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gi|147070                     :        aactAACTG---GTAGC-AGACT-TATGTATTACTTGCAAATTTGCTTGC----AACACTACAGTGTCC---TGT
gi|147071                     :             ACCA---GTAGG-GGATT-TATGTAT------------TGTTTGC----GATACTCAAGTGTCT---CGT
gi|147072                     :             ACTG---ACAGG-GGACTATATGTAT------------TGCTTGT----AATATTCCATTGTAT---TGTT
gi|147073                     :                      AGG-GGACT-TATGTAT------------TGCTTGT----AATACTCCA-TGTCT---TGTT
gi|147074                     :                           GACT-TCTGTAT------------TGCATGC----AATACTCCAGTGTCT---TGT


blockSeqs                     :                 TAA     T     A       TACTTGCAAATT       ATTT         C     AAA
blockSeqs                     :                 .       .     .       AC                 AATA         G     .  
blockSeqs                     :                 .       .     .       .                  .            T     .  
blockSeqs                     :                 .       .     .       .                  .            C     .  
blockSeqs                     :                 .       .     .       .                  .            C     .  
blockSeqs                     :                 .       .     .       .                  .            G     .  
blockSeqs                     :                 .       .     .       .                  .            G     .  
blockSeqs                     :                 .       .     .       .                  .            A     .  
blockSeqs                     :                 .       .     .       .                  .            A     .  
blockSeqs                     :                 .       .     .       .                  .            A     .  
blockSeqs                     :                 .       .     .       .                  .            C     .  
blockSeqs                     :                 .       .     .       .                  .            A     .  
blockSeqs                     :                 .       .     .       .                  .            G     .  
blockSeqs                     :                 .       .     .       .                  .            G     .  
blockSeqs                     :                 .       .     .       .                  .            C     .  
blockSeqs                     :                 .       .     .       .                  .            G     .  
blockSeqs                     :                 .       .     .       .                  .            G     .  
blockSeqs                     :                 .       .     .       .                  .            G     .  
blockSeqs                     :                 .       .     .       .                  .            C     .  
blockSeqs                     :                 .       .     .       .                  .            G     .  
blockSeqs                     :                 .       .     .       .                  .            G     .  
blockSeqs                     :                 .       .     .       .                  .            T     .  
blockSeqs                     :                 .       .     .       .                  .            G     .  
blockSeqs                     :                 .       .     .       .                  .            G     .  
blockSeqs                     :                 .       .     .       .                  .            G     .  
blockSeqs                     :                 .       .     .       .                  .            G     .  
blockSeqs                     :                 .       .     .       .                  .            G     .  
blockSeqs                     :                 .       .     .       .                  .            G     .  
blockSeqs                     :                 .       .     .       .                  .            G     .  
blockSeqs                     :                 .       .     .       .                  .            G     .  
blockSeqs                     :                 .       .     .       .                  .            G     .  
blockSeqs                     :                 .       .     .       .                  .            T     .  
blockSeqs                     :                 .       .     .       .                  .            G     .  
blockSeqs                     :                 .       .     .       .                  .            .     .  
blockSeqs                     :                         .     .       .                  .            .     .  
blockSeqs                     :                               .       .                  .            .        


blockSeqCons                  :        
originalCons                  :        TGTAAACCG---GTAGG-GGACT-TATGTAT------------TGCTTGC----AATACTCCAGTGTCT---TGTT
finalCons                     :        TGTAAACCG---GTAGG-GGACT-TATGTAT------------TGCTTGC----AATACTCCAGTGTCT---TGTT





