lowQualScore : 111111 3333333333 11111 1 11111111 1
lowQualScore : 2 555 000000 22 1 9 9 4 1 1 333 22 2 1 22 333 444444 4444444444 1 1 1 55555 9 44 22 33 555 3333 1 1 55555 1 1 11 11 1 1 333 1 11 2 1 22 00000000 1 22 1
lowQualScore : . ... ...... .. . . . . . . ... .. . . .. ... ...... .......... . . . ..... . .. .. .. ... .... . . ..... . . .. .. . . ... . .. . . .. ........ . .. .
lowQualScore : 4 000 444444 88 9 2 8 4 8 8 222 44 7 0 55 222 888888 6666666666 6 6 6 44444 1 11 00 99 000 0000 4 4 33333 3 3 88 88 3 3 777 3 88 1 4 00 33333333 9 00 5
consensus : AGACACGTTGTCTGAA-CAGCTGGTCTCATC--AT----T-A--AAA-TAGTGTTGAACAACAGTTAGTTCAACNCTACAGG-GTTTGAAACATT-ATAC---TGTATATAGT--TGATTGGTATGAT--CATTTGTCTG---TATGATTTCTAAATATTAGAATCATTT------TATTA--T--TTTT-TTTG-T-TTGAAGTTTACG-AATCATGAGGCAAGAAGCCTGAGGAAAATT--T--ATA--TAT---TA----TATA-GTTTGAAC-AAAATTGTTTAACA-----TAGTTTCAAGCTAGGCTG-TTTC-ACAGCTTAATCCAGTGAAGACA--CAGTCGCCTT--AC-AGAAG-ATC---CCG-TTT--TAAGTTCAAGA-TA--CT-------CAC-CCA--ACA-TCTTGACAG
Reference ( gi|90660 ) : AGACACGTTGTCTGAA-CAGCTGGTCTCATT--AT----T-A--AAA-TAGTGTTGAACAACAGTTGGTTCAACCCTACAAG-GTTTGAAACATT-ATAC---TGTATATAGT--TAATTGGTATGAT--CATTTGTCTG---TATGATTTCTAAATATTAGAATCATTT------TATTA--T--TCCT-TTTG-T-TTGAAGTTAACT-AATCATAAGGCAAGAAGCCTGAGGAAAATT--T--ATA--TAT---TA----TATA-GTTTGAAC-AAAATTGTTTAACA-----TAGTTTCAAGCTAGGCTG-TTTC-ACAGCTTAATCCAGTGAAGACA--CAGTCGCCTT--AC-AGAAG-ATC---CCG-TTT--TTAGTTCAAGA-TA--CC-------CAC-CCA--ACA-TCTTGACAG
gi|90661 : AGACACGTTGTCTGAA-CAGCTGGTCTCATT--AT----T-A--AAA-TAGTGTTGAACAACAGTTGGTTCAACTCTACAAG-GTCTGAAACATT-ATAC---TGCATATAGT--TAATTGGTATGAT--CATTTGTCTG---TATGATTTCTAGATATTAGAATCATTT------TATTA--T--TCCT-TTCG-T-TTGAATTTAACT-AATCATAAGGCAAGAAGCCTGAGGAAAAAT--T--ATA--TAT---TT----TATA-GTTTGAAC-AAAATTGTTTAACA-----TAGTTTCAAGCTAGACTG-TTTC-ACAGCTTAATCCAGTGAAGACA--CAGTCGCCTT--AC-AGAAG-ATC---CCG-TTT--TTAGTTCAAGA-TA--CC-------CAC-CCA--ACA-TCTTGACAG
gi|90664 : AGACACGTTGTCTGAA-CAGCTGGTTTCATT--AT----T-A--AAA-TAGTGTTGAACAACAGTAAGTTCAACTCTACAAG-GGTTGAAACATT-ATAC---TGTATATAGT--TAATTAGTATGAT--CATTTGTCTG---TATGATTTCTAAATATTAGAATCATTT------TATTA--T--TTCT-TTTG-T-TTGAAGTCAACT-ATTCAAAAGGCAAGAAGGTTGAAGAAAATT--T--ATA--TAT---TA----TATA-GTTTGAAC-AAAATTGTTTAACA-----TAGTTTCAATCTAGGCTG-TTTC-ACAGCTTAATCCAGTGAAGGCA--CAGTCGCCTT--AC-AGAAG-ATC---CCG-TTT--TTAATTCAAGA-TT--AT-------AGC-CCA--ATA-TCTTGACA
gi|90662 : AAACACGTTGTCTGAA-CAGCTGGTCTCATT--AT----T-T--AAC-TAGTGTTGAACAACAGTTAGTTCAACTCTACAGG-GTTTGAAACATT-ATAA---TGTATATAGT--TGATTGGTATGAT--CATTTGTCTG---TATGATTTCTAGATATTAGAATCAATT------TATTA--T--TATT-TTTG-T-TTGAAGTTTACT-AATAATGAGGGAAGAAGCCTGAGGAAAATT--T--ATA--TAT---TA----TATA-GTTTAAAC-AAAATTGTTTAATA-----TAGTTTCAAGCTAGGCTG-TTTC-ACAGCTTAATCAAGTGAAGACA--CAGTCGCTTT--AC-AGAAG-ATC---CCGTTTT--TTAGTTCAAGA-TA--CT-------CAC-CCA--ACA-TCTTGACA
gi|90663 : AGACACGT---CTGAA-CAGCTGGTCTCATA--AT----T-A--AAA-CAGTGTTGAACAACAGTTAGTTCAACTCTACAGG-GTTTGAAACAT----AC---TGTATATAGT--TGATTGGTATGAT--CATTTGTCTG---TATGATTTCTAAATATTAGAATCATTT------TATTA--TCTTTAT-TTTG-T-TTGAAGTTTACT-AATCATGAGGCAAGAAGCCTGAGGAAAATT--T--ATA--TAT---TT----TATA-GTTTGAAC-AAAATTGTTTAACA-----TAGTTTCAAGCTAGGCTG-TTTC-ACAGCTTAATCCAGTGAAGACA--AAGTTGCCTT--AA-AGAAG-ATC---CTG-TCT--TAAGTTCATGA-CA--CT-------CAC-CCA--ACA-TCTTGACAG
gi|90665 : AGACACGTTGGCTGAA-CAGCTGGCGTCATT--AT----T-A--AAA-TAGTGTTGAACAACAGTAAGTTCAACTCTACAGG-GTTTGAAACATT-TTAC---TGTATATAGT--TGATTCGTATGAT--CATTTGTCTG---TATAATTTCTAAATATTAGAATCATTT------TATTA--T--TATA-TTTG-T-TTGAAGTTTACT-TATCGTGAGGCAAGAAGCCTGAGGATAATT--T--ATG--TTT---TA----TATA-GTTTGAAC-AAAATTGTTTAACA-----TAGTTTTAAGCTAGGCTG-TTTC-ACAGATTAATCCAGTGAAGACA--CAGTTGCCTT--AT-AGAAG-ATC---CCA-TTT--TAAGTTCAAGG-TA--CT-------CAC-CCA--GCA-TCTTGACAG
gi|90666 : AGACACGTTGTCTGAA-CAGCTGGTCTCATT--AT----T-A--AAA-TATTGTTGAACAACAGTTAGTTCAACTCTACAGG-GTTTGAAACATT-ATAC---TGTAAATAGT--TGAATGATATGAT------TGTCTG---TATGATTTCTAAATATTAGAATCATTG------TATTA--T--ATTT-TTTG-T-TT-------ACG-AGTCATGAAGCAAGAAGCCTGAGGAAAAGTCAT--ATA--TAT---TA----TATA-GTTTTAAC-AAAATTATTTAATA-----TAGTTTCAAGCTAGGCCT-TTTC-ACAGCTTAATCCAGTGCAGACA--CATTCGCCTT--AC-AGAAG-ATC---CCG-TTT--TAAGTTCAAGT-TA--CA-------CAT-CCA--ACA-TCTTGATAG
gi|90667 : AGACACGTTGTCTGAA-CAGCTGGTCTCATC--ATC---T-A--AAA-TAGTGTTTAGCAACAGTTAGTTCAACACTAGAGG-GTTTGAAACATT-ATAC---TGTATATAGT--TGATTCGTATGAT--CATTT-TCTG---TATGATTTCTAAATATAAGAATCATTT------TATTG--T--T-----TTG-T-TTGAAGTTTACT-AATCATGACGCCAAAAGCTTGAGTAAAATT--T--ATA--GATCAATA----TATA-GTTTGATC-AAAAATGTTTAACA-----TAGTTTTGAGTTAGGCTG-TTTC-ACAGCTTAATCTAGTGGAGACA--CAGTCGCCTT--AC-AGAAG-ATC---CCT-TTT--TAAGTTCAATA-TA--CT-------CAC-ACA--ACC-TTTTGACA
gi|90668 : AGACACGTTGTTTGAA-CAGCTGGTCTGATC--AT----A-T--AAA-TTTTGTTGAGCAACAGTTAGTCCAACACTACAGG-GTTTTAAACATT-ATAC---TGTATATAGAGATGATTGATTTGAT--CATTTGTTTG---TATGATTTCCAAATATTATAATCATTT----------A--T--G--T-GTTG-T-TTGTAGTT---TGAATCATGAGGCAAGAAACCTGAGGAAAATT--T--ATA--TAT---TA----CATA-GTTTGAAC-ACAATTGTTGAACA-----TAGTTTCAAGCTAGGCTG-TTTC-ACAGTTTAATCCAGTGAATACA--GAGTCGCCTT--AC-AGAAG-ATT---CAG-TTT--TAAGTTCGAGA-TA--TT-------TACACCA--ACA-TCTTGACA
gi|90669 : AGACACGTTGT-TAAA------------ATT--AT----T-A--AAA-TAGTGTTGAACAACAGTT----CAACTCTACAGG-GTTTGAAACATT-ATAC---TGTAAATAGT--TGATTGATATGAT------TGTCTG---TATGATTTCTAAATATTAGAATCATTT------TATTA--TA-TTTTGTTTG-T-TTGACGTTTACG-AATCATGAGGCAAGAAGCCTGAGGAAAATT--T--ATATATAT---TA----TACA-GTTTGAAC-AAAATTATTTAACA-----TAGTTTCAAGCTAGGCTGTTTTT-ACAGCTTAATCCAGTGAAGACA--CAATCGCCTT--ACGAAAAA-ATA---TCG-CTT--
gi|90670 : AGACACGTTGTCTGAA-AAACTGTTCTCATT--A-----T-A--AAC-TAGTGTTGAACAGCAG-----------------G-GTTTGAAACATT-AAACATTTGTAAATAGT--TGATTGATATGA------TTGTATG---TATGGTTTCTAAATATTAGAATCATTT------TATTA--T--ATTT-TTAG-T-TTGAAGTTTACG-AACCATAAGGCAAGAAGTCTGAGGAAAATTTAT--ATA--TAT---TA----TATA-GTTTGAGCAAAAATTGTTTTACA-----TAGTTTCAAGCTAAGCTG-TTTC-ACAGCTTAATCCAGTGAAGTCA--AAGATGCCTT--AA-AGAAG-ATC---CCG-TTT--TAAGTTTAAGA-TATTTT-------CA--ACA--ACA-TTTTAAC
gi|90671 : AGACATGTTGTCTAAA-CAGCTGGTCTCATC--GT----TTA--AAA-TAGTGTTGAGCAACAGT--------------AAG-GTTTGAAACATT-ATAC---TGTATATAGT--TGACTCGTTTGAT--CATGTGTCTG---TATCATTTCTAAATATTA-AATAATCT------TATTA------CTT-TTTA-TGTTGAAGTTTACG-AATCATGAGGATAAAAGCCTGGGGAAAATT--A--ACA--TAA---TA----TATA-GTATTAAT-AACATTTTTTAACA-----TAGTTTCAAGCTGGGCTG-TTTT-ACAGCATTATCCAGTGAAGACA--CAGTCGCCTT--AC-AGAAG-ATCA--ACG--AT--TAAGTTCAAGA-TA--CT-------AGC-CGA--ACA-CCTTGACAG
gi|90672 : AGACACGTTGTCTGAA-CAGCTGGTTTCATC--AT----T-A--AAAATTGTGTTGAGCAACATTTAGTTCAACTATACAGG-GTCTGAAACATT-ATAC---TGTGTATAGT--TGATTGGTTTAAT--CATTTGTCTATATTATGATTTCTAAATATAAGAATCATTTTACAGGTATTA--T--TTTT-TTTG-T-TTAAAGTTTACG-AATCAT-------------TG--------------ATA--TAT---TATAATTATA-GTTTAAAC-AAAATTGTTAAACA-----TAGTTTCAAGCTAGGCTG-TTTC-ACAGCTTAATCCAGTGAAGACATGTAGTCTCCTT--AT-AGAAG-ATC---CCA-TTT--TCA
