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Reference ( gi|82717 )        :                                                                                  TATACTGAACCAAAAAA--C-AAA-CTTTTGCTATAAAGTTTGAATGTGAAT-----ATTTTGTTAACATTTAA-CT--AAA-TTT--TGCTGAAATCTTCTGTTTGTTGTATAATTATGTC--TT-----ATCAATCT-----ACTGAAATAGCTAAATTGGACAGAAATT--ATCAATTTTATTGTTTGA-TTTGAAT------TTAA-----AACAGGAAGGGATGGATTT--CA-AAATCGGGTTATCAGTAGCATGTGTGGCCGCCACGTGCGATGATGACTGCTTGACAGCAGCGTCGCATCGAGAGCACAAGCTTGTCTAT----GTCAGCCTGTGGGATA
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gi|82725                      :                                                                                                                                                                                                                             -----ACTGAAATAGCTAAATTGGACGGAAATT--ATCAATTTTATTGTTTGA-CT
gi|82726                      :                                                                                                                                                                                                                                            CTAAGTTTGAATGAAATT--ATCAATTTTATTGTTTGA-TTTGAAT------TTAA-----AACAGGAAGTGATGGATTT--CA-AA--------ATCAGTAGCGTGTGTGGCCGCCGCGTGCGATGATGACTACGTGA--------------------CACAAGCTTGTTTTT----GTCAGCCTGTGAGATA
gi|82704                      :                                                                                                                                                                                                                                            CTAAGTTTGAATGAAATT--ATCAATTTTATTGTTTGA-TTTGAAT------TT
gi|82727                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                    atatatactgaaccaaaaagaaactttctGGCATGGATTT--CA-AAATCGGGTTATCAGTAGCATATG
gi|82728                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GTATGTGTGGCCGCCAAATACGATGATGACTGCTTGACAG
gi|82729                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          agcCGCCGCGTACGATGATGACTGCTTGACAGCGACGTTGCATTCAGAGCACAAGCTTGTTTAT----GTCAGTCTGTGGGATA
gi|82730                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TGCGATGATGACTGCATGACAGCGACGTCGCATTGAGAGCGC
gi|82731                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATGGCGACTGCTTGACAGCGACGTTGCATTGAGAGCACAGGCTTGTTTAT----GTCAGCCTGTGGGATA
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Alignments
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lowQualScore                  :                 .    .  . ...           ...               .....                 .  ..   .    ..                                 ..  .....        .....                            ..                  .       ......    .....                   ..  .                     ..                                                                    ....                
lowQualScore                  :                 7    7  7 999           777               88888                 1  11   5    22                                 44  33333        33333                            44                  8       555555    88888                   55  8                     55                                                                    2222                
consensus                     :      TATACTGAACC-AAAA-AAGA---AACTTTCGCTA---AGTTTGAATGTGAAT-----ATTTTGTTAACATTTAA-CT--AAA-TTTG--GCTGAAATCTTCTGTTTGTTGTATAATTATGTC--TT-----ATCAATCT-----ACTGAAATAGCTAAATTGGACAGAAATT--ATCAATTTTATTGTTTGA-TTTGAAT------TTAA-----AACAGGAAGGGATGGATTT--CA-AAATCGGGTTATCAGTAGCGT--GTGTGGCCGCCGCGTGCGATGATGACTGCTTGACAGCGACGTCGCATTGAGAGCACAAGCTTGTTTAT----GTCAGCCTGTGGGATA
