lowQualScore : 22222
lowQualScore : 2 1 1 222 1 222 1 22222 22
lowQualScore : . . . ... . ... . ..... ..
lowQualScore : 1 5 4 444 4 666 6 88888 88
consensus : ATAAAACAAT-TATGGAC-TTTTCAGCTGTGCAATATGATGT---GCTATGC-ACCAG---AAA-AA-A--NAAT--ATTGA
Reference ( gi|106691 ) : ATAAAACAGT-TATGGAC-TTTTCAGCTGTGCAATATGATGT---GCTATGC-ACCAG---AAA-AA-A--AAAT--ATTGA
gi|106693 : ATAAAACAGT-TATGGAC-TTTTCAGCTGTGCAATATGATGT---GCTATGC-ACCAG---GAA-AA-A--
gi|106692 : ATAAAACAAT-TATGGAC-TGTTCAGCTGTGCAATATGATGT---GCTATGC-TCCAG---AAA-AG-A--TAAT--ATTGAt
gi|106696 : ATAAAACAGT-TATGGAT-TTTTCCGCTGTGCAATATGATGT---TCTATGC-ACCAG---AAA-AACAT-AAAT--ATTGA
gi|106694 : ATAAAACAGT-TATGGAC-TTTTCAGCTGTGTATTATGCTGT---ACTATGC-ACCAG---AAATAC-AT-AAAT--ATTGA
gi|106698 : ATAAAACATT-TATGGAC-TTTACAGCTGTGCAATGTAATGT---GCTATGT-GCCAG---AAA-AACAT-AAAT--ATTGA
gi|106697 : ATAAAACGGT-TATGGAC-TTTTCTGCTGTGCAATTTGATGT---TCTATGC-ACCAA---AAA-AACAT-AAAT--ATT
gi|106695 : ATAAAACGGT-TATG-ACATTTTCAGCTGTGCAATATGATGT---GCTATGC-ACCAG---AAA-TA-CTTAAAT--ATT
gi|106700 : ATGGAACAGT-TATGGAC-TTTTCATCTGTGCAATATGATGT---GCTatt
gi|106701 : ATATAACAAA-TATGGAC-TTTACAGCTGTTGAATATGATGT---GAAATGC-ACCAG---AAA-AA-
gi|106699 : ATAAAACATG-TATGGGC-TTTTCAGTTGTTATATATGATAT---GATATGC-ATCAG---Atcgcatcatatt
gi|106702 : ATAAAACAACACATTGAT-TTTTCAACTGTTGAATATGACGT---GTTTTGC-ACCAA---A
gi|106703 : TAAAACAGT-TATGTAC-TTTTCAGCTGTGCAATATGATGT---GCTATACTACC
gi|106704 : AAAACAGT-TATGGAC-TTTTCAGCTGTGCAATAT
gi|106705 : ACAAT-TATGGAC-TTTTCAGCTGTGCAATATGATGT---GCTATGC-ACCAA---AAA-AA-T--TAAT--AGTGA
gi|106706 : ACAAT-TATGGAC-TTTTCAGCTGTGCAATATCATGT---GCTATGC-ACTAG---AAA-AA-T--TAAT--ATTGA
gi|106707 : ACAAT-TATGGAC-TTT-CAGCTGTGCAATATGATGT---GCTATGT-ACTAG---AAA-AA-A--TAAT--ATTG
gi|106713 : ACAAT-TATGGAT-TTTTCAG-TGTGCAATATGATGT---GCTATCC-ACCAGAAAAAA-AA-A--AAAT--ATTGA
gi|106711 : ACAAT-TATGGAC-TTCTCAGCTGTGCAATATGAGGT---GCTATGC-TCCAG----AA-AA-A--AAAT--AT
gi|106714 : ACATT-TATGGAC-TTTTCAGCTGTGCAATATGGTGT---GCTATTC-ACCAC---AAA-AA-A--AACTAAATTGA
gi|106710 : ACAAT-TATCGAC-TTTTCAGCAGTGCAATACGATGT---GCTATGT-ACCAG---AAA-AA-T--CAAT--ATTGA
gi|106712 : ACAAT-TATAGAC-TTTTTAACTGTGTAATATGATGT---GCTAGGC-ACCAG---AAA-AA-
