lowQualScore : 11111111111111111 11 1 1
lowQualScore : 44444 00 1111 00 11111 4 99999999999999999 33333333333333333 8888888888 00 0 00000 0 0 0 55 11 3 1 33 55 1 6 6 2
lowQualScore : ..... .. .... .. ..... . ................. ................. .......... .. . ..... . . . .. .. . . .. .. . . . .
lowQualScore : 99999 99 5555 55 77777 4 22222222222222222 88888888888888888 7777777777 33 5 66666 3 2 2 33 33 6 1 22 66 7 5 5 6
consensus : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCA---GTC--AAGGG----A--AAG-A---GCAA-----------------A-----------------AN---------TG--G-C-----CGC-T-TAAGACAGG--T--GGCTGCTTAATACAGGG-TC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-GAAGTATTTTTGTATATTGGCACA
Reference ( gi|6706 ) : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCA---GCC--AAGGG----A--AAG-G---GCCA-----------------A-----------------AT---------TG--G-C-----TGC-T-TAAGACAGG--T--GGCTGCCTACTACAGGG-TC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-GAAGTATTTTTGTATATTGGCACA
gi|6709 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCA---GCC--AAGGG----A--AAG-G---GCCA-----------------A-----------------AT---------TG--G-C-----CGC-T-TAAGACAGG--T--GGCTGCCTACTACAGGG-TC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-GAAGTATTTTTGTATATTGGCACA
gi|6708 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCA---GCC--AAGGG----A--AAG-G---GCCA-----------------A-----------------AT---------TG--G-C-----CGC-T-TAAGACAGG--T--GGCTGCCTACTACAGGG-TC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-GAAGTATTTTTGTATATTGGCACAata
gi|6716 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCA---GCC--AAGGA----A--AAG-G---GCCA-----------------A-----------------AT---------TG--G-C-----CGC-T-TAAGACAGG--T--GGCTGCCTACTACAGGG-TC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-GAAGTATTTTTGTATATTGGCACA
gi|6714 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCA---GCC--AAGGG----A--AAG-G---GCCA-----------------A-----------------AT---------TG--G-C-----CGC-T-TAAGACAGG--T--GGCTGCCTACTACAGGG-TC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-AAAGTATTTTTGTATATTGGCACA
gi|6713 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCA---GCC--AAGGG----A--AAG-G---ACCA-----------------A-----------------AT---------TG--G-C-----CGC-T-TAAGACAGG--T--GGCTGCCTACTACAGGG-TC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-GAAGTATTTTTGTATATTGGCACA
gi|6711 : TACAGTCAAACCTGTTTTAAGCAGCCA---GCC--AAGGG----A--AAG-G---GCCA-----------------A-----------------AT---------TG--G-C-----CGC-T-TAAGACAGG--T--GGCTGCCTACTACAGGG-TC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-GAAGTATTTTTGTATATTGGCACA
gi|6718 : TACAGTCAAAGCTGTCTTAAGCAGCCA---GCC--AAGGG----A--AAG-G---GCCA-----------------A-----------------AT---------TG--G-C-----CGC-T-TAAGACAGG--T--GGCTGCCTACTACAGGG-TC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-GAAGTATTTTTGTATATTGGCACA
gi|6723 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCA---GCC--AAGGA----A--AAG-G---GCCA-----------------A-----------------AT---------TG--G-C-----CGC-T-TAAGACAGG--T--GGCTGCCTACTACAGGG-TC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-AAAGTATTTTTGTATATTGGCACA
gi|6717 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCA---GCC--AAGGG----A--AAG-G---GCCA-----------------A-----------------AT---------TG--G-C-----CGC-T-TAAGACAGG--T--GGCTACCTACTACAGGG-TC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGT-GAAGTATTTTTGTATATTGGCACA
gi|6726 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCA---GCC--AAGGG----A--AAG-G---GCCA-----------------A-----------------AT---------TA--G-C-----CGC-T-TTAGACAGG--T--GGCTGCCTACTACAGGG-TC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-GAAATATTTTTGTATATTGGCACA
gi|6730 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCA---GCC--AAGGG----A--AAG-T---GCCA-----------------A-----------------AT---------TG--G-T-----CGC-T-TAAGACAGA--A--GGCTGCCTACTACAGGG-TC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-GAAGTATTTTTGTATATTGGCACAg
gi|6736 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCA---GCC--AAGGG----A--AAG-G---GCCA-----------------A-----------------AT---------TG--G-C-----CGC-T-TAAGAC-----------TGCCTACTACAGGG-TC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-GAAGTATTTTTGTATATTGGCACA
gi|6727 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCA---GCC--AAGGG----A--AAG-G---GCCA-----------------A-----------------AT---------TG--G-C-----CGC-T-TAAGACAGG--T--GGCTGCCTACTACA----TC-AT----TTTTCACCCAGATTAGC-GAAGTATTTTTGTATATTGGCACA
gi|6733 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCA---GCC--AAGGG----A--AAG-G---GCCA-----------------A-----------------AT---------TA--G-C-----CGC-T-TAAGACCGG--T--GGCTGCCTACTACAGGG-AA-ATCA-ATTTTCACCCAGA
gi|6695 : TACAGTCTAACCTGTATTAAGCAACCA---CCC--AAGGG----A--AAA-G---GCCA-----------------A-----------------AC---------TG--G-C-----TGC-T-TAATACAGG--T--GGCTGCTTAATAGAGGG-TCAAT---ATTTTTAC
gi|6699 : TACAGTCTAACCTGTATTAAGCAGCCA---CAC--AAAGG----A--A-T-G---GCCA-----------------A-----------------AC---------TG--G-C-----TGC-T-TAACACAGG--T--GGTTGCTTAATAGAGGG-TC---CATATTTTTACCGAGA-AAGCTGAAGTCATGATGTTTATTGAGACAtgacaaagctgcagtcgtgatgtttattaagacagataaaaagtgatcacacatgatggcacatggaccatgcctgtaagttgtactaggggtaaatgagaaaaaatctgcaggaagaaaatatttgaattgacacttttttatgtagaaactcatttaaataagtaaataatttatgttataaaattaaaaa
gi|6702 : TACAGTCTAACCTGTATTAAGCAGTCA---CCC--AAGGG----A--AGT-G---GCCA-----------------A-----------------AC---------TG--A-C-----TGC-T-TAACACAGG--T--GACCTCTTAATAGAGGG-TCTAT---ATTTTCACAGAGA-AAGCTGAAGTAATGATGTTTATTGgataaaaggtgatcactgttgattgtacatgtaccatgcctgtaagttgtattggaggtaaatgagaaaaatccgtaggaagaaaatatttgaactgacactattttacaatgaacatttaaataaataaatagattatgttatataattagaaa
gi|6700 : TACAGTCTAACCTGTATTAAGCAGCCA---CCC--AAGGA----A--AAT-G---GCCA-----------------A-----------------AC---------TG--G-C-----TGC-T-TTACACAGG--T--GGCTGCTTAATTGAGGG-TC---CATATTTTTACAGAGA-AAGCTGAAGTCGTGATGTTTATTGtgacagacaaaaagtgatcacacatgcatggtatatatcttgtaccatgcctgtaagctgtttggaattatgtacaggagtgaaggagaaaaatccacaagaagaaaacattaaattgtataaagaagtacatattaaaaaataattgatgttatctaatttaaaaa
gi|6737 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCA---CTC--AAGGG----A--AAG-A---GCAA-----------------A-----------------AA---------TG--A-C-----CTC-T-TAAGACAGG--T--GGCTGCTTAATACAGGagacggctaaaaagtgatcacacacgcatggtacatgtacaagaaaatatttgaactgacactattttatatagaagtacatttaaataaataaataatttatgttatttaattaaaaa
gi|6692 : TACAGTCTAACATGTATTAAGCAGCCA---CCC--AAGGG----A--AAT-G---GCCA-----------------A-----------------AC---------TG--G-T-----TGC-T-TAACACAGG--T--GGCTGCTTAATAGAGGG-CC---CATATTTTTAC
gi|6768 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCA---GTC--AAGGG----A--AGG-A---GCAA-----------------A-----------------AT---------TG--G-C-----CTT-T-TAAGACAGG--T--TGTTGCTTAATACAGGagagaaaactgaagtcatgaaatttattgagacagataaaaagtgatcacacatgatggtacatgtaccatgcctgtaagttgtactaggggtaaatgagaaaaattccacaggaagaaaatatttgaactgacactatattatatagaagttcatttaaataaataaataatttatgatataaaattaaaaa
gi|6693 : TACAGTCTAACCTGTATTAAGCAGCCA---CCT--AAGGG----A--AAT-G---GTCA-----------------A-----------------AC---------TG--G-C-----TGT-T-TGACACAGA--T--GACTGCTTAATAGAGGGTTC-AT---ATTTTTACCGAGA-AAGCTGAAGT
gi|6739 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCA---CTC--AAGAG----A--AAG-A---GCAA-----------------A-----------------AA---------TG--A-C-----CTC-T-TAAGGCAGG--T--GGCTGCTTAATACAGG------TTG-ATTTT-ACCcatgatatttattgagacagataaaaagtgataacacatgatggtacatgtaccatgcctgtaagttgtactgggagtaaatgaataaaatttgcaggaagaaaatatctgaactgacactattttatatagaagttcatttaaataaataaataatttatgttataaaataaaaaa
gi|6744 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCA---TTC--AAGGG----A--AGG-A---GCAA-----------------A-----------------AG---------TG--G-C-----TTT-T-TAAGACAGG--T--TGTTGCTTAATACAGGG-T
gi|6792 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCA---GTC--AAGGG----A--ATG-A---GCAA-----------------A-----------------AG---------TG--G-C-----CTT-T-TAAGACAGG--T--TGTTGCTTAATACAG------ATTA-ATTT
gi|6762 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCA---GTC--AAGGG----A--AAA-G---GCAA-----------------A-----------------GG---------TG--G-C-----CTT-T-TAAGACAGG--T--TGTTGCTTAATACAGGactctgaaagc
gi|6734 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCA---GTC--AAAGG----A--AAG-A---GCAG-----------------A-----------------AG---------TG--G-C-----TGT-T-TAAGACAGG--T--TGTTGCTTAATAGAGG
gi|6790 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCA---GTC--AAGGG----AGGGAG-GGA-GCAA-----------------A-----------------AG---------TG--G-C-----CTT-T-TAAGACAGG--T--GGCTGCTTAATACAGG
gi|6845 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCA---GTC--AAGGG----A--AGG-G---ACAA-----------------A-----------------AT---------TG--A-C-----CTT-T-TAAGACAGG--T--TGTTGCTTAAAACAGG------TTA-ATTT
gi|6740 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCA---CTC--AAGGG----A--AAG-A---CCAA-----------------A-----------------AA---------TG--A-C-----CTC-T-TAAGACAAG--T--GGCTGCTTAATACAGGgctgtgaaagc
gi|6777 : TACAGGCAAACCTATCTTAAGCAGCCA---GTC--AAGGA----A--AGG-A---GCAA-----------------A-----------------AG---------TG--G-C-----CGC-T-TAAGACAGG--T--TGTTGCTTAATACAGG
gi|6775 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCA---ATC--AAGGG----A--AGG-A---GCAA-----------------A-----------------AG---------TG--G-C-----CTT-T-TAAGACAGG--T--TGTTGCTTAATACAGGttacata
gi|6844 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGTCA---GTC--AAGGG----A--AGG-A---GCAA-----------------A-----------------AG---------TG--G-T-----CTT-T-TAAGACAGG--T--TGTTGCTTAATACAGG------TTA-ATTT
gi|6705 : TACAGCTTAACCTGTATTAAGCAGCCA---CCC--AAGGG----A--AAT-G---GCCA-----------------T-----------------TC---------TG--A-C-----TGC-T-TAACACAGG--T--GACTGCTTAATAGAGGG-TC---CATATTTTTATCAAGA-AAGCTGAAGTactatgaaagc
gi|6841 : TACAGTCAAACCCGTCTTAAGCAGCCA---GTT--AAGGG----A--AGG-A---GCAA-----------------A-----------------AG---------TG--A-C-----CTT-T-TAAGACAGG--T--GGTTGCTTAATACAGGcaagatgtttattagaca
gi|6810 : TACAGTGAAACCTGCCTTAAGCAGCCA---GTC--AAGGG----A--ATG-A---G-CA-----------------A-----------------AT---------TG--G-C-----TTC-T-TAAGATAGG--T--TGTTGCTTAATACAGG
gi|6779 : TACAGTCAAACCTGTTTTAAGCAGCCA---GTC--AAGGG----A--AGG-A---GCAA-----------------A-----------------AG---------TG--A-C-----CTT-T-TAGGACAGG--T--TGTTGCTTAATACAGGG-AC-AT
gi|6849 : TACAGTCAAACGTGTCTTAAGCAGCCA---GTC--AAGGG----C--AGG-A---GCAA-----------------A-----------------AG---------TG--G-C-----CTT-T-TAAGACAGG--T--GGTTGCTTAATACAGGtt
gi|6842 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCA---GTC--AAGGG----A--AGG-A---GCAA-----------------A-----------------AG---------TG--G-C-----CTT-T-TACGACAGG--T--TGTTGCTTAATACAGG
gi|6798 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGTCA---GTC--AAGGA----A--AAG-A---GCAA-----------------A-----------------AC---------TG--G-T-----CTT-T-TAAGACAGG--T--TGTTGCTTAATACAGG
gi|6719 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAACCA---CTC--GAGGG----A--AAG-A---GCAA-----------------A-----------------AA---------TG--A-C-----CCT-T-TAAGACAAA--T--GGCTGCTTACTACAGG
gi|6813 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCA---GTC--AAGGG----A--ACA-A---GCAA-----------------A-----------------AG---------TG--G-C-----CTT-T-TAAGACAGG--T--TGTTGCTTAATACAGG
gi|6781 : TACAGTCAAACCTATCTTAAGCAGCCA---GTC--AAGGG----A--AGA-A---G-CA-----------------A-----------------AG---------TG--G-C-----CTC-T-TAAGACAGG--T--TGTTGCTTAATACAGG
