lowQualScore : 444444 1 1 1 1
lowQualScore : 77 555 888888 666666 555 2 6666 9999999 9 5 33 7 3 7 6 6 1 2222 11 0 1 1 1
lowQualScore : .. ... ...... ...... ... . .... ....... . . .. . . . . . . .... .. . . . .
lowQualScore : 99 000 222222 222222 000 9 1111 3333333 1 0 99 3 2 0 6 7 4 8888 88 5 3 4 5
consensus : TTTATT--TTT---T------ATCTTT------TTT---A-TTG----AAACTGTTACCGGTATTCA-------ACTAACACACTTGAAAAATATGTCAACTTAAAGCAACGACAAAATCACAATCTC--TCTCGCAATCCTGTGATGTAGAAGTATACATGTTGTGTTTGTATGAAAAGCGATATTATTATGCTGAGGTATCGGACATGTTGAAGTAGTTATTCTATTATATTGTCCTGTTTGATT-TTACAGGA----GGCA--CAATCCCA-ACTTTGCTA-GG-GGTGTCC
Reference ( gi|155185 ) : TTTATT--TTT---T------ATCTTTAA----TTT---A-TTG----AAACTGTTACCGGTATTCA-------ACTAACACACTTGGAAAATATGTCAACTTAAAGCAAAGACAAAATCACAATCTC--TTTCGCAATCCTGTGATGTAGACGTTTACATGTTGTGTCTGTATGAAAAGCGATATTATTATGCTGAGGTATCGGACATGTTGAAGCAGTTATTCTATTATATTGTCCTGTTTGATT-TTACAGGA----GGCA--CAATCACA-ACTTTGCTA-GG-GGTGTCC
gi|155186 : TTTATT--TTTATTC------ATTATTAA----TTTTTTA-TTG----AAACTGCTTCCGGTATTCA-------ACTAACACACTTGAAAAAGATGTCAACTCAAAGCAACGACACAATCACAATCTC--TGTCGTAATCCTGTGATGTAGAAGTATACATGTTGTGTTTGTATGAAAAGCGATATTATAATGCTGAGGTATCGGACATGTTGAAGTAGTTATTCTGTTATATTATCCTGTTTGATT-TTACAGGA----GGCA--CAATCCCA-ACTTTGCTA-GA-GGTGTTC
gi|155188 : TTTATT--TCT---T-------TTTTT------TTT---A-ATG----GAACTGTTACCGGTATTCA-------ATTGACACATTTGAAAACTATGTCAACTTAAAGCAACGACAAAATCACAATATC--TCTCTCAATCCTGTGATGTAGAAGTAAACGTGCTGTGTTTGTATGAAAAGTGATATTATTATGTCGAGGCATCGGACATGTTGAAGTAGTTATTTTATTCTATTGTCCTGTTTGATT-TTACAGGA----GGCA--CTATCACA-ACTTTGCTA-GG-GGTGGCC
gi|155189 : TTTATTCTTTT---T------ATCTTTT-----TTT---A-TTG----AAACTGATACTGGTATTCAGCTTGTCACTAACACACTTGAAAGATA---CTA-TTATGGCAACGACAAAATCACAATCCC--TCTCGCAATCCTGTGATGCAGAAGTATACATATTGTGTTTGTATGAAAAGCGATATTATTATGCTGGGGTATCGGACATGCTAAAGTAGTTCTTCGATTACATTTTCCTGTTTGATTGTTACAGGA----GGCA--CACTCACA-ACTTTGCTA-GG-GGTGTCC
gi|155192 : TTCGTT--TTT---A------ATCTTT-------TT---A-TTG----AAACTGTTACCGGTATTCA-------GCTAAAACACTTGAAAGATATGTCAACTTAAAGCGACGACAAAATCACAGTCTCTATCTCGCAATCCTGTGATGTAGAAGTATACATGTTGTGTTTGAATG-AAACCGATACTATTAGGCTGAAGTATCGGAAATGTTGAAGTAGTTATTCTAATAAAATGTCCTGTTTAATT-TTACACAATTTTTGCA--CAATCCAA-ACTTTGCTA-GG-GGTATCC
gi|155193 : tttaTTTATT--TTT---TTCATTCATTTCTAATTTTTTT---A-TTGAAAAAAACTGTTACCTGCTTTCA-------ACTAACTCCCTTGAAAAATATGACAACTTAAAGCGACGTCAAAATCACAATCTC--TCTCGTAATCCTGTGATGTTGAAGAATACAT-TTGTGTTTGTATGAATCACGGTATTATTATGCTGACGTATCGGTCATGTTGAAGTATTTATTCTTTTATATGGTCCTGTTTGATT-TTACAGGA----GGCA--CAGTCCCA-ACTTTGCTA-GG-GGTGTCC
gi|155198 : TTTATTCATCT---T------GTTTTT--------T---A-TTG----AAACTGTTACCGGTATTCA-------ACTGAAACACTTT--ATATGTGTCAAC----------GAAAAAATCACAATATC--TCTCGCAATCCTGTGATGTAGAAGTATACATGCTGTGTTTGTATGAAAAGCGATATTATCATGCTGAGGTATCGGACATGTTGAAGTAGTTAT
gi|155194 : tTTTTTT--TTT---T------AATCTTAT----TTT---A-TTG----AAACTGTTACCGGTATTCA-------ACTAACACACTTGAAAAATATGTCAACTTAAAGCAACGACAAAATCACAATCTC--TCT
gi|155196 : TTCTT--TTT---T------ATATTT------TTT---A-TTG----AAACTGTTACCGGTATTCA-------ACTAACACAC---------ATGTCAACTTAAAGCAACGACAAAATCACAAGCTC--TCTCGCAATCCTGTGATGTAGAAGTATACATGTTGTGTTTGTATG-AAAGCAATATTATTATGCTGAGGTAACTGACATG
