lowQualScore : 111111111 111111111111 33333 1111 11111111111111111 1 1111111111111111 1
lowQualScore : 44 111111111 444444444444 44444 5555 7777 2 11111111111111111 33 2 55555 2 4 666666 7 6 666666 4444 22 333 3333333333333333 1 00 55555 22 333 4 1 33 5555 4 1 7777 1 1
lowQualScore : .. ......... ............ ..... .... .... . ................. .. . ..... . . ...... . . ...... .... .. ... ................ . .. ..... .. ... . . .. .... . . .... . .
lowQualScore : 22 444444444 666666666666 99999 1111 8888 5 55555555555555555 66 4 99999 4 5 444444 1 6 111111 5555 99 777 8888888888888888 1 77 33333 99 555 6 3 22 1111 4 3 5555 3 3
consensus : AATATTGACATT--CTT---------AAATAAA------------CTACATT--T-TTTTATTTAAGTAT----T-TTTA---AA------AAAT-AAGAT-AAACATTAAAAC-TTTTTAAAAA-----CGTGCT-AAAAGATTAATAC------GTGCATNAAA------TA----T--TA---TN----ATG--TGC---CCCAACGGAA-----ATGGAC--GCCAAT---TGCAGCAGGAGTCACAGTC-A--AG---ATACGTA-GACTGG----C-T-ACTGTATGCAGGTTA
Reference ( gi|162011 ) : AATATTGACATT--CTT---------AAATAAA------------CTACATT--TGTTTTATTTCAGTAT----T-TTTA---AA------AAAC-AAGAT-AAACATTAAAAC-TTTTTAAAAA-----CGTGCT-AAACGATTAATAC------GTACATCAAA------TA----T--TA---TA----ATG--TGC---CCCAACGGAA-----ATGGAC--GCCAAT---TGCAGCAGGCGTCACAGTC-A--AG---GTACGCA-GACTGG----C-T-ACTGTATGCAGGTTA
gi|162001 : AATATTGACATT--CTT---------AAATAAA------------CTGCATT--T-TTTTATATAAGTAT----T-TTTA---AA------AAAT-AAGAC-AAACTTTAAAAC-TTTTTTAAAA-----CGTG---AAACGATTAATAC------GTGCATCAAA------TA----T--CA---TA----ATG--TGC---CCCAACGGAA-----ATGGAC--GCCAAT---TGCAGCAGGAGTCACAATC-A--AG---GTACGTA-GACTGG----C-T-ACAGTATGCAGGTTA
gi|162003 : aAATATTAACATT--CTT---------AAAAAAA------------CAACATT--T--TTTATTTAAGTATATTTT-TTTT---TA------AAAT-AAGAC-AAACATTAAAAC-TTTTTACAAA-----CGTGCT-AAAAGATTAATAC------GTGCATCAAA------TC----T--TA---TT----ATA--TG----CCCAACTTGA-----ATGGAC--ACCAAT---TGCAGCAGGAGTCACAGTC-A--AG---ATACGTA-GACTGG----C-T-CCTGTATACAGGTT
gi|162012 : aAAT-TTGACATT--CTT---------AAATAAA------------CAACATT--T--TTTATTTAAGTAT----T-TTTTT--AA------AAGT-AAGGC-AAATATTAAACC-TTTTTAAAAC-----CGTGCT-AAAAGATTAATAC------GTGCATT---------------T--TA---TT----ATA--TGC---CC-AACGGAA-----ATGGAC--GCCAAC---TGCAGATGGAGGCACAGTC-A--AG---ATACGTA-GACTGG----C-T-CCTGTATGCAGGTTA
gi|162004 : AATATTGACATT--CAT---------AAATAAA------------CTACATT--C-TTTTACTTTAGTAT----TATTTT---AA------AAAT-AAGAC-AAATATTAAAAG-TTTTTAAAAG-----CGCGTT-AAAAGATCAATACCTGTATGTGCATCAAA------TA----T--TA---TT----GTA--TG----CCCAACGGAA-----ATGGAC--ACCAAT---TGCAGCAGGAGTCCCAGTC-A--AGATAATATATA-GACTGG----C-TAATTGCA-GCAGG
gi|162000 : aAATATTGACATT--CTT---------AAATAAA------------CTACATT--T--TTTATTTAAGTAT----T-TTTT---AA------AAATTAAGAC-AAACGTTAAAAC-TTTTAACAAC-----CGTGCT-AAAAGATTAATAC------GTGTATCAAA------TA----T--TA---TT----ATA--TG----CTCAACGAAA-----ATGGAC--ACCAAC---TGCAGCAGTAATCACAGTT-A--AG---AT
gi|162005 : aAATATTGACATT--CTA---------AAATAAA------------CAACATT--T--TTTATTAAAGTAT----T-TTT------TTTTTTAAAT-TAGAG-AAACATT----------TAAA--------GTGCT-AAAAGATGAATAC------GTGCATCAAA------TA----T--TAGTATA----A------A---CCCAACGAAG-----ATGGAC--GCCAAT---TGCAGCATGAGTCACAGTC-A--AG---AAACGTA-GACTGG----T-T-ACTGTATGTAGGTTA
gi|162008 : aAGTATTGACATT--CAT---------AAATAAA------------CTACATT--T-------------------T-CTTA---AA------A--T-AAAAT-AAATATTAAAAC-TTTTTAAAAA-----CGTACT-AAACGATTAATCC------AT-CATGAAA------AA----T--TA---TT----TTA--TGC---CA-AACTTCT-----ATATAC--GCCACT---TGCAGTAGGAGTCACAGTC-A--AG---ATGCGTA-GACTGG----T-T-ACTGTATGCAGGT
gi|162007 : aAATATTGACATT--CTT---------AAATAAA------------CTACATT--T-TTTTATTTATGTATA---T-TTTT---GA------AAAT-AAGAT-ATATATTTAAAC-TTTTTAGAAA-----CG-GTT-AAA-AATTAATAT------ATGCATGAAA------TA----T--AA---TT----TTA--TGC---C------GAACTTCTATAGGA--ACCAAT---TGCAGCAAGAGTCACAGTC-G--AA---ATACCTA-GACTGG----C-T-TCTGTATCCAGGTTA
gi|162009 : aAATATCGACATT--CTTTTCAATACAAAAAAGA------------CTACAT----ATTTTATTCT----T----T-TGTA---AA---------T-AAGTTTAAATATCATAAC-TTTTTAAAAA-----CGTGTTTAAA--ATAACTCC------G-GCATGAAC------TA----TCATA---TA----ATG--------CCCAACTTAA-----ATGGAC--GCCAAT---TGCAGCAGGAGTAACAGTC-A--AG---ATACGTA-GACTGG----C-T-ACTGTATGCAGGTTA