gi|90673 : AGACACGTTGTCTGAA-CAGCTGGTCTCATC--ATA---T-A--AAA-TAGTGTTGA------GTTAGTTCCACACTACAGG-GTTTGAAACATT-ATCT---TGTATGTAGA--TGATTGGT-------CATTTGTTTT---TATGATTTCTAAATATTAGAATCATCT------TATT---------T-GTT--T-TTGAATTTTACG-AGTCACGAGGCAAGAAACCCGAGGAAAATT--T--AGA--TAA---TA----TACA-GTTTGAAC-AAAATT---------------GTTTTAAGCTAGGCTG-TT---A-----------AGCGAAGACA--CAGTCGTCTG--AC-AGAAG-GTC---CCG--TT--TAAGTTCAAGA-TA--CT-------TAC-ACC--ATAGTCTTGACAag
gi|90674 : AGGCATGCTGTTGGAA-CAGCTGGTCTCACTGCATGAAAT-AGGAAA-TAGTGTTGAACAATAGTTAGTCTAATACTACAGGTGTTTGAAACCTT-ATAC---T-------AT--TAATT-GTAT
gi|90675 : ATATGCTGTCCAGA-CAGATGGTCTCATC--AT----TTA--AAA-TAGTGTTAAGCAACAGTTAGTTAAACACTACAGG-GTTTGAAACATT-ATAC---TGTGTATAGT--TGATTGGTATGAT--CATTTATCTG---TATGATTTCTAAATATTAGAATTATTT------CATTA--T--GT-T-TTTG-T-TTGAAATTTACA-AAACATGAGTCAAGAAGTCTGAGAACAATT--T--ATA--TAT---TA----TATA-GTTTGAAC-AAAATTGTTTGACT-----TAATTTCAAGCTAGGCTA-TTTC-ACAGCTTAATCCAATGAAGACA--AAGTCGGCTT--AA-AAAAATATC---CCG-TTT--TAAGTTCAAGA-TA--CT-------TACACCA--ACA-TCTTGACAt
gi|90676 : GTTTGAAACAGCTGGTCACATC--AT----A-T--AAA-TAGTGTTGAGCAACAGTTAGTCCAACACTACAGT-ATTTGAAACATT-TTAC---TGTATATAGA--TAACTGGTTTGAT--CATATGTGTG---TATGATTTCTAAATATTATAATCATTT------TAT----------T-TTTG-T-TTGAAGTTTACG-AATCATTAGGCAAGAAGCCTGATGGAAATT--T--ATA--TAT---TA----CATATTTTTAAAA-AAAAATGTTGAACG-----TAGTTCCAAGCTAGGCTG-TTTC-GCAGCTTAATCCAGTAAATACA--CTGTCGCCTT--AC-AGAAG-ATT---CAG-TTT--TAAGTTCAAAA-TA--CT-------TACACCA--ACA-TCTTGGCA
gi|90677 : GTCTGAA-CAGCTGGTCTCATC--AT----TGA--AAA-TAGTGTTGAGCAACAGCTAGTCCAACACTACAGG-GTTTGAAACTTT-ATAC---TGTTTATAGA--TGATTGGTTTGAT--CATTTCTTCA---TATGATTTCTAAATATTAAAATCATTT------TAT----------T-TTTG-T-TTGAAGTTTACA-AATCATGAGGCAAGAAGCCTGAGGAAAATT--A--ATA--TA-----------------TTGAAC-AAAATTGTTTAACATG---TAGTTTCAAGCTAG-------------GCTTAATCCAGTGAAGACA--AAGTCACCTT--GT-AGAAG-ATC---CAA--TT--TAAGTTCAAGA-CA--CT-------TATACCATGACA-TCTTGACA
gi|90678 : TCTCATC--AT----T-A--AAA-TAGATTTGAATAACAGTTAGTTCAACTTTACAGT-GTTTGAAACATT-ATAC---TGTATATAGT--TGATTGGTATGAT--CATTTGTCTG---TATGATTTCTAAATATTAGGATCATTT------TATTACCT--TTAT-TTTG-T-TTGAAGTTTACT-TATCATGAGGCAAGAGGCCTGAGGGCAATT--T--ATA--TAT---TA----TATA-GTTTGAAC-TAAATTGTTTAACA-----TAGTTTCAAGTTAGAGTG-TTTC-ACAGCTTCATCCAGTGAAGACA--AATTCGCCTT--AA-AGAAG-ATC---CCA-TCT--TAAGTTCAAGA-TA--CT-------CAC-CCA--ACA-TCTTGACAG
gi|90679 : TCTCAT---AT----A-A--AAA-ACGTGTTGAGCACCAGTTAGTCCAACACTACAGG-GAATGAAACATT-ATAC---TGTATATAGA--TGATTGTTTTGAT--CATTTGTTTG---TATGACTTCTTAACATTAGAATCATTT------TAT----------T-TTTG-T-TTGAAGTCTATG-GATCATGAGGC-AGAAACCTGAGG-AAATA--T--ATA--TTT---TT----TATA-GTTTGAAC-TAAAGTGTTTAACA-----TAGTTTCAAGCTAGCCTG-TATC-ACAACTTAATACACAGAAGACA--AAGTCGCCTA--AC-AGAAG-ATC---CCG--TT--TAAGTTCAAGA-TA--TT-------TACATCA--ATA-TCTTG
gi|90680 : TCATC--AT----A-T--AAA-TTTTGTTGAACAACAGTTAGTCCAACACTACAGG-GTTTCAAACATT-AGAA---TGTATATAGA--TGATTTATTTGAT--CATTTGTTTG---TATAATTTCCAAATATTATAATCATTT------T------------T-TTTGGT-TTAAAGTTTGC---ATCATGAGGCAAGAAACCTGAGTAAAATT--T--ATG--TAT---TA----CATA-GTTTGAAC-ACAATTGTTGAACA-----AAGCTTCAAGCTAGGCTG-TTTC-GCAGTTAAATCCAATAAATTCA--CAGTCGCCTT--AC-AGAAG-ATT---CAG-TTT--TAAGTTCGAGA-TG--CT-------TACACCA--ACA-TTTTGGCA
gi|90681 : -TAGCGT-GAA--ACAGTT--CTCAAACATACAG----CTGTAACGTTTATAC---TG-----AAC--TG--TGGCATTATTTCATGCGC--G---TA-GTTTTCTAGATATTAGAATAATTT------TATT------------TTG-T-TTGAAATTAA----------AGGCAATAAGCCTTGGAAAAATC--T--ATA--ACG---TA----GATA-ATTTTAAC-AAAATTATTCAACA-----TAGTTTCAAGCTAAGGTG-TTTT-ACAGCTTAGTCCTGTGGCGACA--AAGTCACCTT--AC-AGAAT-ATC---CCG-TTA--TAAGTTCAGGA-TA--
gi|90682 : TGTTGAACAACAATAAGTTCAACTCTACAGG-GTTTGAAACATT-AAAC---TGTATATAGT--TGATTAGTATGAG--CATTTGTCTT---TTTGATTTCTTAATATTAAAATTATTT------CATTA--T--TTTT-TTCA-T-TT----TT-------TTAT-------------TGAGGAAAATT--T--ATA--TAT---TA----TATA-GTTTGAAC-AAA----------------TAGTTTCAAGCTAGGCTG-TTTC-ACAGTTTAATCCAGCGAAGACA--CAGTCGCCTT--AC-AT-AG-ATC---CCA-TTT--TAAGTTCAAGA-TA--CT-------CAC-CCA--ATA-TCTTGACAttta
gi|90683 : --TAAT-AGTATGAT--CATTCATTTG---TACTATTTCTAAATATTAGAATAACTT------TA--A--T--T------TG-T-TTGAAATTAACA-AATCCTCAGGCATAAAGCCTTA--AAAATT--T--ATA---------------GTA-A---GGAC-AAAATTGTTTAACG-----TAGTTTCAAGACAGACAG-TTTT-ACAATCTAATCCAATG
gi|90685 : ttgaTATAAGACTCATTT------TATTA--T--TGTT-TTTG-T-TTGAAGTT---T-A---------CAAGAAGCCTGAGGAAAATT--T--ATA--TAT---AA----TATA-GTTTGAAC-AATA-TGTTTAA-------------CAAGCTAGGCTG-TTTC-ACAGCTTAATCCAGTGAAGACA--CAGTCGCCTT--GC-AGAAG-ATC---CCG-TTT--TTAGTTCAAGA-TA--CT-------CAC-CAA--ACA-TCTTGACAG
gi|90684 : AGAATAATTT------TATT-------------TG-T-TTGAAATTATCA-AATTATTACGTTGGAAGCATAAATGATGTT--TTCATA--TATACATG----CATA-GTGTGAAC-AAATTTGTTCAAAACCTTTTAGTCTAAAACTA-------TTT-AAAACTTAATATATTGAAGACA--ACGTCG-------C-AAAAG--TCAATTCG-TTTCATT--TCCAAGA-TA--CC-------TAC-TTA--ATA-
gi|90686 : tgatttgatcgatcattattaaaactgccaaaagtaT-TTCG-T-TTGAAGTTTATA-AATCATGAGGCAAGAAGTTTGAGGCAAACT--G--ACA--TAT---TA----TATA-GTTTGAAC-AAAATTGCTTAACA-----TAATTTCAAGCTAGGCTG-TTTC-ACAGCTTAATCCAGTGAAGACA--AAGCCGCCTT--AC-AGAAG-ACC---CCG-TTT--TAAGTTCAAGG-CT--CT-------TATACCG--ACA-TCTTGACA
gi|90688 : tACG-AATCATCAGGCAGGAAGCCGGAGAAAGACT--G--A-A--TAT---AA----TTTA-GTTTTAAC-AACATTATTTAACA-----TAGCTTGAAGCTAAGTTG-TTTC-ACA--T--------TGAAGACA--CAGTT-CCAT--AC-AGAAT-ATT---CCG-TTA--TAAGTTGCAGATTA--TT-------GCT-CCA--AAA-CCTTGACA
gi|90687 : AACAAGTCTCA--AACATT--T--ATATATAT---TA----TATA-GTTTGAAC-AAAATTATTTAACA-----TAGTTTCAAGCTAGGCTG-TTTC-ACAGCTTAATCCAGTGAAGACA--CAGTCGCCTT--AC-AGAAG-ATC---CCG-TTT--CAAGTTCAAGA-TA--CT-------CAC-CCA--ACA--ATTGACA
gi|90689 : ttttggtttgagtttgaTA--GAT---TG----TGTG-GTATGA-------TTGTTTAACA-----TA---TCAAGCTAGGCTG-TTTC-ACA-CTTAATCTAGTGAAGATA--CAGTCGCCTT--AC-AGAAG-ATC---CCA-TTT--TAAATTCAAGA-TA--CT-------TACACCA--ACA-TCTTGACA
gi|90690 : C-AAAATTGTTCGGCA-----TATTTTCAAGCTAGGCTG-TTTT-ACAGCTTAGTCCAGTGAAGACA--TGGTTGCCTT--AA-AAAAG-ATC---TCA-TTT--CAATTTGAAGA-TA--CTTACAGGGTAC-TTA--ACA-TCTAGACA
gi|90691 : AGCTAGGCTG-TTTTTATAGCTTAATGCATTGAAGACA--CAATCGCCTT--AC-AGAAG-ATC---CCG-TTT--TAAGCTCAAAA-TA--CT-------CAC-TGC--ACA-AATTGACA
gi|90692 : CTTAATCCAGTTAAGACT--TAACTGCCTTAAAT-ATAAG-A-----CTG-TTT--AAAGTTCAAAC-TA--TG-------TAC-TCA--ACA-TCTTGATA
Alignments
lowQualScore : 111111 1
lowQualScore : 2 22 111111 22 1 2 1 1 333 22 1 22 0 1 22 0 222 444444 999999999 33 6 1 55 22 11 444 2222 1 1 55555 1 1 11 11 1 1 333 1 1 1 11 4444444 1 22 1
lowQualScore : . .. ...... .. . . . . ... .. . .. . . .. . ... ...... ......... .. . . .. .. .. ... .... . . ..... . . .. .. . . ... . . . .. ....... . .. .
