lowQualScore : 2222222 3333333333333333333333 1111111
lowQualScore : 777 222 222 11 2 1 1 1 7777777 3 444 1 1 1 1 33 2 5555555555555555555555 33 1 9999 3333333 1 55555 1 11 1 1 5555555 1 4444444 22 1 1
lowQualScore : ... ... ... .. . . . . ....... . ... . . . . .. . ...................... .. . .... ....... . ..... . .. . . ....... . ....... .. . .
lowQualScore : 666 222 999 66 3 1 1 1 0000000 4 333 1 6 1 1 99 3 0000000000000000000000 66 1 6666 5555555 1 55555 9 55 1 1 8888888 3 3333333 00 5 5
consensus : CACATTGTTTGTTTAAA-TAA---T-T-CACT--TCA-A-A-TAT-A-NN----T-TT---TA-CCC-TG-A--C-CC--T--TTTC-NT--T------A--GGTAAGCAAGACGTCA-TAAA---NA-------T-A----TACG--TTGACGTC-AT-TATTCTGAC------GTA-AC-----GTCTATC--TC-TTT-TTT
Reference ( gi|158356 ) : CACATTGTTTGTTTAAA-TGA---T-T-CACT--TCA-A-A-TAT-A-TA----T-TT---TA-CTC-TG-A--C-CT--T--TTTC-AT--T------A--GGTAAGCAAGACGTCA-TAAA---TA-------T-A----TATG--TTGACGTC-AT-TATTCTGAT------GTA-AC-----GGCTATC--TC-TTT-TTT
gi|158357 : CACAGTGTTTGTTTAAA-TAA---T-T-CACT--TCA-A-A-TAT-A-AT----T-TT---TA-CT--TGTA--T-CT--T--TTTT-CT--TGA----A--GGTAAGCAAGACGTCG-TAAA---TA-------T-A----TACG--TTGATGTC-AT-TATTCTGAC------GTA-AC-----GTCTTTC--TC-TTT-TTT
gi|158355 : CACATTGTTTGTTTAAA-TAA---T-T-CACT--TCA-A-A-TAT-A-AT----T-TT---TA-CTC-TG-A--T-CT--T--TTTC-TTG-T------A--GGCAAGCAAGACATCA-TAAA---TA-------T-A----TACA--TTGATGTC-AT-TATTCTGAC------GTA-AA-----G--TATTTATC-TTT-TTT
gi|158359 : CACATTGTTTGTTTAAA-TAA---T-T-TACT--TCA-A-A-TAT-A-AT----T-TT---TA-CTC-TG-A--C-CT--T--TTTC-TTG-T------A--GGT--------CATCA-TAAA---TA-------T-A----TACA--TTGACGTC-AT-TTTTCTGAC------ATA-AC-----GTCTATC--TC-TTT-TTT
gi|158361 : CACAGTGTTTGTTTAAA-CAA---T-A-CACT--TCA-A-AATAT-AATA----T-TTATTTA--TC-AA-AACC-CTG-T--TCTC-AT---------A--GTTAAGTGAAACGTCA-TAAA----A-------T-A----TACG--TTGACGTC-AT-TATTCTGAC------GTA-AC-----ATCTATC--TA-TTT-TTT
gi|158360 : CACATTGTTTATTTAAA-TAA---T-T-CACT--TCA-A-A-TTT-A-GT----T-TG---TA-CCC-TG-A--C-CC--T--GTTC-TTG-T------G--GGTAA-TACGACATCA-TAAA---CA-------A-A----TACA--TTGACCTC-AT-TATTCTGAC------GTA-AT-----GTCCATC--TC-TAT-TT
gi|158363 : CATATTGCCTGTTCAAA-CAA---T-A-CACT--TTA-A-A-TAT-A-T-----T-TT---TA-CCC-TG-A--CGCA--G--TGTC-AT---------A--GG-GAGCAAAACGTCA-TAAA---AA-------T-A-----ATG--TAGACGTC-AT-TACTTTGAC------GTA-AC-----GTCTATC--TT-TTT-
gi|158364 : CATATTGCCTTTTCAAA-CAA---T-A-CACT--TTT-A-A-TAT-A-AA----T-TT---TA-CCC-TG-A--C-CCAGT--GTT--AT--A------A--GG--AGCAAAACGTCA-TAAA---AA-------T-A-----ATG--TTGACGTC-AT-TTTTCTGAC------GTA-AC-----ATCTATC--TT-TTT-
gi|158365 : CATATTGCCTGTTCAAA-CAA---T-T-CACT--TTA-G-A-TAT-A-AT----T-TT---TA-CCT-TG-A--C-CC--T--GTT--GT--C------A--GG-GAGCCAAACGTCA-TGGA---AA-------T-A-----ATG--TTGACGTT-AT-GACTCTGAC------GAA-AC-----GGCTATC---C-TTT-
gi|158366 : CATATTGCCTGTTCAAA-CAA---T-A-CACT--TCA-A-A-TAT-A-AT----T-TT---TA-CCT-TG-A--C-CCA-G--TGTC-A---T------A--GG-GAGCAAAACGTCA-TAAA---AA-------T-A-----ATG--TTGATGTC-AT-TACTCTGAC------ATATAC-----GA-TACA--TT-TTT-
gi|158362 : CACATTGTTTGTTTAAA-TAA---T-C-CACT--CCA-A-C-TAT-A-AT----T-TT---TA-CAC-AG-A--C-CC--TG-TTTT-TG--T------A--GGTAAGCAAGGCATCA-TAAA---TACAGAATCT-A----TATA--CTGACCTC-AT-T------AT------GT-----------CTATT--TC-TTT-
gi|158358 : CATATTGCTTGTTCAAA-CAA---T-A-CATT--TTA-A-A-TAC-A--A----TATT---TA-CCC-TG-A--C-TTA-G--TGTC-AC---------A--GG-GAGCAAAACGCCA-TAAA----A-------T-A-----ATG--TTAACGTC-AT-TA
gi|158367 : CACGTTGTTCATTTGAA-TAA---T-T-AATT--TCA-T-A-TAT-A-AT----T-TT---TA-CTC-TG-A--C-CC--T--GTTC--TCGC------A--GGTAAGCAAGACGTC---------CA-------T-----------------GTC-AC-TATTCTGGC------GTA-TCTCTTTATCTATT--TC-TTT-TTT
gi|158368 : CACATTTTTTG----AA-TAA---T-T-CACT--TCA-A-A-TAT-A-T-----T-TT---TT-CAC-TG-A--C-CC--TGATTTCGA----------A--AATAGGCAAAACGTCA-TAAAAT-TG-------T-A----TAT
gi|158369 : CATATTACCTGTTCAGA-CAA---T-A-CAAT--TTA-A-A-TAT-A-AG----T-TT---TA-TCC-TG-A--C-CCA-G--TGTC-A---T------A--GG-GAGCAAAACGTCA-TAAA---AA-------T-A-----ATGACATAACGGCTAT-TATTTTAAa
gi|158370 : CACATTGTTTGGTTAAA-AAA---A-A-GACT--TCA-A-A--AT-A-TAATGTT-TT---TA-CTCTTG----------T--TGTC-G---T------A--GGTAAGCAAGAC
gi|158372 : TGTTTGT--AAA-CAAGAAT-T-CACT--TCG-A-A-TAT-A-T-----T-TT---TA-CCT-TG-A--C-CC--T--ATTC-TC--T------G--GGTTAGCAAGACGTCA-TACA---TA-------T-A----TACG--TTGACGTC-AT-TATTCTGAC------GTA-AC-----GTCTGTC--TC-TTT-TTT
gi|158373 : TGTTTGTTTGTA-TAA---T-A-CACT--TCA-C-A-TAT-A--A----TGTT---TA-CCC-TG-A--C-C---------C-AC--G------A--G-TAAGCAAGACGTCA-TATA---AA-------T-G----AACG--TTGACGAC-AC-TATTCTGATGGTACAGTA-AC-----GTCTATC--TC-TTT-TTT
gi|158374 : TTTGTTTAAA-TTA---T-T-CACT--TCA-A-A-TATGA-T-----T-TT---TA-CTC-TG-A--C-CT--T--TTTC-TTA-T------A--GGTAAGCAAGACGCCT-TAAA---TA-------C-A----TACG--TTGACGTC-AT-TACTCTGAC------GCA-AC-----GTCTATC--TT-TTT-TTT
gi|158375 : TTTGTATAAA---A---T-T-CACT--TCA-A-A-TAT-A-AT----T-TT---TA-CTC-TG-A--C-CT--T--TTTC-TTG-T------A--GTTAAGCAAGATGTCA-TAAA---TG-------T-A----TACA--TTGGCTTC-AT-TATTCTGAC------GTA-AC-----GGCTATC--TC-TTT-TTT
gi|158376 : TTTGTTTAAA-TAA---T-T-CAAT--TCA-A-A-TAT-A-CT----T-TC---TA-CCC-TG-AT-C-CTG-T--TCTC-GT---------A--GGTCAGCAGGACGTCA-TAGA----A---------A----TATG--TTGACGCC-AA-TATTCTGAC------GTA-AC-----GTCTATC--TC-TTT-
gi|158377 : TTGTTTAAA-TAG---T-T-CACT--TCA-T-A-TAT-A--A----T-TT---TAACTC-CG-A--C-CT--T--TTTC-TTG-T------A--GGTAAGCAAGACGTCC-AAAA---TA-------T-AATTATACG--TTGACGTC-AT-TATTCTGAT------GTA-AC-----ATCTATC--TC-TTT-TTT
gi|158378 : TTGTTTAAA-TGA---T-T-CACT--TCA-A-A-TAT-A-AT----T-TT---TA-CTC-TG-A--C-CT--T--TTTC--T--TGC----A--GGTAAGCAAAACATCA-TAAA---AA-------T-A----TACG--TTGACATC-AT-TTTTCTAAC------GTA-AT-----G--TGTC--T
gi|158379 : TTGTTCAAA-TAA---T-T-CACT--TCA-A-A-TAT-A-TT----T-TT---TA-CCC-TG-A--C-CC--T--ATTC-TTA-T------A--GATCAGCGAGATGTCA-TAAA---TA-------T-A----TCAG--TTAAAGTC-AT-TATTCTGAC------CTA-AC-----TTCGATC--CC-TTT-TTgtct
