lowQualScore : 1111111111 22222222222222 11111111111111111
lowQualScore : 2222222222 4 222 11 1 2 1 11111111111111 11111111111111111 33333 5 1 1 33 4 1 9 22 1 77
lowQualScore : .......... . ... .. . . . .............. ................. ..... . . . .. . . . .. . ..
lowQualScore : 1111111111 0 333 88 3 6 3 88888888888888 88888888888888888 44444 5 4 4 88 8 6 7 22 6 44
consensus : AGCCTGCACATT----------CATGCTGTACT-ATCAGGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATAAATTAT-C------A-------AAA-----AA----------CA-----CTA-TTT-A-GACCAGGAAT--GGAATTTAAG-GGAAA-ATGGTCTGT--TACATATATTTACCTGTCTA-AGAGAG-AATAAGAAATA
Reference ( gi|46554 ) : AGCCTGCACATT----------CATGCTGTACT-ATCAGGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATAAATTAT-C------A-------AAA-----AA----------CA-----CTA-TTT-A-GACCAGGAAT--GGAATTTAAG-GGAAA-ATGATCTGT--TACATATATTTACCTGTCTA-AGAGAA-AATAAGAAATA
gi|46552 : AGCCTGCACATT----------CATGCTATACT-ATCAGGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATAAATTAT-C------A-------AAA-----A-----------CA-----TTA-TTT-A-GACCAGGAAT--GGAATTTAAG-GGAAA-ATGGTCTGT--TACATATATTTACCTGTCTA-AGAGAG-AATAAGAAATA
gi|46555 : AACCTGCACATT----------TATGCTGTACT-ATCAGGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATAAATTAT-C------A-------AAA-----AA----------CA-----CTA-TTT-A-GACCAGGAAT--GGAATTTAAG-GG-AA-ATGGTCTGT--TACATATATTTACCTGTCTA-AGAGAG-AATAAGAAATa
gi|46557 : AGCCTGCACATT----------CATGCTGTACT-ATCAGGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATACATTAT-CCACAAAA-------AAA-----AA----------CA-----CTA-TTT-A-GACCAGGAAT--GGAATTTAAG-GGAAA-ATGTTTTGT--TACATATATTTACCTGTCTA-AGAGAG-AATAAGAAA
gi|46558 : AGCCTGCACATT----------CATGCTGTACT-ATCAGGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATACATTAT-C------AAAAAAACAAA-----AA----------CA-----CTA-TTT-A-GACCAGGAAT--GAAATTTAAG-GGAAA-ATG-TTTGT--TACATATATTTACCTGTCTA-AGAGGG-AATAAGAAATA
gi|46560 : AGCCTGCACATT----------CATGCTGTACT-ATCAGGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATACATTAT-C------AAAAAAC-AAA-----AA----------CA-----CTA-TTT-A-GACCAGGAAC--GGAATTTAAG-GGAAA-AT-ATTTGT--TACATATATTTACCTGTCTA-AGAGGG-AATAAGAAATAa
gi|46559 : AGCCTGCACATT----------CATGCTGTACT-ATCAGGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATACATTAT-C------AAAAAAC-AAA-----AA----------CA-----CTA-TTT-A-GACCAGGAAC--GGAATTTAAG-GGAAA-AT-ATTTGT--TACATATATTTACCTGTCTA-AGAGGG-AATAAGAAATAa
gi|46556 : AGCCTGCACATT----------CGTGCTGTACT-ATCAAGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATAAATCAT-C------A-------AAA-----AA----------CA-----CTA-TTT-A-GACCAGGAAT--GGAATTTTAC-GCGAA-ATGGTCTCT--TACATATATTTACCTGTCTA-AGAGAG-AATAAGAAATAa
gi|46551 : AGCCTGCACATT----------CATGCTGTACT-ATCAGGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATACATTAT-C------A-------AAA-----AAAAAACAAAAACA-----CTA-ATT-A-GACCAAGAAT--GGAATTTAAG-GGAAA-ATGTTTTGT--TACATATATTTACCTGTCTA-AGAGAG-AATAAGAAATAa
gi|46564 : AGCCTGCACATT----------CATGCTGTACT-ATCAGGGTTT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATACATTAT-CAAA---A-------AAA-----AA----------CA-----CTA-ATT-A-GACCAAGAAT--GGAA-TTAAG-GGAAA-ATGTTTTGT--TACATATATTTACCTGTCTA-AGAGAG-AATAAGAAATAa
gi|46563 : AGCCTGCACATT----------CATGCTGTACT-ATCAGGGTTT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATACATTAT-CAAA---A-------AAA-----AA----------CA-----CTA-ATT-A-GACCAAGAAT--GGAA-TTAAG-GGAAA-ATGTTTTGT--TACATATATTTACCTGTCTA-AGAGAG-AATAAGAAATAa
gi|46562 : AGCCTGCACATT----------CATGCTGTACT-ATCAGGGTTT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATACATTAT-CAAA---A-------AAA-----AA----------CA-----CTA-ATT-A-GACCAAGAAT--GGAA-TTAAG-GGAAA-ATGTTTTGT--TACATATATTTACCTGTCTA-AGAGAG-AATAAGAAATAa
gi|46566 : AGCCTGCACATTGATGATGATTCATGCTGTACT-ATCAGGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATACATTAT-C------A-------AAAAAAAAAA----------CA-----CTA-TTT-A-GACCAGGAAT--GGAATTTAAG-GGGAA-ACGTTTTGT--TACATATATTTACCTGTCTA-AGAGAG-AATAAGAAATAa
gi|46561 : AGTCTGCACATT----------CATGCTGTACT-ATCAGGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATAAATCAT-T------A-------AAA-----A-----------CA-----CTA-CTT-A-GACCAGTAAT--GTAATTTAAG-GGAAA-ATGGTCTGT--TACATATATTTACCTTTATA-AGAGAG-AACAAGAAATa
