCACATATAATCTG C  T    TAGGGGAC  CAT       T   T A     TATT         TATTA            A   C   TTGT   A C ATG    A         ACTT   A  AAGCAATGCACTC             TA   TAAAGATTT        T AGAT  C T  T AA   C   G    C  TC AGATCT      CT   ATACAT   C   G   T C        AC
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                        .        AT  G C  AA   . CACC       .            TTG     .    . .        .         .      .        T  CA          T  A      G     .    GT    GG  .    .               GTTCAC   .  .   GACCAG                       A        .     G .            .       .            .      .  TAA    .    ACAA           CAA    TAC            A  . TATC     .    GTT     .     TT   A  ATG      C    .      ATTTTCTTTCAAAAAT                      G  .  AA      .  G   T         ATG     T   T          T   .          G            A   C      .        G G    A     .   A    .        C   CA       A C    AG   A  .  T  TT     .       ATC                    .  T    .         CAG       T   A A     G            G                A   C   G      A . ACG    A         A      G  AATAATA                   .    CAAGGATTT        . .     C .  T .    C   T    G  .  AGCAA       .    C        .   .   . .        . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                        .        AT  G C  CA   . .          .            .       .    . .        .         .      .        T  CA          .  A      G     .    AT    GG  .    .               C        .  .   GACAAA                       A        .     . .            .       .            .      .  .      .    T              C      T              A  . TATC     .    GAT     .     .    A  ATG      .    .      TTTTGTTTAAAAAAT                       .  .  A       .  G   T         ATG     .   T          T   .          G            A   C      .        G G    A     .   A    .        C   CA       A C    AG   A  .  T  TT     .       ATC                    .  T    .         AT        T   A A     G            .                A   C   G      A . CG     A         A      .  AATAATA                   .    TAAAGATT         . .     C .  T .    .   G    .  .  CT          .    .        .   .   . .        . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                        .        AT  G C  CA   . .          .            .       .    . .        .         .      .        G  CA          .  A      G     .    AT    GG  .    .               C        .  .   GACAAA                       A        .     . .            .       .            .      .  .      .    T              C      T              A  . TATC     .    GAT     .     .    A  G        .    .      TCTCCTTTAGAAA                         .  .  .       .  .   T         ATG     .   T          T   .          G            A   C      .        G G    A     .   A    .        C   CA       A C    AG   A  .  T  TT     .       ATC                    .  C    .         T         T   A A     G            .                A   C   G      A . CG     A         A      .  AATACTA                   .    TTC              . .     C .  . .    .   G    .  .  CT          .    .        .   .   . .        . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                        .        AT  G C  .    . .          .            .       .    . .        .         .      .        G  CA          .  A      G     .    AT    AG  .    .               C        .  .   GATAT                        A        .     . .            .       .            .      .  .      .    T              C      T              A  . AA       .    GTG     .     .    T  G        .    .      CCTCTCTTAAAAA                         .  .  .       .  .   .         ATG     .   T          T   .          G            A   C      .        T G    A     .   A    .        C   CA       A C    AG   A  .  T  TT     .       ACA                    .  A    .         T         T   A A     G            .                A   C   G      . . CG     A         A      .  AATAATA                   .    TTC              . .     A .  . .    .   G    .  .  A           .    .        .   .   . .        . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                        .        AG  G C  .    . .          .            .       .    . .        .         .      .        A  CA          .  .      A     .    AT    TG  .    .               C        .  .   TCAG                         A        .     . .            .       .            .      .  .      .    T              T      T              G  . AA       .    GTT     .     .    T  G        .    .      TTTAACAATCA                           .  .  .       .  .   .         ATG     .   T          G   .          T            T   T      .        T G    C     .   A    .        T   CA       A T    AG   T  .  A  AA     .       GTC                    .  T    .         T         T   A T     G            .                G   T   G      . . CG     T         A      .  AAAATA                    .    TTC              . .     C .  . .    .   T    .  .  A           .    .        .   .   . .        . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                        .        AG  G C  .    . .          .            .       .    . .        .         .      .        T  CA          .  .      A     .    AT    GG  .    .               C        .  .   TGAC                         A        .     . .            .       .            .      .  .      .    T              C      T              T  . AA       .    GTA     .     .    A  G        .    .      CCTTTATGAA                            .  .  .       .  .   .         AGG     .   T          C   .          T            T   T      .        T T    T     .   A    .        C   CA       . T    AG   T  .  A  AA     .       ACG                    .  A    .         T         T   . C     C            .                G   G   T      . . CG     T         T      .  AAATG                     .    TTC              . .     A .  . .    .   T    .  .  A           .    .        .   .   . .        . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                        .        AT  . C  .    . .          .            .       .    . .        .         .      .        A  CA          .  .      C     .    GT    TA  .    .               G        .  .   TAT                          A        .     . .            .       .            .      .  .      .    A              C      A              A  . AA       .    GGT     .     .    T  A        .    .      TTAATGAAA                             .  .  .       .  .   .         ATG     .   T          T   .          G            A   C      .        G T    A     .   A    .        A   CG       . C    AT   A  .  T  TT     .       GCG                    .  A    .         T         T   . A     C            .                A   C   T      . . TA     A         A      .  AATA                      .    TAC              . .     C .  . .    .   G    .  .  A           .    .        .   .   . .        . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                        .        .   . .  .    . .          .            .       .    . .        .         .      .        A  CA          .  .      A     .    GT    GT  .    .               G        .  .   TAT                          T        .     . .            .       .            .      .  .      .    C              A      T              T  . AA       .    AGT     .     .    A  A        .    .      TTAATA                                .  .  .       .  .   .         GAA     .   T          C   .          T            C   T      .        C G    T     .   A    .        T   CA       . C    AG   T  .  C  GA     .       ACC                    .  T    .         T         T   . T     G            .                A   A   A      . . TA     T         T      .  AAA                       .    TAA              . .     C .  . .    .   C    .  .  A           .    .        .   .   . .        . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                 .   . .  .    . .          .            .       .    . .        .         .      .        G  T           .  .      G     .    AT    TG  .    .               G        .  .   TAT                          C        .     . .            .       .            .      .  .      .    A              C      C              C  . AA       .    AAT     .     .    G  G        .    .      TTAATA                                .  .  .       .  .   .         AAA     .   C          C   .          T            T   T      .        T T    T     .   A    .        T   TG       . T    AT   T  .  A  AA     .       GCG                    .  T    .         T         T   . A     T            .                G   G   T      . . CG     T         T      .  AAT                       .    TTC              . .     T .  . .    .   T    .  .  A           .    .        .   .   . .        . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                               . .          .            .       .    . .        .         .      .        A  .           .  .      G     .    T     G   .    .               C        .  .   TAT                          A        .     . .            .       .            .      .  .      .    T              C      G              T  . AA       .    GTT     .     .    A  A        .    .      TTAATA                                .  .  .       .  .   .         ATA     .   C          C   .          T            T   G      .        G G    A     .   A    .        T   CA       . T    AG   T  .  A  GT     .       ATG                    .  A    .         T         T   . T     C            .                A   G   T      . . TA     T         T      .  TA                        .    TTT              . .     A .  . .    .   A    .  .  A           .    .        .   .   . .          
