lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 222222222222 22222222222222 666666666666 11 1 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 1 55555
lowQualScore : 0 999999999999 33333333333333 5 333333 777777777777 6 2222 44 0 22 0 44 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 44 444444 44 44 0 5 7 22222 2 7 5
lowQualScore : . ............ .............. . ...... ............ . .... .. . .. . .. ........................................................... .. ...... .. .. . . . ..... . . .
lowQualScore : 9 666666666666 33333333333333 4 444444 000000000000 6 9999 22 9 55 3 66 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 66 444444 44 77 7 6 1 00000 1 3 4
consensus : TAAGTCGATTTCTATATGGACTC-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCGCTGATGTCGATTTCT--------AT---ATGGAC----C-CC--A-AA---GAGGCAGT----GAGCG-GA--TGACCGCTG-AT------------G-----------------G----------ATTTC-CCC---------ATTCTACCCTTAGTCTCAAG-C------A-AT--CTACGTGATGTGACCTATATAGGAACCCTAAGTCGATTTCTATAT--G--GACTC-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCGCTGATGGAT
Reference ( gi|22769 ) : TAAGTCGATTTCTATATGGACTC-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATGNNNNNNNNNNTCGATTTCT--------TT---TTGGGC----C-CTTTA-AT---G-GGCAAT----GAAAG-GA--TGACCTCTA-AT------------A-----------------A----------A-----------------ATTCTACCCTTAGTCTCAAA-C------A-GT--CTAAATGGTGTGACCTATATAGGAGCCCTAAGTCGATTTCTATAT--ATTGACTC-CAAAGAGGCAGTGAGTGGATGACCGCTGATGGGT
gi|22772 : TAAGTCAATTTCTATATAAACTC-CAAAAAGGCAGTAAGTGGATG
gi|22770 : tatgtcgatttctttatgggcccttaaataggcagtgaaaggatgacctctgatctaattctaccctaagtctcaaacagtctaagtggtgtgacctatataggaatccTAAGTCGATTTCTATATAGACTC-CAGAGAGGCAATGAGCGTATGaccgctgatgggttt
gi|22770 : tatgtcgatttctttatgggcccttaaataggcagtgaaaggatgacctctgatcaaattctacccttactctcaaacagtctaagtggtgtgacctatataggaacccTATGTCGATTTCTTTATGGGCCCTTAAATAGGCAGTGAAAGGATG--ACCTCTGATCAAATTCT--------gccgttgatggat
gi|22771 : TAAGTCGATTTCTATAGGGACTC-CAAAAAGGCAGTGAGCGGATGACTGCTGATG--GATTTacccttactctcaaacagtctaagtggtgtgacctatataggaaccctaagtcgatttctatatagactccagagaggcaatgagcgtatggccgttgatggat
gi|22758 : tatgtcgatttctttatgggccccaaatagggagtgaaagggtgacttctgatcaaatttttcccttagtctcaagcagtctacgtggtgtaaccgatatagaacccTAAGTCGATATCTATATGGACTC-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATGACTGCTGATG--GATTT
gi|22760 : taagtcgatttctatatattgactccaaagaggcagtgagtggatgaccgctgatgggtccccccccccccccagattctacccttagtctcaaacaatctacatgatgtgacctatataggatcccTAAGTCGATTTCTATATGGACTC-TAAAGAGGCAGTGAGCGGATGGCTGCTAATA--GATTTCTACCC----CTGA-TTATAC----C-C-TTA-GTCTCA-AGCAATC---TACAT-GATGTGACCTAT--AT------------A-----------------G----------G-----------------A----ACCCTTAGTC
gi|22764 : TAAGTCGATTTCTATATGGACCC-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCGTTGATG--GATTTgatttatatatggactcaaaagaggcagtgaggggatggccgctgatggattt
gi|22756 : tatgtcgatgaatatattgacccaaaagaggcgatgagaggatggccgctgatggatcccacctgctagattctacctttagtctcaagcaatctacatgatgtgacctatataggatcccTAAGTCGATTTCTATATGGACTC-CAAAGAGGCAGTGAGTGGATGACCGCTGATG--GATTT
gi|22756 : taagtggatttctatataaactccagagaggcagtgagcggatggcctcttatggatttctctccagattctacctttagtctcaagcaatctacgtgatgtgacctttatatgaacccTAAGTGGATTTCTATATAAACTC-CAGAGAGGCAGTGAGCGGATGGCCTCTTATG--GATTTCT--------CT---CCAGATTCTAC-CTTTA-GTCTCA-AGCAAT----CTACGTGATGTGACCTTTATAT------------G-----------------A---------------------------------ACCCTAAGTC
gi|22753 : TAAGTCGATTTCTATATGGACCC-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCGTTGATG--GATTTCT--------gatttctatatggactccaaagaggcagtgagtggatgaccgctgatggattt
gi|22751 : TAAGTCGATTTCTATATGGACTC-CAAAGAGGCAGTGAGTGGATGACCGCTGATG--GATTTCTCCCCCAGATT---CTA-------C-CTTTA-GTCTCA-AGCAATCTACGTAAT-G---TGGCCTAT--AT------------A-----------------G----------G-----------------A----ACCCTTAGTCcccccaaattctaccctaagtctcaagcaatctacgtgatgtgacctatataggaaccctaagtggatttctatataaactccagagaggcagtgagcggatggcctcttatggattt
gi|22761 : TAAGTCGATTTCTATATGGACTC-AAAAGAGGCAGTGAGCGGATG--GCTGCTAATTGATTTgatttctatacggactccaaagaggcagtgagcagatgaccgctaatggattt
gi|22755 : taagtcgatttcaatattaactccaaacaggcagtgaacggatggcctctaatggatttctcccccagattctaccctttgtctcaagcaatctacatgatgtgacctatatagaaacccTAAGTCGATTTCTATAGGGACTC-CAAAAAGGCAGTGAGCGGATGACTGCTGATG--GATTTCT--------T
gi|22776 : TAAGTCGATTTCTATATGGACTC-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATGNNNNNNNNNNTCGATTTccccagattctaccataaatatcaagcaatctacatgatgtgacctatataggaaccctaagccgatttctatatggactccaaagaggcagtgagcggatggccgctaatggat
gi|22763 : aagtcgatttctttatggactccaaagaggcagtgagcagatgaccgccgatggatttctccccaagattctacctttagtctcaaaacaatctacgtgatgtgactaatataggaacccTAAGCCGATTTCTATATGGACTC-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATG
gi|22763 : TAAGTCGATTTCAATATTAACTC-CAAACAGGCAGTGAACGGATGGCCTCTAATG--GATTTgccgctaatggatccatcccaccccttatattctacctttagtctcaagcaatctacatgatgtgacctatataggaaacctaagtcgatttcaatattaactccaaacaggcagtgaacggatggcctctaatggattt
gi|22762 : taagccgatttctatatggactccaaagaggcagtgagcggatggccgctaatggatccatcccaccccttatattctacctttagtctcaagcaatctacatgatgtgacctatataggaaaccTAAGTCGATTTCTATATGGACTC-AAAAGAGGCAGTGAGCGGATG--GCTGCTAATTGATTTCT--------
gi|22780 : TAAGTCGATTTCTATATGGACTC-CAAAGAGGCAGTGAGGGGATGGCCGCTAATG--GATTTcccccagattctaccattagtctcaagcaatcttaatgatgtgacctatataggaaccttcagtcgatttcaatatggactccaaagaggcagtgaggggacggccgctaatgattt
gi|22765 : agtcgatttcaatatggactccaaagaggcagtgaggggacggccgctaatgatttccctccagattctatctttagtctcaagcaatctacgtgatgtgactaataaaggaactcTAAGTCGATTTCTATATAGACTC-CAGAGAGGCAATGAGCGTATG
gi|22754 : TAAGTCGATTTCTATATGGACTC-CAAAGAGGCAGTGAGGGGATGGCCGCTAATG--GATTTCgccgttgatggatcccatctcttagattctacctttagtctcaagcaatttatatgatgtgacctatataggaaaccgaagtcgatttctataatgattccaaagaggcagtgagctgatgaccgctgatggattt
gi|22757 : TAAGTCGATTTCTATATGGATCA-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCACTGATAT--ATTTcctccagattctacctttagtctcaagcaatctacgtgatgtgaccaatataggaaccctatgtcgatttctatatggatcactcagtggcagtcagcggatgaccactgatggattt
gi|22786 : taagacgaattctatatggactccagagaggcagtgaggggatggccgctaatggatttccctccagattctagctttagtctcaagcaatttacgtgatgtgatctatataggaacccTAAGTCGATTTCTATATGGACCC-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCGCTGATG--GATTT
gi|22759 : caaagaggcagtgagctgatgatcactgatggattttcctccaagattctacatgtagtttcaaacaaattacgaggtgtgacctatataggaacccTAAGTCGATTTCTATATGGACTC-TAAAGAGGCAGTGAGCGGATGGCTGCTAATA--GATTT
gi|22752 : taagtcaatttctatataaactccaaaaaggcagtaagtggatgaccgctgatgggtttctctcccagattctacctttagtctcaagcaatctacatgatgtgactaatatagtaacccTAAGTCGATATCTATATGGACTC-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATGACTGCTGATG--GATTTCT--------
gi|22778 : TAAGTCGATTTCTTTATGGACTC-CAGAGAGGTAGTGAGCGGATGccccaagattctacctttagtctcaagcaatctacgtgatgtgacctatatagcaaccctatgtcgatttctatatggatcaccaagaggcagtcagcggatgaccactgatggattt
gi|22785 : aagtcgatttctataatgattccaaagaggcagtgagctgatgaccgctgatggatttctcccccatattctaccctttatctcaagcaatctacatgatgtgacctataaaggaacccTATGTCGATTTCTTTATGGGCCC-CAAATAGGGAGTGAAAGGGTGgtcgttgatggat
gi|22787 : accccaaagaggcagtgagcggatgaccgctgatggatttcttccccagattccacctttagtctcaaacaatctacgtgatgtgacctatataggaacccTATGTCGATTTCTATATGGATCA-CCAAGTGGCAGTCAGCGGATGacttctgat
gi|22775 : ggatggccgctaatggatttccctacagattctacctttagtctcaagcaatctacgtgatgctaccaatataggaacccTAAGTCGATTTCTATATGGACCC-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCGCTGATG--GATTTCT--------Taccactgatgaattt
gi|22773 : TAAGTCGATTTCTATATGGATCA-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCACTGATAT--ATTTTT--------TT---cccc
gi|22774 : TAAGTCGATTTCTTTATGGACTC-CAGAGAGGTAGTGAGCGGATGccaagactctacacttagtctcaagcaagctacgaaagaggccacaaagaggcagtgagctgatgatcactgatggattt
gi|22788 : TATGTCGATGAATATATTGACCC-AAAAGAGGCGATGAGAGGATGgtcgttgatggatcccaccccttagattctacctttagtctcaagcaatttaccctatgt
gi|22765 : AAGTCGATTTCTATAATGATTC-CAAAGAGGCAGTGAGCTGATGACCGCTGATG--GATTTgccgctgatggat
gi|22778 : taagtcgatttctatatagactccagagaggcaatgagcgtatggccgttgatggatcccatctcttagattctacctttagtctcaagcaatttatatgatgtgacctatataggaaaccgAAGTCGATTTCTATAATGATTC-CAAAGAGGCAGTGAGCTGATGACCGCTGATG--GATTTCT--------
gi|22777 : AAGTCGATTTCTATATGGACTC-CAGAGAGACAGTGAGCGAATGGCTGCTAATG--GATTTCcccccatattctaccctttatctcaagcaatctacatgatgtgacctataaaggaaccctaagtcgatttctttatggactccagagaggtagtgagcggatggtcgttgatggat
gi|22781 : AAGTCGATTTCTATATGGACTC-CAGAGAGACAGTGAGCGAATGGCTGCTAATG--GATTTcctccagattctacctttagttttaagcaagctacgtgatgtgacctatatatgaacccaaagtcgatttctttatggactccaaagaggcagtgagcagatgaccgccgatggattt
gi|22779 : agtcgatttatatatggactcaaaagaggcagtgaggggatggccgctgatggatttctccccaagagtctacccttagtctcaagcaatctacatgatgtgacctataAGTCGATTTCTATACGGACTC-CAAAGAGGCAGTGAGCAGATGACCGCTAATG--GATTTCT--------
gi|22782 : GTCGATTTCTATATGGACCC-AAAAGAGGCA-TGAGCGGATGACCGCTGGTG--GATTTCT--------ccaacagattctaccctgtgtctcaagcaatctacatgatgtgatctatataggaactctaagacgaattctatatggactccagagaggcagtgaggggatggccgctaatggattt
gi|22766 : GTCGATTTCTATATGGACCC-AAAAGAGGCA-TGAGCGGATGACCGCTGGTG--GATTTcccccagattcttcctttagtctcaagcaatctacgtgatgtgacctatataggaaccctatgtcgatttctttatgggcccttaaataggcagtgaaaggatgacctctgat
gi|22768 : tatgtcgatttctatatggatcaccaagtggcagtcagcggatgaccactgatgaattttcttcaaagattctacactaagtctgaagcaagttacgaaatgtgacctatataggaaccctgtGTTGATTTCTATATGGACCC-AAAAGAGGCA-TGAGCGGATGACCGCTGGTG--GATTT
gi|22783 : tatgtcgatttctatatggatcactcagtggcagtcagcggatgaccactgatggattttcctcaaagattctacactaagtctcaagcaagttacgaaatgtgatctattttggaaccctgtGTCGATTTCTATATGGACCC-AAAAGAGGCA-TGAGCGGATGACAGCTGGTG--GATTTCT--------
gi|22767 : GTCGATTTCTATATGGACCC-AAAAGAGGCA-TGAGCGGATGACAGCTGGTG--GATTTcccccagattctacctttagtctccagcaatctacgtgatgtgacctatagaggattcctatgtcgatttctttatgggcccttaaataggcagtgaaaggatgacctctgat
gi|22784 : tatgtcgatttctatatggatcaccaagaggcagtcagcggatgaccactgatggattttcctcaaagattctacactaagtctcaagccaagcaagttacgaaatgtaacctatataggaaccatgtGTTGATTTCTATATGGACCC-AAAAGAGGCA-TGAGCGGATGACCGCTGGTG--GATTTCT--------
gi|22785 : ACCC-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCGCTGATG--GATTTCT--------Tcccccagattctacctttagtctcaagcaatctacgtgatgtgacctata
gi|22772 : TCGATTTCT--------TT---ATGGGC----C-CTTAA-AT---A-GGCAGT----GAAAG-GA--TGACCTCTG-AT------------C-----------------T----------A-----------------ATTCTACCCTAAGTCTCAAA-C------A-GT--CTAAGTGGTGTGACCTATATAGGAATCCTAAGTCAATTTCTATAT--A--AACTC-CAAAAAGGCAGTAAGTGGATGACCGCTGATGGGccccagattccacctttagtctcaaacaatctacgtgatgtgacctatataggaaccctatgtcgatttctttatgggccccaaatagggagtgaaagggtgacttctgat
gi|22770 : tatgTCGATTTCT--------TT---ATGGGC----C-CTTAA-AT---A-GGCAGT----GAAAG-GA--TGACCTCTG-AT------------C-----------------A----------A-----------------ATTCTACCCTTACTCTCAAA-C------A-GT--CTAAGTGGTGTGACCTATATAGGAACCCTAAGTCGATTTCTATAT--A--GACTC-CAGAGAGGCAATGAGCGTATGGCCGTTGATGGAtt
gi|22771 : tatgTCGATTTCT--------TT---ATGGGC----C-CCA-A-AT---A-GGGAGT----GAAAG-GG--TGACTTCTG-AT------------C-----------------A----------A-----------------ATTTTTCCCTTAGTCTCAAG-C------A-GT--CTACGTGGTGTAACCGATATA-GAACCCTAAGTCGATTTCTATAG--G--GACTC-CAAAAAGGCAGTGAGCGGATGACTGCTGATGGA
