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gi|69036                      :      AT-TA-T-T-----TAC---------T--------ATA--TAT-----ATATAAAGCTATCCAAAAGCTATA--GTAAGAAAGGG-CCTGTG
gi|69037                      :      AT-TA-T-T-----TAC---------T--------TTA--TAT-----A------GCTATCCAAAAGCTATA--GTAAGATAGGG-TCTGTG
gi|69038                      :      AT-TA-T-T-----TAC---------TCTATATATATA--TAT-----A------GCTATCCAAAAGCTATG--GTAAGATAGGG-CCTGTG
gi|69039                      :      AT-TA-T-T-----TAC---------T--------ATATATAT-----A------GCTATCCAAAAGCTATG--GTAAGGTAGGG-CCT
gi|69040                      :       T-TA-T-T-----TAC---------T--------ATA--TAT-----A------GCTATCCAAAAGCTATA--GTAAGATAGGG-CCTTTG
gi|69041                      :          A-T-T-----TAC---------T--------ATA--TAT-----A------GCTATCCAAAAGCTATA--GTAAGATAGGG-CCTGTG
gi|69042                      :             -T-----TAC---------T--------ATA--TAC-----A------GTT-TCCAAAAGCTA-G--GTAAGATAGGG-CATGTG
gi|69043                      :             -T-----TAC---------T--------ATA--TAT-----A------GCTATCCAAAAGCTATA--GTAAGATTGGA-CCTGTG
gi|69044                      :               -----TAC---------T--------ATA--TAT-----A------GCTGTCAAAAAGCTTTA--GTAAGATAGAG-CCTGT


blockSeqs                     :        A  A A AACTA   AACATTGTA CTATATAT   TA   GTACA TATAAA                 TA           C
blockSeqs                     :        A  . . .       A         .          .    TGTAT CAA                    .            .
blockSeqs                     :        .  . . .       .         .          .    .     TA                     .            .
blockSeqs                     :        .  . . .       .         .          .    .     .                      .            .
blockSeqs                     :        .  . . .       .         .          .    .     .                      .            .
blockSeqs                     :        .  . . .       .         .          .    .     .                      .            .
blockSeqs                     :        .  . . .       .         .          .    .     .                      .            .
blockSeqs                     :        .  . . .       .         .          .    .     .                      .            .
blockSeqs                     :        .  . . .       .         .          .    .     .                      .            .
blockSeqs                     :        .  . . .       .         .          .    .     .                      .            .
blockSeqs                     :        .  . . .       .         .          .    .     .                      .            .
blockSeqs                     :        .  . . .       .         .          .    .     .                      .            .
blockSeqs                     :        .  . . .       .         .          .    .     .                      .            .
blockSeqs                     :        .  . . .       .         .          .    .     .                      .            .
blockSeqs                     :        .  . . .       .         .          .    .     .                      .            .
blockSeqs                     :        .  . . .       .         .          .    .     .                      .            .
blockSeqs                     :        .  . . .       .         .          .    .     .                      .            .
blockSeqs                     :        .  . . .       .         .          .    .     .                      .            .
blockSeqs                     :        .  . . .       .         .          .    .     .                      .            .
blockSeqs                     :        .  . . .       .         .          .    .     .                      .            .
blockSeqs                     :        .  . . .       .         .          .    .     .                      .            .
blockSeqs                     :        .  . . .       .         .          .    .     .                      .            .
blockSeqs                     :        .  . . .       .         .          .    .     .                      .            .
blockSeqs                     :        .  . . .       .         .          .    .     .                      .            .
blockSeqs                     :        .  . . .       .         .          .    .     .                      .            .
blockSeqs                     :        .  . . .       .         .          .    .     .                      .            .
blockSeqs                     :        .  . . .       .         .          .    .     .                      .            .
blockSeqs                     :        .  . . .       .         .          .    .     .                      .            .
blockSeqs                     :        .  . . .       .         .          .    .     .                      .            .
blockSeqs                     :        .  . . .       .         .          .    .     .                      .            .
blockSeqs                     :        .  . . .       .         .          .    .     .                      .            .
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blockSeqs                     :        .  . . .       .         .          .    .     .                      .            .
blockSeqs                     :           . . .       .         .          .    .     .                      .            .
blockSeqs                     :             . .       .         .          .    .     .                      .            .
blockSeqs                     :             . .       .         .          .    .     .                      .            .
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blockSeqCons                  : 
originalCons                  : TTTCCAT-TA-T-T-----TAC---------T--------ATA--TAT-----A------GCTATCCAAAAGCTATA--GTAAGATAGGG-CCTGTG
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Alignments
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lowQualScore                  :        .  . . .....   ......... ........   ..   ..... ......                 ..           .      
lowQualScore                  :        4  1 1 66666   333333333 88888888   44   33333 333333                 44           1      
consensus                     : TTTCCAT-TA-T-T-----TAC---------T--------ATA--TAT-----A------GCTATCCAAAAGCTATA--GTAAGATAGGG-CCTGTG
Reference ( family-560 )      : TTTCCAT-TA-T-T-----TAC---------T--------ATA--TAT-----A------GCTATCCAAAAGCTATA--GTAAGATAGGG-CCTGTG
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gi|69031                      :   TCCAT-TA-T-T-----TAT---------T--------ATA--TAT-----A------GCTATCCAAAAGCTATA--GTAAGATAGGG-CCTGTG
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gi|69033                      :   TCCAT-TA-T-T-----TAC---------A--------ATA--TAT-----A------GCTATCCAAAAGCTATA--GTAAGATAGGG-CCTGTG
gi|69034                      :   TTCAT-TA-T-T-----TATAACATTGTAT--------ATA--TAT-----A------GCTATCCAAAAGCTATA--GAAAGATAGGA-CCTGT
gi|69035                      :      AT-TA-T-T-----TAC---------T---------TG--TTT-----A------GCTATCAAAAAGCTATA--GTAAGATAGGG-CCTGTG
gi|69036                      :      AT-TA-T-T-----TAC---------T--------ATA--TAT-----ATATAAAGCTATCCAAAAGCTATA--GTAAGAAAGGG-CCTGTG
gi|69037                      :      AT-TA-T-T-----TAC---------T--------TTA--TAT-----A------GCTATCCAAAAGCTATA--GTAAGATAGGG-TCTGTG
gi|69038                      :      AT-TA-T-T-----TAC---------TCTATATATATA--TAT-----A------GCTATCCAAAAGCTATG--GTAAGATAGGG-CCTGTG
gi|69039                      :      AT-TA-T-T-----TAC---------T--------ATATATAT-----A------GCTATCCAAAAGCTATG--GTAAGGTAGGG-CCT
gi|69040                      :       T-TA-T-T-----TAC---------T--------ATA--TAT-----A------GCTATCCAAAAGCTATA--GTAAGATAGGG-CCTTTG
gi|69041                      :          A-T-T-----TAC---------T--------ATA--TAT-----A------GCTATCCAAAAGCTATA--GTAAGATAGGG-CCTGTG
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gi|69044                      :               -----TAC---------T--------ATA--TAT-----A------GCTGTCAAAAAGCTTTA--GTAAGATAGAG-CCTGT