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lowQualScore                  :   .          ...           .  . .         ....       .  .. ..  ..  .   .  .. ....   .....  .  ...... ..  . ...   ... ......     ........  ............   ..   . ....  ....  ... .... .....  ...... ....  ....  ......................  .. .. ..  ...  . ...   . .             ... ... .... . ...  .....    ..  ...     .     .. .....     .     ...  ........     ....        . . .    .   
lowQualScore                  :   9          333           6  7 6         6666       5  11 88  44  0   0  44 6666   66666  0  111111 44  0 888   888 000000     00000000  999999999999   55   1 3333  4444  444 4444 11111  444444 4444  1111  9999999999999999999999  66 11 66  999  1 444   1 9             999 999 2222 1 999  88888    99  333     2     77 88888     7     444  66666666     4444        6 9 9    5   
consensus                     : TAATTGTTCTACC---CTCTTTGCAAGGAA-TTTGTACAACA----GGACCAC-TAGAAT-TG--AA-GAA-AA--TG---GCA-----TA-TA-A----A--AC-C---TTC---T------TGGCG--------CT--------T-C-TTG--TCC-T----CT----TT---G----C----TAT------G----AC----CGGC-------CT---A---GC--CT--G--A--TT---TT-T-A-CCA-AGCCATTGTTTGTTA---T---T--G-A-CGCGCC-G---TTGG--GG--CTCGAA-ATAAT--AN----ACCCANGTTTC---AT-CCC----CAGTG----AGCAAGTC-A-G-AAAT-TTT
Reference ( gi|162145 )       : TACTTGTTCTACC---CTCTTTGCAAGAAA-TGTGTACAACA----GGACCAC-TAGTAC-TG--AA-GAA-AA--TG---GCA-----TA-TA-A----A--AC-C---TTC---T------TGGCA--------CT--------T-C-TTG--TCC-T----CT----TT---G----C----TAT------G----AC----CGAC-------CT---A---GC--CT--G--A--TT---TT-T-A-CCA-AGCCATTGTTTGTTA---T---T--G-A-TGTGTC-G---TTGG--GG--TTCAAA-ATAAT--AA----ACCCAAGTTTC---AT-TCG----CAGTG----AGCAAGTC-A-G-AAAT-TTT
gi|162146                     : TAATTGTTCTACC---CTCTTTCCAAGAAA-TTTGTACAACG----TGACTAC-TATAAT-TG--AA-GAA-AA--TG---GCA-----TA-TA-A----A--AC-C---TTC---T------TGGTG--------CT--------T-C-TTG--TCC-T----CT----TT---G----C----TAT------G----AC----CGAC-------CT---A---GC--CT--G--A--TT---TT-T-A-CTA-AGCCATTGTTTGTCA---T---T--G-A-TGTGCC-G---TTGG--GG--CTCGAA-GTAAT--AA----ACTCAAGTTTC---AT-CCC----CAGTG----AGCAAGTC-A-A-AAA
gi|162147                     : TAATTGTTCTACC---CTCTTTGCAAGGGA-TTTGTACAACA----GGACCAC-TAGAAC-TG--AA-AAA-AAAATG---GCT-----TA-TA-A----A--AC-C---TTC---T------TGGCA--------CT--------T-C-TTG--TCC-TGAGACT----TT---G----C----TAT------G----AC----TGGC-------CA---A---GC--CT--G--A--TT---TT-T-A-CCA-AGCCATTGTTTGTTA---T---T--G-A-TGTACC-A---TTGG--GG--CTCAAA-ATAAT--AA----ACCCAAGTTTC---AT-CCC----CCGTA----GGCAAGTC-A-G-AAAT-TTT
gi|162150                     : TAATTGTTTTACC---CTCTTTGCAAGGAA-TTTGCACATCA----GGACCAC-TA-TACTTG--AA-GAA-CA--TG---GCA-----TA-TA-C----A--AC-G---TCC---T------GGGCG--------CT--------T-C-TTG--TCC-T----CT----TT---G----C----TAT------G----GC----CGGC-------CC---T---GC--CT--G--A--AT---TT-T-A-CCA-AGCCATTGTTTGTTA---T---T--A-A-TGCGCA-G---TTGG--GG--CTCAAA-ATAAT--AA----ACATCTGTTTC---AT-CCC----CAGTG----AGCAAGTT-A-G-AAAT-
gi|162149                     : TAATTGTTCTACA---TTCTTTGCAAGGAA-TTTGTTCAACA----GGAATAC-TAAAAT-TG--AA-AAC-AA--TG---GCA-----TA-TA-A----A--AC-C---TTC---T------TGGCG--------CT--------T-C-TTG--TCG-T----CT----TT---G----C----TAT------GTATGAC----CGGC-------AT---A---TC--CT--G--A--TT---TT-T-A-CCA-AGCCATTGTTTGTTA---T---T--G-A-TGCGCC-G---TTGT--GG--CTTAAA-ATAAT--AA----ATTAAAGTTTC---GT-CCC----CAATG----AGCAAGTC-G-G-ACAT-TTT
gi|162151                     : TAATTGTTCTTCC---CTCTTTG------------TACAACA----GGACCAC-TAGAAT-TG--AA-GAC-AA--TG---GTA-----AA-CA-A----A--AC-C---TTC---T------TGGCG--------TG--------T-C-CTG--TCC-T----CT----T-----------------------G----AC----CGGC-------CT---A---GC--CT--G--A--TT---TT-T-A-CCA-AGCCAGTGTTTGTTA---T---C--G-G-TGCACC-G---TTGG--GA--CTCCAA-ATAAT--AA----ACCCAAGTTTT---AT-CCC----CATTG----AGCAAGTC-
gi|162152                     : TAATTGTTCTACC---CTCTTTTCAGGAAT-TTTG-ACAACA----GGACCAC-TATAAT-TG--AA-GAA-TA--TG---GCA-----TA-TA-A----A--CC-C---TTC---A------TGGCT--------CT--------T-C-TTG--TTC-T----CT----TT---G----C----TAT------G----AC----CGGC-------CT---T---GT--CT--G--A--TT---TT-T-A-CAA-AACAATTGTTTGTTG---T---T--G-A-TGCACC-G---TTAG--
gi|162153                     : TAATTGCTCTACC---CTCCTTGTAAGGAA-CTAGTACAACA----GGACCAC-TAGAAT-TG--AA-GTA-AA--TG---GCA-----TA-TA-A----C--AC-C---TTC---T------TGGCG--------CT--------T-C-TTG--TCC-T----CT----TT---G----C----TAT------G----AC----C
gi|162154                     : TAGTTGCTTAACC---CTATTCGTAAAGAA-TATGTATAACA----GGTTCAC-TAGAAT-GG--AA-GAA-AA--TG---AAA-----CA-TA-A----A--TC-C---TTT---T------TAGCG--------GT--------T-C-TTG--TCA-T----CT----TT---G----T----TTT------G----AC----CGGC-------CT---A---GC--TTCAA--A--------T-T-A-CCA-ACCCATTGTTTGTTA---T---C--A-A-TCCGCC-G---TTGG--
gi|162157                     : TAATTGATCTGCC---CTCTTTGCAAGGAA-TTTGTACAAGA----GGACCAC-TAA-AA-TGCAAA-GAA-A
gi|162155                     : TAATTGATCGACC---ATTTTGGGTAGGAA-TTTGAATGACA----GGACGGC-TGGAAT-TG--AA--AA-AA--TA---TC------TAGTA-G----AGTAG-A---TTT---T------TGGCA--------CT--------G-C-TCG---AT-T----GT----TT---GA---C----AAT------G----AT----TTATATTTTGTTT---AT--AC--CT--T--A--TT---CT-T---------CCATTATTTATTA---T---G--A-A-CACGCC-A---TTGG--GGA-CTCAGA-ATAAA--AC----ACACATGTTTC---AT-TAA----CACTA----AGCAATTA-A-A-ATAT-
