lowQualScore : 55 3 3333 6666 555 222 2222 1 2222 11 1 1 1 222 0 1 1 7777777777777 55 8888888 22 55555 222 1 5 77 3 3
lowQualScore : .. . .... .... ... ... .... . .... .. . . . ... . . . ............. .. ....... .. ..... ... . . .. . .
lowQualScore : 55 9 1111 1111 222 444 9999 4 8888 88 3 3 3 333 1 3 3 3333333333333 33 8888888 00 55555 555 4 9 66 1 1
consensus : ATAT--ATATATGATAGGGAGAAT----C----ATACGTCT---A---ACAAAAC----AC-CTTTCAGGAGCA----CCGGA--TC-CGCGA-AG-GATA---CATAAATGATA-GAA-ATA-------G-----TA-AA-------TA--CA-----GTAGAG---AGAA-TTACCA-TTTTACAGT-GC-TAAA
Reference ( gi|89633 ) : ATAT--ATATACGATAGGGAGAAT----C----ATACGTCT---A---ACAAAAC----AC-CTTTCAGGAGCA----CTGGA--TC-CGCGA-AG-GATA---CATAAATGGTA-GAA-ATA-------G-----TG-AA-------TA--CA-----GTAGAG---AGAA-TTACTA-CTTTACAGT-GC-TAAA
gi|89617 : ATAT--ATATATGATAGGGAGAAC----C----ATATGTCT---A---ACAAAAC----AC-CTTTCAGGAGCA----CCAGA--TC-CGCGA-AG-GATA---CATAAATGGTA-GAA-ATG-------G-----TG-AA-------TA--CA-----GTAGAG---AGAA-TTACCA-TTTTACAGT-GC-TAAA
gi|89619 : tatataattATAT--ATATATGATAGAGGGAAT----C----ATACGTCC---T---ACAAAAC----AC-CTTTTAAGAGCA----CCGGA--TC-CGCGA-AT-GATA---CATAAATGGTA-GAA-ATA-------G-----TG-AA-------TA--CA-----GAAGAG---AGAA-TTACCA-TTTTACAGT-GG-TAAA
gi|89618 : tatatatACAT--ATATGTGATAGGGAGAAT----C----ATATGTCT---A---ACAAAAC----AC-CTTTCATGAGCA----CTGGA--TC-CGCGA-AG-GATA---CATAAATGATA-GAA-GTA-------------TA-AA-------TA--CA-----GAAGAG---AGAA-TTACCA-CTTTGCAGT-AC-TAAA
gi|89631 : tatatatATAT--ATATATGATAGGGAGAAT----C----ATACGTCT---A---ACAAAAC----AC-TTTTCAGGAGTG----CCGGA--TC-CGCGA-AG-GATA---CATAAATGGTA-GA---------------------AA-------TA--CA-----GTAGAG---AGAA-TTACCA-TTTT-CAGT-GC-TAAA
gi|89621 : tATAG--ATATACGATAGGGAGAAT----C----ATAAGCCT---A---ACAAAAC----AC-TTTTCAGGAGCA----CCAGA--TC-TGTGA-AG-GATA---CATAAATAAGA-GAA-ATA-------G-----TA-AA-------TA--TA-----GTAGAG---AGAA-TTACCA-TTTTACAGT-GC-TAAA
gi|89632 : tatatatggtataATAT--ATATATGATAGGGAGAAT----C----ATACAATT---A---ACAAAAC----AC-CTTTCAGGAGCA----CCGGA--TC-TGAGA-GG-GATG---CATAAATGATA-GAA-ATA-------G-----TA-AA-------AA--CA-----GTAGAG---AGAA-TTACCA-TTCAACAGT-GT-TAAA
gi|89627 : tATAT--ATATATGATAGGGAGAAC----C----ACATTTCT---A---ACAAAACAAACAC-CTTTCAGGAGCA----CCGGA--TC-CGCAA-AG-GATA---CATAAATGGTA-GAA-ATA-------G-----TG-AA-------TA--CT-----GTAGAG---AGAA-TAACCT-TTTTACAGTGGT-TAAA
gi|89622 : atatatACAT--ATATGTGATAGGGAAAAT----C----ATATGTCA---A---ACAAAAC----AT-CTTTCATGAGCC----CTGGA--TC-CGCGA-AG-GATA---CATAAATGATT-GAA-ATA-------A-----TA-AA-------TA--AA-----GAAGAG---AGAA-TTACCA-TTTTGCAGT-GC-TAAA
gi|89629 : tatgtatATAT--ATATATGAT-GGGAGAAT----C----ATACGTTT---A---ACAAAAC----AC-CTTTTAGGAGTA----CTGGA--TT-CGCAA-AG-GATG---CATAAATGATA-GAA-ATA-------A-----CA-AA-------TA--CA-----GTACAG---AGAA-TAACCA-TATAACAGT-A--TAAA
gi|89624 : tatatATATTCATGTACGATTGGAAGAAT----GTAAAACATGTCTT--A---ACAAAAC----AC-CTTTCAGAAGCA----CTGGA--TC-CACAA-AG-GATA---CGTAAATGATA-TAT-ATA-------
gi|89623 : tatgtATATTCATGTACGATTGGAAGAAT----GTAAAACATGTCTT--A---ACAAAAC----AC-CTTTCAGAAGCA----CTGGA--TC-CACAA-AG-GATA---CGTAAATGATA-TAT-ATA-------tatatata
gi|89630 : tatgtATGT--GTGTATGATAGGGTTAAT----T----ATATATCT---A---ACAAAAC----AT-CT--CAAGAGAA----CTAGA--TC-CGCGA-AG-GATA---CATAAATGATA-tatatata
gi|89625 : atATAT--GTATATGAGTGGTAGAAG----T----ATACGTCTTACACGTACAAAAC----AC-ATTTCAGGAGCA----CTGGGCTTCACACAA-AA-AA-G---CATATATGATA-GAA-TGA-------GT----TA-AA-------TATCCAGATGTGTAGAATATACAA-GTACCA-TTTTACAGT-GT-TTAAtgcatataataaa
gi|89626 : tacacacATAT--ATATACA--AAGGAGAATAGAAC-----TACACCT---A---ACAAGAT-----C-CTTTCAATAGTA----TTGGA--T--CACGG-AGTGATA---C---AAGGGTGTGAAGGTA-------A-----T--AG-------TA--TG-----GGAGAG---ATAA-T