gi|158380 : TTGTTTAAA-TAA---T-T-CAAT--TCA-A-A-TAT-AATA----T-TT---AA-C-C-TG-A--C-CT--T--GTTC-TTG-T------A--TGTAAACCAGACATCA-TAAA---TA-------T-A----AACT--TTGACGTC-AT-TATTTTGAC------GTA-AC-----GTCCAT
gi|158382 : TTGTTTAAA-TAA---T-T-CACT--TCA-A-A-TAT-A-TA----T-TT---T--CTC-TG-A--C-TC--TAATTTC--T--G------T--GGTAGGCACAACATTA-TAGA---TA-------T-A----AATG--TTGACGTC-AT-TATT
gi|158381 : TTGTTTTAA-TAA---T-A-GCCT--TAA-A-A-TAT-A-TT----T-TT---TC-CT--TG-A--CTCTG-T--TTTC-GT---------A--GGTAAGCCAGATTTCC-TAGA---TA-------T-A----TACG--TTGTCTTC-AT-TATTCTGAC------GTA-AC-----GGCAAAC--TG-TTTATTT
gi|158383 : TTGTTTCAA-TAA---TATATATT--TCA-A-A--AT-A-TACT--T-TT---TA-CCA-AG-A--C-C---------C-AT--TCAAAAAA--CATAAGCAGGACATCA-TAAA---AT-------T-A----TACG--TTTACATC-GT-TATTCTGAT------GAA-AT-----ATCAATC--TCATTT-TTT
gi|158384 : TGTCTAGA--AA---T-T-CACT--TCA-ACA-TA--A-T-----T-TC---TA-CCC-TG-A--C-AT--T--GTTC--T--TGA----A--GGTATGCATGACGTCA-TAAA---TA-------T-A----TACG--CTGATGAC-AT-TATTCTGAC------ATA-AC---------ATT--TA-TTT-TT
gi|158386 : GTTTAAACTAG---T-T-CA------A-A-A-TAT-A--A----TGCT---CA-GTC-TG-A--C-CC--T--ATTC-ACA-T------C--GGTAAATAAGACGTCA-TACA---AG-------C-T----TACA--TTGACGTC-AT-CGTTCTAAC------GTA-AA-----GTTTAAC--TC-T
gi|158387 : GTTCACA-TTA---T---CACT--TCACA-A-TAT-A--A----T-TTC--TA-CCC-TG-A--C-CC--T--G--C-AC--T------AA-GGTAAGCATTTCGTTA-AAAA---AG-------C-T----TACA--TTGACGTC-AT-TAGTTTAAT------ATA-A
gi|158388 : TAAA-T-A---T-T-CACT--TTG-A-A-TAT-T-T-----T-TT---TA-CCA-AG-A--C-CT--T--ATTC--T--T------GCTGTTAAGCAAGACGACA-TAAA---TA-------C-A----TACG--GTTACGTT-AT-AATTC
gi|158389 : ---T-C-CACT--TCA-A-A-TAT-G-T-----T-TT---TA-CTT-TG-A--T-AT--T--TTTC-TTG-T------A--GGTAAGTCAGACGTTA-TATA---TA-------A-A----TACA--TTGATGTC-AT-TATTCTGAC------GTA-AC-----ATCTGTC--TC-TTT-TTT
gi|158385 : -T-CACTATCCA-A-A-TAT---CA----G-TT----A-CCC-TG-T--C-CCCGT--TCTC-AT---------A--GGTAAGCAAGAAGCCATTAAA---AA-------T-A----T-----TTAACATT-AT-T-TTCTGAT------GT
gi|158390 : tatctgagtaa-CACA--TCACA-A-TAT-A--A----T-TTC--TA-CCC-TG-A--C-CC--T--G--C-AC--T------AA-GGTAAGCATTTCGTTA-AAAAAGCTA---------------ACA--TTGACGTC-AT-TAGTTTAAT------GTA-A
gi|158391 : ACA--TCA-A-A-TAT-A-TT----T-TG---TA-CCC-TG-GT-C-CTG-T--TCTC-AT--A------A--AGTAAGCAAATTATCC-TTAG---AA-------T-A----TACG--GTGACGCC-AG-T-TTCTGAT------GTA-AC-----ATCTAAT--TC-ATT-TTT
gi|158392 : ------A--GGTAAACAAATTGTCA-TAAA----A-------TCA----CATG--TTTATGTC-TT-TATCCTGAC------TTA-AC-----GTCTCTC--TC-CAT-TT
gi|158393 : --GGTAAA-AAGAAATCA-TGAA---TT-------C-A----CATG--TTGATGTC-AT-TATTCTGAC------ATA-AT-----GTCTAGC--TC-TGT-TTT
gi|158394 : GACGTCA-TGAA---AA-------G-A----TACG--TTGTCGTC-ATATAT--TGAC------GCA-AC-----GACTAGC--TC-TAT-TT
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|158371 ): TTCTCTATCTAAATAATACACTTCAATTCTTATTTTTACCCTGACCCTGTTTTTGTAGGATTTAGTAAAGGACGGAATAA
Alignments
lowQualScore : 111111 2222222
lowQualScore : 1 222 444 11 1 2 333 1 5555 1 1 1 111111 2222 5555555 1 22 11 1 55555 4444444 1 555555 1 1 333333 1 11 33333 1 1
lowQualScore : . ... ... .. . . ... . .... . . . ...... .... ....... . .. .. . ..... ....... . ...... . . ...... . .. ..... . .
lowQualScore : 2 000 333 55 1 2 000 1 6666 1 1 1 888888 3333 6666666 0 88 44 0 33333 9999999 1 555555 1 1 555555 2 77 33333 4 5
consensus : CACATTGTTTGTTTAAA-TAA---T-T-CACT--TC-A-AA---TA-TA--ATT-TTTAC-CCTG-ACCC--T--TT----TCNT--T--A-GG--TAAGCAA--GACGTCA-TAAA----NA-------T-A----T-ACGTTGACGTC-AT-TATTCTGAC------GTA-A--C-----GTCTATCTC-TTT-TTT
Reference ( family-548 ) : CACATTGTTTGTTTAAA-TAA---T-T-CACT--TC-A-AA---TA-TA--NNT-TTTAC-CCTG-ACCC--T--TT----TCNT--T--A-GG--TAAGCAA--GACGTCA-TAAA----NA-------T-A----T-ACGTTGACGTC-AT-TATTCTGAC------GTA-A--C-----GTCTATCTC-TTT-TTT
gi|158355 : CACATTGTTTGTTTAAA-TAA---T-T-CACT--TC-A-AA---TA-TA--ATT-TTTAC-TCTG-ATCT--T--TT----TCTTG-T--A-GG--CAAGCAA--GACATCA-TAAA----TA-------T-A----T-ACATTGATGTC-AT-TATTCTGAC------GTA-A--A-----GTATTTATC-TTT-TTT
gi|158356 : CACATTGTTTGTTTAAA-TGA---T-T-CACT--TC-A-AA---TA-TA--TAT-TTTAC-TCTG-ACCT--T--TT----TCAT--T--A-GG--TAAGCAA--GACGTCA-TAAA----TA-------T-A----T-ATGTTGACGTC-AT-TATTCTGAT------GTA-A--C-----GGCTATCTC-TTT-TTT
gi|158357 : CACAGTGTTTGTTTAAA-TAA---T-T-CACT--TC-A-AA---TA-TA--ATT-TTTAC-T-TGTATCT--T--TT----TTCT--TGAA-GG--TAAGCAA--GACGTCG-TAAA----TA-------T-A----T-ACGTTGATGTC-AT-TATTCTGAC------GTA-A--C-----GTCTTTCTC-TTT-TTT
gi|158358 : CATATTGCTTGTTCAAA-CAA---T-A-CATT--TT-A-AA---TA-CA--ATA-TTTAC-CCTG-AC-------TTAGTGTCA---C--A-GG---GAGCAA--AACGCCA-TAAA-----A-------T-A------ATGTTAACGTC-AT-TA
gi|158359 : CACATTGTTTGTTTAAA-TAA---T-T-TACT--TC-A-AA---TA-TA--ATT-TTTAC-TCTG-ACCT--T--TT----TCTTG-T--A-GG--T----------CATCA-TAAA----TA-------T-A----T-ACATTGACGTC-AT-TTTTCTGAC------ATA-A--C-----GTCTATCTC-TTT-TTT
gi|158360 : CACATTGTTTATTTAAA-TAA---T-T-CACT--TC-A-AA---TT-TA--GTT-TGTAC-CCTG-ACCC--T--GT----TCTTG-T--G-GG--TAA-TAC--GACATCA-TAAA----CA-------A-A----T-ACATTGACCTC-AT-TATTCTGAC------GTA-A--T-----GTCCATCTC-TAT-TT
gi|158361 : CACAGTGTTTGTTTAAA-CAA---T-A-CACT--TC-A-AAATATAATA--TTTATTTAT-CAAA-ACCC--T--GT----TCTCA-T--A-GT--TAAGTGA--AACGTCA-TAAA-----A-------T-A----T-ACGTTGACGTC-AT-TATTCTGAC------GTA-A--C-----ATCTATCTA-TTT-TTT
gi|158362 : CACATTGTTTGTTTAAA-TAA---T-C-CACT--CC-A-AC---TA-TA--ATT-TTTAC-ACAG-ACCC--TG-TT----TTTG--T--A-GG--TAAGCAA--GGCATCA-TAAA----TACAGAATCT-A----T-ATACTGACCTC-AT-TAT-------------------------GTCTATTTC-TTT-
gi|158363 : CATATTGCCTGTTCAAA-CAA---T-A-CACT--TT-A-AA---TA-TA--T-T-TTTAC-CCTG-ACGCA-G--TG----TCAT-----A-GG---GAGCAA--AACGTCA-TAAA----AA-------T-A------ATGTAGACGTC-AT-TACTTTGAC------GTA-A--C-----GTCTATCTT-TTT-
gi|158364 : CATATTGCCTTTTCAAA-CAA---T-A-CACT--TT-T-AA---TA-TA--AAT-TTTAC-CCTG-ACCCAGT--GT----T-AT--A--A-GG----AGCAA--AACGTCA-TAAA----AA-------T-A------ATGTTGACGTC-AT-TTTTCTGAC------GTA-A--C-----ATCTATCTT-TTT-
