lowQualScore : 2222222 111 11 111 22 11 111 111111 11111111 111111111 111 1 11111111 1111111 11 1111111111
lowQualScore : 0 3333333 5 3 111 5 555 2 33 5 33 8888 2 8888 66666 77 999 88888 666666 11 33 5 88 2 4 8888888 1 666 33 777 22 00 2 1 2 66 444 5 2 8 4 000 2 000000 3 1 5 4 1 1 1 1 2 777777 33 11 99999999 1 333333333 1 9999 0 44 33 333 2 4 8888888 3 11 44 999 33 0 3 11 1 00000000 1 888 2222 11 1 5555555 2 2 1 4 8 1 222 2 1 22 1111111111 9 3 1 2 5 1
lowQualScore : . ....... . . ... . ... . .. . .. .... . .... ..... .. ... ..... ...... .. .. . .. . . ....... . ... .. ... .. .. . . . .. ... . . . . ... . ...... . . . . . . . . . ...... .. .. ........ . ......... . .... . .. .. ... . . ....... . .. .. ... .. . . .. . ........ . ... .... .. . ....... . . . . . . ... . . .. .......... . . . . . .
lowQualScore : 2 5555555 4 6 777 0 000 9 99 7 77 7777 7 0000 77777 33 333 33333 999999 11 77 3 22 7 5 1111111 5 999 44 777 44 22 5 4 1 99 444 0 4 7 2 555 0 777777 2 6 4 7 3 3 2 2 0 222222 33 77 11111111 2 666666666 3 1111 8 99 11 999 9 8 8888888 5 88 88 333 22 5 9 88 3 66666666 6 666 8888 88 3 8888888 9 7 4 0 6 4 555 4 6 33 1111111111 2 1 5 5 4 9
consensus : TTTTTATTTNACT--TAGTT-GT---TTAGTTGANT---A-TT--TTT-AT--T---TGCTA-ATATTN---ATGC-----AGAT--TTT---ATATG-A-GACTTT--CTTTGATGACTAAAA-GT--TGACGATTAATT-ATTAAGAN-TTTAA-TTATTT-------TAC---TC--TACCTT-G-TGCAGCCAAATGATGAGTTAAAA-CAGTNGTGT-TGAGTGTAT--AA---GTG-TTACTATGG-TA--GT-TTACTATATG------TAAT-AC-CNATATGT-TAG-GCCAGACA-C-TTTTGCT----TATA--GCGCAAATAAATT--TGCT---NGCGGTA-T---C-A-N-AA-GTG---TCCGACCCA--ACT---TGAACCTTCAA-CAGAA-N-T--GATTTCTATT--GA--TTGTA--T--ATCTGTGCACACTA--A-TTGTGC-T-----CGGTTAC--NATGGTA---AAATT--T-TATT--T---GTAAG-ACAAT-ATCGTTA-G-CAA---CCGTGTATACCGCGTAC---CAA----CAGTAATTGTCAATA-TAAG-AAT-ATCAACAAACTANAGT-ATGCCGTAAAAC
Reference ( gi|118181 ) : TTTTTATTTTACT--TAGCT-GT---TTAGTTGAAT---A-TT--TTT-AT--T---TGCTA-ATATTG---ATGC-----AGAT--TTT---ATATG-A-GACTTT--CTTTGATGACTAAAA-GT--TGACGATTAATT-ATTAAGAT-TTTAA-TCATTT-------TAC---TC--TACCTT-T-TGCAGCCAAATGATGAGTTAAAG-CAGTGGTGT-TGAGTGTAT--AA---GTG-TTATTTTGG-TA--GT-TTACTATATG------TAAT-AC-CTACATGT-TAG-GCCAGACA-C-TTTTGCT----TGTA--GCGCAAATAAATT--TGCT---AGCGGTA-T---C-A-T-AA-GTG---TCCGACTCA--ACT---TGAACCTTCAA-CAGGA-T-T--GATTTCTGTT--GA--TTGTA--T--ATCTGTACCCACTA--A-TTGTGC-T-----CGGTTGC--TATGGTA---AAATT--T-TATT--T---GTAAG-ACAAT-ATCGTTA-G-CAA---CCGTGTATACGACATAC---AAA----CAGTAATTGTCAATA-TAAG-AAT-ATCAACAAATTAGAGT-ATGCCGTAAAAC
gi|118187 : TTTTTAATTTAAC--TAGTT-AT---TTAGTTGAAT---A-TT--TTTTAT--T---TGCTA-ATATTG---ATGC-----AGAC--TTT---ATATG-G-GACTTT--CTTTGATGACCAAAAAGT--TGACGATTATTT-ATTAAGAT-TTTAA-TTATTT-------TAC---TC--TACCTT-G-TGCAGCCAAATGATGAGTTAAAA-TAGTAGTGT-TGAATGTAT--AA---GTG-TTATTATAG-TA--CT-TTACTATATG------TAAT-AC-CAATATGT-TAG-GCCAGACA-C-TTTTGCT----TATA--GTGCAAATAAATT--TGCT---AATGGTA-T---C-A-T-AA-GTG---TCGGACTCA--ACT---TGAACCCTCAA-CAGGA-A-T--GATTTCTGTT--GA--TTGTA--T--ATCTGTGCACACTA--G-TTGTGC-T-----CAGTTGC--TATGGTA---AAATT--T-TGTT--T---GTAAG-ACAAT-ATCGTTG-G-CAA---CCGTGTATACCACATAC---AAA----CAGTAATTGTCAATA-TAAG-AAT-ATCAACAAAGTAGAGT-ATGCCATAAAAC
gi|118189 : TTTTTAATTTAAC--TAGTT-GT---TTAGTTGAAT---A-TT--TTTTAT--T---TGCTA-GTATTG---ATGC-----AGAC--TTT---ATATG-G-GACTTT--CTTTGATGACTAAAAAGT--ATACGATTAATT-ATTAAGAT-TTTAA-TTATTT-------TAC---TC--TACCTT-T-TGCAGCCAAATGATGAGTTAAAA-TAGTAGTGT-TGAGTGTAT--AA---GTG-TTATTATGG-TA--CT-TTACTATATG------TAAT-AC-CTATATGT-TAG-GCCAGACA-C-TTTTGCT----TATA--GCGCAAATAAATT--TCCT---TGTGATA-T---C-A-T-AA-GTG---TCCGAC------------------TCAA-CAGGA-C-T--GATTTCTGTT--AA--TTGTA--T--ATCTGTGAACACTA--A-TTGTGC-T-----CAGTTGC--TATGGTA---AAATT--T-TATT--T---GTAAG-ATAAT-ATCGTTA-G-CAA---CCGTGTACACCACATAC---AAA----CAGTAACTGTCAATA-TAAG-AAT-ATCAACAAACTAGAGT-ATGCCGTAAAAC
gi|118184 : TTCTTTTTTAACTAGTAGTT-TTAAATTAGTTGATT---A-TT--TCA-AT--A----ACTA-ATATTT---ATGC-----AGAT--TTT---ATA---A-GA-------------GACTAAAA-AT--TGGCAATTAATT-ATTAAGAA-TTTAAATCTTTT-------T-C---TT--TACCTTGTGTGCAGCCAAGTGATGAGTTAAA--CAGTTATGT-TGTGTAGAT--GA---ATG-TTGCTTTGG-TA--AT-TTACTATATG------TAAT-AC-CTATATGT-CAG-GCCAGACA-C-TTTCGCT----TAAA--GCGCAAATACATT--TGCT---AATGGTA-T---C-A-A-AA-GTA---TGCGACTCA--ACC---TGAACCTTCAA-CAGAA-A-T--GATTTCTATT--GA--TTGTA--T--GTCTGTGCACACTA--A-TTGTGC-T-----CGATT--------GTA---AAATT--T-TATT---------AA-ACAAT-ATCGTTA-G-CAA---CCGTGTATACCACATAC---CAA----CAGTAATTGTCAATA-TAAG-AAT-ATCAATAAACTAGAGT-ATGCCGCAAAAC
gi|118182 : TTTTTATTG-ACT---AGTA-GT---TTAGGTGATT---A-TT--TTA-AT--T----ACTA-ATATTT---ATGC-----AGAT--ATT---ATATA-G-GGCGCA--CTTCAATGATTAAAA-AT--TGACGACTAATT-ATTAAGAAATTTAG-TTATTT-------TTC---TC--TATCTT-G-TGCAGCCAAGTGATAAGTTAAA--CAGTT-TATCTGTGTAGAT--TA---ATA-TTACTATGG-TA--AT-T-ACTATAAG------TAAT-AC-CTATATGT-TAG-GCCAGACA-C-TTTCGCT----TATA--GCGCAAATAAATT--AGCA---GATGGTA-T---C-A-A-AA-GTA---TCTGTCTCA--ACC---TGAACCTTCAA-CAGAA-A-T--GATTTCTATT--GA--CTGTA--T--ATCTGTGCACACTA--A-TTGTGC-T-----CAGTTGC--TATGGTA---AAATT--T-TATT--T---GTTAG-ACAAT-ATTGTTA-G-CAA---CCACCAATACCACATAC---CAA----CAGTAATTGTCAATA-TAAG-ACT-ATCAACAAACTAGAAT-ATGCTGTAAAAC
gi|118183 : tTTTTTTTTTGACT----ACTAGT---TTAGTTGATT---A-TT--TTA-AT--T----ACTA-ATATTT---ATGC-----AGAT--TTT---ATATA-A-GGCATT--CTTCGATAACAAAAA-AT---GATGATTAATT-TTTAAGAA-TTTAA-TTATTT-------TTC---AC--TACCTT-G-TGCAGACAAGTGATGAGTTAAA--CAGTTATTT-TGTGTGAAT--AA---ATG-TAACTATGG-TA--AT-TTACTATATG------TAAT-AC-CTATATGT-TAG-GCCAGACA-C-TTTTGCT----AATA--GCGCAAATAAATT--TGCT---AATTGTA-T---C-A-A-AA-GTA---TCCTACTCA--ACC---TGAACTTTCAA-CAGAA-A-T--GATTTCTATT--GA--ATGTT--T--ATCTGTGCACACTC--G-TTGTGG-T-----CGGTTGC--TATGGTA---GAATT--T-TATT--T---GTTAG-ACAAT-ATCGTTA-G-CAA---CCGTGTATACCTCATAC---CAA----CAGTAATTGTCAATA-TAAG-AAT-
gi|118185 : TTTTTACTT-AAT--CAGTT-GT---TTAAATAGTT---A-TT--TTT-AA--T---TGCTT-ATATTG---ATGC-----AGAC--TTT---AT--G-C-GATTTA--CTTCAAT-ATTCAA--GTACTAACGTTTAATT-ATTGAAAC-TCCAG-GCATTC-------TAC---TC--TACCTT-G-TGCAGCCAAAATATGATTTAAAAATATTAGTAC-CGATTGTAC--TA---GCA-TTACTATGG-TA-----------TGTG------TAGA-AC-CTATATAT-TAG-GCCAGACG-C-TTTTGCT----TATA--GCGCAAATAAATT--TGCT---TGAGATA-T---C-A-T-AA-GCG---TCCGACCCA--ACT---TGAACCCTCAA-CAGGA-A-T--GATTCCCGCT--GA--TTGTT--T--ATCTGTGCACACTA--A-TTGTGC-T-----CAGTTGC--TATGGTA---ATATT--T-TATT--T---GTATG-ACAGT-ACCGTTA-G-CAA---CCGTATATACCACATAC---AGA----GAGTAATTGTCAATA-TATA-AAT-ATCAACAAACTAAAGT-ATGCCGTAAAAC
gi|118186 : TTTTTATTTAACT---AGTT-GT---TTAGTTGAAT---T-TT--TTT-TT--T---TGCTA-ATATTG---ATGC-----AGAC--TTT---ATATG-A-GACTTT--CTTTAATGACTAATT-GT--TAACGATTAATT-ATTAAGAT-TTTAA-TTATTT-------TAC---TC--TACCTT-G-TGCAGCCAAATGATGAGTTAAAA-TAGTAGTGT-TCAGTGTAT--AA---GTG-TAACTATGG-TA--CT-TTACTATATG------TAAA-AC-CTATATGT-TAG-GCCAGACA-C-TTTTGCT----TATA--GCTCAAATA
gi|118190 : TTTTTAATTTAAC--TAGTT-GT---TTAGTTGAAT---AGTT--TTT-AT--T---TGTTA-ATATTG---ATGC-----AGA-------------------CTTT--CTTTAATGACAAAAAAGT--TGACGATTAATT-ATTAAGAT-TTTAA-TTATTA-------TAC---CC--
gi|118188 : TTTTATTTAACT---AGTT-GT---TTAGTTGAAA---A-TT--TTT-AT--T---TGCTA-ATGTTG---ATGC-----AGAC--TTT---ATATG-A-GACTTT--CTTTAATGACTAAAT-GT--T-ATAATAAATT-ATTAAGAT-TTTAA-TTATTT-------TAC---TT--TACCTT-G-TGCAGCCAAATGATGAGTTAAA--TAGTAGTGT-TCAGTGTAT--AA---GTG-TTATTATGG-TA--CT-TTACTATATG------TAAT-AC-CTATATGT-TAG-GCCAGATA-C-TTTTGCT----TATA--GCGCAAATAAATT--TGCT---TGAGATA-T---C-A-T-AA-GTG---TCCGGCTCA--ACT---TGAACCCTCAA-CAGGA-A-T--GATTCCTGTT--GA--TTGTA--T--ATCTGTGCACACTA--A-TTGTGC-T-----CAGTTGC--TATGGTA---AAATT--T-TATT--T---GTAAG-ACAGT-ATCGTTA-G-AAA---CCGTGTATACCACATAC---AAA----CAGTAATTGTCAATA-TAAA-AAT-ATCAACAAACTAGAGT-ATGCTGTAAAAC
gi|118191 : TTTT-TTTAACTAGTAGTT-TTAAATTAGTTGATT---A-TT--TAA-AT--A----ACTA-ATATTT---ATTC-----AGAT--TTT---ATAGG-A-GACGTT--CTTTGATGACTAAAA-AT--TGGCGATTAATT-ATTAAGAA-TTTAA-TTCTTT-------TTC---TC--TACCTTGTGTGCAGTGAAGTGATGAGTTAAA--CAGTTGTGT-TGTGTGGAT--AA---ATG-TTGCTTTGG-TA--AT-TTACTATATG------TAAT-AC-CTATATGT-TAA-GCTAGACA-C-TTTCGCT----TATA--GTGCAAATAAATT--TGCT---AACGGTA-T---C-A-A-AA-TTA---TCCGACTCA--ACC---TGAACCTTAAA-CAGAA-A-T--GATTTCTATT--GA--TAGTA--T--GTCTGTGCACACTA--G-TTGTGC-T-----CGATTGC--TATGGTA---AAATT--T-TATT---------AG-ACAAT-ATTGTTA-G-CCA---CCGTGTATATCACATAC---CAA----CAGTAGTTGTCAATA-TAAG-AAT-ATCAACAAACTAGAGT-ATGCCGTAAA
gi|118194 : TATTTTAC---------AT---TT--TTGGATTCGG-TT--CTT-AC--TAATTACTA-ACATTGTTTATACTCATGATAT--TTTTAAATTTGTA-GA--------TTGACGACCAAAG-----TGTAGATTAATCGACTAAGAA-TATTA-TTATTTCTTTTTGTAT---T---TACCGA-T-TGCAGCCATAT-ATTACTTA------------T-T-AGTGCATGTAA---TTGATTAATTTAAATAAGGT-GCAC-ATATGGT----TGTTCAC-CAATATTT-TAA-GTTAAACA-A-CACTGCT----CATA--GCGCAAATTGCTT--TGCTTATAACG----T---C-A-G-CG-ATA---TTCAACCTA--ACTA--TAAACCTTAGA-TAAAAAT-T--TAATTCCATC--CAAGGTGT---T--ATCTGAACACATTA--A-TTGTGT-G-----TGGTTAC--AAAGGTA---AAAT---------------ATAAGTACT-T-ATC-TTATG-TAA---CCATGTATCCAGCGTAC---CAC----CAATAATTGTCAATAGTAA--ACC-ATCAACAAATTATGGT-GTGCCGTAAAAC
gi|118192 : aac---TTAGGTGATT---A-TT--ATT-GTAAT---TACTA-ATATAT---ATTC-----AGAT--TCT---ATAAG-T-G-CTCTAACTATG-TGATTAAAA-AT--TGACGACTAATT-ATTTA------TAA-TTAATT-------TATATGTCATTACCTT-G-TGCAGCCAAGTGATAAATTAT-G-CAAC--TAT-TAAGTATTT--GATTCATG-TGAATATGG-TT--GT-TTACTATACG------TAAT-AC-CTCCGTCT------CC------------GCT----TATA--GCGCAAATAAATT--TGCT---TGTAGTA-T---C-A-A-AA-GTA---TCTGGCTCA--ACC---TAAAGCTTCAA-CAGAA-A-T--AATTTCTATT--GA--TTGTA--T--ATCTGTGCACACTA--A-TGGTGC-T-----AGGTTAC--TGCGGTA---TACTT--T-TATT--T---ATAAG-ACAGT-ATTCTTA-A-CAA---CGTTACATAGCACATAC---ATT----CAGTAATAGTCAATA-TAAG-AAT-ATCAACAAACTAAAGT-ATGCCGTAAAAC
gi|118193 : tttatctattataTGATT---A-TTATTTT-AA--T---TGCTA-TTATTT---ATGC-----AGATACTAT---ATATT-ATGATGTA--GCTAGATGATTTAAA-AT--TGTCAACCAATT-ATT----T-TAGAA-TTAAGT-------TTC---TC--TACCTT-G-TGCAGCCAAGTGATAAATGAAA--CAAAGGTTA-TGTGTAAAT--TA---GTG-TGATTATGG-TT--AT-TTACTATATG------AAAT-AC-CTATATAT-TAAAGCGAGTCA-A-TTTTGCT----TATA--GTGCAAATAAATT--TGCA---GATGGTA-T---T-A-A-AA-TTA---TCTGGCTCA--ACC---TAGACCTTCAA-CAGAA-A-T--GATTTCTATT--GA--TTGTA--T--ATCTTCA--CACTA--A-TTGTGC-T-----AGGTTGCTATATGGT-----AATT--T-TTTT--T---ACAA
gi|118195 : tttaactagtatatcggg---A-TT--TTT-TT--T---TATTATATATAT---ATAT-----AGATACTTC---ATAAC-A-GACTTT--CTTTGATGACTAAAA-GT--TGACGATTTATT-ATTAAGAT-TTTAA-TTATTT-------TAC---TC--TACCTT-G-TGCAGCCAAATGATGAGTTAAAA-CAGTGGTGT-TGAGTGTAT--AA---GTG-TTATTCTGG-TA--GT-TTACTATATG------TAAT-AC-CTATATGT-TAG-GCCAGACA-C-TTTTACT----TATA--GCGCAAATAAATT--TGCT---AGTGTTA-T---C-A-T-AA-GTG---TCCGACTTA--ACT---TGAACCTTCAA-CAGGA-T-T--GATTTCTGTT--GA--TTGTA--T--ATCTGTGCCCACTA--A-TTGTGC-T-----CGGTTGC--TATGGTA---AAATT--G-TATT--T---GTAAG-ACAAT-ATCGTTA-G-CAA---CCGTATATACCACATAC---AAA----TAGTAATTGTCAATA-TAAG-AAT-ATCAACAAACTAGAGT-ATGCCGTAAAAC
gi|118196 : --T---TGTTT-ATACTC---ATG------ATAT--TTTTAAATTTGTA-GA--------TTGACGACCAAAG-----TGTAGATTAATCGACTAAGA----------ATTT-------TGTA--TT--TACCGA-T-TGCAGCCATAT-ATTACTTA------------T-T-AGTGCATGTAA---TTGATTAATTTAAATAAGGT-GCAC-ATATGGT----TGTTCAC-CAATATTT-TAA-GTTAAACA-A-CGCTGCT----CATA--GCGCAAATTGCTT--TGCT------TATA-T---C-G-T-CA-GCGATATTCAACCTA--ACTA--TAAACCTTAGA-TAAAAAT-T--TAATTCTATC--CAAGGTGT---T--ATCTGAACACATTA--A-TTGTGT-G-----TGGTTAC--AATGGTA---AAAT---------------ATAAGTACT-T-ATC-TTATG-TAA---CCATGTATCCAGCGTAC---CAC----CAATAATGGTCAATAGTAA--ACC-ATCAACAAATTATGGT-GTGCCGTAAAGC
gi|118198 : TTT-------TAC---TC--TACCTT-G-TGCAGCCAAATGATGAGTTAAAA-TAGTAGTGT-TGAGTGTAT--AA---GTG-TTATTATGG-TA--CT-TTACTATATG------T----------------TAG-GCCAGACA-C-TTTTGCT----TATA--GCGCAAATAAATT--TGCT---TGAGATA-T---T-A-T-AA-GTG---TCCGACTCA--ACT---TGAACCCTCAA-CAGGA-A-T--GATTTCTGTT--AA--TTGTT--T--ATCTGTGCGCACTA--A-TTGTGC-T-----CAGTTGC--TATGGTA---AAATT--T-TATT--T---GTAAG-ACAGT-ATTGTTA-G-CAA---CCTTGTATACCACATAC---AAA----CAGTAATTGTCAATA-TAAG-AAT-AT-AACAA
gi|118200 : TGT-TAAAT---T--GA---ATG-CAACTATGG-TC--GT-TTGTTATATG------TAAA-AT-CAATATA---AA-GCCAAACG-C-CTTCGCT----TATA--GCGCAAACAGATT--C--------------T---C-A-T-AAAGTA---TCAGACG-A--ATT---CGA-CC--CGA-CGTAT-T-T--AAATTATATT--GA--TTGTG--T--ATCTGTACACACTA--G-TTGTGT-T-----AGGTTAC--AATGGTA---TACCT--T-TATT--A---ATAAG-ACATT-ATCATTT-G-TAA---CTGT-TACATTATATGCCGTAAACCATCAGTAATTGCCATAA-TCAG-AAT-ACCAACAGA
gi|118202 : TTTGG-TT--GT-TAACTTTATG------TA-T-ATTCAATATAT-TAA-GCCAAACAAC-CC--GCT----TATA--GCGCAAAAAAATTGATACT---AGTA--A-T---G-A---AG-GAA---TTGGACCCA--ACTAAATAAACCTTCAA-TAT-A-T-T--TAATTATATT--GA--TTGTAG-T--ATCTGTATACACTATAA-TT---C-TA----TGGTTAC--AATAGTA---TATAT--T-TAGT--A---CTATG-GCAAT-ATCGTAT-G-TAA---CATTATATGCAGCAT-C---ACAT---CAGTAAACGTTAATA-TAAG-AAT-ATTAACAATCTACGGT-ATGCCGTCAAACc
gi|118201 : aGG-TT--GT-TTATTTTTTA------TAAA-AC-A-ATATAT-TAC-GCCAAACA-T-CACCGCG----TAAA--GTGTAAATAAATA--TGCT---TATAGTA-T---CGG-T-AA-GAT---TTAGCTTTA--ATA---TAGACCTTCA------A-T-T--GATTT-TGT--------------T--ATCTGTACATACTA--A-TTGCG
gi|118203 : tatatagggtgcgactagGG-TA--TTGTTATTAAAT-------CAAT-AC-ATA-------AG-ACCA-ACA-CATTGCTCT----TATAAAGTGCAAATTCATT--TGCT---AAAAGTA-T---TTA-T-AA-GTGAAGTTTTAATCGGTATG---TAAGCCTT-AA-TAGAA-T-----AT---------AA--TTACA--T---TC----------A--T-TTGTGT-A-----TGGTTAC--GATGATA---TAACT--T-TAGC------GTAAT-GC--T-ATCGTTT-G-TAA---TCTTATAAACAGCGTAT---CGA----CAGTAATGGTCATTA-T--GCACT-ATTAACAAACTA
gi|118204 : T-TTTCTATATGCATTTATAAA-AC-CAGCATGT-AAG-GCAAAACA-A-CACTGCT----TATA--GAGCTAATTTGTT--TGTT--------TA-----------AA-GTA---TCAGAG--A--AGTA--TAGATTTTCAG-TATAT-T-T--TAATTATATT--GA--GAGAA--TT-ATCTGTACACACTA--A-TTGTACATGTATATGGTTAC--AATGGTATTGGACTT--T-TGTA--C----TATG-ATAAT-ATC-----G-CAATTTTC-TGTATAC--CAT------------CAGTAGTTGTCAAT
gi|118205 : taACATG------TAAA-AC-CAATATAT-TAA-GCTAAACA-A-CTCCGCT----TATA--GCGCA------------C------CGAT----------T----GTG---TTAAACCTA--ACTA--TAGACCTTCAA-TAGAA-T-TT-GATT-ATATT--GA--TTGCGG-T--ATCTGTATACACTA--T-GTGTGC-A-----AGGTTAC--AACGATA---TAACT--T-TAAT--A---TTATG-GCAAT-TTCGTAT-G-CAT---CCTTATATGCAGCATCC---TTT----CAGAAATTGCCAATA-TAAG-ACT-ATCAGCAAACTACGGT-ATGTCGTCAA
gi|118207 : T-AC-CAATATTT-TAA-GCCAAATA-A-CACTGCT----CATA--GCGCAAATTACTT--TGCT---TATATTG-T---C-AGC-AA-G-A---TTCGACCTA--AATA--TGAACTTTCGA-TAAAA-T-T--TAATTCTATC--TA--TAG-AGGT--GTCTGTACACACTA--A-TTGTGT-G-----TGGTTAT--AATGGTA---AAATA--C-AATT----------G-ATAGTTATC-TTATG-TAA---CCGTATATCCAGCGTAC---CAT----CAGTAATTGTCAATAGTAA--ACC-ATCAACAAATTACAAT-GTGCTGTAAAAC