gi|106715 : ACAAT-TATGGAC-TTTTCAGCTGCGCAGTATGATAT---GCTATGT-ACCCG---AAA-Atta
gi|106709 : ACAAT-TATGGAC-TT--CAGATGTGCAATATGATGTTGTACTATGC-ACCAG---AAA-AA-T--TAAT--ATTGAtctaatcttga
gi|106716 : ACAAA-TATGGAT-TTGTCAGCTATGAAATATGATGC---GATATGC-ACCAG----AA-AA-A--AAAT--ATTGA
gi|106717 : ACAAT-TATTTAC-TTTTCAACTTTGCAATGTGATGT---GCTATGC-ACTAG---AAA-
gi|106719 : AAT-TATGGAC-TTTTCAGATGTGCAATATGATGT---GCTATGC-ACCAG---AAA-AA-A--TAAT--
gi|106718 : -TATGGAC-TGTTCATATGTTGAATATGATGT---GATATGC-ATCAG---AAA-AA-G--GAAT--ATTGA
gi|106708 : ataaaATGGAC-TTTTCAGCTGTGCAAAATGATGT---GCTATGC-ACCAG---AAA-AA-T--TAAT--ATTGA
gi|106720 : acaatttgcga-TTGTTAGCTGTGCAATATGATGA---ACTATGC-ACCAG---AAA-AA-AATAAAT--ATT
gi|106721 : TGTGCAATATGATGT---TCTATGC-ACCAG---AAA-AACAT-AAAT--ATTGA
Alignments
lowQualScore : 22222
lowQualScore : 1 33333 1 222 1 222 55555 00000 22
lowQualScore : . ..... . ... . ... ..... ..... ..
lowQualScore : 4 44444 3 333 4 555 44444 44444 55
consensus : ATAAAACAAT-T-----ATGGAC-TTTTCAGCTGTGCAATATGATGT---GCTATGC-ACCAG---AAA-----AA-A--NAAT--ATTGA
Reference ( family-634 ) : ATAAAACAAT-T-----ATGGAC-TTTTCAGCTGTGCAATATGATGT---GCTATGC-ACCAG---AAA-----AA-A--NAAT--ATTGA
gi|106691 : ATAAAACAGT-T-----ATGGAC-TTTTCAGCTGTGCAATATGATGT---GCTATGC-ACCAG---AAA-----AA-A--AAAT--ATTGA
gi|106692 : ATAAAACAAT-T-----ATGGAC-TGTTCAGCTGTGCAATATGATGT---GCTATGC-TCCAG---AAA-----AG-A--TAAT--ATTGA
gi|106693 : ATAAAACAGT-T-----ATGGAC-TTTTCAGCTGTGCAATATGATGT---GCTATGC-ACCAG---GAA-----AA-A--
gi|106694 : ATAAAACAGT-T-----ATGGAC-TTTTCAGCTGTGTATTATGCTGT---ACTATGC-ACCAG---AAAT----AC-AT-AAAT--ATTGAt
gi|106695 : ATAAAACGGT-T-----ATG-ACATTTTCAGCTGTGCAATATGATGT---GCTATGC-ACCAG---AAATACTTAA-A--TATT--ATT
gi|106696 : ATAAAACAGT-T-----ATGGAT-TTTTCCGCTGTGCAATATGATGT---TCTATGC-ACCAG---AAA-----AACAT-AAAT--ATTGA
gi|106697 : ATAAAACGGT-T-----ATGGAC-TTTTCTGCTGTGCAATTTGATGT---TCTATGC-ACCAA---AAA-----AACAT-AAAT--ATT
gi|106698 : ATAAAACATT-T-----ATGGAC-TTTACAGCTGTGCAATGTAATGT---GCTATGT-GCCAG---AAA-----AACAT-AAAT--ATTGA
gi|106699 : ATAAAACATG-T-----ATGGGC-TTTTCAGTTGTTATATATGATAT---GATATGC-ATCAG---A
