lowQualScore : 1 2 11 11 11111111 2222 1 1 11111111 666666666666666666666666
lowQualScore : 3 1 6 0 222 11 0 1 1 555555 11 33 11 55 33 11 11 33 55 1 2222 6 99999999 4 2 9 5555555555 22 1 3333 1 22 3 5555 1 22 1 222 4 5 9 1 2 444 0 44 22 55555 1 77 8 1 444444 1 7 2222 1 33 1 22 1 33333333 555555555555555555555555 3
lowQualScore : . . . . ... .. . . . ...... .. .. .. .. .. .. .. .. .. . .... . ........ . . . .......... .. . .... . .. . .... . .. . ... . . . . . ... . .. .. ..... . .. . . ...... . . .... . .. . .. . ........ ........................ .
lowQualScore : 4 5 4 6 222 77 2 2 2 777777 77 33 77 99 00 77 77 00 55 2 8888 7 77777777 0 7 7 4444444444 00 4 0000 4 00 0 6666 5 00 5 666 0 1 6 5 8 666 7 11 00 77777 5 22 4 6 666666 6 9 9999 6 88 6 44 7 66666666 444444444444444444444444 6
consensus : CGAAAAGATATTTA-GCTCCTGGCATGCATTTCCTGCG---TTT--TTCT-GA-TATTT--C---A--GA--C--A--T--T--T--TAAG--CC-GTTCAAATCTATAACACAAACTGCATTT----TATACAATTGCCCA-----T--T-T-T-ACACTA---T------TATC--TTGA-ATACAC----AT-TG--GTGGC-TTTTTAGA-CC-CG--ACATAACAG-TACATAT---CAACTCTTAGTAATAC-ACTGTAAGACAAGTA---TTTGCTGGGTATTATGA--T--ACATTC-----ATACT-G-NANAT-ATTA------TATGTG-AAGGATATG---TCATATT-T--TTGC-AAGAGT--A-ATTCATATTTTGG----GG--ATA----NATTTA-------TTN-T--TT-TTACAAAAA
Reference ( gi|97044 ) : CGAACAGATATTTA-GCTCGTGGCATGCATATCCTGCA---TTT--TTCT-GA-TATTT--C---A--GA--C--A--T--T--T--TAAG--CG-GTTCAAATCTATAACACAAACTACATTT----TATACAACTGCCCA-----T--T-T-T-ACACTA---T------TATC--TTGA-ATACAC----AT-TG--GTGGC-TTTTTATA-AC-CG--ACATAACAG-TACATAT---CACCTCTTAGCAAAAC-ACTGTAAGACAAGTA---TTTGCTGGGTATTATGA--T--ACATTC-----ATACT-G-CATAT-ATTA------TATGTG-AAGGACATG---TCATATT-T--TTGC-AAGAGT--A-ATTCATATTTTGG----AA--ATA----TATTCA------TTTT-T--TT-TTACAAAAA
gi|97042 : CGAAATGATATTTA-GCTCGTGGCATGCATTTCCTGCA---TTT--TTCT-AA-TATTT--C---A--GA--C--A--T--T--T--TAAG--CC-GTTAAAATCTATAACACAAACTGCATTT----TATACAATTGCCCA-----T--T-T-TTACACTA---T------TATC--TTGGTATACAC----AT-TG--ATGGC-TTTTTAGA-CC-CG--ACATAACAG-TACATAT---CAACTCTTAGTAATAC-ACTGTAAAACAAGTA---TTTGCTGGGTATTATGA--T--ACATTC-----ATATT-G-CATAT-ATTATACGAGTATGTG-AATGATATG---TCAT-TT-T--TT-C-AAGAGT--A-ATTCATGTTTTGG----GA--ATA----ACTTTA-------TTC-T--TT-TTACAAAA
gi|97043 : CGAAAATATGTTTA-GCTTGAGGCATGCATTTCCTACA---TTT--TTTT-GA-TTTTT--C---A--GG--C--A--T--T--T--TGAG--AC-GTTAAAATCTATAACACAAACTGCATTT----TATACAATTGCCCT-----T--T-T-TTACACTA---T------TATC--TTGA-ATACAC----AT-TG--GTGGC-TTTTTAGA-CC-CG--ACATAACGG-TACATAT---CAACTCTTAATAATAC-ACTGTAAGACAAGTA---TTTGCTGGGTATTATGA--T--ACATTC-----ATACT-G-CATAT-ATTA------TATGTG-AAGGATATG---TCATG---T--TTGC-AAGAGT--A-ATTCATATTTTTG----GG--ATA-----ATTTT------ATTC-T--TT-TTACAAAA
gi|97045 : CGAAAATATATTTA-GC-------AAGCATTTTCTGCA---TTT--TTCT-GA-TATTT--C---A--GA--C--A--T--T--T--TAAG--CT-GTTCAAATATATAACACAAACTACATTT----TATACAATTGTCCA-----T--T-TGT-ACACTA---T------TATC--TTGA-ATACAC----AT-TG--GTGGC-TTTTTAGA-CC-CG--TCATAACAG-TAAATAT---CAATTCTTAGTAATAC-ACCGTAAGGCAAGTA---TTTGCTAGGCATTATGA--T--GCATTC-----ATACT-G-CATAT-ATTA------TATGTG-AAGGATATG---TCATATT-T--TTGC-AAGAGT--A-ATTCATATTTTGG----GA--ATAAC--TATT-A-----------C--TT-TCACAAAAA
gi|97048 : CGAACGGATATTAA-GCTTGTGGCATGTATTACCTGCA---TTG--TTCT-GA-TATTT--T---A--GAGAC--A--T--T--T--TAAG--CT-GTTCAAATCTATAACACAAACTGCATTT----TATACAATTGCCCA-----T--T-T-TTACAATA---G------CATC--TTTA-ATACAC----AT-TG--GTG-C-TG-----A-CC-CG--ACATAACAG-TACATAT---CAACTCTTTGTAATAC-ACTGTAAGACAAGTA---TTTGCTGGGTATTATGA--A--ACATTCCGATGATACT-G-CATAT-ATTA------TATGTG-AAGGATATG---TCATATT-T--TTGC-AATAGC--A-CTTCATATTTTGG----CG--ATA----ACTTTA-------TCG-T--TT-TTACAAAAAc
gi|97046 : CGAAAAGATATTTA-ACTCGTGGCATGTAT------------TT--TTCC-GA-TATTT--C---A--GC--C--A--T--T--T--TAAG--CC-GTTCAAATCTATAACACAAACTGCTTTT----TATATAATTGCCCAT----T--T-T-T-ACACTA---T------TATC--TTGA-ATACAT----AT-TG--GTGGA-TTTTTAGG-CC-AG--ACATAGCAG-TTCA-AA---CAACTCTTAGTAATAC-ACTGTAAGACAGGTA---TTTGCTGGGTATTATGA--T--ACATTC-----ATACT-G-CATAT-ATTT------TATGTG-AATGATATG---TCATATG-T--TTGC-AAGAGT--T-ATCCATATTTTGG----GG--ATA----ACTTTA-------TTC-G--TT-TTACAAAAc
gi|97049 : CGAGAAGACATTAA-GCTCGTGGCATGCATTTCCTTCA---TTT--TTCT-GT-TATTT--C---A--GA--T--A--T--T--T--TAAG--CC-GTTTAAATCTATAACACAAACTACATTT----TACACAATTGCCCA-----T--TGT-T-ACACTC---T------TACC--TTGA-ATACAT----AA-TT--GTGGC-TTTTTAGA-CC-CG--ACATAACAG-TACATAT---AACTTCTTAATAATAC-ACTGTAAGACAAGTA-----AACAAG---TTACGA--T--ACATTC-----ATACT-G-TATAT-ATTA------TATGTG-ACAGATATG---TCATGTT-T--TTGC-GAGAGT--A-ATTAATATTTTGG----GA--ATAAC--TATT-A-----------C--TT-TTACAAAAA
gi|97047 : CAAAAACATATT-A-ACTCCTGGCATGCATTTCCTGCG---TTT--TT---GA-TGTTT--C---A--GAGAC--A--T--G--T--TAAG--CC-GTTCAAA-CTATAACACAAACTGCATTT----TATACAATTACCCA-----T--T-T-TTACACTT---T------TATC--TTGA-ATATAC----AT-CG--GTAGC-TTTTTAGA-CC-CG--ACATAACGG-TACATAT---CAACTCTTAGTAATAC-ACTGTAAGACAAGTT---TTTGCTGGGTATTATGA--T--ACATTT-----ATACC-T-AAAAT-AGTA------TATATG-AAAGATATG---TCATATT-T--TTGC-AAGAGC--A-ATTCATTTTTTGG----GG--ATA----ACTTTA-------TTA-T--TT-CTACAAAAAc
gi|97050 : CGAAAAGATATTCA-ACTCGTGGCATGCATTTCCTGCA---TTT--TTCT-GA-TATTT--C---A--GA--C--A--T--T--T--TAAG--CT-GTTCAAATCTATAACACAAACTACATTT----TATACAATTGCCAATT---T--T-T-T-ACACTA---T------AATC--TTGA-ATACAC----AT-TA--ATGGC-ATTTTAGA-CC-CG--GCATAAAAG-TACATAT---CAACGCTTAGAAATAC-ACTGTTAGACAAGTA---TTTGCTGGGTATTATGA--T--ACATTC-----ATACT-c
gi|97052 : CGAA-AAATATTTA-GCTCCTGGCATGCATTTCCGGCA---TTT--T-CT-GA-TATTTAAC---A--GA--T--A--T--T--T--TAAG--CC-ATTCAAATCTATAACACAAACTGCGTTG----TATACAATTACCAATT---T--T-T-T-ACACTT---T------TACC--TTGA-ATATAC----AT-CG--GTGGCTTTTTTAGA-CC-CG--ACGTAACAG-TACATAT---CAACTC--AGTAATTC-ACTGCCAGAAAATTA---TTTTCTGGGTATCATGA--T--ACATTC-----AT
gi|97051 : CGAAAAGATATTTA-GCCTGTGGCATGCATTTTCTGCA---TTT--TTCT-GA-TATTT--C---A--GG--C--A--T--T--T--TAAG--CC-GTTCAAATATATAACACAAACTACATTT----TATACAATTGCCCCT----T--T-T-T-ACACTT---T------AATC--TTGA-ATACAC----AT-TG--GTGAC-TTTTTAGA-CC-CG--ACATAACAG-TGCATAT---CAATTCTTAG
gi|97053 : CGAAAAGATATTTA-GTTCGTGGCATGCATTTCCTGCA---TTT--TTC----------------A--GA--C--A--T--T--T--TAAG--CC-GTTCAAATCTATAACACAAACTATATTT----GATACAATTGCCCAT----T--T-T-T-ACACTA---T------TATC--TTGA-ATACAC----AT-TG--GTG---TTTTTAGA-CC-CG--ACATAACAG-TTCATAT---CAt
gi|97056 : CGAACAGATATTTA-GCACGTGGCATGCATTTCCTGTA---TTT--T-CT-GA-TATTT--C---A--GA--T--A--T--T--T--TAAG--CC-GTTCAAACCTATTAAAAAAACTACATTT----TACACAGTTGTCCA-----A--T-T-
gi|97058 : GAAAAAATATTTT-GCTCCGAGCTTGCATTTTCTGCGGTTCTT--TTCT-GA-CATTT--C---A--GAGAC--A--T--A--A--TAAG--CC-GTTAAAGTATATAACACAAACTGCATTT----TATAAAATTTCCCG-----T--T-T-TTACACTA---TAAGATATATC--TTGG-ATACAC----AA-AT--GTCGC-CTTGTA-------G--ACTTGACA--------T---CAACGCATAGTAATAC-TCTGTAAGACAAGTA---TTAGCTGGGTATTATGA--T--ATATTC-----ATAC--------T-ATTA------TAAGTG-ATGAATAGG---TCATACT-T--TTGC-TAGAGT--A-TTTCATTTTTTTG----GT--ATA----ACTTTA-------TTA-T--TT-CTACAAAA
gi|97060 : AAAAAACAATTA-GCTCCAGTCATGCATTTCATGAG---TTT--TTCT-GA-TATTT--C---A--GA--G--AC-T--T--T--TAAGG-CC-GTTCAAATCTATAACTGAAGCTGCATTT----GATACAATTACCCA-----C--T-C-G-TCACTG---T------TTTC--TTGA-ATACAT----AT-TG--GTAGC-TTTTTAGACAT-CG--GCATAACAG-TACATAT---CAACTCTTAGTAATAC-ACTGTAAGACAAGTA---TTTGCTGAGTATTACGA--T--ACATTC-----ATAAT-G-AAAAT-ATTG------TATGGG-AAGGATATG---TCATATT-T--TTCC-AAGAGT--G-ATTCATATTTTGGGGA-AA--ACG----TATTC------------T--TT-TTATAAAAA
gi|97061 : AAAAAATATTAA-TCTTCTGGAATATATTTCCTGTG---TTT--T-CT-GA-TATTT--C---A--GAGAC--A--A--T--T--TAAG--CC-GTTCAAATCTATAACACAGACTGCAGTT----TATGCACTTACCCA-----T--T-T-TTACACTT---T------TATC--TTGT-ATACGG----AT-TG--ATGGC-TTTT---A-GA-CGGGACTTAACAG-TACATATTATCAACTCTTAGTAATAC-ACTGAAAGACAAGTA---TTTGCTAGGTATTATGA--T--ACATTC-----ATACT-G-AAAAT-ATTA------ATTGTA-AGGGATATG---TCATATT-T--TT-C-AAGAGT--A-ATTCATATTTTGA----GG--ATA---------A------CTTTATGATT-TTACAAAA
gi|97062 : AAAAAATATTTAAGCCCCTCGAATGCATTTCCTGTG---TTT--TGCT-GG-TATCC--G---A--GATAC--A--T--T--T--TGAG--CC-TTTCAGATCGATAAAATCAACTGCAGTT----TATACAGTCGCCCA-----TGAT-T-T-ACACTA---
gi|97054 : AGATATTTA-GCTCGTGTTATGCATTTCCTGCA---TTT--TTTC-GGCTATTT--C---A--GA--C--A--T--T--T--TAAG--CC-GTTCAAATCTATAACACAAACTGTATTT----TATACAAATGCCTAT----T--T-T-T-ACGCTA---T------TATC--TTGA-ATACAC----AT-TG--aaat
gi|97059 : cgacaAAATATTTA-GCTCCCACAATGCATTTATTGCG---ACT--TCCT-GA-TATCT--G---A--GAGAC--A--TG-T--T--TAAG--CC-TTTCAAATCGATAAATCATACTGAATTT----CACACAATTGCCCATG---T--T-T-T-ACACCA---A------TATT--TTGA-ATACAC----ATGTGAAGTG-----TTTAGA-TC-TG--ACATATCAG-TACACAT---CTATTCTTAGTAA--------TAAAAC---TA---TCAGCGTTGTACTATGATGT--ATATTG-----ATAGT-G-CA-A-----A------TAAGTG-CAGGAAATG---ATAAATT-TG-TTGC-AAG
gi|97064 : gaagagAAATAATTA-GCTCCCACAATGCATTTATTGCG---GTT--TCCT-GA-TATCT--G---A--GA--C--A--T--TTGT--TAAT--CC-TTTCAAACCGATAACTCATACTGAATTT----TACACAAATGTTCA-----TGGC-T-T-ACACCAATTC------TATG--TTGA-ATACAC----AT--------GC-TTTCTA-A-ACATG--GCATAAAAG-TACACAT-------------CAAGAC-ACAATAAAAC---TA---TTAGCTCTGTACTGTAATGT--ATGTTG-----ATA---G-TAGA--A--A------TATGTG-CAAGAAATG-----ACATT-G--TTGC-AAG
gi|97065 : aATATTTA-GCTCCTAGCATACATTTCCTA-G---TTT--TTCCAGA-TATTT--C---A--GA--C--ACAT--T--G--TAAG--GC-ATCCAAATCAATAACACGGACTGCATTT----TACAGAGTTGCCTA-----TG-T-TAT-ACACCA---T------TATC--TTGA-ATACAC----AC-TG--ATAGT-TTTTTAGA-AC-TG--ACATAATTG-TACATAT---CAACTC---GTAATATGACTATTA-AC--GTC---TTT-----GTATTATGA--T--ACAGTG-----AGACT-G-AA-ATGATGA------TATGTGAAAGGATATG---TCATAGT-T--TTGCTATGAGTGCA-ATTCATATTTTGG----AG--ATA-----ACTTT------GTTA-T--TT-TTACAAAAA
gi|97066 : ATTTTTA-GGTCCTTGAAAGTATTTCCTGCA---TTT--TTCT-GT-TATTT--C---A--GAC-C--AT-T--T--T--TAAG--T--GTTTAAAc
gi|97057 : TATTTA-GCTCCTGGCATGCATTTCCCGCG---TTT--TTCT-GA-TATTT--C---ACAGA--C--A--T--T--T--TAAG--CC-GTTCAAATCTATAACACAAACTGCATTT----AATACAATTACCCA-----T--T-G-T-----------------------TT-------AC----AT-TG--GTAGCATTTTTG-A-CC-CG--ACATTACTG-TACATAG---AAACTTTAAGTAAGAC-ACTGTAAGACATGTA---TTTGCTGGGTATTATGA--T--ACATTC-----ATACA-G-AAAAT-ATTA------TATGTG-AAGGATATG---TCATATTAT--TTGG-CATAGT--A-ATTCATATTTTAG----GG--ATA-----A---------------C--TT-TTACAAAAAgcaaaagcaaaccttttttatgttattgtttttgcgcaaaatagaatacaattg
gi|97067 : gaaaaatTTTA-GCTCCTGGCATGCAT-TCCTGCG---TGT--TT--------TTT-------------------T--T--T--TGTG--TGTGTTTTTTTTTATATTTCAGAG-ACATTT----TA---AGCCGTTCAAA---T--T-T-T-ACGCTA---T------TAT---------------------TG--GAAGC-TTTTTAGA-CC-CG--ACTCAACAG-TACATAT---CAACTTTTAGTAATAC-ACTGTAAG-----TA---TTTGCTGGGTATTATGA--T--ACATTC-----ATACT-G-AAAAT-ATTA------TATGTG-AAGGACAAG---ACAAATT-T--TTGC-CAGAGT--A-ATTCATATTTTGG----GG--ATA----TTTT--------TTTT-C--TTATTTCAAAAAc
