lowQualScore : 2222 1111111 111 111111 444444444444444444444444444444444444444444444444 11111111111111111 222222222222222222222222222222 1111 22222222222222222222222222222 333333333333333333333333333333333333333333333333 111111 111111
lowQualScore : 55 55 2 0 3 0000 0 3 7777 2 2 33 5555 66666 8888888 2 33 444 3 7 2 333 333 5555 4444444 4444 555555 333 1 88888888888 1 1 6666 000 000000 1 222 666 9 222 1 1 22 999999999 1 111111111111111111111111111111111111111111111111 22 888888 33 55 666 55555555555555555 4 0 1 999999999999999999999999999999 4 444 2222 1 1 1 22 1111 333 11111111111111111111111111111 2 1 1 2 4 222 22 22 44 222222222222222222222222222222222222222222222222 11 111 9 2 4 4 2222 0 444444444 11 1 1 222222 111 1 11 555555555555 88888 11 888 11 111 3333333 1 1 777777 222 666 1 99999 33 11 1 1 66 444444 3 999 222 1 888 3 1 3 2
lowQualScore : .. .. . . . .... . . .... . . .. .... ..... ....... . .. ... . . . ... ... .... ....... .... ...... ... . ........... . . .... ... ...... . ... ... . ... . . .. ......... . ................................................ .. ...... .. .. ... ................. . . . .............................. . ... .... . . . .. .... ... ............................. . . . . . ... .. .. .. ................................................ .. ... . . . . .... . ......... .. . . ...... ... . .. ............ ..... .. ... .. ... ....... . . ...... ... ... . ..... .. .. . . .. ...... . ... ... . ... . . . .
lowQualScore : 00 00 0 1 3 2222 1 6 0000 9 7 77 7777 77777 7777777 7 77 777 2 2 9 999 999 4444 9999999 7777 555555 333 9 77777777777 6 6 6666 000 333333 6 888 111 0 777 5 5 11 222222222 5 222222222222222222222222222222222222222222222222 00 888888 99 88 444 00000000000000000 0 2 2 555555555555555555555555555555 1 333 6666 2 2 2 99 2222 777 66666666666666666666666666666 4 2 5 2 9 000 77 66 33 444444444444444444444444444444444444444444444444 55 999 6 5 2 4 6666 6 111111111 77 3 0 999999 888 8 44 444444444444 00000 55 888 55 999 5555555 1 1 444444 111 888 2 77777 00 66 9 2 22 666666 9 000 333 5 000 3 7 5 0
consensus : CAACAATAGATGAAAATACAAACAATAATACTCT--ACTT--CCAGAGTGTATCT-TTAAAAC--TAATAATACCATTGC--AA-AC-A--TG----AT-----CA-------TTACTG-A--ATCAGACATAATT---GA---TAT---TATCG--G---T----AC------T---TTAGA-C-C--C------AAATAAAG-C-T----GTC--GGNGA---A-G---ACAN-AATAA---G-TCACA-GAA--T---------TT-TA----NAGTT-TA---CN--AAA---------C-A----C----A-C--T--AT--N---T--C-NAAACCN-CT-G--T-CT---A--T-GTTA-TTTAATA-AATC-NTT----AC----T-----T--G------AATGTAA-A----T-TT-C-CA-GA--N-TCA---TGGAA-----G--TC------AG--C-T-AC---T-G-TAATGCCNC---T--TTTTAAA-AA--GGG----T--CAAA-C-A--A--A---C-----G-T---GC-CGT---C--T--A---ATTATAGACCNATNTCT---TTATTAA---------GCTGTG-TTGGTAA-ACTT------ATGGAAAG---AGT--T------------GT-N---TACAAAC--ATAT-N-TAT--A---A----T--T-TTC-T---N-NT---TGAN-AA-TAA-N---CTG-A--TTTA-CA--AATN----NCAGTCCGGN--TTT---CTT-AA-G-GGNC-ATTCGAC-AGTTT
Reference ( gi|96841 ) : CAACAATAGATGAAAATATAAACAATAATACTCT--ACTT--CCAGAGTGTATCT-TTAAAAC--TTATAATACCATTGC--AA-AC-A--TG----AT-----CA-------TTACTG-A--ATCAGACACAATT---GA---TAT---TATCG--G---T----AC------T---TTAGA-C-C--C------AAATAAAG-C-T----GTC--GGAGA---A-G---ACAA-AATTA---G-TCACA-GAA--T---------TT-TA----CAGTT-TA---CT--AAA---------C-A----C----A-C--T--AT--A---T--C-TAAACCC-CT-G--T-CT---A--T-GTTA-TTTAATA-AATC-GTT----AC----T-----T--G------AATGTAA-A----T-TT-C-CA-GA--G-TCA---TGGAA-----G--TT------AG--C-T-AC---T-G-TAATGCCTC---T--TTTTAAG-AA--GGG----T--CAAA-C-A--A--A---C-----G-T---GC-CAT---C--T--A---ATTATCGGCCAATATCT---TTATTAA---------GCTGTG-TTGGTAA-ACTT------ATGGAAAG---AGT--T------------GT-C---TACAAAC--ATAT-T-TAT--A---A----T--T-TTC-T---G-AT---TGAA-AA-TAA-A---CTA-A--TTTA-CA--AATT----GCAATCCGGA--TTT---CTT-AA-G-GGAC-ATTCGAC-AGTTT
gi|96842 : CAACAATAGATGAAAATATAAACAATAATACTCT--ACTT--CCAGAGTGTATCT-TTAAAAC--TAATAATACCATTGC--AA-AC-A--TG----AT-----CA-------TTACAT-A--ATCAGACATAATT---GA---TAT---TATCG--G---T----AC------T---TTAGA-C-C--C------AAATAAAG-C-T----GTC--GGAGA---A-G---ACAA-AATTA---G-TCACA-GAA--T---------TA-TA----CAGTT-TA---CT--AAA---------C-A----C----A-C--T--AT--A---T--C-TAAACCC-CT-G--T-CT---A--T-GTTA-TTTAATA-AATC-CTT----AC----T-----T--G------AATGTAA-A----T-TT-C-CA-GA--G-TCA---TGGAA-----G--TC------AG--C-T-AC---T-G-TAATGCCTC---T--TTTTAAG-AA--GGG----T--CAAA-C-A--A--A---C-----G-T---GC-CAT---C--T--A---ATTATCAGCCAATATCT---TTATTAA---------GCTGTG-TTGGTAA-ACTT------ATGGAAAG---AGT--T------------GT-C---CACAAAC--ATAT-T-TAT--A---A----T--T-TTC-T---G-AT---TGAA-AA-TAA-A---CTA-A--TTTA-CA--AATT----GCAATCCGGA--TTT---CTT-AA-G-GGAC-ATTCGAC-AGTTT
gi|96844 : CAACAATAGATGAAAATATAAACAATAATACTCT--ACTT--CCAGAGTGTATCT-TTAAAAC--TAATAATACCATTGC--AA-AC-A--TG----AT-----CA-------TTACTG-A--ATCAGACATAATT---GA---TAT---TATCA--G---T----AC------T---TTAGA-C-C--C------AAATAAAG-C-T----GTC--GGAGA---A-G---ACAA-AATTA---G-TCACA-GAA--T---------TT-TA----CAGTT-TA---CA--AAA---------C-A----C----A-C--T--AT--A---T--C-TAAACCC-CT-G--T-CT---A--T-GTTA-TTTAATA-AATC-CTT----AC----T-----T--G------AATGTAA-A----T-AT-C-CA-GA--G-TCA---TGGAA-----G--TC------AG--C-T-AC---T-G-TAATGCCTC---T--TTTTAAG-AA--GGG----T--CAAA-C-A--A--A---C-----G-T---GT-CAT---C--T--A---ATTATCGGCCAATATCT---TTATTAA---------GGTGTG-TTGGTAA-ACTT------ATGGAAAG---AGT--T------------GT-T---TACAAAC--ATTT-T-TAC--A---A----T--T-TTC-T---G-AT---TGAA-AA-TAA-A---CCA-A--TTTA-CA--AATT----GCAATCCGGA--TTT---CTT-CA-G-GGAC-ATTCGAC-
gi|96843 : CAACAATGGATGAAAATATAAACAATAATACTCT--ACTG--CCAAAGTGTGTCT-TTAAAAC-----------CATTGC--AA-AC-A--TG----AT-----CA-------TTACTG-T--ATCAGACATAGTT---GA---TAT---GATCG--G---T----AC------T---TTAGA-C-C--C------AAATAAAG-C-T----GTC--GGAGA---A-G---ACAA-AATTA---G-TCACA-GAA--T---------TT-TA------GTT-TA---CA--AAA---------C-A----C----A-T--T--AT--A---TATC-TAAACCC-CT-G--T-CT---A--T-GTTA-TTTAATA-AATC-CTT----ACTTACT-----T--G------AATGTAT-A----T-TT-C-GA-GA--G-TCA---TGGAA-----G--TC------AG--C-T-AC---T-G-TAATGCCTC---T--TTTTAAG-AA--GGG----T--CAAA-C-A--A--A---C-----G-T---GC-CAT---C--T--A---ATTATCGGTCAATATCT---TTATTAA---------GCTATG-TTTGTAA-ACTT------ATGGAAAG---AGT--T------------GT-C---TACAAAC--ATAT-T-TAT--A---A----T--T-TTC-T---G-AT---TGAA-AA-TAA-A---CTA-A--TTTA-CA--AATT----GCAATCCGGA--TTT---CTT-AA-G-GGAC-ATTTGAC-AGTTT
gi|96846 : CAACAATAGGTGAAAATACAAACAATACTACTCT--ACTT--CCAGGGTGTATCT-TTAAAAC--TAATAATACCATTGC--AA-AC-A--TG----AT-----CA-------TTACTG-A--ATCAGCCATAGTT---GA---TAT---AATCG--G---T----AC------T---TTAGA-C-C--C------AAATAAAA-C-T----GTC--ACAGA---A-G---ACAA-AATTA---G-TCACA-GAA--A---------TT-AA----CAGTT-TA---CA--AAA---------C-A----C----A-C--T--AT--A---T--C-TAAATCC--T-G--T-CT---A--T-GTTA-ATTAACA-AATC-CTT----AC----T-----T--G------AATGTAA-A----T-TT-C-AA-GA--G-TCA---TGGAA-----G--TC------AG--C-T-TC---T-G-TAATGCCTC---T--TTTTAAA-AA--GGG----T--CAAA-C-A--A--A---C-----G-T---GC-CAT---C--T--A---ATAATCGGCCAATATCT---TTATTAA---------GCTGTG-TTGGTAA-CCTA------ATGGAAAG---AGT--T------------GT-C---TACAAAC--ATAT-T-TAT--A---A----T--T-TTC-T---G-AT---TGAA-AA-TAA-A---CTA-A--TTTA-CA--AATT----GCAATCCGGA--TTT---TTT-AA-G-GGAC-A
gi|96845 : CAACAATAGGTGAAAATACAAACAATACTACTCT--ACTT--CCAGGGTGTATCT-TTAAAAC--TAATAATACCATTGC--AA-AC-A--TG----AT-----CA-------TTACTG-A--ATCAGCCATAGTT---GA---TAT---AATCG--G---T----AC------T---TTAGA-C-C--C------AAATAAAA-C-T----GTC--ACAGA---A-G---ACAA-AATTA---G-TCACA-GAA--A---------TT-AA----CAGTT-TA---CA--AAA---------C-A----C----A-C--T--AT--A---T--C-TAAATCC--T-G--T-CT---A--T-GTTA-ATTAACA-AATC-CTT----AC----T-----T--G------AATGTAA-A----T-TT-C-AA-GA--G-TCA---TGGAA-----G--TC------AG--C-T-TC---T-G-TAATGCCTC---T--TTTTAAA-AA--GGG----T--CAAA-C-A--A--A---C-----G-T---GC-CAT---C--T--A---ATAATCGGCCAATATCT---TTATTAA---------GCTGTG-TTGGTAA-CCTA------ATGGAAAG---AGT--T------------GT-C---TACAAAC--ATAT-T-TAT--A---A----T--T-TTC-T---G-AT---TGAA-AA-TAA-A---CTA-A--TTTA-CA--AATT----GCAATCCGGA--TTT---TTT-AA-G-GGAC-A
gi|96847 : CAACAATAAATGACAGTATTAACAATAATATGTT--ACTT--CCAGGCTGTGTCT-TTAAAAC--GAATAATACCA-------A-AC-T--TG----AT-----CG-------TTACTG-A--ATCAGACATAATT---GT---TTT---GATCG--G---T----AC------T---TTAGA-C-C--C------AAATAAAG-C-T----GTC--GGAAA---A-G---ACAC-AATT-------CCCA-GAA--T---------TT-TT----CAGTA-TA---CA--AAC---------C-A----C----A-C--T--A--------------AACCA-CA-G--T-CT---A--T-GTTA-----ATA-ATTC-CTT----AC----T-----T--T------AATGTAA-A----T-TT-C-CA-G-----TCA---TGGAA-----G--TC------AA--C-T-AC---T-G-TTATGTCTC---A--TCTTAAG-AA--AGG----T--CAAA-C-A--G--A---C-----G-T---GC-CAT---C--T--T---ATCATTGGTCAATATCT---TTATTAA---------GCTGTG-TTGGTAA-ACTT------ATGGAAAG---AGT--T------------GT-C---TACAAAC--ATAT-T-TAT--A---A----C--T-TTC-T---G-AT---TGAA-AA-TAA-A---CTA-ATTTTTA-TA--AATT----TTTATCAGGA--CTT---TCT-AA-T-GGAC-ATTCGAC-AGTTT
gi|96848 : ACAATAGATGATACT-CAAACAA--AT--------CTT--CCTGAATTCGTTT-TTCAAAC--AAATAGTAC-GTTAA--AAGAT-A--TT----AA-----CA-------TCACAG-A--AAAAGAAATAACT---GA---TGT---TCTAG------------------------CAAA-C-C--TCGCTGTAAATAAAG-C-TAGTGGTCTTGACGACATA-GGTCACAA-AAT-----GCTCAAA-GAAACT---------TTGTA-----AACT-TG----T--AAA---------C-T----T----GTC--T--AT--T---T--G-TAAACCT-TA-A--T-GT---A--T-TATA-CTTAACA-GATC---T----A-----------T--GAGAGAAAATGT---A----T-AT-C-CA-AC--A-TCT---TTGAA-----A--TT------AG--C-T-AA---C-G-TTATGCCTT---TA-TTTTAA--AA--AGG----T----GA-T-A--A--ATCTC-------T---AC-CGT---C--T--A---ATTATAGACACATTTCA---TTGATAA---------GCTGTG-TTGGTAA-AGTA------GTGGAAAG---AAT--T------------GT-T---TTTGAAC--ATAT-T-TAC--A---A----T--C-ATCTT---C-AT---T-CA-AA-TAATA---TTATA--TTTA-
gi|96851 : AACAATACTTT--ACTA--CCAACTTGT-TCTCTTAAAAC--AAACCATACACTAAC--AA-AT-A--TC----AA-----AA-------TAACTG-A--A---AATGAAATT---AAGAATAT---TATAG--A---T----ACATTTTAT---TTAAAAT-C--C------TAACAAAT-C-A----GTT--GGAGA---A-G---ATAA-AATCA---G-TTATA-AAC--T---------TT-TA----AAATT-AA---C---AAA---------A-A----A----A-TG-T--AT--T---T--C-TAAACCA-TT-G--G-TT---A--T-GCTT-TATAATA-AATC-ACA----AG----A-----A--G------AATGTAA-A----T-TT-T-CA-TA--A-TTA---TGGAAACATGG--TT------------T-A------A-TAATGCCAC---T--ATTTAAA-AA--AGG--------AAA-T-A--CTTA---T-----A-T---CT-TGT---C--T--A---ATTATAGGCCAATAACA---CTTTTGA---------GTTGTG-TTGGTAA-ATTA------ATGGAAAT---AGT--T------------GT-T---TACAAAC--ATAT-C-TAT--ATTTT----T--T-TTT-T---G--T---TGCA-AA-TAA-C---TTG-A--TATA-CA--AGTT----ACAGTCAGGA--TTT---TTA-AA-A-GTTC-ATTCAAC-TGTTT
gi|96852 : AATGCTCT---CTG--CCTAATTTTACTC-GTAAAAC--TGAAAATTCACTTTC--AA-GT-A--TA----AG-----TA-------TATCAG-A--AAAAGAAATAATT---GA---TGT---TATCACCA---T----AC-----------TGAA-C-G--T------AAACAAAG-CTT----GT---GGCCA---T-G---ATTT-GATAA---G-TCATA-AAA--T---------GT-TAAAAGGAGTT------------G---------C-A----C----A-C--TCAAT--A---T--T-GAAACCA-CT-G--G-CT------T--TTC-TTT--TT-AATC-GTT-----C----TTTTAGT--G------AATGAAC-A----TATC-C-CA-AA--G-T-A---TGGAA-----A--AT------TG--C-C-AA---T-G-TCACACCGT---T--ATATAAA-AA--AGG----TGACAAGTC-A--T--A---T-----G-T---TT-CA----------A---ATTACAGACTTGTGTCT---TTGTTAA---------GTTGTT-GTGGCAA-GCTT------TTTGAGAG---AATCAT------------GT-T---TA-AAA---ATAT-G-TAT--A---A----T--T-TCC-T---G-TA---TGAT-AA-TAA-T---TTA-A--TGTA-TA--AATA----TCAATCAGGC--TTTTTACCT-AA-----AT-ATTCAAC-
gi|96850 : ACTCTGAACTT--CCAAATTTTGTTT-TGAAAACAGTTAC--CACAATT--------C-A--TG----ATATCAATA-------TCACAG-A--ACAAGA---AATTTCTGA---TGT---TCTTT--C---C----AA------T---TTAGT-TGT--C------AAA-AAAA-C-T----TGC--GGCCC---A-G---ACGA-AATAA---G-CCA-------------------T-CA----CA----TG---TT--AAA-----------A----C----A-C--T--AT--G------C-TGA-CCG-CT-T--T-GC---A--TCATT--TTTAATA-GGTC--TC----AA----T-----AA-G------AAAGCAT-A----T-AC-C-CA-AA--T-TGT---TCAAA-----A--TA------AG--C-A-AA---T-G-TAATGCCAT---T--ATTCAAA-AA--GGG----TG-CTAA---A--G--A---T-----A-T---TC-CAT---C--A--A---ACTAAAGACC--TAT-T---TCATTAATGACATGTAGTTGTA-TTGGTAA-GGTC------ATGGAAAG---AGT--A------------AT-A---TTCAAGC----AT-T-TATGCA---A----T--TATTC-A---C-AT---TT-A-AA-TAA-C---CTG-A--TTTA-TA--AAAA----TCAGTCAGGG--TTT---CTT-CC-T-GGTC-ATTCAAC-AATTT
gi|96853 : tacaattgatgatactg--ACTTTACCACAATACATTC-CCAAAAC--AGATGTT-TCATTAG--AA-ACTA--TT----AC-----TA-------TAACTG-A--GCAGGAAATAA-----AA---TAT---T-TTG--AAAAT----AC------T-----AGA-T-A--T------AAATAAAG-C-CA---GTG--GCAGT-----G---ATAT-TATAA---G-CCACA-A-----------------TA----------TA---CT--AAAGGAAACAGCT-A----C----AGT--T--AT--A---T--C-AAAGCCT-CT-A--T-GT---AT-T-ATT--TTTAATA-GATC-CCT----AA----G-----T--G------AGTGTTG-C----T-TT-C-CA-GA--A-TGC---TGGAA-----A--TT------TG--C-A-AA---T-G-TCATGCCAT---T--GTTTAAA-AA--GGG----A--TGTG-C-T--A--A---T-----G-T---TA-CAA---C--T--G---ATTATAGACCGATTTCT---TTATTGA---------GTTGTG-TTGGAAA-ACTT------TTTGAAAG---AGT--T------------
gi|96854 : TGCATCT-T---AAC--T-ACAATAC-ATTCCTCAA-AC-AGATGCTACAT-----CAGAAAATATTACTATA--ACTAAGCATGA-----AA---TAA---AAT----A---T----AT------T---TTGAA-A-A--T------AAATAAAG-C-TT---GT---GGAAG---T-G---ATAG-TATAA---G-CCACA-AGA---------------------CAATA-AA---AG--AAA---------C-AGCTAC----AGT--T--AT--A---T--C-AAAGCCT-TT-A--T-TT---A--T---TACTTTAATG-GATC-CCT----AA----G-----T--G------AATGTTG-C----T-TT-C-CA-GAAAG-T-----TGGAA-----AATTT------TG--C-A-AA---T-G-TCAT-CCAT---T--ATTTAAA-AA--GGGA---T--CTG--C-A--A--A---T-----G-T---TA-TAA---C--T--A---ATTATTGGCCTATTTCT---TTATTGA---------GTTGGG-TTGGAGG-AGTT------TTTGAAAG---AGT--T------------GT-A---TGTAAAC--ACAT-T-TAT--A---A----T--A-ATC-T---T-AA---TAGT-AA-TGA-A---CTC-A--TTTT-CA--AGAA----CCAGTCTGGT--TTT---CT
gi|96856 : AAAAC--TAATGATACTCTTTC--TA-AT-A--TT----AT-----TA-------TTACAA-A--GTCTGAAATAAAA---GA---TAC---GATTG--A---A----AT------T---CTTGA-C-T--C------AAACAAAT-C-T----GTT--G-AGA---ATG---ATAA-AATAA---G-TCACACG----T---------TT-TG----AAGTA-TA---CA--AAA---------T-A----T----A-G--T--AT--T---T--C-TAAACCT-CTAG--TACT--------GTTA-TTTAATA-GATC-ATT----AA----T-----T--A------TAAGTGA-A----T-TT-C-CA-GA--T-TTA---TG----------------------------------A-TAATGCCAC---T--TTTCAAA-AA--AGG----T--AAAA-C-A--A--A---C-----C-C---GG-CGT---C--T--T---ATTATCGACCAATTTCA---CTCTTAA---------GCTGTA-TTGGCAA-GTTA------ATCGAAAG---AAT--T------------GT-G---TACAAAC--ATAT-A-TAT--A---A----T--T-TTC-T---T-CT---TGGT-AA-TAA-C---CTC-A----TA-TA--AGTT----ACAATCTGGA--CTT---CTC-AA-A-GGAC-ATTCCAC-GGTTT
gi|96857 : AAAAC--TTATAATTCCCTTTC--AC-AT-T--TT----AT-----AA-------TAACTG-AGGAT--GATATATCT---GA---ACT---TATTA--G---T----AC------T---T--AA-C-CAGT------AAATAAGGCC-T----GT---GGTCA---T-G---ATAT-GATCA---G-TCACA-GAA--T---------GC-TG----GAATA-TGTGTCG--AAA---------------------G-C--T--AT--T---T--C-AAAA----CT-A--T-TTTAAA--T-TTTA-TTTAACC-GTTC-TTT----AA----G-----T--G------AAGGTAT-A----T-AT-C-CC-GA--T-TTG---TGGAA-----G--AT------TG--C-A-AA---T-G-TAACTCCCA---A--TTCTAAA-AA--GGG--------AGA-C-A--A--G---TCATTGG-T---GT-CA----------A---ATTACAGACCTGTGTCT---TTACTTA---------GTTGTG-TCGGAAA-ACTT------GTTGAAAG---GCT--T------------GT-T---TTTAAGA--ATAT-G-TAT--A---A----C--T-TTT-T-----CT---TGAT-AA-TAA-T---TTG-A--TTTA-TA--AATA----CCAGTCAGGC--TTT---TT
gi|96849 : C-A--TG----AG-----CT-------TT--TG-A--ACC-GATATAAGT---GA---CATACATGTC-------T----AC------T---TTA---C-C--C------AATTTTAG-A-C----GT-----------A-T---ACAACAGTGA---C-TTAAA-GGG--T---------TT-GA-----AGTA-TA---TA--AAA---------T-A----T----A-G--T--AT--T---T--C-TAAACCT-CTAG--TACT--------GTTA-TTTAATA-GATC-ATG----AA----T-----T--A------AATGTGA-A----T-TT-C-CA-GA--T-TTA---TGGAA-----A--TC------AGTCC-T-A------G-TAATTCCAC---T--TTTCAAG-AA--AGG----T--AAAA-C-A--A--A---C-----T-A---AG-CGT---C--T--A---ATTATCGACCAATTTCA---CTCTTAA---------GCTGTA-TTGGCAA-GTTA------ATGGAAAG---AAT--T------------GT-G---TACAAAC--ATATATATAT--A---A----T--T-TTC-T---T-GT---TGAT-AA-TAA-C---CTC-A--TTTA-TA--AATT----ACAATCTGGA--TTT---CCC-AG-A-GGAC-ATTCCAC-GGTTT
gi|96860 : aaaatacaaagatagatagataaaagtttttatcttataagtgtatatatatatataaacaaatagataacaacaaaattgtaagctcttT---GA---TAT---TATC-------T----CC------TCACTTA-A-T-A--C------AAATAAAG-C-C----AGT--GGTCT---A-G---ACCA-AATAA---G-TCATA-AAA--TGATAAGAGGTT-TG----CAGAT-T----CT--AT----------C-A----C----A---------------------AAACCA-TTAG--T---------T-ATCA-TTT--TT-ATCC-GTT-----C----TG----T--A------CAAG-AA-AGTTTT-TT-C-CA-AA--ACTCA---TGGAA-----G--AT------AG--C-TCA---------AATTACTCCCAT--CTTCAAA-AA--GGG--------AGA-TAA--A--A---C-----GTT---AA-CTT---C--T--A---ATTATAGACCCGTTTCA---CTTTTAA---------GCTGTT-GTGGAAA-GATT------CTTGAAAG---AAT--A------------GT-T---TTTAAAA--ATAT-G-TAT--A---A----C--T-TTT-T-----CT---TGAC-AATTCA-A---TTA-T--TGTA-TA--AATT----TCAGTCTG----TTT---TTT-
gi|96859 : T---GA---TAT---CATC-------TCCTCAC------T---TTATA-C-----------AAATAAAG-C-C----AGT--GGTCC---A-A---ACCA-AATTA---G-TCATG-AAA--T---------GA-TA----AAGGGATG---C-----G---------C-A----G----A-T--T--CT--A---T--CACAAAACC----G--T--T---AGTT-ATCA-TTT--TT-AACC-GTTCTATAC----A-----A--G------AAAGTAT-T----T-TT-C-CA-AA--C-TCA---TGGAA-----G--AT------AG--C-T-CA---A-G-TCACTCCCA---T--CTTCAAA-AA--GGG--------AGA-T-A--A--AA--C-----G-T---AAACTT---C--T--A---ATTATAGACCCGTTTCA---CTTTTAA---------GCTGT-------------T------GTGGAAAG---A-T--TCTTGAAAGAATAGT-T---TTTAAAA--ATAT-G-TAT--A---A----C--T-TTT-T---T-TT---TACA-AA-TCA-A---CTG-T--TGTA-TA--AATA----TCAGTCTGG---TTT---TTT-A
gi|96861 : ---GA---CAT---GATTT--G---T----TT------T---TTAGG-T-G--T------GAATAAAG-C-T----GTA--GCGCC---A-G---ACTG-AGTAA---A-TCAGA-GAA--T---------TT-TA----AAACT-AA---CC--AAG---------G-G----T----A-C--A--AT--T---T--C-AGAACCG-TT-A--T-GT---A--T-TTGA-TTTAATA-AGAC---T----AT----T-----T--G------CAAGGAATA----T-TTAC-CA-------TTAAACTAGAA-----A--CA------TG--C---AC---TTG-TTATGCCCC---T--TTATAAA-AA--AGG----C------------A--A---C-----T-T---GT-CATGTGT--T--AGATATTACAGATCTTTATCT---CTGTTAA---------GTTGTA-TTGGTAA-ACTT------ATGGAAA
gi|96862 : ------T---TTAGG-T-G--T------GAATAAAG-C-T----GTA--GGGCC---A-G---ACCT-AGTAA---G-TTACA-TAA--T---------TT-TA----TA-----A---CT--AAC---------C-A---------A-CGGT--AT--AATTT--C-AAAACCT-TT-A--T-GT---A--T-TTTA-TTTAATA-AGT--ATT----TT----T-----TAGG------AATCT--------T-TT-C-CA-------------TGTAA-----C--TTGA----AA--CAT-GCATTT-G-TTATGCCCC---T--TTATAAG-AA--AGG-------CGAT-C-C--A--T---C-----G-T---GT--GT---TAGT--A---ATTACAGACCTATTTGC---CTGTTAA---------GTTATA-TTGGTAA-ACAT------ATGGAACG---TTG--T------------GT-G---TATAAGT--ATAT-A-TAC--A---C----T--T-TCC-
gi|96864 : ------T---TTAGG-T-C--T------GAATAAAG-C-T----GTA--GGGCC---A-G---ACCT-AGTAA---G-TCACA-GAA--T---------TT-CA-----------------------------------------------------------------AAACCT-TT-A--T-GT---A--T-TTTA-TTTTAAA-AGTC---T----AT----T-----C--GTGAGG-AATCT--------T-TT-C-CATG------CAAC-TGGAA-----A--CA------TG--C---AC---TTG-TTGTGCCCC---T--TTATAAG-AA--AGG-------CGAT-T-C--A--T---C-----G-T---GT--GT---TAGT--A---ATTACAGACCTATTTCC---CTGTTAA---------GTTGTA-TTGGTAT-ACTT------ATGGAACG---TTG--T------------GT-G---TACAAGT--ATAT-A-TAT--A---A----A--T-ACC-T---T-ATCTCTGAG-AA-T--------------CTTA-TA--TATTCTAGACAATCAGG---TTT---TTT-AATT-GGTC-ATTCCAC-TGT
gi|96863 : ------T---TTAGG-T-G--T------GAATAAAG-C-T----GTA--GGGCC---A-G---ACCT-GTTAA---G-TTACA-TAA--T---------TT-TA----TA-----A---CT--AAC---------CAA----C----G-G--T--ATAAA---T--T-CAAACCCTTT-A--T-GT---A--T-TTTA-TTTAATA-AGTA-TTT----------T-----T--G------AG---GA-A----T-CT-T-----A--T-CCA---TGTAA-----C--TTGA----AA--CAT-GCATTT-G-TTATGCCCC---T--TTATAAG-AA--AGG-------CGAT-T-C--A--T---C-----G-T---G--TGT---TAGT--A---ATTACAGACCTATTTCC---CTGTTAA---------GTTATA-TTGGTAA-ACAT------ATGGAACG---TTG--T------------GT-G---TATAAGT--ATAT-A-TAC--A---C----T--T-TCC-
gi|96865 : --C------AAATAAAG-C-T----GTT--GGGGA---A-G---ACTT-AATAA---G-TCATA-CAA--T---------TT-TA----AAAAA-TA---CT--CGT---------A-A----T----A-C--T--TT--T---T--C-AAAACCA-CT-T--TGCA---A--TCGT---TTTAACA-AATT-TCT----AA----A-----T--G------AATGTGT-A----T-TT-C-CA-AG--T-TCT---TGGAA-----G--TC------GG--C-T-AT---A-A-TTATGCCGC---T--GTTTAAA-AA--GGGGGATT--C----C-G--A--T---T-----G-T---G----T---T--TAAA---ACTACAGACCTATATCT---TTACTTA---------GCAGTA-TTGGCAA-ACTT------ATGGAAAG---GAC--C------------AT-G---TACAAAC--ACAT-A-TAT--A---A----C--C-ATC-T---C-CT---TGAT-AA-CAA-T---TTG-A--TATA-TAATAAT------CAGTCCGGT--TTT---C-T-AA-G-AAGCTATTC
gi|96866 : --C------AAACAAAG-C-T----GTT--GGGGA---A-G---ACTT-AATAA---A-TCATA-CAG--T---------TT-TA----AAAAA-TA---CT--CGT---------A-A----T----A-C--T--AT--A---T--C-AAAACCA-TT-T--TGCA---A--T-CTT--TTTAACA-AATC-TCT----AT----A-----T--T------AATGTGT-A----T-TT-C-CA-AG--T-TCT---TGGAA-----G--TC------CG--C-T-GT---A-G-TTATGCCAC---T--GTTTAAA-AAT-GGGGAT-T--C----C-G--G--T---T-----G-T---GT-T-T---C--A--A---A-------CTAATATCT---TTACTAA---------GCTGTA-TTGGCAC-ACTT------ATGGAAAG---GAC--A------------AT-G---TACAAAC--ACAT-A-TAT--A---A----C--C-ATC-T---C-TT---TGAT-AG-CCA-T---TTG-A--TATA-TA--ATAA----ACAGTCCGGT--TTT---CTA-AG-A-GGCC-ATTTCAC-AGTTT
gi|96867 : ------AAATAAAG-T-A----AGC--GGTAC---T-G---ACAC-TATAA---G-TCACA-AAA--TG--------CT-TA----AAGGT--G---CTGTAAG---------A-A----C----A-------AT--T---T--C-TGAACAT-CT-T--A-CT---C--T-TTTA-TATAATC-GTTCTATT----AC----C--------G------AAAGTCA-T----T-TC-C-CT-AA--C-TCA---TGGAA-----A--AT------AG--C-C-CA---T-G-TAACTCCTA---TATTTTTGAA-AG--TGG----A--TAAGTC-A--A--------------T---TC-CAT---C--T--A---ATTATAGACCAGT---TAAGTTGCTAA---------GCTGTG-TCGGAAA-GATT------TTAGAAAG---AAT--A------------AT-T---TTTAAAC--AAAT-G-TAT--A---A-------C-TTC-T---T-CT---TGAGTAA-CAA-T---TTA-T--TGTA-TA--AAAA----CCAGTCTGGC--TTT---TT
gi|96868 : AATAAGG-C-T----GTA--GGGTA---A-G---ACCT-AGTAA---G-TCGCA-GAA--T---------TT-TA----AA-----A---CT--AAC---------C-A----TGGGTA-C--A--AT--T---T--C-AAAACCT-TT-A--T-GT---A--T-TTTA-TTTAATA-AGTC-TTT----TC----G-----C--G------AG---GA-A----T-CT-T-----A--T-TCA---TGCA---------------------C-T------T-G-TTAT-CCCC---T--TTATAAG-AA--AGG-------CGAT-T-C--A--T---C-----G-T---GT--GT---TAGT--A---ATTACAGACCTATTTCC---CTGTTAA---------GTTGTA-TTGGTAA-ACTT------ATGGAACG---TTG--T------------GT-G---TATAAGT--ATAT-A-TAT--A---A----T--T-
gi|96869 : A-AATTATAAG-TAACA-AAA--TG--------CT-TA----AAGGT--G---CTGTAAG---------A-A----C----A-------AT--T---T--C-TGAACCT-CT-------T---A--C-ACT--TTTA-TATAATC-GTTCT--AT----TAC---C--G------AAAGTCA-T----T-TC-C-CT-AA--C-TCA---TGGAA-----A--AA------AG--C-T-CA---T-G-TAACTCCTA---T--TTTTAGG-AAAGGGG----A--TAAGTC-A--A--------------T---CC-CAT---C--T--A---ATTATAGACCAATGTCG---TTGCTCA---------GCTGTG-TCGG
gi|96871 : -C--T--AT--A---TTTC-CAAATAT-CT-AGTT-CT---A--T---TA-TTTAATA-GTAC-ATG----AC----A-----T--G------AATGGAA-A----C-GC-A-CA-TA--T-TTA---TGGAA-----A--CA------AG--C-T--T---T-GATAATGCCAC---T--CTTCAAA-AC--AGG----T--AAAA-C-A--A--A---A-----C-T---GG-CGT---C--T--A---TTTATCGATCGATATCT---CTCTTAA---------TCTGTG-TTGGCAA-GTAA------ATGAAACA---AAT--T------------GT-T---TACAAACGTATAT-T-TAT-----------T--T-TTC--------T---TGTA-AA-CAA-AAACCTC-A--TTTA-TA--AATC----ACATTCAGGA--TTT---CTA-CA-T-GGAC-ACTCTAC-GGTCT
gi|96872 : --T--AT--T---T--C-AAAACCT-CT-A---------A--T-GTTACTTT--TT-AATC-GTT-----C----TATAAAC--G------AAAGTAA-A----T-TC-C-CT-GA--A-TCC---AGGAA-----A--AT------AG--C---ACA--T-G-TAAC-CCCC---C--TTTTAAGCAA--GGG---------GA-C-A--A--GT--C-----G-TT--GC-CCT---C--T--A---ATTATAGACCAGTATCA---CTGTTGA---------GTTGTT-TGGGAAA-AGTT------TTAGAAAG---AAT--A------------AT-T---TTCAAGC--GTAT-G-TAT--A---A----C--T-TTC-T-----AC---TAAA-CA-TAA-T---ATG-C--TGTT-CA--AATG----TCAGTCTGG---TTT---CTT-
gi|96870 : AAACCA-CT-T--T-CA---A--T-TTTA-TTTAACC-GTTC-TTT----AA----G-----T--G------AAGGTAT-A----T-AT-C-CC-GA--T-TTG---TGGAA-----G--AT------TG--C-A-AA---T-G-TAACTCCTA---T--TTTTAAA-AA--GGG--------AGA-C-A--A--G---TCATTGG-T---GT-CA----------A---ATTACAGACCTGTGTCT---TTACTTA---------GTTGTG-TTGGAAA-ACTT------TTTGAAAG---GCT--T------------GT-T---TTTAAGA--ATAT-G-TAT--A---A----C--T-TTT-T---T-CT---TGAT-AA-TAA-T---TTG-A--TTTA-TA--AATA----CCAATCAGGC--TTT---TT
gi|96873 : tttaaaaagcaattgcaC-CT-G--T-A----A--T-GTTACTTT--TC-AATC-GTT-----C----TATAACC--A------AAAGTAA-A----T-TC-C-CT-GA--C-TCA---TTGAA-----A--AT------AG--C---ACA--T-G-TA------T---T--TTTTAAA-AA--AGG---------AA-C-A--A--GT--C-----G-TTTGGC-C-T---C--T--T---ATTAT--ACCAGTATCC---ATGTTCA---------TCTGTT-TGGGGAAGATTT------TTAGAAAG---AAT--A------------AT-T---TTCAAGC--GTAT-G-TAT--A---A----C--T-TTC-T-----AC---TAAATAA-TAA-T---CTG-C--TGTA-CA--AATA----ATAATC
gi|96874 : TTAATA-AGTC-ATTCA--AT----T-----T--T------AAAA-AA-A----T----------A--C-TCG---T--AA-----G--TC------GG--C-T-AT---A-G-TTATGCCGC---T--GTTTAAA-AA--GGGGGATT--C----C-G--A--T---T-----G-T---GC-T-T---C--A--A---ACTACAGACCAGTATCT---TTACTTA---------GCTGTA-TTGGCAA-ACTT------ATGGAAAG---GAC--C------------AT-G---TACAAAC--ACCC-A-TGT--A---A----CCAT-TGC-T------T---TGAT-AA-CAA-T---TTG-A--TATA-TAGTAA------ACAATCCGGT--TTT---CTA-AG-A-GGCC-TTTCCAC-AGTTT
gi|96875 : TTAATA-GTTC-TAT----AC----A-----A--G------AAAGTAT-T----T-TC-C-CA-AA--ACTCA---TGGAA-----G--ATCGCTCAAG--T-T-AC---T-C-CAAT-----------CTTCAAA-AA--GGGAGA-T--AAAA-C-ATTA--A---C-------T--------T---C--T--A---ATTATAGACCCGT-TCA---CTTCTAA---------GCTGTT-GTGGAAA-GATT------CTTGAAAAATTAGT--T-------------T-C---TAGAAAT--ATA----TAT--A---A----C--T-TCT-T---G-AC------A-AA-TCA-A---CTA-T--TGTA-CA--AATA----TCAGTCTGG
gi|96876 : ------AATATCA-A----T-AT-CACA-GA--A--CA---AGAAA-----T--TT----------C-T-GA---T-G-TAATGCCAT---T--ATTTAAA-AA--AGA----TG-CTAA---A--G--A---T-----A-T---TC-CAT---C--A--A---ACTATAGACCTATTTCA---TTAATTA---------GATGTA-TTGGTAA-GGTC------ATGGAAAG---AGT--A------------AT-A---TTCAAGC--ATTT-A-TAC--A---A----T--T-ATT-T---ACAT---TT-A-AA-TAA-C---CTG-A--TTTA-TA--AAAA----TCAGTCGGGG--TTT---CTC-CC-A-GGTC-ATTCAAC-AATTT
gi|96878 : --G-TTA---TGGAA-----G--TC------AG--C-T-AC---T-G-TAATGCCTC---T--TTTTAAG-AA--AGG----T--CAAA-C-A--A--A---C-----G-T---GC-CAT---C--T--A---ATTAAAGGCCAATATCT---TTATTAA---------GCTGTG-TTGGTAA-ACTT------ATGGAAAG---GGT--T------------GT-C---TACAAAC--ATAT-T-TAT--A---A----T--T-TTC-T---G-AT---TGAA-AA-TAA-A---CTA-A--TTTA-CA--AATT----GCAATCCGGA--TTT---CTT-AA-G-GGCC-ATTCGACAAGTT
gi|96880 : ---T--TTTTAAA-AAAAGAG----T--CAAA-C-A--T--ATC-C-----G-T----C-AAG---C--T--A---AATA----CCAATTTCT---TTAATTA---------GTTGTA-TTGTTAA-GGTA------ATGAAGCG---TAT--C------------GT-T---TTCAAA---ATATAT-AAC--A---A----A--T-ATC-TATAG-TT---TG----A-TGA-C---TTA-A--TTTATCA--AAAT-----CAATCAGGATGTTT---ACC-AA----GAC-ATTCGAC-TGTTT
gi|96877 : --T--A---ACTATAGACCTATATCA---CTGTTAA---------GC-GTAATTGGCAA-AGTG------TTTGAAAG---ACT--T------------AT-T---TTTAAAC--ACAT-G-TAT--A---A----T--T-TCT-T---T-CG---TGAT-AC-TAA-T---TTT-A--TTT--CGT-CATT----TCAATCTGGT--TTT---GTT-CC-T-GGTG-ATTCAAC-AATT
gi|96879 : caaaagtctggaaagaagcatttgtatgcgctgtttataaaaaaggagacccttctttggttaaCCAATATCT---TTACGTA---------GCTATA-TTGACAA-ACTT------ATGGAAAG---GAC--C------------ATACATGTACAAAC--ACAT-A-TAT--A---A----C--C-ATC-T---C-TT---TGAT-AA-CAA-T---TTG-A--TGTA-TAGTAA------ACAGTCCGG-----T---CTTCAA-GAGGTC-ATTCCAC-AGTTT
gi|96881 : aatcccactgtttaaaaagggggattccgattgtgtttgaaacttcacaTTGA---------GTTTTG-TTAGTAA-ATTA------ATGGAAAG---AGT--T------------GT-T---TACAAAC--ATAT-T-TAT--A---AT---T--T-TTT-T---T-TT---TGCT-AA-TAA------TT-A--TATA-CA--AGTT----ACTGTCAGGA--TTT---TTA-AA-A-GGTC-ATTC
gi|96882 : AA---------G-TATG-TTGGTAA-ACTT------ATGGAAAG---AGT--T------------GT-C---TACAAAC--ATAT-T-TAT--A---A----T--T-TTC-T---G-AT---TGAA-AA-TAA-A---CTA-A--TTTA-CA--AATA----GCAATCCGGA--TTT---CTT-AA-G-GGAC-ATTCGAC-AGTTT
gi|96883 : AA-ACTTGAATGGATGGAAAG---AGT--C------------GT-T---TACAAAC--ACAT-G-TAT--A---ACTTTT--T-TTT-T---G--T---TGCT-AA-TAA-C---TTG-A--TATA-CA--AGCT----ACAATCAGGT--GTT---TTA-AA-A-GGTC-ACTCAAC-TGTT
2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|96855 ): TTGAAAACTCATAATGTTCTTGATAACGTCATGGTAACAGAAACAGAAGTAGAAGATGTAATTCTCTCATTGAATCCAAATAAGTCAAGTGGGCCGGATGATATATGTCATAAAATGTTAAAAGGAGTTGCCAAATCAGTATCTAAACCATTAACATTATTATTGAATCGCTCTCTATCAGAAAGTATTTTTCCAGATAGCTGGAAAACATCAAATGTTATTCCTATATTTAAAAAAGGAGATAAATTCATGGTAAGTAATTATAGACCAATGTCATTATTAAGCTGCACCGGAAAATTATTAGAAAGATTAGTGTTCAAATATTTGTATAATTTTTTAATTAGCAATAATTTATTATATAAATATCAATCGGGTTTTTTACCTAACCACTCGACAAGTTT
Unaligned ( gi|96858 ): TGATATATCTGACATTTTAAACACTGTTAATATAAATAAAGCATGTGGCCATGACTCTGTAAGCCATAAGATTCTTAAAGGGGTAACAAAACCCATATCTAAACCTTTAGCCGTACTTTTTACCCGCTCTCTGAATGAAGGGATTTATCCTGACGTTTGGAAGATAGCAAATGTTACACCAATATATAAAAAAGGTGACAAGTCTATAGCTTCAAACTATAGACCAGTTTCTTTACTTAGCTGTTGTGGTAAGATATTTGAAAGAATCATTTTTAAACACATGTACAACTTTCTTCTTACAAATAAATTATTGTATAAATATCAATCAGGATTTCT
Alignments
lowQualScore : 1111111 222222222222222222222222222222222222222222 1111111 11 111111111111111 1111111111111111111111111 33333333333333333333333333333333333 111111111111
lowQualScore : 666 3 88888 7777 44 3 44 0 0 2 55555 4 2 0 666666 1 33 2 2 88888 33 5555 55555 7777777 0 0 2 33 33 1 3 333 333 3333 5555555 4444 555555 333 1 66666666666 3 1 99999 777777 555 1 1 3 77777 333333333333333333333333333333333333333333 11 5555 11 1 4 0000000 222 11 6666 2 33 333333333333333 333333 4 22 1 1 1 11 222 33 222 7777777777777777777777777 1 2 0 1 11 11 22 66666666666666666666666666666666666 111 77 22 111 1 1 1 1 222222 22 1 1 222222 1 3 000000000000 33333 0 11 1 1 11 222 333 1 44444 66 11 3 4 11 3 1 1 22 5555 2 444 222 777 1 2 3
lowQualScore : ... . ..... .... .. . .. . . . ..... . . . ...... . .. . . ..... .. .... ..... ....... . . . .. .. . . ... ... .... ....... .... ...... ... . ........... . . ..... ...... ... . . . ..... .......................................... .. .... .. . . ....... ... .. .... . .. ............... ...... . .. . . . .. ... .. ... ......................... . . . . .. .. .. ................................... ... .. .. ... . . . . ...... .. . . ...... . . ............ ..... . .. . . .. ... ... . ..... .. .. . . .. . . . .. .... . ... ... ... . . .
