lowQualScore : 444444444 1 11111111 22222222222222 11111 22222222222222222222 333333333333333333333333333333333 111
lowQualScore : 2 1 4 7777777777 3333 000000000 22 999 0 333333 0 33333 2 33333333 77 444 33333333333333 1 11 1 2 44 44444 00000000000000000000 333333 11 333 666666666666666666666666666666666 55555 33333 4 11 333 3 777777 1 77 33 1 1 777 2222 5555 5 444 0 3
lowQualScore : . . . .......... .... ......... .. ... . ...... . ..... . ........ .. ... .............. . .. . . .. ..... .................... ...... .. ... ................................. ..... ..... . .. ... . ...... . .. .. . . ... .... .... . ... . .
lowQualScore : 0 6 2 0000000000 4444 000000000 11 999 1 888888 1 33333 7 33333333 22 777 66666666666666 3 77 2 5 77 22222 11111111111111111111 555555 77 222 222222222222222222222222222222222 55555 00000 8 77 333 6 666666 3 88 11 3 3 222 8888 9999 0 999 8 8
consensus : TTTACTTATTTTCATTCTACAT----------TTA----AC--------AT--GTGGTCCTGT-GNTAAT------TTCAAACTC-----A-TTT-------TT-NAA---AAAA-----N-----A--T-CT--ATAAGAA-G-GTTACTCC----TCCGGAACCT-------------CT-----ATAATTTCT------G--ACATGC--GCA---A------GC---GA-AAT-A-----T----T-----T-----T-ATA--A---C-T------T-TT-GAC--CT-TGACCTG-T-ATT----GCATCAGTTT----TCAGCAGACG-TG-TTTGGAATCGATATT
Reference ( gi|158559 ) : TTTGCTTGTTTTTATTCTACAT----------TTA----A---------AT--GTGGTCCTGT-ACTAAT------TTCAATCTC-----A-TTC-------TT-AAA---AAAA-----A-----A--T-CT--ATAAGAA-G-GTCACTCG----TCCGGAACCT-------------CA-----ATAATTTCT------G--ACATGC--ACA---A------GC---GA-AAT-A-----T----T-----T-----T-ATA--A---C-T------T-TC-GAC--CT-TGACCTG-T-ATT----GCATCAGTTT----TCAGCAGACG-TG-TATGAAATCGATATT
gi|158560 : TTTGCTTGTTTTTATTCTACAT----------TTA----A---------AT--GTGGTCCTGT-ACTAAT------TTCAATCTC-----A-TTC-------TT-AAA---AAAA-----A-----A--T-CT--ATAAAAA-G-GTCACTCG----TCCGGAACCT-------------CG-----ATAATTTCT------G--ACATGC--ACA---A------GC---GA-AAT-A-----T----T-----T-----T-ATA--A---C-T------T-TC-GAC--CT-TGACCTG-T-ATT----GCATCAGTTT----TCAGCAGACG-TG-TATGAAATCGATATT
gi|158561 : TTTGCTTGTTTTTATTCTACAT----------TTA----A---------AT--GTGGTCCTGT-ACTAAT------TTCAATCTC-----A-TTC-------TTTAAA---CAAA-----A-----A--T-CT--ATAAGAA-G-GTCACTCG----TCCGGAACTT-------------CG-----ATAATTTCT------G--ACATGC--ACA---A------GC---AA-AAT-A-----T----T-----T-----T-ATA--A---C-T------T-TC-GAC--CT-TGACCTG-T-ATT----GCATCAG-TT----TCAGCAGACG-TG-TATGAAATCGATATT
gi|158562 : TTTACTTATTTTTATTCTACAT----------TCA----AC--------AT--GTGGTCCTGT-GCTTAT------TTCAACCTC-----A-TTT-------TT-AAA---AAAAAATCTA-----A--T-CT--ATAAGAA-G-GTTACTCA----TCCAGAACCT-------------TAT----GTTATTTCT------G--ACATGC--ACA---A------GT---GA-AAT-C-----T----T-----T-----TCCTT--A---T-T------T-TT-TAC--CT-TGACCTG-T-ACT----GCAACAGTTT----TCAGCAGACG-TG-T
gi|158563 : TTTACTTATTTTCATTCTACAT----------TTA----AG--------AT--GTGGTCCTGT-GATATT------TTCTAACTC-----G-TTT-------TT-TAA---CAAA-----TTTCT-A--T-TT--ATAAGAA-G-GCTACTCGATCCTCTGGAACCT-------------CT-----ATAATTTCT------G--ACATGC--A-----A------GC---GA-AAA-AA----G----T-----T-----T-ATA--A---C-T------T-TT-GAC--CT-TGACCTG-T-ATT----TCATCAGTTT----TCAGCAGACA-T
gi|158565 : TTTACTTATTTTTATTTTACAT----------TTA----AC--------AT--GTGGTCATGT-GTTAAT------TTCAAACTC-----A-TTTATTTTTTTT-AAA---AAA---------------T-GT--ATAAGA-----TTACTCA----TCCGGAACCT-------------TT-----ATAATTTCA------G--ACATTT--ACA---A------GC---GA-AAT-T-----T----T-----T-----T--TA----------------------------TAACCTG-T-ATT----GCATCAGTTT----TCAGCTGATG-TG-TTTGAAATCGTTATTtgatattcat
gi|158564 : TTTACTTATTTT-ATTCTACAT----------TTA----AC--------AT--GTGATTTTGT-GGTAAT------TTCAAACTC-----A-TAT-------TT-TAA---CAAA-----T-----T--T-CT--GTAAGAA-G-GTTTCTTT----TCTGGAACCT-------------TT-----ATAATACCG------G--ACATGC--GCAGT-A------G----GT-GAT-A-----T----TA----T-----T-ATA--A---C-T------T-TT-GAC--CT-TGACATG-T-TTT----GCATCAGTTT----TTAGCAGATG-TG-GTTGGAAT-GATATT
gi|158566 : TTAGCTTTATTTCATTCTACAT----------TTA----A----------C--ATGACATTGT-GATCAT------TACAAACTC-----A-TT---------T-AAATTAAAAA-----A-----A--TTCT--AAAAGGA-G-GCTTCTCC----TCAGGAACCT-------------TG-----ATAATTTCT------G--ACATGC--ACA---A------GC---TA-ATA-A-----G----C-----T-----T-A--------C-T------T-TT-GAC--CT-TGATCTG-T-ATT----GCATCAGTTT----TAAGCAGACA-TG-ATTGGAATTGATATT
gi|158568 : TTTACTTATTTTTATTCTACAT----------TTG----AC--------AT--GTGGTCCTGT-GCTTAT------TTCATACTC-----C-TTT-------TT-TTT---AAAC-----A-----A--T-CT--ATGAGAA-G-GTCATTCA----TCCGGAACCT-------------CT-----TTAATTT-T------G--ACATGC--ACA---A------GC---GA-AAT-CT----T----T-----T-----T-ATA--A---C-
gi|158569 : TTTACTTGTTTTCGTTCTACAT----------TTA----AC--------AT--GCGGTCCTGT-AATGAT------TTTAAACTC-----A-TTT-------TT-TAA---CAAA-----T-----T--T-CT--ATAAGAA-G-GGTACTTT----TCTGTAACCG-------------TT-----TTAATTTCT------G--ACATG---------A------GC----------------T----G-----T-----T-ATC--A---TGT------T-TC-GACA-CT-T--TTTG-TCATT----GCATCAGTTT----TAAGCAGACG-TG-
gi|158570 : TTTACTTGTTTTCATTCTACAT----------TTA----AC--------AT--GTGGTCCTGT-AATGAT------TTTAAACTC-----ATTTT-------TT-TAA---CAAA-----T-----T--T-CT--ATAATAGTG-GT-ACTCT----TCTGTAACCG-------------CT-----TTATTTTCT------G--ACATGA--GCA---G------TC---AT-CAT-G-----T----T-----T-----C-GAC--A---C-T------T-T--------T-TGTCC------TT----GCATCAGTTT----TAAGCAGA
gi|158572 : TTTACTTATTTCCATTCTACAT----------TTG----AC--------AT--GTGATTCTGTGACC-AT------TTCAAACTCTTTATA-TTT-------T--------ATAA-----T-----T--T-CT--ATAAGAA-G-GGTACTCC----TTGGGAACCT-------------CC-----ATTATATCT------G--ACATGC--GCA---G------TC------ATT-A-----TGACAT-----T-----C-ATC--ATTTC-T------T-TT--AC--CT-TGACCTG-T-TAT----GTACCAACTT----TCAGCAGAC
gi|158571 : TTTGCTTGTTTTCATTCTACAT----------TGA----ATATATATATAT--GTGGTCCTGT-GATAAT------TTCAAACTT-----A-TTT-------TT-TTA---ACAA-----ATTTCTA--T-TT--TTATGAA-G-GACACTCC----TACGGAACCT-------------CT-----GTCATTTCT------G--ACATGC--TTA---A------AC-------AT-A-----T----T-----T-----T-ATT--A---C-aacaattgtattaattt
gi|158573 : TTTACTTGTTTTCATTATACAT----------CTA----ATCTCAGATTATCTGTGGTCCTGT-ATTGAT------TTTAAACAC-----A-TTT-------TT-TAA---CAAA-----T-----T--T-CT--ATAAAAA-A-GTTACTTT----TCCGTAACCG-------------CT-----TTAATTTGT------G--ACATGA--GCA---G------TC---AC-CAT-G-----T----T-----T-----C-GAC--A---C-T------T-T--------T-TGTCCT-----TT-----TAACAGTTT----TAAGCAGACG-T
gi|158574 : TTTACTTATTTTCATTCTACAT----------TGA----AC--------AT--TTGGTCCTGT-AATGAT------TTTAAACTT-----G-TAT-------TT-AAC---A-----------------------------------CATTCC----GCTGGAACCT-------------CT-----ATAATTTCT------G--ACATGG--GCA---------------GATAGTCA-----TG---C-----T-----T-ATA--A---C-T------T-CT-GAC--CT-TGACCTA-T-CAT----GCATTA
gi|158575 : TTTACTTATTTTCAT-CTACAT----------TTA----AC--------AT--ATGGTCCTGT-GATAAT------TTCAAACCC-----A-TTA-------TT-ACATGTAACA-----C-----ATTT-CT--ATAAGAA-G-GGTACTCC----TACAGAACC
gi|158576 : TTTACTTATTTT-------CAT----------TTA------------------------TTGT-GATGAT------TTCAAACTT-----G-TTT-------GT-AAC---AAAT-----G--------C-CT--ACTAGAA-G-AGTACTAC----TCCGGAATCT--------------------ATAATTTCT------T--ACATTC--G-A---A------GT---CG-GGT-A-----TG---T-----T-----T-ATA--A---CTT------T-TC-TA---CT-TAACCTG-T-TAT----GCGTCAGTTT----T-------CG-TG-GTTGGAATTGATATTattattat
gi|158577 : CTTATTTTTATTCTACAT----------TTA----AC--------AT--GTGGCCCTGT-GCTAAT------TTCAAACTC-----A-TTT-------TTTAAA---AAAA-----AC----A--T-CT--ATAAGAA-G-GTCACTCA----TTCGGAACCT-------------CT-----ATAATTACT------G--ACATGC--AAA---A------GC---AA-ACT-AT----T----T-----T-----T-ATA--A---T-T------T-TT-GAC--CT-TGACCTG-T-ATT----GCATCACTTT----TCAGCA-----TG-TTTGAAATGGACATT
gi|158578 : CTTATTTTCATTCTACAT----------TTA----AC--------AT--GTGTTCTGGT-GATAAT------TTTAACACC--------TT-------TT-CAT---CAAA-----T-----T--T-CT--ATAAAAA-A-GGTACTCC----TTTGTAACCT-------------CT-----ATTATTTCT------A--ACATGC--GCA---G------TC---TT-CAT-------T----T-----T-----T-AAC--A---C-T------TATT-GAC--CA-TGACCTG-T-TAT----GTATCAATTT----TCAGCA
gi|158579 : CTTAATTTCATTCTACATAAATTATTATTTA----AC--------AT--GTGGTCCTGA-GATAAT------TTTAATAT------A-TT-----------------------------------T-CC--ATAAGAA-A-GGTGTTCC----TTAAGAACCT-------------CT-----ATAATTTAT------G--ACATGC--GCA---A------TC---AT-CAT-G-----T----T-----T-----TGATA--C---T-T------T-TC-TAC--CT-TGACCTG-T--TT----TCATTGATAT----TC
gi|158580 : TATTTTTATTCTACAT----------TTA----AC--------AT--GTGGTCCTGT-GCTACT------TTCGAACTC-----A-TTT-------TT-TAA---AAAA-----A-----A--T-CT--ATATGAA-G-ATCACTCA----TCTGGAACCT-------------CT-----ATAATTTCT------G--ACATGC--CCA---A------GT---GA-AAT-AT----T----T-----T-----T-ATA--A---C-T------T-T--GGC--CT-TGACCTG-T-ATT----GCATCACTTT----TCAACAGACT-TA-TTTGAAATTGCTATT
gi|158581 : ATTCTAGAT----------TTA----CC--------AT--GTGGCTTTGT-GATAAT------TTCAAACTG-----A-TT--------TC-ATT---AACA-----A-----A--T-TTCAATAAGAA-G-GTTACTCT----CTCGGAAACT-------------CT-----ATAACTTTT------A--ACATGC--GCA---G------TT---GGTCAT-G----------T-----T-----T-ATA--A---T-T------A-TT-TAC--CT-TGACACG-T-TAT----GCATCAG-AT----CCGGCAAACA-TG-GTTGGAATTGATATT