gi|162156                     : TAATTGATCGACC---ATTTTGGGTAGGAA-TTTGAATGACA----GGACGGC-TGGTGT-TT--AA-GAA-AA-------GTACCTTTTT-TG-C----A--AT-C---CTC---TAACATCTGGCA--------GT--------GAT-TTG--TCT-T----CT----TT---------------------------------------------T-------GC--C------A--TT---TT-T-GTCCA-A-----TGTTTGTTA---T---C--A-A-CCTGGT-G---TTGG--GG--CTCTGA-ATAAA--CC----ACCCACGTTTC---AT-CAC----CTGTA----AGCAA
gi|162158                     :  ACTTTTTCTACC---CTCTTTGCATGAAG-T-TGTACAACA----GGAACAC-TAGAAT-TG--TA-CAACAA--T------------TA-TA-A----A--AG-C---CTC---
gi|162159                     :  taTTGTTCTACC---CTCTTTGCAAGGAA-TTTGTACAACA----GGACCAC-TTGAAT-TG--AA-GAA-AT--TG---GCA-----TA-TA-A----A--AC-C---TTC---T------TGGCA--------CTAA------T-C-TTG--TCC-T----CT----TT---G----C----TAT------G----AC----CGGC-------TT---A---GC--CT--G--A--TT---TT-T-A-CCA-AGCCATTGTTTGTTA---T---T--G-A-TACGTA-G---TTGG--GG--CTCATA-ATAAT--AA----ACCCAAGTTTC---AT-CCC----CAGTG----AGCAAGTT-G-G---AT-TTT
gi|162161                     :  aaTTATTTTGTA---CTCTTTGCAAGGAA-TTTGTACAACA----GGACCAC-TAGAAT-TG--AA-GAA-AA--TG---GCA-----TA-TA-A----A--CT-C---TTC---T------TGGCG--------CT--------T-C-TTG--TCC-T----CT----TT---G----C----TAT------G----AC----CGGT-------CT---A---GC--CT--G--A--AT---TT-T-A-CCA-ATCCACTGTTTGTTA---T---T--G-A-TACGCC-G---TTGG--GG--CTCAAA-ATAAT--AAGTTTATACAAGTT
gi|162160                     :    TTGTTGTACC---CCCTTTGCAAAGAA-CTTGTACAACA----G
gi|162162                     :    aaGTTTTTCC---CTGTTTGCATGAAA-TTTGTACCACACTGTGGCACAC-TGGAAT-TA--AAAGAA-AG--TT---GCT-----TA-CA-A----A--AC-CG--TTC---A------GGGC----------T--------T-T-TGG--TTC-A----TT----TT---G----C----AAT------A----AC----CATT-------CT---T---GT--CT--A--G--TT---TT-T-A-CCC-AACACTTGTT-GCCA---C---T--G-A-------------------G--TACAAA-ATAGTGTAC----ATCCACATTCC---AT-CTC----CTGTG----AGCAAATA-A-G-ATAT-TTTcatcttgtcatctttgttatgaccggcctggcctgatatttaccaagccattgtttgttattgatgtgcagt
gi|162163                     :      GTTCTGCCAGGTTCTTTG---GATA-TTTGCACAACA----GTACCTG-TCGAAT-TG--AA-GAA-AA--TC---GTG-----CA-TA-A----A--AC-C---ATT---A------TAAAA--------CT------------TTG--T---------T----TT---G----G----TAT------A----AT----CGAT-------CT---T---TCTTTT--C--A--TTGTATT-T---CCATAGCCTCTGTTTATTA---T---T----A-CTCGTT-T---TTGA--GG--TTCGAA-ATAAA--AG----ATCCACGTTTT---AT-
gi|162148                     :       TTCTACC---CTCTTTGCAAGGAA-TTTGTACAACT----GGATCAC-TGGAAT-TA--AA-GAA-AG--TG---GCA-----TA-TA-A----A--AC-C---TTC---T------TGGCG--------CT--------T-C-TTG--ACC-T----CT----TT---G----C----TAT------G----AC----CGGC-------TT---A---GT--CT--G--A--TT---AT-T-A-CCA-AGTCATTGTTTGTTA---T---T--A-A-TGAACC-G---TTTG--GG--CCCAGA-ATAAT--AA----ACCAAAGTTTC---AT-CCC----TAGTG----AGTAAGTC-A-G-AAAT-TTTcacctgtga
gi|162164                     :  taatcaTCTACC---CTCTTTGCATGGAA-TTTGTACAACA----GGACCAC-TAGAAT-TGT-AA-AAC-AA--T------------TA-TAGA----A--GC-CACGTTC---T------T
gi|162165                     :         CTACC---CTCTTTGCAAGGAA-TTTATACAACA----GGACCAC-AAGAAT-TG--AA-GAA-AA--TG---ACA-----TT-AA-A----A--AC-T---TTC---T------TGGCA--------CT--------T-C-TTG--TCC-T----CT----TT---G----C----TACATGTAAG----AC----CGGT-------CT---A---GC--CT--G--A--TT---TT-T-A-CTA-AGCCATTGTTTGTTA---T---T--G-A-TGCGCC-G---TTGG--GG--CTCAAA-GTGAT--AA----ACCCAAGTTTC---AT-CCG----CAGTG----AGCAAGTA-A-G-AATT-TTT
gi|162166                     :           ACC---CTCATTCCAAGAAA-TGTGTACAACA----CGACCAC-TAGAAT-TG--AA-GAA-AA--TG---GCA-----TA-TA-A----A---C-C---TTC---T------CGGCG--------CT--------T-G-TTG--TCC-T----CT----TT---G----C----TAT------G----A---------------------------------------TT---TT-T-A-CCA-AGCCATTGTCTGTTA---T---T--G-A-TGTGCC-G---TTGG--GG--TTCAAA-ATAAT--AA----ACCAAAGTTTT---AT-CCC----CAGTG----AGCAAGTCAA-G-CAAT-TT
gi|162170                     :                        CAAGACACTG-GAACAACT----GGCCCAC-TAGAAT-TA--AA-GAA-AA--TA---GCG-----TA-CA-A----C--AT-T---TTC---C------TCGTA--------CC--------G-A-TGG--TTC-T----CT----TG---G----CAGTACAT------G-----------GGC-------GT---A----C--TT--G--ATCTT---TT-C-A-CC---TCCATTACTTGTTA---T---C--A-G-CCCTTC-T---CTGT--GG--CTCAAACAT-GT--GC----ACCAAGGTTTC---GT-CGA----CTGTT----AGCAAGTT-A-G-AAAT-
gi|162173                     :                             AA-TTTGTATGACT----GGTCCAT-TGTTTC-TA--AA-GAA-TA--TG---GCG-----TA-TA-A----C--AC-C---TTC---T------TCGC---------CG--------T-CATCG--TTC------AT----TT---G----G----CAT------T----ACA---GGGC-------CT---T---TT--TT--G--A--TG---TT-T-G-TGA-GCCCATATCCTGTTA---T---C--A-A-CTTTTC-G---CTTG--GG--CTCATA-GAAAT--GG----ACCCATGTTTC---AT-
gi|162169                     :                              A-TTTGCACAACA----GGACCTT-TGGAAT-TG--AA-GAA-AG--TT---GTG-----TA-TA-G----A--AC-T---TGT---T------TAGAA--------CT------------TTGAATTC-G----TT----TT---G----C----TTT------A----AT----TAAG-------GT---T---TC--TT--G--T--CC---TT-T-C-CTA-AGCCACAGTTTATTA---T---T--T-A-CCCATC-T---TTGA--GA--TTCGAA-ATAAT--Acacctgttacgaaattgtcaaacacttt