Reference ( family-582 )      :      TATACTGAACC-AAAA-AAGA---AACTTTCGCTA---AGTTTGAATGTGAAT-----ATTTTGTTAACATTTAA-CT--AAA-TTTG--GCTGAAATCTTCTGTTTGTTGTATAATTATGTC--TT-----ATCAATCT-----ACTGAAATAGCTAAATTGGACAGAAATT--ATCAATTTTATTGTTTGA-TTTGAAT------TTAA-----AACAGGAAGGGATGGATTT--CA-AAATCGGGTTATCAGTAGCGT--GTGTGGCCGCCGCGTGCGATGATGACTGCTTGACAGCGACGTCGCATTGAGAGCACAAGCTTGTTTAT----GTCAGCCTGTGGGATA
gi|82698                      :      TATACTGAACC-AAAA-AAGA---AACTTTCGCTT---AGTTTGAATGTGAAT-----ATTTTGTTAACATTTAA-CT--AAA-TTTG--GCTGAAATCTTCTATTTGTTGTATAATTATGAC--TT-----ATCAATCT-----ACTGAAATAGCTAAATTGGACAGAAATT--ATCAATTTTATTGTTTGA-TTTGAAT------TTAA-----AACGGGAAGGGATGGATTT--CA-AAATTGGGTTATCAGTAGTGT--GTGTGGCCGCCGCGTGCGATGATGTCTGCTTGACAGGGATGTTGCATTGAGAGCACAAGCTTATTTAT----GTCAGCCTGTGGGATA
gi|82699                      :   ataTATACTGAACC-AAAAAAAGA---AACTTTCGCTT---AGTTTGAATGTGAAT-----ATTTTGTTTACATTTAA-CT--AAA-TTTA--ACTGAAATCTTCTGTTTGTTGTATAATTAGGTC--TT-----ATCAATCT-----ACTGAAATAGCTAAATTTGACAGAAAGT--ATCAATTTTATTGCTTGA-TTTGAAT------TTAA-----AACAGGAAGGGATGGATTT--CA-AAATCGGGTTATCAGTAGCGT--GTGTGGCCGCCGCGTGCGACGATGACTGCTTGACAGCGACGTCGCATTGAGAGCACAAGCTTGTTTAT----GTCAGCCTGCGGGATA
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gi|82702                      :   ataTATACTGAACC-AAAA-AAGA---AACTTTCGCTA---ATTTTGAATGTGAAT-----ATATTGTTAACATTTAA-TT--AAA-TTTA--GCTGAAATCTTCTGTTTGTTCCATAATCATGTC--TT-----ATCAATCT-----ACTGAAATAGCTAAATTAGACAGAAATT--ATCAATTTTATTGTTTGA-TTTGAAT------TTAA-----AATAGGAAGGGGTGGATTT--CT-AAATCGGGTTATCAGTAGC-T--ATGTGGCCCCCGCGTGCGATGATGACTGCTTGACAGCGACGTTGCATTTAGAGCACAAGCTTGTTTAT----GTCAGCCTGTGGGATA
gi|82703                      :   ataTATACTGAATC-AAAA-AAGA---AACTTTCGCTA---AGTTTGAATGTGAAT-----ATTTTGTTAACATTTAA-CT--TAA-TTTG--GCTGAAATCTTCTGTTTGTTGTAAAATTATGTC--TT-----ATCAATCT-----ACTGAAATAGCTAAATTGGACAGAAATT--ATCAATTTTATTGTTTGA-TTTGAAT------TTAA-----AACAGGGCGGGATGGATTT--CA-AAATCGGGTTATCAGTAGAGT--GTGTGGCCGCCGCGTGCGATGATGACTGCTTGACA--------------------CAAGCTTGTTTAT----GTCAGCCTGTGGGATA
gi|82704                      :   ataTATACTGAACC-AAAA--AGA---AACTTTCTCTA---AGTTTGAATG-AAATTATCAATTTTATT---GTTTGATTT--GAA-TTT
gi|82705                      :   ataTATACTGAACCAAAAA-AAAA---AACTTTAGA-A---AGTTTGAATGTGAAT-----ATTTTGTTAACATTTAA-CT--AAA-TTTG--GCTGAAATCTTCTGTTTGTTGTATAATTATGTC--TT-----ATCAATCA-----ACTGAAATAGTTAAATTGAACAGAAATT--ATCAATTTTATTGTTTGA-TTTGAAT------TTAA-----AACAGGAAGGGATGGATTT--CA-AAATCGGGTTAACAGTAGCGT--GTGTGGCCGCCGCATGCGATGATGATTGCTTGACAGCGACGT
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gi|82707                      :   ataTATACTGAACC-AAAA-AAGA---AACTTTCGCTA---GGTTTGAATATCAAT-----ATTTTGT------------T--AA-------------------CTGTTTGTTGTATAATTATGTC--TT-----ATCAATCT-----ACTGAAATAGCTTAACTGGACAGAAATT--ACTAATTTTATTGTTTGA-TTTGAAT------TTTA-----AACAGGAAGGGGTGGATTT--CA-AAATCGGGTTATCAGTAGCGT--GTGTGGCCGCCGCGTGCGATGGTGACTGCTTCACAGCGACTTCGCATTGAGAGCACAAGATTGATTAT----GCCAGCCTGTTGGATA
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lowQualScore                  :                 .    .  . ...           ...               .....                 .  ..   .    ..                                 ..  .....        .....                            ..                  .       ......    .....                   ..  .                     ..                                                                    ....                