gi|22758 : tatgTCGATTTCT--------ATATATTGA--------CTCCA-AA---GAGGCAGT----GAGTG-GA--TGACCGCTG-AT------------GGGTCCCCCCCCCCCCCCA----------G-----------------ATTCTACCCTTAGTCTCAAA-C------A-AT--CTACATGATGTGACCTATATAGGATCCCTAAGTCGATATCTATAT--G--GACTC-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATGACTGCTGATGGAtt
gi|22760 : taagTCGATTTCT--------AT---ATGGAC----T-CT--A-AA---GAGGCAGT----GAGCG-GA--TGGCTGCTA-AT------------A-----------------G----------ATTTCTACCCCTG-----ATTATACCCTTAGTCTCAAG-C------A-AT--CTACATGATGTGACCTATATAGGAACCCTTAGTCGATT--TATAT--ATGGACTC-AAAAGAGGCAGTGAGGGGATGGCCGCTGATGGAtt
gi|22764 : taagTCGATTTCT--------AT---ATGGAC----C-CC--A-AA---GAGGCAGT----GAGCG-GA--TGACCtt
gi|22753 : tatgtcgatgaatatattgacccaaaagaggcgatgagaggatggccgctgatggatcccacctgctagattctacctttagtctcaagcaatctacatgatgtgacctatataggatccctaagTCGATTTCT--------AT---ATGGAC----C-CC--A-AA---GAGGCAGT----GAGCG-GA--TGACCGTTG-AT------------GGATTTCTCCCCC-----A----------A-----------------ATTCTACCCTAAGTCTCAAG-C------A-AT--CTACGTGATGTGACCTATATAGGAACCCTAAGTGGATTTCTATAT--A--AACTC-CAGAGAGGCAGTGAGCGGATGGCCTCTTATGGAgttgatggattt
gi|22751 : taagTCGATTTCT--------AT---ATGGAC----T-CC--A-AA---GAGGCAGT----GAGTG-GA--TGACCGCTG-AT------------G-----------------G----------ATTTCTCCCCCAG-----ATTCTACCTTTAGTCTCAAG-C------A-AT--CTACGTAATGTGGCCTATATAGGAACCCTTAGTCGATTTCTATAC--G--GACTC-CAAAGAGGCAGTGAGCAGATGACCGCTAATGGAtt
gi|22755 : taagTCGATTTCT--------AT---AGGGAC----T-CCAAA-A----A-GGCAGT----GAGCG-GA--TGACTGCTG-AT------------G-----------------G----------ATTTCTTCCCCAG-----ATTCTACCATAAATATCAAG-C------A-AT--CTACATGATGTGACCTATATAGGAACCCTAAGCCGATTTCTATAT--G--GACTC-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATGGCCGCTAATGGAtt
gi|22776 : taagTCGATTTCT--------TT---ATGGAC----T-CC--A-AA---GAGGCAGT----GAGCA-GA--TGACCGCCG-ATGGATTTCTCCCCA-----------------A----------G-----------------ATTCTACCTTTAGTCTCAAAAC------A-AT--CTACGTGATGTGACTAATATAGGAACCCTAAGTCGATTTCTATAT--G--GACTC-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATG
gi|22762 : aagTCGATTTCT--------AT---ATGGAC----T-CA--A-AA---GAGGCAGT----GAGCG-GA--TGGCTGCTA-ATTG----------ATTTCTCCCCC-------A----------G-----------------ATTCTACCATTAGTCTCAAG-C------A-AT--CTTAATGATGTGACCTATATAGGAACCTTCAGTCGATTTCAATAT--G--GACTC-CAAAGAGGCAGTGAGGGGACGGCCGCTAATGnnnnnnnnnntcgattt
gi|22780 : taagTCGATTTCA--------AT---ATGGAC----T-CC--A-AA---GAGGCAGT----GAGGG-GA--CGGCCGCTA-AT------------G-----------------ATTTCCCTCCAG-----------------ATTCTATCTTTAGTCTCAAG-C------A-AT--CTACGTGATGTGACTAATAAAGGAACTCTAAGTCGATTTCTATAT--G--GACTC-CAAAGAGGCAGTGAGGGGATGGCCGCTAATGGAattt
gi|22765 : agTCGATTTCT--------AT---ATAGAC----T-CC--AGAG---A-GGCAAT----GAGCG-TA--TGGCCGTTG-AT------------G-----------------G----------ATCCCATCTCTTAG----ATTCTACCTTTAGTCTCAAG-C------A-AT--TTATATGATGTGACCTATATAGGAAACCGAAGTCGATTTCTATA---A-TGATTC-CAAAGAGGCAGTGAGCTGATGACCGCTGATGGAtt
gi|22779 : taagTCGATTTCT--------AT---ACGGAC----T-CC--A-AA---GAGGCAGT----GAGCA-GA--TGACCGCTA-AT------------G-----------------G----------ATTTCTCCAACAG-----ATTCTACCCTGTGTCTCAAG-C------A-AT--CTACATGATGTGATCTATATAGGAACTCTAAGACGAATTCTATAT--G--GACTC-CAGAGAGGCAGTGAGGGGATGGCCGCTAATGGAtt
gi|22754 : agTCGATTTCT--------AT---ATGGAC----T-C--CA-AA---GAGGCAGT----GAGGG-GA--TGGCCGCTA-AT------------GGATTTCCCTCC------A----------G-----------------ATTCTACCTTTAGTCTCAAG-C------A-AT--CTACGTGATGTGACCAATATAGGAACCCTATGTCGATTTCTATATGGATC-ACTC----AGTGGCAGTCAGCGGATGACCACTGATGGAtt
gi|22757 : taagTCGATTTCT--------AT---ATGGAT----CAC---A-AA---GAGGCAGT----GAGCG-GA--TGACCACTG-AT------------A-----------------tt
gi|22786 : taagacgaattctatatggactccagagaggcagtgaggggatggccgctaatggatttccctccagattctagctttagtctcaagcaatttacgtgatgtgatctatataggaaccctaagTCGATTTCT--------AT---ATGGAC----C-CC--A-AA---GAGGCAGT----GAGCG-GA--TGACCGCTG-AT------------tattt
gi|22759 : caaagaggcagtgagctgatgatcactgatggattttcctccaagattctacatgtagtttcaaacaaattacgaggtgtgacctatataggaaccctaagTCGATTTCT--------AT---ATGGAC----T-C--TA-AA---GAGGCAGT----GAGCG-GA--TGGCTGCTA-AT------------A-----------------G----------A-----------------TTTggattt
gi|22752 : taagtcaatttctatataaactccaaaaaggcagtaagtggatgaccgctgatgggtttctctcccagattctacctttagtctcaagcaatctacatgatgtgactaatatagtaaccctaagTCGATATCT--------AT---ATGGAC----T-CC--A-AA---GAGGCAGT----GAGCG-GA--TGACTGCTG-ATGGATTTCTCCCCA-----------------A----------G-----------------ATTCTACCTTTAGTCTCAAG-C------A-AT--CTACGTGATGTGACCTATATAGCAACCCTATGTCGATTTCTATAT--G--GATCA-CCAAGAGGCAGTCAGCGGATGACCACTGATGGA
gi|22777 : taagTCGATTTCT--------AT---ATGGAC----T-C--CAGAG---A-GACAGT----GAGCG-AA--TGGCTGCTA-AT------------GGATTTCCCTCC------A----------G-----------------ATTCTACCTTTAGTTTTAAG-C------A-AG--CTACGTGATGTGACCTATATATGAACCCAAAGTCGATTTCTTTAT--G--GACTC-CAAAGAGGCAGTGAGCAGATGACCGCCGATGGAtt
gi|22781 : aagTCGATTTAT--------AT---ATGGAC----T-CA--A-AA---GAGGCAGT----GAGGG-GA--TGGCCGCTG-ATGGATTTCTCCCCA-----------------A----------G-----------------AGTCTACCCTTAGTCTCAAG-C------A-AT--CTACATGATGTGACCTATA----------AAGTCGATTTCTATAT--G--GACTC-CAGAGAGACAGTGAGCGAATGGCTGCTAATGGAtt
gi|22782 : agTCGATTTCT--------AT---ATGGAC----C-CA--A-AA---GAGGCA-T----GAGCG-GA--TGACCGCTG-GT------------G-----------------G----------ATTTCTCCCCCAG-----ATTCTTCCTTTAGTCTCAAG-C------A-AT--CTACGTGATGTGACCTATATAGGAACCCTATGTCGATTTCTTTAT--G--GGCCCTTAAATAGGCAGTGAAAGGATGACCTCTGATtt
gi|22785 : gTCGATTTCT--------TT---ATGGGC----C-CCA-A-AT---A-GGGAGT----GAAAG-GG--TGACTTCTG-AT------------
gi|22766 : accccaaagaggcagtgagcggatgaccgctgatggatttcttccccagattccacctttagtctcaaacaatctacgtgatgtgacctatataggaaccctatgTCGATTTCT--------AT---ATGGAT----C-ACCAA-GT---G-G-CAGT----CAGCG-GA--TGACCACTG-AT------------G-----------------A----------ATTTTCTTCAAAG-----ATTCTACACTAAGTCTGAAG-C------AAGTTACGAAATG---TGACCTATATAGGAACCCTGTGTCGATTTCTATAT--G--GACCC-AAAAGAGGCA-TGAGCGGATGACCGCTGGTGGA
gi|22768 : tatgTCGATTTCT--------AT---ATGGAT----C-ACTCA-GT---G-G-CAGT----CAGCG-GA--TGACCACTG-ATGGATTTTCCTCAA-----------------A----------G-----------------ATTCTACACTAAGTCTCAAG-CA-----A-GTTACGAAA---TGTGATCTATTTTGGAACCCTGTGTTGATTTCTATAT--G--GACCC-AAAAGAGGCA-TGAGCGGATGACCGCTGGTGGAtt
gi|22783 : tatgTCGATTTCT--------AT---ATGGAC----C-CA--A-AA---GAGGCA-T----GAGCG-GA--TGACAGCTG-GT------------G-----------------G----------ATTTCTCCCCCAG-----ATTCTACCTTTAGTCTCCAG-C------A-AT--CTACGTGATGTGACCTATAGAGGATTCCTATGTCGATTTCTTTAT--G--GGCCCTTAAATAGGCAGTGAAAGGATGACCTCTGATtt
gi|22767 : gTCGATTTCT--------AT---ATGGAT----CACC--A-AG---A-GGCAGT----CAGCG-GA--TGACCACTG-ATGGATTTTCCTCAA-----------------A----------G-----------------ATTCTACACTAAGTCTCAAG-CCAAGCAA-GTTACGAAA---TGTAACCTATATAGGAACCATGTGTCGATTTCTATAT--G--GACCC-AAAAGAGGCA-TGAGCGGATGACAGCTGGTGGA
gi|22775 : tatgTCGATTTCT--------AT---ATGGAC----C-CC--A-AA---GAGGCAGT----GAGCG-GA--TGACCGCTG-AT------------G-----------------G----------A-----------------TTTCTTCCCtt
gi|22773 : taagTCGATTTCT--------AT---ATGGAT----CAC---A-AA---GAGGCAGT----GAGCG-GA--TGACCACTG-ATATATTTTTTTCCA-----------------A----------G-----------------ACTCTACACTTAGTCTCAAG-C------A-AG--CTAc
gi|22774 : taagTCGATTTCT--------TT---ATGGAC----T-CC--AGAG---A-GGTAGT----GAGCG-GA--TGGTCGTTG-AT------------G-----------------G----------ATCCCACCCCTTAG----ATTCTACCTTTAGTCTCAAG-C------A-AT--TTAcgaaagaggccacaaagaggcagtgagctgatgatcactgatggattt
gi|22784 : taagTTGATTTCT--------AT---ATGGAC----C-CA--A-AA---GAGGCA-T----GAGCG-GA--TGACCGCTG-GT------------G-----------------G----------ATTTCTCCCCCAG-----ATTCTACCTTTAGTCTCAAG-C------A-AT--CTACGTGATGTGACCTATAccctatgt
gi|22763 : gCGATTTCT--------AT---ATGGAC----T-CC--A-AA---GAGGCAGT----GAGCG-GA--TGGCCGCTA-AT------------G-----------------G----------ATCCATCCCACCCCTTATATTCTACCTTTAGTCTCAAG-C------A-AT--CTACATGATGTGACCTATATAGGAAACCTAAGTCGATTTC-A-AT--ATTAACTC-CAAACAGGCAGTGAACGGATGGCCTCTAATGGA
gi|22761 : taagcA-AC---A-GGCAGT----GAACG-GA--TGGCCTCTA-AT------------G-----------------G----------ATTTCTCCCCCAG-----ATTCTACCCTTTGTCTCAAG-C------A-AT--CTACATGATGTGACCTATATAGAAACCCTAAGTCGATTTCTATAT--G--GACTC-AAAAGAGGCAGTGAGCGGATGGCTGCTAATtt
gi|22764 : taagtcgatttcaatattaactcca-GGCGAT----GAGAG-GA--TGGCCGCTG-AT------------G-----------------G----------ATCCCACCTGCTAG----ATTCTACCTTTAGTCTCAAG-C------A-AT--CTACATGATGTGACCTATATAGGATCCCTAAGTCGATTTCTATAT--G--GACCC-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCGTTGATGGAtgattt
gi|22756 : tatgtcgatgaatatattgacccaaaaga-GGCAGT----GAGCG-GA--TGGCCTCTT-AT------------G-----------------G----------ATTTCTCTCCAG------ATTCTACCTTTAGTCTCAAG-C------A-AT--CTACGTGATGTGACCTTTATATGAACCCTAAGTCGATTTCTATAT--G--GACTC-CAAAGAGGCAGTGAGTGGATGACCGCTGATGGAtt
gi|22757 : taagtggatttctatataaactccagaga-GGCAGT----GAGGG-GA--TGGCCGCTA-AT------------G-----------------G----------ATTTCCCTCCAG------ATTCTAGCTTTAGTCTCAAG-C------A-AT--TTACGTGATGTGATCTATATAGGAACCCTAAGTCGATTTCTATAT--G--GATCA-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCACTGATtt
gi|22786 : taagacgaattctatatggactccagaga-GGCAGT----GAGCT-GA--TGATCACTG-ATGGATTTTCCTCCA-----------------A----------G-----------------ATTCTACATGTAGTTTCAAA-C------A-AA--TTACGAGGTGTGACCTATATAGGAACCCTAAGTCGATTTCTATAT--G--GACCC-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCGCTGATGGAatattt
gi|22759 : caaaga-GGCAGT----AAGTG-GA--TGACCGCTG-AT------------GGGTTTCTCTCCC-----A----------G-----------------ATTCTACCTTTAGTCTCAAG-C------A-AT--CTACATGATGTGACTAATATAGTAACCCTAAGTCGATTTCTATAT--G--GACTC-TAAAGAGGCAGTGAGCGGATGGCTGCTAATAGAtt
gi|22778 : taagtcaatttctatataaactccaaaaa-GGCAGT----GAGCT-GA--TGACCGCTG-AT------------G-----------------G----------ATTTCTCCCCCAT-----ATTCTACCCTTTATCTCAAG-C------A-AT--CTACATGATGTGACCTATAAAGGAACCCTAAGTCGATTTCTTTAT--G--GACTC-CAGAGAGGTAGTGAGCGGATGGTCGTTGATGGAtt
gi|22785 : aagtcgatttctataatgattccaaaga-GGCAGT----GAGCG-GA--TGACCGCTG-AT------------G-----------------G----------ATTTCTTCCCCAG-----ATTCCACCTTTAGTCTCAAA-C------A-AT--CTACGTGATGTGACCTATATAGGAACCCTATGTCGATTTCTTTAT--G--GGCCC-CAAATAGGGAGTGAAAGGGTGACTTCTGAT
gi|22787 : accccaaagaG-GA--TGGCCGCTA-AT------------G-----------------G----------ATTTCCCTACAG------ATTCTACCTTTAGTCTCAAG-C------A-AT--CTACGTGATGCTACCAATATAGGAACCCTATGTCGATTTCTATAT--G--GATCA-CCAAGTGGCAGTCAGCGGATGACCACTGATG
gi|22775 : TAAGTCGATTTCTATAT--G--GACCC-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCGCTGATGGAaattt
gi|22773 : TAAGTCGATTTCTATAT--G--GATCA-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCACTGATttcttcccc
gi|22774 : TAAGTCGATTTCTTTAT--G--GACTC-CAGAGAGGTAGTGAGCGGATGGTCGTTGATGGAatatttttttccaagactctacacttagtctcaagcaagctacgaaagaggccacaaagaggcagtgagctgatgatcactgatggattt
gi|22776 : AAGTCGATTTCTTTAT--G--GACTC-CAAAGAGGCAGTGAGCAGATGACCGCCGATGGAcccaccccttagattctacctttagtctcaagcaatttaccctatgt
gi|22784 : GTTGATTTCTATAT--G--GACCC-AAAAGAGGCA-TGAGCGGATGACCGCTGGTGGAttctccccaagattctacctttagtctcaaaacaatctacgtgatgtgactaatataggaaccctaagtcgatttctatatggactccaaagaggcagtgagcggatgnnnnnnnnnntcgattt
gi|22788 : ATAT--ATTGACCC-AAAAGAGGCGATGAGAGGATGGCCGCTGATGGAttctcccccagattctacctttagtctcaagcaatctacgtgatgtgacctata
Alignments
lowQualScore : 111 7777777777777777
lowQualScore : 7777777 11 33 11 333333 000 3333333333333333 22222 1 11 222 2
lowQualScore : ....... .. .. .. ...... ... ................ ..... . .. ... .