lowQualScore : 444 3 33333 1111 22 1 22 7 2 7 99999 3 4 7 888888 6 22 4 4 22222 22 0000 99999 6666666 4 2 4 22 22 6 9 555 555 9999 1111111 2222 000000 000 7 55555555555 1 5 77777 333333 777 9 5 0 00000 555555555555555555555555555555555555555555 88 1111 88 5 1 0000000 333 99 7777 3 44 444444444444444 444444 4 99 2 2 2 66 111 00 000 7777777777777777777777777 1 3 9 4 22 55 66 33333333333333333333333333333333333 999 22 99 888 0 0 1 1 999999 44 6 0 999999 0 3 555555555555 22222 9 44 0 1 44 999 999 1 00000 66 66 7 0 66 5 2 2 00 0000 2 444 666 333 0 3 6
consensus : CAACAATAGATGAAAATACAAACA---ATA-ATA-----CT----CT--A-CTT--CCAGAGTGTATCT-TTA-----AAACTAATA-ATACCA------TTGC--AA-A-C-----A--TG----AT-----CA-------TTACTG-A--ATCAGACATAATTGA---T---AT---TATCG--G---T----AC------T---TTAGA-C-C--C------AAATAAAGC-T-GTC----GGN---NAAGACAN-AATAAGTCACA-GAAT-TTTA----AA----G----TT--T----A---CN---AAACA----CA----CT--ATN---T--CNAAACCNCT-G--T-CTA---T-GTTA---TTTAATAGNTCT-TT-----AC----NT--GA------ATGTAA-AT-TT-C-C--A---GAN-TCA---TGGAAG-----TC--A-G--C-T--AN---TG-TAATGCCNCT-TTTTA--AAAA--GGG----T-CAAA-CA--A---A---CG-T---GC-CGT---C--T--A---ATTATAGACCNATNT-CTTTATTAA------GCTGT-GTTGGTAA-ACTT------A-TGGAAAGAGTT------------GTN----TACAAAC--ATATNTA-TA--A---TT---TTC-TNN---TTGA-NAAT--AANCTGA--TT-TA-CA-AATNNCAGTC---CGGNTTT---CT--TAA-G-GGNCATTCGAC-AGTTT
Reference ( family-531 ) : CAACAATAGATGAAAATACAAACA---ATA-ATA-----CT----CT--A-CTT--CCAGAGTGTATCT-TTA-----AAACTAATA-ATACCA------TTGC--AA-A-C-----A--TG----AT-----CA-------TTACTG-A--ATCAGACATAATTGA---T---AT---TATCG--G---T----AC------T---TTAGA-C-C--C------AAATAAAGC-T-GTC----GGN---GAAGACAN-AATAAGTCACA-GAAT-TTTA----NA----G----TT--T----A---CN---AAACA----CA----CT--ATN---T--CNAAACCNCT-G--T-CTA---T-GTTA---TTTAATAAATCN-TT-----AC----TT--GA------ATGTAA-AT-TT-C-C--A---GAN-TCA---TGGAAG-----TC--A-G--C-T--AC---TG-TAATGCCNCT-TTTTA--AAAA--GGG----T-CAAA-CA--A---A---CG-T---GC-CGT---C--T--A---ATTATAGACCNATNT-CTTTATTAA------GCTGT-GTTGGTAA-ACTT------A-TGGAAAGAGTT------------GTN----TACAAAC--ATATNTA-TA--A---TT---TTC-TNN---TTGA-NAAT--AANCTGA--TT-TA-CA-AATNNCAGTC---CGGNTTT---CT--TAA-G-GGNCATTCGAC-AGTTT
gi|96841 : CAACAATAGATGAAAATATAAACA---ATA-ATA-----CT----CT--A-CTT--CCAGAGTGTATCT-TTA-----AAACTTATA-ATACCA------TTGC--AA-A-C-----A--TG----AT-----CA-------TTACTG-A--ATCAGACACAATTGA---T---AT---TATCG--G---T----AC------T---TTAGA-C-C--C------AAATAAAGC-T-GTC----GGA---GAAGACAA-AATTAGTCACA-GAAT-TTTA----CA----G----TT--T----A---CT---AAACA----CA----CT--ATA---T--CTAAACCCCT-G--T-CTA---T-GTTA---TTTAATAAATCG-TT-----AC----TT--GA------ATGTAA-AT-TT-C-C--A---GAG-TCA---TGGAAG-----TT--A-G--C-T--AC---TG-TAATGCCTCT-TTTTA--AGAA--GGG----T-CAAA-CA--A---A---CG-T---GC-CAT---C--T--A---ATTATCGGCCAATAT-CTTTATTAA------GCTGT-GTTGGTAA-ACTT------A-TGGAAAGAGTT------------GTC----TACAAAC--ATATTTA-TA--A---TT---TTC-TGA---TTGA-AAAT--AAACTAA--TT-TA-CA-AATTGCAATC---CGGATTT---CT--TAA-G-GGACATTCGAC-AGTTT
gi|96842 : CAACAATAGATGAAAATATAAACA---ATA-ATA-----CT----CT--A-CTT--CCAGAGTGTATCT-TTA-----AAACTAATA-ATACCA------TTGC--AA-A-C-----A--TG----AT-----CA-------TTACAT-A--ATCAGACATAATTGA---T---AT---TATCG--G---T----AC------T---TTAGA-C-C--C------AAATAAAGC-T-GTC----GGA---GAAGACAA-AATTAGTCACA-GAAT-TATA----CA----G----TT--T----A---CT---AAACA----CA----CT--ATA---T--CTAAACCCCT-G--T-CTA---T-GTTA---TTTAATAAATCC-TT-----AC----TT--GA------ATGTAA-AT-TT-C-C--A---GAG-TCA---TGGAAG-----TC--A-G--C-T--AC---TG-TAATGCCTCT-TTTTA--AGAA--GGG----T-CAAA-CA--A---A---CG-T---GC-CAT---C--T--A---ATTATCAGCCAATAT-CTTTATTAA------GCTGT-GTTGGTAA-ACTT------A-TGGAAAGAGTT------------GTC----CACAAAC--ATATTTA-TA--A---TT---TTC-TGA---TTGA-AAAT--AAACTAA--TT-TA-CA-AATTGCAATC---CGGATTT---CT--TAA-G-GGACATTCGAC-AGTTT
gi|96843 : CAACAATGGATGAAAATATAAACA---ATA-ATA-----CT----CT--A-CTG--CCAAAGTGTGTCT-TTA-----AAAC----------CA------TTGC--AA-A-C-----A--TG----AT-----CA-------TTACTG-T--ATCAGACATAGTTGA---T---AT---GATCG--G---T----AC------T---TTAGA-C-C--C------AAATAAAGC-T-GTC----GGA---GAAGACAA-AATTAGTCACA-GAAT-TTTA----------G----TT--T----A---CA---AAACA----CA----TT--ATA---TATCTAAACCCCT-G--T-CTA---T-GTTA---TTTAATAAATCC-TT-----ACTTACTT--GA------ATGTAT-AT-TT-C-G--A---GAG-TCA---TGGAAG-----TC--A-G--C-T--AC---TG-TAATGCCTCT-TTTTA--AGAA--GGG----T-CAAA-CA--A---A---CG-T---GC-CAT---C--T--A---ATTATCGGTCAATAT-CTTTATTAA------GCTAT-GTTTGTAA-ACTT------A-TGGAAAGAGTT------------GTC----TACAAAC--ATATTTA-TA--A---TT---TTC-TGA---TTGA-AAAT--AAACTAA--TT-TA-CA-AATTGCAATC---CGGATTT---CT--TAA-G-GGACATTTGAC-AGTTT
gi|96844 : CAACAATAGATGAAAATATAAACA---ATA-ATA-----CT----CT--A-CTT--CCAGAGTGTATCT-TTA-----AAACTAATA-ATACCA------TTGC--AA-A-C-----A--TG----AT-----CA-------TTACTG-A--ATCAGACATAATTGA---T---AT---TATCA--G---T----AC------T---TTAGA-C-C--C------AAATAAAGC-T-GTC----GGA---GAAGACAA-AATTAGTCACA-GAAT-TTTA----CA----G----TT--T----A---CA---AAACA----CA----CT--ATA---T--CTAAACCCCT-G--T-CTA---T-GTTA---TTTAATAAATCC-TT-----AC----TT--GA------ATGTAA-AT-AT-C-C--A---GAG-TCA---TGGAAG-----TC--A-G--C-T--AC---TG-TAATGCCTCT-TTTTA--AGAA--GGG----T-CAAA-CA--A---A---CG-T---GT-CAT---C--T--A---ATTATCGGCCAATAT-CTTTATTAA------GGTGT-GTTGGTAA-ACTT------A-TGGAAAGAGTT------------GTT----TACAAAC--ATTTTTA-CA--A---TT---TTC-TGA---TTGA-AAAT--AAACCAA--TT-TA-CA-AATTGCAATC---CGGATTT---CT--TCA-G-GGACATTCGAC-
gi|96845 : CAACAATAGGTGAAAATACAAACA---ATA-CTA-----CT----CT--A-CTT--CCAGGGTGTATCT-TTA-----AAACTAATA-ATACCA------TTGC--AA-A-C-----A--TG----AT-----CA-------TTACTG-A--ATCAGCCATAGTTGA---T---AT---AATCG--G---T----AC------T---TTAGA-C-C--C------AAATAAAAC-T-GTC----ACA---GAAGACAA-AATTAGTCACA-GAAA-TTAA----CA----G----TT--T----A---CA---AAACA----CA----CT--ATA---T--CTAAATC-CT-G--T-CTA---T-GTTA---ATTAACAAATCC-TT-----AC----TT--GA------ATGTAA-AT-TT-C-A--A---GAG-TCA---TGGAAG-----TC--A-G--C-T--TC---TG-TAATGCCTCT-TTTTA--AAAA--GGG----T-CAAA-CA--A---A---CG-T---GC-CAT---C--T--A---ATAATCGGCCAATAT-CTTTATTAA------GCTGT-GTTGGTAA-CCTA------A-TGGAAAGAGTT------------GTC----TACAAAC--ATATTTA-TA--A---TT---TTC-TGA---TTGA-AAAT--AAACTAA--TT-TA-CA-AATTGCAATC---CGGATTT---TT--TAA-G-GGACA
gi|96846 : CAACAATAGGTGAAAATACAAACA---ATA-CTA-----CT----CT--A-CTT--CCAGGGTGTATCT-TTA-----AAACTAATA-ATACCA------TTGC--AA-A-C-----A--TG----AT-----CA-------TTACTG-A--ATCAGCCATAGTTGA---T---AT---AATCG--G---T----AC------T---TTAGA-C-C--C------AAATAAAAC-T-GTC----ACA---GAAGACAA-AATTAGTCACA-GAAA-TTAA----CA----G----TT--T----A---CA---AAACA----CA----CT--ATA---T--CTAAATC-CT-G--T-CTA---T-GTTA---ATTAACAAATCC-TT-----AC----TT--GA------ATGTAA-AT-TT-C-A--A---GAG-TCA---TGGAAG-----TC--A-G--C-T--TC---TG-TAATGCCTCT-TTTTA--AAAA--GGG----T-CAAA-CA--A---A---CG-T---GC-CAT---C--T--A---ATAATCGGCCAATAT-CTTTATTAA------GCTGT-GTTGGTAA-CCTA------A-TGGAAAGAGTT------------GTC----TACAAAC--ATATTTA-TA--A---TT---TTC-TGA---TTGA-AAAT--AAACTAA--TT-TA-CA-AATTGCAATC---CGGATTT---TT--TAA-G-GGACA
gi|96847 : CAACAATAAATGACAGTATTAACA---ATA-ATA-----TG----TT--A-CTT--CCAGGCTGTGTCT-TTA-----AAACGAATA-ATACCA-------------A-A-C-----T--TG----AT-----CG-------TTACTG-A--ATCAGACATAATTGT---T---TT---GATCG--G---T----AC------T---TTAGA-C-C--C------AAATAAAGC-T-GTC----GGA---AAAGACAC-AAT---TCCCA-GAAT-TTTT----CA----G----TA--T----A---CA---AACCA----CA----CT--A-----------AACCACA-G--T-CTA---T-GTTA-------ATAATTCC-TT-----AC----TT--TA------ATGTAA-AT-TT-C-C--A---G---TCA---TGGAAG-----TC--A-A--C-T--AC---TG-TTATGTCTCA-TCTTA--AGAA--AGG----T-CAAA-CA--G---A---CG-T---GC-CAT---C--T--T---ATCATTGGTCAATAT-CTTTATTAA------GCTGT-GTTGGTAA-ACTT------A-TGGAAAGAGTT------------GTC----TACAAAC--ATATTTA-TA--A---CT---TTC-TGA---TTGA-AAAT--AAACTAATTTT-TA-TA-AATTTTTATC---AGGACTT---TC--TAA-T-GGACATTCGAC-AGTTT
gi|96848 : ACAATAGATGATACT-CAAACA---A---AT------------------CTT--CCTGAATTCGTTT-TTC-----AAACAAATA-GTAC-G------TTAA--AAGA-T-----A--TT----AA-----CA-------TCACAG-A--AAAAGAAATAACTGA---T---GT---TCTAG------------------------CAAA-C-C--TCGCTGTAAATAAAGC-T-AGT----GGTCTTGACGACA----TAGGTCACA-AAATGCTCA----AA----GAAACTT--TGTAAA---CTTGTAAACT----TGT---CT--ATT---T--GTAAACCTTA-A--T-GTA---T-TATA---CTTAACAGATC---T-----A------T--GAGAGAAAATGTAT-AT----C-C--A---ACA-TCT---TTGAAA-----TT--A-G--C-T--AA---CG-TTATGCCTTTATTTTA--AAAA--GG-----T---GA-TA--A---ATCTC--T---AC-CGT---C--T--A---ATTATAGACACATTT-CATTGATAA------GCTGT-GTTGGTAA-AGTA------G-TGGAAAGAATT------------GTT----TTTGAAC--ATATTTA-CA--A---TC---ATCTTCA---TTCA--AAT--AA
gi|96849 : AAAATACAAAGATAGATAGATAAAAGTTT----TT--ATCTT--ATA-AGTGTATAT-ATATATATAAACAAATAGATAACAACAAAATTGT--AA-G-CTCTTCA--TG----AG-----CT-------TT--TG-A--ACC-GATATAAGTGA---C---ATACATGTC-------T----AC------T---TTA---C-C--C------AA------T-T-TTA----GAC---GTATACAACAGTGACTTAAA-GGGT-TTGA-----A----G----TA--T----A---TA---AAATA----TA----GT--ATT---T--CTAAACCTCTAG--TACT------GTTA---TTTAATAGATCA-TG-----AA----TT--AA------ATGTGA-AT-TT-C-C--A---GAT-TTA---TGGAAA-----TC--A-GTCC-T--A-----G-TAATTCCACT-TTTCA--AGAA--AGG----T-AAAA-CA--A---A---CT-A---AG-CGT---C--T--A---ATTATCGACCAATTT-CACTCTTAA------GCTGT-ATTGGCAA-GTTA------A-TGGAAAGAATT------------GTG----TACAAACATATATATA-TA--A---TT---TTC-TTG---TTGA-TAAT--AACCTCA--TT-TA-TA-AATTACAATC---TGGATTT---CC--CAG-A-GGACATTCCAC-GGTTTtattatattta
gi|96850 : TACAATTG---ATG-ATA-----CTGACTCTGAA-CTT--CCAAATTTTGTTT-TGA-----AAAC-AGT---TACCA---------C--AA-TTC-----A--TG----ATATCAATA-------TCACAG-A--ACAAGAAATTTCTGA---T---GT---TCTTT--C---C----AA------T---TTAGT-TGT--C------AAA-AAAAC-T-TGC----GGC---CCAGACGA-AATAAGCCA---------TCA----CAT---G----TT----------------AAA-A----CA----CT--ATG---C--TGA--CCGCT-T--T-GCA---TCATT----TTTAATAGGTCT-CA-----AT----AA--GA------AAGCAT-AT-AC-C-C--A---AAT-TGT---TCAAAA-----TA--A-G--C-A--AA---TG-TAATGCCATT-ATTCA--AAAA--GGG----TGCTAA--A--G---A---TA-T---TC-CAT---C--A--A---ACTAAAGACCTATTT-CATTAATGACATGTAGTTGT-ATTGGTAA-GGTC------A-TGGAAAGAGTA------------ATA----TTCAAGC--ATTTATG-CA--A---TTA--TTC-ACA---TTTA--AAT--AACCTGA--TT-TA-TA-AAAATCAGTC---AGGGTTT---CT--TCC-T-GGTCATTCAAC-AATTT
gi|96851 : A---ACA-ATA-----CT----TT--A-CTA--CCAACTTGT-TCTCTTA-----AAACAAACC-ATACAC------TAAC--AA-A-T-----A--TC----AA-----AA-------TAACTG-A--A---AATGAAATTAAGAAT---AT---TATAG--A---T----ACATTTTAT---TTAAAAT-C--C------TAACAAATC-A-GTT----GGA---GAAGATAA-AATCAGTTATA-AACT-TTTA----AA----A----TT--A----A---CA---AAAAA----AT----GT--ATT---T--CTAAACCATT-G--G-TTA---T-GCTT---TATAATAAATCA-CA-----AG----AA--GA------ATGTAA-AT-TT-T-C--A---TAA-TTA---TGGAAA------C--ATG--G-T--TT---AA-TAATGCCACT-ATTTA--AAAA--AGG-------AAA-TA--CTT-A---TA-T---CT-TGT---C--T--A---ATTATAGGCCAATAA-CACTTTTGA------GTTGT-GTTGGTAA-ATTA------A-TGGAAATAGTT------------GTT----TACAAAC--ATATCTA-TATTT---TT---TTT-TTG---TTGC-AAAT--AACTTGA--TA-TA-CA-AGTTACAGTC---AGGATTT---TT--AAA-A-GTTCATTCAAC-TGTTT
gi|96852 : A-ATG-----CT----CT----CTG--CCTAATTTTACTC-GTA-----AAACTGAAA-ATTCAC------TTTC--AA-G-T-----A--TA----AG-----TA-------TATCAG-A--AAAAGAAATAATTGA---T---GT---TATCACCA---T----AC-----------TGAA-C-G--T------AAACAAAGCTT-GT-----GGC---CATGATTT-GATAAGTCATA-AAAT-GTTAAAAGGA----G----TT------------------GCA----CA----CTCAATA---T--TGAAACCACT-G--G-CTT---T-TCTT---TTTAATCGTTCT-TT-----TA----GT--GA------ATGAAC-ATATC-C-C--A---AAG-T-A---TGGAAA-----AT--T-G--C-C--AA---TG-TCACACCGTT-ATATA--AAAA--AGG----T---GA-CA--AGTCA---TA-T---GT-T-T---C--A--A---ATTACAGACTTGTGT-CTTTGTTAA------GTTGT-TGTGGCAA-GCTT------T-TTGAGAGAATC------------ATG----TTTAAAA--ATATGTA-TA--A---TT---TCC-TGT---ATGA-TAAT--AATTTAA--TG-TA-TA-AATATCAATC---AGGCTTTTTACC--TAA-----ATATTCAAC-
gi|96853 : --A-CTTTACCACAATACATTC-CCA-----AAACAGATG-TT-TCA------TTAG--AA-A-CT----A--TT----AC-----TA-------TAACTG-A--GCAGGAAATAA--AA---T---AT---T-TTG--AAAAT----AC------T-----AGA-T-A--T------AAATAAAGC-C-AGT----GGC---AGTGATAT-TATAAGCCACA-ATAT-ACTA----AA----G------------------G---AAACAGCTACAG---TT--ATA---T--CAAAGCCTCT-A--T-GTA---TTATT----TTTAATAGATCC-CT-----AA----GT--GA------GTGTTG-CT-TT-C-C--A---GAA-TGC---TGGAAA-----TT--T-G--C-A--AA---TG-TCATGCCATT-GTTTA--AAAA--GGG----A-TGTG-CT--A---A---TG-T---TA-CAA---C--T--G---ATTATAGACCGATTT-CTTTATTGA------GTTGT-GTTGGAAA-ACTT------T-TTGAAAGAGTT------------
gi|96854 : TGCATCT-T--------AACTA-CA-ATAC-A------TTCCTCAA-A-C-----AGATGCTACAT-----CAGAAAATATTACTATA--ACTAAGCATGA--AA---T---AA---AAT----A---T----AT------T---TTGAA-A-A--T------AAATAAAGC-TTGT-----GGA---AGTGATAG-TATAAGCCACA-AGAC-AATA----AA----A------------------G---AAACAGCTACAG---TT--ATA---T--CAAAGCCTTT-A--T-TTA---T---TAC--TTTAATGGATCC-CT-----AA----GT--GA------ATGTTG-CT-TT-C-C--A---GAA-AGT---TGGAAAAT---TT--T-G--C-A--AA---TG-TCAT-CCATT-ATTTA--AAAA--GGGA---T-C-TG-CA--A---A---TG-T---TA-TAA---C--T--A---ATTATTGGCCTATTT-CTTTATTGA------GTTGG-GTTGGAGG-AGTT------T-TTGAAAGAGTT------------GTA----TGTAAAC--ACATTTA-TA--A---TA---ATC-TTA---ATAG-TAAT--GAACTCA--TT-TT-CA-AGAACCAGTC---TGGTTTT---CT--
gi|96855 : T-TGA-----AAACTCATA-ATGTTC------TTGA--TA-A-C-----G--TC----AT-----GG-------TAACAG-A--AACAGAAGTAGAAGA---TGTAAT---TCTC-------T-----C------A---TTGAA-T-C--C------AAATAA------GTCAAGTGGG---CCGGATGA-TATATGTCATA-AAAT-GTTA----AAAGGAG----TT-------G---CC---AAAT-----CA----GT--AT-------CTAAACCATT-A--A-CAT---T-ATTA---TTGAATCGCTCT-CT-----AT----CA--GA------AAGTAT-TT-TT-C-C--A---GAT-AGC---TGGAAA-----AC--A-T--C-A--AA---TG-TTATTCCTAT-ATTTA--AAAA--AGG-------AGA-TA--A---ATT-CA-T---G---GT---AAGT--A---ATTATAGACCAATGT-CATTATTAA------GCTGC-ACCGG-AA-AATT------ATTAGAAAGATTA------------GTG----TTCAAAT--ATTTGTA-TA--A---TT---TTT-TAA---TTAG-CAAT--AATTT-A--TTATA-TA-AATATCAATC---GGGTTTTTTACC--TAA-----CCACTCGACAAGTTT
gi|96856 : A-----AAACTAATG-ATACTC------TTTC--TA-A-T-----A--TT----AT-----TA-------TTACAA-A--GTCTGAAATAAAAGA---T---AC---GATTG--A---A----AT------T---CTTGA-C-T--C------AAACAAATC-T-GTT----GAG---AATGATAA-AATAAGTCACACG--T-TTTG----AA----G----TA--T----A---CA---AAATA----TA----GT--ATT---T--CTAAACCTCTAG--TAC-----T-GTTA---TTTAATAGATCA-TT-----AA----TT--AT------AAGTGA-AT-TT-C-C--A---GAT-TTA---TG-----------------------------A-TAATGCCACT-TTTCA--AAAA--AGG----T-AAAA-CA--A---A---CC-C---GG-CGT---C--T--T---ATTATCGACCAATTT-CACTCTTAA------GCTGT-ATTGGCAA-GTTA------A-TCGAAAGAATT------------GTG----TACAAAC--ATATATA-TA--A---TT---TTC-TTC---TTGG-TAAT--AACCTCA-----TA-TA-AGTTACAATC---TGGACTT---CT--CAA-A-GGACATTCCAC-GGTTT
gi|96857 : A-----AAACTTATA-ATTCCC------TTTC--AC-A-T-----T--TT----AT-----AA-------TAACTG-AGGAT--GATATATCTGA---A---CT---TATTA--G---T----AC------T---T--AA-C-CAGT------AAATAAGGCCT-GT-----GGT---CATGATAT-GATCAGTCACA-GAAT-GCTG----GA----A----TA--T----GTGTCG---AAA-------G----CT--ATT---T--CAAAACTATT-T--T-AAA---T-TTTA---TTTAACCGTTCT-TT-----AA----GT--GA------AGGTAT-AT-AT-C-C--C---GAT-TTG---TGGAAG-----AT--T-G--C-A--AA---TG-TAACTCCCAA-TTCTA--AAAA--GGG-------AGA-CA--A---GT--CATT---GG-TGT---C--A--A---ATTACAGACCTGTGT-CTTTACTTA------GTTGT-GTCGGAAA-ACTT------G-TTGAAAGGCTT------------GTT----TTTAAGA--ATATGTA-TA--A---CT---TT--TTC---TTGA-TAAT--AATTTGA--TT-TA-TA-AATACCAGTC---AGGCTTT---TT--
gi|96859 : TGA---T---AT---CATC-------TCCTCAC------T---TTATA-C-----------AAATAAAGC-C-AGT----GGT---CCAAACCA-AATTAGTCATG-AAAT-GATA----AA----G----G-------------G---ATGCG----CAGATTCT--ATC---A--CAAAACCGTT-A--G-TTA---TCATT----TTTAACCGTTCT-AT-----AC----AA--GA------AAGTAT-TT-TT-C-C--A---AAC-TCA---TGGAAG-----AT--A-G--C-T--CA---AG-TCACTCCCAT-CTTCA--AAAA--GGG-------AGA-TA--A---AA--CG-T---AAACTT---C--T--A---ATTATAGACCCGTTT-CACTTTTAA------GCTGT-------------T------G-TGGAAAGA-TTCTTGAAAGAATAGTT----TTTAAAA--ATATGTA-TA--A---CT---TTT-TTT---TTAC-AAAT--CAACTGT--TG-TA-TA-AATATCAGTC---TGGTTTT---TT--
gi|96860 : TGA---T---AT---TATC-------T----CC------TCACTTA-A-T-A--C------AAATAAAGC-C-AGT----GGT---CTAGACCA-AATAAGTCATA-AAAT-GATA----AGAG--G----TT--T----G---C------AGA----TT----CT--ATC---A--CAAAACCATT-A--G-TTA---TCATT----TTTATCCGTTCT-GT-----AC----AA--GA------AAGTTT--T-TT-C-C--A---AAACTCA---TGGAAG-----AT--A-G--C-TCAAA---T--TACTCCCA-T-CTTCA--AAAA--GGG-------AGA-TA--A---AA--CG-TT--AA-CTT---C--T--A---ATTATAGACCCGTTT-CACTTTTAA------GCTGT-------------T------G-TGGAAAGA-TTCTTGAAAGAATAGTT----TTTAAAA--ATATGTA-TA--A---CT---TT--TTC---TTGA-CAATTCAA--TTA--TTGTA-TA-AATTTCAGTC---TGTTTTT---a
gi|96861 : GA---C---AT---GATTT--G---T----TT------T---TTAGG-T-G--T------GAATAAAGC-T-GTA----GCG---CCAGACTG-AGTAAATCAGA-GAAT-TTTA----AA----A----CT--A----A---CC---AAGGG----TA----CA--ATT---T--CAGAACCGTT-A--T-GTA---T-TTGA---TTTAATAAG--A-CT-----AT----TT--GC------AAGGAATAT-TTAC-C--A-------TTAAACTAGAAA------C--ATG--C----ACT--TG-TTATGCCCCT-TTATA--AAAA--AGG----C----------A---A---CT-T---GT-CATGTGT--T--AGATATTACAGATCTTTAT-CTCTGTTAA------GTTGT-ATTGGTAA-ACTT------A-TGGAAAt
gi|96862 : ------T---TTAGG-T-G--T------GAATAAAGC-T-GTA----GGG---CCAGACCT-AGTAAGTTACA-TAAT-TTTA----TA----A----CT--A----A---CC---AACGG----TA----TA--ATT---T--CAAAACCTTT-A--T-GTA---T-TTTA---TTTAATAAGTAT-TT------T----TTAGGA------ATCT----T-TT-C-C--ATGTAAC-T-----TGAAA-------C--ATG--C-A--TT---TG-TTATGCCCCT-TTATA--AGAA--AGG------CGAT-CC--A---T---CG-T---GT--GT---TAGT--A---ATTACAGACCTATTT-GCCTGTTAA------GTTAT-ATTGGTAA-ACAT------A-TGGAACGTTGT------------GTG----TATAAGT--ATATATA-CA--C---TT---TCC-
gi|96863 : ------T---TTAGG-T-G--T------GAATAAAGC-T-GTA----GGG---CCAGACCT-GTTAAGTTACA-TAAT-TTTA----TA----A----CT--A----A---CC---AA-------CG----GT--ATAAATT--CAAACCCTTT-A--T-GTA---T-TTTA---TTTAATAAGTAT-TT-----------TT--GA------G---GA-AT-CT-T---------AT-CCA---TGTAAC-----TTGAA-A--CAT--GCATTTG-TTATGCCCCT-TTATA--AGAA--AGG------CGAT-TC--A---T---CG-T---GT--GT---TAGT--A---ATTACAGACCTATTT-CCCTGTTAA------GTTAT-ATTGGTAA-ACAT------A-TGGAACGTTGT------------GTG----TATAAGT--ATATATA-CA--C---TT---TCC-
gi|96864 : ------T---TTAGG-T-C--T------GAATAAAGC-T-GTA----GGG---CCAGACCT-AGTAAGTCACA-GAAT-TTCA----AA----ACC--TT--T----A---TG------TA----TT----TT--ATT---T--TAAAA------G--T-CTA---T--TCG---T--GAGGAATCT-TT-----TC----C-----------ATGCAA-------C-T--G---GAA-ACA---TG----------C--A----C-T-------TG-TTGTGCCCCT-TTATA--AGAA--AGG------CGAT-TC--A---T---CG-T---GT--GT---TAGT--A---ATTACAGACCTATTT-CCCTGTTAA------GTTGT-ATTGGTAT-ACTT------A-TGGAACGTTGT------------GTG----TACAAGT--ATATATA-TA--A---ATACCTTA-TCT---CTGA-GAAT-----------CT-TA-TA-TATTCTAGACAATCAGGTTT---TT--TAATT-GGTCATTCCAC-TGT
gi|96865 : --C------AAATAAAGC-T-GTT----GGG---GAAGACTT-AATAAGTCATA-CAAT-TTTA----AA----A----AA--T----A---CT---CGTAA----TA----CT--TTT---T--CAAAACCACT-T--TGCAA---TCGT-----TTTAACAAATTT-CT-----AA----AT--GA------ATGTGT-AT-TT-C-C--A---AGT-TCT---TGGAAG-----TC--G-G--C-T--AT---AA-TTATGCCGCT-GTTTA--AAAA--GGGGGATT-C----CG--A---T---TG-T-------GT---T--TAAA---ACTACAGACCTATAT-CTTTACTTA------GCAGT-ATTGGCAA-ACTT------A-TGGAAAGGACC------------ATG----TACAAAC--ACATATA-TA--A---CC---ATC-TCC---TTGA-TAAC--AATTTGA--TA-TA-TA-ATAATCAGTC---CGGTTTT---CT--AAG-A-AGCTATTC
gi|96866 : --C------AAACAAAGC-T-GTT----GGG---GAAGACTT-AATAAATCATA-CAGT-TTTA----AA----A----AA--T----A---CT---CGTAA----TA----CT--ATA---T--CAAAACCATT-T--TGCAA---T-CTT----TTTAACAAATCT-CT-----AT----AT--TA------ATGTGT-AT-TT-C-C--A---AGT-TCT---TGGAAG-----TC--C-G--C-T--GT---AG-TTATGCCACT-GTTTA--AAAAT-GGGGAT-T-C----------------CG-----GT-TGT-------------GTTTCAAACTAATAT-CTTTACTAA------GCTGT-ATTGGCAC-ACTT------A-TGGAAAGGACA------------ATG----TACAAAC--ACATATA-TA--A---CC---ATC-TCT---TTGA-TAGC--CATTTGA--TA-TA-TA-ATAAACAGTC---CGGTTTT---CT--AAG-A-GGCCATTTCAC-AGTTT
gi|96868 : AATAAGGC-T-GTA----GGG---TAAGACCT-AGTAAGTCGCA-GAAT-TTTA----AA----A----CT--A----A---CC---ATGGG----TA----CA--ATT---T--CAAAACCTTT-A--T-GTA---T-TTTA---TTTAATAAGTCT-TT-----TC----GC--GA------G---GA-AT-CT-T---------AT-TCA---TG----------C--A----C-T-------TG-TTAT-CCCCT-TTATA--AGAA--AGG------CGAT-TC--A---T---CG-T---GT--GT---TAGT--A---ATTACAGACCTATTT-CCCTGTTAA------GTTGT-ATTGGTAA-ACTT------A-TGGAACGTTGT------------GTG----TATAAGT--ATATATA-TA--A---TT---
gi|96869 : ATAAGTAACA-AAATGCTTA----AA----G----GTGCT----G---TA---AGA-A----CA--------ATT---T--CTGAACCTCT-------TACACT-TTTA---TATAATCGTTCTATT-----AC----C---GA------AAGTCA-TT-TC-C-C--T---AAC-TCA---TGGAAA-----AA--A-G--C-T--CA---TG-TAACTCCTAT-TTTTAGGAAAG--GGG----A-TAAGTCA--A----------T---CC-CAT---C--T--A---ATTATAGACCAATGT-CGTTGCTCA------GCTGT-GTCGG
gi|96870 : aaatt----TT--T----A---AA---AAGCA--------------ATT---G--CAAAACCACT-T--T-CAA---T-TTTA---TTTAACCGTTCT-TT-----AA----GT--GA------AGGTAT-AT-AT-C-C--C---GAT-TTG---TGGAAG-----AT--T-G--C-A--AA---TG-TAACTCCTAT-TTTTA--AAAA--GGG-------AGA-CA--A---GT--CATT---GG-TGT---C--A--A---ATTACAGACCTGTGT-CTTTACTTA------GTTGT-GTTGGAAA-ACTT------T-TTGAAAGGCTT------------GTT----TTTAAGA--ATATGTA-TA--A---CT---TTT-TTC---TTGA-TAAT--AATTTGA--TT-TA-TA-AATACCAATC---AGGCTTT---TT--
gi|96871 : T--ATT---T--CCAAATATCT-AGTT-CTA---T---TA---TTTAATAGTACA-TG-----AC----AT--GA------ATGGAA-AC-GC-A-C--A---TAT-TTA---TGGAAA-----CA--A-G--C-T---T---TGATAATGCCACT-CTTCA--AAAC--AGG----T-AAAA-CA--A---A---AC-T---GG-CGT---C--T--A---TTTATCGATCGATAT-CTCTCTTAA------TCTGT-GTTGGCAA-GTAA------A-TGAAACAAATT------------GTT----TACAAAC--GTATATT-TA--T---TT---TTC-TTG---TAAA-CAAA--AACCTCA--TT-TA-TA-AATCACATTC---AGGATTT---CT--ACA-T-GGACACTCTAC-GGTCT
gi|96872 : ctaT--ATT---T--CAAAACCTCT-A------A---T-GTTACTTTTTAATCGTTCT-AT-----AA----AC--GA------AAGTAA-AT-TC-C-C--T---GAA-TCC---AGGAAA-----AT--A-G--C----ACA--TG-TAACCCCCCT-TTTAA--GCAA--GGG--------GA-CA--A---GT--CG-TT--GC-CCT---C--T--A---ATTATAGACCAGTAT-CACTGTTGA------GTTGT-TTGGGAAA-AGTT------T-TAGAAAGAATA------------ATT----TTCAAGC--GTATGTA-TA--A---CT---TTC-TAC----TAA-ACAT--AATATGC--TG-TT-CA-AATGTCAGTC---TGG-TTT---CT--T
gi|96873 : A---T-GTTAC--TTT--TCAATCG-TTCTATAAC----CA--AA------A-GTAA-AT-TC-C-C--T---GAC-TCA---TTGAAA-----AT--A-G--C----ACA--TG-TA------TT-TTTTA--AAAA--AGG--------AA-CA--A---GT--CG-TTTGGC-C-T---C--T--T---ATTATA--CCAGTAT-CCATGTTCA------TCTGT-TTGGGGAAGATTT------T-TAGAAAGAATA------------ATT----TTCAAGC--GTATGTA-TA--A---CT---TTC-TAC---TAAA-TAAT--AATCTGC--TG-TA-CA-AATAATAATC---
gi|96874 : cctgtaTTAATAAGTCA-TTCA---AT----TT--TA------AAA-AA-AT--------------AC-TCG---T--AAG-----TC--G-G--C-T--AT---AG-TTATGCCGCT-GTTTA--AAAA--GGGGGATT-C----CG--A---T---TG-T---GC-T-T---C--A--A---ACTACAGACCAGTAT-CTTTACTTA------GCTGT-ATTGGCAA-ACTT------A-TGGAAAGGACC------------ATG----TACAAAC--ACCCATG-TA--A---CC---ATT-GCT---TTGA-TAAC--AATTTGA--TA-TA-TA-GTAAACAATC---CGGTTTT---CT--AAG-A-GGCCTTTCCAC-AGTTT
gi|96875 : TTAATAGTTCT-AT-----AC----AA--GA------AAGTAT--T-TT-C-CCAA---AAC-TCA---TGGAAGATCGCTC--AAG--T-T--AC---T-------CCAAT-CTTCA--AAAA--GGGAGA-T-AAAA-CATTA---A---C--T--------T---C--T--A---ATTATAGACCCGTTCACTT--CTAA------GCTGT-TGTGGAAA-GATT------C-TTGAAAAATTA------------GTT----TCTAGAA--ATATATA-TA--A----------C-TTC---TTGACAAAT--CAACT-A--TTGTA-CA-AATATCAGTC---TGG
gi|96876 : A------ATATCA-AT-AT-CAC--A---GAA--CA---AGAAAT-----TT-------C-T--GA---TG-TAATGCCATT-ATTTA--AAAA--AGA----TGCTAA--A--G---A---TA-T---TC-CAT---C--A--A---ACTATAGACCTATTT-CATTAATTA------GATGT-ATTGGTAA-GGTC------A-TGGAAAGAGTA------------ATA----TTCAAGC--ATTTATA-CA--A---TTA--TTT-ACA---TTTA--AAT--AACCTGA--TT-TA-TA-AAAATCAGTC---GGGGTTT---CT--CCC-A-GGTCATTCAAC-AATTT
gi|96877 : --T--A---ACTATAGACCTATAT-CACTGTTAA------GC-GTAATTGGCAA-AGTG------T-TTGAAAGACTT------------ATT----TTTAAAC--ACATGTA-TA--A---TT---TCT-TTC---GTGA-TACT--AATTTTA--TT-T--CGTCATTTCAATC---TGGTTTT---GT--TCC-T-GGTGATTCAAC-AATT
gi|96878 : caaaagtctggaaagaagcatttgtatgcgctgtttataaaaaaggagacccttctttggttaa-TTA---TGGAAG-----TC--A-G--C-T--AC---TG-TAATGCCTCT-TTTTA--AGAA--AGG----T-CAAA-CA--A---A---CG-T---GC-CAT---C--T--A---ATTAAAGGCCAATAT-CTTTATTAA------GCTGT-GTTGGTAA-ACTT------A-TGGAAAGGGTT------------GTC----TACAAAC--ATATTTA-TA--A---TT---TTC-TGA---TTGA-AAAT--AAACTAA--TT-TA-CA-AATTGCAATC---CGGATTT---CT--TAA-G-GGCCATTCGACAAGTT
gi|96879 : gAATCCCACT-GTTTA--AAAA--GGGGGATT-C----CG--A---T---TG-T---G----T---T--TGAA---ACTTCACACCAATAT-CTTTACGTA------GCTAT-ATTGACAA-ACTT------A-TGGAAAGGACC------------ATACATGTACAAAC--ACATATA-TA--A---CC---ATC-TCT---TTGA-TAAC--AATTTGA--TG-TA-TA-GTAAACAGTC---CGGTCTT---C----AA-GAGGTCATTCCAC-AGTTT
gi|96880 : T-TTTTA--AAAAAAGAG----T-CAAA-CA--T---A---T-------C-CGT---C--A--A---GCTAAATACCAATTT-CTTTAATTA------GTTGT-ATTGTTAA-GGTA------A-TGAAGCGTATC------------GTT----TTCAAA---ATATATAACA--A---AT---ATC-TATAGTTTGA----T--GACTTAA--TT-TATCA-AA-ATCAATC---AGGATGT---TTACCAA-G---ACATTCGAC-TGTTT
gi|96881 : TTGA------GTTTT-GTTAGTAA-ATTA------A-TGGAAAGAGTT------------GTT----TACAAAC--ATATTTA-TA--AT--TT---TTT-TTT---TTGC-TAAT--AA--TTA--TA-TA-CA-AGTTACTGTC---AGGATTT---TT--AAA-A-GGTCATTC
gi|96882 : AA------G-TAT-GTTGGTAA-ACTT------A-TGGAAAGAGTT------------GTC----TACAAAC--ATATTTA-TA--A---TT---TTC-TGA---TTGA-AAAT--AAACTAA--TT-TA-CA-AATAGCAATC---CGGATTT---CT--TAA-G-GGACATTCGAC-AGTTT
gi|96883 : AA-ACTTGAATGGA-TGGAAAGAGTC------------GTT----TACAAAC--ACATGTA-TA--ACTTTT---TTT-TTG---TTGC-TAAT--AACTTGA--TA-TA-CA-AGCTACAATC---AGGTGTT---TT--AAA-A-GGTCACTCAAC-TGTT
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|96858 ): TGATATATCTGACATTTTAAACACTGTTAATATAAATAAAGCATGTGGCCATGACTCTGTAAGCCATAAGATTCTTAAAGGGGTAACAAAACCCATATCTAAACCTTTAGCCGTACTTTTTACCCGCTCTCTGAATGAAGGGATTTATCCTGACGTTTGGAAGATAGCAAATGTTACACCAATATATAAAAAAGGTGACAAGTCTATAGCTTCAAACTATAGACCAGTTTCTTTACTTAGCTGTTGTGGTAAGATATTTGAAAGAATCATTTTTAAACACATGTACAACTTTCTTCTTACAAATAAATTATTGTATAAATATCAATCAGGATTTCT
Unaligned ( gi|96867 ): AAATAAAGTAAGCGGTACTGACACTATAAGTCACAAAATGCTTAAAGGTGCTGTAAGAACAATTTCTGAACATCTTACTCTTTTATATAATCGTTCTATTACCGAAAGTCATTTCCCTAACTCATGGAAAATAGCCCATGTAACTCCTATATTTTTGAAAGTGGATAAGTCAATTCCATCTAATTATAGACCAGTTAAGTTGCTAAGCTGTGTCGGAAAGATTTTAGAAAGAATAATTTTTAAACAAATGTATAACTTCTTCTTGAGTAACAATTTATTGTATAAAAACCAGTCTGGCTTTTT
Alignments
lowQualScore : 11111111 11111111111111 11111 3333333333333333333333333333333333333333333 1111111 11 1111111 111111111111 33333333333333333333333333333333333
lowQualScore : 666 3 88888 7777 44 3 44 0 0 2 55555 4 2 0 666666 1 33 4 88888 33 5555 55555 7777777 0 0 2 33 33 1 3 333 333 5555 66666666 4444 444444 222 1 22222222222222 4 1 11111 444 444 1 11 444 33333 3333333333333333333333333333333333333333333 11 5555 11 1 3 1111111 222 11 4444 222 1 33 0000000 555 555 1 11 1 1 2222222 22 333 333333333333 11 99999 111 1 2 1 222 11 11 0 33 99999999999999999999999999999999999 333 55 22 111 1 1 1 1 0 222222 11 1 222 33333333 1 33333 1 11 1 1 11 222 333 1 33333 66 11 3 6 11 5 1 1 22 5555 333 444 0 999 1 2 3
lowQualScore : ... . ..... .... .. . .. . . . ..... . . . ...... . .. . ..... .. .... ..... ....... . . . .. .. . . ... ... .... ........ .... ...... ... . .............. . . ..... ... ... . .. ... ..... ........................................... .. .... .. . . ....... ... .. .... ... . .. ....... ... ... . .. . . ....... .. ... ............ .. ..... ... . . . ... .. .. . .. ................................... ... .. .. ... . . . . . ...... .. . ... ........ . ..... . .. . . .. ... ... . ..... .. .. . . .. . . . .. .... ... ... . ... . . .