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Reference ( family-582 )      :      TATACTGAACC-AAAA-AAGA---AACTTTCGCTA---AGTTTGAATGTGAAT-----ATTTTGTTAACATTTAA-CT--AAA-TTTG--GCTGAAATCTTCTGTTTGTTGTATAATTATGTC--TT-----ATCAATCT-----ACTGAAATAGCTAAATTGGACAGAAATT--ATCAATTTTATTGTTTGA-TTTGAAT------TTAA-----AACAGGAAGGGATGGATTT--CA-AAATCGGGTTATCAGTAGCGT--GTGTGGCCGCCGCGTGCGATGATGACTGCTTGACAGCGACGTCGCATTGAGAGCACAAGCTTGTTTAT----GTCAGCCTGTGGGATA
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gi|82702                      :   ataTATACTGAACC-AAAA-AAGA---AACTTTCGCTA---ATTTTGAATGTGAAT-----ATATTGTTAACATTTAA-TT--AAA-TTTA--GCTGAAATCTTCTGTTTGTTCCATAATCATGTC--TT-----ATCAATCT-----ACTGAAATAGCTAAATTAGACAGAAATT--ATCAATTTTATTGTTTGA-TTTGAAT------TTAA-----AATAGGAAGGGGTGGATTT--CT-AAATCGGGTTATCAGTAGC-T--ATGTGGCCCCCGCGTGCGATGATGACTGCTTGACAGCGACGTTGCATTTAGAGCACAAGCTTGTTTAT----GTCAGCCTGTGGGATA
gi|82703                      :   ataTATACTGAATC-AAAA-AAGA---AACTTTCGCTA---AGTTTGAATGTGAAT-----ATTTTGTTAACATTTAA-CT--TAA-TTTG--GCTGAAATCTTCTGTTTGTTGTAAAATTATGTC--TT-----ATCAATCT-----ACTGAAATAGCTAAATTGGACAGAAATT--ATCAATTTTATTGTTTGA-TTTGAAT------TTAA-----AACAGGGCGGGATGGATTT--CA-AAATCGGGTTATCAGTAGAGT--GTGTGGCCGCCGCGTGCGATGATGACTGCTTGACA--------------------CAAGCTTGTTTAT----GTCAGCCTGTGGGATA
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gi|82705                      :   ataTATACTGAACCAAAAA-AAAA---AACTTTAGA-A---AGTTTGAATGTGAAT-----ATTTTGTTAACATTTAA-CT--AAA-TTTG--GCTGAAATCTTCTGTTTGTTGTATAATTATGTC--TT-----ATCAATCA-----ACTGAAATAGTTAAATTGAACAGAAATT--ATCAATTTTATTGTTTGA-TTTGAAT------TTAA-----AACAGGAAGGGATGGATTT--CA-AAATCGGGTTAACAGTAGCGT--GTGTGGCCGCCGCATGCGATGATGATTGCTTGACAGCGACGT
gi|82706                      :   ataTATACTGAACA-AAAA-AAGA---AACTTTTGCTA---AATTTGAATGTTAAT-----ATTTTGTTAACATTTAA-CT--AAA-TTTG--GCTGAAATCTTCTGTTTGTTGTATAATTATGTC--TA-----ATCAATCA-----ACTGCAATAG-------------AAATT--ATCAATTTTATTGTTTGA-TTTGAAT------TTAA-----AACAGGAAGGGATAGATTT--CA-AAATCGGGTAATCAGTAGCGT--GTATGGCTTCCGCGTGCGATGAAGATTGCTTGACAGAGACGTCGCATTGAGAGCACAAGCTTGTTTAT----
gi|82707                      :   ataTATACTGAACC-AAAA-AAGA---AACTTTCGCTA---GGTTTGAATATCAAT-----ATTTTGT------------T--AA-------------------CTGTTTGTTGTATAATTATGTC--TT-----ATCAATCT-----ACTGAAATAGCTTAACTGGACAGAAATT--ACTAATTTTATTGTTTGA-TTTGAAT------TTTA-----AACAGGAAGGGGTGGATTT--CA-AAATCGGGTTATCAGTAGCGT--GTGTGGCCGCCGCGTGCGATGGTGACTGCTTCACAGCGACTTCGCATTGAGAGCACAAGATTGATTAT----GCCAGCCTGTTGGATA
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gi|82713                      :    taTATACTGAACC-ATAA-AAGA---AAATTTTGCCA---AGTTTGAATGTGAAT-----ATTTTGTTCACATTTAA-CT--AAA-TTTG--GCTGAAATCTTCGGTTTATTTTACAATTATGTC--TT-----ATTAATCT-----ACTGAAATAACTAAATTGAACAGAAATT--ATCAATTTAATTGTTTGA-TTTGAAT------TTAA-----AACAGGAAGGGATAGATTT--CA-AAATCGGGTTATCAGTAGCCT--GTGTGGCCGCCATGTGCAGTGACGACAGCTTGACAGCAACGTCGCATTGAGAGCACAAGCTTGTTTAT----GTCAGCCTGTGGGATA
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gi|82722                      :                                     GTTA---AGTTTGAATGTAAAT-----ATTTTGTTAACATATAA-CT--AAA-TTTG--GCTGAAATCTTCTGTTTGTTGTATAATTATGTC--TT-----ATCAATCT-----ACTGAAAAAGCTTAATTGGACAGAAATT--ATCAATTTTATTGTTTGA-TTTGAAT------TTAA-----AACAGGAAGTGATGGA-TT--CA-AAATCGGGTTATCAGTAG
gi|82723                      :                                         ---AGATTGGATGTGGA------ATTTTAT--GTATTAAATCTTGATA-TTTC--TCTGCAATTTTC-----ATTGTATA--TATTTCAATT-----AAAAATTTTATATACTGAA----CTAA----GAAAGAAACT--TTCG---CTAA-GTTTGAATGTGAATATTTTGTTAACATTTAAC---------TAAATTTGTCAGAAATCGGGTTATCAGTAGCAT--GTGTGGCCGCCGTGTGCGATGATGACTGCTTGACAGCGACGTTGCATTGAGAGCACAAGCTTGTTAAT----GTCAGCTTGTGGGATA
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gi|82725                      :                                                                                                                                                  -----ACTGAAATAGCTAAATTGGACGGAAATT--ATCAATTTTATTGTTTGA-CT