gi|46567 : AGCCTGCACATT----------CATGCTGTACT-ATCAGGGTAT---A--TACTGT-------------CAATAAATTAT-C------A-------AAA-----AA----------CA-----CTA-TTT-A-GACCAGGAAT--GGAATTTAAG-GGAAA-ATGGTCTGT--TTCATATATTTACCTGTCTA-AGAGAG-AATAAGAAATA
gi|46553 : AGCCTGCACATTGATGATGATTCGTGGTGTACT-ATCAGGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTCAAGTCAATACATTAT-A------A-------AAAA----AA----------CA-----CTA-TTT-A-GACCAGGAAT--GGAGTTTAAG-GGAAA-ATGTTTTGT--TACATATATTTACCTGTCTA-AGAGAG-AATAAGAAATAa
gi|46565 : AGCCTGCACATT----------CATACTGTACT-ATCAGGGTAT---ACATACTGTTAGCTGCTCA-GTCAATCAATTGT-C------A-------AAA-----AA----------CA-----CTA-TTT-A-GACCAGGAAT--GTAATTTAAT-TAAAA-ATGGTCTGT--TACATATATTTACCTGTCTA-AGAG---AATAAGAAAa
gi|46568 : AGCCTGCACATT----------CATGCTGTACT-ATCTGAGTAT---A--TATTGTTTGTTACTCA-GTCAATAAATTAC-C------A-------AAA-----AA----------AT-----CTA-TTT-A-GACCAGGAAT--GGaaa
gi|46546 : AGCCTGTACATC----------CGAGCCGTGTT-ATCAATGTAT---G--CACTGTTTGCTACGCA-GTCAGTAAATTAT-C--------------AAA-----TT----------CA-----CCATTTT-A-AATCAGGAAT--GGAATTTAAG-CAAAA-ATGGTCCAT--TATATATATTTAACGGGCTC-ATAGAG-AATAATAAATA
gi|46544 : tcAGCCTGCACATC----------CAAGCCGTGTTTATCAATGTAT---G--CACTGTTTGCTACGCA-GTCAGTAAATTAT-C--------------AAA-----TT----------CA-----CCATTTT-A-AATCAGGAAT--GGAATTTAAGCAAAAA-ATGGTCCAT--TACATATATTTAACGGACTC-GTAGAG-AATTATAAATAaaaccgtagtta
gi|46547 : tcAGCCTGCACATC----------CAAGCCGTGTT-ATCAAGGTAT---G--CACTGTTTGCTACGCA-TTCAGTAAATTAT-C--------------AAA-----TT----------CA-----CCATTTT-A-AATCAGGAAT--GGAATTTAAG-CAAAATATGGTTCATTATATATATATTTAACGGGCTATAGAGAATAATAAaaaccttattta
gi|46545 : tcAGCCTGCACATC----------CAAGCCGTGTT-ATCAATGTAT---G--CACTGTTTGCTACGCA-GTCAATGAATTAT-C--------------AAA-----TT----------CA-----CCATTTT-A-AATCAGGAAT--GGAATTTAAGCAAAAA-ATGGTCCTT--AATATATATTTAACGGGCTC-ATAGAG-AATTATAAATAattaaaccttattta
gi|46569 : tcAGCCTTCACATT----------CATGCTGTACT-ATCAGGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATACATTAT-C------A-------AAaaaccttattta
gi|46548 : AGCCAGCACATC----------CAAGCCATGTT-ATCAAGGTAC---G--CA------GGTAGTAA-ACCATTA--TTAT-C------A-------AAA-----T-----------CA-----TCA-TTTTA-AATCAGGAAT--GGAATTAAAGCAAAAA-ATGGTCGAT--TACATATATTTAACTGGCTC-ATAGAG-AATAATAAATA
gi|46549 : tcAGCCTGCACATC----------CAAGCCATGTT-ATCAAGGTAT---G--CACTGTTTGCTACAAA-GTCAGTAAATTAT-C--------------AAA-----TT----------CA-----CCA-TTT-GTAATCAGGAAT--Gattaattattaaataaaaccttattta
gi|46570 : tcGCCTGCACATT----------CATGCTGTACT-ATCAGGGTATATAA--TACTGTTTGCTACTCA-GTAAATAAATTAC-C------A-------
gi|46571 : CTGCACAAT----------CATGTTGTTCT-A-CAGGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTTA-GTCAATAAATTAA-A------A-------AAA-----AA----------CAACACCCTA-TTT-A-GACCAGGAAT--GGAATTTAAA-GGGAA-ATGGTCTGT--TACATATATTTACCTGTCTA-AGAGAG-AATAAGAAATA
gi|46572 : GCA-ATC----------CATGCAGT-CTGAGCAGGGTCT---A--CACTGTTTGCTACTCA-GTCAATAAATTATAA------A-------AAA-----AA----------CA-----CCC-TAT-A-AATCAGGAATAAAGAAT
gi|46550 : CATC----------CATGCAAT-CTGAGCAGGGTCT---A--CACTGTTTGCTACTCA-GTC--------------------------AAA-----AA----------CA-----CCC-TAT-A-AATCAGGAATAAAGAATggtccatttataaaccatgtgatgaataaagggatattaaaataaaa
gi|46573 : tcagcTT----------CATGCTGTACT-ATCAGGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATACATTAT-C------A-------AAA-----AAAACAAA----CA-----CTA-ATT-A-GACCAGGAAT--GGAATTTAAG-GGAAA-ATGTTTTGT--TACATATATTTACCTGTCTA-AGAGAG-AAAAAGAAATAggtccatttataaaccatgtgatgaataaagggataatattaaaataaaa
gi|46574 : GTACT-ATCAGGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATAAATTAT-C------A-------AAA-----AA----------CA-----CTA-TTT-A-GACCAGGAAT--GATATTTAAG-GGAAA-ATGGTCTGT--TACATATATTTACCTGTCTA-AGAGAG-AATAAGAAATAa
gi|46575 : GTAT---A--TACTGTTTGCTACTCA-CCCAATAAATTAT-C------A-------AAA-----AA----------CA-----CTA-TTT-A-GATCAGGAAT--GGAATTTAAG-GGAAA-ATGGTCTGT--TACATATATTTACCTGTCTT-AGAGAG-AAAAAGAAATAa
Alignments
lowQualScore : 1111111111 22222222222222 11111111111111111
lowQualScore : 1111111111 3 222 11 1 2 1 00000000000000 00000000000000000 33333 5 1 1 4 1 22
lowQualScore : .......... . ... .. . . . .............. ................. ..... . . . . . ..