lowQualScore : 0000000 55 66 44 000000 111 2222222222222222 88888 1 77 111 4
consensus : TAAGTCGATTTCTATATGGACTCCAAAGAGGCAGTGAGCGGATGNNNNNNNATGTCGATTTCTATATG--GACCCC--AAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCGCTGATGGA--TTT------C---CCCCCAAG-----A-----TTCTACCCTTAGTCT-----CAAG-CAATCTACGTGATGTGACCTATATAGGAACCCTAAGTCGATTTCTATATG--G---ACTC-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCGCTGATGGAT
Reference ( family-569 ) : TAAGTCGATTTCTATATGGACTCCAAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCGCTGATGTCGATTTCTATATG--GACCCC--AAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCGCTGATGGA--TTT------C---CCC----------A-----TTCTACCCTTAGTCT-----CAAG-CAATCTACGTGATGTGACCTATATAGGAACCCTAAGTCGATTTCTATATG--G---ACTC-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCGCTGATGGAT
gi|22751 : GTCGATTTCTATATG--GACTCC--AAAGAGGCAGTGAGTGGATGACCGCTGATGGA--TTT------C---TCCCCCAG-----A-----TTCTACCTTTAGTCT-----CAAG-CAATCTACGTAATGTGGCCTATATAGGAACCCTTAGTCGATTTCTATACG--G---ACTC-CAAAGAGGCAGTGAGCAGATGACCGCTAATGGAT
gi|22752 : taaGTCGATATCTATATG--GACTCC--AAAGAGGCAGTGAGCGGATGACTGCTGATGGA--TTT------C---TCCCCAAG-----A-----TTCTACCTTTAGTCT-----CAAG-CAATCTACGTGATGTGACCTATATAGCAACCCTATGTCGATTTCTATATG--G---ATCA-CCAAGAGGCAGTCAGCGGATGACCACTGATGGATtt
gi|22753 : taaGTCGATTTCTATATG--GACCCC--AAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCGTTGATGGA--TTT------C---TCCCCCAA-----A-----TTCTACCCTAAGTCT-----CAAG-CAATCTACGTGATGTGACCTATATAGGAACCCTAAGTGGATTTCTATATA--A---ACTC-CAGAGAGGCAGTGAGCGGATGGCCTCTTATGGATtt
gi|22754 : taaGTCGATTTCTATATG--GACTCC--AAAGAGGCAGTGAGGGGATGGCCGCTAATGGA--TTT------C---CCTCCAG------A-----TTCTACCTTTAGTCT-----CAAG-CAATCTACGTGATGTGACCAATATAGGAACCCTATGTCGATTTCTATATG--GATCACTC----AGTGGCAGTCAGCGGATGACCACTGATGGATtt
gi|22755 : taaGTCGATTTCTATAGG--GACTCC--AAAAAGGCAGTGAGCGGATGACTGCTGATGGA--TTT------CTTCCCC----------AGA---TTCTACCATAAATAT-----CAAG-CAATCTACATGATGTGACCTATATAGGAACCCTAAGCCGATTTCTATATG--G---ACTC-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATGGCCGCTAATGGATtt
gi|22756 : taaGTGGATTTCTATATA--AACTCC--AGAGAGGCAGTGAGCGGATGGCCTCTTATGGA--TTT------C---TCTCCAG------A-----TTCTACCTTTAGTCT-----CAAG-CAATCTACGTGATGTGACCTTTATATGAACCCTAAGTCGATTTCTATATG--G---ACTC-CAAAGAGGCAGTGAGTGGATGACCGCTGATGGAT
gi|22757 : taaCGAATTCTATATG--GACTCC--AGAGAGGCAGTGAGGGGATGGCCGCTAATGGA--TTT------C---CCTCCAG------A-----TTCTAGCTTTAGTCT-----CAAG-CAATTTACGTGATGTGATCTATATAGGAACCCTAAGTCGATTTCTATATG--G---ATCA-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCACTGATtt
gi|22758 : taagaGTCGATTTCTATATATTGACTCC--AAAGAGGCAGTGAGTGGATGACCGCTGATGGG--TCC------C---CCCCCCCCCCCAGA-----TTCTACCCTTAGTCT-----CAAA-CAATCTACATGATGTGACCTATATAGGATCCCTAAGTCGATATCTATATG--G---ACTC-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATGACTGCTGATGGATatattt
gi|22759 : taaGTCAATTTCTATATA--AACTCC--AAAAAGGCAGTAAGTGGATGACCGCTGATGGG--TTT------CTCTCCC----------AGA---TTCTACCTTTAGTCT-----CAAG-CAATCTACATGATGTGACTAATATAGTAACCCTAAGTCGATTTCTATATG--G---ACTC-TAAAGAGGCAGTGAGCGGATGGCTGCTAATAGATtt
gi|22760 : taaGTCGATTTCTATATG--GACTCT--AAAGAGGCAGTGAGCGGATGGCTGCTAATAGA--TTT------CTACCCCTG--------A-----TTATACCCTTAGTCT-----CAAG-CAATCTACATGATGTGACCTATATAGGAACCCTTAGTCGATTTATATATG--G---ACTC-AAAAGAGGCAGTGAGGGGATGGCCGCTGATGGATtt
gi|22761 : taaGTCGATTTCAATATT--AACTCC--AAACAGGCAGTGAACGGATGGCCTCTAATGGA--TTT------C---TCCCCCAG-----A-----TTCTACCCTTTGTCT-----CAAG-CAATCTACATGATGTGACCTATATAGAAACCCTAAGTCGATTTCTATATG--G---ACTC-AAAAGAGGCAGTGAGCGGATGGCTGCTAATTGATtt
gi|22762 : taaGTCGATTTCTATATG--GACTCA--AAAGAGGCAGTGAGCGGATGGCTGCTAATTGA--TTT------C---TCCCCCAG-----A-----TTCTACCATTAGTCT-----CAAG-CAATCTTAATGATGTGACCTATATAGGAACCTTCAGTCGATTTCAATATG--G---ACTC-CAAAGAGGCAGTGAGGGGACGGCCGCTAATGtt
gi|22763 : taaGCCGATTTCTATATG--GACTCC--AAAGAGGCAGTGAGCGGATGGCCGCTAATGGA--TCCATCCCAC---CCCTTAT------A-----TTCTACCTTTAGTCT-----CAAG-CAATCTACATGATGTGACCTATATAGGAAACCTAAGTCGATTTCAATATT--A---ACTC-CAAACAGGCAGTGAACGGATGGCCTCTAATGGATattt
gi|22764 : taaATGTCGATGAATATATT--GACCCA--AAAGAGGCGATGAGAGGATGGCCGCTGATGGA--TCC------C---ACCTGCTAG----A-----TTCTACCTTTAGTCT-----CAAG-CAATCTACATGATGTGACCTATATAGGATCCCTAAGTCGATTTCTATATG--G---ACCC-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCGTTGATGGATtt
gi|22765 : tGTCGATTTCTATATA--GACTCC--AGAGAGGCAATGAGCGTATGGCCGTTGATGGA--TCC------CAT-CTCTTAG------A-----TTCTACCTTTAGTCT-----CAAG-CAATTTATATGATGTGACCTATATAGGAAACCGAAGTCGATTTCTATAAT--G---ATTC-CAAAGAGGCAGTGAGCTGATGACCGCTGATGGATtt
gi|22766 : taaATGTCGATTTCTATATG--GATCAC--CAAGTGGCAGTCAGCGGATGACCACTGATGAA--TTT------T---CTTCAAAG-----A-----TTCTACACTAAGTCT-----GAAG-CAAGTTACGAAATGTGACCTATATAGGAACCCTGTGTCGATTTCTATATG--G---ACCC-AAAAGAGGCA-TGAGCGGATGACCGCTGGTGGATtt
gi|22767 : tATGTCGATTTCTATATG--GATCAC--CAAGAGGCAGTCAGCGGATGACCACTGATGGA--TTT------T---CCTCAAAG-----A-----TTCTACACTAAGTCTCAAGCCAAG-CAAGTTACGAAATGTAACCTATATAGGAACCATGTGTCGATTTCTATATG--G---ACCC-AAAAGAGGCA-TGAGCGGATGACAGCTGGTGGATtt
gi|22768 : tATGTCGATTTCTATATG--GATCAC--TCAGTGGCAGTCAGCGGATGACCACTGATGGA--TTT------T---CCTCAAAG-----A-----TTCTACACTAAGTCT-----CAAG-CAAGTTACGAAATGTGATCTATTTTGGAACCCTGTGTTGATTTCTATATG--G---ACCC-AAAAGAGGCA-TGAGCGGATGACCGCTGGTGGATtt
gi|22769 : tTAAGTCGATTTCTATATGGACTCCAAAGAGGCAGTGAGCGGATGNNNNNNNNNNTCGATTTCTTTTTG--GGCCCTTTAATG-GGCAATGAAAGGATGACCTCTAATAAA----------------------------A-----TTCTACCCTTAGTCT-----CAAA-CAGTCTAAATGGTGTGACCTATATAGGAGCCCTAAGTCGATTTCTATATATTG---ACTC-CAAAGAGGCAGTGAGTGGATGACCGCTGATGGGTtt
gi|22770 : ATGTCGATTTCTTTATG--GGCCCTT-AAATAGGCAGTGAAAGGATGACCTCTGATCAA----------------------------A-----TTCTACCCTTACTCT-----CAAA-CAGTCTAAGTGGTGTGACCTATATAGGAACCCTAAGTCGATTTCTATATA--G---ACTC-CAGAGAGGCAATGAGCGTATGGCCGTTGATGGAT
gi|22771 : tATGTCGATTTCTTTATG--GGCCCC--AAATAGGGAGTGAAAGGGTGACTTCTGATCAA----------------------------A-----TTTTTCCCTTAGTCT-----CAAG-CAGTCTACGTGGTGTAACCGATATAG-AACCCTAAGTCGATTTCTATAGG--G---ACTC-CAAAAAGGCAGTGAGCGGATGACTGCTGATGGAT
gi|22772 : tATGTCGATTTCTTTATG--GGCCCTT-AAATAGGCAGTGAAAGGATGACCTCTGAT------------------CTA----------A-----TTCTACCCTAAGTCT-----CAAA-CAGTCTAAGTGGTGTGACCTATATAGGAATCCTAAGTCAATTTCTATATA--A---ACTC-CAAAAAGGCAGTAAGTGGATGACCGCTGATGGGTtt
gi|22773 : tGTCGATTTCTATATG--GATCAC--AAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCACTGATATATTTTT------T---TCCAAG-------A-----CTCTACACTTAGTCT-----CAAG-CAAGCTACGtt
gi|22773 : taa--GGCCAC--AAAGAGGCAGTGAGCTGATGATCACTGATGGA--TTT------aaagaggccacaaagaggcagtgagctgatgatcactgatggattt
gi|22774 : taagtcgatttctatatggatcacaaagaggcagtgagcggatgaccactgatatatttttttccaagactctacacttagtctcaagcaagctacgaaagaGTCGATTTCTTTATG--GACTCC--AGAGAGGTAGTGAGCGGATGGTCGTTGATGGA--TCC------CA--CCCCTTAG-----A-----TTCTACCTTTAGTCT-----CAAG-CAATTTACCCTATGT
gi|22775 : taaGTCGATTTCTATATG--GACCCC--AAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCGCTGATGGA--TTT------C---
gi|22776 : taaGTCGATTTCTTTATG--GACTCC--AAAGAGGCAGTGAGCAGATGACCGCCGATGGA--TTT------C---TCCCCAAG-----A-----TTCTACCTTTAGTCT-----CAAAACAATCTACGTGATGTGACTAATATAGGAACCCTAAGTCGATTTCTATATG--G---ACTC-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATGttcccc
gi|22776 : aaTAAGTCGATTTCTATATGGACTCCAAAGAGGCAGTGAGCGGATGNNNNNNNNNNTCGATTTnnnnnnnnnntcgattt
gi|22777 : aagtcgatttctttatggactccaaagaggcagtgagcagatgaccgccgatggatttctccccaagattctacctttagtctcaaaacaatctacgtgatgtgactaatataggaacccGTCGATTTCTATATG--GACTCC--AGAGAGACAGTGAGCGAATGGCTGCTAATGGA--TTT------C---CCTCCAG------A-----TTCTACCTTTAGTTT-----TAAG-CAAGCTACGTGATGTGACCTATATATGAACCCAAAGTCGATTTCTTTATG--G---ACTC-CAAAGAGGCAGTGAGCAGATGACCGCCGATGGAT
gi|22778 : aaGTCGATTTCTATAAT--GATTCC--AAAGAGGCAGTGAGCTGATGACCGCTGATGGA--TTT------C---TCCCCCAT-----A-----TTCTACCCTTTATCT-----CAAG-CAATCTACATGATGTGACCTATAAAGGAACCCTAAGTCGATTTCTTTATG--G---ACTC-CAGAGAGGTAGTGAGCGGATGGTCGTTGATGGATtt
gi|22779 : aaGTCGATTTCTATACG--GACTCC--AAAGAGGCAGTGAGCAGATGACCGCTAATGGA--TTT------C---TCC----------AACAGATTCTACCCTGTGTCT-----CAAG-CAATCTACATGATGTGATCTATATAGGAACTCTAAGACGAATTCTATATG--G---ACTC-CAGAGAGGCAGTGAGGGGATGGCCGCTAATGGAT
gi|22780 : aGTCGATTTCAATATG--GACTCC--AAAGAGGCAGTGAGGGGACGGCCGCTAATG-A--TTT------C---CCTCCAG------A-----TTCTATCTTTAGTCT-----CAAG-CAATCTACGTGATGTGACTAATAAAGGAACTCTAAGTCGATTTCTATATG--G---ACTC-CAAAGAGGCAGTGAGGGGATGGCCGCTAATGGATtt
gi|22781 : aGTCGATTTATATATG--GACTCA--AAAGAGGCAGTGAGGGGATGGCCGCTGATGGA--TTT------C---TCCCCAAG-----A-----GTCTACCCTTAGTCT-----CAAG-CAATCTACATGATGTGACCTATA----------AAGTCGATTTCTATATG--G---ACTC-CAGAGAGACAGTGAGCGAATGGCTGCTAATGGATtt
gi|22782 : aGTCGATTTCTATATG--GACCCA--AAAGAGGCA-TGAGCGGATGACCGCTGGTGGA--TTT------C---TCCCCCAG-----A-----TTCTTCCTTTAGTCT-----CAAG-CAATCTACGTGATGTGACCTATATAGGAACCCTATGTCGATTTCTTTATG--G---GCCCTTAAATAGGCAGTGAAAGGATGACCTCTGATtt
gi|22783 : GTCGATTTCTATATG--GACCCA--AAAGAGGCA-TGAGCGGATGACAGCTGGTGGA--TTT------C---TCCCCCAG-----A-----TTCTACCTTTAGTCT-----CCAG-CAATCTACGTGATGTGACCTATAGAGGATTCCTATGTCGATTTCTTTATG--G---GCCCTTAAATAGGCAGTGAAAGGATGACCTCTGAT
gi|22784 : GTTGATTTCTATATG--GACCCA--AAAGAGGCA-TGAGCGGATGACCGCTGGTGGA--TTT------C---TCCCCCAG-----A-----TTCTACCTTTAGTCT-----CAAG-CAATCTACGTGATGTGACCTATA
gi|22785 : ACCCC--AAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCGCTGATGGA--TTT------CTTCCCC----------AGA---TTCCACCTTTAGTCT-----CAAA-CAATCTACGTGATGTGACCTATATAGGAACCCTATGTCGATTTCTTTATG--G---GCCC-CAAATAGGGAGTGAAAGGGTGACTTCTGAT
gi|22786 : C--AAAGAGGCAGTGAGCTGATGATCACTGATGGA--TTT------T---CCTCCAAG-----A-----TTCTACATGTAGTTT-----CAAA-CAAATTACGAGGTGTGACCTATATAGGAACCCTAAGTCGATTTCTATATG--G---ACCC-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCGCTGATGGAT
gi|22787 : GGATGGCCGCTAATGGA--TTT------C---CCT----------ACAGA-TTCTACCTTTAGTCT-----CAAG-CAATCTACGTGATGCTACCAATATAGGAACCCTATGTCGATTTCTATATG--G---ATCA-CCAAGTGGCAGTCAGCGGATGACCACTGATGAATtt
gi|22788 : ATGTCGATGAATATATT--GACCCA--AAAGAGGCGATGAGAGGATGGCCGCTGATGGA--Ttt
Alignments
lowQualScore : 7777777 11 33 11 44 111 1 666666 22222 1 11 222 2
lowQualScore : ....... .. .. .. .. ... . ...... ..... . .. ... .