lowQualScore : 444 3 33333 1111 22 1 22 7 2 7 99999 3 4 7 888888 6 22 7 22222 22 0000 99999 6666666 4 2 4 22 22 6 9 333 333 7777 11111111 0000 888888 999 7 22222222222222 3 4 00000 666 888 1 44 888 77777 5555555555555555555555555555555555555555555 77 3333 77 4 4 7777777 111 11 8888 111 0 66 4444444 666 000 1 66 1 1 5555555 99 555 222222222222 55 44444 999 1 4 4 888 33 44 4 55 11111111111111111111111111111111111 222 55 88 888 0 0 0 2 5 777777 22 8 666 22222222 7 11111 7 44 0 0 44 888 888 0 99999 77 55 6 0 55 6 1 1 00 3333 777 111 9 222 0 3 6
consensus : CAACAATAGATGAAAATACAAACA---ATA-ATA-----CT----CT--A-CTT--CCAGAGTGTATCT-TTA-----AAACTAATA-ATACCA------TTGC--AA-AC-----A--TG----AT-----CA-------TTACTG-A--ATCAGACATAATTGA---T---AT---TATC-G--G---T----AC------T---TTAGA-C-C--C---------AAATAAAGC-T-GTC----GGNNAAGACNN-AATAAGTCACA-GAAT-T-TTAA----A----G----TT--T----A---CN---AAACA----CA----CT--ATN---T--CNAAACCNCT-G--T-CTA---T-NTTA---TTT---AATAGNTCT-TTACNT----GAA--TGTAA-AT-T--T-C-C--A---GAN-TCA---TGGAAG--T-----CA-G--CT--ANT---G-TNATGCC--NCT-TTTTA--AAA-A--GGG----T-CAAA-CA--A---A---CG-T---GC-CGT---C--T--A---ATTATAGACCNATNT-CTTTATTA------AGCTGT-GTTGGTAA---ACTT------A-TGGAAAGAGTCGTN----TACAAAC--ATATNT-ATA--A---TT---TTC-T---NNTTGA-NAAT--AANCTGA--TT-TA-CA-AATNNCAGTC---CGG--NTTT---CTTAA-G-GGNCATTCGAC-AGTTT
Reference ( family-531 ) : CAACAATAGATGAAAATACAAACA---ATA-ATA-----CT----CT--A-CTT--CCAGAGTGTATCT-TTA-----AAACTAATA-ATACCA------TTGC--AA-AC-----A--TG----AT-----CA-------TTACTG-A--ATCAGACATAATTGA---T---AT---TATC-G--G---T----AC------T---TTAGA-C-C--C---------AAATAAAGC-T-GTC----GGNNAAGACAN-AATAAGTCACA-GAAT-T-TTAA----A----G----TT--T----A---CN---AAACA----CA----CT--ATN---T--CNAAACCNCT-G--T-CTA---T-GTTA---TTT---AATAGNTCT-TTACNT----GAA--TGTAA-AT-T--T-C-C--A---GAN-TCA---TGGAAG--T-----CA-G--CT--ANT---G-TAATGCC--NCT-TTTTA--AAA-A--GGG----T-CAAA-CA--A---A---CG-T---GC-CGT---C--T--A---ATTATAGACCNATNT-CTTTATTA------AGCTGT-GTTGGTAA---ACTT------A-TGGAAAGAGTTGTN----TACAAAC--ATATNT-ATA--A---TT---TTC-T---NNTTGA-NAAT--AANCTGA--TT-TA-CA-AATNNCAGTC---CGG--NTTT---CTTAA-G-GGNCATTCGAC-AGTTT
gi|96841 : CAACAATAGATGAAAATATAAACA---ATA-ATA-----CT----CT--A-CTT--CCAGAGTGTATCT-TTA-----AAACTTATA-ATACCA------TTGC--AA-AC-----A--TG----AT-----CA-------TTACTG-A--ATCAGACACAATTGA---T---AT---TATC-G--G---T----AC------T---TTAGA-C-C--C---------AAATAAAGC-T-GTC----GGAGAAGACAA-AATTAGTCACA-GAAT-T-TTAC----A----G----TT--T----A---CT---AAACA----CA----CT--ATA---T--CTAAACCCCT-G--T-CTA---T-GTTA---TTT---AATAAATCG-TTACTT----GAA--TGTAA-AT-T--T-C-C--A---GAG-TCA---TGGAAG--T-----TA-G--CT--ACT---G-TAATGCC--TCT-TTTTA--AGA-A--GGG----T-CAAA-CA--A---A---CG-T---GC-CAT---C--T--A---ATTATCGGCCAATAT-CTTTATTA------AGCTGT-GTTGGTAA---ACTT------A-TGGAAAGAGTTGTC----TACAAAC--ATATTT-ATA--A---TT---TTC-T---GATTGA-AAAT--AAACTAA--TT-TA-CA-AATTGCAATC---CGG--ATTT---CTTAA-G-GGACATTCGAC-AGTTT
gi|96842 : CAACAATAGATGAAAATATAAACA---ATA-ATA-----CT----CT--A-CTT--CCAGAGTGTATCT-TTA-----AAACTAATA-ATACCA------TTGC--AA-AC-----A--TG----AT-----CA-------TTACAT-A--ATCAGACATAATTGA---T---AT---TATC-G--G---T----AC------T---TTAGA-C-C--C---------AAATAAAGC-T-GTC----GGAGAAGACAA-AATTAGTCACA-GAAT-T-ATAC----A----G----TT--T----A---CT---AAACA----CA----CT--ATA---T--CTAAACCCCT-G--T-CTA---T-GTTA---TTT---AATAAATCC-TTACTT----GAA--TGTAA-AT-T--T-C-C--A---GAG-TCA---TGGAAG--T-----CA-G--CT--ACT---G-TAATGCC--TCT-TTTTA--AGA-A--GGG----T-CAAA-CA--A---A---CG-T---GC-CAT---C--T--A---ATTATCAGCCAATAT-CTTTATTA------AGCTGT-GTTGGTAA---ACTT------A-TGGAAAGAGTTGTC----CACAAAC--ATATTT-ATA--A---TT---TTC-T---GATTGA-AAAT--AAACTAA--TT-TA-CA-AATTGCAATC---CGG--ATTT---CTTAA-G-GGACATTCGAC-AGTTT
gi|96843 : CAACAATGGATGAAAATATAAACA---ATA-ATA-----CT----CT--A-CTG--CCAAAGTGTGTCT-TTA-----AAAC----------CA------TTGC--AA-AC-----A--TG----AT-----CA-------TTACTG-T--ATCAGACATAGTTGA---T---AT---GATC-G--G---T----AC------T---TTAGA-C-C--C---------AAATAAAGC-T-GTC----GGAGAAGACAA-AATTAGTCACA-GAAT-T-TTA----------G----TT--T----A---CA---AAACA----CA----TT--ATA---TATCTAAACCCCT-G--T-CTA---T-GTTA---TTT---AATAAATCC-TTACTTACTTGAA--TGTAT-AT-T--T-C-G--A---GAG-TCA---TGGAAG--T-----CA-G--CT--ACT---G-TAATGCC--TCT-TTTTA--AGA-A--GGG----T-CAAA-CA--A---A---CG-T---GC-CAT---C--T--A---ATTATCGGTCAATAT-CTTTATTA------AGCTAT-GTTTGTAA---ACTT------A-TGGAAAGAGTTGTC----TACAAAC--ATATTT-ATA--A---TT---TTC-T---GATTGA-AAAT--AAACTAA--TT-TA-CA-AATTGCAATC---CGG--ATTT---CTTAA-G-GGACATTTGAC-AGTTT
gi|96844 : CAACAATAGATGAAAATATAAACA---ATA-ATA-----CT----CT--A-CTT--CCAGAGTGTATCT-TTA-----AAACTAATA-ATACCA------TTGC--AA-AC-----A--TG----AT-----CA-------TTACTG-A--ATCAGACATAATTGA---T---AT---TATC-A--G---T----AC------T---TTAGA-C-C--C---------AAATAAAGC-T-GTC----GGAGAAGACAA-AATTAGTCACA-GAAT-T-TTAC----A----G----TT--T----A---CA---AAACA----CA----CT--ATA---T--CTAAACCCCT-G--T-CTA---T-GTTA---TTT---AATAAATCC-TTACTT----GAA--TGTAA-AT-A--T-C-C--A---GAG-TCA---TGGAAG--T-----CA-G--CT--ACT---G-TAATGCC--TCT-TTTTA--AGA-A--GGG----T-CAAA-CA--A---A---CG-T---GT-CAT---C--T--A---ATTATCGGCCAATAT-CTTTATTA------AGGTGT-GTTGGTAA---ACTT------A-TGGAAAGAGTTGTT----TACAAAC--ATTTTT-ACA--A---TT---TTC-T---GATTGA-AAAT--AAACCAA--TT-TA-CA-AATTGCAATC---CGG--ATTT---CTTCA-G-GGACATTCGAC-
gi|96845 : CAACAATAGGTGAAAATACAAACA---ATA-CTA-----CT----CT--A-CTT--CCAGGGTGTATCT-TTA-----AAACTAATA-ATACCA------TTGC--AA-AC-----A--TG----AT-----CA-------TTACTG-A--ATCAGCCATAGTTGA---T---AT---AATC-G--G---T----AC------T---TTAGA-C-C--C---------AAATAAAAC-T-GTC----ACAGAAGACAA-AATTAGTCACA-GAAA-T-TAAC----A----G----TT--T----A---CA---AAACA----CA----CT--ATA---T--CTAAATC-CT-G--T-CTA---T-GTTA---ATT---AACAAATCC-TTACTT----GAA--TGTAA-AT-T--T-C-A--A---GAG-TCA---TGGAAG--T-----CA-G--CT--TCT---G-TAATGCC--TCT-TTTTA--AAA-A--GGG----T-CAAA-CA--A---A---CG-T---GC-CAT---C--T--A---ATAATCGGCCAATAT-CTTTATTA------AGCTGT-GTTGGTAA---CCTA------A-TGGAAAGAGTTGTC----TACAAAC--ATATTT-ATA--A---TT---TTC-T---GATTGA-AAAT--AAACTAA--TT-TA-CA-AATTGCAATC---CGG--ATTT---TTTAA-G-GGACA
gi|96846 : CAACAATAGGTGAAAATACAAACA---ATA-CTA-----CT----CT--A-CTT--CCAGGGTGTATCT-TTA-----AAACTAATA-ATACCA------TTGC--AA-AC-----A--TG----AT-----CA-------TTACTG-A--ATCAGCCATAGTTGA---T---AT---AATC-G--G---T----AC------T---TTAGA-C-C--C---------AAATAAAAC-T-GTC----ACAGAAGACAA-AATTAGTCACA-GAAA-T-TAAC----A----G----TT--T----A---CA---AAACA----CA----CT--ATA---T--CTAAATC-CT-G--T-CTA---T-GTTA---ATT---AACAAATCC-TTACTT----GAA--TGTAA-AT-T--T-C-A--A---GAG-TCA---TGGAAG--T-----CA-G--CT--TCT---G-TAATGCC--TCT-TTTTA--AAA-A--GGG----T-CAAA-CA--A---A---CG-T---GC-CAT---C--T--A---ATAATCGGCCAATAT-CTTTATTA------AGCTGT-GTTGGTAA---CCTA------A-TGGAAAGAGTTGTC----TACAAAC--ATATTT-ATA--A---TT---TTC-T---GATTGA-AAAT--AAACTAA--TT-TA-CA-AATTGCAATC---CGG--ATTT---TTTAA-G-GGACA
gi|96847 : CAACAATAAATGACAGTATTAACA---ATA-ATA-----TG----TT--A-CTT--CCAGGCTGTGTCT-TTA-----AAACGAATA-ATACCA-------------A-AC-----T--TG----AT-----CG-------TTACTG-A--ATCAGACATAATTGT---T---TT---GATC-G--G---T----AC------T---TTAGA-C-C--C---------AAATAAAGC-T-GTC----GGAAAAGACAC-AAT---TCCCA-GAAT-T-TTTC----A----G----TA--T----A---CA---AACCA----CA----CT--A-----------AACCACA-G--T-CTA---T-GTTA----------ATAATTCC-TTACTT----TAA--TGTAA-AT-T--T-C-C--A---G---TCA---TGGAAG--T-----CA-A--CT--ACT---G-TTATGTC--TCA-TCTTA--AGA-A--AGG----T-CAAA-CA--G---A---CG-T---GC-CAT---C--T--T---ATCATTGGTCAATAT-CTTTATTA------AGCTGT-GTTGGTAA---ACTT------A-TGGAAAGAGTTGTC----TACAAAC--ATATTT-ATA--A---CT---TTC-T---GATTGA-AAAT--AAACTAATTTT-TA-TA-AATTTTTATC---AGG--ACTT---TCTAA-T-GGACATTCGAC-AGTTT
gi|96848 : ACAATAGATGATACT-CAAACA---A---AT------------------CTT--CCTGAATTCGTTT-TTC-----AAACAAATA-GTAC-G------TTAA--AAGAT-----A--TT----AA-----CA-------TCACAG-A--AAAAGAAATAACTGA---T---GT---TCTA-G------------------------CAAA-C-C--TCGCTGT---AAATAAAGC-T-AGT----GGTCTTGACGA-CATAGGTCACA-AAATGC-TCAA----A----GAAACTT--TGTAAA---CTTGTAAACT----TGT---CT--ATT---T--GTAAACCTTA-A--T-GTA---T-TATA---CTT---AACAGATCT-ATGAGA----GAAAATGTAT-AT------C-C--A---ACA-TCT---TTGAAA--T-----TA-G--CT--AAC---G-TTATGCC--TTTATTTTA--AAA-A--GG-----T---GA-TA--A---ATCTC--T---AC-CGT---C--T--A---ATTATAGACACATTT-CATTGATA------AGCTGT-GTTGGTAA---AGTA------G-TGGAAAGAATTGTT----TTTGAAC--ATATTT-ACA--A---TC---ATCTT---CATTCA--AAT--AA
gi|96849 : AAAATACAAAGATAGATAGATAAAAGTTT----TT--ATCTT--ATA-AGTGTATAT-ATATATATAAACAAATAGATAACAACAAAATTGT--AA-GCTCTTCA--TG----AG-----CT-------TT--TG-A--ACC-GATATAAGTGA---C---ATACATGTC--------T----AC------T---TTA---C-C--C---------AATTTTAGA-C-GT----------ATACAACAGTGACTTAAA-GGGT-T-T-GA----A----G----TA--T----A---TA---AAATA----TA----GT--ATT---T--CTAAACCTCTAG--TACT------GTTA---TTT---AATAGATCA-TGAATT----AAA--TGTGA-AT-T--T-C-C--A---GAT-TTA---TGGAAA--T-----CA-GTCCT--A-----G-TAATTCC--ACT-TTTCA--AGA-A--AGG----T-AAAA-CA--A---A---CT-A---AG-CGT---C--T--A---ATTATCGACCAATTT-CACTCTTA------AGCTGT-ATTGGCAA---GTTA------A-TGGAAAGAATTGTG----TACAAACATATATAT-ATA--A---TT---TTC-T---TGTTGA-TAAT--AACCTCA--TT-TA-TA-AATTACAATC---TGG--ATTT---CCCAG-A-GGACATTCCAC-GGTTTtattatattta
gi|96850 : TACAATTG---ATG-ATA-----CTGACTCTGAA-CTT--CCAAATTTTGTTT-TGA-----AAAC-AGT---TACCA---------C--AATTC-----A--TG----ATATCAATA-------TCACAG-A--ACAAGAAATTTCTGA---T---GT---TCTT-T--C---C----AA------T---TTAGT-TGT--C---------AAA-AAAAC-T-TGC----GGCCCAGACGA-AATAAGCCATC-ACAT-G-TTAA----A-------------------------------A----CA----CT--ATG---C--TG--ACCGCT-T--T-GCA---TCATT----TTT---AATAGGTCT-CAATAA----GAA--AGCAT-AT-A--C-C-C--A---AAT-TGT---TCAAAA--T-----AA-G--CA--AAT---G-TAATGCC--ATT-ATTCA--AAA-A--GGG----TGCTAA--A--G---A---TA-T---TC-CAT---C--A--A---ACTAAAGACCTATTT-CATTAATGACATGTAGTTGT-ATTGGTAA---GGTC------A-TGGAAAGAGTAATA----TTCAAGC--ATTTAT-GCA--A---TTA--TTC-A---CATTTA--AAT--AACCTGA--TT-TA-TA-AAAATCAGTC---AGG--GTTT---CTTCC-T-GGTCATTCAAC-AATTT
gi|96851 : A---ACA-ATA-----CT----TT--A-CTA--CCAACTTGT-TCTCTTA-----AAACAAACC-ATACAC------TAAC--AA-AT-----A--TC----AA-----AA-------TAACTG-A--A---AATGAAATTAAGAAT---AT---TATA-G--A---T----ACATTTTAT---TTAAAAT-C--C---------TAACAAATC-A-GTT----GGAGAAGATAA-AATCAGTTATA-AACT-T-TTAA----A----A----TT--A----A---CA---AAAAA----AT----GT--ATT---T--CTAAACCATT-G--G-TTA---T-GCTT---TAT---AATAAATCA-CAAGAA----GAA--TGTAA-AT-T--T-T-C--A---TAA-TTA---TGGAAA--------CA-----T--GGTTTAA-TAATGCC--ACT-ATTTA--AAA-A--AGG-------AAA-TA--CTT-A---TA-T---CT-TGT---C--T--A---ATTATAGGCCAATAA-CACTTTTG------AGTTGT-GTTGGTAA---ATTA------A-TGGAAATAGTTGTT----TACAAAC--ATATCT-ATATTT---TT---TTT-T---TGTTGC-AAAT--AACTTGA--TA-TA-CA-AGTTACAGTC---AGG--ATTT---TTAAA-A-GTTCATTCAAC-TGTTT
gi|96852 : A-ATG-----CT----CT----CTG--CCTAATTTTACTC-GTA-----AAACTGAAA-ATTCAC------TTTC--AA-GT-----A--TA----AG-----TA-------TATCAG-A--AAAAGAAATAATTGA---T---GT---TATC-ACCA---T----AC-----------TGAA-C-G--T---------AAACAAAGCTT-GT-----GGCCATGATTT-GATAAGTCATA-AAAT-G-TTAAAAGGA----G----TT------------------GCA----CA----CTCAATA---T--TGAAACCACT-G--G-CTT---T-TCTT---TTT---AATCGTTCT-TTTAGT----GAA--TGAAC-ATAT--C-C-C--A---AAG-T-A---TGGAAA--A-----TT-G--CC--AAT---G-TCACACC--GTT-ATATA--AAA-A--AGG----T---GA-CA--AGTCA---TA-T---GT-T-T---C--A--A---ATTACAGACTTGTGT-CTTTGTTA------AGTTGT-TGTGGCAA---GCTT------T-TTGAGAGAATCATG----TTTAAAA--ATATGT-ATA--A---TT---TCC-T---GTATGA-TAAT--AATTTAA--TG-TA-TA-AATATCAATC---AGG--CTTTTTACCTAA-----ATATTCAAC-
gi|96853 : --A-CTTTACCACAATACATTC-CCA-----AAACAGATG-TT-TCA------TTAG--AA-ACT----A--TT----AC-----TA-------TAACTG-A--GCAGGAAATAA--AA---T---AT---T-TT-G--AAAAT----AC------T-----AGA-T-A--T---------AAATAAAGC-C-AGT----GGCAGTGATAT-TATAAGCCACA-ATAT-A-CTAA----A----G------------------G---AAACAGCTACAG---TT--ATA---T--CAAAGCCTCT-A--T-GTA---TTATT----TTT---AATAGATCC-CTAAGT----GAG--TGTTG-CT-T--T-C-C--A---GAA-TGC---TGGAAA--T-----TT-G--CA--AAT---G-TCATGCC--ATT-GTTTA--AAA-A--GGG----A-TGTG-CT--A---A---TG-T---TA-CAA---C--T--G---ATTATAGACCGATTT-CTTTATTG------AGTTGT-GTTGGAAA---ACTT------T-TTGAAAGAGTT
gi|96854 : TGCATCT-T--------AACTA-CA-ATAC-A------TTCCTCAA-AC-----AGATGCTACAT-----CAGAAAATATTACTATA--ACTAAGCATGA--AA---T---AA---AAT-----A---T----AT------T---TTGAA-A-A--T---------AAATAAAGC-TTGT-----GGAAGTGATAG-TATAAGCCACA-AGAC-A-ATAA----A----A------------------G---AAACAGCTACAG---TT--ATA---T--CAAAGCCTTT-A--T-TTA---T---TAC--TTT---AATGGATCC-CTAAGT----GAA--TGTTG-CT-T--T-C-C--A---GAA-AGT---TGGAAAATT-----TT-G--CA--AAT---G-TCAT-CC--ATT-ATTTA--AAA-A--GGGA---T-C-TG-CA--A---A---TG-T---TA-TAA---C--T--A---ATTATTGGCCTATTT-CTTTATTG------AGTTGG-GTTGGAGG---AGTT------T-TTGAAAGAGTTGTA----TGTAAAC--ACATTT-ATA--A---TA---ATC-T---TAATAG-TAAT--GAACTCA--TT-TT-CA-AGAACCAGTC---TGG--TTTT---CT
gi|96855 : T-TGA-----AAACTCATA-ATGTTC------TTGA--TA-AC-----G--TC----AT-----GG-------TAACAG-A--AACAGAAGTAGAAGA---TGTAAT---TCTC--------T-----C------A---TTGAA-T-C--C---------AAATAA------GTCAAGTGGGCCGGATGA-TATATGTCATA-AAAT-G-TTAA----AAGGAG----TT-------G---CC---AAAT-----CA----GT--AT-------CTAAACCATT-A--A-CAT---T-ATTA---TTG---AATCGCTCT-CTATCA----GAA--AGTAT-TT-T--T-C-C--A---GAT-AGC---TGGAAA--A-----CA-T--CA--AAT---G-TTATTCC--TAT-ATTTA--AA-AA--AGG-------AGA-TA--A---ATT-CA-T---G---GTAA-G--T--A---ATTATAGACCAATGT-CATTATTA------AGCTGC-ACCGG-AA---AATT------ATTAGAAAGATTAGTG----TTCAAAT--ATTTGT-ATA--A---TT---TTT-T---AATTAG-CAAT--AATTT-A--TTATA-TA-AATATCAATC---GGG--TTTTTTACCTAA-----CCACTCGACAAGTTT
gi|96856 : A-----AAACTAATG-ATACTC------TTTC--TA-AT-----A--TT----AT-----TA-------TTACAA-A--GTCTGAAATAAAAGA---T---AC---GATT-G--A---A----AT------T---CTTGA-C-T--C---------AAACAAATC-T-GTT----GAGAATGATAA-AATAAGTCACACG--T-T-TTGA----A----G----TA--T----A---CA---AAATA----TA----GT--ATT---T--CTAAACCTCTAG--TACT------GTTA---TTT---AATAGATCA-TTAATT----ATA--AGTGA-AT-T--T-C-C--A---GAT-TTA---TGA-----------------------------TAATGCC--ACT-TTTCA--AAA-A--AGG----T-AAAA-CA--A---A---CC-C---GG-CGT---C--T--T---ATTATCGACCAATTT-CACTCTTA------AGCTGT-ATTGGCAA---GTTA------A-TCGAAAGAATTGTG----TACAAAC--ATATAT-ATA--A---TT---TTC-T---TCTTGG-TAAT--AACCTCA-----TA-TA-AGTTACAATC---TGG--ACTT---CTCAA-A-GGACATTCCAC-GGTTT
gi|96857 : A-----AAACTTATA-ATTCCC------TTTC--AC-AT-----T--TT----AT-----AA-------TAACTG-AGGAT--GATATATCTGA---A---CT---TATT-A--G---T----AC------T---T--AA-C-CAGT---------AAATAAGGCCT-GT-----GGTCATGATAT-GATCAGTCACA-GAAT-G-CTGG----A----A----TA--T----GTGTCG---AAA-------G----CT--ATT---T--CAAAACTATT-T--T-AAA---T-TTTA---TTT---AACCGTTCT-TTAAGT----GAA--GGTAT-AT-A--T-C-C--C---GAT-TTG---TGGAAG--A-----TT-G--CA--AAT---G-TAACTCC--CAA-TTCTA--AAA-A--GGG-------AGA-CA--A---GT--CATT---GG-TGT---C--A--A---ATTACAGACCTGTGT-CTTTACTT------AGTTGT-GTCGGAAA---ACTT------G-TTGAAAGGCTTGTT----TTTAAGA--ATATGT-ATA--A---CT---TT--T---TCTTGA-TAAT--AATTTGA--TT-TA-TA-AATACCAGTC---AGG--CTTT---TT
gi|96858 : TGA---T---AT----ATCTG--A---C----AT------T---TTAAA-C-A--CTGTTAATATAAATAAAGCAT-GT-----GGCCATGACTC-TGTAAGCCATA-AGAT-TCTTAA----AGG--G----GT--A----A---CA---AAAC-----------CC--ATA---T--CTAAACCTTT-A--G-CCG---T-ACTT---TTT---ACCCGCTCT-CTGAAT----GAA--GG--G-AT-TTAT-C-C--T---GAC-GTT---TGGAAG--A-----TA-G--CA--AAT---G-TTACACC--AAT-ATATA--AAA-A--AGG----T---GA-CA--A---G---TC-TATAGC-T-T---C--A--A---ACTATAGACCAGTTT-CTTTACTT------AGCTGT-TGTGGTAAGATATTT----------GAAAGAATCATT----TTTAAAC--ACATGT-ACA--A---CT---TTC-T---TCTTAC-AAAT--AAATT-A--TTGTA-TA-AATATCAATC---AGG--ATTT---CT
gi|96859 : TGA---T---AT---CATC--------TCCTCAC------T---TTATA-C--------------AAATAAAGC-C-AGT----GGTCCAAACCA-AATTAGTCATG-AAAT-G-ATAA----A----G----G-------------G---ATGCG----CAGATTCT--ATC---A--CAAAACCGTT-A--G-TTA---TCATT----TTT---AACCGTTCT-ATACAA----GAA--AGTAT-TT-T--T-C-C--A---AAC-TCA---TGGAAG--A-----TA-G--CT--CAA---G-TCACTCC--CAT-CTTCA--AAA-A--GGG-------AGA-TA--A---AA--CG-T---AAACTT---C--T--A---ATTATAGACCCGTTT-CACTTTTA------AGCTGT-TGTGGAAA---GATT------C-TTGAAAGAATAGTT----TTTAAAA--ATATGT-ATA--A---CT---TTT-T---TTTTAC-AAAT--CAACTGT--TG-TA-TA-AATATCAGTC---TGG--TTTT---TT
gi|96860 : TGA---T---AT---TATC--------T----CC------TCACTTA-A-T-A--C---------AAATAAAGC-C-AGT----GGTCTAGACCA-AATAAGTCATA-AAAT-G-ATAA----GAG--G----TT--T----G---C------AGA----TT----CT--ATC---A--CAAAACCATT-A--G-TTA---TCATT----TTT---ATCCGTTCT-GTACAA----GAA--AGTTT--T-T--T-C-C--A---AAACTCA---TGGAAG--A-----TA-G--CTCAAAT-----TACTCCC--A-T-CTTCA--AAA-A--GGG-------AGA-TA--A---AA--CG-TT--AA-CTT---C--T--A---ATTATAGACCCGTTT-CACTTTTA------AGCTGT-TGTGGAAA---GATT------C-TTGAAAGAATAGTT----TTTAAAA--ATATGT-ATA--A---CT---TT--T---TCTTGA-CAATTCAA--TTA--TTGTA-TA-AATTTCAGTC---TGT--TTTT---a
gi|96861 : GA---C---AT---GATT-T--G---T----TT------T---TTAGG-T-G--T---------GAATAAAGC-T-GTA----GCGCCAGACTG-AGTAAATCAGA-GAAT-T-TTAA----A----A----CT--A----A---CC---AAGGG----TA----CA--ATT---T--CAGAACCGTT-A--T-GTA---T-TTGA---TTT---AATAAGACT---ATTT----GCA--AGGAATAT-T--TAC-C--A-------TTAAACTAGAAA--------CATG--CA--CTT---G-TTATGCC--CCT-TTATA--AAA-A--AGG----C----------A---A---CT-T---GT-CATGTGT--T--AGATATTACAGATCTTTAT-CTCTGTTA------AGTTGT-ATTGGTAA---ACTT------A-TGGAAAt
gi|96862 : ------T---TTAGG-T-G--T---------GAATAAAGC-T-GTA----GGGCCAGACCT-AGTAAGTTACA-TAAT-T-TTAT----A----A----CT--A----A---CC---AACGG----TA----TA--ATT---T--CAAAACCTTT-A--T-GTA---T-TTTA---TTT---AATAAGTAT-TT-TTTAG--GAA--TCT----T-T--T-C-C--ATGTAAC-T-----TGAAA---------CATG--CA--TTT---G-TTATGCC--CCT-TTATA--AGA-A--AGG------CGAT-CC--A---T---CG-T---G--TGT---TAGT--A---ATTACAGACCTATTT-GCCTGTTA------AGTTAT-ATTGGTAA---ACAT------A-TGGAACGTTGTGTG----TATAAGT--ATATAT-ACA--C---TT---TCC-
gi|96863 : ------T---TTAGG-T-G--T---------GAATAAAGC-T-GTA----GGGCCAGACCT-GTTAAGTTACA-TAAT-T-TTAT----A----A----CT--A----A---CC---AA-------CG----GT--ATAAATT--CAAACCCTTT-A--T-GTA---T-TTTA---TTT---AATAAGTAT-TT--TT----GAG-----GA-AT-C--T-T---------AT-CCA---TGTAAC--TTGAAACATG--CA--TTT---G-TTATGCC--CCT-TTATA--AGA-A--AGG------CGAT-TC--A---T---CG-T---GT--GT---TAGT--A---ATTACAGACCTATTT-CCCTGTTA------AGTTAT-ATTGGTAA---ACAT------A-TGGAACGTTGTGTG----TATAAGT--ATATAT-ACA--C---TT---TCC-
gi|96864 : ------T---TTAGG-T-C--T---------GAATAAAGC-T-GTA----GGGCCAGACCT-AGTAAGTCACA-GAAT-T--------------------------------------------------------------T--CAAAACCTTT-A--T-GTA---T-TTTA---TTT---TAAAAGTCT-ATTCGTGAG-GAA--TCT----T-T--T-C-C-------AT-GCAAC-TGGAAA--------CATG--CA--CTT---G-TTGTGCC--CCT-TTATA--AGA-A--AGG------CGAT-TC--A---T---CG-T---G--TGT---TAGT--A---ATTACAGACCTATTT-CCCTGTTA------AGTTGT-ATTGGTAT---ACTT------A-TGGAACGTTGTGTG----TACAAGT--ATATAT-ATA--A---ATACCTTA-T---CTCTGA-GAAT-----------CT-TA-TA-TATTCTAGACAATCAG--GTTT---TTTAATT-GGTCATTCCAC-TGT
gi|96865 : --C---------AAATAAAGC-T-GTT----GGGGAAGACTT-AATAAGTCATA-CAAT-T-TTAA----A----A----AA--T----A---CT---CGTAA----TA----CT--TTT---T--CAAAACCACT-T--TGCAA---TCGT-----TTT---AACAAATTT-CTAAAT----GAA--TGTGT-AT-T--T-C-C--A---AGT-TCT---TGGAAG--T-----CG-G--CT--ATA---A-TTATGCC--GCT-GTTTA--AAA-A--GGGGGATT-C----CG--A---T---TG-T-------GT---T--TAAA---ACTACAGACCTATAT-CTTTACTT------AGCAGT-ATTGGCAA---ACTT------A-TGGAAAGGACCATG----TACAAAC--ACATAT-ATA--A---CC---ATC-T---CCTTGA-TAAC--AATTTGA--TA-TA-TA-ATAATCAGTC---CGG--TTTT---CTAAG-A-AGCTATTC
gi|96866 : --C---------AAACAAAGC-T-GTT----GGGGAAGACTT-AATAAATCATA-CAGT-T-TTAA----A----A----AA--T----A---CT---CGTAA----TA----CT--ATA---T--CAAAACCATT-T--TGCAA---T-CTT----TTT---AACAAATCT-CTATAT----TAA--TGTGT-AT-T--T-C-C--A---AGT-TCT---TGGAAG--T-----CC-G--CT--GTA---G-TTATGCC--ACT-GTTTA--AAA-AT-GGGGAT-T-C----------------CG-----GT-TGT-------------GTTTCAAACTAATAT-CTTTACTA------AGCTGT-ATTGGCAC---ACTT------A-TGGAAAGGACAATG----TACAAAC--ACATAT-ATA--A---CC---ATC-T---CTTTGA-TAGC--CATTTGA--TA-TA-TA-ATAAACAGTC---CGG--TTTT---CTAAG-A-GGCCATTTCAC-AGTTT
gi|96867 : ---------AAATAAAGT-A-AGC----GGTACTGACAC-TATAAGTCACA-AAATGC-TTAA----A----G----GTGCT----G---TA---AGA-A----CA--------ATT---T--CTGAACATCT-T--A-CTC---T-TTTA---TAT---AATCGTTCTATTACC-----GAA--AGTCA-TT-T--C-C-C--T---AAC-TCA---TGGAAA--A-----TA-G--CC--CAT---G-TAACTCCTATAT-TTTTG--AAA-GT-GGA----T-AAGT-CA--A----------T---TC-CAT---C--T--A---ATTATAGACCAGTTA-AGTTGCTA------AGCTGT-GTCGGAAA---GATT------T-TAGAAAGAATAATT----TTTAAAC--AAATGT-ATA--A----C---TTC-T---TCTTGAGTAAC--AATTT-A--TTGTA-TA-AAAACCAGTC---TGG--CTTT---TT
gi|96868 : AATAAGGC-T-GTA----GGGTAAGACCT-AGTAAGTCGCA-GAAT-T-TTAA----A----A----CT--A----A---CC---ATGGG----TA----CA--ATT---T--CAAAACCTTT-A--T-GTA---T-TTTA---TTT---AATAAGTCT-TTTCGC----GAG-----GA-AT-C--T-T---------AT-TCA---TG------------CA----CT----T---G-TTAT-CC--CCT-TTATA--AGA-A--AGG------CGAT-TC--A---T---CG-T---GT--GT---TAGT--A---ATTACAGACCTATTT-CCCTGTTA------AGTTGT-ATTGGTAA---ACTT------A-TGGAACGTTGTGTG----TATAAGT--ATATAT-ATA--A---TT---
gi|96869 : ATAAGTAACA-AAATGC-TTAA----A----G----GTGCT----G---TA---AGA-A----CA--------ATT---T--CTGAACCTCT-------TACACT-TTTA---TAT---AATCGTTCTATTACC-----GAA--AGTCA-TT-T--C-C-C--T---AAC-TCA---TGGAAA--A-----AA-G--CT--CAT---G-TAACTCC--TAT-TTTTAGGAAA-G--GGG----A-TAAGTCA--A----------T---CC-CAT---C--T--A---ATTATAGACCAATGT-CGTTGCTC------AGCTGT-GTCGG
gi|96870 : aaatt----TT--T----A---AA---AAGCA--------------ATT---G--CAAAACCACT-T--T-CAA---T-TTTA---TTT---AACCGTTCT-TTAAGT----GAA--GGTAT-AT-A--T-C-C--C---GAT-TTG---TGGAAG--A-----TT-G--CA--AAT---G-TAACTCC--TAT-TTTTA--AAA-A--GGG-------AGA-CA--A---GT--CATT---GG-TGT---C--A--A---ATTACAGACCTGTGT-CTTTACTT------AGTTGT-GTTGGAAA---ACTT------T-TTGAAAGGCTTGTT----TTTAAGA--ATATGT-ATA--A---CT---TTT-T---TCTTGA-TAAT--AATTTGA--TT-TA-TA-AATACCAATC---AGG--CTTT---TT
gi|96871 : T--ATT---T--CCAAATATCT-AGTT-CTA---T---TA---TTT---AATAGTACA-TGACAT----GAA--TGGAA-AC-G--C-A-C--A---TAT-TTA---TGGAAA--C-----AA-G--CT---TT---GATAATGCC--ACT-CTTCA--AAA-C--AGG----T-AAAA-CA--A---A---AC-T---GG-CGT---C--T--A---TTTATCGATCGATAT-CTCTCTTA------ATCTGT-GTTGGCAA---GTAA------A-TGAAACAAATTGTT----TACAAAC--GTATAT-TTA--T---TT---TTC-T---TGTAAA-CAAA--AACCTCA--TT-TA-TA-AATCACATTC---AGG--ATTT---CTACA-T-GGACACTCTAC-GGTCT
gi|96872 : ctaT--ATT---T--CAAAACCTCT-A------A---T-GTTACTTTTT---AATCGTTCT-ATAAAC----GAA--AGTAA-AT-T--C-C-C--T---GAA-TCC---AGGAAA--A-----TA-G--CA--CAT---G-TAACCCC--CCT-TTTAA--GCA-A--GGG--------GA-CA--A---GT--CG-TT--GC-CCT---C--T--A---ATTATAGACCAGTAT-CACTGTTG------AGTTGT-TTGGGAAA---AGTT------T-TAGAAAGAATAATT----TTCAAGC--GTATGT-ATA--A---CT---TTC-T---AC-TAA-ACAT--AATATGC--TG-TT-CA-AATGTCAGTC---TGG---TTT---CTT
gi|96873 : A---T-GTTA---CTTTTCAATCGTTCT-ATAACC----AAA--AGTAA-AT-T--C-C-C--T---GAC-TCA---TTGAAA--A-----TA-G--CA--CAT---G-TA--------TT-TTTTA--AAA-A--AGG--------AA-CA--A---GT--CG-TTTGGC-C-T---C--T--T---ATTATA--CCAGTAT-CCATGTTC------ATCTGT-TTGGGGAAG--ATTT------T-TAGAAAGAATAATT----TTCAAGC--GTATGT-ATA--A---CT---TTC-T---ACTAAA-TAAT--AATCTGC--TG-TA-CA-AATAATAATC---
gi|96874 : cctgtaAAG--T-----CG-G--CT--ATA---G-TTATGCC--GCT-GTTTA--AAA-A--GGGGGATT-C----CG--A---T---TG-T---GC-T-T---C--A--A---ACTACAGACCAGTAT-CTTTACTT------AGCTGT-ATTGGCAA---ACTT------A-TGGAAAGGACCATG----TACAAAC--ACCCAT-GTA--A---CC---ATT-G---CTTTGA-TAAC--AATTTGA--TA-TA-TA-GTAAACAATC---CGG--TTTT---CTAAG-A-GGCCTTTCCAC-AGTTT
gi|96875 : ttaataagtcattcaattttaaaaaaatactcgtTT---AATAGTTCT-ATACAA----GAA--AGTAT--T-T--T-C-CCAA---AAC-TCA---TGGAAGA-T-----C--G--CT--CAA---G-TTACTCC--AAT-CTTCA--AAA-A--GGGAGA-T-AAAA-CATTA---A---C--T--------T---C--T--A---ATTATAGACCCGTTCACTTC--TA------AGCTGT-TGTGGAAA---GATT------C-TTGAAAAATTAGTT----TCTAGAA--ATATAT-ATA--A----------C-T---TCTTGACAAAT--CAACT-A--TTGTA-CA-AATATCAGTC---TGG--
gi|96876 : AA--TATCA-AT-A--T-CAC--A---GAA--CA---AGAAAT--T-----T-----CT--GAT---G-TAATGCC--ATT-ATTTA--AAA-A--AGA----TGCTAA--A--G---A---TA-T---TC-CAT---C--A--A---ACTATAGACCTATTT-CATTAATT------AGATGT-ATTGGTAA---GGTC------A-TGGAAAGAGTAATA----TTCAAGC--ATTTAT-ACA--A---TTA--TTT-A---CATTTA--AAT--AACCTGA--TT-TA-TA-AAAATCAGTC---GGG--GTTT---CTCCC-A-GGTCATTCAAC-AATTT
gi|96877 : --T--A---ACTATAGACCTATAT-CACTGTTA------AGC-GTAATTGGCAA---AGTG------T-TTGAAAGACTTATT----TTTAAAC--ACATGT-ATA--A---TT---TCT-T---TCGTGA-TACT--AATTTTA--TT-T--CGTCATTTCAATC---TGG--TTTT---GTTCC-T-GGTGATTCAAC-AATT
gi|96878 : caaaagtctggaaagaagcatttgtatgcgctgtttataaaaaaggagacccttctttggttaa-TTA---TGGAAG--T-----CA-G--CT--ACT---G-TAATGCC--TCT-TTTTA--AGA-A--AGG----T-CAAA-CA--A---A---CG-T---GC-CAT---C--T--A---ATTAAAGGCCAATAT-CTTTATTA------AGCTGT-GTTGGTAA---ACTT------A-TGGAAAGGGTTGTC----TACAAAC--ATATTT-ATA--A---TT---TTC-T---GATTGA-AAAT--AAACTAA--TT-TA-CA-AATTGCAATC---CGG--ATTT---CTTAA-G-GGCCATTCGACAAGTT
gi|96879 : gAATCCC--ACT-GTTTA--AAA-A--GGGGGATT-C----CG--A---T---TG-T---G----T---T--TGAA---ACTTCACACCAATAT-CTTTACGT------AGCTAT-ATTGACAA---ACTT------A-TGGAAAGGACCATACATGTACAAAC--ACATAT-ATA--A---CC---ATC-T---CTTTGA-TAAC--AATTTGA--TG-TA-TA-GTAAACAGTC---CGG--TCTT---C--AA-GAGGTCATTCCAC-AGTTT
gi|96880 : T-TTTTA--AAA-AAAGAG----T-CAAA-CA--T---A---T-------C-CGT---C--A--A---GCTAAATACCAATTT-CTTTAATT------AGTTGT-ATTGTTAA---GGTA------A-TGAAGCGTATCGTT----TTCAAA---ATATATAACA--A---AT---ATC-TATAGTTTG----AT--GACTTAA--TT-TATCA-AA-ATCAATC---AGGATGTTT---ACCAA----GACATTCGAC-TGTTT
gi|96881 : TTG------AGTTTT-GTTAGTAA---ATTA------A-TGGAAAGAGTTGTT----TACAAAC--ATATTT-ATA--AT--TT---TTT-T---TTTTGC-TAAT--AA--TTA--TA-TA-CA-AGTTACTGTC---AGG--ATTT---TTAAA-A-GGTCATTC
gi|96882 : A------AG-TAT-GTTGGTAA---ACTT------A-TGGAAAGAGTTGTC----TACAAAC--ATATTT-ATA--A---TT---TTC-T---GATTGA-AAAT--AAACTAA--TT-TA-CA-AATAGCAATC---CGG--ATTT---CTTAA-G-GGACATTCGAC-AGTTT
gi|96883 : AA---ACTTGAATGGA-TGGAAAGAGTCGTT----TACAAAC--ACATGT-ATA--ACTTTT---TTT-T---TGTTGC-TAAT--AACTTGA--TA-TA-CA-AGCTACAATC---AGG--TGTT---TTAAA-A-GGTCACTCAAC-TGTT
Alignments
lowQualScore : 11111 11111111111111 11111 222222222222222222222222222222222222222222 11111 111111111111 33333333333333333333333333333333333
lowQualScore : 666 3 88888 7777 5555 2 66666 3 2 88888888 1 33 5 66666 33 5555 66666 8888888 0 2 33 22 0 1 333 333 6666 33333 4444 555555 333 0 1 22222222222222 4 1 22222 222 44 1 1 3 1 44444 777777777777777777777777777777777777777777 11 5555 11 1 3 00000 222 2 333 222 1 11 7777777 222 555 444 1 11 1 1 11 3333 33 333 222222222222 11 888 222 1 2 2 1 11 11 22 88888888888888888888888888888888888 111 77 22 111 1 1 1 1 222222 11 1 222 222222 1 4 8 33333 1 11 1 1 11 222 333 1 33333 66 11 3 5 11 4 1 1 22 5555 2 444 222 777 1 2 3
lowQualScore : ... . ..... .... .... . ..... . . ........ . .. . ..... .. .... ..... ....... . . .. .. . . ... ... .... ..... .... ...... ... . . .............. . . ..... ... .. . . . . ..... .......................................... .. .... .. . . ..... ... . ... ... . .. ....... ... ... ... . .. . . .. .... .. ... ............ .. ... ... . . . . .. .. .. ................................... ... .. .. ... . . . . ...... .. . ... ...... . . . ..... . .. . . .. ... ... . ..... .. .. . . .. . . . .. .... . ... ... ... . . .