Alignments
lowQualScore                  :                 222     1     1       777777777777       4444         1     111    
lowQualScore                  :                 ...     .     .       ............       ....         .     ...    
lowQualScore                  :                 000     1     1       000000000000       6666         9     999    
consensus                     :        TGTAAACCG---GTAGG-GGACT-TATGTAT------------TGCTTGC----AATACTCCAGTGTCT---TGTT
Reference ( family-575 )      :        TGTAAACCG---GTAGG-GGACT-TATGTAT------------TGCTTGC----AATACTCCAGTGTCT---TGTT
gi|147038                     :        TGTAAACCG---GTAGG-AGACT-TATGTAT------------TGCTTGC----AATACTCCAGTGTCT---TGTT
gi|147039                     :        TGTAAACCG---GTAGG-GGGCT-TATGTAT------------TGCTTGC----AATACTCCACTGTCT---TGTT
gi|147040                     :        TGTAAACCA---ATAGG-GGACT-TGTGTAT------------TGCTTAC----AATACTCCA--GTCT---TGTT
gi|147041                     :        TGTAAGCTG---GTAAG-GAAAT-TAAGCAT------------TGCTTGC----AATACTTCAGTGTCT---TGTT
gi|147042                     :        TGTAAACCA---GTAGG-GGACT-TGTGTGTAC----------TGCTTGC----AATACTCCATTGTCT---TATT
gi|147043                     :        TGCAAACTG---GTAGA-GGATT-TAAGTAT------------TGCTTGC----AATACTCGACTGTCT---TG
gi|147044                     :        TGTAAACCG---GTAGG-GGACG-TATGCGT------------TGATTGC----AATACTCCACTTTCT---TGTT
gi|147045                     :        TGTGAATCG---GTAAG-ATATT-TATGTAT------------TGCTTGC----AAAACTCCAGTGTCT---TGTT
gi|147046                     :        TGTAAACCG---GTAGG-GGACT-TATATAT------------TGCTTAT----AATACTCTG--GTTT---TGT
gi|147047                     :        TGTAAACTG---GTAGA-GGACT-TGTGTAT------------TGTTTGC----AGTACTGTTGTGTAT---TGCT
gi|147048                     :                G---GTAGG-GGACT-TACGTAT------------TGCTTGC----AATACTCAAATGTTTAAATGTT
gi|147049                     : tggaaatTGTAAACCA---GTAGG-GGA---TATCTTT------------TGCCTGC----AATACTTCAATGTCT---GGTT
gi|147050                     :        TGTAAACCA---GTAGG-GGA---TATCTTT------------TGCCTGC----AATACTTCAATGTCT---GGTT
gi|147051                     :        TGTAAATTATAAGTAGG-GGATT-TATGTAT------------TACTTGT----AATACTCAACTTTCT---
gi|147052                     :        TGTACACCT---GTAGG-G-ATG-TATATAT------------TGCTTGC----AATACTTCAATGTCT---TTTT
gi|147053                     :         GTAAACTG----TAGA-AGACT-TATGTAT------------TGCTTGC----AATA--CCAGTGTCT---TGTT
gi|147054                     :         GTAAACTG---GTAGG-GGACA-TATGTAT------------TGCTTGCATTTAATACCCCGGTGTAT---TGTT
gi|147055                     :         GTAAACCA---GTAAG-GGACT-TGTGTAT------------TGCTTGC----AATACTTCACTGGTT---TGTT
gi|147056                     :         GTAAACCA---GTAGG-GATTT-TATGTAT------------ATCTTGC----AATACTTCAGTATCT---TGTT
gi|147057                     :         GTAAACCG---GTAAA-GTACT-AAAGTAT------------TGCTAGC----CATACTCCAGTGTCT---TGTT
gi|147058                     :          TAAACCT---GTATG-GGATT-TGTGTAT------------TGTTTGC----AATACTCCAGTGTCT---TGTT
gi|147059                     :          TAAACAG---GTAGG-GGTCT-TCTGTAC------------TGCTTGC----AATACTCCACTGTCT---TGTT
gi|147060                     :          TAAACTT---GTAGG-GGACT-TATGTA----------------TTGC----AATACTCCAGTGTTT---TGTT
gi|147061                     :          TAAACTG---GTAGG-GGACT-TTTGCAT------------TGCTTGCAATAAATACTCCAGTGTC
gi|147062                     :          TAAACAG---ATAGG-GGACT-TATGTAT------------TGAATGC----AATACTCCATAGTCT---TGTT
gi|147063                     :          TAAAGCG---GTAGT-GAACT-TGTGTAT------------TTCTTTC----AAAACTCCAGTGTCT---TGTT
gi|147064                     :          TAAAC-----GTAAGTGAACT-TGTGTAT------------TGCTTTC----AATACTGTAGTGTCT---TGTT
gi|147065                     :           AAACCG---GTAGG-GGACT-TATGTTT------------TTCTTGC----AATACTCCAGTGTCT---TGTT
gi|147066                     :           AAACTG---GTTGG-GCACT-TATATAT------------TGCTTGC----AATACTCCAGTGTCT---TGTT
gi|147067                     :           AAATTG---GTAGG-GGACT-TACGTTT------------TGATTGC----AATACTCCAGTGTCT---TGTT
gi|147068                     :           AAACCA---GTAGG-GGACT-TATGTAT------------AGCTTGC----AAAACTCAAGTGTCT---TGTT
gi|147069                     :                 ---GTAAG-GGACT-TATGTGT------------TGCTTGC----AACACTCTGGTGTAT---TGT
gi|147070                     :        aactAACTG---GTAGC-AGACT-TATGTATTACTTGCAAATTTGCTTGC----AACACTACAGTGTCC---TGT
gi|147071                     :             ACCA---GTAGG-GGATT-TATGTAT------------TGTTTGC----GATACTCAAGTGTCT---CGT
gi|147072                     :             ACTG---ACAGG-GGACTATATGTAT------------TGCTTGT----AATATTCCATTGTAT---TGTT
gi|147073                     :                      AGG-GGACT-TATGTAT------------TGCTTGT----AATACTCCA-TGTCT---TGTT
gi|147074                     :                           GACT-TCTGTAT------------TGCATGC----AATACTCCAGTGTCT---TGT