lowQualScore : 444444 22222222222 1 111111 1 111111 11111 11 22222222222222222222222222 22222 11111111111111 11 111111111 111 111111 1111111111111111111 22222222222 11 1111111111 3333333 6666666666666666666666666 1111
lowQualScore : 333333 4 55 3 55 666 3 4 3 66 5 0 5 5 5 1 55555555555 5 2 0 5 0 6 55 55 8888 4 66 4 222222 66 1 4 6 111111 5 2 7 1 99 33333 22 2 1 1 1 222 777 33 9 88888888888888888888888888 33 00000 1 55555555555555 1 5 8 2 22 1 6 2 555555555 1 000 66 333 1 22 666666 22 3333 99999999 1 22 555555 3333333333333333333 77777777777 1 99 66 00 8888888888 888888888 0000000 22 555 5555555555555555555555555 666666 4444 444 777 3 666 4 666 4 6666 4 4 5 1 3 4 2 77777 7777 55 55 4 6
lowQualScore : ...... . .. . .. ... . . . .. . . . . . . ........... . . . . . . .. .. .... . .. . ...... .. . . . ...... . . . . .. ..... .. . . . . ... ... .. . .......................... .. ..... . .............. . . . . .. . . . ......... . ... .. ... . .. ...... .. .... ........ . .. ...... ................... ........... . .. .. .. .......... ......... ....... .. ... ......................... ...... .... ... ... . ... . ... . .... . . . . . . . ..... .... .. .. . .
lowQualScore : 444444 0 55 6 00 444 6 0 0 11 1 5 7 7 7 2 11111111111 0 2 1 6 1 0 55 55 5555 4 11 4 888888 11 7 4 8 555555 7 8 1 1 66 00000 55 5 6 6 6 333 666 00 3 00000000000000000000000000 44 55555 5 11111111111111 9 5 2 1 11 2 8 1 999999999 7 000 88 000 7 44 444444 55 9999 55555555 6 55 222222 4444444444444444444 55555555555 9 44 55 22 1111111111 000000000 1111111 99 888 9999999999999999999999999 111111 2222 222 999 4 111 4 000 8 1111 0 0 7 6 7 0 3 88888 0000 55 55 0 0
consensus : AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA--GAG-A--TGGGTGA--A---ATTTTG-CTGT-TCGTCT--CAACAGGAATAGGAATAG-CC-GTTGAGGGACTTAA-TGGTATGGTCAATTATGTACAGATATATCGAAACTAAGTTCAGATAAATGTTAGTTAAAATTAAGATTTGAAAGGATATTGAAAATATTAACTGTTAAGTGGTTTATGCGCTACTTGAATCTTTTTGATGCTATTATATAGTCTTGT--ACTG--TTAGAAAT----AAGCTTGTATTGATTTCAATGGATAACAAG-GGATCTCCAAACAAAAGTGTATTTACAGT--TGGT-TGTATGT------TT--AATTCTCGTATTTT-TTGTAACATAA------TGCCTCTCTGCTCCGTAT-ACAAA--G--G--ACAGACGAGGAGGTAATGAT-CT-G-TG-CTTTC--NATTGNTCCACATGTACANAGTG--GG----CTNT-TN--AT--TAA-GT-TTTTANNGAA-TAGATG--TTGN------TTAAGNGCGCTACAATT-TGTTCGAAGGCGAGTATG------CNGG-ATCTGTGATAN-T---CT-C--T--TN--C--C----TGCG------TAATAG--TGT------TT--------T-G-GA-----GTAN--TNGGT-CG-GTTNCTATT-NAGT-CTA-G------T-CTTAA---------AGGCTGTAAT--T---GAT-----TC--TGAG-------T-T--T------CTT---GTTTCT--ATN--GGTAGNTCGTTCCAATCCCTT--GTCGTNGAGGGAAGAAA--A-G-A-TTTGTAAAANAGCTGGGTATTAC-ATGGTAATGTACGGTTG----TC--AT--TTGA-ATTTCGCAGGTTGTACGTAAC
Reference ( gi|144608 ) : AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATTGAG-A--TGGGTGA--A---ATTTTG-CTGT-TCGTCT--CAACAGGAATAGGAATAG-CC-ATTGAGGGACTTAA-TGGTATGGTCAATTATGTACAGATATATCGAAACTATGTTCAGGTAAATGTTAGTTAAAATTAAGATTTGAAAGGAT-TTGAAAATATTAACTGTTAAGTGGTTTGTGCGCTACTTGAATCTTTTTGATGCTATTATATAGTCTTGT--ACTG--TTAGAAAT----AAGCTTGTATTGATTTCAATGGATAACAAG-GGATCTCCAAACAAAAGTGTATTTACAGT--TGGT-TGTATGT------TT--AATTCTCGTATTTT-TTGTACCATAA------TGTCTCTCTGCTCCGTAT-ACAAA--G--A--ACAAATGAAAAGGTAATGAT-CT-G-TG-TTTTC--TATTAATCCACATGTACAAAGTG--GG----CTGT-TG--AT--TAA-GT-TTTTATTGTA-TAGAAG--ATAA------TTAAGAGGACTACAGTA-TGTTCTAAGGCGAGTGTG------TTGG-ATCTGTGATAA-T---CT-C--T--TC--C--C----TGCA------TAATAG--TGT------TT--------T-G-GA-----GTAA--TAGGT-CG-GTTGCTATT-GAGT-TTA-G------T-CTTAA---------AAACTGTAAT--T---GAT-----TC--TGAG-------T-T--T------TTT---ATTTCT--ATT--GATAGTTCGTTCCAGTCCCTT--GTTGTCGAGGGAAGAAA--A-G-A-TTTGTAAAAAAGCTGGGTATTGC-ATGGTAATGTACGGTTG----TC--AT--TTGA-ATTTTGCAGGTTGTACGTAAC
gi|144609 : AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA------GAG-A--TGGGTGA--A---ATTTTT-CTGT-TCGTCT--CAACAGGAATAGGAATAG-CC-ATTGAGGGACTTAA-TGGTATGGTCAATTATGTACAGATATATCGAAACTAAGTTCGGATAAATGTTAGTTAAAATTAAGATTTGAAAGGAT-TTGAAAATATTAACTGTTAAGTGGTTTATGCGATACTTGAATCTTTTTTATGCTATTATATAGTCTTGT--ACTG--TTAGAAAA----AAGCTTGTATTGATTTCAATGGATAACAAG-GGATCTCCAAACAAAAGTGTATTTACAGT--TGGT-TGTATGT------TT--AATTCTCATATTTT-TTGTAACATAA------TGGCTCTCTGCTCCGTAT-ACAAA--G--A--ACAAATGAAGAGGTAATGAT-CT-G-TG-TTTTC--TATTAATCCACATGTACAAAGTG--GG----CTGT-TG--AT--TAA-TT-TTTTAGTGTG-TAGAAG--ATAA------TAAAGAGGACTACAGTA-TGTTCTAAGGCGAGTGTG------TTGG-ATCTATGATAA-T---CT-C--T--TC--C--C----TGCA------TAATAG--TGT------TT--------T-G-GA-----GTAA--TAGGT-CG-GTAGCTATT-GAGT-TTA-T------T-CTTAA---------AAACTGTAAT--T---GGT-----TC--TGAGT------T-T--T------TTT---ATTTCT--TTT--GATAGTTCATTCCAGTCCCTT--GTTGTCGAGGGAAGAAA--A-G-A-TTTGTAAAAAAGCTGGGTATTAC-ATGGTAATGTACGGTTG----TC--AT--TTGA-ATTTCGCAGGTTGTACGTTAC
gi|144610 : AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA------GAG-A--TGGGTGA--A---ATTTTG-CTGT-TTGTCT--CATCAGGAATAGGAATAG-CC-ATTGAGGGACTTAA-TGGTATGGTCAATTATGTACAGATATATTAAAA---------------------TTAAAACTAAGATTTGAAAGGATATTAAAAATATTAACTGTTTAGTGGTTTATGCTCTTCTTGAATCTTTTTGATGCTATTATATAGTCTTGT--ACTG--TTAGAAAT----AAGCTTGTATTTATTTCAATGGATAACAAG-GGATCTCCAAACAAAAGTGTATTTACAGT--TGGT-TGTATGT------TT--AATTCTCGTAGTTT-TTGTAACATAA------TACGTCTCTGCTACGTAT-ACAAA--G--A--ACAGATGAAGAGGTAATGAT-TT-G-TGTTTTTC--TATTAATCCACATGTACAAAGTG--GG----CTGT-TC--AT--TAA-GT-TTTTAGTGTA-TAGACG--ATAA------TTAAGAGGACTACAGTA-TGTTCTGAGGCGAGTGTG------TTGG-ATCTGTGATAA-T---CT-C--C--TT--C--C----TGCA------TAATAG--TGT------TT--------T-G-GA-----GTAA--TCGTT-CG-GC--CAATT-GA
gi|144612 : AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA------GAG-A--TGGGTGA--A---ATTTTG-CTGT-TCGTCT--CAACAGGAATAGGAATAG-CC-ATTGAGGGACTTAA-TGGTATGGTCAATTATGTACAGATATATCGAAACTAAGTTCAGATAAATGTTAGTTAAAATTAAGATTTGAAAGGAT-TTGAAAATATTAACTGTTAAGTGGTTTATGCGCTACTTGAATCTTTTTGATGCTATTATATAGTCTTGT--ACTG--TTAAAAAT----AAGCTTGTATTGATTTCAATGAATAACAAG-GGATCTCCAAACAAAAGTGCATTTAC
gi|144613 : AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA--GAGTA--T---CAA--A---A--TTG-CTAT-TAGTTTACCAAC
gi|144614 : AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA--GAG-G--T--------A---ATTTCATCTG----GTCG--AAACTGGAAT
gi|144611 : AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAT-----A--TGGGTGA--A---ATTTTG-CTGT-TCGTCT--CAACAGGAATAGGAATAG-CC-ATTGAGGGACTTAA-TGGTATGGTCACTTAAGTACAGATTTATCGAAAATAAATTCAAATAAATGTTAGTTAAAATTAAGATTTGGAAGAAT-TTTAAAATATTAAGTGTTAAGTGGTTTATGCGCTACTTGAATC-TTTTGATGCTATTATATAGTCTTGT--ACCG--TTAGAAAT----AAGCTTGTATTGATTTCAATGGATAACAAG-GGATCTCCAAATAAAAGTGTATTTACAGT--TGGC-TGTATGT------TT--AATTCTCGTATTTT-TTGTA-CATAA------TGTCTCT
gi|144615 : AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA--GAG-A--TGGGT-A--GCTTATTTTG-C
gi|144616 : AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG-A--TTTGTGATTA---ATGTTC-CTTTATTGTC
gi|144617 : AGAGAGAC--AG-T--TGGGTGA--A---ATTTTG-CTAT-TTGTCT--CGTCAGGAACAAGAATAA-CT-CTCGTTGGACTTAT-TGTCATAGTT-ATCTTGTATAGATTTATCGAAATAAT-TCCCAATAACTGTT
gi|144618 : GAG-AATTTGGTGG--A---ATTTCG-CTGT-TTGTCT--CATCTTAAATAGGAATAGTCC-GTTGAGGCATGTAA-----------AGTCATGTACAGATGTATCGAAAATAAGTTCAAATAACTGTGAGATAAAAATGTGATTTCGAAATATATTAAAAACAGCAACT-TTA------TTATGAACTCTTTGAATCTTTTTGATGTTATTATATAGTTTTGTTCATTG----AGGAAT----AATTTTGTTTTGATTT-GGTGGATGACATG-GTGTTTCCAAACAAAGGTGTATTTACTGT--TAGT-TTTATGT------TT--AATTCTCGTAGTTA-ATGTAGCATAATAATACTGCGTCTCTGTTCTGTAT-ACAAA--G--A--ACA
gi|144619 : GGGTGA--A---CATTTG-CTGT-TTGTCT--TA-------------TAT-CCCGTTGAGGGACCTAAATGGCGTGGTCAGTTGTATGTAGATGTACCGATA--ATG-----ATAAATGTTAGTTAAAAT-ATGATTTAGAAATAC-ATTAAAATC---ACT------TGGTTTACGTTTTATTTTA-TATTTTTTATGCTATTATATAATCTTGT--CCTG--TAGGGACT----ACGTTTGTGTTGGTTcttatgtataaagtggtttgtttattaagtgtttaatgagagaagatcatttagaggactacagtttgttctgaggatctgagatgatcacgtctctgtatattactatttaggagtaattggtcagttgtaattgagttcattccaacaaattgttattgattctgagtttttttttatttctgttgttagttcgtgccagtactttatcgtcgctgaaagacaagatttgtaaaaccgttgggtattatacgctaattgcattgataattgaaatt
gi|144620 : GTACAGATATATCGAAACTAAGTTTAGATAAATGTTAGTTAAAATTAAGATTTGAAAGGAT-TTGAAAATATTAACTGTTAAGTGGTTTATGCGCTACTTGAATCTTTTTGATGCTATTATATAGTGTTGT--ACTG--TTAGAAAT----AAGCTTGTATTGATTTCAATGGATAACAAG-GGATCTCCAAACAAAAGTGTATTTACAGT--TGGT-TGTATGT------TT--AATTCTCGTATTTT-TTGTAACATAA------TGTCTC--TGCTCCGAAT-ACAAA--G--A--ACAAATGAAGAGGTAATGAT-CT-G-TG-TTTTC--TATTAATCCACATGTACAACGTG--GG----CTGT-TG--AT--TAA-GT-TTTTAGTGTA-TAGAAG--ATAA------TTAAGAGGACTACAGTA-TGTTCTAAGGCGAGTGTG------TTGG-ATCTGTGATAA-T---CT-C--T--TC--C--C----TGCA------TAATAG--TGT------TT--------T-G-GA-----GTAA--TAGGT-CG-GTTGCTATT-GAGT-TTA-T------T-CTTAA---------AAACTGTAAT--T---GAT-----TC--TGAG-------T-T--T------TTT---ATTTCT--ATT--GATAGTTCGTTCCAGTCCCTT--GTTGTCGAGGGAAGAAA--A-G-A-TTTGTAAAAAAGCTGGGTATTGC-ATGGTAATGTACGGTTG----TC--AT--TTGA-ATTTCGCAGGTTGTACGTAAC
gi|144621 : TAAGATTTGAAAGGATATTAAAAGTATTCACTTTTAAATGGTTTATGCGCTACTT-----TTTCTGACGCTATTATATAGTCTTGT--ACTG--TTAGAAAT----AAGATTGTATTAATTTCAATGGATAACAAG-GGGTCTCCAAACAAAAGTGAATTAACAGT--TTGT-TGAATAT------TT--AATTCTCGTAGTTT-TTGTAACATGT------TGCGTCTCTGCTCCGTAT-ACAA---G--A--ACAGATGAAGATGTAATGAA-TT-G-TG-TTTTC--TATTAATC-ACATGTACAAAGTG--GG----CTGT-TC--AT--TAA-GT-TTTTAGTGTA-TAGAAG--ATAA------TTAAGAGGACACCAGTA-TGTTCTGAGGCGAGTGTG------TTGG-ATCTGTGATAA-T---CT-A--T--TC--C--C----TGCA------TAATAT--TTT------TT--------T-G-GA-----GTAA--TCGAT-CG-GTTGCTATT-GAGT-TTA-T------T-CTTTA---------AAACTGTAAT--T---GAT-----TC--TGAT-------T-T--T------TTTTAAATTTTT--ATT--GTTAGTTCGTTCCAATCCCTT--TTCGCAGAGTGAAGAAA--A-G-A-TTTGTAAATAAACTGGATATTTC-ATTGTAATGTAGTGTTG----TC--AT--TTGA-
gi|144622 : TGCGCTACTTGAATCTTTTTGATGCTATTATATAGTCTTGT--ACTA--TTAGAAAT----AAGCTTGTATTGATTTCAATGGATAACAAG-GGATCTCCAAACAAAAGTGTATTTACAGT--TGGT-TGTATGT------TT--AATTCTCGTATTTT-TTGTAACATAA------TGTCTCTCTGCTCCGTAT-ACGAA--G--A--GCAAATGAAGAGGTAATGAT-CT-G-TG-TTTTC--TATTAATCCACATGTACAAAGTG--GG----CTGT-TG--AT--TAA-GT-TTTTAGTGTA-TAGAAG--ATAA------TTAAGAGGACTACAGTA-TGTTCTTAGGCGAGTGTG------TTGG-ATCTGTGATAA-T---CT-C--T--TC--C--C----TGCA------TAATAG--TGT------TT--------T-G-GA-----GTAA--TAAGT-CG-GTTGCTATT-GAGT-TTA-T------T-CTTAA---------AAACTGTAAT--T---GAT-----TC--TGAG-------T-T--T------TTT---ATTTCT--ATT--GATAGTTCGTTCCAGTCCCTT--GTTGTAGAGGGAAGAAA--A-G-A-TTTGTAAAAAAGCTGGGTATTAC-ATGGTAATGTACGGTTG----TC--AT--TTGA-ATTTCGCAGGTTGTACGTAAC
gi|144625 : aTATATATTTGTGG--ACAGCATTAAAAATTTCGACGTTTGTATTG-------TGGGTGAGATGAGGTTCACCAAAGAGAAGTGTGTTGAGGGTAACAGTGCATATGTGAGAGATT--GATTC--GAAT--------AGCGTAG------CGC------GTTCGGTATGATAAATAG--G--ACAGACGAGGAGGTAATGAT-TC-G-TA-CTTTC--AATTGCTCCACATGTACACAGTGGAGA----ATTT-TC--AA--TA---T-TTTTTTGGAA-TAAGTG--TTGT------TTCAGCGTGCTACAATT-CGTACGAAGACGAATATG------C--A-ATACCTGACAT-T---TT-C--TTGTG--C--C----TGTG------TAAAAG--TGT------TT--------T-G-AT-----GT-T--TTGGTAAG-ATTTTTATT-TAG--CTG-G------TGCTTAA---------AGGC----AT--T---GATAG---AA--AGAG-------C-TCGT------CTT---GTTTCA--ATA--GTTAGATTGTTCCAATC
gi|144626 : CAAATAAAAGTAAGTTTAAAG----AAT-TAT---T------TTGAAATTCAAGCAGTTTATTGC-TCATGG------TGTTTCTTTGTCTAATGT-ATTTT--G--G--ACATTCGAAAAGAAAGTGAT-TG-A-TA-TCTTA--AATTTGGCCGCAGGAGCAAAATG--AA----TTAT-CA--AT--GAT-GT-TTGT-TTGAA-TAAAGGTGCTGA------TTAAGACTACTGCGGTT-TGTTCTGAGACGAGTGTG------CATG-ATATGTGATTT-T---CT-A--T--TG--CTAC----TATAG-----TAATAG--TAT------TT--------T----------GT----TATTT-TA-TTTG-TATT--AGTGTTA-ATCACTTT-CTTAA---------AAACTG--ATGGC---GAT-----GG--TGCT-------T-C--T------TTT---GTAACT--TGT--GAAAGCATGTTCCAAT--CTTAAATAGTGGAAGGAAGAAAGTA-G---TTTACATACAA-CTGGGTATTGC-ATTTTAATGTCC--TTG-----C--ATGGTCGGCATTCCGTAAGTTATA
gi|144627 : ------TGTTTCTCTGAATAGTGT-ACAAA--G--A--ACAG-TGCAAA--TAATG-T-TT-A-TA-TCTTC--AATACATTCGCATGCACATAAAG--GG----CTCT-CT--AT--TAA-AT-GTTAAT---A-CAGATG--GTGC------TTCAGGTTGCTGCA-TAGTGTCTGAAGATG--TGTG------TGGA-ACTTGTAATTT-G---CT-A--T--TA--T--C----TGTG------TAATAC--TGT------TT--------TGG-GA-----ATTT--TA--T-CATATTACTGTT-AAAT-TTA-T------T-ATTAA---------AGA---TAAT--TA--GATAC---TC--TGAT-------TGT--T------TTT---GTTT
gi|144628 : GTTCGGTATGATAAATAG--G--ACTGACGAGGAGGTAATAAT-TC-G-TA-CTTTC--AGTTGCTCCACATGTACACAGTG--GA----GAAT-T----T--TCA-AT-ATTTTTT----TAGA----ATAAGTGTTTTTTAGCGTGCTACAATT-CGTACGAAGACGAGTATG------CAAG-ACC--TGATAC-T---TTAC--TTGTG--C--C----TGTG------TAAAAG--TGT------TT--------T-G-AT-----GT-T--TTGGTAAG-ATTTTTATT-TAG--CTG-G------TGCTTAA---------AGGC----AT--T---GATAGAA-AC----AG-------C-TCGT------CTT---GTTTCT--ATA--GGTAGATTGTTCCAATC
gi|144629 : GTTCGGTATGATAAATAG--G--ACAGACGAGGAGGTAATGAT-TT-G-TA-CTTTC--AATTGCTCCACATATACATAGTG--GGGAA-TTTT-CA--AT----A-TT-TTTTTTTGAA-TAAGTG--TTGT------TTCAGCGTGCTACAATT-CGTACGAATACGAGTATG------CAAG-ACC--TGACAT-T---TT-C--T--T
gi|144630 : AT-AAATA--G--G--ACAGATGAGGAGGTAATGAT-TT-G-TA-CTTTC--AATTGCTCCACATGTACATAGTGGAGA----ATTT-TC--AA--TA---T-TTTTTTGGAA-TAAGTG--TTGT------TTCAGCGTGCTACAATT-TGTACGAAGACGAGTATG------CAAG-ACC--TGACAT-T---TT-C--TTGTG--C--C----TGTG------TAAAAG--TGT------TT--------T-G-AT-----GT-T--TTGGTAAG-ATTTTTATT-TAG--CTG-G------TGCTTAA---------AGGC----AT--T---GAT-----------AGAAACGGCT-TG-T------CTT---GTTTCA--ATA--GGTAGATTGTTCCAATC
gi|144631 : AT-AAATA--G--G--ACAGACGAGGAGGTAATGAT-TT-G-TA-CTTTC--AATTGCTCCACATGTACATAGTGGAGA----ATTT-TC--AA--TA---T-TTTTTTGGAA-TAAGTG--TTGT------TTCAGCGTGCTACAATT-TGTACGAAGACGAGTATG------CAAG-ACC--TGACAT-T---TT-C--TTGTG--C--C----TGTG------TAAAAG--TGT------TT--------T-G-AT-----GT-T--TTGGTAAG-ATTTTTATT-TAG--CTG-G------TGCTTAA---------AGGC----AT--T---GAT-----------AGAAACGGCT-TG-T------CTT---GTTTCA--ATA--GGTAGATTGTTCCAATC