gi|158365 : CATATTGCCTGTTCAAA-CAA---T-T-CACT--TT-A-GA---TA-TA--ATT-TTTAC-CTTG-ACCC--T--GT----T-GT--C--A-GG---GAGCCA--AACGTCA-TGGA----AA-------T-A------ATGTTGACGTT-AT-GACTCTGAC------GAA-A--C-----GGCTATC-C-TTT-
gi|158366 : CATATTGCCTGTTCAAA-CAA---T-A-CACT--TC-A-AA---TA-TA--ATT-TTTAC-CTTG-ACCCA-G--TG----TCA---T--A-GG---GAGCAA--AACGTCA-TAAA----AA-------T-A------ATGTTGATGTC-AT-TACTCTGAC------ATATA--C-----G---ATACA-TTT-TTT
gi|158367 : CACGTTGTTCATTTGAA-TAA---T-T-AATT--TC-A-TA---TA-TA--ATT-TTTAC-TCTG-ACCC--T--GT----TCTCG-C--A-GG--TAAGCAA--GACGTC----------CA-------T----------------GTC-AC-TATTCTGGC------GTA-T--CTCTTTATCTATTTC-TTT-TTT
gi|158368 : CACATTTTTTG----AA-TAA---T-T-CACT--TC-A-AA---TA-TA--TTT-TTT-C-ACTG-ACCC--TGATT----TCG---A--A-AA--TAGGCAA--AACGTCA-TAAAATTGTA-------T-A----T-A
gi|158369 : CATATTACCTGTTCAGA-CAA---T-A-CAAT--TT-A-AA---TA-TA--AGT-TTTAT-CCTG-ACCCA-G--TG----TCA---T--A-GG---GAGCAA--AACGTCA-TAAA----AA-------TAA----TGACA-TAACGGCTAT-TATTTTAA
gi|158370 : CACATTGTTTGGTTAAA-AAA---A-A-GACT--TCAA-AA---TA-TAATGTT-TTTACTCTTG-------T--TG----TCG---T--A-GG--TAAGCAA--GAC
gi|158371 : TTCTCTATCTAAA-TAA---T-A-CACT--TC-A-AT---TC-TT--ATT-TTTAC-CCTG-ACCC--TG-TT----TTTG--T--A-GGATTTAGTAAAGGACGGAA-TAA
gi|158372 : TGTTTGT--AAA-CAAGAAT-T-CACT--TC-G-AA---TA-TA--T-T-TTTAC-CTTG-ACCC--T--AT----TCTC--T--G-GG--TTAGCAA--GACGTCA-TACA----TA-------T-A----T-ACGTTGACGTC-AT-TATTCTGAC------GTA-A--C-----GTCTGTCTC-TTT-TTT
gi|158373 : TGTTTGTTTGTA-TAA---T-A-CACT--TC-A-CA---TA-TA--ATG-TTTAC-CCTG-ACCC-------------AC--G--A-G---TAAGCAA--GACGTCA-TATA----AA-------T-G----A-ACGTTGACGAC-AC-TATTCTGATGGTACAGTA-A--C-----GTCTATCTC-TTT-TTT
gi|158374 : TTTGTTTAAA-TTA---T-T-CACT--TC-A-AA---TA-TG--ATT-TTTAC-TCTG-ACCT--T--TT----TCTTA-T--A-GG--TAAGCAA--GACGCCT-TAAA----TA-------C-A----T-ACGTTGACGTC-AT-TACTCTGAC------GCA-A--C-----GTCTATCTT-TTT-TTT
gi|158375 : TTTGTATAAA---A---T-T-CACT--TC-A-AA---TA-TA--ATT-TTTAC-TCTG-ACCT--T--TT----TCTTG-T--A-GT--TAAGCAA--GATGTCA-TAAA----TG-------T-A----T-ACATTGGCTTC-AT-TATTCTGAC------GTA-A--C-----GGCTATCTC-TTT-TTT
gi|158376 : TTTGTTTAAA-TAA---T-T-CAAT--TC-A-AA---TA-TA--CTT-TCTAC-CCTG-ATCC--T--GT----TCTCG-T--A-GG--TCAGCAG--GACGTCA-TAGA----AA-------T-A----T---GTTGACGCC-AA-TATTCTGAC------GTA-A--C-----GTCTATCTC-TTT-
gi|158377 : TTGTTTAAA-TAG---T-T-CACT--TC-A-TA---TA-TA--ATT-TTAAC-TCCG-ACCT--T--TT----TCTTG-T--A-GG--TAAGCAA--GACGTCC-AAAA----TA-------T-AATTAT-ACGTTGACGTC-AT-TATTCTGAT------GTA-A--C-----ATCTATCTC-TTT-TTT
gi|158378 : TTGTTTAAA-TGA---T-T-CACT--TC-A-AA---TA-TA--ATT-TTTAC-TCTG-ACCT--T--TT----TCTTG-C--A-GG--TAAGCAA--AACATCA-TAAA----AA-------T-A----T-ACGTTGACATC-AT-TTTTCTAAC------GTA-ATGT-----GTCTGTCT
gi|158379 : TTGTTCAAA-TAA---T-T-CACT--TC-A-AA---TA-TA--TTT-TTTAC-CCTG-ACCC--T--AT----TCTTA-T--A-GA--TCAGCGA--GATGTCA-TAAA----TA-------T-A----T-CAGTTAAAGTC-AT-TATTCTGAC------CTA-A--C-----TTCGATCCC-TTT-TT
gi|158380 : TTGTTTAAA-TAA---T-T-CAAT--TC-A-AA---TA-TA--ATA-TTTAA-CCTG-ACCT--T--GT----TCTTG-T--A-TG--TAAACCA--GACATCA-TAAA----TA-------T-A----A-ACTTTGACGTC-AT-TATTTTGAC------GTA-A--C-----GTCCAT
gi|158381 : TTGTTTTAA-TAA---T-A-GCCT--TA-A-AA---TA-TA--TTT-TTT-C-CTTG-ACTC--TGTTT----TCGT-----A-GG--TAAGCCA--GATTTCC-TAGA----TA-------T-A----T-ACGTTGTCTTC-AT-TATTCTGAC------GTA-A--C-----GGCAAACTG-TTTATTT
gi|158382 : TTGTTTAAA-TAA---T-T-CACT--TC-A-AA---TA-TA--TAT-TTT-C-TCTG-ACTC--TAATT----TCTG--T----GG--TAGGCAC--AACATTA-TAGA----TA-------T-A----A-ATGTTGACGTC-AT-TATT
gi|158383 : TTGTTTCAA-TAA---TATATATT--TC-A-AAA--TA-TA--CTT-TTTAC-CAAG-ACCC--A--TT-----CAA--A--A-AACATAAGCAG--GACATCA-TAAA----AT-------T-A----T-ACGTTTACATC-GT-TATTCTGAT------GAA-A--T-----ATCAATCTCATTT-TTT
gi|158384 : TGTCTAGA--AA---T-T-CACT--TC---AA---CA-TA--ATT-TCTAC-CCTG-ACAT--T--GT----TCTT--GA-A-GG--TATGCAT--GACGTCA-TAAA----TA-------T-A----T-ACGCTGATGAC-AT-TATTCTGAC------ATA-A--C-----ATTTATTTT-T
gi|158385 : TATCTGAG-TAA---T---CACTATCC-A-AA---TA-TC--AGT-T--AC-CCTG-TCCC--C--GT----TCTCA-T--A-GG--TAAGCAA--GAAGCCATTAAA----AA-------T-A----T----TTAACATT-AT-T-TTCTGAT------GT
gi|158386 : GTTTAAACTAG---T-T-CA-------A-AA---TA-TA--ATG-CTCAG-TCTG-ACCC--T--AT----TCACA-T--C-GG--TAAATAA--GACGTCA-TACA----AG-------C-T----T-ACATTGACGTC-AT-CGTTCTAAC------GTA-A--A-----GTTTAACTC-T
gi|158387 : GTTCACA-TTA---T---CACT--TC-ACAA---TA-TA--ATT-TCTAC-CCTG-ACCC------T----GCAC--TA-A-GG--TAAGCAT--TTCGTTA-AAAA----AG-------C-T----T-ACATTGACGTC-AT-TAGTTTAAT------ATA-A--
gi|158388 : TAAA-TA----T-T-CACT--TT-G-AA---TA-T---TTT-TTTAC-CAAG-ACCT--T--AT----TCTTGCT----GT--TAAGCAA--GACGACA-TAAA----TA-------C-A----T-ACGGTTACGTT-AT-AATTC
gi|158389 : ---T-C-CACT--TC-A-AA---TA-T---GTT-TTTAC-TTTG-ATAT--T--TT----TCTTG-T--A-GG--TAAGTCA--GACGTTA-TATA----TA-------A-A----T-ACATTGATGTC-AT-TATTCTGAC------GTA-A--C-----ATCTGTCTC-TTT-TTT
gi|158390 : -CACA--TC-ACAA---TA-TA--ATT-TCTAC-CCTG-ACCC--T--G------CAC--T--AAGG--TAAGCAT--TTCGTTA--AAA----AAGC-----T-A------ACATTGACGTC-AT-TAGTTTAAT------GTA-A--
gi|158391 : ACA--TC-A-AA---TA-TA--TTT-TGTAC-CCTG-GTCCTGT--TC----TCAT--A--A-AG--TAAGCAA--ATTATCC-TTAG----AA-------T-A----T-ACGGTGACGCC-AG-T-TTCTGAT------GTA-A--C-----ATCTAATTC-ATT-TTT
gi|158392 : --A-GG--TAAACAA--ATTGTCA-TAAA----AT-------C-A----C-ATGTTTATGTC-TT-TATCCTGAC------TTA-A--C-----GTCTCTCTC-CAT-TT
gi|158393 : -GG--TAAA-AA--GAAATCA-TGAA----TT-------C-A----C-ATGTTGATGTC-AT-TATTCTGAC------ATA-A--T-----GTCTAGCTC-TGT-TTT
gi|158394 : --GACGTCA-TGAA----AA-------G-A----T-ACGTTGTCGTC-ATATAT--TGAC------GCA-A--C-----GACTAGCTC-TAT-TT
Alignments
lowQualScore : 111111 2222222
lowQualScore : 1 222 444 11 1 2 2 2222 111 1 1 1 333333 2222 6666666 22 11 1 55555 4444444 1 555555 1 1 333333 1 11 33333 1 1
lowQualScore : . ... ... .. . . . .... ... . . . ...... .... ....... .. .. . ..... ....... . ...... . . ...... . .. ..... . .
