lowQualScore : 1 2222222 1 1111111111111111111 1111111 11 222222222222222222 111111111111 222 11111111111111 1 333333333333333 22222222222222222 1111 111 1 666666666666666666666666666666666666666666666 33333333333333333333333333333333333333 111 22222222222 1
lowQualScore : 8 33 33 2 666 66 55 1 333 0 2222222 4 2 3 1 0 2 4444 88 22 4 8 999 444 2 2 4 0000000000000000000 0000000 33 333 5 8 4444 555 55555 4 555555555555555555 77777777777 222222222222 333 3 3 22222222222222 2 77777777 9 55 2 8 1 7 9 8 2 2 4 777777777777777 8 8888 22 22 55 0 11111111111111111 9999999999 999999999999999999999 4 6666 555 999999999 888 000 3 1 6666666 0 0 2 4444 0 4444 2 4 2 33 33 444 55555 22 22 1 44444 7 000000000000000000000000000000000000000000000 1 4 3 333 5 3333 9999999999999 77 1 44444 66666666666666666666666666666666666666 888 44 2 3 00000000000 66 1 0 0 7
lowQualScore : . .. .. . ... .. .. . ... . ....... . . . . . . .... .. .. . . ... ... . . . ................... ....... .. ... . . .... ... ..... . .................. ........... ............ ... . . .............. . ........ . .. . . . . . . . . . ............... . .... .. .. .. . ................. .......... ..................... . .... ... ......... ... ... . . ....... . . . .... . .... . . . .. .. ... ..... .. .. . ..... . ............................................. . . . ... . .... ............. .. . ..... ...................................... ... .. . . ........... .. . . . .
lowQualScore : 5 22 22 4 555 55 88 7 777 5 1111111 6 0 9 8 1 4 5555 77 99 2 4 444 666 2 2 4 1111111111111111111 3333333 66 999 4 1 7777 888 66666 3 777777777777777777 66666666666 999999999999 222 2 0 99999999999999 1 66666666 7 00 1 5 3 3 3 4 1 1 2 777777777777777 3 9999 99 99 88 8 22222222222222222 2222222222 444444444444444444444 2 1111 888 000000000 222 222 2 9 8888888 6 5 1 5555 3 5555 2 4 5 44 33 444 00000 55 44 7 33333 3 000000000000000000000000000000000000000000000 7 6 0 000 0 7777 6666666666666 44 7 33333 66666666666666666666666666666666666666 777 44 6 3 77777777777 11 1 1 2 0
consensus : TGTNGCATAATCG--A--C-TCAA---CA--AC--TCT---T-GTATATC-A--TAAGTAAA-TTTTATTCACATANTTATAAAGTTCTC----ATA--AG--TTCAAAGTCAC-AA-GCTAACATTTTT--AAACTCGCTANC-GCTCGTTT-A-AA-CTAAACCTA----------G--------TCT-------AA--C---TGACATGTTAC----TCTGAC-CG-----TGNCTANAACT------T------AACTG-----A-----CTG----T-CC---NCTCT-TGCTAAAACCAGTCCCTGANTGAATAAACA-------------AC-T--------ATTCTATC--A-TTGGTCAATTCATTNCTACNTTNC-T-A-TTGGTCAG-G----TTA-C-T-AATTACNGA----TC--TTA--A--AGTCC--------A--------GCC----------C----------A----------C-A----A---TTAC--------CT--TG--TCAACAA-------TACATCAAGATAACCCT-AGG-CTA----TCATT----TATCTC-CAGTAANCTGTCATCC-TA--TCT-CA---TTAAACTG-----TCA--TAGA--T-T-----CAAGATTCAAGATT-----TCT-TT--------A-------C--------T--------T-ANACGT---ATA----ATGTTTCTC-------------AN-TA-CATACA-----TATA-------T-------------CA--------------ATAT-A-TTTATTTA-TGTCANATGA-AGTATCT----T------CAATTCT--AACATCTCACTAGCATCCCATAATGTTACA
Reference ( gi|102981 ) : TGTCGCATAATCG--A--C-TCAA---CA--AC--TCT---T-GTATATC-A--TAAGTAGA-TTTTATTCACATAATTATAAAGTTCTC----ATA--AG--TTCAAAGTCAC-AA-GCTAACATTTTT--AAACTCGCTACT-GCTCGTTT-A-AA-CTAAACCTA----------G--------TCT-------AA--C---TAACATCTTAC----TCTGAC-CG-----TGGCTAAAACT------T------AACTG-----A-----CTG----T-CC---ACTCTATGCTAAAACCAGTCCCTGAATGAATAAACA-------------GC-T--------ATTCTCTC--A-TTGGACAATTAATTCCTACATTAC-T-A-TTGGTCA--A----TTAAC-C-AATTACCGA----TC--TTA--A--AGTCC--------A--------GCC----------C----------A----------C-A----A---TTAC--------CT--TG--ACAGCAA-------TACATCAAGATAACCCT-AGG-CTA----TCATT----TATCTC-CAGTAAACTGTCATCC-TA--TCT-CA---TTAAACTG-----TCA--TAGA--T-T-----CAAGATTCAAGACT-----TCC-TC--------A-------C--------T--------T-ATACGT---ACA----ATGTTTCTC-------------AA-TA-CATACA-----TATA-------T-------------CA--------------ATAT-T-TTTATTTA-TGTCAAATGA-AGTATCT----T------CAATTCT--AACATCTCACTAGCATCCCATTATGTTACA
gi|102984 : TGTTGCATAATAG--A--C-TCAA---CA--AC--TCT---T-GTATATC-A--TAAGTAAA-TTTTATTCACATAATTATAAAGTTCTC----ATA--AG--TTCAAAGTCAC-AA-GCTAACATTTTT--AAACTCGCTACT-GCTCGTTT-A-AA-CTAAACCTA----------G--------TCT-------AA--C---TAACATCTTAC----TCTGAC-CG-----TGGCTCAAACT------C------AACTG-----T-----CTG----T-CC---ACTCTATGCTAAACACAGTCTCTGAATGAATAAACA-------------GC-T--------ATTCTCTC--A-TTGGACAATTAATTCCTACATTAC-T-A-TTGGTCA--G----TTAAC-C-AATTACCGA----TC--TTA--A--AGTCC--------A--------GCC----------C----------A----------C-A----A---TTAC--------CT--TG--ACAGCAA-------TACATCAAGATAACCCT-AGG-CTA----CCATT----TATCTCTCATTTAACTGTCATCC-TA--TCT-CA---TTAAACTG-----TCA--TAGA--T-T-----CAAGATTCAAGACT-----TCC-TC--------A-------C--------T--------T-ATACGT---ATA----ATGTTTCTC-------------AA-TA-CATACA-----TATA-------T-------------CA--------------ATAT-A-TTTATTTA-TGTCAAATGA-ATTATCT----T------CAATTCT--AACATCTCACTAGCATCCCATAATGTTACA
gi|102985 : TGTCGCATAATCG--A--C-TCAA---CA--AC--TCT---T-GTATATC-A--TAAGTAAA-TTTTATTCACATAAATATAAAGTTCTC----ATC--AG--TTCAAAGTCAC-AA-GCTAACATTTTT--AAACTCGCTACT-GCTCGTTT-A-AA-CTAAACCTA----------G--------TCT-------AA--C---TAACATCTTAC----TCTGAC-CG-----TGGCTCAAACT------C------AACTC-----C-----CTG----T-CC---ACTCTATGCTAAAACCAGTCCCTGAATGAATAAACA-------------GC-T--------ATTCTCTG--A-TTGGACAATTAA-TCCTATATTAC-T-A-TTGGTCA--G----TTAAC-C-AATTACCGA----TC--TTA--A--AGTCC--------A--------GCC----------C----------A----------C-A----A---TTAC--------CT--TG--ACAGCAA-------TACATCAAGATAACCCT-AGG-CTA----TCATT----TATCTC-CAGTAAACTGTCATCC-TA--TCT-CA---TTAAACTG-----TCA--TAGA--T-T-----CAAGATTCAAGACT-----TCCTTT--------A-------T--------T--------T-ATACGT---ATA----ATGTTTCTC-------------AA-TA-CATACA-----TATA-------T-------------CA--------------ATAT-A-TTTATTTA-TGTCAAATGA-AGTATCA----T------CAATTCT--AACATCTCACTAGCATCCCATAATGTTACA
gi|102983 : TGTTGCATAATCG--A--C-TCAA---CA--AC--TCT---T-GTATATC-A--TAAGTAAA-TTTTATTCACATAATTATAAAGTTCTC----ATA--AG--TTCAAAGTCAC-AA-GCTAACATTTTT--AAACTCTCTACT-GCTCGTTT-A-AA-CTAAACCTA----------GACTAGAAGTCT-------AA--C---T--CATGTTAC----TCTGAC-CG-----TGGCTAAAACT------T------AACTG-----A-----CTG----T-CC---ACTCTATGCAAAAACCAGTCCCTGGATGAATAAACA-------------AC-T--------ATTCTATC--A-TTGGCCAATTCATTTCTACATTTC-T-A-TTGGTCA--A----TAAAC-T-AATTTCAGA----TC--TTA--A--AGTCC--------A--------GTC----------C----------A----------C-A----A---TTAA--------CT--TG--ACAACAA-------TACATCAAGATAACCCT-AGG-CTA----TCA-T----TATCTC-CAGTAAATTGTCATCC-TA--TCT-CA---TTAAACTG-----TCA--TAGA--T-T-----CAAGATTCAAGATT-----TCT-TT--------A-------C--------T--------T-ATACGT---ATA----ATGTTTCTC-------------AA-TA-CATGCA-----TATA-------T-------------CA--------------ATAT-A-TTTATTTA-TGTCAAATGA-AATATCG----T------CAATTCT--AACATCTCACTAGCATCCCATAATGTTACA
gi|102982 : TGTTGCATAATCG--A--C-TCAA---CA--AC--TCT---TTGTATATC-A--TATGTAAA-TTTTATTCACATAATTATAAAGTTATC----ATA--AG--TTCAAAGTCAC-AA-ACTTACATTTTT--AAACTCGCTTCC-GCTCGTTT-A-AA-GTAAACCTA----------G--------TCT-------AA--C---TAACATCTTAC----TCTGAC-CG-----TGGCTATAACT------C------AACTA-----A-----CTG----A-CT---TGTCTCTGCTAAAAACAGTATCTGAATGAATAAACA-------------AC-T--------ATTTTATC--A-TTGGACAATTCATTTTTACATTAC-T-A-TTGGTCA--G----TAAAC-T-AATTACCGA----TC--TTA--A--AGTCC--------A--------GCC----------C----------A----------C-AAC--A---TTAA--------CT--TG--ACAACAA-------TACATCAAGATAACCCT-AGG-CTA----TCATT----TATCTC-CAGTAAACTGTCATCC-TA--TCT-CA---TTCAACTG-----TCA--TAGA--T-T-----CAAGATTCAAGATT-----TCT-TT--------A-------C--------T--------T-ATACGT---ATA----ATGTTTCTC-------------AA-TA-CATACA-----TATA-------T-------------CA--------------CTAT-A-TTTATTTA-TGTCAGATGA-AGTATCT----T------CAATTCT--AACATCTCACTAGCATCCCATAATGTTACA
gi|102986 : TGTTGCATAATCG--A--C-TCAA---CA--AC--TCT---T-GTATATC-A--TAAGTAAA-TTTTATTCACATAATTATAAAGTTCTC----ATA--AT--TTCAAAGTCAC-AA-GCTAACATTTTT--AAACTCGCTACT-GCTCGTTT-A-AA-CTAAACCTA----------G--------TCT-------AA--C---TCACATCTTAT----TCTGAC-CG-----TGGCTAAAACT------T------AACTC-----------CTT----T-C------TCTCTCCTGAAAACAGTCTCTGAATGAATAAACA-------------AC-T--------ATTCTATC--A-TTGGCCAATTCATTTCTACATTTC-T-A-TTGGTCA--A----TAAAC-T-AATTACAGA----TC--TTA--A--AGTCC--------A--------GCC----------C----------A----------C-A----A---TTAA--------CT--TG--ACAACAA-------TACATCAAGATAACCCT-AGG-CTA----TCATT----TATCTC-CAGTAAACTGTCATCC-TA--TCT-CA---TTAAACTG-----TCA--TAGA--T-T-----CAAGAT-------T-----TCT-TT--------A-------C--------T--------A-ATACGT---TTA----ATGTTTCTC-------------AA-TA-CCTACA-----TATA-------T-------------CA--------------ATAT-A-TTTATATA-TGTCAAATGA-AGTATCT----T------CAATTCT--AACATCTCACTTGCACCCCATAATGTTACA
gi|102987 : TGTTGTATATTCG--A--C-TCAA---C-------TCT---TTGTATATC-AAGTAAATTGAATTTTATTCACATAATTATAACGTTCGC----ATA--AG--TTCAAAGTCAC-AA-TCTAACATTTTT--AAACTCGCTAAC-GCTCGTTT-A-AA-CTAACCCTA----------G--------TCT-------AA--C---TGACATGTTAC----TCTGTA-TG-----TGTCTAAAAAC------C------AACTG-----A-----CTG----A-CT---TCTCTCTGCTAAAACCAGTCTCTGAATAAATAAACA-------------AC-T--------ATTATATC--A-TTGGTCAATTCATTTCTACTTTTC-T-A-TTGGTCAGTA----TT--C-T-AATTACAGA----TC--TTA--A--AGACC--------A--------ACC----------C----------A----------C-AAC--A---TTAC--------CT--TG--TCAACAA-------TACATCAAGATAACCCT-AGG-CTA----TCATT----TTTCTC-CAGTAAACTGTCATCC-TA--TCT-CA---TTAAACTG-----TCA--GAGA--T-T-----CAAGATTCAAGATT-----TAT-TTGTTTGTA-A-------C--------T--------T-ATCCAT---ATA----ACGTTTCTC-------------AT-TA-CATACA-----TATATT-----T-------------CA--------------ATATATATTTATTTA-TGTCATATGA-AGTATCT----C------AAATTCT--AA-----------CATCCCATAATGTTACA
gi|102989 : TGTGGTATAATCG--A--C-TCAA---CA--ACGTTCT---TTGTATA---A--TAAGTAAA-TTTTATTCACATAATTATAAAGTTTGC----ATA--AG--TTCAAAGTCAC-AA-ACTAACATTTTT--AAACTCGCTATC-GCTCGTTT-A-AA-CTAACCCTA----------A--------TCT-------AA--G---TGACATGTTAC----TCTGTC-TG-----TGTATACACCC------T------GACTG-----AAGGACTTG----T-CT---ACTT-------AAACCAGTCCCTGAATAAATAAACA-------------AC-T--------TTTCTATC--A-GTGGTCAATTCATTTCTACTTTTC-T-A-TTGGTCAGTA----TT--C-T-AATTACAGA----TC--TTA--A--GATCC--------A--------GCC----------C----------A----------CAA----A---TTAA--------C---TG--TCACCTA-------TACATCAAGATAACCCT-AGA-CTA----TTATT----TATCTC-CAGTAACATGTCATCC-TG--TCC-TA---TTAACCTG-----TCA--TA
gi|102988 : TGTGGTATAATCG--A--C-TCAA---CA--AC--TTTCTTT-GTATA---A--TAAGTAAA-CCTTATTCACAGGATTATAAAGTTCGC----ATA--AG--TTCAAAGTCAC-AC-GCTTACATTTTT--AAACTCGCTATT-GCTCGTTT-A-AA-CTTACCCTA----------G--------TCT-------AA--C---TGACAAGTTAC----TTTGTC-CG-----TGTCTGTACCC------T------CGCTG-----A-----ATGAC--T-TA---ACTC--TCCTAAAATCAGTCCCTGAATGTACAAACA-------------AC-T--------ATTCTATC--A-TTGGTCAATTCATTTCTACTTTTC-T-A-TTGGTCAGTA----TT--C-T-AATTACATA----TC--TTA--A--GGACC--------A--------GCC----------C----------A----------C-AAC--A---TTAA--------CT--TG--TCAACAA-------TACATCAAGATAACCCT-AGG-TTA----TAATT----TAACTC-CAGTAATCTGTCATCC-TA--TCT--A---TTAAACCG-----TCA--TActatgtacatacaattcttaactaccataatataacatcacatgcgcatagctaaacacaaataatatgtttgtcgtttatgaaatcatgcatc
gi|102990 : TGTGGAACAACCG--A--C-TCAA---CT--ATGTTCT---TTGTATA-------AAGTAAA-TTTTATTCACATTGTTATAAAGTTTGG----ATA--AG--TTCTAAGTCAC-AA-GCTAACATTTTT--AAACTCGCTCTC-GCTGGTTT-A-AA-CTAACTCTA----------G--------TCT-------AAA-C---TGACAGGTTAA-----CAGATTCG-----CATCTACATTC------T------AACTG-----A-----AGG----A-CT---TATCTCTACTAAAACCAGTCCCTGACTGAATAACAA-------------AC-T--------ATCCTATG--A-TTGGCCAATTCATTGCTACTTT---T-AATTGGTCAGTA----TT--T-T-ACTTACATG----TC--TTA--A--GATCC--------T--------GCC----------C----------A----------C-A----AA--CTAA--------CT---G--TCAGCTA-------TACATCAAGATAACCCT-AGA-CTA----TTATT----TATCTC-CAGTAACCTGTAATCC-TA--TCT-TA---TTAAACCG-----TCA--TA
gi|102992 : TGTAGTATAACAGGTA--C-TCAAA--CATGGT--TGT---T-TTATAT--A---AAGTC-A-TTTTATTTACATGTTTATATATTTTGC----ATATAAG--TTCGAAATCAC-AAAGCTAACATTTT---AAAGTCGCTTAT-GCTCATCT-A-AAACTAAACTTA----------G--------TGT-------AAAAC---TGACATGTTAC----CATGCT-CG-----AGATTAC--CT------TCG----GACTG-----A-----CCT----T-CC----CTCT---CTAAAATCTGTCTCTAACTGAATAAACA-------------AC-T--------ATGCTATG--A-TTGGTCAATTCATTGCTACCTTCC-A-A-TTGGTTG--G----TTTCT-T-AATTACAGA----CA--TTA--A--AATCC--------C--------GCC----------CTTATCATATGA----------C-A----A---A-AC--------CTACTG--TCAACTA-------CACATCATGATAACC-T-AGG-CTA----TTATT----TATCTC-CAGTAGCCTGTCATCC-TA--TCT-TA---TTAATCTG-----TCA--TA
gi|102991 : TGTGGCATAATCG--A--A-TCAA---CA--AC--T-T---T-GTAC----------------TTTTATTCACATATTTATATAGTACGC----ATA--AG--TTCAAAGTCAC-AA----AACATTTT---AAACTCGC-ATTCGCTCGTTT-A-AA-CTAAACCTA----------G--------TCT-------AA--T---TTACATGTTAC----CCTGTT-CG-----TATCTACATTC------T------GACTG-----A-----AGG----A-CC---TATCTCTACCAAAACCAGTCCCTGACTGAATAACCA-------------AC-T--------ATCCT-----------AC------TTTTTA---------A-TTGGTCAGTA----TTA---T-AATTACAGG----TC--GTA--A--GATCC--------C--------GCC----------C----------A----------CAA----A---CTAA--------C---TG--TCAACTG-------T-CATCAAGATAACCCT-AGG-CTA----TTATT----TATC-------------TCATAC-TA--TCT-AA---TTAACCTG-----TCA--TA-A--TAT-----GTACATACAA---T-----TTT-TA--------A-------C--------TAC------C-ATA-AT---ATA----ACATTCCTCCCATGTTTAAGATAA-AA-TATATA-----TGTA-------C-------------TAAT------------ATAT-T-TTTCTCTATTGT--AATCAGATTATTTTATCT------CAGTTCTGGAACA
gi|102993 : TGTGGTATAACAG--A--CACCAA---CATGAT--TGT---T-TTGTAT------AAGTA-A-TTTTATTCACATATTTATATAGTTTGC----ATA--AAAATTAAAAGTCAC-AAAGCGAACATTTT---AAACTCGCCTTC-GCTCATCT-A-AA-CTAAACCTA----------G--------TTT-------AAA-C---TGACATGTTACCAGATTTG---CA-----T--CTA---CT------TTCT---AAATG-----A-----CTGCCCTT-CC---TCTCTA----AAAATCTGGCTCTGACTGAATAACCA-------------AC-T--------CTGCTATA--A-TTGGTCAATTCATTGCTACCTTTC-G-A-TAGGTCAG-A----TT--C-TTAATTACGGA----CC--TTA--A--AACCC--------C--------ACC----------C----------ATATCATATGAC-A----AAACCTAC--------TT--T----CAGCAA-------CACATCATGATAACCCT-AAGACTA----TTATA-----ATCTC-CATTAGCCTGTGTTCC-TA--TCT-CA---TTAGCCTG-----TCA--TA
gi|102994 : TGTAGTATAACCG--A--C-TCAAATATG--GT--TGT---T-TTATA-C-A---AAGTCAA-TTT-ATTCACATGTTTTTATATTTCTC----ATATAAG--TTCGAAATCAC-AAAGCTAACATTGT---AAACTCGCTTTC-GTTCGTCTGA-AA-CTAAACCTA----------G--------TCT-------AAAAC---TGACATGTTAC----TA-GACTCG-----AGGTTA---CT------TTCT---AACAGCCAGAA-----CTT----T-CC---TCTCTA----AAAATCATTCTCTGACTGAATAAACA-------------AC-T--------AACCTATG--ATTTGGTCAATTCATTGCTACTTCCC-A-A-TTGGTCG--T----TT--CTT-AATTA-TGAAGGTTC--ATAACA--ACTCCCCCATCATA--------TCA----------C----------A----------C-A----A---CTAC--------C---TG--TCAAATA-------TACAACATAATAAGCCTAAGG-CTA----TAATT----TATCTC-CATTAGCCTGTCATC
