lowQualScore : 1 1 1 11 1 0 111 1 1 44444 0 3 0
lowQualScore : . . . .. . . ... . . ..... . . .
lowQualScore : 9 5 8 22 8 9 666 4 8 55555 9 1 9
consensus : TTAATGTGTATATTGAA-TGTAT--G-ACTA-CC---ATGTAT-A----TTGTGAA-TAAAATANTG-TTTAAACTAA
Reference ( gi|107881 ) : TTAATATGTATATTGAA-TGTAT--G-ACTA-CC---ATGTAT-A----CTGTGAA-TAAAATATTG-TTTAAACTAA
gi|107882 : TTAATGTGTGTATTGAA-TGTAT--G-ACTA-CC---ATGTTT-A----TTGTGAA-TAAAATTTTG-TTTAAACTAA
gi|107883 : TTAATATGTTTATTGAA-TGCAT--G-ACTA-CC---ATGTAT-ATTTTTTGTGAA-TAAAACATTG-TTTAAACTAAa
gi|107884 : TTAATATGTTTATTGAA-TGTAT--G-ACTA-CC---ACGTAT-A----TTGTGAA-AAAAACAGTG-TTTAAACTAAa
gi|107885 : TTAATATGTATATTGCA-TATAT--G-ACTA-CC---ATGTAT-G----TTGTGAA-TAAAACCGTG-TTTAAACTAAa
gi|107886 : TCAATATGTATTTTGAA-TGTAT--G-ACTA-CC---GTGCAT-A----TTGTGAA-TAAACTATTG-TTTTAACTAAa
gi|107888 : TTAATATGTTTATTGAA-TGTAT--G-ACTA-CC---ATGTAT-A----TTGTGAA-TAAAACCTTG-TTGAAAa
gi|107889 : TTAAAGTGTATATTGAA-TGTAT--G-ACTA-CT---ATGTTT-A----TTGGGAA-TAAAATAATG-TTTTAACTAA
gi|107893 : TTCATTTGT-TATTGAA-TATAT--G-ACTA-CC---ATGTTA-A----CTGTGAA-CAAAATAGTG-TTTAAACTAA
gi|107894 : TTAATGTTTATATTGAA-AGTAT--G-ACTA-C----GTGTAT-G----CTGTGAA-CGACATATTG-TTTAAACTAAa
gi|107890 : TTCATTTGTATATTGAA-TGTAT--G-ACTA-CC---ATGTAT-A----TTGTTAA-TTAAAAAATA-CTTAAACTAA
gi|107891 : TTTATGTGTATACTTAA-TGTAT--G-ACTC-AC---ATGTAT-A----TTGTGAA-TAAAATATAGTTTTAAACTa
gi|107892 : TTAATGTGTATATTGAA-TGTAT--A-ACTA-CT---ACGTTC-A----TTGGGAA-TGAAAGA-TG-TTTAAAC
gi|107897 : TTAATGTGTATTTTTAA-TGGGT--G-ATTA-CC---AAGTAT-A----TTGTGAA-TAAAACAATG-TTTTAATTA
gi|107898 : TTCATGTGTATATTGAA-AATAT--G-A-TATCC---ATGTAT-G----TTGTGAT-AAAAATGTTA-TTTAAACTAA
gi|107899 : TAATATGTTTATTGAA-TGTAT--G-ACTA-CC---ATGTAT-A----TTGTGAA-TAACACATTG-TTTAAACTGAa
gi|107900 : AATGTATATACTGAA-TGTAT--G-ACTA-CC---ATGTTT-A----TTGTGAA-TAAAATATTG-TTTAAACTa
gi|107902 : AATGTGTATATAGAA-TATAT--G-ATAA-CC---ATGCAT-G----TTGTGAA-TAAAATAGTG-TTTAAATCAA
gi|107903 : AATGTTTATATTGAAATGTTT--GTACAA-AT---ATGTATTA----TTGTGAA-TAAAATATTG-TTTAAACTAA
gi|107901 : AATGTGTATATTGAA-TATATACG-ACAA-CC---CTGTTC-A----TTGAGGA-TAGAATATTG-TTTAAACTA
gi|107904 : AATGTTTATATTGAAATGTTT--GTACAA-AC---ATGTATTA----TTGTGAA-TAAAATACTG-TTCAAACTA
