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Reference ( gi|17136 ) : AAAAGTTCAAACAACTCGTGCAGACGTCCTACTT-GACACACAGTTAAAAGC---TCGC-CCTC-TAAATGTA-GC-C-----------------CAGAC---AC-C--CTACT---A-----G---CGGCTGGGAGTGCGCC--A-AAGAAC-CCA-----GG-----TGTT-CGCCAAGGGGGTGT-A---TTTGT----GTG--TG---------C--CG--AA--------A---------AG---GC-T--------CCCAA--GCG---TC-GCCG-G--TTCGCCCA--AA----AC--G-C-GCGAG-----AAAC------A---------GGCTA--G-C---C-------TTGC--A----A---AA---------GA-------------TAC--AAAA---------G-TT-AAACAAC---T--CAAACAGGCGTTCTG-TTTGACACACACTCAAAAGC
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Reference ( family-589 ) : AAAAGTTCAAACAACTCGTGCAGGCGTTCTACTT-GACACACAGTCAAAAGC---TTGC-CCTC-TAA------------------ATGTAGC-CCAGAC---AC-C--C-TACT---NGCGCCTGGGAGTGCGCC--A-AAGAACCC----A--AG--TGTT-CGCCAAGGGGGTGT-A---TTT---GT----GT-G--T-------G----CCGC---------GA---------A---------G----G---------C---------TGGCC-CAAGCGTC-GCCG-G--TTCGCCCA--AA----AC--GC-GCGAGAAAC--A---------GGCTA--G-C---C------TTGC--AA---A-----------ANACA-----------CAAAA---------G-TT-AAACAACTCGTGCAGGCGTTCTA-TTTGACACACAGTCAAAAGC
gi|17126 : AAAAGTT-AAACAACTCGTACAGGCGATCTGTTT-GACACACAATCAAAAGC---TTGC-CCTC-TAA------------------ATGTAGC-CCAGA----ACGA--C-TACTTTCGACGACTGGGAGTGTGTC--A-TAGAACCC----A--AG--TGTT-TGGCAAGGGGGTGT-A---TTT---GT----GA-G--C-------G----CCGCAAAGACCGGGA---------A---------G----G---------C---------TGGCC-CAGGCGTC-GCCT-G--TTT---------------------------AC--A---------ATCTATGG-C---C------CTGC--CT---A-----------ATAT------------CAAAA---------A-TTCAAACAACTCGTGGAGACGTCCTA-CTTGACACACAGTTAAAAGC
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