lowQualScore                  :                                                        222           
lowQualScore                  :      11                                  1           1 000  777      
lowQualScore                  :      ..                                  .           . ...  ...      
lowQualScore                  :      88                                  4           3 999  444      
consensus                     : TTTGT--TTGTTCCAGTATAGTTTGTCATTAAAGTGAAGAT-AATCAAGCTATAA---TT--TAAAATA
Reference ( gi|48539 )        : TTTGT--TTGTTCCAGTATAGTTTGTCATTAAAGTGAAGAT-AATCAAGCTATAA---TT--CAAAATA
gi|48541                      : TTTGT--TTGTTCCAGTATAGTTTGTCATTGAAGTGAAGAT-AATCAAGCTAGCA---TT--TAAAATA
gi|48540                      : TTTGT--TTGTTCAAGTATAGTTTGTCATTAAAGTGAAAAT-AATCAAGCTATCA---TT--TAAAATA
gi|48542                      : TTTGT--TTGTTCCAGTAAAGTTTGTTATTAAAGTGAAGAT-AATCAAGCTATCA---TT--TAAAATA
gi|48544                      : TTTGT--TTGTTCAAGTATAGCTTGTCATTGAAGTGAAGGT-AATCAAGCTATAA---TT--TAAAATA
gi|48546                      : TTTAT--TTGTTCCAGTATAGTTTGTCATTAAAGTGAAGAT-AATCAAATTATAATT-TT--TAAAATA
gi|48554                      : TTTGT--TTGTTCCGGTATAGTTTGTCATTAAAGTAAAGAT-AATCAAGCTATCA---TG--TAAAATA
gi|48551                      : TTTGT--TTGTTCCAGTACAGTTTGTCATGAAAGTGAAGAT-AATTAAGCTATCA---TT--TAAAATA
gi|48556                      : TTTGT--TTGTTCAAATATAGCTTGTCACTATAGTGAAGAT-AATCAAGCTATAA---TT--CAAAATA
gi|48557                      : TTTGT--TTGTTCCAGTATAGTTTGTCATTAAAGTGAAGAG-AATCAAATTATAA---TTTGTAAAATA
gi|48558                      : TTTGT--TTGTTCCAGTATAGTTTGTAATTAAAGTGATGGT-AATCAAGCTATCA---TT--TAAAATA
gi|48552                      : TTTGT--TTGTTCCAGTATAGTT---CATTAAAGTGAAGAT-AATTAAGCTATCA---TT--TAAAATA
gi|48547                      : TTTGT--TTGTTCCAGTACAGTTTGTCATTAAAGTGAAGAG-AATCAAATTATAATT-TT--TAAAATA
gi|48559                      : TTTTT--TTGTTCCAGTATAGTTTGTCATAAAAGTGAAGAT-AATCAAATTATAATT-TT--TAAAATA
gi|48560                      : TTTGT--TTGTTCCAGTACAGTTTGTCATTAAAGTGAAAAG-AATCAAATTATAATT-TT--TAAAATA
gi|48548                      : TTTGT--TTGTTCCAGTAAAGTTTGTCATTAAAGTGAAAAG-AATCAAATTATAA---TT--TAA
gi|48562                      : TTTGT--TTGTTCCAGTA--GTTTGTCATTAAAGTGAAGAT-AATAAACTTATCA---TT--TAAAATA
gi|48549                      : TTTGT--TTGTACCAGTATAGTTTGTCATTAAAGCGAAGAG-AATTAAATTATAATTTTT--TAAAATA
gi|48550                      : TTTCT--TTGTTCCTGTACAGTTTGTCATTAAAGTGAAGAA-AATCAAATTATAATT-TT--TAAAATA
gi|48553                      : TTTGT--TTGTTCCAGTACAGTTTGTCATGAAAGTGAAAAG-AATCAA