gi|102995 : TGTAGTATAACAG--ATAC-TCAA---AC--AT--GAT---T-GTTTTTCTA--TATGTC-A-TTTTATTAACATATTTATC---TTTTTGCATATA--AG--TTCAAAATCACAAA-GCTGACA-TTTT--AAACTCACTAAT-GCTCGTCT-ATAG-CTAAACCTT----------G--------TCTAA-----AA--T---GAAAATGTTG-------------G-----TGTTT--AGCTTTCTGCT------GACAG-----A-----CCT----T-TC----CTCT---CTAAAATCTGTCTCTGACTGAATAAACA-------------AC-T--------ATCTTATC--A-TTGGTCAATTCACTGTTAC-TTAC-CAA-TTGGTCA--G----TTTCT-C-AATTA-TGAAGGCTC--ATA--ACCCCTCC--------A---------CCGATCATATCAC----------A----------C-A----A---CTAC--------C---TG--TCAAATA-------TACAACATGATAAACCTAAGG-CTA----TAATA----TATCTC-CATTAGCCTGTCATC
gi|102996 : TGTTGCATAATCG--A--C-TCAA---CG--A--------------TA-------AAGTAAA-TTTTATTCACATAATTATAAAGTTCGC----ATC--AG--TTCAAAGTCAC-AA-GCTATCTTTTTTTAAAACTCGCTATC-GCT
gi|102997 : TGTCGCATAATCG--A--C-TCAA---CA--AC--TCT---T-GTATATC-A--TAAGTAAA-TTTT
gi|102998 : TAATCG--A--C-TCAA---CA--AC--TCT---TTGTATATC-A--TAAGTAAA-TTTTATTCACATAATTATAAAATTCTC----CTA--AG--TTCAAAGTCAC-AA-GCTTACATTTTT--AAACTCGCTACT-GCTCGTTT-A-AA-CTAAACCTA----------G--------TCT-------AA--C---TAACATCTTAC----TCTGAC-CG-----TGGCTAAAACT------T------AACTG-----A-----CTG----T-CC---GCTCTTTGTCAAAACCAGTTCCTGAATGAATAAACA-------------GC-T--------TTTCTATT--A-TTGGACAATTCATTTCTACATTGC-T-A-TTGGTCAGTA----TT--T-T-AATTACAGA----TC--TTA--A--AGACC--------A--------GCC----------C----------A----------C-AAC--A---TTAA--------CT--TG--TCAACAA-------TACATCAAGATAACCCT-AGG-CTA----TCATT----TATCTC-CAGTAAACTGTCATCC-TA--TCT--A---CTAAACTG-----TCA--TAGA--T-T-----CAAGATTCAAGATT-----TCT-TT--------A-------C--------T--------T-ATACAT---ATA----ATGTTTCTT-------------AA-TA-CATACA-----TATA-------T-------------CA--------------ATAT-A-TTTATTTA-TGGCATATGA-AGTATCT----A------CAATTCT--AA-A------------CCCATAATGTTACA
gi|102999 : --TTT---T-ATATA-------AAGTC-A-TTTTATTCACATGTTCATGTATTTCTC----ATATAAG--TTCGAAATCACGAA-GCTAACATTTT---ATACTCGCTGAC-GCTCGTCT-A-AAACTAGACATA----------G--------TCT-------AAAAC---TGA-ATGTTAC----CATGTT-GG-----TATCTAG--CT------TTC----AACTG-----A-----CAG----A-CCTTTCCTCT---CTAAAATCTTTCTCTGACTGAATAAACA-------------GCTT--------ATCTTATC--A-TTTGTCAATTCATTGTTAC-TTCC-C-AGTTGGTCA--GTTTCTTAA--T-AATGAAGGT----TC--ATA--ACCCCTCCCCCATCATA--------TCA----------C----------A----------C-A----A---CTAC--------C---TG--TCAAATA-------TACAACATGATAAACCTAAGG-CTA----TAATT----TATCTT-CTTTAGCCTGTCATCTGTAAGTGA-CATGGTTGACCT------TTA--TAAA--T-TATAAACAAAATTTAAGAAT-----T------------------------------G--------T-ATACAT---TAA----AGAATTCTT-------------AACTACCATA-A-----TATA-------A-------------C---------------ATAT-
gi|103000 : --TTT---T-ATATA-------AAGTC-A-TTTTATTCAAATTTTTATATATTTCTC----AT-------TT--AAGTCAC-AAAGCTAACATTTT---AAACTCGCTAAA-TATCGTCT-A-AA-ACCAATCTA----------T--------TCT-------AA--CACTTGTCATGTTAC----CCT-AC-T------TGAC----GCT------TCCTTTCAACTA-----A-----CCG----TGTT---ACCCT-CACTGAGGTTTTTCTCTAACTGACCAAACACTATCCCAAAGAGGC-TTCTAGGTCATTTCCTTG-A-TTGGTCAATTTTTTATTACCTCAC-T-A-TTGGTCA--G----TT--T-C---TTA---A----TT--TCA--A--AGTCC--------AATAACCCTGCC----------C----------A----------------------TAT--------CT--TATCACATCAATCATCTCTATATCATGATAAGCTTAAGG-CTA----CCACT----
gi|103001 : A-TTTTATTCACATG--TATAAA--------------------TCAAAGTCAC-AA-GCTAACATTTTT---AACTCACTAAT-GTCAATCT-A-AA-ACCAACCTATTTTAACAAGG--------TCTATTTTTCAA--C---TTACATGTTAC----CCTAAC-CACTGTCTGTCTCTAAC-------T------AACTA-----A-----ACG----T-TC---A-TCT-TCCCAAAG--AGGCCTCG-----------A-------------GC-T--------CTTTTCTCTGA-TTGGTCAACTCATTGTTACCTGGCTT-A-TT-GTCA--G----TTTCT-T-AATTACTTG----TCAATTA--A--A---C--------AC-------GCC----------C----------A----------T-ATCTTA---TCACAAAACCGACA--TG--TCATCTC-------TACATCATGATAAATCTAAGG-CTATATCTTATTGTAACATATC-CATCTGCCTGATATTT-TA--TTTCCA---TTAGCTTG-----TCG--TATA--T-
gi|103002 : C-T--------ATTCTCCC--A-TTGGACAATTAATTCCTATATTAC-T-A-TTGGTCA--G----TTAAC-C-AATTACCGA----TC--TTA--A--AGTCC--------A--------GCC----------C----------A----------C-A----A---TTAC--------CT--TG--ACAGCAA-------TACATCAAGATAACCCT-AGG-CTA----TCATT----TATCTC-CAGTAAACTGTCATCC-TA--TCT-CA---TTAAACTG-----TCA--TAGA--T-T-----CAAGATTCAAGACT-----TCC-TC--------A-------C--------T--------T-ATACGT---ACA----ATGTTTCTC-------------AA-TA-CATACA-----TATA-------T-------------CA--------------ATAT-A-TTTATTTA-TGTCAAATGA-AGTATCT----T------CAATTCT--AACATCTCAGTAGCATCCCATAATGTTACA
gi|103003 : AAACTGGATATTCAGTTAGA--T-T-----CAAGATTCAAGATTCAAATTCT-TT--------A-------T--------TCAGTAATTT-AAACAT---ATA----ATGTTTCTC-------------AT-TA-CACACA-----AAT--------T-------------CAG-------------ATA
gi|103004 : TA-----TCA--TAGAGAT-T-----CAAGATTCAAGATTCAAATTCT-TT--------A-------TGCAGTAATT--------T-AAACAT---ATA----ATGTTTCTC-------------AT-TA-CATACA-----AAT--------T-------------CA--------------
gi|103006 : -----TCA--TAGA--T-T-----CAAGATTCAAA--T-----TCT-TTATTCAGTAA-------T--------T--------T-AAACAT---ATA----ATGTTTCTC-------------AT-TT-CATACA-----AAT--------T-------------CAG-------------ATA
gi|103005 : -----TTA--TAGA--T-T-----CAAGATTCAAGATTCAAATTCT-TT--------A-------T--------TCAGTAATTT-AAACAT---ATA----ATGTTTCTC-------------AT-TA-CACACA-----AAT--------T-------------CAG-------------ATA
gi|103007 : A--TAGA--T-T-----CAAGATTCAAA--T-----TCT-TT--------A-------T--------TCAGTAATTT-AAACAT---ATG----ATGTTTCTC-------------AT-TA-CATACA-----AAT--------T-------------CA--------------
gi|103008 : --TAGA--T-T-----CGAGATTCAAGATTCAGATTCT-TT--------A-------T--------TCAGTAATTT-AAACAT---ATA----ATGTTTCTC-------------AT-TA-CATACA-----AAT--------T-------------CA--------------
gi|103009 : AGA--T-T-----CAAGATTCAAGTTT-----TCT-TC--------ATTTGTAAC--------T--------T-AAACAT---ATA----ATGTTTCTC-------------AT-TA-CATACA-----AATA-------TTAAACATACATC-CA--------------ATAT-A-TCTATTTA---TCACGTGA-CACATTT----TGTGCAACAATTC
gi|103010 : AGA--T-T-----CAAGATTTAAGATT-----TCT-TT--------ATTTGTAAC--------T--------T-AAACTT---ATA----ATGTTTCTT-------------AT-TA-CAAACA-----TATATTT----T-------------CA--------------AT
gi|103011 : AGA--T-T-----CAAATTTCAAGATT-----TCT-TTATTTGTA-A-------C--------T--------T-AAACAT---ATA----ATGTTTCTG-------------AT-TA-CATACA-----TATA-------G-------------TACACATAT-------ATAT-G-TTTATTTA-T
gi|103014 : --T-T-----CAAGATTCAAGATT-----TCT-TT--------A-------T--------T--------T-GTACCTTTAACATGTTATGTTTCTC-------------AT-AA-CATACA-----TATA-------T-------------TA--------------
gi|103013 : --T-T-----AAAGATTCAAGA-T-----TCT-TT--------ATTGTAA-C--------T--------T-AAACAT---ATA----ATGTTTCTT-------------AA-AA-CACACA-----TATA-------T-------------TATACATACATCCATTATAT-A-TTTATTTA---TCACGTGA-CGCATTT----T------taacatacatccaatatatatgt
gi|103012 : --T-T-----CAAGATTCAAGATT-----TCT-TT--------A-------T--------T--------TGAAACTT---AT-----TTGTTTCTT-------------AT-TA-CATACATTTATTATACATACATT-------------CA--------------ATAT-A-TTTATTTA---TCACGTGA-CACATTT----TATGAAACAATTC
gi|103015 : -----CAAGATTCAAGATT-----TCT-TT--------ATTTGTAAC--------T--------T-AAACAT---ATA----ATATTTCTC-------------AT-TG-CATACA-----TATA-------TTATACAACACCTCCA--------------ATAT-A-TTTATTTA-T
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|103016 ): TATATCATAAGTAAATTTTNNNNNNNNNNAAGTATCTTCAATTCTAACATCTCAGTAGCATCCCATAATGTTACA
Alignments
lowQualScore : 1 1111111 1111111 11 2222 111111111111 33333 111 11111111111111111 1111 111111111 1 11111 555555555555555555555555555555555 1111111111111 33333333333333333333333333333333333333 111111
lowQualScore : 1 33 33 2 666 66 55 1 333 0 9999999 2 3 2 1 1 4444 88 22 4 8 888 1 2 2 4 9999999999 77777777 1111111 00 333 22 1 4444 22 2 2 55555 1 888 88 55555 0 6666 33 2 2 8888 44 1 2 000000000000 22 888888888 2 2 1 1 1 33 00000 1 000 22 22 55 0 99999999999999999 8888888888 8888888888 6 6666 22 555555555 999 0 2 2 1 6666666 0 2 4444 4444 2 1 2 33 22 444 44444 22 22 1 44444 1 66666 000000000000000000000000000000000 1 1 1 5555555 0000000000000 1 44444 1 55555555555555555555555555555555555555 444 0 1 777777
lowQualScore : . .. .. . ... .. .. . ... . ....... . . . . . .... .. .. . . ... . . . . .......... ........ ....... .. ... .. . .... .. . . ..... . ... .. ..... . .... .. . . .... .. . . ............ .. ......... . . . . . .. ..... . ... .. .. .. . ................. .......... .......... . .... .. ......... ... . . . . ....... . . .... .... . . . .. .. ... ..... .. .. . ..... . ..... ................................. . . . ....... ............. . ..... . ...................................... ... . . ......
lowQualScore : 0 11 11 2 111 11 55 2 555 0 1111111 0 8 9 2 8 2222 22 88 0 0 555 0 1 1 2 2222222222 66666666 1111111 88 777 99 4 5555 55 1 1 33333 0 555 77 33333 7 4444 55 1 1 3333 66 0 0 222222222222 88 000000000 0 2 0 0 0 22 55555 7 555 88 88 55 2 77777777777777777 8888888888 8888888888 0 8888 88 333333333 888 1 0 0 4 5555555 1 0 2222 2222 1 7 4 22 55 111 88888 44 33 7 22222 7 77777 111111111111111111111111111111111 7 0 8 4444444 8888888888888 0 00000 6 99999999999999999999999999999999999999 111 8 0 777777
consensus : TGTNGCATAATCG--A--C-TCAA---CA--AC--TCT---T-GTATATC-A--TAAGT-AAATTTTATTCACATAATTATAAAGTTCTC----ATA--AG--TTCAAAGTCAC-AA-GCTAACATTTTT--AAACTCGCTANCGCTCGTTT-A-AA-CTAAACCTA----------G--------TCT-------AA--C---TG-ACATGTTACTC----TGA-C-C-G-----TGNCTANAACTT--AACTG-----ACCG--T-CCNCT-C-T-CG-CTAAAA-CCAGTCCCTGANTGAATAAACAACT-A------------TTCTA--TC---------ATT-GGTCAATTCATTNCTACNTTNC-TATTGGTCAG-TTTNCTAATTACGGA---TC--TTA--A--AGTCC--------A--------GCC----------C----------AC-A----A--TTAC--------CT--TGTCA-A-CAA-------TACATCAAGATAACCCT-AGGCTA----TCATT----TATCTC-CAGTAANCTGTCATCC-TA--TCT-CA---TTAAACTG-----TCA--TAGA--T-T-----CAAGATTCAAGA-TT-----TCTTT-------A-------C--------T--------T-ANACGTATA-------ATGTTTCTC-------------ANTACATACA-----T-ATA-------T-------------CA--------------ATATATT---TATTTATGTCANATGAAGTATCTT------CAATTCTAACATCTCACTAGCATCCCATAATGTTACA
Reference ( family-580 ) : TGTNGCATAATCG--A--C-TCAA---CA--AC--TCT---T-GTATATC-A--TAAGT-AAATTTTATTCACATANTTATAAAGTTCTC----ATA--AG--TTCAAAGTCAC-AA-GCTAACATTTTT--AAACTCGCTANCGCTCGTTT-A-AA-CTAAACCTA----------G--------TCT-------AA--C---TG-ACATGTTACTC----TGA-C-C-G-----TGNCTANAACTT--AACTG-----ACTG--T-CCNCT-C-T-TG-CTAAAA-CCAGTCCCTGANTGAATAAACAACT-A------------TTCTA--TC---------ATT-GGTCAATTCATTNCTACNTTNC-TATTGGTCAG-GTTACTAATTACNGA---TC--TTA--A--AGTCC--------A--------GCC----------C----------AC-A----A--TTAC--------CT--TGTCA-A-CAA-------TACATCAAGATAACCCT-AGGCTA----TCATT----TATCTC-CAGTAANCTGTCATCC-TA--TCT-CA---TTAAACTG-----TCA--TAGA--T-T-----CAAGATTCAAGA-TT-----TCTTT-------A-------C--------T--------T-ANACGTATA-------ATGTTTCTC-------------ANTACATACA-----T-ATA-------T-------------CA--------------ATATATT---TATTTATGTCANATGAAGTATCTT------CAATTCTAACATCTCACTAGCATCCCATAATGTTACA
gi|102981 : TGTCGCATAATCG--A--C-TCAA---CA--AC--TCT---T-GTATATC-A--TAAGT-AGATTTTATTCACATAATTATAAAGTTCTC----ATA--AG--TTCAAAGTCAC-AA-GCTAACATTTTT--AAACTCGCTACTGCTCGTTT-A-AA-CTAAACCTA----------G--------TCT-------AA--C---TA-ACATCTTACTC----TGA-C-C-G-----TGGCTAAAACTT--AACTG-----ACTG--T-CCACT-C-TATG-CTAAAA-CCAGTCCCTGAATGAATAAACAGCT-A------------TTCTC--TC---------ATT-GGACAATTAATTCCTACATTAC-TATTGGTCAA-TTAACCAATTACCGA---TC--TTA--A--AGTCC--------A--------GCC----------C----------AC-A----A--TTAC--------CT--TGACA-G-CAA-------TACATCAAGATAACCCT-AGGCTA----TCATT----TATCTC-CAGTAAACTGTCATCC-TA--TCT-CA---TTAAACTG-----TCA--TAGA--T-T-----CAAGATTCAAGA-CT-----TCCTC-------A-------C--------T--------T-ATACGTACA-------ATGTTTCTC-------------AATACATACA-----T-ATA-------T-------------CA--------------ATATTTT---TATTTATGTCAAATGAAGTATCTT------CAATTCTAACATCTCACTAGCATCCCATTATGTTACA
gi|102982 : TGTTGCATAATCG--A--C-TCAA---CA--AC--TCT---TTGTATATC-A--TATGT-AAATTTTATTCACATAATTATAAAGTTATC----ATA--AG--TTCAAAGTCAC-AA-ACTTACATTTTT--AAACTCGCTTCCGCTCGTTT-A-AA-GTAAACCTA----------G--------TCT-------AA--C---TA-ACATCTTACTC----TGA-C-C-G-----TGGCTATAACTC--AACTA-----ACTG--A-CTTGT-C-TCTG-CTAAAA-ACAGTATCTGAATGAATAAACAACT-A------------TTTTA--TC---------ATT-GGACAATTCATTTTTACATTAC-TATTGGTCAG-TAAACTAATTACCGA---TC--TTA--A--AGTCC--------A--------GCC----------C----------AC-A----ACATTAA--------CT--TGACA-A-CAA-------TACATCAAGATAACCCT-AGGCTA----TCATT----TATCTC-CAGTAAACTGTCATCC-TA--TCT-CA---TTCAACTG-----TCA--TAGA--T-T-----CAAGATTCAAGA-TT-----TCTTT-------A-------C--------T--------T-ATACGTATA-------ATGTTTCTC-------------AATACATACA-----T-ATA-------T-------------CA--------------CTATATT---TATTTATGTCAGATGAAGTATCTT------CAATTCTAACATCTCACTAGCATCCCATAATGTTACA
gi|102983 : TGTTGCATAATCG--A--C-TCAA---CA--AC--TCT---T-GTATATC-A--TAAGT-AAATTTTATTCACATAATTATAAAGTTCTC----ATA--AG--TTCAAAGTCAC-AA-GCTAACATTTTT--AAACTCTCTACTGCTCGTTT-A-AA-CTAAACCTA----------GACTAGAAGTCT-------AA--C---T---CATGTTACTC----TGA-C-C-G-----TGGCTAAAACTT--AACTG-----ACTG--T-CCACT-C-TATG-CAAAAA-CCAGTCCCTGGATGAATAAACAACT-A------------TTCTA--TC---------ATT-GGCCAATTCATTTCTACATTTC-TATTGGTCAA-TAAACTAATTTCAGA---TC--TTA--A--AGTCC--------A--------GTC----------C----------AC-A----A--TTAA--------CT--TGACA-A-CAA-------TACATCAAGATAACCCT-AGGCTA----TCATT-----ATCTC-CAGTAAATTGTCATCC-TA--TCT-CA---TTAAACTG-----TCA--TAGA--T-T-----CAAGATTCAAGA-TT-----TCTTT-------A-------C--------T--------T-ATACGTATA-------ATGTTTCTC-------------AATACATGCA-----T-ATA-------T-------------CA--------------ATATATT---TATTTATGTCAAATGAAATATCGT------CAATTCTAACATCTCACTAGCATCCCATAATGTTACA
gi|102984 : TGTTGCATAATAG--A--C-TCAA---CA--AC--TCT---T-GTATATC-A--TAAGT-AAATTTTATTCACATAATTATAAAGTTCTC----ATA--AG--TTCAAAGTCAC-AA-GCTAACATTTTT--AAACTCGCTACTGCTCGTTT-A-AA-CTAAACCTA----------G--------TCT-------AA--C---TA-ACATCTTACTC----TGA-C-C-G-----TGGCTCAAACTC--AACTG-----TCTG--T-CCACT-C-TATG-CTAAAC-ACAGTCTCTGAATGAATAAACAGCT-A------------TTCTC--TC---------ATT-GGACAATTAATTCCTACATTAC-TATTGGTCAG-TTAACCAATTACCGA---TC--TTA--A--AGTCC--------A--------GCC----------C----------AC-A----A--TTAC--------CT--TGACA-G-CAA-------TACATCAAGATAACCCT-AGGCTA----CCATT----TATCTCTCATTTAACTGTCATCC-TA--TCT-CA---TTAAACTG-----TCA--TAGA--T-T-----CAAGATTCAAGA-CT-----TCCTC-------A-------C--------T--------T-ATACGTATA-------ATGTTTCTC-------------AATACATACA-----T-ATA-------T-------------CA--------------ATATATT---TATTTATGTCAAATGAATTATCTT------CAATTCTAACATCTCACTAGCATCCCATAATGTTACA
gi|102985 : TGTCGCATAATCG--A--C-TCAA---CA--AC--TCT---T-GTATATC-A--TAAGT-AAATTTTATTCACATAAATATAAAGTTCTC----ATC--AG--TTCAAAGTCAC-AA-GCTAACATTTTT--AAACTCGCTACTGCTCGTTT-A-AA-CTAAACCTA----------G--------TCT-------AA--C---TA-ACATCTTACTC----TGA-C-C-G-----TGGCTCAAACTC--AACTC-----CCTG--T-CCACT-C-TATG-CTAAAA-CCAGTCCCTGAATGAATAAACAGCT-A------------TTCTC--TG---------ATT-GGACAATTAA-TCCTATATTAC-TATTGGTCAG-TTAACCAATTACCGA---TC--TTA--A--AGTCC--------A--------GCC----------C----------AC-A----A--TTAC--------CT--TGACA-G-CAA-------TACATCAAGATAACCCT-AGGCTA----TCATT----TATCTC-CAGTAAACTGTCATCC-TA--TCT-CA---TTAAACTG-----TCA--TAGA--T-T-----CAAGATTCAAGACTT-----CCTTT-------A-------T--------T--------T-ATACGTATA-------ATGTTTCTC-------------AATACATACA-----T-ATA-------T-------------CA--------------ATATATT---TATTTATGTCAAATGAAGTATCAT------CAATTCTAACATCTCACTAGCATCCCATAATGTTACA