gi|118197 : T-AC-CAATATTT-TAA-GACAAACA-A-CACTGCT----CATA--GTACAAATTACTT--TGCT---TATATTG-T---C-AGC-GA-GT----TTCGACCTA--AATA--TAAACTTTCGA-TAAAA-T-T-----CTATCTT--AA--GTG-G--T--ATCTGTACACACTA--A-TTGTGT-A-----TGGTTAC--AATGGTA---AAA-T--A-TAAT--T---GTTAG----TT-ATC-TTATG-TAA---CCATATATCCAGCGTAC---CAC----CAATAATTGTCAATAGTAAA-ACC-ATCAACAAATTATATT-GTGCTGTAAAAC
gi|118208 : gattaattaacaaaaaaaaaatagttttatttctttttctatttaccgattgcagccatatattacataaacccatatattaaaggtttataattagtgcatgtaattacttatattaaatgaggtgcacctatggttgttT-AC-CAATA-GTATAA-GTCAAACA-A-CGCTGCT----CATA--GCGCAAATCGCTT--TGCT------TGTA-T---C-G-T-CA-GCGATATTCGACCTA--ACTA--TAAA--TTTAA---------------TTCTATCTAAA--GTGT---T--ATCTGTACACACTT--A-TTGTGC-A-----TAGTTAC--AATGGTA---AAATA--T-AATT--G---GTAGT-----T-ATC-TTATG-TAA---CCATATATCCAGCTTAC---CAC----CAATAATTGTCAATAGTATA-ACC-ATCAACAAATTATGGT-GTGCCGTAAAAC
gi|118199 : T-AC-CAATATTA-TAA-GTCAAACA-A-CACTGCT----CATA--GTGCAAATCGCTT--TGTC---AGCGATA-T---T----------------TGACCTA--ACTA--TAAACTTGAGA-TAAAA-T-TTAAATTTATCTA--AA--GTGT---T--ATCTGTACACATTA--A-TTGTGT-A-----TAGTTAC--AATGGTA---AAATA--T-AATT--G---GTA-----GAT-ATC-TTATG-TAA---CCATATATCCAGCGTGC---CAC----CAATAATTGTCAATAGTATA-ACC-GTCAACAAATAATGGT-GTGCCGTAAAAC
gi|118195 : ttatattaaatgaagtgcacctatggttgttCAAGT-TAA-GTCGGACA-C-TTATG-------ATA--ACACTAGCAAATT--TATT---TGCGCTA-TAAGT-A-A-AA-GTG---TCTGGCCTA--AC
gi|118188 : atttttttttattatatatatatatagatacttcataacagactttctttgatgactaaaagttgacgatttattattaagattttaattattttactctaccttgtgcagccaaatgatgagttaaaacagtggtgttgagtgtataagtgttattctggtagtttactatatgtaatacctatatCAAGT-TGA-GCCGGACA-C-TTATG-------ATA--TCTCAAGCAAATT--TATT---TGCGCTA-TAAGC-A-A-AA-GTA---TCTGGCCTA--ACaaccttcaacaggattgatttctgttgattgtatatctgtgcccactaattgtgctcggttgctatggtaaaattgtatttgtaagacaatatcgttagcaaccgtatataccacatacaaatagtaattgtcaatataagaatatcaacaaactagagtatgccgtaaaac
gi|118198 : ttttatttaactagttgtttagttgaaaatttttatttgctaatgttgatgcagactttatatgagactttctttaatgactaaatgttataataaattattaagattttaattattttactttaccttgtgcagccaaatgatgagttaaatagtagtgttcagtgtataagtgttattatggtactttactatatgtaatacctatatCAAGT-TGA-GTCGGACA-C-TTATA-------ATA--TCTCAAGCAAATT--TATT---TGCGCTA-TAAGC-A-A-AA-GTG---TCTGGCCTA--ACaaccctcaacaggaatgattcctgttgattgtatatctgtgcacactaattgtgctcagttgctatggtaaaattttatttgtaagacagtatcgttagaaaccgtgtataccacatacaaacagtaattgtcaatataaaaatatcaacaaactagagtatgctgtaaaac
gi|118189 : ttttactctaccttgtgcagccaaatgatgagttaaaatagtagtgttgagtgtataagtgttattatggtactttactatatTGT-TGA-GTCGGACA-C-TTATG-------ATA--TCACAAGGAAATT--TATT---TGCGCTA-TAAGC-A-A-AA-GTG---TCTGGCCTA--ACaaccctcaacaggaatgatttctgttaattgtttatctgtgcgcactaattgtgctcagttgctatggtaaaattttatttgtaagacagtattgttagcaaccttgtataccacatacaaacagtaattgtcaatataagaatataacaa
gi|118192 : tttttaatttaactagttgtttagttgaatattttttatttgctagtattgatgcagactttatatgggactttctttgatgactaaaaagtatacgattaattattaagattttaattattttactctaccttttgcagccaaatgatgagttaaaatagtagtgttgagtgtataagtgttattatggtactttactatatgtaatacctatatGT-TGA-GCCAGATA-C-TTTTG-------ATA--CTACAAGCAAATT--TATT---TGCGCTA-T---ggactgatttctgttaattgtatatctgtgaacactaattgtgctcagttgctatggtaaaattttatttgtaagataatatcgttagcaaccgtgtacaccacatacaaacagtaactgtcaatataagaatatcaacaaactagagtatgccgtaaaac
gi|118209 : tttatctattatattaggtgattattattgtaattactaatatatattcagattctataagtgctctaactatgtgattaaaaattgacgactaattatttataattaatttatatgtcattaccttgtgcagccaagtgataaattatgcaactattaagtatttgattcatgtgaatatggttgtttactatacgtaatacctccgtctccgcttAG-GCCA-ACA-C-ATT-GCTCTAATATA--GCGCAAATTAATA--TGCT---AATAGTATT---T-A-T-AA-G----------------------TGAAGCTTTAATCGGTA-TGT--AAGCC---TT--AA--TTGAA--T--ATAAGTA--CATTC--ATTTGTGT-A-----TGGTTAC--GATAATA---TATCA--T-TATTACC---GTAAT-GC--T-ATCGTAT-G-TAA---TCGTATAAACAGCGTAT---CGA----CTGTAATGGTCATTA-T--G-CACAATTAACAAGCTA-ACTGATGCCATGAActaaagcttcaacagaaataatttctattgattgtatatctgtgcacactaatggtgctaggttactgcggtatacttttatttataagacagtattcttaacaacgttacatagcacatacattcagtaatagtcaatataagaatatcaacaaactaaagtatgccgtaaaac
gi|118210 : CTAAACA-C-CTCTGCT----TATA--GCGGAAGTAGAAT--TGCT---TATAGCA-T---T-G-G-AG-GGA---TTCGACATA--A-----TAAACATTCAAATAAAA-T-T--TAATTC-------AC-TTGTA--T--ATCTGTACACACTA--G-TTGTCT-T-----AATTTAC--AATGGTA---CGATT--T-AATTA-C---ATAAT-ACAAT-ATCGTAT-G-TAA---CATTATATACCGCATAC---CGT----CAATAATTGTCAATA-TATA-AAA-ATCAACAAACTATAGT-ATGCCGTAAAAC
gi|118206 : TGCT----CATAAAGTGCAAATTCATT--TGCT---AATAGTA-C---C-AGTGAA-GT----TTTAACTGGT-ATG---TAAGCCTT-AA-TAGAA-T-----ATT---------A--TTACA--TTAATTTGT--TTA-TG--A-TTATG------------------ATGATA---CATCT--T-TATTACT---GTAG---TGAT-ATCGTAT-G-TAA---TCTTATAAACTGTGTAT---CAA----CAGTAATAGTCAATA-T--GCAAT-ATTAACAAACTA
gi|118183 : atatagtacaatcaatatatggccaaaacaa---TAAACATTCAA-TAGAA-A-T--CATTTCTGTT--GA--
gi|118212 : tttttttttgactactagtttagttgattattttaattactaatatttatgcagattttatataaggcattcttcgataacaaaaaatgatgattaatttttaagaatttaattatttttcactaccttgtgcagacaagtgatgagttaaacagttattttgtgtgaataaatgtaactatggtaatttactatatgtaatacctatatgttaggccagacacttttgctaatagcgcaaataaatttgctaattgtatcaaaagtatcctactcaacctgaacttAGAA-A-T--AATTTCTATT--GA--TTGTA--T--ATCTGTTCACACTA--A-TT-------------GTTAC--CATGTTA---AATTT--T-TATTA-TTTAATAAC-ACAGC-A--GTTA-ACCAA---TCGAGCATAtctgtgcacactcgttgtggtcggttgctatggtagaattttatttgttagacaatatcgttagcaaccgtgtatacctcataccaacagtaattgtcaatataagaat
gi|118211 : CTATT--GA--TAGTGGCC--A-CTGTACACACTA--A-TGGTAT-A-----TGGTTAC--ACTAGTA---TGATTAAT-TACT------ATAG---CAAT-ATTGTAT-G-TAA---CCTTCTATGCAGCATAC---CAA----CATTAATTGTCAATA-TAAG-AAT-ACCAACAAACTAAGGT-ATGCCGTCAAACaca
gi|118213 : agtcacctggttctttatgcacatttaattttgcttatattatcgacgaagttcaaccaaaatataaacA--TTGTA--T--ATCTGTGCACACTA--A-TTGTGC-TAC---CAATCAC---ACTGTA---ATATT--T-TACT--T---ACAA
gi|118214 : TCTGTGCACACTA--A-TTGTAT-T-----CAGTTGC--TATGGTA---ATATT--TCTATT--T---GTATG-ACAGT-ATCGTTA-G-CAA---CCGTATATACCACATAC---AGA----CAGTAATTGTCAATA-TAAG-AAT-ATCAGCAAACTAGAGT-ATGCCGTAAAAC
Alignments
lowQualScore : 11 333 111 11 111 111111 1111111111 1111111
lowQualScore : 00 1 000 3 333 1 2 33 5 33 3 2 1 66 888 555 2 444444 2 77 33 5 2 44 7777777 444 33 66 888 33 11 5 1 4 2 55 22 333 6 5 4 55 444444 1 3 222 1 0 1 1 0 1 222 00 2222 33 0 22 000 1 2 666 22 99999 1 22 1 666666 0 2 9999999 333 2222 11 11 44 1 999 1 1 11 1 0000000000 333 2222 11 1 4444444 2 2 1 3 8 1 5555555 0 2 2 1 8 3 1 1
lowQualScore : .. . ... . ... . . .. . .. . . . .. ... ... . ...... . .. .. . . .. ....... ... .. .. ... .. .. . . . . .. .. ... . . . .. ...... . . ... . . . . . . ... .. .... .. . .. ... . . ... .. ..... . .. . ...... . . ....... ... .... .. .. .. . ... . . .. . .......... ... .... .. . ....... . . . . . . ....... . . . . . . . .
lowQualScore : 22 0 888 1 888 0 9 99 7 44 2 5 0 99 888 111 5 222222 5 22 44 0 5 44 6666666 111 22 99 888 44 66 0 8 4 2 88 99 777 3 4 2 33 888888 7 0 666 5 3 5 4 6 4 888 33 9999 88 7 00 222 4 9 888 00 77777 6 44 4 666666 7 1 4444444 333 8888 88 88 88 3 777 3 7 77 2 6666666666 222 4444 88 3 6666666 8 3 4 5 3 4 0000000 9 2 1 8 9 0 5 0
consensus : TTTTTA-TTTAACT---AGT-TGT---TTAGTTGANTA-TT--TTT-AT--TTGCTA-ATATTNATGCAGAT--TTT---ATATG-A-GACTTT--CTTTGATGAC-TAAAA-GT--TGACGATTAATT-ATTA-AGAN-TTTAATTATTT-------TAC---TC--TACCTTGTG--CAGCCAAATGATGA---GTTA--AAA-CA-GTAGT-GT-TGAGTGTA--TA--A---G-TGTTAC-TATGGTAGTTTACTATATG------TA-ATAC---CNATATGT-TAG-GCCAGA-CA-C-CTCCGCT----TATA--GCGCAAATAAATT--TGCTNATGGTA-TC-AN--A--AGTG----TCCGACCCA-ACT------TGAACCTTCAACAGAAA-T--G-ATT--TCTA----T--T--GA--TTG-TA--T-ATCTGTGCACACTA--A-TTGTGC-T-----C--GGTTAC--NATGGTA---AAATT--T-TATT--T---GTAAG-ACAAT-ATCGTTA-G-CAACCG------TGTATACCGCGTACCAACAGTAATTGTCAATA-TAAG-AAT-ATCAACAAACTANAGTATGCCGTAAAAC
Reference ( family-605 ) : TTTTTA-TTTNACT--TAGT-TGT---TTAGTTGANTA-TT--TTT-AT--TTGCTA-ATATTNATGCAGAT--TTT---ATATG-A-GACTTT--CTTTGATGAC-TAAAA-GT--TGACGATTAATT-ATTA-AGAN-TTTAATTATTT-------TAC---TC--TACCTTGTG--CAGCCAAATGATGA---GTTA--AAA-CA-GTNGT-GT-TGAGTGTA--TA--A---G-TGTTAC-TATGGTAGTTTACTATATG------TA-ATAC---CNATATGT-TAG-GCCAGA-CA-C-TTTTGCT----TATA--GCGCAAATAAATT--TGCTNGCGGTA-TC-AN--A--AGTG----TCCGACCCA-ACT------TGAACCTTCAACAGAAN-T--G-ATT--TCTA----T--T--GA--TTG-TA--T-ATCTGTGCACACTA--A-TTGTGC-T-----C--GGTTAC--NATGGTA---AAATT--T-TATT--T---GTAAG-ACAAT-ATCGTTA-G-CAACCG------TGTATACCGCGTACCAACAGTAATTGTCAATA-TAAG-AAT-ATCAACAAACTANAGTATGCCGTAAAAC
gi|118181 : TTTTTA-TTTTACT--TAGC-TGT---TTAGTTGAATA-TT--TTT-AT--TTGCTA-ATATTGATGCAGAT--TTT---ATATG-A-GACTTT--CTTTGATGAC-TAAAA-GT--TGACGATTAATT-ATTA-AGAT-TTTAATCATTT-------TAC---TC--TACCTTTTG--CAGCCAAATGATGA---GTTA--AAG-CA-GTGGT-GT-TGAGTGTA--TA--A---G-TGTTAT-TTTGGTAGTTTACTATATG------TA-ATAC---CTACATGT-TAG-GCCAGA-CA-C-TTTTGCT----TGTA--GCGCAAATAAATT--TGCTAGCGGTA-TC-AT--A--AGTG----TCCGACTCA-ACT------TGAACCTTCAACAGGAT-T--G-ATT--TCTG----T--T--GA--TTG-TA--T-ATCTGTACCCACTA--A-TTGTGC-T-----C--GGTTGC--TATGGTA---AAATT--T-TATT--T---GTAAG-ACAAT-ATCGTTA-G-CAACCG------TGTATACGACATACAAACAGTAATTGTCAATA-TAAG-AAT-ATCAACAAATTAGAGTATGCCGTAAAAC
gi|118182 : TTTTTA-TT-GACT---AGT-AGT---TTAGGTGATTA-TT--TTA-AT--T-ACTA-ATATTTATGCAGAT--ATT---ATATA-G-GGCGCA--CTTCAATGAT-TAAAA-AT--TGACGACTAATT-ATTA-AGAAATTTAGTTATTT-------TTC---TC--TATCTTGTG--CAGCCAAGTGATAA---GTTA--AA--CA-GTT-T-ATCTGTGTAGA--TT--A---A-TATTAC-TATGGTAATT-ACTATAAG------TA-ATAC---CTATATGT-TAG-GCCAGA-CA-C-TTTCGCT----TATA--GCGCAAATAAATT--AGCAGATGGTA-TC-AA--A--AGTA----TCTGTCTCA-ACC------TGAACCTTCAACAGAAA-T--G-ATT--TCTA----T--T--GA--CTG-TA--T-ATCTGTGCACACTA--A-TTGTGC-T-----C--AGTTGC--TATGGTA---AAATT--T-TATT--T---GTTAG-ACAAT-ATTGTTA-G-CAACCA------CCAATACCACATACCAACAGTAATTGTCAATA-TAAG-ACT-ATCAACAAACTAGAATATGCTGTAAAAC
gi|118183 : tTTTTTT-TTTGACT---ACT-AGT---TTAGTTGATTA-TT--TTA-AT--T-ACTA-ATATTTATGCAGAT--TTT---ATATA-A-GGCATT--CTTCGATAAC-AAAAA-AT---GATGATTAATT-TTTA-AGAA-TTTAATTATTT-------TTC---AC--TACCTTGTG--CAGACAAGTGATGA---GTTA--AA--CA-GTTAT-TT-TGTGTGAA--TA--A---A-TGTAAC-TATGGTAATTTACTATATG------TA-ATAC---CTATATGT-TAG-GCCAGA-CA-C-TTTTGCT----AATA--GCGCAAATAAATT--TGCTAATTGTA-TC-AA--A--AGTA----TCCTACTCA-ACC------TGAACTTTCAACAGAAA-T--G-ATT--TCTA----T--T--GA--ATG-TT--T-ATCTGTGCACACTC--G-TTGTGG-T-----C--GGTTGC--TATGGTA---GAATT--T-TATT--T---GTTAG-ACAAT-ATCGTTA-G-CAACCG------TGTATACCTCATACCAACAGTAATTGTCAATA-TAAG-AAT-
gi|118184 : TTCTTT-TTTAACTAGTAGT-TTTAAATTAGTTGATTA-TT--TCA-AT--A-ACTA-ATATTTATGCAGAT--TTT---ATA---A-GA-------------GAC-TAAAA-AT--TGGCAATTAATT-ATTA-AGAA-TTTAAATCTTT-------TTC---TT--TACCTTGTGTGCAGCCAAGTGATGA---GTTA--AA--CA-GTTAT-GT-TGTGTAGA--TG--A---A-TGTTGC-TTTGGTAATTTACTATATG------TA-ATAC---CTATATGT-CAG-GCCAGA-CA-C-TTTCGCT----TAAA--GCGCAAATACATT--TGCTAATGGTA-TC-AA--A--AGTA----TGCGACTCA-ACC------TGAACCTTCAACAGAAA-T--G-ATT--TCTA----T--T--GA--TTG-TA--T-GTCTGTGCACACTA--A-TTGTGC-T-----C--GATT--------GTA---AAATT--T-TATT---------AA-ACAAT-ATCGTTA-G-CAACCG------TGTATACCACATACCAACAGTAATTGTCAATA-TAAG-AAT-ATCAATAAACTAGAGTATGCCGCAAAAC
gi|118185 : TTTTTA-CTTAA-T--CAGT-TGT---TTAAATAGTTA-TT--TTT-AA--TTGCTT-ATATTGATGCAGAC--TTT---AT--G-C-GATTTA--CTTCAAT-AT-TCAA--GTACTAACGTTTAATT-ATTG-AAAC-TCCAGGCATTC-------TAC---TC--TACCTTGTG--CAGCCAAAATATGA---TTTA--AAAATA-TTAGT-AC-CGATTGTA--CT--A---G-CATTAC-TATGGTA--------TGTG------TA-GAAC---CTATATAT-TAG-GCCAGA-CG-C-TTTTGCT----TATA--GCGCAAATAAATT--TGCTTGAGATA-TC-AT--A--AGCG----TCCGACCCA-ACT------TGAACCCTCAACAGGAA-T--G-ATT--CCCG----C--T--GA--TTG-TT--T-ATCTGTGCACACTA--A-TTGTGC-T-----C--AGTTGC--TATGGTA---ATATT--T-TATT--T---GTATG-ACAGT-ACCGTTA-G-CAACCG------TATATACCACATACAGAGAGTAATTGTCAATA-TATA-AAT-ATCAACAAACTAAAGTATGCCGTAAAAC
gi|118186 : TTTTTA-TTTAACT---AGT-TGT---TTAGTTGAATT-TT--TTT-TT--TTGCTA-ATATTGATGCAGAC--TTT---ATATG-A-GACTTT--CTTTAATGAC-TAATT-GT--TAACGATTAATT-ATTA-AGAT-TTTAATTATTT-------TAC---TC--TACCTTGTG--CAGCCAAATGATGA---GTTA--AAA-TA-GTAGT-GT-TCAGTGTA--TA--A---G-TGTAAC-TATGGTACTTTACTATATG------TA-AAAC---CTATATGT-TAG-GCCAGA-CA-C-TTTTGCT----TATA--GCTCAAATA
gi|118187 : TTTTTAATTTAACT---AGT-TAT---TTAGTTGAATA-TT--TTTTAT--TTGCTA-ATATTGATGCAGAC--TTT---ATATG-G-GACTTT--CTTTGATGAC-CAAAAAGT--TGACGATTATTT-ATTA-AGAT-TTTAATTATTT-------TAC---TC--TACCTTGTG--CAGCCAAATGATGA---GTTA--AAA-TA-GTAGT-GT-TGAATGTA--TA--A---G-TGTTAT-TATAGTACTTTACTATATG------TA-ATAC---CAATATGT-TAG-GCCAGA-CA-C-TTTTGCT----TATA--GTGCAAATAAATT--TGCTAATGGTA-TC-AT--A--AGTG----TCGGACTCA-ACT------TGAACCCTCAACAGGAA-T--G-ATT--TCTG----T--T--GA--TTG-TA--T-ATCTGTGCACACTA--G-TTGTGC-T-----C--AGTTGC--TATGGTA---AAATT--T-TGTT--T---GTAAG-ACAAT-ATCGTTG-G-CAACCG------TGTATACCACATACAAACAGTAATTGTCAATA-TAAG-AAT-ATCAACAAAGTAGAGTATGCCATAAAAC
gi|118188 : TTTTA-TTTAACT---AGT-TGT---TTAGTTGAAAA-TT--TTT-AT--TTGCTA-ATGTTGATGCAGAC--TTT---ATATG-A-GACTTT--CTTTAATGAC-TAAAT-GT--T-ATAATAAATT-ATTA-AGAT-TTTAATTATTT-------TAC---TT--TACCTTGTG--CAGCCAAATGATGA---GTTA--AA--TA-GTAGT-GT-TCAGTGTA--TA--A---G-TGTTAT-TATGGTACTTTACTATATG------TA-ATAC---CTATATGT-TAG-GCCAGA-TA-C-TTTTGCT----TATA--GCGCAAATAAATT--TGCTTGAGATA-TC-AT--A--AGTG----TCCGGCTCA-ACT------TGAACCCTCAACAGGAA-T--G-ATT--CCTG----T--T--GA--TTG-TA--T-ATCTGTGCACACTA--A-TTGTGC-T-----C--AGTTGC--TATGGTA---AAATT--T-TATT--T---GTAAG-ACAGT-ATCGTTA-G-AAACCG------TGTATACCACATACAAACAGTAATTGTCAATA-TAAA-AAT-ATCAACAAACTAGAGTATGCTGTAAAAC
gi|118189 : TTTTTAATTTAACT---AGT-TGT---TTAGTTGAATA-TT--TTTTAT--TTGCTA-GTATTGATGCAGAC--TTT---ATATG-G-GACTTT--CTTTGATGAC-TAAAAAGT--ATACGATTAATT-ATTA-AGAT-TTTAATTATTT-------TAC---TC--TACCTTTTG--CAGCCAAATGATGA---GTTA--AAA-TA-GTAGT-GT-TGAGTGTA--TA--A---G-TGTTAT-TATGGTACTTTACTATATG------TA-ATAC---CTATATGT-TAG-GCCAGA-CA-C-TTTTGCT----TATA--GCGCAAATAAATT--TCCTTGTGATA-TC-AT--A--AGTG----TCCGAC--------------------TCAACAGGAC-T--G-ATT--TCTG----T--T--AA--TTG-TA--T-ATCTGTGAACACTA--A-TTGTGC-T-----C--AGTTGC--TATGGTA---AAATT--T-TATT--T---GTAAG-ATAAT-ATCGTTA-G-CAACCG------TGTACACCACATACAAACAGTAACTGTCAATA-TAAG-AAT-ATCAACAAACTAGAGTATGCCGTAAAAC
gi|118190 : TTTTTAATTTAACT---AGT-TGT---TTAGTTGAATAGTT--TTT-AT--TTGTTA-ATATTGATGC------------------A-GACTTT--CTTTAATGACAAAAAA-GT--TGACGATTAATT-ATTA-AGAT-TTTAATTATTA-------TAC---CC--
gi|118191 : TTTT--TTTAACTAGTAGT-TTTAAATTAGTTGATTA-TT--TAA-AT--A-ACTA-ATATTTATTCAGAT--TTT---ATAGG-A-GACGTT--CTTTGATGAC-TAAAA-AT--TGGCGATTAATT-ATTA-AGAA-TTTAATTCTTT-------TTC---TC--TACCTTGTGTGCAGTGAAGTGATGA---GTTA--AA--CA-GTTGT-GT-TGTGTGGA--TA--A---A-TGTTGC-TTTGGTAATTTACTATATG------TA-ATAC---CTATATGT-TAA-GCTAGA-CA-C-TTTCGCT----TATA--GTGCAAATAAATT--TGCTAACGGTA-TC-AA--A--ATTA----TCCGACTCA-ACC------TGAACCTTAAACAGAAA-T--G-ATT--TCTA----T--T--GA--TAG-TA--T-GTCTGTGCACACTA--G-TTGTGC-T-----C--GATTGC--TATGGTA---AAATT--T-TATT---------AG-ACAAT-ATTGTTA-G-CCACCG------TGTATATCACATACCAACAGTAGTTGTCAATA-TAAG-AAT-ATCAACAAACTAGAGTATGCCGTAAA