gi|107905 : AATGTGTATATTGAT-AATCT--G-ATTA-CC---ACGCAT-G----TTGTGAT-TAAAATGTTG-TTTTAACTAA
gi|107906 : ATATGTATATTGAA-TGTAT--G-ACTA-CC---ACGTAT-A----TTGTGAA-CAAAATATTG-TTTAAACTa
gi|107907 : ATGTGCATATTAAA-TGTAT--A-ACTA-CCCAAATGTAT-A----ATGTGAA-TCAAATGATG-TTTAAAtaaa
gi|107896 : ATGTATATTAAC-TGTAT--G-GCTA-CC---ATGTAT-A----TTGTGAACT----TATTG-TTTAAACTA
gi|107911 : ttactgaTGTA-ATTGAA-TGTAT--G-ACTA-CC---ATGTTT-A----CTGTGAA-CAAAATAGTG-TTTAAACTAA
gi|107910 : TGTATATTGAA-TCTAT--G-ACTA-TC---ATGTGT-A----TTATGAA-TAAAATATTG-CTTAAACTAAa
gi|107918 : TGTA-ATTGAA-TGTAT--G-ACTA-CC---ATGTTT-A----CTGTGAA-CAAAATAGTG-TTTAAACTa
gi|107913 : TGTA-ATTGAA-TGTAT--G-ACTA-CC---ATGTTT-A----CTGCGAA-CAAAATAGTG-TTTAAACTAAtaa
gi|107914 : TGTA-ATTGAA-TGTAT--G-ACTA-AC---ATGTTT-A----CTGTGAA-CAAAATAGTG-TTTAAACTAAa
gi|107917 : TGTA-ATTGAT-TGTAT--G-ACTA-CC---ATGTTT-A----CTGTGAA-CAAAATAGTG-TTTAAACTAAa
gi|107916 : TGTA-ATTGAA-TGTAT--G-ACTT-CC---ATGTTT-A----CTGTGAA-CAAAATAGTG-TTTAAACTAAa
gi|107915 : TGTA-ATTGAA-TGTAT--G-ACTA-CC---AAGTTT-A----CTGTGAA-CAAAATAGTG-TTTAAACTAAa
gi|107912 : TGTATATTGAA-AGTAC--G-ACTA-CC---ATGTAT-A----TTGTGAA-TAAAATAGTG-TCTATACTa
gi|107920 : TGTA-ATTGAA-TGTAT--G-ACTA-AC---ATGTTT-A----CTGCGAA-CAAAATAGTG-TTTAAACTAA
gi|107919 : TATATATTGAA-GAGAT--G-ACCA-CC---ATGCAT-A----TTGTAAA-TAAAATATTG-TTTAAACGAAa
gi|107921 : TGTA-ATTGAA-TGTAT--G-ACTT-AC---ATGTTT-A----CTTTGAA-CAAAATAGTG-TTTAAACTAAa
gi|107895 : TGCATATTGAA-TGTAT--G-ACTA-CC---ATGTTT-A----TATTAAA-TAAAATATTG-TTTCAAATAAa
gi|107908 : ttgaggTGTATATTGAA-TGTAT--G-ACTA-CC---ATGTAC-A----GTGTGAA-T----TGTTA-TTTA
gi|107909 : gTGTATATTGAA-TGTAT--G-ACTG-CC---ATGTAC-A----GTGTGAA-T----TGTTA-TTTA
gi|107887 : gGTATATTGAA-TGTAT--G-ATTA-CC---ATGCTT-A----TGGTGAA-TAGAATATTG-TTTAAACTAA
gi|107922 : ttggtggTATGGAA-TATAT--G-ACTA-A----ATGTAT-A----TTGTAAA-TAAAATACTG-TTTAAACTAAa
gi|107923 : TATGAAA-TATAT--G-ACTA-A----ATGTAT-A----TTGTAAA-TAAAATACTG-TTTAAACTAA
gi|107924 : ATTTAA-TATAT--G-ACTA-CC---ATGTAT-A----TTGTGAA-TAAAATATTG-TTTAAACT
gi|107925 : -TGTAT--G-ACTA-CC---ATGTAT-A----TTGTGAT-TAAAGTATTG-TTTAAACTAAtaa
Alignments
lowQualScore : 11 1 1 11 1 0 111 1 1 1111 0 1 0
lowQualScore : .. . . .. . . ... . . .... . . .
