lowQualScore : 1111111 1 333333333333333333333333 1111
lowQualScore : 0000000 1 9999999 1 1 22 22 22 3 0 7777 1 444 33333 2 222 666 4444444 3333 3333 1 0 555555555555555555555555 1 1 5555555 3333 7 5 22 1 1
lowQualScore : ....... . ....... . . .. .. .. . . .... . ... ..... . ... ... ....... .... .... . . ........................ . . ....... .... . . .. . .
lowQualScore : 7777777 7 1111111 5 5 00 00 00 1 2 5555 5 888 88888 2 777 777 9999999 3333 3333 5 5 666666666666666666666666 5 5 0000000 5555 3 2 44 7 7
consensus : TAAAGGTTTGGAAGGC------ATAC-AGCTTATT------CA-TGACA-ATGCTTCT--GCCCAC--AAAA--GTAAAAGTGT-ACAATC----TTTCT-T---AGAACA-----AGAAA---A-G-GTTATTCAG-----G-TTG----A----A-CACC-----CCC-------C-----TT-ATTCC-C-C-------TGACTT-AAGCCCC-TGTGA--CTTTTT-CCTATTT-CCCATGCTAA
Reference ( gi|120450 ) : TAAAGGTTTGGAAGGT------ATAC-AGCTTATT------TA-TGACA-ATGCTTCT--GCCCAC--AAAA--GTAAAAGTGT-ACAATC----TTTCT-T---AGAACA-----ATAAA---A-G-GTTATTCAG-----G-TTG----A----A-CACC-----TCC-------C-----TA-ATTCC-C-C-------TGACTT-TAGCTCC-TGTGA--CTTTTT-CCTATTT-CCCATGCTAA
gi|120457 : TAAAGGTTTGGAAGGC------ATAC-AGTTTATT------CG-TGATA-ATGCTTCT--GCCCAC--AAAA--GTAAAAGCGT-AGAATC----TTTCA-T---AGAACA-----ACAAA---A-G-GTTATTCAG-----C-TTG----A----A-CATC-----TCC-------T-----TT-ATTCC-C-C-------TGACTA-AAGCCTC-TGCGA--CGTTTT-CCTACTT-ACCATGCT
gi|120453 : TAACGGTTTAGAAGGC------ATAC-AGCTTATTAGTTATTAATGACA-ATGCTTCT--GCCCAC--AAAA--GTAAAAGTGT-ACAATC----TTTCT-T---AGAACA-----AGAAA---A-G-GTTATTCAG-----C-TTA----A----A-CACT-----CCG-------C-----TT-ATTCA-A-C-------CGACTT-AAGCCCC-TGTGA--CTTTTC-CCTAGTT-CCCATGCTAA
gi|120451 : TAAAGGTTTGGAAGGC------ATAC-AGCTTATT------CA-TAACA-ATGTTTCT--GCCCAT--AAAA--GTAAAAGTGT-GCACTA----TTTAT-A---AGAACA-----A-AAA---A-T-GTTATTCAG-----G-TTG----A----A-CTCC-----CCC-------G-----TT-ATTCC-C-C-------TGACTA-AAGCCCC-TGTGA--CGTTTT-CCTATTT-CCCATGCTAA
gi|120454 : TAAAGGTTTGGAAGGC------AAAC-AGTTTATT------CA-TGACA-ATGCTTCT--GTCCAC--AAAA--GTAAAAGTGT-TTAATC----TTTCT-T---AGAACA-----ATTAA---A-A-GTTCTTCAG-----C-TTG----A----A-CATC-----CCA-------C-----TT-ATTCA-C-C-------TGACTT-AAGCCCC-TGTGG--CTTTTT-CTTATAT-CCCATGCTA
gi|120452 : TAAAGATTTGGAAGGC------ATGA-AGCTTATT------CA-TGACA-ATGCTTTT--GCCCAC--AAAA--GTAAAAGTGT-ACAATC----TTTCT-T---ATAACA-----AGAAA---A-ATGTTATTCAG-----G-TTG----A----A-CACC-----ATC-------T-----T--ATACC-C-C-------TGGCTA-AAGTCCC-TGTGG--CTTTAT-CCTTTTC-CCCATGCTAA
gi|120458 : TAAAGGTTTGAAATGC------ATAC-AGTTTATT------CA-TGGCA-ACGTTACC--GCCCAC--AATA--GTAAAAGTGT-GCAACC----TTTCT-T---AGAACA-----AGAAA---A-G-GTTATTCAG-----G-TTG----A----A-CACCGCCCGCCC-------C-----T--ATTCC-C-C-------TGATTC-AACCCCC-TGTGA--CGTTTT-CCTATTT-TCCATCCTAA
gi|120455 : TAAATGTGTGAAAGGC------ATAC-AGATCAAT------CA-TGACA-ACGATTCT--GCCAAC--AAAA--GTAAAAGTGT-ACAATC----TATCT-T---AGAACA-----AGAAA---ATG-GTT-TTCAG-----G-TTG----A----A-CACC------CC-------C-----TT-ATTCC-C-C-------TGGCGT-AAGGCCC-TGTAA--CCTTTT-CCTATTT-CCCATGCTA
gi|120456 : TAAAGGTTTGCCAGGC------ACAC-AGCTTATT------CA-TGACA-ATGCCTCT--GCTCAC--AAAA--GTAAAAGTGT-ACAATC----TTTCT-A---AGAACA-----AGAAA---A-T-GTTATTCAG-----GTTTG----A----A-CTCC-----ACC-------T-----T--ATTCCGCAC-------TAAC------CCCC-TGTGC--CGTTTT-CCTATTT-CCCATGCTAA
gi|120460 : TAAATGTTTGGAAGGC------ATAC-AGCCTATT------CA-TGACA-ATGCTTCT--GCCAAC--AAAA--A-GAAAGTGT-ACAATA----TTTCT-T---AAAACA-----ATAAA---C-A-GTTATTCAG-----G-TTG----A----A-CCCCCA---TCC-------CCTCCGT--ATTCT-C-CTGTCTTATGACTTATGACCCC-TGTGA--CTTTTT-CCTATTT-CCGATGCT
gi|120459 : TAAAGGTTTGGAAAGC------ATAC-AGCTTATT------CA-TGACA-ATGCTTCT--GCCCTC--AAAG--GTCAAAGTGT-ACAATC----TCTCT-T---AGAATA-----AGAAA---G-G-GTTATTGAG-----G-TTG----A----A-CACC-----CCG-------T-----TT-ATTCC-C-C-------TGACTT-AAACGCC-TGTG----------------T-CCCATGCT
gi|120461 : TAAATGTTTGAAAG----------ACTAGCTTATT------CA-TGCTA-ATGTTTCT--GTCCAC--AAAA--CTAAAAGTGT-ACACTCTTTTTTTTT-T---TG-ACA-----AGAAA---A-T-GTTATTTAG-----A-TTG----A----A-CACC------CC-------C-----TA-ATTCC-C-C-------TGACGT-CAACCCC-TATGA--CTTTTTCCCTATTT-CCCATGCTAA
gi|120462 : TAAAGGTTTGGAAGGC------ATAT-AACTTATT------TC-TAACA-ATGCTTCT--GCCCAC--AAAA--GTAAAA-TGT-ACAATC----TTTCT-T---AGAACATGGTTCTAGATCTA-G-G---TTCAG-----G-TTG----A----A-CACC------CC-------C-----TT-ATTCC-----------------------CC-TGTGATTTTTTTT-CATATTT-CCCATGCT