gi|118192 : TTTATC--TA-T-TATA--TTAGGTGATTA-TT--ATT-GTAATTACTA-ATATATATTCAGAT--TCT---ATAAG-T-G-CTCTAACTATG-TGAT-TAAAA-AT--TGACGACTAATT-ATTT-A------TAATTAATT-------TATATGTCATTACCTTGTG--CAGCCAAGTGATAA---ATTATGCAA-C------T-AT-TAAGTATT--TG--ATTCA-TGTGAA-TATGGTTGTTTACTATACG------TA-ATAC---CT------------CC-GT-C-----TCCGCT----TATA--GCGCAAATAAATT--TGCTTGTAGTA-TC-AA--A--AGTA----TCTGGCTCA-ACC------TAAAGCTTCAACAGAAA-T--A-ATT--TCTA----T--T--GA--TTG-TA--T-ATCTGTGCACACTA--A-TGGTGC-T-----A--GGTTAC--TGCGGTA---TACTT--T-TATT--T---ATAAG-ACAGT-ATTCTTA-A-CAACGT------TACATAGCACATACATTCAGTAATAGTCAATA-TAAG-AAT-ATCAACAAACTAAAGTATGCCGTAAAAC
gi|118193 : -TTTAACT---AGTATAT---CGGGT-GATTA-TTATTTT-AA--TTGCTA-TTATTTATGCAGATACTAT---ATATT-ATGATGTA--GCTAGATGAT-TTAAA-AT--TGTCAACCAATT-ATTTTAGAA-TT-AA--GTTT---------C---TC--TACCTTGTG--CAGCCAAGTGATAA---AT-G--AAA-CA-A-AG--GT-TATGTGTA--AATTA---G-TGTGAT-TATGGTTATTTACTATATG------AA-ATAC---CTATATAT-TAAAGCGAGT-CA-A-TTTTGCT----TATA--GTGCAAATAAATT--TGCAGATGGTA-TT-AA--A--ATTA----TCTGGCTCA-ACC------TAGACCTTCAACAGAAA-T--G-ATT--TCTA----T--T--GA--TTG-TA--T-ATCT-T-CACACTA--A-TTGTGC-T-----A--GGTTGCTATATGGT-----AATT--T-TTTT--T---ACAA
gi|118194 : --TTGTTT-ATACTCATG-ATAT--TTTTAAATTTGTA-GA--------TTGACGAC-CAAAG-----TGTAGATTAATCGACTA-AGAA-TATTATTATTTCTTTTTGTAT---T---TACCGATTG--CAGCCATAT-ATTACTTATTA--GTG-CATGTAATTGA-TTAATTTAAATA--A---GGTGC-ACATATGGTTGTTCAC----------------------CAATATTT-TAA-GTTAAA-CA-A-CACTGCT----CATA--GCGCAAATTGCTT--TGCTTATAACG-TC-AG--C--GATA----TTCAACCTA-ACTA-----TAAACCTTAGATAAAAA-T--TTAAT--TCCA----T--C--CAAGGTG-T---T-ATCTGAACACATTA--A-TTGTGT-G-----T--GGTTAC--AAAGGTA---AAAT---------------ATAAGTACT-T-ATC-TTATG-TAACCA------TGTATCCAGCGTACCACCAATAATTGTCAATAGTAA--ACC-ATCAACAAATTATGGTGTGCCGTAAAAC
gi|118195 : aactattttacatttttggattcggttcttactaattactaacaA-TT--TTT-TT--TTATTATATATATATATAGATACTTC---ATAAC-A-GACTTT--CTTTGATGAC-TAAAA-GT--TGACGATTTATT-ATTA-AGAT-TTTAATTATTT-------TAC---TC--TACCTTGTG--CAGCCAAATGATGA---GTTA--AAA-CA-GTGGT-GT-TGAGTGTA--TA--A---G-TGTTAT-TCTGGTAGTTTACTATATG------TA-ATAC---CTATATGT-TAG-GCCAGA-CA-C-TTTTACT----TATA--GCGCAAATAAATT--TGCTAGTGTTA-TC-AT--A--AGTG----TCCGACTTA-ACT------TGAACCTTCAACAGGAT-T--G-ATT--TCTG----T--T--GA--TTG-TA--T-ATCTGTGCCCACTA--A-TTGTGC-T-----C--GGTTGC--TATGGTA---AAATT--G-TATT--T---GTAAG-ACAAT-ATCGTTA-G-CAACCG------TATATACCACATACAAATAGTAATTGTCAATA-TAAG-AAT-ATCAACAAACTAGAGTATGCCGTAAAAC
gi|118196 : --TTGTTT-ATACTCATG-ATAT--TTTTAAATTTGTA-GA--------TTGACGAC-CAAAG-----TGTAGATTAATCGACTA-AGAA-TTT------TG-------TAT---T---TACCGATTG--CAGCCATAT-ATTACTTATTA--GTG-CATGTAATTGA-TTAATTTAAATA--A---GGTGC-ACATATGGTTGTTCAC----------------------CAATATTT-TAA-GTTAAA-CA-A-CGCTGCT----CATA--GCGCAAATTGCTT--TGCTTA---TA-TC-GT--C--AGCGATA-TTCAACCTA-ACTA-----TAAACCTTAGATAAAAA-T--TTAAT--TCTA----T--C--CAAGGTG-T---T-ATCTGAACACATTA--A-TTGTGT-G-----T--GGTTAC--AATGGTA---AAAT---------------ATAAGTACT-T-ATC-TTATG-TAACCA------TGTATCCAGCGTACCACCAATAATGGTCAATAGTAA--ACC-ATCAACAAATTATGGTGTGCCGTAAAGC
gi|118197 : TAC---CAATATTT-TAA-GACAAA-CA-A-CACTGCT----CATA--GTACAAATTACTT--TGCTTATATTG-TC-AGC-G--AGT-----TTCGACCTA-AATA-----TAAACTTTCGATAAAA---------T--TCTA----TCTT--AA--GTG--G--T-ATCTGTACACACTA--A-TTGTGT-A-----T--GGTTAC--AATGGTA---AAA-T--A-TAAT--T---GTTAG----TT-ATC-TTATG-TAACCA------TATATCCAGCGTACCACCAATAATTGTCAATAGTAAA-ACC-ATCAACAAATTATATTGTGCTGTAAAAC
gi|118198 : gattaattaacaaaaaaaaaatagttttatttctttttctatttaccgattgcagccatatattacataaacccatatattaaaggtttataattagtgcatgtaattacttatattaaatgaggtgcacctatggttgttTTT-------TAC---TC--TACCTTGTG--CAGCCAAATGATGA---GTTA--AAA-TA-GTAGT-GT-TGAGTGTA--TA--A---G-TGTTAT-TATGGTACTTTACTATAT-----------------------GT-TAG-GCCAGA-CA-C-TTTTGCT----TATA--GCGCAAATAAATT--TGCTTGAGATA-TT-AT--A--AGTG----TCCGACTCA-ACT------TGAACCCTCAACAGGAA-T--G-ATT--TCTG----T--T--AA--TTG-TT--T-ATCTGTGCGCACTA--A-TTGTGC-T-----C--AGTTGC--TATGGTA---AAATT--T-TATT--T---GTAAG-ACAGT-ATTGTTA-G-CAACCT------TGTATACCACATACAAACAGTAATTGTCAATA-TAAG-AAT-AT-AACAA
gi|118199 : TTAT-AT-TAAATG-----A--A---G-TGCACC-TATGGTTGTTTAC----------------------CAATATTA-TAA-GTCAAA-CA-A-CACTGCT----CATA--GTGCAAATCGCTT--TGTCAGCGATA-TT------------------TGACCTA-ACTA-----TAAACTTGAGATAAAAT-TTAA-ATT--TATC----T--A--AA--GTG-T---T-ATCTGTACACATTA--A-TTGTGT-A-----T--AGTTAC--AATGGTA---AAATA--T-AATT--G---GTA-----GAT-ATC-TTATG-TAACCA------TATATCCAGCGTGCCACCAATAATTGTCAATAGTATA-ACC-GTCAACAAATAATGGTGTGCCGTAAAAC
gi|118200 : T-GT-TAAAT-----TG--A---A-TGCAAC-TATGGTCGTTTGTTATATG------TA-AAAT---CAATATA---AA-GCCAAA-CG-C-CTTCGCT----TATA--GCGCAAACAGATT--CTCATAAAGTA-TC-AG--A--CGAA----TTCGACCCG-ACG------TA----TTTAA------------ATT---ATA----T--T--GA--TTG-TG--T-ATCTGTACACACTA--G-TTGTGT-T-----A--GGTTAC--AATGGTA---TACCT--T-TATT--A---ATAAG-ACATT-ATCATTT-G-TAACTGTTACATTATATGCCGTAAACCATCAGTAATTGCCATAA-TCAG-AAT-ACCAACAGAC
gi|118201 : TATA--TA--G---GGTGCGAC-TAGGGTTGTTTATTTTTTA------TA-A-AA---CAATATAT-TAC-GCCAAA-CA-T-CACCGCG----TAAA--GTGTAAATAAATA--TGCTTATAGTA-TCGGT--A--AGAT----TTAGCTTTA-ATA------TAGACCTTC-----AAT-T--G-ATT--------------------TTG-T---T-ATCTGTACATACTA--A-TTGCG
gi|118202 : TGGTTGTTAACTTTATG------TATAT-T---CAATATAT-TAA-GCCAAA-CAAC-CC--GCT----TATA--GCGCAAAAAAATTGATACTAGTAATG-AA-GG--A--ATTG-------GACCCA-ACTAAA---TAAACCTTCAATATATT-T--A-ATT---ATA----T--T--GA--TTG-TAG-T-ATCTGTATACACTATAA-TT---C-TA----T--GGTTAC--AATAGTA---TATAT--T-TAGT--A---CTATG-GCAAT-ATCGTAT-G-TAACAT------TATATGCAGCATCACATCAGTAAACGTTAATA-TAAG-AAT-ATTAACAATCTACGGTATGCCGTCAAAC
gi|118203 : attGGTA--TTGTTAT---------TA-A-AT---CAATACAT-AAG-ACCA-A-CA-CATTGCTCT----TATAAAGTGCAAATTCATT--TGCTAAAAGTA-TTTAT--A--AGTGAAGTTTTAATCGGTATG------TAAGCCTT-AATAGAATAT--A-ATT--AC-A----T--T--CA--TT-----------TGTGTAT------------------------GGTTAC--GATGATA---TAACT--T-TAGC------GTAAT-GC--T-ATCGTTT-G-TAATCT------TATAAACAGCGTATCGACAGTAATGGTCATTA-T--GCACT-ATTAACAAACTA
gi|118204 : TTTTCTATATGCATTTATA-AAAC---CAGCATGT-AAG-GCAAAA-CA-A-CACTGCT----TATA--GAGCTAATTTGTT--TGTTTAAAGTA-TC-AG--AGAAGTA----T-------A-GAT------T-----TTCAGTATATT-T--T-AAT--TATA----T--T--GA--GAG-AA--TTATCTGTACACACTA--A-TTGTACATGTATAT--GGTTAC--AATGGTATTGGACTT--T-TGTA--C----TATG-ATAAT-ATC-----G-CAATTT------TCTGTA-----TACCATCAGTAGTTGTCAAT
gi|118205 : taACATG------TA-AAAC---CAATATAT-TAA-GCTAAA-CA-A-CTCCGCT----TATA--GCGCA------------C---CGAT--T----------GTG----TTAAACCTA-ACTA-----TAGACCTTCAATAGAAT-TT-G-ATT---ATA----T--T--GA--TTG-CGG-T-ATCTGTATACACTA--T-GTGTGC-A-----A--GGTTAC--AACGATA---TAACT--T-TAAT--A---TTATG-GCAAT-TTCGTAT-G-CATCCT------TATATGCAGCATCCTTTCAGAAATTGCCAATA-TAAG-ACT-ATCAGCAAACTACGGTATGTCGTCAA
gi|118206 : ATA------TA-GTACAATCAATATAT---G-GCCAAAACA-A-T---GCT----CATAAAGTGCAAATTCATT--TGCTAATAGTA-CC-AGTGA--AGTT----TT------A-ACTGGTATGTAAGCCTT-AATAGAA--------------TA----T--T---A--TT----------------ACATTA--A-TT-TGT-T-----TATGATTAT--GATGATA---CATCT--T-TATTACT---GTAG---TGAT-ATCGTAT-G-TAATCT------TATAAACTGTGTATCAACAGTAATAGTCAATA-T--GCAAT-ATTAACAAACTA
gi|118207 : TAC---CAATATTT-TAA-GCCAAA-TA-A-CACTGCT----CATA--GCGCAAATTACTT--TGCTTATATTG-TC-AGC-A--AG-A----TTCGACCTA-AATA-----TGAACTTTCGATAAAAT-T--T-AAT--TCTA----T--C--TA--TAGAGG--T-GTCTGTACACACTA--A-TTGTGT-G-----T--GGTTAT--AATGGTA---AAATA--C-AATT----------G-ATAGTTATC-TTATG-TAACCG------TATATCCAGCGTACCATCAGTAATTGTCAATAGTAA--ACC-ATCAACAAATTACAATGTGCTGTAAAAC
gi|118208 : TAC---CAATA-GTATAA-GTCAAA-CA-A-CGCTGCT----CATA--GCGCAAATCGCTT--TGCTTG---TA-TC-GT--C--AGCGATA-TTCGACCTA-ACTA-----TAAA--TTTAA--------------T--TCTA----T--CTAAA--GTG-T---T-ATCTGTACACACTT--A-TTGTGC-A-----T--AGTTAC--AATGGTA---AAATA--T-AATT--G---GTAGT-----T-ATC-TTATG-TAACCA------TATATCCAGCTTACCACCAATAATTGTCAATAGTATA-ACC-ATCAACAAATTATGGTGTGCCGTAAAAC
gi|118209 : AG-GCCA-A-CA-C-ATT-GCTCTAATATA--GCGCAAATTAATA--TGCTAATAGTATTT-AT--A--AG-------------------------TGAAGCTTTAATCGGTA-T--G--------TAAGCCT--T--AA--TTG-AA--T-ATAAGT--ACATTC--ATTTGTGT-A-----T--GGTTAC--GATAATA---TATCA--T-TATTACC---GTAAT-GC--T-ATCGTAT-G-TAATCG------TATAAACAGCGTATCGACTGTAATGGTCATTA-T--G-CACAATTAACAAGCTAACTGATGCCATGAA
gi|118210 : CTAAA-CA-C-CTCTGCT----TATA--GCGGAAGTAGAAT--TGCTTATAGCA-TT-GG--A--GGGA----TTCGACATA-A--------TAAACATTCAA-ATAAA------ATT--TA-A----T--T--CAC-TTG-TA--T-ATCTGTACACACTA--G-TTGTCT-T-----A--ATTTAC--AATGGTA---CGATT--T-AATTA-C---ATAAT-ACAAT-ATCGTAT-G-TAACAT------TATATACCGCATACCGTCAATAATTGTCAATA-TATA-AAA-ATCAACAAACTATAGTATGCCGTAAAAC
gi|118211 : TTCAACCAAAA-T----ATAAACCTA----T--T--GA--TAG-TGGCC-A-CTGTACACACTA--A-TGGTAT-A-----T--GGTTAC--ACTAGTA---TGATTAAT-TACT------ATAG---CAAT-ATTGTAT-G-TAACCT------TCTATGCAGCATACCAACATTAATTGTCAATA-TAAG-AAT-ACCAACAAACTAAGGTATGCCGTCAAAC
gi|118212 : agtcacctggttctttatgcacatttaattttgcttatattatcgacgaagAGAAA-T--A-ATT--TCTA----T--T--GA--TTG-TA--T-ATCTGTTCACACTA--A-TT---------------GTTAC--CATGTTA---AATTT--T-TATTA-TTTAATAAC-ACAGC-A--GTTA-ACCAATCG------AGCATA
gi|118213 : A--TTG-TA--T-ATCTGTGCACACTA--A-TTGTGC-TAC---C--AATCAC--ACT-GTA---ATATT--T-TACT--T---ACAAaca
gi|118214 : TCTGTGCACACTA--A-TTGTAT-T-----C--AGTTGC--TATGGTA---ATATT--TCTATT--T---GTATG-ACAGT-ATCGTTA-G-CAACCG------TATATACCACATACAGACAGTAATTGTCAATA-TAAG-AAT-ATCAGCAAACTAGAGTATGCCGTAAAAC
Alignments
lowQualScore : 111111 1111111111 11 111111 111111 1111111111 1111111
lowQualScore : 99 3 3 3 777777 1 2 33 5 33 3 2 1 66 888 66666 444444 99 33 4 2 3333333333 7777777 333 44444 66 0 888 33 11 4 1 4 2 22 22 55 77777 6666666 4 4 2 99999999 1 22 444444 1 3 222 1 0 1 1 1 1 555555 2222 33 1 1 333 1 2 777 11 000000 22 22 1 666666 2 2 99999999 0 2222 11 11 66 1 999 1 1 11 1 0000000000 333 2222 11 1 4444444 2 2 1 3 8 1 5555555 0 2 2 1 8 3 1 1
lowQualScore : .. . . . ...... . . .. . .. . . . .. ... ..... ...... .. .. . . .......... ....... ... ..... .. . ... .. .. . . . . .. .. .. ..... ....... . . . ........ . .. ...... . . ... . . . . . . ...... .... .. . . ... . . ... .. ...... .. .. . ...... . . ........ . .... .. .. .. . ... . . .. . .......... ... .... .. . ....... . . . . . . ....... . . . . . . . .
lowQualScore : 44 1 1 1 777777 0 9 99 7 44 2 5 0 99 888 00000 222222 88 44 7 4 6666666666 2222222 999 33333 55 3 222 22 88 7 6 2 1 99 88 55 88888 5555555 7 0 0 55555555 7 22 666666 6 0 666 5 3 5 4 5 4 000000 8888 77 2 0 111 4 8 666 99 555555 66 22 4 000000 3 3 99999999 2 8888 88 88 66 3 777 3 7 77 2 6666666666 222 4444 88 3 6666666 8 3 4 5 3 4 0000000 9 2 1 8 9 0 5 0
consensus : TTTTTA-TTTAACT-AGT-TGT-TT------AGTTGANTA-TT--TTT-AT--TTGCTA-ATATTNATGCAGAT--TTT---ATATG-A-GACTTT--CTTTGATGACTAAAA-GT--TGACGATTAATT-ATTA-AGAN---------TTTAATTATTT-------TAC---T--C--TACCTTGTG--CAGCCAAATGATGA---GTTA--AAA-CA-GTAGT-GT-TGA--GTGT--A--TAA---G-TG-------TTAC-T-ATGGTA------GTTTAC-TATA--TG------TA-ATAC---CNATATGT-T-AGGCCAGA-CACCTC-CGCT----TATA--GCGCAAATAAATTTGCTNATG--GTA-TC-AN--A--AGTA----TCCGACCCA-ACT------TGAACCTTCAACAGAA-AT---G-ATTTCTA----T--T--GA--TTG-TA--T-ATCTGTGCACACTA--A-TTGTGC-T-----C--GGTTAC--NATGGTA---AAATT--T-TATT--T---GTAAG-ACAAT-ATCGTTA-G-CAACCG------TGTATACCGCGTACCAACAGTAATTGTCAATA-TAAG-AAT-ATCAACAAACTANAGTATGCCGTAAAAC
Reference ( family-605 ) : TTTTTA-TTTAACT-AGT-TGT-TT------AGTTGANTA-TT--TTT-AT--TTGCTA-ATATTNATGCAGAT--TTT---ATATG-A-GACTTT--CTTTGATGACTAAAA-GT--TGACGATTAATT-ATTA-AGAN---------TTTAATTATTT-------TAC---T--C--TACCTTGTG--CAGCCAAATGATGA---GTTA--AAA-CA-GTAGT-GT-TGA--GTGT--A--TAA---G-TG-------TTAC-T-ATGGTA------GTTTAC-TATA--TG------TA-ATAC---CNATATGT-T-AGGCCAGA-CACCTC-CGCT----TATA--GCGCAAATAAATTTGCTNATG--GTA-TC-AN--A--AGTG----TCCGACCCA-ACT------TGAACCTTCAACAGAA-AT---G-ATTTCTA----T--T--GA--TTG-TA--T-ATCTGTGCACACTA--A-TTGTGC-T-----C--GGTTAC--NATGGTA---AAATT--T-TATT--T---GTAAG-ACAAT-ATCGTTA-G-CAACCG------TGTATACCGCGTACCAACAGTAATTGTCAATA-TAAG-AAT-ATCAACAAACTANAGTATGCCGTAAAAC
gi|118181 : TTTTTA-TTTTACTTAGC-TGT-TT------AGTTGAATA-TT--TTT-AT--TTGCTA-ATATTGATGCAGAT--TTT---ATATG-A-GACTTT--CTTTGATGACTAAAA-GT--TGACGATTAATT-ATTA-AGAT---------TTTAATCATTT-------TAC---T--C--TACCTTTTG--CAGCCAAATGATGA---GTTA--AAG-CA-GTGGT-GT-TGA--GTGT--A--TAA---G-TG-------TTAT-T-TTGGTA------GTTTAC-TATA--TG------TA-ATAC---CTACATGT-T-AGGCCAGA-CACTTT-TGCT----TGTA--GCGCAAATAAATTTGCTAGCG--GTA-TC-AT--A--AGTG----TCCGACTCA-ACT------TGAACCTTCAACAGGA-TT---G-ATTTCTG----T--T--GA--TTG-TA--T-ATCTGTACCCACTA--A-TTGTGC-T-----C--GGTTGC--TATGGTA---AAATT--T-TATT--T---GTAAG-ACAAT-ATCGTTA-G-CAACCG------TGTATACGACATACAAACAGTAATTGTCAATA-TAAG-AAT-ATCAACAAATTAGAGTATGCCGTAAAAC
gi|118182 : TTTTTA-TT-GACT-AGT-AGT-TT------AGGTGATTA-TT--TTA-AT--T-ACTA-ATATTTATGCAGAT--ATT---ATATA-G-GGCGCA--CTTCAATGATTAAAA-AT--TGACGACTAATT-ATTA-AGAAA--------TTTAGTTATTT-------TTC---T--C--TATCTTGTG--CAGCCAAGTGATAA---GTTA--AA--CA-GT-TT-ATCTGT--GTAG--A--TTA---A-TA-------TTAC-T-ATGGTA------ATT-AC-TATA--AG------TA-ATAC---CTATATGT-T-AGGCCAGA-CACTTT-CGCT----TATA--GCGCAAATAAATTAGCAGATG--GTA-TC-AA--A--AGTA----TCTGTCTCA-ACC------TGAACCTTCAACAGAA-AT---G-ATTTCTA----T--T--GA--CTG-TA--T-ATCTGTGCACACTA--A-TTGTGC-T-----C--AGTTGC--TATGGTA---AAATT--T-TATT--T---GTTAG-ACAAT-ATTGTTA-G-CAACCA------CCAATACCACATACCAACAGTAATTGTCAATA-TAAG-ACT-ATCAACAAACTAGAATATGCTGTAAAAC
gi|118183 : tTTTTTT-TTTGACT-ACT-AGT-TT------AGTTGATTA-TT--TTA-AT--T-ACTA-ATATTTATGCAGAT--TTT---ATATA-A-GGCATT--CTTCGATAACAAAAA-AT---GATGATTAATT-TTTA-AGAA---------TTTAATTATTT-------TTC---A--C--TACCTTGTG--CAGACAAGTGATGA---GTTA--AA--CA-GTTAT-TT-TGT--GTGA--A--TAA---A-TG-------TAAC-T-ATGGTA------ATTTAC-TATA--TG------TA-ATAC---CTATATGT-T-AGGCCAGA-CACTTT-TGCT----AATA--GCGCAAATAAATTTGCTAATT--GTA-TC-AA--A--AGTA----TCCTACTCA-ACC------TGAACTTTCAACAGAA-AT---G-ATTTCTA----T--T--GA--ATG-TT--T-ATCTGTGCACACTC--G-TTGTGG-T-----C--GGTTGC--TATGGTA---GAATT--T-TATT--T---GTTAG-ACAAT-ATCGTTA-G-CAACCG------TGTATACCTCATACCAACAGTAATTGTCAATA-TAAG-AAT-
gi|118184 : TTCTTT-TTTAACT-AGT-AGT-TTTAAATTAGTTGATTA-TT--TCA-AT--A-ACTA-ATATTTATGCAGAT--TTT---ATA---A-GA-------------GACTAAAA-AT--TGGCAATTAATT-ATTA-AGAA---------TTTAAATCTTT-------TTC---T--T--TACCTTGTGTGCAGCCAAGTGATGA---GTTA--AA--CA-GTTAT-GT-TGT--GTAG--A--TGA---A-TG-------TTGC-T-TTGGTA------ATTTAC-TATA--TG------TA-ATAC---CTATATGT-C-AGGCCAGA-CACTTT-CGCT----TAAA--GCGCAAATACATTTGCTAATG--GTA-TC-AA--A--AGTA----TGCGACTCA-ACC------TGAACCTTCAACAGAA-AT---G-ATTTCTA----T--T--GA--TTG-TA--T-GTCTGTGCACACTA--A-TTGTGC-T-----C--GATT--------GTA---AAATT--T-TATT---------AA-ACAAT-ATCGTTA-G-CAACCG------TGTATACCACATACCAACAGTAATTGTCAATA-TAAG-AAT-ATCAATAAACTAGAGTATGCCGCAAAAC