gi|89635 : tatatatatTAT--ATATA---TAAGGAGAAT----C----ATATGTCT---A---ACAAAAC----AC-CTTTTAGGAGCA----CCGGA--TC-CGCGA-AG-GATA---CATAAATGATA-GAA-ATA-------G-----TA-AATACAATGTA--CA-----GTAGAG---AGAA-TTGCCA-TTTTACAGT-GC-TAAA
gi|89634 : TAT--ATATACAATATAAA-AAT----C----ATAAATTT---C---CTTAAAC----AG-CTATCAAGATCAGGAGCTAGA--TC-CACCA-GG-GACA---CATAAAATATA-GAA-AAA-------C-----TA-AA-------AA--CA-----GAAAAG---AGAT-TTAATA-TTTAACAGT-TC-TGAA
gi|89616 : AT--ATATATGATAGGGAGAAT----C----ATACGTCT---A---ACAAAAC----AC-CTTTCAGGAGCA----CTGGA--TC-TGCGA-AG-GATA---CATAAATGGTA-GAA-ATA-------G-----TA-AA-------TA--CA-----GTAGAG---AGAA-TTACCA-TTTTACATT-GC-TAAA
gi|89620 : tatatataaAT--TTATGTGATGGGGAGAAT----C----GTAAGTCT---A---ACAAAAC----AC-CTTTCAGGAGCA----CTGGA--TC-CACGA-AG-GGTA---CATAAATGGTA-GAA-ATA-------G-----TG-AA-------TA--CA-----GTAGAG---AGAA-TTACCA-TTTTACAGT-GC-TAAA
gi|89628 : tatatacttgattgcT--ATATATGATTGGGAGAAT----C----ATACATCT---A---ACAAAAC----AC-CTTTCATGAGCA----TTGGA--TC-CGCGG-AC-GATA---TTTAAATGATA-GAA-GTA-------G-----CA-AA-------AA--CA-----GTAGAA---CGAA-TTACCA-A-TTACA
gi|89636 : atataataaaatT--ATATATAATA------------T----ATACATCT---A---ACAAAAC----AC-CTCTCAGGAGCA----CTAGA--TC-CAAGA-GA-GATA---CAGAAATGGTA-TAA-A
gi|89637 : ATATGATAGGGAGAAT----C----ATACGTCT---A---ACAAAAA----AC-CTTTCAGGAGCA----CCGGA--TC-CGCGA-AG-GATA---CATAAATGGTA-GAC-ATA-------G-----TG-AC-------TA--CA-----GTAGAG---AGAA-TTGCCA-TTTTACAGT-GC-TCAAattaccattttacagaactgaa
gi|89638 : ATATGATAGGGAGAAT----C----ATACGTCT---A---ACAAAAA----AA-CTTTCAGGAGCA----CCGGA--TC-CGCGA-AG-GATA---CATAAATGGTA-GAC-ATA-------G-----TG-AC-------TA--CA-----GTAGAG---AGAA-TTGCCA-TTTTACAGT-GC-TCAA
gi|89639 : GATAGCGACAA----------ATA----T---A---ACAAAAC----AT-CTTTCGGAAGCA----CTGGA--TC-C-CGACAG-GATA---CATACATGACA-GTT-ATA-------C-----TACAA-------TA--CA-----AAAAAG---ACAA-TTGCCA-ATGCATAGT-GCTTAAA
gi|89640 : tGGGAAAAT----T----ATACGTCT---T---ATAA--C----AC-CTCTCAGGAACA----CTGGC--TA-CACGA-GT-GCTA---CATTAATAATA-AAA-ATG-------G-----TA-AA-------TA--GA-----GTAGAC---AGAA-TTGCCT-CTTTGCAGG-GCTTAAA
gi|89641 : AGAAT----C----ATACGTCT---A---ACAAAAC----AC-CTTTCAGGTGCA----CCGGA--TC-CGCGA-AG-GATA---CATAAATGGTA-GAA-ATATATATATA-----TA-TA-------TA--CA-----GAAGAG---AGAA-TTACCA-TTTTACAGT-GC-TAAA
gi|89642 : AAT----C----ATACATCT---A---A-AAATC----AC-GTT-CAGGAGTA----CTCGG--TC-C---A-AG-GAAAACCCATAGGTTAAA-GAA-ATA-------G-----TA-AA--------A--CATT---GTTGAG---ATAA-TTTTCA-TTTTACAGT-GC-TAAA
gi|89643 : AC----C----GTATGTTT---A---ACAAAGC----AC-CTTTCAGGAGCA----CTGGT--TC-CACGT-AT-AATA---CATAAATGATA-GAA-ATA-------A-----TG-AA-------TA--CA-----GCAGAG---AGAA-TTATCA-------AGT-GC-TAAA
gi|89644 : ----ATACGTCC---A---ACAAAAC----AC-CTTTCAGGAGCA----CCGGA--TC-TGCGA-AG-GAT
gi|89645 : TCT---A---ACAAAAA----AAACTTTCAGGAGCA----CTGGA--TC-CACAA-AG-GATA---CATTAATGATA-GAA-ACA-------GTTAAATT-AA-------TA--CA-----GTAGAG---AAAATTTACCA-TTT--CAGTGGT-TAAA
gi|89646 : AGCG----CTGGC--TT-CACGA-AC-AACA---CACAATTTATA-GAA-ATA-------G-----TA-AAAGTAAA-TA--CA-----GTAGAA---AGAG-TTACCA-TTTCACAGT-TC-TGAA
gi|89647 : A-AG-AGTA---CATAAATTATA-GAA-ATA-------G-----TA-AA-------TA--CA-----GCAGTG---AGAA-TTACCATCATTACAGT-GC-TAAA
gi|89648 : -GAA-CTA-------G-----TA-AA-------TA--CA-----GTAGAG---AGAA-TTACAA-TATAACAGT-GC-TAAA
gi|89649 : A-------CA--CA-----GTAGAG---AGAA-TTACCA-TTTTACAGT-GC-TAAA
Alignments
lowQualScore : 55 3333 5555 555 222 2222 1 2222 0 11 1 1 1 222 1 1 888888888 777777 3333333 11 44444 222 1 1 2 2
lowQualScore : .. .... .... ... ... .... . .... . .. . . . ... . . ......... ...... ....... .. ..... ... . . . .