gi|6791 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCAA---GTC--AAGGG----A--ATG-A---GCAA-----------------A-----------------AG---------TG--G-C-----CTT-T-TAAAACAGG--T--GGTTGCTTAATACAGGttagtttgccatgaaagcatggaaatgat
gi|6832 : TACAGTGAAACCTGTCTTAAGCAGCCA---GTC--AAGGG----A--AGG-A---GCCA-----------------A-----------------AT---------TG--A-C-----CTT-T-TAAGACAGG--T--TGTTGCTTAATA
gi|6758 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCA---GTC--AGGGG----A--AGT-A---GCAA-----------------A-----------------AG---------TG--G-C-----CTT-T-TAAGACAGG--T--GATTGCTTAATACAGGtgag
gi|6748 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCA---CTC--AAGGG----A--AAA-A---GCAA-----------------A-----------------AA---------TG--ACC-----TG--T-TAAGACATG--T--GGCTGCTTAATACAGG
gi|6774 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCA---GTC--AAAGG----A--ATG-A---GCAA-----------------A-----------------AC---------TG--G-C-----CTT-T-TAAGACAGG--T--TGTTGCTTAATATAGG
gi|6816 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCA---GTC--AAGGG----A--AGG-A---GCAA-----------------A-----------------AG---------TG--A-C-----CTT-T-TAAGACAGG--T--TGTTGCTTAAAGCAGG------TTA-ATTT--ACCCTGA
gi|6761 : TACAGTCAAACCTGTCTTTAGCAGCCA---CTC--AAGGG----A--AAG-A---GCAA-----------------A-----------------AG---------TG--A-C-----CCT-T-TAAGACAGG--T--GGATGCTTAATACAGGaagcataagacat
gi|6809 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCA---GTC--AAGGG----A--TGG-A---GCAA-----------------A-----------------AG---------TG--G-C-----CTT-T-TAAGACAGG--T--GGTTGCTTAATA
gi|6752 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCA---GTC--AAGGG----A--AGG-T---GCAA-----------------A-----------------A----------TG--G-C-----CAT-T-TAAGACAGG--T--TGTTGCTTAATAGAGG
gi|6819 : TACAGTCAAACCTGTCTTAGGCAGCCA---GTC--AAGGG----A--AGG-A---GCAA-----------------A-----------------AG---------TG--G-C-----CCT-T-CAAGACAGG--T--TGTTGCTTAATAAAGGT-TT-AT
gi|6830 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCA---GTC--AAGGG----A--ATG-A---GCAA-----------------A-----------------AG---------TG--G-C-----CTT-T-TAAGACAGG--T--TGTTGCTTAATAtt
gi|6778 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCA---CTC--AAGGG----A--AGG-T---GCAA-----------------A-----------------AG---------TG--G-C-----CTT-T-TAAGACAGG--T--TGTTGCTTAACACAGG
gi|6749 : TACAATCAAACCTGTGTTAAGCAGCCA---CTC--AAGGG----A--AAG-A---ACAA-----------------A-----------------AA---------TG--A-C-----CTC-T-TAAGACAGG--T--GGATGCTTAATACAGG
gi|6754 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGTAGCCA---CTC--AAGGG----A--AAG-A---GCAA-----------------A-----------------AA---------TG--A-C-----CTC-T-TAAGACAGG--T--GGTCGCTTAATA
gi|6738 : TACAGTCAAACCTGTTTTAAGCAGTCA---TTT--AAGGG----A--AAT-A---GCAA-----------------A-----------------AT---------TG--A-C-----ACC-T-TAATACAGG--T--GGCTGCTTAATACAGG
gi|6797 : TACAGTTAAACCTGTATTAAGCAGCCA---GTC--AAGGG----A--AGG-A---ACAA-----------------A-----------------AG---------TG--G-C-----CTT-T-TAAGACAGG--T--TGTTGCTTAATACAGG
gi|6829 : TACAATCAAACCTGTCTTAAGCAGCCA---GTC--AAGGG----A--AAG-A---GCAA-----------------A-----------------AG---------TG--G-C-----CTT-T-TAATACAGG--C--TGTTGCTAAATACAGGT-TT-AT
gi|6811 : TACAGTCAAACCTGTATTAAGCAGCCA---GTC--AAGGG----A--AGG-A---GCAA-----------------A-----------------AG---------TG--G-C-----CTT-T-TAAGACAGG--T--TGTTGCTGAATACAGttt
gi|6769 : TACAGTTTAACCTGTCTTAAGCAGCCA---GTC--AAGGG----A--AGA-A---GCAA-----------------A-----------------AG---------TG--G-C-----CTT-T-TAAGACAGG--T--TGTTGCTTAATACAGG
gi|6831 : TACGATCAAACCTGTCTTAAGCAGCCA---GTC--AAGGG----A--AGG-A---GCTG-----------------A-----------------AC---------TG--A-C-----CTT-T-TAAGACAGA--T--TGTTGCTTAATACAGG
gi|6803 : TACAGTGAAACCTGTCTTAAGCAGCCA---CTC--AAGGG----A--AAG-A---GCAA-----------------A-----------------GA---------TG--C-C-----CCC-T-TAAGGCAGG--T--GGCTTCTTAATACAGGtccgtat
gi|6745 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCA---CTC--AAGGG----A--AAT-A---GCAA-----------------A-----------------AA---------T---A-C-----CCC-T-TAAGGCAGG--T--GGCTGCTCAATACAGG
gi|6776 : TACAGTAAAACCTGTCTTAAGCAGCCA---CTC--AATGG----A--AAG-A---GCAA-----------------A-----------------CA---------TG--A-C-----CTC-T-TAAGACAGG--T--GGTTGCTTAATACAGG
gi|6825 : TACAATTAAACCTGTCGTAAACAGCCA---CTC--AAGAG----A--AAG-G---GCAA-----------------A-----------------AA---------TG--A-C-----CAC-T-TAAGGCAGG--T--GGCTGTTTAATACAGG
gi|6793 : TACAGTCAAACCTGCATTAAGCAGTCA---GTC--AAGGG----A--AGG-A---ACAA-----------------A-----------------AG---------TG--GCC-----TG--T-TAAGACAGG--T--TGTTGCTTAATACAGGT-TT-AT
gi|6789 : TACAATTAAACCTGTCTTAAACAGCCA---GTC--AAGGG-------AAT-G---ACCA-----------------A-----------------AC---------TG--G-C-----CTT-T-TAAGACAGG--T--TGTTGCTTAATACAGttgctatgaaagcatgaa
gi|6767 : TACAGTCAAACCTGTATGAAGCAGCCA---ATC--AGTGG----A--AGG-A---GCAA-----------------A-----------------AC---------TG--G-C-----CTT-T-TAAGACAGG--T--GGTTGCTTAATACAGG
gi|6794 : TACAGCTGAACCTGTCTTAAGCAGCCA---CTC--AAAG-----A--AAG-G---GCAA-----------------A-----------------AA---------TG--A-C-----CGC-T-TAAGACAGG--T--TGCTGCTTAACACAG
gi|6838 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCA---CTC--AGTGG----A--AGG-A---GCAA-----------------A-----------------AA---------TG--G-C-----C-T-T-TAAGACAGA--T--TGTTGCTTAATACAGG------TTA-ATTT
gi|6814 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCA---GTC--AGGGG----A--ATG-A---GCAA-----------------A-----------------AT---------TG--G-C-----CTT-T-TAACACAGG--C--TGTTGCTTAATAgtactgaaagc
gi|6731 : TACAGTCAAACCAGCTTTAAGCAGCCA---CTC--ATGGG----A--AAG-A---GCAA-----------------A-----------------AA---------TG--A-C-----ATC-T-TAAAACAGG--T--GGCTGCTTAATACAGG
gi|6759 : TACAGTCAAACCTGCCTTAAGCAGCCA---CTT--AAGGG----A--AAG-A---GTTA-----------------A-----------------AG---------T---A-C-----TCC-T-TAAAGCAGG--T--GGCTGCTTAATAAAGG
gi|6852 : TACAGTCAAACCTGTCTTAGGCAGCCA---CTC--AAGGG----A--AAG-A---GCAA-----------------A-----------------AT---------TG--A-C-----CCC-CATAAGGCAGA--T--GACTGCTTAATA
gi|6834 : TACGCTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCA---GTT--GAGGG----A--ATT-A---GCAA-----------------A-----------------AT---------TG--G-C-----CTT-T-TAAGACAGG--T--TGTTGCTTAATACAGG
gi|6828 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCA---GTC--AAGGG----A--AGT-A---GCAA-----------------A-----------------AA---------TG--G-C-----CTT-T-TAAGACAGG--T--TGTTGTTTAttaaaatgctgagaaagcacagaaattgattgcttattgttaaaaacag
gi|6820 : TACAGACAAACCTGTCTTAAGCAGCCA---GTC--AAGGG----A--AGC-A---GCAA-----------------A-----------------AG---------TG--G-C-----CTT-T-TAAGACAGG--T--TGTTGCTTAATAat
gi|6712 : TACAGTCAAACCTGTCTACAGCAGCCA---CTT--TAGGG----A--AAT-A---GCAA-----------------A-----------------AA---------TG--A-C-----CTC-T-TAAGACAGG--T--GGCTGCTTAATACAGGg
gi|6805 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGTCA---CTC--AAGGG----A--AAG-A---GCAA-----------------A-----------------AG---------TG--A-C-----C-T-T-TAATGCAGA--T--CGCTGCTTAATACAGG
gi|6770 : TACAGTCAAACCTATCTTAAGCAGCCA---CTC--AAGAG----A--AAT-A---GCAG-----------------A-----------------AA---------TG--A-C-----ATC-T-TAAGGCAGG--T--GCCTGCTTAATACAGG
gi|6784 : TACAGTAAAACCTGTCCTAAGCAGCCA---GTC--AAGGG----A--AAT-A---GCAA-----------------A-----------------AG---------TG--G-T-----CTT-T-TAACACAGG--T--TGGTGCTTAATACAGG
gi|6807 : TACAGTCTAACCTGTCTTGAGCAGCCA---CTC--AAGGG----A--AAG-A---A-CA-----------------A-----------------CT---------TG--A-T-----CAT-T-TAAGGCAGG--T--GGCTGCTAAATACAG
gi|6818 : TACAGTCAACCCTGTCTTAAGCAAACG---GTC--AAGGG----A--AAG-T---TCAA-----------------A-----------------AT---------CG--C-T-----TGC-T-TAACACAGG--T--TGGTGCTTAATAGAGGT-TT-TTC----TTTTACC
gi|6750 : TACAGCTTAACCTGTCTTAAGCAGCCA---CTC--ATGGG----A--AAT-A---GTAA-----------------A-----------------AG---------TGACG-C-----CGCTT-TAAGGCAGG--T--GACTGCTTAATACAGGT-TC-Aaa
gi|6783 : TACAGTAAAACCTGTCTTAAGCAGCCA---ATC--AAGGG----A--ATT-A---GCAA-----------------A-----------------AG---------TG--G-C-----CTT-T-TAACACAGG--T--TGTTGCTTAATAata
gi|6753 : TACAGTCTAACCTGTATTAAGCAGCCA---CCC--AAGGG----A--AAT-G---GCCA-----------------A-----------------AC---------T
gi|6765 : TACAGTCAAACGTGTAGTAAGCAACCA---CTC--AAGGG----A--AAT-A---GATA-----------------A-----------------AA---------TG--A-C-----CCC-T-CAACAGAGG--T--GGCTGCTTA
gi|6704 : ACAGCCA--CCTGTGTTAAGCAGCCA---GTT----------------T-G---GCCATTTCCCTT---------A-----------------GG---------TG--G-C-----TGC-T-TAATACAGG--T--Gat
gi|7091 : tacaacatACAGTCAAACTTGTCTTAAGCAACCA---CTC--AAGGG----A--AAG-A---GCAA-----------------A-----------------AC---------TG--A-C-----CCC-T-TAAGGCAGG--T--GGCTGCTTAATAttaatagagggtctatatttttacctcgaaagctggtcatgtttcttattgtgacagacattatatatataagtgatcgcacatgcatggtacatgttgtaccttgccagaaagttgtttggaattatgtactggggtaatccataaatgagaaaaaatcagcaagaagaaaacatttgaactcagtattttatataatattacatttagataaataaataattttatgttataattaaaaa
gi|6709 : CAGCCA--CCTGTCTTAAGCGGCCA---ATT----------------T-G---GCCCTTTCCCTT---------G-----------------GC---------TG--G-C-----TGC-T-TAAGACAGGTTT--GACTG
gi|6708 : taCAGCCA--CCTGTCTTAAGCGGCCA---ATT----------------T-G---GCCCTTTCCCTT---------G-----------------GC---------TG--G-C-----TGC-T-TAAGACAGGTTT--GACTGcctactacagggtcatcaattttcacccagattagcgaagtatttttgtatattggcacaata
gi|6716 : taCAGCCA--CCTGTCTTAAGCGGCCA---ATT----------------T-G---GCCCTTTTCCTT---------G-----------------GC---------TG--G-C-----TGC-T-TAAGACAGGTTT--GACTGcctactacagggtcatcaattttcacccagattagcgaagtatttttgtatattggcaca
gi|6714 : taCAGCCA--CCTGTCTTAAGCGGCCA---ATT----------------T-G---GCCCTTTCCCTT---------G-----------------GC---------TG--G-C-----TGC-T-TAAGACAGGTTT--GACTGcctactacagggtcatcaattttcacccagattagcgaagtatttttgtatattggcaca
gi|6713 : taCAGCCA--CCTGTCTTAAGCGGCCA---cctactacagggtcatcaattttcacccagattagcaaagtatttttgtatattggcaca
gi|6711 : tacagtcaaacctgtcttaagcagccagccaagggaaaggaccaaatCAGCCA--CCTGTCTTAAGCGGCCA---ATT----------------T-G---GCCCTTTCCCTT---------G-----------------GC---------TG--G-C-----TGC-T-TAAAACAGGTTT--GACTGcctactacagggtcatcaattttcacccagattagcgaagtatttttgtatattggcaca
gi|6718 : taCAGCCA--CCTGTCTTAAGCGGCCA---ATT----------------T-G---GCCCTTTCCCTT---------G-----------------GC---------TG--G-C-----TGC-T-TAAGACAGcctactacagggtcatcaattttcacccagattagcgaagtatttttgtatattggcaca
gi|6723 : tacagtcaaagCAGCCA--CCTGTCTTAAGCGGCCA---ATT----------------T-G---GCCCTTTTCCTT---------G-----------------GC---------TG--G-C-----TGC-T-TAAGACAGGTTT--GACTGcctactacagggtcatcaattttcacccagattagcgaagtatttttgtatattggcaca
gi|6727 : taCAGCCA--CCTGTCTTAAGCGGCCA---ATT----------------T-G---GCCCTTTCCCTT---------G-----------------GC---------TG--G-C-----TGC-T-TAAGACAGGTTT--GACTGcctactacagggtcatcaattttcacccagattagcaaagtatttttgtatattggcaca
gi|6695 : taCAGCCA--CCTGTATTAAGCAGCCA---Gcctactacatcatttttcacccagattagcgaagtatttttgtatattggcaca
gi|7167 : tacagtctaacctgtattaagcaaccacccaagggaaaaggccaaaCAGCCA--CCTGTATTAAGCAGCCA---Gcttaatagagggtcaatatttttactgacaaagctgcagtcgtgatgtttattaagacagataaaaagtgatcacacatgatggcacatggaccatgcctgtaagttgtactaggggtaaatgagaaaaaatctgcaggaagaaaatatttgaattgacacttttttatgtagaaactcatttaaataagtaaataatttatgttataaaattaaaaa
gi|6705 : ttaagcagccactcaagggaaatggtcaaaCAGTCA--CCTGTGTTAAGCAGTCA---G----------------AAT-G---GCCA-----------------T-----------------TTCCCTTGGG-TG--G-C-----TGC-T-TAATACAGG--TTAAGCTGcttaatagagggtccatatttttaccaagaaagctgaagtcatgatgtttattgagacagataaaaagtgatcacacatgatggtacatgtaccatgcctgtaagttgtactggtgataaatgagaaaagtctacaggaagaaaatatctgaactgacactattttatatagaagttcatttaaataaataaataattataaaattaaaaa