gi|118185 : TTTTTA-CTTAATC-AGT-TGT-TT------AAATAGTTA-TT--TTT-AA--TTGCTT-ATATTGATGCAGAC--TTT---AT--G-C-GATTTA--CTTCAAT-ATTCAA--GTACTAACGTTTAATT-ATTG-AAAC---------TCCAGGCATTC-------TAC---T--C--TACCTTGTG--CAGCCAAAATATGA---TTTA--AAAATA-TTAGT-AC-CGA--TTGT--A--CTA---G-CA-------TTAC-T-ATGGTA---------------TG--TG------TA-GAAC---CTATATAT-T-AGGCCAGA-CGCTTT-TGCT----TATA--GCGCAAATAAATTTGCTTGAG--ATA-TC-AT--A--AGCG----TCCGACCCA-ACT------TGAACCCTCAACAGGA-AT---G-ATTCCCG----C--T--GA--TTG-TT--T-ATCTGTGCACACTA--A-TTGTGC-T-----C--AGTTGC--TATGGTA---ATATT--T-TATT--T---GTATG-ACAGT-ACCGTTA-G-CAACCG------TATATACCACATACAGAGAGTAATTGTCAATA-TATA-AAT-ATCAACAAACTAAAGTATGCCGTAAAAC
gi|118186 : TTTTTA-TTTAACT-AGT-TGT-TT------AGTTGAATT-TT--TTT-TT--TTGCTA-ATATTGATGCAGAC--TTT---ATATG-A-GACTTT--CTTTAATGACTAATT-GT--TAACGATTAATT-ATTA-AGAT---------TTTAATTATTT-------TAC---T--C--TACCTTGTG--CAGCCAAATGATGA---GTTA--AAA-TA-GTAGT-GT-TCA--GTGT--A--TAA---G-TG-------TAAC-T-ATGGTA------CTTTAC-TATA--TG------TA-AAAC---CTATATGT-T-AGGCCAGA-CACTTT-TGCT----TATA--GCTCAAATA
gi|118187 : TTTTTAATTTAACT-AGT-TAT-TT------AGTTGAATA-TT--TTTTAT--TTGCTA-ATATTGATGCAGAC--TTT---ATATG-G-GACTTT--CTTTGATGACCAAAAAGT--TGACGATTATTT-ATTA-AGAT---------TTTAATTATTT-------TAC---T--C--TACCTTGTG--CAGCCAAATGATGA---GTTA--AAA-TA-GTAGT-GT-TGA--ATGT--A--TAA---G-TG-------TTAT-T-ATAGTA------CTTTAC-TATA--TG------TA-ATAC---CAATATGT-T-AGGCCAGA-CACTTT-TGCT----TATA--GTGCAAATAAATTTGCTAATG--GTA-TC-AT--A--AGTG----TCGGACTCA-ACT------TGAACCCTCAACAGGA-AT---G-ATTTCTG----T--T--GA--TTG-TA--T-ATCTGTGCACACTA--G-TTGTGC-T-----C--AGTTGC--TATGGTA---AAATT--T-TGTT--T---GTAAG-ACAAT-ATCGTTG-G-CAACCG------TGTATACCACATACAAACAGTAATTGTCAATA-TAAG-AAT-ATCAACAAAGTAGAGTATGCCATAAAAC
gi|118188 : TTTTA-TTTAACT-AGT-TGT-TT------AGTTGAAAA-TT--TTT-AT--TTGCTA-ATGTTGATGCAGAC--TTT---ATATG-A-GACTTT--CTTTAATGACTAAAT-GT--T-ATAATAAATT-ATTA-AGAT---------TTTAATTATTT-------TAC---T--T--TACCTTGTG--CAGCCAAATGATGA---GTTA--AA--TA-GTAGT-GT-TCA--GTGT--A--TAA---G-TG-------TTAT-T-ATGGTA------CTTTAC-TATA--TG------TA-ATAC---CTATATGT-T-AGGCCAGA-TACTTT-TGCT----TATA--GCGCAAATAAATTTGCTTGAG--ATA-TC-AT--A--AGTG----TCCGGCTCA-ACT------TGAACCCTCAACAGGA-AT---G-ATTCCTG----T--T--GA--TTG-TA--T-ATCTGTGCACACTA--A-TTGTGC-T-----C--AGTTGC--TATGGTA---AAATT--T-TATT--T---GTAAG-ACAGT-ATCGTTA-G-AAACCG------TGTATACCACATACAAACAGTAATTGTCAATA-TAAA-AAT-ATCAACAAACTAGAGTATGCTGTAAAAC
gi|118189 : TTTTTAATTTAACT-AGT-TGT-TT------AGTTGAATA-TT--TTTTAT--TTGCTA-GTATTGATGCAGAC--TTT---ATATG-G-GACTTT--CTTTGATGACTAAAAAGT--ATACGATTAATT-ATTA-AGAT---------TTTAATTATTT-------TAC---T--C--TACCTTTTG--CAGCCAAATGATGA---GTTA--AAA-TA-GTAGT-GT-TGA--GTGT--A--TAA---G-TG-------TTAT-T-ATGGTA------CTTTAC-TATA--TG------TA-ATAC---CTATATGT-T-AGGCCAGA-CACTTT-TGCT----TATA--GCGCAAATAAATTTCCTTGTG--ATA-TC-AT--A--AGTG----TCCGAC--------------------TCAACAGGA-CT---G-ATTTCTG----T--T--AA--TTG-TA--T-ATCTGTGAACACTA--A-TTGTGC-T-----C--AGTTGC--TATGGTA---AAATT--T-TATT--T---GTAAG-ATAAT-ATCGTTA-G-CAACCG------TGTACACCACATACAAACAGTAACTGTCAATA-TAAG-AAT-ATCAACAAACTAGAGTATGCCGTAAAAC
gi|118190 : TTTTTAATTTAACT-AGT-TGT-TT------AGTTGAATAGTT--TTT-AT--TTGTTA-ATATTGATGCAGA-------------------CTTT--CTTTAATGACAAAAAAGT--TGACGATTAATT-ATTA-AGAT---------TTTAATTATTA-------TAC---C--C--
gi|118191 : TTTT--TTTAACT-AGT-AGT-TTTAAATTAGTTGATTA-TT--TAA-AT--A-ACTA-ATATTTATTCAGAT--TTT---ATAGG-A-GACGTT--CTTTGATGACTAAAA-AT--TGGCGATTAATT-ATTA-AGAA---------TTTAATTCTTT-------TTC---T--C--TACCTTGTGTGCAGTGAAGTGATGA---GTTA--AA--CA-GTTGT-GT-TGT--GTGG--A--TAA---A-TG-------TTGC-T-TTGGTA------ATTTAC-TATA--TG------TA-ATAC---CTATATGT-T-AAGCTAGA-CACTTT-CGCT----TATA--GTGCAAATAAATTTGCTAACG--GTA-TC-AA--A--ATTA----TCCGACTCA-ACC------TGAACCTTAAACAGAA-AT---G-ATTTCTA----T--T--GA--TAG-TA--T-GTCTGTGCACACTA--G-TTGTGC-T-----C--GATTGC--TATGGTA---AAATT--T-TATT---------AG-ACAAT-ATTGTTA-G-CCACCG------TGTATATCACATACCAACAGTAGTTGTCAATA-TAAG-AAT-ATCAACAAACTAGAGTATGCCGTAAA
gi|118192 : -TTTATCT-A-T-TATATT------AGGTGATTA-TT--ATT-GTAATTACTA-ATATATATTCAGAT--TCT---ATAAG-T-G-CTCTAACTATG-TGATTAAAA-AT--TGACGACTAATT-ATTT-A--------------TAATTAATT-------TATATGT--CATTACCTTGTG--CAGCCAAGTGATAA---ATTATGCAA-C------T-AT-TAA--GTAT--T--TGATTCA-TG-------TGAA-T-ATGGTT------GTTTAC-TATA--CG------TA-ATAC---CT-------------C----CGTCTC-CGCT----TATA--GCGCAAATAAATTTGCTTGTA--GTA-TC-AA--A--AGTA----TCTGGCTCA-ACC------TAAAGCTTCAACAGAA-AT---A-ATTTCTA----T--T--GA--TTG-TA--T-ATCTGTGCACACTA--A-TGGTGC-T-----A--GGTTAC--TGCGGTA---TACTT--T-TATT--T---ATAAG-ACAGT-ATTCTTA-A-CAACGT------TACATAGCACATACATTCAGTAATAGTCAATA-TAAG-AAT-ATCAACAAACTAAAGTATGCCGTAAAAC
gi|118193 : -TTTAACT-AGTATAT-CG------GGT-GATTA-TTATTTT-AA--TTGCTA-TTATTTATGCAGATACTAT---ATATT-ATGATGTA--GCTAGATGATTTAAA-AT--TGTCAACCAATT-ATTTTAGAA---------TT-AA--GTTT---------C---T--C--TACCTTGTG--CAGCCAAGTGATAA---A-TG--AAA-CA-A-AG--GT-TAT--GTGTAAA--TTA---G-TG-------TGAT-T-ATGGTT------ATTTAC-TATA--TG------AA-ATAC---CTATATAT-TAAAGCGAGT-CAATTT-TGCT----TATA--GTGCAAATAAATTTGCAGATG--GTA-TT-AA--A--ATTA----TCTGGCTCA-ACC------TAGACCTTCAACAGAA-AT---G-ATTTCTA----T--T--GA--TTG-TA--T-ATCT-T-CACACTA--A-TTGTGC-T-----A--GGTTGCTATATGGT-----AATT--T-TTTT--T---ACAA
gi|118194 : --TTGTTT-ATACTCATG-ATAT--TTTTAAATTTGTA-GA--------TTGACGACCAAAG-----TGTAGATTAATCGACTA-AGAA---------TATTATTATTTCTTTTTGTAT---T-----TACCGATTG--CAGCCATAT-ATTACTTATTA--GTG-CATGTAATTGA-TTA--ATTT--AAATAA---GGTG-------C-ACAT-ATGGTT------GTTCAC-------------------------CAATATTT-T-AAGTTAAA-CAACAC-TGCT----CATA--GCGCAAATTGCTTTGCTTATA--ACG-TC-AG--C--GATA----TTCAACCTA-ACTA-----TAAACCTTAGATAAAA-AT---TTAATTCCA----T--C--CAAGGTG-T---T-ATCTGAACACATTA--A-TTGTGT-G-----T--GGTTAC--AAAGGTA---AAAT---------------ATAAGTACT-T-ATC-TTATG-TAACCA------TGTATCCAGCGTACCACCAATAATTGTCAATAGTAA--ACC-ATCAACAAATTATGGTGTGCCGTAAAAC
gi|118195 : aactattttacatttttggattcggttcttactaattactaacaA-TT--TTT-TT--TTATTATATATATATATAGATACTTC---ATAAC-A-GACTTT--CTTTGATGACTAAAA-GT--TGACGATTTATT-ATTA-AGAT---------TTTAATTATTT-------TAC---T--C--TACCTTGTG--CAGCCAAATGATGA---GTTA--AAA-CA-GTGGT-GT-TGA--GTGT--A--TAA---G-TG-------TTAT-T-CTGGTA------GTTTAC-TATA--TG------TA-ATAC---CTATATGT-T-AGGCCAGA-CACTTT-TACT----TATA--GCGCAAATAAATTTGCTAGTG--TTA-TC-AT--A--AGTG----TCCGACTTA-ACT------TGAACCTTCAACAGGA-TT---G-ATTTCTG----T--T--GA--TTG-TA--T-ATCTGTGCCCACTA--A-TTGTGC-T-----C--GGTTGC--TATGGTA---AAATT--G-TATT--T---GTAAG-ACAAT-ATCGTTA-G-CAACCG------TATATACCACATACAAATAGTAATTGTCAATA-TAAG-AAT-ATCAACAAACTAGAGTATGCCGTAAAAC
gi|118196 : --TTGTTT-ATACTCATG-ATAT--TTTTAAATTTGTA-GA--------TTGACGACCAAAG-----TGTAGATTAATCGACTA-AGAA---------TTT------TG-------TAT---T-----TACCGATTG--CAGCCATAT-ATTACTTATTA--GTG-CATGTAATTGA-TTA--ATTT--AAATAA---GGTG-------C-ACAT-ATGGTT------GTTCAC-------------------------CAATATTT-T-AAGTTAAA-CAACGC-TGCT----CATA--GCGCAAATTGCTTTGCTTATA--TCG-TC-AG--C--GATA----TTCAACCTA-ACTA-----TAAACCTTAGATAAAA-AT---TTAATTCTA----T--C--CAAGGTG-T---T-ATCTGAACACATTA--A-TTGTGT-G-----T--GGTTAC--AATGGTA---AAAT---------------ATAAGTACT-T-ATC-TTATG-TAACCA------TGTATCCAGCGTACCACCAATAATGGTCAATAGTAA--ACC-ATCAACAAATTATGGTGTGCCGTAAAGC
gi|118197 : GATTAATT-AACA-AAAAAAAAATAGTTTTATTTCTTT-------TTC---TATT--TACCGATTG--CAGCCATAT-ATTA---CATA--AAC-CC-ATA-T-AT-TAAAGGTTT--A--TAATTAG-TGCATGTAATTAC-TTATATTAAATGAGGTGCACCTATGGTTG------TT--TAC---CAATATTT-T-AAGACAAA-CAACAC-TGCT----CATA--GTACAAATTACTTTGCTTATA--TTG-TC-AGC-G--AGT-----TTCGACCTA-AATA-----TAAACTTTCGATAAAA----------TTCTA----TCTT--AA--GTG--G--T-ATCTGTACACACTA--A-TTGTGT-A-----T--GGTTAC--AATGGTA---AAA-T--A-TAAT--T---GTTAG----TT-ATC-TTATG-TAACCA------TATATCCAGCGTACCACCAATAATTGTCAATAGTAAA-ACC-ATCAACAAATTATATTGTGCTGTAAAAC
gi|118198 : TTT-------TAC---T--C--TACCTTGTG--CAGCCAAATGATGA---GTTA--AAA-TA-GTAGT-GT-TGA--GTGT--A--TAA---G-TG-------TTAT-T-ATGGTA------CTTTAC-TATA--T-----------------------GT-T-AGGCCAGA-CACTTT-TGCT----TATA--GCGCAAATAAATTTGCTTGAG--ATA-TT-AT--A--AGTG----TCCGACTCA-ACT------TGAACCCTCAACAGGA-AT---G-ATTTCTG----T--T--AA--TTG-TT--T-ATCTGTGCGCACTA--A-TTGTGC-T-----C--AGTTGC--TATGGTA---AAATT--T-TATT--T---GTAAG-ACAGT-ATTGTTA-G-CAACCT------TGTATACCACATACAAACAGTAATTGTCAATA-TAAG-AAT-AT-AACAA
gi|118199 : T-AT-TAA--ATG-------AA---G-TG-------CACC-T-ATGGTT------GTTTAC-------------------------CAATATTA-T-AAGTCAAA-CAACAC-TGCT----CATA--GTGCAAAT-----CGCTT------TG-TC-AG--C--GATA----TTTGACCTA-ACTA-----TAAACTTGAGATA-AA-ATTTAA-ATTTATC----T--A--AA--GTG-T---T-ATCTGTACACATTA--A-TTGTGT-A-----T--AGTTAC--AATGGTA---AAATA--T-AATT--G---GTA-----GAT-ATC-TTATG-TAACCA------TATATCCAGCGTGCCACCAATAATTGTCAATAGTATA-ACC-GTCAACAAATAATGGTGTGCCGTAAAAC
gi|118200 : ttaT-GT-TAA--AT-------TGA---A-TG-------CAAC-T-ATGGTC------GTTTGT-TATA--TG------TA-AAAT---CAATATA----AAGCCAAA-CGCCTT-CGCT----TATA--GCGCAAACAGATT--CTCATAAAGTA-TC-AG--A--CGAA----TTCGACCCG-ACG------TA----TTTAA-------------ATT-ATA----T--T--GA--TTG-TG--T-ATCTGTACACACTA--G-TTGTGT-T-----A--GGTTAC--AATGGTA---TACCT--T-TATT--A---ATAAG-ACATT-ATCATTT-G-TAACTGTTACATTATATGCCGTAAACCATCAGTAATTGCCATAA-TCAG-AAT-ACCAACAGAC
gi|118201 : TAT--A--TAG---GGTG-------CGAC-T-AGGGTT------GTTTAT-TTTT--TA------TA-A-AA---CAATATAT-T-ACGCCAAA-CATCAC-CGCG----TAAA--GTGTAAATAAATATGCTTATA--GTA-TCGGT--A--AG----------------ATT------T--AGCTTTAATATAG-AC------CTTCAA----T--T--GATTTTG-T---T-ATCTGTACATACTA--A-TTGCG
gi|118202 : TGGTT------GTTAAC-TTTA--TG------TATAT-T---CAATATAT-T-AAGCCAAA-CAAC-C-CGCT----TATA--GCGCAAAAAAATT-GATACTA--GTA-AT-GA--A--GGAA----TTGGACCCA-ACTAAA---TAAACCTTCAATATAT-TT---A-ATT-ATA----T--T--GA--TTG-TAG-T-ATCTGTATACACTATAA-TT---C-TA----T--GGTTAC--AATAGTA---TATAT--T-TAGT--A---CTATG-GCAAT-ATCGTAT-G-TAACAT------TATATGCAGCATCACATCAGTAAACGTTAATA-TAAG-AAT-ATTAACAATCTACGGTATGCCGTCAAAC
gi|118203 : attGGTA--------TTGT-TAT-----------TA-A-AT---CAATACAT-A-AGACCA-A-CACATTGCTCT----TATAAAGTGCAAATTCATTTGCTAAAA--GTA-TTTAT--A--AGTGAAGTTTTAATCGGTATG------TAAGCCTT-AATAGAATAT---A-ATTAC-A----T--T--CA--TT-----------TGTGTAT------------------------GGTTAC--GATGATA---TAACT--T-TAGC------GTAAT-GC--T-ATCGTTT-G-TAATCT------TATAAACAGCGTATCGACAGTAATGGTCATTA-T--GCACT-ATTAACAAACTA
gi|118204 : TTTTC-TATA--TGCATTTATA-AAAC---CAGCATGT-A-AGGCAAAA-CAACAC-TGCT----TATA--GAGCTAATTTGTTTGTTTAAA--GTA-TC-AG--AGAAGTA----T-------A-GAT------T-----TTCAGTATAT-TT---T-AATTATA----T--T--GA--GAG-AA--TTATCTGTACACACTA--A-TTGTACATGTATAT--GGTTAC--AATGGTATTGGACTT--T-TGTA--C----TATG-ATAAT-ATC-----G-CAATTT------TCTGTA-----TACCATCAGTAGTTGTCAAT
gi|118205 : taACA--TG------TA-AAAC---CAATATAT-T-AAGCTAAA-CAACTC-CGCT----TATA--GCGCA----------CCGATT--GTG-TT-AA--A---------------CCTA-ACTA-----TAGACCTTCAATAGAA-TTT--G-ATT-ATA----T--T--GA--TTG-CGG-T-ATCTGTATACACTA--T-GTGTGC-A-----A--GGTTAC--AACGATA---TAACT--T-TAAT--A---TTATG-GCAAT-TTCGTAT-G-CATCCT------TATATGCAGCATCCTTTCAGAAATTGCCAATA-TAAG-ACT-ATCAGCAAACTACGGTATGTCGTCAA
gi|118206 : A--TA------TA-GTACAATCAATATAT----GGCCAAAACAAT----GCT----CATAAAGTGCAAATTCATTTGCTAATA--GTA-CC-AGTGA--AGTT----TT------A-ACTGGTATGTAAGCCTT-AATAGAA-------------TA----T--T---A--TT----------------ACATTA--A-TT-TGT-T-----TATGATTAT--GATGATA---CATCT--T-TATTACT---GTAG---TGAT-ATCGTAT-G-TAATCT------TATAAACTGTGTATCAACAGTAATAGTCAATA-T--GCAAT-ATTAACAAACTA
gi|118207 : TAC---CAATATTT-T-AAGCCAAA-TAACAC-TGCT----CATA--GCGCAAATTACTTTGCTTATA--TTG-TC-AGC-A--AG-A----TTCGACCTA-AATA-----TGAACTTTCGATAAAA-TT---T-AATTCTA----T--C--TA--TAGAGG--T-GTCTGTACACACTA--A-TTGTGT-G-----T--GGTTAT--AATGGTA---AAATA--C-AATT----------G-ATAGTTATC-TTATG-TAACCG------TATATCCAGCGTACCATCAGTAATTGTCAATAGTAA--ACC-ATCAACAAATTACAATGTGCTGTAAAAC
gi|118208 : TAC---CAATA-GTAT-AAGTCAAA-CAACGC-TGCT----CATA--GCGCAAATCGCTTTGCTT-----GTA-TC-GT--C--AGCGATA-TTCGACCTA-ACTA-----TAAA--TTTAA---------------TTCTA----T--CTAAA--GTG-T---T-ATCTGTACACACTT--A-TTGTGC-A-----T--AGTTAC--AATGGTA---AAATA--T-AATT--G---GTAGT-----T-ATC-TTATG-TAACCA------TATATCCAGCTTACCACCAATAATTGTCAATAGTATA-ACC-ATCAACAAATTATGGTGTGCCGTAAAAC
gi|118209 : -AGGCCA-A-CACATT--GCTCTAATATA--GCGCAAATTAATATGCTAATA--GTATTT-AT--A--AG-------------------------TGAAGCTTTAATCGGT-AT---G------TAAGCCT--T--AA--TTG-AA--T-ATAAGT--ACATTC--ATTTGTGT-A-----T--GGTTAC--GATAATA---TATCA--T-TATTACC---GTAAT-GC--T-ATCGTAT-G-TAATCG------TATAAACAGCGTATCGACTGTAATGGTCATTA-T--G-CACAATTAACAAGCTAACTGATGCCATGAA
gi|118210 : CTAAA-CACCTC-TGCT----TATA--GCGGAAGTAGAATTGCTTATA--GCA-TT-GG--A--GGGA----TTCGACATA-A--------TAAACATTCAA-ATAA-A------ATTTA-A----T--T--CAC-TTG-TA--T-ATCTGTACACACTA--G-TTGTCT-T-----A--ATTTAC--AATGGTA---CGATT--T-AATTA-C---ATAAT-ACAAT-ATCGTAT-G-TAACAT------TATATACCGCATACCGTCAATAATTGTCAATA-TATA-AAA-ATCAACAAACTATAGTATGCCGTAAAAC
gi|118211 : T----TAT---GCACATTTAATTTTGCTTATA--TTA-TC-GACGA--AGT-----TC--AACCA-A-----------------AATATAA-AC---------CTA----T--T--GA--TAG-TGGCC-A-CTGTACACACTA--A-TGGTAT-A-----T--GGTTAC--ACTAGTA---TGATTAAT-TACT------ATAG---CAAT-ATTGTAT-G-TAACCT------TCTATGCAGCATACCAACATTAATTGTCAATA-TAAG-AAT-ACCAACAAACTAAGGTATGCCGTCAAAC
gi|118212 : agtcacctggttctAGAA-AT---A-ATTTCTA----T--T--GA--TTG-TA--T-ATCTGTTCACACTA--A-TT---------------GTTAC--CATGTTA---AATTT--T-TATTA-TTTAATAAC-ACAGC-A--GTTA-ACCAATCG------AGCATA
gi|118213 : A--TTG-TA--T-ATCTGTGCACACTA--A-TTGTGC-TAC---C--AATCAC--ACT-GTA---ATATT--T-TACT--T---ACAAaca
gi|118214 : TCTGTGCACACTA--A-TTGTAT-T-----C--AGTTGC--TATGGTA---ATATT--TCTATT--T---GTATG-ACAGT-ATCGTTA-G-CAACCG------TATATACCACATACAGACAGTAATTGTCAATA-TAAG-AAT-ATCAGCAAACTAGAGTATGCCGTAAAAC
Alignments
lowQualScore : 111111 1111111111 11 111111 1111111111 1111111
lowQualScore : 99 3 3 3 777777 1 2 33 5 33 3 2 1 66 888 66666 444444 99 33 4 2 3333333333 7777777 333 44444 66 0 888 33 11 4 1 4 2 22 22 55 77777 6666666 4 4 2 99999999 1 22 444444 1 3 222 1 0 1 1 1 1 555555 2222 33 1 1 333 1 2 777 11 666666666 22 33 1 666666 1 2 88888888 1 2222 11 11 44 1 999 1 1 11 1 0000000000 333 2222 11 1 4444444 2 2 1 3 8 1 5555555 0 2 2 1 8 3 1 1
lowQualScore : .. . . . ...... . . .. . .. . . . .. ... ..... ...... .. .. . . .......... ....... ... ..... .. . ... .. .. . . . . .. .. .. ..... ....... . . . ........ . .. ...... . . ... . . . . . . ...... .... .. . . ... . . ... .. ......... .. .. . ...... . . ........ . .... .. .. .. . ... . . .. . .......... ... .... .. . ....... . . . . . . ....... . . . . . . . .