lowQualScore : 7777777777 9 222 77 2 3 2 88888888888888 88888888888888888 33333 3 3 3 3 4 00
consensus : AGCCTGCACATT----------CATGCTGTACT-ATCAGGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATAAATTAT-C------A-------AAA-----AA----------CA-----CTA-TTT-A-GACCAGGAATGGAATTTAAG-GGAAA-ATGGTCTGT--TACATATATTTACCTGTCTAAGAGAGAATAAGAAATA
Reference ( family-623 ) : AGCCTGCACATT----------CATGCTGTACT-ATCAGGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATAAATTAT-C------A-------AAA-----AA----------CA-----CTA-TTT-A-GACCAGGAATGGAATTTAAG-GGAAA-ATGGTCTGT--TACATATATTTACCTGTCTAAGAGAGAATAAGAAATA
gi|46544 : AGCCTGCACATC----------CAAGCCGTGTTTATCAATGTAT---G--CACTGTTTGCTACGCA-GTCAGTAAATTAT-C--------------AAA-----TT----------CA-----CCATTTT-A-AATCAGGAATGGAATTTAAGCAAAAA-ATGGTCCAT--TACATATATTTAACGGACTCGTAGAGAATTATAAATA
gi|46545 : tcAGCCTGCACATC----------CAAGCCGTGTT-ATCAATGTAT---G--CACTGTTTGCTACGCA-GTCAATGAATTAT-C--------------AAA-----TT----------CA-----CCATTTT-A-AATCAGGAATGGAATTTAAGCAAAAA-ATGGTCCTT--AATATATATTTAACGGGCTCATAGAGAATTATAAATAaaaccttattta
gi|46546 : tcAGCCTGTACATC----------CGAGCCGTGTT-ATCAATGTAT---G--CACTGTTTGCTACGCA-GTCAGTAAATTAT-C--------------AAA-----TT----------CA-----CCATTTT-A-AATCAGGAATGGAATTTAAG-CAAAA-ATGGTCCAT--TATATATATTTAACGGGCTCATAGAGAATAATAAATAaaaccttattta
gi|46547 : tcAGCCTGCACATC----------CAAGCCGTGTT-ATCAAGGTAT---G--CACTGTTTGCTACGCA-TTCAGTAAATTAT-C--------------AAA-----TT----------CA-----CCATTTT-A-AATCAGGAATGGAATTTAAG-CAAAATATGGTTCATTATATATATATTTAACGGGCT-ATAGAGAATAATAAATaaaccgtagtta
gi|46548 : tcAGCCAGCACATC----------CAAGCCATGTT-ATCAAGGTAC---G--CA------GGTAGTAA-ACCATTA--TTAT-C------A-------AAA-----T-----------CA-----TCA-TTTTA-AATCAGGAATGGAATTAAAGCAAAAA-ATGGTCGAT--TACATATATTTAACTGGCTCATAGAGAATAATAAATAtaaaccttattta
gi|46549 : tcAGCCTGCACATC----------CAAGCCATGTT-ATCAAGGTAT---G--CACTGTTTGCTACAAA-GTCAGTAAATTAT-C--------------AAA-----TT----------CA-----CCA-TTT-GTAATCAGGAATGattaattattaaataaaaccttattta
gi|46550 : tcCATC----------CATGCAAT-CTGAGCAGGGTCT---A--CACTGTTTGCTACTCA-GTC--------------------------AAA-----AA----------CA-----CCC-TAT-A-AATCAGGAATA------AAG-----A-ATGGTCCAT--T---TATA
gi|46551 : tcagcAGCCTGCACATT----------CATGCTGTACT-ATCAGGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATACATTAT-C------A-------AAA-----AAAAAACAAAAACA-----CTA-ATT-A-GACCAAGAATGGAATTTAAG-GGAAA-ATGTTTTGT--TACATATATTTACCTGTCTAAGAGAGAATAAGAAATAaaccatgtgatgaataaagggataatattaaaataaaa
gi|46552 : AGCCTGCACATT----------CATGCTATACT-ATCAGGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATAAATTAT-C------A-------AAA-----A-----------CA-----TTA-TTT-A-GACCAGGAATGGAATTTAAG-GGAAA-ATGGTCTGT--TACATATATTTACCTGTCTAAGAGAGAATAAGAAATAa
gi|46553 : AGCCTGCACATTGATGATGATTCGTGGTGTACT-ATCAGGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTCAAGTCAATACATTAT-A------A-------AAAA----AA----------CA-----CTA-TTT-A-GACCAGGAATGGAGTTTAAG-GGAAA-ATGTTTTGT--TACATATATTTACCTGTCTAAGAGAGAATAAGAAATAa
gi|46554 : AGCCTGCACATT----------CATGCTGTACT-ATCAGGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATAAATTAT-C------A-------AAA-----AA----------CA-----CTA-TTT-A-GACCAGGAATGGAATTTAAG-GGAAA-ATGATCTGT--TACATATATTTACCTGTCTAAGAGAAAATAAGAAATAa
gi|46555 : AACCTGCACATT----------TATGCTGTACT-ATCAGGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATAAATTAT-C------A-------AAA-----AA----------CA-----CTA-TTT-A-GACCAGGAATGGAATTTAAG-GG-AA-ATGGTCTGT--TACATATATTTACCTGTCTAAGAGAGAATAAGAAAT
gi|46556 : AGCCTGCACATT----------CGTGCTGTACT-ATCAAGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATAAATCAT-C------A-------AAA-----AA----------CA-----CTA-TTT-A-GACCAGGAATGGAATTTTAC-GCGAA-ATGGTCTCT--TACATATATTTACCTGTCTAAGAGAGAATAAGAAATA
gi|46557 : AGCCTGCACATT----------CATGCTGTACT-ATCAGGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATACATTAT-CCACAAAA-------AAA-----AA----------CA-----CTA-TTT-A-GACCAGGAATGGAATTTAAG-GGAAA-ATGTTTTGT--TACATATATTTACCTGTCTAAGAGAGAATAAGAAAa
gi|46558 : AGCCTGCACATT----------CATGCTGTACT-ATCAGGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATACATTAT-C------AAAAAAACAAA-----AA----------CA-----CTA-TTT-A-GACCAGGAATGAAATTTAAG-GGAAA-AT-GTTTGT--TACATATATTTACCTGTCTAAGAGGGAATAAGAAATA
