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Reference ( gi|131063 )       :    TTGTAGCACATGC-C-GGAA-A--ATGACAG--CCACGTGCATT-GAGAT-CA-TGTTGATATATGTTGTAGA--AAATT---T----A---AT---TCTAAGCAACATTTTT--TCTTTAAG--TA-A----TA-AGCTATCTGTCT---CCGTTTAGTCAGAAACG
gi|131062                     :    TTGTAGCACGTGC-C-GGAA-A--A-AACAGAGTCACGTGCATT-GAAAT-CA-TGTTAATATATGTTGCGGA--AAATT---T----A---AT---TCTAAGCAACATTTGT--TCTTAGAG--TA-A----TA-AGCTATCTGTCT---CTATTTAGTCAGAAAC
gi|131057                     :    TTGTAGCACTTGC-C-GGAA-G--ATGAGGG--ACACGTGCAAT-ACAAT-CA-TGTTGATATATGTTGTAGA--GAATT---T----A---AT---TTTAAGCAACATTTGT--TCTTAGAG--TG-A----TT-AGCTATCTGTCT---CCGTTCAGTCAGAAACG
gi|131065                     :  atTTGTAGCACGTGC-C-GGAA-C--ATGAGAG--CCATGTGCATT-GAGAT-CA-TGTTGATATATGTTGTAAA--GAATT---T----A---AT---TCTAAGCAACATTTGT--TCTTAGAG--TT-A----TA-AGTTACCTGTTT---CC
gi|131059                     :    TTGTAGCACGTGC-C-GAAA-A--ATGAGAG--GCTCATGCATT-TGTTT-CA-TGTTCAAATATATTGTAGA--TAATT---T----C---AT---TCCGTGCAACATTTGT--TCTTAAAG--TG-A----TA-AGCTATCTGTCT---TTGTTTAGTCAGAAAC
gi|131060                     :    TTGTAGCACGTGT-C-GGAA-A--ATAAGAG--GCACTTGCATTTGGGGT-GA-TGTTCGTATATGTTGTAGA--GAATT---T----A---AT---TTTGAGCAATTTTTGT--TCCTAAAG--TG-A----TA-ATCTAACTTTCT---CCGTTTAGTCAAAAAC
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gi|131075                     :                                 AG--CCATGTGCGAT-GGGTT-CA-TCTTCATATATGTTATAGG--GAATT---T----A---AT---TCTGAGCAAC-TTTTG--TGTTTAAC--TT-A----TATGGCTAACTCAAA---CCGTTTAGCCAG
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gi|131077                     :                                                             taagATATGTTGTAG-----ATT---T----AACGAT---TCTAAGCAACTTTTGT--TCTTAAAC--AA-A----TA-AGCTATCTACCA---CCGTTCCGCCAGAAACG
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1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|131073 ): TGAGAGCCACATTCATTGGGTTCAGTTTTAAATATATTGTATACAATTTGATTCTGAGCAACTTT






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Reference ( family-636 )      :            TTGTAGCACGTGC-C-GGAA-A--ATG-AGAGGCACGTGCATT-GGGTTCATNTTCATA-TATGTTGTAGA----GAATT---T--A---A---T---TCTGAGCAACTTTTGTTCTTNAAGTA-ATA-AGCTATCTGTCT---CCGTTTAGTCAGAAACG
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gi|131057                     : aattggttaccTTGTAGCACTTGC-C-GGAA-G--ATG-AGGGACACGTGCAAT-ACAATCATGTTGATA-TATGTTGTAGA----GAATT---T--A---A---T---TTTAAGCAACATTTGTTCTTAGAGTG-ATT-AGCTATCTGTCT---CCGTTCAGTCAGAAACG
gi|131058                     :          atTTCTGGCACGTGC-AAGGCA-T--GTG-TGAGGCA-GTGCACC-GGGCCCATGTTCATG-TCTGTTGTATA-------TT---T--A---A---TGATTCAAAGCAACTTTTGTTCTTCAACAA-ATA-AACTATTTGTCT---CCGTTT
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gi|131061                     :            TTCTGGCACGTGC-AAGGCA-T--GTG-TGAGGCAGGTGCATC-AGGTGTATGTTGATA-TATGATGT-------GTATT---T--A---A---TGATTCTAAGCAATTTTTGGTCTTCAACAA-ATA-AGCTATCTGTCT---CCGTTT
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gi|131064                     :            TTGTAGCACGTGC-C-GGAA-A--ATG-AGGGGCACGTGCAAT-AGGATTATGCTGATA-TATGTTGTAGA----ACACC---T--T---A---T---TCTGAGTAACTTTTGTACTTAGAGTG-ATC-ATCTATTTGTCT---TCGTTTAGTCA-AAACG
