lowQualScore : 1 111111111111111111111111111 111111111111111111111 1 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1111111111 111111 11111111111 1111111111111111111111 1111
lowQualScore : 5 1 000000000000000000000000000 0 888888888888888888888 5555555555555 5 0 2 11 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555 4444444 222 1 6666 333 222 1 222 1 1 0000000000 22 666666 55 00000000000 6666666666666666666666 5 6666
lowQualScore : . . ........................... . ..................... ............. . . . .. ....................................................... ....... ... . .... ... ... . ... . . .......... .. ...... .. ........... ...................... . ....
lowQualScore : 3 2 000000000000000000000000000 3 555555555555555555555 5555555555555 1 9 7 11 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111 8888888 666 9 4444 222 777 3 999 7 7 2222222222 55 111111 00 55555555555 2222222222222222222222 8 4444
consensus : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-CCCCGTTGAAAA------------------------A--TGACCCC-A----------------T-GG-------------G-T-CACTTTTC--AA---C-----G-----A---A---TG-A-----G----T---GA-TC--------CA------TTT---TT-AA----C---GTTGAAAACTGACCCC---GACCGTT---ATT-T-AA----------TGACC--CAC-CC--ACACGTGA--AAA-----------ATTGACC-------C---T----------CGTTAAAATCTGATCACCAACAGTTGG---AAACTGACCGAATAGTCGGCCG
Reference ( gi|162200 ) : CCGGTGTAACATAAAATTTTGA-CCCCGTTGAAAA------------------------A--TGACCCC-A----------------T-GG-------------G-T-CATATTTC--AA---C-----G-----A---A---TG-A-----G----T---GA-TC--------CA------TTT---TT-AA----C---GTTGAAAACTGACCCC---GATCGTT---ATT-T-AA----------TGACC--CAA-TC--ACACGTGA--AAA-----------ATTGACC-------C---T----------CGTTAAAATCTGATCACCAACAATTGT---AAACTGACCGAATAGTCGGCCG
gi|162198 : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-CCCCGTTGAAAA------------------------A--TGACCCC-A----------------T-GG-------------G-T-CACATTTC--AA---C-----A-----G---A---TG-A-----G----T---GA-TC--------TA------TTT---TC-AA----C---ATTGAAAACTGACCCC---GACCGTT---ATT-T-AA----------TGACC--CGC-CC--ACACGTGA--AAA-----------ATTGACC-------C---T----------CGTTAAAATCTGTTCACCAACAATTGG---AAACTGACAGAATAGTCGGCCG
gi|162199 : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-CCCTGTTGAAAA------------------------A--TGACCCT-A----------------T-GG-------------G-T-CTCTTTTC--AA---C-----G-----G---A---TG-A-----G----T---GA-TC--------TA------TTT---TT-AA----C---ATTGAAAACTGACCCC---AACCGTT---ATT-T-AA----------TGACC--CAC-CT--ACACGTGA--AAA-----------ATTGACC-------C---T----------CGTTAATATCTGATCATCAACAGTTGA---AAACTGACAGAATAGTCGGCCG
gi|162202 : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-CCCCGTTGAAAA------------------------A--TGACCCC-A----------------T-TG-------------G-T-CACTTTTC--AA---CG----G-----A---A---TT-------G----T---CA-TC--------CA------TTT---TT-AA----T---ATTGAAAACTGACCCC---GATCGTT---ATT-T-AA----------TGACC--AAC-TC--ACACCTGA--AAA-----------CTTAAAC-------C---T----------AGTTAAAATCTGATCACCAACAGTTGG---AAACTGACCGAATAGTCTACCG
gi|162209 : CCAGTGTAACATTAAATATTGA-CCCCGATGAAAA------------------------G--TGATCC--A----------------T-GG-------------GGT-CAT------------T-----G-----A-------TG-A-----G----T---GA-TC--------AA------TTT---TT-AA----C---ATTGAAAACTGACCCC---GACCGTT---ATT-T-AA----------TGACC--TAC-CC--ATACGTGA--AAA-----------CTTGACC-------C---T----------CGTTAAAATCTGATCACCAACAGTTGG---AAACTGACCGAATAGTCGACCG
gi|162205 : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-ACCCGCTGTAAA------------------------A--TTACCCC-A----------------T-GG-------------G-T-CACTTTTT--AA---C-----G-----G---A---AG-T-----T----T---TA-TC--------CA------TTTG--TT-AT----C---ACTGAAAACTGACCCT---GACCGTT---ATT-T-AA----------TGACC--CAC-CC--ACACGTGA--AAA-----------ATGTACC-------C---T----------CGTTAAAATCTGATCACCAACAGTTTG---AAACTGACCGAATAGTCGGCCG
gi|162207 : CCGGTGTAACATTAAATTTTGC-CCCTGTTAAAAATCGACCCCATGGGTCACTTTATATA--TGACCCC-A----------------T-GG-------------G-T-CACTTTTC--AA---T---------------A---TG-A-----G----T---GA-TC--------CA------TTT---CT-AA----C---ATTGAAAACTGACCCC---GACTGTT---ATT-T-AA----------TGAGA--CAC-CC--ACACGTGA--AAA-----------AGTAACC-------C---T----------CGTTAAAATCTGATCACCAACAGTTGG---AAACTGACCGAATAGTCGGCCG
gi|162210 : CCGATGTAACATTAAATTTTGA-CCCCATTGAAAA------------------------A--TGACCTT-A------------------GG-------------G-T-TACTTTTA--AA---C-----G-----G---A---TG-A-----G----T---GA-TC--------CA------TTT---TT-AA----C---ATTGAAAACTGACCCC---GACCGTA---ATT-T-AA----------TGACC--CAC-CC--ACAAGTGA--AAA-----------ATTTACC----------------------------------ATCATCAACAGTTGG---AAACTGACCGAATAATCAACCG
gi|162212 : CCGGTGTATCATTAAATTTTGA-CC------------------------------------------CC-A----------------T-GG-------------G-T-CACTTTTC--AA---C-----G-----G---A---TG-A-----G----T---GA-TC--------CA------TTT---TT-AA----C---ATTGAAAACTT-CACC---GACAGTT---ATT-T-TA----------TGAAC--CAA-CC--ACACGTGG--AAA-----------GTTGACC-------C---C----------GGTTAATATCTGATCACCAATAGTTTG---AAATTGACCGAATAGGCGGCCG
gi|162214 : CCGGTGTAACTTTAAATTTTGA-CCCCGTTGGAAA------------------------A--TGATCCC-A----------------T-GG-------------A-T-CAC--TT--------------------G---A---TG-A-----G----T---GA-TC--------AA------TTC---TT-AA----C---ATTGAAAACTGACACA---GGCCGTT---ATT-A-AA----------TGACC--CAA-CT--ACACGTGA--AAA-----------AATTACC----------------------------------ATCACCAACAGTTGG---AAACTGACCGAATAGTTGGCCG
gi|162216 : CCGCTGTAACATTAAATTTTGA-CCC---------------------------------A--TG-------------------------GG-------------G-T-CATTTTTC--AA---A-----G-----G---A---TT-T-----A----C---GA-TC--------CA------TTT---TT-AA----C---ATTAAAAACTGACCCC---GACCGT----ATTCT-AA----------TGACC--CAA-CT--ACACGTGA--AAA-----------ATTGACA-------C---T----------CGTTAAAATCTGAACACCAACAGTTGG---AAACTGACCGGA
gi|162203 : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-CC------------------------------------------CC-G----------------T------------------T-CATA------AA---C-----G-----G---A---TG-A-----G----T---GG-TC--------CA------TTT---TT-AA----C---ATTGAAAACTGACCCC---GACCGTT---ATT-T-AA------------------------------------AA-----------ATTGACC-------T---T----------CGTTAAAATCTGATCACCAACAGTTGG---AAACTGACCGAATAGTCGGCCG
gi|162211 : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-CCTCGTTGAAAA------------------------A--TGACCCC-A----------------A-GG-------------G-T-CATATTTC--AA---T-----G-----
gi|162201 : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-CCCCGTTGAAAA------------------------A--TGACCCC-A----------------A-GA-------------G-T-CAT-----------------------------------------------------------------------TTT---TC-AA----T---GTTGAAAATTGACCCG---GGTC
gi|162208 : CCGGTGTAACATTAAATGTTGA-CCC-GTTGAATA------------------------A--TGACCCC-A----------------A-GG-------------G-T-CACATTTC--AA---------------A---A---TT-A-----AATTCT---GA-TC--------AA---------------AATAGTC---GTTGAAAACTGATCacatttcaacattaaattctgatc
gi|162220 : CCGTTGTAACATTAAATTTTGA-CCCCGTTGAAAA------------------------A--TGAACCC-A----------------A-GG-------------G-T-CAT-TTTC--AATGTT-----G-----A---AAATTG-A-----C----TCG-GG-TCA-------CA-------TT---TC-AA----C---ATTAAA
gi|162221 : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-CCCCGTTG-AAA------------------------A--TGAACCC-A----------------A-GG-------------A-T-CATTTTTC--AA---T-----GTTGAAA---A---TG-G-----A----CCCGGA-TCA-------CA-------TT---TC-AA----C---ATTAAA
gi|162206 : CCGGTGTAACATAAAATTTTGA-CCTCGTTAAAAA------------------------A--AAAACCC-T----------------T-GG-------------G-T-CATTTTTC--AATGTT-----G-----A---AAATTG-A-----A----CCG-GG-TC--------AA------ATT---TC-AA----C---ATTAAATTCTGATC
gi|162222 : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-CCCTGTTGAACA------------------------T--TGACCC---------------------GG-------------G-T-CACTTTTC--AG---C-----ATT---A---A---AG-T-----C----T---GA-TCAAAA----CA------GT-------------C---GTTGAAAACTGATC
gi|162223 : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-CCCCGTTGAAAA------------------------A--TGACCCC-A----------------
gi|162219 : CCGGTGTAACATTAAACTTTGATCCCCGTTGAAAA------------------------T--TGACCC---------------------AG-------------G-T-TACATTTC--AG---C-----------A---T---TA-A-----A----T------TC--------TA------ATCAAATC-AGT---C---GTTGAAAACTGATC
gi|162215 : CCGGTGTAGCATTAAATTTTGA-TCCCGTTGAAAA------------------------G--TGAGCTC-A----------------A-TG-------------G-T-CAT-----------------------------------------------------------------------TTT---TC-AA----T---GTTGAAAATTGACCTG---GGTCaataaccggattctttaa
gi|162218 : CCGGTGTAACATTAAA-----A-CCCCGGTGAAAA------------------------A--TGACCCC-A--------------------------------------ATTTTTC--A-------------------------------------------------------------------------A----T---GTTGAAAATTGACCCG---GATC-TC---ATT-TCAACTTTAAATTCTGATC--AAA-AC--AGTCGTTG--AAA-----------ACTGATC-------A---T----------TGTTAAATTTTGATCA--GACATTTGactttgcaacattaaattctgatcaaaacagttgttgaa
gi|162204 : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-ACCCGTT-----------------------------------CACC------------------T-GG-------------G-T-CACATTTC--AA---C-----------A---T---TA-A-----ATTC-T---GA-TCAAAA----CA------GT-------------C---GTTGAAAACTGATCg
gi|162217 : CCGGTGTAACATTACATTATGA-CTTCGTTGAAAA------------------------T--TGACCC---------------------GA-------------G-T-CACATTT---AA---T-----C-----A---T---TA-ACTT--C----T---GA-TC--------AA---------------AACGGTC---GTTGAAAACTGATC