gi|162172                     :                        tgcactgggtTGAACAACA----AAACCTT-T-GAAT-TG--AA-GAA-AA--CC---GTG-----TA-TA-G----A--AC-C---CGT---T------TAGAA--------CT--------T---TTG--TTC-G----TT----TT---G----C----TAC------A----AT----CTGT-------CT---T---TC--TT--G--A--CC---TT-T-C-CTG-AGCCACTGTTTATTA---T---T--T-A-CCCGTC-T---TTGA--GG--TTCGAT-ATATT--AG----ATCCACGTTTC---AT-gttacactttccatcacttgtgag
gi|162177                     :                           aggtactTGCATAATA----GGACCACGTA-TAT-CA--AA-GAA-AA--TA---ACA-----AA-CA-T----T--GC-T---TTC---T------TAGCA--------CT--------G-A-TCA--ATC-T----TT----TG---G----C----AAT------T----GT----AGGG-------C----A---GCAACA--G-----TT---TT-T-G-GTA-GCCCATATTTTGTTG---T---T--A-A-TTTTTC------TGGTAGG--CTCGAA-AAAGT--GT----ACCCATGTCTC---ATATC-----CAGTA----ATAATGTC-A-G-AAAcacctgcgag
gi|162176                     :                                 tTGCATAATA----GGACCACGTA-TAT-CA--AA-GAA-AA--TA---ACA-----AA-CA-T----T--GC-T---TTC---T------TAGCA--------CTGATCAATCT-T-TTG--TC-------AA----TT---G---------TGG------G----GCGG--CGAC------------A---G-------------TT---TT-T-G-GTA-GCCCATATTTTGTTG---T---T--A-A-TTTTTC------TGGTAGG--CTCGAA-AAAGT--GT----ACCCATGTCTC---AT-CTC----CAGTA----ATAATGTC-A-G-AAA
gi|162175                     :                                 tTGTATGACA----GGACCGT-TGCAAG-TG--AA-AAA-AA--TT---GCA-----TA-CA-G----A--AC-C---TTC---T------T
gi|162178                     :                                tcTGCATAATA----GGACCA----G-----A--AA-GAA-AA--TA---ACA-----AA-CA-T----T--GC-T---TTC---T------TAGCA--------CT--------G-A-TCA--ATC-T----TT----TT---GGCAAT----TGT------G----GGGTGGCGAC------------A---G-------------TT---TT-T-G-GTA-GCCCATATTTTCTTG---T---T--A-A-TTTTTCTG---GTAG--GG--TCGAAA-A-AGT--GT----ACCCATGTCTC---AT-CTC----CAGTA----ATAATGTC-A-G-AAA
gi|162174                     :                                    tACAAAA----GGACCTT-TGGAAT-TG--AA-AAA-AA--TC---GTG-----TA-TA-G----A--AC-A---CGT---T------TAGAA--------CT--------T-T-AAG--TTC-G----TT----TT---G----C----TAT------A----AT----CAAT-------AT---T---TC--TT--G--T--CC---TT-T-C-CTC-AGTCATTGTTTATTA---T---T--T-A-CCCGTC-T---TTGA--GG--CTC-GA-ATTAC--AG----ATCCACATTTC---AT-
gi|162171                     :                               tttgacACAACT----GGCCCGC-TAG-AA-TA--AA-GAA-AA--TG---GCG-----TA-TA-A----C--AT-T---TTC---T------TCGTA--------TT--------G-A-TGA--TTC-T----CT----TG---G----C----AAT-----------ACA---TGGG-------CT---T---GC--TT--G--A--TT-----------------CATTGCTTGTT----T---TCAG-A-CCT-TC-T---CTGT--GG--CTCAAA-CACGT--GC----ACCCAGGTTTC---GT-CAC----CTGTT----AGCAAGT------AAAT-c
gi|162179                     :                          caaggcaccttaaAAAA----GGACCACGTA-TAT-CA--AA-GAA-AA--TA---ACA-----AA-CA-T----T--GC-T---TTC---T------TAGCA--------CT--------G-A-TCA--ATC-T----TT----TG---G----C----AATTGTG--G----GG----CGGC------------A---AC------A--G--TT---TT-T-G-GTA-GCCCATATTTTGTTG---T---T--A-A-TTTTTC------TGGTAGG--CTCAAA-AAAGT--GT----ACCCATGTCTC---AT-CTC----CAGTA----ATAATGTC-A-G-AAA
gi|162168                     :                                        ACA----GGCCCAC-TAATAT-TT--AA-GAA-AA--TG---ACA-----CA--A-A----T--GCTC---TTT---T------TGGCA--------CT--------T-T-TTA--TCCGT----TTGTGGTTGA-G----C----AAT------C----AC----TGGC-------CA---T---GC--CT--G--A--TT---GT-G-T-CTT-AACAATTGCGTGTTA---TCCAT--GCA-TGCATC-G---ATGA--AG--TTCGAA-CTAAT--
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Reference ( family-532 )      :                                   TAA-TTGTTCTACC---CTCTTTGCA--AGGA-AT-TTG-TACA-------ACA----GGACCAC-TAGAAT-TG-AA-GAA-AA--TG---GCATA-TA-A----A--AC-C---TTC---TTGGCG--------CT--------TC-T-TG--TCC-T----CT----TT---G-C----TA--T------GAC-C--G-------GCCT-----A-----GC--CT--G--A---TT---TT-T-A-CCA-AGCCATTGTTTGTTA---T---T--G-AC-----GCGCC-GTT-GG---GG-CT-C-GAAATA-ATANAC--CCA--NGTTTCATCCCCAGTG----A-GCAA--GTC-A-G-AAAT-TTT
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gi|162161                     : aattgttgtaccccctttgcaaagaacttgtacaaca-TTATTTTGTA---CTCTTTGCA--AGGA-AT-TTG-TACA-------ACA----GGACCAC-TAGAAT-TG-AA-GAA-AA--TG---GCATA-TA-A----A--CT-C---TTC---TTGGCG--------CT--------TC-T-TG--TCC-T----CT----TT---G-C----TA--T------GAC-C--G-------GTCT-----A-----GC--CT--G--A---AT---TT-T-A-CCA-ATCCACTGTTTGTTA---T---T--G-AT-----ACGCC-GTT-GG---GG-CT-C-AAAATA-ATA
gi|162162                     :                                         GTTTTTCC---CTGTTTGCA--TGAA-AT-TTG-TACC-------ACACTGTGGCACAC-TGGAAT-TA-AAAGAA-AG--TT---GCTTA-CA-A----A--AC-CG--TTC-----AGGG--------CT--------TT-T-GG--TTC-A----TT----TT---G-C----AA--T------AAC-C--A-------TTCT-----T-----GT--CT--A--G---TT---TT-T-A-CCC-AACACTTGTT--------------------------GCC-ACT-GA---G---TAC-AAAATA-GTGTACATCCA--CATTCCATCTCCTGTG----A-GCAA--ATA-A-G-ATAT-TTTagtttatacaagtt
gi|162163                     :                                         GTTCTGCCAGGTTCTTTG------GATAT-TTG-CACA-------ACA----GTACCTG-TCGAAT-TG-AA-GAA-AA--TC---GTGCA-TA-A----A--AC-C---ATT---ATAAAA--------CT-----------T-TG--T---------T----TT---G-G----TA--T------AAT-C--G-------ATCT-----T-----TCTTTT--C--A---TTGTATT-T---CCATAGCCTCTGTTTATTA---T---T----AC-----TCGTT-TTT-GA---GG-TT-C-GAAATA-AAAGAT--CCA--CGTTTTATCACCTGTG----A-