gi|120463 : TAAAGGTTTGGAATGC------ATAC-AGCTTATT------CA-TGACA-CTGTTTCT--ACCCAT--AAAA--GTAAAGATGT-ACAATC----TTTCT-T---AGAACA-----A-GAA---T-G-GTTATTCA----------------------------------------------------TCC-C-C-------------------CT-TGTGA--C-TTTT-ACTATTT-CCCATGCTAA
gi|120464 : TAAAAGTTTGGAAGC----------C-AGCTTATT------CA-TGACA-ATGCTTCG--GCCCAC--AAAA--GTAGAAGTGT-AC---T----TTTTT-T---AGACCA-----AGAAA---A-G-GTT-T-----------------------------------------------------ATTCC-C-T-------TGAATG-AAGCTTT-TGTAG--TTTTTT-CCTATTTCCCCATGTTAA
gi|120465 : TAAATGTTTGGAAGGC------ATA---GCTTATT------CA-TGACA-ATGCTTCT--GCCCAC--AAAA--CTAAAATTAT-TCACTC----TTTTT-TTTAAGAACA-----AGAAA---A---GTTATTCAG-----A-TT
gi|120466 : TAAAGGTTTGAATGGTTATTTTATCC-AGTTTATC------CA-TGACA-ATGCCCCA--GCCAAG--AAAA--GTCAAATAGT-GCCGTC----TGTCT-T---GCAGCA-----AGAAA---A-T-GGCATTAAA-----A-TCA----A----A-CACC-----CAC-------C-----TT-ATTAT-C-C-------TGATCT-TAGC-CA-TGTGA---TTGTT-CCTACTT-CCCCTGCTGA
gi|120467 : TAAATGTTTGGAAGGT------ATAC-AGCTGATT------CA-TGACA-ACGTTTCT--GCCTAC--AAAA--GGAAAA
gi|120468 : AAAGGTTTGGAAGGC------ATAC-AGCTTATT------CA-TGACA-ATGCTTCT--GCCCAT--GCAA--GTAACATTGT-ACAATC----CTTCT-T---GGAACA-----AGAAA---A-G-GTTATTCAG-----G-ATG----A----A-CTCC-----ACCA------C-----TT-ATTTC-C-C-------TGACTT-
gi|120469 : AAGGTTTGAAAGGC------ATAC-AGATTATT------CA-CGACA-ATGCTTTT--GACGGC--AAAA--ATAAAAGTGT-ACAATC----TTTGT-T---TGAGCA-----AGAAA---A-T-GTTATTAAG-----G-TCG----A----A-C-CC-----TCC-------C-----TT-ATTCC-C-C-------TGACTT-AAGCCCC-TGTGA--CTCTTT-CCTTTTT-CCCAaa
gi|120470 : AAGGTTTAGAAGAC------AAAC-AGCTTATT------TA-TGACA-ATGCTTCT--AACCAC--AAAA--TTAA
gi|120471 : AGGTTTGGAAGGC------ATAC-AGTTTATT------CA-TGATA-ATGCGTCT--GTCCAC--CACA--GTAAAAGTGT-ACAATC----TTTCT-T---AGAACA-----AGAAA---A-T-GTTATTCAG-----G-TTG----A----A-CACC------CC-------C-----TT-ATTCC-C-T-------TGGCTT-AAGCT
gi|120472 : GGTGTGAGGGGT------ATCT-GTCTTATC------CA-TGAAA-ATGTATCC--GCACAC--AAGA--GTAATATTGT-GCA-TCAA--TTTCT-GCG-GGACCA-----ACAA--------GTCAAACAA-----C-TGC----A----G-CACC-----CTC-------C-----AT-ACTCG-T-C-------AGACAT-GAGTCCC-TGTGA--CTTCTA-TCTCTTT-gtg
gi|120474 : GTTTGGAAGGC------ATTC-CCCTAATC------AA-TGACA-ATACTTCTCTGTCTAC--AAAA--GTAAAATAAT-TCAATC----TTTCT-T---AGAACA-----AGAAA---A-G-GTTATTTAG-----G-TTG----A----A-CACC------CC-------C-----TT-ATTCC-C-C-------T
gi|120475 : ------ATAA-AACTTCTA------CA-TGACA-ATGTTCCA--GCTCAC--AAAACCGTAACTGTATTACAGTT----GCTCT--------ACC-----ATAAA---C-GAGT------G-----G-ATGTGCTACCCCA-TACC-----TCC-------T--------ATTCC-C-C-------ATA-TT-AAGCCCCATGTGA--CTTCTT-CCTCTTC-CC
gi|120477 : aaagcaaCTTATC------CA-TGAAA-ATGTATCT--GCACAC--AAGA--GTAATATTGT-GCAG-CAG--TTTCTGC---AGAAC-------CAAC---C-A-GTCAAACAA-------TTG----A----AGCACC-----CTT-------C-----TT-ATTTG-C-C-------ATACCT-GAGTCCC-TGTGA--CTTATT-CCTCTTT-CCTATACT
gi|120478 : TATT------CA-TAAAATATGCTTCT--TCTCGTCAAAAA--GTAAAAGTGT-ACAATC----TTTCT-T---AGAACA-----AGAAA---A-T-GTTATTCAG-----G-TTA--------------T-----TTC-------C-----TA-TTTCC-C-C-------T
gi|120473 : A-TGACA-ACGCCCCT--GCGCAT--AAGT--CTGCTATTGTGACC-TC----GTTTT-T----GAACA-----AGGAA---A-G-G--GTTCGA-----G-TT--------------CT-----TCCACATGCAC-----CATATTCC-C-C-------AGAC-C-TAGCCCCGTGTGA--CTATTT-CTTGTTC-CCTA
gi|120479 : ggcttaaagcacctatcgctgttgcGTGT-ACAATC----TTTCT-T---AGAACA-----AGAAT---A-G-ATTATTCAGTTCAGG-TTG----A----A-CACC----------------------------C-C-T-------T--CTT-T--CCCC-TTTGA--CCTTTT-TCTATTC-CCCATGCTAA
gi|120480 : ----A----A-CACC------CC-------C-----TT-ACTCC-T-C-------AGACAT-T-GCCCCATGTGA--CTTCTT-TCTTTTT-CCCA
gi|120481 : aatgttacagtgctatTT-AAGCCTC-TGTGA--CTTTTT-CCTAATT-CCCATGCAAA
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|120476 ): GGCATCCAGCTGACTTGTGACGATACATCAGCTAACAAATCTAAAATATACAGTCTTTATGAAGCAAGAAAATGTGTTCCACAGCTTTATCATATTTTTACAACCCACGTTATTCTCCAGACCTCTGTCCCTGTGACCCTT
Alignments
lowQualScore : 444444 44 4444444 1 11 11 11 0 2 0 7777 1 444 1 33333 222 666 33333 222 333 6666666666 1 777 555 222 222 444 77777777 1 1 2 1 4 22 1 1
lowQualScore : ...... .. ....... . .. .. .. . . . .... . ... . ..... ... ... ..... ... ... .......... . ... ... ... ... ... ........ . . . . . .. . .
