lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 1111111111 1 1111111 11111 11 1 22 2222222222222222222222222222222222222222 33333 1 11 11 2222 1 11 1 1111 5555555555
lowQualScore : 6 9999999999 66 66 4 8 0 3333333 33 2 22222 4 55 2 2 3 44 8 33 3 1 8 8888888 3 8 4 5 4444444444444444444444444444444444444444 3 2 33 66666 66 7 3 6 2 2 1 5 3 6 88 8 88 3 6 5 0 8 6 3333 4 3 4 55 2 2 5 3 999 00 1 8 2 6 7 2 7777 3 4 8888888888 4 6
lowQualScore : . .......... .. .. . . . ....... .. . ..... . .. . . . .. . .. . . . ....... . . . . ........................................ . . .. ..... .. . . . . . . . . . .. . .. . . . . . . .... . . . .. . . . . ... .. . . . . . . .... . . .......... . .
lowQualScore : 2 4444444444 11 11 4 9 8 0000000 22 4 88888 8 99 5 5 2 00 3 77 8 3 3 7777777 8 3 9 3 7777777777777777777777777777777777777777 8 7 77 00000 33 1 2 6 5 5 5 9 1 0 33 3 33 5 0 7 3 9 7 8888 0 9 1 66 5 5 0 2 111 88 3 0 5 9 2 5 8888 1 2 1111111111 1 0
consensus : TTTGACTTTTTGATAGAGTATTGATCAAATGAGTCATCTGAACTCTTAACTTGTCCAACTCCTCAAGCAAGAATTTCAACGATTCAGCTC----------CAG--ATAT--ATATTATGTTTT-AACTTC-AACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATCATCTTCAGTCTGGCAATCATATATTTT-------GTGCTACAACTCCAGTC--AA-TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGT----TATGATTTATGGATAACGAAACGCATTCAGCACAAAATGTTCCTG-ATTG-TCCGAGAA-TATACAACACA-TATCCATAACTC--TTTGTCCAGACCAAAACAAACATGACCTACTTATAGATTTACGCGTATATC-------GACTTGAGTTATGTTCGATTCTCATATAGCTTTCAATCAACAATATAAATNAT-CAAT-AAT-GCA---------T---------TA---------TAAACGGTGTTGCGTGACCTAGATTTAATCAATCTAAAAA-ATACAACAC--AGAA---A--CACAACAAACATAACGGTCGGATGACCTAATTAACCGTTA-AA-TATGTTTGCAT-AAACTAATTAGCAGCAAAAATTGAGTAGCAATACAACAGTATATGATAAGGGTAA--ATATATATATGAAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGCGGTGGATCTGTACATCA-ACATCAAAACACTGCTTGCATAAGATGACAGATTGGCGCGTTTTTCTATGNCAACAACAAANATAGCCCCGAACCTAATTTCNTTATTTTACTATCAAAATT-A-A-AAGAGGACA--NTCCGTAGTGAATAAAATTNCACTAAC-AATCACTATTTACTCAA-ACTACGAGTTATTATATCGAAAACATGTCAATATTTCACCCCGTTAATGATTACATCTGATTACAGTCGAATGGTGTTAGAGATTATA
Reference ( gi|89394 ) : TTTGACTTTTTGATAGAGTATTGATCAAATGAGTCAACTGAACTCTTAACTTGTCCAACTCCTCAAGCAAGAATTTCAACGATTCAGTTC----------CAG--ATAT--ATATTATATTTT-AACTTC-AACTCCAGATTCTGTTTTTCCATGAATCATCTTCAGTCTGGCAATCATATATTTT-------GTGCTACAACTCCAGTC--AA-TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGT----AATGATTTATGGATAACGAAACACATTCAGCACAAAATGTTCCTC-ATTG-TCCGAGAA-TATACTACACAATATCCAGAACTC--TTTGTCCAGAACAAAACAAACATGACCTACTTACAGATTTACGTGAATATC-------GACTTTAGTTATGTTCGATTCTCATAAAGCTTTCAATCAACAATATAAATTAT-CA---------A---------T---------TA---------TAAACGGTTTTGCGTGACCTAGATTTAATCAATCTAAAAA-ATACAACAC--AG-----A--CACAACAAACATAATGGTCAGATGACCTAATTAACGGTTA-AA-TATGTTTGGAT-AAACTAATTAGCAACAAAAATTGAGTAGCAATACAACAGTATATGATAAGGGTAA--ATATATATATGAAATAATGAATGTATATATAAATCAATTACTTTGAGTGGTGGATTTGTACATCA-ACATCAAAACACTGCTTGCATAAGATGACAGATTGGCGCGTTTTTTTCTGACAACAACAAAAATAGCCCTGAACCTAATTTCTTTATTTTACTATCAAAATC-A-A-A-GAAGACA--TTCAATAGTGAATGAAATTACACTAAC-AATCTCTTTTTACTCAA-ACTATAACTTATTATATCGAAAACATGTCAATATTTCACCCTGTCAATGATTACACGTGATTACAGTTGAATGGTGTTAGAAATTATA
gi|89395 : TTTTACTTTTTGATAGAGTATTGATCAAA-GAATCATCTGAACTCTTAACTTGTCCAACTCCTCAAGCAAGAATTTCAACGATTCAGTTC----------CAG--ATAT--ATATTATATTTT-AACTTC-AACACCAGACTTTGTTTTTTCATAAATCATCTTCATTCTGGCAATCATATATTTT-------ATGCTACAACTCCAGTC--AAATTTTAATATCTCCAGTTCAATAGT----AATAATTTATGGATAACGAAATGCATTCAGCACCAAATGTTCCTG-ATTG-TCCAAGAA-TATACCACACACTATCCAGAACTC--TTTGTCCAGAACAAAACAAACATGACCTACTTACAGATTTACGTGAATATC-------GACTTTAGTTATGTTCGATTCTCAAAAAGCTTTCAATCAACAATATAAATTATCCAATTAATTGCA---------T---------TA---------TAAACGGTTTTGCGTGACCTAGATTTAATCAATCTAAACA-ATTCAACAC--AG-----A--CACAACAAACATAACGGTCAGATGACCTAATT-CCACTTG-AA-TATGTTTGGAT-AAACTAATTAGCAGCAAAAATTGAGTAGCAATACAACAGTATATGATAAGGGTAA--ATATATATATGAAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGTGGTGGATCTGTACATCA-ACATCAAATCACTGCTTACATAAGATGACAGATTGGCGC--TTTTTTCTGTCAACAACAAAAATAGCCCTGAACCTAATTTCTTTATTTTACTATCAAAATC-A-A-A-GAGGACA--TTCAATAGTGAATGAAATTACACTAAC-AATCACTTTTTACTCAA-ACTACGAGTTATTATATCGAAAACATGTCAATATTTCACCCTGTCAATGATTACACCTGATTACAATCGAATGATGTTAGAGATTATA
gi|89396 : TTTGACTTTTTGATAGAGTATTGATCAAATGAGTCACCTAAACTCTTAACTTGTCCAACTCTTGAAGCAAGAATTTTAACGATTCAGTTC----------CAG--ATAT--ATATCATATTTTTAACATC-AACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATTATCTTCAGTCTGGCAATCATATATTTT-------GTATTACAACTCCAGTC--AA-TCTTAATATCTCCAGTTCAATAGT----AATGATTTATGGATAACTAAATGCATTCAGCACAAA-TTTTCCTG-ATTG-TCCGAGAA-TATACCATACGATATCCAGAACTC--TTTGTTCAGAACAAAACAAACATGACCTACTTACAGATTTACGTGAATATC-------GACTTTAGTTATGTTCGATTCTCACAAAACTTTCAATCAACAATATAAATTAT-CA---------A---------T---------TAATTGCATTATAAACGGTTTTGCGTGACCAAGCTTTAATCAATCTAAAAA-ATACAACAC--AG-----A--CACAATAAACATAACGGTCGGATGACCTAATTAACGGTTG-AA-TATGTTTGAAT-TAACTAATTAGCAGCAAAAATTGAGTAGCATTACAACAGTATATGATAAGGGTAA--CTATATATATGAAATAATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGCGGTTGATCTGTACATCA-ACATCAAAACACTGCTTGCATAAGATGACAGATTGGTGCG--TTTTTCTGTCAACAACAAAAATAGCCCCGAACCTAATTTCTTTATTTTACTATCAAAATC-A-A-A-GAAGACA--TTCAATAGTGAATGAAATTACACTTAC-ATTCACATTTTACTCAA-AATACGAGTTATTATATCGAAAACTTGTCAATATTTCACCCTGTCAATGATTACACCTGATTACAGTCGAATGATGTTAGAGATTATA
gi|89397 : TTCGACTTTTTGATAGAGTATTGATCAAATGAGTCACCTGAACTCTTAACTTGTCCAACTCCTCAAGCAAGAAATTCAACGATTCAGTTCTATATATATATAT--ATAT--ATATTATATTTT-AACTTC-AACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATCATCTTTAGTCTGGCAATCATATATTTT-------ATGCTACAACTCCAGTC--AA-TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGA----AATGTTCAAAGGATAACGAAACACATTCAGCACAAAATGTTCCTG-ATTG-TCCGAGAA-TATATCACACATTATCCAGAATTC--TTTGTTCAGAACAAAACAAACATGACCTACTTACAGATTTACGTGAATATC-------GACTTTAGTTATGTTCGATTCTCATAAAG-TATCGATCAATTATATAAATTAT-CAATTAATTGCA---------T---------TA---------TGAACTGTTTTGCTTGACCTAAATTTAATCAATCTAAAAA-ACACAACAC--AG-----A--CACAACAAACATTACGGTTGGATTACCTAATTAACGGTTA-AA-TATGTTTGGAT-A----AATTAGCAGCAAAAATTGAGTAGCAAATCAACAGTATATGATAAGGGTAAATATATATATATGAAATTATGAATGTATACTTAAAACAATTACTTTGAGCGGTGGATCTGTACATCA-ACAACAAAACACTGCTTGCATAAGATGACAGATTGGCACG--TTTTTCTGTCAACATCAAAAATAGCCCCGAACCTAATTTCTTTATTTTACTATCAAAATC-A-A-A-GAGGACA--TTCAATAGTGAATGAAATTACACTAAC-AATCACTTTTTACTCAA-ACTAGGAGTTATTATATCGAAAACATGTCAATATTTCACCCTGTCAATGATTACACCTGATT--AGTCGAATGATGTTAGAGATTATA
gi|89398 : TTTGACTTTTTGACAGAGTATTGATCAAATGAGTCATTTGAACTCTTAACTTGTCCAACTCCTATAGCAAGAATTTCAACGATTCAGTTC----------CAG--ATATATATATTATATTTT-AAGTTC-AACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATCATCTTCAGTCTGGCAATCATATATTTT-------GAGCTACAACTCCAGTC--AA-TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGT----AATGATTTATGGATAACGAAACGCATTCAGCACAAAATGTTCCTG-ATTGAT------A-TATACCATACATTATCCAGAACTCTTTTTGTCCAGAACAAAACAAACATGACCTACTTACAGATTTACGTGAATATC-------TACTTTAGTTATGTTCAATTCTCATAAAGCTTTCAATCAACAATATAAATTAT-CAATTAATTGTA---------T---------TA---------TAAACGGTTTTGCATGACCTAGATTTAATCAATCTAAATA-ATACAACAC--AG-----A--CACAACAAACACAACGGTCGGATGACCTAATTAACGGTTA-AA-TATGTTTGGAT-AAACTAATTAGCAGCAAAAATTGAGTAGCAATACAACAGTATATG---------A--ATGTATAT-TTAAATAA-------ATA------------ACTTTGAGCGGTGGATCTGTACATCA-ACATCAAAACACTGCTTGCATAAGATCACAGATTGGTGCG--TTTTTCTGTCAACAACACAAATAGCCCCGAATCCAATTTCTTTATTTTACTATAAAAATC-A-A-A-GAGGACA--TTCAATAGTGAATGAAATTACACTAAC-AATCACTTTTTACTCAA-ACTACGAGTTATTATATCGAAAACATGCCTATATTTCACCCAGTCAATGATTACATCTGATTACAGTCGAATGATGTTAGAGATTATA
gi|89399 : TCAAATGAGTCACCTGAACTCTAAACTTGTCGAACTCCTCAAGGAAGAATTTCAACCATTCAGCTT----------CAG--ATAT--ATATTATGTTTT-GACTTC-AACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATCAT------------GATCATATATTTT-------GTACTACAACTCCAGTC--AA-TTTTAATATCTCCAGTTCAACAGT----TATGATTTATGGATAACGAAACGCATTCAGCACAAAATGTTCCTG-ATTG-TCCTAGAA-TATACCACACA-TATCCATAACTC--TTTGTCCAGAACAAAACAAACATGATCTACTTACAGATTTACGTGAATATC-------TACTTTAGTTATGTTCGATTCTCATATAGCTTTCAATCAATAATATAAATTAT-TA---------A---------TCAATAGCATTA---------TTAACGGTTTTGCGTGACCTAGAATTAATCAATCTAAAAA-ATACAACAC--AG-----AAACACAACAAACATAACGGTCGGATGACCAAATTAACGGTTA-AA-TATGTTTGGAT-AAACCGATTAGCAGCAAAAATTGATTAGCAATACAACAGTATATGATAAGGGTAAATATATATATATGAAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGCGGTGAATCTCTTTATCA-ACATAAAAACACTGCTTGCATAAGATAACAGATTGGCGCG--TTTTTCTGTCAACAACAAAAATAGCGCCGAACCTAATTTCTTTATTTTACTATCAAAATC-A-A-A-GAGGACA--TTCAGTAGTGAATGAAATTACACAAAC-AATCACTATTTACTCAT-ACTATGCGGTATTATATCGAAAACATGTCAATATTTCATCACGTTAATGATTACACCTGCTTACAGTCGAATGATGTTAGAGATTATA
gi|89400 : TCATATGAGTCATCTGAACTCTGAACTTGTCCAACTCCTCAAGCAAGAATTCCAATGATTCAGCTC----------CAG--ATAT--ACATTATGTTTT-ATCTTCGAACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATCATCTTCAGTCTGGCAATCATATACTTT-------GTGCTACAACTCCAGTC--AA-TTTTAATATGTCCAGTTCAGTAGT----TTTGATTTATGGATAATGAAACGCATCCAGCACAAAATGTTCCAG-ATTC-TCTGAGAA-TATATGACACA-TATCAATAACTC--TTTGTACAGAACAAAACAAACATGACTTACTTATAGATTTAGGTGTATATT-------GACTTTAGTTATGTTCGATTCTCATATAGCTTTCAATCAACAATATAAATTATACATTAATAGC-A---------T---------TA---------TAAACGGTTTAGCGTGACCTAGATTTAATCAATCTAAACA-ATACAACAC--AGTTCTAAT-CACAACAAAGATAACAGTCAGATGACCTAATTAACGGTTA-AA-TATGTTTTAATTAAACTAATTAGCAGCAAAAATTGGGTAGCAATACAACATTATATGATAAGGGTAA--ATATATAAATGAAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGCGGTGGATCTGTTCATCA-ACATCAAAACACTGCTTGCATAAGATGGCAGATTGGCGTGTTTTTTT-TATCAACAACAAAAATAGCACCGAACATAATTTCTTTATTTTACTATCAAAATTAA-A-A-GAGGACA--TTC
gi|89401 : TCAAATGGGTCATCTGAACTCTTAACTTGTTCAACTCCTTAAGCAAGAATTTCAACGATTCAGCTC----------CAGATATAT--ATATTATGTTTT-AACTTT-AACTCAAGATT---TCTTTCCATGAATTATCTCCAGTCTGGCAATCATATAGTTT-------GTGCTACAACTCCAGTCAAAA-TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGT----TATAATTTATGGATAACGAAACGCATTCAGCACAAAA-----------TG-TCTGAGAA-TATAGAACAC-ATATCCGTAAGTC--TTTGTCCAGAACAAAACAAACATGACCTACTTAAAGGTTTACGTGTATATCGACTTGTGACTTTAGTTATGTTCGATTCTCATATAGCTTTCAGTCAACAATATAAATTAT-CAATTAATGGCA---------T---------TA---------TAAACGGTTTTGTGTGACATAGATTTAATCAATCTAAAAATATATAACACCGAA-----A--CACAACAAACATAACGGTCGGAT-------------GTTA-AA-TATGTTcgagttattatatcgaaaacatgttaatatttcaccccgttaatgattacacctgattacagtcaaatgatgttagagattata
gi|89402 : TCAAATGAGTCATCTGAACTCTTAACTTGTCCAACTCCTCAAGCAAGAATTTCAACGTTTCAGCTC----------CAG--ATAT--ACATTATGTTTT-AACTTG-AACTCCAGATTATGTTTTTCCATTGATCATCTTCAGGCTGGCAATCATATATTTT-------GTGCTACAACTCCAGTC--AA-TTTTAATATCTCCAGTCC-GTCGT----AA--ATTT
gi|89403 : AACTCCTCAAGCAAGAATTTCAACGATTCAGCTC----------CAG--ATAT--ATATTATATTTT-AACTTCGAACTCCAGATTTTGTTTTTCCACGAATCATCTTCAGTCTGGCAATCATATATTTT-------GTGCTACAACTCC
gi|89404 : ATGTATTTTTAAATGTGTGTTACAAATCCAGTC--AA-TT----TATCTCCGGTTAAATAGTTTTAAATGATTTATAAATAATGTATTGCATTCAACACAAAATGTTCCTCTTTTC-TCCGAGAAGTAT
gi|89405 : TACAACTTCAGTC--AA-TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGT----TATGATTTATGGATAACGAAACGCATTCAGCACAAAATGTTCCTG-ATTG-TCCAAGAA-TATACAACAC-ATATCCATAACTC--TTTGTCTAGACCAAAACAAACATGACCTATTTATAGATTTACGCGTATATT-------GACTTGAGTTATGTTCGATTCTCATATAGCTTTCAATCATCAATATAAATAAT-CAATAAATAGCA---------T---------TA---------TAAACGGTGTTGCATGACCTAGATTTAATCAATCTAAAAA-ATACAACAC--AGAA---A--CACAACAAACATTACGGTCGGATGACCTAATTAACCGTTA-AACTCTGCTTGCAT-AA
gi|89406 : TACAACTCCAGTA--AA-TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGT----TATGATTGATGGATAAGGAAACGCATTCAGCACAAAATGTTCCTG-ATTG-TCCGAGAA-TATACAACACA-TATCCATAACTC--TTTGTCTAGACCAAAACAAACATGACCTACTTATAGATTTACGCGTATATT-------GACTTGAGTTATGTTCGATTCTCATATAGCTTTCAATCATCAATATAAATAAT-CAATAAATAGCA---------T---------TA---------TAAAGGGTGTTGCGTGACCTAGATTGAATCAATCTAAAAA-ATACAACAC--AGAA---A--CACAACAAACATAACGGTCGGATGACCTAATTAACCGTTA-AACTCTGCTTGCAT-AA
gi|89407 : TACAACTCCAGTC--AA-TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGT----TATAATTTATGGATA-CGAAACGCATTCAGCAAAAAATGTTCTTG-ATTG-TCTGAGAA-TATACAACACA-TATCCATAACTC--TTTGTCTAGACCAAAACAAACATGACCTACTTATAGATTTACGCGTATATT-------GACTTGAGTTATGTTCAATTCTCATATAGCTTTCAATCATCAATATAAATAAT-CAATAAATAGCA---------T---------TA---------TAAACGGTGTTGCGTGACCTAGATTTAATCAATCTAAAAA-ATACAACAC--AGAA---A--CACAACAAACATAACGGTCGGATGACCTCATTAACCGTTA-AATTCTGATTGCAT-AA
gi|89409 : TACAACTCCAGTC--AA-TTTTAATATCTCCACTTCAGTAGT----TATGATTTATGGATAGCGAAACTCATTCAGCACAAAATGTTCCTG-GTTG-TCCGAGAA-TATACAACACA-TATCCATAACTT--TTTGTCTGGACCAAAACAAACATGACCTACTTATAGATGTACATGTATATT-------GACTTGAGTTATGTTCGATTCTCATATAGCTTTCAATCAACAATAAAAATAAT-CAATAAATAGCA---------T---------TA---------TAAATGGTGTTGTGTGACCTAGATTTAATCAATCTAAAAA-ATACAACAC--AGAA---A--CACAACAAACATAATGGTCGGATGACCTAATTAACCGTTATGA-TCTGCTTGCAC-AA
gi|89408 : TACAACTCCAGTC--AA-TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGT----TATGATTTATGGATAACGAAACGCATTCAGCACAAAATTTTCCTG-ATTG-TCCAAGAA--ATACAACACA-TATCCATAACTC--TTTGTCTAGACCAAAACAAACATGACCTACTTATAGATTTACGCGTATATT-------GACTTGAGTTATGTTCGATTTTCATATAGCTTTCAACCATCAATATAAATAAT-CA---------A---------TAAATAGCACTA---------TAAATGGTGTTGCGTGACCTAGATTTAATCAATCTAAAAA-ATACAACAC--AGAA---A--CACAACAAACATAA----CGGATGACCTAATTAACCGTTA-AACTCTGCTTGCAT-AA