gi|162006 : aAAAATTGACATT--ATT---------AAATAAA------------TTACATT----------------------T-TTTA---A-----------------------TTAAAGTATTTTTAAAAA-----------------AT-AAGAC------GAACATTAAAACTTTTTA----T--AA---TA----ATG--AGC---CCCAATGGAA-----ATGGAC--GCCAAT---TGCAGCAGGAGTCACAGTC----TG---GTAAGTA-GACTGG----C-T-ACTGTATGCAGGTTA
gi|162010 : aAATATTAACATTATTTT---------CAATAAAAAAATTAGTCGTCTA-ATTATTATTTTATTAAAGTAT----C-TTTA---AA------AA-T-AATAA-AAAAATTAAAA--TGGACAAAAAAAGAACATGCT-TAAAAGTC--TAC------ATGCAT-GAA------TA--------A---TT----ATT--TG-------------A-----ATGGAC--G---ATCTCTGCAGCTAGAGTCACAGTC-A--AG---ATATGTA-GACTGG----T-T-ACTGTATGCAGGTT
gi|162013 : aAATATTGAAATT--CTT---------AAATAA-------------CAACACT--T-TTCGATGAAAATAT----T-TTTGTTGAA------AAAA-AAGAT-AAGCATTAAAAC-TTTTTATAAA-----TGTGC--AAAAAA--AGTAC------ATGCATGAAC------TA----T--TA---T
gi|162002 : TATTGTTATT--CTT---------AAATAAA------------CTTCATT--T-TTTTACGTACGTAT----T-TTTA---AA------AAAT-AAGAT-AAACATTAAATT-TTTTTAAAAA-----CGTGCT-CAAAGATTAATAC------GTGCATAAAA------TA----T--TA---CA----ATG--TGC---CCCAACGGAA-----ATGAAC--GCCAAT---TGCAGCAGGAGTCAGAGTC-A--AA---ATACGTA-GACTGG----C-T-ATTGTATGCAGGTTA
gi|162014 : aac---------AAATAAA------------CTGTATT--T---TTATTTAAGTAT----T-TTCA---AA------AA-T-AAAAT-AAACATGGCAAT-TATTTAAAAA-----CGTACT-AAAAGATTGATAC------GTGCATAAAA------TT----T--TA---T-----ATG--------CCCAACGGAA-----ATGGAC--AGCAAT---ATCAGCAGTAGTTACAGGT-A--AA---GTAAGTA-GACGGA----C-C-ACTGTAAGCA
gi|162015 : TATATT--TTTTTTATCTAAGTAC----T-TTCA---AA------ATAT-ATAAT-AAACATTAGAAC-TTTTAAAAAA-----CATGCT-GA-TGATTAATAC------ATGCATGAAA------TAGTATT--CA---TC----ATG--AGCATGCCCATTTTTA-----ATGGAC--GCCATT---TGTAGCAGGTTTCACAGTC-A--AG---ATAAGTA-GACTAT----C-T-ACTCTATGCATGTTA
gi|162016 : T----T-TTTT---AA------AAAT-AAGAA-AAACAATACA-C-TTTTTAGAAA-----CGTGCT-AAAAGATTAATAC------GCGCATCAAA------TA----T--TA---C------TG--TATA--CCCAACAGAA-----ATGGAC--GCCAAT---TGCAACAAGAGTCACAGTC-ATGAG---G--CGTA-GACTGG----C-T-ACTGCAGGCAGGT
gi|162017 : attcaaatatcTCA---AA------GAAT-AAGAT-GAACATTAAAAC-GTTT-AGAAA--------GCT-AAAAGATTAATAC------ATGCATGAAA------TG----T--TT---TATTACATGAATGC---CC-AACTTAA-----ATGGAC--GTCGTT---TGCTGCAGTAGTCTCAGTC-A--AG---ATGCATA-GACTGG----C-T-AC-ATATGCAGGTTA
gi|162018 : ATTCATAC------GGGC--TGAA------TT----T--T----TA----ATG--AGC---CCCAATGGAA-----ATGGAC--GCCAAT---TGCAGCAGGAGTCACAGTC-A--AG---GGACGTT-GACTGGCT--C-T-ACTGTATGCAGGTTA
gi|162019 : aaA------TA----T--TA---AA----GTG--TGC---CCCAACGGAA-----ATGGAC--GCAAAT---TGCAGCAGGAGCCACATTC-A--AG---GTACGTA-GACTGG----C-T-ACTGTATGCAAGTTA
gi|162020 : -----ATAGACTGGCCAAT---TACAGCAGGAGTCACAGTC-A--AG---ATATATC-GACTGG----CTT-ACAGTATGCAGGTTA
gi|162021 : T---TGCAGCTGGAGTCAT--TC-A--AG---ATACGTA-GACTGG----C-T-ACTGTTTACAGTTTA
gi|162022 : CAACAGGAGTCACAGTCCAT-AT---ATACGTA-GACTGG----C-T-AATGTATGCACGTTA
gi|162024 : GTCACAGTC-A--AA---ATACATA-GACTGG----C-T-ACTGTTTGCAGAT
gi|162025 : ggGTGACAGTC-A--AG---ATACGTA-GACTGGGTACT-T-ACTGTATGCAGGCT
gi|162026 : aGCCACAGTC-A--AG---ATACGTA-GATTGA----C-C-ACTGTGTGCAGAT
gi|162023 : aGTGACAGTC-A--AG---ATACGCA-GACTGG----C-T-ACT
gi|162027 : aagaGTGACAGTA-A--AG---ATACGTA-GACTGGTTTCT-T-ACTGTATGCAGGCT
gi|162028 : aGTCACAGTA-A--AG---ATATGTA-GACTGG----C-T-AC----TACAGGTTA
gi|162029 : ACAGTC-A--AG---ATACGTA-GACTGG----C-T-ACTGTATGCAGGATA
gi|162030 : ACAATC-A--AG---ATGCGTA-GATTGG----C-T-TCTGTATGTAGGT
gi|162031 : CAGTC-A--AG---ATACGCAAGATTGG----C-T-ACTGTGTGCAGGCT
gi|162032 : TACGCA-GACTGG----C-T-ACTGTGTGCAGGTTA
Alignments
lowQualScore : 111111111 111111111111 1111 111111 1111
lowQualScore : 33 000000000 333333333333 33 2 4 4 0000 2 2 111111 2 22 55555 666666 1 555555 4444 22 22 3 2 3333 0 0 55555 22 333 1 1 222 1 7777 1 1
lowQualScore : .. ......... ............ .. . . . .... . . ...... . .. ..... ...... . ...... .... .. .. . . .... . . ..... .. ... . . ... . .... . .