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                 .          .            .       .    . .        .         .      .        G  .           .  .      A     .    G     A   .    .               G        .  .   TAT                          A        .     . .            .       .            .      .  .      .    T              T      A              A  . AA       .    ATT     .     .    T  A        .    .      TTAATA                                .  .  .       .  .   .         GAG     .   C          T   .          G            A   C      .        T T    T     .   A    .        T   GG       . C    AC   C  .  A  GT     .       TCG                    .  T    .         C         T   . T     C            .                A   G   G      . . AA     T         A      .  CA                        .    TAA              . .     T .  . .    .   C    .  .  A           .    .        .   .   . .          
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                 .          .            .       .    . .        .         .      .        G  .           .  .      A     .    .     .   .    .               A        .  .   TAT                          .        .     . .            .       .            .      .  .      .    .              A      T              T  . AA       .    TAT     .     .    T  G        .    .      TTAATA                                .  .  .       .  .   .         GAG     .   T          T   .          T            C   T      .        T T    T     .   A    .        T   CA       . T    A    T  .  A  AA     .       ACA                    .  A    .         C         T   . T     C            .                A   G   T      . . TA     T         A      .  .                         .    T                . .     G .  . .    .   T    .  .  C           .    .        .   .                
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      . .        .         .      .        .  .           .  .      A     .    .     .   .    .               G        .  .   TAT                          .        .     . .            .       .            .      .  .      .    .              .      C              T  . A        .    TAT     .     .    T  T        .    .      TTAAAA                                .  .  .       .  .   .         GA      .   A          C   .          T            T   T      .        T T    T     .   A    .        T   CG       . T    G    T  .  A  GA     .       TTG                    .  A    .         C         G   . G     C            .                A   G   T      . . TG     T         T      .  .                         .    T                . .     T .  . .    .   T    .  .  A           .    .        .                    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          .  .      .     .              .    .               C        .  .   TA                           .        .     . .                                                                             C              T  . .        .    GTG     .     .    T  A        .    .      TTAATA                                .  .  .       .  .   .         GA      .   T          C   .          T            T   T      .        T T    T     .   A    .        C   CA       . T    A    T  .  C  GA     .       GTG                    .  A    .         C         T   . T     G            .                A   G   T      . . TA     C         T      .  .                         .    .                . .     A .  . .    .   T    .  .  A           .    .        .                    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              .               G        .  .   .                                                                                                                           C              T  . .        .    GTA     .     .    T  .        .    .      TTATA                                 .  .  .       .  .   .         GA      .   C          T   .          T            T   T      .        T T    T     .   A    .        T   TT       . T    .    T  .  G  AA     .       ACG                    .  A    .         G         T   . T     C            .                G   G   T      . . TA     T         T      .  .                         .    .                . .     . .  . .    .                                                             
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          C              T  . .        .    TC      .     .    .  .        .    .      TAAT                                  .  .  .       .  .   .         GA      .   C          C   .          T            T   T      .        A T    T     .   .    .        T   TG       . T    .    T  .  C  GT     .       ATG                    .  A    .         T         .   . T     G            .                G   G   T      . . AA     T         T      .  .                         .                                                                                                       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         .  . .        .    GT      .     .    .  .        .    .      TTA                                   .  .  .       .  .   .         GA      .   C          T   .          T            A   T      .        T T    T     .   .    .        .   G        . T    .    T  .  A  GA     .       AT                     .  A    .         C         .   . C     C            .                G   G   A      . . TA     T         A      .  .                         .                                                                                                       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            . .        .    