lowQualScore : 111111111 111 11 111 1 55555555555 111111 222222222222 11 1111111 11 111111111 222 111111 11111 1 1111111111111 11
lowQualScore : 3333 222 222 55555555 1 1 4 777777777 33333 666 1 1 33333 4 1 99 1 22 2222 0 44 11 9 6 1 222 1 666 5 44444444444 44444 222222 555555 9999999999999 555555 000000000000 1 4444 4444 00 3 7777777 777 999 1 00 44444 2 22 555555555 44 1 1 3333 5 666 9999999999 22 5 3 666 22 1 0 1 4 222 22 1 3 1 5 1 7 1 555555 55 22222 0 888888 4 4444444444444 333 77 55555 22
lowQualScore : .... ... ... ........ . . . ......... ..... ... . . ..... . . .. . .. .... . .. .. . . . ... . ... . ........... ..... ...... ...... ............. ...... ............ . .... .... .. . ....... ... ... . .. ..... . .. ......... .. . . .... . ... .......... .. . . ... .. . . . . ... .. . . . . . . . ...... .. ..... . ...... . ............. ... .. ..... ..
lowQualScore : 4444 888 777 66666666 3 5 1 999999999 44444 222 3 3 33333 0 2 55 3 55 7777 5 55 88 9 0 3 333 4 000 3 00000000000 22222 555555 000000 1111111111111 000000 000000000000 9 0000 0000 55 6 9999999 000 222 3 33 88888 8 55 000000000 22 7 7 7777 0 111 3333333333 44 2 5 000 44 7 4 6 5 999 44 7 1 8 7 8 3 9 333333 22 11111 2 777777 3 1111111111111 333 77 66666 44
consensus : GTGCATTTCT----TA---TGTCAGTAAT---AATGTTA--------TGGTATCCATAGCAACATG-CATACATGG-TT-----AGTGCCGCAGCTCAAA-----AT-G-TTGAACAA-TTTG-A-----CAGATAAATATGTG-AAAAATA-ACAATC-ATT----TCCCT-GTA--AAACTCGCGGTAAATCATAT-AT---TA-TTGAGGACACGT-CATCAATGTCTGCA--T-G---AT-GT-----CATTC------CA------G------C------A------T-----T------G-CG----CGCAGGTGTTAGG----AGTTTAAACAAA-CTTA---C--AT-TGAAAAG--GTAGACTCGT-----TCATANGC--AAA------TAGTG-C-GTC-TG----ANGAAAAGGTGAAACAACGA---GC-GGCA-----ATAC--A-G-TTTGN-GTC--AATATTAGCA-AAACACTGATCCAGACG-ATAGATATGCNTA---GTAAAGCTCCGAG--AAAGTTATTT-GTAGTGCGTTTTGTAGTCTACAAATGA-CACAAACGGTACAGTGAGGAACGAGAAACA-ATAATGGATGAT-AACANG----TGTG--GT----CGCCCTGTGTCAAAATCGCGC-----CAACGTCACGTC------------AAC---GTGGTAAAAGGTGCC-----T-CAATAAG
Reference ( gi|144502 ) : GTATATTTCT----TA---TGTCAGTAAT---AATGTTA--------TGGTATCCATAGCAACATA-CATATATGA-TA-----AGTGCCGCAGCTCAAA-----AT-T-TTGAACAA-TTTG-A-----CAGACAAATATGTG-AGTAATA-ACAATC-ATT----TTCCC-GTA--ACACTCGCGATAAATCATAT-AT---TA-TTGAGGACACAG-CATCAATGTGTGCA--T-GACAAT-GT-----CATTC------CA------G------C------A------T-----T------G-CA----CGCAGGTGTTAGG----AGTTTAAATCAA-CTTC---T--AT-TGAAAAT--GTAGATGCAT-----TCATATGC--AAA------TAGTG-C-ATC-TG----ATGAAAAGGTGAAACAACGA---GC-AGTA-----ATAC--A-G-TTTAA-GTC--AATATTAGCA-AAACACTGATTCAGACG-ATAGATATGCATA---GTAAAGCTCCGAG--AAAGTTATTT-GTAGTGCATTTTGTAGTCTACAGATGA-CACAAACGGTACAGTGAGGAGCGAGAAACA-ATAATGGACGAT-AACATA----TGTG--GT----CGCCCTGTGTCAAAATCGCGC-----CAATGTCACGTT------------AAC---GTGGTAAAAACTGCC-----T-TAATAAG
gi|144506 : GTTTATTTCT----TA---TGTCAGTAAT---AATGTTG--------TGGTATCCATAACAACATA-CAAACATGA-TA-----AGTGCCGCAGCTCAAT-----AT-G-TTGAAAAA-TTTG-A-----CAGACAAATATGTG-AATAATA-ACAATC-ATT----TTCCC-GTA--ACACTCGCGGTAAATCATAC-AT---TA-ATGAGGACACGG-CATCAATATCTACA--T-GACAAT-GT-----CATTC------CA------G------C------A------T-----T------G-TA----CGCAGGTGTTAGG----AGTATAAATCAA-CTTC---T--AT-TGAAAAT--GTAGATGCAT-----TCATATGC--AAA------TAGTG-C-ATC-TA----ATGAAAAGGTAAAACAACGA---GC-AGTA-----ATAC--A-G-TTTTA-GTC--GATATTAGCA-AAACACTGATTCAGACG-ATAGATATGTGTA---GTAAAGCTCCGAG--AAAGTTATTT-GTAGTGTATTTTGTAGTCTACAGATAA-CACAAACGATACAGTGAGGAACGAGAAACA-ATAATGGATGAT-AACATA----TGTG--GC----CGCCCTGTGTCAAAATCGCGT-----CAATGTCACGTT------------AAC---GTGTTAAAAACTGCC-----T-TGATAAG
gi|144505 : GTATATTTCA----TA---TGTCAGTAAT---AATGTTA--------TGGTATCCATAGCAACATA-CATGCATGA-AT-----AGTTCCGCAGCTCAAA-----AT-G-TTGAACAA-TTCG-A-----CA----------------AATA-ACAATCAATT----TTCCC-ATA--ACACTCGCAGTGAATCATAT-AT---TA-TTGAGGACATGT-CATCAATGTCTGCA--T-GACAGT-GT-----CATTC------CA------G------C------A------T-----T------G-CG----TGCAGGTGTTAAG----AGTTTAAATAAA-CTTTACAT--AT-TGAAAAG--GTAGACTCAT-----TCATATGC--AAATACCGGTAGTG-C-AGC-TG----ATGAAAAGGTGAAACAACAA---GC-AGCA-----ATAC--A-G-TTTGG-GTC--AATATTAGCA-AAACACTGATTCAGACG-ATAGATATACATA---GTAAAGCTCTGAG--AAAGTTACTT-GTAGTGCATTTTGTAGTCTACAAATAA-CACAAATGGTACAGTGAGGAACGAGAAACA-ATAATAGATGAA-AATCGG----TGTG--G-----CGTCCTGTATTAAAATCACGC-----AAA-GTCACGTC------------AAC---GTGGTTAAAG-TGCC-----T-CAATAAG
gi|144504 : GTATATTTCT----TA---TGTCAGTAAT---AATGTTA--------TGGTATCCATAGAAACATA-TATACAAGA-AT-----ATTGCCACACCTCAAA-----AT-G-TTGAACAA-TTCG-A-----CAGATAAATATGTG-AAAAATA-ACAATC-ATT----TTCCT-GTA--ACGCTCGCGGTGAAGCATAT-AT---TA-TTGAGGACACGT-CATCAATGTCTACA--T-G----T-GT-----CATTC------CA------G------C------A------T-----G------G-CG----CGCAGGTATTAGG----CGTTTAATTAAA-CTTA---T--AT-TGAAAAG--GTAGACTCAT-----TCATATGC--AAA------CAGTG-C-ATC-TG----ATGAAAAGGTGAAACAACGA---GC-AGCA-----ATAT--A-G-TTTGT-GTA--AATATTAGCA-AAACACTGATT-AGACG-AGATATATGCATA---GTAAATATCCGAGAAAAAATTATTT-ATAGTGCATTTTGTTGTCTACAAATGA-CAAAAACAGTACAGTGAAGAACGAGAAATA-ATAATGAATGTT-AACAGG----TGTG--G-----CGCCCTGTGTCAATAT----------CAA-GTCACGTC------------AAC---GTGGTAAAAG-TGCC-----T-CAATAAG
gi|144503 : GTATATTTCG----TA---TGTCAGTAAT---AATGTTA--------TGGTATTCATAGCAACAAA-CATATATGA-TT-----AGTGCCACAGCTCAAA-----AT-G-TTGAACAA-AC-G-A-----CAGTTAAATATGTG-AAAAATA-ACAATC-ATT----TCCCT-GCA--AAACCCACGGTGTATAATAT-AT---TA-TTGAAGACACGT-CATCAATGTCTGCA--T-G----T-GT-----CATTT------CA------G------C------A------T-----T------G-CG----CACAGGTGTTAGG----ACTTTAAATAAA-CTTA---T--AT-TGAAAAG--GTAGACTCAT-----TCATATGC--AAA------TAGTG-C-ATC-TG----ATGAAAAGGTGAAACAACGA---GT-AGCA-----ATAG--A-G-TTTGT-GTC--AATATTAGAC-AAACACTAATTCAGACG-ATAGATATGGACA---G-AAAACTCCAAG--AAAGTTATTT-GTAGTGCATTTTGTGGTTTACAAATGA-CACAAACGATACATTGAGGAATGAGAAACA-ATAAATGATGAT-AACAAG----TGTG--G-----CAACCTTTGTCAAAATCATGC-----AAA-GTCATGTC------------AAC---ATGGTAAAAAGTGCC-----T-CAATAAG
gi|144509 : GTGCATTTCT----TA---TGTTAATAAT---AATGTTA--------TGGTCTCCATAGCAACATG-CATACATGG-TT-----AGTGCCGCAGCTCAAA-----TT-G-TTGCACAA-TTTG-A-----CAGATAAATATGTGAAAAAATA-ACAATT-ATT----TCCCT-GTA--A-ACTCGCGGTAAATCATAT-AT---TA-TTGATGACACAT-CATAAATGTCTACAT-T-G------GT-----CATTTTAGTAATA------G------T------A------T-----G------G-TG----CACAAGTGTTTGG----AGTTTAAACAAA-CTTA---C--ATAAAAAAAG--GTAAACTTGT-----TAATAAGC--AAA------ATTTC-C-ATT-AG----AGAAAAAGGTAAAACAACGA---GC-GGAA-----ATAC--ATT-TTTGT-GTC--AAAATTAGCA-AAACGCTGATCCAGGCG-ATATATATGCTTA---GTAAAGCTCTGAG--AAAATTATTT-GTAGTGTGTTTTGTAGACTATAAATGG-CACAAATGGTACAGTGAGGAA-AATAAACA-ATATTGGATGCT-AACATG----TGTG--GT----CACCATGTGTCAAAATCGCAT-----CAACGCCATGTC------------AAC---GTGGTAAAAGGTGCC-----T-CAATAAG
gi|144508 : GTGCATTTCT----TA---TATTAATAAT---AATGTTA--------CGGTCTCCATAGCAACATG-CATGCATGG-TT-----AGTGCCACAGCTCAAA-----TT-G-TTGAACAA-TTTG-A-----CAGATAAATATGTG-AAAAATA-ACAATG-ATT----TCCAT-GTA--AAACTCACGGTAAATCATAT-AT---TATTTGATGACA-AGTCATCAATGTCTACAT-T-G------GT-----CATTC------TA------G------T------A------C-----TAGTATGG-TG----CGCAAGTGTTAGG----AGTTTAAACAAA-ATTA---C--AT-AAAAAAG--AAAAACTTAT-----TAATAAGC--AAA------ATTTC-C-ATC-TG----AGAAAAAAGTGAAACAACGA---GC-GGAA-----ATAC--ATT-TTTGT-GTC--AAAATTGGCA-AAACACTGATCCAGGCG-ATATATCTGTTTA---GTAAAGCTCTGAG--AAAGTTATTT-GTAGTGTGTTTTGCAGTCTATAAATGG-CACAAATGGTACAGTGAAGAACAGGAAACA-ATAATGGATGAT-AACATGACATTGTGTTGT----CGCCCTGTGTCAAAATTCTAT-----CAACGTCGTGTC------------AAT---GTGGTAAAAGGTGCC-----T-TAATAAG
gi|144510 : GTACATTTTT----TA---TGTTAATAAT---AATGTTA--------TGGTCTCCATAGCAACATG-CATACATGG-TT-----AGTGCCGCA-------------------GAACAATTTTG-A-----CTGATAAATATGTG-AAAAATA-ACTATG-ATT----TTCCT-GTA--AAACTCGCGGTAAATCATAT-AT---TA-TTGATGACACGT-CATCAATGTCAGCAT-T-G------GT-----CATTCTAG---TA------G------T------A------T-----G------G-CA----CGCAAGTGTTAGG----AGTTAAAACAAA-CTTA---C--AT-AAAAAAG--GGAAACTTGT-----TAACAAGC--AAA------ATTTC-C-ATC-CG----AGAAAAAGGTGAAACAACGA---GC-GGAA-----ATAC--ATT-TTTGT-GTC--AAAATTAGCA-AAACACTGATTCAGGCG-ATATATCTGTTTC---GTTATGCTCTGAG--AAATTTATTT-GTAGTGTGTTTTGTAGTCTATAAATGG-CACAAATGGTACAATGAGGAACAGGAAACA-ATAATGGATGAT-AACATGACATTGTGTCAT----CGCCCTGTGGCAAAATCGCAT-----CAACGCCATGTC------------AAC---GTGATAAAAGGTGCC-----TCTAATA
gi|144507 : GTATATTTCT----TA---TGTCAGTAAT---AATGTTA--------TGGTATCCATGGCAACATA-CATACATGA-TA-----AGTGCCGCAGCTCAAA-----AT-G-TTGAACAA-TTCG-A-----CAGACAAATGTGTG-TATAATA-ACAATC-ATT----TTCCC-GTA--ACACTCGCGGTAAATCATAT-AT---TA-TTGAGGACACGG-CATCAATGTCTGCATTT-GA-AAT-GTAGATGCATTC------
gi|144512 : GTGCATTTGT----TA---CGTCAGTAAT---ACTGTTA--------TGGTATCCATAGCAACTTG-CATACATGG-TT-----AATGCCGCAGTT-AAA-----AT-TGTTGAACAA-TTTG-A-----CAAGTAAAT-----------TA-ACAATC-GTT----TCCAT-GTA--AAACTTGCAGTTATTCATAT-ATAATTA-TTGATGACATG----TCA-TGTATAC------------GT-----CGTTC------CA------G------T------A------T-----TAGCAATG-CG----CACATGTGTTGGG----AATTTAA-TCAAACTTA---C--AT-T--ACAT--A-AGACACGT-----AAACGTGC--AAA-------ATTC-T-GTC-TA----AAGGAAAAGTGAAACAACGA---GC-GGCG-----ATAC--A-G-TTTTGTGTC--AATATTAGCA-TAACACCGATTCAGACA-ATGGATATGATTA---GTAAAGCTCCGAG--AAAGTCATCT-ATAGTGCGTTCTGTAATCAACAAATGG-TACAACTGGTTCAGTGAGAAGCGATCAACA-ATA--------------------TGTG--GT----CGATCTGTGTCAAAATTGCGCAAACGTAACGTCACGTTAAAAGGTCGGTCAAC---GTGATAAAAA-TGCC-----T-CAACGAGatatgcaattagtgcatctgatgaaaaggcgaaacaacgagccataatacagtttaagtcaatattagcaaaacactgattcagacgatagatatgtatagtaaagctccgagaaagttatttgtagtgcattttgtagtctacagatgacacaaacggtacagtgaggaacgagaaacaataatggatgataacatgtggtcgccctgtatcacaatcgcgtcaatgtcacgtaaacgtggtaaaaactgccttaataag
gi|144511 : GTGTATTTCTAAAGCA---TGTCAGTACT---AATTTTA--------TGGTAACCATG----CATA-CATGTTT----------AGTGCTTCAGTTCATA------T-G-TTGAACAA-TTTG-A-----CAGATCAGTATGTG-AAAAATA-ACAATA-GTT----TCCAT-GTA--A-ACTCGCAGTAAATC-TAT-AT---TA-TTGAGGACATGT-CATCAAAGACTGCA--T-AA-----GT-----CATTC------CA------GTAATAGC------A------A-----T------G-TG----CGCAAGTGTAAGG----AGTTTAAACAAA-TTTA---A--AT-TTAAACG--GTAAACATGT-----TCACAAGC--AAA-------ATTGAC-ATC-TG----AAAAAAAGGTGAAACAATGA---GT--------------------------GTC--ATTTTTAGAA-AAATACTGATACAGACG-ATCGATACGCTTT---GTAAAGCTCTGAA--AATGATATCT-GTAATGTGTTCTGCAGTCTACAAATGG-CACAAATG--ATAGTCAGGAACGAGAAACA-CTAATGTATGAT-AACAGG----TGTT--GTATGCCATCCTTTGTCAAAATCCTGC-----AAAAGTCATGTC------------AACAAAGTGGTAAAAGATGCC-------TAACAAG
gi|144513 : GTATATTTCT----TA---TGTCAGTAAT---AATGTTA--------TGGTATCCATAGCAACATA-CATACATGA-TA-----AGTGCCGCAGCTCAAA-----AT-G-TTGAACAA-TTCG-A-----CAGACAAATATGTG-AATAATA-ACAATC-ATT----TTCCC-GTA--ACACTCGCGGTAAATCATAT-AT---TA-TTGAGGACACGG-CATCAATGTCTGCA--T-G
gi|144515 : GCATTTTTTT----TA---TGTTAAAAAT---ATTGTTA--------TGGTCTCCATAGCAACATG-CATACATGG-TT-----TGTGTTGCAGCTCAAA-----AT-G-CTGAACAA-TTTG-A-----CAGATAAATATGTG-AAAAATATAAAATA-ATT----TCCCA-GTA--AAACTCGCGGTAAATCATAT-AT---TA-CTGAGGACACAT-CAACAATGTCTGCA--T-----AG-GT-----CATTC------CA------G------T------A------T-----TAGTATGG-CA----TGCAAGTGTTAGC----AGTTTAAA-CAATCTT
gi|144514 : GTATATTT-------A---TATCAGTAAA---AATGTTA--------TAGTATTCATTGCAACATA-CATACACAA-TT-----AGTCCCGCAGCTCAAA-----AT-G-TTGAACAG-CTCG-A-----CAGATAAATATGTG-AAAAATA-ACAATA-ATT----TTCCT-GTA--AATCTCACGTTAAAACATAT-AT---TA-TTGAGAACATGT-CATCAATGTCTGCA--C-AACAGT-GT-----CATTC------CA------G------C------A------acat
gi|144517 : GTGCATTTCT----TA---TGTTAATAAT---AATGTTA--------TGGTCTCCATAGCAACATG-CATACATGT-TA-----AGTGCCGCAGCTCAAA-----GC-G-TTGATCAG-CTTG-A-----CAGATAAATATGTG-AAAAATA-AC--TG-ATT----TCC-----------CTCGTGGTAAATCATAT-AT---TA-TTGAGGACACAT-CATCAATGT
gi|144518 : GTGCATTTCT----TA---TGTTAATAAT---AATGTTA--------TGGTCTCCATAGCAGCATG-CATACATGG-TT-----AGTGCCGCAGTTCAAA-----TT-G-TTAAACAA-TTTG-A-----CAGATAAATATGTG-AAAAATA-ACAACG-AAT----TTCCT-GTA--AAACTTGCCGTAAATCATAT-AT---TA-TTGAc
gi|144516 : GTGCATTTCT----TA---TGTCAACAAT---AATGTTAAGGACTTATGGTATCCATAGCAACATG-CATGTATGG-TT-----AGTGCACCAGCTCAAA-----AT-G-TTGAGCAA-TTTG-A-----CAGATAAATATTTG-AAAGATA-ACATTC-ATT----TGCCT-GT------------ATAA--CATATCAA---TA-TTAAGGACACGC-CATCAATGTCTGCA--tgcgtgtcat
gi|144519 : TATTTTTCT----TA---TGTCAGTAAT---AATGTTA--------TGGTATCCATAGCAACATA-CATACAGGA-TT-----AGTGTCGCAGCTCAAA-----AT-G-TTAAACAA-TTCG-A-----CAGATAAATATGTG-AAAAATA-ACAATA-ATTGATTTTCCCTGTA--ACACTCGTGGTGAAGCCTAT-AT---TA-TTGAGAACACGT-CATCAATGTTTGCA--T-G----T-GC-----CGTTC------CA------G------C------A------T-----G------G-CG----CGCAGGTGTTAGG----AGTTTAAATAAA-TTTA---T--ATATAAAAGT---TAGACGCAT-----TCATATGC--AAA------TAGTA-C-ATC-TG----ATGAAAAGGTGAAG----GA---GC-AGCC-----ATAC--A-G-TTTGT-GTC--AATATTAGCA-AAACACTGAC-CAGACG-ATAGATATGCATA---GTAAAGCTACGAG--GAAGTTATTT-GTAGTGCATATTATAGTCTACAAATGA-CACAAACGGTATAGTGAGGAACGAGAAACA-ATAATAGATGAT-AACAGG----TGAG--G-----CGTCCTGTGTCAAAATCAAGT-----AAA-GTCACGTC------------AAT---GTGGTAAAA
gi|144520 : TGTATTTCT----CA---CGCCAGTAAT---AATATCA--------TGGTATACAAAGAGGCATG-CATTTATAG-GG-----AACGCCGCAGCTCAAA-----AT-A-TTGAAAAG-TTTA-A-----CAGGTAAACATACG-AATAA-A-ACAATC-GTT----TCCCT-GT-------------TAAATTACAG-AA---GA-TT---GTCCCGT-CATCAATATCTACA--T-----AT-GT-----CATTT------CA------G------TGATGAAA------T-----T------G-CA----CCTAAGTGTTAGAAACTAACTTGAACAAA-CGCA---C--AT-TAAAAAC--A-AAATGTAT-----GCACGAGC--AAA-------AATGCC-GTC-TG----AAGAACGCGCGAATCAAAGATTTGC-TGT------ACA---A-A-TTTGATGTC--AATATTAGCG-CAACACCGGTCCCGACG-AT---T-----TA---CTCAAG------A--AAAATCCTTT-GTTACGCGTTCTTTCATTTA-AAACAAGCACACGTGACACGGTGAGGGATGAAAAATA-ATAATGGGTGAC-AACATG----TATG--GT----CAA---GTTTCAAAATCGCGCAA---CAATAGCA--TC------------ATC---TTAGTGAAAggtaacgtaaaaag
gi|144521 : TACACTCCT----T-----GTCCGTAAT---GATATTG--------TCATTTTAATAGCAATAAAGC-----TG----------GTGCCGCAGCTCAAA-----AT-G-GTGAACAA-GGTA-AGGATGCAAAAAAAAACAAC-AAAAA-A-ACAATC-GTA----TCTCT-GTA--AAATTTACAATAAATCATTT-AT---TA-TTAATGATACGT-TATCAATGTCTTCG--T-----AT-GT-----CATTT------CA------G------T------A------T-----T------
gi|144522 : ATTTGT----TA---TGTTAATAAT---AATGATA--------TGGTCTCCTTAACA-CATG-CATACATGT-TT-----AGTGCCGCAGCTCAAA-----AT-G-TTGAACCA-TTTG-A-----CAGATAAATATTTG-AAAAATA-ACAATG-ATT----TCCCT-GTA--AAACTCGTGGTAAATCATAT-AT---TA-TTGAGGACATGT-CATCAATGTCTATA--TTG------GT-----CATTC------CA------G------T------A------TAAGTAT------GGTG----TGCAAGTGTTAGG----AGTTTAAACAAA-CTTA---C--AT---AAAATAGGCAAACTTGT-----TCATAAGC--AAA------TCTTC-C-GTC-TG----AGGAAAAGGTAAAACAACGA---GC-AGAA-----ATAC--A-G-TTTTGTGTC--AATATTAGCA-AAACACTGATCCAGTCG-ATATATATGCTTA---GTAAAGCTCCGAG--AAAATTATTT-GTAGTGCATTTTGTAGTCTACAGATGA-CACCAACGGTAGGGTGATGAACGAGAAACA-ATAATGGATGAT-AACATG----TGTG--GT----CGCCCTGTGTCAAAATCGTAT-----CAACGACACGTC------------AAC---ATAGTAAAAGGTGCC-----T-CAATAAG
gi|144523 : ATTTCA----TA---TGTAAATAAA---AATGTTA--------TGGTCTCCATAGCAACATG-CATACATGG-TT-----AGTGCCGCAGCTCAAA-----GT-G-TTGAACAA-TTTC-A-----CAGATAAATATTTG-GAAAATA-ACAATG-GTT----TCCCT-GTA--AAACTCGCGGTAAATTATAT-AT---TA-TTGATGACACGT-CATCAATGT---CA-----ACATTGGT-----CATTCCAGTAACA------G------T------A------T-----G------G-CG----CGCAAGAGTTAGG----AGTTTGAACAAA-ATTA---C--AT-AAAAAAG--GCAAACTCGT-----TAATAAGC--AAA-------ACTT-CTGTC-TG----AGGAAAGGGTGAAACAACGA---GC--------------------TTTGT-GTC--AATATTAGCA-AAAGTCTGATCCAGGTG-ATATATATGCTTA---GTAAAGCTCCGAG--AATGTTATTT-GTAGTGTGTTTTGTAGTCTTTAAATGG-CACAAACGGTACAGTGAGGAACAAGAAACA-ATAATGGATGATAAACATG----TGTG--AT----CTCCCTGTGTCAAAATCGCGT-----CAACGTCACATC------------AAC---GTGGTAAAAGGTGCC-----T-CAATAAG