lowQualScore : 33 3 8 22 8 9 666 2 8 9999 9 9 9
consensus : TTAATG--TGTATATTGAA-TGTAT--G-ACTA-CC---ATGTAT-A----TTGTGAA-TAAAATANTG-TTTAAACTAA
Reference ( family-518 ) : TTAATG--TGTATATTGAA-TGTAT--G-ACTA-CC---ATGTAT-A----TTGTGAA-TAAAATANTG-TTTAAACTAA
gi|107881 : TTAATA--TGTATATTGAA-TGTAT--G-ACTA-CC---ATGTAT-A----CTGTGAA-TAAAATATTG-TTTAAACTAA
gi|107882 : TTAATG--TGTGTATTGAA-TGTAT--G-ACTA-CC---ATGTTT-A----TTGTGAA-TAAAATTTTG-TTTAAACTAA
gi|107883 : TTAATA--TGTTTATTGAA-TGCAT--G-ACTA-CC---ATGTAT-ATTTTTTGTGAA-TAAAACATTG-TTTAAACTAAa
gi|107884 : TTAATA--TGTTTATTGAA-TGTAT--G-ACTA-CC---ACGTAT-A----TTGTGAA-AAAAACAGTG-TTTAAACTAAa
gi|107885 : TTAATA--TGTATATTGCA-TATAT--G-ACTA-CC---ATGTAT-G----TTGTGAA-TAAAACCGTG-TTTAAACTAAa
gi|107886 : TCAATA--TGTATTTTGAA-TGTAT--G-ACTA-CC---GTGCAT-A----TTGTGAA-TAAACTATTG-TTTTAACTAAa
gi|107887 : TTGGTG--GGTATATTGAA-TGTAT--G-ATTA-CC---ATGCTT-A----TGGTGAA-TAGAATATTG-TTTAAACTAAa
gi|107888 : TTAATA--TGTTTATTGAA-TGTAT--G-ACTA-CC---ATGTAT-A----TTGTGAA-TAAAACCTTG-TTGAAAa
gi|107889 : TTAAAG--TGTATATTGAA-TGTAT--G-ACTA-CT---ATGTTT-A----TTGGGAA-TAAAATAATG-TTTTAACTAA
gi|107890 : TTCATT--TGTATATTGAA-TGTAT--G-ACTA-CC---ATGTAT-A----TTGTTAA-TTAAAAAATA-CTTAAACTAA
gi|107891 : TTTATG--TGTATACTTAA-TGTAT--G-ACTC-AC---ATGTAT-A----TTGTGAA-TAAAATATAGTTTTAAACTa
gi|107892 : TTAATG--TGTATATTGAA-TGTAT--A-ACTA-CT---ACGTTC-A----TTGGGAA-TGAAAGA-TG-TTTAAAC
gi|107893 : TTCATT--TGT-TATTGAA-TATAT--G-ACTA-CC---ATGTTA-A----CTGTGAA-CAAAATAGTG-TTTAAACTAA
gi|107894 : TTAATG--TTTATATTGAA-AGTAT--G-ACTA-C----GTGTAT-G----CTGTGAA-CGACATATTG-TTTAAACTAAa
gi|107895 : TTGAGG--TGCATATTGAA-TGTAT--G-ACTA-CC---ATGTTT-A----TATTAAA-TAAAATATTG-TTTCAAATAA
gi|107896 : TTACTGAATGTATATTAAC-TGTAT--G-GCTA-CC---ATGTAT-A----TTGTGAACT----TATTG-TTTAAACTA
gi|107897 : TTAATG--TGTATTTTTAA-TGGGT--G-ATTA-CC---AAGTAT-A----TTGTGAA-TAAAACAATG-TTTTAATTA
gi|107898 : TTCATG--TGTATATTGAA-AATAT--G-A-TATCC---ATGTAT-G----TTGTGAT-AAAAATGTTA-TTTAAACTAA
gi|107899 : TAATA--TGTTTATTGAA-TGTAT--G-ACTA-CC---ATGTAT-A----TTGTGAA-TAACACATTG-TTTAAACTGAa
gi|107900 : AATG--TATATACTGAA-TGTAT--G-ACTA-CC---ATGTTT-A----TTGTGAA-TAAAATATTG-TTTAAACTa
gi|107901 : AATG--TGTATATTGAA-TATATACG-ACAA-CC---CTGTTC-A----TTGAGGA-TAGAATATTG-TTTAAACTA