T       .                                                                        .  .  .       .  .   .         G       .   T          C   .          C            T   T      .        T T    T     .   .    .        .   .        . T    .    T  .  A  AA     .       GG                     .  T    .         C         .   . T     C            .                T   G   C      . . TA     A         A      .                                                                                                                                    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  .         A       .   C          .   .          T            T   T      .        T T    T     .   .    .        .   .        . .    .    T  .  T  AA     .       GC                     .  .    .         .         .   . T     T            .                A   G   G      . . .      G         .      .                                                                                                                                    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .   T          .   .          .            .   .      .        . .    .     .   .    .        .            . .    .    .  .  A  TT     .       G                      .  .    .         .         .   . A     C            .                A   .   G      . . .      .         .      .                                                                                                                                    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                .   .                                 .    .  .  .  .      .       .                      .  .    .         .         .   . A     C            .                .   .   .      . . .                                                                                                                                                            
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  .                                                                                                                                                                                                                                             


blockSeqCons                  :                                                                                                                                                                                                                                                                 AT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AG                                                                                                                                                                      AATA*********
originalCons                  :                                                                                                                                                                                                                                                  GTAATT-TCGGATAGATATGTCAA--TTA-G--------TTT--------GTGTT------GC-GAGT-T-TTCGTTAC--------AA-TGCTGT--GTAAACAGCACAGGATTAGAGA-GG-CGTGTC----GA-AAGCGT--CGGGAT----G---AAAGGTGTGAATA-------CG-TT--GA--------T-AT---CGCAAATTCACTTGA------TT-----A-A---AATACAAATT------AT----------AAG----TAG-AT------A---TA---------T---AT--C--TA------T--TAGAAANCT-GAA---ATAT----TGNT---TT---TAT----ANGC--G----TA---TT------T-------T------T-----------A-AT---A--TA-CT--T--CCTGAA--A-AGA------GCTG--ANGAAA-ATACGTCACGCTGGCGTA----AAATGTGTCGTCTACTATTGNAATCGACATA--------TTC--TTCTAGGAA---AACGGT---CTATTTCTAG-----CGCC-TCTCACAGTGATGA--ANATNNAATAC------AC--------GC-----------GA-GTNAACA--------CA-C--GACCTCTGAT-ANTGACA---CGCATATTTT-----ATGTAATGAAACGGATGGAA---NATT-A-A-CGCAGTNACCGTATTTA---AAC-TTAA-TAATA-----AATCAGTACACTT--AAT------T-----TCCTA-A----TTCA-AG-T--TAA-TTTNTATT-GA--T----A-----AA--TAG------TAA-ATA-AAA-A-CACACGAG--GTAAAA
finalCons                     :                                                                                                                                                                                                                                                  GTAATT-TCGGATAGATATGTCAA--TTA-G--------TTT--------GTGTT------GC-GAGT-T-TTCGTTAC--------AA-TGCTGT--GTAAACAGCACAGGATTAGAGA-GG-CGTGTC----GA-AAGCGT--CGGGAT----G---AAAGGTGTGAATA-------CG-TT--GA--------T-AT---CGCAAATTCACTTGA------TT-----A-A---AATACAAATT------AT----------AAG----TAG-AT------A---TA---------T---AT--C--TA------T--TAGAAANCT-GAA---ATAT----TGNT---TT---TAT----ANGC--G----TA---TT------T-------T------T-----------A-AT---A--TA-CT--T--CCTGAA--A-AGA------GCTG--ANGAAA-ATACGTCACGCTGGCGTA----AAATGTGTCGTCTACTATTGNAATCGACATA--------TTC--TTCTAGGAA---AACGGT---CTATTTCTAG-----CGCC-TCTCACAGTGATGA--ANATNNAATAC------AC--------GC-----------GA-GTNAACA--------CA-C--GACCTCTGAT-ANTGACA---CGCATATTTT-----ATGTAATGAAACGGATGGAA---NATT-A-A-CGCAGTNACCGTATTTA---AAC-TTAATA---------AATCAGTACACTT--AAT------T-----TCCTA-A----TTCA-AG-T--TAA-TTTNTATT-GA--T----A-----AA--TAG------TAA-ATA-AAA-A-CACACGAG--GTAAAA





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                          22     11111111   11111111     111111                                                              1                                                11111111        222222222222222                                                    1111111111             111111      1111111111111                             11111                               1111111              333333333333333333333333333333333333                       111111    11111                                                                                                              1      11                           2222222222222222222222                                                                                                                      22222222222222222                2222222222222222                                      1111111111                                           