lowQualScore : 333333 11 5555555 4 99 99 99 4 9 1 0000 4 555 4 66666 555 777 66666 555 999 3333333333 4 111 444 555 555 555 44444444 5 5 1 5 6 22 7 7
consensus : TAAAGGTTTGGAAGGC------A--TACAGCTTATTC-------ATGACA-ATGCTTCT--GCCCAC--AAAA--GTAAAAGTGT-ACAATC----TTTCT-T---AGAA-CAAG-----AAA---A-G-GTTA-----TT---CAGG---TTGA----------A-C-ACC---C---C---CCT---TATTCCCC-------TGA-C-TTAAG-CCCC-TGTGA--CTTTTT-CCTATTT-CCCATGCTAA
Reference ( family-621 ) : TAAAGGTTTGGAAGGC------A--TACAGCTTATTC-------ATGACA-ATGCTTCT--GCCCAC--AAAA--GTAAAAGTGT-ACAATC----TTTCT-T---AGAA-CAAG-----AAA---A-G-GTTA-----TT---CAGG---TTGA----------A-C-ACC---C---C---CCT---TATTCCCC-------TGA-C-TTAAG-CCCC-TGTGA--CTTTTT-CCTATTT-CCCATGCTAA
gi|120450 : TAAAGGTTTGGAAGGT------A--TACAGCTTATTT-------ATGACA-ATGCTTCT--GCCCAC--AAAA--GTAAAAGTGT-ACAATC----TTTCT-T---AGAA-CAAT-----AAA---A-G-GTTA-----TT---CAGG---TTGA----------A-C-ACC---T---C---CCT---AATTCCCC-------TGA-C-TTTAG-CTCC-TGTGA--CTTTTT-CCTATTT-CCCATGCTAA
gi|120451 : TAAAGGTTTGGAAGGC------A--TACAGCTTATTC-------ATAACA-ATGTTTCT--GCCCAT--AAAA--GTAAAAGTGT-GCACTA----TTTAT-A---AGAA-CAA------AAA---A-T-GTTA-----TT---CAGG---TTGA----------A-C-TCC---C---C---CGT---TATTCCCC-------TGA-C-TAAAG-CCCC-TGTGA--CGTTTT-CCTATTT-CCCATGCTAA
gi|120452 : TAAAGATTTGGAAGGC------A--TGAAGCTTATTC-------ATGACA-ATGCTTTT--GCCCAC--AAAA--GTAAAAGTGT-ACAATC----TTTCT-T---ATAA-CAAG-----AAA---A-ATGTTA-----TT---CAGG---TTGA----------A-C-A-C---C---A---TCT---TATACCCC-------TGG-C-TAAAG-TCCC-TGTGG--CTTTAT-CCTTTTC-CCCATGCTAA
gi|120453 : TAACGGTTTAGAAGGC------A--TACAGCTTATTAGTTATTAATGACA-ATGCTTCT--GCCCAC--AAAA--GTAAAAGTGT-ACAATC----TTTCT-T---AGAA-CAAG-----AAA---A-G-GTTA-----TT---CAGC---TTAA----------A-C-ACT---C---C---GCT---TATTCAAC-------CGA-C-TTAAG-CCCC-TGTGA--CTTTTC-CCTAGTT-CCCATGCTAA
gi|120454 : TAAAGGTTTGGAAGGC------A--AACAGTTTATTC-------ATGACA-ATGCTTCT--GTCCAC--AAAA--GTAAAAGTGT-TTAATC----TTTCT-T---AGAA-CAAT-----TAA---A-A-GTTC-----TT---CAGC---TTGA----------A-C-ATC---C---C---ACT---TATTCACC-------TGA-C-TTAAG-CCCC-TGTGG--CTTTTT-CTTATAT-CCCATGCTA
gi|120455 : TAAATGTGTGAAAGGC------A--TACAGATCAATC-------ATGACA-ACGATTCT--GCCAAC--AAAA--GTAAAAGTGT-ACAATC----TATCT-T---AGAA-CAAG-----AAA---ATG-GTT------TT---CAGG---TTGA----------A-C-A-C---C---C---CCT---TATTCCCC-------TGG-C-GTAAG-GCCC-TGTAA--CCTTTT-CCTATTT-CCCATGCTA
gi|120456 : TAAAGGTTTGCCAGGC------A--CACAGCTTATTC-------ATGACA-ATGCCTCT--GCTCAC--AAAA--GTAAAAGTGT-ACAATC----TTTCT-A---AGAA-CAAG-----AAA---A-T-GTTA-----TT---CAGGT--TTGA----------A-C--TC---C---A---CCT---TATTCCGC---------A-C--TAAC-CCCC-TGTGC--CGTTTT-CCTATTT-CCCATGCTAA
gi|120457 : TAAAGGTTTGGAAGGC------A--TACAGTTTATTC-------GTGATA-ATGCTTCT--GCCCAC--AAAA--GTAAAAGCGT-AGAATC----TTTCA-T---AGAA-CAAC-----AAA---A-G-GTTA-----TT---CAGC---TTGA----------A-C-ATC---T---C---CTT---TATTCCCC-------TGA-C-TAAAG-CCTC-TGCGA--CGTTTT-CCTACTT-ACCATGCT
gi|120458 : TAAAGGTTTGAAATGC------A--TACAGTTTATTC-------ATGGCA-ACGTTACC--GCCCAC--AATA--GTAAAAGTGT-GCAACC----TTTCT-T---AGAA-CAAG-----AAA---A-G-GTTA-----TT---CAGG---TTGA----------A-C-ACCG--CCCGC---CCC---TATTCCCC-------TGA-T-TCAAC-CCCC-TGTGA--CGTTTT-CCTATTT-TCCATCCTAA
gi|120459 : TAAAGGTTTGGAAAGC------A--TACAGCTTATTC-------ATGACA-ATGCTTCT--GCCCTC--AAAG--GTCAAAGTGT-ACAATC----TCTCT-T---AGAA-TAAG-----AAA---G-G-GTTA-----TT---GAGG---TTGA----------A-C-ACC---C---C---GTT---TATTCCCC-------TGA-C-TTAAA-CGCC-TGTG----------------T-CCCATGCT
gi|120460 : TAAATGTTTGGAAGGC------A--TACAGCCTATTC-------ATGACA-ATGCTTCT--GCCAAC--AAAA--A-GAAAGTGT-ACAATA----TTTCT-T---AAAA-CAAT-----AAA---C-A-GTTA-----TT---CAGG---TTGA----------A-C-CCCCATC---C---CCTCCGTATTCTCCTGTCTTATGA-C-TTATGACCCC-TGTGA--CTTTTT-CCTATTT-CCGATGCT
gi|120461 : TAAATGTTTGAAAGAC-----------TAGCTTATTC-------ATGCTA-ATGTTTCT--GTCCAC--AAAA--CTAAAAGTGT-ACACTCTTTTTTTTT-T---TG-A-CAAG-----AAA---A-T-GTTA-----TT---TAGA---TTGA----------A-C-A-C---C---C---CCT---AATTCCCC-------TGA-C-GTCAA-CCCC-TATGA--CTTTTTCCCTATTT-CCCATGCTAA
gi|120462 : TAAAGGTTTGGAAGGC------A--TATAACTTATTT-------CTAACA-ATGCTTCT--GCCCAC--AAAA--GTAAAA-TGT-ACAATC----TTTCT-T---AGAA-CATGGTTCTAGATCTA-G-G--------TT---CAGG---TTGA----------A-C-A-C---C---C---CCT---TATT-----------------------CCCC-TGTGATTTTTTTT-CATATTT-CCCATGCT