gi|131065                     :            TTGTAGCACGTGC-C-GGAA-C--ATG-AGAGCCATGTGCATT-GAGATCATGTTGATA-TATGTTGTAAA----GAATT---T--A---A---T---TCTAAGCAACATTTGTTCTTAGAGTT-ATA-AGTTACCTGTTT---CC
gi|131066                     :            TTGTGGCACGTGC-A-CGAT-T--CTG-GGAAGCACGTGCACT-GAGTCCATCTTCTAA-CATGTTATAGA----GCA--------A---ACCCT---CCTGAGCAACTTTTGTATAGAAATTC-TTG-GGCTAAC-GT-TAA-CCGTTAAGTCAGAAA
gi|131067                     :             TGTAGCACGTGC-C-AGAA-A--ATG-AGAGCCACATGCATT-TGGGTAATGTTGATA-TATGATGTAGA----AAATT---T--A---A---T---ACTGACCAATTTTTG-TGTTGAA-CATATATGGCTATCT
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gi|131069                     :                                     TG-AGAGCCACTTGCATT-GAGTTCAGCTTCATA-TATGTTGTAAA----GCATT---C--A---A---T---TCTAAGCGACTTTTGTTTTTAAACT---TAGGGCTAACTCAAA---CCGTTTAGCCAGAA
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gi|131075                     :                                       -AGAGCCATGTGCGAT-GGGTTCATCTTCATA-TATGTTATAGG----GAATT---T--A---A---T---TCTGAGCAACTTTTG-TGTTTAACTT-ATATGGCTAACTCAAA---CCGTTTAGCCAG
gi|131076                     :                                          AGGCAAGTGCATT-GGGTTCATGTTCATA-TGTGTTGT-------GTATT---TTTA---A---T---TCGAAGCAACTTTTGTTCTACAACAA-ATA-AGTTATATCTCT---CCGTTTATTCGGAAATG
gi|131077                     :                                                                 TTTATAATATGTTGTAG-------ATT---T--AACGA---T---TCTAAGCAACTTTTGTTCTTAAACAA-ATA-AGCTATCTACCA---CCGTTCCGCCAGAAACG
gi|131078                     :                                                                      A-TATGTTGTAGA----TCAAT---T--G---T---T---TTTAAACAATTTTTGTTC-TCAAATACATG-AGCGATCTCTCT---CCGTTTACTCAGAAA
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Alignments
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consensus                     :            TTGTAGCACGTGC-C-GGAA-A--ATG-AGAGGCACGTGCATT-GGGTTCATNTTCATA-TATGTTGTAGA----GAATT---T--A---A---T---TCTGAGCAACTTTTGTTCTTAAAGTA-ATA-AGCTATCTGTCT---CCGTTTAGTCAGAAACG
Reference ( family-636 )      :            TTGTAGCACGTGC-C-GGAA-A--ATG-AGAGGCACGTGCATT-GGGTTCATNTTCATA-TATGTTGTAGA----GAATT---T--A---A---T---TCTGAGCAACTTTTGTTCTTAAAGTA-ATA-AGCTATCTGTCT---CCGTTTAGTCAGAAACG
gi|131049                     :            TTGTAGCACGTGC-C-AGAA-A--ATG-AGAGGCACGTGTTTT-CAGTTAATTTTCATA-TATGTTGTAGATCTCG---T---C--A---A---T---T-TCAACAACTTTTGTTCTTAAAGTA-TTA-AGCTATCTGTCT---CCGTTTAGTCAGAAAC
gi|131050                     :           aatGTAACACGTGC-T-AGAA-A--ATG-AGAGGCACGTGTATT-GAGCTCATTTTCATA-TATGTTGTAGA----ACACG---T--G---A---T---TCTGAGCAACTTTTGTTCTTAGAGGG-TTC-AGCTTTCTGTCT---TCGTTCAGTCAGAA
gi|131051                     :       aattgTTGTAGCACGTGC-C-AGAG-A--ATA-AGAGGCACGTGCATT-CAATTCATGGTCATA-TATGTTGTAG-------ATCTCGT--C---A---T---TCTTAACAACTTTTG-TCTGAAAGTA-TTA-AGCTATCTGTCT---CCGTTTAGTCGGAAACG
gi|131052                     :           aaaGTAACCCGTGC-C-AGAA-A--ATA-AGAGGCACGTGCATT-GATTTC-TTTTCATA-TATGTTGTAGA----ACACC---T--T---A---T---TCTGAGCGACTTTTGTTCTTAGAGTG-ATC-AGCTATTTGTCT---TCGTTTAGTCCGAAACG