gi|144524 : ATTTCT----TA---TGTTAATAAT---AATGTTA--------TGGTCTCCGTAGCACAATG-CACACATGT-TA-----AGTGCCGCAGCTCAAA-----AT-G-TTGAACAA-TTTG-A-----CTGATAAATATGTG-AAACATA-ACACTG-ATT----TCCCT-GTA--AAACTC-TAGTAAGTCATAT-AT---TA-TTGAGGACATGT-CATCAATGTCTGCA--T-----AG-GT-----CATTC------CA------G------T------AATAATAT-----G------G-CA----TGCAAGTGTTAGG----AATTTACACAAA-CTTA---C--AT-AAAAAAG--GCAAACTCGT-----TCATAAGC--AAA----------A-C-TTC-TGTGTAAGGAAAAGGTGAAACAATGA---GC-GGAA-----ATAT--A-G-TTTTGTGTC--AATATTAGCT-AAACACTGATCCAGGCG-ATATATATGCTTA---GTAAAGCTCTGAG--AAAGTTATAT-GTAGTGCGTTTTGTAGTGTATAAATGG-CACAAACAGTACAGTGAGGCACGAGAAACA-ATA-------------ATA----TGTG--GT----CGCCCTGTGTCAAAATCACAT-----TGACATCACATC------------AAA---GTGGTAAACAGTGCA-----T-CAATAAG
gi|144525 : ATTTCT----TACTATGTCAGTAAT---CATGTTA--------TGGTTTCCATAGCAATATG-CATACTTGGTTACCGGTAGTGCTGCAGCTCAAA-----AT-G-TTTAACAG-TTTG-A-----CAGGTGAGAATGTG-A
gi|144526 : TTTTT----TA----GTATATAAT---AATGTTA--------TGGTATCCATAGCAACATA-CATACAGAA-CT-----AGTGCCGCAGCTTCAA-----ATGT-TTGA-CAA-TTCG-A-----CAGATAATCATGTG-AAAAATA-ACAATC-CTT----TTCCT--TA--ATACTCGAGGTGAAGCATAT-AT---TA-TTGAGAACACAT-CATCAATGTCTGCA--T-G----T-GT-----CATTC------AA------G------C------A------T-----G------G-TA----CGCAGGTGTTAGG----AGTTTACATTTA-CTTG---T--AT-TGAAAAG--GTAGACTCAT-----TCATATGC--AAA------TAGTG-C-ATC-TG----GTGAAAAGGCGAAACAACGA---GC-AGCA-----ATAC--A-G-TTTGT-GTC--AATATTA-CACAAACACTGA-TCAGACG-ATAGATATGCATA---ATAAAGTTCAGAG--GAAGTTATTT-GTAGTGCATTTTATAGTCTACAAATGA-CACAAACGGTACAGTGAGGAAAGAGAAAGA-ATAATGGATGAT-AACAGG----TGTG--G-----CGTCTTGTGTCAAAATCAAGC-----AAA-GTCACGTC------------AAC---GTGGTAACAAaa
gi|144527 : TTCT----TA------CAGTAATTATAATGTCA--------TTGTATCCATGGCAACATG-CATACATGG--------------GTAGC---------------------AG-TTTG-G-----TAG-TAAATATGTG-AAAAATA-TTAAGT-GTC----TCCTT-GTACAACACC--------------T-AT---TA-TTGACGATACGT-CGTCATTATCTGCA--T-----AC-GT-----CATTA------CA------G--------------------T-----T------A-TAAAAATGC--GTGTTAAG----GATTTAAA-CAT-CC-C---T--AC-T-----T--TTTG--GCA-------CGCAAGCCGGAA------T-GT--C-GTC-TG----AAGAAAAAATGAAACAACAA---GCGACTACATATATAC--A-GTTTTGG-GTA--AACA-TAGGA-AAACACCGGTCAAGGCGAATAAAT-TGCTTACTTGTAAAg
gi|144528 : T---AATATTA--------TATTATCTATAGCAACATG-CATACATGGGTG-----AGCACCGCAACTCAAA-----AT-A-ATGAAAAA-TTTGTA-----GAGTC-AACATGTG-AAAAATG-ATGAGT-GTG----TCCCT-ACA--AGATTCGCAGGAAATCATAtggtacactgagggataaaaataatgacatgtgtaatcgcattgtgtcaaaatcgagcaaa
gi|144529 : ATAGCAACATA-CGTACATGA-TT-----GATGCCGCAGCTCAAATCAAAAT-G-TTGAACAA-TTTG-A-----GAGTTAAATATGTG-AAATATA-ACAATC-ATT----TCCCT-GTA--AAACTCGCGGTGAATCATAT-GT---TA-TTGAAGACACGT-CATCAATGTCTGCA--T-G----T-GT-----CATTC------CA------G------C------A------T-----T------G-TG----CGCAGGTGTTAGG----AGTTTAACTAAA-CTTA---T--AT-TGAAAAG--GTAGACTCAT-----TCATATGC--AAA------TAGTG-C-ATC-TG----ATGAAAAGATGAAACAACGA---GC-AACA-----ATAC--A-G-TGTGT-ATC--TATATTAGCA-AAACACTGATTCAGACG-ACAGATATGCATA---GTAAAGCTCCGAG--AAAGTTATTT-GTAGTGCA
gi|144530 : -----AGTGCTAAAGCTTAAA-----AT-G-TTGAATAA-TTTG-A-----CAGGTAAGTATGC--ACAAATA---AACG-AGT----TCCCA-GTA--AAATTTGCGGTACCTCATAT-AT---TA-GTAAAGGCAC
gi|144531 : AAA-----GT-G-TTGAACAA-TTCG-A-----CAGTTAGATATGTG-AAATATA-ACAATC-ATT----TCCCT-GTA--AAACTCGCTGTCAATGATAT-AT---TA-TTGAAGACACGT-CATCAATGTCTGCA--T-----AT-GT-----CATTC------CA------G------C------A------T-----T------G-CA----AGCAGGTGTTAGG----AGTTTAAGT--A-CTTTTA-T--AT-TGAAA--------------------CATATGC--AAA------TAGTG-C-ATC-TA----ATGAAAAGATGAAACAACGA---GC-AGCA-----ATAC--A-G-TTTGT-GTC--AATATTAGCA-AAACATTGA-TCAAACG-ATAGATATGCATA---GTAAAGCTCCGTG--AAAGTTATTT-GTAGT--ATTTTGTAGTCTACAAATGA-CACAAACGATAgt
gi|144532 : GATCAA-TTTG-A-----CA--TAAATATGTG-AAAAATA-ACAATC-ATT----TCCTT-GTA--AATCTCATTGTAAATCATAT-AT---TG-CTTAGGACGTGT-CATCAATGTATGCA--T-----AT-GC-----CATTC------CAAAAAAAG------C------A------T-----G------G-CA----GGCAAGTGTAAGA----AGTTCAAACAAA-CTAA---A--AT-TGAACAG--GTAGATTCGT-----AAACAAAC--AAA------AATTG-C-GTC-TG----AGAGAAAGGTGAAACAACGAACGGC-AATT-----ATGCCAA-G-TTTTATGTC--AGTATAAGCA-AAACACCGATCCAGACG-ATAGATATGCTTA---GTAAAGCTTTACG--AATGTTGTTT-GTATTGCATTC--TAGTCAACAATTGA---------GTA---TGAGAAACAAGAAACATATA
gi|144533 : ACAAATTTGTG-AATAATA-ACAGTC-ATT----TTCCC-GTA--ACACTCGCGGTAAATCATAT-AT---AA-TTGAGGACACGG-CATCAATGTCTGCA--T-GACAAT-GT-----CATTC------CA------G------C------A------T-----T------G-CA----CGCAGGTGGTAGG----AGTTTAAATCAA-CTTT---T--TT-TGAAAAT--GTAGATGCACTCATATCATATGC--AAA------TAGTG-C-ATC-TG----ATGAAAAGGTAAAATAACGA---GC-AGTA-----ATAC--A-G-TTTAA-GTC--AATATTAGCA-AAACACTGATTCAGACG-ATAGATATGTATA---GTAAAGCTCCGAG--AAA------T-GTA------TTTGTAGTCTACAGATGA-TACAAACGATACAGTGAGGAACGAAAAACA-ATAATGGATGAT-AATATA----TGTG--GT----CGCCCTGTGTCAAAATCGCGT-----CAATGTCACGTT------------AAC---GTCGTAAAAACTGCCTTTAGT-TAATAAGcatatcataa
gi|144534 : TATGTG-AAAAATT-ACTATC-ATT----TTCCC-GTG--AAACTCGCGGTATATCATAT-AT---
gi|144507 : ATCAA-TGTC---TGCAT-TTGAAAT--GTAGATGCAT-----TCATATGC--AAT------TAGTG-C-ATC-TG----ATGAAAAGGCGAAACAACGA---GC-CATA-----ATAC--A-G-TTTAA-GTC--AATATTAGCA-AAACACTGATTCAGACG-ATAGATATGTATA---GTAAAGCTCCGAG--AAAGTTATTT-GTAGTGCATTTTGTAGTCTACAGATGA-CACAAACGGTACAGTGAGGAACGAGAAACA-ATAATGGATGAT-AAC--A----TGTG--GT----CGCCCTGTATCACAATCGCGT-----CAATGTCACGTA------------AAC---GTGGTAAAAACTGCC-----T-TAATAAG
gi|144535 : gtatatttcttatgtcagtaataatgttatggtatccatggcaacatacatacatgataagtgccgcagctcaaaatgttgaacaattcgacagacaaatgtgtgtataataacaatcattttcccgtaacactcgcggtaaatcatatattattgaggacacggcTGC--AAA------AACTG-C-ATC-TA----CGGAAAAGGTGAAACAAAGA---AC-GGCA-----ATAC--A-G-TTTG--GTCTCAATATAAGCA-AAATATCGATCCAGATG-ATATATATGCTTA---GTAAAGCTCTGAG--AAAGTAATTTAGT-GTGCGTTCTGTAGTCTATAAATGG-AACAAATGGTACAGTGAGGAACAAATAACA-ATCATCGATGAC-AACAGG----TGTG--GT----TGCCCTGTGTCGAAATCGCAT-----CAACGTCACACC------------AAC---GTGGTAAAATGTGTC-----G-TAATA
gi|144536 : -ATCGTG----AAGAAAACGTGAAACAACGA---GCGAGT------ATAC--A-GTTTTGT-ATC--CGTATTAGCA-AAACATCGGTCCAGACG-GTCGA
gi|144537 : AGCA-AAACACTGATTCAGATG-ATAGATATGCATA---GTAAAGCTCCGAG--AAAGTTATTT-A-AGTGCATTTTGTAGTCTACAAATAA-CACAAACTGTACAGTG-GGAAAGAGAAACA-ATAATGGATGCT-AACAGG----TATG--G-----CGTCCTGTGTCAAGATCAAGC-----AAA-GTCACGTC------------AAC---GTGGCAAAACGTGCC-----T-CAATAAG
gi|144538 : gtgtcattccG-ATAGATATGCATA---GTAAAGCTCCGAG--AAACATATTT-ATGGTGAATTTTGTAGTCTACAAATGA-CACAAATGGTACAGTGAGAAATGAGAAACA-ATAATGGATGCT-AACAGG----TATG--G-----CATCCTGTGTCAAAATCAAGC-----AAA-GTCACGTC------------AAC---GTGGTAAAATGTGCC-----T-CAATAAG
gi|144527 : AAATGGTACACTGAGG---GATAAA-A-ATAATG--------ACATG----TGTA--AT----CGCATTGTGTCAAAATCGAGC-----AAA
gi|144539 : ttcttacagtaattataatgtcattgtatccatggcaacatgcatacatgggtagcagtttggtagtaaatatgtgaaaaatattaagtgtctccttgtacaacacctattattgacgatacgtcgtcattatctgcatacgtcattacagttataaaaatgcgtgttaaggatttaaacatccctactttttggcacgcaagccggaatgtcgtctgaagaaaaaatgaaacaacaagcgactacatatatacagttttgggtaaacataggaaaacaccggtcaaggcgaataaattgcttacttgtGC-----AAAT-TCACGTC------------AAT---GTGGTAAAATATGCC-----T-CAATAAG
Alignments
lowQualScore : 3333333 111111 222222222222 111111111 11111 111111
lowQualScore : 3333 222 222 55555555 0 444444 1 33333 1 33333 1 1 1 0 1 33333 222 1 5 6666666 222222 444444 8888888888888 444444 333333333333 1 3333 333 222 0 3333 1 1 1 22 222222222 44 44 1 1 1 77777 44 555 4 33 1 1 3 1 1 222 22 1 0 1 1 1 1 4 7777 55 11111 888888 55 999999999999 333 1 6 55555 2
lowQualScore : .... ... ... ........ . ...... . ..... . ..... . . . . . ..... ... . . ....... ...... ...... ............. ...... ............ . .... ... ... . .... . . . .. ......... .. .. . . . ..... .. ... . .. . . . . . ... .. . . . . . . . .... .. ..... ...... .. ............ ... . . ..... .
lowQualScore : 3333 777 666 44444444 9 111111 4 33333 3 22222 2 2 2 9 2 11111 333 3 9 1111111 555555 888888 6666666666666 888888 000000000000 8 9999 000 555 2 9999 1 8 0 44 111111111 00 66 0 5 7 11111 00 999 8 22 6 6 4 5 0 888 33 7 1 7 7 7 7 0 7777 00 11111 999999 77 333333333333 222 8 5 33333 1
consensus : GTGCATTTCT----TA---TGTCAGTAAT---AATGTTA--------TGGTATCCATAGCAACATGCATACATGGT------T-AGTGCCGCAGCTCAAA-----ATGTTGAACAA-TTTGA-----CAGA-TAAATATGTG-AAAAATA-ACAATCA-TT-----TCCCTGTAAAACTCGCGGTAAATCATATAT---TA-TTGAGGACACGTCATCAATGTCTGCA-T-GA---TGTCATTC------C------AG------C------A------T-----T------G-CGCGCAGGTGTTAGG----AGTTTAAACAAACTT---ACAT-TGAAAAGGTAGA----CTCGT-TCATANGC--AAATA------GTG-C-GTCTGANGAAAAGGTGAAACAACGAGCGGC-A-----ATAC--A-G-TTT-G-TG-TCAATATTAGCA-AAACACTGATCCAGACG-ATAGATATGCNTA---GTAAAGCTCCGAG--AAAGTTATTT-GTAGTGCGTTTTGTAGTCTACAAATGA-CACAAACGGTACAGTGAGGAACGAGAAACA-ATA-ATGGATGAT-AACANG----TGTG--GT----CGCCCTGTGTCAAAATCGCGT-----CAAC-GTCACGT------------CAAC---GTGGTAA-AAGGTGCC-----TC-AATAAG
Reference ( family-559 ) : GTGCATTTCT----TA---TGTCAGTAAT---AATGTTA--------TGGTATCCATAGCAACATGCATACATGGT------T-AGTGCCGCAGCTCAAA-----ATGTTGAACAA-TTTGA-----CAGA-TAAATATGTG-AAAAATA-ACAATCA-TT-----TCCCTGTAAAACTCGCGGTAAATCATATAT---TA-TTGAGGACACGTCATCAATGTCTGCA-T-GA---TGTCATTC------C------AG------C------A------T-----T------G-CGCGCAGGTGTTAGG----AGTTTAAACAAACTT---ACAT-TGAAAAGGTAGA----CTCGT-TCATANGC--AAATA------GTG-C-GTCTGANGAAAAGGTGAAACAACGAGCGGC-A-----ATAC--A-G-TTT-G-NG-TCAATATTAGCA-AAACACTGATCCAGACG-ATAGATATGCNTA---GTAAAGCTCCGAG--AAAGTTATTT-GTAGTGCGTTTTGTAGTCTACAAATGA-CACAAACGGTACAGTGAGGAACGAGAAACA-ATA-ATGGATGAT-AACANG----TGTG--GT----CGCCCTGTGTCAAAATCGCGC-----CAAC-GTCACGT------------CAAC---GTGGTAA-AAGGTGCC-----TC-AATAAG
gi|144502 : GTATATTTCT----TA---TGTCAGTAAT---AATGTTA--------TGGTATCCATAGCAACATACATATATGAT------A-AGTGCCGCAGCTCAAA-----ATTTTGAACAA-TTTGA-----CAGA-CAAATATGTG-AGTAATA-ACAATCA-TT-----TTCCCGTAACACTCGCGATAAATCATATAT---TA-TTGAGGACACAGCATCAATGTGTGCA-T-GACAATGTCATTC------C------AG------C------A------T-----T------G-CACGCAGGTGTTAGG----AGTTTAAATCAACTT---CTAT-TGAAAATGTAGA----TGCAT-TCATATGC--AAATA------GTG-C-ATCTGATGAAAAGGTGAAACAACGAGCAGT-A-----ATAC--A-G-TTT-A-AG-TCAATATTAGCA-AAACACTGATTCAGACG-ATAGATATGCATA---GTAAAGCTCCGAG--AAAGTTATTT-GTAGTGCATTTTGTAGTCTACAGATGA-CACAAACGGTACAGTGAGGAGCGAGAAACA-ATA-ATGGACGAT-AACATA----TGTG--GT----CGCCCTGTGTCAAAATCGCGC-----CAAT-GTCACGT------------TAAC---GTGGTAA-AAACTGCC-----TT-AATAAG
gi|144503 : GTATATTTCG----TA---TGTCAGTAAT---AATGTTA--------TGGTATTCATAGCAACAAACATATATGAT------T-AGTGCCACAGCTCAAA-----ATGTTGAACAA-AC-GA-----CAGT-TAAATATGTG-AAAAATA-ACAATCA-TT-----TCCCTGCAAAACCCACGGTGTATAATATAT---TA-TTGAAGACACGTCATCAATGTCTGCA-T-G----TGTCATTT------C------AG------C------A------T-----T------G-CGCACAGGTGTTAGG----ACTTTAAATAAACTT---ATAT-TGAAAAGGTAGA----CTCAT-TCATATGC--AAATA------GTG-C-ATCTGATGAAAAGGTGAAACAACGAGTAGC-A-----ATAG--A-G-TTT-G-TG-TCAATATTAGAC-AAACACTAATTCAGACG-ATAGATATGGACA---G-AAAACTCCAAG--AAAGTTATTT-GTAGTGCATTTTGTGGTTTACAAATGA-CACAAACGATACATTGAGGAATGAGAAACA-ATA-AATGATGAT-AACAAG----TGTG--G-----CAACCTTTGTCAAAATCATG------CAAA-GTCATGT------------CAAC---ATGGTAA-AAAGTGCC-----TC-AATAAG
gi|144504 : GTATATTTCT----TA---TGTCAGTAAT---AATGTTA--------TGGTATCCATAGAAACATATATACAAGAA------T-ATTGCCACACCTCAAA-----ATGTTGAACAA-TTCGA-----CAGA-TAAATATGTG-AAAAATA-ACAATCA-TT-----TTCCTGTAACGCTCGCGGTGAAGCATATAT---TA-TTGAGGACACGTCATCAATGTCTACA-T-G----TGTCATTC------C------AG------C------A------T-----G------G-CGCGCAGGTATTAGG----CGTTTAATTAAACTT---ATAT-TGAAAAGGTAGA----CTCAT-TCATATGC--AAACA------GTG-C-ATCTGATGAAAAGGTGAAACAACGAGCAGC-A-----ATAT--A-G-TTT-G-TG-TAAATATTAGCA-AAACACTGAT-TAGACG-AGATATATGCATA---GTAAATATCCGAGAAAAAATTATTT-ATAGTGCATTTTGTTGTCTACAAATGA-CAAAAACAGTACAGTGAAGAACGAGAAATA-ATA-ATGAATGTT-AACAGG----TGTG--G-----CGCCCTGTGTCAATAT----------CAA--GTCACGT------------CAAC---GTGGTAA-AA-GTGCC-----TC-AATAAG
gi|144505 : GTATATTTCA----TA---TGTCAGTAAT---AATGTTA--------TGGTATCCATAGCAACATACATGCATGAA------T-AGTTCCGCAGCTCAAA-----ATGTTGAACAA-TTCGA-----CA-----------------AATA-ACAATCAATT-----TTCCCATAACACTCGCAGTGAATCATATAT---TA-TTGAGGACATGTCATCAATGTCTGCA-T-GACAGTGTCATTC------C------AG------C------A------T-----T------G-CGTGCAGGTGTTAAG----AGTTTAAATAAACTTTACATAT-TGAAAAGGTAGA----CTCAT-TCATATGC--AAATACCGGTAGTG-C-AGCTGATGAAAAGGTGAAACAACAAGCAGC-A-----ATAC--A-G-TTT-G-GG-TCAATATTAGCA-AAACACTGATTCAGACG-ATAGATATACATA---GTAAAGCTCTGAG--AAAGTTACTT-GTAGTGCATTTTGTAGTCTACAAATAA-CACAAATGGTACAGTGAGGAACGAGAAACA-ATA-ATAGATGAA-AATCGG----TGTG--G-----CGTCCTGTATTAAAATCACG------CAAA-GTCACGT------------CAAC---GTGGTTA-AA-GTGCC-----TC-AATAAG
gi|144506 : ATTTCT----TA---TGTCAGTAAT---AATGTTG--------TGGTATCCATAACAACATACAAACATGAT------A-AGTGCCGCAGCTCAAT-----ATGTTGAAAAA-TTTGA-----CAGA-CAAATATGTG-AATAATA-ACAATCA-TT-----TTCCCGTAACACTCGCGGTAAATCATACAT---TA-ATGAGGACACGGCATCAATATCTACA-T-GACAATGTCATTC------C------AG------C------A------T-----T------G-TACGCAGGTGTTAGG----AGTATAAATCAACTT---CTAT-TGAAAATGTAGA----TGCAT-TCATATGC--AAATA------GTG-C-ATCTAATGAAAAGGTAAAACAACGAGCAGT-A-----ATAC--A-G-TTT-T-AG-TCGATATTAGCA-AAACACTGATTCAGACG-ATAGATATGTGTA---GTAAAGCTCCGAG--AAAGTTATTT-GTAGTGTATTTTGTAGTCTACAGATAA-CACAAACGATACAGTGAGGAACGAGAAACA-ATA-ATGGATGAT-AACATA----TGTG--GC----CGCCCTGTGTCAAAATCGCGT-----CAAT-GTCACGT------------TAAC---GTGTTAA-AAACTGCC-----TT-GATAAG
gi|144507 : gtttGTATATTTCT----TA---TGTCAGTAAT---AATGTTA--------TGGTATCCATGGCAACATACATACATGAT------A-AGTGCCGCAGCTCAAA-----ATGTTGAACAA-TTCGA-----CAGA-CAAATGTGTG-TATAATA-ACAATCA-TT-----TTCCCGTAACACTCGCGGTAAATCATATAT---TA-TTGAGGACACGGCATCAATGTCTGCA-T-
gi|144507 : T---GCAT-TTGAAATGTAGA----TGCAT-TCATATGC--AATTA------GTG-C-ATCTGATGAAAAGGCGAAACAACGAGCCAT-A-----ATAC--A-G-TTT-A-AG-TCAATATTAGCA-AAACACTGATTCAGACG-ATAGATATGTATA---GTAAAGCTCCGAG--AAAGTTATTT-GTAGTGCATTTTGTAGTCTACAGATGA-CACAAACGGTACAGTGAGGAACGAGAAACA-ATA-ATGGATGAT-AACA------TGTG--GT----CGCCCTGTATCACAATCGCGT-----CAAT-GTCACGT------------AAAC---GTGGTAA-AAACTGCC-----TT-AATAAGttgaaatgtagatgcattcatatgcaattagtgcatctgatgaaaaggcgaaacaacgagccataatacagtttaagtcaatattagcaaaacactgattcagacgatagatatgtatagtaaagctccgagaaagttatttgtagtgcattttgtagtctacagatgacacaaacggtacagtgaggaacgagaaacaataatggatgataacatgtggtcgccctgtatcacaatcgcgtcaatgtcacgtaaacgtggtaaaaactgccttaataag
gi|144508 : gtatatttcttatgtcagtaataatgttatggtatccatggcaacatacatacatgataagtgccgcagctcaaaatgttgaacaattcgacagacaaatgtgtgtataataacaatcattttcccgtaacactcgcggtaaatcatatattattgaggacacggcatcaatgtcGTGCATTTCT----TA---TATTAATAAT---AATGTTA--------CGGTCTCCATAGCAACATGCATGCATGGT------T-AGTGCCACAGCTCAAA-----TTGTTGAACAA-TTTGA-----CAGA-TAAATATGTG-AAAAATA-ACAATGA-TT-----TCCATGTAAAACTCACGGTAAATCATATAT---TATTTGATGACAAGTCATCAATGTCTACATT-G-----GTCATTC------T------AG------T------A------C-----TAGTATGG-TGCGCAAGTGTTAGG----AGTTTAAACAAAATT---ACAT-AAAAAAGAAAAA----CTTAT-TAATAAGC--AAAAT------TTC-C-ATCTGAGAAAAAAGTGAAACAACGAGCGGA-A-----ATAC--ATT-TTT-G-TG-TCAAAATTGGCA-AAACACTGATCCAGGCG-ATATATCTGTTTA---GTAAAGCTCTGAG--AAAGTTATTT-GTAGTGTGTTTTGCAGTCTATAAATGG-CACAAATGGTACAGTGAAGAACAGGAAACA-ATA-ATGGATGAT-AACATGACATTGTGTTGT----CGCCCTGTGTCAAAATTCTAT-----CAAC-GTCGTGT------------CAAT---GTGGTAA-AAGGTGCC-----TT-AATAAG