gi|89410 : TACAACTCCAGTC--AA-TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGG----TATGATTTATGGATAACGAAATGCATTCAGCACAAAATGTTCCTA-ATTG-TCCGAGAA-TATACAACAC-AT------AACTC--TTTGTATAGACCAAAACAAACATGACCTACTTATAGATTTACGTGTATATT-------GAC-CGAGTTATGTTCAATTCTCATATAGGTTTCAATTAACAATATAAATAAT-CAATTAATAGCA---------T---------TA---------TAAACAGTGTTGCATGACCTAGATTTAATCAATCTAAAAA-ATACAACAC--AGAA---A--CACAACAAACATAACGGTCAGATTACCTAATTAACCGTTA-AA-TATGTT
gi|89411 : TACAACTCCAGCC--AA-TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGT----TATGATTTATGGATAACGGAACACATTCATCACAAAATGTTCCTG-ATTG-TCCTAGAA-TATACAACAC-ATATCCATAACTC--TTTGTCTAGACCAAAACAAACATGACCTACTTATAGATTTATGCGTATATT-------GACTTGATTTATG-----------TAAAGCTTTCAATCAACAATATAAATAAT-CA---------ATAAATAAATT---------TA---------TAAACGGTGTTGTGTGACCTAGATTTAATCTATCAAAAAA-ATACAACAC--AGAA---A--CACAACAAACATAACGGTCGGATGACCTAATTAACTGTTA-AA-TATGTT
gi|89412 : TACAACTCCAGTC--AA-TTTTAATATCTCAAGTTCAATGGT----TATGATTTATGGATAACGAAACGCATTTAGCACAAAATGTTCCTG-TTTG-TCCGAGAA-TATACAACACA-TATCCATTACTC--TTTGTCTAGACCAAAACAAACATGACCTACTTATAGATTTACGCGTATATT-------GACTTGAGTTATGTTCGATTCTCATATAGCTTTCAATCATCAATATAAATAAT-CA---------A---------TAAA------TAGCATTT---TAAACGGTGTTGCGTGACCTAGATTTAATCAATCTAAAAA-ATACAACAC--AGAA---A--CACAACAAACATAACGGTC
gi|89414 : AACGGTCGGATGACCTCATTAACCGTTA-AATTCTGATTGCAT-AA
gi|89413 : AACGGTCGGATGACCTAATTAACCGTTA-AC-TCTGCTTGCAT-AAgatgacagattggcgcgtttttctataaacaacaaatgaagccccgaaccttatttcattattttactatcaaaattaaaagaggacaatcggtagtgaataaaatttcactaacaattactttttactcaaactacgagttattatatcgaaaatatgtcaatatttcaccccattaatgattacatgtcgaatggtgttagagat
gi|89415 : TGTACATCATAC-TAAAAACACTGCTTGCATAAGATGACAGGTCGGCGCGTTTTTCTAT--CAACAACAAAAATAG-CATGAGCCTATATTCTTTATTTTACTATCAGAATT-ACA-A-GAGGACA--ATCCGTAGTGAATAAAATTACACTGAC-AATCACTATTTACTCAA-ACTACGAGTTATAATATCGAGAATATGTCAATATTTCACCCCGTTAATTATTACACCTGATTACAGTCGAATGGTGTTAGAGATTATA
gi|89417 : CATCAATACACTGCTTGCATAAGATGACAGATTGGCGCGTTTTTCTATAA--ACAACAAATGTAGCCCCGAACCTAATTTCGTTATTTTACTACCAAAATTAA-A-A-GAGGACA--ATCCGTATTT-ATAAAATTTCACTAAC-AATCACTATTTATTCAA-ACTACGAGTTATTGTATCGAAAACA-GTCAATATTTCGCCCCATTAATTATTACAT---------GTTGAATGGTGTTAGAGAGTATA
gi|89416 : CATCAATACACTGCTTGCATAAGATGACAGATT-GCGCG--TTTTTCTGTAAACAACAAA
gi|89418 : AAACTCTGCTTGCATAAGATGACAGATTGGCGCGTTTTTCTATAA--ACAACAAATGCAGCCCCGAACCTAATTTCGTTATTTTACTATCAAAATT-A-ATA-GAGGACA--ATCCGTAGTGAATAAAATTTCACTAAC-AATTACTATTTACTCAA-ACTACGAGTTATTATATCGAAAATATGTCAATATTTCACCCCATTAATGATTACAT---------GTCGAATGGTGTTAGAGATTATAtgtcaaaatcaaaagaggacaatctgtagtaaataaaatttcactaacaatcactatttactcaaactacgagttaatatatcaaaaacatgtcagtatttcaccctattaatgattgc
gi|89420 : AAACTCTGCTTGCATAAGATGACAGATTGGCGCGTTTTTCTATAA--ACAACAAATGTAGCCCCGAACCTAATTTCGTTATTTTACTATCAAATTA-A-A-A-GAAGACA--ATCCGTAGTGAATAAAATTTCACTAAC-AATTACTTTTTACTCAA-ACTACAAGTTATTACATCGAAAATATGTCAATATTTCACCCCATTAATGATTACAT---------GTCGAATGGTGTTGG
gi|89419 : AAACTCTGCTTGCATAAGATGACAGATTGGCGCGTTTTTCTATAA--ACAACAAATGTAGCCCCAAACCTAATTTCATTATTTTACTATCAAAATT-A-A-AAGAGGACA--ATCCGTAGTGAATCAAATTTCACTAAC-AATTACTATTTACTCAA-ACTACGAGTTATTATATCGAAAATATGTCAATATTTCACCCCATTAATGATTACAT---------GTCGAATGGTGTTAGAGATTATA
gi|89414 : AAATTCTGATTGCATAAGATGACAGATTGGCGCGTTTTTCTATAA--ACAACAAATGAAGCCCCGAACCTTATTTCATTATTTTACTATCAAAATT-A-A-AAGAGGACA--ATCGGTAGTGAATAAAATTTCACTAAC-AATTACTTTTTACTCAA-ACTACGAGTTATTATATCGAAAATATGTCAATATTTCACCCCATTAATGATTACAT---------GTCGAATGGTGTTAGAGAT
gi|89421 : aacggtcggatgacctcattaaccgttAACTCTGCTTGCATAAGATGACAGATTGGCGCGTTTTTCTATAA--ACAACAAATCTAGGCCCGAATCTAATTTCGTTATTTTACTATCAAAATT-A-A-AAGGAGACA--ATCCGTAGTGAATAATATTTCACTAAC-AATTACTATTTACTCAA-ACTACGAGTTATTATATCGAAAATGTGTCAATATTTCACCCCATTAATGATTACAT---------GTCGAATGGTGTTAGAGATAATA
gi|89422 : CTGCTTGCACAAGATGACAGATTGGCGCGTTTTTTTATAA--ACAACAAATAGAGCCCCGAACCTAATTTCGTTATTTTACTATCAAAATT-A-A-AAGAGGACA--ATCCGTAGTGAATAAAATT----TAACTAATCACTATTTACTCAA-ACTACAAGTTATTTTTTCGAAAACATGTCAATATTTCACCCCATTAATGATTACAT---------GTCGAATGGTGTTAGAGATTATA
gi|89423 : TCGTTTTTTTACGATCAAAATT-A-A-AAGAGGACAATTTC--TAGTGAATAAAAT------AAC-AATCACTATTTACTCAA-ATAACGAGTTGTTATATCGAAAACATGTCAATATCTCACCCCATTAATGGTTACAT---------GTTGAATGGTGTTAGAGATTATA
gi|89416 : TGTCAAAATC-A-A-AAGAGGACA--ATCTGTAGTAAATAAAATTTCACTAAC-AATCACTATTTACTCAA-ACTACGAGTTAATATATCAAAAACATGTCAGTATTTCACCCTATTAATGATTGC
gi|89424 : catcaatacactgcttgcataagatgacagattgcgcgtttttctgtaaacaacaaaCTTAC-AAACGCTATTTGCTCATTCCTATGCGTTATAAAATCGGCAACATGTCAATGTTTCATCCCGT-GAT--TTAAAGATGCTTACAACCGAATTACAATAGAGATTTTA
gi|89400 : TTATTATATCGAAAACATGTTAATATTTCACCCCGTTAATGATTACACCTGATTACAGTCAAATGATGTTAGAGATTATA
Alignments
lowQualScore : 1111111111 1111111 44444444 11111 1 11 222222 555555555
lowQualScore : 7777777777 55 55 4 8 1111111 55 5555 2 2 2 1 5 7 33 2 0 99999999 0 1 5 00000000 2 2 2 11111 1 2 2 0 3 3 55 1 5 888 4 777777 1 1 9 1 2 2 1 2 2 2 222222222
lowQualScore : .......... .. .. . . ....... .. .... . . . . . . .. . . ........ . . . ........ . . . ..... . . . . . . .. . . ... . ...... . . . . . . . . . . .........
lowQualScore : 5555555555 55 55 0 0 8888888 33 0000 4 4 4 1 0 5 44 5 8 11111111 8 0 0 00000000 5 5 5 66666 9 5 5 0 5 1 77 9 0 888 4 333333 0 8 7 0 2 6 1 2 2 2 444444444
consensus : TTTGACTTTTTGATAGAGTATTGATCAAATGAGTCATCTGAACTCTTAACTTGTCCAACTCCTCAAGCAAGAATTTCAACGATTCAGCTC----------CAGATAT--ATAT--TATATTTT-AACTTC-AACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATCATCTTCAGTCTGGCAATCATATATTTT-------GTGCTACAACTCCAGTCAA--TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGTT----ATGATTTATGGATAACGAAACGCATTCAGCACAAAATGTTCCT-GATTGTCCGAGA-A-TATACAACAC-A-TATCCATAACTC--TTTGTCCAGANCAAAACAAACATGACCTACTTATAGATTTACGCGTATATCGACTTG-------AGTTATGTTCGATTCTCATATAGCTTTCAATCAACAATATAAATNAT-CAATTAAA-TAGCATT-ATAAACGGTNTTGCGTGACCTAGATTTAATCAATCTAAAAA-ATACAACACAG----AAACACAACAAACATAACGGTCGGATGACCTAATTAACCG-TTA-AA-TATGTTTGNA-TAAACTAATTAGCAGCAAAAATTGAGTAGCAATACAACAGTATATGATAAGGGTAA--ATATATATATGAAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGCGGT-GGAT---CTGTACATCA-ACATCAAAACACTGCTTGCATAAGATGACAGATTGGCGCGTTTTTCTATA-CAACAACAAANATAGCCCCGAACCTAATTTCNTTATTTTACTATCAAAATTAAAAGAGGACAATCCGTAGTGAATAAAATTNCACTAACAATCACTATT-TACTCAA-ACTACGAGTTATTATATCGAAAACATGTCAAT-ATTTCACCCCGTTAATGATTACAT-TG-TTACAGTCGAATGGTGTTAGAGATTATA
Reference ( family-630 ) : TTTGACTTTTTGATAGAGTATTGATCAAATGAGTCATCTGAACTCTTAACTTGTCCAACTCCTCAAGCAAGAATTTCAACGATTCAGCTC----------CAGATAT--ATAT--TATGTTTT-AACTTC-AACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATCATCTTCAGTCTGGCAATCATATATTTT-------GTGCTACAACTCCAGTCAA--TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGTT----ATGATTTATGGATAACGAAACGCATTCAGCACAAAATGTTCCT-GATTGTCCGAGA-A-TATACAACAC-A-TATCCATAACTC--TTTGTCCAGACCAAAACAAACATGACCTACTTATAGATTTACGCGTATATCGACTTG-------AGTTATGTTCGATTCTCATATAGCTTTCAATCAACAATATAAATNAT-CAA-T-AA-T-GCATT-ATAAACGGTGTTGCGTGACCTAGATTTAATCAATCTAAAAA-ATACAACACAG----AAACACAACAAACATAACGGTCGGATGACCTAATTAACCG-TTA-AA-TATGTTTGCA-TAAACTAATTAGCAGCAAAAATTGAGTAGCAATACAACAGTATATGATAAGGGTAA--ATATATATATGAAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGCGGT-GGAT---CTGTACATCA-ACATCAAAACACTGCTTGCATAAGATGACAGATTGGCGCGTTTTTCTATGNCAACAACAAANATAGCCCCGAACCTAATTTCNTTATTTTACTATCAAAATTAAAAGAGGACANTCCGTAGTGAATAAAATTNCACTAACAATCACTATT-TACTCAA-ACTACGAGTTATTATATCGAAAACATGTCAAT-ATTTCACCCCGTTAATGATTACATCTGATTACAGTCGAATGGTGTTAGAGATTATA
gi|89394 : TTTGACTTTTTGATAGAGTATTGATCAAATGAGTCAACTGAACTCTTAACTTGTCCAACTCCTCAAGCAAGAATTTCAACGATTCAGTTC----------CAGATAT--ATAT--TATATTTT-AACTTC-AACTCCAGATTCTGTTTTTCCATGAATCATCTTCAGTCTGGCAATCATATATTTT-------GTGCTACAACTCCAGTCAA--TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGTA----ATGATTTATGGATAACGAAACACATTCAGCACAAAATGTTCCT-CATTGTCCGAGA-A-TATACTACACAA-TATCCAGAACTC--TTTGTCCAGAACAAAACAAACATGACCTACTTACAGATTTACGTGAATATCGACTTT-------AGTTATGTTCGATTCTCATAAAGCTTTCAATCAACAATATAAATTAT-CA-----------ATT-ATAAACGGTTTTGCGTGACCTAGATTTAATCAATCTAAAAA-ATACAACACAG------ACACAACAAACATAATGGTCAGATGACCTAATTAACGG-TTA-AA-TATGTTTGGA-TAAACTAATTAGCAACAAAAATTGAGTAGCAATACAACAGTATATGATAAGGGTAA--ATATATATATGAAATAATGAATGTATATATAAATCAATTACTTTGAGTGGT-GGAT---TTGTACATCA-ACATCAAAACACTGCTTGCATAAGATGACAGATTGGCGCGTTTTTTTCTGACAACAACAAAAATAGCCCTGAACCTAATTTCTTTATTTTACTATCAAAATC-AAAGAAGACATTCAATAGTGAATGAAATTACACTAACAATCTCTTTT-TACTCAA-ACTATAACTTATTATATCGAAAACATGTCAAT-ATTTCACCCTGTCAATGATTACACGTGATTACAGTTGAATGGTGTTAGAAATTATA
gi|89395 : TTTTACTTTTTGATAGAGTATTGATCAAA-GAATCATCTGAACTCTTAACTTGTCCAACTCCTCAAGCAAGAATTTCAACGATTCAGTTC----------CAGATAT--ATAT--TATATTTT-AACTTC-AACACCAGACTTTGTTTTTTCATAAATCATCTTCATTCTGGCAATCATATATTTT-------ATGCTACAACTCCAGTCAAA-TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGTA----ATAATTTATGGATAACGAAATGCATTCAGCACCAAATGTTCCT-GATTGTCCAAGA-A-TATACCACAC-ACTATCCAGAACTC--TTTGTCCAGAACAAAACAAACATGACCTACTTACAGATTTACGTGAATATCGACTTT-------AGTTATGTTCGATTCTCAAAAAGCTTTCAATCAACAATATAAATTATCCAATT-AATT-GCATT-ATAAACGGTTTTGCGTGACCTAGATTTAATCAATCTAAACA-ATTCAACACAG------ACACAACAAACATAACGGTCAGATGACCTAATT--CCACTTG-AA-TATGTTTGGA-TAAACTAATTAGCAGCAAAAATTGAGTAGCAATACAACAGTATATGATAAGGGTAA--ATATATATATGAAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGTGGT-GGAT---CTGTACATCA-ACATCAAATCACTGCTTACATAAGATGACAGATTGGCGCTTTTTTC--TGTCAACAACAAAAATAGCCCTGAACCTAATTTCTTTATTTTACTATCAAAATC-AAAGAGGACATTCAATAGTGAATGAAATTACACTAACAATCACTTTT-TACTCAA-ACTACGAGTTATTATATCGAAAACATGTCAAT-ATTTCACCCTGTCAATGATTACACCTGATTACAATCGAATGATGTTAGAGATTATA
gi|89396 : TTTGACTTTTTGATAGAGTATTGATCAAATGAGTCACCTAAACTCTTAACTTGTCCAACTCTTGAAGCAAGAATTTTAACGATTCAGTTC----------CAGATAT--ATAT--CATATTTTTAACATC-AACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATTATCTTCAGTCTGGCAATCATATATTTT-------GTATTACAACTCCAGTCAA--TCTTAATATCTCCAGTTCAATAGTA----ATGATTTATGGATAACTAAATGCATTCAGCAC-AAATTTTCCT-GATTGTCCGAGA-A-TATACCATACGA-TATCCAGAACTC--TTTGTTCAGAACAAAACAAACATGACCTACTTACAGATTTACGTGAATATCGACTTT-------AGTTATGTTCGATTCTCACAAAACTTTCAATCAACAATATAAATTAT-CAATT-AATT-GCATT-ATAAACGGTTTTGCGTGACCAAGCTTTAATCAATCTAAAAA-ATACAACACAG------ACACAATAAACATAACGGTCGGATGACCTAATTAACGG-TTG-AA-TATGTTTGAA-TTAACTAATTAGCAGCAAAAATTGAGTAGCATTACAACAGTATATGATAAGGGTAA--CTATATATATGAAATAATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGCGGT-TGAT---CTGTACATCA-ACATCAAAACACTGCTTGCATAAGATGACAGATTGGTGCGTTTTTC--TGTCAACAACAAAAATAGCCCCGAACCTAATTTCTTTATTTTACTATCAAAATC-AAAGAAGACATTCAATAGTGAATGAAATTACACTTACATTCACATTT-TACTCAA-AATACGAGTTATTATATCGAAAACTTGTCAAT-ATTTCACCCTGTCAATGATTACACCTGATTACAGTCGAATGATGTTAGAGATTATA
gi|89397 : TTCGACTTTTTGATAGAGTATTGATCAAATGAGTCACCTGAACTCTTAACTTGTCCAACTCCTCAAGCAAGAAATTCAACGATTCAGTTCTATATATATATATATAT--ATAT--TATATTTT-AACTTC-AACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATCATCTTTAGTCTGGCAATCATATATTTT-------ATGCTACAACTCCAGTCAA--TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGAA----ATGTTCAAAGGATAACGAAACACATTCAGCACAAAATGTTCCT-GATTGTCCGAGA-A-TATATCACAC-ATTATCCAGAATTC--TTTGTTCAGAACAAAACAAACATGACCTACTTACAGATTTACGTGAATATCGACTTT-------AGTTATGTTCGATTCTCATAAAG-TATCGATCAATTATATAAATTAT-CAATT-AATT-GCATT-ATGAACTGTTTTGCTTGACCTAAATTTAATCAATCTAAAAA-ACACAACACAG------ACACAACAAACATTACGGTTGGATTACCTAATTAACGG-TTA-AA-TATGTTTGGA-TA----AATTAGCAGCAAAAATTGAGTAGCAAATCAACAGTATATGATAAGGGTAAATATATATATATGAAATTATGAATGTATACTTAAAACAATTACTTTGAGCGGT-GGAT---CTGTACATCA-ACAACAAAACACTGCTTGCATAAGATGACAGATTGGCACGTTTTTC--TGTCAACATCAAAAATAGCCCCGAACCTAATTTCTTTATTTTACTATCAAAATC-AAAGAGGACATTCAATAGTGAATGAAATTACACTAACAATCACTTTT-TACTCAA-ACTAGGAGTTATTATATCGAAAACATGTCAAT-ATTTCACCCTGTCAATGATTACACCTGATT--AGTCGAATGATGTTAGAGATTATA
gi|89398 : TTTGACTTTTTGACAGAGTATTGATCAAATGAGTCATTTGAACTCTTAACTTGTCCAACTCCTATAGCAAGAATTTCAACGATTCAGTTC----------CAGATATATATAT--TATATTTT-AAGTTC-AACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATCATCTTCAGTCTGGCAATCATATATTTT-------GAGCTACAACTCCAGTCAA--TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGTA----ATGATTTATGGATAACGAAACGCATTCAGCACAAAATGTTCCT-GATT------GATA-TATACCATAC-ATTATCCAGAACTCTTTTTGTCCAGAACAAAACAAACATGACCTACTTACAGATTTACGTGAATATCTACTTT-------AGTTATGTTCAATTCTCATAAAGCTTTCAATCAACAATATAAATTAT-CAATT-AATT-GTATT-ATAAACGGTTTTGCATGACCTAGATTTAATCAATCTAAATA-ATACAACACAG------ACACAACAAACACAACGGTCGGATGACCTAATTAACGG-TTA-AA-TATGTTTGGA-TAAACTAATTAGCAGCAAAAATTGAGTAGCAATACAACAGTATATG---------A--ATGTAT--------------------ATTTAAATAAATAACTTTGAGCGGT-GGAT---CTGTACATCA-ACATCAAAACACTGCTTGCATAAGATCACAGATTGGTGCGTTTTTC--TGTCAACAACACAAATAGCCCCGAATCCAATTTCTTTATTTTACTATAAAAATC-AAAGAGGACATTCAATAGTGAATGAAATTACACTAACAATCACTTTT-TACTCAA-ACTACGAGTTATTATATCGAAAACATGCCTAT-ATTTCACCCAGTCAATGATTACATCTGATTACAGTCGAATGATGTTAGAGATTATA
gi|89399 : TCAAATGAGTCACCTGAACTCTAAACTTGTCGAACTCCTCAAGGAAGAATTTCAACCATTCAGCTT----------CAGATAT--ATAT--TATGTTTT-GACTTC-AACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATCAT------------GATCATATATTTT-------GTACTACAACTCCAGTCAA--TTTTAATATCTCCAGTTCAACAGTT----ATGATTTATGGATAACGAAACGCATTCAGCACAAAATGTTCCT-GATTGTCCTAGA-A-TATACCACAC-A-TATCCATAACTC--TTTGTCCAGAACAAAACAAACATGATCTACTTACAGATTTACGTGAATATCTACTTT-------AGTTATGTTCGATTCTCATATAGCTTTCAATCAATAATATAAATTAT-TAA-TCAA-TAGCATT-ATTAACGGTTTTGCGTGACCTAGAATTAATCAATCTAAAAA-ATACAACACAG----AAACACAACAAACATAACGGTCGGATGACCAAATTAACGG-TTA-AA-TATGTTTGGA-TAAACCGATTAGCAGCAAAAATTGATTAGCAATACAACAGTATATGATAAGGGTAAATATATATATATGAAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGCGGT-GAAT---CTCTTTATCA-ACATAAAAACACTGCTTGCATAAGATAACAGATTGGCGCGTTTTTC--TGTCAACAACAAAAATAGCGCCGAACCTAATTTCTTTATTTTACTATCAAAATC-AAAGAGGACATTCAGTAGTGAATGAAATTACACAAACAATCACTATT-TACTCAT-ACTATGCGGTATTATATCGAAAACATGTCAAT-ATTTCATCACGTTAATGATTACACCTGCTTACAGTCGAATGATGTTAGAGATTATA
