lowQualScore : 22222222222 1 11111111 333333333333 222222 1 111 1 2222 111111111 11 22 111 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444 1 11 222222222222 666666666666666666666666666666666666666666666 22222222222222222222 1 1111111111111111 1111111 22222222
lowQualScore : 55 44 1 3 0 3 00000000000 99999 7 0 22222222 888888888888 3 7777 44 444444 3 1 66 3 1 555 1 999999 1 4 3 4 3 5 3333 3 55 99 333 0 7 44 222 666666666 3 1 1 22 1 1 22 00 1 33 99 0 111 2 44 222 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1 88888888 3333 6 1 888888888 55 1 3 2222 555555555555 333 1 1 111111111111111111111111111111111111111111111 44444444 2222 11111111111111111111 11 11 11 8 33 11 1 9999999999999999 4 333 1111111 555 22 5 11111111 2 2
lowQualScore : .. .. . . . . ........... ..... . . ........ ............ . .... .. ...... . . .. . . ... . ...... . . . . . . .... . .. .. ... . . .. ... ......... . . . .. . . .. .. . .. .. . ... . .. ... ........................................................ . ........ .... . . ......... .. . . .... ............ ... . . ............................................. ........ .... .................... .. .. .. . .. .. . ................ . ... ....... ... .. . ........ . .
lowQualScore : 00 66 0 8 8 3 22222222222 66666 0 4 11111111 000000000000 3 1111 66 666666 3 4 55 3 8 111 8 666666 5 7 2 2 1 4 5555 1 55 22 777 7 0 33 666 333333333 0 5 5 00 5 5 11 44 5 55 66 4 111 9 11 444 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222 3 66666666 1111 8 5 222222222 22 2 3 7777 111111111111 555 2 2 000000000000000000000000000000000000000000000 55555555 7777 00000000000000000000 77 77 77 8 00 88 3 3333333333333333 1 555 3333333 555 99 0 11111111 4 7
consensus : ATGTACAT--GTA--TATGTATTGCTTCTNAATCACACGTGGTCGTTAACAGATCGCG-AC---G-A--A--ACCTGTGAAGN----TGCCTTTGGCAATGGATTATCAATGCTAT--------TAATAGCTATTTCAATAAA--------C---CA-TAT----ATT--ATGTCCCTTTTTCTTTTAAAATAA-ATAAACAAATTGAGTATTATGGT-GAAACTAAAAATGCGGAAAATATAACAACAGATAAAA------TATTTATTCATTTATATANTGACGNAATAAAAA-TA-TTT-T--TAT-CATTTAATA-ATAA---TCATGTTATGCAAATNTTTG---TAAC--A-C-GA-TAAAA-G-T-T--T-TA-TCTTAGGT--AT-ATAAA--A-TACCTC--GATA--T--AT-A--T-N-TG---T-C-----NAT-C--GTN------ACTT--N-ATATCG---C-GGCGGTTTGCCAGT-TAG----GC----GAATAGC-C---CCTTG-TTTATAA-ATCCTC----AT-T--NA--T---G--AGGTCAA-C-C----C----A--------NC--------C----G--------C--G--------GTT----G-T-A--T-------T-----CTTAC--AAT--T--GCTACAA--TCACCGGTCGTGGAGGATTGAGCG--CC-TTT-C-CT-GTC-T-----TCT-TACAT-A---T-TCTCATA---T--ACTT-CTGC----ACTGACTTTTAT-TTTCTT
Reference ( gi|90693 ) : ATGTACAT--GTA--TATGTATTGCTTCTCAATCACACGTGGTCGTTAACAGATCGCG-AT---G-A--A--ACCTGTGAAGA----TGCCTTTGGCTATGGATTATCAATGCTAT--------TAATAGCTATTTCAATAAA--------C---CA-TAT----ATT--ATGTCCCTTTTTCTTTTAAAATAA-ATAAACAAATTGAGTATTGTGGT-GAAACTAAAAATTTGGAAAATATAACAACAGATAAAA------TATTTATTCATTTATACAATGACGAAATAAAAA-TA-TTT-C--TAT-CATTTAATA-ATAA---TCATGGTATGCAAATGTTTG---TAAC--A-T-GA-TAAAA-G-T-T--T-TA-TCTTAGGT--AT-ATAAA--A-CATCTT--AATA--T--AT-A--T-T-TG---T-C-----TAT-C--GTA------ACTT--A-ATATCG---C-GGCGGTTTACCAGT-TAG----GT----GAATTGC-C---CCTTG-TTTATAA-ATCCCC----AT-C--CA--T---G--GGGTCAA-C-C----A----A--------AC--------T----A--------C--G--------GTT----G-T-A--T-------T-----CTTAC--AAT--T--GCT-TAA--TCACCGGTCGTGGAGGATTAAGCG--CC-TTT-C-CT-ATA-T-----TCT-TACAT-A---T-TCTCATA---T--ACTT-CTGC----GCTTACTTTTAT-TTTCTT
gi|90694 : ATGTACAG--GTA--CATGTATTGCTTCTCAATCACACGTGGTCGTTAACAGATCGCG-AT---G-A--A--ACCTGTGAAGA----TGCCTTTGGCAATGGATTATCAATGCTAT--------TGATAGCTATTTCAATAAA--------T---CA-TAT----ATT--ATGTCCCTTTTTCTTTTAAAATAA-ATAAACAAGTTGAGTATTATGGT-GACACTAAAAATGTGGAAAATATAACAACAGATAAAA------TATTTATTCATTTATATAATGACGAAATAAAAA-TATTTT-T--TAT-CATTCAATT-ATAA---GCGTGGTATGCAAATGTTTG---TAAC--A-T-GA-TAAAA-G-T-T--T-TA-TCTTAGGT--AT-ATAAA--A-GATCTT--AATA--T--AT-T--T-T-TG---T-C-----TAT-C--GTT------ACTT----ATATCG---C-GGCGGTTTACCAGT-TAG----GT----GAATAGC-C---CCTTG-TTTATAA-ATCCCC----AT-C--CA--T---G--GGGTCAA-C-C----A----A--------AC--------T----A--------C--G--------GTT----G-T-A--T-------T-----CTTAC--AAT--T--GCT-TAA--TCACCGGTCGTGGAGGATTAAGCA--CC-TTT-C-CT-ATA-T-----TCT-TACAT-A---T-TTTCATA---T--ACTT-CTAC----ACTAACTTTTAA-TTTCTT
gi|90696 : ATGTACAT--GTA--TATGTATTGCTTCTCAATCATACGTGGTCGTTAACAGATCGCG-AT---G-A--A--ACCTGTGAAGA----TGCCTTTGGCAATGGATTATCAATGCTAT--------TAATAGCTATTTCAATAAA--------C---CA-TAT----ATT--ATGTCCCTTTTTCTTTTAAAATAA-ATAAACAAATTGAGTATTATTGT-GAAACTAAAAATGTGGAAAATATACAAACAGATAAAA------AATTTATTCATTTATATAATGACGAAATAAAAA-TA-TTT-T--TAT-CATTTAATA-AAAA---TTATGGTATGCAAATGTTTG---TAAC--A-T-GA-TAAAA-G-T-T--T-AA-TCTTAGGT--AT-ATAAA--A-TATCTT--AATA--T--AT-G--T-T-TG---T-C-----TAT-C--GTT------ACTT--T-ATATCG---C-GGCGGTTTACCAGT-TAG----GT----GAATAGC-C---CCTTG-TTTATAA-ATCCCC----AT-C--CA--T---G--GGGTCAA-C-C----A----A--------AC--------T----A--------C--G--------GTT----G-T-A--T-------T-----CTTAC--AAT--T--GCT-TAA--TCACCGGTCGTGGAGGATTAAGCG--CC-TTT-C-CT------------------AT-A---T-TCTCATA---T--ACTT-CTGC----ACTGACTTTTAT-TTTCTT
gi|90695 : ATGCACAT--GTA--TATGTATTGCTTCTCAATCATACGTGGTCGTTAACAGATCGAA-AC---G-A--A--ACCTGTGAAGGAAGTCGCCTTTGGCAATGGATAATCAATGCTAT--------TAATAGCTATTTCAATAAT--------C---CA-TAT----ATT--ATGTCCCTTTTTCTTTTAAAATAA-ATAAACAAATTGAGTATTATGGT-GAAACTAAAAATGTGGAAAATATAACAACAGATAAAA------TATTTATTCATTTATATAATGACGAAATAAAAA-TA-TTT----TAT-CATTTAATA-ATAA---TCATGGTATGCAAATGTTTG---TAAC--A-T-GA-TAAAA-G-T-T--T-TA-TCTTAGGT--AT-ATAAA--A-GATCTT--AATA--T--AT-G--T-T-TG---T-C-----TAT-C--GTT------ACTT--T-GTATCG---C-GGCGGTTTACCAGT-TAG----GT----GAATAGC-C---CCTTG-TTTATAA-ATCCAC----AT-C--CG--T---T--GGGTCGA-C-C----A----A--------AC--------T----A--------C--G--------GTT----G-T-A--T-------T-----CTTAC--AAT--T--GCT-TAA--TCACCGGTCGTGGAGGATTAAGCG--CC-TTT-C-CT-ATA-T-----TTT-TACAT-A---T-TCTCATA---T--ACTT-CTGC----ACTGACTTTTAT-TTTCTT
gi|90697 : ATGCACAT--GTA--TATGTATTGCTTCTCAATCATACGTGGTCGTTAACAGATCGCG-AT---G-A--A--ACCTGTGAAGT----CGCCTTTGGCAATGGATTATCAATGTTAT--------TAATAGCTATTTTAATAAA--------C---CA-TAT----ATT--ATGTCCCTTTTTCTTTTAAAATAATAAAAACAAATTGAGTATTATGGT-GAAACTAAAATTGTGGAAAATATAATAACAGATAAAA------TATTCGTTAATTTATATAATGACGAAATAAAAA-TA-TTT----TAT-CATTTAATA-ATAA---TCATGGTATGCAAATGTTTG---TAAC--A-T-GA-TAAAA-G-T-T--T-TA-TCTTAGGT--AT-ATAAA--A-GATCTT--AATA--T--AT-G--T-T-TG---C-C-----TAT-C--GTT------ACTT--T-ATATCG---C-GGCCGTTTACCAGT-TAG----GT----GAATAGC-C---CCTTG-TTTATAA-ATCCCC----AT-C--CA--T---G--GGGTCAA-C-C----A----A--------AT--------T----A--------C--G--------GTT----G-T-A--T-------T-----CTTAC--AAT--T--GCT-TAA--TCACCGGTCGTGGAGGATTAAGCG--CC-TTT-C-CT-ATA-G-----TCT-TACAT-A---T-TC-CATA---T--ACTT-CTGC----ACTTTGTTTTATATTTTTT
gi|90698 : ATGTACAT--GTA--TATGTATTGCTTTTCAATCATACGTGACCGTTAACAGATCGCG-AT---G-A--A--ACCTGTGAAGA----TGCCTTTGGCAATGGATTATCAATGCTAT--------TAATAGCTATTTATATAAA--------C---CA-TAT----ATT--ATGTCCCTTTTTCTTTTAAAATAA-ATAAACAAATTGAGTTTTATTGT-GAAGCTAAAAATGTGAAAAATATAACAACAGATAAAA------TATTTATTTATTTATATAATGACGAATTAAAAA-TA-TTT-T--TAT-CATTTAATA-ATAA---TCATAGTATGCAAATGTTTG---TAAC--A-T-TA-TAAAA-G-T-T--T-TA-TCTTAGGT--AT-ATAAA--T-GATCTT--AATA--T--AT-G--T-T-TG---T-C-----TAT-C--GTT------ACTT--T-ATATCG---C-GGCAGTTTACCAGT-TAG----GT----GAATAGC-C---CATTG-TTTATAA-ATCCCC----AT-C--CA--T---G--GGGTCAA-C-C----A----A--------AT--------C----A--------C--G--------GTT----G-T-A--T-------T-----CTTAC--AAT--T--GCT-TAA--TCACCGGGCGTGGAGGATTAAGCG--CC-TTT-C-CT------------------AT-A---T-TTTCATA---T--ACTT-CTGT----ACTGACTTTTAT-TTTCTT
gi|90699 : ATGTACATCTATA--TATATATTGCTTCTTAATCACACGTGGTCGTTAACAGATCGCG-AC---G-A--A--ACCTGTGAAGA----TGCCTTTGGCAATGGATTATCAATGCTAT--------TAATGGCTATTTCAATAAA--------C---CA-TATGTATATT--ATGTCCCCTTTTCTTTTAAAATAA-ATAATCAAATTGAGTATTACGGT-GAAA--AAATATTC--AAAATATAACAACAGATAAAA------TATTTATTCATTTATATAATGACGAA-TAAATA-TA-TTT-T--TAT-CATTTAATA-ATAA---TATTCGTATGCAAATGTTTG---TAAC--A-T-GA-TTAAA-G-T-T--T-TA-TCTAAGGT--AT-ATAAA--A-GGTCTT--AGTA--T--AT-C--C-T-TG---T-C-----GAG-C--GTT------ACTT--T-ATATCG---C-GGCGGTTTATCAGT-AAG----GT----GAACAGC-T---CCTTG-TTTATAA-ATCCCC----AT-C--CA--T---G--GGGTCAA-C-C----A----A--------AC--------T----A--------C--G--------GTT----G-T-A--T-------T-----CTTAC--AAT--T--GCT-TAA--TCGCCGGTCGTGGAGGATTAAGCG--CC-TTT-C-CC-ATA-T-----TCT-TACAT-A---T-TCTCATA---T--ACTT-TTGC----ACTTACTTTTCT-TTTC
gi|90700 : ATGTACAT--GTA--TATGAATTGCTTCTAAATCACACGTGGTTGTTTACAGATCGCA-AC---A-A--T--ATCTGTGAAAA----TGCCTTTGATAATAGATTATAAATGCTATCATGTTATTAATAGCTATTTCAATAAA--------A---CA-TAT----TTTGCATGTC---TTTTCTTT------AA-ATAAACAAAT-GAATATTATGGT-GAAACTATAAATGCAGAAAATGCAACGATATATAAAA------TACGTGTTCATTGATATATTGACATAATAAAAA-TA-TTT-TGTTAT-CATTT--TA--TAA---TCATGTTATGCAAATATTTG---TAAC--A-T-GA-TAAAC-G-T-T--T-TA-ACTTAGGT--AT-ATAAA--A-GATCTT--GATA--T--GT-G--T-A-TA---T-C-----GAT-C--GTT------ACTT--T-ATATCG---C-GGCGCTTAATCAGT-TAG----GT----GAATAGC-C---CCTTG-TTTATAA-ATTCCC----CT-A--CA--T---G--AGGTCAA-C-C----C----A--------CC--------C----A--------C--G--------GTT----G-T-A--T-------T-----CTTAC--AAT--T--GCT-TAA--TCACCGGTCGTGGAGGATTAAGCG--CCTTTT-C-CT-ATT-T-----TCT-TACAT-A------CTTATAC--T--ACTG-CTGC----TGTGACTTTTAT-TTTCTT
gi|90701 : ACAT--GTG--TATATATGGCTTCTAAATTACACGTGGGCGTAACCAGATCACGGAT---ACA--AT-ACCCGTGAATG----TGCCTTTGGGAATGGATTATAAATTATAT--------TAATAGCTATTTCAATAAAAGAA----CG--CA-CAT----ATT--ATGTTCCTTTTTCTTT------AA-ATAGACAAAT-GGGTATAATGGTTAAAACTATAGGTGCAGATAATATAACAAAAGATAAAA------CATTTATTCATTAATATACTGACTTAATAAACA-TAATTTGT--TAT-CAC---GTA-ATAT---TCAT--TATGTAAGTGTTTG---TAAT--A-T-GA-TAAAC-G-T-T--T-TA-TCTTAGGT--GT-ATAAAAGA-CATAAC--AATA--T--AT-A------CG---C-C-----GAT-C--GTT------ACTT--A-AT-TTGC--C-GGCGGTTTACAAGT-TAG----GT----GAATAGC-C---CA-TA-TTTG-AA-ATCCTC----GT-A--CA--G---G--AGGTCAA-C-CT---A----A--------AG--------C----A--------T--G--------GCT----G-C-A--T-------T-----CTTAC--AAT--T--GCT-TAA--TCACCGGTAGTGGAGGATTAAGCG--CC-TTT-C-CT-ATT-T-----TCT-TACAT-----T-TTTC-TAAACT--ATTA-CTACT---GTTGACTTTTAT-TTTCTT
gi|90702 : ACAT--GTA--TATATATGGCTTCTAAATTACACGTGGTCGTAACCAGATCGCG-ATTACA-A--T--ACCCGTGAATG----TGCCTTTGGCAATGGATTATCAATTATAT--------TAAAAGCTATTTCATTAAA--------AGAACG-CAT----AT---ATGTCCCTTTTTCTTT------AA-ATAGACAA-TTGGGTATAATGAT-AAAACTATAAGTGCAGACATTATAACAAAAGATAAAA------CATTTATTCATTAATATACTGACTTAATAAACA-TAATTTGT--TAT-CACTTGATA--T-----TCATATTATGTAAATGTTTG---TAAC--A-C-GA-TAAAA-G-T-T--T-TA-TCTTAGGT--GT-ATAAA--A-GACATA--AATA--T--
gi|90703 : AT--GTAACTATATATGGCTTCTAATTCAAATGCGGTCGTCAACAGATTGCA-AC---A-ACAAT-ACCTGTAAAGT----TGCCTTAATCAATGGGTTATAATTGCTAT--------TAATAGCTATTTCAATAAATACAAAACC---CAACAT----ATT--ATGTGCCTTTTTCTTT------AA-ATAAACAAAT-GGGTATAATGAT-GAAACTATAAATACAGAAAATACAGCAAAAGATAAAA------TATTTATTAATTTATATGCTGACATAATAAAAA-TACTTT-T--TAT-CCTTTA-----TAT---GCATGTTATGCAAATATCTA---TAAC--T-T-G--TAAACCG-T-T--T-TA-TTTTAGGT--AT-ATAAA--A-TATCTA--AATA--T--AT-A--T-T-TT---A-C-----GAC-C--GTT------ACTT--T-ATATTGG--C-GGCGGTTTACCAGT-TAG----GT----GAATAGC-C---C-TTG-TTTTGCA-ATCCTC----CT-T--CA--T---G--AGGTCAA-C-C----C----A--------CC--------C----A--------T--G--------GTT----G-T-A--C-------T-----CTTAC--AAT--T--GCT-TAA--TCACCGGTCGTGGAGGATTAAGCG--TC-TAT-C-CTCAT--T-----TCT-TAGAT-AT--T-TCTTATC---T--ACTG-CTCC----TGTGACTTTAAA-TTTCT
gi|90704 : --GTG--TATATATGGATTCTAAATTGCATGTG-TTGTAACCAGATCTCG-AT---T-AC-AGTACCTGTGAAAT----TGCCTTTGGCAGTGGATTATAAATGCTAT--------TAAAAGat
gi|90705 : --TATACATGGCTTCTAAATTACACGTGGTCG--AATA-----CA-AT-----------ACCCGTGAATG----TGCCTTTGACAATGGATTATAAATTATAT--------TAATAGCTATTTCAATAAAAAAAAAA-CG--CG-CAT----ATT--ATGTCCCTTTTTCTTT------AA-ATAGACAAAT-GAGTATAATGGT-AAAACTATAAGTGCAAAAAATATAACAAAATATAAAA------TATTTATTCATTAATATACTGATTTAATAAACA-TAATTTGT--TAT-CACTTTGTA-TTAA---T-AT--TATGTAAATGTTTG---TAAC--A-T-GG-CAAAC-G-T-T--T-TA-TCTTATGT--GT-ATAAA--A-GA-CAT--AAAAAAT--AT-A--T-A-TG---T-C-----GCC-C--GTT------ACTT--T-AT-TTG---CTGGCGGTTTACCAGT-TAG----GT----GAATAGC-C---CATA---TTAGAA-ATCCCC----GC-T--CA--T---G--GGGTCAA-C-CT---A----A--------AG--------C----A--------T--G--------GTT----G-C-A--T-------T-----CTTAC--AAT--T--GCT-TAA--TCACCGGTCGTGGAGGATTAAGCG--CC-TTT-C-CT-ATT-T-----TCT-AACAT-A---T-TCCCAAA---------T-TTG---------ACCGTTAT-TTTCTT
gi|90706 : --------C---CA-CAT----ATT--ATGTCCCTTTTTCTTC-AAAA------AAA-AAAT-GTGTATAGCGGT-GAAACTAAAAATGCAGATAATGTAGCAAAAGATAAAAAAAAGATATTTATTGAT--ATAC--TGACATAATAGAAA-AA-GTG-T--TAT-CACTT--TAGAT-----TCATATTATGCAAATGTTTG---TAAC--A-T-AA-AAAAACG-T-T--T-TA-TCTAAGGC--AT-ACGCA--A-GACCTT--AAAA--T--AT-A--------------------AT-C--GTT------ACTT--T-ATATTG---CTGGAGGTTTACCAGT-TAG----GT----AAATAGC-C---C-TTA-TTTG-AA-ATCCTC----GA-T--CA--T---T--AGGTCAA-C-CC---A----A--------AC--------C----A--------T--G--------GTT----G-T-A--C-------T-----CTTAC--AAT--T--GCT-TAA--TCATCGGTAGTGGAGGATTTAGCG--CG-TTT-C-TT-ATT-A-----TCT-TAAAA-A---TGTCTTACT---T--ACCT--TGT-----CTGATTTTTAT-TTTCTT
gi|90707 : GGAACAAGAAGTA-ATT-C---ATACGTTTGATA--TAAGTTTTATGTTATGGAAATCGTTG---T--T--A-TCGACTAAAA-G-T-T--T-T--TGTT-GGTGAAT-ATAAA--AATACCTC--GAAA--T--GT-G--T-A-TG-----C-----T------GTA--------TC--C-ATA-CGTTTC-GGCGGTTTGCTAGT-ACT----GC----GAATAGC-C---TAATT-TTGATA---TCCTC----AT-TGATA--T---G--AGGTCAA-C-C----C----ATCCAGTGGAA--------T----G--------T--G--------GTT----G-T------------------CTTAC--AAT--T--GCTACAG--TCATCAGTCGTGGAGGATTGAGCG--CC-TTT-TACT-GTC-C-----TCT-CTCTT-T---C-TCTCTTA---T--
gi|90708 : ---TTATGTTATGCAAATCGTTG---TAAC----C-GACTGAAA-G-T-T--T-T--TGTT-GGTGAAT-ATAAA--A-TACCTCGAAATG--T--GT-A--C-G-TGGAAT-C-----CATCC--GT---------TT-------------T-GGCGGTTTGCTAGT-ACT----GT----GAATAG------CCTAA-TTTTGAA-ATCCTC----AT-T--AATTT---G--AGGTCAA-C-C----A----A------------------T----C--------C--A--------GTG----G-T-A--TGTGGTTGT-----CTTAC--AAT--T--GCTACAA--TCACCGGTCGTGGAGGATTGAGCG--CA-TTTAA-CT-GTT-T-----TCT-TTC-T-G---TCTTTCTTA---T--GCCTAATAC----AATAACTTTC-T-TTTCTTgtctaataatataactttttgttctt
gi|90709 : ---TTATGTTATGCAAATCGTTG---TTAC----C-GA-CTAAG-T-T-T--T-TG-T---AGGTGAAT-ATAAA--A-TACCTC--GACA--T--TT-C--T-A-TG---T-TG----TAT-C------------CAT--ACGTATCG------GTGGTTT----GT-TAGAACTGT----GAATAGC-C---AAAT--TTTA-AA-ATCCTC----AT-T--GA--TTA-G--AGGTCAA-C-C----C----A--------TC--------C----AGTGGGATGT--G--------GTT----G-T------------------CTTAT--AAT--T--GCTACAA--TCACCAGTCGTGGAGGATTGAGCG--CT-TTT-A-CT-GTC-T-----TCT-
gi|90711 : ---TTATGTTATGCCAATCGTTG---TAAC--C-G-G---------------C-TA-TCT--GGTGAAT-ATAAA--A-TAGCTC--GAAA--TTAAT-A-------------C-----GAT----GTA------ATCA--A-ACGTTT---T-GGCGGTTGGCTAGT-ACT----GC----GAATAGG-C-----TTA-TTTTGAA-ATCCTC----AT-T--AA--TTT-G--AGGTCAA-C-CTATCA----A--------GTGAGA----T----G--------T--G--------GTT----G-T------------------CACAC--AAT--T--GCTACAA--TCGCCGGTCGTGGAGGATTGAGCA--CC-TTTAA-CT-GTC-T-----TCTCTAGAT-CT--T-TCTTATctctatctttcttatgtctaataatataactttctgttctt
gi|90712 : ---TTATGTTATGCAAATCGTTG---TAAC----C-GACTAAAC-GAT-T--T-GA-T----GGTGAAT-ATAAA--A-TACCTCGAAATG--T--GT-A--TGT-TGTA-T-C-----CATAC--GT---------TT-------------T-GGCGGTTTGCTAGC-ACT----GC----GAATAG------CCTAA-TTTTGAA-ATCCTC----AT-T--GATTT---A--TAGTCAA-C-C----C----A--------TC--------T----A--------g
gi|90710 : ---TTATGCTATGCAAATTGTTG---TAAC----C-GACTAAAA-G-G-T--T-TT-GCT--GGTGAGT-ATAAA--A-TACCTC--GAAA--T--G---------TG---T-A-----CATAC--GTC------ATTT----ATATC----T-GGCGGTTTACTAGT-AGA----GC----AGATAGC-C------TA-ATCATAA-GT-TAA----AT--------T---A--AGGTTAA-C-C----C----A--------TCTTGTGGGAT----G--------T--G--------GTT----GCC-A--T-------T---------C--AAT--T--GCTACAA--TTGCCGGTCGTGGATGATTGAGAGTCCC-TTT-CACT-G---------TTT-TA----------TCTC-TG---T--ATTT-CTgtgggatgtggttgtcgaattttgaaatcctcaatgatttgaggtcaacctatccagtggaatgtggttgtcttataattgctacaatcaccggtcgtggaggattgagcgccttttgctgtcttctctctatctttcttctgtctaataatataactttcttttctt
gi|90713 : ---TTATGTTATGCAAATCGTTG---TAACCGACT-AA-AAAAA-A-T-G-----A-T----GGTGAAT-ATAAA--A-TACCTCGAAATG--T--GT-AAGT-TGTA---T-C-----CATAC--GT---------TT-------------T-GGCGGTTTGCCAGT-ATT----GC----GAATAGC-C---TAAT--TTTA-AA-ATCCTC----AT-T--GATTT---G--AGGTCAA-C-C----tctgtctcgtaaagtaacatctttttctt
gi|90714 : TGTTATGCAAATCGTTG---TAAC--C-T-AC-TAAAA-G-T-T--TGTGCTGTTGAAT--AT-AT--A--A-TATCTCGAAATGTCT--AT-G--T-TATA---T-C-----CATAC--GT---------TT-------------C-GGCGGTTTGCTAGT-ACT----GC----GAATAG------CCTAA-TTTTGAA-ATCCTC----AT-T--GA--TTTGG--GGGTCAA-C-C----C----A--------TCCAGTGGGAT----G--------T--G--------GTT----G--------------T-----CTTAC--AAT--T--GCTACAA--TCACCGGTCGTGGAGGATTGAGCG--CC-TTT-
gi|90715 : TGTTATGCAAATCGCTG---TAAC----T-GACTAAAA-G-T-T--T-TT-GCT--GGTAAAT-ATAAA--A-TACCTC--GAAA--T--GT-G--T-A-TG------------AT----GCA------TCCA--A-ACGTTT---T-AGCGGTTTGCTAGT-GCT----GC----GAATAG------TCTTA-TTTTGAA-ATCCTC----AT-C--AATTT---G--AGGTCAA-C-C----C----A--------TCCAGCTGGAT----G--------T--G--------GTT----G--------------T-----CTTAC--AAT--T--GTTACAA--TCACCGGACGTGGAGGATTCAGCA--CC-TTTAA-CT-GTC-T-----TCTCTCCAT-CT--T-TCTTATG---T---CTA-ATAA----GATAACTTTC-T-TTTCTTtactgaatctctctgtctttcttatgtataataacataactttcttttctt
gi|90717 : TGTTATGCAAATCGTTG---TAAC----C-GACTAAAT-G-T-T--T-TA-GCT--GGTGAAT-ATAAA--A-TACCTC--GAAA--------A--C-G-TG---TAC-----GAT----GCA------TCCA--A-GCGTTT---T-GGCGGTTTGCTAGT-ACT----GC----GAATAGC-C---TATTT-TTT-TAA-ATCCTC----AT-A--AAATT---G--AGGTCAA-C-C----C----A------------------------------------------------------------------T-----CTTAC--AAT--C--GC-----------CGGTCGTGGAGGATTGAGCA--CC-TT
gi|90716 : TGTTATGCAAATCATTG---TAAC----C-GACTTAAA-G-T-T--T-TT-GCT--GGTGAAT-ATAAA--A-TACCTC--AA----------A--T-G-TG---T-A-----CAT-C--CAA------ACCT-----T-TTG---C---CGGTTTGCTA-T-TACT---GC----GAATAGC-CAAATTTTG------AA-ATTCTCGATAAT-T------T---G--AGGTCAA-C-C----C----A--------TC--------C----AGCGGGATGT--G--------GTT----G-T------------------CTTAC--AAA--T--GCTATAA--TCACCGGTCGTGGAGGATTGAGCA--TC-TTTAA-CT-GGC-T-----TCTCTCTATCG---T-TCTTATG---T---CTCACTAG----ATATACTTTC-T-TTTCTTaaactgttttctctctatctttcttatgtctaataagataactttcttttctt
gi|90718 : GATATGCAAATATTTG---TAAC----T-GACTGAAA-G-AAT--T-TG--CTAAGGC--AC-ATAAA--A-ACTCGA--AATT--C--GTGA--T-A-TG---C--------AT-C---CA------GCTT--A-A-ATTG------GCGGTTT----GT-TTG----ATTAACGAATAGT-C---AGA-G-TTT-TAA-ATCCTC----ACACG-CA--T---G--AGTTCAATC-C----A----T--------TC--------T----A-----------G--------GAT----G-TGA--T-------TACAATCTGAC--AAA--T--GTT-CAG--TCACTGGTCGTGGTAAATTA
gi|90720 : GTATGCAGTTTTGTGGGTTAAC--A-G-GG-CTAAA-C-C-T--T-TA-TCTGAGGT--TT-ACAGAC-A-CATCG------A--T--AT-A--T-T-AT---C-C-----TAT-T--GCA------A-TT--A-A----------GGTGGTTTGCCAGT-TCG----GT----GAA---A-C---TCTTG-TCTGCAAGAACATC----AC-T--TAG-T---G--AGTTTAA-C-C----C----AT-------AC--------T----G--------C--GTGCATGTGGTT----G-C-A--C-------T-----CCTGT--TAT--T--GCT-TCA--TCACCAGTGTTTGTGGATAAGGCG--CC-TTT-T-CT-ATT-T-----TCT-AAC
gi|90719 : GCATACATGTATTTG---TA-T--A-T-G--CAAAT-G-T-TAGT-GA-CCT---GT--ATTATAAA--A-TATCTT--GAAA--------A--T-C-AG---T-CATTAGTAT-CCTGTA------TTTT--A-TTA--------GGCAAATTGCTTGTATAG-----T----GAA--GCGC---CTTTA-TTTG-AA-ATCCTC----AT-T--AA--C---GTCAGGTCAG-CAC----ATCTCA--------GT--------TTGATG--------T--G--------GCT----G-T-C--T-------G-----GTTA---AA------GCT-TAAA-CCACCGGTGGTGGAGGATTAAGCA--CC-TTT-C--------------TCT-TACAT-C---T-Ttgcctttctttatctatcaagtttgacattttctt
gi|90721 : TATGCAAATGTTAG---TAAC--C-A-AC-TAAAA-G-T-T--T-TA-ACTGGTGT--AC-ATAAA--A-TACCTC--GAAA--T--TC-A-------G---T-C-----AGT-T--GTATCCCTGATTTTCA-ATA--------GGCAAATTGCTTGT-ACA----GC----GAA--GC-G---CCTTAATTTG-AA-ATTCTC----AC-TAACG--T---G--AGGTCAG-C-C----C----A--------TC--------T-------------C--A--------ATTTGATG-T-G--G-------T------TTACTGACT--TTAGCT-TAAAAGCACCGGTCGTGGAGGATTAAGCA--CC-TTT-C-TC-TTACT-----TCT-TGC-T-A---T-TTTgctatctttccta
gi|90722 : G---T-C-----GAT-C--GTT------ACTT--A-AT-TAG---CTGGCGGTTTACCAGT-TAG----GT----GAATAGC-A---CAT-A-CTTA-AA-ATC-------AT-CG-CA--C---A--GGATCA-----------------------------------------------T--G--------GTT----G-C-A--T-------T-----CTTAC--AAT--T--GCT-TAA--TCACCGGTTGTGGAGGATTAAGCG--CC-TTT-C-CC-ATT-T-----TCC-TACAT-A---T-T----TA---TTAACTA-CTACAACTGTTCACTTTTAA-TTTCTtcct
gi|90723 : -TTTTTAA-ATCCTC----AT-T--AA--TTT-G--AGATCAA-C-C----C----A--------TC--------C----A--------GTGG--------GGT----G-TGA--T-------TGT---CTTAC--AAA--T--GCTGCAA--TCACCGGTCATGGATGATTGAACG--CC-TTTAA-CT-GTC-T-----CCT-TTC-T-ATCTT-TCTTATG---T--
gi|90712 : gcggtttgatagtactgcgactagcttaaAA-ATCCTC----AA-T--GA--TTT-G--AGGTCAA-C-C----T----ATCCAGTGGAA--------T----G--------T--G--------GTT----G-T------------------CTTAT--AAT--T--GCTACAA--TCACCGGTCGTGGAGGATTGAGCG--CC-TTT-TGCT-GTC-T-----TCT-ctaataagataactctcttt
gi|90724 : ttatgttatgcaaatcgttgtaaccgactaaacgatttgatggtgaatataaaatacctcgaaatgtgtatgttgtatccatacgttttggcggtttgctagcactgcgaatagcctaattttgaaatcctcattgatttatagtcaacccatctagtgggatgtggttgtcgaattttgAA-ATCCTC----AT-T--GA--TTT-G--AATTCAA-C-C----T----A------------------T----C--------C--G--------GTG----G-G-A--TGTGGTTGT-----CTTAC--AAT--T--GCTACAA--TCACCGGTCGTGGAGGGTTGAACG--CG-TTT-CACT-----T-----TCT-T---------T-TCTCctctatctttcttctgtctaataatataactttcttttctt
gi|90725 : ctcaatttgAA-ATCCTC----AT-T--GA--TTT-G--AGGTGAA-C-C----C----A--------TC--------C----A--------GTGG--------GAT----G-T-GGCTG------T-----CTCAC--AATATT--GTTATAA--TCACCGGTCGTGGAGGATTGAGCG--AT-TTT-A-CT-CTA-T-----CTT-Ttttcttatgtctaacaacataacattcttttctt
gi|90726 : AA-ATCCTC----AT-T--GA--TTT-G--AGGTCAA-C-C----C----A--------TCCAGTGGGGT----G--------T--G--------GTT----G--------------T-----CTTAA--AAT--T--ACTACAA--TTAGCGGTCGTAGATGATTGAGTG--CC-TTTAA-CT-GTC-T-----TCT-cttttcttgtgttt
gi|90728 : --------GTT----G-T-T--G-------T-----TTTAC--AAT--T--GCTACAA--TCGCCGGTCGTGGATGATTGAGCG--CC-TTT-TACT-GTC-TCTCTGTCT-TTCAT-A---TGTCTAATA---ctctatctttctaatgtctaataatataacattttgttct
gi|90727 : aat--------GTT----G-T-T--G-------T-----TTTAC--AAT--T--GCTACAA--TCGCCGGTCGTGGATGATTGAGCG--CC-TTT-TACT-GT--C-----TCT-CTC-T-A---TCTTTCATA---T--aagtaacctcattatctt
Alignments
lowQualScore : 111 11111111 333333333333 111111 1111111 11 11 2222222222222 11 222222 66666666666666666666666666666 111111111 1 2222222222222 11111
lowQualScore : 44 44 0 1 000 555 8888 77777 11111111 444444444444 3 6666 44 888888 3 9 1 3 1 1 0 44 0 1 3 2 5 8 8 66 2 22 1 5555 0 22 0 11 222 8888888 22 1 1 2 22 1 1 11 55 33 1 33 33 99999999999999999999999999999 1 1 444444 33 1 666 3333333333333 1 99999999 11 8888888888 44 1 11 1 222222 11 2 33 55555555555555555555555555555 44444444 2 1 777777777 11 1 3 11 1 1 3333333333333 2 33 44444 666 1 0 88888 6 1 22 1 888 777 66 00000 3 2
lowQualScore : .. .. . . ... ... .... ..... ........ ............ . .... .. ...... . . . . . . . .. . . . . . . . .. . .. . .... . .. . .. ... ....... .. . . . .. . . .. .. .. . .. .. ............................. . . ...... .. . ... ............. . ........ .. .......... .. . .. . ...... .. . .. ............................. ........ . . ......... .. . . .. . . ............. . .. ..... ... . . ..... . . .. . ... ... .. ..... . .
