lowQualScore                  :                                                                                                                                                     2222222222222222           11111111111111111111111111111111111                                                            111       11111                                        2222222222222222222222222222222222222222222222                                         1                          1                          1                    1    111111            
lowQualScore                  :                                                                                                111   1 111 2222222 55555555555555         0 22      4444444444444444  1111 111 66666666666666666666666666666666666  5555555555555 00  00  4444444444    44   00 44444     222 333   3   22222 0  0   3333333333 4444 222     3       5555555555555555555555555555555555555555555555         1   55  7777 1 1   1   888888   7 22     2  22  555    22  4  555555     4            1                    3    999999            
lowQualScore                  :                                                                                                ...   . ... ....... ..............         . ..      ................  .... ... ...................................  ............. ..  ..  ..........    ..   .. .....     ... ...   .   ..... .  .   .......... .... ...     .       ..............................................         .   ..  .... . .   .   ......   . ..     .  ..  ...    ..  .  ......     .            .                    .    ......            
lowQualScore                  :                                                                                                999   1 999 9999999 00000000000000         7 00      5555555555555555  4444 222 77777777777777777777777777777777777  8888888888888 88  88  1111111111    44   88 00000     999 444   4   44444 7  7   4444444444 7777 555     0       2222222222222222222222222222222222222222222222         2   66  6666 4 3   5   888888   6 22     2  66  888    99  7  888888     3            7                    2    666666            
consensus                     :                                                                             CCGGTGTAACATTAAATTT---TGA-C---C-------C--------------CGTTGAAAA-A--TGACCCCA---------A--GGGT----C---A------------T----------------------TT-------------T--TC--AA------C---GTTG--AAA--A---T-TGACC---C---GGG-TCA--CN-T-TT-CAA----------C----A---TTAAATTCTGATC-------AA-----A-A--CAG---CC-------------------GTTGAAAAC-TGA--CC----A-GTGTT-AAA------TTTTG--ATCAGACA--TGG--GGTC-CTTTTT------TAACGGTTTGTTAAATATAAGCAAAACATCACATGACTGATGTCGCAT--GTTGCAACAATT
Reference ( gi|94049 )        :                                                                             CCGGTGTAACATTAAATTT---TGA-C---C-------C--------------CGTTGAAAA-A--TGACCCCA---------A--GAGT----C---A------------T----------------------TT-------------T--TC--AA------T---GTTG--AAA--A---T-TGACC---C---GGG-TCA--CA-T-TT-CAA----------C----A---TTAAATTCTGATC-------AA-----A-A--CAG---CC-------------------GTTGAAAAC-TGA--TC----A-GTGTT-AAA------TTTGG--ATCAGACA--TGA--GGTC-CTTATT------TAACGATTTGTTAAATATTAGCAAAACATCACATGACTGCTGTCCCAG--GTTGCAACAATT
gi|94051                      :                                                                             CCGGTGTAACATTAAATTT---TGA-C---C-------C--------------CGTTGAAAA----TGAACCCA---------A--GGAT----C---A------------T----------------------TT-------------T--TC--AA------T---GTTG--AAA--A---T-GGACC---C---GGA-TCA--CA-T-TT-CAA----------C----A---TTAAATTCGGAAC-------AA-----A-A--CGG---TC-------------------GTTGAAAAC-TGA--TC----A-GTGTT-AAG------TTTTG--ATCAGACA--TGG--GGTC-CTTTTT------TAACGGTTTGTTAAATATATGCAAAACATCACATGACTGATGTCGCAT--GTTGTAACAATT
gi|94056                      :                                                                             CCGGTGTAACATTAAA--------A-C---C-------C--------------CGGTGAAAA-A--TGACCCCA---------A---------------------------T----------------------TT-------------T--TC--AA------T---GTTG--AAA--A---T-TGACC---C---GGA-TCT--CA-T-TT-CAA----------C----T---TTAAATTCTGATC-------AA-----A-A--CAG---TC-------------------GTTGAAAAC-TGA--TC----A-TTGTT-AAA------TTTTG--ATCAGACA--TTT--GGTC-CTT-TT------TAAGGGTTTGTTAAATATTAGCAAAACATCACATGACTGATGTCGCAT--GTTGCAACAATT
gi|94054                      :                                                                             CCGGTGTAGCATTAAATTT---TGA-T---C-------C--------------CGTTGAAAA-G--TGAGCTCA---------A--TGGT----C---A------------T----------------------TT-------------T--TC--AA------T---GTTG--AAA--A---T-TGACC---T---GGG-TCA--CT-T-TG-CAA----------C----A---TTAAATTCTGATC-------AA-----A-A--CAG---TT-------------------GTTGAAAAC-TGA--TC----A-GTGTT-AAA------TTTTG--ATCAGACA--TGG--GGTC-ATTTTT------TAACAGTTTGTTAAATACAAGCAAAACATCACATGACT------------GTTGCAACAATT
gi|94052                      :                                                                             CCGGTGTAACATAAAATTT---TGA-C---C-------T--------------CGTTAAAAA-A--AAAACCCT---------T--GGGT----C---A------------T----------------------TT-------------T--TC--AA------T---GTTG--AAA--A---T-TGAAC---C---GGG-TCA--AA-T-TT-CAA----------C----A---TTAAATTCTGATC-------AA-----A-A--TAG---CC-------------------ATTGAAAAC-TGA--TC----A-G-ATTAAAA------TTTTG--ACCAGACA--TGG--GGTC-CTTTTT------TAACAGTTTGTTAAATATTAGCGAAACATCACATGACTGATGTCGCAT--CTTTCAACAATT
gi|94058                      :                                                                             CCGGTGTTACATTAAATTT---TGA-C---C-------C--------------CGTTGAAAA-AACGGACCC------------------------------------------------------------------------------------AA------T---GGT----AA--A---T-TGACC---C---GAG-TCA--CA-T-TT-TAA----------C----A---TTAAATTCCAATC-------AA-----A-A--CAG---TC-------------------GTTGAATAC-TGA--TC----A-GTTTT-AAA------TATTG--ATCAGGCA--TGG--GGTC-CTTTTT------TAACGGTTTGTTAAATATAAGCAAAACATCACATGACTGATGTCGCAT--GTTGTAACAATT
gi|94059                      :                                                                             CCGGTGTAACATTAAATTT-----------------------------------------------TGACCC--------------------------------------------------------------------------------------------T---GTTG--AAC--A---T-TGACC---C---GGG-TCA--CT-T-TT-CAG----------C----A---TTAAAGTCTGATC-------AA-----A-A--CAG---TC-------------------GTTGAAAAC-TGA--TC----A-GTGTT-AAA------TTTTG--ATAAGACA--TGG--GGTC-CCTTTT------TAACCGTTTATTAAATATGAGCAAAACATCACATGACTGATGTCACAT--GTTGCAACAATT
gi|94060                      :                                                                             CCGTTGTAACATTAAATTT---TGA-C---C-------C--------------CGTTGAAAA-A--TGAACCCA---------A--GGGT----C---A------------T----------------------TT-------------T---C--AA------T---GTTG--AAA--A---T-TGACT---C---GGG-TCA--CA-T-TT-CAA----------C----A---TTAAATTCTAATC-------AA-----A-A--CAG---TC-------------------GTTGAAAAC-TGA--TC----A-GTGTT-ATA------TTTTG--ATCA----------------TTTA-T------TAACGGTTTGT
gi|94063                      :                                                                             CCGGTGTAACATTAAATTT---TGA-A---C-------C--------------CGTT
gi|94061                      :                                                                             CCGGTGTAACATTAAATGT---TGA-C---C-------C---------------GTTGAATA-A--TGACCCCA---------A--GGGT----C---A------------C----------------------AT-------------T--TC--AA------cacctgggtcacatttcaacattaaattctgatcaaaacagtcgttgaaaactgatcagtgttaagttttgatcagacatggggtcatttgtttactgtttgttgaatataagcaaaaggtaacatgactgatgtcgcatgttgcaacaatt
gi|94069                      :                                                                             CCGGTGTAACATTAAAAGT---TGA-C---C-------C-----------------TGAAAACAATTGACAC--------------GGGT----CACAA------------T----------------------TC-------------TTATC--AAAACAGTC---ATTG--AAA--A---C-TGAC-------------------------CAG----------T----G---TTAAATTTTGATC-------AG-----ACA--CGGTGTCC-------------------GTTaattaaattctgatcaaaatagtcgttgaaaactgatcagtgtttaattttgatctttttttaacagtttgttaaatacaagcaaaacattacatgactgatgtcgcatgttgcaacaat
gi|94070                      :                                                                             CCGGTGTAACATTAAATTT---TGA-C---C-------T--------------CGTTGAAAA-A--TGACCCCA---------A--GGGT----C---A------------T----------------------AT-------------T--TC--AA------T---GTTT--AAA--A---T-TGACC-------------------T-AT-AAG----------T----G---TTAAATTTTGATC-------AG-----A-ttaacggtttgttaaatataagcaaaacagcacatgacttatgtcaattattgcaacaat
gi|94073                      :                                                                             CCGGTGTAACATTAAACTT---TGATC---C-------C--------------CGTTGAAAA-T--TGACCC-----------A--G-GT----T---A------------C----------------------AT-------------T--TC--AG------C---ATT----AA--A---T-T-------C---TAA-TCA--AA----T-CAGT---------C----G---TTGAAAACTGATC-------AA-----catgaggtcttttttatcggtttgttaaatataagcaaaac
gi|94050                      :                                                                             CCGGTGTAACATAAAATTT---TGA-C---C-------C--------------CGTTGAAAA-A--TGACCCCA---------T--GGGT----C---A------------TATTTCAACGAATGAGTGATCCATT-------------T--TT--AA------C---GTTG--AAA--A---C-TGACC---C---CGA-T----CG-T-T--------------------A---TTTAA---TGACC-------CA-----A-T--CAC---AC-------------------GTGAAAAAT-TGA--CC----C-TCGTT-AAA------ATCTG--ATCAt
gi|94057                      :                                                                             CCGGTGTAACATTAAATTT---TGA-C---C-------C--------------CGTTGAAAA-A--TGACCCCA---------T--GGGT----C---A------------C----------------------AT-------------T--TC--AA------CA--GATG--AG---------TGATC---T-----A-T-------T-TT-CAA----------C----A---TTGAAAACTGACC-------
gi|94062                      :                                                                             CCGGTGTAACATTAAATTT---TGC-C---C-------C--------------TGTTAAAAA-T--CGACCCCA---------T--GGGT----C---A------------C----------------------TT-------------T-------A------T---AT----A----------TGACC---CCATGGG-TCA--CT-T-TT-CAA----------T----A---TGAG----TGATC-------CATTTCTA-A--CA--------------------------TTGAAAAC-TGA--CCCCG-A-CTGTT---A------TTT-A--ATGAGACA--
gi|94065                      :                                                                             CCGGTGTAACATTAAATTT---TGA-C---C-------C--------------CGTTCATAA-A--CGG----A---------T--GAGTGGTCC---A------------T----------------------TT-------------T--T---AA------C---ATTG--AAA--A---C-TGACC---C---CGA-CCGT-TA-T-TT-AAAAATTGACCTTC----G---TTAAAATCTGATC--------------A-C--CAA---CA-------------------GTTGGAAAC-TGA--CC----
gi|94064                      :                                                                             CCGGTGTAACATTAAATTT---TGA-C---C-------C--------------CGTTGAAAA-A--TGACCCCA---------T--TGGT----C---A------------C----------------------TT-------------T--TC--AA------C---G------GA--A---T-T-------------G-TCATCCATT-TT-TAA----------T----A---TTGAAAACTGACC-------
gi|94072                      :                                                                             CCGGTGTAACATTAAATTT---TGA-C---C-------C--------------TGTTGAAAA-A--TGACCCTA---------T--GGGT----C---T------------C----------------------TT-------------T--TC--AA------C---G--G--ATG--A---G-TGATC---T-----A-T-------T-TT-TAA----------C----A---TTGAAAACTGACC-------
gi|94074                      :                                                                             CCGGTGTAACATTAAATTT---TGA-C---C-------C--------------CGTTGAAAA-A--TGACCCCA---------A--G
gi|94071                      :                                                                             CCGATGTAACATTAAATTT---TGA-C---C-------C--------------CATTGAAAA-A--TGACCTT----------A--GGGT----T---A------------C----------------------TT-------------T--TA--AA------C---G--G--ATG--A---G-TGATC---C-----A-T-------T-TT-TAA----------C----A---TTGAAAACTGACC-------
gi|94053                      :                                                                             CCGGTGTAACATTAAATTT---TGA-A---C-------C--------------CGCTGTAAA-A--TTACCCCA---------T--GGGT----C---A------------C----------------------TT-------------T--TT--AA------C---G--G--AAG--T---T-TTATC---C---
gi|94055                      :                                                                             CCGGTGTAACTTTAAATTT---TGA-C---C-------C--------------CGTTGGAAA-A--TGATCCCA---------T--GGAT----C---A------------C----------------------TTGATGAGTGATCAAT--TCTTAA------C---ATTG--AAA--A---C-TGAC
gi|94067                      :                                                                             CCGGTGTAACATTAAATTT---TGA-C---C-------C--------------CGATGAAAA-A--TGATCAAA---------A--CAGT----C-------------------------------------------------------------------------GTTG--AAA--A---C-TGA
gi|94075                      :                                                                             CCAGTGTAACATTAAATAT---TGA-C---C-------C--------------CGATGAAAA-G--TGATCCAT---------G--GGGT----C---A------------TTGATGAGTGATCAA--------TT-------------T--TT--AA------C---ATTG--AAA--A---C-TGACC---C---CGA-C----CG-T-T--------------------A---TTTAA---TGACC-------TA-----C-C--CAT---AC-------------------G-TGAAAACTTGA--CC----C-TCGTT-AAA------ATCTG--ATCA
gi|94066                      :                                                                             CCGCTGTAACATTAAATTT---TGA-C---C-------C------------------------A--TG------------------GGGT----C---A------------T----------------------TT-------------T--TC--AA----------------AGG--A---T-TTAC---------GA-TC---CATT-TT-TAA----------C----A---TTAAAAACTGACC-------
