lowQualScore                  :                                  111111                          1111                                       222222222222222222222222222        22222222222                                                   111             33333333333333333333333333333         11                  2222222    1111                                  11111                              111                                2222222222222222222222222               1111111111         111                        2222222                                               11             222222222               2222222            111                                    1111    33333333333333333333    111                                                11   11111           1111              1    1           11111                               111     1     111                       333333333333333333                                              111      111111                    11                               2222222                                              1                        
lowQualScore                  :          6           0 0     555 000000 222        5  888   7    5555      888  66     3       33   333  8  000000000000000000000000000    6   44444444444  333    22 2  0 4      66 8888   44444   55   6   000     66    2 66666666666666666666666666666   44 44 44    22 3     1 22 6666666  1 5555        22   22   33  77777777  1 22222  1     2          33 222   1 444 22   1   3 4 1  1 444444444 1  8888888888888888888888888  99999999     6666666666 0    5  000  2  0       33   333   4444444   2    2 6 88   2     3     55 0   33  2 22   00    1 88 7 2 666666666  99999999   0 9999999    33 5 2  111  33     1   66666                2 2222    55555555555555555555  4 333       33  33    5   1  5           666   55555 88   33333   2 2  2  4444   444  66666 7 33 0 5555      88888 3    3   44 888888   555      555  3  0  3  000     6  77          0  111111111111111111                     6       7 3     4     4  111    1 555555   3  88            44   3 7777                      2222222  44 3               3   44                   7             3          
lowQualScore                  :          .           . .     ... ...... ...        .  ...   .    ....      ...  ..     .       ..   ...  .  ...........................    .   ...........  ...    .. .  . .      .. ....   .....   ..   .   ...     ..    . .............................   .. .. ..    .. .     . .. .......  . ....        ..   ..   ..  ........  . .....  .     .          .. ...   . ... ..   .   . . .  . ......... .  .........................  ........     .......... .    .  ...  .  .       ..   ...   .......   .    . . ..   .     .     .. .   ..  . ..   ..    . .. . . .........  ........   . .......    .. . .  ...  ..     .   .....                . ....    ....................  . ...       ..  ..    .   .  .           ...   ..... ..   .....   . .  .  ....   ...  ..... . .. . ....      ..... .    .   .. ......   ...      ...  .  .  .  ...     .  ..          .  ..................                     .       . .     .     .  ...    . ......   .  ..            ..   . ....                      .......  .. .               .   ..                   .             .          
lowQualScore                  :          0           7 7     111 777777 999        2  555   1    3333      444  11     6       11   777  4  888888888888888888888888888    0   22222222222  555    88 0  6 6      44 2222   66666   55   6   000     77    0 44444444444444444444444444444   55 55 77    66 4     2 66 5555555  0 6666        55   55   99  00000000  7 11111  0     7          77 999   7 555 44   3   3 3 8  8 888888888 8  6666666666666666666666666  33333333     6666666666 5    7  000  9  3       99   333   5555555   2    2 3 99   2     0     11 2   55  1 99   66    9 00 5 5 777777777  11111111   8 3333333    44 0 5  999  11     4   55555                5 8888    33333333333333333333  4 111       44  44    1   6  4           555   99999 88   88888   4 6  9  2222   444  22222 5 44 0 3333      88888 1    1   22 888888   000      444  6  9  6  999     5  88          8  666666666666666666                     6       5 6     4     0  444    3 555555   6  00            33   6 7777                      5555555  66 3               3   66                   1             3          
consensus                     :  AAAATGTAGGCGATGAAAAAGCCTTTAT--ATT----CAGT-TTTAAACAACG-T-TTA-TTGGA---CTGTTCTT-TA--CAAAATTGGCATG--CTG---AT-TT---A-TATCA----A-TCGA--G----CAAA-GCT--------NNACA---TTAT--A-AGTACTTTAAA-NC-T-AACT--T--AGA--TGTNGAAANGTATCT-TACTT-TG---AAAAT-T--CCA-N-------T-N-AAA--T--TN-AAAA--TNGCACTCT--C----N-AAACT-NN-GATGTTCA--GCT--CAT-TCA----C---TT-T--TA-GTTGAAACCGGAAGACACANCA---ATA-TNC-C--ATACGAANANA-GA-A----T----A-TG--C-----N---T--T---------TT-------GTGTAAC--------TCTGGAG-AA---ATNGAAGACGAATT-TCA---TGT-A-TNA-TGA-AATG-TNCN-TAT-TATGACGATTTAAGAAATC-AG-T--ATC--TTTCAGA-A-T-T------TT-GA--------ATGGT-A-----ACCA--T-A-ATGG-ATT-AAATTTATT----CTACAGATTAATGAGTA-C-A--CAAAN---C-GAC---AATTTGTTGATA---AAACTCT--CC--AAATTTGTACTNGAAATGTTCAA---TAA-----ACAGAAA--TACTT-TATTCAAGT--CCA---AA-----C-T--G-A----AACAAA-----C-TAAA-ATA--T------GAT---TATGCTAC-AC-CG-TT-AT--AAGATTCAAT-TAACACTTGTAAA------GGC---------GATATAACATTTTAGACACTCGATGTTTGTT-AATTCATATGT-GT---TTTCTC------TTT-TT-ATTCCTGATATTGTCTTT-A----TCCTTTTGGCACATTGTTGTAT-------TA--T-TATAATATTTGTGTG-TAT--TTGTATTATGGGCCGGTGGCCTAAATTACTTGA-ATAAACTATT
Reference ( gi|110190 )       :  AAAATGTAAGCGATGAAAAAGCCTTTAT--ATT----CAGT-TTTAAACAGCG-T-TTA-TTGAA---CTGTTCCT-TA--CAAAACTGGCATG--CTG---AT-TT---A-TATCA----A-TCGA--G----CAAA-GCT--------AGACA---TTAT--A-AGTATTTTAAA-AC-T-AACT--T--AGA--TGTAGAAAGGTATCT-CACTT-TG---AAAAT-T--CCA-A-------T-T-AAA--T--TG-AAAA--TAGCACTCT--C----T-TAACT-AC-GATGTTCA--GCT--CAT-TCA----C---TT-T--TA-GTTGAAACCGGAAGACACACCA---ATA-TAC-C--ATACGAACAAA-GA-A----T----A-TG--C-----T---T--T---------TT-------ATGTAAC--------TCTGGAG-AA---ATAGAGGACGAATT-TCA---TGTAA-TAC-TGA-AATG-TACG-TAT-TATGATGATTTGAGAAATC-AG-T--ATC--TTTCAGA-A-T-T------TC-GA--------ATGGT-A-----ACCA--T-A-ATGG-ATT-AAATTTATT----CTATAAATTAATGAGTA-C-A--CAAAT---C-GAT---AATTTGTCGATA---AAACTCT--CC--AAATGTGTACTAGAAATGTTCAA---TAA-----ACGGAAA--TACTT-TATTCAAGT--CCA---AA-----C-T--G-A----AACAAA-----C-TAAA-ATA--T------GAT---TATGCTTC-AC-CG-TT-AT--CAGATTAAAT-TAACACTTGTAAA------GAC---------GATATAACATTTTAGACACTCTATGTTTGAT-AATTCATATGT-GT---TTTCTC------TTT-TT-ATTCCTGATATTGCATTT-A----TCCTTTTGGCACATTGTTGTAT-------TA--T-TATAATATTTGTGTG-TAT--TTGTATTATGGGCCGGTGGACTAAATTACTTGA-ATAAACTATT
gi|110191                     :  AAAATGTAGGCGATGAAAAAGCCTTTAT--ATT----CAGT-TTTAAACAGCG-T-TTA-TTGGA---CTGTTCCT-TA--CAAAACTGGCATG--CTG---AT-TT---A-TATCA----A-TCGA--G----CAAA-GCT--------AGAAA---TTAT--A-AGTATTTAAAA-AC-T-AACT--T--AGA--TGTAGAAAGGTATCT-CACTT-TG---AAAAT-T--CCA-A-------T-T-AAA--T--TG-AAAA--TAGCACTTT--C----T-AAACT-AT-GATGTTCA--GCT--TAT-TCA----C---TT-T--TA-GTTGAAACTGGAAGACACACCA---ATA-TAC-C--ATATGAACAAA-GA-A----T----A-TG--C-----T---T--T---------TT-------ATGTAAC--------TCTGGAG-AA---ATAGAGGACGAATT-TCA---TGTAA-TAA-TGA-AATG-TAAG-TAT-TATGATGATTTGAGAAATC-AG-T--ATC--TTTCAGA-ATT-T------TT-GA--------ATGGT-A-----ACCA--T-A-ATGG-ATT-AAATTTATT----CTATAAATTAATGAGTA-C-C--CAAAA---C-GAT---AATTTGTTGATA---AAACTCT--CC--AAATGTGTACTAGAAATGTTCAA---TAA-----ACAGAAA--TACTT-TATTCAAGT--CTA---AA-----C-T--G-A----AACAAA-----C-TAAA-ATA--T------GAT---TTTGCTAC-AC-CG-TT-AT--CAGATTAAAT-TAACACTTGTAAA------GAC---------GATATAACATTTTAGACACTCTATGTTTGAT-AATTC--ATGT-GT---TTTCTC-------TT-TT-ATTCCTGATTTTGCCTTT-A----TCCTTTTGGCACATTGTTGTAT-------TA--T-TATAATATTTGTGTG-TAT--TTGTATTATGGGCCGGTGGCCTAAATTACTTGA-ATAAACTATT