gi|162213 : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-CCCCGATGAAAA------------------------A--TGATC
gi|162224 : CCGGTGTTACATTAAATTTTGA-CCCCGTTGAAAA------------------------AACGGACCCA-A----------------T-GGTAAATTGACCCGAG-T-CACATTTT--AA---C-----
gi|162225 : CCGGTGTAACATTAAAAGTTGA-CCC---TGAAAAC-----------------------AATTGA---C-A----------------C-GG-------------G-T-CACAATTCTTAT---C-----A-----A---A---AC-A-----G----T---------------------------------------C---ATTGAAAACTGACCattaaa
gi|162226 : GTGTAACATTAAATTTTGA-CCCCGTTGAAAA------------------------A--TGACCCT-AAGGTTCAAAATTGACCT-AG-------------G-T-CACATTTC--AA---C-----------A---T---TA-A-----ATTC-T---GA-TCAAAA----CA------GTT----------------GTTGAAAACTGATC
gi|162227 : GTAACATTAAACTTTGA-CACCGTTGAAAA------------------------A--TGACCCC-A----------------T-AG-------------G-T-CACTTTTC--AA---C-----G-----G---A---TA-A-----G----T---GA-TA--------CA------TTT---TT-AA----C---ATTGAAAACTGACCCC---GACCGTT---ATT-T-AA----------TGACC--CAC-CC--ACACGTGA--AAA-----------ATTGACC-------C---T----------CGTTAAAATCTGATCACCAACAGTTGG---AAACTGACCGAATAGTCGGCC
gi|162205 : ATAAAACTT------CCGTTAAAAA------------------------G--TGACCC--A----------------TGGG-------------G-T-AATTTTAC--AG---C-----G-----
gi|162201 : ccggtgtaacattaaattttgaaccAATTTT---CAACATTGAAAA------------------------A--TGACTCT-T----------------G-GG-------------G-T-CATTTTTC--AA---C-----G-----ccatttgttatcactgaaaactgaccctgaccgttatttaatgacccacccacacgtgaaaaatgtaccctcgttaaaatctgatcaccaacagtttgaaactgaccgaatagtcggccg
gi|162220 : ccggtgtaacattaaattttgacccAATTTT---CAACATTGAAAA---------------------------TGACCCT------------------T-GG-------------GTT-CATTTTTC--AA---C-----G-----gacccgggtcacatttcaacattaaattctgatc
gi|162206 : ccgttgtaacattaaattttgacccAATTTT---CAACATTGAAAA------------------------A--TGACCCA-A----------------G-GG-------------T-T-TTTTTTTT--AA---C-----G-----A---gactcgggtcacatttcaacattaaa
gi|162215 : ccggtgtaacataaaattttgaccAATTTT---CAACATTGAAAA------------------------A--TGACCAT------------------T-GA-------------GCT-CACTTTTC--AA---C-----G-----gaaccgggtcaaatttcaacattaaattctgatc
gi|162198 : ccggtgtagcattaaattttgatccCTGTTGAAAT------------------------G--TGACCC--A----------------T-GG-------------GGT-CATTTTTC--AA---C-----G-----gacctgggtcactttgcaacattaaattctgatcaaaacagttgttgaa
gi|162227 : ccggtgtaacattaaattttgacccCCGTTGAAAA------------------------G--TGA-CCT-A----------------TGGG-------------G-T-CATTTTTC--AA---C-----G----------------------G----T---G--TC--------AA------AGT---TT-AA----T---GTTatgagtgatctattttcaacattgaaaactgaccccgaccgttatttaatgacccgcccacacgtgaaaaattgaccctcgttaaaatctgttcaccaacaattggaaactgacagaatagtcggccg
gi|162199 : gtCCGTTGAAAA------------------------G--AGA-CCC-A----------------TAGG-------------G-T-CATTTTTC--AA---C-----ataagtgatacatttttaacattgaaaactgaccccgaccgttatttaatgacccacccacacgtgaaaaattgaccctcgttaaaatctgatcaccaacagttggaaactgaccgaatagtcggcc
gi|162202 : ccggtgtaacattaaattttgaccctCCGTTGAAAA------------------------G--TGA-CCA-A----------------TGGG-------------G-T-CATTTTTC--AA---C-----G-----atgagtgatctatttttaacattgaaaactgaccccaaccgttatttaatgacccacctacacgtgaaaaattgaccctcgttaatatctgatcatcaacagttgaaaactgacagaatagtcggccg
gi|162212 : ccggtgtaacattaaattttgacccCCGTTGAAAA------------------------G--TGA-CCC-A----------------TGGG-------------G-T-CAAAATTT--AA---T-----G-----A---aattgtcatccatttttaatattgaaaactgaccccgatcgttatttaatgaccaactcacacctgaaaacttaaacctagttaaaatctgatcaccaacagttggaaactgaccgaatagtctaccg
gi|162216 : ccggtgtaCCTTTGAAAA------------------------A--TGACCCC-A----------------T-GG-------------G-T-CAAAATTT--AA---T-----G-----atgagtgatccatttttaacattgaaaacttcaccgacagttattttatgaaccaaccacacgtggaaagttgaccccggttaatatctgatcaccaatagtttgaaattgaccgaataggcggccg
gi|162211 : ccgctgtaaCATTGAAAT------------------------A--TGACCCT-T----------------G-GG-------------G-T-CATTTTTC--AA---C-----G-----A---atttacgatccatttttaacattaaaaactgaccccgaccgtattctaatgacccaactacacgtgaaaaattgacactcgttaaaatctgaacaccaacagttggaaactgaccgga
gi|162221 : ccggtgtaacattaaattttgaccCATTGAAAA------------------------A--TGATCCT------------------T-GG-------------GTT-CAT-TTTC--AA---C-----G-----
gi|162201 : ccggtgtaacattaaattttgacccGTTGAAAT------------------------G--TGACCC---------------------GG-------------G-T-CAATTTTC--AA---CATT--G-----A---A----A-A-----A----T---GACTCTTGGGGT-CA------TTT---TTCAA----C---Gttgaaaatggacccggatcacatttcaacattaaa
gi|162220 : ccggtgtaacattaaattttgacccGTTGAAAT------------------------G--TGACCC---------------------GA-------------G-T-CAATTTTC--AA---CATTGAA-----A---A---TG-ACCCTTG--------GG-TT--------CA------TTT---TTCAA----C---Gattaaattctgatc
gi|162221 : ccgttgtaacattaaattttgacccGTTGAAAT------------------------G--TGATCC---------------------GG-------------G-TCCAT-TTTC--AA---CATT--G-----A---A----A-A-----A----T---GA-TCCTTGGGTTCA------TTT---TC-AA----C---Gattaaa
gi|162207 : ccggtgtaacattaaattttgacccTTGAAAA------------------------G--TGACCC--A----------------T-GG-------------GGT-CATATATA--AAG--T-----G-----ACCCA---TG-G--------------GG-TC--------GA------TTT---TT-AA----C---attaaa
gi|162209 : ccggtgtaacattaaattttgcccctA------------------------A--TGACCCC-A----------------T-GG-------------A-T-CACTTTTC--AT---C-----G-----G-------------------------GG-TC--------AA------TAT---TT-AA----T---GTT--ACACTGtatgagtgatccatttctaacattgaaaactgaccccgactgttatttaatgagacacccacacgtgaaaaagtaaccctcgttaaaatctgatcaccaacagttggaaactgaccgaatagtcggccg
gi|162228 : c------------------------A--TGACCCC-A----------------T-GGT------------G-T--ATTTTTT--AA---C-----A-----G---A---CA-A-----G----T---GA-TC--------AA------TTT---TT-AA----C---ATTGAAAACTGA-CCC---GACCGTT-------------------------------------------A--AAA-----------ATTGACC-------C---T----------CGTAAAAAATTGATCACGAAAAGTCGgatgagtgatcaatttttaacattgaaaactgaccccgaccgttatttaatgacctacccatacgtgaaaacttgaccctcgttaaaatctgatcaccaacagttggaaactgaccgaatagtcgaccg
gi|162229 : --TGACCCCGA----------------T-GG---------------T---TATTT--------------------A---A---TG-A-----C----C---CA-CC--------CA------C---------A----C---GTGAAAAATTGACCC------TCGTTCAAATT-T-GA----------TCACCAACAG-TTGGAAAC-TGACCAAATGGTCAACCGCATTGACC-------C---T----------CGTTCAAATTTGATCACCAACAGTTGG---AAACTGACCAAATGGTCAACCGg
gi|162230 : TTTG--AA---CC----G-----G---A---TG-T-----G----T---TA-TT--------TA------TTT---TT-AA----T---ATTGAAAACTGACACC---GACCGTT---ATT-T-AT----------TGACC--CAC-CC--ACACATGA--AAAC----------ATTGACC-------T---T----------TGTTAAAATCTGATCACCAACAGTTGA---TAACTGACCAAATAGTCGGCCG
gi|162222 : tTTTC--AA---C-----G-----A---C---TGTT-----T----T---GA-TC--------AG------ACT---TT-AA----T---GCTGAAAAGTGACCCG---GGTCAAT---GTT-C-AA----------
gi|162215 : ccggtgtaacattaaattttgaccctg-A-----G----T---GA-CC--------CAGGTCAATTT---TC-AA----C---ATTGAAAAATGACCactgatc
gi|162201 : ccggtgtagcattaaattttgatcccgttgaaaagtgagctcaat---GG-TC--------AA------TTT---TC-AA----C---ATTGAAAAATGACTCTTGGGGTCATT---TTT-C-AA----------CGttgcaacattaaattctgatcaaaacagttgttgaa
gi|162221 : ccggtgtaacattaaattttgaccc---GG-TC--------CA------TTT---TC-AA----C---ATTGAAAAATGATCCcgggtcacatttcaacattaaattctgatc
gi|162220 : ccggtgtaacattaaattttgaccccgttgaaaatgaacccaa-TC--------AA------TTT---TC-AA----C---ATTGAAAA-TGACCCcggatcacatttcaacattaaa
gi|162206 : ccgttgtaacattaaattttgaccccgttgaaaaatgaacccaa-TC--------AA------TTT---TC-AA----C---ATTGAAAAATGACCCctcgggtcacatttcaacattaaa
gi|162201 : ccggtgtaacataaaattttgacctcgttaaaaaaaaaacccttTT---TT-GA----CCCCGTTGAAAAATGACCCC---AAGAGTC---ATT-T----------------TT--CAA-T-------GTTG--AAA-----------ATTGACC-------CGGGTCACATTTCAACATTAAATTCTGATCaccgggtcaaatttcaacattaaattctgatc
gi|162226 : ccggtgtaacattaaaTT---TT-GA----CCCCGTTGAAAAATGACCCT---AA--G-----GTT-C-AAAAT-------TGACC--TAGGTC--ACATTTCA--A------------------------------------------CATTAAATTCTGATCA-AAACAGTTGTTGAAAACTGATC
gi|162215 : gtgtaacattaaaTT---TT-GATCC-C---GTTGAAAAGTGAGCTC---AATGGTC---ATT-T----------------TT--CAA-T-------GTTG--AAA-----------ATTGACCTGGGTCAC---TTTGCAA----CATTAAATTCTGATCA-AAACAGTTGT---
gi|162217 : ccggtgtagcattaaa----C---GTTGAAAATTGACCCG---AGTCA-C---ATT-T-AA----------T------CAT-TA--ACTTCTGATCAAA-----------ACGG--------------T----------CGTTGAAAACTGATCtgaa
gi|162229 : ccggtgtaacattacattatgacttTGACCCC---GATGGTT---ATT-T-AA----------TGACC--CAC-CC--ACACGTGA--AAA-----------ATTGACC-------C---T----------CGTTCAAATTTGATCACCAACAGTTGG---AAACTGACCAAATGGTCAACCG
gi|162231 : TGACCCC---GATGGTT---ATT-T-AA----------TGACC--CAC-CC--ACACGTGA--AAA-----------ATTGACC-------C---T----------CGTTCAAATTTGATCACCAACAGTTGG---AAACTGACCAAATGGTCAACCGcattgaccctcgttcaaatttgatcaccaacagttggaaactgaccaaatggtcaaccg
gi|162232 : TTGACC-------A---T----------CGTTAAACTCTGATTACTAACCGTTGG---AAACTGACCGAATAGTCAGCCG
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111 11111111111111111 2222222222222222222222222222222 1111111111111111111111 11111111111111111111
lowQualScore : 1 444444444444444444444444444 11 11111111111111111 1 1 11 8888888888888888888888888888888 7777777777777777777777 7777 44444 1 22 333 1 1 8888888888 99999999999999999999
lowQualScore : . ........................... .. ................. . . .. ............................... ...................... .... ..... . .. ... . . .......... ....................