gi|155195 : ttaTT--TTT---T------ATCTTT---------------T------AACTATTACCGGTACTCA-------ACTAACACTCGTGAAAAGTATGTCAACTTCAAGCAACGACAAAATCACAATCTT--GCTCGTAATCCTGTGTTGTAGAAGTATACATGTTGTGTTTGTATGAAAAGCGATATTATTATGCTGAGGTTTCGGACATGTTGAAGTAGTTATT-TATTAAATTGTCCTGTTTGATT-TTACAGGA----GGCA--CATTCACA-ACTTTGCTA-GG-GGTGTCC
gi|155190 : ttattTT--TTT---T------ATCTTTT-----TTT---A-TTG----AAACTGTTAACGGTATTCT-------ACTAACACCGTTGAAAAATATACCAACTTAAAGCAACGACAATATCACAATCTC--TCTCGCAATCCTGCGATGTAGAAGTATACATGTTGTGTTCGTACGGAATGCGATGTTACTATGCTGAGGTATCGGACATGTTAAAGAAGTTATTCTATTATATTATGCTGTTTTATT-TTACGGGA----GGAA--CAATCACA-ACTTTGGTA-GG-GGTGTCC
gi|155191 : tttattctTT--TTT---T------ATCTTTT-----TTT---A-TTG----AAAATGTTACCGATATTCA-------ACTGACACACTTGAAACATACGTCAACTTAAAGCAACGACAAAATCACAATATC--TCTCGCAATCCTGTGATGTAGAAGTATGCATGC---GTTTGTATAATAAGCGATATTGTTATGCTGAGGTATCGGACATACTGATGTAGTTATTCTATTATATTGTCCTGTTTGATT-TCACAGGA----GGAA--CACTCACA-ATTTTGCTA-TG-GATGTC
gi|155199 : tttaaacttTT--TTT---T------ATCTTTTT----TTT-----TTG----AAACTGTTACCGGTGTTCA-------ACTAACACACTTGAAAAATATGTCAACTTAAAGCAACGACACAATCACAATC--------------CTGTGATGTAGGAGTATACATGTTGTGTTTTTATGAAAAGCGATATCATTATGCTGA-----------TGTTGAATTAGTTATTCTAATATATCTTCCTGTTTGATT-TTACAGGA----GGCA--CAATTAAA-ACTTTGCTA-GG-GGTGTCC
gi|155197 : ttTT--TTT---T------ATCTTT------TTT---AATTG----AAACTGTTACCTGTACTCA-------ACTAAAACACTTGAAAAATATGTGATCTTAAAGCAACGACAAAATCACAATCTT--TCACGCAATGCTGTCATGAAGAAGTATGTATGTTGTATTTGTATGAAAAGTGGTGTTATTATGCTGATGTTTCGGACATGTTTAAGTAGTTATTCTATTATATTATCCTGT
gi|155187 : att--TTT---T------ATTTTT------TTT---A-TTG----AGACTGGTACCTGTATTCA-------ACTAACACACTTCAAAAATATGTCAACTTAAAGCAACGACAAAATCACAATCTC--CCTCACAATCCTGTGATGAAGACTTATACATGTTGTGTTTGTATGAAAAGCGATATTATTATGCTGAGGTATCGGACATGTTGACGTAGTTATTCTATTACATTGCCCTATTTGATT-TTACAGGA----GGCA--TAATC-CATACTTTGCTA-GA-GGTGTCC
gi|155200 : tttaatctaCAATCCTGTGATGTAGAAGTATACATGTTGTGTATGTATGAAAAGCGATATTATCATACTGAGGTATCGGACAAGTTGAAGTAGTTATTCTGTTATATTGTCCTGTTTGATT-TT---------------------ACA-ACTTTGCTA-TG-GGTATCC
gi|155201 : TGTTTGATT-TTACAGGA----GGCA--GGGTCCCA-ACTTTGCTA-GA-GGTGTC
gi|155202 : GTTTGATT-TTACAGGA----GGCA--CAATCCTA-ACTTTGCTA-GG-GGTGTCC
gi|155203 : GTTTGATT-TTCCAGGA----GGCA--CAATCTCA-ACTTTGCTA-GG-GGTTTCC
gi|155204 : GTTTGATT-TTATAGGA----GGCA--CAATCCCG-ACTTTGCTA-GG-GGTGT
gi|155205 : GTTTGATT-TTACAGGT----GGCA--CAATCCCA-ACCTTGCTA-GG-
gi|155206 : GTTTGGTT-TTACAGGA----GGCA--CAATCCCA-ACTTTGC
gi|155207 : GTTTGAAT-TTACAGGA----GGCA--CAATCCCA-ATATTGCTA-GG-
gi|155208 : GTTTGATT-TTACAGGA----GGCA--CAATATCA-ACATTGCTACGGTGGTATC
gi|155209 : GTTTGATT-TTACAGGA----AGCA--CAATCCCA-TCTTTGCTA-
gi|155210 : GTTTGGTT-TTACAGGA----GGCA--CAATACCA-ACTTTGATA-GG-
gi|155211 : GTTTAATT-TTACATGA----GGCA--CAATCCCA-ACTTTGATA--T-GGTGT
gi|155213 : GTTTGATT-TTACAGGA----GGCAGTCAAACCAA-ACCATGCTA-GA-GGTGCCC
gi|155212 : GTTTGATT-TTACAGGA----GGCA--CACTCTTA-ACTACGCTT-AG-GGTATC
gi|155214 : GTTTGATT-TTACAGGG----GGCA--GAATCCAA-ACCTTGCTA-TG-GG
gi|155215 : TTTGATT-TTACAGGA----GGCA--CAAT------CTTTGCTA-GG-GGTGTCC
gi|155216 : TTTGATT-TTATAAGA----GGCA--CAATCCCA-AAATTGCTA-GG-GG
gi|155217 : TTTGGTT-TTATAGGA----GGCA--CAATCCCA-ACTTTGTT
gi|155218 : TTTAATT-TTATAGGA----GGCA--CATTCTCA-ACCTTGCTA-GC-GG
gi|155219 : TACATGA----GGCA--CAATCCCA-ACTTTGCTA-GG-AGTGTCC
Alignments
lowQualScore : 33 2 33 2 33 5 2 2 2 5555 8888888 2 33 1 2222 11 1 1
lowQualScore : .. . .. . .. . . . . .... ....... . .. . .... .. . .