gi|110192                     :  AAAATGTAGGCGATGAAAAAGCCCTTAT--ATT----CAGT-TTTAAACAGCG-T-TTA-TTGGA---CTGTTCCT-TA--CAAAACTGGCATG--TTG---AT-TT---A-TATCA----A-TCGA--G----CAAA-GCT--------AGACA---TTAT--A-AGTATTTTAAA-AC-T-AACT--T--AGA--TGTAGAAAGGTATCT-CAATT-TA---AAAAT-T--TCT-A-------T-T-AAA--T--TG-AAAAAATAGCACTCT--C----T-AAACT-AC-GATGTTCA--GCT--CAT-TCA----C---CT-T--TA-GTTGAAACTGGAAGACACACCA---ATA-TAC-C--ATACGAACAAA-GA-A----T----A-TG--G-----T---T--T---------TA-------ATGTAAC--------TCTGAAG-CA---ATAAAGGACGAATT-TCA---TATAA-TAA-TGA-AATG-TGCG-TAT-TATGATGATTTGAGAAATC-AG-T--ATC--TTTCAGA-A-T-T------TTTGA--------ACGGT-A-----ACCA--T-A-ATGG-ATT-AAATTTATT----CTATAAATTAATGAGTA-C-A--TAAAA---C-GAT---AATTTGTTAATA---TAACTCT--CC--AAATGTGTGCTAGAAATGTTCAA---TAA-----ACGGAAA--TACTT-TATTCAAGT--CCA---AA-----C-T--G-A----AACAAA-----C-TAAA-ATA--T------GAT---TATGCTAC-AC-CG-TT-AT--AAGATTAAAT-TAACACTTGTAAA------GAC---------GATATAACATTTTAGACACTCTATGTTTGAT-TATTCATATGC-GT---TTTCTC------TTT-TT-ATTCCTGATATTGCCTTT-A----TCCTTTTGGCACATTGTTGTAT-------TA--T-TATAATATGTGTGTG-TAT--TTGTATTATGGGCCGGTGGCCTAAATTACTTGA-ATAAACTATT
gi|110193                     :  AAAATGTAGACGATAAAAAAGCCTTTAT--ATT----CAGT-TTTAAACAGCG-T-TTA-TTGGA---CTGTTCCT-TA--CAAAACTGACATG--CTG---AT-TT---A-TATCA----T-TCGA--G----CAAA-GTT--------AGACA---CTAT--A-AGTATTTTAAA-AC-T-TACC--T--AGA--TGTAGAAAGGTATCT-CATTT-TG---AAAAT-T--CCA-A-------T-T-AAA--T--TG-AAAA--TAGCACTCT--C----T-AAACT-AC-GATGTTCA--ACT--CAT-TCA----C---TT-T--TA-GTTGAAACCGGAAGACACACCA---ATA-TAC-C--ATACAAACAAA-GA-A----T----A-TG--C-----C---T--T---------TT-------ATGTAAC--------TCTAGAG-AA---ATTGAGGACGAATT-TCA---TGTAA-TAA-TGA-AAAG-TGCG-TAT-TATGATGAATTAAGAAATT-AG-T--ATC--TTTCAGA-ATT-T------TT-GA--------ATGGT-A-----ACCA--T-A-ATAG-ATC-AGATTTATT----CTCTAAATTAATGAGTA-C-A--CAAA----C-GAT---ATTTTGTTGATA---AAACTCT--AC--AAATTTGTACTAGAAATGTTCAA---TAA-----ATGGAAA--TATTT-TATTCAAGT--CCA---AA-----T-T--G-A----AACAAA-----C-TAAA-ATA--T------GAT---TATGCTAC-AC-CG-TT-AT--AAGATTCAAT-TAACACTTGTCAA------GAT---------GATATAACATTTTAAACACTCTAAGTTTGAT-AATTCATATGT-GT---TTTCTC------TTT-TA-ATTCCTGAACTTGCCTTT-A----TCCTTTTGGCACACTATTGTAT-------TA--T-CATAATATTTGTGTG-TAT--TTGTATTATGGGCCGGTGGCCTAAATTACTTGA-ATAAACTATT
gi|110194                     :  AAAATGTAGGCGATGAAAAAGCCTTTAT--ATT----CAGT-TTTAAACAGCT-T-TTA--TGGA---CTGTTC
gi|110196                     :      TGTTGGTGATGATAAATTGTTTATTTATA----CA---TTCAAGCAAAGAT-TGA-TTGA----TTGTTCT--------AAACAGGAATG--CTG---CG-GT---AGTGTCGCTGTG-TCTG--G----AAAA-GGT--------GGTTT---TTAT--A-GATATATTATG-CC-TGAACT--G--AAAACTGCAAA---TTACCTGTAATT------ATAAT-TTGCCA-T-------T-G-AAA--T--TC-AGAA--TTTCACTTT--C----A-AGATT-TA-GATGTTCA--GCT--CAT---A----A---TT-TGATG-ATAGAAACTGGCAGACATAACA---ATA-TTC-C--ATATGAATACA-GA-A----T----A-TG--T-----C---C--A---------TT-------TTGCAA------------GGAACAAACTATAGAAGACGAGTA-TCA---TGTTA-TTA-TGA-TCTG-CCCG-TTA-TATAGAAACTTAAGACAGC-AA-T--ACA--TTTC
gi|110197                     :           GTGATGATAAATTGTTTAT--TTA----TATA-TTCAAGCAAAGAT-TGA-TTGA----TTGTTC---TAATCAGGAATGGTATG--GTA---ATGTT---G-T-TGA----G-TCTG--G----AAAA-GGT--------CAATT---TTAT--A-GATAAATTATG-CC-TGAACT--G--AAAACTGCAAA---TTACCT--ATAT-T----ATAAT-TTGCCA-T-------T-G-AAA--T--TC-AGAA--TTTCACTTT--C----A-AGATT-TA-GATGTTCA--GCT--CAT---A----A---TT-TGATG-ATAGAAACTGGCAGGCATAACA---ATA-TTC-C--ATATGAATACA-TA-A----T----A-TG--T-----C---G--A---------TT-------TTGCAA------------GGAACAAACTATAGAAGACGAGTA-TCA---TTTTA-TTA-TGA-TCTG-CCCGTTAT-T-TAGCAACTTAAGACAGC-AG-T--ACA--TTTC
gi|110198                     :          gttgATGAAAA----TTTGT--TTTTTTACAGTATTCAAACAACGAG-TTA-TTGA----TTGTGCTC-T---------TGG--TGGTCTG---AT-TT---T-TCTCA----G-TCAC--A----TAAA-GCT--------GTTCA---TTAT--G-AAAACTTTAAA-TC-T-CCTT--T--CAA--TGTTGAAATGTTTCT-TACTT-T--------T-T--TCATACCTC---T-G-AAG--T--TT-AAAA--TTGCATTGC--C----A--AATT-GA-AATGGTCA--GTTGACA----A----A---TT-A--TATGTAGCAACTGGAAGACACAATA---GTG-TTT-C--TTACGAAGATA-GA-A----T----G-TG--T-----A---TACT---------GT-------GTGCAA----------CTGGAG-AA---GTTGATGATGAAAG-CCA---TGC-A-TGCACGA-AATG-TTCC-TAT-TATGAAGATTT-ATACAGCGAA-T--ACC--GTT-ACC-A-TCT------TCTGA--------ATGTT-------AC----T-A-ATA----T-ACATTCATT----TTACAGATTAAT-AGTA-TAA--CAAATGAAC-AAC---AATT-----A-A---AAACACT--TCGTAAATTTGTTTTCGAAGTACTTAAT--TAA-----A--GAAA-----TT-TATT
gi|110199                     :                         TTTAT--CTT----AAGA-TTTAAACAACG-T-GTA-----A---CAG---AT-TG--CAAAATTGGCACG--CTG---AT-GT---A-CATGA----A-TCAA--G----AAAA-GCT--------ATTCG---TTAT--A-AGCACTTTAAA-ACGC-AACT-----AAA--CATTGAGCAATACCT-TACTT-TG---AAAAT-C--CC--T-------T-T-AAA--A--TATAAAA--TTGCACTCT--C----A-AAACT-GC-GTTGTTCA--AAA--CAT-TCG----T---TA-T--TT-GTTGAAACAGGGAGACATACAA---ATGTTGCTT--ATGCTGAC--A-GA-G----T----A-TG--T-----A---T--T---------TT-------GTGTAAC--------TCACAAG-AA---ATAGAAGATGAATT-TCA---CGCTG-TCA-TGA-CATG-TACC-TTT-TATAACGATCTACGTAACC-AA-T--ATC--TTGCTGATA-T-TA-----TT-AACTATAACGATCGC-AACT--ACCA--T-A-ATGT-ATA-AGA---ATT----CTACAGTTTGATGAGTA-C-AGCCAATT---CTGAC---AA------GATAATCAAACTGG--CA--AAGTTTGTATTTGAGATGTTTCA---TAA-----A-AGAAC--T-CTT-TACC----T--CCG---AT-----CTT--A-A----AACAAAATGACT-TAAA-ACA--T------AAT---
gi|110200                     :                         TTTAT--CTT----AAGA-TTTAAAC---G-T-GTA-ACAGA---TTGTGCTC-TG--CAAAATTGGCATG--CTG---AT-GT---C-CATGA----A-TCAA--G----AAAA-GCT--------ATTCA---TTAT--A-AGCACTTTAAA-ACGC-AAC---T--AAA--CGTTGAGCAATACCT-TACTT-TG---AAAAT-C--CC--T-------T-T-AAA--A--TATAAAA--TTGCACTCT--C----A-AAACT-GC-GTTGCTCA--AAA--CAT-TCG----T---TA-T--TT-GTTGAAACAGGGAGACATGCAA---ATG-TTG-C--TTATGCTGATA-GA-G----T----A-TG--T-----A---T--T---------TT-------GTGTAAC--------TCACAAG-AA---ATAGAAGATGAATT-TCA---CGCTG-TCA-TGA-CATG-TACC-TTT-TATAACGATCTACGTAACC-AA-T--ATC--TTGCTGATA-T-TATTAACTA-TA--------ACGATCACAACTACCA--T-A-ATGT-AT----ATGAATT----CTACAGTTTGATGAGTA-C-AACCAATT---CTGAC---AA------GATAATCAAACTGG--CA--AAGTTTGTATTTGAGATGTTTAA---TAA-----A-AGAAC--T-CTT-TACC----T--CCA---AT-----CTT--A-A----AACAAAATGACT-TAAA-ACA--T------AAT---
gi|110195                     :                         TTTAT--AT-------GT-TT-AAGCAACG-C-TTAATTGA----TTGTTATT-CA--CAAAATTGGCATG--CTG---ATGTTGAAA-CTTCA-------CCA--------AAA-GCC--------TTACA---TTAT--A-AATACTTTAAG-TC-T---CTACT--AAA--TGTTGAACATTATTT-AATTC-T-----AGAT-TTACCA-T-------A-T-AAA--TA-TA-AAAA---AG--CTAT--T----T-CAA-------ATTTTCGTTGCT--CATGTCATAACC---TA-A--TG-ATAGAAAATGGAAGACACATTG---GTA-TA
gi|110201                     : acgttggggatgaattagggtttaTTTGT--ATT-----A---TTCAAACAACG-TATTA-TTGA----CTGTGCTG-TA--CAAGATTGGCGGT--CGG---AT-AT---T-TCTTA----G-TCAC--A----CAAA-GCT--------GTCCA---TTAT--G-AAAACTTTAAA-TA-T-ATTT--T--AAA--TGTTGAAAAATAT-T-CAC
gi|110202                     :                                        AGT-TTTAAGCAACG-C-TTAATTGA----TTGATATT-GA--CAAAATTGGCATG--ATG---ATGTT---G-AATC-------TTCA--C----CAAAAGCA--------TTACA---TTAT--A-AATA-TTTAAA-
gi|110203                     :                                          T-TTTATATGTCA-T-TCA-TTGAAAGACTGTTCAT-TA--CAAAAATGGCACA--GTG---AC-TT---A-CA--A----A-ATGAGCG----CAAA-GCTCACACATGAAAAA---TTAT--A-ATCAAGTTAAA-TCAT-TACT--T---GA--CATGGAATCATAAAT-TATTTATC---AA-------CCG-ACATGTCTT-T-TAA--TTCTA-AAAA--AAGTCCTC----------TAATT-TCTGATGCTCA--G-T--CAT-TCA----C---TT-C--TT-ATTAAAACCAGCAGAC
gi|110204                     :                                          T-TTCAAGCAACG-C-TTAATTGA----CTGTTATT-CA--CAAAATTGGCATG--ATG---ATGTT---G-AATC-------TTCA--C----CAAAAGCA--------TTACA---TTAT--A-AATACTTTAA
gi|110205                     :                                           -TTCAAACAACG-TGTTA-TTGA----CTGTGCTG-TA--CAAGATTGGCA-G--TCGGATAT-TT---A-TGTC-------------------------------------CA---TTAT--G-AAAACTTTAAA-TC-T-CTTT--T--AAA--TGTTGAAACATATCT-TACTT-TA---TCAAT-A--C---A-------TCT-AAAG-T--TT-AAAA--TTGCTTTTG--C----A-AAATT-TA-GATGCTCA----T----T-TCA----CAAATT-A--TATGTAGAAACTGGAAGACACAATA---ATG-TTG-C--TTTCGAAGATA-GA-A----T----T-TG--T-----A---TACT---------TT-------GTGCAGC--------TT--GAG-AA---GTTGAAGATGAATA-CTA---TGT-A-TGC-AGAGAATG-TACC-TAT-TATGAAGATTTACGCAGTG-AA-T--ACCTTTTTCAAT-A-T-T------TT-GA--------ATGTT-ACT---AACA--T-A-A----ATTAAAATTCATT----TTACAGATTAATGAGTA-TAA--CAAAT---G-AACACAAATT-----A-A---AAACACTAGGT--AAATTTATTTTTGAAGTATTTAA---TAA-----A-AGAAATTTATTT-T-TTCAA----TCATTTAA-----CGT--GTA----AACAAA-----