lowQualScore : 3 000000000000000000000000000 77 77777777777777777 3 4 88 6666666666666666666666666666666 4444444444444444444444 2222 00000 4 66 333 9 9 3333333333 22222222222222222222
consensus : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-CCCCGTTGAAAA------------------------A--TGACCCC-A----------------TGG-G-TCAC--TTTTCAA---C-G-----GA---TGA---G----T---GATC-----C--AT----TT---T-TAA----C----GTTGAAAACTGACC-CCGACCG--TT---ATT-T-AA----------TGACCCACCCACACGTGAAAA--------------------ATTGACCCTCGTTAAAATCTGATCACCAACAGTTGGAAACTGACCGAATAGTCGGCCG
Reference ( family-596 ) : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-CCCCGTTGAAAA------------------------A--TGACCCC-A----------------TGG-G-TCAC--TTTTCAA---C-G-----AA---TGA---G----T---GATC-----C--AT----TT---T-TAA----C----GTTGAAAACTGACC-CCGACCG--TT---ATT-T-AA----------TGACCCACCCACACGTGAAAA--------------------ATTGACCCTCGTTAAAATCTGATCACCAACAGTTGGAAACTGACCGAATAGTCGGCCG
gi|162198 : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-CCCCGTTGAAAA------------------------A--TGACCCC-A----------------TGG-G-TCAC--ATTTCAA---C-A-----GA---TGA---G----T---GATC-----T--AT----TT---T-CAA----C----ATTGAAAACTGACC-CCGACCG--TT---ATT-T-AA----------TGACCCGCCCACACGTGAAAA--------------------ATTGACCCTCGTTAAAATCTGTTCACCAACAATTGGAAACTGACAGAATAGTCGGCCG
gi|162199 : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-CCCTGTTGAAAA------------------------A--TGACCCT-A----------------TGG-G-TCTC--TTTTCAA---C-G-----GA---TGA---G----T---GATC-----T--AT----TT---T-TAA----C----ATTGAAAACTGACC-CCAACCG--TT---ATT-T-AA----------TGACCCACCTACACGTGAAAA--------------------ATTGACCCTCGTTAATATCTGATCATCAACAGTTGAAAACTGACAGAATAGTCGGCCG
gi|162200 : CCGGTGTAACATAAAATTTTGA-CCCCGTTGAAAA------------------------A--TGACCCC-A----------------TGG-G-TCAT--ATTTCAA---C-G-----AA---TGA---G----T---GATC-----C--AT----TT---T-TAA----C----GTTGAAAACTGACC-CCGATCG--TT---ATT-T-AA----------TGACCCAATCACACGTGAAAA--------------------ATTGACCCTCGTTAAAATCTGATCACCAACAATTGTAAACTGACCGAATAGTCGGCCG
gi|162201 : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-CCCCGTTGAAAA------------------------A--TGACCCC-A----------------AGA-G-TCAT--TTTTCAA---T-GTTGAAAA---T----------T---GACC-----CGGGTCACATT---T-CAA----C----ATTAAATTCTGATC-
gi|162202 : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-CCCCGTTGAAAA------------------------A--TGACCCC-A----------------TTG-G-TCAC--TTTTCAA---CGG-----AA---TT----G----T---CATC-----C--AT----TT---T-TAA----T----ATTGAAAACTGACC-CCGATCG--TT---ATT-T-AA----------TGACCAACTCACACCTGAAAA--------------------CTTAAACCTAGTTAAAATCTGATCACCAACAGTTGGAAACTGACCGAATAGTCTACCG
gi|162203 : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-CCCCGTT--------------------------------------C-A----------------TA---------------AA---C-G-----GA---TGA---G----T---GGTC-----C--AT----TT---T-TAA----C----ATTGAAAACTGACC-CCGACCG--TT---ATT-T-AA-----------------------------AA--------------------ATTGACCTTCGTTAAAATCTGATCACCAACAGTTGGAAACTGACCGAATAGTCGGCCG
gi|162204 : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-ACCCGTT-----------------------------------CACC------------------TGG-G-TCAC--ATTTCAA---C-------AT---TAA---ATTC-T---GATCAAAA-C--AG----T-------------C----GTTGAAAACTGATC-
gi|162205 : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-ACCCGCTGTAAA------------------------A--TTACCCC-A----------------TGG-G-TCAC--TTTTTAA---C-G-----GA---AGT---T----T---TATC-----C--AT----TTG--T-TAT----C----ACTGAAAACTGACC-CTGACCG--TT---ATT-T-AA----------TGACCCACCCACACGTGAAAA--------------------ATGTACCCTCGTTAAAATCTGATCACCAACAGTTTGAAACTGACCGAATAGTCGGCCG
gi|162206 : CCGGTGTAACATAAAATTTTGA-CCTCGTTAAAAA------------------------A--AAAACCC-T----------------TGG-G-TCAT--TTTTCAATGTT-G-----AAAATTGA---A----CCG-GGTC-----A--AA----TT---T-CAA----C----ATTAAATTCTGATC-
gi|162207 : CCGGTGTAACATTAAATTTTGC-CCCTGTTAAAAATCGACCCCATGGGTCACTTTATATA--TGACCCC-A----------------TGG-G-TCAC--TTTTCAA---T--------A---TGA---G----T---GATC-----C--AT----TT---C-TAA----C----ATTGAAAACTGACC-CCGACTG--TT---ATT-T-AA----------TGAGACACCCACACGTGAAAA--------------------AGTAACCCTCGTTAAAATCTGATCACCAACAGTTGGAAACTGACCGAATAGTCGGCCG
gi|162208 : CCGGTGTAACATTAAATGTTGA-CCC-GTTGAATA------------------------A--TGACCCC-A----------------AGG-G-TCAC--ATTTCAA-----------AA---TTA---AATTCT---GATC-----A--A-------------AATAGTC----GTTGAAAACTGATC-
gi|162209 : CCAGTGTAACATTAAATATTGA-CCCCGATGAAAA------------------------G--TGATCC--A----------------TGG-GGTCAT--T-----------------GA---TGA---G----T---GATC-----A--AT----TT---T-TAA----C----ATTGAAAACTGACC-CCGACCG--TT---ATT-T-AA----------TGACCTACCCATACGTGAAAA--------------------CTTGACCCTCGTTAAAATCTGATCACCAACAGTTGGAAACTGACCGAATAGTCGACCG
gi|162210 : CCGATGTAACATTAAATTTTGA-CCCCATTGAAAA------------------------A--TGACCTT-A-----------------GG-G-TTAC--TTTTAAA---C-G-----GA---TGA---G----T---GATC-----C--AT----TT---T-TAA----C----ATTGAAAACTGACC-CCGACCG--TA---ATT-T-AA----------TGACCCACCCACAAGTGAAAA--------------------ATTTACC--------------ATCATCAACAGTTGGAAACTGACCGAATAATCAACCG
gi|162211 : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-CCTCGTTGAAAA------------------------A--TGACCCC-A----------------AGG-G-TCAT--ATTTCAA---T-G-----
gi|162212 : CCGGTGTATCATTAAATTTTGA-CCCC-------------------------------------------A----------------TGG-G-TCAC--TTTTCAA---C-G-----GA---TGA---G----T---GATC-----C--AT----TT---T-TAA----C----ATTGAAAACTT-CA-CCGACAG--TT---ATT-T-TA----------TGAACCAACCACACGTGGAAA--------------------GTTGACCCCGGTTAATATCTGATCACCAATAGTTTGAAATTGACCGAATAGGCGGCCG
gi|162213 : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-CCCCGATGAAAA------------------------A--TGATC
gi|162214 : CCGGTGTAACTTTAAATTTTGA-CCCCGTTGGAAA------------------------A--TGATCCC-A----------------TGG-A-TCAC--TT----------------GA---TGA---G----T---GATC-----A--AT----TC---T-TAA----C----ATTGAAAACTGACA-CAGGCCG--TT---ATT-A-AA----------TGACCCAACTACACGTGAAAA--------------------AATTACC--------------ATCACCAACAGTTGGAAACTGACCGAATAGTTGGCCG
gi|162215 : CCGGTGTAGCATTAAATTTTGA-TCCCGTTGAAAA------------------------G--TGAGCTC-A----------------ATG-G-TCAT--TTTTCAA---T-GTTGAAAA---T----------T---GACCTGGGTC--AC----TT---TGCAA----C----ATTAAATTCTGATC-AAAACAG--TT---GTT-G-AA----------
gi|162216 : CCGCTGTAACATTAAATTTTGA-CCC---------------------------------A--TG------------------------GG-G-TCAT--TTTTCAA---A-G-----GA---TTT---A----C---GATC-----C--AT----TT---T-TAA----C----ATTAAAAACTGACC-CCGACCG---T---ATTCT-AA----------TGACCCAACTACACGTGAAAA--------------------ATTGACACTCGTTAAAATCTGAACACCAACAGTTGGAAACTGACCGGA
gi|162217 : CCGGTGTAACATTACATTATGA-CTTCGTTGAAAA------------------------T--TGACCC--------------------GA-G-TCAC--ATTT-AA---T-C-----AT---TAACTTC----T---GATC-----A--A-------------AACGGTC----GTTGAAAACTGATC-
gi|162218 : CCGGTGTAACATTAAA-----A-CCCCGGTGAAAA------------------------A--TGACCCC-A------------------------AT--TTTTC-----------------------------------------------------------AA----T----GTTGAAAATTGACC-CGGATC---TC---ATT-TCAACTTTAAATTCTGATCAAAACAGTCGTTGAAA--------------------ACTGATCATTGTTAAATTTTGATCA--GACATTTGG
