lowQualScore : 11111 11111111111111111 2222222222222222222222222222222222222 1111111111 1111111111111 22222222 333333333333333333333333333333 222222222222222 111111111 11111111111111111 1111111 1
lowQualScore : 999 1 44 666666 11111 1 88888888888888888 222 1 1 3 3 6666 1 7777777777 7777777777777777777777777777777777777 4444444444 66 3 55 1 7777777777 555555 1 4 333 111 333 1 9999999999999 55555555 3 111111111111111111111111111111 3333 3333 111111111111111 555555 1 6 1 22 33 1 5 1 6666 222222222 66 55555555555555555 1 1111111 888 8 0 0 2 3333 1 1 2
lowQualScore : ... . .. ...... ..... . ................. ... . . . . .... . .......... ..................................... .......... .. . .. . .......... ...... . . ... ... ... . ............. ........ . .............................. .... .... ............... ...... . . . .. .. . . . .... ......... .. ................. . ....... ... . . . . .... . . .
lowQualScore : 333 3 11 111111 00000 3 77777777777777777 111 9 2 5 2 1111 1 7777777777 5555555555555555555555555555555555555 7777777777 44 3 55 1 1111111111 666666 1 4 777 888 777 1 7777777777777 33333333 2 333333333333333333333333333333 7777 3333 444444444444444 777777 1 3 0 88 55 0 1 0 3333 222222222 00 99999999999999999 0 5555555 666 4 6 6 6 7777 2 2 5
consensus : TAAAATA-N-T-TTG-ACCCA----T-TT---NAT-AAANG-A---TGG--A----C---CAAAGTT-A-AAA-AA--T-T-TAA--------G-AAC----N-G------C---GAA--------A--------A----------TAAAAGNCCAGGC-G-ACNGA-----ATCGAA-----NG-CTTTTTCAAAAT---C---A---A-T---N---AG---TAGTAACATG---CCT-GG------T---A-NA----TGAT-TN-----TT----T----TC---T------A---NATA--AAACATTANAT-C--A--T-ACAAT-AG----T----CN--NGTATTTTCA-CC-N---------------ATGTATCN---N--CCTGNTAA-AAANCCTGTTTGATCCTCA----TTAAT-A-A-TAAATG
Reference ( gi|21603 ) : TAAAATA-C-T-TTG-ACCCA----T-TT---AAT-AAAGG-A---TGG--A----C---CAAAGTT-A-AAA-AA--T-T-TAA--------G-AAC----A-G------C---AAA--------A--------A----------TAAAAGCCCAGGC-G-ACCGA-----GTCAAA-----TG-CTTTCTCAAAGT---C---A---A-T---G---AG---TAGTAACATG---CCT-GG------T---T-CA----TGGT-TC-----TT----T----TC---T------A---AATA--AAACATTAGAT-C--A--T-ACAAT-AA----T----CG--AGTATTTTCG-CC-A---------------ATGTATCG---G--CCTGACAA-AAATCCTGTCTGATCCTCA----TTAAT-A-A-TAAATG
gi|21604 : TAAAATA-C-T-TTG-ACCTA----T-TT---AAT-AAAGG-A---TGG--A----T---CAAAGTT-A-AAC-AA--T-T-TAA--------G-AAC----A-G------C---AAA--------A--------A----------TAAAAGCCCAGGC-G-ACCGA-----GTCGAA-----TG-CTTTCTCAAAGT---C---A---A-T---G---AG---TAGTAACATG---CCT-GG------T---A-CA----TGAT-TC-----TT----T----TC---T------A---AATA--AAACATTAGAT-C--A--T-ACAAT-AA----T----CG--AGTATTTTCG-CC-A---------------ATTTAGCG---G--CCTGACAA-AAATCCTGTCTGATCCTCA----TTAAT-A-A-TAAATG
gi|21606 : TAAAA-A-C-T-TTG-ACTCA----T-TT---AAT-AAAGG-A---TGG--A----C---CAAAGTT-A-AAA-AA--T-T-TAA--------G-AAC----A-G------C---AAA--------A--------A----------TAAAAGCCCAGGC-G-ACCGA-----GTCGAA-----TG-CTTTCTCAAAGT---C---A---A-T---T---AG---TAGTAACATG---CTT-GG------T---A-CA----TTAT-TC-----TT----T----TC---T------A---AATA--AAACATTAGAT-C--A--T-ACAGA-AA----T----CG--AGTATTTTCG-CC-A---------------ATGTATCG---G--CCTGACAA-AAATCTTGTCTGATCCTCA----TTAAT-G-A-TAAATG
gi|21605 : TAAAATA-C-T-TTG-ACCCA----T-T----AAT-AAAGG-A---TGG--A----C---CAAAGGT-T-GAA-AA--T-T-TAA--------G-AAC----A-G------C---AAA--------A--------A----------TAAAAGCCCAGGC-G-ACCGA-----GTCGAG-----TG-CTTTCTCAAAGT---C---A---T-T---T---AG---TAGTAACATG---CCT-GG------T---A-CA----TGAT-TC-----TT----T----TC---T------A---AATAATAAATATTAGAT-C--A--T-ACAAT-AA----T----CG--AGTATTTTCG-CC-A---------------ATTTAGCG---G--CCTGACAA-AAATCCTGTCTGGTCCTCA----TTAAT-A-A-TAAATG
gi|21607 : TAAAATA-T-T-TTG-ACCCA----T-TT---AAT-AAAGG-A---AGG--A----C---GAAAGTT-A-AAA-AA--A-T-GTA--------T-AAC----A-G------C---AAA--------T--------A----------TAAAAGTCAAGGT-G-GCTGA-----ATCGAA-----TG-CTTTCTCAAAGT---C---A---A-T---T---AG---TAGTAGCATG---CCT-GG------T---A-AA----TGAT-TA-----TT----T----TC---T------A---AATT--AAACATTGTAT-C--A--A-TCAGT-AA----T----CG--AGTATTTTCA-CC-A---------------ATATATCG---A--CCTAATGA-AAATCCTGTCTGATCCTTA----CTAAT-A-A-AAGATG
gi|21608 : TAAAATAAC-T-GT--ATCCA----T-TT---TTT-AATTG-A---AGA--G----C---CAAAATT-G-AAA-AA--C-T-GTA--------G-AAC----T-G------A---GAA--------A--------A----------TAAAAGACCAACT-A-ACGGA-----ATCAAA-----TG-CTTTCTCAAAAT---C---G---A-T---T---AA---AAGAAGCATT---CCA-GG------T---A-AA----TGTT-GT-----TT----T----TC---A------A---CATA--AAACATAAGGT-C--A--T-ACAAT-AA----T----CT--AATATTTTCA-CC-T---------------ATATATCT---G--CCAGATAA-AAAACCTGTTTGATCTTCA----TTAAA-A-A-TA
gi|21609 : TAAAATT-G-T-TTA-ACCCA----T-TG---TTT-GAAGG-A---CGG--A----C---CAAAATT-A-AAG-AA--A-T-CGA--------G-GAC----T-T------C---AAA--------T--------A----------GAAAGTTCCAGTT-A-ACGGA-----ATCAAA-----GA-CTTTTTCAAAAT---C---G---A-T---T---AA---GAGTAGCATT---CTT-GG------T-----AA----TTGTCTT-----TT----T----TC---T------A---CATA--AAACATGAAGT-C--A--T-ATAAT-AG----T----CG--AATATTTTCT-CC-A---------------ATATATCT---A--CCAGATAA-AAAACCTGTTTGGTCTTCA----TTGAT-A-ATTAAA
gi|21610 : TAAAATA-A-T-TTA-ATCCA----T-TT---TTT-AAAACTA---TG---A----C---CAAAATT-A-AAA-AAACG-T-TAA----------AAC----C-T------C---CTC--------A--------A----------TAAACGACCATGA-G-ATAGT-----ATCAAG-----TG-CTTTTTCGAAAT---C---AGCAA-T---A---AC---CAATAAC------CCT-GG------T---A-TA----TCAT-TT-----TT----T----TC---T------GTGTAATA--AAAGA---GAT-C--A--T-A-GAT-AG----TG---CG--AGTGTTTTCG-CC-A---------------ATATATCT---T--CCTTCCAA-AAATCCTGTCTGATCATCA----TTTAT-A-A-CA
gi|21611 : TGAAATAAC-T-GT--ATCCA----T-TT---TTT-AATTG-A---AGA--G----C---CAAAATT-G-AAC-AA--C-T-CTA--------G-AAC----T-G------A---GAA--------A--------A----------TAAAAGACCAACT-A-ACGGA-----ATCAAA-----CG-CTAACTCAAAAT---C---G---A-TT--A---AA---T-GAAACATT---CCA-GG------T---A-AA----TGTT-GA-----TA----T----TC---A------A---CATA--AAACATAACGT-C--A--T-ACAAT-AA----T----CT--AATATTGTCA-CC-T---------------ATATATCT---G--CCAGATAG-AAAGCCTGTATGATCTTCA----TTAAT-A-A-TA
gi|21612 : TAAAATA-T-A-TTT-ATCCA----T-TT---TTT-GAAAT-C---TGG--A----C---CAAATTT-ATAAA-AA--T-T-TAA--------T-ACC----TTG------T---GAA----------------------------TAAAATGCCATGC-A-ACCGA-----GTCAAA-----GG-CTTTTTCAAAAT---C---A---ATT---G---AA----AGTAATA-G---TCTAGG------T---A-TA----TAAT-TA-----TT----T----TC---G------G---TATA--AAACATTAAAT-C--A--T-ATAAA-AG----T----T----TTATTTTCT-CCTATATACATGTGTATATATGTATCT---G--TTTGGGAT-GAAACCTGTTTGATCTTCA----TTAAT-A-A-TATAT
gi|21613 : TAAAATA-A-T-TTA-GTCCA----T-TT---TTTTAAATT-A---TG---A----C---CAAAATA-A-AAA-AACGT-T-TAA-----------AC----T-T------C---CTC--------A--------A----------TAAACGACCATGA-G-ATAAT-----ATCAAA-----CG-CTTTTTCGAAAT---C---AGCAA-T---A---AA---CAATAAC------CCT-GG------TATAT-CA----T--T-TT-----TT----T----TC---T------GTGTAATA--AAACA---GAT-T--A--T-A-GAT-AG----TG---CG--AGTGTTTTCG-CC-A---------------ATATATCT---T--CCTTCCAA-ACATCCTGTCTGATCATCA----TTAAT-A-A-CA
gi|21614 : TAAAATA-C-T-TTG-ACCCA----T-TT---AAT-AAAAG-A---TGG--A----C---CAAAGTA-A-ATA-AA--A-T-TAA--------G-AAC----A-G------C---AAA--------A--------A----------TAAAAGCCCAGGC-G-AC
gi|21616 : TAAAATA-CTT-TTT-ACTCA----T-TT---AAT-AAAGG-A---TTG--G----C---CAAAGTT---AGA-AA--T-T-TAA--------G-AAC----A-G------C---AAA--------A--------A----------TAAAAGTCCAGGC-G-ACTGA-----GTCAA
gi|21615 : TAAAATA-A-T-TTA-ATCCAA---T-TT---CTT-AAATT-T---TT--------C---CAAAATT-A-AAA-AA--CAT-TAA----------AAC----C-T------C---ATC--------A--------A----------TAAAAGACCATGA-G-AGTGT-----ATCAAA-----AG-CTTTTTCGAAAT---C---A---A-T---G---ATAACTAGTAA---A---CCT-GG------T---A-CA----TCAT-AT-----GT----T----TC---T------G---CATA--ATGGAATAAAT-C--A--T-A-AAT-TG----TA---CG--TGTATTTTCA-CC-A---------------ATGTATCG---T--CC-GGCAAGAAAACTGGTTTGGTCTTCA----TTAAT-A-A-tg
gi|21617 : TAAAATA---T-GTGTATCCA----T-TTTTTAAT-----------TGA--A----CAGTCAAAATTGA-AAA-AA--C-T-GTA--------G-AAC----G-G------A---GAA--------A--------A----------TAAAATACCAACT-A-ACGGA-----ATCGA--------------TTAAA-----------------------------AGAAGCATT---CCA-GG------T---A-AA----TGTT-GT-----TT----T----TC---A------A---CATA--AAACATAAGGT-C--A--T-ACAAT-AA----T----TT--AACATTTTCA-CC-T---------------ATATATCATCTG--CCAGATAATAAAACCTGTTTGATCTTCA----TTAAT-A-A-TA
gi|21620 : TAAAATA-A-A-TTC-ACCCA-------T---GAT-ATA---A---TGG--AGTTTC---CAAATCC-A-AAA-TA--T-T-TTA--------A-AAC----T-T------T---ATT--------A--------A----------TGAAAGACCAAGA-G-ATGGA-----ATCAAA-----GG-CTTTTTCAAAAT---C---A---A-T---T---AG---TAACAATAAC---CCA-GA------T------A----TGTT-TT-----TTTC--T----TC---C------G---TATT--CTTTATTATAT-C--A--T-ATAAT-AA----T----TT--CGTATTTTCT-CC-T---------------AAGTATCG---T--CCTG-CAATGAACCCAGTTTGATC
gi|21618 : TAAAAAA-C-T-TTG-ACCGA----A-GA---GAT-AACTG-A---TTC--C----C---CGAATTT-A-AAG-AA--T-T-TCA--------A-AAC----T-T------T---GAA--------T--------A----------TGAAGGCCCAAGA-A-AATGA-----ATAGAA-----TG-CCTTCTCAAAAT---C---T---A-C------------TAGTAATATAAGTCCT-GG-------------A----AGAC-TA-----TT----T----TC---TTCTGC-A---AAT----TGCATTATAT-CAAA--T-ATAGT-------T----CT--AGTAATTTCA-CC-A---------------ATGTACCT---A--CCTG-CAATAAACCCTGACAGGCTCTCA----TTTAT---A-TAA
gi|21619 : TAAAAAA-C-T-TTG-ACCCA----A-GA---GAT-AATTG-A---TTT--G----C---CGAATCT-A-AAG-AA--T-T-TCA--------A-AACTT--T-G------C-----A--------T--------A----------TGAATGCCCAAGA-A-AGTGA-----ATCGAA-----TG-CCTTCTCAAAAT---C---T---A-C------------TAATAAAATAAGTCCA-GG------C---A-AA----CTAT-TT-----TC----T----TC---TGC----A---AAT----TGCATTATGT-CAAA--T-ATAGT-------T----CT--TGTATTTTCA-CC-C---------------ATGTACCT---A--CCCG-CAATAAACCCTGACTGACTCTCA----TTAAT-
gi|21624 : TAAAATA-G-T-TTG-ATCCA----A-TT---AAT-AAAAG-A---ATT--A----C---CAAAGTA-A-AAA-TA--T-T-TAA--------G-AGC----T-T------T---TGA--------A--------A----------CAAAA-C---GGT-G-ATCAATGCT-ATCAAA-----GG-CTTTTTCCAAAT---C---A---G-C---A---AA---AAAGATTAAG---CCA-GG------T---T-TATTTTTAGT-TA-----TTTATAT----TT---T------C---GAT----AACTTCAAA------------AAT-AG----TG---TG--AATATTTTCA-CC-T---------------ATGTACCG---T--CCTTTTAA-AAAACCAGTTTGACTATCA----TTGAT-ATA-TAAA
gi|21621 : TAAAATA-A-T-TTT-ATCCA----G-TC---AAT-AAAT------TCGTTA----C---CAAACTT-A-AAA-TA--T-TGTAA--------T----------G------TTTTGAA--------A--------A----------TAAAATTATGGTC-A-ACACT-----GTCGAA-----CG-CTTTTTCAAAAT---C---A---G-C---A---AA---GAATATCAGT---CCC-GG------T---C-TA----TTGT-CG-----TT----A----TT---C------A---AAT------CGTCA-ATGC--A--T-TCAAA-AA----TTTC-CT--TATGTTTTCG-CC-A---------------ATGTAACG---T--CCTTTTAA-GAATCCTGTCTGACTGTCA----TTGAT-A-A-
gi|21626 : TAAAATG-G-T-TTG-ATCCA----A-TT---AAT-AAAAG-A---ATT--A----C---CGAAGTT-A-AAA-TA--T-T-TAA--------G-AGT----T-T------T---TGA--------A--------A----------TAAAA-CC---GT-G-ATC-ATTGCTATCAAA-----GG-CTTTTTCGAAAT---C---A---G-C---A---AA---AAAGATTAAG---CCA-GG------T---T-TA----T-TT-TC-----GT----TA---TT---T------A---TAT-------TTTCGAT-T--AC-T-TCAAA-AA----TAGTGCG--AATATTTTCA-CC-T---------------ATGTACCG---T--CCTTTTAA-AAAAACAGTTTTACTATCA----TTGAT-A-A-
gi|21623 : TAAAATA-G-T-TTA-ATCCA----A-TT---TAT-AAAAG-AGTTT---------C---CAAAATT-A-AAATAA--G-T-TAG--------G----------G------CTTTAAA--------A--------A----------TAAAATCATGGTCTGTACTA-------TCGAA-----TA-CCTTTTCAAAAT---C---A--------------G---TAAAAATATAAGCCCT-GGTTTATTT---T-CA----TCAT-TCAAATGTT----T----TA---T------A---TATA------ATTACTT-C--A----AAAAT-AGT---T----CG--ATTGTTTTCA-CC-T---------------ACATATCT---T--CCTTTTAA-AAAGCCTGTTTGACTATTA----TTGAT-A-A-
gi|21622 : TAAAA-A-C-T-TTG-ACCCA----------------AA---A---TTT--C----C---CGAATTT-A-AAG-TA--T-T-TCA--------A-AAC----T-T------T---GAA--------T--------A----------TGAAGGCCCAAGA-A-AGTTA-----ATCGAA-----TG-CCTTTTCAAAAT---C---T---A-C------------TAATAAGATAAGTCCA-GG------C---A-AA----TGAT-TT-----TC----T----TC---TGC----A---AATT--G--CATTATGT-C--AAAT-ATAGTTCA----T----CT----TATTTTCA-AC-C---------------ATGTACCT---A--CCCG-CAATAAACCCTGACTGACTCTCA----TTAATCA-A-
gi|21629 : TAAAAAA-C-A-TTA-ATCCA----T-TT---TTT-AATTG-A---TTC--T----C---CAAAGTT-A-AAATAA--T-C------------G-AA-----A-GTTT---T---ATA--------A--------A----------TGAAATT----GT-G-ATCTACACT-GTCAAA-----TG-CTTTTTCAAAATCTGC---A---A-A---G---AA---TAATA----G---ACTAGG-------------G----TGGT-CG-----TT----T----TCATTT------A---CATA--ATCTAGTACAT-C--A--T-AT-AT-AAG---T----CT--TATATTTTCA-CC-G---------------ATGTAACG---GTTTCTAATAA-AA--CCAGTTTGTGCCTTA----TCAAT-----TAAA
gi|21627 : TAAAAAA-C-A-TTA-ATCCA----T-TT---TTT-AATTG-A---TTC--T----C---CAAAGTT-A-AAATAA--T-C------------G-AA-----A-GTTT---T---ATA--------A--------A----------TGAAATT----GT-G-ATCTACACT-GTCGAA-----TG-CTTTTTCAAAATCTGC---A---A-A---G---AA---TAATA----G---ACTAGG-------------G----TGGT-CG-----TT----T----TCATTT------A---CATA--ATCTAATACAT-C--A--T-AT-AT-AAG---T----CT--TATATTTTCA-CC-G---------------ATGTAACG---GTTTCTAATAA-AA--CCAGTTTGTGCCTTA----TCAAT-----TAAA
gi|21625 : TAAAACA-T-T-TTA-ATCCA----A-CT---AAT-AAAAG-AATTT---------C---CAAAATT-A-AAA-TA--A-T-TAA--------G-CAC----T-T------T---AAA--------G--------A----------TATAATT----GT-G-GTCAATACT-ATCGAA-----AG-CTTTTTCAAAAT---C---G---G-C---A---AA---AAAAAATAAA---CCA-GG------T---T-------TG----------TT----T----TCA--T------C---ATTT--AAACTTTCAAT-C--AC-T-TCAAA-AATGGTT----CG--TATGTTTTCA-CC-A---------------ATATAGCG---T--CCTTTTAG-AAACCCCGTTTGACTGTCA----TTTAT-A-A-
gi|21630 : TAAAATA-T-A-TCT-ATCCA----T-TT---TTT-GAAAT-C---TAG--A----C---CAAAGTT-ACAAA-AA--A-T-TAA--------T-ACT----T-G----------GTG--------A--------A----------TAAAGTGCCATGC-A-ACCGA-----ATCAAA-----GG-CTTTTTCAAAGT---C---A---A-T---
gi|21631 : TAAAATA---T-TTA-ATCCA----A-TT---GAT-AAAGG-A---GTT--A----C---CAAAATT-A-AAA---------TAT--------GCAAC----A-G------CTT-TAA--------A--------A----------TAAAATC----GT-G-ATCTATACT-ATGGAA-----TGCCTTTTTCA-------C---A---A-T---T---AGC--TAAAAATATAAGTCTT-GG------T---T-------TG---TC-----TT----CAACATG---T------A---AATA--TTCTATTACCT-C--A----AAGAT-AGT---T----CG--AATGTTTTCG-CT-T---------------ATATATCT---T--CCTTTTTA-AAA-GCTGTTTGGCTGTTA----TTGAT-A-A-
gi|21632 : AGAATA-A-TCTTG-ATCCA----TCTT-----T-AAAAG-AC--TGG--T----C---CAAAATG-A-TAA-CA--A-T-CAA--------G-GAT----C-T------C---AAA--------A--------A----------TGAAATTCTACGC-A-AGAGA-----GTCAAA-----TG-CTTTTTTGAAGT---C---A---A-T---C---AA---AAGGAGGAGT---CCT-AGAA----T---C-TA----TTGT-GT-----TT----T----TC---T------T---TATA--AAACATTACAT-C--A--T-ATATT-AG----T----GT--AGTATTTTCC-TT-T---------------ATATATC
gi|21633 : AAATA-G-T-TTA-ACCCA----T-TG---TTT-GAAGG-A---CTA--A----C---CAAAATT-A-AAG-AA--A-T-CAA--------G-GAC----T-T------T---AAA--------T--------A----------GAAAGTCCCAGTT-A-ACAGA-----ATCAAA-----GG-CTTTTTCTAAAT---C---G---A-T---T---AA---GAGTAGCATT---CTT-GG------T---A-TT----TGTC-TT-----TT----T----TC---T------A---CATA--AAACAT--GGT-C--A--A-ATAAT-AG----T----TG--AATATTTTCT-CC-G---------------ATTTATCT---A--CCAGATAA-AATACCTGTTTAATCTTCA----TTTAT-A-ATTAAA
gi|21635 : -TTG-ATCCAGGACT-GT---ATT-AAAGG-A-------------C---CAAAATT-G-AAA-AA--T-T-TTA--------T-TACTTTTT-G------T---ATA--------A--------A----------TGA----CCAAGA-T-AAGGA-----AGCAAA-----AG-CTTTTTCAAAGT---C---A---A-CAAGG---AG---CAGTAAT------CCT-GG------A---A-TA----TGAT-TT-----TC----C----TC---T------A---AATA--ATGCATTATGT-C--A--T-ACGTT-AA----T----CT--TGTATTTTCA-CC-T---------------ATATAATG---A--CCTGTTAA-AAATCCAGTTTGATCTCTA----TTTAT-A-A-
gi|21636 : -ACACA----T-TT---TAG-GAAGG-A---TAG--A----A---TAAAAAT-A-A-----------TAA--------G-AAC----A-T------C---AAA--------A-------------------TAAAAGCCCAGGC-A-ACTAA-----ATCGAA-----TG-CTTTCTCAAAAT---C---A---T-T---T---AG---TAGCACCATG---CCT-GG------T---A-AA----TGAT-TC-----TT----T----TC---T------A---CATA--AAACATTATTT-T--A--TAAAAAA-AA----A----CGCTAGCATAATAA-CC-A---------------ATATATTA---G--CCTCATAA-AAA-CCTG
gi|21637 : ---TGG--T----T---CAAAGTT-ATAAA-AA--T-C-TAACTTACCATA-ATC----A-AAGACTTT---AAA--------A--------A----------TAAAATGCCAAAT-A-ACGGA-----ATTAAA-----TG-CTTTTTCGAAAT---C---A---A-T---C---AA---AAGAAGGA-G---TCC-GGGGAGA-T---TGCA----TTAT-TC-----C---------------------------GCA--AAAAATTATAT-C--A--T-ACATT-AA----T----CT--GGTATTTTCT-TG-T---------------ATGTACCT---T--CCCGCTAA-GAAATATGTTTGATCTTTA----TGTAT-A-A-
gi|21638 : ---CATAATT-G-AAA-AA--CAT-TAA----------AAC----C-T------C---ATC--------A--------A----------TAAAAGACCACGA-G-AGTGT-----ATCAAA-----AG-CTTTTTCGAAAT---C---A---A-T---GATAAC---TAGTAA---A---CCT-GG------T---A-CA----TCAT-AT-----GT----T----TC---T------G---CATA--ATGGAATAAAT-C--A--T-A-AAT-TG----TA---CG--TGTATTTTCA-CC-----------------ACGTA-CG---G--C--AAAAA-AAA--CTGTTCGGTCTTCA----TTAAT-A-A-
gi|21639 : ---CAAAATT-G-AAA-AA--C-T-TAA--------A-TAC----T-T------T---ATA--------A--------G----------TAAAAGAACAGGA-T-ATGGA-----ATCAAAGGTGTTG-TTTTCTT----T---T---T---A-T---T---AA---CAGTA-CAAGA--CCA-GG------A---A-TA----TTGT-TG-----AC----T----TC---A------G---CATA--GTGCATAACAT-C--G--T-ATAAT-TG----T----CT--TGTATTCTGT-CC-C---------------AT--ATCG---T--CCTGACAT-AAATCCTCTCTGGTCCTCG----TGGAT-A-A-
gi|21640 : AA-AA--T-T-TAA--------A-AAA----A-ATT----C---AAA--------GTCTTTTTGA----------TGAAAGACCAAGA-G-AGAGT-----GTCAAA-----GG-CTTTCTCAAAAT---C---T---A-TTAAA---AG---TAGTAAT------CCT-GG------------AA----T-GT-TT-----TT----T----TC---TTCAGAGA---GATG--TAAAAT---GT-C--A--T-ATAAA-AG----T----CT--TGTGTTATCA-CC-T---------------ATATACCT---T--CCTTTTAT-AAAACCTGTCTGTTCTGCA----CTTAT-A-A-
gi|21641 : A-AA--T-T-TAA--------A-AA-----A-G------C---GTA--------G--------AGTCTTTCTATTAAAAGACCAAGA-T-AATGT-----ATCGAA-----AG-CTTTCTCAAAAT---C---A---A-T---T---AG---CAGTAATAAT---CCT-GG------T------A----TATT-TA-----TC----T----TCA--C------A---AATA--TG-CATTACGT-C--A--T-ATAAT-AA----T----CT--AGTGTTATCACCC-ATATAC----------ATGTATCT---G--CCTTTTAT-AAAACCAGTTTGTTCTTTAC---TTAAT---A-TAA
gi|21628 : A-AA--T-T-TAA--------A-AAA----ATT------C---AAAGTCTTTTTG--------A----------TGAAAGACCAAGA-G-AGAGT-----GTCAAA-----GG-CTTTCTCAAAAT---C---T---A-TTAAA---AG---TAGTAAT------CCT-GG------------AA----T-GT-TT-----TT----T----TC---TTCAGAGA---GATG--TAAAAT---GT-C--A--T-ATAAA-AG----T----CT--CGTGTTATCA-CC-T---------------ATATACCT---A--CCCTTTAT-AAATCCTGTCTTGTATACAATATTTAAT-A-A-
gi|21642 : taaaaaagtttgatccagttttgaattgaatctccTCGGA-----GG-CTTTCTCAAAAT---C---A---A----------A---TAGTTACA------AT-AA------T---T-AA-----GGTATG-----TT----G----TC---T------G------------CATTATAT-C--G--T-ATAGT-AC----T----CT--TGTATTTTCT-CC-T---------------AAATATCG---T--CCTG-CAATGGACCCTGTTTTATCC
gi|21643 : A-----TG-TTTTCTCAAAAT---C---A---T-T---T---AG---TAGTAACATG---------------T---A-AA----TGAT-T------------T----TC---T------A---CATA--AAACATCAGAT-C--A--T-GCATT-GG----T----CG--ACAAAAATCA-CC-A---------------ATATATCA---G--CCTCACAA-AAA-GCTGTTT
gi|21644 : TTTCGAAAT---CTATA---A-T---A---AC---TAGTAA---A---CCT-GG------T---A-CA----TCAT-AT-----GT----T----TC---T------G---CATA--ATGGAATAAAT-C--A--T-A-AAT-TG----TA---CG--TGTTTTTTTA-CC-A---------------ATGTATCC---T--CC-GGCAAGAAAACCGGTTTGGTCCTCA----TTAAT-A-
gi|21645 : CATT---CCA-GG------T---T-AA----TGTT-GT-----TT----T----TC---A------A---CATA--AAACATTCG-T-C--T--T-ACAAT-AA----T----CT--TATATTGTCA-CC-T---------------ATATATTT---G--CCTGATAA-AAAGCCTGTTTGATCTTCA----TTAGT-A-A-TA
gi|21646 : A--AAACATAAGGT-C--A--T-ACAAT-AA----T----CT--TATATATTCA-CA-T---------------ATATATCA---G--CCAAATAA-AACACCTGTTTGATCTTCA----TTAAA-A-A-TA
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|21634 ): TTTTATCCAGTCAATAAACTTGTTACCAAACTTAAAATAGTGTAATGTTTTAAAAATAAAATTATGGTCAACACTATCGAACGCTTTTTCAAAATCAGCAAAGAATATCAGGCTCGGTCTATTGTCATTATTCAAGTGGTTAATGCATTCAAAAATTGTCCTTATGTTTTCGCCAATGTAACGTCCTTTTAAAAATCCTGTCTAACTGTTGTTGATAAT
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111 222222222222222222222222222222 1111111 11111111 111111 1111111 111111111111 111
lowQualScore : 2 1 33 5555 66 1 88888888888888888 2 1 3 2 7777 1 555555555555555555555555555555 4444444444 2 99999999 1 5555 1 0000000 1 555555555 333 111 3333 22222222 0 1 999999 222 66666 2222222 2 555555 1 222222222222 22222 22 0 2222 2 2 333 1 4444 6 2222 2 111 4444 88888888888888888 3333333 111 22 33 3 2 1 1 444 1 1 1 2
lowQualScore : . . .. .... .. . ................. . . . . .... . .............................. .......... . ........ . .... . ....... . ......... ... ... .... ........ . . ...... ... ..... ....... . ...... . ............ ..... .. . .... . . ... . .... . .... . ... .... ................. ....... ... .. .. . . . . ... . . . .