lowQualScore : 99 777777777 777777777777 77 5 7 7 6666 4 2 111111 7 99 66666 111111 0 888888 2222 88 88 1 8 2222 5 1 00000 88 333 3 3 222 3 3333 3 3
consensus : AATATTGACATT--CTT---------AAATAAA------------CTA--CATTT-TTTTATTTAAGTA-T----T-TT-T------AAAAAATAAGAT-AAACATTAAAACTTTTTAAAAA-----CGTGCTAAAAGATTAATAC------GTGCATNAAA------TA----T--T--ATNATGTGC---CCCAACGGAA-----ATGGAC--GCCAAT---TGCAGCAGGAGTCACAGTC-A-AG---ATACGTA-GACTGG----C-T-ACTGTATGCAGGTTA
Reference ( family-617 ) : AATATTGACATT--CTT---------AAATAAA------------CTA--CATTT-TTTTATTTAAGTA-T----T-TT-T------AAAAAATAAGAT-AAACATTAAAACTTTTTAAAAA-----CGTGCTAAAAGATTAATAC------GTGCATNAAA------TA----T--T--ATNATGTGC---CCCAACGGAA-----ATGGAC--GCCAAT---TGCAGCAGGAGTCACAGTC-A-AG---ATACGTA-GACTGG----C-T-ACTGTATGCAGGTTA
gi|162000 : AATATTGACATT--CTT---------AAATAAA------------CTA--CA-TT-TTTTATTTAAGTATT----T-TT-T------AAAAATTAAGAC-AAACGTTAAAACTTTTAACAAC-----CGTGCTAAAAGATTAATAC------GTGTATCAAA------TA----T--T--ATTATATG----CTCAACGAAA-----ATGGAC--ACCAAC---TGCAGCAGTAATCACAGTT-A-AG---AT
gi|162001 : aAATATTGACATT--CTT---------AAATAAA------------CTG--CATTT-TTTTATATAAGTA-T----T-TT-T------AAAAAATAAGAC-AAACTTTAAAACTTTTTTAAAA-----CGTG--AAACGATTAATAC------GTGCATCAAA------TA----T--C--ATAATGTGC---CCCAACGGAA-----ATGGAC--GCCAAT---TGCAGCAGGAGTCACAATC-A-AG---GTACGTA-GACTGG----C-T-ACAGTATGCAGGTTA
gi|162002 : aTATTGTTATT--CTT---------AAATAAA------------CTT--CATTT-TTTTACGTACGTA-T----T-TT-T------AAAAAATAAGAT-AAACATTAAATTTTTTTAAAAA-----CGTGCTCAAAGATTAATAC------GTGCATAAAA------TA----T--T--ACAATGTGC---CCCAACGGAA-----ATGAAC--GCCAAT---TGCAGCAGGAGTCAGAGTC-A-AA---ATACGTA-GACTGG----C-T-ATTGTATGCAGGTTA
gi|162003 : aacAATATTAACATT--CTT---------AAAAAAA------------CAA--CATTT-TTT-ATTTAAGTA-TATTTT-TT-T------TTAAAATAAGAC-AAACATTAAAACTTTTTACAAA-----CGTGCTAAAAGATTAATAC------GTGCATCAAA------TC----T--T--ATTATATG----CCCAACTTGA-----ATGGAC--ACCAAT---TGCAGCAGGAGTCACAGTC-A-AG---ATACGTA-GACTGG----C-T-CCTGTATACAGGTT
gi|162004 : aAATATTGACATT--CAT---------AAATAAA------------CTA--CATTC-TTTTACTTTAGTA-T----TATT-T------TAAAAATAAGAC-AAATATTAAAAGTTTTTAAAAG-----CGCGTTAAAAGATCAATACCTGTATGTGCATCAAA------TA----T--T--ATTGTATGC---CC-AACGGAA-----ATGGAC--ACCAAT---TGCAGCAGGAGTCCCAGTC-A-AGATAATATATA-GACTGG----C-TAATTGCA-GCAGG
gi|162005 : aAATATTGACATT--CTA---------AAATAAA------------CAA--CATTT-TTT-ATTAAAGTA-T----T-TT-TTTTTTTAAA---TTAGAG-AAACATT---------TAAA--------GTGCTAAAAGATGAATAC------GTGCATCAAA------TA----T--T--AGTATA-AA---CCCAACGAAG-----ATGGAC--GCCAAT---TGCAGCATGAGTCACAGTC-A-AG---AAACGTA-GACTGG----T-T-ACTGTATGTAGGTTA
gi|162006 : aAAAATTGACATT--ATT---------AAATAAA------------TTA--CATTT------TTTAA------------T-T------AAAG---------------TA----TTTTTAAAAA----------------AT-AAGAC------GAACATTAAAACTTTTTA----T--A--ATAATGAGC---CCCAATGGAA-----ATGGAC--GCCAAT---TGCAGCAGGAGTCACAGTC---TG---GTAAGTA-GACTGG----C-T-ACTGTATGCAGGTTA
gi|162007 : aAATATTGACATT--CTT---------AAATAAA------------CTA--CATTT-TTTTATTTATGTA-TA---T-TT-T------TGAAAATAAGAT-ATATATTTAAACTTTTTAGAAA-----CG-GTTAAAA-ATTAATAT------ATGCATGAAA------TA----T--A--ATTTTATGC---C------GAACTTCTATAGGA--ACCAAT---TGCAGCAAGAGTCACAGTC-G-AA---ATACCTA-GACTGG----C-T-TCTGTATCCAGGTTA
gi|162008 : aAGTATTGACATT--CAT---------AAATAAA------------CTA--CATTT-TCTTA-----------------------------AAATAAAAT-AAATATTAAAACTTTTTAAAAA-----CGTACTAAACGATTAATCC------AT-CATGAAA------AA----T--T--ATTTTATGC---CA-AACTTCT-----ATATAC--GCCACT---TGCAGTAGGAGTCACAGTC-A-AG---ATGCGTA-GACTGG----T-T-ACTGTATGCAGGT
gi|162009 : aAATATCGACATT--CTTTTCAATACAAAAAAGA------------CTA--CATAT-TTT-ATTC------T----T-TTGT------AAA---TAAGTTTAAATATCATAACTTTTTAAAAA-----CGTGTTTAAA-ATAACTCC------G-GCATGAAC------TA----TCAT--ATAATG------CCCAACTTAA-----ATGGAC--GCCAAT---TGCAGCAGGAGTAACAGTC-A-AG---ATACGTA-GACTGG----C-T-ACTGTATGCAGGTTA