gi|107902 : AATG--TGTATATAGAA-TATAT--G-ATAA-CC---ATGCAT-G----TTGTGAA-TAAAATAGTG-TTTAAATCAA
gi|107903 : AATG--TTTATATTGAAATGTTT--GTACAA-AT---ATGTATTA----TTGTGAA-TAAAATATTG-TTTAAACTAA
gi|107904 : AATG--TTTATATTGAAATGTTT--GTACAA-AC---ATGTATTA----TTGTGAA-TAAAATACTG-TTCAAACTA
gi|107905 : AATG--TGTATATTGAT-AATCT--G-ATTA-CC---ACGCAT-G----TTGTGAT-TAAAATGTTG-TTTTAACTAA
gi|107906 : ATA--TGTATATTGAA-TGTAT--G-ACTA-CC---ACGTAT-A----TTGTGAA-CAAAATATTG-TTTAAACTa
gi|107907 : ATG--TGCATATTAAA-TGTAT--A-ACTA-CCCAAATGTAT-A----ATGTGAA-TCAAATGATG-TTTAAAtaaa
gi|107908 : G--TGTATATTGAA-TGTAT--G-ACTA-CC---ATGTAC-A----GTGTGAA-T----TGTTA-TTTA
gi|107909 : G--TGTATATTGAA-TGTAT--G-ACTG-CC---ATGTAC-A----GTGTGAA-T----TGTTA-TTTA
gi|107910 : --TGTATATTGAA-TCTAT--G-ACTA-TC---ATGTGT-A----TTATGAA-TAAAATATTG-CTTAAACTAA
gi|107911 : --TGTA-ATTGAA-TGTAT--G-ACTA-CC---ATGTTT-A----CTGTGAA-CAAAATAGTG-TTTAAACTAAa
gi|107912 : --TGTATATTGAA-AGTAC--G-ACTA-CC---ATGTAT-A----TTGTGAA-TAAAATAGTG-TCTATACTa
gi|107913 : --TGTA-ATTGAA-TGTAT--G-ACTA-CC---ATGTTT-A----CTGCGAA-CAAAATAGTG-TTTAAACTAA
gi|107914 : --TGTA-ATTGAA-TGTAT--G-ACTA-AC---ATGTTT-A----CTGTGAA-CAAAATAGTG-TTTAAACTAAa
gi|107915 : --TGTA-ATTGAA-TGTAT--G-ACTA-CC---AAGTTT-A----CTGTGAA-CAAAATAGTG-TTTAAACTAAa
gi|107916 : --TGTA-ATTGAA-TGTAT--G-ACTT-CC---ATGTTT-A----CTGTGAA-CAAAATAGTG-TTTAAACTAAa
gi|107917 : --TGTA-ATTGAT-TGTAT--G-ACTA-CC---ATGTTT-A----CTGTGAA-CAAAATAGTG-TTTAAACTAAa
gi|107918 : --TGTA-ATTGAA-TGTAT--G-ACTA-CC---ATGTTT-A----CTGTGAA-CAAAATAGTG-TTTAAACTa
gi|107919 : --TATATATTGAA-GAGAT--G-ACCA-CC---ATGCAT-A----TTGTAAA-TAAAATATTG-TTTAAACGAAtaa
gi|107920 : --TGTA-ATTGAA-TGTAT--G-ACTA-AC---ATGTTT-A----CTGCGAA-CAAAATAGTG-TTTAAACTAAa
gi|107921 : --TGTA-ATTGAA-TGTAT--G-ACTT-AC---ATGTTT-A----CTTTGAA-CAAAATAGTG-TTTAAACTAAa
gi|107922 : TATGGAA-TATAT--G-ACTA-A----ATGTAT-A----TTGTAAA-TAAAATACTG-TTTAAACTAAa
gi|107923 : TATGAAA-TATAT--G-ACTA-A----ATGTAT-A----TTGTAAA-TAAAATACTG-TTTAAACTAA
gi|107924 : ATTTAA-TATAT--G-ACTA-CC---ATGTAT-A----TTGTGAA-TAAAATATTG-TTTAAACT
gi|107925 : -TGTAT--G-ACTA-CC---ATGTAT-A----TTGTGAT-TAAAGTATTG-TTTAAACTAAtaa
Alignments
lowQualScore : 11 1 1 11 1 0 111 1 1 1111 0 1 0
lowQualScore : .. . . .. . . ... . . .... . . .
