lowQualScore : 11 222222222222 2222 1111 1111111111111111111111111111111 333333 11111111111 1111111111 1111 111 1111 1 11 2222222222222222222222222222222 111111111111111 11111 1 1 1
lowQualScore : 1 4444 2222 11 00 222 1 999 222222222222 666 444 222 2 222 2222 11 2 0000 3333 2222 7 333 222 1 11 1111 444 7 3 333 7777777 55555 8888888888888888888888888888888 2 2 66 3 33 2 22 2 111111 0 3 77 5555 5555 8888888 66 33 22222222222 4 8888888 5555 2 9999999999 8 3 8 8888 9 44444 1 000 1 333 22 0 1111 4444 6 88 4 4 4444 1111111111111111111111111111111 5555 33 22 1 444444444444444 2 1 2 22 0 00000 4 1 4 4444 4 2 88 22 8 2 2
lowQualScore : . .... .... .. .. ... . ... ............ ... ... ... . ... .... .. . .... .... .... . ... ... . .. .... ... . . ... ....... ..... ............................... . . .. . .. . .. . ...... . . .. .... .... ....... .. .. ........... . ....... .... . .......... . . . .... . ..... . ... . ... .. . .... .... . .. . . .... ............................... .... .. .. . ............... . . . .. . ..... . . . .... . . .. .. . . .
lowQualScore : 1 8888 8888 88 00 333 3 222 888888888888 666 444 222 5 222 7777 77 4 9999 8888 7777 6 444 333 3 88 4444 111 0 3 999 2222222 66666 3333333333333333333333333333333 2 4 66 5 11 2 55 2 777777 8 0 22 7777 7777 7777777 33 77 77777777777 7 7777777 3333 4 0000000000 4 5 6 0000 0 88888 9 777 9 333 66 6 2222 0000 8 22 4 7 7777 1111111111111111111111111111111 3333 44 88 2 777777777777777 4 8 1 99 1 55555 3 8 7 4444 0 0 11 88 0 8 1
consensus : AGAATGAATGAATCAATCAATCAATC----TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTA-T---GTACAAGTT-TAAACGTTCAT--GTA--------N---ATGTT---T---TGT---TA-T---AT----G--ACGTG---TAC---ATA----GATGAGAC---GA---AAAT-AA--AGATAATA----ACT---ATGAAATGAATGGTGTTTTGCGGNA---CG-------AAA-----ATAA--------A---A--------TT--------ATTTAAAGAAATA-TAAAG-GTACTGAGATT--AC-TTCAT-TAAGTTTAGTAA-TC-C----GAAATAGATATTCTAACTGCAAACATGTTTCATTTTGTGCATTTTTAT----GTTC----GT-------TT--TA--T-----------AGNCAT-------CGCATTGATATC----GTGTAAT-TAAC---T---N--AATACAAGTTNGTTATGATAAACCAATATCAAATGTTTATAA-----ATATT-ACAG--CA-TATTG---A--ATTTAAACGTTT--TCCT----AAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAATCC-TTGTAC-AA----AAA-A---AA-CAGAG-A------C---------C----CC--C-GCCCCGCGCC---------------TGTCTG-TTTTT-CAAATCTCAAACA--ATGGAATA-----AGCCAGTG-TT-A--TTT-ATG-ACCTTAATTACCGACTA--CCCCTGCCCCGGAGGCAAAACTTGTAATTTTAT-TGGGGGG
Reference ( gi|49170 ) : AGAATGAATGAATCAATCAATCAATC----TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTT-T---GTACAAGTT-TAAACGTTCAT--ATA--------G---ATGTT---T---TGT---TA-T---AT----G--ACGTT---TAT---ATA----GATTAGAC---AA---AAAT-AA--AGATAATA----ACT---ATGCAATGAATGGTGTTTTGCGGAA---CG-------AAA-----ATAA--------A---A--------TT--------ATTTAAAGAAATA-TAAAG-ATATTGAGATT--AC-TTCAT-TAAGTTTAGTAA-TC-G----GAAATAGATATTCTAACTGCAAACATGTTTTATTTTGTGTATTATTAT----GTTT----GT-------TT--TA--T-----------AGACAT-------CGCATTGATATC----GTGTAAT-TAAC---T---A--AATACAAGTTCGTTAAGATAAACAAACATAAAATGTTTATAA-----ATATT-ACAG--TA-TATTG---A--ATTTAAACGTTT--ATCT----AAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATCTTATAAGTC-TTGTAC-AA----AAA-A---AG-CAGAG-A------C---------C----CC--C-GCCCCGCGCC---------------TGTCTG-TTTTT-CAAATCTCAAACA--ATGGAATA-----AGCCTGCG-TT-A--TTT-ATG-ACCTTAATTACCGACTA--CCCCTG-CCCGGAGGCGAAACTTGTAATTTTAT-TGGGGGG
gi|49171 : AGAATGAATGAATCAATCAATCAATC----TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTT-T---GTACAAGTT-TAAACGTTCAT--ATA--------G---CTGTT---T---TGT---TA-T---AT----G--ACGTG---TAT---ATA----ACTTAGAC---AA---AAAT-AA--AGATAATA----ACT---ATGCAATGAATGGTGTTTTGCGGAA---CG-------AAA-----ATAA--------A---A--------AT--------ATTTAAAGAAATA-TAAAG-GTACTGAGATT--AC-TTCAT-TAAGTTTAGTAA-TC-C----GAAATAGATATTCTAACTGCAAACATGTTTTATTTTGTGTATTATTAT----GTTT----GT-------TT--TA--T-----------AGACAT-------CCCACTGATATC----GTGTAAT-TAAC---T---A--AAAACAAGTTCGTTATGATAAACCAATATAAAATGTTTATAA-----ATATT-ACAG--CA-TATTG---A--ATTTAAACGTTT--ATCT----AAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATCTAACAATCC-TTGTACAAA----AAA-A---AA-CAGAG-AC-----C---------C----CC--C-GCCCCGCGCC---------------TGTCTG-TTTTA-CAAATCTCAAACA--ATGGAATA-----AGCCAGCG-TT-GTTTTT-TTT-ACCTTAATTAC--A--A--CTCCTG-CCCGGAGGCGAAACTTATAATAGTAA-GGGGGGG
gi|49172 : AGAATGAATGAATGAATCAATCAATC----TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTT-T---GTACAAGTT-AAAACGTTCAT--ATA--------G---ATGTT---T---TGT---TA-T---AT----G--ACGTG---TAT---ATA----GATTAGAC---AA---AAAT-AA--AGATAATA----ACT---ATGAAATGAATGGTGTTTTGAGGG-----G-------AAA-----AAAA--------ATTAA--------TT--------ATTTAAAGAAATA-TGAAG-GTACTGAGATT--AC-TTCAT-TAAGTTTAGTAA-TC-C----GAAATAGATATTCTAACTGCGAATATGTTTCATTTTGTGTATTATTAT----GTTT----GT-------TT--TA--T-----------AGACAT-------CGCATTTTTATC----GTGTAAT-TAAC---T---T--AATACAAGTTCGATATGATCAACCAATATCAAATGTTTATAA-----ATATT-ACAG--CA-TATTG---A--ATTTAAACGTTT--TCCT----AAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAATCC-TTGTAC-----------------------------------------------------------GCC---------------TGTCTG-TTTTT-CAAATCTCAAACA--ATGGAATA-----AGCCAGTGTTT-A--TTT-ATG-ACCTTAATCACCGACTA--CCCCTG-CCCGGAGGCAAAACTTGTAATTTTAT-TGAGGGG
gi|49173 : AGAATGAATGAATGAATCAATCAATC----TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTT-T---GTACAAGTT-TAAACGTTCAT--ATA--------G---CTGTT---T---TGT---TA-T---AT----G--ACGTG---TAT---ATA----GCTTAGAC---AA---AAAT-AA--AGATAATA----ACT---ATGCAATGAATGGTGTTTTGCGGAAGTTCGTTATGATAAACCAATATAA--------A---A---------T--------GTTT--ATAAATATTACAGCATATTGAAATTAAACGTTTATCTAAGATCAGTAA-
gi|49174 : GAATGAATCAATCAATCAATCAATCAAACTTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTT-T---GTACAAGTT-TAAACGTTCAT--ATA--------G---CTGTT---T---TGT---TA-T---AT----G--ACGTG---TAT---ATA----GATTAGAC---AA---AAAT-AA--AGATAATA----ACT---CTGCAATGAATGGTGTTTTGCGGTA---CG-------AAA-----ATAA--------A---A--------TT--------ATTTAAAGAAATA-TAAAG-ATATTGAGATT--AC-TTCAT-TAAGGTTAGTTA-TC-C----GAAATAGATATTCTAACTGCAAACATGTTTTATTCTGTGTATTATTAT----GTTT----GT-------T----A--T-----------AGACAT-------CGCATTGATATC----GTGTAAT-TAAC---T---A--AATACAAGTTCGTTATGATAAACCAATATAAAATGTTTATAA-----ATATT-ACAG--CA-TATTG---A--ATTTAAACGTTT--ATCT----AAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAATTC-TTGTAC-AA----AAA-A---GG-AAGAG-A------C---------C----CC--C-GCCCCGCGCC---------------TGTCTG-TTTTT-CAAATCTCAAACA--ATGGAATA-----AACTTGCG-TT-A--TTT-ATG-ACCTTAATTACCGACTA--CCCCTG-CCCGGAGTCGAAACTTGTAATTTTAT-TTGGGGG
gi|49175 : GAATCAATCAATCAATCAATCAATC----TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTC-T---GTACAAGTT-TAAACGTTCAT--GTA--------G---ATGTT---T---TGT---TA-T---AT----G--ACGTG---TAT---ATA----GATTAGAC---AA---AACT-AA--AGATAATA----ACT---ATGAAATGAATGTTGTTTTGCGGAA---CG-------AAA-----ATAAAATTATTTA---A--------TT--------ATTTAAAGAAATA-TAAAG-GTACTGAGATT--AC-TTCAT-TAAGTTTCATAGTTC-GTTCTGAAATAGATATTCTAACTGCAAACATGTTTCATTTTGTGTATTTTTAT----GTTT----GT-------TT--TA--T-----------AGTCAT-------CGCATTGATATC----GTGTTAT-TAAC---T---C--AAT----GTTT------ATAAA--------------------------TATT-ACAG--CA-TATTG---A--ATTTAAACGTTT--TCCT----AAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAA
gi|49176 : GAATGAATGAATCAATCAATGAATCAA--TCATAAAAAAT--T--TTTAGAATGACTT-T---GTACAAGTT-TAAACGTTCAT--ATA--------G---ATGTT---T---TGA---TA-T---AT----G--ACGTG---TAT---ATA----GATTAGAC---AA---AAAT-AA--AGATAATA----ACT---ATGAAATGAATGGTGTTTGGCAGAA---CG-------AAA-----ATAAAATTATTTA---A--------TT--------ATTTAAAGAAATA-TAAAG-GTACTGAGATC--AC-TTCAT-TAAGTTTAGTAA-TC-tc
gi|49177 : AAAGAATGAATGAATCAATCAATC----TTAT----AATTCT--TTTAGAATCGCTT-T---GTACAAGTT---------CAT--ATA--------G---CTGTT---T---TGT---TA-T---AT----G--ACGTG---TAT---ATA----GATTAGAC---AA---AAAT-AA--AGATAATT----ACT---ATGAAATGAATGGTGTTTTGCGGAA---CG-------AAA-----ATAA--------A---A--------TTATTTAATTATTTAAAGAAATA-TAAAG-GTACTGCGATT--AC-TTCAT-TAAGTGTAGTAA-TC-C----GAAATAGATATTCTAACTGCAAACATGTTTCATTTTGTGTATTATTAT----GTTT----GT-------TT--TA--T-----------AGACAT-------CGCATTGATATC----GTGTAAT-TAAC---T---A--AATACAAGTTC-----GATAAACCAATATCAAATGTTTATAA-----ATATT-ACAG--CA-TATTG---A--ATTTAAACGTTT--TCCT----AAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATCTAAAAATCC-TTGTCCAAA----AAA-A---AA-CAGAG-AC-----C---------C----CC--C-GCCCCGCGCC---------------TGTCTG-TTTTT-CAAATCTCAAACA--ATGGAATA-----AGCCAGTGTTT-A--TTT-ATG-ACCCTAATTACCGACTA--CTCCTG-CCCGGAGGCAAAACTTGTAATTTTAT-TGGGGGGcg
gi|49178 : AATCAATCAATCAATCAATCAATC----TTAT----AATTCT--TTTAAAATGGCTT-T---GTACAAGTT-TAAACGTTGAT--GTA--------G---ATGTT---T---TGT---TA-T---AT----G--ACGTG---TAT---ATA----AATTAGAC---AA---AAAT-AA--AGATAATA----ACT---ATGAAATGAATGGTGTTTTGCAGAA---CA-------AAA-----TTAA--------A---A--------TT--------ATTAAAAGAAATA-TAAAG-GTACTGAGATT--AC-TTCAT-TAAGTTTAGTAA-TC-
gi|49179 : AATTAATCAATCAATCAGTC----TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTT-T---GTACAAGTT-TAAACATTCAT--ATA--------G---CTGTT---T---TGT---TA-T---AT----G--ACATG---TAT---ATA----GATAAGAC---AA---AAAT-AA--AGATGA----------------AATAAATGGTGTTTTAC
gi|49180 : AATTTATC----ATAT----AATTCT--TTTAGAATGTCTA-T---GTAGAAGTT-TAAACGTTCAT--GTA--------T---ATGTT---TTAATAT---TA-T---GT----G--ATGTG---TAC---ATA----GATGAGACGAGAA---AAA--AA--AGATAATA----CTT---ATttcattaagtttagtaatccaaaatagatattctaactgcaaacatgtttcattttgtgtattattatgtttgttttatagacatcgcattgatattgtgtaattaacttaatacaagttcgttatgataaaccaatatcaaatgtttataaatattacagcattttgaatttaaacgttttcctaagatcagtaaagtaatatgtaaatttaataatccttgtacaaaaaaaacagagacgagaccccccgccccgcacctgtctgtttttcaaatctcaaacaatgaaataagccagtgtttatttatgaccttaattaccgactacccctgcccggatgcaaaacttgtaactttattgggggg
gi|49181 : AATGAATC----TTAT----AATTCT--TTTAGAGTGGCTA-TGCCGTACCATTT-TAAAA--TCAC--ATGAAT-----A---ATATT---T---TAT---TT-T---GT----G------T---TAT---ATACCTTAATGAGAT---GA---AAAT-AA--AGATAGTATT--ACT---AT
gi|49182 : ATC----TTAT----AATTCT--TTTAGAAAGGCTA-T---GTACAAGTT-TAAACGTTCAT--GTA--------T---ATGTT---T---TGT---TA-T---AT----G--ATGTA---TATGTTATA----GATGAGAT---GA---AAAT-AA--AAATAATA----CCT---ATAAAATGAATGATGTTTTGCAGCA---CG-------AAA-----ATAA--------A------------TT--------ATTTAAAGAAATA-TAATG-GTACTGAGATT--AC-T--A---AAGTTTGATAA-TCCGTTCTGAAATAAATATTTTAACTGCAAACATATTTCATTTTGTGCATGTTTGT----GTTC----GT-------TT--TA--T-----------AGTCAT-------CACATTGATATC----GTGTATT-TAAC---T---T--AATACAAGTTAGTTATGCTAGACCATTATCAAATGTTAATAAGTATTACATT-ACAG--CA-TATTG---A--ATTTAAACGTTT--TCCT----AAGATCAGTAAAATAATATGCAAATCTAATAACTC-TTGTA
gi|49183 : TC----TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTA-T---GTACAAGTT-TAAACGTTCATGTATA--------ATTTATGTT---T---TGT---TA-T---AA----G--ATGT----------GTA----GATGAGAC---GA---AAAG-AA--AGATAATA----CCT---ATGAAATGAATGGTGTTTTGCGGCA---CG-------AAA-----ATAT--------A---A--------TT--------ATTTAAAGAAATA-TAATG-GTACTGAGAAT--AC-TTCCT-AAAGTTTGATAA-TC-C----GAAATAAATATTTTAACTGCAAACATGTTTCATTTAGTGCATGTTTAT----GTTC----GT-------TT--TT--C-----------AGTCAT-------CGCATAGATATC----GTGTAAT-TAACTTTT---A--AA-ACAAGTTCGTTAAGATAATCCAATATCAAATGTTTAT--------------CA--------------A--ATTTTAACGTTT--TCCT----AAGATCAGTGAAATAATATTCAAATCTAATAATCC-TTGTAC-AA----ATA-T---CG-C------------C---------C----CC--C-ACCCACCCCC---------------TGTCTG-TGTTT-CAAGTCTCAAACA--ATGCGATA-----AGCCAGTG-TC-A--TTT-ATG-AACTTAATTACCCCCTA--CCCCTGCCCCGGAGGCAAAACTTGTTCTTTTAT-TGGGGG
gi|49184 : TC----TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTC-T---GTACAA--------CGTTCATGTATA--------ATTTATATT---T---TGT---TA-T---AT----G--ATGT----------GAA----GATGAGAC---GA---AAAG-AA--AGATAATA----CCT-----GAAATGAATGGTGTTTTGCGGCA---CG-------AAA-----ATAA--------A---ACTATCTAATT--------ATTTAAAAAAATA-TAATG-GTACTGAGATT--AC-TTCCT-AAAGTTTGATAA-TC-C----CAAATAGATATT-TAACTGCAAACATGTTTCATTTTATGCATGTTTAT----GTTC----GT-------TT--TT--T-----------AGTCAT-------TGCATAGATACC----GTTTAAT-TAAC---T---TTTAATACAAGTTAGTTAAGATAAACCATTATCAAATGTTTATAG-----ATATT-ACAG--AA-TTTTT---A--ATTTAAACGTTT--TCCT----AAGATCAGTAAAATAATATTCAAATCTGATAATCC-TTGTAC-AA----AAA-A---A--CAAAA-A------CAAAAAGAAACAAAGCA--C-ACCCTCCCAC---------------TGTCTG-TGTTT-CAGGTCTCAAACA--ATGCGATA-----AACCAGTGTTT-A--TTT-ATG-AACTTAATTACC-CCTA--CCCCTGCCCCGGAGGTAAAACTCGTAATTTTAT-TGGGG
gi|49185 : TC----TTAT----AATTCT--TTTAGAATGACTA-T---GCACAAGTT-TAAACGTTCATGTATA--------ATTTATGTT---T---TGT---TA-T---AT----G--ACGT----------GTA----GATGAGAC---AA---AAAG-AA--AAATAATA----CCT---ATGAAATGAATGGTGTTTTGCGGCA---CG-------AAA-----ATAT--------A---A--------TT--------TTTTAAAGAAATA-TAATG-GTACTGAGAAT--AC-TTCCT-AAAGTTTGATAA-TC-C----GAAATAAATATTTTAACTGCAAACATGTTTCATCTAGTGCATGTTTAT----TTTC----GT-------TTC-TAATT-----------A---AT-------CGCATGGATATC----ATGTAAT-TCACTTTT---A--AA-ACAAGTTAGTTAAGATAATCCATTATCAAATGTTTATAA-----ATATT-ACAG--AATTTTTA---A--ATTT-AACGTTT--TCCT----AAGATCAGTGAAATAATATTCAAATCTAATAATCC-TTGTAC-AA----AAA--------------A------C---------C----CC--C-A----GAG------------------------------CAAA---CAA------TGCGATA-----AGCCAGTG-TC-A--TTT-ATG-AACTTAATTACCCCATA--CCCCTGCCCCGGAGGCAAAACTTGTAATTTTAT-TGGGGG
gi|49186 : TC----TTAT----CATTCT--TTTAGAATGGCTA-T---GTACATGTT-TAAACGTTCATGTATA--------ATTTATGTT---T---TGT---TA-T---AT----G--ATGT----------GTA----GATGAGAC---GA---AAAG-AA--AGATAATA----CCT---ATGACATGAATGGTGTTTTGCGGCA---CG-------AAA-----ATAT--------A---A--------TT--------TTTTAAAGAAATA-TAATG-GTACTGAGAAT--AC-TTCCT-AAAGTTTGATAA-TC-C----GAAATAAATATTTTAACTGCAAACATGTTTCATTAAGTGCATGTTTAT----TTTC----GT-------TT--TT--T-----------AGTCAT-------CGCATAGTTATC----GTGTAAT-TAACTTTT---A--AA-ACAAGTTAGTTAAGATAATCCGTTATCAAATGTTTATAA-----ATATT-ACAGATTT-TTTTT---A--ATTT-AACGTTT--TCCT----AAGATCAGTGAAATAATATTAAAATCTAATAA-TCGTTGTAC-AA----AAA-A------------A------C---------C----CC--C-A----GAG------------------------------CAAA---CAATCA-------ATA-----AGCCAGTG-TC-A--TTT-ATG-AACTTGATTACTCCCTA--CCCCTGACGCGGAGGCAAAACATGTAATTTTAT-TGGGGG
gi|49188 : TC----TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTA-T---GTTAAAGTT-TAAACGTTCATGTATA--------ATTTATGTT---T---TGT---TA-T---AT----G--ATGT----------GTA----GATGAGAC---GA---AAAG-AA--AGATAATA----CCT---AGGAAATGAATGGTGTTTTGTGGCA---CG-------AAA-----ATAT--------A---A--------TT--------ATTTAAAGAAATA-TAATG-GTACTGAGAAT--AC-TT-A---AAGTTTGATAA-TC-C----GAAATAAATATTTTAACTGCAAACATGTTTCATTTAGTGCATGTTTAT----GTTC----GG-------TT--TT--C-----------AGTAAT-------CGCATAGATATC----GTGTAAT-TAACTTTT---A--AA-ACAAGTTAGTTAAGATAATC---C----AATGTT-------------------------TATTA---A--ATTTTAACGTTC--TCCT----AAGATCAGTGAAATAATATTCAAATCTAATAA
gi|49189 : TC----TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTA-T---GTACAATTT-TAAACGTTCAT--GTA--------T---ATGTTTGAT---TAT---TA-T---GT----G--ATAAG---TAC---ATA----GATGAGAC---GA---AAAT-AA--AGATAATACT--ACT---ACGTAATtcctcaagtctcaaacaatgcgataagccagtgtcatttatgaacttagttaccccctacccctgccccggaggcaaaacttgtacttttatatgggg
gi|49187 : TC----TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTA-T---GTACAAGTT-TAAACGTTCAT--GTA--------T---ATGTT---T---TAT---TATT---AT----GTAATATG---TAC---ATA----GATGAGAA---GA---AAAT-AA--AGATAATA----
gi|49191 : TC----TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGTTA-T---GTACAATTT-TAAATGTTCAT--GTA--------T---ATGTTTTAT---TAT---TA-T---GT----G--ATAAG---TAC---ATA----GATGAGAC---AA---AAAT-AA--AGATAATACT--ACT---Actggaaagaa
gi|49192 : TC----TTAT----AATTCT--TTTAGAATGATTA-T---GTACAATTT-TAAACGTTCAT--ATA--------T---ATGTT---T---TAT---TATT---AT----G---TGATCAGTAC---ATA----GATGAGAC---GA---AAAT-AA--AGATAAT-----ACT---A
gi|49190 : TC----TTAT----TATTCT--TTTAGAATGGCTA-T---GTACAAGTT-TAAACGTTCAT--GTATAAATTATG---GTGTA---T---TAT---TA-T---GT----G--ATATG---CAC---ATA----GATGAGAC---GA---AAAT-AA--AGATAAT-----ACT---AT
gi|49194 : TC----TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTA-T---GTACAATTT-TAAACGTCCAT--GTA--------T---ATGTTTGAT---TAT---TA-T---GT----G--A--TTAG-TAC---AAA----GATGAGAC---GA---AAAT-AA--AGATAAT-----ACTA--ATACAAaaa