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                        4        44  3 1  00   3 66666666   00000000     333333  2    2 2  00    99999999  2      33 0     2  55          5  2      66666 2    7777  33  5555 444             33333333 2  33  222222222222222              8888888  66666 5 444          777777  1111111111   5555   2  222222 444  7777777777777  33333  999999999      3  2 55555    4444 444444  333   7777 3  1111111  555  666666 555555555555555555555555555555555555  4  22 77      22 6   111111    11111   3   1          2   3333       1          0 2   1      66666666 1 333  3     333 5    333      5   6666666  2 1    44   1  22 1  33     555555  3333333333333333333333 1  2    66666666  9999      7  1 8 22     4444         66666            2   2   5555   5 1 888    1         8888   3 33333333333333333  2             7777777777777777 2 5555  0 2  7 33  2 4   1 2   5  33 2222222222  33   999999   2   2   3 3        55      
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                        .        ..  . .  ..   . ........   ........     ......  .    . .  ..    ........  .      .. .     .  ..          .  .      ..... .    ....  ..  .... ...             ........ .  ..  ...............              .......  ..... . ...          ......  ..........   ....   .  ...... ...  .............  .....  .........      .  . .....    .... ......  ...   .... .  .......  ...  ...... ....................................  .  .. ..      .. .   ......    .....   .   .          .   ....       .          . .   .      ........ . ...  .     ... .    ...      .   .......  . .    ..   .  .. .  ..     ......  ...................... .  .    ........  ....      .  . . ..     ....         .....            .   .   ....   . . ...    .         ....   . .................  .             ................ . ....  . .  . ..  . .   . .   .  .. ..........  ..   ......   .   .   . .        ..      
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                        0        00  6 4  00   3 44444444   44444444     222222  9    7 7  88    77777777  7      77 5     6  11          0  5      00000 5    5555  22  3333 111             88888888 4  22  222222222222222              9999999  22222 0 444          777777  7777777777   7777   7  333333 777  4444444444444  99999  777777777      1  0 99999    2222 444444  555   4444 8  1111111  888  111111 222222222222222222222222222222222222  0  88 55      88 0   222222    33333   6   3          5   9999       5          5 8   0      66666666 7 333  4     000 9    222      6   3333333  7 4    33   7  44 6  22     000000  0000000000000000000000 7  8    00000000  6666      0  7 7 77     9999         11111            6   7   7777   2 7 999    6         1111   6 55555555555555555  1             4444444444444444 4 0000  2 4  1 22  4 7   0 5   0  44 1111111111  44   777777   5   9   1 1        00      
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                  GTAATT-TCGGATAGATATGTCAA--TTA-G--------TTT--------GTGTT------GC-GAGT-T-TTCGTTAC--------AA-TGCTGT--GTAAACAGCACAGGATTAGAGA-GG-CGTGTC----GA-AAGCGT--CGGGAT----G---AAAGGTGTGAATA-------CG-TT--GA--------T-AT---CGCAAATTCACTTGA------TT-----A-A---AATACAAATT------AT----------AAG----TAG-AT------A---TA---------T---AT--C--TA------T--TAGAAANCT-GAA---ATAT----TGNT---TT---TAT----ANGC--G----TA---TT------T-------T------T-----------A-AT---A--TA-CT--T--CCTGAA--A-AGA------GCTG--ANGAAA-ATACGTCACGCTGGCGTA----AAATGTGTCGTCTACTATTGNAATCGACATA--------TTC--TTCTAGGAA---AACGGT---CTATTTCTAG-----CGCC-TCTCACAGTGATGA--ANATNNAATAC------AC--------GC-----------GA-GTNAACA--------CA-C--GACCTCTGA-T-AN-TGACA---CGCATATTTT-----ATGTAATGAAACGGATGGAA---NATT-A-A-CGCAGTNACCGTATTTA---AAC-T---T--AA---TAA---AT-CAGTACACTTAAT------T-----TCCTA-A----TTCA-AG-T--TA-A-TTTNT-ATT-GA--T----A-----AA--TAG------TAA-ATA-AAA-A-CACACGAG--GTAAAA
Reference ( family-658 )      :                                                                                                                                                                                                                                                  GTAATT-TCGGATAGATATGTCAA--TTA-G--------TTT--------GTGTT------GC-GAGT-T-TTCGTTAC--------AA-TGCTGT--GTAAACAGCACAGGATTAGAGA-GG-CGTGTC----GA-AAGCGT--CGGGAT----G---AAAGGTGTGAATA-------CG-TT--GA--------T-AT---CGCAAATTCACTTGA------TT-----A-A---AATACAAATT------AT----------AAG----TAG-AT------A---TA---------T---AT--C--TA------T--TAGAAANCT-GAA---ATAT----TGNT---TT---TAT----ANGC--G----TA---TT------T-------T------T-----------A-AT---A--TA-CT--T--CCTGAA--A-AGA------GCTG--ANGAAA-ATACGTCACGCTGGCGTA----AAATGTGTCGTCTACTATTGNAATCGACATA--------TTC--TTCTAGGAA---AACGGT---CTATTTCTAG-----CGCC-TCTCACAGTGATGA--ANATNNAATAC------AC--------GC-----------GA-GTNAACA--------CA-C--GACCTCTGA-T-AN-TGACA---CGCATATTTT-----ATGTAATGAAACGGATGGAA---NATT-A-A-CGCAGTNACCGTATTTA---AAC-T---T--AA---TAA---AT-CAGTACACTTAAT------T-----TCCTA-A----TTCA-AG-T--TA-A-TTTNT-ATT-GA--T----A-----AA--TAG------TAA-ATA-AAA-A-CACACGAG--GTAAAA