gi|7120 : taCAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCA---TTC--AAGGG----A--AAT-A---CCAA-----------------A-----------------AG---------TG--A-C-----CCC-T-TAGGGTAGG--T--GGCTGTTTAATACAGGcttaatagagggtccatatttttatcaagaaagctgaagtcaagatgtttattagaca
gi|7137 : GTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCA---GTC--AAGGG----A--AGG-A---GCAA-----------------A-----------------AG---------TG--G-C-----CTT-T-TAAGACAGG--T--GGTTGCTTAATACA-----C-GTTA-ATTT
gi|7138 : GTCAAAC-TGTCTTAAGCAGCCA---CTC--AAGGG----A--AAG-A---ACAA-----------------A-----------------AC---------TG--A-C-----CCC-T-TAAAGCAGG--T--GGCTTCTTAATACAGGactatgaaagc
gi|6693 : AACCCTCTATTAAGCAGTCA---TCT--GTGTC----A--AAC-A---GCCA-----------------G-----------------TT---------TG--A-C-----CAT-T-TCCCTTAGG--T--GGCTGCTTAATACAGG
gi|6739 : tacagtctaaAACCTGTATTAAGCAGCCACCTGCCTTAAGAG---------------GTCATTTTTGCTCTTTCTCTTG-----------------AG---------TG--G-C-----TGC-T-TAAGACAGGTTT--GACTGcatatttttaccgagaaagctgaagtcatgatatttattgagacagataaaaagtgataacacatgatggtacatgtaccatgcctgtaagttgtactgggagtaaatgaataaaatttgcaggaagaaaatatctgaactgacactattttatatagaagttcatttaaataaataaataatttatgttataaaataaaaaa
gi|6734 : taAACCTGTCTTAAACAGCCA---gattttacc
gi|6845 : tacagtcaaacctgtcttaagcagccagtcaaaggaaagagcagaagAACCTGTTTTAAGCAAC-A---ACC-----TGTCTTA--AAA-G---GTCA-----------------ATTTTGTCCCTTCCCTTGAC---------TG--G-C-----TGC-T-TAAGACAGGTTT--GACTGgttgcttaatagagg
gi|6777 : taAACCTGTCTTAAGCGGCCA---aatttgctgtgaaagc
gi|6789 : tacaggcaaacctatcttaagcagccagtcaaggaaaggagcaaaagAACCTGTCTTAAAAGGCCA---GTT----------------T-G---GTCATTCCCTT----------G-----------------AC---------TG--G-C-----TGT-T-TAAGACAGG--T--gttgcttaatacaggttacata
gi|6806 : tacaattaaAACCTGTCTTAAGCAGCCA---CTC--AAGGG----A--AAG-A---G-TA-----------------A-----------------AT---------TG--A-C-----CTC-T-TAAGGCAGG--T--GGCTACTTAATACAGGgttgcttaatacag
gi|7150 : tacatgaccAACCTGTCTTAAGCAGCCA---CTC--AAGGG----A--AAG-A---GTAA-----------------A-----------------AA---------TG--A-C-----CTC-T-TAAGACAGG--T--GGCTGCTTAATATAGG
gi|6834 : AACCTGTATTAAGCAAC-A---ACC-----TGTCTTA--AAA-G---GCCA-----------------ATTTTGCTAATTCCCTCAAC---------TG--G-C-----TGC-T-TAAGACAGG--T--
gi|6717 : tacgctcaaACCTGTCTTAAGCGGCCA---ATT----------------T-G---GCCCTTTCCCTT---------G-----------------GC---------TG--G-C-----TGC-T-TAAGACAGGTTT--GACTGaaaatgctgagaaagcacagaaattgattgcttattgttaaaaacag
gi|6699 : taACCTGTGTTAAGCAGCCA---GTT----------------T-G---GCC------------------------------------ATTCCTTTGTGTG--G-C-----TGC-T-TAATACAGG--TTAGACTGggctacctactacagggtcatcaattttcacccagattagtgaagtatttttgtatattggcaca
gi|6704 : taACCTGTATTAAGCAGCCA---CCT--AAGGG----A--AAT-G---GCCA-----------------A-----------------AC---------TG--G-C-----TGC-T-TAACACAGG--T--GGCTGTTTAATAGAGGG-TCTAT---ATTTTTACCggttgcttaatagagggtccatatttttaccgagaaagctgaagtcatgatgtttattgagacagataaaaggtgatcactgttgattgtacatgtaccatgcctgtaagttgtattggaggtaaatgagaaaaatccgtaggaagaaaatatttgaactgacactattttacaatgaacatttaaataaataaatagattatgttatataattagaaa
gi|6842 : tacaacatcCCTGTATTAAGCAACAA---CCT--GTCGT----A--AAA-G---GCCACTTTTGCTCCTTCCCTTG-----------------AC---------TG--G-C-----TGC-T-TAAGACAGGTTT--GACTGtcgaaagctggtcatgtttcttattgtgacagacattatatatataagtgatcgcacatgcatggtacatgttgtaccttgccagaaagttgtttggaattatgtactggggtaatccataaatgagaaaaaatcagcaagaagaaaacatttgaactcagtattttatataatattacatttagataaataaataattttatgttataattaaaaa
gi|6745 : taCCTGTATTGAGCAGCCACCTGCCTTAAGGG----G--TAT-TTTTGCTATTTCCCTT---------G-----------------AG---------TG--G-C-----TGC-T-TAAGACAGGTTT--GACTG
gi|6700 : taTTAAGCAGCCA----CC--TGTGT----A--AAGCA---GCCA-----------------G-----------------TT---------TG--G-CCATTTTCC-T-T-----GGG--T--GGCTGCTTAATACAGG
gi|7167 : tacagtctaaTTAAGCAGCCA---CTC--AAGGG----A--AAT-G---GTCA-----------------A-----------------AC---------TG--G-C-----TGC-T-TAATACAGG--T--GGCTGCTTAATAGAGGG-TC---CATATTTTTACCAAGA-AAGCTGAAGTCATGATGTTTATTGAGACAttgagggtccatatttttacagagaaagctgaagtcgtgatgtttattgagacggctaaaaagtgatcacacacgcatggtacatgtacaagaaaatatttgaactgacactattttatatagaagtacatttaaataaataaataatttatgttatttaattaaaaa
gi|6841 : -----------------A-----------------AC---------TG--G-C-----TGC-T-TAAGACGGGTTT--GACTGgataaaaagtgatcacacatgatggtacatgtaccatgcctgtaagttgtactggtgataaatgagaaaagtctacaggaagaaaatatctgaactgacactattttatatagaagttcatttaaataaataaataattataaaattaaaaa
gi|6759 : ta-----------------A-----------------AG---------TG--G-C-----TGC-T-TAAGGCAGGTTT--GACTGaagggaaggagcaaaagtgaccttttaagacaggtggttgcttaatacagg
gi|6768 : ta-----------------AC---------TG--G-C-----TGC-T-TAAGACAGGTTT--GACTGaagggaaagagttaaagtactccttaaagcaggtggctgcttaataaagg
gi|6792 : ta-----------------AC---------TG--G-C-----TGC-T-TAAGACAGGTTT--GACTGcaagggaaggagcaaaattggccttttaagacaggttgttgcttaatacagg
gi|6762 : ta-----------------AC---------TG--G-C-----TGC-T-TAAGACAGGTTT--GACTGcaagggaatgagcaaaagtggccttttaagacaggttgttgcttaatacagattaatttactctgaaagc
gi|6734 : ta-----------------AC---------TG--G-C-----TGC-T-TAAGACAGGTTT--GACTGcaagggaaaaggcaaaggtggccttttaagacaggttgttgcttaatacagg
gi|6790 : ta-----------------AC---------TG--G-C-----TGC-T-TAAGACAGGTTT--GACTGcaaaggaaagagcagaagtggctgtttaagacaggttgttgcttaatagagg
gi|7137 : ta-----------------AC---------TG--G-C-----TGC-T-TAAGACAGG--T--caagggagggagggagcaaaagtggccttttaagacaggtggctgcttaatacagg
gi|6777 : gtcaa-----------------AC---------TG--G-C-----TGC-T-TAAGATAGG--T----TTGCCTcaagggaaggagcaaaagtggccttttaagacaggtggttgcttaatacacgttaatttactatgaaagc
gi|6775 : tac-----------------AT---------TG--G-C-----TGC-T-TAAGACAGGTTT--GACTGcaaggaaaggagcaaaagtggccgcttaagacaggttgttgcttaatacaggttacata
gi|6844 : ta-----------------AC---------TG--A-C-----TGC-T-TAAGACAGGTTT--GACTGcaagggaaggagcaaaagtggccttttaagacaggttgttgcttaatacagg
gi|6810 : ta-----------------AC---------TG--G-C-----TGC-T-TAAGGCAGG--T--caagggaaggagcaaaagtggtcttttaagacaggttgttgcttaatacaggttaatttactatgaaagc
gi|6779 : tacagtgaa-----------------AC---------TG--G-C-----TGC-T-TAAAACAGGTTT--GACTGcaagggaatgagcaaattggcttcttaagataggttgttgcttaatacagg
gi|6798 : ta-----------------AC---------TG--A-C-----TGC-T-TAAGACAGGTTT--GACTGcaagggaaggagcaaaagtgaccttttaggacaggttgttgcttaatacagggacattt
gi|6813 : ta-----------------AC---------TG--G-C-----TGC-T-TAAGACAGGTTT--GACTGcaaggaaaagagcaaaactggtcttttaagacaggttgttgcttaatacagg
gi|6781 : ta-----------------AC---------TG--G-C-----TGC-T-TAAGATAGGTTT--GACTGcaagggaacaagcaaaagtggccttttaagacaggttgttgcttaatacagg
gi|6832 : ta-----------------AC---------TG--G-C-----TGC-T-TAAGACAGG--T--caagggaagaagcaaagtggcctcttaagacaggttgttgcttaatacaggttagtttgccatgaaagcatggaaatgat
gi|6758 : tacagtgaa-----------------AC---------TG--G-C-----TGC-T-TAAGACAGGTTT--GACTGcaagggaaggagccaaattgaccttttaagacaggttgttgcttaatatgag
gi|6774 : ta-----------------AC---------TG--G-C-----TGC-T-TAAGACAGGTTT--GACTGcaggggaagtagcaaaagtggccttttaagacaggtgattgcttaatacagg
gi|6816 : ta-----------------AC---------TG--G-C-----TGC-T-TAAGACAGGTTT--GACTGcaaaggaatgagcaaaactggccttttaagacaggttgttgcttaatatagg
gi|6809 : ta-----------------AC---------TG--G-C-----TGC-T-TAAGACAGGTTT--GACTGcaagggaaggagcaaaagtgaccttttaagacaggttgttgcttaaagcaggttaatttaccctgaaagcataagacat
gi|6752 : ta-----------------AC---------TG--G-C-----TGC-T-TAAGACAGGTTT--GACTGcaagggatggagcaaaagtggccttttaagacaggtggttgcttaata
gi|6819 : ta-----------------AC---------TG--G-C-----TGC-C-TAAGACAGGTTT--GACTGcaagggaaggtgcaaaatggccatttaagacaggttgttgcttaatagagg
gi|6830 : ta-----------------AC---------TG--G-C-----TGC-T-TAAGACAGGTTT--GACTGcaagggaaggagcaaaagtggcccttcaagacaggttgttgcttaataaaggtttattt
gi|6829 : ta-----------------AC---------TG--G-C-----TGC-T-TAAGACAGG--T--caagggaatgagcaaaagtggccttttaagacaggttgttgcttaata
gi|6769 : tacaatcaa-----------------AC---------TG--G-C-----TGC-T-TAAGACAGG--T--caagggaaagagcaaaagtggccttttaatacaggctgttgctaaatacaggtttatttt
gi|6831 : tacagttta-----------------AC---------TG--G-C-----TGC-T-TAAGACAGG--T--caagggaagaagcaaaagtggccttttaagacaggttgttgcttaatacagg
gi|6814 : tacgatcaa-----------------AC---------TG--G-C-----TGC-T-TAAGACAGGTTT--GACTGcaagggaaggagctgaactgaccttttaagacagattgttgcttaatacaggtccgtat
gi|6828 : ta-----------------AC---------TG--G-C-----TGC-T-TAAGACAGGTTT--GACTGcaggggaatgagcaaaattggccttttaacacaggctgttgcttaata
gi|6820 : ta-----------------AC---------TG--G-C-----TGC-T-TAAGACAGG--T--caagggaagtagcaaaaatggccttttaagacaggttgttgtttaat
gi|6784 : tacagacaa-----------------AC---------TG--G-C-----TGC-T-TAGGACAGG--T--caagggaagcagcaaaagtggccttttaagacaggttgttgcttaatag
gi|6783 : tacagtaaa-----------------AT---------TG--G-C-----TGC-T-TAAGACAGG--T--caagggaaatagcaaaagtggtcttttaacacaggttggtgcttaatacagg
gi|6713 : tacagtaaa---------TG--G-C-----TGC-T-TAAGACAGGTTT--GACTGcaagggaattagcaaaagtggccttttaacacaggttgttgcttaata
gi|6726 : ta---------TG--G-C-----TGC-T-TAAGACAGGTTT--GACTGgccaagggaaaggaccaaattggccgcttaagacaggtggctgcctactacagggtcatcaattttcacccagattagcgaagtatttttgtatattggcaca
gi|6730 : ta---------TG--G-C-----TGC-T-TAAGACAGGTTT--GACTGgccaagggaaagggccaaattagccgctttagacaggtggctgcctactacagggtcatcaattttcacccagattagcgaaatatttttgtatattggcacag
gi|6736 : ta---------TG--G-C-----TGC-T-TAAGACAGGTTT--GACTGgccaagggaaagtgccaaattggtcgcttaagacagaaggctgcctactacagggtcatcaattttcacccagattagcgaagtatttttgtatattggcaca
gi|6733 : ta---------TG--G-C-----TGC-T-TAAGACAGGTTT--GACTGgccaagggaaagggccaaattggccgcttaagactgcctactacagggtcatcaattttcacccagattagcgaagtatttttgtatattggcaca
gi|6737 : ta---------TG--G-C-----TGC-T-TAAGACAGGTTT--GACTGgccaagggaaagggccaaattagccgcttaagaccggtggctgcctactacagggaaatcaattttcacccaga
gi|6744 : ta---------TG--G-C-----TGC-T-TAAGACAGGTTT--GACTGctcaagggaaagagcaaaaatgacctcttaagacaggtggctgcttaatacagg
gi|6740 : ta---------TG--G-C-----TGC-T-TAAGACAGGTTT--GACTGttcaagggaaggagcaaaagtggctttttaagacaggttgttgcttaatacagggt
gi|6748 : ta---------TG--G-C-----TGC-T-TAAGACAGGTTT--GACTGctcaagggaaagaccaaaaatgacctcttaagacaagtggctgcttaatacagg
gi|6778 : ta---------TG--G-C-----TGC-T-TAAGACAGGTTT--GACTGctcaagggaaaaagcaaaaatgacctgttaagacatgtggctgcttaatacagg
gi|6803 : ta---------TG--G-C-----TGC-T-TAAGACAGG--T--ctcaagggaaggtgcaaaagtggccttttaagacaggttgttgcttaacacagg
gi|6776 : tacagtgaa---------TG--G-C-----TGC-T-TAAGACAGG--T--ctcaagggaaagagcaaagatgcccccttaaggcaggtggcttcttaatacagg
gi|6794 : tacagtaaa---------TG--G-C-----TGC-T-TAAGACAGG--TTCAGCTGctcaatggaaagagcaaacatgacctcttaagacaggtggttgcttaatacagg
gi|6838 : ta---------TG--G-C-----TGC-T-TAAGACAGGTTT--GACTGctcaaagaaagggcaaaaatgaccgcttaagacaggttgctgcttaacacag
gi|6806 : ta---------TG--G-C-----TGC-T-TAAGACAGG--T--ctcagtggaaggagcaaaaatggcctttaagacagattgttgcttaatacaggttaatttgtactgaaagc
gi|7150 : tacatgacca---------TG--G-C-----TGC-T-TAAGACAGG--T--ctcaagggaaagagtaaattgacctcttaaggcaggtggctacttaatacagg
gi|7120 : a---------TG--G-C-----TGC-T-TAAGACAGGTTT--GACTGctcaagggaaagagtaaaaatgacctcttaagacaggtggctgcttaatatagg
gi|7138 : ---------TG--G-C-----TGC-T-TAAGACAGttcaagggaaataccaaaagtgaccccttagggtaggtggctgtttaatacagg
gi|6750 : gtcaaa---------TG--G-C-----TGC-T-TAAGACAGG--TTAAGCTGctcaagggaaagaacaaaactgaccccttaaagcaggtggcttcttaatacagg
2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|7344 ): TGATTATTTGAGACCGATAAAAAGTGATCACACATGATTGTACATGAACCATGCCTGTAGGTTTACTGGGGTAAATGTGAAAGAACCGCAGGAAGAAAATATTTGAAATGACACTATTTTATATAGAACATTTCAATAAAAAAATAGATTATGCTATTTAATTAAAAA
Unaligned ( gi|7343 ): TTGTTACTGAGAAAGCTGAAGTCATGATGTTTATTGTGACAGACAAGAAGTGCTCATACATGTATGGTACATGTTGTACCATGCCTGTTAGTTGTTTGGAAATATGTACAGGGGTGAACCATGAATGAGAAAATCCTGAGGAAGAAAACATTTGATCTGGCAGTAATTTATATAGAAGTACATAGAAATAGAATCCAGAAGTTTACATGTT
Alignments
lowQualScore : 1
lowQualScore : 0 0000 0 1 00 7 0 0 0 1 44 8 5 2
lowQualScore : . .... . . .. . . . . . .. . . .