gi|144509 : GTGCATTTCT----TA---TGTTAATAAT---AATGTTA--------TGGTCTCCATAGCAACATGCATACATGGT------T-AGTGCCGCAGCTCAAA-----TTGTTGCACAA-TTTGA-----CAGA-TAAATATGTGAAAAAATA-ACAATTA-TT-----TCCCTGT-AAACTCGCGGTAAATCATATAT---TA-TTGATGACACATCATAAATGTCTACATT-G-----GTCATTTTAGTAAT------AG------T------A------T-----G------G-TGCACAAGTGTTTGG----AGTTTAAACAAACTT---ACATAAAAAAAGGTAAA----CTTGT-TAATAAGC--AAAAT------TTC-C-ATTAGAGAAAAAGGTAAAACAACGAGCGGA-A-----ATAC--ATT-TTT-G-TG-TCAAAATTAGCA-AAACGCTGATCCAGGCG-ATATATATGCTTA---GTAAAGCTCTGAG--AAAATTATTT-GTAGTGTGTTTTGTAGACTATAAATGG-CACAAATGGTACAGTGAGGAA-AATAAACA-ATA-TTGGATGCT-AACATG----TGTG--GT----CACCATGTGTCAAAATCGCAT-----CAAC-GCCATGT------------CAAC---GTGGTAA-AAGGTGCC-----TC-AATAAG
gi|144510 : GTACATTTTT----TA---TGTTAATAAT---AATGTTA--------TGGTCTCCATAGCAACATGCATACATGGT------T-AGTGCCGCA-----------------GAACAATTTTGA-----CTGA-TAAATATGTG-AAAAATA-ACTATGA-TT-----TTCCTGTAAAACTCGCGGTAAATCATATAT---TA-TTGATGACACGTCATCAATGTCAGCATT-G-----GTCATTCTAG---T------AG------T------A------T-----G------G-CACGCAAGTGTTAGG----AGTTAAAACAAACTT---ACAT-AAAAAAGGGAAA----CTTGT-TAACAAGC--AAAAT------TTC-C-ATCCGAGAAAAAGGTGAAACAACGAGCGGA-A-----ATAC--ATT-TTT-G-TG-TCAAAATTAGCA-AAACACTGATTCAGGCG-ATATATCTGTTTC---GTTATGCTCTGAG--AAATTTATTT-GTAGTGTGTTTTGTAGTCTATAAATGG-CACAAATGGTACAATGAGGAACAGGAAACA-ATA-ATGGATGAT-AACATGACATTGTGTCAT----CGCCCTGTGGCAAAATCGCAT-----CAAC-GCCATGT------------CAAC---GTGATAA-AAGGTGCC-----TCTAATA
gi|144511 : GTGTATTTCTAAAGCA---TGTCAGTACT---AATTTTA--------TGGTA--------ACCATGCATACATGTT------T-AGTGCTTCAGTTCATA------TGTTGAACAA-TTTGA-----CAGA-TCAGTATGTG-AAAAATA-ACAATAG-TT-----TCCATGTAAA-CTCGCAGTAAATC-TATAT---TA-TTGAGGACATGTCATCAAAGACTGCA-T-AA----GTCATTC------C------AGTAATAGC------A------A-----T------G-TGCGCAAGTGTAAGG----AGTTTAAACAAATTT---AAAT-TTAAACGGTAAA----CATGT-TCACAAGC--AAA-A------TTGAC-ATCTGAAAAAAAGGTGAAACAATGAGTGTC-A---------------TTT------------TTAGAA-AAATACTGATACAGACG-ATCGATACGCTTT---GTAAAGCTCTGAA--AATGATATCT-GTAATGTGTTCTGCAGTCTACAAATGG-CACAAATG--ATAGTCAGGAACGAGAAACA-CTA-ATGTATGAT-AACAGG----TGTT--GTATGCCATCCTTTGTCAAAATCCTGC-----AAAA-GTCATGT------------CAACAAAGTGGTAA-AAGATGCC-----T--AACAAG
gi|144512 : GTGCATTTGT----TA---CGTCAGTAAT---ACTGTTA--------TGGTATCCATAGCAACTTGCATACATGGT------T-AATGCCGCAGTTAAAA-----TTGTTGAACAA-TTTGA-----CAAG-TAAAT-----------TA-ACAATCG-TT-----TCCATGTAAAACTTGCAGTTATTCATATATAATTA-TTGATGACATGTCAT--------GTA-T--A---CGTCGTTC------C------AG------T------A------T-----TAGCAATG-CGCACATGTGTTGGG----AATTTAATCAAACTT---ACAT-TACATA---AGA----CACGT-AAACGTGC--AAA-A------TTC-T-GTCTAAAGGAAAAGTGAAACAACGAGCGGC-G-----ATAC--A-G-TTTTG-TG-TCAATATTAGCA-TAACACCGATTCAGACA-ATGGATATGATTA---GTAAAGCTCCGAG--AAAGTCATCT-ATAGTGCGTTCTGTAATCAACAAATGG-TACAACTGGTTCAGTGAGAAGCGATCAACA-ATA---------------------TGTG--GT----CGATCTGTGTCAAAATTGCGCAAACGTAAC-GTCACGTTAAAAGGTCGGTCAAC---GTGATAA-AA-ATGCC-----TC-AACGAG
gi|144513 : GTATATTTCT----TA---TGTCAGTAAT---AATGTTA--------TGGTATCCATAGCAACATACATACATGAT------A-AGTGCCGCAGCTCAAA-----ATGTTGAACAA-TTCGA-----CAGA-CAAATATGTG-AATAATA-ACAATCA-TT-----TTCCCGTAACACTCGCGGTAAATCATATAT---TA-TTGAGGACACGGCATCAATGTCTGCA-T-G
gi|144514 : T----TA---TATCAGTAAA---AATGTTA--------TAGTATTCATTGCAACATACATACACAAT------T-AGTCCCGCAGCTCAAA-----ATGTTGAACAG-CTCGA-----CAGA-TAAATATGTG-AAAAATA-ACAATAA-TT-----TTCCTGTAAATCTCACGTTAAAACATATAT---TA-TTGAGAACATGTCATCAATGTCTGCA-C-AACAGTGTCATTC------C------AG------C------A------
gi|144515 : gtatatTTTTT----TA---TGTTAAAAAT---ATTGTTA--------TGGTCTCCATAGCAACATGCATACATGGT------T-TGTGTTGCAGCTCAAA-----ATGCTGAACAA-TTTGA-----CAGA-TAAATATGTG-AAAAATATAAAATAA-TT-----TCCCAGTAAAACTCGCGGTAAATCATATAT---TA-CTGAGGACACATCAACAATGTCTGCA-T--A---GGTCATTC------C------AG------T------A------T-----TAGTATGG-CATGCAAGTGTTAGC----AGTTTAAACAATCTT---ACAT-
gi|144516 : gcattGTGCATTTCT----TA---TGTCAACAAT---AATGTTAAGGACTTATGGTATCCATAGCAACATGCATGTATGGT------T-AGTGCACCAGCTCAAA-----ATGTTGAGCAA-TTTGA-----CAGA-TAAATATTTG-AAAGATA-ACATTCA-TT-----TGCCTGTATAAC-------ATATCA-ATAT---TA----AGGACACGCCATCAATGTCTGCA-
gi|144517 : GTGCATTTCT----TA---TGTTAATAAT---AATGTTA--------TGGTCTCCATAGCAACATGCATACATGTT------A-AGTGCCGCAGCTCAAA-----GCGTTGATCAG-CTTGA-----CAGA-TAAATATGTG-AAAAATA-AC--TGA-TT-----TCC--------CTCGTGGTAAATCATATAT---TA-TTGAGGACACATCATCAATGTC
gi|144518 : GTGCATTTCT----TA---TGTTAATAAT---AATGTTA--------TGGTCTCCATAGCAGCATGCATACATGGT------T-AGTGCCGCAGTTCAAA-----TTGTTAAACAA-TTTGA-----CAGA-TAAATATGTG-AAAAATA-ACAACGA-AT-----TTCCTGTAAAACTTGCCGTAAATCATATAT---TA-TTGATG-CGTGTCAT
gi|144519 : TTTCT----TA---TGTCAGTAAT---AATGTTA--------TGGTATCCATAGCAACATACATACAGGAT------T-AGTGTCGCAGCTCAAA-----ATGTTAAACAA-TTCGA-----CAGA-TAAATATGTG-AAAAATA-ACAATAA-TTGATTTTCCCTGTAACACTCGTGGTGAAGCCTATAT---TA-TTGAGAACACGTCATCAATGTTTGCA-T-G----TGCCGTTC------C------AG------C------A------T-----G------G-CGCGCAGGTGTTAGG----AGTTTAAATAAATTT---ATAT-ATAAAAGTTAGA----CGCAT-TCATATGC--AAATA------GTA-C-ATCTGATGAAAAGGTGAAG----GAGCAGC-C-----ATAC--A-G-TTT-G-TG-TCAATATTAGCA-AAACACTGA-CCAGACG-ATAGATATGCATA---GTAAAGCTACGAG--GAAGTTATTT-GTAGTGCATATTATAGTCTACAAATGA-CACAAACGGTATAGTGAGGAACGAGAAACA-ATA-ATAGATGAT-AACAGG----TGAG--G-----CGTCCTGTGTCAAAATCAAG------TAAA-GTCACGT------------CAAT---GTGGTAA-AAGGT
gi|144520 : tattTGTATTTCT----CA---CGCCAGTAAT---AATATCA--------TGGTATACAAAGAGGCATGCATTTATAGG------G-AACGCCGCAGCTCAAA-----ATATTGAAAAG-TTTAA-----CAGG-TAAACATACG-AATAA-A-ACAATCG-TT-----TCCCTGT-----------TAAATTACAGAA---GA-TT---GTCCCGTCATCAATATCTACA-T--A---TGTCATTT------C------AG------TGATGAAA------T-----T------G-CACCTAAGTGTTAGAAACTAACTTGAACAAACGC---ACAT-TAAAAACA-AAA----TGTAT-GCACGAGC--AAA-A------ATGCC-GTCTGAAGAACGCGCGAATCAAAGATTTGC-T-----GTACA-A-A-TTT-GATG-TCAATATTAGCG-CAACACCGGTCCCGACG-AT--------TTA---CTCAAG------A--AAAATCCTTT-GTTACGCGTTCTTTCATTTA-AAACAAGCACACGTGACACGGTGAGGGATGAAAAATA-ATA-ATGGGTGAC-AACATG----TATG--GT----CAA---GTTTCAAAATCGCG------CAACAATAGCAT------------CATC---TTAGTGA-AAaacgtaaaaag
gi|144521 : TACACTCCT----T-----GTCCGTAAT---GATATTG--------TCATTTTAATAGCAA------TAAA--GC------T-GGTGCCGCAGCTCAAA-----ATGGTGAACAA-GGTAAGGATGCAAA-AAAAAACAAC-AAAAA-A-ACAATCG-TA-----TCTCTGTAAAATTTACAATAAATCATTTAT---TA-TTAATGATACGTTATCAATGTCTTCG-T--A---TGTCATTT------C------AG------T------A------T-----T------
gi|144522 : ATTTGT----TA---TGTTAATAAT---AATGATA--------TGGTCTCCTTAACA-CATGCATACATGTT------T-AGTGCCGCAGCTCAAA-----ATGTTGAACCA-TTTGA-----CAGA-TAAATATTTG-AAAAATA-ACAATGA-TT-----TCCCTGTAAAACTCGTGGTAAATCATATAT---TA-TTGAGGACATGTCATCAATGTCTATA-TTG-----GTCATTC------C------AG------T------A------TAAGTAT------GGTGTGCAAGTGTTAGG----AGTTTAAACAAACTT---ACAT-AAAATAGGCAAA----CTTGT-TCATAAGC--AAATC------TTC-C-GTCTGAGGAAAAGGTAAAACAACGAGCAGA-A-----ATAC--A-G-TTTTG-TG-TCAATATTAGCA-AAACACTGATCCAGTCG-ATATATATGCTTA---GTAAAGCTCCGAG--AAAATTATTT-GTAGTGCATTTTGTAGTCTACAGATGA-CACCAACGGTAGGGTGATGAACGAGAAACA-ATA-ATGGATGAT-AACATG----TGTG--GT----CGCCCTGTGTCAAAATCGTAT-----CAAC-GACACGT------------CAAC---ATAGTAA-AAGGTGCC-----TC-AATAAG
gi|144523 : ATTTCA----TA---TGTAAATAAA---AATGTTA--------TGGTCTCCATAGCAACATGCATACATGGT------T-AGTGCCGCAGCTCAAA-----GTGTTGAACAA-TTTCA-----CAGA-TAAATATTTG-GAAAATA-ACAATGG-TT-----TCCCTGTAAAACTCGCGGTAAATTATATAT---TA-TTGATGACACGTCATCAATGTCAACATT-G-----GTCATTCCAGTAAC------AG------T------A------T-----G------G-CGCGCAAGAGTTAGG----AGTTTGAACAAAATT---ACAT-AAAAAAGGCAAA----CTCGT-TAATAAGC--AAA-A------CTT-CTGTCTGAGGAAAGGGTGAAACAACGAGC--------------------TTT-G-TG-TCAATATTAGCA-AAAGTCTGATCCAGGTG-ATATATATGCTTA---GTAAAGCTCCGAG--AATGTTATTT-GTAGTGTGTTTTGTAGTCTTTAAATGG-CACAAACGGTACAGTGAGGAACAAGAAACA-ATA-ATGGATGATAAACATG----TGTG--AT----CTCCCTGTGTCAAAATCGCGT-----CAAC-GTCACAT------------CAAC---GTGGTAA-AAGGTGCC-----TC-AATAAG
gi|144524 : ATTTCT----TA---TGTTAATAAT---AATGTTA--------TGGTCTCCGTAGCACAATGCACACATGTT------A-AGTGCCGCAGCTCAAA-----ATGTTGAACAA-TTTGA-----CTGA-TAAATATGTG-AAACATA-ACACTGA-TT-----TCCCTGTAAAACTC-TAGTAAGTCATATAT---TA-TTGAGGACATGTCATCAATGTCTGCA-T--A---GGTCATTC------C------AG------T------AATAATAT-----G------G-CATGCAAGTGTTAGG----AATTTACACAAACTT---ACAT-AAAAAAGGCAAA----CTCGT-TCATAAGC--AAA-A------CTT-CTGTGTAAGGAAAAGGTGAAACAATGAGCGGA-A-----ATAT--A-G-TTTTG-TG-TCAATATTAGCT-AAACACTGATCCAGGCG-ATATATATGCTTA---GTAAAGCTCTGAG--AAAGTTATAT-GTAGTGCGTTTTGTAGTGTATAAATGG-CACAAACAGTACAGTGAGGCACGAGAAACA-ATA-AT-------------A----TGTG--GT----CGCCCTGTGTCAAAATCACAT-----TGAC-ATCACAT------------CAAA---GTGGTAA-ACAGTGCA-----TC-AATAAG
gi|144525 : ATTTCT----TACTATGTCAGTAAT---CATGTTA--------TGGTTTCCATAGCAATATGCATACTTGGTTACCGGT-AGTGCTGCAGCTCAAA-----ATGTTTAACAG-TTTGA-----CAGG-TGAGAATGTG-AAA
gi|144526 : TTTTT----TA----GTATATAAT---AATGTTA--------TGGTATCCATAGCAACATACATACAGAAC------T-AGTGCCGCAGCTTCAA-----ATGTTTGACAA-TTCGA-----CAGA-TAATCATGTG-AAAAATA-ACAATCC-TT-----TTCCT-TAATACTCGAGGTGAAGCATATAT---TA-TTGAGAACACATCATCAATGTCTGCA-T-G----TGTCATTC------A------AG------C------A------T-----G------G-TACGCAGGTGTTAGG----AGTTTACATTTACTT---GTAT-TGAAAAGGTAGA----CTCAT-TCATATGC--AAATA------GTG-C-ATCTGGTGAAAAGGCGAAACAACGAGCAGC-A-----ATAC--A-G-TTT-G-TG-TCAATATTA-CACAAACACTGAT-CAGACG-ATAGATATGCATA---ATAAAGTTCAGAG--GAAGTTATTT-GTAGTGCATTTTATAGTCTACAAATGA-CACAAACGGTACAGTGAGGAAAGAGAAAGA-ATA-ATGGATGAT-AACAGG----TGTG--G-----CGTCTTGTGTCAAAATCAAG------CAAA-GTCACGT------------CAAC---GTGGTAACAAG
gi|144527 : TTCT----TA------CAGTAATTATAATGTCA--------TTGTATCCATGGCAACATGCATACATGGG------T-AG---------------------------CAG-TTTGG-----TAG--TAAATATGTG-AAAAATA-TTAAGTG-TC-----TCCTTGTACAAC---------ACC---TAT---TA-TTGACGATACGTCGTCATTATCTGCA-T--A---CGTCATTA------C------AG------TT-----A------TAAAAAT------G-CG------TGTTAAG----GATTTAAACATCCCT---ACTT-T-------TTGG----CACGC-----AAGCCGGAAT-------GT--C-GTCTGAAGAAAAAATGAAACAACAAGCGACTACATATATAC--A-GTTTT-G-GG-TAAACA-TAGGA-AAACACCGGTCAAGGCGAATAAAT-TGCTTACTTGTAAA
gi|144527 : AAATGGTACACTGAGG---GATAAA-A-ATA-ATG--------ACATG----TGTA--AT----CGCATTGTGTCAAAATCGAGC-----AAAtggtacactgagggataaaaataatgacatgtgtaatcgcattgtgtcaaaatcgagcaaa
gi|144528 : ttcttacagtaattataatgtcattgtatccatggcaacatgcatacatgggtagcagtttggtagtaaatatgtgaaaaatattaagtgtctccttgtacaacacctattattgacgatacgtcgtcattatctgcatacgtcattacagttataaaaatgcgtgttaaggatttaaacatccctactttttggcacgcaagccggaatgtcgtctgaagaaaaaatgaaacaacaagcgactacatatatacagttttgggtaaacataggaaaacaccggtcaaggcgaataaattgcttacttgtT---AATATTA--------TATTATCTATAGCAACATGCATACATGGG------TGAGCACCGCAACTCAAA-----ATAATGAAAAA-TTTG------TAGAGTCAACATGTG-AAAAATG-ATGAGTG-TG-----TCCCTACAAGATTCGCAGGAAATCATA
gi|144529 : ATAGCAACATACGTACATGAT------T-GATGCCGCAGCTCAAATCAAAATGTTGAACAA-TTTGA-----GAGT-TAAATATGTG-AAATATA-ACAATCA-TT-----TCCCTGTAAAACTCGCGGTGAATCATATGT---TA-TTGAAGACACGTCATCAATGTCTGCA-T-G----TGTCATTC------C------AG------C------A------T-----T------G-TGCGCAGGTGTTAGG----AGTTTAACTAAACTT---ATAT-TGAAAAGGTAGA----CTCAT-TCATATGC--AAATA------GTG-C-ATCTGATGAAAAGATGAAACAACGAGCAAC-A-----ATAC--A-G-TGT-G-TA-TCTATATTAGCA-AAACACTGATTCAGACG-ACAGATATGCATA---GTAAAGCTCCGAG--AAAGTTATTT-GTAGTGC
gi|144530 : -AGTGCTAAAGCTTAAA-----ATGTTGAATAA-TTTGA-----CAGG-TAAGTATGC--ACAAATA---AACGA-GT-----TCCCAGTAAAATTTGCGGTACCTCATATAT---TA-GTAAAGGCACGTa
gi|144531 : AAA-----GTGTTGAACAA-TTCGA-----CAGT-TAGATATGTG-AAATATA-ACAATCA-TT-----TCCCTGTAAAACTCGCTGTCAATGATATAT---TA-TTGAAGACACGTCATCAATGTCTGCA-T--A---TGTCATTC------C------AG------C------A------T-----T------G-CAAGCAGGTGTTAGG----AGTTTAAGTACTTTT---ATAT-TGAAA------------------CATATGC--AAATA------GTG-C-ATCTAATGAAAAGATGAAACAACGAGCAGC-A-----ATAC--A-G-TTT-G-TG-TCAATATTAGCA-AAACATTGAT-CAAACG-ATAGATATGCATA---GTAAAGCTCCGTG--AAAGTTATTT-GTAGT--ATTTTGTAGTCTACAAATGA-CACAAACGATA
gi|144532 : GATCAA-TTTGA-----CA---TAAATATGTG-AAAAATA-ACAATCA-TT-----TCCTTGTAAATCTCATTGTAAATCATATAT---TG-CTTAGGACGTGTCATCAATGTATGCA-T--A---TGCCATTC------CAAAAAAAG------C------A------T-----G------G-CAGGCAAGTGTAAGA----AGTTCAAACAAACTA---AAAT-TGAACAGGTAGA----TTCGT-AAACAAAC--AAAAA------TTG-C-GTCTGAGAGAAAGGTGAAACAACGAACGGC-AATT--ATGCCAA-GTTTT-A-TG-TCAGTATAAGCA-AAACACCGATCCAGACG-ATAGATATGCTTA---GTAAAGCTTTACG--AATGTTGTTT-GTATTGCATTC--TAGTCAACAATTGA---------GTA---TGAGAAACAAGAAACATATACAT--ATCAT-AA
gi|144533 : A-CAAATTTGTG-AATAATA-ACAGTCA-TT-----TTCCCGTAACACTCGCGGTAAATCATATAT---AA-TTGAGGACACGGCATCAATGTCTGCA-T-GACAATGTCATTC------C------AG------C------A------T-----T------G-CACGCAGGTGGTAGG----AGTTTAAATCAACTT---TTTT-TGAAAATGTAGATGCACTCATATCATATGC--AAATA------GTG-C-ATCTGATGAAAAGGTAAAATAACGAGCAGT-A-----ATAC--A-G-TTT-A-AG-TCAATATTAGCA-AAACACTGATTCAGACG-ATAGATATGTATA---GTAAAGCTCCGAG--AAA------T-GTA------TTTGTAGTCTACAGATGA-TACAAACGATACAGTGAGGAACGAAAAACA-ATA-ATGGATGAT-AATATA----TGTG--GT----CGCCCTGTGTCAAAATCGCGT-----CAAT-GTCACGT------------TAAC---GTCGTAA-AAACTGCCTTTAGTT-AATAAG
gi|144534 : TATGTG-AAAAATT-ACTATCA-TT-----TTCCCGTGAAACTCGCGGTATATCATATAT---
gi|144535 : GC--AAAAA------CTG-C-ATCTACGGAAAAGGTGAAACAAAGAACGGC-A-----ATAC--A-G-TTT-G-GTCTCAATATAAGCA-AAATATCGATCCAGATG-ATATATATGCTTA---GTAAAGCTCTGAG--AAAGTAATTTAGT-GTGCGTTCTGTAGTCTATAAATGG-AACAAATGGTACAGTGAGGAACAAATAACA-ATC-ATCGATGAC-AACAGG----TGTG--GT----TGCCCTGTGTCGAAATCGCAT-----CAAC-GTCACAC------------CAAC---GTGGTAA-AATGTGTC-----GT-AATA
gi|144536 : tTGAAGAAAACGTGAAACAACGAGCGAG-T-----ATAC--A-GTTTT-G-TA-TCCGTATTAGCA-AAACATCGGTCCAGACG-GTCGA
gi|144537 : atcg-G-TG-TCATT-CCAGCA-AAACACTGATTCAGATG-ATAGATATGCATA---GTAAAGCTCCGAG--AAAGTTATTT-A-AGTGCATTTTGTAGTCTACAAATAA-CACAAACTGTACAGTG-GGAAAGAGAAACA-ATA-ATGGATGCT-AACAGG----TATG--G-----CGTCCTGTGTCAAGATCAAG------CAAA-GTCACGT------------CAAC---GTGGCAA-AACGTGCC-----TC-AATAAG
gi|144538 : G-ATAGATATGCATA---GTAAAGCTCCGAG--AAACATATTT-ATGGTGAATTTTGTAGTCTACAAATGA-CACAAATGGTACAGTGAGAAATGAGAAACA-ATA-ATGGATGCT-AACAGG----TATG--G-----CATCCTGTGTCAAAATCAAG------CAAA-GTCACGT------------CAAC---GTGGTAA-AATGTGCC-----TC-AATAAG
gi|144539 : TCACGT------------CAAT---GTGGTAA-AATATGCC-----TC-AATAAG
Alignments
lowQualScore : 3333333 111111 222222222222 111111111 11111 111111
lowQualScore : 3333 222 222 55555555 0 444444 1 33333 1 33333 1 1 1 0 1 33333 222 1 5 6666666 222222 444444 8888888888888 444444 333333333333 1 3333 333 222 0 3333 1 1 1 22 222222222 44 44 1 2 22 77777 44 555 4 3 1 3 1 1 222 22 1 0 1 1 1 1 4 7777 55 11111 111111 55 999999999999 333 1 6 55555 2
lowQualScore : .... ... ... ........ . ...... . ..... . ..... . . . . . ..... ... . . ....... ...... ...... ............. ...... ............ . .... ... ... . .... . . . .. ......... .. .. . . .. ..... .. ... . . . . . . ... .. . . . . . . . .... .. ..... ...... .. ............ ... . . ..... .