lowQualScore : 22 0000 9999 000 333 8888 3 7777 3 88 3 2 2 333 2 2 444444444 333333 9999999 77 88888 333 3 4 9 9
consensus : ATAT--ATATATGATAGGGAGAAT----C----ATACGTCT---A---ACAAAAC----AC-CTTTCAGGAGCA----CCGGA--TC-CGCGA-AG-GATA---CATAAATGATA-GAA-ATA-------G-TA------AA-------TA--CA-----GTAGAG---AGAA-TTACCATT-TTACAGT-GC-TAAA
Reference ( family-609 ) : ATAT--ATATATGATAGGGAGAAT----C----ATACGTCT---A---ACAAAAC----AC-CTTTCAGGAGCA----CCGGA--TC-CGCGA-AG-GATA---CATAAATGATA-GAA-ATA-------G-TA------AA-------TA--CA-----GTAGAG---AGAA-TTACCATT-TTACAGT-GC-TAAA
gi|89616 : AT--ATATATGATAGGGAGAAT----C----ATACGTCT---A---ACAAAAC----AC-CTTTCAGGAGCA----CTGGA--TC-TGCGA-AG-GATA---CATAAATGGTA-GAA-ATA-------G-TA------AA-------TA--CA-----GTAGAG---AGAA-TTACCATT-TTACATT-GC-TAAA
gi|89617 : tatatataaATAT--ATATATGATAGGGAGAAC----C----ATATGTCT---A---ACAAAAC----AC-CTTTCAGGAGCA----CCAGA--TC-CGCGA-AG-GATA---CATAAATGGTA-GAA-ATG-------G-TG------AA-------TA--CA-----GTAGAG---AGAA-TTACCATT-TTACAGT-GC-TAAA
gi|89618 : tatataattACAT--ATATGTGATAGGGAGAAT----C----ATATGTCT---A---ACAAAAC----AC-CTTTCATGAGCA----CTGGA--TC-CGCGA-AG-GATA---CATAAATGATA-GAA-GTA---------TA------AA-------TA--CA-----GAAGAG---AGAA-TTACCACT-TTGCAGT-AC-TAAA
gi|89619 : tatatatATAT--ATATATGATAGAGGGAAT----C----ATACGTCC---T---ACAAAAC----AC-CTTTTAAGAGCA----CCGGA--TC-CGCGA-AT-GATA---CATAAATGGTA-GAA-ATA-------G-TG------AA-------TA--CA-----GAAGAG---AGAA-TTACCATT-TTACAGT-GG-TAAA
gi|89620 : tatatatAT--TTATGTGATGGGGAGAAT----C----GTAAGTCT---A---ACAAAAC----AC-CTTTCAGGAGCA----CTGGA--TC-CACGA-AG-GGTA---CATAAATGGTA-GAA-ATA-------G-TG------AA-------TA--CA-----GTAGAG---AGAA-TTACCATT-TTACAGT-GC-TAAA
gi|89621 : tatatacttgattgcATAG--ATATACGATAGGGAGAAT----C----ATAAGCCT---A---ACAAAAC----AC-TTTTCAGGAGCA----CCAGA--TC-TGTGA-AG-GATA---CATAAATAAGA-GAA-ATA-------G-TA------AA-------TA--TA-----GTAGAG---AGAA-TTACCATT-TTACAGT-GC-TAAA
gi|89622 : tatatatggtataACAT--ATATGTGATAGGGAAAAT----C----ATATGTCA---A---ACAAAAC----AT-CTTTCATGAGCC----CTGGA--TC-CGCGA-AG-GATA---CATAAATGATT-GAA-ATA-------A-TA------AA-------TA--AA-----GAAGAG---AGAA-TTACCATT-TTGCAGT-GC-TAAA
gi|89623 : tatgtatATATTCATGTACGATTGGAAGAAT----GTAAAACATGTCTT--A---ACAAAAC----AC-CTTTCAGAAGCA----CTGGA--TC-CACAA-AG-GATA---CGTAAATGATA-TAT-ATA---------TA------TA-------TA--TA-----
gi|89624 : tatgtATATTCATGTACGATTGGAAGAAT----GTAAAACATGTCTT--A---ACAAAAC----AC-CTTTCAGAAGCA----CTGGA--TC-CACAA-AG-GATA---CGTAAATGATA-TAT-ATA---------TA------TA-------TA--TA-----
gi|89625 : tatgtATAT--GTATATGAGTGGTAGAAG----T----ATACGTCTTACACGTACAAAAC----AC-ATTTCAGGAGCA----CTGGGCTTCACACAA-AA-AA-G---CATATATGATA-GAA-TGA-------GTTA------AA-------TATCCAGATGTGTAGAATATACAA-GTACCATT-TTACAGT-GT-TTAA
gi|89626 : tacacacATAT--ATATATACAAAGGAGAATAGAAC-----TACACCT---A---ACAAGAT-----C-CTTTCAATAGTA----TTGGA--T--CACGG-AGTGATA---CAAGGGTG-TG-AAG-GTA-------A-T-------AG-------TA--TG-----GGAGAG---ATAA-T
gi|89627 : tatatatATAT--ATATATGATAGGGAGAAC----C----ACATTTCT---A---ACAAAACAAACAC-CTTTCAGGAGCA----CCGGA--TC-CGCAA-AG-GATA---CATAAATGGTA-GAA-ATA-------G-TG------AA-------TA--CT-----GTAGAG---AGAA-TAACCTTT-TTACAGTGGT-TAAA
gi|89628 : atatatT--ATATATGATTGGGAGAAT----C----ATACATCT---A---ACAAAAC----AC-CTTTCATGAGCA----TTGGA--TC-CGCGG-AC-GATA---TTTAAATGATA-GAA-GTA-------G-CA------AA-------AA--CA-----GTAGAA---CGAA-TTACCA-A-TTACA
gi|89629 : atataataaaatATAT--ATATATGAT-GGGAGAAT----C----ATACGTTT---A---ACAAAAC----AC-CTTTTAGGAGTA----CTGGA--TT-CGCAA-AG-GATG---CATAAATGATA-GAA-ATA-------A-CA------AA-------TA--CA-----GTACAG---AGAA-TAACCATA-TAACAGT-A--TAAA
gi|89630 : tatatATGT--GTGTATGATAGGGTTAAT----T----ATATATCT---A---ACAAAAC----AT-CT--CAAGAGAA----CTAGA--TC-CGCGA-AG-GATA---CATAAATGATATGCATATA-------A-TA------AA-------