gi|162010 : aAATATTAACATTATTTT---------CAATAAAAAAATTAGTCGTCTAATTATTA-TTTTATTAAAGTA-T----C-TT-T------AAAAA-TAATAA-AAAAATTAAAA-TGGACAAAAAAAGAACATGCTTAAAAGTC--TAC------ATGCATGAA-------TA----------ATTATTTG-------------A-----ATGGAC--G---ATCTCTGCAGCTAGAGTCACAGTC-A-AG---ATATGTA-GACTGG----T-T-ACTGTATGCAGGTT
gi|162011 : aAATATTGACATT--CTT---------AAATAAA------------CTA--CATTTGTTTTATTTCAGTA-T----T-TT-T------AAAAAACAAGAT-AAACATTAAAACTTTTTAAAAA-----CGTGCTAAACGATTAATAC------GTACATCAAA------TA----T--T--ATAATGTGC---CCCAACGGAA-----ATGGAC--GCCAAT---TGCAGCAGGCGTCACAGTC-A-AG---GTACGCA-GACTGG----C-T-ACTGTATGCAGGTTA
gi|162012 : AAT-TTGACATT--CTT---------AAATAAA------------CAA--CA-TT-TTTTATTTAAGTATT----T-TT-T------TAAAAGTAAGGC-AAATATTAAACCTTTTTAAAAC-----CGTGCTAAAAGATTAATAC------GTGCATT---------------T--T--ATTATATG----CCCAACGGAA-----ATGGAC--GCCAAC---TGCAGATGGAGGCACAGTC-A-AG---ATACGTA-GACTGG----C-T-CCTGTATGCAGGTTA
gi|162013 : AATATTGAAATT--CTT---------AAATAA-------------CAA--CACTT-TTCGATGAAAATA-T----T-TT-TGTTG--AAAAAA-AAGAT-AAGCATTAAAACTTTTTATAAA-----TGTGC-AAAAAA--AGTAC------ATGCATGAAC------TA----T--T--AT
gi|162014 : ---------AAATAAA------------CTG--TATTT-TT--ATTTAAGTA-T----T-TT-C------AAAAA-TAAAAT-AAACATGGCAATTATTTAAAAA-----CGTACTAAAAGATTGATAC------GTGCATAAAA------TT----T--T--AT-ATG------CCCAACGGAA-----ATGGAC--AGCAAT---ATCAGCAGTAGTTACAGGT-A-AA---GTAAGTA-GACGGA----C-C-ACTGTAAGCA
gi|162015 : TTT-TTTTATCTAAGTA-C----T-TT-C------AAAATATATAAT-AAACATTAGAACTTTTAAAAAA-----CATGCTGAT-GATTAATAC------ATGCATGAAA------TAGTATT--C--ATCATGAGCATGCCCATTTTTA-----ATGGAC--GCCATT---TGTAGCAGGTTTCACAGTC-A-AG---ATAAGTA-GACTAT----C-T-ACTCTATGCATGTTA
gi|162016 : tatatATTCAAATA-TCT--T-TT-T------TAAAAATAAGAA-AAACAATACA-CTTTTTAGAAA-----CGTGCTAAAAGATTAATAC------GCGCATCAAA------TA----T--T--ACTGTATAC---CC-AACAGAA-----ATGGAC--GCCAAT---TGCAACAAGAGTCACAGTC-A-TG---AGGCGTA-GACTGG----C-T-ACTGCAGGCAGGT
gi|162017 : T-C------AAAGAATAAGAT-GAACATTAAAACGTTT-AGAAA--------GCTAAAAGATTAATAC------ATGCATGAAA------TG----T--TTTATTACATGAATGCCCAACTTAA-----ATGGAC--GTCGTT---TGCTGCAGTAGTCTCAGTC-A-AG---ATGCATA-GACTGG----C-T-AC-ATATGCAGGTTA
gi|162018 : AAATTCATAC------GGGC--TGAA------TT----T--T---TAATGAGC---CCCAATGGAA-----ATGGAC--GCCAAT---TGCAGCAGGAGTCACAGTC-A-AG---GGACGTT-GACTGGCT--C-T-ACTGTATGCAGGTTA
gi|162019 : A------TA----T--T--AAAGTGTGC---CCCAACGGAA-----ATGGAC--GCAAAT---TGCAGCAGGAGCCACATTC-A-AG---GTACGTA-GACTGG----C-T-ACTGTATGCAAGTTA
gi|162020 : -----ATAGACTGGCCAAT---TACAGCAGGAGTCACAGTC-A-AG---ATATATC-GACTGG----CTT-ACAGTATGCAGGTTA
gi|162021 : T---TGCAGCTGGAGTCAT--TC-A-AG---ATACGTA-GACTGG----C-T-ACTGTTTACAGTTTA
gi|162022 : CAACAGGAGTCACAGTCCATAT---ATACGTA-GACTGG----C-T-AATGTATGCACGTTA
gi|162023 : AAGAGTGACAGTC-A-AG---ATACGCA-GACTGG----C-T-ACT
gi|162024 : GGGTCACAGTC-A-AA---ATACATA-GACTGG----C-T-ACTGTTTGCAGAT
gi|162025 : AGTGACAGTC-A-AG---ATACGTA-GACTGGGTACT-T-ACTGTATGCAGGCT
gi|162026 : AGCCACAGTC-A-AG---ATACGTA-GATTGA----C-C-ACTGTGTGCAGAT
gi|162027 : AGTGACAGTA-A-AG---ATACGTA-GACTGGTTTCT-T-ACTGTATGCAGGCT
gi|162028 : GTCACAGTA-A-AG---ATATGTA-GACTGG----C-T-AC----TACAGGTTA
gi|162029 : ACAGTC-A-AG---ATACGTA-GACTGG----C-T-ACTGTATGCAGGATA
gi|162030 : ACAATC-A-AG---ATGCGTA-GATTGG----C-T-TCTGTATGTAGGT
gi|162031 : CAGTC-A-AG---ATACGCAAGATTGG----C-T-ACTGTGTGCAGGCT
gi|162032 : ---ATACGCA-GACTGG----C-T-ACTGTGTGCAGGTTA
Alignments
lowQualScore : 111111111 111111111111 1111 111111 1111
lowQualScore : 33 000000000 333333333333 33 2 4 4 0000 2 2 111111 2 22 55555 666666 1 555555 4444 22 22 3 2 3333 0 0 55555 22 333 1 1 222 1 7777 1 1
lowQualScore : .. ......... ............ .. . . . .... . . ...... . .. ..... ...... . ...... .... .. .. . . .... . . ..... .. ... . . ... . .... . .