gi|97068 : TTTA-GCTCTCAAAATGCATTTCCTGTG---GTT--TTCT-GA-TATC---CGAGA--GA--C--A--C--T--TGTTACG--CC-TTTCAAATCAAAAACACTAACTGCGTTT----TAAATAATTGTCCAACATGT--T-T-T-ACACCA---A------TATA--TTAA-ATATAC----GT-TG---TAGC-TTTTTAGA-CC-TG--ACAT----------T-T---CAGCTCGTAGTAA--------TAA-ACAA------TTGGCTTTGTATGATG---T--ATATTG-----ATACT-GACACAT-A--A------TATGTG-AAGGGAATG---ACATATT-G--TTGC-AAGTGT--ACATTCAAACTTc
gi|97063 : TA-GCTTCTAGAATGCATTCCCTGCG---GTT--TCCT-GA----------------A-----A--T--G--T--TACG--CC-TTTCAAATCGGTAACAT-AACTGCATTT----TATATG--TGTCTA-----TGGT-T-T-ACAC-----C------TAT--------ATA-AC----AA-TG--GTAG--TTTTTAGA-CA-CA--ACATATCAG-TATACAC---CAAAACTTGGCAA--------TAAGAC---TG---CTTGCTTTGTACTGTGA--T--ATATTTTG---ATACT-G-GACAT-A-TA------TA------------------CATATT-G--TTGC-AAGAGT--A-ATTCATATTTTGC----GG--ATA-----ACT-A------TCTT-TG-TT-TTACAACAA
gi|97055 : aaagaaaaaA-GCTC-TAGAATGTATTTTCTGTG---TTT--TTTT-GA-TATCC--G---A--GA--T--AAAT--G--C--TAAG--CC-TTTCAAA---ATGATA-AAATCACAGTT----T---------CCCT-----TGAT-T-T-ACACCA---C------TATC--TTGA-ATATAC----AT-TG--GTAGC-C---------C-CG--ACGTAATTGTTACATAT---CAACTCTTAGTTGA-----TCTAATAAAAATAATGTTTTTT---TATTAGGA--T--ATATAA-----GGACT-G-AAAAT-ATGA------TATGTG-AAGGATACGGTATGACATT-TTGTTGC-AAGAGC--A-ATTCATATTTTGGCGATAACTATA----TATATA------TTTT-T--TT-TT-CAAAAA
gi|97069 : cgaaaaactctg-GCTCCCAGAATGCAT-TCCTGCA---TTT--GCTT-GA-TATTT--GGG-A--GA--C--A--T--T--------------ATTTAAGTCTTT----CAAATTGCATTA----TATACAATTGACCA-----TGTT-T-T-ACACCA---A------TATA--TTAC-ATACAC----TT-TG--ATAGC-TTTTTGGA-CC-TG--ACATAAAAG-TACAAAT---GAACTCTTGGTAA--------TAAGACTAGCAAC-TTTGA-----ACTATGG--T--ACATGG-----GTACTGG-TAAAT-ATGA------TATGTG-CAGGAAATA---ACATATT-G--TTGC-AAGAGT--A-GTTAATATTAT------AA--GGA----CATTTA--------TC-T--TT-TTACAAAAAc
gi|97070 : TCGTGGCATGCATTTGCTGCA---TTT--TTCT-GA-TATTT--C---A--GA--C--A--T--T--T--------------CAAATCTATAACACAAACTGCATTT----TATACAATTGCCTA-----T--T-T-TTACACTA---T------TATC--TTGA-ATGCAC----AT-TG--GTGAC-GTTTTAGA-CC-CG--ACATAGCAG-CACATAT---CAGCTCTTAGTAATAC-A-TGTAAGACAAGTA---TTTGCTAGATATTAAGA--T--ACATTC-----TTACT-G-AAAAT-AGTA------TATGTG-AAAGATATG---TCATATT-T--TTAC-AAGAGT--A-TTTCATATTTTGG----GG--ATGGCTTTATT-G------TTTT-T--TT-TTAAAAAAA
gi|97071 : TCTTAGAATGCAT-TCCTGCG---TTT--TTCT-GA-TATTTGAA---A--GA--C--A--TAAT--G--TAAATCTT-TTTTAAATCAATAACACTAGGTACATc
gi|97072 : TGACATGCATTTCCTGCA---TTT--T-CT-AA-TATTT--C---A--GA--C--A--T--T--T--TAAG--CC-GTCCAAATCTATAACACAAACTACATTT----TACACAATTGACGA-----T--TCT-T-ACACTA---T------TATC--TTGA-ATACAC----TT-TG--GTCAC-TCTTTAGA-CC-CG--ACAT-ATAG-TACATAT---CAACTATTAGTAATAC-ACTGCAAGACAGGTA---TTTCCTGGGT-----------------------ATACT-G-CATAT-ATTA------TATGTG-AAGGATATG---TCATATT-T--TTGA-AAGAGT--A-ATTCATATTTTGG----GA--ATA----ACTTTA-------TTA-T--TT-TTACAAAA
gi|97073 : ACGCATTTCCTGCA---TTT--TCCT-GT-TATTT--C---A--GA--CCAA--T--T--G--TAAG--CG-CTT-AAATC
gi|97074 : TGCAT-TGCTGCG---TTTATTTCT-GG-TATTT--C---A--GAAAC--A--T--T--T--TAAG--CC-TTTCGTATCTATAACACAAACTGCAATT----TTTACAATTACCCA-----T--TGT-T-AAAATA-----------ACCCATTG--TTACACTAGTAT-TG--TTAGC-TTT----------------TAACAG-TACATAT---TAagaccaaatttttcatttattatgtaattattatttgtaca
gi|97075 : TTCAAATCGATAACACTAATTGCATTTCAGATATGCAATTGTC------------T-G-ACA-TG---T------T--T--TTGT-ATGCAT----GT-----GTAAC-ATTTAAGA-CC-TG--ACATTTCAG-TACATGT---CAGAGCTTAGTAA--------TACGAC---TA---TTGGCTTTGTACCATGG--TGTATATTG-----ATACT-G-GAAAT-ATAA------TATGTG-CAGGAAATG---ACATATT-G--TTGC-AAGAAT--A-ATTGTTA-TTTGG----GG--ATAAT--CATTTAATGGTCTTTT-G--TT-TTACAAGAAatcgtgaaacatcgagtatttccgtatcctccgtataatgtttagcataaaggccgaggtaatcagattgagtaatacactgtaattatttgctgggtactatgatacattcatactgaaaatattatatgcgaaggatatgtcatatttttgtaaaagtaattcatattttggggataattttttcttattacaaaaac
gi|97076 : TTAGTAATAC-ACTGTAAGACAAGTA---TTTGCTGGGTATTATGA--T--ACATTC-----ATACT-G-TATAT-ATTA------TGTGTG-AAG----------------------------AGT--A-ATTCAGATTTTGG----AA--ATAAC--TATT-A-----------T--TT-TTACAAAAA
gi|97074 : AGTAATAC-ACTGTAAT-----TA---TTTGCTGGGTACTATGA--T--ACATTC-----ATACT-G-AAAAT-ATTA------TATGCG-AAGGATATG---TCATATT-T--TTGT-AAAAGT--A-ATTCATATTTTGG----GG--ATA-----ATT--------TTTT-C--TTATTACAAAAAc
gi|97077 : tgcattgctgcgtttatttctggtatttcagaaacattttaagcctttcgtatctataacacaaactgcaatttttacaattacccattgttaaaataacccattgttacactagtattgttagcttttaacagtacatattaatcgtgaaacatcgagtatttccgtatcctccgtataatgtttagcataaaggccgaggtaatcagattgAC-ACTGTAAGACAAGTA---TTTGCTGACTATTATAA--T--ACATTC-----ATACT-G-AAT-T-ATTA------TATGTG-AAGGGTATG---TCATA-T-T--TTGC-AAGAGT--A-ATTCATATTTTGG----GG--ATA----ACTTTA-------TTA-T--TT-TTACAAAAAc
Alignments
lowQualScore : 11 11111111 11 1111
lowQualScore : 0 22 1 3 222 33333 11 1 1 222 1 666666 11 11 11 55 22 33 11 1 11 1 11 11 2222 33333333 3 3 00 1 5555555555 11 1 2222 1 11 1 1 1 222 1 1 1 33 22 0 33 22 55555 1 4 1 1 444444 1 0 222 1 1 22 1 22 1 555555 9999 666666 1 1
lowQualScore : . .. . . ... ..... .. . . ... . ...... .. .. .. .. .. .. .. . .. . .. .. .... ........ . . .. . .......... .. . .... . .. . . . ... . . . .. .. . .. .. ..... . . . . ...... . . ... . . .. . .. . ...... .... ...... . .
lowQualScore : 3 22 4 6 111 00000 77 4 2 111 2 888888 77 22 77 88 99 33 77 2 77 1 66 77 6666 77777777 6 6 55 3 3333333333 88 3 8888 3 88 4 4 4 555 5 4 4 11 00 3 99 00 55555 5 5 5 5 444444 5 7 777 5 5 11 5 33 7 000000 0000 777777 0 7
consensus : CGAAAAGA--TATTTA-GCTCCTGGCATGCATTTCCTGCG---T-----TT--TTCT-G---A-TATTT--C---A--GA--C--A--T--T--T--TAAG-CC--GTTCAAATCTATAACACAAA--CTGCATT--T----TATACAATTGCCCA-----T--T-T-T--ACAC-TA---T------TATC--TTGA-ATACAC----AT-TG--GTGGC-TTTTTAGAC-CCGACATAACAGT-ACATAT---CAAC-TCTTAGT-AATAC-ACTGTAAGACAAGTA--TTTGCTGGGTATTATGA--T--ACATTC-----ATACT-GNANAT-ATTA------TATGTG-AAGGATATGTCAT---ATT-T-T--TGC-AAGAGT--A-ATTCATATTTTGGGG------ATA--ACTTTA------TTNT-TTTTACAAAAA
Reference ( family-584 ) : CGAAAAGA--TATTTA-GCTCCTGGCATGCATTTCCTGCG---T-----TT--TTCT-G---A-TATTT--C---A--GA--C--A--T--T--T--TAAG-CC--GTTCAAATCTATAACACAAA--CTGCATT--T----TATACAATTGCCCA-----T--T-T-T--ACAC-TA---T------TATC--TTGA-ATACAC----AT-TG--GTGGC-TTTTTAGAC-CCGACATAACAGT-ACATAT---CAAC-TCTTAGT-AATAC-ACTGTAAGACAAGTA--TTTGCTGGGTATTATGA--T--ACATTC-----ATACT-GNANAT-ATTA------TATGTG-AAGGATATGTCAT---ATT-T-T--TGC-AAGAGT--A-ATTCATATTTTGGGG------ATA--NATTTA------TTNT-TTTTACAAAAA
gi|97042 : CGAAATGA--TATTTA-GCTCGTGGCATGCATTTCCTGCA---T-----TT--TTCT-A---A-TATTT--C---A--GA--C--A--T--T--T--TAAG-CC--GTTAAAATCTATAACACAAA--CTGCATT--T----TATACAATTGCCCA-----T--T-T-TT-ACAC-TA---T------TATC--TTGGTATACAC----AT-TG--ATGGC-TTTTTAGAC-CCGACATAACAGT-ACATAT---CAAC-TCTTAGT-AATAC-ACTGTAAAACAAGTA--TTTGCTGGGTATTATGA--T--ACATTC-----ATATT-GCATAT-ATTATACGAGTATGTG-AATGATATGTCAT----TT-T-T--T-C-AAGAGT--A-ATTCATGTTTTGGGA------ATA--ACTTTA------TTCT-TTTTACAAAA
gi|97043 : CGAAAATA--TGTTTA-GCTTGAGGCATGCATTTCCTACA---T-----TT--TTTT-G---A-TTTTT--C---A--GG--C--A--T--T--T--TGAG-AC--GTTAAAATCTATAACACAAA--CTGCATT--T----TATACAATTGCCCT-----T--T-T-TT-ACAC-TA---T------TATC--TTGA-ATACAC----AT-TG--GTGGC-TTTTTAGAC-CCGACATAACGGT-ACATAT---CAAC-TCTTAAT-AATAC-ACTGTAAGACAAGTA--TTTGCTGGGTATTATGA--T--ACATTC-----ATACT-GCATAT-ATTA------TATGTG-AAGGATATGTCAT---G---T-T--TGC-AAGAGT--A-ATTCATATTTTTGGG------ATA--ATTTTA------TTCT-TTTTACAAAA
gi|97044 : CGAACAGA--TATTTA-GCTCGTGGCATGCATATCCTGCA---T-----TT--TTCT-G---A-TATTT--C---A--GA--C--A--T--T--T--TAAG-CG--GTTCAAATCTATAACACAAA--CTACATT--T----TATACAACTGCCCA-----T--T-T-T--ACAC-TA---T------TATC--TTGA-ATACAC----AT-TG--GTGGC-TTTTTATAA-CCGACATAACAGT-ACATAT---CACC-TCTTAGC-AAAAC-ACTGTAAGACAAGTA--TTTGCTGGGTATTATGA--T--ACATTC-----ATACT-GCATAT-ATTA------TATGTG-AAGGACATGTCAT---ATT-T-T--TGC-AAGAGT--A-ATTCATATTTTGGAA------ATA--TATTCAT-----TTTT-TTTTACAAAAA
gi|97045 : CGAAAATA--TATTTA-GC-------AAGCATTTTCTGCA---T-----TT--TTCT-G---A-TATTT--C---A--GA--C--A--T--T--T--TAAG-CT--GTTCAAATATATAACACAAA--CTACATT--T----TATACAATTGTCCA-----T--T-TGT--ACAC-TA---T------TATC--TTGA-ATACAC----AT-TG--GTGGC-TTTTTAGAC-CCGTCATAACAGT-AAATAT---CAAT-TCTTAGT-AATAC-ACCGTAAGGCAAGTA--TTTGCTAGGCATTATGA--T--GCATTC-----ATACT-GCATAT-ATTA------TATGTG-AAGGATATGTCAT---ATT-T-T--TGC-AAGAGT--A-ATTCATATTTTGGGA------ATA--A--CTA------TTAC-TTTCACAAAAA
gi|97046 : CGAAAAGA--TATTTA-ACTCGTGGCATGTATTT-------------------TTCC-G---A-TATTT--C---A--GC--C--A--T--T--T--TAAG-CC--GTTCAAATCTATAACACAAA--CTGCTTT--T----TATATAATTGCCCA-----T--T-T-TT-ACAC-TA---T------TATC--TTGA-ATACAT----AT-TG--GTGGA-TTTTTAGGC-CAGACATAGCAGT-TCAAA----CAAC-TCTTAGT-AATAC-ACTGTAAGACAGGTA--TTTGCTGGGTATTATGA--T--ACATTC-----ATACT-GCATAT-ATTT------TATGTG-AATGATATGTCAT---ATG-T-T--TGC-AAGAGT--T-ATCCATATTTTGGGG------ATA--ACTTTA------TTCG-TTTTACAAAAc
gi|97047 : CAAAAACA--TATT-A-ACTCCTGGCATGCATTTCCTGCG---T-----TT--T--T-G---A-TGTTT--CAG-A--GA--C--A--T--G--T--TAAG-CC--GTTCAAA-CTATAACACAAA--CTGCATT--T----TATACAATTACCCAT----T--T-T-T--ACAC-TT---T------TATC--TTGA-ATATAC----AT-CG--GTAGC-TTTTTAGAC-CCGACATAACGGT-ACATAT---CAAC-TCTTAGT-AATAC-ACTGTAAGACAAGTT--TTTGCTGGGTATTATGA--T--ACATTT-----ATACC-TAAAAT-AGTA------TATATG-AAAGATATGTCAT---ATT-T-T--TGC-AAGAGC--A-ATTCATTTTTTGGGG------ATA--ACTTTA------TTAT-TTCTACAAAAA
gi|97048 : CGAACGGA--TATTAA-GCTTGTGGCATGTATTACCTGCA---T-----TG--TTCT-G---A-TATTT--T---A--GAGAC--A--T--T--T--TAAG-CT--GTTCAAATCTATAACACAAA--CTGCATT--T----TATACAATTGCCCA-----T--T-T-TT-ACAA-TA---G------CATC--TTTA-ATACAC----AT-TG--GTG-C-T-----GAC-CCGACATAACAGT-ACATAT---CAAC-TCTTTGT-AATAC-ACTGTAAGACAAGTA--TTTGCTGGGTATTATGA--A--ACATTCCGATGATACT-GCATAT-ATTA------TATGTG-AAGGATATGTCAT---ATT-T-T--TGC-AATAGC--A-CTTCATATTTTGGCG------ATA--ACTTTA------TCGT-TTTTACAAAAAc
gi|97049 : CGAGAAGA--CATTAA-GCTCGTGGCATGCATTTCCTTCA---T-----TT--TTCT-G---T-TATTT--C---A--GA--T--A--T--T--T--TAAG-CC--GTTTAAATCTATAACACAAA--CTACATT--T----TACACAATTGCCCA-----T--TGT-T--ACAC-TC---T------TACC--TTGA-ATACAT----AA-TT--GTGGC-TTTTTAGAC-CCGACATAACAGT-ACATAT----AACTTCTTAAT-AATAC-ACTGTAAGACAAGTA----AACAAG---TTACGA--T--ACATTC-----ATACT-GTATAT-ATTA------TATGTG-ACAGATATGTCAT---GTT-T-T--TGC-GAGAGT--A-ATTAATATTTTGGGA------ATA--A--CTA------TTAC-TTTTACAAAAAc
gi|97050 : CGAAAAGA--TATTCA-ACTCGTGGCATGCATTTCCTGCA---T-----TT--TTCT-G---A-TATTT--C---A--GA--C--A--T--T--T--TAAG-CT--GTTCAAATCTATAACACAAA--CTACATT--T----TATACAATTGCCAA-----T--T-T-TTTACAC-TA---T------AATC--TTGA-ATACAC----AT-TA--ATGGC-ATTTTAGAC-CCGGCATAAAAGT-ACATAT---CAAC-GCTTAGA-AATAC-ACTGTTAGACAAGTA--TTTGCTGGGTATTATGA--T--ACATTC-----ATACT-c