gi|106700 : ATGGAACAGT-T-----ATGGAC-TTTTCATCTGTGCAATATGATGT---GCT
gi|106701 : ATATAACAAA-T-----ATGGAC-TTTACAGCTGTTGAATATGATGT---GAAATGC-ACCAG---AAA-----AA-
gi|106702 : ATAAAACAACAC-----ATTGAT-TTTTCAACTGTTGAATATGACGT---GTTTTGC-ACCAA---Atcgcatcatatt
gi|106703 : TAAAACAGT-T-----ATGTAC-TTTTCAGCTGTGCAATATGATGT---GCTATACTACC
gi|106704 : AAAACAGT-T-----ATGGAC-TTTTCAGCTGTGCAATAT
gi|106705 : ACAAT-T-----ATGGAC-TTTTCAGCTGTGCAATATGATGT---GCTATGC-ACCAA---AAA-----AA-T--TAAT--AGTGA
gi|106706 : ACAAT-T-----ATGGAC-TTTTCAGCTGTGCAATATCATGT---GCTATGC-ACTAG---AAA-----AA-T--TAAT--ATTGA
gi|106707 : ACAAT-T-----ATGGAC-TTT-CAGCTGTGCAATATGATGT---GCTATGT-ACTAG---AAA-----AA-A--TAAT--ATTG
gi|106708 : ACAAT-TTGCGAATGGAC-TTTTCAGCTGTGCAAAATGATGT---GCTATGC-ACCAG---AAA-----AA-T--TAAT--ATTGA
gi|106709 : ACAAT-T-----ATGGAC-TT--CAGATGTGCAATATGATGTTGTACTATGC-ACCAG---AAA-----AA-T--TAAT--ATTGA
gi|106710 : ACAAT-T-----ATCGAC-TTTTCAGCAGTGCAATACGATGT---GCTATGT-ACCAG---AAA-----AA-T--CAAT--ATTGA
gi|106711 : ACAAT-T-----ATGGAC-TTCTCAGCTGTGCAATATGAGGT---GCTATGC-TCCAG---AAA-----AA-A---AAT--AT
gi|106712 : ACAAT-T-----ATAGAC-TTTTTAACTGTGTAATATGATGT---GCTAGGC-ACCAG---AAA-----AA-
gi|106713 : ACAAT-T-----ATGGAT-TTTTCAG-TGTGCAATATGATGT---GCTATCC-ACCAGAAAAAA-----AA-A--AAAT--ATTGAtta
gi|106714 : ACATT-T-----ATGGAC-TTTTCAGCTGTGCAATATGGTGT---GCTATTC-ACCAC---AAA-----AA-A--AACTAAATTGA
gi|106715 : ACAAT-T-----ATGGAC-TTTTCAGCTGCGCAGTATGATAT---GCTATGT-ACCCG---AAA-----AT-C--TAAT--CTTGA
gi|106716 : ACAAA-T-----ATGGAT-TTGTCAGCTATGAAATATGATGC---GATATGC-ACCAG---AAA-----AA-A---AAT--ATTGA
gi|106717 : ACAAT-T-----ATTTAC-TTTTCAACTTTGCAATGTGATGT---GCTATGC-ACTAG---AAA-----
gi|106718 : ATAAA-T-----ATGGAC-TGTTCATATGTTGAATATGATGT---GATATGC-ATCAG---AAA-----AA-G--GAAT--ATTGA
gi|106719 : AAT-T-----ATGGAC-TTTTCAGATGTGCAATATGATGT---GCTATGC-ACCAG---AAA-----AA-A--TAAT--
gi|106720 : -TTGTTAGCTGTGCAATATGATGA---ACTATGC-ACCAG---AAA-----AA-AATAAAT--ATT
gi|106721 : TGTGCAATATGATGT---TCTATGC-ACCAG---AAA-----AACAT-AAAT--ATTGA
Alignments
lowQualScore : 22222
lowQualScore : 1 33333 1 222 1 222 55555 00000 22
lowQualScore : . ..... . ... . ... ..... ..... ..