lowQualScore : 33 3 8 22 8 9 666 2 8 9999 9 9 9
consensus : TTAATG--TGTATATTGAA-TGTAT--G-ACTA-CC---ATGTAT-A----TTGTGAA-TAAAATANTG-TTTAAACTAA
Reference ( family-518 ) : TTAATG--TGTATATTGAA-TGTAT--G-ACTA-CC---ATGTAT-A----TTGTGAA-TAAAATANTG-TTTAAACTAA
gi|107881 : TTAATA--TGTATATTGAA-TGTAT--G-ACTA-CC---ATGTAT-A----CTGTGAA-TAAAATATTG-TTTAAACTAA
gi|107882 : TTAATG--TGTGTATTGAA-TGTAT--G-ACTA-CC---ATGTTT-A----TTGTGAA-TAAAATTTTG-TTTAAACTAA
gi|107883 : TTAATA--TGTTTATTGAA-TGCAT--G-ACTA-CC---ATGTAT-ATTTTTTGTGAA-TAAAACATTG-TTTAAACTAAa
gi|107884 : TTAATA--TGTTTATTGAA-TGTAT--G-ACTA-CC---ACGTAT-A----TTGTGAA-AAAAACAGTG-TTTAAACTAAa
gi|107885 : TTAATA--TGTATATTGCA-TATAT--G-ACTA-CC---ATGTAT-G----TTGTGAA-TAAAACCGTG-TTTAAACTAAa
gi|107886 : TCAATA--TGTATTTTGAA-TGTAT--G-ACTA-CC---GTGCAT-A----TTGTGAA-TAAACTATTG-TTTTAACTAAa
gi|107887 : TTGGTG--GGTATATTGAA-TGTAT--G-ATTA-CC---ATGCTT-A----TGGTGAA-TAGAATATTG-TTTAAACTAAa
gi|107888 : TTAATA--TGTTTATTGAA-TGTAT--G-ACTA-CC---ATGTAT-A----TTGTGAA-TAAAACCTTG-TTGAAAa
gi|107889 : TTAAAG--TGTATATTGAA-TGTAT--G-ACTA-CT---ATGTTT-A----TTGGGAA-TAAAATAATG-TTTTAACTAA
gi|107890 : TTCATT--TGTATATTGAA-TGTAT--G-ACTA-CC---ATGTAT-A----TTGTTAA-TTAAAAAATA-CTTAAACTAA
gi|107891 : TTTATG--TGTATACTTAA-TGTAT--G-ACTC-AC---ATGTAT-A----TTGTGAA-TAAAATATAGTTTTAAACTa
gi|107892 : TTAATG--TGTATATTGAA-TGTAT--A-ACTA-CT---ACGTTC-A----TTGGGAA-TGAAAGA-TG-TTTAAAC
gi|107893 : TTCATT--TGT-TATTGAA-TATAT--G-ACTA-CC---ATGTTA-A----CTGTGAA-CAAAATAGTG-TTTAAACTAA
gi|107894 : TTAATG--TTTATATTGAA-AGTAT--G-ACTA-C----GTGTAT-G----CTGTGAA-CGACATATTG-TTTAAACTAAa
gi|107895 : TTGAGG--TGCATATTGAA-TGTAT--G-ACTA-CC---ATGTTT-A----TATTAAA-TAAAATATTG-TTTCAAATAA
gi|107896 : TTACTGAATGTATATTAAC-TGTAT--G-GCTA-CC---ATGTAT-A----TTGTGAACT----TATTG-TTTAAACTA
gi|107897 : TTAATG--TGTATTTTTAA-TGGGT--G-ATTA-CC---AAGTAT-A----TTGTGAA-TAAAACAATG-TTTTAATTA
gi|107898 : TTCATG--TGTATATTGAA-AATAT--G-A-TATCC---ATGTAT-G----TTGTGAT-AAAAATGTTA-TTTAAACTAA
gi|107899 : TAATA--TGTTTATTGAA-TGTAT--G-ACTA-CC---ATGTAT-A----TTGTGAA-TAACACATTG-TTTAAACTGAa
gi|107900 : AATG--TATATACTGAA-TGTAT--G-ACTA-CC---ATGTTT-A----TTGTGAA-TAAAATATTG-TTTAAACTa
gi|107901 : AATG--TGTATATTGAA-TATATACG-ACAA-CC---CTGTTC-A----TTGAGGA-TAGAATATTG-TTTAAACTA
gi|107902 : AATG--TGTATATAGAA-TATAT--G-ATAA-CC---ATGCAT-G----TTGTGAA-TAAAATAGTG-TTTAAATCAA
gi|107903 : AATG--TTTATATTGAAATGTTT--GTACAA-AT---ATGTATTA----TTGTGAA-TAAAATATTG-TTTAAACTAA
gi|107904 : AATG--TTTATATTGAAATGTTT--GTACAA-AC---ATGTATTA----TTGTGAA-TAAAATACTG-TTCAAACTA
gi|107905 : AATG--TGTATATTGAT-AATCT--G-ATTA-CC---ACGCAT-G----TTGTGAT-TAAAATGTTG-TTTTAACTAA
gi|107906 : ATA--TGTATATTGAA-TGTAT--G-ACTA-CC---ACGTAT-A----TTGTGAA-CAAAATATTG-TTTAAACTa
gi|107907 : ATG--TGCATATTAAA-TGTAT--A-ACTA-CCCAAATGTAT-A----ATGTGAA-TCAAATGATG-TTTAAAtaaa
gi|107908 : G--TGTATATTGAA-TGTAT--G-ACTA-CC---ATGTAC-A----GTGTGAA-T----TGTTA-TTTA