gi|97051 : CGAAAAGA--TATTTA-GCCTGTGGCATGCATTTTCTGCA---T-----TT--TTCT-G---A-TATTT--C---A--GG--C--A--T--T--T--TAAG-CC--GTTCAAATATATAACACAAA--CTACATT--T----TATACAATTGCCCCT----T--T-T-T--ACAC-TT---T------AATC--TTGA-ATACAC----AT-TG--GTGAC-TTTTTAGAC-CCGACATAACAGT-GCATAT---CAAT-TCTTAGT-
gi|97052 : CGAAAA-A--TATTTA-GCTCCTGGCATGCATTTCCGGCA---T-----TT--T-CT-G---A-TATTTAAC---A--GA--T--A--T--T--T--TAAG-CC--ATTCAAATCTATAACACAAA--CTGCGTT--G----TATACAATTACCAATT---T--T-T-T--ACAC-TT---T------TACC--TTGA-ATATAC----AT-CG--GTGGCTTTTTTAGAC-CCGACGTAACAGT-ACATAT---CAAC-TC--AGT-AATTC-ACTGCCAGAAAATTA--TTTTCTGGGTATCATGA--T--ACATTC-----AT
gi|97053 : CGAAAAGA--TATTTA-GTTCGTGGCATGCATTTCCTGCA---T-----TT--TTC-------------------A--GA--C--A--T--T--T--TAAG-CC--GTTCAAATCTATAACACAAA--CTATATT--T----GATACAATTGCCCAT----T--T-T-T--ACAC-TA---T------TATC--TTGA-ATACAC----AT-TG--GTG---TTTTTAGAC-CCGACATAACAGT-TCATAT---CA
gi|97054 : CGACAAGA--TATTTA-GCTCGTGTTATGCATTTCCTGCA---T-----TT--TTTC-G---GCTATTT--C---A--GA--C--A--T--T--T--TAAG-CC--GTTCAAATCTATAACACAAA--CTGTATT--T----TATACAAATGCCTAT----T--T-T-T--ACGC-TA---T------TATC--TTGA-ATACAC----AT-TG--
gi|97055 : CGAAAAAC--T-CTGA-GCTC-TAGAATGTATTTTCTGTG---T-----TT--TTTT-G---A-TATCC--G---A--GA--T--AAAT--G--C--TAAG-CC--TTTCAAA---ATGATAAAAT--C----------------ACAGTTTCCCT-----TGAT-T-T--ACAC-CA---C------TATC--TTGA-ATATAC----AT-TG--GTAGC---------C-CCGACGTAATTGTTACATAT---CAAC-TCTTAGTTGATCT-AATA-AAAATAA-TG--TTTTTT---TATTAGGA--T--ATATAA-----GGACT-GAAAAT-ATGA------TATGTG-AAGGATACGGTATGACATT-T-TGTTGC-AAGAGC--A-ATTCATATTTTGGCGATAACTATA--TATATA------TTTT-TTTTTCAAAAA
gi|97056 : CGAACAGA--TATTTA-GCACGTGGCATGCATTTCCTGTA---T-----TT--T-CT-G---A-TATTT--C---A--GA--T--A--T--T--T--TAAG-CC--GTTCAAACCTATTAAAAAAA--CTACATT--T----TACACAGTTGTCCA-----A--T-T-c
gi|97057 : GAAAAAT--TATTTA-GCTCCTGGCATGCATTTCCCGCG---T-----TT--TTCT-G---A-TATTT--C---ACAGA--C--A--T--T--T--TAAG-CC--GTTCAAATCTATAACACAAA--CTGCATT--T----AATACAATTACCCA-----T--T-G-T-------------------------TT-------AC----AT-TG--GTAGC-ATTTTTGAC-CCGACATTACTGT-ACATAG---AAAC-TTTAAGT-AAGAC-ACTGTAAGACATGTA--TTTGCTGGGTATTATGA--T--ACATTC-----ATACA-GAAAAT-ATTA------TATGTG-AAGGATATGTCAT---ATTAT-T--TGG-CATAGT--A-ATTCATATTTTAGGG------ATA----------------AC-TTTTACAAAAA
gi|97058 : GAAAAAA--TATTTT-GCTCCGAGCTTGCATTTTCTGCGGTTC-----TT--TTCT-G---A-CATTT--C---A--GAGAC--A--T--A--A--TAAG-CC--GTTAAAGTATATAACACAAA--CTGCATT--T----TATAAAATTTCCCG-----T--T-T-TT-ACAC-TA---TAAGATATATC--TTGG-ATACAC----AA-AT--GTCGC-CTTGTAGAC-TTGACAT----------------CAAC-GCATAGT-AATAC-TCTGTAAGACAAGTA--TTAGCTGGGTATTATGA--T--ATATTC-----ATAC-------T-ATTA------TAAGTG-ATGAATAGGTCAT---ACT-T-T--TGC-TAGAGT--A-TTTCATTTTTTTGGT------ATA--ACTTTA------TTAT-TTCTACAAAAc
gi|97059 : GAAGAGAAATATTTA-GCTCCCACAATGCATTTATTGCG---A-----CT--TCCT-G---A-TATCT--G---A--GAGAC--A--TG-T--T--TAAG-CC--TTTCAAATCGATAAATCATA--CTGAATT--T----CACACAATTGCCCATG---T--T-T-T--ACAC-CA---A------TATT--TTGA-ATACAC----ATGTGAAGTG-----TTTAGAT-CTGACATATCAGT-ACACAT---CTAT-TCTTAGT-AA--------TAAAAC---TA--TCAGCGTTGTACTATGATGT--ATATTG-----ATAGT-GCAAAT-A--A---------GTG-CAGGAAATGATAA---ATT-TGT--TGC-AAG
gi|97060 : AAAAAA--CAATTA-GCTCCAGTCATGCATTTCATGAG---T-----TT--TTCT-G---A-TATTT--C---A--GA--G--AC-T--T--T--TAAGGCC--GTTCAAATCTATAACTGAAG--CTGCATT--T----GATACAATTACCCA-----C--T-C-G--TCAC-TG---T------TTTC--TTGA-ATACAT----AT-TG--GTAGC-TTTTTAGACATCGGCATAACAGT-ACATAT---CAAC-TCTTAGT-AATAC-ACTGTAAGACAAGTA--TTTGCTGAGTATTACGA--T--ACATTC-----ATAAT-GAAAAT-ATTG------TATGGG-AAGGATATGTCAT---ATT-T-T--TCC-AAGAGT--G-ATTCATATTTTGGGG------A-A--AACGTA------TTCT-TTTTATAAAAA
gi|97061 : AAAAAA--TATTAA-TCTTCTGGAATATATTTCCTGTG---T-----TT--T-CT-G---A-TATTT--C---A--GAGAC--A--A--T--T--TAAG-CC--GTTCAAATCTATAACACAGA--CTGCAGT--T----TATGCACTTACCCA-----T--T-T-TT-ACAC-TT---T------TATC--TTGT-ATACGG----AT-TG--ATGGC-TTTT-AGAC-GGGACTTAACAGT-ACATATTATCAAC-TCTTAGT-AATAC-ACTGAAAGACAAGTA--TTTGCTAGGTATTATGA--T--ACATTC-----ATACT-GAAAAT-ATTA------ATTGTA-AGGGATATGTCAT---ATT-T-T--T-C-AAGAGT--A-ATTCATATTTTGAGG------ATA--ACTTTA------TGA--TTTTACAAAA
gi|97062 : AAAAAA--TATTTAAGCCCCTCGAATGCATTTCCTGTG---T-----TT--TGCT-G---G-TATCC--G---A--GATAC--A--T--T--T--TGAG-CC--TTTCAGATCGATAAAATCAA--CTGCAGT--T----TATACAGTCGCCCA-----TGAT-T-T--ACAC-TA---
gi|97063 : AAAGA--AAAATA-GCTTCTAGAATGCATTCCCTGCG---G-----TT--TCCT-G---A--A-------------------A--T--G--T--TACG-CC--TTTCAAATCGGTAACAT-AA--CTGCATT--T----TATATG--TGTCTA-----TGGT-T-T--ACAC------C------TAT--------ATA-AC----AA-TG--GTAG--TTTTTAGAC-ACAACATATCAGT-ATACAC---CAAA-ACTTGGC-AA--------TAAGAC---TG--CTTGCTTTGTACTGTGA--T--ATATTTTG---ATACT-GGACAT-A-TA------TA---------------CAT---ATT-G-T--TGC-AAGAGT--A-ATTCATATTTTGCGG------ATA--ACTATC------TTTG-TTTTACAACAAaaat
gi|97064 : AAAA--TAATTA-GCTCCCACAATGCATTTATTGCG---G-----TT--TCCT-G---A-TATCT--G---A--GA--C--A--T--TTGT--TAAT-CC--TTTCAAACCGATAACTCATA--CTGAATT--T----TACACAAATGTTCA-----TGGC-T-T--ACAC-CAATTC------TATG--TTGA-ATACAC----AT--------GC-TTTCTAAAC-ATGGCATAAAAGT-ACACAT---CA-------AG-----AC-ACAATAAAAC---TA--TTAGCTCTGTACTGTAATGT--ATGTTG-----ATAGT-AGAA------A------TATGTG-CAAGAAATG--AC---ATT-G-T--TGC-AAG
gi|97065 : A--TATTTA-GCTCCTAGCATACATTTCCTA-G---T-----TT--TTCCAG---A-TATTT--C---A--GA--C--ACAT--T--G--TAAG-GC--ATCCAAATCAATAACACGGA--CTGCATT--T----TACAGAGTTGCCTA-----TG-T-TAT--ACAC-CA---T------TATC--TTGA-ATACAC----AC-TG--ATAGT-TTTTTAGAA-CTGACATAATTGT-ACATAT---CAAC-TC---GT-AATATGACTATTA-AC--GTC--TTT-----GTATTATGA--T--ACAGTG-----AGACT-G-AAATGATGA------TATGTGAAAGGATATGTCAT---AGT-T-T--TGCTATGAGTGCA-ATTCATATTTTGGAG------ATA--ACTTTG------TTAT-TTTTACAAAAA
gi|97066 : A--TTTTTA-GGTCCTTGAAAGTATTTCCTGCA---T-----TT--TTCT-G---T-TATTT--C---A--GAC-C--AT-T--T--T--TAAG--T--GTTTAAAGC-A-AAAGCAAA--CCTT-TT--T----TATGTTATTGT--------T--T-T-T--GCGCAAA---A------TA------GA-ATACA-----AT-TG--c
gi|97067 : TTTA-GCTCCTGGCATGCATT-CCTGCG---TGTTTTTT--TTTT-GTGTG-TGTTT----------------------T--T--T---------TTTATATTT----CAGAGA--C---ATT--T----TAAGCCGTT-CAAA-----T--T-T-T--ACGC-TA---T------TAT---------------------TG--GAAGC-TTTTTAGAC-CCGACTCAACAGT-ACATAT---CAAC-TTTTAGT-AATAC-ACTGTAAG-----TA--TTTGCTGGGTATTATGA--T--ACATTC-----ATACT-GAAAAT-ATTA------TATGTG-AAGGACAAGACAA---ATT-T-T--TGC-CAGAGT--A-ATTCATATTTTGGGG------ATA--TTTTTT------TTCT-TATTTCAAAAA
gi|97068 : TTTA-GCTCTCAAAATGCATTTCCTGTG---G-----TT--TTCT-G---A-TATC---CGAGA--GA--C--A--C--T--TGTTACG-CC--TTTCAAATCAAAAACACTAA--CTGCGTT--T----TAAATAATTGTCCAACATGT--T-T-T--ACAC-CA---A------TATA--TTAA-ATATAC----GT-T---GTAGC-TTTTTAGAC-CTGACAT-----T------T---CAGC-TCGTAGT-AAT---------AAACA---A--TTGGCTTTGTATGATG---T--ATATTG-----ATACT-G-ACAC-ATAA------TATGTG-AAGGGAATGACAT---ATT-G-T--TGC-AAGTGT--ACATTCAAACTTc
gi|97069 : -GCTCCCAGAATGCATT-CCTGCA---T-----TT--GCTT-G---A-TATTT--GGG-A--GA--C--A--T--TATT--TAAG-TC--TTTCAAAT---------------TGCATT--A----TATACAATTGACCA-----TGTT-T-T--ACAC-CA---A------TATA--TTAC-ATACAC----TT-TG--ATAGC-TTTTTGGAC-CTGACATAAAAGT-ACAAAT---GAAC-TCTTGGT-AA--------TAAGACTAGCAACTTTGA-----ACTATGG--T--ACATGG-----GTACTGGTAAAT-ATGA------TATGTG-CAGGAAATAACAT---ATT-G-T--TGC-AAGAGT--A-GTTAATATTATAAGG--------A--CATTTA-------TCT-TTTTACAAAAA
gi|97070 : TCGTGGCATGCATTTGCTGCA---T-----TT--TTCT-G---A-TATTT--C---A--GA--C--A--T--T--T--------------CAAATCTATAACACAAA--CTGCATT--T----TATACAATTGCCTA-----T--T-T-TT-ACAC-TA---T------TATC--TTGA-ATGCAC----AT-TG--GTGAC-GTTTTAGAC-CCGACATAGCAGC-ACATAT---CAGC-TCTTAGT-AATAC-A-TGTAAGACAAGTA--TTTGCTAGATATTAAGA--T--ACATTC-----TTACT-GAAAAT-AGTA------TATGTG-AAAGATATGTCAT---ATT-T-T--TAC-AAGAGT--A-TTTCATATTTTGGGG------ATG--GCTTTA------TTGT-TTTT
gi|97071 : TCTTAGAATGCATT-CCTGCG---T-----TT--TTCT-G---A-TATTTGAA---A--GA--C--A--TAAT--G--TAAA-TCTTTTTTAAATCAATAACACTAG--GTACATttttaaaaaaac
gi|97072 : TGACATGCATTTCCTGCA---T-----TT--T-CT-A---A-TATTT--C---A--GA--C--A--T--T--T--TAAG-CC--GTCCAAATCTATAACACAAA--CTACATT--T----TACACAATTGACGA-----T--TCT-T--ACAC-TA---T------TATC--TTGA-ATACAC----TT-TG--GTCAC-TCTTTAGAC-CCGACAT-ATAGT-ACATAT---CAAC-TATTAGT-AATAC-ACTGCAAGACAGGTA--TTTCCTGGGT-----------------------ATACT-GCATAT-ATTA------TATGTG-AAGGATATGTCAT---ATT-T-T--TGA-AAGAGT--A-ATTCATATTTTGGGA------ATA--ACTTTA------TTAT-TTTTACAAAA
gi|97073 : ACGCATTTCCTGCA---T-----TT--TCCT-G---T-TATTT--C---A--GA--CCAA--T--T--G--TAAG--C--GCTTAAATC-A-GAC-CAAATTTTTCATTTAT----TATGTAATTA-TTA-----T--T-TGT--ACA
gi|97074 : TGCATTGC-TGCG---T-----TTATTTCT-G---G-TATTT--C---A--GAAAC--A--T--T--T--TAAG-CC--TTTCGTATCTATAACACAAA--CTGCAAT--T----TTTACAATTACCCA-----T--TGT-T--AAAA-TA-----------ACCCATTG--TTACACTAGTAT-TG--TTAGC-TTT-------------TAACAGT-ACATAT---TAA
gi|97074 : AGT-AATAC-ACTGTAAT-----TA--TTTGCTGGGTACTATGA--T--ACATTC-----ATACT-GAAAAT-ATTA------TATGCG-AAGGATATGTCAT---ATT-T-T--TGT-AAAAGT--A-ATTCATATTTTGGGG------ATA---ATTTT------TTCT-TATTACAAAAAtcgtgaaacatcgagtatttccgtatcctccgtataatgtttagcataaaggccgaggtaatcagattgagtaatacactgtaattatttgctgggtactatgatacattcatactgaaaatattatatgcgaaggatatgtcatatttttgtaaaagtaattcatattttggggataattttttcttattacaaaaac
gi|97075 : tgcattgctgcgtttatttctggtatttcagaaacattttaagcctttcgtatctataacacaaactgcaatttttacaattacccattgttaaaataacccattgttacactagtattgttagcttttaacagtacatattaatcgtgaaacatcgagtatttccgtatcctccgtataatgtttagcataaaggccgaggtaatcagattgTTCAAATCGATAACACTAA--TTGCATT--TCAGATATGCAATTGTC------------T-G--ACA--TG---T------T--T--TTGT-ATGCAT----GT-----GTAAC-ATTTAAGAC-CTGACATTTCAGT-ACATGT---CAGA-GCTTAGT-AATAC--------GAC---TA--TTGGCTTTGTACCATGG--TGTATATTG-----ATACT-GGAAAT-ATAA------TATGTG-CAGGAAATGACAT---ATT-G-T--TGC-AAGAAT--A-ATTGTTA-TTTGGGG------ATAATCATTTAATGGTCTTTTGTTTTACAAGAAc
gi|97076 : TTAGT-AATAC-ACTGTAAGACAAGTA--TTTGCTGGGTATTATGA--T--ACATTC-----ATACT-GTATAT-ATTA------TGTGTG------------------------------AAGAGT--A-ATTCAGATTTTGGAA------ATA--A--CTA------TTAT-TTTTACAAAAA
gi|97077 : ATAC-ACTGTAAGACAAGTA--TTTGCTGACTATTATAA--T--ACATTC-----ATACT-GAAT-T-ATTA------TATGTG-AAGGGTATGTCAT---ATT-T-T---GC-AAGAGT--A-ATTCATATTTTGGGG------ATA--ACTTTA------TTAT-TTTTACAAAAAc
Alignments
lowQualScore : 11 11111111 11
lowQualScore : 0 22 1 3 222 33333 11 1 1 222 1 666666 11 11 11 55 22 33 11 1 11 1 11 11 2222 33333333 3 3 00 1 5555555555 11 1 2222 1 11 1 1 1 222 1 1 1 33 22 0 33 22 55555 1 4 1 1 444444 1 0 222 1 1 22 1 22 1 7777777777 666666 1 1
lowQualScore : . .. . . ... ..... .. . . ... . ...... .. .. .. .. .. .. .. . .. . .. .. .... ........ . . .. . .......... .. . .... . .. . . . ... . . . .. .. . .. .. ..... . . . . ...... . . ... . . .. . .. . .......... ...... . .