gi|158582 : ATTCTACGC----------TTA----AC--------AT--GTGATCCT-----------------------C-----A-TTG-------TT-TAA---CAAA-----T--------T-TT--ATGAGAA-GTGTT-CTCC----TAAGGAACCT--------------------ATAATTTCT------G--ACATGC--GT------------C---GT-CAT-T-----T----T-----T-----T-TTC--A---G-T------T-TCTAAC--CTGTGACCTG-T-TAT----GCATCAGTTT----TCAGCAGACA-AC-TATGGAATTAATATT
gi|158583 : TTCTGCTT----------TTATTGTG---------AT--GTTATTTTGT-TTTGATGATCAATTCAAACTC-----A-TTT-------TT-AAA---AATT--------------T-CT--ATAAGAA-G-GGTACTCC----TCCAGAACCT-------------CT-----AGAATTTCA------G--ATATGC--GC------------C---GT-CATCA-----TG---T-----T-----T-ATA--AT--C-T------T-TT-GAC--CG-TGACCTA-T-A
gi|158584 : CAT----------TTA----AC--------AT--GTTGT--TG--ATCA--------TTCAAACTC-----A-TTT-------TT-TCA---CAAA-----T-----T--T-CT--ATAAGAA-GAGTAAAAC-----TCCAGAACCT-------------CT-----ATAATGTCT------G--ACATGT--GCA---A------
gi|158585 : T----------TTA----AT--------AT--ATGGCCCTGT-GCCAAT------TTCAAACTC-----A-TTT-------TT-AAA---AAAA-----A-----AA-T-CT--GTAAGAA-G-GTCACTCA----TACGGAACCT-------------C-------TAATTTCT------G--ACATTT--ACA---A------GC---GT-AATCA-----T----T-----T-----T-ATAGTA---C-CGGGGTAT-TT-GTC--TT-TGACCTT-T-ATT----GCATCAGTTT----TCAGCAGACG-TG-TTCGAAATCGATATT
gi|158586 : ---------AT--GTGGTCTTGT-GATAAT------TT---TCTT-------TTT-------TT-AAA---AT----------------T-CT--ACAAGAA-G-GATACTCC----CCCG-AACCTCTATAATTTATGACATGCTTATAACTTTTTACCTTG--ACATGCTTATA---ACTTTTTACCTTGA-CAT-G-----C----T-----T-------ATA--A---C-T------T-TT-TAC--CT-TGACATG-TTATT-----CATCAGTTT----TCAGAAGACA-TG-TTTGGAATAAATATT
gi|158587 : TCCTGT-GCTTAT------TTCAAACTT-----G-TAT-------TT-CAA---AAAA-----A-----A--T-CT--ATAAGAA-G-CTCACTCT----TCCGGAACCT-------------CT-----ATGTTTTCT------G--ACATGC--A------------AT---AA-AAT-C-----T----T-----T-----TTATA--A---C-T------T-TT-GAC--CT-TGACCTT-T-ATT----GCATCAGTTT----TTAGCAGTCG-TG-TTTGAAATCGATATT
gi|158588 : TCCTAT-GATAAT------TTCAATGTC-----AGTTT-------TC-AAA---ACAA-----A-----A--T-CT--ATAAGAA-G-GGTGCTCC----TCTAGAGCCT-------------CA-----ATATCTTTT------G--AGATGC--GCT---C------TC----------A-----T----TTCCAGT-----T-GTC--A---C-TA-----C-TT-GAC--CT-TGACC------TT----GCATATATTTACTATCAGCAGACGACG-T-TGGAATTAATGTT
gi|158589 : TCCTAT-GATAAT------TTCAATGTC-----A-GTT-------TT-CAA---AA-A-----A-----A--T-CT--ATAAGAA-G-GGTGCTCC----TCTAGAGCCT-------------CA-----ATATCTTTT------G--AGATGC--GCT---C------TC----------A-----C----T-----TCCGGCT-GTC--A---C-TA-----C-TT-GAC--CT-TGACC-----A-T----GCATATATTTACTATCAGCAGACGACG-T-TGGAATTAATTTT
gi|158590 : ------TTCA-TGTC-----A-TTT-------TT-TAA---CAAA-----T-----T--T-CT--ATAAGAA-G-GGTACTCC----ACAGGAACCT-------------CT-----ATAATTTCA------G--ACATGC--GCA---------------GA-AAT-ACATGCT----TA----T-----T-ACA--A---C-T------T-TT-GACTATC-TAACAGG-T-ATCATGAGCATTATTTT----TTA
gi|158567 : A-----A-----A--T-CT--TTAAGAA-G-GTTACTCA----TCCGGAACGT-------------CT-----ATACTTTCT------G--ACATGC--ACA---A------GT---GA-AAT-A-----T----T-----T-----TTATA--A---C-T------T-TT-GAC--CT-TGACGTG-T-ACT----GCATCAGTTT----TCAGCAGACG-TG-TTTGGAATCGATA
gi|158591 : ttttctcctttttttttcgcatcattccatttgttcttatatctgaagctttgtttaatcatagt--ATAAGAA-G-GGTACTCC----TCCGTAACCT-------------CC-----TTAGCTTCT------G--ACATGC--CCAGTCA------GC---TA-AGC-A----------------------T-ATA--A---C-T------T-TT-GAC--AT-TGACTTA-T-TAT----GCATAAGCTT----TCAGAAAGCG-AG-GTTGGACTTGATA
gi|158592 : TCATTCT----TCTGAATCAT-------------CT-----GTAATTTCT------GGTATATGC--CCAGTTA------TC---AT-GAC-G----------T-----T-----T-ATC--A---CTT------T-TT-GAC--CT-TGATCTGCT-A-T----GCATCAGTTT----TTTGCAGATGACG--ATGGAATTTATATT
gi|158593 : TTCT------G--ACATGC--ACA---G------TC-------ATCA-----TG---T-----T-----T-ATA--A---C-TG-----T-TT-TAC--CT-CGACTTA-T-TAT----GCATCAGTTT----TCAGAAGACC-TG-GTTGGAACTGATATT
gi|158594 : ----T-----T-----T-ATA--A---C-T------T-GT-GAT--CT-TAACCTG-T-ATT----GTATCAGTTT----TCAGCAGACG-TGCTA-GGAATTGATAT
Alignments
lowQualScore : 222222222 33333333333333333333333333333333333333
lowQualScore : 7777777777 5555555 1 222 5555555 1 1 0 1 222 2 666666 1 6 44444 1 000000000 2222 1 3 2222 0 888888888888888888 11 333333 0 22222222222222222222222222222222222222 55555 22222 5 1 11 333 2 777777 1 33 1 2 555 2222 5555 4 5 3
lowQualScore : .......... ....... . ... ....... . . . . ... . ...... . . ..... . ......... .... . . .... . .................. .. ...... . ...................................... ..... ..... . . .. ... . ...... . .. . . ... .... .... . . .
lowQualScore : 0000000000 2222222 6 888 0000000 3 5 1 3 333 6 000000 3 0 66666 3 555555555 6666 2 3 5555 6 777777777777777777 66 444444 3 22222222222222222222222222222222222222 33333 99999 9 2 66 222 4 333333 2 00 2 5 111 7777 7777 8 0 1
consensus : TTTACTTATTTTCATTCTACAT----------T-------TA-A---CA-------TGTGGTCCTG-TGATAATTTCAA-ACTC---A-TTT------T-TTAA---A-A-AA-----NN--TCTA----TAAGAAG-GNTAC----TCCTCCGGAACCTC------------------TATA--ATTTCT------GACATGCGCA---AGC----------G-A-AAT-A-----T-------T-----T-----T-AT-A--A---C-T------T-TTGAC--CT-TGACCTG-T-ATT----GCATCAGTTT----TCAGCAGACG-TGTTTGGAATCGATATT
Reference ( family-581 ) : TTTACTTATTTTCATTCTACAT----------T-------TA-A---CA-------TGTGGTCCTG-TGNTAATTTCAA-ACTC---A-TTT------T-TNAA---A-A-AA-----NA--TCTA----TAAGAAG-GTTAC----TCCTCCGGAACCTC------------------TATA--ATTTCT------GACATGCGCA---AGC----------G-A-AAT-A-----T-------T-----T-----T-AT-A--A---C-T------T-TTGAC--CT-TGACCTG-T-ATT----GCATCAGTTT----TCAGCAGACG-TGTTTGGAATCGATATT
gi|158559 : TTTGCTTGTTTTTATTCTACAT----------T-------TA-A----A-------TGTGGTCCTG-TACTAATTTCAA-TCTC---A-TTC------T-TAAA---A-A-AA-----AA--TCTA----TAAGAAG-GTCAC----TCGTCCGGAACCTC------------------AATA--ATTTCT------GACATGCACA---AGC----------G-A-AAT-A-----T-------T-----T-----T-AT-A--A---C-T------T-TCGAC--CT-TGACCTG-T-ATT----GCATCAGTTT----TCAGCAGACG-TGTATGAAATCGATATT
gi|158560 : TTTGCTTGTTTTTATTCTACAT----------T-------TA-A----A-------TGTGGTCCTG-TACTAATTTCAA-TCTC---A-TTC------T-TAAA---A-A-AA-----AA--TCTA----TAAAAAG-GTCAC----TCGTCCGGAACCTC------------------GATA--ATTTCT------GACATGCACA---AGC----------G-A-AAT-A-----T-------T-----T-----T-AT-A--A---C-T------T-TCGAC--CT-TGACCTG-T-ATT----GCATCAGTTT----TCAGCAGACG-TGTATGAAATCGATATT
gi|158561 : TTTGCTTGTTTTTATTCTACAT----------T-------TA-A----A-------TGTGGTCCTG-TACTAATTTCAA-TCTC---A-TTC------T-TTAA---ACA-AA-----AA--TCTA----TAAGAAG-GTCAC----TCGTCCGGAACTTC------------------GATA--ATTTCT------GACATGCACA---AGC----------A-A-AAT-A-----T-------T-----T-----T-AT-A--A---C-T------T-TCGAC--CT-TGACCTG-T-ATT----GCATCAG-TT----TCAGCAGACG-TGTATGAAATCGATATT
gi|158562 : TTTACTTATTTTTATTCTACAT----------T-------CA-A---CA-------TGTGGTCCTG-TGCTTATTTCAA-CCTC---A-TTT------T-TAAA---A-A-AAAATCTAA--TCTA----TAAGAAG-GTTAC----TCATCCAGAACCT-------------------TATGTTATTTCT------GACATGCACA---AGT----------G-A-AAT-C-----T-------T-----T-----TCCT-T--A---T-T------T-TTTAC--CT-TGACCTG-T-ACT----GCAACAGTTT----TCAGCAGACG-TGT
gi|158563 : TTTACTTATTTTCATTCTACAT----------T-------TA-A---GA-------TGTGGTCCTG-TGATATTTTCTA-ACTC---G-TTT------T-TTAA---C-A-AATTTC-TA--TTTA----TAAGAAG-GCTACTCGATCCTCTGGAACCTC------------------TATA--ATTTCT------GACAT--GCA---AGC----------GAA-AAA-A-----G-------T-----T-----T-AT-A--A---C-T------T-TTGAC--CT-TGACCTG-T-ATT----TCATCAGTTT----TCAGCAGACA-T
gi|158564 : TTTACTTATTTT-ATTCTACAT----------T-------TA-A---CA-------TGTGATTTTG-TGGTAATTTCAA-ACTC---A-TAT------T-TTAA---C-A-AA-----TT--TCTG----TAAGAAG-GTTTC----TTTTCTGGAACCTT------------------TATA--ATACCG------GACATGCGCAGT-AG-----------G-T-GAT-A-----T-------TA----T-----T-AT-A--A---C-T------T-TTGAC--CT-TGACATG-T-TTT----GCATCAGTTT----TTAGCAGATG-TGGTTGGAAT-GATATTtgatattcat
gi|158565 : TTTACTTATTTTTATTTTACAT----------T-------TA-A---CA-------TGTGGTCATG-TGTTAATTTCAA-ACTC---A-TTTATTTTTT-TTAA---A-A-AA---------TGTA----TAAGA----TTAC----TCATCCGGAACCTT------------------TATA--ATTTCA------GACATTTACA---AGC----------G-A-AAT-T-----T-------T-----T-----T--T-A---------------------------TAACCTG-T-ATT----GCATCAGTTT----TCAGCTGATG-TGTTTGAAATCGTTATT
gi|158566 : TTATTT-CATTCTACAT----------T-------TA-A---CA-------TGACAT--TG-TGATCATTACAA-ACTC---A-TTTAAA---T-TAAA---A-A-AA-----T---TCTA----AAAGGAG-GCTTC----TCCTCAGGAACCTT------------------GATA--ATTTCT------GACATGCACA---AGC----------T-A-ATA-A-----G-------C-----T-----T-A---------C-T------T-TTGAC--CT-TGATCTG-T-ATT----GCATCAGTTT----TAAGCAGACA-TGATTGGAATTGATATT
gi|158567 : ttagctA-----AA--TCTT----TAAGAAG-GTTAC----TCATCCGGAACGTC------------------TATA--CTTTCT------GACATGCACA---AGT----------G-A-AAT-A-----T-------T-----T-----TTAT-A--A---C-T------T-TTGAC--CT-TGACGTG-T-ACT----GCATCAGTTT----TCAGCAGACG-TGTTTGGAATCGATA