gi|89631 : atATAT--ATATATGATAGGGAGAAT----C----ATACGTCT---A---ACAAAAC----AC-TTTTCAGGAGTG----CCGGA--TC-CGCGA-AG-GATA---CATAAATGGTA-G----------------A------AA-------TA--CA-----GTAGAG---AGAA-TTACCATT-TT-CAGT-GC-TAAA
gi|89632 : tATAT--ATATATGATAGGGAGAAT----C----ATACAATT---A---ACAAAAC----AC-CTTTCAGGAGCA----CCGGA--TC-TGAGA-GG-GATG---CATAAATGATA-GAA-ATA-------G-TA------AA-------AA--CA-----GTAGAG---AGAA-TTACCATT-CAACAGT-GT-TAAA
gi|89633 : tATAT--ATATACGATAGGGAGAAT----C----ATACGTCT---A---ACAAAAC----AC-CTTTCAGGAGCA----CTGGA--TC-CGCGA-AG-GATA---CATAAATGGTA-GAA-ATA-------G-TG------AA-------TA--CA-----GTAGAG---AGAA-TTACTACT-TTACAGT-GC-TAAA
gi|89634 : TAT--ATATACAATATAAA-AAT----C----ATAAATTT---C---CTTAAAC----AG-CTATCAAGATCAGGAGCTAGA--TC-CACCA-GG-GACA---CATAAAATATA-GAA-AAA-------C-TA------AA-------AA--CA-----GAAAAG---AGAT-TTAATATT-TAACAGT-TC-TGAA
gi|89635 : T--ATATAT-ATAAGGAGAAT----C----ATATGTCT---A---ACAAAAC----AC-CTTTTAGGAGCA----CCGGA--TC-CGCGA-AG-GATA---CATAAATGATA-GAA-ATA-------G-TA------AATACAATGTA--CA-----GTAGAG---AGAA-TTGCCATT-TTACAGT-GC-TAAA
gi|89636 : T--ATATATAATA------------T----ATACATCT---A---ACAAAAC----AC-CTCTCAGGAGCA----CTAGA--TC-CAAGA-GA-GATA---CAGAAATGGTA-----------------TA------A------------------------------AA-TTACCATT-TTACAGA-AC-TGAA
gi|89637 : ATATGATAGGGAGAAT----C----ATACGTCT---A---ACAAAAA----AC-CTTTCAGGAGCA----CCGGA--TC-CGCGA-AG-GATA---CATAAATGGTA-GAC-ATA-------G-TG------AC-------TA--CA-----GTAGAG---AGAA-TTGCCATT-TTACAGT-GC-TCAA
gi|89638 : ATATGATAGGGAGAAT----C----ATACGTCT---A---ACAAAAA----AA-CTTTCAGGAGCA----CCGGA--TC-CGCGA-AG-GATA---CATAAATGGTA-GAC-ATA-------G-TG------AC-------TA--CA-----GTAGAG---AGAA-TTGCCATT-TTACAGT-GC-TCAA
gi|89639 : TGATAGCGACAA----------ATA----T---A---ACAAAAC----AT-CTTTCGGAAGCA----CTGGA--TC-C-CGACAG-GATA---CATACATGACA-GTT-ATA-------C-TAC-----AA-------TA--CA-----AAAAAG---ACAA-TTGCCAAT-GCATAGT-GCTTAAA
gi|89640 : GGGAAAAT----T----ATACGTCT---T---ATAA--C----AC-CTCTCAGGAACA----CTGGC--TA-CACGA-GT-GCTA---CATTAATAATA-AAA-ATG-------G-TA------AA-------TA--GA-----GTAGAC---AGAA-TTGCCTCT-TTGCAGG-GCTTAAA
gi|89641 : AGAAT----C----ATACGTCT---A---ACAAAAC----AC-CTTTCAGGTGCA----CCGGA--TC-CGCGA-AG-GATA---CATAAATGGTA-GAA-ATATATATATA-TA------TA-------TA--CA-----GAAGAG---AGAA-TTACCATT-TTACAGT-GC-TAAA
gi|89642 : AAT----C----ATACATCT---A---A-AAATC----AC-GTT-CAGGAGTA----CTCGG--TC-C---A-AG-GAAAACCCATAGGTTAAA-GAA-ATA-------G-TA------AA--------A--CATT---GTTGAG---ATAA-TTTTCATT-TTACAGT-GC-TAAA
gi|89643 : AC----C----GTATGTTT---A---ACAAAGC----AC-CTTTCAGGAGCA----CTGGT--TC-CACGT-AT-AATA---CATAAATGATA-GAA-ATA-------A-TG------AA-------TA--CA-----GCAGAG---AGAA-TTATCA-------AGT-GC-TAAA
gi|89644 : ----ATACGTCC---A---ACAAAAC----AC-CTTTCAGGAGCA----CCGGA--TC-TGCGA-AG-GAT
gi|89645 : TCT---A---ACAAAAA----AAACTTTCAGGAGCA----CTGGA--TC-CACAA-AG-GATA---CATTAATGATA-GAA-ACA-------GTTAAATT--AA-------TA--CA-----GTAGAG---AAAATTTACCATT-T--CAGTGGT-TAAA
gi|89646 : AGCG----CTGGC--TT-CACGA-AC-AACA---CACAATTTATA-GAA-ATA-------G-TAAAAGTAAA-------TA--CA-----GTAGAA---AGAG-TTACCATT-TCACAGT-TC-TGAA
gi|89647 : A-AG-AGTA---CATAAATTATA-GAA-ATA-------G-TA------AA-------TA--CA-----GCAGTG---AGAA-TTACCATCATTACAGT-GC-TAAA
gi|89648 : -GAA-CTA-------G-TA------AA-------TA--CA-----GTAGAG---AGAA-TTACAATA-TAACAGT-GC-TAAA
gi|89649 : -ATA---------TA------TA-------CA--CA-----GTAGAG---AGAA-TTACCATT-TTACAGT-GC-TAAA
Alignments
lowQualScore : 55 3333 5555 555 222 2222 1 2222 0 11 1 1 1 222 1 1 888888888 777777 3333333 11 44444 222 1 1 2 2
lowQualScore : .. .... .... ... ... .... . .... . .. . . . ... . . ......... ...... ....... .. ..... ... . . . .