gi|102986 : TGTTGCATAATCG--A--C-TCAA---CA--AC--TCT---T-GTATATC-A--TAAGT-AAATTTTATTCACATAATTATAAAGTTCTC----ATA--AT--TTCAAAGTCAC-AA-GCTAACATTTTT--AAACTCGCTACTGCTCGTTT-A-AA-CTAAACCTA----------G--------TCT-------AA--C---TC-ACATCTTATTC----TGA-C-C-G-----TGGCTAAAACTT--AACT-------CCT--T-TCTCT-C-T-C--CTGAAA-ACAGTCTCTGAATGAATAAACAACT-A------------TTCTA--TC---------ATT-GGCCAATTCATTTCTACATTTC-TATTGGTCAA-TAAACTAATTACAGA---TC--TTA--A--AGTCC--------A--------GCC----------C----------AC-A----A--TTAA--------CT--TGACA-A-CAA-------TACATCAAGATAACCCT-AGGCTA----TCATT----TATCTC-CAGTAAACTGTCATCC-TA--TCT-CA---TTAAACTG-----TCA--T---------------AGATTCAAGA-TT-----TCTTT-------A-------C--------T--------A-ATACGTTTA-------ATGTTTCTC-------------AATACCTACA-----T-ATA-------T-------------CA--------------ATATATT---TATATATGTCAAATGAAGTATCTT------CAATTCTAACATCTCACTTGCACCCCATAATGTTACA
gi|102987 : TGTTGTATATTCG--A--C-TCAA---C-------TCT---TTGTATATC-AAGTAAATTGAATTTTATTCACATAATTATAACGTTCGC----ATA--AG--TTCAAAGTCAC-AA-TCTAACATTTTT--AAACTCGCTAACGCTCGTTT-A-AA-CTAACCCTA----------G--------TCT-------AA--C---TG-ACATGTTACTC----TGT-A-T-G-----TGTCTAAAAACC--AACTG-----ACTG--A-CTTCT-C-TCTG-CTAAAA-CCAGTCTCTGAATAAATAAACAACT-A------------TTATA--TC---------ATT-GGTCAATTCATTTCTACTTTTC-TATTGGTCAGTATT-CTAATTACAGA---TC--TTA--A--AGACC--------A--------ACC----------C----------AC-AAC--A--TTAC--------CT--TGTCA-A-CAA-------TACATCAAGATAACCCT-AGGCTA----TCATT----TTTCTC-CAGTAAACTGTCATCC-TA--TCT-CA---TTAAACTG-----TCA--GAGA--T-T-----CAAGATTCAAGA-TT-----TATTTGTTTGTAA-------C--------T--------T-ATCCATATA-------ACGTTTCTC-------------ATTACATACA-----T-ATATT-----T-------------CAAT------------ATATATT---TATTTATGTCATATGAAGTATCTC------AAATTCTAA-----------CATCCCATAATGTTACA
gi|102988 : TGTGGTATAATCG--A--C-TCAA---CA--AC--TTTCTTT-GTATA---A--TAAGT-AAACCTTATTCACAGGATTATAAAGTTCGC----ATA--AG--TTCAAAGTCAC-AC-GCTTACATTTTT--AAACTCGCTATTGCTCGTTT-A-AA-CTTACCCTA----------G--------TCT-------AA--C---TG-ACAAGTTACTT----TGT-C-C-G-----TGTCTGTACCCT--CGCTG-----AATGACT-TAACT-C-T-C--CTAAAA-TCAGTCCCTGAATGTACAAACAACT-A------------TTCTA--TC---------ATT-GGTCAATTCATTTCTACTTTTC-TATTGGTCAGTATT-CTAATTACATA---TC--TTA--A--GGACC--------A--------GCC----------C----------AC-AAC--A--TTAA--------CT--TGTCA-A-CAA-------TACATCAAGATAACCCT-AGGTTA----TAATT----TAACTC-CAGTAATCTGTCATCC-TA--TCT--A---TTAAACCG-----TCA--TA
gi|102989 : TGTGGTATAATCG--A--C-TCAA---CA--ACGTTCT---TTGTATA---A--TAAGT-AAATTTTATTCACATAATTATAAAGTTTGC----ATA--AG--TTCAAAGTCAC-AA-ACTAACATTTTT--AAACTCGCTATCGCTCGTTT-A-AA-CTAACCCTA----------A--------TCT-------AA--G---TG-ACATGTTACTC----TGT-C-T-G-----TGTATACACCCT--GACTG-----AAGG--A-CTTGT-C-T--A-CTTAAA-CCAGTCCCTGAATAAATAAACAACT-T------------TTCTA--TC---------AGT-GGTCAATTCATTTCTACTTTTC-TATTGGTCAGTATT-CTAATTACAGA---TC--TTA--A--GATCC--------A--------GCC----------C----------ACAA----A--TTAA--------C---TGTCA-C-CTA-------TACATCAAGATAACCCT-AGACTA----TTATT----TATCTC-CAGTAACATGTCATCC-TG--TCC-TA---TTAACCTG-----TCA--TA
gi|102990 : TGTGGAACAACCG--A--C-TCAA---CT--ATGTTCT---TTGTATA-------AAGT-AAATTTTATTCACATTGTTATAAAGTTTGG----ATA--AG--TTCTAAGTCAC-AA-GCTAACATTTTT--AAACTCGCTCTCGCTGGTTT-A-AA-CTAACTCTA----------G--------TCTA------AA--C---TG-ACAGGTTAA-C----AGATT-C-G-----CATCTACATTCT--AACTG-----AAGG--A-CTTAT-C-TCTA-CTAAAA-CCAGTCCCTGACTGAATAACAAACT-A------------TCCTA--TG---------ATT-GGCCAATTCATTGCTACTTTTA--ATTGGTCAGTATT-TTACTTACATG---TC--TTA--A--GATCC--------T--------GCC----------C----------ACAA----A--CTAA--------C---TGTCA-G-CTA-------TACATCAAGATAACCCT-AGACTA----TTATT----TATCTC-CAGTAACCTGTAATCC-TA--TCT-TA---TTAAACCG-----TCA--TActatgtacatacaattcttaactaccataatataacatcacatgcgcatagctaaacacaaataatatgtttgtcgtttatgaaatcatgcatc
gi|102991 : TGTGGCATAATCG--A--A-TCAA---CA--AC--T-T---T-GTAC----------------TTTTATTCACATATTTATATAGTACGC----ATA--AG--TTCAAAGTCAC-AA----AACATTTT---AAACTCGCATTCGCTCGTTT-A-AA-CTAAACCTA----------G--------TCT-------AA--T---TT-ACATGTTACCC----TGT-T-C-G-----TATCTACATTCT--GACTG-----AAGG--A-CCTAT-C-TCTA-CCAAAA-CCAGTCCCTGACTGAATAACCAACT-A---------------------------------------------TCCTACTTTTT-AATTGGTCAGTATTA-TAATTACAGG---TC--GTA--A--GATCC--------C--------GCC----------C----------ACAA----A--CTAA--------C---TGTCA-A-CTG-------T-CATCAAGATAACCCT-AGGCTA----TTATT----TATC-------------TCATAC-TA--TCT-AA---TTAACCTG-----TCA--TA-A--TAT-----GTACATACAA----T-----TTTTA-------A-------C--------TAC------C-ATA-ATATA-------ACATTCCTCCCATGTTTAAGATAAAATATATA-----T-GTA-------C-------------TA--------------ATATATT---T
gi|102992 : TGTAGTATAACAGGTA--C-TCAAA--CATGGT--TGT---T-TTATAT--A---AAGT-CA-TTTTATTTACATGTTTATATATTTTGC----ATATAAG--TTCGAAATCAC-AAAGCTAACATTTT---AAAGTCGCTTATGCTCATCT-A-AAACTAAACTTA----------G--------TGT-------AAAAC---TG-ACATGTTACCA----TGC-T-C-G-----AGATTAC--CTTCGGACTG-----ACCT--T-CC-CT-C-T----CTAAAA-TCTGTCTCTAACTGAATAAACAACT-A------------TGCTA--TG---------ATT-GGTCAATTCATTGCTACCTTCC-AATTGGTTGG-TTTCTTAATTACAGA---CA--TTA--A--AATCC--------C--------GCC----------CTTATCATATGAC-A----A---AAC--------CTACTGTCA-A-CTA-------CACATCATGATAA-CCT-AGGCTA----TTATT----TATCTC-CAGTAGCCTGTCATCC-TA--TCT-TA---TTAATCTG-----TCA--TAttctctattgtaatcagattattttatctcagttctggaaca
gi|102993 : TGTGGTATAACAG--A--CACCAA---CATGAT--TGT---T-TTGTAT------AAGT-AA-TTTTATTCACATATTTATATAGTTTGC----ATA--AAAATTAAAAGTCAC-AAAGCGAACATTTT---AAACTCGCCTTCGCTCATCT-A-AA-CTAAACCTA----------G--------TTT-------AAA-C---TG-ACATGTTAC-C----AGA-T-TTG-----CATCTACTTTCT--AAATG-----ACTG--C-CCTTC-C-T-CT-CTAAAAATCTGGCTCTGACTGAATAACCAACT-C------------TGCTA--TA---------ATT-GGTCAATTCATTGCTACCTTTC-GATAGGTCAG-ATTCTTAATTACGGA---CC--TTA--A--AACCC--------C--------ACC----------C----------AT-ATCATA--TGACAAAACCTACT--T-TCA-G-CAA-------CACATCATGATAACCCTAAGACTA----TTA-T----AATCTC-CATTAGCCTGTGTTCC-TA--TCT-CA---TTAGCCTG-----TCA--TA
gi|102994 : TGTAGTATAACCG--A--C-TCAAATATG--GT--TGT---T-TTATA-C-A---AAGT-CAATTT-ATTCACATGTTTTTATATTTCTC----ATATAAG--TTCGAAATCAC-AAAGCTAACATTGT---AAACTCGCTTTCGTTCGTCTGA-AA-CTAAACCTA----------G--------TCT-------AAAAC---TG-ACATGTTACTA-----GA-CTC-G-----AGGTTACTTTCT--AACAGCCAGAACTT--T-CCTCT-C-T-A----AAAA-TCATTCTCTGACTGAATAAACAACT-A------------ACCTA--TG---------ATTTGGTCAATTCATTGCTACTTCCC-AATTGGTC-G-TTTCTTAATTATGAAGGTTC--ATAACA--ACTCCCCCATCATA--------TCA----------C----------AC-A----A--CTAC--------C---TGTCA-A-ATA-------TACAACATAATAAGCCTAAGGCTA----TAATT----TATCTC-CATTAGCCTGTCATC
gi|102995 : TGTAGTATAACAG--ATAC-TCAA---AC--AT--GAT---T-GTTTTTCTA--TATGT-CA-TTTTATTAACATATTTATC---TTTTTGCATATA--AG--TTCAAAATCACAAA-GCTGACA-TTTT--AAACTCACTAATGCTCGTCT-ATAG-CTAAACCTT----------G--------TCTA------AA--A---TGAAAATGTTG---------------G-----TGTTTAG--CTTTCTGCTG-----ACAG--A-CCTTTCC-T-CT-CTAAAA-TCTGTCTCTGACTGAATAAACAACT-A------------TCTTA--TC---------ATT-GGTCAATTCACTGTTACTTACC-AATTGGTCAG-TTTCTCAATTATGAAGGCTC--ATA--ACCCCTCC--------A---------CCGATCATATCAC----------AC-A----A--CTAC--------C---TGTCA-A-ATA-------TACAACATGATAAACCTAAGGCTA----TAATA----TATCTC-CATTAGCCTGTCATC
gi|102996 : TGTTGCATAATCG--A--C-TCAA---CG--A--------------TA-------AAGT-AAATTTTATTCACATAATTATAAAGTTCGC----ATC--AG--TTCAAAGTCAC-AA-GCTATCTTTTTTTAAAACTCGCTATCGCT
gi|102997 : TGTCGCATAATCG--A--C-TCAA---CA--AC--TCT---T-GTATATC-A--TAAGT-AAATTTT
gi|102998 : TAATCG--A--C-TCAA---CA--AC--TCT---TTGTATATC-A--TAAGT-AAATTTTATTCACATAATTATAAAATTCTC----CTA--AG--TTCAAAGTCAC-AA-GCTTACATTTTT--AAACTCGCTACTGCTCGTTT-A-AA-CTAAACCTA----------G--------TCT-------AA--C---TA-ACATCTTACTC----TGA-C-C-G-----TGGCTAAAACTT--AACTG-----ACTG--T-CCGCT-CTT-TG-TCAAAA-CCAGTTCCTGAATGAATAAACAGCT-T------------TTCTA--TT---------ATT-GGACAATTCATTTCTACATTGC-TATTGGTCAGTATT-TTAATTACAGA---TC--TTA--A--AGACC--------A--------GCC----------C----------AC-AAC--A--TTAA--------CT--TGTCA-A-CAA-------TACATCAAGATAACCCT-AGGCTA----TCATT----TATCTC-CAGTAAACTGTCATCC-TA--TCT--A---CTAAACTG-----TCA--TAGA--T-T-----CAAGATTCAAGA-TT-----TCTTT-------A-------C--------T--------T-ATACATATA-------ATGTTTCTT-------------AATACATACA-----T-ATA-------T-------------CA--------------ATATATT---TATTTATGGCATATGAAGTATCTA------CAATTCTAA-A------------CCCATAATGTTACA
gi|102999 : --TTT---T-ATATA-------AAGT-CA-TTTTATTCACATGTTCATGTATTTCTC----ATATAAG--TTCGAAATCACGAA-GCTAACATTTT---ATACTCGCTGACGCTCGTCT-A-AAACTAGACATA----------G--------TCT-------AAAAC---TG-A-ATGTTACCA----TGT-T-G-G-----TATCTAG--CTTTCAACTG-----ACAG--A-CCTTT-C-C-TCTCTAAAA-TCTTTCTCTGACTGAATAAACAGCTTA------------TCTTA--TC---------ATT-TGTCAATTCATTGTTACTTCCC-AGTTGGTCAG-TTTCTTAATAATGAAGGTTC--ATA--ACCCCTCCCCCATCATA--------TCA----------C----------AC-A----A--CTAC--------C---TGTCA-A-ATA-------TACAACATGATAAACCTAAGGCTA----TAATT----TATCTT-CTTTAGCCTGTCATCTGTAAGTGA-CATGGTTGACCT------TTA--TAAA--T-TATAAACAAAATTTAAGA-AT-----TGTAT-------A-------CA-------T--------T-AAA-G---A-------A---TTCTTA------------ACTAC---CA-----TAATA-------T--------------A--------------ACATAT
gi|103000 : --TTT---T-ATATA-------AAGT-CA-TTTTATTCAAATTTTTATATATTTCTC----AT-------TT--AAGTCAC-AAAGCTAACATTTT---AAACTCGCTAAATATCGTCT-A-AA-ACCAATCTA----------T--------TCT-------AA--CACTTG-TCATGTTACCCTACTTGA-C-G-C-----TTCCT----TTC--AACTA-----ACCG--TGTTACC-C-T-CA-CTGAGG-TTTTTCTCTAACTGACCAAAC-ACT-ATCCCAAAGAGGCTTCTAGGTCATTTCCTTGATT-GGTCAATTTTTTATTACCTCAC-TATTGGTCAG-TTTCTTAATT------------TCA--A--AGTCC--------AATAACCCTGCC----------C----------A-----------TAT--------CT--TATCACATCAATCATCTCTATATCATGATAAGCTTAAGGCTA----CCACT----
gi|103001 : ATTTTATTCACATG--TATAAA--------------------TCAAAGTCAC-AA-GCTAACATTTTT---AACTCACTAATGTCAATCT-A-AA-ACCAACCTATTTTAACAAGG--------TCTATTTTTCAA--C---TT-ACATGTTACCC----TAA-C-C-ACTGTCTGTCTCTAAC-T--AACTA-----AACG--T-TCA-T-C-T-TC-CCAAAG---AGGCCTCGAGC---T------CT-T------------TTCTC--TG---------ATT-GGTCAACTCATTGTTACCTGGCTTATT-GTCAG-TTTCTTAATTACTTG---TCAATTA--A--A---C--------AC-------GCC----------C----------AT-ATCTTA--TCACAAAACCGACA--TGTCA-T-CTC-------TACATCATGATAAATCTAAGGCTATATCTTATTGTAACATATC-CATCTGCCTGATATTT-TA--TTTCCA---TTAGCTTG-----TCG--TATA--T-
gi|103002 : CT-A------------TTCTC--CC---------ATT-GGACAATTAATTCCTATATTAC-TATTGGTCAG-TTAACCAATTACCGA---TC--TTA--A--AGTCC--------A--------GCC----------C----------AC-A----A--TTAC--------CT--TGACA-G-CAA-------TACATCAAGATAACCCT-AGGCTA----TCATT----TATCTC-CAGTAAACTGTCATCC-TA--TCT-CA---TTAAACTG-----TCA--TAGA--T-T-----CAAGATTCAAGA-CT-----TCCTC-------A-------C--------T--------T-ATACGTACA-------ATGTTTCTC-------------AATACATACA-----T-ATA-------T-------------CA--------------ATATATT---TATTTATGTCAAATGAAGTATCTT------CAATTCTAACATCTCAGTAGCATCCCATAATGTTACA
gi|103003 : AAACTGGATATTCAGTTAGA--T-T-----CAAGATTCAAGA-TTCAAATTCTTT-------A-------T--------TCAGTAATTT-AAACATATA-------ATGTTTCTC-------------ATTACACACA-----A-AT--------T-------------CAG-------------ATA
gi|103004 : TA-----TCA--TAGAGAT-T-----CAAGATTCAAGA-TTCAAATTCTTT-------A-------TGCAGTAATT--------T-AAACATATA-------ATGTTTCTC-------------ATTACATACA-----A-AT--------T-------------CA--------------
gi|103005 : -----TTA--TAGA--T-T-----CAAGATTCAAGA-TTCAAATTCTTT-------A-------T--------TCAGTAATTT-AAACATATA-------ATGTTTCTC-------------ATTACACACA-----A-AT--------T-------------CAG-------------ATA
gi|103006 : -----TCA--TAGA--T-T-----CAAGATTCAAA---T-----TCTTT-------A-------T--------TCAGTAATTT-AAACATATA-------ATGTTTCTC-------------ATTTCATACA-----A-AT--------T-------------CAG-------------ATA
gi|103007 : A--TAGA--T-T-----CAAGATTCAAA---T-----TCTTT-------A-------T--------TCAGTAATTT-AAACATATG-------ATGTTTCTC-------------ATTACATACA-----A-AT--------T-------------CA--------------
gi|103008 : --TAGA--T-T-----CGAGATTCAAGA-TTCAGATTCTTT-------A-------T--------TCAGTAATTT-AAACATATA-------ATGTTTCTC-------------ATTACATACA-----A-AT--------T-------------CA--------------
gi|103009 : AGA--T-T-----CAAGATTCAAGT-TT-----TCTTCATTTGTAA-------C--------T--------T-AAACATATA-------ATGTTTCTC-------------ATTACATACA-----A-ATA-------TTAAACATACATC-CA--------------ATATATC---TATTTA--TCACGTGACACATTTTGTGCAACAATTC
gi|103010 : AGA--T-T-----CAAGATTTAAGA-TT-----TCTTT-------ATTTGTAAC--------T--------T-AAACTTATA-------ATGTTTCTT-------------ATTACAAACA-----T-ATATTT----T-------------CA--------------AT
gi|103011 : AGA--T-T-----CAAATTTCAAGA-TT-----TCTTTATTTGTAA-------C--------T--------T-AAACATATA-------ATGTTTCTG-------------ATTACATACA-----T-ATA-------G-------------TACACATAT-------ATATGTT---TATTTAT
gi|103012 : --T-T-----CAAGATTCAAGA-TT-----TCTTT-------A-------T--------T--------TGAAACTTAT--------TTGTTTCTT-------------ATTACATACATTTATT-ATACATACATT-------------CA--------------ATATATT---TATTTA--TCACGTGACACATTTTATGAAACAATTC
gi|103013 : --T-T-----AAAGATTCAAGA-TT------CTTT-------ATTGTAA-C--------T--------T-AAACATATA-------ATGTTTCTT-------------AAAACACACA-----T-ATA-------T-------------TATACATACATCCATTATATATT---TATTTA--TCACGTGACGCATTTT------
gi|103014 : --T-T-----CAAGATTCAAGA-TT-----TCTTT-------A-------T--------T--------T-GTACCTTTAACATGTTATGTTTCTC-------------ATAACATACA-----T-ATA-------T-------------TATAAC----------ATACATCCAATATATATGT
gi|103015 : -----CAAGATTCAAGA-TT-----TCTTTATTTGTAA-------C--------T--------T-AAACATATA-------ATATTTCTC-------------ATTGCATACA-----T-ATA-------TTATACAACACCTCCA--------------ATATATT---TATTTAT
gi|103016 : -----T-ATA-------T-------------CATAA-----------GTAAATT---T---TNNNNNNNNNNAAGTATCTT------CAATTCTAACATCTCAGTAGCATCCCATAATGTTACA
Alignments
lowQualScore : 1 1111111 1 111 11 2222 111111111111 111 11111111111111111 1111 111111111 1 11111 555555555555555555555555555555555 1111111111111 33333333333333333333333333333333333333 111111
lowQualScore : 1 33 33 2 666 66 55 1 333 0 9999999 2 3 3 1 1 4444 88 22 2 0 000 1 2 2 4 9999999999 77777777 6666666 22 555 0 2 1 4444 0 4 2 55555 1 888 55 22 55555 5 6666 33 6 5555 44 1 2 000000000000 22 888888888 2 2 1 1 1 33 333 6 000 22 22 55 0 99999999999999999 8888888888 8888888888 4 6666 44 555555555 777 0 2 2 1 6666666 0 2 4444 4444 2 1 2 33 22 444 44444 22 22 1 44444 1 66666 000000000000000000000000000000000 1 1 1 5555555 0000000000000 1 44444 1 55555555555555555555555555555555555555 444 0 1 777777
lowQualScore : . .. .. . ... .. .. . ... . ....... . . . . . .... .. .. . . ... . . . . .......... ........ ....... .. ... . . . .... . . . ..... . ... .. .. ..... . .... .. . .... .. . . ............ .. ......... . . . . . .. ... . ... .. .. .. . ................. .......... .......... . .... .. ......... ... . . . . ....... . . .... .... . . . .. .. ... ..... .. .. . ..... . ..... ................................. . . . ....... ............. . ..... . ...................................... ... . . ......