gi|49193 : TC----TTCT----AATTCT--TTAAGAATGGCTT-T---GTTCAATTT-TAAACGTTCAT--GTA--------T---ATGTT---T---TATTAGTA-T---AT----G--AAGTG---TAC---ATA----GTTGAGAC---GA---AAAT-AA--AGATAGTACTG-AGT---AAATAATGAAaat
gi|49196 : TC----TTAT----ATTTCT--TTTAGAATGGCTG-T---GTGCAAGTT-TAAACGTTC-T------------------TGTT---TCGGTGT---TA-TGAAAT----G--ATGTG---TAC---AAA----TATGAGAC---GA---AAAT-AA--AGGTAACACTCTACTTAAATACATTGAAAGGCGT------GAA---AG-------AGA-----ATAT--------A---A--------aagaataccatgtctggtctgaagaaaata
gi|49195 : TC----TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTA-T---ATACAAGTT-GAAAAGTTCAT--GTC--------A---CTGTT---T---TAT---TA-T---AC----G--AAATG---TAC---ATA----GATGAGAC---
gi|49197 : TC----TTAT----AATTCT--TTTAGAATTGCTA-T---GTGTGCGTT-GAAACGTCCAC--GTA--------T---CTGTT---T---TAT---TA-T---AT----G--ATATA---TAG---ATA----GATGATAC---GA---AACT-AAATAGATA
gi|49198 : TC----TTGT----AATTCTAATTTAGAATGGCTA-T---GTAC--GTTGTATAGATTAGT--GT-------------ATGTT---T---TAT---T--T---AT-------ATGTTTG-TAC---ATA----GATGAGAC---TT---TAAT-AA--AGA-AATA----A
gi|49199 : ----TTAT----AATTCT--TTCAAAATGGCTA-T---GGTCAAGTT-TAAACATTCAT--GTA--------A---ATGTT---T---TAT---TA-T---AT----G--TTATG---TAC---ATA----GATGAGAG---GA---AAAT-AA--AAATAAagatgaa
gi|49200 : ----AATTCT--TTTAGAATGGCTA-T---GAACAA---------GTTCAT--GTA--------T---ATGTT---T---TAT---TA-T---AC----G--ATAAT---TAT---GTA----CA-TAGAC---AAGACAAATAAA--AGACAAT-----ACT---A
gi|49201 : TTATAATGACCAAT---GTACAAGTT-TAAACGTTCCT--GTA--------T---ATG---------TAT---TA-T---ATACTGG--ATATG---TAC---ATA----GATGAGACA--AA---AAAT-AA--AG
gi|49202 : T---T---TGA---TA-----AT----G--ACGTG---TAT---ATA----GCTTAGAC---AA---AAAT-AA--AGATAATA----ACT---ATGCAATGAATGGTGTTTTGCAGAA---CG-------AAT-----ATAA--------A---A--------TT--------ATTTAAAGAAATA-TAAAG-GTACTGAAATT--AC-TTCAT-TAAGTTTAGTAA-TC-C----GAAATAGATATTCTAACTGCAAACATGTTTTATTTTGTGTATTATTAT----GTTT----GT-------TT--TA--T-----------AGACAT-------CGCATTGATATC----GTGTAAT-TAAC---T---A--AATACAAGTTTGTTATGATAAACCAATATAAAATGTTTATAA-----ATATT-ACAG--CA-TATTG---A--ATTTAAACGTTT--ATCT----AAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAATCC-TTGTAC-AA----AAA-G---AA-CAGAG-AC-----C---------C----CC--C-GCCCCGCGCC---------------TGTCTG-TTTTT-CAAATCTCAAACA--AAGGAATA-----AGCCAGCGTTT-T--TTT-ATG-ACCTTAATTACCGACTA--CCCCTG-CCCGGAGGCGAAACTTGTTATTTTAT-TTGGGGG
gi|49203 : T---ATGAAACGAATTGTGTTTTATGGCA---TG-------AAA-----AT---------------------------------AT-------AATA-------GTACTGAGATT--AC-TTCCT-CAAGTT--------C-T----GAAACAAATATTTTAACTACAAACATGTTTCTTTTTGTACATTTTTAT----GTTC----GT-------TA--CA--T-----------GGTCAT-------CGCATTTATGTC----ATGTA--------------------ACATGTTAGTAATAATAGACCATTATCAAATGTTTATAA-----ATATT-ACAG--CA-TATTG---ATTTTTTTACTTTTT--TTTT----AAGATCAGTAAAATAATATACAAATCTAATAA-TCGTTGTAC-AA----
gi|49179 : A---CA-------AAA-----ATAA--------A---G------------------AT-----GAAATA--AATG-GTGTT----TT--AC-TTCAT-TAAGTTTAGTAA-TC-C----AAAATAGATATTCTAACTGCAAACATGTTTCATTTTGTGTATTATTAT----GTTT----GT-------TT--TA--T-----------AGACAT-------CGCATTGATATT----GTGTAAT-TAAC---T---T--AATACAAGTTCGTTATGATAAACCAATATCAAATGTTTATAA-----ATATT-ACAG--CA-TTTTG---A--ATTTAAACGTTT--TCCT----AAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATTTAATAATCC-TTGTAC-AA----AAA-A---AA-CAGAG-ACGAGACC---------C----CC--C-GCCCCGCACC---------------TGTCTG-TTTTT-CAAATCTCAAACA--ATGAAATA-----AGCCAGTGTTT-A--TTT-ATG-ACCTTAATTACCGACTA--CCCCTG-CCCGGATGCAAAACTTGTAACTTTAT-TGGGGGG
gi|49204 : aattaatcaatcaatcagtcttataattcttttagaatggctttgtacaagtttaaacattcatatagctgttttgttatatgacatgtatatagataag-TAAAG-GTACTGAGATT--AC-TTCAT-TTAGTTTAGTTA-TCCGTTCTGAAATAGATATTTTTACTGCAAACATGTTTCATTTTGTGTATTTTTATGTTTGTTTTATAGTCATCGCATTGATA--TCGTGTAATCAGAGACATAATAAGATGTATT-ATGTCTCTGGTGTTAT-TTAC---T---C--AATACAAGTTAGTTATGATAAACCAATATCAAATGTTTATAA-----ATATT-ACAC--TT-TATTG---A--ATTTAAACGTTT--TCCT----TAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATCTAAT-AGTC-ATGTAC-AACAACAAA-A---AA-CAGAG-C------C---------C----TT--T-CCCTCCCGCC---------------TGTCTGTTTTTT-CAAATCTCAAACA--ATGGAATA-----AGCCAGTGTTT-A--TTT-ATG-AC-----------ATTA--CCCCTG-CCCGGAGGCAAAAC------TTTTAT-TGGGGG
gi|49205 : ATTCATAAC----ATATAATGTAAC---TTTTA--AA-ACAAGTTAGTTAAGATAATCCATTATCAAATGTTTATTA-----ATATT-ACAG---A-TATTTTTTA--ATTTTAACGTTT--TCCT----AAGATCAGTAAAATAATATTCAAATCTAATAATCC-TTGTAC-AA----AAACA---AG-
gi|49206 : GTAAT-CCGT---T---C--AATACAAGTTAGTTATGATAAACCAATACCAAAGGTTTATAA-----ATATT-ACAG--CA-TATTG---A--ATTTAAA--TTTGAATCTTACCAAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAATCC-TTGTAC-AA----AAA-A---Aa
gi|49207 : AAGTTCGTTATGATAAACCAATATAAAATGTTTATAA-----ATATT-ACAG--CA-TATTG---A--AATTAAACGTTT--ATCT----AAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATCTGATAATCC-TTGTAC-AA----AAA-AAACAA-CAGAGAA------C---------C----CC--C-GCCCCGCGCC---------------TGTCTG-TATTT-CAAATCTCAAACA--ATGGAATA-----AGCCAGCGTTT-T--TTT-ATG-ACCTTAATTACCGACTA--TCCCTG-CCCGGAGGCAAAACTTGTAATTTTAT-TGGGGGG
gi|49173 : AAGTTCGTTATGATAAACCAATATAAAATGTTTATAA-----ATATT-ACAG--CA-TATTG---A--AATTAAACGTTT--ATCT----AAGATCAGTAA
gi|49208 : agaatgaatgaatgaatcaatcaatcttataattcttttagaatggctttgtacaagtttaaacgttcatatagctgttttgttatatgacgtgtatatagcttagacaaaaataaagataataactatgcaatgaatggtgttttgcggATCAAATGATTATAA-----ATTTT-ACAG--CA-TGTTG---A--ATTTAAATGTTT--TCCT----AAGATCAGTAATGTAATATGTAAATCTAATAATCC-TTGTAC-AA----AAA-A---AA-CAGAG-C------C---------C----CC--C-CCCCCCCCCCCCCCACACACCCTCCTGTCTG-TTTTTTCAAATCTCAAACA--ATGGAATA-----AGCCAGTG-TTTA--TTT-ATG-ACATTTATTACAGACTA--CCCCTG-CATGGAGGCAAAACTTATAA
gi|49209 : t-----ATATTCATAA--CA-TATTG---A--ATTTAAACGTTT--ATCT----AAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATGTAATAATCC-TTGTAC-AA----AAA-A---AAACAGAG-A------C---------C----CC--CCGCCCCGCGCC---------------TGTCTG-TTTTT-CAAATCTCAAACA--ATGGAATA-----AGCATGCG-TT-T--TTTTATG-ACCTTAATTACCGACTA--CCCCTG-CCCGGAGGCGAAACTTGTAATTTTAT-TGAGGGG
gi|49210 : A----AAA-A---AA-CAGAGCA------T---------C----CCTCC-GCCCCA-ACC---------------AATCTG-TGTTT-CAAGTCTCAAACA--ATGCGATA-----AGCCAGTG-TT-G--TTT-ATG-AACTTAATTACC--CCATTCCCCTGCCCCGGAGGCAAAACTTGTAATTTTAT-TGGGGG
gi|49211 : ------C---------C----CC--C-CCCCCCCCCC---------------TGTCTG-TGTTT-CAAGTCTCAAACA--ATGCGATA-----AGCCAGTG-TC-A--TTT-ATG-AACTTAATTACCCCCTA--CCCCTGCCCCGGAGGCAAAACTTGTACTTTTAT-TGGGGG
gi|49212 : CCCCGCC---------------TGTCTG-TGTTT-CAGGTCTCAAACATAATGGGATATTTAAAGCGAGTA-TTTA--TTT-ATT-ACCTTAATTACTCCCTA--CCCCTGCCCCGGGGGCAAAACTTGCAATTTAAT-TGGGGG
gi|49213 : ccttTTTT-TAATTCT-AAAC----TTGATTATTTGCAGCCAGTG-TT-T--TTTTATG-ACCTTAACTATCGACTT--TCCCTG-CCCGGAGGCAAAACTTGTAATTTTAT-TGGGGG
gi|49188 : T-CAAGTCTCAAACA--ATGCGATA-----AGCCAGTG-TC-A--TTT-ATG-AACTTAGTTACCCCCTA--CCCCTGCCCCGGAGGCAAAACTTGTACTTTTATATGGGG
gi|49214 : tcttataattcttttagaatggctatgttaaagtttaaacgttcatgtataatttatgttttgttatatgatgtgtagatgagacgaaaagaaagataatacctaggaaatgaatggtgttttgtggcacgaaaatataattatttaaagaaatataatggtactgagaatacttaaagtttgataatccgaaataaatattttaactgcaaacatgtttcatttagtgcatgtttatgttcggttttcagtaatcgcatagatatcgtgtaattaacttttaaaacaagttagttaagataatccaatgtttattaaattttaacgttctcctaagatcagtgaaataatattcaaatctaataatccT-A--TCT-ATCTACCTTAATTACCCCCTA--CCTCTGTCCCGGAGGCAAAACTTGTAATTTTAT-TGGGGG
Alignments
lowQualScore : 22222222222 1111111111111111111111111111111 11111 111111111111 1111111111111 111111 1111111111111111111 22222222 111111111111111 1 2
lowQualScore : 4444 2222 11 22 222 1 00000000000 888 444 1 222 1 222 2222 11 33333 5555 22 1 11 888 555555555 22 2 1 333 6666666 55555 7777777777777777777777777777777 2 1 2 22 2 2 55555 11111 0 444444444444 2 3333333333333 0 444 1 2 8888888 5555 2 222222 1 1 3 1 44444 1 555 333 22 0 4444 6 4444 6666666666666666666 00000000 33 0 0 333333333333333 2 1 2 22 99999 7 1 22 1 1 66 22 0 2
lowQualScore : .... .... .. .. ... . ........... ... ... . ... . ... .... .. ..... .... .. . .. ... ......... .. . . ... ....... ..... ............................... . . . .. . . ..... ..... . ............ . ............. . ... . . ....... .... . ...... . . . . ..... . ... ... .. . .... . .... ................... ........ .. . . ............... . . . .. ..... . . .. . . .. .. . .
lowQualScore : 7777 7777 88 33 222 2 33333333333 555 222 2 111 2 111 6666 77 33333 5555 99 2 77 888 555555555 99 1 0 777 8888888 33333 2222222222222222222222222222222 1 8 1 99 1 1 33333 88888 1 222222222222 5 8888888888888 6 444 0 5 1111111 0000 2 444444 0 0 1 7 88888 9 222 333 66 6 0000 7 5555 3333333333333333333 77777777 22 2 6 999999999999999 2 2 0 88 55555 1 9 66 9 9 88 66 5 0
consensus : AGAATGAATGAATCAATCAATCAATC----TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTA-T---GTACAAGTT-TAAACGTTCATGTA-TA--------TGTT---T---TG-T---TA-T---AT----G--A----CGTGTAC---ATAGATGAGAC--GAAAAT-AA--AGATAATA--ACT---------ATGAAATGAATG--GTGTTTTG-CGGNA---CG-------AAA-----ATAA--------A---A--------TT--------ATTTAAAGAAATA-TAAAG-GTACTGAGATT--AC-TTCAT-TAAGTTTAGTAA-----TCCG-----AAATAGATATTCTAACTGCAAACATGTTTCATTTTGTGCATTN-----------TTAT-GT-------------TCGTTTTAT---AGNC-AT-------CGCATTGATATC----GTGTAAT-TAAC--TT--AATACAAGTTNGTTATGATAAACCAATATCAAATGTTTATAA-----ATATT-ACAGCA---TATTG---A--ATTTAAAC----GTTTTCCTAAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAATCCTTGTAC-AA----AAA---------------A---AACAGAG-A------CCCC--CGCCCCGCGCC---------------TGTCTG-TTTT-TCAAATCTCAAACA--ATGGAATA-----AGCCAGTGTTT-A--TTT-ATG-ACCTTAATTACCGACTA--CCCCTG-CCCGGAGGCAAAACTTGTAATTTTAT-TGGGGGG
Reference ( family-519 ) : AGAATGAATGAATCAATCAATCAATC----TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTA-T---GTACAAGTT-TAAACGTTCATGTA-NA--------TGTT---T---TG-T---TA-T---AT----G--A----CGTGTAC---ATAGATGAGAC--GAAAAT-AA--AGATAATA--ACT---------ATGAAATGAATG--GTGTTTTG-CGGNA---CG-------AAA-----ATAA--------A---A--------TT--------ATTTAAAGAAATA-TAAAG-GTACTGAGATT--AC-TTCAT-TAAGTTTAGTAA-----TCCG-----AAATAGATATTCTAACTGCAAACATGTTTCATTTTGTGCATTT-----------TTAT-GT-------------TCGTTTTAT---AGNC-AT-------CGCATTGATATC----GTGTAAT-TAAC--TN--AATACAAGTTNGTTATGATAAACCAATATCAAATGTTTATAA-----ATATT-ACAGCA---TATTG---A--ATTTAAAC----GTTTTCCTAAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAATCCTTGTAC-AA----AAA---------------A---AACAGAG-A------CCCC--CGCCCCGCGCC---------------TGTCTG-TTTT-TCAAATCTCAAACA--ATGGAATA-----AGCCAGTG-TT-A--TTT-ATG-ACCTTAATTACCGACTA--CCCCTGCCCCGGAGGCAAAACTTGTAATTTTAT-TGGGGGG
gi|49170 : AGAATGAATGAATCAATCAATCAATC----TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTT-T---GTACAAGTT-TAAACGTTCATATA-GA--------TGTT---T---TG-T---TA-T---AT----G--A----CGTTTAT---ATAGATTAGAC--AAAAAT-AA--AGATAATA--ACT---------ATGCAATGAATG--GTGTTTTG-CGGAA---CG-------AAA-----ATAA--------A---A--------TT--------ATTTAAAGAAATA-TAAAG-ATATTGAGATT--AC-TTCAT-TAAGTTTAGTAA-----TCGG-----AAATAGATATTCTAACTGCAAACATGTTTTATTTTGTGTATTA-----------TTAT-GT-------------TTGTTTTAT---AGAC-AT-------CGCATTGATATC----GTGTAAT-TAAC--TA--AATACAAGTTCGTTAAGATAAACAAACATAAAATGTTTATAA-----ATATT-ACAGTA---TATTG---A--ATTTAAAC----GTTTATCTAAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATCTTATAAGTCTTGTAC-AA----AAA---------------A---AGCAGAG-A------CCCC--CGCCCCGCGCC---------------TGTCTG-TTTT-TCAAATCTCAAACA--ATGGAATA-----AGCCTGCG-TT-A--TTT-ATG-ACCTTAATTACCGACTA--CCCCTG-CCCGGAGGCGAAACTTGTAATTTTAT-TGGGGGG
gi|49171 : AGAATGAATGAATCAATCAATCAATC----TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTT-T---GTACAAGTT-TAAACGTTCATATA-GC--------TGTT---T---TG-T---TA-T---AT----G--A----CGTGTAT---ATAACTTAGAC--AAAAAT-AA--AGATAATA--ACT---------ATGCAATGAATG--GTGTTTTG-CGGAA---CG-------AAA-----ATAA--------A---A--------AT--------ATTTAAAGAAATA-TAAAG-GTACTGAGATT--AC-TTCAT-TAAGTTTAGTAA-----TCCG-----AAATAGATATTCTAACTGCAAACATGTTTTATTTTGTGTATTA-----------TTAT-GT-------------TTGTTTTAT---AGAC-AT-------CCCACTGATATC----GTGTAAT-TAAC--TA--AAAACAAGTTCGTTATGATAAACCAATATAAAATGTTTATAA-----ATATT-ACAGCA---TATTG---A--ATTTAAAC----GTTTATCTAAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATCTAACAATCCTTGTACAAA----AAA---------------A---AACAGAG-AC-----CCCC--CGCCCCGCGCC---------------TGTCTG-TTTT-ACAAATCTCAAACA--ATGGAATA-----AGCCAGCG-TT-GTTTTT-TTT-ACCTTAATTAC--A--A--CTCCTG-CCCGGAGGCGAAACTTATAATAGTAA-GGGGGGG
gi|49172 : AGAATGAATGAATGAATCAATCAATC----TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTT-T---GTACAAGTT-AAAACGTTCATATA-GA--------TGTT---T---TG-T---TA-T---AT----G--A----CGTGTAT---ATAGATTAGAC--AAAAAT-AA--AGATAATA--ACT---------ATGAAATGAATG--GTGTTTTG-AGGG-----G-------AAA-----AAAA--------ATTAA--------TT--------ATTTAAAGAAATA-TGAAG-GTACTGAGATT--AC-TTCAT-TAAGTTTAGTAA-----TCCG-----AAATAGATATTCTAACTGCGAATATGTTTCATTTTGTGTATTA-----------TTAT-GT-------------TTGTTTTAT---AGAC-AT-------CGCATTTTTATC----GTGTAAT-TAAC--TT--AATACAAGTTCGATATGATCAACCAATATCAAATGTTTATAA-----ATATT-ACAGCA---TATTG---A--ATTTAAAC----GTTTTCCTAAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAATCCTTGTA----------------------------------------------------------CGCC---------------TGTCTG-TTTT-TCAAATCTCAAACA--ATGGAATA-----AGCCAGTGTTT-A--TTT-ATG-ACCTTAATCACCGACTA--CCCCTG-CCCGGAGGCAAAACTTGTAATTTTAT-TGAGGGG
gi|49173 : AGAATGAATGAATGAATCAATCAATC----TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTT-T---GTACAAGTT-TAAACGTTCATATA-GC--------TGTT---T---TG-T---TA-T---AT----G--A----CGTGTAT---ATAGCTTAGAC--AAAAAT-AA--AGATAATA--ACT---------ATGCAATGAATG--GTGTTTTG-CGGAAGTTCGTTATGATAAACCAATATAA--------A---A---------T--------GTTT--ATAAATATTACAGCATATTGAAATTAAACGTTTATCTAAGATCAGTAA-----
gi|49174 : GAATGAATCAATCAATCAATCAATCAAACTTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTT-T---GTACAAGTT-TAAACGTTCATATA-GC--------TGTT---T---TG-T---TA-T---AT----G--A----CGTGTAT---ATAGATTAGAC--AAAAAT-AA--AGATAATA--ACT---------CTGCAATGAATG--GTGTTTTG-CGGTA---CG-------AAA-----ATAA--------A---A--------TT--------ATTTAAAGAAATA-TAAAG-ATATTGAGATT--AC-TTCAT-TAAGGTTAGTTA-----TCCG-----AAATAGATATTCTAACTGCAAACATGTTTTATTCTGTGTATTA-----------TTAT-GT-------------TTGTT--AT---AGAC-AT-------CGCATTGATATC----GTGTAAT-TAAC--TA--AATACAAGTTCGTTATGATAAACCAATATAAAATGTTTATAA-----ATATT-ACAGCA---TATTG---A--ATTTAAAC----GTTTATCTAAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAATTCTTGTAC-AA----AAA---------------A---GGAAGAG-A------CCCC--CGCCCCGCGCC---------------TGTCTG-TTTT-TCAAATCTCAAACA--ATGGAATA-----AACTTGCG-TT-A--TTT-ATG-ACCTTAATTACCGACTA--CCCCTG-CCCGGAGTCGAAACTTGTAATTTTAT-TTGGGGG
gi|49175 : GAATCAATCAATCAATCAATCAATC----TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTC-T---GTACAAGTT-TAAACGTTCATGTA-GA--------TGTT---T---TG-T---TA-T---AT----G--A----CGTGTAT---ATAGATTAGAC--AAAACT-AA--AGATAATA--ACT---------ATGAAATGAATG--TTGTTTTG-CGGAA---CG-------AAA-----ATAAAATTATTTA---A--------TT--------ATTTAAAGAAATA-TAAAG-GTACTGAGATT--AC-TTCAT-TAAGTTTCATAGTTCGTTCTG-----AAATAGATATTCTAACTGCAAACATGTTTCATTTTGTGTATTT-----------TTAT-GT-------------TTGTTTTAT---AGTC-AT-------CGCATTGATATC----GTGTTAT-TAAC--TC--AAT----GTTT------ATAAA--------------------------TATT-ACAGCA---TATTG---A--ATTTAAAC----GTTTTCCTAAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAATC
gi|49176 : GAATGAATGAATCAATCAATGAATCAA--TCATAAAAAAT--T--TTTAGAATGACTT-T---GTACAAGTT-TAAACGTTCATATA-GA--------TGTT---T---TG-A---TA-T---AT----G--A----CGTGTAT---ATAGATTAGAC--AAAAAT-AA--AGATAATA--ACT---------ATGAAATGAATG--GTGTTTGG-CAGAA---CG-------AAA-----ATAAAATTATTTA---A--------TT--------ATTTAAAGAAATA-TAAAG-GTACTGAGATC--AC-TTCAT-TAAGTTTAGTAA-----TCCG-----