lowQualScore : 44 1 1 1 777777 0 9 99 7 44 2 5 0 99 888 00000 222222 88 44 7 4 6666666666 2222222 999 33333 55 3 222 22 88 7 6 2 1 99 88 55 88888 5555555 7 0 0 55555555 7 22 666666 6 0 666 5 3 5 4 5 4 000000 8888 77 2 0 111 4 8 666 99 444444444 00 22 4 000000 2 3 55555555 8 8888 88 88 88 3 777 3 7 77 2 6666666666 222 4444 88 3 6666666 8 3 4 5 3 4 0000000 9 2 1 8 9 0 5 0
consensus : TTTTTA-TTTAACT-AGT-TGT-TT------AGTTGANTA-TT--TTT-AT--TTGCTA-ATATTNATGCAGAT--TTT---ATATG-A-GACTTT--CTTTGATGACTAAAA-GT--TGACGATTAATT-ATTA-AGAN---------TTTAATTATTT-------TAC---T--C--TACCTTGTG--CAGCCAAATGATGA---GTTA--AAA-CA-GTAGT-GT-TGA--GTGT--A--TAA---G-TG-------TTAC-T-ATGGTA------GTTTAC-TATA--TG------TA-ATAC---CNATATGT-T-AGGCCAGA-CACCTC-CGCT----TATA--GCGCAAATAAATTTGCTNATG--GTA-TC-AN--A--AG---TA----TCCGAC-CCA-ACT------TGAACCTTCAACAGAA-AT---G-ATTTCTA----T--T--GA--TTG-TA--T-ATCTGTGCACACTA--A-TTGTGC-T-----C--GGTTAC--NATGGTA---AAATT--T-TATT--T---GTAAG-ACAAT-ATCGTTA-G-CAACCG------TGTATACCGCGTACCAACAGTAATTGTCAATA-TAAG-AAT-ATCAACAAACTANAGTATGCCGTAAAAC
Reference ( family-605 ) : TTTTTA-TTTAACT-AGT-TGT-TT------AGTTGANTA-TT--TTT-AT--TTGCTA-ATATTNATGCAGAT--TTT---ATATG-A-GACTTT--CTTTGATGACTAAAA-GT--TGACGATTAATT-ATTA-AGAN---------TTTAATTATTT-------TAC---T--C--TACCTTGTG--CAGCCAAATGATGA---GTTA--AAA-CA-GTAGT-GT-TGA--GTGT--A--TAA---G-TG-------TTAC-T-ATGGTA------GTTTAC-TATA--TG------TA-ATAC---CNATATGT-T-AGGCCAGA-CACCTC-CGCT----TATA--GCGCAAATAAATTTGCTNATG--GTA-TC-AN--A--AG---TA----TCCGAC-CCA-ACT------TGAACCTTCAACAGAA-AT---G-ATTTCTA----T--T--GA--TTG-TA--T-ATCTGTGCACACTA--A-TTGTGC-T-----C--GGTTAC--NATGGTA---AAATT--T-TATT--T---GTAAG-ACAAT-ATCGTTA-G-CAACCG------TGTATACCGCGTACCAACAGTAATTGTCAATA-TAAG-AAT-ATCAACAAACTANAGTATGCCGTAAAAC
gi|118181 : TTTTTA-TTTTACTTAGC-TGT-TT------AGTTGAATA-TT--TTT-AT--TTGCTA-ATATTGATGCAGAT--TTT---ATATG-A-GACTTT--CTTTGATGACTAAAA-GT--TGACGATTAATT-ATTA-AGAT---------TTTAATCATTT-------TAC---T--C--TACCTTTTG--CAGCCAAATGATGA---GTTA--AAG-CA-GTGGT-GT-TGA--GTGT--A--TAA---G-TG-------TTAT-T-TTGGTA------GTTTAC-TATA--TG------TA-ATAC---CTACATGT-T-AGGCCAGA-CACTTT-TGCT----TGTA--GCGCAAATAAATTTGCTAGCG--GTA-TC-AT--A--AG---TG----TCCGAC-TCA-ACT------TGAACCTTCAACAGGA-TT---G-ATTTCTG----T--T--GA--TTG-TA--T-ATCTGTACCCACTA--A-TTGTGC-T-----C--GGTTGC--TATGGTA---AAATT--T-TATT--T---GTAAG-ACAAT-ATCGTTA-G-CAACCG------TGTATACGACATACAAACAGTAATTGTCAATA-TAAG-AAT-ATCAACAAATTAGAGTATGCCGTAAAAC
gi|118182 : TTTTTA-TT-GACT-AGT-AGT-TT------AGGTGATTA-TT--TTA-AT--T-ACTA-ATATTTATGCAGAT--ATT---ATATA-G-GGCGCA--CTTCAATGATTAAAA-AT--TGACGACTAATT-ATTA-AGAAA--------TTTAGTTATTT-------TTC---T--C--TATCTTGTG--CAGCCAAGTGATAA---GTTA--AA--CA-GT-TT-ATCTGT--GTAG--A--TTA---A-TA-------TTAC-T-ATGGTA------ATT-AC-TATA--AG------TA-ATAC---CTATATGT-T-AGGCCAGA-CACTTT-CGCT----TATA--GCGCAAATAAATTAGCAGATG--GTA-TC-AA--A--AG---TA----TCTGTC-TCA-ACC------TGAACCTTCAACAGAA-AT---G-ATTTCTA----T--T--GA--CTG-TA--T-ATCTGTGCACACTA--A-TTGTGC-T-----C--AGTTGC--TATGGTA---AAATT--T-TATT--T---GTTAG-ACAAT-ATTGTTA-G-CAACCA------CCAATACCACATACCAACAGTAATTGTCAATA-TAAG-ACT-ATCAACAAACTAGAATATGCTGTAAAAC
gi|118183 : tTTTTTT-TTTGACT-ACT-AGT-TT------AGTTGATTA-TT--TTA-AT--T-ACTA-ATATTTATGCAGAT--TTT---ATATA-A-GGCATT--CTTCGATAACAAAAA-AT---GATGATTAATT-TTTA-AGAA---------TTTAATTATTT-------TTC---A--C--TACCTTGTG--CAGACAAGTGATGA---GTTA--AA--CA-GTTAT-TT-TGT--GTGA--A--TAA---A-TG-------TAAC-T-ATGGTA------ATTTAC-TATA--TG------TA-ATAC---CTATATGT-T-AGGCCAGA-CACTTT-TGCT----AATA--GCGCAAATAAATTTGCTAATT--GTA-TC-AA--A--AG---TA----TCCTAC-TCA-ACC------TGAACTTTCAACAGAA-AT---G-ATTTCTA----T--T--GA--ATG-TT--T-ATCTGTGCACACTC--G-TTGTGG-T-----C--GGTTGC--TATGGTA---GAATT--T-TATT--T---GTTAG-ACAAT-ATCGTTA-G-CAACCG------TGTATACCTCATACCAACAGTAATTGTCAATA-TAAG-AAT-
gi|118184 : TTCTTT-TTTAACT-AGT-AGT-TTTAAATTAGTTGATTA-TT--TCA-AT--A-ACTA-ATATTTATGCAGAT--TTT---ATA---A-GA-------------GACTAAAA-AT--TGGCAATTAATT-ATTA-AGAA---------TTTAAATCTTT-------TTC---T--T--TACCTTGTGTGCAGCCAAGTGATGA---GTTA--AA--CA-GTTAT-GT-TGT--GTAG--A--TGA---A-TG-------TTGC-T-TTGGTA------ATTTAC-TATA--TG------TA-ATAC---CTATATGT-C-AGGCCAGA-CACTTT-CGCT----TAAA--GCGCAAATACATTTGCTAATG--GTA-TC-AA--A--AG---TA----TGCGAC-TCA-ACC------TGAACCTTCAACAGAA-AT---G-ATTTCTA----T--T--GA--TTG-TA--T-GTCTGTGCACACTA--A-TTGTGC-T-----C--GATT--------GTA---AAATT--T-TATT---------AA-ACAAT-ATCGTTA-G-CAACCG------TGTATACCACATACCAACAGTAATTGTCAATA-TAAG-AAT-ATCAATAAACTAGAGTATGCCGCAAAAC
gi|118185 : TTTTTA-CTTAATC-AGT-TGT-TT------AAATAGTTA-TT--TTT-AA--TTGCTT-ATATTGATGCAGAC--TTT---AT--G-C-GATTTA--CTTCAAT-ATTCAA--GTACTAACGTTTAATT-ATTG-AAAC---------TCCAGGCATTC-------TAC---T--C--TACCTTGTG--CAGCCAAAATATGA---TTTA--AAAATA-TTAGT-AC-CGA--TTGT--A--CTA---G-CA-------TTAC-T-ATGGTA---------------TG--TG------TA-GAAC---CTATATAT-T-AGGCCAGA-CGCTTT-TGCT----TATA--GCGCAAATAAATTTGCTTGAG--ATA-TC-AT--A--AG---CG----TCCGAC-CCA-ACT------TGAACCCTCAACAGGA-AT---G-ATTCCCG----C--T--GA--TTG-TT--T-ATCTGTGCACACTA--A-TTGTGC-T-----C--AGTTGC--TATGGTA---ATATT--T-TATT--T---GTATG-ACAGT-ACCGTTA-G-CAACCG------TATATACCACATACAGAGAGTAATTGTCAATA-TATA-AAT-ATCAACAAACTAAAGTATGCCGTAAAAC
gi|118186 : TTTTTA-TTTAACT-AGT-TGT-TT------AGTTGAATT-TT--TTT-TT--TTGCTA-ATATTGATGCAGAC--TTT---ATATG-A-GACTTT--CTTTAATGACTAATT-GT--TAACGATTAATT-ATTA-AGAT---------TTTAATTATTT-------TAC---T--C--TACCTTGTG--CAGCCAAATGATGA---GTTA--AAA-TA-GTAGT-GT-TCA--GTGT--A--TAA---G-TG-------TAAC-T-ATGGTA------CTTTAC-TATA--TG------TA-AAAC---CTATATGT-T-AGGCCAGA-CACTTT-TGCT----TATA--GCTCAAATA
gi|118187 : TTTTTAATTTAACT-AGT-TAT-TT------AGTTGAATA-TT--TTTTAT--TTGCTA-ATATTGATGCAGAC--TTT---ATATG-G-GACTTT--CTTTGATGACCAAAAAGT--TGACGATTATTT-ATTA-AGAT---------TTTAATTATTT-------TAC---T--C--TACCTTGTG--CAGCCAAATGATGA---GTTA--AAA-TA-GTAGT-GT-TGA--ATGT--A--TAA---G-TG-------TTAT-T-ATAGTA------CTTTAC-TATA--TG------TA-ATAC---CAATATGT-T-AGGCCAGA-CACTTT-TGCT----TATA--GTGCAAATAAATTTGCTAATG--GTA-TC-AT--A--AG---TG----TCGGAC-TCA-ACT------TGAACCCTCAACAGGA-AT---G-ATTTCTG----T--T--GA--TTG-TA--T-ATCTGTGCACACTA--G-TTGTGC-T-----C--AGTTGC--TATGGTA---AAATT--T-TGTT--T---GTAAG-ACAAT-ATCGTTG-G-CAACCG------TGTATACCACATACAAACAGTAATTGTCAATA-TAAG-AAT-ATCAACAAAGTAGAGTATGCCATAAAAC
gi|118188 : TTTTA-TTTAACT-AGT-TGT-TT------AGTTGAAAA-TT--TTT-AT--TTGCTA-ATGTTGATGCAGAC--TTT---ATATG-A-GACTTT--CTTTAATGACTAAAT-GT--T-ATAATAAATT-ATTA-AGAT---------TTTAATTATTT-------TAC---T--T--TACCTTGTG--CAGCCAAATGATGA---GTTA--AA--TA-GTAGT-GT-TCA--GTGT--A--TAA---G-TG-------TTAT-T-ATGGTA------CTTTAC-TATA--TG------TA-ATAC---CTATATGT-T-AGGCCAGA-TACTTT-TGCT----TATA--GCGCAAATAAATTTGCTTGAG--ATA-TC-AT--A--AG---TG----TCCGGC-TCA-ACT------TGAACCCTCAACAGGA-AT---G-ATTCCTG----T--T--GA--TTG-TA--T-ATCTGTGCACACTA--A-TTGTGC-T-----C--AGTTGC--TATGGTA---AAATT--T-TATT--T---GTAAG-ACAGT-ATCGTTA-G-AAACCG------TGTATACCACATACAAACAGTAATTGTCAATA-TAAA-AAT-ATCAACAAACTAGAGTATGCTGTAAAAC
gi|118189 : TTTTTAATTTAACT-AGT-TGT-TT------AGTTGAATA-TT--TTTTAT--TTGCTA-GTATTGATGCAGAC--TTT---ATATG-G-GACTTT--CTTTGATGACTAAAAAGT--ATACGATTAATT-ATTA-AGAT---------TTTAATTATTT-------TAC---T--C--TACCTTTTG--CAGCCAAATGATGA---GTTA--AAA-TA-GTAGT-GT-TGA--GTGT--A--TAA---G-TG-------TTAT-T-ATGGTA------CTTTAC-TATA--TG------TA-ATAC---CTATATGT-T-AGGCCAGA-CACTTT-TGCT----TATA--GCGCAAATAAATTTCCTTGTG--ATA-TC-AT--A--AG---TG----TCCGAC---------------------TCAACAGGA-CT---G-ATTTCTG----T--T--AA--TTG-TA--T-ATCTGTGAACACTA--A-TTGTGC-T-----C--AGTTGC--TATGGTA---AAATT--T-TATT--T---GTAAG-ATAAT-ATCGTTA-G-CAACCG------TGTACACCACATACAAACAGTAACTGTCAATA-TAAG-AAT-ATCAACAAACTAGAGTATGCCGTAAAAC
gi|118190 : TTTTTAATTTAACT-AGT-TGT-TT------AGTTGAATAGTT--TTT-AT--TTGTTA-ATATTGATGCAGA-------------------CTTT--CTTTAATGACAAAAAAGT--TGACGATTAATT-ATTA-AGAT---------TTTAATTATTA-------TAC---C--C--
gi|118191 : TTTT--TTTAACT-AGT-AGT-TTTAAATTAGTTGATTA-TT--TAA-AT--A-ACTA-ATATTTATTCAGAT--TTT---ATAGG-A-GACGTT--CTTTGATGACTAAAA-AT--TGGCGATTAATT-ATTA-AGAA---------TTTAATTCTTT-------TTC---T--C--TACCTTGTGTGCAGTGAAGTGATGA---GTTA--AA--CA-GTTGT-GT-TGT--GTGG--A--TAA---A-TG-------TTGC-T-TTGGTA------ATTTAC-TATA--TG------TA-ATAC---CTATATGT-T-AAGCTAGA-CACTTT-CGCT----TATA--GTGCAAATAAATTTGCTAACG--GTA-TC-AA--A--AT---TA----TCCGAC-TCA-ACC------TGAACCTTAAACAGAA-AT---G-ATTTCTA----T--T--GA--TAG-TA--T-GTCTGTGCACACTA--G-TTGTGC-T-----C--GATTGC--TATGGTA---AAATT--T-TATT---------AG-ACAAT-ATTGTTA-G-CCACCG------TGTATATCACATACCAACAGTAGTTGTCAATA-TAAG-AAT-ATCAACAAACTAGAGTATGCCGTAAA
gi|118192 : -TTTATCT-A-T-TATATT------AGGTGATTA-TT--ATT-GTAATTACTA-ATATATATTCAGAT--TCT---ATAAG-T-G-CTCTAACTATG-TGATTAAAA-AT--TGACGACTAATT-ATTT-A--------------TAATTAATT-------TATATGT--CATTACCTTGTG--CAGCCAAGTGATAA---ATTATGCAA-C------T-AT-TAA--GTAT--T--TGATTCA-TG-------TGAA-T-ATGGTT------GTTTAC-TATA--CG------TA-ATAC---CT-------------C----CGTCTC-CGCT----TATA--GCGCAAATAAATTTGCTTGTA--GTA-TC-AA--A--AG---TA----TCTGGC-TCA-ACC------TAAAGCTTCAACAGAA-AT---A-ATTTCTA----T--T--GA--TTG-TA--T-ATCTGTGCACACTA--A-TGGTGC-T-----A--GGTTAC--TGCGGTA---TACTT--T-TATT--T---ATAAG-ACAGT-ATTCTTA-A-CAACGT------TACATAGCACATACATTCAGTAATAGTCAATA-TAAG-AAT-ATCAACAAACTAAAGTATGCCGTAAAAC
gi|118193 : -TTTAACT-AGTATAT-CG------GGT-GATTA-TTATTTT-AA--TTGCTA-TTATTTATGCAGATACTAT---ATATT-ATGATGTA--GCTAGATGATTTAAA-AT--TGTCAACCAATT-ATTTTAGAA---------TT-AA--GTTT---------C---T--C--TACCTTGTG--CAGCCAAGTGATAA---A-TG--AAA-CA-A-AG--GT-TAT--GTGTAAA--TTA---G-TG-------TGAT-T-ATGGTT------ATTTAC-TATA--TG------AA-ATAC---CTATATAT-TAAAGCGAGT-CAATTT-TGCT----TATA--GTGCAAATAAATTTGCAGATG--GTA-TT-AA--A--AT---TA----TCTGGC-TCA-ACC------TAGACCTTCAACAGAA-AT---G-ATTTCTA----T--T--GA--TTG-TA--T-ATCT-T-CACACTA--A-TTGTGC-T-----A--GGTTGCTATATGGT-----AATT--T-TTTT--T---ACAA
gi|118194 : --TTGTTT-ATACTCATG-ATAT--TTTTAAATTTGTA-GA--------TTGACGACCAAAG-----TGTAGATTAATCGACTA-AGAA---------TATTATTATTTCTTTTTGTAT---T-----TACCGATTG--CAGCCATAT-ATTACTTATTA--GTG-CATGTAATTGA-TTA--ATTT--AAATAA---GGTG-------C-ACAT-ATGGTT------GTTCAC-------------------------CAATATTT-T-AAGTTAAA-CAACAC-TGCT----CATA--GCGCAAATTGCTTTGCTTATA--ACG-TC-AG--C--GA---TA----TTCAAC-CTA-ACTA-----TAAACCTTAGATAAAA-AT---TTAATTCCA----T--C--CAAGGTG-T---T-ATCTGAACACATTA--A-TTGTGT-G-----T--GGTTAC--AAAGGTA---AAAT---------------ATAAGTACT-T-ATC-TTATG-TAACCA------TGTATCCAGCGTACCACCAATAATTGTCAATAGTAA--ACC-ATCAACAAATTATGGTGTGCCGTAAAAC
gi|118195 : aactattttacatttttggattcggttcttactaattactaacaA-TT--TTT-TT--TTATTATATATATATATAGATACTTC---ATAAC-A-GACTTT--CTTTGATGACTAAAA-GT--TGACGATTTATT-ATTA-AGAT---------TTTAATTATTT-------TAC---T--C--TACCTTGTG--CAGCCAAATGATGA---GTTA--AAA-CA-GTGGT-GT-TGA--GTGT--A--TAA---G-TG-------TTAT-T-CTGGTA------GTTTAC-TATA--TG------TA-ATAC---CTATATGT-T-AGGCCAGA-CACTTT-TACT----TATA--GCGCAAATAAATTTGCTAGTG--TTA-TC-AT--A--AG---TG----TCCGAC-TTA-ACT------TGAACCTTCAACAGGA-TT---G-ATTTCTG----T--T--GA--TTG-TA--T-ATCTGTGCCCACTA--A-TTGTGC-T-----C--GGTTGC--TATGGTA---AAATT--G-TATT--T---GTAAG-ACAAT-ATCGTTA-G-CAACCG------TATATACCACATACAAATAGTAATTGTCAATA-TAAG-AAT-ATCAACAAACTAGAGTATGCCGTAAAAC
gi|118196 : --TTGTTT-ATACTCATG-ATAT--TTTTAAATTTGTA-GA--------TTGACGACCAAAG-----TGTAGATTAATCGACTA-AGAA---------TTT------TG-------TAT---T-----TACCGATTG--CAGCCATAT-ATTACTTATTA--GTG-CATGTAATTGA-TTA--ATTT--AAATAA---GGTG-------C-ACAT-ATGGTT------GTTCAC-------------------------CAATATTT-T-AAGTTAAA-CAACGC-TGCT----CATA--GCGCAAATTGCTTTGCTTATA--TCG-TC-AG--C--GA---TA----TTCAAC-CTA-ACTA-----TAAACCTTAGATAAAA-AT---TTAATTCTA----T--C--CAAGGTG-T---T-ATCTGAACACATTA--A-TTGTGT-G-----T--GGTTAC--AATGGTA---AAAT---------------ATAAGTACT-T-ATC-TTATG-TAACCA------TGTATCCAGCGTACCACCAATAATGGTCAATAGTAA--ACC-ATCAACAAATTATGGTGTGCCGTAAAGC
gi|118197 : GATTAATT-AACA-AAAAAAAAATAGTTTTATTTCTTT-------TTC---TATT--TACCGATTG--CAGCCATAT-ATTA---CATA--AAC-CC-ATA-T-AT-TAAAGGTTT--A--TAATTAG-TGCATGTAATTAC-TTATATTAAATGAGGTGCACCTATGGTTG------TT--TAC---CAATATTT-T-AAGACAAA-CAACAC-TGCT----CATA--GTACAAATTACTTTGCTTATA--TTG-TC-AGC-G--AG---T-----TTCGAC-CTA-AATA-----TAAACTTTCGATAAAA----------TTCTA----TCTT--AA--GTG--G--T-ATCTGTACACACTA--A-TTGTGT-A-----T--GGTTAC--AATGGTA---AAA-T--A-TAAT--T---GTTAG----TT-ATC-TTATG-TAACCA------TATATCCAGCGTACCACCAATAATTGTCAATAGTAAA-ACC-ATCAACAAATTATATTGTGCTGTAAAAC
gi|118198 : TTT-------TAC---T--C--TACCTTGTG--CAGCCAAATGATGA---GTTA--AAA-TA-GTAGT-GT-TGA--GTGT--A--TAA---G-TG-------TTAT-T-ATGGTA------CTTTAC-TATA--T-----------------------GT-T-AGGCCAGA-CACTTT-TGCT----TATA--GCGCAAATAAATTTGCTTGAG--ATA-TT-AT--A--AG---TG----TCCGAC-TCA-ACT------TGAACCCTCAACAGGA-AT---G-ATTTCTG----T--T--AA--TTG-TT--T-ATCTGTGCGCACTA--A-TTGTGC-T-----C--AGTTGC--TATGGTA---AAATT--T-TATT--T---GTAAG-ACAGT-ATTGTTA-G-CAACCT------TGTATACCACATACAAACAGTAATTGTCAATA-TAAG-AAT-AT-AACAA
gi|118199 : T-AT-TAA--ATG-------AA---G-TG-------CACC-T-ATGGTT------GTTTAC-------------------------CAATATTA-T-AAGTCAAA-CAACAC-TGCT----CATA--GTGCAAAT-----CGCTT------TG-TC-AG--C--GA---TA----TTTGAC-CTA-ACTA-----TAAACTTGAGATA-AA-ATTTAA-ATTTATC----T--A--AA--GTG-T---T-ATCTGTACACATTA--A-TTGTGT-A-----T--AGTTAC--AATGGTA---AAATA--T-AATT--G---GTA-----GAT-ATC-TTATG-TAACCA------TATATCCAGCGTGCCACCAATAATTGTCAATAGTATA-ACC-GTCAACAAATAATGGTGTGCCGTAAAAC
gi|118200 : ttaT-GT-TAA--AT-------TGA---A-TG-------CAAC-T-ATGGTC------GTTTGT-TATA--TG------TA-AAAT---CAATATA----AAGCCAAA-CGCCTT-CGCT----TATA--GCGCAAACAGATT--CTCATAAAGTA-TC-AG--A--CG---AA----TTCGAC-CCG-ACG------TA----TTTAA-------------ATT-ATA----T--T--GA--TTG-TG--T-ATCTGTACACACTA--G-TTGTGT-T-----A--GGTTAC--AATGGTA---TACCT--T-TATT--A---ATAAG-ACATT-ATCATTT-G-TAACTGTTACATTATATGCCGTAAACCATCAGTAATTGCCATAA-TCAG-AAT-ACCAACAGAC
gi|118201 : TAT--A--TAG---GGTG-------CGAC-T-AGGGTT------GTTTAT-TTTT--TA------TA-A-AA---CAATATAT-T-ACGCCAAA-CATCAC-CGCG----TAAA--GTGTAAATAAATATGCTTATA--GTA-TCGGT--A--AG----A----TTTAGCTTTA-ATA------TAGACCTTCAAT------T---G-ATT------------------TTG-T---T-ATCTGTACATACTA--A-TTGCG
gi|118202 : TGGTT------GTTAAC-TTTA--TG------TATAT-T---CAATATAT-T-AAGCCAAA-CAAC-C-CGCT----TATA--GCGCAAAAAAATT-GATACTA--GTA-AT-GA--A--GG---AA----TTGGAC-CCA-ACTAAA---TAAACCTTCAATATAT-TT---A-ATT-ATA----T--T--GA--TTG-TAG-T-ATCTGTATACACTATAA-TT---C-TA----T--GGTTAC--AATAGTA---TATAT--T-TAGT--A---CTATG-GCAAT-ATCGTAT-G-TAACAT------TATATGCAGCATCACATCAGTAAACGTTAATA-TAAG-AAT-ATTAACAATCTACGGTATGCCGTCAAAC
gi|118203 : attGGTA--------TTGT-TAT-----------TA-A-AT---CAATACAT-A-AGACCA-A-CACATTGCTCT----TATAAAGTGCAAATTCATTTGCTAAAA--GTA-TTTAT--A--AG---TGAAGTTTTAAT-CGGTATG------TAAGCCTT-AATAGAATAT---A-ATTAC-A----T--T--CA--TT-----------TGTGTAT------------------------GGTTAC--GATGATA---TAACT--T-TAGC------GTAAT-GC--T-ATCGTTT-G-TAATCT------TATAAACAGCGTATCGACAGTAATGGTCATTA-T--GCACT-ATTAACAAACTA
gi|118204 : TTTTC-TATA--TGCATTTATA-AAAC---CAGCATGT-A-AGGCAAAA-CAACAC-TGCT----TATA--GAGCTAATTTGTTTGTTTAAA--GTA-TC-AG--AGAAG---TA----T--------A-GAT------T-----TTCAGTATAT-TT---T-AATTATA----T--T--GA--GAG-AA--TTATCTGTACACACTA--A-TTGTACATGTATAT--GGTTAC--AATGGTATTGGACTT--T-TGTA--C----TATG-ATAAT-ATC-----G-CAATTT------TCTGTA-----TACCATCAGTAGTTGTCAAT
gi|118205 : taACA--TG------TA-AAAC---CAATATAT-T-AAGCTAAA-CAACTC-CGCT----TATA--GCGCA----------CCGATT--GTG-TT-AA--A------------------C-CTA-ACTA-----TAGACCTTCAATAGAA-TTT--G-ATT-ATA----T--T--GA--TTG-CGG-T-ATCTGTATACACTA--T-GTGTGC-A-----A--GGTTAC--AACGATA---TAACT--T-TAAT--A---TTATG-GCAAT-TTCGTAT-G-CATCCT------TATATGCAGCATCCTTTCAGAAATTGCCAATA-TAAG-ACT-ATCAGCAAACTACGGTATGTCGTCAA
gi|118206 : A--TA------TA-GTACAATCAATATAT----GGCCAAAACAAT----GCT----CATAAAGTGCAAATTCATTTGCTAATA--GTA-CC-AGTGA--AG---TT----TT-------A-ACTGGTATGTAAGCCTT-AATAGAA-------------TA----T--T---A--TT----------------ACATTA--A-TT-TGT-T-----TATGATTAT--GATGATA---CATCT--T-TATTACT---GTAG---TGAT-ATCGTAT-G-TAATCT------TATAAACTGTGTATCAACAGTAATAGTCAATA-T--GCAAT-ATTAACAAACTA
gi|118207 : TAC---CAATATTT-T-AAGCCAAA-TAACAC-TGCT----CATA--GCGCAAATTACTTTGCTTATA--TTG-TC-AGC-A--AG----A----TTCGAC-CTA-AATA-----TGAACTTTCGATAAAA-TT---T-AATTCTA----T--C--TA--TAGAGG--T-GTCTGTACACACTA--A-TTGTGT-G-----T--GGTTAT--AATGGTA---AAATA--C-AATT----------G-ATAGTTATC-TTATG-TAACCG------TATATCCAGCGTACCATCAGTAATTGTCAATAGTAA--ACC-ATCAACAAATTACAATGTGCTGTAAAAC
gi|118208 : TAC---CAATA-GTAT-AAGTCAAA-CAACGC-TGCT----CATA--GCGCAAATCGCTTTGCTT-----GTA-TC-GT--C--AGCGATA----TTCGAC-CTA-ACTA-----TAAA--TTTAA---------------TTCTA----T--CTAAA--GTG-T---T-ATCTGTACACACTT--A-TTGTGC-A-----T--AGTTAC--AATGGTA---AAATA--T-AATT--G---GTAGT-----T-ATC-TTATG-TAACCA------TATATCCAGCTTACCACCAATAATTGTCAATAGTATA-ACC-ATCAACAAATTATGGTGTGCCGTAAAAC
gi|118209 : -AGGCCA-A-CACATT--GCTCTAATATA--GCGCAAATTAATATGCTAATA--GTATTT-AT--A--AG-----------------------------TGAAGCTTTAATCGGT-AT---G------TAAGCCT--T--AA--TTG-AA--T-ATAAGT--ACATTC--ATTTGTGT-A-----T--GGTTAC--GATAATA---TATCA--T-TATTACC---GTAAT-GC--T-ATCGTAT-G-TAATCG------TATAAACAGCGTATCGACTGTAATGGTCATTA-T--G-CACAATTAACAAGCTAACTGATGCCATGAA
gi|118210 : CTAAA-CACCTC-TGCT----TATA--GCGGAAGTAGAATTGCTTATA--GCA-TT-GG--A--GG---GA----TTCGAC-ATA-A--------TAAACATTCAA-ATAA-A------ATTTA-A----T--T--CAC-TTG-TA--T-ATCTGTACACACTA--G-TTGTCT-T-----A--ATTTAC--AATGGTA---CGATT--T-AATTA-C---ATAAT-ACAAT-ATCGTAT-G-TAACAT------TATATACCGCATACCGTCAATAATTGTCAATA-TATA-AAA-ATCAACAAACTATAGTATGCCGTAAAAC
gi|118211 : T----TAT---GCACATTTAATTTTGCTTATA--TTA-TC-GACGA--AG---T-----TC--AA-CCA-A-----------------AATATAA-AC---------CTA----T--T--GA--TAG-TGGCC-A-CTGTACACACTA--A-TGGTAT-A-----T--GGTTAC--ACTAGTA---TGATTAAT-TACT------ATAG---CAAT-ATTGTAT-G-TAACCT------TCTATGCAGCATACCAACATTAATTGTCAATA-TAAG-AAT-ACCAACAAACTAAGGTATGCCGTCAAAC
gi|118212 : agtcacctggttctAGAA-AT---A-ATTTCTA----T--T--GA--TTG-TA--T-ATCTGTTCACACTA--A-TT---------------GTTAC--CATGTTA---AATTT--T-TATTA-TTTAATAAC-ACAGC-A--GTTA-ACCAATCG------AGCATA
gi|118213 : A--TTG-TA--T-ATCTGTGCACACTA--A-TTGTGC-TAC---C--AATCAC--ACT-GTA---ATATT--T-TACT--T---ACAAaca
gi|118214 : TCTGTGCACACTA--A-TTGTAT-T-----C--AGTTGC--TATGGTA---ATATT--TCTATT--T---GTATG-ACAGT-ATCGTTA-G-CAACCG------TATATACCACATACAGACAGTAATTGTCAATA-TAAG-AAT-ATCAGCAAACTAGAGTATGCCGTAAAAC
Alignments
lowQualScore : 111111 1111111111 11 111111 1111111111 1111111
lowQualScore : 99 3 3 3 777777 1 2 33 5 33 3 2 1 66 888 66666 444444 99 33 4 2 3333333333 7777777 333 44444 66 0 888 33 11 4 1 4 2 22 22 55 77777 6666666 4 4 2 99999999 1 22 444444 1 3 222 1 0 1 1 1 1 555555 2222 33 1 1 333 1 2 777 11 666666666 22 33 1 666666 1 2 88888888 1 2222 11 11 44 1 999 1 1 11 1 0000000000 333 2222 11 1 4444444 2 2 1 3 8 1 5555555 0 2 2 1 8 3 1 1
lowQualScore : .. . . . ...... . . .. . .. . . . .. ... ..... ...... .. .. . . .......... ....... ... ..... .. . ... .. .. . . . . .. .. .. ..... ....... . . . ........ . .. ...... . . ... . . . . . . ...... .... .. . . ... . . ... .. ......... .. .. . ...... . . ........ . .... .. .. .. . ... . . .. . .......... ... .... .. . ....... . . . . . . ....... . . . . . . . .