lowQualScore : 2 66 999999 66 8 2 7 7 000 22 6 22 6 7 33 2 999 666666 111111111 55 2 2 99 00 99 888 9999 4 3 22222 3 3 88 88 3 3 555 3 3 4 99 5555555 4 00 4
consensus : AGACACGTTGTCTGAA-CAGCTGGTCTCAT--CAT----T-A--AAA-TAGTGTTGAACAACAGTTAGTTCAACNCTACAGG-GTTTGAAACATT-ATAC---TGTATATAGT--TG-AT--TGGTAT-GAT--CATTTGTCTG---TATGATTTCTAAATATTAGAATCATTT------TATTA--T-TTTT--TTTGTTTGAAGTTTACGAATCATGAGGCAAGAAGCCTGAGGAAAATT--T--ATA--TAT---TA----TATA-GTTTGAAC-AAAATTGTTTAACA-----TAGTTTCAAGCTAGGCTG-TTTC-ACAGCTTAATCCAGTGAAGACA--CAGTCGCCTT--AC-AGAAG-ATC---CCG-TTTT-AAGTTCAAGA-TA--CT-------CAC-CCA--ACA-TCTTGACAG
Reference ( family-614 ) : AGACACGTTGTCTGAA-CAGCTGGTCTCAT--CAT----T-A--AAA-TAGTGTTGAACAACAGTTAGTTCAACNCTACAGG-GTTTGAAACATT-ATAC---TGTATATAGT--TG-AT--TGGTAT-GAT--CATTTGTCTG---TATGATTTCTAAATATTAGAATCATTT------TATTA--T-TTTT--TTTGTTTGAAGTTTACGAATCATGAGGCAAGAAGCCTGAGGAAAATT--T--ATA--TAT---TA----TATA-GTTTGAAC-AAAATTGTTTAACA-----TAGTTTCAAGCTAGGCTG-TTTC-ACAGCTTAATCCAGTGAAGACA--CAGTCGCCTT--AC-AGAAG-ATC---CCG-TTTT-AAGTTCAAGA-TA--CT-------CAC-CCA--ACA-TCTTGACAG
gi|90660 : AGACACGTTGTCTGAA-CAGCTGGTCTCAT--TAT----T-A--AAA-TAGTGTTGAACAACAGTTGGTTCAACCCTACAAG-GTTTGAAACATT-ATAC---TGTATATAGT--TA-AT--TGGTAT-GAT--CATTTGTCTG---TATGATTTCTAAATATTAGAATCATTT------TATTA--T-TCCT--TTTGTTTGAAGTTAACTAATCATAAGGCAAGAAGCCTGAGGAAAATT--T--ATA--TAT---TA----TATA-GTTTGAAC-AAAATTGTTTAACA-----TAGTTTCAAGCTAGGCTG-TTTC-ACAGCTTAATCCAGTGAAGACA--CAGTCGCCTT--AC-AGAAG-ATC---CCG-TTTT-TAGTTCAAGA-TA--CC-------CAC-CCA--ACA-TCTTGACAG
gi|90661 : AGACACGTTGTCTGAA-CAGCTGGTCTCAT--TAT----T-A--AAA-TAGTGTTGAACAACAGTTGGTTCAACTCTACAAG-GTCTGAAACATT-ATAC---TGCATATAGT--TA-AT--TGGTAT-GAT--CATTTGTCTG---TATGATTTCTAGATATTAGAATCATTT------TATTA--T-TCCT--TTCGTTTGAATTTAACTAATCATAAGGCAAGAAGCCTGAGGAAAAAT--T--ATA--TAT---TT----TATA-GTTTGAAC-AAAATTGTTTAACA-----TAGTTTCAAGCTAGACTG-TTTC-ACAGCTTAATCCAGTGAAGACA--CAGTCGCCTT--AC-AGAAG-ATC---CCG-TTTT-TAGTTCAAGA-TA--CC-------CAC-CCA--ACA-TCTTGACAG
gi|90662 : AAACACGTTGTCTGAA-CAGCTGGTCTCAT--TAT----T-T--AAC-TAGTGTTGAACAACAGTTAGTTCAACTCTACAGG-GTTTGAAACATT-ATAA---TGTATATAGT--TG-AT--TGGTAT-GAT--CATTTGTCTG---TATGATTTCTAGATATTAGAATCAATT------TATTA--T-TATT--TTTGTTTGAAGTTTACTAATAATGAGGGAAGAAGCCTGAGGAAAATT--T--ATA--TAT---TA----TATA-GTTTAAAC-AAAATTGTTTAATA-----TAGTTTCAAGCTAGGCTG-TTTC-ACAGCTTAATCAAGTGAAGACA--CAGTCGCTTT--AC-AGAAG-ATC---CCGTTTTT-TAGTTCAAGA-TA--CT-------CAC-CCA--ACA-TCTTGACA
gi|90663 : AGACACGT---CTGAA-CAGCTGGTCTCAT--AAT----T-A--AAA-CAGTGTTGAACAACAGTTAGTTCAACTCTACAGG-GTTTGAAACAT----AC---TGTATATAGT--TG-AT--TGGTAT-GAT--CATTTGTCTG---TATGATTTCTAAATATTAGAATCATTT------TATTA--T-CTTTATTTTGTTTGAAGTTTACTAATCATGAGGCAAGAAGCCTGAGGAAAATT--T--ATA--TAT---TT----TATA-GTTTGAAC-AAAATTGTTTAACA-----TAGTTTCAAGCTAGGCTG-TTTC-ACAGCTTAATCCAGTGAAGACA--AAGTTGCCTT--AA-AGAAG-ATC---CTG-TCTT-AAGTTCATGA-CA--CT-------CAC-CCA--ACA-TCTTGACAG
gi|90664 : AGACACGTTGTCTGAA-CAGCTGGTTTCAT--TAT----T-A--AAA-TAGTGTTGAACAACAGTAAGTTCAACTCTACAAG-GGTTGAAACATT-ATAC---TGTATATAGT--TA-AT--TAGTAT-GAT--CATTTGTCTG---TATGATTTCTAAATATTAGAATCATTT------TATTA--T-TTCT--TTTGTTTGAAGTCAACTATTCAAAAGGCAAGAAGGTTGAAGAAAATT--T--ATA--TAT---TA----TATA-GTTTGAAC-AAAATTGTTTAACA-----TAGTTTCAATCTAGGCTG-TTTC-ACAGCTTAATCCAGTGAAGGCA--CAGTCGCCTT--AC-AGAAG-ATC---CCG-TTTT-TAATTCAAGA-TT--AT-------AGC-CCA--ATA-TCTTGACA
gi|90665 : AGACACGTTGGCTGAA-CAGCTGGCGTCAT--TAT----T-A--AAA-TAGTGTTGAACAACAGTAAGTTCAACTCTACAGG-GTTTGAAACATT-TTAC---TGTATATAGT--TG-AT--TCGTAT-GAT--CATTTGTCTG---TATAATTTCTAAATATTAGAATCATTT------TATTA--T-TATA--TTTGTTTGAAGTTTACTTATCGTGAGGCAAGAAGCCTGAGGATAATT--T--ATG--TTT---TA----TATA-GTTTGAAC-AAAATTGTTTAACA-----TAGTTTTAAGCTAGGCTG-TTTC-ACAGATTAATCCAGTGAAGACA--CAGTTGCCTT--AT-AGAAG-ATC---CCA-TTTT-AAGTTCAAGG-TA--CT-------CAC-CCA--GCA-TCTTGACAG
gi|90666 : AGACACGTTGTCTGAA-CAGCTGGTCTCAT--TAT----T-A--AAA-TATTGTTGAACAACAGTTAGTTCAACTCTACAGG-GTTTGAAACATT-ATAC---TGTAAATAGT--TG-AA--TGATAT-GAT------TGTCTG---TATGATTTCTAAATATTAGAATCATTG------TATTA--T-ATTT--TTTGTTT-------ACGAGTCATGAAGCAAGAAGCCTGAGGAAAAGTCAT--ATA--TAT---TA----TATA-GTTTTAAC-AAAATTATTTAATA-----TAGTTTCAAGCTAGGCCT-TTTC-ACAGCTTAATCCAGTGCAGACA--CATTCGCCTT--AC-AGAAG-ATC---CCG-TTTT-AAGTTCAAGT-TA--CA-------CAT-CCA--ACA-TCTTGATAG
gi|90667 : AGACACGTTGTCTGAA-CAGCTGGTCTCAT--CATC---T-A--AAA-TAGTGTTTAGCAACAGTTAGTTCAACACTAGAGG-GTTTGAAACATT-ATAC---TGTATATAGT--TG-AT--TCGTAT-GAT--CATTT-TCTG---TATGATTTCTAAATATAAGAATCATTT------TATTG--T-TTT------GTTTGAAGTTTACTAATCATGACGCCAAAAGCTTGAGTAAAATT--T--ATA--GATCAATA----TATA-GTTTGATC-AAAAATGTTTAACA-----TAGTTTTGAGTTAGGCTG-TTTC-ACAGCTTAATCTAGTGGAGACA--CAGTCGCCTT--AC-AGAAG-ATC---CCT-TTTT-AAGTTCAATA-TA--CT-------CAC-ACA--ACC-TTTTGACA
gi|90668 : AGACACGTTGTTTGAA-CAGCTGGTCTGAT--CAT----A-T--AAA-TTTTGTTGAGCAACAGTTAGTCCAACACTACAGG-GTTTTAAACATT-ATAC---TGTATATAGAGATG-AT--TGATTT-GAT--CATTTGTTTG---TATGATTTCCAAATATTATAATCATTT----------A--T-GTGT--T--GTTTGTAGTTT--GAATCATGAGGCAAGAAACCTGAGGAAAATT--T--ATA--TAT---TA----CATA-GTTTGAAC-ACAATTGTTGAACA-----TAGTTTCAAGCTAGGCTG-TTTC-ACAGTTTAATCCAGTGAATACA--GAGTCGCCTT--AC-AGAAG-ATT---CAG-TTTT-AAGTTCGAGA-TA--TT-------TACACCA--ACA-TCTTGACA
gi|90669 : AGACACGTTGT-TAAA------------AT--TAT----T-A--AAA-TAGTGTTGAACAACAGTT----CAACTCTACAGG-GTTTGAAACATT-ATAC---TGTAAATAGT--TG-AT--TGATAT-GAT------TGTCTG---TATGATTTCTAAATATTAGAATCATTT------TATTA--TATTTTG-TTTGTTTGACGTTTACGAATCATGAGGCAAGAAGCCTGAGGAAAATTTAT--ATA--TAT---TA----TACA-GTTTGAAC-AAAATTATTTAACA-----TAGTTTCAAGCTAGGCTGTTTTT-ACAGCTTAATCCAGTGAAGACA--CAATCGCCTT--ACGAAAAA-ATA---TCG-CTT
gi|90670 : AGACACGTTGTCTGAA-AAACTGTTCTCAT--TAT------A--AAC-TAGTGTTGAACAGCAG-----------------G-GTTTGAAACATT-AAACATTTGTAAATAGT--TG-AT--TGATAT-GAT------TGTATG---TATGGTTTCTAAATATTAGAATCATTT------TATTA--T-ATTT--TTAGTTTGAAGTTTACGAACCATAAGGCAAGAAGTCTGAGGAAAATTTAT--ATA--TAT---TA----TATA-GTTTGAGCAAAAATTGTTTTACA-----TAGTTTCAAGCTAAGCTG-TTTC-ACAGCTTAATCCAGTGAAGTCA--AAGATGCCTT--AA-AGAAG-ATC---CCG-TTTT-AAGTTTAAGA-TATTTT-------CA--ACA--ACA-TTTTAAC
gi|90671 : AGACATGTTGTCTAAA-CAGCTGGTCTCAT--CGT----TTA--AAA-TAGTGTTGAGCAACAGT--------------AAG-GTTTGAAACATT-ATAC---TGTATATAGT--TG-AC--TCGTTT-GAT--CATGTGTCTG---TATCATTTCTAAATATTA-AATAATCT------TATTA--C-TTTT--TATGTT-GAAGTTTACGAATCATGAGGATAAAAGCCTGGGGAAAATT--A--ACA--TAA---TA----TATA-GTATTAAT-AACATTTTTTAACA-----TAGTTTCAAGCTGGGCTG-TTTT-ACAGCATTATCCAGTGAAGACA--CAGTCGCCTT--AC-AGAAG-ATCA--ACG--ATT-AAGTTCAAGA-TA--CT-------AGC-CGA--ACA-CCTTGACAG
gi|90672 : AGACACGTTGTCTGAA-CAGCTGGTTTCAT--CAT----T-A--AAAATTGTGTTGAGCAACATTTAGTTCAACTATACAGG-GTCTGAAACATT-ATAC---TGTGTATAGT--TG-AT--TGGTTT-AAT--CATTTGTCTATATTATGATTTCTAAATATAAGAATCATTTTACAGGTATTA--T-TTTT--TTTGTTTAAAGTTTACGAATCAT-------------TG--------------ATA--TAT---TATAATTATA-GTTTAAAC-AAAATTGTTAAACA-----TAGTTTCAAGCTAGGCTG-TTTC-ACAGCTTAATCCAGTGAAGACATGTAGTCTCCTT--AT-AGAAG-ATC---CCA-TTTTCAAG