lowQualScore : 22 0000 9999 000 333 8888 3 7777 3 88 3 2 2 333 2 2 444444444 333333 9999999 77 88888 333 3 4 9 9
consensus : ATAT--ATATATGATAGGGAGAAT----C----ATACGTCT---A---ACAAAAC----AC-CTTTCAGGAGCA----CCGGA--TC-CGCGA-AG-GATA---CATAAATGATA-GAA-ATA-------G-TA------AA-------TA--CA-----GTAGAG---AGAA-TTACCATT-TTACAGT-GC-TAAA
Reference ( family-609 ) : ATAT--ATATATGATAGGGAGAAT----C----ATACGTCT---A---ACAAAAC----AC-CTTTCAGGAGCA----CCGGA--TC-CGCGA-AG-GATA---CATAAATGATA-GAA-ATA-------G-TA------AA-------TA--CA-----GTAGAG---AGAA-TTACCATT-TTACAGT-GC-TAAA
gi|89616 : AT--ATATATGATAGGGAGAAT----C----ATACGTCT---A---ACAAAAC----AC-CTTTCAGGAGCA----CTGGA--TC-TGCGA-AG-GATA---CATAAATGGTA-GAA-ATA-------G-TA------AA-------TA--CA-----GTAGAG---AGAA-TTACCATT-TTACATT-GC-TAAA
gi|89617 : tatatataaATAT--ATATATGATAGGGAGAAC----C----ATATGTCT---A---ACAAAAC----AC-CTTTCAGGAGCA----CCAGA--TC-CGCGA-AG-GATA---CATAAATGGTA-GAA-ATG-------G-TG------AA-------TA--CA-----GTAGAG---AGAA-TTACCATT-TTACAGT-GC-TAAA
gi|89618 : tatataattACAT--ATATGTGATAGGGAGAAT----C----ATATGTCT---A---ACAAAAC----AC-CTTTCATGAGCA----CTGGA--TC-CGCGA-AG-GATA---CATAAATGATA-GAA-GTA---------TA------AA-------TA--CA-----GAAGAG---AGAA-TTACCACT-TTGCAGT-AC-TAAA
gi|89619 : tatatatATAT--ATATATGATAGAGGGAAT----C----ATACGTCC---T---ACAAAAC----AC-CTTTTAAGAGCA----CCGGA--TC-CGCGA-AT-GATA---CATAAATGGTA-GAA-ATA-------G-TG------AA-------TA--CA-----GAAGAG---AGAA-TTACCATT-TTACAGT-GG-TAAA
gi|89620 : tatatatAT--TTATGTGATGGGGAGAAT----C----GTAAGTCT---A---ACAAAAC----AC-CTTTCAGGAGCA----CTGGA--TC-CACGA-AG-GGTA---CATAAATGGTA-GAA-ATA-------G-TG------AA-------TA--CA-----GTAGAG---AGAA-TTACCATT-TTACAGT-GC-TAAA
gi|89621 : tatatacttgattgcATAG--ATATACGATAGGGAGAAT----C----ATAAGCCT---A---ACAAAAC----AC-TTTTCAGGAGCA----CCAGA--TC-TGTGA-AG-GATA---CATAAATAAGA-GAA-ATA-------G-TA------AA-------TA--TA-----GTAGAG---AGAA-TTACCATT-TTACAGT-GC-TAAA
gi|89622 : tatatatggtataACAT--ATATGTGATAGGGAAAAT----C----ATATGTCA---A---ACAAAAC----AT-CTTTCATGAGCC----CTGGA--TC-CGCGA-AG-GATA---CATAAATGATT-GAA-ATA-------A-TA------AA-------TA--AA-----GAAGAG---AGAA-TTACCATT-TTGCAGT-GC-TAAA
gi|89623 : tatgtatATATTCATGTACGATTGGAAGAAT----GTAAAACATGTCTT--A---ACAAAAC----AC-CTTTCAGAAGCA----CTGGA--TC-CACAA-AG-GATA---CGTAAATGATA-TAT-ATA---------TA------TA-------TA--TA-----
gi|89624 : tatgtATATTCATGTACGATTGGAAGAAT----GTAAAACATGTCTT--A---ACAAAAC----AC-CTTTCAGAAGCA----CTGGA--TC-CACAA-AG-GATA---CGTAAATGATA-TAT-ATA---------TA------TA-------TA--TA-----
gi|89625 : tatgtATAT--GTATATGAGTGGTAGAAG----T----ATACGTCTTACACGTACAAAAC----AC-ATTTCAGGAGCA----CTGGGCTTCACACAA-AA-AA-G---CATATATGATA-GAA-TGA-------GTTA------AA-------TATCCAGATGTGTAGAATATACAA-GTACCATT-TTACAGT-GT-TTAA
gi|89626 : tacacacATAT--ATATATACAAAGGAGAATAGAAC-----TACACCT---A---ACAAGAT-----C-CTTTCAATAGTA----TTGGA--T--CACGG-AGTGATA---CAAGGGTG-TG-AAG-GTA-------A-T-------AG-------TA--TG-----GGAGAG---ATAA-T
gi|89627 : tatatatATAT--ATATATGATAGGGAGAAC----C----ACATTTCT---A---ACAAAACAAACAC-CTTTCAGGAGCA----CCGGA--TC-CGCAA-AG-GATA---CATAAATGGTA-GAA-ATA-------G-TG------AA-------TA--CT-----GTAGAG---AGAA-TAACCTTT-TTACAGTGGT-TAAA
gi|89628 : atatatT--ATATATGATTGGGAGAAT----C----ATACATCT---A---ACAAAAC----AC-CTTTCATGAGCA----TTGGA--TC-CGCGG-AC-GATA---TTTAAATGATA-GAA-GTA-------G-CA------AA-------AA--CA-----GTAGAA---CGAA-TTACCA-A-TTACA
gi|89629 : atataataaaatATAT--ATATATGAT-GGGAGAAT----C----ATACGTTT---A---ACAAAAC----AC-CTTTTAGGAGTA----CTGGA--TT-CGCAA-AG-GATG---CATAAATGATA-GAA-ATA-------A-CA------AA-------TA--CA-----GTACAG---AGAA-TAACCATA-TAACAGT-A--TAAA
gi|89630 : tatatATGT--GTGTATGATAGGGTTAAT----T----ATATATCT---A---ACAAAAC----AT-CT--CAAGAGAA----CTAGA--TC-CGCGA-AG-GATA---CATAAATGATATGCATATA-------A-TA------AA-------
gi|89631 : atATAT--ATATATGATAGGGAGAAT----C----ATACGTCT---A---ACAAAAC----AC-TTTTCAGGAGTG----CCGGA--TC-CGCGA-AG-GATA---CATAAATGGTA-G----------------A------AA-------TA--CA-----GTAGAG---AGAA-TTACCATT-TT-CAGT-GC-TAAA