gi|46559 : AGCCTGCACATT----------CATGCTGTACT-ATCAGGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATACATTAT-C------AAAAAAC-AAA-----AA----------CA-----CTA-TTT-A-GACCAGGAACGGAATTTAAG-GGAAA-AT-ATTTGT--TACATATATTTACCTGTCTAAGAGGGAATAAGAAATAa
gi|46560 : AGCCTGCACATT----------CATGCTGTACT-ATCAGGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATACATTAT-C------AAAAAAC-AAA-----AA----------CA-----CTA-TTT-A-GACCAGGAACGGAATTTAAG-GGAAA-AT-ATTTGT--TACATATATTTACCTGTCTAAGAGGGAATAAGAAATAa
gi|46561 : AGTCTGCACATT----------CATGCTGTACT-ATCAGGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATAAATCAT-T------A-------AAA-----A-----------CA-----CTA-CTT-A-GACCAGTAATGTAATTTAAG-GGAAA-ATGGTCTGT--TACATATATTTACCTTTATAAGAGAGAACAAGAAATa
gi|46562 : AGCCTGCACATT----------CATGCTGTACT-ATCAGGGTTT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATACATTAT-CAAA---A-------AAA-----AA----------CA-----CTA-ATT-A-GACCAAGAATGGAA-TTAAG-GGAAA-ATGTTTTGT--TACATATATTTACCTGTCTAAGAGAGAATAAGAAATA
gi|46563 : AGCCTGCACATT----------CATGCTGTACT-ATCAGGGTTT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATACATTAT-CAAA---A-------AAA-----AA----------CA-----CTA-ATT-A-GACCAAGAATGGAA-TTAAG-GGAAA-ATGTTTTGT--TACATATATTTACCTGTCTAAGAGAGAATAAGAAATAa
gi|46564 : AGCCTGCACATT----------CATGCTGTACT-ATCAGGGTTT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATACATTAT-CAAA---A-------AAA-----AA----------CA-----CTA-ATT-A-GACCAAGAATGGAA-TTAAG-GGAAA-ATGTTTTGT--TACATATATTTACCTGTCTAAGAGAGAATAAGAAATAa
gi|46565 : AGCCTGCACATT----------CATACTGTACT-ATCAGGGTAT---ACATACTGTTAGCTGCTCA-GTCAATCAATTGT-C------A-------AAA-----AA----------CA-----CTA-TTT-A-GACCAGGAATGTAATTTAAT-TAAAA-ATGGTCTGT--TACATATATTTACCTGTCTA--AGAGAATAAGAAAa
gi|46566 : AGCCTGCACATTGATGATGATTCATGCTGTACT-ATCAGGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATACATTAT-C------A-------AAAAAAAAAA----------CA-----CTA-TTT-A-GACCAGGAATGGAATTTAAG-GGGAA-ACGTTTTGT--TACATATATTTACCTGTCTAAGAGAGAATAAGAAATAaaa
gi|46567 : AGCCTGCACATT----------CATGCTGTACT-ATCAGGGTAT---A--TACTGT-------------CAATAAATTAT-C------A-------AAA-----AA----------CA-----CTA-TTT-A-GACCAGGAATGGAATTTAAG-GGAAA-ATGGTCTGT--TTCATATATTTACCTGTCTAAGAGAGAATAAGAAATAa
gi|46568 : AGCCTGCACATT----------CATGCTGTACT-ATCTGAGTAT---A--TATTGTTTGTTACTCA-GTCAATAAATTAC-C------A-------AAA-----AA----------AT-----CTA-TTT-A-GACCAGGAATGGa
gi|46569 : AGCCTTCACATT----------CATGCTGTACT-ATCAGGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATACATTAT-C------A-------AA
gi|46570 : GCCTGCACATT----------CATGCTGTACT-ATCAGGGTATATAA--TACTGTTTGCTACTCA-GTAAATAAATTAC-C------A-------
gi|46571 : CTGCACAAT----------CATGTTGTTCT-A-CAGGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTTA-GTCAATAAATTAA-A------A-------AAA-----AA----------CAACACCCTA-TTT-A-GACCAGGAATGGAATTTAAA-GGGAA-ATGGTCTGT--TACATATATTTACCTGTCTAAGAGAGAATAAGAAATA
gi|46572 : GCA-ATC----------CATGCAGT-CTGAGCAGGGTCT---A--CACTGTTTGCTACTCA-GTCAATAAATTATAA------A-------AAA-----AA----------CA-----CCC-TAT-A-AATCAGGAATA------AAG-----A-ATGGTCCAT--T---TATA
gi|46573 : TT----------CATGCTGTACT-ATCAGGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATACATTAT-C------A-------AAA-----AAAACAAA----CA-----CTA-ATT-A-GACCAGGAATGGAATTTAAG-GGAAA-ATGTTTTGT--TACATATATTTACCTGTCTAAGAGAGAAAAAGAAATAaaccatgtgatgaataaagggatattaaaataaaa
gi|46574 : GTACT-ATCAGGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATAAATTAT-C------A-------AAA-----AA----------CA-----CTA-TTT-A-GACCAGGAATGATATTTAAG-GGAAA-ATGGTCTGT--TACATATATTTACCTGTCTAAGAGAGAATAAGAAATAa
gi|46575 : GTAT---A--TACTGTTTGCTACTCA-CCCAATAAATTAT-C------A-------AAA-----AA----------CA-----CTA-TTT-A-GATCAGGAATGGAATTTAAG-GGAAA-ATGGTCTGT--TACATATATTTACCTGTCTTAGAGAGAAAAAGAAATAa
Alignments
lowQualScore : 1111111111 22222222222222 11111111111111111
lowQualScore : 1111111111 3 222 11 1 2 1 00000000000000 00000000000000000 33333 5 1 1 4 1 22
lowQualScore : .......... . ... .. . . . .............. ................. ..... . . . . . ..