gi|82726                      :                                                                                                                                                                 CTAAGTTTGAATGAAATT--ATCAATTTTATTGTTTGA-TTTGAAT------TTAA-----AACAGGAAGTGATGGATTT--CA-AA--------ATCAGTAGCGT--GTGTGGCCGCCGCGTGCGATGATGACTACGTGA--------------------CACAAGCTTGTTTTT----GTCAGCCTGTGAGATA
gi|82727                      :                                                                                                                                                                                                                                      GGCATGGATTT--CA-AAATCGGGTTATCAGTAGCAT--ATG
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gi|82729                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                    CGCCGCGTACGATGATGACTGCTTGACAGCGACGTTGCATTCAGAGCACAAGCTTGTTTAT----GTCAGTCTGTGGGATA
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gi|82731                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATGGCGACTGCTTGACAGCGACGTTGCATTGAGAGCACAGGCTTGTTTAT----GTCAGCCTGTGGGATA
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gi|82733                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ATT-AGAGC-CGAGCTTGTTTAT----GTCAGCCTGTGGGGTA


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blockSeqs                     :                 .    .    .             .                 .                     .  .    .    .                                  .   .            .                                .                   .       .         .                       .   .                     .                                                                     .   
blockSeqs                     :                 .    .    .             .                 .                     .  .    .    .                                  .   .            .                                .                   .       .         .                       .   .                     .                                                                     .   
blockSeqs                     :                 .    .    .             .                 .                     .  .    .    .                                  .   .            .                                .                   .       .         .                       .   .                     .                                                                     .   
blockSeqs                     :                 .    .    .             .                 .                     .  .    .    .                                  .   .            .                                .                   .       .         .                       .   .                     .                                                                     .   
blockSeqs                     :                 .    .    .             .                 .                     .  .    .    .                                  .   .            .                                .                   .       .         .                       .   .                     .                                                                     .   
blockSeqs                     :                 .    .    .             .                 .                     .  .    .    .                                  .   .            .                                .                   .       .         .                       .   .                     .                                                                     .   
blockSeqs                     :                 .    .    .             .                 .                     .  .    .    .                                  .   .            .                                .                   .       .         .                       .   .                     .                                                                     .   