lowQualScore : 3 22 4 6 111 00000 77 4 2 111 2 888888 77 22 77 88 99 33 77 2 77 1 66 77 6666 77777777 6 6 55 3 3333333333 88 3 8888 3 88 4 4 4 555 5 4 4 11 00 3 99 00 55555 5 5 5 5 444444 5 7 777 5 5 11 5 33 7 5555555555 777777 6 7
consensus : CGAAAAGA--TATTTA-GCTCCTGGCATGCATTTCCTGCG---T-----TT--TTCT-G---A-TATTT--C---A--GA--C--A--T--T--T--TAAG-CC--GTTCAAATCTATAACACAAA--CTGCATT--T----TATACAATTGCCCA-----T--T-T-T--ACAC-TA---T------TATC--TTGA-ATACAC----AT-TG--GTGGC-TTTTTAGAC-CCGACATAACAGT-ACATAT---CAAC-TCTTAGT-AATAC-ACTGTAAGACAAGTA--TTTGCTGGGTATTATGA--T--ACATTC-----ATACT-GNANAT-ATTA------TATGTG-AAGGATATGTCAT---ATT-T-T--TGC-AAGAGT--A-ATTCATATTTTGGGGATAAC--T-T-----TA------TTNT-TTTTACAAAAA
Reference ( family-584 ) : CGAAAAGA--TATTTA-GCTCCTGGCATGCATTTCCTGCG---T-----TT--TTCT-G---A-TATTT--C---A--GA--C--A--T--T--T--TAAG-CC--GTTCAAATCTATAACACAAA--CTGCATT--T----TATACAATTGCCCA-----T--T-T-T--ACAC-TA---T------TATC--TTGA-ATACAC----AT-TG--GTGGC-TTTTTAGAC-CCGACATAACAGT-ACATAT---CAAC-TCTTAGT-AATAC-ACTGTAAGACAAGTA--TTTGCTGGGTATTATGA--T--ACATTC-----ATACT-GNANAT-ATTA------TATGTG-AAGGATATGTCAT---ATT-T-T--TGC-AAGAGT--A-ATTCATATTTTGGGGATAAC--T-T-----TA------TTNT-TTTTACAAAAA
gi|97042 : CGAAATGA--TATTTA-GCTCGTGGCATGCATTTCCTGCA---T-----TT--TTCT-A---A-TATTT--C---A--GA--C--A--T--T--T--TAAG-CC--GTTAAAATCTATAACACAAA--CTGCATT--T----TATACAATTGCCCA-----T--T-T-TT-ACAC-TA---T------TATC--TTGGTATACAC----AT-TG--ATGGC-TTTTTAGAC-CCGACATAACAGT-ACATAT---CAAC-TCTTAGT-AATAC-ACTGTAAAACAAGTA--TTTGCTGGGTATTATGA--T--ACATTC-----ATATT-GCATAT-ATTATACGAGTATGTG-AATGATATGTCAT----TT-T-T--T-C-AAGAGT--A-ATTCATGTTTTGGGAATAAC--T-T-----TA------TTCT-TTTTACAAAA
gi|97043 : CGAAAATA--TGTTTA-GCTTGAGGCATGCATTTCCTACA---T-----TT--TTTT-G---A-TTTTT--C---A--GG--C--A--T--T--T--TGAG-AC--GTTAAAATCTATAACACAAA--CTGCATT--T----TATACAATTGCCCT-----T--T-T-TT-ACAC-TA---T------TATC--TTGA-ATACAC----AT-TG--GTGGC-TTTTTAGAC-CCGACATAACGGT-ACATAT---CAAC-TCTTAAT-AATAC-ACTGTAAGACAAGTA--TTTGCTGGGTATTATGA--T--ACATTC-----ATACT-GCATAT-ATTA------TATGTG-AAGGATATGTCAT---G---T-T--TGC-AAGAGT--A-ATTCATATTTTTGGGATAAT--T-T-----TA------TTCT-TTTTACAAAA
gi|97044 : CGAACAGA--TATTTA-GCTCGTGGCATGCATATCCTGCA---T-----TT--TTCT-G---A-TATTT--C---A--GA--C--A--T--T--T--TAAG-CG--GTTCAAATCTATAACACAAA--CTACATT--T----TATACAACTGCCCA-----T--T-T-T--ACAC-TA---T------TATC--TTGA-ATACAC----AT-TG--GTGGC-TTTTTATAA-CCGACATAACAGT-ACATAT---CACC-TCTTAGC-AAAAC-ACTGTAAGACAAGTA--TTTGCTGGGTATTATGA--T--ACATTC-----ATACT-GCATAT-ATTA------TATGTG-AAGGACATGTCAT---ATT-T-T--TGC-AAGAGT--A-ATTCATATTTTGGAAATATA--T-T-----CAT-----TTTT-TTTTACAAAAA
gi|97045 : CGAAAATA--TATTTA-GC-------AAGCATTTTCTGCA---T-----TT--TTCT-G---A-TATTT--C---A--GA--C--A--T--T--T--TAAG-CT--GTTCAAATATATAACACAAA--CTACATT--T----TATACAATTGTCCA-----T--T-TGT--ACAC-TA---T------TATC--TTGA-ATACAC----AT-TG--GTGGC-TTTTTAGAC-CCGTCATAACAGT-AAATAT---CAAT-TCTTAGT-AATAC-ACCGTAAGGCAAGTA--TTTGCTAGGCATTATGA--T--GCATTC-----ATACT-GCATAT-ATTA------TATGTG-AAGGATATGTCAT---ATT-T-T--TGC-AAGAGT--A-ATTCATATTTTGGGAATAAC----------TA------TTAC-TTTCACAAAAA
gi|97046 : CGAAAAGA--TATTTA-ACTCGTGGCATGTATTT-------------------TTCC-G---A-TATTT--C---A--GC--C--A--T--T--T--TAAG-CC--GTTCAAATCTATAACACAAA--CTGCTTT--T----TATATAATTGCCCA-----T--T-T-TT-ACAC-TA---T------TATC--TTGA-ATACAT----AT-TG--GTGGA-TTTTTAGGC-CAGACATAGCAGT-TCAAA----CAAC-TCTTAGT-AATAC-ACTGTAAGACAGGTA--TTTGCTGGGTATTATGA--T--ACATTC-----ATACT-GCATAT-ATTT------TATGTG-AATGATATGTCAT---ATG-T-T--TGC-AAGAGT--T-ATCCATATTTTGGGGATAAC--T-T-----TA------TTCG-TTTTACAAAAc
gi|97047 : CAAAAACA--TATT-A-ACTCCTGGCATGCATTTCCTGCG---T-----TT--T--T-G---A-TGTTT--CAG-A--GA--C--A--T--G--T--TAAG-CC--GTTCAAA-CTATAACACAAA--CTGCATT--T----TATACAATTACCCAT----T--T-T-T--ACAC-TT---T------TATC--TTGA-ATATAC----AT-CG--GTAGC-TTTTTAGAC-CCGACATAACGGT-ACATAT---CAAC-TCTTAGT-AATAC-ACTGTAAGACAAGTT--TTTGCTGGGTATTATGA--T--ACATTT-----ATACC-TAAAAT-AGTA------TATATG-AAAGATATGTCAT---ATT-T-T--TGC-AAGAGC--A-ATTCATTTTTTGGGGATAAC--T-T-----TA------TTAT-TTCTACAAAAA
gi|97048 : CGAACGGA--TATTAA-GCTTGTGGCATGTATTACCTGCA---T-----TG--TTCT-G---A-TATTT--T---A--GAGAC--A--T--T--T--TAAG-CT--GTTCAAATCTATAACACAAA--CTGCATT--T----TATACAATTGCCCA-----T--T-T-TT-ACAA-TA---G------CATC--TTTA-ATACAC----AT-TG--GTG-C-T-----GAC-CCGACATAACAGT-ACATAT---CAAC-TCTTTGT-AATAC-ACTGTAAGACAAGTA--TTTGCTGGGTATTATGA--A--ACATTCCGATGATACT-GCATAT-ATTA------TATGTG-AAGGATATGTCAT---ATT-T-T--TGC-AATAGC--A-CTTCATATTTTGGCGATAAC--T-T-----TA------TCGT-TTTTACAAAAAc
gi|97049 : CGAGAAGA--CATTAA-GCTCGTGGCATGCATTTCCTTCA---T-----TT--TTCT-G---T-TATTT--C---A--GA--T--A--T--T--T--TAAG-CC--GTTTAAATCTATAACACAAA--CTACATT--T----TACACAATTGCCCA-----T--TGT-T--ACAC-TC---T------TACC--TTGA-ATACAT----AA-TT--GTGGC-TTTTTAGAC-CCGACATAACAGT-ACATAT----AACTTCTTAAT-AATAC-ACTGTAAGACAAGTA----AACAAG---TTACGA--T--ACATTC-----ATACT-GTATAT-ATTA------TATGTG-ACAGATATGTCAT---GTT-T-T--TGC-GAGAGT--A-ATTAATATTTTGGGAATAAC----------TA------TTAC-TTTTACAAAAAc
gi|97050 : CGAAAAGA--TATTCA-ACTCGTGGCATGCATTTCCTGCA---T-----TT--TTCT-G---A-TATTT--C---A--GA--C--A--T--T--T--TAAG-CT--GTTCAAATCTATAACACAAA--CTACATT--T----TATACAATTGCCAA-----T--T-T-TTTACAC-TA---T------AATC--TTGA-ATACAC----AT-TA--ATGGC-ATTTTAGAC-CCGGCATAAAAGT-ACATAT---CAAC-GCTTAGA-AATAC-ACTGTTAGACAAGTA--TTTGCTGGGTATTATGA--T--ACATTC-----ATACT-c
gi|97051 : CGAAAAGA--TATTTA-GCCTGTGGCATGCATTTTCTGCA---T-----TT--TTCT-G---A-TATTT--C---A--GG--C--A--T--T--T--TAAG-CC--GTTCAAATATATAACACAAA--CTACATT--T----TATACAATTGCCCCT----T--T-T-T--ACAC-TT---T------AATC--TTGA-ATACAC----AT-TG--GTGAC-TTTTTAGAC-CCGACATAACAGT-GCATAT---CAAT-TCTTAGT-
gi|97052 : CGAAAA-A--TATTTA-GCTCCTGGCATGCATTTCCGGCA---T-----TT--T-CT-G---A-TATTTAAC---A--GA--T--A--T--T--T--TAAG-CC--ATTCAAATCTATAACACAAA--CTGCGTT--G----TATACAATTACCAATT---T--T-T-T--ACAC-TT---T------TACC--TTGA-ATATAC----AT-CG--GTGGCTTTTTTAGAC-CCGACGTAACAGT-ACATAT---CAAC-TC--AGT-AATTC-ACTGCCAGAAAATTA--TTTTCTGGGTATCATGA--T--ACATTC-----AT
gi|97053 : CGAAAAGA--TATTTA-GTTCGTGGCATGCATTTCCTGCA---T-----TT--TTC-------------------A--GA--C--A--T--T--T--TAAG-CC--GTTCAAATCTATAACACAAA--CTATATT--T----GATACAATTGCCCAT----T--T-T-T--ACAC-TA---T------TATC--TTGA-ATACAC----AT-TG--GTG---TTTTTAGAC-CCGACATAACAGT-TCATAT---CA
gi|97054 : CGACAAGA--TATTTA-GCTCGTGTTATGCATTTCCTGCA---T-----TT--TTTC-G---GCTATTT--C---A--GA--C--A--T--T--T--TAAG-CC--GTTCAAATCTATAACACAAA--CTGTATT--T----TATACAAATGCCTAT----T--T-T-T--ACGC-TA---T------TATC--TTGA-ATACAC----AT-TG--
gi|97055 : CGAAAAAC--T-CTGA-GCTC-TAGAATGTATTTTCTGTG---T-----TT--TTTT-G---A-TATCC--G---A--GA--T--AAAT--G--C--TAAG-CC--TTTCAAA---ATGATAAAAT--C----------------ACAGTTTCCCT-----TGAT-T-T--ACAC-CA---C------TATC--TTGA-ATATAC----AT-TG--GTAGC---------C-CCGACGTAATTGTTACATAT---CAAC-TCTTAGTTGATCT-AATA-AAAATAA-TG--TTTTTT---TATTAGGA--T--ATATAA-----GGACT-GAAAAT-ATGA------TATGTG-AAGGATACGGTATGACATT-T-TGTTGC-AAGAGC--A-ATTCATATTTTGGCGATAAC--TATATATATA------TTTT-TTTTTCAAAAA
gi|97056 : CGAACAGA--TATTTA-GCACGTGGCATGCATTTCCTGTA---T-----TT--T-CT-G---A-TATTT--C---A--GA--T--A--T--T--T--TAAG-CC--GTTCAAACCTATTAAAAAAA--CTACATT--T----TACACAGTTGTCCA-----A--T-T-c
gi|97057 : GAAAAAT--TATTTA-GCTCCTGGCATGCATTTCCCGCG---T-----TT--TTCT-G---A-TATTT--C---ACAGA--C--A--T--T--T--TAAG-CC--GTTCAAATCTATAACACAAA--CTGCATT--T----AATACAATTACCCA-----T--T-G-T-------------------------TT-------AC----AT-TG--GTAGC-ATTTTTGAC-CCGACATTACTGT-ACATAG---AAAC-TTTAAGT-AAGAC-ACTGTAAGACATGTA--TTTGCTGGGTATTATGA--T--ACATTC-----ATACA-GAAAAT-ATTA------TATGTG-AAGGATATGTCAT---ATTAT-T--TGG-CATAGT--A-ATTCATATTTTAGGGATAAC-----------------------TTTTACAAAAA
gi|97058 : GAAAAAA--TATTTT-GCTCCGAGCTTGCATTTTCTGCGGTTC-----TT--TTCT-G---A-CATTT--C---A--GAGAC--A--T--A--A--TAAG-CC--GTTAAAGTATATAACACAAA--CTGCATT--T----TATAAAATTTCCCG-----T--T-T-TT-ACAC-TA---TAAGATATATC--TTGG-ATACAC----AA-AT--GTCGC-CTTGTAGAC-TTGACAT----------------CAAC-GCATAGT-AATAC-TCTGTAAGACAAGTA--TTAGCTGGGTATTATGA--T--ATATTC-----ATAC-------T-ATTA------TAAGTG-ATGAATAGGTCAT---ACT-T-T--TGC-TAGAGT--A-TTTCATTTTTTTGGTATAAC--T-T-----TA------TTAT-TTCTACAAAAc
gi|97059 : GAAGAGAAATATTTA-GCTCCCACAATGCATTTATTGCG---A-----CT--TCCT-G---A-TATCT--G---A--GAGAC--A--TG-T--T--TAAG-CC--TTTCAAATCGATAAATCATA--CTGAATT--T----CACACAATTGCCCATG---T--T-T-T--ACAC-CA---A------TATT--TTGA-ATACAC----ATGTGAAGTG-----TTTAGAT-CTGACATATCAGT-ACACAT---CTAT-TCTTAGT-AA--------TAAAAC---TA--TCAGCGTTGTACTATGATGT--ATATTG-----ATAGT-GCAAAT-A--A---------GTG-CAGGAAATGATAA---ATT-TGT--TGC-AAG
gi|97060 : AAAAAA--CAATTA-GCTCCAGTCATGCATTTCATGAG---T-----TT--TTCT-G---A-TATTT--C---A--GA--G--AC-T--T--T--TAAGGCC--GTTCAAATCTATAACTGAAG--CTGCATT--T----GATACAATTACCCA-----C--T-C-G--TCAC-TG---T------TTTC--TTGA-ATACAT----AT-TG--GTAGC-TTTTTAGACATCGGCATAACAGT-ACATAT---CAAC-TCTTAGT-AATAC-ACTGTAAGACAAGTA--TTTGCTGAGTATTACGA--T--ACATTC-----ATAAT-GAAAAT-ATTG------TATGGG-AAGGATATGTCAT---ATT-T-T--TCC-AAGAGT--G-ATTCATATTTTGGGGAAAAC----G-----TA------TTCT-TTTTATAAAAA
gi|97061 : AAAAAA--TATTAA-TCTTCTGGAATATATTTCCTGTG---T-----TT--T-CT-G---A-TATTT--C---A--GAGAC--A--A--T--T--TAAG-CC--GTTCAAATCTATAACACAGA--CTGCAGT--T----TATGCACTTACCCA-----T--T-T-TT-ACAC-TT---T------TATC--TTGT-ATACGG----AT-TG--ATGGC-TTTT-AGAC-GGGACTTAACAGT-ACATATTATCAAC-TCTTAGT-AATAC-ACTGAAAGACAAGTA--TTTGCTAGGTATTATGA--T--ACATTC-----ATACT-GAAAAT-ATTA------ATTGTA-AGGGATATGTCAT---ATT-T-T--T-C-AAGAGT--A-ATTCATATTTTGAGGATAAC--T-T-----TA------TGA--TTTTACAAAA
gi|97062 : AAAAAA--TATTTAAGCCCCTCGAATGCATTTCCTGTG---T-----TT--TGCT-G---G-TATCC--G---A--GATAC--A--T--T--T--TGAG-CC--TTTCAGATCGATAAAATCAA--CTGCAGT--T----TATACAGTCGCCCA-----TGAT-T-T--ACAC-TA---
gi|97063 : AAAGA--AAAATA-GCTTCTAGAATGCATTCCCTGCG---G-----TT--TCCT-G---A--A-------------------A--T--G--T--TACG-CC--TTTCAAATCGGTAACAT-AA--CTGCATT--T----TATATG--TGTCTA-----TGGT-T-T--ACAC------C------TAT--------ATA-AC----AA-TG--GTAG--TTTTTAGAC-ACAACATATCAGT-ATACAC---CAAA-ACTTGGC-AA--------TAAGAC---TG--CTTGCTTTGTACTGTGA--T--ATATTTTG---ATACT-GGACAT-A-TA------TA---------------CAT---ATT-G-T--TGC-AAGAGT--A-ATTCATATTTTGCGGATAAC--T-A-----TC------TTTG-TTTTACAACAAaaat
gi|97064 : AAAA--TAATTA-GCTCCCACAATGCATTTATTGCG---G-----TT--TCCT-G---A-TATCT--G---A--GA--C--A--T--TTGT--TAAT-CC--TTTCAAACCGATAACTCATA--CTGAATT--T----TACACAAATGTTCA-----TGGC-T-T--ACAC-CAATTC------TATG--TTGA-ATACAC----AT--------GC-TTTCTAAAC-ATGGCATAAAAGT-ACACAT---CA-------AG-----AC-ACAATAAAAC---TA--TTAGCTCTGTACTGTAATGT--ATGTTG-----ATAGT-AGAA------A------TATGTG-CAAGAAATG--AC---ATT-G-T--TGC-AAG