gi|94068                      :                                                                             CCGGTGTATCATTAAATTT---TGA-C---C-------C--------------CAT------------------------------GGGT----C---A------------C----------------------TT-------------T--TC--AA------C---G--G--ATG--A---G-TGATC---C-----A-T-------T-TT-TAA----------C----A---TTGAA
gi|94076                      :                                                                                GTGTAACATTAAATTT---TGA-C---C-------C--------------CGTTGAAAA-A--TGACCCTA---------A--G---------------------------------------------------------------------------------GTTC--AAA--A---T-TGACC---T---AGG-TCA--CA-T-TT-CAA----------C----A---TTAAATTCTGATC-------AA-----A-A--CAG---TT-------------------GTTGAAAAC-TGA--TC----A-GTGTT-AAA------TTTTG--ATAGAAAA--TGG--GGTC-CTTTTT------TAACGGTTTGTTAGATATTAGCAAAACATCACATGACTACTGTCGCAT--GTTGCAACAATT
gi|94077                      :                                                                                  GTAACATTAAACTT---TGA-C---A-------C--------------CGTTGAAAA-A--TGACCCCA---------T--AGGT----C---A------------C----------------------TT-------------T--TC--AA------C---G--G--ATA--A---G-TGA--------------TA--CATT-TT-TAA----------C----A---TTGAAAACTGACC-------
gi|94052                      :                                                                                   TAATGTTGAAATT---TGA-C---C-------CGGTTCAATTTTCAACATTGAAAA-A--TGA-CCCA---------A--GGGT----T---T------------T----------------------TT-------------T--T
gi|94063                      :                                                     ccggtgtaacataaaattttgacctcgttaaAACATTAAATTC---TGA-T---CAAAACAGT--------------CGTTGAAAA-C--TGATCaattctgatcaaaatagccattgaaaactgatcagattaaaattttgaccagacatggggtccttttttaacagtttgttaaatattagcgaaacatcacatgactgatgtcgcatctttcaacaatt
gi|94064                      :                                      ccggtgtaacattaaattttgaacccgttcacctgggtcacatttcAATATTAAAAATGGATGA-CAATT-------C--------------CGTTGAAAA-G--TGACC--A---------ATGGGGT----C---A------------T----------------------TT-------------T--TC--AA------C---GGGGTCAAA--A---T-Tagtgttaagttttgatcagacatggggtcatttgtttactgtttgttgaatataagcaaaaggtaacatgactgatgtcgcatgttgcaacaatt
gi|94060                      :                                                                         ccggtgtaacattaATTAGAATT---TAA-T---------------------------GTTGAAAT-G--TGACCC--------------GAGT----C---A------------A----------------------TT-------------T--TC--AA------C---ATTG--AAA--A-----TGACC---CTT-GGGTTCA--TT-T-TT-CAA----------C----gaaaactgacc
gi|94078                      :                                                             ccgttgtaacattaaattttgaccccATTAGAATT---TAA-T---------------------------GTTGAAAT-G--TGACCC--------------GAGT----C---A------------A----------------------TT-------------T--TC--AA------C---ATTG--AAA--A-----TGACC---CTT-GGGTTCA--TT-T-TT-CAA----------C----caaaacagtcgttgaaaactgatcagtgttatattttgatcatttattaacggtttgt
gi|94080                      :                                                                                       ATTAAATTT---TGA-T---C-------C--------------CGTTGAAAA-G--TGAGCTCA---------A--TGGT----C---A------------T----------------------TT-------------T--TC--AA------T---GTTG--AAA--A---T-TGACC---T---GGG-TCA--CT-T-TG-CAA----------C----
gi|94070                      :                                                                                           AATTT---TAA-A---C-----------------------ATTGAAAT-A--TGACCCTT---------G--GGGT----C---A------------T----------------------TT-------------T--TC--AA------CGA-GGTC--AAA--A---T-T
gi|94079                      :                                                                             ccggtgtaacattaAATTT---T---C---A-------A--------------CATTGAAAA-A--TGACTCTT---------G--GGGT----C---A------------T----------------------TT-------------T--TC--AA------gacctataagtgttaaattttgatcagacatgaggtcttttttatcggtttgttaaatataagcaaaac
gi|94054                      :                                                                                        gttgaaatgtgacccgggtc-------C--------------TGTTAAAAA-A--TGACCCCA-------------------------------------------------------------T-------------G--TC----------T---GATC--AAA--AT--T-TAACA---C---TGA-TCA--GT-T-TT-CAA----------CA---A---CT--GTTTTGATC-------AG-----A-ATTTAA----T-------------------GTTGCAAAG-TGAC-CC----A-G-GTC-AAT------TTTc
gi|94076                      :                                             ccggtgtagcattaaattttgatcccgttgaaaagtgagctcaatggtcatttttcaatgttg-------C--------------CGTTAAAAA-A--GGACCCCA------------------------------------------------------------TT-------------T--TC----------T---ATCA--AAA--T---T-TAACA---C---TGA-TCA--GT-T-TT-CAA----------CA---A---CT--GTTTTGATC-------AG-----A-ATTTAA----T-------------------GTTGAAATG-TGA--CCT---A-G-GTC-AAT------TTTGA--AC----CT--TAG--GGTC-ATTTTT------CAACGtttgttaaatacaagcaaaacatcacatgactgttgcaacaatt
gi|94058                      :                                                                                      gtgtaacattaaattttgaccc-------C--------------CGTTAAAAA-A--GGACCCCA---------T--GCCT----G---A-----------------------------------------------------TC--AA------T---ATTT--AAA--A---C-TGATC---tttgttagatattagcaaaacatcacatgactactgtcgcatgttgcaacaatt
gi|94081                      : ccggtgttacattaaattttgaccccgttgaaaaaacggacccaatggtaaattgacccgagtcacattttaacattaaattccaatcaaaacagtcgttgaatact-------C--------------CGTTAAAAA-A--TGACCCCATGTATGATCA--AAGT----T---AAAAAAGATCTGTT----------------------TTGATCAGAA-----T--TT--AA------T---GTTG--AAA--T---G-TGACC---C---GGT-TCA--AT-T-TT-CAA----------C----A---TTGAAtttgttaaatataagcaaaacatcacatgactgatgtcgcatgttgtaacaatt
gi|94057                      :                                                                                                 aagggtcattt-------C--------------TGTTGAAAT-G--TGACCCAT---------G--GGGT----C---A------------T----------------------TT-------------T--TC--AA------C---GGGGTCAAA--A---T-Ttttgttaaatataagcgaaacatcacatgactgatgttgcatgttgcaacaatt
gi|94072                      :                                                                                              ccggtgtaacatta-------C--------------CGTTGAAAA-G--AGACCCAT---------A--GGGT----C---A------------T----------------------TT-------------T--TC--AA------CAG-GGTC--AAA--A---T-Tatgagtgatctattttcaacattgaaaactgacc
gi|94071                      :                                                                                              ccggtgtaacatta-------C--------------CGTTTAAAA-G--TAACCCTA---------A--G-GT----C---A------------T----------------------TT-------------T--TC--AA------T---GGGGTCAAA--A---T-Tatgagtgatctatttttaacattgaaaactgacc
gi|94077                      :                                                                                              ccgatgtaacatta-------C--------------CGTTGAAAA-G--TGACCTAT---------G--GGGT----C---A------------T----------------------TT-------------T--TC--AA------C---GGTGTCAAA--G---T-Tatgagtgatccatttttaacattgaaaactgacc
gi|94066                      :                                                                                                   gtaacatta-------C--------------CTTTGAAAA-A--TGACCCCA---------T--GGGT----C---A------------A----------------------AA-------------T--TT--AA------T---GTTataagtgatacatttttaacattgaaaactgacc
gi|94050                      :                                                                                                             ccgctgt--------------CGTTGAAAT-A--TGACCCAT---------G--GGGT----C---A------------T----------------------TT-------------T--TC--AA------C---GGGGTCAAA--A---T-Tatttacgatccatttttaacattaaaaactgacc
gi|94050                      :                                                                                                      ccggtgtaacataa--------------CGTT-AAAA-A--TG------------------GA-T----C---A------------C----------------------TCA------------T--TC--------------GTTG--AAA--T---A-TGACC---CATGGGG-TCA--TT-T-TT-CAA----------C----aatgagtgatccatttttaacgttgaaaactgaccccgatcgttatttaatgacccaatcacacgtgaaaaattgaccctcgttaaaatctgatca
gi|94051                      :                                                                                                         ccggtgtaacataaaattttgaccccGTTGAAAT-G--TGATCC--------------GGGT----C---C------------A----------------------TT-------------T--TC--AA------C---ATTG--AAA--A---A-TGATC---CTT-GGGTTCA--T--T-TT-CAA----------C----ttgaaaactgaccccgatcgttatttaatgacccaatcacacgtgaaaaattgaccctcgttaaaatctgatca
gi|94056                      :                                                                                                         ccggtgtaacattaaattttgaccccGTTGAAAT-G--AGATCC--------------GGGT----C---A------------A----------------------TT-------------T--TC--AA------C---ATTGA-AAA--A---T-TG----------GGG-TCA--TT-T-TT-CAattaaattcggaacaaaacggtcgttgaaaactgatcagtgttaagttttgatcagacatggggtccttttttaacggtttgttaaatatatgcaaaacatcacatgactgatgtcgcatgttgtaacaatt
gi|94054                      :                                                                                                            ccggtgtaacattaaaaccccggGTTGCAAA-G--TGACCC-----------A--G-GT----C---A------------A----------------------TT-------------T--TC--AA------C---ATTG--AAA--A---A-TGACCAT-T---GAGCTCA--CT-T-TT-CAA----------CGGG-A---TCAAAATTTAATtttaaattctgatcaaaacagtcgttgaaaactgatcattgttaaattttgatcagacatttggtcctttttaagggtttgttaaatattagcaaaacatcacatgactgatgtcgcatgttgcaacaatt
gi|94052                      :                                                                                                                         ccggtgtagcGTTGAAAT-T--TGACCC--------------GGTT----C---A------------A----------------------TT-------------T--TC--AA------C---ATTG--AAA--A---A-TGACC---CAA-GGG-Tattaaattctgatcaaaacagttgttgaaaactgatcagtgttaaattttgatcagacatggggtcattttttaacagtttgttaaatacaagcaaaacatcacatgactgttgcaacaatt
gi|94078                      :                                                                                             ccggtgtaacataaaattttgacctcgttaaaaaaaaaGTTGAAAA-A--TGAACCCA---------A--GGGT----C---A------------T----------------------TT-------------T---C--AA------T---GTTG--AAA--A---T-TGACT---C---GGG-TCA--CA-T-TT-CAA----------C----A---TTAAATTCTAATattaaattctgatcaaaatagccattgaaaactgatcagattaaaattttgaccagacatggggtccttttttaacagtttgttaaatattagcgaaacatcacatgactgatgtcgcatctttcaacaatt
gi|94079                      :                                                                                                                                   GTTGAAAA-A--TGACCCCA---------A--GAGT----C---A------------T----------------------TT-------------T--TC--AA------T---GTTG--AAA--A---T-TGACC---C---GGG-TCA--CA-T-TT-CAA----------C----
gi|94079                      :                                                                                                                                   GTTGAAAT-G--TGACCC--------------GGGT----C---A------------A----------------------TT-------------T--TC--AA------C---ATTG--AAA--A---A-TGACT---CTTGGGG-TCA--TT-T-TT-CAA----------C----
gi|94080                      :                                                                                                                                   GTTGCAAA-G--TGACCC-----------A--G-GT----C---A------------A----------------------TT-------------T--TC--AA------C---ATTG--AAA--A---A-TGACCAT-T---GAGCTCA--CT-T-TT-CAA----------CGGG-A---TCAAAATTTAAT
gi|94083                      :                                                                                                                                   GTTGAAAT-G--TGACCC--------------GGTT----C---A------------A----------------------TT-------------T--TC--AA------C---ATTG--AA
gi|94062                      :                                                                                                                              tttaatTTGAAAA-G--TGACCCAT---------G--GGGT----C---A------------T---------------------------------------------A------T---AT-----AA--A---G-TGACC---CATGGGG-TCG--AT-T-TT-TAA----------C----A---
gi|94081                      :                                                                                                                             ccggtgtaacattaaattttgccccA---------A--GGGT----C---A------------T----------------------TT-------------T--TC--AA------T---GTTG--AAA--A---T-TGAAC---C---GGG-TCA--CA-T-TT-CAA----------C----A---TTAAATTCTGATC-------AA-----A-A--CA------------------------------------GA--TC----T-TTTTT-AAC------TTT-G--ATCATACA--TGG--GGTC-ATTTTT------TAACGGTTTGTTAAATATAAGCGAAACATCACATGACTGATGTTGCAT--GTTGCAACAATTtatgagtgatccatttctaacattgaaaactgaccccgactgttatttaatgagaca
gi|94065                      :                                                                                                                                                                 --GGGT----C---A------------G----------------------TT-------------T--TC--AA------T---GTTA--AAA--A---T-GGACC---
gi|94075                      :                                                                                                                     ccggtgtaacattaaattttgaccccgttcataaacggatgagt--GGGT----C---A------------G----------------------TT-------------T--TC--AA------T---GTTA--AAA--A---T-TGATC---cgaccgttatttaaaaattgaccttcgttaaaatctgatcaccaacagttggaaactgacc
gi|94070                      :                                                                                                          ccagtgtaacattaaatattgaccccgatgaaaagtgatccatggggtcattgatgagtGT----C---A------------A----------------------TT-------------T--TA--AA------C---ATTG--AAA--T---A-TGACC---CTTGGGG-TCA--TT-T-TT-CAA----------C----cgaccgttatttaatgacctacccatacgtgaaaacttgaccctcgttaaaatctgatca