lowQualScore : 9 9999 4 4 66 8 4 4 3 8 88 8 7 0
consensus : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAAGAG----CAAAANTG--GCCTC-T-TAAGACAGGTGGCTGCTTAATACAGGGTC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-GAAGTATTTTTGTATATTGGCACA
Reference ( family-65 ) : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAAGAG----CAAAANTG--GCCGC-T-TAAGACAGGTGGCTGCTTAATACAGGGTC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-GAAGTATTTTTGTATATTGGCACA
gi|6692 : TACAGTCTAACATGTATTAAGCAGCCACCCAAGGGAAATGG----CCAAACTG--GTTGC-T-TAACACAGGTGGCTGCTTAATAGAGGGCC---CATATTTTTAC
gi|6693 : TACAGTCTAACCTGTATTAAGCAGCCACCTAAGGGAAATGG----TCAAACTG--GCTGT-T-TGACACAGATGACTGCTTAATAGAGGGT---TCATATTTTTACCGAGA-AAGCTGAAGTagagaaaactgaagtcatgaaatttattgagacagataaaaagtgatcacacatgatggtacatgtaccatgcctgtaagttgtactaggggtaaatgagaaaaattccacaggaagaaaatatttgaactgacactatattatatagaagttcatttaaataaataaataatttatgatataaaattaaaaa
gi|6695 : TACAGTCTAACCTGTATTAAGCAACCACCCAAGGGAAAAGG----CCAAACTG--GCTGC-T-TAATACAGGTGGCTGCTTAATAGAGGGTC-A--ATATTTTTACcatgatatttattgagacagataaaaagtgataacacatgatggtacatgtaccatgcctgtaagttgtactgggagtaaatgaataaaatttgcaggaagaaaatatctgaactgacactattttatatagaagttcatttaaataaataaataatttatgttataaaataaaaaa
gi|6699 : TACAGTCTAACCTGTATTAAGCAGCCACACAAAGGAATG-G----CCAAACTG--GCTGC-T-TAACACAGGTGGTTGCTTAATAGAGGGTC---CATATTTTTACCGAGA-AAGCTGAAGTCATGATGTTTATTGAGACAtgacaaagctgcagtcgtgatgtttattaagacagataaaaagtgatcacacatgatggcacatggaccatgcctgtaagttgtactaggggtaaatgagaaaaaatctgcaggaagaaaatatttgaattgacacttttttatgtagaaactcatttaaataagtaaataatttatgttataaaattaaaaa
gi|6700 : TACAGTCTAACCTGTATTAAGCAGCCACCCAAGGAAAATGG----CCAAACTG--GCTGC-T-TTACACAGGTGGCTGCTTAATTGAGGGTC---CATATTTTTACAGAGA-AAGCTGAAGTCGTGATGTTTATTGgataaaaggtgatcactgttgattgtacatgtaccatgcctgtaagttgtattggaggtaaatgagaaaaatccgtaggaagaaaatatttgaactgacactattttacaatgaacatttaaataaataaatagattatgttatataattagaaa
gi|6702 : TACAGTCTAACCTGTATTAAGCAGTCACCCAAGGGAAGTGG----CCAAACTG--ACTGC-T-TAACACAGGTGACCTCTTAATAGAGGGTCTAT---ATTTTCACAGAGA-AAGCTGAAGTAATGATGTTTATTGagacggctaaaaagtgatcacacacgcatggtacatgtacaagaaaatatttgaactgacactattttatatagaagtacatttaaataaataaataatttatgttatttaattaaaaa
gi|6704 : ACCTGTATTAAGCAGCCACCTAAGGGAAATGG----CCAAACTG--GCTGC-T-TAACACAGGTGGCTGTTTAATAGAGGGTCTAT---ATTTTTACCtgacagacaaaaagtgatcacacatgcatggtatatatcttgtaccatgcctgtaagctgtttggaattatgtacaggagtgaaggagaaaaatccacaagaagaaaacattaaattgtataaagaagtacatattaaaaaataattgatgttatctaatttaaaaa
gi|6705 : tacaacatcTACAGCTTAACCTGTATTAAGCAGCCACCCAAGGGAAATGG----CCATTCTG--ACTGC-T-TAACACAGGTGACTGCTTAATAGAGGGTC---CATATTTTTATCAAGA-AAGCTGAAGTtcgaaagctggtcatgtttcttattgtgacagacattatatatataagtgatcgcacatgcatggtacatgttgtaccttgccagaaagttgtttggaattatgtactggggtaatccataaatgagaaaaaatcagcaagaagaaaacatttgaactcagtattttatataatattacatttagataaataaataattttatgttataattaaaaa
gi|6706 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGCCAAGGGAAAGGG----CCAAATTG--GCTGC-T-TAAGACAGGTGGCTGCCTACTACAGGGTC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-GAAGTATTTTTGTATATTGGCACAcaagatgtttattagaca
gi|6708 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGCCAAGGGAAAGGG----CCAAATTG--GCCGC-T-TAAGACAGGTGGCTGCCTACTACAGGGTC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-GAAGTATTTTTGTATATTGGCACA
gi|6709 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGCCAAGGGAAAGGG----CCAAATTG--GCCGC-T-TAAGACAGGTGGCTGCCTACTACAGGGTC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-GAAGTATTTTTGTATATTGGCACA
gi|6711 : TACAGTCAAACCTGTTTTAAGCAGCCAGCCAAGGGAAAGGG----CCAAATTG--GCCGC-T-TAAGACAGGTGGCTGCCTACTACAGGGTC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-GAAGTATTTTTGTATATTGGCACAata
gi|6712 : TACAGTCAAACCTGTCTACAGCAGCCACTTTAGGGAAATAG----CAAAAATG--ACCTC-T-TAAGACAGGTGGCTGCTTAATACAGG
gi|6713 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGCCAAGGGAAAGGA----CCAAATTG--GCCGC-T-TAAGACAGGTGGCTGCCTACTACAGGGTC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-GAAGTATTTTTGTATATTGGCACA
gi|6714 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGCCAAGGGAAAGGG----CCAAATTG--GCCGC-T-TAAGACAGGTGGCTGCCTACTACAGGGTC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-AAAGTATTTTTGTATATTGGCACA
gi|6716 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGCCAAGGAAAAGGG----CCAAATTG--GCCGC-T-TAAGACAGGTGGCTGCCTACTACAGGGTC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-GAAGTATTTTTGTATATTGGCACA
gi|6717 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGCCAAGGGAAAGGG----CCAAATTG--GCCGC-T-TAAGACAGGTGGCTACCTACTACAGGGTC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGT-GAAGTATTTTTGTATATTGGCACA
gi|6718 : TACAGTCAAAGCTGTCTTAAGCAGCCAGCCAAGGGAAAGGG----CCAAATTG--GCCGC-T-TAAGACAGGTGGCTGCCTACTACAGGGTC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-GAAGTATTTTTGTATATTGGCACA
gi|6719 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAACCACTCGAGGGAAAGAG----CAAAAATG--ACCCT-T-TAAGACAAATGGCTGCTTACTACAGG
gi|6723 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGCCAAGGAAAAGGG----CCAAATTG--GCCGC-T-TAAGACAGGTGGCTGCCTACTACAGGGTC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-AAAGTATTTTTGTATATTGGCACA
gi|6726 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGCCAAGGGAAAGGG----CCAAATTA--GCCGC-T-TTAGACAGGTGGCTGCCTACTACAGGGTC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-GAAATATTTTTGTATATTGGCACA
gi|6727 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGCCAAGGGAAAGGG----CCAAATTG--GCCGC-T-TAAGACAGGTGGCTGCCTACTACA---TC-AT----TTTTCACCCAGATTAGC-GAAGTATTTTTGTATATTGGCACAg
gi|6730 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGCCAAGGGAAAGTG----CCAAATTG--GTCGC-T-TAAGACAGAAGGCTGCCTACTACAGGGTC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-GAAGTATTTTTGTATATTGGCACA
gi|6731 : TACAGTCAAACCAGCTTTAAGCAGCCACTCATGGGAAAGAG----CAAAAATG--ACATC-T-TAAAACAGGTGGCTGCTTAATACAGG
gi|6733 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGCCAAGGGAAAGGG----CCAAATTA--GCCGC-T-TAAGACCGGTGGCTGCCTACTACAGGGAA-ATCA-ATTTTCACCCAGA
gi|6734 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAAGGAAAGAG----CAGAAGTG--GCTGT-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATAGAGG
gi|6736 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGCCAAGGGAAAGGG----CCAAATTG--GCCGC-T-TAAGAC-------TGCCTACTACAGGGTC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-GAAGTATTTTTGTATATTGGCACA
gi|6737 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCACTCAAGGGAAAGAG----CAAAAATG--ACCTC-T-TAAGACAGGTGGCTGCTTAATACAGG
gi|6738 : TACAGTCAAACCTGTTTTAAGCAGTCATTTAAGGGAAATAG----CAAAATTG--ACACC-T-TAATACAGGTGGCTGCTTAATACAGG
gi|6739 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCACTCAAGAGAAAGAG----CAAAAATG--ACCTC-T-TAAGGCAGGTGGCTGCTTAATACAGG-----TTG-ATTTT-ACC
gi|6740 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCACTCAAGGGAAAGAC----CAAAAATG--ACCTC-T-TAAGACAAGTGGCTGCTTAATACAGG
gi|6744 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCATTCAAGGGAAGGAG----CAAAAGTG--GCTTT-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATACAGGGT
gi|6745 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCACTCAAGGGAAATAG----CAAAAAT---ACCCC-T-TAAGGCAGGTGGCTGCTCAATACAGG
gi|6748 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCACTCAAGGGAAAAAG----CAAAAATG--ACCTG-T-TAAGACATGTGGCTGCTTAATACAGG
gi|6749 : TACAATCAAACCTGTGTTAAGCAGCCACTCAAGGGAAAGAA----CAAAAATG--ACCTC-T-TAAGACAGGTGGATGCTTAATACAGG
gi|6750 : TACAGCTTAACCTGTCTTAAGCAGCCACTCATGGGAAATAG----TAAAAGTGACGCCGCTT-TAAGGCAGGTGACTGCTTAATACAGGTTC-A
gi|6752 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAGGTG----CAAAA-TG--GCCAT-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATAGAGGata
gi|6753 : TACAGTCTAACCTGTATTAAGCAGCCACCCAAGGGAAATGG----CCAAACT
gi|6754 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGTAGCCACTCAAGGGAAAGAG----CAAAAATG--ACCTC-T-TAAGACAGGTGGTCGCTTAATA
gi|6758 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAGGGGAAGTAG----CAAAAGTG--GCCTT-T-TAAGACAGGTGATTGCTTAATACAGG
gi|6759 : TACAGTCAAACCTGCCTTAAGCAGCCACTTAAGGGAAAGAG----TTAAAGT---ACTCC-T-TAAAGCAGGTGGCTGCTTAATAAAGG
gi|6761 : TACAGTCAAACCTGTCTTTAGCAGCCACTCAAGGGAAAGAG----CAAAAGTG--ACCCT-T-TAAGACAGGTGGATGCTTAATACAGG
gi|6762 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAAAGG----CAAAGGTG--GCCTT-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATACAGG
gi|6765 : TACAGTCAAACGTGTAGTAAGCAACCACTCAAGGGAAATAG----ATAAAATG--ACCCC-T-CAACAGAGGTGGCTGCTTAAT
gi|6767 : TACAGTCAAACCTGTATGAAGCAGCCAATCAGTGGAAGGAG----CAAAACTG--GCCTT-T-TAAGACAGGTGGTTGCTTAATACAGG
gi|6768 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAGGAG----CAAAATTG--GCCTT-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATACAGG
gi|6769 : TACAGTTTAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAGAAG----CAAAAGTG--GCCTT-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATACAGG
gi|6770 : TACAGTCAAACCTATCTTAAGCAGCCACTCAAGAGAAATAG----CAGAAATG--ACATC-T-TAAGGCAGGTGCCTGCTTAATACAGG
gi|6774 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAAGGAATGAG----CAAAACTG--GCCTT-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATATAGG
gi|6775 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAATCAAGGGAAGGAG----CAAAAGTG--GCCTT-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATACAGG
gi|6776 : TACAGTAAAACCTGTCTTAAGCAGCCACTCAATGGAAAGAG----CAAACATG--ACCTC-T-TAAGACAGGTGGTTGCTTAATACAGG
gi|6777 : TACAGGCAAACCTATCTTAAGCAGCCAGTCAAGGAAAGGAG----CAAAAGTG--GCCGC-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATACAGG
gi|6778 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCACTCAAGGGAAGGTG----CAAAAGTG--GCCTT-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAACACAGGttacata
gi|6779 : TACAGTCAAACCTGTTTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAGGAG----CAAAAGTG--ACCTT-T-TAGGACAGGTTGTTGCTTAATACAGGGAC-AT
gi|6781 : TACAGTCAAACCTATCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAGAAG----C-AAAGTG--GCCTC-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATACAGGtt
gi|6783 : TACAGTAAAACCTGTCTTAAGCAGCCAATCAAGGGAATTAG----CAAAAGTG--GCCTT-T-TAACACAGGTTGTTGCTTAATAttagtttgccatgaaagcatggaaatgat
gi|6784 : TACAGTAAAACCTGTCCTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAATAG----CAAAAGTG--GTCTT-T-TAACACAGGTTGGTGCTTAATACAGG
gi|6789 : TACAATTAAACCTGTCTTAAACAGCCAGTCAAGGGAATGA-----CCAAACTG--GCCTT-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATACAG
gi|6790 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAGGGAGGGAGCAAAAGTG--GCCTT-T-TAAGACAGGTGGCTGCTTAATACAGG
gi|6791 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCAAGTCAAGGGAATGAG----CAAAAGTG--GCCTT-T-TAAAACAGGTGGTTGCTTAATACAGG
gi|6792 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAATGAG----CAAAAGTG--GCCTT-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATACAG-----ATTA-ATTT
gi|6793 : TACAGTCAAACCTGCATTAAGCAGTCAGTCAAGGGAAGGAA----CAAAAGTG--GCCTG-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATACAGGTTT-ATactctgaaagc
gi|6794 : TACAGCTGAACCTGTCTTAAGCAGCCACTCAAAG-AAAGGG----CAAAAATG--ACCGC-T-TAAGACAGGTTGCTGCTTAACACAGttgctatgaaagcatgaa
gi|6797 : TACAGTTAAACCTGTATTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAGGAA----CAAAAGTG--GCCTT-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATACAGG
gi|6798 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGTCAGTCAAGGAAAAGAG----CAAAACTG--GTCTT-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATACAGG
gi|6803 : TACAGTGAAACCTGTCTTAAGCAGCCACTCAAGGGAAAGAG----CAAAGATG--CCCCC-T-TAAGGCAGGTGGCTTCTTAATACAGG
gi|6805 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGTCACTCAAGGGAAAGAG----CAAAAGTG--ACC-T-T-TAATGCAGATCGCTGCTTAATACAGG
gi|6806 : AACCTGTCTTAAGCAGCCACTCAAGGGAAAGAG----T-AAATTG--ACCTC-T-TAAGGCAGGTGGCTACTTAATACAGG
gi|6807 : tacatgaccTACAGTCTAACCTGTCTTGAGCAGCCACTCAAGGGAAAGAA----C-AACTTG--ATCAT-T-TAAGGCAGGTGGCTGCTAAATACAG
gi|6809 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGATGGAG----CAAAAGTG--GCCTT-T-TAAGACAGGTGGTTGCTTAATA
gi|6810 : TACAGTGAAACCTGCCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAATGAG----C-AAATTG--GCTTC-T-TAAGATAGGTTGTTGCTTAATACAGG
gi|6811 : TACAGTCAAACCTGTATTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAGGAG----CAAAAGTG--GCCTT-T-TAAGACAGGTTGTTGCTGAATACAG
gi|6813 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAACAAG----CAAAAGTG--GCCTT-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATACAGG
gi|6814 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAGGGGAATGAG----CAAAATTG--GCCTT-T-TAACACAGGCTGTTGCTTAATA
gi|6816 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAGGAG----CAAAAGTG--ACCTT-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAAAGCAGG-----TTA-ATTT--ACCCTGA
gi|6818 : TACAGTCAACCCTGTCTTAAGCAAACGGTCAAGGGAAAGTT----CAAAATCG--CTTGC-T-TAACACAGGTTGGTGCTTAATAGAGGTTT-TTC----TTTTACCaagcataagacat
gi|6819 : TACAGTCAAACCTGTCTTAGGCAGCCAGTCAAGGGAAGGAG----CAAAAGTG--GCCCT-T-CAAGACAGGTTGTTGCTTAATAAAGGTTT-ATaa
gi|6820 : TACAGACAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAGCAG----CAAAAGTG--GCCTT-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATAtt
gi|6825 : TACAATTAAACCTGTCGTAAACAGCCACTCAAGAGAAAGGG----CAAAAATG--ACCAC-T-TAAGGCAGGTGGCTGTTTAATACAGGg
gi|6828 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAGTAG----CAAAAATG--GCCTT-T-TAAGACAGGTTGTTGTTTAAT
gi|6829 : TACAATCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAAGAG----CAAAAGTG--GCCTT-T-TAATACAGGCTGTTGCTAAATACAGGTTT-AT
gi|6830 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAATGAG----CAAAAGTG--GCCTT-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATAttt
gi|6831 : TACGATCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAGGAG----CTGAACTG--ACCTT-T-TAAGACAGATTGTTGCTTAATACAGG
gi|6832 : TACAGTGAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAGGAG----CCAAATTG--ACCTT-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATAtccgtat
gi|6834 : TACGCTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTTGAGGGAATTAG----CAAAATTG--GCCTT-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATACAGGtgag
gi|6838 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCACTCAGTGGAAGGAG----CAAAAATG--GCC-T-T-TAAGACAGATTGTTGCTTAATACAGG-----TTA-ATTTttaaaatgctgagaaagcacagaaattgattgcttattgttaaaaacag
gi|6841 : TACAGTCAAACCCGTCTTAAGCAGCCAGTTAAGGGAAGGAG----CAAAAGTG--ACCTT-T-TAAGACAGGTGGTTGCTTAATACAGGgtactgaaagc
gi|6842 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAGGAG----CAAAAGTG--GCCTT-T-TACGACAGGTTGTTGCTTAATACAGG
gi|6844 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGTCAGTCAAGGGAAGGAG----CAAAAGTG--GTCTT-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATACAGG-----TTA-ATTT
gi|6845 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAGGGA----CAAAATTG--ACCTT-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAAAACAGG-----TTA-ATTTactatgaaagc
gi|6849 : TACAGTCAAACGTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGCAGGAG----CAAAAGTG--GCCTT-T-TAAGACAGGTGGTTGCTTAATACAGGgctgtgaaagc
gi|6852 : TACAGTCAAACCTGTCTTAGGCAGCCACTCAAGGGAAAGAG----CAAAATTG--ACCCC-CATAAGGCAGATGACTGCTTAATA
gi|7091 : ACAGTCAAACTTGTCTTAAGCAACCACTCAAGGGAAAGAG----CAAAACTG--ACCCC-T-TAAGGCAGGTGGCTGCTTAATA
gi|7120 : CAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCATTCAAGGGAAATAC----CAAAAGTG--ACCCC-T-TAGGGTAGGTGGCTGTTTAATACAGG
gi|7137 : GTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAGGAG----CAAAAGTG--GCCTT-T-TAAGACAGGTGGTTGCTTAATACA----C-GTTA-ATTT
gi|7138 : GTCAAAC-TGTCTTAAGCAGCCACTCAAGGGAAAGAA----CAAAACTG--ACCCC-T-TAAAGCAGGTGGCTTCTTAATACAGGactatgaaagc
gi|7150 : AACCTGTCTTAAGCAGCCACTCAAGGGAAAGAG----TAAAAATG--ACCTC-T-TAAGACAGGTGGCTGCTTAATATAGG
gi|7167 : TTAAGCAGCCACTCAAGGGAAATGG----TCAAACTG--GCTGC-T-TAATACAGGTGGCTGCTTAATAGAGGGTC---CATATTTTTACCAAGA-AAGCTGAAGTCATGATGTTTATTGAGACA
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|7344 ): TGATTATTTGAGACCGATAAAAAGTGATCACACATGATTGTACATGAACCATGCCTGTAGGTTTACTGGGGTAAATGTGAAAGAACCGCAGGAAGAAAATATTTGAAATGACACTATTTTATATAGAACATTTCAATAAAAAAATAGATTATGCTATTTAATTAAAAA
Unaligned ( gi|7343 ): TTGTTACTGAGAAAGCTGAAGTCATGATGTTTATTGTGACAGACAAGAAGTGCTCATACATGTATGGTACATGTTGTACCATGCCTGTTAGTTGTTTGGAAATATGTACAGGGGTGAACCATGAATGAGAAAATCCTGAGGAAGAAAACATTTGATCTGGCAGTAATTTATATAGAAGTACATAGAAATAGAATCCAGAAGTTTACATGTT
Alignments
lowQualScore : 1
lowQualScore : 0 0000 0 1 00 11 0 0 0 1 44 8 5 2
lowQualScore : . .... . . .. .. . . . . .. . . .