lowQualScore : 3 2 22 9999 77 2 66666666666666666 0 1 3 2 9999 1 555555555555555555555555555555 6666666666 1 88888888 1 2222 0 5555555 4 333333333 666 888 5555 99999999 1 5 222222 555 22222 7777777 0 000000 0 111111111111 55555 44 5 1111 0 3 555 0 2222 2 1111 0 888 4444 66666666666666666 6666666 888 77 44 1 0 1 1 000 1 1 2 4
consensus : TAAAATANT-TTG-ATCCA----TTTNNT-AAANG-A---TGG--A----CCAAAGTT-A-AAA-AA--T-T-TAA--------------GAACT----TC---GAAAA----------TA-AAA-----GN-CC-AGGCGACNG-A-----ATCGAANG---------CTTTTTCAAAAT---C---AAT---NA---A---NAGTAACA-TG---CCT--GG--TANAT-G---A-TTNTT------T-TC---T---A---CAT-----A--AAAC----AT-TANA---T-CAT----ACAATA----G-T---C--TNGTATTTTCGCC----------------NAT------GT---ATCNNCCTGNTAA-AAANCCTGT-TTG-ATCC--TCA-TTAAT-A-A-TAAATG
Reference ( family-529 ) : TAAAATANT-TTG-ACCCA----TTTNAT-AAANG-A---TGG--A----CCAAAGTT-A-AAA-AA--T-T-TAA--------------GAACN----GC---GAAAA----------TA-AAA-----GN-CC-AGGCGACNG-A-----ATCGAANG---------CTTTTTCAAAAT---C---AAT---NA---G---TAGTAACA-TG---CCT--GG--TANAT-G---A-TTNTT------T-TC---T---A---NAT-----A--AAAC----AT-TANA---T-CAT----ACAATA----G-T---C--NNGTATTTTCACC----------------NAT------GT---ATCNNCCTGNTAA-AAANCCTGT-TTG-ATCC--TCA-TTAAT-A-A-TAAATG
gi|21603 : TAAAATACT-TTG-ACCCA----TTTAAT-AAAGG-A---TGG--A----CCAAAGTT-A-AAA-AA--T-T-TAA--------------GAACA----GC---AAAAA----------TA-AAA-----GC-CC-AGGCGACCG-A-----GTCAAATG---------CTTTCTCAAAGT---C---AAT---GA---G---TAGTAACA-TG---CCT--GG--TTCAT-G---G-TTCTT------T-TC---T---A---AAT-----A--AAAC----AT-TAGA---T-CAT----ACAATA----A-T---C--GAGTATTTTCGCC----------------AAT------GT---ATCGGCCTGACAA-AAATCCTGT-CTG-ATCC--TCA-TTAAT-A-A-TAAATG
gi|21604 : TAAAATACT-TTG-ACCTA----TTTAAT-AAAGG-A---TGG--A----TCAAAGTT-A-AAC-AA--T-T-TAA--------------GAACA----GC---AAAAA----------TA-AAA-----GC-CC-AGGCGACCG-A-----GTCGAATG---------CTTTCTCAAAGT---C---AAT---GA---G---TAGTAACA-TG---CCT--GG--TACAT-G---A-TTCTT------T-TC---T---A---AAT-----A--AAAC----AT-TAGA---T-CAT----ACAATA----A-T---C--GAGTATTTTCGCC----------------AAT------TT---AGCGGCCTGACAA-AAATCCTGT-CTG-ATCC--TCA-TTAAT-A-A-TAAATG
gi|21605 : TAAAATACT-TTG-ACCCA----TT-AAT-AAAGG-A---TGG--A----CCAAAGGT-T-GAA-AA--T-T-TAA--------------GAACA----GC---AAAAA----------TA-AAA-----GC-CC-AGGCGACCG-A-----GTCGAGTG---------CTTTCTCAAAGT---C---ATT---TA---G---TAGTAACA-TG---CCT--GG--TACAT-G---A-TTCTT------T-TC---T---A---AAT-----AATAAAT----AT-TAGA---T-CAT----ACAATA----A-T---C--GAGTATTTTCGCC----------------AAT------TT---AGCGGCCTGACAA-AAATCCTGT-CTG-GTCC--TCA-TTAAT-A-A-TAAATG
gi|21606 : TAAAA-ACT-TTG-ACTCA----TTTAAT-AAAGG-A---TGG--A----CCAAAGTT-A-AAA-AA--T-T-TAA--------------GAACA----GC---AAAAA----------TA-AAA-----GC-CC-AGGCGACCG-A-----GTCGAATG---------CTTTCTCAAAGT---C---AAT---TA---G---TAGTAACA-TG---CTT--GG--TACAT-T---A-TTCTT------T-TC---T---A---AAT-----A--AAAC----AT-TAGA---T-CAT----ACAGAA----A-T---C--GAGTATTTTCGCC----------------AAT------GT---ATCGGCCTGACAA-AAATCTTGT-CTG-ATCC--TCA-TTAAT-G-A-TAAATG
gi|21607 : TAAAATATT-TTG-ACCCA----TTTAAT-AAAGG-A---AGG--A----CGAAAGTT-A-AAA-AA--A-T-GTA--------------TAACA----GC---AAATA----------TA-AAA-----GT-CA-AGGTGGCTG-A-----ATCGAATG---------CTTTCTCAAAGT---C---AAT---TA---G---TAGTAGCA-TG---CCT--GG--TAAAT-G---A-TTATT------T-TC---T---A---AAT-----T--AAAC----AT-TGTA---T-CAA----TCAGTA----A-T---C--GAGTATTTTCACC----------------AAT------AT---ATCGACCTAATGA-AAATCCTGT-CTG-ATCC--TTA-CTAAT-A-A-AAGATG
gi|21608 : TAAAATAAC-TGT-ATCCA----TTTTTT-AATTG-A---AGA--G----CCAAAATT-G-AAA-AA--C-T-GTA--------------GAACT----GA---GAAAA----------TA-AAA-----GA-CC-AACTAACGG-A-----ATCAAATG---------CTTTCTCAAAAT---C---GAT---TA---A---AAGAAGCA-TT---CCA--GG--TAAAT-G---T-TGTTT------T-TC---A---A---CAT-----A--AAAC----AT-AAGG---T-CAT----ACAATA----A-T---C--TAATATTTTCACC----------------TAT------AT---ATCTGCCAGATAA-AAAACCTGT-TTG-ATCT--TCA-TTAAA-A-A-TA
gi|21609 : TAAAATTGT-TTA-ACCCA----TTGTTT-GAAGG-A---CGG--A----CCAAAATT-A-AAG-AA--A-T-CGA--------------GGACT----TC-----AAA----------TAGAAA-----GTTCC-AGTTAACGG-A-----ATCAAAGA---------CTTTTTCAAAAT---C---GAT---TA---A---GAGTAGCA-TT---CTT--GG--TAATT-G---T-CTTTT------T-TC---T---A---CAT-----A--AAAC----AT-GAAG---T-CAT----ATAATA----G-T---C--GAATATTTTCTCC----------------AAT------AT---ATCTACCAGATAA-AAAACCTGT-TTG-GTCT--TCA-TTGAT-A-ATTAAA
gi|21610 : TAAAATAAT-TTA-ATCCA----TTTTTT-AAAACTA---TG---A----CCAAAATT-A-AAA-AAACG-T-TAA---------------AACC----TC---CTCAA----------TA-AAC-----GA-CC-ATGAGATAG-T-----ATCAAGTG---------CTTTTTCGAAATCAGC---AAT---AA---C---CAATAAC-------CCT--GG--TATAT-C---A-TTTTT------T-TC---T---G---TGT-----A--ATAA----AA-GAGA---T-CAT----A-GATA----G-TG--C--GAGTGTTTTCGCC----------------AAT------AT---ATCTTCCTTCCAA-AAATCCTGT-CTG-ATCA--TCA-TTTAT-A-A-CA
gi|21611 : TGAAATAAC-TGT-ATCCA----TTTTTT-AATTG-A---AGA--G----CCAAAATT-G-AAC-AA--C-T-CTA--------------GAACT----GA---GAAAA----------TA-AAA-----GA-CC-AACTAACGG-A-----ATCAAACG---------CTAACTCAAAAT---C---GAT---TA---A---ATGAAACA-TT---CCA--GG--TAAAT-G---T-TGATA------T-TC---A---A---CAT-----A--AAAC----AT-AACG---T-CAT----ACAATA----A-T---C--TAATATTGTCACC----------------TAT------AT---ATCTGCCAGATAG-AAAGCCTGT-ATG-ATCT--TCA-TTAAT-A-A-TA
gi|21612 : TAAAATATA-TTT-ATCCA----TTTTTT-GAAAT-C---TGG--A----CCAAATTT-ATAAA-AA--T-T-TAA--------------TACCTT---GT---GAA------------TA-AAA-----TG-CC-ATGCAACCG-A-----GTCAAAGG---------CTTTTTCAAAAT---C---AAT---TG---A---AAGTAATA--G---TCTA-GG--TATAT-A---A-TTATT------T-TC---G---G---TAT-----A--AAAC----AT-TAAA---T-CAT----ATAAAA----G-T---T--T--TATTTTCTCCTATATACATGTGTATATAT------GT---ATCTGTTTGGGAT-GAAACCTGT-TTG-ATCT--TCA-TTAAT-A-A-TATAT
gi|21613 : TAAAATAAT-TTA-GTCCA----TTTTTTTAAATT-A---TG---A----CCAAAATA-A-AAA-AACGT-T-TAA----------------ACT----TC---CTCAA----------TA-AAC-----GA-CC-ATGAGATAA-T-----ATCAAACG---------CTTTTTCGAAATCAGC---AAT---AA---A---CAATAAC-------CCT--GG--TATAT-C---ATTTTTT------T-TC---T---GTGTAAT-----A--AAAC--------AGA---T-TAT----A-GATA----G-TG--C--GAGTGTTTTCGCC----------------AAT------AT---ATCTTCCTTCCAA-ACATCCTGT-CTG-ATCA--TCA-TTAAT-A-A-CA
gi|21614 : TAAAATACT-TTG-ACCCA----TTTAAT-AAAAG-A---TGG--A----CCAAAGTA-A-ATA-AA--A-T-TAA--------------GAACA----GC---AAAAA----------TA-AAA-----GC-CC-AGGCGAC
gi|21615 : TAAAATAAT-TTA-ATCCAA---TTTCTT-AAATT-T---TT--------CCAAAATT-A-AAA-AA--CAT-TAA---------------AACC----TC---ATCAA----------TA-AAA-----GA-CC-ATGAGAGTG-T-----ATCAAAAG---------CTTTTTCGAAAT---C---AAT---GA---TAACTAGTAA----A---CCT--GG--TACAT-C---A-TATGT------T-TC---T---G---CAT-----A--ATGG----AA-TAAA---T-CAT----A-AATT----G-TA--C--GTGTATTTTCACC----------------AAT------GT---ATCGTCCGGCAAG-AAAACTGGT-TTG-GTCT--TCA-TTAAT-A-A-
gi|21616 : TAAAATACT-TTTTACTCA----TTTAAT-AAAGG-A---TTG--G----CCAAAGTT---AGA-AA--T-T-TAA--------------GAACA----GC---AAAAA----------TA-AAA-----GT-CC-AGGCGACTG-A-----GTCAA
gi|21617 : TAAAATATG-TGT-ATCCA----TTTTTT-AATTG-A---ACA--G----TCAAAATTGA-AAA-AA--C-T-GTA--------------GAACG----GA---GAAAA----------TA-AAA-----TA-CC-AACTAACGG-A-----ATCGA-----------------TTAAAA-------------------------GAAGCA-TT---CCA--GG--TAAAT-G---T-TGTTT------T-TC---A---A---CAT-----A--AAAC----AT-AAGG---T-CAT----ACAATA----A-T---T--TAACATTTTCACC----------------TAT------ATATCATCTGCCAGATAATAAAACCTGT-TTG-ATCT--TCA-TTAAT-A-A-TAtg
gi|21619 : TAAAAAACT-TTG-ACCCA----AGAGAT-AATTG-A---TTT--G----CCGAATCT-A-AAG-AA--T-T-TCA--------------AAACT----TT---GCATA----------TG-AAT-----GC-CC-AAGAAAGTG-A-----ATCGAATG---------CCTTCTCAAAAT---C---TAC---TA---A---TAA-AATA-AGT--CCA--GG--CAAAC-T---A-TTTTC------T-TC---T---G---CAA-----A--TTGC----AT-TATG---T-CAA----ATA-TA----G-TT--C--TTGTATTTTCACC----------------CAT------GT---ACCTACCCGCAAT-AAACCCTGA-CTG-ACTC--TCA-TTAAT-
gi|21620 : TAAAATAAA-TTC-ACCCA----T--GAT-A--TA-A---TGG--AGTTTCCAAATCC-A-AAA-TA--T-T-TTA--------------AAACT----TT---ATTAA----------TG-AAA-----GA-CC-AAGAGATGG-A-----ATCAAAGG---------CTTTTTCAAAAT---C---AAT---TA---G---TAACAATA--A---CCC--AG---ATAT-G-----TTTTT------T-TC---TTCCG---TAT-----T--CTTT----AT-TATA---T-CAT----ATAATA----A-T---T--TCGTATTTTCTCC----------------TAA------GT---ATCGTCCTGCAAT-GAACCCAGT-TTG-ATC
gi|21621 : TAAAATAAT-TTT-ATCCA----GTCAAT-AAAT------TCGTTA----CCAAACTT-A-AAA-TA--T-TGTAA------------------T----GTTTTGAAAA----------TA-AAA-----TT-AT-GGTCAACAC-T-----GTCGAACG---------CTTTTTCAAAAT---C---AGC---AA---A---GAATATCA-GT---CCC--GG--TCTAT-T---G-TCGTTA-----T-TC-------------------A--AATC----GT-CA-A---TGCAT----TCAAAA----A-TTTCC--TTATGTTTTCGCC----------------AAT------GT---AACGTCCTTTTAA-GAATCCTGT-CTG-ACTG--TCA-TTGAT-A-A-
gi|21622 : TAAAA-ACT-TTG-ACCCAAAA-TTTC-----------------------CCGAATTT-A-AAG-TA--T-T-TCA--------------AAACT----TT---GAATA----------TG-AAG-----GC-CC-AAGAAAGTT-A-----ATCGAATG---------CCTTTTCAAAAT---C---------TA---C---TAATAAGA-TAAGTCCA--GG--CAAAT-G---A-TTTTC------T-TC---T---G---CAA-----A--TTGC----AT-TATG---T-CAA----AT-ATA----G-T---TCATCTTATTTTCAAC----------------CAT------GT---ACCTACCCGCAAT-AAACCCTGA-CTG-ACTC--TCA-TTAATCA-A-
gi|21623 : TAAAATAGT-TTA-ATCCA----ATTTAT-AAAAG-AGTTT---------CCAAAATT-A-AAATAA--G-T-TAG--------------GG-CT----TT---AAAAA----------TA-AAA--------TC-ATG-GTCTGTACT---ATCGAATA---------CCTTTTCAAAAT---C---AGT---AA---A-------AATA-TAAGCCCT--GG--TTTAT-TTTCA-TCATTCAAATGT-TT---T---A---TAT-----A--TAA------T-TACT---T-CA-----AAAATA----G-TT--C--GATTGTTTTCACC----------------TAC------AT---ATCTTCCTTTTAA-AAAGCCTGT-TTG-ACTA--TTA-TTGAT-A-A-
gi|21624 : TAAAATAGT-TTG-ATCCA----ATTAAT-AAAAG-A---ATT--A----CCAAAGTA-A-AAA-TA--T-T-TAA--------------GAGCT----TT---TGAAA----------CA-AAA--------C---GGTGATCA-ATGCT-ATCAAAGG---------CTTTTTCCAAAT---C---AGC---AA---A---AAAGATTA-AG---CCA--GG--TTTAT-T---T-TTAGT------TATT---T---A---TATTTTCGA--TAAC----TT-CAAA--------------AATA----G-TG--T--GAATATTTTCACC----------------TAT------GT---ACCGTCCTTTTAA-AAAACCAGT-TTG-ACTA--TCA-TTGAT-ATA-TAAA
gi|21625 : TAAAACATT-TTA-ATCCA----ACTAAT-AAAAG-AATTT---------CCAAAATT-A-AAA-TA--A-T-TAA--------------GCACT----TT---AAAGA----------TA-TAA-----TT-GT-GGTCAATAC-T-----ATCGAAAG---------CTTTTTCAAAAT---C---GGC---AA---A---AAAAAATA-AA---CCA--GG--T-----------TTGTT------T-TCA--T---C---ATT-----T--AAAC----TT-TCAA---T-CACTTCAAAAATG----GTT---C--GTATGTTTTCACC----------------AAT------AT---AGCGTCCTTTTAG-AAACCCCGT-TTG-ACTG--TCA-TTTAT-A-A-
gi|21626 : TAAAATGGT-TTG-ATCCA----ATTAAT-AAAAG-A---ATT--A----CCGAAGTT-A-AAA-TA--T-T-TAA--------------GAGTT----TT---TGAAA----------TA-AAA--------CC---GTGATC--ATTGCTATCAAAGG---------CTTTTTCGAAAT---C---AGC---AA---A---AAAGATTA-AG---CCA--GG--T-----------TTATT------T-TCGT-T---A---TTT-----A--TATTTTCGAT-TACT---T-CA-----AAAATA----G-TG--C--GAATATTTTCACC----------------TAT------GT---ACCGTCCTTTTAA-AAAAACAGT-TTT-ACTA--TCA-TTGAT-A-A-
gi|21627 : TAAAAAACA-TTA-ATCCA----TTTTTT-AATTG-A---TTC--T----CCAAAGTT-A-AAA-TA--A-T-CGA--------------AAGTT----TT---ATAAA----------TG-AAATTGTGAT-CT-A--C-ACTG--------TCGAATG---------CTTTTTCAAAAT---C---TGC---AA---A---GAATAATA--G---ACT--AG----GGT-G---G-TCGTT------T-TCATTT---A---CAT-----A--ATCT----AA-TACA---T-CAT----ATATAA----G-T---C--TTATATTTTCACC----------------GAT------GT---AACGGTTT-CTAATAAAACCAGT-TTG-TGCC--TTA-TCAAT-----TAAA
gi|21628 : TAAAAAAGT-TTG-ATCCA----GTTT-T-GAAT------TGA--ATCT-CCAAATTT-A-AAA-AAA-T-T-CAA--------------AGTCTTTTTG--------A----------TG-AAA-----GA-CC-AAGAGAGAG-T-----GTCAAAGG---------CTTTCTCAAAAT---C---TAT---TAAAAG---TAGTAAT-------CCT--GG----AAT-G-----TTTTT------T-TC---T---T---CA------G--AGAG----ATGTAAAATGT-CAT----ATAAAA----G-T---C--TCGTGTTATCACC----------------TAT------AT---ACCTACCCTTTAT-AAATCCTGTCTTGTATACAATAT-TTAAT-A-A-
gi|21629 : TAAAAAACA-TTA-ATCCA----TTTTTT-AATTG-A---TTC--T----CCAAAGTT-A-AAA-TA--A-T-CGA--------------AAGTT----TT---ATAAA----------TG-AAATTGTGAT-CT-A--C-ACTG--------TCAAATG---------CTTTTTCAAAAT---C---TGC---AA---A---GAATAATA--G---ACT--AG----GGT-G---G-TCGTT------T-TCATTT---A---CAT-----A--ATCT----AG-TACA---T-CAT----ATATAA----G-T---C--TTATATTTTCACC----------------GAT------GT---AACGGTTT-CTAATAAAACCAGT-TTG-TGCC--TTA-TCAAT-----TAAA
gi|21630 : TAAAATATA-TCT-ATCCA----TTTTTT-GAAAT-C---TAG--A----CCAAAGTT-ACAAA-AA--A-T-TAA--------------TACTT----G----GTGAA----------TA-AAG-----TG-CC-ATGCAACCG-A-----ATCAAAGG---------CTTTTTCAAAGT---C---AAT---
gi|21631 : TAAAATA-T-TTA-ATCCA----ATTGAT-AAAGG-A---GTT--A----CCAAAATT-A-AAA-TA--T-G-CAA--------------CAGCT-----T---TAAAA----------TA-AAA------T-C----GTGATCT-ATACT-ATGGAATGC--------CTTTTTCA-------C---AAT---TA---GC--TAAAAATA-TAAGTCTT--GG--T-----------TTGTC------T-TC---A---A---CAT-----GT-AAAT----AT-TCTA---T-TACCTCAAAGATA----GTT---C--GAATGTTTTCGCT----------------TAT------AT---ATCTTCCTTTTTA-AAAG-CTGT-TTG-GCTG--TTA-TTGAT-A-A-
gi|21632 : AGAATAATCTTG-ATCCA----TCTT-T-AAAAG-AC--TGG--T----CCAAAATG-A-TAA-CA--A-T-CAA--------------GGATC----TC---AAAAA----------TG-AAA-----TT-CT-ACGCAAGAG-A-----GTCAAATG---------CTTTTTTGAAGT---C---AAT---CA---A---AAGGAGGA-GT---CCT--AGAATCTAT-T---G-TGTTT------T-TC---T---T---TAT-----A--AAAC----AT-TACA---T-CAT----ATATTA----G-T---G--TAGTATTTTCCTT----------------TAT------AT---ATC
gi|21633 : AAATAGT-TTA-ACCCA----TTGTTT-GAAGG-A---CTA--A----CCAAAATT-A-AAG-AA--A-T-CAA--------------GGACT----TT-----AAA----------TAGAAA-----GT-CCCAGTTAACAG-A-----ATCAAAGG---------CTTTTTCTAAAT---C---GAT---TA---A---GAGTAGCA-TT---CTT--GG--TATTT-G---T-CTTTT------T-TC---T---A---CAT-----A--AAAC----AT---GG---T-CAA----ATAATA----G-T---T--GAATATTTTCTCC----------------GAT------TT---ATCTACCAGATAA-AATACCTGT-TTA-ATCT--TCA-TTTAT-A-ATTAAA
gi|21634 : T-TTT-ATCCA----GTCAAT-AAAC------TTGTTA----CCAAACTT-A-AAATAG--T-G-TAA------------------T----GTTTTAAAAA----------TA-AAA-----TT-AT-GGTCAACAC-T-----ATCGAACG---------CTTTTTCAAAAT---C---AGC---AA---A---GAATATCA-GG---CTC--GG--TCTAT-T---G-TCATTA-----T-TCAAGT---G---GTT-----A--ATGC----AT--------T-CA-----AAAATT----G-TC--C--TTATGTTTTCGCC----------------AAT------GT---AACGTCCTTTTAA-AAATCCTGT-CTA-ACTG--TTG-TTGAT-A-A-
gi|21635 : -TTG-ATCCAGGACTGTATT-AAA--------GG--A----CCAAAATT-G-AAA-AA--T-T-TTA--------------TTACT----TT---TTGTA----------TA-AAT-----GA-CC-AAGATAAGG-A-----AGCAAAAG---------CTTTTTCAAAGT---C---AAC---AA---G---GAGCAGTA-AT---CCT--GG--AATAT-G---A-TTTTC------C-TC---T---A---AAT-----A--ATGC----AT-TATG---T-CAT----ACGTTA----A-T---C--TTGTATTTTCACC----------------TAT------AT---AATGACCTGTTAA-AAATCCAGT-TTG-ATCT--CTA-TTTAT-A-A-
gi|21636 : -ACACA----TTTTAG-GAAGG-A---TAG--A----ATAAAAAT-A-A-----------TAA--------------GAACA----TC----AAAA----------TA-AAA-----GC-CC-AGGCAACTA-A-----ATCGAATG---------CTTTCTCAAAAT---C---ATT---TA---G---TAGCACCA-TG---CCT--GG--TAAAT-G---A-TTCTT------T-TC---T---A---CAT-----A--AAAC----AT-TATT---T-TAT----AAAAAAAAACG-----C--TAGCATAATAACC----------------AAT------AT---ATTAGCCTCATAA-AAA-CCTG
gi|21637 : ---TGG--T----TCAAAGTT-ATAAA-AA--T-C-TAACTTACCATAATCAAAGACT----TT---AAAAA----------TA-AAA-----TG-CC-AAATAACGG-A-----ATTAAATG---------CTTTTTCGAAAT---C---AAT---CA---A---AAGAAGGA-GT---CCG--GG--GAGATTGC--A-TTATT------C--------------CGC-----A--AAAA----AT-TATA---T-CAT----ACATTA----A-T---C--TGGTATTTTCTTG----------------TAT------GT---ACCTTCCCGCTAA-GAAATATGT-TTG-ATCT--TTA-TGTAT-A-A-
gi|21638 : CATAATT-G-AAA-AA--CAT-TAA---------------AACC----TC---ATCAA----------TA-AAA-----GA-CC-ACGAGAGTG-T-----ATCAAAAG---------CTTTTTCGAAAT---C---AAT---GA---TAACTAGTAA----A---CCT--GG--TACAT-C---A-TATGT------T-TC---T---G---CAT-----A--ATGG----AA-TAAA---T-CAT----A-AATT----G-TA--C--GTGTATTTTCACC-----------------AC------GT---A-----CGGCAAA-AAAAACTGT-TCG-GTCT--TCA-TTAAT-A-A-
gi|21639 : CAAAATT-G-AAA-AA--C-T-TAA--------------ATACT----TT---ATAAG----------TA-AAA-----GA-AC-AGGATATGG-A-----ATCAAAGGTGTTGTTTTCTTTTT--------------AT---TA---A---CAGTA-CA-AGA--CCA--GG--AATAT-T---G-TTGAC------T-TC---A---G---CAT-----A--GTGC----AT-AACA---T-CGT----ATAATT----G-T---C--TTGTATTCTGTCC----------------CAT-----------ATCGTCCTGACAT-AAATCCTCT-CTG-GTCC--TCG-TGGAT-A-A-
gi|21640 : A----------TG-AAA-----GA-CC-AAGAGAGAG-T-----GTCAAAGG---------CTTTCTCAAAAT---C---TATTAAAA---G---TAGTAAT-------CCT--GG----AAT-G-----TTTTT------T-TC---T---T---CA------G--AGAG----ATGTAAAATGT-CAT----ATAAAA----G-T---C--TTGTGTTATCACC----------------TAT------AT---ACCTTCCTTTTAT-AAAACCTGT-CTG-TTCT--GCA-CTTAT-A-A-
gi|21641 : aaaatttaaaaaaaattcaaagtctttttgA-AA--T-T-TAA--------------AAA-A----GC---GTAGAGTCTTTCTATTA-AAA-----GA-CC-AAGATAATG-T-----ATCGAAAG---------CTTTCTCAAAAT---C---AAT---TA---G---CAGTAATA-AT---CCT--GG--TATAT-------TTATC------T-TCA--C---A---AAT-----A--TG-C----AT-TACG---T-CAT----ATAATA----A-T---C--TAGTGTTATCACC----------------CATATACATGT---ATCTGCCTTTTAT-AAAACCAGT-TTG-TTCT--TTACTTAAT---A-TAA
gi|21642 : TCGGAGG---------CTTTCTCAAAAT---C---AA---------A---TAGTTACAATA---ATTAAGG--TA-----------TGTT------G-TC---T---G-----------------C----AT-TATA---T-CGT----ATAGTA----C-T---C--TTGTATTTTCTCC----------------TAA------AT---ATCGTCCTGCAAT-GGACCCTGT-TTT-ATCC--
gi|21643 : ATG---------TTTTCTCAAAAT---C---ATT---TA---G---TAGTAACA-TG------------TAAAT-G---A-TT---------T-TC---T---A---CAT-----A--AAAC----AT-CAGA---T-CAT----GCATTG----G-T---C--GACAAAAATCACC----------------AAT------AT---ATCAGCCTCACAA-AAAG-CTGT-TT
gi|21644 : TTTCGAAAT---CTATAAT---AA---C---TAGTAA----A---CCT--GG--TACAT-C---A-TATGT------T-TC---T---G---CAT-----A--ATGG----AA-TAAA---T-CAT----A-AATT----G-TA--C--GTGTTTTTTTACC----------------AAT------GT---ATCCTCCGGCAAG-AAAACCGGT-TTG-GTCC--TCA-TTAAT-A-
gi|21645 : CA-TT---CCA--GG--TTAAT-G---T-TGTTT------T-TC---A---A---CAT-----A--AAAC----AT-T-CG---T-CTT----ACAATA----A-T---C--TTATATTGTCACC----------------TAT------AT---ATTTGCCTGATAA-AAAGCCTGT-TTG-ATCT--TCA-TTAGT-A-A-TA
gi|21646 : -----A--AAAC----AT-AAGG---T-CAT----ACAATA----A-T---C--TTATATATTCACA----------------TAT------AT---ATCAGCCAAATAA-AACACCTGT-TTG-ATCT--TCA-TTAAA-A-A-TA
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|21618 ): TAAAAAACTTTGACCGAAGAGATAACTGATTCCCCGAATTTAAAGAATTTCAAAACTTTGAATATGAAGGCCCAAGAAAATGAATAGAATGCCTTCTCAAAATCTACTAGTAATATAAGTCCTGGAAGACTATTTTCTTCTGCAAATTGCATTATATCAAATATAGTTCTAGTAATTTCACCAATGTACCTACCTGCAATAAACCCTGACAGGCTCTCATTTATATAA
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111 111111111111111 11111 1111111 111111 1111111
lowQualScore : 2 1 22 5555 55 1 88888888888888888 2 444 3 2 6666 1 111111111111111 11 11111 2 99999999 1 5555 1 0000000 1 1 333 111 1 2 1 1 888888 22 66666 2222222 2 555555 1 666666666 1 22222 22 0 2222222 2 2 333 1 4444 6 2222 2 999 3333 22 11 4 88888888888888888 222222 111 0 22 33 3 2 1 1 444 1 1 1 2
lowQualScore : . . .. .... .. . ................. . ... . . .... . ............... .. ..... . ........ . .... . ....... . . ... ... . . . . ...... .. ..... ....... . ...... . ......... . ..... .. . ....... . . ... . .... . .... . ... .... .. .. . ................. ...... ... . .. .. . . . . ... . . . .