lowQualScore : 66 22 2 0 888 444 3333 55555 22222222 333333333333 1 5555 22 555555 1 8 0 1 0 2 8 22 7 0 8 9 7 6 6 88 9 11 6 1111 2 33 7 55 555 0000000 00 4 4 9 00 4 4 00 77 99 4 88 44 66666666666666666666666666666 4 4 111111 44 4 222 2222222222222 4 55555555 44 2222222222 00 2 77 0 555555 77 5 99 66666666666666666666666666666 44444444 4 2 333333333 77 2 8 77 2 2 7777777777777 2 88 44444 111 2 4 33333 4 7 55 9 222 888 22 00000 9 4
consensus : ATGTACAT--GTA--TATGTATTGCTTCTNAATCACACGTGGTCGTTAACAGATCGCG---A---CGA--A-ACCTGTGAAGN----TGCCTTTGGCAATGGATTATCAATGCTAT--------TAATAGCTATTTCAATAAA--------C---CA-TAT----ATT--ATGTCCCTTTTTCTTTTAAAATAA-ATAAACAAATTGAGTATTATGGT-GAAACTAAAAATGCGGAAAATATAACAACAGAT--AAAATATTTATTCATTTATATANTGACGNAATAAAAA-T-A-TTT-T--TATCA-TTTAATAATAA---TCAT--GTTATGCAAATNTTTG---TAAC--ACGA-T--AAA-A-G-TT--T-TA-TCTTAGGT--A--T-ATAAAA-TACCT--CGA--NAT-----ATATNTG---T-CN-----AT-C-G------TT-AC-TT--NAT-ATC-G---C---GGCGGTTTGCCAG-T-TAG----GCGAATAGC-C---CCTT-G-TTTATAA-ATCCT--CATTNA--T---G--AGGTCAACCC-AT-C---------C---------G--------CG--------GT-TG-T-A--T-T--CTTACAAT--TGC-TACAATCACCGGTCGTGGAGGATTGAGCG--CC-TT-T-----------C-CTGTC-T-----TCT---TACAT-A---T-T-CTCA--TA-T--ACTT-CTGC-ACTG-----ACTTTTAT-TTTCTT
Reference ( family-586 ) : ATGTACAT--GTA--TATGTATTGCTTCTNAATCACACGTGGTCGTTAACAGATCGCG---A---CGA--A-ACCTGTGAAGN----TGCCTTTGGCAATGGATTATCAATGCTAT--------TAATAGCTATTTCAATAAA--------C---CA-TAT----ATT--ATGTCCCTTTTTCTTTTAAAATAA-ATAAACAAATTGAGTATTATGGT-GAAACTAAAAATGCGGAAAATATAACAACAGAT--AAAATATTTATTCATTTATATANTGACGNAATAAAAA-T-A-TTT-T--TATCA-TTTAATAATAA---TCAT--GTTATGCAAATNTTTG---TAAC--ACGA-T--AAA-A-G-TT--T-TA-TCTTAGGT--A--T-ATAAAA-TACCT--CGA--TAT-----ATATNTG---T-CN-----AT-C-G------TN-AC-TT--NAT-ATC-G---C---GGCGGTTTGCCAG-T-TAG----GCGAATAGC-C---CCTT-G-TTTATAA-ATCCT--CATTNA--T---G--AGGTCAACCC-AN-C---------C---------G--------CG--------GT-TG-T-A--T-T--CTTACAAT--TGC-TACAATCACCGGTCGTGGAGGATTGAGCG--CC-TT-T-----------C-CTGTC-T-----TCT---TACAT-A---T-T-CTCA--TA-T--ACTT-CTGC-ACTG-----ACTTTTAT-TTTCTT
gi|90693 : ATGTACAT--GTA--TATGTATTGCTTCTCAATCACACGTGGTCGTTAACAGATCGCG---A---TGA--A-ACCTGTGAAGA----TGCCTTTGGCTATGGATTATCAATGCTAT--------TAATAGCTATTTCAATAAA--------C---CA-TAT----ATT--ATGTCCCTTTTTCTTTTAAAATAA-ATAAACAAATTGAGTATTGTGGT-GAAACTAAAAATTTGGAAAATATAACAACAGAT--AAAATATTTATTCATTTATACAATGACGAAATAAAAA-T-A-TTT-C--TATCA-TTTAATAATAA---TCAT--GGTATGCAAATGTTTG---TAAC--ATGA-T--AAA-A-G-TT--T-TA-TCTTAGGT--A--T-ATAAAA-CATCT--TAA--TAT-----ATATTTG---T-CT-----AT-C-G------TA-AC-TT--AAT-ATC-G---C---GGCGGTTTACCAG-T-TAG----GTGAATTGC-C---CCTT-G-TTTATAA-ATCCC--CATCCA--T---G--GGGTCAACCA-AA-C---------T---------A--------CG--------GT-TG-T-A--T-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCACCGGTCGTGGAGGATTAAGCG--CC-TT-T-----------C-CTATA-T-----TCT---TACAT-A---T-T-CTCA--TA-T--ACTT-CTGC-GCTT-----ACTTTTAT-TTTCTT
gi|90694 : ATGTACAG--GTA--CATGTATTGCTTCTCAATCACACGTGGTCGTTAACAGATCGCG---A---TGA--A-ACCTGTGAAGA----TGCCTTTGGCAATGGATTATCAATGCTAT--------TGATAGCTATTTCAATAAA--------T---CA-TAT----ATT--ATGTCCCTTTTTCTTTTAAAATAA-ATAAACAAGTTGAGTATTATGGT-GACACTAAAAATGTGGAAAATATAACAACAGAT--AAAATATTTATTCATTTATATAATGACGAAATAAAAA-T-ATTTT-T--TATCA-TTCAATTATAA---GCGT--GGTATGCAAATGTTTG---TAAC--ATGA-T--AAA-A-G-TT--T-TA-TCTTAGGT--A--T-ATAAAA-GATCT--TAA--TAT-----ATTTTTG---T-CT-----AT-C-G------TT-AC-TT---AT-ATC-G---C---GGCGGTTTACCAG-T-TAG----GTGAATAGC-C---CCTT-G-TTTATAA-ATCCC--CATCCA--T---G--GGGTCAACCA-AA-C---------T---------A--------CG--------GT-TG-T-A--T-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCACCGGTCGTGGAGGATTAAGCA--CC-TT-T-----------C-CTATA-T-----TCT---TACAT-A---T-T-TTCA--TA-T--ACTT-CTAC-ACTA-----ACTTTTAA-TTTCTT
gi|90695 : ATGCACAT--GTA--TATGTATTGCTTCTCAATCATACGTGGTCGTTAACAGATCGAA---A---CGA--A-ACCTGTGAAGGAAGTCGCCTTTGGCAATGGATAATCAATGCTAT--------TAATAGCTATTTCAATAAT--------C---CA-TAT----ATT--ATGTCCCTTTTTCTTTTAAAATAA-ATAAACAAATTGAGTATTATGGT-GAAACTAAAAATGTGGAAAATATAACAACAGAT--AAAATATTTATTCATTTATATAATGACGAAATAAAAA-T-A--TT-T--TATCA-TTTAATAATAA---TCAT--GGTATGCAAATGTTTG---TAAC--ATGA-T--AAA-A-G-TT--T-TA-TCTTAGGT--A--T-ATAAAA-GATCT--TAA--TAT-----ATGTTTG---T-CT-----AT-C-G------TT-AC-TT--TGT-ATC-G---C---GGCGGTTTACCAG-T-TAG----GTGAATAGC-C---CCTT-G-TTTATAA-ATCCA--CATCCG--T---T--GGGTCGACCA-AA-C---------T---------A--------CG--------GT-TG-T-A--T-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCACCGGTCGTGGAGGATTAAGCG--CC-TT-T-----------C-CTATA-T-----TTT---TACAT-A---T-T-CTCA--TA-T--ACTT-CTGC-ACTG-----ACTTTTAT-TTTCTT
gi|90696 : ATGTACAT--GTA--TATGTATTGCTTCTCAATCATACGTGGTCGTTAACAGATCGCG---A---TGA--A-ACCTGTGAAGA----TGCCTTTGGCAATGGATTATCAATGCTAT--------TAATAGCTATTTCAATAAA--------C---CA-TAT----ATT--ATGTCCCTTTTTCTTTTAAAATAA-ATAAACAAATTGAGTATTATTGT-GAAACTAAAAATGTGGAAAATATACAAACAGAT--AAAAAATTTATTCATTTATATAATGACGAAATAAAAA-T-A-TTT-T--TATCA-TTTAATAAAAA---TTAT--GGTATGCAAATGTTTG---TAAC--ATGA-T--AAA-A-G-TT--T-AA-TCTTAGGT--A--T-ATAAAA-TATCT--TAA--TAT-----ATGTTTG---T-CT-----AT-C-G------TT-AC-TT--TAT-ATC-G---C---GGCGGTTTACCAG-T-TAG----GTGAATAGC-C---CCTT-G-TTTATAA-ATCCC--CATCCA--T---G--GGGTCAACCA-AA-C---------T---------A--------CG--------GT-TG-T-A--T-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCACCGGTCGTGGAGGATTAAGCG--CC-TT-T-----------C-CT-------------------AT-A---T-T-CTCA--TA-T--ACTT-CTGC-ACTG-----ACTTTTAT-TTTCTT
gi|90697 : ATGCACAT--GTA--TATGTATTGCTTCTCAATCATACGTGGTCGTTAACAGATCGCG---A---TGA--A-ACCTGTGAAGT----CGCCTTTGGCAATGGATTATCAATGTTAT--------TAATAGCTATTTTAATAAA--------C---CA-TAT----ATT--ATGTCCCTTTTTCTTTTAAAATAATAAAAACAAATTGAGTATTATGGT-GAAACTAAAATTGTGGAAAATATAATAACAGAT--AAAATATTCGTTAATTTATATAATGACGAAATAAAAA-T-A-TTT-T---ATCA-TTTAATAATAA---TCAT--GGTATGCAAATGTTTG---TAAC--ATGA-T--AAA-A-G-TT--T-TA-TCTTAGGT--A--T-ATAAAA-GATCT--TAA--TAT-----ATGTTTG---C-CT-----AT-C-G------TT-AC-TT--TAT-ATC-G---C---GGCCGTTTACCAG-T-TAG----GTGAATAGC-C---CCTT-G-TTTATAA-ATCCC--CATCCA--T---G--GGGTCAACCA-AA-T---------T---------A--------CG--------GT-TG-T-A--T-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCACCGGTCGTGGAGGATTAAGCG--CC-TT-T-----------C-CTATA-G-----TCT---TACAT-A---T-T-C-CA--TA-T--ACTT-CTGC-ACTT-----TGTTTTATATTTTTT
gi|90698 : ATGTACAT--GTA--TATGTATTGCTTTTCAATCATACGTGACCGTTAACAGATCGCG---A---TGA--A-ACCTGTGAAGA----TGCCTTTGGCAATGGATTATCAATGCTAT--------TAATAGCTATTTATATAAA--------C---CA-TAT----ATT--ATGTCCCTTTTTCTTTTAAAATAA-ATAAACAAATTGAGTTTTATTGT-GAAGCTAAAAATGTGAAAAATATAACAACAGAT--AAAATATTTATTTATTTATATAATGACGAATTAAAAA-T-A-TTT-T--TATCA-TTTAATAATAA---TCAT--AGTATGCAAATGTTTG---TAAC--ATTA-T--AAA-A-G-TT--T-TA-TCTTAGGT--A--T-ATAAAT-GATCT--TAA--TAT-----ATGTTTG---T-CT-----AT-C-G------TT-AC-TT--TAT-ATC-G---C---GGCAGTTTACCAG-T-TAG----GTGAATAGC-C---CATT-G-TTTATAA-ATCCC--CATCCA--T---G--GGGTCAACCA-AA-T---------C---------A--------CG--------GT-TG-T-A--T-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCACCGGGCGTGGAGGATTAAGCG--CC-TT-T-----------C-CT-------------------AT-A---T-T-TTCA--TA-T--ACTT-CTGT-ACTG-----ACTTTTAT-TTTCTT
gi|90699 : ATGTACATCTATA--TATATATTGCTTCTTAATCACACGTGGTCGTTAACAGATCGCG---A---CGA--A-ACCTGTGAAGA----TGCCTTTGGCAATGGATTATCAATGCTAT--------TAATGGCTATTTCAATAAA--------C---CA-TATGTATATT--ATGTCCCCTTTTCTTTTAAAATAA-ATAATCAAATTGAGTATTACGGT-GAAA--AAATATTC--AAAATATAACAACAGAT--AAAATATTTATTCATTTATATAATGACG-AATAAATA-T-A-TTT-T--TATCA-TTTAATAATAA---T-ATTCG-TATGCAAATGTTTG---TAAC--ATGA-T--TAA-A-G-TT--T-TA-TCTAAGGT--A--T-ATAAAA-GGTCT--TAG--TAT-----ATCCTTG---T-CG-----AG-C-G------TT-AC-TT--TAT-ATC-G---C---GGCGGTTTATCAG-T-AAG----GTGAACAGC-T---CCTT-G-TTTATAA-ATCCC--CATCCA--T---G--GGGTCAACCA-AA-C---------T---------A--------CG--------GT-TG-T-A--T-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCGCCGGTCGTGGAGGATTAAGCG--CC-TT-T-----------C-CCATA-T-----TCT---TACAT-A---T-T-CTCA--TA-T--ACTT-TTGC-ACTT-----ACTTTTCT-TTTC
gi|90700 : ATGTACAT--GTA--TATGAATTGCTTCTAAATCACACGTGGTTGTTTACAGATCGCA---A---CAA--T-ATCTGTGAAAA----TGCCTTTGATAATAGATTATAAATGCTATCATGTTATTAATAGCTATTTCAATAAA--------A---CA-TAT----TTTGCATGTC---TTTTCTTT------AA-ATAAACAAAT-GAATATTATGGT-GAAACTATAAATGCAGAAAATGCAACGATATAT--AAAATACGTGTTCATTGATATATTGACATAATAAAAA-T-A-TTT-TGTTATCA-TTT--TA-TAA---TCAT--GTTATGCAAATATTTG---TAAC--ATGA-T--AAA-C-G-TT--T-TA-ACTTAGGT--A--T-ATAAAA-GATCT--TGA--TAT-----GTGTATA---T-CG-----AT-C-G------TT-AC-TT--TAT-ATC-G---C---GGCGCTTAATCAG-T-TAG----GTGAATAGC-C---CCTT-G-TTTATAA-ATTCC--CCTACA--T---G--AGGTCAACCC-AC-C---------C---------A--------CG--------GT-TG-T-A--T-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCACCGGTCGTGGAGGATTAAGCG--CCTTT-T-----------C-CTATT-T-----TCT---TACAT-A-------CTTA--TACT--ACTG-CTGC-TGTG-----ACTTTTAT-TTTCTT
gi|90701 : ACAT--GTG--TATATATGGCTTCTAAATTACACGTGGGCGTAACCAGATCACGGATA---CAA--T-ACCCGTGAATG----TGCCTTTGGGAATGGATTATAAATTATAT--------TAATAGCTATTTCAATAAAAGAA----CG--CA-CAT----ATT--ATGTTCCTTTTTCTTT------AA-ATAGACAAAT-GGGTATAATGGTTAAAACTATAGGTGCAGATAATATAACAAAAGAT--AAAACATTTATTCATTAATATACTGACTTAATAAACA-T-AATTTGT--TATCA-C---GTAATAT---TCAT----TATGTAAGTGTTTG---TAAT--ATGA-T--AAA-C-G-TT--T-TA-TCTTAGGT--G--T-ATAAAA-GACATAACAA--TAT-----ATAC--G---C-CG-----AT-C-G------TT-AC-TT--AAT--TT-G---CC--GGCGGTTTACAAG-T-TAG----GTGAATAGC-C---CAT--A-TTTG-AA-ATCCT--CGTACA--G---G--AGGTCAACCT-AA-AG--------C---------A--------TG--------GC-TG-C-A--T-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCACCGGTAGTGGAGGATTAAGCG--CC-TT-T-----------C-CTATT-T-----TCT---TACAT-T---T-TTCTAAACTA-TT-ACTA-CTGT---TG-----ACTTTTAT-TTTCTT
gi|90702 : ACAT--GTA--TATATATGGCTTCTAAATTACACGTGGTCGTAACCAGATCGCG---ATTACAA--T-ACCCGTGAATG----TGCCTTTGGCAATGGATTATCAATTATAT--------TAAAAGCTATTTCATTAAA--------AGAACG-CAT----AT---ATGTCCCTTTTTCTTT------AA-ATAGACAA-TTGGGTATAATGAT-AAAACTATAAGTGCAGACATTATAACAAAAGAT--AAAACATTTATTCATTAATATACTGACTTAATAAACA-TAA-TTTGT--TATCA-CTTGAT-AT-----TCAT--ATTATGTAAATGTTTG---TAAC--ACGA-T--AAA-A-G-TT--T-TA-TCTTAGGT--G--T-ATAAAA-GACAT--AAA--TAT-----
gi|90703 : AT--GTAACTATATATGGCTTCTAATTCAAATGCGGTCGTCAACAGATTGCA---A---CAACAATACCTGTAAAGT----TGCCTTAATCAATGGGTTATAATTGCTAT--------TAATAGCTATTTCAATAAATACAAAACC---CAACAT----ATT--ATGTGCCTTTTTCTTT------AA-ATAAACAAAT-GGGTATAATGAT-GAAACTATAAATACAGAAAATACAGCAAAAGAT--AAAATATTTATTAATTTATATGCTGACATAATAAAAA-T-ACTTT-T--TATCC-TTTA----TAT---GCAT--GTTATGCAAATATCTA---TAAC--TTG--T--AAACC-G-TT--T-TA-TTTTAGGT--A--T-ATAAAA-TATCT--AAA--TAT-----ATATTTT---A-CG-----AC-C-G------TT-AC-TT--TAT-ATTGG---C---GGCGGTTTACCAG-T-TAG----GTGAATAG--C---CCTT-G-TTTTGCA-ATCCT--CCTTCA--T---G--AGGTCAACCC-AC-C---------C---------A--------TG--------GT-TG-T-A--C-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCACCGGTCGTGGAGGATTAAGCG--TC-TA-T-----------C-CTCAT-T-----TCT---TAGAT-AT--T-T-CTTA--TC-T--ACTG-CTCC-TGTG-----ACTTTAAA-TTTCT
gi|90704 : --GTG--TATATATGGATTCTAAATTGCATGT-GTTGTAACCAGATCTCGATTA---CAG--T-ACCTGTGAAAT----TGCCTTTGGCAGTGGATTATAAATGCTAT--------TAAAAGat
gi|90705 : --TATACATGGCTTCTAAATTACACGTGGTCG------AAT-------A---CAA--T-ACCCGTGAATG----TGCCTTTGACAATGGATTATAAATTATAT--------TAATAGCTATTTCAATAAAAAAAAAA-CG--CG-CAT----ATT--ATGTCCCTTTTTCTTT------AA-ATAGACAAAT-GAGTATAATGGT-AAAACTATAAGTGCAAAAAATATAACAAAATAT--AAAATATTTATTCATTAATATACTGATTTAATAAACA-TAA-TTTGT--TATCA-CTTTGTATTA------AT--ATTATGTAAATGTTTG---TAAC--ATGG-C--AAA-C-G-TT--T-TA-TCTTATGT--G--T-ATAAAA-GACATA-AAA--AAT-----ATATATG---T-CG-----CC-C-G------TT-AC-TT--TAT--TT-G---CT--GGCGGTTTACCAG-T-TAG----GTGAATAGC-C---CAT----ATTAGAA-ATCCC--CGCTCA--T---G--GGGTCAACCTAAA-G---------C---------A--------TG--------GT-TG-C-A--T-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCACCGGTCGTGGAGGATTAAGCG--CC-TT-T-----------C-CTATT-T-----TCT---AACAT-A---T-T-CCCA--AA-T-------------TTG-----ACCGTTAT-TTTCTT
gi|90706 : --------C---CA-CAT----ATT--ATGTCCCTTTTTCTTC-AAAA------AAA-AAAT-GTGTATAGCGGT-GAAACTAAAAATGCAGATAATGTAGCAAAAGATAAAAAAAAGATATTTATTGATATACTGACATAATAGAAA-A-A-GTG-T--TATCACTTTA--GAT-----TCAT--ATTATGCAAATGTTTG---TAAC--ATAA-A--AAA-ACG-TT--T-TA-TCTAAGGC--A--T-ACGCAA-GACCT--TAA--AAT-----ATA----------------AT-C-G------TT-AC-TT--TAT-ATT-G---CT--GGAGGTTTACCAG-T-TAG----GTAAATAG--C---CCTT-A-TTTG-AA-ATCCT--CGATCA--T---T--AGGTCAACCCAAA-C---------C---------A--------TG--------GT-TG-T-A--C-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCATCGGTAGTGGAGGATTTAGCG--CG-TT-T-----------C-TTATT-A-----TCT---TAAAA-A---TGT-CTTA--CT-T--ACCT--TGT--CTG-----ATTTTTAT-TTTCTT
gi|90707 : GGAACAAGAAGT-A-ATT-CA-TA-CG-TTTGATA-TAAGTTTTAT--GTTATGGAAATCGTTG---TTAT---CGACT--AAA-A-G-TT--T-T--TGTT-GGTGAA--T-ATAAAAATACCT--CGA--AAT-----GTGTATGC--T-GT-----AT-C------------------CAT-A-C-GTTTC---GGCGGTTTGCTAG-T-ACT----GCGAATAGC-C---TAAT-T-TTGATA---TCCT--CATTGA--TAT-G--AGGTCAACCC-AT-C---------CAGTGGAAT-G--------TG--------GT-TG-T---------CTTACAAT--TGC-TACAGTCATCAGTCGTGGAGGATTGAGCG--CC-TT-T-----------TACTGTC-C-----TCT---CTCTT-T---C-T-CTCT--TA-T--
gi|90708 : ---TTAT--GTTATGCAAATCGTTG---TAAC---CGACT--GAA-A-G-TT--T-T--TGTT-GGTGAA--T-ATAAAA-TACCT--CGAAATGT-----GTACGTGGAAT-CC-----AT-CCG------TT----TT------------------GGCGGTTTGCTAG-T-ACT----GTGAATAGC-C-----TA-A-TTTTGAA-ATCCT--CATTAA--TTT-G--AGGTCAACCA-AT-C---------CA--------G--------TG--------GTATG-T-GGTTGT--CTTACAAT--TGC-TACAATCACCGGTCGTGGAGGATTGAGCG--CA-TT-TA----------A-CTGTT-T-----TCT---TTC-T-G---TCT-TTCT--TA-T--GCCTAATAC-AATA-----ACTTTC-T-TTTCTTgtctaataatataactttttgttctt
gi|90709 : ---TTAT--GTTATGCAAATCGTTG---TTAC---CGA-C--TAA-G-T-TT--T-TG-T---AGGTGAA--T-ATAAAA-TACCT--CGA--CAT-----TTCTATG---T-TGT----AT-C-C------AT-AC------GT-ATC-G--------GTGGTTTG-----T-TAGAACTGTGAATAGC-C---AAAT---TTTA-AA-ATCCT--CATTGA--TTA-G--AGGTCAACCC-AT-C---------CAGTGGGAT-G--------TG--------GT-TG-T---------CTTATAAT--TGC-TACAATCACCAGTCGTGGAGGATTGAGCG--CT-TT-T-----------A-CTGTC-T-----TCT---
gi|90710 : ---TTAT--GCTATGCAAATTGTTG---TAAC---CGACT--AAA-A-G-GT--T-TT-GCT--GGT--GAGT-ATAAAA-TACCT--CGA---A--------ATGTG---T-AC-----ATAC-G------TC-A--TT--TAT-ATC-----T---GGCGGTTTACTAG-T-AGA----GCAGATAGC-C------T-A-ATCATAA-GT--T--AAATTA---------AGGTTAACCC-AT-CTTGTGGGA-T---------G--------TG--------GT-TGCC-A--T-T------CAAT--TGC-TACAATTGCCGGTCGTGGATGATTGAGAGTCCC-TT-T-----------CACTGTT-T-----Tctctatctttcttatgtctaataatataactttctgttctt
gi|90711 : ---TTAT--GTTATGCCAATCGTTG---TAAC---CGG----------------C-TA-TCT--GGTGAA--T-ATAAAA-TAGCT--CGA--AATTA---ATA---------CG-----AT---G------TA-AT-CA--AAC-GTT-T---T---GGCGGTTGGCTAG-T-ACT----GCGAATAG------GCTT-A-TTTTGAA-ATCCT--CATTAATTT---G--AGGTCAACCT-AT-CAAGTGAGA-T---------G--------TG--------GT-TG--------T--CACACAAT--TGC-TACAATCGCCGGTCGTGGAGGATTGAGCA--CC-TT-TA----------A-CTGTC-T-----TCTC--TAGAT-CT--T-T-CTTA--Tatctctgtatttcttctgtctcgtaaagtaacatctttttctt
gi|90712 : ---TTAT--GTTATGCAAATCGTTG---TAAC---CGACT--AAA-C-GATT--T-GA-T----GGTGAA--T-ATAAAA-TACCT--CGA--AAT-----GTGTATG-------------T-T-G------TA----TC--CAT-A-C-GTTTT---GGCGGTTTGCTAG-C-ACT----GCGAATAG------CCTA-A-TTTTGAA-ATCCT--CATTGATTT---A--TAGTCAACCC-AT-C---------g
gi|90712 : AA-ATCCT--CAATGA--TTT-G--AGGTCAACCT-AT-C---------CAGTGGAAT-G--------TG--------GT-TG-T---------CTTATAAT--TGC-TACAATCACCGGTCGTGGAGGATTGAGCG--CC-TT-T-----------TGCTGTC-T-----TCT---tagtgggatgtggttgtcgaattttgaaatcctcaatgatttgaggtcaacctatccagtggaatgtggttgtcttataattgctacaatcaccggtcgtggaggattgagcgccttttgctgtcttctctctatctttcttctgtctaataatataactttcttttctt
gi|90713 : ttatgttatgcaaatcgttgtaaccgactaaacgatttgatggtgaatataaaatacctcgaaatgtgtatgttgtatccatacgttttggcggtttgctagcactgcgaatagcctaattttgaaatcctcattgatttatagtcaacccatctagtgggatgtggttgtcgaattttg---TTAT--GTTATGCAAATCGTTG---TAAC---CGA-CTAAAA-A-A-AA--T-GA-T----GGTGAA--T-ATAAAA-TACCT--CGA----------A-ATGTG---T-AA-----GT-T-G------TA----TC--CAT-A-C-G---TTTTGGCGGTTTGCCAG-T-ATT----GCGAATAGC-C---TAAT---TTTA-AA-ATCCT--CATTGATTT---G--AGGTCAACCctctatctttcttctgtctaataatataactttcttttctt
gi|90714 : T--GTTATGCAAATCGTTG---TAACCTAC---T--AAA-A-G-TT--TGTGCTGTTGAAT--A--T-ATAA---TATCT--CGA--AAT-----------G---T-CT-----AT---G------TT-ATATC--CAT-A-C-GTTTC---GGCGGTTTGCTAG-T-ACT----GCGAATAGC-C-----TA-A-TTTTGAA-ATCCT--CATTGA--TTTGG--GGGTCAACCC-AT-C---------CAGTGGGAT-G--------TG--------GT-TG-T---------CTTACAAT--TGC-TACAATCACCGGTCGTGGAGGATTGAGCG--CC-TT-TTACTGAATCTCT-CTGTCTT-----TCT---TATGT-A---T-
gi|90715 : T--GTTATGCAAATCGCTG---TAAC---TGACT--AAA-A-G-TT--T-TT-GCT--GGT--AAAT-ATAAAA-TACCT--CGA--AAT-----GTGTATGA--T-GC-----AT-C-C------AA-AC-GT--TTT-A------------GCGGTTTGCTAG-T-GCT----GCGAATAGT-C-----TT-A-TTTTGAA-ATCCT--CATCAA--TTT-G--AGGTCAACCC-AT-C---------CAGCTGGAT-G--------TG--------GT-TG-T---------CTTACAAT--TGT-TACAATCACCGGACGTGGAGGATTCAGCA--CC-TT-TA----------A-CTGTC-T-----TCTC--TCCAT-CT--T-T-CTTA--TG-T---CTA-ATAA-GATA-----ACTTTC-T-TTTCTTaataacataactttcttttctt
gi|90716 : T--GTTATGCAAATCATTG---TAAC---CGACT--TAA-A-G-TT--T-TT-GCT--GGTGAA--T-ATAAAA-TACCT--CAA------------ATGTG---T-AC-----AT-C-C------AA-AC-CT--T----TT-G---C-----CGGTTTGCTA--T-TACT---GCGAATAGC-CAAATTTT-G------AA-ATTCT--CGATAA--TTT-G--AGGTCAACCC-AT-C---------CAGCGGGAT-G--------TG--------GT-TG-T---------CTTACAAA--TGC-TATAATCACCGGTCGTGGAGGATTGAGCA--TC-TT-TA----------A-CTGGC-T-----TCTC--TCTATCG---T-T-CTTA--TG-T---CT-----C-ACTAGATATACTTTC-T-TTTCTT
gi|90717 : T--GTTATGCAAATCGTTG---TAAC---CGACT--AAA-T-G-TT--T-TA-GCT--GGTGAA--T-ATAAAA-TACCT--CGA--AA--------ACGTG---TACG-----AT---G------CA-TC-CA--AGC-GTT-T---T---GGCGGTTTGCTAG-T-ACT----GCGAATAGC-C---TATT-T-TTT-TAA-ATCCT--CATAAAATT---G--AGGTCAACCC-A------------------------------------------------------T--CT------------TACAATCGCCGGTCGTGGAGGATTGAGCA--CC-TTAA-----------A-CTGTT-T-----TCTCTCTATCT-----T-T-CTTA--TG-T---CTA-ATAA-GATA-----ACTTTC-T-TTTCTT
gi|90718 : TATGCAAATATTTG---TAAC---TGACT--GAA-A-GAAT--T-TG--CTAAGGC--A--C-ATAAAA--A-CT--CGA--AATTCGTGATATGCA---T-CC-----A--------------GC-TT--AA--AT------T---GGCGGTTTGTTTGAT-TA-----ACGAATAG--T---CAGA-G-TTT-TAA-ATCCTCACACGCA--T---G--AGTTCAATCC-AT-T---------CTAGGAT---G--------TG--------AT-TA-C-A--A-T--CTGACAAA--TGT-T-CAGTCACTGGTCGTGG
gi|90719 : gaATACATGTATTTG---TA-T--ATG--C--AAA-T-G-TTAGT-GA-CCT---GT--A--TTATAAAA-TATCT--TGA--AA--------ATCAG---T-CATTAGTAT-C-C------TGTAT-TT--TATTA-----------GGCAAATTGCTTG-TATAG-----TGAA--GCGC---CTTT-A-TTTG-AA-ATCCT--CATTAA--C---GTCAGGTCAGCAC-AT-C---------TCAGTTTGATG--------TG--------GC-TG-T-C--T-G--GTTA-AA----GC-TTAAACCACCGGTGGTGGAGGATTAAGCA--CC-TT-T-----------C-------------TCT---TACAT-C---T-T-taaatta
gi|90720 : gcTATGCAGTTTTGTGGGTTAAC--AGGG-C--TAA-A-C-CT--T-TA-TCTGAGGT--T--T-ACAGA--CACAT--CGA--TAT-----AT-TAT----C-CT-----AT-T-G------CA-A--TT--AA--------------GGTGGTTTGCCAG-T-TCG----GTGAA-A---C---TCTT-G-TCTGCAAGAACAT--CACTTAG-T---G--AGTTTAACCC-ATAC---------T---------G--------CGTGCATGTGGT-TG-C-A--C-T--CCTGTTAT--TGC-TTCA-TCACCAGTGTTTGTGGATAAGGCG--CC-TT-T-----------T-CTATT-T-----TCT---AACgctatctttccta
gi|90721 : gTATGCAAATGTTAG---TAAC---CAACT--AAA-A-G-TT--T-TA-ACTGGTGT--A--C-ATAAAA-TACCT--CGA--AAT--------TCAG---T-CA-----GT-T-GTATCCCTG-AT-TTTCAAT-A-----------GGCAAATTGCTTG-T-ACA----GCGA--AGC-G---CCTTAA-TTTG-AA-ATTCT--CACTAACGT---G--AGGTCAGCCC-AT-CTCAATTTGAT---------G--------TG--------GT-T--T-A--C-TGACTT----T--AGCTTAAAAGCACCGGTCGTGGAGGATTAAGCA--CC-TT-T-----------CTCTTAC-T-----TCT---TGC-T-A---T-T-TTtgcctttctttatctatcaagtttgacattttctt
gi|90722 : G---T-CG-----AT-C-G------TT-AC-TT--AAT--TA-G---CT--GGCGGTTTACCAG-T-TAG----GTGAATAGC-A---CAT--A-CTTA-AA-ATCAT--CG--CA--C---A--GGATCA-------------------------------------TG--------GT-TG-C-A--T-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCACCGGTTGTGGAGGATTAAGCG--CC-TT-T-----------C-CCATT-T-----TCC---TACAT-A---T-T-------TA-TTAACTA-CTACAACTGTTC--ACTTTTAA-TTTCTtcct
gi|90723 : GCGGTTTGATAG-T-ACT----GCGACTAGC-------TT-AATTTTTAA-ATCCT--CATTAA--TTT-G--AGATCAACCC-AT-C---------CA--------G--------TG--------GGGTG-TGA--T-TGTCTTACAAA--TGC-TGCAATCACCGGTCATGGATGATTGAACG--CC-TT-TA----------A-CTGTC-T-----CCT---TTC-T-ATCTT-T-CTTA--TG-T--
gi|90724 : AA-ATCCT--CATTGA--TTT-G--AATTCAACCT-AT-C---------C---------GGTGGGATGTG--------GT-TG-T---------CTTACAAT--TGC-TACAATCACCGGTCGTGGAGGGTTGAACG--CG-TT-T-----------CACTTTC-T-----TTT---ctaataagataactctcttt
gi|90725 : ctcaatttgAA-ATCCT--CATTGA--TTT-G--AGGTGAACCC-AT-C---------CAGTGGGAT-G--------TG--------GC-TG-T---------CTCACAATATTGT-TATAATCACCGGTCGTGGAGGATTGAGCG--AT-TT-TAC---------T-CTATCTT-----TCT---Tctctttcttatgtctaacaacataacattcttttctt
gi|90726 : AA-ATCCT--CATTGA--TTT-G--AGGTCAACCC-AT-C---------CAGTGGGGT-G--------TG--------GT-TG-T---------CTTAAAAT--TAC-TACAATTAGCGGTCGTAGATGATTGAGTG--CC-TT-TA----------A-CTGTC-T-----TCT---ttcttgtgttt
gi|90727 : --------GT-TG-T-T--G-T--TTTACAAT--TGC-TACAATCGCCGGTCGTGGATGATTGAGCG--CC-TT-T-----------TACTGTC-TC----TCT---C---T-A---TCT-TTCA--TA-T--ctctatctttctaatgtctaataatataacattttgttct
gi|90728 : aat--------GT-TG-T-T--G-T--TTTACAAT--TGC-TACAATCGCCGGTCGTGGATGATTGAGCG--CC-TT-T-----------TACTGTC-TCTCTGTCT---TTCAT-A---TGT-CTAA--TA-g
Alignments
lowQualScore : 111 11111111 333333333333 111111 1111111 11 11 33333333333333333 11 222222 66666666666666666666666666666 111111111 1 2222222222222 11111
lowQualScore : 44 44 0 1 000 555 8888 77777 11111111 444444444444 3 6666 44 888888 3 9 1 3 1 1 0 44 0 1 3 2 5 8 8 66 2 22 1 5555 0 22 0 11 222 8888888 22 1 1 2 22 1 1 11 55 33 1 33 11 2 9999999999999999 555 8888888888888 4 1 2 2 33333333333333333 1 99999999 11 8888888888 44 1 11 1 222222 11 2 22 66666666666666666666666666666 44444444 2 1 888888888 11 1 3 11 1 1 3333333333333 2 33 44444 666 1 0 88888 6 1 22 1 888 777 66 00000 3 2
lowQualScore : .. .. . . ... ... .... ..... ........ ............ . .... .. ...... . . . . . . . .. . . . . . . . .. . .. . .... . .. . .. ... ....... .. . . . .. . . .. .. .. . .. .. . ................ ... ............. . . . . ................. . ........ .. .......... .. . .. . ...... .. . .. ............................. ........ . . ......... .. . . .. . . ............. . .. ..... ... . . ..... . . .. . ... ... .. ..... . .