gi|94055                      :                                                                                                                                           ccggtgtaacattaaattttgacctcGT----C---A------------G----------------------TT-------------T--TC--AA------T---GTTA--AGA--A---T-TGATC---ctataagtgttaaattttgatcagacatgaggtcttttttatcggtttgttaaatataagcaaaac
gi|94077                      :                                                                                                          ccggtgtaactttaaattttgaccccgttggaaaatgatcccatggatcacttgatgagtT----C---A------------C----------------------TT-------------A--TC----------C---GTTG--AAA--A---G-TGACC---TATGGGG-TCA--TT-T-TT-CAA----------C----
gi|94051                      :                                                                                                                                                                                                gtaacattaaactttgacacc-------------T--TT--AA------T---GTTG--AAA--T---G-TGATC---C---GGG-TC---CA-T-TTTCAA----------C----A---TTGAAtacatttttaacattgaaaactgacc
gi|94052                      :                                                                                                                                                                 ccggtgtaacattaaattttgaccccgttgaaaatgaacccaaggatcattt-------------T--TT--AA------T---GTTG--AAA--T---T-TGACC---C---GGT-TCA--AT-T-TT-CAA----------C----A---TTGAAttcggaacaaaacggtcgttgaaaactgatcagtgttaagttttgatcagacatggggtccttttttaacggtttgttaaatatatgcaaaacatcacatgactgatgtcgcatgttgtaacaatt
gi|94058                      :                                                                                                                                                                ccggtgtaacataaaattttgacctcgttaaaaaaaaaacccttgggtcattt-------------T--TT--AA------T---GTT---AAA--A---TGTGACT---C---GGG-TCA---A-T-TT--AC----------C----A---TTttctgatcaaaatagccattgaaaactgatcagattaaaattttgaccagacatggggtccttttttaacagtttgttaaatattagcgaaacatcacatgactgatgtcgcatctttcaacaatt
gi|94059                      :                                                                                                                                                                          ccggtgttacattaaattttgaccccgttgaaaaaacggaccc-------------T--TT--AA------T---GCTG--AAA--A---G-TGACC---C---GGG-TCA---A-TGTT-CAA----------C----AGGGTCAAAATTTAATttccaatcaaaacagtcgttgaatactgatcagttttaaatattgatcaggcatggggtccttttttaacggtttgttaaatataagcaaaacatcacatgactgatgtcgcatgttgtaacaatt
gi|94063                      :                                                                                                                                                                                                           ccggtgtaac-------------T--TA--AA------T---TTTG--AACCCG---T-TCACC---T---GGG-TCA--CA-T-TT-CAA----------C----A---TTAAATTCTGATC-------AA-----A-A--CAG---TC-------------------GTTGAAAAC-TGA--TC----A-GTGTT-AAG------TTTTG--ATCAGACA--TGG--GGTCATTTGTT------T-ACTGTTTGTTGAATATAAGCAAAAGGTAACATGACTGATGTCGCAT--GTTGCAACAATTgtctgatcaaaacagtcgttgaaaactgatcagtgttaaattttgataagacatggggtccctttttaaccgtttattaaatatgagcaaaacatcacatgactgatgtcacatgttgcaacaatt
gi|94073                      :                                                                                                                                                                                                          ccggtgtaaca-------------T--TT--AA------T---GCTG--AAA--T---G-TAACC---T---GGG-TCA--AT-T-TT-CAA----------CGGGGA---TCAAAGTTTAAT
gi|94083                      :                                                                                                                                                                                                           ccggtgtaac-------------T--TC--AA------T---GTTG--AAA--A---T-TGAAC---C---GGG-TCA--CA-T-TT-CAA----------C----A---TTAAAttctaatcaaatcagtcgttgaaaactgatcaat
gi|94083                      :                                                                                                                                                                                                                     -------------T--TT--AA------T---GTTG--AAA--T---G-TGACC---C---GGT-TCA--AT-T-TT-CAA----------C----A---TTGAA
gi|94082                      :                                                                                                                                                                                                                     -------------T--TC--AA------T---GTTG--AAA--A---T-TGAAC---C---GGG-TCA--AA-T-TT-CAA----------C----A---TTAAA
gi|94082                      :                                                                                                                                                                                                                     -------------T--TT--AA------T---GTTG--AAA--T---T-TGACC---C---GGT-TCA--AT-T-TT-CAA----------C----A---TTGAA
gi|94064                      :                                                                                                                                                                                                                                      C--AA------TTCCGTTG--AAA--A---G-TGACCAATG---GGG-TCA--TT-T-TT-CAA----------C----
gi|94061                      :                                                                                                                                                                                                                        ccggtgtaacattaaattttgacccc---GTTG--AAT--A---A-TGACC---CCAAGGG-TCA--CA-T-TT-CAA----------A----A---TTAAATTCTGATC-------AA-----A-A--TAG---TC-------------------GTTGAAAAC-TGA--TC----A-GTGTT-TAA------TTT--------------TGA----TC-TTTTTT------TAACAGTTTGTTAAATACAAGCAAAACATTACATGACTGATGTCGCAT--GTTGCAACAATtcatccatttttaatattgaaaactgacc
gi|94084                      :                                                                                                                                                                                                                         ccggtgtaacattaaatgttgaccc---GTTG--AAA--A---T-TGACC---C---GAG-TCA--CA-T-TT-AAT----------C----A---TTAACTTCTGATC-------AA-----A-A--CGG---TC-------------------GTTGAAAAC-TGA--TC----A-GTGTT-AAA------TTT--------------TGA--G--C-ATTTTTAAAAAGTAACGGTTTGTTAAATATAAGCAAAACATCACATGGCTGATGTCGCAT--GTTGC
gi|94073                      :                                                                                                                                                                                                                                                  ---GTTG--AAA--A---T-TGACC---C---AGG-TTA--CA-T-TT-CAG----------C----A---TTAAATTCTAATC-------AA-----A-T--CAG---TC-------------------GTTGAAAAC-TGA--TC----A-AT
gi|94072                      :                                                                                                                                                                                                                       ccggtgtaacattaaactttgatcccc---GTTG--AAA--A---G-AGACC---CATAGGG-TCA--TT-T-TT-CAA----------C----AGGGTCAAAATTTAAT
gi|94069                      :                                                                                                                                                                                                                                             ccggtgtaacTG--AAA--ACAAT-TGACA---C---GGG-TCA--CA--------------------------------ATTCTTATC-------AA-----A-A--CAG---TC-------------------ATTGAAAAC-TGA--CC----A-GTGTT-AAA------TTTTG--ATCAGACA--CGG--TGTC-CGT-TT------TAACGGTTTGTTAAATATAAGCAAAACAGCACATGACTTATGT--CAATTATTGCAACAATggatgagtgatctatttttaacattgaaaactgacc
gi|94064                      :                                                                                                                                                                                                                                                          ccggtgtaacattaaaagttgacccGG-TCA--GT-T-TT-CAA----------T----A---TTAAAAATGGATG-------AC-----A-A--T-T---CC-------------------GTTGAAAAG-TGA--CC----A-ATG
gi|94061                      :                                                                                                                                                                                                                                                        ccggtgtaacattaaattttgaccccgttgaaaaatgacccT-CAA----------A----A---TTAAACACTGATC-------AGTTTTCA-A--CGA---CT-------------------ATT-----T-TGA--TC----A-GAATT-TAA------TTTTGAAATGTGACCCTTGG--GGTC-ATTATT------CAACG
gi|94070                      :                                                                                                                                                                                                                                                                            ccggtgtaacattaaatgttgaccAA----------C----A---TTAAATTTTGACCTCGTTGAAA-----A-A--TGA---CCCCAAGGGTCATATTTCAATGTTTAAAAT-TGA--CCTATAA-GTGTT-AAA------TTTTG--ATCAGACA--TGA--GGTC-TTT-TT------TATCGGTTTGTTAAATATAAGCAAAACtctttttttaacagtttgttaaatacaagcaaaacattacatgactgatgtcgcatgttgcaacaat
gi|94073                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                             ccggtgtAA----------C----A---TTAAACTTTGATC-------------------C-----CC-------------------GTTGAAAAT-TGAC-CC----A-G-GTT-ACA------TT------TCAG-CA--TTA--AATT-CTAATC------AAATCAGTCGTTGAA
gi|94057                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                             ccggtgtAA----------C----A---TTAAATTTTGACC-------------------------CC-------------------GTTGAAAAA-TGACCCC----ATGGGTC-ACA------TTTCA--A-CAG--A--TGA--Gaactgatcaat
gi|94064                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                             ccggtgtAA----------C----A---TTAAATTTTGACC-------------------------CC-------------------GTTGAAAAA-TGA--CC----tgatctattttcaacattgaaaactgacc
gi|94072                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                             ccggtgtAA----------C----A---TTAAATTTTGACC-------------------------CT-------------------GTTGAAAAA-TGA--CC----ccattggtcacttttcaacggaattgtcatccatttttaatattgaaaactgacc
gi|94074                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                             ccggtgtAA----------C----A---TTAAATTTTGACC-------------------------CC-------------------GTTGAAAAA-TGA--CC----ctatgggtctcttttcaacggatgagtgatctatttttaacattgaaaactgacc
gi|94071                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                             ccggtgtAA----------C----A---TTAAATTTTGACC-------------------------CC-------------------ATTGAAAAA-TGA--CCTT--A-GGGTT-ACT------TTTAA--A-CGG--A--TGAGTGATC-CATTTT------TAAC-ATTccaag
gi|94080                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ccgatgt----A---TTAAATTTTGATC-------------------------CC-------------------GTTGAAAAG-TGAGCTC----A-ATGgaaaactgacc
gi|94059                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                    gttgcaaagtgacccaggtcaattttcaacattgaaaaatgacTCTTATC-------AA-----A-A------------------------------TTTAACAC-TGA--TC----A-GTTTT-CAACGACTGTTTTG--ATCAGAC
gi|94063                      :                                                                                                                                                                                                                                                                 ccggtgtaacattaaattttgaccctgttgaacattgacccgggtcacttttcagcattaaaTCTGATC-------AA-----A-A--C---------------------------TT-AACAC-TGA--TC----A-GTTTT-CAACGACTGTTTTG--ATCAGAcatggggtccctttttaaccgtttattaaatatgagcaaaacatcacatgactgatgtcacatgttgcaacaatt
gi|94085                      :                                                                                                                                                                                                                                                                         ccggtgtaacattaaattttgaacccgttcacctgggtcacatttcaacattaaatTGATC-------AA-----A-A--CAG---TC-------------------GTTGAAAAC-TGA--TC----A-GTGTT-AAA------TTTTG--ATCAGACA--TGT--GGT--TTTATT------TAACGGTTTGTTAGATATAAGCAAAACATCACGTGACTGATTTCGCAT--GTTGCAACAATTcatggggtcatttgtttactgtttgttgaatataagcaaaaggtaacatgactgatgtcgcatgttgcaacaatt
gi|94067                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TGATC-------AA-----A-A--CAG---TC-------------------GTTGAAAAC-TGA--
gi|94086                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ccggtgtaacattaaattttgaccccgatgaaaaaTTTTT------TAACGGTTTGTTAAATACAAGCAAAACATCACATGACTGATGTCGAAT--GTTGCAACAA





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                      111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                         
lowQualScore                  :                                                               1   1   33 1   1  888888888888888888888888888888   11  111111111111111111111111 2      111 1  11    666 0     33      55555555555       3         44444     7          1   1 7777      2                       0   2  666666                                                            
lowQualScore                  :                                                               .   .   .. .   .  ..............................   ..  ........................ .      ... .  ..    ... .     ..      ...........       .         .....     .          .   . ....      .                       .   .  ......                                                            
lowQualScore                  :                                                               3   7   22 2   3  444444444444444444444444444444   77  888888888888888888888888 9      999 1  55    222 1     88      88888888888       6         55555     0          9   9 4444      1                       4   4  888888                                                            