gi|89400 : TCATATGAGTCATCTGAACTCTGAACTTGTCCAACTCCTCAAGCAAGAATTCCAATGATTCAGCTC----------CAGATAT--ACAT--TATGTTTT-ATCTTCGAACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATCATCTTCAGTCTGGCAATCATATACTTT-------GTGCTACAACTCCAGTCAA--TTTTAATATGTCCAGTTCAGTAGTT----TTGATTTATGGATAATGAAACGCATCCAGCACAAAATGTTCCA-GATTCTCTGAGA-A-TATATGACAC-A-TATCAATAACTC--TTTGTACAGAACAAAACAAACATGACTTACTTATAGATTTAGGTGTATATTGACTTT-------AGTTATGTTCGATTCTCATATAGCTTTCAATCAACAATATAAATTATACAT-T-AA-TAGCATT-ATAAACGGTTTAGCGTGACCTAGATTTAATCAATCTAAACA-ATACAACACAGTTCTAATCACAACAAAGATAACAGTCAGATGACCTAATTAACGG-TTA-AA-TATGTTTTAATTAAACTAATTAGCAGCAAAAATTGGGTAGCAATACAACATTATATGATAAGGGTAA--ATATATAAATGAAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGCGGT-GGAT---CTGTTCATCA-ACATCAAAACACTGCTTGCATAAGATGGCAGATTGGCGTGTTTTTTT-TATCAACAACAAAAATAGCACCGAACATAATTTCTTTATTTTACTATCAAAATTAAAAGAGGACATTCCG-AGT------------------------TATTATATCGAA-A--ACATGTTAATATTTC---ACCCCGTTAATGATTACACC-------TGATTAC----------AGTCAAATGATGTTAGAGATTATA
gi|89401 : TCAAATGGGTCATCTGAACTCTTAACTTGTTCAACTCCTTAAGCAAGAATTTCAACGATTCAGCTC----------CAGATAT--ATATATTATGTTTT-AACTTT-AACTCAAGATTTC---TTTCCATGAATTATCTCCAGTCTGGCAATCATATAGTTT-------GTGCTACAACTCCAGTCAAAATTTTAATATCTCCAGTTCAATAGTT----ATAATTTATGGATAACGAAACGCATTCAGCACAAAATGT-----------CTGAGA-A-TATAGAACAC-A-TATCCGTAAGTC--TTTGTCCAGAACAAAACAAACATGACCTACTTAAAGGTTTACGTGTATATCGACTTGTGACTTTAGTTATGTTCGATTCTCATATAGCTTTCAGTCAACAATATAAATTAT-CAATT-AA-TGGCATT-ATAAACGGTTTTGTGTGACATAGATTTAATCAATCTAAAAATATATAACACCG----AAACACAACAAACATAACGGTCGGAT-------------G-TTA-AA-TATGTT
gi|89402 : TCAAATGAGTCATCTGAACTCTTAACTTGTCCAACTCCTCAAGCAAGAATTTCAACGTTTCAGCTC----------CAGATAT--ACAT--TATGTTTT-AACTTG-AACTCCAGATTATGTTTTTCCATTGATCATCTTCAGGCTGGCAATCATATATTTT-------GTGCTACAACTCCAGTCAA--TTTTAATATCTCCAGTCC
gi|89403 : AACTCCTCAAGCAAGAATTTCAACGATTCAGCTC----------CAGATAT--ATAT--TATATTTT-AACTTCGAACTCCAGATTTTGTTTTTCCACGAATCATCTTCAGTCTGGCAATCATATATTTT-------GTGCTACAACTCCgtcgtaaattt
gi|89404 : ATGTATTTTTAAATGTGTGTTACAAATCCAGTCAA--TT----TATCTCCGGTTAAATAGTTTTAAATGATTTATAAATAATGTATTGCATTCAACACAAAATGTTCCTCTTTTCTCCGAGA-AGTAT
gi|89405 : TACAACTTCAGTCAA--TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGTT----ATGATTTATGGATAACGAAACGCATTCAGCACAAAATGTTCCT-GATTGTCCAAGA-A-TATACAACAC-A-TATCCATAACTC--TTTGTCTAGACCAAAACAAACATGACCTATTTATAGATTTACGCGTATATTGACTTG-------AGTTATGTTCGATTCTCATATAGCTTTCAATCATCAATATAAATAAT-CAA-TAAA-TAGCATT-ATAAACGGTGTTGCATGACCTAGATTTAATCAATCTAAAAA-ATACAACACAG----AAACACAACAAACATTACGGTCGGATGACCTAATTAACCG-TTA-AACTCTGCTTGCA-TAA
gi|89406 : TACAACTCCAGTAAA--TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGTT----ATGATTGATGGATAAGGAAACGCATTCAGCACAAAATGTTCCT-GATTGTCCGAGA-A-TATACAACAC-A-TATCCATAACTC--TTTGTCTAGACCAAAACAAACATGACCTACTTATAGATTTACGCGTATATTGACTTG-------AGTTATGTTCGATTCTCATATAGCTTTCAATCATCAATATAAATAAT-CAA-TAAA-TAGCATT-ATAAAGGGTGTTGCGTGACCTAGATTGAATCAATCTAAAAA-ATACAACACAG----AAACACAACAAACATAACGGTCGGATGACCTAATTAACCG-TTA-AACTCTGCTTGCA-TAA
gi|89407 : TACAACTCCAGTCAA--TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGTT----ATAATTTATGGATA-CGAAACGCATTCAGCAAAAAATGTTCTT-GATTGTCTGAGA-A-TATACAACAC-A-TATCCATAACTC--TTTGTCTAGACCAAAACAAACATGACCTACTTATAGATTTACGCGTATATTGACTTG-------AGTTATGTTCAATTCTCATATAGCTTTCAATCATCAATATAAATAAT-CAA-TAAA-TAGCATT-ATAAACGGTGTTGCGTGACCTAGATTTAATCAATCTAAAAA-ATACAACACAG----AAACACAACAAACATAACGGTCGGATGACCTCATTAACCG-TTA-AATTCTGATTGCA-TAA
gi|89408 : TACAACTCCAGTCAA--TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGTT----ATGATTTATGGATAACGAAACGCATTCAGCACAAAATTTTCCT-GATTGTCCAAGA-A--ATACAACAC-A-TATCCATAACTC--TTTGTCTAGACCAAAACAAACATGACCTACTTATAGATTTACGCGTATATTGACTTG-------AGTTATGTTCGATTTTCATATAGCTTTCAACCATCAATATAAATAAT-CAA-TAAA-TAGCACT-ATAAATGGTGTTGCGTGACCTAGATTTAATCAATCTAAAAA-ATACAACACAG----AAACACAACAAACATAA----CGGATGACCTAATTAACCG-TTA-AACTCTGCTTGCA-TAA
gi|89409 : TACAACTCCAGTCAA--TTTTAATATCTCCACTTCAGTAGTT----ATGATTTATGGATAGCGAAACTCATTCAGCACAAAATGTTCCT-GGTTGTCCGAGA-A-TATACAACAC-A-TATCCATAACTT--TTTGTCTGGACCAAAACAAACATGACCTACTTATAGATGTACATGTATATTGACTTG-------AGTTATGTTCGATTCTCATATAGCTTTCAATCAACAATAAAAATAAT-CAA-TAAA-TAGCATT-ATAAATGGTGTTGTGTGACCTAGATTTAATCAATCTAAAAA-ATACAACACAG----AAACACAACAAACATAATGGTCGGATGACCTAATTAACCG-TTATGA-TCTGCTTGCA-CAA
gi|89410 : TACAACTCCAGTCAA--TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGGT----ATGATTTATGGATAACGAAATGCATTCAGCACAAAATGTTCCT-AATTGTCCGAGA-A-TATACAACA--------CATAACTC--TTTGTATAGACCAAAACAAACATGACCTACTTATAGATTTACGTGTATATTGAC-CG-------AGTTATGTTCAATTCTCATATAGGTTTCAATTAACAATATAAATAAT-CAATT-AA-TAGCATT-ATAAACAGTGTTGCATGACCTAGATTTAATCAATCTAAAAA-ATACAACACAG----AAACACAACAAACATAACGGTCAGATTACCTAATTAACCG-TTA-AA-TATGTT
gi|89411 : TACAACTCCAGCCAA--TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGTT----ATGATTTATGGATAACGGAACACATTCATCACAAAATGTTCCT-GATTGTCCTAGA-A-TATACAACAC-A-TATCCATAACTC--TTTGTCTAGACCAAAACAAACATGACCTACTTATAGATTTATGCGTATATTGACTTG-------ATTTATGT-----------AAAGCTTTCAATCAACAATATAAATAAT-CAA-T-AAAT-AAATTTATAAACGGTGTTGTGTGACCTAGATTTAATCTATCAAAAAA-ATACAACACAG----AAACACAACAAACATAACGGTCGGATGACCTAATTAACTG-TTA-AA-TATGTT
gi|89412 : TACAACTCCAGTCAA--TTTTAATATCTCAAGTTCAATGGTT----ATGATTTATGGATAACGAAACGCATTTAGCACAAAATGTTCCT-GTTTGTCCGAGA-A-TATACAACAC-A-TATCCATTACTC--TTTGTCTAGACCAAAACAAACATGACCTACTTATAGATTTACGCGTATATTGACTTG-------AGTTATGTTCGATTCTCATATAGCTTTCAATCATCAATATAAATAAT-CAA-TAAA-TAGCATT-TTAAACGGTGTTGCGTGACCTAGATTTAATCAATCTAAAAA-ATACAACACAG----AAACACAACAAACATAACGGTC
gi|89413 : AACGGTCGGATGACCTAATTAACCG-TTA-AC-TCTGCTTGCA-TAA
gi|89414 : AACGGTCGGATGACCT---CATTA-ACCGTTAAATTCTGATTGCATAAGATGACAGATTGGCGCGTTTTTCTATA--AACAACAAATGAAGCCCCGAACCTTATTTCATTATTTTACTATCAAAATTAAAAGAGGACAATCGGTAGTGAATAAAATTTCACTAACAATTACTTTT-TACTCAA-ACTACGAGTTATTATATCGAAAATATGTCAAT-ATTTCACCCCATTAATGATTACAT---------GTCGAATGGTGTTAGAGAT
gi|89415 : TGTACATCATAC-TAAAAACACTGCTTGCATAAGATGACAGGTCGGCGCGTTTTTCTAT--CAACAACAAAAATAGCAT-GAGCCTATATTCTTTATTTTACTATCAGAATTACAAGAGGACAATCCGTAGTGAATAAAATTACACTGACAATCACTATT-TACTCAA-ACTACGAGTTATAATATCGAGAATATGTCAAT-ATTTCACCCCGTTAATTATTACACCTGATTACAGTCGAATGGTGTTAGAGATTATA
gi|89416 : CATCAATACACTGCTTGCATAAGATGACAGATT-GCGCGTTTTTCTGTA--AACAACAAATGT-----CAAA--------------------ATCAA------AAGAGGACAATCTGTAGTAAATAAAATTTCACTAACAATCACTATT-TACTCAA-ACTACGAGTTAATATATCAAAAACATGTCAGT-ATTTCACCCTATTAATGATTGC
gi|89417 : CATCAATACACTGCTTGCATAAGATGACAGATTGGCGCGTTTTTCTATA--AACAACAAATGTAGCCCCGAACCTAATTTCGTTATTTTACTACCAAAATTAAAAGAGGACAATCCGTATTT-ATAAAATTTCACTAACAATCACTATT-TATTCAA-ACTACGAGTTATTGTATCGAAAACA-GTCAAT-ATTTCGCCCCATTAATTATTACAT---------GTTGAATGGTGTTAGAGAGTATA
gi|89418 : AAACTCTGCTTGCATAAGATGACAGATTGGCGCGTTTTTCTATA--AACAACAAATGCAGCCCCGAACCTAATTTCGTTATTTTACTATCAAAATTAATAGAGGACAATCCGTAGTGAATAAAATTTCACTAACAATTACTATT-TACTCAA-ACTACGAGTTATTATATCGAAAATATGTCAAT-ATTTCACCCCATTAATGATTACAT---------GTCGAATGGTGTTAGAGATTATA
gi|89419 : AAACTCTGCTTGCATAAGATGACAGATTGGCGCGTTTTTCTATA--AACAACAAATGTAGCCCCAAACCTAATTTCATTATTTTACTATCAAAATTAAAAGAGGACAATCCGTAGTGAATCAAATTTCACTAACAATTACTATT-TACTCAA-ACTACGAGTTATTATATCGAAAATATGTCAAT-ATTTCACCCCATTAATGATTACAT---------GTCGAATGGTGTTAGAGATTATA
gi|89420 : AAACTCTGCTTGCATAAGATGACAGATTGGCGCGTTTTTCTATA--AACAACAAATGTAGCCCCGAACCTAATTTCGTTATTTTACTATCAAA-TTAAAAGAAGACAATCCGTAGTGAATAAAATTTCACTAACAATTACTTTT-TACTCAA-ACTACAAGTTATTACATCGAAAATATGTCAAT-ATTTCACCCCATTAATGATTACAT---------GTCGAATGGTGTTGG
gi|89421 : AACTCTGCTTGCATAAGATGACAGATTGGCGCGTTTTTCTATA--AACAACAAATCTAGGCCCGAATCTAATTTCGTTATTTTACTATCAAAATTAAAAGGAGACAATCCGTAGTGAATAATATTTCACTAACAATTACTATT-TACTCAA-ACTACGAGTTATTATATCGAAAATGTGTCAAT-ATTTCACCCCATTAATGATTACAT---------GTCGAATGGTGTTAGAGATAATA
gi|89422 : CTGCTTGCACAAGATGACAGATTGGCGCGTTTTTTTATA--AACAACAAATAGAGCCCCGAACCTAATTTCGTTATTTTACTATCAAAATTAAAAGAGGACAATCCGTAGTGAATAAAATTTAACT---AATCACTATT-TACTCAA-ACTACAAGTTATTTTTTCGAAAACATGTCAAT-ATTTCACCCCATTAATGATTACAT---------GTCGAATGGTGTTAGAGATTATA
gi|89423 : TCGTTTTTTTACGATCAAAATTAAAAGAGGACAATTTCTAGTGAATAAAAT------AACAATCACTATT-TACTCAA-ATAACGAGTTGTTATATCGAAAACATGTCAAT-ATCTCACCCCATTAATGGTTACAT---------GTTGAATGGTGTTAGAGATTATA
gi|89424 : CTTACAAACGCTATT-TGCTCATTCCTATGCGTTATAAAATCGGCAACATGTCAAT-GTTTCATCCCG-TGAT--TTAAAGATGCTTACAACCGAATTACAATAGAGATTTTA
Alignments
lowQualScore : 1111111111 1111111 222 1 11 2222 77777777777
lowQualScore : 7777777777 55 55 4 8 1111111 55 5555 2 2 2 1 5 7 33 1 0 99999999 0 1 2 111 1 1 2 888888 1 2 2 0 1 3 55 1 5 888 4 1 9999 1 1 9 1 2 2 1 2 2 2 333 11111111111
lowQualScore : .......... .. .. . . ....... .. .... . . . . . . .. . . ........ . . . ... . . . ...... . . . . . . .. . . ... . . .... . . . . . . . . . . ... ...........
lowQualScore : 5555555555 55 55 0 0 8888888 33 0000 4 4 4 1 0 5 44 0 8 11111111 8 0 5 333 4 0 5 666666 9 5 5 0 0 1 77 9 0 888 4 2 4444 0 8 7 7 2 6 1 2 2 2 999 88888888888
consensus : TTTGACTTTTTGATAGAGTATTGATCAAATGAGTCATCTGAACTCTTAACTTGTCCAACTCCTCAAGCAAGAATTTCAACGATTCAGCTC----------CAGATAT--ATAT--TATATTTT-AACTTC-AACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATCATCTTCAGTCTGGCAATCATATATTTT-------GTGCTACAACTCCAGTCAA--TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGTT----ATGATTTATGGATAACGAAACGCATTCAGCACAAAATGTTCCT-GATTGTCCGAGA-A-TATACAACAC-A-TATCCATAACTC--TTTGTCCAGANCAAAACAAACATGACCTACTTATAGATTTACGCGTATATCGACTTG-------AGTTATGTTCGATTCTCATATAGCTTTCAATCAACAATATAAATNATC-AATTAAATAGCATTATAAACGGTNTTGCGTGACCTAGATTTAATCAATCTAAAAA-ATACAACACAG----AAACACAACAAACATAACGGTCGGATGACCTAATTAACCG-TTA-AA-TATGTTTGNA-TAAACTAATTAGCAGCAAAAATTGAGTAGCAATACAACAGTATATGATAAGGGTAA--ATATATATATGAAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGCGGT-GGAT---CTGTACATCA-ACATCAAAACACTGCTTGCATAAGATGACAGATTGGCGCGTTTTTCTGT-A-CAACAACAAANATAGCCCCGAACCTAATTTCNTTATTTTACTATCAAAATTAAAAGAGGACAATCCGTAGTGAATAAAATTNCACTAACAATCACTATT-TACTCAA-ACTACGAGTTATTATATCGAAAACATGTCAAT-ATTTCACCCCGTTAATGATT---ACA-T-TG-TTACAGTCGAATGGTGTTAGAGATTATA
Reference ( family-630 ) : TTTGACTTTTTGATAGAGTATTGATCAAATGAGTCATCTGAACTCTTAACTTGTCCAACTCCTCAAGCAAGAATTTCAACGATTCAGCTC----------CAGATAT--ATAT--TATATTTT-AACTTC-AACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATCATCTTCAGTCTGGCAATCATATATTTT-------GTGCTACAACTCCAGTCAA--TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGTT----ATGATTTATGGATAACGAAACGCATTCAGCACAAAATGTTCCT-GATTGTCCGAGA-A-TATACAACAC-A-TATCCATAACTC--TTTGTCCAGANCAAAACAAACATGACCTACTTATAGATTTACGCGTATATCGACTTG-------AGTTATGTTCGATTCTCATATAGCTTTCAATCAACAATATAAATNATC-AATTAAATAGCATTATAAACGGTNTTGCGTGACCTAGATTTAATCAATCTAAAAA-ATACAACACAG----AAACACAACAAACATAACGGTCGGATGACCTAATTAACCG-TTA-AA-TATGTTTGNA-TAAACTAATTAGCAGCAAAAATTGAGTAGCAATACAACAGTATATGATAAGGGTAA--ATATATATATGAAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGCGGT-GGAT---CTGTACATCA-ACATCAAAACACTGCTTGCATAAGATGACAGATTGGCGCGTTTTTCTAT-A-CAACAACAAANATAGCCCCGAACCTAATTTCNTTATTTTACTATCAAAATTAAAAGAGGACAATCCGTAGTGAATAAAATTNCACTAACAATCACTATT-TACTCAA-ACTACGAGTTATTATATCGAAAACATGTCAAT-ATTTCACCCCGTTAATGATT---ACA-T-TG-TTACAGTCGAATGGTGTTAGAGATTATA
gi|89394 : TTTGACTTTTTGATAGAGTATTGATCAAATGAGTCAACTGAACTCTTAACTTGTCCAACTCCTCAAGCAAGAATTTCAACGATTCAGTTC----------CAGATAT--ATAT--TATATTTT-AACTTC-AACTCCAGATTCTGTTTTTCCATGAATCATCTTCAGTCTGGCAATCATATATTTT-------GTGCTACAACTCCAGTCAA--TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGTA----ATGATTTATGGATAACGAAACACATTCAGCACAAAATGTTCCT-CATTGTCCGAGA-A-TATACTACACAA-TATCCAGAACTC--TTTGTCCAGAACAAAACAAACATGACCTACTTACAGATTTACGTGAATATCGACTTT-------AGTTATGTTCGATTCTCATAAAGCTTTCAATCAACAATATAAATTATC-A----------ATTATAAACGGTTTTGCGTGACCTAGATTTAATCAATCTAAAAA-ATACAACACAG------ACACAACAAACATAATGGTCAGATGACCTAATTAACGG-TTA-AA-TATGTTTGGA-TAAACTAATTAGCAACAAAAATTGAGTAGCAATACAACAGTATATGATAAGGGTAA--ATATATATATGAAATAATGAATGTATATATAAATCAATTACTTTGAGTGGT-GGAT---TTGTACATCA-ACATCAAAACACTGCTTGCATAAGATGACAGATTGGCGCGTTTTTTTCTGA-CAACAACAAAAATAGCCCTGAACCTAATTTCTTTATTTTACTATCAAAATC-AAAGAAGACATTCAATAGTGAATGAAATTACACTAACAATCTCTTTT-TACTCAA-ACTATAACTTATTATATCGAAAACATGTCAAT-ATTTCACCCTGTCAATGATT---ACA-CGTGATTACAGTTGAATGGTGTTAGAAATTATA
gi|89395 : TTTTACTTTTTGATAGAGTATTGATCAAA-GAATCATCTGAACTCTTAACTTGTCCAACTCCTCAAGCAAGAATTTCAACGATTCAGTTC----------CAGATAT--ATAT--TATATTTT-AACTTC-AACACCAGACTTTGTTTTTTCATAAATCATCTTCATTCTGGCAATCATATATTTT-------ATGCTACAACTCCAGTCAAA-TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGTA----ATAATTTATGGATAACGAAATGCATTCAGCACCAAATGTTCCT-GATTGTCCAAGA-A-TATACCACAC-ACTATCCAGAACTC--TTTGTCCAGAACAAAACAAACATGACCTACTTACAGATTTACGTGAATATCGACTTT-------AGTTATGTTCGATTCTCAAAAAGCTTTCAATCAACAATATAAATTATCCAATTAATT-GCATTATAAACGGTTTTGCGTGACCTAGATTTAATCAATCTAAACA-ATTCAACACAG----A--CACAACAAACATAACGGTCAGATGACCTAATT--CCACTTG-AA-TATGTTTGGA-TAAACTAATTAGCAGCAAAAATTGAGTAGCAATACAACAGTATATGATAAGGGTAA--ATATATATATGAAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGTGGT-GGAT---CTGTACATCA-ACATCAAATCACTGCTTACATAAGATGACAGATTGGCGCTTTTTTCTGT---CAACAACAAAAATAGCCCTGAACCTAATTTCTTTATTTTACTATCAAAATC-AAAGAGGACATTCAATAGTGAATGAAATTACACTAACAATCACTTTT-TACTCAA-ACTACGAGTTATTATATCGAAAACATGTCAAT-ATTTCACCCTGTCAATGATT---ACACC-TGATTACAATCGAATGATGTTAGAGATTATA