gi|162219 : CCGGTGTAACATTAAACTTTGATCCCCGTTGAAAA------------------------T--TGACCC--------------------AG-G-TTAC--ATTTCAG---C-------AT---TAA---A----T-----TC-----T--AA----TCAAAT-CAGT---C----GTTGAAAACTGATCAATAACCGGATT---CTT-T-AA----------
gi|162220 : CCGTTGTAACATTAAATTTTGA-CCCCGTTGAAAA------------------------A--TGAACCC-A----------------AGG-G-TCA---TTTTCAATGTT-G-----AAAATTGA---C----TCG-GGTCA----C--A-----TT---T-CAA----C----ATTAAA
gi|162221 : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-CCCCGTTG-AAA------------------------A--TGAACCC-A----------------AGG-A-TCAT--TTTTCAA---T-GTTGAAAA---TGG---A----CCCGGATCA----C--A-----TT---T-CAA----C----ATTAAA
gi|162222 : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-CCCTGTTGAACA------------------------T--TGACCC--------------------GG-G-TCAC--TTTTCAG---C-ATT---AA---AGT---C----T---GATCAAAA-C--AG----T-------------C----GTTGAAAACTGATC-
gi|162223 : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-CCCCGTTGAAAA------------------------A--TGACCCC-A----------------
gi|162224 : CCGGTGTTACATTAAATTTTGA-CCCCGTTGAAAA------------------------AACGGACCCA-A----------------TGG-
gi|162225 : CCGGTGTAACATTAAAAGTTGA-CCC---TGAAAAC-----------------------AATTGA---C-A----------------CGG-G-TCACAATTCTTAT---C-A-----AA---ACA---G----T-----------------------------------C----ATTGAAAACTGACC-taaattgacccgagtcacattttaacattaaa
gi|162226 : GTGTAACATTAAATTTTGA-CCCCGTTGAAAA------------------------A--TGACCCT-AAGGTTCAAAATTGACCTAG-G-TCAC--ATTTCAA---C-------AT---TAA---ATTC-T---GATC-----A--A-------------AA----CAGTTGTTGAAAACTGATC-
gi|162227 : GTAACATTAAACTTTGA-CACCGTTGAAAA------------------------A--TGACCCC-A----------------TAG-G-TCAC--TTTTCAA---C-G-----GA---TAA---G----T---GATA-----C--AT----TT---T-TAA----C----ATTGAAAACTGACC-CCGACCG--TT---ATT-T-AA----------TGACCCACCCACACGTGAAAA--------------------ATTGACCCTCGTTAAAATCTGATCACCAACAGTTGGAAACTGACCGAATAGTCGGCC
gi|162228 : ------------------------A--TGACCCC-A----------------TGGTG-T-AT--TTTTTAA---C-A-----GA---CAA---G----T---GATC-----A--AT----TT---T-TAA----C----ATTGAAAACTGA-C-CCGACCG--TT--------------------------------------AAAA--------------------ATTGACCCTCGTAAAAAATTGATCACGAAAAGTCGG
gi|162229 : TGACC-CCGATGG--TT---ATT-T-AA----------TGACCCACCCACACGTGAAAA--------------------ATTGACCCTCGTTCAAATTTGATCACCAACAGTTGGAAACTGACCAAATGGTCAACCG
gi|162229 : --TGACCCCGA----------------TGG---TTAT--TT----------------AA---TGA---C----C---CACC-----C--AC-------------A----C----GTGAAAAATTGACC-CT---CG--TTCAAATT-T-GA----------T----CACCAACAGTTGGAAACTGACCAAATGGTCAACCGCATTGACCCTCGTTCAAATTTGATCACCAACAGTTGGAAACTGACCAAATGGTCAACCGcattgaccctcgttcaaatttgatcaccaacagttggaaactgaccaaatggtcaaccg
gi|162230 : --TTTTGAA---CCG-----GA---TGT---G----T---TATT-----T--AT----TT---T-TAA----T----ATTGAAAACTGACA-CCGACCG--TT---ATT-T-AT----------TGACCCACCCACACATGAAAAC-------------------ATTGACCTTTGTTAAAATCTGATCACCAACAGTTGATAACTGACCAAATAGTCGGCCG
gi|162231 : TGACC-CCGATGG--TT---ATT-T-AA----------TGACCCACCCACACGTGAAAA--------------------ATTGACCCTCGTTCAAATTTGATCACCAACAGTTGGAAACTGACCAAATGGTCAACCG
gi|162232 : TTGACCATCGTTAAACTCTGATTACTAACCGTTGGAAACTGACCGAATAGTCAGCCG
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111 11111111111111111 222222222222222222222222222 11111111111111111111 11111111111111111111
lowQualScore : 1 444444444444444444444444444 11 11111111111111111 1 1 11 555555555555555555555555555 77777777777777777777 7777 44444 1 22 333 1 1 8888888888 99999999999999999999
lowQualScore : . ........................... .. ................. . . .. ........................... .................... .... ..... . .. ... . . .......... ....................
lowQualScore : 3 000000000000000000000000000 77 77777777777777777 3 4 88 777777777777777777777777777 33333333333333333333 2222 00000 4 66 333 9 9 3333333333 22222222222222222222
consensus : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-CCCCGTTGAAAA------------------------A--TGACCCC-A----------------TGG-G-TCAC--TTTTCAAC-G-----GA----T--GAG----T---GATC-----C--AT----TT-T-TAA----C----GTTGAAAACTGACC-CCGACCG--TT---ATT-T-AA----------TGACCCACCCACACGTGAAAA--------------------ATTGACCCTCGTTAAAATCTGATCACCAACAGTTGGAAACTGACCGAATAGTCGGCCG
Reference ( family-596 ) : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-CCCCGTTGAAAA------------------------A--TGACCCC-A----------------TGG-G-TCAC--TTTTCAAC-G-----GA----T--GAG----T---GATC-----C--AT----TT-T-TAA----C----GTTGAAAACTGACC-CCGACCG--TT---ATT-T-AA----------TGACCCACCCACACGTGAAAA--------------------ATTGACCCTCGTTAAAATCTGATCACCAACAGTTGGAAACTGACCGAATAGTCGGCCG
gi|162198 : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-CCCCGTTGAAAA------------------------A--TGACCCC-A----------------TGG-G-TCAC--ATTTCAAC-A-----GA----T--GAG----T---GATC-----T--AT----TT-T-CAA----C----ATTGAAAACTGACC-CCGACCG--TT---ATT-T-AA----------TGACCCGCCCACACGTGAAAA--------------------ATTGACCCTCGTTAAAATCTGTTCACCAACAATTGGAAACTGACAGAATAGTCGGCCG
gi|162199 : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-CCCTGTTGAAAA------------------------A--TGACCCT-A----------------TGG-G-TCTC--TTTTCAAC-G-----GA----T--GAG----T---GATC-----T--AT----TT-T-TAA----C----ATTGAAAACTGACC-CCAACCG--TT---ATT-T-AA----------TGACCCACCTACACGTGAAAA--------------------ATTGACCCTCGTTAATATCTGATCATCAACAGTTGAAAACTGACAGAATAGTCGGCCG
gi|162200 : CCGGTGTAACATAAAATTTTGA-CCCCGTTGAAAA------------------------A--TGACCCC-A----------------TGG-G-TCAT--ATTTCAAC-G-----AA----T--GAG----T---GATC-----C--AT----TT-T-TAA----C----GTTGAAAACTGACC-CCGATCG--TT---ATT-T-AA----------TGACCCAATCACACGTGAAAA--------------------ATTGACCCTCGTTAAAATCTGATCACCAACAATTGTAAACTGACCGAATAGTCGGCCG
gi|162201 : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-CCCCGTTGAAAA------------------------A--TGACCCC-A----------------AGA-G-TCAT--TTTTCAAT-GTT---GA----A--AAT----T---GACC-----CGGGTCACATT-T-CAA----C----ATTAAATTCTGATC-
gi|162202 : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-CCCCGTTGAAAA------------------------A--TGACCCC-A----------------TTG-G-TCAC--TTTTCAAC-G-----GA----A--TTG----T---CATC-----C--AT----TT-T-TAA----T----ATTGAAAACTGACC-CCGATCG--TT---ATT-T-AA----------TGACCAACTCACACCTGAAAA--------------------CTTAAACCTAGTTAAAATCTGATCACCAACAGTTGGAAACTGACCGAATAGTCTACCG
gi|162203 : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-CCCCGTT--------------------------------------C-A----------------TA---------------AAC-G-----GA----T--GAG----T---GGTC-----C--AT----TT-T-TAA----C----ATTGAAAACTGACC-CCGACCG--TT---ATT-T-AA-----------------------------AA--------------------ATTGACCTTCGTTAAAATCTGATCACCAACAGTTGGAAACTGACCGAATAGTCGGCCG
gi|162204 : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-ACCCGTT-----------------------------------CACC------------------TGG-G-TCAC--ATTTCAAC--------A----T--TAAATTCT---GATCAAAA-C--AG----T-----------C----GTTGAAAACTGATC-
gi|162205 : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-ACCCGCTGTAAA------------------------A--TTACCCC-A----------------TGG-G-TCAC--TTTTTAAC-G-----GA----A--GTT----T---TATC-----C--AT----TTGT-TAT----C----ACTGAAAACTGACC-CTGACCG--TT---ATT-T-AA----------TGACCCACCCACACGTGAAAA--------------------ATGTACCCTCGTTAAAATCTGATCACCAACAGTTTGAAACTGACCGAATAGTCGGCCG