lowQualScore : 444 3 33333 1111 0000 9 22222 5 5 00000000 4 44 0 22222 44 3333 22222 1111111 8 5 44 11 8 6 555 555 4444 66666 2222 000000 000 3 7 22222222222222 6 5 00000 000 00 9 5 0 5 77777 222222222222222222222222222222222222222222 88 6666 88 5 6 99999 333 3 555 222 0 99 7777777 111 777 444 2 77 2 2 77 0000 00 777 888888888888 66 222 000 1 1 0 4 22 55 66 33333333333333333333333333333333333 999 22 99 888 0 0 1 1 999999 88 0 888 999999 0 1 7 22222 3 44 0 0 44 888 888 1 99999 44 55 6 0 66 6 1 1 00 3333 2 222 666 333 0 3 6
consensus : CAACAATAGATGAAAATACAAACA---ATA-ATA-----CT----CT--A-CTTCCAGAGTGTATCT-TTA-----AAACTAATA-ATACCA------TTGC--AA-AC-----A--TG----AT-----CA-------TTACTG-A--ATCAGACATAATTGA---T---AT---TATC-G--GT----AC------T---TTAGA-C-C--C---------AAATAAAGC-T-GTC----GGNNAAGACNNAATAAGTCACA-GAAT-T-TTAA----A----G----TT--T----A---CN---AAACA----CA----CT--ATN---T--CNAAACCNCT-GT-CTA---TNTTA---TTT---AATAGNTCT-TTACNT----GA---A--TGTAN-AT-T--T-C-C--A---GAN-TCA---TGGAAG--T-----CA-G--CTANT---G-TNATGCCNCT-TTTTA--AAAA--GGG----T-CAAA-CA--A---A---CG-T---GC-CGT---C--T--A---ATTATAGACCNATNT-CTTTATTA------AGCTGT-GTTGGTAA---ACTT------A-TGGAAAG-AGTCGTN----TACAAAC--ATATNTA-TA--A---TT---TTC-TNN---TTGA-NAAT--AANCTGA--TT-TA-CA-AATNNCAATC---CGGNTTT---CT--TAA-G-GGNCATTCGAC-AGTTT
Reference ( family-531 ) : CAACAATAGATGAAAATACAAACA---ATA-ATA-----CT----CT--A-CTTCCAGAGTGTATCT-TTA-----AAACTAATA-ATACCA------TTGC--AA-AC-----A--TG----AT-----CA-------TTACTG-A--ATCAGACATAATTGA---T---AT---TATC-G--GT----AC------T---TTAGA-C-C--C---------AAATAAAGC-T-GTC----GGNNAAGACNNAATAAGTCACA-GAAT-T-TTAA----A----G----TT--T----A---CN---AAACA----CA----CT--ATN---T--CNAAACCNCT-GT-CTA---TNTTA---TTT---AATAGNTCT-TTACNT----GA---A--TGTAA-AT-T--T-C-C--A---GAN-TCA---TGGAAG--T-----CA-G--CTANT---G-TNATGCCNCT-TTTTA--AAAA--GGG----T-CAAA-CA--A---A---CG-T---GC-CGT---C--T--A---ATTATAGACCNATNT-CTTTATTA------AGCTGT-GTTGGTAA---ACTT------A-TGGAAAG-AGTCGTN----TACAAAC--ATATNTA-TA--A---TT---TTC-TNN---TTGA-NAAT--AANCTGA--TT-TA-CA-AATNNCAGTC---CGGNTTT---CT--TAA-G-GGNCATTCGAC-AGTTT
gi|96841 : CAACAATAGATGAAAATATAAACA---ATA-ATA-----CT----CT--A-CTTCCAGAGTGTATCT-TTA-----AAACTTATA-ATACCA------TTGC--AA-AC-----A--TG----AT-----CA-------TTACTG-A--ATCAGACACAATTGA---T---AT---TATC-G--GT----AC------T---TTAGA-C-C--C---------AAATAAAGC-T-GTC----GGAGAAGACAAAATTAGTCACA-GAAT-T-TTAC----A----G----TT--T----A---CT---AAACA----CA----CT--ATA---T--CTAAACCCCT-GT-CTA---TGTTA---TTT---AATAAATCG-TTACTT----GA---A--TGTAA-AT-T--T-C-C--A---GAG-TCA---TGGAAG--T-----TA-G--CTACT---G-TAATGCCTCT-TTTTA--AGAA--GGG----T-CAAA-CA--A---A---CG-T---GC-CAT---C--T--A---ATTATCGGCCAATAT-CTTTATTA------AGCTGT-GTTGGTAA---ACTT------A-TGGAAAG-AGTTGTC----TACAAAC--ATATTTA-TA--A---TT---TTC-TGA---TTGA-AAAT--AAACTAA--TT-TA-CA-AATTGCAATC---CGGATTT---CT--TAA-G-GGACATTCGAC-AGTTT
gi|96842 : CAACAATAGATGAAAATATAAACA---ATA-ATA-----CT----CT--A-CTTCCAGAGTGTATCT-TTA-----AAACTAATA-ATACCA------TTGC--AA-AC-----A--TG----AT-----CA-------TTACAT-A--ATCAGACATAATTGA---T---AT---TATC-G--GT----AC------T---TTAGA-C-C--C---------AAATAAAGC-T-GTC----GGAGAAGACAAAATTAGTCACA-GAAT-T-ATAC----A----G----TT--T----A---CT---AAACA----CA----CT--ATA---T--CTAAACCCCT-GT-CTA---TGTTA---TTT---AATAAATCC-TTACTT----GA---A--TGTAA-AT-T--T-C-C--A---GAG-TCA---TGGAAG--T-----CA-G--CTACT---G-TAATGCCTCT-TTTTA--AGAA--GGG----T-CAAA-CA--A---A---CG-T---GC-CAT---C--T--A---ATTATCAGCCAATAT-CTTTATTA------AGCTGT-GTTGGTAA---ACTT------A-TGGAAAG-AGTTGTC----CACAAAC--ATATTTA-TA--A---TT---TTC-TGA---TTGA-AAAT--AAACTAA--TT-TA-CA-AATTGCAATC---CGGATTT---CT--TAA-G-GGACATTCGAC-AGTTT
gi|96843 : CAACAATGGATGAAAATATAAACA---ATA-ATA-----CT----CT--A-CTGCCAAAGTGTGTCT-TTA-----AAAC----------CA------TTGC--AA-AC-----A--TG----AT-----CA-------TTACTG-T--ATCAGACATAGTTGA---T---AT---GATC-G--GT----AC------T---TTAGA-C-C--C---------AAATAAAGC-T-GTC----GGAGAAGACAAAATTAGTCACA-GAAT-T-TTA----------G----TT--T----A---CA---AAACA----CA----TT--ATA---TATCTAAACCCCT-GT-CTA---TGTTA---TTT---AATAAATCC-TTACTTACTTGA---A--TGTAT-AT-T--T-C-G--A---GAG-TCA---TGGAAG--T-----CA-G--CTACT---G-TAATGCCTCT-TTTTA--AGAA--GGG----T-CAAA-CA--A---A---CG-T---GC-CAT---C--T--A---ATTATCGGTCAATAT-CTTTATTA------AGCTAT-GTTTGTAA---ACTT------A-TGGAAAG-AGTTGTC----TACAAAC--ATATTTA-TA--A---TT---TTC-TGA---TTGA-AAAT--AAACTAA--TT-TA-CA-AATTGCAATC---CGGATTT---CT--TAA-G-GGACATTTGAC-AGTTT
gi|96844 : CAACAATAGATGAAAATATAAACA---ATA-ATA-----CT----CT--A-CTTCCAGAGTGTATCT-TTA-----AAACTAATA-ATACCA------TTGC--AA-AC-----A--TG----AT-----CA-------TTACTG-A--ATCAGACATAATTGA---T---AT---TATC-A--GT----AC------T---TTAGA-C-C--C---------AAATAAAGC-T-GTC----GGAGAAGACAAAATTAGTCACA-GAAT-T-TTAC----A----G----TT--T----A---CA---AAACA----CA----CT--ATA---T--CTAAACCCCT-GT-CTA---TGTTA---TTT---AATAAATCC-TTACTT----GA---A--TGTAA-AT-A--T-C-C--A---GAG-TCA---TGGAAG--T-----CA-G--CTACT---G-TAATGCCTCT-TTTTA--AGAA--GGG----T-CAAA-CA--A---A---CG-T---GT-CAT---C--T--A---ATTATCGGCCAATAT-CTTTATTA------AGGTGT-GTTGGTAA---ACTT------A-TGGAAAG-AGTTGTT----TACAAAC--ATTTTTA-CA--A---TT---TTC-TGA---TTGA-AAAT--AAACCAA--TT-TA-CA-AATTGCAATC---CGGATTT---CT--TCA-G-GGACATTCGAC-
gi|96845 : CAACAATAGGTGAAAATACAAACA---ATA-CTA-----CT----CT--A-CTTCCAGGGTGTATCT-TTA-----AAACTAATA-ATACCA------TTGC--AA-AC-----A--TG----AT-----CA-------TTACTG-A--ATCAGCCATAGTTGA---T---AT---AATC-G--GT----AC------T---TTAGA-C-C--C---------AAATAAAAC-T-GTC----ACAGAAGACAAAATTAGTCACA-GAAA-T-TAAC----A----G----TT--T----A---CA---AAACA----CA----CT--ATA---T--CTAAATC-CT-GT-CTA---TGTTA---ATT---AACAAATCC-TTACTT----GA---A--TGTAA-AT-T--T-C-A--A---GAG-TCA---TGGAAG--T-----CA-G--CTTCT---G-TAATGCCTCT-TTTTA--AAAA--GGG----T-CAAA-CA--A---A---CG-T---GC-CAT---C--T--A---ATAATCGGCCAATAT-CTTTATTA------AGCTGT-GTTGGTAA---CCTA------A-TGGAAAG-AGTTGTC----TACAAAC--ATATTTA-TA--A---TT---TTC-TGA---TTGA-AAAT--AAACTAA--TT-TA-CA-AATTGCAATC---CGGATTT---TT--TAA-G-GGACA
gi|96846 : CAACAATAGGTGAAAATACAAACA---ATA-CTA-----CT----CT--A-CTTCCAGGGTGTATCT-TTA-----AAACTAATA-ATACCA------TTGC--AA-AC-----A--TG----AT-----CA-------TTACTG-A--ATCAGCCATAGTTGA---T---AT---AATC-G--GT----AC------T---TTAGA-C-C--C---------AAATAAAAC-T-GTC----ACAGAAGACAAAATTAGTCACA-GAAA-T-TAAC----A----G----TT--T----A---CA---AAACA----CA----CT--ATA---T--CTAAATC-CT-GT-CTA---TGTTA---ATT---AACAAATCC-TTACTT----GA---A--TGTAA-AT-T--T-C-A--A---GAG-TCA---TGGAAG--T-----CA-G--CTTCT---G-TAATGCCTCT-TTTTA--AAAA--GGG----T-CAAA-CA--A---A---CG-T---GC-CAT---C--T--A---ATAATCGGCCAATAT-CTTTATTA------AGCTGT-GTTGGTAA---CCTA------A-TGGAAAG-AGTTGTC----TACAAAC--ATATTTA-TA--A---TT---TTC-TGA---TTGA-AAAT--AAACTAA--TT-TA-CA-AATTGCAATC---CGGATTT---TT--TAA-G-GGACA
gi|96847 : CAACAATAAATGACAGTATTAACA---ATA-ATA-----TG----TT--A-CTTCCAGGCTGTGTCT-TTA-----AAACGAATA-ATACCA-------------A-AC-----T--TG----AT-----CG-------TTACTG-A--ATCAGACATAATTGT---T---TT---GATC-G--GT----AC------T---TTAGA-C-C--C---------AAATAAAGC-T-GTC----GGAAAAGACACAAT---TCCCA-GAAT-T-TTTC----A----G----TA--T----A---CA---AACCA----CA----CT--A-----------AACCACA-GT-CTA---TGTTA----------ATAATTCC-TTACTT----TA---A--TGTAA-AT-T--T-C-C--A---G---TCA---TGGAAG--T-----CA-A--CTACT---G-TTATGTCTCA-TCTTA--AGAA--AGG----T-CAAA-CA--G---A---CG-T---GC-CAT---C--T--T---ATCATTGGTCAATAT-CTTTATTA------AGCTGT-GTTGGTAA---ACTT------A-TGGAAAG-AGTTGTC----TACAAAC--ATATTTA-TA--A---CT---TTC-TGA---TTGA-AAAT--AAACTAATTTT-TA-TA-AATTTTTATC---AGGACTT---TC--TAA-T-GGACATTCGAC-AGTTT
gi|96848 : ACAATAGATGATACT-CAAACA---A---AT------------------CTTCCTGAATTCGTTT-TTC-----AAACAAATA-GTAC-G------TTAA--AAGAT-----A--TT----AA-----CA-------TCACAG-A--AAAAGAAATAACTGA---T---GT---TCTA-G---------------------CAAA-C-C--TCGCTGT---AAATAAAGC-T-AGT----GGTCTTGACGACATAGGTCACA-AAATGC-TCAA----A----GAAACTT--TGTAAA---CTTGTAAACT----TGT---CT--ATT---T--GTAAACCTTA-AT-GTA---TTATA---CTT---AACAGATCT-ATGAGA----GA---AAATGTAT-AT------C-C--A---ACA-TCT---TTGAAA--T-----TA-G--CTAAC---G-TTATGCCTTTATTTTA--AAAA--GG-----T---GA-TA--A---ATCTC--T---AC-CGT---C--T--A---ATTATAGACACATTT-CATTGATA------AGCTGT-GTTGGTAA---AGTA------G-TGGAAAG-AATTGTT----TTTGAAC--ATATTTA-CA--A---TC---ATCTTCA---TTCA--AAT--AA
gi|96849 : AAAATACAAAGATAGATAGATAAAAGTTT----TT--ATCTTATA-AGTGTATAT-ATATATATAAACAAATAGATAACAACAAAATTGT--AA-GCTCTTCA--TG----AG-----CT-------TT--TG-A--ACC-GATATAAGTGA---C---ATACATGTC-----T----AC------T---TTA---C-C--C---------AATTTTAGA-C-GT-------ATACAAC--AGTGACTTAAA-GGGT-T-T-GA----A----G----TA--T----A---TA---AAATA----TA----GT--ATT---T--CTAAACCTCTAGTACT-----GTTA---TTT---AATAGATCA-TGAATT----AA---A--TGTGA-AT-T--T-C-C--A---GAT-TTA---TGGAAA--T-----CA-GTCCTA-----G-TAATTCCACT-TTTCA--AGAA--AGG----T-AAAA-CA--A---A---CT-A---AG-CGT---C--T--A---ATTATCGACCAATTT-CACTCTTA------AGCTGT-ATTGGCAA---GTTA------A-TGGAAAG-AATTGTG----TACAAACATATATATA-TA--A---TT---TTC-TTG---TTGA-TAAT--AACCTCA--TT-TA-TA-AATTACAATC---TGGATTT---CC--CAG-A-GGACATTCCAC-GGTTTtattatattta
gi|96850 : TACAATTG---ATG-ATA-----CTGACTCTGAA-CTTCCAAATTTTGTTT-TGA-----AAAC-AGT---TACCA---------C--AATTC-----A--TG----ATATCAATA-------TCACAG-A--ACAAGAAATTTCTGA---T---GT---TCTT-T--CC----AA------T---TTAGT-TGT--C---------AAA-AAAAC-T-TGC----GGCCCAGACGAAATAAGCCATC-ACAT-G-TTAA----A-------------------------------A----CA----CT--ATG---C--TG--ACCGCT-TT-GCA---TCATT---TTT---AATAGGTCT-CAATAA----GA---A--AGCAT-AT-A--C-C-C--A---AAT-TGT---TCAAAA--T-----AA-G--CAAAT---G-TAATGCCATT-ATTCA--AAAA--GGG----TGCTAA--A--G---A---TA-T---TC-CAT---C--A--A---ACTAAAGACCTATTT-CATTAATGACATGTAGTTGT-ATTGGTAA---GGTC------A-TGGAAAG-AGTAATA----TTCAAGC--ATTTATG-CA--A---TTA--TTC-ACA---TTTA--AAT--AACCTGA--TT-TA-TA-AAAATCAGTC---AGGGTTT---CT--TCC-T-GGTCATTCAAC-AATTT
gi|96851 : A---ACA-ATA-----CT----TT--A-CTACCAACTTGT-TCTCTTA-----AAACAAACC-ATACAC------TAAC--AA-AT-----A--TC----AA-----AA-------TAACTG-A--A---AATGAAATTAAGAAT---AT---TATA-G--AT----ACATTTTAT---TTAAAAT-C--C---------TAACAAATC-A-GTT----GGAGAAGATAAAATCAGTTATA-AACT-T-TTAA----A----A----TT--A----A---CA---AAAAA----AT----GT--ATT---T--CTAAACCATT-GG-TTA---TGCTT---TAT---AATAAATCA-CAAGAA----GA---A--TGTAA-AT-T--T-T-C--A---TAA-TTA---TGGAAA--------CA-----TGGTTTAA-TAATGCCACT-ATTTA--AAAA--AGG-------AAA-TA--CTT-A---TA-T---CT-TGT---C--T--A---ATTATAGGCCAATAA-CACTTTTG------AGTTGT-GTTGGTAA---ATTA------A-TGGAAAT-AGTTGTT----TACAAAC--ATATCTA-TATTT---TT---TTT-TTG---TTGC-AAAT--AACTTGA--TA-TA-CA-AGTTACAGTC---AGGATTT---TT--AAA-A-GTTCATTCAAC-TGTTT
gi|96852 : A-ATG-----CT----CT----CTGCCTAATTTTACTC-GTA-----AAACTGAAA-ATTCAC------TTTC--AA-GT-----A--TA----AG-----TA-------TATCAG-A--AAAAGAAATAATTGA---T---GT---TATC-ACCAT----AC-----------TGAA-C-G--T---------AAACAAAGCTT-GT-----GGCCATGATTTGATAAGTCATA-AAAT-G-TTAAAAGGA----G----TT------------------GCA----CA----CTCAATA---T--TGAAACCACT-GG-CTT---TTCTT---TTT---AATCGTTCT-TTTAGT----GA---A--TGAAC-ATAT--C-C-C--A---AAG-T-A---TGGAAA--A-----TT-G--CCAAT---G-TCACACCGTT-ATATA--AAAA--AGG----T---GA-CA--AGTCA---TA-T---GT-T-T---C--A--A---ATTACAGACTTGTGT-CTTTGTTA------AGTTGT-TGTGGCAA---GCTT------T-TTGAGAG-AATCATG----TTTAAAA--ATATGTA-TA--A---TT---TCC-TGT---ATGA-TAAT--AATTTAA--TG-TA-TA-AATATCAATC---AGGCTTTTTACC--TAA-----ATATTCAAC-
gi|96854 : TGCATCT-T--------AACTA-CA-ATAC-A------TTCCTCAA-AC-----AGATGCTACAT-----CAGAAAATATTACTATA--ACTAAGCATGA--AA---T---AA---AAT-----AT----AT------T---TTGAA-A-A--T---------AAATAAAGC-TTGT-----GGAAGTGATAGTATAAGCCACA-AGAC-A-ATAA----A----A------------------G---AAACAGCTACAG---TT--ATA---T--CAAAGCCTTT-AT-TTA---T--TAC--TTT---AATGGATCC-CTAAGT----GA---A--TGTTG-CT-T--T-C-C--A---GAA-AGT---TGGAAAATT-----TT-G--CAAAT---G-TCAT-CCATT-ATTTA--AAAA--GGGA---T-C-TG-CA--A---A---TG-T---TA-TAA---C--T--A---ATTATTGGCCTATTT-CTTTATTG------AGTTGG-GTTGGAGG---AGTT------T-TTGAAAG-AGTTGTA----TGTAAAC--ACATTTA-TA--A---TA---ATC-TTA---ATAG-TAAT--GAACTCA--TT-TT-CA-AGAACCAGTC---TGGTTTT---CT--
gi|96855 : T-TGA-----AAACTCATA-ATGTTC------TTGA--TA-AC-----G--TC----AT-----GG-------TAACAG-A--AACAGAAGTAGAAGA---TGTAAT---TCTC-----T-----C------A---TTGAA-T-C--C---------AAATAA------GTCAAGTGGGCCGGATGATATATGTCATA-AAAT-G-TTAA----AAGGAG----TT-------G---CC---AAAT-----CA----GT--AT-------CTAAACCATT-AA-CAT---TATTA---TTG---AATCGCTCT-CTATCA----GA---A--AGTAT-TT-T--T-C-C--A---GAT-AGC---TGGAAA--A-----CA-T--CAAAT---G-TTATTCCTAT-ATTTA--AAAA--AGG-------AGA-TA--A---ATT-CA-T---G---GT---AAGT--A---ATTATAGACCAATGT-CATTATTA------AGCTGC-ACCGG-AA---AATT------ATTAGAAAG-ATTAGTG----TTCAAAT--ATTTGTA-TA--A---TT---TTT-TAA---TTAG-CAAT--AATTT-A--TTATA-TA-AATATCAATC---GGGTTTTTTACC--TAA-----CCACTCGACAAGTTT
gi|96856 : A-----AAACTAATG-ATACTC------TTTC--TA-AT-----A--TT----AT-----TA-------TTACAA-A--GTCTGAAATAAAAGA---T---AC---GATT-G--AA----AT------T---CTTGA-C-T--C---------AAACAAATC-T-GTT----GAGAATGATAAAATAAGTCACACG--T-T-TTGA----A----G----TA--T----A---CA---AAATA----TA----GT--ATT---T--CTAAACCTCTAGTACT-----GTTA---TTT---AATAGATCA-TTAATT----AT---A--AGTGA-AT-T--T-C-C--A---GAT-TTA---TGA---------------------------TAATGCCACT-TTTCA--AAAA--AGG----T-AAAA-CA--A---A---CC-C---GG-CGT---C--T--T---ATTATCGACCAATTT-CACTCTTA------AGCTGT-ATTGGCAA---GTTA------A-TCGAAAG-AATTGTG----TACAAAC--ATATATA-TA--A---TT---TTC-TTC---TTGG-TAAT--AACCTCA-----TA-TA-AGTTACAATC---TGGACTT---CT--CAA-A-GGACATTCCAC-GGTTT
gi|96857 : A-----AAACTTATA-ATTCCC------TTTC--AC-AT-----T--TT----AT-----AA-------TAACTG-AGGAT--GATATATCTGA---A---CT---TATT-A--GT----AC------T---T--AA-C-CAGT---------AAATAAGGCCT-GT-----GGTCATGATATGATCAGTCACA-GAAT-G-CTGG----A----A----TA--T----GTGTCG---AAA-------G----CT--ATT---T--CAAAACTATT-TT-AAA---TTTTA---TTT---AACCGTTCT-TTAAGT----GA---A--GGTAT-AT-A--T-C-C--C---GAT-TTG---TGGAAG--A-----TT-G--CAAAT---G-TAACTCCCAA-TTCTA--AAAA--GGG-------AGA-CA--A---GT--CATT---GG-TGT---C--A--A---ATTACAGACCTGTGT-CTTTACTT------AGTTGT-GTCGGAAA---ACTT------G-TTGAAAG-GCTTGTT----TTTAAGA--ATATGTA-TA--A---CT---TT--TTC---TTGA-TAAT--AATTTGA--TT-TA-TA-AATACCAGTC---AGGCTTT---TT--
gi|96858 : TGA---T---AT----ATCTG--AC----AT------T---TTAAA-C-A--CTGTTAATATAAATAAAGCAT-GT-----GGCCATGACTCTGTAAGCCATA-AGAT-TCTTAA----AGG--G----GT--A----A---CA---AAAC-----------CC--ATA---T--CTAAACCTTT-AG-CCG---TACTT---TTT---ACCCGCTCT-CTGAAT----GA---A--GG--G-AT-TTAT-C-C--T---GAC-GTT---TGGAAG--A-----TA-G--CAAAT---G-TTACACCAAT-ATATA--AAAA--AGG----T---GA-CA--A---G---TC-TATAGC-T-T---C--A--A---ACTATAGACCAGTTT-CTTTACTT------AGCTGT-TGTGGTAAGATATTT----------GAAAG-AATCATT----TTTAAAC--ACATGTA-CA--A---CT---TTC-TTC---TTAC-AAAT--AAATT-A--TTGTA-TA-AATATCAATC---AGGATTT---CT--
gi|96859 : TGA---T---AT---CATC-----TCCTCAC------T---TTATA-C--------------AAATAAAGC-C-AGT----GGTCCAAACCAAATTAGTCATG-AAAT-G-ATAA----A----G----G-------------G---ATGCG----CAGATTCT--ATC---A--CAAAACCGTT-AG-TTA---TCATT---TTT---AACCGTTCT-ATACAA----GA---A--AGTAT-TT-T--T-C-C--A---AAC-TCA---TGGAAG--A-----TA-G--CTCAA---G-TCACTCCCAT-CTTCA--AAAA--GGG-------AGA-TA--A---AA--CG-T---AAACTT---C--T--A---ATTATAGACCCGTTT-CACTTTTA------AGCTGT-TGTGGAAA---GATT------C-TTGAAAG-AATAGTT----TTTAAAA--ATATGTA-TA--A---CT---TTT-TTT---TTAC-AAAT--CAACTGT--TG-TA-TA-AATATCAGTC---TGGTTTT---TT--
gi|96860 : TGA---T---AT---TATC-----T----CC------TCACTTA-A-T-A--C---------AAATAAAGC-C-AGT----GGTCTAGACCAAATAAGTCATA-AAAT-G-ATAA----GAG--G----TT--T----G---C------AGA----TT----CT--ATC---A--CAAAACCATT-AG-TTA---TCATT---TTT---ATCCGTTCT-GTACAA----GA---A--AGTTT--T-T--T-C-C--A---AAACTCA---TGGAAG--A-----TA-G--CTCAA---A-TTACTCCCAT-CTTCA--AAAA--GGG-------AGA-TA--A---AA--CG-TT--AA-CTT---C--T--A---ATTATAGACCCGTTT-CACTTTTA------AGCTGT-TGTGGAAA---GATT------C-TTGAAAG-AATAGTT----TTTAAAA--ATATGTA-TA--A---CT---TT--TTC---TTGA-CAATTCAA--TTA--TTGTA-TA-AATTTCAGTC---TGTTTTT---a
gi|96861 : GA---C---AT---GATT-T--GT----TT------T---TTAGG-T-G--T---------GAATAAAGC-T-GTA----GCGCCAGACTGAGTAAATCAGA-GAAT-T-TTAA----A----A----CT--A----A---CC---AAGGG----TA----CA--ATT---T--CAGAACCGTT-AT-GTA---TTTGA---TTT---AATAAGAC---TATTT----GC---A--AGGAATAT-T--TAC-C--A-------TTAAACTAGAAA--------CATG--CACTT---G-TTATGCCCCT-TTATA--AAAA--AGG----C----------A---A---CT-T---GT-CATGTGT--T--AGATATTACAGATCTTTAT-CTCTGTTA------AGTTGT-ATTGGTAA---ACTT------A-TGGAAAt
gi|96862 : ------T---TTAGG-T-G--T---------GAATAAAGC-T-GTA----GGGCCAGACCTAGTAAGTTACA-TAAT-T-TTAT----A----A----CT--A----A---CC---AACGG----TA----TA--ATT---T--CAAAACCTTT-AT-GTA---TTTTA---TTT---AATAAGTAT-TT-TTTAG--GA---A--TCT----T-T--T-C-C--ATGTAAC-T-----TGAAA---------CATG--CATTT---G-TTATGCCCCT-TTATA--AGAA--AGG------CGAT-CC--A---T---CG-T---GT--GT---TAGT--A---ATTACAGACCTATTT-GCCTGTTA------AGTTAT-ATTGGTAA---ACAT------A-TGGAACGTTGT-GTG----TATAAGT--ATATATA-CA--C---TT---TCC-
gi|96863 : ------T---TTAGG-T-G--T---------GAATAAAGC-T-GTA----GGGCCAGACCTGTTAAGTTACA-TAAT-T-TTAT----A----A----CT--A----A---CC---AA-------CG----GT--ATAAATT--CAAACCCTTT-AT-GTA---TTTTA---TTT---AATAAGTAT-TT--TT----GA---G-----GA-AT-C--T-T---------AT-CCA---TGTAAC--TTGAAACATG--CATTT---G-TTATGCCCCT-TTATA--AGAA--AGG------CGAT-TC--A---T---CG-T---GT--GT---TAGT--A---ATTACAGACCTATTT-CCCTGTTA------AGTTAT-ATTGGTAA---ACAT------A-TGGAACGTTGT-GTG----TATAAGT--ATATATA-CA--C---TT---TCC-
gi|96864 : ------T---TTAGG-T-C--T---------GAATAAAGC-T-GTA----GGGCCAGACCTAGTAAGTCACA-GAAT-T-T---------------------------------------------------------------CAAAACCTTT-AT-GTA---TTTTA---TTT---TAAAAGTCT-ATTCGT----GAGGAA--TCT----T-T--T-C-C--A-----T-GCAAC-TGGAAA--------CATG--CACTT---G-TTGTGCCCCT-TTATA--AGAA--AGG------CGAT-TC--A---T---CG-T---GT--GT---TAGT--A---ATTACAGACCTATTT-CCCTGTTA------AGTTGT-ATTGGTAT---ACTT------A-TGGAACGTTGT-GTG----TACAAGT--ATATATA-TA--A---ATACCTTA-TCT---CTGA-GAAT-----------CT-TA-TA-TATTCTAGACAATCAGGTTT---TT--TAATT-GGTCATTCCAC-TGT
gi|96865 : --C---------AAATAAAGC-T-GTT----GGGGAAGACTTAATAAGTCATA-CAAT-T-TTAA----A----A----AA--T----A---CT---CGTAA----TA----CT--TTT---T--CAAAACCACT-TTGCAA---TCGT----TTT---AACAAATTT-CTAAAT----GA---A--TGTGT-AT-T--T-C-C--A---AGT-TCT---TGGAAG--T-----CG-G--CTATA---A-TTATGCCGCT-GTTTA--AAAA--GGGGGATT-C----CG--A---T---TG-T-------GT---T--TAAA---ACTACAGACCTATAT-CTTTACTT------AGCAGT-ATTGGCAA---ACTT------A-TGGAAAG-GACCATG----TACAAAC--ACATATA-TA--A---CC---ATC-TCC---TTGA-TAAC--AATTTGA--TA-TA-TA-ATAATCAGTC---CGGTTTT---CT--AAG-A-AGCTATTC
gi|96866 : --C---------AAACAAAGC-T-GTT----GGGGAAGACTTAATAAATCATA-CAGT-T-TTAA----A----A----AA--T----A---CT---CGTAA----TA----CT--ATA---T--CAAAACCATT-TTGCAA---TCTT----TTT---AACAAATCT-CTATAT----TA---A--TGTGT-AT-T--T-C-C--A---AGT-TCT---TGGAAG--T-----CC-G--CTGTA---G-TTATGCCACT-GTTTA--AAAAT-GGGGAT-T-C----------------CG-----GT-TGT-------------GTTTCAAACTAATAT-CTTTACTA------AGCTGT-ATTGGCAC---ACTT------A-TGGAAAG-GACAATG----TACAAAC--ACATATA-TA--A---CC---ATC-TCT---TTGA-TAGC--CATTTGA--TA-TA-TA-ATAAACAGTC---CGGTTTT---CT--AAG-A-GGCCATTTCAC-AGTTT
gi|96868 : AATAAGGC-T-GTA----GGGTAAGACCTAGTAAGTCGCA-GAAT-T-TTAA----A----A----CT--A----A---CC---ATGGG----TA----CA--ATT---T--CAAAACCTTT-AT-GTA---TTTTA---TTT---AATAAGTCT-TTTCGC----GA---G-----GA-AT-C--T-T---------AT-TCA---TG------------CA----CT--T---G-TTAT-CCCCT-TTATA--AGAA--AGG------CGAT-TC--A---T---CG-T---G--TGT---TAGT--A---ATTACAGACCTATTT-CCCTGTTA------AGTTGT-ATTGGTAA---ACTT------A-TGGAACGTTGT-GTG----TATAAGT--ATATATA-TA--A---TT---
gi|96869 : ATAAGTAACA-AAATGC-TTAA----A----G----GTGCT----G---TA---AGA-A----CA--------ATT---T--CTGAACCTCT-----TACACTTTTA---TAT---AATCGTTCTATTACC-----GA---A--AGTCA-TT-T--C-C-C--T---AAC-TCA---TGGAAA--A-----AA-G--CTCAT---G-TAACTCCTAT-TTTTAGGAAAG--GGG----A-TAAGTCA--A----------T---CC-CAT---C--T--A---ATTATAGACCAATGT-CGTTGCTC------AGCTGT-GTCGG
gi|96870 : aaatt----TT--T----A---AA---AAGCA--------------ATT---G--CAAAACCACT-TT-CAA---TTTTA---TTT---AACCGTTCT-TTAAGT----GA---A--GGTAT-AT-A--T-C-C--C---GAT-TTG---TGGAAG--A-----TT-G--CAAAT---G-TAACTCCTAT-TTTTA--AAAA--GGG-------AGA-CA--A---GT--CATT---GG-TGT---C--A--A---ATTACAGACCTGTGT-CTTTACTT------AGTTGT-GTTGGAAA---ACTT------T-TTGAAAG-GCTTGTT----TTTAAGA--ATATGTA-TA--A---CT---TTT-TTC---TTGA-TAAT--AATTTGA--TT-TA-TA-AATACCAATC---AGGCTTT---TT--
gi|96871 : T--ATT---T--CCAAATATCT-AG-TTC---TATTA---TTT---AATAGTACA-TGACAT----GA---A--TGGAA-AC-G--C-A-C--A---TAT-TTA---TGGAAA--C-----AA-G--CT-TT---GATAATGCCACT-CTTCA--AAAC--AGG----T-AAAA-CA--A---A---AC-T---GG-CGT---C--T--A---TTTATCGATCGATAT-CTCTCTTA------ATCTGT-GTTGGCAA---GTAA------A-TGAAACA-AATTGTT----TACAAAC--GTATATT-TA--T---TT---TTC-TTG---TAAA-CAAA--AACCTCA--TT-TA-TA-AATCACATTC---AGGATTT---CT--ACA-T-GGACACTCTAC-GGTCT
gi|96872 : ctaT--ATT---T--CAAAACCTCT-A----A---TGTTACTTTTT---AATCGTTCT-ATAAAC----GA---A--AGTAA-AT-T--C-C-C--T---GAA-TCC---AGGAAA--A-----TA-G--CACAT---G-TAACCCCCCT-TTTAA--GCAA--GGG--------GA-CA--A---GT--CG-TT--GC-CCT---C--T--A---ATTATAGACCAGTAT-CACTGTTG------AGTTGT-TTGGGAAA---AGTT------T-TAGAAAG-AATAATT----TTCAAGC--GTATGTA-TA--A---CT---TTC-TAC----TAA-ACAT--AATATGC--TG-TT-CA-AATGTCAGTC---TGG-TTT---CT--T
gi|96873 : A---TGTTA---CTTTTCAATCGTTCT-ATAACC----AA---A--AGTAA-AT-T--C-C-C--T---GAC-TCA---TTGAAA--A-----TA-G--CACAT---G-T-AT-----T-TTTTA--AAAA--AGG--------AA-CA--A---GT--CG-TTTGGC-C-T---C--T--T---ATTATA--CCAGTAT-CCATGTTC------ATCTGT-TTGGGGAAG--ATTT------T-TAGAAAG-AATAATT----TTCAAGC--GTATGTA-TA--A---CT---TTC-TAC---TAAA-TAAT--AATCTGC--TG-TA-CA-AATAATAATC---
gi|96874 : cctgtaAAG--T-----CG-G--CTATA---G-TTATGCCGCT-GTTTA--AAAA--GGGGGATT-C----CG--A---T---TG-T---GC-T-T---C--A--A---ACTACAGACCAGTAT-CTTTACTT------AGCTGT-ATTGGCAA---ACTT------A-TGGAAAG-GACCATG----TACAAAC--ACCCATG-TA--A---CC---ATT-GCT---TTGA-TAAC--AATTTGA--TA-TA-TA-GTAAACAATC---CGGTTTT---CT--AAG-A-GGCCTTTCCAC-AGTTT
gi|96875 : ttaataagtcattcaattttaaaaaaatactcgtTT---AATAGTTCT-ATACAA----GA---A--AGTAT--T-T--T-C-CCAA---AAC-TCA---TGGAAGA-T-----C--G--CTCAA---G-TTACTCCAAT-CTTCA--AAAA--GGGAGA-T-AAAA-CATTA---A---C--T--------T---C--T--A---ATTATAGACCCGTTCACTT--CTA------AGCTGT-TGTGGAAA---GATT------C-TTGAAAA-ATTAGTT----TCTAGAA--ATATATA-TA--A----------C-TTC---TTGACAAAT--CAACT-A--TTGTA-CA-AATATCAGTC---TGG
gi|96876 : A---A--TATCA-AT-A--T-CAC--A---GAA--CA---AGAAAT--T-----T-----CTGAT---G-TAATGCCATT-ATTTA--AAAA--AGA----TGCTAA--A--G---A---TA-T---TC-CAT---C--A--A---ACTATAGACCTATTT-CATTAATT------AGATGT-ATTGGTAA---GGTC------A-TGGAAAG-AGTAATA----TTCAAGC--ATTTATA-CA--A---TTA--TTT-ACA---TTTA--AAT--AACCTGA--TT-TA-TA-AAAATCAGTC---GGGGTTT---CT--CCC-A-GGTCATTCAAC-AATTT
gi|96877 : --T--A---ACTATAGACCTATAT-CACTGTTA------AGC-GTAATTGGCAA---AGTG------T-TTGAAAG-ACTTATT----TTTAAAC--ACATGTA-TA--A---TT---TCT-TTC---GTGA-TACT--AATTTTA--TT-T--CGTCATTTCAATC---TGGTTTT---GT--TCC-T-GGTGATTCAAC-AATT
gi|96878 : caaaagtctggaaagaagcatttgtatgcgctgtttataaaaaaggagacccttctttggttaa-TTA---TGGAAG--T-----CA-G--CTACT---G-TAATGCCTCT-TTTTA--AGAA--AGG----T-CAAA-CA--A---A---CG-T---GC-CAT---C--T--A---ATTAAAGGCCAATAT-CTTTATTA------AGCTGT-GTTGGTAA---ACTT------A-TGGAAAG-GGTTGTC----TACAAAC--ATATTTA-TA--A---TT---TTC-TGA---TTGA-AAAT--AAACTAA--TT-TA-CA-AATTGCAATC---CGGATTT---CT--TAA-G-GGCCATTCGACAAGTT
gi|96879 : gATCCCACT-GTTTA--AAAA--GGGGGATT-C----CG--A---T---TG-T---G----T---T--TGAA---ACTTCACACCAATAT-CTTTACGT------AGCTAT-ATTGACAA---ACTT------A-TGGAAAG-GACCATACATGTACAAAC--ACATATA-TA--A---CC---ATC-TCT---TTGA-TAAC--AATTTGA--TG-TA-TA-GTAAACAGTC---CGGTCTT---C----AA-GAGGTCATTCCAC-AGTTT
gi|96880 : aT-TTTTA--AAAAAAGAG----T-CAAA-CA--T---A---T-------C-CGT---C--A--A---GCTAAATACCAATTT-CTTTAATT------AGTTGT-ATTGTTAA---GGTA------A-TGAAGCG-TATCGTT----TTCAAA---ATATATAACA--A---AT---ATC-TATAGTTTGA----T--GACTTAA--TT-TATCA-AA-ATCAATC---AGGATGT---TTACCAA-G---ACATTCGAC-TGTTT
gi|96881 : TTG------AGTTTT-GTTAGTAA---ATTA------A-TGGAAAG-AGTTGTT----TACAAAC--ATATTTA-TA--AT--TT---TTT-TTT---TTGC-TAAT--AA--TTA--TA-TA-CA-AGTTACTGTC---AGGATTT---TT--AAA-A-GGTCATTC
gi|96882 : A------AG-TAT-GTTGGTAA---ACTT------A-TGGAAAG-AGTTGTC----TACAAAC--ATATTTA-TA--A---TT---TTC-TGA---TTGA-AAAT--AAACTAA--TT-TA-CA-AATAGCAATC---CGGATTT---CT--TAA-G-GGACATTCGAC-AGTTT
gi|96883 : AA---ACTTGAATGGA-TGGAAAG-AGTCGTT----TACAAAC--ACATGTA-TA--ACTTTT---TTT-TTG---TTGC-TAAT--AACTTGA--TA-TA-CA-AGCTACAATC---AGGTGTT---TT--AAA-A-GGTCACTCAAC-TGTT
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|96853 ): ACTTTACCACAATACATTCCCAAAACAGATGTTTCATTAGAAACTATTACTATAACTGAGCAGGAAATAAAATATTTTGAAAATACTAGATATAAATAAAGCCAGTGGCAGTGATATTATAAGCCACAATATACTAAAGGAAACAGCTACAGTTATATCAAAGCCTCTATGTATTATTTTTAATAGATCCCTAAGTGAGTGTTGCTTTCCAGAATGCTGGAAATTTGCAAATGTCATGCCATTGTTTAAAAAGGGATGTGCTAATGTTACAACTGATTATAGACCGATTTCTTTATTGAGTTGTGTTGGAAAACTTTTTGAAAGAGTT
Unaligned ( gi|96867 ): AAATAAAGTAAGCGGTACTGACACTATAAGTCACAAAATGCTTAAAGGTGCTGTAAGAACAATTTCTGAACATCTTACTCTTTTATATAATCGTTCTATTACCGAAAGTCATTTCCCTAACTCATGGAAAATAGCCCATGTAACTCCTATATTTTTGAAAGTGGATAAGTCAATTCCATCTAATTATAGACCAGTTAAGTTGCTAAGCTGTGTCGGAAAGATTTTAGAAAGAATAATTTTTAAACAAATGTATAACTTCTTCTTGAGTAACAATTTATTGTATAAAAACCAGTCTGGCTTTTT
Alignments
lowQualScore : 11111 11111111111111 11111 222222222222222222222222222222222222222222 11111 1111111 33333333333333333333333333333333333
lowQualScore : 666 3 88888 7777 5555 2 66666 3 2 88888888 1 33 5 66666 33 5555 66666 8888888 0 2 33 22 0 1 333 333 6666 33333 4444 555555 333 0 1 22222222222222 4 1 22222 222 44 1 1 3 1 44444 777777777777777777777777777777777777777777 11 5555 11 1 3 00000 222 2 333 222 1 11 9999999 1 555 11 1 1 1 1 11 555 33 33333 1111111 11 888 222 1 2 2 1 11 11 22 88888888888888888888888888888888888 111 77 22 111 1 1 1 1 222222 11 1 222 222222 1 4 8 33333 1 11 1 1 11 222 333 1 33333 66 11 3 5 11 4 1 1 444444 4 2 444 222 777 1 2 3
lowQualScore : ... . ..... .... .... . ..... . . ........ . .. . ..... .. .... ..... ....... . . .. .. . . ... ... .... ..... .... ...... ... . . .............. . . ..... ... .. . . . . ..... .......................................... .. .... .. . . ..... ... . ... ... . .. ....... . ... .. . . . . .. ... .. ..... ....... .. ... ... . . . . .. .. .. ................................... ... .. .. ... . . . . ...... .. . ... ...... . . . ..... . .. . . .. ... ... . ..... .. .. . . .. . . . ...... . . ... ... ... . . .