lowQualScore : 66 22 2 0 888 444 3333 55555 22222222 333333333333 1 5555 22 555555 1 8 0 1 0 2 8 22 7 0 8 9 7 6 6 88 9 11 6 1111 2 33 7 55 555 0000000 00 4 4 9 00 4 4 00 77 99 4 88 66 4 2222222222222222 444 5555555555555 3 4 9 9 00000000000000000 4 55555555 44 2222222222 00 2 77 0 555555 77 5 11 44444444444444444444444444444 44444444 4 2 111111111 77 2 8 77 2 2 7777777777777 2 88 44444 111 2 4 33333 4 7 55 9 222 888 22 00000 9 4
consensus : ATGTACAT--GTA--TATGTATTGCTTCTNAATCACACGTGGTCGTTAACAGATCGCG---A---CGA--A-ACCTGTGAAGN----TGCCTTTGGCAATGGATTATCAATGCTAT--------TAATAGCTATTTCAATAAA--------C---CA-TAT----ATT--ATGTCCCTTTTTCTTTTAAAATAA-ATAAACAAATTGAGTATTATGGT-GAAACTAAAAATGCGGAAAATATAACAACAGAT--AAAATATTTATTCATTTATATANTGACGNAATAAAAA-T-A-TTT-T--TATCA-TTTAATAATAA---TCAT--GTTATGCAAATNTTTG---TAAC--ACGA-T--AAA-A-G-TT--T-TA-TCTTAGGT--A--T-ATAAAA-TACCT-CGAAAT-----ATGT-N-----TG---T-----C-N-----AT-C-GT-TAC-TTTAT-ATC-G---C----GGCGGTTTGCCAG-T-TAG----GCGAATAGC-C---CCTT-G-TTTATAA-ATCCT--CATTNA--T---G--AGGTCAACCC-AT-C---------C---------G--------CG--------GT-TG-T-A--T-T--CTTACAAT--TGC-TACAATCACCGGTCGTGGAGGATTGAGCG--CC-TT-T-----------C-CTGTC-T-----TCT---TACAT-A---T-T-CTCA--TA-T--ACTT-CTGC-ACTG-----ACTTTTAT-TTTCTT
Reference ( family-586 ) : ATGTACAT--GTA--TATGTATTGCTTCTNAATCACACGTGGTCGTTAACAGATCGCG---A---CGA--A-ACCTGTGAAGN----TGCCTTTGGCAATGGATTATCAATGCTAT--------TAATAGCTATTTCAATAAA--------C---CA-TAT----ATT--ATGTCCCTTTTTCTTTTAAAATAA-ATAAACAAATTGAGTATTATGGT-GAAACTAAAAATGCGGAAAATATAACAACAGAT--AAAATATTTATTCATTTATATANTGACGNAATAAAAA-T-A-TTT-T--TATCA-TTTAATAATAA---TCAT--GTTATGCAAATNTTTG---TAAC--ACGA-T--AAA-A-G-TT--T-TA-TCTTAGGT--A--T-ATAAAA-TACCT-CGANAT-----ATAT-N-----TG---T-----C-N-----AT-C-GT-TAC-TTNAT-ATC-G---C----GGCGGTTTGCCAG-T-TAG----GCGAATAGC-C---CCTT-G-TTTATAA-ATCCT--CATTNA--T---G--AGGTCAACCC-AT-C---------C---------G--------CG--------GT-TG-T-A--T-T--CTTACAAT--TGC-TACAATCACCGGTCGTGGAGGATTGAGCG--CC-TT-T-----------C-CTGTC-T-----TCT---TACAT-A---T-T-CTCA--TA-T--ACTT-CTGC-ACTG-----ACTTTTAT-TTTCTT
gi|90693 : ATGTACAT--GTA--TATGTATTGCTTCTCAATCACACGTGGTCGTTAACAGATCGCG---A---TGA--A-ACCTGTGAAGA----TGCCTTTGGCTATGGATTATCAATGCTAT--------TAATAGCTATTTCAATAAA--------C---CA-TAT----ATT--ATGTCCCTTTTTCTTTTAAAATAA-ATAAACAAATTGAGTATTGTGGT-GAAACTAAAAATTTGGAAAATATAACAACAGAT--AAAATATTTATTCATTTATACAATGACGAAATAAAAA-T-A-TTT-C--TATCA-TTTAATAATAA---TCAT--GGTATGCAAATGTTTG---TAAC--ATGA-T--AAA-A-G-TT--T-TA-TCTTAGGT--A--T-ATAAAA-CATCT-TAATAT-----ATAT-T-----TG---T-----C-T-----AT-C-GT-AAC-TTAAT-ATC-G---C----GGCGGTTTACCAG-T-TAG----GTGAATTGC-C---CCTT-G-TTTATAA-ATCCC--CATCCA--T---G--GGGTCAACCA-AA-C---------T---------A--------CG--------GT-TG-T-A--T-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCACCGGTCGTGGAGGATTAAGCG--CC-TT-T-----------C-CTATA-T-----TCT---TACAT-A---T-T-CTCA--TA-T--ACTT-CTGC-GCTT-----ACTTTTAT-TTTCTT
gi|90694 : ATGTACAG--GTA--CATGTATTGCTTCTCAATCACACGTGGTCGTTAACAGATCGCG---A---TGA--A-ACCTGTGAAGA----TGCCTTTGGCAATGGATTATCAATGCTAT--------TGATAGCTATTTCAATAAA--------T---CA-TAT----ATT--ATGTCCCTTTTTCTTTTAAAATAA-ATAAACAAGTTGAGTATTATGGT-GACACTAAAAATGTGGAAAATATAACAACAGAT--AAAATATTTATTCATTTATATAATGACGAAATAAAAA-T-ATTTT-T--TATCA-TTCAATTATAA---GCGT--GGTATGCAAATGTTTG---TAAC--ATGA-T--AAA-A-G-TT--T-TA-TCTTAGGT--A--T-ATAAAA-GATCT-TAATAT-----ATTT-T-----TG---T-----C-T-----AT-C-GT-TAC-TT-AT-ATC-G---C----GGCGGTTTACCAG-T-TAG----GTGAATAGC-C---CCTT-G-TTTATAA-ATCCC--CATCCA--T---G--GGGTCAACCA-AA-C---------T---------A--------CG--------GT-TG-T-A--T-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCACCGGTCGTGGAGGATTAAGCA--CC-TT-T-----------C-CTATA-T-----TCT---TACAT-A---T-T-TTCA--TA-T--ACTT-CTAC-ACTA-----ACTTTTAA-TTTCTT
gi|90695 : ATGCACAT--GTA--TATGTATTGCTTCTCAATCATACGTGGTCGTTAACAGATCGAA---A---CGA--A-ACCTGTGAAGGAAGTCGCCTTTGGCAATGGATAATCAATGCTAT--------TAATAGCTATTTCAATAAT--------C---CA-TAT----ATT--ATGTCCCTTTTTCTTTTAAAATAA-ATAAACAAATTGAGTATTATGGT-GAAACTAAAAATGTGGAAAATATAACAACAGAT--AAAATATTTATTCATTTATATAATGACGAAATAAAAA-T-A--TT-T--TATCA-TTTAATAATAA---TCAT--GGTATGCAAATGTTTG---TAAC--ATGA-T--AAA-A-G-TT--T-TA-TCTTAGGT--A--T-ATAAAA-GATCT-TAATAT-----ATGT-T-----TG---T-----C-T-----AT-C-GT-TAC-TTTGT-ATC-G---C----GGCGGTTTACCAG-T-TAG----GTGAATAGC-C---CCTT-G-TTTATAA-ATCCA--CATCCG--T---T--GGGTCGACCA-AA-C---------T---------A--------CG--------GT-TG-T-A--T-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCACCGGTCGTGGAGGATTAAGCG--CC-TT-T-----------C-CTATA-T-----TTT---TACAT-A---T-T-CTCA--TA-T--ACTT-CTGC-ACTG-----ACTTTTAT-TTTCTT
gi|90696 : ATGTACAT--GTA--TATGTATTGCTTCTCAATCATACGTGGTCGTTAACAGATCGCG---A---TGA--A-ACCTGTGAAGA----TGCCTTTGGCAATGGATTATCAATGCTAT--------TAATAGCTATTTCAATAAA--------C---CA-TAT----ATT--ATGTCCCTTTTTCTTTTAAAATAA-ATAAACAAATTGAGTATTATTGT-GAAACTAAAAATGTGGAAAATATACAAACAGAT--AAAAAATTTATTCATTTATATAATGACGAAATAAAAA-T-A-TTT-T--TATCA-TTTAATAAAAA---TTAT--GGTATGCAAATGTTTG---TAAC--ATGA-T--AAA-A-G-TT--T-AA-TCTTAGGT--A--T-ATAAAA-TATCT-TAATAT-----ATGT-T-----TG---T-----C-T-----AT-C-GT-TAC-TTTAT-ATC-G---C----GGCGGTTTACCAG-T-TAG----GTGAATAGC-C---CCTT-G-TTTATAA-ATCCC--CATCCA--T---G--GGGTCAACCA-AA-C---------T---------A--------CG--------GT-TG-T-A--T-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCACCGGTCGTGGAGGATTAAGCG--CC-TT-T-----------C-CT-------------------AT-A---T-T-CTCA--TA-T--ACTT-CTGC-ACTG-----ACTTTTAT-TTTCTT
gi|90697 : ATGCACAT--GTA--TATGTATTGCTTCTCAATCATACGTGGTCGTTAACAGATCGCG---A---TGA--A-ACCTGTGAAGT----CGCCTTTGGCAATGGATTATCAATGTTAT--------TAATAGCTATTTTAATAAA--------C---CA-TAT----ATT--ATGTCCCTTTTTCTTTTAAAATAATAAAAACAAATTGAGTATTATGGT-GAAACTAAAATTGTGGAAAATATAATAACAGAT--AAAATATTCGTTAATTTATATAATGACGAAATAAAAA-T-A-TTT-T---ATCA-TTTAATAATAA---TCAT--GGTATGCAAATGTTTG---TAAC--ATGA-T--AAA-A-G-TT--T-TA-TCTTAGGT--A--T-ATAAAA-GATCT-TAATAT-----ATGT-T-----TG---C-----C-T-----AT-C-GT-TAC-TTTAT-ATC-G---C----GGCCGTTTACCAG-T-TAG----GTGAATAGC-C---CCTT-G-TTTATAA-ATCCC--CATCCA--T---G--GGGTCAACCA-AA-T---------T---------A--------CG--------GT-TG-T-A--T-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCACCGGTCGTGGAGGATTAAGCG--CC-TT-T-----------C-CTATA-G-----TCT---TACAT-A---T-T-C-CA--TA-T--ACTT-CTGC-ACTT-----TGTTTTATATTTTTT
gi|90698 : ATGTACAT--GTA--TATGTATTGCTTTTCAATCATACGTGACCGTTAACAGATCGCG---A---TGA--A-ACCTGTGAAGA----TGCCTTTGGCAATGGATTATCAATGCTAT--------TAATAGCTATTTATATAAA--------C---CA-TAT----ATT--ATGTCCCTTTTTCTTTTAAAATAA-ATAAACAAATTGAGTTTTATTGT-GAAGCTAAAAATGTGAAAAATATAACAACAGAT--AAAATATTTATTTATTTATATAATGACGAATTAAAAA-T-A-TTT-T--TATCA-TTTAATAATAA---TCAT--AGTATGCAAATGTTTG---TAAC--ATTA-T--AAA-A-G-TT--T-TA-TCTTAGGT--A--T-ATAAAT-GATCT-TAATAT-----ATGT-T-----TG---T-----C-T-----AT-C-GT-TAC-TTTAT-ATC-G---C----GGCAGTTTACCAG-T-TAG----GTGAATAGC-C---CATT-G-TTTATAA-ATCCC--CATCCA--T---G--GGGTCAACCA-AA-T---------C---------A--------CG--------GT-TG-T-A--T-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCACCGGGCGTGGAGGATTAAGCG--CC-TT-T-----------C-CT-------------------AT-A---T-T-TTCA--TA-T--ACTT-CTGT-ACTG-----ACTTTTAT-TTTCTT
gi|90699 : ATGTACATCTATA--TATATATTGCTTCTTAATCACACGTGGTCGTTAACAGATCGCG---A---CGA--A-ACCTGTGAAGA----TGCCTTTGGCAATGGATTATCAATGCTAT--------TAATGGCTATTTCAATAAA--------C---CA-TATGTATATT--ATGTCCCCTTTTCTTTTAAAATAA-ATAATCAAATTGAGTATTACGGT-GAAA--AAATATTC--AAAATATAACAACAGAT--AAAATATTTATTCATTTATATAATGACG-AATAAATA-T-A-TTT-T--TATCA-TTTAATAATAA---T-ATTCG-TATGCAAATGTTTG---TAAC--ATGA-T--TAA-A-G-TT--T-TA-TCTAAGGT--A--T-ATAAAA-GGTCT-TAGTAT-----ATCC-T-----TG---T-----C-G-----AG-C-GT-TAC-TTTAT-ATC-G---C----GGCGGTTTATCAG-T-AAG----GTGAACAGC-T---CCTT-G-TTTATAA-ATCCC--CATCCA--T---G--GGGTCAACCA-AA-C---------T---------A--------CG--------GT-TG-T-A--T-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCGCCGGTCGTGGAGGATTAAGCG--CC-TT-T-----------C-CCATA-T-----TCT---TACAT-A---T-T-CTCA--TA-T--ACTT-TTGC-ACTT-----ACTTTTCT-TTTC
gi|90700 : ATGTACAT--GTA--TATGAATTGCTTCTAAATCACACGTGGTTGTTTACAGATCGCA---A---CAA--T-ATCTGTGAAAA----TGCCTTTGATAATAGATTATAAATGCTATCATGTTATTAATAGCTATTTCAATAAA--------A---CA-TAT----TTTGCATGTC---TTTTCTTT------AA-ATAAACAAAT-GAATATTATGGT-GAAACTATAAATGCAGAAAATGCAACGATATAT--AAAATACGTGTTCATTGATATATTGACATAATAAAAA-T-A-TTT-TGTTATCA-TTT--TA-TAA---TCAT--GTTATGCAAATATTTG---TAAC--ATGA-T--AAA-C-G-TT--T-TA-ACTTAGGT--A--T-ATAAAA-GATCT-TGATAT-----GTGT-A-----TA---T-----C-G-----AT-C-GT-TAC-TTTAT-ATC-G---C----GGCGCTTAATCAG-T-TAG----GTGAATAGC-C---CCTT-G-TTTATAA-ATTCC--CCTACA--T---G--AGGTCAACCC-AC-C---------C---------A--------CG--------GT-TG-T-A--T-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCACCGGTCGTGGAGGATTAAGCG--CCTTT-T-----------C-CTATT-T-----TCT---TACAT-A-------CTTA--TACT--ACTG-CTGC-TGTG-----ACTTTTAT-TTTCTT
gi|90701 : ACAT--GTG--TATATATGGCTTCTAAATTACACGTGGGCGTAACCAGATCACGGATA---CAA--T-ACCCGTGAATG----TGCCTTTGGGAATGGATTATAAATTATAT--------TAATAGCTATTTCAATAAAAGAA----CG--CA-CAT----ATT--ATGTTCCTTTTTCTTT------AA-ATAGACAAAT-GGGTATAATGGTTAAAACTATAGGTGCAGATAATATAACAAAAGAT--AAAACATTTATTCATTAATATACTGACTTAATAAACA-T-AATTTGT--TATCA-C---GTAATAT---TCAT----TATGTAAGTGTTTG---TAAT--ATGA-T--AAA-C-G-TT--T-TA-TCTTAGGT--G--T-ATAAAA-GACAT-AACAAT-----ATAT-A-----CG---C-----C-G-----AT-C-GT-TAC-TTAAT--TT-G---CC---GGCGGTTTACAAG-T-TAG----GTGAATAGC-C---CAT--A-TTTG-AA-ATCCT--CGTACA--G---G--AGGTCAACCT-AA-AG--------C---------A--------TG--------GC-TG-C-A--T-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCACCGGTAGTGGAGGATTAAGCG--CC-TT-T-----------C-CTATT-T-----TCT---TACAT-T---T-TTCTAAACTA-TT-ACTA-CTGT---TG-----ACTTTTAT-TTTCTT
gi|90702 : ACAT--GTA--TATATATGGCTTCTAAATTACACGTGGTCGTAACCAGATCGCG---ATTACAA--T-ACCCGTGAATG----TGCCTTTGGCAATGGATTATCAATTATAT--------TAAAAGCTATTTCATTAAA--------AGAACG-CAT----AT---ATGTCCCTTTTTCTTT------AA-ATAGACAA-TTGGGTATAATGAT-AAAACTATAAGTGCAGACATTATAACAAAAGAT--AAAACATTTATTCATTAATATACTGACTTAATAAACA-TAA-TTTGT--TATCA-CTTGAT-AT-----TCAT--ATTATGTAAATGTTTG---TAAC--ACGA-T--AAA-A-G-TT--T-TA-TCTTAGGT--G--T-ATAAAA-GACAT---AAAT-----AT
gi|90703 : AT--GTAACTATATATGGCTTCTAATTCAAATGCGGTCGTCAACAGATTGCA---A---CAACAATACCTGTAAAGT----TGCCTTAATCAATGGGTTATAATTGCTAT--------TAATAGCTATTTCAATAAATACAAAACC---CAACAT----ATT--ATGTGCCTTTTTCTTT------AA-ATAAACAAAT-GGGTATAATGAT-GAAACTATAAATACAGAAAATACAGCAAAAGAT--AAAATATTTATTAATTTATATGCTGACATAATAAAAA-T-ACTTT-T--TATCC-TTTA----TAT---GCAT--GTTATGCAAATATCTA---TAAC--TTG--T--AAACC-G-TT--T-TA-TTTTAGGT--A--T-ATAAAA-TATCT-AAATAT-----ATAT-T-----TT---A-----C-G-----AC-C-GT-TAC-TTTAT-ATTGG---C----GGCGGTTTACCAG-T-TAG----GTGAATAG--C---CCTT-G-TTTTGCA-ATCCT--CCTTCA--T---G--AGGTCAACCC-AC-C---------C---------A--------TG--------GT-TG-T-A--C-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCACCGGTCGTGGAGGATTAAGCG--TC-TA-T-----------C-CTCAT-T-----TCT---TAGAT-AT--T-T-CTTA--TC-T--ACTG-CTCC-TGTG-----ACTTTAAA-TTTCT
gi|90704 : --GTG--TATATATGGATTCTAAATTGCATGT-GTTGTAACCAGATCTCGATTA---CAG--T-ACCTGTGAAAT----TGCCTTTGGCAGTGGATTATAAATGCTAT--------TAAAAGat
gi|90705 : --TATACATGGCTTCTAAATTACACGTGGTCG------AAT-------A---CAA--T-ACCCGTGAATG----TGCCTTTGACAATGGATTATAAATTATAT--------TAATAGCTATTTCAATAAAAAAAAAA-CG--CG-CAT----ATT--ATGTCCCTTTTTCTTT------AA-ATAGACAAAT-GAGTATAATGGT-AAAACTATAAGTGCAAAAAATATAACAAAATAT--AAAATATTTATTCATTAATATACTGATTTAATAAACA-TAA-TTTGT--TATCA-CTTTGTATTA------AT--ATTATGTAAATGTTTG---TAAC--ATGG-C--AAA-C-G-TT--T-TA-TCTTATGT--G--T-ATAAAA-GACATAAAAAAT-----ATAT-A-----TG---T-----C-G-----CC-C-GT-TAC-TTTAT--TT-G---CT---GGCGGTTTACCAG-T-TAG----GTGAATAGC-C---CAT----ATTAGAA-ATCCC--CGCTCA--T---G--GGGTCAACCTAAA-G---------C---------A--------TG--------GT-TG-C-A--T-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCACCGGTCGTGGAGGATTAAGCG--CC-TT-T-----------C-CTATT-T-----TCT---AACAT-A---T-T-CCCA--AA-T-------------TTG-----ACCGTTAT-TTTCTT
gi|90706 : --------C---CA-CAT----ATT--ATGTCCCTTTTTCTTC-AAAA------AAA-AAAT-GTGTATAGCGGT-GAAACTAAAAATGCAGATAATGTAGCAAAAGATAAAAAAAAGATATTTATTGATATACTGACATAATAGAAA-A-A-GTG-T--TATCACTTTA--GAT-----TCAT--ATTATGCAAATGTTTG---TAAC--ATAA-A--AAA-ACG-TT--T-TA-TCTAAGGC--A--T-ACGCAA-GACCT-TAAAAT-----ATA---------------------------AT-C-GT-TAC-TTTAT-ATT-G---CT---GGAGGTTTACCAG-T-TAG----GTAAATAG--C---CCTT-A-TTTG-AA-ATCCT--CGATCA--T---T--AGGTCAACCCAAA-C---------C---------A--------TG--------GT-TG-T-A--C-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCATCGGTAGTGGAGGATTTAGCG--CG-TT-T-----------C-TTATT-A-----TCT---TAAAA-A---TGT-CTTA--CT-T--ACCT--TGT--CTG-----ATTTTTAT-TTTCTT
gi|90707 : GGAACAAGAAGT-A-ATT-CA-TA-CG-TTTGATA-TAAGTTTTAT--GTTATGGAAATCGTTG---TTAT---CGACT--AAA-A-G-TT--T-T--TGTT-GGTGAA--T-ATAAAAATACCT-CGAAAT-----GTGT-A-----TGC--T-----G-T-----AT-C-CA-TACGTTT-----------C----GGCGGTTTGCTAG-T-ACT----GCGAATAGC-C---TAAT-T-TTGATA---TCCT--CATTGA--TAT-G--AGGTCAACCC-AT-C---------CAGTGGAAT-G--------TG--------GT-TG-T---------CTTACAAT--TGC-TACAGTCATCAGTCGTGGAGGATTGAGCG--CC-TT-T-----------TACTGTC-C-----TCT---CTCTT-T---C-T-CTCT--TA-T--
gi|90708 : ---TTAT--GTTATGCAAATCGTTG---TAAC---CGACT--GAA-A-G-TT--T-T--TGTT-GGTGAA--T-ATAAAA-TACCT-CGAAAT-----GTGT-A-----CG---TGGAATC-C-----AT-CCGT-T---TT-----------------GGCGGTTTGCTAG-T-ACT----GTGAATAGC-C-----TA-A-TTTTGAA-ATCCT--CATTAA--TTT-G--AGGTCAACCA-AT-C---------CA--------G--------TG--------GTATG-T-GGTTGT--CTTACAAT--TGC-TACAATCACCGGTCGTGGAGGATTGAGCG--CA-TT-TA----------A-CTGTT-T-----TCT---TTC-T-G---TCT-TTCT--TA-T--GCCTAATAC-AATA-----ACTTTC-T-TTTCTTgtctaataatataactttttgttctt
gi|90709 : ---TTAT--GTTATGCAAATCGTTG---TTAC---CGA-C--TAA-G-T-TT--T-TG-T---AGGTGAA--T-ATAAAA-TACCT-CGACAT-----TTCT-A-----TG---T-----T-GT----AT-C-CA-TAC----GT-ATC-G---------GTGGTTTG-----T-TAGAACTGTGAATAGC-C---AAAT---TTTA-AA-ATCCT--CATTGA--TTA-G--AGGTCAACCC-AT-C---------CAGTGGGAT-G--------TG--------GT-TG-T---------CTTATAAT--TGC-TACAATCACCAGTCGTGGAGGATTGAGCG--CT-TT-T-----------A-CTGTC-T-----TCT---
gi|90710 : ---TTAT--GCTATGCAAATTGTTG---TAAC---CGACT--AAA-A-G-GT--T-TT-GCT--GGT--GAGT-ATAAAA-TACCT-CGAA---------AT-G-----TG---T-----A-C-----ATAC-GT-CA--TTTAT-ATC-----T----GGCGGTTTACTAG-T-AGA----GCAGATAGC-C------T-A-ATCATAA-GT--T--AAATTA---------AGGTTAACCC-AT-CTTGTGGGA-T---------G--------TG--------GT-TGCC-A--T-T------CAAT--TGC-TACAATTGCCGGTCGTGGATGATTGAGAGTCCC-TT-T-----------CACTGTT-T-----Tctctatctttcttatgtctaataatataactttctgttctt
gi|90711 : ---TTAT--GTTATGCCAATCGTTG---TAAC---CGG----------------C-TA-TCT--GGTGAA--T-ATAAAA-TAGCT-CGAAATTA---ATACGA-----TGTAAT-----C-A-----AA-C-GT-T---TT-----------------GGCGGTTGGCTAG-T-ACT----GCGAATAG------GCTT-A-TTTTGAA-ATCCT--CATTAATTT---G--AGGTCAACCT-AT-CAAGTGAGA-T---------G--------TG--------GT-TG--------T--CACACAAT--TGC-TACAATCGCCGGTCGTGGAGGATTGAGCA--CC-TT-TA----------A-CTGTC-T-----TCTC--TAGAT-CT--T-T-CTTA--Tatctctgtatttcttctgtctcgtaaagtaacatctttttctt
gi|90712 : ---TTAT--GTTATGCAAATCGTTG---TAAC---CGACT--AAA-C-GATT--T-GA-T----GGTGAA--T-ATAAAA-TACCT-CGAAAT-----GTGT-A-----TG---T-----TGT-----AT-C-CA-TAC-GTTTT--------------GGCGGTTTGCTAG-C-ACT----GCGAATAG------CCTA-A-TTTTGAA-ATCCT--CATTGATTT---A--TAGTCAACCC-AT-C---------g
gi|90712 : AA-ATCCT--CAATGA--TTT-G--AGGTCAACCT-AT-C---------CAGTGGAAT-G--------TG--------GT-TG-T---------CTTATAAT--TGC-TACAATCACCGGTCGTGGAGGATTGAGCG--CC-TT-T-----------TGCTGTC-T-----TCT---tagtgggatgtggttgtcgaattttgaaatcctcaatgatttgaggtcaacctatccagtggaatgtggttgtcttataattgctacaatcaccggtcgtggaggattgagcgccttttgctgtcttctctctatctttcttctgtctaataatataactttcttttctt
gi|90713 : ttatgttatgcaaatcgttgtaaccgactaaacgatttgatggtgaatataaaatacctcgaaatgtgtatgttgtatccatacgttttggcggtttgctagcactgcgaatagcctaattttgaaatcctcattgatttatagtcaacccatctagtgggatgtggttgtcgaattttg---TTAT--GTTATGCAAATCGTTG---TAAC---CGA-CTAAAA-A-A-AA--T-GA-T----GGTGAA--T-ATAAAA-TACCT-CGAAAT-----GTGT-AAGTTGTA---T-----C-C-----ATAC-GT-T---TT-----------------GGCGGTTTGCCAG-T-ATT----GCGAATAGC-C---TAAT---TTTA-AA-ATCCT--CATTGATTT---G--AGGTCAACCctctatctttcttctgtctaataatataactttcttttctt
gi|90714 : T--GTTATGCAAATCGTTG---TAACCTAC---T--AAA-A-G-TT--TGTGCTGTTGAAT--A--T-ATAA---TATCT-CGAAAT-----------------G---T-----C-T-----AT---GT-TATATCCAT-A-C-GTTTC----GGCGGTTTGCTAG-T-ACT----GCGAATAGC-C-----TA-A-TTTTGAA-ATCCT--CATTGA--TTTGG--GGGTCAACCC-AT-C---------CAGTGGGAT-G--------TG--------GT-TG-T---------CTTACAAT--TGC-TACAATCACCGGTCGTGGAGGATTGAGCG--CC-TT-TTACTGAATCTCT-CTGTCTT-----TCT---TATGT-A---T-
gi|90715 : T--GTTATGCAAATCGCTG---TAAC---TGACT--AAA-A-G-TT--T-TT-GCT--GGT--AAAT-ATAAAA-TACCT-CGAAAT-----GTGT-A-----TGA--T-----G-C-----AT-C-CA-AAC-GTTTT-A-------------GCGGTTTGCTAG-T-GCT----GCGAATAGT-C-----TT-A-TTTTGAA-ATCCT--CATCAA--TTT-G--AGGTCAACCC-AT-C---------CAGCTGGAT-G--------TG--------GT-TG-T---------CTTACAAT--TGT-TACAATCACCGGACGTGGAGGATTCAGCA--CC-TT-TA----------A-CTGTC-T-----TCTC--TCCAT-CT--T-T-CTTA--TG-T---CTA-ATAA-GATA-----ACTTTC-T-TTTCTTaataacataactttcttttctt
gi|90716 : T--GTTATGCAAATCATTG---TAAC---CGACT--TAA-A-G-TT--T-TT-GCT--GGTGAA--T-ATAAAA-TACCT-CAA----------AT-G-----TG---T-----A-C-----AT-C-CA-AAC-CTT----TT-G---C------CGGTTTGCTA--T-TACT---GCGAATAGC-CAAATTTT-G------AA-ATTCT--CGATAA--TTT-G--AGGTCAACCC-AT-C---------CAGCGGGAT-G--------TG--------GT-TG-T---------CTTACAAA--TGC-TATAATCACCGGTCGTGGAGGATTGAGCA--TC-TT-TA----------A-CTGGC-T-----TCTC--TCTATCG---T-T-CTTA--TG-T---CT-----C-ACTAGATATACTTTC-T-TTTCTT
gi|90717 : T--GTTATGCAAATCGTTG---TAAC---CGACT--AAA-T-G-TT--T-TA-GCT--GGTGAA--T-ATAAAA-TACCT-CGAAA--------AC-G-----TG---TA----C-G-----ATGC-AT---C-CAAGC-GTT-T---T----GGCGGTTTGCTAG-T-ACT----GCGAATAGC-C---TATT-T-TTT-TAA-ATCCT--CATAAAATT---G--AGGTCAACCC-AT-C------------------------------------------------------------------T-TACAATCGCCGGTCGTGGAGGATTGAGCA--CC-TTAA-----------A-CTGTT-T-----TCTCTCTATCT-----T-T-CTTA--TG-T---CTA-ATAA-GATA-----ACTTTC-T-TTTCTT
gi|90718 : TATGCAAATATTTG---TAAC---TGACT--GAA-A-GAAT--T-TG--CTAAGGC--A--C-ATAAAA--A-CT-CGAAATTCGTGATAT-G-----CA---T-----C-C-----A--------GC-TTAA--AT------T----GGCGGTTTGTTTGAT-TA-----ACGAATAG--T---CAGA-G-TTT-TAA-ATCCTCACACGCA--T---G--AGTTCAATCC-AT-T---------CTAGGAT---G--------TG--------AT-TA-C-A--A-T--CTGACAAA--TGT-T-CAGTCACTGGTCGTGG
gi|90719 : gaATACATGTATTTG---TA-T--ATG--C--AAA-T-G-TTAGT-GA-CCT---GT--A--TTATAAAA-TATCT-TGAAA--------AT-C-----AG---T-----C-ATTAGTAT-C-CTGTAT-TTTATTA------------GGCAAATTGCTTG-TATAG-----TGAA--GCGC---CTTT-A-TTTG-AA-ATCCT--CATTAA--C---GTCAGGTCAGCAC-AT-C---------TCAGTTTGATG--------TG--------GC-TG-T-C--T-G--GTTA-AA----GC-TTAAACCACCGGTGGTGGAGGATTAAGCA--CC-TT-T-----------C-------------TCT---TACAT-C---T-T-taaatta
gi|90720 : gcTATGCAGTTTTGTGGGTTAAC--AGGG-C--TAA-A-C-CT--T-TA-TCTGAGGT--T--T-ACAGA--CACAT-CGATAT-----AT-T-A-----T----C-----C-T-----AT-T-GC--AA-TTAA---------------GGTGGTTTGCCAG-T-TCG----GTGAA-A---C---TCTT-G-TCTGCAAGAACAT--CACTTAG-T---G--AGTTTAACCC-ATAC---------T---------G--------CGTGCATGTGGT-TG-C-A--C-T--CCTGTTAT--TGC-TTCA-TCACCAGTGTTTGTGGATAAGGCG--CC-TT-T-----------T-CTATT-T-----TCT---AACgctatctttccta
gi|90721 : gTATGCAAATGTTAG---TAAC---CAACT--AAA-A-G-TT--T-TA-ACTGGTGT--A--C-ATAAAA-TACCT-CGAAAT--------T-C-----AG---T-----C-A-----GT-T-GTATCC-CTGAT--TT-T---CAATAGGCAAATTGCTTG-T-ACA----GCGA--AGC-G---CCTTAA-TTTG-AA-ATTCT--CACTAACGT---G--AGGTCAGCCC-AT-CTCAATTTGAT---------G--------TG--------GT-T--T-A--C-TGACTT----T--AGCTTAAAAGCACCGGTCGTGGAGGATTAAGCA--CC-TT-T-----------CTCTTAC-T-----TCT---TGC-T-A---T-T-TTtgcctttctttatctatcaagtttgacattttctt