lowQualScore : 3 2 99 7777 44 2 66666666666666666 3 111 2 2 4444 1 222222222222222 55 66666 1 88888888 1 4444 0 5555555 4 1 666 888 4 0 1 0 111111 44 22222 3333333 0 000000 0 999999999 0 55555 44 8 1111111 0 3 555 0 2222 2 1111 0 888 4444 44 44 0 66666666666666666 999999 888 3 77 44 1 0 1 1 000 1 1 2 4
consensus : TAAAATANT-TTG-ATCCA----TTTNNT-AAANG-A---TGG--A----CCAAAGTT---A-AAA-AA--T-T-TAA--------------GAAC--TTC--GAAAATA-AAA-----GN-CC-AGGCGACNG-A-----ATCGAANG-CTTTTTCAAAAT---C---AATNAANA-GTAA-CA-NN---CCT--GG--TANAT-G---A-TTNTT------T-TC---TAC---A-T-----A--AAA--C----AT-TANA---T-CAT----ACAATA----G-T---C--TNG--TA--TTTTCGCC----------------NAT------GT---ATCNNCCTGNTAA-AAANCCTGT-TTG-ATCC--TCA-TTAAT-A-A-TAAATG
Reference ( family-529 ) : TAAAATANT-TTG-ATCCA----TTTNNT-AAANG-A---TGG--A----CCAAAGTT---A-AAA-AA--T-T-TAA--------------GAAC--TTC--GAAAATA-AAA-----GN-CC-AGGCGACNG-A-----ATCGAANG-CTTTTTCAAAAT---C---AATNAANA-GTAA-CA-TG---CCT--GG--TANAT-G---A-TTNTT------T-TC---TAC---A-T-----A--AAA--C----AT-TANA---T-CAT----ACAATA----G-T---C--TNG--TA--TTTTCGCC----------------NAT------GT---ATCNNCCTGNTAA-AAANCCTGT-TTG-ATCC--TCA-TTAAT-A-A-TAAATG
gi|21603 : TAAAATACT-TTG-ACCCA----TTTAAT-AAAGG-A---TGG--A----CCAAAGTT---A-AAA-AA--T-T-TAA--------------GAAC--AGC--AAAAATA-AAA-----GC-CC-AGGCGACCG-A-----GTCAAATG-CTTTCTCAAAGT---C---AATGAGTA-GTAA-CA-TG---CCT--GG--TTCAT-G---G-TTCTT------T-TC---TAA---A-T-----A--AAA--C----AT-TAGA---T-CAT----ACAATA----A-T---C--GAG--TA--TTTTCGCC----------------AAT------GT---ATCGGCCTGACAA-AAATCCTGT-CTG-ATCC--TCA-TTAAT-A-A-TAAATG
gi|21604 : TAAAATACT-TTG-ACCTA----TTTAAT-AAAGG-A---TGG--A----TCAAAGTT---A-AAC-AA--T-T-TAA--------------GAAC--AGC--AAAAATA-AAA-----GC-CC-AGGCGACCG-A-----GTCGAATG-CTTTCTCAAAGT---C---AATGAGTA-GTAA-CA-TG---CCT--GG--TACAT-G---A-TTCTT------T-TC---TAA---A-T-----A--AAA--C----AT-TAGA---T-CAT----ACAATA----A-T---C--GAG--TA--TTTTCGCC----------------AAT------TT---AGCGGCCTGACAA-AAATCCTGT-CTG-ATCC--TCA-TTAAT-A-A-TAAATG
gi|21605 : TAAAATACT-TTG-ACCCA----TT-AAT-AAAGG-A---TGG--A----CCAAAGGT---T-GAA-AA--T-T-TAA--------------GAAC--AGC--AAAAATA-AAA-----GC-CC-AGGCGACCG-A-----GTCGAGTG-CTTTCTCAAAGT---C---ATTTAGTA-GTAA-CA-TG---CCT--GG--TACAT-G---A-TTCTT------T-TC---TAA---A-T-----AATAAA--T----AT-TAGA---T-CAT----ACAATA----A-T---C--GAG--TA--TTTTCGCC----------------AAT------TT---AGCGGCCTGACAA-AAATCCTGT-CTG-GTCC--TCA-TTAAT-A-A-TAAATG
gi|21606 : TAAAA-ACT-TTG-ACTCA----TTTAAT-AAAGG-A---TGG--A----CCAAAGTT---A-AAA-AA--T-T-TAA--------------GAAC--AGC--AAAAATA-AAA-----GC-CC-AGGCGACCG-A-----GTCGAATG-CTTTCTCAAAGT---C---AATTAGTA-GTAA-CA-TG---CTT--GG--TACAT-T---A-TTCTT------T-TC---TAA---A-T-----A--AAA--C----AT-TAGA---T-CAT----ACAGAA----A-T---C--GAG--TA--TTTTCGCC----------------AAT------GT---ATCGGCCTGACAA-AAATCTTGT-CTG-ATCC--TCA-TTAAT-G-A-TAAATG
gi|21607 : TAAAATATT-TTG-ACCCA----TTTAAT-AAAGG-A---AGG--A----CGAAAGTT---A-AAA-AA--A-T-GTA--------------TAAC--AGC--AAATATA-AAA-----GT-CA-AGGTGGCTG-A-----ATCGAATG-CTTTCTCAAAGT---C---AATTAGTA-GTAG-CA-TG---CCT--GG--TAAAT-G---A-TTATT------T-TC---TAA---A-T-----T--AAA--C----AT-TGTA---T-CAA----TCAGTA----A-T---C--GAG--TA--TTTTCACC----------------AAT------AT---ATCGACCTAATGA-AAATCCTGT-CTG-ATCC--TTA-CTAAT-A-A-AAGATG
gi|21608 : TAAAATAAC-TGT-ATCCA----TTTTTT-AATTG-A---AGA--G----CCAAAATT---G-AAA-AA--C-T-GTA--------------GAAC--TGA--GAAAATA-AAA-----GA-CC-AACTAACGG-A-----ATCAAATG-CTTTCTCAAAAT---C---GATTAAAA-GAAG-CA-TT---CCA--GG--TAAAT-G---T-TGTTT------T-TC---AAC---A-T-----A--AAA--C----AT-AAGG---T-CAT----ACAATA----A-T---C--TAA--TA--TTTTCACC----------------TAT------AT---ATCTGCCAGATAA-AAAACCTGT-TTG-ATCT--TCA-TTAAA-A-A-TA
gi|21609 : TAAAATTGT-TTA-ACCCA----TTGTTT-GAAGG-A---CGG--A----CCAAAATT---A-AAG-AA--A-T-CGA--------------GGAC--TTC----AAATAGAAA-----GTTCC-AGTTAACGG-A-----ATCAAAGA-CTTTTTCAAAAT---C---GATTAAGA-GTAG-CA-TT---CTT--GG--TAATT-G---T-CTTTT------T-TC---TAC---A-T-----A--AAA--C----AT-GAAG---T-CAT----ATAATA----G-T---C--GAA--TA--TTTTCTCC----------------AAT------AT---ATCTACCAGATAA-AAAACCTGT-TTG-GTCT--TCA-TTGAT-A-ATTAAA
gi|21610 : TAAAATAAT-TTA-ATCCA----TTTTTT-AAAACTA---TG---A----CCAAAATT---A-AAA-AAACG-T-TAA---------------AAC--CTC--CTCAATA-AAC-----GA-CC-ATGAGATAG-T-----ATCAAGTG-CTTTTTCGAAATCAGC---AATAACCA-ATAA-C-------CCT--GG--TATAT-C---A-TTTTT------T-TC---TGT---G-T-----A--ATA--A----AA-GAGA---T-CAT----A-GATA----G-TG--C--GAG--TG--TTTTCGCC----------------AAT------AT---ATCTTCCTTCCAA-AAATCCTGT-CTG-ATCA--TCA-TTTAT-A-A-CA
gi|21611 : TGAAATAAC-TGT-ATCCA----TTTTTT-AATTG-A---AGA--G----CCAAAATT---G-AAC-AA--C-T-CTA--------------GAAC--TGA--GAAAATA-AAA-----GA-CC-AACTAACGG-A-----ATCAAACG-CTAACTCAAAAT---C---GATTAAAT-GAAA-CA-TT---CCA--GG--TAAAT-G---T-TGATA------T-TC---AAC---A-T-----A--AAA--C----AT-AACG---T-CAT----ACAATA----A-T---C--TAA--TA--TTGTCACC----------------TAT------AT---ATCTGCCAGATAG-AAAGCCTGT-ATG-ATCT--TCA-TTAAT-A-A-TA
gi|21612 : TAAAATATA-TTT-ATCCA----TTTTTT-GAAAT-C---TGG--A----CCAAATTT---ATAAA-AA--T-T-TAA--------------TACC--TT---GTGAATA-AAA-----TG-CC-ATGCAACCG-A-----GTCAAAGG-CTTTTTCAAAAT---C---AATTGAAA-GTAA-TA--G---TCTA-GG--TATAT-A---A-TTATT------T-TC---GGT---A-T-----A--AAA--C----AT-TAAA---T-CAT----ATAAAA----G-T---T--T----TA--TTTTCTCCTATATACATGTGTATATAT------GT---ATCTGTTTGGGAT-GAAACCTGT-TTG-ATCT--TCA-TTAAT-A-A-TATAT
gi|21613 : TAAAATAAT-TTA-GTCCA----TTTTTTTAAATT-A---TG---A----CCAAAATA---A-AAA-AACGT-T-TAA----------------AC--TTC--CTCAATA-AAC-----GA-CC-ATGAGATAA-T-----ATCAAACG-CTTTTTCGAAATCAGC---AATAAACA-ATAA-C-------CCT--GG--TATAT-C---ATTTTTT------T-TC---TGTGTAA-T-----A--AAA--C--------AGA---T-TAT----A-GATA----G-TG--C--GAG--TG--TTTTCGCC----------------AAT------AT---ATCTTCCTTCCAA-ACATCCTGT-CTG-ATCA--TCA-TTAAT-A-A-CA
gi|21614 : TAAAATACT-TTG-ACCCA----TTTAAT-AAAAG-A---TGG--A----CCAAAGTA---A-ATA-AA--A-T-TAA--------------GAAC--AGC--AAAAATA-AAA-----GC-CC-AGGCGAC
gi|21615 : TAAAATAAT-TTA-ATCCAA---TTTCTT-AAATT-T---TT--------CCAAAATT---A-AAA-AA--CAT-TAA---------------AAC--CTC--ATCAATA-AAA-----GA-CC-ATGAGAGTG-T-----ATCAAAAG-CTTTTTCGAAAT---C---AATGATAA-CTAG-TA-AA---CCT--GG--TACAT-C---A-TATGT------T-TC---TGC---A-T-----A--ATG--G----AA-TAAA---T-CAT----A-AATT----G-TA--C--GTG--TA--TTTTCACC----------------AAT------GT---ATCGTCCGGCAAG-AAAACTGGT-TTG-GTCT--TCA-TTAAT-A-A-
gi|21616 : TAAAATACT-TTTTACTCA----TTTAAT-AAAGG-A---TTG--G----CCAAAGTT-----AGA-AA--T-T-TAA--------------GAAC--AGC--AAAAATA-AAA-----GT-CC-AGGCGACTG-A-----GTCAA
gi|21617 : TAAAATATG-TGT-ATCCA----TTTTTT-AATTG-A---ACA--G----TCAAAATTG--A-AAA-AA--C-T-GTA--------------GAAC--GGA--GAAAATA-AAA-----TA-CC-AACTAACGG-A-----ATCGA-------------------------TTAAAA-GAAG-CA-TT---CCA--GG--TAAAT-G---T-TGTTT------T-TC---AAC---A-T-----A--AAA--C----AT-AAGG---T-CAT----ACAATA----A-T---T--TAA--CA--TTTTCACC----------------TAT------ATATCATCTGCCAGATAATAAAACCTGT-TTG-ATCT--TCA-TTAAT-A-A-TAtg
gi|21618 : TAAAAAACT-TTG-ACCGA----AGAGAT-AACTG-A---TTC--C----CCGAATTT---A-AAG-AA--T-T-TCA--------------AAAC--TTT--GAATATG-AAG-----GC-CC-AAGAAAATG-A-----ATAGAATG-CCTTCTCAAAAT---C------TACTA-GTAA-TA-TAAGTCCT--GG--AAGAC-T---A-TTTTC------T-TC---TGC---A-A-----A--TTG--C----AT-TATA---T-CAA----AT-ATA----GTT---C--TAG--TA--ATTTCACC----------------AAT------GT---ACCTACCTGCAAT-AAACCCTGA-CAG-GCTC--TCA-TTTAT---A-TAA
gi|21619 : TAAAAAACT-TTG-ACCCA----AGAGAT-AATTG-A---TTT--G----CCGAATCT---A-AAG-AA--T-T-TCA--------------AAAC--TTT--GCATATG-AAT-----GC-CC-AAGAAAGTG-A-----ATCGAATG-CCTTCTCAAAAT---C---TACTAATA-A-AA-TA-AGT--CCA--GG--CAAAC-T---A-TTTTC------T-TC---TGC---A-A-----A--TTG--C----AT-TATG---T-CAA----ATA-TA----G-TT--C--TTG--TA--TTTTCACC----------------CAT------GT---ACCTACCCGCAAT-AAACCCTGA-CTG-ACTC--TCA-TTAAT-
gi|21620 : TAAAATAAA-TTC-ACCCA----T--GAT-A--TA-A---TGG--AGTTTCCAAATCC---A-AAA-TA--T-T-TTA--------------AAAC--TTT--ATTAATG-AAA-----GA-CC-AAGAGATGG-A-----ATCAAAGG-CTTTTTCAAAAT---C---AATTAGTA-ACAA-TA--A---CCC--AG---ATAT-G-----TTTTT------T-TC---TTCCGTA-T-----T--CTT--T----AT-TATA---T-CAT----ATAATA----A-T---T--TCG--TA--TTTTCTCC----------------TAA------GT---ATCGTCCTGCAAT-GAACCCAGT-TTG-ATC
gi|21621 : TAAAATAAT-TTT-ATCCA----GTCAAT-AAAT------TCGTTA----CCAAACTT---A-AAA-TA--T-TGTAAT-------------G--T--TTT--GAAAATA-AAA-----TT-AT-GGTCAACAC-T-----GTCGAACG-CTTTTTCAAAAT---C---AGCAAAGA-ATAT-CA-GT---CCC--GG--TCTAT-T---G-TCGTTA-----T-TC-----------------A--AAT--C----GT-CA-A---TGCAT----TCAAAA----A-TTTCC--TTA--TG--TTTTCGCC----------------AAT------GT---AACGTCCTTTTAA-GAATCCTGT-CTG-ACTG--TCA-TTGAT-A-A-
gi|21622 : TAAAA-ACT-TTG-ACCCAAAA-TTTC-----------------------CCGAATTT---A-AAG-TA--T-T-TCA--------------AAAC--TTT--GAATATG-AAG-----GC-CC-AAGAAAGTT-A-----ATCGAATG-CCTTTTCAAAAT---C---TACTAA----TAA-GA-TAAGTCCA--GG--CAAAT-G---A-TTTTC------T-TC---TGC---A-A-----A--TTG--C----AT-TATG---T-CAA----AT-ATA----G-T---TCATCT--TA--TTTTCAAC----------------CAT------GT---ACCTACCCGCAAT-AAACCCTGA-CTG-ACTC--TCA-TTAATCA-A-
gi|21623 : TAAAATAGT-TTA-ATCCA----ATTTAT-AAAAG-AGTTT---------CCAAAATT---A-AAATAA--G-T-TAG--------------GG-C--TTT--AAAAATA-AAA--------TC-ATG-GTCTGTACT---ATCGAATA-CCTTTTCAAAAT---C---AGTAAAAATATAAGC-------CCT--GG--TTTAT-TTTCA-TCATTCAAATGT-TT---TAT---A-T-----A--TAA--------T-TACT---T-CA-----AAAATA----G-T------TCGATTG--TTTTCACC----------------TAC------AT---ATCTTCCTTTTAA-AAAGCCTGT-TTG-ACTA--TTA-TTGAT-A-A-
gi|21624 : TAAAATAGT-TTG-ATCCA----ATTAAT-AAAAG-A---ATT--A----CCAAAGTA---A-AAA-TA--T-T-TAA--------------GAGC--TTT--TGAAACA-AAA---------C--GGTGATCA-ATGCT-ATCAAAGG-CTTTTTCCAAAT---C---AGCAAAAA-AGAT-TA-AG---CCA--GG--TTTAT-T---T-TTAGT------TATT---TAT---A-TTTTCGA--TAA--C----TT-CAAA--------------AATA----G-T---G--TGAA-TA--TTTTCACC----------------TAT------GT---ACCGTCCTTTTAA-AAAACCAGT-TTG-ACTA--TCA-TTGAT-ATA-TAAA
gi|21625 : TAAAACATT-TTA-ATCCA----ACTAAT-AAAAG-AATTT---------CCAAAATT---A-AAA-TA--A-T-TAA--------------GCAC--TTT--AAAGATA-TAA-----TT-GT-GGTCAATAC-T-----ATCGAAAG-CTTTTTCAAAAT---C---GGCAAAAA-AAAA-TA-AA---CCA--GG--T-----------TTGTT------T-TC---ATC---ATT-----T--AAA--C----TT-TCAA---T-CACTTCAAAAATG----G-T------TCG--TATGTTTTCACC----------------AAT------AT---AGCGTCCTTTTAG-AAACCCCGT-TTG-ACTG--TCA-TTTAT-A-A-
gi|21626 : TAAAATGGT-TTG-ATCCA----ATTAAT-AAAAG-A---ATT--A----CCGAAGTT---A-AAA-TA--T-T-TAA--------------GAGT--TTT--TGAAATA-AAA--------CC---GTGATC--ATTGCTATCAAAGG-CTTTTTCGAAAT---C---AGCAAAAA-AGAT-TA-AG---CCA--GG--T-----------TTATT------T-TCGT-TAT---T-T-----A--TAT--TTTCGAT-TACT---T-CA-----AAAATA----G-TG--C--GAA--TA--TTTTCACC----------------TAT------GT---ACCGTCCTTTTAA-AAAAACAGT-TTT-ACTA--TCA-TTGAT-A-A-
gi|21627 : TAAAAAACA-TTA-ATCCA----TTTTTT-AATTG-A---TTC--T----CCAAAGTT---A-AAA-TA--A-T-CGA--------------AAGT--TTT--ATAAATG-AAATTGTGAT-CT-A--C-ACTG--------TCGAATG-CTTTTTCAAAAT---C---TGCAAAGA-ATAA-TA--G---ACT--AG----GGT-G---G-TCGTT------T-TCATTTAC---A-T-----A--ATC--T----AA-TACA---T-CAT----ATATAA----G-T---C--TTA--TA--TTTTCACC----------------GAT------GT---AACGGTTT-CTAATAAAACCAGT-TTG-TGCC--TTA-TCAAT-----TAAA
gi|21628 : TAAAAAAGT-TTG-ATCCA----GTT-TT-GAAT------TGA--ATCT-CCAAATTTA--A-AAA-AA--T-T-CAA--------------AGTCTTTTT--G---ATG-AAA-----GA-CC-AAGAGAGAG-T-----GTCAAAGG-CTTTCTCAAAAT---C---TATTAAAA-GTAG-TA-AT---CCT--GG----AAT-G-----TTTTT------T-TC---TTC---A-------G--AGA--G----ATGTAAAATGT-CAT----ATAAAA----G-T---C--TCG--TG--TTATCACC----------------TAT------AT---ACCTACCCTTTAT-AAATCCTGTCTTGTATACAATAT-TTAAT-A-A-
gi|21629 : TAAAAAACA-TTA-ATCCA----TTTTTT-AATTG-A---TTC--T----CCAAAGTT---A-AAA-TA--A-T-CGA--------------AAGT--TTT--ATAAATG-AAATTGTGAT-CT-A--C-ACTG--------TCAAATG-CTTTTTCAAAAT---C---TGCAAAGA-ATAA-TA--G---ACT--AG----GGT-G---G-TCGTT------T-TCATTTAC---A-T-----A--ATC--T----AG-TACA---T-CAT----ATATAA----G-T---C--TTA--TA--TTTTCACC----------------GAT------GT---AACGGTTT-CTAATAAAACCAGT-TTG-TGCC--TTA-TCAAT-----TAAA
gi|21630 : TAAAATATA-TCT-ATCCA----TTTTTT-GAAAT-C---TAG--A----CCAAAGTT---ACAAA-AA--A-T-TAA--------------T-AC--TTG--GTGAATA-AAG-----TG-CC-ATGCAACCG-A-----ATCAAAGG-CTTTTTCAAAGT---C---AAT
gi|21631 : TAAAATA-T-TTA-ATCCA----ATTGAT-AAAGG-A---GTT--A----CCAAAATT---A-AAA-TA--T-G-CAA--------------CAGC--TTT---AAAATA-AAA------T-C----GTGATCT-ATACT-ATGGAATGCCTTTTTCACAAT---T---AGCTAAAA-ATAT-AA-GT---CTT--GG--T-----------TTGTC------T-TC---AAC---A-T-----GT-AAA--T----AT-TCTA---T-TACCTCAAAGATA----GTT---C--GAA--TG--TTTTCGCT----------------TAT------AT---ATCTTCCTTTTTA-AAAG-CTGT-TTG-GCTG--TTA-TTGAT-A-A-
gi|21632 : AGAATAATCTTG-ATCCA----TCT-TT-AAAAG-AC--TGG--T----CCAAAATG---A-TAA-CA--A-T-CAA--------------GGAT--CTC--AAAAATG-AAA-----TT-CT-ACGCAAGAG-A-----GTCAAATG-CTTTTTTGAAGT---C---AATCAAAA-GGAG-GA-GT---CCT--AGAATCTAT-T---G-TGTTT------T-TC---TTT---A-T-----A--AAA--C----AT-TACA---T-CAT----ATATTA----G-T---G--TAG--TA--TTTTCCTT----------------TAT------AT---ATC
gi|21633 : AAATAGT-TTA-ACCCA----TTGTTT-GAAGG-A---CTA--A----CCAAAATT---A-AAG-AA--A-T-CAA--------------GGAC--TTT----AAATAGAAA-----GT-CCCAGTTAACAG-A-----ATCAAAGG-CTTTTTCTAAAT---C---GATTAAGA-GTAG-CA-TT---CTT--GG--TATTT-G---T-CTTTT------T-TC---TAC---A-T-----A--AAA--C----AT---GG---T-CAA----ATAATA----G-T---T--GAA--TA--TTTTCTCC----------------GAT------TT---ATCTACCAGATAA-AATACCTGT-TTA-ATCT--TCA-TTTAT-A-ATTAAA
gi|21634 : T-TTT-ATCCA----GTCAAT-AAAC------TTGTTA----CCAAACTT---A-AAATAG--T-G-TAAT-------------G--T--TTT--AAAAATA-AAA-----TT-AT-GGTCAACAC-T-----ATCGAACG-CTTTTTCAAAAT---C---AGCAAAGA-ATAT-CA-GG---CTC--GG--TCTAT-T---G-TCATTA-----T-TCAAGTGG---T-T-----A--ATG--C----AT--------T-CA-----AAAATT----G-TC--C--TTA--TG--TTTTCGCC----------------AAT------GT---AACGTCCTTTTAA-AAATCCTGT-CTA-ACTG--TTG-TTGAT-A-A-
gi|21635 : -TTG-ATCCAGGACTGTATT-AAA--------GG--A----CCAAAATT---G-AAA-AA--T-T-TTA--------------TTAC--TTT--TTGTATA-AAT-----GA-CC-AAGATAAGG-A-----AGCAAAAG-CTTTTTCAAAGT---C---AACAAGGA-GCAG-TA-AT---CCT--GG--AATAT-G---A-TTTTC------C-TC---TAA---A-T-----A--ATG--C----AT-TATG---T-CAT----ACGTTA----A-T---C--TTG--TA--TTTTCACC----------------TAT------AT---AATGACCTGTTAA-AAATCCAGT-TTG-ATCT--CTA-TTTAT-A-A-
gi|21636 : CA----TTTTAG-GAAGG-A---TAG--A----ATAAAAAT---A-A-----------TAA--------------GAAC--ATC---AAAATA-AAA-----GC-CC-AGGCAACTA-A-----ATCGAATG-CTTTCTCAAAAT---C---ATTTAGTA-GCAC-CA-TG---CCT--GG--TAAAT-G---A-TTCTT------T-TC---TAC---A-T-----A--AAA--C----AT-TATT---T-TAT----AAAAAAAAACG-----C--TAG--CA--TAATAACC----------------AAT------AT---ATTAGCCTCATAA-AAA-CCTG
gi|21637 : aca---TGG--T----TCAAAGTT---ATAAA-AA--T-C-TAACTTACCATAATCAAAGAC--TTT--AAAAATA-AAA-----TG-CC-AAATAACGG-A-----ATTAAATG-CTTTTTCGAAAT---C---AATCAAAA-GAAG-GA-GT---CCG--GG--GAGATTGC--A-TTATT------C--------C---G-C-----A--AAA--A----AT-TATA---T-CAT----ACATTA----A-T---C--TGG--TA--TTTTCTTG----------------TAT------GT---ACCTTCCCGCTAA-GAAATATGT-TTG-ATCT--TTA-TGTAT-A-A-
gi|21638 : CATAATT---G-AAA-AA--CAT-TAA---------------AAC--CTC--ATCAATA-AAA-----GA-CC-ACGAGAGTG-T-----ATCAAAAG-CTTTTTCGAAAT---C---AATGATAA-CTAG-TA-AA---CCT--GG--TACAT-C---A-TATGT------T-TC---TGC---A-T-----A--ATG--G----AA-TAAA---T-CAT----A-AATT----G-TA--C--GTG--TA--TTTTCACC-----------------AC------GT---A-----CGGCAAA-AAAAACTGT-TCG-GTCT--TCA-TTAAT-A-A-
gi|21640 : AAAATTTAAA-AAA-AA--T-T-CAA--------------AGTC--TTTTTGA---TG-AAA-----GA-CC-AAGAGAGAG-T-----GTCAAAGG-CTTTCTCAAAAT---C---TATTAAAA-GTAG-TA-AT---CCT--GG----AAT-G-----TTTTT------T-TC---TTC---A-------G--AGA--G----ATGTAAAATGT-CAT----ATAAAA----G-T---C--TTG--TG--TTATCACC----------------TAT------AT---ACCTTCCTTTTAT-AAAACCTGT-CTG-TTCT--GCA-CTTAT-A-A-
gi|21641 : TA-AAA-----GA-CC-AAGATAATG-T-----ATCGAAAG-CTTTCTCAAAAT---C---AATTAGCA-GTAA-TA-AT---CCT--GG--TATAT-------TTATC------T-TC----AC---A-------A--ATATGC----AT-TACG---T-CAT----ATAATA----A-T---C--TAG--TG--TTATCACC----------------CATATACATGT---ATCTGCCTTTTAT-AAAACCAGT-TTG-TTCT--TTACTTAAT---A-TAA
gi|21642 : aaatttaaaaaagcgtagagtctttctatTCGGAGG-CTTTCTCAAAAT---C---AA---ATA-GTTA-CAATA---ATTAAGG--TA-----------TGTT------G-TC---TGC---A-T---------------------TATA---T-CGT----ATAGTA----C-T---C--TTG--TA--TTTTCTCC----------------TAA------AT---ATCGTCCTGCAAT-GGACCCTGT-TTT-ATCC--
gi|21643 : ATG-TTTTCTCAAAAT---C---ATTTAGTA-GTAA-CA-TG------------TAAAT-G---A-TT---------T-TC---TAC---A-T-----A--AAA--C----AT-CAGA---T-CAT----GCATTG----G-T---C--GAC--AA--AAATCACC----------------AAT------AT---ATCAGCCTCACAA-AAAG-CTGT-TT
gi|21644 : TTTCGAAAT---CTATAATAACTA-GTAA-----A---CCT--GG--TACAT-C---A-TATGT------T-TC---TGC---A-T-----A--ATG--G----AA-TAAA---T-CAT----A-AATT----G-TA--C--GTG--TT--TTTTTACC----------------AAT------GT---ATCCTCCGGCAAG-AAAACCGGT-TTG-GTCC--TCA-TTAAT-A-
gi|21645 : -CA-TT---CCA--GG--TTAAT-G---T-TGTTT------T-TC---AAC---A-T-----A--AAA--C----AT-T-CG---T-CTT----ACAATA----A-T---C--TTA--TA--TTGTCACC----------------TAT------AT---ATTTGCCTGATAA-AAAGCCTGT-TTG-ATCT--TCA-TTAGT-A-A-TA
gi|21646 : -----A--AAA--C----AT-AAGG---T-CAT----ACAATA----A-T---C--TTA--TA--TATTCACA----------------TAT------AT---ATCAGCCAAATAA-AACACCTGT-TTG-ATCT--TCA-TTAAA-A-A-TA
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|21639 ): CAAAATTGAAAAACTTAAATACTTTATAAGTAAAAGAACAGGATATGGAATCAAAGGTGTTGTTTTCTTTTTATTAACAGTACAAGACCAGGAATATTGTTGACTTCAGCATAGTGCATAACATCGTATAATTGTCTTGTATTCTGTCCCATATCGTCCTGACATAAATCCTCTCTGGTCCTCGTGGATAA
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111 111111111111111 11111 1111111 1111111
lowQualScore : 2 1 22 5555 55 1 88888888888888888 2 444 3 2 6666 1 111111111111111 11 11111 2 99999999 1 5555 1 0000000 1 1 111 1 1 22 444 3333 55555 2222222 2 555555 1 777777777 1 22222 22 0 11 2222 2 2 333 1 4444 6 2222 2 999999999 11 11 4 88888888888888888 222222 111 0 22 33 3 2 1 1 444 1 1 1 2
lowQualScore : . . .. .... .. . ................. . ... . . .... . ............... .. ..... . ........ . .... . ....... . . ... . . .. ... .... ..... ....... . ...... . ......... . ..... .. . .. .... . . ... . .... . .... . ......... .. .. . ................. ...... ... . .. .. . . . . ... . . . .