gi|144624 : AT-AAATA--G--G--ACAGACGAGGAGGTAATGAT-TT-G-TA-CTTTC--AATTGCTCCACATGTACATAGTGGAGA----ATTT-TC--AA--TA---T-TTTTTTGGAA-TAAGTG--TTGT------TTCAGCGTGCTACAATT-TGTACGAAGACGCGTATG------CAAG-ACC--TGACAT-T---TT-C--TTGTG--C--C----TGTG------TAAAAG--TGT------TT--------T-G-AT-----GT-T--TTGGTAAG-ATTTTTATT-TAG--CTG-G------TGCTTAA---------AGGC----AT--T---GAT-----------AGAAACGGCT-TG-T------CTT---GTTTCA--ATA--GGTAGATTGTTCCAATC
gi|144623 : tatatatttgtggacagctttaaaaatttcgacgtttgtattgtggaggagatgaggttctccaaagagaagtgtgttgagggtaacagtgcatatatgagagattgatgcaagaagtgtagcgcgttcgacatgAT-AAATA--G--G--ACAGACGAGGAGGTAATGAT-TT-G-TA-CTTTC--AATTGCTCCACATGTACATAGTG--GG----GAAT-T----T--TCA-ATATTTTTTTGGAATAAGTG--TTGT------TTCAGCGTGCTACAATT-TGTACGAAGACGAGTATG------CAAG-ACCTG--ACAT-T---TT-C--T--TGTGC--C----TGTG------TAAAAG--TGT------TTTGATGTTTT-G--------GTAA---------G-ATTTTTATT-TAG--CTG-G------TGCTTTA---------AGGC----AT--T---GAT-----------AGAAACGGCT-TG-T------CTT---GTTTCA--ATA--GGTAGATTGTTCCAATC
gi|144632 : tatatatttgtggacagctttaaaaatttcgacgtttgtattgtgggggagatgaggttctccaaagagaagtgtgttgagggtaacagtgcatatatgagagattgatgcaagaagtgtagcgcgttcggcatgAT-AAATA--G--G--ACAGACAAGGAGGTACTAAT-TT-G-TA-CTTTC--AATTGCTCCACATGTACATAGTG--G
gi|144633 : -ACAAATAG--G--ACAGACGAAGAGGTAATGAT-TT-G-TA-CTTTC--AATTGCTCCATGTGTACATAGTGGAGA----ATTT-TC--AA--TA---T-TTTTTTGGAA-TAAGTG--TTGT------TTCAGCGTGCTACAATT-TGTACGAAGACGAGTATG------CAAG-ACC--TGACAT-T---TT-C--TTGTG--C--C----TGTG------TAAAAG--TGT------TT--------T-G-AT-----GT-T--TTGGTAAG-ATTTTTATT-TAG--CTG-G------TGCTTAA---------AGGC----AT--T---GATAGAAATC---GCT-------T-G--T------CTT---GTTTCA--ATA--GGTAGATTGTTCCAATC
gi|144634 : AAA--G--GTGACAATTGAGAAGGAAGTGAG-CT-G-TG-CTCTC--TATTTGACCACATATACACAGAG--GGGAATCTAC--G--AT------GT-GTTTAAGAAA-TAGATG--TTGC------TTAAGAGCACTACAGCT-CGTTCGAAGGCGAGCATG------
gi|144635 : AAA--G--GTGACAATTGAGAAGGAAGTGAG-CT-G-TG-CTCTC--TATTTGACCACATATACACAGAG--GAGAATCTAC--G--AT------GT-GTTTAAGAAA-TAGATG--TTGC------TTAAGAGCACTACAGCT-CGTTCGAAGGCGAGCATG------
gi|144637 : AAA--GTTG--ACAATTGAGAAAGAAGTGAG-CT-G-TG-CTTTC--TATTTGTCCACATGTACATAGAG--GG----CAAT-CT--AC--AAT-GT-GTTTAAGAAA-TAGATG--TTGC------TTAGGTGCACTACAACT-CGTTCGGAGGCGGGCATG------
gi|144636 : AAA--G--GTGACAATTGAGAAAGAAGTGAG-CT-G-TG-CTTTC--TATTTGTCCACATGTACACAGGG--GGGA--GTCT-TC--AA--TA---T-GTTTAAGAAA-TAGATG--TTGC------TTAAGTGCACTACAACT-CGTTCGGAGGCGGGCATGCAATAATTGGCATTT--------C---CT-T--G--TA--C--C----TATG------TAATAG--AAT------TT--------A-G--------GTACTTTTGGT-TC-GTTACCTTC-GAGT-TTATG------T--TTAA---------AA---GT----------AT-----TC--AGAGAAGAGGCT-TG-T------CTT---GTTTCA--AGTGGGAGAGT--GTTCCAGTC
gi|144638 : AAA--G--GTGACAATTGAGAAAGAAGTGAA-CT-A-TA-CTTTC--TATTTGTCCACATGTACACAGAG--GG----GAGTCT----T--CAATGT-GTTTAAGAAA-TAGATG--TTGC------TTAAGTGCACTACAACT-TGTTCGGAGGC-AG------------GA-ATC---AATAA-TTGGCA-T--T--TC--C--T----TGTAGCTATGTAAAAGAATGT------T--------------A-----GTACTTTTGGT-TA-GTTA-TATTCGAGT-TTATG------T--TTAA---------AAGC
gi|144639 : --G--G--ACAGTTGAGTAAGAAATG-T-TT-ACTG-TCTTC--GAGTGAACGGCATGTGCACA-TG--GGA---CTTT-CA--AC--AAT-AT-TTTTGGAATA-TAAATG--TTGG------TTAAGTGAACTACAATT-TAGTCGTAGACGGGTATG------GTTT-ATTTGAGATAA-T---CT-G--T--CT--C--CGTGGTGGA-------AATAG---GTAGAAACTT--------T-GTCA-----ATAA--TAGG-----------GTT-TAGT-CTA-T------T-CTTAA---------A---TATACT--T---AATG----TTGGTGAG-------T-T--C------TGG---GTTAGT--ATA--GGTAAACTATTCCATGCTTTC--ATTGTTGAAGGAAGAAA--GCG-A-TGTGC-AAAGAGTTGTGTATTAC-A-AGCAAT---TGGTTGAATATT--GT--GTGA-GTTTCGTAAATTGTA
gi|144640 : --ACAGTTGAGTAAGAAATGATACT-G-T---CTTC--GAGTGAACAGCCTGTGCACA-TG--AGA---CTTT-CA--ACAATAA----TTTTAGAATA-TAAATG--TTGA------TTAAGTGAACTACAATT-TAGTCTTAGATGGGTATG------GTAT-ATTTGAGCCAA-T---CT-C--T---------C----TCCA------TGGAGG--AAC------TT--------T-GTCA-----ATAA--TA-------GTT----TT-CAGT-CTA-T------T-CTTAA---------A---TATACT--T---AATG----TTGGTGAG-------T-T--C------TGG---GTTGCT--ATA--GGTAAACTATTCCATGCTTTT--ACTGTTGAAGGAAGAAA--T-GAA-TTTGC-AAAGAGTTGTGTAATAT-A-AGCAAT---TGGTTGAATATT--GT--GTGA-GTTTCGTAAATTGTA
gi|144641 : ATGAATAAATAATGAT-AT-G-TG-TCTTC--AATTTCACCACAAAGACAATTTG--GA----CT---TGCAAC--TAT-GT-TTTTATTGAA-TAAATG--TTGA------TTCAAGTTACTGCAATT-TGTATGAAGTCGTGTATG------CTAT-ATTTG-GGCAG-T----T-CGGT--TT--C--C----TGTA------TAATAG--TGA------TT--------T-G-GA-----
gi|144642 : ATGAAAAG-TAATG-T-CTCG-TA-TCTTCAATACT--TTCGCATGAACA---T---------CTAT-TG--TT--TGA-AT----------A-AAGAAT--TTCA------TTGAGCTTGCTGCATTG-TGTCCAAAGACG----TG------TT-----TTGTAATTT-T---CT-A--T--TA--C--C----AG--------TAATAG--TTT------TTC-------T-T-GATTTTTATAA--TA--------TTACTGT--AAAT-TTT-G------T-TTTCA---------AA--TATAGT--TAGAGAT-----TC--TGAA-------T-G--T------TTT---ATTTCTGGAGC--AAGAGT--AGTCCA-TTCTTA--GTTGTTGGTGGAAGAAA--G-G-AGTTTGC-ATATAGCAGGATATTACAATAATGGTGTTC--TTG----TCTTAT--TTGT-ATAACGAAGGTTGTA
gi|144618 : ATGTATAAAGTG--GT----TTGT-TT--AT--TAA-GT-GTTTAATG-A-GAGAAG--ATCA------TTTAGAGGACTACAGTT-TGTTCTGAGG-------------------ATCTGAGATGA-T---CA-C--G--TC--T--C----TGTA------TATTAC--TAT------TT--------A-G-GA-----GTAA--TTGGT-CA-GTTGTAATT-GAGT-TCA-T------T-CCAAC---------AAATTGTTAT--T---GAT-----TC--TGAGTTT----T-T--T------TTT---ATTTCT--GTT--GTTAGTTCGTGCCAGTACTTT--ATCGTCGCTGAAAGACA--A-G-A-TTTGTAAAACCGTTGGGTATTAT-ACGCTAAT-TGC-ATTG----AT--AA--TTGA-AATT
gi|144643 : gagaatttggtggaatttcgctgtttgtctcatcttaaataggaatagtccgttgaggcatgtaaagtcatgtacagatgtatcgaaaataagttcaaataactgtgagataaaaatgtgatttcgaaatatattaaaaacagcaactttattatgaactctttgaatctttttgatgttattatatagttttgttcattgaggaataattttgttttgatttggtggatgacatggtgtttccaaacaaaggtgtatttactgttagttttatgtttaattctcgtagttaatgtagcataataatactgcgtctctgttctgtatacaaagaacactt-TG--AT--TGG-GGGTTTTAGTGTA-TAGCAG--ATAA------TCAAGAGAACTACAATT-TGGTCTGACGAAATTGTG------GTAA-ATTTGAAATAAAT---GT-C--T--TC--C--G----TGTG------TAATAA--TAA------TT--------A-G-GA-----GTAA--TCGGT-CG-GTTGCTATC-GAGT-GTA--------T-TTTGATATACTCTTAAATTGATAT--T---GAT-----TC--TGAG-------T-T--TCTTTGTTTT---ATTTCT--GTT--GTCAGTTCGTCCCAAACCCTT--ATCGTAGAGGAGAGCAA--A-G-A-TTTGTAAAATAGTTGTGTAGTAC-ATGATATTGTGCGGTTG----TC--AT--TTGA-ATTTCACAGGATGTATGTAAC
Alignments
lowQualScore : 1 111111 111111 11 11111111 111 11 11 11111111 1111 1111111 11111111111111111111 2222222 555555555555555555555555555555 1111
lowQualScore : 55 3 2 44 555 3 3 1 55 3 5 888 5 5 0 9 2 00 8 3 55 55 7777 4 55 4 111111 55 0 4 4 0 000000 00 1 6 0 99 22 88 22 33 1 33 1 33 1 55555555 1 1 666 777 444 0 22 0 1 22 1 66 0 0 9999 00 22 1 22 88 1 44 1 55 333 22 333 555555 1 33333333 2222 1 6666666 55 22 99999999999999999999 9999999 22 555 888888888888888888888888888888 0 999999 0 1 55555 3 0 1 55 2 1 3 3 3 4 3 1 3 1 3 2 5 5555 55 55 3
lowQualScore : .. . . .. ... . . . .. . . ... . . . . . .. . . .. .. .... . .. . ...... .. . . . . ...... .. . . . .. .. .. .. .. . .. . .. . ........ . . ... ... ... . .. . . .. . .. . . .... .. .. . .. .. . .. . .. ... .. ... ...... . ........ .... . ....... .. .. .................... ....... .. ... .............................. . ...... . . ..... . . . .. . . . . . . . . . . . . . .... .. .. .
lowQualScore : 00 6 5 66 888 3 6 8 55 7 0 888 0 0 1 4 9 88 2 9 00 00 7777 0 55 0 555555 55 6 0 0 8 555555 66 8 7 5 22 33 88 22 77 5 44 0 33 0 88888888 0 0 999 000 555 6 00 1 0 99 0 44 8 8 4444 44 77 7 33 33 0 88 7 88 000 44 000 000000 7 44444444 6666 0 5555555 66 99 11111111111111111111 2222222 88 555 444444444444444444444444444444 5 222222 6 0 33333 1 6 1 00 5 0 6 6 6 4 6 0 6 3 6 6 9 5555 00 00 6
consensus : AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA--GAG-ATGGGTGA--A---ATTTTG-CTGT-TCGTCT--CAACAGGAATAGGAATAG-C---C-GTTGAGGGACTTAA-TGGTATGGTCAATTATGTACAGATATATCGAAACTAAGTTCAGATAAATGTTAGTTAAAATTAAGATTTGAAAGGATATTGAAAATATTAACTGTTAAGTGGTTTATGCGCTACTTGAATCTTTTTGATGCTATTATATAGTCTTGT--ACTG--TTAGAAAT----AAGCTTGTATTGATTTCAATGGATAACAAG-GGATCTCCAAACAAAAGTGTATTTACAGT--TGGT-TGTATGT------TT--AATTCTCGTATTTT-TTG-TAACATAA------TGCCTCTCTGCTCCGTAT-ACAAA--G--G--ACAGACGAGGAGGTAATGAT--CT-GTG-CTTTCNATTGNTCCACATGTACANAGTG--GG---NTNTTCAN--TAA-GTTTTTANNGAATA--GATGTTGNTT-AAGNGCGCTACAATTTGTTCGAAGGCGAGTATGCNA-GATCTGTGACAN-TCT-C--T--TNC--C-TGC-GT---AATAG--TG---T------TT-TG-GA-----GTA--NTTGGT-CG-G--TTNCTATT-NAGTC---TA----G------T-CTTAAAGGCTGTAAT--T---GAT-----TC--TG----A--G-------TT--TCTT------GTTTCTATNG-----GTAGNTCGTTCCAATCCCTT--GTCGTCGAGGGAAGAAAA-G-A-TTTGTAAA-ANAGCTGGGTATTAC-ATGGTAATGTACGGTTG----TC--AT--TTGA-ATTTCGCAGGTTGTACGTAAC
Reference ( family-583 ) : AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA--GAG-ATGGGTGA--A---ATTTTG-CTGT-TCGTCT--CAACAGGAATAGGAATAG-C---C-GTTGAGGGACTTAA-TGGTATGGTCAATTATGTACAGATATATCGAAACTAAGTTCAGATAAATGTTAGTTAAAATTAAGATTTGAAAGGATATTGAAAATATTAACTGTTAAGTGGTTTATGCGCTACTTGAATCTTTTTGATGCTATTATATAGTCTTGT--ACTG--TTAGAAAT----AAGCTTGTATTGATTTCAATGGATAACAAG-GGATCTCCAAACAAAAGTGTATTTACAGT--TGGT-TGTATGT------TT--AATTCTCGTATTTT-TTG-TAACATAA------TGCCTCTCTGCTCCGTAT-ACAAA--G--G--ACAGACGAGGAGGTAATGAT--CT-GTG-CTTTCNATTGNTCCACATGTACANAGTG--GG---CTNTTNAT--TAA-GTTTTTANNGAATA--GATGTTGNTT-AAGNGCGCTACAATTTGTTCGAAGGCGAGTATGCNG-GATCTGTGATAN-TCT-C--T--TNC--C-TGC-GT---AATAG--TG---T------TT-TG-GA-----GTA--NTNGGT-CG-G--TTNCTATT-NAGTC---TA----G------T-CTTAAAGGCTGTAAT--T---GAT-----TC--TG----A--G-------TT--TCTT------GTTTCTATNG-----GTAGNTCGTTCCAATCCCTT--GTCGTNGAGGGAAGAAAA-G-A-TTTGTAAA-ANAGCTGGGTATTAC-ATGGTAATGTACGGTTG----TC--AT--TTGA-ATTTCGCAGGTTGTACGTAAC
gi|144608 : AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATTGAG-ATGGGTGA--A---ATTTTG-CTGT-TCGTCT--CAACAGGAATAGGAATAG-C---C-ATTGAGGGACTTAA-TGGTATGGTCAATTATGTACAGATATATCGAAACTATGTTCAGGTAAATGTTAGTTAAAATTAAGATTTGAAAGGAT-TTGAAAATATTAACTGTTAAGTGGTTTGTGCGCTACTTGAATCTTTTTGATGCTATTATATAGTCTTGT--ACTG--TTAGAAAT----AAGCTTGTATTGATTTCAATGGATAACAAG-GGATCTCCAAACAAAAGTGTATTTACAGT--TGGT-TGTATGT------TT--AATTCTCGTATTTT-TTG-TACCATAA------TGTCTCTCTGCTCCGTAT-ACAAA--G--A--ACAAATGAAAAGGTAATGAT--CT-GTG-TTTTCTATTAATCCACATGTACAAAGTG--GG---CTGTTGAT--TAA-GTTTTTATTGTATA--GAAGATAATT-AAGAGGACTACAGTATGTTCTAAGGCGAGTGTGTTG-GATCTGTGATAA-TCT-C--T--TCC--C-TGC-AT---AATAG--TG---T------TT-TG-GA-----GTA--ATAGGT-CG-G--TTGCTATT-GAGTT---TA----G------T-CTTAAAAACTGTAAT--T---GAT-----TC--TG----A--G-------TT--TTTT------ATTTCTATTG-----ATAGTTCGTTCCAGTCCCTT--GTTGTCGAGGGAAGAAAA-G-A-TTTGTAAA-AAAGCTGGGTATTGC-ATGGTAATGTACGGTTG----TC--AT--TTGA-ATTTTGCAGGTTGTACGTAAC
gi|144609 : AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA--GAG-ATGGGTGA--A---ATTTTT-CTGT-TCGTCT--CAACAGGAATAGGAATAG-C---C-ATTGAGGGACTTAA-TGGTATGGTCAATTATGTACAGATATATCGAAACTAAGTTCGGATAAATGTTAGTTAAAATTAAGATTTGAAAGGAT-TTGAAAATATTAACTGTTAAGTGGTTTATGCGATACTTGAATCTTTTTTATGCTATTATATAGTCTTGT--ACTG--TTAGAAAA----AAGCTTGTATTGATTTCAATGGATAACAAG-GGATCTCCAAACAAAAGTGTATTTACAGT--TGGT-TGTATGT------TT--AATTCTCATATTTT-TTG-TAACATAA------TGGCTCTCTGCTCCGTAT-ACAAA--G--A--ACAAATGAAGAGGTAATGAT--CT-GTG-TTTTCTATTAATCCACATGTACAAAGTG--GG---CTGTTGAT--TAA-TTTTTTAGTGTGTA--GAAGATAATA-AAGAGGACTACAGTATGTTCTAAGGCGAGTGTGTTG-GATCTATGATAA-TCT-C--T--TCC--C-TGC-AT---AATAG--TG---T------TT-TG-GA-----GTA--ATAGGT-CG-G--TAGCTATT-GAGTT---TA----T------T-CTTAAAAACTGTAAT--T---GGT-----TC--TG----A--GT------TT--TTTT------ATTTCTTTTG-----ATAGTTCATTCCAGTCCCTT--GTTGTCGAGGGAAGAAAA-G-A-TTTGTAAA-AAAGCTGGGTATTAC-ATGGTAATGTACGGTTG----TC--AT--TTGA-ATTTCGCAGGTTGTACGTTAC
gi|144610 : AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA--GAG-ATGGGTGA--A---ATTTTG-CTGT-TTGTCT--CATCAGGAATAGGAATAG-C---C-ATTGAGGGACTTAA-TGGTATGGTCAATTATGTACAGATATATTAAAA---------------------TTAAAACTAAGATTTGAAAGGATATTAAAAATATTAACTGTTTAGTGGTTTATGCTCTTCTTGAATCTTTTTGATGCTATTATATAGTCTTGT--ACTG--TTAGAAAT----AAGCTTGTATTTATTTCAATGGATAACAAG-GGATCTCCAAACAAAAGTGTATTTACAGT--TGGT-TGTATGT------TT--AATTCTCGTAGTTT-TTG-TAACATAA------TACGTCTCTGCTACGTAT-ACAAA--G--A--ACAGATGAAGAGGTAATGAT--TT-GTGTTTTTCTATTAATCCACATGTACAAAGTG--GG---CTGTTCAT--TAA-GTTTTTAGTGTATA--GACGATAATT-AAGAGGACTACAGTATGTTCTGAGGCGAGTGTGTTG-GATCTGTGATAA-TCT-C--C--TTC--C-TGC-AT---AATAG--TG---T------TT-TG-GA-----GTA--ATCGTT-CG-G--
gi|144611 : AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA--GAT-ATGGGTGA--A---ATTTTG-CTGT-TCGTCT--CAACAGGAATAGGAATAG-C---C-ATTGAGGGACTTAA-TGGTATGGTCACTTAAGTACAGATTTATCGAAAATAAATTCAAATAAATGTTAGTTAAAATTAAGATTTGGAAGAAT-TTTAAAATATTAAGTGTTAAGTGGTTTATGCGCTACTTGAATC-TTTTGATGCTATTATATAGTCTTGT--ACCG--TTAGAAAT----AAGCTTGTATTGATTTCAATGGATAACAAG-GGATCTCCAAATAAAAGTGTATTTACAGT--TGGC-TGTATGT------TT--AATTCTCGTATTTT-TTG-T-ACATAA------TGTCTCTccaattga
gi|144612 : AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA--GAG-ATGGGTGA--A---ATTTTG-CTGT-TCGTCT--CAACAGGAATAGGAATAG-C---C-ATTGAGGGACTTAA-TGGTATGGTCAATTATGTACAGATATATCGAAACTAAGTTCAGATAAATGTTAGTTAAAATTAAGATTTGAAAGGAT-TTGAAAATATTAACTGTTAAGTGGTTTATGCGCTACTTGAATCTTTTTGATGCTATTATATAGTCTTGT--ACTG--TTAAAAAT----AAGCTTGTATTGATTTCAATGAATAACAAG-GGATCTCCAAACAAAAGTGCATTTAC
gi|144613 : AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA--GAGTAT---CAA--A---A--TTG-CTAT-TAGTTTACCAAC