gi|110206                     :                                           -TTTAGATA----C-TTA-GTAGA---TTGTT--T-TATTCAAAACTGGAGTG--CAG---AT-CTC--A-TTTCA----AATAGG--GTTCTCAAC-GTT----------------TTAT--ACAGAAATGTAAA-AC-C-AACT--TTTGGT--TAT-GAAAACTATCT-TGATT-T-------AT-T--GTGTA-------C-T-AAAACC--T--AACG--CAGCTTTTTAAC----T-AAATT-AC-GACTTTCG--TCT--CAT-TCA----C---TT-A--GA-ATCGAAACTGGTAGATATGCCAGGGACA-GAT-TAGATAAAAACGAACGT-A----A----A-TG--C-----CAAAT--T-------------------TGTAAC--------AGTAATG-AT---ATTGAAGACGAATT-TCATTTTGTTT-TAT-TG----TG-TTC--TATGTATACTGATATAAGAAATA-AG-T--
gi|110207                     :                                                         -TTG-TTTGA---CTG---CTGTA--CATGATTGGCGGT--CGG---AT-AT---T-TCTCA----G-TCAC--A----CAAA-GCT--------GTGCA---TTAC--G-AAAACTTTAAA-TC-T-CTTT--T--AAA--TGTTGAAAAATATCT-TACTT-TA---TCAAT-A--CCT-C-------T-A-AAG--T--TT-AAAA--TTGCTTTTG--C----G-AAATT-TA-AATGCTCA--GCT--CA---CA----A---AT-TA-TACGTAGAAACTGGAAGACACAATA---ACG-TTG-C--TTACGAAGATA-GA-A----T----T-TG--T-----A---TACT---------TT-------GTGCAG----------CTGGAG-AA---ATTGAAGATGAATA-CCA---TGT-A-TGCATGA-AATG-TTCC-TAT-TATGAAGCTTTACGCAGTG-AA-T---TCTTTTTCAGT-A-T-G------AT-GA--------ATGTT-ACT---AACA--TAA-AT----TT-AAATTCGTT----TTACGGATTAGTGAGTATT-A--CAAATGAAC-AAA---AAATAA--AAAA---AAACTAT--GC--AAATTTATTTTTGAAGTATTTAA---TAA-----A-AGAAATTTATTT-T-TCCAA-TCACTA---AA-----CAT--GTA----AACAAA-----
gi|110209                     :                                                                  A---CTGTTCGT-TA--TAAAATTGGCATG--CCA---AT-CT---A-TATCA----A---------------A-GTC--------AGACA---T-----A-AGTATTTTAAA-AC-A-AATC--T--TGA--TGTAGAAAGTTATTT-CAC-----------AT-T--------------T-T-GG---T--TT-AAAA--TAGCACTCT--C----T-AAACT-AA-GATGTTCA--GCT--CAT-TCA----C---TT-T--TA-GATGAAACGGGAAGACATACCA---ATA-TAC-C--ATATGAATAAA-GA-A----A----A-TG--C-----C---T--TTTGATGAAATT-------GTGTAAC--------ATTGGAG-AA---ATAGTGGACGAATT-TCA---TGTAA-TA
gi|110208                     :                                                                  A---CTGCTCGT-TA--CAAAAATAGCATA--GTG---AC-TT---A-CA-AA----A-TTCA--C----CAAAAGCT--------C-ACACTTTTACTAA-AGT----TAAATCC-C-GACT-----GGA--CATGGAATCATATTT-GTCTA-CC---AACATAT--CTT-A-------T---AAA--T---G-AAAA--AAAAATCCT--C----TCTAACTTCC-GATGCTCA--AGT--CAT-TCG----C---TT-C--TT-ATTGAAACCAGAAGGCATAACA---ACA-T-T-C--ACA-GAACAatcatagtggattaaatttattctataaattgataagtacacataacgataatttgttgataaaactctccaattgagtacaagaaatgtacaataaactgaattactttattcaagtccaagctgacacaaactaaaatatgattatgctacaccgtttataagattcaagtaatgctggtaaatgccgatataacattttagacacttgatgtttgttaattcatgttttttctttctctttttttattcctgatattgttcttatccttttggcacattgttgtattactatatttgtgtatatttgtattatgggccagtggcctaaataacttgaataaactatt
gi|110210                     :                                                                                                    g---AT-TT---A-TTTAA----A-TCAA--A----CAAA-GCT--------TGTCA---TTAA--A-AATATTTTTAA-AT-T-AATC--C--AGA--TTTAGAAATGAATCT-AAGTT-T----AAACT-T--TCA-A-------T-CGAAA--T--T--AAAA--TATGACTTT--CAAAAA-AAACT------TTTTCA--TCT----T-TTA----C---TT-T--TA-GTTGAAACCGGAAGACTTAATA---ATA-TCT-C--ATATGAGATAA-GA-A----A----ACTG--CACTCTT---T--T---------TT-------A
gi|110211                     :                                                                                                                                    ----CAAA-GCT--------GTCCA---TTAT--A-AAAACTTAAAA-TC-T-CTTT--T--AAA--TGTTGAAAAATATCT-TACTT-TA---TCAAT-A--CCT-C-------T-A-AAG--T--TT-AAAA--TTGCTTTTG--C----G-AAATT-TA-GATGCTTA--ACT--CA---CA----A---AT-TA-TATGTAGAAACTGGAAGACACAATA---ATG-TTG-C--TTTTGAAGATA-GA-ATTTGT----A-TA--C-----T---T----------------------TGTGAA--------GCTGGAG-AA---ATTGAAGATGAATA-CCA---TGT-A-TGCATGG-AATG-TTCC-TAT-TATGTAGCTTTACGCAGTG-AA-T--ACCT-TTTCAAT-A-T-T------TT-GA--------ATGTT-ACT---AACA--TAA-AT----TT-AAATTCAGT----TTACAGATTTATGAGTA-TAA--CAAATGAAC-AAA---AACT----AAAA---ACACTAT--GC--AAATTTATTTTTGAAGTATTTAA---TAA-----A-AGAAATTTATTT-T-TCCAA-TCACTA---AA-----CAT--GTA----AACAAA-----TGCAAA-GCAATT------G-T---TAT------------TT-AT--CTAATTATATGTAACACT
gi|110212                     :                                                                                                                                                                         GTATAATAAA-AC-T-AATC--T--AGA--TGTAGAACTGTATCT-CACTT-TA---ATACT-T--ACA-A-------T-C-AAT--T--TT-GAAA--TAGCACTCT--A----T-AAATT-AA-AATTTTCA--GCT--CAT-TCA----T---TT-T--TA-GTTGAAATCGAAAGTCATAGCA---ATA-TTT-C--ATACAAGGAAA-GA-A----T----A-TG--C-----CA--T--C---------TT-------A-ATAAT--------TCTGATG-AA---ATTAAGGATGAATT-TCA---TGTTA-TTA-TGA-AATG-TGCT-GAT-TATAATGATT
gi|110213                     :                                                                                                                                                                                            T--T--AAA--TGTTGAAAAATATCT-TTCTT-TA---TCAAT-A--CCT-C-------T-A-AAG--T--TT-AAAA--TTGCTTTTG--C----G-AAATT-TA-GATGCTCA--GCT--CA---CA----A---AT-TA-TATGAAGAAACTGGAAGACACAATA---ATG-TTG-C--TTACGAAGATA-GA-A----TTTGGA-TA--C------------T---------TT-------GTGCAG----------CTGGAG-AA---ATTGAAGATGAATA-CCA---TGT-A-TGCATGG-AATGTTCCT-TAT-TATGAAGCTTAACGCAGTG-AA-T--ACCT-TTTCAAT-A-T-T------TT-GA--------ATGTT-------ACTAACT-A-AT----TT-AAATTCATT----TTACAGATTTATGAGTA-CAA--CAAATGAAC-AAA---AACT----AAAA---ACACTAT--GC--AAATTTATTTTTGAAGTATTTAA---TAA-----A-AGAAA--TTTAT-TTTTCAAATCACTA---AA-----CAT--GTA----AACAAA-----
gi|110214                     :                                                                                                                                                                                                                GTAT----ACTT-TGTTTAAAACAT--CAA-A-------T-C-AAA--T--TT-AAAC--TAGCACTGT--A----T-AAATT-AT-GATGTTCT--ACT--CAT-TCA----C---TT-T---A-GTTGAAACAGGAAGACATAACA---ATA-T----------GAGCAAG-GA-A----C----G-TG--A-----G---T--T---------TT-------AATTAAAATAAAATATCTGGAA-GA---ATTGAGGACAAATTGTTA---T-----TA--TGA-AATG-TCCT-TAT-TATAATAGTTTACCAAATC----T--ATC--T---------------------GA--------ATGGT-A-----AGTA--T-A-TTGA-ATT-GAATTTATT----CTATTAATTAA
gi|110215                     :                                                                                                                                                                                                                                    AAT-TTGCCA-T-------T-G-AAA--T--TC-AGAA--TTTCACTTT--C----A-AGATT-TA-GATATTCA--GCT--CAT---A----A---TT-TGATG-ATAAAAACTGGCAGACATAACA---ATA-TTC-C--ATATGAATACA-GA-A----T----A-TG--T-----C---C--A---------TT-------TTGCAA------------GGAACAAACTATAGAAGACGAGTA-TCA---T
gi|110217                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                               AACT-AC-GATGTTCA--GCT--CAT-TCA----C---TT-T--TA-GTTGAAACCGGAAGACACACCA---ATA-TAC-C--ATACGAACAAA-GA-A----T----A-TG--A-----T---T--T---------TT-------ATGTAAC--------TCTGGAA-AA---ATAGAGGACGAATT-TCA---TGTAA-TAA-TGA-AATG-TGCG-TAT-TATGTTGATTTGAGAAATC-AG-T--ATC--TTTCAGA-ATT-T------TT-GA--------ATGGT-A-----ACCA--T-A-ATGG-ATA-AAATTTATT-----TATAAATAAATGAGTA-C-A--CAAAA---C-GAT---AATTTGTTGATA---AAACTCT--CC--AAATGTGTACTAGAAATGTTCAA---TAA-----ACAGAAA--TACTT-TATTCAAGT--CCA---AA-----C-T--G-A----AACAAA-----C-TTAA-ATA--T------GAT---TATGCTAC-AC-CG-TT-AT--AAGATTAAAT-TAACACTTGTAAA------GAC---------GATATAACATTTTAGACACTCTATGTTTGAC-AGTTCATATGT-GT---TTTCTC------TTT-TT-ATTCCTGATATTGCCTTA-A----TCCTTTTGGCACATTGTTGTAT-------TA--C-TATAATATTTGTGTG-TAT--TTGTATTATAGGCCGGTGGCCTAAATTACTTGA-ATAAACTATTtttattatgatctgcccgttat
gi|110218                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tctgaCA----T---TTAT--TA-GTTGAAACAGGGAGACATACAA---ATG-TTG-C--TTATGCTGATA-GA-G----T----A-TG--T-----A---T--T---------TT-------GTGTAAC--------TCACAAG-AA---ATAGAAGATGAATT-TCA---CGCTG-TCA-TGA-CATG-TACC-TTT-TATAACGATCTACGTAACC-AA-T--ATC--TTGCTGATA-T-TATTAACTA-TA--------ACGATCACAACTACCA--T-A-ATGT-AT----ATGAATT----CTACAGTTTGATGAGTA-C-AGCCAATT---CTGAC---AA------GATAATCAAACTGG--CA--AAGTTTGTATTTGAGATGTTTAA---TAA-----A-AGAAC--T-CTT-TACC----T--CCA---AT-----CTT--A-A----AACAAAATGACT-TAAA-ACA--T------AAT---