lowQualScore : 0000000 55 66 44 22 999 1 000000 88888 1 77 111 4
consensus : TAAGTCGATTTCTATATGGACTCCAAAGAGGCAGTGAGCGGATGNNNNNNNATGTCGATTTCTATATG--GACCCC--AAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCGCTGATGGATT--TC-TC---CC-CN-----AGATTCTACCCTTAGTCT-----C-AAGCAATCTACGTGATGTGACCTATATAGGAACCCTAAGTCGATTTCTATATG--G---ACTC-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCGCTGATGGAT
Reference ( family-569 ) : TAAGTCGATTTCTATATGGACTCCAAAGAGGCAGTGAGCGGATGNNNNNNNATGTCGATTTCTATATG--GACCCC--AAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCGCTGATGGATT--TC-CC---CC-CA-----AGATTCTACCCTTAGTCT-----C-AAGCAATCTACGTGATGTGACCTATATAGGAACCCTAAGTCGATTTCTATATG--G---ACTC-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCGCTGATGGAT
gi|22751 : GTCGATTTCTATATG--GACTCC--AAAGAGGCAGTGAGTGGATGACCGCTGATGGATT--TC-TC---CC-CC-----AGATTCTACCTTTAGTCT-----C-AAGCAATCTACGTAATGTGGCCTATATAGGAACCCTTAGTCGATTTCTATACG--G---ACTC-CAAAGAGGCAGTGAGCAGATGACCGCTAATGGAT
gi|22752 : taaGTCGATATCTATATG--GACTCC--AAAGAGGCAGTGAGCGGATGACTGCTGATGGATT--TC-TC---CC-CA-----AGATTCTACCTTTAGTCT-----C-AAGCAATCTACGTGATGTGACCTATATAGCAACCCTATGTCGATTTCTATATG--G---ATCA-CCAAGAGGCAGTCAGCGGATGACCACTGATGGATtt
gi|22753 : taaGTCGATTTCTATATG--GACCCC--AAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCGTTGATGGATT--TC-TC---CC-CC-----AAATTCTACCCTAAGTCT-----C-AAGCAATCTACGTGATGTGACCTATATAGGAACCCTAAGTGGATTTCTATATA--A---ACTC-CAGAGAGGCAGTGAGCGGATGGCCTCTTATGGATtt
gi|22754 : taaGTCGATTTCTATATG--GACTCC--AAAGAGGCAGTGAGGGGATGGCCGCTAATGGATT--TC-CC---TC-CA------GATTCTACCTTTAGTCT-----C-AAGCAATCTACGTGATGTGACCAATATAGGAACCCTATGTCGATTTCTATATG--GATCACTC----AGTGGCAGTCAGCGGATGACCACTGATGGATtt
gi|22755 : taaGTCGATTTCTATAGG--GACTCC--AAAAAGGCAGTGAGCGGATGACTGCTGATGGATT--TC-TT---CC-CC-----AGATTCTACCATAAATAT-----C-AAGCAATCTACATGATGTGACCTATATAGGAACCCTAAGCCGATTTCTATATG--G---ACTC-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATGGCCGCTAATGGATtt
gi|22756 : taaGTGGATTTCTATATA--AACTCC--AGAGAGGCAGTGAGCGGATGGCCTCTTATGGATT--TC-TC---TC-CA------GATTCTACCTTTAGTCT-----C-AAGCAATCTACGTGATGTGACCTTTATATGAACCCTAAGTCGATTTCTATATG--G---ACTC-CAAAGAGGCAGTGAGTGGATGACCGCTGATGGAT
gi|22757 : taaCGAATTCTATATG--GACTCC--AGAGAGGCAGTGAGGGGATGGCCGCTAATGGATT--TC-CC---TC-CA------GATTCTAGCTTTAGTCT-----C-AAGCAATTTACGTGATGTGATCTATATAGGAACCCTAAGTCGATTTCTATATG--G---ATCA-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCACTGATtt
gi|22758 : taagaGTCGATTTCTATATATTGACTCC--AAAGAGGCAGTGAGTGGATGACCGCTGATGGGTC--CC-CC---CC-CCCCCCCAGATTCTACCCTTAGTCT-----C-AAACAATCTACATGATGTGACCTATATAGGATCCCTAAGTCGATATCTATATG--G---ACTC-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATGACTGCTGATGGATatattt
gi|22759 : taaGTCAATTTCTATATA--AACTCC--AAAAAGGCAGTAAGTGGATGACCGCTGATGGGTT--TC-TC---TC-CC-----AGATTCTACCTTTAGTCT-----C-AAGCAATCTACATGATGTGACTAATATAGTAACCCTAAGTCGATTTCTATATG--G---ACTC-TAAAGAGGCAGTGAGCGGATGGCTGCTAATAGATtt
gi|22760 : taaGTCGATTTCTATATG--GACTCT--AAAGAGGCAGTGAGCGGATGGCTGCTAATAGATT--TC-TA---CC-CC-----TGATTATACCCTTAGTCT-----C-AAGCAATCTACATGATGTGACCTATATAGGAACCCTTAGTCGATTTATATATG--G---ACTC-AAAAGAGGCAGTGAGGGGATGGCCGCTGATGGATtt
gi|22761 : taaGTCGATTTCAATATT--AACTCC--AAACAGGCAGTGAACGGATGGCCTCTAATGGATT--TC-TC---CC-CC-----AGATTCTACCCTTTGTCT-----C-AAGCAATCTACATGATGTGACCTATATAGAAACCCTAAGTCGATTTCTATATG--G---ACTC-AAAAGAGGCAGTGAGCGGATGGCTGCTAATTGATtt
gi|22762 : taaGTCGATTTCTATATG--GACTCA--AAAGAGGCAGTGAGCGGATGGCTGCTAATTGATT--TC-TC---CC-CC-----AGATTCTACCATTAGTCT-----C-AAGCAATCTTAATGATGTGACCTATATAGGAACCTTCAGTCGATTTCAATATG--G---ACTC-CAAAGAGGCAGTGAGGGGACGGCCGCTAATGtt
gi|22763 : taaGCCGATTTCTATATG--GACTCC--AAAGAGGCAGTGAGCGGATGGCCGCTAATGGATCCATC-CCACCCC-TT-----ATATTCTACCTTTAGTCT-----C-AAGCAATCTACATGATGTGACCTATATAGGAAACCTAAGTCGATTTCAATATT--A---ACTC-CAAACAGGCAGTGAACGGATGGCCTCTAATGGATattt
gi|22764 : taaATGTCGATGAATATATT--GACCCA--AAAGAGGCGATGAGAGGATGGCCGCTGATGGATC--CC-AC---CTGCT-----AGATTCTACCTTTAGTCT-----C-AAGCAATCTACATGATGTGACCTATATAGGATCCCTAAGTCGATTTCTATATG--G---ACCC-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCGTTGATGGATtt
gi|22765 : tGTCGATTTCTATATA--GACTCC--AGAGAGGCAATGAGCGTATGGCCGTTGATGGATC--CCATC---TC-TT-----AGATTCTACCTTTAGTCT-----C-AAGCAATTTATATGATGTGACCTATATAGGAAACCGAAGTCGATTTCTATAAT--G---ATTC-CAAAGAGGCAGTGAGCTGATGACCGCTGATGGATtt
gi|22766 : taaATGTCGATTTCTATATG--GATCAC--CAAGTGGCAGTCAGCGGATGACCACTGATGAATT--TT-CT---TC-AA-----AGATTCTACACTAAGTCT-----G-AAGCAAGTTACGAAATGTGACCTATATAGGAACCCTGTGTCGATTTCTATATG--G---ACCC-AAAAGAGGCA-TGAGCGGATGACCGCTGGTGGATtt
gi|22767 : tATGTCGATTTCTATATG--GATCAC--CAAGAGGCAGTCAGCGGATGACCACTGATGGATT--TT-CC---TC-AA-----AGATTCTACACTAAGTCTCAAGCC-AAGCAAGTTACGAAATGTAACCTATATAGGAACCATGTGTCGATTTCTATATG--G---ACCC-AAAAGAGGCA-TGAGCGGATGACAGCTGGTGGATtt
gi|22768 : tATGTCGATTTCTATATG--GATCAC--TCAGTGGCAGTCAGCGGATGACCACTGATGGATT--TT-CC---TC-AA-----AGATTCTACACTAAGTCT-----C-AAGCAAGTTACGAAATGTGATCTATTTTGGAACCCTGTGTTGATTTCTATATG--G---ACCC-AAAAGAGGCA-TGAGCGGATGACCGCTGGTGGATtt
gi|22769 : tTAAGTCGATTTCTATATGGACTCCAAAGAGGCAGTGAGCGGATGNNNNNNNNNNTCGATTTCTTTTTG--GGCCCTTTAATG-GGCAATGAAAGGATGACCTCTAAT-------------------A-----AAATTCTACCCTTAGTCT-----C-AAACAGTCTAAATGGTGTGACCTATATAGGAGCCCTAAGTCGATTTCTATATATTG---ACTC-CAAAGAGGCAGTGAGTGGATGACCGCTGATGGGTtt
gi|22770 : ATGTCGATTTCTTTATG--GGCCCTT-AAATAGGCAGTGAAAGGATGACCTCTGAT------------------CA-----A-ATTCTACCCTTACTCT-----C-AAACAGTCTAAGTGGTGTGACCTATATAGGAACCCTAAGTCGATTTCTATATA--G---ACTC-CAGAGAGGCAATGAGCGTATGGCCGTTGATGGAT
gi|22771 : tATGTCGATTTCTTTATG--GGCCCC--AAATAGGGAGTGAAAGGGTGACTTCTGAT------------------CA-----A-ATTTTTCCCTTAGTCT-----C-AAGCAGTCTACGTGGTGTAACCGATATAG-AACCCTAAGTCGATTTCTATAGG--G---ACTC-CAAAAAGGCAGTGAGCGGATGACTGCTGATGGAT
gi|22772 : tATGTCGATTTCTTTATG--GGCCCTT-AAATAGGCAGTGAAAGGATGACCTCTGAT----------------C-TA-----A--TTCTACCCTAAGTCT-----C-AAACAGTCTAAGTGGTGTGACCTATATAGGAATCCTAAGTCAATTTCTATATA--A---ACTC-CAAAAAGGCAGTAAGTGGATGACCGCTGATGGGTtt
gi|22773 : tGTCGATTTCTATATG--GATCAC--AAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCACTGATATATT--TT-TT---TC-CA-----AGACTCTACACTTAGTCT-----C-AAGCAAGCTACGtt
gi|22773 : taa--GGCCAC--AAAGAGGCAGTGAGCTGATGATCACTGATGGATT--Taaagaggccacaaagaggcagtgagctgatgatcactgatggattt
gi|22774 : taagtcgatttctatatggatcacaaagaggcagtgagcggatgaccactgatatatttttttccaagactctacacttagtctcaagcaagctacgaaagaGTCGATTTCTTTATG--GACTCC--AGAGAGGTAGTGAGCGGATGGTCGTTGATGGATC--CCACC---CC-TT-----AGATTCTACCTTTAGTCT-----C-AAGCAATTTACCCTATGT
gi|22775 : taaGTCGATTTCTATATG--GACCCC--AAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCGCTGATGGATT--TC-TT---CC-C
gi|22776 : taaGTCGATTTCTTTATG--GACTCC--AAAGAGGCAGTGAGCAGATGACCGCCGATGGATT--TC-TC---CC-CA-----AGATTCTACCTTTAGTCT-----CAAAACAATCTACGTGATGTGACTAATATAGGAACCCTAAGTCGATTTCTATATG--G---ACTC-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATGc
gi|22776 : aaTAAGTCGATTTCTATATGGACTCCAAAGAGGCAGTGAGCGGATGNNNNNNNNNNTCGATTTnnnnnnnnnntcgattt
gi|22777 : aagtcgatttctttatggactccaaagaggcagtgagcagatgaccgccgatggatttctccccaagattctacctttagtctcaaaacaatctacgtgatgtgactaatataggaacccGTCGATTTCTATATG--GACTCC--AGAGAGACAGTGAGCGAATGGCTGCTAATGGATT--TC-CC---TC-CA------GATTCTACCTTTAGTTT-----T-AAGCAAGCTACGTGATGTGACCTATATATGAACCCAAAGTCGATTTCTTTATG--G---ACTC-CAAAGAGGCAGTGAGCAGATGACCGCCGATGGAT
gi|22778 : aaGTCGATTTCTATAAT--GATTCC--AAAGAGGCAGTGAGCTGATGACCGCTGATGGATT--TC-TC---CC-CC-----ATATTCTACCCTTTATCT-----C-AAGCAATCTACATGATGTGACCTATAAAGGAACCCTAAGTCGATTTCTTTATG--G---ACTC-CAGAGAGGTAGTGAGCGGATGGTCGTTGATGGATtt
gi|22779 : aaGTCGATTTCTATACG--GACTCC--AAAGAGGCAGTGAGCAGATGACCGCTAATGGATT--TC-TC---CA-AC-----AGATTCTACCCTGTGTCT-----C-AAGCAATCTACATGATGTGATCTATATAGGAACTCTAAGACGAATTCTATATG--G---ACTC-CAGAGAGGCAGTGAGGGGATGGCCGCTAATGGAT
gi|22780 : aGTCGATTTCAATATG--GACTCC--AAAGAGGCAGTGAGGGGACGGCCGCTAATG-ATT--TC-CC---TC-CA------GATTCTATCTTTAGTCT-----C-AAGCAATCTACGTGATGTGACTAATAAAGGAACTCTAAGTCGATTTCTATATG--G---ACTC-CAAAGAGGCAGTGAGGGGATGGCCGCTAATGGATtt
gi|22781 : aGTCGATTTATATATG--GACTCA--AAAGAGGCAGTGAGGGGATGGCCGCTGATGGATT--TC-TC---CC-CA-----AGAGTCTACCCTTAGTCT-----C-AAGCAATCTACATGATGTGACCTATA----------AAGTCGATTTCTATATG--G---ACTC-CAGAGAGACAGTGAGCGAATGGCTGCTAATGGATtt
gi|22782 : aGTCGATTTCTATATG--GACCCA--AAAGAGGCA-TGAGCGGATGACCGCTGGTGGATT--TC-TC---CC-CC-----AGATTCTTCCTTTAGTCT-----C-AAGCAATCTACGTGATGTGACCTATATAGGAACCCTATGTCGATTTCTTTATG--G---GCCCTTAAATAGGCAGTGAAAGGATGACCTCTGATtt
gi|22783 : GTCGATTTCTATATG--GACCCA--AAAGAGGCA-TGAGCGGATGACAGCTGGTGGATT--TC-TC---CC-CC-----AGATTCTACCTTTAGTCT-----C-CAGCAATCTACGTGATGTGACCTATAGAGGATTCCTATGTCGATTTCTTTATG--G---GCCCTTAAATAGGCAGTGAAAGGATGACCTCTGAT
gi|22784 : GTTGATTTCTATATG--GACCCA--AAAGAGGCA-TGAGCGGATGACCGCTGGTGGATT--TC-TC---CC-CC-----AGATTCTACCTTTAGTCT-----C-AAGCAATCTACGTGATGTGACCTATA
gi|22785 : ACCCC--AAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCGCTGATGGATT--TC-TT---CC-CC-----AGATTCCACCTTTAGTCT-----C-AAACAATCTACGTGATGTGACCTATATAGGAACCCTATGTCGATTTCTTTATG--G---GCCC-CAAATAGGGAGTGAAAGGGTGACTTCTGAT
gi|22786 : C--AAAGAGGCAGTGAGCTGATGATCACTGATGGATT--TT-CC---TC-CA-----AGATTCTACATGTAGTTT-----C-AAACAAATTACGAGGTGTGACCTATATAGGAACCCTAAGTCGATTTCTATATG--G---ACCC-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCGCTGATGGAT
gi|22787 : GGATGGCCGCTAATGGATT--TC-CC---TA-CA------GATTCTACCTTTAGTCT-----C-AAGCAATCTACGTGATGCTACCAATATAGGAACCCTATGTCGATTTCTATATG--G---ATCA-CCAAGTGGCAGTCAGCGGATGACCACTGATGAATtt
gi|22788 : ATGTCGATGAATATATT--GACCCA--AAAGAGGCGATGAGAGGATGGCCGCTGATGGATtt
Alignments
lowQualScore : 7777777 11 33 11 55 111 1 5555555 22222 1 11 222 2
lowQualScore : ....... .. .. .. .. ... . ....... ..... . .. ... .