gi|158568 : ttttctcctttttttttcgcatcattccatttgttcttatatctgaagctttgtttaatcatagtTTTACTTATTTTTATTCTACAT----------T-------TG-A---CA-------TGTGGTCCTG-TGCTTATTTCAT-ACTC---C-TTT------T-TTTT---A-A-AC-----AA--TCTA----TGAGAAG-GTCAT----TCATCCGGAACCTC------------------TTTA--ATTT-T------GACATGCACA---AGC----------G-A-AAT-CT----T-------T-----T-----T-AT-A--A---C-
gi|158569 : TTTACTTGTTTTCGTTCTACAT----------T-------TA-A---CA-------TGCGGTCCTG-TAATGATTTTAA-ACTC---A-TTT------T-TTAA---C-A-AA-----TT--TCTA----TAAGAAG-GGTAC----TTTTCTGTAACCGT------------------TTTA--ATTTCT------GACATG-------AGC------------------------T-------G-----T-----T-AT-C--A---TGT------T-TCGACA-CT-T--TTTG-TCATT----GCATCAGTTT----TAAGCAGACG-TG
gi|158570 : TTTACTTGTTTTCATTCTACAT----------T-------TA-A---CA-------TGTGGTCCTG-TAATGATTTTAA-ACTC---ATTTT------T-TTAA---C-A-AA-----TT--TCTA----TAATAGT-GGTAC----TCTTCTGTAACCGC------------------TTTA--TTTTCT------GACATGAGCA---GTC----------A-T-CAT-G-----T-------T-----T-----C-GA-C--A---C-T------T-T-------T-TGTCC------TT----GCATCAGTTT----TAAGCAGA
gi|158571 : TTTGCTTGTTTTCATTCTACAT----------TGAATATATATA---TA-------TGTGGTCCTG-TGATAATTTCAA-ACTT---ATTTT------T-TTAA---C-A-AA-----TT--TCTATTTTTATGAAG-GACAC----TCCTACGGAACCTC------------------TGTC--ATTTCT------GACATGCTTA---AAC---------------AT-A-----T-------T-----T-----T-AT-T--A---C-
gi|158572 : TTTACTTATTTCCATTCTACAT----------T-------TG-A---CA-------TGTGATTCTG-TGACCATTTCAA-ACTCTTTA-TAT------T-TT-----A-T-AA-----TT--TCTA----TAAGAAG-GGTAC----TCCTTGGGAACCTC------------------CATT--ATATCT------GACATGCGCA---GTC--------------ATT-A-----TGACA---T-----T-----C-AT-C--ATTTC-T------T-TT-AC--CT-TGACCTG-T-TAT----GTACCAACTT----TCAGCAGAC
gi|158573 : TTTACTTGTTTTCATTATACAT----------C-------TA-ATCTCAGATTATCTGTGGTCCTG-TATTGATTTTAA-ACAC---A-TTT------T-TTAA---C-A-AA-----TT--TCTA----TAAAAAA-GTTAC----TTTTCCGTAACCGC------------------TTTA--ATTTGT------GACATGAGCA---GTC----------A-C-CAT-G-----T-------T-----T-----CGAC-A--C---T-T------T-TTGTC--CT-T----------TT------AACAGTTT----TAAGCAGACG-Taacaattgtattaattt
gi|158574 : TTTACTTATTTTCATTCTACAT----------T-------GA-A---CA-------TTTGGTCCTG-TAATGATTTTAA-ACTT---G-TAT------T-T------A-A-CA-----CA--T------------------------TCCGCTGGAACCTC------------------TATA--ATTTCT------GACATGGGCA----------------G-ATAGTCA-----TG------C-----T-----T-AT-A--A---C-T------T-CTGAC--CT-TGACCTA-T-CAT----GCATTA
gi|158575 : TTTACTTATTTTCAT-CTACAT----------T-------TA-A---CA-------TATGGTCCTG-TGATAATTTCAA-ACCC---A-TTA------T-TACATGTA-A-CA-----CATTTCTA----TAAGAAG-GGTAC----TCCTACAGAACCAT------------------TATT--AT
gi|158576 : TTTACTTATTTTCATTT-------------------------------A-------T-------TG-TGATGATTTCAA-ACTT---G-TTT------G-T-AA---C-A-AA-----TG--CCTA----CTAGAAG-AGTAC----TACTCCGGAA--TC------------------TATA--ATTTCT------TACATTCG-A---AGT----------C-G-GGT-A-----TG------T-----T-----T-AT-A--A---C-T------T-TTCTA--CT-TAACCTG-T-TAT----GCGTCAGTTT----T-------CG-TGGTTGGAATTGATATT
gi|158577 : CTTATTTTTATTCTACAT----------T-------TA-A---CA-------TGTGGCCCTG-TGCTAATTTCAA-ACTC---A-TTT------T-TTAA---A-A-AA-----AACATCTA----TAAGAAG-GTCAC----TCATTCGGAACCTC------------------TATA--ATTACT------GACATGCAAA---AGC----------A-A-ACT-AT----T-------T-----T-----T-AT-A--A---T-T------T-TTGAC--CT-TGACCTG-T-ATT----GCATCACTTT----TCAGCA-----TGTTTGAAATGGACATT
gi|158578 : CTTATTTTCATTCTACAT----------T-------TA-A---CA-------TGTGTTCTGG-TGATAATTTTAACACC-------TT------T-TCAT---C-A-AA-----TT--TCTA----TAAAAAA-GGTAC----TCCTTTGTAACCTC------------------TATT--ATTTCT------AACATGCGCA---GTC----------T-T-CAT-------T-------T-----T-----T-AA-C--A---C-T------TATTGAC--CA-TGACCTG-T-TAT----GTATCAATTT----TCAGCA
gi|158579 : CTTAATTTCATTCTACATAAATTATTATT-------TA-A---CA-------TGTGGTCCTG-AGATAATTTTAA----T---A-TAT------T-T----------------------CCA----TAAGAAA-GGTGT----TCCTTAAGAACCTC------------------TATA--ATTTAT------GACATGCGCA---ATC----------A-T-CAT-G-----T-------T-----T-----TGAT-A--C---T-T------T-TCTAC--CT-TGACCTG-T--TT----TCATTGATAT----TC
gi|158580 : TATTTTTATTCTACAT----------T-------TA-A---CA-------TGTGGTCCTG-TGCTACTTTCGA-ACTC---A-TTT------T-TTAA---A-A-AA-----AA--TCTA----TATGAAG-ATCAC----TCATCTGGAACCTC------------------TATA--ATTTCT------GACATGCCCA---AGT----------G-A-AAT-AT----T-------T-----T-----T-AT-A--A---C--------T-TTGGC--CT-TGACCTG-T-ATT----GCATCACTTT----TCAACAGACT-TATTTGAAATTGCTATT
gi|158581 : ATTCTAGAT----------T-------TA-C---CA-------TGTGGCTTTG-TGATAATTTCAA-ACTG---A-TTT------CATTAA---C-A-AA-----TT--TCAA----TAAGAAG-GTTAC----TCTCTCGGAAACTC------------------TATA--ACTTTT------AACATGCGCA---GTT----------G----GTCA-----TG------T-----T-----T-AT-A--A---T-T------A-TTTAC--CT-TGACACG-T-TAT----GCATCAG-AT----CCGGCAAACA-TGGTTGGAATTGATATT
gi|158582 : ATTCTACGC----------T-------TA-A---CA-------TGTGATCCT------------------C---A-TTG------T-TTAA---C-A-AA-----T---TTTA----TGAGAAGTGTT-C----TCCTAAGGAACCT--------------------ATA--ATTTCT------GACATGCGT------C----------G-T-CAT-T-----T-------T-----T-----T-TTCA--G---T-T------T-CTAAC--CTGTGACCTG-T-TAT----GCATCAGTTT----TCAGCAGACA-ACTATGGAATTAATATT
gi|158583 : GTTTTGATGATCAATTCAA-ACTC---A-TTT------T-T--A---A-A-AA-----TT--TCTA----TAAGAAG-GGTAC----TCCTCCAGAACCTC------------------TAGA--ATTTCA------GATATGCGC------C----------G-T-CATCA-----TG------T-----T-----T-AT-A--AT--C-T------T-TTGAC--CG-TGACCTA-T-A
gi|158584 : ttctgcttttattgtgatgttattttCAT----------T-------TA-A---CA-------TGTTGT-----TGATCATT-CAA-ACTC---A-TTT------T-TTCA---C-A-AA-----TT--TCTA----TAAGAAG-AGTAA----AACTCCAGAACCTC------------------TATA--ATGTCT------GACATGTGCA---A
gi|158585 : T----------T-------TA-A---TA-------TATGGCCCTG-TGCCAATTTCAA-ACTC---A-TTT------T-TAAA---A-A-AA-----AAA-TCTG----TAAGAAG-GTCAC----TCATACGGAACCTC------------------TA----ATTTCT------GACATTTACA---AGC----------G-T-AATCA-----T-------T-----T-----T-AT-AGTA---C-CGGGGTAT-TTGTC--TT-TGACCTT-T-ATT----GCATCAGTTT----TCAGCAGACG-TGTTCGAAATCGATATT
gi|158586 : A-------TGTGGTCTTG-TGATAATTT------TC---T-TTT------T-TTAA---A-A-T----------TCTA----CAAGAAG-GATAC----TCCCCCG-AACCTCTATAATTTATGACATGCTTATA--ACTTTTTACCTTGACATGCTTAT--AACTTTTTACCTTG-A-CAT-G-----C-------T-----T-------AT-A--A---C-T------T-TTTAC--CT-TGACATGTT-ATT-----CATCAGTTT----TCAGAAGACA-TGTTTGGAATAAATATT
gi|158587 : TCCTG-TGCTTATTTCAA-ACTT---G-TAT------T-TCAA---A-A-AA-----AA--TCTA----TAAGAAG-CTCAC----TCTTCCGGAACCTC------------------TATG--TTTTCT------GACATGC------AAT----------A-A-AAT-C-----T-------T-----T-----TTAT-A--A---C-T------T-TTGAC--CT-TGACCTT-T-ATT----GCATCAGTTT----TTAGCAGTCG-TGTTTGAAATCGATATT
gi|158588 : TCCTA-TGATAATTTCAA-TGTC---A-GTT------T-TCAA---A-ACAA-----AA--TCTA----TAAGAAG-GGTGC----TCCTCTAGAGCCTC------------------AATA--TCTTTT------GAGATGCGCT---CTC------------------A-----T-------TTCCAGT-----T-GT-C--A---C-TA-----C-TTGAC--CT-TGACC------TT----GCATATATTTACTATCAGCAGACGACG-TTGGAATTAATGTT
gi|158589 : TCCTA-TGATAATTTCAA-TGTC---A-GTT------T-TCAA---A-A-AA------A--TCTA----TAAGAAG-GGTGC----TCCTCTAGAGCCTC------------------AATA--TCTTTT------GAGATGCGCT---CTC------------------A-----C-------T-----TCCGGCT-GT-C--A---C-TA-----C-TTGAC--CT-TGACC-----A-T----GCATATATTTACTATCAGCAGACGACG-TTGGAATTAATTTT
gi|158590 : TC---A-TTT------T-TTAA---C-A-AA-----TT--TCTA----TAAGAAG-GGTAC----TCCACAGGAACCTC------------------TATA--ATTTCA------GACATGCGCA----------------G-A-AAT-ACATGCT-------TA----T-----T-AC-A--A---C-T------T-TTGACTATC-TAACAGG-T-ATCATGAGCATTATTTT----TTA
gi|158591 : ttcatgA----TAAGAAG-GGTAC----TCCTCCGTAACCTC------------------CTTA--GCTTCT------GACATGCCCAGTCAGC----------T-A-AGC-A-----T---------------------AT-A--A---C-T------T-TTGAC--AT-TGACTTA-T-TAT----GCATAAGCTT----TCAGAAAGCG-AGGTTGGACTTGATA
gi|158592 : TCAT----TCTTCTGAATCATC------------------TGTA--ATTTCT------GGTATATGC------C----------C-A-GTT-A-----TCATGACGT-----T-----T-AT-C--A---CTT------T-TTGAC--CT-TGATCTGCT-A-T----GCATCAGTTT----TTTGCAGATGACG-ATGGAATTTATATT
gi|158593 : TTCT------GACATGCACA---GTC---------------ATCA-----TG------T-----T-----T-AT-A--A---C-TG-----T-TTTAC--CT-CGACTTA-T-TAT----GCATCAGTTT----TCAGAAGACC-TGGTTGGAACTGATATT
gi|158594 : -------T-----T-----T-AT-A--A---C-T------T-GTGAT--CT-TAACCTG-T-ATT----GTATCAGTTT----TCAGCAGACG-TGCTAGGAATTGATAT
Alignments
lowQualScore : 33333333333333333333333333333333333333
lowQualScore : 6666666666 5555555 1 222 4444444 1 1 0 1 222 2 333333 33 55555555 666666 1 88888888 2222 2222 1 2222 0 888888888888888888 11 333333 0 22222222222222222222222222222222222222 55555 22222 5 1 11 333 2 777777 1 33 1 2 555 2222 5555 4 5 3
lowQualScore : .......... ....... . ... ....... . . . . ... . ...... .. ........ ...... . ........ .... .... . .... . .................. .. ...... . ...................................... ..... ..... . . .. ... . ...... . .. . . ... .... .... . . .