gi|89632 : tATAT--ATATATGATAGGGAGAAT----C----ATACAATT---A---ACAAAAC----AC-CTTTCAGGAGCA----CCGGA--TC-TGAGA-GG-GATG---CATAAATGATA-GAA-ATA-------G-TA------AA-------AA--CA-----GTAGAG---AGAA-TTACCATT-CAACAGT-GT-TAAA
gi|89633 : tATAT--ATATACGATAGGGAGAAT----C----ATACGTCT---A---ACAAAAC----AC-CTTTCAGGAGCA----CTGGA--TC-CGCGA-AG-GATA---CATAAATGGTA-GAA-ATA-------G-TG------AA-------TA--CA-----GTAGAG---AGAA-TTACTACT-TTACAGT-GC-TAAA
gi|89634 : TAT--ATATACAATATAAA-AAT----C----ATAAATTT---C---CTTAAAC----AG-CTATCAAGATCAGGAGCTAGA--TC-CACCA-GG-GACA---CATAAAATATA-GAA-AAA-------C-TA------AA-------AA--CA-----GAAAAG---AGAT-TTAATATT-TAACAGT-TC-TGAA
gi|89635 : T--ATATAT-ATAAGGAGAAT----C----ATATGTCT---A---ACAAAAC----AC-CTTTTAGGAGCA----CCGGA--TC-CGCGA-AG-GATA---CATAAATGATA-GAA-ATA-------G-TA------AATACAATGTA--CA-----GTAGAG---AGAA-TTGCCATT-TTACAGT-GC-TAAA
gi|89636 : T--ATATATAATA------------T----ATACATCT---A---ACAAAAC----AC-CTCTCAGGAGCA----CTAGA--TC-CAAGA-GA-GATA---CAGAAATGGTA-----------------TA------A------------------------------AA-TTACCATT-TTACAGA-AC-TGAA
gi|89637 : ATATGATAGGGAGAAT----C----ATACGTCT---A---ACAAAAA----AC-CTTTCAGGAGCA----CCGGA--TC-CGCGA-AG-GATA---CATAAATGGTA-GAC-ATA-------G-TG------AC-------TA--CA-----GTAGAG---AGAA-TTGCCATT-TTACAGT-GC-TCAA
gi|89638 : ATATGATAGGGAGAAT----C----ATACGTCT---A---ACAAAAA----AA-CTTTCAGGAGCA----CCGGA--TC-CGCGA-AG-GATA---CATAAATGGTA-GAC-ATA-------G-TG------AC-------TA--CA-----GTAGAG---AGAA-TTGCCATT-TTACAGT-GC-TCAA
gi|89639 : TGATAGCGACAA----------ATA----T---A---ACAAAAC----AT-CTTTCGGAAGCA----CTGGA--TC-C-CGACAG-GATA---CATACATGACA-GTT-ATA-------C-TAC-----AA-------TA--CA-----AAAAAG---ACAA-TTGCCAAT-GCATAGT-GCTTAAA
gi|89640 : GGGAAAAT----T----ATACGTCT---T---ATAA--C----AC-CTCTCAGGAACA----CTGGC--TA-CACGA-GT-GCTA---CATTAATAATA-AAA-ATG-------G-TA------AA-------TA--GA-----GTAGAC---AGAA-TTGCCTCT-TTGCAGG-GCTTAAA
gi|89641 : AGAAT----C----ATACGTCT---A---ACAAAAC----AC-CTTTCAGGTGCA----CCGGA--TC-CGCGA-AG-GATA---CATAAATGGTA-GAA-ATATATATATA-TA------TA-------TA--CA-----GAAGAG---AGAA-TTACCATT-TTACAGT-GC-TAAA
gi|89642 : AAT----C----ATACATCT---A---A-AAATC----AC-GTT-CAGGAGTA----CTCGG--TC-C---A-AG-GAAAACCCATAGGTTAAA-GAA-ATA-------G-TA------AA--------A--CATT---GTTGAG---ATAA-TTTTCATT-TTACAGT-GC-TAAA
gi|89643 : AC----C----GTATGTTT---A---ACAAAGC----AC-CTTTCAGGAGCA----CTGGT--TC-CACGT-AT-AATA---CATAAATGATA-GAA-ATA-------A-TG------AA-------TA--CA-----GCAGAG---AGAA-TTATCA-------AGT-GC-TAAA
gi|89644 : ----ATACGTCC---A---ACAAAAC----AC-CTTTCAGGAGCA----CCGGA--TC-TGCGA-AG-GAT
gi|89645 : TCT---A---ACAAAAA----AAACTTTCAGGAGCA----CTGGA--TC-CACAA-AG-GATA---CATTAATGATA-GAA-ACA-------GTTAAATT--AA-------TA--CA-----GTAGAG---AAAATTTACCATT-T--CAGTGGT-TAAA
gi|89646 : AGCG----CTGGC--TT-CACGA-AC-AACA---CACAATTTATA-GAA-ATA-------G-TAAAAGTAAA-------TA--CA-----GTAGAA---AGAG-TTACCATT-TCACAGT-TC-TGAA
gi|89647 : A-AG-AGTA---CATAAATTATA-GAA-ATA-------G-TA------AA-------TA--CA-----GCAGTG---AGAA-TTACCATCATTACAGT-GC-TAAA
gi|89648 : -GAA-CTA-------G-TA------AA-------TA--CA-----GTAGAG---AGAA-TTACAATA-TAACAGT-GC-TAAA
gi|89649 : -ATA---------TA------TA-------CA--CA-----GTAGAG---AGAA-TTACCATT-TTACAGT-GC-TAAA
blockSeqs : TC AGAA TAAA TAC CGT AAAC A GGAG CT A C T ACC T T TATATATA AAAGTA TACAATG TC GATGT TAT T A G T
blockSeqs : TC . TAAA T . . . . . . . . . . . GT AATT . . TT . . . G T
blockSeqs : . . . T . . . . . . . . . . . GT C . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqCons :
originalCons : ATAT--ATATATGATAGGGAGAAT----C----ATACGTCT---A---ACAAAAC----AC-CTTTCAGGAGCA----CCGGA--TC-CGCGA-AG-GATA---CATAAATGATA-GAA-ATA-------G-TA------AA-------TA--CA-----GTAGAG---AGAA-TTACCATT-TTACAGT-GC-TAAA
finalCons : ATAT--ATATATGATAGGGAGAAT----C----ATACGTCT---A---ACAAAAC----AC-CTTTCAGGAGCA----CCGGA--TC-CGCGA-AG-GATA---CATAAATGATA-GAA-ATA-------G-TA------AA-------TA--CA-----GTAGAG---AGAA-TTACCATT-TTACAGT-GC-TAAA
Alignments
lowQualScore : 55 3333 5555 555 222 2222 1 2222 0 11 1 1 1 222 1 1 888888888 777777 3333333 11 44444 222 1 1 2 2
lowQualScore : .. .... .... ... ... .... . .... . .. . . . ... . . ......... ...... ....... .. ..... ... . . . .