gi|120463 : TAAAGGTTTGGAATGC------A--TACAGCTTATTC-------ATGACA-CTGTTTCT--ACCCAT--AAAA--GTAAAGATGT-ACAATC----TTTCT-T---AGAA-CAAG------AA---T-G-GTTA-----TT---CA----------------------------------------------TCCCC---------------------CT-TGTGA--C-TTTT-ACTATTT-CCCATGCTAA
gi|120464 : TAAAAGTTTGGAAG-C-----------CAGCTTATTC-------ATGACA-ATGCTTCG--GCCCAC--AAAA--GTAGAAGTGT-AC---T----TTTTT-T---AGAC-CAAG-----AAA---A-G-GT-----------------------------------------------------T---TATTCCCT-------TGA-A-TGAAG-CTTT-TGTAG--TTTTTT-CCTATTTCCCCATGTTAA
gi|120465 : TAAATGTTTGGAAGGC------A--TA--GCTTATTC-------ATGACA-ATGCTTCT--GCCCAC--AAAA--CTAAAATTAT-TCACTC----TTTTT-TTTAAGAA-CAAG-----AAA---A---GTTA-----TT---CAGA---TT
gi|120466 : TAAAGGTTTGAATGGTTATTTTA--TCCAGTTTATCC-------ATGACA-ATGCCCCA--GCCAAG--AAAA--GTCAAATAGT-GCCGTC----TGTCT-T---GCAG-CAAG-----AAA---A-T-GGCA-----TT---AAAA---TCAA----------A-C-ACC---C---A---CCT---TATTATCC-------TGATC-TTAG---CCA-TGTGA---TTGTT-CCTACTT-CCCCTGCTGA
gi|120467 : TAAATGTTTGGAAGGT------A--TACAGCTGATTC-------ATGACA-ACGTTTCT--GCCTAC--AAAA--GGAAAA
gi|120468 : AAAGGTTTGGAAGGC------A--TACAGCTTATTC-------ATGACA-ATGCTTCT--GCCCAT--GCAA--GTAACATTGT-ACAATC----CTTCT-T---GGAA-CAAG-----AAA---A-G-GTTA-----TT---CAGG---ATGA----------A-C-TCCA--C---C---ACT---TATTTCCC-------TGA-C-TTAA
gi|120469 : AAGGTTTGAAAGGC------A--TACAGATTATTC-------ACGACA-ATGCTTTT--GACGGC--AAAA--ATAAAAGTGT-ACAATC----TTTGT-T---TGAG-CAAG-----AAA---A-T-GTTA-----TT---AAGG---TCGA----------A-C--CC---T---C---CCT---TATTCCCC-------TGA-C-TTAAG-CCCC-TGTGA--CTCTTT-CCTTTTT-CCCA
gi|120470 : AAGGTTTAGAAGAC------A--AACAGCTTATTT-------ATGACA-ATGCTTCT--AACCAC--AAAA--TTAA
gi|120471 : AGGTTTGGAAGGC------A--TACAGTTTATTC-------ATGATA-ATGCGTCT--GTCCAC--CACA--GTAAAAGTGT-ACAATC----TTTCT-T---AGAA-CAAG-----AAA---A-T-GTTA-----TT---CAGG---TTGA----------A-C-A-C---C---C---CCT---TATTCCCT-------TGG-C-TTAAG----C-TGTG
gi|120472 : GGTGTGAGGGGT------A--TCTGTCTTATCC-------ATGAAA-ATGTATCC--GCACAC--AAGA--GTAATATTGT-GCA-TCAA--TTTCT-GCG-GGAC-CAAC-----AA--------GTCA-----AA---CAAC---TGCA----------G-C-ACC---C---T---CCA---TACTCGTC-------AGA-C-ATGAG-TCCC-TGTGA--CTTCTA-TCTCTTT-
gi|120473 : GGCTT--AAAGC------ACCTATCGCTGTTGC-------ATGACA-ACGCCCCT--GCGCAT--AAGT--CTGCTATTGTGACC-TC----GTTTT-T----GAA-CAAG-----GAA---A-G-G--G-----TT---CGAGTTCTTCC----------A-C-ATG---C---A---CCA---TATTCCCC-------AGA-C-CT-AG-CCCCGTGTGA--CTATTT-CTTGTTC-CCTA
gi|120474 : GTTTGGAAGGC------A--TTCCCCTAATCA-------ATGACA-ATACTTCTCTGTCTAC--AAAA--GTAAAATAAT-TCAATC----TTTCT-T---AGAA-CAAG-----AAA---A-G-GTTA-----TT---TAGG---TTGA----------A-C-A-C---C---C---CCT---TATTCCCC-------T
gi|120475 : AAAGC------AAATAAAACTTCTAC-------ATGACA-ATGTTCCA--GCTCAC--AAAACCGTAACTGTATTACAGTT----GCTCT--------A-CCAT-----AAA---C-GAGT--------------GG---ATGT----------G-CTACC---C---CATACCTCC-TATTCCCC-------ATA---TTAAG-CCCCATGTGA--CTTCTT-CCTCTTC-CC
gi|120476 : GGC------A--TCCAGCTGACTT-------GTGACG-ATACATCA--GCTAAC--AAAT--CTAAAA-TAT-ACAGTC----TTTAT------GAAGCAAG-----AAA---A-T-G-TG-----TTCCACAGC---TTTATCATATTTTTA-CAACC---C---A---CGT---TATTCTCC-------AGA-C-CTCTG-TCCC-TGTGA--CCCTT
gi|120477 : CTTATCC-------ATGAAA-ATGTATCT--GCACAC--AAGA--GTAATATTGT-GCAG-CAG--TTTCTGC---AGAA-CCAA-----CCA-------GTCA-----AA---CAA----TTGA----------AGC-ACC---C---T---TCT---TATTTGCC-------ATA-C-CTGAG-TCCC-TGTGA--CTTATT-CCTCTTT-CCTATACT
gi|120478 : TATTC-------ATAAAATATGCTTCT--TCTCGTCAAAAA--GTAAAAGTGT-ACAATC----TTTCT-T---AGAA-CAAG-----AAA---A-T-GTTA-----TT---CAGG---TT----------------ATT---T---C---C-----TATTTCCC-------
gi|120479 : GTGT-ACAATC----TTTCT-T---AGAA-CAAG-----AAT---A-G-ATTATTCAGTT---CAGG---TTGA----------A-C-ACC---C---C-----------TTC--------------T-TT----CCCC-TTTGA--CCTTTT-TCTATTC-CCCATGCTAAct
gi|120480 : A----------A-C-ACC---C---C---C-T---TACTCCTC-------AGA-CATT--G-CCCCATGTGA--CTTCTT-TCTTTTT-CCCA
gi|120481 : aatgttacagtgctat-TTAAG-CCTC-TGTGA--CTTTTT-CCTAATT-CCCATGCAAA
Alignments
lowQualScore : 444444 44 4444444 1 11 11 11 0 2 0 7777 1 444 1 33333 222 666 33333 222 333 6666666666 1 777 555 222 222 444 77777777 1 1 2 1 4 22 1 1
lowQualScore : ...... .. ....... . .. .. .. . . . .... . ... . ..... ... ... ..... ... ... .......... . ... ... ... ... ... ........ . . . . . .. . .