lowQualScore : 77 7 77 7 77 3 7 7 7 7777 7777777 7 77 3 7777 88 4 4
consensus : TTTATT--TTTTA-TC--TT-T--T-TT-A-TT-GAAA----CTGTTACCGGTATTCA-------ACTAACACACTTGAAAAATATGTCAACTTAAAG-CAACGACAAAATCACAATCTC--TCTCGCAATCCTGTGATGTAGAAGTATACATGTTGTGTTTGTATGAAAAGCGATATTATTATGCTGAGGTATCGGACATGTTGAAGTAGTTATTCTATTATATTGTCCTGTTTGATT-TTACAGGA----GGCA--CAATCCCAACTTTGCTA-GG-GGTGTCC
Reference ( family-591 ) : TTTATT--TTTTA-TC--TT-T--T-TT-A-TT-GAAA----CTGTTACCGGTATTCA-------ACTAACACACTTGAAAAATATGTCAACTTAAAG-CAACGACAAAATCACAATCTC--TCTCGCAATCCTGTGATGTAGAAGTATACATGTTGTGTTTGTATGAAAAGCGATATTATTATGCTGAGGTATCGGACATGTTGAAGTAGTTATTCTATTATATTGTCCTGTTTGATT-TTACAGGA----GGCA--CAATCCCAACTTTGCTA-GG-GGTGTCC
gi|155185 : TTTATT--TTTTA-TC--TT-TAAT-TT-A-TT-GAAA----CTGTTACCGGTATTCA-------ACTAACACACTTGGAAAATATGTCAACTTAAAG-CAAAGACAAAATCACAATCTC--TTTCGCAATCCTGTGATGTAGACGTTTACATGTTGTGTCTGTATGAAAAGCGATATTATTATGCTGAGGTATCGGACATGTTGAAGCAGTTATTCTATTATATTGTCCTGTTTGATT-TTACAGGA----GGCA--CAATCACAACTTTGCTA-GG-GGTGTCC
gi|155186 : TTTATT--CATTA-TTAATT-T--T-TT-A-TT-GAAA----CTGCTTCCGGTATTCA-------ACTAACACACTTGAAAAAGATGTCAACTCAAAG-CAACGACACAATCACAATCTC--TGTCGTAATCCTGTGATGTAGAAGTATACATGTTGTGTTTGTATGAAAAGCGATATTATAATGCTGAGGTATCGGACATGTTGAAGTAGTTATTCTGTTATATTATCCTGTTTGATT-TTACAGGA----GGCA--CAATCCCAACTTTGCTA-GA-GGTGTTC
gi|155187 : tttatt--TTTTA-TT--TT-T--T-TT-A-TT-GAGA----CTGGTACCTGTATTCA-------ACTAACACACTTCAAAAATATGTCAACTTAAAG-CAACGACAAAATCACAATCTC--CCTCACAATCCTGTGATGAAGACTTATACATGTTGTGTTTGTATGAAAAGCGATATTATTATGCTGAGGTATCGGACATGTTGACGTAGTTATTCTATTACATTGCCCTATTTGATT-TTACAGGA----GGCA--TAATCCATACTTTGCTA-GA-GGTGTCC
gi|155188 : tttaatctaTTTATT--TCTT--TT--TT-T--T-TT-A-AT-GGAA----CTGTTACCGGTATTCA-------ATTGACACATTTGAAAACTATGTCAACTTAAAG-CAACGACAAAATCACAATATC--TCTCTCAATCCTGTGATGTAGAAGTAAACGTGCTGTGTTTGTATGAAAAGTGATATTATTATGTCGAGGCATCGGACATGTTGAAGTAGTTATTTTATTCTATTGTCCTGTTTGATT-TTACAGGA----GGCA--CTATCACAACTTTGCTA-GG-GGTGGCC
gi|155189 : TTTATTCTTTTTA-TC--TT-T--T-TTTA-TT-GAAA----CTGATACTGGTATTCAGCTTGTCACTAACACACTTGAAAGATA---CTA-TTATGG-CAACGACAAAATCACAATCCC--TCTCGCAATCCTGTGATGCAGAAGTATACATATTGTGTTTGTATGAAAAGCGATATTATTATGCTGGGGTATCGGACATGCTAAAGTAGTTCTTCGATTACATTTTCCTGTTTGATTGTTACAGGA----GGCA--CACTCACAACTTTGCTA-GG-GGTGTCC
gi|155190 : TT--TTTTA-TC--TT-T--TTTT-A-TT-GAAA----CTGTTAACGGTATTCT-------ACTAACACCGTTGAAAAATATACCAACTTAAAG-CAACGACAATATCACAATCTC--TCTCGCAATCCTGCGATGTAGAAGTATACATGTTGTGTTCGTACGGAATGCGATGTTACTATGCTGAGGTATCGGACATGTTAAAGAAGTTATTCTATTATATTATGCTGTTTTATT-TTACGGGA----GGAA--CAATCACAACTTTGGTA-GG-GGTGTCC
gi|155191 : tttattctTT--TTTTA-TC--TT-T--TTTT-A-TT-GAAA----ATGTTACCGATATTCA-------ACTGACACACTTGAAACATACGTCAACTTAAAG-CAACGACAAAATCACAATATC--TCTCGCAATCCTGTGATGTAGAAGTATGCA---TGCGTTTGTATAATAAGCGATATTGTTATGCTGAGGTATCGGACATACTGATGTAGTTATTCTATTATATTGTCCTGTTTGATT-TCACAGGA----GGAA--CACTCACAATTTTGCTA-TG-GATGTC
gi|155192 : tttaaacttTTCGTT--TTTAA-TC--TT-T--T--T-A-TT-GAAA----CTGTTACCGGTATTCA-------GCTAAAACACTTGAAAGATATGTCAACTTAAAG-CGACGACAAAATCACAGTCTCTATCTCGCAATCCTGTGATGTAGAAGTATACATGTTGTGTTTGAATG-AAACCGATACTATTAGGCTGAAGTATCGGAAATGTTGAAGTAGTTATTCTAATAAAATGTCCTGTTTAATT-TTACACAATTTTTGCA--CAATCCAAACTTTGCTA-GG-GGTATCC