gi|89396 : TTTGACTTTTTGATAGAGTATTGATCAAATGAGTCACCTAAACTCTTAACTTGTCCAACTCTTGAAGCAAGAATTTTAACGATTCAGTTC----------CAGATAT--ATAT--CATATTTTTAACATC-AACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATTATCTTCAGTCTGGCAATCATATATTTT-------GTATTACAACTCCAGTCAA--TCTTAATATCTCCAGTTCAATAGTA----ATGATTTATGGATAACTAAATGCATTCAGCAC-AAATTTTCCT-GATTGTCCGAGA-A-TATACCATACGA-TATCCAGAACTC--TTTGTTCAGAACAAAACAAACATGACCTACTTACAGATTTACGTGAATATCGACTTT-------AGTTATGTTCGATTCTCACAAAACTTTCAATCAACAATATAAATTATC-AATT-AATTGCATTATAAACGGTTTTGCGTGACCAAGCTTTAATCAATCTAAAAA-ATACAACACAG------ACACAATAAACATAACGGTCGGATGACCTAATTAACGG-TTG-AA-TATGTTTGAA-TTAACTAATTAGCAGCAAAAATTGAGTAGCATTACAACAGTATATGATAAGGGTAA--CTATATATATGAAATAATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGCGGT-TGAT---CTGTACATCA-ACATCAAAACACTGCTTGCATAAGATGACAGATTGGTGCGTTTTTCTGT---CAACAACAAAAATAGCCCCGAACCTAATTTCTTTATTTTACTATCAAAATC-AAAGAAGACATTCAATAGTGAATGAAATTACACTTACATTCACATTT-TACTCAA-AATACGAGTTATTATATCGAAAACTTGTCAAT-ATTTCACCCTGTCAATGATT---ACACC-TGATTACAGTCGAATGATGTTAGAGATTATA
gi|89397 : TTCGACTTTTTGATAGAGTATTGATCAAATGAGTCACCTGAACTCTTAACTTGTCCAACTCCTCAAGCAAGAAATTCAACGATTCAGTTCTATATATATATATATAT--ATAT--TATATTTT-AACTTC-AACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATCATCTTTAGTCTGGCAATCATATATTTT-------ATGCTACAACTCCAGTCAA--TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGAA----ATGTTCAAAGGATAACGAAACACATTCAGCACAAAATGTTCCT-GATTGTCCGAGA-A-TATATCACAC-ATTATCCAGAATTC--TTTGTTCAGAACAAAACAAACATGACCTACTTACAGATTTACGTGAATATCGACTTT-------AGTTATGTTCGATTCTCATAAAG-TATCGATCAATTATATAAATTATC-AATT-AATTGCATTATGAACTGTTTTGCTTGACCTAAATTTAATCAATCTAAAAA-ACACAACACAG------ACACAACAAACATTACGGTTGGATTACCTAATTAACGG-TTA-AA-TATGTTTGGA-TA----AATTAGCAGCAAAAATTGAGTAGCAAATCAACAGTATATGATAAGGGTAAATATATATATATGAAATTATGAATGTATACTTAAAACAATTACTTTGAGCGGT-GGAT---CTGTACATCA-ACAACAAAACACTGCTTGCATAAGATGACAGATTGGCACGTTTTTCTGT---CAACATCAAAAATAGCCCCGAACCTAATTTCTTTATTTTACTATCAAAATC-AAAGAGGACATTCAATAGTGAATGAAATTACACTAACAATCACTTTT-TACTCAA-ACTAGGAGTTATTATATCGAAAACATGTCAAT-ATTTCACCCTGTCAATGATT---ACACC-TGATT--AGTCGAATGATGTTAGAGATTATA
gi|89398 : TTTGACTTTTTGACAGAGTATTGATCAAATGAGTCATTTGAACTCTTAACTTGTCCAACTCCTATAGCAAGAATTTCAACGATTCAGTTC----------CAGATATATATAT--TATATTTT-AAGTTC-AACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATCATCTTCAGTCTGGCAATCATATATTTT-------GAGCTACAACTCCAGTCAA--TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGTA----ATGATTTATGGATAACGAAACGCATTCAGCACAAAATGTTCCT-GATT------GATA-TATACCATAC-ATTATCCAGAACTCTTTTTGTCCAGAACAAAACAAACATGACCTACTTACAGATTTACGTGAATATCTACTTT-------AGTTATGTTCAATTCTCATAAAGCTTTCAATCAACAATATAAATTATC-AATT-AATTGTATTATAAACGGTTTTGCATGACCTAGATTTAATCAATCTAAATA-ATACAACACAG------ACACAACAAACACAACGGTCGGATGACCTAATTAACGG-TTA-AA-TATGTTTGGA-TAAACTAATTAGCAGCAAAAATTGAGTAGCAATACAACAGTATATG---------A--ATGTAT--------------------ATTTAAATAAATAACTTTGAGCGGT-GGAT---CTGTACATCA-ACATCAAAACACTGCTTGCATAAGATCACAGATTGGTGCGTTTTTCTGT---CAACAACACAAATAGCCCCGAATCCAATTTCTTTATTTTACTATAAAAATC-AAAGAGGACATTCAATAGTGAATGAAATTACACTAACAATCACTTTT-TACTCAA-ACTACGAGTTATTATATCGAAAACATGCCTAT-ATTTCACCCAGTCAATGATT---ACA-TCTGATTACAGTCGAATGATGTTAGAGATTATA
gi|89399 : TCAAATGAGTCACCTGAACTCTAAACTTGTCGAACTCCTCAAGGAAGAATTTCAACCATTCAGCTT----------CAGATAT--ATAT--TATGTTTT-GACTTC-AACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATCAT------------GATCATATATTTT-------GTACTACAACTCCAGTCAA--TTTTAATATCTCCAGTTCAACAGTT----ATGATTTATGGATAACGAAACGCATTCAGCACAAAATGTTCCT-GATTGTCCTAGA-A-TATACCACAC-A-TATCCATAACTC--TTTGTCCAGAACAAAACAAACATGATCTACTTACAGATTTACGTGAATATCTACTTT-------AGTTATGTTCGATTCTCATATAGCTTTCAATCAATAATATAAATTATT-AATC-AATAGCATTATTAACGGTTTTGCGTGACCTAGAATTAATCAATCTAAAAA-ATACAACACAG----AAACACAACAAACATAACGGTCGGATGACCAAATTAACGG-TTA-AA-TATGTTTGGA-TAAACCGATTAGCAGCAAAAATTGATTAGCAATACAACAGTATATGATAAGGGTAAATATATATATATGAAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGCGGT-GAAT---CTCTTTATCA-ACATAAAAACACTGCTTGCATAAGATAACAGATTGGCGCGTTTTTCTGT---CAACAACAAAAATAGCGCCGAACCTAATTTCTTTATTTTACTATCAAAATC-AAAGAGGACATTCAGTAGTGAATGAAATTACACAAACAATCACTATT-TACTCAT-ACTATGCGGTATTATATCGAAAACATGTCAAT-ATTTCATCACGTTAATGATT---ACACC-TGCTTACAGTCGAATGATGTTAGAGATTATA
gi|89400 : TCATATGAGTCATCTGAACTCTGAACTTGTCCAACTCCTCAAGCAAGAATTCCAATGATTCAGCTC----------CAGATAT--ACAT--TATGTTTT-ATCTTCGAACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATCATCTTCAGTCTGGCAATCATATACTTT-------GTGCTACAACTCCAGTCAA--TTTTAATATGTCCAGTTCAGTAGTT----TTGATTTATGGATAATGAAACGCATCCAGCACAAAATGTTCCA-GATTCTCTGAGA-A-TATATGACAC-A-TATCAATAACTC--TTTGTACAGAACAAAACAAACATGACTTACTTATAGATTTAGGTGTATATTGACTTT-------AGTTATGTTCGATTCTCATATAGCTTTCAATCAACAATATAAATTATA-CATT-AATAGCATTATAAACGGTTTAGCGTGACCTAGATTTAATCAATCTAAACA-ATACAACACAGTTCTAATCACAACAAAGATAACAGTCAGATGACCTAATTAACGG-TTA-AA-TATGTTTTAATTAAACTAATTAGCAGCAAAAATTGGGTAGCAATACAACATTATATGATAAGGGTAA--ATATATAAATGAAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGCGGT-GGAT---CTGTTCATCA-ACATCAAAACACTGCTTGCATAAGATGGCAGATTGGCGTGTTTTTTT-T-ATCAACAACAAAAATAGCACCGAACATAATTTCTTTATTTTACTATCAAAATTAAAAGAGGACATTCCG-AGT------------------------TATTATATCGAA-A--ACATGTTAATATTTC---ACCCCGTTAATGATTACACC-------TGATT---A-----------CAGTCAAATGATGTTAGAGATTATA
gi|89401 : TCAAATGGGTCATCTGAACTCTTAACTTGTTCAACTCCTTAAGCAAGAATTTCAACGATTCAGCTC----------CAGATAT--ATATATTATGTTTT-AACTTT-AACTCAAGATTTC---TTTCCATGAATTATCTCCAGTCTGGCAATCATATAGTTT-------GTGCTACAACTCCAGTCAAAATTTTAATATCTCCAGTTCAATAGTT----ATAATTTATGGATAACGAAACGCATTCAGCACAAAATGT-----------CTGAGA-A-TATAGAACAC-A-TATCCGTAAGTC--TTTGTCCAGAACAAAACAAACATGACCTACTTAAAGGTTTACGTGTATATCGACTTGTGACTTTAGTTATGTTCGATTCTCATATAGCTTTCAGTCAACAATATAAATTATC-AATT-AATGGCATTATAAACGGTTTTGTGTGACATAGATTTAATCAATCTAAAAATATATAACACCG----AAACACAACAAACATAACGGTCGGAT-------------G-TTA-AA-TATGTT
gi|89402 : TCAAATGAGTCATCTGAACTCTTAACTTGTCCAACTCCTCAAGCAAGAATTTCAACGTTTCAGCTC----------CAGATAT--ACAT--TATGTTTT-AACTTG-AACTCCAGATTATGTTTTTCCATTGATCATCTTCAGGCTGGCAATCATATATTTT-------GTGCTACAACTCCAGTCAA--TTTTAATATCTCCAGTCC
gi|89403 : AACTCCTCAAGCAAGAATTTCAACGATTCAGCTC----------CAGATAT--ATAT--TATATTTT-AACTTCGAACTCCAGATTTTGTTTTTCCACGAATCATCTTCAGTCTGGCAATCATATATTTT-------GTGCTACAACTCCgtcgtaaattt
gi|89404 : ATGTATTTTTAAATGTGTGTTACAAATCCAGTCAA--TT----TATCTCCGGTTAAATAGTTTTAAATGATTTATAAATAATGTATTGCATTCAACACAAAATGTTCCTCTTTTCTCCGAGA-AGTAT
gi|89405 : TACAACTTCAGTCAA--TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGTT----ATGATTTATGGATAACGAAACGCATTCAGCACAAAATGTTCCT-GATTGTCCAAGA-A-TATACAACAC-A-TATCCATAACTC--TTTGTCTAGACCAAAACAAACATGACCTATTTATAGATTTACGCGTATATTGACTTG-------AGTTATGTTCGATTCTCATATAGCTTTCAATCATCAATATAAATAATC-AA-TAAATAGCATTATAAACGGTGTTGCATGACCTAGATTTAATCAATCTAAAAA-ATACAACACAG----AAACACAACAAACATTACGGTCGGATGACCTAATTAACCG-TTA-AACTCTGCTTGCA-TAA
gi|89406 : TACAACTCCAGTAAA--TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGTT----ATGATTGATGGATAAGGAAACGCATTCAGCACAAAATGTTCCT-GATTGTCCGAGA-A-TATACAACAC-A-TATCCATAACTC--TTTGTCTAGACCAAAACAAACATGACCTACTTATAGATTTACGCGTATATTGACTTG-------AGTTATGTTCGATTCTCATATAGCTTTCAATCATCAATATAAATAATC-AA-TAAATAGCATTATAAAGGGTGTTGCGTGACCTAGATTGAATCAATCTAAAAA-ATACAACACAG----AAACACAACAAACATAACGGTCGGATGACCTAATTAACCG-TTA-AACTCTGCTTGCA-TAA
gi|89407 : TACAACTCCAGTCAA--TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGTT----ATAATTTATGGATA-CGAAACGCATTCAGCAAAAAATGTTCTT-GATTGTCTGAGA-A-TATACAACAC-A-TATCCATAACTC--TTTGTCTAGACCAAAACAAACATGACCTACTTATAGATTTACGCGTATATTGACTTG-------AGTTATGTTCAATTCTCATATAGCTTTCAATCATCAATATAAATAATC-AA-TAAATAGCATTATAAACGGTGTTGCGTGACCTAGATTTAATCAATCTAAAAA-ATACAACACAG----AAACACAACAAACATAACGGTCGGATGACCTCATTAACCG-TTA-AATTCTGATTGCA-TAA
gi|89408 : TACAACTCCAGTCAA--TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGTT----ATGATTTATGGATAACGAAACGCATTCAGCACAAAATTTTCCT-GATTGTCCAAGA-A--ATACAACAC-A-TATCCATAACTC--TTTGTCTAGACCAAAACAAACATGACCTACTTATAGATTTACGCGTATATTGACTTG-------AGTTATGTTCGATTTTCATATAGCTTTCAACCATCAATATAAATAATC-AA-TAAATAGCACTATAAATGGTGTTGCGTGACCTAGATTTAATCAATCTAAAAA-ATACAACACAG----AAACACAACAAACATAA----CGGATGACCTAATTAACCG-TTA-AACTCTGCTTGCA-TAA
gi|89409 : TACAACTCCAGTCAA--TTTTAATATCTCCACTTCAGTAGTT----ATGATTTATGGATAGCGAAACTCATTCAGCACAAAATGTTCCT-GGTTGTCCGAGA-A-TATACAACAC-A-TATCCATAACTT--TTTGTCTGGACCAAAACAAACATGACCTACTTATAGATGTACATGTATATTGACTTG-------AGTTATGTTCGATTCTCATATAGCTTTCAATCAACAATAAAAATAATC-AA-TAAATAGCATTATAAATGGTGTTGTGTGACCTAGATTTAATCAATCTAAAAA-ATACAACACAG----AAACACAACAAACATAATGGTCGGATGACCTAATTAACCG-TTATGA-TCTGCTTGCA-CAA
gi|89410 : TACAACTCCAGTCAA--TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGGT----ATGATTTATGGATAACGAAATGCATTCAGCACAAAATGTTCCT-AATTGTCCGAGA-A-TATACAACA--------CATAACTC--TTTGTATAGACCAAAACAAACATGACCTACTTATAGATTTACGTGTATATTGAC-CG-------AGTTATGTTCAATTCTCATATAGGTTTCAATTAACAATATAAATAATC-AATT-AATAGCATTATAAACAGTGTTGCATGACCTAGATTTAATCAATCTAAAAA-ATACAACACAG----AAACACAACAAACATAACGGTCAGATTACCTAATTAACCG-TTA-AA-TATGTT
gi|89411 : TACAACTCCAGCCAA--TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGTT----ATGATTTATGGATAACGGAACACATTCATCACAAAATGTTCCT-GATTGTCCTAGA-A-TATACAACAC-A-TATCCATAACTC--TTTGTCTAGACCAAAACAAACATGACCTACTTATAGATTTATGCGTATATTGACTTG-------ATTTATG-----------TAAAGCTTTCAATCAACAATATAAATAATC-AA-TAAATAAATTTATAAACGGTGTTGTGTGACCTAGATTTAATCTATCAAAAAA-ATACAACACAG----AAACACAACAAACATAACGGTCGGATGACCTAATTAACTG-TTA-AA-TATGTT
gi|89412 : TACAACTCCAGTCAA--TTTTAATATCTCAAGTTCAATGGTT----ATGATTTATGGATAACGAAACGCATTTAGCACAAAATGTTCCT-GTTTGTCCGAGA-A-TATACAACAC-A-TATCCATTACTC--TTTGTCTAGACCAAAACAAACATGACCTACTTATAGATTTACGCGTATATTGACTTG-------AGTTATGTTCGATTCTCATATAGCTTTCAATCATCAATATAAATAATC-AA-TAAATAGCATTTTAAACGGTGTTGCGTGACCTAGATTTAATCAATCTAAAAA-ATACAACACAG----AAACACAACAAACATAACGGTC
gi|89413 : AACGGTCGGATGACCTAATTAACCG-TTA-AC-TCTGCTTGCA-TAA
gi|89414 : AACGGTCGGATGACCT---CATTA-ACCGTTAAATTCTGATTGCATAAGATGACAGATTGGCGCGTTTTTCTAT-A--AACAACAAATGAAGCCCCGAACCTTATTTCATTATTTTACTATCAAAATTAAAAGAGGACAATCGGTAGTGAATAAAATTTCACTAACAATTACTTTT-TACTCAA-ACTACGAGTTATTATATCGAAAATATGTCAAT-ATTTCACCCCATTAATGATT---ACA-T---------GTCGAATGGTGTTAGAGAT
gi|89415 : TGTACATCATAC-TAAAAACACTGCTTGCATAAGATGACAGGTCGGCGCGTTTTTCTAT---CAACAACAAAAATAGCAT-GAGCCTATATTCTTTATTTTACTATCAGAATTACAAGAGGACAATCCGTAGTGAATAAAATTACACTGACAATCACTATT-TACTCAA-ACTACGAGTTATAATATCGAGAATATGTCAAT-ATTTCACCCCGTTAATTATT---ACACC-TGATTACAGTCGAATGGTGTTAGAGATTATA
gi|89416 : CATCAATACACTGCTTGCATAAGATGACAGATT-GCGCGTTTTTCTGT-A--AACAACAAATGT-----CAAA--------------------ATCAA------AAGAGGACAATCTGTAGTAAATAAAATTTCACTAACAATCACTATT-TACTCAA-ACTACGAGTTAATATATCAAAAACATGTCAGT-ATTTCACCCTATTAATGATT---GC
gi|89417 : CATCAATACACTGCTTGCATAAGATGACAGATTGGCGCGTTTTTCTAT-A--AACAACAAATGTAGCCCCGAACCTAATTTCGTTATTTTACTACCAAAATTAAAAGAGGACAATCCGTATTT-ATAAAATTTCACTAACAATCACTATT-TATTCAA-ACTACGAGTTATTGTATCGAAAACA-GTCAAT-ATTTCGCCCCATTAATTATT---ACA-T---------GTTGAATGGTGTTAGAGAGTATA
gi|89418 : AAACTCTGCTTGCATAAGATGACAGATTGGCGCGTTTTTCTAT-A--AACAACAAATGCAGCCCCGAACCTAATTTCGTTATTTTACTATCAAAATTAATAGAGGACAATCCGTAGTGAATAAAATTTCACTAACAATTACTATT-TACTCAA-ACTACGAGTTATTATATCGAAAATATGTCAAT-ATTTCACCCCATTAATGATT---ACA-T---------GTCGAATGGTGTTAGAGATTATA
gi|89419 : AAACTCTGCTTGCATAAGATGACAGATTGGCGCGTTTTTCTAT-A--AACAACAAATGTAGCCCCAAACCTAATTTCATTATTTTACTATCAAAATTAAAAGAGGACAATCCGTAGTGAATCAAATTTCACTAACAATTACTATT-TACTCAA-ACTACGAGTTATTATATCGAAAATATGTCAAT-ATTTCACCCCATTAATGATT---ACA-T---------GTCGAATGGTGTTAGAGATTATA
gi|89420 : AAACTCTGCTTGCATAAGATGACAGATTGGCGCGTTTTTCTAT-A--AACAACAAATGTAGCCCCGAACCTAATTTCGTTATTTTACTATCAAA-TTAAAAGAAGACAATCCGTAGTGAATAAAATTTCACTAACAATTACTTTT-TACTCAA-ACTACAAGTTATTACATCGAAAATATGTCAAT-ATTTCACCCCATTAATGATT---ACA-T---------GTCGAATGGTGTTGG
gi|89421 : AACTCTGCTTGCATAAGATGACAGATTGGCGCGTTTTTCTAT-A--AACAACAAATCTAGGCCCGAATCTAATTTCGTTATTTTACTATCAAAATTAAAAGGAGACAATCCGTAGTGAATAATATTTCACTAACAATTACTATT-TACTCAA-ACTACGAGTTATTATATCGAAAATGTGTCAAT-ATTTCACCCCATTAATGATT---ACA-T---------GTCGAATGGTGTTAGAGATAATA
gi|89422 : CTGCTTGCACAAGATGACAGATTGGCGCGTTTTTTTAT-A--AACAACAAATAGAGCCCCGAACCTAATTTCGTTATTTTACTATCAAAATTAAAAGAGGACAATCCGTAGTGAATAAAATTTAACT---AATCACTATT-TACTCAA-ACTACAAGTTATTTTTTCGAAAACATGTCAAT-ATTTCACCCCATTAATGATT---ACA-T---------GTCGAATGGTGTTAGAGATTATA
gi|89423 : TCGTTTTTTTACGATCAAAATTAAAAGAGGACAATTTCTAGTGAATAAAAT------AACAATCACTATT-TACTCAA-ATAACGAGTTGTTATATCGAAAACATGTCAAT-ATCTCACCCCATTAATGGTT---ACA-T---------GTTGAATGGTGTTAGAGATTATA
gi|89424 : CTTACAAACGCTATT-TGCTCATTCCTATGCGTTATAAAATCGGCAACATGTCAAT-GTTTCATCCCG----TGATTTAAAGA-T-GC-TTACAACCGAATTACAATAGAGATTTTA
Alignments
lowQualScore : 1111111111 1111111 222 1 11 222 77777777777
lowQualScore : 7777777777 55 55 4 8 1111111 55 5555 2 2 2 1 5 7 33 1 0 99999999 0 1 2 111 1 1 2 888888 1 2 2 0 1 3 55 1 5 888 4 33 1 666 1 1 9 1 2 2 1 2 2 2 333 11111111111
lowQualScore : .......... .. .. . . ....... .. .... . . . . . . .. . . ........ . . . ... . . . ...... . . . . . . .. . . ... . .. . ... . . . . . . . . . . ... ...........