gi|90722 : G---T-----C-G-----AT-C-GT-TAC-TTAAT--TA-G---CT---GGCGGTTTACCAG-T-TAG----GTGAATAGC-A---CAT--A-CTTA-AA-ATCAT--CG--CA--C---A--GGATCA-------------------------------------TG--------GT-TG-C-A--T-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCACCGGTTGTGGAGGATTAAGCG--CC-TT-T-----------C-CCATT-T-----TCC---TACAT-A---T-T-------TA-TTAACTA-CTACAACTGTTC--ACTTTTAA-TTTCTtcct
gi|90723 : GCGGTTTGATAG-T-ACT----GCGACTAGC-------TT-AATTTTTAA-ATCCT--CATTAA--TTT-G--AGATCAACCC-AT-C---------CA--------G--------TG--------GGGTG-TGA--T-TGTCTTACAAA--TGC-TGCAATCACCGGTCATGGATGATTGAACG--CC-TT-TA----------A-CTGTC-T-----CCT---TTC-T-ATCTT-T-CTTA--TG-T--
gi|90724 : AA-ATCCT--CATTGA--TTT-G--AATTCAACCT-AT-C---------C---------GGTGGGATGTG--------GT-TG-T---------CTTACAAT--TGC-TACAATCACCGGTCGTGGAGGGTTGAACG--CG-TT-T-----------CACTTTC-T-----TTT---ctaataagataactctcttt
gi|90725 : ctcaatttgAA-ATCCT--CATTGA--TTT-G--AGGTGAACCC-AT-C---------CAGTGGGAT-G--------TG--------GC-TG-T---------CTCACAATATTGT-TATAATCACCGGTCGTGGAGGATTGAGCG--AT-TT-TAC---------T-CTATCTT-----TCT---Tctctttcttatgtctaacaacataacattcttttctt
gi|90726 : AA-ATCCT--CATTGA--TTT-G--AGGTCAACCC-AT-C---------CAGTGGGGT-G--------TG--------GT-TG-T---------CTTAAAAT--TAC-TACAATTAGCGGTCGTAGATGATTGAGTG--CC-TT-TA----------A-CTGTC-T-----TCT---ttcttgtgttt
gi|90727 : --------GT-TG-T-T--G-T--TTTACAAT--TGC-TACAATCGCCGGTCGTGGATGATTGAGCG--CC-TT-T-----------TACTGTC-TC----TCT---C---T-A---TCT-TTCA--TA-T--ctctatctttctaatgtctaataatataacattttgttct
gi|90728 : aat--------GT-TG-T-T--G-T--TTTACAAT--TGC-TACAATCGCCGGTCGTGGATGATTGAGCG--CC-TT-T-----------TACTGTC-TCTCTGTCT---TTCAT-A---TGT-CTAA--TA-g
Alignments
lowQualScore : 111 11111111 333333333333 111111 1111111 11 11 111111111111111111111111 333333333333 11 222222 66666666666666666666666666666 111111111 1 2222222222222 11111
lowQualScore : 44 44 0 1 000 555 8888 77777 11111111 444444444444 3 6666 44 888888 3 9 1 3 1 1 0 44 0 1 3 2 5 8 8 66 2 22 1 5555 0 22 0 11 222 8888888 22 1 1 2 22 1 1 11 55 33 1 33 22 0 1 55555555 1 444444444444444444444444 1 1 2 33333 33 111111111111 1 99999999 11 8888888888 44 1 11 1 222222 11 2 22 66666666666666666666666666666 44444444 2 1 888888888 11 1 3 11 1 1 3333333333333 2 33 44444 666 1 0 88888 6 1 22 1 888 777 66 00000 3 2
lowQualScore : .. .. . . ... ... .... ..... ........ ............ . .... .. ...... . . . . . . . .. . . . . . . . .. . .. . .... . .. . .. ... ....... .. . . . .. . . .. .. .. . .. .. . . ........ . ........................ . . . ..... .. ............ . ........ .. .......... .. . .. . ...... .. . .. ............................. ........ . . ......... .. . . .. . . ............. . .. ..... ... . . ..... . . .. . ... ... .. ..... . .
lowQualScore : 66 22 2 0 888 444 3333 55555 22222222 333333333333 1 5555 22 555555 1 8 0 1 0 2 8 22 7 0 8 9 7 6 6 88 9 11 6 1111 2 33 7 55 555 0000000 00 4 4 9 00 4 4 00 77 99 4 88 55 2 4 55555555 3 888888888888888888888888 4 4 9 66666 66 555555555555 4 55555555 44 2222222222 00 2 77 0 555555 77 5 11 44444444444444444444444444444 44444444 4 2 111111111 77 2 8 77 2 2 7777777777777 2 88 44444 111 2 4 33333 4 7 55 9 222 888 22 00000 9 4
consensus : ATGTACAT--GTA--TATGTATTGCTTCTNAATCACACGTGGTCGTTAACAGATCGCG---A---CGA--A-ACCTGTGAAGN----TGCCTTTGGCAATGGATTATCAATGCTAT--------TAATAGCTATTTCAATAAA--------C---CA-TAT----ATT--ATGTCCCTTTTTCTTTTAAAATAA-ATAAACAAATTGAGTATTATGGT-GAAACTAAAAATGCGGAAAATATAACAACAGAT--AAAATATTTATTCATTTATATANTGACGNAATAAAAA-T-A-TTT-T--TATCA-TTTAATAATAA---TCAT--GTTATGCAAATNTTTG---TAAC--ACGA-T--AAA-A-G-TT--T-TA-TCTTAGGT--A--T-ATAAAA-TACCT-CGAAA-T-------GTGT-ATG------T-----C-N-----AT-C-GT-T-----AC-TTT--AT-ATC-GC-GGCGGTTTGCCAG-T-TAG----GCGAATAGC-C---CCTT-G-TTTATAA-ATCCT--CATTNA--T---G--AGGTCAACCC-AT-C---------C---------G--------CG--------GT-TG-T-A--T-T--CTTACAAT--TGC-TACAATCACCGGTCGTGGAGGATTGAGCG--CC-TT-T-----------C-CTGTC-T-----TCT---TACAT-A---T-T-CTCA--TA-T--ACTT-CTGC-ACTG-----ACTTTTAT-TTTCTT
Reference ( family-586 ) : ATGTACAT--GTA--TATGTATTGCTTCTNAATCACACGTGGTCGTTAACAGATCGCG---A---CGA--A-ACCTGTGAAGN----TGCCTTTGGCAATGGATTATCAATGCTAT--------TAATAGCTATTTCAATAAA--------C---CA-TAT----ATT--ATGTCCCTTTTTCTTTTAAAATAA-ATAAACAAATTGAGTATTATGGT-GAAACTAAAAATGCGGAAAATATAACAACAGAT--AAAATATTTATTCATTTATATANTGACGNAATAAAAA-T-A-TTT-T--TATCA-TTTAATAATAA---TCAT--GTTATGCAAATNTTTG---TAAC--ACGA-T--AAA-A-G-TT--T-TA-TCTTAGGT--A--T-ATAAAA-TACCT-CGAAA-T-------ATGT-NTG------T-----C-N-----AT-C-GT-T-----AC-TTT--AT-ATC-GC-GGCGGTTTGCCAG-T-TAG----GCGAATAGC-C---CCTT-G-TTTATAA-ATCCT--CATTNA--T---G--AGGTCAACCC-AT-C---------C---------G--------CG--------GT-TG-T-A--T-T--CTTACAAT--TGC-TACAATCACCGGTCGTGGAGGATTGAGCG--CC-TT-T-----------C-CTGTC-T-----TCT---TACAT-A---T-T-CTCA--TA-T--ACTT-CTGC-ACTG-----ACTTTTAT-TTTCTT
gi|90693 : ATGTACAT--GTA--TATGTATTGCTTCTCAATCACACGTGGTCGTTAACAGATCGCG---A---TGA--A-ACCTGTGAAGA----TGCCTTTGGCTATGGATTATCAATGCTAT--------TAATAGCTATTTCAATAAA--------C---CA-TAT----ATT--ATGTCCCTTTTTCTTTTAAAATAA-ATAAACAAATTGAGTATTGTGGT-GAAACTAAAAATTTGGAAAATATAACAACAGAT--AAAATATTTATTCATTTATACAATGACGAAATAAAAA-T-A-TTT-C--TATCA-TTTAATAATAA---TCAT--GGTATGCAAATGTTTG---TAAC--ATGA-T--AAA-A-G-TT--T-TA-TCTTAGGT--A--T-ATAAAA-CATCT-TAATA-T-------ATAT-TTG------T-----C-T-----AT-C-GT-A-----AC-TTA--AT-ATC-GC-GGCGGTTTACCAG-T-TAG----GTGAATTGC-C---CCTT-G-TTTATAA-ATCCC--CATCCA--T---G--GGGTCAACCA-AA-C---------T---------A--------CG--------GT-TG-T-A--T-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCACCGGTCGTGGAGGATTAAGCG--CC-TT-T-----------C-CTATA-T-----TCT---TACAT-A---T-T-CTCA--TA-T--ACTT-CTGC-GCTT-----ACTTTTAT-TTTCTT
gi|90694 : ATGTACAG--GTA--CATGTATTGCTTCTCAATCACACGTGGTCGTTAACAGATCGCG---A---TGA--A-ACCTGTGAAGA----TGCCTTTGGCAATGGATTATCAATGCTAT--------TGATAGCTATTTCAATAAA--------T---CA-TAT----ATT--ATGTCCCTTTTTCTTTTAAAATAA-ATAAACAAGTTGAGTATTATGGT-GACACTAAAAATGTGGAAAATATAACAACAGAT--AAAATATTTATTCATTTATATAATGACGAAATAAAAA-T-ATTTT-T--TATCA-TTCAATTATAA---GCGT--GGTATGCAAATGTTTG---TAAC--ATGA-T--AAA-A-G-TT--T-TA-TCTTAGGT--A--T-ATAAAA-GATCT-TAATA-T-------ATTT-TTG------T-----C-T-----AT-C-GT-T-----AC--TT--AT-ATC-GC-GGCGGTTTACCAG-T-TAG----GTGAATAGC-C---CCTT-G-TTTATAA-ATCCC--CATCCA--T---G--GGGTCAACCA-AA-C---------T---------A--------CG--------GT-TG-T-A--T-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCACCGGTCGTGGAGGATTAAGCA--CC-TT-T-----------C-CTATA-T-----TCT---TACAT-A---T-T-TTCA--TA-T--ACTT-CTAC-ACTA-----ACTTTTAA-TTTCTT
gi|90695 : ATGCACAT--GTA--TATGTATTGCTTCTCAATCATACGTGGTCGTTAACAGATCGAA---A---CGA--A-ACCTGTGAAGGAAGTCGCCTTTGGCAATGGATAATCAATGCTAT--------TAATAGCTATTTCAATAAT--------C---CA-TAT----ATT--ATGTCCCTTTTTCTTTTAAAATAA-ATAAACAAATTGAGTATTATGGT-GAAACTAAAAATGTGGAAAATATAACAACAGAT--AAAATATTTATTCATTTATATAATGACGAAATAAAAA-T-A--TT-T--TATCA-TTTAATAATAA---TCAT--GGTATGCAAATGTTTG---TAAC--ATGA-T--AAA-A-G-TT--T-TA-TCTTAGGT--A--T-ATAAAA-GATCT-TAATA-T-------ATGT-TTG------T-----C-T-----AT-C-GT-T-----AC-TTT--GT-ATC-GC-GGCGGTTTACCAG-T-TAG----GTGAATAGC-C---CCTT-G-TTTATAA-ATCCA--CATCCG--T---T--GGGTCGACCA-AA-C---------T---------A--------CG--------GT-TG-T-A--T-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCACCGGTCGTGGAGGATTAAGCG--CC-TT-T-----------C-CTATA-T-----TTT---TACAT-A---T-T-CTCA--TA-T--ACTT-CTGC-ACTG-----ACTTTTAT-TTTCTT
gi|90696 : ATGTACAT--GTA--TATGTATTGCTTCTCAATCATACGTGGTCGTTAACAGATCGCG---A---TGA--A-ACCTGTGAAGA----TGCCTTTGGCAATGGATTATCAATGCTAT--------TAATAGCTATTTCAATAAA--------C---CA-TAT----ATT--ATGTCCCTTTTTCTTTTAAAATAA-ATAAACAAATTGAGTATTATTGT-GAAACTAAAAATGTGGAAAATATACAAACAGAT--AAAAAATTTATTCATTTATATAATGACGAAATAAAAA-T-A-TTT-T--TATCA-TTTAATAAAAA---TTAT--GGTATGCAAATGTTTG---TAAC--ATGA-T--AAA-A-G-TT--T-AA-TCTTAGGT--A--T-ATAAAA-TATCT-TAATA-T-------ATGT-TTG------T-----C-T-----AT-C-GT-T-----AC-TTT--AT-ATC-GC-GGCGGTTTACCAG-T-TAG----GTGAATAGC-C---CCTT-G-TTTATAA-ATCCC--CATCCA--T---G--GGGTCAACCA-AA-C---------T---------A--------CG--------GT-TG-T-A--T-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCACCGGTCGTGGAGGATTAAGCG--CC-TT-T-----------C-CT-------------------AT-A---T-T-CTCA--TA-T--ACTT-CTGC-ACTG-----ACTTTTAT-TTTCTT
gi|90697 : ATGCACAT--GTA--TATGTATTGCTTCTCAATCATACGTGGTCGTTAACAGATCGCG---A---TGA--A-ACCTGTGAAGT----CGCCTTTGGCAATGGATTATCAATGTTAT--------TAATAGCTATTTTAATAAA--------C---CA-TAT----ATT--ATGTCCCTTTTTCTTTTAAAATAATAAAAACAAATTGAGTATTATGGT-GAAACTAAAATTGTGGAAAATATAATAACAGAT--AAAATATTCGTTAATTTATATAATGACGAAATAAAAA-T-A-TTT-T---ATCA-TTTAATAATAA---TCAT--GGTATGCAAATGTTTG---TAAC--ATGA-T--AAA-A-G-TT--T-TA-TCTTAGGT--A--T-ATAAAA-GATCT-TAATA-T-------ATGT-TTG------C-----C-T-----AT-C-GT-T-----AC-TTT--AT-ATC-GC-GGCCGTTTACCAG-T-TAG----GTGAATAGC-C---CCTT-G-TTTATAA-ATCCC--CATCCA--T---G--GGGTCAACCA-AA-T---------T---------A--------CG--------GT-TG-T-A--T-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCACCGGTCGTGGAGGATTAAGCG--CC-TT-T-----------C-CTATA-G-----TCT---TACAT-A---T-T-C-CA--TA-T--ACTT-CTGC-ACTT-----TGTTTTATATTTTTT
gi|90698 : ATGTACAT--GTA--TATGTATTGCTTTTCAATCATACGTGACCGTTAACAGATCGCG---A---TGA--A-ACCTGTGAAGA----TGCCTTTGGCAATGGATTATCAATGCTAT--------TAATAGCTATTTATATAAA--------C---CA-TAT----ATT--ATGTCCCTTTTTCTTTTAAAATAA-ATAAACAAATTGAGTTTTATTGT-GAAGCTAAAAATGTGAAAAATATAACAACAGAT--AAAATATTTATTTATTTATATAATGACGAATTAAAAA-T-A-TTT-T--TATCA-TTTAATAATAA---TCAT--AGTATGCAAATGTTTG---TAAC--ATTA-T--AAA-A-G-TT--T-TA-TCTTAGGT--A--T-ATAAAT-GATCT-TAATA-T-------ATGT-TTG------T-----C-T-----AT-C-GT-T-----AC-TTT--AT-ATC-GC-GGCAGTTTACCAG-T-TAG----GTGAATAGC-C---CATT-G-TTTATAA-ATCCC--CATCCA--T---G--GGGTCAACCA-AA-T---------C---------A--------CG--------GT-TG-T-A--T-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCACCGGGCGTGGAGGATTAAGCG--CC-TT-T-----------C-CT-------------------AT-A---T-T-TTCA--TA-T--ACTT-CTGT-ACTG-----ACTTTTAT-TTTCTT
gi|90699 : ATGTACATCTATA--TATATATTGCTTCTTAATCACACGTGGTCGTTAACAGATCGCG---A---CGA--A-ACCTGTGAAGA----TGCCTTTGGCAATGGATTATCAATGCTAT--------TAATGGCTATTTCAATAAA--------C---CA-TATGTATATT--ATGTCCCCTTTTCTTTTAAAATAA-ATAATCAAATTGAGTATTACGGT-GAAA--AAATATTC--AAAATATAACAACAGAT--AAAATATTTATTCATTTATATAATGACG-AATAAATA-T-A-TTT-T--TATCA-TTTAATAATAA---T-ATTCG-TATGCAAATGTTTG---TAAC--ATGA-T--TAA-A-G-TT--T-TA-TCTAAGGT--A--T-ATAAAA-GGTCT-TAGTA-T-------ATCC-TTG------T-----C-G-----AG-C-GT-T-----AC-TTT--AT-ATC-GC-GGCGGTTTATCAG-T-AAG----GTGAACAGC-T---CCTT-G-TTTATAA-ATCCC--CATCCA--T---G--GGGTCAACCA-AA-C---------T---------A--------CG--------GT-TG-T-A--T-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCGCCGGTCGTGGAGGATTAAGCG--CC-TT-T-----------C-CCATA-T-----TCT---TACAT-A---T-T-CTCA--TA-T--ACTT-TTGC-ACTT-----ACTTTTCT-TTTC
gi|90700 : ATGTACAT--GTA--TATGAATTGCTTCTAAATCACACGTGGTTGTTTACAGATCGCA---A---CAA--T-ATCTGTGAAAA----TGCCTTTGATAATAGATTATAAATGCTATCATGTTATTAATAGCTATTTCAATAAA--------A---CA-TAT----TTTGCATGTC---TTTTCTTT------AA-ATAAACAAAT-GAATATTATGGT-GAAACTATAAATGCAGAAAATGCAACGATATAT--AAAATACGTGTTCATTGATATATTGACATAATAAAAA-T-A-TTT-TGTTATCA-TTT--TA-TAA---TCAT--GTTATGCAAATATTTG---TAAC--ATGA-T--AAA-C-G-TT--T-TA-ACTTAGGT--A--T-ATAAAA-GATCT-TGATA-T-------GTGT-ATA------T-----C-G-----AT-C-GT-T-----AC-TTT--AT-ATC-GC-GGCGCTTAATCAG-T-TAG----GTGAATAGC-C---CCTT-G-TTTATAA-ATTCC--CCTACA--T---G--AGGTCAACCC-AC-C---------C---------A--------CG--------GT-TG-T-A--T-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCACCGGTCGTGGAGGATTAAGCG--CCTTT-T-----------C-CTATT-T-----TCT---TACAT-A-------CTTA--TACT--ACTG-CTGC-TGTG-----ACTTTTAT-TTTCTT
gi|90701 : ACAT--GTG--TATATATGGCTTCTAAATTACACGTGGGCGTAACCAGATCACGGATA---CAA--T-ACCCGTGAATG----TGCCTTTGGGAATGGATTATAAATTATAT--------TAATAGCTATTTCAATAAAAGAA----CG--CA-CAT----ATT--ATGTTCCTTTTTCTTT------AA-ATAGACAAAT-GGGTATAATGGTTAAAACTATAGGTGCAGATAATATAACAAAAGAT--AAAACATTTATTCATTAATATACTGACTTAATAAACA-T-AATTTGT--TATCA-C---GTAATAT---TCAT----TATGTAAGTGTTTG---TAAT--ATGA-T--AAA-C-G-TT--T-TA-TCTTAGGT--G--T-ATAAAA-GACAT-AACAA-T-------ATAT-ACG------C-----C-G-----AT-C-GT-T-----AC-TTA--AT--TT-GCCGGCGGTTTACAAG-T-TAG----GTGAATAGC-C---CAT--A-TTTG-AA-ATCCT--CGTACA--G---G--AGGTCAACCT-AA-AG--------C---------A--------TG--------GC-TG-C-A--T-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCACCGGTAGTGGAGGATTAAGCG--CC-TT-T-----------C-CTATT-T-----TCT---TACAT-T---T-TTCTAAACTA-TT-ACTA-CTGT---TG-----ACTTTTAT-TTTCTT
gi|90702 : ACAT--GTA--TATATATGGCTTCTAAATTACACGTGGTCGTAACCAGATCGCG---ATTACAA--T-ACCCGTGAATG----TGCCTTTGGCAATGGATTATCAATTATAT--------TAAAAGCTATTTCATTAAA--------AGAACG-CAT----AT---ATGTCCCTTTTTCTTT------AA-ATAGACAA-TTGGGTATAATGAT-AAAACTATAAGTGCAGACATTATAACAAAAGAT--AAAACATTTATTCATTAATATACTGACTTAATAAACA-TAA-TTTGT--TATCA-CTTGAT-AT-----TCAT--ATTATGTAAATGTTTG---TAAC--ACGA-T--AAA-A-G-TT--T-TA-TCTTAGGT--G--T-ATAAAA-GACAT---AAA-T-------AT
gi|90703 : AT--GTAACTATATATGGCTTCTAATTCAAATGCGGTCGTCAACAGATTGCA---A---CAACAATACCTGTAAAGT----TGCCTTAATCAATGGGTTATAATTGCTAT--------TAATAGCTATTTCAATAAATACAAAACC---CAACAT----ATT--ATGTGCCTTTTTCTTT------AA-ATAAACAAAT-GGGTATAATGAT-GAAACTATAAATACAGAAAATACAGCAAAAGAT--AAAATATTTATTAATTTATATGCTGACATAATAAAAA-T-ACTTT-T--TATCC-TTTA----TAT---GCAT--GTTATGCAAATATCTA---TAAC--TTG--T--AAACC-G-TT--T-TA-TTTTAGGT--A--T-ATAAAA-TATCT---AAA-T-------ATAT-ATT------TTA---C-G-----AC-C-GT-T-----AC-TTT--AT-ATTGGC-GGCGGTTTACCAG-T-TAG----GTGAATAG--C---CCTT-G-TTTTGCA-ATCCT--CCTTCA--T---G--AGGTCAACCC-AC-C---------C---------A--------TG--------GT-TG-T-A--C-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCACCGGTCGTGGAGGATTAAGCG--TC-TA-T-----------C-CTCAT-T-----TCT---TAGAT-AT--T-T-CTTA--TC-T--ACTG-CTCC-TGTG-----ACTTTAAA-TTTCT
gi|90704 : --GTG--TATATATGGATTCTAAATTGCATGT-GTTGTAACCAGATCTCGATTA---CAG--T-ACCTGTGAAAT----TGCCTTTGGCAGTGGATTATAAATGCTAT--------TAAAAGat
gi|90705 : --TATACATGGCTTCTAAATTACACGTGGTCG------AAT-------A---CAA--T-ACCCGTGAATG----TGCCTTTGACAATGGATTATAAATTATAT--------TAATAGCTATTTCAATAAAAAAAAAA-CG--CG-CAT----ATT--ATGTCCCTTTTTCTTT------AA-ATAGACAAAT-GAGTATAATGGT-AAAACTATAAGTGCAAAAAATATAACAAAATAT--AAAATATTTATTCATTAATATACTGATTTAATAAACA-TAA-TTTGT--TATCA-CTTTGTATTA------AT--ATTATGTAAATGTTTG---TAAC--ATGG-C--AAA-C-G-TT--T-TA-TCTTATGT--G--T-ATAAAA-GACATAAAAAA-T-------ATAT-ATG------T-----C-G-----CC-C-GT-T-----AC-TTT--AT--TT-GCTGGCGGTTTACCAG-T-TAG----GTGAATAGC-C---CAT----ATTAGAA-ATCCC--CGCTCA--T---G--GGGTCAACCTAAA-G---------C---------A--------TG--------GT-TG-C-A--T-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCACCGGTCGTGGAGGATTAAGCG--CC-TT-T-----------C-CTATT-T-----TCT---AACAT-A---T-T-CCCA--AA-T-------------TTG-----ACCGTTAT-TTTCTT
gi|90706 : --------C---CA-CAT----ATT--ATGTCCCTTTTTCTTC-AAAA------AAA-AAAT-GTGTATAGCGGT-GAAACTAAAAATGCAGATAATGTAGCAAAAGATAAAAAAAAGATATTTATTGATATACTGACATAATAGAAA-A-A-GTG-T--TATCACTTTA--GAT-----TCAT--ATTATGCAAATGTTTG---TAAC--ATAA-A--AAA-ACG-TT--T-TA-TCTAAGGC--A--T-ACGCAA-GACCT-TAAAA-T-------AT--------------------A-----AT-C-GT-T-----AC-TTT--AT-ATT-GCTGGAGGTTTACCAG-T-TAG----GTAAATAG--C---CCTT-A-TTTG-AA-ATCCT--CGATCA--T---T--AGGTCAACCCAAA-C---------C---------A--------TG--------GT-TG-T-A--C-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCATCGGTAGTGGAGGATTTAGCG--CG-TT-T-----------C-TTATT-A-----TCT---TAAAA-A---TGT-CTTA--CT-T--ACCT--TGT--CTG-----ATTTTTAT-TTTCTT
gi|90707 : GGAACAAGAAGT-A-ATT-CA-TA-CG-TTTGATA-TAAGTTTTAT--GTTATGGAAATCGTTG---TTAT---CGACT--AAA-A-G-TT--T-T--TGTT-GGTGAA--T-ATAAAAATACCT-CGAAA-T-------GTGT-ATGC-----T-----G-T-----AT-C-CA-T-----ACGTTT----------C-GGCGGTTTGCTAG-T-ACT----GCGAATAGC-C---TAAT-T-TTGATA---TCCT--CATTGA--TAT-G--AGGTCAACCC-AT-C---------CAGTGGAAT-G--------TG--------GT-TG-T---------CTTACAAT--TGC-TACAGTCATCAGTCGTGGAGGATTGAGCG--CC-TT-T-----------TACTGTC-C-----TCT---CTCTT-T---C-T-CTCT--TA-T--
gi|90708 : ---TTAT--GTTATGCAAATCGTTG---TAAC---CGACT--GAA-A-G-TT--T-T--TGTT-GGTGAA--T-ATAAAA-TACCT-CGAAA-T-------GTGT-ACG------TGGAATC-C-----AT-CCGT-T---------TT------------GGCGGTTTGCTAG-T-ACT----GTGAATAGC-C-----TA-A-TTTTGAA-ATCCT--CATTAA--TTT-G--AGGTCAACCA-AT-C---------CA--------G--------TG--------GTATG-T-GGTTGT--CTTACAAT--TGC-TACAATCACCGGTCGTGGAGGATTGAGCG--CA-TT-TA----------A-CTGTT-T-----TCT---TTC-T-G---TCT-TTCT--TA-T--GCCTAATAC-AATA-----ACTTTC-T-TTTCTTgtctaataatataactttttgttctt
gi|90709 : ---TTAT--GTTATGCAAATCGTTG---TTAC---CGA-C--TAA-G-T-TT--T-TG-T---AGGTGAA--T-ATAAAA-TACCT-CGACA-T-------TTCT-ATG------T-----T-GT----AT-C-CA-T-----AC------GT-ATC-G---GTGGTTTG-----T-TAGAACTGTGAATAGC-C---AAAT---TTTA-AA-ATCCT--CATTGA--TTA-G--AGGTCAACCC-AT-C---------CAGTGGGAT-G--------TG--------GT-TG-T---------CTTATAAT--TGC-TACAATCACCAGTCGTGGAGGATTGAGCG--CT-TT-T-----------A-CTGTC-T-----TCT---
gi|90710 : ---TTAT--GCTATGCAAATTGTTG---TAAC---CGACT--AAA-A-G-GT--T-TT-GCT--GGT--GAGT-ATAAAA-TACCT-CGAAA-T-------GTGT-A----------------C-----ATAC-GT-C-----A--TTT--AT-ATC--T-GGCGGTTTACTAG-T-AGA----GCAGATAGC-C------T-A-ATCATAA-GT--T--AAATTA---------AGGTTAACCC-AT-CTTGTGGGA-T---------G--------TG--------GT-TGCC-A--T-T------CAAT--TGC-TACAATTGCCGGTCGTGGATGATTGAGAGTCCC-TT-T-----------CACTGTT-T-----Tctctatctttcttatgtctaataatataactttctgttctt
gi|90711 : ---TTAT--GTTATGCCAATCGTTG---TAAC---CGG----------------C-TA-TCT--GGTGAA--T-ATAAAA-TAGCT-CGAAA-TTAATACGATGT-A-A------T-----C-A-----AA-C-GT-T--------TT-------------GGCGGTTGGCTAG-T-ACT----GCGAATAG------GCTT-A-TTTTGAA-ATCCT--CATTAATTT---G--AGGTCAACCT-AT-CAAGTGAGA-T---------G--------TG--------GT-TG--------T--CACACAAT--TGC-TACAATCGCCGGTCGTGGAGGATTGAGCA--CC-TT-TA----------A-CTGTC-T-----TCTC--TAGAT-CT--T-T-CTTA--Tatctctgtatttcttctgtctcgtaaagtaacatctttttctt
gi|90712 : ---TTAT--GTTATGCAAATCGTTG---TAAC---CGACT--AAA-C-GATT--T-GA-T----GGTGAA--T-ATAAAA-TACCT-CGAAA-T-------GTGT-ATG------T-----TGT-----AT-C-CA-T-----AC-GTT--TT--------GGCGGTTTGCTAG-C-ACT----GCGAATAG------CCTA-A-TTTTGAA-ATCCT--CATTGATTT---A--TAGTCAACCC-AT-C---------g
gi|90712 : AA-ATCCT--CAATGA--TTT-G--AGGTCAACCT-AT-C---------CAGTGGAAT-G--------TG--------GT-TG-T---------CTTATAAT--TGC-TACAATCACCGGTCGTGGAGGATTGAGCG--CC-TT-T-----------TGCTGTC-T-----TCT---tagtgggatgtggttgtcgaattttgaaatcctcaatgatttgaggtcaacctatccagtggaatgtggttgtcttataattgctacaatcaccggtcgtggaggattgagcgccttttgctgtcttctctctatctttcttctgtctaataatataactttcttttctt
gi|90713 : ttatgttatgcaaatcgttgtaaccgactaaacgatttgatggtgaatataaaatacctcgaaatgtgtatgttgtatccatacgttttggcggtttgctagcactgcgaatagcctaattttgaaatcctcattgatttatagtcaacccatctagtgggatgtggttgtcgaattttg---TTAT--GTTATGCAAATCGTTG---TAAC---CGA-CTAAAA-A-A-AA--T-GA-T----GGTGAA--T-ATAAAA-TACCT-CGAAA-T-------GTGT-AAG------T-----TGT-----AT-C-CA-T-----AC-GTT--TT--------GGCGGTTTGCCAG-T-ATT----GCGAATAGC-C---TAAT---TTTA-AA-ATCCT--CATTGATTT---G--AGGTCAACCctctatctttcttctgtctaataatataactttcttttctt
gi|90714 : T--GTTATGCAAATCGTTG---TAACCTAC---T--AAA-A-G-TT--TGTGCTGTTGAAT--A--T-ATAA---TATCT-CGAAA-T-------GTCT-ATG------T-----T-AT----AT-C-CA-T-----ACGTTT----------C-GGCGGTTTGCTAG-T-ACT----GCGAATAGC-C-----TA-A-TTTTGAA-ATCCT--CATTGA--TTTGG--GGGTCAACCC-AT-C---------CAGTGGGAT-G--------TG--------GT-TG-T---------CTTACAAT--TGC-TACAATCACCGGTCGTGGAGGATTGAGCG--CC-TT-TTACTGAATCTCT-CTGTCTT-----TCT---TATGT-A---T-