gi|155193 : tttaTTCATT--TCTAA-T---TT-T--T-TT-A-TT-GAAAAAAACTGTTACCTGCTTTCA-------ACTAACTCCCTTGAAAAATATGACAACTTAAAG-CGACGTCAAAATCACAATCTC--TCTCGTAATCCTGTGATGTTGAAGAATACAT-TTGTGTTTGTATGAATCACGGTATTATTATGCTGACGTATCGGTCATGTTGAAGTATTTATTCTTTTATATGGTCCTGTTTGATT-TTACAGGA----GGCA--CAGTCCCAACTTTGCTA-GG-GGTGTCC
gi|155194 : tttatttttttcaTTTTTT--TTTTAATC--TTAT--T-TT-A-TT-GAAA----CTGTTACCGGTATTCA-------ACTAACACACTTGAAAAATATGTCAACTTAAAG-CAACGACAAAATCACAATCTC--TCT
gi|155195 : TT--TTTTA-TC--TT-T--T-----------AA----CTATTACCGGTACTCA-------ACTAACACTCGTGAAAAGTATGTCAACTTCAAG-CAACGACAAAATCACAATCTT--GCTCGTAATCCTGTGTTGTAGAAGTATACATGTTGTGTTTGTATGAAAAGCGATATTATTATGCTGAGGTTTCGGACATGTTGAAGTAGTTATT-TATTAAATTGTCCTGTTTGATT-TTACAGGA----GGCA--CATTCACAACTTTGCTA-GG-GGTGTCC
gi|155196 : ttattTTCTT--TTTTA-TA--TT-T--T-TT-A-TT-GAAA----CTGTTACCGGTATTCA-------ACTAACACAC---------ATGTCAACTTAAAG-CAACGACAAAATCACAAGCTC--TCTCGCAATCCTGTGATGTAGAAGTATACATGTTGTGTTTGTATG-AAAGCAATATTATTATGCTGAGGTAACTGACATG
gi|155197 : ttaTT--TTTTA-TC--TT-T--T-TT-AATT-GAAA----CTGTTACCTGTACTCA-------ACTAAAACACTTGAAAAATATGTGATCTTAAAG-CAACGACAAAATCACAATCTT--TCACGCAATGCTGTCATGAAGAAGTATGTATGTTGTATTTGTATGAAAAGTGGTGTTATTATGCTGATGTTTCGGACATGTTTAAGTAGTTATTCTATTATATTATCCTGT
gi|155198 : attTTTATT--CATCT-TG--TT-T--T-TT-A-TT-GAAA----CTGTTACCGGTATTCA-------ACTGAAACACTTT----ATATGT---------GTCAACGAAAAAATCACAATATC--TCTCGCAATCCTGTGATGTAGAAGTATACATGCTGTGTTTGTATGAAAAGCGATATTATCATGCTGAGGTATCGGACATGTTGAAGTAGTTAT
gi|155199 : tTT--TTTTA-TC--TT-T--T-TT-T-TTTGAAA----CTGTTACCGGTGTTCA-------ACTAACACACTTGAAAAATATGTCAACTTAAAG-CAACGACACAATCACAATC--------------CTGTGATGTAGGAGTATACATGTTGTGTTTTTATGAAAAGCGATATCATTATGCTGA-----------TGTTGAATTAGTTATTCTAATATATCTTCCTGTTTGATT-TTACAGGA----GGCA--CAATTAAAACTTTGCTA-GG-GGTGTCC
gi|155200 : ttCAATCCTGTGATGTAGAAGTATACATGTTGTGTATGTATGAAAAGCGATATTATCATACTGAGGTATCGGACAAGTTGAAGTAGTTATTCTGTTATATTGTCCTGTTTGATT-TTA---------------------CAACTTTGCTA-TG-GGTATCC
gi|155201 : TGTTTGATT-TTACAGGA----GGCA--GGGTCCCAACTTTGCTA-GA-GGTGTC
gi|155202 : GTTTGATT-TTACAGGA----GGCA--CAATCCTAACTTTGCTA-GG-GGTGTCC
gi|155203 : GTTTGATT-TTCCAGGA----GGCA--CAATCTCAACTTTGCTA-GG-GGTTTCC
gi|155204 : GTTTGATT-TTATAGGA----GGCA--CAATCCCGACTTTGCTA-GG-GGTGT
gi|155205 : GTTTGATT-TTACAGGT----GGCA--CAATCCCAACCTTGCTA-GG-
gi|155206 : GTTTGGTT-TTACAGGA----GGCA--CAATCCCAACTTTGC
gi|155207 : GTTTGAAT-TTACAGGA----GGCA--CAATCCCAATATTGCTA-GG-
gi|155208 : GTTTGATT-TTACAGGA----GGCA--CAATATCAACATTGCTACGGTGGTATC
gi|155209 : GTTTGATT-TTACAGGA----AGCA--CAATCCCATCTTTGCTA-
gi|155210 : GTTTGGTT-TTACAGGA----GGCA--CAATACCAACTTTGATA-GG-
gi|155211 : GTTTAATT-TTACATGA----GGCA--CAATCCCAACTTTGATA--T-GGTGT
gi|155212 : GTTTGATT-TTACAGGA----GGCA--CACTCTTAACTACGCTT-AG-GGTATC
gi|155213 : GTTTGATT-TTACAGGA----GGCAGTCAAACCAAACCATGCTA-GA-GGTGCCC
gi|155214 : GTTTGATT-TTACAGGG----GGCA--GAATCCAAACCTTGCTA-TG-GG
gi|155215 : TTTGATT-TTACAGGA----GGCA--CAAT-----CTTTGCTA-GG-GGTGTCC
gi|155216 : TTTGATT-TTATAAGA----GGCA--CAATCCCAAAATTGCTA-GG-GG
gi|155217 : TTTGGTT-TTATAGGA----GGCA--CAATCCCAACTTTGTT
gi|155218 : TTTAATT-TTATAGGA----GGCA--CATTCTCAACCTTGCTA-GC-GG
gi|155219 : TACATGA----GGCA--CAATCCCAACTTTGCTA-GG-AGTGTCC
Alignments
lowQualScore : 33 2 33 2 33 5 2 2 2 5555 8888888 2 33 1 2222 11 1 1
lowQualScore : .. . .. . .. . . . . .... ....... . .. . .... .. . .