lowQualScore : 0000000 55 66 44 11 999 1 9999999 88888 1 77 111 4
consensus : TAAGTCGATTTCTATATGGACTCCAAAGAGGCAGTGAGCGGATGNNNNNNNATGTCGATTTCTATATG--GACCCC--AAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCGCTGATGGATT--TC-TC---CC-C-C-----AGATTCTACCCTTAGTCT-----C-AAGCAATCTACGTGATGTGACCTATATAGGAACCCTAAGTCGATTTCTATATG--G---ACTC-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCGCTGATGGAT
Reference ( family-569 ) : TAAGTCGATTTCTATATGGACTCCAAAGAGGCAGTGAGCGGATGNNNNNNNATGTCGATTTCTATATG--GACCCC--AAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCGCTGATGGATT--TC-TC---CC-C-N-----AGATTCTACCCTTAGTCT-----C-AAGCAATCTACGTGATGTGACCTATATAGGAACCCTAAGTCGATTTCTATATG--G---ACTC-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCGCTGATGGAT
gi|22751 : GTCGATTTCTATATG--GACTCC--AAAGAGGCAGTGAGTGGATGACCGCTGATGGATT--TC-TC---CC-C-C-----AGATTCTACCTTTAGTCT-----C-AAGCAATCTACGTAATGTGGCCTATATAGGAACCCTTAGTCGATTTCTATACG--G---ACTC-CAAAGAGGCAGTGAGCAGATGACCGCTAATGGAT
gi|22752 : taaGTCGATATCTATATG--GACTCC--AAAGAGGCAGTGAGCGGATGACTGCTGATGGATT--TC-TC---CC-C-A-----AGATTCTACCTTTAGTCT-----C-AAGCAATCTACGTGATGTGACCTATATAGCAACCCTATGTCGATTTCTATATG--G---ATCA-CCAAGAGGCAGTCAGCGGATGACCACTGATGGATtt
gi|22753 : taaGTCGATTTCTATATG--GACCCC--AAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCGTTGATGGATT--TC-TC---CC-C-C-----AAATTCTACCCTAAGTCT-----C-AAGCAATCTACGTGATGTGACCTATATAGGAACCCTAAGTGGATTTCTATATA--A---ACTC-CAGAGAGGCAGTGAGCGGATGGCCTCTTATGGATtt
gi|22754 : taaGTCGATTTCTATATG--GACTCC--AAAGAGGCAGTGAGGGGATGGCCGCTAATGGATT--TC--C---CT-C-C-----AGATTCTACCTTTAGTCT-----C-AAGCAATCTACGTGATGTGACCAATATAGGAACCCTATGTCGATTTCTATATG--GATCACTC----AGTGGCAGTCAGCGGATGACCACTGATGGATtt
gi|22755 : taaGTCGATTTCTATAGG--GACTCC--AAAAAGGCAGTGAGCGGATGACTGCTGATGGATT--TC-TT---CC-C-C-----AGATTCTACCATAAATAT-----C-AAGCAATCTACATGATGTGACCTATATAGGAACCCTAAGCCGATTTCTATATG--G---ACTC-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATGGCCGCTAATGGATtt
gi|22756 : taaGTGGATTTCTATATA--AACTCC--AGAGAGGCAGTGAGCGGATGGCCTCTTATGGATT--TC-TC---TC-C-------AGATTCTACCTTTAGTCT-----C-AAGCAATCTACGTGATGTGACCTTTATATGAACCCTAAGTCGATTTCTATATG--G---ACTC-CAAAGAGGCAGTGAGTGGATGACCGCTGATGGAT
gi|22757 : taaCGAATTCTATATG--GACTCC--AGAGAGGCAGTGAGGGGATGGCCGCTAATGGATT--TC--C---CT-C-C-----AGATTCTAGCTTTAGTCT-----C-AAGCAATTTACGTGATGTGATCTATATAGGAACCCTAAGTCGATTTCTATATG--G---ATCA-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCACTGATtt
gi|22758 : taagaGTCGATTTCTATATATTGACTCC--AAAGAGGCAGTGAGTGGATGACCGCTGATGGGTC--CC-CC---CC-C-CCCCCCAGATTCTACCCTTAGTCT-----C-AAACAATCTACATGATGTGACCTATATAGGATCCCTAAGTCGATATCTATATG--G---ACTC-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATGACTGCTGATGGATatattt
gi|22759 : taaGTCAATTTCTATATA--AACTCC--AAAAAGGCAGTAAGTGGATGACCGCTGATGGGTT--TC-TC---TC-C-C-----AGATTCTACCTTTAGTCT-----C-AAGCAATCTACATGATGTGACTAATATAGTAACCCTAAGTCGATTTCTATATG--G---ACTC-TAAAGAGGCAGTGAGCGGATGGCTGCTAATAGATtt
gi|22760 : taaGTCGATTTCTATATG--GACTCT--AAAGAGGCAGTGAGCGGATGGCTGCTAATAGATT--TC-TA---CC-C-C-----TGATTATACCCTTAGTCT-----C-AAGCAATCTACATGATGTGACCTATATAGGAACCCTTAGTCGATTTATATATG--G---ACTC-AAAAGAGGCAGTGAGGGGATGGCCGCTGATGGATtt
gi|22761 : taaGTCGATTTCAATATT--AACTCC--AAACAGGCAGTGAACGGATGGCCTCTAATGGATT--TC-TC---CC-C-C-----AGATTCTACCCTTTGTCT-----C-AAGCAATCTACATGATGTGACCTATATAGAAACCCTAAGTCGATTTCTATATG--G---ACTC-AAAAGAGGCAGTGAGCGGATGGCTGCTAATTGATtt
gi|22762 : taaGTCGATTTCTATATG--GACTCA--AAAGAGGCAGTGAGCGGATGGCTGCTAATTGATT--TC-TC---CC-C-C-----AGATTCTACCATTAGTCT-----C-AAGCAATCTTAATGATGTGACCTATATAGGAACCTTCAGTCGATTTCAATATG--G---ACTC-CAAAGAGGCAGTGAGGGGACGGCCGCTAATGtt
gi|22763 : taaGCCGATTTCTATATG--GACTCC--AAAGAGGCAGTGAGCGGATGGCCGCTAATGGATCCATC-CCACCCC-T-T-----ATATTCTACCTTTAGTCT-----C-AAGCAATCTACATGATGTGACCTATATAGGAAACCTAAGTCGATTTCAATATT--A---ACTC-CAAACAGGCAGTGAACGGATGGCCTCTAATGGATattt
gi|22764 : taaATGTCGATGAATATATT--GACCCA--AAAGAGGCGATGAGAGGATGGCCGCTGATGGATC--CC-AC---CTGC-T-----AGATTCTACCTTTAGTCT-----C-AAGCAATCTACATGATGTGACCTATATAGGATCCCTAAGTCGATTTCTATATG--G---ACCC-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCGTTGATGGATtt
gi|22765 : tGTCGATTTCTATATA--GACTCC--AGAGAGGCAATGAGCGTATGGCCGTTGATGGATC--CCATC---TC-T-T-----AGATTCTACCTTTAGTCT-----C-AAGCAATTTATATGATGTGACCTATATAGGAAACCGAAGTCGATTTCTATAAT--G---ATTC-CAAAGAGGCAGTGAGCTGATGACCGCTGATGGATtt
gi|22766 : taaATGTCGATTTCTATATG--GATCAC--CAAGTGGCAGTCAGCGGATGACCACTGATGAATT--TT-CT---TC-A-A-----AGATTCTACACTAAGTCT-----G-AAGCAAGTTACGAAATGTGACCTATATAGGAACCCTGTGTCGATTTCTATATG--G---ACCC-AAAAGAGGCA-TGAGCGGATGACCGCTGGTGGATtt
gi|22767 : tATGTCGATTTCTATATG--GATCAC--CAAGAGGCAGTCAGCGGATGACCACTGATGGATT--TT-CC---TC-A-A-----AGATTCTACACTAAGTCTCAAGCC-AAGCAAGTTACGAAATGTAACCTATATAGGAACCATGTGTCGATTTCTATATG--G---ACCC-AAAAGAGGCA-TGAGCGGATGACAGCTGGTGGATtt
gi|22768 : tATGTCGATTTCTATATG--GATCAC--TCAGTGGCAGTCAGCGGATGACCACTGATGGATT--TT-CC---TC-A-A-----AGATTCTACACTAAGTCT-----C-AAGCAAGTTACGAAATGTGATCTATTTTGGAACCCTGTGTTGATTTCTATATG--G---ACCC-AAAAGAGGCA-TGAGCGGATGACCGCTGGTGGATtt
gi|22769 : tTAAGTCGATTTCTATATGGACTCCAAAGAGGCAGTGAGCGGATGNNNNNNNNNNTCGATTTCTTTTTG--GGCCCTTTAATG-GGCAATGAAAGGATGACCTCTAAT--------------------A-----AAATTCTACCCTTAGTCT-----C-AAACAGTCTAAATGGTGTGACCTATATAGGAGCCCTAAGTCGATTTCTATATATTG---ACTC-CAAAGAGGCAGTGAGTGGATGACCGCTGATGGGTtt
gi|22770 : ATGTCGATTTCTTTATG--GGCCCTT-AAATAGGCAGTGAAAGGATGACCTCTGAT--------------------C-----AAATTCTACCCTTACTCT-----C-AAACAGTCTAAGTGGTGTGACCTATATAGGAACCCTAAGTCGATTTCTATATA--G---ACTC-CAGAGAGGCAATGAGCGTATGGCCGTTGATGGAT
gi|22771 : tATGTCGATTTCTTTATG--GGCCCC--AAATAGGGAGTGAAAGGGTGACTTCTGAT--------------------C-----AAATTTTTCCCTTAGTCT-----C-AAGCAGTCTACGTGGTGTAACCGATATAG-AACCCTAAGTCGATTTCTATAGG--G---ACTC-CAAAAAGGCAGTGAGCGGATGACTGCTGATGGAT
gi|22772 : tATGTCGATTTCTTTATG--GGCCCTT-AAATAGGCAGTGAAAGGATGACCTCTGAT------------------C-T-----A-ATTCTACCCTAAGTCT-----C-AAACAGTCTAAGTGGTGTGACCTATATAGGAATCCTAAGTCAATTTCTATATA--A---ACTC-CAAAAAGGCAGTAAGTGGATGACCGCTGATGGGTtt
gi|22773 : tGTCGATTTCTATATG--GATCAC--AAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCACTGATATATT--TT-TT---TC-C-A-----AGACTCTACACTTAGTCT-----C-AAGCAAGCTACGtt
gi|22773 : taa--GGCCAC--AAAGAGGCAGTGAGCTGATGATCACTGATGGATT--Taaagaggccacaaagaggcagtgagctgatgatcactgatggattt
gi|22774 : taagtcgatttctatatggatcacaaagaggcagtgagcggatgaccactgatatatttttttccaagactctacacttagtctcaagcaagctacgaaagaGTCGATTTCTTTATG--GACTCC--AGAGAGGTAGTGAGCGGATGGTCGTTGATGGATC--CC-AC---CC-CTT-----AGATTCTACCTTTAGTCT-----C-AAGCAATTTACCCTATGT
gi|22775 : taaGTCGATTTCTATATG--GACCCC--AAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCGCTGATGGATT--TC-TT---CC-C-
gi|22776 : taaGTCGATTTCTTTATG--GACTCC--AAAGAGGCAGTGAGCAGATGACCGCCGATGGATT--TC-TC---CC-C-A-----AGATTCTACCTTTAGTCT-----CAAAACAATCTACGTGATGTGACTAATATAGGAACCCTAAGTCGATTTCTATATG--G---ACTC-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATGc
gi|22776 : aaTAAGTCGATTTCTATATGGACTCCAAAGAGGCAGTGAGCGGATGNNNNNNNNNNTCGATTTnnnnnnnnnntcgattt
gi|22777 : aagtcgatttctttatggactccaaagaggcagtgagcagatgaccgccgatggatttctccccaagattctacctttagtctcaaaacaatctacgtgatgtgactaatataggaacccGTCGATTTCTATATG--GACTCC--AGAGAGACAGTGAGCGAATGGCTGCTAATGGATT--TC--C---CT-C-C-----AGATTCTACCTTTAGTTT-----T-AAGCAAGCTACGTGATGTGACCTATATATGAACCCAAAGTCGATTTCTTTATG--G---ACTC-CAAAGAGGCAGTGAGCAGATGACCGCCGATGGAT
gi|22778 : aaGTCGATTTCTATAAT--GATTCC--AAAGAGGCAGTGAGCTGATGACCGCTGATGGATT--TC-TC---CC-C-C-----ATATTCTACCCTTTATCT-----C-AAGCAATCTACATGATGTGACCTATAAAGGAACCCTAAGTCGATTTCTTTATG--G---ACTC-CAGAGAGGTAGTGAGCGGATGGTCGTTGATGGATtt
gi|22779 : aaGTCGATTTCTATACG--GACTCC--AAAGAGGCAGTGAGCAGATGACCGCTAATGGATT--TC-TC---CA-A-C-----AGATTCTACCCTGTGTCT-----C-AAGCAATCTACATGATGTGATCTATATAGGAACTCTAAGACGAATTCTATATG--G---ACTC-CAGAGAGGCAGTGAGGGGATGGCCGCTAATGGAT
gi|22780 : aGTCGATTTCAATATG--GACTCC--AAAGAGGCAGTGAGGGGACGGCCGCTAATG-ATT--TC--C---CT-C-C-----AGATTCTATCTTTAGTCT-----C-AAGCAATCTACGTGATGTGACTAATAAAGGAACTCTAAGTCGATTTCTATATG--G---ACTC-CAAAGAGGCAGTGAGGGGATGGCCGCTAATGGATtt
gi|22781 : aGTCGATTTATATATG--GACTCA--AAAGAGGCAGTGAGGGGATGGCCGCTGATGGATT--TC-TC---CC-C-A-----AGAGTCTACCCTTAGTCT-----C-AAGCAATCTACATGATGTGACCTATA----------AAGTCGATTTCTATATG--G---ACTC-CAGAGAGACAGTGAGCGAATGGCTGCTAATGGATtt
gi|22782 : aGTCGATTTCTATATG--GACCCA--AAAGAGGCA-TGAGCGGATGACCGCTGGTGGATT--TC-TC---CC-C-C-----AGATTCTTCCTTTAGTCT-----C-AAGCAATCTACGTGATGTGACCTATATAGGAACCCTATGTCGATTTCTTTATG--G---GCCCTTAAATAGGCAGTGAAAGGATGACCTCTGATtt
gi|22783 : GTCGATTTCTATATG--GACCCA--AAAGAGGCA-TGAGCGGATGACAGCTGGTGGATT--TC-TC---CC-C-C-----AGATTCTACCTTTAGTCT-----C-CAGCAATCTACGTGATGTGACCTATAGAGGATTCCTATGTCGATTTCTTTATG--G---GCCCTTAAATAGGCAGTGAAAGGATGACCTCTGAT
gi|22784 : GTTGATTTCTATATG--GACCCA--AAAGAGGCA-TGAGCGGATGACCGCTGGTGGATT--TC-TC---CC-C-C-----AGATTCTACCTTTAGTCT-----C-AAGCAATCTACGTGATGTGACCTATA
gi|22785 : ACCCC--AAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCGCTGATGGATT--TC-TT---CC-C-C-----AGATTCCACCTTTAGTCT-----C-AAACAATCTACGTGATGTGACCTATATAGGAACCCTATGTCGATTTCTTTATG--G---GCCC-CAAATAGGGAGTGAAAGGGTGACTTCTGAT
gi|22786 : C--AAAGAGGCAGTGAGCTGATGATCACTGATGGATT--TT-CC---TC-C-A-----AGATTCTACATGTAGTTT-----C-AAACAAATTACGAGGTGTGACCTATATAGGAACCCTAAGTCGATTTCTATATG--G---ACCC-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCGCTGATGGAT
gi|22787 : GGATGGCCGCTAATGGATT--TC--C---CT-A-C-----AGATTCTACCTTTAGTCT-----C-AAGCAATCTACGTGATGCTACCAATATAGGAACCCTATGTCGATTTCTATATG--G---ATCA-CCAAGTGGCAGTCAGCGGATGACCACTGATGAATtt
gi|22788 : ATGTCGATGAATATATT--GACCCA--AAAGAGGCGATGAGAGGATGGCCGCTGATGGATtt
Alignments
lowQualScore : 7777777 11 11 2 11 55 1 1 44444444 22222 1 11 222 2
lowQualScore : ....... .. .. . .. .. . . ........ ..... . .. ... .