gi|107909 : G--TGTATATTGAA-TGTAT--G-ACTG-CC---ATGTAC-A----GTGTGAA-T----TGTTA-TTTA
gi|107910 : --TGTATATTGAA-TCTAT--G-ACTA-TC---ATGTGT-A----TTATGAA-TAAAATATTG-CTTAAACTAA
gi|107911 : --TGTA-ATTGAA-TGTAT--G-ACTA-CC---ATGTTT-A----CTGTGAA-CAAAATAGTG-TTTAAACTAAa
gi|107912 : --TGTATATTGAA-AGTAC--G-ACTA-CC---ATGTAT-A----TTGTGAA-TAAAATAGTG-TCTATACTa
gi|107913 : --TGTA-ATTGAA-TGTAT--G-ACTA-CC---ATGTTT-A----CTGCGAA-CAAAATAGTG-TTTAAACTAA
gi|107914 : --TGTA-ATTGAA-TGTAT--G-ACTA-AC---ATGTTT-A----CTGTGAA-CAAAATAGTG-TTTAAACTAAa
gi|107915 : --TGTA-ATTGAA-TGTAT--G-ACTA-CC---AAGTTT-A----CTGTGAA-CAAAATAGTG-TTTAAACTAAa
gi|107916 : --TGTA-ATTGAA-TGTAT--G-ACTT-CC---ATGTTT-A----CTGTGAA-CAAAATAGTG-TTTAAACTAAa
gi|107917 : --TGTA-ATTGAT-TGTAT--G-ACTA-CC---ATGTTT-A----CTGTGAA-CAAAATAGTG-TTTAAACTAAa
gi|107918 : --TGTA-ATTGAA-TGTAT--G-ACTA-CC---ATGTTT-A----CTGTGAA-CAAAATAGTG-TTTAAACTa
gi|107919 : --TATATATTGAA-GAGAT--G-ACCA-CC---ATGCAT-A----TTGTAAA-TAAAATATTG-TTTAAACGAAtaa
gi|107920 : --TGTA-ATTGAA-TGTAT--G-ACTA-AC---ATGTTT-A----CTGCGAA-CAAAATAGTG-TTTAAACTAAa
gi|107921 : --TGTA-ATTGAA-TGTAT--G-ACTT-AC---ATGTTT-A----CTTTGAA-CAAAATAGTG-TTTAAACTAAa
gi|107922 : TATGGAA-TATAT--G-ACTA-A----ATGTAT-A----TTGTAAA-TAAAATACTG-TTTAAACTAAa
gi|107923 : TATGAAA-TATAT--G-ACTA-A----ATGTAT-A----TTGTAAA-TAAAATACTG-TTTAAACTAA
gi|107924 : ATTTAA-TATAT--G-ACTA-CC---ATGTAT-A----TTGTGAA-TAAAATATTG-TTTAAACT
gi|107925 : -TGTAT--G-ACTA-CC---ATGTAT-A----TTGTGAT-TAAAGTATTG-TTTAAACTAAtaa
blockSeqs : AA T A AC T CAA T T TTTT T
blockSeqs : . T A . T . A T . T
blockSeqs : . T . . . . A . . G
blockSeqs : . T . . . . A . . G
blockSeqs : . T . . . . A . . T
blockSeqs : . T . . . . T . . T
blockSeqs : . T . . . . A . . T
blockSeqs : . T . . . . T . . A
blockSeqs : . T . . . . A . . A
blockSeqs : . T . . . . A . . T
blockSeqs : . T . . . . T . . G
blockSeqs : . T . . . . T . . T
blockSeqs : . T . . . . A . . T
blockSeqs : . T . . . . T . . T
blockSeqs : . T . . . . A . . A
blockSeqs : . T . . . . A . . T
blockSeqs : . T . . . . A . . T
blockSeqs : . T . . . . A . . T
blockSeqs : . T . . . . T . . T
blockSeqs : . T . . . . T . . G
blockSeqs : . T . . . . A . . T
blockSeqs : . T . . . . A . . C
blockSeqs : . T . . . . A . . T
blockSeqs : . T . . . . A . . T
blockSeqs : . T . . . . A . . A
blockSeqs : . T . . . . A . . T
blockSeqs : . T . . . . A . . T
blockSeqs : . T . . . . A . . T
blockSeqs : . T . . . . G . . G
blockSeqs : . T . . . . T . . G
blockSeqs : . T . . . . A . . G
blockSeqs : . T . . . . T . . G
blockSeqs : . T . . . . T . . G
blockSeqs : . . . . . . T . . G
blockSeqs : . . . . . . T . . G
blockSeqs : . . . . . . T . . G
blockSeqs : . . . . . . T . . T
blockSeqs : . . . . . . A . . G
blockSeqs : . . . . . . T . . G
blockSeqs : . . . . . . T . . C
blockSeqs : . . . . . A . . C
blockSeqs : . . . . . A . . T
blockSeqs : . . . . A . . T
blockSeqs : . . . . A . . .