lowQualScore : 333333 11 5555555 4 99 99 99 4 9 1 0000 4 555 4 66666 555 777 66666 555 999 3333333333 4 111 444 555 555 555 44444444 5 5 1 5 6 22 7 7
consensus : TAAAGGTTTGGAAGGC------A--TACAGCTTATTC-------ATGACA-ATGCTTCT--GCCCAC--AAAA--GTAAAAGTGT-ACAATC----TTTCT-T---AGAA-CAAG-----AAA---A-G-GTTA-----TT---CAGG---TTGA----------A-C-ACC---C---C---CCT---TATTCCCC-------TGA-C-TTAAG-CCCC-TGTGA--CTTTTT-CCTATTT-CCCATGCTAA
Reference ( family-621 ) : TAAAGGTTTGGAAGGC------A--TACAGCTTATTC-------ATGACA-ATGCTTCT--GCCCAC--AAAA--GTAAAAGTGT-ACAATC----TTTCT-T---AGAA-CAAG-----AAA---A-G-GTTA-----TT---CAGG---TTGA----------A-C-ACC---C---C---CCT---TATTCCCC-------TGA-C-TTAAG-CCCC-TGTGA--CTTTTT-CCTATTT-CCCATGCTAA
gi|120450 : TAAAGGTTTGGAAGGT------A--TACAGCTTATTT-------ATGACA-ATGCTTCT--GCCCAC--AAAA--GTAAAAGTGT-ACAATC----TTTCT-T---AGAA-CAAT-----AAA---A-G-GTTA-----TT---CAGG---TTGA----------A-C-ACC---T---C---CCT---AATTCCCC-------TGA-C-TTTAG-CTCC-TGTGA--CTTTTT-CCTATTT-CCCATGCTAA
gi|120451 : TAAAGGTTTGGAAGGC------A--TACAGCTTATTC-------ATAACA-ATGTTTCT--GCCCAT--AAAA--GTAAAAGTGT-GCACTA----TTTAT-A---AGAA-CAA------AAA---A-T-GTTA-----TT---CAGG---TTGA----------A-C-TCC---C---C---CGT---TATTCCCC-------TGA-C-TAAAG-CCCC-TGTGA--CGTTTT-CCTATTT-CCCATGCTAA
gi|120452 : TAAAGATTTGGAAGGC------A--TGAAGCTTATTC-------ATGACA-ATGCTTTT--GCCCAC--AAAA--GTAAAAGTGT-ACAATC----TTTCT-T---ATAA-CAAG-----AAA---A-ATGTTA-----TT---CAGG---TTGA----------A-C-A-C---C---A---TCT---TATACCCC-------TGG-C-TAAAG-TCCC-TGTGG--CTTTAT-CCTTTTC-CCCATGCTAA
gi|120453 : TAACGGTTTAGAAGGC------A--TACAGCTTATTAGTTATTAATGACA-ATGCTTCT--GCCCAC--AAAA--GTAAAAGTGT-ACAATC----TTTCT-T---AGAA-CAAG-----AAA---A-G-GTTA-----TT---CAGC---TTAA----------A-C-ACT---C---C---GCT---TATTCAAC-------CGA-C-TTAAG-CCCC-TGTGA--CTTTTC-CCTAGTT-CCCATGCTAA
gi|120454 : TAAAGGTTTGGAAGGC------A--AACAGTTTATTC-------ATGACA-ATGCTTCT--GTCCAC--AAAA--GTAAAAGTGT-TTAATC----TTTCT-T---AGAA-CAAT-----TAA---A-A-GTTC-----TT---CAGC---TTGA----------A-C-ATC---C---C---ACT---TATTCACC-------TGA-C-TTAAG-CCCC-TGTGG--CTTTTT-CTTATAT-CCCATGCTA
gi|120455 : TAAATGTGTGAAAGGC------A--TACAGATCAATC-------ATGACA-ACGATTCT--GCCAAC--AAAA--GTAAAAGTGT-ACAATC----TATCT-T---AGAA-CAAG-----AAA---ATG-GTT------TT---CAGG---TTGA----------A-C-A-C---C---C---CCT---TATTCCCC-------TGG-C-GTAAG-GCCC-TGTAA--CCTTTT-CCTATTT-CCCATGCTA
gi|120456 : TAAAGGTTTGCCAGGC------A--CACAGCTTATTC-------ATGACA-ATGCCTCT--GCTCAC--AAAA--GTAAAAGTGT-ACAATC----TTTCT-A---AGAA-CAAG-----AAA---A-T-GTTA-----TT---CAGGT--TTGA----------A-C--TC---C---A---CCT---TATTCCGC---------A-C--TAAC-CCCC-TGTGC--CGTTTT-CCTATTT-CCCATGCTAA
gi|120457 : TAAAGGTTTGGAAGGC------A--TACAGTTTATTC-------GTGATA-ATGCTTCT--GCCCAC--AAAA--GTAAAAGCGT-AGAATC----TTTCA-T---AGAA-CAAC-----AAA---A-G-GTTA-----TT---CAGC---TTGA----------A-C-ATC---T---C---CTT---TATTCCCC-------TGA-C-TAAAG-CCTC-TGCGA--CGTTTT-CCTACTT-ACCATGCT
gi|120458 : TAAAGGTTTGAAATGC------A--TACAGTTTATTC-------ATGGCA-ACGTTACC--GCCCAC--AATA--GTAAAAGTGT-GCAACC----TTTCT-T---AGAA-CAAG-----AAA---A-G-GTTA-----TT---CAGG---TTGA----------A-C-ACCG--CCCGC---CCC---TATTCCCC-------TGA-T-TCAAC-CCCC-TGTGA--CGTTTT-CCTATTT-TCCATCCTAA
gi|120459 : TAAAGGTTTGGAAAGC------A--TACAGCTTATTC-------ATGACA-ATGCTTCT--GCCCTC--AAAG--GTCAAAGTGT-ACAATC----TCTCT-T---AGAA-TAAG-----AAA---G-G-GTTA-----TT---GAGG---TTGA----------A-C-ACC---C---C---GTT---TATTCCCC-------TGA-C-TTAAA-CGCC-TGTG----------------T-CCCATGCT
gi|120460 : TAAATGTTTGGAAGGC------A--TACAGCCTATTC-------ATGACA-ATGCTTCT--GCCAAC--AAAA--A-GAAAGTGT-ACAATA----TTTCT-T---AAAA-CAAT-----AAA---C-A-GTTA-----TT---CAGG---TTGA----------A-C-CCCCATC---C---CCTCCGTATTCTCCTGTCTTATGA-C-TTATGACCCC-TGTGA--CTTTTT-CCTATTT-CCGATGCT
gi|120461 : TAAATGTTTGAAAGAC-----------TAGCTTATTC-------ATGCTA-ATGTTTCT--GTCCAC--AAAA--CTAAAAGTGT-ACACTCTTTTTTTTT-T---TG-A-CAAG-----AAA---A-T-GTTA-----TT---TAGA---TTGA----------A-C-A-C---C---C---CCT---AATTCCCC-------TGA-C-GTCAA-CCCC-TATGA--CTTTTTCCCTATTT-CCCATGCTAA
gi|120462 : TAAAGGTTTGGAAGGC------A--TATAACTTATTT-------CTAACA-ATGCTTCT--GCCCAC--AAAA--GTAAAA-TGT-ACAATC----TTTCT-T---AGAA-CATGGTTCTAGATCTA-G-G--------TT---CAGG---TTGA----------A-C-A-C---C---C---CCT---TATT-----------------------CCCC-TGTGATTTTTTTT-CATATTT-CCCATGCT
gi|120463 : TAAAGGTTTGGAATGC------A--TACAGCTTATTC-------ATGACA-CTGTTTCT--ACCCAT--AAAA--GTAAAGATGT-ACAATC----TTTCT-T---AGAA-CAAG------AA---T-G-GTTA-----TT---CA----------------------------------------------TCCCC---------------------CT-TGTGA--C-TTTT-ACTATTT-CCCATGCTAA
gi|120464 : TAAAAGTTTGGAAG-C-----------CAGCTTATTC-------ATGACA-ATGCTTCG--GCCCAC--AAAA--GTAGAAGTGT-AC---T----TTTTT-T---AGAC-CAAG-----AAA---A-G-GT-----------------------------------------------------T---TATTCCCT-------TGA-A-TGAAG-CTTT-TGTAG--TTTTTT-CCTATTTCCCCATGTTAA
gi|120465 : TAAATGTTTGGAAGGC------A--TA--GCTTATTC-------ATGACA-ATGCTTCT--GCCCAC--AAAA--CTAAAATTAT-TCACTC----TTTTT-TTTAAGAA-CAAG-----AAA---A---GTTA-----TT---CAGA---TT
gi|120466 : TAAAGGTTTGAATGGTTATTTTA--TCCAGTTTATCC-------ATGACA-ATGCCCCA--GCCAAG--AAAA--GTCAAATAGT-GCCGTC----TGTCT-T---GCAG-CAAG-----AAA---A-T-GGCA-----TT---AAAA---TCAA----------A-C-ACC---C---A---CCT---TATTATCC-------TGATC-TTAG---CCA-TGTGA---TTGTT-CCTACTT-CCCCTGCTGA
gi|120467 : TAAATGTTTGGAAGGT------A--TACAGCTGATTC-------ATGACA-ACGTTTCT--GCCTAC--AAAA--GGAAAA
gi|120468 : AAAGGTTTGGAAGGC------A--TACAGCTTATTC-------ATGACA-ATGCTTCT--GCCCAT--GCAA--GTAACATTGT-ACAATC----CTTCT-T---GGAA-CAAG-----AAA---A-G-GTTA-----TT---CAGG---ATGA----------A-C-TCCA--C---C---ACT---TATTTCCC-------TGA-C-TTAA