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gi|131057                     : aattggttaccTTGTAGCACTTGC-C-GGAA-G--ATG-AGGGACACGTGCAAT-ACAATCATGTTGATA-TATGTTGTAGA----GAATT---T--A---A---T---TTTAAGCAACATTTGTTCTTAGAGTG-ATT-AGCTATCTGTCT---CCGTTCAGTCAGAAACG
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gi|131060                     :            TTGTAGCACGTGT-C-GGAA-A--ATA-AGAGGCACTTGCATTTGGGGTGATGTTCGTA-TATGTTGTAGA----GAATT---T--A---A---T---TTTGAGCAATTTTTGTTCCTAAAGTG-ATA-ATCTAACTTTCT---CCGTTTAGTCAAAAAC
gi|131061                     :            TTCTGGCACGTGC-AAGGCA-T--GTG-TGAGGCAGGTGCATC-AGGTGTATGTTGATA-TATGATGT-------GTATT---T--A---A---TGATTCTAAGCAATTTTTGGTCTTCAACAA-ATA-AGCTATCTGTCT---CCGTTT
gi|131062                     :            TTGTAGCACGTGC-C-GGAA-A--AAACAGAGTCACGTGCATT-GAAATCATGTTAATA-TATGTTGCGGA----AAATT---T--A---A---T---TCTAAGCAACATTTGTTCTTAGAGTA-ATA-AGCTATCTGTCT---CTATTTAGTCAGAAAC
gi|131063                     :            TTGTAGCACATGC-C-GGAA-A--ATG-ACAGCCACGTGCATT-GAGATCATGTTGATA-TATGTTGTAGA----AAATT---T--A---A---T---TCTAAGCAACATTTTTTCTTTAAGTA-ATA-AGCTATCTGTCT---CCGTTTAGTCAGAAACG
gi|131064                     :            TTGTAGCACGTGC-C-GGAA-A--ATG-AGGGGCACGTGCAAT-AGGATTATGCTGATA-TATGTTGTAGA----ACACC---T--T---A---T---TCTGAGTAACTTTTGTACTTAGAGTG-ATC-ATCTATTTGTCT---TCGTTTAGTCA-AAACG
gi|131065                     :            TTGTAGCACGTGC-C-GGAA-C--ATG-AGAGCCATGTGCATT-GAGATCATGTTGATA-TATGTTGTAAA----GAATT---T--A---A---T---TCTAAGCAACATTTGTTCTTAGAGTT-ATA-AGTTACCTGTTT---CC
gi|131066                     :            TTGTGGCACGTGC-A-CGAT-T--CTG-GGAAGCACGTGCACT-GAGTCCATCTTCTAA-CATGTTATAGA----GCA--------A---ACCCT---CCTGAGCAACTTTTGTATAGAAATTC-TTG-GGCTAAC-GT-TAA-CCGTTAAGTCAGAAA
gi|131067                     :             TGTAGCACGTGC-C-AGAA-A--ATG-AGAGCCACATGCATT-TGGGTAATGTTGATA-TATGATGTAGA----AAATT---T--A---A---T---ACTGACCAATTTTTGTGTTGAACAT--ATATGGCTATCT
gi|131068                     :               TGGCACGTGC----GCA-ATTCTG-AGAGCCACGTGCAT--GGGTTCATCTTCATA-TATGTTGTAGA----GAATT---T--A---A---T---ACTGAGTAACTTTTGTTTTTAAA
gi|131069                     :                                     TG-AGAGCCACTTGCATT-GAGTTCAGCTTCATA-TATGTTGTAAA----GCATT---C--A---A---T---TCTAAGCGACTTTTGTTTTTAAACT---TAGGGCTAACTCAAA---CCGTTTAGCCAGAA
gi|131070                     :                                     TA-AGAGTCACGTGCATT-GGGTTCAGCTTCATA-TATGTTGTAGA----GAATT---T--A---A---T---TCTTGGCAAGTTTTGTGTTTAAA----------CTATGTGACTAA-CTGTTGAGCCAG
gi|131071                     :                                     TG-AGAGCCACGTGCATT-GAGTTTATCT-CATA-AATGTTATAGA----GAATT---T--A---A---T---TTTTAGCAACTTTTGTCTATAAACT--ATA-A
gi|131072                     :                                     TG-AGAGCCACGTGCGAT-GGGTTCATCTTCATT-TATGTTGTAGG----GAATT---T--A---A---T---TTTGAGCAACTTTTATTTTTAAAattgttgagcca
gi|131073                     :                                     TG-AGAGCCACATTCATT-GGGTTCAGTTTTAAA-TATATTGTATA----CAATT---T--G---A---T---TCTGAGCAACTTT
gi|131074                     :                                     TG-AGAGCCACGTACAT--AGATTCATCTTAATA-TATGTTGTAGA----GAATT---T--A---A---T---ACTGAGGCACTTTTGTCTTTAAACT--ATATGGCTATCT---TAAACTGTTTAGCCAG