lowQualScore : 3333 777 666 44444444 9 111111 4 33333 3 22222 2 2 2 9 2 11111 333 3 9 1111111 555555 888888 6666666666666 888888 000000000000 8 9999 000 555 2 9999 1 8 0 44 111111111 00 66 0 5 77 11111 00 999 8 2 6 4 5 0 888 33 7 1 7 7 7 7 0 7777 00 11111 999999 77 333333333333 222 8 5 33333 1
consensus : GTGCATTTCT----TA---TGTCAGTAAT---AATGTTA--------TGGTATCCATAGCAACATGCATACATGGT------T-AGTGCCGCAGCTCAAA-----ATGTTGAACAA-TTTGA-----CAGA-TAAATATGTG-AAAAATA-ACAATCA-TT-----TCCCTGTAAAACTCGCGGTAAATCATATAT---TA-TTGAGGACACGTCATCAATGTCTGCA-T-GA---TGTCATTC------C------AG------C------A------T-----T------G-CGCGCAGGTGTTAGG----AGTTTAAACAAACTT---ACAT-TGAAAAGGTAGA----CTCGT-TCATANGC--AAATA------GTG-C-GTCTGANGAAAAGGTGAAACAACGAGCGGC-A-----ATAC--A-G-TTT-G-TGTCAATATTAGCA-AAACACTGATCCAGACG-ATAGATATGCNTA---GTAAAGCTCCGAG--AAAGTTATTT-GTAGTGCGTTTTGTAGTCTACAAATGA-CACAAACGGTACAGTGAGGAACGAGAAACA-ATA-ATGGATGAT-AACANG----TGTG--GT----CGCCCTGTGTCAAAATCGCGT-----CAAC-GTCACGT------------CAAC---GTGGTAA-AAGGTGCC-----TC-AATAAG
Reference ( family-559 ) : GTGCATTTCT----TA---TGTCAGTAAT---AATGTTA--------TGGTATCCATAGCAACATGCATACATGGT------T-AGTGCCGCAGCTCAAA-----ATGTTGAACAA-TTTGA-----CAGA-TAAATATGTG-AAAAATA-ACAATCA-TT-----TCCCTGTAAAACTCGCGGTAAATCATATAT---TA-TTGAGGACACGTCATCAATGTCTGCA-T-GA---TGTCATTC------C------AG------C------A------T-----T------G-CGCGCAGGTGTTAGG----AGTTTAAACAAACTT---ACAT-TGAAAAGGTAGA----CTCGT-TCATANGC--AAATA------GTG-C-GTCTGANGAAAAGGTGAAACAACGAGCGGC-A-----ATAC--A-G-TTT-G-TGTCAATATTAGCA-AAACACTGATCCAGACG-ATAGATATGCNTA---GTAAAGCTCCGAG--AAAGTTATTT-GTAGTGCGTTTTGTAGTCTACAAATGA-CACAAACGGTACAGTGAGGAACGAGAAACA-ATA-ATGGATGAT-AACANG----TGTG--GT----CGCCCTGTGTCAAAATCGCGT-----CAAC-GTCACGT------------CAAC---GTGGTAA-AAGGTGCC-----TC-AATAAG
gi|144502 : GTATATTTCT----TA---TGTCAGTAAT---AATGTTA--------TGGTATCCATAGCAACATACATATATGAT------A-AGTGCCGCAGCTCAAA-----ATTTTGAACAA-TTTGA-----CAGA-CAAATATGTG-AGTAATA-ACAATCA-TT-----TTCCCGTAACACTCGCGATAAATCATATAT---TA-TTGAGGACACAGCATCAATGTGTGCA-T-GACAATGTCATTC------C------AG------C------A------T-----T------G-CACGCAGGTGTTAGG----AGTTTAAATCAACTT---CTAT-TGAAAATGTAGA----TGCAT-TCATATGC--AAATA------GTG-C-ATCTGATGAAAAGGTGAAACAACGAGCAGT-A-----ATAC--A-G-TTT-A-AGTCAATATTAGCA-AAACACTGATTCAGACG-ATAGATATGCATA---GTAAAGCTCCGAG--AAAGTTATTT-GTAGTGCATTTTGTAGTCTACAGATGA-CACAAACGGTACAGTGAGGAGCGAGAAACA-ATA-ATGGACGAT-AACATA----TGTG--GT----CGCCCTGTGTCAAAATCGCGC-----CAAT-GTCACGT------------TAAC---GTGGTAA-AAACTGCC-----TT-AATAAG
gi|144503 : GTATATTTCG----TA---TGTCAGTAAT---AATGTTA--------TGGTATTCATAGCAACAAACATATATGAT------T-AGTGCCACAGCTCAAA-----ATGTTGAACAA-AC-GA-----CAGT-TAAATATGTG-AAAAATA-ACAATCA-TT-----TCCCTGCAAAACCCACGGTGTATAATATAT---TA-TTGAAGACACGTCATCAATGTCTGCA-T-G----TGTCATTT------C------AG------C------A------T-----T------G-CGCACAGGTGTTAGG----ACTTTAAATAAACTT---ATAT-TGAAAAGGTAGA----CTCAT-TCATATGC--AAATA------GTG-C-ATCTGATGAAAAGGTGAAACAACGAGTAGC-A-----ATAG--A-G-TTT-G-TGTCAATATTAGAC-AAACACTAATTCAGACG-ATAGATATGGACA---G-AAAACTCCAAG--AAAGTTATTT-GTAGTGCATTTTGTGGTTTACAAATGA-CACAAACGATACATTGAGGAATGAGAAACA-ATA-AATGATGAT-AACAAG----TGTG--G-----CAACCTTTGTCAAAATCATG------CAAA-GTCATGT------------CAAC---ATGGTAA-AAAGTGCC-----TC-AATAAG
gi|144504 : GTATATTTCT----TA---TGTCAGTAAT---AATGTTA--------TGGTATCCATAGAAACATATATACAAGAA------T-ATTGCCACACCTCAAA-----ATGTTGAACAA-TTCGA-----CAGA-TAAATATGTG-AAAAATA-ACAATCA-TT-----TTCCTGTAACGCTCGCGGTGAAGCATATAT---TA-TTGAGGACACGTCATCAATGTCTACA-T-G----TGTCATTC------C------AG------C------A------T-----G------G-CGCGCAGGTATTAGG----CGTTTAATTAAACTT---ATAT-TGAAAAGGTAGA----CTCAT-TCATATGC--AAACA------GTG-C-ATCTGATGAAAAGGTGAAACAACGAGCAGC-A-----ATAT--A-G-TTT-G-TGTAAATATTAGCA-AAACACTGAT-TAGACG-AGATATATGCATA---GTAAATATCCGAGAAAAAATTATTT-ATAGTGCATTTTGTTGTCTACAAATGA-CAAAAACAGTACAGTGAAGAACGAGAAATA-ATA-ATGAATGTT-AACAGG----TGTG--G-----CGCCCTGTGTCAATA-----T-----CAA--GTCACGT------------CAAC---GTGGTAA-AA-GTGCC-----TC-AATAAG
gi|144505 : GTATATTTCA----TA---TGTCAGTAAT---AATGTTA--------TGGTATCCATAGCAACATACATGCATGAA------T-AGTTCCGCAGCTCAAA-----ATGTTGAACAA-TTCGA-----CA-----------------AATA-ACAATCAATT-----TTCCCATAACACTCGCAGTGAATCATATAT---TA-TTGAGGACATGTCATCAATGTCTGCA-T-GACAGTGTCATTC------C------AG------C------A------T-----T------G-CGTGCAGGTGTTAAG----AGTTTAAATAAACTTTACATAT-TGAAAAGGTAGA----CTCAT-TCATATGC--AAATACCGGTAGTG-C-AGCTGATGAAAAGGTGAAACAACAAGCAGC-A-----ATAC--A-G-TTT-G-GGTCAATATTAGCA-AAACACTGATTCAGACG-ATAGATATACATA---GTAAAGCTCTGAG--AAAGTTACTT-GTAGTGCATTTTGTAGTCTACAAATAA-CACAAATGGTACAGTGAGGAACGAGAAACA-ATA-ATAGATGAA-AATCGG----TGTG--G-----CGTCCTGTATTAAAATCACG------CAAA-GTCACGT------------CAAC---GTGGTTA-AA-GTGCC-----TC-AATAAG
gi|144506 : ATTTCT----TA---TGTCAGTAAT---AATGTTG--------TGGTATCCATAACAACATACAAACATGAT------A-AGTGCCGCAGCTCAAT-----ATGTTGAAAAA-TTTGA-----CAGA-CAAATATGTG-AATAATA-ACAATCA-TT-----TTCCCGTAACACTCGCGGTAAATCATACAT---TA-ATGAGGACACGGCATCAATATCTACA-T-GACAATGTCATTC------C------AG------C------A------T-----T------G-TACGCAGGTGTTAGG----AGTATAAATCAACTT---CTAT-TGAAAATGTAGA----TGCAT-TCATATGC--AAATA------GTG-C-ATCTAATGAAAAGGTAAAACAACGAGCAGT-A-----ATAC--A-G-TTT-T-AGTCGATATTAGCA-AAACACTGATTCAGACG-ATAGATATGTGTA---GTAAAGCTCCGAG--AAAGTTATTT-GTAGTGTATTTTGTAGTCTACAGATAA-CACAAACGATACAGTGAGGAACGAGAAACA-ATA-ATGGATGAT-AACATA----TGTG--GC----CGCCCTGTGTCAAAATCGCGT-----CAAT-GTCACGT------------TAAC---GTGTTAA-AAACTGCC-----TT-GATAAG
gi|144507 : gtttGTATATTTCT----TA---TGTCAGTAAT---AATGTTA--------TGGTATCCATGGCAACATACATACATGAT------A-AGTGCCGCAGCTCAAA-----ATGTTGAACAA-TTCGA-----CAGA-CAAATGTGTG-TATAATA-ACAATCA-TT-----TTCCCGTAACACTCGCGGTAAATCATATAT---TA-TTGAGGACACGGCATCAATGTCTGCA-T-
gi|144507 : T---GCAT-TTGAAATGTAGA----TGCAT-TCATATGC--AATTA------GTG-C-ATCTGATGAAAAGGCGAAACAACGAGCCAT-A-----ATAC--A-G-TTT-A-AGTCAATATTAGCA-AAACACTGATTCAGACG-ATAGATATGTATA---GTAAAGCTCCGAG--AAAGTTATTT-GTAGTGCATTTTGTAGTCTACAGATGA-CACAAACGGTACAGTGAGGAACGAGAAACA-ATA-ATGGATGAT-AACA------TGTG--GT----CGCCCTGTATCACAATCGCGT-----CAAT-GTCACGT------------AAAC---GTGGTAA-AAACTGCC-----TT-AATAAGttgaaatgtagatgcattcatatgcaattagtgcatctgatgaaaaggcgaaacaacgagccataatacagtttaagtcaatattagcaaaacactgattcagacgatagatatgtatagtaaagctccgagaaagttatttgtagtgcattttgtagtctacagatgacacaaacggtacagtgaggaacgagaaacaataatggatgataacatgtggtcgccctgtatcacaatcgcgtcaatgtcacgtaaacgtggtaaaaactgccttaataag
gi|144508 : gtatatttcttatgtcagtaataatgttatggtatccatggcaacatacatacatgataagtgccgcagctcaaaatgttgaacaattcgacagacaaatgtgtgtataataacaatcattttcccgtaacactcgcggtaaatcatatattattgaggacacggcatcaatgtcGTGCATTTCT----TA---TATTAATAAT---AATGTTA--------CGGTCTCCATAGCAACATGCATGCATGGT------T-AGTGCCACAGCTCAAA-----TTGTTGAACAA-TTTGA-----CAGA-TAAATATGTG-AAAAATA-ACAATGA-TT-----TCCATGTAAAACTCACGGTAAATCATATAT---TATTTGATGACAAGTCATCAATGTCTACATT-G-----GTCATTC------T------AG------T------A------C-----TAGTATGG-TGCGCAAGTGTTAGG----AGTTTAAACAAAATT---ACAT-AAAAAAGAAAAA----CTTAT-TAATAAGC--AAAAT------TTC-C-ATCTGAGAAAAAAGTGAAACAACGAGCGGA-A-----ATAC--ATT-TTT-G-TGTCAAAATTGGCA-AAACACTGATCCAGGCG-ATATATCTGTTTA---GTAAAGCTCTGAG--AAAGTTATTT-GTAGTGTGTTTTGCAGTCTATAAATGG-CACAAATGGTACAGTGAAGAACAGGAAACA-ATA-ATGGATGAT-AACATGACATTGTGTTGT----CGCCCTGTGTCAAAATTCTAT-----CAAC-GTCGTGT------------CAAT---GTGGTAA-AAGGTGCC-----TT-AATAAG
gi|144509 : GTGCATTTCT----TA---TGTTAATAAT---AATGTTA--------TGGTCTCCATAGCAACATGCATACATGGT------T-AGTGCCGCAGCTCAAA-----TTGTTGCACAA-TTTGA-----CAGA-TAAATATGTGAAAAAATA-ACAATTA-TT-----TCCCTGT-AAACTCGCGGTAAATCATATAT---TA-TTGATGACACATCATAAATGTCTACATT-G-----GTCATTTTAGTAAT------AG------T------A------T-----G------G-TGCACAAGTGTTTGG----AGTTTAAACAAACTT---ACATAAAAAAAGGTAAA----CTTGT-TAATAAGC--AAAAT------TTC-C-ATTAGAGAAAAAGGTAAAACAACGAGCGGA-A-----ATAC--ATT-TTT-G-TGTCAAAATTAGCA-AAACGCTGATCCAGGCG-ATATATATGCTTA---GTAAAGCTCTGAG--AAAATTATTT-GTAGTGTGTTTTGTAGACTATAAATGG-CACAAATGGTACAGTGAGGAA-AATAAACA-ATA-TTGGATGCT-AACATG----TGTG--GT----CACCATGTGTCAAAATCGCAT-----CAAC-GCCATGT------------CAAC---GTGGTAA-AAGGTGCC-----TC-AATAAG
gi|144510 : GTACATTTTT----TA---TGTTAATAAT---AATGTTA--------TGGTCTCCATAGCAACATGCATACATGGT------T-AGTGCCGCA-----------------GAACAATTTTGA-----CTGA-TAAATATGTG-AAAAATA-ACTATGA-TT-----TTCCTGTAAAACTCGCGGTAAATCATATAT---TA-TTGATGACACGTCATCAATGTCAGCATT-G-----GTCATTCTAG---T------AG------T------A------T-----G------G-CACGCAAGTGTTAGG----AGTTAAAACAAACTT---ACAT-AAAAAAGGGAAA----CTTGT-TAACAAGC--AAAAT------TTC-C-ATCCGAGAAAAAGGTGAAACAACGAGCGGA-A-----ATAC--ATT-TTT-G-TGTCAAAATTAGCA-AAACACTGATTCAGGCG-ATATATCTGTTTC---GTTATGCTCTGAG--AAATTTATTT-GTAGTGTGTTTTGTAGTCTATAAATGG-CACAAATGGTACAATGAGGAACAGGAAACA-ATA-ATGGATGAT-AACATGACATTGTGTCAT----CGCCCTGTGGCAAAATCGCAT-----CAAC-GCCATGT------------CAAC---GTGATAA-AAGGTGCC-----TCTAATA
gi|144511 : GTGTATTTCTAAAGCA---TGTCAGTACT---AATTTTA--------TGGTA--------ACCATGCATACATGTT------T-AGTGCTTCAGTTCATA------TGTTGAACAA-TTTGA-----CAGA-TCAGTATGTG-AAAAATA-ACAATAG-TT-----TCCATGTAAA-CTCGCAGTAAATC-TATAT---TA-TTGAGGACATGTCATCAAAGACTGCA-T-AA----GTCATTC------C------AGTAATAGC------A------A-----T------G-TGCGCAAGTGTAAGG----AGTTTAAACAAATTT---AAAT-TTAAACGGTAAA----CATGT-TCACAAGC--AAA-A------TTGAC-ATCTGAAAAAAAGGTGAAACAATGAG---------------------------TGTCATTTTTAGAA-AAATACTGATACAGACG-ATCGATACGCTTT---GTAAAGCTCTGAA--AATGATATCT-GTAATGTGTTCTGCAGTCTACAAATGG-CACAAATG--ATAGTCAGGAACGAGAAACA-CTA-ATGTATGAT-AACAGG----TGTT--GTATGCCATCCTTTGTCAAAATCCTGC-----AAAA-GTCATGT------------CAACAAAGTGGTAA-AAGATGCC-----T--AACAAG
gi|144512 : GTGCATTTGT----TA---CGTCAGTAAT---ACTGTTA--------TGGTATCCATAGCAACTTGCATACATGGT------T-AATGCCGCAGTTAAAA-----TTGTTGAACAA-TTTGA-----CAAG-TAAAT-----------TA-ACAATCG-TT-----TCCATGTAAAACTTGCAGTTATTCATATATAATTA-TTGATGACATGTCAT--------GTA-T--A---CGTCGTTC------C------AG------T------A------T-----TAGCAATG-CGCACATGTGTTGGG----AATTTAATCAAACTT---ACAT-TACATA---AGA----CACGT-AAACGTGC--AAA-A------TTC-T-GTCTAAAGGAAAAGTGAAACAACGAGCGGC-G-----ATAC--A-G-TTTTG-TGTCAATATTAGCA-TAACACCGATTCAGACA-ATGGATATGATTA---GTAAAGCTCCGAG--AAAGTCATCT-ATAGTGCGTTCTGTAATCAACAAATGG-TACAACTGGTTCAGTGAGAAGCGATCAACA-ATA---------------------TGTG--GT----CGATCTGTGTCAAAATTGCGCAAACGTAAC-GTCACGTTAAAAGGTCGGTCAAC---GTGATAA-AA-ATGCC-----TC-AACGAG
gi|144513 : GTATATTTCT----TA---TGTCAGTAAT---AATGTTA--------TGGTATCCATAGCAACATACATACATGAT------A-AGTGCCGCAGCTCAAA-----ATGTTGAACAA-TTCGA-----CAGA-CAAATATGTG-AATAATA-ACAATCA-TT-----TTCCCGTAACACTCGCGGTAAATCATATAT---TA-TTGAGGACACGGCATCAATGTCTGCA-T-G
gi|144514 : T----TA---TATCAGTAAA---AATGTTA--------TAGTATTCATTGCAACATACATACACAAT------T-AGTCCCGCAGCTCAAA-----ATGTTGAACAG-CTCGA-----CAGA-TAAATATGTG-AAAAATA-ACAATAA-TT-----TTCCTGTAAATCTCACGTTAAAACATATAT---TA-TTGAGAACATGTCATCAATGTCTGCA-C-AACAGTGTCATTC------C------AG------C------A------
gi|144515 : gtatatTTTTT----TA---TGTTAAAAAT---ATTGTTA--------TGGTCTCCATAGCAACATGCATACATGGT------T-TGTGTTGCAGCTCAAA-----ATGCTGAACAA-TTTGA-----CAGA-TAAATATGTG-AAAAATATAAAATAA-TT-----TCCCAGTAAAACTCGCGGTAAATCATATAT---TA-CTGAGGACACATCAACAATGTCTGCA-T--A---GGTCATTC------C------AG------T------A------T-----TAGTATGG-CATGCAAGTGTTAGC----AGTTTAAACAATCTT---ACAT-
gi|144516 : gcattGTGCATTTCT----TA---TGTCAACAAT---AATGTTAAGGACTTATGGTATCCATAGCAACATGCATGTATGGT------T-AGTGCACCAGCTCAAA-----ATGTTGAGCAA-TTTGA-----CAGA-TAAATATTTG-AAAGATA-ACATTCA-TT-----TGCCTGTATAAC-------ATATCA-ATAT---TA----AGGACACGCCATCAATGTCTGCA-
gi|144517 : GTGCATTTCT----TA---TGTTAATAAT---AATGTTA--------TGGTCTCCATAGCAACATGCATACATGTT------A-AGTGCCGCAGCTCAAA-----GCGTTGATCAG-CTTGA-----CAGA-TAAATATGTG-AAAAATA-AC--TGA-TT-----TCC--------CTCGTGGTAAATCATATAT---TA-TTGAGGACACATCATCAATGTC
gi|144518 : GTGCATTTCT----TA---TGTTAATAAT---AATGTTA--------TGGTCTCCATAGCAGCATGCATACATGGT------T-AGTGCCGCAGTTCAAA-----TTGTTAAACAA-TTTGA-----CAGA-TAAATATGTG-AAAAATA-ACAACGA-AT-----TTCCTGTAAAACTTGCCGTAAATCATATAT---TA-TTGATG-CGTGTCAT
gi|144519 : TTTCT----TA---TGTCAGTAAT---AATGTTA--------TGGTATCCATAGCAACATACATACAGGAT------T-AGTGTCGCAGCTCAAA-----ATGTTAAACAA-TTCGA-----CAGA-TAAATATGTG-AAAAATA-ACAATAA-TTGATTTTCCCTGTAACACTCGTGGTGAAGCCTATAT---TA-TTGAGAACACGTCATCAATGTTTGCA-T-G----TGCCGTTC------C------AG------C------A------T-----G------G-CGCGCAGGTGTTAGG----AGTTTAAATAAATTT---ATAT-ATAAAAGTTAGA----CGCAT-TCATATGC--AAATA------GTA-C-ATCTGATGAAAAGGTGAAG----GAGCAGC-C-----ATAC--A-G-TTT-G-TGTCAATATTAGCA-AAACACTGA-CCAGACG-ATAGATATGCATA---GTAAAGCTACGAG--GAAGTTATTT-GTAGTGCATATTATAGTCTACAAATGA-CACAAACGGTATAGTGAGGAACGAGAAACA-ATA-ATAGATGAT-AACAGG----TGAG--G-----CGTCCTGTGTCAAAATCAAGT------AAA-GTCACGT------------CAAT---GTGGTAA-AAGGT
gi|144520 : tattTGTATTTCT----CA---CGCCAGTAAT---AATATCA--------TGGTATACAAAGAGGCATGCATTTATAGG------G-AACGCCGCAGCTCAAA-----ATATTGAAAAG-TTTAA-----CAGG-TAAACATACG-AATAA-A-ACAATCG-TT-----TCCCTGT-----------TAAATTACAGAA---GA-TT---GTCCCGTCATCAATATCTACA-T--A---TGTCATTT------C------AG------TGATGAAA------T-----T------G-CACCTAAGTGTTAGAAACTAACTTGAACAAACGC---ACAT-TAAAAACA-AAA----TGTAT-GCACGAGC--AAA-A------ATGCC-GTCTGAAGAACGCGCGAATCAAAGATTTGC-T-----GTACA-A-A-TTT-GATGTCAATATTAGCG-CAACACCGGTCCCGACG-AT--------TTA---CTCAAG------A--AAAATCCTTT-GTTACGCGTTCTTTCATTTA-AAACAAGCACACGTGACACGGTGAGGGATGAAAAATA-ATA-ATGGGTGAC-AACATG----TATG--GT----CAA---GTTTCAAAATCGCG------CAACAATAGCAT------------CATC---TTAGTGA-AAaacgtaaaaag
gi|144521 : TACACTCCT----T-----GTCCGTAAT---GATATTG--------TCATTTTAATAGCAA------TAAA--GC------T-GGTGCCGCAGCTCAAA-----ATGGTGAACAA-GGTAAGGATGCAAA-AAAAAACAAC-AAAAA-A-ACAATCG-TA-----TCTCTGTAAAATTTACAATAAATCATTTAT---TA-TTAATGATACGTTATCAATGTCTTCG-T--A---TGTCATTT------C------AG------T------A------T-----T------
gi|144522 : ATTTGT----TA---TGTTAATAAT---AATGATA--------TGGTCTCCTTAACA-CATGCATACATGTT------T-AGTGCCGCAGCTCAAA-----ATGTTGAACCA-TTTGA-----CAGA-TAAATATTTG-AAAAATA-ACAATGA-TT-----TCCCTGTAAAACTCGTGGTAAATCATATAT---TA-TTGAGGACATGTCATCAATGTCTATA-TTG-----GTCATTC------C------AG------T------A------TAAGTAT------GGTGTGCAAGTGTTAGG----AGTTTAAACAAACTT---ACAT-AAAATAGGCAAA----CTTGT-TCATAAGC--AAATC------TTC-C-GTCTGAGGAAAAGGTAAAACAACGAGCAGA-A-----ATAC--A-G-TTTTG-TGTCAATATTAGCA-AAACACTGATCCAGTCG-ATATATATGCTTA---GTAAAGCTCCGAG--AAAATTATTT-GTAGTGCATTTTGTAGTCTACAGATGA-CACCAACGGTAGGGTGATGAACGAGAAACA-ATA-ATGGATGAT-AACATG----TGTG--GT----CGCCCTGTGTCAAAATCGTAT-----CAAC-GACACGT------------CAAC---ATAGTAA-AAGGTGCC-----TC-AATAAG