lowQualScore : 77 7 77 7 77 3 7 7 7 7777 7777777 7 77 3 7777 88 4 4
consensus : TTTATT--TTTTA-TC--TT-T--T-TT-A-TT-GAAA----CTGTTACCGGTATTCA-------ACTAACACACTTGAAAAATATGTCAACTTAAAG-CAACGACAAAATCACAATCTC--TCTCGCAATCCTGTGATGTAGAAGTATACATGTTGTGTTTGTATGAAAAGCGATATTATTATGCTGAGGTATCGGACATGTTGAAGTAGTTATTCTATTATATTGTCCTGTTTGATT-TTACAGGA----GGCA--CAATCCCAACTTTGCTA-GG-GGTGTCC
Reference ( family-591 ) : TTTATT--TTTTA-TC--TT-T--T-TT-A-TT-GAAA----CTGTTACCGGTATTCA-------ACTAACACACTTGAAAAATATGTCAACTTAAAG-CAACGACAAAATCACAATCTC--TCTCGCAATCCTGTGATGTAGAAGTATACATGTTGTGTTTGTATGAAAAGCGATATTATTATGCTGAGGTATCGGACATGTTGAAGTAGTTATTCTATTATATTGTCCTGTTTGATT-TTACAGGA----GGCA--CAATCCCAACTTTGCTA-GG-GGTGTCC
gi|155185 : TTTATT--TTTTA-TC--TT-TAAT-TT-A-TT-GAAA----CTGTTACCGGTATTCA-------ACTAACACACTTGGAAAATATGTCAACTTAAAG-CAAAGACAAAATCACAATCTC--TTTCGCAATCCTGTGATGTAGACGTTTACATGTTGTGTCTGTATGAAAAGCGATATTATTATGCTGAGGTATCGGACATGTTGAAGCAGTTATTCTATTATATTGTCCTGTTTGATT-TTACAGGA----GGCA--CAATCACAACTTTGCTA-GG-GGTGTCC
gi|155186 : TTTATT--CATTA-TTAATT-T--T-TT-A-TT-GAAA----CTGCTTCCGGTATTCA-------ACTAACACACTTGAAAAAGATGTCAACTCAAAG-CAACGACACAATCACAATCTC--TGTCGTAATCCTGTGATGTAGAAGTATACATGTTGTGTTTGTATGAAAAGCGATATTATAATGCTGAGGTATCGGACATGTTGAAGTAGTTATTCTGTTATATTATCCTGTTTGATT-TTACAGGA----GGCA--CAATCCCAACTTTGCTA-GA-GGTGTTC
gi|155187 : tttatt--TTTTA-TT--TT-T--T-TT-A-TT-GAGA----CTGGTACCTGTATTCA-------ACTAACACACTTCAAAAATATGTCAACTTAAAG-CAACGACAAAATCACAATCTC--CCTCACAATCCTGTGATGAAGACTTATACATGTTGTGTTTGTATGAAAAGCGATATTATTATGCTGAGGTATCGGACATGTTGACGTAGTTATTCTATTACATTGCCCTATTTGATT-TTACAGGA----GGCA--TAATCCATACTTTGCTA-GA-GGTGTCC
gi|155188 : tttaatctaTTTATT--TCTT--TT--TT-T--T-TT-A-AT-GGAA----CTGTTACCGGTATTCA-------ATTGACACATTTGAAAACTATGTCAACTTAAAG-CAACGACAAAATCACAATATC--TCTCTCAATCCTGTGATGTAGAAGTAAACGTGCTGTGTTTGTATGAAAAGTGATATTATTATGTCGAGGCATCGGACATGTTGAAGTAGTTATTTTATTCTATTGTCCTGTTTGATT-TTACAGGA----GGCA--CTATCACAACTTTGCTA-GG-GGTGGCC
gi|155189 : TTTATTCTTTTTA-TC--TT-T--T-TTTA-TT-GAAA----CTGATACTGGTATTCAGCTTGTCACTAACACACTTGAAAGATA---CTA-TTATGG-CAACGACAAAATCACAATCCC--TCTCGCAATCCTGTGATGCAGAAGTATACATATTGTGTTTGTATGAAAAGCGATATTATTATGCTGGGGTATCGGACATGCTAAAGTAGTTCTTCGATTACATTTTCCTGTTTGATTGTTACAGGA----GGCA--CACTCACAACTTTGCTA-GG-GGTGTCC
gi|155190 : TT--TTTTA-TC--TT-T--TTTT-A-TT-GAAA----CTGTTAACGGTATTCT-------ACTAACACCGTTGAAAAATATACCAACTTAAAG-CAACGACAATATCACAATCTC--TCTCGCAATCCTGCGATGTAGAAGTATACATGTTGTGTTCGTACGGAATGCGATGTTACTATGCTGAGGTATCGGACATGTTAAAGAAGTTATTCTATTATATTATGCTGTTTTATT-TTACGGGA----GGAA--CAATCACAACTTTGGTA-GG-GGTGTCC
gi|155191 : tttattctTT--TTTTA-TC--TT-T--TTTT-A-TT-GAAA----ATGTTACCGATATTCA-------ACTGACACACTTGAAACATACGTCAACTTAAAG-CAACGACAAAATCACAATATC--TCTCGCAATCCTGTGATGTAGAAGTATGCA---TGCGTTTGTATAATAAGCGATATTGTTATGCTGAGGTATCGGACATACTGATGTAGTTATTCTATTATATTGTCCTGTTTGATT-TCACAGGA----GGAA--CACTCACAATTTTGCTA-TG-GATGTC
gi|155192 : tttaaacttTTCGTT--TTTAA-TC--TT-T--T--T-A-TT-GAAA----CTGTTACCGGTATTCA-------GCTAAAACACTTGAAAGATATGTCAACTTAAAG-CGACGACAAAATCACAGTCTCTATCTCGCAATCCTGTGATGTAGAAGTATACATGTTGTGTTTGAATG-AAACCGATACTATTAGGCTGAAGTATCGGAAATGTTGAAGTAGTTATTCTAATAAAATGTCCTGTTTAATT-TTACACAATTTTTGCA--CAATCCAAACTTTGCTA-GG-GGTATCC
gi|155193 : tttaTTCATT--TCTAA-T---TT-T--T-TT-A-TT-GAAAAAAACTGTTACCTGCTTTCA-------ACTAACTCCCTTGAAAAATATGACAACTTAAAG-CGACGTCAAAATCACAATCTC--TCTCGTAATCCTGTGATGTTGAAGAATACAT-TTGTGTTTGTATGAATCACGGTATTATTATGCTGACGTATCGGTCATGTTGAAGTATTTATTCTTTTATATGGTCCTGTTTGATT-TTACAGGA----GGCA--CAGTCCCAACTTTGCTA-GG-GGTGTCC
gi|155194 : tttatttttttcaTTTTTT--TTTTAATC--TTAT--T-TT-A-TT-GAAA----CTGTTACCGGTATTCA-------ACTAACACACTTGAAAAATATGTCAACTTAAAG-CAACGACAAAATCACAATCTC--TCT