consensus                     :                            CCGGTGTAACATTAAATTTTGACCCCGTTGAAAAA-TGACCCCAAG-GGT-CAC--------------TT-------------TTC--AA----------------------C-GTTGAAAA---T-TG--ACCC---GGGTCAC-NTTTCAA-----------CATTAAATTCTGATCAA-----AACAGTCGTTGAAAAC-TGATC----AGTGTT-AAATTTTGATCAGACATGGGGTCCTTT-TT------TAACGGTTTGTTAAATATAAGCAAAACATCACATGACTGATGTCGCATGTTGCAACAATT
Reference ( family-564 )      :                            CCGGTGTAACATTAAATTTTGACCCCGTTGAAAAA-TGACCCCAAG-GGT-CAT--------------TT-------------TTC--AA----------------------C-GTTGAAAA---T-TG--ACCC---GGGTCAC-NTTTCAA-----------CATTAAATTCTGATCAA-----AACAGCCGTTGAAAAC-TGACC----AGTGTT-AAATTTTGATCAGACATGGGGTCCTTT-TT------TAACGGTTTGTTAAATATAAGCAAAACATCACATGACTGATGTCGCATGTTGCAACAATT
gi|94049                      :                            CCGGTGTAACATTAAATTTTGACCCCGTTGAAAAA-TGACCCCAAG-AGT-CAT--------------TT-------------TTC--AA----------------------T-GTTGAAAA---T-TG--ACCC---GGGTCAC-ATTTCAA-----------CATTAAATTCTGATCAA-----AACAGCCGTTGAAAAC-TGATC----AGTGTT-AAATTTGGATCAGACATGAGGTCCTTA-TT------TAACGATTTGTTAAATATTAGCAAAACATCACATGACTGCTGTCCCAGGTTGCAACAATT
gi|94050                      :                            CCGGTGTAACATAAAATTTTGACCCCGTTGAAAAA-TGACCCCATG-GGT-CAT--------------AT-------------TTC--AACGAATGAGTGATCCATTTTTAAC-GTTGAAAA---C-TG--ACCC---CGAT--C-GTT----------------ATTTAA---TGACCCA-----ATCACACGTGAAAAAT-TGACC----CTCGTT-AAAATCTGATCA
gi|94051                      :                            CCGGTGTAACATTAAATTTTGACCCCGTTGAAAA--TGAACCCAAG-GAT-CAT--------------TT-------------TTC--AA----------------------T-GTTGAAAA---T-GG--ACCC---GGATCAC-ATTTCAA-----------CATTAAATTCGGAACAA-----AACGGTCGTTGAAAAC-TGATC----AGTGTT-AAGTTTTGATCAGACATGGGGTCCTTT-TT------TAACGGTTTGTTAAATATATGCAAAACATCACATGACTGATGTCGCATGTTGTAACAATT
gi|94052                      :                            CCGGTGTAACATAAAATTTTGACCTCGTTAAAAAA-AAAACCCTTG-GGT-CAT--------------TT-------------TTC--AA----------------------T-GTTGAAAA---T-TG--AACC---GGGTCAA-ATTTCAA-----------CATTAAATTCTGATCAA-----AATAGCCATTGAAAAC-TGATC----AG-ATTAAAATTTTGACCAGACATGGGGTCCTTT-TT------TAACAGTTTGTTAAATATTAGCGAAACATCACATGACTGATGTCGCATCTTTCAACAATT
gi|94053                      :                            CCGGTGTAACATTAAATTTTGAACCCGCTGTAAAA-TTACCCCATG-GGT-CAC--------------TT-------------TTT--AA----------------------C-G--GAAGT---T-TT--ATCC---
gi|94054                      :                            CCGGTGTAGCATTAAATTTTGATCCCGTTGAAAAG-TGAGCTCAAT-GGT-CAT--------------TT-------------TTC--AA----------------------T-GTTGAAAA---T-TG--ACCT---GGGTCAC-TTTGCAA-----------CATTAAATTCTGATCAA-----AACAGTTGTTGAAAAC-TGATC----AGTGTT-AAATTTTGATCAGACATGGGGTCATTT-TT------TAACAGTTTGTTAAATACAAGCAAAACATCACATGAC----------TGTTGCAACAATT
gi|94055                      :                            CCGGTGTAACTTTAAATTTTGACCCCGTTGGAAAA-TGATCCCATG-GAT-CAC--------------TTGATGAGTGATCAATTCTTAA----------------------C-ATTGAAAA---C-TG--AC
gi|94056                      :                            CCGGTGTAACATTAAA-----ACCCCGGTGAAAAA-TGACCCCAA--------T--------------TT-------------TTC--AA----------------------T-GTTGAAAA---T-TG--ACCC---GGATCTC-ATTTCAA-----------CTTTAAATTCTGATCAA-----AACAGTCGTTGAAAAC-TGATC----ATTGTT-AAATTTTGATCAGACATTTGGTCC-TT-TT------TAAGGGTTTGTTAAATATTAGCAAAACATCACATGACTGATGTCGCATGTTGCAACAATT
gi|94057                      :                            CCGGTGTAACATTAAATTTTGACCCCGTTGAAAAA-TGACCCCATG-GGT-CAC--------------AT-------------TTC--AA----------------------CAGATGAG-------TG--ATCT---A-------TTTTCAA-----------CATTGAAAACTGACC
gi|94058                      :                            CCGGTGTTACATTAAATTTTGACCCCGTTGAAAAAACGGACCCAAT-GGT---------------------------------------------------------------------AAA---T-TG--ACCC---GAGTCAC-ATTTTAA-----------CATTAAATTCCAATCAA-----AACAGTCGTTGAATAC-TGATC----AGTTTT-AAATATTGATCAGGCATGGGGTCCTTT-TT------TAACGGTTTGTTAAATATAAGCAAAACATCACATGACTGATGTCGCATGTTGTAACAATT
gi|94059                      :                            CCGGTGTAACATTAAA-TTT----------------TGACCCT-----------------------------------------------------------------------GTTGAACA---T-TG--ACCC---GGGTCAC-TTTTCAG-----------CATTAAAGTCTGATCAA-----AACAGTCGTTGAAAAC-TGATC----AGTGTT-AAATTTTGATAAGACATGGGGTCCCTT-TT------TAACCGTTTATTAAATATGAGCAAAACATCACATGACTGATGTCACATGTTGCAACAATT
gi|94060                      :                            CCGTTGTAACATTAAATTTTGACCCCGTTGAAAAA-TGAACCCAAG-GGT-CAT--------------TT-------------T-C--AA----------------------T-GTTGAAAA---T-TG--ACTC---GGGTCAC-ATTTCAA-----------CATTAAATTCTAATCAA-----AACAGTCGTTGAAAAC-TGATC----AGTGTT-ATATTTTGATCA------------TTT-AT------TAACGGTTTGT
gi|94061                      :                            CCGGTGTAACATTAAATGTTGACCC-GTTGAATAA-TGACCCCAAG-GGT-CAC--------------AT-------------TTC--AA----------------------
gi|94061                      :                                                                                                                      ----------------------C-GTTGAATA---A-TG--ACCCCAAGGGTCAC-ATTTCAA-----------AATTAAATTCTGATCAA-----AATAGTCGTTGAAAAC-TGATC----AGTGTT-TAATTTTGA------------TCTTTT-TT------TAACAGTTTGTTAAATACAAGCAAAACATTACATGACTGATGTCGCATGTTGCAACAATaattaaattctgatcaaaatagtcgttgaaaactgatcagtgtttaattttgatctttttttaacagtttgttaaatacaagcaaaacattacatgactgatgtcgcatgttgcaacaat
gi|94062                      :    ccggtgtaacattaaatgttgaccCCGGTGTAACATTAAATTTTGCCCCTGTTAAAAAT-CGACCCCATG-GGT-CAC--------------TT-------------T-----------------------------------ATA---TATG--ACCCCATGGGTCAC-TTTTCAA-----------TATGAG----TGATCCATTTCTAACA----TTGAAAAC-TGACCCCG-ACTGTT-A---TTTAATGAGACA
gi|94063                      :                            CCGGTGTAACATTAAATTTTGAACCCGTTCA---------CCT--G-GGT-CAC--------------AT-------------TTC--AA----------------------C-ATT
gi|94063                      :                                                                                                                                                      ---T-TC--ACCT---GGGTCAC-ATTTCAA-----------CATTAAATTCTGATCAA-----AACAGTCGTTGAAAAC-TGATC----AGTGTT-AAGTTTTGATCAGACATGGGGTCATTT-GT------TTACTGTTTGTTGAATATAAGCAAAAGGTAACATGACTGATGTCGCATGTTGCAACAATTaaattctgatcaaaacagtcgttgaaaactgatcagtgttaagttttgatcagacatggggtcatttgtttactgtttgttgaatataagcaaaaggtaacatgactgatgtcgcatgttgcaacaatt
gi|94064                      : ccggtgtaacattaaattttgaacccgCCGGTGTAACATTAAATTTTGACCCCGTTGAAAAA-TGACCCCATT-GGT-CAC--------------TT-------------TTC--AA----------------------C-G----GAA---T-TGTCATCC---A-------TTTTTAA-----------TATTGAAAACTGACC
gi|94065                      :                            CCGGTGTAACATTAAATTTTGACCCCGTTCATAAA-CGG--ATGAGTGGTCCAT--------------TT-------------TT---AA----------------------C-ATTGAAAA---C-TG--ACCC---CGACCGT-TATTTAAAAATTGACCTTCGTTAAAATCTGATC-------ACCAACAGTTGGAAAC-TGACC----
gi|94066                      :                            CCGCTGTAACATTAAATTTTGACCC---------A-TG-------G-GGT-CAT--------------TT-------------TTC--AA----------------------------AGGA---T-TT--AC------GATCCA-TTTTTAA-----------CATTAAAAACTGACC
gi|94067                      :                            CCGGTGTAACATTAAATTTTGACCCCGATGAAAAA-TGATCAAAAC-AGT--------------------------------------------------------------C-GTTGAAAA---C-TG--A
gi|94068                      :                            CCGGTGTATCATTAAATTTTGACCCCAT-----------------G-GGT-CAC--------------TT-------------TTC--AA----------------------C-G--GATGA---G-TG--ATCC---A-------TTTTTAA-----------CATTGAA
gi|94069                      :                            CCGGTGTAACATTAAAAGTTGACCC---TGAAAA
gi|94069                      :                                                                                                                                                TGAAAACAAT-TG--ACAC---GGGTCAC------------------------AATTCTTATCAA-----AACAGTCATTGAAAAC-TGACC----AGTGTT-AAATTTTGATCAGACACGGTGTCC-GT-TT------TAACGGTTTGTTAAATATAAGCAAAACAGCACATGACTTATGTCAATTATTGCAACAATcaattgacacgggtcacaattcttatcaaaacagtcattgaaaactgaccagtgttaaattttgatcagacacggtgtccgttttaacggtttgttaaatataagcaaaacagcacatgacttatgtcaattattgcaacaat
gi|94070                      :   ccggtgtaacattaaaagttgacccCCGGTGTAACATTAAATTTTGACCTCGTTGAAAAA-TGACCCCAAG-GGT-CAT--------------AT-------------TTC--AA----------------------T-GTTTAAAA---T-TG--ACC-------------TATAAG-----------TGTTAAATTTTGATCAG-----A
gi|94070                      :                                                                                                                      ----------------------C-GTTGAAAA---A-TG--ACCCCAAGGGTCAT-ATTTCAA-----------T----------------------------GTTTAAAAT-TGACCTATAAGTGTT-AAATTTTGATCAGACATGAGGT-CTTT-TT------TATCGGTTTGTTAAATATAAGCAAAACcatgaggtcttttttatcggtttgttaaatataagcaaaac
gi|94071                      :   ccggtgtaacattaaattttgacctCCGATGTAACATTAAATTTTGACCCCATTGAAAAA-TGACCTT-AG-GGT-TAC--------------TT-------------TTA--AA----------------------C-G--GATGA---G-TG--ATCC---A-------TTTTTAA-----------CATTGAAAACTGACC
gi|94072                      :                            CCGGTGTAACATTAAATTTTGACCCTGTTGAAAAA-TGACCCTATG-GGT-CTC--------------TT-------------TTC--AA----------------------C-G--GATGA---G-TG--ATCT---A-------TTTTTAA-----------CATTGAAAACTGACC
gi|94073                      :                            CCGGTGTAACATTAAACTT-----------------TGATCCC---------------------------------------------------------------------C-GTTGAAAA---T-TG--ACCC---AGGTTAC-ATTTCAG-----------CATTAAATTCTAATCAA-----ATCAGTCGTTGAAAAC-TGATC----AAT
gi|94074                      :                            CCGGTGTAACATTAAATTTTGACCCCGTTGAAAAA-TGACCCCAAG-
gi|94075                      :                            CCAGTGTAACATTAAATATTGACCCCGATGAAAAG-TGATCCATGG-GGT-CATTGATGAGTGATCAATT-------------TTT--AA----------------------C-ATTGAAAA---C-TG--ACCC---CG---AC-CGTT---------------ATTTAA---TGACCTA-----CCCATACG-TGAAAACTTGACC----CTCGTT-AAAATCTGATCA
gi|94076                      :                               GTGTAACATTAAATTTTGACCCCGTTGAAAAA-TGACCCTAAG-G-----------------------------------TTC--------------------------------AAAA---T-TG--ACCT---AGGTCAC-ATTTCAA-----------CATTAAATTCTGATCAA-----AACAGTTGTTGAAAAC-TGATC----AGTGTT-AAATTTTGATAGAAAATGGGGTCCTTT-TT------TAACGGTTTGTTAGATATTAGCAAAACATCACATGACTACTGTCGCATGTTGCAACAATT
gi|94077                      :                                 GTAACATTAAACTTTGACACCGTTGAAAAA-TGACCCCATA-GGT-CAC--------------TT-------------TTC--AA----------------------C-G--GATAA---G-TG--A----------TACATTTTTAA-----------CATTGAAAACTGACC
gi|94078                      :                                                      GTTGAAAAA-TGAACCCAAG-GGT-CAT--------------TT-------------T-C--AA----------------------T-GTTGAAAA---T-TG--ACTC---GGGTCAC-ATTTCAA-----------CATTAAATTCTAAT
gi|94079                      :                                                      GTTGAAAAA-TGACCCCAAG-AGT-CAT--------------TT-------------TTC--AA----------------------T-GTTGAAAA---T-TG--ACCC---GGGTCAC-ATTTCAA-----------C
gi|94080                      :                                      ATTAAATTTTGATCCCGTTGAAAAG-TGAGCTCAAT-GGT-CAT--------------TT-------------TTC--AA----------------------T-GTTGAAAA---T-TG--ACCT---GGGTCAC-TTTGCAA-----------C
gi|94081                      :                                                                       AAG-GGT-CAT--------------TT-------------TTC--AA----------------------T-GTTGAAAA---T-TG--AACC---GGGTCAC-ATTTCAA-----------CATTAAATTCTGATCAA-----AACAG--------ATC-T----------TTTT-TAACTTTGATCATACATGGGGTCATTT-TT------TAACGGTTTGTTAAATATAAGCGAAACATCACATGACTGATGTTGCATGTTGCAACAATT
gi|94082                      :                                                                                                  -------------TTC--AA----------------------T-GTTGAAAA---T-TG--AACC---GGGTCAA-ATTTCAA-----------CATTAAA
gi|94083                      :                                                                                                  -------------TTC--AA----------------------T-GTTGAAAA---T-TG--AACC---GGGTCAC-ATTTCAA-----------CATTAAA
gi|94084                      :                                                                                                                                             -GTTGAAAA---T-TG--ACCC---GAGTCAC-ATTTAAT-----------CATTAACTTCTGATCAA-----AACGGTCGTTGAAAAC-TGATC----AGTGTT-AAATTTTGAGCA------------TTT-TTAAAAAGTAACGGTTTGTTAAATATAAGCAAAACATCACATGGCTGATGTCGCATGTTGC
gi|94085                      :                                                                                                                                                                                                          TGATCAA-----AACAGTCGTTGAAAAC-TGATC----AGTGTT-AAATTTTGATCAGACATGTGGT--TTTATT------TAACGGTTTGTTAGATATAAGCAAAACATCACGTGACTGATTTCGCATGTTGCAACAATT
gi|94086                      :                                                                                                                                                                                                                                                                               TTT-TT------TAACGGTTTGTTAAATACAAGCAAAACATCACATGACTGATGTCGAATGTTGCAACAA





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                           111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                    
lowQualScore                  :                                                              1 33   1  7777777777777777 2     777777777777777777777   11  555555555555555555555555 2      111 1  11    444 0     44      55555555555       2        1 44444 1   3333 1 333          1     333  22    2            0          1   2  777777                                                            