lowQualScore : 7777777777 0000000 5 777 8888888 3 7 6 2 222 5 666666 00 88888888 777777 2 00000000 7777 6666 4 5555 6 777777777777777777 66 444444 3 22222222222222222222222222222222222222 33333 99999 9 2 66 222 4 333333 2 00 2 5 111 7777 7777 8 0 1
consensus : TTTACTTATTTTCATTCTACAT----------T-------TA-A---CA-------TGTGGTCCTG-TGATAATTTCAAACTC---A-TTT------T--T-----T--AA----A-A-AA-----NN-TC----TA----TAAGAAGGNTAC----TCCTCCGGAACCTC------------------TATA--ATTTCT------GACATGCGCA---AGC----------G-A-AAT-A-----T-------T-----T-----T-AT-A--A---C-T------T-TTGAC--CT-TGACCTG-T-ATT----GCATCAGTTT----TCAGCAGACG-TGTTTGGAATCGATATT
Reference ( family-581 ) : TTTACTTATTTTCATTCTACAT----------T-------TA-A---CA-------TGTGGTCCTG-TGATAATTTCAAACTC---A-TTT------T--T-----T--AA----A-A-AA-----NN-TC----TA----TAAGAAGGNTAC----TCCTCCGGAACCTC------------------TATA--ATTTCT------GACATGCGCA---AGC----------G-A-AAT-A-----T-------T-----T-----T-AT-A--A---C-T------T-TTGAC--CT-TGACCTG-T-ATT----GCATCAGTTT----TCAGCAGACG-TGTTTGGAATCGATATT
gi|158559 : TTTGCTTGTTTTTATTCTACAT----------T-------TA-A----A-------TGTGGTCCTG-TACTAATTTCAATCTC---A-TTC------T--T-----A--AA----A-A-AA-----AA-TC----TA----TAAGAAGGTCAC----TCGTCCGGAACCTC------------------AATA--ATTTCT------GACATGCACA---AGC----------G-A-AAT-A-----T-------T-----T-----T-AT-A--A---C-T------T-TCGAC--CT-TGACCTG-T-ATT----GCATCAGTTT----TCAGCAGACG-TGTATGAAATCGATATT
gi|158560 : TTTGCTTGTTTTTATTCTACAT----------T-------TA-A----A-------TGTGGTCCTG-TACTAATTTCAATCTC---A-TTC------T--T-----A--AA----A-A-AA-----AA-TC----TA----TAAAAAGGTCAC----TCGTCCGGAACCTC------------------GATA--ATTTCT------GACATGCACA---AGC----------G-A-AAT-A-----T-------T-----T-----T-AT-A--A---C-T------T-TCGAC--CT-TGACCTG-T-ATT----GCATCAGTTT----TCAGCAGACG-TGTATGAAATCGATATT
gi|158561 : TTTGCTTGTTTTTATTCTACAT----------T-------TA-A----A-------TGTGGTCCTG-TACTAATTTCAATCTC---A-TTC------T--T-----T--AA----ACA-AA-----AA-TC----TA----TAAGAAGGTCAC----TCGTCCGGAACTTC------------------GATA--ATTTCT------GACATGCACA---AGC----------A-A-AAT-A-----T-------T-----T-----T-AT-A--A---C-T------T-TCGAC--CT-TGACCTG-T-ATT----GCATCAG-TT----TCAGCAGACG-TGTATGAAATCGATATT
gi|158562 : TTTACTTATTTTTATTCTACAT----------T-------CA-A---CA-------TGTGGTCCTG-TGCTTATTTCAACCTC---A-TTT------T--T-----A--AA----A-A-AAAATCTAA-TC----TA----TAAGAAGGTTAC----TCATCCAGAACCT-------------------TATGTTATTTCT------GACATGCACA---AGT----------G-A-AAT-C-----T-------T-----T-----TCCT-T--A---T-T------T-TTTAC--CT-TGACCTG-T-ACT----GCAACAGTTT----TCAGCAGACG-TGT
gi|158563 : TTTACTTATTTTCATTCTACAT----------T-------TA-A---GA-------TGTGGTCCTG-TGATATTTTCTAACTC---G-TTT------T--T-----T--AA----C-A-AA-----TT-TCTATTTA----TAAGAAGGCTACTCGATCCTCTGGAACCTC------------------TATA--ATTTCT------GACAT--GCA---AGC----------GAA-AAA-A-----G-------T-----T-----T-AT-A--A---C-T------T-TTGAC--CT-TGACCTG-T-ATT----TCATCAGTTT----TCAGCAGACA-T
gi|158564 : TTTACTTATTTT-ATTCTACAT----------T-------TA-A---CA-------TGTGATTTTG-TGGTAATTTCAAACTC---A-TAT------T--T-----T--AA----C-A-AA-----TT-TC----TG----TAAGAAGGTTTC----TTTTCTGGAACCTT------------------TATA--ATACCG------GACATGCGCAGT-AG-----------G-T-GAT-A-----T-------TA----T-----T-AT-A--A---C-T------T-TTGAC--CT-TGACATG-T-TTT----GCATCAGTTT----TTAGCAGATG-TGGTTGGAAT-GATATTtgatattcat
gi|158565 : TTTACTTATTTTTATTTTACAT----------T-------TA-A---CA-------TGTGGTCATG-TGTTAATTTCAAACTC---A-TTTATTTTTT--T-----T--AA----A-A-AA-----TG-T------A----TAAGA---TTAC----TCATCCGGAACCTT------------------TATA--ATTTCA------GACATTTACA---AGC----------G-A-AAT-T-----T-------T-----T-----T--T-A---------------------------TAACCTG-T-ATT----GCATCAGTTT----TCAGCTGATG-TGTTTGAAATCGTTATT
gi|158566 : TTATTT-CATTCTACAT----------T-------TA-A---CA-------TGACAT--TG-TGATCATTACAAACTC---A-TTT------AAAT-----T--AA----A-A-AA-----AT-TC----TA----AAAGGAGGCTTC----TCCTCAGGAACCTT------------------GATA--ATTTCT------GACATGCACA---AGC----------T-A-ATA-A-----G-------C-----T-----T-A---------C-T------T-TTGAC--CT-TGATCTG-T-ATT----GCATCAGTTT----TAAGCAGACA-TGATTGGAATTGATATT
gi|158567 : ttagctCAT----------T-------C------CA-------TTTGTTCTTA-T----ATCTGAAGCT------TTG------T--T-----T--AATCATA-G-TA-----AA-TC----TT----TAAGAAGGTTAC----TCATCCGGAACGTC------------------TATA--CTTTCT------GACATGCACA---AGT----------G-A-AAT-A-----T-------T-----T-----TTAT-A--A---C-T------T-TTGAC--CT-TGACGTG-T-ACT----GCATCAGTTT----TCAGCAGACG-TGTTTGGAATCGATA
gi|158568 : ttttctcctttttttttcgcatTTTACTTATTTTTATTCTACAT----------T-------TG-A---CA-------TGTGGTCCTG-TGCTTATTTCATACTC---C-TTT------T--T-----T--TT----A-A-AC-----AA-TC----TA----TGAGAAGGTCAT----TCATCCGGAACCTC------------------TTTA--ATTT-T------GACATGCACA---AGC----------G-A-AAT-CT----T-------T-----T-----T-AT-A--A---C-
gi|158569 : TTTACTTGTTTTCGTTCTACAT----------T-------TA-A---CA-------TGCGGTCCTG-TAATGATTTTAAACTC---A-TTT------T--T-----T--AA----C-A-AA-----TT-TC----TA----TAAGAAGGGTAC----TTTTCTGTAACCGT------------------TTTA--ATTTCT------GACATG-------AGC------------------------T-------G-----T-----T-AT-C--A---TGT------T-TCGACA-CT-T--TTTG-TCATT----GCATCAGTTT----TAAGCAGACG-TG
gi|158570 : TTTACTTGTTTTCATTCTACAT----------T-------TA-A---CA-------TGTGGTCCTG-TAATGATTTTAAACTC---ATTTT------T--T-----T--AA----C-A-AA-----TT-TC----TA----TAATAGTGGTAC----TCTTCTGTAACCGC------------------TTTA--TTTTCT------GACATGAGCA---GTC----------A-T-CAT-G-----T-------T-----T-----C-GA-C--A---C-T------T-T-------T-TGTCC------TT----GCATCAGTTT----TAAGCAGA
gi|158571 : TTTGCTTGTTTTCATTCTACAT----------TGAATATATATA---TA-------TGTGGTCCTG-TGATAATTTCAAACTT---ATTTT------T--T-----T--AA----C-A-AA-----TT-TC----TATTTTTATGAAGGACAC----TCCTACGGAACCTC------------------TGTC--ATTTCT------GACATGCTTA---AAC---------------AT-A-----T-------T-----T-----T-AT-T--A---C-
gi|158572 : TTTACTTATTTCCATTCTACAT----------T-------TG-A---CA-------TGTGATTCTG-TGACCATTTCAAACTCTTTA-TAT------T--T-----T--------A-T-AA-----TT-TC----TA----TAAGAAGGGTAC----TCCTTGGGAACCTC------------------CATT--ATATCT------GACATGCGCA---GTC--------------ATT-A-----TGACA---T-----T-----C-AT-C--ATTTC-T------T-TT-AC--CT-TGACCTG-T-TAT----GTACCAACTT----TCAGCAGAC
gi|158573 : TTTACTTGTTTTCATTATACAT----------C-------TA-ATCTCAGATTATCTGTGGTCCTG-TATTGATTTTAAACAC---A-TTT------T--T-----T--AA----C-A-AA-----TT-TC----TA----TAAAAAAGTTAC----TTTTCCGTAACCGC------------------TTTA--ATTTGT------GACATGAGCA---GTC----------A-C-CAT-G-----T-------T-----T-----CGAC-A--C---T-T------T-TTGTC--CT-T----------TT------AACAGTTT----TAAGCAGACG-Taacaattgtattaattt
gi|158574 : TTTACTTATTTTCATTCTACAT----------T-------GA-A---CA-------TTTGGTCCTG-TAATGATTTTAAACTT---G-TAT------T--T--------------A-A-CA-----CA-T---------------------------TCCGCTGGAACCTC------------------TATA--ATTTCT------GACATGGGCA----------------G-ATAGTCA-----TG------C-----T-----T-AT-A--A---C-T------T-CTGAC--CT-TGACCTA-T-CAT----GCATTA
gi|158575 : TTTACTTATTTTCAT-CTACAT----------T-------TA-A---CA-------TATGGTCCTG-TGATAATTTCAAACCC---A-TTA------T--TACATGT--AA----C-A-CA-----TT-TC----TA----TAAGAAGGGTAC----TCCTACAGAACCAT------------------TATT--AT
gi|158576 : TTTACTTATTTTCATTT-------------------------------A-------T-------TG-TGATGATTTCAAACTT---G-TTT------G--T--------AA----C-A-AA-----TG-CC----TA----CTAGAAGAGTAC----TACTCCGGAA--TC------------------TATA--ATTTCT------TACATTCG-A---AGT----------C-G-GGT-A-----TG------T-----T-----T-AT-A--A---C-T------T-TTCTA--CT-TAACCTG-T-TAT----GCGTCAGTTT----T-------CG-TGGTTGGAATTGATATT
gi|158577 : CTTATTTTTATTCTACAT----------T-------TA-A---CA-------TGTGGCCCTG-TGCTAATTTCAAACTC---A-TTT------T--T-----TAAAA----A-A-AA-----CA-TC----TA----TAAGAAGGTCAC----TCATTCGGAACCTC------------------TATA--ATTACT------GACATGCAAA---AGC----------A-A-ACT-AT----T-------T-----T-----T-AT-A--A---T-T------T-TTGAC--CT-TGACCTG-T-ATT----GCATCACTTT----TCAGCA-----TGTTTGAAATGGACATT
gi|158578 : CTTATTTTCATTCTACAT----------T-------TA-A---CA-------TGTGTTCTGG-TGATAATTTTAA---C---A-CCT------T--T-----T--CAT---C-A-AA-----TT-TC----TA----TAAAAAAGGTAC----TCCTTTGTAACCTC------------------TATT--ATTTCT------AACATGCGCA---GTC----------T-T-CAT-------T-------T-----T-----T-AA-C--A---C-T------TATTGAC--CA-TGACCTG-T-TAT----GTATCAATTT----TCAGCA
gi|158579 : CTTAATTTCATTCTACATAAATTATTATT-------TA-A---CA-------TGTGGTCCTG-AGATAATTTTAA---T---A-T-------------------------------A-----TT-TC----CA----TAAGAAAGGTGT----TCCTTAAGAACCTC------------------TATA--ATTTAT------GACATGCGCA---ATC----------A-T-CAT-G-----T-------T-----T-----TGAT-A--C---T-T------T-TCTAC--CT-TGACCTG-T--TT----TCATTGATAT----TC
gi|158580 : TATTTTTATTCTACAT----------T-------TA-A---CA-------TGTGGTCCTG-TGCTACTTTCGAACTC---A-TTT------T--T-----T--AA----A-A-AA-----AA-TC----TA----TATGAAGATCAC----TCATCTGGAACCTC------------------TATA--ATTTCT------GACATGCCCA---AGT----------G-A-AAT-AT----T-------T-----T-----T-AT-A--A---C--------T-TTGGC--CT-TGACCTG-T-ATT----GCATCACTTT----TCAACAGACT-TATTTGAAATTGCTATT
gi|158581 : ATTCTAGAT----------T-------TA-C---CA-------TGTGGCTTTG-TGATAATTTCAAACTG---A-TTT------CA-T-----T--AA----C-A-AA-----TT-TC----AA----TAAGAAGGTTAC----TCTCTCGGAAACTC------------------TATA--ACTTTT------AACATGCGCA---GTT----------G----GTCA-----TG------T-----T-----T-AT-A--A---T-T------A-TTTAC--CT-TGACACG-T-TAT----GCATCAG-AT----CCGGCAAACA-TGGTTGGAATTGATATT
gi|158582 : ATTCTACGC----------T-------TA-A---CA-------TGTGATCCT-----------------C---A-TTG------T--T-----T--AA----C-A-AA-----TT-T-----TA----TGAGAAGTGTTC----TCCTAAGGAACCT--------------------ATA--ATTTCT------GACATGCGT------C----------G-T-CAT-T-----T-------T-----T-----T-TTCA--G---T-T------T-CTAAC--CTGTGACCTG-T-TAT----GCATCAGTTT----TCAGCAGACA-ACTATGGAATTAATATT