lowQualScore : 3 2 99 7777 44 2 66666666666666666 3 111 2 2 4444 1 222222222222222 55 66666 1 88888888 1 4444 0 5555555 4 1 888 4 0 66 777 5555 77777 3333333 0 000000 0 222222222 0 55555 44 8 44 1111 0 3 555 0 2222 2 1111 0 999999999 44 44 0 66666666666666666 999999 888 3 77 44 1 0 1 1 000 1 1 2 4
consensus : TAAAATANT-TTG-ATCCA----TTTNNT-AAANG-A---TGG--A----CCAAAGTT---A-AAA-AA--T-T-TAA--------------GAAC--TTC--GAAAATA-AAA-----GN-CC-AGGCGACNG-A-----ATCGAANG-CTTTTTCAAAAT---CAATNAANAGTAGCANN-CCT---GG--TANAT-G---A-TTNTT------T-TC---TAC---A-T-----A--AAA--C----AT-TANA---T-CAT----ACAATA----G-T---C--T-NG--TA--TTTTCGCC----------------NAT------GT---ATCNNCCTGNTAA-AAANCCTGT-TTG-ATCC--TCA-TTAAT-A-A-TAAATG
Reference ( family-529 ) : TAAAATANT-TTG-ATCCA----TTTNNT-AAANG-A---TGG--A----CCAAAGTT---A-AAA-AA--T-T-TAA--------------GAAC--TTC--GAAAATA-AAA-----GN-CC-AGGCGACNG-A-----ATCGAANG-CTTTTTCAAAAT---CAATNAANAGTAACANN-CCT---GG--TANAT-G---A-TTNTT------T-TC---TAC---A-T-----A--AAA--C----AT-TANA---T-CAT----ACAATA----G-T---C--T-NG--TA--TTTTCGCC----------------NAT------GT---ATCNNCCTGNTAA-AAANCCTGT-TTG-ATCC--TCA-TTAAT-A-A-TAAATG
gi|21603 : TAAAATACT-TTG-ACCCA----TTTAAT-AAAGG-A---TGG--A----CCAAAGTT---A-AAA-AA--T-T-TAA--------------GAAC--AGC--AAAAATA-AAA-----GC-CC-AGGCGACCG-A-----GTCAAATG-CTTTCTCAAAGT---CAATGAGTAGTAACATG-CCT---GG--TTCAT-G---G-TTCTT------T-TC---TAA---A-T-----A--AAA--C----AT-TAGA---T-CAT----ACAATA----A-T---C--G-AG--TA--TTTTCGCC----------------AAT------GT---ATCGGCCTGACAA-AAATCCTGT-CTG-ATCC--TCA-TTAAT-A-A-TAAATG
gi|21604 : TAAAATACT-TTG-ACCTA----TTTAAT-AAAGG-A---TGG--A----TCAAAGTT---A-AAC-AA--T-T-TAA--------------GAAC--AGC--AAAAATA-AAA-----GC-CC-AGGCGACCG-A-----GTCGAATG-CTTTCTCAAAGT---CAATGAGTAGTAACATG-CCT---GG--TACAT-G---A-TTCTT------T-TC---TAA---A-T-----A--AAA--C----AT-TAGA---T-CAT----ACAATA----A-T---C--G-AG--TA--TTTTCGCC----------------AAT------TT---AGCGGCCTGACAA-AAATCCTGT-CTG-ATCC--TCA-TTAAT-A-A-TAAATG
gi|21605 : TAAAATACT-TTG-ACCCA----TT-AAT-AAAGG-A---TGG--A----CCAAAGGT---T-GAA-AA--T-T-TAA--------------GAAC--AGC--AAAAATA-AAA-----GC-CC-AGGCGACCG-A-----GTCGAGTG-CTTTCTCAAAGT---CATTTAGTAGTAACATG-CCT---GG--TACAT-G---A-TTCTT------T-TC---TAA---A-T-----AATAAA--T----AT-TAGA---T-CAT----ACAATA----A-T---C--G-AG--TA--TTTTCGCC----------------AAT------TT---AGCGGCCTGACAA-AAATCCTGT-CTG-GTCC--TCA-TTAAT-A-A-TAAATG
gi|21606 : TAAAA-ACT-TTG-ACTCA----TTTAAT-AAAGG-A---TGG--A----CCAAAGTT---A-AAA-AA--T-T-TAA--------------GAAC--AGC--AAAAATA-AAA-----GC-CC-AGGCGACCG-A-----GTCGAATG-CTTTCTCAAAGT---CAATTAGTAGTAACATG-CTT---GG--TACAT-T---A-TTCTT------T-TC---TAA---A-T-----A--AAA--C----AT-TAGA---T-CAT----ACAGAA----A-T---C--G-AG--TA--TTTTCGCC----------------AAT------GT---ATCGGCCTGACAA-AAATCTTGT-CTG-ATCC--TCA-TTAAT-G-A-TAAATG
gi|21607 : TAAAATATT-TTG-ACCCA----TTTAAT-AAAGG-A---AGG--A----CGAAAGTT---A-AAA-AA--A-T-GTA--------------TAAC--AGC--AAATATA-AAA-----GT-CA-AGGTGGCTG-A-----ATCGAATG-CTTTCTCAAAGT---CAATTAGTAGTAGCATG-CCT---GG--TAAAT-G---A-TTATT------T-TC---TAA---A-T-----T--AAA--C----AT-TGTA---T-CAA----TCAGTA----A-T---C--G-AG--TA--TTTTCACC----------------AAT------AT---ATCGACCTAATGA-AAATCCTGT-CTG-ATCC--TTA-CTAAT-A-A-AAGATG
gi|21608 : TAAAATAAC-TGT-ATCCA----TTTTTT-AATTG-A---AGA--G----CCAAAATT---G-AAA-AA--C-T-GTA--------------GAAC--TGA--GAAAATA-AAA-----GA-CC-AACTAACGG-A-----ATCAAATG-CTTTCTCAAAAT---CGATTAAAAGAAGCATT-CCA---GG--TAAAT-G---T-TGTTT------T-TC---AAC---A-T-----A--AAA--C----AT-AAGG---T-CAT----ACAATA----A-T---C--T-AA--TA--TTTTCACC----------------TAT------AT---ATCTGCCAGATAA-AAAACCTGT-TTG-ATCT--TCA-TTAAA-A-A-TA
gi|21609 : TAAAATTGT-TTA-ACCCA----TTGTTT-GAAGG-A---CGG--A----CCAAAATT---A-AAG-AA--A-T-CGA--------------GGAC--TTC----AAATAGAAA-----GTTCC-AGTTAACGG-A-----ATCAAAGA-CTTTTTCAAAAT---CGATTAAGAGTAGCATT-CTT---GG--TAATT-G---T-CTTTT------T-TC---TAC---A-T-----A--AAA--C----AT-GAAG---T-CAT----ATAATA----G-T---C--G-AA--TA--TTTTCTCC----------------AAT------AT---ATCTACCAGATAA-AAAACCTGT-TTG-GTCT--TCA-TTGAT-A-ATTAAA
gi|21610 : TAAAATAAT-TTA-ATCCA----TTTTTT-AAAACTA---TG---A----CCAAAATT---A-AAA-AAACG-T-TAA---------------AAC--CTC--CTCAATA-AAC-----GA-CC-ATGAGATAG-T-----ATCAAGTG-CTTTTTCGAAAT---CAGCAATAACCAATAAC-CCT---GG--TATAT-C---A-TTTTT------T-TC---TGT---G-T-----A--ATA--A----AA-GAGA---T-CAT----A-GATA----G-TG--C--G-AG--TG--TTTTCGCC----------------AAT------AT---ATCTTCCTTCCAA-AAATCCTGT-CTG-ATCA--TCA-TTTAT-A-A-CA
gi|21611 : TGAAATAAC-TGT-ATCCA----TTTTTT-AATTG-A---AGA--G----CCAAAATT---G-AAC-AA--C-T-CTA--------------GAAC--TGA--GAAAATA-AAA-----GA-CC-AACTAACGG-A-----ATCAAACG-CTAACTCAAAAT---CGATTAAATGAAACATT-CCA---GG--TAAAT-G---T-TGATA------T-TC---AAC---A-T-----A--AAA--C----AT-AACG---T-CAT----ACAATA----A-T---C--T-AA--TA--TTGTCACC----------------TAT------AT---ATCTGCCAGATAG-AAAGCCTGT-ATG-ATCT--TCA-TTAAT-A-A-TA
gi|21612 : TAAAATATA-TTT-ATCCA----TTTTTT-GAAAT-C---TGG--A----CCAAATTT---ATAAA-AA--T-T-TAA--------------TACC--TT---GTGAATA-AAA-----TG-CC-ATGCAACCG-A-----GTCAAAGG-CTTTTTCAAAAT---CAATTGAAAGTAATAGT-CTA---GG--TATAT-A---A-TTATT------T-TC---GGT---A-T-----A--AAA--C----AT-TAAA---T-CAT----ATAAAA----G-T---T--T-----TA--TTTTCTCCTATATACATGTGTATATAT------GT---ATCTGTTTGGGAT-GAAACCTGT-TTG-ATCT--TCA-TTAAT-A-A-TATAT
gi|21613 : TAAAATAAT-TTA-GTCCA----TTTTTTTAAATT-A---TG---A----CCAAAATA---A-AAA-AACGT-T-TAA----------------AC--TTC--CTCAATA-AAC-----GA-CC-ATGAGATAA-T-----ATCAAACG-CTTTTTCGAAATCAGCAATAAACAATAAC----CCT---GG--TATAT-C---ATTTTTT------T-TC---TGTGTAA-T-----A--AAA--C--------AGA---T-TAT----A-GATA----G-TG--C--G-AG--TG--TTTTCGCC----------------AAT------AT---ATCTTCCTTCCAA-ACATCCTGT-CTG-ATCA--TCA-TTAAT-A-A-CA
gi|21614 : TAAAATACT-TTG-ACCCA----TTTAAT-AAAAG-A---TGG--A----CCAAAGTA---A-ATA-AA--A-T-TAA--------------GAAC--AGC--AAAAATA-AAA-----GC-CC-AGGCGAC
gi|21615 : TAAAATAAT-TTA-ATCCAA---TTTCTT-AAATT-T---TT--------CCAAAATT---A-AAA-AA--CAT-TAA---------------AAC--CTC--ATCAATA-AAA-----GA-CC-ATGAGAGTG-T-----ATCAAAAG-CTTTTTCGAAAT---CAATGATAACTAGTAAA-CCT---GG--TACAT-C---A-TATGT------T-TC---TGC---A-T-----A--ATG--G----AA-TAAA---T-CAT----A-AATT----G-TA--C--G-TG--TA--TTTTCACC----------------AAT------GT---ATCGTCCGGCAAG-AAAACTGGT-TTG-GTCT--TCA-TTAAT-A-A-
gi|21616 : TAAAATACT-TTTTACTCA----TTTAAT-AAAGG-A---TTG--G----CCAAAGTT-----AGA-AA--T-T-TAA--------------GAAC--AGC--AAAAATA-AAA-----GT-CC-AGGCGACTG-A-----GTCAA
gi|21617 : TAAAATATG-TGT-ATCCA----TTTTTT-AATTG-A---ACA--G----TCAAAATTG--A-AAA-AA--C-T-GTA--------------GAAC--GGA--GAAAATA-AAA-----TA-CC-AACTAACGG-A-----ATCGA----------------------TTAAAAGAAGCATT-CCA---GG--TAAAT-G---T-TGTTT------T-TC---AAC---A-T-----A--AAA--C----AT-AAGG---T-CAT----ACAATA----A-T---T--T-AA--CA--TTTTCACC----------------TAT------ATATCATCTGCCAGATAATAAAACCTGT-TTG-ATCT--TCA-TTAAT-A-A-TAtg
gi|21618 : TAAAAAACT-TTG-ACCGA----AGAGAT-AACTG-A---TTC--C----CCGAATTT---A-AAG-AA--T-T-TCA--------------AAAC--TTT--GAATATG-AAG-----GC-CC-AAGAAAATG-A-----ATAGAATG-CCTTCTCAAAAT---CTACTAGTAATATAAGT-CCT---GG--AAGAC-T---A-TTTTC------T-TC---TGC---A-A-----A--TTG--C----AT-TATA---T-CAA----AT-ATA----GTT---C--T-AG--TA--ATTTCACC----------------AAT------GT---ACCTACCTGCAAT-AAACCCTGA-CAG-GCTC--TCA-TTTAT---A-TAA
gi|21619 : TAAAAAACT-TTG-ACCCA----AGAGAT-AATTG-A---TTT--G----CCGAATCT---A-AAG-AA--T-T-TCA--------------AAAC--TTT--GCATATG-AAT-----GC-CC-AAGAAAGTG-A-----ATCGAATG-CCTTCTCAAAAT---CTACTAATAA-AATAAGTCCA---GG--CAAAC-T---A-TTTTC------T-TC---TGC---A-A-----A--TTG--C----AT-TATG---T-CAA----ATA-TA----G-TT--C--T-TG--TA--TTTTCACC----------------CAT------GT---ACCTACCCGCAAT-AAACCCTGA-CTG-ACTC--TCA-TTAAT-
gi|21620 : TAAAATAAA-TTC-ACCCA----T--GAT-A--TA-A---TGG--AGTTTCCAAATCC---A-AAA-TA--T-T-TTA--------------AAAC--TTT--ATTAATG-AAA-----GA-CC-AAGAGATGG-A-----ATCAAAGG-CTTTTTCAAAAT---CAATTAGTAACAATAAC-CCA---GA--TATGT-T---T-TTTTC------T-TC---CGT---A-T-----T--CTT--T----AT-TATA---T-CAT----ATAATA----A-T---T--T-CG--TA--TTTTCTCC----------------TAA------GT---ATCGTCCTGCAAT-GAACCCAGT-TTG-ATC
gi|21621 : TAAAATAAT-TTT-ATCCA----GTCAAT-AAAT------TCGTTA----CCAAACTT---A-AAA-TA--T-TGTAAT-------------G--T--TTT--GAAAATA-AAA-----TT-AT-GGTCAACAC-T-----GTCGAACG-CTTTTTCAAAAT---CAGCAAAGAATATCAGT-CCC---GG--TCTAT-T---G-TCGTTA-----T-TC-----------------A--AAT--C----GT-CA-A---TGCAT----TCAAAA----A-TTTCC--T-TA--TG--TTTTCGCC----------------AAT------GT---AACGTCCTTTTAA-GAATCCTGT-CTG-ACTG--TCA-TTGAT-A-A-
gi|21622 : TAAAA-ACT-TTG-ACCCAAAA-TTTC-----------------------CCGAATTT---A-AAG-TA--T-T-TCA--------------AAAC--TTT--GAATATG-AAG-----GC-CC-AAGAAAGTT-A-----ATCGAATG-CCTTTTCAAAAT---CTACTAATAAGATAAGT-CCA---GG--CAAAT-G---A-TTTTC------T-TC---TGC---A-A-----A--TTG--C----AT-TATG---T-CAA----AT-ATA----G-T---TCAT-CT--TA--TTTTCAAC----------------CAT------GT---ACCTACCCGCAAT-AAACCCTGA-CTG-ACTC--TCA-TTAATCA-A-
gi|21623 : TAAAATAGT-TTA-ATCCA----ATTTAT-AAAAG-AGTTT---------CCAAAATT---A-AAATAA--G-T-TAG--------------GG-C--TTT--AAAAATA-AAA--------TC-ATG-GTCTGTACT---ATCGAATA-CCTTTTCAAAAT---CAGTAAAAA-TATAAGC-CCT---GG--TTTAT-TTTCA-TCATTCAAATGT-TT---TAT---A-T-----A--TAA--------T-TACT---T-CA-----AAAATA----G-T------T-CGATTG--TTTTCACC----------------TAC------AT---ATCTTCCTTTTAA-AAAGCCTGT-TTG-ACTA--TTA-TTGAT-A-A-
gi|21624 : TAAAATAGT-TTG-ATCCA----ATTAAT-AAAAG-A---ATT--A----CCAAAGTA---A-AAA-TA--T-T-TAA--------------GAGC--TTT--TGAAACA-AAA--------C---GGTGATCA-ATGCT-ATCAAAGG-CTTTTTCCAAAT---CAGCAAAAAAGATTAAG-CCA---GG--TTTAT-T---T-TTAGT------TATT---TAT---A-TTTTCGA--TAA--C----TT-CAAA--------------AATA----G-T---G--TGAA--TA--TTTTCACC----------------TAT------GT---ACCGTCCTTTTAA-AAAACCAGT-TTG-ACTA--TCA-TTGAT-ATA-TAAA
gi|21625 : TAAAACATT-TTA-ATCCA----ACTAAT-AAAAG-AATTT---------CCAAAATT---A-AAA-TA--A-T-TAA--------------GCAC--TTT--AAAGATA-TAA-----TT-GT-GGTCAATAC-T-----ATCGAAAG-CTTTTTCAAAAT---CGGCAAAAAAAAATAAA-CCA---GG--T-----------TTGTT------T-TC---ATC---ATT-----T--AAA--C----TT-TCAA---T-CACTTCAAAAATG----G-T------T-CG--TATGTTTTCACC----------------AAT------AT---AGCGTCCTTTTAG-AAACCCCGT-TTG-ACTG--TCA-TTTAT-A-A-
gi|21626 : TAAAATGGT-TTG-ATCCA----ATTAAT-AAAAG-A---ATT--A----CCGAAGTT---A-AAA-TA--T-T-TAA--------------GAGT--TTT--TGAAATA-AAA--------CC---GTGATC--ATTGCTATCAAAGG-CTTTTTCGAAAT---CAGCAAAAAAGATTAAG-CCA---GG--T-----------TTATT------T-TCGT-TAT---T-T-----A--TAT--TTTCGAT-TACT---T-CA-----AAAATA----G-TG--C--G-AA--TA--TTTTCACC----------------TAT------GT---ACCGTCCTTTTAA-AAAAACAGT-TTT-ACTA--TCA-TTGAT-A-A-
gi|21627 : TAAAAAACA-TTA-ATCCA----TTTTTT-AATTG-A---TTC--T----CCAAAGTT---A-AAA-TA--A-T-CGA--------------AAGT--TTT--ATAAATG-AAATTGTGAT-CT-A--C-ACTG--------TCGAATG-CTTTTTCAAAAT---CTGCAAAGAATAATAGA-CTA---GG-----GT-G---G-TCGTT------T-TCATTTAC---A-T-----A--ATC--T----AA-TACA---T-CAT----ATATAA----G-T---C--T-TA--TA--TTTTCACC----------------GAT------GT---AACGGTTT-CTAATAAAACCAGT-TTG-TGCC--TTA-TCAAT-----TAAA
gi|21628 : TAAAAAAGT-TTG-ATCCA----GTT-TT-GAAT------TGA--ATCT-CCAAATTTA--A-AAA-AA--T-T-CAA--------------AGTCTTTTT--G---ATG-AAA-----GA-CC-AAGAGAGAG-T-----GTCAAAGG-CTTTCTCAAAAT---CTATTAAAAGTAGTAAT-CCT---GG----AAT-G-----TTTTT------T-TC---TTC---A-------G--AGA--G----ATGTAAAATGT-CAT----ATAAAA----G-T---C--T-CG--TG--TTATCACC----------------TAT------AT---ACCTACCCTTTAT-AAATCCTGTCTTGTATACAATAT-TTAAT-A-A-
gi|21629 : TAAAAAACA-TTA-ATCCA----TTTTTT-AATTG-A---TTC--T----CCAAAGTT---A-AAA-TA--A-T-CGA--------------AAGT--TTT--ATAAATG-AAATTGTGAT-CT-A--C-ACTG--------TCAAATG-CTTTTTCAAAAT---CTGCAAAGAATAATAGA-CTA---GG-----GT-G---G-TCGTT------T-TCATTTAC---A-T-----A--ATC--T----AG-TACA---T-CAT----ATATAA----G-T---C--T-TA--TA--TTTTCACC----------------GAT------GT---AACGGTTT-CTAATAAAACCAGT-TTG-TGCC--TTA-TCAAT-----TAAA
gi|21630 : TAAAATATA-TCT-ATCCA----TTTTTT-GAAAT-C---TAG--A----CCAAAGTT---ACAAA-AA--A-T-TAA--------------T-AC--TTG--GTGAATA-AAG-----TG-CC-ATGCAACCG-A-----ATCAAAGG-CTTTTTCAAAGT---CAAT
gi|21631 : TAAAATA-T-TTA-ATCCA----ATTGAT-AAAGG-A---GTT--A----CCAAAATT---A-AAA-TA--T-G-CAA--------------CAGC--TTT---AAAATA-AAA------T-C----GTGATCT-ATACT-ATGGAATGCCTTTTTCACAAT---TAGCTAAAAATATAAGT-CTT---GG--T-----------TTGTC------T-TC---AAC---A-T-----GT-AAA--T----AT-TCTA---T-TACCTCAAAGATA----GTT---C--G-AA--TG--TTTTCGCT----------------TAT------AT---ATCTTCCTTTTTA-AAAG-CTGT-TTG-GCTG--TTA-TTGAT-A-A-
gi|21632 : AGAATAATCTTG-ATCCA----TCT-TT-AAAAG-AC--TGG--T----CCAAAATG---A-TAA-CA--A-T-CAA--------------GGAT--CTC--AAAAATG-AAA-----TT-CT-ACGCAAGAG-A-----GTCAAATG-CTTTTTTGAAGT---CAATCAAAAGGAGGAGT-CCT---AGAATCTAT-T---G-TGTTT------T-TC---TTT---A-T-----A--AAA--C----AT-TACA---T-CAT----ATATTA----G-T---G--T-AG--TA--TTTTCCTT----------------TAT------AT---ATC
gi|21633 : AAATAGT-TTA-ACCCA----TTGTTT-GAAGG-A---CTA--A----CCAAAATT---A-AAG-AA--A-T-CAA--------------GGAC--TTT----AAATAGAAA-----GT-CCCAGTTAACAG-A-----ATCAAAGG-CTTTTTCTAAAT---CGATTAAGAGTAGCATT-CTT---GG--TATTT-G---T-CTTTT------T-TC---TAC---A-T-----A--AAA--C----AT---GG---T-CAA----ATAATA----G-T---T--G-AA--TA--TTTTCTCC----------------GAT------TT---ATCTACCAGATAA-AATACCTGT-TTA-ATCT--TCA-TTTAT-A-ATTAAA
gi|21634 : T-TTT-ATCCA----GTCAAT-AAAC------TTGTTA----CCAAACTT---A-AAATAG--T-G-TAAT-------------G--T--TTT--AAAAATA-AAA-----TT-AT-GGTCAACAC-T-----ATCGAACG-CTTTTTCAAAAT---CAGCAAAGAATATCAGG-CTC---GG--TCTAT-T---G-TCATTA-----T-TCAAGTGG---T-T-----A--ATG--C----AT--------T-CA-----AAAATT----G-TC--C--T-TA--TG--TTTTCGCC----------------AAT------GT---AACGTCCTTTTAA-AAATCCTGT-CTA-ACTG--TTG-TTGAT-A-A-
gi|21635 : -TTG-ATCCAGGACTGTATT-AAA--------GG--A----CCAAAATT---G-AAA-AA--T-T-TTA--------------TTAC--TTT--TTGTATA-AAT-----GA-CC-AAGATAAGG-A-----AGCAAAAG-CTTTTTCAAAGT---CAACAAGGAGCAGTAAT-CCT---GG--AATAT-G---A-TTTTC------C-TC---TAA---A-T-----A--ATG--C----AT-TATG---T-CAT----ACGTTA----A-T---C--T-TG--TA--TTTTCACC----------------TAT------AT---AATGACCTGTTAA-AAATCCAGT-TTG-ATCT--CTA-TTTAT-A-A-
gi|21636 : CA----TTTTAG-GAAGG-A---TAG--A----ATAAAAAT---A-A-----------TAA--------------GAAC--ATC---AAAATA-AAA-----GC-CC-AGGCAACTA-A-----ATCGAATG-CTTTCTCAAAAT---CATTTAGTAGCACCATG-CCT---GG--TAAAT-G---A-TTCTT------T-TC---TAC---A-T-----A--AAA--C----AT-TATT---T-TAT----AAAAAAAAACG-----C--T-AG--CA--TAATAACC----------------AAT------AT---ATTAGCCTCATAA-AAA-CCTG
gi|21637 : aca---TGG--T----TCAAAGTT---ATAAA-AA--T-C-TAACTTACCATAATCAAAGAC--TTT--AAAAATA-AAA-----TG-CC-AAATAACGG-A-----ATTAAATG-CTTTTTCGAAAT---CAATCAAAAGAAGGAGT-CCG---GG--GAGATTGC--A-TTATT------C--------C---G-C-----A--AAA--A----AT-TATA---T-CAT----ACATTA----A-T---C--T-GG--TA--TTTTCTTG----------------TAT------GT---ACCTTCCCGCTAA-GAAATATGT-TTG-ATCT--TTA-TGTAT-A-A-
gi|21638 : CATAATT---G-AAA-AA--CAT-TAA---------------AAC--CTC--ATCAATA-AAA-----GA-CC-ACGAGAGTG-T-----ATCAAAAG-CTTTTTCGAAAT---CAATGATAACTAGTAAA-CCT---GG--TACAT-C---A-TATGT------T-TC---TGC---A-T-----A--ATG--G----AA-TAAA---T-CAT----A-AATT----G-TA--C--G-TG--TA--TTTTCACC-----------------AC------GT---A-----CGGCAAA-AAAAACTGT-TCG-GTCT--TCA-TTAAT-A-A-
gi|21640 : AAAATTTAAA-AAA-AA--T-T-CAA--------------AGTC--TTTTTGA---TG-AAA-----GA-CC-AAGAGAGAG-T-----GTCAAAGG-CTTTCTCAAAAT---CTATTAAAAGTAGTAAT-CCT---GG----AAT-G-----TTTTT------T-TC---TTC---A-------G--AGA--G----ATGTAAAATGT-CAT----ATAAAA----G-T---C--T-TG--TG--TTATCACC----------------TAT------AT---ACCTTCCTTTTAT-AAAACCTGT-CTG-TTCT--GCA-CTTAT-A-A-
gi|21641 : TA-AAA-----GA-CC-AAGATAATG-T-----ATCGAAAG-CTTTCTCAAAAT---CAATTAGCAGTAATAAT-CCT---GG--TATAT-------TTATC------T-TC----AC---A-------A--ATATGC----AT-TACG---T-CAT----ATAATA----A-T---C--T-AG--TG--TTATCACC----------------CATATACATGT---ATCTGCCTTTTAT-AAAACCAGT-TTG-TTCT--TTACTTAAT---A-TAA
gi|21642 : aaatttaaaaaagcgtagagtctttctatTCGGAGG-CTTTCTCAAAAT---CA---AATAGTTACAAT-AATTAAGG--TA-----------TGTT------G-TC---T------------------G--C----AT-TATA---T-CGT----ATAGTA----C-T---C--T-TG--TA--TTTTCTCC----------------TAA------AT---ATCGTCCTGCAAT-GGACCCTGT-TTT-ATCC--
gi|21643 : ATG-TTTTCTCAAAAT---CATTTAGTAGTAACAT---------G--TAAAT-G---A-TT---------T-TC---TAC---A-T-----A--AAA--C----AT-CAGA---T-CAT----GCATTG----G-T---C--G-AC--AA--AAATCACC----------------AAT------AT---ATCAGCCTCACAA-AAAG-CTGT-TT
gi|21644 : TTTCGAAAT---CTATAATAACTAGTAAA-CCT---GG--TACAT-C---A-TATGT------T-TC---TGC---A-T-----A--ATG--G----AA-TAAA---T-CAT----A-AATT----G-TA--C--G-TG--TT--TTTTTACC----------------AAT------GT---ATCCTCCGGCAAG-AAAACCGGT-TTG-GTCC--TCA-TTAAT-A-
gi|21645 : CATT-CCA---GG--TTAAT-G---T-TGTTT------T-TC---AAC---A-T-----A--AAA--C----AT-T-CG---T-CTT----ACAATA----A-T---C--T-TA--TA--TTGTCACC----------------TAT------AT---ATTTGCCTGATAA-AAAGCCTGT-TTG-ATCT--TCA-TTAGT-A-A-TA
gi|21646 : -----A--AAA--C----AT-AAGG---T-CAT----ACAATA----A-T---C--T-TA--TA--TATTCACA----------------TAT------AT---ATCAGCCAAATAA-AACACCTGT-TTG-ATCT--TCA-TTAAA-A-A-TA
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|21639 ): CAAAATTGAAAAACTTAAATACTTTATAAGTAAAAGAACAGGATATGGAATCAAAGGTGTTGTTTTCTTTTTATTAACAGTACAAGACCAGGAATATTGTTGACTTCAGCATAGTGCATAACATCGTATAATTGTCTTGTATTCTGTCCCATATCGTCCTGACATAAATCCTCTCTGGTCCTCGTGGATAA
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111 111111111111111 11111 1111111 1111111
lowQualScore : 2 1 22 5555 55 1 88888888888888888 2 444 3 2 6666 1 111111111111111 11 11111 2 99999999 1 5555 1 0000000 1 1 111 1 1 33 33 3333 55555 2222222 2 555555 1 666 111 1 22222 22 0 2222222 2 2 333 1 4444 6 2222 2 999999999 11 11 4 88888888888888888 222222 111 0 22 33 3 2 1 1 444 1 1 1 2
lowQualScore : . . .. .... .. . ................. . ... . . .... . ............... .. ..... . ........ . .... . ....... . . ... . . .. .. .... ..... ....... . ...... . ... ... . ..... .. . ....... . . ... . .... . .... . ......... .. .. . ................. ...... ... . .. .. . . . . ... . . . .
