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Reference ( family-550 ) : TTGAACATACGACATCCTGAGT--GACAGTCAAAGGCGTACACCACTGGACCACTTTGGAGCCTAATAATAGTGTAAGA-GTT--AACACCTTTTAAAGCTGTT---AGGTCTTGAAAGGGGCGTCAT--TCTAGTTGACCGGAANTAGAATTAATT--C-ATA-CG-TTTGAT-A-T-ACGTT---TTA-T------GT-TATGCAAATCGTT-GTAAC-C-GACTA--AAA----G---TTTTNGCT--GGTGA--AT-AT-AAAATACCTCG-AAA-T--GT--G-TAC--GT--CG--ATC----CAT-AC---GT--T---T----T-----G---GCGG---TTTGCTAGTANNGCGAATAG--CC--T-A-AT-TTTG-AAATCCTCATTNATTT-GAGGTCAACCCATC
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gi|136110 : TGAC--GAAATAAAAATATTT--TTAT--CA-TTTAAT-A-A-AAATT-----A-T------GG-TATGCAAATGTTT-GTAACAT-GA-TA--AAA----G---TTTAATCTTAGGT----AT-AT-AAAATATCTTA-ATA-T--AT--G-TTT--GT--CT--ATC----GTT-AC---TT--T---A----TATCGCG---GCGG---TTTACCAGTTAGGTGAATAGCCCC--T-T-GT-TTAT-AAATCCCCATCCA--T-GGGGTCAACC
gi|136111 : TGAC--GAAATAAAAATATTT--T-AT--CA-TTTAAT-AAT-AA------TCA-T------GG-TATGCAAATGTTT-GTAACAT-GA-TA--AAA----G---TTTTATCTTAGGT----AT-AT-AAAAGATCTTA-ATA-T--AT--G-TTT--GC--CT--ATC----GTT-AC---TT--T---A----TATCGCG---GCCG---TTTACCAGTTAGGTGAATAGCCCC--T-T-GT-TTAT-AAATCCCCATCCA--T-GGGGTCAACC
gi|136112 : TGAC--GAAATAAAAATATTT--T-AT--CA-TTTAAT-AAT-AA------TCA-T------GG-TATGCAAATGTTT-GTAACAT-GA-TA--AAA----G---TTTTATCTTAGGT----AT-AT-AAAAGATCTTA-ATA-T--AT--G-TTT--GT--CT--ATC----GTT-AC---TT--T---G----TATCGCG---GCGG---TTTACCAGTTAGGTGAATAGCCCC--T-T-GT-TTAT-AAATCCACATCCGTT---GGGTCGACC
gi|136113 : TGAC--GAAATAAAAATATTT--CTAT--CA-TTTAAT-AAT-AA------TCA-T------GG-TATGCAAATGTTT-GTAACAT-GA-TA--AAA----G---TTTTATCTTAGGT----AT-AT-AAAACATCTTA-ATA-T--AT--A-TTT--GT--CT--ATCGTAACTTAAT---AT--C---G----C-----G---GCGG---TTTACCAGTTAGGTGAATTGCCCC--T-T-GT-TTAT-AAATCCCCATCCA--T-GGGGTCAACC
gi|136114 : TGAC--GAAATAAAAATATTT--T-TTATCA-TTCAATTA-T-AAGC------G-T------GG-TATGCAAATGTTT-GTAACAT-GA-TA--AAA----G---TTTTATCTTAGGT----AT-AT-AAAAGATCTTA-ATA-T--AT--T-TTT--GT--CT--ATCGTTACTT-AT---AT--C---G----C-----G---GCGG---TTTACCAGTTAGGTGAATAGCCCC--T-T-GT-TTAT-AAATCCCCATCCA--T-GGGGTCAACC
gi|136115 : TGAC--GAATTAAAAATATTT--TTAT--CA-TTTAAT-AAT-AA------TCA-T------AG-TATGCAAATGTTT-GTAAC----ATTATAAAA----G---TTTTATCTTAGGT----AT-AT-AAATGATCTTA-ATA-T--AT--G-TTT--GT--CT--ATC----GTT-AC---TT--T---A----TATCGCG---GCAG---TTTACCAGTTAGGTGAATAG--CC--C-A-TTGTTTATAAATCCCCATCCA--T-GGGGTCAACC