lowQualScore                  :                                                              . ..   .  ................ .     .....................   ..  ........................ .      ... .  ..    ... .     ..      ...........       .        . ..... .   .... . ...          .     ...  ..    .            .          .   .  ......                                                            
lowQualScore                  :                                                              2 00   4  3333333333333333 4     333333333333333333333   66  111111111111111111111111 9      999 1  55    111 8     22      88888888888       7        8 55555 8   9999 8 222          9     333  88    1            4          1   5  222222                                                            
consensus                     :                            CCGGTGTAACATTAAATTTTGACCCCGTTGAAAA-A--TGACCC-------CA------AG-GGTCA-----CTT-------------TTC--AA----------------------C-GTTGAAAA---T-TG--ACCC---GGGTCAC-NTTTCAA-----------CATTAAATTCTGATCA-A-----A-ACA----G-T---CGTTGAAAAC-TGATC---AG--TGTT-AAATTTTGATCAGACATGGGGTCCTTT-TT------TAACGGTTTGTTAAATATAAGCAAAACATCACATGACTGATGTCGCATGTTGCAACAATT
Reference ( family-564 )      :                            CCGGTGTAACATTAAATTTTGACCCCGTTGAAAA-A--TGACCC-------CA------AG-GGTCA-----CTT-------------TTC--AA----------------------C-GTTGAAAA---T-TG--ACCC---GGGTCAC-NTTTCAA-----------CATTAAATTCTGATCA-A-----A-ACA----G-T---CGTTGAAAAC-TGATC---AG--TGTT-AAATTTTGATCAGACATGGGGTCCTTT-TT------TAACGGTTTGTTAAATATAAGCAAAACATCACATGACTGATGTCGCATGTTGCAACAATT
gi|94049                      :                            CCGGTGTAACATTAAATTTTGACCCCGTTGAAAA-A--TGACCC-------CA------AG-AGTCA-----TTT-------------TTC--AA----------------------T-GTTGAAAA---T-TG--ACCC---GGGTCAC-ATTTCAA-----------CATTAAATTCTGATCA-A-----A-ACA----G-C---CGTTGAAAAC-TGATC---AG--TGTT-AAATTTGGATCAGACATGAGGTCCTTA-TT------TAACGATTTGTTAAATATTAGCAAAACATCACATGACTGCTGTCCCAGGTTGCAACAATT
gi|94050                      :                            CCGGTGTAACATAAAATTTTGACCCCGTTGAAAA-A--TGACCC-------CA------TG-GGTCA-----TAT-------------TTC--AACGAATGAGTGATCCATTTTTAAC-GTTGAAAA---C-TG--ACCC---CGAT--C-GTT----------------ATTTAA---TGACCC-A-----A-TCA----C-A---CGTGAAAAAT-TGACC---CT--CGTT-AAAATCTGATCA
gi|94051                      :                            CCGGTGTAACATTAAATTTTGACCCCGTTGAAAA----TGAACC-------CA------AG-GATCA-----TTT-------------TTC--AA----------------------T-GTTGAAAA---T-GG--ACCC---GGATCAC-ATTTCAA-----------CATTAAATTCGGAACA-A-----A-ACG----G-T---CGTTGAAAAC-TGATC---AG--TGTT-AAGTTTTGATCAGACATGGGGTCCTTT-TT------TAACGGTTTGTTAAATATATGCAAAACATCACATGACTGATGTCGCATGTTGTAACAATT
gi|94052                      :                            CCGGTGTAACATAAAATTTTGACCTCGTTAAAAA-A--AAAACC-------CT------TG-GGTCA-----TTT-------------TTC--AA----------------------T-GTTGAAAA---T-TG--AACC---GGGTCAA-ATTTCAA-----------CATTAAATTCTGATCA-A-----A-ATA----G-C---CATTGAAAAC-TGATC---AG---ATTAAAATTTTGACCAGACATGGGGTCCTTT-TT------TAACAGTTTGTTAAATATTAGCGAAACATCACATGACTGATGTCGCATCTTTCAACAATT
gi|94053                      :                            CCGGTGTAACATTAAATTTTGAACCCGCTGTAAA-A--TTACCC-------CA------TG-GGTCA-----CTT-------------TTT--AA----------------------C-G--GAAGT---T-TT--ATCC---
gi|94054                      :                            CCGGTGTAGCATTAAATTTTGATCCCGTTGAAAA-G--TGAGCT-------CA------AT-GGTCA-----TTT-------------TTC--AA----------------------T-GTTGAAAA---T-TG--ACCT---GGGTCAC-TTTGCAA-----------CATTAAATTCTGATCA-A-----A-ACA----G-T---TGTTGAAAAC-TGATC---AG--TGTT-AAATTTTGATCAGACATGGGGTCATTT-TT------TAACAGTTTGTTAAATACAAGCAAAACATCACATGAC----------TGTTGCAACAATT
gi|94055                      :                            CCGGTGTAACTTTAAATTTTGACCCCGTTGGAAA-A--TGATCC-------CA------TG-GATCA-----CTTGATGAGTGATCAATTCTTAA----------------------C-ATTGAAAA---C-TG--AC
gi|94056                      :                            CCGGTGTAACATTAAA-----ACCCCGGTGAAAA-A--TGACCC-------CA------A------------TTT-------------TTC--AA----------------------T-GTTGAAAA---T-TG--ACCC---GGATCTC-ATTTCAA-----------CTTTAAATTCTGATCA-A-----A-ACA----G-T---CGTTGAAAAC-TGATC---AT--TGTT-AAATTTTGATCAGACATTTGGTCC-TT-TT------TAAGGGTTTGTTAAATATTAGCAAAACATCACATGACTGATGTCGCATGTTGCAACAATT
gi|94057                      :                            CCGGTGTAACATTAAATTTTGACCCCGTTGAAAA-A--TGACCC-------CA------TG-GGTCA-----CAT-------------TTC--AA----------------------CAGATGAG-------TG--ATCT---A-------TTTTCAA-----------CATTGAAAACTGACC
gi|94058                      :                            CCGGTGTTACATTAAATTTTGACCCCGTTGAAAA-AA-CGGACC-------CA------AT-GGT-----------------------------------------------------------AAA---T-TG--ACCC---GAGTCAC-ATTTTAA-----------CATTAAATTCCAATCA-A-----A-ACA----G-T---CGTTGAATAC-TGATC---AG--TTTT-AAATATTGATCAGGCATGGGGTCCTTT-TT------TAACGGTTTGTTAAATATAAGCAAAACATCACATGACTGATGTCGCATGTTGTAACAATT
gi|94059                      :                            CCGGTGTAACATTAAA-TTT------------------TGACCC-------T-------------------------------------------------------------------GTTGAACA---T-TG--ACCC---GGGTCAC-TTTTCAG-----------CATTAAAGTCTGATCA-A-----A-ACA----G-T---CGTTGAAAAC-TGATC---AG--TGTT-AAATTTTGATAAGACATGGGGTCCCTT-TT------TAACCGTTTATTAAATATGAGCAAAACATCACATGACTGATGTCACATGTTGCAACAATT
gi|94060                      :                            CCGTTGTAACATTAAATTTTGACCCCGTTGAAAA-A--TGAACC-------CA------AG-GGTCA------TT-------------TTC--AA----------------------T-GTTGAAAA---T-TG--ACTC---GGGTCAC-ATTTCAA-----------CATTAAATTCTAATCA-A-----A-ACA----G-T---CGTTGAAAAC-TGATC---AG--TGTT-ATATTTTGATCA------------TTT-AT------TAACGGTTTGT
gi|94061                      :                            CCGGTGTAACATTAAATGTTGACCC-GTTGAATA-A--TGACCC-------CA------AG-GGTCA-----CAT-------------TTC--AA----------------------
gi|94061                      :                                                                                                                           ----------------------C-GTTGAATA---A-TG--ACCCCAAGGGTCAC-ATTTCAA-----------AATTAAATTCTGATCA-A-----A-ATA----G-T---CGTTGAAAAC-TGATC---AG--TGTT-TAATTTTGA------------TCTTTT-TT------TAACAGTTTGTTAAATACAAGCAAAACATTACATGACTGATGTCGCATGTTGCAACAATaattaaattctgatcaaaatagtcgttgaaaactgatcagtgtttaattttgatctttttttaacagtttgttaaatacaagcaaaacattacatgactgatgtcgcatgttgcaacaat
gi|94062                      :    ccggtgtaacattaaatgttgaccCCGGTGTAACATTAAATTTTGCCCCTGTTAAAAA-T--CGACCC-------CA------TG-GGTCA-----CTT-------------T-----------------------------------ATA---TATG--ACCCCATGGGTCAC-TTTTCAA-----------TATGAG----TGATCC-ATTTCTA-ACA------------TTGAAAAC-TGACCCCGAC--TGTT-A---TTTAATGAGACA
gi|94063                      :                            CCGGTGTAACATTAAATTTTGAACCCGTTCA-----------CC-------T--------G-GGTCA-----CAT-------------TTC--AA----------------------C-ATT
gi|94063                      :                                                                                                                                                           ---T-TC--ACCT---GGGTCAC-ATTTCAA-----------CATTAAATTCTGATCA-A-----A-ACA----G-T---CGTTGAAAAC-TGATC---AG--TGTT-AAGTTTTGATCAGACATGGGGTCATTT-GT------TTACTGTTTGTTGAATATAAGCAAAAGGTAACATGACTGATGTCGCATGTTGCAACAATTaaattctgatcaaaacagtcgttgaaaactgatcagtgttaagttttgatcagacatggggtcatttgtttactgtttgttgaatataagcaaaaggtaacatgactgatgtcgcatgttgcaacaatt
gi|94064                      : ccggtgtaacattaaattttgaacccgCCGGTGTAACATTAAATTTTGACCCCGTTGAAAA-A--TGACCC-------CA------TT-GGTCA-----CTT-------------TTC--AA----------------------C-G----GAA---T-TGTCATCC---A-------TTTTTAA-----------TATTGAAAACTGACC
gi|94065                      :                            CCGGTGTAACATTAAATTTTGACCCCGTTCATAA-A--CGG--A-------TG------AGTGGTCC-----ATT-------------TTT--AA----------------------C-ATTGAAAA---C-TG--ACCC---CGACCGT-TATTTAAAAATTGACCTTCGTTAAAATCTGATCACC-----A-ACA-----------GTTGGAAAC-TGACC---
gi|94066                      :                            CCGCTGTAACATTAAATTTTGACCC----------A--TG--------------------G-GGTCA-----TTT-------------TTC--AA----------------------------AGGA---T-TT--AC------GATCCA-TTTTTAA-----------CATTAAAAACTGACC
gi|94067                      :                            CCGGTGTAACATTAAATTTTGACCCCGATGAAAA-A--TGATCA-------AA------AC-AGT----------------------------------------------------C-GTTGAAAA---C-TG--A
gi|94068                      :                            CCGGTGTATCATTAAATTTTGACCCCAT--------------------------------G-GGTCA-----CTT-------------TTC--AA----------------------C-G--GATGA---G-TG--ATCC---A-------TTTTTAA-----------CATTGAA
gi|94069                      :                            CCGGTGTAACATTAAAAGTTGACCC---TGAAAACAATTGACAC----------------G-GGTCACAATTCTT-------------ATC--AAAACAGT----------------C-ATTGAAAA---C-TG--AC-----------------CAG-----------TGTTAAATTTTGATCA-G-----ACACG----G-TGTCCGTT
gi|94069                      :                                                                                                                                                     TGAAAACAAT-TG--ACAC---GGGTCAC------------------------AATTCTTATCA-A-----A-ACA----G-T---CATTGAAAAC-TGACC---AG--TGTT-AAATTTTGATCAGACACGGTGTCC-GT-TT------TAACGGTTTGTTAAATATAAGCAAAACAGCACATGACTTATGTCAATTATTGCAACAATttaacggtttgttaaatataagcaaaacagcacatgacttatgtcaattattgcaacaat
gi|94070                      :   ccggtgtaacattaaaagttgacccCCGGTGTAACATTAAATTTTGACCTCGTTGAAAA-A--TGACCC-------CA------AG-GGTCA-----TAT-------------TTC--AA----------------------T-GTTTAAAA---T-TG--ACC-------------TATAAG-----------TGTTAAATTTTGATC--A-----G-ACATGAGG-T---CTTT-----T-TTATC---GGTTTGTT-AAAT
gi|94071                      :                            CCGATGTAACATTAAATTTTGACCCCATTGAAAA-A--TGACCT-------T-------AG-GGTTA-----CTT-------------TTA--AA----------------------C-G--GATGA---G-TG--ATCC---A-------TTTTTAA-----------CATTGAAAACTGACCataagcaaaac
gi|94072                      :                            CCGGTGTAACATTAAATTTTGACCCTGTTGAAAA-A--TGACCC-------TA------TG-GGTCT-----CTT-------------TTC--AA----------------------C-G--GATGA---G-TG--ATCT---A-------TTTTTAA-----------CATTGAAAACTGACC
gi|94073                      :                            CCGGTGTAACATTAAACTT-------------------TGATCC-------C-----------------------------------------------------------------C-GTTGAAAA---T-TG--ACCC---AGGTTAC-ATTTCAG-----------CATTAAATTCTAATCA-A-----A-TCA----G-T---CGTTGAAAAC-TGATC---AA--T
gi|94074                      :                            CCGGTGTAACATTAAATTTTGACCCCGTTGAAAA-A--TGACCC-------CA------AG-
gi|94075                      :                            CCAGTGTAACATTAAATATTGACCCCGATGAAAA-G--TGATCCATGGGGTCATTGATGAGTGATCA-----ATT-------------TTT--AA----------------------C-ATTGAAAA---C-TG--ACCC---CG---AC-CGTT---------------ATTTAA---TGACCT-A-----C-CCA----T-A---CG-TGAAAACTTGACC---CT--CGTT-AAAATCTGATCA
gi|94076                      :                               GTGTAACATTAAATTTTGACCCCGTTGAAAA-A--TGACCC-------TA------AG-G-------------------------TTC--------------------------------AAAA---T-TG--ACCT---AGGTCAC-ATTTCAA-----------CATTAAATTCTGATCA-A-----A-ACA----G-T---TGTTGAAAAC-TGATC---AG--TGTT-AAATTTTGATAGAAAATGGGGTCCTTT-TT------TAACGGTTTGTTAGATATTAGCAAAACATCACATGACTACTGTCGCATGTTGCAACAATT
gi|94077                      :                                 GTAACATTAAACTTTGACACCGTTGAAAA-A--TGACCC-------CA------TA-GGTCA-----CTT-------------TTC--AA----------------------C-G--GATAA---G-TG--A----------TACATTTTTAA-----------CATTGAAAACTGACC
gi|94078                      :                                                      GTTGAAAA-A--TGAACC-------CA------AG-GGTCA------TT-------------TTC--AA----------------------T-GTTGAAAA---T-TG--ACTC---GGGTCAC-ATTTCAA-----------CATTAAATTCTAAT
gi|94079                      :                                                      GTTGAAAA-A--TGACCC-------CA------AG-AGTCA-----TTT-------------TTC--AA----------------------T-GTTGAAAA---T-TG--ACCC---GGGTCAC-ATTTCAA-----------C
gi|94080                      :                                      ATTAAATTTTGATCCCGTTGAAAA-G--TGAGCT-------CA------AT-GGTCA-----TTT-------------TTC--AA----------------------T-GTTGAAAA---T-TG--ACCT---GGGTCAC-TTTGCAA-----------C
gi|94081                      :                                                                                A------AG-GGTCA-----TTT-------------TTC--AA----------------------T-GTTGAAAA---T-TG--AACC---GGGTCAC-ATTTCAA-----------CATTAAATTCTGATCA-A-----A-ACA----GAT---CTTT---------------------TT-TAACTTTGATCATACATGGGGTCATTT-TT------TAACGGTTTGTTAAATATAAGCGAAACATCACATGACTGATGTTGCATGTTGCAACAATT
gi|94082                      :                                                                                                       -------------TTC--AA----------------------T-GTTGAAAA---T-TG--AACC---GGGTCAA-ATTTCAA-----------CATTAAA
gi|94083                      :                                                                                                       -------------TTC--AA----------------------T-GTTGAAAA---T-TG--AACC---GGGTCAC-ATTTCAA-----------CATTAAA
gi|94084                      :                                                                                                                                                  -GTTGAAAA---T-TG--ACCC---GAGTCAC-ATTTAAT-----------CATTAACTTCTGATCA-A-----A-ACG----G-T---CGTTGAAAAC-TGATC---AG--TGTT-AAATTTTGAGCA------------TTT-TTAAAAAGTAACGGTTTGTTAAATATAAGCAAAACATCACATGGCTGATGTCGCATGTTGC
gi|94085                      :                                                                                                                                                                                                               TGATCA-A-----A-ACA----G-T---CGTTGAAAAC-TGATC---AG--TGTT-AAATTTTGATCAGACATGTGGT--TTTATT------TAACGGTTTGTTAGATATAAGCAAAACATCACGTGACTGATTTCGCATGTTGCAACAATT