lowQualScore : 9 9999 4 8 66 00 4 4 3 8 88 8 7 0
consensus : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAAGAG----CAAAANTG--GCCT-C-T-TAAGACAGGTGGCTGCTTAATACAGGGTC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-GAAGTATTTTTGTATATTGGCACA
Reference ( family-65 ) : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAAGAG----CAAAANTG--GCCT-C-T-TAAGACAGGTGGCTGCTTAATACAGGGTC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-GAAGTATTTTTGTATATTGGCACA
gi|6692 : TACAGTCTAACATGTATTAAGCAGCCACCCAAGGGAAATGG----CCAAACTG--GTTG-C-T-TAACACAGGTGGCTGCTTAATAGAGGGCC---CATATTTTTAC
gi|6693 : TACAGTCTAACCTGTATTAAGCAGCCACCTAAGGGAAATGG----TCAAACTG--GCTG-T-T-TGACACAGATGACTGCTTAATAGAGGGT---TCATATTTTTACCGAGA-AAGCTGAAGTagagaaaactgaagtcatgaaatttattgagacagataaaaagtgatcacacatgatggtacatgtaccatgcctgtaagttgtactaggggtaaatgagaaaaattccacaggaagaaaatatttgaactgacactatattatatagaagttcatttaaataaataaataatttatgatataaaattaaaaa
gi|6695 : TACAGTCTAACCTGTATTAAGCAACCACCCAAGGGAAAAGG----CCAAACTG--GCTG-C-T-TAATACAGGTGGCTGCTTAATAGAGGGTC-A--ATATTTTTACcatgatatttattgagacagataaaaagtgataacacatgatggtacatgtaccatgcctgtaagttgtactgggagtaaatgaataaaatttgcaggaagaaaatatctgaactgacactattttatatagaagttcatttaaataaataaataatttatgttataaaataaaaaa
gi|6699 : TACAGTCTAACCTGTATTAAGCAGCCACACAAAGGAATG-G----CCAAACTG--GCTG-C-T-TAACACAGGTGGTTGCTTAATAGAGGGTC---CATATTTTTACCGAGA-AAGCTGAAGTCATGATGTTTATTGAGACAtgacaaagctgcagtcgtgatgtttattaagacagataaaaagtgatcacacatgatggcacatggaccatgcctgtaagttgtactaggggtaaatgagaaaaaatctgcaggaagaaaatatttgaattgacacttttttatgtagaaactcatttaaataagtaaataatttatgttataaaattaaaaa
gi|6700 : TACAGTCTAACCTGTATTAAGCAGCCACCCAAGGAAAATGG----CCAAACTG--GCTG-C-T-TTACACAGGTGGCTGCTTAATTGAGGGTC---CATATTTTTACAGAGA-AAGCTGAAGTCGTGATGTTTATTGgataaaaggtgatcactgttgattgtacatgtaccatgcctgtaagttgtattggaggtaaatgagaaaaatccgtaggaagaaaatatttgaactgacactattttacaatgaacatttaaataaataaatagattatgttatataattagaaa
gi|6702 : TACAGTCTAACCTGTATTAAGCAGTCACCCAAGGGAAGTGG----CCAAACTG--ACTG-C-T-TAACACAGGTGACCTCTTAATAGAGGGTCTAT---ATTTTCACAGAGA-AAGCTGAAGTAATGATGTTTATTGagacggctaaaaagtgatcacacacgcatggtacatgtacaagaaaatatttgaactgacactattttatatagaagtacatttaaataaataaataatttatgttatttaattaaaaa
gi|6704 : ACCTGTATTAAGCAGCCACCTAAGGGAAATGG----CCAAACTG--GCTG-C-T-TAACACAGGTGGCTGTTTAATAGAGGGTCTAT---ATTTTTACCtgacagacaaaaagtgatcacacatgcatggtatatatcttgtaccatgcctgtaagctgtttggaattatgtacaggagtgaaggagaaaaatccacaagaagaaaacattaaattgtataaagaagtacatattaaaaaataattgatgttatctaatttaaaaa
gi|6705 : tacaacatcTACAGCTTAACCTGTATTAAGCAGCCACCCAAGGGAAATGG----CCATTCTG--ACTG-C-T-TAACACAGGTGACTGCTTAATAGAGGGTC---CATATTTTTATCAAGA-AAGCTGAAGTtcgaaagctggtcatgtttcttattgtgacagacattatatatataagtgatcgcacatgcatggtacatgttgtaccttgccagaaagttgtttggaattatgtactggggtaatccataaatgagaaaaaatcagcaagaagaaaacatttgaactcagtattttatataatattacatttagataaataaataattttatgttataattaaaaa
gi|6706 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGCCAAGGGAAAGGG----CCAAATTG--GCTG-C-T-TAAGACAGGTGGCTGCCTACTACAGGGTC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-GAAGTATTTTTGTATATTGGCACAcaagatgtttattagaca
gi|6708 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGCCAAGGGAAAGGG----CCAAATTG--GCCG-C-T-TAAGACAGGTGGCTGCCTACTACAGGGTC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-GAAGTATTTTTGTATATTGGCACA
gi|6709 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGCCAAGGGAAAGGG----CCAAATTG--GCCG-C-T-TAAGACAGGTGGCTGCCTACTACAGGGTC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-GAAGTATTTTTGTATATTGGCACA
gi|6711 : TACAGTCAAACCTGTTTTAAGCAGCCAGCCAAGGGAAAGGG----CCAAATTG--GCCG-C-T-TAAGACAGGTGGCTGCCTACTACAGGGTC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-GAAGTATTTTTGTATATTGGCACAata
gi|6712 : TACAGTCAAACCTGTCTACAGCAGCCACTTTAGGGAAATAG----CAAAAATG--ACCT-C-T-TAAGACAGGTGGCTGCTTAATACAGG
gi|6713 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGCCAAGGGAAAGGA----CCAAATTG--GCCG-C-T-TAAGACAGGTGGCTGCCTACTACAGGGTC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-GAAGTATTTTTGTATATTGGCACA
gi|6714 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGCCAAGGGAAAGGG----CCAAATTG--GCCG-C-T-TAAGACAGGTGGCTGCCTACTACAGGGTC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-AAAGTATTTTTGTATATTGGCACA
gi|6716 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGCCAAGGAAAAGGG----CCAAATTG--GCCG-C-T-TAAGACAGGTGGCTGCCTACTACAGGGTC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-GAAGTATTTTTGTATATTGGCACA
gi|6717 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGCCAAGGGAAAGGG----CCAAATTG--GCCG-C-T-TAAGACAGGTGGCTACCTACTACAGGGTC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGT-GAAGTATTTTTGTATATTGGCACA
gi|6718 : TACAGTCAAAGCTGTCTTAAGCAGCCAGCCAAGGGAAAGGG----CCAAATTG--GCCG-C-T-TAAGACAGGTGGCTGCCTACTACAGGGTC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-GAAGTATTTTTGTATATTGGCACA
gi|6719 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAACCACTCGAGGGAAAGAG----CAAAAATG--ACCC-T-T-TAAGACAAATGGCTGCTTACTACAGG
gi|6723 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGCCAAGGAAAAGGG----CCAAATTG--GCCG-C-T-TAAGACAGGTGGCTGCCTACTACAGGGTC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-AAAGTATTTTTGTATATTGGCACA
gi|6726 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGCCAAGGGAAAGGG----CCAAATTA--GCCG-C-T-TTAGACAGGTGGCTGCCTACTACAGGGTC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-GAAATATTTTTGTATATTGGCACA
gi|6727 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGCCAAGGGAAAGGG----CCAAATTG--GCCG-C-T-TAAGACAGGTGGCTGCCTACTACA---TC-AT----TTTTCACCCAGATTAGC-GAAGTATTTTTGTATATTGGCACAg
gi|6730 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGCCAAGGGAAAGTG----CCAAATTG--GTCG-C-T-TAAGACAGAAGGCTGCCTACTACAGGGTC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-GAAGTATTTTTGTATATTGGCACA
gi|6731 : TACAGTCAAACCAGCTTTAAGCAGCCACTCATGGGAAAGAG----CAAAAATG--ACAT-C-T-TAAAACAGGTGGCTGCTTAATACAGG
gi|6733 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGCCAAGGGAAAGGG----CCAAATTA--GCCG-C-T-TAAGACCGGTGGCTGCCTACTACAGGGAA-ATCA-ATTTTCACCCAGA
gi|6734 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAAGGAAAGAG----CAGAAGTG--GCTG-T-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATAGAGG
gi|6736 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGCCAAGGGAAAGGG----CCAAATTG--GCCG-C-T-TAAGAC-------TGCCTACTACAGGGTC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-GAAGTATTTTTGTATATTGGCACA
gi|6737 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCACTCAAGGGAAAGAG----CAAAAATG--ACCT-C-T-TAAGACAGGTGGCTGCTTAATACAGG
gi|6738 : TACAGTCAAACCTGTTTTAAGCAGTCATTTAAGGGAAATAG----CAAAATTG--ACAC-C-T-TAATACAGGTGGCTGCTTAATACAGG
gi|6739 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCACTCAAGAGAAAGAG----CAAAAATG--ACCT-C-T-TAAGGCAGGTGGCTGCTTAATACAGG-----TTG-ATTTT-ACC
gi|6740 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCACTCAAGGGAAAGAC----CAAAAATG--ACCT-C-T-TAAGACAAGTGGCTGCTTAATACAGG
gi|6744 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCATTCAAGGGAAGGAG----CAAAAGTG--GCTT-T-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATACAGGGT
gi|6745 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCACTCAAGGGAAATAG----CAAAAAT---ACCC-C-T-TAAGGCAGGTGGCTGCTCAATACAGG
gi|6748 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCACTCAAGGGAAAAAG----CAAAAATG--ACCT-G-T-TAAGACATGTGGCTGCTTAATACAGG
gi|6749 : TACAATCAAACCTGTGTTAAGCAGCCACTCAAGGGAAAGAA----CAAAAATG--ACCT-C-T-TAAGACAGGTGGATGCTTAATACAGG
gi|6750 : TACAGCTTAACCTGTCTTAAGCAGCCACTCATGGGAAATAG----TAAAAGTGACGCCG-CTT-TAAGGCAGGTGACTGCTTAATACAGGTTC-A
gi|6752 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAGGTG----CAAAA-TG--GCCA-T-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATAGAGGata
gi|6753 : TACAGTCTAACCTGTATTAAGCAGCCACCCAAGGGAAATGG----CCAAACT
gi|6754 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGTAGCCACTCAAGGGAAAGAG----CAAAAATG--ACCT-C-T-TAAGACAGGTGGTCGCTTAATA
gi|6758 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAGGGGAAGTAG----CAAAAGTG--GCCT-T-T-TAAGACAGGTGATTGCTTAATACAGG
gi|6759 : TACAGTCAAACCTGCCTTAAGCAGCCACTTAAGGGAAAGAG----TTAAAGT---ACTC-C-T-TAAAGCAGGTGGCTGCTTAATAAAGG
gi|6761 : TACAGTCAAACCTGTCTTTAGCAGCCACTCAAGGGAAAGAG----CAAAAGTG--ACCC-T-T-TAAGACAGGTGGATGCTTAATACAGG
gi|6762 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAAAGG----CAAAGGTG--GCCT-T-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATACAGG
gi|6765 : TACAGTCAAACGTGTAGTAAGCAACCACTCAAGGGAAATAG----ATAAAATG--ACCC-C-T-CAACAGAGGTGGCTGCTTAAT
gi|6767 : TACAGTCAAACCTGTATGAAGCAGCCAATCAGTGGAAGGAG----CAAAACTG--GCCT-T-T-TAAGACAGGTGGTTGCTTAATACAGG
gi|6768 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAGGAG----CAAAATTG--GCCT-T-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATACAGG
gi|6769 : TACAGTTTAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAGAAG----CAAAAGTG--GCCT-T-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATACAGG
gi|6770 : TACAGTCAAACCTATCTTAAGCAGCCACTCAAGAGAAATAG----CAGAAATG--ACAT-C-T-TAAGGCAGGTGCCTGCTTAATACAGG
gi|6774 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAAGGAATGAG----CAAAACTG--GCCT-T-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATATAGG
gi|6775 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAATCAAGGGAAGGAG----CAAAAGTG--GCCT-T-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATACAGG
gi|6776 : TACAGTAAAACCTGTCTTAAGCAGCCACTCAATGGAAAGAG----CAAACATG--ACCT-C-T-TAAGACAGGTGGTTGCTTAATACAGG
gi|6777 : TACAGGCAAACCTATCTTAAGCAGCCAGTCAAGGAAAGGAG----CAAAAGTG--GCCG-C-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATACAGG
gi|6778 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCACTCAAGGGAAGGTG----CAAAAGTG--GCCT-T-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAACACAGGttacata
gi|6779 : TACAGTCAAACCTGTTTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAGGAG----CAAAAGTG--ACCT-T-T-TAGGACAGGTTGTTGCTTAATACAGGGAC-AT
gi|6781 : TACAGTCAAACCTATCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAGAAG----C-AAAGTG--GCCT-C-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATACAGGtt
gi|6783 : TACAGTAAAACCTGTCTTAAGCAGCCAATCAAGGGAATTAG----CAAAAGTG--GCCT-T-T-TAACACAGGTTGTTGCTTAATAttagtttgccatgaaagcatggaaatgat
gi|6784 : TACAGTAAAACCTGTCCTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAATAG----CAAAAGTG--GTCT-T-T-TAACACAGGTTGGTGCTTAATACAGG
gi|6789 : TACAATTAAACCTGTCTTAAACAGCCAGTCAAGGGAATGA-----CCAAACTG--GCCT-T-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATACAG
gi|6790 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAGGGAGGGAGCAAAAGTG--GCCT-T-T-TAAGACAGGTGGCTGCTTAATACAGG
gi|6791 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCAAGTCAAGGGAATGAG----CAAAAGTG--GCCT-T-T-TAAAACAGGTGGTTGCTTAATACAGG
gi|6792 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAATGAG----CAAAAGTG--GCCT-T-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATACAG-----ATTA-ATTT
gi|6793 : TACAGTCAAACCTGCATTAAGCAGTCAGTCAAGGGAAGGAA----CAAAAGTG--GCCT-G-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATACAGGTTT-ATactctgaaagc
gi|6794 : TACAGCTGAACCTGTCTTAAGCAGCCACTCAAAG-AAAGGG----CAAAAATG--ACCG-C-T-TAAGACAGGTTGCTGCTTAACACAGttgctatgaaagcatgaa
gi|6797 : TACAGTTAAACCTGTATTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAGGAA----CAAAAGTG--GCCT-T-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATACAGG
gi|6798 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGTCAGTCAAGGAAAAGAG----CAAAACTG--GTCT-T-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATACAGG
gi|6803 : TACAGTGAAACCTGTCTTAAGCAGCCACTCAAGGGAAAGAG----CAAAGATG--CCCC-C-T-TAAGGCAGGTGGCTTCTTAATACAGG
gi|6805 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGTCACTCAAGGGAAAGAG----CAAAAGTG--ACCT---T-TAATGCAGATCGCTGCTTAATACAGG
gi|6806 : AACCTGTCTTAAGCAGCCACTCAAGGGAAAGAG----T-AAATTG--ACCT-C-T-TAAGGCAGGTGGCTACTTAATACAGG