gi|136116 : GGAAATACAATTAATT--T-GAA-AG-TTGCAT-A-C-ATGTA---TT--T------GTATATGCAAAT-GTTAGTGAC-C-------------------------------TGT--ATTAT-AAAATATCTTG-AAAAT--CA--G-T-C--AT--TAGTATC----C-T-GT---AT--T---T----TATTA-G---GCAA---ATTGCTTGTATAGTGAAGCG--CC--T-T-TA-TTTG-AAATCCTCATTAACGT-CAGGTCAGCACATC
gi|136117 : GACTTAATAAAC-ATA--A-TTTGTT-A-TCACGTA---ATA-TTC----AT-TATGTAAGTGTTT-GTAATAT-GA-TA--AAC----G---TTTTATCTTAGGTG----T-AT-AAAAGACATAA-CAA-T--AT--A-TAC--GC--CG--ATC----GTT-AC---TTAAT---T----T-----GCCGGCGG---TTTACAAGTTAGGTGAATAG--CC--C-A-TA-TTTG-AAATCCTCGTACA--G-GAGGTCAACCTA
gi|136118 : act--C-ATA--A-TTTGTT-A-TCACTTTGTATTAAT------AT-TATGTAAATGTTT-GTAACAT-GGC-A--AAC----G---TTTTATCT--TATGT--GT-AT-AAAAGACATAA-AAAAT--AT--A-TAT--GT--CG---CC----CGTTACTTTAT--T---TGC--T-----G---GCGG---TTTACCAGTTAGGTGAATAG--CC--C-A-TA-TTAG-AAATCCCCGCTCA--T-GGGGTCAACCTA
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gi|136121 : -A-T-ACGTT---TTA-T------GT-TATGCAAATCGTT-GTAAC-C-GACTA--AAC----G---ATTT-GAT--GGTGA--AT-AT-AAAATACCTCG-AAA-T--GT--G-TAT--GT--TGT-ATC----CAT-AC---GT--T---T----T-----G---GCGG---TTTGCTAGCACTGCGAATAG--CC--T-A-AT-TTTG-AAATCCTCATTGATTT-ATAGTCAACCCATC
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gi|136124 : -AAA-T--G------AC--GG--C---ATC----GAT-AT---AT--T---T----T-----G---GCGG---TTAGCTAGTACAGCATATAG--CC--T-A-GC-TTTG-AAATTCTCACTAA
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gi|136127 : -A-AT-TTTG-AAATCCTCAATGATTT-GAGGTCAACCTATC
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blockSeqs : . . . . T . C C . . A . . . . G T . . . CG . AT C . . . TG TA GA . . . . G . . C TGT CAT G . T ATCGC . . ACT CC . TA . T G TT .
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Reference ( family-550 ) : TTGAACATACGACATCCTGAGT--GACAGTCAAAGGCGTACACCACTGGACCACTTTGGAGCCTAATAATAGTGTAAGA-GTT--AACACCTTTTAAAGCTGTT---AGGTCTTGAAAGGGGCGTCAT--TCTAGTTGACCGGAANTAGAATTAATT--C-ATA-CG-TTTGAT-A-T-ACGTT---TTA-T------GT-TATGCAAATCGTT-GTAAC-CGACTA--AA-A----G---TTTTNGCT--GGTGA--AT-AT-AAAATACCTCG-AAA-T--GT----GTAC--GT-C-G-----T-A--TC----CA-T-A-C---GT--T---T----T-----G---GCGGTTTGCTAGTANNGCGAATAG--CC--T-A-AT-TTTG-AAATCCTCATTNATTT-GAGGTCAACCCATC