gi|49177 : AAAGAATGAATGAATCAATCAATC----TTAT----AATTCT--TTTAGAATCGCTT-T---GTACAAGTT---------CATATA-GC--------TGTT---T---TG-T---TA-T---AT----G--A----CGTGTAT---ATAGATTAGAC--AAAAAT-AA--AGATAATT--ACT---------ATGAAATGAATG--GTGTTTTG-CGGAA---CG-------AAA-----ATAA--------A---A--------TTATTTAATTATTTAAAGAAATA-TAAAG-GTACTGCGATT--AC-TTCAT-TAAGTGTAGTAA-----TCCG-----AAATAGATATTCTAACTGCAAACATGTTTCATTTTGTGTATTA-----------TTAT-GT-------------TTGTTTTAT---AGAC-AT-------CGCATTGATATC----GTGTAAT-TAAC--TA--AATACAAGTTC-----GATAAACCAATATCAAATGTTTATAA-----ATATT-ACAGCA---TATTG---A--ATTTAAAC----GTTTTCCTAAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATCTAAAAATCCTTGTCCAAA----AAA---------------A---AACAGAG-AC-----CCCC--CGCCCCGCGCC---------------TGTCTG-TTTT-TCAAATCTCAAACA--ATGGAATA-----AGCCAGTGTTT-A--TTT-ATG-ACCCTAATTACCGACTA--CTCCTG-CCCGGAGGCAAAACTTGTAATTTTAT-TGGGGGG
gi|49178 : AATCAATCAATCAATCAATCAATC----TTAT----AATTCT--TTTAAAATGGCTT-T---GTACAAGTT-TAAACGTTGATGTA-GA--------TGTT---T---TG-T---TA-T---AT----G--A----CGTGTAT---ATAAATTAGAC--AAAAAT-AA--AGATAATA--ACT---------ATGAAATGAATG--GTGTTTTG-CAGAA---CA-------AAA-----TTAA--------A---A--------TT--------ATTAAAAGAAATA-TAAAG-GTACTGAGATT--AC-TTCAT-TAAGTTTAGTAA-----TC
gi|49179 : AATTAATCAATCAATCAGTC----TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTT-T---GTACAAGTT-TAAACATTCATATA-GC--------TGTT---T---TG-T---TA-T---AT----G--A----CATGTAT---ATAGATAAGAC--AAAAAT-AA--AG--------------------ATGAAATAAATG--GTGTTTTA-C
gi|49179 : A---CA-------AAA-----ATAA--------A---G------------------AT-----GAAATA--AATG-GTGTT----TT--AC-TTCAT-TAAGTTTAGTAA-----TCCA-----AAATAGATATTCTAACTGCAAACATGTTTCATTTTGTGTATTA-----------TTAT-GT-------------TTGTTTTAT---AGAC-AT-------CGCATTGATATT----GTGTAAT-TAAC--TT--AATACAAGTTCGTTATGATAAACCAATATCAAATGTTTATAA-----ATATT-ACAGCA---TTTTG---A--ATTTAAAC----GTTTTCCTAAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATTTAATAATCCTTGTAC-AA----AAA---------------A---AACAGAG-ACGAGACCCCC--CGCCCCGCACC---------------TGTCTG-TTTT-TCAAATCTCAAACA--ATGAAATA-----AGCCAGTGTTT-A--TTT-ATG-ACCTTAATTACCGACTA--CCCCTG-CCCGGATGCAAAACTTGTAACTTTAT-TGGGGGGttcattaagtttagtaatccaaaatagatattctaactgcaaacatgtttcattttgtgtattattatgtttgttttatagacatcgcattgatattgtgtaattaacttaatacaagttcgttatgataaaccaatatcaaatgtttataaatattacagcattttgaatttaaacgttttcctaagatcagtaaagtaatatgtaaatttaataatccttgtacaaaaaaaacagagacgagaccccccgccccgcacctgtctgtttttcaaatctcaaacaatgaaataagccagtgtttatttatgaccttaattaccgactacccctgcccggatgcaaaacttgtaactttattgggggg
gi|49180 : aattaatcaatcaatcagtcttataattcttttagaatggctttgtacaagtttaaacattcatatagctgttttgttatatgacatgtatatagataagAATTTATC----ATAT----AATTCT--TTTAGAATGTCTA-T---GTAGAAGTT-TAAACGTTCATGTA-TA--------TGTT---TTAATA-T---TA-T---GT----G--A----TGTGTAC---ATAGATGAGACGAGAAAAA-AA--AGATAATA--CTT---------AT
gi|49181 : AATGAATC----TTAT----AATTCT--TTTAGAGTGGCTA-TGCCGTACCATTT-TAAAATCACATGAATAA--------TATT---T---TA-T---TT-T---GT----G--T----TATATAC---CTTAATGAGAT--GAAAAT-AA--AGATAGTATTACT---------AT
gi|49182 : ATC----TTAT----AATTCT--TTTAGAAAGGCTA-T---GTACAAGTT-TAAACGTTCATGTA-TA--------TGTT---T---TG-T---TA-T---AT----G--A----TGTATATGTTATAGATGAGAT--GAAAAT-AA--AAATAATA--CCT---------ATAAAATGAATG--ATGTTTTG-CAGCA---CG-------AAA-----ATAA--------A------------TT--------ATTTAAAGAAATA-TAATG-GTACTGAGATT--AC-T--A---AAGTTTGATAA-----TCCGTTCTGAAATAAATATTTTAACTGCAAACATATTTCATTTTGTGCATGT-----------TTGT-GT-------------TCGTTTTAT---AGTC-AT-------CACATTGATATC----GTGTATT-TAAC--TT--AATACAAGTTAGTTATGCTAGACCATTATCAAATGTTAATAAGTATTACATT-ACAGCA---TATTG---A--ATTTAAAC----GTTTTCCTAAGATCAGTAAAATAATATGCAAATCTAATAACTCTTGTA
gi|49183 : TC----TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTA-T---GTACAAGTT-TAAACGTTCATGTA-TAATTTA---TGTT---T---TG-T---TA-T---AA----G--A----TGTGTA-------GATGAGAC--GAAAAG-AA--AGATAATA--CCT---------ATGAAATGAATG--GTGTTTTG-CGGCA---CG-------AAA-----ATAT--------A---A--------TT--------ATTTAAAGAAATA-TAATG-GTACTGAGAAT--AC-TTCCT-AAAGTTTGATAA-----TCCG-----AAATAAATATTTTAACTGCAAACATGTTTCATTTAGTGCATGT-----------TTAT-GT-------------TCGTTTTTC---AGTC-AT-------CGCATAGATATC----GTGTAAT-TAAC--TTTTAAAACAAGTTCGTTAAGATAATCCAATATCAAATGTTTAT-----------------CA-----------A--ATTTTAAC----GTTTTCCTAAGATCAGTGAAATAATATTCAAATCTAATAATCCTTGTAC-AA----A-----------------------TATCG-C------CCCC--CACCCACCCCC---------------TGTCTG-TGTT-TCAAGTCTCAAACA--ATGCGATA-----AGCCAGTG-TC-A--TTT-ATG-AACTTAATTACCCCCTA--CCCCTGCCCCGGAGGCAAAACTTGTTCTTTTAT-TGGGGG
gi|49184 : TC----TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTC-T---GTACAA--------CGTTCATGTA-TAATTTA---TATT---T---TG-T---TA-T---AT----G--A----TGTG------A-AGATGAGAC--GAAAAG-AA--AGATAATA--CCT-----------GAAATGAATG--GTGTTTTG-CGGCA---CG-------AAA-----ATAA--------A---ACTATCTAATT--------ATTTAAAAAAATA-TAATG-GTACTGAGATT--AC-TTCCT-AAAGTTTGATAA-----TCCC-----AAATAGATATT-TAACTGCAAACATGTTTCATTTTATGCATGT-----------TTAT-GT-------------TCGTTTTTT---AGTC-AT-------TGCATAGATACC----GTTTAAT-TAAC--TTTTAATACAAGTTAGTTAAGATAAACCATTATCAAATGTTTATAG-----ATATT-ACAGAA---TTTTT---A--ATTTAAAC----GTTTTCCTAAGATCAGTAAAATAATATTCAAATCTGATAATCCTTGTAC-AA----AAAAACAAAAACAAAAAGA---AACAAAGCA------CACC--CTCCC----AC---------------TGTCTG-TGTT-TCAGGTCTCAAACA--ATGCGATA-----AACCAGTGTTT-A--TTT-ATG-AACTTAATTACC-CCTA--CCCCTGCCCCGGAGGTAAAACTCGTAATTTTAT-TGGGG
gi|49185 : TC----TTAT----AATTCT--TTTAGAATGACTA-T---GCACAAGTT-TAAACGTTCATGTA-TAATTTA---TGTT---T---TG-T---TA-T---AT----G--A----CGTGTA-------GATGAGAC--AAAAAG-AA--AAATAATA--CCT---------ATGAAATGAATG--GTGTTTTG-CGGCA---CG-------AAA-----ATAT--------A---A--------TT--------TTTTAAAGAAATA-TAATG-GTACTGAGAAT--AC-TTCCT-AAAGTTTGATAA-----TCCG-----AAATAAATATTTTAACTGCAAACATGTTTCATCTAGTGCATGT-----------TTAT-TT-------------TCGTTTC-T---AATTAAT-------CGCATGGATATC----ATGTAAT-TCACTTTT--AAAACAAGTTAGTTAAGATAATCCATTATCAAATGTTTATAA-----ATATT-ACAGAAT--TTTTA---A--ATTT-AAC----GTTTTCCTAAGATCAGTGAAATAATATTCAAATCTAATAATCCTTGTAC-AA----AAA---------------------------A------CCCC--CA----GAG------------------------------CAAA---CAA------TGCGATA-----AGCCAGTG-TC-A--TTT-ATG-AACTTAATTACCCCATA--CCCCTGCCCCGGAGGCAAAACTTGTAATTTTAT-TGGGGG
gi|49186 : TC----TTAT----CATTCT--TTTAGAATGGCTA-T---GTACATGTT-TAAACGTTCATGTA-TAATTTA---TGTT---T---TG-T---TA-T---AT----G--A----TGTGTA-------GATGAGAC--GAAAAG-AA--AGATAATA--CCT---------ATGACATGAATG--GTGTTTTG-CGGCA---CG-------AAA-----ATAT--------A---A--------TT--------TTTTAAAGAAATA-TAATG-GTACTGAGAAT--AC-TTCCT-AAAGTTTGATAA-----TCCG-----AAATAAATATTTTAACTGCAAACATGTTTCATTAAGTGCATGT-----------TTAT-TT-------------TCGTTTTTT---AGTC-AT-------CGCATAGTTATC----GTGTAAT-TAACTTTT--AAAACAAGTTAGTTAAGATAATCCGTTATCAAATGTTTATAA-----ATATT-ACAG-ATTTTTTTT---A--ATTT-AAC----GTTTTCCTAAGATCAGTGAAATAATATTAAAATCTAATAATCGTTGTAC-AA----AAA---------------A-----------A------CCCC--CA----GAG------------------------------CAAA---CAATCA-------ATA-----AGCCAGTG-TC-A--TTT-ATG-AACTTGATTACTCCCTA--CCCCTGACGCGGAGGCAAAACATGTAATTTTAT-TGGGGG
gi|49187 : TC----TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTA-T---GTACAAGTT-TAAACGTTCATGTA-TA--------TGTT---T---TA-T---TATT---AT----GTAA----TATGTAC---ATAGATGAGAA--GAAAAT-AA--AGATAAT---ACT---------G-GAAA-GAA
gi|49188 : TC----TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTA-T---GTTAAAGTT-TAAACGTTCATGTA-TAATTTA---TGTT---T---TG-T---TA-T---AT----G--A----TGTGTA-------GATGAGAC--GAAAAG-AA--AGATAATA--CCT---------AGGAAATGAATG--GTGTTTTG-TGGCA---CG-------AAA-----ATAT--------A---A--------TT--------ATTTAAAGAAATA-TAATG-GTACTGAGAAT--AC-TT-A---AAGTTTGATAA-----TCCG-----AAATAAATATTTTAACTGCAAACATGTTTCATTTAGTGCATGT-----------TTAT-GT-------------TCGGTTTTC---AGTA-AT-------CGCATAGATATC----GTGTAAT-TAACTTTT--AAAACAAGTTAGTTAAGATA-------ATCCAATGTT-------------------------TATTA---A--ATTTTAAC----GTTCTCCTAAGATCAGTGAAATAATATTCAAATCTAATAATCCT
gi|49188 : -TCAAGTCTCAAACA--ATGCGATA-----AGCCAGTG-TC-A--TTT-ATG-AACTTAGTTACCCCCTA--CCCCTGCCCCGGAGGCAAAACTTGTACTTTTATATGGGGcaagtctcaaacaatgcgataagccagtgtcatttatgaacttagttaccccctacccctgccccggaggcaaaacttgtacttttatatgggg
gi|49189 : tcttataattcttttagaatggctatgttaaagtttaaacgttcatgtataatttatgttttgttatatgatgtgtagatgagacgaaaagaaagataatacctaggaaatgaatggtgttttgtggcacgaaaatataattatttaaagaaatataatggtactgagaatacttaaagtttgataatccgaaataaatattttaactgcaaacatgtttcatttagtgcatgtttatgttcggttttcagtaatcgcatagatatcgtgtaattaacttttaaaacaagttagttaagataatccaatgtttattaaattttaacgttctcctaagatcagtgaaataatattcaaatctaataatccTC----TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTA-T---GTACAATTT-TAAACGTTCATGTA-TA--------TGTTTGAT---TA-T---TA-T---GT----G--A----TAAGTAC---ATAGATGAGAC--GAAAAT-AA--AGATAATACTACT---------ACGTAAT
gi|49190 : TC----TTAT----TATTCT--TTTAGAATGGCTA-T---GTACAAGTT-TAAACGTTCATGTA-TAAATTATGGTGTA---T---TA-T---TA-T---GT----G--A----TATGCAC---ATAGATGAGAC--GAAAAT-AA--AGATAAT---ACT---------ATAAA
gi|49191 : TC----TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGTTA-T---GTACAATTT-TAAATGTTCATGTA-TA--------TGTTTTAT---TA-T---TA-T---GT----G--A----TAAGTAC---ATAGATGAGAC--AAAAAT-AA--AGATAATACTACT---------A
gi|49192 : TC----TTAT----AATTCT--TTTAGAATGATTA-T---GTACAATTT-TAAACGTTCATATA-TA--------TGTTTTAT---TA-T---TA-T---GT----G--A----TCAGTAC---ATAGATGAGAC--GAAAAT-AA--AGATAAT---ACT---------A
gi|49193 : TC----TTCT----AATTCT--TTAAGAATGGCTT-T---GTTCAATTT-TAAACGTTCATGTA-TA--------TGTT---T---TA-TTAGTA-T---AT----G--A----AGTGTAC---ATAGTTGAGAC--GAAAAT-AA--AGATAGT---ACTGAGTAAATAATGAAAAGAATACCATGTCTGGTCTGAA----G-------AAA-----ATA
gi|49194 : TC----TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTA-T---GTACAATTT-TAAACGTCCATGTA-TA--------TGTTTGAT---TA-T---TA-T---GT----G--A----TTAGTAC---AAAGATGAGAC--GAAAAT-AA--AGATAATACTAAT---------ACAAAAT
gi|49195 : TC----TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTA-T---ATACAAGTT-GAAAAGTTCATGTC-AC--------TGTT---T---TA-T---TA-T---AC----G--A----AATGTAC---ATAGATGAGAC--
gi|49196 : TC----TTAT----ATTTCT--TTTAGAATGGCTG-T---GTGCAAGTT-TAAACGTTC-T--------------TGTT---TCGGTG-T---TA-TGAAAT----G--A----TGTGTAC---AAATATGAGAC--GAAAAT-AA--AGGTAACA--
gi|49197 : TC----TTAT----AATTCT--TTTAGAATTGCTA-T---GTGTGCGTT-GAAACGTCCACGTA-TC--------TGTT---T---TA-T---TA-T---AT----G--A----TATATAG---ATAGATGATAC--GAAACT-AAATAGATActctacttaaatacattgaaaggcgtgaaagagaatataa
gi|49198 : TC----TTGT----AATTCTAATTTAGAATGGCTA-T---GTAC--GTTGTATAGATTAGTGT---A--------TGTT---T---TATT---TA-T---AT----G-------TTTGTAC---ATAGATGAGAC--TTTAAT-AA--AGA-AATA--AAG---------ATGAA
gi|49199 : ----TTAT----AATTCT--TTCAAAATGGCTA-T---GGTCAAGTT-TAAACATTCATGTA-AA--------TGTT---T---TA-T---TA-T---AT----G--T----TATGTAC---ATAGATGAGAG--GAAAAT-AA--AAATAA
gi|49200 : ----AATTCT--TTTAGAATGGCTA-T---GAACAA---------GTTCATGTA-TA--------TGTT---T---TA-T---TA-T---AC----G--ATAATTATGTAC---ATAGACAAGAC----AAATAAA--AGACAAT---ACT---------A
gi|49201 : TTATAATGACCAAT---GTACAAGTT-TAAACGTTCCTGTA-TA--------TG---------TA-T---TA-T---ATACTGG--A----TATGTAC---ATAGATGAGACA-AAAAAT-AA--AG
gi|49202 : T---T---TG-A---TA-----AT----G--A----CGTGTAT---ATAGCTTAGAC--AAAAAT-AA--AGATAATA--ACT---------ATGCAATGAATG--GTGTTTTG-CAGAA---CG-------AAT-----ATAA--------A---A--------TT--------ATTTAAAGAAATA-TAAAG-GTACTGAAATT--AC-TTCAT-TAAGTTTAGTAA-----TCCG-----AAATAGATATTCTAACTGCAAACATGTTTTATTTTGTGTATTA-----------TTAT-GT-------------TTGTTTTAT---AGAC-AT-------CGCATTGATATC----GTGTAAT-TAAC--TA--AATACAAGTTTGTTATGATAAACCAATATAAAATGTTTATAA-----ATATT-ACAGCA---TATTG---A--ATTTAAAC----GTTTATCTAAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAATCCTTGTAC-AA----AAA---------------G---AACAGAG-AC-----CCCC--CGCCCCGCGCC---------------TGTCTG-TTTT-TCAAATCTCAAACA--AAGGAATA-----AGCCAGCGTTT-T--TTT-ATG-ACCTTAATTACCGACTA--CCCCTG-CCCGGAGGCGAAACTTGTTATTTTAT-TTGGGGG
gi|49203 : T---------ATGAAACGAATT--GTGTTTTA-TGGCA---TG-------AAA-----ATA-----------------------------------TAA--------TA----GTACTGAGATT--AC-TTCCT-CAAGTT------------CTG-----AAACAAATATTTTAACTACAAACATGTTTCTTTTTGTACATTT-----------TTAT-GT-------------TCGTTACAT---GGTC-AT-------CGCATTTATGTC----ATGTA----------------ACATGTTAGTAATAATAGACCATTATCAAATGTTTATAA-----ATATT-ACAGCA---TATTG---ATTTTTTTACT----TTTTTTTTAAGATCAGTAAAATAATATACAAATCTAATAATCGTTGTAC-AA----
gi|49204 : -TAAAG-GTACTGAGATT--AC-TTCAT-TTAGTTTAGTTA-----TCCGTTCTGAAATAGATATTTTTACTGCAAACATGTTTCATTTTGTGTATTTTTATGTTTGTTTTATAGTCATCGCATTGATATCGTGTAATCAGAGAC-ATAATAAGATGTATT-ATGTCTCTGGTGTTAT-TTAC--TC--AATACAAGTTAGTTATGATAAACCAATATCAAATGTTTATAA-----ATATT-ACACTT---TATTG---A--ATTTAAAC----GTTTTCCTTAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAGTCA-TGTAC-AACAACAAA---------------A---AACAGAG-C------CCTT--TCCCTCCCGCC---------------TGTCTGTTTTT-TCAAATCTCAAACA--ATGGAATA-----AGCCAGTGTTT-A--TTT-ATG-AC-----------ATTA--CCCCTG-CCCGGAGGCAAAAC------TTTTAT-TGGGGG
gi|49205 : ATTCATAAC----ATATAATGTAAC--TTTTAAAACAAGTTAGTTAAGATAATCCATTATCAAATGTTTATTA-----ATATT-ACAG-A---TATTTTTTA--ATTTTAAC----GTTTTCCTAAGATCAGTAAAATAATATTCAAATCTAATAATCCTTGTAC-AA----AAA---------------C---AA
gi|49206 : GTAAT-CCGT--TC--AATACAAGTTAGTTATGATAAACCAATACCAAAGGTTTATAA-----ATATT-ACAGCA---TATTG---A--ATTTAAATTTGAATCTTACCAAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAATCCTTGTAC-AA----AAA---------------A---Aga
gi|49207 : AAGTTCGTTATGATAAACCAATATAAAATGTTTATAA-----ATATT-ACAGCA---TATTG---A--AATTAAAC----GTTTATCTAAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATCTGATAATCCTTGTAC-AA----AAA---------------AAACAACAGAGAA------CCCC--CGCCCCGCGCC---------------TGTCTG-TATT-TCAAATCTCAAACA--ATGGAATA-----AGCCAGCGTTT-T--TTT-ATG-ACCTTAATTACCGACTA--TCCCTG-CCCGGAGGCAAAACTTGTAATTTTAT-TGGGGGG
gi|49208 : TATCAAATGATTATAA-----ATTTT-ACAGCA---TGTTG---A--ATTTAAAT----GTTTTCCTAAGATCAGTAATGTAATATGTAAATCTAATAATCCTTGTAC-AA----AAA---------------A---AACAGAG-C------CCCC--CCCCCCCCCCCCCCCACACACCCTCCTGTCTG-TTTTTTCAAATCTCAAACA--ATGGAATA-----AGCCAGTGTTT-A--TTT-ATG-ACATTTATTACAGACTA--CCCCTG-CATGGAGGCAAAACTTATAA
gi|49209 : -----ATATTCATAACA---TATTG---A--ATTTAAAC----GTTTATCTAAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATGTAATAATCCTTGTACAAA----AAA---------------A---AACAGAG-AC-----CCCC--CGCCCCGCGCC---------------TGTCTG-TTTT-TCAAATCTCAAACA--ATGGAATA-----AGCATGCGTTT-T--TTT-ATG-ACCTTAATTACCGACTA--CCCCTG-CCCGGAGGCGAAACTTGTAATTTTAT-TGAGGGG
gi|49210 : A----AAA---------------A---AACAGAGCA------TCCCTCCGCCCCA-ACC---------------AATCTG-TGTT-TCAAGTCTCAAACA--ATGCGATA-----AGCCAGTG-TT-G--TTT-ATG-AACTTAATTACC--CCATTCCCCTGCCCCGGAGGCAAAACTTGTAATTTTAT-TGGGGG
gi|49211 : ------CCCC--CCCCCCCCCCC---------------TGTCTG-TGTT-TCAAGTCTCAAACA--ATGCGATA-----AGCCAGTG-TC-A--TTT-ATG-AACTTAATTACCCCCTA--CCCCTGCCCCGGAGGCAAAACTTGTACTTTTAT-TGGGGG
gi|49212 : CCCCGCC---------------TGTCTG-TGTT-TCAGGTCTCAAACATAATGGGATATTTAAAGCGAGTA-TTTA--TTT-ATT-ACCTTAATTACTCCCTA--CCCCTGCCCCGGGGGCAAAACTTGCAATTTAAT-TGGGGG
gi|49213 : ccttTTT-TTAATTCT-AAAC----TTGATTATTTGCAGCCAGTG-TT-T--TTTTATG-ACCTTAACTATCGACTT--TCCCTG-CCCGGAGGCAAAACTTGTAATTTTAT-TGGGGG
gi|49214 : GGAATA-----AAAGAAT--CT-A--TCT-ATCTACCTTAATTACCCCCTA--CCTCTGTCCCGGAGGCAAAACTTGTAATTTTAT-TGGGGG
Alignments
lowQualScore : 22222222 1111111111111111111111111111111 11111 1111111111111 1111111111111 111111 111111111111111 11111111 111111111111111 1
lowQualScore : 2222 11 2222 11 22 222 1 11 00000000 888 222 1 222 1 2222 11 33333 5555 22 1 11 888 555555555 22 2 1 333 6666666 55555 7777777777777777777777777777777 2 1 2 22 2 2 55555 11111 0 2222222222222 2 3333333333333 0 444 1 2 8888888 5555 2 222222 1 1 3 1 44444 1 555 333 22 0 4444 4 4444 333333333333333 2 444 88888888 33 22 0 333333333333333 2 1 2 22 99999 5 1 1 66 22 1 5 2
lowQualScore : .... .. .... .. .. ... . .. ........ ... ... . ... . .... .. ..... .... .. . .. ... ......... .. . . ... ....... ..... ............................... . . . .. . . ..... ..... . ............. . ............. . ... . . ....... .... . ...... . . . . ..... . ... ... .. . .... . .... ............... . ... ........ .. .. . ............... . . . .. ..... . . . .. .. . . .