lowQualScore : 444 3 33333 1111 0000 9 22222 5 5 00000000 4 44 0 22222 44 3333 22222 1111111 8 5 44 11 8 6 555 555 4444 66666 2222 000000 000 3 7 22222222222222 6 5 00000 000 00 9 5 0 5 77777 222222222222222222222222222222222222222222 88 6666 88 5 6 99999 333 3 555 222 0 99 8888888 2 666 99 2 2 2 2 77 555 00 88888 4444444 66 222 000 1 1 0 4 22 55 66 33333333333333333333333333333333333 999 22 99 888 0 0 1 1 999999 88 0 888 999999 0 1 7 22222 3 44 0 0 44 888 888 1 99999 44 55 6 0 66 6 1 1 444444 1 2 222 666 333 0 3 6
consensus : CAACAATAGATGAAAATACAAACA---ATA-ATA-----CT----CT--A-CTTCCAGAGTGTATCT-TTA-----AAACTAATA-ATACCA------TTGC--AA-AC-----A--TG----AT-----CA-------TTACTG-A--ATCAGACATAATTGA---T---AT---TATC-G--GT----AC------T---TTAGA-C-C--C---------AAATAAAGC-T-GTC----GGNNAAGACNNAATAAGTCACA-GAAT-T-TTAA----A----G----TT--T----A---CN---AAACA----CA----CT--ATN---T--CNAAACCNCT-GT-CTA---TNTTA---TTT---AATAGNTCT-TTACNT----G-AA--TGTANAT-T-T-C-C--A---GAN-TCA---TGGAAG--TCA-G--CTANT---G-TNATGCCNCT-TTTTA--AAAA--GGG----T-CAAA-CA--A---A---CG-T---GC-CGT---C--T--A---ATTATAGACCNATNT-CTTTATTA------AGCTGT-GTTGGTAA---ACTT------A-TGGAAAG-AGTCGTN----TACAAAC--ATATNTA-TA--A---TT---TTC-TNN---TTGA-NAAT--AANCTGA--TT-TA-CA-AAT----NNCAATCNGGNTTT---CT--TAA-G-GGNCATTCGAC-AGTTT
Reference ( family-531 ) : CAACAATAGATGAAAATACAAACA---ATA-ATA-----CT----CT--A-CTTCCAGAGTGTATCT-TTA-----AAACTAATA-ATACCA------TTGC--AA-AC-----A--TG----AT-----CA-------TTACTG-A--ATCAGACATAATTGA---T---AT---TATC-G--GT----AC------T---TTAGA-C-C--C---------AAATAAAGC-T-GTC----GGNNAAGACNNAATAAGTCACA-GAAT-T-TTAA----A----G----TT--T----A---CN---AAACA----CA----CT--ATN---T--CNAAACCNCT-GT-CTA---TNTTA---TTT---AATAGNTCT-TTACNT----G-AA--TGTANAT-T-T-C-C--A---GAN-TCA---TGGAAG--TCA-G--CTANT---G-TNATGCCNCT-TTTTA--AAAA--GGG----T-CAAA-CA--A---A---CG-T---GC-CGT---C--T--A---ATTATAGACCNATNT-CTTTATTA------AGCTGT-GTTGGTAA---ACTT------A-TGGAAAG-AGTCGTN----TACAAAC--ATATNTA-TA--A---TT---TTC-TNN---TTGA-NAAT--AANCTGA--TT-TA-CA-AAT----NNCAATCCGGNTTT---CT--TAA-G-GGNCATTCGAC-AGTTT
gi|96841 : CAACAATAGATGAAAATATAAACA---ATA-ATA-----CT----CT--A-CTTCCAGAGTGTATCT-TTA-----AAACTTATA-ATACCA------TTGC--AA-AC-----A--TG----AT-----CA-------TTACTG-A--ATCAGACACAATTGA---T---AT---TATC-G--GT----AC------T---TTAGA-C-C--C---------AAATAAAGC-T-GTC----GGAGAAGACAAAATTAGTCACA-GAAT-T-TTAC----A----G----TT--T----A---CT---AAACA----CA----CT--ATA---T--CTAAACCCCT-GT-CTA---TGTTA---TTT---AATAAATCG-TTACTT----G-AA--TGTAAAT-T-T-C-C--A---GAG-TCA---TGGAAG--TTA-G--CTACT---G-TAATGCCTCT-TTTTA--AGAA--GGG----T-CAAA-CA--A---A---CG-T---GC-CAT---C--T--A---ATTATCGGCCAATAT-CTTTATTA------AGCTGT-GTTGGTAA---ACTT------A-TGGAAAG-AGTTGTC----TACAAAC--ATATTTA-TA--A---TT---TTC-TGA---TTGA-AAAT--AAACTAA--TT-TA-CA-AAT----TGCAATCCGGATTT---CT--TAA-G-GGACATTCGAC-AGTTT
gi|96842 : CAACAATAGATGAAAATATAAACA---ATA-ATA-----CT----CT--A-CTTCCAGAGTGTATCT-TTA-----AAACTAATA-ATACCA------TTGC--AA-AC-----A--TG----AT-----CA-------TTACAT-A--ATCAGACATAATTGA---T---AT---TATC-G--GT----AC------T---TTAGA-C-C--C---------AAATAAAGC-T-GTC----GGAGAAGACAAAATTAGTCACA-GAAT-T-ATAC----A----G----TT--T----A---CT---AAACA----CA----CT--ATA---T--CTAAACCCCT-GT-CTA---TGTTA---TTT---AATAAATCC-TTACTT----G-AA--TGTAAAT-T-T-C-C--A---GAG-TCA---TGGAAG--TCA-G--CTACT---G-TAATGCCTCT-TTTTA--AGAA--GGG----T-CAAA-CA--A---A---CG-T---GC-CAT---C--T--A---ATTATCAGCCAATAT-CTTTATTA------AGCTGT-GTTGGTAA---ACTT------A-TGGAAAG-AGTTGTC----CACAAAC--ATATTTA-TA--A---TT---TTC-TGA---TTGA-AAAT--AAACTAA--TT-TA-CA-AAT----TGCAATCCGGATTT---CT--TAA-G-GGACATTCGAC-AGTTT
gi|96843 : CAACAATGGATGAAAATATAAACA---ATA-ATA-----CT----CT--A-CTGCCAAAGTGTGTCT-TTA-----AAAC----------CA------TTGC--AA-AC-----A--TG----AT-----CA-------TTACTG-T--ATCAGACATAGTTGA---T---AT---GATC-G--GT----AC------T---TTAGA-C-C--C---------AAATAAAGC-T-GTC----GGAGAAGACAAAATTAGTCACA-GAAT-T-TTA----------G----TT--T----A---CA---AAACA----CA----TT--ATA---TATCTAAACCCCT-GT-CTA---TGTTA---TTT---AATAAATCC-TTACTTACTTG-AA--TGTATAT-T-T-C-G--A---GAG-TCA---TGGAAG--TCA-G--CTACT---G-TAATGCCTCT-TTTTA--AGAA--GGG----T-CAAA-CA--A---A---CG-T---GC-CAT---C--T--A---ATTATCGGTCAATAT-CTTTATTA------AGCTAT-GTTTGTAA---ACTT------A-TGGAAAG-AGTTGTC----TACAAAC--ATATTTA-TA--A---TT---TTC-TGA---TTGA-AAAT--AAACTAA--TT-TA-CA-AAT----TGCAATCCGGATTT---CT--TAA-G-GGACATTTGAC-AGTTT
gi|96844 : CAACAATAGATGAAAATATAAACA---ATA-ATA-----CT----CT--A-CTTCCAGAGTGTATCT-TTA-----AAACTAATA-ATACCA------TTGC--AA-AC-----A--TG----AT-----CA-------TTACTG-A--ATCAGACATAATTGA---T---AT---TATC-A--GT----AC------T---TTAGA-C-C--C---------AAATAAAGC-T-GTC----GGAGAAGACAAAATTAGTCACA-GAAT-T-TTAC----A----G----TT--T----A---CA---AAACA----CA----CT--ATA---T--CTAAACCCCT-GT-CTA---TGTTA---TTT---AATAAATCC-TTACTT----G-AA--TGTAAAT-A-T-C-C--A---GAG-TCA---TGGAAG--TCA-G--CTACT---G-TAATGCCTCT-TTTTA--AGAA--GGG----T-CAAA-CA--A---A---CG-T---GT-CAT---C--T--A---ATTATCGGCCAATAT-CTTTATTA------AGGTGT-GTTGGTAA---ACTT------A-TGGAAAG-AGTTGTT----TACAAAC--ATTTTTA-CA--A---TT---TTC-TGA---TTGA-AAAT--AAACCAA--TT-TA-CA-AAT----TGCAATCCGGATTT---CT--TCA-G-GGACATTCGAC-
gi|96845 : CAACAATAGGTGAAAATACAAACA---ATA-CTA-----CT----CT--A-CTTCCAGGGTGTATCT-TTA-----AAACTAATA-ATACCA------TTGC--AA-AC-----A--TG----AT-----CA-------TTACTG-A--ATCAGCCATAGTTGA---T---AT---AATC-G--GT----AC------T---TTAGA-C-C--C---------AAATAAAAC-T-GTC----ACAGAAGACAAAATTAGTCACA-GAAA-T-TAAC----A----G----TT--T----A---CA---AAACA----CA----CT--ATA---T--CTAAATC-CT-GT-CTA---TGTTA---ATT---AACAAATCC-TTACTT----G-AA--TGTAAAT-T-T-C-A--A---GAG-TCA---TGGAAG--TCA-G--CTTCT---G-TAATGCCTCT-TTTTA--AAAA--GGG----T-CAAA-CA--A---A---CG-T---GC-CAT---C--T--A---ATAATCGGCCAATAT-CTTTATTA------AGCTGT-GTTGGTAA---CCTA------A-TGGAAAG-AGTTGTC----TACAAAC--ATATTTA-TA--A---TT---TTC-TGA---TTGA-AAAT--AAACTAA--TT-TA-CA-AAT----TGCAATCCGGATTT---TT--TAA-G-GGACA
gi|96846 : CAACAATAGGTGAAAATACAAACA---ATA-CTA-----CT----CT--A-CTTCCAGGGTGTATCT-TTA-----AAACTAATA-ATACCA------TTGC--AA-AC-----A--TG----AT-----CA-------TTACTG-A--ATCAGCCATAGTTGA---T---AT---AATC-G--GT----AC------T---TTAGA-C-C--C---------AAATAAAAC-T-GTC----ACAGAAGACAAAATTAGTCACA-GAAA-T-TAAC----A----G----TT--T----A---CA---AAACA----CA----CT--ATA---T--CTAAATC-CT-GT-CTA---TGTTA---ATT---AACAAATCC-TTACTT----G-AA--TGTAAAT-T-T-C-A--A---GAG-TCA---TGGAAG--TCA-G--CTTCT---G-TAATGCCTCT-TTTTA--AAAA--GGG----T-CAAA-CA--A---A---CG-T---GC-CAT---C--T--A---ATAATCGGCCAATAT-CTTTATTA------AGCTGT-GTTGGTAA---CCTA------A-TGGAAAG-AGTTGTC----TACAAAC--ATATTTA-TA--A---TT---TTC-TGA---TTGA-AAAT--AAACTAA--TT-TA-CA-AAT----TGCAATCCGGATTT---TT--TAA-G-GGACA
gi|96847 : CAACAATAAATGACAGTATTAACA---ATA-ATA-----TG----TT--A-CTTCCAGGCTGTGTCT-TTA-----AAACGAATA-ATACCA-------------A-AC-----T--TG----AT-----CG-------TTACTG-A--ATCAGACATAATTGT---T---TT---GATC-G--GT----AC------T---TTAGA-C-C--C---------AAATAAAGC-T-GTC----GGAAAAGACACAAT---TCCCA-GAAT-T-TTTC----A----G----TA--T----A---CA---AACCA----CA----CT--A-----------AACCACA-GT-CTA---TGTTA----------ATAATTCC-TTACTT----T-AA--TGTAAAT-T-T-C-C--A---G---TCA---TGGAAG--TCA-A--CTACT---G-TTATGTCTCA-TCTTA--AGAA--AGG----T-CAAA-CA--G---A---CG-T---GC-CAT---C--T--T---ATCATTGGTCAATAT-CTTTATTA------AGCTGT-GTTGGTAA---ACTT------A-TGGAAAG-AGTTGTC----TACAAAC--ATATTTA-TA--A---CT---TTC-TGA---TTGA-AAAT--AAACTAATTTT-TA-TA-AAT----TTTTATCAGGACTT---TC--TAA-T-GGACATTCGAC-AGTTT
gi|96848 : ACAATAGATGATACT-CAAACA---A---AT------------------CTTCCTGAATTCGTTT-TTC-----AAACAAATA-GTAC-G------TTAA--AAGAT-----A--TT----AA-----CA-------TCACAG-A--AAAAGAAATAACTGA---T---GT---TCTA-G---------------------CAAA-C-C--TCGCTGT---AAATAAAGC-T-AGT----GGTCTTGACGACATAGGTCACA-AAATGC-TCAA----A----GAAACTT--TGTAAA---CTTGTAAACT----TGT---CT--ATT---T--GTAAACCTTA-AT-GTA---TTATA---CTT---AACAGATCT-ATGAGA----G-AAAATGTATAT-----C-C--A---ACA-TCT---TTGAAA--TTA-G--CTAAC---G-TTATGCCTTTATTTTA--AAAA--GG-----T---GA-TA--A---ATCTC--T---AC-CGT---C--T--A---ATTATAGACACATTT-CATTGATA------AGCTGT-GTTGGTAA---AGTA------G-TGGAAAG-AATTGTT----TTTGAAC--ATATTTA-CA--A---TC---ATCTTCA---TTCA--AAT--AA
gi|96849 : AAAATACAAAGATAGATAGATAAAAGTTT----TT--ATCTTATA-AGTGTATAT-ATATATATAAACAAATAGATAACAACAAAATTGT--AA-GCTCTTCA--TG----AG-----CT-------TT--TG-A--ACC-GATATAAGTGA---C---ATACATGTC-----T----AC------T---TTA---C-C--C---------AATTTTAGA-C-GT-------ATACAAC--AGTGACTTAAA-GGGT-T-T-GA----A----G----TA--T----A---TA---AAATA----TA----GT--ATT---T--CTAAACCTCTAGTACT-----GTTA---TTT---AATAGATCA-TGAATT----A-AA--TGTGAAT-T-T-C-C--A---GAT-TTA---TGGAAA--TCA-GTCCTA-----G-TAATTCCACT-TTTCA--AGAA--AGG----T-AAAA-CA--A---A---CT-A---AG-CGT---C--T--A---ATTATCGACCAATTT-CACTCTTA------AGCTGT-ATTGGCAA---GTTA------A-TGGAAAG-AATTGTG----TACAAACATATATATA-TA--A---TT---TTC-TTG---TTGA-TAAT--AACCTCA--TT-TA-TA-AAT----TACAATCTGGATTT---CC--CAG-A-GGACATTCCAC-GGTTTtattatattta
gi|96850 : TACAATTG---ATG-ATA-----CTGACTCTGAA-CTTCCAAATTTTGTTT-TGA-----AAAC-AGT---TACCA---------C--AATTC-----A--TG----ATATCAATA-------TCACAG-A--ACAAGAAATTTCTGA---T---GT---TCTT-T--CC----AA------T---TTAGT-TGT--C---------AAA-AAAAC-T-TGC----GGCCCAGACGAAATAAGCCATC-ACAT-G-TTAA----A-------------------------------A----CA----CT--ATG---C--TG--ACCGCT-TT-GCA---TCATT---TTT---AATAGGTCT-CAATAA----G-AA--AGCATAT-A-C-C-C--A---AAT-TGT---TCAAAA--TAA-G--CAAAT---G-TAATGCCATT-ATTCA--AAAA--GGG----TGCTAA--A--G---A---TA-T---TC-CAT---C--A--A---ACTAAAGACCTATTT-CATTAATGACATGTAGTTGT-ATTGGTAA---GGTC------A-TGGAAAG-AGTAATA----TTCAAGC--ATTTATG-CA--A---TTA--TTC-ACA---TTTA--AAT--AACCTGA--TT-TA-TA-AAA----ATCAGTCAGGGTTT---CT--TCC-T-GGTCATTCAAC-AATTT
gi|96851 : A---ACA-ATA-----CT----TT--A-CTACCAACTTGT-TCTCTTA-----AAACAAACC-ATACAC------TAAC--AA-AT-----A--TC----AA-----AA-------TAACTG-A--A---AATGAAATTAAGAAT---AT---TATA-G--AT----ACATTTTAT---TTAAAAT-C--C---------TAACAAATC-A-GTT----GGAGAAGATAAAATCAGTTATA-AACT-T-TTAA----A----A----TT--A----A---CA---AAAAA----AT----GT--ATT---T--CTAAACCATT-GG-TTA---TGCTT---TAT---AATAAATCA-CAAGAA----G-AA--TGTAAAT-T-T-T-C--A---TAA-TTA---TGGAAA---CA-----TGGTTTAA-TAATGCCACT-ATTTA--AAAA--AGG-------AAA-TA--CTT-A---TA-T---CT-TGT---C--T--A---ATTATAGGCCAATAA-CACTTTTG------AGTTGT-GTTGGTAA---ATTA------A-TGGAAAT-AGTTGTT----TACAAAC--ATATCTA-TATTT---TT---TTT-TTG---TTGC-AAAT--AACTTGA--TA-TA-CA-AGT----TACAGTCAGGATTT---TT--AAA-A-GTTCATTCAAC-TGTTT
gi|96852 : A-ATG-----CT----CT----CTGCCTAATTTTACTC-GTA-----AAACTGAAA-ATTCAC------TTTC--AA-GT-----A--TA----AG-----TA-------TATCAG-A--AAAAGAAATAATTGA---T---GT---TATC-ACCAT----AC-----------TGAA-C-G--T---------AAACAAAGCTT-GT-----GGCCATGATTTGATAAGTCATA-AAAT-G-TTAAAAGGA----G----TT------------------GCA----CA----CTCAATA---T--TGAAACCACT-GG-CTT---TTCTT---TTT---AATCGTTCT-TTTAGT----G-AA--TGAACATAT-C-C-C--A---AAG-T-A---TGGAAA--ATT-G--CCAAT---G-TCACACCGTT-ATATA--AAAA--AGG----T---GA-CA--AGTCA---TA-T---GT-T-T---C--A--A---ATTACAGACTTGTGT-CTTTGTTA------AGTTGT-TGTGGCAA---GCTT------T-TTGAGAG-AATCATG----TTTAAAA--ATATGTA-TA--A---TT---TCC-TGT---ATGA-TAAT--AATTTAA--TG-TA-TA-AAT----ATCAATCAGGCTTTTTACC--TAA-----ATATTCAAC-
gi|96854 : TGCATCT-T--------AACTA-CA-ATAC-A------TTCCTCAA-AC-----AGATGCTACAT-----CAGAAAATATTACTATA--ACTAAGCATGA--AA---T---AA---AAT-----AT----AT------T---TTGAA-A-A--T---------AAATAAAGC-TTGT-----GGAAGTGATAGTATAAGCCACA-AGAC-A-ATAA----A----A------------------G---AAACAGCTACAG---TT--ATA---T--CAAAGCCTTT-AT-TTA---T--TAC--TTT---AATGGATCC-CTAAGT----G-AA--TGTTGCT-T-T-C-C--A---GAA-AGT---TGGAAAATTTT-G--CAAAT---G-TCAT-CCATT-ATTTA--AAAA--GGGA---T-C-TG-CA--A---A---TG-T---TA-TAA---C--T--A---ATTATTGGCCTATTT-CTTTATTG------AGTTGG-GTTGGAGG---AGTT------T-TTGAAAG-AGTTGTA----TGTAAAC--ACATTTA-TA--A---TA---ATC-TTA---ATAG-TAAT--GAACTCA--TT-TT-CA-AGA----ACCAGTCTGGTTTT---CT--
gi|96855 : T-TGA-----AAACTCATA-ATGTTC------TTGA--TA-AC-----G--TC----AT-----GG-------TAACAG-A--AACAGAAGTAGAAGA---TGTAAT---TCTC-----T-----C------A---TTGAA-T-C--C---------AAATAA------GTCAAGTGGGCCGGATGATATATGTCATA-AAAT-G-TTAA----AAGGAG----TT-------G---CC---AAAT-----CA----GT--AT-------CTAAACCATT-AA-CAT---TATTA---TTG---AATCGCTCT-CTATCA----G-AA--AGTATTT-T-T-C-C--A---GAT-AGC---TGGAAA--ACA-T--CAAAT---G-TTATTCCTAT-ATTTA--AAAA--AGG-------AGA-TA--A---ATT-CA-T---G---GT---AAGT--A---ATTATAGACCAATGT-CATTATTA------AGCTGC-ACCGG-AA---AATT------ATTAGAAAG-ATTAGTG----TTCAAAT--ATTTGTA-TA--A---TT---TTT-TAA---TTAG-CAAT--AATTT-A--TTATA-TA-AAT----ATCAATCGGGTTTTTTACC--TAA-----CCACTCGACAAGTTT
gi|96856 : A-----AAACTAATG-ATACTC------TTTC--TA-AT-----A--TT----AT-----TA-------TTACAA-A--GTCTGAAATAAAAGA---T---AC---GATT-G--AA----AT------T---CTTGA-C-T--C---------AAACAAATC-T-GTT----GAGAATGATAAAATAAGTCACACG--T-T-TTGA----A----G----TA--T----A---CA---AAATA----TA----GT--ATT---T--CTAAACCTCTAGTACT-----GTTA---TTT---AATAGATCA-TTAATT----A-TA--AGTGAAT-T-T-C-C--A---GAT-TTA---TGA----------------------TAATGCCACT-TTTCA--AAAA--AGG----T-AAAA-CA--A---A---CC-C---GG-CGT---C--T--T---ATTATCGACCAATTT-CACTCTTA------AGCTGT-ATTGGCAA---GTTA------A-TCGAAAG-AATTGTG----TACAAAC--ATATATA-TA--A---TT---TTC-TTC---TTGG-TAAT--AACCTCA-----TA-TA-AGT----TACAATCTGGACTT---CT--CAA-A-GGACATTCCAC-GGTTT
gi|96857 : A-----AAACTTATA-ATTCCC------TTTC--AC-AT-----T--TT----AT-----AA-------TAACTG-AGGAT--GATATATCTGA---A---CT---TATT-A--GT----AC------T---T--AA-C-CAGT---------AAATAAGGCCT-GT-----GGTCATGATATGATCAGTCACA-GAAT-G-CTGG----A----A----TA--T----GTGTCG---AAA-------G----CT--ATT---T--CAAAACTATT-TT-AAA---TTTTA---TTT---AACCGTTCT-TTAAGT----G-AA--GGTATAT-A-T-C-C--C---GAT-TTG---TGGAAG--ATT-G--CAAAT---G-TAACTCCCAA-TTCTA--AAAA--GGG-------AGA-CA--A---GT--CATT---GG-TGT---C--A--A---ATTACAGACCTGTGT-CTTTACTT------AGTTGT-GTCGGAAA---ACTT------G-TTGAAAG-GCTTGTT----TTTAAGA--ATATGTA-TA--A---CT---TT--TTC---TTGA-TAAT--AATTTGA--TT-TA-TA-AAT----ACCAGTCAGGCTTT---TT--
gi|96858 : TGA---T---AT----ATCTG--AC----AT------T---TTAAA-C-A--CTGTTAATATAAATAAAGCAT-GT-----GGCCATGACTCTGTAAGCCATA-AGAT-TCTTAA----AGG--G----GT--A----A---CA---AAAC-----------CC--ATA---T--CTAAACCTTT-AG-CCG---TACTT---TTT---ACCCGCTCT-CTGAAT----G-AA--GGGATTT-A-T-C-C--T---GAC-GTT---TGGAAG--ATA-G--CAAAT---G-TTACACCAAT-ATATA--AAAA--AGG----T---GA-CA--A---G---TC-TATAGC-T-T---C--A--A---ACTATAGACCAGTTT-CTTTACTT------AGCTGT-TGTGGTAAGATATTT----------GAAAG-AATCATT----TTTAAAC--ACATGTA-CA--A---CT---TTC-TTC---TTAC-AAAT--AAATT-A--TTGTA-TA-AAT----ATCAATCAGGATTT---CT--
gi|96859 : TGA---T---AT---CATC-----TCCTCAC------T---TTATA-C--------------AAATAAAGC-C-AGT----GGTCCAAACCAAATTAGTCATG-AAAT-G-ATAA----A----G----G-------------G---ATGCG----CAGATTCT--ATC---A--CAAAACCGTT-AG-TTA---TCATT---TTT---AACCGTTCT-ATACAA----G-AA--AGTATTT-T-T-C-C--A---AAC-TCA---TGGAAG--ATA-G--CTCAA---G-TCACTCCCAT-CTTCA--AAAA--GGG-------AGA-TA--A---AA--CG-T---AAACTT---C--T--A---ATTATAGACCCGTTT-CACTTTTA------AGCTGT-TGTGGAAA---GATT------C-TTGAAAG-AATAGTT----TTTAAAA--ATATGTA-TA--A---CT---TTT-TTT---TTAC-AAAT--CAACTGT--TG-TA-TA-AAT----ATCAGTCTGGTTTT---TT--
gi|96860 : TGA---T---AT---TATC-----T----CC------TCACTTA-A-T-A--C---------AAATAAAGC-C-AGT----GGTCTAGACCAAATAAGTCATA-AAAT-G-ATAA----GAG--G----TT--T----G---C------AGA----TT----CT--ATC---A--CAAAACCATT-AG-TTA---TCATT---TTT---ATCCGTTCT-GTACAA----G-AA--AGTTT-T-T-T-C-C--A---AAACTCA---TGGAAG--ATA-G--CTCAA---A-TTACTCCCAT-CTTCA--AAAA--GGG-------AGA-TA--A---AA--CG-TT--AA-CTT---C--T--A---ATTATAGACCCGTTT-CACTTTTA------AGCTGT-TGTGGAAA---GATT------C-TTGAAAG-AATAGTT----TTTAAAA--ATATGTA-TA--A---CT---TT--TTC---TTGA-CAATTCAA--TTA--TTGTA-TA-AAT----TTCAGTCTGTTTTT---a
gi|96861 : GA---C---AT---GATT-T--GT----TT------T---TTAGG-T-G--T---------GAATAAAGC-T-GTA----GCGCCAGACTGAGTAAATCAGA-GAAT-T-TTAA----A----A----CT--A----A---CC---AAGGG----TA----CA--ATT---T--CAGAACCGTT-AT-GTA---TTTGA---TTT---AATAAGAC---TATTT----GCAA--GGAATAT-T-TAC-C--A-------TTAAACTAGAAA---CATG--CACTT---G-TTATGCCCCT-TTATA--AAAA--AGG----C----------A---A---CT-T---GT-CATGTGT--T--AGATATTACAGATCTTTAT-CTCTGTTA------AGTTGT-ATTGGTAA---ACTT------A-TGGAAAt
gi|96862 : ------T---TTAGG-T-G--T---------GAATAAAGC-T-GTA----GGGCCAGACCTAGTAAGTTACA-TAAT-T-TTAT----A----A----CT--A----A---CC---AACGG----TA----TA--ATT---T--CAAAACCTTT-AT-GTA---TTTTA---TTT---AATAAGTAT-TT-TTTAG--G-AA--TCT---T-T-T-C-C--ATGTAAC-T-----TGAAA----CATG--CATTT---G-TTATGCCCCT-TTATA--AGAA--AGG------CGAT-CC--A---T---CG-T---GT--GT---TAGT--A---ATTACAGACCTATTT-GCCTGTTA------AGTTAT-ATTGGTAA---ACAT------A-TGGAACGTTGT-GTG----TATAAGT--ATATATA-CA--C---TT---TCC-
gi|96863 : ------T---TTAGG-T-G--T---------GAATAAAGC-T-GTA----GGGCCAGACCTGTTAAGTTACA-TAAT-T-TTAT----A----A----CT--A----A---CC---AA-------CG----GT--ATAAATT--CAAACCCTTT-AT-GTA---TTTTA---TTT---AATAAGTAT-TT--TT----G-AG---GAATCT-TAT-C-C--ATGTAAC-T-----TGAAA----CATG--CATTT---G-TTATGCCCCT-TTATA--AGAA--AGG------CGAT-TC--A---T---CG-T---GT--GT---TAGT--A---ATTACAGACCTATTT-CCCTGTTA------AGTTAT-ATTGGTAA---ACAT------A-TGGAACGTTGT-GTG----TATAAGT--ATATATA-CA--C---TT---TCC-
gi|96864 : ------T---TTAGG-T-C--T---------GAATAAAGC-T-GTA----GGGCCAGACCTAGTAAGTCACA-GAAT-T--------------------------------------------------------------T--CAAAACCTTT-AT-GTA---TTTTA---TTT---TAAAAGTCT-ATTCGTGAG-G-AA--TCT---T-T-T-C-C-------AT-GCAAC-TGGAAA---CATG--CACTT---G-TTGTGCCCCT-TTATA--AGAA--AGG------CGAT-TC--A---T---CG-T---G--TGT---TAGT--A---ATTACAGACCTATTT-CCCTGTTA------AGTTGT-ATTGGTAT---ACTT------A-TGGAACGTTGT-GTG----TACAAGT--ATATATA-TA--A---ATACCTTA-TCT---CTGA-GAAT-----------CT-TA-TA-TATTCTAGACAATCAGGTTTT----T--TAATT-GGTCATTCCAC-TGT
gi|96865 : --C---------AAATAAAGC-T-GTT----GGGGAAGACTTAATAAGTCATA-CAAT-T-TTAA----A----A----AA--T----A---CT---CGTAA----TA----CT--TTT---T--CAAAACCACT-TTGCAA---TCGT----TTT---AACAAATTT-CTAAAT----G-AA--TGTGTAT-T-T-C-C--A---AGT-TCT---TGGAAG--TCG-G--CTATA---A-TTATGCCGCT-GTTTA--AAAA--GGGGGATT-C----CG--A---T---TG-T-------GT---T--TAAA---ACTACAGACCTATAT-CTTTACTT------AGCAGT-ATTGGCAA---ACTT------A-TGGAAAG-GACCATG----TACAAAC--ACATATA-TA--A---CC---ATC-TCC---TTGA-TAAC--AATTTGA--TA-TA-TA-ATA----ATCAGTCCGGTTTT---CT--AAG-A-AGCTATTC
gi|96866 : --C---------AAACAAAGC-T-GTT----GGGGAAGACTTAATAAATCATA-CAGT-T-TTAA----A----A----AA--T----A---CT---CGTAA----TA----CT--ATA---T--CAAAACCATT-TTGCAA---TCTT----TTT---AACAAATCT-CTATAT----T-AA--TGTGTAT-T-T-C-C--A---AGT-TCT---TGGAAG--TCC-G--CTGTA---G-TTATGCCACT-GTTTA--AAAAT-GGGGAT-T-C----------------CG-----GT-TGT-------------GTTTCAAACTAATAT-CTTTACTA------AGCTGT-ATTGGCAC---ACTT------A-TGGAAAG-GACAATG----TACAAAC--ACATATA-TA--A---CC---ATC-TCT---TTGA-TAGC--CATTTGA--TA-TA-TA-ATA----AACAGTCCGGTTTT---CT--AAG-A-GGCCATTTCAC-AGTTT
gi|96868 : AATAAGGC-T-GTA----GGGTAAGACCTAGTAAGTCGCA-GAAT-T-TTAA----A----A----CT--A----A---CC---ATGGG----TA----CA--ATT---T--CAAAACCTTT-AT-GTA---TTTTA---TTT---AATAAGTCT-TTTCGC----G-AG-----GAAT-C-T-T---------AT-TCA---TG-------CA----CT--T---G-TTAT-CCCCT-TTATA--AGAA--AGG------CGAT-TC--A---T---CG-T---G--TGT---TAGT--A---ATTACAGACCTATTT-CCCTGTTA------AGTTGT-ATTGGTAA---ACTT------A-TGGAACGTTGT-GTG----TATAAGT--ATATATA-TA--A---TT---
gi|96869 : ATAAGTAACA-AAATGC-TTAA----A----G----GTGCT----G---TA---AGA-A----CA--------ATT---T--CTGAACCTCT-----TACACTTTTA---TAT---AATCGTTCTATTACC-----G-AA--AGT-CAT-T-T-C-C--CT--AAC-TCA---TGGAAA--AAA-G--CTCAT---G-TAACTCCTAT-TTTTAGGAAAG--GGG----A-TAAGTCA--A----------T---CC-CAT---C--T--A---ATTATAGACCAATGT-CGTTGCTC------AGCTGT-GTCGG
gi|96870 : aaatt----TT--T----A---AA---AAGCA--------------ATT---G--CAAAACCACT-TT-CAA---TTTTA---TTT---AACCGTTCT-TTAAGT----G-AA--GGTATAT-A-T-C-C--C---GAT-TTG---TGGAAG--ATT-G--CAAAT---G-TAACTCCTAT-TTTTA--AAAA--GGG-------AGA-CA--A---GT--CATT---GG-TGT---C--A--A---ATTACAGACCTGTGT-CTTTACTT------AGTTGT-GTTGGAAA---ACTT------T-TTGAAAG-GCTTGTT----TTTAAGA--ATATGTA-TA--A---CT---TTT-TTC---TTGA-TAAT--AATTTGA--TT-TA-TA-AAT----ACCAATCAGGCTTT---TT--
gi|96871 : T--ATT---T--CCAAATATCT-AG-TTC---TATTA---TTT---AATAGTACA-TGACAT----G-AA--TGGAAAC-G-C-A-C--A---TAT-TTA---TGGAAA--CAA-G--CT-TT---GATAATGCCACT-CTTCA--AAAC--AGG----T-AAAA-CA--A---A---AC-T---GG-CGT---C--T--A---TTTATCGATCGATAT-CTCTCTTA------ATCTGT-GTTGGCAA---GTAA------A-TGAAACA-AATTGTT----TACAAAC--GTATATT-TA--T---TT---TTC-TTG---TAAA-CAAA--AACCTCA--TT-TA-TA-AAT----CACATTCAGGATTT---CT--ACA-T-GGACACTCTAC-GGTCT
gi|96872 : ctaT--ATT---T--CAAAACCTCT-A----A---TGTTACTTTTT---AATCGTTCT-ATAAAC----G-AA--AGTAAAT-T-C-C-C--T---GAA-TCC---AGGAAA--ATA-G--CACAT---G-TAACCCCCCT-TTTAA--GCAA--GGG--------GA-CA--A---GT--CG-TT--GC-CCT---C--T--A---ATTATAGACCAGTAT-CACTGTTG------AGTTGT-TTGGGAAA---AGTT------T-TAGAAAG-AATAATT----TTCAAGC--GTATGTA-TA--A---CT---TTC-TAC----TAA-ACAT--AATATGC--TG-TT-CA-AAT----GTCAGTCTGG-TTT---CT--T
gi|96873 : A---TGTTA---CTTTTCAATCGTTCT-ATAACC----A-AA--AGTAAAT-T-C-C-C--T---GAC-TCA---TTGAAA--ATA-G--CACAT---G-T-AT-----T-TTTTA--AAAA--AGG--------AA-CA--A---GT--CG-TTTGGC-C-T---C--T--T---ATTATA--CCAGTAT-CCATGTTC------ATCTGT-TTGGGGAAG--ATTT------T-TAGAAAG-AATAATT----TTCAAGC--GTATGTA-TA--A---CT---TTC-TAC---TAAA-TAAT--AATCTGC--TG-TA-CA-AAT----AATAATC
gi|96874 : cctgtaAAG--TCG-G--CTATA---G-TTATGCCGCT-GTTTA--AAAA--GGGGGATT-C----CG--A---T---TG-T---GC-T-T---C--A--A---ACTACAGACCAGTAT-CTTTACTT------AGCTGT-ATTGGCAA---ACTT------A-TGGAAAG-GACCATG----TACAAAC--ACCCATG-TA--A---CC---ATT-GCT---TTGA-TAAC--AATTTGA--TA-TA-TA-GTA----AACAATCCGGTTTT---CT--AAG-A-GGCCTTTCCAC-AGTTT
gi|96875 : ttaataagtcattcaattttaaaaaaatactcgtTT---AATAGTTCT-ATACAA----G-AA--AGTAT-T-T-T-C-CCAA---AAC-TCA---TGGAAGA-TC--G--CTCAA---G-TTACTCCAAT-CTTCA--AAAA--GGGAGA-T-AAAA-CATTA---A---C--T--------T---C--T--A---ATTATAGACCCGTTCACTT--CTA------AGCTGT-TGTGGAAA---GATT------C-TTGAAAA-ATTAGTT----TCTAGAA--ATATATA-TA--A----------C-TTC---TTGACAAAT--CAACT-A--TTGTA-CA-AAT----ATCAGTCTGG
gi|96876 : -AA--TATCAAT-A-T-CAC--A---GAA--CA---AGAAAT--TT-----CTGAT---G-TAATGCCATT-ATTTA--AAAA--AGA----TGCTAA--A--G---A---TA-T---TC-CAT---C--A--A---ACTATAGACCTATTT-CATTAATT------AGATGT-ATTGGTAA---GGTC------A-TGGAAAG-AGTAATA----TTCAAGC--ATTTATA-CA--A---TTA--TTT-ACA---TTTA--AAT--AACCTGA--TT-TA-TA-AAA----ATCAGTCGGGGTTT---CT--CCC-A-GGTCATTCAAC-AATTT
gi|96877 : --T--A---ACTATAGACCTATAT-CACTGTTA------AGC-GTAATTGGCAA---AGTG------T-TTGAAAG-ACTTATT----TTTAAAC--ACATGTA-TA--A---TT---TCT-TTC---GTGA-TACT--AATTTTA--TT-T--CGTCAT----TTCAATCTGGTTTT---GT--TCC-T-GGTGATTCAAC-AATT
gi|96878 : caaaagtctggaaagaagcatttgtatgcgctgtttataaaaaaggagacccttctttggttaa-TTA---TGGAAG--TCA-G--CTACT---G-TAATGCCTCT-TTTTA--AGAA--AGG----T-CAAA-CA--A---A---CG-T---GC-CAT---C--T--A---ATTAAAGGCCAATAT-CTTTATTA------AGCTGT-GTTGGTAA---ACTT------A-TGGAAAG-GGTTGTC----TACAAAC--ATATTTA-TA--A---TT---TTC-TGA---TTGA-AAAT--AAACTAA--TT-TA-CA-AAT----TGCAATCCGGATTT---CT--TAA-G-GGCCATTCGACAAGTT
gi|96879 : gATCCCACT-GTTTA--AAAA--GGGGGATT-C----CG--A---T---TG-T---G----T---T--TGAA---ACTTCACACCAATAT-CTTTACGT------AGCTAT-ATTGACAA---ACTT------A-TGGAAAG-GACCATACATGTACAAAC--ACATATA-TA--A---CC---ATC-TCT---TTGA-TAAC--AATTTGA--TG-TA-TA-GTA----AACAGTCCGGTCTT---C----AA-GAGGTCATTCCAC-AGTTT
gi|96880 : aT-TTTTA--AAAAAAGAG----T-CAAA-CA--T---A---T-------C-CGT---C--A--A---GCTAAATACCAATTT-CTTTAATT------AGTTGT-ATTGTTAA---GGTA------A-TGAAGCG-TATCGTT----TTCAAA---ATATATAACA--A---AT---ATC-TATAGTTTGA----T--GACTTAA--TT-TATCA-AA-----ATCAATCAGGATGT---TTACCAA-G---ACATTCGAC-TGTTT
gi|96881 : TTG------AGTTTT-GTTAGTAA---ATTA------A-TGGAAAG-AGTTGTT----TACAAAC--ATATTTA-TA--AT--TT---TTT-TTT---TTGC-TAAT--AA--TTA--TA-TA-CA-AGT----TACTGTCAGGATTT---TT--AAA-A-GGTCATTC
gi|96882 : A------AG-TAT-GTTGGTAA---ACTT------A-TGGAAAG-AGTTGTC----TACAAAC--ATATTTA-TA--A---TT---TTC-TGA---TTGA-AAAT--AAACTAA--TT-TA-CA-AAT----AGCAATCCGGATTT---CT--TAA-G-GGACATTCGAC-AGTTT
gi|96883 : AA---ACTTGAATGGA-TGGAAAG-AGTCGTT----TACAAAC--ACATGTA-TA--ACTTTT---TTT-TTG---TTGC-TAAT--AACTTGA--TA-TA-CA-AGC----TACAATCAGGTGTT---TT--AAA-A-GGTCACTCAAC-TGTT
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|96853 ): ACTTTACCACAATACATTCCCAAAACAGATGTTTCATTAGAAACTATTACTATAACTGAGCAGGAAATAAAATATTTTGAAAATACTAGATATAAATAAAGCCAGTGGCAGTGATATTATAAGCCACAATATACTAAAGGAAACAGCTACAGTTATATCAAAGCCTCTATGTATTATTTTTAATAGATCCCTAAGTGAGTGTTGCTTTCCAGAATGCTGGAAATTTGCAAATGTCATGCCATTGTTTAAAAAGGGATGTGCTAATGTTACAACTGATTATAGACCGATTTCTTTATTGAGTTGTGTTGGAAAACTTTTTGAAAGAGTT
Unaligned ( gi|96867 ): AAATAAAGTAAGCGGTACTGACACTATAAGTCACAAAATGCTTAAAGGTGCTGTAAGAACAATTTCTGAACATCTTACTCTTTTATATAATCGTTCTATTACCGAAAGTCATTTCCCTAACTCATGGAAAATAGCCCATGTAACTCCTATATTTTTGAAAGTGGATAAGTCAATTCCATCTAATTATAGACCAGTTAAGTTGCTAAGCTGTGTCGGAAAGATTTTAGAAAGAATAATTTTTAAACAAATGTATAACTTCTTCTTGAGTAACAATTTATTGTATAAAAACCAGTCTGGCTTTTT
Alignments
lowQualScore : 11111 11111111111111 11111 222222222222222222222222222222222222222222 11111 1111111 33333333333333333333333333333333333
lowQualScore : 666 3 88888 7777 5555 2 66666 3 2 88888888 1 33 5 66666 33 5555 66666 8888888 0 2 33 22 0 1 333 333 6666 33333 4444 555555 333 0 1 22222222222222 4 1 22222 222 44 1 1 3 1 44444 777777777777777777777777777777777777777777 11 5555 11 1 3 00000 222 2 333 222 1 11 7777777 1 222 555 11 1 1 1 1 11 6666 33 33333 1111111 11 888 222 1 2 2 1 11 11 22 88888888888888888888888888888888888 111 77 22 111 1 1 1 1 222222 11 1 222 222222 1 4 8 33333 1 11 1 1 11 222 333 1 33333 66 11 3 5 11 4 1 1 444444 1 2 444 222 777 1 2 3
lowQualScore : ... . ..... .... .... . ..... . . ........ . .. . ..... .. .... ..... ....... . . .. .. . . ... ... .... ..... .... ...... ... . . .............. . . ..... ... .. . . . . ..... .......................................... .. .... .. . . ..... ... . ... ... . .. ....... . ... ... .. . . . . .. .... .. ..... ....... .. ... ... . . . . .. .. .. ................................... ... .. .. ... . . . . ...... .. . ... ...... . . . ..... . .. . . .. ... ... . ..... .. .. . . .. . . . ...... . . ... ... ... . . .