gi|131075                     :                                       -AGAGCCATGTGCGAT-GGGTTCATCTTCATA-TATGTTATAGG----GAATT---T--A---A---T---TCTGAGCAACTTTTGTGTTTAACTT--ATATGGCTAACTCAAA---CCGTTTAGCCAG
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gi|131077                     :                                                                 TTTATAATATGTTGTAG-------ATT---T--AACGA---T---TCTAAGCAACTTTTGTTCTTAAACAA-ATA-AGCTATCTACCA---CCGTTCCGCCAGAAACG
gi|131078                     :                                                                      A-TATGTTGTAGA----TCAAT---T--G---T---T---TTTAAACAATTTTTGTTCTCAAA-TACATG-AGCGATCTCTCT---CCGTTTACTCAGAAA
gi|131079                     :                                                                                                   ---A---T---TCTAAGCAACTTTTGTTCTTTAACAA-ATC-AGCTATCTACCA---CCGTTTCGCCAGAAACG


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blockSeqs                     :                         . .    . .    .    G          .        T      .           TA       .   C      .   .     T                   GTA    T            .  
blockSeqs                     :                         . .    . .    .    G          .        T      .           AC       .   T      .   .     A                   CAA    .            .  
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blockSeqs                     :                         . .    . .    .    G          .        G      .           GA       .   A      .   .     C                   GTG    .            .  
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blockSeqs                     :                         . .    . .    .    G          .        G      .           GC       .   A      .   .     G                   GTG    .            .  
blockSeqs                     :                         . .    . .    .    C          .        C      .           AA       .   A      .   .     A                   GTT    .            .  
blockSeqs                     :                         . .    . .    .    G          .        G      .           GA       .   T      .   .     G                   TTC    .            .  
blockSeqs                     :                         . .    . .    .    C          .        C      .           GC       .   A      .   .     G                   CAA    .            .  
blockSeqs                     :                         . .    . .    .    C          .        C      .           GA       .   A      .   .     G                   CAA    .            .  
blockSeqs                     :                                       .    C          .        C      .           GA       .   A      .   .     A                   TAC    .            .  
blockSeqs                     :                                       .    T          .        C      .           GA       .   A      .   .     T                   CAA    .            .  
blockSeqs                     :                                       .    C          .        C      .           CA       .   A      .   .     T                   AT     .            .  