lowQualScore : 3 2 99 7777 44 2 66666666666666666 3 111 2 2 4444 1 222222222222222 55 66666 1 88888888 1 4444 0 5555555 4 1 888 4 0 55 77 5555 77777 3333333 0 000000 0 888 888 0 55555 44 8 1111111 0 3 555 0 2222 2 1111 0 999999999 44 44 0 66666666666666666 999999 888 3 77 44 1 0 1 1 000 1 1 2 4
consensus : TAAAATANT-TTG-ATCCA----TTTNNT-AAANG-A---TGG--A----CCAAAGTT---A-AAA-AA--T-T-TAA--------------GAAC--TTC--GAAAATA-AAA-----GN-CC-AGGCGACNG-A-----ATCGAANG-CTTTTTCAAAAT---CAATNAANAGTANCANNCCT---GG--TANAT-G---A-TTNTT------T-TC---TAC---A-T-----A--AAA--C----AT-TANA---T-CAT----ACAATA----G-T---C--T-NG--TA--TTTTCGCC----------------NAT------GT---ATCNNCCTGNTAA-AAANCCTGT-TTG-ATCC--TCA-TTAAT-A-A-TAAATG
Reference ( family-529 ) : TAAAATANT-TTG-ATCCA----TTTNNT-AAANG-A---TGG--A----CCAAAGTT---A-AAA-AA--T-T-TAA--------------GAAC--TTC--GAAAATA-AAA-----GN-CC-AGGCGACNG-A-----ATCGAANG-CTTTTTCAAAAT---CAATNAANAGTAGCANNCCT---GG--TANAT-G---A-TTNTT------T-TC---TAC---A-T-----A--AAA--C----AT-TANA---T-CAT----ACAATA----G-T---C--T-NG--TA--TTTTCGCC----------------NAT------GT---ATCNNCCTGNTAA-AAANCCTGT-TTG-ATCC--TCA-TTAAT-A-A-TAAATG
gi|21603 : TAAAATACT-TTG-ACCCA----TTTAAT-AAAGG-A---TGG--A----CCAAAGTT---A-AAA-AA--T-T-TAA--------------GAAC--AGC--AAAAATA-AAA-----GC-CC-AGGCGACCG-A-----GTCAAATG-CTTTCTCAAAGT---CAATGAGTAGTAACATGCCT---GG--TTCAT-G---G-TTCTT------T-TC---TAA---A-T-----A--AAA--C----AT-TAGA---T-CAT----ACAATA----A-T---C--G-AG--TA--TTTTCGCC----------------AAT------GT---ATCGGCCTGACAA-AAATCCTGT-CTG-ATCC--TCA-TTAAT-A-A-TAAATG
gi|21604 : TAAAATACT-TTG-ACCTA----TTTAAT-AAAGG-A---TGG--A----TCAAAGTT---A-AAC-AA--T-T-TAA--------------GAAC--AGC--AAAAATA-AAA-----GC-CC-AGGCGACCG-A-----GTCGAATG-CTTTCTCAAAGT---CAATGAGTAGTAACATGCCT---GG--TACAT-G---A-TTCTT------T-TC---TAA---A-T-----A--AAA--C----AT-TAGA---T-CAT----ACAATA----A-T---C--G-AG--TA--TTTTCGCC----------------AAT------TT---AGCGGCCTGACAA-AAATCCTGT-CTG-ATCC--TCA-TTAAT-A-A-TAAATG
gi|21605 : TAAAATACT-TTG-ACCCA----TT-AAT-AAAGG-A---TGG--A----CCAAAGGT---T-GAA-AA--T-T-TAA--------------GAAC--AGC--AAAAATA-AAA-----GC-CC-AGGCGACCG-A-----GTCGAGTG-CTTTCTCAAAGT---CATTTAGTAGTAACATGCCT---GG--TACAT-G---A-TTCTT------T-TC---TAA---A-T-----AATAAA--T----AT-TAGA---T-CAT----ACAATA----A-T---C--G-AG--TA--TTTTCGCC----------------AAT------TT---AGCGGCCTGACAA-AAATCCTGT-CTG-GTCC--TCA-TTAAT-A-A-TAAATG
gi|21606 : TAAAA-ACT-TTG-ACTCA----TTTAAT-AAAGG-A---TGG--A----CCAAAGTT---A-AAA-AA--T-T-TAA--------------GAAC--AGC--AAAAATA-AAA-----GC-CC-AGGCGACCG-A-----GTCGAATG-CTTTCTCAAAGT---CAATTAGTAGTAACATGCTT---GG--TACAT-T---A-TTCTT------T-TC---TAA---A-T-----A--AAA--C----AT-TAGA---T-CAT----ACAGAA----A-T---C--G-AG--TA--TTTTCGCC----------------AAT------GT---ATCGGCCTGACAA-AAATCTTGT-CTG-ATCC--TCA-TTAAT-G-A-TAAATG
gi|21607 : TAAAATATT-TTG-ACCCA----TTTAAT-AAAGG-A---AGG--A----CGAAAGTT---A-AAA-AA--A-T-GTA--------------TAAC--AGC--AAATATA-AAA-----GT-CA-AGGTGGCTG-A-----ATCGAATG-CTTTCTCAAAGT---CAATTAGTAGTAGCATGCCT---GG--TAAAT-G---A-TTATT------T-TC---TAA---A-T-----T--AAA--C----AT-TGTA---T-CAA----TCAGTA----A-T---C--G-AG--TA--TTTTCACC----------------AAT------AT---ATCGACCTAATGA-AAATCCTGT-CTG-ATCC--TTA-CTAAT-A-A-AAGATG
gi|21608 : TAAAATAAC-TGT-ATCCA----TTTTTT-AATTG-A---AGA--G----CCAAAATT---G-AAA-AA--C-T-GTA--------------GAAC--TGA--GAAAATA-AAA-----GA-CC-AACTAACGG-A-----ATCAAATG-CTTTCTCAAAAT---CGATTAAAAGAAGCATTCCA---GG--TAAAT-G---T-TGTTT------T-TC---AAC---A-T-----A--AAA--C----AT-AAGG---T-CAT----ACAATA----A-T---C--T-AA--TA--TTTTCACC----------------TAT------AT---ATCTGCCAGATAA-AAAACCTGT-TTG-ATCT--TCA-TTAAA-A-A-TA
gi|21609 : TAAAATTGT-TTA-ACCCA----TTGTTT-GAAGG-A---CGG--A----CCAAAATT---A-AAG-AA--A-T-CGA--------------GGAC--TTC----AAATAGAAA-----GTTCC-AGTTAACGG-A-----ATCAAAGA-CTTTTTCAAAAT---CGATTAAGAGTAGCATTCTT---GG--TAATT-G---T-CTTTT------T-TC---TAC---A-T-----A--AAA--C----AT-GAAG---T-CAT----ATAATA----G-T---C--G-AA--TA--TTTTCTCC----------------AAT------AT---ATCTACCAGATAA-AAAACCTGT-TTG-GTCT--TCA-TTGAT-A-ATTAAA
gi|21610 : TAAAATAAT-TTA-ATCCA----TTTTTT-AAAACTA---TG---A----CCAAAATT---A-AAA-AAACG-T-TAA---------------AAC--CTC--CTCAATA-AAC-----GA-CC-ATGAGATAG-T-----ATCAAGTG-CTTTTTCGAAAT---CAGCAATAACCAATAACCCT---GG--TATAT-C---A-TTTTT------T-TC---TGT---G-T-----A--ATA--A----AA-GAGA---T-CAT----A-GATA----G-TG--C--G-AG--TG--TTTTCGCC----------------AAT------AT---ATCTTCCTTCCAA-AAATCCTGT-CTG-ATCA--TCA-TTTAT-A-A-CA
gi|21611 : TGAAATAAC-TGT-ATCCA----TTTTTT-AATTG-A---AGA--G----CCAAAATT---G-AAC-AA--C-T-CTA--------------GAAC--TGA--GAAAATA-AAA-----GA-CC-AACTAACGG-A-----ATCAAACG-CTAACTCAAAAT---CGATTAAATGAAACATTCCA---GG--TAAAT-G---T-TGATA------T-TC---AAC---A-T-----A--AAA--C----AT-AACG---T-CAT----ACAATA----A-T---C--T-AA--TA--TTGTCACC----------------TAT------AT---ATCTGCCAGATAG-AAAGCCTGT-ATG-ATCT--TCA-TTAAT-A-A-TA
gi|21612 : TAAAATATA-TTT-ATCCA----TTTTTT-GAAAT-C---TGG--A----CCAAATTT---ATAAA-AA--T-T-TAA--------------TACC--TT---GTGAATA-AAA-----TG-CC-ATGCAACCG-A-----GTCAAAGG-CTTTTTCAAAAT---CAATTGAAAGTAATAGTCTA---GG--TATAT-A---A-TTATT------T-TC---GGT---A-T-----A--AAA--C----AT-TAAA---T-CAT----ATAAAA----G-T---T--T-----TA--TTTTCTCCTATATACATGTGTATATAT------GT---ATCTGTTTGGGAT-GAAACCTGT-TTG-ATCT--TCA-TTAAT-A-A-TATAT
gi|21613 : TAAAATAAT-TTA-GTCCA----TTTTTTTAAATT-A---TG---A----CCAAAATA---A-AAA-AACGT-T-TAA----------------AC--TTC--CTCAATA-AAC-----GA-CC-ATGAGATAA-T-----ATCAAACG-CTTTTTCGAAATCAGCAATAAACAATAAC---CCT---GG--TATAT-C---ATTTTTT------T-TC---TGTGTAA-T-----A--AAA--C--------AGA---T-TAT----A-GATA----G-TG--C--G-AG--TG--TTTTCGCC----------------AAT------AT---ATCTTCCTTCCAA-ACATCCTGT-CTG-ATCA--TCA-TTAAT-A-A-CA
gi|21614 : TAAAATACT-TTG-ACCCA----TTTAAT-AAAAG-A---TGG--A----CCAAAGTA---A-ATA-AA--A-T-TAA--------------GAAC--AGC--AAAAATA-AAA-----GC-CC-AGGCGAC
gi|21615 : TAAAATAAT-TTA-ATCCAA---TTTCTT-AAATT-T---TT--------CCAAAATT---A-AAA-AA--CAT-TAA---------------AAC--CTC--ATCAATA-AAA-----GA-CC-ATGAGAGTG-T-----ATCAAAAG-CTTTTTCGAAAT---CAATGATAACTAGTAAACCT---GG--TACAT-C---A-TATGT------T-TC---TGC---A-T-----A--ATG--G----AA-TAAA---T-CAT----A-AATT----G-TA--C--G-TG--TA--TTTTCACC----------------AAT------GT---ATCGTCCGGCAAG-AAAACTGGT-TTG-GTCT--TCA-TTAAT-A-A-
gi|21616 : TAAAATACT-TTTTACTCA----TTTAAT-AAAGG-A---TTG--G----CCAAAGTT-----AGA-AA--T-T-TAA--------------GAAC--AGC--AAAAATA-AAA-----GT-CC-AGGCGACTG-A-----GTCAA
gi|21617 : TAAAATATG-TGT-ATCCA----TTTTTT-AATTG-A---ACA--G----TCAAAATTG--A-AAA-AA--C-T-GTA--------------GAAC--GGA--GAAAATA-AAA-----TA-CC-AACTAACGG-A-----ATCGA----------------------TTAAAAGAAGCATTCCA---GG--TAAAT-G---T-TGTTT------T-TC---AAC---A-T-----A--AAA--C----AT-AAGG---T-CAT----ACAATA----A-T---T--T-AA--CA--TTTTCACC----------------TAT------ATATCATCTGCCAGATAATAAAACCTGT-TTG-ATCT--TCA-TTAAT-A-A-TAtg
gi|21618 : TAAAAAACT-TTG-ACCGA----AGAGAT-AACTG-A---TTC--C----CCGAATTT---A-AAG-AA--T-T-TCA--------------AAAC--TTT--GAATATG-AAG-----GC-CC-AAGAAAATG-A-----ATAGAATG-CCTTCTCAAAAT---CTACTAGTAATATAAGTCCT---GG--AAGAC-T---A-TTTTC------T-TC---TGC---A-A-----A--TTG--C----AT-TATA---T-CAA----AT-ATA----GTT---C--T-AG--TA--ATTTCACC----------------AAT------GT---ACCTACCTGCAAT-AAACCCTGA-CAG-GCTC--TCA-TTTAT---A-TAA
gi|21619 : TAAAAAACT-TTG-ACCCA----AGAGAT-AATTG-A---TTT--G----CCGAATCT---A-AAG-AA--T-T-TCA--------------AAAC--TTT--GCATATG-AAT-----GC-CC-AAGAAAGTG-A-----ATCGAATG-CCTTCTCAAAAT---CTACTAATAAAATAAGTCCA---GG--CAAAC-T---A-TTTTC------T-TC---TGC---A-A-----A--TTG--C----AT-TATG---T-CAA----ATA-TA----G-TT--C--T-TG--TA--TTTTCACC----------------CAT------GT---ACCTACCCGCAAT-AAACCCTGA-CTG-ACTC--TCA-TTAAT-
gi|21620 : TAAAATAAA-TTC-ACCCA----T--GAT-A--TA-A---TGG--AGTTTCCAAATCC---A-AAA-TA--T-T-TTA--------------AAAC--TTT--ATTAATG-AAA-----GA-CC-AAGAGATGG-A-----ATCAAAGG-CTTTTTCAAAAT---CAATTAGTAACAATAACCCA---GA--TATGT-T---T-TTTTC------T-TC---CGT---A-T-----T--CTT--T----AT-TATA---T-CAT----ATAATA----A-T---T--T-CG--TA--TTTTCTCC----------------TAA------GT---ATCGTCCTGCAAT-GAACCCAGT-TTG-ATC
gi|21621 : TAAAATAAT-TTT-ATCCA----GTCAAT-AAAT------TCGTTA----CCAAACTT---A-AAA-TA--T-TGTAAT-------------G--T--TTT--GAAAATA-AAA-----TT-AT-GGTCAACAC-T-----GTCGAACG-CTTTTTCAAAAT---CAGCAAAGAATATCAGTCCC---GG--TCTAT-T---G-TCGTTA-----T-TC-----------------A--AAT--C----GT-CA-A---TGCAT----TCAAAA----A-TTTCC--T-TA--TG--TTTTCGCC----------------AAT------GT---AACGTCCTTTTAA-GAATCCTGT-CTG-ACTG--TCA-TTGAT-A-A-
gi|21622 : TAAAA-ACT-TTG-ACCCAAAA-TTTC-----------------------CCGAATTT---A-AAG-TA--T-T-TCA--------------AAAC--TTT--GAATATG-AAG-----GC-CC-AAGAAAGTT-A-----ATCGAATG-CCTTTTCAAAAT---CTACTAATAAGATAAGTCCA---GG--CAAAT-G---A-TTTTC------T-TC---TGC---A-A-----A--TTG--C----AT-TATG---T-CAA----AT-ATA----G-T---TCAT-CT--TA--TTTTCAAC----------------CAT------GT---ACCTACCCGCAAT-AAACCCTGA-CTG-ACTC--TCA-TTAATCA-A-
gi|21623 : TAAAATAGT-TTA-ATCCA----ATTTAT-AAAAG-AGTTT---------CCAAAATT---A-AAATAA--G-T-TAG--------------GG-C--TTT--AAAAATA-AAA--------TC-ATG-GTCTGTACT---ATCGAATA-CCTTTTCAAAAT---CAGTAAAAA-TATAAGCCCT---GG--TTTAT-TTTCA-TCATTCAAATGT-TT---TAT---A-T-----A--TAA--------T-TACT---T-CA-----AAAATA----G-T------T-CGATTG--TTTTCACC----------------TAC------AT---ATCTTCCTTTTAA-AAAGCCTGT-TTG-ACTA--TTA-TTGAT-A-A-
gi|21624 : TAAAATAGT-TTG-ATCCA----ATTAAT-AAAAG-A---ATT--A----CCAAAGTA---A-AAA-TA--T-T-TAA--------------GAGC--TTT--TGAAACA-AAA--------C---GGTGATCA-ATGCT-ATCAAAGG-CTTTTTCCAAAT---CAGCAAAAAAGATTAAGCCA---GG--TTTAT-T---T-TTAGT------TATT---TAT---A-TTTTCGA--TAA--C----TT-CAAA--------------AATA----G-T---G--TGAA--TA--TTTTCACC----------------TAT------GT---ACCGTCCTTTTAA-AAAACCAGT-TTG-ACTA--TCA-TTGAT-ATA-TAAA
gi|21625 : TAAAACATT-TTA-ATCCA----ACTAAT-AAAAG-AATTT---------CCAAAATT---A-AAA-TA--A-T-TAA--------------GCAC--TTT--AAAGATA-TAA-----TT-GT-GGTCAATAC-T-----ATCGAAAG-CTTTTTCAAAAT---CGGCAAAAAAAAATAAACCA---GG--T-----------TTGTT------T-TC---ATC---ATT-----T--AAA--C----TT-TCAA---T-CACTTCAAAAATG----G-T------T-CG--TATGTTTTCACC----------------AAT------AT---AGCGTCCTTTTAG-AAACCCCGT-TTG-ACTG--TCA-TTTAT-A-A-
gi|21626 : TAAAATGGT-TTG-ATCCA----ATTAAT-AAAAG-A---ATT--A----CCGAAGTT---A-AAA-TA--T-T-TAA--------------GAGT--TTT--TGAAATA-AAA--------CC---GTGATC--ATTGCTATCAAAGG-CTTTTTCGAAAT---CAGCAAAAAAGATTAAGCCA---GG--T-----------TTATT------T-TCGT-TAT---T-T-----A--TAT--TTTCGAT-TACT---T-CA-----AAAATA----G-TG--C--G-AA--TA--TTTTCACC----------------TAT------GT---ACCGTCCTTTTAA-AAAAACAGT-TTT-ACTA--TCA-TTGAT-A-A-
gi|21627 : TAAAAAACA-TTA-ATCCA----TTTTTT-AATTG-A---TTC--T----CCAAAGTT---A-AAA-TA--A-T-CGA--------------AAGT--TTT--ATAAATG-AAATTGTGAT-CT-A--C-ACTG--------TCGAATG-CTTTTTCAAAAT---CTGCAAAGAATAATAGACTA---GG-----GT-G---G-TCGTT------T-TCATTTAC---A-T-----A--ATC--T----AA-TACA---T-CAT----ATATAA----G-T---C--T-TA--TA--TTTTCACC----------------GAT------GT---AACGGTTT-CTAATAAAACCAGT-TTG-TGCC--TTA-TCAAT-----TAAA
gi|21628 : TAAAAAAGT-TTG-ATCCA----GTT-TT-GAAT------TGA--ATCT-CCAAATTTA--A-AAA-AA--T-T-CAA--------------AGTCTTTTT--G---ATG-AAA-----GA-CC-AAGAGAGAG-T-----GTCAAAGG-CTTTCTCAAAAT---CTATTAAAAGTAGTAATCCT---GG----AAT-G-----TTTTT------T-TC---TTC---A-------G--AGA--G----ATGTAAAATGT-CAT----ATAAAA----G-T---C--T-CG--TG--TTATCACC----------------TAT------AT---ACCTACCCTTTAT-AAATCCTGTCTTGTATACAATAT-TTAAT-A-A-
gi|21629 : TAAAAAACA-TTA-ATCCA----TTTTTT-AATTG-A---TTC--T----CCAAAGTT---A-AAA-TA--A-T-CGA--------------AAGT--TTT--ATAAATG-AAATTGTGAT-CT-A--C-ACTG--------TCAAATG-CTTTTTCAAAAT---CTGCAAAGAATAATAGACTA---GG-----GT-G---G-TCGTT------T-TCATTTAC---A-T-----A--ATC--T----AG-TACA---T-CAT----ATATAA----G-T---C--T-TA--TA--TTTTCACC----------------GAT------GT---AACGGTTT-CTAATAAAACCAGT-TTG-TGCC--TTA-TCAAT-----TAAA
gi|21630 : TAAAATATA-TCT-ATCCA----TTTTTT-GAAAT-C---TAG--A----CCAAAGTT---ACAAA-AA--A-T-TAA--------------T-AC--TTG--GTGAATA-AAG-----TG-CC-ATGCAACCG-A-----ATCAAAGG-CTTTTTCAAAGT---CAAT
gi|21631 : TAAAATA-T-TTA-ATCCA----ATTGAT-AAAGG-A---GTT--A----CCAAAATT---A-AAA-TA--T-G-CAA--------------CAGC--TTT---AAAATA-AAA------T-C----GTGATCT-ATACT-ATGGAATGCCTTTTTCACAAT---TAGCTAAAAATATAAGTCTT---GG--T-----------TTGTC------T-TC---AAC---A-T-----GT-AAA--T----AT-TCTA---T-TACCTCAAAGATA----GTT---C--G-AA--TG--TTTTCGCT----------------TAT------AT---ATCTTCCTTTTTA-AAAG-CTGT-TTG-GCTG--TTA-TTGAT-A-A-
gi|21632 : AGAATAATCTTG-ATCCA----TCT-TT-AAAAG-AC--TGG--T----CCAAAATG---A-TAA-CA--A-T-CAA--------------GGAT--CTC--AAAAATG-AAA-----TT-CT-ACGCAAGAG-A-----GTCAAATG-CTTTTTTGAAGT---CAATCAAAAGGAGGAGTCCT---AGAATCTAT-T---G-TGTTT------T-TC---TTT---A-T-----A--AAA--C----AT-TACA---T-CAT----ATATTA----G-T---G--T-AG--TA--TTTTCCTT----------------TAT------AT---ATC
gi|21633 : AAATAGT-TTA-ACCCA----TTGTTT-GAAGG-A---CTA--A----CCAAAATT---A-AAG-AA--A-T-CAA--------------GGAC--TTT----AAATAGAAA-----GT-CCCAGTTAACAG-A-----ATCAAAGG-CTTTTTCTAAAT---CGATTAAGAGTAGCATTCTT---GG--TATTT-G---T-CTTTT------T-TC---TAC---A-T-----A--AAA--C----AT---GG---T-CAA----ATAATA----G-T---T--G-AA--TA--TTTTCTCC----------------GAT------TT---ATCTACCAGATAA-AATACCTGT-TTA-ATCT--TCA-TTTAT-A-ATTAAA
gi|21634 : T-TTT-ATCCA----GTCAAT-AAAC------TTGTTA----CCAAACTT---A-AAATAG--T-G-TAAT-------------G--T--TTT--AAAAATA-AAA-----TT-AT-GGTCAACAC-T-----ATCGAACG-CTTTTTCAAAAT---CAGCAAAGAATATCAGGCTC---GG--TCTAT-T---G-TCATTA-----T-TCAAGTGG---T-T-----A--ATG--C----AT--------T-CA-----AAAATT----G-TC--C--T-TA--TG--TTTTCGCC----------------AAT------GT---AACGTCCTTTTAA-AAATCCTGT-CTA-ACTG--TTG-TTGAT-A-A-
gi|21635 : -TTG-ATCCAGGACTGTATT-AAA--------GG--A----CCAAAATT---G-AAA-AA--T-T-TTA--------------TTAC--TTT--TTGTATA-AAT-----GA-CC-AAGATAAGG-A-----AGCAAAAG-CTTTTTCAAAGT---CAACAAGGAGCAGTAATCCT---GG--AATAT-G---A-TTTTC------C-TC---TAA---A-T-----A--ATG--C----AT-TATG---T-CAT----ACGTTA----A-T---C--T-TG--TA--TTTTCACC----------------TAT------AT---AATGACCTGTTAA-AAATCCAGT-TTG-ATCT--CTA-TTTAT-A-A-
gi|21636 : CA----TTTTAG-GAAGG-A---TAG--A----ATAAAAAT---A-A-----------TAA--------------GAAC--ATC---AAAATA-AAA-----GC-CC-AGGCAACTA-A-----ATCGAATG-CTTTCTCAAAAT---CATTTAGTAGCACCATGCCT---GG--TAAAT-G---A-TTCTT------T-TC---TAC---A-T-----A--AAA--C----AT-TATT---T-TAT----AAAAAAAAACG-----C--T-AG--CA--TAATAACC----------------AAT------AT---ATTAGCCTCATAA-AAA-CCTG
gi|21637 : aca---TGG--T----TCAAAGTT---ATAAA-AA--T-C-TAACTTACCATAATCAAAGAC--TTT--AAAAATA-AAA-----TG-CC-AAATAACGG-A-----ATTAAATG-CTTTTTCGAAAT---CAATCAAAAGAAGGAGTCCG---GG--GAGATTGC--A-TTATT------C--------C---G-C-----A--AAA--A----AT-TATA---T-CAT----ACATTA----A-T---C--T-GG--TA--TTTTCTTG----------------TAT------GT---ACCTTCCCGCTAA-GAAATATGT-TTG-ATCT--TTA-TGTAT-A-A-
gi|21638 : CATAATT---G-AAA-AA--CAT-TAA---------------AAC--CTC--ATCAATA-AAA-----GA-CC-ACGAGAGTG-T-----ATCAAAAG-CTTTTTCGAAAT---CAATGATAACTAGTAAACCT---GG--TACAT-C---A-TATGT------T-TC---TGC---A-T-----A--ATG--G----AA-TAAA---T-CAT----A-AATT----G-TA--C--G-TG--TA--TTTTCACC-----------------AC------GT---A-----CGGCAAA-AAAAACTGT-TCG-GTCT--TCA-TTAAT-A-A-
gi|21640 : AAAATTTAAA-AAA-AA--T-T-CAA--------------AGTC--TTTTTGA---TG-AAA-----GA-CC-AAGAGAGAG-T-----GTCAAAGG-CTTTCTCAAAAT---CTATTAAAAGTAGTAATCCT---GG----AAT-G-----TTTTT------T-TC---TTC---A-------G--AGA--G----ATGTAAAATGT-CAT----ATAAAA----G-T---C--T-TG--TG--TTATCACC----------------TAT------AT---ACCTTCCTTTTAT-AAAACCTGT-CTG-TTCT--GCA-CTTAT-A-A-
gi|21641 : TA-AAA-----GA-CC-AAGATAATG-T-----ATCGAAAG-CTTTCTCAAAAT---CAATTAGCAGTAATAATCCT---GG--TATAT-------TTATC------T-TC----AC---A-------A--ATATGC----AT-TACG---T-CAT----ATAATA----A-T---C--T-AG--TG--TTATCACC----------------CATATACATGT---ATCTGCCTTTTAT-AAAACCAGT-TTG-TTCT--TTACTTAAT---A-TAA
gi|21642 : aaatttaaaaaagcgtagagtctttctatTCGGAGG-CTTTCTCAAAAT---CAA---ATAGTTACAATAATTAAGG--TA-----------TGTT------G-TC---TGC---A-T---------------------TATA---T-CGT----ATAGTA----C-T---C--T-TG--TA--TTTTCTCC----------------TAA------AT---ATCGTCCTGCAAT-GGACCCTGT-TTT-ATCC--
gi|21643 : ATG-TTTTCTCAAAAT---CATTTAGTAGTAACAT--------G--TAAAT-G---A-TT---------T-TC---TAC---A-T-----A--AAA--C----AT-CAGA---T-CAT----GCATTG----G-T---C--G-AC--AA--AAATCACC----------------AAT------AT---ATCAGCCTCACAA-AAAG-CTGT-TT
gi|21644 : TTTCGAAAT---CTATAATAACTAGTAAACCT---GG--TACAT-C---A-TATGT------T-TC---TGC---A-T-----A--ATG--G----AA-TAAA---T-CAT----A-AATT----G-TA--C--G-TG--TT--TTTTTACC----------------AAT------GT---ATCCTCCGGCAAG-AAAACCGGT-TTG-GTCC--TCA-TTAAT-A-
gi|21645 : CATTCCA---GG--TTAAT-G---T-TGTTT------T-TC---AAC---A-T-----A--AAA--C----AT-T-CG---T-CTT----ACAATA----A-T---C--T-TA--TA--TTGTCACC----------------TAT------AT---ATTTGCCTGATAA-AAAGCCTGT-TTG-ATCT--TCA-TTAGT-A-A-TA
gi|21646 : -----A--AAA--C----AT-AAGG---T-CAT----ACAATA----A-T---C--T-TA--TA--TATTCACA----------------TAT------AT---ATCAGCCAAATAA-AACACCTGT-TTG-ATCT--TCA-TTAAA-A-A-TA
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|21639 ): CAAAATTGAAAAACTTAAATACTTTATAAGTAAAAGAACAGGATATGGAATCAAAGGTGTTGTTTTCTTTTTATTAACAGTACAAGACCAGGAATATTGTTGACTTCAGCATAGTGCATAACATCGTATAATTGTCTTGTATTCTGTCCCATATCGTCCTGACATAAATCCTCTCTGGTCCTCGTGGATAA
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111 1111111111111111 11111 1111111 1111111
lowQualScore : 2 1 22 5555 55 1 88888888888888888 2 333 3 2 6666 1 1111111111111111 11 22222 2 99999999 1 5555 1 0000000 1 555555555 111 1 1 22 33 3333 55555 2222222 2 444444 1 666 111 1 22222 22 1 11 2222 2 2 333 1 4444 6 2222 2 999 44444 11 11 4 88888888888888888 3333333 111 22 33 3 2 1 1 333 1 1 1 2
lowQualScore : . . .. .... .. . ................. . ... . . .... . ................ .. ..... . ........ . .... . ....... . ......... ... . . .. .. .... ..... ....... . ...... . ... ... . ..... .. . .. .... . . ... . .... . .... . ... ..... .. .. . ................. ....... ... .. .. . . . . ... . . . .