gi|128435                     :                                                                                                                                                                                                                                                  GTGATT-TCGGATA---AT-------TTA-G--------TTT--------GTGTT------GC-GAGT-T-TTCCTTAC--------AA-TGCTGT--GTAAACAGCACAGGATTAGAGA-GG-CGTGTC----GA-AAGCGT--CGGGAT----G---AAAGGTGTGAATA-------CG-TT--GA--------T-AT---CGCAAATTCACTTGA------TT-----A-A---GATACAAATT------AT----------AAG----TAG-AT------A---TA---------T---AT--C--TA------T--TAGAAAACT-GAA---ATAT----TGAT---TT---TAT----AAGC--G----TA---TT------T-------T------T-----------A-AT---A--TA-CT--T--CCTGAA--A-AGA------GCTG--ATGAAT-ATATGTCACGCTGGTGTG----AAATATGGCGTTTACTATAGAAATCGACATA--------TAC--GTCAAAGAA---AATGGT---ATAACTCTAG-----CACCATCTCAC--TGGAGA--CTATTTAATAC------AC--------AT-----------CA-GTTAACA--------CA-T--GGCCTC-GA-TAAA-TGACA---GGCATATTTT-----ATGTAATGAGACAGATCGAA---GGTA-A-A-CGCAGTAACCGTATTTA---AAC-T---T--AA---TAATAGAT-TAATACACTTAAT------T-----TCCTA-A----TTCA-AG-T--TA-A-TTTGT-ATT-GA--T----A-----AA--TAG------TAA-ATA-AAA-A-CACAAGAG--GTAAAA
gi|128436                     :                                                                                                                                                                                                                                                  GTAATT-TCTGATAG-----T-----TTA-G--------TTT--------GTGTT------GC-GAGT-T-TTCGTTAC--------AA-TGCTGT--GTAAACAGCACAGGATTAGAGA-GG-CGTGTC----GA-AAGCGT--CGGTAT----G---AAAGGTGTGAATA-------CG-TT--GA--------T-AT---CGCAAATTCACTTGA------TT-----A-A---AAT-CAAATA------AT----------AAG----TAG-AT------A---TA---------T---AT--C--TA------T--TAGAAAACT-GAA---ATAT----TGTT---TT---TAT----AAGC--G----TA---TT------T-------T------T-----------A-AT---A--TA-CT--T--CCTGAA--A-AGA------GCTG--ATGAAA-ATATGTCACGCTGGTGTG----AAATATGGCGTTTACTATAGAAATCGACATA--------TGC--GTCAAAGAA---AATGGT---ATAACTCTAG-----CACCATCTTAC--TGGAGA--CTATTTAATAC------AC--------AT-----------CA-GTTAACA--------CA-T--GGCCTC-GATT-AA-TGACA---GGCATATTTT-----ATGTAATGAGACAGATCGAT---GGTT-A-A-CGCAGTAGCCCTATTTA---AAC-TTAAT--AA---TAA---AT-TAATACACTTAAT------T-----TCCTA-A----TTCA-AG-T--TA-A-TGTGT-ATT-GA--T----A-----AA--TAG------TAA-ATA-AAA-A-CACACGAG--GTAAAA
gi|128437                     :                                                                                                                                                                                                                                                  GTAATT-TCGGATACATATGTCAAAATTA-G--------TTT--------GTGTT------GC-GAGT-T-TTCGTTAC--------AA-TGCTGT--GTAAACATCACAGGATTAGAGA-GG-CGTGTC----GA-AAGCAT--CGGGAT----G---AAAGGTGTGAATA-------CG-TT--GA--------T-AT---CGCAAATTCATTTGA------TT-----A-A---TATACAAATT------AT----------AAG----TAG-AT------A---TA---------T---AT--C--TA------T--TAGAAAACT-GAA---ATAT----TGAT---TT---TAT----AAGC--G----TA---TT------T-------T------T-----------A-AT---A--TA-CT--T--CCTGAA--A-AGA------GCTG--ATGAAA-ATATGTCACGCTGGTGTG----AAATATAGCGTTTACTCTAGAAATCGACATA--------TGT--GTCAAAGAA---AATGGT---TTAACTCTAA-----CACCATCTCAC--TGAAGA--ATATTTAATA---------------------------------G---------------A-T--GGCCTC-GA-T-AAATGACA---GGCATATTTT-----ATGTAATGAGACAGATCGAA---GGTT-A-AACGCAGTAGCCGTATTTA---AAT-T---T--AA---TAATAAAT-TAATACACTTAAT------T-----TCCTA-A----TTCA-AG-T--TA-A-TTTTT-ATT-AA--T----A-----AA--TAG------TAA-ATA-AAA-A-CACACGAG--GTAAAA
gi|128438                     :                                                                                                                                                                                                                                                  GTAATT-TCGGATAGATATGTCAAAATTA-G--------TTT--------GTGTT------GC-GAGT-T-TTCGTTAC--------AA-TGCTGT--GTAAACATCACAGGATTAGAGA-GG-CGTGTC----GA-AAGCAT--CGGGAT----G---AAAGGTGTGAATA-------CG-TT--GA--------T-AT---CGCAAATTCACTTGA------TT-----A-A---AATACAAATT------AT----------AAG----TAG-AT------A---TA---------T---AT--C--TA------T--TAGAAAACT-GAA---ATAT----TGAT---TT---TAT----AAGC--G----TA---TT------T-------T------T-----------A-AT---A--TA-CT--T--CCTGAA--A-AGA------ACTG--ATGAAA-ATATGTCACGCTGGTGAG----ATATATGGCGTTTACTCTAGAAAGCGACATA--------TGC--GTCAAAGAA---AATGGT---TTAACTCTAG-----CACCATCTCAC--TGGAGA--ATATTTAAT----------------------------------------A--------CA-T--GGCCTC-GA-TAAA-TGACA---GGCATATTTT-----ATGTAATGAGACAAATCGAA---GGTTAA-A-CGCAGTAGAAGTATATA---AAT-T---TAAAA---TAA---AT-TAATACACTTAAT------T-----TCCTA-A----TTCA-AG-T--TA-A-TTTGT-ATT-GA--T----A-----AA--TAG------TAA-ATA-GAA-A-CACACGAG--GTGAAA
gi|128439                     :                                                                                                                                                                                                                                                  GTAATT-TCGAATAG-----T-----TTA-G--------TTT--------GTGTT------GT-GAGT-T-TTCTTTAC--------AA-TGCTGT--GTAAACAGCACAGGATTAGAGA-GG-CGTGTC----GA-AAGCAT--CGGGAT----G---AAATTTGTGAATA-------CG-TT--GA--------T-AT---CGCAAATTCACTTGA------TT-----A-A---AATACAAATT------AT----------AAG----TAG-AT------A---TA---------T---AT--T--TA------T--TGGAAAACC-GAA---ATAT----TGTG---TT---TA----------------TA---TT------T-------T------T-----------A-AT---A--TA-CT--T--CCTGAA--A-AAA------GCTG--ATGAAA-ATATGTCACGCTGGTGTG----AAATATGGCGTTTACTATAGAAATCGACATA--------TGT--GTCAAAGAA---AATGAT---TCAACTCTAG-----CACCATCTCAC--TGGAGA--ATATTTAAAAC------AC--------AT-----------CA-GTTAGTA--------CA-T--GGCCTC-GA-TAAA-TGACA---GGCATATTTT-----ATGTAATGAGACAGATCGAA---GTTTAA-A-CGCAGTAGCCGTATTTA---AAC-T---T--AATACTAA---AT-AAATACACTTAAT------T-----TCCTA-A----TTCA-AG-T--TA-A-TTTGT-ATT-GA--T----A-----AA--TAG------AAA-ATA-AAA-A-CACACGAG--GTAAAA