lowQualScore : 2 000 333 55 1 2 2 5555 999 1 1 1 111111 3333 6666666 88 44 0 33333 9999999 1 555555 1 1 555555 2 77 33333 4 5
consensus : CACATTGTTTGTTTAAA-TAA---T-T-CACT--TC-A-AA-TATA-A--T---T-TTTAC-CCTG-ACCC--T--TT----TCNT--T--AGG--TAAGCAA--GACGTCA-TAAA----NA-------T-A----T-ACGTTGACGTC-AT-TATTCTGAC------GTA-A--C-----GTCTATCTC-TTT-TTT
Reference ( family-548 ) : CACATTGTTTGTTTAAA-TAA---T-T-CACT--TC-A-AA-TATA-A--T---T-TTTAC-CCTG-ACCC--T--TT----TCNT--T--AGG--TAAGCAA--GACGTCA-TAAA----NA-------T-A----T-ACGTTGACGTC-AT-TATTCTGAC------GTA-A--C-----GTCTATCTC-TTT-TTT
gi|158355 : CACATTGTTTGTTTAAA-TAA---T-T-CACT--TC-A-AA-TATA-A--T---T-TTTAC-TCTG-ATCT--T--TT----TCTTG-T--AGG--CAAGCAA--GACATCA-TAAA----TA-------T-A----T-ACATTGATGTC-AT-TATTCTGAC------GTA-A--A-----GTATTTATC-TTT-TTT
gi|158356 : CACATTGTTTGTTTAAA-TGA---T-T-CACT--TC-A-AA-TATA-T--A---T-TTTAC-TCTG-ACCT--T--TT----TCAT--T--AGG--TAAGCAA--GACGTCA-TAAA----TA-------T-A----T-ATGTTGACGTC-AT-TATTCTGAT------GTA-A--C-----GGCTATCTC-TTT-TTT
gi|158357 : CACAGTGTTTGTTTAAA-TAA---T-T-CACT--TC-A-AA-TATA-A--T---T-TTTAC-T-TGTATCT--T--TT----TTCT--TGAAGG--TAAGCAA--GACGTCG-TAAA----TA-------T-A----T-ACGTTGATGTC-AT-TATTCTGAC------GTA-A--C-----GTCTTTCTC-TTT-TTT
gi|158358 : CATATTGCTTGTTCAAA-CAA---T-A-CATT--TT-A-AA-TACA-A--T---A-TTTAC-CCTG-AC-------TTAGTGTCAC-----AGG---GAGCAA--AACGCCA-TAAA-----A-------T-A------ATGTTAACGTC-AT-TA
gi|158359 : CACATTGTTTGTTTAAA-TAA---T-T-TACT--TC-A-AA-TATA-A--T---T-TTTAC-TCTG-ACCT--T--TT----TCTTG-T--AGG--T----------CATCA-TAAA----TA-------T-A----T-ACATTGACGTC-AT-TTTTCTGAC------ATA-A--C-----GTCTATCTC-TTT-TTT
gi|158360 : CACATTGTTTATTTAAA-TAA---T-T-CACT--TC-A-AA-TTTA-G--T---T-TGTAC-CCTG-ACCC--T--GT----TCTTG-T--GGG--TAA-TAC--GACATCA-TAAA----CA-------A-A----T-ACATTGACCTC-AT-TATTCTGAC------GTA-A--T-----GTCCATCTC-TAT-TT
gi|158361 : CACAGTGTTTGTTTAAA-CAA---T-A-CACT--TC-A-AAATATA-A--TATTTATTTAT-CAAA-ACCC--T--GT----TCTCA-T--AGT--TAAGTGA--AACGTCA-TAAA-----A-------T-A----T-ACGTTGACGTC-AT-TATTCTGAC------GTA-A--C-----ATCTATCTA-TTT-TTT
gi|158362 : CACATTGTTTGTTTAAA-TAA---T-C-CACT--CC-A-AC-TATA-A--T---T-TTTAC-ACAG-ACCC--TG-TT----TTTG--T--AGG--TAAGCAA--GGCATCA-TAAA----TACAGAATCT-A----T-ATACTGACCTC-AT-TAT-------------------------GTCTATTTC-TTT-
gi|158363 : CATATTGCCTGTTCAAA-CAA---T-A-CACT--TT-A-AA-TATA----T---T-TTTAC-CCTG-ACGCA-G--TG----TCAT-----AGG---GAGCAA--AACGTCA-TAAA----AA-------T-A------ATGTAGACGTC-AT-TACTTTGAC------GTA-A--C-----GTCTATCTT-TTT-
gi|158364 : CATATTGCCTTTTCAAA-CAA---T-A-CACT--TT-T-AA-TATA-A--A---T-TTTAC-CCTG-ACCCAGT--GT----T-AT--A--AGG----AGCAA--AACGTCA-TAAA----AA-------T-A------ATGTTGACGTC-AT-TTTTCTGAC------GTA-A--C-----ATCTATCTT-TTT-
gi|158365 : CATATTGCCTGTTCAAA-CAA---T-T-CACT--TT-A-GA-TATA-A--T---T-TTTAC-CTTG-ACCC--T--GT----T-GT--C--AGG---GAGCCA--AACGTCA-TGGA----AA-------T-A------ATGTTGACGTT-AT-GACTCTGAC------GAA-A--C-----GGCTATC-C-TTT-
gi|158366 : CATATTGCCTGTTCAAA-CAA---T-A-CACT--TC-A-AA-TATA-A--T---T-TTTAC-CTTG-ACCCA-G--TG----TCA---T--AGG---GAGCAA--AACGTCA-TAAA----AA-------T-A------ATGTTGATGTC-AT-TACTCTGAC------ATATA--C-----G---ATACA-TTT-TTT
gi|158367 : CACGTTGTTCATTTGAA-TAA---T-T-AATT--TC-A-TA-TATA-A--T---T-TTTAC-TCTG-ACCC--T--GT----TCTCG-C--AGG--TAAGCAA--GACGTC----------CA-------T----------------GTC-AC-TATTCTGGC------GTA-T--CTCTTTATCTATTTC-TTT-TTT
gi|158368 : CACATTTTTTG----AA-TAA---T-T-CACT--TC-A-AA-TAT--A--T---T-TTTTC-ACTG-ACCC--TGATT----TCG---A--AAA--TAGGCAA--AACGTCA-TAAAATTGTA-------T-A----T-A
gi|158369 : CATATTACCTGTTCAGA-CAA---T-A-CAAT--TT-A-AA-TATA-A--G---T-TTTAT-CCTG-ACCCA-G--TG----TCA---T--AGG---GAGCAA--AACGTCA-TAAA----AA-------TAA----TGACA-TAACGGCTAT-TATTTTAA
gi|158370 : CACATTGTTTGGTTAAA-AAA---A-A-GACT--TCAA-AA-TATA-ATGT---T-TTTACTCTTG-------T--TG----TCG---T--AGG--TAAGCAA--GAC
gi|158371 : TTCTCTATCTAAA-TAA---T-A-CACT--TC-A-AT-TCTT-A--T---T-TTTAC-CCTG-ACCC--TG-TT----TTTG--T--AGGATTTAGTAAAGGACGGAA-TAA
gi|158372 : TGTTTGT--AAA-CAAGAAT-T-CACT--TC-G-AA-TATA----T---T-TTTAC-CTTG-ACCC--T--AT----TCTC--T--GGG--TTAGCAA--GACGTCA-TACA----TA-------T-A----T-ACGTTGACGTC-AT-TATTCTGAC------GTA-A--C-----GTCTGTCTC-TTT-TTT
gi|158373 : TGTTTGTTTGTA-TAA---T-A-CACT--TC-A-CA-TATA-A--T---G-TTTAC-CCTG-ACCC-------------AC--G--AG---TAAGCAA--GACGTCA-TATA----AA-------T-G----A-ACGTTGACGAC-AC-TATTCTGATGGTACAGTA-A--C-----GTCTATCTC-TTT-TTT
gi|158374 : TTTGTTTAAA-TTA---T-T-CACT--TC-A-AA-TATG-A--T---T-TTTAC-TCTG-ACCT--T--TT----TCTTA-T--AGG--TAAGCAA--GACGCCT-TAAA----TA-------C-A----T-ACGTTGACGTC-AT-TACTCTGAC------GCA-A--C-----GTCTATCTT-TTT-TTT
gi|158375 : TTTGTATAAA---A---T-T-CACT--TC-A-AA-TATA-A--T---T-TTTAC-TCTG-ACCT--T--TT----TCTTG-T--AGT--TAAGCAA--GATGTCA-TAAA----TG-------T-A----T-ACATTGGCTTC-AT-TATTCTGAC------GTA-A--C-----GGCTATCTC-TTT-TTT
gi|158376 : TTTGTTTAAA-TAA---T-T-CAAT--TC-A-AA-TATA-C--T---T-TCTAC-CCTG-ATCC--T--GT----TCTCG-T--AGG--TCAGCAG--GACGTCA-TAGA----AA-------T-A----T---GTTGACGCC-AA-TATTCTGAC------GTA-A--C-----GTCTATCTC-TTT-
gi|158377 : TTGTTTAAA-TAG---T-T-CACT--TC-A-TA-TATA-A--T---T-TTAAC-TCCG-ACCT--T--TT----TCTTG-T--AGG--TAAGCAA--GACGTCC-AAAA----TA-------T-AATTAT-ACGTTGACGTC-AT-TATTCTGAT------GTA-A--C-----ATCTATCTC-TTT-TTT
gi|158378 : TTGTTTAAA-TGA---T-T-CACT--TC-A-AA-TATA-A--T---T-TTTAC-TCTG-ACCT--T--TT----TCTTG-C--AGG--TAAGCAA--AACATCA-TAAA----AA-------T-A----T-ACGTTGACATC-AT-TTTTCTAAC------GTA-ATGT-----GTCTGTCT
gi|158379 : TTGTTCAAA-TAA---T-T-CACT--TC-A-AA-TATA-T--T---T-TTTAC-CCTG-ACCC--T--AT----TCTTA-T--AGA--TCAGCGA--GATGTCA-TAAA----TA-------T-A----T-CAGTTAAAGTC-AT-TATTCTGAC------CTA-A--C-----TTCGATCCC-TTT-TT
gi|158380 : TTGTTTAAA-TAA---T-T-CAAT--TC-A-AA-TATA-A--T---A-TTTAA-CCTG-ACCT--T--GT----TCTTG-T--ATG--TAAACCA--GACATCA-TAAA----TA-------T-A----A-ACTTTGACGTC-AT-TATTTTGAC------GTA-A--C-----GTCCAT