gi|158583 : GTTTTGATGATCAATTCAAACTC---A-TTT------T--T---------A----A-A-AA-----TT-TC----TA----TAAGAAGGGTAC----TCCTCCAGAACCTC------------------TAGA--ATTTCA------GATATGCGC------C----------G-T-CATCA-----TG------T-----T-----T-AT-A--AT--C-T------T-TTGAC--CG-TGACCTA-T-A
gi|158584 : ttctgcttttattgtgatgttattttCAT----------T-------TA-A---CA-------TGTTGT-----TGATCATT-CAAACTC---A-TTT------T--T-----T--CA----C-A-AA-----TT-TC----TA----TAAGAAGAGTAA----AACTCCAGAACCTC------------------TATA--ATGTCT------GACATGTGCA---A
gi|158585 : T----------T-------TA-A---TA-------TATGGCCCTG-TGCCAATTTCAAACTC---A-TTT------T--T-----A--AA----A-A-AA-----AAATC----TG----TAAGAAGGTCAC----TCATACGGAACCTC------------------TA----ATTTCT------GACATTTACA---AGC----------G-T-AATCA-----T-------T-----T-----T-AT-AGTA---C-CGGGGTAT-TTGTC--TT-TGACCTT-T-ATT----GCATCAGTTT----TCAGCAGACG-TGTTCGAAATCGATATT
gi|158586 : A-------TGTGGTCTTG-TGATAATTT-----TC---T-TTT------T--T-----T--AA----A-A---------T-TC----TA----CAAGAAGGATAC----TCCCCCG-AACCTCTATAATTTATGACATGCTTATA--ACTTTTTACCTTGACATGCTTAT--AACTTTTTACCTTG-A-CAT-G-----C-------T-----T-------AT-A--A---C-T------T-TTTAC--CT-TGACATGTT-ATT-----CATCAGTTT----TCAGAAGACA-TGTTTGGAATAAATATT
gi|158587 : TCCTG-TGCTTATTTCAAACTT---G-TAT------T--T-----C--AA----A-A-AA-----AA-TC----TA----TAAGAAGCTCAC----TCTTCCGGAACCTC------------------TATG--TTTTCT------GACATGC------AAT----------A-A-AAT-C-----T-------T-----T-----TTAT-A--A---C-T------T-TTGAC--CT-TGACCTT-T-ATT----GCATCAGTTT----TTAGCAGTCG-TGTTTGAAATCGATATT
gi|158588 : TCCTA-TGATAATTTCAATGTC---A-GTT------T--T-----C--AA----A-ACAA-----AA-TC----TA----TAAGAAGGGTGC----TCCTCTAGAGCCTC------------------AATA--TCTTTT------GAGATGCGCT---CTC------------------A-----T-------TTCCAGT-----T-GT-C--A---C-TA-----C-TTGAC--CT-TGACC------TT----GCATATATTTACTATCAGCAGACGACG-TTGGAATTAATGTT
gi|158589 : TCCTA-TGATAATTTCAATGTC---A-GTT------T--T-----C--AA----A-A-AA-----A--TC----TA----TAAGAAGGGTGC----TCCTCTAGAGCCTC------------------AATA--TCTTTT------GAGATGCGCT---CTC------------------A-----C-------T-----TCCGGCT-GT-C--A---C-TA-----C-TTGAC--CT-TGACC-----A-T----GCATATATTTACTATCAGCAGACGACG-TTGGAATTAATTTT
gi|158590 : TC---A-TTT------T--T-----T--AA----C-A-AA-----TT-TC----TA----TAAGAAGGGTAC----TCCACAGGAACCTC------------------TATA--ATTTCA------GACATGCGCA----------------G-A-AAT-ACATGCT-------TA----T-----T-AC-A--A---C-T------T-TTGACTATC-TAACAGG-T-ATCATGAGCATTATTTT----TTA
gi|158591 : ttcatgA----TAAGAAGGGTAC----TCCTCCGTAACCTC------------------CTTA--GCTTCT------GACATGCCCAGTCAGC----------T-A-AGC-A-----T---------------------AT-A--A---C-T------T-TTGAC--AT-TGACTTA-T-TAT----GCATAAGCTT----TCAGAAAGCG-AGGTTGGACTTGATA
gi|158592 : AT----TCTTCTGAATCATC------------------TGTA--ATTTCT------GGTATATGC------C----------C-A-GTT-A-----TCATGACGT-----T-----T-AT-C--A---CTT------T-TTGAC--CT-TGATCTGCT-A-T----GCATCAGTTT----TTTGCAGATGACG-ATGGAATTTATATT
gi|158593 : tcTTCT------GACATGCACA---GTC---------------ATCA-----TG------T-----T-----T-AT-A--A---C-TG-----T-TTTAC--CT-CGACTTA-T-TAT----GCATCAGTTT----TCAGAAGACC-TGGTTGGAACTGATATT
gi|158594 : -------T-----T-----T-AT-A--A---C-T------T-GTGAT--CT-TAACCTG-T-ATT----GTATCAGTTT----TCAGCAGACG-TGCTAGGAATTGATAT
Alignments
lowQualScore : 33333333333333333333333333333333333333
lowQualScore : 6666666666 5555555 1 222 4444444 1 1 0 1 222 2 333333 33 55555555 666666 1 88888888 2222 2222 1 2222 0 888888888888888888 11 333333 0 22222222222222222222222222222222222222 55555 22222 5 1 11 333 2 777777 1 33 1 2 555 2222 5555 4 5 3
lowQualScore : .......... ....... . ... ....... . . . . ... . ...... .. ........ ...... . ........ .... .... . .... . .................. .. ...... . ...................................... ..... ..... . . .. ... . ...... . .. . . ... .... .... . . .
lowQualScore : 7777777777 0000000 5 777 8888888 3 7 6 2 222 5 666666 00 88888888 777777 2 00000000 7777 6666 4 5555 6 777777777777777777 66 444444 3 22222222222222222222222222222222222222 33333 99999 9 2 66 222 4 333333 2 00 2 5 111 7777 7777 8 0 1
consensus : TTTACTTATTTTCATTCTACAT----------T-------TA-A---CA-------TGTGGTCCTG-TGATAATTTCAAACTC---A-TTT------T--T-----T--AA----A-A-AA-----NN-TC----TA----TAAGAAGGNTAC----TCCTCCGGAACCTC------------------TATA--ATTTCT------GACATGCGCA---AGC----------G-A-AAT-A-----T-------T-----T-----T-AT-A--A---C-T------T-TTGAC--CT-TGACCTG-T-ATT----GCATCAGTTT----TCAGCAGACG-TGTTTGGAATCGATATT
Reference ( family-581 ) : TTTACTTATTTTCATTCTACAT----------T-------TA-A---CA-------TGTGGTCCTG-TGATAATTTCAAACTC---A-TTT------T--T-----T--AA----A-A-AA-----NN-TC----TA----TAAGAAGGNTAC----TCCTCCGGAACCTC------------------TATA--ATTTCT------GACATGCGCA---AGC----------G-A-AAT-A-----T-------T-----T-----T-AT-A--A---C-T------T-TTGAC--CT-TGACCTG-T-ATT----GCATCAGTTT----TCAGCAGACG-TGTTTGGAATCGATATT
gi|158559 : TTTGCTTGTTTTTATTCTACAT----------T-------TA-A----A-------TGTGGTCCTG-TACTAATTTCAATCTC---A-TTC------T--T-----A--AA----A-A-AA-----AA-TC----TA----TAAGAAGGTCAC----TCGTCCGGAACCTC------------------AATA--ATTTCT------GACATGCACA---AGC----------G-A-AAT-A-----T-------T-----T-----T-AT-A--A---C-T------T-TCGAC--CT-TGACCTG-T-ATT----GCATCAGTTT----TCAGCAGACG-TGTATGAAATCGATATT
gi|158560 : TTTGCTTGTTTTTATTCTACAT----------T-------TA-A----A-------TGTGGTCCTG-TACTAATTTCAATCTC---A-TTC------T--T-----A--AA----A-A-AA-----AA-TC----TA----TAAAAAGGTCAC----TCGTCCGGAACCTC------------------GATA--ATTTCT------GACATGCACA---AGC----------G-A-AAT-A-----T-------T-----T-----T-AT-A--A---C-T------T-TCGAC--CT-TGACCTG-T-ATT----GCATCAGTTT----TCAGCAGACG-TGTATGAAATCGATATT
gi|158561 : TTTGCTTGTTTTTATTCTACAT----------T-------TA-A----A-------TGTGGTCCTG-TACTAATTTCAATCTC---A-TTC------T--T-----T--AA----ACA-AA-----AA-TC----TA----TAAGAAGGTCAC----TCGTCCGGAACTTC------------------GATA--ATTTCT------GACATGCACA---AGC----------A-A-AAT-A-----T-------T-----T-----T-AT-A--A---C-T------T-TCGAC--CT-TGACCTG-T-ATT----GCATCAG-TT----TCAGCAGACG-TGTATGAAATCGATATT
gi|158562 : TTTACTTATTTTTATTCTACAT----------T-------CA-A---CA-------TGTGGTCCTG-TGCTTATTTCAACCTC---A-TTT------T--T-----A--AA----A-A-AAAATCTAA-TC----TA----TAAGAAGGTTAC----TCATCCAGAACCT-------------------TATGTTATTTCT------GACATGCACA---AGT----------G-A-AAT-C-----T-------T-----T-----TCCT-T--A---T-T------T-TTTAC--CT-TGACCTG-T-ACT----GCAACAGTTT----TCAGCAGACG-TGT
gi|158563 : TTTACTTATTTTCATTCTACAT----------T-------TA-A---GA-------TGTGGTCCTG-TGATATTTTCTAACTC---G-TTT------T--T-----T--AA----C-A-AA-----TT-TCTATTTA----TAAGAAGGCTACTCGATCCTCTGGAACCTC------------------TATA--ATTTCT------GACAT--GCA---AGC----------GAA-AAA-A-----G-------T-----T-----T-AT-A--A---C-T------T-TTGAC--CT-TGACCTG-T-ATT----TCATCAGTTT----TCAGCAGACA-T
gi|158564 : TTTACTTATTTT-ATTCTACAT----------T-------TA-A---CA-------TGTGATTTTG-TGGTAATTTCAAACTC---A-TAT------T--T-----T--AA----C-A-AA-----TT-TC----TG----TAAGAAGGTTTC----TTTTCTGGAACCTT------------------TATA--ATACCG------GACATGCGCAGT-AG-----------G-T-GAT-A-----T-------TA----T-----T-AT-A--A---C-T------T-TTGAC--CT-TGACATG-T-TTT----GCATCAGTTT----TTAGCAGATG-TGGTTGGAAT-GATATTtgatattcat
gi|158565 : TTTACTTATTTTTATTTTACAT----------T-------TA-A---CA-------TGTGGTCATG-TGTTAATTTCAAACTC---A-TTTATTTTTT--T-----T--AA----A-A-AA-----TG-T------A----TAAGA---TTAC----TCATCCGGAACCTT------------------TATA--ATTTCA------GACATTTACA---AGC----------G-A-AAT-T-----T-------T-----T-----T--T-A---------------------------TAACCTG-T-ATT----GCATCAGTTT----TCAGCTGATG-TGTTTGAAATCGTTATT
gi|158566 : TTATTT-CATTCTACAT----------T-------TA-A---CA-------TGACAT--TG-TGATCATTACAAACTC---A-TTT------AAAT-----T--AA----A-A-AA-----AT-TC----TA----AAAGGAGGCTTC----TCCTCAGGAACCTT------------------GATA--ATTTCT------GACATGCACA---AGC----------T-A-ATA-A-----G-------C-----T-----T-A---------C-T------T-TTGAC--CT-TGATCTG-T-ATT----GCATCAGTTT----TAAGCAGACA-TGATTGGAATTGATATT
gi|158567 : ttagctCAT----------T-------C------CA-------TTTGTTCTTA-T----ATCTGAAGCT------TTG------T--T-----T--AATCATA-G-TA-----AA-TC----TT----TAAGAAGGTTAC----TCATCCGGAACGTC------------------TATA--CTTTCT------GACATGCACA---AGT----------G-A-AAT-A-----T-------T-----T-----TTAT-A--A---C-T------T-TTGAC--CT-TGACGTG-T-ACT----GCATCAGTTT----TCAGCAGACG-TGTTTGGAATCGATA
gi|158568 : ttttctcctttttttttcgcatTTTACTTATTTTTATTCTACAT----------T-------TG-A---CA-------TGTGGTCCTG-TGCTTATTTCATACTC---C-TTT------T--T-----T--TT----A-A-AC-----AA-TC----TA----TGAGAAGGTCAT----TCATCCGGAACCTC------------------TTTA--ATTT-T------GACATGCACA---AGC----------G-A-AAT-CT----T-------T-----T-----T-AT-A--A---C-
gi|158569 : TTTACTTGTTTTCGTTCTACAT----------T-------TA-A---CA-------TGCGGTCCTG-TAATGATTTTAAACTC---A-TTT------T--T-----T--AA----C-A-AA-----TT-TC----TA----TAAGAAGGGTAC----TTTTCTGTAACCGT------------------TTTA--ATTTCT------GACATG-------AGC------------------------T-------G-----T-----T-AT-C--A---TGT------T-TCGACA-CT-T--TTTG-TCATT----GCATCAGTTT----TAAGCAGACG-TG
gi|158570 : TTTACTTGTTTTCATTCTACAT----------T-------TA-A---CA-------TGTGGTCCTG-TAATGATTTTAAACTC---ATTTT------T--T-----T--AA----C-A-AA-----TT-TC----TA----TAATAGTGGTAC----TCTTCTGTAACCGC------------------TTTA--TTTTCT------GACATGAGCA---GTC----------A-T-CAT-G-----T-------T-----T-----C-GA-C--A---C-T------T-T-------T-TGTCC------TT----GCATCAGTTT----TAAGCAGA
gi|158571 : TTTGCTTGTTTTCATTCTACAT----------TGAATATATATA---TA-------TGTGGTCCTG-TGATAATTTCAAACTT---ATTTT------T--T-----T--AA----C-A-AA-----TT-TC----TATTTTTATGAAGGACAC----TCCTACGGAACCTC------------------TGTC--ATTTCT------GACATGCTTA---AAC---------------AT-A-----T-------T-----T-----T-AT-T--A---C-