gi|120469 : AAGGTTTGAAAGGC------A--TACAGATTATTC-------ACGACA-ATGCTTTT--GACGGC--AAAA--ATAAAAGTGT-ACAATC----TTTGT-T---TGAG-CAAG-----AAA---A-T-GTTA-----TT---AAGG---TCGA----------A-C--CC---T---C---CCT---TATTCCCC-------TGA-C-TTAAG-CCCC-TGTGA--CTCTTT-CCTTTTT-CCCA
gi|120470 : AAGGTTTAGAAGAC------A--AACAGCTTATTT-------ATGACA-ATGCTTCT--AACCAC--AAAA--TTAA
gi|120471 : AGGTTTGGAAGGC------A--TACAGTTTATTC-------ATGATA-ATGCGTCT--GTCCAC--CACA--GTAAAAGTGT-ACAATC----TTTCT-T---AGAA-CAAG-----AAA---A-T-GTTA-----TT---CAGG---TTGA----------A-C-A-C---C---C---CCT---TATTCCCT-------TGG-C-TTAAG----C-TGTG
gi|120472 : GGTGTGAGGGGT------A--TCTGTCTTATCC-------ATGAAA-ATGTATCC--GCACAC--AAGA--GTAATATTGT-GCA-TCAA--TTTCT-GCG-GGAC-CAAC-----AA--------GTCA-----AA---CAAC---TGCA----------G-C-ACC---C---T---CCA---TACTCGTC-------AGA-C-ATGAG-TCCC-TGTGA--CTTCTA-TCTCTTT-
gi|120473 : GGCTT--AAAGC------ACCTATCGCTGTTGC-------ATGACA-ACGCCCCT--GCGCAT--AAGT--CTGCTATTGTGACC-TC----GTTTT-T----GAA-CAAG-----GAA---A-G-G--G-----TT---CGAGTTCTTCC----------A-C-ATG---C---A---CCA---TATTCCCC-------AGA-C-CT-AG-CCCCGTGTGA--CTATTT-CTTGTTC-CCTA
gi|120474 : GTTTGGAAGGC------A--TTCCCCTAATCA-------ATGACA-ATACTTCTCTGTCTAC--AAAA--GTAAAATAAT-TCAATC----TTTCT-T---AGAA-CAAG-----AAA---A-G-GTTA-----TT---TAGG---TTGA----------A-C-A-C---C---C---CCT---TATTCCCC-------T
gi|120475 : AAAGC------AAATAAAACTTCTAC-------ATGACA-ATGTTCCA--GCTCAC--AAAACCGTAACTGTATTACAGTT----GCTCT--------A-CCAT-----AAA---C-GAGT--------------GG---ATGT----------G-CTACC---C---CATACCTCC-TATTCCCC-------ATA---TTAAG-CCCCATGTGA--CTTCTT-CCTCTTC-CC
gi|120476 : GGC------A--TCCAGCTGACTT-------GTGACG-ATACATCA--GCTAAC--AAAT--CTAAAA-TAT-ACAGTC----TTTAT------GAAGCAAG-----AAA---A-T-G-TG-----TTCCACAGC---TTTATCATATTTTTA-CAACC---C---A---CGT---TATTCTCC-------AGA-C-CTCTG-TCCC-TGTGA--CCCTT
gi|120477 : CTTATCC-------ATGAAA-ATGTATCT--GCACAC--AAGA--GTAATATTGT-GCAG-CAG--TTTCTGC---AGAA-CCAA-----CCA-------GTCA-----AA---CAA----TTGA----------AGC-ACC---C---T---TCT---TATTTGCC-------ATA-C-CTGAG-TCCC-TGTGA--CTTATT-CCTCTTT-CCTATACT
gi|120478 : TATTC-------ATAAAATATGCTTCT--TCTCGTCAAAAA--GTAAAAGTGT-ACAATC----TTTCT-T---AGAA-CAAG-----AAA---A-T-GTTA-----TT---CAGG---TT----------------ATT---T---C---C-----TATTTCCC-------
gi|120479 : GTGT-ACAATC----TTTCT-T---AGAA-CAAG-----AAT---A-G-ATTATTCAGTT---CAGG---TTGA----------A-C-ACC---C---C-----------TTC--------------T-TT----CCCC-TTTGA--CCTTTT-TCTATTC-CCCATGCTAAct
gi|120480 : A----------A-C-ACC---C---C---C-T---TACTCCTC-------AGA-CATT--G-CCCCATGTGA--CTTCTT-TCTTTTT-CCCA
gi|120481 : aatgttacagtgctat-TTAAG-CCTC-TGTGA--CTTTTT-CCTAATT-CCCATGCAAA
blockSeqs : TATTTT CC GTTATTA T CT CA CC G TTTT G TTA G GTTCT TCT AT TTCAG CCA TTC TCATATTTTT G TAC CAT CCG ATA CCG TGTCTTAT T A A A G TT C C
blockSeqs : . AA . . . . . T AA . CG . . . TG . . T . . AAC G . . CC T . . A . A . . .
blockSeqs : . . . . . . . . AG . . . . . GA . . . . . TC A . . . T . . A . A . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . AC . . . . C . . A . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . AT . . . . T . . A . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . AT . . . . T . . A . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . AC . . . . T . . A . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . AC . . . . T . . A . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . CC . . . . T . . A . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . AC . . . . T . . A . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . TC . . . . T . . C . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . AC . . . . T . . A . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . AT . . . . T . . A . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . AC . . . . T . . A . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . AT . . . . T . . A . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . AC . . . . A . . A . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . AC . . . . A . . G . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . A . . . . T . . A . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . A . . . . A . . C . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . T . . . . A . . G . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . A . . . . A . . A . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . A . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . C . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . A . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : TAAAGGTTTGGAAGGC------A--TACAGCTTATTC-------ATGACA-ATGCTTCT--GCCCAC--AAAA--GTAAAAGTGT-ACAATC----TTTCT-T---AGAA-CAAG-----AAA---A-G-GTTA-----TT---CAGG---TTGA----------A-C-ACC---C---C---CCT---TATTCCCC-------TGA-C-TTAAG-CCCC-TGTGA--CTTTTT-CCTATTT-CCCATGCTAA
finalCons : TAAAGGTTTGGAAGGC------A--TACAGCTTATTC-------ATGACA-ATGCTTCT--GCCCAC--AAAA--GTAAAAGTGT-ACAATC----TTTCT-T---AGAA-CAAG-----AAA---A-G-GTTA-----TT---CAGG---TTGA----------A-C-ACC---C---C---CCT---TATTCCCC-------TGA-C-TTAAG-CCCC-TGTGA--CTTTTT-CCTATTT-CCCATGCTAA
Alignments
lowQualScore : 444444 44 4444444 1 11 11 11 0 2 0 7777 1 444 1 33333 222 666 33333 222 333 6666666666 1 777 555 222 222 444 77777777 1 1 2 1 4 22 1 1
lowQualScore : ...... .. ....... . .. .. .. . . . .... . ... . ..... ... ... ..... ... ... .......... . ... ... ... ... ... ........ . . . . . .. . .