gi|128440                     :                                                                                                                                                                                                                                                  GTAATC-TCGAATAGATATGTCAACATAA-G--------TTT--------GTGTT------GC-GAGT-T-TTCGTTAC--------AA-TGCTGT--GTAAACAGCACAGGATTATAAA-GG-CGTGTC----AA-AACCAT--CGAGAT----G---AAAGGTTTGAATA-------CG-TT--GAGA------T-AT---CGCAAATTAACTTGA------TT-----A-A---AATACAAATT------AT----------AAG----TAG-AT------A---TA---------T---ATATC--TA------T--TA-AAAACT-GAA---ATAT----TGTT---TG---TAT----AAGC--G----TA---GT------T-------T------T-----------A-AT---A--TA-CT--T--CCTGAA--A-AGT------GCTG--ATGAAA-ATATGTCACGCTGGTGTG----AAATATGGCGTCTACTCTAGAAATCGACATA--------TTC--GTCAAAGAA---AATGGT---TTAACTCTAG-----CACCATCTCAC--TGGAGA--ATATTTAATAC------AC--------AT-----------CA-GTTAACA--------TA-T--AGCCTC-GG-TAAA-TGACA---GGCATATTTT-----ATGTAATGAGACAGATCGAA---GGTTAA-A-CGCATTAGCCGTATTTA---AAT-TTAAT--AA---TAA---AT-TAATACACTTAAT------T-----ACCAA-A----TTAA-AG-T--TA-A-TTTGT-ATT-GA--T----A-----AA--TAG------TGA-ATA-AAA-A-CACACCAG--CTAAAA
gi|128441                     :                                                                                                                                                                                                                                                  GTAATT-TCGGATAGATATGTCAACATAA-G--------AAT--------GTGTT------GC-GAGT-T-TTCGTTAC--------AA-TGCTGT--GTAAACAACACAGGCTTAGAG------GTGTC----AA-
gi|128442                     :                                                                                                                                                                                                                                                  GTCATT-TTGGGTAGATGTGTCAA--TTA-GCCGACAGTTTT--------GTCTT------GC-GACG-T-TTCATTAC--------AA-TAC-------AAACATCACATGATAAGAGA-GAACATGCC----CA-AAGCAT--AGTGTT----G---ATACACGTGAATA-------GG-TT--AA--------T-AT---CGTAAATTCACTTGA------TT-----A-A---AACACAAAAT------AT----------TAG-----AA-AT------A---TA---------A---AT--C--TA------A--TAGAGAGCT-GA-----TTT----TTTTCCCTT---TAT----ATGC--A----TA---T----------------------------------A-AT------------------TAAA--G-AGA------GCTG--AGGAAA-ATATGTCACGCCG
gi|128443                     :                                                                                                                                                                                                                                                  GTAATTGTTGGG-AGAGATGTCAA--TTA-G--------TCTGTGCTTTAGTGTT------AT-GAGT-T-TTGATCAA--------AC-TGTTAT--GAAAACAACA----ATTGGAGA-GGATGTGTC----AC-AAG----------T----T---AAAGTTGTTAATA-------GA-TT--GAGAC-----C-AG---CACAAATTCACTTG-------TT-----AGA---AATAat
gi|128443                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AGAAATCT-G------CGT----TGTA---TT---TATTCGTATGC--A----TA---TTCTCTCTT-------T------T-----------A-AA---A--TT-TT--TTACTTGAA--A-CAAT-----GCTG--GA-AAA-ATATGTCACGCTGTGGTA----AAATGTGTTGTCTACTATTGTAATTGACATA--------TTC--TTCCAGGAA---A-CGGT---ATATTTTTATATAATTTTT-TTTTATA-TAATCATTAAATAAAATAA------AC--------AC-----------AA-GTCAACA--------CA-T--GACCTGTGA-T-AT-TAACA---CGCATATTTT-----ATGTAATGAAATGGATTGAA---TATT-G-A-TACAGTTACTGTATTTT---AAC-T-----------TAA---AT-CAGTACACTTAAT------T-----AAACA-T----TTCA-AATT--TA-A-TTTtttatttctccttgagaaaaagaaataaaaacttaatagtaataggctactctttaattaaatacaagaaatctgcgttgtatttattcgtatgcatattctctcttttaaaattttttacttgaaacaatgctggaaaaatatgtcacgctgtggtaaaatgtgttgtctactattgtaattgacatattcttccaggaaacggtatatttttatataatttttttttatataatcattaaataaaataaacacaagtcaacacatgacctgtgatattaacacgcatattttatgtaatgaaatggattgaatattgatacagttactgtattttaacttaaatcagtacacttaattaaacatttcaaatttaattt
gi|128444                     :                            gtaattgttgggagagatgtcaattagtctgtgctttagtgttatgagttttgatcaaactgttatgaaaacaacaattggagaggatgtgtcacaagttaaagttgttaatagattgagaccagcacaaattcacttgttagaaatatttatttctccttgagaaaaagaaataaaaacttaatagtaataggctactctttaattaaatacaGTAATC-ATGGGTAGAGATGTCAG--TTATGCACC----TTG--------GTGTT------AC-GAGA-G-TTGATCAA--------AC-TGTTAT--GTAATCAACA----ATTGGAGATGA-CATGTT----GC-AAGT-T-----GAT----G-------GTGTAAATA-------GG-TT--GA--------G-ACAAATGCATATTCACT
gi|128444                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ------GCTG--GA-AAA-ATATGTGATGCTGAC--A----AAATGTGTCATCTACTGATGTAAGTGACATA--------TTC--TTCTAGGAA---A-TAGT---CTATTT-TAA------GCT-TTTCACAGTGATGA--AAATAAAATAC------AC--------GT-----------CG-GTAAACA--------CA-T--GATCTCTGA-T-AC-TGACA---CGCATGTTTT-----ATATAATGAAACGGATGGAA---TATT-A-A-TACAGTTACCATATTT--------T---A--AA---TGA---AT-CAGTACACTTAAT---------------TA-AAGATTTAA-AG-T--TT-A-CTTTT--TC-AA--T----AGATCTAA--TAG------CAA-AT--TGA-G-CACACTAA--ATAGAAcattcactcattagaaatatttatttctcatcgacaaaaagaaacaaaaataggctacttttcaattaaataattaatctgtatggtactcattcacacacattttctctttttacaataactaattaagataatgctggaaaaatatgtgatgctgacaaaatgtgtcatctactgatgtaagtgacatattcttctaggaaatagtctattttaagcttttcacagtgatgaaaataaaatacacgtcggtaaacacatgatctctgatactgacacgcatgttttatataatgaaacggatggaatattaatacagttaccatattttaaatgaatcagtacacttaattaaagatttaaagtttactttttcaatagatctaatagcaaattgagcacactaaatagaa