lowQualScore : 5555555555 55 55 0 0 8888888 33 0000 4 4 4 1 0 5 44 0 8 11111111 8 0 5 333 4 0 5 666666 9 5 5 0 0 1 77 9 0 888 4 44 1 999 0 8 7 7 2 6 1 2 2 2 999 88888888888
consensus : TTTGACTTTTTGATAGAGTATTGATCAAATGAGTCATCTGAACTCTTAACTTGTCCAACTCCTCAAGCAAGAATTTCAACGATTCAGCTC----------CAGATAT--ATAT--TATATTTT-AACTTC-AACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATCATCTTCAGTCTGGCAATCATATATTTT-------GTGCTACAACTCCAGTCAA--TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGTT----ATGATTTATGGATAACGAAACGCATTCAGCACAAAATGTTCCT-GATTGTCCGAGA-A-TATACAACAC-A-TATCCATAACTC--TTTGTCCAGANCAAAACAAACATGACCTACTTATAGATTTACGCGTATATCGACTTG-------AGTTATGTTCGATTCTCATATAGCTTTCAATCAACAATATAAATNATC-AATTAAATAGCATTATAAACGGTNTTGCGTGACCTAGATTTAATCAATCTAAAAA-ATACAACACAG----AAACACAACAAACATAACGGTCGGATGACCTAATTAACCG-TTA-AA-TATGTTTGNA-TAAACTAATTAGCAGCAAAAATTGAGTAGCAATACAACAGTATATGATAAGGGTAA--ATATATATATGAAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGCGGT-GGAT---CTGTACATCA-ACATCAAAACACTGCTTGCATAAGATGACAGATTGGCGCG--TTTTTCTGTA-CAACAACAAANATAGCCCCGAACCTAATTTCNTTATTTTACTATCAAAATTAAAAGAGGACAATCCGTAGTGAATAAAATTNCACTAACAATCACTATT-TACTCAA-ACTACGAGTTATTATATCGAAAACATGTCAAT-ATTTCACCCCGTTAATGATT---ACA-T-TG-TTACAGTCGAATGGTGTTAGAGATTATA
Reference ( family-630 ) : TTTGACTTTTTGATAGAGTATTGATCAAATGAGTCATCTGAACTCTTAACTTGTCCAACTCCTCAAGCAAGAATTTCAACGATTCAGCTC----------CAGATAT--ATAT--TATATTTT-AACTTC-AACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATCATCTTCAGTCTGGCAATCATATATTTT-------GTGCTACAACTCCAGTCAA--TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGTT----ATGATTTATGGATAACGAAACGCATTCAGCACAAAATGTTCCT-GATTGTCCGAGA-A-TATACAACAC-A-TATCCATAACTC--TTTGTCCAGANCAAAACAAACATGACCTACTTATAGATTTACGCGTATATCGACTTG-------AGTTATGTTCGATTCTCATATAGCTTTCAATCAACAATATAAATNATC-AATTAAATAGCATTATAAACGGTNTTGCGTGACCTAGATTTAATCAATCTAAAAA-ATACAACACAG----AAACACAACAAACATAACGGTCGGATGACCTAATTAACCG-TTA-AA-TATGTTTGNA-TAAACTAATTAGCAGCAAAAATTGAGTAGCAATACAACAGTATATGATAAGGGTAA--ATATATATATGAAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGCGGT-GGAT---CTGTACATCA-ACATCAAAACACTGCTTGCATAAGATGACAGATTGGCGCG--TTTTTCTGTA-CAACAACAAANATAGCCCCGAACCTAATTTCNTTATTTTACTATCAAAATTAAAAGAGGACAATCCGTAGTGAATAAAATTNCACTAACAATCACTATT-TACTCAA-ACTACGAGTTATTATATCGAAAACATGTCAAT-ATTTCACCCCGTTAATGATT---ACA-T-TG-TTACAGTCGAATGGTGTTAGAGATTATA
gi|89394 : TTTGACTTTTTGATAGAGTATTGATCAAATGAGTCAACTGAACTCTTAACTTGTCCAACTCCTCAAGCAAGAATTTCAACGATTCAGTTC----------CAGATAT--ATAT--TATATTTT-AACTTC-AACTCCAGATTCTGTTTTTCCATGAATCATCTTCAGTCTGGCAATCATATATTTT-------GTGCTACAACTCCAGTCAA--TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGTA----ATGATTTATGGATAACGAAACACATTCAGCACAAAATGTTCCT-CATTGTCCGAGA-A-TATACTACACAA-TATCCAGAACTC--TTTGTCCAGAACAAAACAAACATGACCTACTTACAGATTTACGTGAATATCGACTTT-------AGTTATGTTCGATTCTCATAAAGCTTTCAATCAACAATATAAATTATC-A----------ATTATAAACGGTTTTGCGTGACCTAGATTTAATCAATCTAAAAA-ATACAACACAG------ACACAACAAACATAATGGTCAGATGACCTAATTAACGG-TTA-AA-TATGTTTGGA-TAAACTAATTAGCAACAAAAATTGAGTAGCAATACAACAGTATATGATAAGGGTAA--ATATATATATGAAATAATGAATGTATATATAAATCAATTACTTTGAGTGGT-GGAT---TTGTACATCA-ACATCAAAACACTGCTTGCATAAGATGACAGATTGGCGCGTTTTTTTCTG-A-CAACAACAAAAATAGCCCTGAACCTAATTTCTTTATTTTACTATCAAAATC-AAAGAAGACATTCAATAGTGAATGAAATTACACTAACAATCTCTTTT-TACTCAA-ACTATAACTTATTATATCGAAAACATGTCAAT-ATTTCACCCTGTCAATGATT---ACA-CGTGATTACAGTTGAATGGTGTTAGAAATTATA
gi|89395 : TTTTACTTTTTGATAGAGTATTGATCAAA-GAATCATCTGAACTCTTAACTTGTCCAACTCCTCAAGCAAGAATTTCAACGATTCAGTTC----------CAGATAT--ATAT--TATATTTT-AACTTC-AACACCAGACTTTGTTTTTTCATAAATCATCTTCATTCTGGCAATCATATATTTT-------ATGCTACAACTCCAGTCAAA-TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGTA----ATAATTTATGGATAACGAAATGCATTCAGCACCAAATGTTCCT-GATTGTCCAAGA-A-TATACCACAC-ACTATCCAGAACTC--TTTGTCCAGAACAAAACAAACATGACCTACTTACAGATTTACGTGAATATCGACTTT-------AGTTATGTTCGATTCTCAAAAAGCTTTCAATCAACAATATAAATTATCCAATTAATT-GCATTATAAACGGTTTTGCGTGACCTAGATTTAATCAATCTAAACA-ATTCAACACAG----A--CACAACAAACATAACGGTCAGATGACCTAATT--CCACTTG-AA-TATGTTTGGA-TAAACTAATTAGCAGCAAAAATTGAGTAGCAATACAACAGTATATGATAAGGGTAA--ATATATATATGAAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGTGGT-GGAT---CTGTACATCA-ACATCAAATCACTGCTTACATAAGATGACAGATTGGCGCT--TTTTTCTGT--CAACAACAAAAATAGCCCTGAACCTAATTTCTTTATTTTACTATCAAAATC-AAAGAGGACATTCAATAGTGAATGAAATTACACTAACAATCACTTTT-TACTCAA-ACTACGAGTTATTATATCGAAAACATGTCAAT-ATTTCACCCTGTCAATGATT---ACACC-TGATTACAATCGAATGATGTTAGAGATTATA
gi|89396 : TTTGACTTTTTGATAGAGTATTGATCAAATGAGTCACCTAAACTCTTAACTTGTCCAACTCTTGAAGCAAGAATTTTAACGATTCAGTTC----------CAGATAT--ATAT--CATATTTTTAACATC-AACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATTATCTTCAGTCTGGCAATCATATATTTT-------GTATTACAACTCCAGTCAA--TCTTAATATCTCCAGTTCAATAGTA----ATGATTTATGGATAACTAAATGCATTCAGCAC-AAATTTTCCT-GATTGTCCGAGA-A-TATACCATACGA-TATCCAGAACTC--TTTGTTCAGAACAAAACAAACATGACCTACTTACAGATTTACGTGAATATCGACTTT-------AGTTATGTTCGATTCTCACAAAACTTTCAATCAACAATATAAATTATC-AATT-AATTGCATTATAAACGGTTTTGCGTGACCAAGCTTTAATCAATCTAAAAA-ATACAACACAG------ACACAATAAACATAACGGTCGGATGACCTAATTAACGG-TTG-AA-TATGTTTGAA-TTAACTAATTAGCAGCAAAAATTGAGTAGCATTACAACAGTATATGATAAGGGTAA--CTATATATATGAAATAATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGCGGT-TGAT---CTGTACATCA-ACATCAAAACACTGCTTGCATAAGATGACAGATTGGTGCG--TTTTTCTGT--CAACAACAAAAATAGCCCCGAACCTAATTTCTTTATTTTACTATCAAAATC-AAAGAAGACATTCAATAGTGAATGAAATTACACTTACATTCACATTT-TACTCAA-AATACGAGTTATTATATCGAAAACTTGTCAAT-ATTTCACCCTGTCAATGATT---ACACC-TGATTACAGTCGAATGATGTTAGAGATTATA
gi|89397 : TTCGACTTTTTGATAGAGTATTGATCAAATGAGTCACCTGAACTCTTAACTTGTCCAACTCCTCAAGCAAGAAATTCAACGATTCAGTTCTATATATATATATATAT--ATAT--TATATTTT-AACTTC-AACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATCATCTTTAGTCTGGCAATCATATATTTT-------ATGCTACAACTCCAGTCAA--TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGAA----ATGTTCAAAGGATAACGAAACACATTCAGCACAAAATGTTCCT-GATTGTCCGAGA-A-TATATCACAC-ATTATCCAGAATTC--TTTGTTCAGAACAAAACAAACATGACCTACTTACAGATTTACGTGAATATCGACTTT-------AGTTATGTTCGATTCTCATAAAG-TATCGATCAATTATATAAATTATC-AATT-AATTGCATTATGAACTGTTTTGCTTGACCTAAATTTAATCAATCTAAAAA-ACACAACACAG------ACACAACAAACATTACGGTTGGATTACCTAATTAACGG-TTA-AA-TATGTTTGGA-TA----AATTAGCAGCAAAAATTGAGTAGCAAATCAACAGTATATGATAAGGGTAAATATATATATATGAAATTATGAATGTATACTTAAAACAATTACTTTGAGCGGT-GGAT---CTGTACATCA-ACAACAAAACACTGCTTGCATAAGATGACAGATTGGCACG--TTTTTCTGT--CAACATCAAAAATAGCCCCGAACCTAATTTCTTTATTTTACTATCAAAATC-AAAGAGGACATTCAATAGTGAATGAAATTACACTAACAATCACTTTT-TACTCAA-ACTAGGAGTTATTATATCGAAAACATGTCAAT-ATTTCACCCTGTCAATGATT---ACACC-TGATT--AGTCGAATGATGTTAGAGATTATA
gi|89398 : TTTGACTTTTTGACAGAGTATTGATCAAATGAGTCATTTGAACTCTTAACTTGTCCAACTCCTATAGCAAGAATTTCAACGATTCAGTTC----------CAGATATATATAT--TATATTTT-AAGTTC-AACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATCATCTTCAGTCTGGCAATCATATATTTT-------GAGCTACAACTCCAGTCAA--TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGTA----ATGATTTATGGATAACGAAACGCATTCAGCACAAAATGTTCCT-GATT------GATA-TATACCATAC-ATTATCCAGAACTCTTTTTGTCCAGAACAAAACAAACATGACCTACTTACAGATTTACGTGAATATCTACTTT-------AGTTATGTTCAATTCTCATAAAGCTTTCAATCAACAATATAAATTATC-AATT-AATTGTATTATAAACGGTTTTGCATGACCTAGATTTAATCAATCTAAATA-ATACAACACAG------ACACAACAAACACAACGGTCGGATGACCTAATTAACGG-TTA-AA-TATGTTTGGA-TAAACTAATTAGCAGCAAAAATTGAGTAGCAATACAACAGTATATG---------A--ATGTAT--------------------ATTTAAATAAATAACTTTGAGCGGT-GGAT---CTGTACATCA-ACATCAAAACACTGCTTGCATAAGATCACAGATTGGTGCG--TTTTTCTGT--CAACAACACAAATAGCCCCGAATCCAATTTCTTTATTTTACTATAAAAATC-AAAGAGGACATTCAATAGTGAATGAAATTACACTAACAATCACTTTT-TACTCAA-ACTACGAGTTATTATATCGAAAACATGCCTAT-ATTTCACCCAGTCAATGATT---ACA-TCTGATTACAGTCGAATGATGTTAGAGATTATA
gi|89399 : TCAAATGAGTCACCTGAACTCTAAACTTGTCGAACTCCTCAAGGAAGAATTTCAACCATTCAGCTT----------CAGATAT--ATAT--TATGTTTT-GACTTC-AACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATCAT------------GATCATATATTTT-------GTACTACAACTCCAGTCAA--TTTTAATATCTCCAGTTCAACAGTT----ATGATTTATGGATAACGAAACGCATTCAGCACAAAATGTTCCT-GATTGTCCTAGA-A-TATACCACAC-A-TATCCATAACTC--TTTGTCCAGAACAAAACAAACATGATCTACTTACAGATTTACGTGAATATCTACTTT-------AGTTATGTTCGATTCTCATATAGCTTTCAATCAATAATATAAATTATT-AATC-AATAGCATTATTAACGGTTTTGCGTGACCTAGAATTAATCAATCTAAAAA-ATACAACACAG----AAACACAACAAACATAACGGTCGGATGACCAAATTAACGG-TTA-AA-TATGTTTGGA-TAAACCGATTAGCAGCAAAAATTGATTAGCAATACAACAGTATATGATAAGGGTAAATATATATATATGAAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGCGGT-GAAT---CTCTTTATCA-ACATAAAAACACTGCTTGCATAAGATAACAGATTGGCGCG--TTTTTCTGT--CAACAACAAAAATAGCGCCGAACCTAATTTCTTTATTTTACTATCAAAATC-AAAGAGGACATTCAGTAGTGAATGAAATTACACAAACAATCACTATT-TACTCAT-ACTATGCGGTATTATATCGAAAACATGTCAAT-ATTTCATCACGTTAATGATT---ACACC-TGCTTACAGTCGAATGATGTTAGAGATTATA
gi|89400 : TCATATGAGTCATCTGAACTCTGAACTTGTCCAACTCCTCAAGCAAGAATTCCAATGATTCAGCTC----------CAGATAT--ACAT--TATGTTTT-ATCTTCGAACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATCATCTTCAGTCTGGCAATCATATACTTT-------GTGCTACAACTCCAGTCAA--TTTTAATATGTCCAGTTCAGTAGTT----TTGATTTATGGATAATGAAACGCATCCAGCACAAAATGTTCCA-GATTCTCTGAGA-A-TATATGACAC-A-TATCAATAACTC--TTTGTACAGAACAAAACAAACATGACTTACTTATAGATTTAGGTGTATATTGACTTT-------AGTTATGTTCGATTCTCATATAGCTTTCAATCAACAATATAAATTATA-CATT-AATAGCATTATAAACGGTTTAGCGTGACCTAGATTTAATCAATCTAAACA-ATACAACACAGTTCTAATCACAACAAAGATAACAGTCAGATGACCTAATTAACGG-TTA-AA-TATGTTTTAATTAAACTAATTAGCAGCAAAAATTGGGTAGCAATACAACATTATATGATAAGGGTAA--ATATATAAATGAAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGCGGT-GGAT---CTGTTCATCA-ACATCAAAACACTGCTTGCATAAGATGGCAGATTGGCGTG--TTTTTTT-TATCAACAACAAAAATAGCACCGAACATAATTTCTTTATTTTACTATCAAAATTAAAAGAGGACATTCCG-AGT------------------------TATTATATCGAA-A--ACATGTTAATATTTC---ACCCCGTTAATGATTACACC-------TGATT---A-----------CAGTCAAATGATGTTAGAGATTATA
gi|89401 : TCAAATGGGTCATCTGAACTCTTAACTTGTTCAACTCCTTAAGCAAGAATTTCAACGATTCAGCTC----------CAGATAT--ATATATTATGTTTT-AACTTT-AACTCAAGATTTC---TTTCCATGAATTATCTCCAGTCTGGCAATCATATAGTTT-------GTGCTACAACTCCAGTCAAAATTTTAATATCTCCAGTTCAATAGTT----ATAATTTATGGATAACGAAACGCATTCAGCACAAAATGT-----------CTGAGA-A-TATAGAACAC-A-TATCCGTAAGTC--TTTGTCCAGAACAAAACAAACATGACCTACTTAAAGGTTTACGTGTATATCGACTTGTGACTTTAGTTATGTTCGATTCTCATATAGCTTTCAGTCAACAATATAAATTATC-AATT-AATGGCATTATAAACGGTTTTGTGTGACATAGATTTAATCAATCTAAAAATATATAACACCG----AAACACAACAAACATAACGGTCGGAT-------------G-TTA-AA-TATGTT
gi|89402 : TCAAATGAGTCATCTGAACTCTTAACTTGTCCAACTCCTCAAGCAAGAATTTCAACGTTTCAGCTC----------CAGATAT--ACAT--TATGTTTT-AACTTG-AACTCCAGATTATGTTTTTCCATTGATCATCTTCAGGCTGGCAATCATATATTTT-------GTGCTACAACTCCAGTCAA--TTTTAATATCTCCAGTCC
gi|89403 : AACTCCTCAAGCAAGAATTTCAACGATTCAGCTC----------CAGATAT--ATAT--TATATTTT-AACTTCGAACTCCAGATTTTGTTTTTCCACGAATCATCTTCAGTCTGGCAATCATATATTTT-------GTGCTACAACTCCgtcgtaaattt
gi|89404 : ATGTATTTTTAAATGTGTGTTACAAATCCAGTCAA--TT----TATCTCCGGTTAAATAGTTTTAAATGATTTATAAATAATGTATTGCATTCAACACAAAATGTTCCTCTTTTCTCCGAGA-AGTAT
gi|89405 : TACAACTTCAGTCAA--TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGTT----ATGATTTATGGATAACGAAACGCATTCAGCACAAAATGTTCCT-GATTGTCCAAGA-A-TATACAACAC-A-TATCCATAACTC--TTTGTCTAGACCAAAACAAACATGACCTATTTATAGATTTACGCGTATATTGACTTG-------AGTTATGTTCGATTCTCATATAGCTTTCAATCATCAATATAAATAATC-AA-TAAATAGCATTATAAACGGTGTTGCATGACCTAGATTTAATCAATCTAAAAA-ATACAACACAG----AAACACAACAAACATTACGGTCGGATGACCTAATTAACCG-TTA-AACTCTGCTTGCA-TAA
gi|89406 : TACAACTCCAGTAAA--TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGTT----ATGATTGATGGATAAGGAAACGCATTCAGCACAAAATGTTCCT-GATTGTCCGAGA-A-TATACAACAC-A-TATCCATAACTC--TTTGTCTAGACCAAAACAAACATGACCTACTTATAGATTTACGCGTATATTGACTTG-------AGTTATGTTCGATTCTCATATAGCTTTCAATCATCAATATAAATAATC-AA-TAAATAGCATTATAAAGGGTGTTGCGTGACCTAGATTGAATCAATCTAAAAA-ATACAACACAG----AAACACAACAAACATAACGGTCGGATGACCTAATTAACCG-TTA-AACTCTGCTTGCA-TAA
gi|89407 : TACAACTCCAGTCAA--TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGTT----ATAATTTATGGATA-CGAAACGCATTCAGCAAAAAATGTTCTT-GATTGTCTGAGA-A-TATACAACAC-A-TATCCATAACTC--TTTGTCTAGACCAAAACAAACATGACCTACTTATAGATTTACGCGTATATTGACTTG-------AGTTATGTTCAATTCTCATATAGCTTTCAATCATCAATATAAATAATC-AA-TAAATAGCATTATAAACGGTGTTGCGTGACCTAGATTTAATCAATCTAAAAA-ATACAACACAG----AAACACAACAAACATAACGGTCGGATGACCTCATTAACCG-TTA-AATTCTGATTGCA-TAA
gi|89408 : TACAACTCCAGTCAA--TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGTT----ATGATTTATGGATAACGAAACGCATTCAGCACAAAATTTTCCT-GATTGTCCAAGA-A--ATACAACAC-A-TATCCATAACTC--TTTGTCTAGACCAAAACAAACATGACCTACTTATAGATTTACGCGTATATTGACTTG-------AGTTATGTTCGATTTTCATATAGCTTTCAACCATCAATATAAATAATC-AA-TAAATAGCACTATAAATGGTGTTGCGTGACCTAGATTTAATCAATCTAAAAA-ATACAACACAG----AAACACAACAAACATAA----CGGATGACCTAATTAACCG-TTA-AACTCTGCTTGCA-TAA
gi|89409 : TACAACTCCAGTCAA--TTTTAATATCTCCACTTCAGTAGTT----ATGATTTATGGATAGCGAAACTCATTCAGCACAAAATGTTCCT-GGTTGTCCGAGA-A-TATACAACAC-A-TATCCATAACTT--TTTGTCTGGACCAAAACAAACATGACCTACTTATAGATGTACATGTATATTGACTTG-------AGTTATGTTCGATTCTCATATAGCTTTCAATCAACAATAAAAATAATC-AA-TAAATAGCATTATAAATGGTGTTGTGTGACCTAGATTTAATCAATCTAAAAA-ATACAACACAG----AAACACAACAAACATAATGGTCGGATGACCTAATTAACCG-TTATGA-TCTGCTTGCA-CAA
gi|89410 : TACAACTCCAGTCAA--TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGGT----ATGATTTATGGATAACGAAATGCATTCAGCACAAAATGTTCCT-AATTGTCCGAGA-A-TATACAACA--------CATAACTC--TTTGTATAGACCAAAACAAACATGACCTACTTATAGATTTACGTGTATATTGAC-CG-------AGTTATGTTCAATTCTCATATAGGTTTCAATTAACAATATAAATAATC-AATT-AATAGCATTATAAACAGTGTTGCATGACCTAGATTTAATCAATCTAAAAA-ATACAACACAG----AAACACAACAAACATAACGGTCAGATTACCTAATTAACCG-TTA-AA-TATGTT
gi|89411 : TACAACTCCAGCCAA--TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGTT----ATGATTTATGGATAACGGAACACATTCATCACAAAATGTTCCT-GATTGTCCTAGA-A-TATACAACAC-A-TATCCATAACTC--TTTGTCTAGACCAAAACAAACATGACCTACTTATAGATTTATGCGTATATTGACTTG-------ATTTATG-----------TAAAGCTTTCAATCAACAATATAAATAATC-AA-TAAATAAATTTATAAACGGTGTTGTGTGACCTAGATTTAATCTATCAAAAAA-ATACAACACAG----AAACACAACAAACATAACGGTCGGATGACCTAATTAACTG-TTA-AA-TATGTT
gi|89412 : TACAACTCCAGTCAA--TTTTAATATCTCAAGTTCAATGGTT----ATGATTTATGGATAACGAAACGCATTTAGCACAAAATGTTCCT-GTTTGTCCGAGA-A-TATACAACAC-A-TATCCATTACTC--TTTGTCTAGACCAAAACAAACATGACCTACTTATAGATTTACGCGTATATTGACTTG-------AGTTATGTTCGATTCTCATATAGCTTTCAATCATCAATATAAATAATC-AA-TAAATAGCATTTTAAACGGTGTTGCGTGACCTAGATTTAATCAATCTAAAAA-ATACAACACAG----AAACACAACAAACATAACGGTC
gi|89413 : AACGGTCGGATGACCTAATTAACCG-TTA-AC-TCTGCTTGCA-TAA
gi|89414 : AACGGTCGGATGACCT---CATTA-ACCGTTAAATTCTGATTGCATAAGATGACAGATTGGCGCG--TTTTTCTATA--AACAACAAATGAAGCCCCGAACCTTATTTCATTATTTTACTATCAAAATTAAAAGAGGACAATCGGTAGTGAATAAAATTTCACTAACAATTACTTTT-TACTCAA-ACTACGAGTTATTATATCGAAAATATGTCAAT-ATTTCACCCCATTAATGATT---ACA-T---------GTCGAATGGTGTTAGAGAT
gi|89415 : TGTACATCATAC-TAAAAACACTGCTTGCATAAGATGACAGGTCGGCGCG--TTTTTCTAT--CAACAACAAAAATAGCAT-GAGCCTATATTCTTTATTTTACTATCAGAATTACAAGAGGACAATCCGTAGTGAATAAAATTACACTGACAATCACTATT-TACTCAA-ACTACGAGTTATAATATCGAGAATATGTCAAT-ATTTCACCCCGTTAATTATT---ACACC-TGATTACAGTCGAATGGTGTTAGAGATTATA
gi|89416 : CATCAATACACTGCTTGCATAAGATGACAGATT-GCGCG--TTTTTCTGTA--AACAACAAATGT-----CAAA--------------------ATCAA------AAGAGGACAATCTGTAGTAAATAAAATTTCACTAACAATCACTATT-TACTCAA-ACTACGAGTTAATATATCAAAAACATGTCAGT-ATTTCACCCTATTAATGATT---GC
gi|89417 : CATCAATACACTGCTTGCATAAGATGACAGATTGGCGCG--TTTTTCTATA--AACAACAAATGTAGCCCCGAACCTAATTTCGTTATTTTACTACCAAAATTAAAAGAGGACAATCCGTATTT-ATAAAATTTCACTAACAATCACTATT-TATTCAA-ACTACGAGTTATTGTATCGAAAACA-GTCAAT-ATTTCGCCCCATTAATTATT---ACA-T---------GTTGAATGGTGTTAGAGAGTATA
gi|89418 : AAACTCTGCTTGCATAAGATGACAGATTGGCGCG--TTTTTCTATA--AACAACAAATGCAGCCCCGAACCTAATTTCGTTATTTTACTATCAAAATTAATAGAGGACAATCCGTAGTGAATAAAATTTCACTAACAATTACTATT-TACTCAA-ACTACGAGTTATTATATCGAAAATATGTCAAT-ATTTCACCCCATTAATGATT---ACA-T---------GTCGAATGGTGTTAGAGATTATA
gi|89419 : AAACTCTGCTTGCATAAGATGACAGATTGGCGCG--TTTTTCTATA--AACAACAAATGTAGCCCCAAACCTAATTTCATTATTTTACTATCAAAATTAAAAGAGGACAATCCGTAGTGAATCAAATTTCACTAACAATTACTATT-TACTCAA-ACTACGAGTTATTATATCGAAAATATGTCAAT-ATTTCACCCCATTAATGATT---ACA-T---------GTCGAATGGTGTTAGAGATTATA
gi|89420 : AAACTCTGCTTGCATAAGATGACAGATTGGCGCG--TTTTTCTATA--AACAACAAATGTAGCCCCGAACCTAATTTCGTTATTTTACTATCAAA-TTAAAAGAAGACAATCCGTAGTGAATAAAATTTCACTAACAATTACTTTT-TACTCAA-ACTACAAGTTATTACATCGAAAATATGTCAAT-ATTTCACCCCATTAATGATT---ACA-T---------GTCGAATGGTGTTGG
gi|89421 : AACTCTGCTTGCATAAGATGACAGATTGGCGCG--TTTTTCTATA--AACAACAAATCTAGGCCCGAATCTAATTTCGTTATTTTACTATCAAAATTAAAAGGAGACAATCCGTAGTGAATAATATTTCACTAACAATTACTATT-TACTCAA-ACTACGAGTTATTATATCGAAAATGTGTCAAT-ATTTCACCCCATTAATGATT---ACA-T---------GTCGAATGGTGTTAGAGATAATA
gi|89422 : CTGCTTGCACAAGATGACAGATTGGCGCG--TTTTTTTATA--AACAACAAATAGAGCCCCGAACCTAATTTCGTTATTTTACTATCAAAATTAAAAGAGGACAATCCGTAGTGAATAAAATTTAACT---AATCACTATT-TACTCAA-ACTACAAGTTATTTTTTCGAAAACATGTCAAT-ATTTCACCCCATTAATGATT---ACA-T---------GTCGAATGGTGTTAGAGATTATA
gi|89423 : TCGTTTTTTTACGATCAAAATTAAAAGAGGACAATTTCTAGTGAATAAAAT------AACAATCACTATT-TACTCAA-ATAACGAGTTGTTATATCGAAAACATGTCAAT-ATCTCACCCCATTAATGGTT---ACA-T---------GTTGAATGGTGTTAGAGATTATA
gi|89424 : CTTACAAACGCTATT-TGCTCATTCCTATGCGTTATAAAATCGGCAACATGTCAAT-GTTTCATCCCG----TGATTTAAAGA-T-GC-TTACAACCGAATTACAATAGAGATTTTA
Alignments
lowQualScore : 1111111111 1111111 222 1 11 222 77777777777
lowQualScore : 7777777777 55 55 4 8 1111111 55 5555 2 2 2 1 5 7 33 1 0 99999999 0 1 2 111 1 1 2 888888 1 2 2 0 1 3 55 1 5 888 4 33 1 666 1 1 9 1 2 2 1 2 2 2 333 11111111111
lowQualScore : .......... .. .. . . ....... .. .... . . . . . . .. . . ........ . . . ... . . . ...... . . . . . . .. . . ... . .. . ... . . . . . . . . . . ... ...........