gi|158381 : TTGTTTTAA-TAA---T-A-GCCT--TA-A-AA-TATA-T--T---T-TTT-C-CTTG-ACTC--TGTTT----TCGT-----AGG--TAAGCCA--GATTTCC-TAGA----TA-------T-A----T-ACGTTGTCTTC-AT-TATTCTGAC------GTA-A--C-----GGCAAACTG-TTTATTT
gi|158382 : TTGTTTAAA-TAA---T-T-CACT--TC-A-AA-TATATA--T---T-TT--C-TCTG-ACTC--TAATT----TCTG--T---GG--TAGGCAC--AACATTA-TAGA----TA-------T-A----A-ATGTTGACGTC-AT-TATT
gi|158383 : TTGTTTCAA-TAA---TATATATT--TC-A-AAATATA-C--T---T-TTTAC-CAAG-ACCC--A--TT-----CAA--A--AAACATAAGCAG--GACATCA-TAAA----AT-------T-A----T-ACGTTTACATC-GT-TATTCTGAT------GAA-A--T-----ATCAATCTCATTT-TTT
gi|158384 : TGTCTAGA--AA---T-T-CACT--TC---AA-CATA-A--T---T-TCTAC-CCTG-ACAT--T--GT----TCTT--GA-AGG--TATGCAT--GACGTCA-TAAA----TA-------T-A----T-ACGCTGATGAC-AT-TATTCTGAC------ATA-A--C-----ATTTATTTT-T
gi|158385 : TATCTGAG-TAA---T---CACTATCC-A-AA-TATC-A--G---T-T--AC-CCTG-TCCC--C--GT----TCTCA-T--AGG--TAAGCAA--GAAGCCATTAAA----AA-------T-A----T----TTAACATT-AT-T-TTCTGAT------GT
gi|158386 : GTTTAAACTAG---T-T-CA-------A-AA-TATA-A--T---G-CTCAG-TCTG-ACCC--T--AT----TCACA-T--CGG--TAAATAA--GACGTCA-TACA----AG-------C-T----T-ACATTGACGTC-AT-CGTTCTAAC------GTA-A--A-----GTTTAACTC-T
gi|158387 : GTTCACA-TTA---T---CACT--TC-ACAA-TATA-A--T---T-TCTAC-CCTG-ACCC------T----GCAC--TA-AGG--TAAGCAT--TTCGTTA-AAAA----AG-------C-T----T-ACATTGACGTC-AT-TAGTTTAAT------ATA-A--
gi|158388 : TAAA-TA----T-T-CACT--TT-G-AA-TATT----T---T-TTTAC-CAAG-ACCT--T--AT----TCTTGCT---GT--TAAGCAA--GACGACA-TAAA----TA-------C-A----T-ACGGTTACGTT-AT-AATTC
gi|158389 : ---T-C-CACT--TC-A-AA-TAT--G--T---T-TTTAC-TTTG-ATAT--T--TT----TCTTG-T--AGG--TAAGTCA--GACGTTA-TATA----TA-------A-A----T-ACATTGATGTC-AT-TATTCTGAC------GTA-A--C-----ATCTGTCTC-TTT-TTT
gi|158390 : -CACA--TC-ACAA-TATA-A--T---T-TCTAC-CCTG-ACCC------T----GCAC--TA-AGG--TAAGCAT--TTCGTTA--AAA----AAGC-----T-A------ACATTGACGTC-AT-TAGTTTAAT------GTA-A--
gi|158391 : ACA--TC-A-AA-TATA-T--T---T-TGTAC-CCTG-GTCCTGT--TC----TCAT--A--AAG--TAAGCAA--ATTATCC-TTAG----AA-------T-A----T-ACGGTGACGCC-AG-T-TTCTGAT------GTA-A--C-----ATCTAATTC-ATT-TTT
gi|158392 : --AGG--TAAACAA--ATTGTCA-TAAA----AT-------C-A----C-ATGTTTATGTC-TT-TATCCTGAC------TTA-A--C-----GTCTCTCTC-CAT-TT
gi|158393 : GG--TAAA-AA--GAAATCA-TGAA----TT-------C-A----C-ATGTTGATGTC-AT-TATTCTGAC------ATA-A--T-----GTCTAGCTC-TGT-TTT
gi|158394 : --GACGTCA-TGAA----AA-------G-A----T-ACGTTGTCGTC-ATATAT--TGAC------GCA-A--C-----GACTAGCTC-TAT-TT
Alignments
lowQualScore : 111111 2222222
lowQualScore : 1 222 444 11 1 2 2 2222 111 1 1 1 333333 2222 6666666 22 11 1 55555 4444444 1 555555 1 1 333333 1 11 33333 1 1
lowQualScore : . ... ... .. . . . .... ... . . . ...... .... ....... .. .. . ..... ....... . ...... . . ...... . .. ..... . .
lowQualScore : 2 000 333 55 1 2 2 5555 999 1 1 1 111111 3333 6666666 88 44 0 33333 9999999 1 555555 1 1 555555 2 77 33333 4 5
consensus : CACATTGTTTGTTTAAA-TAA---T-T-CACT--TC-A-AA-TATA-A--T---T-TTTAC-CCTG-ACCC--T--TT----TCNT--T--AGG--TAAGCAA--GACGTCA-TAAA----NA-------T-A----T-ACGTTGACGTC-AT-TATTCTGAC------GTA-A--C-----GTCTATCTC-TTT-TTT
Reference ( family-548 ) : CACATTGTTTGTTTAAA-TAA---T-T-CACT--TC-A-AA-TATA-A--T---T-TTTAC-CCTG-ACCC--T--TT----TCNT--T--AGG--TAAGCAA--GACGTCA-TAAA----NA-------T-A----T-ACGTTGACGTC-AT-TATTCTGAC------GTA-A--C-----GTCTATCTC-TTT-TTT
gi|158355 : CACATTGTTTGTTTAAA-TAA---T-T-CACT--TC-A-AA-TATA-A--T---T-TTTAC-TCTG-ATCT--T--TT----TCTTG-T--AGG--CAAGCAA--GACATCA-TAAA----TA-------T-A----T-ACATTGATGTC-AT-TATTCTGAC------GTA-A--A-----GTATTTATC-TTT-TTT
gi|158356 : CACATTGTTTGTTTAAA-TGA---T-T-CACT--TC-A-AA-TATA-T--A---T-TTTAC-TCTG-ACCT--T--TT----TCAT--T--AGG--TAAGCAA--GACGTCA-TAAA----TA-------T-A----T-ATGTTGACGTC-AT-TATTCTGAT------GTA-A--C-----GGCTATCTC-TTT-TTT
gi|158357 : CACAGTGTTTGTTTAAA-TAA---T-T-CACT--TC-A-AA-TATA-A--T---T-TTTAC-T-TGTATCT--T--TT----TTCT--TGAAGG--TAAGCAA--GACGTCG-TAAA----TA-------T-A----T-ACGTTGATGTC-AT-TATTCTGAC------GTA-A--C-----GTCTTTCTC-TTT-TTT
gi|158358 : CATATTGCTTGTTCAAA-CAA---T-A-CATT--TT-A-AA-TACA-A--T---A-TTTAC-CCTG-AC-------TTAGTGTCAC-----AGG---GAGCAA--AACGCCA-TAAA-----A-------T-A------ATGTTAACGTC-AT-TA
gi|158359 : CACATTGTTTGTTTAAA-TAA---T-T-TACT--TC-A-AA-TATA-A--T---T-TTTAC-TCTG-ACCT--T--TT----TCTTG-T--AGG--T----------CATCA-TAAA----TA-------T-A----T-ACATTGACGTC-AT-TTTTCTGAC------ATA-A--C-----GTCTATCTC-TTT-TTT
gi|158360 : CACATTGTTTATTTAAA-TAA---T-T-CACT--TC-A-AA-TTTA-G--T---T-TGTAC-CCTG-ACCC--T--GT----TCTTG-T--GGG--TAA-TAC--GACATCA-TAAA----CA-------A-A----T-ACATTGACCTC-AT-TATTCTGAC------GTA-A--T-----GTCCATCTC-TAT-TT
gi|158361 : CACAGTGTTTGTTTAAA-CAA---T-A-CACT--TC-A-AAATATA-A--TATTTATTTAT-CAAA-ACCC--T--GT----TCTCA-T--AGT--TAAGTGA--AACGTCA-TAAA-----A-------T-A----T-ACGTTGACGTC-AT-TATTCTGAC------GTA-A--C-----ATCTATCTA-TTT-TTT
gi|158362 : CACATTGTTTGTTTAAA-TAA---T-C-CACT--CC-A-AC-TATA-A--T---T-TTTAC-ACAG-ACCC--TG-TT----TTTG--T--AGG--TAAGCAA--GGCATCA-TAAA----TACAGAATCT-A----T-ATACTGACCTC-AT-TAT-------------------------GTCTATTTC-TTT-
gi|158363 : CATATTGCCTGTTCAAA-CAA---T-A-CACT--TT-A-AA-TATA----T---T-TTTAC-CCTG-ACGCA-G--TG----TCAT-----AGG---GAGCAA--AACGTCA-TAAA----AA-------T-A------ATGTAGACGTC-AT-TACTTTGAC------GTA-A--C-----GTCTATCTT-TTT-
gi|158364 : CATATTGCCTTTTCAAA-CAA---T-A-CACT--TT-T-AA-TATA-A--A---T-TTTAC-CCTG-ACCCAGT--GT----T-AT--A--AGG----AGCAA--AACGTCA-TAAA----AA-------T-A------ATGTTGACGTC-AT-TTTTCTGAC------GTA-A--C-----ATCTATCTT-TTT-
gi|158365 : CATATTGCCTGTTCAAA-CAA---T-T-CACT--TT-A-GA-TATA-A--T---T-TTTAC-CTTG-ACCC--T--GT----T-GT--C--AGG---GAGCCA--AACGTCA-TGGA----AA-------T-A------ATGTTGACGTT-AT-GACTCTGAC------GAA-A--C-----GGCTATC-C-TTT-
gi|158366 : CATATTGCCTGTTCAAA-CAA---T-A-CACT--TC-A-AA-TATA-A--T---T-TTTAC-CTTG-ACCCA-G--TG----TCA---T--AGG---GAGCAA--AACGTCA-TAAA----AA-------T-A------ATGTTGATGTC-AT-TACTCTGAC------ATATA--C-----G---ATACA-TTT-TTT