gi|110219                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ---TT-T--TA-GTTGAAACCAAAATACACACTA---ATG-TCC-C--ATATGAACAAT-GA-A----A----A-TG--CA----T---T--T---------TT-------TTGTATC--------TCTGGCG-AA---ATGGAGGACGAATG-TCA---TGTAAATAA-TGA-AATG-TGCG-TAT-TATGATAATT-GAGAAATG-AG-A--ATC--T--CCGA-A-T-T------TTTGA--------ATGGT-A-----ATCA--T-AGATGC--TT-CAATTTATT----CTTTAAATTAATTAGTA-C-A--CAAAA---C-CAC---CATTTGTTGATA---AAATTCA--CC--AAATGT-------------TCAA---AAA-----ACGGAA------------TCAAGT--CCA---AG-----C-T--G-A----CACAAA-----C-TTAA-ATA--T------GAC---TATGCTAT-AC-CG-TTTAT--AAGATTCAAT-TAACTCTAATAAA------CGCT--------GATATAACATTTTAGACACTCGATGTTTTTT-T-TTCATATGT-ATATTTTTCTC------TTT-TTTATTCCTGATATTG--TCT-AAAGATCCTTTTGTCACATTGTTGTAT-------TA--T-AATAATATTTGTGTA-TAT--TTGTATTATGGGACGGTGGCCTAAATTACTTGA-ATAAAATATT
gi|110216                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TTGAAACCGGCAGATACGC-A---AGA--------ACACGAGTAGA-GAGA----C----A-TGAACG----T---T--T---------TTGTCAAAGATGTAAT--------TCTGGTG-AT---ATAGAAGACGAATT-TCA---T
gi|110209                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          attgcatttgctaggttacggttgccatcacatagcttaaggaATTGGAGAAAT--AG-TGGAC--------GA-A-T-T------TC-AT--------GTAAT-A-----ATCA--T-A-GTGG-ATT-AAATTTATT----CTATAAATTGATAAGTA-C-A--CATAA---C-GAT---AATTTGTTGATA---AAACTCT--CC--AATTGAGTACAAGAAATGTACAA---TAA-----ACTGAAT--TACTT-TATTCAAGT--CCA---AG-----C-T--G-A----CACAAA-----C-TAAA-ATA--T------GAT---TATGCTAC-AC-CGTTT-AT--AAGATTCAAG-TAATGCTGGTAAAT-----GCC---------GATATAACATTTTAGACACTTGATGTTTGTT-AATTCATGTTT-TTTC-TTTCTCTT----TTT-TT-ATTCCTGATATTGTTCTT-A----TCCTTTTGGCACATTGTTGTAT-------TA--C-T---ATATTTGTGTA-TAT--TTGTATTATGGGCCAGTGGCCTAAATAACTTGA-ATAAACTATT
gi|110220                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      actgttcgttataaaattggcatgccaatctatatcaaagtcagacataagtattttaaaacaaatcttgatgtagaaagttatttcacattttggtttaaaatagcactctctaaactaagatgttcagctcattcacttttagatgaaacgggaagacataccaatataccatatgaataaagaaaatgccttttgatgaaattgtgtaacGAAATC-AGCT--A-C--TATCCGA-A-T-T------TTTGA--------ATTGT-A-----ATCA--T-T-ATGGTATT-AAATCTATTGATTTTATGAATTAATTGGTA-T-A--CAATA---C-ACT---TATCTGTTGACT---TAACTCT--CC--AAATAAGTACTAGAAATGTTCTA---TAA-----GC--------ACTTCCATTTCCCT--CTA---AA-----C-T--G-GTCATGACAAA-----C-TAAA-ATA--T------GAT---TATACCCCTAC-CGTTT-AT--AAGATTCAA----------GTA--------------------------ACATGTTAGATACTCGATGTTTGTT-AATTC--ATGT-GT---TGTTGC--------------TTCCTAATGTTGTATTT-G----TCCTTTTGGCACGTTGTTGTATTCC----TG--T-TATAATATTTGTAAA-TAT--TGGTATTATGGGCCGGTGACCAAAATTAGTTAA-ATAAACTATT
gi|110221                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -ATT-AAACTAATT------ATAAATTCATGAGTT-C-A--AAAGA---C-ATT---AAGTTGTTGAGG---AAATTCT--CA--AAACGTATACTAGATATGTTCAA---TAA-----ACGGAAA--TACTC-TATTAGATA--CTA---AG-----A-T--G-A----CACAAA-----C------------------------TATGCTAC-AC-CGTTT-AT--AAGATTCGAG-TA-----TGCCAG------GGT---------GATATAATATGTTAGATACACAATGTTTGTC-AATAAATAT
gi|110222                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AATGTTTAAGTGTAAGTTGTACGG-----CACTT-CATTTACTT--TCA---AAGTGTGC-TAAG-A----AA-AAA-----G-TAAAGATA--CCAACTAGATCGTTATATAT--ACACA-TT-ATGCCGGATGCAAG-TAGCACTTGTTAATGCCAGGTC---------GAAATAATATGTTTTCTACTCGATGTTCGTT-TACTCATATGTTGT---TTT---------TTT-CT-CTGCCTAATATTGTCTTT-G----TCCTTTTGGCACACTGTTGTATTGC----TA--T-AATAATATTGGTGTATTAT--TTGAAT
gi|110223                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AT---TAAGCTAC-AC-CG-TT-AT--CAGATTTAAG-TAACACTTGTCAA------TGCCATCAGGTTGATATATC-TTTTAGACACTTGATGTTTGTTAAATTC-----T-TT---TTTCCCCCCTCTTTT-TT-CTTCCTTATATTGTATTT-A----TCCTTTGTGTTCATTGTTGTAT-------AG--C-TATA
gi|110224                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTAGATATCGAATGTTTGTT-ACTTTAT-TAT-GC---TGTTGC------TTTGTT-TTCCCTAATGCTGTCTTT-G----CGTTTCTGGCACCTTATTTTAT-------AACTT-TATATTGTATGTGTG-TATGTTTGTATTATGGGCCAGTGGCCTAAATTAATTGACCTAAACAATT
gi|110225                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ---TTTCAC------TTC-TT--TTCCTGACATTTTTTTTCA----TCATTTTGG-ATATTGTTGTATAACTGCGTA--TGTACAATATTTGTGTA-TAT--TTGT----TGGA-TGGTGT-CCAAATTGCTTGA-
gi|110226                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TTTGTCACTCTGTTGTAA-------AA--T-TGTATTATTTGTATG-T----TTGTATTTTGGGCCAGAGGCCTATTTTAC-TAA-ATAAAATA
gi|110227                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTTTTGTA-TTT--TTGTATTTTGGGCCAGAGGCCTATATTACCTGA-ATAAA
gi|110228                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TGTATTATGGGCCGGAGGCCTACATTACTCAA-ATAAAATATT

lowQualScore                  :                                                                                                                    111111111111111                                                                                       222222222222222222222222222222                                                                                                                                1111111111   111111111      1111111111                                      11                                                   11                                  333333333333                                                   1111                  111                                                1    11111           1111         1              11111                                                         2222222222222222222                                               111      111111                                                   11111111111                                                                      
lowQualScore                  :        0              1     666  88888 444        1  777   2 66666        444       1       22   333  8  55555 2   444444444444444   1   8888 6666666   22   1 11 1 4444     1 8888   22 22      2    66     777   22  1 444444444444444444444444444444 1    1 1    22 1  0    22 55555     22           22  33 3  222  9999  8  0     2          1  222    66 1      1 1   1  3333 1  9999999999   000000000 1    7777777777 1    5  999  1          1   666  9 1 00 88 1   1    1 1 44   1     4      2 0   2  2 22   00   22 1 88 4  2  9  88888888   0  777777777777    33  2   8888 22     0   55555                2 1111   8888888   444  444 22   3        33  33    3   0  1               4    22222    44  1  0000   444   6  9 5555      77777                 3   3    7  7   55     0  4          3  1111111111111111111                     1 3      1 3       2   3  000    0 444444   3  66                44 3                       77777777777 44 3               3   44                                 3          
lowQualScore                  :        .              .     ...  ..... ...        .  ...   . .....        ...       .       ..   ...  .  ..... .   ...............   .   .... .......   ..   . .. . ....     . ....   .. ..      .    ..     ...   ..  . .............................. .    . .    .. .  .    .. .....     ..           ..  .. .  ...  ....  .  .     .          .  ...    .. .      . .   .  .... .  ..........   ......... .    .......... .    .  ...  .          .   ...  . . .. .. .   .    . . ..   .     .      . .   .  . ..   ..   .. . .. .  .  .  ........   .  ............    ..  .   .... ..     .   .....                . ....   .......   ...  ... ..   .        ..  ..    .   .  .               .    .....    ..  .  ....   ...   .  . ....      .....                 .   .    .  .   ..     .  .          .  ...................                     . .      . .       .   .  ...    . ......   .  ..                .. .                       ........... .. .               .   ..                                 .          