gi|144614 : AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA--GAG-GT--------A---ATTTCATCTG----GTCG--AAACTGGAAT
gi|144615 : AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA--GAG-ATGGGT-A--GCTTATTTTG-C
gi|144616 : AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA--GAG-ATTTGTGATTA---ATGTTC-CTTTATTGTC
gi|144617 : AGAGAGA--CAG-TTGGGTGA--A---ATTTTG-CTAT-TTGTCT--CGTCAGGAACAAGAATAA-CTCTC-GTT---GGACTTAT-TGTCATAGTT-ATCTTGTATAGATTTATCGAAA-TAATTCCCAATAACTGTT
gi|144618 : GA--GAA-TTTGGTGG--A---ATTTCG-CTGT-TTGTCT--CATCTTAAATAGGAATAGTC---C-GTTGAGGCATGTAA-----------AGTCATGTACAGATGTATCGAAAATAAGTTCAAATAACTGTGAGATAAAAATGTGATTTCGAAATATATTAAAAACAGCAACT-TTA------TTATGAACTCTTTGAATCTTTTTGATGTTATTATATAGTTTTGTTCATTG----AGGAAT----AATTTTGTTTTGATTT-GGTGGATGACATG-GTGTTTCCAAACAAAGGTGTATTTACTGT--TAGT-TTTATGT------TT--AATTCTCGTAGTTA-ATG-TAGCATAATAATACTGCGTCTCTGTTCTGTAT-ACAAA--G--A--ACA
gi|144618 : ATGTATAAAGTG--GT---TTGTTTAT--TAA-GTGTTTAATGAG-A--GAAGATCATT-TAGAGGACTACAGTTTGTTC-----------TG-AG-GATCTGAGATGA-TCA-C--G--TCT--C-TGT-AT---ATTAC--TA---T------TT-AG-GA-----GTA--ATTGGT-CA-G--TTGTAATT-GAGTT---CA----T------T-CCAACAAATTGTTAT--T---GAT-----TC--TG----A--GTTT----TT--TTTT------ATTTCTGTTG-----TTAGTTCGTGCCAGTACTTT--ATCGTCGCTGAAAGACAA-G-A-TTTGTAAA-ACCGTTGGGTATTAT-ACGCTAAT-TGC-ATTG----AT--AA--TTGA-AATTcttatgtataaagtggtttgtttattaagtgtttaatgagagaagatcatttagaggactacagtttgttctgaggatctgagatgatcacgtctctgtatattactatttaggagtaattggtcagttgtaattgagttcattccaacaaattgttattgattctgagtttttttttatttctgttgttagttcgtgccagtactttatcgtcgctgaaagacaagatttgtaaaaccgttgggtattatacgctaattgcattgataattgaaatt
gi|144619 : gagaatttggtggaatttcgctgtttgtctcatcttaaataggaatagtccgttgaggcatgtaaagtcatgtacagatgtatcgaaaataagttcaaataactgtgagataaaaatgtgatttcgaaatatattaaaaacagcaactttattatgaactctttgaatctttttgatgttattatatagttttgttcattgaggaataattttgttttgatttggtggatgacatggtgtttccaaacaaaggtgtatttactgttagttttatgtttaattctcgtagttaatgtagcataataatactgcgtctctgttctgtatacaaagaacacttGGGTGA--A---CATTTG-CTGT-TTGTCT--TA-------------TAT-C---CCGTTGAGGGACCTAAATGGCGTGGTCAGTTGTATGTAGATGTACCGA---TAA--T--GATAAATGTTAGTTAAAAT-ATGATTTAGAAATACATTAAAA----TCACT------TGGTTTACGTTTTATTTTA-TATTTTTTATGCTATTATATAATCTTGT--CCTG--TAGGGACT----ACGTTTGTGTTGGTT
gi|144620 : GTACAGATATATCGAAACTAAGTTTAGATAAATGTTAGTTAAAATTAAGATTTGAAAGGAT-TTGAAAATATTAACTGTTAAGTGGTTTATGCGCTACTTGAATCTTTTTGATGCTATTATATAGTGTTGT--ACTG--TTAGAAAT----AAGCTTGTATTGATTTCAATGGATAACAAG-GGATCTCCAAACAAAAGTGTATTTACAGT--TGGT-TGTATGT------TT--AATTCTCGTATTTT-TTG-TAACATAA------TG--TCTCTGCTCCGAAT-ACAAA--G--A--ACAAATGAAGAGGTAATGAT--CT-GTG-TTTTCTATTAATCCACATGTACAACGTG--GG---CTGTTGAT--TAA-GTTTTTAGTGTATA--GAAGATAATT-AAGAGGACTACAGTATGTTCTAAGGCGAGTGTGTTG-GATCTGTGATAA-TCT-C--T--TCC--C-TGC-AT---AATAG--TG---T------TT-TG-GA-----GTA--ATAGGT-CG-G--TTGCTATT-GAGTT---TA----T------T-CTTAAAAACTGTAAT--T---GAT-----TC--TG----A--G-------TT--TTTT------ATTTCTATTG-----ATAGTTCGTTCCAGTCCCTT--GTTGTCGAGGGAAGAAAA-G-A-TTTGTAAA-AAAGCTGGGTATTGC-ATGGTAATGTACGGTTG----TC--AT--TTGA-ATTTCGCAGGTTGTACGTAAC
gi|144621 : TAAGATTTGAAAGGATATTAAAAGTATTCACTTTTAAATGGTTTATGCGCTACTT-----TTTCTGACGCTATTATATAGTCTTGT--ACTG--TTAGAAAT----AAGATTGTATTAATTTCAATGGATAACAAG-GGGTCTCCAAACAAAAGTGAATTAACAGT--TTGT-TGAATAT------TT--AATTCTCGTAGTTT-TTG-TAACATGT------TGCGTCTCTGCTCCGTAT-AC-AA--G--A--ACAGATGAAGATGTAATGAA--TT-GTG-TTTTCTATTAAT-CACATGTACAAAGTG--GG---CTGTTCAT--TAA-GTTTTTAGTGTATA--GAAGATAATT-AAGAGGACACCAGTATGTTCTGAGGCGAGTGTGTTG-GATCTGTGATAA-TCT-A--T--TCC--C-TGC-AT---AATAT--TT---T------TT-TG-GA-----GTA--ATCGAT-CG-G--TTGCTATT-GAGTT---TA----T------T-CTTTAAAACTGTAAT--T---GAT-----TC--TG----A--T-------TT--TTTTTAA---ATTTTTATTG-----TTAGTTCGTTCCAATCCCTT--TTCGCAGAGTGAAGAAAA-G-A-TTTGTAAA-TAAACTGGATATTTC-ATTGTAATGTAGTGTTG----TC--AT--TTGA-
gi|144622 : ATGCGCTACTTGAATCTTTTTGATGCTATTATATAGTCTTGT--ACTA--TTAGAAAT----AAGCTTGTATTGATTTCAATGGATAACAAG-GGATCTCCAAACAAAAGTGTATTTACAGT--TGGT-TGTATGT------TT--AATTCTCGTATTTT-TTG-TAACATAA------TGTCTCTCTGCTCCGTAT-ACGAA--G--A--GCAAATGAAGAGGTAATGAT--CT-GTG-TTTTCTATTAATCCACATGTACAAAGTG--GG---CTGTTGAT--TAA-GTTTTTAGTGTATA--GAAGATAATT-AAGAGGACTACAGTATGTTCTTAGGCGAGTGTGTTG-GATCTGTGATAA-TCT-C--T--TCC--C-TGC-AT---AATAG--TG---T------TT-TG-GA-----GTA--ATAAGT-CG-G--TTGCTATT-GAGTT---TA----T------T-CTTAAAAACTGTAAT--T---GAT-----TC--TG----A--G-------TT--TTTT------ATTTCTATTG-----ATAGTTCGTTCCAGTCCCTT--GTTGTAGAGGGAAGAAAA-G-A-TTTGTAAA-AAAGCTGGGTATTAC-ATGGTAATGTACGGTTG----TC--AT--TTGA-ATTTCGCAGGTTGTACGTAAC
gi|144623 : AT-AAATA--G--G--ACAGACGAGGAGGTAATGAT--TT-GTA-CTTTCAATTGCTCCACATGTACATAGTG--GGGA-ATTTTCAA--TA---TTTTTTTGGAATA--AGTGTTGTTT-CAGCGTGCTACAATTTGTACGAAGACGAGTATGCAA-GACC--TGACAT-TTT-C--TTGTGC--C-TGT-GT---AAAAG--TG---T------TT-TG-AT-----GT---TTTGGTAAG-A--TTTTTATT-TAG-C---TG----G------TGCTTTAAGGC----AT--T---GAT---------------A--GAAACGGCTTG-TCTT------GTTTCAATAG-----GTAGATTGTTCCAATC
gi|144624 : tatatatttgtggacagctttaaaaatttcgacgtttgtattgtgggggagatgaggttctccaaagagaagtgtgttgagggtaacagtgcatatatgagagattgatgcaagaagtgtagcgcgttcggcatgAT-AAATA--G--G--ACAGACGAGGAGGTAATGAT--TT-GTA-CTTTCAATTGCTCCACATGTACATAGTGGAGA---ATTTTCAA--TA---TTTTTTTGGAATA--AGTGTTGTTT-CAGCGTGCTACAATTTGTACGAAGACGCGTATGCAA-GACC--TGACAT-TTT-C--TTGTGC--C-TGT-GT---AAAAG--TG---T------TT-TG-AT-----GT---TTTGGTAAG-A--TTTTTATT-TAG-C---TG----G------TGCTTAAAGGC----AT--T---GAT---------------A--GAAACGGCTTG-TCTT------GTTTCAATAG-----GTAGATTGTTCCAATC
gi|144625 : tatatatttgtggacagctttaaaaatttcgacgtttgtattgtggaggagatgaggttctccaaagagaagtgtgttgagggtaacagtgcatatatgagagattgatgcaagaagtgtagcgcgttcgacatgTATATATTTGTGG--ACAGCATTAAAAATTTCGACGTTTGTATTG-------TGGGTGAGATGAGGTTCACCAAAGAGAAGTGTGTTGAGGGTAACAGTGCATATGTGAGAGATT--GATTC--GAAT---------AGCGTAG------CGC------GTTCGGTATGATAAATAG--G--ACAGACGAGGAGGTAATGAT--TC-GTA-CTTTCAATTGCTCCACATGTACACAGTGGAGA---ATTTTCAA--TA---TTTTTTTGGAATA--AGTGTTGTTT-CAGCGTGCTACAATTCGTACGAAGACGAATATGCAA-TACC--TGACAT-TTT-C--TTGTGC--C-TGT-GT---AAAAG--TG---T------TT-TG-AT-----GT---TTTGGTAAG-A--TTTTTATT-TAG-C---TG----G------TGCTTAAAGGC----AT--T---GATAG---AA--AG----A--G-------CTCGTCTT------GTTTCAATAG-----TTAGATTGTTCCAATC
gi|144626 : CAAATAAAAGTAAGTTTAAAG----AAT-TAT---T------TTGAAATTCAAGCAGTTTATTGCT--CATGG------TGTTTCTTTGTCTAATGT-ATTTT--G--G--ACATTCGAAAAGAAAGTGAT--TG-ATA-TCTTAAATTTGGCCGCAGGAGCAAAATG--AA---TTATCAAT--GAT-GTTTGT-TTGAATAAAGGTGCTGATT-AAGACTACTGCGGTTTGTTCTGAGACGAGTGTGCAT-GATATGTGATTT-TCT-A--T--TGCTAC-TATAGT---AATAG--TA---T------TT-TG--------TTA--TTTTAT-TT-GTATTAGTGTT-AA-TCACTT------------T-CTTAAAAACTG--ATGGC---GAT-----GG--TG----C--T-------TC--TTTT------GTAACTTGTG-----AAAGCATGTTCCAAT--CTTAAATAGTGGAAGGAAGAAAG-T-A-GTT-TACATACAACTGGGTATTGC-ATTTTAATGTCC--TTG-----C--ATGGTCGGCATTCCGTAAGTTATA
gi|144627 : ------TGTTTCTCTGAATAGTGT-ACAAA--G--A--ACAGT---GCAAATAATG-T--TT-ATA-TCTTCAATACATTCGCATGCACATAAAG--GG---CTCTCTAT--TAA-ATGTTAAT---ACA--GATGGTGCTT-CAGGTTGCTGCATAGTGTCTGAAGATGTGTGTG--G-AACTTGTAATTT-GCT-A--T--TAT--C-TGT-GT---AATAC--TG---T------TT-TG-G------GAA--TTTTAT-CATA--TTACTGTT-AAATT---TA----T------T-ATTAAAG---ATAAT--TA--GATAC---TC--TG----ATTG-------TT--T-TT------GTTT
gi|144628 : GTTCGGTATGATAAATAG--G--ACTGACGAGGAGGTAATAAT--TC-GTA-CTTTCAGTTGCTCCACATGTACACAGTGGAGA---ATTTTCAA--TA---TTTTTTTAGAATA--AGTGTTTTTT--AGCGTGCTACAATTCGTACGAAGACGAGTATGCAA-GACC--TGATAC-TTTAC--TTGTGC--C-TGT-GT---AAAAG--TG---T------TT-TG-AT-----GT---TTTGGTAAG-A--TTTTTATT-TAG-C---TG----G------TGCTTAAAGGC----AT--T---GAT---------AGAAACA--G-------CTCGTCTT------GTTTCTATAG-----GTAGATTGTTCCAATC
gi|144629 : GTTCGGTATGATAAATAG--G--ACAGACGAGGAGGTAATGAT--TT-GTA-CTTTCAATTGCTCCACATATACATAGTG--GGGAATTTTCAAT----A-TTTTTTTTTGAATA--AGTGTTGTTT-CAGCGTGCTACAATTCGTACGAATACGAGTATGCAA-GACC--TGACAT-TTT-C--T--T
gi|144630 : AT-AAATA--G--G--ACAGATGAGGAGGTAATGAT--TT-GTA-CTTTCAATTGCTCCACATGTACATAGTGGAGA---ATTTTCAA--TA---TTTTTTTGGAATA--AGTGTTGTTT-CAGCGTGCTACAATTTGTACGAAGACGAGTATGCAA-GACC--TGACAT-TTT-C--TTGTGC--C-TGT-GT---AAAAG--TG---T------TT-TG-AT-----GT---TTTGGTAAG-A--TTTTTATT-TAG-C---TG----G------TGCTTAAAGGC----AT--T---GAT---------------A--GAAACGGCTTG-TCTT------GTTTCAATAG-----GTAGATTGTTCCAATC
gi|144631 : AT-AAATA--G--G--ACAGACGAGGAGGTAATGAT--TT-GTA-CTTTCAATTGCTCCACATGTACATAGTGGAGA---ATTTTCAA--TA---TTTTTTTGGAATA--AGTGTTGTTT-CAGCGTGCTACAATTTGTACGAAGACGAGTATGCAA-GACC--TGACAT-TTT-C--TTGTGC--C-TGT-GT---AAAAG--TG---T------TT-TG-AT-----GT---TTTGGTAAG-A--TTTTTATT-TAG-C---TG----G------TGCTTAAAGGC----AT--T---GAT---------------A--GAAACGGCTTG-TCTT------GTTTCAATAG-----GTAGATTGTTCCAATC
gi|144632 : AT-AAATA--G--G--ACAGACAAGGAGGTACTAAT--TT-GTA-CTTTCAATTGCTCCACATGTACATAGTG--G
gi|144633 : -ACAAATAG--G--ACAGACGAAGAGGTAATGAT--TT-GTA-CTTTCAATTGCTCCATGTGTACATAGTGGAGA---ATTTTCAA--TA---TTTTTTTGGAATA--AGTGTTGTTT-CAGCGTGCTACAATTTGTACGAAGACGAGTATGCAA-GACC--TGACAT-TTT-C--TTGTGC--C-TGT-GT---AAAAG--TG---T------TT-TG-AT-----GT---TTTGGTAAG-A--TTTTTATT-TAG-C---TG----G------TGCTTAAAGGC----AT--T---GATAGAAATC---G----C--T-------TG--TCTT------GTTTCAATAG-----GTAGATTGTTCCAATC
gi|144634 : AAA--G--GTGACAATTGAGAAGGAAGTGAG--CT-GTG-CTCTCTATTTGACCACATATACACAGAG--GG---GAATCTAC--GAT-GTGTTTAAGAAATA--GATGTTGCTT-AAGAGCACTACAGCTCGTTCGAAGGCGAGCATG
gi|144635 : AAA--G--GTGACAATTGAGAAGGAAGTGAG--CT-GTG-CTCTCTATTTGACCACATATACACAGAG--GA---GAATCTAC--GAT-GTGTTTAAGAAATA--GATGTTGCTT-AAGAGCACTACAGCTCGTTCGAAGGCGAGCATG
gi|144636 : AAA--G--GTGACAATTGAGAAAGAAGTGAG--CT-GTG-CTTTCTATTTGTCCACATGTACACAGGG--GGGA-GTCTTCAA--TA---TGTTTAAGAAATA--GATGTTGCTT-AAGTGCACTACAACTCGTTCGGAGGCGGGCATGCAATAAT---TGGCAT-TTC-C--TTGTAC--C-TAT-GT---AATAG--AA---T------TT-AG--------GTACTTTTGGT-TC-G--TTACCTTC-GAGTT---TAT---G------T--TTAAAAGT-------------AT-----TC--AG----A--GAAGAGGCTTG-TCTT------GTTTCAAGTG-----GGAGAGTGTTCCAGTC
gi|144637 : AAA--GTTG--ACAATTGAGAAAGAAGTGAG--CT-GTG-CTTTCTATTTGTCCACATGTACATAGAG--GG---CAATCTAC--AAT-GTGTTTAAGAAATA--GATGTTGCTT-AGGTGCACTACAACTCGTTCGGAGGCGGGCATG
gi|144638 : AAA--G--GTGACAATTGAGAAAGAAGTGAA--CT-ATA-CTTTCTATTTGTCCACATGTACACAGAG--GGGA-GTCTTCA----AT-GTGTTTAAGAAATA--GATGTTGCTT-AAGTGCACTACAACTTGTTCGGAGGCAGGAATCAAT-AAT---TGGCAT-TTC-C--T--TGTAGC-TAT-GT---AAAAGAATG---T------T------A-----GTACTTTTGGT-TA-G--TTA-TATTCGAGTT---TAT---G------T--TTAAAAGC
gi|144639 : --G--G--ACAGTTGAGTAAGAAATGTTTACT-GT---CTTCGAGTGAACGGCATGTGCACA-TG--GG---ACTTTCAA--CAATATTTTTGGAATATA--AATGTTGGTT-AAGTGAACTACAATTTAGTCGTAGACGGGTATGGTT-TATTTGAGATAA-TCT-G--T--CTC--CGTG--GTGGAAATAG---G---TAGAAACTT-TGTCA-----ATA--ATAGG-------------GTT-TAGTC---TA----T------T-CTTAAA---TATACT--T---AATG----TTGGTG----A--G-------TT--CTGG------GTTAGTATAG-----GTAAACTATTCCATGCTTTC--ATTGTTGAAGGAAGAAAGCG-A-TGTGC-AA-AGAGTTGTGTATTAC-A-AGCAAT---TGGTTGAATATT--GT--GTGA-GTTTCGTAAATTGTA
gi|144640 : --ACAGTTGAGTAAGAAATGATA-CT-GT---CTTCGAGTGAACAGCCTGTGCACA-TG--AGA--CTTTCAACAATAA---TTTTAGAATATA--AATGTTGATT-AAGTGAACTACAATTTAGTCTTAGATGGGTATGGTA-TATTTGAGCCAA-TCT-C--T--CTC--C-----------ATGG--AGGAAC------TT-TGTCA-----ATA--ATA-------G--TT----TT-CAGTC---TA----T------T-CTTAAA---TATACT--T---AATG----TTGGTG----A--G-------TT--CTGG------GTTGCTATAG-----GTAAACTATTCCATGCTTTT--ACTGTTGAAGGAAGAAAT-GAA-TTTGC-AA-AGAGTTGTGTAATAT-A-AGCAAT---TGGTTGAATATT--GT--GTGA-GTTTCGTAAATTGTA
gi|144641 : TAATGAT--AT-GTG-TCTTCAATTTCACCACAAAGACAATTTG--GA---CTTGCAAC--TAT-GTTTTTATTGAATA--AATGTTGATTCAAGT-TACTGCAATTTGTATGAAGTCGTGTATGCTA-TATTTG-GGCAG-T-T-CGGT--TTC--C-TGT-AT---AATAG--TG---A------TT-TG-GA-----
gi|144642 : atgaataaaAAGTAATG-T--CTCGTA-TCTTCAATACTTTCGCATGAACAT-----------CTATTGTT--TGA-AT----AAAGAAT-------TTCATT-GAGCTTGCTGCATTGTGTCCAAAGACGTGT---------TTTGTAATTT-TCT-A--T--TAC--C---A-GT---AATAG--TT---T------TTCTT-GATTTTTATA--ATA----------TTACTGT--AAATT---TT----G------T-TTTCAAA--TATAGT--TAGAGAT-----TC--TG----A--A-------TG--TTTT------ATTTCTGGAGCAAGAGTAG-----TCCA-TTCTTA--GTTGTTGGTGGAAGAAAG-G-AGTTTGC-AT-ATAGCAGGATATTACAATAATGGTGTTC--TTG----TCTTAT--TTGT-ATAACGAAGGTTGTA
gi|144643 : atgaaTTTTAGTGTATA--GCAGATAATC-AAGAGAACTACAATTTGGTCTGACGAAATTGTGGTA-AATTTGAAATAAATGT-C--T--TCC--G-TGT-GT---AATAA--TA---A------TT-AG-GA-----GTA--ATCGGT-CG-G--TTGCTATC-GAGTG---TATTTTGATATACT-CTTAAA--TTGATAT--T---GAT-----TC--TG----A--G-------TT--TCTTTGTTTTATTTCTGTTG-----TCAGTTCGTCCCAAACCCTT--ATCGTAGAGGAGAGCAAA-G-A-TTTGTAAA-ATAGTTGTGTAGTAC-ATGATATTGTGCGGTTG----TC--AT--TTGA-ATTTCACAGGATGTATGTAAC
Alignments
lowQualScore : 1 111111 111111 11 1111111 111 11 11 1111 11 11111111111111111111 2222222 555555555555555555555555555555 1111
lowQualScore : 55 3 2 44 555 3 3 1 55 3 5 888 5 5 0 9 2 00 8 3 55 55 7777 4 55 4 111111 55 0 4 4 0 000000 00 1 6 0 99 22 88 22 33 1 33 1 33 1 3333333 1 1 777 22 22 444 0 22 0 1 22 1 66 0 0 6666 00 22 1 22 88 1 44 1 55 333 22 1 33 3333 1 55 1 22 55 33 22 99999999999999999999 9999999 22 555 888888888888888888888888888888 6666666 333 0 1 55555 3 0 1 55 2 3 3 3 3 4 3 1 3 1 3 2 5 5555 55 55 3
lowQualScore : .. . . .. ... . . . .. . . ... . . . . . .. . . .. .. .... . .. . ...... .. . . . . ...... .. . . . .. .. .. .. .. . .. . .. . ....... . . ... .. .. ... . .. . . .. . .. . . .... .. .. . .. .. . .. . .. ... .. . .. .... . .. . .. .. .. .. .................... ....... .. ... .............................. ....... ... . . ..... . . . .. . . . . . . . . . . . . . .... .. .. .