lowQualScore : 333333 11 5555555 4 99 99 99 4 9 1 0000 4 555 4 66666 555 777 66666 555 999 3333333333 4 111 444 555 555 555 44444444 5 5 1 5 6 22 7 7
consensus : TAAAGGTTTGGAAGGC------A--TACAGCTTATTC-------ATGACA-ATGCTTCT--GCCCAC--AAAA--GTAAAAGTGT-ACAATC----TTTCT-T---AGAA-CAAG-----AAA---A-G-GTTA-----TT---CAGG---TTGA----------A-C-ACC---C---C---CCT---TATTCCCC-------TGA-C-TTAAG-CCCC-TGTGA--CTTTTT-CCTATTT-CCCATGCTAA
Reference ( family-621 ) : TAAAGGTTTGGAAGGC------A--TACAGCTTATTC-------ATGACA-ATGCTTCT--GCCCAC--AAAA--GTAAAAGTGT-ACAATC----TTTCT-T---AGAA-CAAG-----AAA---A-G-GTTA-----TT---CAGG---TTGA----------A-C-ACC---C---C---CCT---TATTCCCC-------TGA-C-TTAAG-CCCC-TGTGA--CTTTTT-CCTATTT-CCCATGCTAA
gi|120450 : TAAAGGTTTGGAAGGT------A--TACAGCTTATTT-------ATGACA-ATGCTTCT--GCCCAC--AAAA--GTAAAAGTGT-ACAATC----TTTCT-T---AGAA-CAAT-----AAA---A-G-GTTA-----TT---CAGG---TTGA----------A-C-ACC---T---C---CCT---AATTCCCC-------TGA-C-TTTAG-CTCC-TGTGA--CTTTTT-CCTATTT-CCCATGCTAA
gi|120451 : TAAAGGTTTGGAAGGC------A--TACAGCTTATTC-------ATAACA-ATGTTTCT--GCCCAT--AAAA--GTAAAAGTGT-GCACTA----TTTAT-A---AGAA-CAA------AAA---A-T-GTTA-----TT---CAGG---TTGA----------A-C-TCC---C---C---CGT---TATTCCCC-------TGA-C-TAAAG-CCCC-TGTGA--CGTTTT-CCTATTT-CCCATGCTAA
gi|120452 : TAAAGATTTGGAAGGC------A--TGAAGCTTATTC-------ATGACA-ATGCTTTT--GCCCAC--AAAA--GTAAAAGTGT-ACAATC----TTTCT-T---ATAA-CAAG-----AAA---A-ATGTTA-----TT---CAGG---TTGA----------A-C-A-C---C---A---TCT---TATACCCC-------TGG-C-TAAAG-TCCC-TGTGG--CTTTAT-CCTTTTC-CCCATGCTAA
gi|120453 : TAACGGTTTAGAAGGC------A--TACAGCTTATTAGTTATTAATGACA-ATGCTTCT--GCCCAC--AAAA--GTAAAAGTGT-ACAATC----TTTCT-T---AGAA-CAAG-----AAA---A-G-GTTA-----TT---CAGC---TTAA----------A-C-ACT---C---C---GCT---TATTCAAC-------CGA-C-TTAAG-CCCC-TGTGA--CTTTTC-CCTAGTT-CCCATGCTAA
gi|120454 : TAAAGGTTTGGAAGGC------A--AACAGTTTATTC-------ATGACA-ATGCTTCT--GTCCAC--AAAA--GTAAAAGTGT-TTAATC----TTTCT-T---AGAA-CAAT-----TAA---A-A-GTTC-----TT---CAGC---TTGA----------A-C-ATC---C---C---ACT---TATTCACC-------TGA-C-TTAAG-CCCC-TGTGG--CTTTTT-CTTATAT-CCCATGCTA
gi|120455 : TAAATGTGTGAAAGGC------A--TACAGATCAATC-------ATGACA-ACGATTCT--GCCAAC--AAAA--GTAAAAGTGT-ACAATC----TATCT-T---AGAA-CAAG-----AAA---ATG-GTT------TT---CAGG---TTGA----------A-C-A-C---C---C---CCT---TATTCCCC-------TGG-C-GTAAG-GCCC-TGTAA--CCTTTT-CCTATTT-CCCATGCTA
gi|120456 : TAAAGGTTTGCCAGGC------A--CACAGCTTATTC-------ATGACA-ATGCCTCT--GCTCAC--AAAA--GTAAAAGTGT-ACAATC----TTTCT-A---AGAA-CAAG-----AAA---A-T-GTTA-----TT---CAGGT--TTGA----------A-C--TC---C---A---CCT---TATTCCGC---------A-C--TAAC-CCCC-TGTGC--CGTTTT-CCTATTT-CCCATGCTAA
gi|120457 : TAAAGGTTTGGAAGGC------A--TACAGTTTATTC-------GTGATA-ATGCTTCT--GCCCAC--AAAA--GTAAAAGCGT-AGAATC----TTTCA-T---AGAA-CAAC-----AAA---A-G-GTTA-----TT---CAGC---TTGA----------A-C-ATC---T---C---CTT---TATTCCCC-------TGA-C-TAAAG-CCTC-TGCGA--CGTTTT-CCTACTT-ACCATGCT
gi|120458 : TAAAGGTTTGAAATGC------A--TACAGTTTATTC-------ATGGCA-ACGTTACC--GCCCAC--AATA--GTAAAAGTGT-GCAACC----TTTCT-T---AGAA-CAAG-----AAA---A-G-GTTA-----TT---CAGG---TTGA----------A-C-ACCG--CCCGC---CCC---TATTCCCC-------TGA-T-TCAAC-CCCC-TGTGA--CGTTTT-CCTATTT-TCCATCCTAA
gi|120459 : TAAAGGTTTGGAAAGC------A--TACAGCTTATTC-------ATGACA-ATGCTTCT--GCCCTC--AAAG--GTCAAAGTGT-ACAATC----TCTCT-T---AGAA-TAAG-----AAA---G-G-GTTA-----TT---GAGG---TTGA----------A-C-ACC---C---C---GTT---TATTCCCC-------TGA-C-TTAAA-CGCC-TGTG----------------T-CCCATGCT
gi|120460 : TAAATGTTTGGAAGGC------A--TACAGCCTATTC-------ATGACA-ATGCTTCT--GCCAAC--AAAA--A-GAAAGTGT-ACAATA----TTTCT-T---AAAA-CAAT-----AAA---C-A-GTTA-----TT---CAGG---TTGA----------A-C-CCCCATC---C---CCTCCGTATTCTCCTGTCTTATGA-C-TTATGACCCC-TGTGA--CTTTTT-CCTATTT-CCGATGCT
gi|120461 : TAAATGTTTGAAAGAC-----------TAGCTTATTC-------ATGCTA-ATGTTTCT--GTCCAC--AAAA--CTAAAAGTGT-ACACTCTTTTTTTTT-T---TG-A-CAAG-----AAA---A-T-GTTA-----TT---TAGA---TTGA----------A-C-A-C---C---C---CCT---AATTCCCC-------TGA-C-GTCAA-CCCC-TATGA--CTTTTTCCCTATTT-CCCATGCTAA