gi|97065 : A--TATTTA-GCTCCTAGCATACATTTCCTA-G---T-----TT--TTCCAG---A-TATTT--C---A--GA--C--ACAT--T--G--TAAG-GC--ATCCAAATCAATAACACGGA--CTGCATT--T----TACAGAGTTGCCTA-----TG-T-TAT--ACAC-CA---T------TATC--TTGA-ATACAC----AC-TG--ATAGT-TTTTTAGAA-CTGACATAATTGT-ACATAT---CAAC-TC---GT-AATATGACTATTA-AC--GTC--TTT-----GTATTATGA--T--ACAGTG-----AGACT-G-AAATGATGA------TATGTGAAAGGATATGTCAT---AGT-T-T--TGCTATGAGTGCA-ATTCATATTTTGGAGATAAC--T-T-----TG------TTAT-TTTTACAAAAA
gi|97066 : A--TTTTTA-GGTCCTTGAAAGTATTTCCTGCA---T-----TT--TTCT-G---T-TATTT--C---A--GAC-C--AT-T--T--T--TAAG--T--GTTTAAAGC-A-AAAGCAAA--CCTT-TT--T----TATGTTATTGT--------T--T-T-T--GCGCAAA---A------TA------GA-ATACA-----AT-TG--c
gi|97067 : TTTA-GCTCCTGGCATGCATT-CCTGCG---TGTTTTTT--TTTT-GTGTG-TGTTT----------------------T--T--T---------TTTATATTT----CAGAGA--C---ATT--T----TAAGCCGTT-CAAA-----T--T-T-T--ACGC-TA---T------TAT---------------------TG--GAAGC-TTTTTAGAC-CCGACTCAACAGT-ACATAT---CAAC-TTTTAGT-AATAC-ACTGTAAG-----TA--TTTGCTGGGTATTATGA--T--ACATTC-----ATACT-GAAAAT-ATTA------TATGTG-AAGGACAAGACAA---ATT-T-T--TGC-CAGAGT--A-ATTCATATTTTGGGGATATT--T-T-----TT------TTCT-TATTTCAAAAA
gi|97068 : TTTA-GCTCTCAAAATGCATTTCCTGTG---G-----TT--TTCT-G---A-TATC---CGAGA--GA--C--A--C--T--TGTTACG-CC--TTTCAAATCAAAAACACTAA--CTGCGTT--T----TAAATAATTGTCCAACATGT--T-T-T--ACAC-CA---A------TATA--TTAA-ATATAC----GT-T---GTAGC-TTTTTAGAC-CTGACAT-----T------T---CAGC-TCGTAGT-AAT---------AAACA---A--TTGGCTTTGTATGATG---T--ATATTG-----ATACT-G-ACAC-ATAA------TATGTG-AAGGGAATGACAT---ATT-G-T--TGC-AAGTGT--ACATTCAAACTTc
gi|97069 : -GCTCCCAGAATGCATT-CCTGCA---T-----TT--GCTT-G---A-TATTT--GGG-A--GA--C--A--T--TATT--TAAG-TC--TTTCAAAT---------------TGCATT--A----TATACAATTGACCA-----TGTT-T-T--ACAC-CA---A------TATA--TTAC-ATACAC----TT-TG--ATAGC-TTTTTGGAC-CTGACATAAAAGT-ACAAAT---GAAC-TCTTGGT-AA--------TAAGACTAGCAACTTTGA-----ACTATGG--T--ACATGG-----GTACTGGTAAAT-ATGA------TATGTG-CAGGAAATAACAT---ATT-G-T--TGC-AAGAGT--A-GTTAATATTATAAGGACA----T-T-----TA-------TCT-TTTTACAAAAA
gi|97070 : TCGTGGCATGCATTTGCTGCA---T-----TT--TTCT-G---A-TATTT--C---A--GA--C--A--T--T--T--------------CAAATCTATAACACAAA--CTGCATT--T----TATACAATTGCCTA-----T--T-T-TT-ACAC-TA---T------TATC--TTGA-ATGCAC----AT-TG--GTGAC-GTTTTAGAC-CCGACATAGCAGC-ACATAT---CAGC-TCTTAGT-AATAC-A-TGTAAGACAAGTA--TTTGCTAGATATTAAGA--T--ACATTC-----TTACT-GAAAAT-AGTA------TATGTG-AAAGATATGTCAT---ATT-T-T--TAC-AAGAGT--A-TTTCATATTTTGGGGATGGC--T-T-----TA------TTGT-TTTT
gi|97071 : TCTTAGAATGCATT-CCTGCG---T-----TT--TTCT-G---A-TATTTGAA---A--GA--C--A--TAAT--G--TAAA-TCTTTTTTAAATCAATAACACTAG--GTACATttttaaaaaaac
gi|97072 : TGACATGCATTTCCTGCA---T-----TT--T-CT-A---A-TATTT--C---A--GA--C--A--T--T--T--TAAG-CC--GTCCAAATCTATAACACAAA--CTACATT--T----TACACAATTGACGA-----T--TCT-T--ACAC-TA---T------TATC--TTGA-ATACAC----TT-TG--GTCAC-TCTTTAGAC-CCGACAT-ATAGT-ACATAT---CAAC-TATTAGT-AATAC-ACTGCAAGACAGGTA--TTTCCTGGGT-----------------------ATACT-GCATAT-ATTA------TATGTG-AAGGATATGTCAT---ATT-T-T--TGA-AAGAGT--A-ATTCATATTTTGGGAATAAC--T-T-----TA------TTAT-TTTTACAAAA
gi|97073 : ACGCATTTCCTGCA---T-----TT--TCCT-G---T-TATTT--C---A--GA--CCAA--T--T--G--TAAG--C--GCTTAAATC-A-GAC-CAAATTTTTCATTTAT----TATGTAATTA-TTA-----T--T-TGT--ACA
gi|97074 : TGCATTGC-TGCG---T-----TTATTTCT-G---G-TATTT--C---A--GAAAC--A--T--T--T--TAAG-CC--TTTCGTATCTATAACACAAA--CTGCAAT--T----TTTACAATTACCCA-----T--TGT-T--AAAA-TA-----------ACCCATTG--TTACACTAGTAT-TG--TTAGC-TTT-------------TAACAGT-ACATAT---TAA
gi|97074 : AGT-AATAC-ACTGTAAT-----TA--TTTGCTGGGTACTATGA--T--ACATTC-----ATACT-GAAAAT-ATTA------TATGCG-AAGGATATGTCAT---ATT-T-T--TGT-AAAAGT--A-ATTCATATTTTGGGGATAAT--T-T-----T-------TTCT-TATTACAAAAAtcgtgaaacatcgagtatttccgtatcctccgtataatgtttagcataaaggccgaggtaatcagattgagtaatacactgtaattatttgctgggtactatgatacattcatactgaaaatattatatgcgaaggatatgtcatatttttgtaaaagtaattcatattttggggataattttttcttattacaaaaac
gi|97075 : tgcattgctgcgtttatttctggtatttcagaaacattttaagcctttcgtatctataacacaaactgcaatttttacaattacccattgttaaaataacccattgttacactagtattgttagcttttaacagtacatattaatcgtgaaacatcgagtatttccgtatcctccgtataatgtttagcataaaggccgaggtaatcagattgTTCAAATCGATAACACTAA--TTGCATT--TCAGATATGCAATTGTC------------T-G--ACA--TG---T------T--T--TTGT-ATGCAT----GT-----GTAAC-ATTTAAGAC-CTGACATTTCAGT-ACATGT---CAGA-GCTTAGT-AATAC--------GAC---TA--TTGGCTTTGTACCATGG--TGTATATTG-----ATACT-GGAAAT-ATAA------TATGTG-CAGGAAATGACAT---ATT-G-T--TGC-AAGAAT--A-ATTGTTA-TTTGGGGATAATCAT-T-----TAATGGTCTTTTGTTTTACAAGAAc
gi|97076 : TTAGT-AATAC-ACTGTAAGACAAGTA--TTTGCTGGGTATTATGA--T--ACATTC-----ATACT-GTATAT-ATTA------TGTGTG------------------------------AAGAGT--A-ATTCAGATTTTGGAAATAAC----------TA------TTAT-TTTTACAAAAA
gi|97077 : ATAC-ACTGTAAGACAAGTA--TTTGCTGACTATTATAA--T--ACATTC-----ATACT-GAAT-T-ATTA------TATGTG-AAGGGTATGTCAT---ATT-T-T---GC-AAGAGT--A-ATTCATATTTTGGGGATAAC--T-T-----TA------TTAT-TTTTACAAAAAc
Alignments
lowQualScore : 11 11111111 11
lowQualScore : 0 22 1 3 222 33333 11 1 1 222 1 666666 11 11 11 55 22 33 11 1 11 1 11 11 2222 33333333 3 3 00 1 5555555555 11 1 2222 1 11 1 1 1 222 1 1 1 33 22 0 33 22 55555 1 4 1 1 444444 1 0 222 1 1 22 1 22 1 7777777777 666666 1 1
lowQualScore : . .. . . ... ..... .. . . ... . ...... .. .. .. .. .. .. .. . .. . .. .. .... ........ . . .. . .......... .. . .... . .. . . . ... . . . .. .. . .. .. ..... . . . . ...... . . ... . . .. . .. . .......... ...... . .
lowQualScore : 3 22 4 6 111 00000 77 4 2 111 2 888888 77 22 77 88 99 33 77 2 77 1 66 77 6666 77777777 6 6 55 3 3333333333 88 3 8888 3 88 4 4 4 555 5 4 4 11 00 3 99 00 55555 5 5 5 5 444444 5 7 777 5 5 11 5 33 7 5555555555 777777 6 7
consensus : CGAAAAGA--TATTTA-GCTCCTGGCATGCATTTCCTGCG---T-----TT--TTCT-G---A-TATTT--C---A--GA--C--A--T--T--T--TAAG-CC--GTTCAAATCTATAACACAAA--CTGCATT--T----TATACAATTGCCCA-----T--T-T-T--ACAC-TA---T------TATC--TTGA-ATACAC----AT-TG--GTGGC-TTTTTAGAC-CCGACATAACAGT-ACATAT---CAAC-TCTTAGT-AATAC-ACTGTAAGACAAGTA--TTTGCTGGGTATTATGA--T--ACATTC-----ATACT-GNANAT-ATTA------TATGTG-AAGGATATGTCAT---ATT-T-T--TGC-AAGAGT--A-ATTCATATTTTGGGGATAAC--T-T-----TA------TTNT-TTTTACAAAAA
Reference ( family-584 ) : CGAAAAGA--TATTTA-GCTCCTGGCATGCATTTCCTGCG---T-----TT--TTCT-G---A-TATTT--C---A--GA--C--A--T--T--T--TAAG-CC--GTTCAAATCTATAACACAAA--CTGCATT--T----TATACAATTGCCCA-----T--T-T-T--ACAC-TA---T------TATC--TTGA-ATACAC----AT-TG--GTGGC-TTTTTAGAC-CCGACATAACAGT-ACATAT---CAAC-TCTTAGT-AATAC-ACTGTAAGACAAGTA--TTTGCTGGGTATTATGA--T--ACATTC-----ATACT-GNANAT-ATTA------TATGTG-AAGGATATGTCAT---ATT-T-T--TGC-AAGAGT--A-ATTCATATTTTGGGGATAAC--T-T-----TA------TTNT-TTTTACAAAAA
gi|97042 : CGAAATGA--TATTTA-GCTCGTGGCATGCATTTCCTGCA---T-----TT--TTCT-A---A-TATTT--C---A--GA--C--A--T--T--T--TAAG-CC--GTTAAAATCTATAACACAAA--CTGCATT--T----TATACAATTGCCCA-----T--T-T-TT-ACAC-TA---T------TATC--TTGGTATACAC----AT-TG--ATGGC-TTTTTAGAC-CCGACATAACAGT-ACATAT---CAAC-TCTTAGT-AATAC-ACTGTAAAACAAGTA--TTTGCTGGGTATTATGA--T--ACATTC-----ATATT-GCATAT-ATTATACGAGTATGTG-AATGATATGTCAT----TT-T-T--T-C-AAGAGT--A-ATTCATGTTTTGGGAATAAC--T-T-----TA------TTCT-TTTTACAAAA
gi|97043 : CGAAAATA--TGTTTA-GCTTGAGGCATGCATTTCCTACA---T-----TT--TTTT-G---A-TTTTT--C---A--GG--C--A--T--T--T--TGAG-AC--GTTAAAATCTATAACACAAA--CTGCATT--T----TATACAATTGCCCT-----T--T-T-TT-ACAC-TA---T------TATC--TTGA-ATACAC----AT-TG--GTGGC-TTTTTAGAC-CCGACATAACGGT-ACATAT---CAAC-TCTTAAT-AATAC-ACTGTAAGACAAGTA--TTTGCTGGGTATTATGA--T--ACATTC-----ATACT-GCATAT-ATTA------TATGTG-AAGGATATGTCAT---G---T-T--TGC-AAGAGT--A-ATTCATATTTTTGGGATAAT--T-T-----TA------TTCT-TTTTACAAAA
gi|97044 : CGAACAGA--TATTTA-GCTCGTGGCATGCATATCCTGCA---T-----TT--TTCT-G---A-TATTT--C---A--GA--C--A--T--T--T--TAAG-CG--GTTCAAATCTATAACACAAA--CTACATT--T----TATACAACTGCCCA-----T--T-T-T--ACAC-TA---T------TATC--TTGA-ATACAC----AT-TG--GTGGC-TTTTTATAA-CCGACATAACAGT-ACATAT---CACC-TCTTAGC-AAAAC-ACTGTAAGACAAGTA--TTTGCTGGGTATTATGA--T--ACATTC-----ATACT-GCATAT-ATTA------TATGTG-AAGGACATGTCAT---ATT-T-T--TGC-AAGAGT--A-ATTCATATTTTGGAAATATA--T-T-----CAT-----TTTT-TTTTACAAAAA
gi|97045 : CGAAAATA--TATTTA-GC-------AAGCATTTTCTGCA---T-----TT--TTCT-G---A-TATTT--C---A--GA--C--A--T--T--T--TAAG-CT--GTTCAAATATATAACACAAA--CTACATT--T----TATACAATTGTCCA-----T--T-TGT--ACAC-TA---T------TATC--TTGA-ATACAC----AT-TG--GTGGC-TTTTTAGAC-CCGTCATAACAGT-AAATAT---CAAT-TCTTAGT-AATAC-ACCGTAAGGCAAGTA--TTTGCTAGGCATTATGA--T--GCATTC-----ATACT-GCATAT-ATTA------TATGTG-AAGGATATGTCAT---ATT-T-T--TGC-AAGAGT--A-ATTCATATTTTGGGAATAAC----------TA------TTAC-TTTCACAAAAA
gi|97046 : CGAAAAGA--TATTTA-ACTCGTGGCATGTATTT-------------------TTCC-G---A-TATTT--C---A--GC--C--A--T--T--T--TAAG-CC--GTTCAAATCTATAACACAAA--CTGCTTT--T----TATATAATTGCCCA-----T--T-T-TT-ACAC-TA---T------TATC--TTGA-ATACAT----AT-TG--GTGGA-TTTTTAGGC-CAGACATAGCAGT-TCAAA----CAAC-TCTTAGT-AATAC-ACTGTAAGACAGGTA--TTTGCTGGGTATTATGA--T--ACATTC-----ATACT-GCATAT-ATTT------TATGTG-AATGATATGTCAT---ATG-T-T--TGC-AAGAGT--T-ATCCATATTTTGGGGATAAC--T-T-----TA------TTCG-TTTTACAAAAc
gi|97047 : CAAAAACA--TATT-A-ACTCCTGGCATGCATTTCCTGCG---T-----TT--T--T-G---A-TGTTT--CAG-A--GA--C--A--T--G--T--TAAG-CC--GTTCAAA-CTATAACACAAA--CTGCATT--T----TATACAATTACCCAT----T--T-T-T--ACAC-TT---T------TATC--TTGA-ATATAC----AT-CG--GTAGC-TTTTTAGAC-CCGACATAACGGT-ACATAT---CAAC-TCTTAGT-AATAC-ACTGTAAGACAAGTT--TTTGCTGGGTATTATGA--T--ACATTT-----ATACC-TAAAAT-AGTA------TATATG-AAAGATATGTCAT---ATT-T-T--TGC-AAGAGC--A-ATTCATTTTTTGGGGATAAC--T-T-----TA------TTAT-TTCTACAAAAA
gi|97048 : CGAACGGA--TATTAA-GCTTGTGGCATGTATTACCTGCA---T-----TG--TTCT-G---A-TATTT--T---A--GAGAC--A--T--T--T--TAAG-CT--GTTCAAATCTATAACACAAA--CTGCATT--T----TATACAATTGCCCA-----T--T-T-TT-ACAA-TA---G------CATC--TTTA-ATACAC----AT-TG--GTG-C-T-----GAC-CCGACATAACAGT-ACATAT---CAAC-TCTTTGT-AATAC-ACTGTAAGACAAGTA--TTTGCTGGGTATTATGA--A--ACATTCCGATGATACT-GCATAT-ATTA------TATGTG-AAGGATATGTCAT---ATT-T-T--TGC-AATAGC--A-CTTCATATTTTGGCGATAAC--T-T-----TA------TCGT-TTTTACAAAAAc
gi|97049 : CGAGAAGA--CATTAA-GCTCGTGGCATGCATTTCCTTCA---T-----TT--TTCT-G---T-TATTT--C---A--GA--T--A--T--T--T--TAAG-CC--GTTTAAATCTATAACACAAA--CTACATT--T----TACACAATTGCCCA-----T--TGT-T--ACAC-TC---T------TACC--TTGA-ATACAT----AA-TT--GTGGC-TTTTTAGAC-CCGACATAACAGT-ACATAT----AACTTCTTAAT-AATAC-ACTGTAAGACAAGTA----AACAAG---TTACGA--T--ACATTC-----ATACT-GTATAT-ATTA------TATGTG-ACAGATATGTCAT---GTT-T-T--TGC-GAGAGT--A-ATTAATATTTTGGGAATAAC----------TA------TTAC-TTTTACAAAAAc
gi|97050 : CGAAAAGA--TATTCA-ACTCGTGGCATGCATTTCCTGCA---T-----TT--TTCT-G---A-TATTT--C---A--GA--C--A--T--T--T--TAAG-CT--GTTCAAATCTATAACACAAA--CTACATT--T----TATACAATTGCCAA-----T--T-T-TTTACAC-TA---T------AATC--TTGA-ATACAC----AT-TA--ATGGC-ATTTTAGAC-CCGGCATAAAAGT-ACATAT---CAAC-GCTTAGA-AATAC-ACTGTTAGACAAGTA--TTTGCTGGGTATTATGA--T--ACATTC-----ATACT-c