gi|6807 : tacatgaccTACAGTCTAACCTGTCTTGAGCAGCCACTCAAGGGAAAGAA----C-AACTTG--ATCA-T-T-TAAGGCAGGTGGCTGCTAAATACAG
gi|6809 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGATGGAG----CAAAAGTG--GCCT-T-T-TAAGACAGGTGGTTGCTTAATA
gi|6810 : TACAGTGAAACCTGCCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAATGAG----C-AAATTG--GCTT-C-T-TAAGATAGGTTGTTGCTTAATACAGG
gi|6811 : TACAGTCAAACCTGTATTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAGGAG----CAAAAGTG--GCCT-T-T-TAAGACAGGTTGTTGCTGAATACAG
gi|6813 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAACAAG----CAAAAGTG--GCCT-T-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATACAGG
gi|6814 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAGGGGAATGAG----CAAAATTG--GCCT-T-T-TAACACAGGCTGTTGCTTAATA
gi|6816 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAGGAG----CAAAAGTG--ACCT-T-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAAAGCAGG-----TTA-ATTT--ACCCTGA
gi|6818 : TACAGTCAACCCTGTCTTAAGCAAACGGTCAAGGGAAAGTT----CAAAA-TC--GCTTGC-T-TAACACAGGTTGGTGCTTAATAGAGGTTT-TTC----TTTTACCaagcataagacat
gi|6819 : TACAGTCAAACCTGTCTTAGGCAGCCAGTCAAGGGAAGGAG----CAAAAGTG--GCCC-T-T-CAAGACAGGTTGTTGCTTAATAAAGGTTT-ATaa
gi|6820 : TACAGACAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAGCAG----CAAAAGTG--GCCT-T-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATAtt
gi|6825 : TACAATTAAACCTGTCGTAAACAGCCACTCAAGAGAAAGGG----CAAAAATG--ACCA-C-T-TAAGGCAGGTGGCTGTTTAATACAGGg
gi|6828 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAGTAG----CAAAAATG--GCCT-T-T-TAAGACAGGTTGTTGTTTAAT
gi|6829 : TACAATCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAAGAG----CAAAAGTG--GCCT-T-T-TAATACAGGCTGTTGCTAAATACAGGTTT-AT
gi|6830 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAATGAG----CAAAAGTG--GCCT-T-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATAttt
gi|6831 : TACGATCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAGGAG----CTGAACTG--ACCT-T-T-TAAGACAGATTGTTGCTTAATACAGG
gi|6832 : TACAGTGAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAGGAG----CCAAATTG--ACCT-T-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATAtccgtat
gi|6834 : TACGCTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTTGAGGGAATTAG----CAAAATTG--GCCT-T-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATACAGGtgag
gi|6838 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCACTCAGTGGAAGGAG----CAAAAATG--GCCT---T-TAAGACAGATTGTTGCTTAATACAGG-----TTA-ATTTttaaaatgctgagaaagcacagaaattgattgcttattgttaaaaacag
gi|6841 : TACAGTCAAACCCGTCTTAAGCAGCCAGTTAAGGGAAGGAG----CAAAAGTG--ACCT-T-T-TAAGACAGGTGGTTGCTTAATACAGGgtactgaaagc
gi|6842 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAGGAG----CAAAAGTG--GCCT-T-T-TACGACAGGTTGTTGCTTAATACAGG
gi|6844 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGTCAGTCAAGGGAAGGAG----CAAAAGTG--GTCT-T-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATACAGG-----TTA-ATTT
gi|6845 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAGGGA----CAAAATTG--ACCT-T-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAAAACAGG-----TTA-ATTTactatgaaagc
gi|6849 : TACAGTCAAACGTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGCAGGAG----CAAAAGTG--GCCT-T-T-TAAGACAGGTGGTTGCTTAATACAGGgctgtgaaagc
gi|6852 : TACAGTCAAACCTGTCTTAGGCAGCCACTCAAGGGAAAGAG----CAAAATTG--ACCC-C-CATAAGGCAGATGACTGCTTAATA
gi|7091 : ACAGTCAAACTTGTCTTAAGCAACCACTCAAGGGAAAGAG----CAAAACTG--ACCC-C-T-TAAGGCAGGTGGCTGCTTAATA
gi|7120 : CAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCATTCAAGGGAAATAC----CAAAAGTG--ACCC-C-T-TAGGGTAGGTGGCTGTTTAATACAGG
gi|7137 : GTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAGGAG----CAAAAGTG--GCCT-T-T-TAAGACAGGTGGTTGCTTAATACA----C-GTTA-ATTT
gi|7138 : GTCAAAC-TGTCTTAAGCAGCCACTCAAGGGAAAGAA----CAAAACTG--ACCC-C-T-TAAAGCAGGTGGCTTCTTAATACAGGactatgaaagc
gi|7150 : AACCTGTCTTAAGCAGCCACTCAAGGGAAAGAG----TAAAAATG--ACCT-C-T-TAAGACAGGTGGCTGCTTAATATAGG
gi|7167 : TTAAGCAGCCACTCAAGGGAAATGG----TCAAACTG--GCTG-C-T-TAATACAGGTGGCTGCTTAATAGAGGGTC---CATATTTTTACCAAGA-AAGCTGAAGTCATGATGTTTATTGAGACA
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|7344 ): TGATTATTTGAGACCGATAAAAAGTGATCACACATGATTGTACATGAACCATGCCTGTAGGTTTACTGGGGTAAATGTGAAAGAACCGCAGGAAGAAAATATTTGAAATGACACTATTTTATATAGAACATTTCAATAAAAAAATAGATTATGCTATTTAATTAAAAA
Unaligned ( gi|7343 ): TTGTTACTGAGAAAGCTGAAGTCATGATGTTTATTGTGACAGACAAGAAGTGCTCATACATGTATGGTACATGTTGTACCATGCCTGTTAGTTGTTTGGAAATATGTACAGGGGTGAACCATGAATGAGAAAATCCTGAGGAAGAAAACATTTGATCTGGCAGTAATTTATATAGAAGTACATAGAAATAGAATCCAGAAGTTTACATGTT
Alignments
lowQualScore : 1
lowQualScore : 0 0000 0 1 00 11 0 0 0 1 44 8 5 2
lowQualScore : . .... . . .. .. . . . . .. . . .
lowQualScore : 9 9999 4 8 66 00 4 4 3 8 88 8 7 0
consensus : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAAGAG----CAAAANTG--GCCT-C-T-TAAGACAGGTGGCTGCTTAATACAGGGTC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-GAAGTATTTTTGTATATTGGCACA
Reference ( family-65 ) : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAAGAG----CAAAANTG--GCCT-C-T-TAAGACAGGTGGCTGCTTAATACAGGGTC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-GAAGTATTTTTGTATATTGGCACA
gi|6692 : TACAGTCTAACATGTATTAAGCAGCCACCCAAGGGAAATGG----CCAAACTG--GTTG-C-T-TAACACAGGTGGCTGCTTAATAGAGGGCC---CATATTTTTAC
gi|6693 : TACAGTCTAACCTGTATTAAGCAGCCACCTAAGGGAAATGG----TCAAACTG--GCTG-T-T-TGACACAGATGACTGCTTAATAGAGGGT---TCATATTTTTACCGAGA-AAGCTGAAGTagagaaaactgaagtcatgaaatttattgagacagataaaaagtgatcacacatgatggtacatgtaccatgcctgtaagttgtactaggggtaaatgagaaaaattccacaggaagaaaatatttgaactgacactatattatatagaagttcatttaaataaataaataatttatgatataaaattaaaaa
gi|6695 : TACAGTCTAACCTGTATTAAGCAACCACCCAAGGGAAAAGG----CCAAACTG--GCTG-C-T-TAATACAGGTGGCTGCTTAATAGAGGGTC-A--ATATTTTTACcatgatatttattgagacagataaaaagtgataacacatgatggtacatgtaccatgcctgtaagttgtactgggagtaaatgaataaaatttgcaggaagaaaatatctgaactgacactattttatatagaagttcatttaaataaataaataatttatgttataaaataaaaaa
gi|6699 : TACAGTCTAACCTGTATTAAGCAGCCACACAAAGGAATG-G----CCAAACTG--GCTG-C-T-TAACACAGGTGGTTGCTTAATAGAGGGTC---CATATTTTTACCGAGA-AAGCTGAAGTCATGATGTTTATTGAGACAtgacaaagctgcagtcgtgatgtttattaagacagataaaaagtgatcacacatgatggcacatggaccatgcctgtaagttgtactaggggtaaatgagaaaaaatctgcaggaagaaaatatttgaattgacacttttttatgtagaaactcatttaaataagtaaataatttatgttataaaattaaaaa
gi|6700 : TACAGTCTAACCTGTATTAAGCAGCCACCCAAGGAAAATGG----CCAAACTG--GCTG-C-T-TTACACAGGTGGCTGCTTAATTGAGGGTC---CATATTTTTACAGAGA-AAGCTGAAGTCGTGATGTTTATTGgataaaaggtgatcactgttgattgtacatgtaccatgcctgtaagttgtattggaggtaaatgagaaaaatccgtaggaagaaaatatttgaactgacactattttacaatgaacatttaaataaataaatagattatgttatataattagaaa
gi|6702 : TACAGTCTAACCTGTATTAAGCAGTCACCCAAGGGAAGTGG----CCAAACTG--ACTG-C-T-TAACACAGGTGACCTCTTAATAGAGGGTCTAT---ATTTTCACAGAGA-AAGCTGAAGTAATGATGTTTATTGagacggctaaaaagtgatcacacacgcatggtacatgtacaagaaaatatttgaactgacactattttatatagaagtacatttaaataaataaataatttatgttatttaattaaaaa
gi|6704 : ACCTGTATTAAGCAGCCACCTAAGGGAAATGG----CCAAACTG--GCTG-C-T-TAACACAGGTGGCTGTTTAATAGAGGGTCTAT---ATTTTTACCtgacagacaaaaagtgatcacacatgcatggtatatatcttgtaccatgcctgtaagctgtttggaattatgtacaggagtgaaggagaaaaatccacaagaagaaaacattaaattgtataaagaagtacatattaaaaaataattgatgttatctaatttaaaaa
gi|6705 : tacaacatcTACAGCTTAACCTGTATTAAGCAGCCACCCAAGGGAAATGG----CCATTCTG--ACTG-C-T-TAACACAGGTGACTGCTTAATAGAGGGTC---CATATTTTTATCAAGA-AAGCTGAAGTtcgaaagctggtcatgtttcttattgtgacagacattatatatataagtgatcgcacatgcatggtacatgttgtaccttgccagaaagttgtttggaattatgtactggggtaatccataaatgagaaaaaatcagcaagaagaaaacatttgaactcagtattttatataatattacatttagataaataaataattttatgttataattaaaaa
gi|6706 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGCCAAGGGAAAGGG----CCAAATTG--GCTG-C-T-TAAGACAGGTGGCTGCCTACTACAGGGTC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-GAAGTATTTTTGTATATTGGCACAcaagatgtttattagaca
gi|6708 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGCCAAGGGAAAGGG----CCAAATTG--GCCG-C-T-TAAGACAGGTGGCTGCCTACTACAGGGTC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-GAAGTATTTTTGTATATTGGCACA
gi|6709 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGCCAAGGGAAAGGG----CCAAATTG--GCCG-C-T-TAAGACAGGTGGCTGCCTACTACAGGGTC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-GAAGTATTTTTGTATATTGGCACA
gi|6711 : TACAGTCAAACCTGTTTTAAGCAGCCAGCCAAGGGAAAGGG----CCAAATTG--GCCG-C-T-TAAGACAGGTGGCTGCCTACTACAGGGTC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-GAAGTATTTTTGTATATTGGCACAata
gi|6712 : TACAGTCAAACCTGTCTACAGCAGCCACTTTAGGGAAATAG----CAAAAATG--ACCT-C-T-TAAGACAGGTGGCTGCTTAATACAGG
gi|6713 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGCCAAGGGAAAGGA----CCAAATTG--GCCG-C-T-TAAGACAGGTGGCTGCCTACTACAGGGTC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-GAAGTATTTTTGTATATTGGCACA
gi|6714 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGCCAAGGGAAAGGG----CCAAATTG--GCCG-C-T-TAAGACAGGTGGCTGCCTACTACAGGGTC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-AAAGTATTTTTGTATATTGGCACA
gi|6716 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGCCAAGGAAAAGGG----CCAAATTG--GCCG-C-T-TAAGACAGGTGGCTGCCTACTACAGGGTC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-GAAGTATTTTTGTATATTGGCACA
gi|6717 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGCCAAGGGAAAGGG----CCAAATTG--GCCG-C-T-TAAGACAGGTGGCTACCTACTACAGGGTC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGT-GAAGTATTTTTGTATATTGGCACA
gi|6718 : TACAGTCAAAGCTGTCTTAAGCAGCCAGCCAAGGGAAAGGG----CCAAATTG--GCCG-C-T-TAAGACAGGTGGCTGCCTACTACAGGGTC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-GAAGTATTTTTGTATATTGGCACA
gi|6719 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAACCACTCGAGGGAAAGAG----CAAAAATG--ACCC-T-T-TAAGACAAATGGCTGCTTACTACAGG
gi|6723 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGCCAAGGAAAAGGG----CCAAATTG--GCCG-C-T-TAAGACAGGTGGCTGCCTACTACAGGGTC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-AAAGTATTTTTGTATATTGGCACA
gi|6726 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGCCAAGGGAAAGGG----CCAAATTA--GCCG-C-T-TTAGACAGGTGGCTGCCTACTACAGGGTC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-GAAATATTTTTGTATATTGGCACA
gi|6727 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGCCAAGGGAAAGGG----CCAAATTG--GCCG-C-T-TAAGACAGGTGGCTGCCTACTACA---TC-AT----TTTTCACCCAGATTAGC-GAAGTATTTTTGTATATTGGCACAg
gi|6730 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGCCAAGGGAAAGTG----CCAAATTG--GTCG-C-T-TAAGACAGAAGGCTGCCTACTACAGGGTC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-GAAGTATTTTTGTATATTGGCACA
gi|6731 : TACAGTCAAACCAGCTTTAAGCAGCCACTCATGGGAAAGAG----CAAAAATG--ACAT-C-T-TAAAACAGGTGGCTGCTTAATACAGG
gi|6733 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGCCAAGGGAAAGGG----CCAAATTA--GCCG-C-T-TAAGACCGGTGGCTGCCTACTACAGGGAA-ATCA-ATTTTCACCCAGA
gi|6734 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAAGGAAAGAG----CAGAAGTG--GCTG-T-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATAGAGG
gi|6736 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGCCAAGGGAAAGGG----CCAAATTG--GCCG-C-T-TAAGAC-------TGCCTACTACAGGGTC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-GAAGTATTTTTGTATATTGGCACA
gi|6737 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCACTCAAGGGAAAGAG----CAAAAATG--ACCT-C-T-TAAGACAGGTGGCTGCTTAATACAGG
gi|6738 : TACAGTCAAACCTGTTTTAAGCAGTCATTTAAGGGAAATAG----CAAAATTG--ACAC-C-T-TAATACAGGTGGCTGCTTAATACAGG
gi|6739 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCACTCAAGAGAAAGAG----CAAAAATG--ACCT-C-T-TAAGGCAGGTGGCTGCTTAATACAGG-----TTG-ATTTT-ACC
gi|6740 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCACTCAAGGGAAAGAC----CAAAAATG--ACCT-C-T-TAAGACAAGTGGCTGCTTAATACAGG
gi|6744 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCATTCAAGGGAAGGAG----CAAAAGTG--GCTT-T-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATACAGGGT
gi|6745 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCACTCAAGGGAAATAG----CAAAAAT---ACCC-C-T-TAAGGCAGGTGGCTGCTCAATACAGG
gi|6748 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCACTCAAGGGAAAAAG----CAAAAATG--ACCT-G-T-TAAGACATGTGGCTGCTTAATACAGG
gi|6749 : TACAATCAAACCTGTGTTAAGCAGCCACTCAAGGGAAAGAA----CAAAAATG--ACCT-C-T-TAAGACAGGTGGATGCTTAATACAGG
gi|6750 : TACAGCTTAACCTGTCTTAAGCAGCCACTCATGGGAAATAG----TAAAAGTGACGCCG-CTT-TAAGGCAGGTGACTGCTTAATACAGGTTC-A
gi|6752 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAGGTG----CAAAA-TG--GCCA-T-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATAGAGGata
gi|6753 : TACAGTCTAACCTGTATTAAGCAGCCACCCAAGGGAAATGG----CCAAACT
gi|6754 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGTAGCCACTCAAGGGAAAGAG----CAAAAATG--ACCT-C-T-TAAGACAGGTGGTCGCTTAATA
gi|6758 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAGGGGAAGTAG----CAAAAGTG--GCCT-T-T-TAAGACAGGTGATTGCTTAATACAGG
gi|6759 : TACAGTCAAACCTGCCTTAAGCAGCCACTTAAGGGAAAGAG----TTAAAGT---ACTC-C-T-TAAAGCAGGTGGCTGCTTAATAAAGG
gi|6761 : TACAGTCAAACCTGTCTTTAGCAGCCACTCAAGGGAAAGAG----CAAAAGTG--ACCC-T-T-TAAGACAGGTGGATGCTTAATACAGG
gi|6762 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAAAGG----CAAAGGTG--GCCT-T-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATACAGG
gi|6765 : TACAGTCAAACGTGTAGTAAGCAACCACTCAAGGGAAATAG----ATAAAATG--ACCC-C-T-CAACAGAGGTGGCTGCTTAAT
gi|6767 : TACAGTCAAACCTGTATGAAGCAGCCAATCAGTGGAAGGAG----CAAAACTG--GCCT-T-T-TAAGACAGGTGGTTGCTTAATACAGG
gi|6768 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAGGAG----CAAAATTG--GCCT-T-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATACAGG
gi|6769 : TACAGTTTAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAGAAG----CAAAAGTG--GCCT-T-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATACAGG
gi|6770 : TACAGTCAAACCTATCTTAAGCAGCCACTCAAGAGAAATAG----CAGAAATG--ACAT-C-T-TAAGGCAGGTGCCTGCTTAATACAGG
gi|6774 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAAGGAATGAG----CAAAACTG--GCCT-T-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATATAGG
gi|6775 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAATCAAGGGAAGGAG----CAAAAGTG--GCCT-T-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATACAGG
gi|6776 : TACAGTAAAACCTGTCTTAAGCAGCCACTCAATGGAAAGAG----CAAACATG--ACCT-C-T-TAAGACAGGTGGTTGCTTAATACAGG
gi|6777 : TACAGGCAAACCTATCTTAAGCAGCCAGTCAAGGAAAGGAG----CAAAAGTG--GCCG-C-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATACAGG
gi|6778 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCACTCAAGGGAAGGTG----CAAAAGTG--GCCT-T-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAACACAGGttacata
gi|6779 : TACAGTCAAACCTGTTTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAGGAG----CAAAAGTG--ACCT-T-T-TAGGACAGGTTGTTGCTTAATACAGGGAC-AT
gi|6781 : TACAGTCAAACCTATCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAGAAG----C-AAAGTG--GCCT-C-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATACAGGtt
gi|6783 : TACAGTAAAACCTGTCTTAAGCAGCCAATCAAGGGAATTAG----CAAAAGTG--GCCT-T-T-TAACACAGGTTGTTGCTTAATAttagtttgccatgaaagcatggaaatgat
gi|6784 : TACAGTAAAACCTGTCCTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAATAG----CAAAAGTG--GTCT-T-T-TAACACAGGTTGGTGCTTAATACAGG
gi|6789 : TACAATTAAACCTGTCTTAAACAGCCAGTCAAGGGAATGA-----CCAAACTG--GCCT-T-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATACAG
gi|6790 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAGGGAGGGAGCAAAAGTG--GCCT-T-T-TAAGACAGGTGGCTGCTTAATACAGG
gi|6791 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCAAGTCAAGGGAATGAG----CAAAAGTG--GCCT-T-T-TAAAACAGGTGGTTGCTTAATACAGG
gi|6792 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAATGAG----CAAAAGTG--GCCT-T-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATACAG-----ATTA-ATTT
gi|6793 : TACAGTCAAACCTGCATTAAGCAGTCAGTCAAGGGAAGGAA----CAAAAGTG--GCCT-G-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATACAGGTTT-ATactctgaaagc
gi|6794 : TACAGCTGAACCTGTCTTAAGCAGCCACTCAAAG-AAAGGG----CAAAAATG--ACCG-C-T-TAAGACAGGTTGCTGCTTAACACAGttgctatgaaagcatgaa
gi|6797 : TACAGTTAAACCTGTATTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAGGAA----CAAAAGTG--GCCT-T-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATACAGG
gi|6798 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGTCAGTCAAGGAAAAGAG----CAAAACTG--GTCT-T-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATACAGG
gi|6803 : TACAGTGAAACCTGTCTTAAGCAGCCACTCAAGGGAAAGAG----CAAAGATG--CCCC-C-T-TAAGGCAGGTGGCTTCTTAATACAGG
gi|6805 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGTCACTCAAGGGAAAGAG----CAAAAGTG--ACCT---T-TAATGCAGATCGCTGCTTAATACAGG
gi|6806 : AACCTGTCTTAAGCAGCCACTCAAGGGAAAGAG----T-AAATTG--ACCT-C-T-TAAGGCAGGTGGCTACTTAATACAGG
gi|6807 : tacatgaccTACAGTCTAACCTGTCTTGAGCAGCCACTCAAGGGAAAGAA----C-AACTTG--ATCA-T-T-TAAGGCAGGTGGCTGCTAAATACAG
gi|6809 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGATGGAG----CAAAAGTG--GCCT-T-T-TAAGACAGGTGGTTGCTTAATA
gi|6810 : TACAGTGAAACCTGCCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAATGAG----C-AAATTG--GCTT-C-T-TAAGATAGGTTGTTGCTTAATACAGG
gi|6811 : TACAGTCAAACCTGTATTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAGGAG----CAAAAGTG--GCCT-T-T-TAAGACAGGTTGTTGCTGAATACAG
gi|6813 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAACAAG----CAAAAGTG--GCCT-T-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATACAGG
gi|6814 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAGGGGAATGAG----CAAAATTG--GCCT-T-T-TAACACAGGCTGTTGCTTAATA
gi|6816 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAGGAG----CAAAAGTG--ACCT-T-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAAAGCAGG-----TTA-ATTT--ACCCTGA
gi|6818 : TACAGTCAACCCTGTCTTAAGCAAACGGTCAAGGGAAAGTT----CAAAA-TC--GCTTGC-T-TAACACAGGTTGGTGCTTAATAGAGGTTT-TTC----TTTTACCaagcataagacat
gi|6819 : TACAGTCAAACCTGTCTTAGGCAGCCAGTCAAGGGAAGGAG----CAAAAGTG--GCCC-T-T-CAAGACAGGTTGTTGCTTAATAAAGGTTT-ATaa
gi|6820 : TACAGACAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAGCAG----CAAAAGTG--GCCT-T-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATAtt
gi|6825 : TACAATTAAACCTGTCGTAAACAGCCACTCAAGAGAAAGGG----CAAAAATG--ACCA-C-T-TAAGGCAGGTGGCTGTTTAATACAGGg
gi|6828 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAGTAG----CAAAAATG--GCCT-T-T-TAAGACAGGTTGTTGTTTAAT
gi|6829 : TACAATCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAAGAG----CAAAAGTG--GCCT-T-T-TAATACAGGCTGTTGCTAAATACAGGTTT-AT
gi|6830 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAATGAG----CAAAAGTG--GCCT-T-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATAttt
gi|6831 : TACGATCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAGGAG----CTGAACTG--ACCT-T-T-TAAGACAGATTGTTGCTTAATACAGG
gi|6832 : TACAGTGAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAGGAG----CCAAATTG--ACCT-T-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATAtccgtat
gi|6834 : TACGCTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTTGAGGGAATTAG----CAAAATTG--GCCT-T-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATACAGGtgag
gi|6838 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCACTCAGTGGAAGGAG----CAAAAATG--GCCT---T-TAAGACAGATTGTTGCTTAATACAGG-----TTA-ATTTttaaaatgctgagaaagcacagaaattgattgcttattgttaaaaacag
gi|6841 : TACAGTCAAACCCGTCTTAAGCAGCCAGTTAAGGGAAGGAG----CAAAAGTG--ACCT-T-T-TAAGACAGGTGGTTGCTTAATACAGGgtactgaaagc
gi|6842 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAGGAG----CAAAAGTG--GCCT-T-T-TACGACAGGTTGTTGCTTAATACAGG
gi|6844 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGTCAGTCAAGGGAAGGAG----CAAAAGTG--GTCT-T-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATACAGG-----TTA-ATTT
gi|6845 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAGGGA----CAAAATTG--ACCT-T-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAAAACAGG-----TTA-ATTTactatgaaagc
gi|6849 : TACAGTCAAACGTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGCAGGAG----CAAAAGTG--GCCT-T-T-TAAGACAGGTGGTTGCTTAATACAGGgctgtgaaagc
gi|6852 : TACAGTCAAACCTGTCTTAGGCAGCCACTCAAGGGAAAGAG----CAAAATTG--ACCC-C-CATAAGGCAGATGACTGCTTAATA
gi|7091 : ACAGTCAAACTTGTCTTAAGCAACCACTCAAGGGAAAGAG----CAAAACTG--ACCC-C-T-TAAGGCAGGTGGCTGCTTAATA
gi|7120 : CAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCATTCAAGGGAAATAC----CAAAAGTG--ACCC-C-T-TAGGGTAGGTGGCTGTTTAATACAGG
gi|7137 : GTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAGGAG----CAAAAGTG--GCCT-T-T-TAAGACAGGTGGTTGCTTAATACA----C-GTTA-ATTT
gi|7138 : GTCAAAC-TGTCTTAAGCAGCCACTCAAGGGAAAGAA----CAAAACTG--ACCC-C-T-TAAAGCAGGTGGCTTCTTAATACAGGactatgaaagc
gi|7150 : AACCTGTCTTAAGCAGCCACTCAAGGGAAAGAG----TAAAAATG--ACCT-C-T-TAAGACAGGTGGCTGCTTAATATAGG
gi|7167 : TTAAGCAGCCACTCAAGGGAAATGG----TCAAACTG--GCTG-C-T-TAATACAGGTGGCTGCTTAATAGAGGGTC---CATATTTTTACCAAGA-AAGCTGAAGTCATGATGTTTATTGAGACA
blockSeqs : C TG G TA T T T
blockSeqs : C G G TA T T T
blockSeqs : C G G A T T T
blockSeqs : C G G A T T T
blockSeqs : C G G A T T T
blockSeqs : C G G A T T .
blockSeqs : C G G A . T .
blockSeqs : T G G A . T .
blockSeqs : T G G A . T .
blockSeqs : T G G A . T .
blockSeqs : T G G A . T .
blockSeqs : A G G A . T .
blockSeqs : T T G A . T .
blockSeqs : T G G A . T .
blockSeqs : T G G A . . .
blockSeqs : T G G A . . .
blockSeqs : T G G A . . .
blockSeqs : A G G A . . .
blockSeqs : T C G A . . .
blockSeqs : T G G A .
blockSeqs : T G G A .
blockSeqs : T G G A .
blockSeqs : A G T T .
blockSeqs : T T G A .
blockSeqs : G G T A .
blockSeqs : T G T G .
blockSeqs : A G T . .
blockSeqs : T T T . .
blockSeqs : A C G . .
blockSeqs : A T . . .
blockSeqs : G T . . .
blockSeqs : A T . .
blockSeqs : A C . .
blockSeqs : A T . .
blockSeqs : G T . .
blockSeqs : C G . .
blockSeqs : A A .
blockSeqs : G T
blockSeqs : G T
blockSeqs : G C
blockSeqs : G C
blockSeqs : A T
blockSeqs : C C
blockSeqs : T T
blockSeqs : G T
blockSeqs : A T
blockSeqs : C T
blockSeqs : G T
blockSeqs : A T
blockSeqs : G T
blockSeqs : G G
blockSeqs : G T
blockSeqs : G T
blockSeqs : G T
blockSeqs : G T
blockSeqs : C T
blockSeqs : G T
blockSeqs : G T
blockSeqs : G T
blockSeqs : G T
blockSeqs : A T
blockSeqs : G G
blockSeqs : C T
blockSeqs : A T
blockSeqs : G C
blockSeqs : T T
blockSeqs : T T
blockSeqs : G A
blockSeqs : T T
blockSeqs : G T
blockSeqs : G T
blockSeqs : T T
blockSeqs : G T
blockSeqs : G T
blockSeqs : G C
blockSeqs : A T
blockSeqs : A A
blockSeqs : G T
blockSeqs : G T
blockSeqs : C T
blockSeqs : T T
blockSeqs : T T
blockSeqs : A T
blockSeqs : G T
blockSeqs : G T
blockSeqs : G T
blockSeqs : T T
blockSeqs : G T
blockSeqs : T T
blockSeqs : C C
blockSeqs : G C
blockSeqs : G C
blockSeqs : C T
blockSeqs : A C
blockSeqs : C T
blockSeqs : . G
blockSeqs : .
blockSeqCons : A*
originalCons : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAAGAG----CAAAANTG--GCCT-C-T-TAAGACAGGTGGCTGCTTAATACAGGGTC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-GAAGTATTTTTGTATATTGGCACA
finalCons : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAAGAG----CAAAANTG--GCCT-C-T-TAAGACAGGTGGCTGCTTAATACAGGGTCA-TCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-GAAGTATTTTTGTATATTGGCACA
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|7344 ): TGATTATTTGAGACCGATAAAAAGTGATCACACATGATTGTACATGAACCATGCCTGTAGGTTTACTGGGGTAAATGTGAAAGAACCGCAGGAAGAAAATATTTGAAATGACACTATTTTATATAGAACATTTCAATAAAAAAATAGATTATGCTATTTAATTAAAAA
Unaligned ( gi|7343 ): TTGTTACTGAGAAAGCTGAAGTCATGATGTTTATTGTGACAGACAAGAAGTGCTCATACATGTATGGTACATGTTGTACCATGCCTGTTAGTTGTTTGGAAATATGTACAGGGGTGAACCATGAATGAGAAAATCCTGAGGAAGAAAACATTTGATCTGGCAGTAATTTATATAGAAGTACATAGAAATAGAATCCAGAAGTTTACATGTT
Alignments
lowQualScore : 1
lowQualScore : 0 0000 0 1 00 11 0 0 0 1 44 8 5 2
lowQualScore : . .... . . .. .. . . . . .. . . .