lowQualScore : 444 3 33333 1111 0000 9 22222 5 5 00000000 4 44 0 22222 44 3333 22222 1111111 8 5 44 11 8 6 555 555 4444 66666 2222 000000 000 3 7 22222222222222 6 5 00000 000 00 9 5 0 5 77777 222222222222222222222222222222222222222222 88 6666 88 5 6 99999 333 3 555 222 0 99 7777777 2 111 666 99 2 2 2 2 77 1111 00 88888 4444444 66 222 000 1 1 0 4 22 55 66 33333333333333333333333333333333333 999 22 99 888 0 0 1 1 999999 88 0 888 999999 0 1 7 22222 3 44 0 0 44 888 888 1 99999 44 55 6 0 66 6 1 1 444444 0 2 222 666 333 0 3 6
consensus : CAACAATAGATGAAAATACAAACA---ATA-ATA-----CT----CT--A-CTTCCAGAGTGTATCT-TTA-----AAACTAATA-ATACCA------TTGC--AA-AC-----A--TG----AT-----CA-------TTACTG-A--ATCAGACATAATTGA---T---AT---TATC-G--GT----AC------T---TTAGA-C-C--C---------AAATAAAGC-T-GTC----GGNNAAGACNNAATAAGTCACA-GAAT-T-TTAA----A----G----TT--T----A---CN---AAACA----CA----CT--ATN---T--CNAAACCNCT-GT-CTA---TNTTA---TTT---AATAGNTCT-TTACNT----G-A---A--TGTANAT-T-T-C-C--A---GAN-TCA---TGGAAG--TCA-G--CTANT---G-TNATGCCNCT-TTTTA--AAAA--GGG----T-CAAA-CA--A---A---CG-T---GC-CGT---C--T--A---ATTATAGACCNATNT-CTTTATTA------AGCTGT-GTTGGTAA---ACTT------A-TGGAAAG-AGTCGTN----TACAAAC--ATATNTA-TA--A---TT---TTC-TNN---TTGA-NAAT--AANCTGA--TT-TA-CA-AAT----NNCAATCNGGNTTT---CT--TAA-G-GGNCATTCGAC-AGTTT
Reference ( family-531 ) : CAACAATAGATGAAAATACAAACA---ATA-ATA-----CT----CT--A-CTTCCAGAGTGTATCT-TTA-----AAACTAATA-ATACCA------TTGC--AA-AC-----A--TG----AT-----CA-------TTACTG-A--ATCAGACATAATTGA---T---AT---TATC-G--GT----AC------T---TTAGA-C-C--C---------AAATAAAGC-T-GTC----GGNNAAGACNNAATAAGTCACA-GAAT-T-TTAA----A----G----TT--T----A---CN---AAACA----CA----CT--ATN---T--CNAAACCNCT-GT-CTA---TNTTA---TTT---AATAGNTCT-TTACNT----G-A---A--TGTANAT-T-T-C-C--A---GAN-TCA---TGGAAG--TCA-G--CTANT---G-TNATGCCNCT-TTTTA--AAAA--GGG----T-CAAA-CA--A---A---CG-T---GC-CGT---C--T--A---ATTATAGACCNATNT-CTTTATTA------AGCTGT-GTTGGTAA---ACTT------A-TGGAAAG-AGTCGTN----TACAAAC--ATATNTA-TA--A---TT---TTC-TNN---TTGA-NAAT--AANCTGA--TT-TA-CA-AAT----NNCAATCNGGNTTT---CT--TAA-G-GGNCATTCGAC-AGTTT
gi|96841 : CAACAATAGATGAAAATATAAACA---ATA-ATA-----CT----CT--A-CTTCCAGAGTGTATCT-TTA-----AAACTTATA-ATACCA------TTGC--AA-AC-----A--TG----AT-----CA-------TTACTG-A--ATCAGACACAATTGA---T---AT---TATC-G--GT----AC------T---TTAGA-C-C--C---------AAATAAAGC-T-GTC----GGAGAAGACAAAATTAGTCACA-GAAT-T-TTAC----A----G----TT--T----A---CT---AAACA----CA----CT--ATA---T--CTAAACCCCT-GT-CTA---TGTTA---TTT---AATAAATCG-TTACTT----G-A---A--TGTAAAT-T-T-C-C--A---GAG-TCA---TGGAAG--TTA-G--CTACT---G-TAATGCCTCT-TTTTA--AGAA--GGG----T-CAAA-CA--A---A---CG-T---GC-CAT---C--T--A---ATTATCGGCCAATAT-CTTTATTA------AGCTGT-GTTGGTAA---ACTT------A-TGGAAAG-AGTTGTC----TACAAAC--ATATTTA-TA--A---TT---TTC-TGA---TTGA-AAAT--AAACTAA--TT-TA-CA-AAT----TGCAATCCGGATTT---CT--TAA-G-GGACATTCGAC-AGTTT
gi|96842 : CAACAATAGATGAAAATATAAACA---ATA-ATA-----CT----CT--A-CTTCCAGAGTGTATCT-TTA-----AAACTAATA-ATACCA------TTGC--AA-AC-----A--TG----AT-----CA-------TTACAT-A--ATCAGACATAATTGA---T---AT---TATC-G--GT----AC------T---TTAGA-C-C--C---------AAATAAAGC-T-GTC----GGAGAAGACAAAATTAGTCACA-GAAT-T-ATAC----A----G----TT--T----A---CT---AAACA----CA----CT--ATA---T--CTAAACCCCT-GT-CTA---TGTTA---TTT---AATAAATCC-TTACTT----G-A---A--TGTAAAT-T-T-C-C--A---GAG-TCA---TGGAAG--TCA-G--CTACT---G-TAATGCCTCT-TTTTA--AGAA--GGG----T-CAAA-CA--A---A---CG-T---GC-CAT---C--T--A---ATTATCAGCCAATAT-CTTTATTA------AGCTGT-GTTGGTAA---ACTT------A-TGGAAAG-AGTTGTC----CACAAAC--ATATTTA-TA--A---TT---TTC-TGA---TTGA-AAAT--AAACTAA--TT-TA-CA-AAT----TGCAATCCGGATTT---CT--TAA-G-GGACATTCGAC-AGTTT
gi|96843 : CAACAATGGATGAAAATATAAACA---ATA-ATA-----CT----CT--A-CTGCCAAAGTGTGTCT-TTA-----AAAC----------CA------TTGC--AA-AC-----A--TG----AT-----CA-------TTACTG-T--ATCAGACATAGTTGA---T---AT---GATC-G--GT----AC------T---TTAGA-C-C--C---------AAATAAAGC-T-GTC----GGAGAAGACAAAATTAGTCACA-GAAT-T-TTA----------G----TT--T----A---CA---AAACA----CA----TT--ATA---TATCTAAACCCCT-GT-CTA---TGTTA---TTT---AATAAATCC-TTACTTACTTG-A---A--TGTATAT-T-T-C-G--A---GAG-TCA---TGGAAG--TCA-G--CTACT---G-TAATGCCTCT-TTTTA--AGAA--GGG----T-CAAA-CA--A---A---CG-T---GC-CAT---C--T--A---ATTATCGGTCAATAT-CTTTATTA------AGCTAT-GTTTGTAA---ACTT------A-TGGAAAG-AGTTGTC----TACAAAC--ATATTTA-TA--A---TT---TTC-TGA---TTGA-AAAT--AAACTAA--TT-TA-CA-AAT----TGCAATCCGGATTT---CT--TAA-G-GGACATTTGAC-AGTTT
gi|96844 : CAACAATAGATGAAAATATAAACA---ATA-ATA-----CT----CT--A-CTTCCAGAGTGTATCT-TTA-----AAACTAATA-ATACCA------TTGC--AA-AC-----A--TG----AT-----CA-------TTACTG-A--ATCAGACATAATTGA---T---AT---TATC-A--GT----AC------T---TTAGA-C-C--C---------AAATAAAGC-T-GTC----GGAGAAGACAAAATTAGTCACA-GAAT-T-TTAC----A----G----TT--T----A---CA---AAACA----CA----CT--ATA---T--CTAAACCCCT-GT-CTA---TGTTA---TTT---AATAAATCC-TTACTT----G-A---A--TGTAAAT-A-T-C-C--A---GAG-TCA---TGGAAG--TCA-G--CTACT---G-TAATGCCTCT-TTTTA--AGAA--GGG----T-CAAA-CA--A---A---CG-T---GT-CAT---C--T--A---ATTATCGGCCAATAT-CTTTATTA------AGGTGT-GTTGGTAA---ACTT------A-TGGAAAG-AGTTGTT----TACAAAC--ATTTTTA-CA--A---TT---TTC-TGA---TTGA-AAAT--AAACCAA--TT-TA-CA-AAT----TGCAATCCGGATTT---CT--TCA-G-GGACATTCGAC-
gi|96845 : CAACAATAGGTGAAAATACAAACA---ATA-CTA-----CT----CT--A-CTTCCAGGGTGTATCT-TTA-----AAACTAATA-ATACCA------TTGC--AA-AC-----A--TG----AT-----CA-------TTACTG-A--ATCAGCCATAGTTGA---T---AT---AATC-G--GT----AC------T---TTAGA-C-C--C---------AAATAAAAC-T-GTC----ACAGAAGACAAAATTAGTCACA-GAAA-T-TAAC----A----G----TT--T----A---CA---AAACA----CA----CT--ATA---T--CTAAATC-CT-GT-CTA---TGTTA---ATT---AACAAATCC-TTACTT----G-A---A--TGTAAAT-T-T-C-A--A---GAG-TCA---TGGAAG--TCA-G--CTTCT---G-TAATGCCTCT-TTTTA--AAAA--GGG----T-CAAA-CA--A---A---CG-T---GC-CAT---C--T--A---ATAATCGGCCAATAT-CTTTATTA------AGCTGT-GTTGGTAA---CCTA------A-TGGAAAG-AGTTGTC----TACAAAC--ATATTTA-TA--A---TT---TTC-TGA---TTGA-AAAT--AAACTAA--TT-TA-CA-AAT----TGCAATCCGGATTT---TT--TAA-G-GGACA
gi|96846 : CAACAATAGGTGAAAATACAAACA---ATA-CTA-----CT----CT--A-CTTCCAGGGTGTATCT-TTA-----AAACTAATA-ATACCA------TTGC--AA-AC-----A--TG----AT-----CA-------TTACTG-A--ATCAGCCATAGTTGA---T---AT---AATC-G--GT----AC------T---TTAGA-C-C--C---------AAATAAAAC-T-GTC----ACAGAAGACAAAATTAGTCACA-GAAA-T-TAAC----A----G----TT--T----A---CA---AAACA----CA----CT--ATA---T--CTAAATC-CT-GT-CTA---TGTTA---ATT---AACAAATCC-TTACTT----G-A---A--TGTAAAT-T-T-C-A--A---GAG-TCA---TGGAAG--TCA-G--CTTCT---G-TAATGCCTCT-TTTTA--AAAA--GGG----T-CAAA-CA--A---A---CG-T---GC-CAT---C--T--A---ATAATCGGCCAATAT-CTTTATTA------AGCTGT-GTTGGTAA---CCTA------A-TGGAAAG-AGTTGTC----TACAAAC--ATATTTA-TA--A---TT---TTC-TGA---TTGA-AAAT--AAACTAA--TT-TA-CA-AAT----TGCAATCCGGATTT---TT--TAA-G-GGACA
gi|96847 : CAACAATAAATGACAGTATTAACA---ATA-ATA-----TG----TT--A-CTTCCAGGCTGTGTCT-TTA-----AAACGAATA-ATACCA-------------A-AC-----T--TG----AT-----CG-------TTACTG-A--ATCAGACATAATTGT---T---TT---GATC-G--GT----AC------T---TTAGA-C-C--C---------AAATAAAGC-T-GTC----GGAAAAGACACAAT---TCCCA-GAAT-T-TTTC----A----G----TA--T----A---CA---AACCA----CA----CT--A-----------AACCACA-GT-CTA---TGTTA----------ATAATTCC-TTACTT----T-A---A--TGTAAAT-T-T-C-C--A---G---TCA---TGGAAG--TCA-A--CTACT---G-TTATGTCTCA-TCTTA--AGAA--AGG----T-CAAA-CA--G---A---CG-T---GC-CAT---C--T--T---ATCATTGGTCAATAT-CTTTATTA------AGCTGT-GTTGGTAA---ACTT------A-TGGAAAG-AGTTGTC----TACAAAC--ATATTTA-TA--A---CT---TTC-TGA---TTGA-AAAT--AAACTAATTTT-TA-TA-AAT----TTTTATCAGGACTT---TC--TAA-T-GGACATTCGAC-AGTTT
gi|96848 : ACAATAGATGATACT-CAAACA---A---AT------------------CTTCCTGAATTCGTTT-TTC-----AAACAAATA-GTAC-G------TTAA--AAGAT-----A--TT----AA-----CA-------TCACAG-A--AAAAGAAATAACTGA---T---GT---TCTA-G---------------------CAAA-C-C--TCGCTGT---AAATAAAGC-T-AGT----GGTCTTGACGACATAGGTCACA-AAATGC-TCAA----A----GAAACTT--TGTAAA---CTTGTAAACT----TGT---CT--ATT---T--GTAAACCTTA-AT-GTA---TTATA---CTT---AACAGATCT-ATGAGA----G-A---AAATGTATAT-----C-C--A---ACA-TCT---TTGAAA--TTA-G--CTAAC---G-TTATGCCTTTATTTTA--AAAA--GG-----T---GA-TA--A---ATCTC--T---AC-CGT---C--T--A---ATTATAGACACATTT-CATTGATA------AGCTGT-GTTGGTAA---AGTA------G-TGGAAAG-AATTGTT----TTTGAAC--ATATTTA-CA--A---TC---ATCTTCA---TTCA--AAT--AA
gi|96849 : AAAATACAAAGATAGATAGATAAAAGTTT----TT--ATCTTATA-AGTGTATAT-ATATATATAAACAAATAGATAACAACAAAATTGT--AA-GCTCTTCA--TG----AG-----CT-------TT--TG-A--ACC-GATATAAGTGA---C---ATACATGTC-----T----AC------T---TTA---C-C--C---------AATTTTAGA-C-GT-------ATACAAC--AGTGACTTAAA-GGGT-T-T-GA----A----G----TA--T----A---TA---AAATA----TA----GT--ATT---T--CTAAACCTCTAGTACT-----GTTA---TTT---AATAGATCA-TGAATT----A-A---A--TGTGAAT-T-T-C-C--A---GAT-TTA---TGGAAA--TCA-GTCCTA-----G-TAATTCCACT-TTTCA--AGAA--AGG----T-AAAA-CA--A---A---CT-A---AG-CGT---C--T--A---ATTATCGACCAATTT-CACTCTTA------AGCTGT-ATTGGCAA---GTTA------A-TGGAAAG-AATTGTG----TACAAACATATATATA-TA--A---TT---TTC-TTG---TTGA-TAAT--AACCTCA--TT-TA-TA-AAT----TACAATCTGGATTT---CC--CAG-A-GGACATTCCAC-GGTTTtattatattta
gi|96850 : TACAATTG---ATG-ATA-----CTGACTCTGAA-CTTCCAAATTTTGTTT-TGA-----AAAC-AGT---TACCA---------C--AATTC-----A--TG----ATATCAATA-------TCACAG-A--ACAAGAAATTTCTGA---T---GT---TCTT-T--CC----AA------T---TTAGT-TGT--C---------AAA-AAAAC-T-TGC----GGCCCAGACGAAATAAGCCATC-ACAT-G-TTAA----A-------------------------------A----CA----CT--ATG---C--TG--ACCGCT-TT-GCA---TCATT---TTT---AATAGGTCT-CAATAA----G-A---A--AGCATAT-A-C-C-C--A---AAT-TGT---TCAAAA--TAA-G--CAAAT---G-TAATGCCATT-ATTCA--AAAA--GGG----TGCTAA--A--G---A---TA-T---TC-CAT---C--A--A---ACTAAAGACCTATTT-CATTAATGACATGTAGTTGT-ATTGGTAA---GGTC------A-TGGAAAG-AGTAATA----TTCAAGC--ATTTATG-CA--A---TTA--TTC-ACA---TTTA--AAT--AACCTGA--TT-TA-TA-AAA----ATCAGTCAGGGTTT---CT--TCC-T-GGTCATTCAAC-AATTT
gi|96851 : A---ACA-ATA-----CT----TT--A-CTACCAACTTGT-TCTCTTA-----AAACAAACC-ATACAC------TAAC--AA-AT-----A--TC----AA-----AA-------TAACTG-A--A---AATGAAATTAAGAAT---AT---TATA-G--AT----ACATTTTAT---TTAAAAT-C--C---------TAACAAATC-A-GTT----GGAGAAGATAAAATCAGTTATA-AACT-T-TTAA----A----A----TT--A----A---CA---AAAAA----AT----GT--ATT---T--CTAAACCATT-GG-TTA---TGCTT---TAT---AATAAATCA-CAAGAA----G-A---A--TGTAAAT-T-T-T-C--A---TAA-TTA---TGGAAA---CA-----TGGTTTAA-TAATGCCACT-ATTTA--AAAA--AGG-------AAA-TA--CTT-A---TA-T---CT-TGT---C--T--A---ATTATAGGCCAATAA-CACTTTTG------AGTTGT-GTTGGTAA---ATTA------A-TGGAAAT-AGTTGTT----TACAAAC--ATATCTA-TATTT---TT---TTT-TTG---TTGC-AAAT--AACTTGA--TA-TA-CA-AGT----TACAGTCAGGATTT---TT--AAA-A-GTTCATTCAAC-TGTTT
gi|96852 : A-ATG-----CT----CT----CTGCCTAATTTTACTC-GTA-----AAACTGAAA-ATTCAC------TTTC--AA-GT-----A--TA----AG-----TA-------TATCAG-A--AAAAGAAATAATTGA---T---GT---TATC-ACCAT----AC-----------TGAA-C-G--T---------AAACAAAGCTT-GT-----GGCCATGATTTGATAAGTCATA-AAAT-G-TTAAAAGGA----G----TT------------------GCA----CA----CTCAATA---T--TGAAACCACT-GG-CTT---TTCTT---TTT---AATCGTTCT-TTTAGT----G-A---A--TGAACATAT-C-C-C--A---AAG-T-A---TGGAAA--ATT-G--CCAAT---G-TCACACCGTT-ATATA--AAAA--AGG----T---GA-CA--AGTCA---TA-T---GT-T-T---C--A--A---ATTACAGACTTGTGT-CTTTGTTA------AGTTGT-TGTGGCAA---GCTT------T-TTGAGAG-AATCATG----TTTAAAA--ATATGTA-TA--A---TT---TCC-TGT---ATGA-TAAT--AATTTAA--TG-TA-TA-AAT----ATCAATCAGGCTTTTTACC--TAA-----ATATTCAAC-
gi|96854 : TGCATCT-T--------AACTA-CA-ATAC-A------TTCCTCAA-AC-----AGATGCTACAT-----CAGAAAATATTACTATA--ACTAAGCATGA--AA---T---AA---AAT-----AT----AT------T---TTGAA-A-A--T---------AAATAAAGC-TTGT-----GGAAGTGATAGTATAAGCCACA-AGAC-A-ATAA----A----A------------------G---AAACAGCTACAG---TT--ATA---T--CAAAGCCTTT-AT-TTA---T--TAC--TTT---AATGGATCC-CTAAGT----G-A---A--TGTTGCT-T-T-C-C--A---GAA-AGT---TGGAAAATTTT-G--CAAAT---G-TCAT-CCATT-ATTTA--AAAA--GGGA---T-C-TG-CA--A---A---TG-T---TA-TAA---C--T--A---ATTATTGGCCTATTT-CTTTATTG------AGTTGG-GTTGGAGG---AGTT------T-TTGAAAG-AGTTGTA----TGTAAAC--ACATTTA-TA--A---TA---ATC-TTA---ATAG-TAAT--GAACTCA--TT-TT-CA-AGA----ACCAGTCTGGTTTT---CT--
gi|96855 : T-TGA-----AAACTCATA-ATGTTC------TTGA--TA-AC-----G--TC----AT-----GG-------TAACAG-A--AACAGAAGTAGAAGA---TGTAAT---TCTC-----T-----C------A---TTGAA-T-C--C---------AAATAA------GTCAAGTGGGCCGGATGATATATGTCATA-AAAT-G-TTAA----AAGGAG----TT-------G---CC---AAAT-----CA----GT--AT-------CTAAACCATT-AA-CAT---TATTA---TTG---AATCGCTCT-CTATCA----G-A---A--AGTATTT-T-T-C-C--A---GAT-AGC---TGGAAA--ACA-T--CAAAT---G-TTATTCCTAT-ATTTA--AAAA--AGG-------AGA-TA--A---ATT-CA-T---G---GT---AAGT--A---ATTATAGACCAATGT-CATTATTA------AGCTGC-ACCGG-AA---AATT------ATTAGAAAG-ATTAGTG----TTCAAAT--ATTTGTA-TA--A---TT---TTT-TAA---TTAG-CAAT--AATTT-A--TTATA-TA-AAT----ATCAATCGGGTTTTTTACC--TAA-----CCACTCGACAAGTTT
gi|96856 : A-----AAACTAATG-ATACTC------TTTC--TA-AT-----A--TT----AT-----TA-------TTACAA-A--GTCTGAAATAAAAGA---T---AC---GATT-G--AA----AT------T---CTTGA-C-T--C---------AAACAAATC-T-GTT----GAGAATGATAAAATAAGTCACACG--T-T-TTGA----A----G----TA--T----A---CA---AAATA----TA----GT--ATT---T--CTAAACCTCTAGTACT-----GTTA---TTT---AATAGATCA-TTAATT----A-T---A--AGTGAAT-T-T-C-C--A---GAT-TTA---TGA----------------------TAATGCCACT-TTTCA--AAAA--AGG----T-AAAA-CA--A---A---CC-C---GG-CGT---C--T--T---ATTATCGACCAATTT-CACTCTTA------AGCTGT-ATTGGCAA---GTTA------A-TCGAAAG-AATTGTG----TACAAAC--ATATATA-TA--A---TT---TTC-TTC---TTGG-TAAT--AACCTCA-----TA-TA-AGT----TACAATCTGGACTT---CT--CAA-A-GGACATTCCAC-GGTTT
gi|96857 : A-----AAACTTATA-ATTCCC------TTTC--AC-AT-----T--TT----AT-----AA-------TAACTG-AGGAT--GATATATCTGA---A---CT---TATT-A--GT----AC------T---T--AA-C-CAGT---------AAATAAGGCCT-GT-----GGTCATGATATGATCAGTCACA-GAAT-G-CTGG----A----A----TA--T----GTGTCG---AAA-------G----CT--ATT---T--CAAAACTATT-TT-AAA---TTTTA---TTT---AACCGTTCT-TTAAGT----G-A---A--GGTATAT-A-T-C-C--C---GAT-TTG---TGGAAG--ATT-G--CAAAT---G-TAACTCCCAA-TTCTA--AAAA--GGG-------AGA-CA--A---GT--CATT---GG-TGT---C--A--A---ATTACAGACCTGTGT-CTTTACTT------AGTTGT-GTCGGAAA---ACTT------G-TTGAAAG-GCTTGTT----TTTAAGA--ATATGTA-TA--A---CT---TT--TTC---TTGA-TAAT--AATTTGA--TT-TA-TA-AAT----ACCAGTCAGGCTTT---TT--
gi|96858 : TGA---T---AT----ATCTG--AC----AT------T---TTAAA-C-A--CTGTTAATATAAATAAAGCAT-GT-----GGCCATGACTCTGTAAGCCATA-AGAT-TCTTAA----AGG--G----GT--A----A---CA---AAAC-----------CC--ATA---T--CTAAACCTTT-AG-CCG---TACTT---TTT---ACCCGCTCT-CTGAAT----G-A---A--GGGATTT-A-T-C-C--T---GAC-GTT---TGGAAG--ATA-G--CAAAT---G-TTACACCAAT-ATATA--AAAA--AGG----T---GA-CA--A---G---TC-TATAGC-T-T---C--A--A---ACTATAGACCAGTTT-CTTTACTT------AGCTGT-TGTGGTAAGATATTT----------GAAAG-AATCATT----TTTAAAC--ACATGTA-CA--A---CT---TTC-TTC---TTAC-AAAT--AAATT-A--TTGTA-TA-AAT----ATCAATCAGGATTT---CT--
gi|96859 : TGA---T---AT---CATC-----TCCTCAC------T---TTATA-C--------------AAATAAAGC-C-AGT----GGTCCAAACCAAATTAGTCATG-AAAT-G-ATAA----A----G----G-------------G---ATGCG----CAGATTCT--ATC---A--CAAAACCGTT-AG-TTA---TCATT---TTT---AACCGTTCT-ATACAA----G-A---A--AGTATTT-T-T-C-C--A---AAC-TCA---TGGAAG--ATA-G--CTCAA---G-TCACTCCCAT-CTTCA--AAAA--GGG-------AGA-TA--A---AA--CG-T---AAACTT---C--T--A---ATTATAGACCCGTTT-CACTTTTA------AGCTGT-TGTGGAAA---GATT------C-TTGAAAG-AATAGTT----TTTAAAA--ATATGTA-TA--A---CT---TTT-TTT---TTAC-AAAT--CAACTGT--TG-TA-TA-AAT----ATCAGTCTGGTTTT---TT--
gi|96860 : TGA---T---AT---TATC-----T----CC------TCACTTA-A-T-A--C---------AAATAAAGC-C-AGT----GGTCTAGACCAAATAAGTCATA-AAAT-G-ATAA----GAG--G----TT--T----G---C------AGA----TT----CT--ATC---A--CAAAACCATT-AG-TTA---TCATT---TTT---ATCCGTTCT-GTACAA----G-A---A--AGTTT-T-T-T-C-C--A---AAACTCA---TGGAAG--ATA-G--CTCAA---A-TTACTCCCAT-CTTCA--AAAA--GGG-------AGA-TA--A---AA--CG-TT--AA-CTT---C--T--A---ATTATAGACCCGTTT-CACTTTTA------AGCTGT-TGTGGAAA---GATT------C-TTGAAAG-AATAGTT----TTTAAAA--ATATGTA-TA--A---CT---TT--TTC---TTGA-CAATTCAA--TTA--TTGTA-TA-AAT----TTCAGTCTGTTTTT---a
gi|96861 : GA---C---AT---GATT-T--GT----TT------T---TTAGG-T-G--T---------GAATAAAGC-T-GTA----GCGCCAGACTGAGTAAATCAGA-GAAT-T-TTAA----A----A----CT--A----A---CC---AAGGG----TA----CA--ATT---T--CAGAACCGTT-AT-GTA---TTTGA---TTT---AATAAGAC---TATTT----GCA---A--GGAATAT-T-TAC-C--A-------TTAAACTAGAAA---CATG--CACTT---G-TTATGCCCCT-TTATA--AAAA--AGG----C----------A---A---CT-T---GT-CATGTGT--T--AGATATTACAGATCTTTAT-CTCTGTTA------AGTTGT-ATTGGTAA---ACTT------A-TGGAAAt
gi|96862 : ------T---TTAGG-T-G--T---------GAATAAAGC-T-GTA----GGGCCAGACCTAGTAAGTTACA-TAAT-T-TTAT----A----A----CT--A----A---CC---AACGG----TA----TA--ATT---T--CAAAACCTTT-AT-GTA---TTTTA---TTT---AATAAGTAT-TT-TTTAG--G-A---A--TCT---T-T-T-C-C--ATGTAAC-T-----TGAAA----CATG--CATTT---G-TTATGCCCCT-TTATA--AGAA--AGG------CGAT-CC--A---T---CG-T---GT--GT---TAGT--A---ATTACAGACCTATTT-GCCTGTTA------AGTTAT-ATTGGTAA---ACAT------A-TGGAACGTTGT-GTG----TATAAGT--ATATATA-CA--C---TT---TCC-
gi|96863 : ------T---TTAGG-T-G--T---------GAATAAAGC-T-GTA----GGGCCAGACCTGTTAAGTTACA-TAAT-T-TTAT----A----A----CT--A----A---CC---AA-------CG----GT--ATAAATT--CAAACCCTTT-AT-GTA---TTTTA---TTT---AATAAGTAT-TT--TT----G-A---G---GAATCT-TAT-C-C--ATGTAAC-T-----TGAAA----CATG--CATTT---G-TTATGCCCCT-TTATA--AGAA--AGG------CGAT-TC--A---T---CG-T---GT--GT---TAGT--A---ATTACAGACCTATTT-CCCTGTTA------AGTTAT-ATTGGTAA---ACAT------A-TGGAACGTTGT-GTG----TATAAGT--ATATATA-CA--C---TT---TCC-
gi|96864 : ------T---TTAGG-T-C--T---------GAATAAAGC-T-GTA----GGGCCAGACCTAGTAAGTCACA-GAAT-T-T---------------------------------------------------------------CAAAACCTTT-AT-GTA---TTTTA---TTT---TAAAAGTCT-ATTCGT----G-AGGAA--TCT---T-T-T-C-C--A-----T-GCAAC-TGGAAA---CATG--CACTT---G-TTGTGCCCCT-TTATA--AGAA--AGG------CGAT-TC--A---T---CG-T---GT--GT---TAGT--A---ATTACAGACCTATTT-CCCTGTTA------AGTTGT-ATTGGTAT---ACTT------A-TGGAACGTTGT-GTG----TACAAGT--ATATATA-TA--A---ATACCTTA-TCT---CTGA-GAAT-----------CT-TA-TA-TATTCTAGACAATCAGGTTTT----T--TAATT-GGTCATTCCAC-TGT
gi|96865 : --C---------AAATAAAGC-T-GTT----GGGGAAGACTTAATAAGTCATA-CAAT-T-TTAA----A----A----AA--T----A---CT---CGTAA----TA----CT--TTT---T--CAAAACCACT-TTGCAA---TCGT----TTT---AACAAATTT-CTAAAT----G-A---A--TGTGTAT-T-T-C-C--A---AGT-TCT---TGGAAG--TCG-G--CTATA---A-TTATGCCGCT-GTTTA--AAAA--GGGGGATT-C----CG--A---T---TG-T-------GT---T--TAAA---ACTACAGACCTATAT-CTTTACTT------AGCAGT-ATTGGCAA---ACTT------A-TGGAAAG-GACCATG----TACAAAC--ACATATA-TA--A---CC---ATC-TCC---TTGA-TAAC--AATTTGA--TA-TA-TA-ATA----ATCAGTCCGGTTTT---CT--AAG-A-AGCTATTC
gi|96866 : --C---------AAACAAAGC-T-GTT----GGGGAAGACTTAATAAATCATA-CAGT-T-TTAA----A----A----AA--T----A---CT---CGTAA----TA----CT--ATA---T--CAAAACCATT-TTGCAA---TCTT----TTT---AACAAATCT-CTATAT----T-A---A--TGTGTAT-T-T-C-C--A---AGT-TCT---TGGAAG--TCC-G--CTGTA---G-TTATGCCACT-GTTTA--AAAAT-GGGGAT-T-C----------------CG-----GT-TGT-------------GTTTCAAACTAATAT-CTTTACTA------AGCTGT-ATTGGCAC---ACTT------A-TGGAAAG-GACAATG----TACAAAC--ACATATA-TA--A---CC---ATC-TCT---TTGA-TAGC--CATTTGA--TA-TA-TA-ATA----AACAGTCCGGTTTT---CT--AAG-A-GGCCATTTCAC-AGTTT
gi|96868 : AATAAGGC-T-GTA----GGGTAAGACCTAGTAAGTCGCA-GAAT-T-TTAA----A----A----CT--A----A---CC---ATGGG----TA----CA--ATT---T--CAAAACCTTT-AT-GTA---TTTTA---TTT---AATAAGTCT-TTTCGC----G-A---G-----GAAT-C-T-T---------AT-TCA---TG-------CA----CT--T---G-TTAT-CCCCT-TTATA--AGAA--AGG------CGAT-TC--A---T---CG-T---G--TGT---TAGT--A---ATTACAGACCTATTT-CCCTGTTA------AGTTGT-ATTGGTAA---ACTT------A-TGGAACGTTGT-GTG----TATAAGT--ATATATA-TA--A---TT---
gi|96869 : ATAAGTAACA-AAATGC-TTAA----A----G----GTGCT----G---TA---AGA-A----CA--------ATT---T--CTGAACCTCT-----TACACTTTTA---TAT---AATCGTTCTATTACC-----G-A---A--AGT-CAT-T-T-C-C--CT--AAC-TCA---TGGAAA--AAA-G--CTCAT---G-TAACTCCTAT-TTTTAGGAAAG--GGG----A-TAAGTCA--A----------T---CC-CAT---C--T--A---ATTATAGACCAATGT-CGTTGCTC------AGCTGT-GTCGG
gi|96870 : aaatt----TT--T----A---AA---AAGCA--------------ATT---G--CAAAACCACT-TT-CAA---TTTTA---TTT---AACCGTTCT-TTAAGT----G-A---A--GGTATAT-A-T-C-C--C---GAT-TTG---TGGAAG--ATT-G--CAAAT---G-TAACTCCTAT-TTTTA--AAAA--GGG-------AGA-CA--A---GT--CATT---GG-TGT---C--A--A---ATTACAGACCTGTGT-CTTTACTT------AGTTGT-GTTGGAAA---ACTT------T-TTGAAAG-GCTTGTT----TTTAAGA--ATATGTA-TA--A---CT---TTT-TTC---TTGA-TAAT--AATTTGA--TT-TA-TA-AAT----ACCAATCAGGCTTT---TT--
gi|96871 : T--ATT---T--CCAAATATCT-AG-TTC---TATTA---TTT---AATAGTACA-TGACAT----G-A---A--TGGAAAC-G-C-A-C--A---TAT-TTA---TGGAAA--CAA-G--CT-TT---GATAATGCCACT-CTTCA--AAAC--AGG----T-AAAA-CA--A---A---AC-T---GG-CGT---C--T--A---TTTATCGATCGATAT-CTCTCTTA------ATCTGT-GTTGGCAA---GTAA------A-TGAAACA-AATTGTT----TACAAAC--GTATATT-TA--T---TT---TTC-TTG---TAAA-CAAA--AACCTCA--TT-TA-TA-AAT----CACATTCAGGATTT---CT--ACA-T-GGACACTCTAC-GGTCT
gi|96872 : ctaT--ATT---T--CAAAACCTCT-A----A---TGTTACTTTTT---AATCGTTCT-ATAAAC----G-A---A--AGTAAAT-T-C-C-C--T---GAA-TCC---AGGAAA--ATA-G--CACAT---G-TAACCCCCCT-TTTAA--GCAA--GGG--------GA-CA--A---GT--CG-TT--GC-CCT---C--T--A---ATTATAGACCAGTAT-CACTGTTG------AGTTGT-TTGGGAAA---AGTT------T-TAGAAAG-AATAATT----TTCAAGC--GTATGTA-TA--A---CT---TTC-TAC----TAA-ACAT--AATATGC--TG-TT-CA-AAT----GTCAGTCTGG-TTT---CT--T
gi|96873 : A---TGTTA---CTTTTCAATCGTTCT-ATAACC----A-A---A--AGTAAAT-T-C-C-C--T---GAC-TCA---TTGAAA--ATA-G--CACAT---G-T-AT-----T-TTTTA--AAAA--AGG--------AA-CA--A---GT--CG-TTTGGC-C-T---C--T--T---ATTATA--CCAGTAT-CCATGTTC------ATCTGT-TTGGGGAAG--ATTT------T-TAGAAAG-AATAATT----TTCAAGC--GTATGTA-TA--A---CT---TTC-TAC---TAAA-TAAT--AATCTGC--TG-TA-CA-AAT----AATAATC
gi|96874 : cctgtaAAG--TCG-G--CTATA---G-TTATGCCGCT-GTTTA--AAAA--GGGGGATT-C----CG--A---T---TG-T---GC-T-T---C--A--A---ACTACAGACCAGTAT-CTTTACTT------AGCTGT-ATTGGCAA---ACTT------A-TGGAAAG-GACCATG----TACAAAC--ACCCATG-TA--A---CC---ATT-GCT---TTGA-TAAC--AATTTGA--TA-TA-TA-GTA----AACAATCCGGTTTT---CT--AAG-A-GGCCTTTCCAC-AGTTT
gi|96875 : ttaataagtcattcaattttaaaaaaatactcgtTT---AATAGTTCT-ATACAA----G-A---A--AGTAT-T-T-T-C-CCAA---AAC-TCA---TGGAAGA-TC--G--CTCAA---G-TTACTCCAAT-CTTCA--AAAA--GGGAGA-T-AAAA-CATTA---A---C--T--------T---C--T--A---ATTATAGACCCGTTCACTT--CTA------AGCTGT-TGTGGAAA---GATT------C-TTGAAAA-ATTAGTT----TCTAGAA--ATATATA-TA--A----------C-TTC---TTGACAAAT--CAACT-A--TTGTA-CA-AAT----ATCAGTCTGG
gi|96876 : -A---A--TATCAAT-A-T-CAC--A---GAA--CA---AGAAAT--TT-----CTGAT---G-TAATGCCATT-ATTTA--AAAA--AGA----TGCTAA--A--G---A---TA-T---TC-CAT---C--A--A---ACTATAGACCTATTT-CATTAATT------AGATGT-ATTGGTAA---GGTC------A-TGGAAAG-AGTAATA----TTCAAGC--ATTTATA-CA--A---TTA--TTT-ACA---TTTA--AAT--AACCTGA--TT-TA-TA-AAA----ATCAGTCGGGGTTT---CT--CCC-A-GGTCATTCAAC-AATTT
gi|96877 : --T--A---ACTATAGACCTATAT-CACTGTTA------AGC-GTAATTGGCAA---AGTG------T-TTGAAAG-ACTTATT----TTTAAAC--ACATGTA-TA--A---TT---TCT-TTC---GTGA-TACT--AATTTTA--TT-T--CGTCAT----TTCAATCTGGTTTT---GT--TCC-T-GGTGATTCAAC-AATT
gi|96878 : caaaagtctggaaagaagcatttgtatgcgctgtttataaaaaaggagacccttctttggttaa-TTA---TGGAAG--TCA-G--CTACT---G-TAATGCCTCT-TTTTA--AGAA--AGG----T-CAAA-CA--A---A---CG-T---GC-CAT---C--T--A---ATTAAAGGCCAATAT-CTTTATTA------AGCTGT-GTTGGTAA---ACTT------A-TGGAAAG-GGTTGTC----TACAAAC--ATATTTA-TA--A---TT---TTC-TGA---TTGA-AAAT--AAACTAA--TT-TA-CA-AAT----TGCAATCCGGATTT---CT--TAA-G-GGCCATTCGACAAGTT
gi|96879 : gATCCCACT-GTTTA--AAAA--GGGGGATT-C----CG--A---T---TG-T---G----T---T--TGAA---ACTTCACACCAATAT-CTTTACGT------AGCTAT-ATTGACAA---ACTT------A-TGGAAAG-GACCATACATGTACAAAC--ACATATA-TA--A---CC---ATC-TCT---TTGA-TAAC--AATTTGA--TG-TA-TA-GTA----AACAGTCCGGTCTT---C----AA-GAGGTCATTCCAC-AGTTT
gi|96880 : aT-TTTTA--AAAAAAGAG----T-CAAA-CA--T---A---T-------C-CGT---C--A--A---GCTAAATACCAATTT-CTTTAATT------AGTTGT-ATTGTTAA---GGTA------A-TGAAGCG-TATCGTT----TTCAAA---ATATATAACA--A---AT---ATC-TATAGTTTGA----T--GACTTAA--TT-TATCA-AA-----ATCAATCAGGATGT---TTACCAA-G---ACATTCGAC-TGTTT
gi|96881 : TTG------AGTTTT-GTTAGTAA---ATTA------A-TGGAAAG-AGTTGTT----TACAAAC--ATATTTA-TA--AT--TT---TTT-TTT---TTGC-TAAT--AA--TTA--TA-TA-CA-AGT----TACTGTCAGGATTT---TT--AAA-A-GGTCATTC
gi|96882 : A------AG-TAT-GTTGGTAA---ACTT------A-TGGAAAG-AGTTGTC----TACAAAC--ATATTTA-TA--A---TT---TTC-TGA---TTGA-AAAT--AAACTAA--TT-TA-CA-AAT----AGCAATCCGGATTT---CT--TAA-G-GGACATTCGAC-AGTTT
gi|96883 : AA---ACTTGAATGGA-TGGAAAG-AGTCGTT----TACAAAC--ACATGTA-TA--ACTTTT---TTT-TTG---TTGC-TAAT--AACTTGA--TA-TA-CA-AGC----TACAATCAGGTGTT---TT--AAA-A-GGTCACTCAAC-TGTT
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|96853 ): ACTTTACCACAATACATTCCCAAAACAGATGTTTCATTAGAAACTATTACTATAACTGAGCAGGAAATAAAATATTTTGAAAATACTAGATATAAATAAAGCCAGTGGCAGTGATATTATAAGCCACAATATACTAAAGGAAACAGCTACAGTTATATCAAAGCCTCTATGTATTATTTTTAATAGATCCCTAAGTGAGTGTTGCTTTCCAGAATGCTGGAAATTTGCAAATGTCATGCCATTGTTTAAAAAGGGATGTGCTAATGTTACAACTGATTATAGACCGATTTCTTTATTGAGTTGTGTTGGAAAACTTTTTGAAAGAGTT
Unaligned ( gi|96867 ): AAATAAAGTAAGCGGTACTGACACTATAAGTCACAAAATGCTTAAAGGTGCTGTAAGAACAATTTCTGAACATCTTACTCTTTTATATAATCGTTCTATTACCGAAAGTCATTTCCCTAACTCATGGAAAATAGCCCATGTAACTCCTATATTTTTGAAAGTGGATAAGTCAATTCCATCTAATTATAGACCAGTTAAGTTGCTAAGCTGTGTCGGAAAGATTTTAGAAAGAATAATTTTTAAACAAATGTATAACTTCTTCTTGAGTAACAATTTATTGTATAAAAACCAGTCTGGCTTTTT
Alignments
lowQualScore : 11111 11111111111111 11111 222222222222222222222222222222222222222222 11111 1111111 33333333333333333333333333333333333
lowQualScore : 666 3 88888 7777 5555 2 66666 3 2 88888888 1 33 5 66666 33 5555 66666 8888888 0 2 33 22 0 1 333 333 6666 33333 4444 555555 333 0 1 22222222222222 4 1 22222 222 44 1 1 3 1 44444 777777777777777777777777777777777777777777 11 5555 11 1 3 00000 222 2 333 222 1 11 7777777 1 222 555 11 1 1 1 1 11 6666 33 33333 1111111 11 888 222 1 2 2 1 11 11 22 88888888888888888888888888888888888 111 77 22 111 1 1 1 1 222222 11 1 222 222222 1 4 8 33333 1 11 1 1 11 222 333 1 33333 66 11 3 5 11 4 1 1 444444 1 2 444 222 777 1 2 3
lowQualScore : ... . ..... .... .... . ..... . . ........ . .. . ..... .. .... ..... ....... . . .. .. . . ... ... .... ..... .... ...... ... . . .............. . . ..... ... .. . . . . ..... .......................................... .. .... .. . . ..... ... . ... ... . .. ....... . ... ... .. . . . . .. .... .. ..... ....... .. ... ... . . . . .. .. .. ................................... ... .. .. ... . . . . ...... .. . ... ...... . . . ..... . .. . . .. ... ... . ..... .. .. . . .. . . . ...... . . ... ... ... . . .