lowQualScore : 4 44444 3 333 4 555 44444 44444 55
consensus : ATAAAACAAT-T-----ATGGAC-TTTTCAGCTGTGCAATATGATGT---GCTATGC-ACCAG---AAA-----AA-A--NAAT--ATTGA
Reference ( family-634 ) : ATAAAACAAT-T-----ATGGAC-TTTTCAGCTGTGCAATATGATGT---GCTATGC-ACCAG---AAA-----AA-A--NAAT--ATTGA
gi|106691 : ATAAAACAGT-T-----ATGGAC-TTTTCAGCTGTGCAATATGATGT---GCTATGC-ACCAG---AAA-----AA-A--AAAT--ATTGA
gi|106692 : ATAAAACAAT-T-----ATGGAC-TGTTCAGCTGTGCAATATGATGT---GCTATGC-TCCAG---AAA-----AG-A--TAAT--ATTGA
gi|106693 : ATAAAACAGT-T-----ATGGAC-TTTTCAGCTGTGCAATATGATGT---GCTATGC-ACCAG---GAA-----AA-A--
gi|106694 : ATAAAACAGT-T-----ATGGAC-TTTTCAGCTGTGTATTATGCTGT---ACTATGC-ACCAG---AAAT----AC-AT-AAAT--ATTGAt
gi|106695 : ATAAAACGGT-T-----ATG-ACATTTTCAGCTGTGCAATATGATGT---GCTATGC-ACCAG---AAATACTTAA-A--TATT--ATT
gi|106696 : ATAAAACAGT-T-----ATGGAT-TTTTCCGCTGTGCAATATGATGT---TCTATGC-ACCAG---AAA-----AACAT-AAAT--ATTGA
gi|106697 : ATAAAACGGT-T-----ATGGAC-TTTTCTGCTGTGCAATTTGATGT---TCTATGC-ACCAA---AAA-----AACAT-AAAT--ATT
gi|106698 : ATAAAACATT-T-----ATGGAC-TTTACAGCTGTGCAATGTAATGT---GCTATGT-GCCAG---AAA-----AACAT-AAAT--ATTGA
gi|106699 : ATAAAACATG-T-----ATGGGC-TTTTCAGTTGTTATATATGATAT---GATATGC-ATCAG---A
gi|106700 : ATGGAACAGT-T-----ATGGAC-TTTTCATCTGTGCAATATGATGT---GCT
gi|106701 : ATATAACAAA-T-----ATGGAC-TTTACAGCTGTTGAATATGATGT---GAAATGC-ACCAG---AAA-----AA-
gi|106702 : ATAAAACAACAC-----ATTGAT-TTTTCAACTGTTGAATATGACGT---GTTTTGC-ACCAA---Atcgcatcatatt
gi|106703 : TAAAACAGT-T-----ATGTAC-TTTTCAGCTGTGCAATATGATGT---GCTATACTACC
gi|106704 : AAAACAGT-T-----ATGGAC-TTTTCAGCTGTGCAATAT
gi|106705 : ACAAT-T-----ATGGAC-TTTTCAGCTGTGCAATATGATGT---GCTATGC-ACCAA---AAA-----AA-T--TAAT--AGTGA
gi|106706 : ACAAT-T-----ATGGAC-TTTTCAGCTGTGCAATATCATGT---GCTATGC-ACTAG---AAA-----AA-T--TAAT--ATTGA
gi|106707 : ACAAT-T-----ATGGAC-TTT-CAGCTGTGCAATATGATGT---GCTATGT-ACTAG---AAA-----AA-A--TAAT--ATTG
gi|106708 : ACAAT-TTGCGAATGGAC-TTTTCAGCTGTGCAAAATGATGT---GCTATGC-ACCAG---AAA-----AA-T--TAAT--ATTGA
gi|106709 : ACAAT-T-----ATGGAC-TT--CAGATGTGCAATATGATGTTGTACTATGC-ACCAG---AAA-----AA-T--TAAT--ATTGA
gi|106710 : ACAAT-T-----ATCGAC-TTTTCAGCAGTGCAATACGATGT---GCTATGT-ACCAG---AAA-----AA-T--CAAT--ATTGA
gi|106711 : ACAAT-T-----ATGGAC-TTCTCAGCTGTGCAATATGAGGT---GCTATGC-TCCAG---AAA-----AA-A---AAT--AT
gi|106712 : ACAAT-T-----ATAGAC-TTTTTAACTGTGTAATATGATGT---GCTAGGC-ACCAG---AAA-----AA-
gi|106713 : ACAAT-T-----ATGGAT-TTTTCAG-TGTGCAATATGATGT---GCTATCC-ACCAGAAAAAA-----AA-A--AAAT--ATTGAtta
gi|106714 : ACATT-T-----ATGGAC-TTTTCAGCTGTGCAATATGGTGT---GCTATTC-ACCAC---AAA-----AA-A--AACTAAATTGA
gi|106715 : ACAAT-T-----ATGGAC-TTTTCAGCTGCGCAGTATGATAT---GCTATGT-ACCCG---AAA-----AT-C--TAAT--CTTGA
gi|106716 : ACAAA-T-----ATGGAT-TTGTCAGCTATGAAATATGATGC---GATATGC-ACCAG---AAA-----AA-A---AAT--ATTGA
gi|106717 : ACAAT-T-----ATTTAC-TTTTCAACTTTGCAATGTGATGT---GCTATGC-ACTAG---AAA-----
gi|106718 : ATAAA-T-----ATGGAC-TGTTCATATGTTGAATATGATGT---GATATGC-ATCAG---AAA-----AA-G--GAAT--ATTGA
gi|106719 : AAT-T-----ATGGAC-TTTTCAGATGTGCAATATGATGT---GCTATGC-ACCAG---AAA-----AA-A--TAAT--
gi|106720 : -TTGTTAGCTGTGCAATATGATGA---ACTATGC-ACCAG---AAA-----AA-AATAAAT--ATT
gi|106721 : TGTGCAATATGATGT---TCTATGC-ACCAG---AAA-----AACAT-AAAT--ATTGA
blockSeqs : A TGCGA A TGT T AAA TACTT CATA AA
blockSeqs : . . . . . . T CATA .