lowQualScore : 44 1 1 1 777777 0 9 99 7 44 2 5 0 99 888 00000 222222 88 44 7 4 6666666666 2222222 999 33333 55 3 222 22 88 7 6 2 1 99 88 55 88888 5555555 7 0 0 55555555 7 22 666666 6 0 666 5 3 5 4 5 4 000000 8888 77 2 0 111 4 8 666 99 444444444 00 22 4 000000 2 3 55555555 8 8888 88 88 88 3 777 3 7 77 2 6666666666 222 4444 88 3 6666666 8 3 4 5 3 4 0000000 9 2 1 8 9 0 5 0
consensus : TTTTTA-TTTAACT-AGT-TGT-TT------AGTTGANTA-TT--TTT-AT--TTGCTA-ATATTNATGCAGAT--TTT---ATATG-A-GACTTT--CTTTGATGACTAAAA-GT--TGACGATTAATT-ATTA-AGAN---------TTTAATTATTT-------TAC---T--C--TACCTTGTG--CAGCCAAATGATGA---GTTA--AAA-CA-GTAGT-GT-TGA--GTGT--A--TAA---G-TG-------TTAC-T-ATGGTA------GTTTAC-TATA--TG------TA-ATAC---CNATATGT-T-AGGCCAGA-CACCTC-CGCT----TATA--GCGCAAATAAATTTGCTNATG--GTA-TC-AN--A--AG---TA----TCCGAC-CCA-ACT------TGAACCTTCAACAGAA-AT---G-ATTTCTA----T--T--GA--TTG-TA--T-ATCTGTGCACACTA--A-TTGTGC-T-----C--GGTTAC--NATGGTA---AAATT--T-TATT--T---GTAAG-ACAAT-ATCGTTA-G-CAACCG------TGTATACCGCGTACCAACAGTAATTGTCAATA-TAAG-AAT-ATCAACAAACTANAGTATGCCGTAAAAC
Reference ( family-605 ) : TTTTTA-TTTAACT-AGT-TGT-TT------AGTTGANTA-TT--TTT-AT--TTGCTA-ATATTNATGCAGAT--TTT---ATATG-A-GACTTT--CTTTGATGACTAAAA-GT--TGACGATTAATT-ATTA-AGAN---------TTTAATTATTT-------TAC---T--C--TACCTTGTG--CAGCCAAATGATGA---GTTA--AAA-CA-GTAGT-GT-TGA--GTGT--A--TAA---G-TG-------TTAC-T-ATGGTA------GTTTAC-TATA--TG------TA-ATAC---CNATATGT-T-AGGCCAGA-CACCTC-CGCT----TATA--GCGCAAATAAATTTGCTNATG--GTA-TC-AN--A--AG---TA----TCCGAC-CCA-ACT------TGAACCTTCAACAGAA-AT---G-ATTTCTA----T--T--GA--TTG-TA--T-ATCTGTGCACACTA--A-TTGTGC-T-----C--GGTTAC--NATGGTA---AAATT--T-TATT--T---GTAAG-ACAAT-ATCGTTA-G-CAACCG------TGTATACCGCGTACCAACAGTAATTGTCAATA-TAAG-AAT-ATCAACAAACTANAGTATGCCGTAAAAC
gi|118181 : TTTTTA-TTTTACTTAGC-TGT-TT------AGTTGAATA-TT--TTT-AT--TTGCTA-ATATTGATGCAGAT--TTT---ATATG-A-GACTTT--CTTTGATGACTAAAA-GT--TGACGATTAATT-ATTA-AGAT---------TTTAATCATTT-------TAC---T--C--TACCTTTTG--CAGCCAAATGATGA---GTTA--AAG-CA-GTGGT-GT-TGA--GTGT--A--TAA---G-TG-------TTAT-T-TTGGTA------GTTTAC-TATA--TG------TA-ATAC---CTACATGT-T-AGGCCAGA-CACTTT-TGCT----TGTA--GCGCAAATAAATTTGCTAGCG--GTA-TC-AT--A--AG---TG----TCCGAC-TCA-ACT------TGAACCTTCAACAGGA-TT---G-ATTTCTG----T--T--GA--TTG-TA--T-ATCTGTACCCACTA--A-TTGTGC-T-----C--GGTTGC--TATGGTA---AAATT--T-TATT--T---GTAAG-ACAAT-ATCGTTA-G-CAACCG------TGTATACGACATACAAACAGTAATTGTCAATA-TAAG-AAT-ATCAACAAATTAGAGTATGCCGTAAAAC
gi|118182 : TTTTTA-TT-GACT-AGT-AGT-TT------AGGTGATTA-TT--TTA-AT--T-ACTA-ATATTTATGCAGAT--ATT---ATATA-G-GGCGCA--CTTCAATGATTAAAA-AT--TGACGACTAATT-ATTA-AGAAA--------TTTAGTTATTT-------TTC---T--C--TATCTTGTG--CAGCCAAGTGATAA---GTTA--AA--CA-GT-TT-ATCTGT--GTAG--A--TTA---A-TA-------TTAC-T-ATGGTA------ATT-AC-TATA--AG------TA-ATAC---CTATATGT-T-AGGCCAGA-CACTTT-CGCT----TATA--GCGCAAATAAATTAGCAGATG--GTA-TC-AA--A--AG---TA----TCTGTC-TCA-ACC------TGAACCTTCAACAGAA-AT---G-ATTTCTA----T--T--GA--CTG-TA--T-ATCTGTGCACACTA--A-TTGTGC-T-----C--AGTTGC--TATGGTA---AAATT--T-TATT--T---GTTAG-ACAAT-ATTGTTA-G-CAACCA------CCAATACCACATACCAACAGTAATTGTCAATA-TAAG-ACT-ATCAACAAACTAGAATATGCTGTAAAAC
gi|118183 : tTTTTTT-TTTGACT-ACT-AGT-TT------AGTTGATTA-TT--TTA-AT--T-ACTA-ATATTTATGCAGAT--TTT---ATATA-A-GGCATT--CTTCGATAACAAAAA-AT---GATGATTAATT-TTTA-AGAA---------TTTAATTATTT-------TTC---A--C--TACCTTGTG--CAGACAAGTGATGA---GTTA--AA--CA-GTTAT-TT-TGT--GTGA--A--TAA---A-TG-------TAAC-T-ATGGTA------ATTTAC-TATA--TG------TA-ATAC---CTATATGT-T-AGGCCAGA-CACTTT-TGCT----AATA--GCGCAAATAAATTTGCTAATT--GTA-TC-AA--A--AG---TA----TCCTAC-TCA-ACC------TGAACTTTCAACAGAA-AT---G-ATTTCTA----T--T--GA--ATG-TT--T-ATCTGTGCACACTC--G-TTGTGG-T-----C--GGTTGC--TATGGTA---GAATT--T-TATT--T---GTTAG-ACAAT-ATCGTTA-G-CAACCG------TGTATACCTCATACCAACAGTAATTGTCAATA-TAAG-AAT-
gi|118184 : TTCTTT-TTTAACT-AGT-AGT-TTTAAATTAGTTGATTA-TT--TCA-AT--A-ACTA-ATATTTATGCAGAT--TTT---ATA---A-GA-------------GACTAAAA-AT--TGGCAATTAATT-ATTA-AGAA---------TTTAAATCTTT-------TTC---T--T--TACCTTGTGTGCAGCCAAGTGATGA---GTTA--AA--CA-GTTAT-GT-TGT--GTAG--A--TGA---A-TG-------TTGC-T-TTGGTA------ATTTAC-TATA--TG------TA-ATAC---CTATATGT-C-AGGCCAGA-CACTTT-CGCT----TAAA--GCGCAAATACATTTGCTAATG--GTA-TC-AA--A--AG---TA----TGCGAC-TCA-ACC------TGAACCTTCAACAGAA-AT---G-ATTTCTA----T--T--GA--TTG-TA--T-GTCTGTGCACACTA--A-TTGTGC-T-----C--GATT--------GTA---AAATT--T-TATT---------AA-ACAAT-ATCGTTA-G-CAACCG------TGTATACCACATACCAACAGTAATTGTCAATA-TAAG-AAT-ATCAATAAACTAGAGTATGCCGCAAAAC
gi|118185 : TTTTTA-CTTAATC-AGT-TGT-TT------AAATAGTTA-TT--TTT-AA--TTGCTT-ATATTGATGCAGAC--TTT---AT--G-C-GATTTA--CTTCAAT-ATTCAA--GTACTAACGTTTAATT-ATTG-AAAC---------TCCAGGCATTC-------TAC---T--C--TACCTTGTG--CAGCCAAAATATGA---TTTA--AAAATA-TTAGT-AC-CGA--TTGT--A--CTA---G-CA-------TTAC-T-ATGGTA---------------TG--TG------TA-GAAC---CTATATAT-T-AGGCCAGA-CGCTTT-TGCT----TATA--GCGCAAATAAATTTGCTTGAG--ATA-TC-AT--A--AG---CG----TCCGAC-CCA-ACT------TGAACCCTCAACAGGA-AT---G-ATTCCCG----C--T--GA--TTG-TT--T-ATCTGTGCACACTA--A-TTGTGC-T-----C--AGTTGC--TATGGTA---ATATT--T-TATT--T---GTATG-ACAGT-ACCGTTA-G-CAACCG------TATATACCACATACAGAGAGTAATTGTCAATA-TATA-AAT-ATCAACAAACTAAAGTATGCCGTAAAAC
gi|118186 : TTTTTA-TTTAACT-AGT-TGT-TT------AGTTGAATT-TT--TTT-TT--TTGCTA-ATATTGATGCAGAC--TTT---ATATG-A-GACTTT--CTTTAATGACTAATT-GT--TAACGATTAATT-ATTA-AGAT---------TTTAATTATTT-------TAC---T--C--TACCTTGTG--CAGCCAAATGATGA---GTTA--AAA-TA-GTAGT-GT-TCA--GTGT--A--TAA---G-TG-------TAAC-T-ATGGTA------CTTTAC-TATA--TG------TA-AAAC---CTATATGT-T-AGGCCAGA-CACTTT-TGCT----TATA--GCTCAAATA
gi|118187 : TTTTTAATTTAACT-AGT-TAT-TT------AGTTGAATA-TT--TTTTAT--TTGCTA-ATATTGATGCAGAC--TTT---ATATG-G-GACTTT--CTTTGATGACCAAAAAGT--TGACGATTATTT-ATTA-AGAT---------TTTAATTATTT-------TAC---T--C--TACCTTGTG--CAGCCAAATGATGA---GTTA--AAA-TA-GTAGT-GT-TGA--ATGT--A--TAA---G-TG-------TTAT-T-ATAGTA------CTTTAC-TATA--TG------TA-ATAC---CAATATGT-T-AGGCCAGA-CACTTT-TGCT----TATA--GTGCAAATAAATTTGCTAATG--GTA-TC-AT--A--AG---TG----TCGGAC-TCA-ACT------TGAACCCTCAACAGGA-AT---G-ATTTCTG----T--T--GA--TTG-TA--T-ATCTGTGCACACTA--G-TTGTGC-T-----C--AGTTGC--TATGGTA---AAATT--T-TGTT--T---GTAAG-ACAAT-ATCGTTG-G-CAACCG------TGTATACCACATACAAACAGTAATTGTCAATA-TAAG-AAT-ATCAACAAAGTAGAGTATGCCATAAAAC
gi|118188 : TTTTA-TTTAACT-AGT-TGT-TT------AGTTGAAAA-TT--TTT-AT--TTGCTA-ATGTTGATGCAGAC--TTT---ATATG-A-GACTTT--CTTTAATGACTAAAT-GT--T-ATAATAAATT-ATTA-AGAT---------TTTAATTATTT-------TAC---T--T--TACCTTGTG--CAGCCAAATGATGA---GTTA--AA--TA-GTAGT-GT-TCA--GTGT--A--TAA---G-TG-------TTAT-T-ATGGTA------CTTTAC-TATA--TG------TA-ATAC---CTATATGT-T-AGGCCAGA-TACTTT-TGCT----TATA--GCGCAAATAAATTTGCTTGAG--ATA-TC-AT--A--AG---TG----TCCGGC-TCA-ACT------TGAACCCTCAACAGGA-AT---G-ATTCCTG----T--T--GA--TTG-TA--T-ATCTGTGCACACTA--A-TTGTGC-T-----C--AGTTGC--TATGGTA---AAATT--T-TATT--T---GTAAG-ACAGT-ATCGTTA-G-AAACCG------TGTATACCACATACAAACAGTAATTGTCAATA-TAAA-AAT-ATCAACAAACTAGAGTATGCTGTAAAAC
gi|118189 : TTTTTAATTTAACT-AGT-TGT-TT------AGTTGAATA-TT--TTTTAT--TTGCTA-GTATTGATGCAGAC--TTT---ATATG-G-GACTTT--CTTTGATGACTAAAAAGT--ATACGATTAATT-ATTA-AGAT---------TTTAATTATTT-------TAC---T--C--TACCTTTTG--CAGCCAAATGATGA---GTTA--AAA-TA-GTAGT-GT-TGA--GTGT--A--TAA---G-TG-------TTAT-T-ATGGTA------CTTTAC-TATA--TG------TA-ATAC---CTATATGT-T-AGGCCAGA-CACTTT-TGCT----TATA--GCGCAAATAAATTTCCTTGTG--ATA-TC-AT--A--AG---TG----TCCGAC---------------------TCAACAGGA-CT---G-ATTTCTG----T--T--AA--TTG-TA--T-ATCTGTGAACACTA--A-TTGTGC-T-----C--AGTTGC--TATGGTA---AAATT--T-TATT--T---GTAAG-ATAAT-ATCGTTA-G-CAACCG------TGTACACCACATACAAACAGTAACTGTCAATA-TAAG-AAT-ATCAACAAACTAGAGTATGCCGTAAAAC
gi|118190 : TTTTTAATTTAACT-AGT-TGT-TT------AGTTGAATAGTT--TTT-AT--TTGTTA-ATATTGATGCAGA-------------------CTTT--CTTTAATGACAAAAAAGT--TGACGATTAATT-ATTA-AGAT---------TTTAATTATTA-------TAC---C--C--
gi|118191 : TTTT--TTTAACT-AGT-AGT-TTTAAATTAGTTGATTA-TT--TAA-AT--A-ACTA-ATATTTATTCAGAT--TTT---ATAGG-A-GACGTT--CTTTGATGACTAAAA-AT--TGGCGATTAATT-ATTA-AGAA---------TTTAATTCTTT-------TTC---T--C--TACCTTGTGTGCAGTGAAGTGATGA---GTTA--AA--CA-GTTGT-GT-TGT--GTGG--A--TAA---A-TG-------TTGC-T-TTGGTA------ATTTAC-TATA--TG------TA-ATAC---CTATATGT-T-AAGCTAGA-CACTTT-CGCT----TATA--GTGCAAATAAATTTGCTAACG--GTA-TC-AA--A--AT---TA----TCCGAC-TCA-ACC------TGAACCTTAAACAGAA-AT---G-ATTTCTA----T--T--GA--TAG-TA--T-GTCTGTGCACACTA--G-TTGTGC-T-----C--GATTGC--TATGGTA---AAATT--T-TATT---------AG-ACAAT-ATTGTTA-G-CCACCG------TGTATATCACATACCAACAGTAGTTGTCAATA-TAAG-AAT-ATCAACAAACTAGAGTATGCCGTAAA
gi|118192 : -TTTATCT-A-T-TATATT------AGGTGATTA-TT--ATT-GTAATTACTA-ATATATATTCAGAT--TCT---ATAAG-T-G-CTCTAACTATG-TGATTAAAA-AT--TGACGACTAATT-ATTT-A--------------TAATTAATT-------TATATGT--CATTACCTTGTG--CAGCCAAGTGATAA---ATTATGCAA-C------T-AT-TAA--GTAT--T--TGATTCA-TG-------TGAA-T-ATGGTT------GTTTAC-TATA--CG------TA-ATAC---CT-------------C----CGTCTC-CGCT----TATA--GCGCAAATAAATTTGCTTGTA--GTA-TC-AA--A--AG---TA----TCTGGC-TCA-ACC------TAAAGCTTCAACAGAA-AT---A-ATTTCTA----T--T--GA--TTG-TA--T-ATCTGTGCACACTA--A-TGGTGC-T-----A--GGTTAC--TGCGGTA---TACTT--T-TATT--T---ATAAG-ACAGT-ATTCTTA-A-CAACGT------TACATAGCACATACATTCAGTAATAGTCAATA-TAAG-AAT-ATCAACAAACTAAAGTATGCCGTAAAAC
gi|118193 : -TTTAACT-AGTATAT-CG------GGT-GATTA-TTATTTT-AA--TTGCTA-TTATTTATGCAGATACTAT---ATATT-ATGATGTA--GCTAGATGATTTAAA-AT--TGTCAACCAATT-ATTTTAGAA---------TT-AA--GTTT---------C---T--C--TACCTTGTG--CAGCCAAGTGATAA---A-TG--AAA-CA-A-AG--GT-TAT--GTGTAAA--TTA---G-TG-------TGAT-T-ATGGTT------ATTTAC-TATA--TG------AA-ATAC---CTATATAT-TAAAGCGAGT-CAATTT-TGCT----TATA--GTGCAAATAAATTTGCAGATG--GTA-TT-AA--A--AT---TA----TCTGGC-TCA-ACC------TAGACCTTCAACAGAA-AT---G-ATTTCTA----T--T--GA--TTG-TA--T-ATCT-T-CACACTA--A-TTGTGC-T-----A--GGTTGCTATATGGT-----AATT--T-TTTT--T---ACAA
gi|118194 : --TTGTTT-ATACTCATG-ATAT--TTTTAAATTTGTA-GA--------TTGACGACCAAAG-----TGTAGATTAATCGACTA-AGAA---------TATTATTATTTCTTTTTGTAT---T-----TACCGATTG--CAGCCATAT-ATTACTTATTA--GTG-CATGTAATTGA-TTA--ATTT--AAATAA---GGTG-------C-ACAT-ATGGTT------GTTCAC-------------------------CAATATTT-T-AAGTTAAA-CAACAC-TGCT----CATA--GCGCAAATTGCTTTGCTTATA--ACG-TC-AG--C--GA---TA----TTCAAC-CTA-ACTA-----TAAACCTTAGATAAAA-AT---TTAATTCCA----T--C--CAAGGTG-T---T-ATCTGAACACATTA--A-TTGTGT-G-----T--GGTTAC--AAAGGTA---AAAT---------------ATAAGTACT-T-ATC-TTATG-TAACCA------TGTATCCAGCGTACCACCAATAATTGTCAATAGTAA--ACC-ATCAACAAATTATGGTGTGCCGTAAAAC
gi|118195 : aactattttacatttttggattcggttcttactaattactaacaA-TT--TTT-TT--TTATTATATATATATATAGATACTTC---ATAAC-A-GACTTT--CTTTGATGACTAAAA-GT--TGACGATTTATT-ATTA-AGAT---------TTTAATTATTT-------TAC---T--C--TACCTTGTG--CAGCCAAATGATGA---GTTA--AAA-CA-GTGGT-GT-TGA--GTGT--A--TAA---G-TG-------TTAT-T-CTGGTA------GTTTAC-TATA--TG------TA-ATAC---CTATATGT-T-AGGCCAGA-CACTTT-TACT----TATA--GCGCAAATAAATTTGCTAGTG--TTA-TC-AT--A--AG---TG----TCCGAC-TTA-ACT------TGAACCTTCAACAGGA-TT---G-ATTTCTG----T--T--GA--TTG-TA--T-ATCTGTGCCCACTA--A-TTGTGC-T-----C--GGTTGC--TATGGTA---AAATT--G-TATT--T---GTAAG-ACAAT-ATCGTTA-G-CAACCG------TATATACCACATACAAATAGTAATTGTCAATA-TAAG-AAT-ATCAACAAACTAGAGTATGCCGTAAAAC
gi|118196 : --TTGTTT-ATACTCATG-ATAT--TTTTAAATTTGTA-GA--------TTGACGACCAAAG-----TGTAGATTAATCGACTA-AGAA---------TTT------TG-------TAT---T-----TACCGATTG--CAGCCATAT-ATTACTTATTA--GTG-CATGTAATTGA-TTA--ATTT--AAATAA---GGTG-------C-ACAT-ATGGTT------GTTCAC-------------------------CAATATTT-T-AAGTTAAA-CAACGC-TGCT----CATA--GCGCAAATTGCTTTGCTTATA--TCG-TC-AG--C--GA---TA----TTCAAC-CTA-ACTA-----TAAACCTTAGATAAAA-AT---TTAATTCTA----T--C--CAAGGTG-T---T-ATCTGAACACATTA--A-TTGTGT-G-----T--GGTTAC--AATGGTA---AAAT---------------ATAAGTACT-T-ATC-TTATG-TAACCA------TGTATCCAGCGTACCACCAATAATGGTCAATAGTAA--ACC-ATCAACAAATTATGGTGTGCCGTAAAGC
gi|118197 : GATTAATT-AACA-AAAAAAAAATAGTTTTATTTCTTT-------TTC---TATT--TACCGATTG--CAGCCATAT-ATTA---CATA--AAC-CC-ATA-T-AT-TAAAGGTTT--A--TAATTAG-TGCATGTAATTAC-TTATATTAAATGAGGTGCACCTATGGTTG------TT--TAC---CAATATTT-T-AAGACAAA-CAACAC-TGCT----CATA--GTACAAATTACTTTGCTTATA--TTG-TC-AGC-G--AG---T-----TTCGAC-CTA-AATA-----TAAACTTTCGATAAAA----------TTCTA----TCTT--AA--GTG--G--T-ATCTGTACACACTA--A-TTGTGT-A-----T--GGTTAC--AATGGTA---AAA-T--A-TAAT--T---GTTAG----TT-ATC-TTATG-TAACCA------TATATCCAGCGTACCACCAATAATTGTCAATAGTAAA-ACC-ATCAACAAATTATATTGTGCTGTAAAAC
gi|118198 : TTT-------TAC---T--C--TACCTTGTG--CAGCCAAATGATGA---GTTA--AAA-TA-GTAGT-GT-TGA--GTGT--A--TAA---G-TG-------TTAT-T-ATGGTA------CTTTAC-TATA--T-----------------------GT-T-AGGCCAGA-CACTTT-TGCT----TATA--GCGCAAATAAATTTGCTTGAG--ATA-TT-AT--A--AG---TG----TCCGAC-TCA-ACT------TGAACCCTCAACAGGA-AT---G-ATTTCTG----T--T--AA--TTG-TT--T-ATCTGTGCGCACTA--A-TTGTGC-T-----C--AGTTGC--TATGGTA---AAATT--T-TATT--T---GTAAG-ACAGT-ATTGTTA-G-CAACCT------TGTATACCACATACAAACAGTAATTGTCAATA-TAAG-AAT-AT-AACAA
gi|118199 : T-AT-TAA--ATG-------AA---G-TG-------CACC-T-ATGGTT------GTTTAC-------------------------CAATATTA-T-AAGTCAAA-CAACAC-TGCT----CATA--GTGCAAAT-----CGCTT------TG-TC-AG--C--GA---TA----TTTGAC-CTA-ACTA-----TAAACTTGAGATA-AA-ATTTAA-ATTTATC----T--A--AA--GTG-T---T-ATCTGTACACATTA--A-TTGTGT-A-----T--AGTTAC--AATGGTA---AAATA--T-AATT--G---GTA-----GAT-ATC-TTATG-TAACCA------TATATCCAGCGTGCCACCAATAATTGTCAATAGTATA-ACC-GTCAACAAATAATGGTGTGCCGTAAAAC