lowQualScore : 22 0000 9999 000 333 8888 3 7777 3 88 3 2 2 333 2 2 444444444 333333 9999999 77 88888 333 3 4 9 9
consensus : ATAT--ATATATGATAGGGAGAAT----C----ATACGTCT---A---ACAAAAC----AC-CTTTCAGGAGCA----CCGGA--TC-CGCGA-AG-GATA---CATAAATGATA-GAA-ATA-------G-TA------AA-------TA--CA-----GTAGAG---AGAA-TTACCATT-TTACAGT-GC-TAAA
Reference ( family-609 ) : ATAT--ATATATGATAGGGAGAAT----C----ATACGTCT---A---ACAAAAC----AC-CTTTCAGGAGCA----CCGGA--TC-CGCGA-AG-GATA---CATAAATGATA-GAA-ATA-------G-TA------AA-------TA--CA-----GTAGAG---AGAA-TTACCATT-TTACAGT-GC-TAAA
gi|89616 : AT--ATATATGATAGGGAGAAT----C----ATACGTCT---A---ACAAAAC----AC-CTTTCAGGAGCA----CTGGA--TC-TGCGA-AG-GATA---CATAAATGGTA-GAA-ATA-------G-TA------AA-------TA--CA-----GTAGAG---AGAA-TTACCATT-TTACATT-GC-TAAA
gi|89617 : tatatataaATAT--ATATATGATAGGGAGAAC----C----ATATGTCT---A---ACAAAAC----AC-CTTTCAGGAGCA----CCAGA--TC-CGCGA-AG-GATA---CATAAATGGTA-GAA-ATG-------G-TG------AA-------TA--CA-----GTAGAG---AGAA-TTACCATT-TTACAGT-GC-TAAA
gi|89618 : tatataattACAT--ATATGTGATAGGGAGAAT----C----ATATGTCT---A---ACAAAAC----AC-CTTTCATGAGCA----CTGGA--TC-CGCGA-AG-GATA---CATAAATGATA-GAA-GTA---------TA------AA-------TA--CA-----GAAGAG---AGAA-TTACCACT-TTGCAGT-AC-TAAA
gi|89619 : tatatatATAT--ATATATGATAGAGGGAAT----C----ATACGTCC---T---ACAAAAC----AC-CTTTTAAGAGCA----CCGGA--TC-CGCGA-AT-GATA---CATAAATGGTA-GAA-ATA-------G-TG------AA-------TA--CA-----GAAGAG---AGAA-TTACCATT-TTACAGT-GG-TAAA
gi|89620 : tatatatAT--TTATGTGATGGGGAGAAT----C----GTAAGTCT---A---ACAAAAC----AC-CTTTCAGGAGCA----CTGGA--TC-CACGA-AG-GGTA---CATAAATGGTA-GAA-ATA-------G-TG------AA-------TA--CA-----GTAGAG---AGAA-TTACCATT-TTACAGT-GC-TAAA
gi|89621 : tatatacttgattgcATAG--ATATACGATAGGGAGAAT----C----ATAAGCCT---A---ACAAAAC----AC-TTTTCAGGAGCA----CCAGA--TC-TGTGA-AG-GATA---CATAAATAAGA-GAA-ATA-------G-TA------AA-------TA--TA-----GTAGAG---AGAA-TTACCATT-TTACAGT-GC-TAAA
gi|89622 : tatatatggtataACAT--ATATGTGATAGGGAAAAT----C----ATATGTCA---A---ACAAAAC----AT-CTTTCATGAGCC----CTGGA--TC-CGCGA-AG-GATA---CATAAATGATT-GAA-ATA-------A-TA------AA-------TA--AA-----GAAGAG---AGAA-TTACCATT-TTGCAGT-GC-TAAA
gi|89623 : tatgtatATATTCATGTACGATTGGAAGAAT----GTAAAACATGTCTT--A---ACAAAAC----AC-CTTTCAGAAGCA----CTGGA--TC-CACAA-AG-GATA---CGTAAATGATA-TAT-ATA---------TA------TA-------TA--TA-----
gi|89624 : tatgtATATTCATGTACGATTGGAAGAAT----GTAAAACATGTCTT--A---ACAAAAC----AC-CTTTCAGAAGCA----CTGGA--TC-CACAA-AG-GATA---CGTAAATGATA-TAT-ATA---------TA------TA-------TA--TA-----
gi|89625 : tatgtATAT--GTATATGAGTGGTAGAAG----T----ATACGTCTTACACGTACAAAAC----AC-ATTTCAGGAGCA----CTGGGCTTCACACAA-AA-AA-G---CATATATGATA-GAA-TGA-------GTTA------AA-------TATCCAGATGTGTAGAATATACAA-GTACCATT-TTACAGT-GT-TTAA
gi|89626 : tacacacATAT--ATATATACAAAGGAGAATAGAAC-----TACACCT---A---ACAAGAT-----C-CTTTCAATAGTA----TTGGA--T--CACGG-AGTGATA---CAAGGGTG-TG-AAG-GTA-------A-T-------AG-------TA--TG-----GGAGAG---ATAA-T
gi|89627 : tatatatATAT--ATATATGATAGGGAGAAC----C----ACATTTCT---A---ACAAAACAAACAC-CTTTCAGGAGCA----CCGGA--TC-CGCAA-AG-GATA---CATAAATGGTA-GAA-ATA-------G-TG------AA-------TA--CT-----GTAGAG---AGAA-TAACCTTT-TTACAGTGGT-TAAA
gi|89628 : atatatT--ATATATGATTGGGAGAAT----C----ATACATCT---A---ACAAAAC----AC-CTTTCATGAGCA----TTGGA--TC-CGCGG-AC-GATA---TTTAAATGATA-GAA-GTA-------G-CA------AA-------AA--CA-----GTAGAA---CGAA-TTACCA-A-TTACA
gi|89629 : atataataaaatATAT--ATATATGAT-GGGAGAAT----C----ATACGTTT---A---ACAAAAC----AC-CTTTTAGGAGTA----CTGGA--TT-CGCAA-AG-GATG---CATAAATGATA-GAA-ATA-------A-CA------AA-------TA--CA-----GTACAG---AGAA-TAACCATA-TAACAGT-A--TAAA