gi|48543                      : TTTGTGCTTGTTGGAGGATAGATTGTCATTAAAGTGAAGAG-AATCAAATTATAATT-TT--TAAAATA
gi|48555                      : TTTGT--TTGTTCCAGTATAGTTTGACATTAAAGTGAA
gi|48545                      : TTTGC--TTGTAGGAGAATAGATTGTCATTAAAGTGAAGAG-AATCAAATTATAATT-TT--TAAAATA
gi|48561                      : TTTGT--TTGTTCCAGTATAGTTTGT----------AAGATAAATAAAGCTATCA---TT--TAAAATA
gi|48563                      : TTTGT--TTGTTCCAGTATA----GTCATTATAGTGTAGAT-AATCAA
gi|48564                      :  TTGT--TTGTTCCAGTATAGTTTGTCATTAAAGTGAAGAT-AATTAAGCTATCA---TT--TAAAATA
gi|48566                      :   TGT--TTGTTCCAGTATAGTTTGTCATTAAAGTGAAGAT-AATCAAGGTATCA---TT--TAAAATA
gi|48567                      :   TGC--TTGTTGGAGGATAGATTGTCATTAAAGTGAAGAG-AATCAAATTATAATT-TT--TAAAATA
gi|48565                      :   TGC--TTGTTGGAAGATAGATTGTCATTAAAGTGAAGTT-AATCAAATTATAATT-TT--TAAAATA
gi|48568                      :     T--TTGTTCAAGTATAGTTTGTCATTTAAGTGAAGAT-AATCAAGCTATAA---AT--TAAAATA
gi|48569                      :     T--TTGTTCAAGTATAGTTTGTCATTATAGTGTAGAT-AATCAAGCTATGA---TT--TAAAAT





Alignments
lowQualScore                  :                                                        222           
lowQualScore                  :      11                                  1           1 000  22       
lowQualScore                  :      ..                                  .           . ...  ..       
lowQualScore                  :      88                                  3           0 222  00       
consensus                     : TTTGT--TTGTTCCAGTATAGTTTGTCATTAAAGTGAAGAT-AATCAAGCTATAA---TT--TAAAATA
Reference ( family-637 )      : TTTGT--TTGTTCCAGTATAGTTTGTCATTAAAGTGAAGAT-AATCAAGCTATAA---TT--TAAAATA
gi|48539                      : TTTGT--TTGTTCCAGTATAGTTTGTCATTAAAGTGAAGAT-AATCAAGCTATAA---TT--CAAAATA
gi|48540                      : TTTGT--TTGTTCAAGTATAGTTTGTCATTAAAGTGAAAAT-AATCAAGCTATCA---TT--TAAAATA
gi|48541                      : TTTGT--TTGTTCCAGTATAGTTTGTCATTGAAGTGAAGAT-AATCAAGCTAGCA---TT--TAAAATA
gi|48542                      : TTTGT--TTGTTCCAGTAAAGTTTGTTATTAAAGTGAAGAT-AATCAAGCTATCA---TT--TAAAATA
gi|48543                      : TTTGTGCTTGTTGGAGGATAGATTGTCATTAAAGTGAAGAG-AATCAAATTATAATT-TT--TAAAATA
gi|48544                      : TTTGT--TTGTTCAAGTATAGCTTGTCATTGAAGTGAAGGT-AATCAAGCTATAA---TT--TAAAATA
gi|48545                      : TTTGC--TTGTAGGAGAATAGATTGTCATTAAAGTGAAGAG-AATCAAATTATAATT-TT--TAAAATA
gi|48546                      : TTTAT--TTGTTCCAGTATAGTTTGTCATTAAAGTGAAGAT-AATCAAATTATAATT-TT--TAAAATA