gi|158572 : TTTACTTATTTCCATTCTACAT----------T-------TG-A---CA-------TGTGATTCTG-TGACCATTTCAAACTCTTTA-TAT------T--T-----T--------A-T-AA-----TT-TC----TA----TAAGAAGGGTAC----TCCTTGGGAACCTC------------------CATT--ATATCT------GACATGCGCA---GTC--------------ATT-A-----TGACA---T-----T-----C-AT-C--ATTTC-T------T-TT-AC--CT-TGACCTG-T-TAT----GTACCAACTT----TCAGCAGAC
gi|158573 : TTTACTTGTTTTCATTATACAT----------C-------TA-ATCTCAGATTATCTGTGGTCCTG-TATTGATTTTAAACAC---A-TTT------T--T-----T--AA----C-A-AA-----TT-TC----TA----TAAAAAAGTTAC----TTTTCCGTAACCGC------------------TTTA--ATTTGT------GACATGAGCA---GTC----------A-C-CAT-G-----T-------T-----T-----CGAC-A--C---T-T------T-TTGTC--CT-T----------TT------AACAGTTT----TAAGCAGACG-Taacaattgtattaattt
gi|158574 : TTTACTTATTTTCATTCTACAT----------T-------GA-A---CA-------TTTGGTCCTG-TAATGATTTTAAACTT---G-TAT------T--T--------------A-A-CA-----CA-T---------------------------TCCGCTGGAACCTC------------------TATA--ATTTCT------GACATGGGCA----------------G-ATAGTCA-----TG------C-----T-----T-AT-A--A---C-T------T-CTGAC--CT-TGACCTA-T-CAT----GCATTA
gi|158575 : TTTACTTATTTTCAT-CTACAT----------T-------TA-A---CA-------TATGGTCCTG-TGATAATTTCAAACCC---A-TTA------T--TACATGT--AA----C-A-CA-----TT-TC----TA----TAAGAAGGGTAC----TCCTACAGAACCAT------------------TATT--AT
gi|158576 : TTTACTTATTTTCATTT-------------------------------A-------T-------TG-TGATGATTTCAAACTT---G-TTT------G--T--------AA----C-A-AA-----TG-CC----TA----CTAGAAGAGTAC----TACTCCGGAA--TC------------------TATA--ATTTCT------TACATTCG-A---AGT----------C-G-GGT-A-----TG------T-----T-----T-AT-A--A---C-T------T-TTCTA--CT-TAACCTG-T-TAT----GCGTCAGTTT----T-------CG-TGGTTGGAATTGATATT
gi|158577 : CTTATTTTTATTCTACAT----------T-------TA-A---CA-------TGTGGCCCTG-TGCTAATTTCAAACTC---A-TTT------T--T-----TAAAA----A-A-AA-----CA-TC----TA----TAAGAAGGTCAC----TCATTCGGAACCTC------------------TATA--ATTACT------GACATGCAAA---AGC----------A-A-ACT-AT----T-------T-----T-----T-AT-A--A---T-T------T-TTGAC--CT-TGACCTG-T-ATT----GCATCACTTT----TCAGCA-----TGTTTGAAATGGACATT
gi|158578 : CTTATTTTCATTCTACAT----------T-------TA-A---CA-------TGTGTTCTGG-TGATAATTTTAA---C---A-CCT------T--T-----T--CAT---C-A-AA-----TT-TC----TA----TAAAAAAGGTAC----TCCTTTGTAACCTC------------------TATT--ATTTCT------AACATGCGCA---GTC----------T-T-CAT-------T-------T-----T-----T-AA-C--A---C-T------TATTGAC--CA-TGACCTG-T-TAT----GTATCAATTT----TCAGCA
gi|158579 : CTTAATTTCATTCTACATAAATTATTATT-------TA-A---CA-------TGTGGTCCTG-AGATAATTTTAA---T---A-T-------------------------------A-----TT-TC----CA----TAAGAAAGGTGT----TCCTTAAGAACCTC------------------TATA--ATTTAT------GACATGCGCA---ATC----------A-T-CAT-G-----T-------T-----T-----TGAT-A--C---T-T------T-TCTAC--CT-TGACCTG-T--TT----TCATTGATAT----TC
gi|158580 : TATTTTTATTCTACAT----------T-------TA-A---CA-------TGTGGTCCTG-TGCTACTTTCGAACTC---A-TTT------T--T-----T--AA----A-A-AA-----AA-TC----TA----TATGAAGATCAC----TCATCTGGAACCTC------------------TATA--ATTTCT------GACATGCCCA---AGT----------G-A-AAT-AT----T-------T-----T-----T-AT-A--A---C--------T-TTGGC--CT-TGACCTG-T-ATT----GCATCACTTT----TCAACAGACT-TATTTGAAATTGCTATT
gi|158581 : ATTCTAGAT----------T-------TA-C---CA-------TGTGGCTTTG-TGATAATTTCAAACTG---A-TTT------CA-T-----T--AA----C-A-AA-----TT-TC----AA----TAAGAAGGTTAC----TCTCTCGGAAACTC------------------TATA--ACTTTT------AACATGCGCA---GTT----------G----GTCA-----TG------T-----T-----T-AT-A--A---T-T------A-TTTAC--CT-TGACACG-T-TAT----GCATCAG-AT----CCGGCAAACA-TGGTTGGAATTGATATT
gi|158582 : ATTCTACGC----------T-------TA-A---CA-------TGTGATCCT-----------------C---A-TTG------T--T-----T--AA----C-A-AA-----TT-T-----TA----TGAGAAGTGTTC----TCCTAAGGAACCT--------------------ATA--ATTTCT------GACATGCGT------C----------G-T-CAT-T-----T-------T-----T-----T-TTCA--G---T-T------T-CTAAC--CTGTGACCTG-T-TAT----GCATCAGTTT----TCAGCAGACA-ACTATGGAATTAATATT
gi|158583 : GTTTTGATGATCAATTCAAACTC---A-TTT------T--T---------A----A-A-AA-----TT-TC----TA----TAAGAAGGGTAC----TCCTCCAGAACCTC------------------TAGA--ATTTCA------GATATGCGC------C----------G-T-CATCA-----TG------T-----T-----T-AT-A--AT--C-T------T-TTGAC--CG-TGACCTA-T-A
gi|158584 : ttctgcttttattgtgatgttattttCAT----------T-------TA-A---CA-------TGTTGT-----TGATCATT-CAAACTC---A-TTT------T--T-----T--CA----C-A-AA-----TT-TC----TA----TAAGAAGAGTAA----AACTCCAGAACCTC------------------TATA--ATGTCT------GACATGTGCA---A
gi|158585 : T----------T-------TA-A---TA-------TATGGCCCTG-TGCCAATTTCAAACTC---A-TTT------T--T-----A--AA----A-A-AA-----AAATC----TG----TAAGAAGGTCAC----TCATACGGAACCTC------------------TA----ATTTCT------GACATTTACA---AGC----------G-T-AATCA-----T-------T-----T-----T-AT-AGTA---C-CGGGGTAT-TTGTC--TT-TGACCTT-T-ATT----GCATCAGTTT----TCAGCAGACG-TGTTCGAAATCGATATT
gi|158586 : A-------TGTGGTCTTG-TGATAATTT-----TC---T-TTT------T--T-----T--AA----A-A---------T-TC----TA----CAAGAAGGATAC----TCCCCCG-AACCTCTATAATTTATGACATGCTTATA--ACTTTTTACCTTGACATGCTTAT--AACTTTTTACCTTG-A-CAT-G-----C-------T-----T-------AT-A--A---C-T------T-TTTAC--CT-TGACATGTT-ATT-----CATCAGTTT----TCAGAAGACA-TGTTTGGAATAAATATT
gi|158587 : TCCTG-TGCTTATTTCAAACTT---G-TAT------T--T-----C--AA----A-A-AA-----AA-TC----TA----TAAGAAGCTCAC----TCTTCCGGAACCTC------------------TATG--TTTTCT------GACATGC------AAT----------A-A-AAT-C-----T-------T-----T-----TTAT-A--A---C-T------T-TTGAC--CT-TGACCTT-T-ATT----GCATCAGTTT----TTAGCAGTCG-TGTTTGAAATCGATATT
gi|158588 : TCCTA-TGATAATTTCAATGTC---A-GTT------T--T-----C--AA----A-ACAA-----AA-TC----TA----TAAGAAGGGTGC----TCCTCTAGAGCCTC------------------AATA--TCTTTT------GAGATGCGCT---CTC------------------A-----T-------TTCCAGT-----T-GT-C--A---C-TA-----C-TTGAC--CT-TGACC------TT----GCATATATTTACTATCAGCAGACGACG-TTGGAATTAATGTT
gi|158589 : TCCTA-TGATAATTTCAATGTC---A-GTT------T--T-----C--AA----A-A-AA-----A--TC----TA----TAAGAAGGGTGC----TCCTCTAGAGCCTC------------------AATA--TCTTTT------GAGATGCGCT---CTC------------------A-----C-------T-----TCCGGCT-GT-C--A---C-TA-----C-TTGAC--CT-TGACC-----A-T----GCATATATTTACTATCAGCAGACGACG-TTGGAATTAATTTT
gi|158590 : TC---A-TTT------T--T-----T--AA----C-A-AA-----TT-TC----TA----TAAGAAGGGTAC----TCCACAGGAACCTC------------------TATA--ATTTCA------GACATGCGCA----------------G-A-AAT-ACATGCT-------TA----T-----T-AC-A--A---C-T------T-TTGACTATC-TAACAGG-T-ATCATGAGCATTATTTT----TTA
gi|158591 : ttcatgA----TAAGAAGGGTAC----TCCTCCGTAACCTC------------------CTTA--GCTTCT------GACATGCCCAGTCAGC----------T-A-AGC-A-----T---------------------AT-A--A---C-T------T-TTGAC--AT-TGACTTA-T-TAT----GCATAAGCTT----TCAGAAAGCG-AGGTTGGACTTGATA
gi|158592 : AT----TCTTCTGAATCATC------------------TGTA--ATTTCT------GGTATATGC------C----------C-A-GTT-A-----TCATGACGT-----T-----T-AT-C--A---CTT------T-TTGAC--CT-TGATCTGCT-A-T----GCATCAGTTT----TTTGCAGATGACG-ATGGAATTTATATT
gi|158593 : tcTTCT------GACATGCACA---GTC---------------ATCA-----TG------T-----T-----T-AT-A--A---C-TG-----T-TTTAC--CT-CGACTTA-T-TAT----GCATCAGTTT----TCAGAAGACC-TGGTTGGAACTGATATT
gi|158594 : -------T-----T-----T-AT-A--A---C-T------T-GTGAT--CT-TAACCTG-T-ATT----GTATCAGTTT----TCAGCAGACG-TGCTAGGAATTGATAT
blockSeqs : AAATTATTAT GAATATA T TCT GATTATC A C T TTT T ATTTTT AA ACATGT TCATA C AATCTAA TATT TTTT T TCGA TATAATTTATGACATGCT TT TACCTT TAACTTTTTACCTTGACATGC TCCAG CCGGC C C GT TTT G GGGGTA A TA G T CAT ATGA ACTA A T C
blockSeqs : . . . . . . C T . T . A TAA AC . AAA . . T . . . . CCAGTTATCATGACG A . T . . T T A . A . C AT . ACTA A T C
blockSeqs : . . . . . . C C . . . . A TC . AA . . T . . . . GTCAGCTAAGCAT A . G . . . . A . . . . AT . . A T C
blockSeqs : . . . . . . A A . . . . T A . AA . . C . . . . GTCATTATGACA . . G . . . . G . . . . AC . . . G T
blockSeqs : . . . . . . G A . . . . A A . TT . . T . . . . GAAATACATGCT . . T . . . . . . . . . AT . . . T C
blockSeqs : . . . . . . T A . . . . T C . TT . . T . . . . AGCGAAAAAAG . . . . . . . . . . . . TT . . . A T
blockSeqs : . . . . . . A A . . . . T C . TG . . C . . . . GTAGGTGATAT . . . . . . . . . . . . AT . . . T G
blockSeqs : . . . . . . C G . . . . T A . AT . . T . . . . AGCGAAATCTT . . . . . . . . . . . . AT . . . G T
blockSeqs : . . . . . . A A . . . . T A . AA . . T . . . . AGTCGGGTATG . . . . . . . . . . . . AC . . . T T
blockSeqs : . . . . . . A A . . . . T A . AA . . G . . . . AGCAAACTATT . . . . . . . . . . . . TA . . . T T
blockSeqs : . . . . . . A A . . . . T C . TT . . G . . . . AGTGAAATATT . . . . . . . . . . . . CA . . . G C
blockSeqs : . . . . . . A A . . . . T C . TT . . A . . . . AGCGTAATCAT . . . . . . . . . . . . TA . . . T A
blockSeqs : . . . . . . T A . . . . T C . TT . . G . . . . AGCGAAATAT . . . . . . . . . . . . AT . . . T C
blockSeqs : . . . . . . A A . . . . T A . TT . . T . . . . AGCAAAATAT . . . . . . . . . . . . TA . . . T T
blockSeqs : . . . . . . A A . . . . T C . TT . . G . . . . AGTGAAATCT . . . . . . . . . . . . AT . . . T T
blockSeqs : . . . . . . A A . . . . T A . CA . . G . . . . AGCGAAATTT . . . . . . . . . . . . TA . . . G T
blockSeqs : . . . . . . C A . . . . T C . TT . . T . . . . AGCTAATAAG . . . . . . . . . . . . TA . . . G T
blockSeqs : . . . . . . A A . . . . T C . TG . . G . . . . AGTGAAATAT . . . . . . . . . . . . AT . . . C T
blockSeqs : . . . . . . A A . . . . T A . CA . . G . . . . GTCATCATGT . . . . . . . . . . . . AT . . . . T
blockSeqs : . . . . . . C A . . . . T A . TT . . T . . . . GTCACCATGT . . . . . . . . . . . . AT . . . . .