lowQualScore : 99 777777777 777777777777 77 5 7 7 6666 4 2 111111 7 99 66666 111111 0 888888 2222 88 88 1 8 2222 5 1 00000 88 333 3 3 222 3 3333 3 3
consensus : AATATTGACATT--CTT---------AAATAAA------------CTA--CATTT-TTTTATTTAAGTA-T----T-TT-T------AAAAAATAAGAT-AAACATTAAAACTTTTTAAAAA-----CGTGCTAAAAGATTAATAC------GTGCATNAAA------TA----T--T--ATNATGTGC---CCCAACGGAA-----ATGGAC--GCCAAT---TGCAGCAGGAGTCACAGTC-A-AG---ATACGTA-GACTGG----C-T-ACTGTATGCAGGTTA
Reference ( family-617 ) : AATATTGACATT--CTT---------AAATAAA------------CTA--CATTT-TTTTATTTAAGTA-T----T-TT-T------AAAAAATAAGAT-AAACATTAAAACTTTTTAAAAA-----CGTGCTAAAAGATTAATAC------GTGCATNAAA------TA----T--T--ATNATGTGC---CCCAACGGAA-----ATGGAC--GCCAAT---TGCAGCAGGAGTCACAGTC-A-AG---ATACGTA-GACTGG----C-T-ACTGTATGCAGGTTA
gi|162000 : AATATTGACATT--CTT---------AAATAAA------------CTA--CA-TT-TTTTATTTAAGTATT----T-TT-T------AAAAATTAAGAC-AAACGTTAAAACTTTTAACAAC-----CGTGCTAAAAGATTAATAC------GTGTATCAAA------TA----T--T--ATTATATG----CTCAACGAAA-----ATGGAC--ACCAAC---TGCAGCAGTAATCACAGTT-A-AG---AT
gi|162001 : aAATATTGACATT--CTT---------AAATAAA------------CTG--CATTT-TTTTATATAAGTA-T----T-TT-T------AAAAAATAAGAC-AAACTTTAAAACTTTTTTAAAA-----CGTG--AAACGATTAATAC------GTGCATCAAA------TA----T--C--ATAATGTGC---CCCAACGGAA-----ATGGAC--GCCAAT---TGCAGCAGGAGTCACAATC-A-AG---GTACGTA-GACTGG----C-T-ACAGTATGCAGGTTA
gi|162002 : aTATTGTTATT--CTT---------AAATAAA------------CTT--CATTT-TTTTACGTACGTA-T----T-TT-T------AAAAAATAAGAT-AAACATTAAATTTTTTTAAAAA-----CGTGCTCAAAGATTAATAC------GTGCATAAAA------TA----T--T--ACAATGTGC---CCCAACGGAA-----ATGAAC--GCCAAT---TGCAGCAGGAGTCAGAGTC-A-AA---ATACGTA-GACTGG----C-T-ATTGTATGCAGGTTA
gi|162003 : aacAATATTAACATT--CTT---------AAAAAAA------------CAA--CATTT-TTT-ATTTAAGTA-TATTTT-TT-T------TTAAAATAAGAC-AAACATTAAAACTTTTTACAAA-----CGTGCTAAAAGATTAATAC------GTGCATCAAA------TC----T--T--ATTATATG----CCCAACTTGA-----ATGGAC--ACCAAT---TGCAGCAGGAGTCACAGTC-A-AG---ATACGTA-GACTGG----C-T-CCTGTATACAGGTT
gi|162004 : aAATATTGACATT--CAT---------AAATAAA------------CTA--CATTC-TTTTACTTTAGTA-T----TATT-T------TAAAAATAAGAC-AAATATTAAAAGTTTTTAAAAG-----CGCGTTAAAAGATCAATACCTGTATGTGCATCAAA------TA----T--T--ATTGTATGC---CC-AACGGAA-----ATGGAC--ACCAAT---TGCAGCAGGAGTCCCAGTC-A-AGATAATATATA-GACTGG----C-TAATTGCA-GCAGG
gi|162005 : aAATATTGACATT--CTA---------AAATAAA------------CAA--CATTT-TTT-ATTAAAGTA-T----T-TT-TTTTTTTAAA---TTAGAG-AAACATT---------TAAA--------GTGCTAAAAGATGAATAC------GTGCATCAAA------TA----T--T--AGTATA-AA---CCCAACGAAG-----ATGGAC--GCCAAT---TGCAGCATGAGTCACAGTC-A-AG---AAACGTA-GACTGG----T-T-ACTGTATGTAGGTTA
gi|162006 : aAAAATTGACATT--ATT---------AAATAAA------------TTA--CATTT------TTTAA------------T-T------AAAG---------------TA----TTTTTAAAAA----------------AT-AAGAC------GAACATTAAAACTTTTTA----T--A--ATAATGAGC---CCCAATGGAA-----ATGGAC--GCCAAT---TGCAGCAGGAGTCACAGTC---TG---GTAAGTA-GACTGG----C-T-ACTGTATGCAGGTTA
gi|162007 : aAATATTGACATT--CTT---------AAATAAA------------CTA--CATTT-TTTTATTTATGTA-TA---T-TT-T------TGAAAATAAGAT-ATATATTTAAACTTTTTAGAAA-----CG-GTTAAAA-ATTAATAT------ATGCATGAAA------TA----T--A--ATTTTATGC---C------GAACTTCTATAGGA--ACCAAT---TGCAGCAAGAGTCACAGTC-G-AA---ATACCTA-GACTGG----C-T-TCTGTATCCAGGTTA
gi|162008 : aAGTATTGACATT--CAT---------AAATAAA------------CTA--CATTT-TCTTA-----------------------------AAATAAAAT-AAATATTAAAACTTTTTAAAAA-----CGTACTAAACGATTAATCC------AT-CATGAAA------AA----T--T--ATTTTATGC---CA-AACTTCT-----ATATAC--GCCACT---TGCAGTAGGAGTCACAGTC-A-AG---ATGCGTA-GACTGG----T-T-ACTGTATGCAGGT
gi|162009 : aAATATCGACATT--CTTTTCAATACAAAAAAGA------------CTA--CATAT-TTT-ATTC------T----T-TTGT------AAA---TAAGTTTAAATATCATAACTTTTTAAAAA-----CGTGTTTAAA-ATAACTCC------G-GCATGAAC------TA----TCAT--ATAATG------CCCAACTTAA-----ATGGAC--GCCAAT---TGCAGCAGGAGTAACAGTC-A-AG---ATACGTA-GACTGG----C-T-ACTGTATGCAGGTTA
gi|162010 : aAATATTAACATTATTTT---------CAATAAAAAAATTAGTCGTCTAATTATTA-TTTTATTAAAGTA-T----C-TT-T------AAAAA-TAATAA-AAAAATTAAAA-TGGACAAAAAAAGAACATGCTTAAAAGTC--TAC------ATGCATGAA-------TA----------ATTATTTG-------------A-----ATGGAC--G---ATCTCTGCAGCTAGAGTCACAGTC-A-AG---ATATGTA-GACTGG----T-T-ACTGTATGCAGGTT
gi|162011 : aAATATTGACATT--CTT---------AAATAAA------------CTA--CATTTGTTTTATTTCAGTA-T----T-TT-T------AAAAAACAAGAT-AAACATTAAAACTTTTTAAAAA-----CGTGCTAAACGATTAATAC------GTACATCAAA------TA----T--T--ATAATGTGC---CCCAACGGAA-----ATGGAC--GCCAAT---TGCAGCAGGCGTCACAGTC-A-AG---GTACGCA-GACTGG----C-T-ACTGTATGCAGGTTA