gi|144523 : ATTTCA----TA---TGTAAATAAA---AATGTTA--------TGGTCTCCATAGCAACATGCATACATGGT------T-AGTGCCGCAGCTCAAA-----GTGTTGAACAA-TTTCA-----CAGA-TAAATATTTG-GAAAATA-ACAATGG-TT-----TCCCTGTAAAACTCGCGGTAAATTATATAT---TA-TTGATGACACGTCATCAATGTCAACATT-G-----GTCATTCCAGTAAC------AG------T------A------T-----G------G-CGCGCAAGAGTTAGG----AGTTTGAACAAAATT---ACAT-AAAAAAGGCAAA----CTCGT-TAATAAGC--AAA-A------CTT-CTGTCTGAGGAAAGGGTGAAACAACGAGC--------------------TTT-G-TGTCAATATTAGCA-AAAGTCTGATCCAGGTG-ATATATATGCTTA---GTAAAGCTCCGAG--AATGTTATTT-GTAGTGTGTTTTGTAGTCTTTAAATGG-CACAAACGGTACAGTGAGGAACAAGAAACA-ATA-ATGGATGATAAACATG----TGTG--AT----CTCCCTGTGTCAAAATCGCGT-----CAAC-GTCACAT------------CAAC---GTGGTAA-AAGGTGCC-----TC-AATAAG
gi|144524 : ATTTCT----TA---TGTTAATAAT---AATGTTA--------TGGTCTCCGTAGCACAATGCACACATGTT------A-AGTGCCGCAGCTCAAA-----ATGTTGAACAA-TTTGA-----CTGA-TAAATATGTG-AAACATA-ACACTGA-TT-----TCCCTGTAAAACTC-TAGTAAGTCATATAT---TA-TTGAGGACATGTCATCAATGTCTGCA-T--A---GGTCATTC------C------AG------T------AATAATAT-----G------G-CATGCAAGTGTTAGG----AATTTACACAAACTT---ACAT-AAAAAAGGCAAA----CTCGT-TCATAAGC--AAA-A------CTT-CTGTGTAAGGAAAAGGTGAAACAATGAGCGGA-A-----ATAT--A-G-TTTTG-TGTCAATATTAGCT-AAACACTGATCCAGGCG-ATATATATGCTTA---GTAAAGCTCTGAG--AAAGTTATAT-GTAGTGCGTTTTGTAGTGTATAAATGG-CACAAACAGTACAGTGAGGCACGAGAAACA-ATA-AT-------------A----TGTG--GT----CGCCCTGTGTCAAAATCACAT-----TGAC-ATCACAT------------CAAA---GTGGTAA-ACAGTGCA-----TC-AATAAG
gi|144525 : ATTTCT----TACTATGTCAGTAAT---CATGTTA--------TGGTTTCCATAGCAATATGCATACTTGGTTACCGGT-AGTGCTGCAGCTCAAA-----ATGTTTAACAG-TTTGA-----CAGG-TGAGAATGTG-AAA
gi|144526 : TTTTT----TA----GTATATAAT---AATGTTA--------TGGTATCCATAGCAACATACATACAGAAC------T-AGTGCCGCAGCTTCAA-----ATGTTTGACAA-TTCGA-----CAGA-TAATCATGTG-AAAAATA-ACAATCC-TT-----TTCCT-TAATACTCGAGGTGAAGCATATAT---TA-TTGAGAACACATCATCAATGTCTGCA-T-G----TGTCATTC------A------AG------C------A------T-----G------G-TACGCAGGTGTTAGG----AGTTTACATTTACTT---GTAT-TGAAAAGGTAGA----CTCAT-TCATATGC--AAATA------GTG-C-ATCTGGTGAAAAGGCGAAACAACGAGCAGC-A-----ATAC--A-G-TTT-G-TGTCAATATTA-CACAAACACTGAT-CAGACG-ATAGATATGCATA---ATAAAGTTCAGAG--GAAGTTATTT-GTAGTGCATTTTATAGTCTACAAATGA-CACAAACGGTACAGTGAGGAAAGAGAAAGA-ATA-ATGGATGAT-AACAGG----TGTG--G-----CGTCTTGTGTCAAAATCAAG------CAAA-GTCACGT------------CAAC---GTGGTAACAAG
gi|144527 : TTCT----TA------CAGTAATTATAATGTCA--------TTGTATCCATGGCAACATGCATACATGGG------T-AG---------------------------CAG-TTTGG-----TAG--TAAATATGTG-AAAAATA-TTAAGTG-TC-----TCCTTGTACAAC---------ACC---TAT---TA-TTGACGATACGTCGTCATTATCTGCA-T--A---CGTCATTA------C------AG------TT-----A------TAAAAAT------G-CG------TGTTAAG----GATTTAAACATCCCT---ACTT-T-------TTGG----CACGC-----AAGCCGGAAT-------GT--C-GTCTGAAGAAAAAATGAAACAACAAGCGACTACATATATAC--A-GTTTT-G-GGTAAACA-TAGGA-AAACACCGGTCAAGGCGAATAAAT-TGCTTACTTGTAAA
gi|144527 : AAATGGTACACTGAGG---GATAAA-A-ATA-ATG--------ACATG----TGTA--AT----CGCATTGTGTCAAAATCGtggtacactgagggataaaaataatgacatgtgtaatcgcattgtgtcaaaatcgagcaaa
gi|144528 : ttcttacagtaattataatgtcattgtatccatggcaacatgcatacatgggtagcagtttggtagtaaatatgtgaaaaatattaagtgtctccttgtacaacacctattattgacgatacgtcgtcattatctgcatacgtcattacagttataaaaatgcgtgttaaggatttaaacatccctactttttggcacgcaagccggaatgtcgtctgaagaaaaaatgaaacaacaagcgactacatatatacagttttgggtaaacataggaaaacaccggtcaaggcgaataaattgcttacttgtT---AATATTA--------TATTATCTATAGCAACATGCATACATGGG------TGAGCACCGCAACTCAAA-----ATAATGAAAAA-TTTG------TAGAGTCAACATGTG-AAAAATG-ATGAGTG-TG-----TCCCTACAAGATTCGCAGGAAATCATAagcaaa
gi|144529 : ATAGCAACATACGTACATGAT------T-GATGCCGCAGCTCAAATCAAAATGTTGAACAA-TTTGA-----GAGT-TAAATATGTG-AAATATA-ACAATCA-TT-----TCCCTGTAAAACTCGCGGTGAATCATATGT---TA-TTGAAGACACGTCATCAATGTCTGCA-T-G----TGTCATTC------C------AG------C------A------T-----T------G-TGCGCAGGTGTTAGG----AGTTTAACTAAACTT---ATAT-TGAAAAGGTAGA----CTCAT-TCATATGC--AAATA------GTG-C-ATCTGATGAAAAGATGAAACAACGAGCAAC-A-----ATAC--A-G-TGT-G-TATCTATATTAGCA-AAACACTGATTCAGACG-ACAGATATGCATA---GTAAAGCTCCGAG--AAAGTTATTT-GTAGTGC
gi|144530 : -AGTGCTAAAGCTTAAA-----ATGTTGAATAA-TTTGA-----CAGG-TAAGTATGC--ACAAATA---AACGA-GT-----TCCCAGTAAAATTTGCGGTACCTCATATAT---TA-GTAAAGGCACGTa
gi|144531 : AAA-----GTGTTGAACAA-TTCGA-----CAGT-TAGATATGTG-AAATATA-ACAATCA-TT-----TCCCTGTAAAACTCGCTGTCAATGATATAT---TA-TTGAAGACACGTCATCAATGTCTGCA-T--A---TGTCATTC------C------AG------C------A------T-----T------G-CAAGCAGGTGTTAGG----AGTTTAAGTACTTTT---ATAT-TGAAA------------------CATATGC--AAATA------GTG-C-ATCTAATGAAAAGATGAAACAACGAGCAGC-A-----ATAC--A-G-TTT-G-TGTCAATATTAGCA-AAACATTGAT-CAAACG-ATAGATATGCATA---GTAAAGCTCCGTG--AAAGTTATTT-GTAGT--ATTTTGTAGTCTACAAATGA-CACAAACGATA
gi|144532 : GATCAA-TTTGA-----CA---TAAATATGTG-AAAAATA-ACAATCA-TT-----TCCTTGTAAATCTCATTGTAAATCATATAT---TG-CTTAGGACGTGTCATCAATGTATGCA-T--A---TGCCATTC------CAAAAAAAG------C------A------T-----G------G-CAGGCAAGTGTAAGA----AGTTCAAACAAACTA---AAAT-TGAACAGGTAGA----TTCGT-AAACAAAC--AAAAA------TTG-C-GTCTGAGAGAAAGGTGAAACAACGAACGGC-AATT--ATGCCAA-GTTTT-A-TGTCAGTATAAGCA-AAACACCGATCCAGACG-ATAGATATGCTTA---GTAAAGCTTTACG--AATGTTGTTT-GTATTGCATTC--TAGTCAACAATTGA---------GTA---TGAGAAACAAGAAACATATACAT--ATCAT-AA
gi|144533 : A-CAAATTTGTG-AATAATA-ACAGTCA-TT-----TTCCCGTAACACTCGCGGTAAATCATATAT---AA-TTGAGGACACGGCATCAATGTCTGCA-T-GACAATGTCATTC------C------AG------C------A------T-----T------G-CACGCAGGTGGTAGG----AGTTTAAATCAACTT---TTTT-TGAAAATGTAGATGCACTCATATCATATGC--AAATA------GTG-C-ATCTGATGAAAAGGTAAAATAACGAGCAGT-A-----ATAC--A-G-TTT-A-AGTCAATATTAGCA-AAACACTGATTCAGACG-ATAGATATGTATA---GTAAAGCTCCGAG--AAA------T-GTA------TTTGTAGTCTACAGATGA-TACAAACGATACAGTGAGGAACGAAAAACA-ATA-ATGGATGAT-AATATA----TGTG--GT----CGCCCTGTGTCAAAATCGCGT-----CAAT-GTCACGT------------TAAC---GTCGTAA-AAACTGCCTTTAGTT-AATAAG
gi|144534 : TATGTG-AAAAATT-ACTATCA-TT-----TTCCCGTGAAACTCGCGGTATATCATATAT---
gi|144535 : GC--AAAAA------CTG-C-ATCTACGGAAAAGGTGAAACAAAGAACGGC-A-----ATAC--A-G-TTT-GGTCTCAATATAAGCA-AAATATCGATCCAGATG-ATATATATGCTTA---GTAAAGCTCTGAG--AAAGTAATTTAGT-GTGCGTTCTGTAGTCTATAAATGG-AACAAATGGTACAGTGAGGAACAAATAACA-ATC-ATCGATGAC-AACAGG----TGTG--GT----TGCCCTGTGTCGAAATCGCAT-----CAAC-GTCACAC------------CAAC---GTGGTAA-AATGTGTC-----GT-AATA
gi|144536 : tTGAAGAAAACGTGAAACAACGAGCGAG-T-----ATAC--A-GTTTT-G-TATCCGTATTAGCA-AAACATCGGTCCAGACG-GTCGA
gi|144537 : atcg-G-TGTCATT-CCAGCA-AAACACTGATTCAGATG-ATAGATATGCATA---GTAAAGCTCCGAG--AAAGTTATTT-A-AGTGCATTTTGTAGTCTACAAATAA-CACAAACTGTACAGTG-GGAAAGAGAAACA-ATA-ATGGATGCT-AACAGG----TATG--G-----CGTCCTGTGTCAAGATCAAG------CAAA-GTCACGT------------CAAC---GTGGCAA-AACGTGCC-----TC-AATAAG
gi|144538 : G-ATAGATATGCATA---GTAAAGCTCCGAG--AAACATATTT-ATGGTGAATTTTGTAGTCTACAAATGA-CACAAATGGTACAGTGAGAAATGAGAAACA-ATA-ATGGATGCT-AACAGG----TATG--G-----CATCCTGTGTCAAAATCAAG------CAAA-GTCACGT------------CAAC---GTGGTAA-AATGTGCC-----TC-AATAAG
gi|144539 : TCACGT------------CAAT---GTGGTAA-AATATGCC-----TC-AATAAG
Alignments
lowQualScore : 3333333 111111 222222222222 111111111 11111 111111
lowQualScore : 3333 222 222 55555555 0 444444 1 33333 1 33333 1 1 1 0 1 33333 222 1 5 6666666 222222 444444 8888888888888 444444 333333333333 1 3333 333 222 0 3333 1 1 1 22 222222222 44 44 1 2 22 77777 44 555 4 3 1 3 1 1 222 22 1 0 1 1 1 1 4 7777 55 11111 111111 55 999999999999 333 1 6 55555 2
lowQualScore : .... ... ... ........ . ...... . ..... . ..... . . . . . ..... ... . . ....... ...... ...... ............. ...... ............ . .... ... ... . .... . . . .. ......... .. .. . . .. ..... .. ... . . . . . . ... .. . . . . . . . .... .. ..... ...... .. ............ ... . . ..... .
lowQualScore : 3333 777 666 44444444 9 111111 4 33333 3 22222 2 2 2 9 2 11111 333 3 9 1111111 555555 888888 6666666666666 888888 000000000000 8 9999 000 555 2 9999 1 8 0 44 111111111 00 66 0 5 77 11111 00 999 8 2 6 4 5 0 888 33 7 1 7 7 7 7 0 7777 00 11111 999999 77 333333333333 222 8 5 33333 1
consensus : GTGCATTTCT----TA---TGTCAGTAAT---AATGTTA--------TGGTATCCATAGCAACATGCATACATGGT------T-AGTGCCGCAGCTCAAA-----ATGTTGAACAA-TTTGA-----CAGA-TAAATATGTG-AAAAATA-ACAATCA-TT-----TCCCTGTAAAACTCGCGGTAAATCATATAT---TA-TTGAGGACACGTCATCAATGTCTGCA-T-GA---TGTCATTC------C------AG------C------A------T-----T------G-CGCGCAGGTGTTAGG----AGTTTAAACAAACTT---ACAT-TGAAAAGGTAGA----CTCGT-TCATANGC--AAATA------GTG-C-GTCTGANGAAAAGGTGAAACAACGAGCGGC-A-----ATAC--A-G-TTT-G-TGTCAATATTAGCA-AAACACTGATCCAGACG-ATAGATATGCNTA---GTAAAGCTCCGAG--AAAGTTATTT-GTAGTGCGTTTTGTAGTCTACAAATGA-CACAAACGGTACAGTGAGGAACGAGAAACA-ATA-ATGGATGAT-AACANG----TGTG--GT----CGCCCTGTGTCAAAATCGCGT-----CAAC-GTCACGT------------CAAC---GTGGTAA-AAGGTGCC-----TC-AATAAG
Reference ( family-559 ) : GTGCATTTCT----TA---TGTCAGTAAT---AATGTTA--------TGGTATCCATAGCAACATGCATACATGGT------T-AGTGCCGCAGCTCAAA-----ATGTTGAACAA-TTTGA-----CAGA-TAAATATGTG-AAAAATA-ACAATCA-TT-----TCCCTGTAAAACTCGCGGTAAATCATATAT---TA-TTGAGGACACGTCATCAATGTCTGCA-T-GA---TGTCATTC------C------AG------C------A------T-----T------G-CGCGCAGGTGTTAGG----AGTTTAAACAAACTT---ACAT-TGAAAAGGTAGA----CTCGT-TCATANGC--AAATA------GTG-C-GTCTGANGAAAAGGTGAAACAACGAGCGGC-A-----ATAC--A-G-TTT-G-TGTCAATATTAGCA-AAACACTGATCCAGACG-ATAGATATGCNTA---GTAAAGCTCCGAG--AAAGTTATTT-GTAGTGCGTTTTGTAGTCTACAAATGA-CACAAACGGTACAGTGAGGAACGAGAAACA-ATA-ATGGATGAT-AACANG----TGTG--GT----CGCCCTGTGTCAAAATCGCGT-----CAAC-GTCACGT------------CAAC---GTGGTAA-AAGGTGCC-----TC-AATAAG
gi|144502 : GTATATTTCT----TA---TGTCAGTAAT---AATGTTA--------TGGTATCCATAGCAACATACATATATGAT------A-AGTGCCGCAGCTCAAA-----ATTTTGAACAA-TTTGA-----CAGA-CAAATATGTG-AGTAATA-ACAATCA-TT-----TTCCCGTAACACTCGCGATAAATCATATAT---TA-TTGAGGACACAGCATCAATGTGTGCA-T-GACAATGTCATTC------C------AG------C------A------T-----T------G-CACGCAGGTGTTAGG----AGTTTAAATCAACTT---CTAT-TGAAAATGTAGA----TGCAT-TCATATGC--AAATA------GTG-C-ATCTGATGAAAAGGTGAAACAACGAGCAGT-A-----ATAC--A-G-TTT-A-AGTCAATATTAGCA-AAACACTGATTCAGACG-ATAGATATGCATA---GTAAAGCTCCGAG--AAAGTTATTT-GTAGTGCATTTTGTAGTCTACAGATGA-CACAAACGGTACAGTGAGGAGCGAGAAACA-ATA-ATGGACGAT-AACATA----TGTG--GT----CGCCCTGTGTCAAAATCGCGC-----CAAT-GTCACGT------------TAAC---GTGGTAA-AAACTGCC-----TT-AATAAG
gi|144503 : GTATATTTCG----TA---TGTCAGTAAT---AATGTTA--------TGGTATTCATAGCAACAAACATATATGAT------T-AGTGCCACAGCTCAAA-----ATGTTGAACAA-AC-GA-----CAGT-TAAATATGTG-AAAAATA-ACAATCA-TT-----TCCCTGCAAAACCCACGGTGTATAATATAT---TA-TTGAAGACACGTCATCAATGTCTGCA-T-G----TGTCATTT------C------AG------C------A------T-----T------G-CGCACAGGTGTTAGG----ACTTTAAATAAACTT---ATAT-TGAAAAGGTAGA----CTCAT-TCATATGC--AAATA------GTG-C-ATCTGATGAAAAGGTGAAACAACGAGTAGC-A-----ATAG--A-G-TTT-G-TGTCAATATTAGAC-AAACACTAATTCAGACG-ATAGATATGGACA---G-AAAACTCCAAG--AAAGTTATTT-GTAGTGCATTTTGTGGTTTACAAATGA-CACAAACGATACATTGAGGAATGAGAAACA-ATA-AATGATGAT-AACAAG----TGTG--G-----CAACCTTTGTCAAAATCATG------CAAA-GTCATGT------------CAAC---ATGGTAA-AAAGTGCC-----TC-AATAAG
gi|144504 : GTATATTTCT----TA---TGTCAGTAAT---AATGTTA--------TGGTATCCATAGAAACATATATACAAGAA------T-ATTGCCACACCTCAAA-----ATGTTGAACAA-TTCGA-----CAGA-TAAATATGTG-AAAAATA-ACAATCA-TT-----TTCCTGTAACGCTCGCGGTGAAGCATATAT---TA-TTGAGGACACGTCATCAATGTCTACA-T-G----TGTCATTC------C------AG------C------A------T-----G------G-CGCGCAGGTATTAGG----CGTTTAATTAAACTT---ATAT-TGAAAAGGTAGA----CTCAT-TCATATGC--AAACA------GTG-C-ATCTGATGAAAAGGTGAAACAACGAGCAGC-A-----ATAT--A-G-TTT-G-TGTAAATATTAGCA-AAACACTGAT-TAGACG-AGATATATGCATA---GTAAATATCCGAGAAAAAATTATTT-ATAGTGCATTTTGTTGTCTACAAATGA-CAAAAACAGTACAGTGAAGAACGAGAAATA-ATA-ATGAATGTT-AACAGG----TGTG--G-----CGCCCTGTGTCAATA-----T-----CAA--GTCACGT------------CAAC---GTGGTAA-AA-GTGCC-----TC-AATAAG
gi|144505 : GTATATTTCA----TA---TGTCAGTAAT---AATGTTA--------TGGTATCCATAGCAACATACATGCATGAA------T-AGTTCCGCAGCTCAAA-----ATGTTGAACAA-TTCGA-----CA-----------------AATA-ACAATCAATT-----TTCCCATAACACTCGCAGTGAATCATATAT---TA-TTGAGGACATGTCATCAATGTCTGCA-T-GACAGTGTCATTC------C------AG------C------A------T-----T------G-CGTGCAGGTGTTAAG----AGTTTAAATAAACTTTACATAT-TGAAAAGGTAGA----CTCAT-TCATATGC--AAATACCGGTAGTG-C-AGCTGATGAAAAGGTGAAACAACAAGCAGC-A-----ATAC--A-G-TTT-G-GGTCAATATTAGCA-AAACACTGATTCAGACG-ATAGATATACATA---GTAAAGCTCTGAG--AAAGTTACTT-GTAGTGCATTTTGTAGTCTACAAATAA-CACAAATGGTACAGTGAGGAACGAGAAACA-ATA-ATAGATGAA-AATCGG----TGTG--G-----CGTCCTGTATTAAAATCACG------CAAA-GTCACGT------------CAAC---GTGGTTA-AA-GTGCC-----TC-AATAAG
gi|144506 : ATTTCT----TA---TGTCAGTAAT---AATGTTG--------TGGTATCCATAACAACATACAAACATGAT------A-AGTGCCGCAGCTCAAT-----ATGTTGAAAAA-TTTGA-----CAGA-CAAATATGTG-AATAATA-ACAATCA-TT-----TTCCCGTAACACTCGCGGTAAATCATACAT---TA-ATGAGGACACGGCATCAATATCTACA-T-GACAATGTCATTC------C------AG------C------A------T-----T------G-TACGCAGGTGTTAGG----AGTATAAATCAACTT---CTAT-TGAAAATGTAGA----TGCAT-TCATATGC--AAATA------GTG-C-ATCTAATGAAAAGGTAAAACAACGAGCAGT-A-----ATAC--A-G-TTT-T-AGTCGATATTAGCA-AAACACTGATTCAGACG-ATAGATATGTGTA---GTAAAGCTCCGAG--AAAGTTATTT-GTAGTGTATTTTGTAGTCTACAGATAA-CACAAACGATACAGTGAGGAACGAGAAACA-ATA-ATGGATGAT-AACATA----TGTG--GC----CGCCCTGTGTCAAAATCGCGT-----CAAT-GTCACGT------------TAAC---GTGTTAA-AAACTGCC-----TT-GATAAG
gi|144507 : gtttGTATATTTCT----TA---TGTCAGTAAT---AATGTTA--------TGGTATCCATGGCAACATACATACATGAT------A-AGTGCCGCAGCTCAAA-----ATGTTGAACAA-TTCGA-----CAGA-CAAATGTGTG-TATAATA-ACAATCA-TT-----TTCCCGTAACACTCGCGGTAAATCATATAT---TA-TTGAGGACACGGCATCAATGTCTGCA-T-
gi|144507 : T---GCAT-TTGAAATGTAGA----TGCAT-TCATATGC--AATTA------GTG-C-ATCTGATGAAAAGGCGAAACAACGAGCCAT-A-----ATAC--A-G-TTT-A-AGTCAATATTAGCA-AAACACTGATTCAGACG-ATAGATATGTATA---GTAAAGCTCCGAG--AAAGTTATTT-GTAGTGCATTTTGTAGTCTACAGATGA-CACAAACGGTACAGTGAGGAACGAGAAACA-ATA-ATGGATGAT-AACA------TGTG--GT----CGCCCTGTATCACAATCGCGT-----CAAT-GTCACGT------------AAAC---GTGGTAA-AAACTGCC-----TT-AATAAGttgaaatgtagatgcattcatatgcaattagtgcatctgatgaaaaggcgaaacaacgagccataatacagtttaagtcaatattagcaaaacactgattcagacgatagatatgtatagtaaagctccgagaaagttatttgtagtgcattttgtagtctacagatgacacaaacggtacagtgaggaacgagaaacaataatggatgataacatgtggtcgccctgtatcacaatcgcgtcaatgtcacgtaaacgtggtaaaaactgccttaataag