lowQualScore : 0 11 11 2 111 11 55 2 555 0 1111111 0 8 3 2 8 2222 22 88 0 0 999 0 1 1 2 2222222222 66666666 8888888 99 888 8 1 4 5555 4 2 1 33333 0 555 88 99 33333 0 4444 55 3 0000 66 0 0 222222222222 88 000000000 0 2 0 0 0 22 888 0 555 88 88 55 2 77777777777777777 8888888888 8888888888 0 8888 88 333333333 333 1 0 0 4 5555555 1 0 2222 2222 1 7 4 22 55 111 88888 44 33 7 22222 7 77777 111111111111111111111111111111111 7 0 8 4444444 8888888888888 0 00000 6 99999999999999999999999999999999999999 111 8 0 777777
consensus : TGTNGCATAATCG--A--C-TCAA---CA--AC--TCT---T-GTATATC-A--TAAGT-AAATTTTATTCACATAATTATAAAGTTCTC----ATA--AG--TTCAAAGTCAC-AA-GCTAACATTTTT--AAACTCGCTANCGCTCGTTT-A-AA-CTAAACCTA----------G--------TCT-------AA--C---TGACA-TGTTACTC----TGAC-C-G-----TGNCTANAACTT--A--ACTG-----ACCG--T-CCNCTC-T-C-GCTAAAA-CCAGTCCCTGANTGAATAAACAACT-A------------TTCTA--TC---------A-TTGGTCAATTCATTNCTACNTTNC-TATTGGTCAGTNTNCTAATTACGGA---TC--TTA--A--AGTCC--------A--------GCC----------C----------AC-A----A--TTAC--------CT--TGTCA-A-CAA-------TACATCAAGATAACCCT-AGGCTA----TCATT----TATCTC-CAGTAANCTGTCATCC-TA--TCT-CA---TTAAACTG-----TCA--TAGA--T-T-----CAAGATTCAAGA-TT-----TCTTT-------A-------C--------T--------T-ANACGTATA-------ATGTTTCTC-------------ANTACATACA-----T-ATA-------T-------------CA--------------ATATATT---TATTTATGTCANATGAAGTATCTT------CAATTCTAACATCTCACTAGCATCCCATAATGTTACA
Reference ( family-580 ) : TGTNGCATAATCG--A--C-TCAA---CA--AC--TCT---T-GTATATC-A--TAAGT-AAATTTTATTCACATAATTATAAAGTTCTC----ATA--AG--TTCAAAGTCAC-AA-GCTAACATTTTT--AAACTCGCTANCGCTCGTTT-A-AA-CTAAACCTA----------G--------TCT-------AA--C---TGACA-TGTTACTC----TGAC-C-G-----TGNCTANAACTT--A--ACTG-----ACCG--T-CCNCTC-T-C-GCTAAAA-CCAGTCCCTGANTGAATAAACAACT-A------------TTCTA--TC---------A-TTGGTCAATTCATTNCTACNTTNC-TATTGGTCAGTTTNCTAATTACGGA---TC--TTA--A--AGTCC--------A--------GCC----------C----------AC-A----A--TTAC--------CT--TGTCA-A-CAA-------TACATCAAGATAACCCT-AGGCTA----TCATT----TATCTC-CAGTAANCTGTCATCC-TA--TCT-CA---TTAAACTG-----TCA--TAGA--T-T-----CAAGATTCAAGA-TT-----TCTTT-------A-------C--------T--------T-ANACGTATA-------ATGTTTCTC-------------ANTACATACA-----T-ATA-------T-------------CA--------------ATATATT---TATTTATGTCANATGAAGTATCTT------CAATTCTAACATCTCACTAGCATCCCATAATGTTACA
gi|102981 : TGTCGCATAATCG--A--C-TCAA---CA--AC--TCT---T-GTATATC-A--TAAGT-AGATTTTATTCACATAATTATAAAGTTCTC----ATA--AG--TTCAAAGTCAC-AA-GCTAACATTTTT--AAACTCGCTACTGCTCGTTT-A-AA-CTAAACCTA----------G--------TCT-------AA--C---TAACA-TCTTACTC----TGAC-C-G-----TGGCTAAAACTT--A--ACTG-----ACTG--T-CCACTC-TAT-GCTAAAA-CCAGTCCCTGAATGAATAAACAGCT-A------------TTCTC--TC---------A-TTGGACAATTAATTCCTACATTAC-TATTGGTCAATTAACCAATTACCGA---TC--TTA--A--AGTCC--------A--------GCC----------C----------AC-A----A--TTAC--------CT--TGACA-G-CAA-------TACATCAAGATAACCCT-AGGCTA----TCATT----TATCTC-CAGTAAACTGTCATCC-TA--TCT-CA---TTAAACTG-----TCA--TAGA--T-T-----CAAGATTCAAGA-CT-----TCCTC-------A-------C--------T--------T-ATACGTACA-------ATGTTTCTC-------------AATACATACA-----T-ATA-------T-------------CA--------------ATATTTT---TATTTATGTCAAATGAAGTATCTT------CAATTCTAACATCTCACTAGCATCCCATTATGTTACA
gi|102982 : TGTTGCATAATCG--A--C-TCAA---CA--AC--TCT---TTGTATATC-A--TATGT-AAATTTTATTCACATAATTATAAAGTTATC----ATA--AG--TTCAAAGTCAC-AA-ACTTACATTTTT--AAACTCGCTTCCGCTCGTTT-A-AA-GTAAACCTA----------G--------TCT-------AA--C---TAACA-TCTTACTC----TGAC-C-G-----TGGCTATAACTC--A--ACTA-----ACTG--A-CTTGTC-T-CTGCTAAAA-ACAGTATCTGAATGAATAAACAACT-A------------TTTTA--TC---------A-TTGGACAATTCATTTTTACATTAC-TATTGGTCAGTAAACTAATTACCGA---TC--TTA--A--AGTCC--------A--------GCC----------C----------AC-A----ACATTAA--------CT--TGACA-A-CAA-------TACATCAAGATAACCCT-AGGCTA----TCATT----TATCTC-CAGTAAACTGTCATCC-TA--TCT-CA---TTCAACTG-----TCA--TAGA--T-T-----CAAGATTCAAGA-TT-----TCTTT-------A-------C--------T--------T-ATACGTATA-------ATGTTTCTC-------------AATACATACA-----T-ATA-------T-------------CA--------------CTATATT---TATTTATGTCAGATGAAGTATCTT------CAATTCTAACATCTCACTAGCATCCCATAATGTTACA
gi|102983 : TGTTGCATAATCG--A--C-TCAA---CA--AC--TCT---T-GTATATC-A--TAAGT-AAATTTTATTCACATAATTATAAAGTTCTC----ATA--AG--TTCAAAGTCAC-AA-GCTAACATTTTT--AAACTCTCTACTGCTCGTTT-A-AA-CTAAACCTA----------GACTAGAAGTCT-------AA--C---T--CA-TGTTACTC----TGAC-C-G-----TGGCTAAAACTT--A--ACTG-----ACTG--T-CCACTC-TAT-GCAAAAA-CCAGTCCCTGGATGAATAAACAACT-A------------TTCTA--TC---------A-TTGGCCAATTCATTTCTACATTTC-TATTGGTCAATAAACTAATTTCAGA---TC--TTA--A--AGTCC--------A--------GTC----------C----------AC-A----A--TTAA--------CT--TGACA-A-CAA-------TACATCAAGATAACCCT-AGGCTA----TCATT-----ATCTC-CAGTAAATTGTCATCC-TA--TCT-CA---TTAAACTG-----TCA--TAGA--T-T-----CAAGATTCAAGA-TT-----TCTTT-------A-------C--------T--------T-ATACGTATA-------ATGTTTCTC-------------AATACATGCA-----T-ATA-------T-------------CA--------------ATATATT---TATTTATGTCAAATGAAATATCGT------CAATTCTAACATCTCACTAGCATCCCATAATGTTACA
gi|102984 : TGTTGCATAATAG--A--C-TCAA---CA--AC--TCT---T-GTATATC-A--TAAGT-AAATTTTATTCACATAATTATAAAGTTCTC----ATA--AG--TTCAAAGTCAC-AA-GCTAACATTTTT--AAACTCGCTACTGCTCGTTT-A-AA-CTAAACCTA----------G--------TCT-------AA--C---TAACA-TCTTACTC----TGAC-C-G-----TGGCTCAAACTC--A--ACTG-----TCTG--T-CCACTC-TAT-GCTAAAC-ACAGTCTCTGAATGAATAAACAGCT-A------------TTCTC--TC---------A-TTGGACAATTAATTCCTACATTAC-TATTGGTCAGTTAACCAATTACCGA---TC--TTA--A--AGTCC--------A--------GCC----------C----------AC-A----A--TTAC--------CT--TGACA-G-CAA-------TACATCAAGATAACCCT-AGGCTA----CCATT----TATCTCTCATTTAACTGTCATCC-TA--TCT-CA---TTAAACTG-----TCA--TAGA--T-T-----CAAGATTCAAGA-CT-----TCCTC-------A-------C--------T--------T-ATACGTATA-------ATGTTTCTC-------------AATACATACA-----T-ATA-------T-------------CA--------------ATATATT---TATTTATGTCAAATGAATTATCTT------CAATTCTAACATCTCACTAGCATCCCATAATGTTACA
gi|102985 : TGTCGCATAATCG--A--C-TCAA---CA--AC--TCT---T-GTATATC-A--TAAGT-AAATTTTATTCACATAAATATAAAGTTCTC----ATC--AG--TTCAAAGTCAC-AA-GCTAACATTTTT--AAACTCGCTACTGCTCGTTT-A-AA-CTAAACCTA----------G--------TCT-------AA--C---TAACA-TCTTACTC----TGAC-C-G-----TGGCTCAAACTC--A--ACTC-----CCTG--T-CCACTC-TAT-GCTAAAA-CCAGTCCCTGAATGAATAAACAGCT-A------------TTCTC--TG---------A-TTGGACAATTAA-TCCTATATTAC-TATTGGTCAGTTAACCAATTACCGA---TC--TTA--A--AGTCC--------A--------GCC----------C----------AC-A----A--TTAC--------CT--TGACA-G-CAA-------TACATCAAGATAACCCT-AGGCTA----TCATT----TATCTC-CAGTAAACTGTCATCC-TA--TCT-CA---TTAAACTG-----TCA--TAGA--T-T-----CAAGATTCAAGACTT-----CCTTT-------A-------T--------T--------T-ATACGTATA-------ATGTTTCTC-------------AATACATACA-----T-ATA-------T-------------CA--------------ATATATT---TATTTATGTCAAATGAAGTATCAT------CAATTCTAACATCTCACTAGCATCCCATAATGTTACA
gi|102986 : TGTTGCATAATCG--A--C-TCAA---CA--AC--TCT---T-GTATATC-A--TAAGT-AAATTTTATTCACATAATTATAAAGTTCTC----ATA--AT--TTCAAAGTCAC-AA-GCTAACATTTTT--AAACTCGCTACTGCTCGTTT-A-AA-CTAAACCTA----------G--------TCT-------AA--C---TCACA-TCTTATTC----TGAC-C-G-----TGGCTAAAACTT--A--ACT-------CCT--T-TCTCTC-T-C--CTGAAA-ACAGTCTCTGAATGAATAAACAACT-A------------TTCTA--TC---------A-TTGGCCAATTCATTTCTACATTTC-TATTGGTCAATAAACTAATTACAGA---TC--TTA--A--AGTCC--------A--------GCC----------C----------AC-A----A--TTAA--------CT--TGACA-A-CAA-------TACATCAAGATAACCCT-AGGCTA----TCATT----TATCTC-CAGTAAACTGTCATCC-TA--TCT-CA---TTAAACTG-----TCA--T---------------AGATTCAAGA-TT-----TCTTT-------A-------C--------T--------A-ATACGTTTA-------ATGTTTCTC-------------AATACCTACA-----T-ATA-------T-------------CA--------------ATATATT---TATATATGTCAAATGAAGTATCTT------CAATTCTAACATCTCACTTGCACCCCATAATGTTACA
gi|102987 : TGTTGTATATTCG--A--C-TCAA---C-------TCT---TTGTATATC-AAGTAAATTGAATTTTATTCACATAATTATAACGTTCGC----ATA--AG--TTCAAAGTCAC-AA-TCTAACATTTTT--AAACTCGCTAACGCTCGTTT-A-AA-CTAACCCTA----------G--------TCT-------AA--C---TGACA-TGTTACTC----TGTA-T-G-----TGTCTAAAAACC--A--ACTG-----ACTG--A-CTTCTC-T-CTGCTAAAA-CCAGTCTCTGAATAAATAAACAACT-A------------TTATA--TC---------A-TTGGTCAATTCATTTCTACTTTTC-TATTGGTCAGTATTCTAATTACAGA---TC--TTA--A--AGACC--------A--------ACC----------C----------AC-AAC--A--TTAC--------CT--TGTCA-A-CAA-------TACATCAAGATAACCCT-AGGCTA----TCATT----TTTCTC-CAGTAAACTGTCATCC-TA--TCT-CA---TTAAACTG-----TCA--GAGA--T-T-----CAAGATTCAAGA-TT-----TATTTGTTTGTAA-------C--------T--------T-ATCCATATA-------ACGTTTCTC-------------ATTACATACA-----T-ATATT-----T-------------CAAT------------ATATATT---TATTTATGTCATATGAAGTATCTC------AAATTCTAA-----------CATCCCATAATGTTACA
gi|102988 : TGTGGTATAATCG--A--C-TCAA---CA--AC--TTTCTTT-GTATA---A--TAAGT-AAACCTTATTCACAGGATTATAAAGTTCGC----ATA--AG--TTCAAAGTCAC-AC-GCTTACATTTTT--AAACTCGCTATTGCTCGTTT-A-AA-CTTACCCTA----------G--------TCT-------AA--C---TGACA-AGTTACTT----TGTC-C-G-----TGTCTGTACCCT--C--GCTG-----AATGACT-TAACTC-T-C--CTAAAA-TCAGTCCCTGAATGTACAAACAACT-A------------TTCTA--TC---------A-TTGGTCAATTCATTTCTACTTTTC-TATTGGTCAGTATTCTAATTACATA---TC--TTA--A--GGACC--------A--------GCC----------C----------AC-AAC--A--TTAA--------CT--TGTCA-A-CAA-------TACATCAAGATAACCCT-AGGTTA----TAATT----TAACTC-CAGTAATCTGTCATCC-TA--TCT--A---TTAAACCG-----TCA--TA
gi|102989 : TGTGGTATAATCG--A--C-TCAA---CA--ACGTTCT---TTGTATA---A--TAAGT-AAATTTTATTCACATAATTATAAAGTTTGC----ATA--AG--TTCAAAGTCAC-AA-ACTAACATTTTT--AAACTCGCTATCGCTCGTTT-A-AA-CTAACCCTA----------A--------TCT-------AA--G---TGACA-TGTTACTC----TGTC-T-G-----TGTATACACCCT--G--ACTG-----AAGG--A-CTTGTC-T---ACTTAAA-CCAGTCCCTGAATAAATAAACAACT-T------------TTCTA--TC---------A-GTGGTCAATTCATTTCTACTTTTC-TATTGGTCAGTATTCTAATTACAGA---TC--TTA--A--GATCC--------A--------GCC----------C----------ACAA----A--TTAA--------C---TGTCA-C-CTA-------TACATCAAGATAACCCT-AGACTA----TTATT----TATCTC-CAGTAACATGTCATCC-TG--TCC-TA---TTAACCTG-----TCA--TA
gi|102990 : TGTGGAACAACCG--A--C-TCAA---CT--ATGTTCT---TTGTATA-------AAGT-AAATTTTATTCACATTGTTATAAAGTTTGG----ATA--AG--TTCTAAGTCAC-AA-GCTAACATTTTT--AAACTCGCTCTCGCTGGTTT-A-AA-CTAACTCTA----------G--------TCT-------AAA-C---TGACA-GGTTAA-C----AGATTC-G-----CATCTACATTCT--A--ACTG-----AAGG--A-CTTATC-T-CTACTAAAA-CCAGTCCCTGACTGAATAACAAACT-A------------TCCTA--TG---------A-TTGGCCAATTCATTGCTACTTTTA--ATTGGTCAGTATTTTACTTACATG---TC--TTA--A--GATCC--------T--------GCC----------C----------AC-A----AA-CTAA--------CT---GTCA-G-CTA-------TACATCAAGATAACCCT-AGACTA----TTATT----TATCTC-CAGTAACCTGTAATCC-TA--TCT-TA---TTAAACCG-----TCA--TActatgtacatacaattcttaactaccataatataacatcacatgcgcatagctaaacacaaataatatgtttgtcgtttatgaaatcatgcatc
gi|102991 : TGTGGCATAATCG--A--A-TCAA---CA--AC--T-T---T-GTAC----------------TTTTATTCACATATTTATATAGTACGC----ATA--AG--TTCAAAGTCAC-AA----AACATTTT---AAACTCGCATTCGCTCGTTT-A-AA-CTAAACCTA----------G--------TCT-------AA--T---TTACA-TGTTACCC----TGTT-C-G-----TATCTACATTCT--G--ACTG-----AAGG--A-CCTATC-T-CTACCAAAA-CCAGTCCCTGACTGAATAACCAACT-A---------------------------------------------TCCTACTTTTT-AATTGGTCAGTATTATAATTACAGG---TC--GTA--A--GATCC--------C--------GCC----------C----------ACAA----A--CTAA--------C---TGTCA-A-CTG-------T-CATCAAGATAACCCT-AGGCTA----TTATT----TATC-------------TCATAC-TA--TCT-AA---TTAACCTG-----TCA--TA-A--TAT-----GTACATACAA----T-----TTTTA-------A-------C--------TAC------C-ATA-ATATA-------ACATTCCTCCCATGTTTAAGATAAAATATATA-----T-GTA-------C-------------TA--------------ATATATT---T
gi|102992 : TGTAGTATAACAGGTA--C-TCAAA--CATGGT--TGT---T-TTATAT--A---AAGT-CA-TTTTATTTACATGTTTATATATTTTGC----ATATAAG--TTCGAAATCAC-AAAGCTAACATTTT---AAAGTCGCTTATGCTCATCT-A-AAACTAAACTTA----------G--------TGT-------AAAAC---TGACA-TGTTACCA----TGCT-C-G-----AGATTAC--CTTCGG--ACTG-----ACCT--T-CC-CTC-T-C---TAAAA-TCTGTCTCTAACTGAATAAACAACT-A------------TGCTA--TG---------A-TTGGTCAATTCATTGCTACCTTCC-AATTGGTTGGTTTCTTAATTACAGA---CA--TTA--A--AATCC--------C--------GCC----------CTTATCATATGAC-A----A---AAC--------CTACTGTCA-A-CTA-------CACATCATGATAA-CCT-AGGCTA----TTATT----TATCTC-CAGTAGCCTGTCATCC-TA--TCT-TA---TTAATCTG-----TCA--TAttctctattgtaatcagattattttatctcagttctggaaca
gi|102993 : TGTGGTATAACAG--A--CACCAA---CATGAT--TGT---T-TTGTAT------AAGT-AA-TTTTATTCACATATTTATATAGTTTGC----ATA--AAAATTAAAAGTCAC-AAAGCGAACATTTT---AAACTCGCCTTCGCTCATCT-A-AA-CTAAACCTA----------G--------TTT-------AAA-C---TGACA-TGTTAC-C----AGAT-TTG-----CATCTACTTTCT--A--AATG-----ACTG--C-CCTTCC-T-C-TCTAAAAATCTGGCTCTGACTGAATAACCAACT-C------------TGCTA--TA---------A-TTGGTCAATTCATTGCTACCTTTC-GATAGGTCAGATTCTTAATTACGGA---CC--TTA--A--AACCC--------C--------ACC----------C----------AT-ATCATA--TGACAAAACCTACT--T-TCA-G-CAA-------CACATCATGATAACCCTAAGACTA----TTA-T----AATCTC-CATTAGCCTGTGTTCC-TA--TCT-CA---TTAGCCTG-----TCA--TA
gi|102994 : TGTAGTATAACCG--A--C-TCAAATATG--GT--TGT---T-TTATA-C-A---AAGT-CAATTT-ATTCACATGTTTTTATATTTCTC----ATATAAG--TTCGAAATCAC-AAAGCTAACATTGT---AAACTCGCTTTCGTTCGTCTGA-AA-CTAAACCTA----------G--------TCT-------AAAAC---TGACA-TGTTACTA-----GACTC-G-----AGGTTACTTTCT--A--ACAGCCAGAACTT--T-CCTCTC-T-A----AAAA-TCATTCTCTGACTGAATAAACAACT-A------------ACCTA--TG---------ATTTGGTCAATTCATTGCTACTTCCC-AATTGGTC-GTTTCTTAATTATGAAGGTTC--ATAACA--ACTCCCCCATCATA--------TCA----------C----------AC-A----A--CTAC--------C---TGTCA-A-ATA-------TACAACATAATAAGCCTAAGGCTA----TAATT----TATCTC-CATTAGCCTGTCATC
gi|102995 : TGTAGTATAACAG--ATAC-TCAA---AC--AT--GAT---T-GTTTTTCTA--TATGT-CA-TTTTATTAACATATTTATC---TTTTTGCATATA--AG--TTCAAAATCAC-AAAGCTGACATTTT---AAACTCACTAATGCTCGTCT-ATAG-CTAAACCTT----------G--------TCT-------AA--AA--TGAAAATGTTG--------------G-----TGTTTAG--CTT--TCTGCTG-----ACAG--A-CCTTTCCT-C-TCTAAAA-TCTGTCTCTGACTGAATAAACAACT-A------------TCTTA--TC---------A-TTGGTCAATTCACTGTTACTTACC-AATTGGTCAGTTTCTCAATTATGAAGGCTC--ATA--ACCCCTCC--------A---------CCGATCATATCAC----------AC-A----A--CTAC--------C---TGTCA-A-ATA-------TACAACATGATAAACCTAAGGCTA----TAATA----TATCTC-CATTAGCCTGTCATC
gi|102996 : TGTTGCATAATCG--A--C-TCAA---CG--A--------------TA-------AAGT-AAATTTTATTCACATAATTATAAAGTTCGC----ATC--AG--TTCAAAGTCAC-AA-GCTATCTTTTTTTAAAACTCGCTATCGCT
gi|102997 : TGTCGCATAATCG--A--C-TCAA---CA--AC--TCT---T-GTATATC-A--TAAGT-AAATTTT