gi|155195 : TT--TTTTA-TC--TT-T--T-----------AA----CTATTACCGGTACTCA-------ACTAACACTCGTGAAAAGTATGTCAACTTCAAG-CAACGACAAAATCACAATCTT--GCTCGTAATCCTGTGTTGTAGAAGTATACATGTTGTGTTTGTATGAAAAGCGATATTATTATGCTGAGGTTTCGGACATGTTGAAGTAGTTATT-TATTAAATTGTCCTGTTTGATT-TTACAGGA----GGCA--CATTCACAACTTTGCTA-GG-GGTGTCC
gi|155196 : ttattTTCTT--TTTTA-TA--TT-T--T-TT-A-TT-GAAA----CTGTTACCGGTATTCA-------ACTAACACAC---------ATGTCAACTTAAAG-CAACGACAAAATCACAAGCTC--TCTCGCAATCCTGTGATGTAGAAGTATACATGTTGTGTTTGTATG-AAAGCAATATTATTATGCTGAGGTAACTGACATG
gi|155197 : ttaTT--TTTTA-TC--TT-T--T-TT-AATT-GAAA----CTGTTACCTGTACTCA-------ACTAAAACACTTGAAAAATATGTGATCTTAAAG-CAACGACAAAATCACAATCTT--TCACGCAATGCTGTCATGAAGAAGTATGTATGTTGTATTTGTATGAAAAGTGGTGTTATTATGCTGATGTTTCGGACATGTTTAAGTAGTTATTCTATTATATTATCCTGT
gi|155198 : attTTTATT--CATCT-TG--TT-T--T-TT-A-TT-GAAA----CTGTTACCGGTATTCA-------ACTGAAACACTTT----ATATGT---------GTCAACGAAAAAATCACAATATC--TCTCGCAATCCTGTGATGTAGAAGTATACATGCTGTGTTTGTATGAAAAGCGATATTATCATGCTGAGGTATCGGACATGTTGAAGTAGTTAT
gi|155199 : tTT--TTTTA-TC--TT-T--T-TT-T-TTTGAAA----CTGTTACCGGTGTTCA-------ACTAACACACTTGAAAAATATGTCAACTTAAAG-CAACGACACAATCACAATC--------------CTGTGATGTAGGAGTATACATGTTGTGTTTTTATGAAAAGCGATATCATTATGCTGA-----------TGTTGAATTAGTTATTCTAATATATCTTCCTGTTTGATT-TTACAGGA----GGCA--CAATTAAAACTTTGCTA-GG-GGTGTCC
gi|155200 : ttCAATCCTGTGATGTAGAAGTATACATGTTGTGTATGTATGAAAAGCGATATTATCATACTGAGGTATCGGACAAGTTGAAGTAGTTATTCTGTTATATTGTCCTGTTTGATT-TTA---------------------CAACTTTGCTA-TG-GGTATCC
gi|155201 : TGTTTGATT-TTACAGGA----GGCA--GGGTCCCAACTTTGCTA-GA-GGTGTC
gi|155202 : GTTTGATT-TTACAGGA----GGCA--CAATCCTAACTTTGCTA-GG-GGTGTCC
gi|155203 : GTTTGATT-TTCCAGGA----GGCA--CAATCTCAACTTTGCTA-GG-GGTTTCC
gi|155204 : GTTTGATT-TTATAGGA----GGCA--CAATCCCGACTTTGCTA-GG-GGTGT
gi|155205 : GTTTGATT-TTACAGGT----GGCA--CAATCCCAACCTTGCTA-GG-
gi|155206 : GTTTGGTT-TTACAGGA----GGCA--CAATCCCAACTTTGC
gi|155207 : GTTTGAAT-TTACAGGA----GGCA--CAATCCCAATATTGCTA-GG-
gi|155208 : GTTTGATT-TTACAGGA----GGCA--CAATATCAACATTGCTACGGTGGTATC
gi|155209 : GTTTGATT-TTACAGGA----AGCA--CAATCCCATCTTTGCTA-
gi|155210 : GTTTGGTT-TTACAGGA----GGCA--CAATACCAACTTTGATA-GG-
gi|155211 : GTTTAATT-TTACATGA----GGCA--CAATCCCAACTTTGATA--T-GGTGT
gi|155212 : GTTTGATT-TTACAGGA----GGCA--CACTCTTAACTACGCTT-AG-GGTATC
gi|155213 : GTTTGATT-TTACAGGA----GGCAGTCAAACCAAACCATGCTA-GA-GGTGCCC
gi|155214 : GTTTGATT-TTACAGGG----GGCA--GAATCCAAACCTTGCTA-TG-GG
gi|155215 : TTTGATT-TTACAGGA----GGCA--CAAT-----CTTTGCTA-GG-GGTGTCC
gi|155216 : TTTGATT-TTATAAGA----GGCA--CAATCCCAAAATTGCTA-GG-GG
gi|155217 : TTTGGTT-TTATAGGA----GGCA--CAATCCCAACTTTGTT
gi|155218 : TTTAATT-TTATAGGA----GGCA--CATTCTCAACCTTGCTA-GC-GG
gi|155219 : TACATGA----GGCA--CAATCCCAACTTTGCTA-GG-AGTGTCC
blockSeqs : CT A AA A . T T A T AAAA GCTTGTC T TA G TTTT GT C T
blockSeqs : . . . . . T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . .
blockSeqCons : **
originalCons : TTTATT--TTTTA-TC--TT-T--T-TT-A-TT-GAAA----CTGTTACCGGTATTCA-------ACTAACACACTTGAAAAATATGTCAACTTAAAG-CAACGACAAAATCACAATCTC--TCTCGCAATCCTGTGATGTAGAAGTATACATGTTGTGTTTGTATGAAAAGCGATATTATTATGCTGAGGTATCGGACATGTTGAAGTAGTTATTCTATTATATTGTCCTGTTTGATT-TTACAGGA----GGCA--CAATCCCAACTTTGCTA-GG-GGTGTCC
finalCons : TTTATT--TTTTA-TC--TT-T--T-TT-A-TT-GAAA----CTGTTACCGGTATTCA-------ACTAACACACTTGAAAAATATGTCAACTTAAAG-CAACGACAAAATCACAATCTC--TCTCGCAATCCTGTGATGTAGAAGTATACATGTTGTGTTTGTATGAAAAGCGATATTATTATGCTGAGGTATCGGACATGTTGAAGTAGTTATTCTATTATATTGTCCTGTTTGATT-TTACAGGA----GGCA--CAATCCCAACTTTGCTA-GG-GGTGTCC
Alignments
lowQualScore : 33 2 33 2 33 5 2 2 2 5555 8888888 2 33 1 2222 11 1 1
lowQualScore : .. . .. . .. . . . . .... ....... . .. . .... .. . .