lowQualScore : 00 6 5 66 888 3 6 8 55 7 0 888 0 0 1 4 9 88 2 9 00 00 7777 0 55 0 555555 55 6 0 0 8 555555 66 8 7 5 22 33 88 22 77 5 44 0 33 0 4444444 0 5 777 00 00 555 6 00 1 0 99 0 44 8 8 9999 44 77 7 33 33 0 88 7 88 000 44 7 44 8888 8 11 8 55 22 00 99 11111111111111111111 2222222 88 555 444444444444444444444444444444 2222222 555 6 0 33333 1 6 1 00 5 5 6 6 6 4 6 0 6 3 6 6 9 5555 00 00 6
consensus : AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA--GAG-ATGGGTGA--A---ATTTTG-CTGT-TCGTCT--CAACAGGAATAGGAATAG-C---C-GTTGAGGGACTTAA-TGGTATGGTCAATTATGTACAGATATATCGAAACTAAGTTCAGATAAATGTTAGTTAAAATTAAGATTTGAAAGGATATTGAAAATATTAACTGTTAAGTGGTTTATGCGCTACTTGAATCTTTTTGATGCTATTATATAGTCTTGT--ACTG--TTAGAAAT----AAGCTTGTATTGATTTCAATGGATAACAAG-GGATCTCCAAACAAAAGTGTATTTACAGT--TGGT-TGTATGT------TT--AATTCTCGTATTTT-TTG-TAACATAA------TGCCTCTCTGCTCCGTAT-ACAAA--G--G--ACAGACGAGGAGGTAATGAT--CT-GTG-CTTTCNATTGNTCCACATGTACANAGTG--GG--NTNTTCANTAA-GT--TTT--TANNGAATA--GATGTTGNTT-AAGNGCGCTACAATTTGTTCGAAGGCGAGTATGCNA-GATCTGTGACAN-TCT-C--T--TNC--C-TGC-GT---AATAG--TGTTT-TGGAGTA--NT-TGGT-CG-G--T--TNCTATT-NAGTC---TA----G------T-CTTAAAGGCTGTAAT--T---GAT-----TC--TG----A--G-------TT--TC------TT---GTTTCTATNG-----GTAGNTCGTTCCAATCCCTT--GTCGTCGAGGGAAGAAAA-G-A-TTTGTAAA-ANAGCTGGGTATTAC-ATGGTAATGTACGGTTG----TC--AT--TTGA-ATTTCGCAGGTTGTACGTAAC
Reference ( family-583 ) : AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA--GAG-ATGGGTGA--A---ATTTTG-CTGT-TCGTCT--CAACAGGAATAGGAATAG-C---C-GTTGAGGGACTTAA-TGGTATGGTCAATTATGTACAGATATATCGAAACTAAGTTCAGATAAATGTTAGTTAAAATTAAGATTTGAAAGGATATTGAAAATATTAACTGTTAAGTGGTTTATGCGCTACTTGAATCTTTTTGATGCTATTATATAGTCTTGT--ACTG--TTAGAAAT----AAGCTTGTATTGATTTCAATGGATAACAAG-GGATCTCCAAACAAAAGTGTATTTACAGT--TGGT-TGTATGT------TT--AATTCTCGTATTTT-TTG-TAACATAA------TGCCTCTCTGCTCCGTAT-ACAAA--G--G--ACAGACGAGGAGGTAATGAT--CT-GTG-CTTTCNATTGNTCCACATGTACANAGTG--GG--NTNTTCANTAA-GT--TTT--TANNGAATA--GATGTTGNTT-AAGNGCGCTACAATTTGTTCGAAGGCGAGTATGCNA-GATCTGTGACAN-TCT-C--T--TNC--C-TGC-GT---AATAG--TGTTT-TGGAGTA--NT-TGGT-CG-G--T--TNCTATT-NAGTC---TA----G------T-CTTAAAGGCTGTAAT--T---GAT-----TC--TG----A--G-------TT--TC------TT---GTTTCTATNG-----GTAGNTCGTTCCAATCCCTT--GTCGTCGAGGGAAGAAAA-G-A-TTTGTAAA-ANAGCTGGGTATTAC-ATGGTAATGTACGGTTG----TC--AT--TTGA-ATTTCGCAGGTTGTACGTAAC
gi|144608 : AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATTGAG-ATGGGTGA--A---ATTTTG-CTGT-TCGTCT--CAACAGGAATAGGAATAG-C---C-ATTGAGGGACTTAA-TGGTATGGTCAATTATGTACAGATATATCGAAACTATGTTCAGGTAAATGTTAGTTAAAATTAAGATTTGAAAGGAT-TTGAAAATATTAACTGTTAAGTGGTTTGTGCGCTACTTGAATCTTTTTGATGCTATTATATAGTCTTGT--ACTG--TTAGAAAT----AAGCTTGTATTGATTTCAATGGATAACAAG-GGATCTCCAAACAAAAGTGTATTTACAGT--TGGT-TGTATGT------TT--AATTCTCGTATTTT-TTG-TACCATAA------TGTCTCTCTGCTCCGTAT-ACAAA--G--A--ACAAATGAAAAGGTAATGAT--CT-GTG-TTTTCTATTAATCCACATGTACAAAGTG--GG--CTGTTGATTAA-GT--TTT--TATTGTATA--GAAGATAATT-AAGAGGACTACAGTATGTTCTAAGGCGAGTGTGTTG-GATCTGTGATAA-TCT-C--T--TCC--C-TGC-AT---AATAG--TGTTT-TGGAGTA--AT-AGGT-CG-G--T--TGCTATT-GAGTT---TA----G------T-CTTAAAAACTGTAAT--T---GAT-----TC--TG----A--G-------TT--TT------TT---ATTTCTATTG-----ATAGTTCGTTCCAGTCCCTT--GTTGTCGAGGGAAGAAAA-G-A-TTTGTAAA-AAAGCTGGGTATTGC-ATGGTAATGTACGGTTG----TC--AT--TTGA-ATTTTGCAGGTTGTACGTAAC
gi|144609 : AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA--GAG-ATGGGTGA--A---ATTTTT-CTGT-TCGTCT--CAACAGGAATAGGAATAG-C---C-ATTGAGGGACTTAA-TGGTATGGTCAATTATGTACAGATATATCGAAACTAAGTTCGGATAAATGTTAGTTAAAATTAAGATTTGAAAGGAT-TTGAAAATATTAACTGTTAAGTGGTTTATGCGATACTTGAATCTTTTTTATGCTATTATATAGTCTTGT--ACTG--TTAGAAAA----AAGCTTGTATTGATTTCAATGGATAACAAG-GGATCTCCAAACAAAAGTGTATTTACAGT--TGGT-TGTATGT------TT--AATTCTCATATTTT-TTG-TAACATAA------TGGCTCTCTGCTCCGTAT-ACAAA--G--A--ACAAATGAAGAGGTAATGAT--CT-GTG-TTTTCTATTAATCCACATGTACAAAGTG--GG--CTGTTGATTAA-TT--TTT--TAGTGTGTA--GAAGATAATA-AAGAGGACTACAGTATGTTCTAAGGCGAGTGTGTTG-GATCTATGATAA-TCT-C--T--TCC--C-TGC-AT---AATAG--TGTTT-TGGAGTA--AT-AGGT-CG-G--T--AGCTATT-GAGTT---TA----T------T-CTTAAAAACTGTAAT--T---GGT-----TC--TG----A--GT------TT--TT------TT---ATTTCTTTTG-----ATAGTTCATTCCAGTCCCTT--GTTGTCGAGGGAAGAAAA-G-A-TTTGTAAA-AAAGCTGGGTATTAC-ATGGTAATGTACGGTTG----TC--AT--TTGA-ATTTCGCAGGTTGTACGTTAC
gi|144610 : AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA--GAG-ATGGGTGA--A---ATTTTG-CTGT-TTGTCT--CATCAGGAATAGGAATAG-C---C-ATTGAGGGACTTAA-TGGTATGGTCAATTATGTACAGATATATTAAAA---------------------TTAAAACTAAGATTTGAAAGGATATTAAAAATATTAACTGTTTAGTGGTTTATGCTCTTCTTGAATCTTTTTGATGCTATTATATAGTCTTGT--ACTG--TTAGAAAT----AAGCTTGTATTTATTTCAATGGATAACAAG-GGATCTCCAAACAAAAGTGTATTTACAGT--TGGT-TGTATGT------TT--AATTCTCGTAGTTT-TTG-TAACATAA------TACGTCTCTGCTACGTAT-ACAAA--G--A--ACAGATGAAGAGGTAATGAT--TT-GTGTTTTTCTATTAATCCACATGTACAAAGTG--GG--CTGTTCATTAA-GT--TTT--TAGTGTATA--GACGATAATT-AAGAGGACTACAGTATGTTCTGAGGCGAGTGTGTTG-GATCTGTGATAA-TCT-C--C--TTC--C-TGC-AT---AATAG--TGTTT-TGGAGTA--AT-CGTT-CG-G--
gi|144611 : AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA--GAT-ATGGGTGA--A---ATTTTG-CTGT-TCGTCT--CAACAGGAATAGGAATAG-C---C-ATTGAGGGACTTAA-TGGTATGGTCACTTAAGTACAGATTTATCGAAAATAAATTCAAATAAATGTTAGTTAAAATTAAGATTTGGAAGAAT-TTTAAAATATTAAGTGTTAAGTGGTTTATGCGCTACTTGAATC-TTTTGATGCTATTATATAGTCTTGT--ACCG--TTAGAAAT----AAGCTTGTATTGATTTCAATGGATAACAAG-GGATCTCCAAATAAAAGTGTATTTACAGT--TGGC-TGTATGT------TT--AATTCTCGTATTTT-TTG-T-ACATAA------TGTCTCTccaattga
gi|144612 : AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA--GAG-ATGGGTGA--A---ATTTTG-CTGT-TCGTCT--CAACAGGAATAGGAATAG-C---C-ATTGAGGGACTTAA-TGGTATGGTCAATTATGTACAGATATATCGAAACTAAGTTCAGATAAATGTTAGTTAAAATTAAGATTTGAAAGGAT-TTGAAAATATTAACTGTTAAGTGGTTTATGCGCTACTTGAATCTTTTTGATGCTATTATATAGTCTTGT--ACTG--TTAAAAAT----AAGCTTGTATTGATTTCAATGAATAACAAG-GGATCTCCAAACAAAAGTGCATTTAC
gi|144613 : AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA--GAGTAT---CAA--A---A--TTG-CTAT-TAGTTTACCAAC
gi|144614 : AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA--GAG-GT--------A---ATTTCATCTG----GTCG--AAACTGGAAT
gi|144615 : AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA--GAG-ATGGGT-A--GCTTATTTTG-C
gi|144616 : AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA--GAG-ATTTGTGATTA---ATGTTC-CTTTATTGTC
gi|144617 : AGAGAGA--CAG-TTGGGTGA--A---ATTTTG-CTAT-TTGTCT--CGTCAGGAACAAGAATAA-CTCTC-GTT---GGACTTAT-TGTCATAGTT-ATCTTGTATAGATTTATCGAAA-TAATTCCCAATAACTGTT
gi|144618 : GA--GAA-TTTGGTGG--A---ATTTCG-CTGT-TTGTCT--CATCTTAAATAGGAATAGTC---C-GTTGAGGCATGTAA-----------AGTCATGTACAGATGTATCGAAAATAAGTTCAAATAACTGTGAGATAAAAATGTGATTTCGAAATATATTAAAAACAGCAACT-TTA------TTATGAACTCTTTGAATCTTTTTGATGTTATTATATAGTTTTGTTCATTG----AGGAAT----AATTTTGTTTTGATTT-GGTGGATGACATG-GTGTTTCCAAACAAAGGTGTATTTACTGT--TAGT-TTTATGT------TT--AATTCTCGTAGTTA-ATG-TAGCATAATAATACTGCGTCTCTGTTCTGTAT-ACAAA--G--A--ACA
gi|144618 : ATGTATAAAGTG--GT--TTGTTTATTAA-GT--GTT--TAATGAG-A--GAAGATCATT-TAGAGGACTACAGTTTGTTC-----TGAG--------GATCTGAGATGA-TCA-C--G--TCT--C-TGT-AT---ATTAC--TATTT-AGGAGTA--AT-TGGT-CA-G--T--TGTAATT-GAGTT---CA----T------T-CCAACAAATTGTTAT--T---GAT-----TC--TG----A--GTTT----TT--TT------TT---ATTTCTGTTG-----TTAGTTCGTGCCAGTACTTT--ATCGTCGCTGAAAGACAA-G-A-TTTGTAAA-ACCGTTGGGTATTAT-ACGCTAAT-TGC-ATTG----AT--AA--TTGA-AATTcttatgtataaagtggtttgtttattaagtgtttaatgagagaagatcatttagaggactacagtttgttctgaggatctgagatgatcacgtctctgtatattactatttaggagtaattggtcagttgtaattgagttcattccaacaaattgttattgattctgagtttttttttatttctgttgttagttcgtgccagtactttatcgtcgctgaaagacaagatttgtaaaaccgttgggtattatacgctaattgcattgataattgaaatt
gi|144619 : gagaatttggtggaatttcgctgtttgtctcatcttaaataggaatagtccgttgaggcatgtaaagtcatgtacagatgtatcgaaaataagttcaaataactgtgagataaaaatgtgatttcgaaatatattaaaaacagcaactttattatgaactctttgaatctttttgatgttattatatagttttgttcattgaggaataattttgttttgatttggtggatgacatggtgtttccaaacaaaggtgtatttactgttagttttatgtttaattctcgtagttaatgtagcataataatactgcgtctctgttctgtatacaaagaacacttGGGTGA--A---CATTTG-CTGT-TTGTCT--TA-------------TAT-C---CCGTTGAGGGACCTAAATGGCGTGGTCAGTTGTATGTAGATGTACCGA---TAA--T--GATAAATGTTAGTTAAAAT-ATGATTTAGAAATACATTAAAA----TCACT------TGGTTTACGTTTTATTTTA-TATTTTTTATGCTATTATATAATCTTGT--CCTG--TAGGGACT----ACGTTTGTGTTGGTT
gi|144620 : GTACAGATATATCGAAACTAAGTTTAGATAAATGTTAGTTAAAATTAAGATTTGAAAGGAT-TTGAAAATATTAACTGTTAAGTGGTTTATGCGCTACTTGAATCTTTTTGATGCTATTATATAGTGTTGT--ACTG--TTAGAAAT----AAGCTTGTATTGATTTCAATGGATAACAAG-GGATCTCCAAACAAAAGTGTATTTACAGT--TGGT-TGTATGT------TT--AATTCTCGTATTTT-TTG-TAACATAA------TG--TCTCTGCTCCGAAT-ACAAA--G--A--ACAAATGAAGAGGTAATGAT--CT-GTG-TTTTCTATTAATCCACATGTACAACGTG--GG--CTGTTGATTAA-GT--TTT--TAGTGTATA--GAAGATAATT-AAGAGGACTACAGTATGTTCTAAGGCGAGTGTGTTG-GATCTGTGATAA-TCT-C--T--TCC--C-TGC-AT---AATAG--TGTTT-TGGAGTA--AT-AGGT-CG-G--T--TGCTATT-GAGTT---TA----T------T-CTTAAAAACTGTAAT--T---GAT-----TC--TG----A--G-------TT--TT------TT---ATTTCTATTG-----ATAGTTCGTTCCAGTCCCTT--GTTGTCGAGGGAAGAAAA-G-A-TTTGTAAA-AAAGCTGGGTATTGC-ATGGTAATGTACGGTTG----TC--AT--TTGA-ATTTCGCAGGTTGTACGTAAC
gi|144621 : TAAGATTTGAAAGGATATTAAAAGTATTCACTTTTAAATGGTTTATGCGCTACTT-----TTTCTGACGCTATTATATAGTCTTGT--ACTG--TTAGAAAT----AAGATTGTATTAATTTCAATGGATAACAAG-GGGTCTCCAAACAAAAGTGAATTAACAGT--TTGT-TGAATAT------TT--AATTCTCGTAGTTT-TTG-TAACATGT------TGCGTCTCTGCTCCGTAT-AC-AA--G--A--ACAGATGAAGATGTAATGAA--TT-GTG-TTTTCTATTAAT-CACATGTACAAAGTG--GG--CTGTTCATTAA-GT--TTT--TAGTGTATA--GAAGATAATT-AAGAGGACACCAGTATGTTCTGAGGCGAGTGTGTTG-GATCTGTGATAA-TCT-A--T--TCC--C-TGC-AT---AATAT--TTTTT-TGGAGTA--AT-CGAT-CG-G--T--TGCTATT-GAGTT---TA----T------T-CTTTAAAACTGTAAT--T---GAT-----TC--TG----A--T-------TT--TT------TTTAAATTTTTATTG-----TTAGTTCGTTCCAATCCCTT--TTCGCAGAGTGAAGAAAA-G-A-TTTGTAAA-TAAACTGGATATTTC-ATTGTAATGTAGTGTTG----TC--AT--TTGA-
gi|144622 : ATGCGCTACTTGAATCTTTTTGATGCTATTATATAGTCTTGT--ACTA--TTAGAAAT----AAGCTTGTATTGATTTCAATGGATAACAAG-GGATCTCCAAACAAAAGTGTATTTACAGT--TGGT-TGTATGT------TT--AATTCTCGTATTTT-TTG-TAACATAA------TGTCTCTCTGCTCCGTAT-ACGAA--G--A--GCAAATGAAGAGGTAATGAT--CT-GTG-TTTTCTATTAATCCACATGTACAAAGTG--GG--CTGTTGATTAA-GT--TTT--TAGTGTATA--GAAGATAATT-AAGAGGACTACAGTATGTTCTTAGGCGAGTGTGTTG-GATCTGTGATAA-TCT-C--T--TCC--C-TGC-AT---AATAG--TGTTT-TGGAGTA--AT-AAGT-CG-G--T--TGCTATT-GAGTT---TA----T------T-CTTAAAAACTGTAAT--T---GAT-----TC--TG----A--G-------TT--TT------TT---ATTTCTATTG-----ATAGTTCGTTCCAGTCCCTT--GTTGTAGAGGGAAGAAAA-G-A-TTTGTAAA-AAAGCTGGGTATTAC-ATGGTAATGTACGGTTG----TC--AT--TTGA-ATTTCGCAGGTTGTACGTAAC
gi|144623 : AT-AAATA--G--G--ACAGACGAGGAGGTAATGAT--TT-GTA-CTTTCAATTGCTCCACATGTACATAGTG--GGGAATTTTCAATA---T--TTT--TTTGGAATA--AGTGTTGTTT-CAGCGTGCTACAATTTGTACGAAGACGAGTATGCAA-GACC--TGACAT-TTT-C--TTGTGC--C-TGT-GT---AAAAG--TGTTT-TGATGT---TT-TGGTAAG-A--T--TTTTATT-TAG-C---TG----G------TGCTTTAAGGC----AT--T---GAT---------------A--GAAACGGCTTG-TC------TT---GTTTCAATAG-----GTAGATTGTTCCAATC
gi|144624 : tatatatttgtggacagctttaaaaatttcgacgtttgtattgtgggggagatgaggttctccaaagagaagtgtgttgagggtaacagtgcatatatgagagattgatgcaagaagtgtagcgcgttcggcatgAT-AAATA--G--G--ACAGACGAGGAGGTAATGAT--TT-GTA-CTTTCAATTGCTCCACATGTACATAGTGGAGA--ATTTTCAATA---T--TTT--TTTGGAATA--AGTGTTGTTT-CAGCGTGCTACAATTTGTACGAAGACGCGTATGCAA-GACC--TGACAT-TTT-C--TTGTGC--C-TGT-GT---AAAAG--TGTTT-TGATGT---TT-TGGTAAG-A--T--TTTTATT-TAG-C---TG----G------TGCTTAAAGGC----AT--T---GAT---------------A--GAAACGGCTTG-TC------TT---GTTTCAATAG-----GTAGATTGTTCCAATC
gi|144625 : tatatatttgtggacagctttaaaaatttcgacgtttgtattgtggaggagatgaggttctccaaagagaagtgtgttgagggtaacagtgcatatatgagagattgatgcaagaagtgtagcgcgttcgacatgTATATATTTGTGG--ACAGCATTAAAAATTTCGACGTTTGTATTG-------TGGGTGAGATGAGGTTCACCAAAGAGAAGTGTGTTGAGGGTAACAGTGCATATGTGAGAGATT--GATTC--GAAT---------AGCGTAG------CGC------GTTCGGTATGATAAATAG--G--ACAGACGAGGAGGTAATGAT--TC-GTA-CTTTCAATTGCTCCACATGTACACAGTGGAGA--ATTTTCAATA---T--TTT--TTTGGAATA--AGTGTTGTTT-CAGCGTGCTACAATTCGTACGAAGACGAATATGCAA-TACC--TGACAT-TTT-C--TTGTGC--C-TGT-GT---AAAAG--TGTTT-TGATGT---TT-TGGTAAG-A--T--TTTTATT-TAG-C---TG----G------TGCTTAAAGGC----AT--T---GATAG---AA--AG----A--G-------CTCGTC------TT---GTTTCAATAG-----TTAGATTGTTCCAATC
gi|144626 : CAAATAAAAGTAAGTTTAAAG----AAT-TAT---T------TTGAAATTCAAGCAGTTTATTGCT--CATGG------TGTTTCTTTGTCTAATGT-ATTTT--G--G--ACATTCGAAAAGAAAGTGAT--TG-ATA-TCTTAAATTTGGCCGCAGGAGCAAAATG--AA--TTAT-CAATGATGT--TTG--T-TTGAATAAAGGTGCTGATT-AAGACTACTGCGGTTTGTTCTGAGACGAGTGTGCAT-GATATGTGATTT-TCT-A--T--TGCTAC-TATAGT---AATAG--TATTT-TG--TTA--TT-TTAT-TT-GTAT--TAGTGTT-AA-TCACTT------------T-CTTAAAAACTG--ATGGC---GAT-----GG--TG----C--T-------TC--TT------TT---GTAACTTGTG-----AAAGCATGTTCCAAT--CTTAAATAGTGGAAGGAAGAAAG-T-A-GTT-TACATACAACTGGGTATTGC-ATTTTAATGTCC--TTG-----C--ATGGTCGGCATTCCGTAAGTTATA