gi|90715 : T--GTTATGCAAATCGCTG---TAAC---TGACT--AAA-A-G-TT--T-TT-GCT--GGT--AAAT-ATAAAA-TACCT-CGAAA-T-------GTGT-ATGA-----T-----G-C-----AT-C-CA-A-----AC-GTT--TT-A-------GCGGTTTGCTAG-T-GCT----GCGAATAGT-C-----TT-A-TTTTGAA-ATCCT--CATCAA--TTT-G--AGGTCAACCC-AT-C---------CAGCTGGAT-G--------TG--------GT-TG-T---------CTTACAAT--TGT-TACAATCACCGGACGTGGAGGATTCAGCA--CC-TT-TA----------A-CTGTC-T-----TCTC--TCCAT-CT--T-T-CTTA--TG-T---CTA-ATAA-GATA-----ACTTTC-T-TTTCTTaataacataactttcttttctt
gi|90716 : T--GTTATGCAAATCATTG---TAAC---CGACT--TAA-A-G-TT--T-TT-GCT--GGTGAA--T-ATAAAA-TACCT-C-AAA-T-------GTGT-ACA------T-----C-C-----AA------------AC-CTT------TT-GC---CGGTTTGCTA--T-TACT---GCGAATAGC-CAAATTTT-G------AA-ATTCT--CGATAA--TTT-G--AGGTCAACCC-AT-C---------CAGCGGGAT-G--------TG--------GT-TG-T---------CTTACAAA--TGC-TATAATCACCGGTCGTGGAGGATTGAGCA--TC-TT-TA----------A-CTGGC-T-----TCTC--TCTATCG---T-T-CTTA--TG-T---CT-----C-ACTAGATATACTTTC-T-TTTCTT
gi|90717 : T--GTTATGCAAATCGTTG---TAAC---CGACT--AAA-T-G-TT--T-TA-GCT--GGTGAA--T-ATAAAA-TACCT-CGAAAAC-------GTGT-ACGATGCATC-----C-A-----AG-C-GT-T---------TT------------GGCGGTTTGCTAG-T-ACT----GCGAATAGC-C---TATT-T-TTT-TAA-ATCCT--CATAAAATT---G--AGGTCAACCC-AT-C------------------------------------------------------------------T-TACAATCGCCGGTCGTGGAGGATTGAGCA--CC-TTAA-----------A-CTGTT-T-----TCTCTCTATCT-----T-T-CTTA--TG-T---CTA-ATAA-GATA-----ACTTTC-T-TTTCTT
gi|90718 : TATGCAAATATTTG---TAAC---TGACT--GAA-A-GAAT--T-TG--CTAAGGC--A--C-ATAAAA--A-CT-CGAAA-T-------TCGTGATA------T-----G-C-----AT-C----C-----AG-CTT--AA-AT---T-GGCGGTTTGTTTGAT-TA-----ACGAATAG--T---CAGA-G-TTT-TAA-ATCCTCACACGCA--T---G--AGTTCAATCC-AT-T---------CTAGGAT---G--------TG--------AT-TA-C-A--A-T--CTGACAAA--TGT-T-CAGTCACTGGTCGTGG
gi|90719 : gaATACATGTATTTG---TA-T--ATG--C--AAA-T-G-TTAGT-GA-CCT---GT--A--TTATAAAA-TATCT-TGAAA-----------AT-CAG------T-----C-ATTAGTAT-C-CTGT-----AT-TTT--ATTA------GGCAAATTGCTTG-TATAG-----TGAA--GCGC---CTTT-A-TTTG-AA-ATCCT--CATTAA--C---GTCAGGTCAGCAC-AT-C---------TCAGTTTGATG--------TG--------GC-TG-T-C--T-G--GTTA-AA----GC-TTAAACCACCGGTGGTGGAGGATTAAGCA--CC-TT-T-----------C-------------TCT---TACAT-C---T-T-taaatta
gi|90720 : gcTATGCAGTTTTGTGGGTTAAC--AGGG-C--TAA-A-C-CT--T-TA-TCTGAGGT--T--T-ACAGA--CACAT-CGATA-T-------AT-T-AT-------C-----C-T-----AT-T-GC-A-----A---TT--A--A------GGTGGTTTGCCAG-T-TCG----GTGAA-A---C---TCTT-G-TCTGCAAGAACAT--CACTTAG-T---G--AGTTTAACCC-ATAC---------T---------G--------CGTGCATGTGGT-TG-C-A--C-T--CCTGTTAT--TGC-TTCA-TCACCAGTGTTTGTGGATAAGGCG--CC-TT-T-----------T-CTATT-T-----TCT---AACgctatctttccta
gi|90721 : gTATGCAAATGTTAG---TAAC---CAACT--AAA-A-G-TT--T-TA-ACTGGTGT--A--C-ATAAAA-TACCT-CGAAA-T----------T-CAG------T-----C-A-----GT-T-GTATCCCTGAT-TTTCAAT-A------GGCAAATTGCTTG-T-ACA----GCGA--AGC-G---CCTTAA-TTTG-AA-ATTCT--CACTAACGT---G--AGGTCAGCCC-AT-CTCAATTTGAT---------G--------TG--------GT-T--T-A--C-TGACTT----T--AGCTTAAAAGCACCGGTCGTGGAGGATTAAGCA--CC-TT-T-----------CTCTTAC-T-----TCT---TGC-T-A---T-T-TTtgcctttctttatctatcaagtttgacattttctt
gi|90722 : G------T-----C-G-----AT-C-GT-T-----AC-TTA--AT--TA-GCTGGCGGTTTACCAG-T-TAG----GTGAATAGC-A---CAT--A-CTTA-AA-ATCAT--CG--CA--C---A--GGATCA-------------------------------------TG--------GT-TG-C-A--T-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCACCGGTTGTGGAGGATTAAGCG--CC-TT-T-----------C-CCATT-T-----TCC---TACAT-A---T-T-------TA-TTAACTA-CTACAACTGTTC--ACTTTTAA-TTTCTtcct
gi|90723 : GCGGTTTGATAG-T-ACT----GCGACTAGC-------TT-AATTTTTAA-ATCCT--CATTAA--TTT-G--AGATCAACCC-AT-C---------CA--------G--------TG--------GGGTG-TGA--T-TGTCTTACAAA--TGC-TGCAATCACCGGTCATGGATGATTGAACG--CC-TT-TA----------A-CTGTC-T-----CCT---TTC-T-ATCTT-T-CTTA--TG-T--
gi|90724 : AA-ATCCT--CATTGA--TTT-G--AATTCAACCT-AT-C---------C---------GGTGGGATGTG--------GT-TG-T---------CTTACAAT--TGC-TACAATCACCGGTCGTGGAGGGTTGAACG--CG-TT-T-----------CACTTTC-T-----TTT---ctaataagataactctcttt
gi|90725 : ctcaatttgAA-ATCCT--CATTGA--TTT-G--AGGTGAACCC-AT-C---------CAGTGGGAT-G--------TG--------GC-TG-T---------CTCACAATATTGT-TATAATCACCGGTCGTGGAGGATTGAGCG--AT-TT-TAC---------T-CTATCTT-----TCT---Tctctttcttatgtctaacaacataacattcttttctt
gi|90726 : AA-ATCCT--CATTGA--TTT-G--AGGTCAACCC-AT-C---------CAGTGGGGT-G--------TG--------GT-TG-T---------CTTAAAAT--TAC-TACAATTAGCGGTCGTAGATGATTGAGTG--CC-TT-TA----------A-CTGTC-T-----TCT---ttcttgtgttt
gi|90727 : --------GT-TG-T-T--G-T--TTTACAAT--TGC-TACAATCGCCGGTCGTGGATGATTGAGCG--CC-TT-T-----------TACTGTC-TC----TCT---C---T-A---TCT-TTCA--TA-T--ctctatctttctaatgtctaataatataacattttgttct
gi|90728 : aat--------GT-TG-T-T--G-T--TTTACAAT--TGC-TACAATCGCCGGTCGTGGATGATTGAGCG--CC-TT-T-----------TACTGTC-TCTCTGTCT---TTCAT-A---TGT-CTAA--TA-g
Alignments
lowQualScore : 111 11111111 333333333333 111111 1111111 11 11 11111111111111111111 333333333333 11 222222 66666666666666666666666666666 111111111 1 2222222222222 11111
lowQualScore : 44 44 0 1 000 555 8888 77777 11111111 444444444444 3 6666 44 888888 3 9 1 3 1 1 0 44 0 1 3 2 5 8 8 66 2 22 1 5555 0 22 0 11 222 8888888 22 1 1 2 22 1 1 11 55 33 1 33 22 0 1 9999999 4444 0 22 88888888888888888888 1 2222 1 33 111111111111 1 99999999 11 8888888888 44 1 11 1 222222 11 2 22 66666666666666666666666666666 44444444 2 1 888888888 11 1 3 11 1 1 3333333333333 2 33 44444 666 1 0 88888 6 1 22 1 888 777 66 00000 3 2
lowQualScore : .. .. . . ... ... .... ..... ........ ............ . .... .. ...... . . . . . . . .. . . . . . . . .. . .. . .... . .. . .. ... ....... .. . . . .. . . .. .. .. . .. .. . . ....... .... . .. .................... . .... . .. ............ . ........ .. .......... .. . .. . ...... .. . .. ............................. ........ . . ......... .. . . .. . . ............. . .. ..... ... . . ..... . . .. . ... ... .. ..... . .
lowQualScore : 66 22 2 0 888 444 3333 55555 22222222 333333333333 1 5555 22 555555 1 8 0 1 0 2 8 22 7 0 8 9 7 6 6 88 9 11 6 1111 2 33 7 55 555 0000000 00 4 4 9 00 4 4 00 77 99 4 88 55 2 4 1111111 1111 4 00 44444444444444444444 4 0000 4 66 555555555555 4 55555555 44 2222222222 00 2 77 0 555555 77 5 11 44444444444444444444444444444 44444444 4 2 111111111 77 2 8 77 2 2 7777777777777 2 88 44444 111 2 4 33333 4 7 55 9 222 888 22 00000 9 4
consensus : ATGTACAT--GTA--TATGTATTGCTTCTNAATCACACGTGGTCGTTAACAGATCGCG---A---CGA--A-ACCTGTGAAGN----TGCCTTTGGCAATGGATTATCAATGCTAT--------TAATAGCTATTTCAATAAA--------C---CA-TAT----ATT--ATGTCCCTTTTTCTTTTAAAATAA-ATAAACAAATTGAGTATTATGGT-GAAACTAAAAATGCGGAAAATATAACAACAGAT--AAAATATTTATTCATTTATATANTGACGNAATAAAAA-T-A-TTT-T--TATCA-TTTAATAATAA---TCAT--GTTATGCAAATNTTTG---TAAC--ACGA-T--AAA-A-G-TT--T-TA-TCTTAGGT--A--T-ATAAAA-TACCT-CGAAA-T-------GT--G-TAT--G------T-----C-N-----AT-C-GT-T-AC-TTT--AT-ATC-GC-GGCGGTTTGCCAG-T-TAG----GCGAATAGC-C---CCTT-G-TTTATAA-ATCCT--CATTNA--T---G--AGGTCAACCC-AT-C---------C---------G--------CG--------GT-TG-T-A--T-T--CTTACAAT--TGC-TACAATCACCGGTCGTGGAGGATTGAGCG--CC-TT-T-----------C-CTGTC-T-----TCT---TACAT-A---T-T-CTCA--TA-T--ACTT-CTGC-ACTG-----ACTTTTAT-TTTCTT
Reference ( family-586 ) : ATGTACAT--GTA--TATGTATTGCTTCTNAATCACACGTGGTCGTTAACAGATCGCG---A---CGA--A-ACCTGTGAAGN----TGCCTTTGGCAATGGATTATCAATGCTAT--------TAATAGCTATTTCAATAAA--------C---CA-TAT----ATT--ATGTCCCTTTTTCTTTTAAAATAA-ATAAACAAATTGAGTATTATGGT-GAAACTAAAAATGCGGAAAATATAACAACAGAT--AAAATATTTATTCATTTATATANTGACGNAATAAAAA-T-A-TTT-T--TATCA-TTTAATAATAA---TCAT--GTTATGCAAATNTTTG---TAAC--ACGA-T--AAA-A-G-TT--T-TA-TCTTAGGT--A--T-ATAAAA-TACCT-CGAAA-T-------GT--G-TAT--G------T-----C-N-----AT-C-GT-T-AC-TTT--AT-ATC-GC-GGCGGTTTGCCAG-T-TAG----GCGAATAGC-C---CCTT-G-TTTATAA-ATCCT--CATTNA--T---G--AGGTCAACCC-AT-C---------C---------G--------CG--------GT-TG-T-A--T-T--CTTACAAT--TGC-TACAATCACCGGTCGTGGAGGATTGAGCG--CC-TT-T-----------C-CTGTC-T-----TCT---TACAT-A---T-T-CTCA--TA-T--ACTT-CTGC-ACTG-----ACTTTTAT-TTTCTT
gi|90693 : ATGTACAT--GTA--TATGTATTGCTTCTCAATCACACGTGGTCGTTAACAGATCGCG---A---TGA--A-ACCTGTGAAGA----TGCCTTTGGCTATGGATTATCAATGCTAT--------TAATAGCTATTTCAATAAA--------C---CA-TAT----ATT--ATGTCCCTTTTTCTTTTAAAATAA-ATAAACAAATTGAGTATTGTGGT-GAAACTAAAAATTTGGAAAATATAACAACAGAT--AAAATATTTATTCATTTATACAATGACGAAATAAAAA-T-A-TTT-C--TATCA-TTTAATAATAA---TCAT--GGTATGCAAATGTTTG---TAAC--ATGA-T--AAA-A-G-TT--T-TA-TCTTAGGT--A--T-ATAAAA-CATCT-TAATA-T-------AT--A-TTT--G------T-----C-T-----AT-C-GT-A-AC-TTA--AT-ATC-GC-GGCGGTTTACCAG-T-TAG----GTGAATTGC-C---CCTT-G-TTTATAA-ATCCC--CATCCA--T---G--GGGTCAACCA-AA-C---------T---------A--------CG--------GT-TG-T-A--T-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCACCGGTCGTGGAGGATTAAGCG--CC-TT-T-----------C-CTATA-T-----TCT---TACAT-A---T-T-CTCA--TA-T--ACTT-CTGC-GCTT-----ACTTTTAT-TTTCTT
gi|90694 : ATGTACAG--GTA--CATGTATTGCTTCTCAATCACACGTGGTCGTTAACAGATCGCG---A---TGA--A-ACCTGTGAAGA----TGCCTTTGGCAATGGATTATCAATGCTAT--------TGATAGCTATTTCAATAAA--------T---CA-TAT----ATT--ATGTCCCTTTTTCTTTTAAAATAA-ATAAACAAGTTGAGTATTATGGT-GACACTAAAAATGTGGAAAATATAACAACAGAT--AAAATATTTATTCATTTATATAATGACGAAATAAAAA-T-ATTTT-T--TATCA-TTCAATTATAA---GCGT--GGTATGCAAATGTTTG---TAAC--ATGA-T--AAA-A-G-TT--T-TA-TCTTAGGT--A--T-ATAAAA-GATCT-TAATA-T-------AT--T-TTT--G------T-----C-T-----AT-C-GT-T-AC--TT--AT-ATC-GC-GGCGGTTTACCAG-T-TAG----GTGAATAGC-C---CCTT-G-TTTATAA-ATCCC--CATCCA--T---G--GGGTCAACCA-AA-C---------T---------A--------CG--------GT-TG-T-A--T-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCACCGGTCGTGGAGGATTAAGCA--CC-TT-T-----------C-CTATA-T-----TCT---TACAT-A---T-T-TTCA--TA-T--ACTT-CTAC-ACTA-----ACTTTTAA-TTTCTT
gi|90695 : ATGCACAT--GTA--TATGTATTGCTTCTCAATCATACGTGGTCGTTAACAGATCGAA---A---CGA--A-ACCTGTGAAGGAAGTCGCCTTTGGCAATGGATAATCAATGCTAT--------TAATAGCTATTTCAATAAT--------C---CA-TAT----ATT--ATGTCCCTTTTTCTTTTAAAATAA-ATAAACAAATTGAGTATTATGGT-GAAACTAAAAATGTGGAAAATATAACAACAGAT--AAAATATTTATTCATTTATATAATGACGAAATAAAAA-T-A--TT-T--TATCA-TTTAATAATAA---TCAT--GGTATGCAAATGTTTG---TAAC--ATGA-T--AAA-A-G-TT--T-TA-TCTTAGGT--A--T-ATAAAA-GATCT-TAATA-T-------AT--G-TTT--G------T-----C-T-----AT-C-GT-T-AC-TTT--GT-ATC-GC-GGCGGTTTACCAG-T-TAG----GTGAATAGC-C---CCTT-G-TTTATAA-ATCCA--CATCCG--T---T--GGGTCGACCA-AA-C---------T---------A--------CG--------GT-TG-T-A--T-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCACCGGTCGTGGAGGATTAAGCG--CC-TT-T-----------C-CTATA-T-----TTT---TACAT-A---T-T-CTCA--TA-T--ACTT-CTGC-ACTG-----ACTTTTAT-TTTCTT
gi|90696 : ATGTACAT--GTA--TATGTATTGCTTCTCAATCATACGTGGTCGTTAACAGATCGCG---A---TGA--A-ACCTGTGAAGA----TGCCTTTGGCAATGGATTATCAATGCTAT--------TAATAGCTATTTCAATAAA--------C---CA-TAT----ATT--ATGTCCCTTTTTCTTTTAAAATAA-ATAAACAAATTGAGTATTATTGT-GAAACTAAAAATGTGGAAAATATACAAACAGAT--AAAAAATTTATTCATTTATATAATGACGAAATAAAAA-T-A-TTT-T--TATCA-TTTAATAAAAA---TTAT--GGTATGCAAATGTTTG---TAAC--ATGA-T--AAA-A-G-TT--T-AA-TCTTAGGT--A--T-ATAAAA-TATCT-TAATA-T-------AT--G-TTT--G------T-----C-T-----AT-C-GT-T-AC-TTT--AT-ATC-GC-GGCGGTTTACCAG-T-TAG----GTGAATAGC-C---CCTT-G-TTTATAA-ATCCC--CATCCA--T---G--GGGTCAACCA-AA-C---------T---------A--------CG--------GT-TG-T-A--T-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCACCGGTCGTGGAGGATTAAGCG--CC-TT-T-----------C-CT-------------------AT-A---T-T-CTCA--TA-T--ACTT-CTGC-ACTG-----ACTTTTAT-TTTCTT
gi|90697 : ATGCACAT--GTA--TATGTATTGCTTCTCAATCATACGTGGTCGTTAACAGATCGCG---A---TGA--A-ACCTGTGAAGT----CGCCTTTGGCAATGGATTATCAATGTTAT--------TAATAGCTATTTTAATAAA--------C---CA-TAT----ATT--ATGTCCCTTTTTCTTTTAAAATAATAAAAACAAATTGAGTATTATGGT-GAAACTAAAATTGTGGAAAATATAATAACAGAT--AAAATATTCGTTAATTTATATAATGACGAAATAAAAA-T-A-TTT-T---ATCA-TTTAATAATAA---TCAT--GGTATGCAAATGTTTG---TAAC--ATGA-T--AAA-A-G-TT--T-TA-TCTTAGGT--A--T-ATAAAA-GATCT-TAATA-T-------AT--G-TTT--G------C-----C-T-----AT-C-GT-T-AC-TTT--AT-ATC-GC-GGCCGTTTACCAG-T-TAG----GTGAATAGC-C---CCTT-G-TTTATAA-ATCCC--CATCCA--T---G--GGGTCAACCA-AA-T---------T---------A--------CG--------GT-TG-T-A--T-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCACCGGTCGTGGAGGATTAAGCG--CC-TT-T-----------C-CTATA-G-----TCT---TACAT-A---T-T-C-CA--TA-T--ACTT-CTGC-ACTT-----TGTTTTATATTTTTT
gi|90698 : ATGTACAT--GTA--TATGTATTGCTTTTCAATCATACGTGACCGTTAACAGATCGCG---A---TGA--A-ACCTGTGAAGA----TGCCTTTGGCAATGGATTATCAATGCTAT--------TAATAGCTATTTATATAAA--------C---CA-TAT----ATT--ATGTCCCTTTTTCTTTTAAAATAA-ATAAACAAATTGAGTTTTATTGT-GAAGCTAAAAATGTGAAAAATATAACAACAGAT--AAAATATTTATTTATTTATATAATGACGAATTAAAAA-T-A-TTT-T--TATCA-TTTAATAATAA---TCAT--AGTATGCAAATGTTTG---TAAC--ATTA-T--AAA-A-G-TT--T-TA-TCTTAGGT--A--T-ATAAAT-GATCT-TAATA-T-------AT--G-TTT--G------T-----C-T-----AT-C-GT-T-AC-TTT--AT-ATC-GC-GGCAGTTTACCAG-T-TAG----GTGAATAGC-C---CATT-G-TTTATAA-ATCCC--CATCCA--T---G--GGGTCAACCA-AA-T---------C---------A--------CG--------GT-TG-T-A--T-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCACCGGGCGTGGAGGATTAAGCG--CC-TT-T-----------C-CT-------------------AT-A---T-T-TTCA--TA-T--ACTT-CTGT-ACTG-----ACTTTTAT-TTTCTT
gi|90699 : ATGTACATCTATA--TATATATTGCTTCTTAATCACACGTGGTCGTTAACAGATCGCG---A---CGA--A-ACCTGTGAAGA----TGCCTTTGGCAATGGATTATCAATGCTAT--------TAATGGCTATTTCAATAAA--------C---CA-TATGTATATT--ATGTCCCCTTTTCTTTTAAAATAA-ATAATCAAATTGAGTATTACGGT-GAAA--AAATATTC--AAAATATAACAACAGAT--AAAATATTTATTCATTTATATAATGACG-AATAAATA-T-A-TTT-T--TATCA-TTTAATAATAA---T-ATTCG-TATGCAAATGTTTG---TAAC--ATGA-T--TAA-A-G-TT--T-TA-TCTAAGGT--A--T-ATAAAA-GGTCT-TAGTA-T-------AT--C-CTT--G------T-----C-G-----AG-C-GT-T-AC-TTT--AT-ATC-GC-GGCGGTTTATCAG-T-AAG----GTGAACAGC-T---CCTT-G-TTTATAA-ATCCC--CATCCA--T---G--GGGTCAACCA-AA-C---------T---------A--------CG--------GT-TG-T-A--T-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCGCCGGTCGTGGAGGATTAAGCG--CC-TT-T-----------C-CCATA-T-----TCT---TACAT-A---T-T-CTCA--TA-T--ACTT-TTGC-ACTT-----ACTTTTCT-TTTC
gi|90700 : ATGTACAT--GTA--TATGAATTGCTTCTAAATCACACGTGGTTGTTTACAGATCGCA---A---CAA--T-ATCTGTGAAAA----TGCCTTTGATAATAGATTATAAATGCTATCATGTTATTAATAGCTATTTCAATAAA--------A---CA-TAT----TTTGCATGTC---TTTTCTTT------AA-ATAAACAAAT-GAATATTATGGT-GAAACTATAAATGCAGAAAATGCAACGATATAT--AAAATACGTGTTCATTGATATATTGACATAATAAAAA-T-A-TTT-TGTTATCA-TTT--TA-TAA---TCAT--GTTATGCAAATATTTG---TAAC--ATGA-T--AAA-C-G-TT--T-TA-ACTTAGGT--A--T-ATAAAA-GATCT-TGATA-T-------GT--G-TAT--A------T-----C-G-----AT-C-GT-T-AC-TTT--AT-ATC-GC-GGCGCTTAATCAG-T-TAG----GTGAATAGC-C---CCTT-G-TTTATAA-ATTCC--CCTACA--T---G--AGGTCAACCC-AC-C---------C---------A--------CG--------GT-TG-T-A--T-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCACCGGTCGTGGAGGATTAAGCG--CCTTT-T-----------C-CTATT-T-----TCT---TACAT-A-------CTTA--TACT--ACTG-CTGC-TGTG-----ACTTTTAT-TTTCTT
gi|90701 : ACAT--GTG--TATATATGGCTTCTAAATTACACGTGGGCGTAACCAGATCACGGATA---CAA--T-ACCCGTGAATG----TGCCTTTGGGAATGGATTATAAATTATAT--------TAATAGCTATTTCAATAAAAGAA----CG--CA-CAT----ATT--ATGTTCCTTTTTCTTT------AA-ATAGACAAAT-GGGTATAATGGTTAAAACTATAGGTGCAGATAATATAACAAAAGAT--AAAACATTTATTCATTAATATACTGACTTAATAAACA-T-AATTTGT--TATCA-C---GTAATAT---TCAT----TATGTAAGTGTTTG---TAAT--ATGA-T--AAA-C-G-TT--T-TA-TCTTAGGT--G--T-ATAAAA-GACAT-AACAA-T-------AT--A-TAC--G------C-----C-G-----AT-C-GT-T-AC-TTA--AT--TT-GCCGGCGGTTTACAAG-T-TAG----GTGAATAGC-C---CAT--A-TTTG-AA-ATCCT--CGTACA--G---G--AGGTCAACCT-AA-AG--------C---------A--------TG--------GC-TG-C-A--T-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCACCGGTAGTGGAGGATTAAGCG--CC-TT-T-----------C-CTATT-T-----TCT---TACAT-T---T-TTCTAAACTA-TT-ACTA-CTGT---TG-----ACTTTTAT-TTTCTT
gi|90702 : ACAT--GTA--TATATATGGCTTCTAAATTACACGTGGTCGTAACCAGATCGCG---ATTACAA--T-ACCCGTGAATG----TGCCTTTGGCAATGGATTATCAATTATAT--------TAAAAGCTATTTCATTAAA--------AGAACG-CAT----AT---ATGTCCCTTTTTCTTT------AA-ATAGACAA-TTGGGTATAATGAT-AAAACTATAAGTGCAGACATTATAACAAAAGAT--AAAACATTTATTCATTAATATACTGACTTAATAAACA-TAA-TTTGT--TATCA-CTTGAT-AT-----TCAT--ATTATGTAAATGTTTG---TAAC--ACGA-T--AAA-A-G-TT--T-TA-TCTTAGGT--G--T-ATAAAA-GACAT---AAA-T-------AT--
gi|90703 : AT--GTAACTATATATGGCTTCTAATTCAAATGCGGTCGTCAACAGATTGCA---A---CAACAATACCTGTAAAGT----TGCCTTAATCAATGGGTTATAATTGCTAT--------TAATAGCTATTTCAATAAATACAAAACC---CAACAT----ATT--ATGTGCCTTTTTCTTT------AA-ATAAACAAAT-GGGTATAATGAT-GAAACTATAAATACAGAAAATACAGCAAAAGAT--AAAATATTTATTAATTTATATGCTGACATAATAAAAA-T-ACTTT-T--TATCC-TTTA----TAT---GCAT--GTTATGCAAATATCTA---TAAC--TTG--T--AAACC-G-TT--T-TA-TTTTAGGT--A--T-ATAAAA-TATCT---AAA-T-------AT--A-TAT--T------TTA---C-G-----AC-C-GT-T-AC-TTT--AT-ATTGGC-GGCGGTTTACCAG-T-TAG----GTGAATAG--C---CCTT-G-TTTTGCA-ATCCT--CCTTCA--T---G--AGGTCAACCC-AC-C---------C---------A--------TG--------GT-TG-T-A--C-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCACCGGTCGTGGAGGATTAAGCG--TC-TA-T-----------C-CTCAT-T-----TCT---TAGAT-AT--T-T-CTTA--TC-T--ACTG-CTCC-TGTG-----ACTTTAAA-TTTCT
gi|90704 : --GTG--TATATATGGATTCTAAATTGCATGT-GTTGTAACCAGATCTCGATTA---CAG--T-ACCTGTGAAAT----TGCCTTTGGCAGTGGATTATAAATGCTAT--------TAAAAGat
gi|90705 : --TATACATGGCTTCTAAATTACACGTGGTCG------AAT-------A---CAA--T-ACCCGTGAATG----TGCCTTTGACAATGGATTATAAATTATAT--------TAATAGCTATTTCAATAAAAAAAAAA-CG--CG-CAT----ATT--ATGTCCCTTTTTCTTT------AA-ATAGACAAAT-GAGTATAATGGT-AAAACTATAAGTGCAAAAAATATAACAAAATAT--AAAATATTTATTCATTAATATACTGATTTAATAAACA-TAA-TTTGT--TATCA-CTTTGTATTA------AT--ATTATGTAAATGTTTG---TAAC--ATGG-C--AAA-C-G-TT--T-TA-TCTTATGT--G--T-ATAAAA-GACATAAAAAA-T-------AT--A-TAT--G------T-----C-G-----CC-C-GT-T-AC-TTT--AT--TT-GCTGGCGGTTTACCAG-T-TAG----GTGAATAGC-C---CAT----ATTAGAA-ATCCC--CGCTCA--T---G--GGGTCAACCTAAA-G---------C---------A--------TG--------GT-TG-C-A--T-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCACCGGTCGTGGAGGATTAAGCG--CC-TT-T-----------C-CTATT-T-----TCT---AACAT-A---T-T-CCCA--AA-T-------------TTG-----ACCGTTAT-TTTCTT
gi|90706 : --------C---CA-CAT----ATT--ATGTCCCTTTTTCTTC-AAAA------AAA-AAAT-GTGTATAGCGGT-GAAACTAAAAATGCAGATAATGTAGCAAAAGATAAAAAAAAGATATTTATTGATATACTGACATAATAGAAA-A-A-GTG-T--TATCACTTTA--GAT-----TCAT--ATTATGCAAATGTTTG---TAAC--ATAA-A--AAA-ACG-TT--T-TA-TCTAAGGC--A--T-ACGCAA-GACCT-TAAAA-T-------AT------------------------A-----AT-C-GT-T-AC-TTT--AT-ATT-GCTGGAGGTTTACCAG-T-TAG----GTAAATAG--C---CCTT-A-TTTG-AA-ATCCT--CGATCA--T---T--AGGTCAACCCAAA-C---------C---------A--------TG--------GT-TG-T-A--C-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCATCGGTAGTGGAGGATTTAGCG--CG-TT-T-----------C-TTATT-A-----TCT---TAAAA-A---TGT-CTTA--CT-T--ACCT--TGT--CTG-----ATTTTTAT-TTTCTT
gi|90707 : GGAACAAGAAGT-A-ATT-CA-TA-CG-TTTGATA-TAAGTTTTAT--GTTATGGAAATCGTTG---TTAT---CGACT--AAA-A-G-TT--T-T--TGTT-GGTGAA--T-ATAAAAATACCT-CGAAA-T-------GT--G-TAT--GC-----T-----G-T-----AT-C-CA-T-ACGTTT----------C-GGCGGTTTGCTAG-T-ACT----GCGAATAGC-C---TAAT-T-TTGATA---TCCT--CATTGA--TAT-G--AGGTCAACCC-AT-C---------CAGTGGAAT-G--------TG--------GT-TG-T---------CTTACAAT--TGC-TACAGTCATCAGTCGTGGAGGATTGAGCG--CC-TT-T-----------TACTGTC-C-----TCT---CTCTT-T---C-T-CTCT--TA-T--
gi|90708 : ---TTAT--GTTATGCAAATCGTTG---TAAC---CGACT--GAA-A-G-TT--T-T--TGTT-GGTGAA--T-ATAAAA-TACCT-CGAAA-T-------GT--G-TAC--G------TGGAATC-C-----AT-CCGT-T-----TT------------GGCGGTTTGCTAG-T-ACT----GTGAATAGC-C-----TA-A-TTTTGAA-ATCCT--CATTAA--TTT-G--AGGTCAACCA-AT-C---------CA--------G--------TG--------GTATG-T-GGTTGT--CTTACAAT--TGC-TACAATCACCGGTCGTGGAGGATTGAGCG--CA-TT-TA----------A-CTGTT-T-----TCT---TTC-T-G---TCT-TTCT--TA-T--GCCTAATAC-AATA-----ACTTTC-T-TTTCTTgtctaataatataactttttgttctt