lowQualScore : 3 2 99 7777 44 2 66666666666666666 4 999 2 1 4444 1 3333333333333333 44 00000 1 33333333 0 5555 0 0000000 4 111111111 888 4 0 00 77 8888 88888 5555555 0 999999 0 666 888 0 44444 33 2 33 1111 0 3 444 0 1111 2 1111 0 555 00000 33 33 2 44444444444444444 3333333 777 77 00 0 0 0 1 666 1 1 1 4
consensus : TAAAATANT-TTG-ATCCA----TTTNNT-AAANG-A---TGG--A----CCAAAGTT---A-AAA-AA--T-T-TAA--------------GAAC--TTC--GAAAATA-AAA-----GN-CC-AGGCGACNG-A-----ATCGAANG---------CTTTTTCAAAAT---CAATNAANAGTANCANNCCT---GG--TANAT-G---A-TTNTT------T-TC---TAC---A-T-----A--AAA--C----AT-TANA---T-CAT----ACAATA----G-T---C--T-NG--TA--TTTTCGCC----------------NAT------GT---ATCNNCCTGNTAA-AAANCCTGT-TTG-ATCC--TCA-TTAAT-A-A-TAAATG
Reference ( family-529 ) : TAAAATANT-TTG-ATCCA----TTTNNT-AAANG-A---TGG--A----CCAAAGTT---A-AAA-AA--T-T-TAA--------------GAAC--TTC--GAAAATA-AAA-----GN-CC-AGGCGACNG-A-----ATCGAANG---------CTTTTTCAAAAT---CAATNAANAGTANCANNCCT---GG--TANAT-G---A-TTNTT------T-TC---TAC---A-T-----A--AAA--C----AT-TANA---T-CAT----ACAATA----G-T---C--T-NG--TA--TTTTCGCC----------------NAT------GT---ATCNNCCTGNTAA-AAANCCTGT-TTG-ATCC--TCA-TTAAT-A-A-TAAATG
gi|21603 : TAAAATACT-TTG-ACCCA----TTTAAT-AAAGG-A---TGG--A----CCAAAGTT---A-AAA-AA--T-T-TAA--------------GAAC--AGC--AAAAATA-AAA-----GC-CC-AGGCGACCG-A-----GTCAAATG---------CTTTCTCAAAGT---CAATGAGTAGTAACATGCCT---GG--TTCAT-G---G-TTCTT------T-TC---TAA---A-T-----A--AAA--C----AT-TAGA---T-CAT----ACAATA----A-T---C--G-AG--TA--TTTTCGCC----------------AAT------GT---ATCGGCCTGACAA-AAATCCTGT-CTG-ATCC--TCA-TTAAT-A-A-TAAATG
gi|21604 : TAAAATACT-TTG-ACCTA----TTTAAT-AAAGG-A---TGG--A----TCAAAGTT---A-AAC-AA--T-T-TAA--------------GAAC--AGC--AAAAATA-AAA-----GC-CC-AGGCGACCG-A-----GTCGAATG---------CTTTCTCAAAGT---CAATGAGTAGTAACATGCCT---GG--TACAT-G---A-TTCTT------T-TC---TAA---A-T-----A--AAA--C----AT-TAGA---T-CAT----ACAATA----A-T---C--G-AG--TA--TTTTCGCC----------------AAT------TT---AGCGGCCTGACAA-AAATCCTGT-CTG-ATCC--TCA-TTAAT-A-A-TAAATG
gi|21605 : TAAAATACT-TTG-ACCCA----TT-AAT-AAAGG-A---TGG--A----CCAAAGGT---T-GAA-AA--T-T-TAA--------------GAAC--AGC--AAAAATA-AAA-----GC-CC-AGGCGACCG-A-----GTCGAGTG---------CTTTCTCAAAGT---CATTTAGTAGTAACATGCCT---GG--TACAT-G---A-TTCTT------T-TC---TAA---A-T-----AATAAA--T----AT-TAGA---T-CAT----ACAATA----A-T---C--G-AG--TA--TTTTCGCC----------------AAT------TT---AGCGGCCTGACAA-AAATCCTGT-CTG-GTCC--TCA-TTAAT-A-A-TAAATG
gi|21606 : TAAAA-ACT-TTG-ACTCA----TTTAAT-AAAGG-A---TGG--A----CCAAAGTT---A-AAA-AA--T-T-TAA--------------GAAC--AGC--AAAAATA-AAA-----GC-CC-AGGCGACCG-A-----GTCGAATG---------CTTTCTCAAAGT---CAATTAGTAGTAACATGCTT---GG--TACAT-T---A-TTCTT------T-TC---TAA---A-T-----A--AAA--C----AT-TAGA---T-CAT----ACAGAA----A-T---C--G-AG--TA--TTTTCGCC----------------AAT------GT---ATCGGCCTGACAA-AAATCTTGT-CTG-ATCC--TCA-TTAAT-G-A-TAAATG
gi|21607 : TAAAATATT-TTG-ACCCA----TTTAAT-AAAGG-A---AGG--A----CGAAAGTT---A-AAA-AA--A-T-GTA--------------TAAC--AGC--AAATATA-AAA-----GT-CA-AGGTGGCTG-A-----ATCGAATG---------CTTTCTCAAAGT---CAATTAGTAGTAGCATGCCT---GG--TAAAT-G---A-TTATT------T-TC---TAA---A-T-----T--AAA--C----AT-TGTA---T-CAA----TCAGTA----A-T---C--G-AG--TA--TTTTCACC----------------AAT------AT---ATCGACCTAATGA-AAATCCTGT-CTG-ATCC--TTA-CTAAT-A-A-AAGATG
gi|21608 : TAAAATAAC-TGT-ATCCA----TTTTTT-AATTG-A---AGA--G----CCAAAATT---G-AAA-AA--C-T-GTA--------------GAAC--TGA--GAAAATA-AAA-----GA-CC-AACTAACGG-A-----ATCAAATG---------CTTTCTCAAAAT---CGATTAAAAGAAGCATTCCA---GG--TAAAT-G---T-TGTTT------T-TC---AAC---A-T-----A--AAA--C----AT-AAGG---T-CAT----ACAATA----A-T---C--T-AA--TA--TTTTCACC----------------TAT------AT---ATCTGCCAGATAA-AAAACCTGT-TTG-ATCT--TCA-TTAAA-A-A-TA
gi|21609 : TAAAATTGT-TTA-ACCCA----TTGTTT-GAAGG-A---CGG--A----CCAAAATT---A-AAG-AA--A-T-CGA--------------GGAC--TTC----AAATAGAAA-----GTTCC-AGTTAACGG-A-----ATCAAAGA---------CTTTTTCAAAAT---CGATTAAGAGTAGCATTCTT---GG--TAATT-G---T-CTTTT------T-TC---TAC---A-T-----A--AAA--C----AT-GAAG---T-CAT----ATAATA----G-T---C--G-AA--TA--TTTTCTCC----------------AAT------AT---ATCTACCAGATAA-AAAACCTGT-TTG-GTCT--TCA-TTGAT-A-ATTAAA
gi|21610 : TAAAATAAT-TTA-ATCCA----TTTTTT-AAAACTA---TG---A----CCAAAATT---A-AAA-AAACG-T-TAA---------------AAC--CTC--CTCAATA-AAC-----GA-CC-ATGAGATAG-T-----ATCAAGTG---------CTTTTTCGAAAT---CAGCAATAACCAATAACCCT---GG--TATAT-C---A-TTTTT------T-TC---TGT---G-T-----A--ATA--A----AA-GAGA---T-CAT----A-GATA----G-TG--C--G-AG--TG--TTTTCGCC----------------AAT------AT---ATCTTCCTTCCAA-AAATCCTGT-CTG-ATCA--TCA-TTTAT-A-A-CA
gi|21611 : TGAAATAAC-TGT-ATCCA----TTTTTT-AATTG-A---AGA--G----CCAAAATT---G-AAC-AA--C-T-CTA--------------GAAC--TGA--GAAAATA-AAA-----GA-CC-AACTAACGG-A-----ATCAAACG---------CTAACTCAAAAT---CGATTAAATGAAACATTCCA---GG--TAAAT-G---T-TGATA------T-TC---AAC---A-T-----A--AAA--C----AT-AACG---T-CAT----ACAATA----A-T---C--T-AA--TA--TTGTCACC----------------TAT------AT---ATCTGCCAGATAG-AAAGCCTGT-ATG-ATCT--TCA-TTAAT-A-A-TA
gi|21612 : TAAAATATA-TTT-ATCCA----TTTTTT-GAAAT-C---TGG--A----CCAAATTT---ATAAA-AA--T-T-TAA--------------TACC--TT---GTGAATA-AAA-----TG-CC-ATGCAACCG-A-----GTCAAAGG---------CTTTTTCAAAAT---CAATTGAAAGTAATAGTCTA---GG--TATAT-A---A-TTATT------T-TC---GGT---A-T-----A--AAA--C----AT-TAAA---T-CAT----ATAAAA----G-T---T--T-----TA--TTTTCTCCTATATACATGTGTATATAT------GT---ATCTGTTTGGGAT-GAAACCTGT-TTG-ATCT--TCA-TTAAT-A-A-TATAT
gi|21613 : TAAAATAAT-TTA-GTCCA----TTTTTTTAAATT-A---TG---A----CCAAAATA---A-AAA-AACGT-T-TAA----------------AC--TTC--CTCAATA-AAC-----GA-CC-ATGAGATAA-T-----ATCAAACG---------CTTTTTCGAAATCAGCAATAAACAATAAC---CCT---GG--TATAT-C---ATTTTTT------T-TC---TGTGTAA-T-----A--AAA--C--------AGA---T-TAT----A-GATA----G-TG--C--G-AG--TG--TTTTCGCC----------------AAT------AT---ATCTTCCTTCCAA-ACATCCTGT-CTG-ATCA--TCA-TTAAT-A-A-CA
gi|21614 : TAAAATACT-TTG-ACCCA----TTTAAT-AAAAG-A---TGG--A----CCAAAGTA---A-ATA-AA--A-T-TAA--------------GAAC--AGC--AAAAATA-AAA-----GC-CC-AGGCGAC
gi|21615 : TAAAATAAT-TTA-ATCCAA---TTTCTT-AAATT-T---TT--------CCAAAATT---A-AAA-AA--CAT-TAA---------------AAC--CTC--ATCAATA-AAA-----GA-CC-ATGAGAGTG-T-----ATCAAAAG---------CTTTTTCGAAAT---CAATGATAACTAGTAAACCT---GG--TACAT-C---A-TATGT------T-TC---TGC---A-T-----A--ATG--G----AA-TAAA---T-CAT----A-AATT----G-TA--C--G-TG--TA--TTTTCACC----------------AAT------GT---ATCGTCCGGCAAG-AAAACTGGT-TTG-GTCT--TCA-TTAAT-A-A-
gi|21616 : TAAAATACT-TTTTACTCA----TTTAAT-AAAGG-A---TTG--G----CCAAAGTT-----AGA-AA--T-T-TAA--------------GAAC--AGC--AAAAATA-AAA-----GT-CC-AGGCGACTG-A-----GTCAA
gi|21617 : TAAAATATG-TGT-ATCCA----TTTTTT-AATTG-A---ACA--G----TCAAAATTG--A-AAA-AA--C-T-GTA--------------GAAC--GGA--GAAAATA-AAA-----TA-CC-AACTAACGG-A-----ATCGA------------------------------TTAAAAGAAGCATTCCA---GG--TAAAT-G---T-TGTTT------T-TC---AAC---A-T-----A--AAA--C----AT-AAGG---T-CAT----ACAATA----A-T---T--T-AA--CA--TTTTCACC----------------TAT------ATATCATCTGCCAGATAATAAAACCTGT-TTG-ATCT--TCA-TTAAT-A-A-TAtg
gi|21618 : TAAAAAACT-TTG-ACCGA----AGAGAT-AACTG-A---TTC--C----CCGAATTT---A-AAG-AA--T-T-TCA--------------AAAC--TTT--GAATATG-AAG-----GC-CC-AAGAAAATG-A-----ATAGAATG---------CCTTCTCAAAAT---CTACTAGTAATATAAGTCCT---GG--AAGAC-T---A-TTTTC------T-TC---TGC---A-A-----A--TTG--C----AT-TATA---T-CAA----AT-ATA----GTT---C--T-AG--TA--ATTTCACC----------------AAT------GT---ACCTACCTGCAAT-AAACCCTGA-CAG-GCTC--TCA-TTTAT---A-TAA
gi|21619 : TAAAAAACT-TTG-ACCCA----AGAGAT-AATTG-A---TTT--G----CCGAATCT---A-AAG-AA--T-T-TCA--------------AAAC--TTT--GCATATG-AAT-----GC-CC-AAGAAAGTG-A-----ATCGAATG---------CCTTCTCAAAAT---CTACTAATAAAATAAGTCCA---GG--CAAAC-T---A-TTTTC------T-TC---TGC---A-A-----A--TTG--C----AT-TATG---T-CAA----ATA-TA----G-TT--C--T-TG--TA--TTTTCACC----------------CAT------GT---ACCTACCCGCAAT-AAACCCTGA-CTG-ACTC--TCA-TTAAT-
gi|21620 : TAAAATAAA-TTC-ACCCA----T--GAT-A--TA-A---TGG--AGTTTCCAAATCC---A-AAA-TA--T-T-TTA--------------AAAC--TTT--ATTAATG-AAA-----GA-CC-AAGAGATGG-A-----ATCAAAGG---------CTTTTTCAAAAT---CAATTAGTAACAATAACCCA---GA--TATGT-T---T-TTTTC------T-TC---CGT---A-T-----T--CTT--T----AT-TATA---T-CAT----ATAATA----A-T---T--T-CG--TA--TTTTCTCC----------------TAA------GT---ATCGTCCTGCAAT-GAACCCAGT-TTG-ATC
gi|21621 : TAAAATAAT-TTT-ATCCA----GTCAAT-AAAT------TCGTTA----CCAAACTT---A-AAA-TA--T-TGTAAT-------------G--T--TTT--GAAAATA-AAA-----TT-AT-GGTCAACAC-T-----GTCGAACG---------CTTTTTCAAAAT---CAGCAAAGAATATCAGTCCC---GG--TCTAT-T---G-TCGTTA-----T-TC-----------------A--AAT--C----GT-CA-A---TGCAT----TCAAAA----A-TTTCC--T-TA--TG--TTTTCGCC----------------AAT------GT---AACGTCCTTTTAA-GAATCCTGT-CTG-ACTG--TCA-TTGAT-A-A-
gi|21622 : TAAAA-ACT-TTG-ACCCAAAA-TTTC-----------------------CCGAATTT---A-AAG-TA--T-T-TCA--------------AAAC--TTT--GAATATG-AAG-----GC-CC-AAGAAAGTT-A-----ATCGAATG---------CCTTTTCAAAAT---CTACTAATAAGATAAGTCCA---GG--CAAAT-G---A-TTTTC------T-TC---TGC---A-A-----A--TTG--C----AT-TATG---T-CAA----AT-ATA----G-T---TCAT-CT--TA--TTTTCAAC----------------CAT------GT---ACCTACCCGCAAT-AAACCCTGA-CTG-ACTC--TCA-TTAATCA-A-
gi|21623 : TAAAATAGT-TTA-ATCCA----ATTTAT-AAAAG-AGTTT---------CCAAAATT---A-AAATAA--G-T-TAG--------------GG-C--TTT--AAAAATA-AAA--------TC-ATG-GTCTGTACT---ATCGAATA---------CCTTTTCAAAAT---CAGTAAAAA-TATAAGCCCT---GG--TTTAT-TTTCA-TCATTCAAATGT-TT---TAT---A-T-----A--TAA--------T-TACT---T-CA-----AAAATA----G-T------T-CGATTG--TTTTCACC----------------TAC------AT---ATCTTCCTTTTAA-AAAGCCTGT-TTG-ACTA--TTA-TTGAT-A-A-
gi|21624 : TAAAATAGT-TTG-ATCCA----ATTAAT-AAAAG-A---ATT--A----CCAAAGTA---A-AAA-TA--T-T-TAA--------------GAGC--TTT--TGAAACA-AAA--------C---GGTGATCA-ATGCT-ATCAAAGG---------CTTTTTCCAAAT---CAGCAAAAAAGATTAAGCCA---GG--TTTAT-T---T-TTAGT------TATT---TAT---A-TTTTCGA--TAA--C----TT-CAAA--------------AATA----G-T---G--TGAA--TA--TTTTCACC----------------TAT------GT---ACCGTCCTTTTAA-AAAACCAGT-TTG-ACTA--TCA-TTGAT-ATA-TAAA
gi|21625 : TAAAACATT-TTA-ATCCA----ACTAAT-AAAAG-AATTT---------CCAAAATT---A-AAA-TA--A-T-TAA--------------GCAC--TTT--AAAGATA-TAA-----TT-GT-GGTCAATAC-T-----ATCGAAAG---------CTTTTTCAAAAT---CGGCAAAAAAAAATAAACCA---GG--T-----------TTGTT------T-TC---ATC---ATT-----T--AAA--C----TT-TCAA---T-CACTTCAAAAATG----G-T------T-CG--TATGTTTTCACC----------------AAT------AT---AGCGTCCTTTTAG-AAACCCCGT-TTG-ACTG--TCA-TTTAT-A-A-
gi|21626 : TAAAATGGT-TTG-ATCCA----ATTAAT-AAAAG-A---ATT--A----CCGAAGTT---A-AAA-TA--T-T-TAA--------------GAGT--TTT--TGAAATA-AAA--------CC---GTGATC--ATTGCTATCAAAGG---------CTTTTTCGAAAT---CAGCAAAAAAGATTAAGCCA---GG--T-----------TTATT------T-TCGT-TAT---T-T-----A--TAT--TTTCGAT-TACT---T-CA-----AAAATA----G-TG--C--G-AA--TA--TTTTCACC----------------TAT------GT---ACCGTCCTTTTAA-AAAAACAGT-TTT-ACTA--TCA-TTGAT-A-A-
gi|21627 : TAAAAAACA-TTA-ATCCA----TTTTTT-AATTG-A---TTC--T----CCAAAGTT---A-AAA-TA--A-T-CGA--------------AAGT--TTT--ATAAATG-AAATTGTGAT-CT-A--C-ACTG--------TCGAATG---------CTTTTTCAAAAT---CTGCAAAGAATAATAGACTA---GG-----GT-G---G-TCGTT------T-TCATTTAC---A-T-----A--ATC--T----AA-TACA---T-CAT----ATATAA----G-T---C--T-TA--TA--TTTTCACC----------------GAT------GT---AACGGTTT-CTAATAAAACCAGT-TTG-TGCC--TTA-TCAAT-----TAAA
gi|21628 : TAAAAAAGT-TTG-ATCCA----GTT-TT-GAAT------TGA--ATCT-CCAAATTTA--A-AAA-AA--T-T-CAA--------------AGTCTTTTT--G---ATG-AAA-----GA-CC-AAGAGAGAG-T-----GTCAAAGG---------CTTTCTCAAAAT---CTATTAAAAGTAGTAATCCT---GG----AAT-G-----TTTTT------T-TC---TTC---A-------G--AGA--G----ATGTAAAATGT-CAT----ATAAAA----G-T---C--T-CG--TG--TTATCACC----------------TAT------AT---ACCTACCCTTTAT-AAATCCTGTCTTGTATACAATAT-TTAAT-A-A-
gi|21629 : TAAAAAACA-TTA-ATCCA----TTTTTT-AATTG-A---TTC--T----CCAAAGTT---A-AAA-TA--A-T-CGA--------------AAGT--TTT--ATAAATG-AAATTGTGAT-CT-A--C-ACTG--------TCAAATG---------CTTTTTCAAAAT---CTGCAAAGAATAATAGACTA---GG-----GT-G---G-TCGTT------T-TCATTTAC---A-T-----A--ATC--T----AG-TACA---T-CAT----ATATAA----G-T---C--T-TA--TA--TTTTCACC----------------GAT------GT---AACGGTTT-CTAATAAAACCAGT-TTG-TGCC--TTA-TCAAT-----TAAA
gi|21630 : TAAAATATA-TCT-ATCCA----TTTTTT-GAAAT-C---TAG--A----CCAAAGTT---ACAAA-AA--A-T-TAA--------------T-AC--TTG--GTGAATA-AAG-----TG-CC-ATGCAACCG-A-----ATCAAAGG---------CTTTTTCAAAGT---CAAT
gi|21631 : TAAAATA-T-TTA-ATCCA----ATTGAT-AAAGG-A---GTT--A----CCAAAATT---A-AAA-TA--T-G-CAA--------------CAGC--TTT---AAAATA-AAA------T-C----GTGATCT-ATACT-ATGGAATGC--------CTTTTTCACAAT---TAGCTAAAAATATAAGTCTT---GG--T-----------TTGTC------T-TC---AAC---A-T-----GT-AAA--T----AT-TCTA---T-TACCTCAAAGATA----GTT---C--G-AA--TG--TTTTCGCT----------------TAT------AT---ATCTTCCTTTTTA-AAAG-CTGT-TTG-GCTG--TTA-TTGAT-A-A-
gi|21632 : AGAATAATCTTG-ATCCA----TCT-TT-AAAAG-AC--TGG--T----CCAAAATG---A-TAA-CA--A-T-CAA--------------GGAT--CTC--AAAAATG-AAA-----TT-CT-ACGCAAGAG-A-----GTCAAATG---------CTTTTTTGAAGT---CAATCAAAAGGAGGAGTCCT---AGAATCTAT-T---G-TGTTT------T-TC---TTT---A-T-----A--AAA--C----AT-TACA---T-CAT----ATATTA----G-T---G--T-AG--TA--TTTTCCTT----------------TAT------AT---ATC
gi|21633 : AAATAGT-TTA-ACCCA----TTGTTT-GAAGG-A---CTA--A----CCAAAATT---A-AAG-AA--A-T-CAA--------------GGAC--TTT----AAATAGAAA-----GT-CCCAGTTAACAG-A-----ATCAAAGG---------CTTTTTCTAAAT---CGATTAAGAGTAGCATTCTT---GG--TATTT-G---T-CTTTT------T-TC---TAC---A-T-----A--AAA--C----AT---GG---T-CAA----ATAATA----G-T---T--G-AA--TA--TTTTCTCC----------------GAT------TT---ATCTACCAGATAA-AATACCTGT-TTA-ATCT--TCA-TTTAT-A-ATTAAA
gi|21634 : T-TTT-ATCCA----GTCAAT-AAAC------TTGTTA----CCAAACTT---A-AAATAG--T-G-TAAT-------------G--T--TTT--AAAAATA-AAA-----TT-AT-GGTCAACAC-T-----ATCGAACG---------CTTTTTCAAAAT---CAGCAAAGAATATCAGGCTC---GG--TCTAT-T---G-TCATTA-----T-TCAAGTGG---T-T-----A--ATG--C----AT--------T-CA-----AAAATT----G-TC--C--T-TA--TG--TTTTCGCC----------------AAT------GT---AACGTCCTTTTAA-AAATCCTGT-CTA-ACTG--TTG-TTGAT-A-A-
gi|21635 : -TTG-ATCCAGGACTGTATT-AAA--------GG--A----CCAAAATT---G-AAA-AA--T-T-TTA--------------TTAC--TTT--TTGTATA-AAT-----GA-CC-AAGATAAGG-A-----AGCAAAAG---------CTTTTTCAAAGT---CAACAAGGAGCAGTAATCCT---GG--AATAT-G---A-TTTTC------C-TC---TAA---A-T-----A--ATG--C----AT-TATG---T-CAT----ACGTTA----A-T---C--T-TG--TA--TTTTCACC----------------TAT------AT---AATGACCTGTTAA-AAATCCAGT-TTG-ATCT--CTA-TTTAT-A-A-
gi|21636 : CA----TTTTAG-GAAGG-A---TAG--A----ATAAAAAT---A-A-----------TAA--------------GAAC--ATC---AAAATA-AAA-----GC-CC-AGGCAACTA-A-----ATCGAATG---------CTTTCTCAAAAT---CATTTAGTAGCACCATGCCT---GG--TAAAT-G---A-TTCTT------T-TC---TAC---A-T-----A--AAA--C----AT-TATT---T-TAT----AAAAAAAAACG-----C--T-AG--CA--TAATAACC----------------AAT------AT---ATTAGCCTCATAA-AAA-CCTG
gi|21637 : aca---TGG--T----TCAAAGTT---ATAAA-AA--T-C-TAACTTACCATAATCAAAGAC--TTT--AAAAATA-AAA-----TG-CC-AAATAACGG-A-----ATTAAATG---------CTTTTTCGAAAT---CAATCAAAAGAAGGAGTCCG---GG--GAGATTGC--A-TTATT------C--------C---G-C-----A--AAA--A----AT-TATA---T-CAT----ACATTA----A-T---C--T-GG--TA--TTTTCTTG----------------TAT------GT---ACCTTCCCGCTAA-GAAATATGT-TTG-ATCT--TTA-TGTAT-A-A-
gi|21638 : CATAATT---G-AAA-AA--CAT-TAA---------------AAC--CTC--ATCAATA-AAA-----GA-CC-ACGAGAGTG-T-----ATCAAAAG---------CTTTTTCGAAAT---CAATGATAACTAGTAAACCT---GG--TACAT-C---A-TATGT------T-TC---TGC---A-T-----A--ATG--G----AA-TAAA---T-CAT----A-AATT----G-TA--C--G-TG--TA--TTTTCACC-----------------AC------GT---A-----CGGCAAA-AAAAACTGT-TCG-GTCT--TCA-TTAAT-A-A-
gi|21639 : CAAAATT---G-AAA-AA--C-T-TAA--------------ATAC--TTT--ATAAGTA-AAA-----GA-AC-AGGATATGG-A-----ATCAAAGGTGTTGTTTTCTTTTT-----------ATTAACAGTACAAGACCA---GG--AATAT-T---G-TTGAC------T-TC---AGC---A-T-----A--GTG--C----AT-AACA---T-CGT----ATAATT----G-T---C--T-TG--TA--TTCTGTCC----------------CAT-----------ATCGTCCTGACAT-AAATCCTCT-CTG-GTCC--TCG-TGGAT-A-A-
gi|21640 : AAAATTTAAA-AAA-AA--T-T-CAA--------------AGTC--TTTTTGA---TG-AAA-----GA-CC-AAGAGAGAG-T-----GTCAAAGG---------CTTTCTCAAAAT---CTATTAAAAGTAGTAATCCT---GG----AAT-G-----TTTTT------T-TC---TTC---A-------G--AGA--G----ATGTAAAATGT-CAT----ATAAAA----G-T---C--T-TG--TG--TTATCACC----------------TAT------AT---ACCTTCCTTTTAT-AAAACCTGT-CTG-TTCT--GCA-CTTAT-A-A-
gi|21641 : TA-AAA-----GA-CC-AAGATAATG-T-----ATCGAAAG---------CTTTCTCAAAAT---CAATTAGCAGTAATAATCCT---GG--TATAT-------TTATC------T-TC----AC---A-------A--ATATGC----AT-TACG---T-CAT----ATAATA----A-T---C--T-AG--TG--TTATCACC----------------CATATACATGT---ATCTGCCTTTTAT-AAAACCAGT-TTG-TTCT--TTACTTAAT---A-TAA
gi|21642 : aaatttaaaaaagcgtagagtctttctatTCGGAGG---------CTTTCTCAAAAT---CAA---ATAGTTACAATAATTAAGG--TA-----------TGTT------G-TC---TGC---A-T---------------------TATA---T-CGT----ATAGTA----C-T---C--T-TG--TA--TTTTCTCC----------------TAA------AT---ATCGTCCTGCAAT-GGACCCTGT-TTT-ATCC--
gi|21643 : ATG---------TTTTCTCAAAAT---CATTTAGTAGTAACAT--------G--TAAAT-G---A-TT---------T-TC---TAC---A-T-----A--AAA--C----AT-CAGA---T-CAT----GCATTG----G-T---C--G-AC--AA--AAATCACC----------------AAT------AT---ATCAGCCTCACAA-AAAG-CTGT-TT
gi|21644 : TTTCGAAAT---CTATAATAACTAGTAAACCT---GG--TACAT-C---A-TATGT------T-TC---TGC---A-T-----A--ATG--G----AA-TAAA---T-CAT----A-AATT----G-TA--C--G-TG--TT--TTTTTACC----------------AAT------GT---ATCCTCCGGCAAG-AAAACCGGT-TTG-GTCC--TCA-TTAAT-A-
gi|21645 : CATTCCA---GG--TTAAT-G---T-TGTTT------T-TC---AAC---A-T-----A--AAA--C----AT-T-CG---T-CTT----ACAATA----A-T---C--T-TA--TA--TTGTCACC----------------TAT------AT---ATTTGCCTGATAA-AAAGCCTGT-TTG-ATCT--TCA-TTAGT-A-A-TA
gi|21646 : -----A--AAA--C----AT-AAGG---T-CAT----ACAATA----A-T---C--T-TA--TA--TATTCACA----------------TAT------AT---ATCAGCCAAATAA-AACACCTGT-TTG-ATCT--TCA-TTAAA-A-A-TA
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111 1111111111111111 11111 1111111 1111111
lowQualScore : 2 1 22 5555 55 1 88888888888888888 2 333 3 2 6666 1 1111111111111111 11 22222 2 99999999 1 5555 1 0000000 1 555555555 111 1 1 22 33 3333 55555 2222222 2 444444 1 666 111 1 22222 22 1 11 2222 2 2 333 1 4444 6 2222 2 999 44444 11 11 4 88888888888888888 3333333 111 22 33 3 2 1 1 333 1 1 1 2
lowQualScore : . . .. .... .. . ................. . ... . . .... . ................ .. ..... . ........ . .... . ....... . ......... ... . . .. .. .... ..... ....... . ...... . ... ... . ..... .. . .. .... . . ... . .... . .... . ... ..... .. .. . ................. ....... ... .. .. . . . . ... . . . .