gi|48547                      : TTTGT--TTGTTCCAGTACAGTTTGTCATTAAAGTGAAGAG-AATCAAATTATAATT-TT--TAAAATA
gi|48548                      : TTTGT--TTGTTCCAGTAAAGTTTGTCATTAAAGTGAAAAG-AATCAAATTATAA---TT--TAA
gi|48549                      : TTTGT--TTGTACCAGTATAGTTTGTCATTAAAGCGAAGAG-AATTAAATTATAATTTTT--TAAAATA
gi|48550                      : TTTCT--TTGTTCCTGTACAGTTTGTCATTAAAGTGAAGAA-AATCAAATTATAATT-TT--TAAAATA
gi|48551                      : TTTGT--TTGTTCCAGTACAGTTTGTCATGAAAGTGAAGAT-AATTAAGCTATCA---TT--TAAAATA
gi|48552                      : TTTGT--TTGTTCCAGTATAGTT---CATTAAAGTGAAGAT-AATTAAGCTATCA---TT--TAAAATA
gi|48553                      : TTTGT--TTGTTCCAGTACAGTTTGTCATGAAAGTGAAAAG-AATCAA
gi|48554                      : TTTGT--TTGTTCCGGTATAGTTTGTCATTAAAGTAAAGAT-AATCAAGCTATCA---TG--TAAAATA
gi|48555                      : TTTGT--TTGTTCCAGTATAGTTTGACATTAAAGTGAA
gi|48556                      : TTTGT--TTGTTCAAATATAGCTTGTCACTATAGTGAAGAT-AATCAAGCTATAA---TT--CAAAATA
gi|48557                      : TTTGT--TTGTTCCAGTATAGTTTGTCATTAAAGTGAAGAG-AATCAAATTATAA---TTTGTAAAATA
gi|48558                      : TTTGT--TTGTTCCAGTATAGTTTGTAATTAAAGTGATGGT-AATCAAGCTATCA---TT--TAAAATA
gi|48559                      : TTTTT--TTGTTCCAGTATAGTTTGTCATAAAAGTGAAGAT-AATCAAATTATAATT-TT--TAAAATA
gi|48560                      : TTTGT--TTGTTCCAGTACAGTTTGTCATTAAAGTGAAAAG-AATCAAATTATAATT-TT--TAAAATA
gi|48561                      : TTTGT--TTGTTCCAGTATAGTTTGT----------AAGATAAATAAAGCTATCA---TT--TAAAATA
gi|48562                      : TTTGT--TTGTTCCAGTA--GTTTGTCATTAAAGTGAAGAT-AATAAACTTATCA---TT--TAAAATA
gi|48563                      : TTTGT--TTGTTCCAGTATA----GTCATTATAGTGTAGAT-AATCAA
gi|48564                      :  TTGT--TTGTTCCAGTATAGTTTGTCATTAAAGTGAAGAT-AATTAAGCTATCA---TT--TAAAATA
gi|48565                      :   TGC--TTGTTGGAAGATAGATTGTCATTAAAGTGAAGTT-AATCAAATTATAATT-TT--TAAAATA
gi|48566                      :   TGT--TTGTTCCAGTATAGTTTGTCATTAAAGTGAAGAT-AATCAAGGTATCA---TT--TAAAATA
gi|48567                      :   TGC--TTGTTGGAGGATAGATTGTCATTAAAGTGAAGAG-AATCAAATTATAATT-TT--TAAAATA
gi|48568                      :     T--TTGTTCAAGTATAGTTTGTCATTTAAGTGAAGAT-AATCAAGCTATAA---AT--TAAAATA
gi|48569                      :     T--TTGTTCAAGTATAGTTTGTCATTATAGTGTAGAT-AATCAAGCTATGA---TT--TAAAAT





Alignments
lowQualScore                  :                                                        222           
lowQualScore                  :      11                                  1           1 000  22       
lowQualScore                  :      ..                                  .           . ...  ..       