gi|102998 : TAATCG--A--C-TCAA---CA--AC--TCT---TTGTATATC-A--TAAGT-AAATTTTATTCACATAATTATAAAATTCTC----CTA--AG--TTCAAAGTCAC-AA-GCTTACATTTTT--AAACTCGCTACTGCTCGTTT-A-AA-CTAAACCTA----------G--------TCT-------AA--C---TAACA-TCTTACTC----TGAC-C-G-----TGGCTAAAACTT--A--ACTG-----ACTG--T-CCGCTCTT-T-GTCAAAA-CCAGTTCCTGAATGAATAAACAGCT-T------------TTCTA--TT---------A-TTGGACAATTCATTTCTACATTGC-TATTGGTCAGTATTTTAATTACAGA---TC--TTA--A--AGACC--------A--------GCC----------C----------AC-AAC--A--TTAA--------CT--TGTCA-A-CAA-------TACATCAAGATAACCCT-AGGCTA----TCATT----TATCTC-CAGTAAACTGTCATCC-TA--TCT--A---CTAAACTG-----TCA--TAGA--T-T-----CAAGATTCAAGA-TT-----TCTTT-------A-------C--------T--------T-ATACATATA-------ATGTTTCTT-------------AATACATACA-----T-ATA-------T-------------CA--------------ATATATT---TATTTATGGCATATGAAGTATCTA------CAATTCTAA-A------------CCCATAATGTTACA
gi|102999 : --TTT---T-ATATA-------AAGT-CA-TTTTATTCACATGTTCATGTATTTCTC----ATATAAG--TTCGAAATCACGAA-GCTAACATTTT---ATACTCGCTGACGCTCGTCT-A-AAACTAGACATA----------G--------TCT-------AAAAC---TGA-A-TGTTACCA----TGTT-G-G-----TATCTAG--CTTTCA--ACTG-----ACAG--A-CCTTTCCT-C-TCTAAAA-TCTTTCTCTGACTGAATAAACAGCTTA------------TCTTA--TC---------A-TTTGTCAATTCATTGTTACTTCCC-AGTTGGTCAGTTTCTTAATAATGAAGGTTC--ATA--ACCCCTCCCCCATCATA--------TCA----------C----------AC-A----A--CTAC--------C---TGTCA-A-ATA-------TACAACATGATAAACCTAAGGCTA----TAATT----TATCTT-CTTTAGCCTGTCATCTGTAAGTGA-CATGGTTGACCT------TTA--TAAA--T-TATAAACAAAATTTAAGA-AT-----TGTAT-------A-------CA-------T--------T-AAA-G---A-------A---TTCTTA------------ACTAC---CA-----TAATA-------T--------------A--------------ACATAT
gi|103000 : --TTT---T-ATATA-------AAGT-CA-TTTTATTCAAATTTTTATATATTTCTC----AT-------TT--AAGTCAC-AAAGCTAACATTTT---AAACTCGCTAAATATCGTCT-A-AA-ACCAATCTA----------T--------TCT-------AA--CACTTGTCA-TGTTACCCTACTTGAC-G-C-----TTCCT----TTC--A--ACTA-----ACCG--TGTTACCC-T-C-ACTGAGG-TTTTTCTCTAACTGACCAAAC-ACT-ATCCCAAAGAGGCTTCTAGGTCATTTCCTTGA-TTGGTCAATTTTTTATTACCTCAC-TATTGGTCAGTTTCTTAATT------------TCA--A--AGTCC--------AATAACCCTGCC----------C----------A-----------TAT--------CT--TATCACATCAATCATCTCTATATCATGATAAGCTTAAGGCTA----CCACT----
gi|103001 : ATTTTATTCACATG--TATAAA--------------------TCAAAGTCAC-AA-GCTAACATTTTT---AACTCACTAATGTCAATCT-A-AA-ACCAACCTATTTTAACAAGG--------TCTATTTTTCAA--C---TTACA-TGTTACCC----TAAC-C-ACTGTCTGTCTCTAAC-T--A--ACTA-----AACG--T-TCA-TC-T-T-CCCAAAG---AGGCCTCGAGC---T------CT-T------------TTCTC--TG---------A-TTGGTCAACTCATTGTTACCTGGCTTATT-GTCAGTTTCTTAATTACTTG---TCAATTA--A--A---C--------AC-------GCC----------C----------AT-ATCTTA--TCACAAAACCGACA--TGTCA-T-CTC-------TACATCATGATAAATCTAAGGCTATATCTTATTGTAACATATC-CATCTGCCTGATATTT-TA--TTTCCA---TTAGCTTG-----TCG--TATA--T-
gi|103002 : CT-A------------TTCTC--CC---------A-TTGGACAATTAATTCCTATATTAC-TATTGGTCAGTTAACCAATTACCGA---TC--TTA--A--AGTCC--------A--------GCC----------C----------AC-A----A--TTAC--------CT--TGACA-G-CAA-------TACATCAAGATAACCCT-AGGCTA----TCATT----TATCTC-CAGTAAACTGTCATCC-TA--TCT-CA---TTAAACTG-----TCA--TAGA--T-T-----CAAGATTCAAGA-CT-----TCCTC-------A-------C--------T--------T-ATACGTACA-------ATGTTTCTC-------------AATACATACA-----T-ATA-------T-------------CA--------------ATATATT---TATTTATGTCAAATGAAGTATCTT------CAATTCTAACATCTCAGTAGCATCCCATAATGTTACA
gi|103003 : AAACTGGATATTCAGTTAGA--T-T-----CAAGATTCAAGA-TTCAAATTCTTT-------A-------T--------TCAGTAATTT-AAACATATA-------ATGTTTCTC-------------ATTACACACA-----A-AT--------T-------------CAG-------------ATA
gi|103004 : TA-----TCA--TAGAGAT-T-----CAAGATTCAAGA-TTCAAATTCTTT-------A-------TGCAGTAATT--------T-AAACATATA-------ATGTTTCTC-------------ATTACATACA-----A-AT--------T-------------CA--------------
gi|103005 : -----TTA--TAGA--T-T-----CAAGATTCAAGA-TTCAAATTCTTT-------A-------T--------TCAGTAATTT-AAACATATA-------ATGTTTCTC-------------ATTACACACA-----A-AT--------T-------------CAG-------------ATA
gi|103006 : -----TCA--TAGA--T-T-----CAAGATTCAAA---T-----TCTTT-------A-------T--------TCAGTAATTT-AAACATATA-------ATGTTTCTC-------------ATTTCATACA-----A-AT--------T-------------CAG-------------ATA
gi|103007 : A--TAGA--T-T-----CAAGATTCAAA---T-----TCTTT-------A-------T--------TCAGTAATTT-AAACATATG-------ATGTTTCTC-------------ATTACATACA-----A-AT--------T-------------CA--------------
gi|103008 : --TAGA--T-T-----CGAGATTCAAGA-TTCAGATTCTTT-------A-------T--------TCAGTAATTT-AAACATATA-------ATGTTTCTC-------------ATTACATACA-----A-AT--------T-------------CA--------------
gi|103009 : AGA--T-T-----CAAGATTCAAGT-TT-----TCTTCATTTGTAA-------C--------T--------T-AAACATATA-------ATGTTTCTC-------------ATTACATACA-----A-ATA-------TTAAACATACATC-CA--------------ATATATC---TATTTA--TCACGTGACACATTTTGTGCAACAATTC
gi|103010 : AGA--T-T-----CAAGATTTAAGA-TT-----TCTTT-------ATTTGTAAC--------T--------T-AAACTTATA-------ATGTTTCTT-------------ATTACAAACA-----T-ATATTT----T-------------CA--------------AT
gi|103011 : AGA--T-T-----CAAATTTCAAGA-TT-----TCTTTATTTGTAA-------C--------T--------T-AAACATATA-------ATGTTTCTG-------------ATTACATACA-----T-ATA-------G-------------TACACATAT-------ATATGTT---TATTTAT
gi|103012 : --T-T-----CAAGATTCAAGA-TT-----TCTTT-------A-------T--------T--------TGAAACTTAT--------TTGTTTCTT-------------ATTACATACATTTATT-ATACATACATT-------------CA--------------ATATATT---TATTTA--TCACGTGACACATTTTATGAAACAATTC
gi|103013 : --T-T-----AAAGATTCAAGA-TT------CTTT-------ATTGTAA-C--------T--------T-AAACATATA-------ATGTTTCTT-------------AAAACACACA-----T-ATA-------T-------------TATACATACATCCATTATATATT---TATTTA--TCACGTGACGCATTTT------
gi|103014 : --T-T-----CAAGATTCAAGA-TT-----TCTTT-------A-------T--------T--------T-GTACCTTTAACATGTTATGTTTCTC-------------ATAACATACA-----T-ATA-------T-------------TATAAC----------ATACATCCAATATATATGT
gi|103015 : -----CAAGATTCAAGA-TT-----TCTTTATTTGTAA-------C--------T--------T-AAACATATA-------ATATTTCTC-------------ATTGCATACA-----T-ATA-------TTATACAACACCTCCA--------------ATATATT---TATTTAT
gi|103016 : -----T-ATA-------T-------------CATAA-----------GTAAATT---T---TNNNNNNNNNNAAGTATCTT------CAATTCTAACATCTCAGTAGCATCCCATAATGTTACA
Alignments
lowQualScore : 1 1111111 1 111 11 2222 111111111111 111 11111111111111111 1111 111111111 1 11111 555555555555555555555555555555555 1111111111111 33333333333333333333333333333333333333 111111
lowQualScore : 1 33 33 2 666 66 55 1 333 0 9999999 2 3 3 1 1 4444 88 22 2 0 000 1 2 2 4 9999999999 77777777 6666666 22 555 0 2 1 4444 0 4 2 55555 1 888 55 22 55555 5 6666 33 6 5555 44 1 2 000000000000 22 888888888 2 2 1 1 1 33 222 6 000 22 22 55 0 99999999999999999 8888888888 8888888888 4 6666 44 555555555 777 0 2 2 1 6666666 0 2 4444 4444 2 1 2 33 22 444 44444 22 22 1 44444 1 66666 000000000000000000000000000000000 1 1 1 5555555 0000000000000 1 44444 1 55555555555555555555555555555555555555 444 0 1 777777
lowQualScore : . .. .. . ... .. .. . ... . ....... . . . . . .... .. .. . . ... . . . . .......... ........ ....... .. ... . . . .... . . . ..... . ... .. .. ..... . .... .. . .... .. . . ............ .. ......... . . . . . .. ... . ... .. .. .. . ................. .......... .......... . .... .. ......... ... . . . . ....... . . .... .... . . . .. .. ... ..... .. .. . ..... . ..... ................................. . . . ....... ............. . ..... . ...................................... ... . . ......
lowQualScore : 0 11 11 2 111 11 55 2 555 0 1111111 0 8 3 2 8 2222 22 88 0 0 999 0 1 1 2 2222222222 66666666 8888888 99 888 8 1 4 5555 4 2 1 33333 0 555 88 99 33333 0 4444 55 3 0000 66 0 0 222222222222 88 000000000 0 2 0 0 0 22 111 0 555 88 88 55 2 77777777777777777 8888888888 8888888888 0 8888 88 333333333 333 1 0 0 4 5555555 1 0 2222 2222 1 7 4 22 55 111 88888 44 33 7 22222 7 77777 111111111111111111111111111111111 7 0 8 4444444 8888888888888 0 00000 6 99999999999999999999999999999999999999 111 8 0 777777
consensus : TGTNGCATAATCG--A--C-TCAA---CA--AC--TCT---T-GTATATC-A--TAAGT-AAATTTTATTCACATAATTATAAAGTTCTC----ATA--AG--TTCAAAGTCAC-AA-GCTAACATTTTT--AAACTCGCTANCGCTCGTTT-A-AA-CTAAACCTA----------G--------TCT-------AA--C---TGACA-TGTTACTC----TGAC-C-G-----TGNCTANAACTT--A--ACTG-----ACCG--T-CCNCTC-T-C-GCTAAAA-CCAGTCCCTGANTGAATAAACAACT-A------------TTCTA--TC---------A-TTGGTCAATTCATTNCTACNTTNC-TATTGGTCAGTNTNCTAATTACGGA---TC--TTA--A--AGTCC--------A--------GCC----------C----------AC-A----A--TTAC--------CT--TGTCA-A-CAA-------TACATCAAGATAACCCT-AGGCTA----TCATT----TATCTC-CAGTAANCTGTCATCC-TA--TCT-CA---TTAAACTG-----TCA--TAGA--T-T-----CAAGATTCAAGA-TT-----TCTTT-------A-------C--------T--------T-ANACGTATA-------ATGTTTCTC-------------ANTACATACA-----T-ATA-------T-------------CA--------------ATATATT---TATTTATGTCANATGAAGTATCTT------CAATTCTAACATCTCACTAGCATCCCATAATGTTACA
Reference ( family-580 ) : TGTNGCATAATCG--A--C-TCAA---CA--AC--TCT---T-GTATATC-A--TAAGT-AAATTTTATTCACATAATTATAAAGTTCTC----ATA--AG--TTCAAAGTCAC-AA-GCTAACATTTTT--AAACTCGCTANCGCTCGTTT-A-AA-CTAAACCTA----------G--------TCT-------AA--C---TGACA-TGTTACTC----TGAC-C-G-----TGNCTANAACTT--A--ACTG-----ACCG--T-CCNCTC-T-C-GCTAAAA-CCAGTCCCTGANTGAATAAACAACT-A------------TTCTA--TC---------A-TTGGTCAATTCATTNCTACNTTNC-TATTGGTCAGTNTNCTAATTACGGA---TC--TTA--A--AGTCC--------A--------GCC----------C----------AC-A----A--TTAC--------CT--TGTCA-A-CAA-------TACATCAAGATAACCCT-AGGCTA----TCATT----TATCTC-CAGTAANCTGTCATCC-TA--TCT-CA---TTAAACTG-----TCA--TAGA--T-T-----CAAGATTCAAGA-TT-----TCTTT-------A-------C--------T--------T-ANACGTATA-------ATGTTTCTC-------------ANTACATACA-----T-ATA-------T-------------CA--------------ATATATT---TATTTATGTCANATGAAGTATCTT------CAATTCTAACATCTCACTAGCATCCCATAATGTTACA
gi|102981 : TGTCGCATAATCG--A--C-TCAA---CA--AC--TCT---T-GTATATC-A--TAAGT-AGATTTTATTCACATAATTATAAAGTTCTC----ATA--AG--TTCAAAGTCAC-AA-GCTAACATTTTT--AAACTCGCTACTGCTCGTTT-A-AA-CTAAACCTA----------G--------TCT-------AA--C---TAACA-TCTTACTC----TGAC-C-G-----TGGCTAAAACTT--A--ACTG-----ACTG--T-CCACTC-TAT-GCTAAAA-CCAGTCCCTGAATGAATAAACAGCT-A------------TTCTC--TC---------A-TTGGACAATTAATTCCTACATTAC-TATTGGTCAATTAACCAATTACCGA---TC--TTA--A--AGTCC--------A--------GCC----------C----------AC-A----A--TTAC--------CT--TGACA-G-CAA-------TACATCAAGATAACCCT-AGGCTA----TCATT----TATCTC-CAGTAAACTGTCATCC-TA--TCT-CA---TTAAACTG-----TCA--TAGA--T-T-----CAAGATTCAAGA-CT-----TCCTC-------A-------C--------T--------T-ATACGTACA-------ATGTTTCTC-------------AATACATACA-----T-ATA-------T-------------CA--------------ATATTTT---TATTTATGTCAAATGAAGTATCTT------CAATTCTAACATCTCACTAGCATCCCATTATGTTACA
gi|102982 : TGTTGCATAATCG--A--C-TCAA---CA--AC--TCT---TTGTATATC-A--TATGT-AAATTTTATTCACATAATTATAAAGTTATC----ATA--AG--TTCAAAGTCAC-AA-ACTTACATTTTT--AAACTCGCTTCCGCTCGTTT-A-AA-GTAAACCTA----------G--------TCT-------AA--C---TAACA-TCTTACTC----TGAC-C-G-----TGGCTATAACTC--A--ACTA-----ACTG--A-CTTGTC-T-CTGCTAAAA-ACAGTATCTGAATGAATAAACAACT-A------------TTTTA--TC---------A-TTGGACAATTCATTTTTACATTAC-TATTGGTCAGTAAACTAATTACCGA---TC--TTA--A--AGTCC--------A--------GCC----------C----------AC-A----ACATTAA--------CT--TGACA-A-CAA-------TACATCAAGATAACCCT-AGGCTA----TCATT----TATCTC-CAGTAAACTGTCATCC-TA--TCT-CA---TTCAACTG-----TCA--TAGA--T-T-----CAAGATTCAAGA-TT-----TCTTT-------A-------C--------T--------T-ATACGTATA-------ATGTTTCTC-------------AATACATACA-----T-ATA-------T-------------CA--------------CTATATT---TATTTATGTCAGATGAAGTATCTT------CAATTCTAACATCTCACTAGCATCCCATAATGTTACA
gi|102983 : TGTTGCATAATCG--A--C-TCAA---CA--AC--TCT---T-GTATATC-A--TAAGT-AAATTTTATTCACATAATTATAAAGTTCTC----ATA--AG--TTCAAAGTCAC-AA-GCTAACATTTTT--AAACTCTCTACTGCTCGTTT-A-AA-CTAAACCTA----------GACTAGAAGTCT-------AA--C---T--CA-TGTTACTC----TGAC-C-G-----TGGCTAAAACTT--A--ACTG-----ACTG--T-CCACTC-TAT-GCAAAAA-CCAGTCCCTGGATGAATAAACAACT-A------------TTCTA--TC---------A-TTGGCCAATTCATTTCTACATTTC-TATTGGTCAATAAACTAATTTCAGA---TC--TTA--A--AGTCC--------A--------GTC----------C----------AC-A----A--TTAA--------CT--TGACA-A-CAA-------TACATCAAGATAACCCT-AGGCTA----TCATT-----ATCTC-CAGTAAATTGTCATCC-TA--TCT-CA---TTAAACTG-----TCA--TAGA--T-T-----CAAGATTCAAGA-TT-----TCTTT-------A-------C--------T--------T-ATACGTATA-------ATGTTTCTC-------------AATACATGCA-----T-ATA-------T-------------CA--------------ATATATT---TATTTATGTCAAATGAAATATCGT------CAATTCTAACATCTCACTAGCATCCCATAATGTTACA
gi|102984 : TGTTGCATAATAG--A--C-TCAA---CA--AC--TCT---T-GTATATC-A--TAAGT-AAATTTTATTCACATAATTATAAAGTTCTC----ATA--AG--TTCAAAGTCAC-AA-GCTAACATTTTT--AAACTCGCTACTGCTCGTTT-A-AA-CTAAACCTA----------G--------TCT-------AA--C---TAACA-TCTTACTC----TGAC-C-G-----TGGCTCAAACTC--A--ACTG-----TCTG--T-CCACTC-TAT-GCTAAAC-ACAGTCTCTGAATGAATAAACAGCT-A------------TTCTC--TC---------A-TTGGACAATTAATTCCTACATTAC-TATTGGTCAGTTAACCAATTACCGA---TC--TTA--A--AGTCC--------A--------GCC----------C----------AC-A----A--TTAC--------CT--TGACA-G-CAA-------TACATCAAGATAACCCT-AGGCTA----CCATT----TATCTCTCATTTAACTGTCATCC-TA--TCT-CA---TTAAACTG-----TCA--TAGA--T-T-----CAAGATTCAAGA-CT-----TCCTC-------A-------C--------T--------T-ATACGTATA-------ATGTTTCTC-------------AATACATACA-----T-ATA-------T-------------CA--------------ATATATT---TATTTATGTCAAATGAATTATCTT------CAATTCTAACATCTCACTAGCATCCCATAATGTTACA
gi|102985 : TGTCGCATAATCG--A--C-TCAA---CA--AC--TCT---T-GTATATC-A--TAAGT-AAATTTTATTCACATAAATATAAAGTTCTC----ATC--AG--TTCAAAGTCAC-AA-GCTAACATTTTT--AAACTCGCTACTGCTCGTTT-A-AA-CTAAACCTA----------G--------TCT-------AA--C---TAACA-TCTTACTC----TGAC-C-G-----TGGCTCAAACTC--A--ACTC-----CCTG--T-CCACTC-TAT-GCTAAAA-CCAGTCCCTGAATGAATAAACAGCT-A------------TTCTC--TG---------A-TTGGACAATTAA-TCCTATATTAC-TATTGGTCAGTTAACCAATTACCGA---TC--TTA--A--AGTCC--------A--------GCC----------C----------AC-A----A--TTAC--------CT--TGACA-G-CAA-------TACATCAAGATAACCCT-AGGCTA----TCATT----TATCTC-CAGTAAACTGTCATCC-TA--TCT-CA---TTAAACTG-----TCA--TAGA--T-T-----CAAGATTCAAGACTT-----CCTTT-------A-------T--------T--------T-ATACGTATA-------ATGTTTCTC-------------AATACATACA-----T-ATA-------T-------------CA--------------ATATATT---TATTTATGTCAAATGAAGTATCAT------CAATTCTAACATCTCACTAGCATCCCATAATGTTACA