gi|144627 : ------TGTTTCTCTGAATAGTGT-ACAAA--G--A--ACAGT---GCAAATAATG-T--TT-ATA-TCTTCAATACATTCGCATGCACATAAAG--GG--CTCTCTATTAA-AT--GTT--AAT---ACA--GATGGTGCTT-CAGGTTGCTGCATAGTGTCTGAAGATGTGTGTG--G-AACTTGTAATTT-GCT-A--T--TAT--C-TGT-GT---AATAC--TGTTT-TGG-GAA--TT-TTAT-CATA--T--TACTGTT-AAATT---TA----T------T-ATTAAAG---ATAAT--TA--GATAC---TC--TG----ATTG-------TT--T-------TT---GTTT
gi|144628 : GTTCGGTATGATAAATAG--G--ACTGACGAGGAGGTAATAAT--TC-GTA-CTTTCAGTTGCTCCACATGTACACAGTGGAGA--ATTTTCAATA---T--TTT--TTTAGAATA--AGTGTTTTTT--AGCGTGCTACAATTCGTACGAAGACGAGTATGCAA-GACC--TGATAC-TTTAC--TTGTGC--C-TGT-GT---AAAAG--TGTTT-TGATGT---TT-TGGTAAG-A--T--TTTTATT-TAG-C---TG----G------TGCTTAAAGGC----AT--T---GAT---------AGAAACA--G-------CTCGTC------TT---GTTTCTATAG-----GTAGATTGTTCCAATC
gi|144629 : GTTCGGTATGATAAATAG--G--ACAGACGAGGAGGTAATGAT--TT-GTA-CTTTCAATTGCTCCACATATACATAGTG--GGGAATTTTCAAT-A-TT--TTT--TTTTGAATA--AGTGTTGTTT-CAGCGTGCTACAATTCGTACGAATACGAGTATGCAA-GACC--TGACAT-TTT-C--T--T
gi|144630 : AT-AAATA--G--G--ACAGATGAGGAGGTAATGAT--TT-GTA-CTTTCAATTGCTCCACATGTACATAGTGGAGA--ATTTTCAATA---T--TTT--TTTGGAATA--AGTGTTGTTT-CAGCGTGCTACAATTTGTACGAAGACGAGTATGCAA-GACC--TGACAT-TTT-C--TTGTGC--C-TGT-GT---AAAAG--TGTTT-TGATGT---TT-TGGTAAG-A--T--TTTTATT-TAG-C---TG----G------TGCTTAAAGGC----AT--T---GAT---------------A--GAAACGGCTTG-TC------TT---GTTTCAATAG-----GTAGATTGTTCCAATC
gi|144631 : AT-AAATA--G--G--ACAGACGAGGAGGTAATGAT--TT-GTA-CTTTCAATTGCTCCACATGTACATAGTGGAGA--ATTTTCAATA---T--TTT--TTTGGAATA--AGTGTTGTTT-CAGCGTGCTACAATTTGTACGAAGACGAGTATGCAA-GACC--TGACAT-TTT-C--TTGTGC--C-TGT-GT---AAAAG--TGTTT-TGATGT---TT-TGGTAAG-A--T--TTTTATT-TAG-C---TG----G------TGCTTAAAGGC----AT--T---GAT---------------A--GAAACGGCTTG-TC------TT---GTTTCAATAG-----GTAGATTGTTCCAATC
gi|144632 : AT-AAATA--G--G--ACAGACAAGGAGGTACTAAT--TT-GTA-CTTTCAATTGCTCCACATGTACATAGTG--G
gi|144633 : -ACAAATAG--G--ACAGACGAAGAGGTAATGAT--TT-GTA-CTTTCAATTGCTCCATGTGTACATAGTGGAGA--ATTTTCAATA---T--TTT--TTTGGAATA--AGTGTTGTTT-CAGCGTGCTACAATTTGTACGAAGACGAGTATGCAA-GACC--TGACAT-TTT-C--TTGTGC--C-TGT-GT---AAAAG--TGTTT-TGATGT---TT-TGGTAAG-A--T--TTTTATT-TAG-C---TG----G------TGCTTAAAGGC----AT--T---GATAGAAATC---G----C--T-------TG--TC------TT---GTTTCAATAG-----GTAGATTGTTCCAATC
gi|144634 : AAA--G--GTGACAATTGAGAAGGAAGTGAG--CT-GTG-CTCTCTATTTGACCACATATACACAGAG--GG--GAATCTACGAT-GT--GTT--TAAGAAATA--GATGTTGCTT-AAGAGCACTACAGCTCGTTCGAAGGCGAGCATG
gi|144635 : AAA--G--GTGACAATTGAGAAGGAAGTGAG--CT-GTG-CTCTCTATTTGACCACATATACACAGAG--GA--GAATCTACGAT-GT--GTT--TAAGAAATA--GATGTTGCTT-AAGAGCACTACAGCTCGTTCGAAGGCGAGCATG
gi|144636 : AAA--G--GTGACAATTGAGAAAGAAGTGAG--CT-GTG-CTTTCTATTTGTCCACATGTACACAGGG--GGGAGTCTTCAATA---T--GTT--TAAGAAATA--GATGTTGCTT-AAGTGCACTACAACTCGTTCGGAGGCGGGCATGCAATAAT---TGGCAT-TTC-C--TTGTAC--C-TAT-GT---AATAG--AATTT-AG--GTACTTT-TGGT-TC-G--T--TACCTTC-GAGTT---TAT---G------T--TTAAAAGT-------------AT-----TC--AG----A--GAAGAGGCTTG-TC------TT---GTTTCAAGTG-----GGAGAGTGTTCCAGTC
gi|144637 : AAA--GTTG--ACAATTGAGAAAGAAGTGAG--CT-GTG-CTTTCTATTTGTCCACATGTACATAGAG--GGCAATCTACAAT---GT--GTT--TAAGAAATA--GATGTTGCTT-AGGTGCACTACAACTCGTTCGGAGGCGGGCATG
gi|144638 : AAA--G--GTGACAATTGAGAAAGAAGTGAA--CT-ATA-CTTTCTATTTGTCCACATGTACACAGAG--GGGAGTCTTCAAT---GT--GTT--TAAGAAATA--GATGTTGCTT-AAGTGCACTACAACTTGTTCGGAGGCAGGAAT-CAATAAT---TGGCAT-TTC-C--T--TGTAGC-TAT-GT---AAAAGAATGTT-----AGTACTTT-TGGT-TA-G--T--TA-TATTCGAGTT---TAT---G------T--TTAAAAGC
gi|144639 : --G--G--ACAGTTGAGTAAGAAATGTTTACT-GT---CTTCGAGTGAACGGCATGTGCACA-TG--GG--ACTTTCAACAATAT--TTT--TGGAATATA--AATGTTGGTT-AAGTGAACTACAATTTAGTCGTAGACGGGTATGGTT-TATTTGAGATAA-TCT-G--T--CTC--CGTG--GTGGAAATAG---G----TAGAA-A--CT-TTGT-CA-A--TAATAGGGTT-TAGTC---TA----T------T-CTTAAA---TATACT--T---AATG----TTGGTG----A--G-------TT--CT------GG---GTTAGTATAG-----GTAAACTATTCCATGCTTTC--ATTGTTGAAGGAAGAAAGCG-A-TGTGC-AA-AGAGTTGTGTATTAC-A-AGCAAT---TGGTTGAATATT--GT--GTGA-GTTTCGTAAATTGTA
gi|144640 : --ACAGTTGAGTAAGAAATGATA-CT-GT---CTTCGAGTGAACAGCCTGTGCACA-TG--AG--ACTTTCAACAA--TAATTT--TAGAATATA--AATGTTGATT-AAGTGAACTACAATTTAGTCTTAGATGGGTATGGTA-TATTTGAGCCAA-TCT-C--T--CTC--C-----------ATGG--------AGGA--A--CT-TTGT-CA-A--TAATAGTTTT-CAGTC---TA----T------T-CTTAAA---TATACT--T---AATG----TTGGTG----A--G-------TT--CT------GG---GTTGCTATAG-----GTAAACTATTCCATGCTTTT--ACTGTTGAAGGAAGAAAT-GAA-TTTGC-AA-AGAGTTGTGTAATAT-A-AGCAAT---TGGTTGAATATT--GT--GTGA-GTTTCGTAAATTGTA
gi|144641 : TAATGAT--AT-GTG-TCTTCAATTTCACCACAAAGACAATTTG--GA--CTTGCAACTAT-GT--TTT--TATTGAATA--AATGTTGATTCAAGT-TACTGCAATTTGTATGAAGTCGTGTATGCTA-TATTTG-GGCAG-T-T-CGGT--TTC--C-TGT-AT---AATAG--TGATT-TGGA
gi|144642 : atgaataaaAAGTAATG-T--CTCGTA-TCTTCAATACTTTCGCATGAACAT----------CTATT-------GT--TTGAATAAAGAAT-------TTCATT-GAGCTTGCTGCATTGTGTCCAAAGACGTGT---------TTTGTAATTT-TCT-A--T--TAC--C---A-GT---AATAG--TTTTTCTTGATTT--TTATAAT----A--T--TACTGT--AAATT---TT----G------T-TTTCAAA--TATAGT--TAGAGAT-----TC--TG----A--A-------TG--TT------TT---ATTTCTGGAGCAAGAGTAG-----TCCA-TTCTTA--GTTGTTGGTGGAAGAAAG-G-AGTTTGC-AT-ATAGCAGGATATTACAATAATGGTGTTC--TTG----TCTTAT--TTGT-ATAACGAAGGTTGTA
gi|144643 : atgaa--TTT--TAGTGTATA--GCAGATAATC-AAGAGAACTACAATTTGGTCTGACGAAATTGTGGTA-AATTTGAAATAAATGT-C--T--TCC--G-TGT-GT---AATAA--TAATT-AGGAGTA--AT-CGGT-CG-G--T--TGCTATC-GAGTG---TATTTTGATATACT-CTTAAA--TTGATAT--T---GAT-----TC--TG----A--G-------TT--TCTTTGTTTT---ATTTCTGTTG-----TCAGTTCGTCCCAAACCCTT--ATCGTAGAGGAGAGCAAA-G-A-TTTGTAAA-ATAGTTGTGTAGTAC-ATGATATTGTGCGGTTG----TC--AT--TTGA-ATTTCACAGGATGTATGTAAC
Alignments
lowQualScore : 1 111111 111111 11 1111111 111 11 11 1111 11 11111111111111111111 2222222 555555555555555555555555555555 1111
lowQualScore : 55 3 2 44 555 3 3 1 55 3 5 888 5 5 0 9 2 00 8 3 55 55 7777 4 55 4 111111 55 0 4 4 0 000000 00 1 6 0 99 22 88 22 33 1 33 1 33 1 3333333 1 1 777 22 22 444 0 22 0 1 22 1 66 0 0 6666 00 22 1 22 88 1 44 1 55 333 22 1 33 3333 1 55 1 22 55 33 22 99999999999999999999 9999999 22 555 888888888888888888888888888888 6666666 333 0 1 55555 3 0 1 55 2 3 3 3 3 4 3 1 3 1 3 2 5 5555 55 55 3
lowQualScore : .. . . .. ... . . . .. . . ... . . . . . .. . . .. .. .... . .. . ...... .. . . . . ...... .. . . . .. .. .. .. .. . .. . .. . ....... . . ... .. .. ... . .. . . .. . .. . . .... .. .. . .. .. . .. . .. ... .. . .. .... . .. . .. .. .. .. .................... ....... .. ... .............................. ....... ... . . ..... . . . .. . . . . . . . . . . . . . .... .. .. .
lowQualScore : 00 6 5 66 888 3 6 8 55 7 0 888 0 0 1 4 9 88 2 9 00 00 7777 0 55 0 555555 55 6 0 0 8 555555 66 8 7 5 22 33 88 22 77 5 44 0 33 0 4444444 0 5 777 00 00 555 6 00 1 0 99 0 44 8 8 9999 44 77 7 33 33 0 88 7 88 000 44 7 44 8888 8 11 8 55 22 00 99 11111111111111111111 2222222 88 555 444444444444444444444444444444 2222222 555 6 0 33333 1 6 1 00 5 5 6 6 6 4 6 0 6 3 6 6 9 5555 00 00 6
consensus : AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA--GAG-ATGGGTGA--A---ATTTTG-CTGT-TCGTCT--CAACAGGAATAGGAATAG-C---C-GTTGAGGGACTTAA-TGGTATGGTCAATTATGTACAGATATATCGAAACTAAGTTCAGATAAATGTTAGTTAAAATTAAGATTTGAAAGGATATTGAAAATATTAACTGTTAAGTGGTTTATGCGCTACTTGAATCTTTTTGATGCTATTATATAGTCTTGT--ACTG--TTAGAAAT----AAGCTTGTATTGATTTCAATGGATAACAAG-GGATCTCCAAACAAAAGTGTATTTACAGT--TGGT-TGTATGT------TT--AATTCTCGTATTTT-TTG-TAACATAA------TGCCTCTCTGCTCCGTAT-ACAAA--G--G--ACAGACGAGGAGGTAATGAT--CT-GTG-CTTTCNATTGNTCCACATGTACANAGTG--GG--NTNTTCANTAA-GT--TTT--TANNGAATA--GATGTTGNTT-AAGNGCGCTACAATTTGTTCGAAGGCGAGTATGCNA-GATCTGTGACAN-TCT-C--T--TNC--C-TGC-GT---AATAG--TGTTT-TGGAGTA--NT-TGGT-CG-G--T--TNCTATT-NAGTC---TA----G------T-CTTAAAGGCTGTAAT--T---GAT-----TC--TG----A--G-------TT--TC------TT---GTTTCTATNG-----GTAGNTCGTTCCAATCCCTT--GTCGTCGAGGGAAGAAAA-G-A-TTTGTAAA-ANAGCTGGGTATTAC-ATGGTAATGTACGGTTG----TC--AT--TTGA-ATTTCGCAGGTTGTACGTAAC
Reference ( family-583 ) : AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA--GAG-ATGGGTGA--A---ATTTTG-CTGT-TCGTCT--CAACAGGAATAGGAATAG-C---C-GTTGAGGGACTTAA-TGGTATGGTCAATTATGTACAGATATATCGAAACTAAGTTCAGATAAATGTTAGTTAAAATTAAGATTTGAAAGGATATTGAAAATATTAACTGTTAAGTGGTTTATGCGCTACTTGAATCTTTTTGATGCTATTATATAGTCTTGT--ACTG--TTAGAAAT----AAGCTTGTATTGATTTCAATGGATAACAAG-GGATCTCCAAACAAAAGTGTATTTACAGT--TGGT-TGTATGT------TT--AATTCTCGTATTTT-TTG-TAACATAA------TGCCTCTCTGCTCCGTAT-ACAAA--G--G--ACAGACGAGGAGGTAATGAT--CT-GTG-CTTTCNATTGNTCCACATGTACANAGTG--GG--NTNTTCANTAA-GT--TTT--TANNGAATA--GATGTTGNTT-AAGNGCGCTACAATTTGTTCGAAGGCGAGTATGCNA-GATCTGTGACAN-TCT-C--T--TNC--C-TGC-GT---AATAG--TGTTT-TGGAGTA--NT-TGGT-CG-G--T--TNCTATT-NAGTC---TA----G------T-CTTAAAGGCTGTAAT--T---GAT-----TC--TG----A--G-------TT--TC------TT---GTTTCTATNG-----GTAGNTCGTTCCAATCCCTT--GTCGTCGAGGGAAGAAAA-G-A-TTTGTAAA-ANAGCTGGGTATTAC-ATGGTAATGTACGGTTG----TC--AT--TTGA-ATTTCGCAGGTTGTACGTAAC
gi|144608 : AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATTGAG-ATGGGTGA--A---ATTTTG-CTGT-TCGTCT--CAACAGGAATAGGAATAG-C---C-ATTGAGGGACTTAA-TGGTATGGTCAATTATGTACAGATATATCGAAACTATGTTCAGGTAAATGTTAGTTAAAATTAAGATTTGAAAGGAT-TTGAAAATATTAACTGTTAAGTGGTTTGTGCGCTACTTGAATCTTTTTGATGCTATTATATAGTCTTGT--ACTG--TTAGAAAT----AAGCTTGTATTGATTTCAATGGATAACAAG-GGATCTCCAAACAAAAGTGTATTTACAGT--TGGT-TGTATGT------TT--AATTCTCGTATTTT-TTG-TACCATAA------TGTCTCTCTGCTCCGTAT-ACAAA--G--A--ACAAATGAAAAGGTAATGAT--CT-GTG-TTTTCTATTAATCCACATGTACAAAGTG--GG--CTGTTGATTAA-GT--TTT--TATTGTATA--GAAGATAATT-AAGAGGACTACAGTATGTTCTAAGGCGAGTGTGTTG-GATCTGTGATAA-TCT-C--T--TCC--C-TGC-AT---AATAG--TGTTT-TGGAGTA--AT-AGGT-CG-G--T--TGCTATT-GAGTT---TA----G------T-CTTAAAAACTGTAAT--T---GAT-----TC--TG----A--G-------TT--TT------TT---ATTTCTATTG-----ATAGTTCGTTCCAGTCCCTT--GTTGTCGAGGGAAGAAAA-G-A-TTTGTAAA-AAAGCTGGGTATTGC-ATGGTAATGTACGGTTG----TC--AT--TTGA-ATTTTGCAGGTTGTACGTAAC
gi|144609 : AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA--GAG-ATGGGTGA--A---ATTTTT-CTGT-TCGTCT--CAACAGGAATAGGAATAG-C---C-ATTGAGGGACTTAA-TGGTATGGTCAATTATGTACAGATATATCGAAACTAAGTTCGGATAAATGTTAGTTAAAATTAAGATTTGAAAGGAT-TTGAAAATATTAACTGTTAAGTGGTTTATGCGATACTTGAATCTTTTTTATGCTATTATATAGTCTTGT--ACTG--TTAGAAAA----AAGCTTGTATTGATTTCAATGGATAACAAG-GGATCTCCAAACAAAAGTGTATTTACAGT--TGGT-TGTATGT------TT--AATTCTCATATTTT-TTG-TAACATAA------TGGCTCTCTGCTCCGTAT-ACAAA--G--A--ACAAATGAAGAGGTAATGAT--CT-GTG-TTTTCTATTAATCCACATGTACAAAGTG--GG--CTGTTGATTAA-TT--TTT--TAGTGTGTA--GAAGATAATA-AAGAGGACTACAGTATGTTCTAAGGCGAGTGTGTTG-GATCTATGATAA-TCT-C--T--TCC--C-TGC-AT---AATAG--TGTTT-TGGAGTA--AT-AGGT-CG-G--T--AGCTATT-GAGTT---TA----T------T-CTTAAAAACTGTAAT--T---GGT-----TC--TG----A--GT------TT--TT------TT---ATTTCTTTTG-----ATAGTTCATTCCAGTCCCTT--GTTGTCGAGGGAAGAAAA-G-A-TTTGTAAA-AAAGCTGGGTATTAC-ATGGTAATGTACGGTTG----TC--AT--TTGA-ATTTCGCAGGTTGTACGTTAC
gi|144610 : AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA--GAG-ATGGGTGA--A---ATTTTG-CTGT-TTGTCT--CATCAGGAATAGGAATAG-C---C-ATTGAGGGACTTAA-TGGTATGGTCAATTATGTACAGATATATTAAAA---------------------TTAAAACTAAGATTTGAAAGGATATTAAAAATATTAACTGTTTAGTGGTTTATGCTCTTCTTGAATCTTTTTGATGCTATTATATAGTCTTGT--ACTG--TTAGAAAT----AAGCTTGTATTTATTTCAATGGATAACAAG-GGATCTCCAAACAAAAGTGTATTTACAGT--TGGT-TGTATGT------TT--AATTCTCGTAGTTT-TTG-TAACATAA------TACGTCTCTGCTACGTAT-ACAAA--G--A--ACAGATGAAGAGGTAATGAT--TT-GTGTTTTTCTATTAATCCACATGTACAAAGTG--GG--CTGTTCATTAA-GT--TTT--TAGTGTATA--GACGATAATT-AAGAGGACTACAGTATGTTCTGAGGCGAGTGTGTTG-GATCTGTGATAA-TCT-C--C--TTC--C-TGC-AT---AATAG--TGTTT-TGGAGTA--AT-CGTT-CG-G--
gi|144611 : AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA--GAT-ATGGGTGA--A---ATTTTG-CTGT-TCGTCT--CAACAGGAATAGGAATAG-C---C-ATTGAGGGACTTAA-TGGTATGGTCACTTAAGTACAGATTTATCGAAAATAAATTCAAATAAATGTTAGTTAAAATTAAGATTTGGAAGAAT-TTTAAAATATTAAGTGTTAAGTGGTTTATGCGCTACTTGAATC-TTTTGATGCTATTATATAGTCTTGT--ACCG--TTAGAAAT----AAGCTTGTATTGATTTCAATGGATAACAAG-GGATCTCCAAATAAAAGTGTATTTACAGT--TGGC-TGTATGT------TT--AATTCTCGTATTTT-TTG-T-ACATAA------TGTCTCTccaattga
gi|144612 : AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA--GAG-ATGGGTGA--A---ATTTTG-CTGT-TCGTCT--CAACAGGAATAGGAATAG-C---C-ATTGAGGGACTTAA-TGGTATGGTCAATTATGTACAGATATATCGAAACTAAGTTCAGATAAATGTTAGTTAAAATTAAGATTTGAAAGGAT-TTGAAAATATTAACTGTTAAGTGGTTTATGCGCTACTTGAATCTTTTTGATGCTATTATATAGTCTTGT--ACTG--TTAAAAAT----AAGCTTGTATTGATTTCAATGAATAACAAG-GGATCTCCAAACAAAAGTGCATTTAC
gi|144613 : AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA--GAGTAT---CAA--A---A--TTG-CTAT-TAGTTTACCAAC
gi|144614 : AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA--GAG-GT--------A---ATTTCATCTG----GTCG--AAACTGGAAT
gi|144615 : AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA--GAG-ATGGGT-A--GCTTATTTTG-C