lowQualScore : 0000000 55 44 1 44 11 1 1 44444444 88888 1 77 111 4
consensus : TAAGTCGATTTCTATATGGACTCCAAAGAGGCAGTGAGCGGATGNNNNNNNATGTCGATTTCTATATG--GACCC--C-AAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCGCTGATGGATT--TC-TC-CC-C-----C--AGATTCTACCCTTAGTCT-----CAAG-CAATCTACGTGATGTGACCTATATAGGAACCCTAAGTCGATTTCTATATG--G---ACTC-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCGCTGATGGAT
Reference ( family-569 ) : TAAGTCGATTTCTATATGGACTCCAAAGAGGCAGTGAGCGGATGNNNNNNNATGTCGATTTCTATATG--GACCC--C-AAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCGCTGATGGATT--TC-TC-CC-C-----C--AGATTCTACCCTTAGTCT-----CAAG-CAATCTACGTGATGTGACCTATATAGGAACCCTAAGTCGATTTCTATATG--G---ACTC-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCGCTGATGGAT
gi|22751 : GTCGATTTCTATATG--GACTC--C-AAAGAGGCAGTGAGTGGATGACCGCTGATGGATT--TC-TC-CC-C-----C--AGATTCTACCTTTAGTCT-----CAAG-CAATCTACGTAATGTGGCCTATATAGGAACCCTTAGTCGATTTCTATACG--G---ACTC-CAAAGAGGCAGTGAGCAGATGACCGCTAATGGAT
gi|22752 : taaGTCGATATCTATATG--GACTC--C-AAAGAGGCAGTGAGCGGATGACTGCTGATGGATT--TC-TC-CC-C-----A--AGATTCTACCTTTAGTCT-----CAAG-CAATCTACGTGATGTGACCTATATAGCAACCCTATGTCGATTTCTATATG--G---ATCA-CCAAGAGGCAGTCAGCGGATGACCACTGATGGATtt
gi|22753 : taaGTCGATTTCTATATG--GACCC--C-AAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCGTTGATGGATT--TC-TC-CC-C-----C--AAATTCTACCCTAAGTCT-----CAAG-CAATCTACGTGATGTGACCTATATAGGAACCCTAAGTGGATTTCTATATA--A---ACTC-CAGAGAGGCAGTGAGCGGATGGCCTCTTATGGATtt
gi|22754 : taaGTCGATTTCTATATG--GACTC--C-AAAGAGGCAGTGAGGGGATGGCCGCTAATGGATT--TC--C-CT-C-----C--AGATTCTACCTTTAGTCT-----CAAG-CAATCTACGTGATGTGACCAATATAGGAACCCTATGTCGATTTCTATATG--GATCACTC----AGTGGCAGTCAGCGGATGACCACTGATGGATtt
gi|22755 : taaGTCGATTTCTATAGG--GACTC--C-AAAAAGGCAGTGAGCGGATGACTGCTGATGGATT--TC-TT-CC-C-----C--AGATTCTACCATAAATAT-----CAAG-CAATCTACATGATGTGACCTATATAGGAACCCTAAGCCGATTTCTATATG--G---ACTC-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATGGCCGCTAATGGATtt
gi|22756 : taaGTGGATTTCTATATA--AACTC--C-AGAGAGGCAGTGAGCGGATGGCCTCTTATGGATT--TC-TC-TC-C--------AGATTCTACCTTTAGTCT-----CAAG-CAATCTACGTGATGTGACCTTTATATGAACCCTAAGTCGATTTCTATATG--G---ACTC-CAAAGAGGCAGTGAGTGGATGACCGCTGATGGAT
gi|22757 : taaCGAATTCTATATG--GACTC--C-AGAGAGGCAGTGAGGGGATGGCCGCTAATGGATT--TC--C-CT-C-----C--AGATTCTAGCTTTAGTCT-----CAAG-CAATTTACGTGATGTGATCTATATAGGAACCCTAAGTCGATTTCTATATG--G---ATCA-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCACTGATtt
gi|22758 : taagaGTCGATTTCTATATATTGACTC--C-AAAGAGGCAGTGAGTGGATGACCGCTGATGGGTC--CC-CC-CC-CCCCCCC--AGATTCTACCCTTAGTCT-----CAAA-CAATCTACATGATGTGACCTATATAGGATCCCTAAGTCGATATCTATATG--G---ACTC-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATGACTGCTGATGGATatattt
gi|22759 : taaGTCAATTTCTATATA--AACTC--C-AAAAAGGCAGTAAGTGGATGACCGCTGATGGGTT--TC-TC-TC-C-----C--AGATTCTACCTTTAGTCT-----CAAG-CAATCTACATGATGTGACTAATATAGTAACCCTAAGTCGATTTCTATATG--G---ACTC-TAAAGAGGCAGTGAGCGGATGGCTGCTAATAGATtt
gi|22760 : taaGTCGATTTCTATATG--GACTC--T-AAAGAGGCAGTGAGCGGATGGCTGCTAATAGATT--TC-TA-CC-C-----C--TGATTATACCCTTAGTCT-----CAAG-CAATCTACATGATGTGACCTATATAGGAACCCTTAGTCGATTTATATATG--G---ACTC-AAAAGAGGCAGTGAGGGGATGGCCGCTGATGGATtt
gi|22761 : taaGTCGATTTCAATATT--AACTC--C-AAACAGGCAGTGAACGGATGGCCTCTAATGGATT--TC-TC-CC-C-----C--AGATTCTACCCTTTGTCT-----CAAG-CAATCTACATGATGTGACCTATATAGAAACCCTAAGTCGATTTCTATATG--G---ACTC-AAAAGAGGCAGTGAGCGGATGGCTGCTAATTGATtt
gi|22762 : taaGTCGATTTCTATATG--GACTC--A-AAAGAGGCAGTGAGCGGATGGCTGCTAATTGATT--TC-TC-CC-C-----C--AGATTCTACCATTAGTCT-----CAAG-CAATCTTAATGATGTGACCTATATAGGAACCTTCAGTCGATTTCAATATG--G---ACTC-CAAAGAGGCAGTGAGGGGACGGCCGCTAATGtt
gi|22763 : taaGCCGATTTCTATATG--GACTC--C-AAAGAGGCAGTGAGCGGATGGCCGCTAATGGATCCATC-CCACC-C-----CTTATATTCTACCTTTAGTCT-----CAAG-CAATCTACATGATGTGACCTATATAGGAAACCTAAGTCGATTTCAATATT--A---ACTC-CAAACAGGCAGTGAACGGATGGCCTCTAATGGATattt
gi|22764 : taaATGTCGATGAATATATT--GACCC--A-AAAGAGGCGATGAGAGGATGGCCGCTGATGGATC--CC-AC-CTGC-----T--AGATTCTACCTTTAGTCT-----CAAG-CAATCTACATGATGTGACCTATATAGGATCCCTAAGTCGATTTCTATATG--G---ACCC-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCGTTGATGGATtt
gi|22765 : tGTCGATTTCTATATA--GACTC--C-AGAGAGGCAATGAGCGTATGGCCGTTGATGGATC--CCATC-TC-T-----T--AGATTCTACCTTTAGTCT-----CAAG-CAATTTATATGATGTGACCTATATAGGAAACCGAAGTCGATTTCTATAAT--G---ATTC-CAAAGAGGCAGTGAGCTGATGACCGCTGATGGATtt
gi|22766 : taaATGTCGATTTCTATATG--GATCA--C-CAAGTGGCAGTCAGCGGATGACCACTGATGAATT--TT-CT-TC-A-----A--AGATTCTACACTAAGTCT-----GAAG-CAAGTTACGAAATGTGACCTATATAGGAACCCTGTGTCGATTTCTATATG--G---ACCC-AAAAGAGGCA-TGAGCGGATGACCGCTGGTGGATtt
gi|22767 : tATGTCGATTTCTATATG--GATCA--C-CAAGAGGCAGTCAGCGGATGACCACTGATGGATT--TT-CC-TC-A-----A--AGATTCTACACTAAGTCTCAAGCCAAG-CAAGTTACGAAATGTAACCTATATAGGAACCATGTGTCGATTTCTATATG--G---ACCC-AAAAGAGGCA-TGAGCGGATGACAGCTGGTGGATtt
gi|22768 : tATGTCGATTTCTATATG--GATCA--C-TCAGTGGCAGTCAGCGGATGACCACTGATGGATT--TT-CC-TC-A-----A--AGATTCTACACTAAGTCT-----CAAG-CAAGTTACGAAATGTGATCTATTTTGGAACCCTGTGTTGATTTCTATATG--G---ACCC-AAAAGAGGCA-TGAGCGGATGACCGCTGGTGGATtt
gi|22769 : tTAAGTCGATTTCTATATGGACTCCAAAGAGGCAGTGAGCGGATGNNNNNNNNNNTCGATTTCTTTTTG--GGCCCTTT-AATG-GGCAATGAAAGGATGACCTCTAATA------------------------AAATTCTACCCTTAGTCT-----CAAA-CAGTCTAAATGGTGTGACCTATATAGGAGCCCTAAGTCGATTTCTATATATTG---ACTC-CAAAGAGGCAGTGAGTGGATGACCGCTGATGGGTtt
gi|22770 : ATGTCGATTTCTTTATG--GGCCC--TTAAATAGGCAGTGAAAGGATGACCTCTGAT----------------------C--AAATTCTACCCTTACTCT-----CAAA-CAGTCTAAGTGGTGTGACCTATATAGGAACCCTAAGTCGATTTCTATATA--G---ACTC-CAGAGAGGCAATGAGCGTATGGCCGTTGATGGAT
gi|22771 : tATGTCGATTTCTTTATG--GGCCC--C-AAATAGGGAGTGAAAGGGTGACTTCTGAT----------------------C--AAATTTTTCCCTTAGTCT-----CAAG-CAGTCTACGTGGTGTAACCGATATAG-AACCCTAAGTCGATTTCTATAGG--G---ACTC-CAAAAAGGCAGTGAGCGGATGACTGCTGATGGAT
gi|22772 : tATGTCGATTTCTTTATG--GGCCC--TTAAATAGGCAGTGAAAGGATGACCTCTGAT----------------C-----T--A-ATTCTACCCTAAGTCT-----CAAA-CAGTCTAAGTGGTGTGACCTATATAGGAATCCTAAGTCAATTTCTATATA--A---ACTC-CAAAAAGGCAGTAAGTGGATGACCGCTGATGGGTtt
gi|22773 : tGTCGATTTCTATATG--GATCA--C-AAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCACTGATATATT--TT-TT-TC-C-----A--AGACTCTACACTTAGTCT-----CAAG-CAAGCTACGtt
gi|22773 : taa--GGCCA--C-AAAGAGGCAGTGAGCTGATGATCACTGATGGATT--Taaagaggccacaaagaggcagtgagctgatgatcactgatggattt
gi|22774 : taagtcgatttctatatggatcacaaagaggcagtgagcggatgaccactgatatatttttttccaagactctacacttagtctcaagcaagctacgaaagaGTCGATTTCTTTATG--GACTC--C-AGAGAGGTAGTGAGCGGATGGTCGTTGATGGATC--CC-AC-CC-CT----T--AGATTCTACCTTTAGTCT-----CAAG-CAATTTACCCTATGT
gi|22775 : taaGTCGATTTCTATATG--GACCC--C-AAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCGCTGATGGATT--TC-TT-CC-C-----C--
gi|22776 : taaGTCGATTTCTTTATG--GACTC--C-AAAGAGGCAGTGAGCAGATGACCGCCGATGGATT--TC-TC-CC-C-----A--AGATTCTACCTTTAGTCT-----CAAAACAATCTACGTGATGTGACTAATATAGGAACCCTAAGTCGATTTCTATATG--G---ACTC-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATG
gi|22776 : aaTAAGTCGATTTCTATATGGACTCCAAAGAGGCAGTGAGCGGATGNNNNNNNNNNTCGATTTnnnnnnnnnntcgattt
gi|22777 : aagtcgatttctttatggactccaaagaggcagtgagcagatgaccgccgatggatttctccccaagattctacctttagtctcaaaacaatctacgtgatgtgactaatataggaacccGTCGATTTCTATATG--GACTC--C-AGAGAGACAGTGAGCGAATGGCTGCTAATGGATT--TC--C-CT-C-----C--AGATTCTACCTTTAGTTT-----TAAG-CAAGCTACGTGATGTGACCTATATATGAACCCAAAGTCGATTTCTTTATG--G---ACTC-CAAAGAGGCAGTGAGCAGATGACCGCCGATGGAT
gi|22778 : aaGTCGATTTCTATAAT--GATTC--C-AAAGAGGCAGTGAGCTGATGACCGCTGATGGATT--TC-TC-CC-C-----C--ATATTCTACCCTTTATCT-----CAAG-CAATCTACATGATGTGACCTATAAAGGAACCCTAAGTCGATTTCTTTATG--G---ACTC-CAGAGAGGTAGTGAGCGGATGGTCGTTGATGGATtt
gi|22779 : aaGTCGATTTCTATACG--GACTC--C-AAAGAGGCAGTGAGCAGATGACCGCTAATGGATT--TC-TC-CA-A-----C--AGATTCTACCCTGTGTCT-----CAAG-CAATCTACATGATGTGATCTATATAGGAACTCTAAGACGAATTCTATATG--G---ACTC-CAGAGAGGCAGTGAGGGGATGGCCGCTAATGGAT
gi|22780 : aGTCGATTTCAATATG--GACTC--C-AAAGAGGCAGTGAGGGGACGGCCGCTAATG-ATT--TC--C-CT-C-----C--AGATTCTATCTTTAGTCT-----CAAG-CAATCTACGTGATGTGACTAATAAAGGAACTCTAAGTCGATTTCTATATG--G---ACTC-CAAAGAGGCAGTGAGGGGATGGCCGCTAATGGATtt
gi|22781 : aGTCGATTTATATATG--GACTC--A-AAAGAGGCAGTGAGGGGATGGCCGCTGATGGATT--TC-TC-CC-C-----A--AGAGTCTACCCTTAGTCT-----CAAG-CAATCTACATGATGTGACCTATA----------AAGTCGATTTCTATATG--G---ACTC-CAGAGAGACAGTGAGCGAATGGCTGCTAATGGATtt
gi|22782 : aGTCGATTTCTATATG--GACCC--A-AAAGAGGCA-TGAGCGGATGACCGCTGGTGGATT--TC-TC-CC-C-----C--AGATTCTTCCTTTAGTCT-----CAAG-CAATCTACGTGATGTGACCTATATAGGAACCCTATGTCGATTTCTTTATG--G---GCCCTTAAATAGGCAGTGAAAGGATGACCTCTGATtt
gi|22783 : GTCGATTTCTATATG--GACCC--A-AAAGAGGCA-TGAGCGGATGACAGCTGGTGGATT--TC-TC-CC-C-----C--AGATTCTACCTTTAGTCT-----CCAG-CAATCTACGTGATGTGACCTATAGAGGATTCCTATGTCGATTTCTTTATG--G---GCCCTTAAATAGGCAGTGAAAGGATGACCTCTGAT
gi|22784 : GTTGATTTCTATATG--GACCC--A-AAAGAGGCA-TGAGCGGATGACCGCTGGTGGATT--TC-TC-CC-C-----C--AGATTCTACCTTTAGTCT-----CAAG-CAATCTACGTGATGTGACCTATA
gi|22785 : ACCC--C-AAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCGCTGATGGATT--TC-TT-CC-C-----C--AGATTCCACCTTTAGTCT-----CAAA-CAATCTACGTGATGTGACCTATATAGGAACCCTATGTCGATTTCTTTATG--G---GCCC-CAAATAGGGAGTGAAAGGGTGACTTCTGAT
gi|22786 : --C-AAAGAGGCAGTGAGCTGATGATCACTGATGGATT--TT-CC-TC-C-----A--AGATTCTACATGTAGTTT-----CAAA-CAAATTACGAGGTGTGACCTATATAGGAACCCTAAGTCGATTTCTATATG--G---ACCC-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCGCTGATGGAT
gi|22787 : GGATGGCCGCTAATGGATT--TC--C-CT-A-----C--AGATTCTACCTTTAGTCT-----CAAG-CAATCTACGTGATGCTACCAATATAGGAACCCTATGTCGATTTCTATATG--G---ATCA-CCAAGTGGCAGTCAGCGGATGACCACTGATGAATtt
gi|22788 : ATGTCGATGAATATATT--GACCC--A-AAAGAGGCGATGAGAGGATGGCCGCTGATGGATtt
Alignments
lowQualScore : 7777777 11 11 2 11 55 1 1 44444444 22222 1 11 222 2
lowQualScore : ....... .. .. . .. .. . . ........ ..... . .. ... .