gi|90673 : AGACACGTTGTCTGAA-CAGCTGGTCTCAT--CATA---T-A--AAA-TAGTGTTGA------GTTAGTTCCACACTACAGG-GTTTGAAACATT-ATCT---TGTATGTAGA--TG-AT--TGGT--------CATTTGTTTT---TATGATTTCTAAATATTAGAATCATCT------TATT--------T--GTT-TTTGAATTTTACGAGTCACGAGGCAAGAAACCCGAGGAAAATT--T--AGA--TAA---TA----TACA-GTTTGAAC-AAAATT---------------GTTTTAAGCTAGGCTG-TT---A-----------AGCGAAGACA--CAGTCGTCTG--AC-AGAAG-GTC---CCG--TTT-AAGTTCAAGA-TA--CT-------TAC-ACC--ATAGTCTTGACA
gi|90674 : AGGCATGCTGTTGGAA-CAGCTGGTCTCACTGCATGAAAT-AGGAAA-TAGTGTTGAACAATAGTTAGTCTAATACTACAGGTGTTTGAAACCTT-ATAC---TAT---TAAT--TGTAT--T
gi|90675 : ATATGCTGTCCAGA-CAGATGGTCTCAT--CAT----TTA--AAA-TAGTGTTAAGCAACAGTTAGTTAAACACTACAGG-GTTTGAAACATT-ATAC---TGTGTATAGT--TG-AT--TGGTAT-GAT--CATTTATCTG---TATGATTTCTAAATATTAGAATTATTT------CATTA----TGTT--TTTGTTTGAAATTTACAAAACATGAGTCAAGAAGTCTGAGAACAATT--T--ATA--TAT---TA----TATA-GTTTGAAC-AAAATTGTTTGACT-----TAATTTCAAGCTAGGCTA-TTTC-ACAGCTTAATCCAATGAAGACA--AAGTCGGCTT--AA-AAAAATATC---CCG-TTTT-AAGTTCAAGA-TA--CT-------TACACCA--ACA-TCTTGACA
gi|90676 : GTTTGAAACAGCTGGTCACAT--CAT----A-T--AAA-TAGTGTTGAGCAACAGTTAGTCCAACACTACAGT-ATTTGAAACATT-TTAC---TGTATATAGA--TA-AC--TGGTTT-GAT--CATATGTGTG---TATGATTTCTAAATATTATAATCATTT------TA---------TT--TTTGTTTGAAGTTTACGAATCATTAGGCAAGAAGCCTGATGGAAATT--T--ATA--TAT---TA----CATATTTTTAAAA-AAAAATGTTGAACG-----TAGTTCCAAGCTAGGCTG-TTTC-GCAGCTTAATCCAGTAAATACA--CTGTCGCCTT--AC-AGAAG-ATT---CAG-TTTT-AAGTTCAAAA-TA--CT-------TACACCA--ACA-TCTTGGCA
gi|90677 : GTCTGAA-CAGCTGGTCTCAT--CAT----TGA--AAA-TAGTGTTGAGCAACAGCTAGTCCAACACTACAGG-GTTTGAAACTTT-ATAC---TGTTTATAGA--TG-AT--TGGTTT-GAT--CATTTCTTCA---TATGATTTCTAAATATTAAAATCATTT------TA---------TT--TTTGTTTGAAGTTTACAAATCATGAGGCAAGAAGCCTGAGGAAAATT--A--ATA--TA-----------------TTGAAC-AAAATTGTTTAACATG---TAGTTTCAAGCTAG-------------GCTTAATCCAGTGAAGACA--AAGTCACCTT--GT-AGAAG-ATC---CAA--TTT-AAGTTCAAGA-CA--CT-------TATACCATGACA-TCTTGACA
gi|90678 : TCTCAT--CAT----T-A--AAA-TAGATTTGAATAACAGTTAGTTCAACTTTACAGT-GTTTGAAACATT-ATAC---TGTATATAGT--TG-AT--TGGTAT-GAT--CATTTGTCTG---TATGATTTCTAAATATTAGGATCATTT------TATTACCT-TTAT--TTTGTTTGAAGTTTACTTATCATGAGGCAAGAGGCCTGAGGGCAATT--T--ATA--TAT---TA----TATA-GTTTGAAC-TAAATTGTTTAACA-----TAGTTTCAAGTTAGAGTG-TTTC-ACAGCTTCATCCAGTGAAGACA--AATTCGCCTT--AA-AGAAG-ATC---CCA-TCTT-AAGTTCAAGA-TA--CT-------CAC-CCA--ACA-TCTTGACAG
gi|90679 : TCTCAT---AT----A-A--AAA-ACGTGTTGAGCACCAGTTAGTCCAACACTACAGG-GAATGAAACATT-ATAC---TGTATATAGA--TG-AT--TGTTTT-GAT--CATTTGTTTG---TATGACTTCTTAACATTAGAATCATTT------TA---------TT--TTTGTTTGAAGTCTATGGATCATGAGGC-AGAAACCTGAGG-AAATA--T--ATA--TTT---TT----TATA-GTTTGAAC-TAAAGTGTTTAACA-----TAGTTTCAAGCTAGCCTG-TATC-ACAACTTAATACACAGAAGACA--AAGTCGCCTA--AC-AGAAG-ATC---CCG--TTT-AAGTTCAAGA-TA--TT-------TACATCA--ATA-TCTTG
gi|90680 : TCAT--CAT----A-T--AAA-TTTTGTTGAACAACAGTTAGTCCAACACTACAGG-GTTTCAAACATT-AGAA---TGTATATAGA--TG-AT--TTATTT-GAT--CATTTGTTTG---TATAATTTCCAAATATTATAATCATTT------T----------TT--TTGGTTTAAAGTTTGC--ATCATGAGGCAAGAAACCTGAGTAAAATT--T--ATG--TAT---TA----CATA-GTTTGAAC-ACAATTGTTGAACA-----AAGCTTCAAGCTAGGCTG-TTTC-GCAGTTAAATCCAATAAATTCA--CAGTCGCCTT--AC-AGAAG-ATT---CAG-TTTT-AAGTTCGAGA-TG--CT-------TACACCA--ACA-TTTTGGCA
gi|90681 : -TAGCGT-GAA--ACAGTT--CTCAAACATACAG----CTGTAACGTTTATAC---TG-----AAC--TG-----TGGCAT-TATTTCATGCGC--G---TA-GTTTTCTAGATATTAGAATAATTT------TATT------------TTGTTTGAAATT----AA-----AGGCAATAAGCCTTGGAAAAATC--T--ATA--ACG---TA----GATA-ATTTTAAC-AAAATTATTCAACA-----TAGTTTCAAGCTAAGGTG-TTTT-ACAGCTTAGTCCTGTGGCGACA--AAGTCACCTT--AC-AGAAT-ATC---CCG-TTAT-AAGTTCAGGA-TA--TT-------TA
gi|90682 : TGTTGAACAACAATAAGTTCAACTCTACAGG-GTTTGAAACATT-AAAC---TGTATATAGT--TG-AT--TAGTAT-GAG--CATTTGTCTT---TTTGATTTCTTAATATTAAAATTATTT------CATTA--T-TTTT--TTCATTT-----TT-----TTAT-------------TGAGGAAAATT--T--ATA--TAT---TA----TATA-GTTTGAAC-AAA----------------TAGTTTCAAGCTAGGCTG-TTTC-ACAGTTTAATCCAGCGAAGACA--CAGTCGCCTT--AC-AT-AG-ATC---CCA-TTTT-AAGTTCAAGA-TA--CT-------CAC-CCA--ATA-TCTTGACA
gi|90683 : T--TG-ATAATAGTAT-GAT--CATTCATTTG---TACTATTTCTAAATATTAGAATAACTT------TA--A--T-TT-------GTTTGAAATTAACAAATCCTCAGGCATAAAGCCTTA--AAAATT--T--ATA---------------GTA-A---GGAC-AAAATTGTTTAACG-----TAGTTTCAAGACAGACAG-TTTT-ACAATCTAATCCAATG
gi|90684 : --TG-AT--TTG-ATCGAT--CATT-AT------TAAAACTGCCAAAAGTAAGAATAATTT------TA-------------TTTGTTTGAAATTATCAAATTATTACGTTGGAAGCATAAATGATGTT--TTCATA--TATACATG----CATA-GTGTGAAC-AAATTTGTTCAAAACCTTTTAGTCTAAAACTA-------TTT-AAAACTTAATATATTGAAGACA--ACGTCG-------C-AAAAG--TCAATTCG-TTTC-ATTTCCAAGA-TA--CC-------TAC-TTA--ATA-
gi|90685 : TATAAGACTCATTT------TATTA--T-TGTT--TTTGTTTGAAGTTTAC------------AAGAAGCCTGAGGAAAATT--T--ATA--TAT---AA----TATA-GTTTGAAC-AATAT-GTTTAACA-------------AGCTAGGCTG-TTTC-ACAGCTTAATCCAGTGAAGACA--CAGTCGCCTT--GC-AGAAG-ATC---CCG-TTTT-TAGTTCAAGA-TA--CT-------CAC-CAA--ACA-TCTTGACAG
gi|90686 : TT--TTCGTTTGAAGTTTATAAATCATGAGGCAAGAAGTTTGAGGCAAACT--G--ACA--TAT---TA----TATA-GTTTGAAC-AAAATTGCTTAACA-----TAATTTCAAGCTAGGCTG-TTTC-ACAGCTTAATCCAGTGAAGACA--AAGCCGCCTT--AC-AGAAG-ACC---CCG-TTTT-AAGTTCAAGG-CT--CT-------TATACCG--ACA-TCTTGACA
gi|90687 : TT--TTGGTTTGA-GTTT---------GA---AACAAGTCTCA--AACATT--T--ATATATAT---TA----TATA-GTTTGAAC-AAAATTATTTAACA-----TAGTTTCAAGCTAGGCTG-TTTC-ACAGCTTAATCCAGTGAAGACA--CAGTCGCCTT--AC-AGAAG-ATC---CCG-TTTC-AAGTTCAAGA-TA--CT-------CAC-CCA--ACA--ATTGACA
gi|90688 : ACGAATCATCAGGCAGGAAGCCGGAGAAAGACT--G--A-A--TAT---AA----TTTA-GTTTTAAC-AACATTATTTAACA-----TAGCTTGAAGCTAAGTTG-TTTC-ACA--T--------TGAAGACA--CAGTT-CCAT--AC-AGAAT-ATT---CCG-TTAT-AAGTTGCAGATTA--TT-------GCT-CCA--AAA-CCTTGACA
gi|90689 : TA--GAT---TG----TGTG-GTATGA-------TTGTTTAACA-----TA---TCAAGCTAGGCTG-TTTC-ACA-CTTAATCTAGTGAAGATA--CAGTCGCCTT--AC-AGAAG-ATC---CCA-TTTT-AAATTCAAGA-TA--CT-------TACACCA--ACA-TCTTGACA
gi|90690 : C-AAAATTGTTCGGCA-----TATTTTCAAGCTAGGCTG-TTTT-ACAGCTTAGTCCAGTGAAGACA--TGGTTGCCTT--AA-AAAAG-ATC---TCA-TTTC-AATTTGAAGA-TA--CTTACAGGGTAC-TTA--ACA-TCTAGACA
gi|90691 : AGCTAGGCTG-TTTTTATAGCTTAATGCATTGAAGACA--CAATCGCCTT--AC-AGAAG-ATC---CCG-TTTT-AAGCTCAAAA-TA--CT-------CAC-TGC--ACA-AATTGACA
gi|90692 : CTTAATCCAGTTAAGACT--TAACTGCCTTAAAT-ATAAG-A-----CTG-TTTA-AAGTTCAAAC-TA--TG-------TAC-TCA--ACA-TCTTGATA
Alignments
lowQualScore : 111111 1
lowQualScore : 2 22 111111 22 1 2 1 1 333 22 1 22 0 1 22 0 222 444444 999999999 33 6 1 55 22 11 444 2222 1 1 55555 1 1 11 11 1 1 333 1 1 1 11 4444444 1 22 1
lowQualScore : . .. ...... .. . . . . ... .. . .. . . .. . ... ...... ......... .. . . .. .. .. ... .... . . ..... . . .. .. . . ... . . . .. ....... . .. .