gi|102986 : TGTTGCATAATCG--A--C-TCAA---CA--AC--TCT---T-GTATATC-A--TAAGT-AAATTTTATTCACATAATTATAAAGTTCTC----ATA--AT--TTCAAAGTCAC-AA-GCTAACATTTTT--AAACTCGCTACTGCTCGTTT-A-AA-CTAAACCTA----------G--------TCT-------AA--C---TCACA-TCTTATTC----TGAC-C-G-----TGGCTAAAACTT--A--ACT-------CCT--T-TCTCTC-T-C--CTGAAA-ACAGTCTCTGAATGAATAAACAACT-A------------TTCTA--TC---------A-TTGGCCAATTCATTTCTACATTTC-TATTGGTCAATAAACTAATTACAGA---TC--TTA--A--AGTCC--------A--------GCC----------C----------AC-A----A--TTAA--------CT--TGACA-A-CAA-------TACATCAAGATAACCCT-AGGCTA----TCATT----TATCTC-CAGTAAACTGTCATCC-TA--TCT-CA---TTAAACTG-----TCA--T---------------AGATTCAAGA-TT-----TCTTT-------A-------C--------T--------A-ATACGTTTA-------ATGTTTCTC-------------AATACCTACA-----T-ATA-------T-------------CA--------------ATATATT---TATATATGTCAAATGAAGTATCTT------CAATTCTAACATCTCACTTGCACCCCATAATGTTACA
gi|102987 : TGTTGTATATTCG--A--C-TCAA---C-------TCT---TTGTATATC-AAGTAAATTGAATTTTATTCACATAATTATAACGTTCGC----ATA--AG--TTCAAAGTCAC-AA-TCTAACATTTTT--AAACTCGCTAACGCTCGTTT-A-AA-CTAACCCTA----------G--------TCT-------AA--C---TGACA-TGTTACTC----TGTA-T-G-----TGTCTAAAAACC--A--ACTG-----ACTG--A-CTTCTC-T-CTGCTAAAA-CCAGTCTCTGAATAAATAAACAACT-A------------TTATA--TC---------A-TTGGTCAATTCATTTCTACTTTTC-TATTGGTCAGTATTCTAATTACAGA---TC--TTA--A--AGACC--------A--------ACC----------C----------AC-AAC--A--TTAC--------CT--TGTCA-A-CAA-------TACATCAAGATAACCCT-AGGCTA----TCATT----TTTCTC-CAGTAAACTGTCATCC-TA--TCT-CA---TTAAACTG-----TCA--GAGA--T-T-----CAAGATTCAAGA-TT-----TATTTGTTTGTAA-------C--------T--------T-ATCCATATA-------ACGTTTCTC-------------ATTACATACA-----T-ATATT-----T-------------CAAT------------ATATATT---TATTTATGTCATATGAAGTATCTC------AAATTCTAA-----------CATCCCATAATGTTACA
gi|102988 : TGTGGTATAATCG--A--C-TCAA---CA--AC--TTTCTTT-GTATA---A--TAAGT-AAACCTTATTCACAGGATTATAAAGTTCGC----ATA--AG--TTCAAAGTCAC-AC-GCTTACATTTTT--AAACTCGCTATTGCTCGTTT-A-AA-CTTACCCTA----------G--------TCT-------AA--C---TGACA-AGTTACTT----TGTC-C-G-----TGTCTGTACCCT--C--GCTG-----AATGACT-TAACTC-T-C--CTAAAA-TCAGTCCCTGAATGTACAAACAACT-A------------TTCTA--TC---------A-TTGGTCAATTCATTTCTACTTTTC-TATTGGTCAGTATTCTAATTACATA---TC--TTA--A--GGACC--------A--------GCC----------C----------AC-AAC--A--TTAA--------CT--TGTCA-A-CAA-------TACATCAAGATAACCCT-AGGTTA----TAATT----TAACTC-CAGTAATCTGTCATCC-TA--TCT--A---TTAAACCG-----TCA--TA
gi|102989 : TGTGGTATAATCG--A--C-TCAA---CA--ACGTTCT---TTGTATA---A--TAAGT-AAATTTTATTCACATAATTATAAAGTTTGC----ATA--AG--TTCAAAGTCAC-AA-ACTAACATTTTT--AAACTCGCTATCGCTCGTTT-A-AA-CTAACCCTA----------A--------TCT-------AA--G---TGACA-TGTTACTC----TGTC-T-G-----TGTATACACCCT--G--ACTG-----AAGG--A-CTTGTC-T---ACTTAAA-CCAGTCCCTGAATAAATAAACAACT-T------------TTCTA--TC---------A-GTGGTCAATTCATTTCTACTTTTC-TATTGGTCAGTATTCTAATTACAGA---TC--TTA--A--GATCC--------A--------GCC----------C----------ACAA----A--TTAA--------C---TGTCA-C-CTA-------TACATCAAGATAACCCT-AGACTA----TTATT----TATCTC-CAGTAACATGTCATCC-TG--TCC-TA---TTAACCTG-----TCA--TA
gi|102990 : TGTGGAACAACCG--A--C-TCAA---CT--ATGTTCT---TTGTATA-------AAGT-AAATTTTATTCACATTGTTATAAAGTTTGG----ATA--AG--TTCTAAGTCAC-AA-GCTAACATTTTT--AAACTCGCTCTCGCTGGTTT-A-AA-CTAACTCTA----------G--------TCT-------AAA-C---TGACA-GGTTAA-C----AGATTC-G-----CATCTACATTCT--A--ACTG-----AAGG--A-CTTATC-T-CTACTAAAA-CCAGTCCCTGACTGAATAACAAACT-A------------TCCTA--TG---------A-TTGGCCAATTCATTGCTACTTTTA--ATTGGTCAGTATTTTACTTACATG---TC--TTA--A--GATCC--------T--------GCC----------C----------AC-A----AA-CTAA--------CT---GTCA-G-CTA-------TACATCAAGATAACCCT-AGACTA----TTATT----TATCTC-CAGTAACCTGTAATCC-TA--TCT-TA---TTAAACCG-----TCA--TActatgtacatacaattcttaactaccataatataacatcacatgcgcatagctaaacacaaataatatgtttgtcgtttatgaaatcatgcatc
gi|102991 : TGTGGCATAATCG--A--A-TCAA---CA--AC--T-T---T-GTAC----------------TTTTATTCACATATTTATATAGTACGC----ATA--AG--TTCAAAGTCAC-AA----AACATTTT---AAACTCGCATTCGCTCGTTT-A-AA-CTAAACCTA----------G--------TCT-------AA--T---TTACA-TGTTACCC----TGTT-C-G-----TATCTACATTCT--G--ACTG-----AAGG--A-CCTATC-T-CTACCAAAA-CCAGTCCCTGACTGAATAACCAACT-A---------------------------------------------TCCTACTTTTT-AATTGGTCAGTATTATAATTACAGG---TC--GTA--A--GATCC--------C--------GCC----------C----------ACAA----A--CTAA--------C---TGTCA-A-CTG-------T-CATCAAGATAACCCT-AGGCTA----TTATT----TATC-------------TCATAC-TA--TCT-AA---TTAACCTG-----TCA--TA-A--TAT-----GTACATACAA----T-----TTTTA-------A-------C--------TAC------C-ATA-ATATA-------ACATTCCTCCCATGTTTAAGATAAAATATATA-----T-GTA-------C-------------TA--------------ATATATT---T
gi|102992 : TGTAGTATAACAGGTA--C-TCAAA--CATGGT--TGT---T-TTATAT--A---AAGT-CA-TTTTATTTACATGTTTATATATTTTGC----ATATAAG--TTCGAAATCAC-AAAGCTAACATTTT---AAAGTCGCTTATGCTCATCT-A-AAACTAAACTTA----------G--------TGT-------AAAAC---TGACA-TGTTACCA----TGCT-C-G-----AGATTAC--CTTCGG--ACTG-----ACCT--T-CC-CTC-T-C---TAAAA-TCTGTCTCTAACTGAATAAACAACT-A------------TGCTA--TG---------A-TTGGTCAATTCATTGCTACCTTCC-AATTGGTTGGTTTCTTAATTACAGA---CA--TTA--A--AATCC--------C--------GCC----------CTTATCATATGAC-A----A---AAC--------CTACTGTCA-A-CTA-------CACATCATGATAA-CCT-AGGCTA----TTATT----TATCTC-CAGTAGCCTGTCATCC-TA--TCT-TA---TTAATCTG-----TCA--TAttctctattgtaatcagattattttatctcagttctggaaca
gi|102993 : TGTGGTATAACAG--A--CACCAA---CATGAT--TGT---T-TTGTAT------AAGT-AA-TTTTATTCACATATTTATATAGTTTGC----ATA--AAAATTAAAAGTCAC-AAAGCGAACATTTT---AAACTCGCCTTCGCTCATCT-A-AA-CTAAACCTA----------G--------TTT-------AAA-C---TGACA-TGTTAC-C----AGAT-TTG-----CATCTACTTTCT--A--AATG-----ACTG--C-CCTTCC-T-C-TCTAAAAATCTGGCTCTGACTGAATAACCAACT-C------------TGCTA--TA---------A-TTGGTCAATTCATTGCTACCTTTC-GATAGGTCAGATTCTTAATTACGGA---CC--TTA--A--AACCC--------C--------ACC----------C----------AT-ATCATA--TGACAAAACCTACT--T-TCA-G-CAA-------CACATCATGATAACCCTAAGACTA----TTA-T----AATCTC-CATTAGCCTGTGTTCC-TA--TCT-CA---TTAGCCTG-----TCA--TA
gi|102994 : TGTAGTATAACCG--A--C-TCAAATATG--GT--TGT---T-TTATA-C-A---AAGT-CAATTT-ATTCACATGTTTTTATATTTCTC----ATATAAG--TTCGAAATCAC-AAAGCTAACATTGT---AAACTCGCTTTCGTTCGTCTGA-AA-CTAAACCTA----------G--------TCT-------AAAAC---TGACA-TGTTACTA-----GACTC-G-----AGGTTACTTTCT--A--ACAGCCAGAACTT--T-CCTCTC-T-A----AAAA-TCATTCTCTGACTGAATAAACAACT-A------------ACCTA--TG---------ATTTGGTCAATTCATTGCTACTTCCC-AATTGGTC-GTTTCTTAATTATGAAGGTTC--ATAACA--ACTCCCCCATCATA--------TCA----------C----------AC-A----A--CTAC--------C---TGTCA-A-ATA-------TACAACATAATAAGCCTAAGGCTA----TAATT----TATCTC-CATTAGCCTGTCATC
gi|102995 : TGTAGTATAACAG--ATAC-TCAA---AC--AT--GAT---T-GTTTTTCTA--TATGT-CA-TTTTATTAACATATTTATC---TTTTTGCATATA--AG--TTCAAAATCAC-AAAGCTGACATTTT---AAACTCACTAATGCTCGTCT-ATAG-CTAAACCTT----------G--------TCT-------AA--AA--TGAAAATGTTG--------------G-----TGTTTAG--CTT--TCTGCTG-----ACAG--A-CCTTTCCT-C-TCTAAAA-TCTGTCTCTGACTGAATAAACAACT-A------------TCTTA--TC---------A-TTGGTCAATTCACTGTTACTTACC-AATTGGTCAGTTTCTCAATTATGAAGGCTC--ATA--ACCCCTCC--------A---------CCGATCATATCAC----------AC-A----A--CTAC--------C---TGTCA-A-ATA-------TACAACATGATAAACCTAAGGCTA----TAATA----TATCTC-CATTAGCCTGTCATC
gi|102996 : TGTTGCATAATCG--A--C-TCAA---CG--A--------------TA-------AAGT-AAATTTTATTCACATAATTATAAAGTTCGC----ATC--AG--TTCAAAGTCAC-AA-GCTATCTTTTTTTAAAACTCGCTATCGCT
gi|102997 : TGTCGCATAATCG--A--C-TCAA---CA--AC--TCT---T-GTATATC-A--TAAGT-AAATTTT
gi|102998 : TAATCG--A--C-TCAA---CA--AC--TCT---TTGTATATC-A--TAAGT-AAATTTTATTCACATAATTATAAAATTCTC----CTA--AG--TTCAAAGTCAC-AA-GCTTACATTTTT--AAACTCGCTACTGCTCGTTT-A-AA-CTAAACCTA----------G--------TCT-------AA--C---TAACA-TCTTACTC----TGAC-C-G-----TGGCTAAAACTT--A--ACTG-----ACTG--T-CCGCTCTT-T-GTCAAAA-CCAGTTCCTGAATGAATAAACAGCT-T------------TTCTA--TT---------A-TTGGACAATTCATTTCTACATTGC-TATTGGTCAGTATTTTAATTACAGA---TC--TTA--A--AGACC--------A--------GCC----------C----------AC-AAC--A--TTAA--------CT--TGTCA-A-CAA-------TACATCAAGATAACCCT-AGGCTA----TCATT----TATCTC-CAGTAAACTGTCATCC-TA--TCT--A---CTAAACTG-----TCA--TAGA--T-T-----CAAGATTCAAGA-TT-----TCTTT-------A-------C--------T--------T-ATACATATA-------ATGTTTCTT-------------AATACATACA-----T-ATA-------T-------------CA--------------ATATATT---TATTTATGGCATATGAAGTATCTA------CAATTCTAA-A------------CCCATAATGTTACA
gi|102999 : --TTT---T-ATATA-------AAGT-CA-TTTTATTCACATGTTCATGTATTTCTC----ATATAAG--TTCGAAATCACGAA-GCTAACATTTT---ATACTCGCTGACGCTCGTCT-A-AAACTAGACATA----------G--------TCT-------AAAAC---TGA-A-TGTTACCA----TGTT-G-G-----TATCTAG--CTTTCA--ACTG-----ACAG--A-CCTTTCCT-C-TCTAAAA-TCTTTCTCTGACTGAATAAACAGCTTA------------TCTTA--TC---------A-TTTGTCAATTCATTGTTACTTCCC-AGTTGGTCAGTTTCTTAATAATGAAGGTTC--ATA--ACCCCTCCCCCATCATA--------TCA----------C----------AC-A----A--CTAC--------C---TGTCA-A-ATA-------TACAACATGATAAACCTAAGGCTA----TAATT----TATCTT-CTTTAGCCTGTCATCTGTAAGTGA-CATGGTTGACCT------TTA--TAAA--T-TATAAACAAAATTTAAGA-AT-----TGTAT-------A-------CA-------T--------T-AAA-G---A-------A---TTCTTA------------ACTAC---CA-----TAATA-------T--------------A--------------ACATAT
gi|103000 : --TTT---T-ATATA-------AAGT-CA-TTTTATTCAAATTTTTATATATTTCTC----AT-------TT--AAGTCAC-AAAGCTAACATTTT---AAACTCGCTAAATATCGTCT-A-AA-ACCAATCTA----------T--------TCT-------AA--CACTTGTCA-TGTTACCCTACTTGAC-G-C-----TTCCT----TTC--A--ACTA-----ACCG--TGTTACCC-T-C-ACTGAGG-TTTTTCTCTAACTGACCAAAC-ACT-ATCCCAAAGAGGCTTCTAGGTCATTTCCTTGA-TTGGTCAATTTTTTATTACCTCAC-TATTGGTCAGTTTCTTAATT------------TCA--A--AGTCC--------AATAACCCTGCC----------C----------A-----------TAT--------CT--TATCACATCAATCATCTCTATATCATGATAAGCTTAAGGCTA----CCACT----
gi|103001 : ATTTTATTCACATG--TATAAA--------------------TCAAAGTCAC-AA-GCTAACATTTTT---AACTCACTAATGTCAATCT-A-AA-ACCAACCTATTTTAACAAGG--------TCTATTTTTCAA--C---TTACA-TGTTACCC----TAAC-C-ACTGTCTGTCTCTAAC-T--A--ACTA-----AACG--T-TCA-TC-T-T-CCCAAAG---AGGCCTCGAGC---T------CT-T------------TTCTC--TG---------A-TTGGTCAACTCATTGTTACCTGGCTTATT-GTCAGTTTCTTAATTACTTG---TCAATTA--A--A---C--------AC-------GCC----------C----------AT-ATCTTA--TCACAAAACCGACA--TGTCA-T-CTC-------TACATCATGATAAATCTAAGGCTATATCTTATTGTAACATATC-CATCTGCCTGATATTT-TA--TTTCCA---TTAGCTTG-----TCG--TATA--T-
gi|103002 : CT-A------------TTCTC--CC---------A-TTGGACAATTAATTCCTATATTAC-TATTGGTCAGTTAACCAATTACCGA---TC--TTA--A--AGTCC--------A--------GCC----------C----------AC-A----A--TTAC--------CT--TGACA-G-CAA-------TACATCAAGATAACCCT-AGGCTA----TCATT----TATCTC-CAGTAAACTGTCATCC-TA--TCT-CA---TTAAACTG-----TCA--TAGA--T-T-----CAAGATTCAAGA-CT-----TCCTC-------A-------C--------T--------T-ATACGTACA-------ATGTTTCTC-------------AATACATACA-----T-ATA-------T-------------CA--------------ATATATT---TATTTATGTCAAATGAAGTATCTT------CAATTCTAACATCTCAGTAGCATCCCATAATGTTACA
gi|103003 : AAACTGGATATTCAGTTAGA--T-T-----CAAGATTCAAGA-TTCAAATTCTTT-------A-------T--------TCAGTAATTT-AAACATATA-------ATGTTTCTC-------------ATTACACACA-----A-AT--------T-------------CAG-------------ATA
gi|103004 : TA-----TCA--TAGAGAT-T-----CAAGATTCAAGA-TTCAAATTCTTT-------A-------TGCAGTAATT--------T-AAACATATA-------ATGTTTCTC-------------ATTACATACA-----A-AT--------T-------------CA--------------
gi|103005 : -----TTA--TAGA--T-T-----CAAGATTCAAGA-TTCAAATTCTTT-------A-------T--------TCAGTAATTT-AAACATATA-------ATGTTTCTC-------------ATTACACACA-----A-AT--------T-------------CAG-------------ATA
gi|103006 : -----TCA--TAGA--T-T-----CAAGATTCAAA---T-----TCTTT-------A-------T--------TCAGTAATTT-AAACATATA-------ATGTTTCTC-------------ATTTCATACA-----A-AT--------T-------------CAG-------------ATA
gi|103007 : A--TAGA--T-T-----CAAGATTCAAA---T-----TCTTT-------A-------T--------TCAGTAATTT-AAACATATG-------ATGTTTCTC-------------ATTACATACA-----A-AT--------T-------------CA--------------
gi|103008 : --TAGA--T-T-----CGAGATTCAAGA-TTCAGATTCTTT-------A-------T--------TCAGTAATTT-AAACATATA-------ATGTTTCTC-------------ATTACATACA-----A-AT--------T-------------CA--------------
gi|103009 : AGA--T-T-----CAAGATTCAAGT-TT-----TCTTCATTTGTAA-------C--------T--------T-AAACATATA-------ATGTTTCTC-------------ATTACATACA-----A-ATA-------TTAAACATACATC-CA--------------ATATATC---TATTTA--TCACGTGACACATTTTGTGCAACAATTC
gi|103010 : AGA--T-T-----CAAGATTTAAGA-TT-----TCTTT-------ATTTGTAAC--------T--------T-AAACTTATA-------ATGTTTCTT-------------ATTACAAACA-----T-ATATTT----T-------------CA--------------AT
gi|103011 : AGA--T-T-----CAAATTTCAAGA-TT-----TCTTTATTTGTAA-------C--------T--------T-AAACATATA-------ATGTTTCTG-------------ATTACATACA-----T-ATA-------G-------------TACACATAT-------ATATGTT---TATTTAT
gi|103012 : --T-T-----CAAGATTCAAGA-TT-----TCTTT-------A-------T--------T--------TGAAACTTAT--------TTGTTTCTT-------------ATTACATACATTTATT-ATACATACATT-------------CA--------------ATATATT---TATTTA--TCACGTGACACATTTTATGAAACAATTC
gi|103013 : --T-T-----AAAGATTCAAGA-TT------CTTT-------ATTGTAA-C--------T--------T-AAACATATA-------ATGTTTCTT-------------AAAACACACA-----T-ATA-------T-------------TATACATACATCCATTATATATT---TATTTA--TCACGTGACGCATTTT------
gi|103014 : --T-T-----CAAGATTCAAGA-TT-----TCTTT-------A-------T--------T--------T-GTACCTTTAACATGTTATGTTTCTC-------------ATAACATACA-----T-ATA-------T-------------TATAAC----------ATACATCCAATATATATGT
gi|103015 : -----CAAGATTCAAGA-TT-----TCTTTATTTGTAA-------C--------T--------T-AAACATATA-------ATATTTCTC-------------ATTGCATACA-----T-ATA-------TTATACAACACCTCCA--------------ATATATT---TATTTAT
gi|103016 : -----T-ATA-------T-------------CATAA-----------GTAAATT---T---TNNNNNNNNNNAAGTATCTT------CAATTCTAACATCTCAGTAGCATCCCATAATGTTACA
blockSeqs : T GT TA A ATA TG GT C CTT T TCAAGT T A A A T GCAT TA AA G A TTA C G T A TTTTAACAAG ACTAGAAG ATTTTTC AA ACT A T TACT T T CTGTC G TAA CG CT CCAGA T ACT TG C CTG AT A T TCCCAAAGAGGC GG ATTTCCTTG T A T A A TT AAA C GGT AA AC CC CCCATCATA GATCATATCA TTATCATATG A TCAT CA CAAAACCTA TAC C T A TCATCTC A TATC GTAA T A G AG CC TGG GATAT GT GA A ATAAA C CAAAT ATTCAGTAATT G T G ACATGTT CCATGTTTAAGAT A TTTAT A ATTATACATACATCCATT CAA G GTGCAA
blockSeqs : T . . . A TG GT C . T TCTAT . A A A T . TA . . A T C . . A . . . AA A . T . T . . G AAA TC . . T TG AC T ATG A A . . . . . C T A T T AAA A GGC . . CC CCCATCATA . . A TCTT A CAAAACCGA T . . A . A . . . A . . C . . . . . . . CAAAT ATGCAGTAATT . T G . A A . . ATTATACAACACCTCCA . A ATGAAA
blockSeqs : T . . . . . . C . T TCAT . A A A T . TA . . A T C . . . . . . AA . . T . . . . G AAA . . . T A AC C ATG C A . . . . . A C A A T TAA C GGT . . . AATAACCCT . . . AC . A T . . A . A . . . A . . C . . . . . . . CAAAT ATTCAGTAATT . T G . . A . . ATTAAACATACATCCA . A .