blockSeqs : . . . . . . . CATA .
blockSeqs : . . . . . . . AATA .
blockSeqs : . . . . . . . CATA .
blockSeqs : . . . . . . . ATA .
blockSeqs : . . . . . . . AT .
blockSeqs : . . . . . . . AT .
blockSeqs : . . . . . . . TT .
blockSeqs : . . . . . . . TT .
blockSeqs : . . . . . . . AT .
blockSeqs : . . . . . . . TT .
blockSeqs : . . . . . . . TT .
blockSeqs : . . . . . . . TC .
blockSeqs : . . . . . . . AA .
blockSeqs : . . . . . . . AA .
blockSeqs : . . . . . . . CT .
blockSeqs : . . . . . . . GG .
blockSeqs : . . . . . . . AT .
blockSeqs : . . . . . . . A .
blockSeqs : . . . . . . . A .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . .
blockSeqCons :
originalCons : ATAAAACAAT-T-----ATGGAC-TTTTCAGCTGTGCAATATGATGT---GCTATGC-ACCAG---AAA-----AA-A--NAAT--ATTGA
finalCons : ATAAAACAAT-T-----ATGGAC-TTTTCAGCTGTGCAATATGATGT---GCTATGC-ACCAG---AAA-----AA-A--NAAT--ATTGA
Alignments
lowQualScore : 22222
lowQualScore : 1 33333 1 222 1 222 55555 00000 22
lowQualScore : . ..... . ... . ... ..... ..... ..
lowQualScore : 4 44444 3 333 4 555 44444 44444 55
consensus : ATAAAACAAT-T-----ATGGAC-TTTTCAGCTGTGCAATATGATGT---GCTATGC-ACCAG---AAA-----AA-A--NAAT--ATTGA
Reference ( family-634 ) : ATAAAACAAT-T-----ATGGAC-TTTTCAGCTGTGCAATATGATGT---GCTATGC-ACCAG---AAA-----AA-A--NAAT--ATTGA
gi|106691 : ATAAAACAGT-T-----ATGGAC-TTTTCAGCTGTGCAATATGATGT---GCTATGC-ACCAG---AAA-----AA-A--AAAT--ATTGA
gi|106692 : ATAAAACAAT-T-----ATGGAC-TGTTCAGCTGTGCAATATGATGT---GCTATGC-TCCAG---AAA-----AG-A--TAAT--ATTGA
gi|106693 : ATAAAACAGT-T-----ATGGAC-TTTTCAGCTGTGCAATATGATGT---GCTATGC-ACCAG---GAA-----AA-A--
gi|106694 : ATAAAACAGT-T-----ATGGAC-TTTTCAGCTGTGTATTATGCTGT---ACTATGC-ACCAG---AAAT----AC-AT-AAAT--ATTGAt
gi|106695 : ATAAAACGGT-T-----ATG-ACATTTTCAGCTGTGCAATATGATGT---GCTATGC-ACCAG---AAATACTTAA-A--TATT--ATT
gi|106696 : ATAAAACAGT-T-----ATGGAT-TTTTCCGCTGTGCAATATGATGT---TCTATGC-ACCAG---AAA-----AACAT-AAAT--ATTGA
gi|106697 : ATAAAACGGT-T-----ATGGAC-TTTTCTGCTGTGCAATTTGATGT---TCTATGC-ACCAA---AAA-----AACAT-AAAT--ATT
gi|106698 : ATAAAACATT-T-----ATGGAC-TTTACAGCTGTGCAATGTAATGT---GCTATGT-GCCAG---AAA-----AACAT-AAAT--ATTGA