gi|144616 : AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA--GAG-ATTTGTGATTA---ATGTTC-CTTTATTGTC
gi|144617 : AGAGAGA--CAG-TTGGGTGA--A---ATTTTG-CTAT-TTGTCT--CGTCAGGAACAAGAATAA-CTCTC-GTT---GGACTTAT-TGTCATAGTT-ATCTTGTATAGATTTATCGAAA-TAATTCCCAATAACTGTT
gi|144618 : GA--GAA-TTTGGTGG--A---ATTTCG-CTGT-TTGTCT--CATCTTAAATAGGAATAGTC---C-GTTGAGGCATGTAA-----------AGTCATGTACAGATGTATCGAAAATAAGTTCAAATAACTGTGAGATAAAAATGTGATTTCGAAATATATTAAAAACAGCAACT-TTA------TTATGAACTCTTTGAATCTTTTTGATGTTATTATATAGTTTTGTTCATTG----AGGAAT----AATTTTGTTTTGATTT-GGTGGATGACATG-GTGTTTCCAAACAAAGGTGTATTTACTGT--TAGT-TTTATGT------TT--AATTCTCGTAGTTA-ATG-TAGCATAATAATACTGCGTCTCTGTTCTGTAT-ACAAA--G--A--ACA
gi|144618 : ATGTATAAAGTG--GT--TTGTTTATTAA-GT--GTT--TAATGAG-A--GAAGATCATT-TAGAGGACTACAGTTTGTTC-----TGAG--------GATCTGAGATGA-TCA-C--G--TCT--C-TGT-AT---ATTAC--TATTT-AGGAGTA--AT-TGGT-CA-G--T--TGTAATT-GAGTT---CA----T------T-CCAACAAATTGTTAT--T---GAT-----TC--TG----A--GTTT----TT--TT------TT---ATTTCTGTTG-----TTAGTTCGTGCCAGTACTTT--ATCGTCGCTGAAAGACAA-G-A-TTTGTAAA-ACCGTTGGGTATTAT-ACGCTAAT-TGC-ATTG----AT--AA--TTGA-AATTcttatgtataaagtggtttgtttattaagtgtttaatgagagaagatcatttagaggactacagtttgttctgaggatctgagatgatcacgtctctgtatattactatttaggagtaattggtcagttgtaattgagttcattccaacaaattgttattgattctgagtttttttttatttctgttgttagttcgtgccagtactttatcgtcgctgaaagacaagatttgtaaaaccgttgggtattatacgctaattgcattgataattgaaatt
gi|144619 : gagaatttggtggaatttcgctgtttgtctcatcttaaataggaatagtccgttgaggcatgtaaagtcatgtacagatgtatcgaaaataagttcaaataactgtgagataaaaatgtgatttcgaaatatattaaaaacagcaactttattatgaactctttgaatctttttgatgttattatatagttttgttcattgaggaataattttgttttgatttggtggatgacatggtgtttccaaacaaaggtgtatttactgttagttttatgtttaattctcgtagttaatgtagcataataatactgcgtctctgttctgtatacaaagaacacttGGGTGA--A---CATTTG-CTGT-TTGTCT--TA-------------TAT-C---CCGTTGAGGGACCTAAATGGCGTGGTCAGTTGTATGTAGATGTACCGA---TAA--T--GATAAATGTTAGTTAAAAT-ATGATTTAGAAATACATTAAAA----TCACT------TGGTTTACGTTTTATTTTA-TATTTTTTATGCTATTATATAATCTTGT--CCTG--TAGGGACT----ACGTTTGTGTTGGTT
gi|144620 : GTACAGATATATCGAAACTAAGTTTAGATAAATGTTAGTTAAAATTAAGATTTGAAAGGAT-TTGAAAATATTAACTGTTAAGTGGTTTATGCGCTACTTGAATCTTTTTGATGCTATTATATAGTGTTGT--ACTG--TTAGAAAT----AAGCTTGTATTGATTTCAATGGATAACAAG-GGATCTCCAAACAAAAGTGTATTTACAGT--TGGT-TGTATGT------TT--AATTCTCGTATTTT-TTG-TAACATAA------TG--TCTCTGCTCCGAAT-ACAAA--G--A--ACAAATGAAGAGGTAATGAT--CT-GTG-TTTTCTATTAATCCACATGTACAACGTG--GG--CTGTTGATTAA-GT--TTT--TAGTGTATA--GAAGATAATT-AAGAGGACTACAGTATGTTCTAAGGCGAGTGTGTTG-GATCTGTGATAA-TCT-C--T--TCC--C-TGC-AT---AATAG--TGTTT-TGGAGTA--AT-AGGT-CG-G--T--TGCTATT-GAGTT---TA----T------T-CTTAAAAACTGTAAT--T---GAT-----TC--TG----A--G-------TT--TT------TT---ATTTCTATTG-----ATAGTTCGTTCCAGTCCCTT--GTTGTCGAGGGAAGAAAA-G-A-TTTGTAAA-AAAGCTGGGTATTGC-ATGGTAATGTACGGTTG----TC--AT--TTGA-ATTTCGCAGGTTGTACGTAAC
gi|144621 : TAAGATTTGAAAGGATATTAAAAGTATTCACTTTTAAATGGTTTATGCGCTACTT-----TTTCTGACGCTATTATATAGTCTTGT--ACTG--TTAGAAAT----AAGATTGTATTAATTTCAATGGATAACAAG-GGGTCTCCAAACAAAAGTGAATTAACAGT--TTGT-TGAATAT------TT--AATTCTCGTAGTTT-TTG-TAACATGT------TGCGTCTCTGCTCCGTAT-AC-AA--G--A--ACAGATGAAGATGTAATGAA--TT-GTG-TTTTCTATTAAT-CACATGTACAAAGTG--GG--CTGTTCATTAA-GT--TTT--TAGTGTATA--GAAGATAATT-AAGAGGACACCAGTATGTTCTGAGGCGAGTGTGTTG-GATCTGTGATAA-TCT-A--T--TCC--C-TGC-AT---AATAT--TTTTT-TGGAGTA--AT-CGAT-CG-G--T--TGCTATT-GAGTT---TA----T------T-CTTTAAAACTGTAAT--T---GAT-----TC--TG----A--T-------TT--TT------TTTAAATTTTTATTG-----TTAGTTCGTTCCAATCCCTT--TTCGCAGAGTGAAGAAAA-G-A-TTTGTAAA-TAAACTGGATATTTC-ATTGTAATGTAGTGTTG----TC--AT--TTGA-
gi|144622 : ATGCGCTACTTGAATCTTTTTGATGCTATTATATAGTCTTGT--ACTA--TTAGAAAT----AAGCTTGTATTGATTTCAATGGATAACAAG-GGATCTCCAAACAAAAGTGTATTTACAGT--TGGT-TGTATGT------TT--AATTCTCGTATTTT-TTG-TAACATAA------TGTCTCTCTGCTCCGTAT-ACGAA--G--A--GCAAATGAAGAGGTAATGAT--CT-GTG-TTTTCTATTAATCCACATGTACAAAGTG--GG--CTGTTGATTAA-GT--TTT--TAGTGTATA--GAAGATAATT-AAGAGGACTACAGTATGTTCTTAGGCGAGTGTGTTG-GATCTGTGATAA-TCT-C--T--TCC--C-TGC-AT---AATAG--TGTTT-TGGAGTA--AT-AAGT-CG-G--T--TGCTATT-GAGTT---TA----T------T-CTTAAAAACTGTAAT--T---GAT-----TC--TG----A--G-------TT--TT------TT---ATTTCTATTG-----ATAGTTCGTTCCAGTCCCTT--GTTGTAGAGGGAAGAAAA-G-A-TTTGTAAA-AAAGCTGGGTATTAC-ATGGTAATGTACGGTTG----TC--AT--TTGA-ATTTCGCAGGTTGTACGTAAC
gi|144623 : AT-AAATA--G--G--ACAGACGAGGAGGTAATGAT--TT-GTA-CTTTCAATTGCTCCACATGTACATAGTG--GGGAATTTTCAATA---T--TTT--TTTGGAATA--AGTGTTGTTT-CAGCGTGCTACAATTTGTACGAAGACGAGTATGCAA-GACC--TGACAT-TTT-C--TTGTGC--C-TGT-GT---AAAAG--TGTTT-TGATGT---TT-TGGTAAG-A--T--TTTTATT-TAG-C---TG----G------TGCTTTAAGGC----AT--T---GAT---------------A--GAAACGGCTTG-TC------TT---GTTTCAATAG-----GTAGATTGTTCCAATC
gi|144624 : tatatatttgtggacagctttaaaaatttcgacgtttgtattgtgggggagatgaggttctccaaagagaagtgtgttgagggtaacagtgcatatatgagagattgatgcaagaagtgtagcgcgttcggcatgAT-AAATA--G--G--ACAGACGAGGAGGTAATGAT--TT-GTA-CTTTCAATTGCTCCACATGTACATAGTGGAGA--ATTTTCAATA---T--TTT--TTTGGAATA--AGTGTTGTTT-CAGCGTGCTACAATTTGTACGAAGACGCGTATGCAA-GACC--TGACAT-TTT-C--TTGTGC--C-TGT-GT---AAAAG--TGTTT-TGATGT---TT-TGGTAAG-A--T--TTTTATT-TAG-C---TG----G------TGCTTAAAGGC----AT--T---GAT---------------A--GAAACGGCTTG-TC------TT---GTTTCAATAG-----GTAGATTGTTCCAATC
gi|144625 : tatatatttgtggacagctttaaaaatttcgacgtttgtattgtggaggagatgaggttctccaaagagaagtgtgttgagggtaacagtgcatatatgagagattgatgcaagaagtgtagcgcgttcgacatgTATATATTTGTGG--ACAGCATTAAAAATTTCGACGTTTGTATTG-------TGGGTGAGATGAGGTTCACCAAAGAGAAGTGTGTTGAGGGTAACAGTGCATATGTGAGAGATT--GATTC--GAAT---------AGCGTAG------CGC------GTTCGGTATGATAAATAG--G--ACAGACGAGGAGGTAATGAT--TC-GTA-CTTTCAATTGCTCCACATGTACACAGTGGAGA--ATTTTCAATA---T--TTT--TTTGGAATA--AGTGTTGTTT-CAGCGTGCTACAATTCGTACGAAGACGAATATGCAA-TACC--TGACAT-TTT-C--TTGTGC--C-TGT-GT---AAAAG--TGTTT-TGATGT---TT-TGGTAAG-A--T--TTTTATT-TAG-C---TG----G------TGCTTAAAGGC----AT--T---GATAG---AA--AG----A--G-------CTCGTC------TT---GTTTCAATAG-----TTAGATTGTTCCAATC
gi|144626 : CAAATAAAAGTAAGTTTAAAG----AAT-TAT---T------TTGAAATTCAAGCAGTTTATTGCT--CATGG------TGTTTCTTTGTCTAATGT-ATTTT--G--G--ACATTCGAAAAGAAAGTGAT--TG-ATA-TCTTAAATTTGGCCGCAGGAGCAAAATG--AA--TTAT-CAATGATGT--TTG--T-TTGAATAAAGGTGCTGATT-AAGACTACTGCGGTTTGTTCTGAGACGAGTGTGCAT-GATATGTGATTT-TCT-A--T--TGCTAC-TATAGT---AATAG--TATTT-TG--TTA--TT-TTAT-TT-GTAT--TAGTGTT-AA-TCACTT------------T-CTTAAAAACTG--ATGGC---GAT-----GG--TG----C--T-------TC--TT------TT---GTAACTTGTG-----AAAGCATGTTCCAAT--CTTAAATAGTGGAAGGAAGAAAG-T-A-GTT-TACATACAACTGGGTATTGC-ATTTTAATGTCC--TTG-----C--ATGGTCGGCATTCCGTAAGTTATA
gi|144627 : ------TGTTTCTCTGAATAGTGT-ACAAA--G--A--ACAGT---GCAAATAATG-T--TT-ATA-TCTTCAATACATTCGCATGCACATAAAG--GG--CTCTCTATTAA-AT--GTT--AAT---ACA--GATGGTGCTT-CAGGTTGCTGCATAGTGTCTGAAGATGTGTGTG--G-AACTTGTAATTT-GCT-A--T--TAT--C-TGT-GT---AATAC--TGTTT-TGG-GAA--TT-TTAT-CATA--T--TACTGTT-AAATT---TA----T------T-ATTAAAG---ATAAT--TA--GATAC---TC--TG----ATTG-------TT--T-------TT---GTTT
gi|144628 : GTTCGGTATGATAAATAG--G--ACTGACGAGGAGGTAATAAT--TC-GTA-CTTTCAGTTGCTCCACATGTACACAGTGGAGA--ATTTTCAATA---T--TTT--TTTAGAATA--AGTGTTTTTT--AGCGTGCTACAATTCGTACGAAGACGAGTATGCAA-GACC--TGATAC-TTTAC--TTGTGC--C-TGT-GT---AAAAG--TGTTT-TGATGT---TT-TGGTAAG-A--T--TTTTATT-TAG-C---TG----G------TGCTTAAAGGC----AT--T---GAT---------AGAAACA--G-------CTCGTC------TT---GTTTCTATAG-----GTAGATTGTTCCAATC
gi|144629 : GTTCGGTATGATAAATAG--G--ACAGACGAGGAGGTAATGAT--TT-GTA-CTTTCAATTGCTCCACATATACATAGTG--GGGAATTTTCAAT-A-TT--TTT--TTTTGAATA--AGTGTTGTTT-CAGCGTGCTACAATTCGTACGAATACGAGTATGCAA-GACC--TGACAT-TTT-C--T--T
gi|144630 : AT-AAATA--G--G--ACAGATGAGGAGGTAATGAT--TT-GTA-CTTTCAATTGCTCCACATGTACATAGTGGAGA--ATTTTCAATA---T--TTT--TTTGGAATA--AGTGTTGTTT-CAGCGTGCTACAATTTGTACGAAGACGAGTATGCAA-GACC--TGACAT-TTT-C--TTGTGC--C-TGT-GT---AAAAG--TGTTT-TGATGT---TT-TGGTAAG-A--T--TTTTATT-TAG-C---TG----G------TGCTTAAAGGC----AT--T---GAT---------------A--GAAACGGCTTG-TC------TT---GTTTCAATAG-----GTAGATTGTTCCAATC
gi|144631 : AT-AAATA--G--G--ACAGACGAGGAGGTAATGAT--TT-GTA-CTTTCAATTGCTCCACATGTACATAGTGGAGA--ATTTTCAATA---T--TTT--TTTGGAATA--AGTGTTGTTT-CAGCGTGCTACAATTTGTACGAAGACGAGTATGCAA-GACC--TGACAT-TTT-C--TTGTGC--C-TGT-GT---AAAAG--TGTTT-TGATGT---TT-TGGTAAG-A--T--TTTTATT-TAG-C---TG----G------TGCTTAAAGGC----AT--T---GAT---------------A--GAAACGGCTTG-TC------TT---GTTTCAATAG-----GTAGATTGTTCCAATC
gi|144632 : AT-AAATA--G--G--ACAGACAAGGAGGTACTAAT--TT-GTA-CTTTCAATTGCTCCACATGTACATAGTG--G
gi|144633 : -ACAAATAG--G--ACAGACGAAGAGGTAATGAT--TT-GTA-CTTTCAATTGCTCCATGTGTACATAGTGGAGA--ATTTTCAATA---T--TTT--TTTGGAATA--AGTGTTGTTT-CAGCGTGCTACAATTTGTACGAAGACGAGTATGCAA-GACC--TGACAT-TTT-C--TTGTGC--C-TGT-GT---AAAAG--TGTTT-TGATGT---TT-TGGTAAG-A--T--TTTTATT-TAG-C---TG----G------TGCTTAAAGGC----AT--T---GATAGAAATC---G----C--T-------TG--TC------TT---GTTTCAATAG-----GTAGATTGTTCCAATC
gi|144634 : AAA--G--GTGACAATTGAGAAGGAAGTGAG--CT-GTG-CTCTCTATTTGACCACATATACACAGAG--GG--GAATCTACGAT-GT--GTT--TAAGAAATA--GATGTTGCTT-AAGAGCACTACAGCTCGTTCGAAGGCGAGCATG
gi|144635 : AAA--G--GTGACAATTGAGAAGGAAGTGAG--CT-GTG-CTCTCTATTTGACCACATATACACAGAG--GA--GAATCTACGAT-GT--GTT--TAAGAAATA--GATGTTGCTT-AAGAGCACTACAGCTCGTTCGAAGGCGAGCATG
gi|144636 : AAA--G--GTGACAATTGAGAAAGAAGTGAG--CT-GTG-CTTTCTATTTGTCCACATGTACACAGGG--GGGAGTCTTCAATA---T--GTT--TAAGAAATA--GATGTTGCTT-AAGTGCACTACAACTCGTTCGGAGGCGGGCATGCAATAAT---TGGCAT-TTC-C--TTGTAC--C-TAT-GT---AATAG--AATTT-AG--GTACTTT-TGGT-TC-G--T--TACCTTC-GAGTT---TAT---G------T--TTAAAAGT-------------AT-----TC--AG----A--GAAGAGGCTTG-TC------TT---GTTTCAAGTG-----GGAGAGTGTTCCAGTC
gi|144637 : AAA--GTTG--ACAATTGAGAAAGAAGTGAG--CT-GTG-CTTTCTATTTGTCCACATGTACATAGAG--GGCAATCTACAAT---GT--GTT--TAAGAAATA--GATGTTGCTT-AGGTGCACTACAACTCGTTCGGAGGCGGGCATG
gi|144638 : AAA--G--GTGACAATTGAGAAAGAAGTGAA--CT-ATA-CTTTCTATTTGTCCACATGTACACAGAG--GGGAGTCTTCAAT---GT--GTT--TAAGAAATA--GATGTTGCTT-AAGTGCACTACAACTTGTTCGGAGGCAGGAAT-CAATAAT---TGGCAT-TTC-C--T--TGTAGC-TAT-GT---AAAAGAATGTT-----AGTACTTT-TGGT-TA-G--T--TA-TATTCGAGTT---TAT---G------T--TTAAAAGC
gi|144639 : --G--G--ACAGTTGAGTAAGAAATGTTTACT-GT---CTTCGAGTGAACGGCATGTGCACA-TG--GG--ACTTTCAACAATAT--TTT--TGGAATATA--AATGTTGGTT-AAGTGAACTACAATTTAGTCGTAGACGGGTATGGTT-TATTTGAGATAA-TCT-G--T--CTC--CGTG--GTGGAAATAG---G----TAGAA-A--CT-TTGT-CA-A--TAATAGGGTT-TAGTC---TA----T------T-CTTAAA---TATACT--T---AATG----TTGGTG----A--G-------TT--CT------GG---GTTAGTATAG-----GTAAACTATTCCATGCTTTC--ATTGTTGAAGGAAGAAAGCG-A-TGTGC-AA-AGAGTTGTGTATTAC-A-AGCAAT---TGGTTGAATATT--GT--GTGA-GTTTCGTAAATTGTA
gi|144640 : --ACAGTTGAGTAAGAAATGATA-CT-GT---CTTCGAGTGAACAGCCTGTGCACA-TG--AG--ACTTTCAACAA--TAATTT--TAGAATATA--AATGTTGATT-AAGTGAACTACAATTTAGTCTTAGATGGGTATGGTA-TATTTGAGCCAA-TCT-C--T--CTC--C-----------ATGG--------AGGA--A--CT-TTGT-CA-A--TAATAGTTTT-CAGTC---TA----T------T-CTTAAA---TATACT--T---AATG----TTGGTG----A--G-------TT--CT------GG---GTTGCTATAG-----GTAAACTATTCCATGCTTTT--ACTGTTGAAGGAAGAAAT-GAA-TTTGC-AA-AGAGTTGTGTAATAT-A-AGCAAT---TGGTTGAATATT--GT--GTGA-GTTTCGTAAATTGTA
gi|144641 : TAATGAT--AT-GTG-TCTTCAATTTCACCACAAAGACAATTTG--GA--CTTGCAACTAT-GT--TTT--TATTGAATA--AATGTTGATTCAAGT-TACTGCAATTTGTATGAAGTCGTGTATGCTA-TATTTG-GGCAG-T-T-CGGT--TTC--C-TGT-AT---AATAG--TGATT-TGGA
gi|144642 : atgaataaaAAGTAATG-T--CTCGTA-TCTTCAATACTTTCGCATGAACAT----------CTATT-------GT--TTGAATAAAGAAT-------TTCATT-GAGCTTGCTGCATTGTGTCCAAAGACGTGT---------TTTGTAATTT-TCT-A--T--TAC--C---A-GT---AATAG--TTTTTCTTGATTT--TTATAAT----A--T--TACTGT--AAATT---TT----G------T-TTTCAAA--TATAGT--TAGAGAT-----TC--TG----A--A-------TG--TT------TT---ATTTCTGGAGCAAGAGTAG-----TCCA-TTCTTA--GTTGTTGGTGGAAGAAAG-G-AGTTTGC-AT-ATAGCAGGATATTACAATAATGGTGTTC--TTG----TCTTAT--TTGT-ATAACGAAGGTTGTA
gi|144643 : atgaa--TTT--TAGTGTATA--GCAGATAATC-AAGAGAACTACAATTTGGTCTGACGAAATTGTGGTA-AATTTGAAATAAATGT-C--T--TCC--G-TGT-GT---AATAA--TAATT-AGGAGTA--AT-CGGT-CG-G--T--TGCTATC-GAGTG---TATTTTGATATACT-CTTAAA--TTGATAT--T---GAT-----TC--TG----A--G-------TT--TCTTTGTTTT---ATTTCTGTTG-----TCAGTTCGTCCCAAACCCTT--ATCGTAGAGGAGAGCAAA-G-A-TTTGTAAA-ATAGTTGTGTAGTAC-ATGATATTGTGCGGTTG----TC--AT--TTGA-ATTTCACAGGATGTATGTAAC
blockSeqs : . T G TT CTT T A C AC A T TCT C A C G A G TC CA TTCG A AA G GAGAGA GA A C TAATAC GC C G TA TT TG AT TA C GT T AA A GGGAA G T ATG AA AA AGT AA A CA A GA CAAT TA AA A GG TG C TA G TA GGA AA C GA ACTT A AA T TA AA GC CG TGTATTTTGATATACT AACTGTA GG AGA TCAGAGAAGAGGCTTG CTTTGTT TAA T CAAGA T G AA T C C A G A T A A T G A G AATA TT GG C
blockSeqs : . . G . . . . T . T . . . . A A A G . . . . . . . . . . . CG C G TA . TG AT A . G T AA A GAGAA G T ATA . . AGT . A A A GA CAAT TG A . . TG T AG . C . . . GA ACTT . AA . . AA GT G TCACTTT AATTGTT . A AGAAACGGCTTG T . T . T G . C C . . . A . C . C G G G AATA . . .