lowQualScore                  :        8              1     111  11111 999        2  444   3 11111        555       0       99   555  0  99999 4   999999999999999   9   4444 2222222   66   9 33 3 0000     0 9999   66 66      9    22     111   66  9 000000000000000000000000000000 6    8 0    55 0  3    44 33333     00           44  22 3  888  8888  0  6     2          6  888    99 1      0 0   7  7777 7  7777777777   111111111 8    1111111111 1    5  555  6          5   888  5 9 22 66 9   9    9 0 88   9     7      5 9   0  0 88   00   99 2 55 7  4  4  55555555   2  999999999999    22  4   7777 44     8   66666                4 5555   4444444   111  666 55   6        22  22    9   9  8               5    99999    99  9  8888   111   5  4 0000      66666                 6   6    3  3   00     5  2          6  5555555555555555555                     8 3      8 3       4   6  444    4 222222   3  66                66 3                       88888888888 22 1               1   22                                 1          
consensus                     : AAAATGTAGGCGATGAAAAAGCCTTTAT--ATT----CAGT-TTTAAACAACG-T-TTATTG---GACTGTTCT--TTACAAAATTGGCATG--CTG---AT-TT---A-TATCA----A-TCGA--GC-AAA-GCT-NNAC-------ATT--ATA-AGTACT----TTAAANC-T-AACT--T--AGATGTNGAAANGTATCT---TAC--TT-TG---AA---A-AT-T--CC----AN-----TNAAAT-TTAAAA--TNGCACTCT--C----NAAATTNCGATGTTCAGCT--CATTC-AC---TT-T--TA-GTTGAAACCGGAAGACACANCA---ATATTCCATACGAANANAGA-AT----A-TG--CA---T--TTT--------GT-GTAA--------CTCTGGAG-AA---ATNGAAGACGAATTTCA---TG-T-A--T-NA-TGA-AATG-TNC-NTAT-TATGACGATTTANGAAATCAG-T--ATC--TTT--CAGA-A-TT-TT-GA--------ATGGTA------------ACCA--TA-ATGG-A-TT-AAATTTATT----CTACAGATTAATGAGTA-C-A--CAA---ANC-GAC---AATTTGT-TGATAAAACTCT--CC--AAATTTGTACTNGAAATGTTCAATAAACAGAAA--TACTTT-ATTCAAGT--CCA---AAC-TG-A----AACAAA-----CTAAAATATGATTATGC-TAC-ACCG-TT-ATA--AGATTCAATTAACACTTGT-AA----A-GG-C---------GATATAACATTTTAGACACTCGA-TGTTTGTT-AATTCATATGT-GT---TTTCTC------TTT-TT-ATTCCTGATATTGTCTT--T-ATCCTTTTGGCACATTGTTGTAT-------T---A--T-TATAATATTTGTGTG-TAT--TTGTATTATGGGCCGGTGGCCTAAATTACTTGA-ATAAACTATT
Reference ( family-557 )      : AAAATGTAGGCGATGAAAAAGCCTTTAT--ATT----CAGT-TTTAAACAACG-T-TTATTG---GACTGTTCT--TTACAAAATTGGCATG--CTG---AT-TT---A-TATCA----A-TCGA--GC-AAA-GCT-NNAC-------ATT--ATA-AGTACT----TTAAANC-T-AACT--T--AGATGTNGAAANGTATCT---TAC--TT-TG---AA---A-AT-T--CC----AN-----TNAAAT-TNAAAA--TNGCACTCT--C----NAAACTNNGATGTTCAGCT--CATTC-AC---TT-T--TA-GTTGAAACCGGAAGACACANCA---ATATNCCATACGAANANAGA-AT----A-TG--CN---T--TTT--------GT-GTAA--------CTCTGGAG-AA---ATNGAAGACGAATTTCA---TG-T-A--T-NA-TGA-AATG-TNC-NTAT-TATGACGATTTAAGAAATCAG-T--ATC--TTT--CAGA-A-TT-TT-GA--------ATGGTA------------ACCA--TA-ATGG-A-TT-AAATTTATT----CTACAGATTAATGAGTA-C-A--CAA---ANC-GAC---AATTTGT-TGATAAAACTCT--CC--AAATTTGTACTNGAAATGTTCAATAAACAGAAA--TACTTT-ATTCAAGT--CCA---AAC-TG-A----AACAAA-----CTAAAATATGATTATGC-TAC-ACCG-TT-ATA--AGATTCAATTAACACTTGT-AA----A-GG-C---------GATATAACATTTTAGACACTCGA-TGTTTGTT-AATTCATATGT-GT---TTTCTC------TTT-TT-ATTCCTGATATTGTCTT--T-ATCCTTTTGGCACATTGTTGTAT-------T---A--T-TATAATATTTGTGTG-TAT--TTGTATTATGGGCCGGTGGCCTAAATTACTTGA-ATAAACTATT
gi|110190                     : AAAATGTAAGCGATGAAAAAGCCTTTAT--ATT----CAGT-TTTAAACAGCG-T-TTATTG---AACTGTTCC--TTACAAAACTGGCATG--CTG---AT-TT---A-TATCA----A-TCGA--GC-AAA-GCT-AGAC-------ATT--ATA-AGTATT----TTAAAAC-T-AACT--T--AGATGTAGAAAGGTATCT---CAC--TT-TG---AA---A-AT-T--CC----AA-----TTAAAT-TGAAAA--TAGCACTCT--C----TTAACTACGATGTTCAGCT--CATTC-AC---TT-T--TA-GTTGAAACCGGAAGACACACCA---ATATACCATACGAACAAAGA-AT----A-TG--CT---T--TTT--------AT-GTAA--------CTCTGGAG-AA---ATAGAGGACGAATTTCA---TG-T-AA-T-AC-TGA-AATG-TAC-GTAT-TATGATGATTTGAGAAATCAG-T--ATC--TTT--CAGA-A-TT-TC-GA--------ATGGTA------------ACCA--TA-ATGG-A-TT-AAATTTATT----CTATAAATTAATGAGTA-C-A--CAA---ATC-GAT---AATTTGT-CGATAAAACTCT--CC--AAATGTGTACTAGAAATGTTCAATAAACGGAAA--TACTTT-ATTCAAGT--CCA---AAC-TG-A----AACAAA-----CTAAAATATGATTATGC-TTC-ACCG-TT-ATC--AGATTAAATTAACACTTGT-AA----A-GA-C---------GATATAACATTTTAGACACTCTA-TGTTTGAT-AATTCATATGT-GT---TTTCTC------TTT-TT-ATTCCTGATATTGCATT--T-ATCCTTTTGGCACATTGTTGTAT-------T---A--T-TATAATATTTGTGTG-TAT--TTGTATTATGGGCCGGTGGACTAAATTACTTGA-ATAAACTATT
gi|110191                     : AAAATGTAGGCGATGAAAAAGCCTTTAT--ATT----CAGT-TTTAAACAGCG-T-TTATTG---GACTGTTCC--TTACAAAACTGGCATG--CTG---AT-TT---A-TATCA----A-TCGA--GC-AAA-GCT-AGAA-------ATT--ATA-AGTATT----TAAAAAC-T-AACT--T--AGATGTAGAAAGGTATCT---CAC--TT-TG---AA---A-AT-T--CC----AA-----TTAAAT-TGAAAA--TAGCACTTT--C----TAAACTATGATGTTCAGCT--TATTC-AC---TT-T--TA-GTTGAAACTGGAAGACACACCA---ATATACCATATGAACAAAGA-AT----A-TG--CT---T--TTT--------AT-GTAA--------CTCTGGAG-AA---ATAGAGGACGAATTTCA---TG-TAA--T-AA-TGA-AATG-TAA-GTAT-TATGATGATTTGAGAAATCAG-T--ATC--TTT--CAGA-ATTT-TT-GA--------ATGGTA------------ACCA--TA-ATGG-A-TT-AAATTTATT----CTATAAATTAATGAGTA-C-C--CAA---AAC-GAT---AATTTGT-TGATAAAACTCT--CC--AAATGTGTACTAGAAATGTTCAATAAACAGAAA--TACTTT-ATTCAAGT--CTA---AAC-TG-A----AACAAA-----CTAAAATATGATTTTGC-TAC-ACCG-TT-ATC--AGATTAAATTAACACTTGT-AA----A-GA-C---------GATATAACATTTTAGACACTCTA-TGTTTGAT-AATTC--ATGT-GT---TTTCTC-------TT-TT-ATTCCTGATTTTGCCTT--T-ATCCTTTTGGCACATTGTTGTAT-------T---A--T-TATAATATTTGTGTG-TAT--TTGTATTATGGGCCGGTGGCCTAAATTACTTGA-ATAAACTATT
gi|110192                     : AAAATGTAGGCGATGAAAAAGCCCTTAT--ATT----CAGT-TTTAAACAGCG-T-TTATTG---GACTGTTCC--TTACAAAACTGGCATG--TTG---AT-TT---A-TATCA----A-TCGA--GC-AAA-GCT-AGAC-------ATT--ATA-AGTATT----TTAAAAC-T-AACT--T--AGATGTAGAAAGGTATCT---CAA--TT-TA---AA---A-AT-T--TC----TA-----TTAAAT-TGAAAAAATAGCACTCT--C----TAAACTACGATGTTCAGCT--CATTC-AC---CT-T--TA-GTTGAAACTGGAAGACACACCA---ATATACCATACGAACAAAGA-AT----A-TG--GT---T--TTA--------AT-GTAA--------CTCTGAAG-CA---ATAAAGGACGAATTTCA---TA-T-AA-T-AA-TGA-AATG-TGC-GTAT-TATGATGATTTGAGAAATCAG-T--ATC--TTT--CAGA-A-TT-TTTGA--------ACGGTA------------ACCA--TA-ATGG-A-TT-AAATTTATT----CTATAAATTAATGAGTA-C-A--TAA---AAC-GAT---AATTTGT-TAATATAACTCT--CC--AAATGTGTGCTAGAAATGTTCAATAAACGGAAA--TACTTT-ATTCAAGT--CCA---AAC-TG-A----AACAAA-----CTAAAATATGATTATGC-TAC-ACCG-TT-ATA--AGATTAAATTAACACTTGT-AA----A-GA-C---------GATATAACATTTTAGACACTCTA-TGTTTGAT-TATTCATATGC-GT---TTTCTC------TTT-TT-ATTCCTGATATTGCCTT--T-ATCCTTTTGGCACATTGTTGTAT-------T---A--T-TATAATATGTGTGTG-TAT--TTGTATTATGGGCCGGTGGCCTAAATTACTTGA-ATAAACTATT