gi|106699 : ATAAAACATG-T-----ATGGGC-TTTTCAGTTGTTATATATGATAT---GATATGC-ATCAG---A
gi|106700 : ATGGAACAGT-T-----ATGGAC-TTTTCATCTGTGCAATATGATGT---GCT
gi|106701 : ATATAACAAA-T-----ATGGAC-TTTACAGCTGTTGAATATGATGT---GAAATGC-ACCAG---AAA-----AA-
gi|106702 : ATAAAACAACAC-----ATTGAT-TTTTCAACTGTTGAATATGACGT---GTTTTGC-ACCAA---Atcgcatcatatt
gi|106703 : TAAAACAGT-T-----ATGTAC-TTTTCAGCTGTGCAATATGATGT---GCTATACTACC
gi|106704 : AAAACAGT-T-----ATGGAC-TTTTCAGCTGTGCAATAT
gi|106705 : ACAAT-T-----ATGGAC-TTTTCAGCTGTGCAATATGATGT---GCTATGC-ACCAA---AAA-----AA-T--TAAT--AGTGA
gi|106706 : ACAAT-T-----ATGGAC-TTTTCAGCTGTGCAATATCATGT---GCTATGC-ACTAG---AAA-----AA-T--TAAT--ATTGA
gi|106707 : ACAAT-T-----ATGGAC-TTT-CAGCTGTGCAATATGATGT---GCTATGT-ACTAG---AAA-----AA-A--TAAT--ATTG
gi|106708 : ACAAT-TTGCGAATGGAC-TTTTCAGCTGTGCAAAATGATGT---GCTATGC-ACCAG---AAA-----AA-T--TAAT--ATTGA
gi|106709 : ACAAT-T-----ATGGAC-TT--CAGATGTGCAATATGATGTTGTACTATGC-ACCAG---AAA-----AA-T--TAAT--ATTGA
gi|106710 : ACAAT-T-----ATCGAC-TTTTCAGCAGTGCAATACGATGT---GCTATGT-ACCAG---AAA-----AA-T--CAAT--ATTGA
gi|106711 : ACAAT-T-----ATGGAC-TTCTCAGCTGTGCAATATGAGGT---GCTATGC-TCCAG---AAA-----AA-A---AAT--AT
gi|106712 : ACAAT-T-----ATAGAC-TTTTTAACTGTGTAATATGATGT---GCTAGGC-ACCAG---AAA-----AA-
gi|106713 : ACAAT-T-----ATGGAT-TTTTCAG-TGTGCAATATGATGT---GCTATCC-ACCAGAAAAAA-----AA-A--AAAT--ATTGAtta
gi|106714 : ACATT-T-----ATGGAC-TTTTCAGCTGTGCAATATGGTGT---GCTATTC-ACCAC---AAA-----AA-A--AACTAAATTGA
gi|106715 : ACAAT-T-----ATGGAC-TTTTCAGCTGCGCAGTATGATAT---GCTATGT-ACCCG---AAA-----AT-C--TAAT--CTTGA
gi|106716 : ACAAA-T-----ATGGAT-TTGTCAGCTATGAAATATGATGC---GATATGC-ACCAG---AAA-----AA-A---AAT--ATTGA
gi|106717 : ACAAT-T-----ATTTAC-TTTTCAACTTTGCAATGTGATGT---GCTATGC-ACTAG---AAA-----
gi|106718 : ATAAA-T-----ATGGAC-TGTTCATATGTTGAATATGATGT---GATATGC-ATCAG---AAA-----AA-G--GAAT--ATTGA
gi|106719 : AAT-T-----ATGGAC-TTTTCAGATGTGCAATATGATGT---GCTATGC-ACCAG---AAA-----AA-A--TAAT--
gi|106720 : -TTGTTAGCTGTGCAATATGATGA---ACTATGC-ACCAG---AAA-----AA-AATAAAT--ATT
gi|106721 : TGTGCAATATGATGT---TCTATGC-ACCAG---AAA-----AACAT-AAAT--ATTGA