lowQualScore : 7777777777 9 222 77 2 3 2 88888888888888 88888888888888888 33333 3 3 3 3 4 00
consensus : AGCCTGCACATT----------CATGCTGTACT-ATCAGGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATAAATTAT-C------A-------AAA-----AA----------CA-----CTA-TTT-A-GACCAGGAATGGAATTTAAG-GGAAA-ATGGTCTGT--TACATATATTTACCTGTCTAAGAGAGAATAAGAAATA
Reference ( family-623 ) : AGCCTGCACATT----------CATGCTGTACT-ATCAGGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATAAATTAT-C------A-------AAA-----AA----------CA-----CTA-TTT-A-GACCAGGAATGGAATTTAAG-GGAAA-ATGGTCTGT--TACATATATTTACCTGTCTAAGAGAGAATAAGAAATA
gi|46544 : AGCCTGCACATC----------CAAGCCGTGTTTATCAATGTAT---G--CACTGTTTGCTACGCA-GTCAGTAAATTAT-C--------------AAA-----TT----------CA-----CCATTTT-A-AATCAGGAATGGAATTTAAGCAAAAA-ATGGTCCAT--TACATATATTTAACGGACTCGTAGAGAATTATAAATA
gi|46545 : tcAGCCTGCACATC----------CAAGCCGTGTT-ATCAATGTAT---G--CACTGTTTGCTACGCA-GTCAATGAATTAT-C--------------AAA-----TT----------CA-----CCATTTT-A-AATCAGGAATGGAATTTAAGCAAAAA-ATGGTCCTT--AATATATATTTAACGGGCTCATAGAGAATTATAAATAaaaccttattta
gi|46546 : tcAGCCTGTACATC----------CGAGCCGTGTT-ATCAATGTAT---G--CACTGTTTGCTACGCA-GTCAGTAAATTAT-C--------------AAA-----TT----------CA-----CCATTTT-A-AATCAGGAATGGAATTTAAG-CAAAA-ATGGTCCAT--TATATATATTTAACGGGCTCATAGAGAATAATAAATAaaaccttattta
gi|46547 : tcAGCCTGCACATC----------CAAGCCGTGTT-ATCAAGGTAT---G--CACTGTTTGCTACGCA-TTCAGTAAATTAT-C--------------AAA-----TT----------CA-----CCATTTT-A-AATCAGGAATGGAATTTAAG-CAAAATATGGTTCATTATATATATATTTAACGGGCT-ATAGAGAATAATAAATaaaccgtagtta
gi|46548 : tcAGCCAGCACATC----------CAAGCCATGTT-ATCAAGGTAC---G--CA------GGTAGTAA-ACCATTA--TTAT-C------A-------AAA-----T-----------CA-----TCA-TTTTA-AATCAGGAATGGAATTAAAGCAAAAA-ATGGTCGAT--TACATATATTTAACTGGCTCATAGAGAATAATAAATAtaaaccttattta
gi|46549 : tcAGCCTGCACATC----------CAAGCCATGTT-ATCAAGGTAT---G--CACTGTTTGCTACAAA-GTCAGTAAATTAT-C--------------AAA-----TT----------CA-----CCA-TTT-GTAATCAGGAATGattaattattaaataaaaccttattta
gi|46550 : tcCATC----------CATGCAAT-CTGAGCAGGGTCT---A--CACTGTTTGCTACTCA-GTC--------------------------AAA-----AA----------CA-----CCC-TAT-A-AATCAGGAATA------AAG-----A-ATGGTCCAT--T---TATA
gi|46551 : tcagcAGCCTGCACATT----------CATGCTGTACT-ATCAGGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATACATTAT-C------A-------AAA-----AAAAAACAAAAACA-----CTA-ATT-A-GACCAAGAATGGAATTTAAG-GGAAA-ATGTTTTGT--TACATATATTTACCTGTCTAAGAGAGAATAAGAAATAaaccatgtgatgaataaagggataatattaaaataaaa
gi|46552 : AGCCTGCACATT----------CATGCTATACT-ATCAGGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATAAATTAT-C------A-------AAA-----A-----------CA-----TTA-TTT-A-GACCAGGAATGGAATTTAAG-GGAAA-ATGGTCTGT--TACATATATTTACCTGTCTAAGAGAGAATAAGAAATAa
gi|46553 : AGCCTGCACATTGATGATGATTCGTGGTGTACT-ATCAGGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTCAAGTCAATACATTAT-A------A-------AAAA----AA----------CA-----CTA-TTT-A-GACCAGGAATGGAGTTTAAG-GGAAA-ATGTTTTGT--TACATATATTTACCTGTCTAAGAGAGAATAAGAAATAa
gi|46554 : AGCCTGCACATT----------CATGCTGTACT-ATCAGGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATAAATTAT-C------A-------AAA-----AA----------CA-----CTA-TTT-A-GACCAGGAATGGAATTTAAG-GGAAA-ATGATCTGT--TACATATATTTACCTGTCTAAGAGAAAATAAGAAATAa
gi|46555 : AACCTGCACATT----------TATGCTGTACT-ATCAGGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATAAATTAT-C------A-------AAA-----AA----------CA-----CTA-TTT-A-GACCAGGAATGGAATTTAAG-GG-AA-ATGGTCTGT--TACATATATTTACCTGTCTAAGAGAGAATAAGAAAT
gi|46556 : AGCCTGCACATT----------CGTGCTGTACT-ATCAAGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATAAATCAT-C------A-------AAA-----AA----------CA-----CTA-TTT-A-GACCAGGAATGGAATTTTAC-GCGAA-ATGGTCTCT--TACATATATTTACCTGTCTAAGAGAGAATAAGAAATA
gi|46557 : AGCCTGCACATT----------CATGCTGTACT-ATCAGGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATACATTAT-CCACAAAA-------AAA-----AA----------CA-----CTA-TTT-A-GACCAGGAATGGAATTTAAG-GGAAA-ATGTTTTGT--TACATATATTTACCTGTCTAAGAGAGAATAAGAAAa
gi|46558 : AGCCTGCACATT----------CATGCTGTACT-ATCAGGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATACATTAT-C------AAAAAAACAAA-----AA----------CA-----CTA-TTT-A-GACCAGGAATGAAATTTAAG-GGAAA-AT-GTTTGT--TACATATATTTACCTGTCTAAGAGGGAATAAGAAATA
gi|46559 : AGCCTGCACATT----------CATGCTGTACT-ATCAGGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATACATTAT-C------AAAAAAC-AAA-----AA----------CA-----CTA-TTT-A-GACCAGGAACGGAATTTAAG-GGAAA-AT-ATTTGT--TACATATATTTACCTGTCTAAGAGGGAATAAGAAATAa
gi|46560 : AGCCTGCACATT----------CATGCTGTACT-ATCAGGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATACATTAT-C------AAAAAAC-AAA-----AA----------CA-----CTA-TTT-A-GACCAGGAACGGAATTTAAG-GGAAA-AT-ATTTGT--TACATATATTTACCTGTCTAAGAGGGAATAAGAAATAa
gi|46561 : AGTCTGCACATT----------CATGCTGTACT-ATCAGGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATAAATCAT-T------A-------AAA-----A-----------CA-----CTA-CTT-A-GACCAGTAATGTAATTTAAG-GGAAA-ATGGTCTGT--TACATATATTTACCTTTATAAGAGAGAACAAGAAATa
gi|46562 : AGCCTGCACATT----------CATGCTGTACT-ATCAGGGTTT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATACATTAT-CAAA---A-------AAA-----AA----------CA-----CTA-ATT-A-GACCAAGAATGGAA-TTAAG-GGAAA-ATGTTTTGT--TACATATATTTACCTGTCTAAGAGAGAATAAGAAATA