gi|94086                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                               TTT-TT------TAACGGTTTGTTAAATACAAGCAAAACATCACATGACTGATGTCGAATGTTGCAACAA





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                           111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                    
lowQualScore                  :                                                              1 33   1  7777777777777777 2     777777777777777777777   11  555555555555555555555555 2      111 1  11    444 0     44      55555555555       2        1 44444 1   3333 1 333          1     333  22    2            0          1   2  777777                                                            
lowQualScore                  :                                                              . ..   .  ................ .     .....................   ..  ........................ .      ... .  ..    ... .     ..      ...........       .        . ..... .   .... . ...          .     ...  ..    .            .          .   .  ......                                                            
lowQualScore                  :                                                              2 00   4  3333333333333333 4     333333333333333333333   66  111111111111111111111111 9      999 1  55    111 8     22      88888888888       7        8 55555 8   9999 8 222          9     333  88    1            4          1   5  222222                                                            
consensus                     :                            CCGGTGTAACATTAAATTTTGACCCCGTTGAAAA-A--TGACCC-------CA------AG-GGTCA-----CTT-------------TTC--AA----------------------C-GTTGAAAA---T-TG--ACCC---GGGTCAC-NTTTCAA-----------CATTAAATTCTGATCA-A-----A-ACA----G-T---CGTTGAAAAC-TGATC---AG--TGTT-AAATTTTGATCAGACATGGGGTCCTTT-TT------TAACGGTTTGTTAAATATAAGCAAAACATCACATGACTGATGTCGCATGTTGCAACAATT
Reference ( family-564 )      :                            CCGGTGTAACATTAAATTTTGACCCCGTTGAAAA-A--TGACCC-------CA------AG-GGTCA-----CTT-------------TTC--AA----------------------C-GTTGAAAA---T-TG--ACCC---GGGTCAC-NTTTCAA-----------CATTAAATTCTGATCA-A-----A-ACA----G-T---CGTTGAAAAC-TGATC---AG--TGTT-AAATTTTGATCAGACATGGGGTCCTTT-TT------TAACGGTTTGTTAAATATAAGCAAAACATCACATGACTGATGTCGCATGTTGCAACAATT
gi|94049                      :                            CCGGTGTAACATTAAATTTTGACCCCGTTGAAAA-A--TGACCC-------CA------AG-AGTCA-----TTT-------------TTC--AA----------------------T-GTTGAAAA---T-TG--ACCC---GGGTCAC-ATTTCAA-----------CATTAAATTCTGATCA-A-----A-ACA----G-C---CGTTGAAAAC-TGATC---AG--TGTT-AAATTTGGATCAGACATGAGGTCCTTA-TT------TAACGATTTGTTAAATATTAGCAAAACATCACATGACTGCTGTCCCAGGTTGCAACAATT
gi|94050                      :                            CCGGTGTAACATAAAATTTTGACCCCGTTGAAAA-A--TGACCC-------CA------TG-GGTCA-----TAT-------------TTC--AACGAATGAGTGATCCATTTTTAAC-GTTGAAAA---C-TG--ACCC---CGAT--C-GTT----------------ATTTAA---TGACCC-A-----A-TCA----C-A---CGTGAAAAAT-TGACC---CT--CGTT-AAAATCTGATCA
gi|94051                      :                            CCGGTGTAACATTAAATTTTGACCCCGTTGAAAA----TGAACC-------CA------AG-GATCA-----TTT-------------TTC--AA----------------------T-GTTGAAAA---T-GG--ACCC---GGATCAC-ATTTCAA-----------CATTAAATTCGGAACA-A-----A-ACG----G-T---CGTTGAAAAC-TGATC---AG--TGTT-AAGTTTTGATCAGACATGGGGTCCTTT-TT------TAACGGTTTGTTAAATATATGCAAAACATCACATGACTGATGTCGCATGTTGTAACAATT
gi|94052                      :                            CCGGTGTAACATAAAATTTTGACCTCGTTAAAAA-A--AAAACC-------CT------TG-GGTCA-----TTT-------------TTC--AA----------------------T-GTTGAAAA---T-TG--AACC---GGGTCAA-ATTTCAA-----------CATTAAATTCTGATCA-A-----A-ATA----G-C---CATTGAAAAC-TGATC---AG---ATTAAAATTTTGACCAGACATGGGGTCCTTT-TT------TAACAGTTTGTTAAATATTAGCGAAACATCACATGACTGATGTCGCATCTTTCAACAATT
gi|94053                      :                            CCGGTGTAACATTAAATTTTGAACCCGCTGTAAA-A--TTACCC-------CA------TG-GGTCA-----CTT-------------TTT--AA----------------------C-G--GAAGT---T-TT--ATCC---
gi|94054                      :                            CCGGTGTAGCATTAAATTTTGATCCCGTTGAAAA-G--TGAGCT-------CA------AT-GGTCA-----TTT-------------TTC--AA----------------------T-GTTGAAAA---T-TG--ACCT---GGGTCAC-TTTGCAA-----------CATTAAATTCTGATCA-A-----A-ACA----G-T---TGTTGAAAAC-TGATC---AG--TGTT-AAATTTTGATCAGACATGGGGTCATTT-TT------TAACAGTTTGTTAAATACAAGCAAAACATCACATGAC----------TGTTGCAACAATT
gi|94055                      :                            CCGGTGTAACTTTAAATTTTGACCCCGTTGGAAA-A--TGATCC-------CA------TG-GATCA-----CTTGATGAGTGATCAATTCTTAA----------------------C-ATTGAAAA---C-TG--AC
gi|94056                      :                            CCGGTGTAACATTAAA-----ACCCCGGTGAAAA-A--TGACCC-------CA------A------------TTT-------------TTC--AA----------------------T-GTTGAAAA---T-TG--ACCC---GGATCTC-ATTTCAA-----------CTTTAAATTCTGATCA-A-----A-ACA----G-T---CGTTGAAAAC-TGATC---AT--TGTT-AAATTTTGATCAGACATTTGGTCC-TT-TT------TAAGGGTTTGTTAAATATTAGCAAAACATCACATGACTGATGTCGCATGTTGCAACAATT
gi|94057                      :                            CCGGTGTAACATTAAATTTTGACCCCGTTGAAAA-A--TGACCC-------CA------TG-GGTCA-----CAT-------------TTC--AA----------------------CAGATGAG-------TG--ATCT---A-------TTTTCAA-----------CATTGAAAACTGACC
gi|94058                      :                            CCGGTGTTACATTAAATTTTGACCCCGTTGAAAA-AA-CGGACC-------CA------AT-GGT-----------------------------------------------------------AAA---T-TG--ACCC---GAGTCAC-ATTTTAA-----------CATTAAATTCCAATCA-A-----A-ACA----G-T---CGTTGAATAC-TGATC---AG--TTTT-AAATATTGATCAGGCATGGGGTCCTTT-TT------TAACGGTTTGTTAAATATAAGCAAAACATCACATGACTGATGTCGCATGTTGTAACAATT
gi|94059                      :                            CCGGTGTAACATTAAA-TTT------------------TGACCC-------T-------------------------------------------------------------------GTTGAACA---T-TG--ACCC---GGGTCAC-TTTTCAG-----------CATTAAAGTCTGATCA-A-----A-ACA----G-T---CGTTGAAAAC-TGATC---AG--TGTT-AAATTTTGATAAGACATGGGGTCCCTT-TT------TAACCGTTTATTAAATATGAGCAAAACATCACATGACTGATGTCACATGTTGCAACAATT
gi|94060                      :                            CCGTTGTAACATTAAATTTTGACCCCGTTGAAAA-A--TGAACC-------CA------AG-GGTCA------TT-------------TTC--AA----------------------T-GTTGAAAA---T-TG--ACTC---GGGTCAC-ATTTCAA-----------CATTAAATTCTAATCA-A-----A-ACA----G-T---CGTTGAAAAC-TGATC---AG--TGTT-ATATTTTGATCA------------TTT-AT------TAACGGTTTGT
gi|94061                      :                            CCGGTGTAACATTAAATGTTGACCC-GTTGAATA-A--TGACCC-------CA------AG-GGTCA-----CAT-------------TTC--AA----------------------
gi|94061                      :                                                                                                                           ----------------------C-GTTGAATA---A-TG--ACCCCAAGGGTCAC-ATTTCAA-----------AATTAAATTCTGATCA-A-----A-ATA----G-T---CGTTGAAAAC-TGATC---AG--TGTT-TAATTTTGA------------TCTTTT-TT------TAACAGTTTGTTAAATACAAGCAAAACATTACATGACTGATGTCGCATGTTGCAACAATaattaaattctgatcaaaatagtcgttgaaaactgatcagtgtttaattttgatctttttttaacagtttgttaaatacaagcaaaacattacatgactgatgtcgcatgttgcaacaat
gi|94062                      :    ccggtgtaacattaaatgttgaccCCGGTGTAACATTAAATTTTGCCCCTGTTAAAAA-T--CGACCC-------CA------TG-GGTCA-----CTT-------------T-----------------------------------ATA---TATG--ACCCCATGGGTCAC-TTTTCAA-----------TATGAG----TGATCC-ATTTCTA-ACA------------TTGAAAAC-TGACCCCGAC--TGTT-A---TTTAATGAGACA
gi|94063                      :                            CCGGTGTAACATTAAATTTTGAACCCGTTCA-----------CC-------T--------G-GGTCA-----CAT-------------TTC--AA----------------------C-ATT
gi|94063                      :                                                                                                                                                           ---T-TC--ACCT---GGGTCAC-ATTTCAA-----------CATTAAATTCTGATCA-A-----A-ACA----G-T---CGTTGAAAAC-TGATC---AG--TGTT-AAGTTTTGATCAGACATGGGGTCATTT-GT------TTACTGTTTGTTGAATATAAGCAAAAGGTAACATGACTGATGTCGCATGTTGCAACAATTaaattctgatcaaaacagtcgttgaaaactgatcagtgttaagttttgatcagacatggggtcatttgtttactgtttgttgaatataagcaaaaggtaacatgactgatgtcgcatgttgcaacaatt
gi|94064                      : ccggtgtaacattaaattttgaacccgCCGGTGTAACATTAAATTTTGACCCCGTTGAAAA-A--TGACCC-------CA------TT-GGTCA-----CTT-------------TTC--AA----------------------C-G----GAA---T-TGTCATCC---A-------TTTTTAA-----------TATTGAAAACTGACC
gi|94065                      :                            CCGGTGTAACATTAAATTTTGACCCCGTTCATAA-A--CGG--A-------TG------AGTGGTCC-----ATT-------------TTT--AA----------------------C-ATTGAAAA---C-TG--ACCC---CGACCGT-TATTTAAAAATTGACCTTCGTTAAAATCTGATCACC-----A-ACA-----------GTTGGAAAC-TGACC---
gi|94066                      :                            CCGCTGTAACATTAAATTTTGACCC----------A--TG--------------------G-GGTCA-----TTT-------------TTC--AA----------------------------AGGA---T-TT--AC------GATCCA-TTTTTAA-----------CATTAAAAACTGACC
gi|94067                      :                            CCGGTGTAACATTAAATTTTGACCCCGATGAAAA-A--TGATCA-------AA------AC-AGT----------------------------------------------------C-GTTGAAAA---C-TG--A
gi|94068                      :                            CCGGTGTATCATTAAATTTTGACCCCAT--------------------------------G-GGTCA-----CTT-------------TTC--AA----------------------C-G--GATGA---G-TG--ATCC---A-------TTTTTAA-----------CATTGAA
gi|94069                      :                            CCGGTGTAACATTAAAAGTTGACCC---TGAAAACAATTGACAC----------------G-GGTCACAATTCTT-------------ATC--AAAACAGT----------------C-ATTGAAAA---C-TG--AC-----------------CAG-----------TGTTAAATTTTGATCA-G-----ACACG----G-TGTCCGTT
gi|94069                      :                                                                                                                                                     TGAAAACAAT-TG--ACAC---GGGTCAC------------------------AATTCTTATCA-A-----A-ACA----G-T---CATTGAAAAC-TGACC---AG--TGTT-AAATTTTGATCAGACACGGTGTCC-GT-TT------TAACGGTTTGTTAAATATAAGCAAAACAGCACATGACTTATGTCAATTATTGCAACAATttaacggtttgttaaatataagcaaaacagcacatgacttatgtcaattattgcaacaat
gi|94070                      :   ccggtgtaacattaaaagttgacccCCGGTGTAACATTAAATTTTGACCTCGTTGAAAA-A--TGACCC-------CA------AG-GGTCA-----TAT-------------TTC--AA----------------------T-GTTTAAAA---T-TG--ACC-------------TATAAG-----------TGTTAAATTTTGATC--A-----G-ACATGAGG-T---CTTT-----T-TTATC---GGTTTGTT-AAAT
gi|94071                      :                            CCGATGTAACATTAAATTTTGACCCCATTGAAAA-A--TGACCT-------T-------AG-GGTTA-----CTT-------------TTA--AA----------------------C-G--GATGA---G-TG--ATCC---A-------TTTTTAA-----------CATTGAAAACTGACCataagcaaaac
gi|94072                      :                            CCGGTGTAACATTAAATTTTGACCCTGTTGAAAA-A--TGACCC-------TA------TG-GGTCT-----CTT-------------TTC--AA----------------------C-G--GATGA---G-TG--ATCT---A-------TTTTTAA-----------CATTGAAAACTGACC
gi|94073                      :                            CCGGTGTAACATTAAACTT-------------------TGATCC-------C-----------------------------------------------------------------C-GTTGAAAA---T-TG--ACCC---AGGTTAC-ATTTCAG-----------CATTAAATTCTAATCA-A-----A-TCA----G-T---CGTTGAAAAC-TGATC---AA--T
gi|94074                      :                            CCGGTGTAACATTAAATTTTGACCCCGTTGAAAA-A--TGACCC-------CA------AG-
gi|94075                      :                            CCAGTGTAACATTAAATATTGACCCCGATGAAAA-G--TGATCCATGGGGTCATTGATGAGTGATCA-----ATT-------------TTT--AA----------------------C-ATTGAAAA---C-TG--ACCC---CG---AC-CGTT---------------ATTTAA---TGACCT-A-----C-CCA----T-A---CG-TGAAAACTTGACC---CT--CGTT-AAAATCTGATCA
gi|94076                      :                               GTGTAACATTAAATTTTGACCCCGTTGAAAA-A--TGACCC-------TA------AG-G-------------------------TTC--------------------------------AAAA---T-TG--ACCT---AGGTCAC-ATTTCAA-----------CATTAAATTCTGATCA-A-----A-ACA----G-T---TGTTGAAAAC-TGATC---AG--TGTT-AAATTTTGATAGAAAATGGGGTCCTTT-TT------TAACGGTTTGTTAGATATTAGCAAAACATCACATGACTACTGTCGCATGTTGCAACAATT
gi|94077                      :                                 GTAACATTAAACTTTGACACCGTTGAAAA-A--TGACCC-------CA------TA-GGTCA-----CTT-------------TTC--AA----------------------C-G--GATAA---G-TG--A----------TACATTTTTAA-----------CATTGAAAACTGACC
gi|94078                      :                                                      GTTGAAAA-A--TGAACC-------CA------AG-GGTCA------TT-------------TTC--AA----------------------T-GTTGAAAA---T-TG--ACTC---GGGTCAC-ATTTCAA-----------CATTAAATTCTAAT
gi|94079                      :                                                      GTTGAAAA-A--TGACCC-------CA------AG-AGTCA-----TTT-------------TTC--AA----------------------T-GTTGAAAA---T-TG--ACCC---GGGTCAC-ATTTCAA-----------C
gi|94080                      :                                      ATTAAATTTTGATCCCGTTGAAAA-G--TGAGCT-------CA------AT-GGTCA-----TTT-------------TTC--AA----------------------T-GTTGAAAA---T-TG--ACCT---GGGTCAC-TTTGCAA-----------C
gi|94081                      :                                                                                A------AG-GGTCA-----TTT-------------TTC--AA----------------------T-GTTGAAAA---T-TG--AACC---GGGTCAC-ATTTCAA-----------CATTAAATTCTGATCA-A-----A-ACA----GAT---CTTT---------------------TT-TAACTTTGATCATACATGGGGTCATTT-TT------TAACGGTTTGTTAAATATAAGCGAAACATCACATGACTGATGTTGCATGTTGCAACAATT
gi|94082                      :                                                                                                       -------------TTC--AA----------------------T-GTTGAAAA---T-TG--AACC---GGGTCAA-ATTTCAA-----------CATTAAA
gi|94083                      :                                                                                                       -------------TTC--AA----------------------T-GTTGAAAA---T-TG--AACC---GGGTCAC-ATTTCAA-----------CATTAAA