lowQualScore : 5555555555 55 55 0 0 8888888 33 0000 4 4 4 1 0 5 44 0 8 11111111 8 0 5 333 4 0 5 666666 9 5 5 0 0 1 77 9 0 888 4 44 1 999 0 8 7 7 2 6 1 2 2 2 999 88888888888
consensus : TTTGACTTTTTGATAGAGTATTGATCAAATGAGTCATCTGAACTCTTAACTTGTCCAACTCCTCAAGCAAGAATTTCAACGATTCAGCTC----------CAGATAT--ATAT--TATATTTT-AACTTC-AACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATCATCTTCAGTCTGGCAATCATATATTTT-------GTGCTACAACTCCAGTCAA--TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGTT----ATGATTTATGGATAACGAAACGCATTCAGCACAAAATGTTCCT-GATTGTCCGAGA-A-TATACAACAC-A-TATCCATAACTC--TTTGTCCAGANCAAAACAAACATGACCTACTTATAGATTTACGCGTATATCGACTTG-------AGTTATGTTCGATTCTCATATAGCTTTCAATCAACAATATAAATNATC-AATTAAATAGCATTATAAACGGTNTTGCGTGACCTAGATTTAATCAATCTAAAAA-ATACAACACAG----AAACACAACAAACATAACGGTCGGATGACCTAATTAACCG-TTA-AA-TATGTTTGNA-TAAACTAATTAGCAGCAAAAATTGAGTAGCAATACAACAGTATATGATAAGGGTAA--ATATATATATGAAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGCGGT-GGAT---CTGTACATCA-ACATCAAAACACTGCTTGCATAAGATGACAGATTGGCGCG--TTTTTCTGTA-CAACAACAAANATAGCCCCGAACCTAATTTCNTTATTTTACTATCAAAATTAAAAGAGGACAATCCGTAGTGAATAAAATTNCACTAACAATCACTATT-TACTCAA-ACTACGAGTTATTATATCGAAAACATGTCAAT-ATTTCACCCCGTTAATGATT---ACA-T-TG-TTACAGTCGAATGGTGTTAGAGATTATA
Reference ( family-630 ) : TTTGACTTTTTGATAGAGTATTGATCAAATGAGTCATCTGAACTCTTAACTTGTCCAACTCCTCAAGCAAGAATTTCAACGATTCAGCTC----------CAGATAT--ATAT--TATATTTT-AACTTC-AACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATCATCTTCAGTCTGGCAATCATATATTTT-------GTGCTACAACTCCAGTCAA--TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGTT----ATGATTTATGGATAACGAAACGCATTCAGCACAAAATGTTCCT-GATTGTCCGAGA-A-TATACAACAC-A-TATCCATAACTC--TTTGTCCAGANCAAAACAAACATGACCTACTTATAGATTTACGCGTATATCGACTTG-------AGTTATGTTCGATTCTCATATAGCTTTCAATCAACAATATAAATNATC-AATTAAATAGCATTATAAACGGTNTTGCGTGACCTAGATTTAATCAATCTAAAAA-ATACAACACAG----AAACACAACAAACATAACGGTCGGATGACCTAATTAACCG-TTA-AA-TATGTTTGNA-TAAACTAATTAGCAGCAAAAATTGAGTAGCAATACAACAGTATATGATAAGGGTAA--ATATATATATGAAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGCGGT-GGAT---CTGTACATCA-ACATCAAAACACTGCTTGCATAAGATGACAGATTGGCGCG--TTTTTCTGTA-CAACAACAAANATAGCCCCGAACCTAATTTCNTTATTTTACTATCAAAATTAAAAGAGGACAATCCGTAGTGAATAAAATTNCACTAACAATCACTATT-TACTCAA-ACTACGAGTTATTATATCGAAAACATGTCAAT-ATTTCACCCCGTTAATGATT---ACA-T-TG-TTACAGTCGAATGGTGTTAGAGATTATA
gi|89394 : TTTGACTTTTTGATAGAGTATTGATCAAATGAGTCAACTGAACTCTTAACTTGTCCAACTCCTCAAGCAAGAATTTCAACGATTCAGTTC----------CAGATAT--ATAT--TATATTTT-AACTTC-AACTCCAGATTCTGTTTTTCCATGAATCATCTTCAGTCTGGCAATCATATATTTT-------GTGCTACAACTCCAGTCAA--TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGTA----ATGATTTATGGATAACGAAACACATTCAGCACAAAATGTTCCT-CATTGTCCGAGA-A-TATACTACACAA-TATCCAGAACTC--TTTGTCCAGAACAAAACAAACATGACCTACTTACAGATTTACGTGAATATCGACTTT-------AGTTATGTTCGATTCTCATAAAGCTTTCAATCAACAATATAAATTATC-A----------ATTATAAACGGTTTTGCGTGACCTAGATTTAATCAATCTAAAAA-ATACAACACAG------ACACAACAAACATAATGGTCAGATGACCTAATTAACGG-TTA-AA-TATGTTTGGA-TAAACTAATTAGCAACAAAAATTGAGTAGCAATACAACAGTATATGATAAGGGTAA--ATATATATATGAAATAATGAATGTATATATAAATCAATTACTTTGAGTGGT-GGAT---TTGTACATCA-ACATCAAAACACTGCTTGCATAAGATGACAGATTGGCGCGTTTTTTTCTG-A-CAACAACAAAAATAGCCCTGAACCTAATTTCTTTATTTTACTATCAAAATC-AAAGAAGACATTCAATAGTGAATGAAATTACACTAACAATCTCTTTT-TACTCAA-ACTATAACTTATTATATCGAAAACATGTCAAT-ATTTCACCCTGTCAATGATT---ACA-CGTGATTACAGTTGAATGGTGTTAGAAATTATA
gi|89395 : TTTTACTTTTTGATAGAGTATTGATCAAA-GAATCATCTGAACTCTTAACTTGTCCAACTCCTCAAGCAAGAATTTCAACGATTCAGTTC----------CAGATAT--ATAT--TATATTTT-AACTTC-AACACCAGACTTTGTTTTTTCATAAATCATCTTCATTCTGGCAATCATATATTTT-------ATGCTACAACTCCAGTCAAA-TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGTA----ATAATTTATGGATAACGAAATGCATTCAGCACCAAATGTTCCT-GATTGTCCAAGA-A-TATACCACAC-ACTATCCAGAACTC--TTTGTCCAGAACAAAACAAACATGACCTACTTACAGATTTACGTGAATATCGACTTT-------AGTTATGTTCGATTCTCAAAAAGCTTTCAATCAACAATATAAATTATCCAATTAATT-GCATTATAAACGGTTTTGCGTGACCTAGATTTAATCAATCTAAACA-ATTCAACACAG----A--CACAACAAACATAACGGTCAGATGACCTAATT--CCACTTG-AA-TATGTTTGGA-TAAACTAATTAGCAGCAAAAATTGAGTAGCAATACAACAGTATATGATAAGGGTAA--ATATATATATGAAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGTGGT-GGAT---CTGTACATCA-ACATCAAATCACTGCTTACATAAGATGACAGATTGGCGCT--TTTTTCTGT--CAACAACAAAAATAGCCCTGAACCTAATTTCTTTATTTTACTATCAAAATC-AAAGAGGACATTCAATAGTGAATGAAATTACACTAACAATCACTTTT-TACTCAA-ACTACGAGTTATTATATCGAAAACATGTCAAT-ATTTCACCCTGTCAATGATT---ACACC-TGATTACAATCGAATGATGTTAGAGATTATA
gi|89396 : TTTGACTTTTTGATAGAGTATTGATCAAATGAGTCACCTAAACTCTTAACTTGTCCAACTCTTGAAGCAAGAATTTTAACGATTCAGTTC----------CAGATAT--ATAT--CATATTTTTAACATC-AACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATTATCTTCAGTCTGGCAATCATATATTTT-------GTATTACAACTCCAGTCAA--TCTTAATATCTCCAGTTCAATAGTA----ATGATTTATGGATAACTAAATGCATTCAGCAC-AAATTTTCCT-GATTGTCCGAGA-A-TATACCATACGA-TATCCAGAACTC--TTTGTTCAGAACAAAACAAACATGACCTACTTACAGATTTACGTGAATATCGACTTT-------AGTTATGTTCGATTCTCACAAAACTTTCAATCAACAATATAAATTATC-AATT-AATTGCATTATAAACGGTTTTGCGTGACCAAGCTTTAATCAATCTAAAAA-ATACAACACAG------ACACAATAAACATAACGGTCGGATGACCTAATTAACGG-TTG-AA-TATGTTTGAA-TTAACTAATTAGCAGCAAAAATTGAGTAGCATTACAACAGTATATGATAAGGGTAA--CTATATATATGAAATAATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGCGGT-TGAT---CTGTACATCA-ACATCAAAACACTGCTTGCATAAGATGACAGATTGGTGCG--TTTTTCTGT--CAACAACAAAAATAGCCCCGAACCTAATTTCTTTATTTTACTATCAAAATC-AAAGAAGACATTCAATAGTGAATGAAATTACACTTACATTCACATTT-TACTCAA-AATACGAGTTATTATATCGAAAACTTGTCAAT-ATTTCACCCTGTCAATGATT---ACACC-TGATTACAGTCGAATGATGTTAGAGATTATA
gi|89397 : TTCGACTTTTTGATAGAGTATTGATCAAATGAGTCACCTGAACTCTTAACTTGTCCAACTCCTCAAGCAAGAAATTCAACGATTCAGTTCTATATATATATATATAT--ATAT--TATATTTT-AACTTC-AACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATCATCTTTAGTCTGGCAATCATATATTTT-------ATGCTACAACTCCAGTCAA--TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGAA----ATGTTCAAAGGATAACGAAACACATTCAGCACAAAATGTTCCT-GATTGTCCGAGA-A-TATATCACAC-ATTATCCAGAATTC--TTTGTTCAGAACAAAACAAACATGACCTACTTACAGATTTACGTGAATATCGACTTT-------AGTTATGTTCGATTCTCATAAAG-TATCGATCAATTATATAAATTATC-AATT-AATTGCATTATGAACTGTTTTGCTTGACCTAAATTTAATCAATCTAAAAA-ACACAACACAG------ACACAACAAACATTACGGTTGGATTACCTAATTAACGG-TTA-AA-TATGTTTGGA-TA----AATTAGCAGCAAAAATTGAGTAGCAAATCAACAGTATATGATAAGGGTAAATATATATATATGAAATTATGAATGTATACTTAAAACAATTACTTTGAGCGGT-GGAT---CTGTACATCA-ACAACAAAACACTGCTTGCATAAGATGACAGATTGGCACG--TTTTTCTGT--CAACATCAAAAATAGCCCCGAACCTAATTTCTTTATTTTACTATCAAAATC-AAAGAGGACATTCAATAGTGAATGAAATTACACTAACAATCACTTTT-TACTCAA-ACTAGGAGTTATTATATCGAAAACATGTCAAT-ATTTCACCCTGTCAATGATT---ACACC-TGATT--AGTCGAATGATGTTAGAGATTATA
gi|89398 : TTTGACTTTTTGACAGAGTATTGATCAAATGAGTCATTTGAACTCTTAACTTGTCCAACTCCTATAGCAAGAATTTCAACGATTCAGTTC----------CAGATATATATAT--TATATTTT-AAGTTC-AACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATCATCTTCAGTCTGGCAATCATATATTTT-------GAGCTACAACTCCAGTCAA--TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGTA----ATGATTTATGGATAACGAAACGCATTCAGCACAAAATGTTCCT-GATT------GATA-TATACCATAC-ATTATCCAGAACTCTTTTTGTCCAGAACAAAACAAACATGACCTACTTACAGATTTACGTGAATATCTACTTT-------AGTTATGTTCAATTCTCATAAAGCTTTCAATCAACAATATAAATTATC-AATT-AATTGTATTATAAACGGTTTTGCATGACCTAGATTTAATCAATCTAAATA-ATACAACACAG------ACACAACAAACACAACGGTCGGATGACCTAATTAACGG-TTA-AA-TATGTTTGGA-TAAACTAATTAGCAGCAAAAATTGAGTAGCAATACAACAGTATATG---------A--ATGTAT--------------------ATTTAAATAAATAACTTTGAGCGGT-GGAT---CTGTACATCA-ACATCAAAACACTGCTTGCATAAGATCACAGATTGGTGCG--TTTTTCTGT--CAACAACACAAATAGCCCCGAATCCAATTTCTTTATTTTACTATAAAAATC-AAAGAGGACATTCAATAGTGAATGAAATTACACTAACAATCACTTTT-TACTCAA-ACTACGAGTTATTATATCGAAAACATGCCTAT-ATTTCACCCAGTCAATGATT---ACA-TCTGATTACAGTCGAATGATGTTAGAGATTATA
gi|89399 : TCAAATGAGTCACCTGAACTCTAAACTTGTCGAACTCCTCAAGGAAGAATTTCAACCATTCAGCTT----------CAGATAT--ATAT--TATGTTTT-GACTTC-AACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATCAT------------GATCATATATTTT-------GTACTACAACTCCAGTCAA--TTTTAATATCTCCAGTTCAACAGTT----ATGATTTATGGATAACGAAACGCATTCAGCACAAAATGTTCCT-GATTGTCCTAGA-A-TATACCACAC-A-TATCCATAACTC--TTTGTCCAGAACAAAACAAACATGATCTACTTACAGATTTACGTGAATATCTACTTT-------AGTTATGTTCGATTCTCATATAGCTTTCAATCAATAATATAAATTATT-AATC-AATAGCATTATTAACGGTTTTGCGTGACCTAGAATTAATCAATCTAAAAA-ATACAACACAG----AAACACAACAAACATAACGGTCGGATGACCAAATTAACGG-TTA-AA-TATGTTTGGA-TAAACCGATTAGCAGCAAAAATTGATTAGCAATACAACAGTATATGATAAGGGTAAATATATATATATGAAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGCGGT-GAAT---CTCTTTATCA-ACATAAAAACACTGCTTGCATAAGATAACAGATTGGCGCG--TTTTTCTGT--CAACAACAAAAATAGCGCCGAACCTAATTTCTTTATTTTACTATCAAAATC-AAAGAGGACATTCAGTAGTGAATGAAATTACACAAACAATCACTATT-TACTCAT-ACTATGCGGTATTATATCGAAAACATGTCAAT-ATTTCATCACGTTAATGATT---ACACC-TGCTTACAGTCGAATGATGTTAGAGATTATA
gi|89400 : TCATATGAGTCATCTGAACTCTGAACTTGTCCAACTCCTCAAGCAAGAATTCCAATGATTCAGCTC----------CAGATAT--ACAT--TATGTTTT-ATCTTCGAACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATCATCTTCAGTCTGGCAATCATATACTTT-------GTGCTACAACTCCAGTCAA--TTTTAATATGTCCAGTTCAGTAGTT----TTGATTTATGGATAATGAAACGCATCCAGCACAAAATGTTCCA-GATTCTCTGAGA-A-TATATGACAC-A-TATCAATAACTC--TTTGTACAGAACAAAACAAACATGACTTACTTATAGATTTAGGTGTATATTGACTTT-------AGTTATGTTCGATTCTCATATAGCTTTCAATCAACAATATAAATTATA-CATT-AATAGCATTATAAACGGTTTAGCGTGACCTAGATTTAATCAATCTAAACA-ATACAACACAGTTCTAATCACAACAAAGATAACAGTCAGATGACCTAATTAACGG-TTA-AA-TATGTTTTAATTAAACTAATTAGCAGCAAAAATTGGGTAGCAATACAACATTATATGATAAGGGTAA--ATATATAAATGAAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGCGGT-GGAT---CTGTTCATCA-ACATCAAAACACTGCTTGCATAAGATGGCAGATTGGCGTG--TTTTTTT-TATCAACAACAAAAATAGCACCGAACATAATTTCTTTATTTTACTATCAAAATTAAAAGAGGACATTCCG-AGT------------------------TATTATATCGAA-A--ACATGTTAATATTTC---ACCCCGTTAATGATTACACC-------TGATT---A-----------CAGTCAAATGATGTTAGAGATTATA
gi|89401 : TCAAATGGGTCATCTGAACTCTTAACTTGTTCAACTCCTTAAGCAAGAATTTCAACGATTCAGCTC----------CAGATAT--ATATATTATGTTTT-AACTTT-AACTCAAGATTTC---TTTCCATGAATTATCTCCAGTCTGGCAATCATATAGTTT-------GTGCTACAACTCCAGTCAAAATTTTAATATCTCCAGTTCAATAGTT----ATAATTTATGGATAACGAAACGCATTCAGCACAAAATGT-----------CTGAGA-A-TATAGAACAC-A-TATCCGTAAGTC--TTTGTCCAGAACAAAACAAACATGACCTACTTAAAGGTTTACGTGTATATCGACTTGTGACTTTAGTTATGTTCGATTCTCATATAGCTTTCAGTCAACAATATAAATTATC-AATT-AATGGCATTATAAACGGTTTTGTGTGACATAGATTTAATCAATCTAAAAATATATAACACCG----AAACACAACAAACATAACGGTCGGAT-------------G-TTA-AA-TATGTT
gi|89402 : TCAAATGAGTCATCTGAACTCTTAACTTGTCCAACTCCTCAAGCAAGAATTTCAACGTTTCAGCTC----------CAGATAT--ACAT--TATGTTTT-AACTTG-AACTCCAGATTATGTTTTTCCATTGATCATCTTCAGGCTGGCAATCATATATTTT-------GTGCTACAACTCCAGTCAA--TTTTAATATCTCCAGTCC
gi|89403 : AACTCCTCAAGCAAGAATTTCAACGATTCAGCTC----------CAGATAT--ATAT--TATATTTT-AACTTCGAACTCCAGATTTTGTTTTTCCACGAATCATCTTCAGTCTGGCAATCATATATTTT-------GTGCTACAACTCCgtcgtaaattt