lowQualScore                  :      88                                  3           0 222  00       
consensus                     : TTTGT--TTGTTCCAGTATAGTTTGTCATTAAAGTGAAGAT-AATCAAGCTATAA---TT--TAAAATA
Reference ( family-637 )      : TTTGT--TTGTTCCAGTATAGTTTGTCATTAAAGTGAAGAT-AATCAAGCTATAA---TT--TAAAATA
gi|48539                      : TTTGT--TTGTTCCAGTATAGTTTGTCATTAAAGTGAAGAT-AATCAAGCTATAA---TT--CAAAATA
gi|48540                      : TTTGT--TTGTTCAAGTATAGTTTGTCATTAAAGTGAAAAT-AATCAAGCTATCA---TT--TAAAATA
gi|48541                      : TTTGT--TTGTTCCAGTATAGTTTGTCATTGAAGTGAAGAT-AATCAAGCTAGCA---TT--TAAAATA
gi|48542                      : TTTGT--TTGTTCCAGTAAAGTTTGTTATTAAAGTGAAGAT-AATCAAGCTATCA---TT--TAAAATA
gi|48543                      : TTTGTGCTTGTTGGAGGATAGATTGTCATTAAAGTGAAGAG-AATCAAATTATAATT-TT--TAAAATA
gi|48544                      : TTTGT--TTGTTCAAGTATAGCTTGTCATTGAAGTGAAGGT-AATCAAGCTATAA---TT--TAAAATA
gi|48545                      : TTTGC--TTGTAGGAGAATAGATTGTCATTAAAGTGAAGAG-AATCAAATTATAATT-TT--TAAAATA
gi|48546                      : TTTAT--TTGTTCCAGTATAGTTTGTCATTAAAGTGAAGAT-AATCAAATTATAATT-TT--TAAAATA
gi|48547                      : TTTGT--TTGTTCCAGTACAGTTTGTCATTAAAGTGAAGAG-AATCAAATTATAATT-TT--TAAAATA
gi|48548                      : TTTGT--TTGTTCCAGTAAAGTTTGTCATTAAAGTGAAAAG-AATCAAATTATAA---TT--TAA
gi|48549                      : TTTGT--TTGTACCAGTATAGTTTGTCATTAAAGCGAAGAG-AATTAAATTATAATTTTT--TAAAATA
gi|48550                      : TTTCT--TTGTTCCTGTACAGTTTGTCATTAAAGTGAAGAA-AATCAAATTATAATT-TT--TAAAATA
gi|48551                      : TTTGT--TTGTTCCAGTACAGTTTGTCATGAAAGTGAAGAT-AATTAAGCTATCA---TT--TAAAATA
gi|48552                      : TTTGT--TTGTTCCAGTATAGTT---CATTAAAGTGAAGAT-AATTAAGCTATCA---TT--TAAAATA
gi|48553                      : TTTGT--TTGTTCCAGTACAGTTTGTCATGAAAGTGAAAAG-AATCAA
gi|48554                      : TTTGT--TTGTTCCGGTATAGTTTGTCATTAAAGTAAAGAT-AATCAAGCTATCA---TG--TAAAATA
gi|48555                      : TTTGT--TTGTTCCAGTATAGTTTGACATTAAAGTGAA
gi|48556                      : TTTGT--TTGTTCAAATATAGCTTGTCACTATAGTGAAGAT-AATCAAGCTATAA---TT--CAAAATA
gi|48557                      : TTTGT--TTGTTCCAGTATAGTTTGTCATTAAAGTGAAGAG-AATCAAATTATAA---TTTGTAAAATA
gi|48558                      : TTTGT--TTGTTCCAGTATAGTTTGTAATTAAAGTGATGGT-AATCAAGCTATCA---TT--TAAAATA
gi|48559                      : TTTTT--TTGTTCCAGTATAGTTTGTCATAAAAGTGAAGAT-AATCAAATTATAATT-TT--TAAAATA
gi|48560                      : TTTGT--TTGTTCCAGTACAGTTTGTCATTAAAGTGAAAAG-AATCAAATTATAATT-TT--TAAAATA
gi|48561                      : TTTGT--TTGTTCCAGTATAGTTTGT----------AAGATAAATAAAGCTATCA---TT--TAAAATA
gi|48562                      : TTTGT--TTGTTCCAGTA--GTTTGTCATTAAAGTGAAGAT-AATAAACTTATCA---TT--TAAAATA
gi|48563                      : TTTGT--TTGTTCCAGTATA----GTCATTATAGTGTAGAT-AATCAA
gi|48564                      :  TTGT--TTGTTCCAGTATAGTTTGTCATTAAAGTGAAGAT-AATTAAGCTATCA---TT--TAAAATA
gi|48565                      :   TGC--TTGTTGGAAGATAGATTGTCATTAAAGTGAAGTT-AATCAAATTATAATT-TT--TAAAATA
gi|48566                      :   TGT--TTGTTCCAGTATAGTTTGTCATTAAAGTGAAGAT-AATCAAGGTATCA---TT--TAAAATA
gi|48567                      :   TGC--TTGTTGGAGGATAGATTGTCATTAAAGTGAAGAG-AATCAAATTATAATT-TT--TAAAATA
gi|48568                      :     T--TTGTTCAAGTATAGTTTGTCATTTAAGTGAAGAT-AATCAAGCTATAA---AT--TAAAATA
gi|48569                      :     T--TTGTTCAAGTATAGTTTGTCATTATAGTGTAGAT-AATCAAGCTATGA---TT--TAAAAT


blockSeqs                     :      GC                                  A             TTT  TG
blockSeqs                     :      .                                   .             TT   . 