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gi|136101 : CTAGTTGACCGGAACTAGAATTAATC--C-ATA-CG-TCTGAT-A-T-ATGTT---TTA-T------GT-TATACAAATCGTT-GTAAT-CGACTA--TA-A----G---TTTTTGCT--GATGA--AT-AT-AAAATACGTCG-AAA-T--AT----GTAT--AT-T-G-----T-A--TC----CA-T-A-C---GT--T---T----C-----G---GCGGTTTGCTATTACTGCGAATAT--CC--T-A-AT-TTTG-AAATCCTTTTTGATTA-AAGGTCAACCCATCctagttgaccggaactagaattaatccatacgtctgatatatgttttatgttatacaaatcgttgtaatcgactataagtttttgctgatgaatataaaatacgtcgaaatatgtatattgtatccatacgtttcggcggtttgctattactgcgaatatcctaattttgaaatcctttttgattaaaggtcaacccatc
gi|136102 : ttgaacatacgccatcctgagtgacagtcaaaggcgaacaccattagaccactttggagcctaataatagcgaaagagttaTTGAACATACGACATTCTGAGT--GACAGTTAAAGGCGTATGCCACTGCGCCACTTTGGAGCCTAATAATAATACAACA-GTT--ATCACCTTTTAAAGTTGTT---AGATNNNNNNNNNN-------------------------TGGAATTAATT--C-ATA-CG-TTTGAT-A-T-ACGTT---TTA-T------GC-TATGCAAATTGTT-GAAAC-CAACTG--AA-A----G---GTTTTGTT--GGTGA--GT-AT-AAAATACCTCG-AAA-T--GT----ATAC--AT-A-G-----C-A--TC----CA-T-T-T---ATA-T---T----T-----G---GCGGTTTGCTAGTACAGCAGATAG--CC--T-A-GT-TTTC-AAATGCTCAATAATTT-
gi|136103 : TTGAACATGCGACATCCTGTGT--GGCAGTCAAAGGCGTACACCATTAGACCACTTTGGAGCCTAATAATGATGTAAGC-GTT--AGCACCTTTTAAATTTGTT---AGGTCTTG--ATGGGCGTTAT--TCTAGTTGACCGGAAATAAA
gi|136104 : TTGAACATACGGCATCCTGAGT--GACAGTCAAAGGCGTACACCATTAAACCACTTTGGGGCCTAATAATAGTGCAAGA-GTT--AACACCTTTTAAAGTTGTT---AGATATTTAA
gi|136105 : TTGAACATACAACTTCCTTGGC--AGCAGT-AAA-----ACGCCA---AGCC-----GGGTCCCATTTATA-TGTAACG-GTTTTAACACCTTTTAAACTTGTT----TTTCTTGAAAGGGAAGTCGT--TCTAATTGACTG-------------TT--C-AGA-AGGTTCTAT-A-T-TCGTT---TG---------GA-TATGCAAATATTT-GTAAC-TGACTG--AA-A----G---AATTTGCT--AAGGC--AC-AT-AAAA-AC-TCG-AAA-TTCGT----G-AT--AT---G-----C-A--TC----CA---------GC--T---TAAATT-----G---GCGGTTTGTTTGATTAACGAATAG--TC--A-G-AG-TTTT-AAATCCTCACACGCAT-GAGTTCAATCCAT
gi|136106 : TTGAATATACGACATTCTGAGT--GACAGTCAAAGGCGTACACCATT
gi|136107 : TCGAGCCTGCGAC-TCCTGGGTTCG-CAGTCCAAGGCGTTAACCACTGGACCACTT
gi|136108 : CTCGAAAGGGGCGTCATATTCTAGTT-ACCGGAAGTAGAATTAATT--C-ATA-CG-TTCGGT-A-T-ACGTT---TTA-T------GT-TATGCCAATCGTT-GTAAC-CGGCTA--------------T-----CT--GGTGA--AT-AT-AAAATAGCTCG-AAA-T--TA----ATAC--GA-T-G-----T-A--AT----CA-A-A-C---GT--T---T----T-----G---GCGGTTGGCTAGTACTGCGAATAG--GC--T-T-AT-TTTG-AAATCCTCATTAATTT-GAGGTCAACCTATC