gi|128445                     : gtaatcatgggtagagatgtcagttatgcaccttggtgttacgagagttgatcaaactgttatgtaatcaacaattggagatgacatgttgcaagttgatggtgtaaataggttgagacaaatgcatattcactcattcactcattagaaatatttatttctcatcgacaaaaagaaacaaaaataggctacttttcaattaaataattaatctgtatggtactcattcacacacattttctctttttacaataactaattaagataatA-G--------TTT--------GTGTTTAATACGCCGAGT-T-TTCCTTAC--------AA-TGCTGT--GTAAACAGCACAGGATTAGAGA-GG-CGTGTC----GA-AAGCGT--CGGGAT----G---AAAGGTGTGAATA-------CG-TT--AA--------T-AT---CGCAAATTCACTTGA------TT-----A-A---AATACAAATT------AT----------AAG----TAG-AT------A---TA---------C---AT--C--TA------T--TAGAAAACT-GAA---ATAT----TGGT---TT---TAT----AAGC--G----TA---TT------T-------T------T-----------A-AT---A--TA-CT--T--CCTGAA--A-AGA------GCTG--ATGAAT-ATATGTCACGCTGGTGTG----AAATATGGCGTTTACTATAGAAATCGACATA--------TGC--GTCAAAGAA---AATGGT---ATAACTCTAG-----CACCATCTCAC--TGGAGA--CTATTTAATAC------AC--------AT------------A-GTTAACA--------CA-T--GGCCTC-GA-TAAA-TGACA---GGCATATTTT-----ATATAACGAGATAGATCGAA---AGTT-A-A-CGCAGTAGCCGTATTTA---AA-----------------------CAATACAATTAAT------T-----TCCTA-A----TTCA-AG-T--TA-A-TTTTT-ACT-GA--T----A-----AA--TAG------TAA-ATC-AAA-T-CACACGAG--GTAAAA
gi|128446                     :                                                                                                                                                                                                                            attccatggatcattttataaaaaatagtaCGAATAGATAT--CAA--TAA-G--------TTG--------GAGCTTTG---GC-GAAT-TATTTATGACCTTGATTTAACTGTTAC--GAAAACAATAT-GGA----AGATGA-CGTGTCATAAGATAAGTG---CGTAAT----GTCAAAAGGTCAGAATAGCGAGGTCG-T---GA--------TCAG---CGTCAATTCCCTCGT------TA-----A-A---AATACTGATT------CT----------TCG----TA--AT------A---TA---------ACAAAC--CAATA------C--TAGAAAT---------ATAT----T--T---TT---TATTT--ATGC--A----CA---TT------TATTTTCTT------TCAAA-------A-AT------TA-CT--T--TTTTGA--A-AAA------GATG--GA-AAA-ATACGTCACGCTGACGTA----AAATATGTCGTCTACTATTGCAACTGACATA--------TCC--TTC-AGGGA---AACGGT---CTATTTATAG-----C
gi|128447                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                 --------TTT--------GTGTT------AC-AAGT-T-TT-GTTAT--------AA-TACTATATGCAAACAGCA-----TTAGAGT-GGATGTGTC-----A-ATGCTTACCGGTATTGTCA---AAAGGCGTGAACA-------GG-TTATGACCACAGGTT-ATGACCACAAATTCACTTGC------TA-----A-A---CATAACATTT------AT----------AAATTCCTAG-AT------A---GA---------A---AT--A---A------G--TAAAAAC---GAA---ACAG----TAGT---TT---a
gi|128448                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                 --------TTT--------GTGTT------AC-CAGT-T-TTGATTA---------AA-T-TTAT--GAAAATAGCA-----TTGGAGA-GAACATGTC----AC-A--CGT--TGA-AT----G---CTTATTGCCAACA-------AA-TT---------------------TAAATTCACTCG-------TT-----A-A---AAAACTAATTCCTCGAAA----------AAA----TAGTAT------GAGGTA-------------AT--C--TAATAAATC--TAGAAATCT-GTATC-GTAT----T-TC---TT---CGC----AAAC--A----TAATCTT------TCC-----T------T-----------T-ATGA-A--TC-AT--TAACTTGAT--ATAGT------GCTG--GAAAAA-ACCCATCAAGCTGGCGAA----AAATATGTCGTCTGCTATTGTATTTGACATA--------TTTGTTTTTAA-AA---AACGGT---CTATTT-TA------------CT----GTGATGA--ACATGAAATAC------AT--------AC-----------GA-GTAAGTA--------CG-C--TACCACTAA-T-AT-TGACA---TGCATATAAT-----ATGTAATAAAATAAACAGAA---TATT-A-A-TACAGTT---TTTTTTACTTAAC-T---T--AA---TAA---ATGCACTA-ATTTTAT------T-----T----------TTC--AG-TAATA-A---TGA-ATT-GA--T----A-----AACTTAT------TGG-ATA-A
gi|128449                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AGTGT-TTTGTCAA--------AC-TGTTAT--GAAAACA---CAA-ATTGGAGA-GGACGTATC----AC-AAGT---------T----G---AA-GATGTACGTA-------GG-TC--GA--------G-ACAAACGCAAATTCACTC-A------TC-----AGA---AATATGTATT------CT----------TCG----TCG-AC------A--------------------------A------A--CAGAAA--T-GAAGTTATAA----TAAT---CC---AAT----AGGC-------TAC--TT------T-------T------T-----------A-ATGAAA--TA-CT--T--TC
gi|128449                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TAAA--C-AAA------GCTG--AAAAAA-ATACGTCACGCTGACGTA----GAATTGGTCGTTTACTGTTGTAATGGACAT----------------CTAGGTA---A-CGGT---CTATTTTAAG-----CGCT-TTCCACAGCGATCA--AAATAACATAT------AC--------GC-----------GA-G-AAACA--------CA-C--TACCTCTGA-T-AA-TGACA---CGCATTGTTT-----ATGTAATCAAACGGTTGGAA---TATT-A-A-AACAGATACCGTATTTT---AAC-T---T---------A---AT-CAGTGCACTAAATTAAAGAT-----TTCAA-A----TTTA-AATT--TA-ACTTTCG-ATA-CATCT----A-----AA--TGA------TAA-ATG-AGC-A-CACgagtagtttttttttaaaaagagaataagcgtgcgaataaatacaatgcagatttaaacaaagctgaaaaaaatacgtcacgctgacgtagaattggtcgtttactgttgtaatggacatctaggtaacggtctattttaagcgctttccacagcgatcaaaataacatatacgcgagaaacacactacctctgataatgacacgcattgtttatgtaatcaaacggttggaatattaaaacagataccgtattttaacttaatcagtgcactaaattaaagatttcaaatttaaatttaactttcgatacatctaaatgataaatgagcacac
gi|128450                     :                                                                                                                                agtgttttgtcaaactgttatgaaaacacaaattggagaggacgtatcacaagttgaagatgtacgtaggtcgagacaaacgcaaattcactcatcagaaatatgtattcttcgtcgacaaacagaaatgaagttataataatccaataggctactttttaatgaaatactttcgagtagtttttttttaaaaagagaataagcgtgcgaataaatacaatgcagattTATAGA-GG-CGTGTC----AA-AACCAT--CGTGAT----G---AAAGGTGTGAATA-------CG-TT--GA--------T-AT---CATAAATTCACTGGA------TA-----A-A---AATAAAAATT------AT----------AAG----TAG-AT------A---TA---------T---AT--C--TA------T--TAGAAAACT-AAA---ATAT----TGTT---TT---TAT----AAGC--G----TA---TT------T-------T------T-------------AT---A--AA-CT--T--CCTGAA--A-AGA------GCTG--ATAAAA-ATATGTCACGCTGGTGTG----AAATATGGCGTTTACTCTAGAAATCGACATA--------TGC--GTTAAAGAA---AATGG
gi|128451                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ----G---AAAGGTGTTATTA-------GG-TC---A--------TGAC---TGCAAATTGACTT--------TTCCACAA-A---AGTA---ATT------ATTTGTAGATAGAAG----TAA-ATGAAAACA---TAATGCTTTTTT---AT--T--TA------TACTAGAAATTT-G------TATCCTATATT---TT---TGT----ATGCATG----TC---TT------T-------T------TTTATTTAAAAAA-AT---ACCTA-CTGGTA-CTTGAA--AGAGA------GCCG--GA-AAA-ATAAGCAACGCTGGTGTT----AAATGTGT-------TATTG------ACATG--------TTC--TTCTAGGAA---A-TGGC---CTATTTTTAG-----CACC-TTTTACAGTGATGA--AAATGTAATAC------AC--------AC-----------CA-GTTAATA--------C