blockSeqs                     :      .                                   .             TT   . 
blockSeqs                     :      .                                   .             TT   . 
blockSeqs                     :      .                                   .             TT   . 
blockSeqs                     :      .                                   .             TT   . 
blockSeqs                     :      .                                   .             TT   . 
blockSeqs                     :      .                                   .             TT   . 
blockSeqs                     :      .                                   .             TT   . 
blockSeqs                     :      .                                   .             TT   . 
blockSeqs                     :      .                                   .             .    . 
blockSeqs                     :      .                                   .             .    . 
blockSeqs                     :      .                                   .             .    . 
blockSeqs                     :      .                                   .             .    . 
blockSeqs                     :      .                                   .             .    . 
blockSeqs                     :      .                                   .             .    . 
blockSeqs                     :      .                                   .             .    . 
blockSeqs                     :      .                                   .             .    . 
blockSeqs                     :      .                                   .             .    . 
blockSeqs                     :      .                                   .             .    . 
blockSeqs                     :      .                                   .             .    . 
blockSeqs                     :      .                                   .             .    . 
blockSeqs                     :      .                                   .             .    . 
blockSeqs                     :      .                                   .             .    . 
blockSeqs                     :      .                                   .             .    . 
blockSeqs                     :      .                                   .             .    . 
blockSeqs                     :      .                                   .             .    . 
blockSeqs                     :      .                                   .                    
blockSeqs                     :      .                                   .                    
blockSeqs                     :      .                                                        


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : TTTGT--TTGTTCCAGTATAGTTTGTCATTAAAGTGAAGAT-AATCAAGCTATAA---TT--TAAAATA
finalCons                     : TTTGT--TTGTTCCAGTATAGTTTGTCATTAAAGTGAAGAT-AATCAAGCTATAA---TT--TAAAATA





Alignments
lowQualScore                  :                                                        222           
lowQualScore                  :      11                                  1           1 000  22       
lowQualScore                  :      ..                                  .           . ...  ..       
lowQualScore                  :      88                                  3           0 222  00       