gi|136109 : TTGACCGGAAATACATTTAATT--T-AAA-CG-TTGAAC-A-T-TCGT------A-T----------ATGCAAAT-GTTAGTAAC-CAACTA--AA-A----G---TTTTAACT--GGTGT--AC-AT-AAAATACCTCG-AAA-T---TCA--GTCA--GT-T-G-----T-A--TC----CC-T-G-----AT--T---T----TCAATAG---GCAAATTGCTTGTACAGCGAAGCG--CC--T-T-AA-TTTG-AAATTCTCACTAACGT-GAGGTCAGCCCATC
gi|136110 : TGAC--GAAATAAAAATATTT--TTAT--CA-TTTAAT-A-A-AAATT-----A-T------GG-TATGCAAATGTTT-GTAACATGA-TA--AA-A----G---TTTAATCTTAGGT----AT-AT-AAAATATCTTA-ATA-T--AT----GTTT--GT-C-------T-A--TC----GT-T-A-C---TT--T---A----TATCGCG---GCGGTTTACCAGTTAGGTGAATAGCCCC--T-T-GT-TTAT-AAATCCCCATCCA--T-GGGGTCAACC
gi|136111 : TGAC--GAAATAAAAATATTT--T-AT--CA-TTTAAT-AAT-AA------TCA-T------GG-TATGCAAATGTTT-GTAACATGA-TA--AA-A----G---TTTTATCTTAGGT----AT-AT-AAAAGATCTTA-ATA-T--AT----GTTT--GC-C-------T-A--TC----GT-T-A-C---TT--T---A----TATCGCG---GCCGTTTACCAGTTAGGTGAATAGCCCC--T-T-GT-TTAT-AAATCCCCATCCA--T-GGGGTCAACC
gi|136112 : TGAC--GAAATAAAAATATTT--T-AT--CA-TTTAAT-AAT-AA------TCA-T------GG-TATGCAAATGTTT-GTAACATGA-TA--AA-A----G---TTTTATCTTAGGT----AT-AT-AAAAGATCTTA-ATA-T--AT----GTTT--GT-C-------T-A--TC----GT-T-A-C---TT--T---G----TATCGCG---GCGGTTTACCAGTTAGGTGAATAGCCCC--T-T-GT-TTAT-AAATCCACATCCGTT---GGGTCGACC
gi|136113 : TGAC--GAAATAAAAATATTT--CTAT--CA-TTTAAT-AAT-AA------TCA-T------GG-TATGCAAATGTTT-GTAACATGA-TA--AA-A----G---TTTTATCTTAGGT----AT-AT-AAAACATCTTA-ATA-T--ATATTTGTCT--AT-C-G-----T-AACTT----AA-T-ATC---GC-----------------G---GCGGTTTACCAGTTAGGTGAATTGCCCC--T-T-GT-TTAT-AAATCCCCATCCA--T-GGGGTCAACC
gi|136114 : TGAC--GAAATAAAAATATTT--T-TTATCA-TTCAATTA-T-AAGC------G-T------GG-TATGCAAATGTTT-GTAACATGA-TA--AA-A----G---TTTTATCTTAGGT----AT-AT-AAAAGATCTTA-ATA-T--AT----TTTT--GT-C-------T-A--TCGTTACT-T-A-T---AT--C---G----C-----G---GCGGTTTACCAGTTAGGTGAATAGCCCC--T-T-GT-TTAT-AAATCCCCATCCA--T-GGGGTCAACC
gi|136115 : TGAC--GAATTAAAAATATTT--TTAT--CA-TTTAAT-AAT-AA------TCA-T------AG-TATGCAAATGTTT-GTAAC---ATTATAAA-A----G---TTTTATCTTAGGT----AT-AT-AAATGATCTTA-ATA-T--AT----GTTT--GT-C-------T-A--TC----GT-T-A-C---TT--T---A----TATCGCG---GCAGTTTACCAGTTAGGTGAATAG--CC--C-A-TTGTTTATAAATCCCCATCCA--T-GGGGTCAACC
gi|136116 : GGAAATACAATTAATT--T-GAA-AG-TTGCAT-A-C-ATGTA---TT--T------GTATATGCAAAT-GTTAGTGAC-C-------------------------------TGT--ATTAT-AAAATATCTTG-AAAAT--CA----GT-C--AT-TAG-----T-A--TC----C--T-G-T---AT--T---T----TATTA-G---GCAAATTGCTTGTATAGTGAAGCG--CC--T-T-TA-TTTG-AAATCCTCATTAACGT-CAGGTCAGCACATC