gi|90709 : ---TTAT--GTTATGCAAATCGTTG---TTAC---CGA-C--TAA-G-T-TT--T-TG-T---AGGTGAA--T-ATAAAA-TACCT-CGACA-T-------TT--C-TAT--G------T-----T-GT----AT-C-CA-T-AC------GT-ATC-G---GTGGTTTG-----T-TAGAACTGTGAATAGC-C---AAAT---TTTA-AA-ATCCT--CATTGA--TTA-G--AGGTCAACCC-AT-C---------CAGTGGGAT-G--------TG--------GT-TG-T---------CTTATAAT--TGC-TACAATCACCAGTCGTGGAGGATTGAGCG--CT-TT-T-----------A-CTGTC-T-----TCT---
gi|90710 : ---TTAT--GCTATGCAAATTGTTG---TAAC---CGACT--AAA-A-G-GT--T-TT-GCT--GGT--GAGT-ATAAAA-TACCT-CGAAA-T-------GT--G-TA------------------C-----ATAC-GT-C-A--TTT--AT-ATC--T-GGCGGTTTACTAG-T-AGA----GCAGATAGC-C------T-A-ATCATAA-GT--T--AAATTA---------AGGTTAACCC-AT-CTTGTGGGA-T---------G--------TG--------GT-TGCC-A--T-T------CAAT--TGC-TACAATTGCCGGTCGTGGATGATTGAGAGTCCC-TT-T-----------CACTGTT-T-----Tctctatctttcttatgtctaataatataactttctgttctt
gi|90711 : ---TTAT--GTTATGCCAATCGTTG---TAAC---CGG----------------C-TA-TCT--GGTGAA--T-ATAAAA-TAGCT-CGAAA-TTAATACGAT--G-TA---A------T-----C-A-----AA-C-GT-T----TT-------------GGCGGTTGGCTAG-T-ACT----GCGAATAG------GCTT-A-TTTTGAA-ATCCT--CATTAATTT---G--AGGTCAACCT-AT-CAAGTGAGA-T---------G--------TG--------GT-TG--------T--CACACAAT--TGC-TACAATCGCCGGTCGTGGAGGATTGAGCA--CC-TT-TA----------A-CTGTC-T-----TCTC--TAGAT-CT--T-T-CTTA--Tatctctgtatttcttctgtctcgtaaagtaacatctttttctt
gi|90712 : ---TTAT--GTTATGCAAATCGTTG---TAAC---CGACT--AAA-C-GATT--T-GA-T----GGTGAA--T-ATAAAA-TACCT-CGAAA-T-------GT--G-TAT--G------T-----TGT-----AT-C-CA-T-AC-GTT--TT--------GGCGGTTTGCTAG-C-ACT----GCGAATAG------CCTA-A-TTTTGAA-ATCCT--CATTGATTT---A--TAGTCAACCC-AT-C---------g
gi|90712 : AA-ATCCT--CAATGA--TTT-G--AGGTCAACCT-AT-C---------CAGTGGAAT-G--------TG--------GT-TG-T---------CTTATAAT--TGC-TACAATCACCGGTCGTGGAGGATTGAGCG--CC-TT-T-----------TGCTGTC-T-----TCT---tagtgggatgtggttgtcgaattttgaaatcctcaatgatttgaggtcaacctatccagtggaatgtggttgtcttataattgctacaatcaccggtcgtggaggattgagcgccttttgctgtcttctctctatctttcttctgtctaataatataactttcttttctt
gi|90713 : ttatgttatgcaaatcgttgtaaccgactaaacgatttgatggtgaatataaaatacctcgaaatgtgtatgttgtatccatacgttttggcggtttgctagcactgcgaatagcctaattttgaaatcctcattgatttatagtcaacccatctagtgggatgtggttgtcgaattttg---TTAT--GTTATGCAAATCGTTG---TAAC---CGA-CTAAAA-A-A-AA--T-GA-T----GGTGAA--T-ATAAAA-TACCT-CGAAA-T-------GT--G-TAA--G------T-----TGT-----AT-C-CA-T-AC-GTT--TT--------GGCGGTTTGCCAG-T-ATT----GCGAATAGC-C---TAAT---TTTA-AA-ATCCT--CATTGATTT---G--AGGTCAACCctctatctttcttctgtctaataatataactttcttttctt
gi|90714 : T--GTTATGCAAATCGTTG---TAACCTAC---T--AAA-A-G-TT--TGTGCTGTTGAAT--A--T-ATAA---TATCT-CGAAA-T-------GT--C-TAT--G------T-----T-AT----AT-C-CA-T-ACGTTT----------C-GGCGGTTTGCTAG-T-ACT----GCGAATAGC-C-----TA-A-TTTTGAA-ATCCT--CATTGA--TTTGG--GGGTCAACCC-AT-C---------CAGTGGGAT-G--------TG--------GT-TG-T---------CTTACAAT--TGC-TACAATCACCGGTCGTGGAGGATTGAGCG--CC-TT-TTACTGAATCTCT-CTGTCTT-----TCT---TATGT-A---T-
gi|90715 : T--GTTATGCAAATCGCTG---TAAC---TGACT--AAA-A-G-TT--T-TT-GCT--GGT--AAAT-ATAAAA-TACCT-CGAAA-T-------GT--G-TAT--GA-----T-----G-C-----AT-C-CA-A-AC-GTT--TT-A-------GCGGTTTGCTAG-T-GCT----GCGAATAGT-C-----TT-A-TTTTGAA-ATCCT--CATCAA--TTT-G--AGGTCAACCC-AT-C---------CAGCTGGAT-G--------TG--------GT-TG-T---------CTTACAAT--TGT-TACAATCACCGGACGTGGAGGATTCAGCA--CC-TT-TA----------A-CTGTC-T-----TCTC--TCCAT-CT--T-T-CTTA--TG-T---CTA-ATAA-GATA-----ACTTTC-T-TTTCTTaataacataactttcttttctt
gi|90716 : T--GTTATGCAAATCATTG---TAAC---CGACT--TAA-A-G-TT--T-TT-GCT--GGTGAA--T-ATAAAA-TACCT-C-AAA-T-------GT--G-TAC--A------T-----C-C-----AA--------AC-CTT------TT-GC---CGGTTTGCTA--T-TACT---GCGAATAGC-CAAATTTT-G------AA-ATTCT--CGATAA--TTT-G--AGGTCAACCC-AT-C---------CAGCGGGAT-G--------TG--------GT-TG-T---------CTTACAAA--TGC-TATAATCACCGGTCGTGGAGGATTGAGCA--TC-TT-TA----------A-CTGGC-T-----TCTC--TCTATCG---T-T-CTTA--TG-T---CT-----C-ACTAGATATACTTTC-T-TTTCTT
gi|90717 : T--GTTATGCAAATCGTTG---TAAC---CGACT--AAA-T-G-TT--T-TA-GCT--GGTGAA--T-ATAAAA-TACCT-CGAAAAC-------GT--G-TAC--GATGCATC-----C-A-----AG-C-GT-T-----TT------------GGCGGTTTGCTAG-T-ACT----GCGAATAGC-C---TATT-T-TTT-TAA-ATCCT--CATAAAATT---G--AGGTCAACCC-AT-C------------------------------------------------------------------T-TACAATCGCCGGTCGTGGAGGATTGAGCA--CC-TTAA-----------A-CTGTT-T-----TCTCTCTATCT-----T-T-CTTA--TG-T---CTA-ATAA-GATA-----ACTTTC-T-TTTCTT
gi|90718 : TATGCAAATATTTG---TAAC---TGACT--GAA-A-GAAT--T-TG--CTAAGGC--A--C-ATAAAA--A-CT-CGAAA-TTC-----GT--GATAT--G--------------C-----AT-C----C-AG-CTT--AA-AT---T-GGCGGTTTGTTTGAT-TA-----ACGAATAG--T---CAGA-G-TTT-TAA-ATCCTCACACGCA--T---G--AGTTCAATCC-AT-T---------CTAGGAT---G--------TG--------AT-TA-C-A--A-T--CTGACAAA--TGT-T-CAGTCACTGGTCGTGG
gi|90719 : gaATACATGTATTTG---TA-T--ATG--C--AAA-T-G-TTAGT-GA-CCT---GT--A--TTATAAAA-TATCT-TGAAA----------------ATCAG------T-----C-ATTAGTAT-C-CTGT-AT-TTT--ATTA------GGCAAATTGCTTG-TATAG-----TGAA--GCGC---CTTT-A-TTTG-AA-ATCCT--CATTAA--C---GTCAGGTCAGCAC-AT-C---------TCAGTTTGATG--------TG--------GC-TG-T-C--T-G--GTTA-AA----GC-TTAAACCACCGGTGGTGGAGGATTAAGCA--CC-TT-T-----------C-------------TCT---TACAT-C---T-T-taaatta
gi|90720 : gcTATGCAGTTTTGTGGGTTAAC--AGGG-C--TAA-A-C-CT--T-TA-TCTGAGGT--T--T-ACAGA--CACAT-CGATA-T-------AT----TAT---------C-----C-T-----AT-T-GC-A-A---TT--A--A------GGTGGTTTGCCAG-T-TCG----GTGAA-A---C---TCTT-G-TCTGCAAGAACAT--CACTTAG-T---G--AGTTTAACCC-ATAC---------T---------G--------CGTGCATGTGGT-TG-C-A--C-T--CCTGTTAT--TGC-TTCA-TCACCAGTGTTTGTGGATAAGGCG--CC-TT-T-----------T-CTATT-T-----TCT---AACgctatctttccta
gi|90721 : gTATGCAAATGTTAG---TAAC---CAACT--AAA-A-G-TT--T-TA-ACTGGTGT--A--C-ATAAAA-TACCT-CGAAA-TTCA----GTCAG-T-T--G------T-------------AT-C-CC-TGAT-TTTCAAT-A------GGCAAATTGCTTG-T-ACA----GCGA--AGC-G---CCTTAA-TTTG-AA-ATTCT--CACTAACGT---G--AGGTCAGCCC-AT-CTCAATTTGAT---------G--------TG--------GT-T--T-A--C-TGACTT----T--AGCTTAAAAGCACCGGTCGTGGAGGATTAAGCA--CC-TT-T-----------CTCTTAC-T-----TCT---TGC-T-A---T-T-TTtgcctttctttatctatcaagtttgacattttctt
gi|90722 : --G------T-----C-G-----AT-C-GT-T-AC-TTA--AT--TA-GCTGGCGGTTTACCAG-T-TAG----GTGAATAGC-A---CAT--A-CTTA-AA-ATCAT--CG--CA--C---A--GGATCA-------------------------------------TG--------GT-TG-C-A--T-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCACCGGTTGTGGAGGATTAAGCG--CC-TT-T-----------C-CCATT-T-----TCC---TACAT-A---T-T-------TA-TTAACTA-CTACAACTGTTC--ACTTTTAA-TTTCTtcct
gi|90723 : GCGGTTTGATAG-T-ACT----GCGACTAGC-------TT-AATTTTTAA-ATCCT--CATTAA--TTT-G--AGATCAACCC-AT-C---------CA--------G--------TG--------GGGTG-TGA--T-TGTCTTACAAA--TGC-TGCAATCACCGGTCATGGATGATTGAACG--CC-TT-TA----------A-CTGTC-T-----CCT---TTC-T-ATCTT-T-CTTA--TG-T--
gi|90724 : AA-ATCCT--CATTGA--TTT-G--AATTCAACCT-AT-C---------C---------GGTGGGATGTG--------GT-TG-T---------CTTACAAT--TGC-TACAATCACCGGTCGTGGAGGGTTGAACG--CG-TT-T-----------CACTTTC-T-----TTT---ctaataagataactctcttt
gi|90725 : ctcaatttgAA-ATCCT--CATTGA--TTT-G--AGGTGAACCC-AT-C---------CAGTGGGAT-G--------TG--------GC-TG-T---------CTCACAATATTGT-TATAATCACCGGTCGTGGAGGATTGAGCG--AT-TT-TAC---------T-CTATCTT-----TCT---Tctctttcttatgtctaacaacataacattcttttctt
gi|90726 : AA-ATCCT--CATTGA--TTT-G--AGGTCAACCC-AT-C---------CAGTGGGGT-G--------TG--------GT-TG-T---------CTTAAAAT--TAC-TACAATTAGCGGTCGTAGATGATTGAGTG--CC-TT-TA----------A-CTGTC-T-----TCT---ttcttgtgttt
gi|90727 : --------GT-TG-T-T--G-T--TTTACAAT--TGC-TACAATCGCCGGTCGTGGATGATTGAGCG--CC-TT-T-----------TACTGTC-TC----TCT---C---T-A---TCT-TTCA--TA-T--ctctatctttctaatgtctaataatataacattttgttct
gi|90728 : aat--------GT-TG-T-T--G-T--TTTACAAT--TGC-TACAATCGCCGGTCGTGGATGATTGAGCG--CC-TT-T-----------TACTGTC-TCTCTGTCT---TTCAT-A---TGT-CTAA--TA-g
Alignments
lowQualScore : 111 11111111 333333333333 111111 1111111 11 11 11111111111111111111 333333333333 11 222222 66666666666666666666666666666 111111111 1 2222222222222 11111
lowQualScore : 44 44 0 1 000 555 8888 77777 11111111 444444444444 3 6666 44 888888 3 9 1 3 1 1 0 44 0 1 3 2 5 8 8 66 2 22 1 5555 0 22 0 11 222 8888888 22 1 1 2 22 1 1 11 55 33 1 33 22 0 1 9999999 4444 0 22 88888888888888888888 1 2222 1 33 111111111111 1 99999999 11 8888888888 44 1 11 1 222222 11 2 22 66666666666666666666666666666 44444444 2 1 888888888 11 1 3 11 1 1 3333333333333 2 33 44444 666 1 0 88888 6 1 22 1 888 777 66 00000 3 2
lowQualScore : .. .. . . ... ... .... ..... ........ ............ . .... .. ...... . . . . . . . .. . . . . . . . .. . .. . .... . .. . .. ... ....... .. . . . .. . . .. .. .. . .. .. . . ....... .... . .. .................... . .... . .. ............ . ........ .. .......... .. . .. . ...... .. . .. ............................. ........ . . ......... .. . . .. . . ............. . .. ..... ... . . ..... . . .. . ... ... .. ..... . .
lowQualScore : 66 22 2 0 888 444 3333 55555 22222222 333333333333 1 5555 22 555555 1 8 0 1 0 2 8 22 7 0 8 9 7 6 6 88 9 11 6 1111 2 33 7 55 555 0000000 00 4 4 9 00 4 4 00 77 99 4 88 55 2 4 1111111 1111 4 00 44444444444444444444 4 0000 4 66 555555555555 4 55555555 44 2222222222 00 2 77 0 555555 77 5 11 44444444444444444444444444444 44444444 4 2 111111111 77 2 8 77 2 2 7777777777777 2 88 44444 111 2 4 33333 4 7 55 9 222 888 22 00000 9 4
consensus : ATGTACAT--GTA--TATGTATTGCTTCTNAATCACACGTGGTCGTTAACAGATCGCG---A---CGA--A-ACCTGTGAAGN----TGCCTTTGGCAATGGATTATCAATGCTAT--------TAATAGCTATTTCAATAAA--------C---CA-TAT----ATT--ATGTCCCTTTTTCTTTTAAAATAA-ATAAACAAATTGAGTATTATGGT-GAAACTAAAAATGCGGAAAATATAACAACAGAT--AAAATATTTATTCATTTATATANTGACGNAATAAAAA-T-A-TTT-T--TATCA-TTTAATAATAA---TCAT--GTTATGCAAATNTTTG---TAAC--ACGA-T--AAA-A-G-TT--T-TA-TCTTAGGT--A--T-ATAAAA-TACCT-CGAAA-T-------GT--G-TAT--G------T-----C-N-----AT-C-GT-T-AC-TTT--AT-ATC-GC-GGCGGTTTGCCAG-T-TAG----GCGAATAGC-C---CCTT-G-TTTATAA-ATCCT--CATTNA--T---G--AGGTCAACCC-AT-C---------C---------G--------CG--------GT-TG-T-A--T-T--CTTACAAT--TGC-TACAATCACCGGTCGTGGAGGATTGAGCG--CC-TT-T-----------C-CTGTC-T-----TCT---TACAT-A---T-T-CTCA--TA-T--ACTT-CTGC-ACTG-----ACTTTTAT-TTTCTT
Reference ( family-586 ) : ATGTACAT--GTA--TATGTATTGCTTCTNAATCACACGTGGTCGTTAACAGATCGCG---A---CGA--A-ACCTGTGAAGN----TGCCTTTGGCAATGGATTATCAATGCTAT--------TAATAGCTATTTCAATAAA--------C---CA-TAT----ATT--ATGTCCCTTTTTCTTTTAAAATAA-ATAAACAAATTGAGTATTATGGT-GAAACTAAAAATGCGGAAAATATAACAACAGAT--AAAATATTTATTCATTTATATANTGACGNAATAAAAA-T-A-TTT-T--TATCA-TTTAATAATAA---TCAT--GTTATGCAAATNTTTG---TAAC--ACGA-T--AAA-A-G-TT--T-TA-TCTTAGGT--A--T-ATAAAA-TACCT-CGAAA-T-------GT--G-TAT--G------T-----C-N-----AT-C-GT-T-AC-TTT--AT-ATC-GC-GGCGGTTTGCCAG-T-TAG----GCGAATAGC-C---CCTT-G-TTTATAA-ATCCT--CATTNA--T---G--AGGTCAACCC-AT-C---------C---------G--------CG--------GT-TG-T-A--T-T--CTTACAAT--TGC-TACAATCACCGGTCGTGGAGGATTGAGCG--CC-TT-T-----------C-CTGTC-T-----TCT---TACAT-A---T-T-CTCA--TA-T--ACTT-CTGC-ACTG-----ACTTTTAT-TTTCTT
gi|90693 : ATGTACAT--GTA--TATGTATTGCTTCTCAATCACACGTGGTCGTTAACAGATCGCG---A---TGA--A-ACCTGTGAAGA----TGCCTTTGGCTATGGATTATCAATGCTAT--------TAATAGCTATTTCAATAAA--------C---CA-TAT----ATT--ATGTCCCTTTTTCTTTTAAAATAA-ATAAACAAATTGAGTATTGTGGT-GAAACTAAAAATTTGGAAAATATAACAACAGAT--AAAATATTTATTCATTTATACAATGACGAAATAAAAA-T-A-TTT-C--TATCA-TTTAATAATAA---TCAT--GGTATGCAAATGTTTG---TAAC--ATGA-T--AAA-A-G-TT--T-TA-TCTTAGGT--A--T-ATAAAA-CATCT-TAATA-T-------AT--A-TTT--G------T-----C-T-----AT-C-GT-A-AC-TTA--AT-ATC-GC-GGCGGTTTACCAG-T-TAG----GTGAATTGC-C---CCTT-G-TTTATAA-ATCCC--CATCCA--T---G--GGGTCAACCA-AA-C---------T---------A--------CG--------GT-TG-T-A--T-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCACCGGTCGTGGAGGATTAAGCG--CC-TT-T-----------C-CTATA-T-----TCT---TACAT-A---T-T-CTCA--TA-T--ACTT-CTGC-GCTT-----ACTTTTAT-TTTCTT
gi|90694 : ATGTACAG--GTA--CATGTATTGCTTCTCAATCACACGTGGTCGTTAACAGATCGCG---A---TGA--A-ACCTGTGAAGA----TGCCTTTGGCAATGGATTATCAATGCTAT--------TGATAGCTATTTCAATAAA--------T---CA-TAT----ATT--ATGTCCCTTTTTCTTTTAAAATAA-ATAAACAAGTTGAGTATTATGGT-GACACTAAAAATGTGGAAAATATAACAACAGAT--AAAATATTTATTCATTTATATAATGACGAAATAAAAA-T-ATTTT-T--TATCA-TTCAATTATAA---GCGT--GGTATGCAAATGTTTG---TAAC--ATGA-T--AAA-A-G-TT--T-TA-TCTTAGGT--A--T-ATAAAA-GATCT-TAATA-T-------AT--T-TTT--G------T-----C-T-----AT-C-GT-T-AC--TT--AT-ATC-GC-GGCGGTTTACCAG-T-TAG----GTGAATAGC-C---CCTT-G-TTTATAA-ATCCC--CATCCA--T---G--GGGTCAACCA-AA-C---------T---------A--------CG--------GT-TG-T-A--T-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCACCGGTCGTGGAGGATTAAGCA--CC-TT-T-----------C-CTATA-T-----TCT---TACAT-A---T-T-TTCA--TA-T--ACTT-CTAC-ACTA-----ACTTTTAA-TTTCTT
gi|90695 : ATGCACAT--GTA--TATGTATTGCTTCTCAATCATACGTGGTCGTTAACAGATCGAA---A---CGA--A-ACCTGTGAAGGAAGTCGCCTTTGGCAATGGATAATCAATGCTAT--------TAATAGCTATTTCAATAAT--------C---CA-TAT----ATT--ATGTCCCTTTTTCTTTTAAAATAA-ATAAACAAATTGAGTATTATGGT-GAAACTAAAAATGTGGAAAATATAACAACAGAT--AAAATATTTATTCATTTATATAATGACGAAATAAAAA-T-A--TT-T--TATCA-TTTAATAATAA---TCAT--GGTATGCAAATGTTTG---TAAC--ATGA-T--AAA-A-G-TT--T-TA-TCTTAGGT--A--T-ATAAAA-GATCT-TAATA-T-------AT--G-TTT--G------T-----C-T-----AT-C-GT-T-AC-TTT--GT-ATC-GC-GGCGGTTTACCAG-T-TAG----GTGAATAGC-C---CCTT-G-TTTATAA-ATCCA--CATCCG--T---T--GGGTCGACCA-AA-C---------T---------A--------CG--------GT-TG-T-A--T-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCACCGGTCGTGGAGGATTAAGCG--CC-TT-T-----------C-CTATA-T-----TTT---TACAT-A---T-T-CTCA--TA-T--ACTT-CTGC-ACTG-----ACTTTTAT-TTTCTT
gi|90696 : ATGTACAT--GTA--TATGTATTGCTTCTCAATCATACGTGGTCGTTAACAGATCGCG---A---TGA--A-ACCTGTGAAGA----TGCCTTTGGCAATGGATTATCAATGCTAT--------TAATAGCTATTTCAATAAA--------C---CA-TAT----ATT--ATGTCCCTTTTTCTTTTAAAATAA-ATAAACAAATTGAGTATTATTGT-GAAACTAAAAATGTGGAAAATATACAAACAGAT--AAAAAATTTATTCATTTATATAATGACGAAATAAAAA-T-A-TTT-T--TATCA-TTTAATAAAAA---TTAT--GGTATGCAAATGTTTG---TAAC--ATGA-T--AAA-A-G-TT--T-AA-TCTTAGGT--A--T-ATAAAA-TATCT-TAATA-T-------AT--G-TTT--G------T-----C-T-----AT-C-GT-T-AC-TTT--AT-ATC-GC-GGCGGTTTACCAG-T-TAG----GTGAATAGC-C---CCTT-G-TTTATAA-ATCCC--CATCCA--T---G--GGGTCAACCA-AA-C---------T---------A--------CG--------GT-TG-T-A--T-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCACCGGTCGTGGAGGATTAAGCG--CC-TT-T-----------C-CT-------------------AT-A---T-T-CTCA--TA-T--ACTT-CTGC-ACTG-----ACTTTTAT-TTTCTT
gi|90697 : ATGCACAT--GTA--TATGTATTGCTTCTCAATCATACGTGGTCGTTAACAGATCGCG---A---TGA--A-ACCTGTGAAGT----CGCCTTTGGCAATGGATTATCAATGTTAT--------TAATAGCTATTTTAATAAA--------C---CA-TAT----ATT--ATGTCCCTTTTTCTTTTAAAATAATAAAAACAAATTGAGTATTATGGT-GAAACTAAAATTGTGGAAAATATAATAACAGAT--AAAATATTCGTTAATTTATATAATGACGAAATAAAAA-T-A-TTT-T---ATCA-TTTAATAATAA---TCAT--GGTATGCAAATGTTTG---TAAC--ATGA-T--AAA-A-G-TT--T-TA-TCTTAGGT--A--T-ATAAAA-GATCT-TAATA-T-------AT--G-TTT--G------C-----C-T-----AT-C-GT-T-AC-TTT--AT-ATC-GC-GGCCGTTTACCAG-T-TAG----GTGAATAGC-C---CCTT-G-TTTATAA-ATCCC--CATCCA--T---G--GGGTCAACCA-AA-T---------T---------A--------CG--------GT-TG-T-A--T-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCACCGGTCGTGGAGGATTAAGCG--CC-TT-T-----------C-CTATA-G-----TCT---TACAT-A---T-T-C-CA--TA-T--ACTT-CTGC-ACTT-----TGTTTTATATTTTTT
gi|90698 : ATGTACAT--GTA--TATGTATTGCTTTTCAATCATACGTGACCGTTAACAGATCGCG---A---TGA--A-ACCTGTGAAGA----TGCCTTTGGCAATGGATTATCAATGCTAT--------TAATAGCTATTTATATAAA--------C---CA-TAT----ATT--ATGTCCCTTTTTCTTTTAAAATAA-ATAAACAAATTGAGTTTTATTGT-GAAGCTAAAAATGTGAAAAATATAACAACAGAT--AAAATATTTATTTATTTATATAATGACGAATTAAAAA-T-A-TTT-T--TATCA-TTTAATAATAA---TCAT--AGTATGCAAATGTTTG---TAAC--ATTA-T--AAA-A-G-TT--T-TA-TCTTAGGT--A--T-ATAAAT-GATCT-TAATA-T-------AT--G-TTT--G------T-----C-T-----AT-C-GT-T-AC-TTT--AT-ATC-GC-GGCAGTTTACCAG-T-TAG----GTGAATAGC-C---CATT-G-TTTATAA-ATCCC--CATCCA--T---G--GGGTCAACCA-AA-T---------C---------A--------CG--------GT-TG-T-A--T-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCACCGGGCGTGGAGGATTAAGCG--CC-TT-T-----------C-CT-------------------AT-A---T-T-TTCA--TA-T--ACTT-CTGT-ACTG-----ACTTTTAT-TTTCTT
gi|90699 : ATGTACATCTATA--TATATATTGCTTCTTAATCACACGTGGTCGTTAACAGATCGCG---A---CGA--A-ACCTGTGAAGA----TGCCTTTGGCAATGGATTATCAATGCTAT--------TAATGGCTATTTCAATAAA--------C---CA-TATGTATATT--ATGTCCCCTTTTCTTTTAAAATAA-ATAATCAAATTGAGTATTACGGT-GAAA--AAATATTC--AAAATATAACAACAGAT--AAAATATTTATTCATTTATATAATGACG-AATAAATA-T-A-TTT-T--TATCA-TTTAATAATAA---T-ATTCG-TATGCAAATGTTTG---TAAC--ATGA-T--TAA-A-G-TT--T-TA-TCTAAGGT--A--T-ATAAAA-GGTCT-TAGTA-T-------AT--C-CTT--G------T-----C-G-----AG-C-GT-T-AC-TTT--AT-ATC-GC-GGCGGTTTATCAG-T-AAG----GTGAACAGC-T---CCTT-G-TTTATAA-ATCCC--CATCCA--T---G--GGGTCAACCA-AA-C---------T---------A--------CG--------GT-TG-T-A--T-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCGCCGGTCGTGGAGGATTAAGCG--CC-TT-T-----------C-CCATA-T-----TCT---TACAT-A---T-T-CTCA--TA-T--ACTT-TTGC-ACTT-----ACTTTTCT-TTTC
gi|90700 : ATGTACAT--GTA--TATGAATTGCTTCTAAATCACACGTGGTTGTTTACAGATCGCA---A---CAA--T-ATCTGTGAAAA----TGCCTTTGATAATAGATTATAAATGCTATCATGTTATTAATAGCTATTTCAATAAA--------A---CA-TAT----TTTGCATGTC---TTTTCTTT------AA-ATAAACAAAT-GAATATTATGGT-GAAACTATAAATGCAGAAAATGCAACGATATAT--AAAATACGTGTTCATTGATATATTGACATAATAAAAA-T-A-TTT-TGTTATCA-TTT--TA-TAA---TCAT--GTTATGCAAATATTTG---TAAC--ATGA-T--AAA-C-G-TT--T-TA-ACTTAGGT--A--T-ATAAAA-GATCT-TGATA-T-------GT--G-TAT--A------T-----C-G-----AT-C-GT-T-AC-TTT--AT-ATC-GC-GGCGCTTAATCAG-T-TAG----GTGAATAGC-C---CCTT-G-TTTATAA-ATTCC--CCTACA--T---G--AGGTCAACCC-AC-C---------C---------A--------CG--------GT-TG-T-A--T-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCACCGGTCGTGGAGGATTAAGCG--CCTTT-T-----------C-CTATT-T-----TCT---TACAT-A-------CTTA--TACT--ACTG-CTGC-TGTG-----ACTTTTAT-TTTCTT
gi|90701 : ACAT--GTG--TATATATGGCTTCTAAATTACACGTGGGCGTAACCAGATCACGGATA---CAA--T-ACCCGTGAATG----TGCCTTTGGGAATGGATTATAAATTATAT--------TAATAGCTATTTCAATAAAAGAA----CG--CA-CAT----ATT--ATGTTCCTTTTTCTTT------AA-ATAGACAAAT-GGGTATAATGGTTAAAACTATAGGTGCAGATAATATAACAAAAGAT--AAAACATTTATTCATTAATATACTGACTTAATAAACA-T-AATTTGT--TATCA-C---GTAATAT---TCAT----TATGTAAGTGTTTG---TAAT--ATGA-T--AAA-C-G-TT--T-TA-TCTTAGGT--G--T-ATAAAA-GACAT-AACAA-T-------AT--A-TAC--G------C-----C-G-----AT-C-GT-T-AC-TTA--AT--TT-GCCGGCGGTTTACAAG-T-TAG----GTGAATAGC-C---CAT--A-TTTG-AA-ATCCT--CGTACA--G---G--AGGTCAACCT-AA-AG--------C---------A--------TG--------GC-TG-C-A--T-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCACCGGTAGTGGAGGATTAAGCG--CC-TT-T-----------C-CTATT-T-----TCT---TACAT-T---T-TTCTAAACTA-TT-ACTA-CTGT---TG-----ACTTTTAT-TTTCTT
gi|90702 : ACAT--GTA--TATATATGGCTTCTAAATTACACGTGGTCGTAACCAGATCGCG---ATTACAA--T-ACCCGTGAATG----TGCCTTTGGCAATGGATTATCAATTATAT--------TAAAAGCTATTTCATTAAA--------AGAACG-CAT----AT---ATGTCCCTTTTTCTTT------AA-ATAGACAA-TTGGGTATAATGAT-AAAACTATAAGTGCAGACATTATAACAAAAGAT--AAAACATTTATTCATTAATATACTGACTTAATAAACA-TAA-TTTGT--TATCA-CTTGAT-AT-----TCAT--ATTATGTAAATGTTTG---TAAC--ACGA-T--AAA-A-G-TT--T-TA-TCTTAGGT--G--T-ATAAAA-GACAT---AAA-T-------AT--
gi|90703 : AT--GTAACTATATATGGCTTCTAATTCAAATGCGGTCGTCAACAGATTGCA---A---CAACAATACCTGTAAAGT----TGCCTTAATCAATGGGTTATAATTGCTAT--------TAATAGCTATTTCAATAAATACAAAACC---CAACAT----ATT--ATGTGCCTTTTTCTTT------AA-ATAAACAAAT-GGGTATAATGAT-GAAACTATAAATACAGAAAATACAGCAAAAGAT--AAAATATTTATTAATTTATATGCTGACATAATAAAAA-T-ACTTT-T--TATCC-TTTA----TAT---GCAT--GTTATGCAAATATCTA---TAAC--TTG--T--AAACC-G-TT--T-TA-TTTTAGGT--A--T-ATAAAA-TATCT---AAA-T-------AT--A-TAT--T------TTA---C-G-----AC-C-GT-T-AC-TTT--AT-ATTGGC-GGCGGTTTACCAG-T-TAG----GTGAATAG--C---CCTT-G-TTTTGCA-ATCCT--CCTTCA--T---G--AGGTCAACCC-AC-C---------C---------A--------TG--------GT-TG-T-A--C-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCACCGGTCGTGGAGGATTAAGCG--TC-TA-T-----------C-CTCAT-T-----TCT---TAGAT-AT--T-T-CTTA--TC-T--ACTG-CTCC-TGTG-----ACTTTAAA-TTTCT