lowQualScore : 77 7 77 7 77 3 7 7 7 7777 7777777 7 77 3 7777 88 4 4
consensus : TTTATT--TTTTA-TC--TT-T--T-TT-A-TT-GAAA----CTGTTACCGGTATTCA-------ACTAACACACTTGAAAAATATGTCAACTTAAAG-CAACGACAAAATCACAATCTC--TCTCGCAATCCTGTGATGTAGAAGTATACATGTTGTGTTTGTATGAAAAGCGATATTATTATGCTGAGGTATCGGACATGTTGAAGTAGTTATTCTATTATATTGTCCTGTTTGATT-TTACAGGA----GGCA--CAATCCCAACTTTGCTA-GG-GGTGTCC
Reference ( family-591 ) : TTTATT--TTTTA-TC--TT-T--T-TT-A-TT-GAAA----CTGTTACCGGTATTCA-------ACTAACACACTTGAAAAATATGTCAACTTAAAG-CAACGACAAAATCACAATCTC--TCTCGCAATCCTGTGATGTAGAAGTATACATGTTGTGTTTGTATGAAAAGCGATATTATTATGCTGAGGTATCGGACATGTTGAAGTAGTTATTCTATTATATTGTCCTGTTTGATT-TTACAGGA----GGCA--CAATCCCAACTTTGCTA-GG-GGTGTCC
gi|155185 : TTTATT--TTTTA-TC--TT-TAAT-TT-A-TT-GAAA----CTGTTACCGGTATTCA-------ACTAACACACTTGGAAAATATGTCAACTTAAAG-CAAAGACAAAATCACAATCTC--TTTCGCAATCCTGTGATGTAGACGTTTACATGTTGTGTCTGTATGAAAAGCGATATTATTATGCTGAGGTATCGGACATGTTGAAGCAGTTATTCTATTATATTGTCCTGTTTGATT-TTACAGGA----GGCA--CAATCACAACTTTGCTA-GG-GGTGTCC
gi|155186 : TTTATT--CATTA-TTAATT-T--T-TT-A-TT-GAAA----CTGCTTCCGGTATTCA-------ACTAACACACTTGAAAAAGATGTCAACTCAAAG-CAACGACACAATCACAATCTC--TGTCGTAATCCTGTGATGTAGAAGTATACATGTTGTGTTTGTATGAAAAGCGATATTATAATGCTGAGGTATCGGACATGTTGAAGTAGTTATTCTGTTATATTATCCTGTTTGATT-TTACAGGA----GGCA--CAATCCCAACTTTGCTA-GA-GGTGTTC
gi|155187 : tttatt--TTTTA-TT--TT-T--T-TT-A-TT-GAGA----CTGGTACCTGTATTCA-------ACTAACACACTTCAAAAATATGTCAACTTAAAG-CAACGACAAAATCACAATCTC--CCTCACAATCCTGTGATGAAGACTTATACATGTTGTGTTTGTATGAAAAGCGATATTATTATGCTGAGGTATCGGACATGTTGACGTAGTTATTCTATTACATTGCCCTATTTGATT-TTACAGGA----GGCA--TAATCCATACTTTGCTA-GA-GGTGTCC
gi|155188 : tttaatctaTTTATT--TCTT--TT--TT-T--T-TT-A-AT-GGAA----CTGTTACCGGTATTCA-------ATTGACACATTTGAAAACTATGTCAACTTAAAG-CAACGACAAAATCACAATATC--TCTCTCAATCCTGTGATGTAGAAGTAAACGTGCTGTGTTTGTATGAAAAGTGATATTATTATGTCGAGGCATCGGACATGTTGAAGTAGTTATTTTATTCTATTGTCCTGTTTGATT-TTACAGGA----GGCA--CTATCACAACTTTGCTA-GG-GGTGGCC
gi|155189 : TTTATTCTTTTTA-TC--TT-T--T-TTTA-TT-GAAA----CTGATACTGGTATTCAGCTTGTCACTAACACACTTGAAAGATA---CTA-TTATGG-CAACGACAAAATCACAATCCC--TCTCGCAATCCTGTGATGCAGAAGTATACATATTGTGTTTGTATGAAAAGCGATATTATTATGCTGGGGTATCGGACATGCTAAAGTAGTTCTTCGATTACATTTTCCTGTTTGATTGTTACAGGA----GGCA--CACTCACAACTTTGCTA-GG-GGTGTCC
gi|155190 : TT--TTTTA-TC--TT-T--TTTT-A-TT-GAAA----CTGTTAACGGTATTCT-------ACTAACACCGTTGAAAAATATACCAACTTAAAG-CAACGACAATATCACAATCTC--TCTCGCAATCCTGCGATGTAGAAGTATACATGTTGTGTTCGTACGGAATGCGATGTTACTATGCTGAGGTATCGGACATGTTAAAGAAGTTATTCTATTATATTATGCTGTTTTATT-TTACGGGA----GGAA--CAATCACAACTTTGGTA-GG-GGTGTCC
gi|155191 : tttattctTT--TTTTA-TC--TT-T--TTTT-A-TT-GAAA----ATGTTACCGATATTCA-------ACTGACACACTTGAAACATACGTCAACTTAAAG-CAACGACAAAATCACAATATC--TCTCGCAATCCTGTGATGTAGAAGTATGCA---TGCGTTTGTATAATAAGCGATATTGTTATGCTGAGGTATCGGACATACTGATGTAGTTATTCTATTATATTGTCCTGTTTGATT-TCACAGGA----GGAA--CACTCACAATTTTGCTA-TG-GATGTC
gi|155192 : tttaaacttTTCGTT--TTTAA-TC--TT-T--T--T-A-TT-GAAA----CTGTTACCGGTATTCA-------GCTAAAACACTTGAAAGATATGTCAACTTAAAG-CGACGACAAAATCACAGTCTCTATCTCGCAATCCTGTGATGTAGAAGTATACATGTTGTGTTTGAATG-AAACCGATACTATTAGGCTGAAGTATCGGAAATGTTGAAGTAGTTATTCTAATAAAATGTCCTGTTTAATT-TTACACAATTTTTGCA--CAATCCAAACTTTGCTA-GG-GGTATCC