gi|162012 : AAT-TTGACATT--CTT---------AAATAAA------------CAA--CA-TT-TTTTATTTAAGTATT----T-TT-T------TAAAAGTAAGGC-AAATATTAAACCTTTTTAAAAC-----CGTGCTAAAAGATTAATAC------GTGCATT---------------T--T--ATTATATG----CCCAACGGAA-----ATGGAC--GCCAAC---TGCAGATGGAGGCACAGTC-A-AG---ATACGTA-GACTGG----C-T-CCTGTATGCAGGTTA
gi|162013 : AATATTGAAATT--CTT---------AAATAA-------------CAA--CACTT-TTCGATGAAAATA-T----T-TT-TGTTG--AAAAAA-AAGAT-AAGCATTAAAACTTTTTATAAA-----TGTGC-AAAAAA--AGTAC------ATGCATGAAC------TA----T--T--AT
gi|162014 : ---------AAATAAA------------CTG--TATTT-TT--ATTTAAGTA-T----T-TT-C------AAAAA-TAAAAT-AAACATGGCAATTATTTAAAAA-----CGTACTAAAAGATTGATAC------GTGCATAAAA------TT----T--T--AT-ATG------CCCAACGGAA-----ATGGAC--AGCAAT---ATCAGCAGTAGTTACAGGT-A-AA---GTAAGTA-GACGGA----C-C-ACTGTAAGCA
gi|162015 : TTT-TTTTATCTAAGTA-C----T-TT-C------AAAATATATAAT-AAACATTAGAACTTTTAAAAAA-----CATGCTGAT-GATTAATAC------ATGCATGAAA------TAGTATT--C--ATCATGAGCATGCCCATTTTTA-----ATGGAC--GCCATT---TGTAGCAGGTTTCACAGTC-A-AG---ATAAGTA-GACTAT----C-T-ACTCTATGCATGTTA
gi|162016 : tatatATTCAAATA-TCT--T-TT-T------TAAAAATAAGAA-AAACAATACA-CTTTTTAGAAA-----CGTGCTAAAAGATTAATAC------GCGCATCAAA------TA----T--T--ACTGTATAC---CC-AACAGAA-----ATGGAC--GCCAAT---TGCAACAAGAGTCACAGTC-A-TG---AGGCGTA-GACTGG----C-T-ACTGCAGGCAGGT
gi|162017 : T-C------AAAGAATAAGAT-GAACATTAAAACGTTT-AGAAA--------GCTAAAAGATTAATAC------ATGCATGAAA------TG----T--TTTATTACATGAATGCCCAACTTAA-----ATGGAC--GTCGTT---TGCTGCAGTAGTCTCAGTC-A-AG---ATGCATA-GACTGG----C-T-AC-ATATGCAGGTTA
gi|162018 : AAATTCATAC------GGGC--TGAA------TT----T--T---TAATGAGC---CCCAATGGAA-----ATGGAC--GCCAAT---TGCAGCAGGAGTCACAGTC-A-AG---GGACGTT-GACTGGCT--C-T-ACTGTATGCAGGTTA
gi|162019 : A------TA----T--T--AAAGTGTGC---CCCAACGGAA-----ATGGAC--GCAAAT---TGCAGCAGGAGCCACATTC-A-AG---GTACGTA-GACTGG----C-T-ACTGTATGCAAGTTA
gi|162020 : -----ATAGACTGGCCAAT---TACAGCAGGAGTCACAGTC-A-AG---ATATATC-GACTGG----CTT-ACAGTATGCAGGTTA
gi|162021 : T---TGCAGCTGGAGTCAT--TC-A-AG---ATACGTA-GACTGG----C-T-ACTGTTTACAGTTTA
gi|162022 : CAACAGGAGTCACAGTCCATAT---ATACGTA-GACTGG----C-T-AATGTATGCACGTTA
gi|162023 : AAGAGTGACAGTC-A-AG---ATACGCA-GACTGG----C-T-ACT
gi|162024 : GGGTCACAGTC-A-AA---ATACATA-GACTGG----C-T-ACTGTTTGCAGAT
gi|162025 : AGTGACAGTC-A-AG---ATACGTA-GACTGGGTACT-T-ACTGTATGCAGGCT
gi|162026 : AGCCACAGTC-A-AG---ATACGTA-GATTGA----C-C-ACTGTGTGCAGAT
gi|162027 : AGTGACAGTA-A-AG---ATACGTA-GACTGGTTTCT-T-ACTGTATGCAGGCT
gi|162028 : GTCACAGTA-A-AG---ATATGTA-GACTGG----C-T-AC----TACAGGTTA
gi|162029 : ACAGTC-A-AG---ATACGTA-GACTGG----C-T-ACTGTATGCAGGATA
gi|162030 : ACAATC-A-AG---ATGCGTA-GATTGG----C-T-TCTGTATGTAGGT
gi|162031 : CAGTC-A-AG---ATACGCAAGATTGG----C-T-ACTGTGTGCAGGCT
gi|162032 : ---ATACGCA-GACTGG----C-T-ACTGTGTGCAGGTTA
blockSeqs : AT TTCAATACA AAAATTAGTCGT AT G T T ATTT A G TTTTTT A TT AAGAA CTGTAT C ACTTTT GTAT CA TT A T CATG CTTCT TG CTC C T ATA A GTAC T A
blockSeqs : . . . . . T . CT . . GTTG A C . . A . . . . A T AATG . . . . . . . TTTC . .
blockSeqs : . . . . . T . A . . . A T . . C . . . . T T C . . . . . . . CT . .
blockSeqs : . . . . . T . . . . . A C . . C . . . . T T C . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . T . . . . . A C . . C . . . . T A C . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . T . . . . . A G . . T . . . . A T A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . T . . . . . A T . . G . . . . T T C . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . T . . . . . G T . . G . . . . T T C . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . G . . . . . A A . . G . . . . A T C . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . T . . . . . A T . . G . . . . T T C . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . A C . . C . . . . A A C . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . A T . . T . . . . T T C . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . T . . G . . . . C T C . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . T . . A . . . . T A . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . G . . . . T T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . T . . C . . . . A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . G . . . . A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : .
blockSeqCons : C***
originalCons : AATATTGACATT--CTT---------AAATAAA------------CTA--CATTT-TTTTATTTAAGTA-T----T-TT-T------AAAAAATAAGAT-AAACATTAAAACTTTTTAAAAA-----CGTGCTAAAAGATTAATAC------GTGCATNAAA------TA----T--T--ATNATGTGC---CCCAACGGAA-----ATGGAC--GCCAAT---TGCAGCAGGAGTCACAGTC-A-AG---ATACGTA-GACTGG----C-T-ACTGTATGCAGGTTA
finalCons : AATATTGACATT--CTT---------AAATAAA------------CTA--CATTT-TTTTATTTAAGTA-T----T-TT-T------AAAAAATAAGAT-AAACATTAAAACTTTTTAAAAA-----CGTGCTAAAAGATTAATAC------GTGCATNAAA------TA----T--T--ATNATGTGC---CCCAACGGAA-----ATGGAC--GCCAAT---TGCAGCAGGAGTCACAGTC-A-AG---ATACGTA-GACTGG----C-T-ACTGTATGCAGGTTA
Alignments
lowQualScore : 111111111 111111111111 1111 111111 1111
lowQualScore : 33 000000000 333333333333 33 2 4 4 0000 2 2 111111 2 22 55555 666666 1 555555 4444 22 22 3 2 3333 0 0 55555 22 333 1 1 222 1 7777 1 1
lowQualScore : .. ......... ............ .. . . . .... . . ...... . .. ..... ...... . ...... .... .. .. . . .... . . ..... .. ... . . ... . .... . .
lowQualScore : 99 777777777 777777777777 77 5 7 7 6666 4 2 111111 7 99 66666 111111 0 888888 2222 88 88 1 8 2222 5 1 00000 88 333 3 3 222 3 3333 3 3
consensus : AATATTGACATT--CTT---------AAATAAA------------CTA--CATTT-TTTTATTTAAGTA-T----T-TT-T------AAAAAATAAGAT-AAACATTAAAACTTTTTAAAAA-----CGTGCTAAAAGATTAATAC------GTGCATNAAA------TA----T--T--ATNATGTGC---CCCAACGGAA-----ATGGAC--GCCAAT---TGCAGCAGGAGTCACAGTC-A-AG---ATACGTA-GACTGG----C-T-ACTGTATGCAGGTTA
Reference ( family-617 ) : AATATTGACATT--CTT---------AAATAAA------------CTA--CATTT-TTTTATTTAAGTA-T----T-TT-T------AAAAAATAAGAT-AAACATTAAAACTTTTTAAAAA-----CGTGCTAAAAGATTAATAC------GTGCATNAAA------TA----T--T--ATNATGTGC---CCCAACGGAA-----ATGGAC--GCCAAT---TGCAGCAGGAGTCACAGTC-A-AG---ATACGTA-GACTGG----C-T-ACTGTATGCAGGTTA
gi|162000 : AATATTGACATT--CTT---------AAATAAA------------CTA--CA-TT-TTTTATTTAAGTATT----T-TT-T------AAAAATTAAGAC-AAACGTTAAAACTTTTAACAAC-----CGTGCTAAAAGATTAATAC------GTGTATCAAA------TA----T--T--ATTATATG----CTCAACGAAA-----ATGGAC--ACCAAC---TGCAGCAGTAATCACAGTT-A-AG---AT
gi|162001 : aAATATTGACATT--CTT---------AAATAAA------------CTG--CATTT-TTTTATATAAGTA-T----T-TT-T------AAAAAATAAGAC-AAACTTTAAAACTTTTTTAAAA-----CGTG--AAACGATTAATAC------GTGCATCAAA------TA----T--C--ATAATGTGC---CCCAACGGAA-----ATGGAC--GCCAAT---TGCAGCAGGAGTCACAATC-A-AG---GTACGTA-GACTGG----C-T-ACAGTATGCAGGTTA
gi|162002 : aTATTGTTATT--CTT---------AAATAAA------------CTT--CATTT-TTTTACGTACGTA-T----T-TT-T------AAAAAATAAGAT-AAACATTAAATTTTTTTAAAAA-----CGTGCTCAAAGATTAATAC------GTGCATAAAA------TA----T--T--ACAATGTGC---CCCAACGGAA-----ATGAAC--GCCAAT---TGCAGCAGGAGTCAGAGTC-A-AA---ATACGTA-GACTGG----C-T-ATTGTATGCAGGTTA
gi|162003 : aacAATATTAACATT--CTT---------AAAAAAA------------CAA--CATTT-TTT-ATTTAAGTA-TATTTT-TT-T------TTAAAATAAGAC-AAACATTAAAACTTTTTACAAA-----CGTGCTAAAAGATTAATAC------GTGCATCAAA------TC----T--T--ATTATATG----CCCAACTTGA-----ATGGAC--ACCAAT---TGCAGCAGGAGTCACAGTC-A-AG---ATACGTA-GACTGG----C-T-CCTGTATACAGGTT
gi|162004 : aAATATTGACATT--CAT---------AAATAAA------------CTA--CATTC-TTTTACTTTAGTA-T----TATT-T------TAAAAATAAGAC-AAATATTAAAAGTTTTTAAAAG-----CGCGTTAAAAGATCAATACCTGTATGTGCATCAAA------TA----T--T--ATTGTATGC---CC-AACGGAA-----ATGGAC--ACCAAT---TGCAGCAGGAGTCCCAGTC-A-AGATAATATATA-GACTGG----C-TAATTGCA-GCAGG
gi|162005 : aAATATTGACATT--CTA---------AAATAAA------------CAA--CATTT-TTT-ATTAAAGTA-T----T-TT-TTTTTTTAAA---TTAGAG-AAACATT---------TAAA--------GTGCTAAAAGATGAATAC------GTGCATCAAA------TA----T--T--AGTATA-AA---CCCAACGAAG-----ATGGAC--GCCAAT---TGCAGCATGAGTCACAGTC-A-AG---AAACGTA-GACTGG----T-T-ACTGTATGTAGGTTA
gi|162006 : aAAAATTGACATT--ATT---------AAATAAA------------TTA--CATTT------TTTAA------------T-T------AAAG---------------TA----TTTTTAAAAA----------------AT-AAGAC------GAACATTAAAACTTTTTA----T--A--ATAATGAGC---CCCAATGGAA-----ATGGAC--GCCAAT---TGCAGCAGGAGTCACAGTC---TG---GTAAGTA-GACTGG----C-T-ACTGTATGCAGGTTA
gi|162007 : aAATATTGACATT--CTT---------AAATAAA------------CTA--CATTT-TTTTATTTATGTA-TA---T-TT-T------TGAAAATAAGAT-ATATATTTAAACTTTTTAGAAA-----CG-GTTAAAA-ATTAATAT------ATGCATGAAA------TA----T--A--ATTTTATGC---C------GAACTTCTATAGGA--ACCAAT---TGCAGCAAGAGTCACAGTC-G-AA---ATACCTA-GACTGG----C-T-TCTGTATCCAGGTTA