gi|90704 : --GTG--TATATATGGATTCTAAATTGCATGT-GTTGTAACCAGATCTCGATTA---CAG--T-ACCTGTGAAAT----TGCCTTTGGCAGTGGATTATAAATGCTAT--------TAAAAGat
gi|90705 : --TATACATGGCTTCTAAATTACACGTGGTCG------AAT-------A---CAA--T-ACCCGTGAATG----TGCCTTTGACAATGGATTATAAATTATAT--------TAATAGCTATTTCAATAAAAAAAAAA-CG--CG-CAT----ATT--ATGTCCCTTTTTCTTT------AA-ATAGACAAAT-GAGTATAATGGT-AAAACTATAAGTGCAAAAAATATAACAAAATAT--AAAATATTTATTCATTAATATACTGATTTAATAAACA-TAA-TTTGT--TATCA-CTTTGTATTA------AT--ATTATGTAAATGTTTG---TAAC--ATGG-C--AAA-C-G-TT--T-TA-TCTTATGT--G--T-ATAAAA-GACATAAAAAA-T-------AT--A-TAT--G------T-----C-G-----CC-C-GT-T-AC-TTT--AT--TT-GCTGGCGGTTTACCAG-T-TAG----GTGAATAGC-C---CAT----ATTAGAA-ATCCC--CGCTCA--T---G--GGGTCAACCTAAA-G---------C---------A--------TG--------GT-TG-C-A--T-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCACCGGTCGTGGAGGATTAAGCG--CC-TT-T-----------C-CTATT-T-----TCT---AACAT-A---T-T-CCCA--AA-T-------------TTG-----ACCGTTAT-TTTCTT
gi|90706 : --------C---CA-CAT----ATT--ATGTCCCTTTTTCTTC-AAAA------AAA-AAAT-GTGTATAGCGGT-GAAACTAAAAATGCAGATAATGTAGCAAAAGATAAAAAAAAGATATTTATTGATATACTGACATAATAGAAA-A-A-GTG-T--TATCACTTTA--GAT-----TCAT--ATTATGCAAATGTTTG---TAAC--ATAA-A--AAA-ACG-TT--T-TA-TCTAAGGC--A--T-ACGCAA-GACCT-TAAAA-T-------AT------------------------A-----AT-C-GT-T-AC-TTT--AT-ATT-GCTGGAGGTTTACCAG-T-TAG----GTAAATAG--C---CCTT-A-TTTG-AA-ATCCT--CGATCA--T---T--AGGTCAACCCAAA-C---------C---------A--------TG--------GT-TG-T-A--C-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCATCGGTAGTGGAGGATTTAGCG--CG-TT-T-----------C-TTATT-A-----TCT---TAAAA-A---TGT-CTTA--CT-T--ACCT--TGT--CTG-----ATTTTTAT-TTTCTT
gi|90707 : GGAACAAGAAGT-A-ATT-CA-TA-CG-TTTGATA-TAAGTTTTAT--GTTATGGAAATCGTTG---TTAT---CGACT--AAA-A-G-TT--T-T--TGTT-GGTGAA--T-ATAAAAATACCT-CGAAA-T-------GT--G-TAT--GC-----T-----G-T-----AT-C-CA-T-ACGTTT----------C-GGCGGTTTGCTAG-T-ACT----GCGAATAGC-C---TAAT-T-TTGATA---TCCT--CATTGA--TAT-G--AGGTCAACCC-AT-C---------CAGTGGAAT-G--------TG--------GT-TG-T---------CTTACAAT--TGC-TACAGTCATCAGTCGTGGAGGATTGAGCG--CC-TT-T-----------TACTGTC-C-----TCT---CTCTT-T---C-T-CTCT--TA-T--
gi|90708 : ---TTAT--GTTATGCAAATCGTTG---TAAC---CGACT--GAA-A-G-TT--T-T--TGTT-GGTGAA--T-ATAAAA-TACCT-CGAAA-T-------GT--G-TAC--G------TGGAATC-C-----AT-CCGT-T-----TT------------GGCGGTTTGCTAG-T-ACT----GTGAATAGC-C-----TA-A-TTTTGAA-ATCCT--CATTAA--TTT-G--AGGTCAACCA-AT-C---------CA--------G--------TG--------GTATG-T-GGTTGT--CTTACAAT--TGC-TACAATCACCGGTCGTGGAGGATTGAGCG--CA-TT-TA----------A-CTGTT-T-----TCT---TTC-T-G---TCT-TTCT--TA-T--GCCTAATAC-AATA-----ACTTTC-T-TTTCTTgtctaataatataactttttgttctt
gi|90709 : ---TTAT--GTTATGCAAATCGTTG---TTAC---CGA-C--TAA-G-T-TT--T-TG-T---AGGTGAA--T-ATAAAA-TACCT-CGACA-T-------TT--C-TAT--G------T-----T-GT----AT-C-CA-T-AC------GT-ATC-G---GTGGTTTG-----T-TAGAACTGTGAATAGC-C---AAAT---TTTA-AA-ATCCT--CATTGA--TTA-G--AGGTCAACCC-AT-C---------CAGTGGGAT-G--------TG--------GT-TG-T---------CTTATAAT--TGC-TACAATCACCAGTCGTGGAGGATTGAGCG--CT-TT-T-----------A-CTGTC-T-----TCT---
gi|90710 : ---TTAT--GCTATGCAAATTGTTG---TAAC---CGACT--AAA-A-G-GT--T-TT-GCT--GGT--GAGT-ATAAAA-TACCT-CGAAA-T-------GT--G-TA------------------C-----ATAC-GT-C-A--TTT--AT-ATC--T-GGCGGTTTACTAG-T-AGA----GCAGATAGC-C------T-A-ATCATAA-GT--T--AAATTA---------AGGTTAACCC-AT-CTTGTGGGA-T---------G--------TG--------GT-TGCC-A--T-T------CAAT--TGC-TACAATTGCCGGTCGTGGATGATTGAGAGTCCC-TT-T-----------CACTGTT-T-----Tctctatctttcttatgtctaataatataactttctgttctt
gi|90711 : ---TTAT--GTTATGCCAATCGTTG---TAAC---CGG----------------C-TA-TCT--GGTGAA--T-ATAAAA-TAGCT-CGAAA-TTAATACGAT--G-TA---A------T-----C-A-----AA-C-GT-T----TT-------------GGCGGTTGGCTAG-T-ACT----GCGAATAG------GCTT-A-TTTTGAA-ATCCT--CATTAATTT---G--AGGTCAACCT-AT-CAAGTGAGA-T---------G--------TG--------GT-TG--------T--CACACAAT--TGC-TACAATCGCCGGTCGTGGAGGATTGAGCA--CC-TT-TA----------A-CTGTC-T-----TCTC--TAGAT-CT--T-T-CTTA--Tatctctgtatttcttctgtctcgtaaagtaacatctttttctt
gi|90712 : ---TTAT--GTTATGCAAATCGTTG---TAAC---CGACT--AAA-C-GATT--T-GA-T----GGTGAA--T-ATAAAA-TACCT-CGAAA-T-------GT--G-TAT--G------T-----TGT-----AT-C-CA-T-AC-GTT--TT--------GGCGGTTTGCTAG-C-ACT----GCGAATAG------CCTA-A-TTTTGAA-ATCCT--CATTGATTT---A--TAGTCAACCC-AT-C---------g
gi|90712 : AA-ATCCT--CAATGA--TTT-G--AGGTCAACCT-AT-C---------CAGTGGAAT-G--------TG--------GT-TG-T---------CTTATAAT--TGC-TACAATCACCGGTCGTGGAGGATTGAGCG--CC-TT-T-----------TGCTGTC-T-----TCT---tagtgggatgtggttgtcgaattttgaaatcctcaatgatttgaggtcaacctatccagtggaatgtggttgtcttataattgctacaatcaccggtcgtggaggattgagcgccttttgctgtcttctctctatctttcttctgtctaataatataactttcttttctt
gi|90713 : ttatgttatgcaaatcgttgtaaccgactaaacgatttgatggtgaatataaaatacctcgaaatgtgtatgttgtatccatacgttttggcggtttgctagcactgcgaatagcctaattttgaaatcctcattgatttatagtcaacccatctagtgggatgtggttgtcgaattttg---TTAT--GTTATGCAAATCGTTG---TAAC---CGA-CTAAAA-A-A-AA--T-GA-T----GGTGAA--T-ATAAAA-TACCT-CGAAA-T-------GT--G-TAA--G------T-----TGT-----AT-C-CA-T-AC-GTT--TT--------GGCGGTTTGCCAG-T-ATT----GCGAATAGC-C---TAAT---TTTA-AA-ATCCT--CATTGATTT---G--AGGTCAACCctctatctttcttctgtctaataatataactttcttttctt
gi|90714 : T--GTTATGCAAATCGTTG---TAACCTAC---T--AAA-A-G-TT--TGTGCTGTTGAAT--A--T-ATAA---TATCT-CGAAA-T-------GT--C-TAT--G------T-----T-AT----AT-C-CA-T-ACGTTT----------C-GGCGGTTTGCTAG-T-ACT----GCGAATAGC-C-----TA-A-TTTTGAA-ATCCT--CATTGA--TTTGG--GGGTCAACCC-AT-C---------CAGTGGGAT-G--------TG--------GT-TG-T---------CTTACAAT--TGC-TACAATCACCGGTCGTGGAGGATTGAGCG--CC-TT-TTACTGAATCTCT-CTGTCTT-----TCT---TATGT-A---T-
gi|90715 : T--GTTATGCAAATCGCTG---TAAC---TGACT--AAA-A-G-TT--T-TT-GCT--GGT--AAAT-ATAAAA-TACCT-CGAAA-T-------GT--G-TAT--GA-----T-----G-C-----AT-C-CA-A-AC-GTT--TT-A-------GCGGTTTGCTAG-T-GCT----GCGAATAGT-C-----TT-A-TTTTGAA-ATCCT--CATCAA--TTT-G--AGGTCAACCC-AT-C---------CAGCTGGAT-G--------TG--------GT-TG-T---------CTTACAAT--TGT-TACAATCACCGGACGTGGAGGATTCAGCA--CC-TT-TA----------A-CTGTC-T-----TCTC--TCCAT-CT--T-T-CTTA--TG-T---CTA-ATAA-GATA-----ACTTTC-T-TTTCTTaataacataactttcttttctt
gi|90716 : T--GTTATGCAAATCATTG---TAAC---CGACT--TAA-A-G-TT--T-TT-GCT--GGTGAA--T-ATAAAA-TACCT-C-AAA-T-------GT--G-TAC--A------T-----C-C-----AA--------AC-CTT------TT-GC---CGGTTTGCTA--T-TACT---GCGAATAGC-CAAATTTT-G------AA-ATTCT--CGATAA--TTT-G--AGGTCAACCC-AT-C---------CAGCGGGAT-G--------TG--------GT-TG-T---------CTTACAAA--TGC-TATAATCACCGGTCGTGGAGGATTGAGCA--TC-TT-TA----------A-CTGGC-T-----TCTC--TCTATCG---T-T-CTTA--TG-T---CT-----C-ACTAGATATACTTTC-T-TTTCTT
gi|90717 : T--GTTATGCAAATCGTTG---TAAC---CGACT--AAA-T-G-TT--T-TA-GCT--GGTGAA--T-ATAAAA-TACCT-CGAAAAC-------GT--G-TAC--GATGCATC-----C-A-----AG-C-GT-T-----TT------------GGCGGTTTGCTAG-T-ACT----GCGAATAGC-C---TATT-T-TTT-TAA-ATCCT--CATAAAATT---G--AGGTCAACCC-AT-C------------------------------------------------------------------T-TACAATCGCCGGTCGTGGAGGATTGAGCA--CC-TTAA-----------A-CTGTT-T-----TCTCTCTATCT-----T-T-CTTA--TG-T---CTA-ATAA-GATA-----ACTTTC-T-TTTCTT
gi|90718 : TATGCAAATATTTG---TAAC---TGACT--GAA-A-GAAT--T-TG--CTAAGGC--A--C-ATAAAA--A-CT-CGAAA-TTC-----GT--GATAT--G--------------C-----AT-C----C-AG-CTT--AA-AT---T-GGCGGTTTGTTTGAT-TA-----ACGAATAG--T---CAGA-G-TTT-TAA-ATCCTCACACGCA--T---G--AGTTCAATCC-AT-T---------CTAGGAT---G--------TG--------AT-TA-C-A--A-T--CTGACAAA--TGT-T-CAGTCACTGGTCGTGG
gi|90719 : gaATACATGTATTTG---TA-T--ATG--C--AAA-T-G-TTAGT-GA-CCT---GT--A--TTATAAAA-TATCT-TGAAA----------------ATCAG------T-----C-ATTAGTAT-C-CTGT-AT-TTT--ATTA------GGCAAATTGCTTG-TATAG-----TGAA--GCGC---CTTT-A-TTTG-AA-ATCCT--CATTAA--C---GTCAGGTCAGCAC-AT-C---------TCAGTTTGATG--------TG--------GC-TG-T-C--T-G--GTTA-AA----GC-TTAAACCACCGGTGGTGGAGGATTAAGCA--CC-TT-T-----------C-------------TCT---TACAT-C---T-T-taaatta
gi|90720 : gcTATGCAGTTTTGTGGGTTAAC--AGGG-C--TAA-A-C-CT--T-TA-TCTGAGGT--T--T-ACAGA--CACAT-CGATA-T-------AT----TAT---------C-----C-T-----AT-T-GC-A-A---TT--A--A------GGTGGTTTGCCAG-T-TCG----GTGAA-A---C---TCTT-G-TCTGCAAGAACAT--CACTTAG-T---G--AGTTTAACCC-ATAC---------T---------G--------CGTGCATGTGGT-TG-C-A--C-T--CCTGTTAT--TGC-TTCA-TCACCAGTGTTTGTGGATAAGGCG--CC-TT-T-----------T-CTATT-T-----TCT---AACgctatctttccta
gi|90721 : gTATGCAAATGTTAG---TAAC---CAACT--AAA-A-G-TT--T-TA-ACTGGTGT--A--C-ATAAAA-TACCT-CGAAA-TTCA----GTCAG-T-T--G------T-------------AT-C-CC-TGAT-TTTCAAT-A------GGCAAATTGCTTG-T-ACA----GCGA--AGC-G---CCTTAA-TTTG-AA-ATTCT--CACTAACGT---G--AGGTCAGCCC-AT-CTCAATTTGAT---------G--------TG--------GT-T--T-A--C-TGACTT----T--AGCTTAAAAGCACCGGTCGTGGAGGATTAAGCA--CC-TT-T-----------CTCTTAC-T-----TCT---TGC-T-A---T-T-TTtgcctttctttatctatcaagtttgacattttctt
gi|90722 : --G------T-----C-G-----AT-C-GT-T-AC-TTA--AT--TA-GCTGGCGGTTTACCAG-T-TAG----GTGAATAGC-A---CAT--A-CTTA-AA-ATCAT--CG--CA--C---A--GGATCA-------------------------------------TG--------GT-TG-C-A--T-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCACCGGTTGTGGAGGATTAAGCG--CC-TT-T-----------C-CCATT-T-----TCC---TACAT-A---T-T-------TA-TTAACTA-CTACAACTGTTC--ACTTTTAA-TTTCTtcct
gi|90723 : GCGGTTTGATAG-T-ACT----GCGACTAGC-------TT-AATTTTTAA-ATCCT--CATTAA--TTT-G--AGATCAACCC-AT-C---------CA--------G--------TG--------GGGTG-TGA--T-TGTCTTACAAA--TGC-TGCAATCACCGGTCATGGATGATTGAACG--CC-TT-TA----------A-CTGTC-T-----CCT---TTC-T-ATCTT-T-CTTA--TG-T--
gi|90724 : AA-ATCCT--CATTGA--TTT-G--AATTCAACCT-AT-C---------C---------GGTGGGATGTG--------GT-TG-T---------CTTACAAT--TGC-TACAATCACCGGTCGTGGAGGGTTGAACG--CG-TT-T-----------CACTTTC-T-----TTT---ctaataagataactctcttt
gi|90725 : ctcaatttgAA-ATCCT--CATTGA--TTT-G--AGGTGAACCC-AT-C---------CAGTGGGAT-G--------TG--------GC-TG-T---------CTCACAATATTGT-TATAATCACCGGTCGTGGAGGATTGAGCG--AT-TT-TAC---------T-CTATCTT-----TCT---Tctctttcttatgtctaacaacataacattcttttctt
gi|90726 : AA-ATCCT--CATTGA--TTT-G--AGGTCAACCC-AT-C---------CAGTGGGGT-G--------TG--------GT-TG-T---------CTTAAAAT--TAC-TACAATTAGCGGTCGTAGATGATTGAGTG--CC-TT-TA----------A-CTGTC-T-----TCT---ttcttgtgttt
gi|90727 : --------GT-TG-T-T--G-T--TTTACAAT--TGC-TACAATCGCCGGTCGTGGATGATTGAGCG--CC-TT-T-----------TACTGTC-TC----TCT---C---T-A---TCT-TTCA--TA-T--ctctatctttctaatgtctaataatataacattttgttct
gi|90728 : aat--------GT-TG-T-T--G-T--TTTACAAT--TGC-TACAATCGCCGGTCGTGGATGATTGAGCG--CC-TT-T-----------TACTGTC-TCTCTGTCT---TTCAT-A---TGT-CTAA--TA-g
blockSeqs : CT AC C GAT TTA CAAT GAAGT CATGTTAT TACAAAACC A GTAT GC TAAAAT T T T T A G AA A A G A T G GT C AA A AGTT TC GT GGT ATGA TA C C A AG G C TA GA AG T AT AA A TAATACG CAG CA ATGCATCCA A CGT G GT ATATTGGC A TAGAACT CG AAATTTTG AT G CA C TTTG TC A TA TCAGTTTGATGT TGCATGTG A C GGTTGT AT T A TC T A TACTGAATCTCT A CT CTCTG CTC A ATCT G T AC C TAA TAA AA GATAT A A
blockSeqs : . . C ATT . A A . AAAAAAACG . . . TAAAAT . T T . A G . A A . A A G A . AA A A . GT . ATGA . . . A . . . TA GA AA . G T . TCA GA . TGGAATCC . CTG . GT ATATTGCT . TACT C CCTTAA AT . . C TAT . A A TCAATTTGATGT . G . GATTGT . . A . . . ACT A CT C C A AT C . . . TA TC A TTC A .
blockSeqs : . . C . . A A . AGAACG . . . TAAAAT . T T . A G . A A . . C G . . AA A A . GT . ATGA . . . . . . . TA GA . . G T . TC T . TCATTAGT . GT . T ATATCGC . ATAG C CCTTG AT . . C TTT . . A CAGTGGAATGT . . . ACTGA . . A . . . TA A A . C A CT C . . . A TC A . A .
blockSeqs : . . C . . A T . AGAA . . . TAAAAT . T T . A G . A A . . . . . . AA A A . GT . ATGA . . . . . . . TA GA . . T T . . G . TTACG . GT . T GTATCGC . TAG C CCTTG AT . . C TTA . . A CAGTGGGATGT . . . ATT . . A . . . AA A A . C A CT G . . . A TC A . A .
blockSeqs : . . C . . A A . T . . . TAAAAT . T T . A G . A A . . . . . . AA A A . GT . ATTA . . . . . . . TA GA . . G T . . G . CTGT . GT . T ATATCGC . TAG C CCTTG AT . . C TTT . . A TTGTGGGATGT . . . ATT . . A . . . CA A A . . A CG . . . . A TC A . A .
blockSeqs : . . T . . A A . C . . . TAAAAT . T T . A A . A T . . . . . . AA A A . GT . ATGA . . . . . . . AA GA . . G T . . G . TTGT . GT . T ATATCGC . TAG C CCTTG AT . . C TTT . . A AAGTGAGATGT . . . ATT . . A . . . AA A A . . A A . . . . A TC A . C .
blockSeqs : . . A . . A A . C . . . AAAA . T T . T A . T T . . . . . . GA A A . AT . ATGA . . . . . . . TA GA . . G T . . G . TTGT . GT . T ATATCGC . TAG C CATTG AT . . C TTT . . A CAGTGGAATGT . . . ATT . . A . . . TG C T . . A A . . . . A TT A . A .
blockSeqs : . . A . . T G . C . . . . . . A . T A . C T . . . . . . TG A A . GT . ATGA . . . . . . . TA GA . . G T . . C . TTGT . GT . T ATATCGC . TAG C CCTTG TG . . C TTT . . C CAGTGGGATGT . . . ATT . . A . . . AA A T . . A A . . . . A GC T . A .
blockSeqs : . . A . . T G . C . . . . . . A . T A . C T . . . . . . GA T T . GT . ACGA . . . . . . . TA . . . G A . . G . TTAT . GT . T ATATCGC . AAG C CCTTG AG . . C TTT . . A CAGCTGGATGT . . . ATT . . A . . . AA A T . . A A . . . . A AC T . A .
blockSeqs : . . A . . T T . C . . . . . . A . T A . C T . . . . . . G A T . AT . ATGG . . . . . . . TA . . . G T . . A . ATGC . GT . T ATTTGCC . TAG C CCTTG AT . . C TTT . . C CAGCGGGATGT . . . ATT . . A . . . CT G T . . T A . . . . A GC A . A .
blockSeqs : . . A . . T T . A . . . . . . A . T A . C T . . . . . . A . . . GT . ATAA . . . . . . . TA . . . T C . . A . TCT . GT . T ATTTGCT . TAG C CCTTA TG . . C ATT . . A CGGTGGGATGT . . . ATT . . T . . . AA G T . . T A . . . . A AA G . A .
blockSeqs : . A . . T G . C . . . . . . A . A . . C G . . . . . . A . . . GT . CGAC . . . . . . . AA . . . G C . . A . TCT . GT . T ATTAGCT . TAG C TAATT AT . . G CGT . . A CAGTGGGATGT . . . ACT . . T . . . CA G C . . A A . . . . G AA A . A .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . CG . CGAC . . . . . . . TG . . . G C . . G . TCT . GT . T GTATCG . TAG C GCTTA TG . . A TTT . . T CAGTGGGGTGT . . . ATT . . A . . . AA G T . . A T . . . . . AC G . . .
blockSeqs : . CG . CGAC . . . . . . . AA . . . T C . . G . CCT . CA . T ATATCT . TAG C CCTAA TG . . G TTT . . T CTAGGATGT . . . ACT . . G . . . TA G C . . C A . . . . . T . . . .
blockSeqs : . CG . CGAC . . . . . . . GA . . . T C . . C . TCT . CA . G AAATT . ACT C TATTT TG . . T TTT . . T GCAT . . . ATT . . A . . . TA G T . . C A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . TG . CTAC . . . . . . . GG . . . T C . . G . TCG . GT . G CAATA . ACT C CAGAG TG . . A TTT . . T CAGT . . . AAT . . A . . . C G C . . A T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . CG . TGAC . . . . . . . T . . . T C . . G . TCG . GT . G TTGC . AGA T CTTTA GC . . G GT . . T CAGT . . . CTG . . A . . . C G C . . A G . . . .
blockSeqs : . CG . CGAC . . . . . . . T . . . T C . . G . CCG . CA . C ATTA . ACT C TCTTG TT . . G T . . T TAC . . . ACT . . A . . . C G C . . A A . . . .
blockSeqs : . CG . CGAC . . . . . . . A . . . T C . . G . TCG . CA . C TTA . ACT C CATA G . . G T . . T TAC . . . ATT . . A . . . C G C . . G C . . . .
blockSeqs : . CG . TGAC . . . . . . . . . . . T C . . C . TCA . CA . T TT . ATT C AAAT G . . G T . . T TAC . . . TGT . . . . . . C A T . . A A . . . .
blockSeqs : . CG . AGGG . . . . . . . . . . . T C . . G . TCC . CA . T TT . ACT C TAAT A . . A T . . T TAC . . . TGT . . . . . . C T T . . T A . . .
blockSeqs : . CA . CAAC . . . . . . . . . . . T C . . G . CCT . GT . T AA . GCT C CATA A . . A T . . T CAC . . . T . . . . . . C A C . . T A . .
blockSeqs : . CG . TTG . . . . . . . . . . . T T . . G . TCG . GC . . C . ACT . TTAA T . . A T . . T TAC . . . . . . . . . . C G T . . . A . .
blockSeqs : AT . CGA . . . . . . . . . . . T C . . . . A . CC . . C . TCG . CAT T . . C T . . T CAC . . . . . . . . . . C T C . . . . .
blockSeqs : AT . CGG . . . . . . . . . . . C C . . . . C . GT . . . . ACA . TAA G . . A G . . T CAT . . . . . . . . . . C A C . . .
blockSeqs : TT . CGA . . . . . . . . . . . T . . . . . C . . . . . . TAG . TAA G . . T T . . T CAT . . . . . . . . . . C G C . .
blockSeqs : GT . ATG . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . ACT . TTA A . . A T . . T CAT . . . . . . . . . . A G C . .
blockSeqs : . TA . TA . . . C T . . T TGC . . . . . . . . . . A G C . .
blockSeqs : . . A T . . T T . . . . . . . . . . C . . . .
blockSeqs : . . G C . . T . . . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . G C . . . . . . . . . . . . . C . . .
blockSeqs : . . G . . . . . . . . .
blockSeqCons : TTT***
originalCons : ATGTACAT--GTA--TATGTATTGCTTCTNAATCACACGTGGTCGTTAACAGATCGCG---A---CGA--A-ACCTGTGAAGN----TGCCTTTGGCAATGGATTATCAATGCTAT--------TAATAGCTATTTCAATAAA--------C---CA-TAT----ATT--ATGTCCCTTTTTCTTTTAAAATAA-ATAAACAAATTGAGTATTATGGT-GAAACTAAAAATGCGGAAAATATAACAACAGAT--AAAATATTTATTCATTTATATANTGACGNAATAAAAA-T-A-TTT-T--TATCA-TTTAATAATAA---TCAT--GTTATGCAAATNTTTG---TAAC--ACGA-T--AAA-A-G-TT--T-TA-TCTTAGGT--A--T-ATAAAA-TACCT-CGAAA-T-------GT--G-TAT--G------T-----C-N-----AT-C-GT-T-AC-TTT--AT-ATC-GC-GGCGGTTTGCCAG-T-TAG----GCGAATAGC-C---CCTT-G-TTTATAA-ATCCT--CATTNA--T---G--AGGTCAACCC-AT-C---------C---------G--------CG--------GT-TG-T-A--T-T--CTTACAAT--TGC-TACAATCACCGGTCGTGGAGGATTGAGCG--CC-TT-T-----------C-CTGTC-T-----TCT---TACAT-A---T-T-CTCA--TA-T--ACTT-CTGC-ACTG-----ACTTTTAT-TTTCTT
finalCons : ATGTACAT--GTA--TATGTATTGCTTCTNAATCACACGTGGTCGTTAACAGATCGCG---A---CGA--A-ACCTGTGAAGN----TGCCTTTGGCAATGGATTATCAATGCTAT--------TAATAGCTATTTCAATAAA--------C---CA-TAT----ATT--ATGTCCCTTTTTCTTTTAAAATAA-ATAAACAAATTGAGTATTATGGT-GAAACTAAAAATGCGGAAAATATAACAACAGAT--AAAATATTTATTCATTTATATANTGACGNAATAAAAA-T-A-TTT-T--TATCA-TTTAATAATAA---TCAT--GTTATGCAAATNTTTG---TAAC--ACGA-T--AAA-A-G-TT--T-TA-TCTTAGGT--A--T-ATAAAA-TACCT-CGAAA-T-------GT--G-TAT--G------T-----C-N-----AT-C-GT-T-AC-TTT--AT-ATC-GC-GGCGGTTTGCCAG-T-TAG----GCGAATAGC-C---CCTT-G-TTTATAA-ATCCT--CATTNATTT---G--AGGTCAACCC-AT-C---------C---------G--------CG--------GT-TG-T-A--T-T--CTTACAAT--TGC-TACAATCACCGGTCGTGGAGGATTGAGCG--CC-TT-T-----------C-CTGTC-T-----TCT---TACAT-A---T-T-CTCA--TA-T--ACTT-CTGC-ACTG-----ACTTTTAT-TTTCTT
Alignments
lowQualScore : 111 11111111 333333333333 111111 11 1111111 11 11 11111111111111111111 3333333333333 11 11 66666666666666666666666666666 111111111 1 2222222222222 11111
lowQualScore : 44 44 0 1 555 000 8888 77777 11111111 444444444444 9999 44 888888 3 9 1 3 1 1 0 44 0 1 3 2 5 00 8 66 2 33 5555 0 22 0 11 222 8888888 22 1 1 2 22 1 1 11 55 33 1 33 22 0 1 9999999 4444 0 22 88888888888888888888 1 2222 1 33 1111111111111 1 99999999 11 8888888888 44 1 1 22 1 3 11 55555555555555555555555555555 44444444 2 1 888888888 11 1 3 11 1 1 3333333333333 2 33 44444 666 1 22 88888 6 22 3 666 777 44 00000 3 2
lowQualScore : .. .. . . ... ... .... ..... ........ ............ .... .. ...... . . . . . . . .. . . . . . .. . .. . .. .... . .. . .. ... ....... .. . . . .. . . .. .. .. . .. .. . . ....... .... . .. .................... . .... . .. ............. . ........ .. .......... .. . . .. . . .. ............................. ........ . . ......... .. . . .. . . ............. . .. ..... ... . .. ..... . .. . ... ... .. ..... . .