gi|110193                     : AAAATGTAGACGATAAAAAAGCCTTTAT--ATT----CAGT-TTTAAACAGCG-T-TTATTG---GACTGTTCC--TTACAAAACTGACATG--CTG---AT-TT---A-TATCA----T-TCGA--GC-AAA-GTT-AGAC-------ACT--ATA-AGTATT----TTAAAAC-T-TACC--T--AGATGTAGAAAGGTATCT---CAT--TT-TG---AA---A-AT-T--CC----AA-----TTAAAT-TGAAAA--TAGCACTCT--C----TAAACTACGATGTTCAACT--CATTC-AC---TT-T--TA-GTTGAAACCGGAAGACACACCA---ATATACCATACAAACAAAGA-AT----A-TG--CC---T--TTT--------AT-GTAA--------CTCTAGAG-AA---ATTGAGGACGAATTTCA---TG-T-AA-T-AA-TGA-AAAG-TGC-GTAT-TATGATGAATTAAGAAATTAG-T--ATC--TTT--CAGA-A-TT-TTTGA--------ATGGTA------------ACCA--TA-ATAG-A-TC-AGATTTATT----CTCTAAATTAATGAGTA-C-A--CAA---A-C-GAT---ATTTTGT-TGATAAAACTCT--AC--AAATTTGTACTAGAAATGTTCAATAAATGGAAA--TATTTT-ATTCAAGT--CCA---AAT-TG-A----AACAAA-----CTAAAATATGATTATGC-TAC-ACCG-TT-ATA--AGATTCAATTAACACTTGT-CA----A-GA-T---------GATATAACATTTTAAACACTCTA-AGTTTGAT-AATTCATATGT-GT---TTTCTC------TTT-TA-ATTCCTGAACTTGCCTT--T-ATCCTTTTGGCACACTATTGTAT-------T---A--T-CATAATATTTGTGTG-TAT--TTGTATTATGGGCCGGTGGCCTAAATTACTTGA-ATAAACTATT
gi|110194                     : AAAATGTAGGCGATGAAAAAGCCTTTAT--ATT----CAGT-TTTAAACAGCT-T-TTA-TG---GACTGTTC
gi|110195                     :    ACGTTGGGGATGAATTAGGGTTTAT--TTA----TATG-TTTAAGCAACG-C-TTAATT---GATTGTTAT--TCACAAAATTGGCATG--CTG---ATGTTGAAA-CTTCA-------CCA-----AAA-GCC-TTAC-------ATT--ATA-AATACT----TTAAGTC-T---CTACT--AAATGTTGAACATTAT-T---TAA--TT-CT---AG---A-TT-TA-CC----AT-----ATAAAT-ATAAAA--AAGCTATTT--C----AAATTTTCGTTGCTCATGT--CA-TA-AC---CTAA--TG-ATAGAAAATGGAAGACACATTG---GTAT
gi|110196                     :     TGTTGGTGATGATAAATTGTTTATTTATA----CA---TTCAAGCAAAGAT-TGATTG----ATTGTTCT-------AAACAGGAATG--CTG---CG-GT---AGTGTCGCTGTG-TCTG--GA-AAA-GGT-GGTT-------TTT--ATA-GATATA----TTATGCC-TGAACT--G--AAAACTGCAAAT-TACCTG--TAA--TT------AT---A-AT-TTGCC----AT-----TGAAAT-TCAGAA--TTTCACTTT--C----AAGATTTAGATGTTCAGCT--CAT---AA---TT-TGATG-ATAGAAACTGGCAGACATAACA---ATATTCCATATGAATACAGA-AT----A-TGTCCA---T--TT----------T-GCAA------------GGAACAAACTATAGAAGACGAGTATCA---TGTT-A--T-TA-TGA-TCTG-CCC-GTTA-TATAGAAACTTAAGACAGCAA-T--ACA--TTT--Ca
gi|110197                     :      GTTGGTGATGATAAATTGTTTAT--TTA----TATA-TTCAAGCAAAGAT-TGATTG----ATTGTTCTAATCAGGAA--TGGTATG--GTA---ATGTT---G-T-TGA----G-TCTG--GA-AAA-GGT-CAAT-------TTT--ATA-GATAAA----TTATGCC-TGAACT--G--AAAACTGCAAAT-TACCTA--TAT--TA-T---------A-AT-TTGCC----AT-----TGAAAT-TCAGAA--TTTCACTTT--C----AAGATTTAGATGTTCAGCT--CAT---AA---TT-TGATG-ATAGAAACTGGCAGGCATAACA---ATATTCCATATGAATACATA-AT----A-TGT-CG---A--TTT---------T-GCAA------------GGAACAAACTATAGAAGACGAGTATCAT--TT-T-A--T-TA-TGA-TCTG-CCCGTTAT-T-TAGCAACTTAAGACAGCAG-T--ACA--TTT--C
gi|110198                     :             ATGAAAA----TTTGT--TTTTTTACAGTATTCAAACAACGAG-TTATTG----ATTGTGCT--CT-------TGG--TGGTCTG---AT-TT---T-TCTCA----G-TCAC--AT-AAA-GCT-GTTC-------ATT--ATG-AAAACT----TTAAATC-T-CCTT--T--CAATGTTGAAATGTTTCT---TAC--TT-T------------T-T--TC----ATACCTCTGAAGT-TTAAAA--TTGCATTG---C----CAAATTGAAATGGTCAGTTGACA----AA---TT-A--TATGTAGCAACTGGAAGACACAATA---GTGTTTCTTACGAAGATAGA-AT----G-TG--TA---TACTGT--------GT-GCAA----------CTGGAG-AA---GTTGATGATGAAAGCCA---TG-C-A--TGCA-CGA-AATG-TTC-CTAT-TATGAAGATTTATACAGCGAA-T--ACC--GTTACCAT--C-TT-CT-GA--------ATGTT-------------AC----TA-ATA-----T-ACATTCATT----TTACAGATTAAT-AGTA-TAA--CAAATGAAC-AAC---AATT------A-AAAACACT--TCGTAAATTTGTTTTCGAAGTACTTAATTAA-AGAAA-----TTT-ATT
gi|110199                     :                        TTTAT--CTT----AAGA-TTTAAACAACG-T-GTAACA---GATTG---------CAAAATTGGCACG--CTG---AT-GT---A-CATGA----A-TCAA--GA-AAA-GCT-ATTC-------GTT--ATA-AGCACT----TTAAAACGC-AAC---T--AAACATTGAGCAATACCT---TAC--TT-TG---AA---A-AT-C--CC----TT-----TAAAAT-ATAAAA--TTGCACTCT--C----AAAACTGCGTTGTTCAAAA--CATTC-GT---TA-T--TT-GTTGAAACAGGGAGACATACAA---ATGTTGCTTATGCTGACAGA-GT----A-TG--TA---T--TTT--------GT-GTAA--------CTCACAAG-AA---ATAGAAGATGAATTTCA---CGCT-G--T-CA-TGA-CATG-TAC-CTTT-TATAACGATCTACGTAACCAA-T--ATC--TTG--CTGATA-TTATT-AACTATAACGATCGCAACT---------ACCA--TA-ATGT-A-TA-AGA---ATT----CTACAGTTTGATGAGTA-C-AGCCAA---TTCTGAC---AA---GA-TAATCAAACTGG--CA--AAGTTTGTATTTGAGATGTTTCATAAA-AGAAC--T-CTTT-ACC----T--CCG---ATCTTA-A----AACAAAATGACTTAAAACATAAT
gi|110200                     :                        TTTAT--CTT----AAGA-TTTAAAC---G-T-GTAACA---GATTGTGCT--CTGCAAAATTGGCATG--CTG---AT-GT---C-CATGA----A-TCAA--GA-AAA-GCT-ATTC-------ATT--ATA-AGCACT----TTAAAACGC-AAC---T--AAACGTTGAGCAATACCT---TAC--TT-TG---AA---A-AT-C--CC----TT-----TAAAAT-ATAAAA--TTGCACTCT--C----AAAACTGCGTTGCTCAAAA--CATTC-GT---TA-T--TT-GTTGAAACAGGGAGACATGCAA---ATGTTGCTTATGCTGATAGA-GT----A-TG--TA---T--TTT--------GT-GTAA--------CTCACAAG-AA---ATAGAAGATGAATTTCA---CGCT-G--T-CA-TGA-CATG-TAC-CTTT-TATAACGATCTACGTAACCAA-T--ATC--TTG--CTGATA-TT-AT-TA--------ACTATAACGATCACAACTACCA--TA-ATGT-A-T----ATGAATT----CTACAGTTTGATGAGTA-C-AACCAA---TTCTGAC---AA---GA-TAATCAAACTGG--CA--AAGTTTGTATTTGAGATGTTTAATAAA-AGAAC--T-CTTT-ACC----T--CCA---ATCTTA-A----AACAAAATGACTTAAAACATAAT
gi|110201                     :                        TTTGT--ATT-----A---TTCAAACAACG-TATTATT----GACTGTGCT--GTACAAGATTGGCGGT--CGG---AT-AT---T-TCTTA----G-TCAC--AC-AAA-GCT-GTCC-------ATT--ATG-AAAACT----TTAAATA-T-ATTT--T--AAATGTTGAAAAATAT
gi|110202                     :                                       AGT-TTTAAGCAACG-C-TTAATT---GATTGATAT--TGACAAAATTGGCATG--ATG---ATGTT---G-AATC-------TTCA--CCAAAA-GCA-TTAC-------ATT--ATA-AATA-T----TTAAAtcac
gi|110203                     :                                         T-TTTATATGTCA-T-TCATTGAAAGACTGTTCA--TTACAAAAATGGCACA--GTG---AC-TT---A-CA--A----A-ATGAGCGC-AAA-GCTCACACATGAAAAATT--ATA-ATCAAG----TTAAATCAT-TACT--T---GACATGGAATCATAAAT---TAT--TTATC---AACCGACAT-G--TC----TT-----TTAATTCTAAAAA--AAGTCCTCT--------AATTTCTGATGCTCAG-T--CATTC-AC---TT-C--TT-ATTAAAACCAGCAGAC
gi|110204                     :                                         T-TTCAAGCAACG-C-TTAATT---GACTGTTAT--TCACAAAATTGGCATG--ATG---ATGTT---G-AATC-------TTCA--CCAAAA-GCA-TTAC-------ATT--ATA-AATACT----TTAA