blockSeqs : C . . . . . . C . T TCAT . A A A T . . . . A T C . . . . . . A . . T . . . . G AAA . . . T T AC . ATG A A . . . . . A C A A T TAA C . . . . AC . . . AC . A T . . A . A . . . A . . C . . . . . . . CAGAT ATTCAGTAATT . T G . . A . . AGTACACATAT . A .
blockSeqs : T . . . . . . C . T TCAT . A A A T . . . . A T C . . . . . . A . . T . . . . G AAA . . . C T TC . CTG C A . . . . . C T A T T AAA A . . . . A . . . AC . C T . . A . A . . . A . . C . . . . . . . . ATTCAGTAATT . T G . . A . . ACATACATTCA . A .
blockSeqs : T . . . . . . C . . TCAT . A A A G . . . . . T A . . . . . . . . . T . . . . T AAA . . . T T TC . CTA A A . . . . . T T T T T ATT A . . . . A . . . . . C T . . A . A . . . A . . C . . . . . . . . ATTCAGTAATT . T A . . T . . ATTTCAAT . T .
blockSeqs : G . . . . . . T . . TCAT . A A A G . . . . . T T . . . . . . . . . T . . . . T TAC . . . T T AC . CTA C A . . . . . T T T T T ATT A . . . . A . . . . . A T . . A . . . . . T . . C . . . . . . . . GTTTGTAACT . T A . . A . . ATTATAAC . T .
blockSeqs : G . . . . . . C . . TCAT . A A A G . . . . . T T . . . . . . . . . T . . . . T CAC . . . G A TG . CT T A . . . . . T T T T T ATT A . . . . A . . . . . C T . . T . . . . . C . . T . . . . . . . . ATTTGTAACT . T A . . A . . ATTTTCA . A .
blockSeqs : G . . . . . . C . . TCAT . A G A G . . . . . T T . . . . . . . . . C . . . . T CAT . . . G A TA . CT C C . . . . . C G T T T ATT A . . . . A . . . . . A T . . T . . . . . C . . T . . . . . . . . ATTTGTAACT . A G . . C . . ATCATAA . C .
blockSeqs : G . . . . . . G . . AT . A T T G . . . . . T T . . . . . . . . . C . . . . T CAT . . . G A TA . TG C C . . . . . T C T T A ATT A . . . . A . . . . . A T . . T . . . . . C . . A . . . . . . . . ATTTGTAACT . T G . . A . . ATCA . C .
blockSeqs : A . . . . . . G . . AT . A T T G . . . . . T A . . . . . . . . . T . . . . A CTT . . . C A TT . CT C C . . . . . T G C C A TTC A . . . . A . . . . . A T . . T . . . . . C . . T . . . . . . . . ATTTGTAACT . A A . . T . . ATCA . C .
blockSeqs : G . . . . . . G . . TA . A T T G . . . . . T T . . . . . . . . . T . . . . T CTT . . . T T TC . CA T C . . . . . T G C T G TTC G . . . . A . . . . . A T . . A . . . . . C . . C . . . . . . . . ATTGTAACT . A A . . T . . ATCA . N .
blockSeqs : A . . . . . . A . . CA . A T T T . . . . . . T . . . . . . . . . C . . . . G AAA . . . T C TT . TC T C . . . . . T G T C A TTC G . . . . T . . . . . C A . . T . . . . . C . . C . . . . . . . . ACTAC . A A . . T . . ATCA .
blockSeqs : A . . . . . . C . . T . A T A T . . . . . . A . . . . . . . . . C . . . . T TAA . . . A T GC . C T C . . . . . A G T C A TTC G . . . . C . . . . . C T . . T . . . . . A . . C . . . . . . . . ACAT . A A . . T . . ATCA .
blockSeqs : T . . . . . . C . . . . . A A G . . . . . . T . . . . . . . . . C . . . . G C . . . T A TT . C C A . . . . . T T A G T ATT A . . . . C . . . . . C . . . A . . . . . C . . . . . . . . . . . ACT . A A . . T . . ACTA .
blockSeqs : C . . . . . . T . . . . . A T T . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . T G . . . A T AC . A T C . . . . . T G T C A TTC G . . . . C . . . . . A . . . T . . . . . C . . . . . . . . . . . ACT . A A . . T . . ATCA .
blockSeqs : . . . . . . T . . . . . T T T . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . C G . . . C A C . C T C . . . . . T A C A T TTC T . . . . A . . . . . C . . . A . . . . . A . . . . . . . ACT . A A . . T . . ATCA
blockSeqs : . . . . . . . T A T . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . T . . . . C T A . A . G . . . . . A G C G T TTC C . . . . A . . . . . T . . . T . . . . . . . . . . . . . ATT . A T . . T . . TCAG
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . C A A . TAA . . . . . A . . . . . C . . . A . . . . . . . . . . . ACT . A A . . T . . TCAG
blockSeqs : . . . . . . . . ACT . A T . . T . . TCAG
blockSeqs : . . . . . . ACT . A A . . A . . ATA
blockSeqs : . . . . . . ATT . T C . . T . . TCA
blockSeqs : . . . . . ATT . A A . . T . . TCA
blockSeqs : . . TCA
blockSeqCons :
originalCons : TGTNGCATAATCG--A--C-TCAA---CA--AC--TCT---T-GTATATC-A--TAAGT-AAATTTTATTCACATAATTATAAAGTTCTC----ATA--AG--TTCAAAGTCAC-AA-GCTAACATTTTT--AAACTCGCTANCGCTCGTTT-A-AA-CTAAACCTA----------G--------TCT-------AA--C---TGACA-TGTTACTC----TGAC-C-G-----TGNCTANAACTT--A--ACTG-----ACCG--T-CCNCTC-T-C-GCTAAAA-CCAGTCCCTGANTGAATAAACAACT-A------------TTCTA--TC---------A-TTGGTCAATTCATTNCTACNTTNC-TATTGGTCAGTNTNCTAATTACGGA---TC--TTA--A--AGTCC--------A--------GCC----------C----------AC-A----A--TTAC--------CT--TGTCA-A-CAA-------TACATCAAGATAACCCT-AGGCTA----TCATT----TATCTC-CAGTAANCTGTCATCC-TA--TCT-CA---TTAAACTG-----TCA--TAGA--T-T-----CAAGATTCAAGA-TT-----TCTTT-------A-------C--------T--------T-ANACGTATA-------ATGTTTCTC-------------ANTACATACA-----T-ATA-------T-------------CA--------------ATATATT---TATTTATGTCANATGAAGTATCTT------CAATTCTAACATCTCACTAGCATCCCATAATGTTACA
finalCons : TGTNGCATAATCG--A--C-TCAA---CA--AC--TCT---T-GTATATC-A--TAAGT-AAATTTTATTCACATAATTATAAAGTTCTC----ATA--AG--TTCAAAGTCAC-AA-GCTAACATTTTT--AAACTCGCTANCGCTCGTTT-A-AA-CTAAACCTA----------G--------TCT-------AA--C---TGACA-TGTTACTC----TGAC-C-G-----TGNCTANAACTT--A--ACTG-----ACCG--T-CCNCTC-T-C-GCTAAAA-CCAGTCCCTGANTGAATAAACAACT-A------------TTCTA--TC---------A-TTGGTCAATTCATTNCTACNTTNC-TATTGGTCAGTNTNCTAATTACGGA---TC--TTA--A--AGTCC--------A--------GCC----------C----------AC-A----A--TTAC--------CT--TGTCA-A-CAA-------TACATCAAGATAACCCT-AGGCTA----TCATT----TATCTC-CAGTAANCTGTCATCC-TA--TCT-CA---TTAAACTG-----TCA--TAGA--T-T-----CAAGATTCAAGA-TT-----TCTTT-------A-------C--------T--------T-ANACGTATA-------ATGTTTCTC-------------ANTACATACA-----T-ATA-------T-------------CA--------------ATATATT---TATTTATGTCANATGAAGTATCTT------CAATTCTAACATCTCACTAGCATCCCATAATGTTACA
Alignments
lowQualScore : 1 1111111 1 111 11 2222 111111111111 111 11111111111111111 1111 111111111 1 11111 555555555555555555555555555555555 1111111111111 33333333333333333333333333333333333333 111111
lowQualScore : 1 33 33 2 666 66 55 1 333 0 9999999 2 3 3 1 1 4444 88 22 2 0 000 1 2 2 4 9999999999 77777777 6666666 22 555 0 2 1 4444 0 4 2 55555 1 888 55 22 55555 5 6666 33 6 5555 44 1 2 000000000000 22 888888888 2 2 1 1 1 33 222 6 000 22 22 55 0 99999999999999999 8888888888 8888888888 4 6666 44 555555555 777 0 2 2 1 6666666 0 2 4444 4444 2 1 2 33 22 444 44444 22 22 1 44444 1 66666 000000000000000000000000000000000 1 1 1 5555555 0000000000000 1 44444 1 55555555555555555555555555555555555555 444 0 1 777777
lowQualScore : . .. .. . ... .. .. . ... . ....... . . . . . .... .. .. . . ... . . . . .......... ........ ....... .. ... . . . .... . . . ..... . ... .. .. ..... . .... .. . .... .. . . ............ .. ......... . . . . . .. ... . ... .. .. .. . ................. .......... .......... . .... .. ......... ... . . . . ....... . . .... .... . . . .. .. ... ..... .. .. . ..... . ..... ................................. . . . ....... ............. . ..... . ...................................... ... . . ......
lowQualScore : 0 11 11 2 111 11 55 2 555 0 1111111 0 8 3 2 8 2222 22 88 0 0 999 0 1 1 2 2222222222 66666666 8888888 99 888 8 1 4 5555 4 2 1 33333 0 555 88 99 33333 0 4444 55 3 0000 66 0 0 222222222222 88 000000000 0 2 0 0 0 22 111 0 555 88 88 55 2 77777777777777777 8888888888 8888888888 0 8888 88 333333333 333 1 0 0 4 5555555 1 0 2222 2222 1 7 4 22 55 111 88888 44 33 7 22222 7 77777 111111111111111111111111111111111 7 0 8 4444444 8888888888888 0 00000 6 99999999999999999999999999999999999999 111 8 0 777777
consensus : TGTNGCATAATCG--A--C-TCAA---CA--AC--TCT---T-GTATATC-A--TAAGT-AAATTTTATTCACATAATTATAAAGTTCTC----ATA--AG--TTCAAAGTCAC-AA-GCTAACATTTTT--AAACTCGCTANCGCTCGTTT-A-AA-CTAAACCTA----------G--------TCT-------AA--C---TGACA-TGTTACTC----TGAC-C-G-----TGNCTANAACTT--A--ACTG-----ACCG--T-CCNCTC-T-C-GCTAAAA-CCAGTCCCTGANTGAATAAACAACT-A------------TTCTA--TC---------A-TTGGTCAATTCATTNCTACNTTNC-TATTGGTCAGTNTNCTAATTACGGA---TC--TTA--A--AGTCC--------A--------GCC----------C----------AC-A----A--TTAC--------CT--TGTCA-A-CAA-------TACATCAAGATAACCCT-AGGCTA----TCATT----TATCTC-CAGTAANCTGTCATCC-TA--TCT-CA---TTAAACTG-----TCA--TAGA--T-T-----CAAGATTCAAGA-TT-----TCTTT-------A-------C--------T--------T-ANACGTATA-------ATGTTTCTC-------------ANTACATACA-----T-ATA-------T-------------CA--------------ATATATT---TATTTATGTCANATGAAGTATCTT------CAATTCTAACATCTCACTAGCATCCCATAATGTTACA
Reference ( family-580 ) : TGTNGCATAATCG--A--C-TCAA---CA--AC--TCT---T-GTATATC-A--TAAGT-AAATTTTATTCACATAATTATAAAGTTCTC----ATA--AG--TTCAAAGTCAC-AA-GCTAACATTTTT--AAACTCGCTANCGCTCGTTT-A-AA-CTAAACCTA----------G--------TCT-------AA--C---TGACA-TGTTACTC----TGAC-C-G-----TGNCTANAACTT--A--ACTG-----ACCG--T-CCNCTC-T-C-GCTAAAA-CCAGTCCCTGANTGAATAAACAACT-A------------TTCTA--TC---------A-TTGGTCAATTCATTNCTACNTTNC-TATTGGTCAGTNTNCTAATTACGGA---TC--TTA--A--AGTCC--------A--------GCC----------C----------AC-A----A--TTAC--------CT--TGTCA-A-CAA-------TACATCAAGATAACCCT-AGGCTA----TCATT----TATCTC-CAGTAANCTGTCATCC-TA--TCT-CA---TTAAACTG-----TCA--TAGA--T-T-----CAAGATTCAAGA-TT-----TCTTT-------A-------C--------T--------T-ANACGTATA-------ATGTTTCTC-------------ANTACATACA-----T-ATA-------T-------------CA--------------ATATATT---TATTTATGTCANATGAAGTATCTT------CAATTCTAACATCTCACTAGCATCCCATAATGTTACA
gi|102981 : TGTCGCATAATCG--A--C-TCAA---CA--AC--TCT---T-GTATATC-A--TAAGT-AGATTTTATTCACATAATTATAAAGTTCTC----ATA--AG--TTCAAAGTCAC-AA-GCTAACATTTTT--AAACTCGCTACTGCTCGTTT-A-AA-CTAAACCTA----------G--------TCT-------AA--C---TAACA-TCTTACTC----TGAC-C-G-----TGGCTAAAACTT--A--ACTG-----ACTG--T-CCACTC-TAT-GCTAAAA-CCAGTCCCTGAATGAATAAACAGCT-A------------TTCTC--TC---------A-TTGGACAATTAATTCCTACATTAC-TATTGGTCAATTAACCAATTACCGA---TC--TTA--A--AGTCC--------A--------GCC----------C----------AC-A----A--TTAC--------CT--TGACA-G-CAA-------TACATCAAGATAACCCT-AGGCTA----TCATT----TATCTC-CAGTAAACTGTCATCC-TA--TCT-CA---TTAAACTG-----TCA--TAGA--T-T-----CAAGATTCAAGA-CT-----TCCTC-------A-------C--------T--------T-ATACGTACA-------ATGTTTCTC-------------AATACATACA-----T-ATA-------T-------------CA--------------ATATTTT---TATTTATGTCAAATGAAGTATCTT------CAATTCTAACATCTCACTAGCATCCCATTATGTTACA
gi|102982 : TGTTGCATAATCG--A--C-TCAA---CA--AC--TCT---TTGTATATC-A--TATGT-AAATTTTATTCACATAATTATAAAGTTATC----ATA--AG--TTCAAAGTCAC-AA-ACTTACATTTTT--AAACTCGCTTCCGCTCGTTT-A-AA-GTAAACCTA----------G--------TCT-------AA--C---TAACA-TCTTACTC----TGAC-C-G-----TGGCTATAACTC--A--ACTA-----ACTG--A-CTTGTC-T-CTGCTAAAA-ACAGTATCTGAATGAATAAACAACT-A------------TTTTA--TC---------A-TTGGACAATTCATTTTTACATTAC-TATTGGTCAGTAAACTAATTACCGA---TC--TTA--A--AGTCC--------A--------GCC----------C----------AC-A----ACATTAA--------CT--TGACA-A-CAA-------TACATCAAGATAACCCT-AGGCTA----TCATT----TATCTC-CAGTAAACTGTCATCC-TA--TCT-CA---TTCAACTG-----TCA--TAGA--T-T-----CAAGATTCAAGA-TT-----TCTTT-------A-------C--------T--------T-ATACGTATA-------ATGTTTCTC-------------AATACATACA-----T-ATA-------T-------------CA--------------CTATATT---TATTTATGTCAGATGAAGTATCTT------CAATTCTAACATCTCACTAGCATCCCATAATGTTACA
gi|102983 : TGTTGCATAATCG--A--C-TCAA---CA--AC--TCT---T-GTATATC-A--TAAGT-AAATTTTATTCACATAATTATAAAGTTCTC----ATA--AG--TTCAAAGTCAC-AA-GCTAACATTTTT--AAACTCTCTACTGCTCGTTT-A-AA-CTAAACCTA----------GACTAGAAGTCT-------AA--C---T--CA-TGTTACTC----TGAC-C-G-----TGGCTAAAACTT--A--ACTG-----ACTG--T-CCACTC-TAT-GCAAAAA-CCAGTCCCTGGATGAATAAACAACT-A------------TTCTA--TC---------A-TTGGCCAATTCATTTCTACATTTC-TATTGGTCAATAAACTAATTTCAGA---TC--TTA--A--AGTCC--------A--------GTC----------C----------AC-A----A--TTAA--------CT--TGACA-A-CAA-------TACATCAAGATAACCCT-AGGCTA----TCATT-----ATCTC-CAGTAAATTGTCATCC-TA--TCT-CA---TTAAACTG-----TCA--TAGA--T-T-----CAAGATTCAAGA-TT-----TCTTT-------A-------C--------T--------T-ATACGTATA-------ATGTTTCTC-------------AATACATGCA-----T-ATA-------T-------------CA--------------ATATATT---TATTTATGTCAAATGAAATATCGT------CAATTCTAACATCTCACTAGCATCCCATAATGTTACA
gi|102984 : TGTTGCATAATAG--A--C-TCAA---CA--AC--TCT---T-GTATATC-A--TAAGT-AAATTTTATTCACATAATTATAAAGTTCTC----ATA--AG--TTCAAAGTCAC-AA-GCTAACATTTTT--AAACTCGCTACTGCTCGTTT-A-AA-CTAAACCTA----------G--------TCT-------AA--C---TAACA-TCTTACTC----TGAC-C-G-----TGGCTCAAACTC--A--ACTG-----TCTG--T-CCACTC-TAT-GCTAAAC-ACAGTCTCTGAATGAATAAACAGCT-A------------TTCTC--TC---------A-TTGGACAATTAATTCCTACATTAC-TATTGGTCAGTTAACCAATTACCGA---TC--TTA--A--AGTCC--------A--------GCC----------C----------AC-A----A--TTAC--------CT--TGACA-G-CAA-------TACATCAAGATAACCCT-AGGCTA----CCATT----TATCTCTCATTTAACTGTCATCC-TA--TCT-CA---TTAAACTG-----TCA--TAGA--T-T-----CAAGATTCAAGA-CT-----TCCTC-------A-------C--------T--------T-ATACGTATA-------ATGTTTCTC-------------AATACATACA-----T-ATA-------T-------------CA--------------ATATATT---TATTTATGTCAAATGAATTATCTT------CAATTCTAACATCTCACTAGCATCCCATAATGTTACA
gi|102985 : TGTCGCATAATCG--A--C-TCAA---CA--AC--TCT---T-GTATATC-A--TAAGT-AAATTTTATTCACATAAATATAAAGTTCTC----ATC--AG--TTCAAAGTCAC-AA-GCTAACATTTTT--AAACTCGCTACTGCTCGTTT-A-AA-CTAAACCTA----------G--------TCT-------AA--C---TAACA-TCTTACTC----TGAC-C-G-----TGGCTCAAACTC--A--ACTC-----CCTG--T-CCACTC-TAT-GCTAAAA-CCAGTCCCTGAATGAATAAACAGCT-A------------TTCTC--TG---------A-TTGGACAATTAA-TCCTATATTAC-TATTGGTCAGTTAACCAATTACCGA---TC--TTA--A--AGTCC--------A--------GCC----------C----------AC-A----A--TTAC--------CT--TGACA-G-CAA-------TACATCAAGATAACCCT-AGGCTA----TCATT----TATCTC-CAGTAAACTGTCATCC-TA--TCT-CA---TTAAACTG-----TCA--TAGA--T-T-----CAAGATTCAAGACTT-----CCTTT-------A-------T--------T--------T-ATACGTATA-------ATGTTTCTC-------------AATACATACA-----T-ATA-------T-------------CA--------------ATATATT---TATTTATGTCAAATGAAGTATCAT------CAATTCTAACATCTCACTAGCATCCCATAATGTTACA