gi|158367 : CACGTTGTTCATTTGAA-TAA---T-T-AATT--TC-A-TA-TATA-A--T---T-TTTAC-TCTG-ACCC--T--GT----TCTCG-C--AGG--TAAGCAA--GACGTC----------CA-------T----------------GTC-AC-TATTCTGGC------GTA-T--CTCTTTATCTATTTC-TTT-TTT
gi|158368 : CACATTTTTTG----AA-TAA---T-T-CACT--TC-A-AA-TAT--A--T---T-TTTTC-ACTG-ACCC--TGATT----TCG---A--AAA--TAGGCAA--AACGTCA-TAAAATTGTA-------T-A----T-A
gi|158369 : CATATTACCTGTTCAGA-CAA---T-A-CAAT--TT-A-AA-TATA-A--G---T-TTTAT-CCTG-ACCCA-G--TG----TCA---T--AGG---GAGCAA--AACGTCA-TAAA----AA-------TAA----TGACA-TAACGGCTAT-TATTTTAA
gi|158370 : CACATTGTTTGGTTAAA-AAA---A-A-GACT--TCAA-AA-TATA-ATGT---T-TTTACTCTTG-------T--TG----TCG---T--AGG--TAAGCAA--GAC
gi|158371 : TTCTCTATCTAAA-TAA---T-A-CACT--TC-A-AT-TCTT-A--T---T-TTTAC-CCTG-ACCC--TG-TT----TTTG--T--AGGATTTAGTAAAGGACGGAA-TAA
gi|158372 : TGTTTGT--AAA-CAAGAAT-T-CACT--TC-G-AA-TATA----T---T-TTTAC-CTTG-ACCC--T--AT----TCTC--T--GGG--TTAGCAA--GACGTCA-TACA----TA-------T-A----T-ACGTTGACGTC-AT-TATTCTGAC------GTA-A--C-----GTCTGTCTC-TTT-TTT
gi|158373 : TGTTTGTTTGTA-TAA---T-A-CACT--TC-A-CA-TATA-A--T---G-TTTAC-CCTG-ACCC-------------AC--G--AG---TAAGCAA--GACGTCA-TATA----AA-------T-G----A-ACGTTGACGAC-AC-TATTCTGATGGTACAGTA-A--C-----GTCTATCTC-TTT-TTT
gi|158374 : TTTGTTTAAA-TTA---T-T-CACT--TC-A-AA-TATG-A--T---T-TTTAC-TCTG-ACCT--T--TT----TCTTA-T--AGG--TAAGCAA--GACGCCT-TAAA----TA-------C-A----T-ACGTTGACGTC-AT-TACTCTGAC------GCA-A--C-----GTCTATCTT-TTT-TTT
gi|158375 : TTTGTATAAA---A---T-T-CACT--TC-A-AA-TATA-A--T---T-TTTAC-TCTG-ACCT--T--TT----TCTTG-T--AGT--TAAGCAA--GATGTCA-TAAA----TG-------T-A----T-ACATTGGCTTC-AT-TATTCTGAC------GTA-A--C-----GGCTATCTC-TTT-TTT
gi|158376 : TTTGTTTAAA-TAA---T-T-CAAT--TC-A-AA-TATA-C--T---T-TCTAC-CCTG-ATCC--T--GT----TCTCG-T--AGG--TCAGCAG--GACGTCA-TAGA----AA-------T-A----T---GTTGACGCC-AA-TATTCTGAC------GTA-A--C-----GTCTATCTC-TTT-
gi|158377 : TTGTTTAAA-TAG---T-T-CACT--TC-A-TA-TATA-A--T---T-TTAAC-TCCG-ACCT--T--TT----TCTTG-T--AGG--TAAGCAA--GACGTCC-AAAA----TA-------T-AATTAT-ACGTTGACGTC-AT-TATTCTGAT------GTA-A--C-----ATCTATCTC-TTT-TTT
gi|158378 : TTGTTTAAA-TGA---T-T-CACT--TC-A-AA-TATA-A--T---T-TTTAC-TCTG-ACCT--T--TT----TCTTG-C--AGG--TAAGCAA--AACATCA-TAAA----AA-------T-A----T-ACGTTGACATC-AT-TTTTCTAAC------GTA-ATGT-----GTCTGTCT
gi|158379 : TTGTTCAAA-TAA---T-T-CACT--TC-A-AA-TATA-T--T---T-TTTAC-CCTG-ACCC--T--AT----TCTTA-T--AGA--TCAGCGA--GATGTCA-TAAA----TA-------T-A----T-CAGTTAAAGTC-AT-TATTCTGAC------CTA-A--C-----TTCGATCCC-TTT-TT
gi|158380 : TTGTTTAAA-TAA---T-T-CAAT--TC-A-AA-TATA-A--T---A-TTTAA-CCTG-ACCT--T--GT----TCTTG-T--ATG--TAAACCA--GACATCA-TAAA----TA-------T-A----A-ACTTTGACGTC-AT-TATTTTGAC------GTA-A--C-----GTCCAT
gi|158381 : TTGTTTTAA-TAA---T-A-GCCT--TA-A-AA-TATA-T--T---T-TTT-C-CTTG-ACTC--TGTTT----TCGT-----AGG--TAAGCCA--GATTTCC-TAGA----TA-------T-A----T-ACGTTGTCTTC-AT-TATTCTGAC------GTA-A--C-----GGCAAACTG-TTTATTT
gi|158382 : TTGTTTAAA-TAA---T-T-CACT--TC-A-AA-TATATA--T---T-TT--C-TCTG-ACTC--TAATT----TCTG--T---GG--TAGGCAC--AACATTA-TAGA----TA-------T-A----A-ATGTTGACGTC-AT-TATT
gi|158383 : TTGTTTCAA-TAA---TATATATT--TC-A-AAATATA-C--T---T-TTTAC-CAAG-ACCC--A--TT-----CAA--A--AAACATAAGCAG--GACATCA-TAAA----AT-------T-A----T-ACGTTTACATC-GT-TATTCTGAT------GAA-A--T-----ATCAATCTCATTT-TTT
gi|158384 : TGTCTAGA--AA---T-T-CACT--TC---AA-CATA-A--T---T-TCTAC-CCTG-ACAT--T--GT----TCTT--GA-AGG--TATGCAT--GACGTCA-TAAA----TA-------T-A----T-ACGCTGATGAC-AT-TATTCTGAC------ATA-A--C-----ATTTATTTT-T
gi|158385 : TATCTGAG-TAA---T---CACTATCC-A-AA-TATC-A--G---T-T--AC-CCTG-TCCC--C--GT----TCTCA-T--AGG--TAAGCAA--GAAGCCATTAAA----AA-------T-A----T----TTAACATT-AT-T-TTCTGAT------GT
gi|158386 : GTTTAAACTAG---T-T-CA-------A-AA-TATA-A--T---G-CTCAG-TCTG-ACCC--T--AT----TCACA-T--CGG--TAAATAA--GACGTCA-TACA----AG-------C-T----T-ACATTGACGTC-AT-CGTTCTAAC------GTA-A--A-----GTTTAACTC-T
gi|158387 : GTTCACA-TTA---T---CACT--TC-ACAA-TATA-A--T---T-TCTAC-CCTG-ACCC------T----GCAC--TA-AGG--TAAGCAT--TTCGTTA-AAAA----AG-------C-T----T-ACATTGACGTC-AT-TAGTTTAAT------ATA-A--
gi|158388 : TAAA-TA----T-T-CACT--TT-G-AA-TATT----T---T-TTTAC-CAAG-ACCT--T--AT----TCTTGCT---GT--TAAGCAA--GACGACA-TAAA----TA-------C-A----T-ACGGTTACGTT-AT-AATTC
gi|158389 : ---T-C-CACT--TC-A-AA-TAT--G--T---T-TTTAC-TTTG-ATAT--T--TT----TCTTG-T--AGG--TAAGTCA--GACGTTA-TATA----TA-------A-A----T-ACATTGATGTC-AT-TATTCTGAC------GTA-A--C-----ATCTGTCTC-TTT-TTT
gi|158390 : -CACA--TC-ACAA-TATA-A--T---T-TCTAC-CCTG-ACCC------T----GCAC--TA-AGG--TAAGCAT--TTCGTTA--AAA----AAGC-----T-A------ACATTGACGTC-AT-TAGTTTAAT------GTA-A--
gi|158391 : ACA--TC-A-AA-TATA-T--T---T-TGTAC-CCTG-GTCCTGT--TC----TCAT--A--AAG--TAAGCAA--ATTATCC-TTAG----AA-------T-A----T-ACGGTGACGCC-AG-T-TTCTGAT------GTA-A--C-----ATCTAATTC-ATT-TTT
gi|158392 : --AGG--TAAACAA--ATTGTCA-TAAA----AT-------C-A----C-ATGTTTATGTC-TT-TATCCTGAC------TTA-A--C-----GTCTCTCTC-CAT-TT
gi|158393 : GG--TAAA-AA--GAAATCA-TGAA----TT-------C-A----C-ATGTTGATGTC-AT-TATTCTGAC------ATA-A--T-----GTCTAGCTC-TGT-TTT
gi|158394 : --GACGTCA-TGAA----AA-------G-A----T-ACGTTGTCGTC-ATATAT--TGAC------GCA-A--C-----GACTAGCTC-TAT-TT
blockSeqs : C GAA ATA AT A C A ATG ATT A T T AGTG AGTG CTTGA AT AG T ATTGT CAGAATC A ATTAT T A GGTACA T TG TCTTT A A