gi|118200 : ttaT-GT-TAA--AT-------TGA---A-TG-------CAAC-T-ATGGTC------GTTTGT-TATA--TG------TA-AAAT---CAATATA----AAGCCAAA-CGCCTT-CGCT----TATA--GCGCAAACAGATT--CTCATAAAGTA-TC-AG--A--CG---AA----TTCGAC-CCG-ACG------TA----TTTAA-------------ATT-ATA----T--T--GA--TTG-TG--T-ATCTGTACACACTA--G-TTGTGT-T-----A--GGTTAC--AATGGTA---TACCT--T-TATT--A---ATAAG-ACATT-ATCATTT-G-TAACTGTTACATTATATGCCGTAAACCATCAGTAATTGCCATAA-TCAG-AAT-ACCAACAGAC
gi|118201 : TAT--A--TAG---GGTG-------CGAC-T-AGGGTT------GTTTAT-TTTT--TA------TA-A-AA---CAATATAT-T-ACGCCAAA-CATCAC-CGCG----TAAA--GTGTAAATAAATATGCTTATA--GTA-TCGGT--A--AG----A----TTTAGCTTTA-ATA------TAGACCTTCAAT------T---G-ATT------------------TTG-T---T-ATCTGTACATACTA--A-TTGCG
gi|118202 : TGGTT------GTTAAC-TTTA--TG------TATAT-T---CAATATAT-T-AAGCCAAA-CAAC-C-CGCT----TATA--GCGCAAAAAAATT-GATACTA--GTA-AT-GA--A--GG---AA----TTGGAC-CCA-ACTAAA---TAAACCTTCAATATAT-TT---A-ATT-ATA----T--T--GA--TTG-TAG-T-ATCTGTATACACTATAA-TT---C-TA----T--GGTTAC--AATAGTA---TATAT--T-TAGT--A---CTATG-GCAAT-ATCGTAT-G-TAACAT------TATATGCAGCATCACATCAGTAAACGTTAATA-TAAG-AAT-ATTAACAATCTACGGTATGCCGTCAAAC
gi|118203 : attGGTA--------TTGT-TAT-----------TA-A-AT---CAATACAT-A-AGACCA-A-CACATTGCTCT----TATAAAGTGCAAATTCATTTGCTAAAA--GTA-TTTAT--A--AG---TGAAGTTTTAAT-CGGTATG------TAAGCCTT-AATAGAATAT---A-ATTAC-A----T--T--CA--TT-----------TGTGTAT------------------------GGTTAC--GATGATA---TAACT--T-TAGC------GTAAT-GC--T-ATCGTTT-G-TAATCT------TATAAACAGCGTATCGACAGTAATGGTCATTA-T--GCACT-ATTAACAAACTA
gi|118204 : TTTTC-TATA--TGCATTTATA-AAAC---CAGCATGT-A-AGGCAAAA-CAACAC-TGCT----TATA--GAGCTAATTTGTTTGTTTAAA--GTA-TC-AG--AGAAG---TA----T--------A-GAT------T-----TTCAGTATAT-TT---T-AATTATA----T--T--GA--GAG-AA--TTATCTGTACACACTA--A-TTGTACATGTATAT--GGTTAC--AATGGTATTGGACTT--T-TGTA--C----TATG-ATAAT-ATC-----G-CAATTT------TCTGTA-----TACCATCAGTAGTTGTCAAT
gi|118205 : taACA--TG------TA-AAAC---CAATATAT-T-AAGCTAAA-CAACTC-CGCT----TATA--GCGCA----------CCGATT--GTG-TT-AA--A------------------C-CTA-ACTA-----TAGACCTTCAATAGAA-TTT--G-ATT-ATA----T--T--GA--TTG-CGG-T-ATCTGTATACACTA--T-GTGTGC-A-----A--GGTTAC--AACGATA---TAACT--T-TAAT--A---TTATG-GCAAT-TTCGTAT-G-CATCCT------TATATGCAGCATCCTTTCAGAAATTGCCAATA-TAAG-ACT-ATCAGCAAACTACGGTATGTCGTCAA
gi|118206 : A--TA------TA-GTACAATCAATATAT----GGCCAAAACAAT----GCT----CATAAAGTGCAAATTCATTTGCTAATA--GTA-CC-AGTGA--AG---TT----TT-------A-ACTGGTATGTAAGCCTT-AATAGAA-------------TA----T--T---A--TT----------------ACATTA--A-TT-TGT-T-----TATGATTAT--GATGATA---CATCT--T-TATTACT---GTAG---TGAT-ATCGTAT-G-TAATCT------TATAAACTGTGTATCAACAGTAATAGTCAATA-T--GCAAT-ATTAACAAACTA
gi|118207 : TAC---CAATATTT-T-AAGCCAAA-TAACAC-TGCT----CATA--GCGCAAATTACTTTGCTTATA--TTG-TC-AGC-A--AG----A----TTCGAC-CTA-AATA-----TGAACTTTCGATAAAA-TT---T-AATTCTA----T--C--TA--TAGAGG--T-GTCTGTACACACTA--A-TTGTGT-G-----T--GGTTAT--AATGGTA---AAATA--C-AATT----------G-ATAGTTATC-TTATG-TAACCG------TATATCCAGCGTACCATCAGTAATTGTCAATAGTAA--ACC-ATCAACAAATTACAATGTGCTGTAAAAC
gi|118208 : TAC---CAATA-GTAT-AAGTCAAA-CAACGC-TGCT----CATA--GCGCAAATCGCTTTGCTT-----GTA-TC-GT--C--AGCGATA----TTCGAC-CTA-ACTA-----TAAA--TTTAA---------------TTCTA----T--CTAAA--GTG-T---T-ATCTGTACACACTT--A-TTGTGC-A-----T--AGTTAC--AATGGTA---AAATA--T-AATT--G---GTAGT-----T-ATC-TTATG-TAACCA------TATATCCAGCTTACCACCAATAATTGTCAATAGTATA-ACC-ATCAACAAATTATGGTGTGCCGTAAAAC
gi|118209 : -AGGCCA-A-CACATT--GCTCTAATATA--GCGCAAATTAATATGCTAATA--GTATTT-AT--A--AG-----------------------------TGAAGCTTTAATCGGT-AT---G------TAAGCCT--T--AA--TTG-AA--T-ATAAGT--ACATTC--ATTTGTGT-A-----T--GGTTAC--GATAATA---TATCA--T-TATTACC---GTAAT-GC--T-ATCGTAT-G-TAATCG------TATAAACAGCGTATCGACTGTAATGGTCATTA-T--G-CACAATTAACAAGCTAACTGATGCCATGAA
gi|118210 : CTAAA-CACCTC-TGCT----TATA--GCGGAAGTAGAATTGCTTATA--GCA-TT-GG--A--GG---GA----TTCGAC-ATA-A--------TAAACATTCAA-ATAA-A------ATTTA-A----T--T--CAC-TTG-TA--T-ATCTGTACACACTA--G-TTGTCT-T-----A--ATTTAC--AATGGTA---CGATT--T-AATTA-C---ATAAT-ACAAT-ATCGTAT-G-TAACAT------TATATACCGCATACCGTCAATAATTGTCAATA-TATA-AAA-ATCAACAAACTATAGTATGCCGTAAAAC
gi|118211 : T----TAT---GCACATTTAATTTTGCTTATA--TTA-TC-GACGA--AG---T-----TC--AA-CCA-A-----------------AATATAA-AC---------CTA----T--T--GA--TAG-TGGCC-A-CTGTACACACTA--A-TGGTAT-A-----T--GGTTAC--ACTAGTA---TGATTAAT-TACT------ATAG---CAAT-ATTGTAT-G-TAACCT------TCTATGCAGCATACCAACATTAATTGTCAATA-TAAG-AAT-ACCAACAAACTAAGGTATGCCGTCAAAC
gi|118212 : agtcacctggttctAGAA-AT---A-ATTTCTA----T--T--GA--TTG-TA--T-ATCTGTTCACACTA--A-TT---------------GTTAC--CATGTTA---AATTT--T-TATTA-TTTAATAAC-ACAGC-A--GTTA-ACCAATCG------AGCATA
gi|118213 : A--TTG-TA--T-ATCTGTGCACACTA--A-TTGTGC-TAC---C--AATCAC--ACT-GTA---ATATT--T-TACT--T---ACAAaca
gi|118214 : TCTGTGCACACTA--A-TTGTAT-T-----C--AGTTGC--TATGGTA---ATATT--TCTATT--T---GTATG-ACAGT-ATCGTTA-G-CAACCG------TATATACCACATACAGACAGTAATTGTCAATA-TAAG-AAT-ATCAGCAAACTAGAGTATGCCGTAAAAC
blockSeqs : AA . A A TAAATT T G AT T AA T T T AC TAA TTAT CTCTAA AG AC G T AAAAAATAGT CTTTTTG ATG CAT TG CTT TG AA T T T C AG AA AA TTCA CATGTAA T A T AAATGAGG C GT CATTTA T T AAT T A A G A CATTGC CTAA AA A G AAA T G GTG GA TGAAGT CT TT T GGTATG G C ATTTAA T AGCC CT TA AG A GGC T G TA T ATGTATAT TAT TTGG AA C ATTTAA T A T G T C GTTACAT C A A G C A G
blockSeqs : AA . . . TAAATT T . . T . T . T AC TAA TGTA CGCA AG . G . AA . . ATT TG CTT . A T T T . . . AA TTAG . A A . AA . . . . T . T . . G . CTTTC . AA A A G . T ACG . CGATA CC T . AAA G C ATTT T . . . AG . AG . G . . TTAT T A . . ACTG T A . G T . A C A A G C . G
blockSeqs : AA . . . . T . . . . T . T . . TGTA CATT AG . . . A . . C . . . A . A . . . . . GG . T . . AA . . . . T . T . . G . CTTTT . . A A T . . GC . TA GC T . A G C ATTT T . . . C . GG . G . . TACC T G . . ACCG . A . G T . G C A A G . . A
blockSeqs : A . . . . T . . . . T . G . . TAG TTTA A . . . A . . C . . . A . A . . . . . GG . T . . AA . . . . A . T . . G . CTTTC . . A T G . . GC . TA CC T . A G C TATA C . . . . . A . G . . TAT T A . . ACA . G . G T . G C A A G . . G
blockSeqs : T . . . . A . . . . T . G . . TAA CTTT A . . . C . . T . . . A . A . . . . . GG . A . . AC . . . . A . T . . G . CTTTT . . A A G . . A . TA CG C . A G C TTTG T . . . . . T . G . . TC T A . . TG . A . G T . G C A A G . . G
blockSeqs : T . . . . A . . . . T . G . . TGA CTTT A . . . T . . C . . . A . A . . . . . A . T . . AC . . . . T . A . . G . CTTTT . . A T G . . A . CG CC T . A G C ATG C . . . . . A . G . . TC T A . . TG . G . G T . G C A A G . . G
blockSeqs : A . . . . A . . . . T . G . . TGG CTTT G . . . T . . C . . . G . A . . . . . A . T . . AC . . . . T . T . . G . CTTTT . . A T G . . A . TG CC T . A G C ATG T . . . . . T . G . . TC T A . . TG . A . G . . G C A A . . . G
blockSeqs : A . . . . A . . . . T . G . . TGA CTTT G . . . T . . C . . . A . T . . . . . A . T . . AC . . . . T . T . . G . CTTTT . . A A G . . T . TG CC T . A A C ATG T . . . . . A . G . . TC T A . . TG . A . G . . G C A A . . . A
blockSeqs : A . . . . A . . . . T . G . . TGG CTTT G . . . T . . T . . . G . A . . . . . G . T . . AA . . . . T . T . . G . CTTTT . . A T G . . T . TG CT T . A A C ATG T . . . . . A . G . . TC T A . . TG . G . C . . G C A T . . . T
blockSeqs : . . . . . T . . . . T . T . . GGA CGTT A . . . T . . C . . . C . A . . . . . G . G . . TG . . . . T . T . . G . CTTTC . . A G A . . T . TA CT T . . A C ATG T . . . . . A . A . . TC A T . . TG . A . G . . T A G C . . . G
blockSeqs : . . . . T . . . . T . T . . AGT TGTA A . . . A . . C . . . A . G . . . . . G . G . . TA . . . . T . T . . A . TCTCC . . A T G . . T . TA TC C . . G T ATG T . . . . . A . G . . TC T A . . TA . T . G . . A C A A . . . T
blockSeqs : . . . . T . . . . . . T . . ACA CTTT A . . . A . . C . . . . . A . . . . . G . T . . TG . . . . T . A . . G . ATTTT . . T A A . . A . TA CC T . . A C CTG T . . . . . A . A . . TC A A . . TA . G . A . . G A G C . . . T
blockSeqs : . . . . . . C . . GC . G . . . A . . C . . . . . A . . . . . G . T . . AG . . . . T . T . . A . ACACT . . A T G . . A . TA TC C . . A T ATG T . . . . . A . A . . TA A A . . TG . A . G . . A A G C . . . T
blockSeqs : . . . T . . A . . . . . T . . C . . . . . A . . . . . A . T . . TG . . . . A . A . . A . CTTTT . . T T A . . A . TG TC C . . G T ATA T . . . . . A . G . . TA T A . . TG . T . G . . A C A A . . . C
blockSeqs : . . . C . . . . . . . . A . . C . . . . . . . . . . . G . A . . AC . . . . T . A . . G . ACGCT . . T T A . . G . TA CC T . . A C ATG T . . . . . G . A . . GT A A . . TG . A . G . . T A G C . . . C
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . G . A . . TG . . . . A . A . . A . ACACT . . A T G . . T . TG TT C . . A T TTG T . . . . . T . A . . TC A A . . GG . A . G . . A C A T . . . C
blockSeqs : . . . . . . . . G . G . . CG . . . . A . A . . A . CTTTT . . A C A . . G . TA TC C . . A T ATG A . . . . . G . A . . GT A T . . AA . A . G . . T A A T . . . T
blockSeqs : . . . . . G . . . . TG . . . . T . A . . A . ACACT . . A T A . . T . AA TT C . . A T TTA T . . . . . A . A . . AT G T . . AC . A . G . . T A G A . . . A
blockSeqs : . . A . . . . TG . . . . T . A . . A . CCTTC . . A A A . . G . AA TG C . . A T TTT T . . . . . G . G . . TC A T . . AT . G . G . . T A A T . . . T
blockSeqs : A . . . . T . A . . A . TCACC . . T A A . . G . TA TT C . . A T TTT T . . . . . A . A . . AT A T . . GG . A . G . . T T G T . . . A
blockSeqs : A . . . . . . A . . A . ACACT . . T T T . . T . TT TC C . . A T ATG T . . . . . A . A . . TA G C . . TA . A . G . . T A G A . . . G
blockSeqs : . . . . . . A . . A . ACTCC . . T G A . . A . GA TC C . . G T ATA T . . . . . A . A . . AA A A . . TG . G . . . . G A T T . . .
blockSeqs : . . . . . A . . A . ACACT . . T A A . . T . T TC A . . A T TG . . . . . . A . A . . GT A A . . A . G . . . . A A G C . . .
blockSeqs : . . . . . A . . A . ACGCT . . C T A . . G . A T C . . G T AC . . . . . . . . A . . AT G T . . A . . . . . . G C A A . . .
blockSeqs : . . A . . A . CCTCT . . T T A . . A . A C . . . A T A . . . . . . . . A . . AT A C . . G . . . . . . T A A T . . .
blockSeqs : . . . . . . . ACCC . . A A A . . T . T . . . . . . . . . . . . . . . T . . TA A T . . C . . . . . . T C A A . . .
blockSeqs : . . . CATT . . A T . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . AT C A . . A . . . . . . G . . A
blockSeqs : . . AT . . . T . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . TC A A . . . . . . . . . G
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . T A . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqCons :
originalCons : TTTTTA-TTTAACT-AGT-TGT-TT------AGTTGANTA-TT--TTT-AT--TTGCTA-ATATTNATGCAGAT--TTT---ATATG-A-GACTTT--CTTTGATGACTAAAA-GT--TGACGATTAATT-ATTA-AGAN---------TTTAATTATTT-------TAC---T--C--TACCTTGTG--CAGCCAAATGATGA---GTTA--AAA-CA-GTAGT-GT-TGA--GTGT--A--TAA---G-TG-------TTAC-T-ATGGTA------GTTTAC-TATA--TG------TA-ATAC---CNATATGT-T-AGGCCAGA-CACCTC-CGCT----TATA--GCGCAAATAAATTTGCTNATG--GTA-TC-AN--A--AG---TA----TCCGAC-CCA-ACT------TGAACCTTCAACAGAA-AT---G-ATTTCTA----T--T--GA--TTG-TA--T-ATCTGTGCACACTA--A-TTGTGC-T-----C--GGTTAC--NATGGTA---AAATT--T-TATT--T---GTAAG-ACAAT-ATCGTTA-G-CAACCG------TGTATACCGCGTACCAACAGTAATTGTCAATA-TAAG-AAT-ATCAACAAACTANAGTATGCCGTAAAAC
finalCons : TTTTTA-TTTAACT-AGT-TGT-TT------AGTTGANTA-TT--TTT-AT--TTGCTA-ATATTNATGCAGAT--TTT---ATATG-A-GACTTT--CTTTGATGACTAAAA-GT--TGACGATTAATT-ATTA-AGAN---------TTTAATTATTT-------TAC---T--C--TACCTTGTG--CAGCCAAATGATGA---GTTA--AAA-CA-GTAGT-GT-TGA--GTGT--A--TAA---G-TG-------TTAC-T-ATGGTA------GTTTAC-TATA--TG------TA-ATAC---CNATATGT-T-AGGCCAGA-CACCTC-CGCT----TATA--GCGCAAATAAATTTGCTNATG--GTA-TC-AN--A--AG---TA----TCCGAC-CCA-ACT------TGAACCTTCAACAGAA-AT---G-ATTTCTA----T--T--GA--TTG-TA--T-ATCTGTGCACACTA--A-TTGTGC-T-----C--GGTTAC--NATGGTA---AAATT--T-TATT--T---GTAAG-ACAAT-ATCGTTA-G-CAACCG------TGTATACCGCGTACCAACAGTAATTGTCAATA-TAAG-AAT-ATCAACAAACTANAGTATGCCGTAAAAC
Alignments
lowQualScore : 111111 1111111111 11 111111 1111111111 1111111
lowQualScore : 99 3 3 3 777777 1 2 33 5 33 3 2 1 66 888 66666 444444 99 33 4 2 3333333333 7777777 333 44444 66 0 888 33 11 4 1 4 2 22 22 55 77777 6666666 4 4 2 99999999 1 22 444444 1 3 222 1 0 1 1 1 1 555555 2222 33 1 1 333 1 2 777 11 666666666 22 33 1 666666 1 2 88888888 1 2222 11 11 44 1 999 1 1 11 1 0000000000 333 2222 11 1 4444444 2 2 1 3 8 1 5555555 0 2 2 1 8 3 1 1
lowQualScore : .. . . . ...... . . .. . .. . . . .. ... ..... ...... .. .. . . .......... ....... ... ..... .. . ... .. .. . . . . .. .. .. ..... ....... . . . ........ . .. ...... . . ... . . . . . . ...... .... .. . . ... . . ... .. ......... .. .. . ...... . . ........ . .... .. .. .. . ... . . .. . .......... ... .... .. . ....... . . . . . . ....... . . . . . . . .