gi|162164                     :                                           TCTACC---CTCTTTGCA--TGGA-AT-TTG-TACA-------ACA----GGACCAC-TAGAAT-TGTAA-AAC-AA--T-------TA-TAGA----A--GC-CACGTTC---TT
gi|162165                     :                                            CTACC---CTCTTTGCA--AGGA-AT-TTA-TACA-------ACA----GGACCAC-AAGAAT-TG-AA-GAA-AA--TG---ACATT-AA-A----A--AC-T---TTC---TTGGCA--------CT--------TC-T-TG--TCC-T----CT----TT---G-C----TA--CATGTAAGAC-C--G-------GTCT-----A-----GC--CT--G--A---TT---TT-T-A-CTA-AGCCATTGTTTGTTA---T---T--G-AT-----GCGCC-GTT-GG---GG-CT-C-AAAGTG-ATAAAC--CCA--AGTTTCATCCGCAGTG----A-GCAA--GTA-A-G-AATT-TTT
gi|162166                     :                                              ACC---CTCATTCCA--AGAA-AT-GTG-TACA-------ACA----CGACCAC-TAGAAT-TG-AA-GAA-AA--TG---GCATA-TA-A----A---C-C---TTC---TCGGCG--------CT--------TG-T-TG--TCC-T----CT----TT---G-C----TA--T------GA-------------------------------------------TT---TT-T-A-CCA-AGCCATTGTCTGTTA---T---T--G-AT-----GTGCC-GTT-GG---GG-TT-C-AAAATA-ATAAAC--CAA--AGTTTTATCCCCAGTG----A-GCAA--GTCAA-G-CAAT-TT
gi|162167                     :                                                     TCTTTG------GA-AT-TTG-TATA-------ACA-----------------T-TG-A--GAA-AA--TG---GCATA-TA-A----A--AC-C---TTC---TTGGCG--------CT--------TC-T-TG--TCC-T----CT----TT---C-C----TA--T------GAC-C--A-------GTGT-----A-----GT--CT--G--A---TT---TT-T-A-CCA-AGCTATTGTTTGTTA---G---T--C-AT-----ATGCC-GTT-GG---GG-CT-C-AAAATA-ATAAAC--CCA--AGTTTCATCCCAAGTG----A-GCAA--GTC-A-G-AAGT-TTT
gi|162168                     :                                                      CTTTGTG--TGGA-AT-CTG-AAGACTGAAATACA----GGCCCAC-TAATAT-TT-AA-GAA-AA--TG---ACACA--A-A----T--GCTC---TTT---TTGGCA--------CT--------TT-T-TA--TCCGT----TTGTGGTTGA-G-C----AA--T------CAC-T--G-------GCCA-----T-----GC--CT--G--A---TT---GT-G-T-CTT-AACAATTGCGTGTTA---TCCAT--GCAT-----GCATC-GAT-GA---AG-TT-C-GAACTA-AT
gi|162169                     :                                                         TGCACTGGGT-AT-TTG-CACA-------ACA----GGACCTT-TGGAAT-TG-AA-GAA-AG--TT---GTGTA-TA-G----A--AC-T---TGT---TTAGAA--------CT-----------T-TGAATTC-G----TT----TT---G-C----TT--T------AAT-TAAG-------GTTT------------C--TT--G--T---CC---TT-T-C-CTA-AGCCACAGTTTATTA---T---T--T-AC-----CCATC-TTT-GA---GA-TT-C-GAAATA-ATAGTT--ACA--CTTTCCATCACTTGTG----A-G
gi|162170                     :                                                           CA--AGAC-AC-TGG-AACA-------ACT----GGCCCAC-TAGAAT-TA-AA-GAA-AA--TA---GCGTA-CA-A----C--AT-T---TTC---CTCGTA--------CC--------GA-T-GG--TTC-T----CT----TG---G-CAGTACA--T------G------G-------GCGT-----A------C--TT--G--ATC-TT---TT-C-A-CC---TCCATTACTTGTTA---T---C--A-GC-----CCTTC-TCT-GT---GG-CT-C--AAACATGTGCAC--CAA--GGTTTCGTCGACTGTT----A-GCAA--GTT-A-G-AAAT-
gi|162171                     :                                                           CA--AGGC-ACCTTA-AACA-------ACT----GGCCCGC-TAGAAT--A-AA-GAA-AA--TG---GCGTA-TA-A----C--AT-T---TTC---TTCGTA--------TT--------GA-T-GA--TTC-T----CT----TG---G-C----AA--T-------ACAT--G-------GGCT-----T-----GC--TT--G--A---TT-----------------CATTGCTTGTT----T---TCAG-AC------CTTC-TCT-GT---GG-CT-C--AAACACGTGCAC--CCA--GGTTTCGTCACCTGTT----A-GCAA--GT------AAAT-
gi|162172                     :                                                             --AGGT-AC-TTG-AACA-------ACA----AAACCTT-T-GAAT-TG-AA-GAA-AA--CC---GTGTA-TA-G----A--AC-C---CGT---TTAGAA--------CT--------T--T-TG--TTC-G----TT----TT---G-C----TA--C------AAT-C--T-------GTCT-----T-----TC--TT--G--A---CC---TT-T-C-CTG-AGCCACTGTTTATTA---T---T--T-AC-----CCGTC-TTT-GA---GG-TT-C-GATATA-TTAGAT--CCA--CGTTTCATCACCTGCG----A-G
gi|162173                     :                                                                  A-AT-TTG-TATG-------ACT----GGTCCAT-TGTTTC-TA-AA-GAA-TA--TG---GCGTA-TA-A----C--AC-C---TTC---TTCGC---------CG--------TCAT-CG--TTC------AT----TT---G-G----CA--T------TACAG--G-------GCCT-----T-----TT--TT--G--A---TG---TT-T-G-TGA-GCCCATATCCTGTTA---T---C--A-AC-----TTTTC-GCT-TG---GG-CT-C-ATAGAA-ATGGAC--CCA--TGTTTCATCACCTGTT----ACGAAATTGTC-A-A-ACAC-TTT
gi|162174                     :                                                                     T-TTGACACA-------AAA----GGACCTT-TGGAAT-TG-AA-AAA-AA--TC---GTGTA-TA-G----A--AC-A---CGT---TTAGAA--------CT--------TT-A-AG--TTC-G----TT----TT---G-C----TA--T------AAT-C--A-------ATAT-----T-----TC--TT--G--T---CC---TT-T-C-CTC-AGTCATTGTTTATTA---T---T--T-AC-----CCGTC-TTT-GA---GG-CT-C-G-AATT-ACAGAT--CCA--CATTTCATC
gi|162175                     :                                                                     T-CTG-TATG-------ACA----GGACCGT-TGCAAG-TG-AA-AAA-AA--TT---GCATA-CA-G----A--AC-C---TTC---TT
gi|162176                     :                                                                      -TTG-CATA-------ATA----GGACCACGTAT-AT-CA-AA-GAA-AA--TA---ACAAA-CA-T----T--GC-T---TTC---TTAGCA--------CTGATCAATCTT-T-TG--TCA-A----TT----GT---G-----------------GGG-C--G-------GC-------------GA--CA--G------TT---TT-T-G-GTA-GCCCATATTTTGTTG---T---T--A-AT-----TTTTC---T-GGTA-GG-CT-C-GAAAAA-GTGTAC--CCA--TGTCTCATCTCCAGTA----A-TAAT--GTC-A-G-AAA