gi|110205                     :                                          -TTCAAACAACG-TGTTATTG----ACTGTGCT--GTACAAGATTGGCA-G--TCGGATAT-TT---A-TGTC---------------------------C-------ATT--ATG-AAAACT----TTAAATC-T-CTTT--T--AAATGTTGAAACATATCT---TAC--TT-TA---TC---A-AT-A--CA----TC-----TAAAGT-TTAAAA--TTGCTTTTG--C----AAAATTTAGATGCTCA--T----TTC-ACAAATT-A--TATGTAGAAACTGGAAGACACAATA---ATGTTGCTTTCGAAGATAGA-AT----T-TG--TA---TACTTT--------GT-GCAG--------CTT--GAG-AA---GTTGAAGATGAATACTA---TG-T-A--T-GC-AGAGAATG-TAC-CTAT-TATGAAGATTTACGCAGTGAA-T--ACCTTTTT--CAAT-A-TT-TT-GA--------ATGTTACT----------AACA--TA-A----A-TTAAAATTCATT----TTACAGATTAATGAGTA-TAA--CAA---ATG-AACACAAATT------A-AAAACACTAGGT--AAATTTATTTTTGAAGTATTTAATAAA-AGAAATTTATTTT--TTCAA----TCATTTAACGTGTA----AACAAA-----
gi|110206                     :                                          -TTTAGATA----C-TTAGTA---GATTGTTTT--ATTCAAAACTGGAGTG--CAG---AT-CTC--A-TTTCA----AATAGG--GT-----TCT-CAAC-------GTTTTATACAGAAAT----GTAAAAC-C-AACT--TTTGGTTAT-GAAAACTATCT---TGA--TT-T-----------AT-T--GTGT--AC-----TAAAAC-CTAACG--CAGCTTTTTAAC----TAAATTACGACTTTCGTCT--CATTC-AC---TT-A--GA-ATCGAAACTGGTAGATATGCCAGGGACAGATTAGATAAAAAC-GA-ACGTAAA-TG--CCAAAT--TT------------GTAA--------CAGTAATG-AT---ATTGAAGACGAATTTCATTTTG-T-T--T-TATTG----TG-TTC--TATGTATACTGATATAAGAAATAAG-T--
gi|110207                     :                                                        -TTGTTT---GACTG--CT--GTACATGATTGGCGGT--CGG---AT-AT---T-TCTCA----G-TCAC--AC-AAA-GCT-GTGC-------ATT--ACG-AAAACT----TTAAATC-T-CTTT--T--AAATGTTGAAAAATATCT---TAC--TT-TA---TC---A-AT-A--CC----TC-----TAAAGT-TTAAAA--TTGCTTTTG--C----GAAATTTAAATGCTCAGCT--CA--CAAA---TT-A--TACGTAGAAACTGGAAGACACAATA---ACGTTGCTTACGAAGATAGA-AT----T-TG--TA---TACTTT--------GT-GCAG----------CTGGAG-AA---ATTGAAGATGAATACCA---TG-T-A--TGCA-TGA-AATG-TTC-CTAT-TATGAAGCTTTACGCAGTGAA-T---TCTTTTT--CAGT-A-TG-AT-GA--------ATGTTACT----------AACA--TA-A----ATTT-AAATTCGTT----TTACGGATTAGTGAGTATT-A--CAA---ATG-AAC---AAAAAATAAAAAAAAACTAT--GC--AAATTTATTTTTGAAGTATTTAATAAA-AGAAATTTATTTT--TCCAA-TCACTA---AACATGTA----AACAAA-----
gi|110208                     :                                                               ---GACTGCTCG--TTACAAAAATAGCATA--GTG---AC-TT---A-CA-AA----A-TTCA--CC-AAAAGCT-C-AC-------ACT--TT----TACTAAAGTTAAATC-CCGACT-----GGACATGGAATCATATTTGTCTAC--C-------AA---C-ATAT--CTTATAAA-----TGAAAA--AAAAA--TC---CTCT--C----TAACTTCCGATGCTCAAGT--CATTC-GC---TT-C--TT-ATTGAAACCAGAAGGCATAACA---ACATTC
gi|110209                     :                                                                   ACTGTTCG--TTATAAAATTGGCATG--CCA---AT-CT---A-TATCA----A------------A-GTC-AGAC-------AT-----A-AGTATT----TTAAAAC-A-AATC--T--TGATGTAGAAAGTTATTT---CACATTT-TG---G------------------------------T-TTAAAA--TAGCACTCT--C----TAAACTAAGATGTTCAGCT--CATTC-AC---TT-T--TA-GATGAAACGGGAAGAC----------------ATACCAATATACC-AT----A-TG--AA---T-------------------------------------AA---A--GAAAATGCCTTT-------------T-GA-TGA-AAT--TGT-GTA------AC-ATTGGAGAAAT-AG-TGGAC----------GA-A-TT-TC-AT--------GTAATA------------ATCA--TA-GTGG-A-TT-AAATTTATT----CTATAAATTGATAAGTA-C-A--CAT---AAC-GAT---AATTTGT-TGATAAAACTCT--CC--AATTGAGTACAAGAAATGTACAATAAACTGAAT--TACTTT-ATTCAAGT--CCA---AGC-TG-A----CACAAA-----CTAAAATATGATTATGC-TAC-ACCGTTT-ATA--AGATTCAAGTAATGCTGGT-AA----ATGC-C---------GATATAACATTTTAGACACTTGA-TGTTTGTT-AATTCATGTTT-TTTC-TTTCTCTT----TTT-TT-ATTCCTGATATTGTTCT--T-ATCCTTTTGGCACATTGTTGTAT-------T---A--C-T---ATATTTGTGTA-TAT--TTGTATTATGGGCCAGTGGCCTAAATAACTTGA-ATAAACTATTacagaaca
gi|110210                     :                                                                                                  ---AT-TT---A-TTTAA----A-TCAA--AC-AAA-GCT-TGTC-------ATT--AAA-AATATT----TTTAAAT-T-AATC--C--AGATTTAGAAATGAATCT---AAG--TT-T----AA---A-CT-T--TC----AA-----TCGAAA-TTAAAA--TATGACTTT--CAAAAAAAACTTT----TTCATCT----TTT-AC---TT-T--TA-GTTGAAACCGGAAGACTTAATA---ATATCTCATATGAGATAAGA-AA----ACTG--CA---C--TCT--------
gi|110211                     :                                                                                                                                 C-AAA-GCT-GTCC-------ATT--ATA-AAAACT----TAAAATC-T-CTTT--T--AAATGTTGAAAAATATCT---TAC--TT-TA---TC---A-AT-A--CC----TC-----TAAAGT-TTAAAA--TTGCTTTTG--C----GAAATTTAGATGCTTAACT--CA--CAAA---TT-A--TATGTAGAAACTGGAAGACACAATA---ATGTTGCTTTTGAAGATAGA-AT----T-TG--TA---TACTTT--------GT-GAAG----------CTGGAG-AA---ATTGAAGATGAATACCA---TG-T-A--TGCA-TGG-AATG-TTC-CTAT-TATGTAGCTTTACGCAGTGAA-T--ACCT-TTT--CAAT-A-TT-TT-GA--------ATGTTACT----------AACA--TA-A----ATTT-AAATTCAGT----TTACAGATTTATGAGTA-TAA--CAA---ATG-AAC---AA-AAAC-TAAAAACACTAT--GC--AAATTTATTTTTGAAGTATTTAATAAA-AGAAATTTATTTT--TCCAA-TCACTA---AACATGTA----AACAAA-----ttttta
gi|110212                     :                                                                                                                                                                          TAAAAC-T-AATC--T--AGATGTAGAACTGTATCT---CAC--TT-TA---AT---A-CT-T--AC----AA-----TCAATT-TTGAAA--TAGCACTCT--A----TAAATTAAAATTTTCAGCT--CATTC-AT---TT-T--TA-GTTGAAATCGAAAGTCATAGCA---ATATTTCATACAAGGAAAGA-AT----A-TGC-CA---T--CTT--------A--ATAA--------TTCTGATG-AA---ATTAAGGATGAATTTCA---TGTT-A--T-TA-TGA-AATG-TGC-TGAT-TATAATGATTtgcaaagcaattgttatttatctaattatatgtaacact
gi|110213                     :                                                                                                                                                                                gtataaT--T--AAATGTTGAAAAATATCT---TTC--TT-TA---TC---A-AT-A--CC----TC-----TAAAGT-TTAAAA--TTGCTTTTG--C----GAAATTTAGATGCTCAGCT--CA--C-AA---AT-TA-TATGAAGAAACTGGAAGACACAATA---ATGTTGCTTACGAAGATAGA-AT----T-TG--GA---TACTTT--------GT-GCAG----------CTGGAG-AA---ATTGAAGATGAATACCA---TG-T-A--TGCA-TGG-AATGTTCC-TTAT-TATGAAGCTTAACGCAGTGAA-T--ACCT-TTT--CAAT-A-TT-TT-GA--------ATGTT-------------ACTAACTA-AT-----TT-AAATTCATT----TTACAGATTTATGAGTA-CAA--CAA---ATG-AAC---AA-AAAC-TAAAAACACTAT--GC--AAATTTATTTTTGAAGTATTTAATAAA-AGAAA--TTTATT-TTTCAAATCACTA---AACATGTA----AACAAA-----