lowQualScore : 44 1 1 1 777777 0 9 99 7 44 2 5 0 99 888 00000 222222 88 44 7 4 6666666666 2222222 999 33333 55 3 222 22 88 7 6 2 1 99 88 55 88888 5555555 7 0 0 55555555 7 22 666666 6 0 666 5 3 5 4 5 4 000000 8888 77 2 0 111 4 8 666 99 444444444 00 22 4 000000 2 3 55555555 8 8888 88 88 88 3 777 3 7 77 2 6666666666 222 4444 88 3 6666666 8 3 4 5 3 4 0000000 9 2 1 8 9 0 5 0
consensus : TTTTTA-TTTAACT-AGT-TGT-TT------AGTTGANTA-TT--TTT-AT--TTGCTA-ATATTNATGCAGAT--TTT---ATATG-A-GACTTT--CTTTGATGACTAAAA-GT--TGACGATTAATT-ATTA-AGAN---------TTTAATTATTT-------TAC---T--C--TACCTTGTG--CAGCCAAATGATGA---GTTA--AAA-CA-GTAGT-GT-TGA--GTGT--A--TAA---G-TG-------TTAC-T-ATGGTA------GTTTAC-TATA--TG------TA-ATAC---CNATATGT-T-AGGCCAGA-CACCTC-CGCT----TATA--GCGCAAATAAATTTGCTNATG--GTA-TC-AN--A--AG---TA----TCCGAC-CCA-ACT------TGAACCTTCAACAGAA-AT---G-ATTTCTA----T--T--GA--TTG-TA--T-ATCTGTGCACACTA--A-TTGTGC-T-----C--GGTTAC--NATGGTA---AAATT--T-TATT--T---GTAAG-ACAAT-ATCGTTA-G-CAACCG------TGTATACCGCGTACCAACAGTAATTGTCAATA-TAAG-AAT-ATCAACAAACTANAGTATGCCGTAAAAC
Reference ( family-605 ) : TTTTTA-TTTAACT-AGT-TGT-TT------AGTTGANTA-TT--TTT-AT--TTGCTA-ATATTNATGCAGAT--TTT---ATATG-A-GACTTT--CTTTGATGACTAAAA-GT--TGACGATTAATT-ATTA-AGAN---------TTTAATTATTT-------TAC---T--C--TACCTTGTG--CAGCCAAATGATGA---GTTA--AAA-CA-GTAGT-GT-TGA--GTGT--A--TAA---G-TG-------TTAC-T-ATGGTA------GTTTAC-TATA--TG------TA-ATAC---CNATATGT-T-AGGCCAGA-CACCTC-CGCT----TATA--GCGCAAATAAATTTGCTNATG--GTA-TC-AN--A--AG---TA----TCCGAC-CCA-ACT------TGAACCTTCAACAGAA-AT---G-ATTTCTA----T--T--GA--TTG-TA--T-ATCTGTGCACACTA--A-TTGTGC-T-----C--GGTTAC--NATGGTA---AAATT--T-TATT--T---GTAAG-ACAAT-ATCGTTA-G-CAACCG------TGTATACCGCGTACCAACAGTAATTGTCAATA-TAAG-AAT-ATCAACAAACTANAGTATGCCGTAAAAC
gi|118181 : TTTTTA-TTTTACTTAGC-TGT-TT------AGTTGAATA-TT--TTT-AT--TTGCTA-ATATTGATGCAGAT--TTT---ATATG-A-GACTTT--CTTTGATGACTAAAA-GT--TGACGATTAATT-ATTA-AGAT---------TTTAATCATTT-------TAC---T--C--TACCTTTTG--CAGCCAAATGATGA---GTTA--AAG-CA-GTGGT-GT-TGA--GTGT--A--TAA---G-TG-------TTAT-T-TTGGTA------GTTTAC-TATA--TG------TA-ATAC---CTACATGT-T-AGGCCAGA-CACTTT-TGCT----TGTA--GCGCAAATAAATTTGCTAGCG--GTA-TC-AT--A--AG---TG----TCCGAC-TCA-ACT------TGAACCTTCAACAGGA-TT---G-ATTTCTG----T--T--GA--TTG-TA--T-ATCTGTACCCACTA--A-TTGTGC-T-----C--GGTTGC--TATGGTA---AAATT--T-TATT--T---GTAAG-ACAAT-ATCGTTA-G-CAACCG------TGTATACGACATACAAACAGTAATTGTCAATA-TAAG-AAT-ATCAACAAATTAGAGTATGCCGTAAAAC
gi|118182 : TTTTTA-TT-GACT-AGT-AGT-TT------AGGTGATTA-TT--TTA-AT--T-ACTA-ATATTTATGCAGAT--ATT---ATATA-G-GGCGCA--CTTCAATGATTAAAA-AT--TGACGACTAATT-ATTA-AGAAA--------TTTAGTTATTT-------TTC---T--C--TATCTTGTG--CAGCCAAGTGATAA---GTTA--AA--CA-GT-TT-ATCTGT--GTAG--A--TTA---A-TA-------TTAC-T-ATGGTA------ATT-AC-TATA--AG------TA-ATAC---CTATATGT-T-AGGCCAGA-CACTTT-CGCT----TATA--GCGCAAATAAATTAGCAGATG--GTA-TC-AA--A--AG---TA----TCTGTC-TCA-ACC------TGAACCTTCAACAGAA-AT---G-ATTTCTA----T--T--GA--CTG-TA--T-ATCTGTGCACACTA--A-TTGTGC-T-----C--AGTTGC--TATGGTA---AAATT--T-TATT--T---GTTAG-ACAAT-ATTGTTA-G-CAACCA------CCAATACCACATACCAACAGTAATTGTCAATA-TAAG-ACT-ATCAACAAACTAGAATATGCTGTAAAAC
gi|118183 : tTTTTTT-TTTGACT-ACT-AGT-TT------AGTTGATTA-TT--TTA-AT--T-ACTA-ATATTTATGCAGAT--TTT---ATATA-A-GGCATT--CTTCGATAACAAAAA-AT---GATGATTAATT-TTTA-AGAA---------TTTAATTATTT-------TTC---A--C--TACCTTGTG--CAGACAAGTGATGA---GTTA--AA--CA-GTTAT-TT-TGT--GTGA--A--TAA---A-TG-------TAAC-T-ATGGTA------ATTTAC-TATA--TG------TA-ATAC---CTATATGT-T-AGGCCAGA-CACTTT-TGCT----AATA--GCGCAAATAAATTTGCTAATT--GTA-TC-AA--A--AG---TA----TCCTAC-TCA-ACC------TGAACTTTCAACAGAA-AT---G-ATTTCTA----T--T--GA--ATG-TT--T-ATCTGTGCACACTC--G-TTGTGG-T-----C--GGTTGC--TATGGTA---GAATT--T-TATT--T---GTTAG-ACAAT-ATCGTTA-G-CAACCG------TGTATACCTCATACCAACAGTAATTGTCAATA-TAAG-AAT-
gi|118184 : TTCTTT-TTTAACT-AGT-AGT-TTTAAATTAGTTGATTA-TT--TCA-AT--A-ACTA-ATATTTATGCAGAT--TTT---ATA---A-GA-------------GACTAAAA-AT--TGGCAATTAATT-ATTA-AGAA---------TTTAAATCTTT-------TTC---T--T--TACCTTGTGTGCAGCCAAGTGATGA---GTTA--AA--CA-GTTAT-GT-TGT--GTAG--A--TGA---A-TG-------TTGC-T-TTGGTA------ATTTAC-TATA--TG------TA-ATAC---CTATATGT-C-AGGCCAGA-CACTTT-CGCT----TAAA--GCGCAAATACATTTGCTAATG--GTA-TC-AA--A--AG---TA----TGCGAC-TCA-ACC------TGAACCTTCAACAGAA-AT---G-ATTTCTA----T--T--GA--TTG-TA--T-GTCTGTGCACACTA--A-TTGTGC-T-----C--GATT--------GTA---AAATT--T-TATT---------AA-ACAAT-ATCGTTA-G-CAACCG------TGTATACCACATACCAACAGTAATTGTCAATA-TAAG-AAT-ATCAATAAACTAGAGTATGCCGCAAAAC
gi|118185 : TTTTTA-CTTAATC-AGT-TGT-TT------AAATAGTTA-TT--TTT-AA--TTGCTT-ATATTGATGCAGAC--TTT---AT--G-C-GATTTA--CTTCAAT-ATTCAA--GTACTAACGTTTAATT-ATTG-AAAC---------TCCAGGCATTC-------TAC---T--C--TACCTTGTG--CAGCCAAAATATGA---TTTA--AAAATA-TTAGT-AC-CGA--TTGT--A--CTA---G-CA-------TTAC-T-ATGGTA---------------TG--TG------TA-GAAC---CTATATAT-T-AGGCCAGA-CGCTTT-TGCT----TATA--GCGCAAATAAATTTGCTTGAG--ATA-TC-AT--A--AG---CG----TCCGAC-CCA-ACT------TGAACCCTCAACAGGA-AT---G-ATTCCCG----C--T--GA--TTG-TT--T-ATCTGTGCACACTA--A-TTGTGC-T-----C--AGTTGC--TATGGTA---ATATT--T-TATT--T---GTATG-ACAGT-ACCGTTA-G-CAACCG------TATATACCACATACAGAGAGTAATTGTCAATA-TATA-AAT-ATCAACAAACTAAAGTATGCCGTAAAAC
gi|118186 : TTTTTA-TTTAACT-AGT-TGT-TT------AGTTGAATT-TT--TTT-TT--TTGCTA-ATATTGATGCAGAC--TTT---ATATG-A-GACTTT--CTTTAATGACTAATT-GT--TAACGATTAATT-ATTA-AGAT---------TTTAATTATTT-------TAC---T--C--TACCTTGTG--CAGCCAAATGATGA---GTTA--AAA-TA-GTAGT-GT-TCA--GTGT--A--TAA---G-TG-------TAAC-T-ATGGTA------CTTTAC-TATA--TG------TA-AAAC---CTATATGT-T-AGGCCAGA-CACTTT-TGCT----TATA--GCTCAAATA
gi|118187 : TTTTTAATTTAACT-AGT-TAT-TT------AGTTGAATA-TT--TTTTAT--TTGCTA-ATATTGATGCAGAC--TTT---ATATG-G-GACTTT--CTTTGATGACCAAAAAGT--TGACGATTATTT-ATTA-AGAT---------TTTAATTATTT-------TAC---T--C--TACCTTGTG--CAGCCAAATGATGA---GTTA--AAA-TA-GTAGT-GT-TGA--ATGT--A--TAA---G-TG-------TTAT-T-ATAGTA------CTTTAC-TATA--TG------TA-ATAC---CAATATGT-T-AGGCCAGA-CACTTT-TGCT----TATA--GTGCAAATAAATTTGCTAATG--GTA-TC-AT--A--AG---TG----TCGGAC-TCA-ACT------TGAACCCTCAACAGGA-AT---G-ATTTCTG----T--T--GA--TTG-TA--T-ATCTGTGCACACTA--G-TTGTGC-T-----C--AGTTGC--TATGGTA---AAATT--T-TGTT--T---GTAAG-ACAAT-ATCGTTG-G-CAACCG------TGTATACCACATACAAACAGTAATTGTCAATA-TAAG-AAT-ATCAACAAAGTAGAGTATGCCATAAAAC
gi|118188 : TTTTA-TTTAACT-AGT-TGT-TT------AGTTGAAAA-TT--TTT-AT--TTGCTA-ATGTTGATGCAGAC--TTT---ATATG-A-GACTTT--CTTTAATGACTAAAT-GT--T-ATAATAAATT-ATTA-AGAT---------TTTAATTATTT-------TAC---T--T--TACCTTGTG--CAGCCAAATGATGA---GTTA--AA--TA-GTAGT-GT-TCA--GTGT--A--TAA---G-TG-------TTAT-T-ATGGTA------CTTTAC-TATA--TG------TA-ATAC---CTATATGT-T-AGGCCAGA-TACTTT-TGCT----TATA--GCGCAAATAAATTTGCTTGAG--ATA-TC-AT--A--AG---TG----TCCGGC-TCA-ACT------TGAACCCTCAACAGGA-AT---G-ATTCCTG----T--T--GA--TTG-TA--T-ATCTGTGCACACTA--A-TTGTGC-T-----C--AGTTGC--TATGGTA---AAATT--T-TATT--T---GTAAG-ACAGT-ATCGTTA-G-AAACCG------TGTATACCACATACAAACAGTAATTGTCAATA-TAAA-AAT-ATCAACAAACTAGAGTATGCTGTAAAAC
gi|118189 : TTTTTAATTTAACT-AGT-TGT-TT------AGTTGAATA-TT--TTTTAT--TTGCTA-GTATTGATGCAGAC--TTT---ATATG-G-GACTTT--CTTTGATGACTAAAAAGT--ATACGATTAATT-ATTA-AGAT---------TTTAATTATTT-------TAC---T--C--TACCTTTTG--CAGCCAAATGATGA---GTTA--AAA-TA-GTAGT-GT-TGA--GTGT--A--TAA---G-TG-------TTAT-T-ATGGTA------CTTTAC-TATA--TG------TA-ATAC---CTATATGT-T-AGGCCAGA-CACTTT-TGCT----TATA--GCGCAAATAAATTTCCTTGTG--ATA-TC-AT--A--AG---TG----TCCGAC---------------------TCAACAGGA-CT---G-ATTTCTG----T--T--AA--TTG-TA--T-ATCTGTGAACACTA--A-TTGTGC-T-----C--AGTTGC--TATGGTA---AAATT--T-TATT--T---GTAAG-ATAAT-ATCGTTA-G-CAACCG------TGTACACCACATACAAACAGTAACTGTCAATA-TAAG-AAT-ATCAACAAACTAGAGTATGCCGTAAAAC
gi|118190 : TTTTTAATTTAACT-AGT-TGT-TT------AGTTGAATAGTT--TTT-AT--TTGTTA-ATATTGATGCAGA-------------------CTTT--CTTTAATGACAAAAAAGT--TGACGATTAATT-ATTA-AGAT---------TTTAATTATTA-------TAC---C--C--
gi|118191 : TTTT--TTTAACT-AGT-AGT-TTTAAATTAGTTGATTA-TT--TAA-AT--A-ACTA-ATATTTATTCAGAT--TTT---ATAGG-A-GACGTT--CTTTGATGACTAAAA-AT--TGGCGATTAATT-ATTA-AGAA---------TTTAATTCTTT-------TTC---T--C--TACCTTGTGTGCAGTGAAGTGATGA---GTTA--AA--CA-GTTGT-GT-TGT--GTGG--A--TAA---A-TG-------TTGC-T-TTGGTA------ATTTAC-TATA--TG------TA-ATAC---CTATATGT-T-AAGCTAGA-CACTTT-CGCT----TATA--GTGCAAATAAATTTGCTAACG--GTA-TC-AA--A--AT---TA----TCCGAC-TCA-ACC------TGAACCTTAAACAGAA-AT---G-ATTTCTA----T--T--GA--TAG-TA--T-GTCTGTGCACACTA--G-TTGTGC-T-----C--GATTGC--TATGGTA---AAATT--T-TATT---------AG-ACAAT-ATTGTTA-G-CCACCG------TGTATATCACATACCAACAGTAGTTGTCAATA-TAAG-AAT-ATCAACAAACTAGAGTATGCCGTAAA
gi|118192 : -TTTATCT-A-T-TATATT------AGGTGATTA-TT--ATT-GTAATTACTA-ATATATATTCAGAT--TCT---ATAAG-T-G-CTCTAACTATG-TGATTAAAA-AT--TGACGACTAATT-ATTT-A--------------TAATTAATT-------TATATGT--CATTACCTTGTG--CAGCCAAGTGATAA---ATTATGCAA-C------T-AT-TAA--GTAT--T--TGATTCA-TG-------TGAA-T-ATGGTT------GTTTAC-TATA--CG------TA-ATAC---CT-------------C----CGTCTC-CGCT----TATA--GCGCAAATAAATTTGCTTGTA--GTA-TC-AA--A--AG---TA----TCTGGC-TCA-ACC------TAAAGCTTCAACAGAA-AT---A-ATTTCTA----T--T--GA--TTG-TA--T-ATCTGTGCACACTA--A-TGGTGC-T-----A--GGTTAC--TGCGGTA---TACTT--T-TATT--T---ATAAG-ACAGT-ATTCTTA-A-CAACGT------TACATAGCACATACATTCAGTAATAGTCAATA-TAAG-AAT-ATCAACAAACTAAAGTATGCCGTAAAAC
gi|118193 : -TTTAACT-AGTATAT-CG------GGT-GATTA-TTATTTT-AA--TTGCTA-TTATTTATGCAGATACTAT---ATATT-ATGATGTA--GCTAGATGATTTAAA-AT--TGTCAACCAATT-ATTTTAGAA---------TT-AA--GTTT---------C---T--C--TACCTTGTG--CAGCCAAGTGATAA---A-TG--AAA-CA-A-AG--GT-TAT--GTGTAAA--TTA---G-TG-------TGAT-T-ATGGTT------ATTTAC-TATA--TG------AA-ATAC---CTATATAT-TAAAGCGAGT-CAATTT-TGCT----TATA--GTGCAAATAAATTTGCAGATG--GTA-TT-AA--A--AT---TA----TCTGGC-TCA-ACC------TAGACCTTCAACAGAA-AT---G-ATTTCTA----T--T--GA--TTG-TA--T-ATCT-T-CACACTA--A-TTGTGC-T-----A--GGTTGCTATATGGT-----AATT--T-TTTT--T---ACAA
gi|118194 : --TTGTTT-ATACTCATG-ATAT--TTTTAAATTTGTA-GA--------TTGACGACCAAAG-----TGTAGATTAATCGACTA-AGAA---------TATTATTATTTCTTTTTGTAT---T-----TACCGATTG--CAGCCATAT-ATTACTTATTA--GTG-CATGTAATTGA-TTA--ATTT--AAATAA---GGTG-------C-ACAT-ATGGTT------GTTCAC-------------------------CAATATTT-T-AAGTTAAA-CAACAC-TGCT----CATA--GCGCAAATTGCTTTGCTTATA--ACG-TC-AG--C--GA---TA----TTCAAC-CTA-ACTA-----TAAACCTTAGATAAAA-AT---TTAATTCCA----T--C--CAAGGTG-T---T-ATCTGAACACATTA--A-TTGTGT-G-----T--GGTTAC--AAAGGTA---AAAT---------------ATAAGTACT-T-ATC-TTATG-TAACCA------TGTATCCAGCGTACCACCAATAATTGTCAATAGTAA--ACC-ATCAACAAATTATGGTGTGCCGTAAAAC
gi|118195 : aactattttacatttttggattcggttcttactaattactaacaA-TT--TTT-TT--TTATTATATATATATATAGATACTTC---ATAAC-A-GACTTT--CTTTGATGACTAAAA-GT--TGACGATTTATT-ATTA-AGAT---------TTTAATTATTT-------TAC---T--C--TACCTTGTG--CAGCCAAATGATGA---GTTA--AAA-CA-GTGGT-GT-TGA--GTGT--A--TAA---G-TG-------TTAT-T-CTGGTA------GTTTAC-TATA--TG------TA-ATAC---CTATATGT-T-AGGCCAGA-CACTTT-TACT----TATA--GCGCAAATAAATTTGCTAGTG--TTA-TC-AT--A--AG---TG----TCCGAC-TTA-ACT------TGAACCTTCAACAGGA-TT---G-ATTTCTG----T--T--GA--TTG-TA--T-ATCTGTGCCCACTA--A-TTGTGC-T-----C--GGTTGC--TATGGTA---AAATT--G-TATT--T---GTAAG-ACAAT-ATCGTTA-G-CAACCG------TATATACCACATACAAATAGTAATTGTCAATA-TAAG-AAT-ATCAACAAACTAGAGTATGCCGTAAAAC
gi|118196 : --TTGTTT-ATACTCATG-ATAT--TTTTAAATTTGTA-GA--------TTGACGACCAAAG-----TGTAGATTAATCGACTA-AGAA---------TTT------TG-------TAT---T-----TACCGATTG--CAGCCATAT-ATTACTTATTA--GTG-CATGTAATTGA-TTA--ATTT--AAATAA---GGTG-------C-ACAT-ATGGTT------GTTCAC-------------------------CAATATTT-T-AAGTTAAA-CAACGC-TGCT----CATA--GCGCAAATTGCTTTGCTTATA--TCG-TC-AG--C--GA---TA----TTCAAC-CTA-ACTA-----TAAACCTTAGATAAAA-AT---TTAATTCTA----T--C--CAAGGTG-T---T-ATCTGAACACATTA--A-TTGTGT-G-----T--GGTTAC--AATGGTA---AAAT---------------ATAAGTACT-T-ATC-TTATG-TAACCA------TGTATCCAGCGTACCACCAATAATGGTCAATAGTAA--ACC-ATCAACAAATTATGGTGTGCCGTAAAGC
gi|118197 : GATTAATT-AACA-AAAAAAAAATAGTTTTATTTCTTT-------TTC---TATT--TACCGATTG--CAGCCATAT-ATTA---CATA--AAC-CC-ATA-T-AT-TAAAGGTTT--A--TAATTAG-TGCATGTAATTAC-TTATATTAAATGAGGTGCACCTATGGTTG------TT--TAC---CAATATTT-T-AAGACAAA-CAACAC-TGCT----CATA--GTACAAATTACTTTGCTTATA--TTG-TC-AGC-G--AG---T-----TTCGAC-CTA-AATA-----TAAACTTTCGATAAAA----------TTCTA----TCTT--AA--GTG--G--T-ATCTGTACACACTA--A-TTGTGT-A-----T--GGTTAC--AATGGTA---AAA-T--A-TAAT--T---GTTAG----TT-ATC-TTATG-TAACCA------TATATCCAGCGTACCACCAATAATTGTCAATAGTAAA-ACC-ATCAACAAATTATATTGTGCTGTAAAAC
gi|118198 : TTT-------TAC---T--C--TACCTTGTG--CAGCCAAATGATGA---GTTA--AAA-TA-GTAGT-GT-TGA--GTGT--A--TAA---G-TG-------TTAT-T-ATGGTA------CTTTAC-TATA--T-----------------------GT-T-AGGCCAGA-CACTTT-TGCT----TATA--GCGCAAATAAATTTGCTTGAG--ATA-TT-AT--A--AG---TG----TCCGAC-TCA-ACT------TGAACCCTCAACAGGA-AT---G-ATTTCTG----T--T--AA--TTG-TT--T-ATCTGTGCGCACTA--A-TTGTGC-T-----C--AGTTGC--TATGGTA---AAATT--T-TATT--T---GTAAG-ACAGT-ATTGTTA-G-CAACCT------TGTATACCACATACAAACAGTAATTGTCAATA-TAAG-AAT-AT-AACAA
gi|118199 : T-AT-TAA--ATG-------AA---G-TG-------CACC-T-ATGGTT------GTTTAC-------------------------CAATATTA-T-AAGTCAAA-CAACAC-TGCT----CATA--GTGCAAAT-----CGCTT------TG-TC-AG--C--GA---TA----TTTGAC-CTA-ACTA-----TAAACTTGAGATA-AA-ATTTAA-ATTTATC----T--A--AA--GTG-T---T-ATCTGTACACATTA--A-TTGTGT-A-----T--AGTTAC--AATGGTA---AAATA--T-AATT--G---GTA-----GAT-ATC-TTATG-TAACCA------TATATCCAGCGTGCCACCAATAATTGTCAATAGTATA-ACC-GTCAACAAATAATGGTGTGCCGTAAAAC
gi|118200 : ttaT-GT-TAA--AT-------TGA---A-TG-------CAAC-T-ATGGTC------GTTTGT-TATA--TG------TA-AAAT---CAATATA----AAGCCAAA-CGCCTT-CGCT----TATA--GCGCAAACAGATT--CTCATAAAGTA-TC-AG--A--CG---AA----TTCGAC-CCG-ACG------TA----TTTAA-------------ATT-ATA----T--T--GA--TTG-TG--T-ATCTGTACACACTA--G-TTGTGT-T-----A--GGTTAC--AATGGTA---TACCT--T-TATT--A---ATAAG-ACATT-ATCATTT-G-TAACTGTTACATTATATGCCGTAAACCATCAGTAATTGCCATAA-TCAG-AAT-ACCAACAGAC
gi|118201 : TAT--A--TAG---GGTG-------CGAC-T-AGGGTT------GTTTAT-TTTT--TA------TA-A-AA---CAATATAT-T-ACGCCAAA-CATCAC-CGCG----TAAA--GTGTAAATAAATATGCTTATA--GTA-TCGGT--A--AG----A----TTTAGCTTTA-ATA------TAGACCTTCAAT------T---G-ATT------------------TTG-T---T-ATCTGTACATACTA--A-TTGCG
gi|118202 : TGGTT------GTTAAC-TTTA--TG------TATAT-T---CAATATAT-T-AAGCCAAA-CAAC-C-CGCT----TATA--GCGCAAAAAAATT-GATACTA--GTA-AT-GA--A--GG---AA----TTGGAC-CCA-ACTAAA---TAAACCTTCAATATAT-TT---A-ATT-ATA----T--T--GA--TTG-TAG-T-ATCTGTATACACTATAA-TT---C-TA----T--GGTTAC--AATAGTA---TATAT--T-TAGT--A---CTATG-GCAAT-ATCGTAT-G-TAACAT------TATATGCAGCATCACATCAGTAAACGTTAATA-TAAG-AAT-ATTAACAATCTACGGTATGCCGTCAAAC
gi|118203 : attGGTA--------TTGT-TAT-----------TA-A-AT---CAATACAT-A-AGACCA-A-CACATTGCTCT----TATAAAGTGCAAATTCATTTGCTAAAA--GTA-TTTAT--A--AG---TGAAGTTTTAAT-CGGTATG------TAAGCCTT-AATAGAATAT---A-ATTAC-A----T--T--CA--TT-----------TGTGTAT------------------------GGTTAC--GATGATA---TAACT--T-TAGC------GTAAT-GC--T-ATCGTTT-G-TAATCT------TATAAACAGCGTATCGACAGTAATGGTCATTA-T--GCACT-ATTAACAAACTA
gi|118204 : TTTTC-TATA--TGCATTTATA-AAAC---CAGCATGT-A-AGGCAAAA-CAACAC-TGCT----TATA--GAGCTAATTTGTTTGTTTAAA--GTA-TC-AG--AGAAG---TA----T--------A-GAT------T-----TTCAGTATAT-TT---T-AATTATA----T--T--GA--GAG-AA--TTATCTGTACACACTA--A-TTGTACATGTATAT--GGTTAC--AATGGTATTGGACTT--T-TGTA--C----TATG-ATAAT-ATC-----G-CAATTT------TCTGTA-----TACCATCAGTAGTTGTCAAT
gi|118205 : taACA--TG------TA-AAAC---CAATATAT-T-AAGCTAAA-CAACTC-CGCT----TATA--GCGCA----------CCGATT--GTG-TT-AA--A------------------C-CTA-ACTA-----TAGACCTTCAATAGAA-TTT--G-ATT-ATA----T--T--GA--TTG-CGG-T-ATCTGTATACACTA--T-GTGTGC-A-----A--GGTTAC--AACGATA---TAACT--T-TAAT--A---TTATG-GCAAT-TTCGTAT-G-CATCCT------TATATGCAGCATCCTTTCAGAAATTGCCAATA-TAAG-ACT-ATCAGCAAACTACGGTATGTCGTCAA
gi|118206 : A--TA------TA-GTACAATCAATATAT----GGCCAAAACAAT----GCT----CATAAAGTGCAAATTCATTTGCTAATA--GTA-CC-AGTGA--AG---TT----TT-------A-ACTGGTATGTAAGCCTT-AATAGAA-------------TA----T--T---A--TT----------------ACATTA--A-TT-TGT-T-----TATGATTAT--GATGATA---CATCT--T-TATTACT---GTAG---TGAT-ATCGTAT-G-TAATCT------TATAAACTGTGTATCAACAGTAATAGTCAATA-T--GCAAT-ATTAACAAACTA
gi|118207 : TAC---CAATATTT-T-AAGCCAAA-TAACAC-TGCT----CATA--GCGCAAATTACTTTGCTTATA--TTG-TC-AGC-A--AG----A----TTCGAC-CTA-AATA-----TGAACTTTCGATAAAA-TT---T-AATTCTA----T--C--TA--TAGAGG--T-GTCTGTACACACTA--A-TTGTGT-G-----T--GGTTAT--AATGGTA---AAATA--C-AATT----------G-ATAGTTATC-TTATG-TAACCG------TATATCCAGCGTACCATCAGTAATTGTCAATAGTAA--ACC-ATCAACAAATTACAATGTGCTGTAAAAC
gi|118208 : TAC---CAATA-GTAT-AAGTCAAA-CAACGC-TGCT----CATA--GCGCAAATCGCTTTGCTT-----GTA-TC-GT--C--AGCGATA----TTCGAC-CTA-ACTA-----TAAA--TTTAA---------------TTCTA----T--CTAAA--GTG-T---T-ATCTGTACACACTT--A-TTGTGC-A-----T--AGTTAC--AATGGTA---AAATA--T-AATT--G---GTAGT-----T-ATC-TTATG-TAACCA------TATATCCAGCTTACCACCAATAATTGTCAATAGTATA-ACC-ATCAACAAATTATGGTGTGCCGTAAAAC
gi|118209 : -AGGCCA-A-CACATT--GCTCTAATATA--GCGCAAATTAATATGCTAATA--GTATTT-AT--A--AG-----------------------------TGAAGCTTTAATCGGT-AT---G------TAAGCCT--T--AA--TTG-AA--T-ATAAGT--ACATTC--ATTTGTGT-A-----T--GGTTAC--GATAATA---TATCA--T-TATTACC---GTAAT-GC--T-ATCGTAT-G-TAATCG------TATAAACAGCGTATCGACTGTAATGGTCATTA-T--G-CACAATTAACAAGCTAACTGATGCCATGAA
gi|118210 : CTAAA-CACCTC-TGCT----TATA--GCGGAAGTAGAATTGCTTATA--GCA-TT-GG--A--GG---GA----TTCGAC-ATA-A--------TAAACATTCAA-ATAA-A------ATTTA-A----T--T--CAC-TTG-TA--T-ATCTGTACACACTA--G-TTGTCT-T-----A--ATTTAC--AATGGTA---CGATT--T-AATTA-C---ATAAT-ACAAT-ATCGTAT-G-TAACAT------TATATACCGCATACCGTCAATAATTGTCAATA-TATA-AAA-ATCAACAAACTATAGTATGCCGTAAAAC
gi|118211 : T----TAT---GCACATTTAATTTTGCTTATA--TTA-TC-GACGA--AG---T-----TC--AA-CCA-A-----------------AATATAA-AC---------CTA----T--T--GA--TAG-TGGCC-A-CTGTACACACTA--A-TGGTAT-A-----T--GGTTAC--ACTAGTA---TGATTAAT-TACT------ATAG---CAAT-ATTGTAT-G-TAACCT------TCTATGCAGCATACCAACATTAATTGTCAATA-TAAG-AAT-ACCAACAAACTAAGGTATGCCGTCAAAC
gi|118212 : agtcacctggttctAGAA-AT---A-ATTTCTA----T--T--GA--TTG-TA--T-ATCTGTTCACACTA--A-TT---------------GTTAC--CATGTTA---AATTT--T-TATTA-TTTAATAAC-ACAGC-A--GTTA-ACCAATCG------AGCATA
gi|118213 : A--TTG-TA--T-ATCTGTGCACACTA--A-TTGTGC-TAC---C--AATCAC--ACT-GTA---ATATT--T-TACT--T---ACAAaca
gi|118214 : TCTGTGCACACTA--A-TTGTAT-T-----C--AGTTGC--TATGGTA---ATATT--TCTATT--T---GTATG-ACAGT-ATCGTTA-G-CAACCG------TATATACCACATACAGACAGTAATTGTCAATA-TAAG-AAT-ATCAGCAAACTAGAGTATGCCGTAAAAC