lowQualScore : 9999 88 7777 88 33 222 2 44 22222222 555 111 2 111 2 6666 77 33333 5555 99 2 77 888 555555555 99 1 0 777 8888888 33333 2222222222222222222222222222222 1 8 1 99 1 1 33333 88888 1 9999999999999 5 8888888888888 6 444 0 5 1111111 0000 2 777777 0 0 1 7 88888 9 222 333 66 6 0000 4 5555 999999999999999 4 444 22222222 22 55 6 999999999999999 2 2 0 88 55555 0 9 9 88 66 4 7 0
consensus : AGAATGAATGAATCAATCAATCAAT----C--TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTA-T---GTACAAGTT-TAAACGTTCATGTAT-A--------TGTT---T---TG-T---TA-TAT----G--A----CGTGTAC---ATAGATGAGAC--GAAAAT-AA--AGATAATA--ACT---------ATGAAATGAATG--GTGTTTTG-CGGNA---CG-------AAA-----ATAA--------A---A--------TT--------ATTTAAAGAAATA-TAAAG-GTACTGAGATT--AC-TTCAT-TAAGTTTAGTAA-----TCCG-----AAATAGATATTCTAACTGCAAACATGTTTCATTTTGTGCAT-----------TNTTAT-GT-------------TCGTTTTAT---AGNC-AT-------CGCATTGATATC----GTGTAAT-TAAC--TT--AATACAAGTTNGTTATGATAAACCAATATCAAATGTTTATAA-----ATATT-ACAGCA---TATTG---A--ATTTAAAC----GTTTTCCTAAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAATCCTTGTAC-AA----AAA---------------AAA-CA---GAG-A------CCCC--C-GCCCCGCGCC---------------TGTCTG-TTTT-TCAAATCTCAAACA--ATGGAATA-----AGCCAGCGTT-TATTTATG-ACCTTAATTACCGACTA--CCCCTG-CCC-GGAGGCAAAACTTGTAATTTTAT-TGGGGGG
Reference ( family-519 ) : AGAATGAATGAATCAATCAATCAAT----C--TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTA-T---GTACAAGTT-TAAACGTTCATGTAT-A--------TGTT---T---TG-T---TA-TAT----G--A----CGTGTAC---ATAGATGAGAC--GAAAAT-AA--AGATAATA--ACT---------ATGAAATGAATG--GTGTTTTG-CGGNA---CG-------AAA-----ATAA--------A---A--------TT--------ATTTAAAGAAATA-TAAAG-GTACTGAGATT--AC-TTCAT-TAAGTTTAGTAA-----TCCG-----AAATAGATATTCTAACTGCAAACATGTTTCATTTTGTGCAT-----------TNTTAT-GT-------------TCGTTTTAT---AGNC-AT-------CGCATTGATATC----GTGTAAT-TAAC--TT--AATACAAGTTNGTTATGATAAACCAATATCAAATGTTTATAA-----ATATT-ACAGCA---TATTG---A--ATTTAAAC----GTTTTCCTAAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAATCCTTGTAC-AA----AAA---------------AAA-CA---GAG-A------CCCC--C-GCCCCGCGCC---------------TGTCTG-TTTT-TCAAATCTCAAACA--ATGGAATA-----AGCCAGTGTT-TATTTATG-ACCTTAATTACCGACTA--CCCCTG-CCC-GGAGGCAAAACTTGTAATTTTAT-TGGGGGG
gi|49170 : AGAATGAATGAATCAATCAATCAAT----C--TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTT-T---GTACAAGTT-TAAACGTTCATATAG-A--------TGTT---T---TG-T---TA-TAT----G--A----CGTTTAT---ATAGATTAGAC--AAAAAT-AA--AGATAATA--ACT---------ATGCAATGAATG--GTGTTTTG-CGGAA---CG-------AAA-----ATAA--------A---A--------TT--------ATTTAAAGAAATA-TAAAG-ATATTGAGATT--AC-TTCAT-TAAGTTTAGTAA-----TCGG-----AAATAGATATTCTAACTGCAAACATGTTTTATTTTGTGTAT-----------TATTAT-GT-------------TTGTTTTAT---AGAC-AT-------CGCATTGATATC----GTGTAAT-TAAC--TA--AATACAAGTTCGTTAAGATAAACAAACATAAAATGTTTATAA-----ATATT-ACAGTA---TATTG---A--ATTTAAAC----GTTTATCTAAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATCTTATAAGTCTTGTAC-AA----AAA---------------AAG-CA---GAG-A------CCCC--C-GCCCCGCGCC---------------TGTCTG-TTTT-TCAAATCTCAAACA--ATGGAATA-----AGCCTGCG-T-TATTTATG-ACCTTAATTACCGACTA--CCCCTG-CCC-GGAGGCGAAACTTGTAATTTTAT-TGGGGGG
gi|49171 : AGAATGAATGAATCAATCAATCAAT----C--TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTT-T---GTACAAGTT-TAAACGTTCATATAG-C--------TGTT---T---TG-T---TA-TAT----G--A----CGTGTAT---ATAACTTAGAC--AAAAAT-AA--AGATAATA--ACT---------ATGCAATGAATG--GTGTTTTG-CGGAA---CG-------AAA-----ATAA--------A---A--------AT--------ATTTAAAGAAATA-TAAAG-GTACTGAGATT--AC-TTCAT-TAAGTTTAGTAA-----TCCG-----AAATAGATATTCTAACTGCAAACATGTTTTATTTTGTGTAT-----------TATTAT-GT-------------TTGTTTTAT---AGAC-AT-------CCCACTGATATC----GTGTAAT-TAAC--TA--AAAACAAGTTCGTTATGATAAACCAATATAAAATGTTTATAA-----ATATT-ACAGCA---TATTG---A--ATTTAAAC----GTTTATCTAAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATCTAACAATCCTTGTACAAA----AAA---------------AAA-CA---GAG-AC-----CCCC--C-GCCCCGCGCC---------------TGTCTG-TTTT-ACAAATCTCAAACA--ATGGAATA-----AGCCAGCGTTGTTTTTTTT-ACCTTAATTAC--A--A--CTCCTG-CCC-GGAGGCGAAACTTATAATAGTAA-GGGGGGG
gi|49172 : AGAATGAATGAATGAATCAATCAAT----C--TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTT-T---GTACAAGTT-AAAACGTTCATATAG-A--------TGTT---T---TG-T---TA-TAT----G--A----CGTGTAT---ATAGATTAGAC--AAAAAT-AA--AGATAATA--ACT---------ATGAAATGAATG--GTGTTTTG-AGGG-----G-------AAA-----AAAA--------ATTAA--------TT--------ATTTAAAGAAATA-TGAAG-GTACTGAGATT--AC-TTCAT-TAAGTTTAGTAA-----TCCG-----AAATAGATATTCTAACTGCGAATATGTTTCATTTTGTGTAT-----------TATTAT-GT-------------TTGTTTTAT---AGAC-AT-------CGCATTTTTATC----GTGTAAT-TAAC--TT--AATACAAGTTCGATATGATCAACCAATATCAAATGTTTATAA-----ATATT-ACAGCA---TATTG---A--ATTTAAAC----GTTTTCCTAAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAATCCTTGTA------------------------------------------------------------CGCC---------------TGTCTG-TTTT-TCAAATCTCAAACA--ATGGAATA-----AGCCAGTGTT-TATTTATG-ACCTTAATCACCGACTA--CCCCTG-CCC-GGAGGCAAAACTTGTAATTTTAT-TGAGGGG
gi|49173 : AGAATGAATGAATGAATCAATCAAT----C--TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTT-T---GTACAAGTT-TAAACGTTCATATAG-C--------TGTT---T---TG-T---TA-TAT----G--A----CGTGTAT---ATAGCTTAGAC--AAAAAT-AA--AGATAATA--ACT---------ATGCAATGAATG--GTGTTTTG-CGGAAGTTCGTTATGATAAACCAATATAA--------A---A---------T--------GTTT--ATAAATATTACAGCATATTGAAATTAAACGTTTATCTAAGATCAGTAA-----
gi|49174 : GAATGAATCAATCAATCAATCAATCAAAC--TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTT-T---GTACAAGTT-TAAACGTTCATATAG-C--------TGTT---T---TG-T---TA-TAT----G--A----CGTGTAT---ATAGATTAGAC--AAAAAT-AA--AGATAATA--ACT---------CTGCAATGAATG--GTGTTTTG-CGGTA---CG-------AAA-----ATAA--------A---A--------TT--------ATTTAAAGAAATA-TAAAG-ATATTGAGATT--AC-TTCAT-TAAGGTTAGTTA-----TCCG-----AAATAGATATTCTAACTGCAAACATGTTTTATTCTGTGTAT-----------TATTAT-GT-------------TTG--TTAT---AGAC-AT-------CGCATTGATATC----GTGTAAT-TAAC--TA--AATACAAGTTCGTTATGATAAACCAATATAAAATGTTTATAA-----ATATT-ACAGCA---TATTG---A--ATTTAAAC----GTTTATCTAAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAATTCTTGTAC-AA----AAA---------------AGG-AA---GAG-A------CCCC--C-GCCCCGCGCC---------------TGTCTG-TTTT-TCAAATCTCAAACA--ATGGAATA-----AACTTGCG-T-TATTTATG-ACCTTAATTACCGACTA--CCCCTG-CCC-GGAGTCGAAACTTGTAATTTTAT-TTGGGGG
gi|49175 : GAATCAATCAATCAATCAATCAAT----C--TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTC-T---GTACAAGTT-TAAACGTTCATGTAG-A--------TGTT---T---TG-T---TA-TAT----G--A----CGTGTAT---ATAGATTAGAC--AAAACT-AA--AGATAATA--ACT---------ATGAAATGAATG--TTGTTTTG-CGGAA---CG-------AAA-----ATAAAATTATTTA---A--------TT--------ATTTAAAGAAATA-TAAAG-GTACTGAGATT--AC-TTCAT-TAAGTTTCATAGTTCGTTCTG-----AAATAGATATTCTAACTGCAAACATGTTTCATTTTGTGTAT-----------TTTTAT-GT-------------TTGTTTTAT---AGTC-AT-------CGCATTGATATC----GTGTTAT-TAAC--TC--AAT----GTTT------ATAAA--------------------------TATT-ACAGCA---TATTG---A--ATTTAAAC----GTTTTCCTAAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAATC
gi|49176 : GAATGAATGAATCAATCAATGAAT----CAATCATAAAAAAT--T--TTTAGAATGACTT-T---GTACAAGTT-TAAACGTTCATATAG-A--------TGTT---T---TG-A---TA-TAT----G--A----CGTGTAT---ATAGATTAGAC--AAAAAT-AA--AGATAATA--ACT---------ATGAAATGAATG--GTGTTTGG-CAGAA---CG-------AAA-----ATAAAATTATTTA---A--------TT--------ATTTAAAGAAATA-TAAAG-GTACTGAGATC--AC-TTCAT-TAAGTTTAGTAA-----TCCG-----
gi|49177 : AAAGAATGAATGAATCAATCAAT----C--TTAT----AATTCT--TTTAGAATCGCTT-T---GTACAAGTT---------CATATAG-C--------TGTT---T---TG-T---TA-TAT----G--A----CGTGTAT---ATAGATTAGAC--AAAAAT-AA--AGATAATT--ACT---------ATGAAATGAATG--GTGTTTTG-CGGAA---CG-------AAA-----ATAA--------A---A--------TTATTTAATTATTTAAAGAAATA-TAAAG-GTACTGCGATT--AC-TTCAT-TAAGTGTAGTAA-----TCCG-----AAATAGATATTCTAACTGCAAACATGTTTCATTTTGTGTAT-----------TATTAT-GT-------------TTGTTTTAT---AGAC-AT-------CGCATTGATATC----GTGTAAT-TAAC--TA--AATACAAGTTC-----GATAAACCAATATCAAATGTTTATAA-----ATATT-ACAGCA---TATTG---A--ATTTAAAC----GTTTTCCTAAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATCTAAAAATCCTTGTCCAAA----AAA---------------AAA-CA---GAG-AC-----CCCC--C-GCCCCGCGCC---------------TGTCTG-TTTT-TCAAATCTCAAACA--ATGGAATA-----AGCCAGTGTT-TATTTATG-ACCCTAATTACCGACTA--CTCCTG-CCC-GGAGGCAAAACTTGTAATTTTAT-TGGGGGG
gi|49178 : AATCAATCAATCAATCAATCAAT----C--TTAT----AATTCT--TTTAAAATGGCTT-T---GTACAAGTT-TAAACGTTGATGTAG-A--------TGTT---T---TG-T---TA-TAT----G--A----CGTGTAT---ATAAATTAGAC--AAAAAT-AA--AGATAATA--ACT---------ATGAAATGAATG--GTGTTTTG-CAGAA---CA-------AAA-----TTAA--------A---A--------TT--------ATTAAAAGAAATA-TAAAG-GTACTGAGATT--AC-TTCAT-TAAGTTTAGTAA-----TC
gi|49179 : AATTAATCAATCAATCAGT----C--TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTT-T---GTACAAGTT-TAAACATTCATATAG-C--------TGTT---T---TG-T---TA-TAT----G--A----CATGTAT---ATAGATAAGAC--AAAAAT-AA--AG--------------------ATGAAATAAATG--GTGTTTTA-C
gi|49179 : A---CA-------AAA-----ATAA--------A---G------------------AT-----GAAATA--AATG-GTGTT----TT--AC-TTCAT-TAAGTTTAGTAA-----TCCA-----AAATAGATATTCTAACTGCAAACATGTTTCATTTTGTGTAT-----------TATTAT-GT-------------TTGTTTTAT---AGAC-AT-------CGCATTGATATT----GTGTAAT-TAAC--TT--AATACAAGTTCGTTATGATAAACCAATATCAAATGTTTATAA-----ATATT-ACAGCA---TTTTG---A--ATTTAAAC----GTTTTCCTAAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATTTAATAATCCTTGTAC-AA----AAA---------------AAA-CA---GAG-ACGAGACCCCC--C-GCCCCGCACC---------------TGTCTG-TTTT-TCAAATCTCAAACA--ATGAAATA-----AGCCAGTGTT-TATTTATG-ACCTTAATTACCGACTA--CCCCTG-CCC-GGATGCAAAACTTGTAACTTTAT-TGGGGGGttcattaagtttagtaatccaaaatagatattctaactgcaaacatgtttcattttgtgtattattatgtttgttttatagacatcgcattgatattgtgtaattaacttaatacaagttcgttatgataaaccaatatcaaatgtttataaatattacagcattttgaatttaaacgttttcctaagatcagtaaagtaatatgtaaatttaataatccttgtacaaaaaaaacagagacgagaccccccgccccgcacctgtctgtttttcaaatctcaaacaatgaaataagccagtgtttatttatgaccttaattaccgactacccctgcccggatgcaaaacttgtaactttattgggggg
gi|49180 : aattaatcaatcaatcagtcttataattcttttagaatggctttgtacaagtttaaacattcatatagctgttttgttatatgacatgtatatagataagAATTTAT----C--ATAT----AATTCT--TTTAGAATGTCTA-T---GTAGAAGTT-TAAACGTTCATGTAT-A--------TGTT---TTAATA-T---TA-TGT----G--A----TGTGTAC---ATAGATGAGACGAGAAAAA-AA--AGATAATA--CTT---------AT
gi|49181 : AATGAAT----C--TTAT----AATTCT--TTTAGAGTGGCTA-TGCCGTACCATTT-TAAAATCACATGAATAA--------TATT---T---TA-T---TT-TGT----G--T----TATATAC---CTTAATGAGAT--GAAAAT-AA--AGATAGTATTACT---------AT
gi|49182 : AT----C--TTAT----AATTCT--TTTAGAAAGGCTA-T---GTACAAGTT-TAAACGTTCATGTAT-A--------TGTT---T---TG-T---TA-TAT----G--A----TGTATATGTTATAGATGAGAT--GAAAAT-AA--AAATAATA--CCT---------ATAAAATGAATG--ATGTTTTG-CAGCA---CG-------AAA-----ATAA--------A------------TT--------ATTTAAAGAAATA-TAATG-GTACTGAGATT--AC-T--A---AAGTTTGATAA-----TCCGTTCTGAAATAAATATTTTAACTGCAAACATATTTCATTTTGTGCAT-----------GTTTGT-GT-------------TCGTTTTAT---AGTC-AT-------CACATTGATATC----GTGTATT-TAAC--TT--AATACAAGTTAGTTATGCTAGACCATTATCAAATGTTAATAAGTATTACATT-ACAGCA---TATTG---A--ATTTAAAC----GTTTTCCTAAGATCAGTAAAATAATATGCAAATCTAATAACTCTTGTA
gi|49183 : T----C--TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTA-T---GTACAAGTT-TAAACGTTCATGTAT-AATTTA---TGTT---T---TG-T---TA-TAA----G--A----TGTGTA-------GATGAGAC--GAAAAG-AA--AGATAATA--CCT---------ATGAAATGAATG--GTGTTTTG-CGGCA---CG-------AAA-----ATAT--------A---A--------TT--------ATTTAAAGAAATA-TAATG-GTACTGAGAAT--AC-TTCCT-AAAGTTTGATAA-----TCCG-----AAATAAATATTTTAACTGCAAACATGTTTCATTTAGTGCAT-----------GTTTAT-GT-------------TCGTTTTTC---AGTC-AT-------CGCATAGATATC----GTGTAAT-TAAC--TTTTAAAACAAGTTCGTTAAGATAATCCAATATCAAATGTTTAT-----------------CA-----------A--ATTTTAAC----GTTTTCCTAAGATCAGTGAAATAATATTCAAATCTAATAATCCTTGTAC-AA----A---------------------TA---TCG-C------CCCC--C-ACCCACCCCC---------------TGTCTG-TGTT-TCAAGTCTCAAACA--ATGCGATA-----AGCCAGTGTC--ATTTATG-AACTTAATTACCCCCTA--CCCCTG-CCCCGGAGGCAAAACTTGTTCTTTTAT-TGGGGG
gi|49184 : T----C--TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTC-T---GTACAA--------CGTTCATGTAT-AATTTA---TATT---T---TG-T---TA-TAT----G--A----TGTG------A-AGATGAGAC--GAAAAG-AA--AGATAATA--CCT-----------GAAATGAATG--GTGTTTTG-CGGCA---CG-------AAA-----ATAA--------A---ACTATCTAATT--------ATTTAAAAAAATA-TAATG-GTACTGAGATT--AC-TTCCT-AAAGTTTGATAA-----TCCC-----AAATAGATATT-TAACTGCAAACATGTTTCATTTTATGCAT-----------GTTTAT-GT-------------TCGTTTTTT---AGTC-AT-------TGCATAGATACC----GTTTAAT-TAAC--TTTTAATACAAGTTAGTTAAGATAAACCATTATCAAATGTTTATAG-----ATATT-ACAGAA---TTTTT---A--ATTTAAAC----GTTTTCCTAAGATCAGTAAAATAATATTCAAATCTGATAATCCTTGTAC-AA----AAAAACAAAAACAAAAAGAAA-CA---AAGCA------CACC--C-TCCC----AC---------------TGTCTG-TGTT-TCAGGTCTCAAACA--ATGCGATA-----AACCAGTGTT-TATTTATG-AACTTAATTACC-CCTA--CCCCTGCCCC-GGAGGTAAAACTCGTAATTTTAT-TGGGG
gi|49185 : T----C--TTAT----AATTCT--TTTAGAATGACTA-T---GCACAAGTT-TAAACGTTCATGTAT-AATTTA---TGTT---T---TG-T---TA-TAT----G--A----CGTGTA-------GATGAGAC--AAAAAG-AA--AAATAATA--CCT---------ATGAAATGAATG--GTGTTTTG-CGGCA---CG-------AAA-----ATAT--------A---A--------TT--------TTTTAAAGAAATA-TAATG-GTACTGAGAAT--AC-TTCCT-AAAGTTTGATAA-----TCCG-----AAATAAATATTTTAACTGCAAACATGTTTCATCTAGTGCAT-----------GTTTAT-TT-------------TCGTTTC-T---AATTAAT-------CGCATGGATATC----ATGTAAT-TCACTTTT--AAAACAAGTTAGTTAAGATAATCCATTATCAAATGTTTATAA-----ATATT-ACAGAAT--TTTTA---A--ATTT-AAC----GTTTTCCTAAGATCAGTGAAATAATATTCAAATCTAATAATCCTTGTAC-AA----AAA----------------------------A------CCCC--C-A----GAG------------------------------CAAA---CAA------TGCGATA-----AGCCAGTG-T-CATTTATG-AACTTAATTACCCCATA--CCCCTGCCCC-GGAGGCAAAACTTGTAATTTTAT-TGGGGG
gi|49186 : T----C--TTAT----CATTCT--TTTAGAATGGCTA-T---GTACATGTT-TAAACGTTCATGTAT-AATTTA---TGTT---T---TG-T---TA-TAT----G--A----TGTGTA-------GATGAGAC--GAAAAG-AA--AGATAATA--CCT---------ATGACATGAATG--GTGTTTTG-CGGCA---CG-------AAA-----ATAT--------A---A--------TT--------TTTTAAAGAAATA-TAATG-GTACTGAGAAT--AC-TTCCT-AAAGTTTGATAA-----TCCG-----AAATAAATATTTTAACTGCAAACATGTTTCATTAAGTGCAT-----------GTTTAT-TT-------------TCGTTTTTT---AGTC-AT-------CGCATAGTTATC----GTGTAAT-TAACTTTT--AAAACAAGTTAGTTAAGATAATCCGTTATCAAATGTTTATAA-----ATATT-ACAG-ATTTTTTTT---A--ATTT-AAC----GTTTTCCTAAGATCAGTGAAATAATATTAAAATCTAATAATCGTTGTAC-AA----AAA---------------A------------A------CCCC--C-A----GAG------------------------------CAAA---CAATCA-------ATA-----AGCCAGTG-T-CATTTATG-AACTTGATTACTCCCTA--CCCCTGACGC-GGAGGCAAAACATGTAATTTTAT-TGGGGG
gi|49187 : T----C--TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTA-T---GTACAAGTT-TAAACGTTCATGTAT-A--------TGTT---T---TA-T---TATTAT----GTAA----TATGTAC---ATAGATGAGAA--GAAAAT-AA--AGATAAT---ACT---------G-GAAA-GAA
gi|49188 : T----C--TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTA-T---GTTAAAGTT-TAAACGTTCATGTAT-AATTTA---TGTT---T---TG-T---TA-TAT----G--A----TGTGTA-------GATGAGAC--GAAAAG-AA--AGATAATA--CCT---------AGGAAATGAATG--GTGTTTTG-TGGCA---CG-------AAA-----ATAT--------A---A--------TT--------ATTTAAAGAAATA-TAATG-GTACTGAGAAT--AC-TT-A---AAGTTTGATAA-----TCCG-----AAATAAATATTTTAACTGCAAACATGTTTCATTTAGTGCAT-----------GTTTAT-GT-------------TCGGTTTTC---AGTA-AT-------CGCATAGATATC----GTGTAAT-TAACTTTT--AAAACAAGTTAGTTAAGATA-------ATCCAATGTT-------------------------TATTA---A--ATTTTAAC----GTTCTCCTAAGATCAGTGAAATAATATTCAAATCTAATAATCCT
gi|49188 : -TCAAGTCTCAAACA--ATGCGATA-----AGCCAGTG-T-CATTTATG-AACTTAGTTACCCCCTA--CCCCTGCCCC-GGAGGCAAAACTTGTACTTTTATATGGGGcaagtctcaaacaatgcgataagccagtgtcatttatgaacttagttaccccctacccctgccccggaggcaaaacttgtacttttatatgggg