lowQualScore : 2 66 999999 66 8 2 7 7 000 22 6 22 6 7 33 2 999 666666 111111111 55 2 2 99 00 99 888 9999 4 3 22222 3 3 88 88 3 3 555 3 3 4 99 5555555 4 00 4
consensus : AGACACGTTGTCTGAA-CAGCTGGTCTCAT--CAT----T-A--AAA-TAGTGTTGAACAACAGTTAGTTCAACNCTACAGG-GTTTGAAACATT-ATAC---TGTATATAGT--TG-AT--TGGTAT-GAT--CATTTGTCTG---TATGATTTCTAAATATTAGAATCATTT------TATTA--T-TTTT--TTTGTTTGAAGTTTACGAATCATGAGGCAAGAAGCCTGAGGAAAATT--T--ATA--TAT---TA----TATA-GTTTGAAC-AAAATTGTTTAACA-----TAGTTTCAAGCTAGGCTG-TTTC-ACAGCTTAATCCAGTGAAGACA--CAGTCGCCTT--AC-AGAAG-ATC---CCG-TTTT-AAGTTCAAGA-TA--CT-------CAC-CCA--ACA-TCTTGACAG
Reference ( family-614 ) : AGACACGTTGTCTGAA-CAGCTGGTCTCAT--CAT----T-A--AAA-TAGTGTTGAACAACAGTTAGTTCAACNCTACAGG-GTTTGAAACATT-ATAC---TGTATATAGT--TG-AT--TGGTAT-GAT--CATTTGTCTG---TATGATTTCTAAATATTAGAATCATTT------TATTA--T-TTTT--TTTGTTTGAAGTTTACGAATCATGAGGCAAGAAGCCTGAGGAAAATT--T--ATA--TAT---TA----TATA-GTTTGAAC-AAAATTGTTTAACA-----TAGTTTCAAGCTAGGCTG-TTTC-ACAGCTTAATCCAGTGAAGACA--CAGTCGCCTT--AC-AGAAG-ATC---CCG-TTTT-AAGTTCAAGA-TA--CT-------CAC-CCA--ACA-TCTTGACAG
gi|90660 : AGACACGTTGTCTGAA-CAGCTGGTCTCAT--TAT----T-A--AAA-TAGTGTTGAACAACAGTTGGTTCAACCCTACAAG-GTTTGAAACATT-ATAC---TGTATATAGT--TA-AT--TGGTAT-GAT--CATTTGTCTG---TATGATTTCTAAATATTAGAATCATTT------TATTA--T-TCCT--TTTGTTTGAAGTTAACTAATCATAAGGCAAGAAGCCTGAGGAAAATT--T--ATA--TAT---TA----TATA-GTTTGAAC-AAAATTGTTTAACA-----TAGTTTCAAGCTAGGCTG-TTTC-ACAGCTTAATCCAGTGAAGACA--CAGTCGCCTT--AC-AGAAG-ATC---CCG-TTTT-TAGTTCAAGA-TA--CC-------CAC-CCA--ACA-TCTTGACAG
gi|90661 : AGACACGTTGTCTGAA-CAGCTGGTCTCAT--TAT----T-A--AAA-TAGTGTTGAACAACAGTTGGTTCAACTCTACAAG-GTCTGAAACATT-ATAC---TGCATATAGT--TA-AT--TGGTAT-GAT--CATTTGTCTG---TATGATTTCTAGATATTAGAATCATTT------TATTA--T-TCCT--TTCGTTTGAATTTAACTAATCATAAGGCAAGAAGCCTGAGGAAAAAT--T--ATA--TAT---TT----TATA-GTTTGAAC-AAAATTGTTTAACA-----TAGTTTCAAGCTAGACTG-TTTC-ACAGCTTAATCCAGTGAAGACA--CAGTCGCCTT--AC-AGAAG-ATC---CCG-TTTT-TAGTTCAAGA-TA--CC-------CAC-CCA--ACA-TCTTGACAG
gi|90662 : AAACACGTTGTCTGAA-CAGCTGGTCTCAT--TAT----T-T--AAC-TAGTGTTGAACAACAGTTAGTTCAACTCTACAGG-GTTTGAAACATT-ATAA---TGTATATAGT--TG-AT--TGGTAT-GAT--CATTTGTCTG---TATGATTTCTAGATATTAGAATCAATT------TATTA--T-TATT--TTTGTTTGAAGTTTACTAATAATGAGGGAAGAAGCCTGAGGAAAATT--T--ATA--TAT---TA----TATA-GTTTAAAC-AAAATTGTTTAATA-----TAGTTTCAAGCTAGGCTG-TTTC-ACAGCTTAATCAAGTGAAGACA--CAGTCGCTTT--AC-AGAAG-ATC---CCGTTTTT-TAGTTCAAGA-TA--CT-------CAC-CCA--ACA-TCTTGACA
gi|90663 : AGACACGT---CTGAA-CAGCTGGTCTCAT--AAT----T-A--AAA-CAGTGTTGAACAACAGTTAGTTCAACTCTACAGG-GTTTGAAACAT----AC---TGTATATAGT--TG-AT--TGGTAT-GAT--CATTTGTCTG---TATGATTTCTAAATATTAGAATCATTT------TATTA--T-CTTTATTTTGTTTGAAGTTTACTAATCATGAGGCAAGAAGCCTGAGGAAAATT--T--ATA--TAT---TT----TATA-GTTTGAAC-AAAATTGTTTAACA-----TAGTTTCAAGCTAGGCTG-TTTC-ACAGCTTAATCCAGTGAAGACA--AAGTTGCCTT--AA-AGAAG-ATC---CTG-TCTT-AAGTTCATGA-CA--CT-------CAC-CCA--ACA-TCTTGACAG
gi|90664 : AGACACGTTGTCTGAA-CAGCTGGTTTCAT--TAT----T-A--AAA-TAGTGTTGAACAACAGTAAGTTCAACTCTACAAG-GGTTGAAACATT-ATAC---TGTATATAGT--TA-AT--TAGTAT-GAT--CATTTGTCTG---TATGATTTCTAAATATTAGAATCATTT------TATTA--T-TTCT--TTTGTTTGAAGTCAACTATTCAAAAGGCAAGAAGGTTGAAGAAAATT--T--ATA--TAT---TA----TATA-GTTTGAAC-AAAATTGTTTAACA-----TAGTTTCAATCTAGGCTG-TTTC-ACAGCTTAATCCAGTGAAGGCA--CAGTCGCCTT--AC-AGAAG-ATC---CCG-TTTT-TAATTCAAGA-TT--AT-------AGC-CCA--ATA-TCTTGACA
gi|90665 : AGACACGTTGGCTGAA-CAGCTGGCGTCAT--TAT----T-A--AAA-TAGTGTTGAACAACAGTAAGTTCAACTCTACAGG-GTTTGAAACATT-TTAC---TGTATATAGT--TG-AT--TCGTAT-GAT--CATTTGTCTG---TATAATTTCTAAATATTAGAATCATTT------TATTA--T-TATA--TTTGTTTGAAGTTTACTTATCGTGAGGCAAGAAGCCTGAGGATAATT--T--ATG--TTT---TA----TATA-GTTTGAAC-AAAATTGTTTAACA-----TAGTTTTAAGCTAGGCTG-TTTC-ACAGATTAATCCAGTGAAGACA--CAGTTGCCTT--AT-AGAAG-ATC---CCA-TTTT-AAGTTCAAGG-TA--CT-------CAC-CCA--GCA-TCTTGACAG
gi|90666 : AGACACGTTGTCTGAA-CAGCTGGTCTCAT--TAT----T-A--AAA-TATTGTTGAACAACAGTTAGTTCAACTCTACAGG-GTTTGAAACATT-ATAC---TGTAAATAGT--TG-AA--TGATAT-GAT------TGTCTG---TATGATTTCTAAATATTAGAATCATTG------TATTA--T-ATTT--TTTGTTT-------ACGAGTCATGAAGCAAGAAGCCTGAGGAAAAGTCAT--ATA--TAT---TA----TATA-GTTTTAAC-AAAATTATTTAATA-----TAGTTTCAAGCTAGGCCT-TTTC-ACAGCTTAATCCAGTGCAGACA--CATTCGCCTT--AC-AGAAG-ATC---CCG-TTTT-AAGTTCAAGT-TA--CA-------CAT-CCA--ACA-TCTTGATAG
gi|90667 : AGACACGTTGTCTGAA-CAGCTGGTCTCAT--CATC---T-A--AAA-TAGTGTTTAGCAACAGTTAGTTCAACACTAGAGG-GTTTGAAACATT-ATAC---TGTATATAGT--TG-AT--TCGTAT-GAT--CATTT-TCTG---TATGATTTCTAAATATAAGAATCATTT------TATTG--T-TTT------GTTTGAAGTTTACTAATCATGACGCCAAAAGCTTGAGTAAAATT--T--ATA--GATCAATA----TATA-GTTTGATC-AAAAATGTTTAACA-----TAGTTTTGAGTTAGGCTG-TTTC-ACAGCTTAATCTAGTGGAGACA--CAGTCGCCTT--AC-AGAAG-ATC---CCT-TTTT-AAGTTCAATA-TA--CT-------CAC-ACA--ACC-TTTTGACA
gi|90668 : AGACACGTTGTTTGAA-CAGCTGGTCTGAT--CAT----A-T--AAA-TTTTGTTGAGCAACAGTTAGTCCAACACTACAGG-GTTTTAAACATT-ATAC---TGTATATAGAGATG-AT--TGATTT-GAT--CATTTGTTTG---TATGATTTCCAAATATTATAATCATTT----------A--T-GTGT--T--GTTTGTAGTTT--GAATCATGAGGCAAGAAACCTGAGGAAAATT--T--ATA--TAT---TA----CATA-GTTTGAAC-ACAATTGTTGAACA-----TAGTTTCAAGCTAGGCTG-TTTC-ACAGTTTAATCCAGTGAATACA--GAGTCGCCTT--AC-AGAAG-ATT---CAG-TTTT-AAGTTCGAGA-TA--TT-------TACACCA--ACA-TCTTGACA
gi|90669 : AGACACGTTGT-TAAA------------AT--TAT----T-A--AAA-TAGTGTTGAACAACAGTT----CAACTCTACAGG-GTTTGAAACATT-ATAC---TGTAAATAGT--TG-AT--TGATAT-GAT------TGTCTG---TATGATTTCTAAATATTAGAATCATTT------TATTA--TATTTTG-TTTGTTTGACGTTTACGAATCATGAGGCAAGAAGCCTGAGGAAAATTTAT--ATA--TAT---TA----TACA-GTTTGAAC-AAAATTATTTAACA-----TAGTTTCAAGCTAGGCTGTTTTT-ACAGCTTAATCCAGTGAAGACA--CAATCGCCTT--ACGAAAAA-ATA---TCG-CTT
gi|90670 : AGACACGTTGTCTGAA-AAACTGTTCTCAT--TAT------A--AAC-TAGTGTTGAACAGCAG-----------------G-GTTTGAAACATT-AAACATTTGTAAATAGT--TG-AT--TGATAT-GAT------TGTATG---TATGGTTTCTAAATATTAGAATCATTT------TATTA--T-ATTT--TTAGTTTGAAGTTTACGAACCATAAGGCAAGAAGTCTGAGGAAAATTTAT--ATA--TAT---TA----TATA-GTTTGAGCAAAAATTGTTTTACA-----TAGTTTCAAGCTAAGCTG-TTTC-ACAGCTTAATCCAGTGAAGTCA--AAGATGCCTT--AA-AGAAG-ATC---CCG-TTTT-AAGTTTAAGA-TATTTT-------CA--ACA--ACA-TTTTAAC
gi|90671 : AGACATGTTGTCTAAA-CAGCTGGTCTCAT--CGT----TTA--AAA-TAGTGTTGAGCAACAGT--------------AAG-GTTTGAAACATT-ATAC---TGTATATAGT--TG-AC--TCGTTT-GAT--CATGTGTCTG---TATCATTTCTAAATATTA-AATAATCT------TATTA--C-TTTT--TATGTT-GAAGTTTACGAATCATGAGGATAAAAGCCTGGGGAAAATT--A--ACA--TAA---TA----TATA-GTATTAAT-AACATTTTTTAACA-----TAGTTTCAAGCTGGGCTG-TTTT-ACAGCATTATCCAGTGAAGACA--CAGTCGCCTT--AC-AGAAG-ATCA--ACG--ATT-AAGTTCAAGA-TA--CT-------AGC-CGA--ACA-CCTTGACAG
gi|90672 : AGACACGTTGTCTGAA-CAGCTGGTTTCAT--CAT----T-A--AAAATTGTGTTGAGCAACATTTAGTTCAACTATACAGG-GTCTGAAACATT-ATAC---TGTGTATAGT--TG-AT--TGGTTT-AAT--CATTTGTCTATATTATGATTTCTAAATATAAGAATCATTTTACAGGTATTA--T-TTTT--TTTGTTTAAAGTTTACGAATCAT-------------TG--------------ATA--TAT---TATAATTATA-GTTTAAAC-AAAATTGTTAAACA-----TAGTTTCAAGCTAGGCTG-TTTC-ACAGCTTAATCCAGTGAAGACATGTAGTCTCCTT--AT-AGAAG-ATC---CCA-TTTTCAAG
gi|90673 : AGACACGTTGTCTGAA-CAGCTGGTCTCAT--CATA---T-A--AAA-TAGTGTTGA------GTTAGTTCCACACTACAGG-GTTTGAAACATT-ATCT---TGTATGTAGA--TG-AT--TGGT--------CATTTGTTTT---TATGATTTCTAAATATTAGAATCATCT------TATT--------T--GTT-TTTGAATTTTACGAGTCACGAGGCAAGAAACCCGAGGAAAATT--T--AGA--TAA---TA----TACA-GTTTGAAC-AAAATT---------------GTTTTAAGCTAGGCTG-TT---A-----------AGCGAAGACA--CAGTCGTCTG--AC-AGAAG-GTC---CCG--TTT-AAGTTCAAGA-TA--CT-------TAC-ACC--ATAGTCTTGACA
gi|90674 : AGGCATGCTGTTGGAA-CAGCTGGTCTCACTGCATGAAAT-AGGAAA-TAGTGTTGAACAATAGTTAGTCTAATACTACAGGTGTTTGAAACCTT-ATAC---TAT---TAAT--TGTAT--T
gi|90675 : ATATGCTGTCCAGA-CAGATGGTCTCAT--CAT----TTA--AAA-TAGTGTTAAGCAACAGTTAGTTAAACACTACAGG-GTTTGAAACATT-ATAC---TGTGTATAGT--TG-AT--TGGTAT-GAT--CATTTATCTG---TATGATTTCTAAATATTAGAATTATTT------CATTA----TGTT--TTTGTTTGAAATTTACAAAACATGAGTCAAGAAGTCTGAGAACAATT--T--ATA--TAT---TA----TATA-GTTTGAAC-AAAATTGTTTGACT-----TAATTTCAAGCTAGGCTA-TTTC-ACAGCTTAATCCAATGAAGACA--AAGTCGGCTT--AA-AAAAATATC---CCG-TTTT-AAGTTCAAGA-TA--CT-------TACACCA--ACA-TCTTGACA
gi|90676 : GTTTGAAACAGCTGGTCACAT--CAT----A-T--AAA-TAGTGTTGAGCAACAGTTAGTCCAACACTACAGT-ATTTGAAACATT-TTAC---TGTATATAGA--TA-AC--TGGTTT-GAT--CATATGTGTG---TATGATTTCTAAATATTATAATCATTT------TA---------TT--TTTGTTTGAAGTTTACGAATCATTAGGCAAGAAGCCTGATGGAAATT--T--ATA--TAT---TA----CATATTTTTAAAA-AAAAATGTTGAACG-----TAGTTCCAAGCTAGGCTG-TTTC-GCAGCTTAATCCAGTAAATACA--CTGTCGCCTT--AC-AGAAG-ATT---CAG-TTTT-AAGTTCAAAA-TA--CT-------TACACCA--ACA-TCTTGGCA