gi|155193 : tttaTTCATT--TCTAA-T---TT-T--T-TT-A-TT-GAAAAAAACTGTTACCTGCTTTCA-------ACTAACTCCCTTGAAAAATATGACAACTTAAAG-CGACGTCAAAATCACAATCTC--TCTCGTAATCCTGTGATGTTGAAGAATACAT-TTGTGTTTGTATGAATCACGGTATTATTATGCTGACGTATCGGTCATGTTGAAGTATTTATTCTTTTATATGGTCCTGTTTGATT-TTACAGGA----GGCA--CAGTCCCAACTTTGCTA-GG-GGTGTCC
gi|155194 : tttatttttttcaTTTTTT--TTTTAATC--TTAT--T-TT-A-TT-GAAA----CTGTTACCGGTATTCA-------ACTAACACACTTGAAAAATATGTCAACTTAAAG-CAACGACAAAATCACAATCTC--TCT
gi|155195 : TT--TTTTA-TC--TT-T--T-----------AA----CTATTACCGGTACTCA-------ACTAACACTCGTGAAAAGTATGTCAACTTCAAG-CAACGACAAAATCACAATCTT--GCTCGTAATCCTGTGTTGTAGAAGTATACATGTTGTGTTTGTATGAAAAGCGATATTATTATGCTGAGGTTTCGGACATGTTGAAGTAGTTATT-TATTAAATTGTCCTGTTTGATT-TTACAGGA----GGCA--CATTCACAACTTTGCTA-GG-GGTGTCC
gi|155196 : ttattTTCTT--TTTTA-TA--TT-T--T-TT-A-TT-GAAA----CTGTTACCGGTATTCA-------ACTAACACAC---------ATGTCAACTTAAAG-CAACGACAAAATCACAAGCTC--TCTCGCAATCCTGTGATGTAGAAGTATACATGTTGTGTTTGTATG-AAAGCAATATTATTATGCTGAGGTAACTGACATG
gi|155197 : ttaTT--TTTTA-TC--TT-T--T-TT-AATT-GAAA----CTGTTACCTGTACTCA-------ACTAAAACACTTGAAAAATATGTGATCTTAAAG-CAACGACAAAATCACAATCTT--TCACGCAATGCTGTCATGAAGAAGTATGTATGTTGTATTTGTATGAAAAGTGGTGTTATTATGCTGATGTTTCGGACATGTTTAAGTAGTTATTCTATTATATTATCCTGT
gi|155198 : attTTTATT--CATCT-TG--TT-T--T-TT-A-TT-GAAA----CTGTTACCGGTATTCA-------ACTGAAACACTTT----ATATGT---------GTCAACGAAAAAATCACAATATC--TCTCGCAATCCTGTGATGTAGAAGTATACATGCTGTGTTTGTATGAAAAGCGATATTATCATGCTGAGGTATCGGACATGTTGAAGTAGTTAT
gi|155199 : tTT--TTTTA-TC--TT-T--T-TT-T-TTTGAAA----CTGTTACCGGTGTTCA-------ACTAACACACTTGAAAAATATGTCAACTTAAAG-CAACGACACAATCACAATC--------------CTGTGATGTAGGAGTATACATGTTGTGTTTTTATGAAAAGCGATATCATTATGCTGA-----------TGTTGAATTAGTTATTCTAATATATCTTCCTGTTTGATT-TTACAGGA----GGCA--CAATTAAAACTTTGCTA-GG-GGTGTCC
gi|155200 : ttCAATCCTGTGATGTAGAAGTATACATGTTGTGTATGTATGAAAAGCGATATTATCATACTGAGGTATCGGACAAGTTGAAGTAGTTATTCTGTTATATTGTCCTGTTTGATT-TTA---------------------CAACTTTGCTA-TG-GGTATCC
gi|155201 : TGTTTGATT-TTACAGGA----GGCA--GGGTCCCAACTTTGCTA-GA-GGTGTC
gi|155202 : GTTTGATT-TTACAGGA----GGCA--CAATCCTAACTTTGCTA-GG-GGTGTCC
gi|155203 : GTTTGATT-TTCCAGGA----GGCA--CAATCTCAACTTTGCTA-GG-GGTTTCC
gi|155204 : GTTTGATT-TTATAGGA----GGCA--CAATCCCGACTTTGCTA-GG-GGTGT
gi|155205 : GTTTGATT-TTACAGGT----GGCA--CAATCCCAACCTTGCTA-GG-
gi|155206 : GTTTGGTT-TTACAGGA----GGCA--CAATCCCAACTTTGC
gi|155207 : GTTTGAAT-TTACAGGA----GGCA--CAATCCCAATATTGCTA-GG-
gi|155208 : GTTTGATT-TTACAGGA----GGCA--CAATATCAACATTGCTACGGTGGTATC
gi|155209 : GTTTGATT-TTACAGGA----AGCA--CAATCCCATCTTTGCTA-
gi|155210 : GTTTGGTT-TTACAGGA----GGCA--CAATACCAACTTTGATA-GG-
gi|155211 : GTTTAATT-TTACATGA----GGCA--CAATCCCAACTTTGATA--T-GGTGT
gi|155212 : GTTTGATT-TTACAGGA----GGCA--CACTCTTAACTACGCTT-AG-GGTATC
gi|155213 : GTTTGATT-TTACAGGA----GGCAGTCAAACCAAACCATGCTA-GA-GGTGCCC
gi|155214 : GTTTGATT-TTACAGGG----GGCA--GAATCCAAACCTTGCTA-TG-GG
gi|155215 : TTTGATT-TTACAGGA----GGCA--CAAT-----CTTTGCTA-GG-GGTGTCC
gi|155216 : TTTGATT-TTATAAGA----GGCA--CAATCCCAAAATTGCTA-GG-GG
gi|155217 : TTTGGTT-TTATAGGA----GGCA--CAATCCCAACTTTGTT
gi|155218 : TTTAATT-TTATAGGA----GGCA--CATTCTCAACCTTGCTA-GC-GG
gi|155219 : TACATGA----GGCA--CAATCCCAACTTTGCTA-GG-AGTGTCC