gi|46563 : AGCCTGCACATT----------CATGCTGTACT-ATCAGGGTTT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATACATTAT-CAAA---A-------AAA-----AA----------CA-----CTA-ATT-A-GACCAAGAATGGAA-TTAAG-GGAAA-ATGTTTTGT--TACATATATTTACCTGTCTAAGAGAGAATAAGAAATAa
gi|46564 : AGCCTGCACATT----------CATGCTGTACT-ATCAGGGTTT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATACATTAT-CAAA---A-------AAA-----AA----------CA-----CTA-ATT-A-GACCAAGAATGGAA-TTAAG-GGAAA-ATGTTTTGT--TACATATATTTACCTGTCTAAGAGAGAATAAGAAATAa
gi|46565 : AGCCTGCACATT----------CATACTGTACT-ATCAGGGTAT---ACATACTGTTAGCTGCTCA-GTCAATCAATTGT-C------A-------AAA-----AA----------CA-----CTA-TTT-A-GACCAGGAATGTAATTTAAT-TAAAA-ATGGTCTGT--TACATATATTTACCTGTCTA--AGAGAATAAGAAAa
gi|46566 : AGCCTGCACATTGATGATGATTCATGCTGTACT-ATCAGGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATACATTAT-C------A-------AAAAAAAAAA----------CA-----CTA-TTT-A-GACCAGGAATGGAATTTAAG-GGGAA-ACGTTTTGT--TACATATATTTACCTGTCTAAGAGAGAATAAGAAATAaaa
gi|46567 : AGCCTGCACATT----------CATGCTGTACT-ATCAGGGTAT---A--TACTGT-------------CAATAAATTAT-C------A-------AAA-----AA----------CA-----CTA-TTT-A-GACCAGGAATGGAATTTAAG-GGAAA-ATGGTCTGT--TTCATATATTTACCTGTCTAAGAGAGAATAAGAAATAa
gi|46568 : AGCCTGCACATT----------CATGCTGTACT-ATCTGAGTAT---A--TATTGTTTGTTACTCA-GTCAATAAATTAC-C------A-------AAA-----AA----------AT-----CTA-TTT-A-GACCAGGAATGGa
gi|46569 : AGCCTTCACATT----------CATGCTGTACT-ATCAGGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATACATTAT-C------A-------AA
gi|46570 : GCCTGCACATT----------CATGCTGTACT-ATCAGGGTATATAA--TACTGTTTGCTACTCA-GTAAATAAATTAC-C------A-------
gi|46571 : CTGCACAAT----------CATGTTGTTCT-A-CAGGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTTA-GTCAATAAATTAA-A------A-------AAA-----AA----------CAACACCCTA-TTT-A-GACCAGGAATGGAATTTAAA-GGGAA-ATGGTCTGT--TACATATATTTACCTGTCTAAGAGAGAATAAGAAATA
gi|46572 : GCA-ATC----------CATGCAGT-CTGAGCAGGGTCT---A--CACTGTTTGCTACTCA-GTCAATAAATTATAA------A-------AAA-----AA----------CA-----CCC-TAT-A-AATCAGGAATA------AAG-----A-ATGGTCCAT--T---TATA
gi|46573 : TT----------CATGCTGTACT-ATCAGGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATACATTAT-C------A-------AAA-----AAAACAAA----CA-----CTA-ATT-A-GACCAGGAATGGAATTTAAG-GGAAA-ATGTTTTGT--TACATATATTTACCTGTCTAAGAGAGAAAAAGAAATAaaccatgtgatgaataaagggatattaaaataaaa
gi|46574 : GTACT-ATCAGGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATAAATTAT-C------A-------AAA-----AA----------CA-----CTA-TTT-A-GACCAGGAATGATATTTAAG-GGAAA-ATGGTCTGT--TACATATATTTACCTGTCTAAGAGAGAATAAGAAATAa
gi|46575 : GTAT---A--TACTGTTTGCTACTCA-CCCAATAAATTAT-C------A-------AAA-----AA----------CA-----CTA-TTT-A-GATCAGGAATGGAATTTAAG-GGAAA-ATGGTCTGT--TACATATATTTACCTGTCTTAGAGAGAAAAAGAAATAa
blockSeqs : GATGATGATT G ATA CA A A A AAAAAAAC AAAAAACAAAAA ACACC T T T C T TA
blockSeqs : GATGATGATT G . . . A . CACAAAA AAAACAAA . T . . C . .
blockSeqs : . . . . . A . AAAAAAC AAAAAAA . T . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . AAAAAAC AAA . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C . AAAA TT . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . AAAA TT . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C . AAAA TT . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . A TT . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . A AA . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . A AA . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C . A AA . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C . A AA . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C . A AA . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C . A AA . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . A AA . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C . A AA . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C . A AA . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C . A AA . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . A AA . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C . A AA . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . A AA . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . A AA . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C . A AA . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . A AA . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . A AA . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . A AA . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C . . T . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqCons : A*************
originalCons : AGCCTGCACATT----------CATGCTGTACT-ATCAGGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATAAATTAT-C------A-------AAA-----AA----------CA-----CTA-TTT-A-GACCAGGAATGGAATTTAAG-GGAAA-ATGGTCTGT--TACATATATTTACCTGTCTAAGAGAGAATAAGAAATA
finalCons : AGCCTGCACATT----------CATGCTGTACT-ATCAGGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATAAATTAT-CA-------------AAA-----AA----------CA-----CTA-TTT-A-GACCAGGAATGGAATTTAAG-GGAAA-ATGGTCTGT--TACATATATTTACCTGTCTAAGAGAGAATAAGAAATA
Alignments
lowQualScore : 1111111111 22222222222222 11111111111111111
lowQualScore : 1111111111 3 222 11 1 2 1 00000000000000 00000000000000000 33333 5 1 1 4 1 22
lowQualScore : .......... . ... .. . . . .............. ................. ..... . . . . . ..