lowQualScore : 0000000 55 44 1 44 11 1 1 44444444 88888 1 77 111 4
consensus : TAAGTCGATTTCTATATGGACTCCAAAGAGGCAGTGAGCGGATGNNNNNNNATGTCGATTTCTATATG--GACCC--C-AAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCGCTGATGGATT--TC-TC-CC-C-----C--AGATTCTACCCTTAGTCT-----CAAG-CAATCTACGTGATGTGACCTATATAGGAACCCTAAGTCGATTTCTATATG--G---ACTC-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCGCTGATGGAT
Reference ( family-569 ) : TAAGTCGATTTCTATATGGACTCCAAAGAGGCAGTGAGCGGATGNNNNNNNATGTCGATTTCTATATG--GACCC--C-AAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCGCTGATGGATT--TC-TC-CC-C-----C--AGATTCTACCCTTAGTCT-----CAAG-CAATCTACGTGATGTGACCTATATAGGAACCCTAAGTCGATTTCTATATG--G---ACTC-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCGCTGATGGAT
gi|22751 : GTCGATTTCTATATG--GACTC--C-AAAGAGGCAGTGAGTGGATGACCGCTGATGGATT--TC-TC-CC-C-----C--AGATTCTACCTTTAGTCT-----CAAG-CAATCTACGTAATGTGGCCTATATAGGAACCCTTAGTCGATTTCTATACG--G---ACTC-CAAAGAGGCAGTGAGCAGATGACCGCTAATGGAT
gi|22752 : taaGTCGATATCTATATG--GACTC--C-AAAGAGGCAGTGAGCGGATGACTGCTGATGGATT--TC-TC-CC-C-----A--AGATTCTACCTTTAGTCT-----CAAG-CAATCTACGTGATGTGACCTATATAGCAACCCTATGTCGATTTCTATATG--G---ATCA-CCAAGAGGCAGTCAGCGGATGACCACTGATGGATtt
gi|22753 : taaGTCGATTTCTATATG--GACCC--C-AAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCGTTGATGGATT--TC-TC-CC-C-----C--AAATTCTACCCTAAGTCT-----CAAG-CAATCTACGTGATGTGACCTATATAGGAACCCTAAGTGGATTTCTATATA--A---ACTC-CAGAGAGGCAGTGAGCGGATGGCCTCTTATGGATtt
gi|22754 : taaGTCGATTTCTATATG--GACTC--C-AAAGAGGCAGTGAGGGGATGGCCGCTAATGGATT--TC--C-CT-C-----C--AGATTCTACCTTTAGTCT-----CAAG-CAATCTACGTGATGTGACCAATATAGGAACCCTATGTCGATTTCTATATG--GATCACTC----AGTGGCAGTCAGCGGATGACCACTGATGGATtt
gi|22755 : taaGTCGATTTCTATAGG--GACTC--C-AAAAAGGCAGTGAGCGGATGACTGCTGATGGATT--TC-TT-CC-C-----C--AGATTCTACCATAAATAT-----CAAG-CAATCTACATGATGTGACCTATATAGGAACCCTAAGCCGATTTCTATATG--G---ACTC-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATGGCCGCTAATGGATtt
gi|22756 : taaGTGGATTTCTATATA--AACTC--C-AGAGAGGCAGTGAGCGGATGGCCTCTTATGGATT--TC-TC-TC-C--------AGATTCTACCTTTAGTCT-----CAAG-CAATCTACGTGATGTGACCTTTATATGAACCCTAAGTCGATTTCTATATG--G---ACTC-CAAAGAGGCAGTGAGTGGATGACCGCTGATGGAT
gi|22757 : taaCGAATTCTATATG--GACTC--C-AGAGAGGCAGTGAGGGGATGGCCGCTAATGGATT--TC--C-CT-C-----C--AGATTCTAGCTTTAGTCT-----CAAG-CAATTTACGTGATGTGATCTATATAGGAACCCTAAGTCGATTTCTATATG--G---ATCA-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCACTGATtt
gi|22758 : taagaGTCGATTTCTATATATTGACTC--C-AAAGAGGCAGTGAGTGGATGACCGCTGATGGGTC--CC-CC-CC-CCCCCCC--AGATTCTACCCTTAGTCT-----CAAA-CAATCTACATGATGTGACCTATATAGGATCCCTAAGTCGATATCTATATG--G---ACTC-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATGACTGCTGATGGATatattt
gi|22759 : taaGTCAATTTCTATATA--AACTC--C-AAAAAGGCAGTAAGTGGATGACCGCTGATGGGTT--TC-TC-TC-C-----C--AGATTCTACCTTTAGTCT-----CAAG-CAATCTACATGATGTGACTAATATAGTAACCCTAAGTCGATTTCTATATG--G---ACTC-TAAAGAGGCAGTGAGCGGATGGCTGCTAATAGATtt
gi|22760 : taaGTCGATTTCTATATG--GACTC--T-AAAGAGGCAGTGAGCGGATGGCTGCTAATAGATT--TC-TA-CC-C-----C--TGATTATACCCTTAGTCT-----CAAG-CAATCTACATGATGTGACCTATATAGGAACCCTTAGTCGATTTATATATG--G---ACTC-AAAAGAGGCAGTGAGGGGATGGCCGCTGATGGATtt
gi|22761 : taaGTCGATTTCAATATT--AACTC--C-AAACAGGCAGTGAACGGATGGCCTCTAATGGATT--TC-TC-CC-C-----C--AGATTCTACCCTTTGTCT-----CAAG-CAATCTACATGATGTGACCTATATAGAAACCCTAAGTCGATTTCTATATG--G---ACTC-AAAAGAGGCAGTGAGCGGATGGCTGCTAATTGATtt
gi|22762 : taaGTCGATTTCTATATG--GACTC--A-AAAGAGGCAGTGAGCGGATGGCTGCTAATTGATT--TC-TC-CC-C-----C--AGATTCTACCATTAGTCT-----CAAG-CAATCTTAATGATGTGACCTATATAGGAACCTTCAGTCGATTTCAATATG--G---ACTC-CAAAGAGGCAGTGAGGGGACGGCCGCTAATGtt
gi|22763 : taaGCCGATTTCTATATG--GACTC--C-AAAGAGGCAGTGAGCGGATGGCCGCTAATGGATCCATC-CCACC-C-----CTTATATTCTACCTTTAGTCT-----CAAG-CAATCTACATGATGTGACCTATATAGGAAACCTAAGTCGATTTCAATATT--A---ACTC-CAAACAGGCAGTGAACGGATGGCCTCTAATGGATattt
gi|22764 : taaATGTCGATGAATATATT--GACCC--A-AAAGAGGCGATGAGAGGATGGCCGCTGATGGATC--CC-AC-CTGC-----T--AGATTCTACCTTTAGTCT-----CAAG-CAATCTACATGATGTGACCTATATAGGATCCCTAAGTCGATTTCTATATG--G---ACCC-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCGTTGATGGATtt
gi|22765 : tGTCGATTTCTATATA--GACTC--C-AGAGAGGCAATGAGCGTATGGCCGTTGATGGATC--CCATC-TC-T-----T--AGATTCTACCTTTAGTCT-----CAAG-CAATTTATATGATGTGACCTATATAGGAAACCGAAGTCGATTTCTATAAT--G---ATTC-CAAAGAGGCAGTGAGCTGATGACCGCTGATGGATtt
gi|22766 : taaATGTCGATTTCTATATG--GATCA--C-CAAGTGGCAGTCAGCGGATGACCACTGATGAATT--TT-CT-TC-A-----A--AGATTCTACACTAAGTCT-----GAAG-CAAGTTACGAAATGTGACCTATATAGGAACCCTGTGTCGATTTCTATATG--G---ACCC-AAAAGAGGCA-TGAGCGGATGACCGCTGGTGGATtt
gi|22767 : tATGTCGATTTCTATATG--GATCA--C-CAAGAGGCAGTCAGCGGATGACCACTGATGGATT--TT-CC-TC-A-----A--AGATTCTACACTAAGTCTCAAGCCAAG-CAAGTTACGAAATGTAACCTATATAGGAACCATGTGTCGATTTCTATATG--G---ACCC-AAAAGAGGCA-TGAGCGGATGACAGCTGGTGGATtt
gi|22768 : tATGTCGATTTCTATATG--GATCA--C-TCAGTGGCAGTCAGCGGATGACCACTGATGGATT--TT-CC-TC-A-----A--AGATTCTACACTAAGTCT-----CAAG-CAAGTTACGAAATGTGATCTATTTTGGAACCCTGTGTTGATTTCTATATG--G---ACCC-AAAAGAGGCA-TGAGCGGATGACCGCTGGTGGATtt
gi|22769 : tTAAGTCGATTTCTATATGGACTCCAAAGAGGCAGTGAGCGGATGNNNNNNNNNNTCGATTTCTTTTTG--GGCCCTTT-AATG-GGCAATGAAAGGATGACCTCTAATA------------------------AAATTCTACCCTTAGTCT-----CAAA-CAGTCTAAATGGTGTGACCTATATAGGAGCCCTAAGTCGATTTCTATATATTG---ACTC-CAAAGAGGCAGTGAGTGGATGACCGCTGATGGGTtt
gi|22770 : ATGTCGATTTCTTTATG--GGCCC--TTAAATAGGCAGTGAAAGGATGACCTCTGAT----------------------C--AAATTCTACCCTTACTCT-----CAAA-CAGTCTAAGTGGTGTGACCTATATAGGAACCCTAAGTCGATTTCTATATA--G---ACTC-CAGAGAGGCAATGAGCGTATGGCCGTTGATGGAT
gi|22771 : tATGTCGATTTCTTTATG--GGCCC--C-AAATAGGGAGTGAAAGGGTGACTTCTGAT----------------------C--AAATTTTTCCCTTAGTCT-----CAAG-CAGTCTACGTGGTGTAACCGATATAG-AACCCTAAGTCGATTTCTATAGG--G---ACTC-CAAAAAGGCAGTGAGCGGATGACTGCTGATGGAT
gi|22772 : tATGTCGATTTCTTTATG--GGCCC--TTAAATAGGCAGTGAAAGGATGACCTCTGAT----------------C-----T--A-ATTCTACCCTAAGTCT-----CAAA-CAGTCTAAGTGGTGTGACCTATATAGGAATCCTAAGTCAATTTCTATATA--A---ACTC-CAAAAAGGCAGTAAGTGGATGACCGCTGATGGGTtt
gi|22773 : tGTCGATTTCTATATG--GATCA--C-AAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCACTGATATATT--TT-TT-TC-C-----A--AGACTCTACACTTAGTCT-----CAAG-CAAGCTACGtt
gi|22773 : taa--GGCCA--C-AAAGAGGCAGTGAGCTGATGATCACTGATGGATT--Taaagaggccacaaagaggcagtgagctgatgatcactgatggattt
gi|22774 : taagtcgatttctatatggatcacaaagaggcagtgagcggatgaccactgatatatttttttccaagactctacacttagtctcaagcaagctacgaaagaGTCGATTTCTTTATG--GACTC--C-AGAGAGGTAGTGAGCGGATGGTCGTTGATGGATC--CC-AC-CC-CT----T--AGATTCTACCTTTAGTCT-----CAAG-CAATTTACCCTATGT
gi|22775 : taaGTCGATTTCTATATG--GACCC--C-AAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCGCTGATGGATT--TC-TT-CC-C-----C--
gi|22776 : taaGTCGATTTCTTTATG--GACTC--C-AAAGAGGCAGTGAGCAGATGACCGCCGATGGATT--TC-TC-CC-C-----A--AGATTCTACCTTTAGTCT-----CAAAACAATCTACGTGATGTGACTAATATAGGAACCCTAAGTCGATTTCTATATG--G---ACTC-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATG
gi|22776 : aaTAAGTCGATTTCTATATGGACTCCAAAGAGGCAGTGAGCGGATGNNNNNNNNNNTCGATTTnnnnnnnnnntcgattt
gi|22777 : aagtcgatttctttatggactccaaagaggcagtgagcagatgaccgccgatggatttctccccaagattctacctttagtctcaaaacaatctacgtgatgtgactaatataggaacccGTCGATTTCTATATG--GACTC--C-AGAGAGACAGTGAGCGAATGGCTGCTAATGGATT--TC--C-CT-C-----C--AGATTCTACCTTTAGTTT-----TAAG-CAAGCTACGTGATGTGACCTATATATGAACCCAAAGTCGATTTCTTTATG--G---ACTC-CAAAGAGGCAGTGAGCAGATGACCGCCGATGGAT
gi|22778 : aaGTCGATTTCTATAAT--GATTC--C-AAAGAGGCAGTGAGCTGATGACCGCTGATGGATT--TC-TC-CC-C-----C--ATATTCTACCCTTTATCT-----CAAG-CAATCTACATGATGTGACCTATAAAGGAACCCTAAGTCGATTTCTTTATG--G---ACTC-CAGAGAGGTAGTGAGCGGATGGTCGTTGATGGATtt
gi|22779 : aaGTCGATTTCTATACG--GACTC--C-AAAGAGGCAGTGAGCAGATGACCGCTAATGGATT--TC-TC-CA-A-----C--AGATTCTACCCTGTGTCT-----CAAG-CAATCTACATGATGTGATCTATATAGGAACTCTAAGACGAATTCTATATG--G---ACTC-CAGAGAGGCAGTGAGGGGATGGCCGCTAATGGAT
gi|22780 : aGTCGATTTCAATATG--GACTC--C-AAAGAGGCAGTGAGGGGACGGCCGCTAATG-ATT--TC--C-CT-C-----C--AGATTCTATCTTTAGTCT-----CAAG-CAATCTACGTGATGTGACTAATAAAGGAACTCTAAGTCGATTTCTATATG--G---ACTC-CAAAGAGGCAGTGAGGGGATGGCCGCTAATGGATtt
gi|22781 : aGTCGATTTATATATG--GACTC--A-AAAGAGGCAGTGAGGGGATGGCCGCTGATGGATT--TC-TC-CC-C-----A--AGAGTCTACCCTTAGTCT-----CAAG-CAATCTACATGATGTGACCTATA----------AAGTCGATTTCTATATG--G---ACTC-CAGAGAGACAGTGAGCGAATGGCTGCTAATGGATtt
gi|22782 : aGTCGATTTCTATATG--GACCC--A-AAAGAGGCA-TGAGCGGATGACCGCTGGTGGATT--TC-TC-CC-C-----C--AGATTCTTCCTTTAGTCT-----CAAG-CAATCTACGTGATGTGACCTATATAGGAACCCTATGTCGATTTCTTTATG--G---GCCCTTAAATAGGCAGTGAAAGGATGACCTCTGATtt
gi|22783 : GTCGATTTCTATATG--GACCC--A-AAAGAGGCA-TGAGCGGATGACAGCTGGTGGATT--TC-TC-CC-C-----C--AGATTCTACCTTTAGTCT-----CCAG-CAATCTACGTGATGTGACCTATAGAGGATTCCTATGTCGATTTCTTTATG--G---GCCCTTAAATAGGCAGTGAAAGGATGACCTCTGAT
gi|22784 : GTTGATTTCTATATG--GACCC--A-AAAGAGGCA-TGAGCGGATGACCGCTGGTGGATT--TC-TC-CC-C-----C--AGATTCTACCTTTAGTCT-----CAAG-CAATCTACGTGATGTGACCTATA
gi|22785 : ACCC--C-AAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCGCTGATGGATT--TC-TT-CC-C-----C--AGATTCCACCTTTAGTCT-----CAAA-CAATCTACGTGATGTGACCTATATAGGAACCCTATGTCGATTTCTTTATG--G---GCCC-CAAATAGGGAGTGAAAGGGTGACTTCTGAT
gi|22786 : --C-AAAGAGGCAGTGAGCTGATGATCACTGATGGATT--TT-CC-TC-C-----A--AGATTCTACATGTAGTTT-----CAAA-CAAATTACGAGGTGTGACCTATATAGGAACCCTAAGTCGATTTCTATATG--G---ACCC-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCGCTGATGGAT
gi|22787 : GGATGGCCGCTAATGGATT--TC--C-CT-A-----C--AGATTCTACCTTTAGTCT-----CAAG-CAATCTACGTGATGCTACCAATATAGGAACCCTATGTCGATTTCTATATG--G---ATCA-CCAAGTGGCAGTCAGCGGATGACCACTGATGAATtt
gi|22788 : ATGTCGATGAATATATT--GACCC--A-AAAGAGGCGATGAGAGGATGGCCGCTGATGGATtt
blockSeqs : NNNNNNN TT TT T CA AT A G CCCCCC CAAGC A TT ATC T
blockSeqs : . . T . T . . CTT . . . . T
blockSeqs : . . . . T . . TT . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . A . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . C . . . . .
blockSeqs : . . . . C . . C . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . C . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . C . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . C . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . C . . . . .
blockSeqs : . . . . C . . C . . . . .
blockSeqs : . . . . A . . C . . . . .
blockSeqs : . . . . C . . T . . . . .
blockSeqs : . . . . C . . T . . . . .
blockSeqs : . . . . C . . A . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . A . . . . .
blockSeqs : . . . . A . . A . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . C . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . C . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . T . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . A . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . C . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . A . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . C . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . C . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . C . . . . .
blockSeqs : . . . . C . . C . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . C . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . C . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . C . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . C . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . .
blockSeqs : . . . . . . . C . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqCons :
originalCons : TAAGTCGATTTCTATATGGACTCCAAAGAGGCAGTGAGCGGATGNNNNNNNATGTCGATTTCTATATG--GACCC--C-AAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCGCTGATGGATT--TC-TC-CC-C-----C--AGATTCTACCCTTAGTCT-----CAAG-CAATCTACGTGATGTGACCTATATAGGAACCCTAAGTCGATTTCTATATG--G---ACTC-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCGCTGATGGAT
finalCons : TAAGTCGATTTCTATATGGACTCCAAAGAGGCAGTGAGCGGATGNNNNNNNATGTCGATTTCTATATG--GACCC--C-AAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCGCTGATGGATT--TC-TC-CC-C-----C--AGATTCTACCCTTAGTCT-----CAAG-CAATCTACGTGATGTGACCTATATAGGAACCCTAAGTCGATTTCTATATG--G---ACTC-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCGCTGATGGAT
Alignments
lowQualScore : 7777777 11 11 2 11 55 1 1 44444444 22222 1 11 222 2
lowQualScore : ....... .. .. . .. .. . . ........ ..... . .. ... .