gi|162206 : CCGGTGTAACATAAAATTTTGA-CCTCGTTAAAAA------------------------A--AAAACCC-T----------------TGG-G-TCAT--TTTTCAAT-GTT---GAAAATT--GAA----CCG-GGTC-----A--AA----TT-T-CAA----C----ATTAAATTCTGATC-
gi|162207 : CCGGTGTAACATTAAATTTTGC-CCCTGTTAAAAATCGACCCCATGGGTCACTTTATATA--TGACCCC-A----------------TGG-G-TCAC--TTTTCAAT--------A----T--GAG----T---GATC-----C--AT----TT-C-TAA----C----ATTGAAAACTGACC-CCGACTG--TT---ATT-T-AA----------TGAGACACCCACACGTGAAAA--------------------AGTAACCCTCGTTAAAATCTGATCACCAACAGTTGGAAACTGACCGAATAGTCGGCCG
gi|162208 : CCGGTGTAACATTAAATGTTGA-CCC-GTTGAATA------------------------A--TGACCCC-A----------------AGG-G-TCAC--ATTTCAA--------AA----T--TAAATTCT---GATC-----A--A-----------AATAGTC----GTTGAAAACTGATC-
gi|162209 : CCAGTGTAACATTAAATATTGA-CCCCGATGAAAA------------------------G--TGATCC--A----------------TGG-GGTCAT--T--------------GA----T--GAG----T---GATC-----A--AT----TT-T-TAA----C----ATTGAAAACTGACC-CCGACCG--TT---ATT-T-AA----------TGACCTACCCATACGTGAAAA--------------------CTTGACCCTCGTTAAAATCTGATCACCAACAGTTGGAAACTGACCGAATAGTCGACCG
gi|162210 : CCGATGTAACATTAAATTTTGA-CCCCATTGAAAA------------------------A--TGACCTT-A-----------------GG-G-TTAC--TTTTAAAC-G-----GA----T--GAG----T---GATC-----C--AT----TT-T-TAA----C----ATTGAAAACTGACC-CCGACCG--TA---ATT-T-AA----------TGACCCACCCACAAGTGAAAA--------------------ATTTACC--------------ATCATCAACAGTTGGAAACTGACCGAATAATCAACCG
gi|162211 : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-CCTCGTTGAAAA------------------------A--TGACCCC-A----------------AGG-G-TCAT--ATTTCAAT-G-----
gi|162212 : CCGGTGTATCATTAAATTTTGA-CCCC-------------------------------------------A----------------TGG-G-TCAC--TTTTCAAC-G-----GA----T--GAG----T---GATC-----C--AT----TT-T-TAA----C----ATTGAAAACTT-CA-CCGACAG--TT---ATT-T-TA----------TGAACCAACCACACGTGGAAA--------------------GTTGACCCCGGTTAATATCTGATCACCAATAGTTTGAAATTGACCGAATAGGCGGCCG
gi|162213 : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-CCCCGATGAAAA------------------------A--TGATC
gi|162214 : CCGGTGTAACTTTAAATTTTGA-CCCCGTTGGAAA------------------------A--TGATCCC-A----------------TGG-A-TCAC--TT-------------GA----T--GAG----T---GATC-----A--AT----TC-T-TAA----C----ATTGAAAACTGACA-CAGGCCG--TT---ATT-A-AA----------TGACCCAACTACACGTGAAAA--------------------AATTACC--------------ATCACCAACAGTTGGAAACTGACCGAATAGTTGGCCG
gi|162215 : CCGGTGTAGCATTAAATTTTGA-TCCCGTTGAAAA------------------------G--TGAGCTC-A----------------ATG-G-TCAT--TTTTCAAT-GTT---GA----A--AAT----T---GACCTGGGTC--AC----TT-TGCAA----C----ATTAAATTCTGATC-AAAACAG--TT---GTT-G-AA----------
gi|162216 : CCGCTGTAACATTAAATTTTGA-CCC---------------------------------A--TG------------------------GG-G-TCAT--TTTTCAAA-G-----GA----T--TTA----C---GATC-----C--AT----TT-T-TAA----C----ATTAAAAACTGACC-CCGACCG---T---ATTCT-AA----------TGACCCAACTACACGTGAAAA--------------------ATTGACACTCGTTAAAATCTGAACACCAACAGTTGGAAACTGACCGGA
gi|162217 : CCGGTGTAACATTACATTATGA-CTTCGTTGAAAA------------------------T--TGACCC--------------------GA-G-TCAC--ATTTAATC--------A----T--TAACTTCT---GATC-----A--A-----------AACGGTC----GTTGAAAACTGATC-
gi|162218 : CCGGTGTAACATTAAA-----A-CCCCGGTGAAAA------------------------A--TGACCCC-A------------------------AT--TTTTC------------------------------------------------------AA----T----GTTGAAAATTGACC-CGGATC---TC---ATT-TCAACTTTAAATTCTGATCAAAACAGTCGTTGAAA--------------------ACTGATCATTGTTAAATTTTGATCA--GACATTTGG
gi|162219 : CCGGTGTAACATTAAACTTTGATCCCCGTTGAAAA------------------------T--TGACCC--------------------AG-G-TTAC--ATTTCAGC--------A----T--TAAATTCT---AATC-----A--A------A-T-CAGT---C----GTTGAAAACTGATCAATAACCGGATT---CTT-T-AA----------
gi|162220 : CCGTTGTAACATTAAATTTTGA-CCCCGTTGAAAA------------------------A--TGAACCC-A----------------AGG-G-TCA---TTTTCAAT-GTT---GAAAATT--GAC----TCG-GGTCA----C--A-----TT-T-CAA----C----ATTAAA
gi|162221 : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-CCCCGTTG-AAA------------------------A--TGAACCC-A----------------AGG-A-TCAT--TTTTCAAT-GTTGAAAA----T--GGA----CCCGGATCA----C--A-----TT-T-CAA----C----ATTAAA
gi|162222 : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-CCCTGTTGAACA------------------------T--TGACCC--------------------GG-G-TCAC--TTTTCAGC--------A----TTAAAGTC--T---GATCAAAA-C--AG----T-----------C----GTTGAAAACTGATC-
gi|162223 : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-CCCCGTTGAAAA------------------------A--TGACCCC-A----------------
gi|162224 : CCGGTGTTACATTAAATTTTGA-CCCCGTTGAAAA------------------------AACGGACCCA-A----------------TGG-
gi|162225 : CCGGTGTAACATTAAAAGTTGA-CCC---TGAAAAC-----------------------AATTGA---C-A----------------CGG-G-TCACAATTCTTATC-A-----AA----A--CAG----T---------------------------------C----ATTGAAAACTGACC-taaattgacccgagtcacattttaacattaaa
gi|162226 : GTGTAACATTAAATTTTGA-CCCCGTTGAAAA------------------------A--TGACCCT-AAGGTTCAAAATTGACCTAG-G-TCAC--ATTTCAAC--------A----T--TAAATTCT---GATC-----A--A-----------AA----CAGTTGTTGAAAACTGATC-
gi|162227 : GTAACATTAAACTTTGA-CACCGTTGAAAA------------------------A--TGACCCC-A----------------TAG-G-TCAC--TTTTCAAC-G-----GA----T--AAG----T---GATA-----C--AT----TT-T-TAA----C----ATTGAAAACTGACC-CCGACCG--TT---ATT-T-AA----------TGACCCACCCACACGTGAAAA--------------------ATTGACCCTCGTTAAAATCTGATCACCAACAGTTGGAAACTGACCGAATAGTCGGCC
gi|162228 : ------------------------A--TGACCCC-A----------------TGGTG-T-AT--TTTTTAAC-A-----GA----C--AAG----T---GATC-----A--AT----TT-T-TAA----C----ATTGAAAACTGA-C-CCGACCG--TT--------------------------------------AAAA--------------------ATTGACCCTCGTAAAAAATTGATCACGAAAAGTCGG
gi|162229 : TGACC-CCGATGG--TT---ATT-T-AA----------TGACCCACCCACACGTGAAAA--------------------ATTGACCCTCGTTCAAATTTGATCACCAACAGTTGGAAACTGACCAAATGGTCAACCG
gi|162229 : --TGACCCCGA----------------TGG---TTAT--TT-------------AA----T--GAC----C---CACC-----C--AC-----------A----C----GTGAAAAATTGACC-CT---CG--TTCAAATT-T-GA----------T----CACCAACAGTTGGAAACTGACCAAATGGTCAACCGCATTGACCCTCGTTCAAATTTGATCACCAACAGTTGGAAACTGACCAAATGGTCAACCGcattgaccctcgttcaaatttgatcaccaacagttggaaactgaccaaatggtcaaccg
gi|162230 : --TTTTGAACCG-----GA----T--GTG----T---TATT-----T--AT----TT-T-TAA----T----ATTGAAAACTGACA-CCGACCG--TT---ATT-T-AT----------TGACCCACCCACACATGAAAAC-------------------ATTGACCTTTGTTAAAATCTGATCACCAACAGTTGATAACTGACCAAATAGTCGGCCG
gi|162231 : TGACC-CCGATGG--TT---ATT-T-AA----------TGACCCACCCACACGTGAAAA--------------------ATTGACCCTCGTTCAAATTTGATCACCAACAGTTGGAAACTGACCAAATGGTCAACCG
gi|162232 : TTGACCATCGTTAAACTCTGATTACTAACCGTTGGAAACTGACCGAATAGTCAGCCG
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111 11111111111111111 222222222222222222222222222 11111111111111111111 11111111111111111111
lowQualScore : 1 444444444444444444444444444 11 11111111111111111 1 1 11 555555555555555555555555555 77777777777777777777 7777 44444 1 22 333 1 1 8888888888 99999999999999999999
lowQualScore : . ........................... .. ................. . . .. ........................... .................... .... ..... . .. ... . . .......... ....................