lowQualScore : 7777777777 9 222 77 2 3 2 88888888888888 88888888888888888 33333 3 3 3 3 4 00
consensus : AGCCTGCACATT----------CATGCTGTACT-ATCAGGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATAAATTAT-C------A-------AAA-----AA----------CA-----CTA-TTT-A-GACCAGGAATGGAATTTAAG-GGAAA-ATGGTCTGT--TACATATATTTACCTGTCTAAGAGAGAATAAGAAATA
Reference ( family-623 ) : AGCCTGCACATT----------CATGCTGTACT-ATCAGGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATAAATTAT-C------A-------AAA-----AA----------CA-----CTA-TTT-A-GACCAGGAATGGAATTTAAG-GGAAA-ATGGTCTGT--TACATATATTTACCTGTCTAAGAGAGAATAAGAAATA
gi|46544 : AGCCTGCACATC----------CAAGCCGTGTTTATCAATGTAT---G--CACTGTTTGCTACGCA-GTCAGTAAATTAT-C--------------AAA-----TT----------CA-----CCATTTT-A-AATCAGGAATGGAATTTAAGCAAAAA-ATGGTCCAT--TACATATATTTAACGGACTCGTAGAGAATTATAAATA
gi|46545 : tcAGCCTGCACATC----------CAAGCCGTGTT-ATCAATGTAT---G--CACTGTTTGCTACGCA-GTCAATGAATTAT-C--------------AAA-----TT----------CA-----CCATTTT-A-AATCAGGAATGGAATTTAAGCAAAAA-ATGGTCCTT--AATATATATTTAACGGGCTCATAGAGAATTATAAATAaaaccttattta
gi|46546 : tcAGCCTGTACATC----------CGAGCCGTGTT-ATCAATGTAT---G--CACTGTTTGCTACGCA-GTCAGTAAATTAT-C--------------AAA-----TT----------CA-----CCATTTT-A-AATCAGGAATGGAATTTAAG-CAAAA-ATGGTCCAT--TATATATATTTAACGGGCTCATAGAGAATAATAAATAaaaccttattta
gi|46547 : tcAGCCTGCACATC----------CAAGCCGTGTT-ATCAAGGTAT---G--CACTGTTTGCTACGCA-TTCAGTAAATTAT-C--------------AAA-----TT----------CA-----CCATTTT-A-AATCAGGAATGGAATTTAAG-CAAAATATGGTTCATTATATATATATTTAACGGGCT-ATAGAGAATAATAAATaaaccgtagtta
gi|46548 : tcAGCCAGCACATC----------CAAGCCATGTT-ATCAAGGTAC---G--CA------GGTAGTAA-ACCATTA--TTAT-C------A-------AAA-----T-----------CA-----TCA-TTTTA-AATCAGGAATGGAATTAAAGCAAAAA-ATGGTCGAT--TACATATATTTAACTGGCTCATAGAGAATAATAAATAtaaaccttattta
gi|46549 : tcAGCCTGCACATC----------CAAGCCATGTT-ATCAAGGTAT---G--CACTGTTTGCTACAAA-GTCAGTAAATTAT-C--------------AAA-----TT----------CA-----CCA-TTT-GTAATCAGGAATGattaattattaaataaaaccttattta
gi|46550 : tcCATC----------CATGCAAT-CTGAGCAGGGTCT---A--CACTGTTTGCTACTCA-GTC--------------------------AAA-----AA----------CA-----CCC-TAT-A-AATCAGGAATA------AAG-----A-ATGGTCCAT--T---TATA
gi|46551 : tcagcAGCCTGCACATT----------CATGCTGTACT-ATCAGGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATACATTAT-C------A-------AAA-----AAAAAACAAAAACA-----CTA-ATT-A-GACCAAGAATGGAATTTAAG-GGAAA-ATGTTTTGT--TACATATATTTACCTGTCTAAGAGAGAATAAGAAATAaaccatgtgatgaataaagggataatattaaaataaaa
gi|46552 : AGCCTGCACATT----------CATGCTATACT-ATCAGGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATAAATTAT-C------A-------AAA-----A-----------CA-----TTA-TTT-A-GACCAGGAATGGAATTTAAG-GGAAA-ATGGTCTGT--TACATATATTTACCTGTCTAAGAGAGAATAAGAAATAa
gi|46553 : AGCCTGCACATTGATGATGATTCGTGGTGTACT-ATCAGGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTCAAGTCAATACATTAT-A------A-------AAAA----AA----------CA-----CTA-TTT-A-GACCAGGAATGGAGTTTAAG-GGAAA-ATGTTTTGT--TACATATATTTACCTGTCTAAGAGAGAATAAGAAATAa
gi|46554 : AGCCTGCACATT----------CATGCTGTACT-ATCAGGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATAAATTAT-C------A-------AAA-----AA----------CA-----CTA-TTT-A-GACCAGGAATGGAATTTAAG-GGAAA-ATGATCTGT--TACATATATTTACCTGTCTAAGAGAAAATAAGAAATAa
gi|46555 : AACCTGCACATT----------TATGCTGTACT-ATCAGGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATAAATTAT-C------A-------AAA-----AA----------CA-----CTA-TTT-A-GACCAGGAATGGAATTTAAG-GG-AA-ATGGTCTGT--TACATATATTTACCTGTCTAAGAGAGAATAAGAAAT
gi|46556 : AGCCTGCACATT----------CGTGCTGTACT-ATCAAGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATAAATCAT-C------A-------AAA-----AA----------CA-----CTA-TTT-A-GACCAGGAATGGAATTTTAC-GCGAA-ATGGTCTCT--TACATATATTTACCTGTCTAAGAGAGAATAAGAAATA
gi|46557 : AGCCTGCACATT----------CATGCTGTACT-ATCAGGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATACATTAT-CCACAAAA-------AAA-----AA----------CA-----CTA-TTT-A-GACCAGGAATGGAATTTAAG-GGAAA-ATGTTTTGT--TACATATATTTACCTGTCTAAGAGAGAATAAGAAAa