blockSeqs : . . . . . . A A . . . . T C . TT . . T . . . . GATAGTCATG . . . . . . . . . . . . AT . . . .
blockSeqs : . . . . . . A A . . . . A C . AA . . G . . . . ATCATCATGT . . . . . . . . . . . . TA . . .
blockSeqs : . . . . . . A A . . . . T A . TT . . G . . . . GTTGGTCATG . . . . . . . . . . . . TA . . .
blockSeqs : . . . . . . C A . . . . C C . TT . . G . . . . CGTCATCATG . . . . . . . . . . . . AT . . .
blockSeqs : . . . . . . A T . . . . C A . TT . . T . . . . AATAAAATCT . . . . . . . . . . . . T . .
blockSeqs : . . C T . . . . C A . TT . . A . . . . GTCTTCATT . . . . . . . . . . . . T . .
blockSeqs : . A . . . . . T A . AA . . T . . . . GTCATCATG . . . . . . . . . . . . T . .
blockSeqs : . A . . . . . . A . AA . . G . . . . CGTCATTT . . . . . . . . . . . . T . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . TT . . G . . . . AACATAT . . . . . . . . . . . . A . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . T . . G . . . . CTCAT . . . . . . . . . . . . A .
blockSeqs : . . . . . . . A . . G . . . . CTCAC . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . AGCT . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : TTTACTTATTTTCATTCTACAT----------T-------TA-A---CA-------TGTGGTCCTG-TGATAATTTCAAACTC---A-TTT------T--T-----T--AA----A-A-AA-----NN-TC----TA----TAAGAAGGNTAC----TCCTCCGGAACCTC------------------TATA--ATTTCT------GACATGCGCA---AGC----------G-A-AAT-A-----T-------T-----T-----T-AT-A--A---C-T------T-TTGAC--CT-TGACCTG-T-ATT----GCATCAGTTT----TCAGCAGACG-TGTTTGGAATCGATATT
finalCons : TTTACTTATTTTCATTCTACAT----------T-------TA-A---CA-------TGTGGTCCTG-TGATAATTTCAAACTC---A-TTT------T--T-----T--AA----A-A-AA-----NN-TC----TA----TAAGAAGGNTAC----TCCTCCGGAACCTC------------------TATA--ATTTCT------GACATGCGCA---AGC----------G-A-AAT-A-----T-------T-----T-----T-AT-A--A---C-T------T-TTGAC--CT-TGACCTG-T-ATT----GCATCAGTTT----TCAGCAGACG-TGTTTGGAATCGATATT
Alignments
lowQualScore : 33333333333333333333333333333333333333
lowQualScore : 6666666666 5555555 1 222 4444444 1 1 0 1 222 2 333333 33 55555555 666666 1 88888888 2222 2222 1 2222 0 888888888888888888 11 333333 0 22222222222222222222222222222222222222 55555 22222 5 1 11 333 2 777777 1 33 1 2 555 2222 5555 4 5 3
lowQualScore : .......... ....... . ... ....... . . . . ... . ...... .. ........ ...... . ........ .... .... . .... . .................. .. ...... . ...................................... ..... ..... . . .. ... . ...... . .. . . ... .... .... . . .
lowQualScore : 7777777777 0000000 5 777 8888888 3 7 6 2 222 5 666666 00 88888888 777777 2 00000000 7777 6666 4 5555 6 777777777777777777 66 444444 3 22222222222222222222222222222222222222 33333 99999 9 2 66 222 4 333333 2 00 2 5 111 7777 7777 8 0 1
consensus : TTTACTTATTTTCATTCTACAT----------T-------TA-A---CA-------TGTGGTCCTG-TGATAATTTCAAACTC---A-TTT------T--T-----T--AA----A-A-AA-----NN-TC----TA----TAAGAAGGNTAC----TCCTCCGGAACCTC------------------TATA--ATTTCT------GACATGCGCA---AGC----------G-A-AAT-A-----T-------T-----T-----T-AT-A--A---C-T------T-TTGAC--CT-TGACCTG-T-ATT----GCATCAGTTT----TCAGCAGACG-TGTTTGGAATCGATATT
Reference ( family-581 ) : TTTACTTATTTTCATTCTACAT----------T-------TA-A---CA-------TGTGGTCCTG-TGATAATTTCAAACTC---A-TTT------T--T-----T--AA----A-A-AA-----NN-TC----TA----TAAGAAGGNTAC----TCCTCCGGAACCTC------------------TATA--ATTTCT------GACATGCGCA---AGC----------G-A-AAT-A-----T-------T-----T-----T-AT-A--A---C-T------T-TTGAC--CT-TGACCTG-T-ATT----GCATCAGTTT----TCAGCAGACG-TGTTTGGAATCGATATT
gi|158559 : TTTGCTTGTTTTTATTCTACAT----------T-------TA-A----A-------TGTGGTCCTG-TACTAATTTCAATCTC---A-TTC------T--T-----A--AA----A-A-AA-----AA-TC----TA----TAAGAAGGTCAC----TCGTCCGGAACCTC------------------AATA--ATTTCT------GACATGCACA---AGC----------G-A-AAT-A-----T-------T-----T-----T-AT-A--A---C-T------T-TCGAC--CT-TGACCTG-T-ATT----GCATCAGTTT----TCAGCAGACG-TGTATGAAATCGATATT
gi|158560 : TTTGCTTGTTTTTATTCTACAT----------T-------TA-A----A-------TGTGGTCCTG-TACTAATTTCAATCTC---A-TTC------T--T-----A--AA----A-A-AA-----AA-TC----TA----TAAAAAGGTCAC----TCGTCCGGAACCTC------------------GATA--ATTTCT------GACATGCACA---AGC----------G-A-AAT-A-----T-------T-----T-----T-AT-A--A---C-T------T-TCGAC--CT-TGACCTG-T-ATT----GCATCAGTTT----TCAGCAGACG-TGTATGAAATCGATATT
gi|158561 : TTTGCTTGTTTTTATTCTACAT----------T-------TA-A----A-------TGTGGTCCTG-TACTAATTTCAATCTC---A-TTC------T--T-----T--AA----ACA-AA-----AA-TC----TA----TAAGAAGGTCAC----TCGTCCGGAACTTC------------------GATA--ATTTCT------GACATGCACA---AGC----------A-A-AAT-A-----T-------T-----T-----T-AT-A--A---C-T------T-TCGAC--CT-TGACCTG-T-ATT----GCATCAG-TT----TCAGCAGACG-TGTATGAAATCGATATT
gi|158562 : TTTACTTATTTTTATTCTACAT----------T-------CA-A---CA-------TGTGGTCCTG-TGCTTATTTCAACCTC---A-TTT------T--T-----A--AA----A-A-AAAATCTAA-TC----TA----TAAGAAGGTTAC----TCATCCAGAACCT-------------------TATGTTATTTCT------GACATGCACA---AGT----------G-A-AAT-C-----T-------T-----T-----TCCT-T--A---T-T------T-TTTAC--CT-TGACCTG-T-ACT----GCAACAGTTT----TCAGCAGACG-TGT
gi|158563 : TTTACTTATTTTCATTCTACAT----------T-------TA-A---GA-------TGTGGTCCTG-TGATATTTTCTAACTC---G-TTT------T--T-----T--AA----C-A-AA-----TT-TCTATTTA----TAAGAAGGCTACTCGATCCTCTGGAACCTC------------------TATA--ATTTCT------GACAT--GCA---AGC----------GAA-AAA-A-----G-------T-----T-----T-AT-A--A---C-T------T-TTGAC--CT-TGACCTG-T-ATT----TCATCAGTTT----TCAGCAGACA-T
gi|158564 : TTTACTTATTTT-ATTCTACAT----------T-------TA-A---CA-------TGTGATTTTG-TGGTAATTTCAAACTC---A-TAT------T--T-----T--AA----C-A-AA-----TT-TC----TG----TAAGAAGGTTTC----TTTTCTGGAACCTT------------------TATA--ATACCG------GACATGCGCAGT-AG-----------G-T-GAT-A-----T-------TA----T-----T-AT-A--A---C-T------T-TTGAC--CT-TGACATG-T-TTT----GCATCAGTTT----TTAGCAGATG-TGGTTGGAAT-GATATTtgatattcat
gi|158565 : TTTACTTATTTTTATTTTACAT----------T-------TA-A---CA-------TGTGGTCATG-TGTTAATTTCAAACTC---A-TTTATTTTTT--T-----T--AA----A-A-AA-----TG-T------A----TAAGA---TTAC----TCATCCGGAACCTT------------------TATA--ATTTCA------GACATTTACA---AGC----------G-A-AAT-T-----T-------T-----T-----T--T-A---------------------------TAACCTG-T-ATT----GCATCAGTTT----TCAGCTGATG-TGTTTGAAATCGTTATT
gi|158566 : TTATTT-CATTCTACAT----------T-------TA-A---CA-------TGACAT--TG-TGATCATTACAAACTC---A-TTT------AAAT-----T--AA----A-A-AA-----AT-TC----TA----AAAGGAGGCTTC----TCCTCAGGAACCTT------------------GATA--ATTTCT------GACATGCACA---AGC----------T-A-ATA-A-----G-------C-----T-----T-A---------C-T------T-TTGAC--CT-TGATCTG-T-ATT----GCATCAGTTT----TAAGCAGACA-TGATTGGAATTGATATT
gi|158567 : ttagctCAT----------T-------C------CA-------TTTGTTCTTA-T----ATCTGAAGCT------TTG------T--T-----T--AATCATA-G-TA-----AA-TC----TT----TAAGAAGGTTAC----TCATCCGGAACGTC------------------TATA--CTTTCT------GACATGCACA---AGT----------G-A-AAT-A-----T-------T-----T-----TTAT-A--A---C-T------T-TTGAC--CT-TGACGTG-T-ACT----GCATCAGTTT----TCAGCAGACG-TGTTTGGAATCGATA
gi|158568 : ttttctcctttttttttcgcatTTTACTTATTTTTATTCTACAT----------T-------TG-A---CA-------TGTGGTCCTG-TGCTTATTTCATACTC---C-TTT------T--T-----T--TT----A-A-AC-----AA-TC----TA----TGAGAAGGTCAT----TCATCCGGAACCTC------------------TTTA--ATTT-T------GACATGCACA---AGC----------G-A-AAT-CT----T-------T-----T-----T-AT-A--A---C-
gi|158569 : TTTACTTGTTTTCGTTCTACAT----------T-------TA-A---CA-------TGCGGTCCTG-TAATGATTTTAAACTC---A-TTT------T--T-----T--AA----C-A-AA-----TT-TC----TA----TAAGAAGGGTAC----TTTTCTGTAACCGT------------------TTTA--ATTTCT------GACATG-------AGC------------------------T-------G-----T-----T-AT-C--A---TGT------T-TCGACA-CT-T--TTTG-TCATT----GCATCAGTTT----TAAGCAGACG-TG