gi|162008 : aAGTATTGACATT--CAT---------AAATAAA------------CTA--CATTT-TCTTA-----------------------------AAATAAAAT-AAATATTAAAACTTTTTAAAAA-----CGTACTAAACGATTAATCC------AT-CATGAAA------AA----T--T--ATTTTATGC---CA-AACTTCT-----ATATAC--GCCACT---TGCAGTAGGAGTCACAGTC-A-AG---ATGCGTA-GACTGG----T-T-ACTGTATGCAGGT
gi|162009 : aAATATCGACATT--CTTTTCAATACAAAAAAGA------------CTA--CATAT-TTT-ATTC------T----T-TTGT------AAA---TAAGTTTAAATATCATAACTTTTTAAAAA-----CGTGTTTAAA-ATAACTCC------G-GCATGAAC------TA----TCAT--ATAATG------CCCAACTTAA-----ATGGAC--GCCAAT---TGCAGCAGGAGTAACAGTC-A-AG---ATACGTA-GACTGG----C-T-ACTGTATGCAGGTTA
gi|162010 : aAATATTAACATTATTTT---------CAATAAAAAAATTAGTCGTCTAATTATTA-TTTTATTAAAGTA-T----C-TT-T------AAAAA-TAATAA-AAAAATTAAAA-TGGACAAAAAAAGAACATGCTTAAAAGTC--TAC------ATGCATGAA-------TA----------ATTATTTG-------------A-----ATGGAC--G---ATCTCTGCAGCTAGAGTCACAGTC-A-AG---ATATGTA-GACTGG----T-T-ACTGTATGCAGGTT
gi|162011 : aAATATTGACATT--CTT---------AAATAAA------------CTA--CATTTGTTTTATTTCAGTA-T----T-TT-T------AAAAAACAAGAT-AAACATTAAAACTTTTTAAAAA-----CGTGCTAAACGATTAATAC------GTACATCAAA------TA----T--T--ATAATGTGC---CCCAACGGAA-----ATGGAC--GCCAAT---TGCAGCAGGCGTCACAGTC-A-AG---GTACGCA-GACTGG----C-T-ACTGTATGCAGGTTA
gi|162012 : AAT-TTGACATT--CTT---------AAATAAA------------CAA--CA-TT-TTTTATTTAAGTATT----T-TT-T------TAAAAGTAAGGC-AAATATTAAACCTTTTTAAAAC-----CGTGCTAAAAGATTAATAC------GTGCATT---------------T--T--ATTATATG----CCCAACGGAA-----ATGGAC--GCCAAC---TGCAGATGGAGGCACAGTC-A-AG---ATACGTA-GACTGG----C-T-CCTGTATGCAGGTTA
gi|162013 : AATATTGAAATT--CTT---------AAATAA-------------CAA--CACTT-TTCGATGAAAATA-T----T-TT-TGTTG--AAAAAA-AAGAT-AAGCATTAAAACTTTTTATAAA-----TGTGC-AAAAAA--AGTAC------ATGCATGAAC------TA----T--T--AT
gi|162014 : ---------AAATAAA------------CTG--TATTT-TT--ATTTAAGTA-T----T-TT-C------AAAAA-TAAAAT-AAACATGGCAATTATTTAAAAA-----CGTACTAAAAGATTGATAC------GTGCATAAAA------TT----T--T--AT-ATG------CCCAACGGAA-----ATGGAC--AGCAAT---ATCAGCAGTAGTTACAGGT-A-AA---GTAAGTA-GACGGA----C-C-ACTGTAAGCA
gi|162015 : TTT-TTTTATCTAAGTA-C----T-TT-C------AAAATATATAAT-AAACATTAGAACTTTTAAAAAA-----CATGCTGAT-GATTAATAC------ATGCATGAAA------TAGTATT--C--ATCATGAGCATGCCCATTTTTA-----ATGGAC--GCCATT---TGTAGCAGGTTTCACAGTC-A-AG---ATAAGTA-GACTAT----C-T-ACTCTATGCATGTTA
gi|162016 : tatatATTCAAATA-TCT--T-TT-T------TAAAAATAAGAA-AAACAATACA-CTTTTTAGAAA-----CGTGCTAAAAGATTAATAC------GCGCATCAAA------TA----T--T--ACTGTATAC---CC-AACAGAA-----ATGGAC--GCCAAT---TGCAACAAGAGTCACAGTC-A-TG---AGGCGTA-GACTGG----C-T-ACTGCAGGCAGGT
gi|162017 : T-C------AAAGAATAAGAT-GAACATTAAAACGTTT-AGAAA--------GCTAAAAGATTAATAC------ATGCATGAAA------TG----T--TTTATTACATGAATGCCCAACTTAA-----ATGGAC--GTCGTT---TGCTGCAGTAGTCTCAGTC-A-AG---ATGCATA-GACTGG----C-T-AC-ATATGCAGGTTA
gi|162018 : AAATTCATAC------GGGC--TGAA------TT----T--T---TAATGAGC---CCCAATGGAA-----ATGGAC--GCCAAT---TGCAGCAGGAGTCACAGTC-A-AG---GGACGTT-GACTGGCT--C-T-ACTGTATGCAGGTTA
gi|162019 : A------TA----T--T--AAAGTGTGC---CCCAACGGAA-----ATGGAC--GCAAAT---TGCAGCAGGAGCCACATTC-A-AG---GTACGTA-GACTGG----C-T-ACTGTATGCAAGTTA
gi|162020 : -----ATAGACTGGCCAAT---TACAGCAGGAGTCACAGTC-A-AG---ATATATC-GACTGG----CTT-ACAGTATGCAGGTTA
gi|162021 : T---TGCAGCTGGAGTCAT--TC-A-AG---ATACGTA-GACTGG----C-T-ACTGTTTACAGTTTA
gi|162022 : CAACAGGAGTCACAGTCCATAT---ATACGTA-GACTGG----C-T-AATGTATGCACGTTA
gi|162023 : AAGAGTGACAGTC-A-AG---ATACGCA-GACTGG----C-T-ACT
gi|162024 : GGGTCACAGTC-A-AA---ATACATA-GACTGG----C-T-ACTGTTTGCAGAT
gi|162025 : AGTGACAGTC-A-AG---ATACGTA-GACTGGGTACT-T-ACTGTATGCAGGCT
gi|162026 : AGCCACAGTC-A-AG---ATACGTA-GATTGA----C-C-ACTGTGTGCAGAT
gi|162027 : AGTGACAGTA-A-AG---ATACGTA-GACTGGTTTCT-T-ACTGTATGCAGGCT
gi|162028 : GTCACAGTA-A-AG---ATATGTA-GACTGG----C-T-AC----TACAGGTTA
gi|162029 : ACAGTC-A-AG---ATACGTA-GACTGG----C-T-ACTGTATGCAGGATA
gi|162030 : ACAATC-A-AG---ATGCGTA-GATTGG----C-T-TCTGTATGTAGGT
gi|162031 : CAGTC-A-AG---ATACGCAAGATTGG----C-T-ACTGTGTGCAGGCT
gi|162032 : ---ATACGCA-GACTGG----C-T-ACTGTGTGCAGGTTA