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blockSeqs                     :       .              .         CACCA           .     .  .            .  .    .
blockSeqs                     :       .              .         G               .     .  .            .  .    .
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blockSeqs                     :       .              .         A               .     .  .            .  .    .
blockSeqs                     :       .              .         G               .     .  .            .  .    .
blockSeqs                     :       .              .         G               .     .  .            .  .    .
blockSeqs                     :       .              .         G               .     .  .            .  .    .
blockSeqs                     :       .              .         A               .     .  .            .  .    .
blockSeqs                     :       .              .         A               .     .  .            .  .    .
blockSeqs                     :       .              .         A               .     .  .            .  .    .
blockSeqs                     :       .              .         T               .     .  .            .  .    .
blockSeqs                     :       .              .         G               .     .  .            .  .    .
blockSeqs                     :       .              .         G               .     .  .            .  .    .
blockSeqs                     :       .              .         C               .     .  .            .  .    .
blockSeqs                     :       .              .         G               .     .  .            .  .    .
blockSeqs                     :       .              .         G               .     .  .            .  .    .
blockSeqs                     :       .              .         A               .     .  .            .  .    .
blockSeqs                     :       .              .         G               .     .  .            .  .    .
blockSeqs                     :       .              .         G               .     .  .            .  .    .
blockSeqs                     :       .              .         G               .     .  .            .  .    .
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blockSeqs                     :       .              .         G               .     .  .            .  .    .
blockSeqs                     :       .              .         G               .     .  .            .  .    .
blockSeqs                     :       .              .         T               .     .  .            .  .    .
blockSeqs                     :       .              .         G               .     .  .            .  .    .
blockSeqs                     :       .              .         G               .     .  .            .  .    .
blockSeqs                     :       .              .         G               .     .  .            .  .    .
blockSeqs                     :       .              .         G               .     .  .            .  .     
blockSeqs                     :                      .         A               .     .  .                     


blockSeqCons                  : 
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Alignments
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lowQualScore                  :       ..             .         ...........     .     .  ..           .. .... .      
lowQualScore                  :       88             3         88888888888     3     3  88           88 8888 4      
consensus                     : TTTGAA--ATAATGAATGAAA-TCGGATCGC----G------GGATA-CGGGG-GA--GGAAAACGGAA--T----A-GCATTT
Reference ( family-631 )      : TTTGAA--ATAATGAATGAAA-TCGGATCGC----G------GGATA-CGGGG-GA--GGAAAACGGAA--T----A-GCATTT
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gi|25601                      :               AATGAAA-TTGGATCGC----A------GGATA-CGGGA-GA--GGAAAACGAAA--T----A-GCTTTT