gi|89404 : ATGTATTTTTAAATGTGTGTTACAAATCCAGTCAA--TT----TATCTCCGGTTAAATAGTTTTAAATGATTTATAAATAATGTATTGCATTCAACACAAAATGTTCCTCTTTTCTCCGAGA-AGTAT
gi|89405 : TACAACTTCAGTCAA--TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGTT----ATGATTTATGGATAACGAAACGCATTCAGCACAAAATGTTCCT-GATTGTCCAAGA-A-TATACAACAC-A-TATCCATAACTC--TTTGTCTAGACCAAAACAAACATGACCTATTTATAGATTTACGCGTATATTGACTTG-------AGTTATGTTCGATTCTCATATAGCTTTCAATCATCAATATAAATAATC-AA-TAAATAGCATTATAAACGGTGTTGCATGACCTAGATTTAATCAATCTAAAAA-ATACAACACAG----AAACACAACAAACATTACGGTCGGATGACCTAATTAACCG-TTA-AACTCTGCTTGCA-TAA
gi|89406 : TACAACTCCAGTAAA--TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGTT----ATGATTGATGGATAAGGAAACGCATTCAGCACAAAATGTTCCT-GATTGTCCGAGA-A-TATACAACAC-A-TATCCATAACTC--TTTGTCTAGACCAAAACAAACATGACCTACTTATAGATTTACGCGTATATTGACTTG-------AGTTATGTTCGATTCTCATATAGCTTTCAATCATCAATATAAATAATC-AA-TAAATAGCATTATAAAGGGTGTTGCGTGACCTAGATTGAATCAATCTAAAAA-ATACAACACAG----AAACACAACAAACATAACGGTCGGATGACCTAATTAACCG-TTA-AACTCTGCTTGCA-TAA
gi|89407 : TACAACTCCAGTCAA--TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGTT----ATAATTTATGGATA-CGAAACGCATTCAGCAAAAAATGTTCTT-GATTGTCTGAGA-A-TATACAACAC-A-TATCCATAACTC--TTTGTCTAGACCAAAACAAACATGACCTACTTATAGATTTACGCGTATATTGACTTG-------AGTTATGTTCAATTCTCATATAGCTTTCAATCATCAATATAAATAATC-AA-TAAATAGCATTATAAACGGTGTTGCGTGACCTAGATTTAATCAATCTAAAAA-ATACAACACAG----AAACACAACAAACATAACGGTCGGATGACCTCATTAACCG-TTA-AATTCTGATTGCA-TAA
gi|89408 : TACAACTCCAGTCAA--TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGTT----ATGATTTATGGATAACGAAACGCATTCAGCACAAAATTTTCCT-GATTGTCCAAGA-A--ATACAACAC-A-TATCCATAACTC--TTTGTCTAGACCAAAACAAACATGACCTACTTATAGATTTACGCGTATATTGACTTG-------AGTTATGTTCGATTTTCATATAGCTTTCAACCATCAATATAAATAATC-AA-TAAATAGCACTATAAATGGTGTTGCGTGACCTAGATTTAATCAATCTAAAAA-ATACAACACAG----AAACACAACAAACATAA----CGGATGACCTAATTAACCG-TTA-AACTCTGCTTGCA-TAA
gi|89409 : TACAACTCCAGTCAA--TTTTAATATCTCCACTTCAGTAGTT----ATGATTTATGGATAGCGAAACTCATTCAGCACAAAATGTTCCT-GGTTGTCCGAGA-A-TATACAACAC-A-TATCCATAACTT--TTTGTCTGGACCAAAACAAACATGACCTACTTATAGATGTACATGTATATTGACTTG-------AGTTATGTTCGATTCTCATATAGCTTTCAATCAACAATAAAAATAATC-AA-TAAATAGCATTATAAATGGTGTTGTGTGACCTAGATTTAATCAATCTAAAAA-ATACAACACAG----AAACACAACAAACATAATGGTCGGATGACCTAATTAACCG-TTATGA-TCTGCTTGCA-CAA
gi|89410 : TACAACTCCAGTCAA--TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGGT----ATGATTTATGGATAACGAAATGCATTCAGCACAAAATGTTCCT-AATTGTCCGAGA-A-TATACAACA--------CATAACTC--TTTGTATAGACCAAAACAAACATGACCTACTTATAGATTTACGTGTATATTGAC-CG-------AGTTATGTTCAATTCTCATATAGGTTTCAATTAACAATATAAATAATC-AATT-AATAGCATTATAAACAGTGTTGCATGACCTAGATTTAATCAATCTAAAAA-ATACAACACAG----AAACACAACAAACATAACGGTCAGATTACCTAATTAACCG-TTA-AA-TATGTT
gi|89411 : TACAACTCCAGCCAA--TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGTT----ATGATTTATGGATAACGGAACACATTCATCACAAAATGTTCCT-GATTGTCCTAGA-A-TATACAACAC-A-TATCCATAACTC--TTTGTCTAGACCAAAACAAACATGACCTACTTATAGATTTATGCGTATATTGACTTG-------ATTTATG-----------TAAAGCTTTCAATCAACAATATAAATAATC-AA-TAAATAAATTTATAAACGGTGTTGTGTGACCTAGATTTAATCTATCAAAAAA-ATACAACACAG----AAACACAACAAACATAACGGTCGGATGACCTAATTAACTG-TTA-AA-TATGTT
gi|89412 : TACAACTCCAGTCAA--TTTTAATATCTCAAGTTCAATGGTT----ATGATTTATGGATAACGAAACGCATTTAGCACAAAATGTTCCT-GTTTGTCCGAGA-A-TATACAACAC-A-TATCCATTACTC--TTTGTCTAGACCAAAACAAACATGACCTACTTATAGATTTACGCGTATATTGACTTG-------AGTTATGTTCGATTCTCATATAGCTTTCAATCATCAATATAAATAATC-AA-TAAATAGCATTTTAAACGGTGTTGCGTGACCTAGATTTAATCAATCTAAAAA-ATACAACACAG----AAACACAACAAACATAACGGTC
gi|89413 : AACGGTCGGATGACCTAATTAACCG-TTA-AC-TCTGCTTGCA-TAA
gi|89414 : AACGGTCGGATGACCT---CATTA-ACCGTTAAATTCTGATTGCATAAGATGACAGATTGGCGCG--TTTTTCTATA--AACAACAAATGAAGCCCCGAACCTTATTTCATTATTTTACTATCAAAATTAAAAGAGGACAATCGGTAGTGAATAAAATTTCACTAACAATTACTTTT-TACTCAA-ACTACGAGTTATTATATCGAAAATATGTCAAT-ATTTCACCCCATTAATGATT---ACA-T---------GTCGAATGGTGTTAGAGAT
gi|89415 : TGTACATCATAC-TAAAAACACTGCTTGCATAAGATGACAGGTCGGCGCG--TTTTTCTAT--CAACAACAAAAATAGCAT-GAGCCTATATTCTTTATTTTACTATCAGAATTACAAGAGGACAATCCGTAGTGAATAAAATTACACTGACAATCACTATT-TACTCAA-ACTACGAGTTATAATATCGAGAATATGTCAAT-ATTTCACCCCGTTAATTATT---ACACC-TGATTACAGTCGAATGGTGTTAGAGATTATA
gi|89416 : CATCAATACACTGCTTGCATAAGATGACAGATT-GCGCG--TTTTTCTGTA--AACAACAAATGT-----CAAA--------------------ATCAA------AAGAGGACAATCTGTAGTAAATAAAATTTCACTAACAATCACTATT-TACTCAA-ACTACGAGTTAATATATCAAAAACATGTCAGT-ATTTCACCCTATTAATGATT---GC
gi|89417 : CATCAATACACTGCTTGCATAAGATGACAGATTGGCGCG--TTTTTCTATA--AACAACAAATGTAGCCCCGAACCTAATTTCGTTATTTTACTACCAAAATTAAAAGAGGACAATCCGTATTT-ATAAAATTTCACTAACAATCACTATT-TATTCAA-ACTACGAGTTATTGTATCGAAAACA-GTCAAT-ATTTCGCCCCATTAATTATT---ACA-T---------GTTGAATGGTGTTAGAGAGTATA
gi|89418 : AAACTCTGCTTGCATAAGATGACAGATTGGCGCG--TTTTTCTATA--AACAACAAATGCAGCCCCGAACCTAATTTCGTTATTTTACTATCAAAATTAATAGAGGACAATCCGTAGTGAATAAAATTTCACTAACAATTACTATT-TACTCAA-ACTACGAGTTATTATATCGAAAATATGTCAAT-ATTTCACCCCATTAATGATT---ACA-T---------GTCGAATGGTGTTAGAGATTATA
gi|89419 : AAACTCTGCTTGCATAAGATGACAGATTGGCGCG--TTTTTCTATA--AACAACAAATGTAGCCCCAAACCTAATTTCATTATTTTACTATCAAAATTAAAAGAGGACAATCCGTAGTGAATCAAATTTCACTAACAATTACTATT-TACTCAA-ACTACGAGTTATTATATCGAAAATATGTCAAT-ATTTCACCCCATTAATGATT---ACA-T---------GTCGAATGGTGTTAGAGATTATA
gi|89420 : AAACTCTGCTTGCATAAGATGACAGATTGGCGCG--TTTTTCTATA--AACAACAAATGTAGCCCCGAACCTAATTTCGTTATTTTACTATCAAA-TTAAAAGAAGACAATCCGTAGTGAATAAAATTTCACTAACAATTACTTTT-TACTCAA-ACTACAAGTTATTACATCGAAAATATGTCAAT-ATTTCACCCCATTAATGATT---ACA-T---------GTCGAATGGTGTTGG
gi|89421 : AACTCTGCTTGCATAAGATGACAGATTGGCGCG--TTTTTCTATA--AACAACAAATCTAGGCCCGAATCTAATTTCGTTATTTTACTATCAAAATTAAAAGGAGACAATCCGTAGTGAATAATATTTCACTAACAATTACTATT-TACTCAA-ACTACGAGTTATTATATCGAAAATGTGTCAAT-ATTTCACCCCATTAATGATT---ACA-T---------GTCGAATGGTGTTAGAGATAATA
gi|89422 : CTGCTTGCACAAGATGACAGATTGGCGCG--TTTTTTTATA--AACAACAAATAGAGCCCCGAACCTAATTTCGTTATTTTACTATCAAAATTAAAAGAGGACAATCCGTAGTGAATAAAATTTAACT---AATCACTATT-TACTCAA-ACTACAAGTTATTTTTTCGAAAACATGTCAAT-ATTTCACCCCATTAATGATT---ACA-T---------GTCGAATGGTGTTAGAGATTATA
gi|89423 : TCGTTTTTTTACGATCAAAATTAAAAGAGGACAATTTCTAGTGAATAAAAT------AACAATCACTATT-TACTCAA-ATAACGAGTTGTTATATCGAAAACATGTCAAT-ATCTCACCCCATTAATGGTT---ACA-T---------GTTGAATGGTGTTAGAGATTATA
gi|89424 : CTTACAAACGCTATT-TGCTCATTCCTATGCGTTATAAAATCGGCAACATGTCAAT-GTTTCATCCCG----TGATTTAAAGA-T-GC-TTACAACCGAATTACAATAGAGATTTTA
blockSeqs : TATATATATA AT AT T G TAAATGT AA TTAA C T G C G C TT A GTGACTTT T C TTA T T T TTCTAA C C T C G T AT T C GAC T . G ATC A T A T A A T A T G TAA CCTGATTACA
blockSeqs : . . . . G . A . . . . C . T . A T T . TT T T . AA G . . C A . AT A . . . . G C A T A T A A T . . . . CCTGATTACA
blockSeqs : . . . . . . . . . . . C . T . A T T . TT T T . AA G . . T G . . T . . . . G C A T A T A A T . . . . TCTGATTACA
blockSeqs : . . . . . . . . . . . C . . . A T T . TT A T . AA G . . C G . . T . . . . G C A T A T A A T . . . . CCTGCTTACA
blockSeqs : . . . . . . . . . . . C . . . A T T . TC A T . AA G . . . G . . T . . . . G C A T A T A A A . . . . CCTGATTACA
blockSeqs : . . . . . . . . . . . G . . . A T T . TT G T . AA G . . . A . . . . . . . A C A T A T C T A . . . . CCTGATTA
blockSeqs : . . . . . . . . . . . A . . . A T T . TT A T . AA C . . . C . . . . . A A T A A A G A T . . . . TGCTTACA
blockSeqs : . . . . . . . . . . . A . . . C G A . TA A G . AA C . . . C . . . G C A T A A C T A . . . . CA
blockSeqs : . . . . . . . . . . . A . . . C G A . TA A G . AA C . . . C . . A A T G A A T T A . . . . T
blockSeqs : . . . . . . A . . . C G A . TA A G . AA C . . . C . . A A T G A A C T A . . . . T
blockSeqs : . . . . . A . . . C G A . TA A G . AA C . . . C . . A A T A . A C T A . . . . T
blockSeqs : . . . . . A . . . C G A . TA A G . A C . . . C . . A A T G . A C T A . . . . T
blockSeqs : . . . . . A . . . C G A . TT A G . . T . . . . A A T G . A C T T . . . . T
blockSeqs : . . . . . A . . . C G A . TA A G . . C . . . . A A T G . A C T A . . . . T
blockSeqs : . . . . . A . . . C G A . TA . G . . . . . . . . A T G . A C . A . . . . T
blockSeqs : . . . . . . . A T . A . . . . T
blockSeqs : . A . . . .
blockSeqCons : TN* AA**** ** A** TGTTCA*****
originalCons : TTTGACTTTTTGATAGAGTATTGATCAAATGAGTCATCTGAACTCTTAACTTGTCCAACTCCTCAAGCAAGAATTTCAACGATTCAGCTC----------CAGATAT--ATAT--TATATTTT-AACTTC-AACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATCATCTTCAGTCTGGCAATCATATATTTT-------GTGCTACAACTCCAGTCAA--TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGTT----ATGATTTATGGATAACGAAACGCATTCAGCACAAAATGTTCCT-GATTGTCCGAGA-A-TATACAACAC-A-TATCCATAACTC--TTTGTCCAGANCAAAACAAACATGACCTACTTATAGATTTACGCGTATATCGACTTG-------AGTTATGTTCGATTCTCATATAGCTTTCAATCAACAATATAAATNATC-AATTAAATAGCATTATAAACGGTNTTGCGTGACCTAGATTTAATCAATCTAAAAA-ATACAACACAG----AAACACAACAAACATAACGGTCGGATGACCTAATTAACCG-TTA-AA-TATGTTTGNA-TAAACTAATTAGCAGCAAAAATTGAGTAGCAATACAACAGTATATGATAAGGGTAA--ATATATATATGAAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGCGGT-GGAT---CTGTACATCA-ACATCAAAACACTGCTTGCATAAGATGACAGATTGGCGCG--TTTTTCTGTA-CAACAACAAANATAGCCCCGAACCTAATTTCNTTATTTTACTATCAAAATTAAAAGAGGACAATCCGTAGTGAATAAAATTNCACTAACAATCACTATT-TACTCAA-ACTACGAGTTATTATATCGAAAACATGTCAAT-ATTTCACCCCGTTAATGATT---ACA-T-TG-TTACAGTCGAATGGTGTTAGAGATTATA
finalCons : TTTGACTTTTTGATAGAGTATTGATCAAATGAGTCATCTGAACTCTTAACTTGTCCAACTCCTCAAGCAAGAATTTCAACGATTCAGCTC----------CAGATAT--ATAT--TATATTTT-AACTTC-AACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATCATCTTCAGTCTGGCAATCATATATTTT-------GTGCTACAACTCCAGTCAA--TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGTT----ATGATTTATGGATAACGAAACGCATTCAGCACAAAATGTTCCT-GATTGTCCGAGA-A-TATACAACAC-A-TATCCATAACTC--TTTGTCCAGANCAAAACAAACATGACCTACTTATAGATTTACGCGTATATCGACTTG-------AGTTATGTTCGATTCTCATATAGCTTTCAATCAACAATATAAATNATC-AATN-AATAGCATTATAAACGGTNTTGCGTGACCTAGATTTAATCAATCTAAAAA-ATACAACACAGAA----ACACAACAAACATAACGGTCGGATGACCTAATTAACCG-TTA-AA-TATGTTTGNA-TAAACTAATTAGCAGCAAAAATTGAGTAGCAATACAACAGTATATGATAAGGGTAA--ATATATATATGAAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGCGGT-GGAT---CTGTACATCA-ACATCAAAACACTGCTTGCATAAGATGACAGATTGGCGCG--TTTTTCTGTA--AACAACAAANATAGCCCCGAACCTAATTTCNTTATTTTACTATCAAAATTAAAAGAGGACAATCCGTAGTGAATAAAATTNCACTAACAATCACTATT-TACTCAA-ACTACGAGTTATTATATCGAAAACATGTCAAT-ATTTCACCCCGTTAATGATT---ACATGTTCA-----GTCGAATGGTGTTAGAGATTATA
Alignments
lowQualScore : 1111111111 1111111 11111 1 11 6666666666666666
lowQualScore : 7777777777 55 55 4 8 1111111 2 33 5555 2 2 2 1 5 7 33 1 0 99999999 0 1 2 1 1 2 11111 1 2 2 0 1 3 55 1 5 888 4 55 3 1 1 9 1 2 2 1 2 2 2 333 6666666666666666
lowQualScore : .......... .. .. . . ....... . .. .... . . . . . . .. . . ........ . . . . . . ..... . . . . . . .. . . ... . .. . . . . . . . . . . . ... ................