gi|94084                      :                                                                                                                                                  -GTTGAAAA---T-TG--ACCC---GAGTCAC-ATTTAAT-----------CATTAACTTCTGATCA-A-----A-ACG----G-T---CGTTGAAAAC-TGATC---AG--TGTT-AAATTTTGAGCA------------TTT-TTAAAAAGTAACGGTTTGTTAAATATAAGCAAAACATCACATGGCTGATGTCGCATGTTGC
gi|94085                      :                                                                                                                                                                                                               TGATCA-A-----A-ACA----G-T---CGTTGAAAAC-TGATC---AG--TGTT-AAATTTTGATCAGACATGTGGT--TTTATT------TAACGGTTTGTTAGATATAAGCAAAACATCACGTGACTGATTTCGCATGTTGCAACAATT
gi|94086                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                               TTT-TT------TAACGGTTTGTTAAATACAAGCAAAACATCACATGACTGATGTCGAATGTTGCAACAA


blockSeqs                     :                                                              C AT   C  ATGGGGTCATTGATGA T     CTTGATGAGTGATCAA        TT  CGAATGAGTGATCCATTTTTAAC  T      CAA A  TC    CAA       AT      AAATTGACCTT       T        C TTTCT C   TGAG A GTC          T     CCG  TT    A                       C   A  AAAAAG
blockSeqs                     :                                                              . A    A  CAT              T     CAATTCTT                .   AACAGTC                  T      .   .  .     CAT       G       .                 T        . .     .   .    . .            .     .    .     .                       C   .  .     
blockSeqs                     :                                                              . .    A  CAA              .     TAT                     .   CA                       T      .   .  .     .         A       .                 T        . .     .   .    . .            .     .    .     .                       A   .  .     
blockSeqs                     :                                                              . .    C  CTT              .     TTT                     .   T                        T      .   .  .     .         A       .                 T        . .     .   .    . .            .     .    .     .                       C   .  .     
blockSeqs                     :                                                              . .    G  CAT              .     TTT                     .   T                        T      .   .  .     .         T       .                 A        . .     .   .    . .            .     .    .     .                       C   .  .     
blockSeqs                     :                                                              . .    T  CAA              .     CTT                     .   C                        T      .   .  .     .         A       .                 T        . .     .   .    . .            .     .    .     .                       C   .  .     
blockSeqs                     :                                                              . .    C  CAT              .     TTT                     .   T                        A      .   .  .     .         T       .                 G        . .     .   .    . .            .     .    .     .                       T   .  .     
blockSeqs                     :                                                              . .    C  CAA              .     TTT                     .   C                        T      .   .  .     .         A       .                 T        . .     .   .    . .            .     .    .     .                       A   .  .     
blockSeqs                     :                                                              . .    A  CAT              .     CAT                     .   T                        T      .   .  .     .         T       .                 T        . .     .   .    . .            .     .    .     .                       C   .  .     
blockSeqs                     :                                                              . .    C  CAA              .     CAT                     .   T                        T      .   .  .     .         A       .                 T        . .     .   .    . .            .     .    .     .                       C   .  .     
blockSeqs                     :                                                              . .    A  CAA              .     CTT                     .   C                        T      .   .  .     .         A       .                 A        . .     .   .    . .            .     .    .     .                       A   .  .     
blockSeqs                     :                                                              . .    C  CAA              .     CAT                     .   C                        T      .   .  .     .         T       .                 A        . .     .   .    . .            .     .    .     .                       .   .  .     
blockSeqs                     :                                                              . .    C  CAT              .     CTT                     .   C                        T      .   .  .     .         A       .                 A        . .     .   .    . .            .     .    .     .                       .   .  .     
blockSeqs                     :                                                              . .    C  CAT              .     ATT                     .   C                        T      .   .  .     .         T       .                 T        . .     .   .    . .            .     .    .     .                       .   .  .     
blockSeqs                     :                                                              . .    T  TGA              .     TTT                     .   C                        T      .   .  .     .         T       .                 T        . .     .   .    . .            .     .    .     .                           .  .     
blockSeqs                     :                                                              . .    C  AAA              .     CTT                     .   C                        T      .   .  .     .         T       .                 T        . .     .   .    . .            .     .    .     .                                    
blockSeqs                     :                                                              . .    C  CAA              .     TAT                     .   T                        T      .   .  .     .         T       .                 A        . .     .   .    . .            .     .    .     .                                    
blockSeqs                     :                                                              . .    C  TAT              .     CTT                     .   C                        T      .   .  .     .         T       .                 A        . .     .   .    . .            .     .    .     .                                    
blockSeqs                     :                                                              . .    C  CAA              .     CTT                     .   C                        T      .   .  .     .         T       .                 T        . .     .   .    . .            .     .    .                                          
blockSeqs                     :                                                              . .    T  TAA              .     ATT                     .   C                        T      .   .  .     .         A       .                 T        . .     .   .    . .            .     .                                               
blockSeqs                     :                                                              . .    C  CAT              .     CTT                     .   C                        T      .   .  .     .         C       .                 A        . .     .   .    . .                                                                  
blockSeqs                     :                                                              . .    T  CAA              .     TTT                     .   C                        T      .   .  .     .         A       .                 T                                                                                              
blockSeqs                     :                                                              . .    C  CAA              .     TTT                     .   T                        T      .   .  .     .         A       .                 T                                                                                              
blockSeqs                     :                                                              . .    C  CAA              .     TTT                     .   T                        T      .   .  .     .         A       .                 T                                                                                              
blockSeqs                     :                                                              . .    A  TA               .     TT                      .   T                        .      .   .  .     .         T       .                 .                                                                                              
blockSeqs                     :                                                              . .    C  T                .     TT                      .   T                        .      .   .  .     .         A       .                 .                                                                                              
blockSeqs                     :                                                              . .    G  T                .     .                       .   T                        .      .   .  .     .         A       .                 .                                                                                              
blockSeqs                     :                                                              . .    .  C                .     .                       .   T                        .      .   .  .     .         A       .                                                                                                                
blockSeqs                     :                                                              . .    .  .                .     .                       .   .                        .      .   .  .     .         A       .                                                                                                                
blockSeqs                     :                                                              . .    .  .                .     .                       .   .                        .      .   .  .     .         .       .                                                                                                                
blockSeqs                     :                                                              . .    .  .                .     .                       .   .                        .      .   .  .     .         .       .                                                                                                                
blockSeqs                     :                                                                                         .                             .   .                        .      .   .  .     .         .       .                                                                                                                
blockSeqs                     :                                                                                                                       .   .                        .      .   .  .     .                                                                                                                                  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                    .      .   .  .                                                                                                                                        
blockSeqs                     :                                                                                                                                                           .   .  .                                                                                                                                        


blockSeqCons                  :                            
originalCons                  :                            CCGGTGTAACATTAAATTTTGACCCCGTTGAAAA-A--TGACCC-------CA------AG-GGTCA-----CTT-------------TTC--AA----------------------C-GTTGAAAA---T-TG--ACCC---GGGTCAC-NTTTCAA-----------CATTAAATTCTGATCA-A-----A-ACA----G-T---CGTTGAAAAC-TGATC---AG--TGTT-AAATTTTGATCAGACATGGGGTCCTTT-TT------TAACGGTTTGTTAAATATAAGCAAAACATCACATGACTGATGTCGCATGTTGCAACAATT
finalCons                     :                            CCGGTGTAACATTAAATTTTGACCCCGTTGAAAA-A--TGACCC-------CA------AG-GGTCA-----CTT-------------TTC--AA----------------------C-GTTGAAAA---T-TG--ACCC---GGGTCAC-NTTTCAA-----------CATTAAATTCTGATCA-A-----A-ACA----G-T---CGTTGAAAAC-TGATC---AG--TGTT-AAATTTTGATCAGACATGGGGTCCTTT-TT------TAACGGTTTGTTAAATATAAGCAAAACATCACATGACTGATGTCGCATGTTGCAACAATT





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                           111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                    
lowQualScore                  :                                                              1 33   1  7777777777777777 2     777777777777777777777   11  555555555555555555555555 2      111 1  11    444 0     44      55555555555       2        1 44444 1   3333 1 333          1     333  22    2            0          1   2  777777                                                            