blockSeqs : . . G . . . . C . A . . . . C G A G . . . . . . . . . . . TC T G TA . TG AT . . G T AA A GAGAA G T AT . . AAT . A A A GA TTG TG A . . TG C . . C . . . GA AA . AA . . . GC G TTTATGT AACTGTA . . AGAAACGGCTTG T . T . T G . T C . . . A . A . T G A T . . . .
blockSeqs : . . G . . . . C . A . . . . A T A G . . . . . . . . . . . CG C . TA . TG AT . . G T AA A GAGAA G T AG . . AGT . A T A GA TTG TG A . . TG C . . T . . . GA AA . AA . . . GC G TTTATGT AACTGTA . . AGAAAGAGCTCG T . T . T A . C A . . . A . A . T G A G . . . .
blockSeqs : . . G . . . . A . A . . . . C G . G . . . . . . . . . . . CG C . . . . AT . . G T AA A GGGAA G T AG . . AGT . A A A GA TTG TG A . . TG C . . C . . . GA AA . AA . . . GC G TTTATT AACTGTA . . ACTCTGATTGTT T . T . T G . T A . . . A . A . T G A G . . . .
blockSeqs : . . T . . . . T . A . . . . . G . T . . . . . . . . . . . TC C . . . . AC . . A A GC A GAGAA G T AG . . AGT . A A A GA TTG TG A . . TG C . . C . . . GA AA . AA . . . TT G TTCATT AACTG . . AGAAACAGCTCG T . A . A A . A G . . . A . C . T G C G . . . .
blockSeqs : . . G . . . . T . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT G . . . . AC . . A A GC T GAGAA T A AG . . TTG . T A C TG TTG TG A . . TG G . . C . . . AT AA . AA . . . TT T TTTATT ATATA . . AGAAACGGCTTG C . A . A A . T T . . . A . G . T G T G . . . .
blockSeqs : . . T . . . . T . T . . . . . . . . . . . . . . . TT A . . . . AC . . A A GC T GAGAA T A AG . . TTG . T C C TG CAA TG T . . TG G . . T . . . AT AA . C . . . TT T TTTATT TTGAT . . AGAAACGGCTTG C . A . A A . T T . . . . . G . T . G . . . . .
blockSeqs : . . G . . . . T . . . . . . . . . . . . . C A . . . . TC . . A A TG C GGGAG T A AA . . TTG . T C C TG CAA TG T . . . G . . T . . . AT AT . C . . . AG T TTTATT GATA . . AGAAATCGCTTG C . T . C A . T T . . . . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . G . . . . AC . . A A CA A GGCAA A A AT . . TTA . A C A TA CAA TG T . . . G . . T . . . AT AT . C . . . AC A CTGGTG TATA . . TCTGAGTTTTT T . A . A A . C A . . . . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . G . . . . AC . . A A GC T GGGAG C T TG . . TTT . C A G TG CAT TG T . . . A . . T . . . AT AC . C . . . TT A CTGGTG TATA . . GTTGGTGAGTT C . A . A A
blockSeqs : . . . . AT . . A A GC C GGC T A TG . . TTG . T C C TG CAA TG T . . . G . . T . . . AT AC . C . . . TT T CTGGTG GGC . . GTTGGTGAGTT C . A . A A
blockSeqs : . . . . AC . . A A GC T GGC T A TG . . TTG . T C C TG CAA TG C . . . G . . T . . . AT TT . C . . . TT T TTTATT GGC . . TCTGAGTTT C . A . A A
blockSeqs : . . . . AC . . A A GC T GTT T A G . . TTG . T C C TG CAA . T . . . G . . T . . . GA AA . T . . . TT T CTGGTG GGC . . TCTGAGTT C . T . A G
blockSeqs : . . . . AC . . A A GC T GGC T A G . . AAG . T C C TG CAA . T . . . G . . T . . . GA T . C . . . AC T CTGGTG GGC . . TCTGATTT C . A . A T
blockSeqs : . . . . TT . . A A GC T GGC T A A . . AAG . T C C TG CAA . T . . . A . . T . . . GA T . T . . . AG G CTGGTG GGC . . TCTGAGTT T . A . A T
blockSeqs : . . . . TT . . G T TG T GGC A C G . . AAG . C A A CA GTT . T . . . G . . T . . . GA T . T . . . AG T CTGGTG GGC . . GGTGCTTC T . A . T A
blockSeqs : . . . TT . . G T TG C AAT A C . . . AAG . C A A CA GTA . T . . . T . . T . . . GA T . C . . . AC C TCTATT GGC . . TCTGAATG T . T . . .
blockSeqs : . . . TT . . G T TG C GGC C A . . . AAG . C A T CA CTA . T . . . T . . A . . . G T . C . . . GC A TCTATT AGT . . TCTGAGTT . .
blockSeqs : . . . TT . . G T TG C GGG C A . . . GGA . C A T CA GTA . A . . . T . . T . . . A T . C . . . A G TTTTGT
blockSeqs : . . . TT . . A T TG T GAG C A . . . AGA . C A T CA G . A . . . A . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . TT . . G G GA C GGA T A . . . ATT . G A T AA . . G . . . C . . . . . . .
blockSeqs : . . . T . . A G GA C AGA T A . . . AAA . A A T AA . . T . . .
blockSeqs : . . . . A TC C GAC T C . . . AGT . A G T TA
blockSeqs : . . . A CT A C A . . . . TT . A A C TG
blockSeqs : T . . AT . A . A AA
blockSeqCons : ** GGCTGTA AGAAAGGCTTG*******************
originalCons : AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA--GAG-ATGGGTGA--A---ATTTTG-CTGT-TCGTCT--CAACAGGAATAGGAATAG-C---C-GTTGAGGGACTTAA-TGGTATGGTCAATTATGTACAGATATATCGAAACTAAGTTCAGATAAATGTTAGTTAAAATTAAGATTTGAAAGGATATTGAAAATATTAACTGTTAAGTGGTTTATGCGCTACTTGAATCTTTTTGATGCTATTATATAGTCTTGT--ACTG--TTAGAAAT----AAGCTTGTATTGATTTCAATGGATAACAAG-GGATCTCCAAACAAAAGTGTATTTACAGT--TGGT-TGTATGT------TT--AATTCTCGTATTTT-TTG-TAACATAA------TGCCTCTCTGCTCCGTAT-ACAAA--G--G--ACAGACGAGGAGGTAATGAT--CT-GTG-CTTTCNATTGNTCCACATGTACANAGTG--GG--NTNTTCANTAA-GT--TTT--TANNGAATA--GATGTTGNTT-AAGNGCGCTACAATTTGTTCGAAGGCGAGTATGCNA-GATCTGTGACAN-TCT-C--T--TNC--C-TGC-GT---AATAG--TGTTT-TGGAGTA--NT-TGGT-CG-G--T--TNCTATT-NAGTC---TA----G------T-CTTAAAGGCTGTAAT--T---GAT-----TC--TG----A--G-------TT--TC------TT---GTTTCTATNG-----GTAGNTCGTTCCAATCCCTT--GTCGTCGAGGGAAGAAAA-G-A-TTTGTAAA-ANAGCTGGGTATTAC-ATGGTAATGTACGGTTG----TC--AT--TTGA-ATTTCGCAGGTTGTACGTAAC
finalCons : AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA--GAG-ATGGGTGA--A---ATTTTG-CTGT-TCGTCT--CAACAGGAATAGGAATAG-C---C-GTTGAGGGACTTAA-TGGTATGGTCAATTATGTACAGATATATCGAAACTAAGTTCAGATAAATGTTAGTTAAAATTAAGATTTGAAAGGATATTGAAAATATTAACTGTTAAGTGGTTTATGCGCTACTTGAATCTTTTTGATGCTATTATATAGTCTTGT--ACTG--TTAGAAAT----AAGCTTGTATTGATTTCAATGGATAACAAG-GGATCTCCAAACAAAAGTGTATTTACAGT--TGGT-TGTATGT------TT--AATTCTCGTATTTT-TTG-TAACATAA------TGCCTCTCTGCTCCGTAT-ACAAA--G--G--ACAGACGAGGAGGTAATGAT--CT-GTG-CTTTCNATTGNTCCACATGTACANAGTG--GG--NTNTTCANTAA-GT--TTT--TANNGAATA--GATGTTGNTT-AAGNGCGCTACAATTTGTTCGAAGGCGAGTATGCNA-GATCTGTGACAN-TCT-C--T--TNC--C-TGC-GT---AATAG--TGTTT-TGGAGTA--NT-TGGT-CG-G--T--TNCTATT-NAGTC---TA----G------T-CTTAAAGGCTGTAAT--T---GATAGAAAGGCTTG-------------------TC------TT---GTTTCTATNG-----GTAGNTCGTTCCAATCCCTT--GTCGTCGAGGGAAGAAAA-G-A-TTTGTAAA-ANAGCTGGGTATTAC-ATGGTAATGTACGGTTG----TC--AT--TTGA-ATTTCGCAGGTTGTACGTAAC
Alignments
lowQualScore : 1 111111 111111 11 11 111 111 11 11 1111 11 11111 1 222222222 33333333333333333333 1111
lowQualScore : 55 3 2 44 555 3 3 1 55 3 5 888 5 5 0 9 2 00 8 3 55 55 7777 4 55 4 111111 55 0 4 4 0 000000 00 1 6 0 99 22 88 22 33 33 1 22 1 22 222 1 1 888 22 555 0 22 0 1 22 1 66 0 0 5555 11 22 0 1 22 99 1 55 1 55 333 0 22 44 3333 44 1 22 55 33 33 00000 66 4 777777777 22 2 777 33333333333333333333 3 33 1 1 1 666 2 3 4 4 0 4 1 2 5 1 2 7777 55 4
lowQualScore : .. . . .. ... . . . .. . . ... . . . . . .. . . .. .. .... . .. . ...... .. . . . . ...... .. . . . .. .. .. .. .. .. . .. . .. ... . . ... .. ... . .. . . .. . .. . . .... .. .. . . .. .. . .. . .. ... . .. .. .... .. . .. .. .. .. ..... .. . ......... .. . ... .................... . .. . . . ... . . . . . . . . . . . .... .. .
lowQualScore : 00 6 5 66 888 3 6 8 55 7 0 888 0 0 1 4 9 88 2 9 00 00 7777 0 55 0 555555 55 6 0 0 8 555555 66 8 7 5 22 33 88 22 88 33 0 88 0 77 000 0 0 222 11 000 9 11 5 0 88 0 88 6 6 3333 77 77 2 7 44 11 0 00 8 44 222 5 55 55 6666 00 9 66 55 77 00 11111 55 0 888888888 99 1 444 00000000000000000000 9 11 1 0 0 000 1 2 0 0 8 0 0 3 0 2 5 0000 55 0
consensus : AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA--GAG-ATGGGTGA--A---ATTTTG-CTGT-TCGTCT--CAACAGGAATAGGAATAG-C---C-GTTGAGGGACTTAA-TGGTATGGTCAATTATGTACAGATATATCGAAACTAAGTTCAGATAAATGTTAGTTAAAATTAAGATTTGAAAGGATATTGAAAATATTAACTGTTAAGTGGTTTATGCGCTACTTGAATCTTTTTGATGCTATTATATAGTCTTGT--ACTG--TTAGAAAT----AAGCTTGTATTGATTTCAATGGATAACAAG-GGATCTCCAAACAAAAGTGTATTTACAGT--TGGT-TGTATGT------TT--AATTCTCGTATTTT-TTG-TAACATAA------TGCCTCTCTGCTCCGTAT-ACAAA--G--G--ACAGACGAGGAGGTAATGAT--CTGTG-CTTTCNATTGNTCCACATGTACANAGTG--GG--NTNTTCANTAA-GT--TTTTANNGAATA--GATGTTGNTT-AAGNGCGCTACAATTTGTTCGAAGGCGAGTATGCNA-GATCTGTGACAN-TCT-C--T--TNC--C-TGC-GT---AATAG--TGTTTTGGAGTA--NTTGGT-CG-G--T--TNCTATT-NAGTC---TA-GT-CTTAAAGGCTGT--AAT--T-GA---T--A--GA----G-A-G---GCTTGTCTT--GTTTCTATNGGTAGNTCGTTCCAATCCCTT--GTCGTCGAGGGAAGAAAA-G-ATTTGTAAA-AAAGCTGGGTATTACATGGTAATGTACGGTTG----TCAT--TTGA-ATTTCGCAGGTTGTACGTAAC
Reference ( family-583 ) : AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA--GAG-ATGGGTGA--A---ATTTTG-CTGT-TCGTCT--CAACAGGAATAGGAATAG-C---C-GTTGAGGGACTTAA-TGGTATGGTCAATTATGTACAGATATATCGAAACTAAGTTCAGATAAATGTTAGTTAAAATTAAGATTTGAAAGGATATTGAAAATATTAACTGTTAAGTGGTTTATGCGCTACTTGAATCTTTTTGATGCTATTATATAGTCTTGT--ACTG--TTAGAAAT----AAGCTTGTATTGATTTCAATGGATAACAAG-GGATCTCCAAACAAAAGTGTATTTACAGT--TGGT-TGTATGT------TT--AATTCTCGTATTTT-TTG-TAACATAA------TGCCTCTCTGCTCCGTAT-ACAAA--G--G--ACAGACGAGGAGGTAATGAT--CTGTG-CTTTCNATTGNTCCACATGTACANAGTG--GG--NTNTTCANTAA-GT--TTTTANNGAATA--GATGTTGNTT-AAGNGCGCTACAATTTGTTCGAAGGCGAGTATGCNA-GATCTGTGACAN-TCT-C--T--TNC--C-TGC-GT---AATAG--TGTTTTGGAGTA--NTTGGT-CG-G--T--TNCTATT-NAGTC---TA-GT-CTTAAAGGCTGT--AAT--T-GA---T--A--GA----A-A-G---GCTTGTCTT--GTTTCTATNGGTAGNTCGTTCCAATCCCTT--GTCGTCGAGGGAAGAAAA-G-ATTTGTAAA-ANAGCTGGGTATTACATGGTAATGTACGGTTG----TCAT--TTGA-ATTTCGCAGGTTGTACGTAAC
gi|144608 : AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATTGAG-ATGGGTGA--A---ATTTTG-CTGT-TCGTCT--CAACAGGAATAGGAATAG-C---C-ATTGAGGGACTTAA-TGGTATGGTCAATTATGTACAGATATATCGAAACTATGTTCAGGTAAATGTTAGTTAAAATTAAGATTTGAAAGGAT-TTGAAAATATTAACTGTTAAGTGGTTTGTGCGCTACTTGAATCTTTTTGATGCTATTATATAGTCTTGT--ACTG--TTAGAAAT----AAGCTTGTATTGATTTCAATGGATAACAAG-GGATCTCCAAACAAAAGTGTATTTACAGT--TGGT-TGTATGT------TT--AATTCTCGTATTTT-TTG-TACCATAA------TGTCTCTCTGCTCCGTAT-ACAAA--G--A--ACAAATGAAAAGGTAATGAT--CTGTG-TTTTCTATTAATCCACATGTACAAAGTG--GG--CTGTTGATTAA-GT--TTTTATTGTATA--GAAGATAATT-AAGAGGACTACAGTATGTTCTAAGGCGAGTGTGTTG-GATCTGTGATAA-TCT-C--T--TCC--C-TGC-AT---AATAG--TGTTTTGGAGTA--ATAGGT-CG-G--T--TGCTATT-GAGTT---TA-GT-CTTAAAAACTGT--AAT--T-GA---T--T--CT----G-A-G-----TT-TTTT--ATTTCTATTGATAGTTCGTTCCAGTCCCTT--GTTGTCGAGGGAAGAAAA-G-ATTTGTAAA-AAAGCTGGGTATTGCATGGTAATGTACGGTTG----TCAT--TTGA-ATTTTGCAGGTTGTACGTAAC
gi|144609 : AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA--GAG-ATGGGTGA--A---ATTTTT-CTGT-TCGTCT--CAACAGGAATAGGAATAG-C---C-ATTGAGGGACTTAA-TGGTATGGTCAATTATGTACAGATATATCGAAACTAAGTTCGGATAAATGTTAGTTAAAATTAAGATTTGAAAGGAT-TTGAAAATATTAACTGTTAAGTGGTTTATGCGATACTTGAATCTTTTTTATGCTATTATATAGTCTTGT--ACTG--TTAGAAAA----AAGCTTGTATTGATTTCAATGGATAACAAG-GGATCTCCAAACAAAAGTGTATTTACAGT--TGGT-TGTATGT------TT--AATTCTCATATTTT-TTG-TAACATAA------TGGCTCTCTGCTCCGTAT-ACAAA--G--A--ACAAATGAAGAGGTAATGAT--CTGTG-TTTTCTATTAATCCACATGTACAAAGTG--GG--CTGTTGATTAA-TT--TTTTAGTGTGTA--GAAGATAATA-AAGAGGACTACAGTATGTTCTAAGGCGAGTGTGTTG-GATCTATGATAA-TCT-C--T--TCC--C-TGC-AT---AATAG--TGTTTTGGAGTA--ATAGGT-CG-G--T--AGCTATT-GAGTT---TA-TT-CTTAAAAACTGT--AAT--T-GG---T--T--CT----G-A-G-----TTTTTTT--ATTTCTTTTGATAGTTCATTCCAGTCCCTT--GTTGTCGAGGGAAGAAAA-G-ATTTGTAAA-AAAGCTGGGTATTACATGGTAATGTACGGTTG----TCAT--TTGA-ATTTCGCAGGTTGTACGTTAC
gi|144610 : AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA--GAG-ATGGGTGA--A---ATTTTG-CTGT-TTGTCT--CATCAGGAATAGGAATAG-C---C-ATTGAGGGACTTAA-TGGTATGGTCAATTATGTACAGATATATTAAAA---------------------TTAAAACTAAGATTTGAAAGGATATTAAAAATATTAACTGTTTAGTGGTTTATGCTCTTCTTGAATCTTTTTGATGCTATTATATAGTCTTGT--ACTG--TTAGAAAT----AAGCTTGTATTTATTTCAATGGATAACAAG-GGATCTCCAAACAAAAGTGTATTTACAGT--TGGT-TGTATGT------TT--AATTCTCGTAGTTT-TTG-TAACATAA------TACGTCTCTGCTACGTAT-ACAAA--G--A--ACAGATGAAGAGGTAATGAT--TTGTGTTTTTCTATTAATCCACATGTACAAAGTG--GG--CTGTTCATTAA-GT--TTTTAGTGTATA--GACGATAATT-AAGAGGACTACAGTATGTTCTGAGGCGAGTGTGTTG-GATCTGTGATAA-TCT-C--C--TTC--C-TGC-AT---AATAG--TGTTTTGGAGTA--ATCGTT-CG-G--
gi|144611 : AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA--GAT-ATGGGTGA--A---ATTTTG-CTGT-TCGTCT--CAACAGGAATAGGAATAG-C---C-ATTGAGGGACTTAA-TGGTATGGTCACTTAAGTACAGATTTATCGAAAATAAATTCAAATAAATGTTAGTTAAAATTAAGATTTGGAAGAAT-TTTAAAATATTAAGTGTTAAGTGGTTTATGCGCTACTTGAATC-TTTTGATGCTATTATATAGTCTTGT--ACCG--TTAGAAAT----AAGCTTGTATTGATTTCAATGGATAACAAG-GGATCTCCAAATAAAAGTGTATTTACAGT--TGGC-TGTATGT------TT--AATTCTCGTATTTT-TTG-T-ACATAA------TGTCTCTccaattga