lowQualScore : 3 000000000000000000000000000 77 77777777777777777 3 4 88 777777777777777777777777777 33333333333333333333 2222 00000 4 66 333 9 9 3333333333 22222222222222222222
consensus : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-CCCCGTTGAAAA------------------------A--TGACCCC-A----------------TGG-G-TCAC--TTTTCAAC-G-----GA----T--GAG----T---GATC-----C--AT----TT-T-TAA----C----GTTGAAAACTGACC-CCGACCG--TT---ATT-T-AA----------TGACCCACCCACACGTGAAAA--------------------ATTGACCCTCGTTAAAATCTGATCACCAACAGTTGGAAACTGACCGAATAGTCGGCCG
Reference ( family-596 ) : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-CCCCGTTGAAAA------------------------A--TGACCCC-A----------------TGG-G-TCAC--TTTTCAAC-G-----GA----T--GAG----T---GATC-----C--AT----TT-T-TAA----C----GTTGAAAACTGACC-CCGACCG--TT---ATT-T-AA----------TGACCCACCCACACGTGAAAA--------------------ATTGACCCTCGTTAAAATCTGATCACCAACAGTTGGAAACTGACCGAATAGTCGGCCG
gi|162198 : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-CCCCGTTGAAAA------------------------A--TGACCCC-A----------------TGG-G-TCAC--ATTTCAAC-A-----GA----T--GAG----T---GATC-----T--AT----TT-T-CAA----C----ATTGAAAACTGACC-CCGACCG--TT---ATT-T-AA----------TGACCCGCCCACACGTGAAAA--------------------ATTGACCCTCGTTAAAATCTGTTCACCAACAATTGGAAACTGACAGAATAGTCGGCCG
gi|162199 : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-CCCTGTTGAAAA------------------------A--TGACCCT-A----------------TGG-G-TCTC--TTTTCAAC-G-----GA----T--GAG----T---GATC-----T--AT----TT-T-TAA----C----ATTGAAAACTGACC-CCAACCG--TT---ATT-T-AA----------TGACCCACCTACACGTGAAAA--------------------ATTGACCCTCGTTAATATCTGATCATCAACAGTTGAAAACTGACAGAATAGTCGGCCG
gi|162200 : CCGGTGTAACATAAAATTTTGA-CCCCGTTGAAAA------------------------A--TGACCCC-A----------------TGG-G-TCAT--ATTTCAAC-G-----AA----T--GAG----T---GATC-----C--AT----TT-T-TAA----C----GTTGAAAACTGACC-CCGATCG--TT---ATT-T-AA----------TGACCCAATCACACGTGAAAA--------------------ATTGACCCTCGTTAAAATCTGATCACCAACAATTGTAAACTGACCGAATAGTCGGCCG
gi|162201 : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-CCCCGTTGAAAA------------------------A--TGACCCC-A----------------AGA-G-TCAT--TTTTCAAT-GTT---GA----A--AAT----T---GACC-----CGGGTCACATT-T-CAA----C----ATTAAATTCTGATC-
gi|162202 : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-CCCCGTTGAAAA------------------------A--TGACCCC-A----------------TTG-G-TCAC--TTTTCAAC-G-----GA----A--TTG----T---CATC-----C--AT----TT-T-TAA----T----ATTGAAAACTGACC-CCGATCG--TT---ATT-T-AA----------TGACCAACTCACACCTGAAAA--------------------CTTAAACCTAGTTAAAATCTGATCACCAACAGTTGGAAACTGACCGAATAGTCTACCG
gi|162203 : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-CCCCGTT--------------------------------------C-A----------------TA---------------AAC-G-----GA----T--GAG----T---GGTC-----C--AT----TT-T-TAA----C----ATTGAAAACTGACC-CCGACCG--TT---ATT-T-AA-----------------------------AA--------------------ATTGACCTTCGTTAAAATCTGATCACCAACAGTTGGAAACTGACCGAATAGTCGGCCG
gi|162204 : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-ACCCGTT-----------------------------------CACC------------------TGG-G-TCAC--ATTTCAAC--------A----T--TAAATTCT---GATCAAAA-C--AG----T-----------C----GTTGAAAACTGATC-
gi|162205 : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-ACCCGCTGTAAA------------------------A--TTACCCC-A----------------TGG-G-TCAC--TTTTTAAC-G-----GA----A--GTT----T---TATC-----C--AT----TTGT-TAT----C----ACTGAAAACTGACC-CTGACCG--TT---ATT-T-AA----------TGACCCACCCACACGTGAAAA--------------------ATGTACCCTCGTTAAAATCTGATCACCAACAGTTTGAAACTGACCGAATAGTCGGCCG
gi|162206 : CCGGTGTAACATAAAATTTTGA-CCTCGTTAAAAA------------------------A--AAAACCC-T----------------TGG-G-TCAT--TTTTCAAT-GTT---GAAAATT--GAA----CCG-GGTC-----A--AA----TT-T-CAA----C----ATTAAATTCTGATC-
gi|162207 : CCGGTGTAACATTAAATTTTGC-CCCTGTTAAAAATCGACCCCATGGGTCACTTTATATA--TGACCCC-A----------------TGG-G-TCAC--TTTTCAAT--------A----T--GAG----T---GATC-----C--AT----TT-C-TAA----C----ATTGAAAACTGACC-CCGACTG--TT---ATT-T-AA----------TGAGACACCCACACGTGAAAA--------------------AGTAACCCTCGTTAAAATCTGATCACCAACAGTTGGAAACTGACCGAATAGTCGGCCG
gi|162208 : CCGGTGTAACATTAAATGTTGA-CCC-GTTGAATA------------------------A--TGACCCC-A----------------AGG-G-TCAC--ATTTCAA--------AA----T--TAAATTCT---GATC-----A--A-----------AATAGTC----GTTGAAAACTGATC-
gi|162209 : CCAGTGTAACATTAAATATTGA-CCCCGATGAAAA------------------------G--TGATCC--A----------------TGG-GGTCAT--T--------------GA----T--GAG----T---GATC-----A--AT----TT-T-TAA----C----ATTGAAAACTGACC-CCGACCG--TT---ATT-T-AA----------TGACCTACCCATACGTGAAAA--------------------CTTGACCCTCGTTAAAATCTGATCACCAACAGTTGGAAACTGACCGAATAGTCGACCG
gi|162210 : CCGATGTAACATTAAATTTTGA-CCCCATTGAAAA------------------------A--TGACCTT-A-----------------GG-G-TTAC--TTTTAAAC-G-----GA----T--GAG----T---GATC-----C--AT----TT-T-TAA----C----ATTGAAAACTGACC-CCGACCG--TA---ATT-T-AA----------TGACCCACCCACAAGTGAAAA--------------------ATTTACC--------------ATCATCAACAGTTGGAAACTGACCGAATAATCAACCG
gi|162211 : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-CCTCGTTGAAAA------------------------A--TGACCCC-A----------------AGG-G-TCAT--ATTTCAAT-G-----
gi|162212 : CCGGTGTATCATTAAATTTTGA-CCCC-------------------------------------------A----------------TGG-G-TCAC--TTTTCAAC-G-----GA----T--GAG----T---GATC-----C--AT----TT-T-TAA----C----ATTGAAAACTT-CA-CCGACAG--TT---ATT-T-TA----------TGAACCAACCACACGTGGAAA--------------------GTTGACCCCGGTTAATATCTGATCACCAATAGTTTGAAATTGACCGAATAGGCGGCCG
gi|162213 : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-CCCCGATGAAAA------------------------A--TGATC
gi|162214 : CCGGTGTAACTTTAAATTTTGA-CCCCGTTGGAAA------------------------A--TGATCCC-A----------------TGG-A-TCAC--TT-------------GA----T--GAG----T---GATC-----A--AT----TC-T-TAA----C----ATTGAAAACTGACA-CAGGCCG--TT---ATT-A-AA----------TGACCCAACTACACGTGAAAA--------------------AATTACC--------------ATCACCAACAGTTGGAAACTGACCGAATAGTTGGCCG
gi|162215 : CCGGTGTAGCATTAAATTTTGA-TCCCGTTGAAAA------------------------G--TGAGCTC-A----------------ATG-G-TCAT--TTTTCAAT-GTT---GA----A--AAT----T---GACCTGGGTC--AC----TT-TGCAA----C----ATTAAATTCTGATC-AAAACAG--TT---GTT-G-AA----------
gi|162216 : CCGCTGTAACATTAAATTTTGA-CCC---------------------------------A--TG------------------------GG-G-TCAT--TTTTCAAA-G-----GA----T--TTA----C---GATC-----C--AT----TT-T-TAA----C----ATTAAAAACTGACC-CCGACCG---T---ATTCT-AA----------TGACCCAACTACACGTGAAAA--------------------ATTGACACTCGTTAAAATCTGAACACCAACAGTTGGAAACTGACCGGA
gi|162217 : CCGGTGTAACATTACATTATGA-CTTCGTTGAAAA------------------------T--TGACCC--------------------GA-G-TCAC--ATTTAATC--------A----T--TAACTTCT---GATC-----A--A-----------AACGGTC----GTTGAAAACTGATC-
gi|162218 : CCGGTGTAACATTAAA-----A-CCCCGGTGAAAA------------------------A--TGACCCC-A------------------------AT--TTTTC------------------------------------------------------AA----T----GTTGAAAATTGACC-CGGATC---TC---ATT-TCAACTTTAAATTCTGATCAAAACAGTCGTTGAAA--------------------ACTGATCATTGTTAAATTTTGATCA--GACATTTGG
gi|162219 : CCGGTGTAACATTAAACTTTGATCCCCGTTGAAAA------------------------T--TGACCC--------------------AG-G-TTAC--ATTTCAGC--------A----T--TAAATTCT---AATC-----A--A------A-T-CAGT---C----GTTGAAAACTGATCAATAACCGGATT---CTT-T-AA----------
gi|162220 : CCGTTGTAACATTAAATTTTGA-CCCCGTTGAAAA------------------------A--TGAACCC-A----------------AGG-G-TCA---TTTTCAAT-GTT---GAAAATT--GAC----TCG-GGTCA----C--A-----TT-T-CAA----C----ATTAAA
gi|162221 : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-CCCCGTTG-AAA------------------------A--TGAACCC-A----------------AGG-A-TCAT--TTTTCAAT-GTTGAAAA----T--GGA----CCCGGATCA----C--A-----TT-T-CAA----C----ATTAAA