gi|102986 : TGTTGCATAATCG--A--C-TCAA---CA--AC--TCT---T-GTATATC-A--TAAGT-AAATTTTATTCACATAATTATAAAGTTCTC----ATA--AT--TTCAAAGTCAC-AA-GCTAACATTTTT--AAACTCGCTACTGCTCGTTT-A-AA-CTAAACCTA----------G--------TCT-------AA--C---TCACA-TCTTATTC----TGAC-C-G-----TGGCTAAAACTT--A--ACT-------CCT--T-TCTCTC-T-C--CTGAAA-ACAGTCTCTGAATGAATAAACAACT-A------------TTCTA--TC---------A-TTGGCCAATTCATTTCTACATTTC-TATTGGTCAATAAACTAATTACAGA---TC--TTA--A--AGTCC--------A--------GCC----------C----------AC-A----A--TTAA--------CT--TGACA-A-CAA-------TACATCAAGATAACCCT-AGGCTA----TCATT----TATCTC-CAGTAAACTGTCATCC-TA--TCT-CA---TTAAACTG-----TCA--T---------------AGATTCAAGA-TT-----TCTTT-------A-------C--------T--------A-ATACGTTTA-------ATGTTTCTC-------------AATACCTACA-----T-ATA-------T-------------CA--------------ATATATT---TATATATGTCAAATGAAGTATCTT------CAATTCTAACATCTCACTTGCACCCCATAATGTTACA
gi|102987 : TGTTGTATATTCG--A--C-TCAA---C-------TCT---TTGTATATC-AAGTAAATTGAATTTTATTCACATAATTATAACGTTCGC----ATA--AG--TTCAAAGTCAC-AA-TCTAACATTTTT--AAACTCGCTAACGCTCGTTT-A-AA-CTAACCCTA----------G--------TCT-------AA--C---TGACA-TGTTACTC----TGTA-T-G-----TGTCTAAAAACC--A--ACTG-----ACTG--A-CTTCTC-T-CTGCTAAAA-CCAGTCTCTGAATAAATAAACAACT-A------------TTATA--TC---------A-TTGGTCAATTCATTTCTACTTTTC-TATTGGTCAGTATTCTAATTACAGA---TC--TTA--A--AGACC--------A--------ACC----------C----------AC-AAC--A--TTAC--------CT--TGTCA-A-CAA-------TACATCAAGATAACCCT-AGGCTA----TCATT----TTTCTC-CAGTAAACTGTCATCC-TA--TCT-CA---TTAAACTG-----TCA--GAGA--T-T-----CAAGATTCAAGA-TT-----TATTTGTTTGTAA-------C--------T--------T-ATCCATATA-------ACGTTTCTC-------------ATTACATACA-----T-ATATT-----T-------------CAAT------------ATATATT---TATTTATGTCATATGAAGTATCTC------AAATTCTAA-----------CATCCCATAATGTTACA
gi|102988 : TGTGGTATAATCG--A--C-TCAA---CA--AC--TTTCTTT-GTATA---A--TAAGT-AAACCTTATTCACAGGATTATAAAGTTCGC----ATA--AG--TTCAAAGTCAC-AC-GCTTACATTTTT--AAACTCGCTATTGCTCGTTT-A-AA-CTTACCCTA----------G--------TCT-------AA--C---TGACA-AGTTACTT----TGTC-C-G-----TGTCTGTACCCT--C--GCTG-----AATGACT-TAACTC-T-C--CTAAAA-TCAGTCCCTGAATGTACAAACAACT-A------------TTCTA--TC---------A-TTGGTCAATTCATTTCTACTTTTC-TATTGGTCAGTATTCTAATTACATA---TC--TTA--A--GGACC--------A--------GCC----------C----------AC-AAC--A--TTAA--------CT--TGTCA-A-CAA-------TACATCAAGATAACCCT-AGGTTA----TAATT----TAACTC-CAGTAATCTGTCATCC-TA--TCT--A---TTAAACCG-----TCA--TA
gi|102989 : TGTGGTATAATCG--A--C-TCAA---CA--ACGTTCT---TTGTATA---A--TAAGT-AAATTTTATTCACATAATTATAAAGTTTGC----ATA--AG--TTCAAAGTCAC-AA-ACTAACATTTTT--AAACTCGCTATCGCTCGTTT-A-AA-CTAACCCTA----------A--------TCT-------AA--G---TGACA-TGTTACTC----TGTC-T-G-----TGTATACACCCT--G--ACTG-----AAGG--A-CTTGTC-T---ACTTAAA-CCAGTCCCTGAATAAATAAACAACT-T------------TTCTA--TC---------A-GTGGTCAATTCATTTCTACTTTTC-TATTGGTCAGTATTCTAATTACAGA---TC--TTA--A--GATCC--------A--------GCC----------C----------ACAA----A--TTAA--------C---TGTCA-C-CTA-------TACATCAAGATAACCCT-AGACTA----TTATT----TATCTC-CAGTAACATGTCATCC-TG--TCC-TA---TTAACCTG-----TCA--TA
gi|102990 : TGTGGAACAACCG--A--C-TCAA---CT--ATGTTCT---TTGTATA-------AAGT-AAATTTTATTCACATTGTTATAAAGTTTGG----ATA--AG--TTCTAAGTCAC-AA-GCTAACATTTTT--AAACTCGCTCTCGCTGGTTT-A-AA-CTAACTCTA----------G--------TCT-------AAA-C---TGACA-GGTTAA-C----AGATTC-G-----CATCTACATTCT--A--ACTG-----AAGG--A-CTTATC-T-CTACTAAAA-CCAGTCCCTGACTGAATAACAAACT-A------------TCCTA--TG---------A-TTGGCCAATTCATTGCTACTTTTA--ATTGGTCAGTATTTTACTTACATG---TC--TTA--A--GATCC--------T--------GCC----------C----------AC-A----AA-CTAA--------CT---GTCA-G-CTA-------TACATCAAGATAACCCT-AGACTA----TTATT----TATCTC-CAGTAACCTGTAATCC-TA--TCT-TA---TTAAACCG-----TCA--TActatgtacatacaattcttaactaccataatataacatcacatgcgcatagctaaacacaaataatatgtttgtcgtttatgaaatcatgcatc
gi|102991 : TGTGGCATAATCG--A--A-TCAA---CA--AC--T-T---T-GTAC----------------TTTTATTCACATATTTATATAGTACGC----ATA--AG--TTCAAAGTCAC-AA----AACATTTT---AAACTCGCATTCGCTCGTTT-A-AA-CTAAACCTA----------G--------TCT-------AA--T---TTACA-TGTTACCC----TGTT-C-G-----TATCTACATTCT--G--ACTG-----AAGG--A-CCTATC-T-CTACCAAAA-CCAGTCCCTGACTGAATAACCAACT-A---------------------------------------------TCCTACTTTTT-AATTGGTCAGTATTATAATTACAGG---TC--GTA--A--GATCC--------C--------GCC----------C----------ACAA----A--CTAA--------C---TGTCA-A-CTG-------T-CATCAAGATAACCCT-AGGCTA----TTATT----TATC-------------TCATAC-TA--TCT-AA---TTAACCTG-----TCA--TA-A--TAT-----GTACATACAA----T-----TTTTA-------A-------C--------TAC------C-ATA-ATATA-------ACATTCCTCCCATGTTTAAGATAAAATATATA-----T-GTA-------C-------------TA--------------ATATATT---T
gi|102992 : TGTAGTATAACAGGTA--C-TCAAA--CATGGT--TGT---T-TTATAT--A---AAGT-CA-TTTTATTTACATGTTTATATATTTTGC----ATATAAG--TTCGAAATCAC-AAAGCTAACATTTT---AAAGTCGCTTATGCTCATCT-A-AAACTAAACTTA----------G--------TGT-------AAAAC---TGACA-TGTTACCA----TGCT-C-G-----AGATTAC--CTTCGG--ACTG-----ACCT--T-CC-CTC-T-C---TAAAA-TCTGTCTCTAACTGAATAAACAACT-A------------TGCTA--TG---------A-TTGGTCAATTCATTGCTACCTTCC-AATTGGTTGGTTTCTTAATTACAGA---CA--TTA--A--AATCC--------C--------GCC----------CTTATCATATGAC-A----A---AAC--------CTACTGTCA-A-CTA-------CACATCATGATAA-CCT-AGGCTA----TTATT----TATCTC-CAGTAGCCTGTCATCC-TA--TCT-TA---TTAATCTG-----TCA--TAttctctattgtaatcagattattttatctcagttctggaaca
gi|102993 : TGTGGTATAACAG--A--CACCAA---CATGAT--TGT---T-TTGTAT------AAGT-AA-TTTTATTCACATATTTATATAGTTTGC----ATA--AAAATTAAAAGTCAC-AAAGCGAACATTTT---AAACTCGCCTTCGCTCATCT-A-AA-CTAAACCTA----------G--------TTT-------AAA-C---TGACA-TGTTAC-C----AGAT-TTG-----CATCTACTTTCT--A--AATG-----ACTG--C-CCTTCC-T-C-TCTAAAAATCTGGCTCTGACTGAATAACCAACT-C------------TGCTA--TA---------A-TTGGTCAATTCATTGCTACCTTTC-GATAGGTCAGATTCTTAATTACGGA---CC--TTA--A--AACCC--------C--------ACC----------C----------AT-ATCATA--TGACAAAACCTACT--T-TCA-G-CAA-------CACATCATGATAACCCTAAGACTA----TTA-T----AATCTC-CATTAGCCTGTGTTCC-TA--TCT-CA---TTAGCCTG-----TCA--TA
gi|102994 : TGTAGTATAACCG--A--C-TCAAATATG--GT--TGT---T-TTATA-C-A---AAGT-CAATTT-ATTCACATGTTTTTATATTTCTC----ATATAAG--TTCGAAATCAC-AAAGCTAACATTGT---AAACTCGCTTTCGTTCGTCTGA-AA-CTAAACCTA----------G--------TCT-------AAAAC---TGACA-TGTTACTA-----GACTC-G-----AGGTTACTTTCT--A--ACAGCCAGAACTT--T-CCTCTC-T-A----AAAA-TCATTCTCTGACTGAATAAACAACT-A------------ACCTA--TG---------ATTTGGTCAATTCATTGCTACTTCCC-AATTGGTC-GTTTCTTAATTATGAAGGTTC--ATAACA--ACTCCCCCATCATA--------TCA----------C----------AC-A----A--CTAC--------C---TGTCA-A-ATA-------TACAACATAATAAGCCTAAGGCTA----TAATT----TATCTC-CATTAGCCTGTCATC
gi|102995 : TGTAGTATAACAG--ATAC-TCAA---AC--AT--GAT---T-GTTTTTCTA--TATGT-CA-TTTTATTAACATATTTATC---TTTTTGCATATA--AG--TTCAAAATCAC-AAAGCTGACATTTT---AAACTCACTAATGCTCGTCT-ATAG-CTAAACCTT----------G--------TCT-------AA--AA--TGAAAATGTTG--------------G-----TGTTTAG--CTT--TCTGCTG-----ACAG--A-CCTTTCCT-C-TCTAAAA-TCTGTCTCTGACTGAATAAACAACT-A------------TCTTA--TC---------A-TTGGTCAATTCACTGTTACTTACC-AATTGGTCAGTTTCTCAATTATGAAGGCTC--ATA--ACCCCTCC--------A---------CCGATCATATCAC----------AC-A----A--CTAC--------C---TGTCA-A-ATA-------TACAACATGATAAACCTAAGGCTA----TAATA----TATCTC-CATTAGCCTGTCATC
gi|102996 : TGTTGCATAATCG--A--C-TCAA---CG--A--------------TA-------AAGT-AAATTTTATTCACATAATTATAAAGTTCGC----ATC--AG--TTCAAAGTCAC-AA-GCTATCTTTTTTTAAAACTCGCTATCGCT
gi|102997 : TGTCGCATAATCG--A--C-TCAA---CA--AC--TCT---T-GTATATC-A--TAAGT-AAATTTT
gi|102998 : TAATCG--A--C-TCAA---CA--AC--TCT---TTGTATATC-A--TAAGT-AAATTTTATTCACATAATTATAAAATTCTC----CTA--AG--TTCAAAGTCAC-AA-GCTTACATTTTT--AAACTCGCTACTGCTCGTTT-A-AA-CTAAACCTA----------G--------TCT-------AA--C---TAACA-TCTTACTC----TGAC-C-G-----TGGCTAAAACTT--A--ACTG-----ACTG--T-CCGCTCTT-T-GTCAAAA-CCAGTTCCTGAATGAATAAACAGCT-T------------TTCTA--TT---------A-TTGGACAATTCATTTCTACATTGC-TATTGGTCAGTATTTTAATTACAGA---TC--TTA--A--AGACC--------A--------GCC----------C----------AC-AAC--A--TTAA--------CT--TGTCA-A-CAA-------TACATCAAGATAACCCT-AGGCTA----TCATT----TATCTC-CAGTAAACTGTCATCC-TA--TCT--A---CTAAACTG-----TCA--TAGA--T-T-----CAAGATTCAAGA-TT-----TCTTT-------A-------C--------T--------T-ATACATATA-------ATGTTTCTT-------------AATACATACA-----T-ATA-------T-------------CA--------------ATATATT---TATTTATGGCATATGAAGTATCTA------CAATTCTAA-A------------CCCATAATGTTACA
gi|102999 : --TTT---T-ATATA-------AAGT-CA-TTTTATTCACATGTTCATGTATTTCTC----ATATAAG--TTCGAAATCACGAA-GCTAACATTTT---ATACTCGCTGACGCTCGTCT-A-AAACTAGACATA----------G--------TCT-------AAAAC---TGA-A-TGTTACCA----TGTT-G-G-----TATCTAG--CTTTCA--ACTG-----ACAG--A-CCTTTCCT-C-TCTAAAA-TCTTTCTCTGACTGAATAAACAGCTTA------------TCTTA--TC---------A-TTTGTCAATTCATTGTTACTTCCC-AGTTGGTCAGTTTCTTAATAATGAAGGTTC--ATA--ACCCCTCCCCCATCATA--------TCA----------C----------AC-A----A--CTAC--------C---TGTCA-A-ATA-------TACAACATGATAAACCTAAGGCTA----TAATT----TATCTT-CTTTAGCCTGTCATCTGTAAGTGA-CATGGTTGACCT------TTA--TAAA--T-TATAAACAAAATTTAAGA-AT-----TGTAT-------A-------CA-------T--------T-AAA-G---A-------A---TTCTTA------------ACTAC---CA-----TAATA-------T--------------A--------------ACATAT
gi|103000 : --TTT---T-ATATA-------AAGT-CA-TTTTATTCAAATTTTTATATATTTCTC----AT-------TT--AAGTCAC-AAAGCTAACATTTT---AAACTCGCTAAATATCGTCT-A-AA-ACCAATCTA----------T--------TCT-------AA--CACTTGTCA-TGTTACCCTACTTGAC-G-C-----TTCCT----TTC--A--ACTA-----ACCG--TGTTACCC-T-C-ACTGAGG-TTTTTCTCTAACTGACCAAAC-ACT-ATCCCAAAGAGGCTTCTAGGTCATTTCCTTGA-TTGGTCAATTTTTTATTACCTCAC-TATTGGTCAGTTTCTTAATT------------TCA--A--AGTCC--------AATAACCCTGCC----------C----------A-----------TAT--------CT--TATCACATCAATCATCTCTATATCATGATAAGCTTAAGGCTA----CCACT----
gi|103001 : ATTTTATTCACATG--TATAAA--------------------TCAAAGTCAC-AA-GCTAACATTTTT---AACTCACTAATGTCAATCT-A-AA-ACCAACCTATTTTAACAAGG--------TCTATTTTTCAA--C---TTACA-TGTTACCC----TAAC-C-ACTGTCTGTCTCTAAC-T--A--ACTA-----AACG--T-TCA-TC-T-T-CCCAAAG---AGGCCTCGAGC---T------CT-T------------TTCTC--TG---------A-TTGGTCAACTCATTGTTACCTGGCTTATT-GTCAGTTTCTTAATTACTTG---TCAATTA--A--A---C--------AC-------GCC----------C----------AT-ATCTTA--TCACAAAACCGACA--TGTCA-T-CTC-------TACATCATGATAAATCTAAGGCTATATCTTATTGTAACATATC-CATCTGCCTGATATTT-TA--TTTCCA---TTAGCTTG-----TCG--TATA--T-
gi|103002 : CT-A------------TTCTC--CC---------A-TTGGACAATTAATTCCTATATTAC-TATTGGTCAGTTAACCAATTACCGA---TC--TTA--A--AGTCC--------A--------GCC----------C----------AC-A----A--TTAC--------CT--TGACA-G-CAA-------TACATCAAGATAACCCT-AGGCTA----TCATT----TATCTC-CAGTAAACTGTCATCC-TA--TCT-CA---TTAAACTG-----TCA--TAGA--T-T-----CAAGATTCAAGA-CT-----TCCTC-------A-------C--------T--------T-ATACGTACA-------ATGTTTCTC-------------AATACATACA-----T-ATA-------T-------------CA--------------ATATATT---TATTTATGTCAAATGAAGTATCTT------CAATTCTAACATCTCAGTAGCATCCCATAATGTTACA
gi|103003 : AAACTGGATATTCAGTTAGA--T-T-----CAAGATTCAAGA-TTCAAATTCTTT-------A-------T--------TCAGTAATTT-AAACATATA-------ATGTTTCTC-------------ATTACACACA-----A-AT--------T-------------CAG-------------ATA
gi|103004 : TA-----TCA--TAGAGAT-T-----CAAGATTCAAGA-TTCAAATTCTTT-------A-------TGCAGTAATT--------T-AAACATATA-------ATGTTTCTC-------------ATTACATACA-----A-AT--------T-------------CA--------------
gi|103005 : -----TTA--TAGA--T-T-----CAAGATTCAAGA-TTCAAATTCTTT-------A-------T--------TCAGTAATTT-AAACATATA-------ATGTTTCTC-------------ATTACACACA-----A-AT--------T-------------CAG-------------ATA
gi|103006 : -----TCA--TAGA--T-T-----CAAGATTCAAA---T-----TCTTT-------A-------T--------TCAGTAATTT-AAACATATA-------ATGTTTCTC-------------ATTTCATACA-----A-AT--------T-------------CAG-------------ATA
gi|103007 : A--TAGA--T-T-----CAAGATTCAAA---T-----TCTTT-------A-------T--------TCAGTAATTT-AAACATATG-------ATGTTTCTC-------------ATTACATACA-----A-AT--------T-------------CA--------------
gi|103008 : --TAGA--T-T-----CGAGATTCAAGA-TTCAGATTCTTT-------A-------T--------TCAGTAATTT-AAACATATA-------ATGTTTCTC-------------ATTACATACA-----A-AT--------T-------------CA--------------
gi|103009 : AGA--T-T-----CAAGATTCAAGT-TT-----TCTTCATTTGTAA-------C--------T--------T-AAACATATA-------ATGTTTCTC-------------ATTACATACA-----A-ATA-------TTAAACATACATC-CA--------------ATATATC---TATTTA--TCACGTGACACATTTTGTGCAACAATTC
gi|103010 : AGA--T-T-----CAAGATTTAAGA-TT-----TCTTT-------ATTTGTAAC--------T--------T-AAACTTATA-------ATGTTTCTT-------------ATTACAAACA-----T-ATATTT----T-------------CA--------------AT
gi|103011 : AGA--T-T-----CAAATTTCAAGA-TT-----TCTTTATTTGTAA-------C--------T--------T-AAACATATA-------ATGTTTCTG-------------ATTACATACA-----T-ATA-------G-------------TACACATAT-------ATATGTT---TATTTAT
gi|103012 : --T-T-----CAAGATTCAAGA-TT-----TCTTT-------A-------T--------T--------TGAAACTTAT--------TTGTTTCTT-------------ATTACATACATTTATT-ATACATACATT-------------CA--------------ATATATT---TATTTA--TCACGTGACACATTTTATGAAACAATTC
gi|103013 : --T-T-----AAAGATTCAAGA-TT------CTTT-------ATTGTAA-C--------T--------T-AAACATATA-------ATGTTTCTT-------------AAAACACACA-----T-ATA-------T-------------TATACATACATCCATTATATATT---TATTTA--TCACGTGACGCATTTT------
gi|103014 : --T-T-----CAAGATTCAAGA-TT-----TCTTT-------A-------T--------T--------T-GTACCTTTAACATGTTATGTTTCTC-------------ATAACATACA-----T-ATA-------T-------------TATAAC----------ATACATCCAATATATATGT
gi|103015 : -----CAAGATTCAAGA-TT-----TCTTTATTTGTAA-------C--------T--------T-AAACATATA-------ATATTTCTC-------------ATTGCATACA-----T-ATA-------TTATACAACACCTCCA--------------ATATATT---TATTTAT
gi|103016 : -----T-ATA-------T-------------CATAA-----------GTAAATT---T---TNNNNNNNNNNAAGTATCTT------CAATTCTAACATCTCAGTAGCATCCCATAATGTTACA