blockSeqs                     :                                       .    C          .        T      .           GA       .   A      .   .     G                   CT     .            .  
blockSeqs                     :                                       .    C          .        C      .           GA       .   A      .   .     G                   CT     .            .  
blockSeqs                     :                                       .    C          .        C      .           GT       .   A      .   .     G                   CT     .            .  
blockSeqs                     :                                       .    C          .        G      .           TC       .   G      .   .     G                   TT     .               
blockSeqs                     :                                            G          .        .      .           .        .   A      .   .     A                   .      .               
blockSeqs                     :                                                                       .           .        .   A      .   .     A                                          
blockSeqs                     :                                                                       .           .        .   G      .   .     A                                          
blockSeqs                     :                                                                                                       .   .     A                                          


blockSeqCons                  :                                                                                   GA****
originalCons                  :            TTGTAGCACGTGC-C-GGAA-A--ATG-AGAGGCACGTGCATT-GGGTTCATNTTCATA-TATGTTGTAGA----GAATT---T--A---A---T---TCTGAGCAACTTTTGTTCTTAAAGTA-ATA-AGCTATCTGTCT---CCGTTTAGTCAGAAACG
finalCons                     :            TTGTAGCACGTGC-C-GGAA-A--ATG-AGAGGCACGTGCATT-GGGTTCATNTTCATA-TATGTTGTAGAGA----ATT---T--A---A---T---TCTGAGCAACTTTTGTTCTTAAAGTA-ATA-AGCTATCTGTCT---CCGTTTAGTCAGAAACG





Alignments
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lowQualScore                  :                         2 4    2 22   1    1          1        1      1           888888   222 222222 222 444   1                   0000   5            666                 
lowQualScore                  :                         . .    . ..   .    .          .        .      .           ......   ... ...... ... ...   .                   ....   .            ...                 
lowQualScore                  :                         0 0    0 88   5    3          4        5      3           666666   333 555555 333 555   0                   4444   7            999                 
consensus                     :            TTGTAGCACGTGC-C-GGAA-A--ATG-AGAGGCACGTGCATT-GGGTTCATNTTCATA-TATGTTGTAGA----GAATT---T--A---A---T---TCTGAGCAACTTTTGTTCTTAAAGTA-ATA-AGCTATCTGTCT---CCGTTTAGTCAGAAACG
Reference ( family-636 )      :            TTGTAGCACGTGC-C-GGAA-A--ATG-AGAGGCACGTGCATT-GGGTTCATNTTCATA-TATGTTGTAGA----GAATT---T--A---A---T---TCTGAGCAACTTTTGTTCTTAAAGTA-ATA-AGCTATCTGTCT---CCGTTTAGTCAGAAACG