gi|144508 : gtatatttcttatgtcagtaataatgttatggtatccatggcaacatacatacatgataagtgccgcagctcaaaatgttgaacaattcgacagacaaatgtgtgtataataacaatcattttcccgtaacactcgcggtaaatcatatattattgaggacacggcatcaatgtcGTGCATTTCT----TA---TATTAATAAT---AATGTTA--------CGGTCTCCATAGCAACATGCATGCATGGT------T-AGTGCCACAGCTCAAA-----TTGTTGAACAA-TTTGA-----CAGA-TAAATATGTG-AAAAATA-ACAATGA-TT-----TCCATGTAAAACTCACGGTAAATCATATAT---TATTTGATGACAAGTCATCAATGTCTACATT-G-----GTCATTC------T------AG------T------A------C-----TAGTATGG-TGCGCAAGTGTTAGG----AGTTTAAACAAAATT---ACAT-AAAAAAGAAAAA----CTTAT-TAATAAGC--AAAAT------TTC-C-ATCTGAGAAAAAAGTGAAACAACGAGCGGA-A-----ATAC--ATT-TTT-G-TGTCAAAATTGGCA-AAACACTGATCCAGGCG-ATATATCTGTTTA---GTAAAGCTCTGAG--AAAGTTATTT-GTAGTGTGTTTTGCAGTCTATAAATGG-CACAAATGGTACAGTGAAGAACAGGAAACA-ATA-ATGGATGAT-AACATGACATTGTGTTGT----CGCCCTGTGTCAAAATTCTAT-----CAAC-GTCGTGT------------CAAT---GTGGTAA-AAGGTGCC-----TT-AATAAG
gi|144509 : GTGCATTTCT----TA---TGTTAATAAT---AATGTTA--------TGGTCTCCATAGCAACATGCATACATGGT------T-AGTGCCGCAGCTCAAA-----TTGTTGCACAA-TTTGA-----CAGA-TAAATATGTGAAAAAATA-ACAATTA-TT-----TCCCTGT-AAACTCGCGGTAAATCATATAT---TA-TTGATGACACATCATAAATGTCTACATT-G-----GTCATTTTAGTAAT------AG------T------A------T-----G------G-TGCACAAGTGTTTGG----AGTTTAAACAAACTT---ACATAAAAAAAGGTAAA----CTTGT-TAATAAGC--AAAAT------TTC-C-ATTAGAGAAAAAGGTAAAACAACGAGCGGA-A-----ATAC--ATT-TTT-G-TGTCAAAATTAGCA-AAACGCTGATCCAGGCG-ATATATATGCTTA---GTAAAGCTCTGAG--AAAATTATTT-GTAGTGTGTTTTGTAGACTATAAATGG-CACAAATGGTACAGTGAGGAA-AATAAACA-ATA-TTGGATGCT-AACATG----TGTG--GT----CACCATGTGTCAAAATCGCAT-----CAAC-GCCATGT------------CAAC---GTGGTAA-AAGGTGCC-----TC-AATAAG
gi|144510 : GTACATTTTT----TA---TGTTAATAAT---AATGTTA--------TGGTCTCCATAGCAACATGCATACATGGT------T-AGTGCCGCA-----------------GAACAATTTTGA-----CTGA-TAAATATGTG-AAAAATA-ACTATGA-TT-----TTCCTGTAAAACTCGCGGTAAATCATATAT---TA-TTGATGACACGTCATCAATGTCAGCATT-G-----GTCATTCTAG---T------AG------T------A------T-----G------G-CACGCAAGTGTTAGG----AGTTAAAACAAACTT---ACAT-AAAAAAGGGAAA----CTTGT-TAACAAGC--AAAAT------TTC-C-ATCCGAGAAAAAGGTGAAACAACGAGCGGA-A-----ATAC--ATT-TTT-G-TGTCAAAATTAGCA-AAACACTGATTCAGGCG-ATATATCTGTTTC---GTTATGCTCTGAG--AAATTTATTT-GTAGTGTGTTTTGTAGTCTATAAATGG-CACAAATGGTACAATGAGGAACAGGAAACA-ATA-ATGGATGAT-AACATGACATTGTGTCAT----CGCCCTGTGGCAAAATCGCAT-----CAAC-GCCATGT------------CAAC---GTGATAA-AAGGTGCC-----TCTAATA
gi|144511 : GTGTATTTCTAAAGCA---TGTCAGTACT---AATTTTA--------TGGTA--------ACCATGCATACATGTT------T-AGTGCTTCAGTTCATA------TGTTGAACAA-TTTGA-----CAGA-TCAGTATGTG-AAAAATA-ACAATAG-TT-----TCCATGTAAA-CTCGCAGTAAATC-TATAT---TA-TTGAGGACATGTCATCAAAGACTGCA-T-AA----GTCATTC------C------AGTAATAGC------A------A-----T------G-TGCGCAAGTGTAAGG----AGTTTAAACAAATTT---AAAT-TTAAACGGTAAA----CATGT-TCACAAGC--AAA-A------TTGAC-ATCTGAAAAAAAGGTGAAACAATGAG---------------------------TGTCATTTTTAGAA-AAATACTGATACAGACG-ATCGATACGCTTT---GTAAAGCTCTGAA--AATGATATCT-GTAATGTGTTCTGCAGTCTACAAATGG-CACAAATG--ATAGTCAGGAACGAGAAACA-CTA-ATGTATGAT-AACAGG----TGTT--GTATGCCATCCTTTGTCAAAATCCTGC-----AAAA-GTCATGT------------CAACAAAGTGGTAA-AAGATGCC-----T--AACAAG
gi|144512 : GTGCATTTGT----TA---CGTCAGTAAT---ACTGTTA--------TGGTATCCATAGCAACTTGCATACATGGT------T-AATGCCGCAGTTAAAA-----TTGTTGAACAA-TTTGA-----CAAG-TAAAT-----------TA-ACAATCG-TT-----TCCATGTAAAACTTGCAGTTATTCATATATAATTA-TTGATGACATGTCAT--------GTA-T--A---CGTCGTTC------C------AG------T------A------T-----TAGCAATG-CGCACATGTGTTGGG----AATTTAATCAAACTT---ACAT-TACATA---AGA----CACGT-AAACGTGC--AAA-A------TTC-T-GTCTAAAGGAAAAGTGAAACAACGAGCGGC-G-----ATAC--A-G-TTTTG-TGTCAATATTAGCA-TAACACCGATTCAGACA-ATGGATATGATTA---GTAAAGCTCCGAG--AAAGTCATCT-ATAGTGCGTTCTGTAATCAACAAATGG-TACAACTGGTTCAGTGAGAAGCGATCAACA-ATA---------------------TGTG--GT----CGATCTGTGTCAAAATTGCGCAAACGTAAC-GTCACGTTAAAAGGTCGGTCAAC---GTGATAA-AA-ATGCC-----TC-AACGAG
gi|144513 : GTATATTTCT----TA---TGTCAGTAAT---AATGTTA--------TGGTATCCATAGCAACATACATACATGAT------A-AGTGCCGCAGCTCAAA-----ATGTTGAACAA-TTCGA-----CAGA-CAAATATGTG-AATAATA-ACAATCA-TT-----TTCCCGTAACACTCGCGGTAAATCATATAT---TA-TTGAGGACACGGCATCAATGTCTGCA-T-G
gi|144514 : T----TA---TATCAGTAAA---AATGTTA--------TAGTATTCATTGCAACATACATACACAAT------T-AGTCCCGCAGCTCAAA-----ATGTTGAACAG-CTCGA-----CAGA-TAAATATGTG-AAAAATA-ACAATAA-TT-----TTCCTGTAAATCTCACGTTAAAACATATAT---TA-TTGAGAACATGTCATCAATGTCTGCA-C-AACAGTGTCATTC------C------AG------C------A------
gi|144515 : gtatatTTTTT----TA---TGTTAAAAAT---ATTGTTA--------TGGTCTCCATAGCAACATGCATACATGGT------T-TGTGTTGCAGCTCAAA-----ATGCTGAACAA-TTTGA-----CAGA-TAAATATGTG-AAAAATATAAAATAA-TT-----TCCCAGTAAAACTCGCGGTAAATCATATAT---TA-CTGAGGACACATCAACAATGTCTGCA-T--A---GGTCATTC------C------AG------T------A------T-----TAGTATGG-CATGCAAGTGTTAGC----AGTTTAAACAATCTT---ACAT-
gi|144516 : gcattGTGCATTTCT----TA---TGTCAACAAT---AATGTTAAGGACTTATGGTATCCATAGCAACATGCATGTATGGT------T-AGTGCACCAGCTCAAA-----ATGTTGAGCAA-TTTGA-----CAGA-TAAATATTTG-AAAGATA-ACATTCA-TT-----TGCCTGTATAAC-------ATATCA-ATAT---TA----AGGACACGCCATCAATGTCTGCA-
gi|144517 : GTGCATTTCT----TA---TGTTAATAAT---AATGTTA--------TGGTCTCCATAGCAACATGCATACATGTT------A-AGTGCCGCAGCTCAAA-----GCGTTGATCAG-CTTGA-----CAGA-TAAATATGTG-AAAAATA-AC--TGA-TT-----TCC--------CTCGTGGTAAATCATATAT---TA-TTGAGGACACATCATCAATGTC
gi|144518 : GTGCATTTCT----TA---TGTTAATAAT---AATGTTA--------TGGTCTCCATAGCAGCATGCATACATGGT------T-AGTGCCGCAGTTCAAA-----TTGTTAAACAA-TTTGA-----CAGA-TAAATATGTG-AAAAATA-ACAACGA-AT-----TTCCTGTAAAACTTGCCGTAAATCATATAT---TA-TTGATG-CGTGTCAT
gi|144519 : TTTCT----TA---TGTCAGTAAT---AATGTTA--------TGGTATCCATAGCAACATACATACAGGAT------T-AGTGTCGCAGCTCAAA-----ATGTTAAACAA-TTCGA-----CAGA-TAAATATGTG-AAAAATA-ACAATAA-TTGATTTTCCCTGTAACACTCGTGGTGAAGCCTATAT---TA-TTGAGAACACGTCATCAATGTTTGCA-T-G----TGCCGTTC------C------AG------C------A------T-----G------G-CGCGCAGGTGTTAGG----AGTTTAAATAAATTT---ATAT-ATAAAAGTTAGA----CGCAT-TCATATGC--AAATA------GTA-C-ATCTGATGAAAAGGTGAAG----GAGCAGC-C-----ATAC--A-G-TTT-G-TGTCAATATTAGCA-AAACACTGA-CCAGACG-ATAGATATGCATA---GTAAAGCTACGAG--GAAGTTATTT-GTAGTGCATATTATAGTCTACAAATGA-CACAAACGGTATAGTGAGGAACGAGAAACA-ATA-ATAGATGAT-AACAGG----TGAG--G-----CGTCCTGTGTCAAAATCAAGT------AAA-GTCACGT------------CAAT---GTGGTAA-AAGGT
gi|144520 : tattTGTATTTCT----CA---CGCCAGTAAT---AATATCA--------TGGTATACAAAGAGGCATGCATTTATAGG------G-AACGCCGCAGCTCAAA-----ATATTGAAAAG-TTTAA-----CAGG-TAAACATACG-AATAA-A-ACAATCG-TT-----TCCCTGT-----------TAAATTACAGAA---GA-TT---GTCCCGTCATCAATATCTACA-T--A---TGTCATTT------C------AG------TGATGAAA------T-----T------G-CACCTAAGTGTTAGAAACTAACTTGAACAAACGC---ACAT-TAAAAACA-AAA----TGTAT-GCACGAGC--AAA-A------ATGCC-GTCTGAAGAACGCGCGAATCAAAGATTTGC-T-----GTACA-A-A-TTT-GATGTCAATATTAGCG-CAACACCGGTCCCGACG-AT--------TTA---CTCAAG------A--AAAATCCTTT-GTTACGCGTTCTTTCATTTA-AAACAAGCACACGTGACACGGTGAGGGATGAAAAATA-ATA-ATGGGTGAC-AACATG----TATG--GT----CAA---GTTTCAAAATCGCG------CAACAATAGCAT------------CATC---TTAGTGA-AAaacgtaaaaag
gi|144521 : TACACTCCT----T-----GTCCGTAAT---GATATTG--------TCATTTTAATAGCAA------TAAA--GC------T-GGTGCCGCAGCTCAAA-----ATGGTGAACAA-GGTAAGGATGCAAA-AAAAAACAAC-AAAAA-A-ACAATCG-TA-----TCTCTGTAAAATTTACAATAAATCATTTAT---TA-TTAATGATACGTTATCAATGTCTTCG-T--A---TGTCATTT------C------AG------T------A------T-----T------
gi|144522 : ATTTGT----TA---TGTTAATAAT---AATGATA--------TGGTCTCCTTAACA-CATGCATACATGTT------T-AGTGCCGCAGCTCAAA-----ATGTTGAACCA-TTTGA-----CAGA-TAAATATTTG-AAAAATA-ACAATGA-TT-----TCCCTGTAAAACTCGTGGTAAATCATATAT---TA-TTGAGGACATGTCATCAATGTCTATA-TTG-----GTCATTC------C------AG------T------A------TAAGTAT------GGTGTGCAAGTGTTAGG----AGTTTAAACAAACTT---ACAT-AAAATAGGCAAA----CTTGT-TCATAAGC--AAATC------TTC-C-GTCTGAGGAAAAGGTAAAACAACGAGCAGA-A-----ATAC--A-G-TTTTG-TGTCAATATTAGCA-AAACACTGATCCAGTCG-ATATATATGCTTA---GTAAAGCTCCGAG--AAAATTATTT-GTAGTGCATTTTGTAGTCTACAGATGA-CACCAACGGTAGGGTGATGAACGAGAAACA-ATA-ATGGATGAT-AACATG----TGTG--GT----CGCCCTGTGTCAAAATCGTAT-----CAAC-GACACGT------------CAAC---ATAGTAA-AAGGTGCC-----TC-AATAAG
gi|144523 : ATTTCA----TA---TGTAAATAAA---AATGTTA--------TGGTCTCCATAGCAACATGCATACATGGT------T-AGTGCCGCAGCTCAAA-----GTGTTGAACAA-TTTCA-----CAGA-TAAATATTTG-GAAAATA-ACAATGG-TT-----TCCCTGTAAAACTCGCGGTAAATTATATAT---TA-TTGATGACACGTCATCAATGTCAACATT-G-----GTCATTCCAGTAAC------AG------T------A------T-----G------G-CGCGCAAGAGTTAGG----AGTTTGAACAAAATT---ACAT-AAAAAAGGCAAA----CTCGT-TAATAAGC--AAA-A------CTT-CTGTCTGAGGAAAGGGTGAAACAACGAGC--------------------TTT-G-TGTCAATATTAGCA-AAAGTCTGATCCAGGTG-ATATATATGCTTA---GTAAAGCTCCGAG--AATGTTATTT-GTAGTGTGTTTTGTAGTCTTTAAATGG-CACAAACGGTACAGTGAGGAACAAGAAACA-ATA-ATGGATGATAAACATG----TGTG--AT----CTCCCTGTGTCAAAATCGCGT-----CAAC-GTCACAT------------CAAC---GTGGTAA-AAGGTGCC-----TC-AATAAG
gi|144524 : ATTTCT----TA---TGTTAATAAT---AATGTTA--------TGGTCTCCGTAGCACAATGCACACATGTT------A-AGTGCCGCAGCTCAAA-----ATGTTGAACAA-TTTGA-----CTGA-TAAATATGTG-AAACATA-ACACTGA-TT-----TCCCTGTAAAACTC-TAGTAAGTCATATAT---TA-TTGAGGACATGTCATCAATGTCTGCA-T--A---GGTCATTC------C------AG------T------AATAATAT-----G------G-CATGCAAGTGTTAGG----AATTTACACAAACTT---ACAT-AAAAAAGGCAAA----CTCGT-TCATAAGC--AAA-A------CTT-CTGTGTAAGGAAAAGGTGAAACAATGAGCGGA-A-----ATAT--A-G-TTTTG-TGTCAATATTAGCT-AAACACTGATCCAGGCG-ATATATATGCTTA---GTAAAGCTCTGAG--AAAGTTATAT-GTAGTGCGTTTTGTAGTGTATAAATGG-CACAAACAGTACAGTGAGGCACGAGAAACA-ATA-AT-------------A----TGTG--GT----CGCCCTGTGTCAAAATCACAT-----TGAC-ATCACAT------------CAAA---GTGGTAA-ACAGTGCA-----TC-AATAAG
gi|144525 : ATTTCT----TACTATGTCAGTAAT---CATGTTA--------TGGTTTCCATAGCAATATGCATACTTGGTTACCGGT-AGTGCTGCAGCTCAAA-----ATGTTTAACAG-TTTGA-----CAGG-TGAGAATGTG-AAA
gi|144526 : TTTTT----TA----GTATATAAT---AATGTTA--------TGGTATCCATAGCAACATACATACAGAAC------T-AGTGCCGCAGCTTCAA-----ATGTTTGACAA-TTCGA-----CAGA-TAATCATGTG-AAAAATA-ACAATCC-TT-----TTCCT-TAATACTCGAGGTGAAGCATATAT---TA-TTGAGAACACATCATCAATGTCTGCA-T-G----TGTCATTC------A------AG------C------A------T-----G------G-TACGCAGGTGTTAGG----AGTTTACATTTACTT---GTAT-TGAAAAGGTAGA----CTCAT-TCATATGC--AAATA------GTG-C-ATCTGGTGAAAAGGCGAAACAACGAGCAGC-A-----ATAC--A-G-TTT-G-TGTCAATATTA-CACAAACACTGAT-CAGACG-ATAGATATGCATA---ATAAAGTTCAGAG--GAAGTTATTT-GTAGTGCATTTTATAGTCTACAAATGA-CACAAACGGTACAGTGAGGAAAGAGAAAGA-ATA-ATGGATGAT-AACAGG----TGTG--G-----CGTCTTGTGTCAAAATCAAG------CAAA-GTCACGT------------CAAC---GTGGTAACAAG
gi|144527 : TTCT----TA------CAGTAATTATAATGTCA--------TTGTATCCATGGCAACATGCATACATGGG------T-AG---------------------------CAG-TTTGG-----TAG--TAAATATGTG-AAAAATA-TTAAGTG-TC-----TCCTTGTACAAC---------ACC---TAT---TA-TTGACGATACGTCGTCATTATCTGCA-T--A---CGTCATTA------C------AG------TT-----A------TAAAAAT------G-CG------TGTTAAG----GATTTAAACATCCCT---ACTT-T-------TTGG----CACGC-----AAGCCGGAAT-------GT--C-GTCTGAAGAAAAAATGAAACAACAAGCGACTACATATATAC--A-GTTTT-G-GGTAAACA-TAGGA-AAACACCGGTCAAGGCGAATAAAT-TGCTTACTTGTAAA
gi|144527 : AAATGGTACACTGAGG---GATAAA-A-ATA-ATG--------ACATG----TGTA--AT----CGCATTGTGTCAAAATCGtggtacactgagggataaaaataatgacatgtgtaatcgcattgtgtcaaaatcgagcaaa
gi|144528 : ttcttacagtaattataatgtcattgtatccatggcaacatgcatacatgggtagcagtttggtagtaaatatgtgaaaaatattaagtgtctccttgtacaacacctattattgacgatacgtcgtcattatctgcatacgtcattacagttataaaaatgcgtgttaaggatttaaacatccctactttttggcacgcaagccggaatgtcgtctgaagaaaaaatgaaacaacaagcgactacatatatacagttttgggtaaacataggaaaacaccggtcaaggcgaataaattgcttacttgtT---AATATTA--------TATTATCTATAGCAACATGCATACATGGG------TGAGCACCGCAACTCAAA-----ATAATGAAAAA-TTTG------TAGAGTCAACATGTG-AAAAATG-ATGAGTG-TG-----TCCCTACAAGATTCGCAGGAAATCATAagcaaa
gi|144529 : ATAGCAACATACGTACATGAT------T-GATGCCGCAGCTCAAATCAAAATGTTGAACAA-TTTGA-----GAGT-TAAATATGTG-AAATATA-ACAATCA-TT-----TCCCTGTAAAACTCGCGGTGAATCATATGT---TA-TTGAAGACACGTCATCAATGTCTGCA-T-G----TGTCATTC------C------AG------C------A------T-----T------G-TGCGCAGGTGTTAGG----AGTTTAACTAAACTT---ATAT-TGAAAAGGTAGA----CTCAT-TCATATGC--AAATA------GTG-C-ATCTGATGAAAAGATGAAACAACGAGCAAC-A-----ATAC--A-G-TGT-G-TATCTATATTAGCA-AAACACTGATTCAGACG-ACAGATATGCATA---GTAAAGCTCCGAG--AAAGTTATTT-GTAGTGC
gi|144530 : -AGTGCTAAAGCTTAAA-----ATGTTGAATAA-TTTGA-----CAGG-TAAGTATGC--ACAAATA---AACGA-GT-----TCCCAGTAAAATTTGCGGTACCTCATATAT---TA-GTAAAGGCACGTa
gi|144531 : AAA-----GTGTTGAACAA-TTCGA-----CAGT-TAGATATGTG-AAATATA-ACAATCA-TT-----TCCCTGTAAAACTCGCTGTCAATGATATAT---TA-TTGAAGACACGTCATCAATGTCTGCA-T--A---TGTCATTC------C------AG------C------A------T-----T------G-CAAGCAGGTGTTAGG----AGTTTAAGTACTTTT---ATAT-TGAAA------------------CATATGC--AAATA------GTG-C-ATCTAATGAAAAGATGAAACAACGAGCAGC-A-----ATAC--A-G-TTT-G-TGTCAATATTAGCA-AAACATTGAT-CAAACG-ATAGATATGCATA---GTAAAGCTCCGTG--AAAGTTATTT-GTAGT--ATTTTGTAGTCTACAAATGA-CACAAACGATA
gi|144532 : GATCAA-TTTGA-----CA---TAAATATGTG-AAAAATA-ACAATCA-TT-----TCCTTGTAAATCTCATTGTAAATCATATAT---TG-CTTAGGACGTGTCATCAATGTATGCA-T--A---TGCCATTC------CAAAAAAAG------C------A------T-----G------G-CAGGCAAGTGTAAGA----AGTTCAAACAAACTA---AAAT-TGAACAGGTAGA----TTCGT-AAACAAAC--AAAAA------TTG-C-GTCTGAGAGAAAGGTGAAACAACGAACGGC-AATT--ATGCCAA-GTTTT-A-TGTCAGTATAAGCA-AAACACCGATCCAGACG-ATAGATATGCTTA---GTAAAGCTTTACG--AATGTTGTTT-GTATTGCATTC--TAGTCAACAATTGA---------GTA---TGAGAAACAAGAAACATATACAT--ATCAT-AA
gi|144533 : A-CAAATTTGTG-AATAATA-ACAGTCA-TT-----TTCCCGTAACACTCGCGGTAAATCATATAT---AA-TTGAGGACACGGCATCAATGTCTGCA-T-GACAATGTCATTC------C------AG------C------A------T-----T------G-CACGCAGGTGGTAGG----AGTTTAAATCAACTT---TTTT-TGAAAATGTAGATGCACTCATATCATATGC--AAATA------GTG-C-ATCTGATGAAAAGGTAAAATAACGAGCAGT-A-----ATAC--A-G-TTT-A-AGTCAATATTAGCA-AAACACTGATTCAGACG-ATAGATATGTATA---GTAAAGCTCCGAG--AAA------T-GTA------TTTGTAGTCTACAGATGA-TACAAACGATACAGTGAGGAACGAAAAACA-ATA-ATGGATGAT-AATATA----TGTG--GT----CGCCCTGTGTCAAAATCGCGT-----CAAT-GTCACGT------------TAAC---GTCGTAA-AAACTGCCTTTAGTT-AATAAG
gi|144534 : TATGTG-AAAAATT-ACTATCA-TT-----TTCCCGTGAAACTCGCGGTATATCATATAT---