gi|49189 : tcttataattcttttagaatggctatgttaaagtttaaacgttcatgtataatttatgttttgttatatgatgtgtagatgagacgaaaagaaagataatacctaggaaatgaatggtgttttgtggcacgaaaatataattatttaaagaaatataatggtactgagaatacttaaagtttgataatccgaaataaatattttaactgcaaacatgtttcatttagtgcatgtttatgttcggttttcagtaatcgcatagatatcgtgtaattaacttttaaaacaagttagttaagataatccaatgtttattaaattttaacgttctcctaagatcagtgaaataatattcaaatctaataatccT----C--TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTA-T---GTACAATTT-TAAACGTTCATGTAT-A--------TGTTTGAT---TA-T---TA-TGT----G--A----TAAGTAC---ATAGATGAGAC--GAAAAT-AA--AGATAATACTACT---------ACGTAAT
gi|49190 : T----C--TTAT----TATTCT--TTTAGAATGGCTA-T---GTACAAGTT-TAAACGTTCATGTAT-AAATTATGGTGTA---T---TA-T---TA-TGT----G--A----TATGCAC---ATAGATGAGAC--GAAAAT-AA--AGATAAT---ACT---------ATAAA
gi|49191 : T----C--TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGTTA-T---GTACAATTT-TAAATGTTCATGTAT-A--------TGTTTTAT---TA-T---TA-TGT----G--A----TAAGTAC---ATAGATGAGAC--AAAAAT-AA--AGATAATACTACT---------A
gi|49192 : T----C--TTAT----AATTCT--TTTAGAATGATTA-T---GTACAATTT-TAAACGTTCATATAT-A--------TGTTTTAT---TA-T---TA-TGT----G--A----TCAGTAC---ATAGATGAGAC--GAAAAT-AA--AGATAAT---ACT---------A
gi|49193 : T----C--TTCT----AATTCT--TTAAGAATGGCTT-T---GTTCAATTT-TAAACGTTCATGTAT-A--------TGTT---T---TA-TTAGTA-TAT----G--A----AGTGTAC---ATAGTTGAGAC--GAAAAT-AA--AGATAGT---ACTGAGTAAATAATGAAAAGAATACCATGTCTGGTCTGAA----G-------AAA-----ATA
gi|49194 : T----C--TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTA-T---GTACAATTT-TAAACGTCCATGTAT-A--------TGTTTGAT---TA-T---TA-TGT----G--A----TTAGTAC---AAAGATGAGAC--GAAAAT-AA--AGATAATACTAAT---------ACAAAAT
gi|49195 : T----C--TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTA-T---ATACAAGTT-GAAAAGTTCATGTCA-C--------TGTT---T---TA-T---TA-TAC----G--A----AATGTAC---ATAGATGAGAC--
gi|49196 : T----C--TTAT----ATTTCT--TTTAGAATGGCTG-T---GTGCAAGTT-TAAACGTTCTTGTTT-C--------GGTG---T---TA-T---GA-AAT----G--A----TGTGTAC---AAATATGAGAC--GAAAAT-AA--AGGTAACA--
gi|49197 : T----C--TTAT----AATTCT--TTTAGAATTGCTA-T---GTGTGCGTT-GAAACGTCCACGTAT-C--------TGTT---T---TA-T---TA-TAT----G--A----TATATAG---ATAGATGATAC--GAAACT-AAATAGATActctacttaaatacattgaaaggcgtgaaagagaatataa
gi|49198 : T----C--TTGT----AATTCTAATTTAGAATGGCTA-T---GTAC--GTTGTATAGATT-A-GTGT-A--------TGTT---T---TATT---TA-TAT----G-------TTTGTAC---ATAGATGAGAC--TTTAAT-AA--AGA-AATA--AAG---------ATGAA
gi|49199 : --TTAT----AATTCT--TTCAAAATGGCTA-T---GGTCAAGTT-TAAACATTCATGTAA-A--------TGTT---T---TA-T---TA-TAT----G--T----TATGTAC---ATAGATGAGAG--GAAAAT-AA--AAATAA
gi|49200 : ----AATTCT--TTTAGAATGGCTA-T---GAACAA---------GTTCATGTAT-A--------TGTT---T---TA-T---TA-TAC----G--ATAATTATGTAC---ATAGACAAGAC----AAATAAA--AGACAAT---ACT---------A
gi|49201 : TTATAATGACCAAT---GTACAAGTT-TAAACGTTCCTGTAT-A--------TG---------TA-T---TA-TATACTGG--A----TATGTAC---ATAGATGAGACA-AAAAAT-AA--AG
gi|49202 : T---T---TG-A---TA--AT----G--A----CGTGTAT---ATAGCTTAGAC--AAAAAT-AA--AGATAATA--ACT---------ATGCAATGAATG--GTGTTTTG-CAGAA---CG-------AAT-----ATAA--------A---A--------TT--------ATTTAAAGAAATA-TAAAG-GTACTGAAATT--AC-TTCAT-TAAGTTTAGTAA-----TCCG-----AAATAGATATTCTAACTGCAAACATGTTTTATTTTGTGTAT-----------TATTAT-GT-------------TTGTTTTAT---AGAC-AT-------CGCATTGATATC----GTGTAAT-TAAC--TA--AATACAAGTTTGTTATGATAAACCAATATAAAATGTTTATAA-----ATATT-ACAGCA---TATTG---A--ATTTAAAC----GTTTATCTAAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAATCCTTGTAC-AA----AAA---------------GAA-CA---GAG-AC-----CCCC--C-GCCCCGCGCC---------------TGTCTG-TTTT-TCAAATCTCAAACA--AAGGAATA-----AGCCAGCGTT-TTTTTATG-ACCTTAATTACCGACTA--CCCCTG-CCC-GGAGGCGAAACTTGTTATTTTAT-TTGGGGG
gi|49203 : T---------ATGAAACGAATT--GTGTTTTA-TGGCA---TG-------AAA-----ATA-----------------------------------TAA--------TA----GTACTGAGATT--AC-TTCCT-CAAGTT------------CTG-----AAACAAATATTTTAACTACAAACATGTTTCTTTTTGTACAT-----------TTTTAT-GT-------------TCGTTACAT---GGTC-AT-------CGCATTTATGTC----ATGTA----------------ACATGTTAGTAATAATAGACCATTATCAAATGTTTATAA-----ATATT-ACAGCA---TATTG---ATTTTTTTACT----TTTTTTTTAAGATCAGTAAAATAATATACAAATCTAATAATCGTTGTAC-AA----
gi|49204 : -TAAAG-GTACTGAGATT--AC-TTCAT-TTAGTTTAGTTA-----TCCGTTCTGAAATAGATATTTTTACTGCAAACATGTTTCATTTTGTGTATTTTTATGTTTGTTTTATAGTCATCGCATTGATATCGTGTAATCAGAGAC-ATAATAAGATGTATT-ATGTCTCTGGTGTTAT-TTAC--TC--AATACAAGTTAGTTATGATAAACCAATATCAAATGTTTATAA-----ATATT-ACACTT---TATTG---A--ATTTAAAC----GTTTTCCTTAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAGTCA-TGTAC-AACAACAAA---------------AAA-CA---GAG-C------CCTT--T-CCCTCCCGCC---------------TGTCTGTTTTT-TCAAATCTCAAACA--ATGGAATA-----AGCCAGTGTT-TATTTATG-AC-----------ATTA--CCCCTG-CCC-GGAGGCAAAAC------TTTTAT-TGGGGG
gi|49205 : ATTCATAAC----ATATAATGTAAC--TTTTAAAACAAGTTAGTTAAGATAATCCATTATCAAATGTTTATTA-----ATATT-ACAG-A---TATTTTTTA--ATTTTAAC----GTTTTCCTAAGATCAGTAAAATAATATTCAAATCTAATAATCCTTGTAC-AA----AAA---------------CAA-
gi|49206 : GTAAT-CCGT--TC--AATACAAGTTAGTTATGATAAACCAATACCAAAGGTTTATAA-----ATATT-ACAGCA---TATTG---A--ATTTAAATTTGAATCTTACCAAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAATCCTTGTAC-AA----AAA---------------AAga
gi|49207 : AAGTTCGTTATGATAAACCAATATAAAATGTTTATAA-----ATATT-ACAGCA---TATTG---A--AATTAAAC----GTTTATCTAAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATCTGATAATCCTTGTAC-AA----AAA---------------AAA-CAACAGAG-AA-----CCCC--C-GCCCCGCGCC---------------TGTCTG-TATT-TCAAATCTCAAACA--ATGGAATA-----AGCCAGCGTT-TTTTTATG-ACCTTAATTACCGACTA--TCCCTG-CCC-GGAGGCAAAACTTGTAATTTTAT-TGGGGGG
gi|49208 : TATCAAATGATTATAA-----ATTTT-ACAGCA---TGTTG---A--ATTTAAAT----GTTTTCCTAAGATCAGTAATGTAATATGTAAATCTAATAATCCTTGTAC-AA----AAA---------------AAA-CA---GAG-C------CCCC--C-CCCCCCCCCCCCCCACACACCCTCCTGTCTG-TTTTTTCAAATCTCAAACA--ATGGAATA-----AGCCAGTGTT-TATTTATG-ACATTTATTACAGACTA--CCCCTG-CAT-GGAGGCAAAACTTATAA
gi|49209 : -----ATATTCATAACA---TATTG---A--ATTTAAAC----GTTTATCTAAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATGTAATAATCCTTGTAC-AA----AAA---------------AAAACA---GAG-A------CCCC--CCGCCCCGCGCC---------------TGTCTG-TTTT-TCAAATCTCAAACA--ATGGAATA-----AGCATGCGTT-TTTTTATG-ACCTTAATTACCGACTA--CCCCTG-CCC-GGAGGCGAAACTTGTAATTTTAT-TGAGGGG
gi|49210 : A----AAA---------------AAA-CA---GAGCA------TCCCTCC-GCCCCA-ACC---------------AATCTG-TGTT-TCAAGTCTCAAACA--ATGCGATA-----AGCCAGTG-T-TGTTTATG-AACTTAATTACC--CCATTCCCCTGCCCC-GGAGGCAAAACTTGTAATTTTAT-TGGGGG
gi|49211 : ------CCCC--C-CCCCCCCCCC---------------TGTCTG-TGTT-TCAAGTCTCAAACA--ATGCGATA-----AGCCAGTGTC--ATTTATG-AACTTAATTACCCCCTA--CCCCTG-CCCCGGAGGCAAAACTTGTACTTTTAT-TGGGGG
gi|49212 : CCCCGCC---------------TGTCTG-TGTT-TCAGGTCTCAAACATAATGGGATATTTAAAGCGAGTATT-TATTTATT-ACCTTAATTACTCCCTA--CCCCTG-CCCCGGGGGCAAAACTTGCAATTTAAT-TGGGGG
gi|49213 : ccttTTT-TTAATTCT-AAAC----TTGATTATTTGCAGCCAGTGTT-TTTTTATG-ACCTTAACTATCGACTT--TCCCTG-CCC-GGAGGCAAAACTTGTAATTTTAT-TGGGGG
gi|49214 : GGAATA-----AA--AGAATC-TATCTATCTACCTTAATTACCCCCTA--CCTCTGTCCC-GGAGGCAAAACTTGTAATTTTAT-TGGGGG
Alignments
lowQualScore : 22222222 1111111111111111111111111111111 11111 1111111111111 1111111111111 111111 111111111111111 11111111 111111111111111 1
lowQualScore : 2222 11 2222 11 22 222 1 11 00000000 888 222 1 222 1 2222 11 33333 5555 22 1 11 888 555555555 22 2 1 333 6666666 55555 7777777777777777777777777777777 2 1 2 22 2 2 55555 11111 0 2222222222222 2 3333333333333 0 444 1 2 8888888 5555 2 222222 1 1 3 1 44444 1 555 333 22 0 4444 4 4444 333333333333333 2 444 88888888 33 22 0 333333333333333 2 1 2 22 99999 1 5 1 1 66 22 1 5 2
lowQualScore : .... .. .... .. .. ... . .. ........ ... ... . ... . .... .. ..... .... .. . .. ... ......... .. . . ... ....... ..... ............................... . . . .. . . ..... ..... . ............. . ............. . ... . . ....... .... . ...... . . . . ..... . ... ... .. . .... . .... ............... . ... ........ .. .. . ............... . . . .. ..... . . . . .. .. . . .
lowQualScore : 9999 88 7777 88 33 222 2 44 22222222 555 111 2 111 2 6666 77 33333 5555 99 2 77 888 555555555 99 1 0 777 8888888 33333 2222222222222222222222222222222 1 8 1 99 1 1 33333 88888 1 9999999999999 5 8888888888888 6 444 0 5 1111111 0000 2 777777 0 0 1 7 88888 9 222 333 66 6 0000 4 5555 999999999999999 4 444 22222222 22 55 6 999999999999999 2 2 0 88 55555 9 0 9 9 88 66 4 7 0
consensus : AGAATGAATGAATCAATCAATCAAT----C--TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTA-T---GTACAAGTT-TAAACGTTCATGTAT-A--------TGTT---T---TG-T---TA-TAT----G--A----CGTGTAC---ATAGATGAGAC--GAAAAT-AA--AGATAATA--ACT---------ATGAAATGAATG--GTGTTTTG-CGGNA---CG-------AAA-----ATAA--------A---A--------TT--------ATTTAAAGAAATA-TAAAG-GTACTGAGATT--AC-TTCAT-TAAGTTTAGTAA-----TCCG-----AAATAGATATTCTAACTGCAAACATGTTTCATTTTGTGCAT-----------TNTTAT-GT-------------TCGTTTTAT---AGNC-AT-------CGCATTGATATC----GTGTAAT-TAAC--TT--AATACAAGTTNGTTATGATAAACCAATATCAAATGTTTATAA-----ATATT-ACAGCA---TATTG---A--ATTTAAAC----GTTTTCCTAAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAATCCTTGTAC-AA----AAA---------------AAA-CA---GAG-A------CCCC--C-GCCCCGCGCC---------------TGTCTG-TTTT-TCAAATCTCAAACA--ATGGAATA-----AGCCAGCGTT-TATTTATG-ACCTTAATTACCGACTA--CCCCTG-CCC-GGAGGCAAAACTTGTAATTTTAT-TGGGGGG
Reference ( family-519 ) : AGAATGAATGAATCAATCAATCAAT----C--TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTA-T---GTACAAGTT-TAAACGTTCATGTAT-A--------TGTT---T---TG-T---TA-TAT----G--A----CGTGTAC---ATAGATGAGAC--GAAAAT-AA--AGATAATA--ACT---------ATGAAATGAATG--GTGTTTTG-CGGNA---CG-------AAA-----ATAA--------A---A--------TT--------ATTTAAAGAAATA-TAAAG-GTACTGAGATT--AC-TTCAT-TAAGTTTAGTAA-----TCCG-----AAATAGATATTCTAACTGCAAACATGTTTCATTTTGTGCAT-----------TNTTAT-GT-------------TCGTTTTAT---AGNC-AT-------CGCATTGATATC----GTGTAAT-TAAC--TT--AATACAAGTTNGTTATGATAAACCAATATCAAATGTTTATAA-----ATATT-ACAGCA---TATTG---A--ATTTAAAC----GTTTTCCTAAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAATCCTTGTAC-AA----AAA---------------AAA-CA---GAG-A------CCCC--C-GCCCCGCGCC---------------TGTCTG-TTTT-TCAAATCTCAAACA--ATGGAATA-----AGCCAGCGTT-TATTTATG-ACCTTAATTACCGACTA--CCCCTG-CCC-GGAGGCAAAACTTGTAATTTTAT-TGGGGGG
gi|49170 : AGAATGAATGAATCAATCAATCAAT----C--TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTT-T---GTACAAGTT-TAAACGTTCATATAG-A--------TGTT---T---TG-T---TA-TAT----G--A----CGTTTAT---ATAGATTAGAC--AAAAAT-AA--AGATAATA--ACT---------ATGCAATGAATG--GTGTTTTG-CGGAA---CG-------AAA-----ATAA--------A---A--------TT--------ATTTAAAGAAATA-TAAAG-ATATTGAGATT--AC-TTCAT-TAAGTTTAGTAA-----TCGG-----AAATAGATATTCTAACTGCAAACATGTTTTATTTTGTGTAT-----------TATTAT-GT-------------TTGTTTTAT---AGAC-AT-------CGCATTGATATC----GTGTAAT-TAAC--TA--AATACAAGTTCGTTAAGATAAACAAACATAAAATGTTTATAA-----ATATT-ACAGTA---TATTG---A--ATTTAAAC----GTTTATCTAAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATCTTATAAGTCTTGTAC-AA----AAA---------------AAG-CA---GAG-A------CCCC--C-GCCCCGCGCC---------------TGTCTG-TTTT-TCAAATCTCAAACA--ATGGAATA-----AGCCTGCG-T-TATTTATG-ACCTTAATTACCGACTA--CCCCTG-CCC-GGAGGCGAAACTTGTAATTTTAT-TGGGGGG
gi|49171 : AGAATGAATGAATCAATCAATCAAT----C--TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTT-T---GTACAAGTT-TAAACGTTCATATAG-C--------TGTT---T---TG-T---TA-TAT----G--A----CGTGTAT---ATAACTTAGAC--AAAAAT-AA--AGATAATA--ACT---------ATGCAATGAATG--GTGTTTTG-CGGAA---CG-------AAA-----ATAA--------A---A--------AT--------ATTTAAAGAAATA-TAAAG-GTACTGAGATT--AC-TTCAT-TAAGTTTAGTAA-----TCCG-----AAATAGATATTCTAACTGCAAACATGTTTTATTTTGTGTAT-----------TATTAT-GT-------------TTGTTTTAT---AGAC-AT-------CCCACTGATATC----GTGTAAT-TAAC--TA--AAAACAAGTTCGTTATGATAAACCAATATAAAATGTTTATAA-----ATATT-ACAGCA---TATTG---A--ATTTAAAC----GTTTATCTAAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATCTAACAATCCTTGTACAAA----AAA---------------AAA-CA---GAG-AC-----CCCC--C-GCCCCGCGCC---------------TGTCTG-TTTT-ACAAATCTCAAACA--ATGGAATA-----AGCCAGCGTTGTTTTTTTT-ACCTTAATTAC--A--A--CTCCTG-CCC-GGAGGCGAAACTTATAATAGTAA-GGGGGGG
gi|49172 : AGAATGAATGAATGAATCAATCAAT----C--TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTT-T---GTACAAGTT-AAAACGTTCATATAG-A--------TGTT---T---TG-T---TA-TAT----G--A----CGTGTAT---ATAGATTAGAC--AAAAAT-AA--AGATAATA--ACT---------ATGAAATGAATG--GTGTTTTG-AGGG-----G-------AAA-----AAAA--------ATTAA--------TT--------ATTTAAAGAAATA-TGAAG-GTACTGAGATT--AC-TTCAT-TAAGTTTAGTAA-----TCCG-----AAATAGATATTCTAACTGCGAATATGTTTCATTTTGTGTAT-----------TATTAT-GT-------------TTGTTTTAT---AGAC-AT-------CGCATTTTTATC----GTGTAAT-TAAC--TT--AATACAAGTTCGATATGATCAACCAATATCAAATGTTTATAA-----ATATT-ACAGCA---TATTG---A--ATTTAAAC----GTTTTCCTAAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAATCCTTGTA------------------------------------------------------------CGCC---------------TGTCTG-TTTT-TCAAATCTCAAACA--ATGGAATA-----AGCCAGTGTT-TATTTATG-ACCTTAATCACCGACTA--CCCCTG-CCC-GGAGGCAAAACTTGTAATTTTAT-TGAGGGG
gi|49173 : AGAATGAATGAATGAATCAATCAAT----C--TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTT-T---GTACAAGTT-TAAACGTTCATATAG-C--------TGTT---T---TG-T---TA-TAT----G--A----CGTGTAT---ATAGCTTAGAC--AAAAAT-AA--AGATAATA--ACT---------ATGCAATGAATG--GTGTTTTG-CGGAAGTTCGTTATGATAAACCAATATAA--------A---A---------T--------GTTT--ATAAATATTACAGCATATTGAAATTAAACGTTTATCTAAGATCAGTAA-----
gi|49174 : GAATGAATCAATCAATCAATCAATCAAAC--TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTT-T---GTACAAGTT-TAAACGTTCATATAG-C--------TGTT---T---TG-T---TA-TAT----G--A----CGTGTAT---ATAGATTAGAC--AAAAAT-AA--AGATAATA--ACT---------CTGCAATGAATG--GTGTTTTG-CGGTA---CG-------AAA-----ATAA--------A---A--------TT--------ATTTAAAGAAATA-TAAAG-ATATTGAGATT--AC-TTCAT-TAAGGTTAGTTA-----TCCG-----AAATAGATATTCTAACTGCAAACATGTTTTATTCTGTGTAT-----------TATTAT-GT-------------TTG--TTAT---AGAC-AT-------CGCATTGATATC----GTGTAAT-TAAC--TA--AATACAAGTTCGTTATGATAAACCAATATAAAATGTTTATAA-----ATATT-ACAGCA---TATTG---A--ATTTAAAC----GTTTATCTAAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAATTCTTGTAC-AA----AAA---------------AGG-AA---GAG-A------CCCC--C-GCCCCGCGCC---------------TGTCTG-TTTT-TCAAATCTCAAACA--ATGGAATA-----AACTTGCG-T-TATTTATG-ACCTTAATTACCGACTA--CCCCTG-CCC-GGAGTCGAAACTTGTAATTTTAT-TTGGGGG
gi|49175 : GAATCAATCAATCAATCAATCAAT----C--TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTC-T---GTACAAGTT-TAAACGTTCATGTAG-A--------TGTT---T---TG-T---TA-TAT----G--A----CGTGTAT---ATAGATTAGAC--AAAACT-AA--AGATAATA--ACT---------ATGAAATGAATG--TTGTTTTG-CGGAA---CG-------AAA-----ATAAAATTATTTA---A--------TT--------ATTTAAAGAAATA-TAAAG-GTACTGAGATT--AC-TTCAT-TAAGTTTCATAGTTCGTTCTG-----AAATAGATATTCTAACTGCAAACATGTTTCATTTTGTGTAT-----------TTTTAT-GT-------------TTGTTTTAT---AGTC-AT-------CGCATTGATATC----GTGTTAT-TAAC--TC--AAT----GTTT------ATAAA--------------------------TATT-ACAGCA---TATTG---A--ATTTAAAC----GTTTTCCTAAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAATC
gi|49176 : GAATGAATGAATCAATCAATGAAT----CAATCATAAAAAAT--T--TTTAGAATGACTT-T---GTACAAGTT-TAAACGTTCATATAG-A--------TGTT---T---TG-A---TA-TAT----G--A----CGTGTAT---ATAGATTAGAC--AAAAAT-AA--AGATAATA--ACT---------ATGAAATGAATG--GTGTTTGG-CAGAA---CG-------AAA-----ATAAAATTATTTA---A--------TT--------ATTTAAAGAAATA-TAAAG-GTACTGAGATC--AC-TTCAT-TAAGTTTAGTAA-----TCCG-----