gi|90677 : GTCTGAA-CAGCTGGTCTCAT--CAT----TGA--AAA-TAGTGTTGAGCAACAGCTAGTCCAACACTACAGG-GTTTGAAACTTT-ATAC---TGTTTATAGA--TG-AT--TGGTTT-GAT--CATTTCTTCA---TATGATTTCTAAATATTAAAATCATTT------TA---------TT--TTTGTTTGAAGTTTACAAATCATGAGGCAAGAAGCCTGAGGAAAATT--A--ATA--TA-----------------TTGAAC-AAAATTGTTTAACATG---TAGTTTCAAGCTAG-------------GCTTAATCCAGTGAAGACA--AAGTCACCTT--GT-AGAAG-ATC---CAA--TTT-AAGTTCAAGA-CA--CT-------TATACCATGACA-TCTTGACA
gi|90678 : TCTCAT--CAT----T-A--AAA-TAGATTTGAATAACAGTTAGTTCAACTTTACAGT-GTTTGAAACATT-ATAC---TGTATATAGT--TG-AT--TGGTAT-GAT--CATTTGTCTG---TATGATTTCTAAATATTAGGATCATTT------TATTACCT-TTAT--TTTGTTTGAAGTTTACTTATCATGAGGCAAGAGGCCTGAGGGCAATT--T--ATA--TAT---TA----TATA-GTTTGAAC-TAAATTGTTTAACA-----TAGTTTCAAGTTAGAGTG-TTTC-ACAGCTTCATCCAGTGAAGACA--AATTCGCCTT--AA-AGAAG-ATC---CCA-TCTT-AAGTTCAAGA-TA--CT-------CAC-CCA--ACA-TCTTGACAG
gi|90679 : TCTCAT---AT----A-A--AAA-ACGTGTTGAGCACCAGTTAGTCCAACACTACAGG-GAATGAAACATT-ATAC---TGTATATAGA--TG-AT--TGTTTT-GAT--CATTTGTTTG---TATGACTTCTTAACATTAGAATCATTT------TA---------TT--TTTGTTTGAAGTCTATGGATCATGAGGC-AGAAACCTGAGG-AAATA--T--ATA--TTT---TT----TATA-GTTTGAAC-TAAAGTGTTTAACA-----TAGTTTCAAGCTAGCCTG-TATC-ACAACTTAATACACAGAAGACA--AAGTCGCCTA--AC-AGAAG-ATC---CCG--TTT-AAGTTCAAGA-TA--TT-------TACATCA--ATA-TCTTG
gi|90680 : TCAT--CAT----A-T--AAA-TTTTGTTGAACAACAGTTAGTCCAACACTACAGG-GTTTCAAACATT-AGAA---TGTATATAGA--TG-AT--TTATTT-GAT--CATTTGTTTG---TATAATTTCCAAATATTATAATCATTT------T----------TT--TTGGTTTAAAGTTTGC--ATCATGAGGCAAGAAACCTGAGTAAAATT--T--ATG--TAT---TA----CATA-GTTTGAAC-ACAATTGTTGAACA-----AAGCTTCAAGCTAGGCTG-TTTC-GCAGTTAAATCCAATAAATTCA--CAGTCGCCTT--AC-AGAAG-ATT---CAG-TTTT-AAGTTCGAGA-TG--CT-------TACACCA--ACA-TTTTGGCA
gi|90681 : -TAGCGT-GAA--ACAGTT--CTCAAACATACAG----CTGTAACGTTTATAC---TG-----AAC--TG-----TGGCAT-TATTTCATGCGC--G---TA-GTTTTCTAGATATTAGAATAATTT------TATT------------TTGTTTGAAATT----AA-----AGGCAATAAGCCTTGGAAAAATC--T--ATA--ACG---TA----GATA-ATTTTAAC-AAAATTATTCAACA-----TAGTTTCAAGCTAAGGTG-TTTT-ACAGCTTAGTCCTGTGGCGACA--AAGTCACCTT--AC-AGAAT-ATC---CCG-TTAT-AAGTTCAGGA-TA--TT-------TA
gi|90682 : TGTTGAACAACAATAAGTTCAACTCTACAGG-GTTTGAAACATT-AAAC---TGTATATAGT--TG-AT--TAGTAT-GAG--CATTTGTCTT---TTTGATTTCTTAATATTAAAATTATTT------CATTA--T-TTTT--TTCATTT-----TT-----TTAT-------------TGAGGAAAATT--T--ATA--TAT---TA----TATA-GTTTGAAC-AAA----------------TAGTTTCAAGCTAGGCTG-TTTC-ACAGTTTAATCCAGCGAAGACA--CAGTCGCCTT--AC-AT-AG-ATC---CCA-TTTT-AAGTTCAAGA-TA--CT-------CAC-CCA--ATA-TCTTGACA
gi|90683 : T--TG-ATAATAGTAT-GAT--CATTCATTTG---TACTATTTCTAAATATTAGAATAACTT------TA--A--T-TT-------GTTTGAAATTAACAAATCCTCAGGCATAAAGCCTTA--AAAATT--T--ATA---------------GTA-A---GGAC-AAAATTGTTTAACG-----TAGTTTCAAGACAGACAG-TTTT-ACAATCTAATCCAATG
gi|90684 : --TG-AT--TTG-ATCGAT--CATT-AT------TAAAACTGCCAAAAGTAAGAATAATTT------TA-------------TTTGTTTGAAATTATCAAATTATTACGTTGGAAGCATAAATGATGTT--TTCATA--TATACATG----CATA-GTGTGAAC-AAATTTGTTCAAAACCTTTTAGTCTAAAACTA-------TTT-AAAACTTAATATATTGAAGACA--ACGTCG-------C-AAAAG--TCAATTCG-TTTC-ATTTCCAAGA-TA--CC-------TAC-TTA--ATA-
gi|90685 : TATAAGACTCATTT------TATTA--T-TGTT--TTTGTTTGAAGTTTAC------------AAGAAGCCTGAGGAAAATT--T--ATA--TAT---AA----TATA-GTTTGAAC-AATAT-GTTTAACA-------------AGCTAGGCTG-TTTC-ACAGCTTAATCCAGTGAAGACA--CAGTCGCCTT--GC-AGAAG-ATC---CCG-TTTT-TAGTTCAAGA-TA--CT-------CAC-CAA--ACA-TCTTGACAG
gi|90686 : TT--TTCGTTTGAAGTTTATAAATCATGAGGCAAGAAGTTTGAGGCAAACT--G--ACA--TAT---TA----TATA-GTTTGAAC-AAAATTGCTTAACA-----TAATTTCAAGCTAGGCTG-TTTC-ACAGCTTAATCCAGTGAAGACA--AAGCCGCCTT--AC-AGAAG-ACC---CCG-TTTT-AAGTTCAAGG-CT--CT-------TATACCG--ACA-TCTTGACA
gi|90687 : TT--TTGGTTTGA-GTTT---------GA---AACAAGTCTCA--AACATT--T--ATATATAT---TA----TATA-GTTTGAAC-AAAATTATTTAACA-----TAGTTTCAAGCTAGGCTG-TTTC-ACAGCTTAATCCAGTGAAGACA--CAGTCGCCTT--AC-AGAAG-ATC---CCG-TTTC-AAGTTCAAGA-TA--CT-------CAC-CCA--ACA--ATTGACA
gi|90688 : ACGAATCATCAGGCAGGAAGCCGGAGAAAGACT--G--A-A--TAT---AA----TTTA-GTTTTAAC-AACATTATTTAACA-----TAGCTTGAAGCTAAGTTG-TTTC-ACA--T--------TGAAGACA--CAGTT-CCAT--AC-AGAAT-ATT---CCG-TTAT-AAGTTGCAGATTA--TT-------GCT-CCA--AAA-CCTTGACA
gi|90689 : TA--GAT---TG----TGTG-GTATGA-------TTGTTTAACA-----TA---TCAAGCTAGGCTG-TTTC-ACA-CTTAATCTAGTGAAGATA--CAGTCGCCTT--AC-AGAAG-ATC---CCA-TTTT-AAATTCAAGA-TA--CT-------TACACCA--ACA-TCTTGACA
gi|90690 : C-AAAATTGTTCGGCA-----TATTTTCAAGCTAGGCTG-TTTT-ACAGCTTAGTCCAGTGAAGACA--TGGTTGCCTT--AA-AAAAG-ATC---TCA-TTTC-AATTTGAAGA-TA--CTTACAGGGTAC-TTA--ACA-TCTAGACA
gi|90691 : AGCTAGGCTG-TTTTTATAGCTTAATGCATTGAAGACA--CAATCGCCTT--AC-AGAAG-ATC---CCG-TTTT-AAGCTCAAAA-TA--CT-------CAC-TGC--ACA-AATTGACA
gi|90692 : CTTAATCCAGTTAAGACT--TAACTGCCTTAAAT-ATAAG-A-----CTG-TTTA-AAGTTCAAAC-TA--TG-------TAC-TCA--ACA-TCTTGATA
blockSeqs : A TG GAAAT GG A T T T ATT GA T AA C TT TAT TACAGG TTACCTTT AT T A CA TC TA CAA TAAT T A CCTTT T T TG AA G T AAT T C T TT TACAGGG A TG G
blockSeqs : . . CT . . T . . . . . . . . . . TTATATT G T G TA . . ACA . . . TG . . . . . . A . . . . . A . .
blockSeqs : . . TT . . T . . . . . . . . . . TTATTC . T G TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . .
blockSeqs : . . AT . . T . . . . . . . . . . TTATTA . T A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . .
blockSeqs : . . TT . . T . . . . . . . . . . TTATCT . T G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . .
blockSeqs : . . TG . . T . . . . . . . . . . TTATTT . G G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . .
blockSeqs : . . T . . A . . . . . . . . . . TTATTA . T G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . .
blockSeqs : . . T . . A . . . . . . . . . . TTATAT . G G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . .
blockSeqs : . . T . . T . . . . . . . . . . TTGTTT . G G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . T . . . . . . . . . . TTATAT . G A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . A . . . . . . . . . . TTACTT . G G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . A . . . . . . . . . . TTATTT . G G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . A . . . . . . . . . . TTATTT . G G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . A . . . . . . . . . . TTATTG . A T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . A . . . . . . . . . . TTATG . G G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . T . . . . . . . . . . ATGT . A G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . A . . . . . . . . . . ATTT . T G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . A . . . . . . . . . . TT . G G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . C . . . . . . . . . . TT . A C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . . . . . . . . . . . A T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . G G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : AGACACGTTGTCTGAA-CAGCTGGTCTCAT--CAT----T-A--AAA-TAGTGTTGAACAACAGTTAGTTCAACNCTACAGG-GTTTGAAACATT-ATAC---TGTATATAGT--TG-AT--TGGTAT-GAT--CATTTGTCTG---TATGATTTCTAAATATTAGAATCATTT------TATTA--T-TTTT--TTTGTTTGAAGTTTACGAATCATGAGGCAAGAAGCCTGAGGAAAATT--T--ATA--TAT---TA----TATA-GTTTGAAC-AAAATTGTTTAACA-----TAGTTTCAAGCTAGGCTG-TTTC-ACAGCTTAATCCAGTGAAGACA--CAGTCGCCTT--AC-AGAAG-ATC---CCG-TTTT-AAGTTCAAGA-TA--CT-------CAC-CCA--ACA-TCTTGACAG
finalCons : AGACACGTTGTCTGAA-CAGCTGGTCTCAT--CAT----T-A--AAA-TAGTGTTGAACAACAGTTAGTTCAACNCTACAGG-GTTTGAAACATT-ATAC---TGTATATAGT--TG-AT--TGGTAT-GAT--CATTTGTCTG---TATGATTTCTAAATATTAGAATCATTT------TATTA--T-TTTT--TTTGTTTGAAGTTTACGAATCATGAGGCAAGAAGCCTGAGGAAAATT--T--ATA--TAT---TA----TATA-GTTTGAAC-AAAATTGTTTAACA-----TAGTTTCAAGCTAGGCTG-TTTC-ACAGCTTAATCCAGTGAAGACA--CAGTCGCCTT--AC-AGAAG-ATC---CCG-TTTT-AAGTTCAAGA-TA--CT-------CAC-CCA--ACA-TCTTGACAG
Alignments
lowQualScore : 111111 1
lowQualScore : 2 22 111111 22 1 2 1 1 333 22 1 22 0 1 22 0 222 444444 999999999 33 6 1 55 22 11 444 2222 1 1 55555 1 1 11 11 1 1 333 1 1 1 11 4444444 1 22 1
lowQualScore : . .. ...... .. . . . . ... .. . .. . . .. . ... ...... ......... .. . . .. .. .. ... .... . . ..... . . .. .. . . ... . . . .. ....... . .. .