blockSeqs : . . T . . C A TA . . . . TGAT . TTGCT CA . . T GC . TG . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . T . . . . TGTT . TTGT . . . T . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . A . . . . TAAT . TTGT . . . T . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . A . . . . TGTT . TCAT . . . C . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . A . . . . TGT . TCGC . . . T . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . G . . . . AGT . TTAT . . . A . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . C . . . . A . . . . AGT . TTGT . . . A . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . A . . . . AGT . TCGT . . . A . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . A . . . . TGT . TTGT . . . A . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . A . . . . TT . TTGC . . . C . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . A . . . . TT . TTAT . . . A . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . A . . . . TT . TTGT . . . T . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . A . . . . TG . TTGA . . . A . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . A . . . . TG . TCAT . . . T . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . A . . . . TG . ACAT . . . T . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . A . . . . TG . ACTA . . . A . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . A . . . . TT . TTGT . . . T . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . A . . . . TA . ACTA . . . A . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . C . . . . TT . ATT . . . T . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . A . . . . TT . TGT . . . T . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . A . . . . TG . ATA . . . T . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . T . . . . TT . GTC . . . T . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . A . . . . TT . TGT . . . A . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . T . . . . TA . TCT . . . T . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . C . . . . TG . ACG . . . A . . T . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . A . . . . AT . TGT . . . A . . T . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . A . . . . TG . AAA . . . A . . C . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . A . . . . CG . ATA . . . T . . C . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . A . . . . TA . AC . . . T . . T . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . G . . . . TA . AT . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . C . . . . A . . . . TT . AT . . . A . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . . T . GA . . . A . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . AT . . . T . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . GT . . . A . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . GT . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : .
blockSeqCons :
originalCons : CACATTGTTTGTTTAAA-TAA---T-T-CACT--TC-A-AA-TATA-A--T---T-TTTAC-CCTG-ACCC--T--TT----TCNT--T--AGG--TAAGCAA--GACGTCA-TAAA----NA-------T-A----T-ACGTTGACGTC-AT-TATTCTGAC------GTA-A--C-----GTCTATCTC-TTT-TTT
finalCons : CACATTGTTTGTTTAAA-TAA---T-T-CACT--TC-A-AA-TATA-A--T---T-TTTAC-CCTG-ACCC--T--TT----TCNT--T--AGG--TAAGCAA--GACGTCA-TAAA----NA-------T-A----T-ACGTTGACGTC-AT-TATTCTGAC------GTA-A--C-----GTCTATCTC-TTT-TTT
Alignments
lowQualScore : 111111 2222222
lowQualScore : 1 222 444 11 1 2 2 2222 111 1 1 1 333333 2222 6666666 22 11 1 55555 4444444 1 555555 1 1 333333 1 11 33333 1 1
lowQualScore : . ... ... .. . . . .... ... . . . ...... .... ....... .. .. . ..... ....... . ...... . . ...... . .. ..... . .
lowQualScore : 2 000 333 55 1 2 2 5555 999 1 1 1 111111 3333 6666666 88 44 0 33333 9999999 1 555555 1 1 555555 2 77 33333 4 5
consensus : CACATTGTTTGTTTAAA-TAA---T-T-CACT--TC-A-AA-TATA-A--T---T-TTTAC-CCTG-ACCC--T--TT----TCNT--T--AGG--TAAGCAA--GACGTCA-TAAA----NA-------T-A----T-ACGTTGACGTC-AT-TATTCTGAC------GTA-A--C-----GTCTATCTC-TTT-TTT
Reference ( family-548 ) : CACATTGTTTGTTTAAA-TAA---T-T-CACT--TC-A-AA-TATA-A--T---T-TTTAC-CCTG-ACCC--T--TT----TCNT--T--AGG--TAAGCAA--GACGTCA-TAAA----NA-------T-A----T-ACGTTGACGTC-AT-TATTCTGAC------GTA-A--C-----GTCTATCTC-TTT-TTT
gi|158355 : CACATTGTTTGTTTAAA-TAA---T-T-CACT--TC-A-AA-TATA-A--T---T-TTTAC-TCTG-ATCT--T--TT----TCTTG-T--AGG--CAAGCAA--GACATCA-TAAA----TA-------T-A----T-ACATTGATGTC-AT-TATTCTGAC------GTA-A--A-----GTATTTATC-TTT-TTT
gi|158356 : CACATTGTTTGTTTAAA-TGA---T-T-CACT--TC-A-AA-TATA-T--A---T-TTTAC-TCTG-ACCT--T--TT----TCAT--T--AGG--TAAGCAA--GACGTCA-TAAA----TA-------T-A----T-ATGTTGACGTC-AT-TATTCTGAT------GTA-A--C-----GGCTATCTC-TTT-TTT
gi|158357 : CACAGTGTTTGTTTAAA-TAA---T-T-CACT--TC-A-AA-TATA-A--T---T-TTTAC-T-TGTATCT--T--TT----TTCT--TGAAGG--TAAGCAA--GACGTCG-TAAA----TA-------T-A----T-ACGTTGATGTC-AT-TATTCTGAC------GTA-A--C-----GTCTTTCTC-TTT-TTT
gi|158358 : CATATTGCTTGTTCAAA-CAA---T-A-CATT--TT-A-AA-TACA-A--T---A-TTTAC-CCTG-AC-------TTAGTGTCAC-----AGG---GAGCAA--AACGCCA-TAAA-----A-------T-A------ATGTTAACGTC-AT-TA
gi|158359 : CACATTGTTTGTTTAAA-TAA---T-T-TACT--TC-A-AA-TATA-A--T---T-TTTAC-TCTG-ACCT--T--TT----TCTTG-T--AGG--T----------CATCA-TAAA----TA-------T-A----T-ACATTGACGTC-AT-TTTTCTGAC------ATA-A--C-----GTCTATCTC-TTT-TTT
gi|158360 : CACATTGTTTATTTAAA-TAA---T-T-CACT--TC-A-AA-TTTA-G--T---T-TGTAC-CCTG-ACCC--T--GT----TCTTG-T--GGG--TAA-TAC--GACATCA-TAAA----CA-------A-A----T-ACATTGACCTC-AT-TATTCTGAC------GTA-A--T-----GTCCATCTC-TAT-TT
gi|158361 : CACAGTGTTTGTTTAAA-CAA---T-A-CACT--TC-A-AAATATA-A--TATTTATTTAT-CAAA-ACCC--T--GT----TCTCA-T--AGT--TAAGTGA--AACGTCA-TAAA-----A-------T-A----T-ACGTTGACGTC-AT-TATTCTGAC------GTA-A--C-----ATCTATCTA-TTT-TTT
gi|158362 : CACATTGTTTGTTTAAA-TAA---T-C-CACT--CC-A-AC-TATA-A--T---T-TTTAC-ACAG-ACCC--TG-TT----TTTG--T--AGG--TAAGCAA--GGCATCA-TAAA----TACAGAATCT-A----T-ATACTGACCTC-AT-TAT-------------------------GTCTATTTC-TTT-
gi|158363 : CATATTGCCTGTTCAAA-CAA---T-A-CACT--TT-A-AA-TATA----T---T-TTTAC-CCTG-ACGCA-G--TG----TCAT-----AGG---GAGCAA--AACGTCA-TAAA----AA-------T-A------ATGTAGACGTC-AT-TACTTTGAC------GTA-A--C-----GTCTATCTT-TTT-