blockSeqCons :
originalCons : TTAATG--TGTATATTGAA-TGTAT--G-ACTA-CC---ATGTAT-A----TTGTGAA-TAAAATANTG-TTTAAACTAA
finalCons : TTAATG--TGTATATTGAA-TGTAT--G-ACTA-CC---ATGTAT-A----TTGTGAA-TAAAATANTG-TTTAAACTAA
Alignments
lowQualScore : 11 1 1 11 1 0 111 1 1 1111 0 1 0
lowQualScore : .. . . .. . . ... . . .... . . .
lowQualScore : 33 3 8 22 8 9 666 2 8 9999 9 9 9
consensus : TTAATG--TGTATATTGAA-TGTAT--G-ACTA-CC---ATGTAT-A----TTGTGAA-TAAAATANTG-TTTAAACTAA
Reference ( family-518 ) : TTAATG--TGTATATTGAA-TGTAT--G-ACTA-CC---ATGTAT-A----TTGTGAA-TAAAATANTG-TTTAAACTAA
gi|107881 : TTAATA--TGTATATTGAA-TGTAT--G-ACTA-CC---ATGTAT-A----CTGTGAA-TAAAATATTG-TTTAAACTAA
gi|107882 : TTAATG--TGTGTATTGAA-TGTAT--G-ACTA-CC---ATGTTT-A----TTGTGAA-TAAAATTTTG-TTTAAACTAA
gi|107883 : TTAATA--TGTTTATTGAA-TGCAT--G-ACTA-CC---ATGTAT-ATTTTTTGTGAA-TAAAACATTG-TTTAAACTAAa
gi|107884 : TTAATA--TGTTTATTGAA-TGTAT--G-ACTA-CC---ACGTAT-A----TTGTGAA-AAAAACAGTG-TTTAAACTAAa
gi|107885 : TTAATA--TGTATATTGCA-TATAT--G-ACTA-CC---ATGTAT-G----TTGTGAA-TAAAACCGTG-TTTAAACTAAa
gi|107886 : TCAATA--TGTATTTTGAA-TGTAT--G-ACTA-CC---GTGCAT-A----TTGTGAA-TAAACTATTG-TTTTAACTAAa
gi|107887 : TTGGTG--GGTATATTGAA-TGTAT--G-ATTA-CC---ATGCTT-A----TGGTGAA-TAGAATATTG-TTTAAACTAAa
gi|107888 : TTAATA--TGTTTATTGAA-TGTAT--G-ACTA-CC---ATGTAT-A----TTGTGAA-TAAAACCTTG-TTGAAAa
gi|107889 : TTAAAG--TGTATATTGAA-TGTAT--G-ACTA-CT---ATGTTT-A----TTGGGAA-TAAAATAATG-TTTTAACTAA
gi|107890 : TTCATT--TGTATATTGAA-TGTAT--G-ACTA-CC---ATGTAT-A----TTGTTAA-TTAAAAAATA-CTTAAACTAA
gi|107891 : TTTATG--TGTATACTTAA-TGTAT--G-ACTC-AC---ATGTAT-A----TTGTGAA-TAAAATATAGTTTTAAACTa
gi|107892 : TTAATG--TGTATATTGAA-TGTAT--A-ACTA-CT---ACGTTC-A----TTGGGAA-TGAAAGA-TG-TTTAAAC
gi|107893 : TTCATT--TGT-TATTGAA-TATAT--G-ACTA-CC---ATGTTA-A----CTGTGAA-CAAAATAGTG-TTTAAACTAA
gi|107894 : TTAATG--TTTATATTGAA-AGTAT--G-ACTA-C----GTGTAT-G----CTGTGAA-CGACATATTG-TTTAAACTAAa
gi|107895 : TTGAGG--TGCATATTGAA-TGTAT--G-ACTA-CC---ATGTTT-A----TATTAAA-TAAAATATTG-TTTCAAATAA
gi|107896 : TTACTGAATGTATATTAAC-TGTAT--G-GCTA-CC---ATGTAT-A----TTGTGAACT----TATTG-TTTAAACTA
gi|107897 : TTAATG--TGTATTTTTAA-TGGGT--G-ATTA-CC---AAGTAT-A----TTGTGAA-TAAAACAATG-TTTTAATTA
gi|107898 : TTCATG--TGTATATTGAA-AATAT--G-A-TATCC---ATGTAT-G----TTGTGAT-AAAAATGTTA-TTTAAACTAA
gi|107899 : TAATA--TGTTTATTGAA-TGTAT--G-ACTA-CC---ATGTAT-A----TTGTGAA-TAACACATTG-TTTAAACTGAa