gi|49177 : AAAGAATGAATGAATCAATCAAT----C--TTAT----AATTCT--TTTAGAATCGCTT-T---GTACAAGTT---------CATATAG-C--------TGTT---T---TG-T---TA-TAT----G--A----CGTGTAT---ATAGATTAGAC--AAAAAT-AA--AGATAATT--ACT---------ATGAAATGAATG--GTGTTTTG-CGGAA---CG-------AAA-----ATAA--------A---A--------TTATTTAATTATTTAAAGAAATA-TAAAG-GTACTGCGATT--AC-TTCAT-TAAGTGTAGTAA-----TCCG-----AAATAGATATTCTAACTGCAAACATGTTTCATTTTGTGTAT-----------TATTAT-GT-------------TTGTTTTAT---AGAC-AT-------CGCATTGATATC----GTGTAAT-TAAC--TA--AATACAAGTTC-----GATAAACCAATATCAAATGTTTATAA-----ATATT-ACAGCA---TATTG---A--ATTTAAAC----GTTTTCCTAAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATCTAAAAATCCTTGTCCAAA----AAA---------------AAA-CA---GAG-AC-----CCCC--C-GCCCCGCGCC---------------TGTCTG-TTTT-TCAAATCTCAAACA--ATGGAATA-----AGCCAGTGTT-TATTTATG-ACCCTAATTACCGACTA--CTCCTG-CCC-GGAGGCAAAACTTGTAATTTTAT-TGGGGGG
gi|49178 : AATCAATCAATCAATCAATCAAT----C--TTAT----AATTCT--TTTAAAATGGCTT-T---GTACAAGTT-TAAACGTTGATGTAG-A--------TGTT---T---TG-T---TA-TAT----G--A----CGTGTAT---ATAAATTAGAC--AAAAAT-AA--AGATAATA--ACT---------ATGAAATGAATG--GTGTTTTG-CAGAA---CA-------AAA-----TTAA--------A---A--------TT--------ATTAAAAGAAATA-TAAAG-GTACTGAGATT--AC-TTCAT-TAAGTTTAGTAA-----TC
gi|49179 : AATTAATCAATCAATCAGT----C--TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTT-T---GTACAAGTT-TAAACATTCATATAG-C--------TGTT---T---TG-T---TA-TAT----G--A----CATGTAT---ATAGATAAGAC--AAAAAT-AA--AG--------------------ATGAAATAAATG--GTGTTTTA-C
gi|49179 : A---CA-------AAA-----ATAA--------A---G------------------AT-----GAAATA--AATG-GTGTT----TT--AC-TTCAT-TAAGTTTAGTAA-----TCCA-----AAATAGATATTCTAACTGCAAACATGTTTCATTTTGTGTAT-----------TATTAT-GT-------------TTGTTTTAT---AGAC-AT-------CGCATTGATATT----GTGTAAT-TAAC--TT--AATACAAGTTCGTTATGATAAACCAATATCAAATGTTTATAA-----ATATT-ACAGCA---TTTTG---A--ATTTAAAC----GTTTTCCTAAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATTTAATAATCCTTGTAC-AA----AAA---------------AAA-CA---GAG-ACGAGACCCCC--C-GCCCCGCACC---------------TGTCTG-TTTT-TCAAATCTCAAACA--ATGAAATA-----AGCCAGTGTT-TATTTATG-ACCTTAATTACCGACTA--CCCCTG-CCC-GGATGCAAAACTTGTAACTTTAT-TGGGGGGttcattaagtttagtaatccaaaatagatattctaactgcaaacatgtttcattttgtgtattattatgtttgttttatagacatcgcattgatattgtgtaattaacttaatacaagttcgttatgataaaccaatatcaaatgtttataaatattacagcattttgaatttaaacgttttcctaagatcagtaaagtaatatgtaaatttaataatccttgtacaaaaaaaacagagacgagaccccccgccccgcacctgtctgtttttcaaatctcaaacaatgaaataagccagtgtttatttatgaccttaattaccgactacccctgcccggatgcaaaacttgtaactttattgggggg
gi|49180 : aattaatcaatcaatcagtcttataattcttttagaatggctttgtacaagtttaaacattcatatagctgttttgttatatgacatgtatatagataagAATTTAT----C--ATAT----AATTCT--TTTAGAATGTCTA-T---GTAGAAGTT-TAAACGTTCATGTAT-A--------TGTT---TTAATA-T---TA-TGT----G--A----TGTGTAC---ATAGATGAGACGAGAAAAA-AA--AGATAATA--CTT---------AT
gi|49181 : AATGAAT----C--TTAT----AATTCT--TTTAGAGTGGCTA-TGCCGTACCATTT-TAAAATCACATGAATAA--------TATT---T---TA-T---TT-TGT----G--T----TATATAC---CTTAATGAGAT--GAAAAT-AA--AGATAGTATTACT---------AT
gi|49182 : AT----C--TTAT----AATTCT--TTTAGAAAGGCTA-T---GTACAAGTT-TAAACGTTCATGTAT-A--------TGTT---T---TG-T---TA-TAT----G--A----TGTATATGTTATAGATGAGAT--GAAAAT-AA--AAATAATA--CCT---------ATAAAATGAATG--ATGTTTTG-CAGCA---CG-------AAA-----ATAA--------A------------TT--------ATTTAAAGAAATA-TAATG-GTACTGAGATT--AC-T--A---AAGTTTGATAA-----TCCGTTCTGAAATAAATATTTTAACTGCAAACATATTTCATTTTGTGCAT-----------GTTTGT-GT-------------TCGTTTTAT---AGTC-AT-------CACATTGATATC----GTGTATT-TAAC--TT--AATACAAGTTAGTTATGCTAGACCATTATCAAATGTTAATAAGTATTACATT-ACAGCA---TATTG---A--ATTTAAAC----GTTTTCCTAAGATCAGTAAAATAATATGCAAATCTAATAACTCTTGTA
gi|49183 : T----C--TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTA-T---GTACAAGTT-TAAACGTTCATGTAT-AATTTA---TGTT---T---TG-T---TA-TAA----G--A----TGTGTA-------GATGAGAC--GAAAAG-AA--AGATAATA--CCT---------ATGAAATGAATG--GTGTTTTG-CGGCA---CG-------AAA-----ATAT--------A---A--------TT--------ATTTAAAGAAATA-TAATG-GTACTGAGAAT--AC-TTCCT-AAAGTTTGATAA-----TCCG-----AAATAAATATTTTAACTGCAAACATGTTTCATTTAGTGCAT-----------GTTTAT-GT-------------TCGTTTTTC---AGTC-AT-------CGCATAGATATC----GTGTAAT-TAAC--TTTTAAAACAAGTTCGTTAAGATAATCCAATATCAAATGTTTAT-----------------CA-----------A--ATTTTAAC----GTTTTCCTAAGATCAGTGAAATAATATTCAAATCTAATAATCCTTGTAC-AA----A---------------------TA---TCG-C------CCCC--C-ACCCACCCCC---------------TGTCTG-TGTT-TCAAGTCTCAAACA--ATGCGATA-----AGCCAGTGTC--ATTTATG-AACTTAATTACCCCCTA--CCCCTG-CCCCGGAGGCAAAACTTGTTCTTTTAT-TGGGGG
gi|49184 : T----C--TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTC-T---GTACAA--------CGTTCATGTAT-AATTTA---TATT---T---TG-T---TA-TAT----G--A----TGTG------A-AGATGAGAC--GAAAAG-AA--AGATAATA--CCT-----------GAAATGAATG--GTGTTTTG-CGGCA---CG-------AAA-----ATAA--------A---ACTATCTAATT--------ATTTAAAAAAATA-TAATG-GTACTGAGATT--AC-TTCCT-AAAGTTTGATAA-----TCCC-----AAATAGATATT-TAACTGCAAACATGTTTCATTTTATGCAT-----------GTTTAT-GT-------------TCGTTTTTT---AGTC-AT-------TGCATAGATACC----GTTTAAT-TAAC--TTTTAATACAAGTTAGTTAAGATAAACCATTATCAAATGTTTATAG-----ATATT-ACAGAA---TTTTT---A--ATTTAAAC----GTTTTCCTAAGATCAGTAAAATAATATTCAAATCTGATAATCCTTGTAC-AA----AAAAACAAAAACAAAAAGAAA-CA---AAGCA------CACC--C-TCCC----AC---------------TGTCTG-TGTT-TCAGGTCTCAAACA--ATGCGATA-----AACCAGTGTT-TATTTATG-AACTTAATTACC-CCTA--CCCCTGCCCC-GGAGGTAAAACTCGTAATTTTAT-TGGGG
gi|49185 : T----C--TTAT----AATTCT--TTTAGAATGACTA-T---GCACAAGTT-TAAACGTTCATGTAT-AATTTA---TGTT---T---TG-T---TA-TAT----G--A----CGTGTA-------GATGAGAC--AAAAAG-AA--AAATAATA--CCT---------ATGAAATGAATG--GTGTTTTG-CGGCA---CG-------AAA-----ATAT--------A---A--------TT--------TTTTAAAGAAATA-TAATG-GTACTGAGAAT--AC-TTCCT-AAAGTTTGATAA-----TCCG-----AAATAAATATTTTAACTGCAAACATGTTTCATCTAGTGCAT-----------GTTTAT-TT-------------TCGTTTC-T---AATTAAT-------CGCATGGATATC----ATGTAAT-TCACTTTT--AAAACAAGTTAGTTAAGATAATCCATTATCAAATGTTTATAA-----ATATT-ACAGAAT--TTTTA---A--ATTT-AAC----GTTTTCCTAAGATCAGTGAAATAATATTCAAATCTAATAATCCTTGTAC-AA----AAA----------------------------A------CCCC--C-A----GAG------------------------------CAAA---CAA------TGCGATA-----AGCCAGTG-T-CATTTATG-AACTTAATTACCCCATA--CCCCTGCCCC-GGAGGCAAAACTTGTAATTTTAT-TGGGGG
gi|49186 : T----C--TTAT----CATTCT--TTTAGAATGGCTA-T---GTACATGTT-TAAACGTTCATGTAT-AATTTA---TGTT---T---TG-T---TA-TAT----G--A----TGTGTA-------GATGAGAC--GAAAAG-AA--AGATAATA--CCT---------ATGACATGAATG--GTGTTTTG-CGGCA---CG-------AAA-----ATAT--------A---A--------TT--------TTTTAAAGAAATA-TAATG-GTACTGAGAAT--AC-TTCCT-AAAGTTTGATAA-----TCCG-----AAATAAATATTTTAACTGCAAACATGTTTCATTAAGTGCAT-----------GTTTAT-TT-------------TCGTTTTTT---AGTC-AT-------CGCATAGTTATC----GTGTAAT-TAACTTTT--AAAACAAGTTAGTTAAGATAATCCGTTATCAAATGTTTATAA-----ATATT-ACAG-ATTTTTTTT---A--ATTT-AAC----GTTTTCCTAAGATCAGTGAAATAATATTAAAATCTAATAATCGTTGTAC-AA----AAA---------------A------------A------CCCC--C-A----GAG------------------------------CAAA---CAATCA-------ATA-----AGCCAGTG-T-CATTTATG-AACTTGATTACTCCCTA--CCCCTGACGC-GGAGGCAAAACATGTAATTTTAT-TGGGGG
gi|49187 : T----C--TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTA-T---GTACAAGTT-TAAACGTTCATGTAT-A--------TGTT---T---TA-T---TATTAT----GTAA----TATGTAC---ATAGATGAGAA--GAAAAT-AA--AGATAAT---ACT---------G-GAAA-GAA
gi|49188 : T----C--TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTA-T---GTTAAAGTT-TAAACGTTCATGTAT-AATTTA---TGTT---T---TG-T---TA-TAT----G--A----TGTGTA-------GATGAGAC--GAAAAG-AA--AGATAATA--CCT---------AGGAAATGAATG--GTGTTTTG-TGGCA---CG-------AAA-----ATAT--------A---A--------TT--------ATTTAAAGAAATA-TAATG-GTACTGAGAAT--AC-TT-A---AAGTTTGATAA-----TCCG-----AAATAAATATTTTAACTGCAAACATGTTTCATTTAGTGCAT-----------GTTTAT-GT-------------TCGGTTTTC---AGTA-AT-------CGCATAGATATC----GTGTAAT-TAACTTTT--AAAACAAGTTAGTTAAGATA-------ATCCAATGTT-------------------------TATTA---A--ATTTTAAC----GTTCTCCTAAGATCAGTGAAATAATATTCAAATCTAATAATCCT
gi|49188 : -TCAAGTCTCAAACA--ATGCGATA-----AGCCAGTG-T-CATTTATG-AACTTAGTTACCCCCTA--CCCCTGCCCC-GGAGGCAAAACTTGTACTTTTATATGGGGcaagtctcaaacaatgcgataagccagtgtcatttatgaacttagttaccccctacccctgccccggaggcaaaacttgtacttttatatgggg
gi|49189 : tcttataattcttttagaatggctatgttaaagtttaaacgttcatgtataatttatgttttgttatatgatgtgtagatgagacgaaaagaaagataatacctaggaaatgaatggtgttttgtggcacgaaaatataattatttaaagaaatataatggtactgagaatacttaaagtttgataatccgaaataaatattttaactgcaaacatgtttcatttagtgcatgtttatgttcggttttcagtaatcgcatagatatcgtgtaattaacttttaaaacaagttagttaagataatccaatgtttattaaattttaacgttctcctaagatcagtgaaataatattcaaatctaataatccT----C--TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTA-T---GTACAATTT-TAAACGTTCATGTAT-A--------TGTTTGAT---TA-T---TA-TGT----G--A----TAAGTAC---ATAGATGAGAC--GAAAAT-AA--AGATAATACTACT---------ACGTAAT
gi|49190 : T----C--TTAT----TATTCT--TTTAGAATGGCTA-T---GTACAAGTT-TAAACGTTCATGTAT-AAATTATGGTGTA---T---TA-T---TA-TGT----G--A----TATGCAC---ATAGATGAGAC--GAAAAT-AA--AGATAAT---ACT---------ATAAA
gi|49191 : T----C--TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGTTA-T---GTACAATTT-TAAATGTTCATGTAT-A--------TGTTTTAT---TA-T---TA-TGT----G--A----TAAGTAC---ATAGATGAGAC--AAAAAT-AA--AGATAATACTACT---------A
gi|49192 : T----C--TTAT----AATTCT--TTTAGAATGATTA-T---GTACAATTT-TAAACGTTCATATAT-A--------TGTTTTAT---TA-T---TA-TGT----G--A----TCAGTAC---ATAGATGAGAC--GAAAAT-AA--AGATAAT---ACT---------A
gi|49193 : T----C--TTCT----AATTCT--TTAAGAATGGCTT-T---GTTCAATTT-TAAACGTTCATGTAT-A--------TGTT---T---TA-TTAGTA-TAT----G--A----AGTGTAC---ATAGTTGAGAC--GAAAAT-AA--AGATAGT---ACTGAGTAAATAATGAAAAGAATACCATGTCTGGTCTGAA----G-------AAA-----ATA
gi|49194 : T----C--TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTA-T---GTACAATTT-TAAACGTCCATGTAT-A--------TGTTTGAT---TA-T---TA-TGT----G--A----TTAGTAC---AAAGATGAGAC--GAAAAT-AA--AGATAATACTAAT---------ACAAAAT
gi|49195 : T----C--TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTA-T---ATACAAGTT-GAAAAGTTCATGTCA-C--------TGTT---T---TA-T---TA-TAC----G--A----AATGTAC---ATAGATGAGAC--
gi|49196 : T----C--TTAT----ATTTCT--TTTAGAATGGCTG-T---GTGCAAGTT-TAAACGTTCTTGTTT-C--------GGTG---T---TA-T---GA-AAT----G--A----TGTGTAC---AAATATGAGAC--GAAAAT-AA--AGGTAACA--
gi|49197 : T----C--TTAT----AATTCT--TTTAGAATTGCTA-T---GTGTGCGTT-GAAACGTCCACGTAT-C--------TGTT---T---TA-T---TA-TAT----G--A----TATATAG---ATAGATGATAC--GAAACT-AAATAGATActctacttaaatacattgaaaggcgtgaaagagaatataa
gi|49198 : T----C--TTGT----AATTCTAATTTAGAATGGCTA-T---GTAC--GTTGTATAGATT-A-GTGT-A--------TGTT---T---TATT---TA-TAT----G-------TTTGTAC---ATAGATGAGAC--TTTAAT-AA--AGA-AATA--AAG---------ATGAA
gi|49199 : --TTAT----AATTCT--TTCAAAATGGCTA-T---GGTCAAGTT-TAAACATTCATGTAA-A--------TGTT---T---TA-T---TA-TAT----G--T----TATGTAC---ATAGATGAGAG--GAAAAT-AA--AAATAA
gi|49200 : ----AATTCT--TTTAGAATGGCTA-T---GAACAA---------GTTCATGTAT-A--------TGTT---T---TA-T---TA-TAC----G--ATAATTATGTAC---ATAGACAAGAC----AAATAAA--AGACAAT---ACT---------A
gi|49201 : TTATAATGACCAAT---GTACAAGTT-TAAACGTTCCTGTAT-A--------TG---------TA-T---TA-TATACTGG--A----TATGTAC---ATAGATGAGACA-AAAAAT-AA--AG
gi|49202 : T---T---TG-A---TA--AT----G--A----CGTGTAT---ATAGCTTAGAC--AAAAAT-AA--AGATAATA--ACT---------ATGCAATGAATG--GTGTTTTG-CAGAA---CG-------AAT-----ATAA--------A---A--------TT--------ATTTAAAGAAATA-TAAAG-GTACTGAAATT--AC-TTCAT-TAAGTTTAGTAA-----TCCG-----AAATAGATATTCTAACTGCAAACATGTTTTATTTTGTGTAT-----------TATTAT-GT-------------TTGTTTTAT---AGAC-AT-------CGCATTGATATC----GTGTAAT-TAAC--TA--AATACAAGTTTGTTATGATAAACCAATATAAAATGTTTATAA-----ATATT-ACAGCA---TATTG---A--ATTTAAAC----GTTTATCTAAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAATCCTTGTAC-AA----AAA---------------GAA-CA---GAG-AC-----CCCC--C-GCCCCGCGCC---------------TGTCTG-TTTT-TCAAATCTCAAACA--AAGGAATA-----AGCCAGCGTT-TTTTTATG-ACCTTAATTACCGACTA--CCCCTG-CCC-GGAGGCGAAACTTGTTATTTTAT-TTGGGGG
gi|49203 : T---------ATGAAACGAATT--GTGTTTTA-TGGCA---TG-------AAA-----ATA-----------------------------------TAA--------TA----GTACTGAGATT--AC-TTCCT-CAAGTT------------CTG-----AAACAAATATTTTAACTACAAACATGTTTCTTTTTGTACAT-----------TTTTAT-GT-------------TCGTTACAT---GGTC-AT-------CGCATTTATGTC----ATGTA----------------ACATGTTAGTAATAATAGACCATTATCAAATGTTTATAA-----ATATT-ACAGCA---TATTG---ATTTTTTTACT----TTTTTTTTAAGATCAGTAAAATAATATACAAATCTAATAATCGTTGTAC-AA----
gi|49204 : -TAAAG-GTACTGAGATT--AC-TTCAT-TTAGTTTAGTTA-----TCCGTTCTGAAATAGATATTTTTACTGCAAACATGTTTCATTTTGTGTATTTTTATGTTTGTTTTATAGTCATCGCATTGATATCGTGTAATCAGAGAC-ATAATAAGATGTATT-ATGTCTCTGGTGTTAT-TTAC--TC--AATACAAGTTAGTTATGATAAACCAATATCAAATGTTTATAA-----ATATT-ACACTT---TATTG---A--ATTTAAAC----GTTTTCCTTAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAGTCA-TGTAC-AACAACAAA---------------AAA-CA---GAG-C------CCTT--T-CCCTCCCGCC---------------TGTCTGTTTTT-TCAAATCTCAAACA--ATGGAATA-----AGCCAGTGTT-TATTTATG-AC-----------ATTA--CCCCTG-CCC-GGAGGCAAAAC------TTTTAT-TGGGGG
gi|49205 : ATTCATAAC----ATATAATGTAAC--TTTTAAAACAAGTTAGTTAAGATAATCCATTATCAAATGTTTATTA-----ATATT-ACAG-A---TATTTTTTA--ATTTTAAC----GTTTTCCTAAGATCAGTAAAATAATATTCAAATCTAATAATCCTTGTAC-AA----AAA---------------CAA-
gi|49206 : GTAAT-CCGT--TC--AATACAAGTTAGTTATGATAAACCAATACCAAAGGTTTATAA-----ATATT-ACAGCA---TATTG---A--ATTTAAATTTGAATCTTACCAAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAATCCTTGTAC-AA----AAA---------------AAga
gi|49207 : AAGTTCGTTATGATAAACCAATATAAAATGTTTATAA-----ATATT-ACAGCA---TATTG---A--AATTAAAC----GTTTATCTAAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATCTGATAATCCTTGTAC-AA----AAA---------------AAA-CAACAGAG-AA-----CCCC--C-GCCCCGCGCC---------------TGTCTG-TATT-TCAAATCTCAAACA--ATGGAATA-----AGCCAGCGTT-TTTTTATG-ACCTTAATTACCGACTA--TCCCTG-CCC-GGAGGCAAAACTTGTAATTTTAT-TGGGGGG
gi|49208 : TATCAAATGATTATAA-----ATTTT-ACAGCA---TGTTG---A--ATTTAAAT----GTTTTCCTAAGATCAGTAATGTAATATGTAAATCTAATAATCCTTGTAC-AA----AAA---------------AAA-CA---GAG-C------CCCC--C-CCCCCCCCCCCCCCACACACCCTCCTGTCTG-TTTTTTCAAATCTCAAACA--ATGGAATA-----AGCCAGTGTT-TATTTATG-ACATTTATTACAGACTA--CCCCTG-CAT-GGAGGCAAAACTTATAA
gi|49209 : -----ATATTCATAACA---TATTG---A--ATTTAAAC----GTTTATCTAAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATGTAATAATCCTTGTAC-AA----AAA---------------AAAACA---GAG-A------CCCC--CCGCCCCGCGCC---------------TGTCTG-TTTT-TCAAATCTCAAACA--ATGGAATA-----AGCATGCGTT-TTTTTATG-ACCTTAATTACCGACTA--CCCCTG-CCC-GGAGGCGAAACTTGTAATTTTAT-TGAGGGG
gi|49210 : A----AAA---------------AAA-CA---GAGCA------TCCCTCC-GCCCCA-ACC---------------AATCTG-TGTT-TCAAGTCTCAAACA--ATGCGATA-----AGCCAGTG-T-TGTTTATG-AACTTAATTACC--CCATTCCCCTGCCCC-GGAGGCAAAACTTGTAATTTTAT-TGGGGG
gi|49211 : ------CCCC--C-CCCCCCCCCC---------------TGTCTG-TGTT-TCAAGTCTCAAACA--ATGCGATA-----AGCCAGTGTC--ATTTATG-AACTTAATTACCCCCTA--CCCCTG-CCCCGGAGGCAAAACTTGTACTTTTAT-TGGGGG
gi|49212 : CCCCGCC---------------TGTCTG-TGTT-TCAGGTCTCAAACATAATGGGATATTTAAAGCGAGTATT-TATTTATT-ACCTTAATTACTCCCTA--CCCCTG-CCCCGGGGGCAAAACTTGCAATTTAAT-TGGGGG
gi|49213 : ccttTTT-TTAATTCT-AAAC----TTGATTATTTGCAGCCAGTGTT-TTTTTATG-ACCTTAACTATCGACTT--TCCCTG-CCC-GGAGGCAAAACTTGTAATTTTAT-TGGGGG
gi|49214 : GGAATA-----AA--AGAATC-TATCTATCTACCTTAATTACCCCCTA--CCTCTGTCCC-GGAGGCAAAACTTGTAATTTTAT-TGGGGG
blockSeqs : CAAA AA AAAA AA AA GCC G TA AATTATGG TGA TAA T TAG T ACTG TA TAATT TGTT GA A AT ATT GAGTAAATA CC T A GTT TTATGAT CCAAT AATTATTTAATT T A C AA G C TTCGT TTCTG TTTTATGTTTGTT A CATCGCATTGATA CAG A A AATAAGA TCTG G TTTT A C T A GTATT C TTT TTT TT TTGA A CAAC AACAAAAACAAAAAG A ACA ACGAGAC TC CG CCCCACACACCCTCC T T T TA TTTAA C T G T GA TT C C A
blockSeqs : . . . . T . . G ATTTA TTA . . . . . . C T A . . ACT . . . G . . . AATTATTTAATT . A . . . . . TTCTG TA . . . A . . . . TTTT T C T A . . T . . . A . . . . AC . G . . T . . TTTGC T T . . GA . C C .