consensus                     : TTTGT--TTGTTCCAGTATAGTTTGTCATTAAAGTGAAGAT-AATCAAGCTATAA---TT--TAAAATA
Reference ( family-637 )      : TTTGT--TTGTTCCAGTATAGTTTGTCATTAAAGTGAAGAT-AATCAAGCTATAA---TT--TAAAATA
gi|48539                      : TTTGT--TTGTTCCAGTATAGTTTGTCATTAAAGTGAAGAT-AATCAAGCTATAA---TT--CAAAATA
gi|48540                      : TTTGT--TTGTTCAAGTATAGTTTGTCATTAAAGTGAAAAT-AATCAAGCTATCA---TT--TAAAATA
gi|48541                      : TTTGT--TTGTTCCAGTATAGTTTGTCATTGAAGTGAAGAT-AATCAAGCTAGCA---TT--TAAAATA
gi|48542                      : TTTGT--TTGTTCCAGTAAAGTTTGTTATTAAAGTGAAGAT-AATCAAGCTATCA---TT--TAAAATA
gi|48543                      : TTTGTGCTTGTTGGAGGATAGATTGTCATTAAAGTGAAGAG-AATCAAATTATAATT-TT--TAAAATA
gi|48544                      : TTTGT--TTGTTCAAGTATAGCTTGTCATTGAAGTGAAGGT-AATCAAGCTATAA---TT--TAAAATA
gi|48545                      : TTTGC--TTGTAGGAGAATAGATTGTCATTAAAGTGAAGAG-AATCAAATTATAATT-TT--TAAAATA
gi|48546                      : TTTAT--TTGTTCCAGTATAGTTTGTCATTAAAGTGAAGAT-AATCAAATTATAATT-TT--TAAAATA
gi|48547                      : TTTGT--TTGTTCCAGTACAGTTTGTCATTAAAGTGAAGAG-AATCAAATTATAATT-TT--TAAAATA
gi|48548                      : TTTGT--TTGTTCCAGTAAAGTTTGTCATTAAAGTGAAAAG-AATCAAATTATAA---TT--TAA
gi|48549                      : TTTGT--TTGTACCAGTATAGTTTGTCATTAAAGCGAAGAG-AATTAAATTATAATTTTT--TAAAATA
gi|48550                      : TTTCT--TTGTTCCTGTACAGTTTGTCATTAAAGTGAAGAA-AATCAAATTATAATT-TT--TAAAATA
gi|48551                      : TTTGT--TTGTTCCAGTACAGTTTGTCATGAAAGTGAAGAT-AATTAAGCTATCA---TT--TAAAATA
gi|48552                      : TTTGT--TTGTTCCAGTATAGTT---CATTAAAGTGAAGAT-AATTAAGCTATCA---TT--TAAAATA
gi|48553                      : TTTGT--TTGTTCCAGTACAGTTTGTCATGAAAGTGAAAAG-AATCAA
gi|48554                      : TTTGT--TTGTTCCGGTATAGTTTGTCATTAAAGTAAAGAT-AATCAAGCTATCA---TG--TAAAATA
gi|48555                      : TTTGT--TTGTTCCAGTATAGTTTGACATTAAAGTGAA
gi|48556                      : TTTGT--TTGTTCAAATATAGCTTGTCACTATAGTGAAGAT-AATCAAGCTATAA---TT--CAAAATA
gi|48557                      : TTTGT--TTGTTCCAGTATAGTTTGTCATTAAAGTGAAGAG-AATCAAATTATAA---TTTGTAAAATA
gi|48558                      : TTTGT--TTGTTCCAGTATAGTTTGTAATTAAAGTGATGGT-AATCAAGCTATCA---TT--TAAAATA
gi|48559                      : TTTTT--TTGTTCCAGTATAGTTTGTCATAAAAGTGAAGAT-AATCAAATTATAATT-TT--TAAAATA
gi|48560                      : TTTGT--TTGTTCCAGTACAGTTTGTCATTAAAGTGAAAAG-AATCAAATTATAATT-TT--TAAAATA
gi|48561                      : TTTGT--TTGTTCCAGTATAGTTTGT----------AAGATAAATAAAGCTATCA---TT--TAAAATA
gi|48562                      : TTTGT--TTGTTCCAGTA--GTTTGTCATTAAAGTGAAGAT-AATAAACTTATCA---TT--TAAAATA
gi|48563                      : TTTGT--TTGTTCCAGTATA----GTCATTATAGTGTAGAT-AATCAA
gi|48564                      :  TTGT--TTGTTCCAGTATAGTTTGTCATTAAAGTGAAGAT-AATTAAGCTATCA---TT--TAAAATA
gi|48565                      :   TGC--TTGTTGGAAGATAGATTGTCATTAAAGTGAAGTT-AATCAAATTATAATT-TT--TAAAATA
gi|48566                      :   TGT--TTGTTCCAGTATAGTTTGTCATTAAAGTGAAGAT-AATCAAGGTATCA---TT--TAAAATA
gi|48567                      :   TGC--TTGTTGGAGGATAGATTGTCATTAAAGTGAAGAG-AATCAAATTATAATT-TT--TAAAATA
gi|48568                      :     T--TTGTTCAAGTATAGTTTGTCATTTAAGTGAAGAT-AATCAAGCTATAA---AT--TAAAATA
gi|48569                      :     T--TTGTTCAAGTATAGTTTGTCATTATAGTGTAGAT-AATCAAGCTATGA---TT--TAAAAT