gi|158364 : CATATTGCCTTTTCAAA-CAA---T-A-CACT--TT-T-AA-TATA-A--A---T-TTTAC-CCTG-ACCCAGT--GT----T-AT--A--AGG----AGCAA--AACGTCA-TAAA----AA-------T-A------ATGTTGACGTC-AT-TTTTCTGAC------GTA-A--C-----ATCTATCTT-TTT-
gi|158365 : CATATTGCCTGTTCAAA-CAA---T-T-CACT--TT-A-GA-TATA-A--T---T-TTTAC-CTTG-ACCC--T--GT----T-GT--C--AGG---GAGCCA--AACGTCA-TGGA----AA-------T-A------ATGTTGACGTT-AT-GACTCTGAC------GAA-A--C-----GGCTATC-C-TTT-
gi|158366 : CATATTGCCTGTTCAAA-CAA---T-A-CACT--TC-A-AA-TATA-A--T---T-TTTAC-CTTG-ACCCA-G--TG----TCA---T--AGG---GAGCAA--AACGTCA-TAAA----AA-------T-A------ATGTTGATGTC-AT-TACTCTGAC------ATATA--C-----G---ATACA-TTT-TTT
gi|158367 : CACGTTGTTCATTTGAA-TAA---T-T-AATT--TC-A-TA-TATA-A--T---T-TTTAC-TCTG-ACCC--T--GT----TCTCG-C--AGG--TAAGCAA--GACGTC----------CA-------T----------------GTC-AC-TATTCTGGC------GTA-T--CTCTTTATCTATTTC-TTT-TTT
gi|158368 : CACATTTTTTG----AA-TAA---T-T-CACT--TC-A-AA-TAT--A--T---T-TTTTC-ACTG-ACCC--TGATT----TCG---A--AAA--TAGGCAA--AACGTCA-TAAAATTGTA-------T-A----T-A
gi|158369 : CATATTACCTGTTCAGA-CAA---T-A-CAAT--TT-A-AA-TATA-A--G---T-TTTAT-CCTG-ACCCA-G--TG----TCA---T--AGG---GAGCAA--AACGTCA-TAAA----AA-------TAA----TGACA-TAACGGCTAT-TATTTTAA
gi|158370 : CACATTGTTTGGTTAAA-AAA---A-A-GACT--TCAA-AA-TATA-ATGT---T-TTTACTCTTG-------T--TG----TCG---T--AGG--TAAGCAA--GAC
gi|158371 : TTCTCTATCTAAA-TAA---T-A-CACT--TC-A-AT-TCTT-A--T---T-TTTAC-CCTG-ACCC--TG-TT----TTTG--T--AGGATTTAGTAAAGGACGGAA-TAA
gi|158372 : TGTTTGT--AAA-CAAGAAT-T-CACT--TC-G-AA-TATA----T---T-TTTAC-CTTG-ACCC--T--AT----TCTC--T--GGG--TTAGCAA--GACGTCA-TACA----TA-------T-A----T-ACGTTGACGTC-AT-TATTCTGAC------GTA-A--C-----GTCTGTCTC-TTT-TTT
gi|158373 : TGTTTGTTTGTA-TAA---T-A-CACT--TC-A-CA-TATA-A--T---G-TTTAC-CCTG-ACCC-------------AC--G--AG---TAAGCAA--GACGTCA-TATA----AA-------T-G----A-ACGTTGACGAC-AC-TATTCTGATGGTACAGTA-A--C-----GTCTATCTC-TTT-TTT
gi|158374 : TTTGTTTAAA-TTA---T-T-CACT--TC-A-AA-TATG-A--T---T-TTTAC-TCTG-ACCT--T--TT----TCTTA-T--AGG--TAAGCAA--GACGCCT-TAAA----TA-------C-A----T-ACGTTGACGTC-AT-TACTCTGAC------GCA-A--C-----GTCTATCTT-TTT-TTT
gi|158375 : TTTGTATAAA---A---T-T-CACT--TC-A-AA-TATA-A--T---T-TTTAC-TCTG-ACCT--T--TT----TCTTG-T--AGT--TAAGCAA--GATGTCA-TAAA----TG-------T-A----T-ACATTGGCTTC-AT-TATTCTGAC------GTA-A--C-----GGCTATCTC-TTT-TTT
gi|158376 : TTTGTTTAAA-TAA---T-T-CAAT--TC-A-AA-TATA-C--T---T-TCTAC-CCTG-ATCC--T--GT----TCTCG-T--AGG--TCAGCAG--GACGTCA-TAGA----AA-------T-A----T---GTTGACGCC-AA-TATTCTGAC------GTA-A--C-----GTCTATCTC-TTT-
gi|158377 : TTGTTTAAA-TAG---T-T-CACT--TC-A-TA-TATA-A--T---T-TTAAC-TCCG-ACCT--T--TT----TCTTG-T--AGG--TAAGCAA--GACGTCC-AAAA----TA-------T-AATTAT-ACGTTGACGTC-AT-TATTCTGAT------GTA-A--C-----ATCTATCTC-TTT-TTT
gi|158378 : TTGTTTAAA-TGA---T-T-CACT--TC-A-AA-TATA-A--T---T-TTTAC-TCTG-ACCT--T--TT----TCTTG-C--AGG--TAAGCAA--AACATCA-TAAA----AA-------T-A----T-ACGTTGACATC-AT-TTTTCTAAC------GTA-ATGT-----GTCTGTCT
gi|158379 : TTGTTCAAA-TAA---T-T-CACT--TC-A-AA-TATA-T--T---T-TTTAC-CCTG-ACCC--T--AT----TCTTA-T--AGA--TCAGCGA--GATGTCA-TAAA----TA-------T-A----T-CAGTTAAAGTC-AT-TATTCTGAC------CTA-A--C-----TTCGATCCC-TTT-TT
gi|158380 : TTGTTTAAA-TAA---T-T-CAAT--TC-A-AA-TATA-A--T---A-TTTAA-CCTG-ACCT--T--GT----TCTTG-T--ATG--TAAACCA--GACATCA-TAAA----TA-------T-A----A-ACTTTGACGTC-AT-TATTTTGAC------GTA-A--C-----GTCCAT
gi|158381 : TTGTTTTAA-TAA---T-A-GCCT--TA-A-AA-TATA-T--T---T-TTT-C-CTTG-ACTC--TGTTT----TCGT-----AGG--TAAGCCA--GATTTCC-TAGA----TA-------T-A----T-ACGTTGTCTTC-AT-TATTCTGAC------GTA-A--C-----GGCAAACTG-TTTATTT
gi|158382 : TTGTTTAAA-TAA---T-T-CACT--TC-A-AA-TATATA--T---T-TT--C-TCTG-ACTC--TAATT----TCTG--T---GG--TAGGCAC--AACATTA-TAGA----TA-------T-A----A-ATGTTGACGTC-AT-TATT
gi|158383 : TTGTTTCAA-TAA---TATATATT--TC-A-AAATATA-C--T---T-TTTAC-CAAG-ACCC--A--TT-----CAA--A--AAACATAAGCAG--GACATCA-TAAA----AT-------T-A----T-ACGTTTACATC-GT-TATTCTGAT------GAA-A--T-----ATCAATCTCATTT-TTT
gi|158384 : TGTCTAGA--AA---T-T-CACT--TC---AA-CATA-A--T---T-TCTAC-CCTG-ACAT--T--GT----TCTT--GA-AGG--TATGCAT--GACGTCA-TAAA----TA-------T-A----T-ACGCTGATGAC-AT-TATTCTGAC------ATA-A--C-----ATTTATTTT-T
gi|158385 : TATCTGAG-TAA---T---CACTATCC-A-AA-TATC-A--G---T-T--AC-CCTG-TCCC--C--GT----TCTCA-T--AGG--TAAGCAA--GAAGCCATTAAA----AA-------T-A----T----TTAACATT-AT-T-TTCTGAT------GT
gi|158386 : GTTTAAACTAG---T-T-CA-------A-AA-TATA-A--T---G-CTCAG-TCTG-ACCC--T--AT----TCACA-T--CGG--TAAATAA--GACGTCA-TACA----AG-------C-T----T-ACATTGACGTC-AT-CGTTCTAAC------GTA-A--A-----GTTTAACTC-T
gi|158387 : GTTCACA-TTA---T---CACT--TC-ACAA-TATA-A--T---T-TCTAC-CCTG-ACCC------T----GCAC--TA-AGG--TAAGCAT--TTCGTTA-AAAA----AG-------C-T----T-ACATTGACGTC-AT-TAGTTTAAT------ATA-A--
gi|158388 : TAAA-TA----T-T-CACT--TT-G-AA-TATT----T---T-TTTAC-CAAG-ACCT--T--AT----TCTTGCT---GT--TAAGCAA--GACGACA-TAAA----TA-------C-A----T-ACGGTTACGTT-AT-AATTC
gi|158389 : ---T-C-CACT--TC-A-AA-TAT--G--T---T-TTTAC-TTTG-ATAT--T--TT----TCTTG-T--AGG--TAAGTCA--GACGTTA-TATA----TA-------A-A----T-ACATTGATGTC-AT-TATTCTGAC------GTA-A--C-----ATCTGTCTC-TTT-TTT
gi|158390 : -CACA--TC-ACAA-TATA-A--T---T-TCTAC-CCTG-ACCC------T----GCAC--TA-AGG--TAAGCAT--TTCGTTA--AAA----AAGC-----T-A------ACATTGACGTC-AT-TAGTTTAAT------GTA-A--
gi|158391 : ACA--TC-A-AA-TATA-T--T---T-TGTAC-CCTG-GTCCTGT--TC----TCAT--A--AAG--TAAGCAA--ATTATCC-TTAG----AA-------T-A----T-ACGGTGACGCC-AG-T-TTCTGAT------GTA-A--C-----ATCTAATTC-ATT-TTT
gi|158392 : --AGG--TAAACAA--ATTGTCA-TAAA----AT-------C-A----C-ATGTTTATGTC-TT-TATCCTGAC------TTA-A--C-----GTCTCTCTC-CAT-TT
gi|158393 : GG--TAAA-AA--GAAATCA-TGAA----TT-------C-A----C-ATGTTGATGTC-AT-TATTCTGAC------ATA-A--T-----GTCTAGCTC-TGT-TTT
gi|158394 : --GACGTCA-TGAA----AA-------G-A----T-ACGTTGTCGTC-ATATAT--TGAC------GCA-A--C-----GACTAGCTC-TAT-TT