lowQualScore : 3 2 99 7777 44 2 66666666666666666 4 999 2 1 4444 1 3333333333333333 44 00000 1 33333333 0 5555 0 0000000 4 111111111 888 4 0 00 77 8888 88888 5555555 0 999999 0 666 888 0 44444 33 2 33 1111 0 3 444 0 1111 2 1111 0 555 00000 33 33 2 44444444444444444 3333333 777 77 00 0 0 0 1 666 1 1 1 4
consensus : TAAAATANT-TTG-ATCCA----TTTNNT-AAANG-A---TGG--A----CCAAAGTT---A-AAA-AA--T-T-TAA--------------GAAC--TTC--GAAAATA-AAA-----GN-CC-AGGCGACNG-A-----ATCGAANG---------CTTTTTCAAAAT---CAATNAANAGTANCANNCCT---GG--TANAT-G---A-TTNTT------T-TC---TAC---A-T-----A--AAA--C----AT-TANA---T-CAT----ACAATA----G-T---C--T-NG--TA--TTTTCGCC----------------NAT------GT---ATCNNCCTGNTAA-AAANCCTGT-TTG-ATCC--TCA-TTAAT-A-A-TAAATG
Reference ( family-529 ) : TAAAATANT-TTG-ATCCA----TTTNNT-AAANG-A---TGG--A----CCAAAGTT---A-AAA-AA--T-T-TAA--------------GAAC--TTC--GAAAATA-AAA-----GN-CC-AGGCGACNG-A-----ATCGAANG---------CTTTTTCAAAAT---CAATNAANAGTANCANNCCT---GG--TANAT-G---A-TTNTT------T-TC---TAC---A-T-----A--AAA--C----AT-TANA---T-CAT----ACAATA----G-T---C--T-NG--TA--TTTTCGCC----------------NAT------GT---ATCNNCCTGNTAA-AAANCCTGT-TTG-ATCC--TCA-TTAAT-A-A-TAAATG
gi|21603 : TAAAATACT-TTG-ACCCA----TTTAAT-AAAGG-A---TGG--A----CCAAAGTT---A-AAA-AA--T-T-TAA--------------GAAC--AGC--AAAAATA-AAA-----GC-CC-AGGCGACCG-A-----GTCAAATG---------CTTTCTCAAAGT---CAATGAGTAGTAACATGCCT---GG--TTCAT-G---G-TTCTT------T-TC---TAA---A-T-----A--AAA--C----AT-TAGA---T-CAT----ACAATA----A-T---C--G-AG--TA--TTTTCGCC----------------AAT------GT---ATCGGCCTGACAA-AAATCCTGT-CTG-ATCC--TCA-TTAAT-A-A-TAAATG
gi|21604 : TAAAATACT-TTG-ACCTA----TTTAAT-AAAGG-A---TGG--A----TCAAAGTT---A-AAC-AA--T-T-TAA--------------GAAC--AGC--AAAAATA-AAA-----GC-CC-AGGCGACCG-A-----GTCGAATG---------CTTTCTCAAAGT---CAATGAGTAGTAACATGCCT---GG--TACAT-G---A-TTCTT------T-TC---TAA---A-T-----A--AAA--C----AT-TAGA---T-CAT----ACAATA----A-T---C--G-AG--TA--TTTTCGCC----------------AAT------TT---AGCGGCCTGACAA-AAATCCTGT-CTG-ATCC--TCA-TTAAT-A-A-TAAATG
gi|21605 : TAAAATACT-TTG-ACCCA----TT-AAT-AAAGG-A---TGG--A----CCAAAGGT---T-GAA-AA--T-T-TAA--------------GAAC--AGC--AAAAATA-AAA-----GC-CC-AGGCGACCG-A-----GTCGAGTG---------CTTTCTCAAAGT---CATTTAGTAGTAACATGCCT---GG--TACAT-G---A-TTCTT------T-TC---TAA---A-T-----AATAAA--T----AT-TAGA---T-CAT----ACAATA----A-T---C--G-AG--TA--TTTTCGCC----------------AAT------TT---AGCGGCCTGACAA-AAATCCTGT-CTG-GTCC--TCA-TTAAT-A-A-TAAATG
gi|21606 : TAAAA-ACT-TTG-ACTCA----TTTAAT-AAAGG-A---TGG--A----CCAAAGTT---A-AAA-AA--T-T-TAA--------------GAAC--AGC--AAAAATA-AAA-----GC-CC-AGGCGACCG-A-----GTCGAATG---------CTTTCTCAAAGT---CAATTAGTAGTAACATGCTT---GG--TACAT-T---A-TTCTT------T-TC---TAA---A-T-----A--AAA--C----AT-TAGA---T-CAT----ACAGAA----A-T---C--G-AG--TA--TTTTCGCC----------------AAT------GT---ATCGGCCTGACAA-AAATCTTGT-CTG-ATCC--TCA-TTAAT-G-A-TAAATG
gi|21607 : TAAAATATT-TTG-ACCCA----TTTAAT-AAAGG-A---AGG--A----CGAAAGTT---A-AAA-AA--A-T-GTA--------------TAAC--AGC--AAATATA-AAA-----GT-CA-AGGTGGCTG-A-----ATCGAATG---------CTTTCTCAAAGT---CAATTAGTAGTAGCATGCCT---GG--TAAAT-G---A-TTATT------T-TC---TAA---A-T-----T--AAA--C----AT-TGTA---T-CAA----TCAGTA----A-T---C--G-AG--TA--TTTTCACC----------------AAT------AT---ATCGACCTAATGA-AAATCCTGT-CTG-ATCC--TTA-CTAAT-A-A-AAGATG
gi|21608 : TAAAATAAC-TGT-ATCCA----TTTTTT-AATTG-A---AGA--G----CCAAAATT---G-AAA-AA--C-T-GTA--------------GAAC--TGA--GAAAATA-AAA-----GA-CC-AACTAACGG-A-----ATCAAATG---------CTTTCTCAAAAT---CGATTAAAAGAAGCATTCCA---GG--TAAAT-G---T-TGTTT------T-TC---AAC---A-T-----A--AAA--C----AT-AAGG---T-CAT----ACAATA----A-T---C--T-AA--TA--TTTTCACC----------------TAT------AT---ATCTGCCAGATAA-AAAACCTGT-TTG-ATCT--TCA-TTAAA-A-A-TA
gi|21609 : TAAAATTGT-TTA-ACCCA----TTGTTT-GAAGG-A---CGG--A----CCAAAATT---A-AAG-AA--A-T-CGA--------------GGAC--TTC----AAATAGAAA-----GTTCC-AGTTAACGG-A-----ATCAAAGA---------CTTTTTCAAAAT---CGATTAAGAGTAGCATTCTT---GG--TAATT-G---T-CTTTT------T-TC---TAC---A-T-----A--AAA--C----AT-GAAG---T-CAT----ATAATA----G-T---C--G-AA--TA--TTTTCTCC----------------AAT------AT---ATCTACCAGATAA-AAAACCTGT-TTG-GTCT--TCA-TTGAT-A-ATTAAA
gi|21610 : TAAAATAAT-TTA-ATCCA----TTTTTT-AAAACTA---TG---A----CCAAAATT---A-AAA-AAACG-T-TAA---------------AAC--CTC--CTCAATA-AAC-----GA-CC-ATGAGATAG-T-----ATCAAGTG---------CTTTTTCGAAAT---CAGCAATAACCAATAACCCT---GG--TATAT-C---A-TTTTT------T-TC---TGT---G-T-----A--ATA--A----AA-GAGA---T-CAT----A-GATA----G-TG--C--G-AG--TG--TTTTCGCC----------------AAT------AT---ATCTTCCTTCCAA-AAATCCTGT-CTG-ATCA--TCA-TTTAT-A-A-CA
gi|21611 : TGAAATAAC-TGT-ATCCA----TTTTTT-AATTG-A---AGA--G----CCAAAATT---G-AAC-AA--C-T-CTA--------------GAAC--TGA--GAAAATA-AAA-----GA-CC-AACTAACGG-A-----ATCAAACG---------CTAACTCAAAAT---CGATTAAATGAAACATTCCA---GG--TAAAT-G---T-TGATA------T-TC---AAC---A-T-----A--AAA--C----AT-AACG---T-CAT----ACAATA----A-T---C--T-AA--TA--TTGTCACC----------------TAT------AT---ATCTGCCAGATAG-AAAGCCTGT-ATG-ATCT--TCA-TTAAT-A-A-TA
gi|21612 : TAAAATATA-TTT-ATCCA----TTTTTT-GAAAT-C---TGG--A----CCAAATTT---ATAAA-AA--T-T-TAA--------------TACC--TT---GTGAATA-AAA-----TG-CC-ATGCAACCG-A-----GTCAAAGG---------CTTTTTCAAAAT---CAATTGAAAGTAATAGTCTA---GG--TATAT-A---A-TTATT------T-TC---GGT---A-T-----A--AAA--C----AT-TAAA---T-CAT----ATAAAA----G-T---T--T-----TA--TTTTCTCCTATATACATGTGTATATAT------GT---ATCTGTTTGGGAT-GAAACCTGT-TTG-ATCT--TCA-TTAAT-A-A-TATAT
gi|21613 : TAAAATAAT-TTA-GTCCA----TTTTTTTAAATT-A---TG---A----CCAAAATA---A-AAA-AACGT-T-TAA----------------AC--TTC--CTCAATA-AAC-----GA-CC-ATGAGATAA-T-----ATCAAACG---------CTTTTTCGAAATCAGCAATAAACAATAAC---CCT---GG--TATAT-C---ATTTTTT------T-TC---TGTGTAA-T-----A--AAA--C--------AGA---T-TAT----A-GATA----G-TG--C--G-AG--TG--TTTTCGCC----------------AAT------AT---ATCTTCCTTCCAA-ACATCCTGT-CTG-ATCA--TCA-TTAAT-A-A-CA
gi|21614 : TAAAATACT-TTG-ACCCA----TTTAAT-AAAAG-A---TGG--A----CCAAAGTA---A-ATA-AA--A-T-TAA--------------GAAC--AGC--AAAAATA-AAA-----GC-CC-AGGCGAC
gi|21615 : TAAAATAAT-TTA-ATCCAA---TTTCTT-AAATT-T---TT--------CCAAAATT---A-AAA-AA--CAT-TAA---------------AAC--CTC--ATCAATA-AAA-----GA-CC-ATGAGAGTG-T-----ATCAAAAG---------CTTTTTCGAAAT---CAATGATAACTAGTAAACCT---GG--TACAT-C---A-TATGT------T-TC---TGC---A-T-----A--ATG--G----AA-TAAA---T-CAT----A-AATT----G-TA--C--G-TG--TA--TTTTCACC----------------AAT------GT---ATCGTCCGGCAAG-AAAACTGGT-TTG-GTCT--TCA-TTAAT-A-A-
gi|21616 : TAAAATACT-TTTTACTCA----TTTAAT-AAAGG-A---TTG--G----CCAAAGTT-----AGA-AA--T-T-TAA--------------GAAC--AGC--AAAAATA-AAA-----GT-CC-AGGCGACTG-A-----GTCAA
gi|21617 : TAAAATATG-TGT-ATCCA----TTTTTT-AATTG-A---ACA--G----TCAAAATTG--A-AAA-AA--C-T-GTA--------------GAAC--GGA--GAAAATA-AAA-----TA-CC-AACTAACGG-A-----ATCGA------------------------------TTAAAAGAAGCATTCCA---GG--TAAAT-G---T-TGTTT------T-TC---AAC---A-T-----A--AAA--C----AT-AAGG---T-CAT----ACAATA----A-T---T--T-AA--CA--TTTTCACC----------------TAT------ATATCATCTGCCAGATAATAAAACCTGT-TTG-ATCT--TCA-TTAAT-A-A-TAtg
gi|21618 : TAAAAAACT-TTG-ACCGA----AGAGAT-AACTG-A---TTC--C----CCGAATTT---A-AAG-AA--T-T-TCA--------------AAAC--TTT--GAATATG-AAG-----GC-CC-AAGAAAATG-A-----ATAGAATG---------CCTTCTCAAAAT---CTACTAGTAATATAAGTCCT---GG--AAGAC-T---A-TTTTC------T-TC---TGC---A-A-----A--TTG--C----AT-TATA---T-CAA----AT-ATA----GTT---C--T-AG--TA--ATTTCACC----------------AAT------GT---ACCTACCTGCAAT-AAACCCTGA-CAG-GCTC--TCA-TTTAT---A-TAA
gi|21619 : TAAAAAACT-TTG-ACCCA----AGAGAT-AATTG-A---TTT--G----CCGAATCT---A-AAG-AA--T-T-TCA--------------AAAC--TTT--GCATATG-AAT-----GC-CC-AAGAAAGTG-A-----ATCGAATG---------CCTTCTCAAAAT---CTACTAATAAAATAAGTCCA---GG--CAAAC-T---A-TTTTC------T-TC---TGC---A-A-----A--TTG--C----AT-TATG---T-CAA----ATA-TA----G-TT--C--T-TG--TA--TTTTCACC----------------CAT------GT---ACCTACCCGCAAT-AAACCCTGA-CTG-ACTC--TCA-TTAAT-
gi|21620 : TAAAATAAA-TTC-ACCCA----T--GAT-A--TA-A---TGG--AGTTTCCAAATCC---A-AAA-TA--T-T-TTA--------------AAAC--TTT--ATTAATG-AAA-----GA-CC-AAGAGATGG-A-----ATCAAAGG---------CTTTTTCAAAAT---CAATTAGTAACAATAACCCA---GA--TATGT-T---T-TTTTC------T-TC---CGT---A-T-----T--CTT--T----AT-TATA---T-CAT----ATAATA----A-T---T--T-CG--TA--TTTTCTCC----------------TAA------GT---ATCGTCCTGCAAT-GAACCCAGT-TTG-ATC
gi|21621 : TAAAATAAT-TTT-ATCCA----GTCAAT-AAAT------TCGTTA----CCAAACTT---A-AAA-TA--T-TGTAAT-------------G--T--TTT--GAAAATA-AAA-----TT-AT-GGTCAACAC-T-----GTCGAACG---------CTTTTTCAAAAT---CAGCAAAGAATATCAGTCCC---GG--TCTAT-T---G-TCGTTA-----T-TC-----------------A--AAT--C----GT-CA-A---TGCAT----TCAAAA----A-TTTCC--T-TA--TG--TTTTCGCC----------------AAT------GT---AACGTCCTTTTAA-GAATCCTGT-CTG-ACTG--TCA-TTGAT-A-A-
gi|21622 : TAAAA-ACT-TTG-ACCCAAAA-TTTC-----------------------CCGAATTT---A-AAG-TA--T-T-TCA--------------AAAC--TTT--GAATATG-AAG-----GC-CC-AAGAAAGTT-A-----ATCGAATG---------CCTTTTCAAAAT---CTACTAATAAGATAAGTCCA---GG--CAAAT-G---A-TTTTC------T-TC---TGC---A-A-----A--TTG--C----AT-TATG---T-CAA----AT-ATA----G-T---TCAT-CT--TA--TTTTCAAC----------------CAT------GT---ACCTACCCGCAAT-AAACCCTGA-CTG-ACTC--TCA-TTAATCA-A-
gi|21623 : TAAAATAGT-TTA-ATCCA----ATTTAT-AAAAG-AGTTT---------CCAAAATT---A-AAATAA--G-T-TAG--------------GG-C--TTT--AAAAATA-AAA--------TC-ATG-GTCTGTACT---ATCGAATA---------CCTTTTCAAAAT---CAGTAAAAA-TATAAGCCCT---GG--TTTAT-TTTCA-TCATTCAAATGT-TT---TAT---A-T-----A--TAA--------T-TACT---T-CA-----AAAATA----G-T------T-CGATTG--TTTTCACC----------------TAC------AT---ATCTTCCTTTTAA-AAAGCCTGT-TTG-ACTA--TTA-TTGAT-A-A-
gi|21624 : TAAAATAGT-TTG-ATCCA----ATTAAT-AAAAG-A---ATT--A----CCAAAGTA---A-AAA-TA--T-T-TAA--------------GAGC--TTT--TGAAACA-AAA--------C---GGTGATCA-ATGCT-ATCAAAGG---------CTTTTTCCAAAT---CAGCAAAAAAGATTAAGCCA---GG--TTTAT-T---T-TTAGT------TATT---TAT---A-TTTTCGA--TAA--C----TT-CAAA--------------AATA----G-T---G--TGAA--TA--TTTTCACC----------------TAT------GT---ACCGTCCTTTTAA-AAAACCAGT-TTG-ACTA--TCA-TTGAT-ATA-TAAA
gi|21625 : TAAAACATT-TTA-ATCCA----ACTAAT-AAAAG-AATTT---------CCAAAATT---A-AAA-TA--A-T-TAA--------------GCAC--TTT--AAAGATA-TAA-----TT-GT-GGTCAATAC-T-----ATCGAAAG---------CTTTTTCAAAAT---CGGCAAAAAAAAATAAACCA---GG--T-----------TTGTT------T-TC---ATC---ATT-----T--AAA--C----TT-TCAA---T-CACTTCAAAAATG----G-T------T-CG--TATGTTTTCACC----------------AAT------AT---AGCGTCCTTTTAG-AAACCCCGT-TTG-ACTG--TCA-TTTAT-A-A-
gi|21626 : TAAAATGGT-TTG-ATCCA----ATTAAT-AAAAG-A---ATT--A----CCGAAGTT---A-AAA-TA--T-T-TAA--------------GAGT--TTT--TGAAATA-AAA--------CC---GTGATC--ATTGCTATCAAAGG---------CTTTTTCGAAAT---CAGCAAAAAAGATTAAGCCA---GG--T-----------TTATT------T-TCGT-TAT---T-T-----A--TAT--TTTCGAT-TACT---T-CA-----AAAATA----G-TG--C--G-AA--TA--TTTTCACC----------------TAT------GT---ACCGTCCTTTTAA-AAAAACAGT-TTT-ACTA--TCA-TTGAT-A-A-
gi|21627 : TAAAAAACA-TTA-ATCCA----TTTTTT-AATTG-A---TTC--T----CCAAAGTT---A-AAA-TA--A-T-CGA--------------AAGT--TTT--ATAAATG-AAATTGTGAT-CT-A--C-ACTG--------TCGAATG---------CTTTTTCAAAAT---CTGCAAAGAATAATAGACTA---GG-----GT-G---G-TCGTT------T-TCATTTAC---A-T-----A--ATC--T----AA-TACA---T-CAT----ATATAA----G-T---C--T-TA--TA--TTTTCACC----------------GAT------GT---AACGGTTT-CTAATAAAACCAGT-TTG-TGCC--TTA-TCAAT-----TAAA
gi|21628 : TAAAAAAGT-TTG-ATCCA----GTT-TT-GAAT------TGA--ATCT-CCAAATTTA--A-AAA-AA--T-T-CAA--------------AGTCTTTTT--G---ATG-AAA-----GA-CC-AAGAGAGAG-T-----GTCAAAGG---------CTTTCTCAAAAT---CTATTAAAAGTAGTAATCCT---GG----AAT-G-----TTTTT------T-TC---TTC---A-------G--AGA--G----ATGTAAAATGT-CAT----ATAAAA----G-T---C--T-CG--TG--TTATCACC----------------TAT------AT---ACCTACCCTTTAT-AAATCCTGTCTTGTATACAATAT-TTAAT-A-A-
gi|21629 : TAAAAAACA-TTA-ATCCA----TTTTTT-AATTG-A---TTC--T----CCAAAGTT---A-AAA-TA--A-T-CGA--------------AAGT--TTT--ATAAATG-AAATTGTGAT-CT-A--C-ACTG--------TCAAATG---------CTTTTTCAAAAT---CTGCAAAGAATAATAGACTA---GG-----GT-G---G-TCGTT------T-TCATTTAC---A-T-----A--ATC--T----AG-TACA---T-CAT----ATATAA----G-T---C--T-TA--TA--TTTTCACC----------------GAT------GT---AACGGTTT-CTAATAAAACCAGT-TTG-TGCC--TTA-TCAAT-----TAAA
gi|21630 : TAAAATATA-TCT-ATCCA----TTTTTT-GAAAT-C---TAG--A----CCAAAGTT---ACAAA-AA--A-T-TAA--------------T-AC--TTG--GTGAATA-AAG-----TG-CC-ATGCAACCG-A-----ATCAAAGG---------CTTTTTCAAAGT---CAAT
gi|21631 : TAAAATA-T-TTA-ATCCA----ATTGAT-AAAGG-A---GTT--A----CCAAAATT---A-AAA-TA--T-G-CAA--------------CAGC--TTT---AAAATA-AAA------T-C----GTGATCT-ATACT-ATGGAATGC--------CTTTTTCACAAT---TAGCTAAAAATATAAGTCTT---GG--T-----------TTGTC------T-TC---AAC---A-T-----GT-AAA--T----AT-TCTA---T-TACCTCAAAGATA----GTT---C--G-AA--TG--TTTTCGCT----------------TAT------AT---ATCTTCCTTTTTA-AAAG-CTGT-TTG-GCTG--TTA-TTGAT-A-A-
gi|21632 : AGAATAATCTTG-ATCCA----TCT-TT-AAAAG-AC--TGG--T----CCAAAATG---A-TAA-CA--A-T-CAA--------------GGAT--CTC--AAAAATG-AAA-----TT-CT-ACGCAAGAG-A-----GTCAAATG---------CTTTTTTGAAGT---CAATCAAAAGGAGGAGTCCT---AGAATCTAT-T---G-TGTTT------T-TC---TTT---A-T-----A--AAA--C----AT-TACA---T-CAT----ATATTA----G-T---G--T-AG--TA--TTTTCCTT----------------TAT------AT---ATC
gi|21633 : AAATAGT-TTA-ACCCA----TTGTTT-GAAGG-A---CTA--A----CCAAAATT---A-AAG-AA--A-T-CAA--------------GGAC--TTT----AAATAGAAA-----GT-CCCAGTTAACAG-A-----ATCAAAGG---------CTTTTTCTAAAT---CGATTAAGAGTAGCATTCTT---GG--TATTT-G---T-CTTTT------T-TC---TAC---A-T-----A--AAA--C----AT---GG---T-CAA----ATAATA----G-T---T--G-AA--TA--TTTTCTCC----------------GAT------TT---ATCTACCAGATAA-AATACCTGT-TTA-ATCT--TCA-TTTAT-A-ATTAAA
gi|21634 : T-TTT-ATCCA----GTCAAT-AAAC------TTGTTA----CCAAACTT---A-AAATAG--T-G-TAAT-------------G--T--TTT--AAAAATA-AAA-----TT-AT-GGTCAACAC-T-----ATCGAACG---------CTTTTTCAAAAT---CAGCAAAGAATATCAGGCTC---GG--TCTAT-T---G-TCATTA-----T-TCAAGTGG---T-T-----A--ATG--C----AT--------T-CA-----AAAATT----G-TC--C--T-TA--TG--TTTTCGCC----------------AAT------GT---AACGTCCTTTTAA-AAATCCTGT-CTA-ACTG--TTG-TTGAT-A-A-
gi|21635 : -TTG-ATCCAGGACTGTATT-AAA--------GG--A----CCAAAATT---G-AAA-AA--T-T-TTA--------------TTAC--TTT--TTGTATA-AAT-----GA-CC-AAGATAAGG-A-----AGCAAAAG---------CTTTTTCAAAGT---CAACAAGGAGCAGTAATCCT---GG--AATAT-G---A-TTTTC------C-TC---TAA---A-T-----A--ATG--C----AT-TATG---T-CAT----ACGTTA----A-T---C--T-TG--TA--TTTTCACC----------------TAT------AT---AATGACCTGTTAA-AAATCCAGT-TTG-ATCT--CTA-TTTAT-A-A-
gi|21636 : CA----TTTTAG-GAAGG-A---TAG--A----ATAAAAAT---A-A-----------TAA--------------GAAC--ATC---AAAATA-AAA-----GC-CC-AGGCAACTA-A-----ATCGAATG---------CTTTCTCAAAAT---CATTTAGTAGCACCATGCCT---GG--TAAAT-G---A-TTCTT------T-TC---TAC---A-T-----A--AAA--C----AT-TATT---T-TAT----AAAAAAAAACG-----C--T-AG--CA--TAATAACC----------------AAT------AT---ATTAGCCTCATAA-AAA-CCTG
gi|21637 : aca---TGG--T----TCAAAGTT---ATAAA-AA--T-C-TAACTTACCATAATCAAAGAC--TTT--AAAAATA-AAA-----TG-CC-AAATAACGG-A-----ATTAAATG---------CTTTTTCGAAAT---CAATCAAAAGAAGGAGTCCG---GG--GAGATTGC--A-TTATT------C--------C---G-C-----A--AAA--A----AT-TATA---T-CAT----ACATTA----A-T---C--T-GG--TA--TTTTCTTG----------------TAT------GT---ACCTTCCCGCTAA-GAAATATGT-TTG-ATCT--TTA-TGTAT-A-A-
gi|21638 : CATAATT---G-AAA-AA--CAT-TAA---------------AAC--CTC--ATCAATA-AAA-----GA-CC-ACGAGAGTG-T-----ATCAAAAG---------CTTTTTCGAAAT---CAATGATAACTAGTAAACCT---GG--TACAT-C---A-TATGT------T-TC---TGC---A-T-----A--ATG--G----AA-TAAA---T-CAT----A-AATT----G-TA--C--G-TG--TA--TTTTCACC-----------------AC------GT---A-----CGGCAAA-AAAAACTGT-TCG-GTCT--TCA-TTAAT-A-A-
gi|21639 : CAAAATT---G-AAA-AA--C-T-TAA--------------ATAC--TTT--ATAAGTA-AAA-----GA-AC-AGGATATGG-A-----ATCAAAGGTGTTGTTTTCTTTTT-----------ATTAACAGTACAAGACCA---GG--AATAT-T---G-TTGAC------T-TC---AGC---A-T-----A--GTG--C----AT-AACA---T-CGT----ATAATT----G-T---C--T-TG--TA--TTCTGTCC----------------CAT-----------ATCGTCCTGACAT-AAATCCTCT-CTG-GTCC--TCG-TGGAT-A-A-
gi|21640 : AAAATTTAAA-AAA-AA--T-T-CAA--------------AGTC--TTTTTGA---TG-AAA-----GA-CC-AAGAGAGAG-T-----GTCAAAGG---------CTTTCTCAAAAT---CTATTAAAAGTAGTAATCCT---GG----AAT-G-----TTTTT------T-TC---TTC---A-------G--AGA--G----ATGTAAAATGT-CAT----ATAAAA----G-T---C--T-TG--TG--TTATCACC----------------TAT------AT---ACCTTCCTTTTAT-AAAACCTGT-CTG-TTCT--GCA-CTTAT-A-A-
gi|21641 : TA-AAA-----GA-CC-AAGATAATG-T-----ATCGAAAG---------CTTTCTCAAAAT---CAATTAGCAGTAATAATCCT---GG--TATAT-------TTATC------T-TC----AC---A-------A--ATATGC----AT-TACG---T-CAT----ATAATA----A-T---C--T-AG--TG--TTATCACC----------------CATATACATGT---ATCTGCCTTTTAT-AAAACCAGT-TTG-TTCT--TTACTTAAT---A-TAA
gi|21642 : aaatttaaaaaagcgtagagtctttctatTCGGAGG---------CTTTCTCAAAAT---CAA---ATAGTTACAATAATTAAGG--TA-----------TGTT------G-TC---TGC---A-T---------------------TATA---T-CGT----ATAGTA----C-T---C--T-TG--TA--TTTTCTCC----------------TAA------AT---ATCGTCCTGCAAT-GGACCCTGT-TTT-ATCC--
gi|21643 : ATG---------TTTTCTCAAAAT---CATTTAGTAGTAACAT--------G--TAAAT-G---A-TT---------T-TC---TAC---A-T-----A--AAA--C----AT-CAGA---T-CAT----GCATTG----G-T---C--G-AC--AA--AAATCACC----------------AAT------AT---ATCAGCCTCACAA-AAAG-CTGT-TT
gi|21644 : TTTCGAAAT---CTATAATAACTAGTAAACCT---GG--TACAT-C---A-TATGT------T-TC---TGC---A-T-----A--ATG--G----AA-TAAA---T-CAT----A-AATT----G-TA--C--G-TG--TT--TTTTTACC----------------AAT------GT---ATCCTCCGGCAAG-AAAACCGGT-TTG-GTCC--TCA-TTAAT-A-
gi|21645 : CATTCCA---GG--TTAAT-G---T-TGTTT------T-TC---AAC---A-T-----A--AAA--C----AT-T-CG---T-CTT----ACAATA----A-T---C--T-TA--TA--TTGTCACC----------------TAT------AT---ATTTGCCTGATAA-AAAGCCTGT-TTG-ATCT--TCA-TTAGT-A-A-TA
gi|21646 : -----A--AAA--C----AT-AAGG---T-CAT----ACAATA----A-T---C--T-TA--TA--TATTCACA----------------TAT------AT---ATCAGCCAAATAA-AACACCTGT-TTG-ATCT--TCA-TTAAA-A-A-TA
blockSeqs : C C TT GGAC AA T TAATGGAGTTT G TAA T T ACG G CTTACCATAATCAAAG TT TTTGA G TTGTGAT C GGCG C ATTGCT T TGTTGTTTT CAG G T AC TG TTAA AATCT TTTCA C CAAATG A ATT GTA T TTTCG AT A TG TTCG G G ATG TTCA C AAAC T TTC CATC AT TG G TATATACATGTGTATAT ATACATG ATC GG GA T T C T CAA C C T T
blockSeqs : C . G AAA AA . TTGAATCT G G C T CGT . GA . CAA G TTGTGAT . GGCG C ATGCT T C . T T AC TG T TAC TGCA C A . ATT . . . T A . . G G ATG CTCA C . T G TGA . . G A T . GG GA T T . . C . . . T
blockSeqs : C . G A AA . AGACTGGT G A T . CA . GA . CAA . GTT . GGCG C ATACT T . . T T AC TG T TAC CAT C A . AAG . . . . A . . . G . . C . . G GA . . G A T . GG GA T T . . C . . . .
blockSeqs : T . G . AA . GGATGGA G . . . CA . GA . CAA . GC . GGTG T TACT T . . T T GC TG T TAC GA A . . GT . . . . A . . . T . . C . . A GA . . A A G . GA AA . T . . C . . . .
blockSeqs : A . G . TT . GGATGGA A . . . T . TA . CAA . GC . ACTA G A T . . T A GC TT T TAA GA T . . . . . . . A . . . G . . C . . T GA . . A A A . TG GA . A . . C . . . .
blockSeqs : G . T . TT . GGATGGA A . . . T . GA . AGA . GC . GTTA G A G . . T G GC TT A TAA TA T . . . . . . . A . . . A . . T . . G GA . . T T A . TA GA . A . . T . . . .
blockSeqs : A . A . TT . GGAAGGA A . . . T . GG . CCT . GT . TGAG A A T . . A A AT AC T TAA GA T . . . . . . . T . . . G . . C . . C TA . . G A A . TT TC . T . . T . . . .
blockSeqs : A . A . TT . TGAAGAG A . . . A . GA . AGA . GA . ACTA G A C . . T A AC TT T TAT GT A . . . . . . . A . . . C . . T . . A GA . . A A A . TG GA . G . . A . . . .
blockSeqs : T . T . TT . GGACGGA T . . . C . TA . CCT . GA . TGCA C A G . . T A AT GT A TAA GT A . . . . . . . A . . . A . . C . . A GA . . T T A . TG GG . A . . T . . . .
blockSeqs : A . T . TT . ACTATGA A . . . A . GA . CAA . GA . TGAG A A C . . A C AC AA A TAT CA T . . . . . . . A . . . G . . T . . . TA . . G A G . TT TC . T . . T . . . .
blockSeqs : C . A . AA . TGAAGAG G . . . C . GA . CAT . TG . GGCG T T A . . G A GT TT T TAT GT T . . . . . . . T . . . A . . T . . . GA . . A A A . GT GC . A . . A . . . .
blockSeqs : A . G . CT . ATCTGGA A . . . T . GA . CAA . GA . TGAG T A T . . T A GC GT T TAC AA T . . . . . . . A . . . G . . T . . . GT . . A T G . TG GA . A . . T . . . .
blockSeqs : C . A . AA . AGATGGA G . . . A . AA . AGA . GC . GGCG G A T . . T T TA GT A TAA CA T . . . . . . . T . . . T . . C . . . TA . . A A A . TA GC . C . . T . . . .
blockSeqs : T . T . TT . GGATTGG A . . . T . AA . TGA . GA . ACTA T T G . . T T TA AC T AAG GT T . . . . . . . T . . . T . . T . . . TA . . A C G . TA GC . C . . C . . . .
blockSeqs : C . G . GA . TGAACAG T . . . C . AA . TGC . GT . AGAA T T C . . T T AT GT A CAA TA T . . . . . . . T . . . T . . A . . . TT . . T T G . GT GC . C . . C . . . .
blockSeqs : C . G . GA . TGATTCC T . . . T . TG . TAT . TA . AGAA G A T . . A G TC GT A TAT TA G . . . . . . . A . . . T . . A . . . TC . . G A G . GT TT . T . . G . . . .
blockSeqs : A . C . GA . TGATTTG T . . . T . AA . TGA . GC . AGAG A A T . . T T TA GC C TCT TT T . . . . . . . T . . . C . . A . . . TT . . A C G . TA GC . C . . C . . . .
blockSeqs : A . T . AA . TTCGTTA C . . . T . GG . TGA . GC . GTCA T A G . . A A TA AG A CAA TG A . . . . . . . A . . . A . . T . . . TC . . A T G . TT TT . G . . A . . . .
blockSeqs : C . G . TA . AGAGTTT T . . . T . GA . TAA . GA . AGAA T A A . . A A TT AA T TTT GA A . . . . . . . A . . . A . . T . . . TC . . A T A . GT TT . A . . A . . . .
blockSeqs : G . A . AA . AGAATTA A . . . T . GC . TTG . TT . GGTG C A G . . A A AT AG A TTT TT G . . . . . . . A . . . C . . T . . . GA . . A A G . GT TT . C . . G . . . .
blockSeqs : G . G . AA . AGAATTT G . . . G . GA . TAA . GC . GTCA A T T . . A A TT GA A TAT GG A . . . . . . . A . . . C . . A . . . TT . . A T A . GT TT . A . . A . . . .
blockSeqs : T . A . AA . AGAATTA A . . . T . AA . TTG . TT . AGAG C A G . . A G AT AT A TCT GG G . . . . . . . T . . . A . . T . . . TC . . A G G . GG TT . A . . C . . . .
blockSeqs : G . G . TT . TGATTCT G . . . A . AG . TAT . GA . TGCA T T T . . T A GT GA A AAT TG T . . . . . . . G . . . C . . T . . . TT . . A T G . TA TT . T . . C . . . .
blockSeqs : C . A . TT . TGATTCT G . . . T . AA . TAT . TG . CGCA A T G . . A G AT GT T TAA GT G . . . . . . . T . . . T . . A . . . GA . . A G A . GG GA . A . . G . . . .
blockSeqs : G . G . TT . ATCTAGA T . . . A . CA . GGT . TT . GTTA T A T . . T A TA GT A GAG TG G . . . . . . . A . . . C . . C . . . TA . . G T G . TT TT . G . . T . . . .
blockSeqs : C . A . GA . GGAGTTA G . . . T . GG . CAA . GT . GTCA C A T . . C A GG TT T TAC GA T . . . . . . . A . . . G . . A . . . GA . . C T A . TA GT . A . . G . . . .
blockSeqs : T . T . TT . GGACTAA G . . . A . GG . TAA . TT . AGAT C A G . . T G GC GG T AAT GA T . . . . . . . A . . . T . . C . . . TT . . T G A . GT CA . T . . T . . . .
blockSeqs : A . A . AA . CTTGTTA A . . . A . TG . TTT . GA . GGCA A T C . . A G TC AT T TAT CA A . . . . . . . T . . . T . . T . . . TT . . G A T . GA GC . T . . T . . . .
blockSeqs : G . G . AT . GGATAGA A . . . T . TT . TAA . GC . AATA A A A . . A G GT TG C TAA TG T . . . . . . . T . . . T . . T . . . TA . . A T G . AG GC . A . . T . . . .
blockSeqs : . . A . TA . TTATGA A . . . A . GA . CAT . TG . CGAG A A T . . T T CC GT T TAC GA C . . . . . . . A . . . A . . T . . . TG . . A A A . TT GA . A . . C . . . .
blockSeqs : . T . C . TTTTT C . . . A . AT . TAT . GA . GGAT G A T . . C A GG AA T TTA CA A . . . . . . . A . . . C . . T . . . GT . . T T A . GT TT . T . . T . . . .
blockSeqs : . G . T . GGA A . . . T . AG . GT . GA . AGAG T T A . . G A GT GA G TA GT T . . . . . . . T . . . A . . C . . . TT . . A C G . TT TT . A . . T . . . .
blockSeqs : . T . . A . . . T . A . TG . GA . AGAT G A G . . T C CA AT T T G G . . . . . . . T . . . C . . C . . . TT . . T T G . TG GC . A . . C . . . .
blockSeqs : G . . . T . A . TA . GA . TGG T T G . . T A GT AT A T G T . . . . . . . G . . . T . . C . . . TA . . A C A . GT CA . C . . C . . .
blockSeqs : A . . . C . T . CA . T . GTG G T A . . T C AT AT T A . A . . . . . . . T . . . G . . . . . . TT . . A T A . AG GC . G . . T . .
blockSeqs : A . . . T . A . C . . . GTG A . G . . T T AC AA T T . G . . . . . . . A . . . A . . . . . . GA . . T A A . CT GA . A . . T
blockSeqs : A . . . . . . . T . . . C T . T . . A T AC TT T A . T . . . . . . . T . . . C . . . . . . GT . . A A G . TG AA . G . .
blockSeqs : . . . C . . . . A GT T A . . T . . . . . . . A . . . G . . . . . . TT . . A T A . AG C . A .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . TT . . A T A . . C . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . T . . A . . .