gi|110214                     :                                                                                                                                                                                                              ---TAC--TT-TGTTTAA---A-ACAT--CA----AA-----TCAAAT-TTAAAC--TAGCACTGT--A----TAAATTATGATGTTCTACT--CATTC-AC----T-T--TA-GTTGAAACAGGAAGACATAACA---ATAT-------GAGCAAGGA-AC----G-TG--AG---T--TTT--------AA-TTAAAATAAAATATCTGGAA-GA---ATTGAGGACAAATT--G---T--T-A--T-TA-TGA-AATG-TCC-TTAT-TATAATAGTTTACCAAATC---T--ATC------------------T-GA--------ATGGTA------------AGTA--TA-TTGA-A-TT-GAATTTATT----CTATTAATTAA
gi|110215                     :                                                                                                                                                                                                                             gta---A-AT-TTGCC----AT-----TGAAAT-TCAGAA--TTTCACTTT--C----AAGATTTAGATATTCAGCT--CAT---AA---TT-TGATG-ATAAAAACTGGCAGACATAACA---ATATTCCATATGAATACAGA-AT----A-TGTCCA---T--TT----------T-GCAA------------GGAACAAACTATAGAAGACGAGTATCAT--TT-T-A--T-TA-TG---ATC-TGC-CCGT-TAT
gi|110216                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTGAAACCGGCAGATAC-GCA---AGA----ACACGAGTAGAGAGAC----A-TGAACG---T--TTTTGTCAAAGAT-GTAA--------TTCTGGTG-AT---ATAGAAGACGAATTTCA---T
gi|110217                     :                                                                                                                                                                                                                                  attgcatttgctaggttacggttgccatcacatagcttaaggaTCT-------GAAACTACGATGTTCAGCT--CATTC-AC---TT-T--TA-GTTGAAACCGGAAGACACACCA---ATATACCATACGAACAAAGA-AT----A-TG--AT---T--TTT--------AT-GTAA--------CTCTGGAA-AA---ATAGAGGACGAATTTCA---TG-T-AA-T-AA-TGA-AATG-TGC-GTAT-TATGTTGATTTGAGAAATCAG-T--ATC--TTT--CAGA-ATTT-TT-GA--------ATGGTA------------ACCA--TA-ATGG-A-TA-AAATTTATT-----TATAAATAAATGAGTA-C-A--CAA---AAC-GAT---AATTTGT-TGATAAAACTCT--CC--AAATGTGTACTAGAAATGTTCAATAAACAGAAA--TACTTT-ATTCAAGT--CCA---AAC-TG-A----AACAAA-----CTTAAATATGATTATGC-TAC-ACCG-TT-ATA--AGATTAAATTAACACTTGT-AA----A-GA-C---------GATATAACATTTTAGACACTCTA-TGTTTGAC-AGTTCATATGT-GT---TTTCTC------TTT-TT-ATTCCTGATATTGCCTT--A-ATCCTTTTGGCACATTGTTGTAT-------T---A--C-TATAATATTTGTGTG-TAT--TTGTATTATAGGCCGGTGGCCTAAATTACTTGA-ATAAACTATT
gi|110218                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                C-AT---TTAT--TA-GTTGAAACAGGGAGACATACAA---ATGTTGCTTATGCTGATAGA-GT----A-TG--TA---T--TTT--------GT-GTAA--------CTCACAAG-AA---ATAGAAGATGAATTTCA---CGCT-G--T-CA-TGA-CATG-TAC-CTTT-TATAACGATCTACGTAACCAA-T--ATC--TTG--CTGATA-TT-AT-TA--------ACTATAACGATCACAACTACCA--TA-ATGT-A-T----ATGAATT----CTACAGTTTGATGAGTA-C-AGCCAA---TTCTGAC---AA---GA-TAATCAAACTGG--CA--AAGTTTGTATTTGAGATGTTTAATAAA-AGAAC--T-CTTT-ACC----T--CCA---ATCTTA-A----AACAAAATGACTTAAAACATAAT
gi|110219                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ---TT-T--TA-GTTGAAACCAAAATACACACTA---ATGTCCCATATGAACAATGA-AA----A-TG--CA---T--TTT--------TTTGTAT--------CTCTGGCG-AA---ATGGAGGACGAATGTCA---TG-T-AAAT-AA-TGA-AATG-TGC-GTAT-TATGATAATT-GAGAAATGAG-A--ATC--T----CCGA-A-TT-TTTGA--------ATGGTA------------ATCA--TAGATGC---TT-CAATTTATT----CTTTAAATTAATTAGTA-C-A--CAA---AAC-CAC---CATTTGT-TGATAAAATTCA--CC--AAAT-------------GTTCAAAAAACGGAA------------TCAAGT--CCA---AGC-TG-A----CACAAA-----CTTAAATATGACTATGC-TAT-ACCG-TTTATA--AGATTCAATTAACTCTAAT-AA----A-CG-CT--------GATATAACATTTTAGACACTCGA-TGTTTTTT-T-TTCATATGT-ATATTTTTCTC------TTT-TTTATTCCTGATATTGTCTAAAG-ATCCTTTTGTCACATTGTTGTAT-------T---A--T-AATAATATTTGTGTA-TAT--TTGTATTATGGGACGGTGGCCTAAATTACTTGA-ATAAAATATT
gi|110220                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GAAATCAGCT--A-C--TAT--CCGA-A-TT-TTTGA--------ATTGTA------------ATCA--TT-ATGGTA-TT-AAATCTATTGATTTTATGAATTAATTGGTA-T-A--CAA---TAC-ACT---TATCTGT-TGACTTAACTCT--CC--AAATAAGTACTAGAAATGTTCTATAAGCA--------CTTCCATTTCCCT--CTA---AAC-TG-GTCATGACAAA-----CTAAAATATGATTATAC-CCCTACCG-TTTATA--AGATTCAA------------------------------------GTAACATGTTAGATACTCGA-TGTTTGTT-AATTCAT--GT-GT---TGTTGC------TT--------CCTAATGTTGTATT--T-GTCCTTTTGGCACGTTGTTGTAT-------TCCTG--T-TATAATATTTGTAAA-TAT--TGGTATTATGGGCCGGTGACCAAAATTAGTTAA-ATAAACTATT
gi|110221                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -A-TT-AAACTAATT------ATAAATTCATGAGTT-C-A--AAA---GAC-ATT---AAGTTGT-TGAGGAAATTCT--CA--AAACGTATACTAGATATGTTCAATAAACGGAAA--TACTCT-ATTAGATA--CTA---AGA-TG-A----CACAAA-----C-----------TATGC-TAC-ACCGTTT-ATA--AGATTCGAGTA-----TGC-CA----G-GG-T---------GATATAATATGTTAGATACACAA-TGTTTGTC-AATAAATAT
gi|110222                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AAGT----A---AA---G-A----TACCAA-----CTAGA---TCGTTATATATAC-AC-A-TT-ATGCCGGATGCAAGTAGCACTTGTTAATGCCA-GGTC---------GAAATAATATGTTTTCTACTCGA-TGTTCGTT-TACTCATATGTTGT---TTT---------TTT-CT-CTGCCTAATATTGTCTT--T-GTCCTTTTGGCACACTGTTGTATTGC----T---A--T-AATAATATTGGTGTATTAT--TTGAAT
gi|110223                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aatgtttaagtgtaagttgtacggcacttcatttactttcaaagtgtgctaagaaaaATTAAGC-TAC-ACCG-TT-ATC--AGATTTAAGTAACACTTGT-CA----A-TG-CCATCAGGTTGATATATC-TTTTAGACACTTGA-TGTTTGTTAAATTC-----T-TT---TTTCCCCCCTCTTTT-TT-CTTCCTTATATTGTATT--T-ATCCTTTGTGTTCATTGTTGTAT-------A---G--C-TATA
gi|110224                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TTAGATA-TCGAATGTTTGTT-ACTTTAT-TAT-GC---TGTTGC------TTTGTT-TTCCCTAATGCTGTCTT--T-GCGTTTCTGGCACCTTATTTTAT-------A---ACTT-TATATTGTATGTGTG-TATGTTTGTATTATGGGCCAGTGGCCTAAATTAATTGACCTAAACAATT
gi|110225                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ---TTTCAC------TTC-TT--TTCCTGACATTTTTTT--TCATCATTTTGG-ATATTGTTGTATAACTGCGT---A--TGTACAATATTTGTGTA-TAT--TTGT----TGGA-TGGTGTCC-AAATTGCTTGA-
gi|110226                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TTTGTCACTCTGTTGTAA-------A---A--T-TGTATTATTTGTATG-T----TTGTATTTTGGGCCAGAGGCCTATTTTAC-TAA-ATAAAATA
gi|110227                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TTTTTGTA-TTT--TTGTATTTTGGGCCAGAGGCCTATATTACCTGA-ATAAA
gi|110228                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TGTATTATGGGCCGGAGGCCTACATTACTCAA-ATAAAATATT