gi|144612 : AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA--GAG-ATGGGTGA--A---ATTTTG-CTGT-TCGTCT--CAACAGGAATAGGAATAG-C---C-ATTGAGGGACTTAA-TGGTATGGTCAATTATGTACAGATATATCGAAACTAAGTTCAGATAAATGTTAGTTAAAATTAAGATTTGAAAGGAT-TTGAAAATATTAACTGTTAAGTGGTTTATGCGCTACTTGAATCTTTTTGATGCTATTATATAGTCTTGT--ACTG--TTAAAAAT----AAGCTTGTATTGATTTCAATGAATAACAAG-GGATCTCCAAACAAAAGTGCATTTAC
gi|144613 : AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA--GAGTAT---CAA--A---A--TTG-CTAT-TAGTTTACCAAC
gi|144614 : AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA--GAG-GT--------A---ATTTCATCTG----GTCG--AAACTGGAAT
gi|144615 : AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA--GAG-ATGGGT-A--GCTTATTTTG-C
gi|144616 : AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA--GAG-ATTTGTGATTA---ATGTTC-CTTTATTGTC
gi|144617 : AGAGAGA--CAG-TTGGGTGA--A---ATTTTG-CTAT-TTGTCT--CGTCAGGAACAAGAATAA-CTCTC-GTT---GGACTTAT-TGTCATAGTT-ATCTTGTATAGATTTATCGAAA-TAATTCCCAATAACTGTT
gi|144618 : GA--GAA-TTTGGTGG--A---ATTTCG-CTGT-TTGTCT--CATCTTAAATAGGAATAGTC---C-GTTGAGGCATGTAA-----------AGTCATGTACAGATGTATCGAAAATAAGTTCAAATAACTGTGAGATAAAAATGTGATTTCGAAATATATTAAAAACAGCAACT-TTA------TTATGAACTCTTTGAATCTTTTTGATGTTATTATATAGTTTTGTTCATTG----AGGAAT----AATTTTGTTTTGATTT-GGTGGATGACATG-GTGTTTCCAAACAAAGGTGTATTTACTGT--TAGT-TTTATGT------TT--AATTCTCGTAGTTA-ATG-TAGCATAATAATACTGCGTCTCTGTTCTGTAT-ACAAA--G--A--ACA
gi|144618 : ATGTATAAAGTG--GT--TTGTTTATTAA-GT--GTTTAATGAG-A--GAAGATCATT-TAGAGGACTACAGTTTGTTC-----TGAG--------GATCTGAGATGA-TCA-C--G--TCT--C-TGT-AT---ATTAC--TATTTAGGAGTA--ATTGGT-CA-G--T--TGTAATT-GAGTT---CA-TT-CCAACAAATTGT--TAT--T-GA---T--T--CT----G-A-G---TTTTTTTTT--ATTTCTGTTGTTAGTTCGTGCCAGTACTTT--ATCGTCGCTGAAAGACAA-G-ATTTGTAAA-ACCGTTGGGTATTATACGCTAAT-TGC-ATTG----ATAA--TTGA-AATTcttatgtataaagtggtttgtttattaagtgtttaatgagagaagatcatttagaggactacagtttgttctgaggatctgagatgatcacgtctctgtatattactatttaggagtaattggtcagttgtaattgagttcattccaacaaattgttattgattctgagtttttttttatttctgttgttagttcgtgccagtactttatcgtcgctgaaagacaagatttgtaaaaccgttgggtattatacgctaattgcattgataattgaaatt
gi|144619 : gagaatttggtggaatttcgctgtttgtctcatcttaaataggaatagtccgttgaggcatgtaaagtcatgtacagatgtatcgaaaataagttcaaataactgtgagataaaaatgtgatttcgaaatatattaaaaacagcaactttattatgaactctttgaatctttttgatgttattatatagttttgttcattgaggaataattttgttttgatttggtggatgacatggtgtttccaaacaaaggtgtatttactgttagttttatgtttaattctcgtagttaatgtagcataataatactgcgtctctgttctgtatacaaagaacacttGGGTGA--A---CATTTG-CTGT-TTGTCT--TA-------------TAT-C---CCGTTGAGGGACCTAAATGGCGTGGTCAGTTGTATGTAGATGTACCGA---TAA--T--GATAAATGTTAGTTAAAAT-ATGATTTAGAAATACATTAAAA----TCACT------TGGTTTACGTTTTATTTTA-TATTTTTTATGCTATTATATAATCTTGT--CCTG--TAGGGACT----ACGTTTGTGTTGGTT
gi|144620 : GTACAGATATATCGAAACTAAGTTTAGATAAATGTTAGTTAAAATTAAGATTTGAAAGGAT-TTGAAAATATTAACTGTTAAGTGGTTTATGCGCTACTTGAATCTTTTTGATGCTATTATATAGTGTTGT--ACTG--TTAGAAAT----AAGCTTGTATTGATTTCAATGGATAACAAG-GGATCTCCAAACAAAAGTGTATTTACAGT--TGGT-TGTATGT------TT--AATTCTCGTATTTT-TTG-TAACATAA------TG--TCTCTGCTCCGAAT-ACAAA--G--A--ACAAATGAAGAGGTAATGAT--CTGTG-TTTTCTATTAATCCACATGTACAACGTG--GG--CTGTTGATTAA-GT--TTTTAGTGTATA--GAAGATAATT-AAGAGGACTACAGTATGTTCTAAGGCGAGTGTGTTG-GATCTGTGATAA-TCT-C--T--TCC--C-TGC-AT---AATAG--TGTTTTGGAGTA--ATAGGT-CG-G--T--TGCTATT-GAGTT---TA-TT-CTTAAAAACTGT--AAT--T-GA---T--T--CT----G-A-G-----TT-TTTT--ATTTCTATTGATAGTTCGTTCCAGTCCCTT--GTTGTCGAGGGAAGAAAA-G-ATTTGTAAA-AAAGCTGGGTATTGCATGGTAATGTACGGTTG----TCAT--TTGA-ATTTCGCAGGTTGTACGTAAC
gi|144621 : TAAGATTTGAAAGGATATTAAAAGTATTCACTTTTAAATGGTTTATGCGCTACTT-----TTTCTGACGCTATTATATAGTCTTGT--ACTG--TTAGAAAT----AAGATTGTATTAATTTCAATGGATAACAAG-GGGTCTCCAAACAAAAGTGAATTAACAGT--TTGT-TGAATAT------TT--AATTCTCGTAGTTT-TTG-TAACATGT------TGCGTCTCTGCTCCGTAT-ACAA---G--A--ACAGATGAAGATGTAATGAA--TTGTG-TTTTCTATTAATC-ACATGTACAAAGTG--GG--CTGTTCATTAA-GT--TTTTAGTGTATA--GAAGATAATT-AAGAGGACACCAGTATGTTCTGAGGCGAGTGTGTTG-GATCTGTGATAA-TCT-A--T--TCC--C-TGC-AT---AATAT--TTTTTTGGAGTA--ATCGAT-CG-G--T--TGCTATT-GAGTT---TA-TT-CTTTAAAACTGT--AAT--T-GA---TTCT--GA-------------TTTTTTTTAAATTTTTATTGTTAGTTCGTTCCAATCCCTT--TTCGCAGAGTGAAGAAAA-G-ATTTGTAAA-TAAACTGGATATTTCATTGTAATGTAGTGTTG----TCAT--TTGA-
gi|144622 : ATGCGCTACTTGAATCTTTTTGATGCTATTATATAGTCTTGT--ACTA--TTAGAAAT----AAGCTTGTATTGATTTCAATGGATAACAAG-GGATCTCCAAACAAAAGTGTATTTACAGT--TGGT-TGTATGT------TT--AATTCTCGTATTTT-TTG-TAACATAA------TGTCTCTCTGCTCCGTAT-ACGAA--G--A--GCAAATGAAGAGGTAATGAT--CTGTG-TTTTCTATTAATCCACATGTACAAAGTG--GG--CTGTTGATTAA-GT--TTTTAGTGTATA--GAAGATAATT-AAGAGGACTACAGTATGTTCTTAGGCGAGTGTGTTG-GATCTGTGATAA-TCT-C--T--TCC--C-TGC-AT---AATAG--TGTTTTGGAGTA--ATAAGT-CG-G--T--TGCTATT-GAGTT---TA-TT-CTTAAAAACTGT--AAT--T-GA---T--T--CT----G-A-G-----TT-TTTT--ATTTCTATTGATAGTTCGTTCCAGTCCCTT--GTTGTAGAGGGAAGAAAA-G-ATTTGTAAA-AAAGCTGGGTATTACATGGTAATGTACGGTTG----TCAT--TTGA-ATTTCGCAGGTTGTACGTAAC
gi|144623 : AT-AAATA--G--G--ACAGACGAGGAGGTAATGAT--TTGTA-CTTTCAATTGCTCCACATGTACATAGTG--GGGAATTTTCAATA---T--TTTTTTGGAATA--AGTGTTGTTT-CAGCGTGCTACAATTTGTACGAAGACGAGTATGCAA-GACC--TGACAT-TTT-C--TTGTGC--C-TGT-GT---AAAAG--TGTTTTGATGT---TTTGGTAAG-A--T--TTTTATT-TAG-C---TG-GTGCTTTAAGGC------AT--T-GA---T--A--GA----A-ACG---GCTTGTCTT--GTTTCAATAGGTAGATTGTTCCAATC
gi|144624 : tatatatttgtggacagctttaaaaatttcgacgtttgtattgtgggggagatgaggttctccaaagagaagtgtgttgagggtaacagtgcatatatgagagattgatgcaagaagtgtagcgcgttcggcatgAT-AAATA--G--G--ACAGACGAGGAGGTAATGAT--TTGTA-CTTTCAATTGCTCCACATGTACATAGTGGAGA--ATTTTCAATA---T--TTTTTTGGAATA--AGTGTTGTTT-CAGCGTGCTACAATTTGTACGAAGACGCGTATGCAA-GACC--TGACAT-TTT-C--TTGTGC--C-TGT-GT---AAAAG--TGTTTTGATGT---TTTGGTAAG-A--T--TTTTATT-TAG-C---TG-GTGCTTAAAGGC------AT--T-GA---T--A--GA----A-ACG---GCTTGTCTT--GTTTCAATAGGTAGATTGTTCCAATC
gi|144625 : tatatatttgtggacagctttaaaaatttcgacgtttgtattgtggaggagatgaggttctccaaagagaagtgtgttgagggtaacagtgcatatatgagagattgatgcaagaagtgtagcgcgttcgacatgTATATATTTGTGG--ACAGCATTAAAAATTTCGACGTTTGTATTG-------TGGGTGAGATGAGGTTCACCAAAGAGAAGTGTGTTGAGGGTAACAGTGCATATGTGAGAGATT--GATTC--GAAT---------AGCGTAG------CGC------GTTCGGTATGATAAATAG--G--ACAGACGAGGAGGTAATGAT--TCGTA-CTTTCAATTGCTCCACATGTACACAGTGGAGA--ATTTTCAATA---T--TTTTTTGGAATA--AGTGTTGTTT-CAGCGTGCTACAATTCGTACGAAGACGAATATGCAA-TACC--TGACAT-TTT-C--TTGTGC--C-TGT-GT---AAAAG--TGTTTTGATGT---TTTGGTAAG-A--T--TTTTATT-TAG-C---TG-GTGCTTAAAGGC------AT--T-GA---T--A--GA----A-A-GA--GCTCGTCTT--GTTTCAATAGTTAGATTGTTCCAATC
gi|144626 : CAAATAAAAGTAAGTTTAAAG----AAT-TAT---T------TTGAAATTCAAGCAGTTTATTGCT--CATGG------TGTTTCTTTGTCTAATGT-ATTTT--G--G--ACATTCGAAAAGAAAGTGAT--TGATA-TCTTAAATTTGGCCGCAGGAGCAAAATG--AA--TTAT-CAATGATGT--TTGT-TTGAATAAAGGTGCTGATT-AAGACTACTGCGGTTTGTTCTGAGACGAGTGTGCAT-GATATGTGATTT-TCT-A--T--TGCTAC-TATAGT---AATAG--TATTTTG--TTA--TTTTAT-TT-GTAT--TAGTGTT-AA-TCACTT---T-CTTAAAAACTG----ATGGC-GA---T--G--G---------T---GCTTCTTTT--GTAACTTGTGAAAGCATGTTCCAAT--CTTAAATAGTGGAAGGAAGAAAG-T-AGTT-TACATACAACTGGGTATTGCATTTTAATGTCC--TTG-----CATGGTCGGCATTCCGTAAGTTATA
gi|144627 : ------TGTTTCTCTGAATAGTGT-ACAAA--G--A--ACAGT---GCAAATAATG-T--TTATA-TCTTCAATACATTCGCATGCACATAAAG--GG--CTCTCTATTAA-AT--GTTAAT---ACA--GATGGTGCTT-CAGGTTGCTGCATAGTGTCTGAAGATGTGTGTG--G-AACTTGTAATTT-GCT-A--T--TAT--C-TGT-GT---AATAC--TGTTTTGG-GAA--TTTTAT-CATA--T--TACTGTT-AAATT---TA-TT-ATTAAAG---AT--AAT--TAGA---T--A--
gi|144628 : GTTCGGTATGATAAATAG--G--ACTGACGAGGAGGTAATAAT--TCGTA-CTTTCAGTTGCTCCACATGTACACAGTGGAGA--ATTTTCAATA---T--TTTTTTAGAATA--AGTGTTTTTT--AGCGTGCTACAATTCGTACGAAGACGAGTATGCAA-GACC--TGATAC-TTTAC--TTGTGC--C-TGT-GT---AAAAG--TGTTTTGATGT---TTTGGTAAG-A--T--TTTTATT-TAG-C---TG-GTGCTTAAAGGC------AT--T-GA---T--A--GA----A-ACA---GCTCGTCTT--GTTTCTATAGGTAGATTGTTCCAATCctctgattgtttttgttt
gi|144629 : GTTCGGTATGATAAATAG--G--ACAGACGAGGAGGTAATGAT--TTGTA-CTTTCAATTGCTCCACATATACATAGTG--GGGAATTTTCAAT-A-TT--TTTTTTTGAATA--AGTGTTGTTT-CAGCGTGCTACAATTCGTACGAATACGAGTATGCAA-GACC--TGACAT-TTT-C--T--T
gi|144630 : AT-AAATA--G--G--ACAGATGAGGAGGTAATGAT--TTGTA-CTTTCAATTGCTCCACATGTACATAGTGGAGA--ATTTTCAATA---T--TTTTTTGGAATA--AGTGTTGTTT-CAGCGTGCTACAATTTGTACGAAGACGAGTATGCAA-GACC--TGACAT-TTT-C--TTGTGC--C-TGT-GT---AAAAG--TGTTTTGATGT---TTTGGTAAG-A--T--TTTTATT-TAG-C---TG-GTGCTTAAAGGC------AT--T-GA---T--A--GA----A-ACG---GCTTGTCTT--GTTTCAATAGGTAGATTGTTCCAATC
gi|144631 : AT-AAATA--G--G--ACAGACGAGGAGGTAATGAT--TTGTA-CTTTCAATTGCTCCACATGTACATAGTGGAGA--ATTTTCAATA---T--TTTTTTGGAATA--AGTGTTGTTT-CAGCGTGCTACAATTTGTACGAAGACGAGTATGCAA-GACC--TGACAT-TTT-C--TTGTGC--C-TGT-GT---AAAAG--TGTTTTGATGT---TTTGGTAAG-A--T--TTTTATT-TAG-C---TG-GTGCTTAAAGGC------AT--T-GA---T--A--GA----A-ACG---GCTTGTCTT--GTTTCAATAGGTAGATTGTTCCAATC
gi|144632 : AT-AAATA--G--G--ACAGACAAGGAGGTACTAAT--TTGTA-CTTTCAATTGCTCCACATGTACATAGTG--G
gi|144633 : -ACAAATAG--G--ACAGACGAAGAGGTAATGAT--TTGTA-CTTTCAATTGCTCCATGTGTACATAGTGGAGA--ATTTTCAATA---T--TTTTTTGGAATA--AGTGTTGTTT-CAGCGTGCTACAATTTGTACGAAGACGAGTATGCAA-GACC--TGACAT-TTT-C--TTGTGC--C-TGT-GT---AAAAG--TGTTTTGATGT---TTTGGTAAG-A--T--TTTTATT-TAG-C---TG-GTGCTTAAAGGC------AT--T-GA---T--A--GA----A-ATC---GCTTGTCTT--GTTTCAATAGGTAGATTGTTCCAATC
gi|144634 : AAA--G--GTGACAATTGAGAAGGAAGTGAG--CTGTG-CTCTCTATTTGACCACATATACACAGAG--GG--GAATCTACGAT-GT--GTTTAAGAAATA--GATGTTGCTT-AAGAGCACTACAGCTCGTTCGAAGGCGAGCATG
gi|144635 : AAA--G--GTGACAATTGAGAAGGAAGTGAG--CTGTG-CTCTCTATTTGACCACATATACACAGAG--GA--GAATCTACGAT-GT--GTTTAAGAAATA--GATGTTGCTT-AAGAGCACTACAGCTCGTTCGAAGGCGAGCATG
gi|144636 : AAA--G--GTGACAATTGAGAAAGAAGTGAG--CTGTG-CTTTCTATTTGTCCACATGTACACAGGG--GGGAGTCTTCAATA---T--GTTTAAGAAATA--GATGTTGCTT-AAGTGCACTACAACTCGTTCGGAGGCGGGCATGCAATAAT---TGGCAT-TTC-C--TTGTAC--C-TAT-GT---AATAG--AATTTAG--GTACTTTTGGT-TC-G--T--TACCTTC-GAGTT---TATGT--TTAAAAGT------AT--T-CA---G--A--GA----AGA-G---GCTTGTCTT--GTTTCAAGTGGGAGAGTGTTCCAGTC
gi|144637 : AAA--GTTG--ACAATTGAGAAAGAAGTGAG--CTGTG-CTTTCTATTTGTCCACATGTACATAGAG--GGCAATCTACAAT---GT--GTTTAAGAAATA--GATGTTGCTT-AGGTGCACTACAACTCGTTCGGAGGCGGGCATG
gi|144638 : AAA--G--GTGACAATTGAGAAAGAAGTGAA--CTATA-CTTTCTATTTGTCCACATGTACACAGAG--GGGAGTCTTCAAT---GT--GTTTAAGAAATA--GATGTTGCTT-AAGTGCACTACAACTTGTTCGGAGGCAGGAAT-CAATAAT---TGGCAT-TTC-C--T--TGTAGC-TAT-GT---AAAAGAATGTT----AGTACTTTTGGT-TA-G--T--TA-TATTCGAGTT---TATGT--TTAAAAGC
gi|144639 : --G--G--ACAGTTGAGTAAGAAATGTTTACTGT---CTTCGAGTGAACGGCATGTGCACA-TG--GG--ACTTTCAACAATAT--TTTTGGAATATA--AATGTTGGTT-AAGTGAACTACAATTTAGTCGTAGACGGGTATGGTT-TATTTGAGATAA-TCT-G--T--CTC--CGTG--GTGGAAATAG---G---TAGAA-A--CTTTGT-CA-A--TAATAGGGTT-TAGTC---TA-TT-CTTAAA---TAT--ACT--T-AATGTT--G--GT----G-A-G---TTCTG---G--GTTAGTATAGGTAAACTATTCCATGCTTTC--ATTGTTGAAGGAAGAAAGCG-ATGTGC-AA-AGAGTTGTGTATTACA-AGCAAT---TGGTTGAATATTGT--GTGA-GTTTCGTAAATTGTA
gi|144640 : --ACAGTTGAGTAAGAAATGATA-CTGT---CTTCGAGTGAACAGCCTGTGCACA-TG--AG--ACTTTCAACAA--TAATTTTAGAATATA--AATGTTGATT-AAGTGAACTACAATTTAGTCTTAGATGGGTATGGTA-TATTTGAGCCAA-TCT-C--T--CTC--C-----------ATGG-------AGGA--A--CTTTGT-CA-A--TAATAGTTTT-CAGTC---TA-TT-CTTAAA---TAT--ACT--T-AATGTT--G--GT----G-A-G---TTCTG---G--GTTGCTATAGGTAAACTATTCCATGCTTTT--ACTGTTGAAGGAAGAAAT-GAATTTGC-AA-AGAGTTGTGTAATATA-AGCAAT---TGGTTGAATATTGT--GTGA-GTTTCGTAAATTGTA
gi|144641 : TAATGAT--ATGTG-TCTTCAATTTCACCACAAAGACAATTTG--GA--CTTGCAACTAT-GT--TTTTATTGAATA--AATGTTGATTCAAGT-TACTGCAATTTGTATGAAGTCGTGTATGCTA-TATTTG-GGCAG-T-T-CGGT--TTC--C-TGT-AT---AATAG--TGATTTGGA
gi|144643 : atgaataaa--TTTTAGTGTATA--GCAGATAATC-AAGAGAACTACAATTTGGTCTGACGAAATTGTGGTA-AATTTGAAATAAATGT-C--T--TCC--G-TGT-GT---AATAA--TAATTAGGAGTA--ATCGGT-CG-G--T--TGCTATC-GAGTG---TA-TT-TTGATATACTCTTAAAT--T-GA---T--ATTGATTCTG-A-GTTTCTTTGTTTT--ATTTCTGTTGTCAGTTCGTCCCAAACCCTT--ATCGTAGAGGAGAGCAAA-G-ATTTGTAAA-ATAGTTGTGTAGTACATGATATTGTGCGGTTG----TCAT--TTGA-ATTTCACAGGATGTATGTAAC
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|144642 ): ATGAAAAGTAATGTCTCGTATCTTCAATACTTTCGCATGAACATCTATTGTTTGAATAAAGAATTTCATTGAGCTTGCTGCATTGTGTCCAAAGACGTGTTTTGTAATTTTCTATTACCAGTAATAGTTTTTCTTGATTTTTATAATATTACTGTAAATTTTGTTTTCAAATATAGTTAGAGATTCTGAATGTTTTATTTCTGGAGCAAGAGTAGTCCATTCTTAGTTGTTGGTGGAAGAAAGGAGTTTGCATATAGCAGGATATTACAATAATGGTGTTCTTGTCTTATTTGTATAACGAAGGTTGTA