blockSeqCons :
originalCons : TAAAATANT-TTG-ATCCA----TTTNNT-AAANG-A---TGG--A----CCAAAGTT---A-AAA-AA--T-T-TAA--------------GAAC--TTC--GAAAATA-AAA-----GN-CC-AGGCGACNG-A-----ATCGAANG---------CTTTTTCAAAAT---CAATNAANAGTANCANNCCT---GG--TANAT-G---A-TTNTT------T-TC---TAC---A-T-----A--AAA--C----AT-TANA---T-CAT----ACAATA----G-T---C--T-NG--TA--TTTTCGCC----------------NAT------GT---ATCNNCCTGNTAA-AAANCCTGT-TTG-ATCC--TCA-TTAAT-A-A-TAAATG
finalCons : TAAAATANT-TTG-ATCCA----TTTNNT-AAANG-A---TGG--A----CCAAAGTT---A-AAA-AA--T-T-TAA--------------GAAC--TTC--GAAAATA-AAA-----GN-CC-AGGCGACNG-A-----ATCGAANG---------CTTTTTCAAAAT---CAATNAANAGTANCANNCCT---GG--TANAT-G---A-TTNTT------T-TC---TAC---A-T-----A--AAA--C----AT-TANA---T-CAT----ACAATA----G-T---C--T-NG--TA--TTTTCGCC----------------NAT------GT---ATCNNCCTGNTAA-AAANCCTGT-TTG-ATCC--TCA-TTAAT-A-A-TAAATG
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111 1111111111111111 11111 1111111 1111111
lowQualScore : 2 1 22 5555 55 1 88888888888888888 2 333 3 2 6666 1 1111111111111111 11 22222 2 99999999 1 5555 1 0000000 1 555555555 111 1 1 22 33 3333 55555 2222222 2 444444 1 666 111 1 22222 22 1 11 2222 2 2 333 1 4444 6 2222 2 999 44444 11 11 4 88888888888888888 3333333 111 22 33 3 2 1 1 333 1 1 1 2
lowQualScore : . . .. .... .. . ................. . ... . . .... . ................ .. ..... . ........ . .... . ....... . ......... ... . . .. .. .... ..... ....... . ...... . ... ... . ..... .. . .. .... . . ... . .... . .... . ... ..... .. .. . ................. ....... ... .. .. . . . . ... . . . .
lowQualScore : 3 2 99 7777 44 2 66666666666666666 4 999 2 1 4444 1 3333333333333333 44 00000 1 33333333 0 5555 0 0000000 4 111111111 888 4 0 00 77 8888 88888 5555555 0 999999 0 666 888 0 44444 33 2 33 1111 0 3 444 0 1111 2 1111 0 555 00000 33 33 2 44444444444444444 3333333 777 77 00 0 0 0 1 666 1 1 1 4
consensus : TAAAATANT-TTG-ATCCA----TTTNNT-AAANG-A---TGG--A----CCAAAGTT---A-AAA-AA--T-T-TAA--------------GAAC--TTC--GAAAATA-AAA-----GN-CC-AGGCGACNG-A-----ATCGAANG---------CTTTTTCAAAAT---CAATNAANAGTANCANNCCT---GG--TANAT-G---A-TTNTT------T-TC---TAC---A-T-----A--AAA--C----AT-TANA---T-CAT----ACAATA----G-T---C--T-NG--TA--TTTTCGCC----------------NAT------GT---ATCNNCCTGNTAA-AAANCCTGT-TTG-ATCC--TCA-TTAAT-A-A-TAAATG
Reference ( family-529 ) : TAAAATANT-TTG-ATCCA----TTTNNT-AAANG-A---TGG--A----CCAAAGTT---A-AAA-AA--T-T-TAA--------------GAAC--TTC--GAAAATA-AAA-----GN-CC-AGGCGACNG-A-----ATCGAANG---------CTTTTTCAAAAT---CAATNAANAGTANCANNCCT---GG--TANAT-G---A-TTNTT------T-TC---TAC---A-T-----A--AAA--C----AT-TANA---T-CAT----ACAATA----G-T---C--T-NG--TA--TTTTCGCC----------------NAT------GT---ATCNNCCTGNTAA-AAANCCTGT-TTG-ATCC--TCA-TTAAT-A-A-TAAATG
gi|21603 : TAAAATACT-TTG-ACCCA----TTTAAT-AAAGG-A---TGG--A----CCAAAGTT---A-AAA-AA--T-T-TAA--------------GAAC--AGC--AAAAATA-AAA-----GC-CC-AGGCGACCG-A-----GTCAAATG---------CTTTCTCAAAGT---CAATGAGTAGTAACATGCCT---GG--TTCAT-G---G-TTCTT------T-TC---TAA---A-T-----A--AAA--C----AT-TAGA---T-CAT----ACAATA----A-T---C--G-AG--TA--TTTTCGCC----------------AAT------GT---ATCGGCCTGACAA-AAATCCTGT-CTG-ATCC--TCA-TTAAT-A-A-TAAATG
gi|21604 : TAAAATACT-TTG-ACCTA----TTTAAT-AAAGG-A---TGG--A----TCAAAGTT---A-AAC-AA--T-T-TAA--------------GAAC--AGC--AAAAATA-AAA-----GC-CC-AGGCGACCG-A-----GTCGAATG---------CTTTCTCAAAGT---CAATGAGTAGTAACATGCCT---GG--TACAT-G---A-TTCTT------T-TC---TAA---A-T-----A--AAA--C----AT-TAGA---T-CAT----ACAATA----A-T---C--G-AG--TA--TTTTCGCC----------------AAT------TT---AGCGGCCTGACAA-AAATCCTGT-CTG-ATCC--TCA-TTAAT-A-A-TAAATG
gi|21605 : TAAAATACT-TTG-ACCCA----TT-AAT-AAAGG-A---TGG--A----CCAAAGGT---T-GAA-AA--T-T-TAA--------------GAAC--AGC--AAAAATA-AAA-----GC-CC-AGGCGACCG-A-----GTCGAGTG---------CTTTCTCAAAGT---CATTTAGTAGTAACATGCCT---GG--TACAT-G---A-TTCTT------T-TC---TAA---A-T-----AATAAA--T----AT-TAGA---T-CAT----ACAATA----A-T---C--G-AG--TA--TTTTCGCC----------------AAT------TT---AGCGGCCTGACAA-AAATCCTGT-CTG-GTCC--TCA-TTAAT-A-A-TAAATG
gi|21606 : TAAAA-ACT-TTG-ACTCA----TTTAAT-AAAGG-A---TGG--A----CCAAAGTT---A-AAA-AA--T-T-TAA--------------GAAC--AGC--AAAAATA-AAA-----GC-CC-AGGCGACCG-A-----GTCGAATG---------CTTTCTCAAAGT---CAATTAGTAGTAACATGCTT---GG--TACAT-T---A-TTCTT------T-TC---TAA---A-T-----A--AAA--C----AT-TAGA---T-CAT----ACAGAA----A-T---C--G-AG--TA--TTTTCGCC----------------AAT------GT---ATCGGCCTGACAA-AAATCTTGT-CTG-ATCC--TCA-TTAAT-G-A-TAAATG
gi|21607 : TAAAATATT-TTG-ACCCA----TTTAAT-AAAGG-A---AGG--A----CGAAAGTT---A-AAA-AA--A-T-GTA--------------TAAC--AGC--AAATATA-AAA-----GT-CA-AGGTGGCTG-A-----ATCGAATG---------CTTTCTCAAAGT---CAATTAGTAGTAGCATGCCT---GG--TAAAT-G---A-TTATT------T-TC---TAA---A-T-----T--AAA--C----AT-TGTA---T-CAA----TCAGTA----A-T---C--G-AG--TA--TTTTCACC----------------AAT------AT---ATCGACCTAATGA-AAATCCTGT-CTG-ATCC--TTA-CTAAT-A-A-AAGATG
gi|21608 : TAAAATAAC-TGT-ATCCA----TTTTTT-AATTG-A---AGA--G----CCAAAATT---G-AAA-AA--C-T-GTA--------------GAAC--TGA--GAAAATA-AAA-----GA-CC-AACTAACGG-A-----ATCAAATG---------CTTTCTCAAAAT---CGATTAAAAGAAGCATTCCA---GG--TAAAT-G---T-TGTTT------T-TC---AAC---A-T-----A--AAA--C----AT-AAGG---T-CAT----ACAATA----A-T---C--T-AA--TA--TTTTCACC----------------TAT------AT---ATCTGCCAGATAA-AAAACCTGT-TTG-ATCT--TCA-TTAAA-A-A-TA
gi|21609 : TAAAATTGT-TTA-ACCCA----TTGTTT-GAAGG-A---CGG--A----CCAAAATT---A-AAG-AA--A-T-CGA--------------GGAC--TTC----AAATAGAAA-----GTTCC-AGTTAACGG-A-----ATCAAAGA---------CTTTTTCAAAAT---CGATTAAGAGTAGCATTCTT---GG--TAATT-G---T-CTTTT------T-TC---TAC---A-T-----A--AAA--C----AT-GAAG---T-CAT----ATAATA----G-T---C--G-AA--TA--TTTTCTCC----------------AAT------AT---ATCTACCAGATAA-AAAACCTGT-TTG-GTCT--TCA-TTGAT-A-ATTAAA
gi|21610 : TAAAATAAT-TTA-ATCCA----TTTTTT-AAAACTA---TG---A----CCAAAATT---A-AAA-AAACG-T-TAA---------------AAC--CTC--CTCAATA-AAC-----GA-CC-ATGAGATAG-T-----ATCAAGTG---------CTTTTTCGAAAT---CAGCAATAACCAATAACCCT---GG--TATAT-C---A-TTTTT------T-TC---TGT---G-T-----A--ATA--A----AA-GAGA---T-CAT----A-GATA----G-TG--C--G-AG--TG--TTTTCGCC----------------AAT------AT---ATCTTCCTTCCAA-AAATCCTGT-CTG-ATCA--TCA-TTTAT-A-A-CA
gi|21611 : TGAAATAAC-TGT-ATCCA----TTTTTT-AATTG-A---AGA--G----CCAAAATT---G-AAC-AA--C-T-CTA--------------GAAC--TGA--GAAAATA-AAA-----GA-CC-AACTAACGG-A-----ATCAAACG---------CTAACTCAAAAT---CGATTAAATGAAACATTCCA---GG--TAAAT-G---T-TGATA------T-TC---AAC---A-T-----A--AAA--C----AT-AACG---T-CAT----ACAATA----A-T---C--T-AA--TA--TTGTCACC----------------TAT------AT---ATCTGCCAGATAG-AAAGCCTGT-ATG-ATCT--TCA-TTAAT-A-A-TA
gi|21612 : TAAAATATA-TTT-ATCCA----TTTTTT-GAAAT-C---TGG--A----CCAAATTT---ATAAA-AA--T-T-TAA--------------TACC--TT---GTGAATA-AAA-----TG-CC-ATGCAACCG-A-----GTCAAAGG---------CTTTTTCAAAAT---CAATTGAAAGTAATAGTCTA---GG--TATAT-A---A-TTATT------T-TC---GGT---A-T-----A--AAA--C----AT-TAAA---T-CAT----ATAAAA----G-T---T--T-----TA--TTTTCTCCTATATACATGTGTATATAT------GT---ATCTGTTTGGGAT-GAAACCTGT-TTG-ATCT--TCA-TTAAT-A-A-TATAT
gi|21613 : TAAAATAAT-TTA-GTCCA----TTTTTTTAAATT-A---TG---A----CCAAAATA---A-AAA-AACGT-T-TAA----------------AC--TTC--CTCAATA-AAC-----GA-CC-ATGAGATAA-T-----ATCAAACG---------CTTTTTCGAAATCAGCAATAAACAATAAC---CCT---GG--TATAT-C---ATTTTTT------T-TC---TGTGTAA-T-----A--AAA--C--------AGA---T-TAT----A-GATA----G-TG--C--G-AG--TG--TTTTCGCC----------------AAT------AT---ATCTTCCTTCCAA-ACATCCTGT-CTG-ATCA--TCA-TTAAT-A-A-CA
gi|21614 : TAAAATACT-TTG-ACCCA----TTTAAT-AAAAG-A---TGG--A----CCAAAGTA---A-ATA-AA--A-T-TAA--------------GAAC--AGC--AAAAATA-AAA-----GC-CC-AGGCGAC
gi|21615 : TAAAATAAT-TTA-ATCCAA---TTTCTT-AAATT-T---TT--------CCAAAATT---A-AAA-AA--CAT-TAA---------------AAC--CTC--ATCAATA-AAA-----GA-CC-ATGAGAGTG-T-----ATCAAAAG---------CTTTTTCGAAAT---CAATGATAACTAGTAAACCT---GG--TACAT-C---A-TATGT------T-TC---TGC---A-T-----A--ATG--G----AA-TAAA---T-CAT----A-AATT----G-TA--C--G-TG--TA--TTTTCACC----------------AAT------GT---ATCGTCCGGCAAG-AAAACTGGT-TTG-GTCT--TCA-TTAAT-A-A-
gi|21616 : TAAAATACT-TTTTACTCA----TTTAAT-AAAGG-A---TTG--G----CCAAAGTT-----AGA-AA--T-T-TAA--------------GAAC--AGC--AAAAATA-AAA-----GT-CC-AGGCGACTG-A-----GTCAA
gi|21617 : TAAAATATG-TGT-ATCCA----TTTTTT-AATTG-A---ACA--G----TCAAAATTG--A-AAA-AA--C-T-GTA--------------GAAC--GGA--GAAAATA-AAA-----TA-CC-AACTAACGG-A-----ATCGA------------------------------TTAAAAGAAGCATTCCA---GG--TAAAT-G---T-TGTTT------T-TC---AAC---A-T-----A--AAA--C----AT-AAGG---T-CAT----ACAATA----A-T---T--T-AA--CA--TTTTCACC----------------TAT------ATATCATCTGCCAGATAATAAAACCTGT-TTG-ATCT--TCA-TTAAT-A-A-TAtg
gi|21618 : TAAAAAACT-TTG-ACCGA----AGAGAT-AACTG-A---TTC--C----CCGAATTT---A-AAG-AA--T-T-TCA--------------AAAC--TTT--GAATATG-AAG-----GC-CC-AAGAAAATG-A-----ATAGAATG---------CCTTCTCAAAAT---CTACTAGTAATATAAGTCCT---GG--AAGAC-T---A-TTTTC------T-TC---TGC---A-A-----A--TTG--C----AT-TATA---T-CAA----AT-ATA----GTT---C--T-AG--TA--ATTTCACC----------------AAT------GT---ACCTACCTGCAAT-AAACCCTGA-CAG-GCTC--TCA-TTTAT---A-TAA
gi|21619 : TAAAAAACT-TTG-ACCCA----AGAGAT-AATTG-A---TTT--G----CCGAATCT---A-AAG-AA--T-T-TCA--------------AAAC--TTT--GCATATG-AAT-----GC-CC-AAGAAAGTG-A-----ATCGAATG---------CCTTCTCAAAAT---CTACTAATAAAATAAGTCCA---GG--CAAAC-T---A-TTTTC------T-TC---TGC---A-A-----A--TTG--C----AT-TATG---T-CAA----ATA-TA----G-TT--C--T-TG--TA--TTTTCACC----------------CAT------GT---ACCTACCCGCAAT-AAACCCTGA-CTG-ACTC--TCA-TTAAT-
gi|21620 : TAAAATAAA-TTC-ACCCA----T--GAT-A--TA-A---TGG--AGTTTCCAAATCC---A-AAA-TA--T-T-TTA--------------AAAC--TTT--ATTAATG-AAA-----GA-CC-AAGAGATGG-A-----ATCAAAGG---------CTTTTTCAAAAT---CAATTAGTAACAATAACCCA---GA--TATGT-T---T-TTTTC------T-TC---CGT---A-T-----T--CTT--T----AT-TATA---T-CAT----ATAATA----A-T---T--T-CG--TA--TTTTCTCC----------------TAA------GT---ATCGTCCTGCAAT-GAACCCAGT-TTG-ATC
gi|21621 : TAAAATAAT-TTT-ATCCA----GTCAAT-AAAT------TCGTTA----CCAAACTT---A-AAA-TA--T-TGTAAT-------------G--T--TTT--GAAAATA-AAA-----TT-AT-GGTCAACAC-T-----GTCGAACG---------CTTTTTCAAAAT---CAGCAAAGAATATCAGTCCC---GG--TCTAT-T---G-TCGTTA-----T-TC-----------------A--AAT--C----GT-CA-A---TGCAT----TCAAAA----A-TTTCC--T-TA--TG--TTTTCGCC----------------AAT------GT---AACGTCCTTTTAA-GAATCCTGT-CTG-ACTG--TCA-TTGAT-A-A-
gi|21622 : TAAAA-ACT-TTG-ACCCAAAA-TTTC-----------------------CCGAATTT---A-AAG-TA--T-T-TCA--------------AAAC--TTT--GAATATG-AAG-----GC-CC-AAGAAAGTT-A-----ATCGAATG---------CCTTTTCAAAAT---CTACTAATAAGATAAGTCCA---GG--CAAAT-G---A-TTTTC------T-TC---TGC---A-A-----A--TTG--C----AT-TATG---T-CAA----AT-ATA----G-T---TCAT-CT--TA--TTTTCAAC----------------CAT------GT---ACCTACCCGCAAT-AAACCCTGA-CTG-ACTC--TCA-TTAATCA-A-
gi|21623 : TAAAATAGT-TTA-ATCCA----ATTTAT-AAAAG-AGTTT---------CCAAAATT---A-AAATAA--G-T-TAG--------------GG-C--TTT--AAAAATA-AAA--------TC-ATG-GTCTGTACT---ATCGAATA---------CCTTTTCAAAAT---CAGTAAAAA-TATAAGCCCT---GG--TTTAT-TTTCA-TCATTCAAATGT-TT---TAT---A-T-----A--TAA--------T-TACT---T-CA-----AAAATA----G-T------T-CGATTG--TTTTCACC----------------TAC------AT---ATCTTCCTTTTAA-AAAGCCTGT-TTG-ACTA--TTA-TTGAT-A-A-
gi|21624 : TAAAATAGT-TTG-ATCCA----ATTAAT-AAAAG-A---ATT--A----CCAAAGTA---A-AAA-TA--T-T-TAA--------------GAGC--TTT--TGAAACA-AAA--------C---GGTGATCA-ATGCT-ATCAAAGG---------CTTTTTCCAAAT---CAGCAAAAAAGATTAAGCCA---GG--TTTAT-T---T-TTAGT------TATT---TAT---A-TTTTCGA--TAA--C----TT-CAAA--------------AATA----G-T---G--TGAA--TA--TTTTCACC----------------TAT------GT---ACCGTCCTTTTAA-AAAACCAGT-TTG-ACTA--TCA-TTGAT-ATA-TAAA
gi|21625 : TAAAACATT-TTA-ATCCA----ACTAAT-AAAAG-AATTT---------CCAAAATT---A-AAA-TA--A-T-TAA--------------GCAC--TTT--AAAGATA-TAA-----TT-GT-GGTCAATAC-T-----ATCGAAAG---------CTTTTTCAAAAT---CGGCAAAAAAAAATAAACCA---GG--T-----------TTGTT------T-TC---ATC---ATT-----T--AAA--C----TT-TCAA---T-CACTTCAAAAATG----G-T------T-CG--TATGTTTTCACC----------------AAT------AT---AGCGTCCTTTTAG-AAACCCCGT-TTG-ACTG--TCA-TTTAT-A-A-
gi|21626 : TAAAATGGT-TTG-ATCCA----ATTAAT-AAAAG-A---ATT--A----CCGAAGTT---A-AAA-TA--T-T-TAA--------------GAGT--TTT--TGAAATA-AAA--------CC---GTGATC--ATTGCTATCAAAGG---------CTTTTTCGAAAT---CAGCAAAAAAGATTAAGCCA---GG--T-----------TTATT------T-TCGT-TAT---T-T-----A--TAT--TTTCGAT-TACT---T-CA-----AAAATA----G-TG--C--G-AA--TA--TTTTCACC----------------TAT------GT---ACCGTCCTTTTAA-AAAAACAGT-TTT-ACTA--TCA-TTGAT-A-A-
gi|21627 : TAAAAAACA-TTA-ATCCA----TTTTTT-AATTG-A---TTC--T----CCAAAGTT---A-AAA-TA--A-T-CGA--------------AAGT--TTT--ATAAATG-AAATTGTGAT-CT-A--C-ACTG--------TCGAATG---------CTTTTTCAAAAT---CTGCAAAGAATAATAGACTA---GG-----GT-G---G-TCGTT------T-TCATTTAC---A-T-----A--ATC--T----AA-TACA---T-CAT----ATATAA----G-T---C--T-TA--TA--TTTTCACC----------------GAT------GT---AACGGTTT-CTAATAAAACCAGT-TTG-TGCC--TTA-TCAAT-----TAAA
gi|21628 : TAAAAAAGT-TTG-ATCCA----GTT-TT-GAAT------TGA--ATCT-CCAAATTTA--A-AAA-AA--T-T-CAA--------------AGTCTTTTT--G---ATG-AAA-----GA-CC-AAGAGAGAG-T-----GTCAAAGG---------CTTTCTCAAAAT---CTATTAAAAGTAGTAATCCT---GG----AAT-G-----TTTTT------T-TC---TTC---A-------G--AGA--G----ATGTAAAATGT-CAT----ATAAAA----G-T---C--T-CG--TG--TTATCACC----------------TAT------AT---ACCTACCCTTTAT-AAATCCTGTCTTGTATACAATAT-TTAAT-A-A-
gi|21629 : TAAAAAACA-TTA-ATCCA----TTTTTT-AATTG-A---TTC--T----CCAAAGTT---A-AAA-TA--A-T-CGA--------------AAGT--TTT--ATAAATG-AAATTGTGAT-CT-A--C-ACTG--------TCAAATG---------CTTTTTCAAAAT---CTGCAAAGAATAATAGACTA---GG-----GT-G---G-TCGTT------T-TCATTTAC---A-T-----A--ATC--T----AG-TACA---T-CAT----ATATAA----G-T---C--T-TA--TA--TTTTCACC----------------GAT------GT---AACGGTTT-CTAATAAAACCAGT-TTG-TGCC--TTA-TCAAT-----TAAA
gi|21630 : TAAAATATA-TCT-ATCCA----TTTTTT-GAAAT-C---TAG--A----CCAAAGTT---ACAAA-AA--A-T-TAA--------------T-AC--TTG--GTGAATA-AAG-----TG-CC-ATGCAACCG-A-----ATCAAAGG---------CTTTTTCAAAGT---CAAT
gi|21631 : TAAAATA-T-TTA-ATCCA----ATTGAT-AAAGG-A---GTT--A----CCAAAATT---A-AAA-TA--T-G-CAA--------------CAGC--TTT---AAAATA-AAA------T-C----GTGATCT-ATACT-ATGGAATGC--------CTTTTTCACAAT---TAGCTAAAAATATAAGTCTT---GG--T-----------TTGTC------T-TC---AAC---A-T-----GT-AAA--T----AT-TCTA---T-TACCTCAAAGATA----GTT---C--G-AA--TG--TTTTCGCT----------------TAT------AT---ATCTTCCTTTTTA-AAAG-CTGT-TTG-GCTG--TTA-TTGAT-A-A-
gi|21632 : AGAATAATCTTG-ATCCA----TCT-TT-AAAAG-AC--TGG--T----CCAAAATG---A-TAA-CA--A-T-CAA--------------GGAT--CTC--AAAAATG-AAA-----TT-CT-ACGCAAGAG-A-----GTCAAATG---------CTTTTTTGAAGT---CAATCAAAAGGAGGAGTCCT---AGAATCTAT-T---G-TGTTT------T-TC---TTT---A-T-----A--AAA--C----AT-TACA---T-CAT----ATATTA----G-T---G--T-AG--TA--TTTTCCTT----------------TAT------AT---ATC
gi|21633 : AAATAGT-TTA-ACCCA----TTGTTT-GAAGG-A---CTA--A----CCAAAATT---A-AAG-AA--A-T-CAA--------------GGAC--TTT----AAATAGAAA-----GT-CCCAGTTAACAG-A-----ATCAAAGG---------CTTTTTCTAAAT---CGATTAAGAGTAGCATTCTT---GG--TATTT-G---T-CTTTT------T-TC---TAC---A-T-----A--AAA--C----AT---GG---T-CAA----ATAATA----G-T---T--G-AA--TA--TTTTCTCC----------------GAT------TT---ATCTACCAGATAA-AATACCTGT-TTA-ATCT--TCA-TTTAT-A-ATTAAA
gi|21634 : T-TTT-ATCCA----GTCAAT-AAAC------TTGTTA----CCAAACTT---A-AAATAG--T-G-TAAT-------------G--T--TTT--AAAAATA-AAA-----TT-AT-GGTCAACAC-T-----ATCGAACG---------CTTTTTCAAAAT---CAGCAAAGAATATCAGGCTC---GG--TCTAT-T---G-TCATTA-----T-TCAAGTGG---T-T-----A--ATG--C----AT--------T-CA-----AAAATT----G-TC--C--T-TA--TG--TTTTCGCC----------------AAT------GT---AACGTCCTTTTAA-AAATCCTGT-CTA-ACTG--TTG-TTGAT-A-A-
gi|21635 : -TTG-ATCCAGGACTGTATT-AAA--------GG--A----CCAAAATT---G-AAA-AA--T-T-TTA--------------TTAC--TTT--TTGTATA-AAT-----GA-CC-AAGATAAGG-A-----AGCAAAAG---------CTTTTTCAAAGT---CAACAAGGAGCAGTAATCCT---GG--AATAT-G---A-TTTTC------C-TC---TAA---A-T-----A--ATG--C----AT-TATG---T-CAT----ACGTTA----A-T---C--T-TG--TA--TTTTCACC----------------TAT------AT---AATGACCTGTTAA-AAATCCAGT-TTG-ATCT--CTA-TTTAT-A-A-
gi|21636 : CA----TTTTAG-GAAGG-A---TAG--A----ATAAAAAT---A-A-----------TAA--------------GAAC--ATC---AAAATA-AAA-----GC-CC-AGGCAACTA-A-----ATCGAATG---------CTTTCTCAAAAT---CATTTAGTAGCACCATGCCT---GG--TAAAT-G---A-TTCTT------T-TC---TAC---A-T-----A--AAA--C----AT-TATT---T-TAT----AAAAAAAAACG-----C--T-AG--CA--TAATAACC----------------AAT------AT---ATTAGCCTCATAA-AAA-CCTG
gi|21637 : aca---TGG--T----TCAAAGTT---ATAAA-AA--T-C-TAACTTACCATAATCAAAGAC--TTT--AAAAATA-AAA-----TG-CC-AAATAACGG-A-----ATTAAATG---------CTTTTTCGAAAT---CAATCAAAAGAAGGAGTCCG---GG--GAGATTGC--A-TTATT------C--------C---G-C-----A--AAA--A----AT-TATA---T-CAT----ACATTA----A-T---C--T-GG--TA--TTTTCTTG----------------TAT------GT---ACCTTCCCGCTAA-GAAATATGT-TTG-ATCT--TTA-TGTAT-A-A-
gi|21638 : CATAATT---G-AAA-AA--CAT-TAA---------------AAC--CTC--ATCAATA-AAA-----GA-CC-ACGAGAGTG-T-----ATCAAAAG---------CTTTTTCGAAAT---CAATGATAACTAGTAAACCT---GG--TACAT-C---A-TATGT------T-TC---TGC---A-T-----A--ATG--G----AA-TAAA---T-CAT----A-AATT----G-TA--C--G-TG--TA--TTTTCACC-----------------AC------GT---A-----CGGCAAA-AAAAACTGT-TCG-GTCT--TCA-TTAAT-A-A-
gi|21639 : CAAAATT---G-AAA-AA--C-T-TAA--------------ATAC--TTT--ATAAGTA-AAA-----GA-AC-AGGATATGG-A-----ATCAAAGGTGTTGTTTTCTTTTT-----------ATTAACAGTACAAGACCA---GG--AATAT-T---G-TTGAC------T-TC---AGC---A-T-----A--GTG--C----AT-AACA---T-CGT----ATAATT----G-T---C--T-TG--TA--TTCTGTCC----------------CAT-----------ATCGTCCTGACAT-AAATCCTCT-CTG-GTCC--TCG-TGGAT-A-A-
gi|21640 : AAAATTTAAA-AAA-AA--T-T-CAA--------------AGTC--TTTTTGA---TG-AAA-----GA-CC-AAGAGAGAG-T-----GTCAAAGG---------CTTTCTCAAAAT---CTATTAAAAGTAGTAATCCT---GG----AAT-G-----TTTTT------T-TC---TTC---A-------G--AGA--G----ATGTAAAATGT-CAT----ATAAAA----G-T---C--T-TG--TG--TTATCACC----------------TAT------AT---ACCTTCCTTTTAT-AAAACCTGT-CTG-TTCT--GCA-CTTAT-A-A-
gi|21641 : TA-AAA-----GA-CC-AAGATAATG-T-----ATCGAAAG---------CTTTCTCAAAAT---CAATTAGCAGTAATAATCCT---GG--TATAT-------TTATC------T-TC----AC---A-------A--ATATGC----AT-TACG---T-CAT----ATAATA----A-T---C--T-AG--TG--TTATCACC----------------CATATACATGT---ATCTGCCTTTTAT-AAAACCAGT-TTG-TTCT--TTACTTAAT---A-TAA
gi|21642 : aaatttaaaaaagcgtagagtctttctatTCGGAGG---------CTTTCTCAAAAT---CAA---ATAGTTACAATAATTAAGG--TA-----------TGTT------G-TC---TGC---A-T---------------------TATA---T-CGT----ATAGTA----C-T---C--T-TG--TA--TTTTCTCC----------------TAA------AT---ATCGTCCTGCAAT-GGACCCTGT-TTT-ATCC--
gi|21643 : ATG---------TTTTCTCAAAAT---CATTTAGTAGTAACAT--------G--TAAAT-G---A-TT---------T-TC---TAC---A-T-----A--AAA--C----AT-CAGA---T-CAT----GCATTG----G-T---C--G-AC--AA--AAATCACC----------------AAT------AT---ATCAGCCTCACAA-AAAG-CTGT-TT
gi|21644 : TTTCGAAAT---CTATAATAACTAGTAAACCT---GG--TACAT-C---A-TATGT------T-TC---TGC---A-T-----A--ATG--G----AA-TAAA---T-CAT----A-AATT----G-TA--C--G-TG--TT--TTTTTACC----------------AAT------GT---ATCCTCCGGCAAG-AAAACCGGT-TTG-GTCC--TCA-TTAAT-A-
gi|21645 : CATTCCA---GG--TTAAT-G---T-TGTTT------T-TC---AAC---A-T-----A--AAA--C----AT-T-CG---T-CTT----ACAATA----A-T---C--T-TA--TA--TTGTCACC----------------TAT------AT---ATTTGCCTGATAA-AAAGCCTGT-TTG-ATCT--TCA-TTAGT-A-A-TA
gi|21646 : -----A--AAA--C----AT-AAGG---T-CAT----ACAATA----A-T---C--T-TA--TA--TATTCACA----------------TAT------AT---ATCAGCCAAATAA-AACACCTGT-TTG-ATCT--TCA-TTAAA-A-A-TA