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Reference ( family-532 )      :                                   TAA-TTGTTCTACC---CTCTTTGCA--AGGA-AT-TTG-TACA-------ACA----GGACCAC-TAGAAT-TG-AA-GAA-AA--TG---GCATA-TA-A----A--AC-C---TTC---TTGGCG--------CT--------TC-T-TG--TCC-T----CT----TT---G-C----TA--T------GAC-C--G-------GCCT-----A-----GC--CT--G--A---TT---TT-T-A-CCA-AGCCATTGTTTGTTA---T---T--G-AC-----GCGCC-GTT-GG---GG-CT-C-GAAATA-ATANAC--CCA--NGTTTCATCNCCAGTG----A-GCAA--GTC-A-G-AAAT-TTT
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gi|162161                     : aattgttgtaccccctttgcaaagaacttgtacaaca-TTATTTTGTA---CTCTTTGCA--AGGA-AT-TTG-TACA-------ACA----GGACCAC-TAGAAT-TG-AA-GAA-AA--TG---GCATA-TA-A----A--CT-C---TTC---TTGGCG--------CT--------TC-T-TG--TCC-T----CT----TT---G-C----TA--T------GAC-C--G-------GTCT-----A-----GC--CT--G--A---AT---TT-T-A-CCA-ATCCACTGTTTGTTA---T---T--G-AT-----ACGCC-GTT-GG---GG-CT-C-AAAATA-ATA
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gi|162163                     :                                         GTTCTGCCAGGTTCTTTG------GATAT-TTG-CACA-------ACA----GTACCTG-TCGAAT-TG-AA-GAA-AA--TC---GTGCA-TA-A----A--AC-C---ATT---ATAAAA--------CT-----------T-TG--T---------T----TT---G-G----TA--T------AAT-C--G-------ATCT-----T-----TCTTTT--C--A---TTGTATT-T---CCATAGCCTCTGTTTATTA---T---T----AC-----TCGTT-TTT-GA---GG-TT-C-GAAATA-AAAGAT--CCA--CGTTTTATCACCTGTG----A-
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gi|162166                     :                                              ACC---CTCATTCCA--AGAA-AT-GTG-TACA-------ACA----CGACCAC-TAGAAT-TG-AA-GAA-AA--TG---GCATA-TA-A----A---C-C---TTC---TCGGCG--------CT--------TG-T-TG--TCC-T----CT----TT---G-C----TA--T------GA-------------------------------------------TT---TT-T-A-CCA-AGCCATTGTCTGTTA---T---T--G-AT-----GTGCC-GTT-GG---GG-TT-C-AAAATA-ATAAAC--CAA--AGTTTTATCCCCAGTG----A-GCAA--GTCAA-G-CAAT-TT
gi|162167                     :                                                     TCTTTG------GA-AT-TTG-TATA-------ACA-----------------T-TG-A--GAA-AA--TG---GCATA-TA-A----A--AC-C---TTC---TTGGCG--------CT--------TC-T-TG--TCC-T----CT----TT---C-C----TA--T------GAC-C--A-------GTGT-----A-----GT--CT--G--A---TT---TT-T-A-CCA-AGCTATTGTTTGTTA---G---T--C-AT-----ATGCC-GTT-GG---GG-CT-C-AAAATA-ATAAAC--CCA--AGTTTCATCCCAAGTG----A-GCAA--GTC-A-G-AAGT-TTT
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gi|162169                     :                                                         TGCACTGGGT-AT-TTG-CACA-------ACA----GGACCTT-TGGAAT-TG-AA-GAA-AG--TT---GTGTA-TA-G----A--AC-T---TGT---TTAGAA--------CT-----------T-TGAATTC-G----TT----TT---G-C----TT--T------AAT-TAAG-------GTTT------------C--TT--G--T---CC---TT-T-C-CTA-AGCCACAGTTTATTA---T---T--T-AC-----CCATC-TTT-GA---GA-TT-C-GAAATA-ATAGTT--ACA--CTTTCCATCACTTGTG----A-G
gi|162170                     :                                                           CA--AGAC-AC-TGG-AACA-------ACT----GGCCCAC-TAGAAT-TA-AA-GAA-AA--TA---GCGTA-CA-A----C--AT-T---TTC---CTCGTA--------CC--------GA-T-GG--TTC-T----CT----TG---G-CAGTACA--T------G------G-------GCGT-----A------C--TT--G--ATC-TT---TT-C-A-CC---TCCATTACTTGTTA---T---C--A-GC-----CCTTC-TCT-GT---GG-CT-C--AAACATGTGCAC--CAA--GGTTTCGTCGACTGTT----A-GCAA--GTT-A-G-AAAT-
gi|162171                     :                                                           CA--AGGC-ACCTTA-AACA-------ACT----GGCCCGC-TAGAAT--A-AA-GAA-AA--TG---GCGTA-TA-A----C--AT-T---TTC---TTCGTA--------TT--------GA-T-GA--TTC-T----CT----TG---G-C----AA--T-------ACAT--G-------GGCT-----T-----GC--TT--G--A---TT-----------------CATTGCTTGTT----T---TCAG-AC------CTTC-TCT-GT---GG-CT-C--AAACACGTGCAC--CCA--GGTTTCGTCACCTGTT----A-GCAA--GT------AAAT-
gi|162172                     :                                                             --AGGT-AC-TTG-AACA-------ACA----AAACCTT-T-GAAT-TG-AA-GAA-AA--CC---GTGTA-TA-G----A--AC-C---CGT---TTAGAA--------CT--------T--T-TG--TTC-G----TT----TT---G-C----TA--C------AAT-C--T-------GTCT-----T-----TC--TT--G--A---CC---TT-T-C-CTG-AGCCACTGTTTATTA---T---T--T-AC-----CCGTC-TTT-GA---GG-TT-C-GATATA-TTAGAT--CCA--CGTTTCATCACCTGCG----A-G
gi|162173                     :                                                                  A-AT-TTG-TATG-------ACT----GGTCCAT-TGTTTC-TA-AA-GAA-TA--TG---GCGTA-TA-A----C--AC-C---TTC---TTCGC---------CG--------TCAT-CG--TTC------AT----TT---G-G----CA--T------TACAG--G-------GCCT-----T-----TT--TT--G--A---TG---TT-T-G-TGA-GCCCATATCCTGTTA---T---C--A-AC-----TTTTC-GCT-TG---GG-CT-C-ATAGAA-ATGGAC--CCA--TGTTTCATCACCTGTT----ACGAAATTGTC-A-A-ACAC-TTT
gi|162174                     :                                                                     T-TTGACACA-------AAA----GGACCTT-TGGAAT-TG-AA-AAA-AA--TC---GTGTA-TA-G----A--AC-A---CGT---TTAGAA--------CT--------TT-A-AG--TTC-G----TT----TT---G-C----TA--T------AAT-C--A-------ATAT-----T-----TC--TT--G--T---CC---TT-T-C-CTC-AGTCATTGTTTATTA---T---T--T-AC-----CCGTC-TTT-GA---GG-CT-C-G-AATT-ACAGAT--CCA--CATTTCATC