lowQualScore : 2 66 999999 66 8 2 7 7 000 22 6 22 6 7 33 2 999 666666 111111111 55 2 2 99 00 99 888 9999 4 3 22222 3 3 88 88 3 3 555 3 3 4 99 5555555 4 00 4
consensus : AGACACGTTGTCTGAA-CAGCTGGTCTCAT--CAT----T-A--AAA-TAGTGTTGAACAACAGTTAGTTCAACNCTACAGG-GTTTGAAACATT-ATAC---TGTATATAGT--TG-AT--TGGTAT-GAT--CATTTGTCTG---TATGATTTCTAAATATTAGAATCATTT------TATTA--T-TTTT--TTTGTTTGAAGTTTACGAATCATGAGGCAAGAAGCCTGAGGAAAATT--T--ATA--TAT---TA----TATA-GTTTGAAC-AAAATTGTTTAACA-----TAGTTTCAAGCTAGGCTG-TTTC-ACAGCTTAATCCAGTGAAGACA--CAGTCGCCTT--AC-AGAAG-ATC---CCG-TTTT-AAGTTCAAGA-TA--CT-------CAC-CCA--ACA-TCTTGACAG
Reference ( family-614 ) : AGACACGTTGTCTGAA-CAGCTGGTCTCAT--CAT----T-A--AAA-TAGTGTTGAACAACAGTTAGTTCAACNCTACAGG-GTTTGAAACATT-ATAC---TGTATATAGT--TG-AT--TGGTAT-GAT--CATTTGTCTG---TATGATTTCTAAATATTAGAATCATTT------TATTA--T-TTTT--TTTGTTTGAAGTTTACGAATCATGAGGCAAGAAGCCTGAGGAAAATT--T--ATA--TAT---TA----TATA-GTTTGAAC-AAAATTGTTTAACA-----TAGTTTCAAGCTAGGCTG-TTTC-ACAGCTTAATCCAGTGAAGACA--CAGTCGCCTT--AC-AGAAG-ATC---CCG-TTTT-AAGTTCAAGA-TA--CT-------CAC-CCA--ACA-TCTTGACAG
gi|90660 : AGACACGTTGTCTGAA-CAGCTGGTCTCAT--TAT----T-A--AAA-TAGTGTTGAACAACAGTTGGTTCAACCCTACAAG-GTTTGAAACATT-ATAC---TGTATATAGT--TA-AT--TGGTAT-GAT--CATTTGTCTG---TATGATTTCTAAATATTAGAATCATTT------TATTA--T-TCCT--TTTGTTTGAAGTTAACTAATCATAAGGCAAGAAGCCTGAGGAAAATT--T--ATA--TAT---TA----TATA-GTTTGAAC-AAAATTGTTTAACA-----TAGTTTCAAGCTAGGCTG-TTTC-ACAGCTTAATCCAGTGAAGACA--CAGTCGCCTT--AC-AGAAG-ATC---CCG-TTTT-TAGTTCAAGA-TA--CC-------CAC-CCA--ACA-TCTTGACAG
gi|90661 : AGACACGTTGTCTGAA-CAGCTGGTCTCAT--TAT----T-A--AAA-TAGTGTTGAACAACAGTTGGTTCAACTCTACAAG-GTCTGAAACATT-ATAC---TGCATATAGT--TA-AT--TGGTAT-GAT--CATTTGTCTG---TATGATTTCTAGATATTAGAATCATTT------TATTA--T-TCCT--TTCGTTTGAATTTAACTAATCATAAGGCAAGAAGCCTGAGGAAAAAT--T--ATA--TAT---TT----TATA-GTTTGAAC-AAAATTGTTTAACA-----TAGTTTCAAGCTAGACTG-TTTC-ACAGCTTAATCCAGTGAAGACA--CAGTCGCCTT--AC-AGAAG-ATC---CCG-TTTT-TAGTTCAAGA-TA--CC-------CAC-CCA--ACA-TCTTGACAG
gi|90662 : AAACACGTTGTCTGAA-CAGCTGGTCTCAT--TAT----T-T--AAC-TAGTGTTGAACAACAGTTAGTTCAACTCTACAGG-GTTTGAAACATT-ATAA---TGTATATAGT--TG-AT--TGGTAT-GAT--CATTTGTCTG---TATGATTTCTAGATATTAGAATCAATT------TATTA--T-TATT--TTTGTTTGAAGTTTACTAATAATGAGGGAAGAAGCCTGAGGAAAATT--T--ATA--TAT---TA----TATA-GTTTAAAC-AAAATTGTTTAATA-----TAGTTTCAAGCTAGGCTG-TTTC-ACAGCTTAATCAAGTGAAGACA--CAGTCGCTTT--AC-AGAAG-ATC---CCGTTTTT-TAGTTCAAGA-TA--CT-------CAC-CCA--ACA-TCTTGACA
gi|90663 : AGACACGT---CTGAA-CAGCTGGTCTCAT--AAT----T-A--AAA-CAGTGTTGAACAACAGTTAGTTCAACTCTACAGG-GTTTGAAACAT----AC---TGTATATAGT--TG-AT--TGGTAT-GAT--CATTTGTCTG---TATGATTTCTAAATATTAGAATCATTT------TATTA--T-CTTTATTTTGTTTGAAGTTTACTAATCATGAGGCAAGAAGCCTGAGGAAAATT--T--ATA--TAT---TT----TATA-GTTTGAAC-AAAATTGTTTAACA-----TAGTTTCAAGCTAGGCTG-TTTC-ACAGCTTAATCCAGTGAAGACA--AAGTTGCCTT--AA-AGAAG-ATC---CTG-TCTT-AAGTTCATGA-CA--CT-------CAC-CCA--ACA-TCTTGACAG
gi|90664 : AGACACGTTGTCTGAA-CAGCTGGTTTCAT--TAT----T-A--AAA-TAGTGTTGAACAACAGTAAGTTCAACTCTACAAG-GGTTGAAACATT-ATAC---TGTATATAGT--TA-AT--TAGTAT-GAT--CATTTGTCTG---TATGATTTCTAAATATTAGAATCATTT------TATTA--T-TTCT--TTTGTTTGAAGTCAACTATTCAAAAGGCAAGAAGGTTGAAGAAAATT--T--ATA--TAT---TA----TATA-GTTTGAAC-AAAATTGTTTAACA-----TAGTTTCAATCTAGGCTG-TTTC-ACAGCTTAATCCAGTGAAGGCA--CAGTCGCCTT--AC-AGAAG-ATC---CCG-TTTT-TAATTCAAGA-TT--AT-------AGC-CCA--ATA-TCTTGACA
gi|90665 : AGACACGTTGGCTGAA-CAGCTGGCGTCAT--TAT----T-A--AAA-TAGTGTTGAACAACAGTAAGTTCAACTCTACAGG-GTTTGAAACATT-TTAC---TGTATATAGT--TG-AT--TCGTAT-GAT--CATTTGTCTG---TATAATTTCTAAATATTAGAATCATTT------TATTA--T-TATA--TTTGTTTGAAGTTTACTTATCGTGAGGCAAGAAGCCTGAGGATAATT--T--ATG--TTT---TA----TATA-GTTTGAAC-AAAATTGTTTAACA-----TAGTTTTAAGCTAGGCTG-TTTC-ACAGATTAATCCAGTGAAGACA--CAGTTGCCTT--AT-AGAAG-ATC---CCA-TTTT-AAGTTCAAGG-TA--CT-------CAC-CCA--GCA-TCTTGACAG
gi|90666 : AGACACGTTGTCTGAA-CAGCTGGTCTCAT--TAT----T-A--AAA-TATTGTTGAACAACAGTTAGTTCAACTCTACAGG-GTTTGAAACATT-ATAC---TGTAAATAGT--TG-AA--TGATAT-GAT------TGTCTG---TATGATTTCTAAATATTAGAATCATTG------TATTA--T-ATTT--TTTGTTT-------ACGAGTCATGAAGCAAGAAGCCTGAGGAAAAGTCAT--ATA--TAT---TA----TATA-GTTTTAAC-AAAATTATTTAATA-----TAGTTTCAAGCTAGGCCT-TTTC-ACAGCTTAATCCAGTGCAGACA--CATTCGCCTT--AC-AGAAG-ATC---CCG-TTTT-AAGTTCAAGT-TA--CA-------CAT-CCA--ACA-TCTTGATAG
gi|90667 : AGACACGTTGTCTGAA-CAGCTGGTCTCAT--CATC---T-A--AAA-TAGTGTTTAGCAACAGTTAGTTCAACACTAGAGG-GTTTGAAACATT-ATAC---TGTATATAGT--TG-AT--TCGTAT-GAT--CATTT-TCTG---TATGATTTCTAAATATAAGAATCATTT------TATTG--T-TTT------GTTTGAAGTTTACTAATCATGACGCCAAAAGCTTGAGTAAAATT--T--ATA--GATCAATA----TATA-GTTTGATC-AAAAATGTTTAACA-----TAGTTTTGAGTTAGGCTG-TTTC-ACAGCTTAATCTAGTGGAGACA--CAGTCGCCTT--AC-AGAAG-ATC---CCT-TTTT-AAGTTCAATA-TA--CT-------CAC-ACA--ACC-TTTTGACA
gi|90668 : AGACACGTTGTTTGAA-CAGCTGGTCTGAT--CAT----A-T--AAA-TTTTGTTGAGCAACAGTTAGTCCAACACTACAGG-GTTTTAAACATT-ATAC---TGTATATAGAGATG-AT--TGATTT-GAT--CATTTGTTTG---TATGATTTCCAAATATTATAATCATTT----------A--T-GTGT--T--GTTTGTAGTTT--GAATCATGAGGCAAGAAACCTGAGGAAAATT--T--ATA--TAT---TA----CATA-GTTTGAAC-ACAATTGTTGAACA-----TAGTTTCAAGCTAGGCTG-TTTC-ACAGTTTAATCCAGTGAATACA--GAGTCGCCTT--AC-AGAAG-ATT---CAG-TTTT-AAGTTCGAGA-TA--TT-------TACACCA--ACA-TCTTGACA
gi|90669 : AGACACGTTGT-TAAA------------AT--TAT----T-A--AAA-TAGTGTTGAACAACAGTT----CAACTCTACAGG-GTTTGAAACATT-ATAC---TGTAAATAGT--TG-AT--TGATAT-GAT------TGTCTG---TATGATTTCTAAATATTAGAATCATTT------TATTA--TATTTTG-TTTGTTTGACGTTTACGAATCATGAGGCAAGAAGCCTGAGGAAAATTTAT--ATA--TAT---TA----TACA-GTTTGAAC-AAAATTATTTAACA-----TAGTTTCAAGCTAGGCTGTTTTT-ACAGCTTAATCCAGTGAAGACA--CAATCGCCTT--ACGAAAAA-ATA---TCG-CTT
gi|90670 : AGACACGTTGTCTGAA-AAACTGTTCTCAT--TAT------A--AAC-TAGTGTTGAACAGCAG-----------------G-GTTTGAAACATT-AAACATTTGTAAATAGT--TG-AT--TGATAT-GAT------TGTATG---TATGGTTTCTAAATATTAGAATCATTT------TATTA--T-ATTT--TTAGTTTGAAGTTTACGAACCATAAGGCAAGAAGTCTGAGGAAAATTTAT--ATA--TAT---TA----TATA-GTTTGAGCAAAAATTGTTTTACA-----TAGTTTCAAGCTAAGCTG-TTTC-ACAGCTTAATCCAGTGAAGTCA--AAGATGCCTT--AA-AGAAG-ATC---CCG-TTTT-AAGTTTAAGA-TATTTT-------CA--ACA--ACA-TTTTAAC
gi|90671 : AGACATGTTGTCTAAA-CAGCTGGTCTCAT--CGT----TTA--AAA-TAGTGTTGAGCAACAGT--------------AAG-GTTTGAAACATT-ATAC---TGTATATAGT--TG-AC--TCGTTT-GAT--CATGTGTCTG---TATCATTTCTAAATATTA-AATAATCT------TATTA--C-TTTT--TATGTT-GAAGTTTACGAATCATGAGGATAAAAGCCTGGGGAAAATT--A--ACA--TAA---TA----TATA-GTATTAAT-AACATTTTTTAACA-----TAGTTTCAAGCTGGGCTG-TTTT-ACAGCATTATCCAGTGAAGACA--CAGTCGCCTT--AC-AGAAG-ATCA--ACG--ATT-AAGTTCAAGA-TA--CT-------AGC-CGA--ACA-CCTTGACAG