lowQualScore : 444 3 33333 1111 0000 9 22222 5 5 00000000 4 44 0 22222 44 3333 22222 1111111 8 5 44 11 8 6 555 555 4444 66666 2222 000000 000 3 7 22222222222222 6 5 00000 000 00 9 5 0 5 77777 222222222222222222222222222222222222222222 88 6666 88 5 6 99999 333 3 555 222 0 99 7777777 2 111 666 99 2 2 2 2 77 1111 00 88888 4444444 66 222 000 1 1 0 4 22 55 66 33333333333333333333333333333333333 999 22 99 888 0 0 1 1 999999 88 0 888 999999 0 1 7 22222 3 44 0 0 44 888 888 1 99999 44 55 6 0 66 6 1 1 444444 0 2 222 666 333 0 3 6
consensus : CAACAATAGATGAAAATACAAACA---ATA-ATA-----CT----CT--A-CTTCCAGAGTGTATCT-TTA-----AAACTAATA-ATACCA------TTGC--AA-AC-----A--TG----AT-----CA-------TTACTG-A--ATCAGACATAATTGA---T---AT---TATC-G--GT----AC------T---TTAGA-C-C--C---------AAATAAAGC-T-GTC----GGNNAAGACNNAATAAGTCACA-GAAT-T-TTAA----A----G----TT--T----A---CN---AAACA----CA----CT--ATN---T--CNAAACCNCT-GT-CTA---TNTTA---TTT---AATAGNTCT-TTACNT----G-A---A--TGTANAT-T-T-C-C--A---GAN-TCA---TGGAAG--TCA-G--CTANT---G-TNATGCCNCT-TTTTA--AAAA--GGG----T-CAAA-CA--A---A---CG-T---GC-CGT---C--T--A---ATTATAGACCNATNT-CTTTATTA------AGCTGT-GTTGGTAA---ACTT------A-TGGAAAG-AGTCGTN----TACAAAC--ATATNTA-TA--A---TT---TTC-TNN---TTGA-NAAT--AANCTGA--TT-TA-CA-AAT----NNCAATCNGGNTTT---CT--TAA-G-GGNCATTCGAC-AGTTT
Reference ( family-531 ) : CAACAATAGATGAAAATACAAACA---ATA-ATA-----CT----CT--A-CTTCCAGAGTGTATCT-TTA-----AAACTAATA-ATACCA------TTGC--AA-AC-----A--TG----AT-----CA-------TTACTG-A--ATCAGACATAATTGA---T---AT---TATC-G--GT----AC------T---TTAGA-C-C--C---------AAATAAAGC-T-GTC----GGNNAAGACNNAATAAGTCACA-GAAT-T-TTAA----A----G----TT--T----A---CN---AAACA----CA----CT--ATN---T--CNAAACCNCT-GT-CTA---TNTTA---TTT---AATAGNTCT-TTACNT----G-A---A--TGTANAT-T-T-C-C--A---GAN-TCA---TGGAAG--TCA-G--CTANT---G-TNATGCCNCT-TTTTA--AAAA--GGG----T-CAAA-CA--A---A---CG-T---GC-CGT---C--T--A---ATTATAGACCNATNT-CTTTATTA------AGCTGT-GTTGGTAA---ACTT------A-TGGAAAG-AGTCGTN----TACAAAC--ATATNTA-TA--A---TT---TTC-TNN---TTGA-NAAT--AANCTGA--TT-TA-CA-AAT----NNCAATCNGGNTTT---CT--TAA-G-GGNCATTCGAC-AGTTT
gi|96841 : CAACAATAGATGAAAATATAAACA---ATA-ATA-----CT----CT--A-CTTCCAGAGTGTATCT-TTA-----AAACTTATA-ATACCA------TTGC--AA-AC-----A--TG----AT-----CA-------TTACTG-A--ATCAGACACAATTGA---T---AT---TATC-G--GT----AC------T---TTAGA-C-C--C---------AAATAAAGC-T-GTC----GGAGAAGACAAAATTAGTCACA-GAAT-T-TTAC----A----G----TT--T----A---CT---AAACA----CA----CT--ATA---T--CTAAACCCCT-GT-CTA---TGTTA---TTT---AATAAATCG-TTACTT----G-A---A--TGTAAAT-T-T-C-C--A---GAG-TCA---TGGAAG--TTA-G--CTACT---G-TAATGCCTCT-TTTTA--AGAA--GGG----T-CAAA-CA--A---A---CG-T---GC-CAT---C--T--A---ATTATCGGCCAATAT-CTTTATTA------AGCTGT-GTTGGTAA---ACTT------A-TGGAAAG-AGTTGTC----TACAAAC--ATATTTA-TA--A---TT---TTC-TGA---TTGA-AAAT--AAACTAA--TT-TA-CA-AAT----TGCAATCCGGATTT---CT--TAA-G-GGACATTCGAC-AGTTT
gi|96842 : CAACAATAGATGAAAATATAAACA---ATA-ATA-----CT----CT--A-CTTCCAGAGTGTATCT-TTA-----AAACTAATA-ATACCA------TTGC--AA-AC-----A--TG----AT-----CA-------TTACAT-A--ATCAGACATAATTGA---T---AT---TATC-G--GT----AC------T---TTAGA-C-C--C---------AAATAAAGC-T-GTC----GGAGAAGACAAAATTAGTCACA-GAAT-T-ATAC----A----G----TT--T----A---CT---AAACA----CA----CT--ATA---T--CTAAACCCCT-GT-CTA---TGTTA---TTT---AATAAATCC-TTACTT----G-A---A--TGTAAAT-T-T-C-C--A---GAG-TCA---TGGAAG--TCA-G--CTACT---G-TAATGCCTCT-TTTTA--AGAA--GGG----T-CAAA-CA--A---A---CG-T---GC-CAT---C--T--A---ATTATCAGCCAATAT-CTTTATTA------AGCTGT-GTTGGTAA---ACTT------A-TGGAAAG-AGTTGTC----CACAAAC--ATATTTA-TA--A---TT---TTC-TGA---TTGA-AAAT--AAACTAA--TT-TA-CA-AAT----TGCAATCCGGATTT---CT--TAA-G-GGACATTCGAC-AGTTT
gi|96843 : CAACAATGGATGAAAATATAAACA---ATA-ATA-----CT----CT--A-CTGCCAAAGTGTGTCT-TTA-----AAAC----------CA------TTGC--AA-AC-----A--TG----AT-----CA-------TTACTG-T--ATCAGACATAGTTGA---T---AT---GATC-G--GT----AC------T---TTAGA-C-C--C---------AAATAAAGC-T-GTC----GGAGAAGACAAAATTAGTCACA-GAAT-T-TTA----------G----TT--T----A---CA---AAACA----CA----TT--ATA---TATCTAAACCCCT-GT-CTA---TGTTA---TTT---AATAAATCC-TTACTTACTTG-A---A--TGTATAT-T-T-C-G--A---GAG-TCA---TGGAAG--TCA-G--CTACT---G-TAATGCCTCT-TTTTA--AGAA--GGG----T-CAAA-CA--A---A---CG-T---GC-CAT---C--T--A---ATTATCGGTCAATAT-CTTTATTA------AGCTAT-GTTTGTAA---ACTT------A-TGGAAAG-AGTTGTC----TACAAAC--ATATTTA-TA--A---TT---TTC-TGA---TTGA-AAAT--AAACTAA--TT-TA-CA-AAT----TGCAATCCGGATTT---CT--TAA-G-GGACATTTGAC-AGTTT
gi|96844 : CAACAATAGATGAAAATATAAACA---ATA-ATA-----CT----CT--A-CTTCCAGAGTGTATCT-TTA-----AAACTAATA-ATACCA------TTGC--AA-AC-----A--TG----AT-----CA-------TTACTG-A--ATCAGACATAATTGA---T---AT---TATC-A--GT----AC------T---TTAGA-C-C--C---------AAATAAAGC-T-GTC----GGAGAAGACAAAATTAGTCACA-GAAT-T-TTAC----A----G----TT--T----A---CA---AAACA----CA----CT--ATA---T--CTAAACCCCT-GT-CTA---TGTTA---TTT---AATAAATCC-TTACTT----G-A---A--TGTAAAT-A-T-C-C--A---GAG-TCA---TGGAAG--TCA-G--CTACT---G-TAATGCCTCT-TTTTA--AGAA--GGG----T-CAAA-CA--A---A---CG-T---GT-CAT---C--T--A---ATTATCGGCCAATAT-CTTTATTA------AGGTGT-GTTGGTAA---ACTT------A-TGGAAAG-AGTTGTT----TACAAAC--ATTTTTA-CA--A---TT---TTC-TGA---TTGA-AAAT--AAACCAA--TT-TA-CA-AAT----TGCAATCCGGATTT---CT--TCA-G-GGACATTCGAC-
gi|96845 : CAACAATAGGTGAAAATACAAACA---ATA-CTA-----CT----CT--A-CTTCCAGGGTGTATCT-TTA-----AAACTAATA-ATACCA------TTGC--AA-AC-----A--TG----AT-----CA-------TTACTG-A--ATCAGCCATAGTTGA---T---AT---AATC-G--GT----AC------T---TTAGA-C-C--C---------AAATAAAAC-T-GTC----ACAGAAGACAAAATTAGTCACA-GAAA-T-TAAC----A----G----TT--T----A---CA---AAACA----CA----CT--ATA---T--CTAAATC-CT-GT-CTA---TGTTA---ATT---AACAAATCC-TTACTT----G-A---A--TGTAAAT-T-T-C-A--A---GAG-TCA---TGGAAG--TCA-G--CTTCT---G-TAATGCCTCT-TTTTA--AAAA--GGG----T-CAAA-CA--A---A---CG-T---GC-CAT---C--T--A---ATAATCGGCCAATAT-CTTTATTA------AGCTGT-GTTGGTAA---CCTA------A-TGGAAAG-AGTTGTC----TACAAAC--ATATTTA-TA--A---TT---TTC-TGA---TTGA-AAAT--AAACTAA--TT-TA-CA-AAT----TGCAATCCGGATTT---TT--TAA-G-GGACA
gi|96846 : CAACAATAGGTGAAAATACAAACA---ATA-CTA-----CT----CT--A-CTTCCAGGGTGTATCT-TTA-----AAACTAATA-ATACCA------TTGC--AA-AC-----A--TG----AT-----CA-------TTACTG-A--ATCAGCCATAGTTGA---T---AT---AATC-G--GT----AC------T---TTAGA-C-C--C---------AAATAAAAC-T-GTC----ACAGAAGACAAAATTAGTCACA-GAAA-T-TAAC----A----G----TT--T----A---CA---AAACA----CA----CT--ATA---T--CTAAATC-CT-GT-CTA---TGTTA---ATT---AACAAATCC-TTACTT----G-A---A--TGTAAAT-T-T-C-A--A---GAG-TCA---TGGAAG--TCA-G--CTTCT---G-TAATGCCTCT-TTTTA--AAAA--GGG----T-CAAA-CA--A---A---CG-T---GC-CAT---C--T--A---ATAATCGGCCAATAT-CTTTATTA------AGCTGT-GTTGGTAA---CCTA------A-TGGAAAG-AGTTGTC----TACAAAC--ATATTTA-TA--A---TT---TTC-TGA---TTGA-AAAT--AAACTAA--TT-TA-CA-AAT----TGCAATCCGGATTT---TT--TAA-G-GGACA
gi|96847 : CAACAATAAATGACAGTATTAACA---ATA-ATA-----TG----TT--A-CTTCCAGGCTGTGTCT-TTA-----AAACGAATA-ATACCA-------------A-AC-----T--TG----AT-----CG-------TTACTG-A--ATCAGACATAATTGT---T---TT---GATC-G--GT----AC------T---TTAGA-C-C--C---------AAATAAAGC-T-GTC----GGAAAAGACACAAT---TCCCA-GAAT-T-TTTC----A----G----TA--T----A---CA---AACCA----CA----CT--A-----------AACCACA-GT-CTA---TGTTA----------ATAATTCC-TTACTT----T-A---A--TGTAAAT-T-T-C-C--A---G---TCA---TGGAAG--TCA-A--CTACT---G-TTATGTCTCA-TCTTA--AGAA--AGG----T-CAAA-CA--G---A---CG-T---GC-CAT---C--T--T---ATCATTGGTCAATAT-CTTTATTA------AGCTGT-GTTGGTAA---ACTT------A-TGGAAAG-AGTTGTC----TACAAAC--ATATTTA-TA--A---CT---TTC-TGA---TTGA-AAAT--AAACTAATTTT-TA-TA-AAT----TTTTATCAGGACTT---TC--TAA-T-GGACATTCGAC-AGTTT
gi|96848 : ACAATAGATGATACT-CAAACA---A---AT------------------CTTCCTGAATTCGTTT-TTC-----AAACAAATA-GTAC-G------TTAA--AAGAT-----A--TT----AA-----CA-------TCACAG-A--AAAAGAAATAACTGA---T---GT---TCTA-G---------------------CAAA-C-C--TCGCTGT---AAATAAAGC-T-AGT----GGTCTTGACGACATAGGTCACA-AAATGC-TCAA----A----GAAACTT--TGTAAA---CTTGTAAACT----TGT---CT--ATT---T--GTAAACCTTA-AT-GTA---TTATA---CTT---AACAGATCT-ATGAGA----G-A---AAATGTATAT-----C-C--A---ACA-TCT---TTGAAA--TTA-G--CTAAC---G-TTATGCCTTTATTTTA--AAAA--GG-----T---GA-TA--A---ATCTC--T---AC-CGT---C--T--A---ATTATAGACACATTT-CATTGATA------AGCTGT-GTTGGTAA---AGTA------G-TGGAAAG-AATTGTT----TTTGAAC--ATATTTA-CA--A---TC---ATCTTCA---TTCA--AAT--AA
gi|96849 : AAAATACAAAGATAGATAGATAAAAGTTT----TT--ATCTTATA-AGTGTATAT-ATATATATAAACAAATAGATAACAACAAAATTGT--AA-GCTCTTCA--TG----AG-----CT-------TT--TG-A--ACC-GATATAAGTGA---C---ATACATGTC-----T----AC------T---TTA---C-C--C---------AATTTTAGA-C-GT-------ATACAAC--AGTGACTTAAA-GGGT-T-T-GA----A----G----TA--T----A---TA---AAATA----TA----GT--ATT---T--CTAAACCTCTAGTACT-----GTTA---TTT---AATAGATCA-TGAATT----A-A---A--TGTGAAT-T-T-C-C--A---GAT-TTA---TGGAAA--TCA-GTCCTA-----G-TAATTCCACT-TTTCA--AGAA--AGG----T-AAAA-CA--A---A---CT-A---AG-CGT---C--T--A---ATTATCGACCAATTT-CACTCTTA------AGCTGT-ATTGGCAA---GTTA------A-TGGAAAG-AATTGTG----TACAAACATATATATA-TA--A---TT---TTC-TTG---TTGA-TAAT--AACCTCA--TT-TA-TA-AAT----TACAATCTGGATTT---CC--CAG-A-GGACATTCCAC-GGTTTtattatattta
gi|96850 : TACAATTG---ATG-ATA-----CTGACTCTGAA-CTTCCAAATTTTGTTT-TGA-----AAAC-AGT---TACCA---------C--AATTC-----A--TG----ATATCAATA-------TCACAG-A--ACAAGAAATTTCTGA---T---GT---TCTT-T--CC----AA------T---TTAGT-TGT--C---------AAA-AAAAC-T-TGC----GGCCCAGACGAAATAAGCCATC-ACAT-G-TTAA----A-------------------------------A----CA----CT--ATG---C--TG--ACCGCT-TT-GCA---TCATT---TTT---AATAGGTCT-CAATAA----G-A---A--AGCATAT-A-C-C-C--A---AAT-TGT---TCAAAA--TAA-G--CAAAT---G-TAATGCCATT-ATTCA--AAAA--GGG----TGCTAA--A--G---A---TA-T---TC-CAT---C--A--A---ACTAAAGACCTATTT-CATTAATGACATGTAGTTGT-ATTGGTAA---GGTC------A-TGGAAAG-AGTAATA----TTCAAGC--ATTTATG-CA--A---TTA--TTC-ACA---TTTA--AAT--AACCTGA--TT-TA-TA-AAA----ATCAGTCAGGGTTT---CT--TCC-T-GGTCATTCAAC-AATTT
gi|96851 : A---ACA-ATA-----CT----TT--A-CTACCAACTTGT-TCTCTTA-----AAACAAACC-ATACAC------TAAC--AA-AT-----A--TC----AA-----AA-------TAACTG-A--A---AATGAAATTAAGAAT---AT---TATA-G--AT----ACATTTTAT---TTAAAAT-C--C---------TAACAAATC-A-GTT----GGAGAAGATAAAATCAGTTATA-AACT-T-TTAA----A----A----TT--A----A---CA---AAAAA----AT----GT--ATT---T--CTAAACCATT-GG-TTA---TGCTT---TAT---AATAAATCA-CAAGAA----G-A---A--TGTAAAT-T-T-T-C--A---TAA-TTA---TGGAAA---CA-----TGGTTTAA-TAATGCCACT-ATTTA--AAAA--AGG-------AAA-TA--CTT-A---TA-T---CT-TGT---C--T--A---ATTATAGGCCAATAA-CACTTTTG------AGTTGT-GTTGGTAA---ATTA------A-TGGAAAT-AGTTGTT----TACAAAC--ATATCTA-TATTT---TT---TTT-TTG---TTGC-AAAT--AACTTGA--TA-TA-CA-AGT----TACAGTCAGGATTT---TT--AAA-A-GTTCATTCAAC-TGTTT
gi|96852 : A-ATG-----CT----CT----CTGCCTAATTTTACTC-GTA-----AAACTGAAA-ATTCAC------TTTC--AA-GT-----A--TA----AG-----TA-------TATCAG-A--AAAAGAAATAATTGA---T---GT---TATC-ACCAT----AC-----------TGAA-C-G--T---------AAACAAAGCTT-GT-----GGCCATGATTTGATAAGTCATA-AAAT-G-TTAAAAGGA----G----TT------------------GCA----CA----CTCAATA---T--TGAAACCACT-GG-CTT---TTCTT---TTT---AATCGTTCT-TTTAGT----G-A---A--TGAACATAT-C-C-C--A---AAG-T-A---TGGAAA--ATT-G--CCAAT---G-TCACACCGTT-ATATA--AAAA--AGG----T---GA-CA--AGTCA---TA-T---GT-T-T---C--A--A---ATTACAGACTTGTGT-CTTTGTTA------AGTTGT-TGTGGCAA---GCTT------T-TTGAGAG-AATCATG----TTTAAAA--ATATGTA-TA--A---TT---TCC-TGT---ATGA-TAAT--AATTTAA--TG-TA-TA-AAT----ATCAATCAGGCTTTTTACC--TAA-----ATATTCAAC-
gi|96854 : TGCATCT-T--------AACTA-CA-ATAC-A------TTCCTCAA-AC-----AGATGCTACAT-----CAGAAAATATTACTATA--ACTAAGCATGA--AA---T---AA---AAT-----AT----AT------T---TTGAA-A-A--T---------AAATAAAGC-TTGT-----GGAAGTGATAGTATAAGCCACA-AGAC-A-ATAA----A----A------------------G---AAACAGCTACAG---TT--ATA---T--CAAAGCCTTT-AT-TTA---T--TAC--TTT---AATGGATCC-CTAAGT----G-A---A--TGTTGCT-T-T-C-C--A---GAA-AGT---TGGAAAATTTT-G--CAAAT---G-TCAT-CCATT-ATTTA--AAAA--GGGA---T-C-TG-CA--A---A---TG-T---TA-TAA---C--T--A---ATTATTGGCCTATTT-CTTTATTG------AGTTGG-GTTGGAGG---AGTT------T-TTGAAAG-AGTTGTA----TGTAAAC--ACATTTA-TA--A---TA---ATC-TTA---ATAG-TAAT--GAACTCA--TT-TT-CA-AGA----ACCAGTCTGGTTTT---CT--
gi|96855 : T-TGA-----AAACTCATA-ATGTTC------TTGA--TA-AC-----G--TC----AT-----GG-------TAACAG-A--AACAGAAGTAGAAGA---TGTAAT---TCTC-----T-----C------A---TTGAA-T-C--C---------AAATAA------GTCAAGTGGGCCGGATGATATATGTCATA-AAAT-G-TTAA----AAGGAG----TT-------G---CC---AAAT-----CA----GT--AT-------CTAAACCATT-AA-CAT---TATTA---TTG---AATCGCTCT-CTATCA----G-A---A--AGTATTT-T-T-C-C--A---GAT-AGC---TGGAAA--ACA-T--CAAAT---G-TTATTCCTAT-ATTTA--AAAA--AGG-------AGA-TA--A---ATT-CA-T---G---GT---AAGT--A---ATTATAGACCAATGT-CATTATTA------AGCTGC-ACCGG-AA---AATT------ATTAGAAAG-ATTAGTG----TTCAAAT--ATTTGTA-TA--A---TT---TTT-TAA---TTAG-CAAT--AATTT-A--TTATA-TA-AAT----ATCAATCGGGTTTTTTACC--TAA-----CCACTCGACAAGTTT
gi|96856 : A-----AAACTAATG-ATACTC------TTTC--TA-AT-----A--TT----AT-----TA-------TTACAA-A--GTCTGAAATAAAAGA---T---AC---GATT-G--AA----AT------T---CTTGA-C-T--C---------AAACAAATC-T-GTT----GAGAATGATAAAATAAGTCACACG--T-T-TTGA----A----G----TA--T----A---CA---AAATA----TA----GT--ATT---T--CTAAACCTCTAGTACT-----GTTA---TTT---AATAGATCA-TTAATT----A-T---A--AGTGAAT-T-T-C-C--A---GAT-TTA---TGA----------------------TAATGCCACT-TTTCA--AAAA--AGG----T-AAAA-CA--A---A---CC-C---GG-CGT---C--T--T---ATTATCGACCAATTT-CACTCTTA------AGCTGT-ATTGGCAA---GTTA------A-TCGAAAG-AATTGTG----TACAAAC--ATATATA-TA--A---TT---TTC-TTC---TTGG-TAAT--AACCTCA-----TA-TA-AGT----TACAATCTGGACTT---CT--CAA-A-GGACATTCCAC-GGTTT
gi|96857 : A-----AAACTTATA-ATTCCC------TTTC--AC-AT-----T--TT----AT-----AA-------TAACTG-AGGAT--GATATATCTGA---A---CT---TATT-A--GT----AC------T---T--AA-C-CAGT---------AAATAAGGCCT-GT-----GGTCATGATATGATCAGTCACA-GAAT-G-CTGG----A----A----TA--T----GTGTCG---AAA-------G----CT--ATT---T--CAAAACTATT-TT-AAA---TTTTA---TTT---AACCGTTCT-TTAAGT----G-A---A--GGTATAT-A-T-C-C--C---GAT-TTG---TGGAAG--ATT-G--CAAAT---G-TAACTCCCAA-TTCTA--AAAA--GGG-------AGA-CA--A---GT--CATT---GG-TGT---C--A--A---ATTACAGACCTGTGT-CTTTACTT------AGTTGT-GTCGGAAA---ACTT------G-TTGAAAG-GCTTGTT----TTTAAGA--ATATGTA-TA--A---CT---TT--TTC---TTGA-TAAT--AATTTGA--TT-TA-TA-AAT----ACCAGTCAGGCTTT---TT--
gi|96858 : TGA---T---AT----ATCTG--AC----AT------T---TTAAA-C-A--CTGTTAATATAAATAAAGCAT-GT-----GGCCATGACTCTGTAAGCCATA-AGAT-TCTTAA----AGG--G----GT--A----A---CA---AAAC-----------CC--ATA---T--CTAAACCTTT-AG-CCG---TACTT---TTT---ACCCGCTCT-CTGAAT----G-A---A--GGGATTT-A-T-C-C--T---GAC-GTT---TGGAAG--ATA-G--CAAAT---G-TTACACCAAT-ATATA--AAAA--AGG----T---GA-CA--A---G---TC-TATAGC-T-T---C--A--A---ACTATAGACCAGTTT-CTTTACTT------AGCTGT-TGTGGTAAGATATTT----------GAAAG-AATCATT----TTTAAAC--ACATGTA-CA--A---CT---TTC-TTC---TTAC-AAAT--AAATT-A--TTGTA-TA-AAT----ATCAATCAGGATTT---CT--
gi|96859 : TGA---T---AT---CATC-----TCCTCAC------T---TTATA-C--------------AAATAAAGC-C-AGT----GGTCCAAACCAAATTAGTCATG-AAAT-G-ATAA----A----G----G-------------G---ATGCG----CAGATTCT--ATC---A--CAAAACCGTT-AG-TTA---TCATT---TTT---AACCGTTCT-ATACAA----G-A---A--AGTATTT-T-T-C-C--A---AAC-TCA---TGGAAG--ATA-G--CTCAA---G-TCACTCCCAT-CTTCA--AAAA--GGG-------AGA-TA--A---AA--CG-T---AAACTT---C--T--A---ATTATAGACCCGTTT-CACTTTTA------AGCTGT-TGTGGAAA---GATT------C-TTGAAAG-AATAGTT----TTTAAAA--ATATGTA-TA--A---CT---TTT-TTT---TTAC-AAAT--CAACTGT--TG-TA-TA-AAT----ATCAGTCTGGTTTT---TT--
gi|96860 : TGA---T---AT---TATC-----T----CC------TCACTTA-A-T-A--C---------AAATAAAGC-C-AGT----GGTCTAGACCAAATAAGTCATA-AAAT-G-ATAA----GAG--G----TT--T----G---C------AGA----TT----CT--ATC---A--CAAAACCATT-AG-TTA---TCATT---TTT---ATCCGTTCT-GTACAA----G-A---A--AGTTT-T-T-T-C-C--A---AAACTCA---TGGAAG--ATA-G--CTCAA---A-TTACTCCCAT-CTTCA--AAAA--GGG-------AGA-TA--A---AA--CG-TT--AA-CTT---C--T--A---ATTATAGACCCGTTT-CACTTTTA------AGCTGT-TGTGGAAA---GATT------C-TTGAAAG-AATAGTT----TTTAAAA--ATATGTA-TA--A---CT---TT--TTC---TTGA-CAATTCAA--TTA--TTGTA-TA-AAT----TTCAGTCTGTTTTT---a
gi|96861 : GA---C---AT---GATT-T--GT----TT------T---TTAGG-T-G--T---------GAATAAAGC-T-GTA----GCGCCAGACTGAGTAAATCAGA-GAAT-T-TTAA----A----A----CT--A----A---CC---AAGGG----TA----CA--ATT---T--CAGAACCGTT-AT-GTA---TTTGA---TTT---AATAAGAC---TATTT----GCA---A--GGAATAT-T-TAC-C--A-------TTAAACTAGAAA---CATG--CACTT---G-TTATGCCCCT-TTATA--AAAA--AGG----C----------A---A---CT-T---GT-CATGTGT--T--AGATATTACAGATCTTTAT-CTCTGTTA------AGTTGT-ATTGGTAA---ACTT------A-TGGAAAt
gi|96862 : ------T---TTAGG-T-G--T---------GAATAAAGC-T-GTA----GGGCCAGACCTAGTAAGTTACA-TAAT-T-TTAT----A----A----CT--A----A---CC---AACGG----TA----TA--ATT---T--CAAAACCTTT-AT-GTA---TTTTA---TTT---AATAAGTAT-TT-TTTAG--G-A---A--TCT---T-T-T-C-C--ATGTAAC-T-----TGAAA----CATG--CATTT---G-TTATGCCCCT-TTATA--AGAA--AGG------CGAT-CC--A---T---CG-T---GT--GT---TAGT--A---ATTACAGACCTATTT-GCCTGTTA------AGTTAT-ATTGGTAA---ACAT------A-TGGAACGTTGT-GTG----TATAAGT--ATATATA-CA--C---TT---TCC-
gi|96863 : ------T---TTAGG-T-G--T---------GAATAAAGC-T-GTA----GGGCCAGACCTGTTAAGTTACA-TAAT-T-TTAT----A----A----CT--A----A---CC---AA-------CG----GT--ATAAATT--CAAACCCTTT-AT-GTA---TTTTA---TTT---AATAAGTAT-TT--TT----G-A---G---GAATCT-TAT-C-C--ATGTAAC-T-----TGAAA----CATG--CATTT---G-TTATGCCCCT-TTATA--AGAA--AGG------CGAT-TC--A---T---CG-T---GT--GT---TAGT--A---ATTACAGACCTATTT-CCCTGTTA------AGTTAT-ATTGGTAA---ACAT------A-TGGAACGTTGT-GTG----TATAAGT--ATATATA-CA--C---TT---TCC-
gi|96864 : ------T---TTAGG-T-C--T---------GAATAAAGC-T-GTA----GGGCCAGACCTAGTAAGTCACA-GAAT-T-T---------------------------------------------------------------CAAAACCTTT-AT-GTA---TTTTA---TTT---TAAAAGTCT-ATTCGT----G-AGGAA--TCT---T-T-T-C-C--A-----T-GCAAC-TGGAAA---CATG--CACTT---G-TTGTGCCCCT-TTATA--AGAA--AGG------CGAT-TC--A---T---CG-T---GT--GT---TAGT--A---ATTACAGACCTATTT-CCCTGTTA------AGTTGT-ATTGGTAT---ACTT------A-TGGAACGTTGT-GTG----TACAAGT--ATATATA-TA--A---ATACCTTA-TCT---CTGA-GAAT-----------CT-TA-TA-TATTCTAGACAATCAGGTTTT----T--TAATT-GGTCATTCCAC-TGT
gi|96865 : --C---------AAATAAAGC-T-GTT----GGGGAAGACTTAATAAGTCATA-CAAT-T-TTAA----A----A----AA--T----A---CT---CGTAA----TA----CT--TTT---T--CAAAACCACT-TTGCAA---TCGT----TTT---AACAAATTT-CTAAAT----G-A---A--TGTGTAT-T-T-C-C--A---AGT-TCT---TGGAAG--TCG-G--CTATA---A-TTATGCCGCT-GTTTA--AAAA--GGGGGATT-C----CG--A---T---TG-T-------GT---T--TAAA---ACTACAGACCTATAT-CTTTACTT------AGCAGT-ATTGGCAA---ACTT------A-TGGAAAG-GACCATG----TACAAAC--ACATATA-TA--A---CC---ATC-TCC---TTGA-TAAC--AATTTGA--TA-TA-TA-ATA----ATCAGTCCGGTTTT---CT--AAG-A-AGCTATTC
gi|96866 : --C---------AAACAAAGC-T-GTT----GGGGAAGACTTAATAAATCATA-CAGT-T-TTAA----A----A----AA--T----A---CT---CGTAA----TA----CT--ATA---T--CAAAACCATT-TTGCAA---TCTT----TTT---AACAAATCT-CTATAT----T-A---A--TGTGTAT-T-T-C-C--A---AGT-TCT---TGGAAG--TCC-G--CTGTA---G-TTATGCCACT-GTTTA--AAAAT-GGGGAT-T-C----------------CG-----GT-TGT-------------GTTTCAAACTAATAT-CTTTACTA------AGCTGT-ATTGGCAC---ACTT------A-TGGAAAG-GACAATG----TACAAAC--ACATATA-TA--A---CC---ATC-TCT---TTGA-TAGC--CATTTGA--TA-TA-TA-ATA----AACAGTCCGGTTTT---CT--AAG-A-GGCCATTTCAC-AGTTT
gi|96868 : AATAAGGC-T-GTA----GGGTAAGACCTAGTAAGTCGCA-GAAT-T-TTAA----A----A----CT--A----A---CC---ATGGG----TA----CA--ATT---T--CAAAACCTTT-AT-GTA---TTTTA---TTT---AATAAGTCT-TTTCGC----G-A---G-----GAAT-C-T-T---------AT-TCA---TG-------CA----CT--T---G-TTAT-CCCCT-TTATA--AGAA--AGG------CGAT-TC--A---T---CG-T---G--TGT---TAGT--A---ATTACAGACCTATTT-CCCTGTTA------AGTTGT-ATTGGTAA---ACTT------A-TGGAACGTTGT-GTG----TATAAGT--ATATATA-TA--A---TT---
gi|96869 : ATAAGTAACA-AAATGC-TTAA----A----G----GTGCT----G---TA---AGA-A----CA--------ATT---T--CTGAACCTCT-----TACACTTTTA---TAT---AATCGTTCTATTACC-----G-A---A--AGT-CAT-T-T-C-C--CT--AAC-TCA---TGGAAA--AAA-G--CTCAT---G-TAACTCCTAT-TTTTAGGAAAG--GGG----A-TAAGTCA--A----------T---CC-CAT---C--T--A---ATTATAGACCAATGT-CGTTGCTC------AGCTGT-GTCGG
gi|96870 : aaatt----TT--T----A---AA---AAGCA--------------ATT---G--CAAAACCACT-TT-CAA---TTTTA---TTT---AACCGTTCT-TTAAGT----G-A---A--GGTATAT-A-T-C-C--C---GAT-TTG---TGGAAG--ATT-G--CAAAT---G-TAACTCCTAT-TTTTA--AAAA--GGG-------AGA-CA--A---GT--CATT---GG-TGT---C--A--A---ATTACAGACCTGTGT-CTTTACTT------AGTTGT-GTTGGAAA---ACTT------T-TTGAAAG-GCTTGTT----TTTAAGA--ATATGTA-TA--A---CT---TTT-TTC---TTGA-TAAT--AATTTGA--TT-TA-TA-AAT----ACCAATCAGGCTTT---TT--
gi|96871 : T--ATT---T--CCAAATATCT-AG-TTC---TATTA---TTT---AATAGTACA-TGACAT----G-A---A--TGGAAAC-G-C-A-C--A---TAT-TTA---TGGAAA--CAA-G--CT-TT---GATAATGCCACT-CTTCA--AAAC--AGG----T-AAAA-CA--A---A---AC-T---GG-CGT---C--T--A---TTTATCGATCGATAT-CTCTCTTA------ATCTGT-GTTGGCAA---GTAA------A-TGAAACA-AATTGTT----TACAAAC--GTATATT-TA--T---TT---TTC-TTG---TAAA-CAAA--AACCTCA--TT-TA-TA-AAT----CACATTCAGGATTT---CT--ACA-T-GGACACTCTAC-GGTCT
gi|96872 : ctaT--ATT---T--CAAAACCTCT-A----A---TGTTACTTTTT---AATCGTTCT-ATAAAC----G-A---A--AGTAAAT-T-C-C-C--T---GAA-TCC---AGGAAA--ATA-G--CACAT---G-TAACCCCCCT-TTTAA--GCAA--GGG--------GA-CA--A---GT--CG-TT--GC-CCT---C--T--A---ATTATAGACCAGTAT-CACTGTTG------AGTTGT-TTGGGAAA---AGTT------T-TAGAAAG-AATAATT----TTCAAGC--GTATGTA-TA--A---CT---TTC-TAC----TAA-ACAT--AATATGC--TG-TT-CA-AAT----GTCAGTCTGG-TTT---CT--T
gi|96873 : A---TGTTA---CTTTTCAATCGTTCT-ATAACC----A-A---A--AGTAAAT-T-C-C-C--T---GAC-TCA---TTGAAA--ATA-G--CACAT---G-T-AT-----T-TTTTA--AAAA--AGG--------AA-CA--A---GT--CG-TTTGGC-C-T---C--T--T---ATTATA--CCAGTAT-CCATGTTC------ATCTGT-TTGGGGAAG--ATTT------T-TAGAAAG-AATAATT----TTCAAGC--GTATGTA-TA--A---CT---TTC-TAC---TAAA-TAAT--AATCTGC--TG-TA-CA-AAT----AATAATC
gi|96874 : cctgtaAAG--TCG-G--CTATA---G-TTATGCCGCT-GTTTA--AAAA--GGGGGATT-C----CG--A---T---TG-T---GC-T-T---C--A--A---ACTACAGACCAGTAT-CTTTACTT------AGCTGT-ATTGGCAA---ACTT------A-TGGAAAG-GACCATG----TACAAAC--ACCCATG-TA--A---CC---ATT-GCT---TTGA-TAAC--AATTTGA--TA-TA-TA-GTA----AACAATCCGGTTTT---CT--AAG-A-GGCCTTTCCAC-AGTTT
gi|96875 : ttaataagtcattcaattttaaaaaaatactcgtTT---AATAGTTCT-ATACAA----G-A---A--AGTAT-T-T-T-C-CCAA---AAC-TCA---TGGAAGA-TC--G--CTCAA---G-TTACTCCAAT-CTTCA--AAAA--GGGAGA-T-AAAA-CATTA---A---C--T--------T---C--T--A---ATTATAGACCCGTTCACTT--CTA------AGCTGT-TGTGGAAA---GATT------C-TTGAAAA-ATTAGTT----TCTAGAA--ATATATA-TA--A----------C-TTC---TTGACAAAT--CAACT-A--TTGTA-CA-AAT----ATCAGTCTGG
gi|96876 : -A---A--TATCAAT-A-T-CAC--A---GAA--CA---AGAAAT--TT-----CTGAT---G-TAATGCCATT-ATTTA--AAAA--AGA----TGCTAA--A--G---A---TA-T---TC-CAT---C--A--A---ACTATAGACCTATTT-CATTAATT------AGATGT-ATTGGTAA---GGTC------A-TGGAAAG-AGTAATA----TTCAAGC--ATTTATA-CA--A---TTA--TTT-ACA---TTTA--AAT--AACCTGA--TT-TA-TA-AAA----ATCAGTCGGGGTTT---CT--CCC-A-GGTCATTCAAC-AATTT
gi|96877 : --T--A---ACTATAGACCTATAT-CACTGTTA------AGC-GTAATTGGCAA---AGTG------T-TTGAAAG-ACTTATT----TTTAAAC--ACATGTA-TA--A---TT---TCT-TTC---GTGA-TACT--AATTTTA--TT-T--CGTCAT----TTCAATCTGGTTTT---GT--TCC-T-GGTGATTCAAC-AATT
gi|96878 : caaaagtctggaaagaagcatttgtatgcgctgtttataaaaaaggagacccttctttggttaa-TTA---TGGAAG--TCA-G--CTACT---G-TAATGCCTCT-TTTTA--AGAA--AGG----T-CAAA-CA--A---A---CG-T---GC-CAT---C--T--A---ATTAAAGGCCAATAT-CTTTATTA------AGCTGT-GTTGGTAA---ACTT------A-TGGAAAG-GGTTGTC----TACAAAC--ATATTTA-TA--A---TT---TTC-TGA---TTGA-AAAT--AAACTAA--TT-TA-CA-AAT----TGCAATCCGGATTT---CT--TAA-G-GGCCATTCGACAAGTT
gi|96879 : gATCCCACT-GTTTA--AAAA--GGGGGATT-C----CG--A---T---TG-T---G----T---T--TGAA---ACTTCACACCAATAT-CTTTACGT------AGCTAT-ATTGACAA---ACTT------A-TGGAAAG-GACCATACATGTACAAAC--ACATATA-TA--A---CC---ATC-TCT---TTGA-TAAC--AATTTGA--TG-TA-TA-GTA----AACAGTCCGGTCTT---C----AA-GAGGTCATTCCAC-AGTTT
gi|96880 : aT-TTTTA--AAAAAAGAG----T-CAAA-CA--T---A---T-------C-CGT---C--A--A---GCTAAATACCAATTT-CTTTAATT------AGTTGT-ATTGTTAA---GGTA------A-TGAAGCG-TATCGTT----TTCAAA---ATATATAACA--A---AT---ATC-TATAGTTTGA----T--GACTTAA--TT-TATCA-AA-----ATCAATCAGGATGT---TTACCAA-G---ACATTCGAC-TGTTT
gi|96881 : TTG------AGTTTT-GTTAGTAA---ATTA------A-TGGAAAG-AGTTGTT----TACAAAC--ATATTTA-TA--AT--TT---TTT-TTT---TTGC-TAAT--AA--TTA--TA-TA-CA-AGT----TACTGTCAGGATTT---TT--AAA-A-GGTCATTC
gi|96882 : A------AG-TAT-GTTGGTAA---ACTT------A-TGGAAAG-AGTTGTC----TACAAAC--ATATTTA-TA--A---TT---TTC-TGA---TTGA-AAAT--AAACTAA--TT-TA-CA-AAT----AGCAATCCGGATTT---CT--TAA-G-GGACATTCGAC-AGTTT
gi|96883 : AA---ACTTGAATGGA-TGGAAAG-AGTCGTT----TACAAAC--ACATGTA-TA--ACTTTT---TTT-TTG---TTGC-TAAT--AACTTGA--TA-TA-CA-AGC----TACAATCAGGTGTT---TT--AAA-A-GGTCACTCAAC-TGTT
blockSeqs : TAG G AAAGT GACT GAA C TATAT T G CAACAAAA G TC G TCTTC GA CTAC ATCAA GAAAATA T GG TC T GAA GTA ACAT ACCA CCTC ATTTTA CAC A ACTGTTAATAT T T CAAGT AGA AA T C G C AAAGG GAAACTTTGTAAACTTGTAAACTTGT CA AAAT AT T C AGTAC CAC G CTT TTC A AT CTTACTT C GGA AAT AA A A A A CA TGTA AC TAAAC AATTTT TC TAC TTA A A G T AT GG AA TCAAACAAACGTGCCA GTG AG AA GAT A A A T ACATGT AA T GAT GAATGG T T T ACATG A AT T A TT CTT ACC T ATAGT CA TC A A TT A T T TCTAGA C A TTA ACC TT A G A
blockSeqs : . . . . AT . . T . CA G . T . . . . . . . TC T . . T TGA . . . . CTCGCTGT C . C AGA AA T . G . C AGGAGTTGCCAAATCA . A . T C AGTAC . G C . A T TTTAG . . T AT . . . . . TGTA G CAAC GTCA . TAC . . A G T T . T TCAAACAAACGTGCCA . AG GA . A A . T . G T G . . T T C A . T . . T A . GA A . A A . G . . TG C A TTA T GA A G A
blockSeqs : . . . . A . . T . CA G . . . . . . . . . TC T . . G GG . . . . CAGT A . C AGA AA T . . . C GGTGCTGTAAGAACA . A . T C TTGC . G . . A T CTT . . T AA . . . . . TA G CA GTCA . TAC . . A G T T . . TCAAACAAACGTGTCA . AG . . A A . T . G T . . . T T C A . T . . . A . GA A . A A . G . . TG C A . T G A G .
blockSeqs : . . . . A . . T . CA G . . . . . . . . . TC T . . T GG . . . . GTC . . C AGA AA T . . . C GTTTACTAAACACA . A . T A TTGC . G . . A T CTT . . T AA . . . . . G G CA GTCA . TTC . . A G T T . . TCAAACAAACGTGCCA . AG . . A A . T . G T . . . T T T A . T . . . . . GA A . A A . G . . TG C A . T G A G .
blockSeqs : . . . . A . . G . CA G . . . . . . . . . TC T . . A AG . . . . CC . . C AGA AA T . . . C GTTTACAAAACACA . A . T T GTC . G . . A T CTT . . T AA . . . . . G G CA GTCA . TTC . . A G T T . . TCAAACAAACGTGCCA . AG . . A A . T . G T . . . . T C A . T . . . . . GA A . A A . . . . TG C A . T G A C .
blockSeqs : . . . . A . . A . CA A . . . . . . . . . TC T . . A GG . . . . CC . . C AAA AC A . . . C GTTTACAAAACACA . A . T T GTC . G . . T T CTT . . T AA . . . . . G G CA GTCA . TAC . . T G T T . . TCAAACAGACGTGCCA . . . . A A . T . G T . . . . T C A . T . . . . . GA A . A A . . . . TG A A . T G A A .
blockSeqs : . . . . A . . A . CA G . . . . . . . . . AA C . . G GG . . . . CC . . C TCT GA G . . . A GTTTACAAAACACA . T . T G GTC . T . . A T CTT . . T AT . . . . . G A CA GTCA . TAA . . T G T T . . TGATAAATCTCTACCG . . . . C T . A . G T . . . . T C T . T . . . . . GA A . C C . . . . TT T A . T G A A .
blockSeqs : . . . . A . . A . CA A . . . . . . . . . CC G . . T GG . . . . CC . . T ATA GA A . . . A GTTTACAAAACACA . T . G A GTC . G . . A A AGA . . T GA . . . . . G T CA ATTA . AAA . . A T A T . . TAAAACAAACTAAGCG . . . . A T . A . G C . . . . T T A . A . . . . . CA T . C G . . . . TA A G . C T T A .
blockSeqs : . . . . A . . T . AC T . . . . . . . . . CA C . . T TC . . . . CC . . C CCC AA C . . . A GTATACAAACCACA . G . T A GTC . C . . G T ATT . . A AT . . . . . G T CT ATCA . TGG . . A G A A . . TGCTAAAGATATTCCA . . . . T T . A . A T . . . . A G T . A . . . . . TG A . C G . . . . AT A A . T A T G .
blockSeqs : . . . . . . . T . AC C . . . . . . . . . AA T . . T GA . . . . CC . . T AGA TT A . . . A GTATATAAAATATA . T . G T GTC . G . . A C TAA . . T AA . . . . . A A TA ATAA . CAA . . A G A A . . AAATACTTATATCTTG . . . . A A . A . A T . . . . T A A . C . . . . . CA T . T A . . . . TA A C . A T A C .
blockSeqs : . . . . . . T . TC G . . . . . . . . . CT T . . T GA . . . . CC . . T CCA AG A . . . A ATTAACAAAAAAAT . A . A A ATG . T . . T C GAA . . T AC . . . . . G G GT AATT . AAA . . C A G A . . TGACAAGTCATATGTT . . . . T G . T . G C . . . . C T T . G . . . . . TG T . A C . . . . AT T T . T A C C .
blockSeqs : . . T . TC T . . . . . . . . . AC A . . A AG . . . . CC . . T AAG GA A . . . A AGAAACAGCTACAG . A . T T TTG . A . . A T AGT . . T TG . . . . . A A TA AACA . AAA . . C T A A . . ATCTGCAAATGTTATA . . . . T T . T . T A . . . . T G G . T . . . . . GT C . T C . . . . AC G T . T A A C .
blockSeqs : . . T . CC T . . . . . . . . . TC A . . T TG . . . . GT . . T GCC AA A . . . A GTATACAAAATATA . T . T A GGT . G . . C C AGT . . A AT . . . . . T T GT GATT . AAA . . T G T A . . TAAAACAAACCCGGCG . . . . A G . A . G C . . . . A A T . G . . . . . TA T . C G . . . . AT T A . C A T T .
blockSeqs : . . . G . . . . . . . . . . T C . . G G . . . . AT . . A GAA AT C . . . G ATATGTGTCGAAAG . T . A T GGC . T . . A C TCA . . A GA . . . . . A T GC GATA . AAA . . A T A T . . AGACAAGTCATTGGTG . . . . A T . A . A A . . . . T G A . A . . . . . AA T . T G . . . . TA A C . T A C C .
blockSeqs : . . . A . . . . . . . . . . . . . . T A . . . . CC . . A TCA TC A . . . A GGGATGCGCAGATT . A . T G ATT . A . . T T ATT . . G AT . . . . . G T TA GATA . TCA . . A A C T . . TGACAAGTCTATAGCT . . . . T G . T . A T . . . . T G T . G . . . . . TC A . A T . . . . AC A A . A T C A .
blockSeqs : . . C . . . . . TC . . A CCA CA T . . . A ACTAACCAAGGGTA . C . A A AAC . C . . C T AGT . . G AT . . . . . G C TG GATA . TCA . . T T A A . . AGATAAAACGTAAACT . . . . A T . T . G A . . . . C T T . G . . . . . TC A . A G . . . . AT T T . A A A A .
blockSeqs : . . T . . . . . AC . . A TCC CA A . . . A ACTAACCAACGGTA . C . A G TTA . C . . T C AAT . . A AT . . . . . G C TT ACAT . ACT . . C T C C . . AGATAAAACGTTAACT . . . . C T . A . T A . . . . A T T . G . . . . . TC C . T G . . . . AT T T . A A C G .
blockSeqs : . . G . . . . . GT . . T TCT TG A . . . A AAATACTCGTAATA . T . A T AGC . T . . T A CAA . . A TT . . . . . G C CA ACAT . ATT . . T G C C . . AGACAAGTCATTGGTG . . . . C T . A . T T . . . . A T T . G . . . . . TT G . T G . . . . TT A T . T T T C .
blockSeqs : . . . . . . . . GT . . T GCC CT A . . . T AAATACTCGTAATA . T . A T AGT . T . . G G CAA . . G AT . . . . . G C CA GTCG . ATT . . T G C T . . TAAAACAAAACTGGCG . . . . T A . T . T T . . . . C T A . A . . . . . TC T . T C . . . . AT C T . A G T G .
blockSeqs : . . . GT . . A GCC CT A . . . T ACTAACCATGGGTA . T . A T AGT . T . . G T TTT . . T AT . . . . . A T CT GTCC . ACT . . T G C T . . AACAAGTCGTTTGGCC . . . . T T . C . A T . . . . A G A . A . . . . . CT T . C G . . . . AA C T . C G C G .
blockSeqs : . . . CT . . . GCC CT A . . . A GGGGTAACAAAAC . A . A A ATG . T . . G T CGT . . T GT . . . . . A T CT AAAA . TAT . . T G C T . . GGATTCCGATTGTGCT . . . . T T . C . A T . . . . T G A . A . . . . . CC T . T G . . . . AC A C . T A T A .
blockSeqs : . . . . . . . GCC TT A . . . A AGGTTTGCAGATT . T . A A ATG . C . . G A AAT . . T GT . . . . . A T CA GATT . TGT . . T G C T . . AGATAAAACATTAACT . . . . T T . C . A C . . . . T G A . A . . . . . CT C . T G . . . . CA A A . T G A
blockSeqs : . . . GGA TT A . . . A ACTAACCAACG . T . A T ATG . C . . A C TAT . . T GA . . . . . A T CA ACAA . TCA . . T G G G . . TGCTAAAGATATTCCA . . . . T A . T . A C . . . . A G A . A . . . . . TC A . T G . . . . GT T T . A A T
blockSeqs : . . . GGA CT A . . . A GTTGCACA . T . A T ATG . T . . A C CGC . . A AT . . . . . G C TG AATA . AAA . . T T A G . . TCAAACAAACGTGCCA . . . . A A . T . A T . . . . A G A . A . . . . . TG T . A T . . . . AA C G . T . A
blockSeqs : . . . GTA . A . . . . ACA . T . T A ATG . T . . G T AGT . . G AA . . . . . T T TA AATA . ACA . . T T C T . . GACAAGTCGTTGCCC . . . . T T . C . A A . . . . C G T . G . . . . . AC T . C A . . . . AA T T . A . T
blockSeqs : . . . . . . . T . A T TTC . T . . T T CAT . . T AA . . . . . G T CC GTCG . ACA . . A G T T . . AGATAAATTCATGG . . . . A G . G . A C . . . . A T A . A . . . . . AC T . T G . . . . AT G A . .
blockSeqs : . . . C T AGT . A . . T T AAC . . A AA . . . . . G A CA GATC . TAT . . A C T T . . CGATCCATCGTGTG . . . . T G . T . G A . . . . A T T . G . . . . . CT A . A A . . . . AT T T .
blockSeqs : . . . A . A . G . . T A ACC . . A AT . . . . . A C CA GTCA . TCA . . A G A C . . CGATTCATCGTGTG . . . . G A . T . G G . . . . T T T . G . . . . . TC T . T T . . . . TT C A .
blockSeqs : . . . . . . . G . . T A CAA . . A CA . . . . . G C CA ACA . TGA . . A T C T . . CGATTCATCGTGTG . . . . A A . A . G C . . . . T T A . A . . . . . CA T . C A . . . . TG C A .
blockSeqs : . . . . T A TT . . T C . . . . . . A TA CAT . TAC . . T G G T . . GGATTCCGATTGTG . . . . A A . C . T A . . . . C G C . A . . . . . TC A . A G . . . . AA A A .
blockSeqs : . T . CC . . . . . . . . . . . A CAT . TA . . T G A G . . CGATTCATCGTGTG . . . . A A . T . T T . . . . C T T . A . . . . . GA T . C . . . . . AT A T .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . TTT . TT . . A C A C . . ATAAGTCAATCCCA . . . . C T . T . A C . . . . T A T . G . . . . . CT . . . . . . . . TA C . .
blockSeqs : . CA . T . . A . T A . . GGATTCCGATTGTG . . . . T T . A . T T . . . . T T A . T . . . . . TT . . . . . . . . AG A
blockSeqs : . . . . . . . A T . . TCAAACATATCCG . . . . T A . A . A C . . . . C C A . A . . . . . GA . . . . . . . . TA
blockSeqs : . . G . . GATTCCGGTTG . . . . A A . T . G T . . . . . T T . A . . . . . TG . .
blockSeqs : T . . CAACTTGTCA . . . . A A . T . A T . . . . . T A . T . . . . .
blockSeqs : . . . A T . T . A T . . . . . C A . T . . . . .
blockSeqs : . G . . . . . . T A . G . . . .
blockSeqs : . G . . .