gi|158570 : TTTACTTGTTTTCATTCTACAT----------T-------TA-A---CA-------TGTGGTCCTG-TAATGATTTTAAACTC---ATTTT------T--T-----T--AA----C-A-AA-----TT-TC----TA----TAATAGTGGTAC----TCTTCTGTAACCGC------------------TTTA--TTTTCT------GACATGAGCA---GTC----------A-T-CAT-G-----T-------T-----T-----C-GA-C--A---C-T------T-T-------T-TGTCC------TT----GCATCAGTTT----TAAGCAGA
gi|158571 : TTTGCTTGTTTTCATTCTACAT----------TGAATATATATA---TA-------TGTGGTCCTG-TGATAATTTCAAACTT---ATTTT------T--T-----T--AA----C-A-AA-----TT-TC----TATTTTTATGAAGGACAC----TCCTACGGAACCTC------------------TGTC--ATTTCT------GACATGCTTA---AAC---------------AT-A-----T-------T-----T-----T-AT-T--A---C-
gi|158572 : TTTACTTATTTCCATTCTACAT----------T-------TG-A---CA-------TGTGATTCTG-TGACCATTTCAAACTCTTTA-TAT------T--T-----T--------A-T-AA-----TT-TC----TA----TAAGAAGGGTAC----TCCTTGGGAACCTC------------------CATT--ATATCT------GACATGCGCA---GTC--------------ATT-A-----TGACA---T-----T-----C-AT-C--ATTTC-T------T-TT-AC--CT-TGACCTG-T-TAT----GTACCAACTT----TCAGCAGAC
gi|158573 : TTTACTTGTTTTCATTATACAT----------C-------TA-ATCTCAGATTATCTGTGGTCCTG-TATTGATTTTAAACAC---A-TTT------T--T-----T--AA----C-A-AA-----TT-TC----TA----TAAAAAAGTTAC----TTTTCCGTAACCGC------------------TTTA--ATTTGT------GACATGAGCA---GTC----------A-C-CAT-G-----T-------T-----T-----CGAC-A--C---T-T------T-TTGTC--CT-T----------TT------AACAGTTT----TAAGCAGACG-Taacaattgtattaattt
gi|158574 : TTTACTTATTTTCATTCTACAT----------T-------GA-A---CA-------TTTGGTCCTG-TAATGATTTTAAACTT---G-TAT------T--T--------------A-A-CA-----CA-T---------------------------TCCGCTGGAACCTC------------------TATA--ATTTCT------GACATGGGCA----------------G-ATAGTCA-----TG------C-----T-----T-AT-A--A---C-T------T-CTGAC--CT-TGACCTA-T-CAT----GCATTA
gi|158575 : TTTACTTATTTTCAT-CTACAT----------T-------TA-A---CA-------TATGGTCCTG-TGATAATTTCAAACCC---A-TTA------T--TACATGT--AA----C-A-CA-----TT-TC----TA----TAAGAAGGGTAC----TCCTACAGAACCAT------------------TATT--AT
gi|158576 : TTTACTTATTTTCATTT-------------------------------A-------T-------TG-TGATGATTTCAAACTT---G-TTT------G--T--------AA----C-A-AA-----TG-CC----TA----CTAGAAGAGTAC----TACTCCGGAA--TC------------------TATA--ATTTCT------TACATTCG-A---AGT----------C-G-GGT-A-----TG------T-----T-----T-AT-A--A---C-T------T-TTCTA--CT-TAACCTG-T-TAT----GCGTCAGTTT----T-------CG-TGGTTGGAATTGATATT
gi|158577 : CTTATTTTTATTCTACAT----------T-------TA-A---CA-------TGTGGCCCTG-TGCTAATTTCAAACTC---A-TTT------T--T-----TAAAA----A-A-AA-----CA-TC----TA----TAAGAAGGTCAC----TCATTCGGAACCTC------------------TATA--ATTACT------GACATGCAAA---AGC----------A-A-ACT-AT----T-------T-----T-----T-AT-A--A---T-T------T-TTGAC--CT-TGACCTG-T-ATT----GCATCACTTT----TCAGCA-----TGTTTGAAATGGACATT
gi|158578 : CTTATTTTCATTCTACAT----------T-------TA-A---CA-------TGTGTTCTGG-TGATAATTTTAA---C---A-CCT------T--T-----T--CAT---C-A-AA-----TT-TC----TA----TAAAAAAGGTAC----TCCTTTGTAACCTC------------------TATT--ATTTCT------AACATGCGCA---GTC----------T-T-CAT-------T-------T-----T-----T-AA-C--A---C-T------TATTGAC--CA-TGACCTG-T-TAT----GTATCAATTT----TCAGCA
gi|158579 : CTTAATTTCATTCTACATAAATTATTATT-------TA-A---CA-------TGTGGTCCTG-AGATAATTTTAA---T---A-T-------------------------------A-----TT-TC----CA----TAAGAAAGGTGT----TCCTTAAGAACCTC------------------TATA--ATTTAT------GACATGCGCA---ATC----------A-T-CAT-G-----T-------T-----T-----TGAT-A--C---T-T------T-TCTAC--CT-TGACCTG-T--TT----TCATTGATAT----TC
gi|158580 : TATTTTTATTCTACAT----------T-------TA-A---CA-------TGTGGTCCTG-TGCTACTTTCGAACTC---A-TTT------T--T-----T--AA----A-A-AA-----AA-TC----TA----TATGAAGATCAC----TCATCTGGAACCTC------------------TATA--ATTTCT------GACATGCCCA---AGT----------G-A-AAT-AT----T-------T-----T-----T-AT-A--A---C--------T-TTGGC--CT-TGACCTG-T-ATT----GCATCACTTT----TCAACAGACT-TATTTGAAATTGCTATT
gi|158581 : ATTCTAGAT----------T-------TA-C---CA-------TGTGGCTTTG-TGATAATTTCAAACTG---A-TTT------CA-T-----T--AA----C-A-AA-----TT-TC----AA----TAAGAAGGTTAC----TCTCTCGGAAACTC------------------TATA--ACTTTT------AACATGCGCA---GTT----------G----GTCA-----TG------T-----T-----T-AT-A--A---T-T------A-TTTAC--CT-TGACACG-T-TAT----GCATCAG-AT----CCGGCAAACA-TGGTTGGAATTGATATT
gi|158582 : ATTCTACGC----------T-------TA-A---CA-------TGTGATCCT-----------------C---A-TTG------T--T-----T--AA----C-A-AA-----TT-T-----TA----TGAGAAGTGTTC----TCCTAAGGAACCT--------------------ATA--ATTTCT------GACATGCGT------C----------G-T-CAT-T-----T-------T-----T-----T-TTCA--G---T-T------T-CTAAC--CTGTGACCTG-T-TAT----GCATCAGTTT----TCAGCAGACA-ACTATGGAATTAATATT
gi|158583 : GTTTTGATGATCAATTCAAACTC---A-TTT------T--T---------A----A-A-AA-----TT-TC----TA----TAAGAAGGGTAC----TCCTCCAGAACCTC------------------TAGA--ATTTCA------GATATGCGC------C----------G-T-CATCA-----TG------T-----T-----T-AT-A--AT--C-T------T-TTGAC--CG-TGACCTA-T-A
gi|158584 : ttctgcttttattgtgatgttattttCAT----------T-------TA-A---CA-------TGTTGT-----TGATCATT-CAAACTC---A-TTT------T--T-----T--CA----C-A-AA-----TT-TC----TA----TAAGAAGAGTAA----AACTCCAGAACCTC------------------TATA--ATGTCT------GACATGTGCA---A
gi|158585 : T----------T-------TA-A---TA-------TATGGCCCTG-TGCCAATTTCAAACTC---A-TTT------T--T-----A--AA----A-A-AA-----AAATC----TG----TAAGAAGGTCAC----TCATACGGAACCTC------------------TA----ATTTCT------GACATTTACA---AGC----------G-T-AATCA-----T-------T-----T-----T-AT-AGTA---C-CGGGGTAT-TTGTC--TT-TGACCTT-T-ATT----GCATCAGTTT----TCAGCAGACG-TGTTCGAAATCGATATT
gi|158586 : A-------TGTGGTCTTG-TGATAATTT-----TC---T-TTT------T--T-----T--AA----A-A---------T-TC----TA----CAAGAAGGATAC----TCCCCCG-AACCTCTATAATTTATGACATGCTTATA--ACTTTTTACCTTGACATGCTTAT--AACTTTTTACCTTG-A-CAT-G-----C-------T-----T-------AT-A--A---C-T------T-TTTAC--CT-TGACATGTT-ATT-----CATCAGTTT----TCAGAAGACA-TGTTTGGAATAAATATT
gi|158587 : TCCTG-TGCTTATTTCAAACTT---G-TAT------T--T-----C--AA----A-A-AA-----AA-TC----TA----TAAGAAGCTCAC----TCTTCCGGAACCTC------------------TATG--TTTTCT------GACATGC------AAT----------A-A-AAT-C-----T-------T-----T-----TTAT-A--A---C-T------T-TTGAC--CT-TGACCTT-T-ATT----GCATCAGTTT----TTAGCAGTCG-TGTTTGAAATCGATATT
gi|158588 : TCCTA-TGATAATTTCAATGTC---A-GTT------T--T-----C--AA----A-ACAA-----AA-TC----TA----TAAGAAGGGTGC----TCCTCTAGAGCCTC------------------AATA--TCTTTT------GAGATGCGCT---CTC------------------A-----T-------TTCCAGT-----T-GT-C--A---C-TA-----C-TTGAC--CT-TGACC------TT----GCATATATTTACTATCAGCAGACGACG-TTGGAATTAATGTT
gi|158589 : TCCTA-TGATAATTTCAATGTC---A-GTT------T--T-----C--AA----A-A-AA-----A--TC----TA----TAAGAAGGGTGC----TCCTCTAGAGCCTC------------------AATA--TCTTTT------GAGATGCGCT---CTC------------------A-----C-------T-----TCCGGCT-GT-C--A---C-TA-----C-TTGAC--CT-TGACC-----A-T----GCATATATTTACTATCAGCAGACGACG-TTGGAATTAATTTT
gi|158590 : TC---A-TTT------T--T-----T--AA----C-A-AA-----TT-TC----TA----TAAGAAGGGTAC----TCCACAGGAACCTC------------------TATA--ATTTCA------GACATGCGCA----------------G-A-AAT-ACATGCT-------TA----T-----T-AC-A--A---C-T------T-TTGACTATC-TAACAGG-T-ATCATGAGCATTATTTT----TTA
gi|158591 : ttcatgA----TAAGAAGGGTAC----TCCTCCGTAACCTC------------------CTTA--GCTTCT------GACATGCCCAGTCAGC----------T-A-AGC-A-----T---------------------AT-A--A---C-T------T-TTGAC--AT-TGACTTA-T-TAT----GCATAAGCTT----TCAGAAAGCG-AGGTTGGACTTGATA
gi|158592 : AT----TCTTCTGAATCATC------------------TGTA--ATTTCT------GGTATATGC------C----------C-A-GTT-A-----TCATGACGT-----T-----T-AT-C--A---CTT------T-TTGAC--CT-TGATCTGCT-A-T----GCATCAGTTT----TTTGCAGATGACG-ATGGAATTTATATT
gi|158593 : tcTTCT------GACATGCACA---GTC---------------ATCA-----TG------T-----T-----T-AT-A--A---C-TG-----T-TTTAC--CT-CGACTTA-T-TAT----GCATCAGTTT----TCAGAAGACC-TGGTTGGAACTGATATT
gi|158594 : -------T-----T-----T-AT-A--A---C-T------T-GTGAT--CT-TAACCTG-T-ATT----GTATCAGTTT----TCAGCAGACG-TGCTAGGAATTGATAT