gi|136117 : GACTTAATAAAC-ATA--A-TTTGTT-A-TCACGTA---ATA-TTC----AT-TATGTAAGTGTTT-GTAATATGA-TA--AA-C----G---TTTTATCTTAGGTG----T-AT-AAAAGACATAA-CAA-T--AT----ATAC--GC-C-G-------A--TC----GT-T-A-C---TTAAT---T----T-----GCCGGCGGTTTACAAGTTAGGTGAATAG--CC--C-A-TA-TTTG-AAATCCTCGTACA--G-GAGGTCAACCTA
gi|136118 : act--C-ATA--A-TTTGTT-A-TCACTTTGTATTAAT------AT-TATGTAAATGTTT-GTAACATGGC-A--AA-C----G---TTTTATCT--TATGT--GT-AT-AAAAGACATAA-AAAAT--AT----ATAT--GT-C-G-----C-----C----CG-TTA-CTTTAT--T---TGC--T-----G---GCGGTTTACCAGTTAGGTGAATAG--CC--C-A-TA-TTAG-AAATCCCCGCTCA--T-GGGGTCAACCTA
gi|136119 : actgatttaataaaAATAAAAATACTT--T-TTA-TC-CTTTAT-A-T-GC--------A-T------GT-TATGCAAATATCT-ATAACTTG--TA--AACC----G---TTTTATTTTAGGT----AT-AT-AAAATATCT---AAA-T--AT----ATAT--TT-T-A-----C-G--AC----CGTT-A-C---TT--TATAT----TGGC--G---GCGGTTTACCAGTTAGGTGAATAGC-CC--T-T-GT-TTTG-CAATCCTCCTTCA--T-GAGGTCAACCCACC
gi|136120 : attaatttatatgctgacat-TTTGTT-A-T--CATT---TTA-TAATCATGT-TATGCAAATATTT-GTAACATGA-TA--AA-C----G---TTTTAACTTAGGT----AT-AT-AAAAGATCTTG-ATA-T--GT----GTAT--AT-C-G-------A--TC----GT-T-A-C---TT--T---A----TATCGCG---GCGCTTAATCAGTTAGGTGAATAGCCCC--T-T-GT-TTAT-AAATTCCCCTACA--T-GAGGTCAACCCACC
gi|136121 : -A-T-ACGTT---TTA-T------GT-TATGCAAATCGTT-GTAAC-CGACTA--AA-C----G---ATTT-GAT--GGTGA--AT-AT-AAAATACCTCG-AAA-T--GT----GTAT--GT-T-G-----T-A--TC----CA-T-A-C---GT--T---T----T-----G---GCGGTTTGCTAGCACTGCGAATAG--CC--T-A-AT-TTTG-AAATCCTCATTGATTT-ATAGTCAACCCATC
gi|136122 : T---TCA-T------AT-TATGCAAATGTTT-GTAAC---A-TA--AA-AAAACG---TTTTATCT--AAGGC--AT-AC-GCAAGACCTTA-AAA-T--AT----A-----AT-C-G-----T-T--AC----TT-T-A-T---AT--TG--C----T-----G---GAGGTTTACCAGTTAGGTAAATAG--CCCTT-A----TTTG-AAATCCTCGATCATT---AGGTCAACCCA
gi|136123 : -TATGCAAATGTTT-GTAACATGATTA--AA------G---TTTTATCTAAGGT----AT-AT-AAAAGGTCTT---AG-T--AT----ATCCTTGT-C-GAGCGTT-AC-TT----TA-T-ATC---GC-----------------G---GCGGTTTATCAGTAAGGTGAACAGCTCC--T-T-GT-TTAT-AAATCCCCATCCA--T-GGGGTCAACC
gi|136124 : -AAA-T--G-------AC--G----G-----C-A--TC----GA-T-A-T---AT--T---T----T-----G---GCGGTTAGCTAGTACAGCATATAG--CC--T-A-GC-TTTG-AAATTCTCACTAA
gi|136125 : ---GCGGTTTGATAGTACTGCGACTAG--CT--T-A-AT-TTTT-AAATCCTCATTAATTT-GAGATCAACCCATC
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gi|136127 : -A-AT-TTTG-AAATCCTCAATGATTT-GAGGTCAACCTATC