gi|97051 : CGAAAAGA--TATTTA-GCCTGTGGCATGCATTTTCTGCA---T-----TT--TTCT-G---A-TATTT--C---A--GG--C--A--T--T--T--TAAG-CC--GTTCAAATATATAACACAAA--CTACATT--T----TATACAATTGCCCCT----T--T-T-T--ACAC-TT---T------AATC--TTGA-ATACAC----AT-TG--GTGAC-TTTTTAGAC-CCGACATAACAGT-GCATAT---CAAT-TCTTAGT-
gi|97052 : CGAAAA-A--TATTTA-GCTCCTGGCATGCATTTCCGGCA---T-----TT--T-CT-G---A-TATTTAAC---A--GA--T--A--T--T--T--TAAG-CC--ATTCAAATCTATAACACAAA--CTGCGTT--G----TATACAATTACCAATT---T--T-T-T--ACAC-TT---T------TACC--TTGA-ATATAC----AT-CG--GTGGCTTTTTTAGAC-CCGACGTAACAGT-ACATAT---CAAC-TC--AGT-AATTC-ACTGCCAGAAAATTA--TTTTCTGGGTATCATGA--T--ACATTC-----AT
gi|97053 : CGAAAAGA--TATTTA-GTTCGTGGCATGCATTTCCTGCA---T-----TT--TTC-------------------A--GA--C--A--T--T--T--TAAG-CC--GTTCAAATCTATAACACAAA--CTATATT--T----GATACAATTGCCCAT----T--T-T-T--ACAC-TA---T------TATC--TTGA-ATACAC----AT-TG--GTG---TTTTTAGAC-CCGACATAACAGT-TCATAT---CA
gi|97054 : CGACAAGA--TATTTA-GCTCGTGTTATGCATTTCCTGCA---T-----TT--TTTC-G---GCTATTT--C---A--GA--C--A--T--T--T--TAAG-CC--GTTCAAATCTATAACACAAA--CTGTATT--T----TATACAAATGCCTAT----T--T-T-T--ACGC-TA---T------TATC--TTGA-ATACAC----AT-TG--
gi|97055 : CGAAAAAC--T-CTGA-GCTC-TAGAATGTATTTTCTGTG---T-----TT--TTTT-G---A-TATCC--G---A--GA--T--AAAT--G--C--TAAG-CC--TTTCAAA---ATGATAAAAT--C----------------ACAGTTTCCCT-----TGAT-T-T--ACAC-CA---C------TATC--TTGA-ATATAC----AT-TG--GTAGC---------C-CCGACGTAATTGTTACATAT---CAAC-TCTTAGTTGATCT-AATA-AAAATAA-TG--TTTTTT---TATTAGGA--T--ATATAA-----GGACT-GAAAAT-ATGA------TATGTG-AAGGATACGGTATGACATT-T-TGTTGC-AAGAGC--A-ATTCATATTTTGGCGATAAC--TATATATATA------TTTT-TTTTTCAAAAA
gi|97056 : CGAACAGA--TATTTA-GCACGTGGCATGCATTTCCTGTA---T-----TT--T-CT-G---A-TATTT--C---A--GA--T--A--T--T--T--TAAG-CC--GTTCAAACCTATTAAAAAAA--CTACATT--T----TACACAGTTGTCCA-----A--T-T-c
gi|97057 : GAAAAAT--TATTTA-GCTCCTGGCATGCATTTCCCGCG---T-----TT--TTCT-G---A-TATTT--C---ACAGA--C--A--T--T--T--TAAG-CC--GTTCAAATCTATAACACAAA--CTGCATT--T----AATACAATTACCCA-----T--T-G-T-------------------------TT-------AC----AT-TG--GTAGC-ATTTTTGAC-CCGACATTACTGT-ACATAG---AAAC-TTTAAGT-AAGAC-ACTGTAAGACATGTA--TTTGCTGGGTATTATGA--T--ACATTC-----ATACA-GAAAAT-ATTA------TATGTG-AAGGATATGTCAT---ATTAT-T--TGG-CATAGT--A-ATTCATATTTTAGGGATAAC-----------------------TTTTACAAAAA
gi|97058 : GAAAAAA--TATTTT-GCTCCGAGCTTGCATTTTCTGCGGTTC-----TT--TTCT-G---A-CATTT--C---A--GAGAC--A--T--A--A--TAAG-CC--GTTAAAGTATATAACACAAA--CTGCATT--T----TATAAAATTTCCCG-----T--T-T-TT-ACAC-TA---TAAGATATATC--TTGG-ATACAC----AA-AT--GTCGC-CTTGTAGAC-TTGACAT----------------CAAC-GCATAGT-AATAC-TCTGTAAGACAAGTA--TTAGCTGGGTATTATGA--T--ATATTC-----ATAC-------T-ATTA------TAAGTG-ATGAATAGGTCAT---ACT-T-T--TGC-TAGAGT--A-TTTCATTTTTTTGGTATAAC--T-T-----TA------TTAT-TTCTACAAAAc
gi|97059 : GAAGAGAAATATTTA-GCTCCCACAATGCATTTATTGCG---A-----CT--TCCT-G---A-TATCT--G---A--GAGAC--A--TG-T--T--TAAG-CC--TTTCAAATCGATAAATCATA--CTGAATT--T----CACACAATTGCCCATG---T--T-T-T--ACAC-CA---A------TATT--TTGA-ATACAC----ATGTGAAGTG-----TTTAGAT-CTGACATATCAGT-ACACAT---CTAT-TCTTAGT-AA--------TAAAAC---TA--TCAGCGTTGTACTATGATGT--ATATTG-----ATAGT-GCAAAT-A--A---------GTG-CAGGAAATGATAA---ATT-TGT--TGC-AAG
gi|97060 : AAAAAA--CAATTA-GCTCCAGTCATGCATTTCATGAG---T-----TT--TTCT-G---A-TATTT--C---A--GA--G--AC-T--T--T--TAAGGCC--GTTCAAATCTATAACTGAAG--CTGCATT--T----GATACAATTACCCA-----C--T-C-G--TCAC-TG---T------TTTC--TTGA-ATACAT----AT-TG--GTAGC-TTTTTAGACATCGGCATAACAGT-ACATAT---CAAC-TCTTAGT-AATAC-ACTGTAAGACAAGTA--TTTGCTGAGTATTACGA--T--ACATTC-----ATAAT-GAAAAT-ATTG------TATGGG-AAGGATATGTCAT---ATT-T-T--TCC-AAGAGT--G-ATTCATATTTTGGGGAAAAC----G-----TA------TTCT-TTTTATAAAAA
gi|97061 : AAAAAA--TATTAA-TCTTCTGGAATATATTTCCTGTG---T-----TT--T-CT-G---A-TATTT--C---A--GAGAC--A--A--T--T--TAAG-CC--GTTCAAATCTATAACACAGA--CTGCAGT--T----TATGCACTTACCCA-----T--T-T-TT-ACAC-TT---T------TATC--TTGT-ATACGG----AT-TG--ATGGC-TTTT-AGAC-GGGACTTAACAGT-ACATATTATCAAC-TCTTAGT-AATAC-ACTGAAAGACAAGTA--TTTGCTAGGTATTATGA--T--ACATTC-----ATACT-GAAAAT-ATTA------ATTGTA-AGGGATATGTCAT---ATT-T-T--T-C-AAGAGT--A-ATTCATATTTTGAGGATAAC--T-T-----TA------TGA--TTTTACAAAA
gi|97062 : AAAAAA--TATTTAAGCCCCTCGAATGCATTTCCTGTG---T-----TT--TGCT-G---G-TATCC--G---A--GATAC--A--T--T--T--TGAG-CC--TTTCAGATCGATAAAATCAA--CTGCAGT--T----TATACAGTCGCCCA-----TGAT-T-T--ACAC-TA---
gi|97063 : AAAGA--AAAATA-GCTTCTAGAATGCATTCCCTGCG---G-----TT--TCCT-G---A--A-------------------A--T--G--T--TACG-CC--TTTCAAATCGGTAACAT-AA--CTGCATT--T----TATATG--TGTCTA-----TGGT-T-T--ACAC------C------TAT--------ATA-AC----AA-TG--GTAG--TTTTTAGAC-ACAACATATCAGT-ATACAC---CAAA-ACTTGGC-AA--------TAAGAC---TG--CTTGCTTTGTACTGTGA--T--ATATTTTG---ATACT-GGACAT-A-TA------TA---------------CAT---ATT-G-T--TGC-AAGAGT--A-ATTCATATTTTGCGGATAAC--T-A-----TC------TTTG-TTTTACAACAAaaat
gi|97064 : AAAA--TAATTA-GCTCCCACAATGCATTTATTGCG---G-----TT--TCCT-G---A-TATCT--G---A--GA--C--A--T--TTGT--TAAT-CC--TTTCAAACCGATAACTCATA--CTGAATT--T----TACACAAATGTTCA-----TGGC-T-T--ACAC-CAATTC------TATG--TTGA-ATACAC----AT--------GC-TTTCTAAAC-ATGGCATAAAAGT-ACACAT---CA-------AG-----AC-ACAATAAAAC---TA--TTAGCTCTGTACTGTAATGT--ATGTTG-----ATAGT-AGAA------A------TATGTG-CAAGAAATG--AC---ATT-G-T--TGC-AAG
gi|97065 : A--TATTTA-GCTCCTAGCATACATTTCCTA-G---T-----TT--TTCCAG---A-TATTT--C---A--GA--C--ACAT--T--G--TAAG-GC--ATCCAAATCAATAACACGGA--CTGCATT--T----TACAGAGTTGCCTA-----TG-T-TAT--ACAC-CA---T------TATC--TTGA-ATACAC----AC-TG--ATAGT-TTTTTAGAA-CTGACATAATTGT-ACATAT---CAAC-TC---GT-AATATGACTATTA-AC--GTC--TTT-----GTATTATGA--T--ACAGTG-----AGACT-G-AAATGATGA------TATGTGAAAGGATATGTCAT---AGT-T-T--TGCTATGAGTGCA-ATTCATATTTTGGAGATAAC--T-T-----TG------TTAT-TTTTACAAAAA
gi|97066 : A--TTTTTA-GGTCCTTGAAAGTATTTCCTGCA---T-----TT--TTCT-G---T-TATTT--C---A--GAC-C--AT-T--T--T--TAAG--T--GTTTAAAGC-A-AAAGCAAA--CCTT-TT--T----TATGTTATTGT--------T--T-T-T--GCGCAAA---A------TA------GA-ATACA-----AT-TG--c
gi|97067 : TTTA-GCTCCTGGCATGCATT-CCTGCG---TGTTTTTT--TTTT-GTGTG-TGTTT----------------------T--T--T---------TTTATATTT----CAGAGA--C---ATT--T----TAAGCCGTT-CAAA-----T--T-T-T--ACGC-TA---T------TAT---------------------TG--GAAGC-TTTTTAGAC-CCGACTCAACAGT-ACATAT---CAAC-TTTTAGT-AATAC-ACTGTAAG-----TA--TTTGCTGGGTATTATGA--T--ACATTC-----ATACT-GAAAAT-ATTA------TATGTG-AAGGACAAGACAA---ATT-T-T--TGC-CAGAGT--A-ATTCATATTTTGGGGATATT--T-T-----TT------TTCT-TATTTCAAAAA
gi|97068 : TTTA-GCTCTCAAAATGCATTTCCTGTG---G-----TT--TTCT-G---A-TATC---CGAGA--GA--C--A--C--T--TGTTACG-CC--TTTCAAATCAAAAACACTAA--CTGCGTT--T----TAAATAATTGTCCAACATGT--T-T-T--ACAC-CA---A------TATA--TTAA-ATATAC----GT-T---GTAGC-TTTTTAGAC-CTGACAT-----T------T---CAGC-TCGTAGT-AAT---------AAACA---A--TTGGCTTTGTATGATG---T--ATATTG-----ATACT-G-ACAC-ATAA------TATGTG-AAGGGAATGACAT---ATT-G-T--TGC-AAGTGT--ACATTCAAACTTc
gi|97069 : -GCTCCCAGAATGCATT-CCTGCA---T-----TT--GCTT-G---A-TATTT--GGG-A--GA--C--A--T--TATT--TAAG-TC--TTTCAAAT---------------TGCATT--A----TATACAATTGACCA-----TGTT-T-T--ACAC-CA---A------TATA--TTAC-ATACAC----TT-TG--ATAGC-TTTTTGGAC-CTGACATAAAAGT-ACAAAT---GAAC-TCTTGGT-AA--------TAAGACTAGCAACTTTGA-----ACTATGG--T--ACATGG-----GTACTGGTAAAT-ATGA------TATGTG-CAGGAAATAACAT---ATT-G-T--TGC-AAGAGT--A-GTTAATATTATAAGGACA----T-T-----TA-------TCT-TTTTACAAAAA
gi|97070 : TCGTGGCATGCATTTGCTGCA---T-----TT--TTCT-G---A-TATTT--C---A--GA--C--A--T--T--T--------------CAAATCTATAACACAAA--CTGCATT--T----TATACAATTGCCTA-----T--T-T-TT-ACAC-TA---T------TATC--TTGA-ATGCAC----AT-TG--GTGAC-GTTTTAGAC-CCGACATAGCAGC-ACATAT---CAGC-TCTTAGT-AATAC-A-TGTAAGACAAGTA--TTTGCTAGATATTAAGA--T--ACATTC-----TTACT-GAAAAT-AGTA------TATGTG-AAAGATATGTCAT---ATT-T-T--TAC-AAGAGT--A-TTTCATATTTTGGGGATGGC--T-T-----TA------TTGT-TTTT
gi|97071 : TCTTAGAATGCATT-CCTGCG---T-----TT--TTCT-G---A-TATTTGAA---A--GA--C--A--TAAT--G--TAAA-TCTTTTTTAAATCAATAACACTAG--GTACATttttaaaaaaac
gi|97072 : TGACATGCATTTCCTGCA---T-----TT--T-CT-A---A-TATTT--C---A--GA--C--A--T--T--T--TAAG-CC--GTCCAAATCTATAACACAAA--CTACATT--T----TACACAATTGACGA-----T--TCT-T--ACAC-TA---T------TATC--TTGA-ATACAC----TT-TG--GTCAC-TCTTTAGAC-CCGACAT-ATAGT-ACATAT---CAAC-TATTAGT-AATAC-ACTGCAAGACAGGTA--TTTCCTGGGT-----------------------ATACT-GCATAT-ATTA------TATGTG-AAGGATATGTCAT---ATT-T-T--TGA-AAGAGT--A-ATTCATATTTTGGGAATAAC--T-T-----TA------TTAT-TTTTACAAAA
gi|97073 : ACGCATTTCCTGCA---T-----TT--TCCT-G---T-TATTT--C---A--GA--CCAA--T--T--G--TAAG--C--GCTTAAATC-A-GAC-CAAATTTTTCATTTAT----TATGTAATTA-TTA-----T--T-TGT--ACA
gi|97074 : TGCATTGC-TGCG---T-----TTATTTCT-G---G-TATTT--C---A--GAAAC--A--T--T--T--TAAG-CC--TTTCGTATCTATAACACAAA--CTGCAAT--T----TTTACAATTACCCA-----T--TGT-T--AAAA-TA-----------ACCCATTG--TTACACTAGTAT-TG--TTAGC-TTT-------------TAACAGT-ACATAT---TAA
gi|97074 : AGT-AATAC-ACTGTAAT-----TA--TTTGCTGGGTACTATGA--T--ACATTC-----ATACT-GAAAAT-ATTA------TATGCG-AAGGATATGTCAT---ATT-T-T--TGT-AAAAGT--A-ATTCATATTTTGGGGATAAT--T-T-----T-------TTCT-TATTACAAAAAtcgtgaaacatcgagtatttccgtatcctccgtataatgtttagcataaaggccgaggtaatcagattgagtaatacactgtaattatttgctgggtactatgatacattcatactgaaaatattatatgcgaaggatatgtcatatttttgtaaaagtaattcatattttggggataattttttcttattacaaaaac
gi|97075 : tgcattgctgcgtttatttctggtatttcagaaacattttaagcctttcgtatctataacacaaactgcaatttttacaattacccattgttaaaataacccattgttacactagtattgttagcttttaacagtacatattaatcgtgaaacatcgagtatttccgtatcctccgtataatgtttagcataaaggccgaggtaatcagattgTTCAAATCGATAACACTAA--TTGCATT--TCAGATATGCAATTGTC------------T-G--ACA--TG---T------T--T--TTGT-ATGCAT----GT-----GTAAC-ATTTAAGAC-CTGACATTTCAGT-ACATGT---CAGA-GCTTAGT-AATAC--------GAC---TA--TTGGCTTTGTACCATGG--TGTATATTG-----ATACT-GGAAAT-ATAA------TATGTG-CAGGAAATGACAT---ATT-G-T--TGC-AAGAAT--A-ATTGTTA-TTTGGGGATAATCAT-T-----TAATGGTCTTTTGTTTTACAAGAAc
gi|97076 : TTAGT-AATAC-ACTGTAAGACAAGTA--TTTGCTGGGTATTATGA--T--ACATTC-----ATACT-GTATAT-ATTA------TGTGTG------------------------------AAGAGT--A-ATTCAGATTTTGGAAATAAC----------TA------TTAT-TTTTACAAAAA
gi|97077 : ATAC-ACTGTAAGACAAGTA--TTTGCTGACTATTATAA--T--ACATTC-----ATACT-GAAT-T-ATTA------TATGTG-AAGGGTATGTCAT---ATT-T-T---GC-AAGAGT--A-ATTCATATTTTGGGGATAAC--T-T-----TA------TTAT-TTTTACAAAAAc
blockSeqs : AA A G GTT GTTTT AT T A TGT C CGAG CA GA CA AA AA TG GT G TT T TT TA CAGA ACATGT G G TT A TAAGATA CA . TAGT G AA T A T TAT T T G AA AC TG GT CGATG G C T G . A GAC A G GT T GC C TATATATA ATGGTC C G
blockSeqs : . . G . . . T . . . CAG . GA . CA G AT . . . T . . . TTT C A T . ATTC . . . . . . . . . . . . AA . TG . TG . C T . . . . . . . . . . CATT T T .