gi|162222 : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-CCCTGTTGAACA------------------------T--TGACCC--------------------GG-G-TCAC--TTTTCAGC--------A----TTAAAGTC--T---GATCAAAA-C--AG----T-----------C----GTTGAAAACTGATC-
gi|162223 : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-CCCCGTTGAAAA------------------------A--TGACCCC-A----------------
gi|162224 : CCGGTGTTACATTAAATTTTGA-CCCCGTTGAAAA------------------------AACGGACCCA-A----------------TGG-
gi|162225 : CCGGTGTAACATTAAAAGTTGA-CCC---TGAAAAC-----------------------AATTGA---C-A----------------CGG-G-TCACAATTCTTATC-A-----AA----A--CAG----T---------------------------------C----ATTGAAAACTGACC-taaattgacccgagtcacattttaacattaaa
gi|162226 : GTGTAACATTAAATTTTGA-CCCCGTTGAAAA------------------------A--TGACCCT-AAGGTTCAAAATTGACCTAG-G-TCAC--ATTTCAAC--------A----T--TAAATTCT---GATC-----A--A-----------AA----CAGTTGTTGAAAACTGATC-
gi|162227 : GTAACATTAAACTTTGA-CACCGTTGAAAA------------------------A--TGACCCC-A----------------TAG-G-TCAC--TTTTCAAC-G-----GA----T--AAG----T---GATA-----C--AT----TT-T-TAA----C----ATTGAAAACTGACC-CCGACCG--TT---ATT-T-AA----------TGACCCACCCACACGTGAAAA--------------------ATTGACCCTCGTTAAAATCTGATCACCAACAGTTGGAAACTGACCGAATAGTCGGCC
gi|162228 : ------------------------A--TGACCCC-A----------------TGGTG-T-AT--TTTTTAAC-A-----GA----C--AAG----T---GATC-----A--AT----TT-T-TAA----C----ATTGAAAACTGA-C-CCGACCG--TT--------------------------------------AAAA--------------------ATTGACCCTCGTAAAAAATTGATCACGAAAAGTCGG
gi|162229 : TGACC-CCGATGG--TT---ATT-T-AA----------TGACCCACCCACACGTGAAAA--------------------ATTGACCCTCGTTCAAATTTGATCACCAACAGTTGGAAACTGACCAAATGGTCAACCG
gi|162229 : --TGACCCCGA----------------TGG---TTAT--TT-------------AA----T--GAC----C---CACC-----C--AC-----------A----C----GTGAAAAATTGACC-CT---CG--TTCAAATT-T-GA----------T----CACCAACAGTTGGAAACTGACCAAATGGTCAACCGCATTGACCCTCGTTCAAATTTGATCACCAACAGTTGGAAACTGACCAAATGGTCAACCGcattgaccctcgttcaaatttgatcaccaacagttggaaactgaccaaatggtcaaccg
gi|162230 : --TTTTGAACCG-----GA----T--GTG----T---TATT-----T--AT----TT-T-TAA----T----ATTGAAAACTGACA-CCGACCG--TT---ATT-T-AT----------TGACCCACCCACACATGAAAAC-------------------ATTGACCTTTGTTAAAATCTGATCACCAACAGTTGATAACTGACCAAATAGTCGGCCG
gi|162231 : TGACC-CCGATGG--TT---ATT-T-AA----------TGACCCACCCACACGTGAAAA--------------------ATTGACCCTCGTTCAAATTTGATCACCAACAGTTGGAAACTGACCAAATGGTCAACCG
gi|162232 : TTGACCATCGTTAAACTCTGATTACTAACCGTTGGAAACTGACCGAATAGTCAGCCG
blockSeqs : T TCGACCCCATGGGTCACTTTATATA CG AGGTTCAAAATTGACCT T G AA GTTGAAAATTGAACCG CGGGTCACATTTC TAGT AGTTG A GA CAA C C CTTTAAATTC CTGACCAAATGGTCAACCGC
blockSeqs : . CAAT T T . . . GTTGAAAATTGACTCG TGGGTCACTTTGC CGGT A . . . . . . C
blockSeqs : . AAC C T . . . GTTGAAAATGGACCCG AAAACAGT T G . . . . . . .
blockSeqs : . A C A . . . AATTAAATTCT CATTTGTT . A . . . . . . .
blockSeqs : . A C T . . . GTTGAAAATT AAAACAGT . A . . . . . . .
blockSeqs : . A C T . . . ATTAAATTCT TATTTTT . A . . . . . . .
blockSeqs : . A C T . . . GTTGAAAATT CATTTTT . G . . . . . . .
blockSeqs : . A C T . . . ATTAACTTCT CATTTTT . A . . . . . . .
blockSeqs : . A C T . . . ATTAAATTCT CATTTTT . A . . . . . . .
blockSeqs : . A C T . . . ATTAAAGTCT AAATTTC . A . . . . . . .
blockSeqs : . G C A . . . ATTAAATTCT CATTTCT . G . . . . . . .
blockSeqs : . A T T . . . CGGATGTGT AATTTTT . A . . . . . . .
blockSeqs : . A C A . . . GGATGAGT CATTTTT . A . . . . . . .
blockSeqs : . A C T . . . GAATGAGT CATTTTT . A . . . . . . .
blockSeqs : . A C T . . . GGAATTGT AATTCTT . A . . . . . . .
blockSeqs : . G C A . . . GGATGAGT CATTTTT . A . . . . . . .
blockSeqs : . A C A . . . GGAAGTTT ACATTTC . A . . . . . . .
blockSeqs : . T C A . . . GGATGAGT ACATTTC . G . . . . . . .
blockSeqs : . A C T . . . GGATGAGT CATTTTT . G . . . . . .
blockSeqs : . T A C . . . GGATTTAC AATTTTT . G . . . . . .
blockSeqs : . A C T . . . AAAACAGT TATTTTT . A .
blockSeqs : . A T T . . . GGATAAGT AAATC . A .
blockSeqs : . T C T . . . AGACAAGT CAC . G .
blockSeqs : . A C . . . . GATGAGT AA . A .
blockSeqs : . A . . . . . GATGAGT AA . A .
blockSeqs : . A . . . . . AATGACC AA . A .
blockSeqs : . A . . . . . ATGAGT . . G .
blockSeqs : . . . . . . . . . . A .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . .
blockSeqCons :
originalCons : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-CCCCGTTGAAAA------------------------A--TGACCCC-A----------------TGG-G-TCAC--TTTTCAAC-G-----GA----T--GAG----T---GATC-----C--AT----TT-T-TAA----C----GTTGAAAACTGACC-CCGACCG--TT---ATT-T-AA----------TGACCCACCCACACGTGAAAA--------------------ATTGACCCTCGTTAAAATCTGATCACCAACAGTTGGAAACTGACCGAATAGTCGGCCG
finalCons : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-CCCCGTTGAAAA------------------------A--TGACCCC-A----------------TGG-G-TCAC--TTTTCAAC-G-----GA----T--GAG----T---GATC-----C--AT----TT-T-TAA----C----GTTGAAAACTGACC-CCGACCG--TT---ATT-T-AA----------TGACCCACCCACACGTGAAAA--------------------ATTGACCCTCGTTAAAATCTGATCACCAACAGTTGGAAACTGACCGAATAGTCGGCCG
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111 11111111111111111 222222222222222222222222222 11111111111111111111 11111111111111111111
lowQualScore : 1 444444444444444444444444444 11 11111111111111111 1 1 11 555555555555555555555555555 77777777777777777777 7777 44444 1 22 333 1 1 8888888888 99999999999999999999
lowQualScore : . ........................... .. ................. . . .. ........................... .................... .... ..... . .. ... . . .......... ....................
lowQualScore : 3 000000000000000000000000000 77 77777777777777777 3 4 88 777777777777777777777777777 33333333333333333333 2222 00000 4 66 333 9 9 3333333333 22222222222222222222
consensus : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-CCCCGTTGAAAA------------------------A--TGACCCC-A----------------TGG-G-TCAC--TTTTCAAC-G-----GA----T--GAG----T---GATC-----C--AT----TT-T-TAA----C----GTTGAAAACTGACC-CCGACCG--TT---ATT-T-AA----------TGACCCACCCACACGTGAAAA--------------------ATTGACCCTCGTTAAAATCTGATCACCAACAGTTGGAAACTGACCGAATAGTCGGCCG
Reference ( family-596 ) : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-CCCCGTTGAAAA------------------------A--TGACCCC-A----------------TGG-G-TCAC--TTTTCAAC-G-----GA----T--GAG----T---GATC-----C--AT----TT-T-TAA----C----GTTGAAAACTGACC-CCGACCG--TT---ATT-T-AA----------TGACCCACCCACACGTGAAAA--------------------ATTGACCCTCGTTAAAATCTGATCACCAACAGTTGGAAACTGACCGAATAGTCGGCCG
gi|162198 : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-CCCCGTTGAAAA------------------------A--TGACCCC-A----------------TGG-G-TCAC--ATTTCAAC-A-----GA----T--GAG----T---GATC-----T--AT----TT-T-CAA----C----ATTGAAAACTGACC-CCGACCG--TT---ATT-T-AA----------TGACCCGCCCACACGTGAAAA--------------------ATTGACCCTCGTTAAAATCTGTTCACCAACAATTGGAAACTGACAGAATAGTCGGCCG
gi|162199 : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-CCCTGTTGAAAA------------------------A--TGACCCT-A----------------TGG-G-TCTC--TTTTCAAC-G-----GA----T--GAG----T---GATC-----T--AT----TT-T-TAA----C----ATTGAAAACTGACC-CCAACCG--TT---ATT-T-AA----------TGACCCACCTACACGTGAAAA--------------------ATTGACCCTCGTTAATATCTGATCATCAACAGTTGAAAACTGACAGAATAGTCGGCCG
gi|162200 : CCGGTGTAACATAAAATTTTGA-CCCCGTTGAAAA------------------------A--TGACCCC-A----------------TGG-G-TCAT--ATTTCAAC-G-----AA----T--GAG----T---GATC-----C--AT----TT-T-TAA----C----GTTGAAAACTGACC-CCGATCG--TT---ATT-T-AA----------TGACCCAATCACACGTGAAAA--------------------ATTGACCCTCGTTAAAATCTGATCACCAACAATTGTAAACTGACCGAATAGTCGGCCG
gi|162201 : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-CCCCGTTGAAAA------------------------A--TGACCCC-A----------------AGA-G-TCAT--TTTTCAAT-GTT---GA----A--AAT----T---GACC-----CGGGTCACATT-T-CAA----C----ATTAAATTCTGATC-