gi|131049                     :            TTGTAGCACGTGC-C-AGAA-A--ATG-AGAGGCACGTGTTTT-CAGTTAATTTTCATA-TATGTTGTAGATCTCG---T---C--A---A---T---T-TCAACAACTTTTGTTCTTAAAGTA-TTA-AGCTATCTGTCT---CCGTTTAGTCAGAAAC
gi|131050                     :           aatGTAACACGTGC-T-AGAA-A--ATG-AGAGGCACGTGTATT-GAGCTCATTTTCATA-TATGTTGTAGA----ACACG---T--G---A---T---TCTGAGCAACTTTTGTTCTTAGAGGG-TTC-AGCTTTCTGTCT---TCGTTCAGTCAGAA
gi|131051                     :       aattgTTGTAGCACGTGC-C-AGAG-A--ATA-AGAGGCACGTGCATT-CAATTCATGGTCATA-TATGTTGTAG-------ATCTCGT--C---A---T---TCTTAACAACTTTTG-TCTGAAAGTA-TTA-AGCTATCTGTCT---CCGTTTAGTCGGAAACG
gi|131052                     :           aaaGTAACCCGTGC-C-AGAA-A--ATA-AGAGGCACGTGCATT-GATTTC-TTTTCATA-TATGTTGTAGA----ACACC---T--T---A---T---TCTGAGCGACTTTTGTTCTTAGAGTG-ATC-AGCTATTTGTCT---TCGTTTAGTCCGAAACG
gi|131053                     :       aattgTTGTAGCACGTGC-C-AGAA-A--ATG-ATAGGTACGTGCATT-CAGTTCATTTTCATA-TATGTTGTAGA----TCTTG---T--C---A---T---ACTTAACGACTTTTGATCTTAAAGTA-TTA-AGGTATCTGTCT---CATTATAGTCAGAAACG
gi|131054                     :         aatTTGCGGCATGTGCAC-GGCATA--ATA-A-AGGCACGTGCATT-GGGTT-A-----ATA-TATGTTGTGTA----TATTT---T--A---A---T---TTTAAGCAATTTTTGTTTTTCAACAA-AAA-AGTTAGCTCTCT---TCTTTT
gi|131055                     :           aagGTAACACGTGT-C-AGAA-A--ATG-AGAGGCACGTGCAT--GATTTTTTTTTAATA-TATGTTGTAGA----ACACC---T--T---A---T---TCTGAGCAACTTTTGTTCTTAGAGTG-ATC-AGCTATCTGTCT---TCATTTAGTCCAAAACGtttttcggaaatg
gi|131056                     :               aattgCGTGC-C-ATAA-A--ATG-AGAGGCACGTGCATT-GATTTATTTTTCATA-TATATTGTAGA----ACACC---T--T---A---T---TCTCGGCAATTTTTGTTCTGAAAGTG-ATC-AGCTATCTGTCT---TCGTTAAGTCCGAAAC
gi|131057                     : aattggttaccTTGTAGCACTTGC-C-GGAA-G--ATG-AGGGACACGTGCAAT-ACAATCATGTTGATA-TATGTTGTAGA----GAATT---T--A---A---T---TTTAAGCAACATTTGTTCTTAGAGTG-ATT-AGCTATCTGTCT---CCGTTCAGTCAGAAACG
gi|131058                     :          atTTCTGGCACGTGC-AAGGCA-T--GTG-TGAGGCA-GTGCACC-GGGCCCATGTTCATG-TCTGTTGTATA-------TT---T--A---A---TGATTCAAAGCAACTTTTGTTCTTCAACAA-ATA-AACTATTTGTCT---CCGTTT
gi|131059                     :            TTGTAGCACGTGC-C-GAAA-A--ATG-AGAGGCTCATGCATT-TGTTTCATGTTCAAA-TATATTGTAGA----TAATT---T--C---A---T---TCCGTGCAACATTTGTTCTTAAAGTG-ATA-AGCTATCTGTCT---TTGTTTAGTCAGAAAC
gi|131060                     :            TTGTAGCACGTGT-C-GGAA-A--ATA-AGAGGCACTTGCATTTGGGGTGATGTTCGTA-TATGTTGTAGA----GAATT---T--A---A---T---TTTGAGCAATTTTTGTTCCTAAAGTG-ATA-ATCTAACTTTCT---CCGTTTAGTCAAAAAC
gi|131061                     :            TTCTGGCACGTGC-AAGGCA-T--GTG-TGAGGCAGGTGCATC-AGGTGTATGTTGATA-TATGATGT-------GTATT---T--A---A---TGATTCTAAGCAATTTTTGGTCTTCAACAA-ATA-AGCTATCTGTCT---CCGTTT
gi|131062                     :            TTGTAGCACGTGC-C-GGAA-A--AAACAGAGTCACGTGCATT-GAAATCATGTTAATA-TATGTTGCGGA----AAATT---T--A---A---T---TCTAAGCAACATTTGTTCTTAGAGTA-ATA-AGCTATCTGTCT---CTATTTAGTCAGAAAC
gi|131063                     :            TTGTAGCACATGC-C-GGAA-A--ATG-ACAGCCACGTGCATT-GAGATCATGTTGATA-TATGTTGTAGA----AAATT---T--A---A---T---TCTAAGCAACATTTTTTCTTTAAGTA-ATA-AGCTATCTGTCT---CCGTTTAGTCAGAAACG