blockSeqs : . . G . . . T . . . AAC . GA . C . . . . . T . . . TGA G G T . T . . . . . . . . . . . . AA . . . . . C T . . . . . . . . . . TT . A .
blockSeqs : . . C . . . T . . . GGG . GA . T . . . . . T . . . TGT . . T . T . . . . . . . . . . . . AG . . . . . C T . . . . . . . . . . TT . C .
blockSeqs : . . G . . . T . . . GAA . TA . . . . . . . T . . . TGA . . T . T . . . . . . . . . . . . AA . . . . . A A . . . . . . . . . . TT . A .
blockSeqs : . . G . . . T . . . C . AA . . . . . . . T . . . TGG . . T . T . . . . . . . . . . . . AA . . . . . C T . . . . . . . . . . TT . G .
blockSeqs : . . G . . . T . . . C . C . . . . . . . T . . . TGG . . T . T . . . . . . . . . . . . AA . . . . . T T . . . . . . . . . . TT . A .
blockSeqs : . . G . . . T . . . C . . . . . . . . . T . . . TGT . . . . G . . . . . . . . . . . . AA . . . . . A A . . . . . . . . . . TT . T .
blockSeqs : . . C . . . T . . . C . . . . . . . . . T . . . TT . . . . T . . . . . . . . . . . . AA . . . . . A A . . . . . . . . . . TT . A .
blockSeqs : . . G . . . T . . . T . . . . . . . . . T . . . TT . . . . T . . . . . . . . . . . . AA . . . . . C A . . . . . . . . . . TA . C .
blockSeqs : . . G . . . T . . . C . . . . . . . . . T . . . TT . . . . T . . . . . . . . . . . . AT . . . . . A A . . . . . . . . . . TT . A .
blockSeqs : . . G . . . T . . . C . . . . . . . . . T . . . TT . . . . T . . . . . . . . . . . . AA . . . . . A A . . . . . . . . . . TT . T .
blockSeqs : . . C . . . T . . . C . . . . . . . . . T . . . TG . . . . T . . . . . . . . . . . . AA . . . . . G C . . . . . . . . . . TT . A .
blockSeqs : . . C . . . C . . . C . . . . . . . . . T . . . T . . . . T . . . . . . . . . . . . AA . . . . . G A . . . . . . . . . . TT . C .
blockSeqs : . . C . . . T . . . G . . . . . . . . . T . . . T . . . . C . . . . . . . . . . . . TA . . . . . A A . . . . . . . . . . TT . C .
blockSeqs : . . C . . . G . . . C . . . . . . . . . G . . . T . . . . A . . . . . . . . . . . . AA . . . . . T A . . . . . . . . . . TT . G .
blockSeqs : . . C . . . C . . . C . . . . . . . . . T . . . T . . . . T . . . . . . . . . . . . AG . . . . . A C . . . . . . . . . . TT . A .
blockSeqs : . . C . . . C . . . C . . . . . . . . . T . . . T . . . . T . . . . . . . . . . . . AA . . . . . C A . . . . . . . . . . G . C .
blockSeqs : . . C . . . T . . . G . . . . . . . . . G . . . T . . . . C . . . . . . . . . . . . AA . . . . . A A . . . . . . . . . . . . T .
blockSeqs : . . C . . . T . . . C . . . . . . . . . G . . . T . . . . T . . . . . . . . . . . . A . . . . . G T . . . . . . . . . . . . A .
blockSeqs : . . C . . . T . . . C . . . . . . . . . G . . . A . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . T A . . . . . . . . . . . . A .
blockSeqs : . . C . . . T . . . G . . . . . . . . . A . . . T . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . A A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . C . . . C . . . G . . . . . . . . . T . . . T . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . T . . . C . . . . . . . . . A . . . C . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . C . . . T . . . C . . . . . . . . . T . . . T . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . G . . . C . . . C . . . . . . . . . A . . . T . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . T . . . C . . . . . . . . . T . . . T . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . . . . . . . . . T . . . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . . . . . . . . . G . . . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . .
blockSeqCons : ** ******
originalCons : CGAAAAGA--TATTTA-GCTCCTGGCATGCATTTCCTGCG---T-----TT--TTCT-G---A-TATTT--C---A--GA--C--A--T--T--T--TAAG-CC--GTTCAAATCTATAACACAAA--CTGCATT--T----TATACAATTGCCCA-----T--T-T-T--ACAC-TA---T------TATC--TTGA-ATACAC----AT-TG--GTGGC-TTTTTAGAC-CCGACATAACAGT-ACATAT---CAAC-TCTTAGT-AATAC-ACTGTAAGACAAGTA--TTTGCTGGGTATTATGA--T--ACATTC-----ATACT-GNANAT-ATTA------TATGTG-AAGGATATGTCAT---ATT-T-T--TGC-AAGAGT--A-ATTCATATTTTGGGGATAAC--T-T-----TA------TTNT-TTTTACAAAAA
finalCons : CGAAAAGA--TATTTA-GCTCCTGGCATGCATTTCCTGCG---T-----TT--TTCT-G---A-TATTT--C---A--GA--C--A--T--T--T--TAAG-CC--GTTCAAATCTATAACACAAA--CTGCATT--T----TATACAATTGCCCA-----T--T-T-T--ACAC-TA---T------TATC--TTGA-ATACAC----AT-TG--GTGGC-TTTTTAGAC-CCGACATAACAGT-ACATAT---CAAC-TCTTAGT-AATAC-ACTGTAAGACAAGTA--TTTGCTGGGTATTATGA--T--ACATTC-----ATACT-GNANAT-ATTA------TATGTG-AAGGATATGTCAT---ATT-T-T--TGC-AAGAGT--A-ATTCATATTTTGGGGATAAC--T-T-----TA------TTNT-TTTTACAAAAA
Alignments
lowQualScore : 11 11111111 11
lowQualScore : 0 22 1 3 222 33333 11 1 1 222 1 666666 11 11 11 55 22 33 11 1 11 1 11 11 2222 33333333 3 3 00 1 5555555555 11 1 2222 1 11 1 1 1 222 1 1 1 33 22 0 33 22 55555 1 4 1 1 444444 1 0 222 1 1 22 1 22 1 7777777777 666666 1 1
lowQualScore : . .. . . ... ..... .. . . ... . ...... .. .. .. .. .. .. .. . .. . .. .. .... ........ . . .. . .......... .. . .... . .. . . . ... . . . .. .. . .. .. ..... . . . . ...... . . ... . . .. . .. . .......... ...... . .
lowQualScore : 3 22 4 6 111 00000 77 4 2 111 2 888888 77 22 77 88 99 33 77 2 77 1 66 77 6666 77777777 6 6 55 3 3333333333 88 3 8888 3 88 4 4 4 555 5 4 4 11 00 3 99 00 55555 5 5 5 5 444444 5 7 777 5 5 11 5 33 7 5555555555 777777 6 7
consensus : CGAAAAGA--TATTTA-GCTCCTGGCATGCATTTCCTGCG---T-----TT--TTCT-G---A-TATTT--C---A--GA--C--A--T--T--T--TAAG-CC--GTTCAAATCTATAACACAAA--CTGCATT--T----TATACAATTGCCCA-----T--T-T-T--ACAC-TA---T------TATC--TTGA-ATACAC----AT-TG--GTGGC-TTTTTAGAC-CCGACATAACAGT-ACATAT---CAAC-TCTTAGT-AATAC-ACTGTAAGACAAGTA--TTTGCTGGGTATTATGA--T--ACATTC-----ATACT-GNANAT-ATTA------TATGTG-AAGGATATGTCAT---ATT-T-T--TGC-AAGAGT--A-ATTCATATTTTGGGGATAAC--T-T-----TA------TTNT-TTTTACAAAAA
Reference ( family-584 ) : CGAAAAGA--TATTTA-GCTCCTGGCATGCATTTCCTGCG---T-----TT--TTCT-G---A-TATTT--C---A--GA--C--A--T--T--T--TAAG-CC--GTTCAAATCTATAACACAAA--CTGCATT--T----TATACAATTGCCCA-----T--T-T-T--ACAC-TA---T------TATC--TTGA-ATACAC----AT-TG--GTGGC-TTTTTAGAC-CCGACATAACAGT-ACATAT---CAAC-TCTTAGT-AATAC-ACTGTAAGACAAGTA--TTTGCTGGGTATTATGA--T--ACATTC-----ATACT-GNANAT-ATTA------TATGTG-AAGGATATGTCAT---ATT-T-T--TGC-AAGAGT--A-ATTCATATTTTGGGGATAAC--T-T-----TA------TTNT-TTTTACAAAAA
gi|97042 : CGAAATGA--TATTTA-GCTCGTGGCATGCATTTCCTGCA---T-----TT--TTCT-A---A-TATTT--C---A--GA--C--A--T--T--T--TAAG-CC--GTTAAAATCTATAACACAAA--CTGCATT--T----TATACAATTGCCCA-----T--T-T-TT-ACAC-TA---T------TATC--TTGGTATACAC----AT-TG--ATGGC-TTTTTAGAC-CCGACATAACAGT-ACATAT---CAAC-TCTTAGT-AATAC-ACTGTAAAACAAGTA--TTTGCTGGGTATTATGA--T--ACATTC-----ATATT-GCATAT-ATTATACGAGTATGTG-AATGATATGTCAT----TT-T-T--T-C-AAGAGT--A-ATTCATGTTTTGGGAATAAC--T-T-----TA------TTCT-TTTTACAAAA
gi|97043 : CGAAAATA--TGTTTA-GCTTGAGGCATGCATTTCCTACA---T-----TT--TTTT-G---A-TTTTT--C---A--GG--C--A--T--T--T--TGAG-AC--GTTAAAATCTATAACACAAA--CTGCATT--T----TATACAATTGCCCT-----T--T-T-TT-ACAC-TA---T------TATC--TTGA-ATACAC----AT-TG--GTGGC-TTTTTAGAC-CCGACATAACGGT-ACATAT---CAAC-TCTTAAT-AATAC-ACTGTAAGACAAGTA--TTTGCTGGGTATTATGA--T--ACATTC-----ATACT-GCATAT-ATTA------TATGTG-AAGGATATGTCAT---G---T-T--TGC-AAGAGT--A-ATTCATATTTTTGGGATAAT--T-T-----TA------TTCT-TTTTACAAAA
gi|97044 : CGAACAGA--TATTTA-GCTCGTGGCATGCATATCCTGCA---T-----TT--TTCT-G---A-TATTT--C---A--GA--C--A--T--T--T--TAAG-CG--GTTCAAATCTATAACACAAA--CTACATT--T----TATACAACTGCCCA-----T--T-T-T--ACAC-TA---T------TATC--TTGA-ATACAC----AT-TG--GTGGC-TTTTTATAA-CCGACATAACAGT-ACATAT---CACC-TCTTAGC-AAAAC-ACTGTAAGACAAGTA--TTTGCTGGGTATTATGA--T--ACATTC-----ATACT-GCATAT-ATTA------TATGTG-AAGGACATGTCAT---ATT-T-T--TGC-AAGAGT--A-ATTCATATTTTGGAAATATA--T-T-----CAT-----TTTT-TTTTACAAAAA
gi|97045 : CGAAAATA--TATTTA-GC-------AAGCATTTTCTGCA---T-----TT--TTCT-G---A-TATTT--C---A--GA--C--A--T--T--T--TAAG-CT--GTTCAAATATATAACACAAA--CTACATT--T----TATACAATTGTCCA-----T--T-TGT--ACAC-TA---T------TATC--TTGA-ATACAC----AT-TG--GTGGC-TTTTTAGAC-CCGTCATAACAGT-AAATAT---CAAT-TCTTAGT-AATAC-ACCGTAAGGCAAGTA--TTTGCTAGGCATTATGA--T--GCATTC-----ATACT-GCATAT-ATTA------TATGTG-AAGGATATGTCAT---ATT-T-T--TGC-AAGAGT--A-ATTCATATTTTGGGAATAAC----------TA------TTAC-TTTCACAAAAA
gi|97046 : CGAAAAGA--TATTTA-ACTCGTGGCATGTATTT-------------------TTCC-G---A-TATTT--C---A--GC--C--A--T--T--T--TAAG-CC--GTTCAAATCTATAACACAAA--CTGCTTT--T----TATATAATTGCCCA-----T--T-T-TT-ACAC-TA---T------TATC--TTGA-ATACAT----AT-TG--GTGGA-TTTTTAGGC-CAGACATAGCAGT-TCAAA----CAAC-TCTTAGT-AATAC-ACTGTAAGACAGGTA--TTTGCTGGGTATTATGA--T--ACATTC-----ATACT-GCATAT-ATTT------TATGTG-AATGATATGTCAT---ATG-T-T--TGC-AAGAGT--T-ATCCATATTTTGGGGATAAC--T-T-----TA------TTCG-TTTTACAAAAc
gi|97047 : CAAAAACA--TATT-A-ACTCCTGGCATGCATTTCCTGCG---T-----TT--T--T-G---A-TGTTT--CAG-A--GA--C--A--T--G--T--TAAG-CC--GTTCAAA-CTATAACACAAA--CTGCATT--T----TATACAATTACCCAT----T--T-T-T--ACAC-TT---T------TATC--TTGA-ATATAC----AT-CG--GTAGC-TTTTTAGAC-CCGACATAACGGT-ACATAT---CAAC-TCTTAGT-AATAC-ACTGTAAGACAAGTT--TTTGCTGGGTATTATGA--T--ACATTT-----ATACC-TAAAAT-AGTA------TATATG-AAAGATATGTCAT---ATT-T-T--TGC-AAGAGC--A-ATTCATTTTTTGGGGATAAC--T-T-----TA------TTAT-TTCTACAAAAA
gi|97048 : CGAACGGA--TATTAA-GCTTGTGGCATGTATTACCTGCA---T-----TG--TTCT-G---A-TATTT--T---A--GAGAC--A--T--T--T--TAAG-CT--GTTCAAATCTATAACACAAA--CTGCATT--T----TATACAATTGCCCA-----T--T-T-TT-ACAA-TA---G------CATC--TTTA-ATACAC----AT-TG--GTG-C-T-----GAC-CCGACATAACAGT-ACATAT---CAAC-TCTTTGT-AATAC-ACTGTAAGACAAGTA--TTTGCTGGGTATTATGA--A--ACATTCCGATGATACT-GCATAT-ATTA------TATGTG-AAGGATATGTCAT---ATT-T-T--TGC-AATAGC--A-CTTCATATTTTGGCGATAAC--T-T-----TA------TCGT-TTTTACAAAAAc
gi|97049 : CGAGAAGA--CATTAA-GCTCGTGGCATGCATTTCCTTCA---T-----TT--TTCT-G---T-TATTT--C---A--GA--T--A--T--T--T--TAAG-CC--GTTTAAATCTATAACACAAA--CTACATT--T----TACACAATTGCCCA-----T--TGT-T--ACAC-TC---T------TACC--TTGA-ATACAT----AA-TT--GTGGC-TTTTTAGAC-CCGACATAACAGT-ACATAT----AACTTCTTAAT-AATAC-ACTGTAAGACAAGTA----AACAAG---TTACGA--T--ACATTC-----ATACT-GTATAT-ATTA------TATGTG-ACAGATATGTCAT---GTT-T-T--TGC-GAGAGT--A-ATTAATATTTTGGGAATAAC----------TA------TTAC-TTTTACAAAAAc