gi|162175                     :                                                                     T-CTG-TATG-------ACA----GGACCGT-TGCAAG-TG-AA-AAA-AA--TT---GCATA-CA-G----A--AC-C---TTC---TT
gi|162176                     :                                                                      -TTG-CATA-------ATA----GGACCACGTAT-AT-CA-AA-GAA-AA--TA---ACAAA-CA-T----T--GC-T---TTC---TTAGCA--------CTGATCAATCTT-T-TG--TCA-A----TT----GT---G-----------------GGG-C--G-------GC-------------GA--CA--G------TT---TT-T-G-GTA-GCCCATATTTTGTTG---T---T--A-AT-----TTTTC---T-GGTA-GG-CT-C-GAAAAA-GTGTAC--CCA--TGTCTCATCTCCAGTA----A-TAAT--GTC-A-G-AAA
gi|162177                     :                                                                      -TTG-CATA-------ATA----GGACCACGTAT-AT-CA-AA-GAA-AA--TA---ACAAA-CA-T----T--GC-T---TTC---TTAGCA--------CT--------GA-T-CA--ATC-T----TT----TG---G-C----AA--T------TGT-A--G-------GGC------A-----GCAACA--G------TT---TT-T-G-GTA-GCCCATATTTTGTTG---T---T--A-AT-----TTTTC---T-GGTA-GG-CT-C-GAAAAA-GTGTAC--CCA--TGTCTCATATCCAGTA----A-TAAT--GTC-A-G-AAA
gi|162178                     :                                                                      -TTG-CATA-------ATA----GGACCA----GAA------A-GAA-AA--TA---ACAAA-CA-T----T--GC-T---TTC---TTAGCA--------CT--------GA-T-CA--ATC-T----TT----TT---G-G----CAATT------G---T--G-------GGGT-----G-----GC------G--ACAGTT---TT-T-G-GTA-GCCCATATTTTCTTG---T---T--A-AT-----TTTTCTGGT-AG---GG--T-C-GAAAAA-GTGTAC--CCA--TGTCTCATCTCCAGTA----A-TAAT--GTC-A-G-AAA
gi|162179                     :                                                                              A-------AAA----GGACCACGTAT-AT-CA-AA-GAA-AA--TA---ACAAA-CA-T----T--GC-T---TTC---TTAGCA--------CT--------GA-T-CA--ATC-T----TT----TG---G-C----AA--TTGTG--GGG-C--G-------GC-------A-----AC------A--G---TT---TT-T-G-GTA-GCCCATATTTTGTTG---T---T--A-AT-----TTTTC---T-GGTA-GG-CT-C-AAAAAA-GTGTAC--CCA--TGTCTCATCTCCAGTA----A-TAAT--GTC-A-G-AAA
gi|162180                     :                                                                                                CCAC-TAGAAT-TA-AA-GAA-AA--TG---GCATA-AA-G----G--AC-C-----C---TT-------------------------T-AA--TCT-G----CT----TTATAG-C----AA--T------CAC-A--G-------GACT-----------GT--TT--A--A---TT---TTGT-T-TTA-A-CTATAGCTCATTA---T---T--C-CT-----GTGTT-AGT-GA---GG-TT-C-AAATTA-ACATGC--ACA--TGCCTCATTCCCAGTATTATA-GTAA--CTCAA-G-ACAT-TTT
gi|162181                     :                                                                                                          T-TT-AA-GGA-AA--TA---GCATA-TA-AAATGA--AC-C---TT----TTGTCA--------CA--------TT-T-AG--TTT-T----CT----TA---G-C----AA--T------ACC-C--A-------AACT-----C-----GT--CT--GTTA---TT---TT-T----CA-AG-CATTGTTTATTA---C---T--
gi|162182                     :                                                                                                           -TG-AA-TAA-AC--TGTATGCATT-TC-A----A--AC-C---TTTACTTTGGCGTTTATTTTCT--------TC-T-TG--TCC-T----CT----TT---G-C----TA--T------GAC-C--G-------GCCT-----A-----GC--CT--A--A---TT---TT-TTA-CCA-AACCGCTGTTTGTTA---T---A--A-AT-----GCACC-GTT-GG---GG-CT-T-TCAATG-ATAAAC--CTA--ACTTTCATCCCCAGTG----A-GCAA--GTC-A-G-TAAT-TTTtttgcatgt
gi|162183                     :                                                                                                           -TG-AA-AAA-AA--CG---ACATA--A-A----A--AC-C---TTT---TTGACA--------CC--------GA-T-TG--TCC-T----CT----TG---A-C----TA--T------ATA-T--G-------GTCTTTCGCA-----CC--TT---------TC---TT-T-T-CCA-ATACA-CGTGGGATAGCTT---T-----C------CGAC-GT-------GG-TT-C-GTAAAA-ATATAT--CCA--CGTTTCGTCGCCGGTG----A--CAA--
gi|162184                     :                                                                                                             G-AA-GAA-AA--TT---GCAT--TA-GG---A--AT-C---TTC---TTTACA--------CT--------CA-A-GG--TCC-G----TT----TG---G-C----AA--T------GAC-T--G-------GCCT------------T--CT--GCCA---TG---TT-T----CG-GGCC--TGTATTTTG---T---T-----C-----GCAC---TT-G-------TT-C-GAAATA-GTGTAC--CCA--GGTTTCGTCACCAGTG----A--CAA--AAC-ATGCAAAT-
gi|162185                     :                                                                                                             G-AA-GAA-AA--TT---GCATA-AA-C----A--AT-G---TTC---TTTACA--------CT--------CA-A-TG--TCC-G----TT----TG---A-C----AA--T------GAC-T--G-------GCCTTCC--ACTT--GT--CT--G--G---TG---GT-----------CCATATTTTGTTT---C---T--A-ACCTTTCGCACT-G---------G-TT-C-GAAATA-GTGTAC--CCA--GGTTTCGCCACCAGTG----A-
gi|162186                     :                                                                                                             G-AA-GAA-AA--TT---GCATA-AA-T----A--AC-C---TTC---TTTACA--------C---------TC-A-AG--TTC-C----CTA---TC---G-C----AA--T------GAC-T--G-------GCCT-----T-----TT--GT--A--A---TG---TT-T-G-GTG-GCCCA-TATT--TTA---T---T--T-CC-----A-ACT-GTTCGGATTGG-TT-C-GAAATA-GTGAACAGTCACCGGATTCGTCACCAGTG----A-
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blockSeqs                     :                                      C          AGG         CTG   T  C   A    CTGAAAT   CTGT       G      G            AA GTAT     G  G AATG GT  T ACG   ACT     GTTTATTTT  GATCAATCTT  C  AA   G GAGA  GTGG  ATA A TATGT AT ATGTAA   A AA ATATTTT    TCCACTT      TT  CA ACAG    GTA  G GT    T G             GCT CCA AACCTTTCG       TG  C  ATT  A  A AG     T   A  AT   CCG        C      TTAT C    TT   A T C    A