blockSeqCons :
originalCons : CAACAATAGATGAAAATACAAACA---ATA-ATA-----CT----CT--A-CTTCCAGAGTGTATCT-TTA-----AAACTAATA-ATACCA------TTGC--AA-AC-----A--TG----AT-----CA-------TTACTG-A--ATCAGACATAATTGA---T---AT---TATC-G--GT----AC------T---TTAGA-C-C--C---------AAATAAAGC-T-GTC----GGNNAAGACNNAATAAGTCACA-GAAT-T-TTAA----A----G----TT--T----A---CN---AAACA----CA----CT--ATN---T--CNAAACCNCT-GT-CTA---TNTTA---TTT---AATAGNTCT-TTACNT----G-A---A--TGTANAT-T-T-C-C--A---GAN-TCA---TGGAAG--TCA-G--CTANT---G-TNATGCCNCT-TTTTA--AAAA--GGG----T-CAAA-CA--A---A---CG-T---GC-CGT---C--T--A---ATTATAGACCNATNT-CTTTATTA------AGCTGT-GTTGGTAA---ACTT------A-TGGAAAG-AGTCGTN----TACAAAC--ATATNTA-TA--A---TT---TTC-TNN---TTGA-NAAT--AANCTGA--TT-TA-CA-AAT----NNCAATCNGGNTTT---CT--TAA-G-GGNCATTCGAC-AGTTT
finalCons : CAACAATAGATGAAAATACAAACA---ATA-ATA-----CT----CT--A-CTTCCAGAGTGTATCT-TTA-----AAACTAATA-ATACCA------TTGC--AA-AC-----A--TG----AT-----CA-------TTACTG-A--ATCAGACATAATTGA---T---AT---TATC-G--GT----AC------T---TTAGA-C-C--C---------AAATAAAGC-T-GTC----GGNNAAGACNNAATAAGTCACA-GAAT-T-TTAA----A----G----TT--T----A---CN---AAACA----CA----CT--ATN---T--CNAAACCNCT-GT-CTA---TNTTA---TTT---AATAGNTCT-TTACNT----G-A---A--TGTANAT-T-T-C-C--A---GAN-TCA---TGGAAG--TCA-G--CTANT---G-TNATGCCNCT-TTTTA--AAAA--GGG----T-CAAA-CA--A---A---CG-T---GC-CGT---C--T--A---ATTATAGACCNATNT-CTTTATTA------AGCTGT-GTTGGTAA---ACTT------A-TGGAAAG-AGTCGTN----TACAAAC--ATATNTA-TA--A---TT---TTC-TNN---TTGA-NAAT--AANCTGA--TT-TA-CA-AAT----NNCAATCNGGNTTT---CT--TAA-G-GGNCATTCGAC-AGTTT
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|96853 ): ACTTTACCACAATACATTCCCAAAACAGATGTTTCATTAGAAACTATTACTATAACTGAGCAGGAAATAAAATATTTTGAAAATACTAGATATAAATAAAGCCAGTGGCAGTGATATTATAAGCCACAATATACTAAAGGAAACAGCTACAGTTATATCAAAGCCTCTATGTATTATTTTTAATAGATCCCTAAGTGAGTGTTGCTTTCCAGAATGCTGGAAATTTGCAAATGTCATGCCATTGTTTAAAAAGGGATGTGCTAATGTTACAACTGATTATAGACCGATTTCTTTATTGAGTTGTGTTGGAAAACTTTTTGAAAGAGTT
Unaligned ( gi|96867 ): AAATAAAGTAAGCGGTACTGACACTATAAGTCACAAAATGCTTAAAGGTGCTGTAAGAACAATTTCTGAACATCTTACTCTTTTATATAATCGTTCTATTACCGAAAGTCATTTCCCTAACTCATGGAAAATAGCCCATGTAACTCCTATATTTTTGAAAGTGGATAAGTCAATTCCATCTAATTATAGACCAGTTAAGTTGCTAAGCTGTGTCGGAAAGATTTTAGAAAGAATAATTTTTAAACAAATGTATAACTTCTTCTTGAGTAACAATTTATTGTATAAAAACCAGTCTGGCTTTTT
Alignments
lowQualScore : 11111 11111111111111 11111 222222222222222222222222222222222222222222 11111 1111111 33333333333333333333333333333333333
lowQualScore : 666 3 88888 7777 5555 2 66666 3 2 88888888 1 33 5 66666 33 5555 66666 8888888 0 2 33 22 0 1 333 333 6666 33333 4444 555555 333 0 1 22222222222222 4 1 22222 222 44 1 1 3 1 44444 777777777777777777777777777777777777777777 11 5555 11 1 3 00000 222 2 333 222 1 11 7777777 1 222 555 11 1 1 1 1 11 6666 33 33333 1111111 11 888 222 1 2 2 1 11 11 22 88888888888888888888888888888888888 111 77 22 111 1 1 1 1 222222 11 1 222 222222 1 4 8 33333 1 11 1 1 11 222 333 1 33333 66 11 3 5 11 4 1 1 444444 1 2 444 222 777 1 2 3
lowQualScore : ... . ..... .... .... . ..... . . ........ . .. . ..... .. .... ..... ....... . . .. .. . . ... ... .... ..... .... ...... ... . . .............. . . ..... ... .. . . . . ..... .......................................... .. .... .. . . ..... ... . ... ... . .. ....... . ... ... .. . . . . .. .... .. ..... ....... .. ... ... . . . . .. .. .. ................................... ... .. .. ... . . . . ...... .. . ... ...... . . . ..... . .. . . .. ... ... . ..... .. .. . . .. . . . ...... . . ... ... ... . . .
lowQualScore : 444 3 33333 1111 0000 9 22222 5 5 00000000 4 44 0 22222 44 3333 22222 1111111 8 5 44 11 8 6 555 555 4444 66666 2222 000000 000 3 7 22222222222222 6 5 00000 000 00 9 5 0 5 77777 222222222222222222222222222222222222222222 88 6666 88 5 6 99999 333 3 555 222 0 99 7777777 2 111 666 99 2 2 2 2 77 1111 00 88888 4444444 66 222 000 1 1 0 4 22 55 66 33333333333333333333333333333333333 999 22 99 888 0 0 1 1 999999 88 0 888 999999 0 1 7 22222 3 44 0 0 44 888 888 1 99999 44 55 6 0 66 6 1 1 444444 0 2 222 666 333 0 3 6
consensus : CAACAATAGATGAAAATACAAACA---ATA-ATA-----CT----CT--A-CTTCCAGAGTGTATCT-TTA-----AAACTAATA-ATACCA------TTGC--AA-AC-----A--TG----AT-----CA-------TTACTG-A--ATCAGACATAATTGA---T---AT---TATC-G--GT----AC------T---TTAGA-C-C--C---------AAATAAAGC-T-GTC----GGNNAAGACNNAATAAGTCACA-GAAT-T-TTAA----A----G----TT--T----A---CN---AAACA----CA----CT--ATN---T--CNAAACCNCT-GT-CTA---TNTTA---TTT---AATAGNTCT-TTACNT----G-A---A--TGTANAT-T-T-C-C--A---GAN-TCA---TGGAAG--TCA-G--CTANT---G-TNATGCCNCT-TTTTA--AAAA--GGG----T-CAAA-CA--A---A---CG-T---GC-CGT---C--T--A---ATTATAGACCNATNT-CTTTATTA------AGCTGT-GTTGGTAA---ACTT------A-TGGAAAG-AGTCGTN----TACAAAC--ATATNTA-TA--A---TT---TTC-TNN---TTGA-NAAT--AANCTGA--TT-TA-CA-AAT----NNCAATCNGGNTTT---CT--TAA-G-GGNCATTCGAC-AGTTT
Reference ( family-531 ) : CAACAATAGATGAAAATACAAACA---ATA-ATA-----CT----CT--A-CTTCCAGAGTGTATCT-TTA-----AAACTAATA-ATACCA------TTGC--AA-AC-----A--TG----AT-----CA-------TTACTG-A--ATCAGACATAATTGA---T---AT---TATC-G--GT----AC------T---TTAGA-C-C--C---------AAATAAAGC-T-GTC----GGNNAAGACNNAATAAGTCACA-GAAT-T-TTAA----A----G----TT--T----A---CN---AAACA----CA----CT--ATN---T--CNAAACCNCT-GT-CTA---TNTTA---TTT---AATAGNTCT-TTACNT----G-A---A--TGTANAT-T-T-C-C--A---GAN-TCA---TGGAAG--TCA-G--CTANT---G-TNATGCCNCT-TTTTA--AAAA--GGG----T-CAAA-CA--A---A---CG-T---GC-CGT---C--T--A---ATTATAGACCNATNT-CTTTATTA------AGCTGT-GTTGGTAA---ACTT------A-TGGAAAG-AGTCGTN----TACAAAC--ATATNTA-TA--A---TT---TTC-TNN---TTGA-NAAT--AANCTGA--TT-TA-CA-AAT----NNCAATCNGGNTTT---CT--TAA-G-GGNCATTCGAC-AGTTT
gi|96841 : CAACAATAGATGAAAATATAAACA---ATA-ATA-----CT----CT--A-CTTCCAGAGTGTATCT-TTA-----AAACTTATA-ATACCA------TTGC--AA-AC-----A--TG----AT-----CA-------TTACTG-A--ATCAGACACAATTGA---T---AT---TATC-G--GT----AC------T---TTAGA-C-C--C---------AAATAAAGC-T-GTC----GGAGAAGACAAAATTAGTCACA-GAAT-T-TTAC----A----G----TT--T----A---CT---AAACA----CA----CT--ATA---T--CTAAACCCCT-GT-CTA---TGTTA---TTT---AATAAATCG-TTACTT----G-A---A--TGTAAAT-T-T-C-C--A---GAG-TCA---TGGAAG--TTA-G--CTACT---G-TAATGCCTCT-TTTTA--AGAA--GGG----T-CAAA-CA--A---A---CG-T---GC-CAT---C--T--A---ATTATCGGCCAATAT-CTTTATTA------AGCTGT-GTTGGTAA---ACTT------A-TGGAAAG-AGTTGTC----TACAAAC--ATATTTA-TA--A---TT---TTC-TGA---TTGA-AAAT--AAACTAA--TT-TA-CA-AAT----TGCAATCCGGATTT---CT--TAA-G-GGACATTCGAC-AGTTT
gi|96842 : CAACAATAGATGAAAATATAAACA---ATA-ATA-----CT----CT--A-CTTCCAGAGTGTATCT-TTA-----AAACTAATA-ATACCA------TTGC--AA-AC-----A--TG----AT-----CA-------TTACAT-A--ATCAGACATAATTGA---T---AT---TATC-G--GT----AC------T---TTAGA-C-C--C---------AAATAAAGC-T-GTC----GGAGAAGACAAAATTAGTCACA-GAAT-T-ATAC----A----G----TT--T----A---CT---AAACA----CA----CT--ATA---T--CTAAACCCCT-GT-CTA---TGTTA---TTT---AATAAATCC-TTACTT----G-A---A--TGTAAAT-T-T-C-C--A---GAG-TCA---TGGAAG--TCA-G--CTACT---G-TAATGCCTCT-TTTTA--AGAA--GGG----T-CAAA-CA--A---A---CG-T---GC-CAT---C--T--A---ATTATCAGCCAATAT-CTTTATTA------AGCTGT-GTTGGTAA---ACTT------A-TGGAAAG-AGTTGTC----CACAAAC--ATATTTA-TA--A---TT---TTC-TGA---TTGA-AAAT--AAACTAA--TT-TA-CA-AAT----TGCAATCCGGATTT---CT--TAA-G-GGACATTCGAC-AGTTT
gi|96843 : CAACAATGGATGAAAATATAAACA---ATA-ATA-----CT----CT--A-CTGCCAAAGTGTGTCT-TTA-----AAAC----------CA------TTGC--AA-AC-----A--TG----AT-----CA-------TTACTG-T--ATCAGACATAGTTGA---T---AT---GATC-G--GT----AC------T---TTAGA-C-C--C---------AAATAAAGC-T-GTC----GGAGAAGACAAAATTAGTCACA-GAAT-T-TTA----------G----TT--T----A---CA---AAACA----CA----TT--ATA---TATCTAAACCCCT-GT-CTA---TGTTA---TTT---AATAAATCC-TTACTTACTTG-A---A--TGTATAT-T-T-C-G--A---GAG-TCA---TGGAAG--TCA-G--CTACT---G-TAATGCCTCT-TTTTA--AGAA--GGG----T-CAAA-CA--A---A---CG-T---GC-CAT---C--T--A---ATTATCGGTCAATAT-CTTTATTA------AGCTAT-GTTTGTAA---ACTT------A-TGGAAAG-AGTTGTC----TACAAAC--ATATTTA-TA--A---TT---TTC-TGA---TTGA-AAAT--AAACTAA--TT-TA-CA-AAT----TGCAATCCGGATTT---CT--TAA-G-GGACATTTGAC-AGTTT
gi|96844 : CAACAATAGATGAAAATATAAACA---ATA-ATA-----CT----CT--A-CTTCCAGAGTGTATCT-TTA-----AAACTAATA-ATACCA------TTGC--AA-AC-----A--TG----AT-----CA-------TTACTG-A--ATCAGACATAATTGA---T---AT---TATC-A--GT----AC------T---TTAGA-C-C--C---------AAATAAAGC-T-GTC----GGAGAAGACAAAATTAGTCACA-GAAT-T-TTAC----A----G----TT--T----A---CA---AAACA----CA----CT--ATA---T--CTAAACCCCT-GT-CTA---TGTTA---TTT---AATAAATCC-TTACTT----G-A---A--TGTAAAT-A-T-C-C--A---GAG-TCA---TGGAAG--TCA-G--CTACT---G-TAATGCCTCT-TTTTA--AGAA--GGG----T-CAAA-CA--A---A---CG-T---GT-CAT---C--T--A---ATTATCGGCCAATAT-CTTTATTA------AGGTGT-GTTGGTAA---ACTT------A-TGGAAAG-AGTTGTT----TACAAAC--ATTTTTA-CA--A---TT---TTC-TGA---TTGA-AAAT--AAACCAA--TT-TA-CA-AAT----TGCAATCCGGATTT---CT--TCA-G-GGACATTCGAC-
gi|96845 : CAACAATAGGTGAAAATACAAACA---ATA-CTA-----CT----CT--A-CTTCCAGGGTGTATCT-TTA-----AAACTAATA-ATACCA------TTGC--AA-AC-----A--TG----AT-----CA-------TTACTG-A--ATCAGCCATAGTTGA---T---AT---AATC-G--GT----AC------T---TTAGA-C-C--C---------AAATAAAAC-T-GTC----ACAGAAGACAAAATTAGTCACA-GAAA-T-TAAC----A----G----TT--T----A---CA---AAACA----CA----CT--ATA---T--CTAAATC-CT-GT-CTA---TGTTA---ATT---AACAAATCC-TTACTT----G-A---A--TGTAAAT-T-T-C-A--A---GAG-TCA---TGGAAG--TCA-G--CTTCT---G-TAATGCCTCT-TTTTA--AAAA--GGG----T-CAAA-CA--A---A---CG-T---GC-CAT---C--T--A---ATAATCGGCCAATAT-CTTTATTA------AGCTGT-GTTGGTAA---CCTA------A-TGGAAAG-AGTTGTC----TACAAAC--ATATTTA-TA--A---TT---TTC-TGA---TTGA-AAAT--AAACTAA--TT-TA-CA-AAT----TGCAATCCGGATTT---TT--TAA-G-GGACA
gi|96846 : CAACAATAGGTGAAAATACAAACA---ATA-CTA-----CT----CT--A-CTTCCAGGGTGTATCT-TTA-----AAACTAATA-ATACCA------TTGC--AA-AC-----A--TG----AT-----CA-------TTACTG-A--ATCAGCCATAGTTGA---T---AT---AATC-G--GT----AC------T---TTAGA-C-C--C---------AAATAAAAC-T-GTC----ACAGAAGACAAAATTAGTCACA-GAAA-T-TAAC----A----G----TT--T----A---CA---AAACA----CA----CT--ATA---T--CTAAATC-CT-GT-CTA---TGTTA---ATT---AACAAATCC-TTACTT----G-A---A--TGTAAAT-T-T-C-A--A---GAG-TCA---TGGAAG--TCA-G--CTTCT---G-TAATGCCTCT-TTTTA--AAAA--GGG----T-CAAA-CA--A---A---CG-T---GC-CAT---C--T--A---ATAATCGGCCAATAT-CTTTATTA------AGCTGT-GTTGGTAA---CCTA------A-TGGAAAG-AGTTGTC----TACAAAC--ATATTTA-TA--A---TT---TTC-TGA---TTGA-AAAT--AAACTAA--TT-TA-CA-AAT----TGCAATCCGGATTT---TT--TAA-G-GGACA
gi|96847 : CAACAATAAATGACAGTATTAACA---ATA-ATA-----TG----TT--A-CTTCCAGGCTGTGTCT-TTA-----AAACGAATA-ATACCA-------------A-AC-----T--TG----AT-----CG-------TTACTG-A--ATCAGACATAATTGT---T---TT---GATC-G--GT----AC------T---TTAGA-C-C--C---------AAATAAAGC-T-GTC----GGAAAAGACACAAT---TCCCA-GAAT-T-TTTC----A----G----TA--T----A---CA---AACCA----CA----CT--A-----------AACCACA-GT-CTA---TGTTA----------ATAATTCC-TTACTT----T-A---A--TGTAAAT-T-T-C-C--A---G---TCA---TGGAAG--TCA-A--CTACT---G-TTATGTCTCA-TCTTA--AGAA--AGG----T-CAAA-CA--G---A---CG-T---GC-CAT---C--T--T---ATCATTGGTCAATAT-CTTTATTA------AGCTGT-GTTGGTAA---ACTT------A-TGGAAAG-AGTTGTC----TACAAAC--ATATTTA-TA--A---CT---TTC-TGA---TTGA-AAAT--AAACTAATTTT-TA-TA-AAT----TTTTATCAGGACTT---TC--TAA-T-GGACATTCGAC-AGTTT
gi|96848 : ACAATAGATGATACT-CAAACA---A---AT------------------CTTCCTGAATTCGTTT-TTC-----AAACAAATA-GTAC-G------TTAA--AAGAT-----A--TT----AA-----CA-------TCACAG-A--AAAAGAAATAACTGA---T---GT---TCTA-G---------------------CAAA-C-C--TCGCTGT---AAATAAAGC-T-AGT----GGTCTTGACGACATAGGTCACA-AAATGC-TCAA----A----GAAACTT--TGTAAA---CTTGTAAACT----TGT---CT--ATT---T--GTAAACCTTA-AT-GTA---TTATA---CTT---AACAGATCT-ATGAGA----G-A---AAATGTATAT-----C-C--A---ACA-TCT---TTGAAA--TTA-G--CTAAC---G-TTATGCCTTTATTTTA--AAAA--GG-----T---GA-TA--A---ATCTC--T---AC-CGT---C--T--A---ATTATAGACACATTT-CATTGATA------AGCTGT-GTTGGTAA---AGTA------G-TGGAAAG-AATTGTT----TTTGAAC--ATATTTA-CA--A---TC---ATCTTCA---TTCA--AAT--AA
gi|96849 : AAAATACAAAGATAGATAGATAAAAGTTT----TT--ATCTTATA-AGTGTATAT-ATATATATAAACAAATAGATAACAACAAAATTGT--AA-GCTCTTCA--TG----AG-----CT-------TT--TG-A--ACC-GATATAAGTGA---C---ATACATGTC-----T----AC------T---TTA---C-C--C---------AATTTTAGA-C-GT-------ATACAAC--AGTGACTTAAA-GGGT-T-T-GA----A----G----TA--T----A---TA---AAATA----TA----GT--ATT---T--CTAAACCTCTAGTACT-----GTTA---TTT---AATAGATCA-TGAATT----A-A---A--TGTGAAT-T-T-C-C--A---GAT-TTA---TGGAAA--TCA-GTCCTA-----G-TAATTCCACT-TTTCA--AGAA--AGG----T-AAAA-CA--A---A---CT-A---AG-CGT---C--T--A---ATTATCGACCAATTT-CACTCTTA------AGCTGT-ATTGGCAA---GTTA------A-TGGAAAG-AATTGTG----TACAAACATATATATA-TA--A---TT---TTC-TTG---TTGA-TAAT--AACCTCA--TT-TA-TA-AAT----TACAATCTGGATTT---CC--CAG-A-GGACATTCCAC-GGTTTtattatattta
gi|96850 : TACAATTG---ATG-ATA-----CTGACTCTGAA-CTTCCAAATTTTGTTT-TGA-----AAAC-AGT---TACCA---------C--AATTC-----A--TG----ATATCAATA-------TCACAG-A--ACAAGAAATTTCTGA---T---GT---TCTT-T--CC----AA------T---TTAGT-TGT--C---------AAA-AAAAC-T-TGC----GGCCCAGACGAAATAAGCCATC-ACAT-G-TTAA----A-------------------------------A----CA----CT--ATG---C--TG--ACCGCT-TT-GCA---TCATT---TTT---AATAGGTCT-CAATAA----G-A---A--AGCATAT-A-C-C-C--A---AAT-TGT---TCAAAA--TAA-G--CAAAT---G-TAATGCCATT-ATTCA--AAAA--GGG----TGCTAA--A--G---A---TA-T---TC-CAT---C--A--A---ACTAAAGACCTATTT-CATTAATGACATGTAGTTGT-ATTGGTAA---GGTC------A-TGGAAAG-AGTAATA----TTCAAGC--ATTTATG-CA--A---TTA--TTC-ACA---TTTA--AAT--AACCTGA--TT-TA-TA-AAA----ATCAGTCAGGGTTT---CT--TCC-T-GGTCATTCAAC-AATTT
gi|96851 : A---ACA-ATA-----CT----TT--A-CTACCAACTTGT-TCTCTTA-----AAACAAACC-ATACAC------TAAC--AA-AT-----A--TC----AA-----AA-------TAACTG-A--A---AATGAAATTAAGAAT---AT---TATA-G--AT----ACATTTTAT---TTAAAAT-C--C---------TAACAAATC-A-GTT----GGAGAAGATAAAATCAGTTATA-AACT-T-TTAA----A----A----TT--A----A---CA---AAAAA----AT----GT--ATT---T--CTAAACCATT-GG-TTA---TGCTT---TAT---AATAAATCA-CAAGAA----G-A---A--TGTAAAT-T-T-T-C--A---TAA-TTA---TGGAAA---CA-----TGGTTTAA-TAATGCCACT-ATTTA--AAAA--AGG-------AAA-TA--CTT-A---TA-T---CT-TGT---C--T--A---ATTATAGGCCAATAA-CACTTTTG------AGTTGT-GTTGGTAA---ATTA------A-TGGAAAT-AGTTGTT----TACAAAC--ATATCTA-TATTT---TT---TTT-TTG---TTGC-AAAT--AACTTGA--TA-TA-CA-AGT----TACAGTCAGGATTT---TT--AAA-A-GTTCATTCAAC-TGTTT
gi|96852 : A-ATG-----CT----CT----CTGCCTAATTTTACTC-GTA-----AAACTGAAA-ATTCAC------TTTC--AA-GT-----A--TA----AG-----TA-------TATCAG-A--AAAAGAAATAATTGA---T---GT---TATC-ACCAT----AC-----------TGAA-C-G--T---------AAACAAAGCTT-GT-----GGCCATGATTTGATAAGTCATA-AAAT-G-TTAAAAGGA----G----TT------------------GCA----CA----CTCAATA---T--TGAAACCACT-GG-CTT---TTCTT---TTT---AATCGTTCT-TTTAGT----G-A---A--TGAACATAT-C-C-C--A---AAG-T-A---TGGAAA--ATT-G--CCAAT---G-TCACACCGTT-ATATA--AAAA--AGG----T---GA-CA--AGTCA---TA-T---GT-T-T---C--A--A---ATTACAGACTTGTGT-CTTTGTTA------AGTTGT-TGTGGCAA---GCTT------T-TTGAGAG-AATCATG----TTTAAAA--ATATGTA-TA--A---TT---TCC-TGT---ATGA-TAAT--AATTTAA--TG-TA-TA-AAT----ATCAATCAGGCTTTTTACC--TAA-----ATATTCAAC-
gi|96854 : TGCATCT-T--------AACTA-CA-ATAC-A------TTCCTCAA-AC-----AGATGCTACAT-----CAGAAAATATTACTATA--ACTAAGCATGA--AA---T---AA---AAT-----AT----AT------T---TTGAA-A-A--T---------AAATAAAGC-TTGT-----GGAAGTGATAGTATAAGCCACA-AGAC-A-ATAA----A----A------------------G---AAACAGCTACAG---TT--ATA---T--CAAAGCCTTT-AT-TTA---T--TAC--TTT---AATGGATCC-CTAAGT----G-A---A--TGTTGCT-T-T-C-C--A---GAA-AGT---TGGAAAATTTT-G--CAAAT---G-TCAT-CCATT-ATTTA--AAAA--GGGA---T-C-TG-CA--A---A---TG-T---TA-TAA---C--T--A---ATTATTGGCCTATTT-CTTTATTG------AGTTGG-GTTGGAGG---AGTT------T-TTGAAAG-AGTTGTA----TGTAAAC--ACATTTA-TA--A---TA---ATC-TTA---ATAG-TAAT--GAACTCA--TT-TT-CA-AGA----ACCAGTCTGGTTTT---CT--
gi|96855 : T-TGA-----AAACTCATA-ATGTTC------TTGA--TA-AC-----G--TC----AT-----GG-------TAACAG-A--AACAGAAGTAGAAGA---TGTAAT---TCTC-----T-----C------A---TTGAA-T-C--C---------AAATAA------GTCAAGTGGGCCGGATGATATATGTCATA-AAAT-G-TTAA----AAGGAG----TT-------G---CC---AAAT-----CA----GT--AT-------CTAAACCATT-AA-CAT---TATTA---TTG---AATCGCTCT-CTATCA----G-A---A--AGTATTT-T-T-C-C--A---GAT-AGC---TGGAAA--ACA-T--CAAAT---G-TTATTCCTAT-ATTTA--AAAA--AGG-------AGA-TA--A---ATT-CA-T---G---GT---AAGT--A---ATTATAGACCAATGT-CATTATTA------AGCTGC-ACCGG-AA---AATT------ATTAGAAAG-ATTAGTG----TTCAAAT--ATTTGTA-TA--A---TT---TTT-TAA---TTAG-CAAT--AATTT-A--TTATA-TA-AAT----ATCAATCGGGTTTTTTACC--TAA-----CCACTCGACAAGTTT
gi|96856 : A-----AAACTAATG-ATACTC------TTTC--TA-AT-----A--TT----AT-----TA-------TTACAA-A--GTCTGAAATAAAAGA---T---AC---GATT-G--AA----AT------T---CTTGA-C-T--C---------AAACAAATC-T-GTT----GAGAATGATAAAATAAGTCACACG--T-T-TTGA----A----G----TA--T----A---CA---AAATA----TA----GT--ATT---T--CTAAACCTCTAGTACT-----GTTA---TTT---AATAGATCA-TTAATT----A-T---A--AGTGAAT-T-T-C-C--A---GAT-TTA---TGA----------------------TAATGCCACT-TTTCA--AAAA--AGG----T-AAAA-CA--A---A---CC-C---GG-CGT---C--T--T---ATTATCGACCAATTT-CACTCTTA------AGCTGT-ATTGGCAA---GTTA------A-TCGAAAG-AATTGTG----TACAAAC--ATATATA-TA--A---TT---TTC-TTC---TTGG-TAAT--AACCTCA-----TA-TA-AGT----TACAATCTGGACTT---CT--CAA-A-GGACATTCCAC-GGTTT
gi|96857 : A-----AAACTTATA-ATTCCC------TTTC--AC-AT-----T--TT----AT-----AA-------TAACTG-AGGAT--GATATATCTGA---A---CT---TATT-A--GT----AC------T---T--AA-C-CAGT---------AAATAAGGCCT-GT-----GGTCATGATATGATCAGTCACA-GAAT-G-CTGG----A----A----TA--T----GTGTCG---AAA-------G----CT--ATT---T--CAAAACTATT-TT-AAA---TTTTA---TTT---AACCGTTCT-TTAAGT----G-A---A--GGTATAT-A-T-C-C--C---GAT-TTG---TGGAAG--ATT-G--CAAAT---G-TAACTCCCAA-TTCTA--AAAA--GGG-------AGA-CA--A---GT--CATT---GG-TGT---C--A--A---ATTACAGACCTGTGT-CTTTACTT------AGTTGT-GTCGGAAA---ACTT------G-TTGAAAG-GCTTGTT----TTTAAGA--ATATGTA-TA--A---CT---TT--TTC---TTGA-TAAT--AATTTGA--TT-TA-TA-AAT----ACCAGTCAGGCTTT---TT--
gi|96858 : TGA---T---AT----ATCTG--AC----AT------T---TTAAA-C-A--CTGTTAATATAAATAAAGCAT-GT-----GGCCATGACTCTGTAAGCCATA-AGAT-TCTTAA----AGG--G----GT--A----A---CA---AAAC-----------CC--ATA---T--CTAAACCTTT-AG-CCG---TACTT---TTT---ACCCGCTCT-CTGAAT----G-A---A--GGGATTT-A-T-C-C--T---GAC-GTT---TGGAAG--ATA-G--CAAAT---G-TTACACCAAT-ATATA--AAAA--AGG----T---GA-CA--A---G---TC-TATAGC-T-T---C--A--A---ACTATAGACCAGTTT-CTTTACTT------AGCTGT-TGTGGTAAGATATTT----------GAAAG-AATCATT----TTTAAAC--ACATGTA-CA--A---CT---TTC-TTC---TTAC-AAAT--AAATT-A--TTGTA-TA-AAT----ATCAATCAGGATTT---CT--
gi|96859 : TGA---T---AT---CATC-----TCCTCAC------T---TTATA-C--------------AAATAAAGC-C-AGT----GGTCCAAACCAAATTAGTCATG-AAAT-G-ATAA----A----G----G-------------G---ATGCG----CAGATTCT--ATC---A--CAAAACCGTT-AG-TTA---TCATT---TTT---AACCGTTCT-ATACAA----G-A---A--AGTATTT-T-T-C-C--A---AAC-TCA---TGGAAG--ATA-G--CTCAA---G-TCACTCCCAT-CTTCA--AAAA--GGG-------AGA-TA--A---AA--CG-T---AAACTT---C--T--A---ATTATAGACCCGTTT-CACTTTTA------AGCTGT-TGTGGAAA---GATT------C-TTGAAAG-AATAGTT----TTTAAAA--ATATGTA-TA--A---CT---TTT-TTT---TTAC-AAAT--CAACTGT--TG-TA-TA-AAT----ATCAGTCTGGTTTT---TT--
gi|96860 : TGA---T---AT---TATC-----T----CC------TCACTTA-A-T-A--C---------AAATAAAGC-C-AGT----GGTCTAGACCAAATAAGTCATA-AAAT-G-ATAA----GAG--G----TT--T----G---C------AGA----TT----CT--ATC---A--CAAAACCATT-AG-TTA---TCATT---TTT---ATCCGTTCT-GTACAA----G-A---A--AGTTT-T-T-T-C-C--A---AAACTCA---TGGAAG--ATA-G--CTCAA---A-TTACTCCCAT-CTTCA--AAAA--GGG-------AGA-TA--A---AA--CG-TT--AA-CTT---C--T--A---ATTATAGACCCGTTT-CACTTTTA------AGCTGT-TGTGGAAA---GATT------C-TTGAAAG-AATAGTT----TTTAAAA--ATATGTA-TA--A---CT---TT--TTC---TTGA-CAATTCAA--TTA--TTGTA-TA-AAT----TTCAGTCTGTTTTT---a
gi|96861 : GA---C---AT---GATT-T--GT----TT------T---TTAGG-T-G--T---------GAATAAAGC-T-GTA----GCGCCAGACTGAGTAAATCAGA-GAAT-T-TTAA----A----A----CT--A----A---CC---AAGGG----TA----CA--ATT---T--CAGAACCGTT-AT-GTA---TTTGA---TTT---AATAAGAC---TATTT----GCA---A--GGAATAT-T-TAC-C--A-------TTAAACTAGAAA---CATG--CACTT---G-TTATGCCCCT-TTATA--AAAA--AGG----C----------A---A---CT-T---GT-CATGTGT--T--AGATATTACAGATCTTTAT-CTCTGTTA------AGTTGT-ATTGGTAA---ACTT------A-TGGAAAt
gi|96862 : ------T---TTAGG-T-G--T---------GAATAAAGC-T-GTA----GGGCCAGACCTAGTAAGTTACA-TAAT-T-TTAT----A----A----CT--A----A---CC---AACGG----TA----TA--ATT---T--CAAAACCTTT-AT-GTA---TTTTA---TTT---AATAAGTAT-TT-TTTAG--G-A---A--TCT---T-T-T-C-C--ATGTAAC-T-----TGAAA----CATG--CATTT---G-TTATGCCCCT-TTATA--AGAA--AGG------CGAT-CC--A---T---CG-T---GT--GT---TAGT--A---ATTACAGACCTATTT-GCCTGTTA------AGTTAT-ATTGGTAA---ACAT------A-TGGAACGTTGT-GTG----TATAAGT--ATATATA-CA--C---TT---TCC-
gi|96863 : ------T---TTAGG-T-G--T---------GAATAAAGC-T-GTA----GGGCCAGACCTGTTAAGTTACA-TAAT-T-TTAT----A----A----CT--A----A---CC---AA-------CG----GT--ATAAATT--CAAACCCTTT-AT-GTA---TTTTA---TTT---AATAAGTAT-TT--TT----G-A---G---GAATCT-TAT-C-C--ATGTAAC-T-----TGAAA----CATG--CATTT---G-TTATGCCCCT-TTATA--AGAA--AGG------CGAT-TC--A---T---CG-T---GT--GT---TAGT--A---ATTACAGACCTATTT-CCCTGTTA------AGTTAT-ATTGGTAA---ACAT------A-TGGAACGTTGT-GTG----TATAAGT--ATATATA-CA--C---TT---TCC-
gi|96864 : ------T---TTAGG-T-C--T---------GAATAAAGC-T-GTA----GGGCCAGACCTAGTAAGTCACA-GAAT-T-T---------------------------------------------------------------CAAAACCTTT-AT-GTA---TTTTA---TTT---TAAAAGTCT-ATTCGT----G-AGGAA--TCT---T-T-T-C-C--A-----T-GCAAC-TGGAAA---CATG--CACTT---G-TTGTGCCCCT-TTATA--AGAA--AGG------CGAT-TC--A---T---CG-T---GT--GT---TAGT--A---ATTACAGACCTATTT-CCCTGTTA------AGTTGT-ATTGGTAT---ACTT------A-TGGAACGTTGT-GTG----TACAAGT--ATATATA-TA--A---ATACCTTA-TCT---CTGA-GAAT-----------CT-TA-TA-TATTCTAGACAATCAGGTTTT----T--TAATT-GGTCATTCCAC-TGT
gi|96865 : --C---------AAATAAAGC-T-GTT----GGGGAAGACTTAATAAGTCATA-CAAT-T-TTAA----A----A----AA--T----A---CT---CGTAA----TA----CT--TTT---T--CAAAACCACT-TTGCAA---TCGT----TTT---AACAAATTT-CTAAAT----G-A---A--TGTGTAT-T-T-C-C--A---AGT-TCT---TGGAAG--TCG-G--CTATA---A-TTATGCCGCT-GTTTA--AAAA--GGGGGATT-C----CG--A---T---TG-T-------GT---T--TAAA---ACTACAGACCTATAT-CTTTACTT------AGCAGT-ATTGGCAA---ACTT------A-TGGAAAG-GACCATG----TACAAAC--ACATATA-TA--A---CC---ATC-TCC---TTGA-TAAC--AATTTGA--TA-TA-TA-ATA----ATCAGTCCGGTTTT---CT--AAG-A-AGCTATTC
gi|96866 : --C---------AAACAAAGC-T-GTT----GGGGAAGACTTAATAAATCATA-CAGT-T-TTAA----A----A----AA--T----A---CT---CGTAA----TA----CT--ATA---T--CAAAACCATT-TTGCAA---TCTT----TTT---AACAAATCT-CTATAT----T-A---A--TGTGTAT-T-T-C-C--A---AGT-TCT---TGGAAG--TCC-G--CTGTA---G-TTATGCCACT-GTTTA--AAAAT-GGGGAT-T-C----------------CG-----GT-TGT-------------GTTTCAAACTAATAT-CTTTACTA------AGCTGT-ATTGGCAC---ACTT------A-TGGAAAG-GACAATG----TACAAAC--ACATATA-TA--A---CC---ATC-TCT---TTGA-TAGC--CATTTGA--TA-TA-TA-ATA----AACAGTCCGGTTTT---CT--AAG-A-GGCCATTTCAC-AGTTT
gi|96868 : AATAAGGC-T-GTA----GGGTAAGACCTAGTAAGTCGCA-GAAT-T-TTAA----A----A----CT--A----A---CC---ATGGG----TA----CA--ATT---T--CAAAACCTTT-AT-GTA---TTTTA---TTT---AATAAGTCT-TTTCGC----G-A---G-----GAAT-C-T-T---------AT-TCA---TG-------CA----CT--T---G-TTAT-CCCCT-TTATA--AGAA--AGG------CGAT-TC--A---T---CG-T---G--TGT---TAGT--A---ATTACAGACCTATTT-CCCTGTTA------AGTTGT-ATTGGTAA---ACTT------A-TGGAACGTTGT-GTG----TATAAGT--ATATATA-TA--A---TT---
gi|96869 : ATAAGTAACA-AAATGC-TTAA----A----G----GTGCT----G---TA---AGA-A----CA--------ATT---T--CTGAACCTCT-----TACACTTTTA---TAT---AATCGTTCTATTACC-----G-A---A--AGT-CAT-T-T-C-C--CT--AAC-TCA---TGGAAA--AAA-G--CTCAT---G-TAACTCCTAT-TTTTAGGAAAG--GGG----A-TAAGTCA--A----------T---CC-CAT---C--T--A---ATTATAGACCAATGT-CGTTGCTC------AGCTGT-GTCGG
gi|96870 : aaatt----TT--T----A---AA---AAGCA--------------ATT---G--CAAAACCACT-TT-CAA---TTTTA---TTT---AACCGTTCT-TTAAGT----G-A---A--GGTATAT-A-T-C-C--C---GAT-TTG---TGGAAG--ATT-G--CAAAT---G-TAACTCCTAT-TTTTA--AAAA--GGG-------AGA-CA--A---GT--CATT---GG-TGT---C--A--A---ATTACAGACCTGTGT-CTTTACTT------AGTTGT-GTTGGAAA---ACTT------T-TTGAAAG-GCTTGTT----TTTAAGA--ATATGTA-TA--A---CT---TTT-TTC---TTGA-TAAT--AATTTGA--TT-TA-TA-AAT----ACCAATCAGGCTTT---TT--
gi|96871 : T--ATT---T--CCAAATATCT-AG-TTC---TATTA---TTT---AATAGTACA-TGACAT----G-A---A--TGGAAAC-G-C-A-C--A---TAT-TTA---TGGAAA--CAA-G--CT-TT---GATAATGCCACT-CTTCA--AAAC--AGG----T-AAAA-CA--A---A---AC-T---GG-CGT---C--T--A---TTTATCGATCGATAT-CTCTCTTA------ATCTGT-GTTGGCAA---GTAA------A-TGAAACA-AATTGTT----TACAAAC--GTATATT-TA--T---TT---TTC-TTG---TAAA-CAAA--AACCTCA--TT-TA-TA-AAT----CACATTCAGGATTT---CT--ACA-T-GGACACTCTAC-GGTCT
gi|96872 : ctaT--ATT---T--CAAAACCTCT-A----A---TGTTACTTTTT---AATCGTTCT-ATAAAC----G-A---A--AGTAAAT-T-C-C-C--T---GAA-TCC---AGGAAA--ATA-G--CACAT---G-TAACCCCCCT-TTTAA--GCAA--GGG--------GA-CA--A---GT--CG-TT--GC-CCT---C--T--A---ATTATAGACCAGTAT-CACTGTTG------AGTTGT-TTGGGAAA---AGTT------T-TAGAAAG-AATAATT----TTCAAGC--GTATGTA-TA--A---CT---TTC-TAC----TAA-ACAT--AATATGC--TG-TT-CA-AAT----GTCAGTCTGG-TTT---CT--T
gi|96873 : A---TGTTA---CTTTTCAATCGTTCT-ATAACC----A-A---A--AGTAAAT-T-C-C-C--T---GAC-TCA---TTGAAA--ATA-G--CACAT---G-T-AT-----T-TTTTA--AAAA--AGG--------AA-CA--A---GT--CG-TTTGGC-C-T---C--T--T---ATTATA--CCAGTAT-CCATGTTC------ATCTGT-TTGGGGAAG--ATTT------T-TAGAAAG-AATAATT----TTCAAGC--GTATGTA-TA--A---CT---TTC-TAC---TAAA-TAAT--AATCTGC--TG-TA-CA-AAT----AATAATC
gi|96874 : cctgtaAAG--TCG-G--CTATA---G-TTATGCCGCT-GTTTA--AAAA--GGGGGATT-C----CG--A---T---TG-T---GC-T-T---C--A--A---ACTACAGACCAGTAT-CTTTACTT------AGCTGT-ATTGGCAA---ACTT------A-TGGAAAG-GACCATG----TACAAAC--ACCCATG-TA--A---CC---ATT-GCT---TTGA-TAAC--AATTTGA--TA-TA-TA-GTA----AACAATCCGGTTTT---CT--AAG-A-GGCCTTTCCAC-AGTTT
gi|96875 : ttaataagtcattcaattttaaaaaaatactcgtTT---AATAGTTCT-ATACAA----G-A---A--AGTAT-T-T-T-C-CCAA---AAC-TCA---TGGAAGA-TC--G--CTCAA---G-TTACTCCAAT-CTTCA--AAAA--GGGAGA-T-AAAA-CATTA---A---C--T--------T---C--T--A---ATTATAGACCCGTTCACTT--CTA------AGCTGT-TGTGGAAA---GATT------C-TTGAAAA-ATTAGTT----TCTAGAA--ATATATA-TA--A----------C-TTC---TTGACAAAT--CAACT-A--TTGTA-CA-AAT----ATCAGTCTGG
gi|96876 : -A---A--TATCAAT-A-T-CAC--A---GAA--CA---AGAAAT--TT-----CTGAT---G-TAATGCCATT-ATTTA--AAAA--AGA----TGCTAA--A--G---A---TA-T---TC-CAT---C--A--A---ACTATAGACCTATTT-CATTAATT------AGATGT-ATTGGTAA---GGTC------A-TGGAAAG-AGTAATA----TTCAAGC--ATTTATA-CA--A---TTA--TTT-ACA---TTTA--AAT--AACCTGA--TT-TA-TA-AAA----ATCAGTCGGGGTTT---CT--CCC-A-GGTCATTCAAC-AATTT
gi|96877 : --T--A---ACTATAGACCTATAT-CACTGTTA------AGC-GTAATTGGCAA---AGTG------T-TTGAAAG-ACTTATT----TTTAAAC--ACATGTA-TA--A---TT---TCT-TTC---GTGA-TACT--AATTTTA--TT-T--CGTCAT----TTCAATCTGGTTTT---GT--TCC-T-GGTGATTCAAC-AATT
gi|96878 : caaaagtctggaaagaagcatttgtatgcgctgtttataaaaaaggagacccttctttggttaa-TTA---TGGAAG--TCA-G--CTACT---G-TAATGCCTCT-TTTTA--AGAA--AGG----T-CAAA-CA--A---A---CG-T---GC-CAT---C--T--A---ATTAAAGGCCAATAT-CTTTATTA------AGCTGT-GTTGGTAA---ACTT------A-TGGAAAG-GGTTGTC----TACAAAC--ATATTTA-TA--A---TT---TTC-TGA---TTGA-AAAT--AAACTAA--TT-TA-CA-AAT----TGCAATCCGGATTT---CT--TAA-G-GGCCATTCGACAAGTT
gi|96879 : gATCCCACT-GTTTA--AAAA--GGGGGATT-C----CG--A---T---TG-T---G----T---T--TGAA---ACTTCACACCAATAT-CTTTACGT------AGCTAT-ATTGACAA---ACTT------A-TGGAAAG-GACCATACATGTACAAAC--ACATATA-TA--A---CC---ATC-TCT---TTGA-TAAC--AATTTGA--TG-TA-TA-GTA----AACAGTCCGGTCTT---C----AA-GAGGTCATTCCAC-AGTTT
gi|96880 : aT-TTTTA--AAAAAAGAG----T-CAAA-CA--T---A---T-------C-CGT---C--A--A---GCTAAATACCAATTT-CTTTAATT------AGTTGT-ATTGTTAA---GGTA------A-TGAAGCG-TATCGTT----TTCAAA---ATATATAACA--A---AT---ATC-TATAGTTTGA----T--GACTTAA--TT-TATCA-AA-----ATCAATCAGGATGT---TTACCAA-G---ACATTCGAC-TGTTT
gi|96881 : TTG------AGTTTT-GTTAGTAA---ATTA------A-TGGAAAG-AGTTGTT----TACAAAC--ATATTTA-TA--AT--TT---TTT-TTT---TTGC-TAAT--AA--TTA--TA-TA-CA-AGT----TACTGTCAGGATTT---TT--AAA-A-GGTCATTC
gi|96882 : A------AG-TAT-GTTGGTAA---ACTT------A-TGGAAAG-AGTTGTC----TACAAAC--ATATTTA-TA--A---TT---TTC-TGA---TTGA-AAAT--AAACTAA--TT-TA-CA-AAT----AGCAATCCGGATTT---CT--TAA-G-GGACATTCGAC-AGTTT
gi|96883 : AA---ACTTGAATGGA-TGGAAAG-AGTCGTT----TACAAAC--ACATGTA-TA--ACTTTT---TTT-TTG---TTGC-TAAT--AACTTGA--TA-TA-CA-AGC----TACAATCAGGTGTT---TT--AAA-A-GGTCACTCAAC-TGTT
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|96853 ): ACTTTACCACAATACATTCCCAAAACAGATGTTTCATTAGAAACTATTACTATAACTGAGCAGGAAATAAAATATTTTGAAAATACTAGATATAAATAAAGCCAGTGGCAGTGATATTATAAGCCACAATATACTAAAGGAAACAGCTACAGTTATATCAAAGCCTCTATGTATTATTTTTAATAGATCCCTAAGTGAGTGTTGCTTTCCAGAATGCTGGAAATTTGCAAATGTCATGCCATTGTTTAAAAAGGGATGTGCTAATGTTACAACTGATTATAGACCGATTTCTTTATTGAGTTGTGTTGGAAAACTTTTTGAAAGAGTT
Unaligned ( gi|96867 ): AAATAAAGTAAGCGGTACTGACACTATAAGTCACAAAATGCTTAAAGGTGCTGTAAGAACAATTTCTGAACATCTTACTCTTTTATATAATCGTTCTATTACCGAAAGTCATTTCCCTAACTCATGGAAAATAGCCCATGTAACTCCTATATTTTTGAAAGTGGATAAGTCAATTCCATCTAATTATAGACCAGTTAAGTTGCTAAGCTGTGTCGGAAAGATTTTAGAAAGAATAATTTTTAAACAAATGTATAACTTCTTCTTGAGTAACAATTTATTGTATAAAAACCAGTCTGGCTTTTT