gi|120462 : TAAAGGTTTGGAAGGC------A--TATAACTTATTT-------CTAACA-ATGCTTCT--GCCCAC--AAAA--GTAAAA-TGT-ACAATC----TTTCT-T---AGAA-CATGGTTCTAGATCTA-G-G--------TT---CAGG---TTGA----------A-C-A-C---C---C---CCT---TATT-----------------------CCCC-TGTGATTTTTTTT-CATATTT-CCCATGCT
gi|120463 : TAAAGGTTTGGAATGC------A--TACAGCTTATTC-------ATGACA-CTGTTTCT--ACCCAT--AAAA--GTAAAGATGT-ACAATC----TTTCT-T---AGAA-CAAG------AA---T-G-GTTA-----TT---CA----------------------------------------------TCCCC---------------------CT-TGTGA--C-TTTT-ACTATTT-CCCATGCTAA
gi|120464 : TAAAAGTTTGGAAG-C-----------CAGCTTATTC-------ATGACA-ATGCTTCG--GCCCAC--AAAA--GTAGAAGTGT-AC---T----TTTTT-T---AGAC-CAAG-----AAA---A-G-GT-----------------------------------------------------T---TATTCCCT-------TGA-A-TGAAG-CTTT-TGTAG--TTTTTT-CCTATTTCCCCATGTTAA
gi|120465 : TAAATGTTTGGAAGGC------A--TA--GCTTATTC-------ATGACA-ATGCTTCT--GCCCAC--AAAA--CTAAAATTAT-TCACTC----TTTTT-TTTAAGAA-CAAG-----AAA---A---GTTA-----TT---CAGA---TT
gi|120466 : TAAAGGTTTGAATGGTTATTTTA--TCCAGTTTATCC-------ATGACA-ATGCCCCA--GCCAAG--AAAA--GTCAAATAGT-GCCGTC----TGTCT-T---GCAG-CAAG-----AAA---A-T-GGCA-----TT---AAAA---TCAA----------A-C-ACC---C---A---CCT---TATTATCC-------TGATC-TTAG---CCA-TGTGA---TTGTT-CCTACTT-CCCCTGCTGA
gi|120467 : TAAATGTTTGGAAGGT------A--TACAGCTGATTC-------ATGACA-ACGTTTCT--GCCTAC--AAAA--GGAAAA
gi|120468 : AAAGGTTTGGAAGGC------A--TACAGCTTATTC-------ATGACA-ATGCTTCT--GCCCAT--GCAA--GTAACATTGT-ACAATC----CTTCT-T---GGAA-CAAG-----AAA---A-G-GTTA-----TT---CAGG---ATGA----------A-C-TCCA--C---C---ACT---TATTTCCC-------TGA-C-TTAA
gi|120469 : AAGGTTTGAAAGGC------A--TACAGATTATTC-------ACGACA-ATGCTTTT--GACGGC--AAAA--ATAAAAGTGT-ACAATC----TTTGT-T---TGAG-CAAG-----AAA---A-T-GTTA-----TT---AAGG---TCGA----------A-C--CC---T---C---CCT---TATTCCCC-------TGA-C-TTAAG-CCCC-TGTGA--CTCTTT-CCTTTTT-CCCA
gi|120470 : AAGGTTTAGAAGAC------A--AACAGCTTATTT-------ATGACA-ATGCTTCT--AACCAC--AAAA--TTAA
gi|120471 : AGGTTTGGAAGGC------A--TACAGTTTATTC-------ATGATA-ATGCGTCT--GTCCAC--CACA--GTAAAAGTGT-ACAATC----TTTCT-T---AGAA-CAAG-----AAA---A-T-GTTA-----TT---CAGG---TTGA----------A-C-A-C---C---C---CCT---TATTCCCT-------TGG-C-TTAAG----C-TGTG
gi|120472 : GGTGTGAGGGGT------A--TCTGTCTTATCC-------ATGAAA-ATGTATCC--GCACAC--AAGA--GTAATATTGT-GCA-TCAA--TTTCT-GCG-GGAC-CAAC-----AA--------GTCA-----AA---CAAC---TGCA----------G-C-ACC---C---T---CCA---TACTCGTC-------AGA-C-ATGAG-TCCC-TGTGA--CTTCTA-TCTCTTT-
gi|120473 : GGCTT--AAAGC------ACCTATCGCTGTTGC-------ATGACA-ACGCCCCT--GCGCAT--AAGT--CTGCTATTGTGACC-TC----GTTTT-T----GAA-CAAG-----GAA---A-G-G--G-----TT---CGAGTTCTTCC----------A-C-ATG---C---A---CCA---TATTCCCC-------AGA-C-CT-AG-CCCCGTGTGA--CTATTT-CTTGTTC-CCTA
gi|120474 : GTTTGGAAGGC------A--TTCCCCTAATCA-------ATGACA-ATACTTCTCTGTCTAC--AAAA--GTAAAATAAT-TCAATC----TTTCT-T---AGAA-CAAG-----AAA---A-G-GTTA-----TT---TAGG---TTGA----------A-C-A-C---C---C---CCT---TATTCCCC-------T
gi|120475 : AAAGC------AAATAAAACTTCTAC-------ATGACA-ATGTTCCA--GCTCAC--AAAACCGTAACTGTATTACAGTT----GCTCT--------A-CCAT-----AAA---C-GAGT--------------GG---ATGT----------G-CTACC---C---CATACCTCC-TATTCCCC-------ATA---TTAAG-CCCCATGTGA--CTTCTT-CCTCTTC-CC
gi|120476 : GGC------A--TCCAGCTGACTT-------GTGACG-ATACATCA--GCTAAC--AAAT--CTAAAA-TAT-ACAGTC----TTTAT------GAAGCAAG-----AAA---A-T-G-TG-----TTCCACAGC---TTTATCATATTTTTA-CAACC---C---A---CGT---TATTCTCC-------AGA-C-CTCTG-TCCC-TGTGA--CCCTT
gi|120477 : CTTATCC-------ATGAAA-ATGTATCT--GCACAC--AAGA--GTAATATTGT-GCAG-CAG--TTTCTGC---AGAA-CCAA-----CCA-------GTCA-----AA---CAA----TTGA----------AGC-ACC---C---T---TCT---TATTTGCC-------ATA-C-CTGAG-TCCC-TGTGA--CTTATT-CCTCTTT-CCTATACT
gi|120478 : TATTC-------ATAAAATATGCTTCT--TCTCGTCAAAAA--GTAAAAGTGT-ACAATC----TTTCT-T---AGAA-CAAG-----AAA---A-T-GTTA-----TT---CAGG---TT----------------ATT---T---C---C-----TATTTCCC-------
gi|120479 : GTGT-ACAATC----TTTCT-T---AGAA-CAAG-----AAT---A-G-ATTATTCAGTT---CAGG---TTGA----------A-C-ACC---C---C-----------TTC--------------T-TT----CCCC-TTTGA--CCTTTT-TCTATTC-CCCATGCTAAct
gi|120480 : A----------A-C-ACC---C---C---C-T---TACTCCTC-------AGA-CATT--G-CCCCATGTGA--CTTCTT-TCTTTTT-CCCA
gi|120481 : aatgttacagtgctat-TTAAG-CCTC-TGTGA--CTTTTT-CCTAATT-CCCATGCAAA