blockSeqs                     :                                      .          .           A     .  .   .    .         .          G      .            .  G        .  . G    .   . G     .       G          AATC        .  A    . .     A     GA  . AGTAC .  TGTG     A .  .          TCTTTT       AA  .  ATC     .    . TA    . G             .   .   GCATG           G   .  TA   .  . G      C   A  AG   A          C      .    .    .    A . .    .
blockSeqs                     :                                      .          .           A     .  .   .    .         .          G      .            .  G        .  . .    .   . .     .       A          TCA         .  .    . .     .     .   . T     .  .        . .  .          TTCGCA       .   .  TTA     .    . A     . G             .   .   CAGAC           A   .  TA   .  . A      .   A  .    A          C      .    .    .    . . .    .
blockSeqs                     :                                      .          .           A     .  .   .    .         .          .      .            .  G        .  . .    .   . .     .       G          TC          .  .    . .     .     .   . T     .  .        . .  .          AT           .   .  CCA     .    . A     . G             .   .   GATG            G   .  TA   .  . A      .   A  .    A          C      .    .    .    . . .    .
blockSeqs                     :                                      .          .           A     .  .   .    .         .          .      .            .  G        .  . .    .   . .     .       G          TC          .  .    . .     .     .   . T     .  .        . .  .          A            .   .  A       .    . A     . G             .   .   GATG            G   .  .    .  . A      .   A  .    A          C      .    .    .    . . .    .
blockSeqs                     :                                      .          .           A     .  .   .    .         .          .      .            .  G        .  . .    .   . .     .       G          TC          .  .    . .     .     .   . T     .  .        . .  .          A            .   .  A       .    . A     . G             .   .   AATG            G   .  .    .  . A      .   A  .    T          C      .    .    .    . . .    .
blockSeqs                     :                                      .          .           A     .  .   .    .         .          .      .            .  G        .  . .    .   . .     .       G          TC          .  .    . .     .     .   . T     .  .        . .  .          A            .   .  A       .    . A     . A             .   .   GATG            G   .  .    .  . C      .   C  .    A          A      .    .    .    . . .    .
blockSeqs                     :                                      .          .           A     .  .   .    .         .          .      .            .  G        .  . .    .   . .     .       T          TC          .  .    . .     .     .   . T     .  .        . .  .          A            .   .  A       .    . A     . C             .   .   AATG            G   .  .    .  . A      .   C  .    T          A      .    .    .    . . .    .
blockSeqs                     :                                      .          .           A     .  .   .    .         .          .      .            .  G        .  . .    .   . .     .       G          TC          .  .    . .     .     .   . T     .  .        . .  .          T            .   .  A       .    . A     . G             .   .   GGTG            G   .  .    .  . T      .   A  .    C          C      .    .    .    . . .    .
blockSeqs                     :                                      .          .           A     .  .   .    .         .          .      .            .  G        .  . .    .   . .     .       G          TC          .  .    . .     .     .   . A     .  .        . .  .          A            .   .  A       .    . A     . G             .   .   GATG            A   .  .    .  . A      .   T  .    A          T      .    .    .    . . .    .
blockSeqs                     :                                      .          .           A     .  .   .    .         .          .      .            .  A        .  . .    .   . .     .       A          TC          .  .    . .     .     .   . A     .  .        . .  .          T            .   .  A       .    . A     . T             .   .   AATC            G   .  .    .  . A      .   G  .    C          A      .    .    .    . . .    .
blockSeqs                     :                                      .          .           A     .  .   .    .         .          .      .            .  G        .  . .    .   . .     .       A          TC          .  .    . .     .     .   . T     .  .        . .  .          A            .   .  A       .    . A     . A             .   .   AACA            G   .  .    .  . A      .   A  .    C          C      .    .    .    . . .    .