gi|89630 : tatatATGT--GTGTATGATAGGGTTAAT----T----ATATATCT---A---ACAAAAC----AT-CT--CAAGAGAA----CTAGA--TC-CGCGA-AG-GATA---CATAAATGATATGCATATA-------A-TA------AA-------
gi|89631 : atATAT--ATATATGATAGGGAGAAT----C----ATACGTCT---A---ACAAAAC----AC-TTTTCAGGAGTG----CCGGA--TC-CGCGA-AG-GATA---CATAAATGGTA-G----------------A------AA-------TA--CA-----GTAGAG---AGAA-TTACCATT-TT-CAGT-GC-TAAA
gi|89632 : tATAT--ATATATGATAGGGAGAAT----C----ATACAATT---A---ACAAAAC----AC-CTTTCAGGAGCA----CCGGA--TC-TGAGA-GG-GATG---CATAAATGATA-GAA-ATA-------G-TA------AA-------AA--CA-----GTAGAG---AGAA-TTACCATT-CAACAGT-GT-TAAA
gi|89633 : tATAT--ATATACGATAGGGAGAAT----C----ATACGTCT---A---ACAAAAC----AC-CTTTCAGGAGCA----CTGGA--TC-CGCGA-AG-GATA---CATAAATGGTA-GAA-ATA-------G-TG------AA-------TA--CA-----GTAGAG---AGAA-TTACTACT-TTACAGT-GC-TAAA
gi|89634 : TAT--ATATACAATATAAA-AAT----C----ATAAATTT---C---CTTAAAC----AG-CTATCAAGATCAGGAGCTAGA--TC-CACCA-GG-GACA---CATAAAATATA-GAA-AAA-------C-TA------AA-------AA--CA-----GAAAAG---AGAT-TTAATATT-TAACAGT-TC-TGAA
gi|89635 : T--ATATAT-ATAAGGAGAAT----C----ATATGTCT---A---ACAAAAC----AC-CTTTTAGGAGCA----CCGGA--TC-CGCGA-AG-GATA---CATAAATGATA-GAA-ATA-------G-TA------AATACAATGTA--CA-----GTAGAG---AGAA-TTGCCATT-TTACAGT-GC-TAAA
gi|89636 : T--ATATATAATA------------T----ATACATCT---A---ACAAAAC----AC-CTCTCAGGAGCA----CTAGA--TC-CAAGA-GA-GATA---CAGAAATGGTA-----------------TA------A------------------------------AA-TTACCATT-TTACAGA-AC-TGAA
gi|89637 : ATATGATAGGGAGAAT----C----ATACGTCT---A---ACAAAAA----AC-CTTTCAGGAGCA----CCGGA--TC-CGCGA-AG-GATA---CATAAATGGTA-GAC-ATA-------G-TG------AC-------TA--CA-----GTAGAG---AGAA-TTGCCATT-TTACAGT-GC-TCAA
gi|89638 : ATATGATAGGGAGAAT----C----ATACGTCT---A---ACAAAAA----AA-CTTTCAGGAGCA----CCGGA--TC-CGCGA-AG-GATA---CATAAATGGTA-GAC-ATA-------G-TG------AC-------TA--CA-----GTAGAG---AGAA-TTGCCATT-TTACAGT-GC-TCAA
gi|89639 : TGATAGCGACAA----------ATA----T---A---ACAAAAC----AT-CTTTCGGAAGCA----CTGGA--TC-C-CGACAG-GATA---CATACATGACA-GTT-ATA-------C-TAC-----AA-------TA--CA-----AAAAAG---ACAA-TTGCCAAT-GCATAGT-GCTTAAA
gi|89640 : GGGAAAAT----T----ATACGTCT---T---ATAA--C----AC-CTCTCAGGAACA----CTGGC--TA-CACGA-GT-GCTA---CATTAATAATA-AAA-ATG-------G-TA------AA-------TA--GA-----GTAGAC---AGAA-TTGCCTCT-TTGCAGG-GCTTAAA
gi|89641 : AGAAT----C----ATACGTCT---A---ACAAAAC----AC-CTTTCAGGTGCA----CCGGA--TC-CGCGA-AG-GATA---CATAAATGGTA-GAA-ATATATATATA-TA------TA-------TA--CA-----GAAGAG---AGAA-TTACCATT-TTACAGT-GC-TAAA
gi|89642 : AAT----C----ATACATCT---A---A-AAATC----AC-GTT-CAGGAGTA----CTCGG--TC-C---A-AG-GAAAACCCATAGGTTAAA-GAA-ATA-------G-TA------AA--------A--CATT---GTTGAG---ATAA-TTTTCATT-TTACAGT-GC-TAAA
gi|89643 : AC----C----GTATGTTT---A---ACAAAGC----AC-CTTTCAGGAGCA----CTGGT--TC-CACGT-AT-AATA---CATAAATGATA-GAA-ATA-------A-TG------AA-------TA--CA-----GCAGAG---AGAA-TTATCA-------AGT-GC-TAAA
gi|89644 : ----ATACGTCC---A---ACAAAAC----AC-CTTTCAGGAGCA----CCGGA--TC-TGCGA-AG-GAT
gi|89645 : TCT---A---ACAAAAA----AAACTTTCAGGAGCA----CTGGA--TC-CACAA-AG-GATA---CATTAATGATA-GAA-ACA-------GTTAAATT--AA-------TA--CA-----GTAGAG---AAAATTTACCATT-T--CAGTGGT-TAAA
gi|89646 : AGCG----CTGGC--TT-CACGA-AC-AACA---CACAATTTATA-GAA-ATA-------G-TAAAAGTAAA-------TA--CA-----GTAGAA---AGAG-TTACCATT-TCACAGT-TC-TGAA
gi|89647 : A-AG-AGTA---CATAAATTATA-GAA-ATA-------G-TA------AA-------TA--CA-----GCAGTG---AGAA-TTACCATCATTACAGT-GC-TAAA
gi|89648 : -GAA-CTA-------G-TA------AA-------TA--CA-----GTAGAG---AGAA-TTACAATA-TAACAGT-GC-TAAA
gi|89649 : -ATA---------TA------TA-------CA--CA-----GTAGAG---AGAA-TTACCATT-TTACAGT-GC-TAAA