gi|162202 : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-CCCCGTTGAAAA------------------------A--TGACCCC-A----------------TTG-G-TCAC--TTTTCAAC-G-----GA----A--TTG----T---CATC-----C--AT----TT-T-TAA----T----ATTGAAAACTGACC-CCGATCG--TT---ATT-T-AA----------TGACCAACTCACACCTGAAAA--------------------CTTAAACCTAGTTAAAATCTGATCACCAACAGTTGGAAACTGACCGAATAGTCTACCG
gi|162203 : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-CCCCGTT--------------------------------------C-A----------------TA---------------AAC-G-----GA----T--GAG----T---GGTC-----C--AT----TT-T-TAA----C----ATTGAAAACTGACC-CCGACCG--TT---ATT-T-AA-----------------------------AA--------------------ATTGACCTTCGTTAAAATCTGATCACCAACAGTTGGAAACTGACCGAATAGTCGGCCG
gi|162204 : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-ACCCGTT-----------------------------------CACC------------------TGG-G-TCAC--ATTTCAAC--------A----T--TAAATTCT---GATCAAAA-C--AG----T-----------C----GTTGAAAACTGATC-
gi|162205 : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-ACCCGCTGTAAA------------------------A--TTACCCC-A----------------TGG-G-TCAC--TTTTTAAC-G-----GA----A--GTT----T---TATC-----C--AT----TTGT-TAT----C----ACTGAAAACTGACC-CTGACCG--TT---ATT-T-AA----------TGACCCACCCACACGTGAAAA--------------------ATGTACCCTCGTTAAAATCTGATCACCAACAGTTTGAAACTGACCGAATAGTCGGCCG
gi|162206 : CCGGTGTAACATAAAATTTTGA-CCTCGTTAAAAA------------------------A--AAAACCC-T----------------TGG-G-TCAT--TTTTCAAT-GTT---GAAAATT--GAA----CCG-GGTC-----A--AA----TT-T-CAA----C----ATTAAATTCTGATC-
gi|162207 : CCGGTGTAACATTAAATTTTGC-CCCTGTTAAAAATCGACCCCATGGGTCACTTTATATA--TGACCCC-A----------------TGG-G-TCAC--TTTTCAAT--------A----T--GAG----T---GATC-----C--AT----TT-C-TAA----C----ATTGAAAACTGACC-CCGACTG--TT---ATT-T-AA----------TGAGACACCCACACGTGAAAA--------------------AGTAACCCTCGTTAAAATCTGATCACCAACAGTTGGAAACTGACCGAATAGTCGGCCG
gi|162208 : CCGGTGTAACATTAAATGTTGA-CCC-GTTGAATA------------------------A--TGACCCC-A----------------AGG-G-TCAC--ATTTCAA--------AA----T--TAAATTCT---GATC-----A--A-----------AATAGTC----GTTGAAAACTGATC-
gi|162209 : CCAGTGTAACATTAAATATTGA-CCCCGATGAAAA------------------------G--TGATCC--A----------------TGG-GGTCAT--T--------------GA----T--GAG----T---GATC-----A--AT----TT-T-TAA----C----ATTGAAAACTGACC-CCGACCG--TT---ATT-T-AA----------TGACCTACCCATACGTGAAAA--------------------CTTGACCCTCGTTAAAATCTGATCACCAACAGTTGGAAACTGACCGAATAGTCGACCG
gi|162210 : CCGATGTAACATTAAATTTTGA-CCCCATTGAAAA------------------------A--TGACCTT-A-----------------GG-G-TTAC--TTTTAAAC-G-----GA----T--GAG----T---GATC-----C--AT----TT-T-TAA----C----ATTGAAAACTGACC-CCGACCG--TA---ATT-T-AA----------TGACCCACCCACAAGTGAAAA--------------------ATTTACC--------------ATCATCAACAGTTGGAAACTGACCGAATAATCAACCG
gi|162211 : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-CCTCGTTGAAAA------------------------A--TGACCCC-A----------------AGG-G-TCAT--ATTTCAAT-G-----
gi|162212 : CCGGTGTATCATTAAATTTTGA-CCCC-------------------------------------------A----------------TGG-G-TCAC--TTTTCAAC-G-----GA----T--GAG----T---GATC-----C--AT----TT-T-TAA----C----ATTGAAAACTT-CA-CCGACAG--TT---ATT-T-TA----------TGAACCAACCACACGTGGAAA--------------------GTTGACCCCGGTTAATATCTGATCACCAATAGTTTGAAATTGACCGAATAGGCGGCCG
gi|162213 : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-CCCCGATGAAAA------------------------A--TGATC
gi|162214 : CCGGTGTAACTTTAAATTTTGA-CCCCGTTGGAAA------------------------A--TGATCCC-A----------------TGG-A-TCAC--TT-------------GA----T--GAG----T---GATC-----A--AT----TC-T-TAA----C----ATTGAAAACTGACA-CAGGCCG--TT---ATT-A-AA----------TGACCCAACTACACGTGAAAA--------------------AATTACC--------------ATCACCAACAGTTGGAAACTGACCGAATAGTTGGCCG
gi|162215 : CCGGTGTAGCATTAAATTTTGA-TCCCGTTGAAAA------------------------G--TGAGCTC-A----------------ATG-G-TCAT--TTTTCAAT-GTT---GA----A--AAT----T---GACCTGGGTC--AC----TT-TGCAA----C----ATTAAATTCTGATC-AAAACAG--TT---GTT-G-AA----------
gi|162216 : CCGCTGTAACATTAAATTTTGA-CCC---------------------------------A--TG------------------------GG-G-TCAT--TTTTCAAA-G-----GA----T--TTA----C---GATC-----C--AT----TT-T-TAA----C----ATTAAAAACTGACC-CCGACCG---T---ATTCT-AA----------TGACCCAACTACACGTGAAAA--------------------ATTGACACTCGTTAAAATCTGAACACCAACAGTTGGAAACTGACCGGA
gi|162217 : CCGGTGTAACATTACATTATGA-CTTCGTTGAAAA------------------------T--TGACCC--------------------GA-G-TCAC--ATTTAATC--------A----T--TAACTTCT---GATC-----A--A-----------AACGGTC----GTTGAAAACTGATC-
gi|162218 : CCGGTGTAACATTAAA-----A-CCCCGGTGAAAA------------------------A--TGACCCC-A------------------------AT--TTTTC------------------------------------------------------AA----T----GTTGAAAATTGACC-CGGATC---TC---ATT-TCAACTTTAAATTCTGATCAAAACAGTCGTTGAAA--------------------ACTGATCATTGTTAAATTTTGATCA--GACATTTGG
gi|162219 : CCGGTGTAACATTAAACTTTGATCCCCGTTGAAAA------------------------T--TGACCC--------------------AG-G-TTAC--ATTTCAGC--------A----T--TAAATTCT---AATC-----A--A------A-T-CAGT---C----GTTGAAAACTGATCAATAACCGGATT---CTT-T-AA----------
gi|162220 : CCGTTGTAACATTAAATTTTGA-CCCCGTTGAAAA------------------------A--TGAACCC-A----------------AGG-G-TCA---TTTTCAAT-GTT---GAAAATT--GAC----TCG-GGTCA----C--A-----TT-T-CAA----C----ATTAAA
gi|162221 : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-CCCCGTTG-AAA------------------------A--TGAACCC-A----------------AGG-A-TCAT--TTTTCAAT-GTTGAAAA----T--GGA----CCCGGATCA----C--A-----TT-T-CAA----C----ATTAAA
gi|162222 : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-CCCTGTTGAACA------------------------T--TGACCC--------------------GG-G-TCAC--TTTTCAGC--------A----TTAAAGTC--T---GATCAAAA-C--AG----T-----------C----GTTGAAAACTGATC-
gi|162223 : CCGGTGTAACATTAAATTTTGA-CCCCGTTGAAAA------------------------A--TGACCCC-A----------------
gi|162224 : CCGGTGTTACATTAAATTTTGA-CCCCGTTGAAAA------------------------AACGGACCCA-A----------------TGG-
gi|162225 : CCGGTGTAACATTAAAAGTTGA-CCC---TGAAAAC-----------------------AATTGA---C-A----------------CGG-G-TCACAATTCTTATC-A-----AA----A--CAG----T---------------------------------C----ATTGAAAACTGACC-taaattgacccgagtcacattttaacattaaa
gi|162226 : GTGTAACATTAAATTTTGA-CCCCGTTGAAAA------------------------A--TGACCCT-AAGGTTCAAAATTGACCTAG-G-TCAC--ATTTCAAC--------A----T--TAAATTCT---GATC-----A--A-----------AA----CAGTTGTTGAAAACTGATC-
gi|162227 : GTAACATTAAACTTTGA-CACCGTTGAAAA------------------------A--TGACCCC-A----------------TAG-G-TCAC--TTTTCAAC-G-----GA----T--AAG----T---GATA-----C--AT----TT-T-TAA----C----ATTGAAAACTGACC-CCGACCG--TT---ATT-T-AA----------TGACCCACCCACACGTGAAAA--------------------ATTGACCCTCGTTAAAATCTGATCACCAACAGTTGGAAACTGACCGAATAGTCGGCC
gi|162228 : ------------------------A--TGACCCC-A----------------TGGTG-T-AT--TTTTTAAC-A-----GA----C--AAG----T---GATC-----A--AT----TT-T-TAA----C----ATTGAAAACTGA-C-CCGACCG--TT--------------------------------------AAAA--------------------ATTGACCCTCGTAAAAAATTGATCACGAAAAGTCGG
gi|162229 : TGACC-CCGATGG--TT---ATT-T-AA----------TGACCCACCCACACGTGAAAA--------------------ATTGACCCTCGTTCAAATTTGATCACCAACAGTTGGAAACTGACCAAATGGTCAACCG
gi|162229 : --TGACCCCGA----------------TGG---TTAT--TT-------------AA----T--GAC----C---CACC-----C--AC-----------A----C----GTGAAAAATTGACC-CT---CG--TTCAAATT-T-GA----------T----CACCAACAGTTGGAAACTGACCAAATGGTCAACCGCATTGACCCTCGTTCAAATTTGATCACCAACAGTTGGAAACTGACCAAATGGTCAACCGcattgaccctcgttcaaatttgatcaccaacagttggaaactgaccaaatggtcaaccg
gi|162230 : --TTTTGAACCG-----GA----T--GTG----T---TATT-----T--AT----TT-T-TAA----T----ATTGAAAACTGACA-CCGACCG--TT---ATT-T-AT----------TGACCCACCCACACATGAAAAC-------------------ATTGACCTTTGTTAAAATCTGATCACCAACAGTTGATAACTGACCAAATAGTCGGCCG
gi|162231 : TGACC-CCGATGG--TT---ATT-T-AA----------TGACCCACCCACACGTGAAAA--------------------ATTGACCCTCGTTCAAATTTGATCACCAACAGTTGGAAACTGACCAAATGGTCAACCG
gi|162232 : TTGACCATCGTTAAACTCTGATTACTAACCGTTGGAAACTGACCGAATAGTCAGCCG