lowQualScore                  :                                                              . ..   .  ................ .     .....................   ..  ........................ .      ... .  ..    ... .     ..      ...........       .        . ..... .   .... . ...          .     ...  ..    .            .          .   .  ......                                                            
lowQualScore                  :                                                              2 00   4  3333333333333333 4     333333333333333333333   66  111111111111111111111111 9      999 1  55    111 8     22      88888888888       7        8 55555 8   9999 8 222          9     333  88    1            4          1   5  222222                                                            
consensus                     :                            CCGGTGTAACATTAAATTTTGACCCCGTTGAAAA-A--TGACCC-------CA------AG-GGTCA-----CTT-------------TTC--AA----------------------C-GTTGAAAA---T-TG--ACCC---GGGTCAC-NTTTCAA-----------CATTAAATTCTGATCA-A-----A-ACA----G-T---CGTTGAAAAC-TGATC---AG--TGTT-AAATTTTGATCAGACATGGGGTCCTTT-TT------TAACGGTTTGTTAAATATAAGCAAAACATCACATGACTGATGTCGCATGTTGCAACAATT
Reference ( family-564 )      :                            CCGGTGTAACATTAAATTTTGACCCCGTTGAAAA-A--TGACCC-------CA------AG-GGTCA-----CTT-------------TTC--AA----------------------C-GTTGAAAA---T-TG--ACCC---GGGTCAC-NTTTCAA-----------CATTAAATTCTGATCA-A-----A-ACA----G-T---CGTTGAAAAC-TGATC---AG--TGTT-AAATTTTGATCAGACATGGGGTCCTTT-TT------TAACGGTTTGTTAAATATAAGCAAAACATCACATGACTGATGTCGCATGTTGCAACAATT
gi|94049                      :                            CCGGTGTAACATTAAATTTTGACCCCGTTGAAAA-A--TGACCC-------CA------AG-AGTCA-----TTT-------------TTC--AA----------------------T-GTTGAAAA---T-TG--ACCC---GGGTCAC-ATTTCAA-----------CATTAAATTCTGATCA-A-----A-ACA----G-C---CGTTGAAAAC-TGATC---AG--TGTT-AAATTTGGATCAGACATGAGGTCCTTA-TT------TAACGATTTGTTAAATATTAGCAAAACATCACATGACTGCTGTCCCAGGTTGCAACAATT
gi|94050                      :                            CCGGTGTAACATAAAATTTTGACCCCGTTGAAAA-A--TGACCC-------CA------TG-GGTCA-----TAT-------------TTC--AACGAATGAGTGATCCATTTTTAAC-GTTGAAAA---C-TG--ACCC---CGAT--C-GTT----------------ATTTAA---TGACCC-A-----A-TCA----C-A---CGTGAAAAAT-TGACC---CT--CGTT-AAAATCTGATCA
gi|94051                      :                            CCGGTGTAACATTAAATTTTGACCCCGTTGAAAA----TGAACC-------CA------AG-GATCA-----TTT-------------TTC--AA----------------------T-GTTGAAAA---T-GG--ACCC---GGATCAC-ATTTCAA-----------CATTAAATTCGGAACA-A-----A-ACG----G-T---CGTTGAAAAC-TGATC---AG--TGTT-AAGTTTTGATCAGACATGGGGTCCTTT-TT------TAACGGTTTGTTAAATATATGCAAAACATCACATGACTGATGTCGCATGTTGTAACAATT
gi|94052                      :                            CCGGTGTAACATAAAATTTTGACCTCGTTAAAAA-A--AAAACC-------CT------TG-GGTCA-----TTT-------------TTC--AA----------------------T-GTTGAAAA---T-TG--AACC---GGGTCAA-ATTTCAA-----------CATTAAATTCTGATCA-A-----A-ATA----G-C---CATTGAAAAC-TGATC---AG---ATTAAAATTTTGACCAGACATGGGGTCCTTT-TT------TAACAGTTTGTTAAATATTAGCGAAACATCACATGACTGATGTCGCATCTTTCAACAATT
gi|94053                      :                            CCGGTGTAACATTAAATTTTGAACCCGCTGTAAA-A--TTACCC-------CA------TG-GGTCA-----CTT-------------TTT--AA----------------------C-G--GAAGT---T-TT--ATCC---
gi|94054                      :                            CCGGTGTAGCATTAAATTTTGATCCCGTTGAAAA-G--TGAGCT-------CA------AT-GGTCA-----TTT-------------TTC--AA----------------------T-GTTGAAAA---T-TG--ACCT---GGGTCAC-TTTGCAA-----------CATTAAATTCTGATCA-A-----A-ACA----G-T---TGTTGAAAAC-TGATC---AG--TGTT-AAATTTTGATCAGACATGGGGTCATTT-TT------TAACAGTTTGTTAAATACAAGCAAAACATCACATGAC----------TGTTGCAACAATT
gi|94055                      :                            CCGGTGTAACTTTAAATTTTGACCCCGTTGGAAA-A--TGATCC-------CA------TG-GATCA-----CTTGATGAGTGATCAATTCTTAA----------------------C-ATTGAAAA---C-TG--AC
gi|94056                      :                            CCGGTGTAACATTAAA-----ACCCCGGTGAAAA-A--TGACCC-------CA------A------------TTT-------------TTC--AA----------------------T-GTTGAAAA---T-TG--ACCC---GGATCTC-ATTTCAA-----------CTTTAAATTCTGATCA-A-----A-ACA----G-T---CGTTGAAAAC-TGATC---AT--TGTT-AAATTTTGATCAGACATTTGGTCC-TT-TT------TAAGGGTTTGTTAAATATTAGCAAAACATCACATGACTGATGTCGCATGTTGCAACAATT
gi|94057                      :                            CCGGTGTAACATTAAATTTTGACCCCGTTGAAAA-A--TGACCC-------CA------TG-GGTCA-----CAT-------------TTC--AA----------------------CAGATGAG-------TG--ATCT---A-------TTTTCAA-----------CATTGAAAACTGACC
gi|94058                      :                            CCGGTGTTACATTAAATTTTGACCCCGTTGAAAA-AA-CGGACC-------CA------AT-GGT-----------------------------------------------------------AAA---T-TG--ACCC---GAGTCAC-ATTTTAA-----------CATTAAATTCCAATCA-A-----A-ACA----G-T---CGTTGAATAC-TGATC---AG--TTTT-AAATATTGATCAGGCATGGGGTCCTTT-TT------TAACGGTTTGTTAAATATAAGCAAAACATCACATGACTGATGTCGCATGTTGTAACAATT
gi|94059                      :                            CCGGTGTAACATTAAA-TTT------------------TGACCC-------T-------------------------------------------------------------------GTTGAACA---T-TG--ACCC---GGGTCAC-TTTTCAG-----------CATTAAAGTCTGATCA-A-----A-ACA----G-T---CGTTGAAAAC-TGATC---AG--TGTT-AAATTTTGATAAGACATGGGGTCCCTT-TT------TAACCGTTTATTAAATATGAGCAAAACATCACATGACTGATGTCACATGTTGCAACAATT
gi|94060                      :                            CCGTTGTAACATTAAATTTTGACCCCGTTGAAAA-A--TGAACC-------CA------AG-GGTCA------TT-------------TTC--AA----------------------T-GTTGAAAA---T-TG--ACTC---GGGTCAC-ATTTCAA-----------CATTAAATTCTAATCA-A-----A-ACA----G-T---CGTTGAAAAC-TGATC---AG--TGTT-ATATTTTGATCA------------TTT-AT------TAACGGTTTGT
gi|94061                      :                            CCGGTGTAACATTAAATGTTGACCC-GTTGAATA-A--TGACCC-------CA------AG-GGTCA-----CAT-------------TTC--AA----------------------
gi|94061                      :                                                                                                                           ----------------------C-GTTGAATA---A-TG--ACCCCAAGGGTCAC-ATTTCAA-----------AATTAAATTCTGATCA-A-----A-ATA----G-T---CGTTGAAAAC-TGATC---AG--TGTT-TAATTTTGA------------TCTTTT-TT------TAACAGTTTGTTAAATACAAGCAAAACATTACATGACTGATGTCGCATGTTGCAACAATaattaaattctgatcaaaatagtcgttgaaaactgatcagtgtttaattttgatctttttttaacagtttgttaaatacaagcaaaacattacatgactgatgtcgcatgttgcaacaat
gi|94062                      :    ccggtgtaacattaaatgttgaccCCGGTGTAACATTAAATTTTGCCCCTGTTAAAAA-T--CGACCC-------CA------TG-GGTCA-----CTT-------------T-----------------------------------ATA---TATG--ACCCCATGGGTCAC-TTTTCAA-----------TATGAG----TGATCC-ATTTCTA-ACA------------TTGAAAAC-TGACCCCGAC--TGTT-A---TTTAATGAGACA
gi|94063                      :                            CCGGTGTAACATTAAATTTTGAACCCGTTCA-----------CC-------T--------G-GGTCA-----CAT-------------TTC--AA----------------------C-ATT
gi|94063                      :                                                                                                                                                           ---T-TC--ACCT---GGGTCAC-ATTTCAA-----------CATTAAATTCTGATCA-A-----A-ACA----G-T---CGTTGAAAAC-TGATC---AG--TGTT-AAGTTTTGATCAGACATGGGGTCATTT-GT------TTACTGTTTGTTGAATATAAGCAAAAGGTAACATGACTGATGTCGCATGTTGCAACAATTaaattctgatcaaaacagtcgttgaaaactgatcagtgttaagttttgatcagacatggggtcatttgtttactgtttgttgaatataagcaaaaggtaacatgactgatgtcgcatgttgcaacaatt
gi|94064                      : ccggtgtaacattaaattttgaacccgCCGGTGTAACATTAAATTTTGACCCCGTTGAAAA-A--TGACCC-------CA------TT-GGTCA-----CTT-------------TTC--AA----------------------C-G----GAA---T-TGTCATCC---A-------TTTTTAA-----------TATTGAAAACTGACC
gi|94065                      :                            CCGGTGTAACATTAAATTTTGACCCCGTTCATAA-A--CGG--A-------TG------AGTGGTCC-----ATT-------------TTT--AA----------------------C-ATTGAAAA---C-TG--ACCC---CGACCGT-TATTTAAAAATTGACCTTCGTTAAAATCTGATCACC-----A-ACA-----------GTTGGAAAC-TGACC---
gi|94066                      :                            CCGCTGTAACATTAAATTTTGACCC----------A--TG--------------------G-GGTCA-----TTT-------------TTC--AA----------------------------AGGA---T-TT--AC------GATCCA-TTTTTAA-----------CATTAAAAACTGACC
gi|94067                      :                            CCGGTGTAACATTAAATTTTGACCCCGATGAAAA-A--TGATCA-------AA------AC-AGT----------------------------------------------------C-GTTGAAAA---C-TG--A
gi|94068                      :                            CCGGTGTATCATTAAATTTTGACCCCAT--------------------------------G-GGTCA-----CTT-------------TTC--AA----------------------C-G--GATGA---G-TG--ATCC---A-------TTTTTAA-----------CATTGAA
gi|94069                      :                            CCGGTGTAACATTAAAAGTTGACCC---TGAAAACAATTGACAC----------------G-GGTCACAATTCTT-------------ATC--AAAACAGT----------------C-ATTGAAAA---C-TG--AC-----------------CAG-----------TGTTAAATTTTGATCA-G-----ACACG----G-TGTCCGTT
gi|94069                      :                                                                                                                                                     TGAAAACAAT-TG--ACAC---GGGTCAC------------------------AATTCTTATCA-A-----A-ACA----G-T---CATTGAAAAC-TGACC---AG--TGTT-AAATTTTGATCAGACACGGTGTCC-GT-TT------TAACGGTTTGTTAAATATAAGCAAAACAGCACATGACTTATGTCAATTATTGCAACAATttaacggtttgttaaatataagcaaaacagcacatgacttatgtcaattattgcaacaat
gi|94070                      :   ccggtgtaacattaaaagttgacccCCGGTGTAACATTAAATTTTGACCTCGTTGAAAA-A--TGACCC-------CA------AG-GGTCA-----TAT-------------TTC--AA----------------------T-GTTTAAAA---T-TG--ACC-------------TATAAG-----------TGTTAAATTTTGATC--A-----G-ACATGAGG-T---CTTT-----T-TTATC---GGTTTGTT-AAAT
gi|94071                      :                            CCGATGTAACATTAAATTTTGACCCCATTGAAAA-A--TGACCT-------T-------AG-GGTTA-----CTT-------------TTA--AA----------------------C-G--GATGA---G-TG--ATCC---A-------TTTTTAA-----------CATTGAAAACTGACCataagcaaaac
gi|94072                      :                            CCGGTGTAACATTAAATTTTGACCCTGTTGAAAA-A--TGACCC-------TA------TG-GGTCT-----CTT-------------TTC--AA----------------------C-G--GATGA---G-TG--ATCT---A-------TTTTTAA-----------CATTGAAAACTGACC
gi|94073                      :                            CCGGTGTAACATTAAACTT-------------------TGATCC-------C-----------------------------------------------------------------C-GTTGAAAA---T-TG--ACCC---AGGTTAC-ATTTCAG-----------CATTAAATTCTAATCA-A-----A-TCA----G-T---CGTTGAAAAC-TGATC---AA--T
gi|94074                      :                            CCGGTGTAACATTAAATTTTGACCCCGTTGAAAA-A--TGACCC-------CA------AG-
gi|94075                      :                            CCAGTGTAACATTAAATATTGACCCCGATGAAAA-G--TGATCCATGGGGTCATTGATGAGTGATCA-----ATT-------------TTT--AA----------------------C-ATTGAAAA---C-TG--ACCC---CG---AC-CGTT---------------ATTTAA---TGACCT-A-----C-CCA----T-A---CG-TGAAAACTTGACC---CT--CGTT-AAAATCTGATCA
gi|94076                      :                               GTGTAACATTAAATTTTGACCCCGTTGAAAA-A--TGACCC-------TA------AG-G-------------------------TTC--------------------------------AAAA---T-TG--ACCT---AGGTCAC-ATTTCAA-----------CATTAAATTCTGATCA-A-----A-ACA----G-T---TGTTGAAAAC-TGATC---AG--TGTT-AAATTTTGATAGAAAATGGGGTCCTTT-TT------TAACGGTTTGTTAGATATTAGCAAAACATCACATGACTACTGTCGCATGTTGCAACAATT
gi|94077                      :                                 GTAACATTAAACTTTGACACCGTTGAAAA-A--TGACCC-------CA------TA-GGTCA-----CTT-------------TTC--AA----------------------C-G--GATAA---G-TG--A----------TACATTTTTAA-----------CATTGAAAACTGACC
gi|94078                      :                                                      GTTGAAAA-A--TGAACC-------CA------AG-GGTCA------TT-------------TTC--AA----------------------T-GTTGAAAA---T-TG--ACTC---GGGTCAC-ATTTCAA-----------CATTAAATTCTAAT
gi|94079                      :                                                      GTTGAAAA-A--TGACCC-------CA------AG-AGTCA-----TTT-------------TTC--AA----------------------T-GTTGAAAA---T-TG--ACCC---GGGTCAC-ATTTCAA-----------C
gi|94080                      :                                      ATTAAATTTTGATCCCGTTGAAAA-G--TGAGCT-------CA------AT-GGTCA-----TTT-------------TTC--AA----------------------T-GTTGAAAA---T-TG--ACCT---GGGTCAC-TTTGCAA-----------C
gi|94081                      :                                                                                A------AG-GGTCA-----TTT-------------TTC--AA----------------------T-GTTGAAAA---T-TG--AACC---GGGTCAC-ATTTCAA-----------CATTAAATTCTGATCA-A-----A-ACA----GAT---CTTT---------------------TT-TAACTTTGATCATACATGGGGTCATTT-TT------TAACGGTTTGTTAAATATAAGCGAAACATCACATGACTGATGTTGCATGTTGCAACAATT
gi|94082                      :                                                                                                       -------------TTC--AA----------------------T-GTTGAAAA---T-TG--AACC---GGGTCAA-ATTTCAA-----------CATTAAA
gi|94083                      :                                                                                                       -------------TTC--AA----------------------T-GTTGAAAA---T-TG--AACC---GGGTCAC-ATTTCAA-----------CATTAAA
gi|94084                      :                                                                                                                                                  -GTTGAAAA---T-TG--ACCC---GAGTCAC-ATTTAAT-----------CATTAACTTCTGATCA-A-----A-ACG----G-T---CGTTGAAAAC-TGATC---AG--TGTT-AAATTTTGAGCA------------TTT-TTAAAAAGTAACGGTTTGTTAAATATAAGCAAAACATCACATGGCTGATGTCGCATGTTGC
gi|94085                      :                                                                                                                                                                                                               TGATCA-A-----A-ACA----G-T---CGTTGAAAAC-TGATC---AG--TGTT-AAATTTTGATCAGACATGTGGT--TTTATT------TAACGGTTTGTTAGATATAAGCAAAACATCACGTGACTGATTTCGCATGTTGCAACAATT
gi|94086                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                               TTT-TT------TAACGGTTTGTTAAATACAAGCAAAACATCACATGACTGATGTCGAATGTTGCAACAA