lowQualScore : 5555555555 55 55 0 0 8888888 2 11 0000 4 4 4 1 0 5 44 0 8 11111111 8 0 5 9 0 5 66666 9 5 5 0 0 1 77 9 0 888 4 99 0 0 8 7 7 2 6 1 2 2 2 999 1111111111111111
consensus : TTTGACTTTTTGATAGAGTATTGATCAAATGAGTCATCTGAACTCTTAACTTGTCCAACTCCTCAAGCAAGAATTTCAACGATTCAGCTC----------CAGATAT--ATAT--TATATTTT-AACTTC-AACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATCATCTTCAGTCTGGCAATCATATATTTT-------GTGCTACAACTCCAGTC-AA--TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGTT----ATGATTTATGGATAACGAAACGCATTCAGCACAAAATGTTCCT-GATTGTCCGAGA-A-TATACAACAC-A-TATCCATAACTC--TTTGTCCAGANCAAAACAAACATGACCTACTTATAGATTTACGCGTATATCGACTTG-------AGTTATGTTCGATTCTCATATAGCTTTCAATCAACAATATAAATNAT-CAATNAATAGCATTATAAACGGTNTTGCGTGACCTAGATTTAATCAATCTAAAAA-ATACAACACAG----AAACACAACAAACATAACGGTCGGATGACCTAATTAACCG-TTA-AA-TATGTTTGNA-TAAACTAATTAGCAGCAAAAATTGAGTAGCAATACAACAGTATATGATAAGGGTAA--ATATATATATGAAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGCGGT-GGAT---CTGTACATCA-ACATCAAAACACTGCTTGCATAAGATGACAGATTGGCGCG--TTTTTCTGTNAACAACAAANATAGCCCCGAACCTAATTTCNTTATTTTACTATCAAAATTAAAAGAGGACAATCCGTAGTGAATAAAATTNCACTAACAATCACTATT-TACTCAA-ACTACGAGTTATTATATCGAAAACATGTCAAT-ATTTCACCCCGTTAATGATT---ACA--T---G-T--T--CAGTCGAATGGTGTTAGAGATTATA
Reference ( family-630 ) : TTTGACTTTTTGATAGAGTATTGATCAAATGAGTCATCTGAACTCTTAACTTGTCCAACTCCTCAAGCAAGAATTTCAACGATTCAGCTC----------CAGATAT--ATAT--TATATTTT-AACTTC-AACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATCATCTTCAGTCTGGCAATCATATATTTT-------GTGCTACAACTCCAGTC-AA--TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGTT----ATGATTTATGGATAACGAAACGCATTCAGCACAAAATGTTCCT-GATTGTCCGAGA-A-TATACAACAC-A-TATCCATAACTC--TTTGTCCAGANCAAAACAAACATGACCTACTTATAGATTTACGCGTATATCGACTTG-------AGTTATGTTCGATTCTCATATAGCTTTCAATCAACAATATAAATNAT-CAATNAATAGCATTATAAACGGTNTTGCGTGACCTAGATTTAATCAATCTAAAAA-ATACAACACAG----AAACACAACAAACATAACGGTCGGATGACCTAATTAACCG-TTA-AA-TATGTTTGNA-TAAACTAATTAGCAGCAAAAATTGAGTAGCAATACAACAGTATATGATAAGGGTAA--ATATATATATGAAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGCGGT-GGAT---CTGTACATCA-ACATCAAAACACTGCTTGCATAAGATGACAGATTGGCGCG--TTTTTCTGTAAACAACAAANATAGCCCCGAACCTAATTTCNTTATTTTACTATCAAAATTAAAAGAGGACAATCCGTAGTGAATAAAATTNCACTAACAATCACTATT-TACTCAA-ACTACGAGTTATTATATCGAAAACATGTCAAT-ATTTCACCCCGTTAATGATT---ACA--T---G-T--T--CAGTCGAATGGTGTTAGAGATTATA
gi|89394 : TTTGACTTTTTGATAGAGTATTGATCAAATGAGTCAACTGAACTCTTAACTTGTCCAACTCCTCAAGCAAGAATTTCAACGATTCAGTTC----------CAGATAT--ATAT--TATATTTT-AACTTC-AACTCCAGATTCTGTTTTTCCATGAATCATCTTCAGTCTGGCAATCATATATTTT-------GTGCTACAACTCCAGTC-AA--TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGTA----ATGATTTATGGATAACGAAACACATTCAGCACAAAATGTTCCT-CATTGTCCGAGA-A-TATACTACACAA-TATCCAGAACTC--TTTGTCCAGAACAAAACAAACATGACCTACTTACAGATTTACGTGAATATCGACTTT-------AGTTATGTTCGATTCTCATAAAGCTTTCAATCAACAATATAAATTAT-CA---------ATTATAAACGGTTTTGCGTGACCTAGATTTAATCAATCTAAAAA-ATACAACACAG------ACACAACAAACATAATGGTCAGATGACCTAATTAACGG-TTA-AA-TATGTTTGGA-TAAACTAATTAGCAACAAAAATTGAGTAGCAATACAACAGTATATGATAAGGGTAA--ATATATATATGAAATAATGAATGTATATATAAATCAATTACTTTGAGTGGT-GGAT---TTGTACATCA-ACATCAAAACACTGCTTGCATAAGATGACAGATTGGCGCGTTTTTTTCTGACAACAACAAAAATAGCCCTGAACCTAATTTCTTTATTTTACTATCAAAATC-AAAGAAGACATTCAATAGTGAATGAAATTACACTAACAATCTCTTTT-TACTCAA-ACTATAACTTATTATATCGAAAACATGTCAAT-ATTTCACCCTGTCAATGATT---ACA--C---G-TGATTACAGTTGAATGGTGTTAGAAATTATA
gi|89395 : TTTTACTTTTTGATAGAGTATTGATCAAA-GAATCATCTGAACTCTTAACTTGTCCAACTCCTCAAGCAAGAATTTCAACGATTCAGTTC----------CAGATAT--ATAT--TATATTTT-AACTTC-AACACCAGACTTTGTTTTTTCATAAATCATCTTCATTCTGGCAATCATATATTTT-------ATGCTACAACTCCAGTCAAA--TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGTA----ATAATTTATGGATAACGAAATGCATTCAGCACCAAATGTTCCT-GATTGTCCAAGA-A-TATACCACAC-ACTATCCAGAACTC--TTTGTCCAGAACAAAACAAACATGACCTACTTACAGATTTACGTGAATATCGACTTT-------AGTTATGTTCGATTCTCAAAAAGCTTTCAATCAACAATATAAATTATCCAATTAATTGCATTATAAACGGTTTTGCGTGACCTAGATTTAATCAATCTAAACA-ATTCAACACAG------ACACAACAAACATAACGGTCAGATGACCTAATT--CCACTTG-AA-TATGTTTGGA-TAAACTAATTAGCAGCAAAAATTGAGTAGCAATACAACAGTATATGATAAGGGTAA--ATATATATATGAAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGTGGT-GGAT---CTGTACATCA-ACATCAAATCACTGCTTACATAAGATGACAGATTGGCGCT--TTTTTCTGTCAACAACAAAAATAGCCCTGAACCTAATTTCTTTATTTTACTATCAAAATC-AAAGAGGACATTCAATAGTGAATGAAATTACACTAACAATCACTTTT-TACTCAA-ACTACGAGTTATTATATCGAAAACATGTCAAT-ATTTCACCCTGTCAATGATT---ACACCT---GAT--TA-CAATCGAATGATGTTAGAGATTATA
gi|89396 : TTTGACTTTTTGATAGAGTATTGATCAAATGAGTCACCTAAACTCTTAACTTGTCCAACTCTTGAAGCAAGAATTTTAACGATTCAGTTC----------CAGATAT--ATAT--CATATTTTTAACATC-AACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATTATCTTCAGTCTGGCAATCATATATTTT-------GTATTACAACTCCAGTC-AA--TCTTAATATCTCCAGTTCAATAGTA----ATGATTTATGGATAACTAAATGCATTCAGCAC-AAATTTTCCT-GATTGTCCGAGA-A-TATACCATACGA-TATCCAGAACTC--TTTGTTCAGAACAAAACAAACATGACCTACTTACAGATTTACGTGAATATCGACTTT-------AGTTATGTTCGATTCTCACAAAACTTTCAATCAACAATATAAATTAT-CAATTAATTGCATTATAAACGGTTTTGCGTGACCAAGCTTTAATCAATCTAAAAA-ATACAACACAG------ACACAATAAACATAACGGTCGGATGACCTAATTAACGG-TTG-AA-TATGTTTGAA-TTAACTAATTAGCAGCAAAAATTGAGTAGCATTACAACAGTATATGATAAGGGTAA--CTATATATATGAAATAATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGCGGT-TGAT---CTGTACATCA-ACATCAAAACACTGCTTGCATAAGATGACAGATTGGTGCG--TTTTTCTGTCAACAACAAAAATAGCCCCGAACCTAATTTCTTTATTTTACTATCAAAATC-AAAGAAGACATTCAATAGTGAATGAAATTACACTTACATTCACATTT-TACTCAA-AATACGAGTTATTATATCGAAAACTTGTCAAT-ATTTCACCCTGTCAATGATT---ACACCT---GAT--TA-CAGTCGAATGATGTTAGAGATTATA
gi|89397 : TTCGACTTTTTGATAGAGTATTGATCAAATGAGTCACCTGAACTCTTAACTTGTCCAACTCCTCAAGCAAGAAATTCAACGATTCAGTTCTATATATATATATATAT--ATAT--TATATTTT-AACTTC-AACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATCATCTTTAGTCTGGCAATCATATATTTT-------ATGCTACAACTCCAGTC-AA--TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGAA----ATGTTCAAAGGATAACGAAACACATTCAGCACAAAATGTTCCT-GATTGTCCGAGA-A-TATATCACAC-ATTATCCAGAATTC--TTTGTTCAGAACAAAACAAACATGACCTACTTACAGATTTACGTGAATATCGACTTT-------AGTTATGTTCGATTCTCATAAAG-TATCGATCAATTATATAAATTAT-CAATTAATTGCATTATGAACTGTTTTGCTTGACCTAAATTTAATCAATCTAAAAA-ACACAACACAG------ACACAACAAACATTACGGTTGGATTACCTAATTAACGG-TTA-AA-TATGTTTGGA-TA----AATTAGCAGCAAAAATTGAGTAGCAAATCAACAGTATATGATAAGGGTAAATATATATATATGAAATTATGAATGTATACTTAAAACAATTACTTTGAGCGGT-GGAT---CTGTACATCA-ACAACAAAACACTGCTTGCATAAGATGACAGATTGGCACG--TTTTTCTGTCAACATCAAAAATAGCCCCGAACCTAATTTCTTTATTTTACTATCAAAATC-AAAGAGGACATTCAATAGTGAATGAAATTACACTAACAATCACTTTT-TACTCAA-ACTAGGAGTTATTATATCGAAAACATGTCAAT-ATTTCACCCTGTCAATGATT---ACACCT---G-A--T--TAGTCGAATGATGTTAGAGATTATA
gi|89398 : TTTGACTTTTTGACAGAGTATTGATCAAATGAGTCATTTGAACTCTTAACTTGTCCAACTCCTATAGCAAGAATTTCAACGATTCAGTTC----------CAGATATATATAT--TATATTTT-AAGTTC-AACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATCATCTTCAGTCTGGCAATCATATATTTT-------GAGCTACAACTCCAGTC-AA--TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGTA----ATGATTTATGGATAACGAAACGCATTCAGCACAAAATGTTCCT-GATT------GATA-TATACCATAC-ATTATCCAGAACTCTTTTTGTCCAGAACAAAACAAACATGACCTACTTACAGATTTACGTGAATATCTACTTT-------AGTTATGTTCAATTCTCATAAAGCTTTCAATCAACAATATAAATTAT-CAATTAATTGTATTATAAACGGTTTTGCATGACCTAGATTTAATCAATCTAAATA-ATACAACACAG------ACACAACAAACACAACGGTCGGATGACCTAATTAACGG-TTA-AA-TATGTTTGGA-TAAACTAATTAGCAGCAAAAATTGAGTAGCAATACAACAGTATATG---------A--ATGTAT--------------------ATTTAAATAAATAACTTTGAGCGGT-GGAT---CTGTACATCA-ACATCAAAACACTGCTTGCATAAGATCACAGATTGGTGCG--TTTTTCTGTCAACAACACAAATAGCCCCGAATCCAATTTCTTTATTTTACTATAAAAATC-AAAGAGGACATTCAATAGTGAATGAAATTACACTAACAATCACTTTT-TACTCAA-ACTACGAGTTATTATATCGAAAACATGCCTAT-ATTTCACCCAGTCAATGATT---ACA--TCTGA-T--TA-CAGTCGAATGATGTTAGAGATTATA
gi|89399 : TCAAATGAGTCACCTGAACTCTAAACTTGTCGAACTCCTCAAGGAAGAATTTCAACCATTCAGCTT----------CAGATAT--ATAT--TATGTTTT-GACTTC-AACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATCAT------------GATCATATATTTT-------GTACTACAACTCCAGTC-AA--TTTTAATATCTCCAGTTCAACAGTT----ATGATTTATGGATAACGAAACGCATTCAGCACAAAATGTTCCT-GATTGTCCTAGA-A-TATACCACAC-A-TATCCATAACTC--TTTGTCCAGAACAAAACAAACATGATCTACTTACAGATTTACGTGAATATCTACTTT-------AGTTATGTTCGATTCTCATATAGCTTTCAATCAATAATATAAATTAT-TAATCAATAGCATTATTAACGGTTTTGCGTGACCTAGAATTAATCAATCTAAAAA-ATACAACACAG----AAACACAACAAACATAACGGTCGGATGACCAAATTAACGG-TTA-AA-TATGTTTGGA-TAAACCGATTAGCAGCAAAAATTGATTAGCAATACAACAGTATATGATAAGGGTAAATATATATATATGAAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGCGGT-GAAT---CTCTTTATCA-ACATAAAAACACTGCTTGCATAAGATAACAGATTGGCGCG--TTTTTCTGTCAACAACAAAAATAGCGCCGAACCTAATTTCTTTATTTTACTATCAAAATC-AAAGAGGACATTCAGTAGTGAATGAAATTACACAAACAATCACTATT-TACTCAT-ACTATGCGGTATTATATCGAAAACATGTCAAT-ATTTCATCACGTTAATGATT---ACACCT---G-C--TTACAGTCGAATGATGTTAGAGATTATA
gi|89400 : TCATATGAGTCATCTGAACTCTGAACTTGTCCAACTCCTCAAGCAAGAATTCCAATGATTCAGCTC----------CAGATAT--ACAT--TATGTTTT-ATCTTCGAACTCCAGATTTTGTTTTTCCATGAATCATCTTCAGTCTGGCAATCATATACTTT-------GTGCTACAACTCCAGTC-AA--TTTTAATATGTCCAGTTCAGTAGTT----TTGATTTATGGATAATGAAACGCATCCAGCACAAAATGTTCCA-GATTCTCTGAGA-A-TATATGACAC-A-TATCAATAACTC--TTTGTACAGAACAAAACAAACATGACTTACTTATAGATTTAGGTGTATATTGACTTT-------AGTTATGTTCGATTCTCATATAGCTTTCAATCAACAATATAAATTAT-ACATTAATAGCATTATAAACGGTTTAGCGTGACCTAGATTTAATCAATCTAAACA-ATACAACACAGTTCTAATCACAACAAAGATAACAGTCAGATGACCTAATTAACGG-TTA-AA-TATGTTTTAATTAAACTAATTAGCAGCAAAAATTGGGTAGCAATACAACATTATATGATAAGGGTAA--ATATATAAATGAAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGCGGT-GGAT---CTGTTCATCA-ACATCAAAACACTGCTTGCATAAGATGGCAGATTGGCGTGT-TTTTTTTATCAACAACAAAAATAGCACCGAACATAATTTCTTTATTTTACTATCAAAATTAAAAGAGGACATTCCG-AGT------------------------TATTATATCGAA-A--ACATGTTAATATTTC---ACCCCGTTAATGATTACACC-------TGATT---A----------------CAGTCAAATGATGTTAGAGATTATA
gi|89401 : TCAAATGGGTCATCTGAACTCTTAACTTGTTCAACTCCTTAAGCAAGAATTTCAACGATTCAGCTC----------CAGATAT--ATATATTATGTTTT-AACTTT-AACTCAAGATTTC---TTTCCATGAATTATCTCCAGTCTGGCAATCATATAGTTT-------GTGCTACAACTCCAGTC-AAAATTTTAATATCTCCAGTTCAATAGTT----ATAATTTATGGATAACGAAACGCATTCAGCACAAAATGT-----------CTGAGA-A-TATAGAACAC-A-TATCCGTAAGTC--TTTGTCCAGAACAAAACAAACATGACCTACTTAAAGGTTTACGTGTATATCGACTTGTGACTTTAGTTATGTTCGATTCTCATATAGCTTTCAGTCAACAATATAAATTAT-CAATTAATGGCATTATAAACGGTTTTGTGTGACATAGATTTAATCAATCTAAAAATATATAACACCG----AAACACAACAAACATAACGGTCGGAT-------------G-TTA-AA-TATGTT
gi|89402 : TCAAATGAGTCATCTGAACTCTTAACTTGTCCAACTCCTCAAGCAAGAATTTCAACGTTTCAGCTC----------CAGATAT--ACAT--TATGTTTT-AACTTG-AACTCCAGATTATGTTTTTCCATTGATCATCTTCAGGCTGGCAATCATATATTTT-------GTGCTACAACTCCAGTC-AA--TTTTAATATCTCCAGTCC
gi|89403 : AACTCCTCAAGCAAGAATTTCAACGATTCAGCTC----------CAGATAT--ATAT--TATATTTT-AACTTCGAACTCCAGATTTTGTTTTTCCACGAATCATCTTCAGTCTGGCAATCATATATTTT-------GTGCTACAACTCCgtcgtaaattt
gi|89404 : ATGTATTTTTAAATGTGTGTTACAAATCCAGTC-AA--TT----TATCTCCGGTTAAATAGTTTTAAATGATTTATAAATAATGTATTGCATTCAACACAAAATGTTCCTCTTTTCTCCGAGA-AGTAT
gi|89405 : TACAACTTCAGTC-AA--TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGTT----ATGATTTATGGATAACGAAACGCATTCAGCACAAAATGTTCCT-GATTGTCCAAGA-A-TATACAACAC-A-TATCCATAACTC--TTTGTCTAGACCAAAACAAACATGACCTATTTATAGATTTACGCGTATATTGACTTG-------AGTTATGTTCGATTCTCATATAGCTTTCAATCATCAATATAAATAAT-CAATAAATAGCATTATAAACGGTGTTGCATGACCTAGATTTAATCAATCTAAAAA-ATACAACACAG----AAACACAACAAACATTACGGTCGGATGACCTAATTAACCG-TTA-AACTCTGCTTGCA-TAA
gi|89406 : TACAACTCCAGTA-AA--TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGTT----ATGATTGATGGATAAGGAAACGCATTCAGCACAAAATGTTCCT-GATTGTCCGAGA-A-TATACAACAC-A-TATCCATAACTC--TTTGTCTAGACCAAAACAAACATGACCTACTTATAGATTTACGCGTATATTGACTTG-------AGTTATGTTCGATTCTCATATAGCTTTCAATCATCAATATAAATAAT-CAATAAATAGCATTATAAAGGGTGTTGCGTGACCTAGATTGAATCAATCTAAAAA-ATACAACACAG----AAACACAACAAACATAACGGTCGGATGACCTAATTAACCG-TTA-AACTCTGCTTGCA-TAA
gi|89407 : TACAACTCCAGTC-AA--TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGTT----ATAATTTATGGATA-CGAAACGCATTCAGCAAAAAATGTTCTT-GATTGTCTGAGA-A-TATACAACAC-A-TATCCATAACTC--TTTGTCTAGACCAAAACAAACATGACCTACTTATAGATTTACGCGTATATTGACTTG-------AGTTATGTTCAATTCTCATATAGCTTTCAATCATCAATATAAATAAT-CAATAAATAGCATTATAAACGGTGTTGCGTGACCTAGATTTAATCAATCTAAAAA-ATACAACACAG----AAACACAACAAACATAACGGTCGGATGACCTCATTAACCG-TTA-AATTCTGATTGCA-TAA
gi|89408 : TACAACTCCAGTC-AA--TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGTT----ATGATTTATGGATAACGAAACGCATTCAGCACAAAATTTTCCT-GATTGTCCAAGA-A--ATACAACAC-A-TATCCATAACTC--TTTGTCTAGACCAAAACAAACATGACCTACTTATAGATTTACGCGTATATTGACTTG-------AGTTATGTTCGATTTTCATATAGCTTTCAACCATCAATATAAATAAT-CAATAAATAGCACTATAAATGGTGTTGCGTGACCTAGATTTAATCAATCTAAAAA-ATACAACACAG----AAACACAACAAACATAA----CGGATGACCTAATTAACCG-TTA-AACTCTGCTTGCA-TAA
gi|89409 : TACAACTCCAGTC-AA--TTTTAATATCTCCACTTCAGTAGTT----ATGATTTATGGATAGCGAAACTCATTCAGCACAAAATGTTCCT-GGTTGTCCGAGA-A-TATACAACAC-A-TATCCATAACTT--TTTGTCTGGACCAAAACAAACATGACCTACTTATAGATGTACATGTATATTGACTTG-------AGTTATGTTCGATTCTCATATAGCTTTCAATCAACAATAAAAATAAT-CAATAAATAGCATTATAAATGGTGTTGTGTGACCTAGATTTAATCAATCTAAAAA-ATACAACACAG----AAACACAACAAACATAATGGTCGGATGACCTAATTAACCG-TTATGA-TCTGCTTGCA-CAA
gi|89410 : TACAACTCCAGTC-AA--TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGGT----ATGATTTATGGATAACGAAATGCATTCAGCACAAAATGTTCCT-AATTGTCCGAGA-A-TATACAACAC-A-TA------ACTC--TTTGTATAGACCAAAACAAACATGACCTACTTATAGATTTACGTGTATATTGACC-G-------AGTTATGTTCAATTCTCATATAGGTTTCAATTAACAATATAAATAAT-CAATTAATAGCATTATAAACAGTGTTGCATGACCTAGATTTAATCAATCTAAAAA-ATACAACACAG----AAACACAACAAACATAACGGTCAGATTACCTAATTAACCG-TTA-AA-TATGTT
gi|89411 : TACAACTCCAGCC-AA--TTTTAATATCTCCAGTTCAATAGTT----ATGATTTATGGATAACGGAACACATTCATCACAAAATGTTCCT-GATTGTCCTAGA-A-TATACAACAC-A-TATCCATAACTC--TTTGTCTAGACCAAAACAAACATGACCTACTTATAGATTTATGCGTATATTGACTTG-------ATTTATGT-----------AAAGCTTTCAATCAACAATATAAATAAT-CAATAAATAAATTTATAAACGGTGTTGTGTGACCTAGATTTAATCTATCAAAAAA-ATACAACACAG----AAACACAACAAACATAACGGTCGGATGACCTAATTAACTG-TTA-AA-TATGTT
gi|89412 : TACAACTCCAGTC-AA--TTTTAATATCTCAAGTTCAATGGTT----ATGATTTATGGATAACGAAACGCATTTAGCACAAAATGTTCCT-GTTTGTCCGAGA-A-TATACAACAC-A-TATCCATTACTC--TTTGTCTAGACCAAAACAAACATGACCTACTTATAGATTTACGCGTATATTGACTTG-------AGTTATGTTCGATTCTCATATAGCTTTCAATCATCAATATAAATAAT-CAATAAATAGCATTTTAAACGGTGTTGCGTGACCTAGATTTAATCAATCTAAAAA-ATACAACACAG----AAACACAACAAACATAACGGTC
gi|89413 : AACGGTCGGATGACCTAATTAACCG-TTA-AC-TCTGCTTGCA-TAA
gi|89414 : AACGGTCGGATGACCT---CATTA-ACCGTTAAATTCTGATTGCATAAGATGACAGATTGGCGCG--TTTTTCTATAAACAACAAATGAAGCCCCGAACCTTATTTCATTATTTTACTATCAAAATTAAAAGAGGACAATCGGTAGTGAATAAAATTTCACTAACAATTACTTTT-TACTCAA-ACTACGAGTTATTATATCGAAAATATGTCAAT-ATTTCACCCCATTAATGATT---ACA--T-------------GTCGAATGGTGTTAGAGAT
gi|89415 : TGTACATCATAC-TAAAAACACTGCTTGCATAAGATGACAGGTCGGCGCG--TTTTTCTATCAACAACAAAAATAGCAT-GAGCCTATATTCTTTATTTTACTATCAGAATTACAAGAGGACAATCCGTAGTGAATAAAATTACACTGACAATCACTATT-TACTCAA-ACTACGAGTTATAATATCGAGAATATGTCAAT-ATTTCACCCCGTTAATTATT---ACACCT---GAT--TA-CAGTCGAATGGTGTTAGAGATTATA
gi|89416 : CATCAATACACTGCTTGCATAAGATGACAGATT-GCGCG--TTTTTCTGTAAACAACAAATGT-----CAAA--------------------ATCAA------AAGAGGACAATCTGTAGTAAATAAAATTTCACTAACAATCACTATT-TACTCAA-ACTACGAGTTAATATATCAAAAACATGTCAGT-ATTTCACCCTATTAATGATT---GC
gi|89417 : CATCAATACACTGCTTGCATAAGATGACAGATTGGCGCG--TTTTTCTATAAACAACAAATGTAGCCCCGAACCTAATTTCGTTATTTTACTACCAAAATTAAAAGAGGACAATCCGTATTT-ATAAAATTTCACTAACAATCACTATT-TATTCAA-ACTACGAGTTATTGTATCGAAAACA-GTCAAT-ATTTCGCCCCATTAATTATT---ACA--T---G-T--T-------GAATGGTGTTAGAGAGTATA
gi|89418 : AAACTCTGCTTGCATAAGATGACAGATTGGCGCG--TTTTTCTATAAACAACAAATGCAGCCCCGAACCTAATTTCGTTATTTTACTATCAAAATTAATAGAGGACAATCCGTAGTGAATAAAATTTCACTAACAATTACTATT-TACTCAA-ACTACGAGTTATTATATCGAAAATATGTCAAT-ATTTCACCCCATTAATGATT---ACA--T-------------GTCGAATGGTGTTAGAGATTATA
gi|89419 : AAACTCTGCTTGCATAAGATGACAGATTGGCGCG--TTTTTCTATAAACAACAAATGTAGCCCCAAACCTAATTTCATTATTTTACTATCAAAATTAAAAGAGGACAATCCGTAGTGAATCAAATTTCACTAACAATTACTATT-TACTCAA-ACTACGAGTTATTATATCGAAAATATGTCAAT-ATTTCACCCCATTAATGATT---ACA--T-------------GTCGAATGGTGTTAGAGATTATA
gi|89420 : AAACTCTGCTTGCATAAGATGACAGATTGGCGCG--TTTTTCTATAAACAACAAATGTAGCCCCGAACCTAATTTCGTTATTTTACTATCAAA-TTAAAAGAAGACAATCCGTAGTGAATAAAATTTCACTAACAATTACTTTT-TACTCAA-ACTACAAGTTATTACATCGAAAATATGTCAAT-ATTTCACCCCATTAATGATT---ACA--T-------------GTCGAATGGTGTTGG
gi|89421 : AACTCTGCTTGCATAAGATGACAGATTGGCGCG--TTTTTCTATAAACAACAAATCTAGGCCCGAATCTAATTTCGTTATTTTACTATCAAAATTAAAAGGAGACAATCCGTAGTGAATAATATTTCACTAACAATTACTATT-TACTCAA-ACTACGAGTTATTATATCGAAAATGTGTCAAT-ATTTCACCCCATTAATGATT---ACA--T-------------GTCGAATGGTGTTAGAGATAATA
gi|89422 : CTGCTTGCACAAGATGACAGATTGGCGCG--TTTTTTTATAAACAACAAATAGAGCCCCGAACCTAATTTCGTTATTTTACTATCAAAATTAAAAGAGGACAATCCGTAGTGAATAAAATTTAACT---AATCACTATT-TACTCAA-ACTACAAGTTATTTTTTCGAAAACATGTCAAT-ATTTCACCCCATTAATGATT---ACA--T-------------GTCGAATGGTGTTAGAGATTATA
gi|89423 : TCGTTTTTTTACGATCAAAATTAAAAGAGGACAATTTCTAGTGAATAAAAT------AACAATCACTATT-TACTCAA-ATAACGAGTTGTTATATCGAAAACATGTCAAT-ATCTCACCCCATTAATGGTT---ACA--T---G-T--T-------GAATGGTGTTAGAGATTATA
gi|89424 : CTTACAAACGCTATT-TGCTCATTCCTATGCGTTATAAAATCGGCAACATGTCAAT-GTTTCATCCCG----TGATTTAAAGA--T---G-C--TTACAACCGAATTACAATAGAGATTTTA