lowQualScore : 66 22 2 0 444 888 3333 55555 22222222 333333333333 6666 22 555555 1 8 0 1 0 2 8 22 7 0 8 9 7 11 6 88 9 88 1111 2 33 7 55 555 0000000 00 4 4 9 00 4 4 00 77 99 4 88 55 2 4 1111111 1111 4 00 44444444444444444444 4 0000 4 66 5555555555555 4 55555555 44 2222222222 00 2 0 88 2 8 33 77777777777777777777777777777 44444444 4 2 111111111 77 2 8 77 2 2 7777777777777 2 88 44444 111 2 00 33333 4 55 8 222 888 88 00000 9 4
consensus : ATGTACAT--GTA--TATGTATTGCTTCTNAATCACACGTGGTCGTTAACAGATCGCG---A---CGA--A-ACCTGTGAAGN----TGCCTTTGGCAATGGATTATCAATGCTAT--------TAATAGCTATTTCAATAAA--------C---CA----TATATT--ATGTCCCTTTTTCTTTTAAAATAA-ATAAACAAATTGAGTATTATGGT-GAAACTAAAAATGCGGAAAATATAACAACAGAT--AAAATATTTATTCATTTATATANTGACGNAATAAAAA-T-A-TTT-T--TATCA-TTTAATAATAA---TCAT--GTTATGCAAATNTTTG---TAAC--ACGA-T--AAA-A-G-TT--T-TA-TCTTAGGT--A--T-ATAAAA-TACCT-CGAAA-T-------GT--G-TAT--G------T-----C-N-----AT-C-GT-T-AC-TTT--AT-ATC-G-C-GGCGGTTTGCCAG-T-TAG----GCGAATAGC-C---CCTT-G-TTTATAA-ATCCTCATTNATTTGAGG-TCAACCC-AT-C---------C---------G--------CG--------GT-TG-T-A--T-T--CTTACAAT--TGC-TACAATCACCGGTCGTGGAGGATTGAGCG--CC-TT-T-----------C-CTGTC-T-----TCT---TACA-T-A---T-TCTCA--TA-T--ACTT-CTGC-ACTG-----ACTTTTAT-TTTCTT
Reference ( family-586 ) : ATGTACAT--GTA--TATGTATTGCTTCTNAATCACACGTGGTCGTTAACAGATCGCG---A---CGA--A-ACCTGTGAAGN----TGCCTTTGGCAATGGATTATCAATGCTAT--------TAATAGCTATTTCAATAAA--------C---CA----TATATT--ATGTCCCTTTTTCTTTTAAAATAA-ATAAACAAATTGAGTATTATGGT-GAAACTAAAAATGCGGAAAATATAACAACAGAT--AAAATATTTATTCATTTATATANTGACGNAATAAAAA-T-A-TTT-T--TATCA-TTTAATAATAA---TCAT--GTTATGCAAATNTTTG---TAAC--ACGA-T--AAA-A-G-TT--T-TA-TCTTAGGT--A--T-ATAAAA-TACCT-CGAAA-T-------GT--G-TAT--G------T-----C-N-----AT-C-GT-T-AC-TTT--AT-ATC-G-C-GGCGGTTTGCCAG-T-TAG----GCGAATAGC-C---CCTT-G-TTTATAA-ATCCTCATTNATTTGAGG-TCAACCC-AT-C---------C---------G--------CG--------GT-TG-T-A--T-T--CTTACAAT--TGC-TACAATCACCGGTCGTGGAGGATTGAGCG--CC-TT-T-----------C-CTGTC-T-----TCT---TACA-T-A---T-TCTCA--TA-T--ACTT-CTGC-ACTG-----ACTTTTAT-TTTCTT
gi|90693 : ATGTACAT--GTA--TATGTATTGCTTCTCAATCACACGTGGTCGTTAACAGATCGCG---A---TGA--A-ACCTGTGAAGA----TGCCTTTGGCTATGGATTATCAATGCTAT--------TAATAGCTATTTCAATAAA--------C---CA----TATATT--ATGTCCCTTTTTCTTTTAAAATAA-ATAAACAAATTGAGTATTGTGGT-GAAACTAAAAATTTGGAAAATATAACAACAGAT--AAAATATTTATTCATTTATACAATGACGAAATAAAAA-T-A-TTT-C--TATCA-TTTAATAATAA---TCAT--GGTATGCAAATGTTTG---TAAC--ATGA-T--AAA-A-G-TT--T-TA-TCTTAGGT--A--T-ATAAAA-CATCT-TAATA-T-------AT--A-TTT--G------T-----C-T-----AT-C-GT-A-AC-TTA--AT-ATC-G-C-GGCGGTTTACCAG-T-TAG----GTGAATTGC-C---CCTT-G-TTTATAA-ATCCCCATCCA--TGGGG-TCAACCA-AA-C---------T---------A--------CG--------GT-TG-T-A--T-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCACCGGTCGTGGAGGATTAAGCG--CC-TT-T-----------C-CTATA-T-----TCT---TACA-T-A---T-TCTCA--TA-T--ACTT-CTGC-GCTT-----ACTTTTAT-TTTCTT
gi|90694 : ATGTACAG--GTA--CATGTATTGCTTCTCAATCACACGTGGTCGTTAACAGATCGCG---A---TGA--A-ACCTGTGAAGA----TGCCTTTGGCAATGGATTATCAATGCTAT--------TGATAGCTATTTCAATAAA--------T---CA----TATATT--ATGTCCCTTTTTCTTTTAAAATAA-ATAAACAAGTTGAGTATTATGGT-GACACTAAAAATGTGGAAAATATAACAACAGAT--AAAATATTTATTCATTTATATAATGACGAAATAAAAA-T-ATTTT-T--TATCA-TTCAATTATAA---GCGT--GGTATGCAAATGTTTG---TAAC--ATGA-T--AAA-A-G-TT--T-TA-TCTTAGGT--A--T-ATAAAA-GATCT-TAATA-T-------AT--T-TTT--G------T-----C-T-----AT-C-GT-T-AC--TT--AT-ATC-G-C-GGCGGTTTACCAG-T-TAG----GTGAATAGC-C---CCTT-G-TTTATAA-ATCCCCATCCA--TGGGG-TCAACCA-AA-C---------T---------A--------CG--------GT-TG-T-A--T-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCACCGGTCGTGGAGGATTAAGCA--CC-TT-T-----------C-CTATA-T-----TCT---TACA-T-A---T-TTTCA--TA-T--ACTT-CTAC-ACTA-----ACTTTTAA-TTTCTT
gi|90695 : ATGCACAT--GTA--TATGTATTGCTTCTCAATCATACGTGGTCGTTAACAGATCGAA---A---CGA--A-ACCTGTGAAGGAAGTCGCCTTTGGCAATGGATAATCAATGCTAT--------TAATAGCTATTTCAATAAT--------C---CA----TATATT--ATGTCCCTTTTTCTTTTAAAATAA-ATAAACAAATTGAGTATTATGGT-GAAACTAAAAATGTGGAAAATATAACAACAGAT--AAAATATTTATTCATTTATATAATGACGAAATAAAAA-T-A--TT-T--TATCA-TTTAATAATAA---TCAT--GGTATGCAAATGTTTG---TAAC--ATGA-T--AAA-A-G-TT--T-TA-TCTTAGGT--A--T-ATAAAA-GATCT-TAATA-T-------AT--G-TTT--G------T-----C-T-----AT-C-GT-T-AC-TTT--GT-ATC-G-C-GGCGGTTTACCAG-T-TAG----GTGAATAGC-C---CCTT-G-TTTATAA-ATCCACATCCGTT--GGG-TCGACCA-AA-C---------T---------A--------CG--------GT-TG-T-A--T-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCACCGGTCGTGGAGGATTAAGCG--CC-TT-T-----------C-CTATA-T-----TTT---TACA-T-A---T-TCTCA--TA-T--ACTT-CTGC-ACTG-----ACTTTTAT-TTTCTT
gi|90696 : ATGTACAT--GTA--TATGTATTGCTTCTCAATCATACGTGGTCGTTAACAGATCGCG---A---TGA--A-ACCTGTGAAGA----TGCCTTTGGCAATGGATTATCAATGCTAT--------TAATAGCTATTTCAATAAA--------C---CA----TATATT--ATGTCCCTTTTTCTTTTAAAATAA-ATAAACAAATTGAGTATTATTGT-GAAACTAAAAATGTGGAAAATATACAAACAGAT--AAAAAATTTATTCATTTATATAATGACGAAATAAAAA-T-A-TTT-T--TATCA-TTTAATAAAAA---TTAT--GGTATGCAAATGTTTG---TAAC--ATGA-T--AAA-A-G-TT--T-AA-TCTTAGGT--A--T-ATAAAA-TATCT-TAATA-T-------AT--G-TTT--G------T-----C-T-----AT-C-GT-T-AC-TTT--AT-ATC-G-C-GGCGGTTTACCAG-T-TAG----GTGAATAGC-C---CCTT-G-TTTATAA-ATCCCCATCCA--TGGGG-TCAACCA-AA-C---------T---------A--------CG--------GT-TG-T-A--T-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCACCGGTCGTGGAGGATTAAGCG--CC-TT-T-----------C-CT-------------------A-T-A---T-TCTCA--TA-T--ACTT-CTGC-ACTG-----ACTTTTAT-TTTCTT
gi|90697 : ATGCACAT--GTA--TATGTATTGCTTCTCAATCATACGTGGTCGTTAACAGATCGCG---A---TGA--A-ACCTGTGAAGT----CGCCTTTGGCAATGGATTATCAATGTTAT--------TAATAGCTATTTTAATAAA--------C---CA----TATATT--ATGTCCCTTTTTCTTTTAAAATAATAAAAACAAATTGAGTATTATGGT-GAAACTAAAATTGTGGAAAATATAATAACAGAT--AAAATATTCGTTAATTTATATAATGACGAAATAAAAA-T-A--TT-T--TATCA-TTTAATAATAA---TCAT--GGTATGCAAATGTTTG---TAAC--ATGA-T--AAA-A-G-TT--T-TA-TCTTAGGT--A--T-ATAAAA-GATCT-TAATA-T-------AT--G-TTT--G------C-----C-T-----AT-C-GT-T-AC-TTT--AT-ATC-G-C-GGCCGTTTACCAG-T-TAG----GTGAATAGC-C---CCTT-G-TTTATAA-ATCCCCATCCA--TGGGG-TCAACCA-AA-T---------T---------A--------CG--------GT-TG-T-A--T-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCACCGGTCGTGGAGGATTAAGCG--CC-TT-T-----------C-CTATA-G-----TCT---TACA-T-A---T-TC-CA--TA-T--ACTT-CTGC-ACTT-----TGTTTTATATTTTTT
gi|90698 : ATGTACAT--GTA--TATGTATTGCTTTTCAATCATACGTGACCGTTAACAGATCGCG---A---TGA--A-ACCTGTGAAGA----TGCCTTTGGCAATGGATTATCAATGCTAT--------TAATAGCTATTTATATAAA--------C---CA----TATATT--ATGTCCCTTTTTCTTTTAAAATAA-ATAAACAAATTGAGTTTTATTGT-GAAGCTAAAAATGTGAAAAATATAACAACAGAT--AAAATATTTATTTATTTATATAATGACGAATTAAAAA-T-A-TTT-T--TATCA-TTTAATAATAA---TCAT--AGTATGCAAATGTTTG---TAAC--ATTA-T--AAA-A-G-TT--T-TA-TCTTAGGT--A--T-ATAAAT-GATCT-TAATA-T-------AT--G-TTT--G------T-----C-T-----AT-C-GT-T-AC-TTT--AT-ATC-G-C-GGCAGTTTACCAG-T-TAG----GTGAATAGC-C---CATT-G-TTTATAA-ATCCCCATCCA--TGGGG-TCAACCA-AA-T---------C---------A--------CG--------GT-TG-T-A--T-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCACCGGGCGTGGAGGATTAAGCG--CC-TT-T-----------C-CT-------------------A-T-A---T-TTTCA--TA-T--ACTT-CTGT-ACTG-----ACTTTTAT-TTTCTT
gi|90699 : ATGTACATCTATA--TATATATTGCTTCTTAATCACACGTGGTCGTTAACAGATCGCG---A---CGA--A-ACCTGTGAAGA----TGCCTTTGGCAATGGATTATCAATGCTAT--------TAATGGCTATTTCAATAAA--------C---CATATGTATATT--ATGTCCCCTTTTCTTTTAAAATAA-ATAATCAAATTGAGTATTACGGT-GAAA--AAATATTC--AAAATATAACAACAGAT--AAAATATTTATTCATTTATATAATGACG-AATAAATA-T-A-TTT-T--TATCA-TTTAATAATAA---T-ATTCG-TATGCAAATGTTTG---TAAC--ATGA-T--TAA-A-G-TT--T-TA-TCTAAGGT--A--T-ATAAAA-GGTCT-TAGTA-T-------AT--C-CTT--G------T-----C-G-----AG-C-GT-T-AC-TTT--AT-ATC-G-C-GGCGGTTTATCAG-T-AAG----GTGAACAGC-T---CCTT-G-TTTATAA-ATCCCCATCCA--TGGGG-TCAACCA-AA-C---------T---------A--------CG--------GT-TG-T-A--T-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCGCCGGTCGTGGAGGATTAAGCG--CC-TT-T-----------C-CCATA-T-----TCT---TACA-T-A---T-TCTCA--TA-T--ACTT-TTGC-ACTT-----ACTTTTCT-TTTC
gi|90700 : ATGTACAT--GTA--TATGAATTGCTTCTAAATCACACGTGGTTGTTTACAGATCGCA---A---CAA--T-ATCTGTGAAAA----TGCCTTTGATAATAGATTATAAATGCTATCATGTTATTAATAGCTATTTCAATAAA--------A---CA----TATTTTGCATGTC---TTTTCTTT------AA-ATAAACAAAT-GAATATTATGGT-GAAACTATAAATGCAGAAAATGCAACGATATAT--AAAATACGTGTTCATTGATATATTGACATAATAAAAA-T-A-TTT-TGTTATCA-TTT--TA-TAA---TCAT--GTTATGCAAATATTTG---TAAC--ATGA-T--AAA-C-G-TT--T-TA-ACTTAGGT--A--T-ATAAAA-GATCT-TGATA-T-------GT--G-TAT--A------T-----C-G-----AT-C-GT-T-AC-TTT--AT-ATC-G-C-GGCGCTTAATCAG-T-TAG----GTGAATAGC-C---CCTT-G-TTTATAA-ATTCCCCTACA--TGAGG-TCAACCC-AC-C---------C---------A--------CG--------GT-TG-T-A--T-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCACCGGTCGTGGAGGATTAAGCG--CCTTT-T-----------C-CTATT-T-----TCT---TACA-T-A------CTTA--TACT--ACTG-CTGC-TGTG-----ACTTTTAT-TTTCTT
gi|90701 : ACAT--GTG--TATATATGGCTTCTAAATTACACGTGGGCGTAACCAGATCACGGATA---CAA--T-ACCCGTGAATG----TGCCTTTGGGAATGGATTATAAATTATAT--------TAATAGCTATTTCAATAAAAGAA----CG--CA----CATATT--ATGTTCCTTTTTCTTT------AA-ATAGACAAAT-GGGTATAATGGTTAAAACTATAGGTGCAGATAATATAACAAAAGAT--AAAACATTTATTCATTAATATACTGACTTAATAAACA-T-AATTTGT--TATCA-C---GTAATAT---TCAT----TATGTAAGTGTTTG---TAAT--ATGA-T--AAA-C-G-TT--T-TA-TCTTAGGT--G--T-ATAAAA-GACAT-AACAA-T-------AT--A-TAC--G------C-----C-G-----AT-C-GT-T-AC-TTA--AT--TT-GCC-GGCGGTTTACAAG-T-TAG----GTGAATAGC-C---CA-T-A-TTTG-AA-ATCCTCGTACA--GGAGG-TCAACCTAAA-G---------C---------A--------TG--------GC-TG-C-A--T-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCACCGGTAGTGGAGGATTAAGCG--CC-TT-T-----------C-CTATT-T-----TCT---TACATT-T---T-TCTAAACTATT--ACTA-CTG---TTG-----ACTTTTAT-TTTCTT
gi|90702 : ACAT--GTA--TATATATGGCTTCTAAATTACACGTGGTCGTAACCAGATCGCG---ATTACAA--T-ACCCGTGAATG----TGCCTTTGGCAATGGATTATCAATTATAT--------TAAAAGCTATTTCATTAAA--------AGAACG----CATAT---ATGTCCCTTTTTCTTT------AA-ATAGACAA-TTGGGTATAATGAT-AAAACTATAAGTGCAGACATTATAACAAAAGAT--AAAACATTTATTCATTAATATACTGACTTAATAAACA-TAA-TTTGT--TATCA-CTTGAT-AT-----TCAT--ATTATGTAAATGTTTG---TAAC--ACGA-T--AAA-A-G-TT--T-TA-TCTTAGGT--G--T-ATAAAA-GACAT---AAA-T-------AT--
gi|90703 : AT--GTAACTATATATGGCTTCTAATTCAAATGCGGTCGTCAACAGATTGCA---A---CAACAATACCTGTAAAGT----TGCCTTAATCAATGGGTTATAATTGCTAT--------TAATAGCTATTTCAATAAATACAAAACC---CAA---CATATT--ATGTGCCTTTTTCTTT------AA-ATAAACAAAT-GGGTATAATGAT-GAAACTATAAATACAGAAAATACAGCAAAAGAT--AAAATATTTATTAATTTATATGCTGACATAATAAAAA-T-ACTTT-T--TATCC-TTT----ATAT---GCAT--GTTATGCAAATATCTA---TAAC--TTG--T--AAACC-G-TT--T-TA-TTTTAGGT--A--T-ATAAAA-TATCT---AAA-T-------AT--A-TAT--T------TTA---C-G-----AC-C-GT-T-AC-TTT--AT-ATTGG-C-GGCGGTTTACCAG-T-TAG----GTGAATAG--C---CCTT-G-TTTTGCA-ATCCTCCTTCA--TGAGG-TCAACCC-AC-C---------C---------A--------TG--------GT-TG-T-A--C-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCACCGGTCGTGGAGGATTAAGCG--TC-TA-T-----------C-CTCAT-T-----TCT---TAGA-T-AT--T-TCTTA--TC-T--ACTG-CTCC-TGTG-----ACTTTAAA-TTTCT
gi|90704 : --GTG--TATATATGGATTCTAAATTGCATGTG-TTGTAACCAGATCTCG---ATTACAG--T-ACCTGTGAAAT----TGCCTTTGGCAGTGGATTATAAATGCTAT--------TAAAAGat
gi|90705 : --TATACATGGCTTCTAAATTACACGTGGTCG------AAT-------A---CAA--T-ACCCGTGAATG----TGCCTTTGACAATGGATTATAAATTATAT--------TAATAGCTATTTCAATAAAAAAAAAA-CG--CG----CATATT--ATGTCCCTTTTTCTTT------AA-ATAGACAAAT-GAGTATAATGGT-AAAACTATAAGTGCAAAAAATATAACAAAATAT--AAAATATTTATTCATTAATATACTGATTTAATAAACA-TAA-TTTGT--TATCA-CTTTGTATTA------AT--ATTATGTAAATGTTTG---TAAC--ATGG-C--AAA-C-G-TT--T-TA-TCTTATGT--G--T-ATAAAA-GACATAAAAAA-T-------AT--A-TAT--G------T-----C-G-----CC-C-GT-T-AC-TTT--AT--TT-G-CTGGCGGTTTACCAG-T-TAG----GTGAATAGC-C---CAT----ATTAGAA-ATCCCCGCTCA--TGGGG-TCAACCTAAA-G---------C---------A--------TG--------GT-TG-C-A--T-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCACCGGTCGTGGAGGATTAAGCG--CC-TT-T-----------C-CTATT-T-----TCT---AACA-T-A---T-TCCCA--AA-T-------------TTG-----ACCGTTAT-TTTCTT
gi|90706 : --------C---CA----CATATT--ATGTCCCTTTTTCTTC-AAAA------AAA-AAAT-GTGTATAGCGGT-GAAACTAAAAATGCAGATAATGTAGCAAAAGATAAAAAAAAGATATTTATTGATATACTGACATAATAGAAA-A-A-GTG-T--TATCACTTTA--GAT-----TCAT--ATTATGCAAATGTTTG---TAAC--ATAA-A--AAA-ACG-TT--T-TA-TCTAAGGC--A--T-ACGCAA-GACCT-TAAAA-T-------AT------------------------A-----AT-C-GT-T-AC-TTT--AT-ATT-G-CTGGAGGTTTACCAG-T-TAG----GTAAATAG--C---CCTT-A-TTTG-AA-ATCCTCGATCATT--AGG-TCAACCCAAA-C---------C---------A--------TG--------GT-TG-T-A--C-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCATCGGTAGTGGAGGATTTAGCG--CG-TT-T-----------C-TTATT-A-----TCT---TAAA-A-A---TGTCTTA--CT-T--ACCT--TGT--CTG-----ATTTTTAT-TTTCTT
gi|90707 : GGAACAAGAAGT-A-ATT-CA-TA-CG-TTTGATA-TAAGTTTTAT--GTTATGGAAATCGTTG---TTAT---CGACT--AAA-A-G-TT--T-T--TGTT-GGTGAA--T-ATAAAAATACCT-CGAAA-T-------GT--G-TAT--GC-----T-----G-T-----AT-C-CA-T-ACGTTT-----------C-GGCGGTTTGCTAG-T-ACT----GCGAATAGC-C---TAAT-T-TTGATA---TCCTCATTGATATGAGG-TCAACCC-AT-C---------CAGTGGAAT-G--------TG--------GT-TG-T---------CTTACAAT--TGC-TACAGTCATCAGTCGTGGAGGATTGAGCG--CC-TT-T-----------TACTGTC-C-----TCT---CTCT-T-T---C-TCTCT--TA-T--
gi|90708 : ---TTAT--GTTATGCAAATCGTTG---TAAC---CGACT--GAA-A-G-TT--T-T--TGTT-GGTGAA--T-ATAAAA-TACCT-CGAAA-T-------GT--G-TAC--G------TGGAATC-C-----AT-CCGT-T-----TT-------------GGCGGTTTGCTAG-T-ACT----GTGAATAGC-C-----TA-A-TTTTGAA-ATCCTCATTAATTTGAGG-TCAACCA-AT-C---------CA--------G--------TG--------GTATG-T-GGTTGT--CTTACAAT--TGC-TACAATCACCGGTCGTGGAGGATTGAGCG--CA-TT-TA----------A-CTGTT-T-----TCT---TTC--T-G---TCTTTCT--TA-T--GCCTAATAC-AATA-----ACTTTC-T-TTTCTTgtctaataatataactttttgttctt
gi|90709 : ---TTAT--GTTATGCAAATCGTTG---TTAC---CGA-C--TAA-G-T-TT--T-TG-T---AGGTGAA--T-ATAAAA-TACCT-CGACA-T-------TT--C-TAT--G------T-----T-GT----AT-C-CA-T-AC------GT-ATC-G----GTGGTTTG-----T-TAGAACTGTGAATAGC-C---AAAT---TTTA-AA-ATCCTCATTGATTAGAGG-TCAACCC-AT-C---------CAGTGGGAT-G--------TG--------GT-TG-T---------CTTATAAT--TGC-TACAATCACCAGTCGTGGAGGATTGAGCG--CT-TT-T-----------A-CTGTC-T-----TCT---
gi|90710 : ---TTAT--GCTATGCAAATTGTTG---TAAC---CGACT--AAA-A-G-GT--T-TT-GCT--GGT--GAGT-ATAAAA-TACCT-CGAAA-T-------GT--G-TA------------------C-----ATAC-GT-C-A--TTT--AT-ATC---T-GGCGGTTTACTAG-T-AGA----GCAGATAGC-C------T-A-ATCATAA-------GTTAAATTAAGG-TTAACCC-AT-CTTGTGGGA-T---------G--------TG--------GT-TGCC-A--T-T------CAAT--TGC-TACAATTGCCGGTCGTGGATGATTGAGAGTCCC-TT-T-----------CACTGTT-T-----Tctctatctttcttatgtctaataatataactttctgttctt
gi|90711 : ---TTAT--GTTATGCCAATCGTTG---TAAC---CGG----------------C-TA-TCT--GGTGAA--T-ATAAAA-TAGCT-CGAAA-TTAATACGAT--G-TA---A------T-----C-A-----AA-C-GT-T----TT--------------GGCGGTTGGCTAG-T-ACT----GCGAATAG------GCTT-A-TTTTGAA-ATCCTCATTAATTTGAGG-TCAACCT-AT-CAAGTGAGA-T---------G--------TG--------GT-TG--------T--CACACAAT--TGC-TACAATCGCCGGTCGTGGAGGATTGAGCA--CC-TT-TA----------A-CTGTC-T-----TCTC--TAGA-T-CT--T-TCTTA--Tatctctgtatttcttctgtctcgtaaagtaacatctttttctt
gi|90712 : ---TTAT--GTTATGCAAATCGTTG---TAAC---CGACT--AAA-C-GATT--T-GA-T----GGTGAA--T-ATAAAA-TACCT-CGAAA-T-------GT--G-TAT--G------T-----TGT-----AT-C-CA-T-AC-GTT--TT---------GGCGGTTTGCTAG-C-ACT----GCGAATAG------CCTA-A-TTTTGAA-ATCCTCATTGATTTATAG-TCAACCC-AT-C---------g
gi|90712 : AA-ATCCTCAATGATTTGAGG-TCAACCT-AT-C---------CAGTGGAAT-G--------TG--------GT-TG-T---------CTTATAAT--TGC-TACAATCACCGGTCGTGGAGGATTGAGCG--CC-TT-T-----------TGCTGTC-T-----TCT---tagtgggatgtggttgtcgaattttgaaatcctcaatgatttgaggtcaacctatccagtggaatgtggttgtcttataattgctacaatcaccggtcgtggaggattgagcgccttttgctgtcttctctctatctttcttctgtctaataatataactttcttttctt
gi|90713 : ttatgttatgcaaatcgttgtaaccgactaaacgatttgatggtgaatataaaatacctcgaaatgtgtatgttgtatccatacgttttggcggtttgctagcactgcgaatagcctaattttgaaatcctcattgatttatagtcaacccatctagtgggatgtggttgtcgaattttg---TTAT--GTTATGCAAATCGTTG---TAAC---CGA-CTAAAA-A-A-AA--T-GA-T----GGTGAA--T-ATAAAA-TACCT-CGAAA-T-------GT--G-TAA--G------T-----TGT-----AT-C-CA-T-AC-GTT--TT---------GGCGGTTTGCCAG-T-ATT----GCGAATAGC-C---TAAT---TTTA-AA-ATCCTCATTGATTTGAGG-TCAACCctctatctttcttctgtctaataatataactttcttttctt
gi|90714 : T--GTTATGCAAATCGTTG---TAACCTAC---T--AAA-A-G-TT--TGTGCTGTTGAAT--A--T-ATAA---TATCT-CGAAA-T-------GT--C-TAT--G------T-----T-AT----AT-C-CA-T-ACGTTT-----------C-GGCGGTTTGCTAG-T-ACT----GCGAATAGC-C-----TA-A-TTTTGAA-ATCCTCATTGATTTGGGGGTCAACCC-AT-C---------CAGTGGGAT-G--------TG--------GT-TG-T---------CTTACAAT--TGC-TACAATCACCGGTCGTGGAGGATTGAGCG--CC-TT-TTACTGAATCTCT-CTGTCTT-----TCT---TATG-T-A---T-
gi|90715 : T--GTTATGCAAATCGCTG---TAAC---TGACT--AAA-A-G-TT--T-TT-GCT--GGT--AAAT-ATAAAA-TACCT-CGAAA-T-------GT--G-TAT--GA-----T-----G-C-----AT-C-CA-A-AC-GTT--TT-A--------GCGGTTTGCTAG-T-GCT----GCGAATAGT-C-----TT-A-TTTTGAA-ATCCTCATCAATTTGAGG-TCAACCC-AT-C---------CAGCTGGAT-G--------TG--------GT-TG-T---------CTTACAAT--TGT-TACAATCACCGGACGTGGAGGATTCAGCA--CC-TT-TA----------A-CTGTC-T-----TCTC--TCCA-T-CT--T-TCTTA--TG-T---CTA-ATAA-GATA-----ACTTTC-T-TTTCTTaataacataactttcttttctt
gi|90716 : T--GTTATGCAAATCATTG---TAAC---CGACT--TAA-A-G-TT--T-TT-GCT--GGTGAA--T-ATAAAA-TACCT-C-AAA-T-------GT--G-TAC--A------T-----C-C-----AA--------AC-CTT------TT-G-C---CGGTTTGCTA--T-TACT---GCGAATAGC-CAAATTTT-G------AA-ATTCTCGATAATTTGAGG-TCAACCC-AT-C---------CAGCGGGAT-G--------TG--------GT-TG-T---------CTTACAAA--TGC-TATAATCACCGGTCGTGGAGGATTGAGCA--TC-TT-TA----------A-CTGGC-T-----TCTC--TCTA-TCG---T-TCTTA--TG-T---CT-----C-ACTAGATATACTTTC-T-TTTCTT
gi|90717 : T--GTTATGCAAATCGTTG---TAAC---CGACT--AAA-T-G-TT--T-TA-GCT--GGTGAA--T-ATAAAA-TACCT-CGAAAAC-------GT--G-TAC--GATGCATC-----C-A-----AG-C-GT-T-----TT-------------GGCGGTTTGCTAG-T-ACT----GCGAATAGC-C---TATT-T-TTT-TAA-ATCCTCATAAAATTGAGG-TCAACCC-AT-C------------------------------------------------------------------T-TACAATCGCCGGTCGTGGAGGATTGAGCA--CC-TTAA-----------A-CTGTT-T-----TCTCTCTATC-T-----T-TCTTA--TG-T---CTA-ATAA-GATA-----ACTTTC-T-TTTCTT
gi|90718 : TATGCAAATATTTG---TAAC---TGACT--GAA-A-GAAT--T-TG--CTAAGGC--A--C-ATAAAA--A-CT-CGAAA-TTC-----GT--GATAT--G--------------C-----AT-C----C-AG-CTT--AA-AT----T-GGCGGTTTGTTTGAT-TA-----ACGAATAG--T---CAGA-G-TTT-TAA-ATCCTCACACGCATGAGT-TCAATCC-AT-T---------CTAGGAT---G--------TG--------AT-TA-C-A--A-T--CTGACAAA--TGT-T-CAGTCACTGGTCGTGG
gi|90719 : gaATACATGTATTTG---TA-T--ATG--C--AAA-T-G-TTAGT-GA-CCT---GT--A--TTATAAAA-TATCT-TGAAA----------------ATCAG------T-----C-ATTAGTAT-C-CTGT-AT-TTT--ATTA-------GGCAAATTGCTTG-TATAG-----TGAA--GCGC---CTTT-A-TTTG-AA-ATCCTCATTAACGTCAGG-TCAGCAC-AT-C---------TCAGTTTGATG--------TG--------GC-TG-T-C--T-G--GTTA-AA----GC-TTAAACCACCGGTGGTGGAGGATTAAGCA--CC-TT-T-----------C-------------TCT---TACA-T-C---T-Ttaaatta
gi|90720 : gcTATGCAGTTTTGTGGGTTAAC--AGGG-C--TAA-A-C-CT--T-TA-TCTGAGGT--T--T-ACAGA--CACAT-CGATA-T-------AT----TAT---------C-----C-T-----AT-T-GC-A-A---TT--A--A-------GGTGGTTTGCCAG-T-TCG----GTGAA-A---C---TCTT-G-TCTGCAAGAACATCACTTAGT-GAGT-TTAACCC-ATAC---------T---------G--------CGTGCATGTGGT-TG-C-A--C-T--CCTGTTAT--TGC-TTCA-TCACCAGTGTTTGTGGATAAGGCG--CC-TT-T-----------T-CTATT-T-----TCT---AACgctatctttccta
gi|90721 : gTATGCAAATGTTAG---TAAC---CAACT--AAA-A-G-TT--T-TA-ACTGGTGT--A--C-ATAAAA-TACCT-CGAAA-TTCA----GTCAG-T-T--G------T-------------AT-C-CC-TGAT-TTTCAAT-A-------GGCAAATTGCTTG-T-ACA----GCGA--AGC-G---CCTTAA-TTTG-AA-ATTCTCACTAACGTGAGG-TCAGCCC-AT-CTCAATTTGAT---------G--------TG--------GT-T--T-A--C-TGACTT----T--AGCTTAAAAGCACCGGTCGTGGAGGATTAAGCA--CC-TT-T-----------CTCTTAC-T-----TCT---TGC--T-A---T-TTTtgcctttctttatctatcaagtttgacattttctt
gi|90722 : --G------T-----C-G-----AT-C-GT-T-AC-TTA--AT--TA-G-CTGGCGGTTTACCAG-T-TAG----GTGAATAGC-A---CAT--A-CTTA-AA-ATCATCG--CAC---AGG---------AT-C-------------------A--------TG--------GT-TG-C-A--T-T--CTTACAAT--TGC-T-TAATCACCGGTTGTGGAGGATTAAGCG--CC-TT-T-----------C-CCATT-T-----TCC---TACA-T-A---T-T------TA-TTAACTA-CTACAACTGTTC--ACTTTTAA-TTTCTtcct
gi|90723 : GCGGTTTGATAG-T-ACT----GCGACTAGC-------TT-AATTTTTAA-ATCCTCATTAATTTGAGA-TCAACCC-AT-C---------CA--------G--------TG--------GGGTG-TGA--T-TGTCTTACAAA--TGC-TGCAATCACCGGTCATGGATGATTGAACG--CC-TT-TA----------A-CTGTC-T-----CCT---TTC--T-ATCTT-TCTTA--TG-T--
gi|90724 : AA-ATCCTCATTGATTTGAAT-TCAACCT-AT-C---------C---------GGTGGGATGTG--------GT-TG-T---------CTTACAAT--TGC-TACAATCACCGGTCGTGGAGGGTTGAACG--CG-TT-T-----------CACTTTC-T-----TTT---ctaataagataactctcttt
gi|90725 : ctcaatttgAA-ATCCTCATTGATTTGAGG-TGAACCC-AT-C---------CAGTGGGAT-G--------TG--------GC-TG-T---------CTCACAATATTGT-TATAATCACCGGTCGTGGAGGATTGAGCG--AT-TT-TAC---------T-CTATCTT-----TCT---Tctctttcttatgtctaacaacataacattcttttctt
gi|90726 : AA-ATCCTCATTGATTTGAGG-TCAACCC-AT-C---------CAGTGGGGT-G--------TG--------GT-TG-T---------CTTAAAAT--TAC-TACAATTAGCGGTCGTAGATGATTGAGTG--CC-TT-TA----------A-CTGTC-T-----TCT---ttcttgtgttt
gi|90727 : --------GT-TG-T-T--G-T--TTTACAAT--TGC-TACAATCGCCGGTCGTGGATGATTGAGCG--CC-TT-T-----------TACTGTC-TC----TCT---C----T-A---TCTTTCA--TA-T--ctctatctttctaatgtctaataatataacattttgttct
gi|90728 : aat--------GT-TG-T-T--G-T--TTTACAAT--TGC-TACAATCGCCGGTCGTGGATGATTGAGCG--CC-TT-T-----------TACTGTC-TCTCTGTCT---TTCA-T-A---TGTCTAA--TA-g