gi|128452                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ---AAACATGTGAATAGTTCA--CGGCT--GG--------T-A-----G-AAATTCTCTTGAAACAAATT-----A-ATACAATATGCATT------GT------------G----TAG-TTTAA---A---TA---------T---A---A--TA------C--TAGATATCT-GTATC-ACAT----TTAT---TTGCATGC----ATGT--T----TG---TT------T-------T------TTAAC-------A-ATC--A--T--CT--T--CTTAAA--AGAGA------GCTG----GAAACATATGTTACACTGG-GTATAAAAAATGTGTCGTCTTCTATTGCAGTTTACATA--------TTC--TTCTGGGAACCAGACTATTTACTATTTTCAG-----TGCC-TCTCACAGTGACGA--AAATGTAAAAC------ACATGTATATGCACATATAATCTGACATTGACA--------TA-CATGACCTCTGA-C-AT-TGACATATTACATGGTTT-----ATATAATTCAATAAATGGAA---GATT-ACA-TACAGT
gi|128453                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      --TA------C--TAGAAATCT-GTATC-ATAT----TTAT---TC----AC----ATGC--A----TA---TT------T-------TCTCCTTT-----------AGAA---A--TAGCT--A--CCTGAACTA-ATG------CTTG--A--AAA-ATACGTCATGCTGACATA----AAATGTGTCGTCTTCTATTGTAAATGACATA--------TTC--TTCTAGGAA---A-CTGT---CTATT-------------------ACAGTGATGA--AAATAAAAAGC------AT--------GC-----------GA-GTAAACA--------CA-C--AACCTCTGA-A-AT-TGATT---CAAATATTTT-----A-GAAATGAAACAGATGGAA---TATT-A-A-TGCAGTTACCGGATTTT---AAC-A---T--AA---T
gi|128454                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      --TA------C--TAGAAATCT-G------TAT----TGTG---TT---TAT----TTGCATG----CA---TT------T-------T------T-----------A------------TT--T--CTTTTA--A-AAATTACCTACTT--GAGAGA-GTGCTTGATGTT-----A----AAATGT--TGTCTGTTATTGTAATTGGTATA--------CTC--TTCTAG-AA---AATGGT---CTATTTTTAG-----CACT-TTTCACAGTGATGA--AAATGAAATACCGGTACAC--------AT-----------GA-GTTAACA--------CA-C--GACCTCTCA-T-AT-TGACA---CGCATATTTT-----ATGTAATAAAACAGATGGAA---TCCA-G-A-TACAGTTACTGTATTT----AAC-T---T---------A---AG-CAATGCACTCAATCAAAAAC-----TTTAA-A----TTCT-AA-T--TATA-TTTTTCAAT-AA--TAGCAA-----AA--TAGATACATTAA-ATAGAAA-A-CA
gi|128455                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      --TA------C--TAGAAATCTTGA-------T----TGTA---TT---TAT----TTGC--GCTCATA---TT------TCCTCTC-T------T-----------A-AA---AA-CAGCT--G--TTTGAA--A-CAAT-----GCTG--GAGAAATATACATCACGTTGACGTA----AAATGGGTCATCTACTATTGTAATTGACGCA--------TTC--TCCTAG-AA---AATGGA---CTGTTTTTAG-----GGCT-TTCCACA-----------------TAC------AT--------G------------GA-GTAAACA--------CA-G--GACCTCTGA-T-AG-TGACA---CGCATATTTT-----AAGTCATGAAACAGATGGAA---TATT-A-A---TAGTTACCATATTTT---AAC-------------CAA---AT-CAGTGCACTAAAT------
gi|128456                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aa-GAA---ATAT------GT---AT---CAT----A----------TA---TT------T-------T------TTTGTTTAAAA-A-AT------TA-CC--T--ACTTGA--A-AGA------A-TGTTACAAGA-ATATGTCAGGCTGGTGTA----AAATGTGTCGTCAGCTGTTGTAATTGACATA--------TAC--TTCTAGGAA---A-TGAT---CTATTTTGAG-----CACT-TTCCACAGTGATGA--ACGTGAGATAC------AC--------TC-----------GA-GTAAACA--------CA-T--GTCCTATGC-T-AT-TGACA---GGCATATTTC-----ATGTGATGAAACAGATGGAG---TATT--------------TGTATTTA---AAC-T---T---------A---AT-CAGTACAC-TA------------------A-A----TTAA-AG----AA-A-TATAT-ATT-TT--T----C-----AA--TAA------T-A-ACA-AAATA-CACACAA----TAAA
gi|128457                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -CT--A--CTTGAA--A-CAAT-----GCTG--GA-AAA-ATACGTCACGCTAACGTA----AAATTGGTCGACTACTATTGAAATTGACATGATAAATTCTTC--TTCTAGGAC---A-CAGT---CTATTTCTAG-----CGCT-TTTCACATTGATGA--AGCTAAAATAC------AA--------AC-----------AA-GTA---------------------CTCTGA-T-AT-TGACA---CGCATATTTT-----ATGTAATGAAA------GAA------T-A-A-TACATTTACTGTATTTA---AAC-T---T---------A---AT-CAGTACACTAAATCAAGGAT-----TTCAA-A----TTTATAT-T--TA-ACTTTCA-ACT-GA--T----CT----AA--TAGC-----TAA-AT
gi|128458                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AAA-ATATGTCACGGTAGTACA----CAATGTGCTGTCAACTATTGTAATTGACATA--------TTC--TTTTAAG-----AACAGT---CTATTTTTAT-----CACT-T---------------ACATGTAAAAC------AC--------GC-----------------AATA--------TA--------TCTGA-T-TT-TGACA---GGTATATTTT-----ATGTAATAAAACGGATGGAATTGTATT-A-----CAGTCACAGTACTTT---AACAT---T--AA----AA---AT-CAGTGCACTAAAG------T--------CA-A-----GGA-AG-T--TA-C-TTTTT-TTTCAA--T----A-----AA---AG------CAA-A-A-TAA-C-CACACTAA--ATAAAA
gi|128459                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATGCTGACGTA----AAATGTGTTGTCCACTATTATAATTGACATA--------CTC--TTCTAGG-A---AACGGT---CTATTT-TAG-----TTCT-TTTGACAGTGATGA--AAATGAAATAT------AC--------TT-----------GA-GTAACCATAGGGGACCA-CAGGACCTCTGA-T-AC-TGAAA---CCCATATTTTG----AT---ATGAAATGGATGGAA---TATT-T-A-AACAGTTACCATATTTT---AAC-T---T---------A---AT-CAGTGCACTAAAT------TAAAGATTTTATA----TTTA-AATT--TA-A-CTTTT-ATTGGA--T----CT----GA--TAG------CAA-AT
gi|128460                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GAA---AACGGT---CTATATTTAG-----TGCT-TTCCACATTGATGA--AAATAAAATGC------AT--------GT-----------GA-GTAAACA--------CA-C--AACTTCTGA-T-AT-T--TA---CGCATATTTT-----ATGTAATGAAACGGAT-GAA---AATT-A-A-TATA-TTACTGTATTTT---AGC-T---T--GA---
gi|128461                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              a-TTTCACAGTGATAA--ATATAAAATAC------AC--------AC-----------GA-GTAATCA--------CA-C--AACCTGGGA-T-AT-TAACA---TGAATATTTT-----ATGTAATGAAACTGATGGAA---CATT-A-A-TACAGCTACCATATTTT---AAC-T---T---------A---AT-CAGTGCGCTTAAT------T-----
gi|128462                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CACTGGTGA--AAATTTGATAC------AC--------AT-----------GG-GTTAACA--------C-----GACCTCTGA-C-AA-TGACT---CG-ATACTTT-----ATGTAATGAAACAAATGGAA---GAAT-A-AATGCAGTAACCATATTTA---AAC-T---T--AA---T--------CAATGCACTAAAT------T-----AAATA-T----TTAA-AT-T--TC-A-TTTTT-ATT-GA--T----A-----AA--TAG------TAACACA-AAG-ACCACATGAGACATAAAA
gi|128463                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AACA--------TAAT--GTCCTTTAG-C-AA-TGACA---CGCATGCTTTTATTAATGTAATGAAGCAGGTGAGA---GACT-A-AACGCAGTGACCGTATTTA---AACGT---T--GA---TAA---A