lowQualScore : 0000000 55 44 1 44 11 1 1 44444444 88888 1 77 111 4
consensus : TAAGTCGATTTCTATATGGACTCCAAAGAGGCAGTGAGCGGATGNNNNNNNATGTCGATTTCTATATG--GACCC--C-AAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCGCTGATGGATT--TC-TC-CC-C-----C--AGATTCTACCCTTAGTCT-----CAAG-CAATCTACGTGATGTGACCTATATAGGAACCCTAAGTCGATTTCTATATG--G---ACTC-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCGCTGATGGAT
Reference ( family-569 ) : TAAGTCGATTTCTATATGGACTCCAAAGAGGCAGTGAGCGGATGNNNNNNNATGTCGATTTCTATATG--GACCC--C-AAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCGCTGATGGATT--TC-TC-CC-C-----C--AGATTCTACCCTTAGTCT-----CAAG-CAATCTACGTGATGTGACCTATATAGGAACCCTAAGTCGATTTCTATATG--G---ACTC-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCGCTGATGGAT
gi|22751 : GTCGATTTCTATATG--GACTC--C-AAAGAGGCAGTGAGTGGATGACCGCTGATGGATT--TC-TC-CC-C-----C--AGATTCTACCTTTAGTCT-----CAAG-CAATCTACGTAATGTGGCCTATATAGGAACCCTTAGTCGATTTCTATACG--G---ACTC-CAAAGAGGCAGTGAGCAGATGACCGCTAATGGAT
gi|22752 : taaGTCGATATCTATATG--GACTC--C-AAAGAGGCAGTGAGCGGATGACTGCTGATGGATT--TC-TC-CC-C-----A--AGATTCTACCTTTAGTCT-----CAAG-CAATCTACGTGATGTGACCTATATAGCAACCCTATGTCGATTTCTATATG--G---ATCA-CCAAGAGGCAGTCAGCGGATGACCACTGATGGATtt
gi|22753 : taaGTCGATTTCTATATG--GACCC--C-AAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCGTTGATGGATT--TC-TC-CC-C-----C--AAATTCTACCCTAAGTCT-----CAAG-CAATCTACGTGATGTGACCTATATAGGAACCCTAAGTGGATTTCTATATA--A---ACTC-CAGAGAGGCAGTGAGCGGATGGCCTCTTATGGATtt
gi|22754 : taaGTCGATTTCTATATG--GACTC--C-AAAGAGGCAGTGAGGGGATGGCCGCTAATGGATT--TC--C-CT-C-----C--AGATTCTACCTTTAGTCT-----CAAG-CAATCTACGTGATGTGACCAATATAGGAACCCTATGTCGATTTCTATATG--GATCACTC----AGTGGCAGTCAGCGGATGACCACTGATGGATtt
gi|22755 : taaGTCGATTTCTATAGG--GACTC--C-AAAAAGGCAGTGAGCGGATGACTGCTGATGGATT--TC-TT-CC-C-----C--AGATTCTACCATAAATAT-----CAAG-CAATCTACATGATGTGACCTATATAGGAACCCTAAGCCGATTTCTATATG--G---ACTC-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATGGCCGCTAATGGATtt
gi|22756 : taaGTGGATTTCTATATA--AACTC--C-AGAGAGGCAGTGAGCGGATGGCCTCTTATGGATT--TC-TC-TC-C--------AGATTCTACCTTTAGTCT-----CAAG-CAATCTACGTGATGTGACCTTTATATGAACCCTAAGTCGATTTCTATATG--G---ACTC-CAAAGAGGCAGTGAGTGGATGACCGCTGATGGAT
gi|22757 : taaCGAATTCTATATG--GACTC--C-AGAGAGGCAGTGAGGGGATGGCCGCTAATGGATT--TC--C-CT-C-----C--AGATTCTAGCTTTAGTCT-----CAAG-CAATTTACGTGATGTGATCTATATAGGAACCCTAAGTCGATTTCTATATG--G---ATCA-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCACTGATtt
gi|22758 : taagaGTCGATTTCTATATATTGACTC--C-AAAGAGGCAGTGAGTGGATGACCGCTGATGGGTC--CC-CC-CC-CCCCCCC--AGATTCTACCCTTAGTCT-----CAAA-CAATCTACATGATGTGACCTATATAGGATCCCTAAGTCGATATCTATATG--G---ACTC-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATGACTGCTGATGGATatattt
gi|22759 : taaGTCAATTTCTATATA--AACTC--C-AAAAAGGCAGTAAGTGGATGACCGCTGATGGGTT--TC-TC-TC-C-----C--AGATTCTACCTTTAGTCT-----CAAG-CAATCTACATGATGTGACTAATATAGTAACCCTAAGTCGATTTCTATATG--G---ACTC-TAAAGAGGCAGTGAGCGGATGGCTGCTAATAGATtt
gi|22760 : taaGTCGATTTCTATATG--GACTC--T-AAAGAGGCAGTGAGCGGATGGCTGCTAATAGATT--TC-TA-CC-C-----C--TGATTATACCCTTAGTCT-----CAAG-CAATCTACATGATGTGACCTATATAGGAACCCTTAGTCGATTTATATATG--G---ACTC-AAAAGAGGCAGTGAGGGGATGGCCGCTGATGGATtt
gi|22761 : taaGTCGATTTCAATATT--AACTC--C-AAACAGGCAGTGAACGGATGGCCTCTAATGGATT--TC-TC-CC-C-----C--AGATTCTACCCTTTGTCT-----CAAG-CAATCTACATGATGTGACCTATATAGAAACCCTAAGTCGATTTCTATATG--G---ACTC-AAAAGAGGCAGTGAGCGGATGGCTGCTAATTGATtt
gi|22762 : taaGTCGATTTCTATATG--GACTC--A-AAAGAGGCAGTGAGCGGATGGCTGCTAATTGATT--TC-TC-CC-C-----C--AGATTCTACCATTAGTCT-----CAAG-CAATCTTAATGATGTGACCTATATAGGAACCTTCAGTCGATTTCAATATG--G---ACTC-CAAAGAGGCAGTGAGGGGACGGCCGCTAATGtt
gi|22763 : taaGCCGATTTCTATATG--GACTC--C-AAAGAGGCAGTGAGCGGATGGCCGCTAATGGATCCATC-CCACC-C-----CTTATATTCTACCTTTAGTCT-----CAAG-CAATCTACATGATGTGACCTATATAGGAAACCTAAGTCGATTTCAATATT--A---ACTC-CAAACAGGCAGTGAACGGATGGCCTCTAATGGATattt
gi|22764 : taaATGTCGATGAATATATT--GACCC--A-AAAGAGGCGATGAGAGGATGGCCGCTGATGGATC--CC-AC-CTGC-----T--AGATTCTACCTTTAGTCT-----CAAG-CAATCTACATGATGTGACCTATATAGGATCCCTAAGTCGATTTCTATATG--G---ACCC-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCGTTGATGGATtt
gi|22765 : tGTCGATTTCTATATA--GACTC--C-AGAGAGGCAATGAGCGTATGGCCGTTGATGGATC--CCATC-TC-T-----T--AGATTCTACCTTTAGTCT-----CAAG-CAATTTATATGATGTGACCTATATAGGAAACCGAAGTCGATTTCTATAAT--G---ATTC-CAAAGAGGCAGTGAGCTGATGACCGCTGATGGATtt
gi|22766 : taaATGTCGATTTCTATATG--GATCA--C-CAAGTGGCAGTCAGCGGATGACCACTGATGAATT--TT-CT-TC-A-----A--AGATTCTACACTAAGTCT-----GAAG-CAAGTTACGAAATGTGACCTATATAGGAACCCTGTGTCGATTTCTATATG--G---ACCC-AAAAGAGGCA-TGAGCGGATGACCGCTGGTGGATtt
gi|22767 : tATGTCGATTTCTATATG--GATCA--C-CAAGAGGCAGTCAGCGGATGACCACTGATGGATT--TT-CC-TC-A-----A--AGATTCTACACTAAGTCTCAAGCCAAG-CAAGTTACGAAATGTAACCTATATAGGAACCATGTGTCGATTTCTATATG--G---ACCC-AAAAGAGGCA-TGAGCGGATGACAGCTGGTGGATtt
gi|22768 : tATGTCGATTTCTATATG--GATCA--C-TCAGTGGCAGTCAGCGGATGACCACTGATGGATT--TT-CC-TC-A-----A--AGATTCTACACTAAGTCT-----CAAG-CAAGTTACGAAATGTGATCTATTTTGGAACCCTGTGTTGATTTCTATATG--G---ACCC-AAAAGAGGCA-TGAGCGGATGACCGCTGGTGGATtt
gi|22769 : tTAAGTCGATTTCTATATGGACTCCAAAGAGGCAGTGAGCGGATGNNNNNNNNNNTCGATTTCTTTTTG--GGCCCTTT-AATG-GGCAATGAAAGGATGACCTCTAATA------------------------AAATTCTACCCTTAGTCT-----CAAA-CAGTCTAAATGGTGTGACCTATATAGGAGCCCTAAGTCGATTTCTATATATTG---ACTC-CAAAGAGGCAGTGAGTGGATGACCGCTGATGGGTtt
gi|22770 : ATGTCGATTTCTTTATG--GGCCC--TTAAATAGGCAGTGAAAGGATGACCTCTGAT----------------------C--AAATTCTACCCTTACTCT-----CAAA-CAGTCTAAGTGGTGTGACCTATATAGGAACCCTAAGTCGATTTCTATATA--G---ACTC-CAGAGAGGCAATGAGCGTATGGCCGTTGATGGAT
gi|22771 : tATGTCGATTTCTTTATG--GGCCC--C-AAATAGGGAGTGAAAGGGTGACTTCTGAT----------------------C--AAATTTTTCCCTTAGTCT-----CAAG-CAGTCTACGTGGTGTAACCGATATAG-AACCCTAAGTCGATTTCTATAGG--G---ACTC-CAAAAAGGCAGTGAGCGGATGACTGCTGATGGAT
gi|22772 : tATGTCGATTTCTTTATG--GGCCC--TTAAATAGGCAGTGAAAGGATGACCTCTGAT----------------C-----T--A-ATTCTACCCTAAGTCT-----CAAA-CAGTCTAAGTGGTGTGACCTATATAGGAATCCTAAGTCAATTTCTATATA--A---ACTC-CAAAAAGGCAGTAAGTGGATGACCGCTGATGGGTtt
gi|22773 : tGTCGATTTCTATATG--GATCA--C-AAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCACTGATATATT--TT-TT-TC-C-----A--AGACTCTACACTTAGTCT-----CAAG-CAAGCTACGtt
gi|22773 : taa--GGCCA--C-AAAGAGGCAGTGAGCTGATGATCACTGATGGATT--Taaagaggccacaaagaggcagtgagctgatgatcactgatggattt
gi|22774 : taagtcgatttctatatggatcacaaagaggcagtgagcggatgaccactgatatatttttttccaagactctacacttagtctcaagcaagctacgaaagaGTCGATTTCTTTATG--GACTC--C-AGAGAGGTAGTGAGCGGATGGTCGTTGATGGATC--CC-AC-CC-CT----T--AGATTCTACCTTTAGTCT-----CAAG-CAATTTACCCTATGT
gi|22775 : taaGTCGATTTCTATATG--GACCC--C-AAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCGCTGATGGATT--TC-TT-CC-C-----C--
gi|22776 : taaGTCGATTTCTTTATG--GACTC--C-AAAGAGGCAGTGAGCAGATGACCGCCGATGGATT--TC-TC-CC-C-----A--AGATTCTACCTTTAGTCT-----CAAAACAATCTACGTGATGTGACTAATATAGGAACCCTAAGTCGATTTCTATATG--G---ACTC-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATG
gi|22776 : aaTAAGTCGATTTCTATATGGACTCCAAAGAGGCAGTGAGCGGATGNNNNNNNNNNTCGATTTnnnnnnnnnntcgattt
gi|22777 : aagtcgatttctttatggactccaaagaggcagtgagcagatgaccgccgatggatttctccccaagattctacctttagtctcaaaacaatctacgtgatgtgactaatataggaacccGTCGATTTCTATATG--GACTC--C-AGAGAGACAGTGAGCGAATGGCTGCTAATGGATT--TC--C-CT-C-----C--AGATTCTACCTTTAGTTT-----TAAG-CAAGCTACGTGATGTGACCTATATATGAACCCAAAGTCGATTTCTTTATG--G---ACTC-CAAAGAGGCAGTGAGCAGATGACCGCCGATGGAT
gi|22778 : aaGTCGATTTCTATAAT--GATTC--C-AAAGAGGCAGTGAGCTGATGACCGCTGATGGATT--TC-TC-CC-C-----C--ATATTCTACCCTTTATCT-----CAAG-CAATCTACATGATGTGACCTATAAAGGAACCCTAAGTCGATTTCTTTATG--G---ACTC-CAGAGAGGTAGTGAGCGGATGGTCGTTGATGGATtt
gi|22779 : aaGTCGATTTCTATACG--GACTC--C-AAAGAGGCAGTGAGCAGATGACCGCTAATGGATT--TC-TC-CA-A-----C--AGATTCTACCCTGTGTCT-----CAAG-CAATCTACATGATGTGATCTATATAGGAACTCTAAGACGAATTCTATATG--G---ACTC-CAGAGAGGCAGTGAGGGGATGGCCGCTAATGGAT
gi|22780 : aGTCGATTTCAATATG--GACTC--C-AAAGAGGCAGTGAGGGGACGGCCGCTAATG-ATT--TC--C-CT-C-----C--AGATTCTATCTTTAGTCT-----CAAG-CAATCTACGTGATGTGACTAATAAAGGAACTCTAAGTCGATTTCTATATG--G---ACTC-CAAAGAGGCAGTGAGGGGATGGCCGCTAATGGATtt
gi|22781 : aGTCGATTTATATATG--GACTC--A-AAAGAGGCAGTGAGGGGATGGCCGCTGATGGATT--TC-TC-CC-C-----A--AGAGTCTACCCTTAGTCT-----CAAG-CAATCTACATGATGTGACCTATA----------AAGTCGATTTCTATATG--G---ACTC-CAGAGAGACAGTGAGCGAATGGCTGCTAATGGATtt
gi|22782 : aGTCGATTTCTATATG--GACCC--A-AAAGAGGCA-TGAGCGGATGACCGCTGGTGGATT--TC-TC-CC-C-----C--AGATTCTTCCTTTAGTCT-----CAAG-CAATCTACGTGATGTGACCTATATAGGAACCCTATGTCGATTTCTTTATG--G---GCCCTTAAATAGGCAGTGAAAGGATGACCTCTGATtt
gi|22783 : GTCGATTTCTATATG--GACCC--A-AAAGAGGCA-TGAGCGGATGACAGCTGGTGGATT--TC-TC-CC-C-----C--AGATTCTACCTTTAGTCT-----CCAG-CAATCTACGTGATGTGACCTATAGAGGATTCCTATGTCGATTTCTTTATG--G---GCCCTTAAATAGGCAGTGAAAGGATGACCTCTGAT
gi|22784 : GTTGATTTCTATATG--GACCC--A-AAAGAGGCA-TGAGCGGATGACCGCTGGTGGATT--TC-TC-CC-C-----C--AGATTCTACCTTTAGTCT-----CAAG-CAATCTACGTGATGTGACCTATA
gi|22785 : ACCC--C-AAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCGCTGATGGATT--TC-TT-CC-C-----C--AGATTCCACCTTTAGTCT-----CAAA-CAATCTACGTGATGTGACCTATATAGGAACCCTATGTCGATTTCTTTATG--G---GCCC-CAAATAGGGAGTGAAAGGGTGACTTCTGAT
gi|22786 : --C-AAAGAGGCAGTGAGCTGATGATCACTGATGGATT--TT-CC-TC-C-----A--AGATTCTACATGTAGTTT-----CAAA-CAAATTACGAGGTGTGACCTATATAGGAACCCTAAGTCGATTTCTATATG--G---ACCC-CAAAGAGGCAGTGAGCGGATGACCGCTGATGGAT
gi|22787 : GGATGGCCGCTAATGGATT--TC--C-CT-A-----C--AGATTCTACCTTTAGTCT-----CAAG-CAATCTACGTGATGCTACCAATATAGGAACCCTATGTCGATTTCTATATG--G---ATCA-CCAAGTGGCAGTCAGCGGATGACCACTGATGAATtt
gi|22788 : ATGTCGATGAATATATT--GACCC--A-AAAGAGGCGATGAGAGGATGGCCGCTGATGGATtt