blockSeqs : . . . . T . . G ATTTA TTA . . . . . . C T . . . ACT . . . A . . . AATTATTTAATT . A . . . . . . TA . . . A . . . . TTTT T C T A . . . . . . . . . . . AC . G . . T . . . C T . . GA . A C .
blockSeqs : . . . . T . . G ATTTA TGA . . . . . . C T . . . ACT . . . T . . . AACTATCTAATT . A . . . . . . TA . . . T . . . . TTTT T T T A . . . . . . . . . . . CA . G . . T . . . T T . . GA . C . .
blockSeqs : . . . . T . . G ATTTA . . . . . . . C T . . . A . . . A . . . ATTAATT . A . . . . . . TT . . . A . . . . TTTT T C T A . . . . . . . . . . . AC . G . . T . . . T T . . CC . C . .
blockSeqs : . . . . C . . G ATTTA . . . . . . . C T . . . A . . . A . . . AAAT . A . . . . . . TA . . . A . . . . TTTT T C A T . . . . . . . . . . . AA . A . . G . . . T T . . CC . T . .
blockSeqs : . . . . T . . G . . . . . . . . C T . . . A . . . A . . . AATT . A . . . . . . TA . . . T . . . . TA T A A A . . . . . . . . . . . CA . T . . G . . . T T . . CC . . . .
blockSeqs : . . . . T . . G . . . . . . . . C T . . . A . . . A . . . AATT . A . . . . . . GT . . . T . . . . TT A C A T . . . . . . . . . . . A . A . . T . . . T T . . CC . . . .
blockSeqs : . . . . T . . G . . . . . . . . C T . . . A . . . C . . . AATT . T . . . . . . GT . . . T . . . . TA T A A T . . . . . . . . . . . C . A . . T . . . T T . . GA . . . .
blockSeqs : . . . . T . . G . . . . . . . . C T . . . A . . . C . . . AATT . T . . . . . . GT . . . T . . . . TC A A A T . . . . . . . . . . . A . G . . A . . . T T . . GA . . . .
blockSeqs : . . . . A . . T . . . . . . . . T C . . . T . . . C . . . AATT . T . . . . . . GT . . . T . . . . TA A A T A . . . . . . . . . . . A . C . . T . . . C T . . GA . . . .
blockSeqs : . . . . A . . T . . . . . . . . T C . . . A . . . C . . . AATT . T . . . . . . GT . . . T . . . . TT A A T T . . . . . . . . . . . C . G . . T . . . T T . . GA . . . .
blockSeqs : . . . . A . . T . . . . . . . . T C . . . A . . . C . . . AATT . T . . . . . . GT . . . A . . . . TT T T T A . . . . . . . . . . . C . C . . G . . . C T . . CC . . . .
blockSeqs : . . . . A . . T . . . . . . . . T C . . . A . . . C . . . AAT . T . . . . . . TA . . . T . . . . TA T A A T . . . . . . . . . . . A . G . . G . . . T T . . CC . . . .
blockSeqs : . . . . C . . T . . . . . . . . T C . . . A . . . A . . . ATT . T . . . . . . TT . . . A . . . . TC A A T A . . . . . . . . . . . . . C . . G . . . C T . . GA . . . .
blockSeqs : . . . . A . . T . . . . . . . . C C . . . A . . . A . . . AG . A . . . . . . . . TC T A T A . . . . . . . . . . . . . . T . . . T . . . CC . . . .
blockSeqs : . . . . A . . T . . . . . . . . T C . . . A . . . C . . . . . A . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . A . . T . . . . . . . . T C . . . A . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . T . . . C . . . .
blockSeqs : . . . . A . . T . . . . . . . . T C . . . A . . . . . . . . . . T . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . A . . T . . . . . . . . T C . . . A . . . . . . . . A . . . . . . .
blockSeqs : . . . . A . . T . . . . . . . . T C . . . A .
blockSeqs : . . . . A . . T . . . . . . . . T G . . . A .
blockSeqs : . . . . A . . T . . . . . . . . T C . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . T . . . . . . . . A C . . . . .
blockSeqs : . . . . A . . A . . . . . . . . T C . . . . .
blockSeqs : . . . . A . . T . . . . . . . . A C . . . . .
blockSeqs : . . . . G . . T . . . . . . . . T T . . . . .
blockSeqs : . . . . A . . T . . . . . . . . T . . . . . .
blockSeqs : . . . A . . A . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . A . . T . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : A . . T . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . C . .
blockSeqCons :
originalCons : AGAATGAATGAATCAATCAATCAAT----C--TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTA-T---GTACAAGTT-TAAACGTTCATGTAT-A--------TGTT---T---TG-T---TA-TAT----G--A----CGTGTAC---ATAGATGAGAC--GAAAAT-AA--AGATAATA--ACT---------ATGAAATGAATG--GTGTTTTG-CGGNA---CG-------AAA-----ATAA--------A---A--------TT--------ATTTAAAGAAATA-TAAAG-GTACTGAGATT--AC-TTCAT-TAAGTTTAGTAA-----TCCG-----AAATAGATATTCTAACTGCAAACATGTTTCATTTTGTGCAT-----------TNTTAT-GT-------------TCGTTTTAT---AGNC-AT-------CGCATTGATATC----GTGTAAT-TAAC--TT--AATACAAGTTNGTTATGATAAACCAATATCAAATGTTTATAA-----ATATT-ACAGCA---TATTG---A--ATTTAAAC----GTTTTCCTAAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAATCCTTGTAC-AA----AAA---------------AAA-CA---GAG-A------CCCC--C-GCCCCGCGCC---------------TGTCTG-TTTT-TCAAATCTCAAACA--ATGGAATA-----AGCCAGCGTT-TATTTATG-ACCTTAATTACCGACTA--CCCCTG-CCC-GGAGGCAAAACTTGTAATTTTAT-TGGGGGG
finalCons : AGAATGAATGAATCAATCAATCAAT----C--TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTA-T---GTACAAGTT-TAAACGTTCATGTAT-A--------TGTT---T---TG-T---TA-TAT----G--A----CGTGTAC---ATAGATGAGAC--GAAAAT-AA--AGATAATA--ACT---------ATGAAATGAATG--GTGTTTTG-CGGNA---CG-------AAA-----ATAA--------A---A--------TT--------ATTTAAAGAAATA-TAAAG-GTACTGAGATT--AC-TTCAT-TAAGTTTAGTAA-----TCCG-----AAATAGATATTCTAACTGCAAACATGTTTCATTTTGTGCAT-----------TNTTAT-GT-------------TCGTTTTAT---AGNC-AT-------CGCATTGATATC----GTGTAAT-TAAC--TT--AATACAAGTTNGTTATGATAAACCAATATCAAATGTTTATAA-----ATATT-ACAGCA---TATTG---A--ATTTAAAC----GTTTTCCTAAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAATCCTTGTAC-AA----AAA---------------AAA-CA---GAG-A------CCCC--C-GCCCCGCGCC---------------TGTCTG-TTTT-TCAAATCTCAAACA--ATGGAATA-----AGCCAGCGTT-TATTTATG-ACCTTAATTACCGACTA--CCCCTG-CCC-GGAGGCAAAACTTGTAATTTTAT-TGGGGGG
Alignments
lowQualScore : 22222222 1111111111111111111111111111111 11111 1111111111111 1111111111111 111111 111111111111111 11111111 111111111111111 1
lowQualScore : 2222 11 2222 11 22 222 1 11 00000000 888 222 1 222 1 2222 11 33333 5555 22 1 11 888 555555555 22 2 1 333 6666666 55555 7777777777777777777777777777777 2 1 2 22 2 2 55555 11111 0 2222222222222 2 3333333333333 0 444 1 2 8888888 5555 2 222222 1 1 3 1 44444 1 555 333 22 0 4444 4 4444 333333333333333 2 444 88888888 33 22 0 333333333333333 2 1 2 22 99999 1 5 1 1 66 22 1 5 2
lowQualScore : .... .. .... .. .. ... . .. ........ ... ... . ... . .... .. ..... .... .. . .. ... ......... .. . . ... ....... ..... ............................... . . . .. . . ..... ..... . ............. . ............. . ... . . ....... .... . ...... . . . . ..... . ... ... .. . .... . .... ............... . ... ........ .. .. . ............... . . . .. ..... . . . . .. .. . . .
lowQualScore : 9999 88 7777 88 33 222 2 44 22222222 555 111 2 111 2 6666 77 33333 5555 99 2 77 888 555555555 99 1 0 777 8888888 33333 2222222222222222222222222222222 1 8 1 99 1 1 33333 88888 1 9999999999999 5 8888888888888 6 444 0 5 1111111 0000 2 777777 0 0 1 7 88888 9 222 333 66 6 0000 4 5555 999999999999999 4 444 22222222 22 55 6 999999999999999 2 2 0 88 55555 9 0 9 9 88 66 4 7 0
consensus : AGAATGAATGAATCAATCAATCAAT----C--TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTA-T---GTACAAGTT-TAAACGTTCATGTAT-A--------TGTT---T---TG-T---TA-TAT----G--A----CGTGTAC---ATAGATGAGAC--GAAAAT-AA--AGATAATA--ACT---------ATGAAATGAATG--GTGTTTTG-CGGNA---CG-------AAA-----ATAA--------A---A--------TT--------ATTTAAAGAAATA-TAAAG-GTACTGAGATT--AC-TTCAT-TAAGTTTAGTAA-----TCCG-----AAATAGATATTCTAACTGCAAACATGTTTCATTTTGTGCAT-----------TNTTAT-GT-------------TCGTTTTAT---AGNC-AT-------CGCATTGATATC----GTGTAAT-TAAC--TT--AATACAAGTTNGTTATGATAAACCAATATCAAATGTTTATAA-----ATATT-ACAGCA---TATTG---A--ATTTAAAC----GTTTTCCTAAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAATCCTTGTAC-AA----AAA---------------AAA-CA---GAG-A------CCCC--C-GCCCCGCGCC---------------TGTCTG-TTTT-TCAAATCTCAAACA--ATGGAATA-----AGCCAGCGTT-TATTTATG-ACCTTAATTACCGACTA--CCCCTG-CCC-GGAGGCAAAACTTGTAATTTTAT-TGGGGGG
Reference ( family-519 ) : AGAATGAATGAATCAATCAATCAAT----C--TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTA-T---GTACAAGTT-TAAACGTTCATGTAT-A--------TGTT---T---TG-T---TA-TAT----G--A----CGTGTAC---ATAGATGAGAC--GAAAAT-AA--AGATAATA--ACT---------ATGAAATGAATG--GTGTTTTG-CGGNA---CG-------AAA-----ATAA--------A---A--------TT--------ATTTAAAGAAATA-TAAAG-GTACTGAGATT--AC-TTCAT-TAAGTTTAGTAA-----TCCG-----AAATAGATATTCTAACTGCAAACATGTTTCATTTTGTGCAT-----------TNTTAT-GT-------------TCGTTTTAT---AGNC-AT-------CGCATTGATATC----GTGTAAT-TAAC--TT--AATACAAGTTNGTTATGATAAACCAATATCAAATGTTTATAA-----ATATT-ACAGCA---TATTG---A--ATTTAAAC----GTTTTCCTAAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAATCCTTGTAC-AA----AAA---------------AAA-CA---GAG-A------CCCC--C-GCCCCGCGCC---------------TGTCTG-TTTT-TCAAATCTCAAACA--ATGGAATA-----AGCCAGCGTT-TATTTATG-ACCTTAATTACCGACTA--CCCCTG-CCC-GGAGGCAAAACTTGTAATTTTAT-TGGGGGG
gi|49170 : AGAATGAATGAATCAATCAATCAAT----C--TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTT-T---GTACAAGTT-TAAACGTTCATATAG-A--------TGTT---T---TG-T---TA-TAT----G--A----CGTTTAT---ATAGATTAGAC--AAAAAT-AA--AGATAATA--ACT---------ATGCAATGAATG--GTGTTTTG-CGGAA---CG-------AAA-----ATAA--------A---A--------TT--------ATTTAAAGAAATA-TAAAG-ATATTGAGATT--AC-TTCAT-TAAGTTTAGTAA-----TCGG-----AAATAGATATTCTAACTGCAAACATGTTTTATTTTGTGTAT-----------TATTAT-GT-------------TTGTTTTAT---AGAC-AT-------CGCATTGATATC----GTGTAAT-TAAC--TA--AATACAAGTTCGTTAAGATAAACAAACATAAAATGTTTATAA-----ATATT-ACAGTA---TATTG---A--ATTTAAAC----GTTTATCTAAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATCTTATAAGTCTTGTAC-AA----AAA---------------AAG-CA---GAG-A------CCCC--C-GCCCCGCGCC---------------TGTCTG-TTTT-TCAAATCTCAAACA--ATGGAATA-----AGCCTGCG-T-TATTTATG-ACCTTAATTACCGACTA--CCCCTG-CCC-GGAGGCGAAACTTGTAATTTTAT-TGGGGGG
gi|49171 : AGAATGAATGAATCAATCAATCAAT----C--TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTT-T---GTACAAGTT-TAAACGTTCATATAG-C--------TGTT---T---TG-T---TA-TAT----G--A----CGTGTAT---ATAACTTAGAC--AAAAAT-AA--AGATAATA--ACT---------ATGCAATGAATG--GTGTTTTG-CGGAA---CG-------AAA-----ATAA--------A---A--------AT--------ATTTAAAGAAATA-TAAAG-GTACTGAGATT--AC-TTCAT-TAAGTTTAGTAA-----TCCG-----AAATAGATATTCTAACTGCAAACATGTTTTATTTTGTGTAT-----------TATTAT-GT-------------TTGTTTTAT---AGAC-AT-------CCCACTGATATC----GTGTAAT-TAAC--TA--AAAACAAGTTCGTTATGATAAACCAATATAAAATGTTTATAA-----ATATT-ACAGCA---TATTG---A--ATTTAAAC----GTTTATCTAAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATCTAACAATCCTTGTACAAA----AAA---------------AAA-CA---GAG-AC-----CCCC--C-GCCCCGCGCC---------------TGTCTG-TTTT-ACAAATCTCAAACA--ATGGAATA-----AGCCAGCGTTGTTTTTTTT-ACCTTAATTAC--A--A--CTCCTG-CCC-GGAGGCGAAACTTATAATAGTAA-GGGGGGG
gi|49172 : AGAATGAATGAATGAATCAATCAAT----C--TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTT-T---GTACAAGTT-AAAACGTTCATATAG-A--------TGTT---T---TG-T---TA-TAT----G--A----CGTGTAT---ATAGATTAGAC--AAAAAT-AA--AGATAATA--ACT---------ATGAAATGAATG--GTGTTTTG-AGGG-----G-------AAA-----AAAA--------ATTAA--------TT--------ATTTAAAGAAATA-TGAAG-GTACTGAGATT--AC-TTCAT-TAAGTTTAGTAA-----TCCG-----AAATAGATATTCTAACTGCGAATATGTTTCATTTTGTGTAT-----------TATTAT-GT-------------TTGTTTTAT---AGAC-AT-------CGCATTTTTATC----GTGTAAT-TAAC--TT--AATACAAGTTCGATATGATCAACCAATATCAAATGTTTATAA-----ATATT-ACAGCA---TATTG---A--ATTTAAAC----GTTTTCCTAAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAATCCTTGTA------------------------------------------------------------CGCC---------------TGTCTG-TTTT-TCAAATCTCAAACA--ATGGAATA-----AGCCAGTGTT-TATTTATG-ACCTTAATCACCGACTA--CCCCTG-CCC-GGAGGCAAAACTTGTAATTTTAT-TGAGGGG
gi|49173 : AGAATGAATGAATGAATCAATCAAT----C--TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTT-T---GTACAAGTT-TAAACGTTCATATAG-C--------TGTT---T---TG-T---TA-TAT----G--A----CGTGTAT---ATAGCTTAGAC--AAAAAT-AA--AGATAATA--ACT---------ATGCAATGAATG--GTGTTTTG-CGGAAGTTCGTTATGATAAACCAATATAA--------A---A---------T--------GTTT--ATAAATATTACAGCATATTGAAATTAAACGTTTATCTAAGATCAGTAA-----
gi|49174 : GAATGAATCAATCAATCAATCAATCAAAC--TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTT-T---GTACAAGTT-TAAACGTTCATATAG-C--------TGTT---T---TG-T---TA-TAT----G--A----CGTGTAT---ATAGATTAGAC--AAAAAT-AA--AGATAATA--ACT---------CTGCAATGAATG--GTGTTTTG-CGGTA---CG-------AAA-----ATAA--------A---A--------TT--------ATTTAAAGAAATA-TAAAG-ATATTGAGATT--AC-TTCAT-TAAGGTTAGTTA-----TCCG-----AAATAGATATTCTAACTGCAAACATGTTTTATTCTGTGTAT-----------TATTAT-GT-------------TTG--TTAT---AGAC-AT-------CGCATTGATATC----GTGTAAT-TAAC--TA--AATACAAGTTCGTTATGATAAACCAATATAAAATGTTTATAA-----ATATT-ACAGCA---TATTG---A--ATTTAAAC----GTTTATCTAAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAATTCTTGTAC-AA----AAA---------------AGG-AA---GAG-A------CCCC--C-GCCCCGCGCC---------------TGTCTG-TTTT-TCAAATCTCAAACA--ATGGAATA-----AACTTGCG-T-TATTTATG-ACCTTAATTACCGACTA--CCCCTG-CCC-GGAGTCGAAACTTGTAATTTTAT-TTGGGGG
gi|49175 : GAATCAATCAATCAATCAATCAAT----C--TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTC-T---GTACAAGTT-TAAACGTTCATGTAG-A--------TGTT---T---TG-T---TA-TAT----G--A----CGTGTAT---ATAGATTAGAC--AAAACT-AA--AGATAATA--ACT---------ATGAAATGAATG--TTGTTTTG-CGGAA---CG-------AAA-----ATAAAATTATTTA---A--------TT--------ATTTAAAGAAATA-TAAAG-GTACTGAGATT--AC-TTCAT-TAAGTTTCATAGTTCGTTCTG-----AAATAGATATTCTAACTGCAAACATGTTTCATTTTGTGTAT-----------TTTTAT-GT-------------TTGTTTTAT---AGTC-AT-------CGCATTGATATC----GTGTTAT-TAAC--TC--AAT----GTTT------ATAAA--------------------------TATT-ACAGCA---TATTG---A--ATTTAAAC----GTTTTCCTAAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAATC
gi|49176 : GAATGAATGAATCAATCAATGAAT----CAATCATAAAAAAT--T--TTTAGAATGACTT-T---GTACAAGTT-TAAACGTTCATATAG-A--------TGTT---T---TG-A---TA-TAT----G--A----CGTGTAT---ATAGATTAGAC--AAAAAT-AA--AGATAATA--ACT---------ATGAAATGAATG--GTGTTTGG-CAGAA---CG-------AAA-----ATAAAATTATTTA---A--------TT--------ATTTAAAGAAATA-TAAAG-GTACTGAGATC--AC-TTCAT-TAAGTTTAGTAA-----TCCG-----
gi|49177 : AAAGAATGAATGAATCAATCAAT----C--TTAT----AATTCT--TTTAGAATCGCTT-T---GTACAAGTT---------CATATAG-C--------TGTT---T---TG-T---TA-TAT----G--A----CGTGTAT---ATAGATTAGAC--AAAAAT-AA--AGATAATT--ACT---------ATGAAATGAATG--GTGTTTTG-CGGAA---CG-------AAA-----ATAA--------A---A--------TTATTTAATTATTTAAAGAAATA-TAAAG-GTACTGCGATT--AC-TTCAT-TAAGTGTAGTAA-----TCCG-----AAATAGATATTCTAACTGCAAACATGTTTCATTTTGTGTAT-----------TATTAT-GT-------------TTGTTTTAT---AGAC-AT-------CGCATTGATATC----GTGTAAT-TAAC--TA--AATACAAGTTC-----GATAAACCAATATCAAATGTTTATAA-----ATATT-ACAGCA---TATTG---A--ATTTAAAC----GTTTTCCTAAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATCTAAAAATCCTTGTCCAAA----AAA---------------AAA-CA---GAG-AC-----CCCC--C-GCCCCGCGCC---------------TGTCTG-TTTT-TCAAATCTCAAACA--ATGGAATA-----AGCCAGTGTT-TATTTATG-ACCCTAATTACCGACTA--CTCCTG-CCC-GGAGGCAAAACTTGTAATTTTAT-TGGGGGG