blockSeqs                     :                 .    .    .             .                 .                     .  .    .    .                                  .   .            .                                .                   .       .         .                       .   .                     .                                                                     .   
blockSeqs                     :                 .    .    .             .                 .                     .  .    .    .                                  .   .            .                                .                   .       .         .                       .   .                     .                                                                     .   
blockSeqs                     :                 .    .    .             .                 .                     .  .    .    .                                  .   .            .                                .                   .       .         .                       .   .                     .                                                                     .   
blockSeqs                     :                 .    .    .             .                 .                     .  .    .    .                                  .   .            .                                .                   .       .         .                       .   .                     .                                                                     .   
blockSeqs                     :                 .    .    .             .                 .                     .  .    .    .                                  .   .            .                                .                   .       .         .                       .   .                     .                                                                     .   
blockSeqs                     :                 .    .    .             .                 .                     .  .    .    .                                  .   .            .                                .                   .       .         .                       .   .                     .                                                                     .   
blockSeqs                     :                 .    .    .             .                 .                     .  .    .    .                                  .   .            .                                .                   .       .         .                       .   .                     .                                                                     .   
blockSeqs                     :                 .    .    .             .                 .                     .  .    .    .                                  .   .            .                                .                   .       .         .                       .   .                     .                                                                     .   
blockSeqs                     :                 .    .    .             .                 .                     .  .    .    .                                  .   .            .                                .                   .       .         .                       .   .                     .                                                                     .   
blockSeqs                     :                 .    .    .             .                 .                     .  .    .    .                                  .   .            .                                .                   .       .         .                       .   .                     .                                                                         
blockSeqs                     :                 .    .    .             .                 .                     .  .    .    .                                  .   .            .                                .                   .                                         .   .                     .                                                                         
blockSeqs                     :                 .    .    .             .                 .                     .  .    .    .                                  .   .            .                                .                                                                                                                                                                 
blockSeqs                     :                 .    .    .             .                 .                     .  .    .    .                                                                                                                                                                                                                                                      
blockSeqs                     :                                         .                 .                     .  .    .    .                                                                                                                                                                                                                                                      
blockSeqs                     :                                         .                 .                     .  .    .                                                                                                                                                                                                                                                           


blockSeqCons                  :      
originalCons                  :      TATACTGAACC-AAAA-AAGA---AACTTTCGCTA---AGTTTGAATGTGAAT-----ATTTTGTTAACATTTAA-CT--AAA-TTTG--GCTGAAATCTTCTGTTTGTTGTATAATTATGTC--TT-----ATCAATCT-----ACTGAAATAGCTAAATTGGACAGAAATT--ATCAATTTTATTGTTTGA-TTTGAAT------TTAA-----AACAGGAAGGGATGGATTT--CA-AAATCGGGTTATCAGTAGCGT--GTGTGGCCGCCGCGTGCGATGATGACTGCTTGACAGCGACGTCGCATTGAGAGCACAAGCTTGTTTAT----GTCAGCCTGTGGGATA
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Alignments
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Reference ( family-582 )      :      TATACTGAACC-AAAA-AAGA---AACTTTCGCTA---AGTTTGAATGTGAAT-----ATTTTGTTAACATTTAA-CT--AAA-TTTG--GCTGAAATCTTCTGTTTGTTGTATAATTATGTC--TT-----ATCAATCT-----ACTGAAATAGCTAAATTGGACAGAAATT--ATCAATTTTATTGTTTGA-TTTGAAT------TTAA-----AACAGGAAGGGATGGATTT--CA-AAATCGGGTTATCAGTAGCGT--GTGTGGCCGCCGCGTGCGATGATGACTGCTTGACAGCGACGTCGCATTGAGAGCACAAGCTTGTTTAT----GTCAGCCTGTGGGATA
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gi|82730                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGCGATGATGACTGCATGACAGCGACGTCGCATTGAGAGCGC
gi|82731                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATGGCGACTGCTTGACAGCGACGTTGCATTGAGAGCACAGGCTTGTTTAT----GTCAGCCTGTGGGATA
gi|82732                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GCGTAACAA-GACGTGGCATTGAGAGCACAAGCTTGTTTAT----GTCAGCCTGTGGGATA
gi|82733                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ATT-AGAGC-CGAGCTTGTTTAT----GTCAGCCTGTGGGGTA