gi|90672 : AGACACGTTGTCTGAA-CAGCTGGTTTCAT--CAT----T-A--AAAATTGTGTTGAGCAACATTTAGTTCAACTATACAGG-GTCTGAAACATT-ATAC---TGTGTATAGT--TG-AT--TGGTTT-AAT--CATTTGTCTATATTATGATTTCTAAATATAAGAATCATTTTACAGGTATTA--T-TTTT--TTTGTTTAAAGTTTACGAATCAT-------------TG--------------ATA--TAT---TATAATTATA-GTTTAAAC-AAAATTGTTAAACA-----TAGTTTCAAGCTAGGCTG-TTTC-ACAGCTTAATCCAGTGAAGACATGTAGTCTCCTT--AT-AGAAG-ATC---CCA-TTTTCAAG
gi|90673 : AGACACGTTGTCTGAA-CAGCTGGTCTCAT--CATA---T-A--AAA-TAGTGTTGA------GTTAGTTCCACACTACAGG-GTTTGAAACATT-ATCT---TGTATGTAGA--TG-AT--TGGT--------CATTTGTTTT---TATGATTTCTAAATATTAGAATCATCT------TATT--------T--GTT-TTTGAATTTTACGAGTCACGAGGCAAGAAACCCGAGGAAAATT--T--AGA--TAA---TA----TACA-GTTTGAAC-AAAATT---------------GTTTTAAGCTAGGCTG-TT---A-----------AGCGAAGACA--CAGTCGTCTG--AC-AGAAG-GTC---CCG--TTT-AAGTTCAAGA-TA--CT-------TAC-ACC--ATAGTCTTGACA
gi|90674 : AGGCATGCTGTTGGAA-CAGCTGGTCTCACTGCATGAAAT-AGGAAA-TAGTGTTGAACAATAGTTAGTCTAATACTACAGGTGTTTGAAACCTT-ATAC---TAT---TAAT--TGTAT--T
gi|90675 : ATATGCTGTCCAGA-CAGATGGTCTCAT--CAT----TTA--AAA-TAGTGTTAAGCAACAGTTAGTTAAACACTACAGG-GTTTGAAACATT-ATAC---TGTGTATAGT--TG-AT--TGGTAT-GAT--CATTTATCTG---TATGATTTCTAAATATTAGAATTATTT------CATTA----TGTT--TTTGTTTGAAATTTACAAAACATGAGTCAAGAAGTCTGAGAACAATT--T--ATA--TAT---TA----TATA-GTTTGAAC-AAAATTGTTTGACT-----TAATTTCAAGCTAGGCTA-TTTC-ACAGCTTAATCCAATGAAGACA--AAGTCGGCTT--AA-AAAAATATC---CCG-TTTT-AAGTTCAAGA-TA--CT-------TACACCA--ACA-TCTTGACA
gi|90676 : GTTTGAAACAGCTGGTCACAT--CAT----A-T--AAA-TAGTGTTGAGCAACAGTTAGTCCAACACTACAGT-ATTTGAAACATT-TTAC---TGTATATAGA--TA-AC--TGGTTT-GAT--CATATGTGTG---TATGATTTCTAAATATTATAATCATTT------TA---------TT--TTTGTTTGAAGTTTACGAATCATTAGGCAAGAAGCCTGATGGAAATT--T--ATA--TAT---TA----CATATTTTTAAAA-AAAAATGTTGAACG-----TAGTTCCAAGCTAGGCTG-TTTC-GCAGCTTAATCCAGTAAATACA--CTGTCGCCTT--AC-AGAAG-ATT---CAG-TTTT-AAGTTCAAAA-TA--CT-------TACACCA--ACA-TCTTGGCA
gi|90677 : GTCTGAA-CAGCTGGTCTCAT--CAT----TGA--AAA-TAGTGTTGAGCAACAGCTAGTCCAACACTACAGG-GTTTGAAACTTT-ATAC---TGTTTATAGA--TG-AT--TGGTTT-GAT--CATTTCTTCA---TATGATTTCTAAATATTAAAATCATTT------TA---------TT--TTTGTTTGAAGTTTACAAATCATGAGGCAAGAAGCCTGAGGAAAATT--A--ATA--TA-----------------TTGAAC-AAAATTGTTTAACATG---TAGTTTCAAGCTAG-------------GCTTAATCCAGTGAAGACA--AAGTCACCTT--GT-AGAAG-ATC---CAA--TTT-AAGTTCAAGA-CA--CT-------TATACCATGACA-TCTTGACA
gi|90678 : TCTCAT--CAT----T-A--AAA-TAGATTTGAATAACAGTTAGTTCAACTTTACAGT-GTTTGAAACATT-ATAC---TGTATATAGT--TG-AT--TGGTAT-GAT--CATTTGTCTG---TATGATTTCTAAATATTAGGATCATTT------TATTACCT-TTAT--TTTGTTTGAAGTTTACTTATCATGAGGCAAGAGGCCTGAGGGCAATT--T--ATA--TAT---TA----TATA-GTTTGAAC-TAAATTGTTTAACA-----TAGTTTCAAGTTAGAGTG-TTTC-ACAGCTTCATCCAGTGAAGACA--AATTCGCCTT--AA-AGAAG-ATC---CCA-TCTT-AAGTTCAAGA-TA--CT-------CAC-CCA--ACA-TCTTGACAG
gi|90679 : TCTCAT---AT----A-A--AAA-ACGTGTTGAGCACCAGTTAGTCCAACACTACAGG-GAATGAAACATT-ATAC---TGTATATAGA--TG-AT--TGTTTT-GAT--CATTTGTTTG---TATGACTTCTTAACATTAGAATCATTT------TA---------TT--TTTGTTTGAAGTCTATGGATCATGAGGC-AGAAACCTGAGG-AAATA--T--ATA--TTT---TT----TATA-GTTTGAAC-TAAAGTGTTTAACA-----TAGTTTCAAGCTAGCCTG-TATC-ACAACTTAATACACAGAAGACA--AAGTCGCCTA--AC-AGAAG-ATC---CCG--TTT-AAGTTCAAGA-TA--TT-------TACATCA--ATA-TCTTG
gi|90680 : TCAT--CAT----A-T--AAA-TTTTGTTGAACAACAGTTAGTCCAACACTACAGG-GTTTCAAACATT-AGAA---TGTATATAGA--TG-AT--TTATTT-GAT--CATTTGTTTG---TATAATTTCCAAATATTATAATCATTT------T----------TT--TTGGTTTAAAGTTTGC--ATCATGAGGCAAGAAACCTGAGTAAAATT--T--ATG--TAT---TA----CATA-GTTTGAAC-ACAATTGTTGAACA-----AAGCTTCAAGCTAGGCTG-TTTC-GCAGTTAAATCCAATAAATTCA--CAGTCGCCTT--AC-AGAAG-ATT---CAG-TTTT-AAGTTCGAGA-TG--CT-------TACACCA--ACA-TTTTGGCA
gi|90681 : -TAGCGT-GAA--ACAGTT--CTCAAACATACAG----CTGTAACGTTTATAC---TG-----AAC--TG-----TGGCAT-TATTTCATGCGC--G---TA-GTTTTCTAGATATTAGAATAATTT------TATT------------TTGTTTGAAATT----AA-----AGGCAATAAGCCTTGGAAAAATC--T--ATA--ACG---TA----GATA-ATTTTAAC-AAAATTATTCAACA-----TAGTTTCAAGCTAAGGTG-TTTT-ACAGCTTAGTCCTGTGGCGACA--AAGTCACCTT--AC-AGAAT-ATC---CCG-TTAT-AAGTTCAGGA-TA--TT-------TA
gi|90682 : TGTTGAACAACAATAAGTTCAACTCTACAGG-GTTTGAAACATT-AAAC---TGTATATAGT--TG-AT--TAGTAT-GAG--CATTTGTCTT---TTTGATTTCTTAATATTAAAATTATTT------CATTA--T-TTTT--TTCATTT-----TT-----TTAT-------------TGAGGAAAATT--T--ATA--TAT---TA----TATA-GTTTGAAC-AAA----------------TAGTTTCAAGCTAGGCTG-TTTC-ACAGTTTAATCCAGCGAAGACA--CAGTCGCCTT--AC-AT-AG-ATC---CCA-TTTT-AAGTTCAAGA-TA--CT-------CAC-CCA--ATA-TCTTGACA
gi|90683 : T--TG-ATAATAGTAT-GAT--CATTCATTTG---TACTATTTCTAAATATTAGAATAACTT------TA--A--T-TT-------GTTTGAAATTAACAAATCCTCAGGCATAAAGCCTTA--AAAATT--T--ATA---------------GTA-A---GGAC-AAAATTGTTTAACG-----TAGTTTCAAGACAGACAG-TTTT-ACAATCTAATCCAATG
gi|90684 : --TG-AT--TTG-ATCGAT--CATT-AT------TAAAACTGCCAAAAGTAAGAATAATTT------TA-------------TTTGTTTGAAATTATCAAATTATTACGTTGGAAGCATAAATGATGTT--TTCATA--TATACATG----CATA-GTGTGAAC-AAATTTGTTCAAAACCTTTTAGTCTAAAACTA-------TTT-AAAACTTAATATATTGAAGACA--ACGTCG-------C-AAAAG--TCAATTCG-TTTC-ATTTCCAAGA-TA--CC-------TAC-TTA--ATA-
gi|90685 : TATAAGACTCATTT------TATTA--T-TGTT--TTTGTTTGAAGTTTAC------------AAGAAGCCTGAGGAAAATT--T--ATA--TAT---AA----TATA-GTTTGAAC-AATAT-GTTTAACA-------------AGCTAGGCTG-TTTC-ACAGCTTAATCCAGTGAAGACA--CAGTCGCCTT--GC-AGAAG-ATC---CCG-TTTT-TAGTTCAAGA-TA--CT-------CAC-CAA--ACA-TCTTGACAG
gi|90686 : TT--TTCGTTTGAAGTTTATAAATCATGAGGCAAGAAGTTTGAGGCAAACT--G--ACA--TAT---TA----TATA-GTTTGAAC-AAAATTGCTTAACA-----TAATTTCAAGCTAGGCTG-TTTC-ACAGCTTAATCCAGTGAAGACA--AAGCCGCCTT--AC-AGAAG-ACC---CCG-TTTT-AAGTTCAAGG-CT--CT-------TATACCG--ACA-TCTTGACA
gi|90687 : TT--TTGGTTTGA-GTTT---------GA---AACAAGTCTCA--AACATT--T--ATATATAT---TA----TATA-GTTTGAAC-AAAATTATTTAACA-----TAGTTTCAAGCTAGGCTG-TTTC-ACAGCTTAATCCAGTGAAGACA--CAGTCGCCTT--AC-AGAAG-ATC---CCG-TTTC-AAGTTCAAGA-TA--CT-------CAC-CCA--ACA--ATTGACA
gi|90688 : ACGAATCATCAGGCAGGAAGCCGGAGAAAGACT--G--A-A--TAT---AA----TTTA-GTTTTAAC-AACATTATTTAACA-----TAGCTTGAAGCTAAGTTG-TTTC-ACA--T--------TGAAGACA--CAGTT-CCAT--AC-AGAAT-ATT---CCG-TTAT-AAGTTGCAGATTA--TT-------GCT-CCA--AAA-CCTTGACA
gi|90689 : TA--GAT---TG----TGTG-GTATGA-------TTGTTTAACA-----TA---TCAAGCTAGGCTG-TTTC-ACA-CTTAATCTAGTGAAGATA--CAGTCGCCTT--AC-AGAAG-ATC---CCA-TTTT-AAATTCAAGA-TA--CT-------TACACCA--ACA-TCTTGACA
gi|90690 : C-AAAATTGTTCGGCA-----TATTTTCAAGCTAGGCTG-TTTT-ACAGCTTAGTCCAGTGAAGACA--TGGTTGCCTT--AA-AAAAG-ATC---TCA-TTTC-AATTTGAAGA-TA--CTTACAGGGTAC-TTA--ACA-TCTAGACA
gi|90691 : AGCTAGGCTG-TTTTTATAGCTTAATGCATTGAAGACA--CAATCGCCTT--AC-AGAAG-ATC---CCG-TTTT-AAGCTCAAAA-TA--CT-------CAC-TGC--ACA-AATTGACA
gi|90692 : CTTAATCCAGTTAAGACT--TAACTGCCTTAAAT-ATAAG-A-----CTG-TTTA-AAGTTCAAAC-TA--TG-------TAC-TCA--ACA-TCTTGATA