gi|144535 : GC--AAAAA------CTG-C-ATCTACGGAAAAGGTGAAACAAAGAACGGC-A-----ATAC--A-G-TTT-GGTCTCAATATAAGCA-AAATATCGATCCAGATG-ATATATATGCTTA---GTAAAGCTCTGAG--AAAGTAATTTAGT-GTGCGTTCTGTAGTCTATAAATGG-AACAAATGGTACAGTGAGGAACAAATAACA-ATC-ATCGATGAC-AACAGG----TGTG--GT----TGCCCTGTGTCGAAATCGCAT-----CAAC-GTCACAC------------CAAC---GTGGTAA-AATGTGTC-----GT-AATA
gi|144536 : tTGAAGAAAACGTGAAACAACGAGCGAG-T-----ATAC--A-GTTTT-G-TATCCGTATTAGCA-AAACATCGGTCCAGACG-GTCGA
gi|144537 : atcg-G-TGTCATT-CCAGCA-AAACACTGATTCAGATG-ATAGATATGCATA---GTAAAGCTCCGAG--AAAGTTATTT-A-AGTGCATTTTGTAGTCTACAAATAA-CACAAACTGTACAGTG-GGAAAGAGAAACA-ATA-ATGGATGCT-AACAGG----TATG--G-----CGTCCTGTGTCAAGATCAAG------CAAA-GTCACGT------------CAAC---GTGGCAA-AACGTGCC-----TC-AATAAG
gi|144538 : G-ATAGATATGCATA---GTAAAGCTCCGAG--AAACATATTT-ATGGTGAATTTTGTAGTCTACAAATGA-CACAAATGGTACAGTGAGAAATGAGAAACA-ATA-ATGGATGCT-AACAGG----TATG--G-----CATCCTGTGTCAAAATCAAG------CAAA-GTCACGT------------CAAC---GTGGTAA-AATGTGCC-----TC-AATAAG
gi|144539 : TCACGT------------CAAT---GTGGTAA-AATATGCC-----TC-AATAAG
blockSeqs : AAAG CTA TAT AGGACTTA TACCGG G TCAAA T GGATG G A T A GATTT AAT T T GACAGT TAGTAA AAAAAA TAATAGC ATAATA TAGTATG G AACT TAC AAA TGCA T A T CG TACCGGTAG GA TG T A CT CATAT CA TT T A C T A A CTT AA A G T C A A ACAT TT TATGC CAAACG CA TAAAAGGTCGGT AAA C A TTTAG T
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . T GACAAT CAGTAA . TGATGAA . TAGCAAT . . . TG . T . T . TAG GC TG T A C ATT A TT T G . T . A . . . . . . . G ACAT TC C T A . . . A . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . T AACAGT TAG . TT . TAGTATG . . . TG . T . T . CAG G A T A C . . TT T . . T . A . . . . . . . G . . T T A . . . A . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . T GACAAT . . C . AAGTAT . . . TG . G . T . TAG G A T A C . . GT . . . T . G . . . . . . . T . . T T T . . . G . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . GT . . C . AAAAAT . . . TG . G . T . TAG G A T C T . . GT . . . C . A . . . . . . . T . . T T T . . . G . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . GT . . C . T . . . TT . T . A . ATT G A G G T . . GT . . . C . T . . . . . . . T . . T T C . . . G . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . C . G . . . AA . T . A . ATT G A G G A . . G . . . T . T . . . . . . . T . . T T C . . . G . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . AC . . T . T . . . AA . T . A . ATT C A G G A . . G . . . A . T . . . . . . . G . . T C C . . . G . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . AG . . T . T . . . TT . A . A . TAG C A A G A . . G . . . T . T . . . . . . . G . . T T A . . . G . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . GT . . T . G . . . TA . A . T . TCT C A A A C . . G . . . C . T . . . . . . . T . . T T C . . . G . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . T . G . . . AT . G . T . TAG C A T T C . . G . . . C . A . . . . . . . T . . T T A . . . A . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . C . T . . . TA . G . A . TAG A G A A C . . G . . . C . T . . . . . . . T . . T T C . . . G . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . TG . . T . G . . . AA . T . A . TAG C A G G A . . G . . . C . T . . . . . . . G . . T T C . . . A . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . AG . . C . T . . . AA . T . A . AAT T G G A A . . A . . . C . T . . . . . . . T . . T T C . . . T . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . GT . . T . T . . . AA . T . A . TAG T G G G C . . G . . . C . T . . . . . . . T . . . . A . . . C . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . AC . . T . G . . . TG . T . T . AAC G A T A C . . G . . . T . A . . . . . . . G . . . . T . . . T . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . GT . . T . G . . . TG . A . A . AT G G A A C . . G . . . C . T . . . . . . . G . . . . C . . . T . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . T . G . . . TG . T . T . AT G A T G C . . G . . . T . A . . . . . . . G . . . . A . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . C . T . . . TG . T . T . AA G A T A T . . G . . . C . A . . . . . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . C . T . . . TG . T . A . AC G G G G C . . G . . . C . T . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . C . G . . . T . . . T . AC G A T G G . . G . . . T . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . C . T . . TG . A G . . . . . . . . . . T . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . C . A . . . . . . . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : .
blockSeqCons : AT*****
originalCons : GTGCATTTCT----TA---TGTCAGTAAT---AATGTTA--------TGGTATCCATAGCAACATGCATACATGGT------T-AGTGCCGCAGCTCAAA-----ATGTTGAACAA-TTTGA-----CAGA-TAAATATGTG-AAAAATA-ACAATCA-TT-----TCCCTGTAAAACTCGCGGTAAATCATATAT---TA-TTGAGGACACGTCATCAATGTCTGCA-T-GA---TGTCATTC------C------AG------C------A------T-----T------G-CGCGCAGGTGTTAGG----AGTTTAAACAAACTT---ACAT-TGAAAAGGTAGA----CTCGT-TCATANGC--AAATA------GTG-C-GTCTGANGAAAAGGTGAAACAACGAGCGGC-A-----ATAC--A-G-TTT-G-TGTCAATATTAGCA-AAACACTGATCCAGACG-ATAGATATGCNTA---GTAAAGCTCCGAG--AAAGTTATTT-GTAGTGCGTTTTGTAGTCTACAAATGA-CACAAACGGTACAGTGAGGAACGAGAAACA-ATA-ATGGATGAT-AACANG----TGTG--GT----CGCCCTGTGTCAAAATCGCGT-----CAAC-GTCACGT------------CAAC---GTGGTAA-AAGGTGCC-----TC-AATAAG
finalCons : GTGCATTTCT----TA---TGTCAGTAAT---AATGTTA--------TGGTATCCATAGCAACATGCATACATGGT------T-AGTGCCGCAGCTCAAA-----ATGTTGAACAA-TTTGA-----CAGA-TAAATATGTG-AAAAATA-ACAATCA-TT-----TCCCTGTAAAACTCGCGGTAAATCATATAT---TA-TTGAGGACACGTCATCAATGTCTGCA-TAT-----GTCATTC------C------AG------C------A------T-----T------G-CGCGCAGGTGTTAGG----AGTTTAAACAAACTT---ACAT-TGAAAAGGTAGA----CTCGT-TCATANGC--AAATA------GTG-C-GTCTGANGAAAAGGTGAAACAACGAGCGGC-A-----ATAC--A-G-TTT-G-TGTCAATATTAGCA-AAACACTGATCCAGACG-ATAGATATGCNTA---GTAAAGCTCCGAG--AAAGTTATTT-GTAGTGCGTTTTGTAGTCTACAAATGA-CACAAACGGTACAGTGAGGAACGAGAAACA-ATA-ATGGATGAT-AACANG----TGTG--GT----CGCCCTGTGTCAAAATCGCGT-----CAAC-GTCACGT------------CAAC---GTGGTAA-AAGGTGCC-----TC-AATAAG
Alignments
lowQualScore : 111111111111 111111 222222222222 111111111 11111 111111
lowQualScore : 3333 222 222 55555555 0 444444 1 33333 1 33333 1 1 1 0 1 33333 222 1 777777777777 222222 444444 8888888888888 444444 333333333333 1 3333 333 222 0 3333 1 1 1 22 222222222 44 44 1 2 22 77777 44 5 3 6 3 1 3 1 1 222 22 1 0 1 1 1 1 4 7777 55 11111 111111 55 999999999999 333 1 6 55555 2
lowQualScore : .... ... ... ........ . ...... . ..... . ..... . . . . . ..... ... . ............ ...... ...... ............. ...... ............ . .... ... ... . .... . . . .. ......... .. .. . . .. ..... .. . . . . . . . . ... .. . . . . . . . .... .. ..... ...... .. ............ ... . . ..... .
lowQualScore : 3333 777 666 44444444 9 111111 4 33333 3 22222 2 2 2 9 2 11111 333 3 666666666666 555555 888888 6666666666666 888888 000000000000 8 9999 000 555 2 9999 1 8 0 44 111111111 00 66 0 5 77 11111 00 0 3 4 2 6 4 5 0 888 33 7 1 7 7 7 7 0 7777 00 11111 999999 77 333333333333 222 8 5 33333 1
consensus : GTGCATTTCT----TA---TGTCAGTAAT---AATGTTA--------TGGTATCCATAGCAACATGCATACATGGT------T-AGTGCCGCAGCTCAA-----AATGTTGAACAA-TTTGA-----CAGA-TAAATATGTG-AAAAATA-ACAATCA-TT-----TCCCTGTAAAACTCGCGGTAAATCATATAT---TA-TTGAGGACACGTCATCAATGTCTGCAT----A----T--GTCATTC------C------AG------C------A------T-----T------G-CGCGCAGGTGTTAGG----AGTTTAAACAAACTT---ACAT-TGAAAAGGTAGA----CTCGT-TCATANGC--AAATA------GTG-C-GTCTGANGAAAAGGTGAAACAACGAGCGGC-A-----ATAC--A-G-TTT-G-TGTCAATATTAGCA-AAACACTGATCCAGACG-ATAGATATGCNTA---GTAAAGCTCCGAG--AAAGTTATTT-GTAGTGCGTTTTGTAGTCTACAAATGA-CACAAACGGTACAGTGAGGAACGAGAAACA-ATA-ATGGATGAT-AACANG----TGTG--GT----CGCCCTGTGTCAAAATCGCGT-----CAAC-GTCACGT------------CAAC---GTGGTAA-AAGGTGCC-----TC-AATAAG
Reference ( family-559 ) : GTGCATTTCT----TA---TGTCAGTAAT---AATGTTA--------TGGTATCCATAGCAACATGCATACATGGT------T-AGTGCCGCAGCTCAA-----AATGTTGAACAA-TTTGA-----CAGA-TAAATATGTG-AAAAATA-ACAATCA-TT-----TCCCTGTAAAACTCGCGGTAAATCATATAT---TA-TTGAGGACACGTCATCAATGTCTGCAT----A----T--GTCATTC------C------AG------C------A------T-----T------G-CGCGCAGGTGTTAGG----AGTTTAAACAAACTT---ACAT-TGAAAAGGTAGA----CTCGT-TCATANGC--AAATA------GTG-C-GTCTGANGAAAAGGTGAAACAACGAGCGGC-A-----ATAC--A-G-TTT-G-TGTCAATATTAGCA-AAACACTGATCCAGACG-ATAGATATGCNTA---GTAAAGCTCCGAG--AAAGTTATTT-GTAGTGCGTTTTGTAGTCTACAAATGA-CACAAACGGTACAGTGAGGAACGAGAAACA-ATA-ATGGATGAT-AACANG----TGTG--GT----CGCCCTGTGTCAAAATCGCGT-----CAAC-GTCACGT------------CAAC---GTGGTAA-AAGGTGCC-----TC-AATAAG
gi|144502 : GTATATTTCT----TA---TGTCAGTAAT---AATGTTA--------TGGTATCCATAGCAACATACATATATGAT------A-AGTGCCGCAGCTCAA-----AATTTTGAACAA-TTTGA-----CAGA-CAAATATGTG-AGTAATA-ACAATCA-TT-----TTCCCGTAACACTCGCGATAAATCATATAT---TA-TTGAGGACACAGCATCAATGTGTGCATGACAA----T--GTCATTC------C------AG------C------A------T-----T------G-CACGCAGGTGTTAGG----AGTTTAAATCAACTT---CTAT-TGAAAATGTAGA----TGCAT-TCATATGC--AAATA------GTG-C-ATCTGATGAAAAGGTGAAACAACGAGCAGT-A-----ATAC--A-G-TTT-A-AGTCAATATTAGCA-AAACACTGATTCAGACG-ATAGATATGCATA---GTAAAGCTCCGAG--AAAGTTATTT-GTAGTGCATTTTGTAGTCTACAGATGA-CACAAACGGTACAGTGAGGAGCGAGAAACA-ATA-ATGGACGAT-AACATA----TGTG--GT----CGCCCTGTGTCAAAATCGCGC-----CAAT-GTCACGT------------TAAC---GTGGTAA-AAACTGCC-----TT-AATAAG
gi|144503 : GTATATTTCG----TA---TGTCAGTAAT---AATGTTA--------TGGTATTCATAGCAACAAACATATATGAT------T-AGTGCCACAGCTCAA-----AATGTTGAACAA-AC-GA-----CAGT-TAAATATGTG-AAAAATA-ACAATCA-TT-----TCCCTGCAAAACCCACGGTGTATAATATAT---TA-TTGAAGACACGTCATCAATGTCTGCAT----G----T--GTCATTT------C------AG------C------A------T-----T------G-CGCACAGGTGTTAGG----ACTTTAAATAAACTT---ATAT-TGAAAAGGTAGA----CTCAT-TCATATGC--AAATA------GTG-C-ATCTGATGAAAAGGTGAAACAACGAGTAGC-A-----ATAG--A-G-TTT-G-TGTCAATATTAGAC-AAACACTAATTCAGACG-ATAGATATGGACA---G-AAAACTCCAAG--AAAGTTATTT-GTAGTGCATTTTGTGGTTTACAAATGA-CACAAACGATACATTGAGGAATGAGAAACA-ATA-AATGATGAT-AACAAG----TGTG--G-----CAACCTTTGTCAAAATCATG------CAAA-GTCATGT------------CAAC---ATGGTAA-AAAGTGCC-----TC-AATAAG
gi|144504 : GTATATTTCT----TA---TGTCAGTAAT---AATGTTA--------TGGTATCCATAGAAACATATATACAAGAA------T-ATTGCCACACCTCAA-----AATGTTGAACAA-TTCGA-----CAGA-TAAATATGTG-AAAAATA-ACAATCA-TT-----TTCCTGTAACGCTCGCGGTGAAGCATATAT---TA-TTGAGGACACGTCATCAATGTCTACAT----G----T--GTCATTC------C------AG------C------A------T-----G------G-CGCGCAGGTATTAGG----CGTTTAATTAAACTT---ATAT-TGAAAAGGTAGA----CTCAT-TCATATGC--AAACA------GTG-C-ATCTGATGAAAAGGTGAAACAACGAGCAGC-A-----ATAT--A-G-TTT-G-TGTAAATATTAGCA-AAACACTGAT-TAGACG-AGATATATGCATA---GTAAATATCCGAGAAAAAATTATTT-ATAGTGCATTTTGTTGTCTACAAATGA-CAAAAACAGTACAGTGAAGAACGAGAAATA-ATA-ATGAATGTT-AACAGG----TGTG--G-----CGCCCTGTGTCAATA-----T-----CAA--GTCACGT------------CAAC---GTGGTAA-AA-GTGCC-----TC-AATAAG
gi|144505 : GTATATTTCA----TA---TGTCAGTAAT---AATGTTA--------TGGTATCCATAGCAACATACATGCATGAA------T-AGTTCCGCAGCTCAA-----AATGTTGAACAA-TTCGA-----CA-----------------AATA-ACAATCAATT-----TTCCCATAACACTCGCAGTGAATCATATAT---TA-TTGAGGACATGTCATCAATGTCTGCAT----GACAGT--GTCATTC------C------AG------C------A------T-----T------G-CGTGCAGGTGTTAAG----AGTTTAAATAAACTTTACATAT-TGAAAAGGTAGA----CTCAT-TCATATGC--AAATACCGGTAGTG-C-AGCTGATGAAAAGGTGAAACAACAAGCAGC-A-----ATAC--A-G-TTT-G-GGTCAATATTAGCA-AAACACTGATTCAGACG-ATAGATATACATA---GTAAAGCTCTGAG--AAAGTTACTT-GTAGTGCATTTTGTAGTCTACAAATAA-CACAAATGGTACAGTGAGGAACGAGAAACA-ATA-ATAGATGAA-AATCGG----TGTG--G-----CGTCCTGTATTAAAATCACG------CAAA-GTCACGT------------CAAC---GTGGTTA-AA-GTGCC-----TC-AATAAG
gi|144506 : ATTTCT----TA---TGTCAGTAAT---AATGTTG--------TGGTATCCATAACAACATACAAACATGAT------A-AGTGCCGCAGCTCAA-----TATGTTGAAAAA-TTTGA-----CAGA-CAAATATGTG-AATAATA-ACAATCA-TT-----TTCCCGTAACACTCGCGGTAAATCATACAT---TA-ATGAGGACACGGCATCAATATCTACATGACAA----T--GTCATTC------C------AG------C------A------T-----T------G-TACGCAGGTGTTAGG----AGTATAAATCAACTT---CTAT-TGAAAATGTAGA----TGCAT-TCATATGC--AAATA------GTG-C-ATCTAATGAAAAGGTAAAACAACGAGCAGT-A-----ATAC--A-G-TTT-T-AGTCGATATTAGCA-AAACACTGATTCAGACG-ATAGATATGTGTA---GTAAAGCTCCGAG--AAAGTTATTT-GTAGTGTATTTTGTAGTCTACAGATAA-CACAAACGATACAGTGAGGAACGAGAAACA-ATA-ATGGATGAT-AACATA----TGTG--GC----CGCCCTGTGTCAAAATCGCGT-----CAAT-GTCACGT------------TAAC---GTGTTAA-AAACTGCC-----TT-GATAAG
gi|144507 : gtttGTATATTTCT----TA---TGTCAGTAAT---AATGTTA--------TGGTATCCATGGCAACATACATACATGAT------A-AGTGCCGCAGCTCAA-----AATGTTGAACAA-TTCGA-----CAGA-CAAATGTGTG-TATAATA-ACAATCA-TT-----TTCCCGTAACACTCGCGGTAAATCATATAT---TA-TTGAGGACACGGCATCAATGTCTGCAT----T----T--G
gi|144507 : T---GCAT-TTGAAATGTAGA----TGCAT-TCATATGC--AATTA------GTG-C-ATCTGATGAAAAGGCGAAACAACGAGCCAT-A-----ATAC--A-G-TTT-A-AGTCAATATTAGCA-AAACACTGATTCAGACG-ATAGATATGTATA---GTAAAGCTCCGAG--AAAGTTATTT-GTAGTGCATTTTGTAGTCTACAGATGA-CACAAACGGTACAGTGAGGAACGAGAAACA-ATA-ATGGATGAT-AACA------TGTG--GT----CGCCCTGTATCACAATCGCGT-----CAAT-GTCACGT------------AAAC---GTGGTAA-AAACTGCC-----TT-AATAAGaaatgtagatgcattcatatgcaattagtgcatctgatgaaaaggcgaaacaacgagccataatacagtttaagtcaatattagcaaaacactgattcagacgatagatatgtatagtaaagctccgagaaagttatttgtagtgcattttgtagtctacagatgacacaaacggtacagtgaggaacgagaaacaataatggatgataacatgtggtcgccctgtatcacaatcgcgtcaatgtcacgtaaacgtggtaaaaactgccttaataag
gi|144508 : gtatatttcttatgtcagtaataatgttatggtatccatggcaacatacatacatgataagtgccgcagctcaaaatgttgaacaattcgacagacaaatgtgtgtataataacaatcattttcccgtaacactcgcggtaaatcatatattattgaggacacggcatcaatgtcGTGCATTTCT----TA---TATTAATAAT---AATGTTA--------CGGTCTCCATAGCAACATGCATGCATGGT------T-AGTGCCACAGCTCAA-----ATTGTTGAACAA-TTTGA-----CAGA-TAAATATGTG-AAAAATA-ACAATGA-TT-----TCCATGTAAAACTCACGGTAAATCATATAT---TATTTGATGACAAGTCATCAATGTCTACAT----T----G--GTCATTC------T------AG------T------A------C-----TAGTATGG-TGCGCAAGTGTTAGG----AGTTTAAACAAAATT---ACAT-AAAAAAGAAAAA----CTTAT-TAATAAGC--AAAAT------TTC-C-ATCTGAGAAAAAAGTGAAACAACGAGCGGA-A-----ATAC--ATT-TTT-G-TGTCAAAATTGGCA-AAACACTGATCCAGGCG-ATATATCTGTTTA---GTAAAGCTCTGAG--AAAGTTATTT-GTAGTGTGTTTTGCAGTCTATAAATGG-CACAAATGGTACAGTGAAGAACAGGAAACA-ATA-ATGGATGAT-AACATGACATTGTGTTGT----CGCCCTGTGTCAAAATTCTAT-----CAAC-GTCGTGT------------CAAT---GTGGTAA-AAGGTGCC-----TT-AATAAG