gi|49178 : AATCAATCAATCAATCAATCAAT----C--TTAT----AATTCT--TTTAAAATGGCTT-T---GTACAAGTT-TAAACGTTGATGTAG-A--------TGTT---T---TG-T---TA-TAT----G--A----CGTGTAT---ATAAATTAGAC--AAAAAT-AA--AGATAATA--ACT---------ATGAAATGAATG--GTGTTTTG-CAGAA---CA-------AAA-----TTAA--------A---A--------TT--------ATTAAAAGAAATA-TAAAG-GTACTGAGATT--AC-TTCAT-TAAGTTTAGTAA-----TC
gi|49179 : AATTAATCAATCAATCAGT----C--TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTT-T---GTACAAGTT-TAAACATTCATATAG-C--------TGTT---T---TG-T---TA-TAT----G--A----CATGTAT---ATAGATAAGAC--AAAAAT-AA--AG--------------------ATGAAATAAATG--GTGTTTTA-C
gi|49179 : A---CA-------AAA-----ATAA--------A---G------------------AT-----GAAATA--AATG-GTGTT----TT--AC-TTCAT-TAAGTTTAGTAA-----TCCA-----AAATAGATATTCTAACTGCAAACATGTTTCATTTTGTGTAT-----------TATTAT-GT-------------TTGTTTTAT---AGAC-AT-------CGCATTGATATT----GTGTAAT-TAAC--TT--AATACAAGTTCGTTATGATAAACCAATATCAAATGTTTATAA-----ATATT-ACAGCA---TTTTG---A--ATTTAAAC----GTTTTCCTAAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATTTAATAATCCTTGTAC-AA----AAA---------------AAA-CA---GAG-ACGAGACCCCC--C-GCCCCGCACC---------------TGTCTG-TTTT-TCAAATCTCAAACA--ATGAAATA-----AGCCAGTGTT-TATTTATG-ACCTTAATTACCGACTA--CCCCTG-CCC-GGATGCAAAACTTGTAACTTTAT-TGGGGGGttcattaagtttagtaatccaaaatagatattctaactgcaaacatgtttcattttgtgtattattatgtttgttttatagacatcgcattgatattgtgtaattaacttaatacaagttcgttatgataaaccaatatcaaatgtttataaatattacagcattttgaatttaaacgttttcctaagatcagtaaagtaatatgtaaatttaataatccttgtacaaaaaaaacagagacgagaccccccgccccgcacctgtctgtttttcaaatctcaaacaatgaaataagccagtgtttatttatgaccttaattaccgactacccctgcccggatgcaaaacttgtaactttattgggggg
gi|49180 : aattaatcaatcaatcagtcttataattcttttagaatggctttgtacaagtttaaacattcatatagctgttttgttatatgacatgtatatagataagAATTTAT----C--ATAT----AATTCT--TTTAGAATGTCTA-T---GTAGAAGTT-TAAACGTTCATGTAT-A--------TGTT---TTAATA-T---TA-TGT----G--A----TGTGTAC---ATAGATGAGACGAGAAAAA-AA--AGATAATA--CTT---------AT
gi|49181 : AATGAAT----C--TTAT----AATTCT--TTTAGAGTGGCTA-TGCCGTACCATTT-TAAAATCACATGAATAA--------TATT---T---TA-T---TT-TGT----G--T----TATATAC---CTTAATGAGAT--GAAAAT-AA--AGATAGTATTACT---------AT
gi|49182 : AT----C--TTAT----AATTCT--TTTAGAAAGGCTA-T---GTACAAGTT-TAAACGTTCATGTAT-A--------TGTT---T---TG-T---TA-TAT----G--A----TGTATATGTTATAGATGAGAT--GAAAAT-AA--AAATAATA--CCT---------ATAAAATGAATG--ATGTTTTG-CAGCA---CG-------AAA-----ATAA--------A------------TT--------ATTTAAAGAAATA-TAATG-GTACTGAGATT--AC-T--A---AAGTTTGATAA-----TCCGTTCTGAAATAAATATTTTAACTGCAAACATATTTCATTTTGTGCAT-----------GTTTGT-GT-------------TCGTTTTAT---AGTC-AT-------CACATTGATATC----GTGTATT-TAAC--TT--AATACAAGTTAGTTATGCTAGACCATTATCAAATGTTAATAAGTATTACATT-ACAGCA---TATTG---A--ATTTAAAC----GTTTTCCTAAGATCAGTAAAATAATATGCAAATCTAATAACTCTTGTA
gi|49183 : T----C--TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTA-T---GTACAAGTT-TAAACGTTCATGTAT-AATTTA---TGTT---T---TG-T---TA-TAA----G--A----TGTGTA-------GATGAGAC--GAAAAG-AA--AGATAATA--CCT---------ATGAAATGAATG--GTGTTTTG-CGGCA---CG-------AAA-----ATAT--------A---A--------TT--------ATTTAAAGAAATA-TAATG-GTACTGAGAAT--AC-TTCCT-AAAGTTTGATAA-----TCCG-----AAATAAATATTTTAACTGCAAACATGTTTCATTTAGTGCAT-----------GTTTAT-GT-------------TCGTTTTTC---AGTC-AT-------CGCATAGATATC----GTGTAAT-TAAC--TTTTAAAACAAGTTCGTTAAGATAATCCAATATCAAATGTTTAT-----------------CA-----------A--ATTTTAAC----GTTTTCCTAAGATCAGTGAAATAATATTCAAATCTAATAATCCTTGTAC-AA----A---------------------TA---TCG-C------CCCC--C-ACCCACCCCC---------------TGTCTG-TGTT-TCAAGTCTCAAACA--ATGCGATA-----AGCCAGTGTC--ATTTATG-AACTTAATTACCCCCTA--CCCCTG-CCCCGGAGGCAAAACTTGTTCTTTTAT-TGGGGG
gi|49184 : T----C--TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTC-T---GTACAA--------CGTTCATGTAT-AATTTA---TATT---T---TG-T---TA-TAT----G--A----TGTG------A-AGATGAGAC--GAAAAG-AA--AGATAATA--CCT-----------GAAATGAATG--GTGTTTTG-CGGCA---CG-------AAA-----ATAA--------A---ACTATCTAATT--------ATTTAAAAAAATA-TAATG-GTACTGAGATT--AC-TTCCT-AAAGTTTGATAA-----TCCC-----AAATAGATATT-TAACTGCAAACATGTTTCATTTTATGCAT-----------GTTTAT-GT-------------TCGTTTTTT---AGTC-AT-------TGCATAGATACC----GTTTAAT-TAAC--TTTTAATACAAGTTAGTTAAGATAAACCATTATCAAATGTTTATAG-----ATATT-ACAGAA---TTTTT---A--ATTTAAAC----GTTTTCCTAAGATCAGTAAAATAATATTCAAATCTGATAATCCTTGTAC-AA----AAAAACAAAAACAAAAAGAAA-CA---AAGCA------CACC--C-TCCC----AC---------------TGTCTG-TGTT-TCAGGTCTCAAACA--ATGCGATA-----AACCAGTGTT-TATTTATG-AACTTAATTACC-CCTA--CCCCTGCCCC-GGAGGTAAAACTCGTAATTTTAT-TGGGG
gi|49185 : T----C--TTAT----AATTCT--TTTAGAATGACTA-T---GCACAAGTT-TAAACGTTCATGTAT-AATTTA---TGTT---T---TG-T---TA-TAT----G--A----CGTGTA-------GATGAGAC--AAAAAG-AA--AAATAATA--CCT---------ATGAAATGAATG--GTGTTTTG-CGGCA---CG-------AAA-----ATAT--------A---A--------TT--------TTTTAAAGAAATA-TAATG-GTACTGAGAAT--AC-TTCCT-AAAGTTTGATAA-----TCCG-----AAATAAATATTTTAACTGCAAACATGTTTCATCTAGTGCAT-----------GTTTAT-TT-------------TCGTTTC-T---AATTAAT-------CGCATGGATATC----ATGTAAT-TCACTTTT--AAAACAAGTTAGTTAAGATAATCCATTATCAAATGTTTATAA-----ATATT-ACAGAAT--TTTTA---A--ATTT-AAC----GTTTTCCTAAGATCAGTGAAATAATATTCAAATCTAATAATCCTTGTAC-AA----AAA----------------------------A------CCCC--C-A----GAG------------------------------CAAA---CAA------TGCGATA-----AGCCAGTG-T-CATTTATG-AACTTAATTACCCCATA--CCCCTGCCCC-GGAGGCAAAACTTGTAATTTTAT-TGGGGG
gi|49186 : T----C--TTAT----CATTCT--TTTAGAATGGCTA-T---GTACATGTT-TAAACGTTCATGTAT-AATTTA---TGTT---T---TG-T---TA-TAT----G--A----TGTGTA-------GATGAGAC--GAAAAG-AA--AGATAATA--CCT---------ATGACATGAATG--GTGTTTTG-CGGCA---CG-------AAA-----ATAT--------A---A--------TT--------TTTTAAAGAAATA-TAATG-GTACTGAGAAT--AC-TTCCT-AAAGTTTGATAA-----TCCG-----AAATAAATATTTTAACTGCAAACATGTTTCATTAAGTGCAT-----------GTTTAT-TT-------------TCGTTTTTT---AGTC-AT-------CGCATAGTTATC----GTGTAAT-TAACTTTT--AAAACAAGTTAGTTAAGATAATCCGTTATCAAATGTTTATAA-----ATATT-ACAG-ATTTTTTTT---A--ATTT-AAC----GTTTTCCTAAGATCAGTGAAATAATATTAAAATCTAATAATCGTTGTAC-AA----AAA---------------A------------A------CCCC--C-A----GAG------------------------------CAAA---CAATCA-------ATA-----AGCCAGTG-T-CATTTATG-AACTTGATTACTCCCTA--CCCCTGACGC-GGAGGCAAAACATGTAATTTTAT-TGGGGG
gi|49187 : T----C--TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTA-T---GTACAAGTT-TAAACGTTCATGTAT-A--------TGTT---T---TA-T---TATTAT----GTAA----TATGTAC---ATAGATGAGAA--GAAAAT-AA--AGATAAT---ACT---------G-GAAA-GAA
gi|49188 : T----C--TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTA-T---GTTAAAGTT-TAAACGTTCATGTAT-AATTTA---TGTT---T---TG-T---TA-TAT----G--A----TGTGTA-------GATGAGAC--GAAAAG-AA--AGATAATA--CCT---------AGGAAATGAATG--GTGTTTTG-TGGCA---CG-------AAA-----ATAT--------A---A--------TT--------ATTTAAAGAAATA-TAATG-GTACTGAGAAT--AC-TT-A---AAGTTTGATAA-----TCCG-----AAATAAATATTTTAACTGCAAACATGTTTCATTTAGTGCAT-----------GTTTAT-GT-------------TCGGTTTTC---AGTA-AT-------CGCATAGATATC----GTGTAAT-TAACTTTT--AAAACAAGTTAGTTAAGATA-------ATCCAATGTT-------------------------TATTA---A--ATTTTAAC----GTTCTCCTAAGATCAGTGAAATAATATTCAAATCTAATAATCCT
gi|49188 : -TCAAGTCTCAAACA--ATGCGATA-----AGCCAGTG-T-CATTTATG-AACTTAGTTACCCCCTA--CCCCTGCCCC-GGAGGCAAAACTTGTACTTTTATATGGGGcaagtctcaaacaatgcgataagccagtgtcatttatgaacttagttaccccctacccctgccccggaggcaaaacttgtacttttatatgggg
gi|49189 : tcttataattcttttagaatggctatgttaaagtttaaacgttcatgtataatttatgttttgttatatgatgtgtagatgagacgaaaagaaagataatacctaggaaatgaatggtgttttgtggcacgaaaatataattatttaaagaaatataatggtactgagaatacttaaagtttgataatccgaaataaatattttaactgcaaacatgtttcatttagtgcatgtttatgttcggttttcagtaatcgcatagatatcgtgtaattaacttttaaaacaagttagttaagataatccaatgtttattaaattttaacgttctcctaagatcagtgaaataatattcaaatctaataatccT----C--TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTA-T---GTACAATTT-TAAACGTTCATGTAT-A--------TGTTTGAT---TA-T---TA-TGT----G--A----TAAGTAC---ATAGATGAGAC--GAAAAT-AA--AGATAATACTACT---------ACGTAAT
gi|49190 : T----C--TTAT----TATTCT--TTTAGAATGGCTA-T---GTACAAGTT-TAAACGTTCATGTAT-AAATTATGGTGTA---T---TA-T---TA-TGT----G--A----TATGCAC---ATAGATGAGAC--GAAAAT-AA--AGATAAT---ACT---------ATAAA
gi|49191 : T----C--TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGTTA-T---GTACAATTT-TAAATGTTCATGTAT-A--------TGTTTTAT---TA-T---TA-TGT----G--A----TAAGTAC---ATAGATGAGAC--AAAAAT-AA--AGATAATACTACT---------A
gi|49192 : T----C--TTAT----AATTCT--TTTAGAATGATTA-T---GTACAATTT-TAAACGTTCATATAT-A--------TGTTTTAT---TA-T---TA-TGT----G--A----TCAGTAC---ATAGATGAGAC--GAAAAT-AA--AGATAAT---ACT---------A
gi|49193 : T----C--TTCT----AATTCT--TTAAGAATGGCTT-T---GTTCAATTT-TAAACGTTCATGTAT-A--------TGTT---T---TA-TTAGTA-TAT----G--A----AGTGTAC---ATAGTTGAGAC--GAAAAT-AA--AGATAGT---ACTGAGTAAATAATGAAAAGAATACCATGTCTGGTCTGAA----G-------AAA-----ATA
gi|49194 : T----C--TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTA-T---GTACAATTT-TAAACGTCCATGTAT-A--------TGTTTGAT---TA-T---TA-TGT----G--A----TTAGTAC---AAAGATGAGAC--GAAAAT-AA--AGATAATACTAAT---------ACAAAAT
gi|49195 : T----C--TTAT----AATTCT--TTTAGAATGGCTA-T---ATACAAGTT-GAAAAGTTCATGTCA-C--------TGTT---T---TA-T---TA-TAC----G--A----AATGTAC---ATAGATGAGAC--
gi|49196 : T----C--TTAT----ATTTCT--TTTAGAATGGCTG-T---GTGCAAGTT-TAAACGTTCTTGTTT-C--------GGTG---T---TA-T---GA-AAT----G--A----TGTGTAC---AAATATGAGAC--GAAAAT-AA--AGGTAACA--
gi|49197 : T----C--TTAT----AATTCT--TTTAGAATTGCTA-T---GTGTGCGTT-GAAACGTCCACGTAT-C--------TGTT---T---TA-T---TA-TAT----G--A----TATATAG---ATAGATGATAC--GAAACT-AAATAGATActctacttaaatacattgaaaggcgtgaaagagaatataa
gi|49198 : T----C--TTGT----AATTCTAATTTAGAATGGCTA-T---GTAC--GTTGTATAGATT-A-GTGT-A--------TGTT---T---TATT---TA-TAT----G-------TTTGTAC---ATAGATGAGAC--TTTAAT-AA--AGA-AATA--AAG---------ATGAA
gi|49199 : --TTAT----AATTCT--TTCAAAATGGCTA-T---GGTCAAGTT-TAAACATTCATGTAA-A--------TGTT---T---TA-T---TA-TAT----G--T----TATGTAC---ATAGATGAGAG--GAAAAT-AA--AAATAA
gi|49200 : ----AATTCT--TTTAGAATGGCTA-T---GAACAA---------GTTCATGTAT-A--------TGTT---T---TA-T---TA-TAC----G--ATAATTATGTAC---ATAGACAAGAC----AAATAAA--AGACAAT---ACT---------A
gi|49201 : TTATAATGACCAAT---GTACAAGTT-TAAACGTTCCTGTAT-A--------TG---------TA-T---TA-TATACTGG--A----TATGTAC---ATAGATGAGACA-AAAAAT-AA--AG
gi|49202 : T---T---TG-A---TA--AT----G--A----CGTGTAT---ATAGCTTAGAC--AAAAAT-AA--AGATAATA--ACT---------ATGCAATGAATG--GTGTTTTG-CAGAA---CG-------AAT-----ATAA--------A---A--------TT--------ATTTAAAGAAATA-TAAAG-GTACTGAAATT--AC-TTCAT-TAAGTTTAGTAA-----TCCG-----AAATAGATATTCTAACTGCAAACATGTTTTATTTTGTGTAT-----------TATTAT-GT-------------TTGTTTTAT---AGAC-AT-------CGCATTGATATC----GTGTAAT-TAAC--TA--AATACAAGTTTGTTATGATAAACCAATATAAAATGTTTATAA-----ATATT-ACAGCA---TATTG---A--ATTTAAAC----GTTTATCTAAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAATCCTTGTAC-AA----AAA---------------GAA-CA---GAG-AC-----CCCC--C-GCCCCGCGCC---------------TGTCTG-TTTT-TCAAATCTCAAACA--AAGGAATA-----AGCCAGCGTT-TTTTTATG-ACCTTAATTACCGACTA--CCCCTG-CCC-GGAGGCGAAACTTGTTATTTTAT-TTGGGGG
gi|49203 : T---------ATGAAACGAATT--GTGTTTTA-TGGCA---TG-------AAA-----ATA-----------------------------------TAA--------TA----GTACTGAGATT--AC-TTCCT-CAAGTT------------CTG-----AAACAAATATTTTAACTACAAACATGTTTCTTTTTGTACAT-----------TTTTAT-GT-------------TCGTTACAT---GGTC-AT-------CGCATTTATGTC----ATGTA----------------ACATGTTAGTAATAATAGACCATTATCAAATGTTTATAA-----ATATT-ACAGCA---TATTG---ATTTTTTTACT----TTTTTTTTAAGATCAGTAAAATAATATACAAATCTAATAATCGTTGTAC-AA----
gi|49204 : -TAAAG-GTACTGAGATT--AC-TTCAT-TTAGTTTAGTTA-----TCCGTTCTGAAATAGATATTTTTACTGCAAACATGTTTCATTTTGTGTATTTTTATGTTTGTTTTATAGTCATCGCATTGATATCGTGTAATCAGAGAC-ATAATAAGATGTATT-ATGTCTCTGGTGTTAT-TTAC--TC--AATACAAGTTAGTTATGATAAACCAATATCAAATGTTTATAA-----ATATT-ACACTT---TATTG---A--ATTTAAAC----GTTTTCCTTAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAGTCA-TGTAC-AACAACAAA---------------AAA-CA---GAG-C------CCTT--T-CCCTCCCGCC---------------TGTCTGTTTTT-TCAAATCTCAAACA--ATGGAATA-----AGCCAGTGTT-TATTTATG-AC-----------ATTA--CCCCTG-CCC-GGAGGCAAAAC------TTTTAT-TGGGGG
gi|49205 : ATTCATAAC----ATATAATGTAAC--TTTTAAAACAAGTTAGTTAAGATAATCCATTATCAAATGTTTATTA-----ATATT-ACAG-A---TATTTTTTA--ATTTTAAC----GTTTTCCTAAGATCAGTAAAATAATATTCAAATCTAATAATCCTTGTAC-AA----AAA---------------CAA-
gi|49206 : GTAAT-CCGT--TC--AATACAAGTTAGTTATGATAAACCAATACCAAAGGTTTATAA-----ATATT-ACAGCA---TATTG---A--ATTTAAATTTGAATCTTACCAAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATCTAATAATCCTTGTAC-AA----AAA---------------AAga
gi|49207 : AAGTTCGTTATGATAAACCAATATAAAATGTTTATAA-----ATATT-ACAGCA---TATTG---A--AATTAAAC----GTTTATCTAAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATCTGATAATCCTTGTAC-AA----AAA---------------AAA-CAACAGAG-AA-----CCCC--C-GCCCCGCGCC---------------TGTCTG-TATT-TCAAATCTCAAACA--ATGGAATA-----AGCCAGCGTT-TTTTTATG-ACCTTAATTACCGACTA--TCCCTG-CCC-GGAGGCAAAACTTGTAATTTTAT-TGGGGGG
gi|49208 : TATCAAATGATTATAA-----ATTTT-ACAGCA---TGTTG---A--ATTTAAAT----GTTTTCCTAAGATCAGTAATGTAATATGTAAATCTAATAATCCTTGTAC-AA----AAA---------------AAA-CA---GAG-C------CCCC--C-CCCCCCCCCCCCCCACACACCCTCCTGTCTG-TTTTTTCAAATCTCAAACA--ATGGAATA-----AGCCAGTGTT-TATTTATG-ACATTTATTACAGACTA--CCCCTG-CAT-GGAGGCAAAACTTATAA
gi|49209 : -----ATATTCATAACA---TATTG---A--ATTTAAAC----GTTTATCTAAGATCAGTAAAGTAATATGTAAATGTAATAATCCTTGTAC-AA----AAA---------------AAAACA---GAG-A------CCCC--CCGCCCCGCGCC---------------TGTCTG-TTTT-TCAAATCTCAAACA--ATGGAATA-----AGCATGCGTT-TTTTTATG-ACCTTAATTACCGACTA--CCCCTG-CCC-GGAGGCGAAACTTGTAATTTTAT-TGAGGGG
gi|49210 : A----AAA---------------AAA-CA---GAGCA------TCCCTCC-GCCCCA-ACC---------------AATCTG-TGTT-TCAAGTCTCAAACA--ATGCGATA-----AGCCAGTG-T-TGTTTATG-AACTTAATTACC--CCATTCCCCTGCCCC-GGAGGCAAAACTTGTAATTTTAT-TGGGGG
gi|49211 : ------CCCC--C-CCCCCCCCCC---------------TGTCTG-TGTT-TCAAGTCTCAAACA--ATGCGATA-----AGCCAGTGTC--ATTTATG-AACTTAATTACCCCCTA--CCCCTG-CCCCGGAGGCAAAACTTGTACTTTTAT-TGGGGG
gi|49212 : CCCCGCC---------------TGTCTG-TGTT-TCAGGTCTCAAACATAATGGGATATTTAAAGCGAGTATT-TATTTATT-ACCTTAATTACTCCCTA--CCCCTG-CCCCGGGGGCAAAACTTGCAATTTAAT-TGGGGG
gi|49213 : ccttTTT-TTAATTCT-AAAC----TTGATTATTTGCAGCCAGTGTT-TTTTTATG-ACCTTAACTATCGACTT--TCCCTG-CCC-GGAGGCAAAACTTGTAATTTTAT-TGGGGG
gi|49214 : GGAATA-----AA--AGAATC-TATCTATCTACCTTAATTACCCCCTA--CCTCTGTCCC-GGAGGCAAAACTTGTAATTTTAT-TGGGGG