gi|97050 : CGAAAAGA--TATTCA-ACTCGTGGCATGCATTTCCTGCA---T-----TT--TTCT-G---A-TATTT--C---A--GA--C--A--T--T--T--TAAG-CT--GTTCAAATCTATAACACAAA--CTACATT--T----TATACAATTGCCAA-----T--T-T-TTTACAC-TA---T------AATC--TTGA-ATACAC----AT-TA--ATGGC-ATTTTAGAC-CCGGCATAAAAGT-ACATAT---CAAC-GCTTAGA-AATAC-ACTGTTAGACAAGTA--TTTGCTGGGTATTATGA--T--ACATTC-----ATACT-c
gi|97051 : CGAAAAGA--TATTTA-GCCTGTGGCATGCATTTTCTGCA---T-----TT--TTCT-G---A-TATTT--C---A--GG--C--A--T--T--T--TAAG-CC--GTTCAAATATATAACACAAA--CTACATT--T----TATACAATTGCCCCT----T--T-T-T--ACAC-TT---T------AATC--TTGA-ATACAC----AT-TG--GTGAC-TTTTTAGAC-CCGACATAACAGT-GCATAT---CAAT-TCTTAGT-
gi|97052 : CGAAAA-A--TATTTA-GCTCCTGGCATGCATTTCCGGCA---T-----TT--T-CT-G---A-TATTTAAC---A--GA--T--A--T--T--T--TAAG-CC--ATTCAAATCTATAACACAAA--CTGCGTT--G----TATACAATTACCAATT---T--T-T-T--ACAC-TT---T------TACC--TTGA-ATATAC----AT-CG--GTGGCTTTTTTAGAC-CCGACGTAACAGT-ACATAT---CAAC-TC--AGT-AATTC-ACTGCCAGAAAATTA--TTTTCTGGGTATCATGA--T--ACATTC-----AT
gi|97053 : CGAAAAGA--TATTTA-GTTCGTGGCATGCATTTCCTGCA---T-----TT--TTC-------------------A--GA--C--A--T--T--T--TAAG-CC--GTTCAAATCTATAACACAAA--CTATATT--T----GATACAATTGCCCAT----T--T-T-T--ACAC-TA---T------TATC--TTGA-ATACAC----AT-TG--GTG---TTTTTAGAC-CCGACATAACAGT-TCATAT---CA
gi|97054 : CGACAAGA--TATTTA-GCTCGTGTTATGCATTTCCTGCA---T-----TT--TTTC-G---GCTATTT--C---A--GA--C--A--T--T--T--TAAG-CC--GTTCAAATCTATAACACAAA--CTGTATT--T----TATACAAATGCCTAT----T--T-T-T--ACGC-TA---T------TATC--TTGA-ATACAC----AT-TG--
gi|97055 : CGAAAAAC--T-CTGA-GCTC-TAGAATGTATTTTCTGTG---T-----TT--TTTT-G---A-TATCC--G---A--GA--T--AAAT--G--C--TAAG-CC--TTTCAAA---ATGATAAAAT--C----------------ACAGTTTCCCT-----TGAT-T-T--ACAC-CA---C------TATC--TTGA-ATATAC----AT-TG--GTAGC---------C-CCGACGTAATTGTTACATAT---CAAC-TCTTAGTTGATCT-AATA-AAAATAA-TG--TTTTTT---TATTAGGA--T--ATATAA-----GGACT-GAAAAT-ATGA------TATGTG-AAGGATACGGTATGACATT-T-TGTTGC-AAGAGC--A-ATTCATATTTTGGCGATAAC--TATATATATA------TTTT-TTTTTCAAAAA
gi|97056 : CGAACAGA--TATTTA-GCACGTGGCATGCATTTCCTGTA---T-----TT--T-CT-G---A-TATTT--C---A--GA--T--A--T--T--T--TAAG-CC--GTTCAAACCTATTAAAAAAA--CTACATT--T----TACACAGTTGTCCA-----A--T-T-c
gi|97057 : GAAAAAT--TATTTA-GCTCCTGGCATGCATTTCCCGCG---T-----TT--TTCT-G---A-TATTT--C---ACAGA--C--A--T--T--T--TAAG-CC--GTTCAAATCTATAACACAAA--CTGCATT--T----AATACAATTACCCA-----T--T-G-T-------------------------TT-------AC----AT-TG--GTAGC-ATTTTTGAC-CCGACATTACTGT-ACATAG---AAAC-TTTAAGT-AAGAC-ACTGTAAGACATGTA--TTTGCTGGGTATTATGA--T--ACATTC-----ATACA-GAAAAT-ATTA------TATGTG-AAGGATATGTCAT---ATTAT-T--TGG-CATAGT--A-ATTCATATTTTAGGGATAAC-----------------------TTTTACAAAAA
gi|97058 : GAAAAAA--TATTTT-GCTCCGAGCTTGCATTTTCTGCGGTTC-----TT--TTCT-G---A-CATTT--C---A--GAGAC--A--T--A--A--TAAG-CC--GTTAAAGTATATAACACAAA--CTGCATT--T----TATAAAATTTCCCG-----T--T-T-TT-ACAC-TA---TAAGATATATC--TTGG-ATACAC----AA-AT--GTCGC-CTTGTAGAC-TTGACAT----------------CAAC-GCATAGT-AATAC-TCTGTAAGACAAGTA--TTAGCTGGGTATTATGA--T--ATATTC-----ATAC-------T-ATTA------TAAGTG-ATGAATAGGTCAT---ACT-T-T--TGC-TAGAGT--A-TTTCATTTTTTTGGTATAAC--T-T-----TA------TTAT-TTCTACAAAAc
gi|97059 : GAAGAGAAATATTTA-GCTCCCACAATGCATTTATTGCG---A-----CT--TCCT-G---A-TATCT--G---A--GAGAC--A--TG-T--T--TAAG-CC--TTTCAAATCGATAAATCATA--CTGAATT--T----CACACAATTGCCCATG---T--T-T-T--ACAC-CA---A------TATT--TTGA-ATACAC----ATGTGAAGTG-----TTTAGAT-CTGACATATCAGT-ACACAT---CTAT-TCTTAGT-AA--------TAAAAC---TA--TCAGCGTTGTACTATGATGT--ATATTG-----ATAGT-GCAAAT-A--A---------GTG-CAGGAAATGATAA---ATT-TGT--TGC-AAG
gi|97060 : AAAAAA--CAATTA-GCTCCAGTCATGCATTTCATGAG---T-----TT--TTCT-G---A-TATTT--C---A--GA--G--AC-T--T--T--TAAGGCC--GTTCAAATCTATAACTGAAG--CTGCATT--T----GATACAATTACCCA-----C--T-C-G--TCAC-TG---T------TTTC--TTGA-ATACAT----AT-TG--GTAGC-TTTTTAGACATCGGCATAACAGT-ACATAT---CAAC-TCTTAGT-AATAC-ACTGTAAGACAAGTA--TTTGCTGAGTATTACGA--T--ACATTC-----ATAAT-GAAAAT-ATTG------TATGGG-AAGGATATGTCAT---ATT-T-T--TCC-AAGAGT--G-ATTCATATTTTGGGGAAAAC----G-----TA------TTCT-TTTTATAAAAA
gi|97061 : AAAAAA--TATTAA-TCTTCTGGAATATATTTCCTGTG---T-----TT--T-CT-G---A-TATTT--C---A--GAGAC--A--A--T--T--TAAG-CC--GTTCAAATCTATAACACAGA--CTGCAGT--T----TATGCACTTACCCA-----T--T-T-TT-ACAC-TT---T------TATC--TTGT-ATACGG----AT-TG--ATGGC-TTTT-AGAC-GGGACTTAACAGT-ACATATTATCAAC-TCTTAGT-AATAC-ACTGAAAGACAAGTA--TTTGCTAGGTATTATGA--T--ACATTC-----ATACT-GAAAAT-ATTA------ATTGTA-AGGGATATGTCAT---ATT-T-T--T-C-AAGAGT--A-ATTCATATTTTGAGGATAAC--T-T-----TA------TGA--TTTTACAAAA
gi|97062 : AAAAAA--TATTTAAGCCCCTCGAATGCATTTCCTGTG---T-----TT--TGCT-G---G-TATCC--G---A--GATAC--A--T--T--T--TGAG-CC--TTTCAGATCGATAAAATCAA--CTGCAGT--T----TATACAGTCGCCCA-----TGAT-T-T--ACAC-TA---
gi|97063 : AAAGA--AAAATA-GCTTCTAGAATGCATTCCCTGCG---G-----TT--TCCT-G---A--A-------------------A--T--G--T--TACG-CC--TTTCAAATCGGTAACAT-AA--CTGCATT--T----TATATG--TGTCTA-----TGGT-T-T--ACAC------C------TAT--------ATA-AC----AA-TG--GTAG--TTTTTAGAC-ACAACATATCAGT-ATACAC---CAAA-ACTTGGC-AA--------TAAGAC---TG--CTTGCTTTGTACTGTGA--T--ATATTTTG---ATACT-GGACAT-A-TA------TA---------------CAT---ATT-G-T--TGC-AAGAGT--A-ATTCATATTTTGCGGATAAC--T-A-----TC------TTTG-TTTTACAACAAaaat
gi|97064 : AAAA--TAATTA-GCTCCCACAATGCATTTATTGCG---G-----TT--TCCT-G---A-TATCT--G---A--GA--C--A--T--TTGT--TAAT-CC--TTTCAAACCGATAACTCATA--CTGAATT--T----TACACAAATGTTCA-----TGGC-T-T--ACAC-CAATTC------TATG--TTGA-ATACAC----AT--------GC-TTTCTAAAC-ATGGCATAAAAGT-ACACAT---CA-------AG-----AC-ACAATAAAAC---TA--TTAGCTCTGTACTGTAATGT--ATGTTG-----ATAGT-AGAA------A------TATGTG-CAAGAAATG--AC---ATT-G-T--TGC-AAG
gi|97065 : A--TATTTA-GCTCCTAGCATACATTTCCTA-G---T-----TT--TTCCAG---A-TATTT--C---A--GA--C--ACAT--T--G--TAAG-GC--ATCCAAATCAATAACACGGA--CTGCATT--T----TACAGAGTTGCCTA-----TG-T-TAT--ACAC-CA---T------TATC--TTGA-ATACAC----AC-TG--ATAGT-TTTTTAGAA-CTGACATAATTGT-ACATAT---CAAC-TC---GT-AATATGACTATTA-AC--GTC--TTT-----GTATTATGA--T--ACAGTG-----AGACT-G-AAATGATGA------TATGTGAAAGGATATGTCAT---AGT-T-T--TGCTATGAGTGCA-ATTCATATTTTGGAGATAAC--T-T-----TG------TTAT-TTTTACAAAAA
gi|97066 : A--TTTTTA-GGTCCTTGAAAGTATTTCCTGCA---T-----TT--TTCT-G---T-TATTT--C---A--GAC-C--AT-T--T--T--TAAG--T--GTTTAAAGC-A-AAAGCAAA--CCTT-TT--T----TATGTTATTGT--------T--T-T-T--GCGCAAA---A------TA------GA-ATACA-----AT-TG--c
gi|97067 : TTTA-GCTCCTGGCATGCATT-CCTGCG---TGTTTTTT--TTTT-GTGTG-TGTTT----------------------T--T--T---------TTTATATTT----CAGAGA--C---ATT--T----TAAGCCGTT-CAAA-----T--T-T-T--ACGC-TA---T------TAT---------------------TG--GAAGC-TTTTTAGAC-CCGACTCAACAGT-ACATAT---CAAC-TTTTAGT-AATAC-ACTGTAAG-----TA--TTTGCTGGGTATTATGA--T--ACATTC-----ATACT-GAAAAT-ATTA------TATGTG-AAGGACAAGACAA---ATT-T-T--TGC-CAGAGT--A-ATTCATATTTTGGGGATATT--T-T-----TT------TTCT-TATTTCAAAAA
gi|97068 : TTTA-GCTCTCAAAATGCATTTCCTGTG---G-----TT--TTCT-G---A-TATC---CGAGA--GA--C--A--C--T--TGTTACG-CC--TTTCAAATCAAAAACACTAA--CTGCGTT--T----TAAATAATTGTCCAACATGT--T-T-T--ACAC-CA---A------TATA--TTAA-ATATAC----GT-T---GTAGC-TTTTTAGAC-CTGACAT-----T------T---CAGC-TCGTAGT-AAT---------AAACA---A--TTGGCTTTGTATGATG---T--ATATTG-----ATACT-G-ACAC-ATAA------TATGTG-AAGGGAATGACAT---ATT-G-T--TGC-AAGTGT--ACATTCAAACTTc
gi|97069 : -GCTCCCAGAATGCATT-CCTGCA---T-----TT--GCTT-G---A-TATTT--GGG-A--GA--C--A--T--TATT--TAAG-TC--TTTCAAAT---------------TGCATT--A----TATACAATTGACCA-----TGTT-T-T--ACAC-CA---A------TATA--TTAC-ATACAC----TT-TG--ATAGC-TTTTTGGAC-CTGACATAAAAGT-ACAAAT---GAAC-TCTTGGT-AA--------TAAGACTAGCAACTTTGA-----ACTATGG--T--ACATGG-----GTACTGGTAAAT-ATGA------TATGTG-CAGGAAATAACAT---ATT-G-T--TGC-AAGAGT--A-GTTAATATTATAAGGACA----T-T-----TA-------TCT-TTTTACAAAAA
gi|97070 : TCGTGGCATGCATTTGCTGCA---T-----TT--TTCT-G---A-TATTT--C---A--GA--C--A--T--T--T--------------CAAATCTATAACACAAA--CTGCATT--T----TATACAATTGCCTA-----T--T-T-TT-ACAC-TA---T------TATC--TTGA-ATGCAC----AT-TG--GTGAC-GTTTTAGAC-CCGACATAGCAGC-ACATAT---CAGC-TCTTAGT-AATAC-A-TGTAAGACAAGTA--TTTGCTAGATATTAAGA--T--ACATTC-----TTACT-GAAAAT-AGTA------TATGTG-AAAGATATGTCAT---ATT-T-T--TAC-AAGAGT--A-TTTCATATTTTGGGGATGGC--T-T-----TA------TTGT-TTTT
gi|97071 : TCTTAGAATGCATT-CCTGCG---T-----TT--TTCT-G---A-TATTTGAA---A--GA--C--A--TAAT--G--TAAA-TCTTTTTTAAATCAATAACACTAG--GTACATttttaaaaaaac
gi|97072 : TGACATGCATTTCCTGCA---T-----TT--T-CT-A---A-TATTT--C---A--GA--C--A--T--T--T--TAAG-CC--GTCCAAATCTATAACACAAA--CTACATT--T----TACACAATTGACGA-----T--TCT-T--ACAC-TA---T------TATC--TTGA-ATACAC----TT-TG--GTCAC-TCTTTAGAC-CCGACAT-ATAGT-ACATAT---CAAC-TATTAGT-AATAC-ACTGCAAGACAGGTA--TTTCCTGGGT-----------------------ATACT-GCATAT-ATTA------TATGTG-AAGGATATGTCAT---ATT-T-T--TGA-AAGAGT--A-ATTCATATTTTGGGAATAAC--T-T-----TA------TTAT-TTTTACAAAA
gi|97073 : ACGCATTTCCTGCA---T-----TT--TCCT-G---T-TATTT--C---A--GA--CCAA--T--T--G--TAAG--C--GCTTAAATC-A-GAC-CAAATTTTTCATTTAT----TATGTAATTA-TTA-----T--T-TGT--ACA
gi|97074 : TGCATTGC-TGCG---T-----TTATTTCT-G---G-TATTT--C---A--GAAAC--A--T--T--T--TAAG-CC--TTTCGTATCTATAACACAAA--CTGCAAT--T----TTTACAATTACCCA-----T--TGT-T--AAAA-TA-----------ACCCATTG--TTACACTAGTAT-TG--TTAGC-TTT-------------TAACAGT-ACATAT---TAA
gi|97074 : AGT-AATAC-ACTGTAAT-----TA--TTTGCTGGGTACTATGA--T--ACATTC-----ATACT-GAAAAT-ATTA------TATGCG-AAGGATATGTCAT---ATT-T-T--TGT-AAAAGT--A-ATTCATATTTTGGGGATAAT--T-T-----T-------TTCT-TATTACAAAAAtcgtgaaacatcgagtatttccgtatcctccgtataatgtttagcataaaggccgaggtaatcagattgagtaatacactgtaattatttgctgggtactatgatacattcatactgaaaatattatatgcgaaggatatgtcatatttttgtaaaagtaattcatattttggggataattttttcttattacaaaaac
gi|97075 : tgcattgctgcgtttatttctggtatttcagaaacattttaagcctttcgtatctataacacaaactgcaatttttacaattacccattgttaaaataacccattgttacactagtattgttagcttttaacagtacatattaatcgtgaaacatcgagtatttccgtatcctccgtataatgtttagcataaaggccgaggtaatcagattgTTCAAATCGATAACACTAA--TTGCATT--TCAGATATGCAATTGTC------------T-G--ACA--TG---T------T--T--TTGT-ATGCAT----GT-----GTAAC-ATTTAAGAC-CTGACATTTCAGT-ACATGT---CAGA-GCTTAGT-AATAC--------GAC---TA--TTGGCTTTGTACCATGG--TGTATATTG-----ATACT-GGAAAT-ATAA------TATGTG-CAGGAAATGACAT---ATT-G-T--TGC-AAGAAT--A-ATTGTTA-TTTGGGGATAATCAT-T-----TAATGGTCTTTTGTTTTACAAGAAc
gi|97076 : TTAGT-AATAC-ACTGTAAGACAAGTA--TTTGCTGGGTATTATGA--T--ACATTC-----ATACT-GTATAT-ATTA------TGTGTG------------------------------AAGAGT--A-ATTCAGATTTTGGAAATAAC----------TA------TTAT-TTTTACAAAAA
gi|97077 : ATAC-ACTGTAAGACAAGTA--TTTGCTGACTATTATAA--T--ACATTC-----ATACT-GAAT-T-ATTA------TATGTG-AAGGGTATGTCAT---ATT-T-T---GC-AAGAGT--A-ATTCATATTTTGGGGATAAC--T-T-----TA------TTAT-TTTTACAAAAAc