gi|107900 : AATG--TATATACTGAA-TGTAT--G-ACTA-CC---ATGTTT-A----TTGTGAA-TAAAATATTG-TTTAAACTa
gi|107901 : AATG--TGTATATTGAA-TATATACG-ACAA-CC---CTGTTC-A----TTGAGGA-TAGAATATTG-TTTAAACTA
gi|107902 : AATG--TGTATATAGAA-TATAT--G-ATAA-CC---ATGCAT-G----TTGTGAA-TAAAATAGTG-TTTAAATCAA
gi|107903 : AATG--TTTATATTGAAATGTTT--GTACAA-AT---ATGTATTA----TTGTGAA-TAAAATATTG-TTTAAACTAA
gi|107904 : AATG--TTTATATTGAAATGTTT--GTACAA-AC---ATGTATTA----TTGTGAA-TAAAATACTG-TTCAAACTA
gi|107905 : AATG--TGTATATTGAT-AATCT--G-ATTA-CC---ACGCAT-G----TTGTGAT-TAAAATGTTG-TTTTAACTAA
gi|107906 : ATA--TGTATATTGAA-TGTAT--G-ACTA-CC---ACGTAT-A----TTGTGAA-CAAAATATTG-TTTAAACTa
gi|107907 : ATG--TGCATATTAAA-TGTAT--A-ACTA-CCCAAATGTAT-A----ATGTGAA-TCAAATGATG-TTTAAAtaaa
gi|107908 : G--TGTATATTGAA-TGTAT--G-ACTA-CC---ATGTAC-A----GTGTGAA-T----TGTTA-TTTA
gi|107909 : G--TGTATATTGAA-TGTAT--G-ACTG-CC---ATGTAC-A----GTGTGAA-T----TGTTA-TTTA
gi|107910 : --TGTATATTGAA-TCTAT--G-ACTA-TC---ATGTGT-A----TTATGAA-TAAAATATTG-CTTAAACTAA
gi|107911 : --TGTA-ATTGAA-TGTAT--G-ACTA-CC---ATGTTT-A----CTGTGAA-CAAAATAGTG-TTTAAACTAAa
gi|107912 : --TGTATATTGAA-AGTAC--G-ACTA-CC---ATGTAT-A----TTGTGAA-TAAAATAGTG-TCTATACTa
gi|107913 : --TGTA-ATTGAA-TGTAT--G-ACTA-CC---ATGTTT-A----CTGCGAA-CAAAATAGTG-TTTAAACTAA
gi|107914 : --TGTA-ATTGAA-TGTAT--G-ACTA-AC---ATGTTT-A----CTGTGAA-CAAAATAGTG-TTTAAACTAAa
gi|107915 : --TGTA-ATTGAA-TGTAT--G-ACTA-CC---AAGTTT-A----CTGTGAA-CAAAATAGTG-TTTAAACTAAa
gi|107916 : --TGTA-ATTGAA-TGTAT--G-ACTT-CC---ATGTTT-A----CTGTGAA-CAAAATAGTG-TTTAAACTAAa
gi|107917 : --TGTA-ATTGAT-TGTAT--G-ACTA-CC---ATGTTT-A----CTGTGAA-CAAAATAGTG-TTTAAACTAAa
gi|107918 : --TGTA-ATTGAA-TGTAT--G-ACTA-CC---ATGTTT-A----CTGTGAA-CAAAATAGTG-TTTAAACTa
gi|107919 : --TATATATTGAA-GAGAT--G-ACCA-CC---ATGCAT-A----TTGTAAA-TAAAATATTG-TTTAAACGAAtaa
gi|107920 : --TGTA-ATTGAA-TGTAT--G-ACTA-AC---ATGTTT-A----CTGCGAA-CAAAATAGTG-TTTAAACTAAa
gi|107921 : --TGTA-ATTGAA-TGTAT--G-ACTT-AC---ATGTTT-A----CTTTGAA-CAAAATAGTG-TTTAAACTAAa
gi|107922 : TATGGAA-TATAT--G-ACTA-A----ATGTAT-A----TTGTAAA-TAAAATACTG-TTTAAACTAAa
gi|107923 : TATGAAA-TATAT--G-ACTA-A----ATGTAT-A----TTGTAAA-TAAAATACTG-TTTAAACTAA
gi|107924 : ATTTAA-TATAT--G-ACTA-CC---ATGTAT-A----TTGTGAA-TAAAATATTG-TTTAAACT
gi|107925 : -TGTAT--G-ACTA-CC---ATGTAT-A----TTGTGAT-TAAAGTATTG-TTTAAACTAAtaa