gi|46558 : AGCCTGCACATT----------CATGCTGTACT-ATCAGGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATACATTAT-C------AAAAAAACAAA-----AA----------CA-----CTA-TTT-A-GACCAGGAATGAAATTTAAG-GGAAA-AT-GTTTGT--TACATATATTTACCTGTCTAAGAGGGAATAAGAAATA
gi|46559 : AGCCTGCACATT----------CATGCTGTACT-ATCAGGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATACATTAT-C------AAAAAAC-AAA-----AA----------CA-----CTA-TTT-A-GACCAGGAACGGAATTTAAG-GGAAA-AT-ATTTGT--TACATATATTTACCTGTCTAAGAGGGAATAAGAAATAa
gi|46560 : AGCCTGCACATT----------CATGCTGTACT-ATCAGGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATACATTAT-C------AAAAAAC-AAA-----AA----------CA-----CTA-TTT-A-GACCAGGAACGGAATTTAAG-GGAAA-AT-ATTTGT--TACATATATTTACCTGTCTAAGAGGGAATAAGAAATAa
gi|46561 : AGTCTGCACATT----------CATGCTGTACT-ATCAGGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATAAATCAT-T------A-------AAA-----A-----------CA-----CTA-CTT-A-GACCAGTAATGTAATTTAAG-GGAAA-ATGGTCTGT--TACATATATTTACCTTTATAAGAGAGAACAAGAAATa
gi|46562 : AGCCTGCACATT----------CATGCTGTACT-ATCAGGGTTT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATACATTAT-CAAA---A-------AAA-----AA----------CA-----CTA-ATT-A-GACCAAGAATGGAA-TTAAG-GGAAA-ATGTTTTGT--TACATATATTTACCTGTCTAAGAGAGAATAAGAAATA
gi|46563 : AGCCTGCACATT----------CATGCTGTACT-ATCAGGGTTT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATACATTAT-CAAA---A-------AAA-----AA----------CA-----CTA-ATT-A-GACCAAGAATGGAA-TTAAG-GGAAA-ATGTTTTGT--TACATATATTTACCTGTCTAAGAGAGAATAAGAAATAa
gi|46564 : AGCCTGCACATT----------CATGCTGTACT-ATCAGGGTTT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATACATTAT-CAAA---A-------AAA-----AA----------CA-----CTA-ATT-A-GACCAAGAATGGAA-TTAAG-GGAAA-ATGTTTTGT--TACATATATTTACCTGTCTAAGAGAGAATAAGAAATAa
gi|46565 : AGCCTGCACATT----------CATACTGTACT-ATCAGGGTAT---ACATACTGTTAGCTGCTCA-GTCAATCAATTGT-C------A-------AAA-----AA----------CA-----CTA-TTT-A-GACCAGGAATGTAATTTAAT-TAAAA-ATGGTCTGT--TACATATATTTACCTGTCTA--AGAGAATAAGAAAa
gi|46566 : AGCCTGCACATTGATGATGATTCATGCTGTACT-ATCAGGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATACATTAT-C------A-------AAAAAAAAAA----------CA-----CTA-TTT-A-GACCAGGAATGGAATTTAAG-GGGAA-ACGTTTTGT--TACATATATTTACCTGTCTAAGAGAGAATAAGAAATAaaa
gi|46567 : AGCCTGCACATT----------CATGCTGTACT-ATCAGGGTAT---A--TACTGT-------------CAATAAATTAT-C------A-------AAA-----AA----------CA-----CTA-TTT-A-GACCAGGAATGGAATTTAAG-GGAAA-ATGGTCTGT--TTCATATATTTACCTGTCTAAGAGAGAATAAGAAATAa
gi|46568 : AGCCTGCACATT----------CATGCTGTACT-ATCTGAGTAT---A--TATTGTTTGTTACTCA-GTCAATAAATTAC-C------A-------AAA-----AA----------AT-----CTA-TTT-A-GACCAGGAATGGa
gi|46569 : AGCCTTCACATT----------CATGCTGTACT-ATCAGGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATACATTAT-C------A-------AA
gi|46570 : GCCTGCACATT----------CATGCTGTACT-ATCAGGGTATATAA--TACTGTTTGCTACTCA-GTAAATAAATTAC-C------A-------
gi|46571 : CTGCACAAT----------CATGTTGTTCT-A-CAGGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTTA-GTCAATAAATTAA-A------A-------AAA-----AA----------CAACACCCTA-TTT-A-GACCAGGAATGGAATTTAAA-GGGAA-ATGGTCTGT--TACATATATTTACCTGTCTAAGAGAGAATAAGAAATA
gi|46572 : GCA-ATC----------CATGCAGT-CTGAGCAGGGTCT---A--CACTGTTTGCTACTCA-GTCAATAAATTATAA------A-------AAA-----AA----------CA-----CCC-TAT-A-AATCAGGAATA------AAG-----A-ATGGTCCAT--T---TATA
gi|46573 : TT----------CATGCTGTACT-ATCAGGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATACATTAT-C------A-------AAA-----AAAACAAA----CA-----CTA-ATT-A-GACCAGGAATGGAATTTAAG-GGAAA-ATGTTTTGT--TACATATATTTACCTGTCTAAGAGAGAAAAAGAAATAaaccatgtgatgaataaagggatattaaaataaaa
gi|46574 : GTACT-ATCAGGGTAT---A--TACTGTTTGCTACTCA-GTCAATAAATTAT-C------A-------AAA-----AA----------CA-----CTA-TTT-A-GACCAGGAATGATATTTAAG-GGAAA-ATGGTCTGT--TACATATATTTACCTGTCTAAGAGAGAATAAGAAATAa
gi|46575 : GTAT---A--TACTGTTTGCTACTCA-CCCAATAAATTAT-C------A-------AAA-----AA----------CA-----CTA-TTT-A-GATCAGGAATGGAATTTAAG-GGAAA-ATGGTCTGT--TACATATATTTACCTGTCTTAGAGAGAAAAAGAAATAa