gi|131064                     :            TTGTAGCACGTGC-C-GGAA-A--ATG-AGGGGCACGTGCAAT-AGGATTATGCTGATA-TATGTTGTAGA----ACACC---T--T---A---T---TCTGAGTAACTTTTGTACTTAGAGTG-ATC-ATCTATTTGTCT---TCGTTTAGTCA-AAACG
gi|131065                     :            TTGTAGCACGTGC-C-GGAA-C--ATG-AGAGCCATGTGCATT-GAGATCATGTTGATA-TATGTTGTAAA----GAATT---T--A---A---T---TCTAAGCAACATTTGTTCTTAGAGTT-ATA-AGTTACCTGTTT---CC
gi|131066                     :            TTGTGGCACGTGC-A-CGAT-T--CTG-GGAAGCACGTGCACT-GAGTCCATCTTCTAA-CATGTTATAGA----GCA--------A---ACCCT---CCTGAGCAACTTTTGTATAGAAATTC-TTG-GGCTAAC-GT-TAA-CCGTTAAGTCAGAAA
gi|131067                     :             TGTAGCACGTGC-C-AGAA-A--ATG-AGAGCCACATGCATT-TGGGTAATGTTGATA-TATGATGTAGA----AAATT---T--A---A---T---ACTGACCAATTTTTGTGTTGAACAT--ATATGGCTATCT
gi|131068                     :               TGGCACGTGC----GCA-ATTCTG-AGAGCCACGTGCAT--GGGTTCATCTTCATA-TATGTTGTAGA----GAATT---T--A---A---T---ACTGAGTAACTTTTGTTTTTAAA
gi|131069                     :                                     TG-AGAGCCACTTGCATT-GAGTTCAGCTTCATA-TATGTTGTAAA----GCATT---C--A---A---T---TCTAAGCGACTTTTGTTTTTAAACT---TAGGGCTAACTCAAA---CCGTTTAGCCAGAA
gi|131070                     :                                     TA-AGAGTCACGTGCATT-GGGTTCAGCTTCATA-TATGTTGTAGA----GAATT---T--A---A---T---TCTTGGCAAGTTTTGTGTTTAAA----------CTATGTGACTAA-CTGTTGAGCCAG
gi|131071                     :                                     TG-AGAGCCACGTGCATT-GAGTTTATCT-CATA-AATGTTATAGA----GAATT---T--A---A---T---TTTTAGCAACTTTTGTCTATAAACT--ATA-A
gi|131072                     :                                     TG-AGAGCCACGTGCGAT-GGGTTCATCTTCATT-TATGTTGTAGG----GAATT---T--A---A---T---TTTGAGCAACTTTTATTTTTAAAattgttgagcca
gi|131073                     :                                     TG-AGAGCCACATTCATT-GGGTTCAGTTTTAAA-TATATTGTATA----CAATT---T--G---A---T---TCTGAGCAACTTT
gi|131074                     :                                     TG-AGAGCCACGTACAT--AGATTCATCTTAATA-TATGTTGTAGA----GAATT---T--A---A---T---ACTGAGGCACTTTTGTCTTTAAACT--ATATGGCTATCT---TAAACTGTTTAGCCAG
gi|131075                     :                                       -AGAGCCATGTGCGAT-GGGTTCATCTTCATA-TATGTTATAGG----GAATT---T--A---A---T---TCTGAGCAACTTTTGTGTTTAACTT--ATATGGCTAACTCAAA---CCGTTTAGCCAG
gi|131076                     :                                          AGGCAAGTGCATT-GGGTTCATGTTCATA-TGTGTTGT-------GTATT---TTTA---A---T---TCGAAGCAACTTTTGTTCTACAACAA-ATA-AGTTATATCTCT---CCGTTTATTCGGAAATG
gi|131077                     :                                                                 TTTATAATATGTTGTAG-------ATT---T--AACGA---T---TCTAAGCAACTTTTGTTCTTAAACAA-ATA-AGCTATCTACCA---CCGTTCCGCCAGAAACG
gi|131078                     :                                                                      A-TATGTTGTAGA----TCAAT---T--G---T---T---TTTAAACAATTTTTGTTCTCAAA-TACATG-AGCGATCTCTCT---CCGTTTACTCAGAAA
gi|131079                     :                                                                                                   ---A---T---TCTAAGCAACTTTTGTTCTTTAACAA-ATC-AGCTATCTACCA---CCGTTTCGCCAGAAACG