lowQualScore : 9 9999 4 8 66 00 4 4 3 8 88 8 7 0
consensus : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAAGAG----CAAAANTG--GCCT-C-T-TAAGACAGGTGGCTGCTTAATACAGGGTC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-GAAGTATTTTTGTATATTGGCACA
Reference ( family-65 ) : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAAGAG----CAAAANTG--GCCT-C-T-TAAGACAGGTGGCTGCTTAATACAGGGTC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-GAAGTATTTTTGTATATTGGCACA
gi|6692 : TACAGTCTAACATGTATTAAGCAGCCACCCAAGGGAAATGG----CCAAACTG--GTTG-C-T-TAACACAGGTGGCTGCTTAATAGAGGGCC---CATATTTTTAC
gi|6693 : TACAGTCTAACCTGTATTAAGCAGCCACCTAAGGGAAATGG----TCAAACTG--GCTG-T-T-TGACACAGATGACTGCTTAATAGAGGGT---TCATATTTTTACCGAGA-AAGCTGAAGTagagaaaactgaagtcatgaaatttattgagacagataaaaagtgatcacacatgatggtacatgtaccatgcctgtaagttgtactaggggtaaatgagaaaaattccacaggaagaaaatatttgaactgacactatattatatagaagttcatttaaataaataaataatttatgatataaaattaaaaa
gi|6695 : TACAGTCTAACCTGTATTAAGCAACCACCCAAGGGAAAAGG----CCAAACTG--GCTG-C-T-TAATACAGGTGGCTGCTTAATAGAGGGTC-A--ATATTTTTACcatgatatttattgagacagataaaaagtgataacacatgatggtacatgtaccatgcctgtaagttgtactgggagtaaatgaataaaatttgcaggaagaaaatatctgaactgacactattttatatagaagttcatttaaataaataaataatttatgttataaaataaaaaa
gi|6699 : TACAGTCTAACCTGTATTAAGCAGCCACACAAAGGAATG-G----CCAAACTG--GCTG-C-T-TAACACAGGTGGTTGCTTAATAGAGGGTC---CATATTTTTACCGAGA-AAGCTGAAGTCATGATGTTTATTGAGACAtgacaaagctgcagtcgtgatgtttattaagacagataaaaagtgatcacacatgatggcacatggaccatgcctgtaagttgtactaggggtaaatgagaaaaaatctgcaggaagaaaatatttgaattgacacttttttatgtagaaactcatttaaataagtaaataatttatgttataaaattaaaaa
gi|6700 : TACAGTCTAACCTGTATTAAGCAGCCACCCAAGGAAAATGG----CCAAACTG--GCTG-C-T-TTACACAGGTGGCTGCTTAATTGAGGGTC---CATATTTTTACAGAGA-AAGCTGAAGTCGTGATGTTTATTGgataaaaggtgatcactgttgattgtacatgtaccatgcctgtaagttgtattggaggtaaatgagaaaaatccgtaggaagaaaatatttgaactgacactattttacaatgaacatttaaataaataaatagattatgttatataattagaaa
gi|6702 : TACAGTCTAACCTGTATTAAGCAGTCACCCAAGGGAAGTGG----CCAAACTG--ACTG-C-T-TAACACAGGTGACCTCTTAATAGAGGGTCTAT---ATTTTCACAGAGA-AAGCTGAAGTAATGATGTTTATTGagacggctaaaaagtgatcacacacgcatggtacatgtacaagaaaatatttgaactgacactattttatatagaagtacatttaaataaataaataatttatgttatttaattaaaaa
gi|6704 : ACCTGTATTAAGCAGCCACCTAAGGGAAATGG----CCAAACTG--GCTG-C-T-TAACACAGGTGGCTGTTTAATAGAGGGTCTAT---ATTTTTACCtgacagacaaaaagtgatcacacatgcatggtatatatcttgtaccatgcctgtaagctgtttggaattatgtacaggagtgaaggagaaaaatccacaagaagaaaacattaaattgtataaagaagtacatattaaaaaataattgatgttatctaatttaaaaa
gi|6705 : tacaacatcTACAGCTTAACCTGTATTAAGCAGCCACCCAAGGGAAATGG----CCATTCTG--ACTG-C-T-TAACACAGGTGACTGCTTAATAGAGGGTC---CATATTTTTATCAAGA-AAGCTGAAGTtcgaaagctggtcatgtttcttattgtgacagacattatatatataagtgatcgcacatgcatggtacatgttgtaccttgccagaaagttgtttggaattatgtactggggtaatccataaatgagaaaaaatcagcaagaagaaaacatttgaactcagtattttatataatattacatttagataaataaataattttatgttataattaaaaa
gi|6706 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGCCAAGGGAAAGGG----CCAAATTG--GCTG-C-T-TAAGACAGGTGGCTGCCTACTACAGGGTC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-GAAGTATTTTTGTATATTGGCACAcaagatgtttattagaca
gi|6708 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGCCAAGGGAAAGGG----CCAAATTG--GCCG-C-T-TAAGACAGGTGGCTGCCTACTACAGGGTC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-GAAGTATTTTTGTATATTGGCACA
gi|6709 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGCCAAGGGAAAGGG----CCAAATTG--GCCG-C-T-TAAGACAGGTGGCTGCCTACTACAGGGTC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-GAAGTATTTTTGTATATTGGCACA
gi|6711 : TACAGTCAAACCTGTTTTAAGCAGCCAGCCAAGGGAAAGGG----CCAAATTG--GCCG-C-T-TAAGACAGGTGGCTGCCTACTACAGGGTC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-GAAGTATTTTTGTATATTGGCACAata
gi|6712 : TACAGTCAAACCTGTCTACAGCAGCCACTTTAGGGAAATAG----CAAAAATG--ACCT-C-T-TAAGACAGGTGGCTGCTTAATACAGG
gi|6713 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGCCAAGGGAAAGGA----CCAAATTG--GCCG-C-T-TAAGACAGGTGGCTGCCTACTACAGGGTC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-GAAGTATTTTTGTATATTGGCACA
gi|6714 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGCCAAGGGAAAGGG----CCAAATTG--GCCG-C-T-TAAGACAGGTGGCTGCCTACTACAGGGTC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-AAAGTATTTTTGTATATTGGCACA
gi|6716 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGCCAAGGAAAAGGG----CCAAATTG--GCCG-C-T-TAAGACAGGTGGCTGCCTACTACAGGGTC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-GAAGTATTTTTGTATATTGGCACA
gi|6717 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGCCAAGGGAAAGGG----CCAAATTG--GCCG-C-T-TAAGACAGGTGGCTACCTACTACAGGGTC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGT-GAAGTATTTTTGTATATTGGCACA
gi|6718 : TACAGTCAAAGCTGTCTTAAGCAGCCAGCCAAGGGAAAGGG----CCAAATTG--GCCG-C-T-TAAGACAGGTGGCTGCCTACTACAGGGTC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-GAAGTATTTTTGTATATTGGCACA
gi|6719 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAACCACTCGAGGGAAAGAG----CAAAAATG--ACCC-T-T-TAAGACAAATGGCTGCTTACTACAGG
gi|6723 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGCCAAGGAAAAGGG----CCAAATTG--GCCG-C-T-TAAGACAGGTGGCTGCCTACTACAGGGTC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-AAAGTATTTTTGTATATTGGCACA
gi|6726 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGCCAAGGGAAAGGG----CCAAATTA--GCCG-C-T-TTAGACAGGTGGCTGCCTACTACAGGGTC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-GAAATATTTTTGTATATTGGCACA
gi|6727 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGCCAAGGGAAAGGG----CCAAATTG--GCCG-C-T-TAAGACAGGTGGCTGCCTACTACA---TC-AT----TTTTCACCCAGATTAGC-GAAGTATTTTTGTATATTGGCACAg
gi|6730 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGCCAAGGGAAAGTG----CCAAATTG--GTCG-C-T-TAAGACAGAAGGCTGCCTACTACAGGGTC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-GAAGTATTTTTGTATATTGGCACA
gi|6731 : TACAGTCAAACCAGCTTTAAGCAGCCACTCATGGGAAAGAG----CAAAAATG--ACAT-C-T-TAAAACAGGTGGCTGCTTAATACAGG
gi|6733 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGCCAAGGGAAAGGG----CCAAATTA--GCCG-C-T-TAAGACCGGTGGCTGCCTACTACAGGGAA-ATCA-ATTTTCACCCAGA
gi|6734 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAAGGAAAGAG----CAGAAGTG--GCTG-T-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATAGAGG
gi|6736 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGCCAAGGGAAAGGG----CCAAATTG--GCCG-C-T-TAAGAC-------TGCCTACTACAGGGTC-ATCA-ATTTTCACCCAGATTAGC-GAAGTATTTTTGTATATTGGCACA
gi|6737 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCACTCAAGGGAAAGAG----CAAAAATG--ACCT-C-T-TAAGACAGGTGGCTGCTTAATACAGG
gi|6738 : TACAGTCAAACCTGTTTTAAGCAGTCATTTAAGGGAAATAG----CAAAATTG--ACAC-C-T-TAATACAGGTGGCTGCTTAATACAGG
gi|6739 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCACTCAAGAGAAAGAG----CAAAAATG--ACCT-C-T-TAAGGCAGGTGGCTGCTTAATACAGG-----TTG-ATTTT-ACC
gi|6740 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCACTCAAGGGAAAGAC----CAAAAATG--ACCT-C-T-TAAGACAAGTGGCTGCTTAATACAGG
gi|6744 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCATTCAAGGGAAGGAG----CAAAAGTG--GCTT-T-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATACAGGGT
gi|6745 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCACTCAAGGGAAATAG----CAAAAAT---ACCC-C-T-TAAGGCAGGTGGCTGCTCAATACAGG
gi|6748 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCACTCAAGGGAAAAAG----CAAAAATG--ACCT-G-T-TAAGACATGTGGCTGCTTAATACAGG
gi|6749 : TACAATCAAACCTGTGTTAAGCAGCCACTCAAGGGAAAGAA----CAAAAATG--ACCT-C-T-TAAGACAGGTGGATGCTTAATACAGG
gi|6750 : TACAGCTTAACCTGTCTTAAGCAGCCACTCATGGGAAATAG----TAAAAGTGACGCCG-CTT-TAAGGCAGGTGACTGCTTAATACAGGTTC-A
gi|6752 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAGGTG----CAAAA-TG--GCCA-T-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATAGAGGata
gi|6753 : TACAGTCTAACCTGTATTAAGCAGCCACCCAAGGGAAATGG----CCAAACT
gi|6754 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGTAGCCACTCAAGGGAAAGAG----CAAAAATG--ACCT-C-T-TAAGACAGGTGGTCGCTTAATA
gi|6758 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAGGGGAAGTAG----CAAAAGTG--GCCT-T-T-TAAGACAGGTGATTGCTTAATACAGG
gi|6759 : TACAGTCAAACCTGCCTTAAGCAGCCACTTAAGGGAAAGAG----TTAAAGT---ACTC-C-T-TAAAGCAGGTGGCTGCTTAATAAAGG
gi|6761 : TACAGTCAAACCTGTCTTTAGCAGCCACTCAAGGGAAAGAG----CAAAAGTG--ACCC-T-T-TAAGACAGGTGGATGCTTAATACAGG
gi|6762 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAAAGG----CAAAGGTG--GCCT-T-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATACAGG
gi|6765 : TACAGTCAAACGTGTAGTAAGCAACCACTCAAGGGAAATAG----ATAAAATG--ACCC-C-T-CAACAGAGGTGGCTGCTTAAT
gi|6767 : TACAGTCAAACCTGTATGAAGCAGCCAATCAGTGGAAGGAG----CAAAACTG--GCCT-T-T-TAAGACAGGTGGTTGCTTAATACAGG
gi|6768 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAGGAG----CAAAATTG--GCCT-T-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATACAGG
gi|6769 : TACAGTTTAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAGAAG----CAAAAGTG--GCCT-T-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATACAGG
gi|6770 : TACAGTCAAACCTATCTTAAGCAGCCACTCAAGAGAAATAG----CAGAAATG--ACAT-C-T-TAAGGCAGGTGCCTGCTTAATACAGG
gi|6774 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAAGGAATGAG----CAAAACTG--GCCT-T-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATATAGG
gi|6775 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAATCAAGGGAAGGAG----CAAAAGTG--GCCT-T-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATACAGG
gi|6776 : TACAGTAAAACCTGTCTTAAGCAGCCACTCAATGGAAAGAG----CAAACATG--ACCT-C-T-TAAGACAGGTGGTTGCTTAATACAGG
gi|6777 : TACAGGCAAACCTATCTTAAGCAGCCAGTCAAGGAAAGGAG----CAAAAGTG--GCCG-C-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATACAGG
gi|6778 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCACTCAAGGGAAGGTG----CAAAAGTG--GCCT-T-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAACACAGGttacata
gi|6779 : TACAGTCAAACCTGTTTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAGGAG----CAAAAGTG--ACCT-T-T-TAGGACAGGTTGTTGCTTAATACAGGGAC-AT
gi|6781 : TACAGTCAAACCTATCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAGAAG----C-AAAGTG--GCCT-C-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATACAGGtt
gi|6783 : TACAGTAAAACCTGTCTTAAGCAGCCAATCAAGGGAATTAG----CAAAAGTG--GCCT-T-T-TAACACAGGTTGTTGCTTAATAttagtttgccatgaaagcatggaaatgat
gi|6784 : TACAGTAAAACCTGTCCTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAATAG----CAAAAGTG--GTCT-T-T-TAACACAGGTTGGTGCTTAATACAGG
gi|6789 : TACAATTAAACCTGTCTTAAACAGCCAGTCAAGGGAATGA-----CCAAACTG--GCCT-T-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATACAG
gi|6790 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAGGGAGGGAGCAAAAGTG--GCCT-T-T-TAAGACAGGTGGCTGCTTAATACAGG
gi|6791 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCAAGTCAAGGGAATGAG----CAAAAGTG--GCCT-T-T-TAAAACAGGTGGTTGCTTAATACAGG
gi|6792 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAATGAG----CAAAAGTG--GCCT-T-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATACAG-----ATTA-ATTT
gi|6793 : TACAGTCAAACCTGCATTAAGCAGTCAGTCAAGGGAAGGAA----CAAAAGTG--GCCT-G-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATACAGGTTT-ATactctgaaagc
gi|6794 : TACAGCTGAACCTGTCTTAAGCAGCCACTCAAAG-AAAGGG----CAAAAATG--ACCG-C-T-TAAGACAGGTTGCTGCTTAACACAGttgctatgaaagcatgaa
gi|6797 : TACAGTTAAACCTGTATTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAGGAA----CAAAAGTG--GCCT-T-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATACAGG
gi|6798 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGTCAGTCAAGGAAAAGAG----CAAAACTG--GTCT-T-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATACAGG
gi|6803 : TACAGTGAAACCTGTCTTAAGCAGCCACTCAAGGGAAAGAG----CAAAGATG--CCCC-C-T-TAAGGCAGGTGGCTTCTTAATACAGG
gi|6805 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGTCACTCAAGGGAAAGAG----CAAAAGTG--ACCT---T-TAATGCAGATCGCTGCTTAATACAGG
gi|6806 : AACCTGTCTTAAGCAGCCACTCAAGGGAAAGAG----T-AAATTG--ACCT-C-T-TAAGGCAGGTGGCTACTTAATACAGG
gi|6807 : tacatgaccTACAGTCTAACCTGTCTTGAGCAGCCACTCAAGGGAAAGAA----C-AACTTG--ATCA-T-T-TAAGGCAGGTGGCTGCTAAATACAG
gi|6809 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGATGGAG----CAAAAGTG--GCCT-T-T-TAAGACAGGTGGTTGCTTAATA
gi|6810 : TACAGTGAAACCTGCCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAATGAG----C-AAATTG--GCTT-C-T-TAAGATAGGTTGTTGCTTAATACAGG
gi|6811 : TACAGTCAAACCTGTATTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAGGAG----CAAAAGTG--GCCT-T-T-TAAGACAGGTTGTTGCTGAATACAG
gi|6813 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAACAAG----CAAAAGTG--GCCT-T-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATACAGG
gi|6814 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAGGGGAATGAG----CAAAATTG--GCCT-T-T-TAACACAGGCTGTTGCTTAATA
gi|6816 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAGGAG----CAAAAGTG--ACCT-T-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAAAGCAGG-----TTA-ATTT--ACCCTGA
gi|6818 : TACAGTCAACCCTGTCTTAAGCAAACGGTCAAGGGAAAGTT----CAAAA-TC--GCTTGC-T-TAACACAGGTTGGTGCTTAATAGAGGTTT-TTC----TTTTACCaagcataagacat
gi|6819 : TACAGTCAAACCTGTCTTAGGCAGCCAGTCAAGGGAAGGAG----CAAAAGTG--GCCC-T-T-CAAGACAGGTTGTTGCTTAATAAAGGTTT-ATaa
gi|6820 : TACAGACAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAGCAG----CAAAAGTG--GCCT-T-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATAtt
gi|6825 : TACAATTAAACCTGTCGTAAACAGCCACTCAAGAGAAAGGG----CAAAAATG--ACCA-C-T-TAAGGCAGGTGGCTGTTTAATACAGGg
gi|6828 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAGTAG----CAAAAATG--GCCT-T-T-TAAGACAGGTTGTTGTTTAAT
gi|6829 : TACAATCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAAGAG----CAAAAGTG--GCCT-T-T-TAATACAGGCTGTTGCTAAATACAGGTTT-AT
gi|6830 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAATGAG----CAAAAGTG--GCCT-T-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATAttt
gi|6831 : TACGATCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAGGAG----CTGAACTG--ACCT-T-T-TAAGACAGATTGTTGCTTAATACAGG
gi|6832 : TACAGTGAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAGGAG----CCAAATTG--ACCT-T-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATAtccgtat
gi|6834 : TACGCTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTTGAGGGAATTAG----CAAAATTG--GCCT-T-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATACAGGtgag
gi|6838 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCACTCAGTGGAAGGAG----CAAAAATG--GCCT---T-TAAGACAGATTGTTGCTTAATACAGG-----TTA-ATTTttaaaatgctgagaaagcacagaaattgattgcttattgttaaaaacag
gi|6841 : TACAGTCAAACCCGTCTTAAGCAGCCAGTTAAGGGAAGGAG----CAAAAGTG--ACCT-T-T-TAAGACAGGTGGTTGCTTAATACAGGgtactgaaagc
gi|6842 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAGGAG----CAAAAGTG--GCCT-T-T-TACGACAGGTTGTTGCTTAATACAGG
gi|6844 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGTCAGTCAAGGGAAGGAG----CAAAAGTG--GTCT-T-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAATACAGG-----TTA-ATTT
gi|6845 : TACAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAGGGA----CAAAATTG--ACCT-T-T-TAAGACAGGTTGTTGCTTAAAACAGG-----TTA-ATTTactatgaaagc
gi|6849 : TACAGTCAAACGTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGCAGGAG----CAAAAGTG--GCCT-T-T-TAAGACAGGTGGTTGCTTAATACAGGgctgtgaaagc
gi|6852 : TACAGTCAAACCTGTCTTAGGCAGCCACTCAAGGGAAAGAG----CAAAATTG--ACCC-C-CATAAGGCAGATGACTGCTTAATA
gi|7091 : ACAGTCAAACTTGTCTTAAGCAACCACTCAAGGGAAAGAG----CAAAACTG--ACCC-C-T-TAAGGCAGGTGGCTGCTTAATA
gi|7120 : CAGTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCATTCAAGGGAAATAC----CAAAAGTG--ACCC-C-T-TAGGGTAGGTGGCTGTTTAATACAGG
gi|7137 : GTCAAACCTGTCTTAAGCAGCCAGTCAAGGGAAGGAG----CAAAAGTG--GCCT-T-T-TAAGACAGGTGGTTGCTTAATACA----C-GTTA-ATTT
gi|7138 : GTCAAAC-TGTCTTAAGCAGCCACTCAAGGGAAAGAA----CAAAACTG--ACCC-C-T-TAAAGCAGGTGGCTTCTTAATACAGGactatgaaagc
gi|7150 : AACCTGTCTTAAGCAGCCACTCAAGGGAAAGAG----TAAAAATG--ACCT-C-T-TAAGACAGGTGGCTGCTTAATATAGG
gi|7167 : TTAAGCAGCCACTCAAGGGAAATGG----TCAAACTG--GCTG-C-T-TAATACAGGTGGCTGCTTAATAGAGGGTC---CATATTTTTACCAAGA-AAGCTGAAGTCATGATGTTTATTGAGACA
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|7344 ): TGATTATTTGAGACCGATAAAAAGTGATCACACATGATTGTACATGAACCATGCCTGTAGGTTTACTGGGGTAAATGTGAAAGAACCGCAGGAAGAAAATATTTGAAATGACACTATTTTATATAGAACATTTCAATAAAAAAATAGATTATGCTATTTAATTAAAAA
Unaligned ( gi|7343 ): TTGTTACTGAGAAAGCTGAAGTCATGATGTTTATTGTGACAGACAAGAAGTGCTCATACATGTATGGTACATGTTGTACCATGCCTGTTAGTTGTTTGGAAATATGTACAGGGGTGAACCATGAATGAGAAAATCCTGAGGAAGAAAACATTTGATCTGGCAGTAATTTATATAGAAGTACATAGAAATAGAATCCAGAAGTTTACATGTT