blockSeqs                     :                                      .          .           A     .  .   .    .         .          .      .            .  G        .  . .    .   . .     .       A          GC          .  .    . .     .     .   . T     .  .        . .  .          A            .   .  A       .    . A     . G             .   .   AACC            G   .  .    .  . G      .   A  .    A          C      .    .    .    . . .    .
blockSeqs                     :                                      .          .           A     .  .   .    .         .          .      .            .  T        .  . .    .   . .     .       G          CC          .  .    . .     .     .   . T     .  .        . .  .          G            .   .  A       .    . A     . G             .   .   GATA            G   .  .    .  . A      .   A  .    A          C      .    .    .    . . .    .
blockSeqs                     :                                      .          .           T     .  .   .    .         .          .      .            .  C        .  . .    .   . .     .       G          TC          .  .    . .     .     .   . A     .  .        . .  .          A            .   .  A       .    . A     . G             .   .   GATG            A   .  .    .  . A      .   G  .    A          A      .    .    .    . . .    .
blockSeqs                     :                                      .          .           T     .  .   .    .         .          .      .            .  G        .  . .    .   . .     .       G          TC          .  .    . .     .     .   . T     .  .        . .  .          T            .   .  A       .    . A     . G             .   .   GATA            T   .  .    .  . A      .   C  .    C          G      .    .    .    . . .    .
blockSeqs                     :                                                 .           A     .  .   .    .         .          .      .            .  G        .  . .    .   . .     .       A          TT          .  .    . .     .     .   . T     .  .        . .  .          T            .   .  A       .    . A     . A             .   .   GATG            G   .  .    .  . G      .   C  .    G          A      .    .    .    . . .    .
blockSeqs                     :                                                 .           A     .  .   .    .         .          .      .            .  G        .  . .    .   . .     .       A          TC          .  .    . .     .     .   . T     .  .        . .  .          A            .   .  G       .    . T     . G             .   .   GATG            G   .  .    .  . G      .   G  .    G          A      .    .    .    . . .     
blockSeqs                     :                                                 .           T     .  .   .    .         .          .      .            .  G        .  . .    .   . .     .       G          TG          .  .    . .     .     .   . T     .  .        . .  .          A            .   .  A       .    . C     . T             .   .   CATA            G   .  .    .  . G      .   G  .    C          A      .    .    .    . . .     
blockSeqs                     :                                                 .           A     .  .   .    .         .          .      .            .  T        .  . .    .   . .     .       G          TC          .  .    . .     .     .   . A     .  .        . .  .          T            .   .  A       .    . A     . G             .   .   TACC            G   .  .    .  . A      .   G  .    T          T      .    .    .    . . .     
blockSeqs                     :                                                 .           A     .  .   .    .         .          .      .            .  A        .  . .    .   . .     .       A          TT          .  .    . .     .     .   . T     .  .        . .  .          A            .   .  A       .    . C     . C             .   .   AGCC            T   .  .    .  . G      .   T  .    C          T      .    .    .    . . .     
blockSeqs                     :                                                             A     .  .   .    .         .          .      .            .  G        .  . .    .   . .     .       A          GA          .  .    . .     .     .   . A     .  .        . .  .          T            .   .  A       .    . G     . G             .   .   TACC            T   .  .    .  . G      .   T  .    T          T      .    .    .    . . .     
blockSeqs                     :                                                             .     .  .   .    .         .          .      .            .  C        .  . .    .   . .     .       A          GA          .  .    . .     .     .   . T     .  .        . .  .          T            .   .  T       .    . C     . C             .   .   AACT            T   .  .    .  . G      .   T  .    T          T      .    .    .    .         
blockSeqs                     :                                                             .     .  .   .    .         .          .      .            .  G        .  . .    .   . .     .       A          TT          .  .    . .     .     .   . C     .  .        . .  .          T            .   .  A       .    . G     . C             .   .   TACC            T   .  .    .  . G      .   T  .    T          C      .    .    .              
blockSeqs                     :                                                             .     .  .   .    .         .          .      .            .  C        .  . .    .   . .     .       A          GA          .  .    . .     .     .   . T     .  .        . .  .          T            .   .  A       .    . G     . C             .   .   AATT            G   .  .    .  . A      .   T  .    T          C      .    .    .              
blockSeqs                     :                                                             .     .  .   .    .         .          .      .            .  T        .  . .    .   . .     .       A          GA          .  .    . .     .     .   . A     .  .        . .  .          A            .   .  A       .    . G     . C             .   .   AATT            T   .  .    .  . A      .   A  .    T          G      .    .                   
blockSeqs                     :                                                             .     .  .   .    .         .          .      .            .  A        .  . .    .   . .     .       A          GA          .  .    . .     .     .   . C     .  .        . .  .          G            .   .  T       .    . G     . G             .   .   AATT            A   .  .    .  . T      .   T  .    A          A      .    .                   
blockSeqs                     :                                                                   .  .   .    .         .          .      .            .  A        .  . .    .   . .     .       A          TT          .  .    . .     .     .   . A     .  .        . .  .          A            .   .  G       .    . T     . A             .   .   AATT            G   .  .    .  . G      .   T  .    C          A      .    .                   
blockSeqs                     :                                                                      .   .    .         .          .      .            .  A        .  . .    .   . .     .       A          TC          .  .    . .     .     .   . A     .  .        . .  .          C            .   .  A       .    . T     . T             .   .   CCTG            G   .  .    .  . G      .   T  .    G          A      .    .                   
blockSeqs                     :                                                                      .   .    .         .          .      .            .  A        .  . .    .   . .     .       A          GA          .  .    . .     .     .   . A     .  .        . .  .          A            .   .  A       .    . G     . G             .   .   AATG            G   .  .    .  . G      .   A  .    G          T      .    .                   
blockSeqs                     :                                                                      .   .    .         .          .      .            .  G        .  . .    .   . .     .       A          CA          .  .    . .     .     .   . T     .  .        . .  .          T            .   .  G       .    . A     . C             .   .   TCCA            G   .  .    .  . G      .   T  .    C                                          
blockSeqs                     :                                                                      .   .    .         .          .      .            .  A        .  . .    .   . .     .       A          CA          .  .    . .     .     .   . T     .  .        . .  .          .            .   .  A       .    . .     . G             .   .   ACT             .   .  .    .  . .      .                                                      
blockSeqs                     :                                                                      .   .    .         .          .      .            .  G        .  . .    .   . .     .       A          TC          .  .    . .     .     .   . A     .  .        . .  .          .            .   .  .       .    . .     . .             .   .   GCG             .   .  .    .  . .      .                                                      
blockSeqs                     :                                                                               .         .          .      .            .  T        .  . .    .   . .     .       A          T           .  .    . .     .     .   . A     .  .        . .  .          .            .   .  .       .    . .     . .             .   .   CG              .   .  .                                                                       
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