gi|144509 : GTGCATTTCT----TA---TGTTAATAAT---AATGTTA--------TGGTCTCCATAGCAACATGCATACATGGT------T-AGTGCCGCAGCTCAA-----ATTGTTGCACAA-TTTGA-----CAGA-TAAATATGTGAAAAAATA-ACAATTA-TT-----TCCCTGT-AAACTCGCGGTAAATCATATAT---TA-TTGATGACACATCATAAATGTCTACAT----T----G--GTCATTTTAGTAAT------AG------T------A------T-----G------G-TGCACAAGTGTTTGG----AGTTTAAACAAACTT---ACATAAAAAAAGGTAAA----CTTGT-TAATAAGC--AAAAT------TTC-C-ATTAGAGAAAAAGGTAAAACAACGAGCGGA-A-----ATAC--ATT-TTT-G-TGTCAAAATTAGCA-AAACGCTGATCCAGGCG-ATATATATGCTTA---GTAAAGCTCTGAG--AAAATTATTT-GTAGTGTGTTTTGTAGACTATAAATGG-CACAAATGGTACAGTGAGGAA-AATAAACA-ATA-TTGGATGCT-AACATG----TGTG--GT----CACCATGTGTCAAAATCGCAT-----CAAC-GCCATGT------------CAAC---GTGGTAA-AAGGTGCC-----TC-AATAAG
gi|144510 : GTACATTTTT----TA---TGTTAATAAT---AATGTTA--------TGGTCTCCATAGCAACATGCATACATGGT------T-AGTGCCGCA-----------------GAACAATTTTGA-----CTGA-TAAATATGTG-AAAAATA-ACTATGA-TT-----TTCCTGTAAAACTCGCGGTAAATCATATAT---TA-TTGATGACACGTCATCAATGTCAGCAT----T----G--GTCATTCTAG---T------AG------T------A------T-----G------G-CACGCAAGTGTTAGG----AGTTAAAACAAACTT---ACAT-AAAAAAGGGAAA----CTTGT-TAACAAGC--AAAAT------TTC-C-ATCCGAGAAAAAGGTGAAACAACGAGCGGA-A-----ATAC--ATT-TTT-G-TGTCAAAATTAGCA-AAACACTGATTCAGGCG-ATATATCTGTTTC---GTTATGCTCTGAG--AAATTTATTT-GTAGTGTGTTTTGTAGTCTATAAATGG-CACAAATGGTACAATGAGGAACAGGAAACA-ATA-ATGGATGAT-AACATGACATTGTGTCAT----CGCCCTGTGGCAAAATCGCAT-----CAAC-GCCATGT------------CAAC---GTGATAA-AAGGTGCC-----TCTAATA
gi|144511 : GTGTATTTCTAAAGCA---TGTCAGTACT---AATTTTA--------TGGTA--------ACCATGCATACATGTT------T-AGTGCTTCAGTTCAT-----A-TGTTGAACAA-TTTGA-----CAGA-TCAGTATGTG-AAAAATA-ACAATAG-TT-----TCCATGTAAA-CTCGCAGTAAATC-TATAT---TA-TTGAGGACATGTCATCAAAGACTGCAT----A----A--GTCATTC------C------AGTAATAGC------A------A-----T------G-TGCGCAAGTGTAAGG----AGTTTAAACAAATTT---AAAT-TTAAACGGTAAA----CATGT-TCACAAGC--AAA-A------TTGAC-ATCTGAAAAAAAGGTGAAACAATGAG---------------------------TGTCATTTTTAGAA-AAATACTGATACAGACG-ATCGATACGCTTT---GTAAAGCTCTGAA--AATGATATCT-GTAATGTGTTCTGCAGTCTACAAATGG-CACAAATG--ATAGTCAGGAACGAGAAACA-CTA-ATGTATGAT-AACAGG----TGTT--GTATGCCATCCTTTGTCAAAATCCTGC-----AAAA-GTCATGT------------CAACAAAGTGGTAA-AAGATGCC-----T--AACAAG
gi|144512 : GTGCATTTGT----TA---CGTCAGTAAT---ACTGTTA--------TGGTATCCATAGCAACTTGCATACATGGT------T-AATGCCGCAGTTAAA-----ATTGTTGAACAA-TTTGA-----CAAG-TAAAT-----------TA-ACAATCG-TT-----TCCATGTAAAACTTGCAGTTATTCATATATAATTA-TTGATGACATGTCAT--------GTAT----A----C--GTCGTTC------C------AG------T------A------T-----TAGCAATG-CGCACATGTGTTGGG----AATTTAATCAAACTT---ACAT-TACATA---AGA----CACGT-AAACGTGC--AAA-A------TTC-T-GTCTAAAGGAAAAGTGAAACAACGAGCGGC-G-----ATAC--A-G-TTTTG-TGTCAATATTAGCA-TAACACCGATTCAGACA-ATGGATATGATTA---GTAAAGCTCCGAG--AAAGTCATCT-ATAGTGCGTTCTGTAATCAACAAATGG-TACAACTGGTTCAGTGAGAAGCGATCAACA-ATA---------------------TGTG--GT----CGATCTGTGTCAAAATTGCGCAAACGTAAC-GTCACGTTAAAAGGTCGGTCAAC---GTGATAA-AA-ATGCC-----TC-AACGAG
gi|144513 : GTATATTTCT----TA---TGTCAGTAAT---AATGTTA--------TGGTATCCATAGCAACATACATACATGAT------A-AGTGCCGCAGCTCAA-----AATGTTGAACAA-TTCGA-----CAGA-CAAATATGTG-AATAATA-ACAATCA-TT-----TTCCCGTAACACTCGCGGTAAATCATATAT---TA-TTGAGGACACGGCATCAATGTCTGCAT----
gi|144514 : T----TA---TATCAGTAAA---AATGTTA--------TAGTATTCATTGCAACATACATACACAAT------T-AGTCCCGCAGCTCAA-----AATGTTGAACAG-CTCGA-----CAGA-TAAATATGTG-AAAAATA-ACAATAA-TT-----TTCCTGTAAATCTCACGTTAAAACATATAT---TA-TTGAGAACATGTCATCAATGTCTGCAC----AACAGT--GTCATTC------C------AG------C------A------g
gi|144515 : gtatatTTTTT----TA---TGTTAAAAAT---ATTGTTA--------TGGTCTCCATAGCAACATGCATACATGGT------T-TGTGTTGCAGCTCAA-----AATGCTGAACAA-TTTGA-----CAGA-TAAATATGTG-AAAAATATAAAATAA-TT-----TCCCAGTAAAACTCGCGGTAAATCATATAT---TA-CTGAGGACACATCAACAATGTCTGCAT----A----G--GTCATTC------C------AG------T------A------T-----TAGTATGG-CATGCAAGTGTTAGC----AGTTTAAACAATCTT---ACAT-
gi|144516 : gcattGTGCATTTCT----TA---TGTCAACAAT---AATGTTAAGGACTTATGGTATCCATAGCAACATGCATGTATGGT------T-AGTGCACCAGCTCAA-----AATGTTGAGCAA-TTTGA-----CAGA-TAAATATTTG-AAAGATA-ACATTCA-TT-----TGCCTGTATAAC-------ATATCA-ATAT---TA----AGGACACGCCATCAATGTCTGCA
gi|144517 : GTGCATTTCT----TA---TGTTAATAAT---AATGTTA--------TGGTCTCCATAGCAACATGCATACATGTT------A-AGTGCCGCAGCTCAA-----AGCGTTGATCAG-CTTGA-----CAGA-TAAATATGTG-AAAAATA-AC--TGA-TT-----TCC--------CTCGTGGTAAATCATATAT---TA-TTGAGGACACATCATCAATGTC
gi|144518 : GTGCATTTCT----TA---TGTTAATAAT---AATGTTA--------TGGTCTCCATAGCAGCATGCATACATGGT------T-AGTGCCGCAGTTCAA-----ATTGTTAAACAA-TTTGA-----CAGA-TAAATATGTG-AAAAATA-ACAACGA-AT-----TTCCTGTAAAACTTGCCGTAAATCATATAT---TA-TTGATG-CGTGTCAT
gi|144519 : TTTCT----TA---TGTCAGTAAT---AATGTTA--------TGGTATCCATAGCAACATACATACAGGAT------T-AGTGTCGCAGCTCAA-----AATGTTAAACAA-TTCGA-----CAGA-TAAATATGTG-AAAAATA-ACAATAA-TTGATTTTCCCTGTAACACTCGTGGTGAAGCCTATAT---TA-TTGAGAACACGTCATCAATGTTTGCAT----G----T--GCCGTTC------C------AG------C------A------T-----G------G-CGCGCAGGTGTTAGG----AGTTTAAATAAATTT---ATAT-ATAAAAGTTAGA----CGCAT-TCATATGC--AAATA------GTA-C-ATCTGATGAAAAGGTGAAG----GAGCAGC-C-----ATAC--A-G-TTT-G-TGTCAATATTAGCA-AAACACTGA-CCAGACG-ATAGATATGCATA---GTAAAGCTACGAG--GAAGTTATTT-GTAGTGCATATTATAGTCTACAAATGA-CACAAACGGTATAGTGAGGAACGAGAAACA-ATA-ATAGATGAT-AACAGG----TGAG--G-----CGTCCTGTGTCAAAATCAAGT------AAA-GTCACGT------------CAAT---GTGGTAA-AAGGT
gi|144520 : tattTGTATTTCT----CA---CGCCAGTAAT---AATATCA--------TGGTATACAAAGAGGCATGCATTTATAGG------G-AACGCCGCAGCTCAA-----AATATTGAAAAG-TTTAA-----CAGG-TAAACATACG-AATAA-A-ACAATCG-TT-----TCCCTGT-----------TAAATTACAGAA---GA-TT---GTCCCGTCATCAATATCTACAT----A----T--GTCATTT------C------AG------TGATGAAA------T-----T------G-CACCTAAGTGTTAGAAACTAACTTGAACAAACGC---ACAT-TAAAAACA-AAA----TGTAT-GCACGAGC--AAA-A------ATGCC-GTCTGAAGAACGCGCGAATCAAAGATTTGC-T-----GTACA-A-A-TTT-GATGTCAATATTAGCG-CAACACCGGTCCCGACG-AT--------TTA---CTCAAG------A--AAAATCCTTT-GTTACGCGTTCTTTCATTTA-AAACAAGCACACGTGACACGGTGAGGGATGAAAAATA-ATA-ATGGGTGAC-AACATG----TATG--GT----CAA---GTTTCAAAATCGCG------CAACAATAGCAT------------CATC---TTAGTGA-AAaacgtaaaaag
gi|144521 : TACACTCCT----T-----GTCCGTAAT---GATATTG--------TCATTTTAATAGCAA------TAAA--GC------T-GGTGCCGCAGCTCAA-----AATGGTGAACAA-GGTAAGGATGCAAA-AAAAAACAAC-AAAAA-A-ACAATCG-TA-----TCTCTGTAAAATTTACAATAAATCATTTAT---TA-TTAATGATACGTTATCAATGTCTTCGT----A----T--GTCATTT------C------AG------T------A------T-----T------
gi|144522 : ATTTGT----TA---TGTTAATAAT---AATGATA--------TGGTCTCCTTAACA-CATGCATACATGTT------T-AGTGCCGCAGCTCAA-----AATGTTGAACCA-TTTGA-----CAGA-TAAATATTTG-AAAAATA-ACAATGA-TT-----TCCCTGTAAAACTCGTGGTAAATCATATAT---TA-TTGAGGACATGTCATCAATGTCT--AT----A----TTGGTCATTC------C------AG------T------A------TAAGTAT------GGTGTGCAAGTGTTAGG----AGTTTAAACAAACTT---ACAT-AAAATAGGCAAA----CTTGT-TCATAAGC--AAATC------TTC-C-GTCTGAGGAAAAGGTAAAACAACGAGCAGA-A-----ATAC--A-G-TTTTG-TGTCAATATTAGCA-AAACACTGATCCAGTCG-ATATATATGCTTA---GTAAAGCTCCGAG--AAAATTATTT-GTAGTGCATTTTGTAGTCTACAGATGA-CACCAACGGTAGGGTGATGAACGAGAAACA-ATA-ATGGATGAT-AACATG----TGTG--GT----CGCCCTGTGTCAAAATCGTAT-----CAAC-GACACGT------------CAAC---ATAGTAA-AAGGTGCC-----TC-AATAAG
gi|144523 : ATTTCA----TA---TGTAAATAAA---AATGTTA--------TGGTCTCCATAGCAACATGCATACATGGT------T-AGTGCCGCAGCTCAA-----AGTGTTGAACAA-TTTCA-----CAGA-TAAATATTTG-GAAAATA-ACAATGG-TT-----TCCCTGTAAAACTCGCGGTAAATTATATAT---TA-TTGATGACACGTCATCAATGTCAACAT----T----G--GTCATTCCAGTAAC------AG------T------A------T-----G------G-CGCGCAAGAGTTAGG----AGTTTGAACAAAATT---ACAT-AAAAAAGGCAAA----CTCGT-TAATAAGC--AAA-A------CTT-CTGTCTGAGGAAAGGGTGAAACAACGAGC--------------------TTT-G-TGTCAATATTAGCA-AAAGTCTGATCCAGGTG-ATATATATGCTTA---GTAAAGCTCCGAG--AATGTTATTT-GTAGTGTGTTTTGTAGTCTTTAAATGG-CACAAACGGTACAGTGAGGAACAAGAAACA-ATA-ATGGATGATAAACATG----TGTG--AT----CTCCCTGTGTCAAAATCGCGT-----CAAC-GTCACAT------------CAAC---GTGGTAA-AAGGTGCC-----TC-AATAAG
gi|144524 : ATTTCT----TA---TGTTAATAAT---AATGTTA--------TGGTCTCCGTAGCACAATGCACACATGTT------A-AGTGCCGCAGCTCAA-----AATGTTGAACAA-TTTGA-----CTGA-TAAATATGTG-AAACATA-ACACTGA-TT-----TCCCTGTAAAACTC-TAGTAAGTCATATAT---TA-TTGAGGACATGTCATCAATGTCTGCAT----A----G--GTCATTC------C------AG------T------AATAATAT-----G------G-CATGCAAGTGTTAGG----AATTTACACAAACTT---ACAT-AAAAAAGGCAAA----CTCGT-TCATAAGC--AAA-A------CTT-CTGTGTAAGGAAAAGGTGAAACAATGAGCGGA-A-----ATAT--A-G-TTTTG-TGTCAATATTAGCT-AAACACTGATCCAGGCG-ATATATATGCTTA---GTAAAGCTCTGAG--AAAGTTATAT-GTAGTGCGTTTTGTAGTGTATAAATGG-CACAAACAGTACAGTGAGGCACGAGAAACA-ATA-AT-------------A----TGTG--GT----CGCCCTGTGTCAAAATCACAT-----TGAC-ATCACAT------------CAAA---GTGGTAA-ACAGTGCA-----TC-AATAAG
gi|144525 : ATTTCT----TACTATGTCAGTAAT---CATGTTA--------TGGTTTCCATAGCAATATGCATACTTGGTTACCGGT-AGTGCTGCAGCTCAA-----AATGTTTAACAG-TTTGA-----CAGG-TGAGAATGTG-AAA
gi|144526 : TTTTT----TA----GTATATAAT---AATGTTA--------TGGTATCCATAGCAACATACATACAGAAC------T-AGTGCCGCAGCTTCA-----AATGTTTGACAA-TTCGA-----CAGA-TAATCATGTG-AAAAATA-ACAATCC-TT-----TTCCT-TAATACTCGAGGTGAAGCATATAT---TA-TTGAGAACACATCATCAATGTCTGCAT----G----T--GTCATTC------A------AG------C------A------T-----G------G-TACGCAGGTGTTAGG----AGTTTACATTTACTT---GTAT-TGAAAAGGTAGA----CTCAT-TCATATGC--AAATA------GTG-C-ATCTGGTGAAAAGGCGAAACAACGAGCAGC-A-----ATAC--A-G-TTT-G-TGTCAATATTA-CACAAACACTGAT-CAGACG-ATAGATATGCATA---ATAAAGTTCAGAG--GAAGTTATTT-GTAGTGCATTTTATAGTCTACAAATGA-CACAAACGGTACAGTGAGGAAAGAGAAAGA-ATA-ATGGATGAT-AACAGG----TGTG--G-----CGTCTTGTGTCAAAATCAAG------CAAA-GTCACGT------------CAAC---GTGGTAACAAG
gi|144527 : TTCT----TA------CAGTAATTATAATGTCA--------TTGTATCCATGGCAACATGCATACATGGG------T-AG---------------------------CAG-TTTGG-----TAG--TAAATATGTG-AAAAATA-TTAAGTG-TC-----TCCTTGTACAAC---------ACC---TAT---TA-TTGACGATACGTCGTCATTATCTGCAT----A----C--GTCATTA------C------AG------TT-----A------TAAAAAT------G-CG------TGTTAAG----GATTTAAACATCCCT---ACTT-T-------TTGG----CACGC-----AAGCCGGAAT-------GT--C-GTCTGAAGAAAAAATGAAACAACAAGCGACTACATATATAC--A-GTTTT-G-GGTAAACA-TAGGA-AAACACCGGTCAAGGCGAATAAAT-TGCTTACTTGTAAA
gi|144527 : AAATGGTACACTGAGG---GATAAA-A-ATA-ATG--------ACATG----TGTA--AT----CGCATTGTGTCAAAATCGtggtacactgagggataaaaataatgacatgtgtaatcgcattgtgtcaaaatcgagcaaa
gi|144528 : ttcttacagtaattataatgtcattgtatccatggcaacatgcatacatgggtagcagtttggtagtaaatatgtgaaaaatattaagtgtctccttgtacaacacctattattgacgatacgtcgtcattatctgcatacgtcattacagttataaaaatgcgtgttaaggatttaaacatccctactttttggcacgcaagccggaatgtcgtctgaagaaaaaatgaaacaacaagcgactacatatatacagttttgggtaaacataggaaaacaccggtcaaggcgaataaattgcttacttgtT---AATATTA--------TATTATCTATAGCAACATGCATACATGGG------TGAGCACCGCAACTCAA-----AATAATGAAAAA-TTTG------TAGAGTCAACATGTG-AAAAATG-ATGAGTG-TG-----TCCCTACAAGATTCGCAGGAAATCATAagcaaa
gi|144529 : ATAGCAACATACGTACATGAT------T-GATGCCGCAGCTCAAATCAAAATGTTGAACAA-TTTGA-----GAGT-TAAATATGTG-AAATATA-ACAATCA-TT-----TCCCTGTAAAACTCGCGGTGAATCATATGT---TA-TTGAAGACACGTCATCAATGTCTGCAT----G----T--GTCATTC------C------AG------C------A------T-----T------G-TGCGCAGGTGTTAGG----AGTTTAACTAAACTT---ATAT-TGAAAAGGTAGA----CTCAT-TCATATGC--AAATA------GTG-C-ATCTGATGAAAAGATGAAACAACGAGCAAC-A-----ATAC--A-G-TGT-G-TATCTATATTAGCA-AAACACTGATTCAGACG-ACAGATATGCATA---GTAAAGCTCCGAG--AAAGTTATTT-GTAGTGC
gi|144530 : -AGTGCTAAAGCTTAA-----AATGTTGAATAA-TTTGA-----CAGG-TAAGTATGC--ACAAATA---AACGA-GT-----TCCCAGTAAAATTTGCGGTACCTCATATAT---TA-GTAAAGGCACGTa
gi|144531 : AA-----AGTGTTGAACAA-TTCGA-----CAGT-TAGATATGTG-AAATATA-ACAATCA-TT-----TCCCTGTAAAACTCGCTGTCAATGATATAT---TA-TTGAAGACACGTCATCAATGTCTGCAT----A----T--GTCATTC------C------AG------C------A------T-----T------G-CAAGCAGGTGTTAGG----AGTTTAAGTACTTTT---ATAT-TGAAA------------------CATATGC--AAATA------GTG-C-ATCTAATGAAAAGATGAAACAACGAGCAGC-A-----ATAC--A-G-TTT-G-TGTCAATATTAGCA-AAACATTGAT-CAAACG-ATAGATATGCATA---GTAAAGCTCCGTG--AAAGTTATTT-GTAGT--ATTTTGTAGTCTACAAATGA-CACAAACGATA
gi|144532 : GATCAA-TTTGA-----CA---TAAATATGTG-AAAAATA-ACAATCA-TT-----TCCTTGTAAATCTCATTGTAAATCATATAT---TG-CTTAGGACGTGTCATCAATGTATGCAT----A----T--GCCATTC------CAAAAAAAG------C------A------T-----G------G-CAGGCAAGTGTAAGA----AGTTCAAACAAACTA---AAAT-TGAACAGGTAGA----TTCGT-AAACAAAC--AAAAA------TTG-C-GTCTGAGAGAAAGGTGAAACAACGAACGGC-AATT--ATGCCAA-GTTTT-A-TGTCAGTATAAGCA-AAACACCGATCCAGACG-ATAGATATGCTTA---GTAAAGCTTTACG--AATGTTGTTT-GTATTGCATTC--TAGTCAACAATTGA---------GTA---TGAGAAACAAGAAACATATACAT--ATCAT-AA
gi|144533 : A-CAAATTTGTG-AATAATA-ACAGTCA-TT-----TTCCCGTAACACTCGCGGTAAATCATATAT---AA-TTGAGGACACGGCATCAATGTCTGCATGACAA----T--GTCATTC------C------AG------C------A------T-----T------G-CACGCAGGTGGTAGG----AGTTTAAATCAACTT---TTTT-TGAAAATGTAGATGCACTCATATCATATGC--AAATA------GTG-C-ATCTGATGAAAAGGTAAAATAACGAGCAGT-A-----ATAC--A-G-TTT-A-AGTCAATATTAGCA-AAACACTGATTCAGACG-ATAGATATGTATA---GTAAAGCTCCGAG--AAA------T-GTA------TTTGTAGTCTACAGATGA-TACAAACGATACAGTGAGGAACGAAAAACA-ATA-ATGGATGAT-AATATA----TGTG--GT----CGCCCTGTGTCAAAATCGCGT-----CAAT-GTCACGT------------TAAC---GTCGTAA-AAACTGCCTTTAGTT-AATAAG
gi|144534 : TATGTG-AAAAATT-ACTATCA-TT-----TTCCCGTGAAACTCGCGGTATATCATATAT---
gi|144535 : GC--AAAAA------CTG-C-ATCTACGGAAAAGGTGAAACAAAGAACGGC-A-----ATAC--A-G-TTT-GGTCTCAATATAAGCA-AAATATCGATCCAGATG-ATATATATGCTTA---GTAAAGCTCTGAG--AAAGTAATTTAGT-GTGCGTTCTGTAGTCTATAAATGG-AACAAATGGTACAGTGAGGAACAAATAACA-ATC-ATCGATGAC-AACAGG----TGTG--GT----TGCCCTGTGTCGAAATCGCAT-----CAAC-GTCACAC------------CAAC---GTGGTAA-AATGTGTC-----GT-AATA
gi|144536 : tTGAAGAAAACGTGAAACAACGAGCGAG-T-----ATAC--A-G-TTTTG-TATCCGTATTAGCA-AAACATCGGTCCAGACG-GTCGA
gi|144537 : atcg-G-TGTCATT-CCAGCA-AAACACTGATTCAGATG-ATAGATATGCATA---GTAAAGCTCCGAG--AAAGTTATTT-A-AGTGCATTTTGTAGTCTACAAATAA-CACAAACTGTACAGTG-GGAAAGAGAAACA-ATA-ATGGATGCT-AACAGG----TATG--G-----CGTCCTGTGTCAAGATCAAG------CAAA-GTCACGT------------CAAC---GTGGCAA-AACGTGCC-----TC-AATAAG
gi|144538 : G-ATAGATATGCATA---GTAAAGCTCCGAG--AAACATATTT-ATGGTGAATTTTGTAGTCTACAAATGA-CACAAATGGTACAGTGAGAAATGAGAAACA-ATA-ATGGATGCT-AACAGG----TATG--G-----CATCCTGTGTCAAAATCAAG------CAAA-GTCACGT------------CAAC---GTGGTAA-AATGTGCC-----TC-AATAAG
gi|144539 : TCACGT------------CAAT---GTGGTAA-AATATGCC-----TC-AATAAG